BLASTP 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for compositional score matrix adjustment: Altschul, Stephen F.,
John C. Wootton, E. Michael Gertz, Richa Agarwala, Aleksandr Morgulis,
Alejandro A. Schaffer, and Yi-Kuo Yu (2005) "Protein database searches
using compositionally adjusted substitution matrices", FEBS J. 272:5101-5109.
Query= psy16558
(245 letters)
Database: swissprot
539,616 sequences; 191,569,459 total letters
Searching..................................................done
>sp|Q7TQN8|GP119_RAT Glucose-dependent insulinotropic receptor OS=Rattus norvegicus
GN=Gpr119 PE=1 SV=1
Length = 468
Score = 66.2 bits (160), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/130 (34%), Positives = 47/130 (36%), Gaps = 13/130 (10%)
Query: 96 TYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYP 155
T Y C T Y C A T Y C T Y C + T Y C T Y C T Y
Sbjct: 323 TLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAC-----DTQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYT 377
Query: 156 CKVTTYYPCKATTYYPYKVTPYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKATTYYPCKATTYYPCKVT 215
C T Y C A T Y Y C + T Y C A T Y C A T Y C
Sbjct: 378 CDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDTQ--------TLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQ 429
Query: 216 TYYPCKVTTY 225
T Y C T
Sbjct: 430 TLYTCDAQTL 439
Score = 65.5 bits (158), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/131 (33%), Positives = 45/131 (34%), Gaps = 13/131 (9%)
Query: 40 TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYP 99
T Y C T Y C T Y T Y C C T Y C T Y
Sbjct: 323 TLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCD-------------ACDTQTLYTCDAQTLYT 369
Query: 100 CKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVT 159
C T Y C A T Y C T Y C + Y T Y C T Y C T Y C
Sbjct: 370 CDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDTQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQ 429
Query: 160 TYYPCKATTYY 170
T Y C A T Y
Sbjct: 430 TLYTCDAQTLY 440
Score = 59.3 bits (142), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/139 (30%), Positives = 44/139 (31%), Gaps = 21/139 (15%)
Query: 24 TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSP 83
T Y C T Y C T Y C T Y C C C T
Sbjct: 323 TLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCD-------------ACDTQTLYTCDAQTLYT 369
Query: 84 CKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKVT 143
C T Y C T Y C T Y C A T Y C T Y C + T Y C
Sbjct: 370 CDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDTQTLYTCDAQ--------TLYTCDAQ 421
Query: 144 TYYPCKVTTYYPCKVTTYY 162
T Y C T Y C T Y
Sbjct: 422 TLYTCDAQTLYTCDAQTLY 440
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/110 (34%), Positives = 38/110 (34%), Gaps = 3/110 (2%)
Query: 16 TYYPCKVTTYYPCKVTTYY---PCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTP 72
T Y C T Y C T Y C T Y C T Y C T Y T Y C
Sbjct: 331 TLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDACDTQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQT 390
Query: 73 YSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYY 122
C T C T Y C T Y C T Y C A T Y C T Y
Sbjct: 391 LYTCDAQTLYTCDTQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLY 440
Score = 52.8 bits (125), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/115 (32%), Positives = 40/115 (34%), Gaps = 3/115 (2%)
Query: 16 TYYPCKVTTYY---PCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTP 72
T Y C T Y C T Y C T Y C T Y C T Y T Y C
Sbjct: 339 TLYTCDAQTLYTCDACDTQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQT 398
Query: 73 YSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSP 127
C T C T Y C T Y C T Y C A T Y + T ++P
Sbjct: 399 LYTCDTQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTCDAQTLYTSSLVTGQTEQTP 453
>sp|P18146|EGR1_HUMAN Early growth response protein 1 OS=Homo sapiens GN=EGR1 PE=1 SV=1
Length = 543
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/106 (33%), Positives = 49/106 (46%), Gaps = 10/106 (9%)
Query: 18 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCK 77
YP V T YP VTT YP TT YP V T + ++ YP V + +P SP
Sbjct: 442 YPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFP------SPSV 495
Query: 78 VTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYP 123
TTYS V +P +++++ VT + A+T T+ P
Sbjct: 496 ATTYS--SVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSF--SASTGLSDMTATFSP 537
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/80 (37%), Positives = 39/80 (48%), Gaps = 3/80 (3%)
Query: 90 YPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPC-KVTTYYPC 148
YP + T YP VTT YP ATT YP V T + YP V + +P V T Y
Sbjct: 442 YPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTY-S 500
Query: 149 KVTTYYPCKVTTYYPCKATT 168
V +P +V++ +P A T
Sbjct: 501 SVPPAFPAQVSS-FPSSAVT 519
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/79 (35%), Positives = 37/79 (46%), Gaps = 9/79 (11%)
Query: 130 YPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVTPYYPCKS------- 182
YP V T YP VTT YP TT YP V T + ++ YP V +P S
Sbjct: 442 YPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYSS 501
Query: 183 -PRDYPYKVTTYYPCKATT 200
P +P +V++ +P A T
Sbjct: 502 VPPAFPAQVSS-FPSSAVT 519
Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/80 (36%), Positives = 37/80 (46%), Gaps = 8/80 (10%)
Query: 146 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVTPYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKATTYYPCK 205
YP V T YP VTT YP ATT YP V + YP V + +P P
Sbjct: 442 YPSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPS------PSV 495
Query: 206 ATTYYPCKVTTYYPCKVTTY 225
ATTY V +P +V+++
Sbjct: 496 ATTY--SSVPPAFPAQVSSF 513
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.93, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/88 (31%), Positives = 39/88 (44%), Gaps = 8/88 (9%)
Query: 75 PCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKV 134
P V T P VTT YP TT YP V T + ++ YP V + +P P
Sbjct: 443 PSPVATSYPSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPS------PSVA 496
Query: 135 TTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYY 162
TTY V +P +V+++ VT +
Sbjct: 497 TTY--SSVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSF 522
>sp|Q29W20|EGR1_BOVIN Early growth response protein 1 OS=Bos taurus GN=EGR1 PE=2 SV=1
Length = 540
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/106 (33%), Positives = 48/106 (45%), Gaps = 10/106 (9%)
Query: 18 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCK 77
YP V T YP TT YP TT YP V T Y ++ YP V +P SP
Sbjct: 439 YPSPVATSYPSPATTSYPSPATTSYPSPVPTSYSSPGSSTYPSPVHNGFP------SPSV 492
Query: 78 VTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYP 123
TTYS V +P +++++ VT + A+T TT+ P
Sbjct: 493 ATTYS--SVPPAFPTQVSSFPSSAVTNSF--SASTGLSDMTTTFSP 534
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/98 (31%), Positives = 42/98 (42%), Gaps = 10/98 (10%)
Query: 130 YPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVTPYYPCKS------- 182
YP V T YP TT YP TT YP V T Y ++ YP V +P S
Sbjct: 439 YPSPVATSYPSPATTSYPSPATTSYPSPVPTSYSSPGSSTYPSPVHNGFPSPSVATTYSS 498
Query: 183 -PRDYPYKVTTYYPCKATTYYPCKATTYYPCKVTTYYP 219
P +P +V+++ T + A+T TT+ P
Sbjct: 499 VPPAFPTQVSSFPSSAVTNSF--SASTGLSDMTTTFSP 534
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/80 (37%), Positives = 37/80 (46%), Gaps = 3/80 (3%)
Query: 90 YPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPC-KVTTYYPC 148
YP + T YP TT YP ATT YP V T Y YP V +P V T Y
Sbjct: 439 YPSPVATSYPSPATTSYPSPATTSYPSPVPTSYSSPGSSTYPSPVHNGFPSPSVATTY-S 497
Query: 149 KVTTYYPCKVTTYYPCKATT 168
V +P +V++ +P A T
Sbjct: 498 SVPPAFPTQVSS-FPSSAVT 516
Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/80 (36%), Positives = 35/80 (43%), Gaps = 8/80 (10%)
Query: 146 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVTPYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKATTYYPCK 205
YP V T YP TT YP ATT YP V Y YP V +P P
Sbjct: 439 YPSPVATSYPSPATTSYPSPATTSYPSPVPTSYSSPGSSTYPSPVHNGFPS------PSV 492
Query: 206 ATTYYPCKVTTYYPCKVTTY 225
ATTY V +P +V+++
Sbjct: 493 ATTY--SSVPPAFPTQVSSF 510
Score = 32.3 bits (72), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/88 (31%), Positives = 37/88 (42%), Gaps = 8/88 (9%)
Query: 75 PCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKV 134
P V T P TT YP TT YP V T Y ++ YP V +P P
Sbjct: 440 PSPVATSYPSPATTSYPSPATTSYPSPVPTSYSSPGSSTYPSPVHNGFPS------PSVA 493
Query: 135 TTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYY 162
TTY V +P +V+++ VT +
Sbjct: 494 TTY--SSVPPAFPTQVSSFPSSAVTNSF 519
>sp|P35324|SPRR1_RABIT Cornifin alpha OS=Oryctolagus cuniculus PE=2 SV=1
Length = 126
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/86 (25%), Positives = 34/86 (39%)
Query: 40 TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYP 99
T PC+ PC+ P + PC+ PC+ PC+ PC+ P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 100 CKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCK 125
C+ PC++ PC+ PC+
Sbjct: 97 CQPKVPEPCQSKVPQPCQPKVPEPCQ 122
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/86 (25%), Positives = 33/86 (38%)
Query: 32 TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYP 91
T PC+ PC+ PC+ P + PC+ PC+ PC+ P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 92 CKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCK 117
C+ PC+ PC+ PC+
Sbjct: 97 CQPKVPEPCQSKVPQPCQPKVPEPCQ 122
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/86 (25%), Positives = 33/86 (38%)
Query: 80 TYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYP 139
T PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ P + P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 140 CKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCK 165
C+ PC+ PC+ PC+
Sbjct: 97 CQPKVPEPCQSKVPQPCQPKVPEPCQ 122
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/86 (25%), Positives = 33/86 (38%)
Query: 16 TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSP 75
T PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ P + PC+ P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 76 CKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCK 101
C+ PC+ PC+ PC+
Sbjct: 97 CQPKVPEPCQSKVPQPCQPKVPEPCQ 122
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/94 (24%), Positives = 34/94 (36%), Gaps = 8/94 (8%)
Query: 64 TYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYP 123
T PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 124 CKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCK 157
C+ PC+ PC+ PC+
Sbjct: 97 CQP--------KVPEPCQSKVPQPCQPKVPEPCQ 122
Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/94 (24%), Positives = 34/94 (36%), Gaps = 8/94 (8%)
Query: 56 TYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYP 115
T P + PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 116 CKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCK 149
C+ PC+S PC+ PC+
Sbjct: 97 CQPKVPEPCQS--------KVPQPCQPKVPEPCQ 122
Score = 33.1 bits (74), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 19/76 (25%), Positives = 29/76 (38%)
Query: 96 TYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYP 155
T PC+ PC+ PC+ PC+ P + PC+ PC+ P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 156 CKVTTYYPCKATTYYP 171
C+ PC++ P
Sbjct: 97 CQPKVPEPCQSKVPQP 112
Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 21/86 (24%), Positives = 33/86 (38%)
Query: 136 TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVTPYYPCKSPRDYPYKVTTYYP 195
T PC+ PC+ PC+ PC+ P + PC+ P + P
Sbjct: 37 TKEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPQPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEP 96
Query: 196 CKATTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCK 221
C+ PC++ PC+ PC+
Sbjct: 97 CQPKVPEPCQSKVPQPCQPKVPEPCQ 122
>sp|Q63532|SPR1A_RAT Cornifin-A OS=Rattus norvegicus GN=Sprr1a PE=2 SV=1
Length = 152
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.096, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/94 (25%), Positives = 32/94 (34%)
Query: 18 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCK 77
PC PC+ PC+ PC+ PC+ P + PC+ PC
Sbjct: 46 EPCNPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCH 105
Query: 78 VTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKAT 111
PC PC+ PC+ PC T
Sbjct: 106 PKAPEPCHPVVPEPCQPVAPEPCQPVVPEPCPPT 139
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.096, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/94 (25%), Positives = 32/94 (34%)
Query: 26 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCK 85
PC PC+ PC+ PC+ P + PC+ PC+ PC
Sbjct: 46 EPCNPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCH 105
Query: 86 VTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVT 119
PC PC+ PC+ PC T
Sbjct: 106 PKAPEPCHPVVPEPCQPVAPEPCQPVVPEPCPPT 139
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/101 (25%), Positives = 35/101 (34%), Gaps = 9/101 (8%)
Query: 74 SPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYK 133
PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ PC+ PC
Sbjct: 54 EPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCHP------- 106
Query: 134 VTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKAT-TYYPYK 173
PC PC+ PC+ PC T T PY+
Sbjct: 107 -KAPEPCHPVVPEPCQPVAPEPCQPVVPEPCPPTVTPSPYQ 146
Score = 31.2 bits (69), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/82 (24%), Positives = 27/82 (32%)
Query: 90 YPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCK 149
PC PC+ PC+ PC+ PC+ P + PC+ PC
Sbjct: 46 EPCNPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCH 105
Query: 150 VTTYYPCKVTTYYPCKATTYYP 171
PC PC+ P
Sbjct: 106 PKAPEPCHPVVPEPCQPVAPEP 127
>sp|O33479|ICEV_PSESX Ice nucleation protein OS=Pseudomonas syringae GN=inaV PE=3 SV=1
Length = 1196
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.096, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/228 (20%), Positives = 63/228 (27%), Gaps = 16/228 (7%)
Query: 18 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCK 77
Y +TT Y T +TT Y T Y + Y T Y +T
Sbjct: 774 YGSTLTTGYGSTQTAQENSSLTTGYGSTSTAGYSSSLIAGYGSTQTAGYESTLTA----- 828
Query: 78 VTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTY 137
Y T + T Y +T Y + Y Y +T
Sbjct: 829 -----------GYGSTQTAQERSDLVTGYGSTSTAGYASSLIAGYGSTQTAGYESTLTAG 877
Query: 138 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVTPYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCK 197
Y T +TT Y T + Y T Y Y T Y
Sbjct: 878 YGSTQTAQENSSLTTGYGSTSTAGFASSLIAGYGSTQTAGYKSTLTAGYGSTQTAEYGSS 937
Query: 198 ATTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKVTTYLLSFLDTYYPCKVTTYLLSL 245
T Y AT + Y +T+ + SFL Y + L S+
Sbjct: 938 LTAGYGSTATAGQDSSLIAGYGSTLTSGIRSFLTAGYGSTLIAGLRSV 985
>sp|Q62267|SPR1B_MOUSE Cornifin-B OS=Mus musculus GN=Sprr1b PE=2 SV=1
Length = 153
Score = 32.7 bits (73), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/100 (26%), Positives = 27/100 (27%)
Query: 27 PCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKV 86
PC PC PC PC P PC PC PC
Sbjct: 40 PCDTKVPEPCHPKAPEPCHPKAPEPCHPKAPEPCHPKAPEPCHPKAPEPCHPKAPEPCHP 99
Query: 87 TTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKS 126
PC PC PC PC+ PC S
Sbjct: 100 KAPEPCHPKAPEPCHPKVPEPCLPKAPEPCQPIVPEPCPS 139
>sp|Q13117|DAZ2_HUMAN Deleted in azoospermia protein 2 OS=Homo sapiens GN=DAZ2 PE=1 SV=3
Length = 558
Score = 32.3 bits (72), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/240 (28%), Positives = 88/240 (36%), Gaps = 21/240 (8%)
Query: 1 MRIATGASMKAYSLDTY-----YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVT 55
++ATG Y+ + P +VTT Y V Y P +VTT Y V
Sbjct: 296 FQVATGYQFPVYNYQAFPAYPNSPVQVTTGYQLPVYNYQAFPAYPNSPVQVTTGYQLPVY 355
Query: 56 TYY--------PFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYP 107
Y PF+VTT Y + Y SP +VTT Y + Y P
Sbjct: 356 NYQAFPAYPSSPFQVTTGYQLPVYNYQAFPAYPSSPFQVTTGYQLPVYNYQAFPAYPSSP 415
Query: 108 CKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKAT 167
+ TT Y V Y + P++VTT Y V Y P +VTT Y
Sbjct: 416 FQVTTGYQLPVYNYQAFPAYPSSPFQVTTGYQLPVYNYQAFPAYPSSPFQVTTGYQLPV- 474
Query: 168 TYYPYKVTPYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKATTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKVTTYLL 227
Y Y+ P YP P++VTT Y Y A +VTT Y V Y +
Sbjct: 475 --YNYQAFPAYPSS-----PFQVTTGYQLPVYNYQAFPAYPNSAVQVTTGYQFHVYNYQM 527
>sp|Q54YG2|ECMA_DICDI Extracellular matrix protein A OS=Dictyostelium discoideum GN=ecmA
PE=2 SV=1
Length = 1710
Score = 32.0 bits (71), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/185 (19%), Positives = 52/185 (28%), Gaps = 8/185 (4%)
Query: 4 ATGASMKAYSLDTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVT 63
+TG S D PC V + P V PC V T+ P V
Sbjct: 536 STGCVNTPISCDDNNPCTVDSCDDITGCCNTPINVDDNNPCTVDACTKSTGVTHTPVNVD 595
Query: 64 TYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYP 123
C + + T++P C + + P ++ P PC V +
Sbjct: 596 DNNKCTIDACTKEGGVTHTPVNTDDNNACTLDSCSPSTGVSHTPINCDDSNPCTVDSCSN 655
Query: 124 CKSPRDYPYKVTTYYPCKVT--------TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVT 175
+ P V PC V T+ P V C + T+ P
Sbjct: 656 STGCVNTPVNVDDNNPCTVDACTKSTGVTHTPVNVDDNNKCTIDACTKEGGVTHTPVNTD 715
Query: 176 PYYPC 180
C
Sbjct: 716 DNNAC 720
Score = 31.6 bits (70), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/251 (18%), Positives = 70/251 (27%), Gaps = 16/251 (6%)
Query: 4 ATGASMKAYSLDTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVT 63
+TG ++D PC V T+ P V C + T+ P
Sbjct: 896 STGCVNTPVNVDDNNPCTVDACTKSTGVTHTPVNVDDNNKCTIDACTKEGGVTHTPVNTD 955
Query: 64 TYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYP 123
C + + T++P C + + P ++ P PC V +
Sbjct: 956 DNNACTIDACTKEGGVTHTPVNTDDNNACTLDSCSPSTGVSHTPINCDDSNPCTVDSCSN 1015
Query: 124 CKSPRDYPYKVTTYYPCKVT--------TYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPYKVT 175
+ P V PC V T+ P V C + T+ P
Sbjct: 1016 STGCCNTPINVDDNNPCTVDSCTKPTGVTHTPVNVDDNNKCTIDACTKEGGVTHTPVNTD 1075
Query: 176 PYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCKATTYYPCKATT--------YYPCKVTTYYPCKVTTYLL 227
C P ++ P PC + P V PC V +
Sbjct: 1076 DNNACTLDSCSPSTGISHAPINCDDSNPCTIDSCNNSTGCCNTPINVDDNNPCTVDSCTK 1135
Query: 228 SFLDTYYPCKV 238
S T+ P V
Sbjct: 1136 SGGVTHTPVNV 1146
Score = 30.8 bits (68), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/161 (19%), Positives = 50/161 (31%)
Query: 4 ATGASMKAYSLDTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVT 63
+TG S + D PC V + P V PC V + T+ P V
Sbjct: 992 STGVSHTPINCDDSNPCTVDSCSNSTGCCNTPINVDDNNPCTVDSCTKPTGVTHTPVNVD 1051
Query: 64 TYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYP 123
C + + T++P C + + P ++ P PC + +
Sbjct: 1052 DNNKCTIDACTKEGGVTHTPVNTDDNNACTLDSCSPSTGISHAPINCDDSNPCTIDSCNN 1111
Query: 124 CKSPRDYPYKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPC 164
+ P V PC V + T+ P V C
Sbjct: 1112 STGCCNTPINVDDNNPCTVDSCTKSGGVTHTPVNVDDNNKC 1152
>sp|Q62266|SPR1A_MOUSE Cornifin-A OS=Mus musculus GN=Sprr1a PE=2 SV=1
Length = 144
Score = 31.6 bits (70), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/86 (25%), Positives = 26/86 (30%)
Query: 26 YPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPFKVTTYYPCKMTPYSPCKVTTYSPCK 85
PC PC PC PC P + PC+ PC PC+
Sbjct: 46 EPCNPKGPEPCHPKAPEPCHPKAPEPCNPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCNPKVPEPCQ 105
Query: 86 VTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKAT 111
PC PC PC +T
Sbjct: 106 PKAPEPCHPKAPEPCHPVVPEPCPST 131
Score = 31.6 bits (70), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/86 (25%), Positives = 26/86 (30%)
Query: 82 SPCKVTTYYPCKMTTYYPCKVTTYYPCKATTYYPCKVTTYYPCKSPRDYPYKVTTYYPCK 141
PC PC PC PC PC+ PC+ P PC+
Sbjct: 46 EPCNPKGPEPCHPKAPEPCHPKAPEPCNPKVPEPCQPKVPEPCQPKVPEPCNPKVPEPCQ 105
Query: 142 VTTYYPCKVTTYYPCKVTTYYPCKAT 167
PC PC PC +T
Sbjct: 106 PKAPEPCHPKAPEPCHPVVPEPCPST 131
Database: swissprot
Posted date: Mar 23, 2013 2:32 AM
Number of letters in database: 191,569,459
Number of sequences in database: 539,616
Lambda K H
0.323 0.137 0.483
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 99,954,277
Number of Sequences: 539616
Number of extensions: 4208279
Number of successful extensions: 6995
Number of sequences better than 100.0: 50
Number of HSP's better than 100.0 without gapping: 40
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 34
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 5545
Number of HSP's gapped (non-prelim): 684
length of query: 245
length of database: 191,569,459
effective HSP length: 114
effective length of query: 131
effective length of database: 130,053,235
effective search space: 17036973785
effective search space used: 17036973785
T: 11
A: 40
X1: 16 ( 7.5 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (22.0 bits)
S2: 60 (27.7 bits)