Diaphorina citri psyllid: psy15636

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-
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cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHcHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHcc
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xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Transcription factor Sox-14 Acts as a negative regulator of transcription. May function as a switch in neuronal development.very confidentA4QNG3
Transcription factor SOX-14 Acts as a negative regulator of transcription.very confidentQ9W7R6
Transcription factor SOX-3 Transcription factor required during the formation of the hypothalamo-pituitary axis. May function as a switch in neuronal development. Keeps neural cells undifferentiated by counteracting the activity of proneural proteins and suppresses neuronal differentiation. Required also within the pharyngeal epithelia for craniofacial morphogenesis. Controls a genetic switch in male development. Is necessary for initiating male sex determination by directing the development of supporting cell precursors (pre-Sertoli cells) as Sertoli rather than granulosa cells.very confidentP41225

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0050973 [BP]detection of mechanical stimulus involved in equilibrioceptionprobableGO:0009581, GO:0009582, GO:0050974, GO:0051606, GO:0009605, GO:0050885, GO:0009628, GO:0050982, GO:0050954, GO:0050957, GO:0050905, GO:0007600, GO:0009612, GO:0032501, GO:0050906, GO:0050877, GO:0044707, GO:0008150, GO:0050896, GO:0044699, GO:0003008
GO:0009950 [BP]dorsal/ventral axis specificationprobableGO:0032502, GO:0007389, GO:0032501, GO:0009953, GO:0044707, GO:0008150, GO:0003002, GO:0009798, GO:0007275, GO:0044699
GO:0003730 [MF]mRNA 3'-UTR bindingprobableGO:0097159, GO:0003674, GO:0005488, GO:0003676, GO:0003729, GO:1901363, GO:0003723
GO:0050910 [BP]detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of soundprobableGO:0009581, GO:0009582, GO:0050974, GO:0051606, GO:0009605, GO:0044707, GO:0009628, GO:0007605, GO:0050877, GO:0050896, GO:0007600, GO:0009612, GO:0050982, GO:0032501, GO:0050906, GO:0050954, GO:0008150, GO:0044699, GO:0003008
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GO:0003413 [BP]chondrocyte differentiation involved in endochondral bone morphogenesisprobableGO:0048705, GO:0030154, GO:0060349, GO:0060348, GO:0001501, GO:0009653, GO:0007275, GO:0044699, GO:0048869, GO:0048513, GO:0002062, GO:0032502, GO:0060351, GO:0009887, GO:0032501, GO:0009987, GO:0009888, GO:0061448, GO:0044767, GO:0044763, GO:0048731, GO:0051216, GO:0044707, GO:0048856, GO:0060350, GO:0008150
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GO:0006977 [BP]DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrestprobableGO:0051726, GO:0044699, GO:0010948, GO:0044773, GO:0044774, GO:0007165, GO:0035556, GO:0072331, GO:0050789, GO:0072401, GO:0090068, GO:0051716, GO:2000134, GO:0031570, GO:0031571, GO:0072395, GO:0010564, GO:0071158, GO:0065007, GO:1901988, GO:0048518, GO:0048519, GO:0071156, GO:1901990, GO:0030330, GO:0008150, GO:0009987, GO:0007346, GO:0050794, GO:0006974, GO:1901987, GO:0006950, GO:0044763, GO:0023052, GO:0007154, GO:0072413, GO:0042770, GO:0044700, GO:0007049, GO:0000077, GO:2000045, GO:0000075, GO:0072431, GO:0022402, GO:0072422, GO:0033554, GO:1901991, GO:0044783, GO:0007093, GO:0050896, GO:0048523, GO:0048522

Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 2GZK, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 40-101
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL