Diaphorina citri psyllid: psy16245

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
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Function Prediction

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Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 Orphan receptor that binds DNA as a monomer to hormone response elements (HRE) containing an extended core motif half-site sequence 5'-AAGGTCA-3' in which the 5' flanking nucleotides participate in determining receptor specificity. May be required to pattern anterior brain differentiation (By similarity). Involved in the regulation of retinal development.confidentQ91379
Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 Orphan receptor that binds DNA as a monomer to hormone response elements (HRE) containing an extended core motif half-site sequence 5'-AAGGTCA-3' in which the 5' flanking nucleotides participate in determining receptor specificity (By similarity). Regulates cell cycle progression in neural stem cells of rhe developing brain. Involved in the regulation of retinal development and essential for vision. During retinogenesis, regulates PTEN-Cyclin D expression via binding to the promoter region of PTEN and suppressing its activity. May be involved in retinoic acid receptor (RAR) regulation in retinal cells.confidentQ64104
Nuclear hormone receptor family member nhr-67 Orphan nuclear receptor.confidentQ9XVV3

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
GO:0001078 [MF]RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding transcription factor activity involved in negative regulation of transcriptionconfidentGO:0001227, GO:0003700, GO:0003674, GO:0001071, GO:0000982, GO:0000981
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GO:0042524 [BP]negative regulation of tyrosine phosphorylation of Stat5 proteinprobableGO:0010563, GO:0019220, GO:0080090, GO:0019222, GO:0048585, GO:0031324, GO:0048583, GO:0023057, GO:0010648, GO:0023051, GO:0009892, GO:0010646, GO:0010627, GO:0050789, GO:0051248, GO:0010605, GO:0009968, GO:0009966, GO:0045936, GO:0051246, GO:0042532, GO:0065007, GO:0031399, GO:0048519, GO:0010741, GO:0042325, GO:0046426, GO:0046425, GO:0060255, GO:0031323, GO:0050794, GO:0051174, GO:0032268, GO:0008150, GO:0042509, GO:0042522, GO:0032269, GO:0042326, GO:0050730, GO:0031400, GO:0050732, GO:0001933, GO:0001932, GO:0048523
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

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Template: 3DZU, chain D
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