Diaphorina citri psyllid: psy1898

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Paired box protein Pax-7 Probable transcription factor. May have a role in myogenesis.confidentP47239
Segmentation protein paired Pair-rule protein expressed in a segmentally repeating pattern to define the polarity of embryonic segments. Capable of sequence-specific DNA-binding.confidentP06601
Paired box protein Pax-3 Probable transcription factor associated with development of alveolar rhabdomyosarcoma.confidentP23760

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0071300 [BP]cellular response to retinoic acidprobableGO:1901700, GO:1901701, GO:0032526, GO:0033993, GO:0050896, GO:0009987, GO:0071396, GO:0051716, GO:0008150, GO:0071310, GO:0044763, GO:0070887, GO:0042221, GO:0010033, GO:0044699

Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 1PDN, chain C
Confidence level:very confident
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Template: 1K78, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 42-139
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