BLASTP 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for compositional score matrix adjustment: Altschul, Stephen F.,
John C. Wootton, E. Michael Gertz, Richa Agarwala, Aleksandr Morgulis,
Alejandro A. Schaffer, and Yi-Kuo Yu (2005) "Protein database searches
using compositionally adjusted substitution matrices", FEBS J. 272:5101-5109.
Query= psy4503
(447 letters)
Database: nr
23,463,169 sequences; 8,064,228,071 total letters
Searching..................................................done
>gi|156391149|ref|XP_001635631.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156222727|gb|EDO43568.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 744
Score = 231 bits (590), Expect = 4e-58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 142/431 (32%), Positives = 216/431 (50%), Gaps = 6/431 (1%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA G ++ TA LG ++ TA TLG
Sbjct: 107 SKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHPLGVSKHTAPDHTLGV 166
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
++ TA LG ++ TA LG ++ TA G ++ TA LG ++ TA LG
Sbjct: 167 SKRTAPDHPLGVSKHTAPDHPLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHPLGLSKRTAPDHPLGL 226
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG ++ T T G ++ TA LG
Sbjct: 227 SKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPDHPLGV 286
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
++ TA LG ++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA LG ++ TA TLG
Sbjct: 287 SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGL 346
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
++ T TLG ++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG ++ TA T G
Sbjct: 347 SKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTHGV 406
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS--ATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
++ TA LG ++ TA L V + P + ++ TA LG ++ TA
Sbjct: 407 SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVS----KRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGLSKHTAPDH 462
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
TLG ++ T T G ++ TA LG ++ TA G ++ TA T+G ++ TA
Sbjct: 463 TLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPHHPLGLSKRTAPDHPHGVSKHTAPDHTIGLSKRTAPDH 522
Query: 420 TLGATELTAKN 430
TLG ++ TA +
Sbjct: 523 TLGVSKRTAPD 533
Score = 229 bits (583), Expect = 3e-57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 141/431 (32%), Positives = 216/431 (50%), Gaps = 6/431 (1%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA LG ++ TA TLG ++ T TLG
Sbjct: 299 SKRTAPDHTLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTLGL 358
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG ++ TA T G ++ TA LG
Sbjct: 359 SKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTHGVSKRTAPDHPLGV 418
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
++ TA LG ++ TA LG ++ TA LG ++ TA TLG ++ T T G
Sbjct: 419 SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGLSKHTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGV 478
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
++ TA LG ++ TA G ++ TA T+G ++ TA TLG ++ TA LG
Sbjct: 479 SKRTAPHHPLGLSKRTAPDHPHGVSKHTAPDHTIGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGV 538
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
++ TA G ++ TA TLG ++ T T G ++ TA LG ++ TA LG
Sbjct: 539 SKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGV 598
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA--TELTAKVFTLGATELTAKVF 359
++ TA TLG ++ TA L + + P + ++ TA T G ++ TA
Sbjct: 599 SKRTAPDHTLGLSKRTAPDHPLGLS----KRTAPDHPHGVSKRTAPDHTHGLSKRTAPDH 654
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
TLG ++ TA G ++ TA T G ++ T TLG ++ TA LG ++ TA
Sbjct: 655 TLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTHGLSKRTGPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDH 714
Query: 420 TLGATELTAKN 430
LG ++ TA +
Sbjct: 715 PLGVSKRTAPD 725
Score = 228 bits (580), Expect = 7e-57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 140/428 (32%), Positives = 212/428 (49%), Gaps = 6/428 (1%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
TA G ++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA G ++ TA LG ++
Sbjct: 98 TAPDHPHGVSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHPLGVSKH 157
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
TA TLG ++ TA LG ++ TA LG ++ TA G ++ TA LG ++
Sbjct: 158 TAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKHTAPDHPLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHPLGLSKR 217
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
TA LG ++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG ++ T T G ++
Sbjct: 218 TAPDHPLGLSKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKR 277
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
TA LG ++ TA LG ++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA LG ++
Sbjct: 278 TAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKR 337
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 304
TA TLG ++ T TLG ++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG ++
Sbjct: 338 TAPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKR 397
Query: 305 TAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
TA T G ++ TA L V + P + ++ TA LG ++ TA LG
Sbjct: 398 TAPDHTHGVSKRTAPDHPLGVS----KRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLG 453
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
++ TA TLG ++ T T G ++ TA LG ++ TA G ++ TA T+G
Sbjct: 454 LSKHTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPHHPLGLSKRTAPDHPHGVSKHTAPDHTIG 513
Query: 423 ATELTAKN 430
++ TA +
Sbjct: 514 LSKRTAPD 521
Score = 227 bits (578), Expect = 1e-56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 140/429 (32%), Positives = 212/429 (49%), Gaps = 14/429 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
++ TA TLG ++ T T G ++ TA LG ++ TA LG ++ TA TLG
Sbjct: 251 SKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGV 310
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
++ TA TLG ++ TA LG ++ TA TLG ++ T TLG ++ T TLG
Sbjct: 311 SKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGL 370
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
++ TA G ++ TA TLG ++ TA T G ++ TA LG ++ TA LG
Sbjct: 371 SKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTHGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGV 430
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
++ TA LG ++ TA LG ++ TA TLG ++ T T G ++ TA LG
Sbjct: 431 SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGLSKHTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPHHPLGL 490
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
++ TA G ++ TA T+G ++ TA TLG ++ TA LG ++ TA G
Sbjct: 491 SKRTAPDHPHGVSKHTAPDHTIGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPHGL 550
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
++ TA TLG ++ T V ++ TA LG ++ TA L
Sbjct: 551 SKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGV--------------SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPL 596
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G ++ TA TLG ++ TA LG ++ TA G ++ TA T G ++ TA TL
Sbjct: 597 GVSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHPLGLSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHTHGLSKRTAPDHTL 656
Query: 422 GATELTAKN 430
G ++ TA +
Sbjct: 657 GLSKRTAPD 665
Score = 223 bits (569), Expect = 1e-55, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 139/431 (32%), Positives = 213/431 (49%), Gaps = 6/431 (1%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
++ T TLG ++ T TLG ++ T T+G ++ TA LG + TA G
Sbjct: 47 SKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTIGLSKRTAPDQPLGLSIRTAPDHPHGV 106
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA G ++ TA LG ++ TA TLG
Sbjct: 107 SKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHPLGVSKHTAPDHTLGV 166
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
++ TA LG ++ TA LG ++ TA G ++ TA LG ++ TA LG
Sbjct: 167 SKRTAPDHPLGVSKHTAPDHPLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHPLGLSKRTAPDHPLGL 226
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG ++ T T G ++ TA LG
Sbjct: 227 SKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPDHPLGV 286
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
++ TA LG ++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA LG ++ TA TLG
Sbjct: 287 SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGL 346
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA--TELTAKVFTLGATELTAKVF 359
++ T TLG ++ T L + + P + ++ TA TLG ++ TA
Sbjct: 347 SKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGLS----KRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTAPDH 402
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
T G ++ TA LG ++ TA LG ++ TA LG ++ TA LG ++ TA
Sbjct: 403 THGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGLSKHTAPDH 462
Query: 420 TLGATELTAKN 430
TLG ++ T +
Sbjct: 463 TLGLSKRTGPD 473
Score = 222 bits (566), Expect = 3e-55, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 139/429 (32%), Positives = 209/429 (48%), Gaps = 14/429 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
++ TA LG + TA G ++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA G
Sbjct: 83 SKRTAPDQPLGLSIRTAPDHPHGVSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPHGV 142
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
++ TA LG ++ TA TLG ++ TA LG ++ TA LG ++ TA G
Sbjct: 143 SKRTAPDHPLGVSKHTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKHTAPDHPLGVSKRTAPDHPHGV 202
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
++ TA LG ++ TA LG ++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG
Sbjct: 203 SKRTAPDHPLGLSKRTAPDHPLGLSKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGL 262
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
++ T T G ++ TA LG ++ TA LG ++ TA TLG ++ TA TLG
Sbjct: 263 SKRTGPDHTHGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHTLGV 322
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
++ TA LG ++ TA TLG ++ T TLG ++ T TLG ++ TA G
Sbjct: 323 SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGL 382
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
++ TA TLG ++ TA V ++ TA LG ++ TA L
Sbjct: 383 SKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTHGV--------------SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPL 428
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G ++ TA LG ++ TA LG ++ TA TLG ++ T T G ++ TA L
Sbjct: 429 GVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGLSKHTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPHHPL 488
Query: 422 GATELTAKN 430
G ++ TA +
Sbjct: 489 GLSKRTAPD 497
Score = 214 bits (545), Expect = 7e-53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 134/422 (31%), Positives = 204/422 (48%), Gaps = 14/422 (3%)
Query: 9 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 68
LG ++ T LG ++ T TLG ++ T TLG ++ T T+G ++ TA
Sbjct: 30 HPLGLSKRTGPNHPLGLSKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTIGLSKRTAPD 89
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
LG + TA G ++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA G ++ TA
Sbjct: 90 QPLGLSIRTAPDHPHGVSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPD 149
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
LG ++ TA TLG ++ TA LG ++ TA LG ++ TA G ++ TA
Sbjct: 150 HPLGVSKHTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKHTAPDHPLGVSKRTAPDHPHGVSKRTAPD 209
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
LG ++ TA LG ++ T TLG ++ TA G ++ TA TLG ++ T
Sbjct: 210 HPLGLSKRTAPDHPLGLSKRTGPDHTLGLSKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTGPD 269
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
T G ++ TA LG ++ TA LG ++ TA TLG ++ TA TLG ++ TA
Sbjct: 270 HTHGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHTLGVSKRTAPD 329
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 368
LG ++ TA L + ++ T TLG ++ T TLG ++ TA
Sbjct: 330 HPLGVSKRTAPDHTLGL--------------SKRTGPDHTLGLSKRTGPDHTLGLSKRTA 375
Query: 369 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G ++ TA TLG ++ TA T G ++ TA LG ++ TA LG ++ TA
Sbjct: 376 PDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTAPDHTHGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTA 435
Query: 429 KN 430
+
Sbjct: 436 PD 437
Score = 179 bits (455), Expect = 2e-42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/317 (33%), Positives = 160/317 (50%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
++ TA LG ++ TA LG ++ TA LG ++ TA TLG ++ T T G
Sbjct: 419 SKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGLSKHTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGV 478
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
++ TA LG ++ TA G ++ TA T+G ++ TA TLG ++ TA LG
Sbjct: 479 SKRTAPHHPLGLSKRTAPDHPHGVSKHTAPDHTIGLSKRTAPDHTLGVSKRTAPDHPLGV 538
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
++ TA G ++ TA TLG ++ T T G ++ TA LG ++ TA LG
Sbjct: 539 SKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTLGLSKRTGPDHTHGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGV 598
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
++ TA TLG ++ TA LG ++ TA G ++ TA T G ++ TA TLG
Sbjct: 599 SKRTAPDHTLGLSKRTAPDHPLGLSKRTAPDHPHGVSKRTAPDHTHGLSKRTAPDHTLGL 658
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
++ TA G ++ TA T G ++ T TLG ++ TA LG ++ TA LG
Sbjct: 659 SKRTAPDHPHGLSKRTAPDHTHGLSKRTGPDHTLGVSKRTAPDHPLGVSKRTAPDHPLGV 718
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTA 318
++ TA TLG + TA
Sbjct: 719 SKRTAPDHTLGLHKRTA 735
>gi|383319026|ref|YP_005379867.1| hypothetical protein Mtc_0583 [Methanocella conradii HZ254]
gi|379320396|gb|AFC99348.1| hypothetical protein Mtc_0583 [Methanocella conradii HZ254]
Length = 241
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 73
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 26 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 85
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 38 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 97
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 50 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 266 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 177 bits (448), Expect = 1e-41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/209 (42%), Positives = 123/209 (58%)
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 290 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 167 bits (424), Expect = 7e-39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/198 (41%), Positives = 116/198 (58%)
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 142
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 143 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 202
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAK 319
TE T ++FT TE T +
Sbjct: 203 TEDTERIFTTEDTEDTER 220
Score = 163 bits (412), Expect = 2e-37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/235 (37%), Positives = 123/235 (52%), Gaps = 26/235 (11%)
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTT-- 140
Query: 314 TELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 373
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 141 ------------------------EDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTT 176
Query: 374 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T+
Sbjct: 177 EDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTS 231
Score = 154 bits (388), Expect = 1e-34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/224 (37%), Positives = 116/224 (51%), Gaps = 26/224 (11%)
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 23 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTED 82
Query: 266 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEV 325
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 83 TEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTT-------------- 128
Query: 326 EYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 385
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT
Sbjct: 129 ------------EDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTT 176
Query: 386 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
TE T ++FT TE T ++FT TE T ++FT TE T +
Sbjct: 177 EDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTERIFTTEDTEDTER 220
>gi|194895082|ref|XP_001978179.1| GG17842 [Drosophila erecta]
gi|190649828|gb|EDV47106.1| GG17842 [Drosophila erecta]
Length = 3122
Score = 166 bits (420), Expect = 2e-38, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 232/477 (48%), Positives = 237/477 (49%), Gaps = 35/477 (7%)
Query: 5 TAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLG 60
TAK TL TE TAK TL TE T AK TL TE T K T TE T AK TL
Sbjct: 1765 TAKQTTLRPTEGTTAKQTTLRPTERTTAKPTTLKPTEGTTVKPTTQKPTERTTAKETTLR 1824
Query: 61 ATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AK 115
TE TAK TL TE TAK TL TE TAK TL TE TAK TL TE T AK
Sbjct: 1825 PTEGTTAKPTTLRPTEGTTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLRPTEGTTAKPTTLKPTERTTAK 1884
Query: 116 VFTLGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATE 171
TL TE T +K TL TE T AK TL TE T AK TL TE T AK TL TE
Sbjct: 1885 QTTLRPTERTTSKPTTLKPTERTTAKHTTLRPTERTTAKQTTLRPTERTTAKQTTLRPTE 1944
Query: 172 -LTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFT 226
TAK TL T E TAK T TE T K T TE TAK TL TE TAK T
Sbjct: 1945 GTTAKPTTLRPTKETTAKQTTQKPTEGTTVKPTTQKPTEGTTAKQTTLRPTEGTTAKQTT 2004
Query: 227 LGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT- 281
L TE T AK TL TE T +K TL TE T AK TL TE T K T TE T
Sbjct: 2005 LRPTERTTAKQTTLRPTERTTSKPTTLKPTERTTAKHTTLRPTEGTTVKPTTQKPTERTT 2064
Query: 282 AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKSVILEVEYYKPIKIVPQNS 338
AK TL TE T K T TE TAK TL TE T AK L +K Q
Sbjct: 2065 AKETTLSPTEGTTVKPTTQKPTEGTTAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTVKPTTQKP 2124
Query: 339 ATELTAKVFTLGATEL-TAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKV 394
TAK TL TE TAK TL TE TAK TL TE T K T TE TAK
Sbjct: 2125 TERTTAKETTLRPTERTTAKPTTLRPTEGTTAKQTTLRPTEGTTVKPTTQKPTEGTTAKP 2184
Query: 395 FTLGATE-LTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATEL-TAKN--IRSNTGTVGSPTHMSP 446
TL TE TAK TL T E TAK TL TE TAK +R T PT + P
Sbjct: 2185 TTLKPTEGTTAKPTTLRPTKETTAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTERTTAKPTTLKP 2241
Score = 145 bits (367), Expect = 3e-32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 221/485 (45%), Positives = 230/485 (47%), Gaps = 85/485 (17%)
Query: 17 TAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLG 72
TAK TL TE TAK T+ TE +AK TL TE T AK TL TE TAK TL
Sbjct: 942 TAKSTTLKPTEGTTAKPTTVKPTEGTSAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLK 1001
Query: 73 ATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELTAKVFT----------- 118
TE ++K TL TE +AK TL TE T + TL TE T T
Sbjct: 1002 PTEGTSSKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTVRQTTLKPTECTTAKPTTGTTAKSTTLK 1061
Query: 119 -----------LGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAK 163
L TE TAK T+ TE +AK TL TE T AK TL TE TAK
Sbjct: 1062 PTEGTTAKTTTLKPTEGTTAKPTTVKPTEGTSAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAK 1121
Query: 164 VFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE 219
TL TE T AK TL TE TAK TL TE TAK TL TE TAK TL T
Sbjct: 1122 PTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAKSTTLKPTEGTTAKPTTLRPTEGTTAKPITLKPT- 1180
Query: 220 LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTL 275
TAK TL TE T AK TL TE TAK TL TE T AK TL TE TAK TL
Sbjct: 1181 -TAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAKSTTL 1239
Query: 276 GATE------LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKSVILEVE 326
TE TAK TL TE T AK TL TE TAK TL TE T AK L
Sbjct: 1240 KPTEAYNSEPTTAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLKPTERTTAKQTTLR-- 1297
Query: 327 YYKPIKIVPQNSATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELTAKVF 383
TE TAK TL TE TAK TL TE TAK TL T TAK
Sbjct: 1298 ------------PTEGTTAKSTTLKPTEGTTAKPTTLRPTEGTTAKPITLKPT--TAKPT 1343
Query: 384 TLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGSP 441
TL TE T AK TL TE TAK TL T TAK TL TE GT P
Sbjct: 1344 TLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLKPT--TAKPTTLKPTE----------GTTAKP 1391
Query: 442 THMSP 446
T + P
Sbjct: 1392 TTLKP 1396
Score = 144 bits (363), Expect = 8e-32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 227/495 (45%), Positives = 232/495 (46%), Gaps = 58/495 (11%)
Query: 5 TAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLG 60
T K T TE T AK TL TE TAK TL TE TAK TL TE T K T
Sbjct: 2532 TVKPTTQKPTERTTAKETTLRPTEGTTAKQTTLRPTEGTTAKQTTLRPTEGTTVKPTTQK 2591
Query: 61 ATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAK 115
TE T AK T TE +AK T+ TE TAK T TE T AK TL TE TAK
Sbjct: 2592 PTERTTAKQTTQKPTEGTSAKPTTVRPTEGTTAKQTTQKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAK 2651
Query: 116 VFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE 171
TL TE TAK TL TE TAK TL T E TAK TL TE TAK TL TE
Sbjct: 2652 QTTLRPTEGTTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLRPTKETTAKHTTLRPTEGTTAKQTTLRPTE 2711
Query: 172 -LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFT 226
T K T TE T AK TL T E TAK TL TE TAK TL TE TAK T
Sbjct: 2712 GTTVKPTTQKPTERTTAKETTLRPTKETTAKPTTLKPTEGTTAKHTTLRPTEGTTAKQTT 2771
Query: 227 LGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT- 281
L TE T K T TE T AK TL TE TAK TL TE T K T TE T
Sbjct: 2772 LRPTEGTTVKPTTQKPTERTTAKHTTLRPTEGTTAKQTTLRPTEGTTVKPTTQKPTERTT 2831
Query: 282 AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGAT-ELTAKSVILEVEYYKP-----IKI 333
AK TL TE TAK TL TE TAK TL T E TAK L KP +K
Sbjct: 2832 AKETTLRPTEGTTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLRPTKETTAKPTTL-----KPTEGTTVKP 2886
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATEL 390
Q TAK TL TE T K T TE TAK TL TE TAK T TE
Sbjct: 2887 TTQKPTERTTAKETTLRPTEGTTVKPTTQKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKQTTQKPTER 2946
Query: 391 -TAKVFTLGATELTA-KVFTLGATE--------------LTAKVFTLGATELTAKN---I 431
TAK TL TE T K TL TE TAK TL TE T +
Sbjct: 2947 TTAKQTTLRPTERTTVKPTTLKPTEGTTVKPTTQKPTEGTTAKPTTLKPTERTTDKQTTL 3006
Query: 432 RSNTGTVGSPTHMSP 446
R T PT + P
Sbjct: 3007 RPTERTTAKPTTLRP 3021
Score = 90.1 bits (222), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 213/589 (36%), Positives = 244/589 (41%), Gaps = 162/589 (27%)
Query: 6 AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGA------------- 49
AK TL TE T + TL TE TAK TL TE TAK TL
Sbjct: 514 AKPTTLKPTEGTTVRQTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKTTTLKP 573
Query: 50 TE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE------------------- 87
TE TAK T+ TE ++K TL TE +AK TL TE
Sbjct: 574 TEGTTAKPTTVKPTEGTSSKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTVRQTTLKPTEGTTTKP 633
Query: 88 --------LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGA-------------TE-LTAKVFTLGATE- 123
TAK TL TE TAK TL TE TAK TL TE
Sbjct: 634 TTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKSTTLKPTEGTTAKTTTLKPTEGTTAKSTTLKPTEG 693
Query: 124 LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTL 179
TAK T+ TE ++K T TE ++K TL TE +AK TL TE TA+ TL
Sbjct: 694 TTAKPTTVKPTEGTSSKPTTSKPTEGTSSKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTARQTTL 753
Query: 180 GATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTA 234
TE TAK T+ TE ++K TL TE +AK TL TE TAK TL TE TA
Sbjct: 754 KPTEGTTAKPTTVKPTEGTSSKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKSTTLKPTEGTTA 813
Query: 235 KVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFT---- 286
+ TL TE +AK TL TE T AK TL TE TAK TL TE TAK T
Sbjct: 814 RQTTLKPTEGTSAKPTTLKPTERTTAKQTTLRPTEGTTAKSTTLKPTEGTTAKPTTVKPT 873
Query: 287 ---------LGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-------------------- 315
L TE ++K TL TE +AK TL TE
Sbjct: 874 EGTTAKTTTLKPTEGTSSKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTVRQTTLKPTEGTTTKPT 933
Query: 316 -------LTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATEL 366
TAKS L+ TE TAK T+ TE +AK TL TE
Sbjct: 934 TLKPTEGTTAKSTTLK--------------PTEGTTAKPTTVKPTEGTSAKPTTLKPTER 979
Query: 367 T-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTL 421
T AK TL TE TAK TL TE ++K TL TE +AK TL TE T + TL
Sbjct: 980 TTAKQTTLRPTEGTTAKPTTLKPTEGTSSKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTVRQTTL 1039
Query: 422 GATELTAKN------------------------IRSNTGTVGSPTHMSP 446
TE T ++ GT PT + P
Sbjct: 1040 KPTECTTAKPTTGTTAKSTTLKPTEGTTAKTTTLKPTEGTTAKPTTVKP 1088
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/199 (38%), Positives = 90/199 (45%), Gaps = 41/199 (20%)
Query: 281 TAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKSVILEVEYY--------K 329
TA+ TL TE +AK TL TE TAK TL TE TAKS L+ K
Sbjct: 149 TARQTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKQTTLKPTEGTTAKSTTLKPTEGTTAKTTTLK 208
Query: 330 PIKIVPQNSATELTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLG 386
P + TAK TL TE TAK TL TE TAK T+ TE ++K TL
Sbjct: 209 PTEGT--------TAKPTTLKPTEGTTAKSTTLKPTEGTTAKPTTVKPTEGTSSKPTTLK 260
Query: 387 ATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFT-------------LGATE-LTAK 429
TE +AK TL TE T + TL TE TAK T L TE TAK
Sbjct: 261 PTEGTSAKPTTLKPTEGTTVRQTTLKPTEGTTAKPTTVKPTEGTTAKTTTLKPTEGTTAK 320
Query: 430 N--IRSNTGTVGSPTHMSP 446
+ ++ GT PT + P
Sbjct: 321 STTLKPTEGTTAKPTTVKP 339
>gi|56311430|ref|NP_727774.2| mucin 12Ea [Drosophila melanogaster]
gi|55380396|gb|AAN09586.2| mucin 12Ea [Drosophila melanogaster]
Length = 3269
Score = 156 bits (395), Expect = 2e-35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 241/480 (50%), Positives = 252/480 (52%), Gaps = 38/480 (7%)
Query: 5 TAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLG 60
TAK TL TE T AK TL TE TAK TL TE TAK TL T+ TAK TL
Sbjct: 812 TAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLK 871
Query: 61 ATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AK 115
TE T AK TL TE TAK TL TE TAK TL T+ TAK TL TE T AK
Sbjct: 872 PTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTDGTTAKPTTLKPTEGTSAK 931
Query: 116 VFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE 171
TL T+ TAK TL TE T AK TL TE TAK TL TE TAK TL TE
Sbjct: 932 PTTLKPTDGTTAKSTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTE 991
Query: 172 LT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFT 226
T AK TL TE TAK TL TE T A+ TL TE T AK TL T+ TAK T
Sbjct: 992 GTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAQPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTDGTTAKPTT 1051
Query: 227 LGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LT 281
L TE T AK TL TE TAK TL TE T AK TL TE TAK TL TE T
Sbjct: 1052 LKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTT 1111
Query: 282 AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKSVIL---EVEYYKPIKIVP 335
AK TL TE TAK TL TE T AK TL TE TAK L E KP + P
Sbjct: 1112 AKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKP 1171
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LT 391
+ TAK TL TE TAK TL T+ TAK TL TE T AK TL TE T
Sbjct: 1172 TEGTSGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTKGTTAKSTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTT 1231
Query: 392 AKVFTLGATELT-AKVFTLGATE-LTAKVFTLGATE-LTAKN--IRSNTGTVGSPTHMSP 446
AK TL TE T AK TL TE TAK TL TE TAK ++ GT PT + P
Sbjct: 1232 AKPTTLKPTEGTSAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTTAKPTTLKPTEGTSAKPTTLKP 1291
>gi|194014486|ref|ZP_03053103.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus pumilus ATCC 7061]
gi|194013512|gb|EDW23077.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus pumilus ATCC 7061]
Length = 917
Score = 150 bits (378), Expect = 2e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 139/441 (31%), Positives = 176/441 (39%), Gaps = 14/441 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 222 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 281
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 282 ATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTG 341
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 342 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 401
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 402 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 461
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 462 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 521
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ---NSATELTAKVFTLGA 351
GAT +T GAT +T V + + AT +T GA
Sbjct: 522 DTGATGATGVTGDTGATGATGVT--GVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 579
Query: 352 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
T +T GAT +T GAT +T GA T +T GAT +T
Sbjct: 580 TGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGA 639
Query: 409 LGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T GAT +T
Sbjct: 640 TGATGVTGDTGATGATGVTGD 660
Score = 150 bits (378), Expect = 2e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/438 (31%), Positives = 174/438 (39%), Gaps = 23/438 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 174 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 233
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 234 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 293
Query: 121 ATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 294 ATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTG 353
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 354 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 413
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 414 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 473
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL 354
GAT +T GAT +T + AT +T GAT +
Sbjct: 474 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT--------------GATGVTGDTGATGATGV 519
Query: 355 TAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
T GAT +T GA T +T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 520 TGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 579
Query: 412 TELTAKVFTLGATELTAK 429
T +T GAT +T
Sbjct: 580 TGVTGDTGATGATGVTGD 597
Score = 149 bits (377), Expect = 2e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/439 (31%), Positives = 175/439 (39%), Gaps = 10/439 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 210 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 269
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTA 114
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 270 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTG 329
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 330 DTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 389
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 390 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 449
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 450 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 509
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI-KIVPQNSATELTAKVFTLGATE 353
GAT +T GAT +T + + AT +T GAT
Sbjct: 510 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATG 569
Query: 354 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLG 410
+T GAT +T GAT +T GAT +T GA T +T G
Sbjct: 570 VTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATG 629
Query: 411 ATELTAKVFTLGATELTAK 429
AT +T GAT +T
Sbjct: 630 ATGVTGDTGATGATGVTGD 648
Score = 149 bits (377), Expect = 2e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/441 (31%), Positives = 174/441 (39%), Gaps = 19/441 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 198 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 257
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTA 114
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 258 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTG 317
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 318 DTGATGATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 377
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 378 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 437
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 438 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 497
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-------SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT +T GAT +T V + + T +T
Sbjct: 498 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGV------TGVTGDTG 551
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 552 ATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTG 611
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T GAT T
Sbjct: 612 ATGATGVTGVTGDTGATGATG 632
Score = 149 bits (377), Expect = 2e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/438 (31%), Positives = 174/438 (39%), Gaps = 23/438 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 162 ATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 221
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 222 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 281
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 282 ATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTG 341
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 342 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 401
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 402 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 461
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL 354
GAT +T GAT +T + AT +T GAT +
Sbjct: 462 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT--------------GATGVTGDTGATGATGV 507
Query: 355 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
T GAT +T GAT +T GA T +T GAT +T GA
Sbjct: 508 TGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 567
Query: 412 TELTAKVFTLGATELTAK 429
T +T GAT +T
Sbjct: 568 TGVTGDTGATGATGVTGD 585
Score = 149 bits (375), Expect = 4e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 137/428 (32%), Positives = 171/428 (39%), Gaps = 20/428 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 150 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 209
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 210 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 269
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT +T GAT +T GAT T G T +T G
Sbjct: 270 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGAT------GVTGVTGDTGATG 323
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 324 ATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 383
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 384 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 443
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
AT +T GAT +T + AT +T GAT +T
Sbjct: 444 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT--------------GATGVTGDTGATGATGVTGDTGA 489
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 490 TGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGD 549
Query: 421 LGATELTA 428
GAT T
Sbjct: 550 TGATGATG 557
Score = 148 bits (374), Expect = 5e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 134/417 (32%), Positives = 168/417 (40%), Gaps = 20/417 (4%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 149 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 208
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 209 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 268
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT +T GAT +T GAT +T GAT T G T +T
Sbjct: 269 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGAT------GVTGVTGDTGAT 322
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 323 GATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 382
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 383 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 442
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GAT +T + AT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 443 GATGVTGDTGAT--------------GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTG 488
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 489 ATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 545
Score = 147 bits (371), Expect = 1e-32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 139/441 (31%), Positives = 175/441 (39%), Gaps = 14/441 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 234 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 293
Query: 61 ATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 294 ATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTG 353
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 354 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 413
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 414 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 473
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 474 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 533
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ---NSATELTAKVFTLGA 351
GAT +T GAT T V + + AT +T GA
Sbjct: 534 DTGATGATGVTGVTGDTGATGAT--GVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 591
Query: 352 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
T +T GAT +T GA T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 592 TGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGA 651
Query: 409 LGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T GAT +T
Sbjct: 652 TGATGVTGDTGATGATGVTGD 672
Score = 147 bits (370), Expect = 1e-32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/433 (31%), Positives = 173/433 (39%), Gaps = 17/433 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 313 TGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 372
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 373 TGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 432
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 433 TGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 492
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFT 238
T +T GAT +T GAT +T GAT +T GA T +T
Sbjct: 493 TGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGA 552
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 553 TGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGA 612
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
GAT +T GAT T V + AT +T GAT +T
Sbjct: 613 TGATGVTGVTGDTGATGAT--GVTGDTGATG---------ATGVTGDTGATGATGVTGDT 661
Query: 359 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 415
GAT +T GAT +T GA T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 662 GATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVT 721
Query: 416 AKVFTLGATELTA 428
GAT +T
Sbjct: 722 GDTGATGATGVTG 734
Score = 144 bits (363), Expect = 8e-32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/442 (31%), Positives = 175/442 (39%), Gaps = 13/442 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 54
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 282 ATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTG 341
Query: 55 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 342 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 401
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 402 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 461
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 462 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 521
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
GAT +T GA T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 522 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATG 581
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI-KIVPQNSATELTAKVFTLG 350
+T GAT +T GAT +T + + AT +T G
Sbjct: 582 VTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 641
Query: 351 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVF 407
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GA T +T
Sbjct: 642 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTG 701
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T GAT +T
Sbjct: 702 ATGATGVTGDTGATGATGVTGD 723
Score = 144 bits (363), Expect = 9e-32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/444 (31%), Positives = 174/444 (39%), Gaps = 22/444 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTA 54
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 270 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTG 329
Query: 55 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 330 DTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 389
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 390 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 449
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 450 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 509
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
GAT +T GAT +T GA T +T GAT +T GAT
Sbjct: 510 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATG 569
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-------SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTA 344
+T GAT +T GAT +T V + + T +T
Sbjct: 570 VTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGV------TGVTG 623
Query: 345 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 404
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 624 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTG 683
Query: 405 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T GAT T
Sbjct: 684 DTGATGATGVTGVTGDTGATGATG 707
Score = 144 bits (363), Expect = 1e-31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/406 (32%), Positives = 163/406 (40%), Gaps = 20/406 (4%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 149 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 208
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 209 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 268
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT +T GAT +T GAT T G T +T
Sbjct: 269 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGAT------GVTGVTGDTGAT 322
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 323 GATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 382
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 383 GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT 442
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 443 --------------GATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTG 488
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 489 ATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGD 534
Score = 144 bits (362), Expect = 1e-31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/437 (31%), Positives = 173/437 (39%), Gaps = 23/437 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 324 ATGVTGDTGVTGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 383
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 384 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 443
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 444 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 503
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVF 237
AT +T GAT +T GAT +T GA T +T GAT +T
Sbjct: 504 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTG 563
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GA T +T
Sbjct: 564 ATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTG 623
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL 354
GAT +T GAT +T + AT +T GAT +
Sbjct: 624 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGAT--------------GATGVTGDTGATGATGV 669
Query: 355 TAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
T GAT +T GA T +T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 670 TGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGA 729
Query: 412 TELTAKVFTLGATELTA 428
T +T GAT T
Sbjct: 730 TGVTGVTGDTGATGATG 746
Score = 143 bits (360), Expect = 2e-31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 143/463 (30%), Positives = 180/463 (38%), Gaps = 32/463 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 336 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 395
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 396 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 455
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 456 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATG 515
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 516 ATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTG 575
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 576 ATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTG 635
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-------SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT +T GAT +T V + + AT T
Sbjct: 636 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGAT---- 691
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTA 404
G T +T GAT +T GAT +T GA T +T GAT +T
Sbjct: 692 --GVTGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVTG 749
Query: 405 KVFTLGATELTAKVFTLGATELT----------AKNIRSNTGT 437
GAT +T GAT +T A +R TGT
Sbjct: 750 DTGATGATGVTGDTGATGATGVTGVTGDTGATGATGVRGATGT 792
>gi|157692573|ref|YP_001487035.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus pumilus SAFR-032]
gi|157681331|gb|ABV62475.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus pumilus SAFR-032]
Length = 1865
Score = 149 bits (376), Expect = 3e-33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 133/450 (29%), Positives = 178/450 (39%), Gaps = 32/450 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T + GAT T G+T +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 1075 ATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 1134
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T G
Sbjct: 1135 VTGITGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTG 1194
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT +T + GAT +T + GAT T G+T +T G
Sbjct: 1195 ATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTG 1254
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------- 227
AT +T G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1255 ATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTG 1314
Query: 228 -----------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 1315 STGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTG 1374
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
T +T + GAT +T + GAT +T + GAT +T + I P
Sbjct: 1375 VTGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGI--TGSTGPTGATGI 1432
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
AT +T GAT +T GAT +T + GAT +T + GAT +T
Sbjct: 1433 TGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGIT----- 1487
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
GAT +T GAT +T GAT +
Sbjct: 1488 -GATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGI 1516
Score = 139 bits (349), Expect = 3e-30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 129/441 (29%), Positives = 172/441 (39%), Gaps = 39/441 (8%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1074 GATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPT 1133
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T
Sbjct: 1134 GVTGITGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPT 1193
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT +T + GAT +T + GAT T G+T +T
Sbjct: 1194 GATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPT 1253
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 251
GAT +T G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1254 GATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGST 1313
Query: 252 ------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1314 GSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPT 1373
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
G T +T + GAT +T + AT +T + GAT +T
Sbjct: 1374 GVTGITGATGSTGATGITGATG--------------STGATGITGATGSTGATGITGATG 1419
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
G+T T GAT +T GAT +T GAT +T + GAT +T
Sbjct: 1420 ITGSTGPTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATG 1479
Query: 420 TLGATELT-AKNIRSNTGTVG 439
+ GAT +T A I +TG G
Sbjct: 1480 STGATGITGATGITGSTGPTG 1500
Score = 131 bits (330), Expect = 6e-28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 135/488 (27%), Positives = 179/488 (36%), Gaps = 69/488 (14%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T + GAT T G+T +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 1147 ATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 1206
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T + GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T G
Sbjct: 1207 ATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTG 1266
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------G 156
T +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 1267 VTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGATGPTG 1326
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T + G
Sbjct: 1327 ATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGATGSTG 1386
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
AT +T + GAT +T + GAT +T G+T T GAT +T G
Sbjct: 1387 ATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGITGSTGPTG 1446
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
AT +T GAT +T + GAT +T + GAT +T
Sbjct: 1447 ATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITG------------------ 1488
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------------------------LTAKVFT 372
AT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1489 --ATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGSTGATGTTGATGPTGATGITGATGP 1546
Query: 373 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKNI 431
G T +T GAT +T G T +T GAT +T G T +T A I
Sbjct: 1547 TGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGI 1606
Query: 432 RSNTGTVG 439
+TG G
Sbjct: 1607 TGSTGPTG 1614
Score = 104 bits (260), Expect = 9e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/370 (31%), Positives = 152/370 (41%), Gaps = 26/370 (7%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T +
Sbjct: 1326 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGATGST 1385
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1386 GATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGIT------GATGITGSTGPTGATGIT------ 1433
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT +T GAT +T GAT +T + GAT +T + GAT +T
Sbjct: 1434 GATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGIT------ 1487
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT +T GAT +T GAT +T + GAT T GAT +T
Sbjct: 1488 GATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGSTGATGTTGATGPTGATGITGATGPT 1547
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G T +T GAT +T G T +T GAT +T + V
Sbjct: 1548 GVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGIT------ 1601
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
AT +T GAT +T G T +T GAT T GAT +T
Sbjct: 1602 --GATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATG 1659
Query: 396 TLGATELTAK 405
+ GAT +T
Sbjct: 1660 STGATGITGS 1669
Score = 95.5 bits (236), Expect = 5e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 126/513 (24%), Positives = 167/513 (32%), Gaps = 110/513 (21%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T G T +T
Sbjct: 858 GATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPT 917
Query: 72 ------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 95
G+T +T GAT +T
Sbjct: 918 GATGITGATGTTGATGITGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGTT 977
Query: 96 ------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 978 GATGITGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPT 1037
Query: 144 GATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T GAT +T + GAT T
Sbjct: 1038 GVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPT 1097
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G+T +T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T +
Sbjct: 1098 GSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGST 1157
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T G+T +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 1158 GATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGST 1217
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
GAT +T + GAT T + P S T +T GAT +T
Sbjct: 1218 GATGITGATGSTGATGSTGPT-------------GPTGS-TGITGATGPTGATGITGATG 1263
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------------------- 397
G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1264 PTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGATG 1323
Query: 398 --GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1324 PTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 1356
Score = 90.1 bits (222), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 131/529 (24%), Positives = 172/529 (32%), Gaps = 113/529 (21%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL- 59
+T +T GAT +T G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1243 STGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTG 1302
Query: 60 -----------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 1303 VTGITGTTGSTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 1362
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
AT +T G T +T + GAT +T + GAT +T + GAT +T G
Sbjct: 1363 ATGITGSTGPTGVTGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITG 1422
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+T T GAT +T GAT +T GAT +T + GAT +T + G
Sbjct: 1423 STGPTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTG 1482
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL-------------------- 256
AT +T GAT +T GAT +T GAT +
Sbjct: 1483 ATGIT------GATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGSTGATGTTGATGPTG 1536
Query: 257 ----TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
T G T +T GAT +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 1537 ATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTG 1596
Query: 313 ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 372
T +T + I AT +T G T +T GAT T
Sbjct: 1597 VTGITGATGITGSTG--------PTGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGPTGVTGI 1648
Query: 373 LGATELTAKVFTLGATELTA------------------------KVFTLGATELTAKVFT 408
GAT +T + GAT +T GAT T
Sbjct: 1649 TGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGATGATGATGSTGPTGPTGATGSTGATGP 1708
Query: 409 LGATELTAK---------------------------VFTLGATELTAKN 430
GAT +T V G T + N
Sbjct: 1709 TGATGITGSTGPTGATGTGGFTDTALYAANSSGPTIVTVAGGTNIPLPN 1757
Score = 68.2 bits (165), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 99/421 (23%), Positives = 131/421 (31%), Gaps = 106/421 (25%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKV 116
GAT +T + GAT T G+T +T GA T +T GAT +T
Sbjct: 366 GATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGITGSTGPTGATGITGST 425
Query: 117 FTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KVFTLGATELT 149
GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 426 GPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPTGATGITGIT 485
Query: 150 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------ 191
GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 486 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGIT 545
Query: 192 ------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
GAT +T + GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 546 GSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGIT 605
Query: 246 A------------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
+ GAT +T GAT +T
Sbjct: 606 GATGPTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPT 665
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY------- 328
GAT +T + GAT +T + GAT +T G T +T + V
Sbjct: 666 GATGITGATGSTGATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITGTTGST 725
Query: 329 ---------KPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 379
P AT +T + GAT T G+T +T GAT +T
Sbjct: 726 GSTGITGVTGPTG------ATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGIT 779
Query: 380 A 380
Sbjct: 780 G 780
Score = 65.1 bits (157), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 99/418 (23%), Positives = 132/418 (31%), Gaps = 95/418 (22%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T G T +T
Sbjct: 858 GATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPT 917
Query: 144 ------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 167
G+T +T GAT +T
Sbjct: 918 GATGITGATGTTGATGITGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGTT 977
Query: 168 ------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G+T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 978 GATGITGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPT 1037
Query: 216 GATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T +T GAT +T + GAT T
Sbjct: 1038 GVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPT 1097
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G+T +T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T +
Sbjct: 1098 GSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGST 1157
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GAT T + P S T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1158 GATGSTGPTG-------------PTGS-TGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATG 1203
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T + GAT +T T G+T T + G T T
Sbjct: 1204 PTGATGITGATGSTGATGITG---------ATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGP 1252
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/438 (22%), Positives = 130/438 (29%), Gaps = 128/438 (29%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T +T
Sbjct: 366 GATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG---------ITGSTGPT 416
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KV 164
GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 417 GATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPT 476
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL--------- 215
G T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 477 GATGITGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTT 536
Query: 216 ---------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
GAT +T + GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 537 GSTGSTGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGST 596
Query: 261 FTLGATELTA------------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
GAT +T + GAT +T GAT
Sbjct: 597 GPTGATGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGAT 656
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
+T GAT +T + GAT +T + AT +T G
Sbjct: 657 GITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGSTG--------------STGATGITGATGPTG 702
Query: 351 ATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 386
T +T GAT +T + GAT T G
Sbjct: 703 VTGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTG 762
Query: 387 ATELTAKVFTLGATELTA 404
+T +T GAT +T
Sbjct: 763 STGITGATGPTGATGITG 780
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/438 (22%), Positives = 130/438 (29%), Gaps = 128/438 (29%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T +T
Sbjct: 366 GATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG---------ITGSTGPT 416
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KV 176
GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 417 GATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPT 476
Query: 177 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL--------- 227
G T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 477 GATGITGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTT 536
Query: 228 ---------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
GAT +T + GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 537 GSTGSTGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGST 596
Query: 273 FTLGATELTA------------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
GAT +T + GAT +T GAT
Sbjct: 597 GPTGATGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGAT 656
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+T GAT +T + AT +T + GAT +T G
Sbjct: 657 GITGATGPTGATGITGATG--------------STGATGITGSTGSTGATGITGATGPTG 702
Query: 363 ATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
T +T GAT +T + GAT T G
Sbjct: 703 VTGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTG 762
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTA 416
+T +T GAT +T
Sbjct: 763 STGITGATGPTGATGITG 780
Score = 58.9 bits (141), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/299 (23%), Positives = 94/299 (31%), Gaps = 78/299 (26%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------- 47
T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 482 TGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGS 541
Query: 48 ----------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 97
GAT +T + GAT T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 542 TGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGA 601
Query: 98 TELTA------------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
T +T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 602 TGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITGA 661
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------- 179
GAT +T + GAT +T + GAT +T G T +T
Sbjct: 662 TGPTGATGITGATGSTGATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITGT 721
Query: 180 ----------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T
Sbjct: 722 TGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG 780
Score = 58.9 bits (141), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/299 (23%), Positives = 94/299 (31%), Gaps = 78/299 (26%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------- 59
T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 482 TGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGS 541
Query: 60 ----------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
GAT +T + GAT T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 542 TGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGA 601
Query: 110 TELTA------------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 139
T +T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 602 TGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITGA 661
Query: 140 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------- 191
GAT +T + GAT +T + GAT +T G T +T
Sbjct: 662 TGPTGATGITGATGSTGATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITGT 721
Query: 192 ----------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T
Sbjct: 722 TGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG 780
Score = 58.9 bits (141), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/299 (23%), Positives = 94/299 (31%), Gaps = 78/299 (26%)
Query: 26 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------- 71
T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 482 TGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGS 541
Query: 72 ----------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
GAT +T + GAT T GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 542 TGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGA 601
Query: 122 TELTA------------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 151
T +T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 602 TGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITGA 661
Query: 152 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------- 203
GAT +T + GAT +T + GAT +T G T +T
Sbjct: 662 TGPTGATGITGATGSTGATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITGT 721
Query: 204 ----------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T
Sbjct: 722 TGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG 780
Score = 58.2 bits (139), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 124/583 (21%), Positives = 171/583 (29%), Gaps = 170/583 (29%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T + GAT T G T T + G T +T + G+T +T G+
Sbjct: 212 TGITGATGSTGATGSTGSTGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGSTGSTGVTGSTGPTGS 271
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------------TLGA 97
T +T + GAT +T + GAT +T + G
Sbjct: 272 TGITGSTGSTGATGITGSTGSTGATGITGPTGPTGVTGITGATGTTGATGITGVTGSTGV 331
Query: 98 TELTAKVFTL---------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---A 133
T +T G T T + G+T T G +
Sbjct: 332 TGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGS 391
Query: 134 TELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---- 186
T +T GA T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 392 TGITGATGPTGATGITGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGP 451
Query: 187 -----------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 452 TGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPTGATGITGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGA 511
Query: 224 VFTLGATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTLGATELTAK 259
G T +T GAT +T + GAT T
Sbjct: 512 TGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGP 571
Query: 260 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA------------------------- 294
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 572 TGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGA 631
Query: 295 -----KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTL 349
+ GAT +T GAT +T + AT +T +
Sbjct: 632 TGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITGATG--------------PTGATGITGATGST 677
Query: 350 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------ 385
GAT +T + GAT +T G T +T
Sbjct: 678 GATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPT 737
Query: 386 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T
Sbjct: 738 GATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG 780
Score = 54.7 bits (130), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/228 (25%), Positives = 76/228 (33%), Gaps = 54/228 (23%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA------ 54
AT +T + GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 553 ATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTG 612
Query: 55 ------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 90
+ GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 613 ATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 672
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------- 131
+ GAT +T + GAT +T G T +T
Sbjct: 673 ATGSTGATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITG 732
Query: 132 -----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T + GAT T G+T +T GAT +T
Sbjct: 733 VTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG 780
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/512 (21%), Positives = 149/512 (29%), Gaps = 149/512 (29%)
Query: 50 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
T T G+T T GAT +T G T +T G+T +T G+
Sbjct: 215 TGATGSTGATGSTGSTGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGST---GSTGVTGSTGPTGS 271
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------------TLGA 145
T +T + GAT +T + GAT +T + G
Sbjct: 272 TGITGSTGSTGATGITGSTGSTGATGITGPTGPTGVTGITGATGTTGATGITGVTGSTGV 331
Query: 146 TELTAKVFTL---------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---A 181
T +T G T T + G+T T G +
Sbjct: 332 TGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGS 391
Query: 182 TELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---- 234
T +T GA T +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 392 TGITGATGPTGATGITGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGP 451
Query: 235 -----------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 452 TGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPTGATGITGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGA 511
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTLGATELTAK 307
G T +T GAT +T + GAT T
Sbjct: 512 TGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGP 571
Query: 308 VFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA----------- 356
GAT +T + AT +T GAT +T
Sbjct: 572 TGPTGATGITGATG--------------PTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGIT 617
Query: 357 -------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
+ GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 618 GATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGST 677
Query: 398 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T + GAT +T G T +T
Sbjct: 678 GATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGS 709
>gi|384182335|ref|YP_005568097.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
gi|324328419|gb|ADY23679.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
Length = 696
Score = 131 bits (329), Expect = 8e-28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 128/420 (30%), Positives = 159/420 (37%), Gaps = 23/420 (5%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G+T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 157 GSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPT 216
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 217 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPT 276
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T +
Sbjct: 277 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGST 336
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKV 248
G T T GAT T GAT +T GAT T + G AT +T
Sbjct: 337 GVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGAT 396
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
GAT +T GAT T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 397 GPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPT---GATGVTGSTGPTGATGVTGST 453
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 368
G T +T + V T T GAT T GAT +T
Sbjct: 454 GPTGVTGITGPTGSTGV--------------TGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITG 499
Query: 369 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G T +T G+T +T GAT +T G T T + GAT T
Sbjct: 500 STGPTGVTGITGPT---GSTGVTGATGPTGATGITGATGITGPTGATGSTGSTGATGPTG 556
Score = 124 bits (312), Expect = 7e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 129/464 (27%), Positives = 167/464 (35%), Gaps = 41/464 (8%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-- 59
T T + GAT T + G+T T + GAT +T G+T T +
Sbjct: 54 TGATGDIGPTGATGDTGPTGSTGSTGATGSTGSTGATGVTGSTGATGSTGSTGATGSTGP 113
Query: 60 ----------------GATELTAKVF---------------TLGATELTAKVFTLGATEL 88
G+T +T + G+T +T GAT +
Sbjct: 114 TGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGV 173
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 148
T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +
Sbjct: 174 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGV 233
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +
Sbjct: 234 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGV 293
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
T GAT +T GAT +T G T +T + G T T GAT
Sbjct: 294 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGP 353
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEV 325
T GAT +T GAT T + G AT +T GAT +T + I
Sbjct: 354 TGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGA 413
Query: 326 EYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 385
P T T GAT +T GAT +T G T +T +
Sbjct: 414 T--GPTGAT---GVTGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGST 468
Query: 386 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T GAT T GAT +T G T +T
Sbjct: 469 GVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGSTGPTGVTGITGP 512
Score = 124 bits (312), Expect = 8e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 131/466 (28%), Positives = 168/466 (36%), Gaps = 43/466 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------- 47
AT T + G+T T + GAT +T G+T T +
Sbjct: 65 ATGDTGPTGSTGSTGATGSTGSTGATGVTGSTGATGSTGSTGATGSTGPTGATGATGATG 124
Query: 48 -----GATELTAK---------------VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
G+T +T + G+T +T GAT +T GAT
Sbjct: 125 PTGSTGSTGITGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATG 184
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 185 VTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATG 244
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 245 VTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATG 304
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
+T GAT +T G T +T + G T T GAT T GAT
Sbjct: 305 VTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATG 364
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKSVIL 323
+T GAT T + GAT +T GAT +T GAT T A V
Sbjct: 365 ITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTG 424
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
P AT +T GAT +T G T +T + G T T
Sbjct: 425 ATGSTGPTG------ATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATG 478
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT T GAT +T G T +T + G T T
Sbjct: 479 PTGATGPTGITGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGATGP 524
Score = 121 bits (304), Expect = 6e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 131/421 (31%), Positives = 162/421 (38%), Gaps = 36/421 (8%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G+T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 157 GSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPT 216
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 217 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPT 276
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T +
Sbjct: 277 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGST 336
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKV 260
G T T GAT T GAT +T GAT T + G AT +T
Sbjct: 337 GVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGAT 396
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
GAT +T GAT T GAT T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 397 GPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPT---GATGVTGSTGPTGATGVTGST 453
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
V T +T + G T T GAT T GAT T
Sbjct: 454 GPTGV--------------TGITGPTGSTGVTGST------GATGPT------GATGPTG 487
Query: 381 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKNIRSNTGTVG 439
GAT +T G T +T G+T +T GAT +T A I TG G
Sbjct: 488 ITGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPT---GSTGVTGATGPTGATGITGATGITGPTGATG 544
Query: 440 S 440
S
Sbjct: 545 S 545
Score = 120 bits (300), Expect = 2e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 131/465 (28%), Positives = 166/465 (35%), Gaps = 43/465 (9%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T G T T + GAT T + G+T T + GAT +T G+
Sbjct: 42 TGATGSTGATGPTGATGDIGPTGATGDTGPTGSTGSTGATGSTGSTGATGVTGSTGATGS 101
Query: 62 TELTAKVFTL------------------GATELTAKVF---------------TLGATEL 88
T T + G+T +T + G+T +
Sbjct: 102 TGSTGATGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGI 161
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 148
T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +
Sbjct: 162 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGV 221
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +
Sbjct: 222 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGV 281
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T + G T
Sbjct: 282 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGS 341
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELT-AKSVILE 324
T GAT T GAT +T GAT T + GAT +T A
Sbjct: 342 TGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGA 401
Query: 325 VEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 384
P I AT T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 402 TGITGPTGIT---GATGPTGATGVTGATGSTGPT---GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 455
Query: 385 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T +T + G T T GAT T GAT +T
Sbjct: 456 TGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGS 500
Score = 119 bits (297), Expect = 4e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 125/447 (27%), Positives = 159/447 (35%), Gaps = 43/447 (9%)
Query: 19 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 78
KV G T T G T T + GAT T + G+T T + GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGSTGATGPTGATGDIGPTGATGDTGPTGSTGSTGATGSTGSTGATGVTG 94
Query: 79 KVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVF--------------- 105
G+T T + G+T +T
Sbjct: 95 STGATGSTGSTGATGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGATGATGPTG 154
Query: 106 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 165
+ G+T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 155 STGSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTG 214
Query: 166 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 215 PTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTG 274
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 275 PTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTG 334
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA----KSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE 341
+ G T T GAT T GAT +T E I AT
Sbjct: 335 STGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGIT---GATG 391
Query: 342 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 401
+T GAT +T GAT T GAT T GAT +T GAT
Sbjct: 392 ITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPT---GATGVTGSTGPTGATG 448
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
+T G T +T + G T T
Sbjct: 449 VTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTG 475
Score = 97.4 bits (241), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 101/324 (31%), Positives = 125/324 (38%), Gaps = 18/324 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 254 ATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTG 313
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T G T +T + G T T GAT T GAT +T G
Sbjct: 314 ATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAG 373
Query: 121 ATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
AT T + G AT +T GAT +T GAT T GAT T
Sbjct: 374 ATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPT- 432
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT +T GAT +T G T +T + G T T GAT T
Sbjct: 433 --GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITG 490
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
GAT +T G T +T G+T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 491 PTGATGITGSTGPTGVTGITGPT---GSTGVTGATGPTGATGIT------GATGITGPT- 540
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
GAT T G T +T S+
Sbjct: 541 --GATGSTGSTGATGPTGVTGTSI 562
>gi|261335128|emb|CBH18122.1| hypothetical protein, conserved [Trypanosoma brucei gambiense DAL972]
Length = 1260
Score = 122 bits (307), Expect = 3e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 136/423 (32%), Positives = 137/423 (32%), Gaps = 2/423 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T F GAT A F GAT T F GAT T F GAT F G
Sbjct: 597 ATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQG 656
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
A T F G T F GA T F G T F GA T F G
Sbjct: 657 AAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQG 716
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A T F GA A F G T T F GA T F G T F G
Sbjct: 717 AAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQG 776
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
A T F G T F GA T F GA T F GA T F G
Sbjct: 777 AAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQG 836
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
A A F G T T F GA A F G T T F G T F G
Sbjct: 837 AAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGTAAGTTPAFGQG 896
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
A T F GA T + KP T T F G T T F
Sbjct: 897 AAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFG--QGVTADTTPAFGQGVTADTTPAFG 954
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GA T F GA T F GA T F GA A F GA T F
Sbjct: 955 QGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKAPAFGQGAAAGTTPAFG 1014
Query: 421 LGA 423
GA
Sbjct: 1015 QGA 1017
Score = 116 bits (290), Expect = 2e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 129/417 (30%), Positives = 130/417 (31%), Gaps = 2/417 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T A F GA T F G F G T F GA A
Sbjct: 447 PAFGQGVTANKASAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTTLAFGQGAAANKA 506
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GA T F G F G T F G T T F G T
Sbjct: 507 PAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADKP 566
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T F G T T F GAT T F GAT A F GAT T
Sbjct: 567 PAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTT 626
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GAT T F GAT F GA T F G T F GA T
Sbjct: 627 PAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTT 686
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T F GA T F GA T F GA A F G T T
Sbjct: 687 PAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTT 746
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA T + V KP A T F G T F GA
Sbjct: 747 PAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFG--QGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAG 804
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F GA T F GA T F GA A F G T T F GA
Sbjct: 805 TTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGA 861
Score = 115 bits (289), Expect = 3e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 131/424 (30%), Positives = 132/424 (31%), Gaps = 2/424 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T F GAT T F GAT F G T F G T F G
Sbjct: 345 ATADTTPAFGQGATADTTPAFGQGATADKPPAFGQGVNADTTPAFGQGTAAGTTPAFGQG 404
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T A F GAT F G T T F GA F G T A F G
Sbjct: 405 VTANKASAFGQGATADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGVTANKASAFGQG 464
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A T F G F G T F GA A F GA T F G
Sbjct: 465 AAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTTLAFGQGAAANKAPAFGQGAAAGTTPAFGQG 524
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
F G T F G T T F G T F G T F G
Sbjct: 525 VNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQG 584
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T T F GAT T F GAT A F GAT T F GAT T F G
Sbjct: 585 TTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQG 644
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
AT F GA T + KP A T F G T F
Sbjct: 645 ATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFG--QGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFG 702
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GA T F GA T F GA A F G T T F GA T F
Sbjct: 703 QGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFG 762
Query: 421 LGAT 424
G T
Sbjct: 763 QGVT 766
Score = 115 bits (289), Expect = 4e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 132/417 (31%), Positives = 134/417 (32%), Gaps = 14/417 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T F G T T F GAT T F GAT A F GAT T
Sbjct: 567 PAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTT 626
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GAT T F GAT F GA T F G T F GA T
Sbjct: 627 PAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTT 686
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T F GA T F GA T F GA A F G T T
Sbjct: 687 PAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTT 746
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA T F G T F GA T F G T F GA T
Sbjct: 747 PAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTT 806
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA T F GA T F GA A F G T T F GA A
Sbjct: 807 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAVANKA 866
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T T + Q +A T F GA T F GA
Sbjct: 867 SAFGQGVTAGTTPAFG-------------QGTAAGTT-PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAG 912
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F G T F G T T F G T T F GA T F GA
Sbjct: 913 TTPAFGQGTTADKPPAFGQGVTADTTPAFGQGVTADTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGA 969
Score = 115 bits (287), Expect = 6e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 131/417 (31%), Positives = 132/417 (31%), Gaps = 14/417 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T T F GAT T F GAT A F GAT T F GAT T
Sbjct: 579 PAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTT 638
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GAT F GA T F G T F GA T F G T
Sbjct: 639 PAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKP 698
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA T F GA T F GA A F G T T F GA T
Sbjct: 699 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTT 758
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G T F GA T F G T F GA T F GA T
Sbjct: 759 PAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTT 818
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA T F GA A F G T T F GA A F G T T
Sbjct: 819 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTT 878
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T + A T F GA T F G T
Sbjct: 879 PAFGQGTAAGTTPAFGQ--------------GAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTAD 924
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
F G T T F G T T F GA T F GA T F GA
Sbjct: 925 KPPAFGQGVTADTTPAFGQGVTADTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGA 981
Score = 115 bits (287), Expect = 6e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/417 (31%), Positives = 131/417 (31%), Gaps = 14/417 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T F G T F G T T F GAT T F GAT A
Sbjct: 555 PAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKA 614
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GAT T F GAT T F GAT F GA T F G T
Sbjct: 615 PAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKP 674
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA T F G T F GA T F GA T F GA A
Sbjct: 675 PAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKA 734
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G T T F GA T F G T F GA T F G T
Sbjct: 735 SAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKP 794
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA T F GA T F GA T F GA A F G T T
Sbjct: 795 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTT 854
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA A + V T T F G T F GA
Sbjct: 855 PAFGQGAVANKASAFGQGV--------------TAGTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGAAAG 900
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F GA T F G T F G T T F G T T F GA
Sbjct: 901 TTPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGVTADTTPAFGQGVTADTTPAFGQGA 957
Score = 114 bits (285), Expect = 9e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/427 (30%), Positives = 131/427 (30%), Gaps = 2/427 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT F G T F GAT T F GAT T F GAT F G
Sbjct: 321 ATADKPPAFGQGTTADKPPAFGQGATADTTPAFGQGATADTTPAFGQGATADKPPAFGQG 380
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T F G T F G T A F GAT F G T T F G
Sbjct: 381 VNADTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGVTANKASAFGQGATADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQG 440
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A F G T A F GA T F G F G T F G
Sbjct: 441 AAADKPPAFGQGVTANKASAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTTLAFGQG 500
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
A A F GA T F G F G T F G T T F G
Sbjct: 501 AAANKAPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQG 560
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T F G T F G T T F GAT T F GAT A F G
Sbjct: 561 VTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQG 620
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
AT T F GAT T + KP A T F G T F
Sbjct: 621 ATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFG--QGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFG 678
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GA T F G T F GA T F GA T F GA A F
Sbjct: 679 QGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFG 738
Query: 421 LGATELT 427
G T T
Sbjct: 739 QGVTAGT 745
Score = 112 bits (281), Expect = 3e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/421 (30%), Positives = 131/421 (31%), Gaps = 14/421 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T F G T T F G T F G T F G T T
Sbjct: 531 PAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTT 590
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GAT T F GAT A F GAT T F GAT T F GAT
Sbjct: 591 PAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKP 650
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA T F G T F GA T F G T F GA T
Sbjct: 651 PAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTT 710
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA T F GA A F G T T F GA T F G T
Sbjct: 711 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKP 770
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA T F G T F GA T F GA T F GA T
Sbjct: 771 PAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTT 830
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA A + V T T F GA A F G T
Sbjct: 831 PAFGQGAAANKASAFGQGV--------------TAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAG 876
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T F G T F GA T F GA T F G T F G T
Sbjct: 877 TTPAFGQGTAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGVTAD 936
Query: 427 T 427
T
Sbjct: 937 T 937
Score = 112 bits (281), Expect = 3e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 127/416 (30%), Positives = 128/416 (30%), Gaps = 2/416 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G F G T F GA A F GA T F G
Sbjct: 471 PAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTTLAFGQGAAANKAPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKP 530
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T F G T T F G T F G T F G T T
Sbjct: 531 PAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTT 590
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GAT T F GAT A F GAT T F GAT T F GAT
Sbjct: 591 PAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKP 650
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA T F G T F GA T F G T F GA T
Sbjct: 651 PAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTT 710
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA T F GA A F G T T F GA T F G T
Sbjct: 711 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKP 770
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA T + KP A T F GA T F GA
Sbjct: 771 PAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFG--QGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAG 828
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
T F GA A F G T T F GA A F G T T F G
Sbjct: 829 TTPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQG 884
Score = 111 bits (278), Expect = 6e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/421 (30%), Positives = 131/421 (31%), Gaps = 14/421 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T T F G T F G T F G T T F GAT T
Sbjct: 543 PAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTT 602
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GAT A F GAT T F GAT T F GAT F GA T
Sbjct: 603 PAFGQGATADKAPAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTT 662
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T F GA T F G T F GA T F GA T
Sbjct: 663 PAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTT 722
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA A F G T T F GA T F G T F GA T
Sbjct: 723 PAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTT 782
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T F GA T F GA T F GA T F GA A
Sbjct: 783 PAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKA 842
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T T + K A F G T T F G
Sbjct: 843 SAFGQGVTAGTTPAFGQGAVANK--------------ASAFGQGVTAGTTPAFGQGTAAG 888
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T F GA T F GA T F G T F G T T F G T
Sbjct: 889 TTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGVTADTTPAFGQGVTAD 948
Query: 427 T 427
T
Sbjct: 949 T 949
Score = 111 bits (278), Expect = 7e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 128/418 (30%), Positives = 129/418 (30%), Gaps = 14/418 (3%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
A F GA T F G F G T F G T T F G T
Sbjct: 506 APAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADK 565
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
F G T F G T T F GAT T F GAT A F GAT T
Sbjct: 566 PPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGT 625
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
F GAT T F GAT F GA T F G T F GA T
Sbjct: 626 TPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGT 685
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
F G T F GA T F GA T F GA A F G T T
Sbjct: 686 TPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGT 745
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
F GA T F G T F GA T F G T F GA T
Sbjct: 746 TPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGT 805
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 365
F GA T + A T F GA A F G T
Sbjct: 806 TPAFGQGAAAGTTPAFGQ--------------GAAAGTTPAFGQGAAANKASAFGQGVTA 851
Query: 366 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F GA A F G T T F G T F GA T F GA
Sbjct: 852 GTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGA 909
Score = 111 bits (277), Expect = 8e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 125/417 (29%), Positives = 126/417 (30%), Gaps = 14/417 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F GAT F G T F GAT T F GAT T F GAT
Sbjct: 315 PAFGQGATADKPPAFGQGTTADKPPAFGQGATADTTPAFGQGATADTTPAFGQGATADKP 374
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T F G T F G T A F GAT F G T T
Sbjct: 375 PAFGQGVNADTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGVTANKASAFGQGATADKPPAFGQGTTAGTT 434
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA F G T A F GA T F G F G T
Sbjct: 435 PAFGQGAAADKPPAFGQGVTANKASAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTT 494
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA A F GA T F G F G T F G T T
Sbjct: 495 LAFGQGAAANKAPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTT 554
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T F G T F G T T F GAT T F GAT A
Sbjct: 555 PAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKA 614
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GAT T + AT T F GAT F GA
Sbjct: 615 PAFGQGATAGTTPAFGQ--------------GATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQGAAAG 660
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F G T F GA T F G T F GA T F GA
Sbjct: 661 TTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGA 717
Score = 111 bits (277), Expect = 9e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 127/416 (30%), Positives = 128/416 (30%), Gaps = 14/416 (3%)
Query: 8 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 67
F GA A F GA T F G F G T F G T T
Sbjct: 496 AFGQGAAANKAPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTP 555
Query: 68 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
F G T F G T F G T T F GAT T F GAT A
Sbjct: 556 AFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAP 615
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
F GAT T F GAT T F GAT F GA T F G T
Sbjct: 616 AFGQGATAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPP 675
Query: 188 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
F GA T F G T F GA T F GA T F GA A
Sbjct: 676 AFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKAS 735
Query: 248 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
F G T T F GA T F G T F GA T F G T
Sbjct: 736 AFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPP 795
Query: 308 VFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 367
F GA T + A T F GA T F GA
Sbjct: 796 AFGQGAAAGTTPAFGQ--------------GAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANK 841
Query: 368 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
A F G T T F GA A F G T T F G T F GA
Sbjct: 842 ASAFGQGVTAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGA 897
Score = 110 bits (275), Expect = 1e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 126/416 (30%), Positives = 127/416 (30%), Gaps = 14/416 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G F G T F G T T F G T F G T
Sbjct: 519 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKP 578
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T T F GAT T F GAT A F GAT T F GAT T
Sbjct: 579 PAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGTTPAFGQGATAGTT 638
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GAT F GA T F G T F GA T F G T
Sbjct: 639 PAFGQGATADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKP 698
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA T F GA T F GA A F G T T F GA T
Sbjct: 699 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTT 758
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T F GA T F G T F GA T F GA T
Sbjct: 759 PAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTT 818
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA T + K A F G T T F GA
Sbjct: 819 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANK--------------ASAFGQGVTAGTTPAFGQGAVAN 864
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
A F G T T F G T F GA T F GA T F G
Sbjct: 865 KASAFGQGVTAGTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQG 920
Score = 110 bits (274), Expect = 2e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 127/416 (30%), Positives = 128/416 (30%), Gaps = 14/416 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F GA A F G T T F GA T F G T F GA T
Sbjct: 723 PAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTT 782
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T F GA T F GA T F GA T F GA A
Sbjct: 783 PAFGQGTTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKA 842
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T T F GA A F G T T F G T F GA T
Sbjct: 843 SAFGQGVTAGTTPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGAAAGTT 902
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA T F G T F G T T F G T T F GA T
Sbjct: 903 PAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGVTADTTPAFGQGVTADTTPAFGQGAAAGTT 962
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA T F GA T F GA A F GA T F GA T
Sbjct: 963 PAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKAPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTT 1022
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA + K A VF G T F GA
Sbjct: 1023 PAFGQGAAAGRTPAFGQGTAANK--------------ASVFGQGVTADKPPAFGQGAAAG 1068
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
T F GA T F GA A F GA T F GA T F G
Sbjct: 1069 TTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQG 1124
Score = 106 bits (265), Expect = 2e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 132/438 (30%), Positives = 137/438 (31%), Gaps = 14/438 (3%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
A F G T T F GA T F G T F GA T F G T
Sbjct: 734 ASAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADK 793
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
F GA T F GA T F GA T F GA A F G T T
Sbjct: 794 PPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGT 853
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
F GA A F G T T F G T F GA T F GA T
Sbjct: 854 TPAFGQGAVANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGTAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGT 913
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
F G T F G T T F G T T F GA T F GA T
Sbjct: 914 TPAFGQGTTADKPPAFGQGVTADTTPAFGQGVTADTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGT 973
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
F GA T F GA A F GA T F GA T F GA
Sbjct: 974 TPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKAPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGR 1033
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILE-VEYYKPIKIVPQNSATELTA-----------KVFTLGATE 353
F G T SV + V KP Q +A T F GA
Sbjct: 1034 TPAFGQG-TAANKASVFGQGVTADKPPAFG-QGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAA 1091
Query: 354 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
A F GA T F GA T F G T F GA F G T
Sbjct: 1092 NKASAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGTTADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGVTV 1151
Query: 414 LTAKVFTLGATELTAKNI 431
T F GA + ++
Sbjct: 1152 GTTPAFGQGAGGCVSNSV 1169
Score = 105 bits (262), Expect = 4e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 119/414 (28%), Positives = 120/414 (28%), Gaps = 2/414 (0%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 73
TE F G F G F GAT F G T F G
Sbjct: 214 TEDKPPAFGQGVNAEKPPAFGQGVNADKPPAFGQGATADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGV 273
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
F GAT F G T F F GAT F G
Sbjct: 274 NADKPPAFGQGATADKPPAFGQGVTADKPPAFGQVVNADKPPAFGQGATADKPPAFGQGT 333
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T F GAT T F GAT T F GAT F G T F G
Sbjct: 334 TADKPPAFGQGATADTTPAFGQGATADTTPAFGQGATADKPPAFGQGVNADTTPAFGQGT 393
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T F G T A F GAT F G T T F GA F G
Sbjct: 394 AAGTTPAFGQGVTANKASAFGQGATADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGV 453
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
T A F GA T F G F G T F GA A F GA
Sbjct: 454 TANKASAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTTLAFGQGAAANKAPAFGQGA 513
Query: 314 TELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 373
T + V KP T F G T T F G T F
Sbjct: 514 AAGTTPAFGQGVNADKPPAFG--QGVTADKPPAFGQGTTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQ 571
Query: 374 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 427
G T F G T T F GAT T F GAT A F GAT T
Sbjct: 572 GVTADKPPAFGQGTTADTTPAFGQGATAGTTPAFGQGATADKAPAFGQGATAGT 625
>gi|350409163|ref|XP_003488634.1| PREDICTED: hypothetical protein LOC100746493 [Bombus impatiens]
Length = 391
Score = 119 bits (298), Expect = 3e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/211 (32%), Positives = 121/211 (57%)
Query: 43 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 58 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 117
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 118 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 177
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 178 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 237
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
+ T +TE +A+ T +TE + + T +
Sbjct: 238 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSTQPSTQPS 268
Score = 119 bits (298), Expect = 3e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/211 (32%), Positives = 121/211 (57%)
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 58 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 117
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 118 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 177
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 178 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 237
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
+ T +TE +A+ T +TE + + T +
Sbjct: 238 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSTQPSTQPS 268
Score = 119 bits (298), Expect = 3e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/211 (32%), Positives = 121/211 (57%)
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 58 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 117
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 118 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 177
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 178 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 237
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
+ T +TE +A+ T +TE + + T +
Sbjct: 238 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSTQPSTQPS 268
Score = 118 bits (295), Expect = 7e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/205 (32%), Positives = 119/205 (58%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T
Sbjct: 64 STEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEP 123
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T
Sbjct: 124 STEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEP 183
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T
Sbjct: 184 STEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEP 243
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
+TE +A+ T +TE + + T +
Sbjct: 244 STEPSAEPSTEPSTEPSTQPSTQPS 268
Score = 105 bits (262), Expect = 5e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/227 (30%), Positives = 120/227 (52%), Gaps = 19/227 (8%)
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A
Sbjct: 58 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSA 117
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+
Sbjct: 118 EPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTE------- 170
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 390
+TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE
Sbjct: 171 -------PSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEP 223
Query: 391 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL-----TAKNIR 432
+A+ T +TE +A+ T +TE +A+ T +TE T +IR
Sbjct: 224 SAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSAEPSTEPSTEPSTQPSTQPSIR 270
>gi|345797634|ref|XP_545585.3| PREDICTED: BTB/POZ domain-containing protein KCTD18 [Canis lupus
familiaris]
Length = 605
Score = 119 bits (297), Expect = 4e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/255 (37%), Positives = 117/255 (45%), Gaps = 1/255 (0%)
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
+V L T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E
Sbjct: 348 PRVIKLKRTPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAA 406
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
+ TLG E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E
Sbjct: 407 RGLVTLGDPEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAA 466
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
+ TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 467 RGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAT 526
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
+ TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 527 RGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEAT 586
Query: 306 AKVFTLGATELTAKS 320
+ TLG E +
Sbjct: 587 RILLTLGDLEAPPRP 601
Score = 119 bits (297), Expect = 4e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/254 (37%), Positives = 117/254 (46%), Gaps = 1/254 (0%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
+V L T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E
Sbjct: 348 PRVIKLKRTPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAA 406
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
+ TLG E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E
Sbjct: 407 RGLVTLGDPEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAA 466
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
+ TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 467 RGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAT 526
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
+ TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 527 RGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEAT 586
Query: 246 AKVFTLGATELTAK 259
+ TLG E +
Sbjct: 587 RILLTLGDLEAPPR 600
Score = 119 bits (297), Expect = 4e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/254 (37%), Positives = 117/254 (46%), Gaps = 1/254 (0%)
Query: 18 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 77
+V L T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E
Sbjct: 348 PRVIKLKRTPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAA 406
Query: 78 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 137
+ TLG E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E
Sbjct: 407 RGLVTLGDPEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAA 466
Query: 138 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 197
+ TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 467 RGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAT 526
Query: 198 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 257
+ TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 527 RGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEAT 586
Query: 258 AKVFTLGATELTAK 271
+ TLG E +
Sbjct: 587 RILLTLGDLEAPPR 600
Score = 119 bits (297), Expect = 4e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/254 (37%), Positives = 117/254 (46%), Gaps = 1/254 (0%)
Query: 30 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 89
+V L T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E
Sbjct: 348 PRVIKLKRTPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAA 406
Query: 90 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 149
+ TLG E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E
Sbjct: 407 RGLVTLGDPEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAA 466
Query: 150 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 209
+ TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 467 RGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAT 526
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 269
+ TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 527 RGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEAT 586
Query: 270 AKVFTLGATELTAK 283
+ TLG E +
Sbjct: 587 RILLTLGDLEAPPR 600
Score = 119 bits (297), Expect = 4e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/254 (37%), Positives = 117/254 (46%), Gaps = 1/254 (0%)
Query: 42 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 101
+V L T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E
Sbjct: 348 PRVIKLKRTPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAA 406
Query: 102 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 161
+ TLG E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E
Sbjct: 407 RGLVTLGDPEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAA 466
Query: 162 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 221
+ TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 467 RGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAT 526
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
+ TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 527 RGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEAT 586
Query: 282 AKVFTLGATELTAK 295
+ TLG E +
Sbjct: 587 RILLTLGDLEAPPR 600
Score = 119 bits (297), Expect = 4e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/254 (37%), Positives = 117/254 (46%), Gaps = 1/254 (0%)
Query: 54 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 113
+V L T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E
Sbjct: 348 PRVIKLKRTPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAA 406
Query: 114 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 173
+ TLG E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E
Sbjct: 407 RGLVTLGDPEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAA 466
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 233
+ TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 467 RGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAT 526
Query: 234 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 293
+ TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG E T
Sbjct: 527 RGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEAT 586
Query: 294 AKVFTLGATELTAK 307
+ TLG E +
Sbjct: 587 RILLTLGDLEAPPR 600
Score = 115 bits (288), Expect = 4e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 94/246 (38%), Positives = 114/246 (46%), Gaps = 1/246 (0%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E + TLG
Sbjct: 356 TPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAARGLVTLGD 414
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E + TLG
Sbjct: 415 PEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGG 474
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
E T + TLG E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG
Sbjct: 475 LEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGD 534
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
E T + TLG E + TLG E T + TLG E T + TLG E T + TLG
Sbjct: 535 PEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEATRILLTLGD 594
Query: 242 TELTAK 247
E +
Sbjct: 595 LEAPPR 600
Score = 104 bits (260), Expect = 7e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 97/280 (34%), Positives = 117/280 (41%), Gaps = 27/280 (9%)
Query: 150 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 209
+V L T L +V TLG E + TL E T + TLG E T + TLG E
Sbjct: 348 PRVIKLKRTPLAVRV-TLGDPEAARGLVTLRDPEPTRGLVTLGDPEATCILVTLGDLEAA 406
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 269
+ TLG E V TL E T + TLG E + TLG E T + TLG E
Sbjct: 407 RGLVTLGDPEAARGVVTLCDLEATCGLVTLGDPEAARGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEAA 466
Query: 270 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYK 329
+ TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E T V
Sbjct: 467 RGLVTLGGLEPTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDLEAARGLVTLGDPEPTRGLV-------- 518
Query: 330 PIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 389
TLG E T + TLG E T + TLG E + TLG E
Sbjct: 519 ------------------TLGDPEATRGLVTLGDPEPTRGLVTLGDPEAARGLVTLGDPE 560
Query: 390 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T + TLG E T + TLG E T + TLG E +
Sbjct: 561 PTRGLVTLGDPEATRGLVTLGDPEATRILLTLGDLEAPPR 600
>gi|74025216|ref|XP_829174.1| hypothetical protein [Trypanosoma brucei brucei strain 927/4
GUTat10.1]
gi|70834560|gb|EAN80062.1| hypothetical protein, conserved [Trypanosoma brucei brucei strain
927/4 GUTat10.1]
Length = 1464
Score = 118 bits (296), Expect = 5e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 132/425 (31%), Positives = 136/425 (32%), Gaps = 14/425 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F GA A F G T T F G F GA T F G T T
Sbjct: 963 PAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTT 1022
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T T F GA A VF G T T F G T T F GAT T
Sbjct: 1023 PAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGATAGTT 1082
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T T F G T T F GA A VF G F G
Sbjct: 1083 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGVAADKP 1142
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA A VF GA A VF G F GA A VF GA T
Sbjct: 1143 PAFGQGAAANKASVFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTT 1202
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA F GA T F G T T F GA A VF GA T
Sbjct: 1203 PAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTT 1262
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA T + A T F GA T F GA
Sbjct: 1263 PAFGQGAAAGTTPAFG--------------QGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAG 1308
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T F G T T F GA T F GA A VF G T T F GA
Sbjct: 1309 TTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGAGGC 1368
Query: 427 TAKNI 431
+ ++
Sbjct: 1369 VSNSV 1373
Score = 117 bits (293), Expect = 1e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/418 (31%), Positives = 131/418 (31%), Gaps = 2/418 (0%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
A VF G T T F G VF G T F G T F G
Sbjct: 890 ASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGVAADK 949
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
VF G F GA A F G T T F G F GA T
Sbjct: 950 PPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGT 1009
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
F G T T F G T T F GA A VF G T T F G T T
Sbjct: 1010 TPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGT 1069
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
F GAT T F G T T F G T T F GA A VF G
Sbjct: 1070 TPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVAADK 1129
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
F G F GA A VF GA A VF G F GA
Sbjct: 1130 PPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGAAANK 1189
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 365
A VF GA T + KP A T F G T T F GA
Sbjct: 1190 ASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAADKPPAFG--QGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAA 1247
Query: 366 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
A VF GA T F GA T F GA T F GA T F GA
Sbjct: 1248 NKASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGA 1305
Score = 116 bits (290), Expect = 2e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 132/421 (31%), Positives = 133/421 (31%), Gaps = 14/421 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
VF G F GA A F G T T F G F GA T
Sbjct: 951 PVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTT 1010
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T T F G T T F GA A VF G T T F G T T
Sbjct: 1011 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTT 1070
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GAT T F G T T F G T T F GA A VF G
Sbjct: 1071 PAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVAADKP 1130
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G F GA A VF GA A VF G F GA A
Sbjct: 1131 PAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 1190
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
VF GA T F GA F GA T F G T T F GA A
Sbjct: 1191 SVFGQGAAAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKA 1250
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
VF GA T + A T F GA T F GA
Sbjct: 1251 SVFGQGAAAGTTPAFG--------------QGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAG 1296
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T F GA T F G T T F GA T F GA A VF G T
Sbjct: 1297 TTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAG 1356
Query: 427 T 427
T
Sbjct: 1357 T 1357
Score = 114 bits (284), Expect = 1e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 127/417 (30%), Positives = 127/417 (30%), Gaps = 2/417 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G VF G F GA A VF G T T F G
Sbjct: 855 PAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKP 914
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
VF G T F G T F G VF G F GA A
Sbjct: 915 PVFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 974
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T T F G F GA T F G T T F G T T
Sbjct: 975 SAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTT 1034
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA A VF G T T F G T T F GAT T F G T T
Sbjct: 1035 PAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTT 1094
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T T F GA A VF G F G F GA A
Sbjct: 1095 PAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 1154
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
VF GA A V KP A A VF GA T F GA
Sbjct: 1155 SVFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFG--QGAAANKASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAAD 1212
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
F GA T F G T T F GA A VF GA T F GA
Sbjct: 1213 KPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTTPAFGQGA 1269
Score = 113 bits (282), Expect = 2e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 139/453 (30%), Positives = 148/453 (32%), Gaps = 29/453 (6%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G F GA T F G T T F G T T F GA A
Sbjct: 987 PAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKA 1046
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
VF G T T F G T T F GAT T F G T T F G T T
Sbjct: 1047 SVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTT 1106
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA A VF G F G F GA A VF GA A
Sbjct: 1107 PAFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAANKA 1166
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
VF G F GA A VF GA T F GA F GA T
Sbjct: 1167 SVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTT 1226
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T T F GA A VF GA T F GA T F GA T
Sbjct: 1227 PAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTT 1286
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA T + A T F G T T F GA
Sbjct: 1287 PAFGQGAAAGTTPAFG--------------QGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAG 1332
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-VF----TLGATELTAKVFTL 421
T F GA A VF G T T F GA + VF G EL +
Sbjct: 1333 TTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGAGGCVSNSVFGTTPASGGCEL-GTICGF 1391
Query: 422 GATELTAKNIRSNTGT---VGSPT------HMS 445
G+ K++R N G VG+P+ H+S
Sbjct: 1392 GSDPSGVKSLRVNLGANCGVGTPSVFGVPGHVS 1424
Score = 108 bits (269), Expect = 7e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 124/417 (29%), Positives = 125/417 (29%), Gaps = 2/417 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G F G F GA A F G T T F G
Sbjct: 807 PAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKP 866
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
VF G F GA A VF G T T F G VF G T
Sbjct: 867 PVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVTADKP 926
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T F G VF G F GA A F G T T
Sbjct: 927 PAFGQGVTADKPPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTT 986
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G F GA T F G T T F G T T F GA A
Sbjct: 987 PAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKA 1046
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
VF G T T F G T T F GAT T F G T T F G T T
Sbjct: 1047 SVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTT 1106
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA A V KP Q A + F GA A VF GA
Sbjct: 1107 PAFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFG-QGVAADKP-PAFGQGAAANKASVFGQGAAAN 1164
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
A VF G F GA A VF GA T F GA F GA
Sbjct: 1165 KASVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGA 1221
Score = 107 bits (267), Expect = 1e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/312 (33%), Positives = 106/312 (33%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
A VF G T T F G T T F GAT T F G T T F G T T
Sbjct: 1046 ASVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGT 1105
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
F GA A VF G F G F GA A VF GA
Sbjct: 1106 TPAFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAANK 1165
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
A VF G F GA A VF GA T F GA F GA T
Sbjct: 1166 ASVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGT 1225
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
F G T T F GA A VF GA T F GA T F GA T
Sbjct: 1226 TPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGT 1285
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
F GA T F GA T F G T T F GA T F GA
Sbjct: 1286 TPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANK 1345
Query: 306 AKVFTLGATELT 317
A VF G T T
Sbjct: 1346 ASVFGQGVTAGT 1357
Score = 101 bits (251), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 120/417 (28%), Positives = 121/417 (29%), Gaps = 14/417 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F GA A VF G T T F G F G F GA A
Sbjct: 783 PAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 842
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T T F G VF G F GA A VF G T T
Sbjct: 843 SAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTT 902
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G VF G T F G T F G VF G
Sbjct: 903 PAFGQGVAADKPPVFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKP 962
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA A F G T T F G F GA T F G T T
Sbjct: 963 PAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTT 1022
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T T F GA A VF G T T F G T T F GAT T
Sbjct: 1023 PAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGATAGTT 1082
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T T + V T T F GA A VF G
Sbjct: 1083 PAFGQGVTAGTTPAFGQGV--------------TAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVAAD 1128
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
F G F GA A VF GA A VF G F GA
Sbjct: 1129 KPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGA 1185
Score = 98.6 bits (244), Expect = 6e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 97/289 (33%), Positives = 97/289 (33%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T F G T T F G T T F GA A VF G F G
Sbjct: 1077 ATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQG 1136
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
F GA A VF GA A VF G F GA A VF G
Sbjct: 1137 VAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQG 1196
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A T F GA F GA T F G T T F GA A VF G
Sbjct: 1197 AAAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQG 1256
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
A T F GA T F GA T F GA T F GA T F G
Sbjct: 1257 AAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQG 1316
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
T T F GA T F GA A VF G T T F GA
Sbjct: 1317 VTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGA 1365
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/417 (26%), Positives = 115/417 (27%), Gaps = 2/417 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T F GA T F G F GA T F G
Sbjct: 627 PAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKP 686
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GA F GA F GA T F G F GA T
Sbjct: 687 PAFGQGAAADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTT 746
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T F G F G F GA A VF G T T
Sbjct: 747 PAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTT 806
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G F G F GA A F G T T F G
Sbjct: 807 PAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKP 866
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
VF G F GA A VF G T T F G VF G T
Sbjct: 867 PVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVTADKP 926
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T + V KP + Q A + F GA A F G T
Sbjct: 927 PAFGQGVTADKPPAFGQGVAADKP-PVFGQGVAADKP-PAFGQGAAANKASAFGQGVTAG 984
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F G F GA T F G T T F G T T F GA
Sbjct: 985 TTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGA 1041
Score = 92.0 bits (227), Expect = 5e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/417 (27%), Positives = 117/417 (28%), Gaps = 14/417 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F GA T F G F GA T F G T F G
Sbjct: 711 PAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKP 770
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G F GA A VF G T T F G F G
Sbjct: 771 PAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKP 830
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA A F G T T F G VF G F GA A
Sbjct: 831 PAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 890
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
VF G T T F G VF G T F G T F G
Sbjct: 891 SVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGVAADKP 950
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
VF G F GA A F G T T F G F GA T
Sbjct: 951 PVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTT 1010
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T T + V T T F GA A VF G T
Sbjct: 1011 PAFGQGVTAGTTPAFGQGV--------------TAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVTAG 1056
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F G T T F GAT T F G T T F G T T F GA
Sbjct: 1057 TTPAFGQGVTAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGA 1113
Score = 92.0 bits (227), Expect = 5e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/416 (27%), Positives = 116/416 (27%), Gaps = 14/416 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G F GA T F G T F G F G
Sbjct: 723 PAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKP 782
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GA A VF G T T F G F G F GA A
Sbjct: 783 PAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 842
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T T F G VF G F GA A VF G T T
Sbjct: 843 SAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTT 902
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G VF G T F G T F G VF G
Sbjct: 903 PAFGQGVAADKPPVFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKP 962
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA A F G T T F G F GA T F G T T
Sbjct: 963 PAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTT 1022
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T T + K A VF G T T F G T
Sbjct: 1023 PAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANK--------------ASVFGQGVTAGTTPAFGQGVTAG 1068
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
T F GAT T F G T T F G T T F GA A VF G
Sbjct: 1069 TTPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQG 1124
Score = 91.7 bits (226), Expect = 7e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/416 (26%), Positives = 113/416 (27%), Gaps = 2/416 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G F G T T F GA F G T F G T T
Sbjct: 495 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTAGTT 554
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T T F G T F G F G T T F GA T
Sbjct: 555 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTT 614
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G F G T F GA T F G F GA T
Sbjct: 615 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTT 674
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G F GA F GA F GA T F G
Sbjct: 675 PAFGQGVNADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKP 734
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F GA T F G T F G F G F GA A
Sbjct: 735 PAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 794
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
VF G T T + V KP Q A + F GA A F G T
Sbjct: 795 SVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFG-QGVAADKP-PAFGQGAAANKASAFGQGVTAG 852
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
T F G VF G F GA A VF G T T F G
Sbjct: 853 TTPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQG 908
Score = 90.9 bits (224), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/417 (27%), Positives = 116/417 (27%), Gaps = 14/417 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T F G F G F GA A VF G T T
Sbjct: 747 PAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTT 806
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G F G F GA A F G T T F G
Sbjct: 807 PAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKP 866
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
VF G F GA A VF G T T F G VF G T
Sbjct: 867 PVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVTADKP 926
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G T F G VF G F GA A F G T T
Sbjct: 927 PAFGQGVTADKPPAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTT 986
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G F GA T F G T T F G T T F GA A
Sbjct: 987 PAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKA 1046
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
VF G T T + V T T F GAT T F G T
Sbjct: 1047 SVFGQGVTAGTTPAFGQGV--------------TAGTTPAFGQGATAGTTPAFGQGVTAG 1092
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F G T T F GA A VF G F G F GA
Sbjct: 1093 TTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAANKASVFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGA 1149
Score = 90.9 bits (224), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/418 (26%), Positives = 112/418 (26%), Gaps = 2/418 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T T F GA F G T F G T T F G T T
Sbjct: 507 PAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTT 566
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T F G F G T T F GA T F G
Sbjct: 567 PAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKP 626
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T F GA T F G F GA T F G
Sbjct: 627 PAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKP 686
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA F GA F GA T F G F GA T
Sbjct: 687 PAFGQGAAADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTT 746
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T F G F G F GA A VF G T T
Sbjct: 747 PAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTT 806
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G + V KP A A F G T T F G
Sbjct: 807 PAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFG--QGAAANKASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAAD 864
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
VF G F GA A VF G T T F G VF G T
Sbjct: 865 KPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPVFGQGVT 922
Score = 90.5 bits (223), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/418 (26%), Positives = 111/418 (26%), Gaps = 2/418 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F GA F GAT F G T F GA F G T T
Sbjct: 339 PAFGQGAAADKPLAFGQGATADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGVTAGTT 398
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T F G F G T F G T T F G T T
Sbjct: 399 PAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTT 458
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA F G F G T T F G F G T T
Sbjct: 459 PAFGQGAAADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTT 518
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F GA F G T F G T T F G T T F G T
Sbjct: 519 PAFGQGAAADKTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKP 578
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G F G T T F GA T F G F G T
Sbjct: 579 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKP 638
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F GA T + V KP A T F G F GA
Sbjct: 639 PAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFG--QGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAD 696
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
F GA F GA T F G F GA T F G T
Sbjct: 697 KPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVT 754
Score = 89.7 bits (221), Expect = 3e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/421 (26%), Positives = 113/421 (26%), Gaps = 2/421 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G F G T F GA T F G F GA T
Sbjct: 615 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTT 674
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G F GA F GA F GA T F G
Sbjct: 675 PAFGQGVNADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKP 734
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA T F G T F G F G F GA A
Sbjct: 735 PAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKA 794
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
VF G T T F G F G F GA A F G T T
Sbjct: 795 SVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASAFGQGVTAGTT 854
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G VF G F GA A VF G T T F G
Sbjct: 855 PAFGQGVAADKPPVFGQGVAADKPPAFGQGAAANKASVFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKP 914
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
VF G T + V KP Q A + VF G F GA
Sbjct: 915 PVFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFG-QGVAADKP-PVFGQGVAADKPPAFGQGAAAN 972
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
A F G T T F G F GA T F G T T F G T
Sbjct: 973 KASAFGQGVTAGTTPAFGQGVAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAG 1032
Query: 427 T 427
T
Sbjct: 1033 T 1033
Score = 89.0 bits (219), Expect = 5e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/422 (26%), Positives = 113/422 (26%), Gaps = 2/422 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT F G T F GA F G T T F G T F G
Sbjct: 357 ATADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQG 416
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
F G T F G T T F G T T F GA F G
Sbjct: 417 VNADKPPAFGQGVNAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQG 476
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
F G T T F G F G T T F GA F G
Sbjct: 477 VNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKTPAFGQG 536
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T F G T T F G T T F G T F G F G
Sbjct: 537 VTADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQG 596
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T T F GA T F G F G T F GA T F G
Sbjct: 597 VTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQG 656
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
F GA T + V KP Q +A + F GA F
Sbjct: 657 VNADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFG-QGAAADKP-PAFGQGAAADKPPAFG 714
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GA T F G F GA T F G T F G F
Sbjct: 715 QGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTADKTPAFGQGVAADKPPAFG 774
Query: 421 LG 422
G
Sbjct: 775 QG 776
Score = 87.4 bits (215), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 108/416 (25%), Positives = 109/416 (26%), Gaps = 2/416 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T F G T F GA F GAT F G T
Sbjct: 315 PAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAADKPLAFGQGATADKPPAFGQGVTADKP 374
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F GA F G T T F G T F G F G T
Sbjct: 375 PAFGQGAAADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTT 434
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F G T T F G T T F GA F G F G T T
Sbjct: 435 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTT 494
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G F G T T F GA F G T F G T T
Sbjct: 495 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTAGTT 554
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G T T F G T F G F G T T F GA T
Sbjct: 555 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTT 614
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G + V KP A T F G F GA
Sbjct: 615 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFG--QGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAAG 672
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
T F G F GA F GA F GA T F G
Sbjct: 673 TTPAFGQGVNADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQG 728
Score = 87.4 bits (215), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/423 (26%), Positives = 112/423 (26%), Gaps = 2/423 (0%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
TE F GAT F G T F GA T F G T T F G
Sbjct: 214 TEDKPLAFGQGATADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGV 273
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T F GA F G F G F G T F G
Sbjct: 274 TADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGV 333
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T F GA F GAT F G T F GA F G
Sbjct: 334 TADKPPAFGQGAAADKPLAFGQGATADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGV 393
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T F G T F G F G T F G T T F G
Sbjct: 394 TAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGV 453
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T F GA F G F G T T F G F G
Sbjct: 454 TAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGV 513
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T T F GA + V KP T T F G T T F
Sbjct: 514 TAGTTPAFGQGAAADKTPAFGQGVTADKPPAFG--QGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQ 571
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T F G F G T T F GA T F G F
Sbjct: 572 GVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQ 631
Query: 422 GAT 424
G T
Sbjct: 632 GVT 634
Score = 85.5 bits (210), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/417 (26%), Positives = 112/417 (26%), Gaps = 2/417 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
F G T T F G T F GA F G F G
Sbjct: 255 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGAAADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVNADKP 314
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
F G T F G T F GA F GAT F G T
Sbjct: 315 PAFGQGVTADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAADKPLAFGQGATADKPPAFGQGVTADKP 374
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
F GA F G T T F G T F G F G T
Sbjct: 375 PAFGQGAAADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVNAGTT 434
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
F G T T F G T T F GA F G F G T T
Sbjct: 435 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKPPAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTT 494
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
F G F G T T F GA F G T F G T T
Sbjct: 495 PAFGQGVNADKPPAFGQGVTAGTTPAFGQGAAADKTPAFGQGVTADKPPAFGQGVTAGTT 554
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
F G T T + V KP +A + A F G T T F GA
Sbjct: 555 PAFGQGVTAGTTPAFGQGVTADKPPAFGQGVNADKPPA--FGQGVTAGTTPAFGQGAAAG 612
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T F G F G T F GA T F G F GA
Sbjct: 613 TTPAFGQGVNADKPPAFGQGVTADKPPAFGQGAAAGTTPAFGQGVNADKPPAFGQGA 669
>gi|47569234|ref|ZP_00239920.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
gi|47554108|gb|EAL12473.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
Length = 1285
Score = 113 bits (283), Expect = 2e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 129/435 (29%), Positives = 132/435 (30%), Gaps = 19/435 (4%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
G T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 172 RGNTGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGN 231
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 232 TGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGN 291
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
GAT GAT GAT GAT GAT T
Sbjct: 292 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGN 351
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 352 TGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGP 411
Query: 251 L---GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 412 QGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGP 471
Query: 308 VFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 365
GAT T PQ + AT GAT GAT
Sbjct: 472 RGNTGATGATGPQ-------------GPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 518
Query: 366 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
T G T T G T T G T T G T T G T
Sbjct: 519 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 578
Query: 426 LTA-KNIRSNTGTVG 439
T + + NTG G
Sbjct: 579 ATGPQGAQGNTGATG 593
Score = 112 bits (280), Expect = 4e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 129/443 (29%), Positives = 132/443 (29%), Gaps = 24/443 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T GAT T GAT T GAT T G
Sbjct: 186 ATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTG 245
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T GAT T GAT T GAT T GAT G
Sbjct: 246 ATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGAQGNTG 305
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT GAT GAT GAT T GAT T G
Sbjct: 306 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTG 365
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVF 237
AT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 366 ATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRG 425
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 426 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQG 485
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
G T T G T T PQ GAT
Sbjct: 486 PQGNTGATGPQGAQGNTGATG----------------PQ----GAQGNTGATGATGPQGA 525
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
GAT GAT GAT GAT GAT
Sbjct: 526 QGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGA 585
Query: 418 VFTLGATELTA-KNIRSNTGTVG 439
GAT T + ++ NTG G
Sbjct: 586 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 608
Score = 85.9 bits (211), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 120/443 (27%), Positives = 124/443 (27%), Gaps = 12/443 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT GAT T GAT T GAT T GAT T G
Sbjct: 330 ATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTG 389
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
AT T GAT T G AT T GAT T GAT T
Sbjct: 390 ATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRG 449
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 450 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQG 509
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G T T GA T GA T GA T GA T
Sbjct: 510 AQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 569
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
GA T GA T G + GAT GAT
Sbjct: 570 PQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQG 629
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
GAT T G T T AT GAT
Sbjct: 630 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT--------GATGPQGAQGNTGATGPQGA 681
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
GAT T GAT GAT GAT GAT
Sbjct: 682 QGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGA 741
Query: 418 VFTLGATELTA-KNIRSNTGTVG 439
GAT T + ++ NTG G
Sbjct: 742 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 764
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 117/446 (26%), Positives = 121/446 (27%), Gaps = 12/446 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T GAT T GAT T GAT T G
Sbjct: 417 ATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTG 476
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G T T G T T G T T GA T G
Sbjct: 477 ATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG 536
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A T GA T GA T GA T GA T G
Sbjct: 537 AQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATG 596
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL- 239
+ GAT GAT GAT T G T T
Sbjct: 597 PQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 656
Query: 240 -----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT GAT GAT T GAT GAT
Sbjct: 657 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQG 716
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATE 353
GAT GAT A+ P + AT GAT
Sbjct: 717 AQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATG 776
Query: 354 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
T G T T G T T GA T GAT GAT
Sbjct: 777 ATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT---GATGPQGAQGNTGATG 833
Query: 414 LTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVG 439
GAT T + NTG G
Sbjct: 834 PQGAQGNTGATGATGP--QGNTGATG 857
Score = 52.8 bits (125), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/440 (26%), Positives = 119/440 (27%), Gaps = 33/440 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT GAT GAT T G T GAT G
Sbjct: 636 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT---------GATGPQGAQGNTG 686
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T GAT GAT GAT GAT G
Sbjct: 687 ATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 746
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T G T T G T T GAT GAT G
Sbjct: 747 ATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGAT------GATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTG 800
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T G T T GAT GAT GAT T G
Sbjct: 801 ATGATGPQGAQGNTGAT------GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTG 854
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
AT GAT GAT GAT GAT T G
Sbjct: 855 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQG 914
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
T T G T T + V+ AT T G T T
Sbjct: 915 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNT--------GATGATGPQGVQGNTGATGPQGA 966
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
G T T GA T GAT GAT T G T T
Sbjct: 967 QGNTGATGATGPQGAQGNTGAT---GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGA 1023
Query: 421 LGATELTA-KNIRSNTGTVG 439
G T T + + NTG G
Sbjct: 1024 QGNTGATGPQGAQGNTGATG 1043
Score = 52.0 bits (123), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/436 (26%), Positives = 119/436 (27%), Gaps = 17/436 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T G T T G T T GA T GA T
Sbjct: 605 GATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT--- 661
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT GAT GAT T GAT GAT
Sbjct: 662 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNT 721
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
GAT GAT GAT T GAT GAT T
Sbjct: 722 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 781
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T T G T T GA T GAT GAT
Sbjct: 782 GVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT---GATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 838
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
GAT T GAT GAT GAT GAT
Sbjct: 839 GNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 898
Query: 309 FTLGATELTA-KSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGAT 364
GAT T + V P AT T GAT T G T
Sbjct: 899 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNT 958
Query: 365 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
T G T T GA T GAT GAT T G T
Sbjct: 959 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT---GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 1015
Query: 425 ELTA-KNIRSNTGTVG 439
T + + NTG G
Sbjct: 1016 GATGPQGAQGNTGATG 1031
Score = 51.6 bits (122), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/448 (25%), Positives = 120/448 (26%), Gaps = 25/448 (5%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT GAT GAT T GAT GAT
Sbjct: 662 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNT 721
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
GAT GAT GAT T GAT GAT T
Sbjct: 722 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 781
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
G T T G T T GA T GAT GAT
Sbjct: 782 GVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT---GATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 838
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
GAT T GAT GAT GAT GAT
Sbjct: 839 GNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 898
Query: 249 FTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGAT 302
GAT T GAT GAT T GAT T G T
Sbjct: 899 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNT 958
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
T G T T + + AT T G T T G
Sbjct: 959 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT--------GATGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 1010
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
A T GA T GA T G + GAT G
Sbjct: 1011 AQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGIQGPAG 1070
Query: 423 ATELTA-KNIRSNTGTVG----SPTHMS 445
AT T + I+ TG G PT S
Sbjct: 1071 ATGATGPQGIQGPTGATGIGVTGPTGPS 1098
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/444 (25%), Positives = 117/444 (26%), Gaps = 20/444 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT GAT T GAT GAT GAT G
Sbjct: 675 ATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 734
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
AT GAT T GAT GAT T G T T
Sbjct: 735 ATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 794
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
G T T GA T GAT GAT GAT T
Sbjct: 795 AQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT---GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 851
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT GAT GAT GAT GAT T
Sbjct: 852 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 911
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G T T G T T GAT GAT T G T T
Sbjct: 912 VQGNTGATGPQGAQGNTGAT------GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 965
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
G T T GA T + + + T T GA T
Sbjct: 966 AQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ--------GNTGATGATGPQGAQGNTGA 1017
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
GA T GA T G + GAT GAT T
Sbjct: 1018 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGIQGPAGATGATGP 1077
Query: 418 VFTLGATELTAKNIRSNTGTVGSP 441
G T T + TG G P
Sbjct: 1078 QGIQGPTGATGIGVTGPTGPSGGP 1101
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 113/443 (25%), Positives = 116/443 (26%), Gaps = 54/443 (12%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT GAT GAT GAT T G T T G
Sbjct: 555 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT------G 608
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT GAT GAT T G T T G T T G
Sbjct: 609 ATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT------G 662
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT GAT GAT T GAT GAT G
Sbjct: 663 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 722
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT GAT GAT T G T GAT G
Sbjct: 723 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNT---------GATGPQGAQGNTG 773
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
AT T G T T G T T GAT GAT T G
Sbjct: 774 ATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGAT------GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 827
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
T T G T AT T GAT
Sbjct: 828 NTGATGPQGAQGNT-----------------------GATGATGPQGNTGATGPQGAQGN 864
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GAT GAT GAT GAT T G T T
Sbjct: 865 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGA 924
Query: 421 LGATELTA----KNIRSNTGTVG 439
G T T + ++ NTG G
Sbjct: 925 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 947
>gi|325296771|ref|NP_001191623.1| pedal peptide 2 precursor [Aplysia californica]
gi|94434888|gb|ABF18973.1| pedal peptide 2 [Aplysia californica]
Length = 628
Score = 113 bits (283), Expect = 2e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/423 (16%), Positives = 236/423 (55%), Gaps = 10/423 (2%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
+ V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + V ++G++
Sbjct: 67 IKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSF 126
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+ V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + V ++G++
Sbjct: 127 IKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSF 186
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+ V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + V ++G++
Sbjct: 187 IKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSF 246
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + V ++G++ + + T+G++
Sbjct: 247 IKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKRGVDSIGSSFIKRPIDTIGSSF 306
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-VFTLGATELTAKVFTLGAT 302
+ V ++G++ + V ++G++ + + F G E + + T+G++ + V ++G++
Sbjct: 307 IKRGVDSIGSSFIKRPVDSIGSSFIKKRRFG-GENEFMKRPIDTIGSSFIKKNVDSIGSS 365
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+ + T+G++ K++ +PI + ++ + + ++G++ + V ++G
Sbjct: 366 FIKRPIDTIGSS-FIKKNMDQAAFIKRPIDTI---GSSFIKKNIDSIGSSFIKRPVDSIG 421
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-VFTLGATELTAKVFTL 421
++ + + ++G++ + + T+G++ + + G E+ + V ++G++ + + T+
Sbjct: 422 SSFIKKNIDSIGSSFIKRPIDTIGSSFIKK---SYGQNEMMKRPVDSIGSSFIKRPIDTI 478
Query: 422 GAT 424
G++
Sbjct: 479 GSS 481
>gi|149059028|gb|EDM10035.1| rCG44860 [Rattus norvegicus]
Length = 391
Score = 102 bits (255), Expect = 3e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/277 (17%), Positives = 163/277 (58%), Gaps = 18/277 (6%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-------LGATELTAKVFTLGAT 62
+LG L+ K F L E + + ++ E++A + T G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 32 SLGDCRLS-KAFGL---ESSGSMVSVIGREVSAPLSTSCDARERRGSGACSSSLWTMGSG 87
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
++ ++T+G+ + ++T G+ ++ ++T+G+ ++ + T+G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 88 ACSSSLWTMGSGACFS-LWTRGSGACSSSLWTMGSGACSSSLRTMGSGACSSSLWTMGSG 146
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+ ++T+G+ + ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+ ++ ++++G+
Sbjct: 147 ACFS-LWTMGSGACSCSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSGACSS-LWSMGSG 204
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+
Sbjct: 205 ACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSG 264
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTL 275
++ ++++G+ ++ ++++G+ E+ T +F+L
Sbjct: 265 ACSSSLWSMGSGACSSSLWSMGSDEVTGSDTGSIFSL 301
Score = 102 bits (255), Expect = 3e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/277 (17%), Positives = 163/277 (58%), Gaps = 18/277 (6%)
Query: 22 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-------LGATELTAKVFTLGAT 74
+LG L+ K F L E + + ++ E++A + T G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 32 SLGDCRLS-KAFGL---ESSGSMVSVIGREVSAPLSTSCDARERRGSGACSSSLWTMGSG 87
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
++ ++T+G+ + ++T G+ ++ ++T+G+ ++ + T+G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 88 ACSSSLWTMGSGACFS-LWTRGSGACSSSLWTMGSGACSSSLRTMGSGACSSSLWTMGSG 146
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+ ++T+G+ + ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+ ++ ++++G+
Sbjct: 147 ACFS-LWTMGSGACSCSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSGACSS-LWSMGSG 204
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+
Sbjct: 205 ACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSG 264
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTL 287
++ ++++G+ ++ ++++G+ E+ T +F+L
Sbjct: 265 ACSSSLWSMGSGACSSSLWSMGSDEVTGSDTGSIFSL 301
Score = 102 bits (255), Expect = 3e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/277 (17%), Positives = 163/277 (58%), Gaps = 18/277 (6%)
Query: 34 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-------LGATELTAKVFTLGAT 86
+LG L+ K F L E + + ++ E++A + T G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 32 SLGDCRLS-KAFGL---ESSGSMVSVIGREVSAPLSTSCDARERRGSGACSSSLWTMGSG 87
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
++ ++T+G+ + ++T G+ ++ ++T+G+ ++ + T+G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 88 ACSSSLWTMGSGACFS-LWTRGSGACSSSLWTMGSGACSSSLRTMGSGACSSSLWTMGSG 146
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+ ++T+G+ + ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+ ++ ++++G+
Sbjct: 147 ACFS-LWTMGSGACSCSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSGACSS-LWSMGSG 204
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+
Sbjct: 205 ACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSG 264
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTL 299
++ ++++G+ ++ ++++G+ E+ T +F+L
Sbjct: 265 ACSSSLWSMGSGACSSSLWSMGSDEVTGSDTGSIFSL 301
Score = 102 bits (255), Expect = 3e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/277 (17%), Positives = 163/277 (58%), Gaps = 18/277 (6%)
Query: 46 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-------LGATELTAKVFTLGAT 98
+LG L+ K F L E + + ++ E++A + T G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 32 SLGDCRLS-KAFGL---ESSGSMVSVIGREVSAPLSTSCDARERRGSGACSSSLWTMGSG 87
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
++ ++T+G+ + ++T G+ ++ ++T+G+ ++ + T+G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 88 ACSSSLWTMGSGACFS-LWTRGSGACSSSLWTMGSGACSSSLRTMGSGACSSSLWTMGSG 146
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
+ ++T+G+ + ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+ ++ ++++G+
Sbjct: 147 ACFS-LWTMGSGACSCSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSGACSS-LWSMGSG 204
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+
Sbjct: 205 ACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSG 264
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTL 311
++ ++++G+ ++ ++++G+ E+ T +F+L
Sbjct: 265 ACSSSLWSMGSGACSSSLWSMGSDEVTGSDTGSIFSL 301
Score = 102 bits (253), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/269 (17%), Positives = 159/269 (59%), Gaps = 14/269 (5%)
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-------LGATELTAKVFTLGAT 110
+LG L+ K F L E + + ++ E++A + T G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 32 SLGDCRLS-KAFGL---ESSGSMVSVIGREVSAPLSTSCDARERRGSGACSSSLWTMGSG 87
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
++ ++T+G+ + ++T G+ ++ ++T+G+ ++ + T+G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 88 ACSSSLWTMGSGACFS-LWTRGSGACSSSLWTMGSGACSSSLRTMGSGACSSSLWTMGSG 146
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
+ ++T+G+ + ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+ ++ ++++G+
Sbjct: 147 ACFS-LWTMGSGACSCSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSGACSS-LWSMGSG 204
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+
Sbjct: 205 ACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSG 264
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
++ ++++G+ ++ ++++G+ E+T
Sbjct: 265 ACSSSLWSMGSGACSSSLWSMGSDEVTGS 293
Score = 101 bits (252), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/228 (16%), Positives = 142/228 (62%), Gaps = 7/228 (3%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
++ ++T+G+ ++ ++T+G+ + ++T G+ ++ ++T+G+ ++ + T+G+
Sbjct: 77 CSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACFS-LWTRGSGACSSSLWTMGSGACSSSLRTMGSGA 135
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
++ ++T+G+ + ++T+G+ + ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+
Sbjct: 136 CSSSLWTMGSGACFS-LWTMGSGACSCSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSGA 194
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
++ ++++G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T G+
Sbjct: 195 CSS-LWSMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTRGSGA 253
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTL 227
++ ++T G+ ++ ++++G+ ++ ++++G+ E+ T +F+L
Sbjct: 254 CSSSLWTRGSGACSSSLWSMGSGACSSSLWSMGSDEVTGSDTGSIFSL 301
Score = 90.9 bits (224), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/292 (17%), Positives = 162/292 (55%), Gaps = 32/292 (10%)
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-------LGATELTAKVFTLGAT 206
+LG L+ K F L E + + ++ E++A + T G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 32 SLGDCRLS-KAFGL---ESSGSMVSVIGREVSAPLSTSCDARERRGSGACSSSLWTMGSG 87
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
++ ++T+G+ + ++T G+ ++ ++T+G+ ++ + T+G+ ++ ++T+G+
Sbjct: 88 ACSSSLWTMGSGACFS-LWTRGSGACSSSLWTMGSGACSSSLRTMGSGACSSSLWTMGSG 146
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVE 326
+ ++T+G+ + ++T+G+ ++ ++T G+ ++ ++T G+ A S + +
Sbjct: 147 ACFS-LWTMGSGACSCSLWTMGSGACSSSLWTRGSGACSSSLWTRGSG---ACSSLWSMG 202
Query: 327 YYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 386
+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T+G+ ++ ++T G
Sbjct: 203 ------------SGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTMGSGACSSSLWTRG 250
Query: 387 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTV 438
+ ++ ++T G+ ++ ++++G+ ++ ++++G+ E+T S+TG++
Sbjct: 251 SGACSSSLWTRGSGACSSSLWSMGSGACSSSLWSMGSDEVTG----SDTGSI 298
>gi|145475943|ref|XP_001423994.1| hypothetical protein [Paramecium tetraurelia strain d4-2]
gi|124391056|emb|CAK56596.1| unnamed protein product [Paramecium tetraurelia]
Length = 970
Score = 101 bits (252), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/414 (25%), Positives = 127/414 (30%), Gaps = 14/414 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G TE K G TE + G E K G TE + G E K
Sbjct: 432 GTTEGEGKSEEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKSEDH 491
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G TE + G+ E K G TE + G TE K G TE +
Sbjct: 492 GTTEGEGQSEDHGSQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTTEGEGKSEDHGTTEGEGQSQDH 551
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G TE + G E K G TE + G E K G TE +
Sbjct: 552 GTTEGEGQSEDHGTQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKSEDHGTTEGEGQSEDH 611
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G TE + G E K G TE + G E K G TE +
Sbjct: 612 GTTEGQGQSEDHGTQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEVKSEDHGTTEGEGQSEDH 671
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G E K G TE + G TE K G TE + G TE +
Sbjct: 672 GTQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTTEGEGKSEDHGTTEGEGQSQDHGTTEGEGQSEDH 731
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G E KS ++ TE + G TE + G TE K
Sbjct: 732 GTQEGEVKSD--------------EHGTTEGEGQSEDHGTTEGEGQSEDHGTTEGEVKSE 777
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
G TE + G E K G TE + G E K G TE
Sbjct: 778 DHGTTEGEGQSEDHGTQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKAEDHGTTE 831
Score = 99.8 bits (247), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 105/412 (25%), Positives = 125/412 (30%), Gaps = 14/412 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
TE K G TE + G E K G TE + G E K G
Sbjct: 434 TEGEGKSEEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKSEDHGT 493
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
TE + G+ E K G TE + G TE K G TE + G
Sbjct: 494 TEGEGQSEDHGSQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTTEGEGKSEDHGTTEGEGQSQDHGT 553
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
TE + G E K G TE + G E K G TE + G
Sbjct: 554 TEGEGQSEDHGTQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKSEDHGTTEGEGQSEDHGT 613
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
TE + G E K G TE + G E K G TE + G
Sbjct: 614 TEGQGQSEDHGTQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEVKSEDHGTTEGEGQSEDHGT 673
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
E K G TE + G TE K G TE + G TE + G
Sbjct: 674 QEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTTEGEGKSEDHGTTEGEGQSQDHGTTEGEGQSEDHGT 733
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
E K G TE +S + TE + G TE K
Sbjct: 734 QEGEVKSDEHGTTEGEGQSED--------------HGTTEGEGQSEDHGTTEGEVKSEDH 779
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
G TE + G E K G TE + G E K G TE
Sbjct: 780 GTTEGEGQSEDHGTQEGEVKSDEHGTTEGEGQSEDHGTQEGEGKAEDHGTTE 831
>gi|218905956|ref|YP_002453790.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH820]
gi|218536305|gb|ACK88703.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH820]
Length = 1219
Score = 98.6 bits (244), Expect = 6e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 126/431 (29%), Positives = 157/431 (36%), Gaps = 23/431 (5%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + G+T +T GAT T G+T T + G T T + G+
Sbjct: 262 TGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGS 321
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T G T +T G T T + GAT T GAT T + GA
Sbjct: 322 TGVTGNTGPTGETGVTGST---GVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGA 378
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T GAT T GAT T GAT +T G+T +T GA
Sbjct: 379 TGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVT------GSTGVTGNTGPTGA 432
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFT 238
T T G+T T + G T T + G+T +T + GAT T
Sbjct: 433 TGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGE 492
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT T + GAT T + GAT T GAT T GAT T +
Sbjct: 493 TGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGS 552
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
GAT T + GAT +T P + AT T + GAT T
Sbjct: 553 TGATGNTGPTGSTGATGVTGS--TGATGNTGPTG---ETGATGSTGVTGSTGATGSTGVT 607
Query: 359 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 418
+ GAT T GAT T GAT T + GAT T + G T T
Sbjct: 608 GSTGATGNT------GATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNT 661
Query: 419 FTLGATELTAK 429
G T +T
Sbjct: 662 GPTGETGVTGS 672
Score = 96.3 bits (238), Expect = 3e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 122/435 (28%), Positives = 155/435 (35%), Gaps = 29/435 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T G T T + G+T +T GAT T G+T T + G
Sbjct: 249 STGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTG 308
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T + G+T +T G T +T G T T + GAT T G
Sbjct: 309 NTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGST---GVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETG 365
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T + GAT T GAT T GAT T GAT +T G
Sbjct: 366 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVT------G 419
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VF 237
+T +T GAT T G+T T + G T T + G+T +T
Sbjct: 420 STGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTG 479
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
+ GAT T GAT T + GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 480 STGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTG 539
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
GAT T + GAT T + AT +T G T T +
Sbjct: 540 NTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGST--------------GATGVTGSTGATGNTGPTGE 585
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 414
G+T +T G+T +T GAT T GAT T + GAT
Sbjct: 586 TGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGN 645
Query: 415 TAKVFTLGATELTAK 429
T + G T T
Sbjct: 646 TGPTGSTGETGATGN 660
Score = 96.3 bits (238), Expect = 3e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 122/434 (28%), Positives = 155/434 (35%), Gaps = 29/434 (6%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + G+T T G T T + G+T +T GAT T G+
Sbjct: 238 TGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGATGS 297
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T + G T T + G+T +T G T +T G T T + GA
Sbjct: 298 TGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGST---GVTGNTGPTGSTGA 354
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T GAT T + GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 355 TGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGA 414
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T +T G+T +T GAT T G+T T + G T T + G+
Sbjct: 415 TGVT------GSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGS 468
Query: 242 TELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
T +T + GAT T GAT T + GAT T + GAT T
Sbjct: 469 TGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGN 528
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
GAT T GAT T + AT T + GAT +T
Sbjct: 529 TGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGST--------------GATGNTGPTGSTGATGVTGST 574
Query: 359 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELT 415
G T T + G+T +T G+T +T GAT T GAT T
Sbjct: 575 GATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGST 634
Query: 416 AKVFTLGATELTAK 429
+ GAT T
Sbjct: 635 GPTGSTGATGNTGP 648
Score = 95.5 bits (236), Expect = 5e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 123/438 (28%), Positives = 156/438 (35%), Gaps = 26/438 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF--- 57
+T T G T +T G T +T G T T + G+T +T
Sbjct: 291 STGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTG 350
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+ GAT T GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 351 STGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTG 410
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT +T G+T +T GAT T G+T T + G T T +
Sbjct: 411 NTGATGVT------GSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETG 464
Query: 178 TLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
G+T +T + GAT T GAT T + GAT T + GAT T
Sbjct: 465 VTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTG 524
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT T GAT T + GAT T + GAT +T G T T
Sbjct: 525 ATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTG 584
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL 354
+ G+T +T G+T +T + AT T GAT
Sbjct: 585 ETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATG-----------NTGATGSTGPTGNTGATGS 633
Query: 355 TAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
T + GAT T + GAT T G T T GAT T G+
Sbjct: 634 TGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGS 693
Query: 412 TELTAKVFTLGATELTAK 429
T +T G+T T
Sbjct: 694 TGVTGSTGPTGSTGATGN 711
Score = 84.3 bits (207), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 126/478 (26%), Positives = 158/478 (33%), Gaps = 44/478 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 54
AT T GAT T GAT +T GAT T G+T T
Sbjct: 390 ATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTG 449
Query: 55 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
+ G T T + G+T +T + GAT T GAT T + GAT
Sbjct: 450 ETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATG 509
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
T + GAT T GAT T GAT T + GAT T + GAT
Sbjct: 510 STGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATG 569
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLG 228
+T G T T + G+T +T G+T +T GAT T G
Sbjct: 570 VTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTG 629
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
AT T + GAT T + G T T G T +T G T T + G
Sbjct: 630 ATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTG 689
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY-------------------- 328
T T + G T T GAT T + V
Sbjct: 690 PTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETG 749
Query: 329 -----KPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
P +T +T G T T G T +T G T +T
Sbjct: 750 VTGSTGPTG------STGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTG 803
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-NIRSNTGTVGS 440
G T T G T T + G+T +T G+T +T NTG GS
Sbjct: 804 VTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGS 861
Score = 78.6 bits (192), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/459 (25%), Positives = 148/459 (32%), Gaps = 44/459 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T + GAT T + GAT T GAT T G
Sbjct: 483 ATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTG 542
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T + GAT T + GAT +T G T T + G+T +T G
Sbjct: 543 ATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATG 602
Query: 121 ATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
+T +T GAT T GAT T + GAT T + G T T
Sbjct: 603 STGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTG 662
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G T +T G T T + G T T + G T T GAT T
Sbjct: 663 PTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTG 722
Query: 238 TLG---------------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G +T T G T T + G+T T
Sbjct: 723 NTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTG 782
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
+ G T T + G+T +T G+T T G T T + +
Sbjct: 783 ETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVT------- 835
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 390
+T T G+T T G+T T G T T + G T
Sbjct: 836 -------GSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGP 888
Query: 391 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T + G+T +T G+T T G T T
Sbjct: 889 TGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGS 927
Score = 73.2 bits (178), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/460 (25%), Positives = 148/460 (32%), Gaps = 31/460 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVF 57
AT +T G T T + G+T +T G+T +T GAT T
Sbjct: 567 ATGVTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTG 626
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
GAT T + GAT T + G T T G T +T G T T +
Sbjct: 627 NTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETG 686
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG--------------------- 156
G T T + G T T GAT T G
Sbjct: 687 VTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTG 746
Query: 157 ------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+T T G T T + G+T T + G T T + G+T +T
Sbjct: 747 ETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTG 806
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G+T T G T T G+T T G+T T G+T T
Sbjct: 807 NTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTG 866
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVILEVEYYK 329
G T T + G T T + G+T +T G+T T E
Sbjct: 867 NTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATG 926
Query: 330 PIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 389
+ AT T + GAT T + GAT T + GAT T G T
Sbjct: 927 STGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGATGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTG 986
Query: 390 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T GAT T GAT T G+T +T
Sbjct: 987 STGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTGS 1026
Score = 73.2 bits (178), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/462 (24%), Positives = 149/462 (32%), Gaps = 44/462 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 57
+T +T G+T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 591 STGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTG 650
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+ G T T G T +T G T T + G T T + G T T
Sbjct: 651 STGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATG 710
Query: 118 TLGATELTAKVFTLG---------------------------ATELTAKVFTLGATELTA 150
GAT T G +T T G T T
Sbjct: 711 NTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATG 770
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ G+T T + G T T + G+T +T G+T T G T T
Sbjct: 771 ETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATG 830
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G+T T G+T T G+T T G T T + G T T
Sbjct: 831 STGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTG 890
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
+ G+T +T G+T T G T T G+T T + +
Sbjct: 891 ETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTG--- 947
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGA 387
AT T + GAT T + GAT T G+T +T G+
Sbjct: 948 --------ATGNTGATGSTGATGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGS 999
Query: 388 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T +T GAT T + G T T ++GAT T
Sbjct: 1000 TGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSIGATGATGS 1041
Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 108/451 (23%), Positives = 141/451 (31%), Gaps = 47/451 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T + GAT T + G T T G T +T G
Sbjct: 618 ATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTG 677
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG------------ 108
T T + G T T + G T T GAT T G
Sbjct: 678 NTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETG 737
Query: 109 ---------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 153
+T T G T T + G+T T + G T T +
Sbjct: 738 VTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETG 797
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 213
G+T +T G+T T G T T G+T T G+T T
Sbjct: 798 VTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTG 857
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
G+T T G T T + G T T + G+T +T G+T T
Sbjct: 858 ATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTG 917
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
G T T G+T T G+T T G+T T
Sbjct: 918 PTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGATGN-------------- 963
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
T T G T T + G+T +T G+T +T GAT T
Sbjct: 964 ------TGATGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGP 1017
Query: 394 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
+ G T T ++GAT T G+T
Sbjct: 1018 TGSTGVTGSTGATGSIGATGATGSTGPTGST 1048
Score = 70.1 bits (170), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/358 (26%), Positives = 127/358 (35%), Gaps = 18/358 (5%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T +T G T T + + G T T + G+T +T T T +
Sbjct: 194 GSTGVTGSTGPTGETGATGETGSTGNTGPTGETGATGSTGVTGN------TGPTGETGAT 247
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G+T T G T T + G+T +T GAT T G+T T +
Sbjct: 248 GSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVT 307
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T + G+T +T G T +T G T T + GAT T
Sbjct: 308 GNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGST---GVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGET 364
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
GAT T + GAT T GAT T GAT T GAT +T + +
Sbjct: 365 GATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVTGSTGV- 423
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
P AT T G+T T + G T T + G+T +T
Sbjct: 424 -TGNTGPTG------ATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTG 476
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-NIRSNTGTVGS 440
G+T T G T T G+T T G+T T NTG GS
Sbjct: 477 PTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGS 534
Score = 59.7 bits (143), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 81/309 (26%), Positives = 109/309 (35%), Gaps = 17/309 (5%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T T G T T + G+T T + G T T + G+T +T G
Sbjct: 753 STGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTG 812
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T T G T T G+T T G+T T G+T T G
Sbjct: 813 STGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATG 872
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
T T + G T T + G+T +T + GAT T GAT T
Sbjct: 873 NTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTG 932
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTA 294
+ GAT T + GAT T + GAT T + GAT T G+T +T
Sbjct: 933 STGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGATGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTG 992
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL 354
G+T +T GAT T + V +T T + GAT
Sbjct: 993 NTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTG-----------STGATGSIGATGATGS 1041
Query: 355 TAKVFTLGA 363
T + GA
Sbjct: 1042 TGPTGSTGA 1050
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/241 (30%), Positives = 88/241 (36%), Gaps = 6/241 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T + GAT T + GAT T + G T T G
Sbjct: 816 ATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTG 875
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G T T + G T T + GAT T GAT T + G
Sbjct: 876 PTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTG 935
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T + GAT T + GAT T + GAT T G T T G
Sbjct: 936 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGATGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTG 995
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T GAT T G+T +T G+T T + GAT T + G
Sbjct: 996 ATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVT------GSTGATGSIGATGATGSTGPTGSTG 1049
Query: 241 A 241
A
Sbjct: 1050 A 1050
>gi|402572774|ref|YP_006622117.1| collagen triple helix repeat protein [Desulfosporosinus meridiei DSM
13257]
gi|402253971|gb|AFQ44246.1| collagen triple helix repeat protein [Desulfosporosinus meridiei DSM
13257]
Length = 2166
Score = 93.2 bits (230), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 143/385 (37%), Positives = 164/385 (42%), Gaps = 10/385 (2%)
Query: 55 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
V + GAT T V G+T T V G T T V + GAT T V GAT T
Sbjct: 1322 DVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGETGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATG 1381
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
V + GAT T V GAT +T V + GAT T V GAT T V + GAT T
Sbjct: 1382 DVGSTGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATG 1441
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
V GAT T V GAT T V G+T T V + GAT T V GAT +T
Sbjct: 1442 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGVTG 1501
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
V + GAT T V + GAT T V G T T V + GAT T V GAT T
Sbjct: 1502 DVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGETGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATG 1561
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFT---------LGATELT-AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTA 344
V GAT T V +GAT T A + V AT T
Sbjct: 1562 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 1621
Query: 345 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 404
V GAT T V + G+T T V G+T T V GAT T V + GAT T
Sbjct: 1622 DVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATG 1681
Query: 405 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
V + GAT T V G+T T
Sbjct: 1682 DVGSTGATGATGDVGATGSTGATGD 1706
Score = 90.1 bits (222), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 148/387 (38%), Positives = 168/387 (43%), Gaps = 2/387 (0%)
Query: 43 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
V + GAT T V GAT T V + GAT T V GAT T V + GAT T
Sbjct: 1166 DVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATG 1225
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
V G+T T V GAT T V + G+T T V GAT T V GAT T
Sbjct: 1226 DVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 1285
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
V GAT T V GAT T V GAT T V + GAT T V G+T T
Sbjct: 1286 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATG 1345
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
V G T T V + GAT T V GAT T V + GAT T V GAT +T
Sbjct: 1346 DVGATGETGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGVTG 1405
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATEL 342
V + GAT T V GAT T V + GAT T + V AT
Sbjct: 1406 DVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGD--VGATGATGATGDVGATGATGA 1463
Query: 343 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 402
T V G+T T V + GAT T V GAT +T V + GAT T V + GAT
Sbjct: 1464 TGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGSTGATGA 1523
Query: 403 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T V G T T V + GAT T
Sbjct: 1524 TGDVGATGETGATGDVGSTGATGATGD 1550
Score = 79.3 bits (194), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 162/474 (34%), Positives = 189/474 (39%), Gaps = 53/474 (11%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
V G+T T V + GAT T V + GAT T V GAT T V + G+T T
Sbjct: 362 DVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATG 421
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
V GAT T V GAT T V + GAT T V GAT T V + G+T T
Sbjct: 422 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATG 481
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
V GAT T V GAT T V GAT T V + GAT T V GAT T
Sbjct: 482 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATG 541
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
V + GAT T V + GAT T V + GAT T V + GAT T V GAT T
Sbjct: 542 DVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATG 601
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
V + G+T T V GAT T V GAT T V GAT +T V + GAT T
Sbjct: 602 DVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATG 661
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTA------------KVFTLGATEL 354
V + GAT T + V +T T V + GAT
Sbjct: 662 DVGSTGATGATGD--VGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGA 719
Query: 355 TAKVFTL------------GATELTAKVFTLGATELTA---------------------- 380
T V GAT T +GAT T
Sbjct: 720 TGDVGATGATGATGDVGATGATGETGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGA 779
Query: 381 -----KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
V + GAT T V + GAT T V + GAT T V + G+T T
Sbjct: 780 TGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGSTGATGD 833
Score = 75.9 bits (185), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 126/319 (39%), Positives = 143/319 (44%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T V + GAT T V GAT T V + GAT T V GAT T V G
Sbjct: 1400 ATGVTGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATG 1459
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T V G+T T V + GAT T V GAT +T V + GAT T V + G
Sbjct: 1460 ATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGSTG 1519
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T V G T T V + GAT T V GAT T V GAT T V G
Sbjct: 1520 ATGATGDVGATGETGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATG 1579
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T V G+T T V GAT T V GAT T V GAT T V + G
Sbjct: 1580 ATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTG 1639
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
+T T V G+T T V GAT T V + GAT T V + GAT T V G
Sbjct: 1640 STGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATG 1699
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAK 319
+T T V G+T T
Sbjct: 1700 STGATGDVGATGSTGATGD 1718
Score = 75.5 bits (184), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 162/493 (32%), Positives = 184/493 (37%), Gaps = 92/493 (18%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------- 47
AT T V + GAT T V + GAT T V + GAT T V
Sbjct: 548 ATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTG 607
Query: 48 -----------------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 72
GAT +T V + GAT T V + G
Sbjct: 608 STGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGSTG 667
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
AT T V GAT T V G+T T V GAT T V + GAT T V G
Sbjct: 668 ATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATG 727
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KVF 165
AT T V GAT T +GAT T V
Sbjct: 728 ATGATGDVGATGATGETGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVG 787
Query: 166 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
+ GAT T V + GAT T V + GAT T V + G+T T V GAT T V
Sbjct: 788 STGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVG 847
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
GAT T V GAT T V G+T T V GAT T V GAT T V
Sbjct: 848 ATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVG 907
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAK 345
GAT T V + GAT T V G+T T +V AT T
Sbjct: 908 ATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATG-----DV------------GATGATGD 950
Query: 346 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 405
V + GAT T V + GAT T V GAT T V G+T T V GAT T
Sbjct: 951 VGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGPTGATGATGD 1010
Query: 406 VFTLGATELTAKV 418
V + GAT T V
Sbjct: 1011 VGSTGATGATGDV 1023
Score = 73.6 bits (179), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 154/412 (37%), Positives = 176/412 (42%), Gaps = 2/412 (0%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
V G T T V G T T V GAT T V G+T T V + GAT +T
Sbjct: 182 DVGATGETGATGDVGATGETGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTG 241
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
V + GAT T V G+T T V + GAT +T V GAT T V GAT T
Sbjct: 242 DVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 301
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
V GAT T V G+T T V GAT T V GAT T V GAT T
Sbjct: 302 DVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 361
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
V G+T T V + GAT T V + GAT T V GAT T V + G+T T
Sbjct: 362 DVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATG 421
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
V GAT T V GAT T V + GAT T V GAT T V + G+T T
Sbjct: 422 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATG 481
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
V A + V AT T V + GAT T V GAT
Sbjct: 482 DVGAT--GATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGA 539
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 418
T V + GAT T V + GAT T V + GAT T V + GAT T V
Sbjct: 540 TGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDV 591
Score = 71.2 bits (173), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 162/459 (35%), Positives = 188/459 (40%), Gaps = 38/459 (8%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
V G+T T V + GAT +T V + GAT T V G+T T V + GAT +T
Sbjct: 218 DVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTG 277
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
V GAT T V GAT T V GAT T V G+T T V GAT T
Sbjct: 278 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATG 337
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
V GAT T V GAT T V G+T T V + GAT T V + GAT T
Sbjct: 338 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATG 397
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
V GAT T V + G+T T V GAT T V GAT T V + GAT T
Sbjct: 398 DVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATG 457
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
V GAT T V + G+T T V GAT T V GAT T V GAT T
Sbjct: 458 DVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 517
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
V + GAT T + V AT T V + GAT T V + GAT
Sbjct: 518 DVGSTGATGATGD--VGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGA 575
Query: 367 TAKVFTLGATELTA------------KVFTLGATELTAKVFTL----------------- 397
T V + GAT T V + G+T T V
Sbjct: 576 TGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGA 635
Query: 398 -------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T V + GAT T V + GAT T
Sbjct: 636 TGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGD 674
Score = 70.1 bits (170), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 160/428 (37%), Positives = 183/428 (42%), Gaps = 2/428 (0%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T V G T T V GAT T V G+T T V + GAT +T V + GA
Sbjct: 189 TGATGDVGATGETGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGSTGA 248
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T V G+T T V + GAT +T V GAT T V GAT T V GA
Sbjct: 249 TGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGA 308
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T V G+T T V GAT T V GAT T V GAT T V G+
Sbjct: 309 TGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGS 368
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T V + GAT T V + GAT T V GAT T V + G+T T V GA
Sbjct: 369 TGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGA 428
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T V GAT T V + GAT T V GAT T V + G+T T V GA
Sbjct: 429 TGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGA 488
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T T V A + V AT T V GAT T V +
Sbjct: 489 TGATGDVGAT--GATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGST 546
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
GAT T V + GAT T V + GAT T V + GAT T V GAT T V +
Sbjct: 547 GATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGST 606
Query: 422 GATELTAK 429
G+T T
Sbjct: 607 GSTGATGD 614
Score = 69.3 bits (168), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 148/460 (32%), Positives = 174/460 (37%), Gaps = 74/460 (16%)
Query: 19 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 78
V G+T T V + GAT +T V + GAT T V G+T T V + GAT +T
Sbjct: 218 DVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTG 277
Query: 79 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------- 131
V GAT T V GAT T V GAT T V G+T T V
Sbjct: 278 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATG 337
Query: 132 -----------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
G+T T V + GAT T V + GAT T
Sbjct: 338 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATG 397
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
V GAT T V + G+T T V GAT T V GAT T V + GAT T
Sbjct: 398 DVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATG 457
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA------------------------------------ 246
V GAT T V + G+T T
Sbjct: 458 DVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 517
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
V + GAT T V GAT T V + GAT T V + GAT T V + GAT T
Sbjct: 518 DVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATG 577
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
V + GAT T + V +T T V GAT T V GAT
Sbjct: 578 DVGSTGATGATGD--VGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGA 635
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 406
T V GAT +T V + GAT T V + GAT T V
Sbjct: 636 TGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDV 675
Score = 68.9 bits (167), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 165/489 (33%), Positives = 192/489 (39%), Gaps = 62/489 (12%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T V + GAT T V G+T T V + GAT +T V GAT T V G
Sbjct: 236 ATGVTGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGATGATGATGDVGATG 295
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------- 95
AT T V GAT T V G+T T V
Sbjct: 296 ATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATG 355
Query: 96 -----------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
G+T T V + GAT T V + GAT T V GAT T V + G
Sbjct: 356 ATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTG 415
Query: 145 ATELTA------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T T V + GAT T V GAT T V + G
Sbjct: 416 STGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGSTG 475
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+T T V GAT T V GAT T V GAT T V + GAT T V G
Sbjct: 476 STGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATG 535
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
AT T V + GAT T V + GAT T V + GAT T V + GAT T V G
Sbjct: 536 ATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATG 595
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
AT T V + G+T T + V AT T V GAT +T V +
Sbjct: 596 ATGATGDVGSTGSTGATGD--VGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGVTGDVGS 653
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GAT T V + GAT T V GAT T V G+T T V GAT T V +
Sbjct: 654 TGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGS 713
Query: 421 LGATELTAK 429
GAT T
Sbjct: 714 TGATGATGD 722
Score = 64.3 bits (155), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/278 (40%), Positives = 125/278 (44%), Gaps = 3/278 (1%)
Query: 19 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 78
V + GAT T V + GAT T V + GAT T V + G+T T V GAT T
Sbjct: 785 DVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATG 844
Query: 79 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 138
V GAT T V GAT T V G+T T V GAT T V GAT T
Sbjct: 845 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 904
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
V GAT T V + GAT T V G+T T V GAT T V + GAT T
Sbjct: 905 DVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDV---GATGATGDVGSTGATGATG 961
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
V + GAT T V GAT T V G+T T V GAT T V + GAT T
Sbjct: 962 DVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGPTGATGATGDVGSTGATGATG 1021
Query: 259 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
V GAT T V GAT T V + GAT T V
Sbjct: 1022 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDV 1059
Score = 62.4 bits (150), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 114/299 (38%), Positives = 130/299 (43%), Gaps = 9/299 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
V + GAT T V + GAT T V + GAT T V + G+T T V GAT T
Sbjct: 785 DVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATG 844
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
V GAT T V GAT T V G+T T V GAT T V GAT T
Sbjct: 845 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG 904
Query: 127 KVFT---------LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
V +G+T T +GAT T +GAT T V + GAT T V
Sbjct: 905 DVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGDVGSTGATGATGDVG 964
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
+ GAT T V GAT T V G+T T V GAT T V + GAT T V
Sbjct: 965 STGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGPTGATGATGDVGSTGATGATGDVG 1024
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
GAT T V GAT T V + GAT T V GAT T V G+T T V
Sbjct: 1025 ATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDV 1083
Score = 61.6 bits (148), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/272 (33%), Positives = 107/272 (39%), Gaps = 36/272 (13%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T V + GAT T V GAT +T V + GAT T V + GAT T V G
Sbjct: 1472 STGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATG 1531
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAK------------------------------------VFTLG 84
T T V + GAT T V G
Sbjct: 1532 ETGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATG 1591
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
+T T V GAT T V GAT T V GAT T V + G+T T V G
Sbjct: 1592 STGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATG 1651
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
+T T V GAT T V + GAT T V + GAT T V G+T T V G
Sbjct: 1652 STGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATG 1711
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
+T T V GAT T V + GAT T V
Sbjct: 1712 STGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDV 1743
Score = 55.8 bits (133), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/293 (34%), Positives = 117/293 (39%), Gaps = 33/293 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T V + GAT T V + GAT T V + G+T T V GAT T V G
Sbjct: 791 ATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGSTGATGDVGATGATGATGDVGATG 850
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-------------------------- 94
AT T V GAT T V G+T T V
Sbjct: 851 ATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATG 910
Query: 95 -------LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+G+T T +GAT T +GAT T V + GAT T V + GAT
Sbjct: 911 ATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATG 970
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
T V GAT T V G+T T V GAT T V + GAT T V GAT
Sbjct: 971 ATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGPTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATG 1030
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
T V GAT T V + GAT T V GAT T V G+T T V
Sbjct: 1031 ATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDV 1083
Score = 52.0 bits (123), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 133/355 (37%), Positives = 151/355 (42%), Gaps = 5/355 (1%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
V + G+T T V G+T T V GAT T V + GAT T V + GAT T
Sbjct: 1634 DVGSTGSTGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATG 1693
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
V G+T T V G+T T V GAT T V + GAT T V T G T T
Sbjct: 1694 DVGATGSTGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGTTGETGATG 1753
Query: 127 KVFTLGATELTAKV---FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
V GAT T V + GAT T V GAT T V G+T T V GAT
Sbjct: 1754 DVGATGATGATGDVGATGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATG 1813
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
T V + GAT T V GAT T V GAT T V GAT T V G+T
Sbjct: 1814 ATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTG 1873
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T V GAT T V GAT T V GAT T V G+T T V + GAT
Sbjct: 1874 ATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATG 1933
Query: 304 LTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
T V + GAT T + V AT +T V + GAT T V
Sbjct: 1934 ATGDVGSTGATGATGD--VGATGATGATGDVGATGATGVTGDVGSTGATGATGDV 1986
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 94/242 (38%), Positives = 106/242 (43%)
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
V G+T T V GAT T V G T T V G T T V GAT T
Sbjct: 158 DVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGETGATGDVGATGETGATGDVGATGATGATG 217
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
V G+T T V + GAT +T V + GAT T V G+T T V + GAT +T
Sbjct: 218 DVGATGSTGATGDVGSTGATGVTGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGVTG 277
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
V GAT T V GAT T V GAT T V G+T T V GAT T
Sbjct: 278 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATG 337
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
V GAT T V GAT T V G+T T V + GAT T V + GAT T
Sbjct: 338 DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATG 397
Query: 307 KV 308
V
Sbjct: 398 DV 399
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/311 (35%), Positives = 122/311 (39%), Gaps = 39/311 (12%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T V + GAT T V G+T T V G+T T V GAT T V + G
Sbjct: 1676 ATGATGDVGSTGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTG 1735
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKV---------------FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 105
AT T V T G T T V + GAT T V GAT T V
Sbjct: 1736 ATGATGDVGTTGETGATGDVGATGATGATGDVGATGSTGATGATGDVGATGATGATGDVG 1795
Query: 106 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 165
G+T T V GAT T V + GAT T V GAT T V GAT T V
Sbjct: 1796 ATGSTGATGDVGATGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVG 1855
Query: 166 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------------------- 203
GAT T V G+T T V GAT T V
Sbjct: 1856 ATGATGATGDVGATGSTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVG 1915
Query: 204 --GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 261
G+T T V + GAT T V + GAT T V GAT T V GAT +T V
Sbjct: 1916 ATGSTGATGDVGSTGATGATGDVGSTGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGVTGDVG 1975
Query: 262 TLGATELTAKV 272
+ GAT T V
Sbjct: 1976 STGATGATGDV 1986
>gi|432107236|gb|ELK32650.1| Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M [Myotis davidii]
Length = 256
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 184 LTAKVFTLGATELTA 198
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 16 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 75
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 135
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 196 LTAKVFTLGATELTA 210
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 28 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 208 LTAKVFTLGATELTA 222
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 40 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 99
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 220 LTAKVFTLGATELTA 234
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 232 LTAKVFTLGATELTA 246
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 244 LTAKVFTLGATELTA 258
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 135
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 255
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 256 LTAKVFTLGATELTA 270
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 268 LTAKVFTLGATELTA 282
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 280 LTAKVFTLGATELTA 294
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 292 LTAKVFTLGATELTA 306
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/195 (16%), Positives = 97/195 (49%)
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 120
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 121 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 180
Query: 304 LTAKVFTLGATELTA 318
+ + +GA ++
Sbjct: 181 MGGGLDQVGAQQMGG 195
Score = 84.0 bits (206), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/221 (16%), Positives = 102/221 (46%), Gaps = 19/221 (8%)
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA +
Sbjct: 1 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQ 60
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA 339
+ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +V A
Sbjct: 61 MGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGG--LDQV------------GA 106
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA ++ + +GA
Sbjct: 107 QQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGA 166
Query: 400 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL-----TAKNIRSNT 435
++ + +GA ++ + +GA ++ N+ SNT
Sbjct: 167 QQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQVGAQQMGGGLDQGPNLCSNT 207
>gi|359411480|ref|ZP_09203945.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
gi|357170364|gb|EHI98538.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
Length = 1746
Score = 92.4 bits (228), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/431 (26%), Positives = 151/431 (35%), Gaps = 11/431 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 57
AT +T + GAT +T GAT +T + G T T + G+T T
Sbjct: 514 ATGVTGSTGSTGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATG 573
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
G+T T G T T GAT +T + G T T G+T T
Sbjct: 574 VTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTG 633
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT T GAT +T + G T T + G T T G+T T
Sbjct: 634 ATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTG 693
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
+ G T T GAT +T G T T + G T T G+T T
Sbjct: 694 STGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTG 753
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
+ GAT T GAT +T G T T + G+T T G+T T
Sbjct: 754 STGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTG 813
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
+ GAT T GAT +T + P T T GAT +T
Sbjct: 814 STGATGSTGSTGDTGATGVTGST--------GPTGDTGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGS 865
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
+ G T T + G+T T G+T T + G T T GAT +
Sbjct: 866 TGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVAGS 925
Query: 418 VFTLGATELTA 428
G T +T
Sbjct: 926 TGPTGDTGVTG 936
Score = 84.7 bits (208), Expect = 8e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 119/453 (26%), Positives = 157/453 (34%), Gaps = 29/453 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T G+T T + GAT T GAT +T + G T +T + G
Sbjct: 328 ATGITGST---GSTGDTGDTGSTGATGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGVTGATGSTG 384
Query: 61 ATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+T +T + GAT T GAT +T + G T +T + G+T T
Sbjct: 385 STGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGATG 444
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG--------- 168
G+T T G T T GAT +T + G T T G
Sbjct: 445 VTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTG 504
Query: 169 ---------ATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
AT +T + GAT +T GAT +T + G T T + G
Sbjct: 505 STGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTG 564
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
+T T G+T T G T T GAT +T + G T T G
Sbjct: 565 STGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTG 624
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
+T T GAT T GAT +T + G T T V
Sbjct: 625 STGPTGDTGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATG--VTGSTGPTGDTGATGV 682
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
+T T + G T T GAT +T G T T + G T T
Sbjct: 683 TGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGPTGDTGVTGA 742
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G+T T + GAT T GAT +T
Sbjct: 743 TGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGS 775
Score = 84.0 bits (206), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 119/446 (26%), Positives = 151/446 (33%), Gaps = 29/446 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T + G T +T + G+T T G+T T G T T G
Sbjct: 412 ATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTG 471
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG------------------ATELTAKVFTLGATELTA 102
AT +T + G T T G AT +T + GAT +T
Sbjct: 472 ATGVTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITG 531
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT T GAT +T + G T T + G+T T G+T T
Sbjct: 532 ST---GATGDT------GATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTG 582
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
G T T GAT +T + G T T G+T T GAT T
Sbjct: 583 DTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTG 642
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
GAT +T + G T T + G T T G+T T + G T T
Sbjct: 643 PTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTG 702
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATEL 342
GAT +T G T T + G T T V P AT
Sbjct: 703 STGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGPTGDTG--VTGATGSTGPTGDTGSTGATGS 760
Query: 343 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 402
T GAT +T G T T + G+T T G+T T + GAT
Sbjct: 761 TGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGS 820
Query: 403 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
T GAT +T G T T
Sbjct: 821 TGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTG 846
Score = 81.6 bits (200), Expect = 6e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 118/455 (25%), Positives = 152/455 (33%), Gaps = 35/455 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 57
AT T GAT +T + G AT +T G T T + G+T T
Sbjct: 430 ATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTG 489
Query: 58 TLG---------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVF 93
+ G AT +T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 490 STGVTGDTGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTG 549
Query: 94 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 153
+ G T T + G+T T G+T T G T T GAT +T
Sbjct: 550 STGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTG 609
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 213
+ G T T G+T T GAT T GAT +T + G T T
Sbjct: 610 STGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTG 669
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
+ G T T G+T T + G T T GAT +T G T T
Sbjct: 670 STGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITG 729
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
+ G T T G+T T + GAT T GAT +T + P
Sbjct: 730 STGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGST--------GPTGD 781
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
T T GAT +T G T T + G+T T G+T T
Sbjct: 782 TGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGD 841
Query: 394 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G T T GAT +T + G T T
Sbjct: 842 TGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATG 876
Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/390 (26%), Positives = 132/390 (33%), Gaps = 47/390 (12%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G+T T G T T GAT +T G+T T + GAT T
Sbjct: 303 GSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGST---GSTGDTGDTGSTGATGSTGPTGDT 359
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 176
GAT +T + G T +T + G+ T +T + GAT T GAT +T
Sbjct: 360 GATGVTGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITGST 419
Query: 177 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
+ G T +T + G+T T G+T T G T T GAT +T
Sbjct: 420 GSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGST 479
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLG------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
+ G T T G AT +T + GAT +T GAT
Sbjct: 480 GSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITGST---GAT 536
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS 338
T G+T T G T T GAT +T
Sbjct: 537 GDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTG-------------------- 576
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
+T T G T T GAT +T + G T T G+T T G
Sbjct: 577 STGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATG 636
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
AT T GAT +T + G T T
Sbjct: 637 ATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATG 666
Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/314 (27%), Positives = 112/314 (35%), Gaps = 6/314 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT +T + G T T + G T T G+T T + G
Sbjct: 637 ATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTG 696
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T GAT +T G T T + G T T G+T T + G
Sbjct: 697 VTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTG 756
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T GAT +T G T T + G+T T G+T T + G
Sbjct: 757 ATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTG 816
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T GAT +T G+T T G T T GAT +T + G
Sbjct: 817 ATGSTGSTGDTGATGVT------GSTGPTGDTGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTG 870
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T T + G+T T G+T T + G T T GAT + G
Sbjct: 871 DTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVAGSTGPTG 930
Query: 301 ATELTAKVFTLGAT 314
T +T + G T
Sbjct: 931 DTGVTGATGSTGPT 944
Score = 64.7 bits (156), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/358 (25%), Positives = 122/358 (34%), Gaps = 29/358 (8%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G+T T G T T GAT +T G+T T + GAT T
Sbjct: 303 GSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGST---GSTGDTGDTGSTGATGSTGPTGDT 359
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 212
GAT +T + G T +T + G+ T +T + GAT T GAT +T
Sbjct: 360 GATGVTGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITGST 419
Query: 213 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
+ G T +T + G+T T G+T T G T T GAT +T
Sbjct: 420 GSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGST 479
Query: 273 FTLGATELTAKVFTLG------------------ATELTAKVFTLGATELTAK---VFTL 311
+ G T T G AT +T + GAT +T
Sbjct: 480 GSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITGSTGATGDT 539
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GAT +T + +T T G+T T G T T
Sbjct: 540 GATGVTGS--TGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTG 597
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T + G T T G+T T GAT T GAT +T
Sbjct: 598 DTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTGPTGNTGATGITGS 655
Score = 63.2 bits (152), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/323 (27%), Positives = 120/323 (37%), Gaps = 13/323 (4%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T GAT +T G T T + G+T T + GAT T
Sbjct: 300 GVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGSTGATGSTGPTGDT 359
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
GAT +T + G T +T + G+ T +T + GAT T GAT +T
Sbjct: 360 GATGVTGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITGST 419
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
+ G T +T GAT T GAT +T + G T T + G T T
Sbjct: 420 GSTGDTGVT------GATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGAT 473
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
G+T T G+T +T + + AT +T + GAT +T
Sbjct: 474 GVTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGST--GSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITG 531
Query: 357 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
G T T + G+T T G+T T G T T GAT +T
Sbjct: 532 STGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTG 591
Query: 417 KVFTLGATELTAKNIRSNTGTVG 439
+ G T T I +TG+ G
Sbjct: 592 STGSTGDTGATG--ITGSTGSTG 612
>gi|42783700|ref|NP_980947.1| hypothetical protein BCE_4654 [Bacillus cereus ATCC 10987]
gi|42739629|gb|AAS43555.1| hypothetical protein BCE_4654 [Bacillus cereus ATCC 10987]
Length = 462
Score = 91.7 bits (226), Expect = 7e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/287 (32%), Positives = 112/287 (39%), Gaps = 3/287 (1%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LG T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGATGPTGV 95
Query: 71 LG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
G AT T + GAT +T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 96 TGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGA 155
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 156 TGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGA 215
Query: 188 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T + GAT T
Sbjct: 216 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGSTGATGATGS 275
Query: 248 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T + GAT T + GAT T + G+T T
Sbjct: 276 TGPTGATGITGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGSTGSTGPTG 322
Score = 90.1 bits (222), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 90/282 (31%), Positives = 111/282 (39%), Gaps = 3/282 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T GAT T G T +T GAT T G
Sbjct: 44 ATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGAT---GATGPTGVTGITG 100
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T + GAT +T GAT +T G T +T G T +T G
Sbjct: 101 ATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTG 160
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T G
Sbjct: 161 ATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTG 220
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T + GAT T G
Sbjct: 221 ATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGSTGATGATGSTGPTG 280
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
AT +T + GAT T + GAT T + G+T T
Sbjct: 281 ATGITGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGSTGSTGPTG 322
Score = 83.2 bits (204), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/277 (31%), Positives = 108/277 (38%), Gaps = 6/277 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T G T +T GAT T GAT T + G
Sbjct: 56 ATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGAT---GATGPTGVTGITGATGPTGVTGSTG 112
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T G T +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 113 ATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTG 172
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 173 ATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTG 232
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT +T GAT +T GAT +T + GAT T GAT +T + G
Sbjct: 233 ATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGSTG 292
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTAKVFT 274
AT T + GAT T + G T +T T
Sbjct: 293 ATGSTGATGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGITGTSIT 329
Score = 80.5 bits (197), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/301 (30%), Positives = 113/301 (37%), Gaps = 17/301 (5%)
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
LG T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGATGPTGV 95
Query: 191 LG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
G AT T + GAT +T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 96 TGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGA 155
Query: 248 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 156 TGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGA 215
Query: 308 VFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 367
GAT +T + P AT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 216 TGPTGATGITGAT--------GPTG------ATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGIT 261
Query: 368 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 427
+ GAT T GAT +T + GAT T + GAT T + G+T T
Sbjct: 262 GATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGSTGSTGPT 321
Query: 428 A 428
Sbjct: 322 G 322
Score = 72.8 bits (177), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 94/316 (29%), Positives = 116/316 (36%), Gaps = 26/316 (8%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
LG T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGATGPTGV 95
Query: 179 LG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
G AT T + GAT +T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 96 TGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGA 155
Query: 236 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 156 TGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGA 215
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELT 355
GAT +T GAT +T + P AT +T GAT +T
Sbjct: 216 TGPTGATGITGATGPTGATGITGAT--------GPTG------ATGVTGATGPTGATGIT 261
Query: 356 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 415
+ GAT T GAT +T G+T T G+T T G T T
Sbjct: 262 GATGSTGATGATGSTGPTGATGITGAT---GSTGAT------GSTGATGSTGATGPTGAT 312
Query: 416 AKVFTLGATELTAKNI 431
+ G T +T +I
Sbjct: 313 GSTGSTGPTGITGTSI 328
>gi|300855075|ref|YP_003780059.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium
ljungdahlii DSM 13528]
gi|300435190|gb|ADK14957.1| putative collagen triple helix repeat protein [Clostridium
ljungdahlii DSM 13528]
Length = 800
Score = 90.5 bits (223), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/429 (27%), Positives = 152/429 (35%), Gaps = 32/429 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T T GAT +T G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 205 PTGATGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGETG 264
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T GAT +T G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 265 PTGVT------GATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTG 318
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T G T +T G T +T G T +T + G T +T +G
Sbjct: 319 ATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGET---GPTGVTGP---IG 372
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T G T +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 373 PTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTG 432
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
+T GAT +T G T +T GAT +T G T +T G
Sbjct: 433 PAGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVT------GPTGVTGPTGETG 486
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
AT +T GAT +T + + T +T GAT +T
Sbjct: 487 ATGVTGPTGETGATGVTGPTGVT--------------GPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGE 532
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
G T +T GAT +T G T T G T +T GAT +T
Sbjct: 533 TGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGE 592
Query: 421 LGATELTAK 429
GAT +T
Sbjct: 593 TGATGVTGP 601
Score = 90.1 bits (222), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 114/417 (27%), Positives = 147/417 (35%), Gaps = 26/417 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 246 GPTGVTGPTGVTGPTGETGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVT 305
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T GAT +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 306 GPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGET--- 362
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T +G T T G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 363 GPTGVTGP---IGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGET 419
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT +T G +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 420 GATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVT------ 473
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T +T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 474 GPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGET 533
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G T +T + + AT +T G T T G T +T
Sbjct: 534 GPTGVTGPTG--------------ETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTG 579
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T GAT +T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 580 VTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGPTG 636
Score = 89.0 bits (219), Expect = 5e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 113/416 (27%), Positives = 146/416 (35%), Gaps = 26/416 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T G T T GAT +T G T +T G T +T G
Sbjct: 247 PTGVTGPTGVTGPTGETGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTG 306
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T GAT +T G T +T G T +T G T +T + G
Sbjct: 307 PTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGET---G 363
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T +T +G T T G T +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 364 PTGVTGP---IGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETG 420
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT +T G +T GAT +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 421 ATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVT------G 474
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T +T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 475 PTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETG 534
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
T +T GAT +T + + T T G T +T
Sbjct: 535 PTGVTGPTGETGATGVTGPTGVT--------------GPTGETGATGVTGPTGVTGPTGV 580
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
GAT +T GAT +T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 581 TGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGPTG 636
Score = 88.2 bits (217), Expect = 7e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 113/418 (27%), Positives = 147/418 (35%), Gaps = 20/418 (4%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T T G T T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 192 GPTGETGPTGVTGPTGATGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVT 251
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T G T +T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 252 GPTGVTGPTGETGPTGVT------GATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVT 305
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T GAT +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 306 GPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGET--- 362
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T +T +G T T G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 363 GPTGVTGP---IGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGET 419
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT +T G +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 420 GATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVT 479
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G T T + + P + AT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 480 GPTGETGATGVT-----GPTG---ETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTG 531
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T +T GAT +T G T T G T +T GAT +T
Sbjct: 532 ETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGP 589
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/311 (28%), Positives = 111/311 (35%), Gaps = 21/311 (6%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
+G T T G T +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 371 IGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGV 430
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
G +T GAT +T G T +T GAT +T G T +T
Sbjct: 431 TGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVT------GPTGVTGPTGE 484
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
GAT +T GAT +T G T +T GAT +T G T +T
Sbjct: 485 TGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGE 544
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
GAT +T G T T G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 545 TGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGV 604
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------KVFTLGATELTAK 295
G T T G T +T GAT T GAT +T
Sbjct: 605 TGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGPTGVTGPTGETGPTGPTGPTGVTGATGVTGP 664
Query: 296 VFTLGATELTA 306
GAT L++
Sbjct: 665 TGPTGATILSS 675
Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/308 (27%), Positives = 107/308 (34%), Gaps = 27/308 (8%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T GAT +T GAT +T GAT +T G +T G
Sbjct: 385 PTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTG 444
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T G T +T GAT +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 445 ATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVT------GPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETG 498
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T G T +T GAT +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 499 ATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTG 558
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T G T +T GAT +T GAT +T G T T G
Sbjct: 559 PTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTG 618
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTA---------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELT---- 281
T +T GAT T GAT +T GAT L+
Sbjct: 619 PTGVTGPTGVTGATGPTGVTGPTGETGPTGPTGPTGVTGATGVTGPTGPTGATILSSLEN 678
Query: 282 --AKVFTL 287
A T
Sbjct: 679 SAANAVTA 686
>gi|402555349|ref|YP_006596620.1| hypothetical protein BCK_12595 [Bacillus cereus FRI-35]
gi|401796559|gb|AFQ10418.1| hypothetical protein BCK_12595 [Bacillus cereus FRI-35]
Length = 498
Score = 88.2 bits (217), Expect = 8e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 100/324 (30%), Positives = 122/324 (37%), Gaps = 6/324 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T GAT T G T +T G T +T G
Sbjct: 44 ATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGATGVTG 103
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T GAT +T GAT T + G T +T G T T + G
Sbjct: 104 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTG 163
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT +T GAT T GAT T GAT T + G
Sbjct: 164 ATGITGPTGATGATGVTGVT---GATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTG 220
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T +T GAT T GAT +T GAT T + G T +T G
Sbjct: 221 VTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTG 280
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL---TAKVF 297
T T + GAT +T GAT +T G T +T GAT + T
Sbjct: 281 VTGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGVTGATGATG 340
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
GAT +T + GAT +T S+
Sbjct: 341 PTGATGITGATGSTGATGVTGTSI 364
Score = 82.8 bits (203), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/308 (31%), Positives = 116/308 (37%), Gaps = 9/308 (2%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LG T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGI 95
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
GAT +T + GAT T GAT +T GAT T + G T +T
Sbjct: 96 TGATGVTGATGSTGATGPT------GATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGP 149
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
G T T + GAT +T GAT +T GAT T GAT T
Sbjct: 150 TGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVT---GATGPTGATGPTGATGPTGATGP 206
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
GAT T + G T +T GAT T GAT +T GAT T +
Sbjct: 207 TGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGP 266
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
G T +T G T T + GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 267 TGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGATGATGPTGVTGITGA 326
Query: 311 LGATELTA 318
GAT +T
Sbjct: 327 TGATGVTG 334
Score = 82.4 bits (202), Expect = 4e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/350 (31%), Positives = 131/350 (37%), Gaps = 20/350 (5%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
LG T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGI 95
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
GAT +T + GAT T GAT +T GAT T + G T +T
Sbjct: 96 TGATGVTGATGSTGATGPT------GATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGP 149
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
G T T + GAT +T GAT +T GAT T GAT T
Sbjct: 150 TGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVT---GATGPTGATGPTGATGPTGATGP 206
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
GAT T + G T +T GAT T GAT +T GAT T +
Sbjct: 207 TGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGP 266
Query: 311 LGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 370
G T +T + V P + AT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 267 TGVTGITGATGPTGVT--GPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGATGATGPTGVTGIT 324
Query: 371 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GAT +T GAT T GAT +T + GAT +T T
Sbjct: 325 GATGATGVT------GATGATGPT---GATGITGATGSTGATGVTGTSIT 365
Score = 82.4 bits (202), Expect = 4e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/313 (30%), Positives = 117/313 (37%), Gaps = 6/313 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T G T +T G T +T GAT T G
Sbjct: 56 ATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTG 115
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT T + G T +T G T T + GAT +T G
Sbjct: 116 ATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGATG 175
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T GAT T GAT T GAT T + G T +T G
Sbjct: 176 ATGVTGVT---GATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTG 232
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T GAT +T GAT T + G T +T G T T + G
Sbjct: 233 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTG 292
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVF 297
AT +T GAT +T G T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 293 ATGITGATGPTGATGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGVTGATGATGPTGATGITGATG 352
Query: 298 TLGATELTAKVFT 310
+ GAT +T T
Sbjct: 353 STGATGVTGTSIT 365
Score = 81.6 bits (200), Expect = 7e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/350 (30%), Positives = 128/350 (36%), Gaps = 20/350 (5%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
LG T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGI 95
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
GAT +T + GAT T GAT +T GAT T + G T +T
Sbjct: 96 TGATGVTGATGSTGATGPT------GATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGP 149
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
G T T + GAT +T GAT +T GAT T GAT T
Sbjct: 150 TGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVT---GATGPTGATGPTGATGPTGATGP 206
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
GAT T + G T +T GAT T GAT +T GAT T +
Sbjct: 207 TGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGP 266
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIV 334
G T +T G T T + GAT +T GAT +T + P +
Sbjct: 267 TGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGAT-----GATGPTGV- 320
Query: 335 PQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 384
T +T G T T GAT +T + GAT +T T
Sbjct: 321 -----TGITGATGATGVTGATGATGPTGATGITGATGSTGATGVTGTSIT 365
Score = 80.1 bits (196), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/352 (30%), Positives = 130/352 (36%), Gaps = 26/352 (7%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
LG T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGI 95
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
GAT +T + GAT T GAT +T GAT T + G T +T
Sbjct: 96 TGATGVTGATGSTGATGPT------GATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGP 149
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
G T T + GAT +T GAT +T GAT T GAT T
Sbjct: 150 TGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVT---GATGPTGATGPTGATGPTGATGP 206
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
GAT T + G T +T GAT T GAT +T GAT T ++
Sbjct: 207 TGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGP 266
Query: 323 LEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 382
V T +T G T T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 267 TGV--------------TGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGAT 312
Query: 383 FTLGATELTAKVFTLGATEL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
G T +T GAT + T GAT +T + GAT +T +I
Sbjct: 313 GATGPTGVTGITGATGATGVTGATGATGPTGATGITGATGSTGATGVTGTSI 364
>gi|376268663|ref|YP_005121375.1| Phage tail fiber protein [Bacillus cereus F837/76]
gi|364514463|gb|AEW57862.1| Phage tail fiber protein [Bacillus cereus F837/76]
Length = 883
Score = 84.7 bits (208), Expect = 8e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 108/422 (25%), Positives = 146/422 (34%), Gaps = 1/422 (0%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T +T G T +T G T T GAT T G
Sbjct: 295 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGV 354
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T GAT T + G T T + G+T +T G+T T + G
Sbjct: 355 TGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGV 414
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T + G T T G T T G+T +T G T T + G+
Sbjct: 415 TGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGS 474
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T T G+T T + G+T +T G+T +T G+
Sbjct: 475 TGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGS 534
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T T G
Sbjct: 535 TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGE 594
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAK-SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
T T G+T +T V E + AT T GAT T +
Sbjct: 595 TGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 654
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
G T T G T T GAT T ++GAT T G T +T +
Sbjct: 655 TGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGS 714
Query: 421 LG 422
G
Sbjct: 715 TG 716
Score = 83.2 bits (204), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/444 (25%), Positives = 157/444 (35%), Gaps = 17/444 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + G+T +T + G+T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 223 TGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 282
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T G T +T G T +T G T +T G T T GA
Sbjct: 283 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGA 342
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T GAT T + G T T + G+T +T G+
Sbjct: 343 TGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGS 402
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T + G T T + G T T G T T G+T +T G
Sbjct: 403 TGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGN 462
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T + G+T T G T T G+T T + G+T +T G+
Sbjct: 463 TGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGS 522
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN----SATELTAKVFTLGATELTAK 357
T +T G+T T ++ P N +T +T + G+T +T
Sbjct: 523 TGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTG------APGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGS 576
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
G+T T G T T G+T +T T +T + G+T +T
Sbjct: 577 TGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGN------TGVTGETGPTGSTGVTGS 630
Query: 418 VFTLGATELTAK-NIRSNTGTVGS 440
G+T +T NTG GS
Sbjct: 631 TGATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 654
Score = 82.0 bits (201), Expect = 5e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/426 (24%), Positives = 146/426 (34%), Gaps = 14/426 (3%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
T G T T G T T + G+T +T + G+T +T G T
Sbjct: 201 PTGSTGPTGETGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETG 260
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+T G T +T G T +T G T +T G T +T G T
Sbjct: 261 VTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETG 320
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+T G T T GAT T G T T GAT T + G T
Sbjct: 321 VTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTG 380
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
T + G+T +T G+T T + G T T + G T T G T
Sbjct: 381 STGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTG 440
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T G+T +T G T T + G+T T G T T G+T
Sbjct: 441 PTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTG 500
Query: 304 LTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 363
T + G+T +T + + +T +T G+T T + + G+
Sbjct: 501 PTGETGPTGSTGVTGNTGLT--------------GSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGS 546
Query: 364 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
T G+T +T + G+T +T G+T T G T T G+
Sbjct: 547 TGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGS 606
Query: 424 TELTAK 429
T +T
Sbjct: 607 TGVTGN 612
Score = 81.6 bits (200), Expect = 8e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 104/428 (24%), Positives = 147/428 (34%), Gaps = 20/428 (4%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T +T G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 271 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 330
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T GAT T G T T GAT T + G T T + G+
Sbjct: 331 TGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGS 390
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T +T G+T T + G T T + G T T G T T G+
Sbjct: 391 TGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGS 450
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T +T G T T + G+T T G T T G+T T + G+
Sbjct: 451 TGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGS 510
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T +T G+T +T G+T T + + G+T G+T +T + G+
Sbjct: 511 TGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGS 570
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T +T G+T T T T + G+T +T
Sbjct: 571 TGVTGSTGPTGSTGPTGN--------------------TGPTGETGATGSTGVTGSTGVT 610
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T +T + G+T +T G+T +T G T T G T T +
Sbjct: 611 GNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPT 670
Query: 422 GATELTAK 429
G+T T
Sbjct: 671 GSTGATGN 678
Score = 75.9 bits (185), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 99/398 (24%), Positives = 141/398 (35%), Gaps = 23/398 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T GAT T + G T T + G+T +T G
Sbjct: 342 ATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTG 401
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T T + G T T + G T T G T T G+T +T G
Sbjct: 402 STGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATG 461
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T + G+T T G T T G+T T + G+T +T G
Sbjct: 462 NTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTG 521
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+T +T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G
Sbjct: 522 STGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTG 581
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
+T T G T T G+T +T T +T + G+T +T G
Sbjct: 582 STGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGN------TGVTGETGPTGSTGVTGSTGATG 635
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
+T +T G T T + + AT T + GAT T
Sbjct: 636 STGVTGNTGATGNTGATGSTGVTG-----------NTGATGETGPTGSTGATGNT----- 679
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
GAT T ++GAT T G T +T + G
Sbjct: 680 -GATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGSTG 716
Score = 68.9 bits (167), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 100/389 (25%), Positives = 138/389 (35%), Gaps = 19/389 (4%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
T G T T G T T + G+T +T + G+T +T G T
Sbjct: 201 PTGSTGPTGETGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETG 260
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
+T G T +T G T +T G T +T G T +T G T
Sbjct: 261 VTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETG 320
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
+T G T T GAT T G T T GAT T + G T
Sbjct: 321 VTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTG 380
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
T + G+T +T G T T + G+T +T G+T T + G T
Sbjct: 381 STGETGATGSTGVTGNT---GPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTG 437
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA 351
T + GAT T + GAT T + + P S T T G
Sbjct: 438 NTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATG----------ETGPTGS-TGATGNTGATGE 486
Query: 352 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
T T G+T T + G+T +T G+T +T G+T T + + G+
Sbjct: 487 TGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGS 546
Query: 412 TELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGS 440
T G+T +T NTG+ GS
Sbjct: 547 TGAPGNTGATGSTGVTG-----NTGSTGS 570
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/335 (23%), Positives = 108/335 (32%), Gaps = 35/335 (10%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KVFTLGATELTAKV 152
G+T +T G+T +T + G T T
Sbjct: 155 GSTGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGGTGNTGSTGETGPTGSTGPTGETGAT 214
Query: 153 FTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 209
+ GAT T ++ G+T +T + G+T +T G T +T G T +T
Sbjct: 215 GSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVT 274
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 269
G T +T G T +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 275 GSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPT 334
Query: 270 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYK 329
GAT T G T T GAT T + G T T E
Sbjct: 335 GSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTG-----ETGATG 389
Query: 330 PIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 389
+ T T + G+T +T G+T T + G T T + GAT
Sbjct: 390 STGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATG 449
Query: 390 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
T + GAT T G T T GAT
Sbjct: 450 STGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGAT 484
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.75, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/327 (23%), Positives = 105/327 (32%), Gaps = 35/327 (10%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KVFTLGATELTAKV 164
G+T +T G+T +T + G T T
Sbjct: 155 GSTGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGGTGNTGSTGETGPTGSTGPTGETGAT 214
Query: 165 FTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 221
+ GAT T ++ G+T +T + G+T +T G T +T G T +T
Sbjct: 215 GSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVT 274
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
G T +T G T +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 275 GSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPT 334
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE 341
GAT T G T T GAT T P + AT
Sbjct: 335 GSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGA-----TGSTGPTGSTGETGATG 389
Query: 342 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 401
T G T T + G+T +T G+T T + G T T + GAT
Sbjct: 390 STGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATG 449
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
T + GAT T G T T
Sbjct: 450 STGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTG 476
>gi|261326520|emb|CBH09481.1| hypothetical protein, conserved [Trypanosoma brucei gambiense
DAL972]
Length = 1076
Score = 83.6 bits (205), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 146/416 (35%), Positives = 181/416 (43%), Gaps = 110/416 (26%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
T+ ATE+ + ATE T+ ATE+ L ATE T+ ATE+ V
Sbjct: 281 TVEATEVAETAEAINATE------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATEVAETVE 328
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE
Sbjct: 329 ALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------ 370
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V
Sbjct: 371 TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVE 418
Query: 190 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
L ATE T+ ATE+ L ATE T+ ATE+ V L ATE
Sbjct: 419 ALNATE------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------ 460
Query: 250 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 309
T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V
Sbjct: 461 TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVE 508
Query: 310 TLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 369
+ ATE ATE+ L ATE T+ ATE+
Sbjct: 509 AINATETV--------------------EATEVAETAEALNATE------TVEATEVAEA 542
Query: 370 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE
Sbjct: 543 VEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE 586
Score = 80.9 bits (198), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 146/413 (35%), Positives = 183/413 (44%), Gaps = 110/413 (26%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
ATE+ + ATE T+ ATE+ L ATE T+ ATE+ V L
Sbjct: 284 ATEVAETAEAINATE------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATEVAETVEALN 331
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+
Sbjct: 332 ATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVE 373
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L
Sbjct: 374 ATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALN 421
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
ATE T+ ATE+ L ATE T+ ATE+ V L ATE T+
Sbjct: 422 ATE------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVE 463
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V +
Sbjct: 464 ATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEAIN 511
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
ATE T+ ATE+ + L +ATE T+ ATE+ V
Sbjct: 512 ATE------TVEATEVAETAEAL--------------NATE------TVEATEVAEAVEA 545
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE
Sbjct: 546 LNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE 586
Score = 78.6 bits (192), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 147/423 (34%), Positives = 186/423 (43%), Gaps = 88/423 (20%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V
Sbjct: 173 TVEATEVAETVEALNATE------TVEATEVAETVEALNATE------TVEATEVAETVE 220
Query: 70 TLGAT------ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
L AT E+ V L ATE T+ ATE+ V + ATE + E
Sbjct: 221 ALNATETVETMEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEIVEAVNATETVETMEVAETVE 274
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T+ ATE+ + ATE T+ ATE+ L ATE T+ ATE
Sbjct: 275 ADDATETVEATEVAETAEAINATE------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATE 322
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE
Sbjct: 323 VAETVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE 370
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE
Sbjct: 371 ------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATE 412
Query: 304 LTAKVFTLGATELTAKSVILE-VEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+ V L ATE + + E E + V ATE+ V L ATE T+
Sbjct: 413 VAEAVEALNATETVEATEVAETAEALNATETV---EATEVAEAVEALNATE------TVE 463
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V +
Sbjct: 464 ATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEAIN 511
Query: 423 ATE 425
ATE
Sbjct: 512 ATE 514
Score = 76.3 bits (186), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 147/423 (34%), Positives = 185/423 (43%), Gaps = 88/423 (20%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT------ELTAKVFTLGATE 63
T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L AT E+ V L ATE
Sbjct: 191 TVEATEVAETVEALNATE------TVEATEVAETVEALNATETVETMEVAEAVEALNATE 244
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
T+ ATE+ V + ATE + E T+ ATE+ + ATE
Sbjct: 245 ------TVEATEVAEIVEAVNATETVETMEVAETVEADDATETVEATEVAETAEAINATE 298
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T+ ATE+ L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE
Sbjct: 299 ------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATEVAETVEALNATE------TVEATE 340
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE
Sbjct: 341 VAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE 388
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE
Sbjct: 389 ------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATE 430
Query: 304 LTAKVFTLGATE-LTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+ L ATE + A V VE + V ATE+ V L ATE T+
Sbjct: 431 VAETAEALNATETVEATEVAEAVEALNATETV---EATEVAEAVEALNATE------TVE 481
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
ATE+ V L ATE T+ ATE+ V + ATE T+ ATE+ L
Sbjct: 482 ATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEAINATE------TVEATEVAETAEALN 529
Query: 423 ATE 425
ATE
Sbjct: 530 ATE 532
Score = 75.9 bits (185), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 147/423 (34%), Positives = 185/423 (43%), Gaps = 88/423 (20%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
T+ ATE+ + ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V
Sbjct: 155 TVEATEVAETAEAINATE------TVEATEVAETVEALNATE------TVEATEVAETVE 202
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
L ATE T+ ATE+ V L ATE + V L ATE T+ ATE
Sbjct: 203 ALNATE------TVEATEVAETVEALNATETVETMEVAEAVEALNATE------TVEATE 250
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+ V + ATE + E T+ ATE+ + ATE T+ ATE
Sbjct: 251 VAEIVEAVNATETVETMEVAETVEADDATETVEATEVAETAEAINATE------TVEATE 304
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE
Sbjct: 305 VAETAEALNATE------TVEATEVAETVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE 352
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE
Sbjct: 353 ------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATE 394
Query: 304 LTAKVFTLGATE-LTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+ V L ATE + A V VE + V ATE+ L ATE T+
Sbjct: 395 VAEAVEALNATETVEATEVAEAVEALNATETV---EATEVAETAEALNATE------TVE 445
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L
Sbjct: 446 ATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALN 493
Query: 423 ATE 425
ATE
Sbjct: 494 ATE 496
Score = 73.2 bits (178), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 149/430 (34%), Positives = 189/430 (43%), Gaps = 100/430 (23%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
E+ V L ATE T+ ATE+ V + ATE + E T+ AT
Sbjct: 232 EVAEAVEALNATE------TVEATEVAEIVEAVNATETVETMEVAETVEADDATETVEAT 285
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
E+ + ATE T+ ATE+ L ATE T+ ATE+ V L AT
Sbjct: 286 EVAETAEAINATE------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATEVAETVEALNAT 333
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
E T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ AT
Sbjct: 334 E------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEAT 375
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
E+ V L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+ V L AT
Sbjct: 376 EVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVAEAVEALNAT 423
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
E T+ ATE+ L ATE T+ ATE+ V L ATE T+ AT
Sbjct: 424 E------TVEATEVAETAEALNATE------TVEATEVAEAVEALNATE------TVEAT 465
Query: 303 ELTAKVFTLGATE-LTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
E+ V L ATE + A V VE +ATE T+ ATE+ V +
Sbjct: 466 EVAEAVEALNATETVEATEVAEAVEAL---------NATE------TVEATEVAEAVEAI 510
Query: 362 GATELTAKVFTLGATEL--TAKVF----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 415
ATE T+ ATE+ TA+ T+ ATE+ V L ATE T+ ATE+
Sbjct: 511 NATE------TVEATEVAETAEALNATETVEATEVAEAVEALNATE------TVEATEVA 558
Query: 416 AKVFTLGATE 425
V L ATE
Sbjct: 559 EAVEALNATE 568
>gi|407707041|ref|YP_006830626.1| Small, acid-soluble spore protein B [Bacillus thuringiensis MC28]
gi|407384726|gb|AFU15227.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
MC28]
Length = 723
Score = 82.8 bits (203), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/267 (32%), Positives = 99/267 (37%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 454
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
AT +T GAT +T GAT
Sbjct: 455 ATGITGATGITGATGITGATGITGATG 481
Score = 82.8 bits (203), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/267 (32%), Positives = 99/267 (37%)
Query: 37 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 454
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
AT +T GAT +T GAT
Sbjct: 455 ATGITGATGITGATGITGATGITGATG 481
Score = 82.8 bits (203), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/267 (32%), Positives = 99/267 (37%)
Query: 49 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 454
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 315
AT +T GAT +T GAT
Sbjct: 455 ATGITGATGITGATGITGATGITGATG 481
Score = 78.6 bits (192), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/250 (32%), Positives = 93/250 (37%)
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 454
Query: 313 ATELTAKSVI 322
AT +T + I
Sbjct: 455 ATGITGATGI 464
Score = 74.7 bits (182), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/281 (30%), Positives = 100/281 (35%), Gaps = 14/281 (4%)
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILE 324
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T + I
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGIT- 453
Query: 325 VEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 365
AT +T GAT +T GAT
Sbjct: 454 -------------GATGITGATGITGATGITGATGITGATG 481
Score = 74.7 bits (182), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/281 (30%), Positives = 100/281 (35%), Gaps = 14/281 (4%)
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T + I
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGIT------------- 441
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 377
AT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 442 -GATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATG 481
Score = 74.7 bits (182), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/281 (30%), Positives = 100/281 (35%), Gaps = 14/281 (4%)
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFT 348
AT +T GAT +T GAT +T + I AT +T
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGIT--------------GATGITGATGI 440
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 389
GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 441 TGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATG 481
Score = 74.7 bits (182), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/281 (30%), Positives = 100/281 (35%), Gaps = 14/281 (4%)
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 313 ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 372
AT +T + I AT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 395 ATGITGATGIT--------------GATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGI 440
Query: 373 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 441 TGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATG 481
Score = 73.6 bits (179), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/272 (30%), Positives = 97/272 (35%), Gaps = 8/272 (2%)
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
AT T GAT T G T T GAT T G T T G
Sbjct: 215 ATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGATG 274
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T T G T T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
AT T GAT +T GAT T GAT +T + I
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGIT------- 387
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 388 -GATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGI 446
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 447 TGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 478
>gi|163941394|ref|YP_001646278.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus
weihenstephanensis KBAB4]
gi|163863591|gb|ABY44650.1| Collagen triple helix repeat [Bacillus weihenstephanensis KBAB4]
Length = 936
Score = 80.5 bits (197), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 124/457 (27%), Positives = 132/457 (28%), Gaps = 17/457 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T GAT T GAT T GAT T G
Sbjct: 171 ATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTG 230
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T GAT T GAT T GAT T GAT G
Sbjct: 231 ATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGAIGPRGNTG 290
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T GAT T GAT T GAT T G T T G
Sbjct: 291 ATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGSTGPQGAQGNTGATGPQGVQG 350
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTLGATELTA 234
T T G T T G T T GAT T G T T
Sbjct: 351 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGLQGNTGATGSTGPQGAQGNTGATG 410
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
G T T G T + G L G+T GAT
Sbjct: 411 PQGVQGNTGATGSTGPQGLQGNTGATGSTGPQGLQGNTGATGSTGPQGAQGNTGATGPQG 470
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY----KPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
GAT T G T T + V+ P + AT T G
Sbjct: 471 VQGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQG 530
Query: 351 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTLGATELTA 404
T T G T T G T T GAT GAT T
Sbjct: 531 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTG 590
Query: 405 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KNIRSNTGTVGS 440
G T T G T T + ++ NTG GS
Sbjct: 591 PQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGS 627
Score = 79.3 bits (194), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 122/440 (27%), Positives = 128/440 (29%), Gaps = 26/440 (5%)
Query: 21 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 80
F G T T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 155 FGRGPTGPTGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPR 214
Query: 81 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 140
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 215 GNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPR 274
Query: 141 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 200
GAT GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 275 GNTGATGAIGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGSTGPQ 334
Query: 201 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GAT 254
G T T G T T G T T G T T GAT
Sbjct: 335 GAQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGLQGNTGAT 394
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTLGATELTAKV 308
T G T T G T T GAT T G T T
Sbjct: 395 GSTGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGLQGNTGATGSTGPQGLQGNTGATGST 454
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYY-------KPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
GA T + V+ P + AT T G T T
Sbjct: 455 GPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGPQGVQ 514
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T T G T GAT GAT GAT T
Sbjct: 515 GNTGATGSTGPQGVQGNT------GATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQ 568
Query: 422 GATELTA-KNIRSNTGTVGS 440
G T T + ++ NTG GS
Sbjct: 569 GNTGATGPQGVQGNTGATGS 588
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/419 (24%), Positives = 110/419 (26%), Gaps = 11/419 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT GAT T GAT T GAT T G
Sbjct: 267 ATGATGPRGNTGATGAIGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTG 326
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVF 117
AT T G T T G T T G T T GAT T
Sbjct: 327 ATGSTGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQG 386
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
G T T GA T G T + G L G+T
Sbjct: 387 LQGNTGATGSTGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGLQGNTGATGSTGPQGLQG 446
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT T G T T G T T G T + G +
Sbjct: 447 NTGATGSTGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNTG 506
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G + G+T GAT GAT GAT T
Sbjct: 507 ATGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQG 566
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
G T T G T T + V+ AT GAT
Sbjct: 567 VQGNTGATGPQGVQGNTGATGSTGPQGVQGNT--------GATGPQGAQGNTGATGPQGV 618
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
GAT T G T T T G T T G T T G T T
Sbjct: 619 QGNTGATGSTGPQGVQGNTGATGPQGTQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 677
>gi|196032756|ref|ZP_03100169.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus W]
gi|195994185|gb|EDX58140.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus W]
Length = 1297
Score = 80.1 bits (196), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/462 (24%), Positives = 151/462 (32%), Gaps = 44/462 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + G T T + G+T T G+T +T + GAT T G
Sbjct: 654 ATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATG 713
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVF 117
T T G T T + G+T T + + G T T GAT T
Sbjct: 714 NTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTG 773
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
+ GAT T GAT T G T T + G T T + G+T T
Sbjct: 774 STGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTG 833
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--------------- 222
G T +T + G T T + GAT T G T T
Sbjct: 834 ATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTG 893
Query: 223 ------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G+T +T GAT T + G T T + G+T +T
Sbjct: 894 GTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGATGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTG 953
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
G+T T G T T G+T T G+T +T +
Sbjct: 954 NTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGVTGSTGATG------ 1007
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGA 387
AT T GAT T + GAT T G+T +T G+
Sbjct: 1008 -----NTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGS 1062
Query: 388 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T +T GAT T + G T T ++GAT T
Sbjct: 1063 TGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSIGATGATGS 1104
Score = 77.8 bits (190), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 119/459 (25%), Positives = 153/459 (33%), Gaps = 50/459 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T + GAT T G T T G T T + G+T T + + G
Sbjct: 690 STGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTG 749
Query: 61 ATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
T T GAT T + GAT T GAT T G T T +
Sbjct: 750 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETG 809
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
G T T + G+T T G T +T + G T T + GAT T
Sbjct: 810 ATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATG 869
Query: 178 TLGATELTA---------------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
G T T G+T +T GAT T
Sbjct: 870 ETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGATGPTG 929
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
+ G T T + G+T +T + GAT T GAT T + GAT
Sbjct: 930 ETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATG 989
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEY 327
T + G T T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 990 NTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGP-----TGE 1044
Query: 328 YKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 387
P +T +T G+T +T GAT T + G T T ++GA
Sbjct: 1045 TGPTG------STGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSIGA 1098
Query: 388 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T T G+T T GAT T + GAT +
Sbjct: 1099 TGATGSTGPTGSTGAT------GATGSTGPTGSTGATGV 1131
Score = 77.8 bits (190), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/461 (25%), Positives = 151/461 (32%), Gaps = 44/461 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T G+T +T + GAT T G T T G T T + G
Sbjct: 678 STGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTG 737
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+T T + + G T T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 738 STGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATG 797
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
G T T + G T T + G+T T G T +T + G T T
Sbjct: 798 NTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTG 857
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KVFTLGATELTA 210
+ GAT T G T T G+T +T
Sbjct: 858 STGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTG 917
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATE 267
GAT T + G T T + G+T +T + GAT T GAT
Sbjct: 918 NTGATGATGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATG 977
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEY 327
T + GAT T + G T T GAT T GAT T +
Sbjct: 978 STGVTGSTGATGNTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATG 1037
Query: 328 YKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 387
T T + G+T +T G+T +T GAT T + G
Sbjct: 1038 N-----------TGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGV 1086
Query: 388 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
T T ++GAT T G+T T + G T T
Sbjct: 1087 TGSTGATGSIGATGATGSTGPTGSTGATGATGSTGPTGSTG 1127
Score = 77.4 bits (189), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/466 (24%), Positives = 152/466 (32%), Gaps = 37/466 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVF 57
+T T G+T +T G+T +T G AT T + G T T +
Sbjct: 615 STGATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETG 674
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
G+T T G+T +T + GAT T G T T G T T +
Sbjct: 675 VTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIG 734
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
G+T T + + G T T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 735 PTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTG 794
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
G T T + G T T + G+T T G T +T + G T T
Sbjct: 795 ATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTG 854
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------------KVFTLGATE 267
+ GAT T G T T G+T
Sbjct: 855 PTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTG 914
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVILEVE 326
+T GAT T + G T T + G+T +T G+T T E
Sbjct: 915 VTGNTGATGATGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETG 974
Query: 327 YYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 386
+ AT T + G T T GAT T GAT T + G
Sbjct: 975 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTG 1034
Query: 387 ATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
AT T G+T +T G+T +T GAT T
Sbjct: 1035 ATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGP 1080
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/318 (27%), Positives = 112/318 (35%), Gaps = 6/318 (1%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + G T T GAT T + G T T + G+T T G+T +
Sbjct: 541 TGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGV 600
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T + GAT T GAT T + G T T + G T T GAT
Sbjct: 601 TGNTGSTGATGPTGST---GATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGS 657
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T + G T T + G+T T G+T +T + GAT T G T
Sbjct: 658 TGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGA 717
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGA 241
T G T T + G+T T + + G T T GAT T + GA
Sbjct: 718 TGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGA 777
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T GAT T G T T + G T T + G+T T G
Sbjct: 778 TGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGE 837
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAK 319
T +T + G T T
Sbjct: 838 TGVTGPTGSTGVTGSTGP 855
Score = 67.0 bits (162), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 90/343 (26%), Positives = 118/343 (34%), Gaps = 20/343 (5%)
Query: 41 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 100
T + G T T GAT T + G T T + G+T T G+T +
Sbjct: 541 TGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGV 600
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 160
T + GAT T GAT T + G T T + G T T GAT
Sbjct: 601 TGNTGSTGATGPTGST---GATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGS 657
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 220
T + G T T + G+T T G+T +T + GAT T G T
Sbjct: 658 TGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGA 717
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGA 277
T G T T + G+T T + + G T T GAT T + GA
Sbjct: 718 TGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGA 777
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN 337
T T GAT T G T T + G T T ++ +
Sbjct: 778 TGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTG------------- 824
Query: 338 SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
+T T G T +T + G T T + GAT T
Sbjct: 825 -STGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTG 866
Score = 62.0 bits (149), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/320 (26%), Positives = 109/320 (34%), Gaps = 8/320 (2%)
Query: 113 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 172
T + G T T GAT T + G T T + G+T T G+T +
Sbjct: 541 TGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGV 600
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
T + GAT T GAT T + G T T + G T T GAT
Sbjct: 601 TGNTGSTGATGPTGST---GATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGS 657
Query: 233 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 292
T + G T T + G+T T G+T +T + GAT T G T
Sbjct: 658 TGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGA 717
Query: 293 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP---IKIVPQNSATELTAKVFTL 349
T G T T + G+T T + P + AT T +
Sbjct: 718 TGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGE--TGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGST 775
Query: 350 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 409
GAT T GAT T G T T + G T T + G+T T
Sbjct: 776 GATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGAT 835
Query: 410 GATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T +T + G T T
Sbjct: 836 GETGVTGPTGSTGVTGSTGP 855
Score = 55.5 bits (132), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/232 (27%), Positives = 82/232 (35%), Gaps = 3/232 (1%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G+T +T G T T +G T T GAT T + G T T +
Sbjct: 194 GSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVT 253
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T T G+T +T + GAT T G T T G T T +
Sbjct: 254 GSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPT 313
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 200
G+T T + + G T T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 314 GSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGAT 373
Query: 201 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
G T T + G T T + G+T T G T +T + G
Sbjct: 374 GNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTG 425
Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/231 (26%), Positives = 81/231 (35%), Gaps = 3/231 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T G T T +G T T GAT T + G T T + G
Sbjct: 195 STGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTG 254
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T T G+T +T + GAT T G T T G T T + G
Sbjct: 255 STGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTG 314
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
+T T + + G T T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 315 STGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATG 374
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
G T T + G T T + G+T T G T +T + G
Sbjct: 375 NTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTG 425
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/249 (24%), Positives = 83/249 (33%), Gaps = 17/249 (6%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G+T +T G T T +G T T GAT T + G T T +
Sbjct: 194 GSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVT 253
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G+T T G+T +T + GAT T G T T G T T +
Sbjct: 254 GSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPT 313
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G+T T + + G T T G T T + G+T T + +
Sbjct: 314 GSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGV------------- 360
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
T T + GAT T + G T T G T +T G T T +
Sbjct: 361 ----TGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETG 416
Query: 396 TLGATELTA 404
G T T
Sbjct: 417 VTGPTGSTG 425
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/255 (25%), Positives = 86/255 (33%), Gaps = 23/255 (9%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G+T +T G T T +G T T GAT T + G T T +
Sbjct: 194 GSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVT 253
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G+T T G+T +T + GAT T G+T T G+T +T
Sbjct: 254 GSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPT------GSTGATGNTGATGSTGVTGNTGAT 307
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GA T G T T G+T +T + AT T
Sbjct: 308 GAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNT-----------------GATGETGPTG 350
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
+ GAT T GAT T G T T + G T T + G+T T
Sbjct: 351 STGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTG 410
Query: 408 TLGATELTAKVFTLG 422
G T +T + G
Sbjct: 411 ATGETGVTGPTGSTG 425
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/241 (26%), Positives = 81/241 (33%), Gaps = 8/241 (3%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G+T +T G T T +G T T GAT T + G T T +
Sbjct: 194 GSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVT 253
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G+T T G+T +T + GAT T G T T G T T +
Sbjct: 254 GSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPT 313
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
G+T T + + G T T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 314 GSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGA- 372
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
P + AT T G T T GAT T G+T +T
Sbjct: 373 ----TGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTG 428
Query: 381 K 381
Sbjct: 429 S 429
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/228 (27%), Positives = 79/228 (34%), Gaps = 15/228 (6%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G+T +T G T T +G T T GAT T + G T T +
Sbjct: 194 GSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVT 253
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
G+T T G+T +T + GAT T G+T T G+T +T +
Sbjct: 254 GSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPT------GSTGATGNTGATGSTGVTGNTGAT 307
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNS--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
I P S AT T G T T GAT T + GAT T
Sbjct: 308 GA-------IGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGV 360
Query: 382 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT T G T T + G T T + G+T T
Sbjct: 361 TGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGN 408
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/213 (25%), Positives = 70/213 (32%), Gaps = 25/213 (11%)
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G+T +T G T T +G T T GAT T + G T T +
Sbjct: 194 GSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVT 253
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G+T T G+T +T + GAT T T T
Sbjct: 254 GSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGS--------------------TGATGNTG 293
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
G+T +T GA T G T T G+T +T G T T
Sbjct: 294 ATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTG 353
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGS 440
G+T +T G+T T NTG GS
Sbjct: 354 ATGSTGVTGNTGATGSTGATG-----NTGPTGS 381
>gi|407475204|ref|YP_006789604.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium acidurici 9a]
gi|407051712|gb|AFS79757.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium acidurici 9a]
Length = 692
Score = 79.7 bits (195), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/429 (24%), Positives = 135/429 (31%), Gaps = 14/429 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
A +T G T T + G T T G T T +G+T T +G
Sbjct: 138 ANGMTGPTGATGITGATGPTGSRGNTGSTGATGITGPTGSTGSTGAMGSTGPTGATGVIG 197
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T + G T T ++G T T +G T T G T G
Sbjct: 198 ATGPTGNIGATGPTGSTGATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGADGVTGPTGPRGNTGADG 257
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T + + G T GAT T G T + G T G
Sbjct: 258 ATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDT---GPTGSNGPIGPTGPTGADGPTGPTG 314
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
A +T + G+T GAT T GAT T G T G
Sbjct: 315 ADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGETGPVGATGATG 374
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
A T + GAT T G T +T +G T GAT T G
Sbjct: 375 ADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGATGETGPTGATG 434
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
T GAT T ++ + AT + G+T T +
Sbjct: 435 PTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGAT-----------GATGADGATGSTGSTGATGATGS 483
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GAT T +GAT T + GA T GAT T + G+T T
Sbjct: 484 DGATGPTGATGAVGATGPTGSIGATGADGATGSTGPTGATGATGANGSTGSTGATGATGA 543
Query: 421 LGATELTAK 429
GAT T
Sbjct: 544 DGATGPTGP 552
Score = 74.7 bits (182), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 105/406 (25%), Positives = 133/406 (32%), Gaps = 16/406 (3%)
Query: 32 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 91
+ GA +T G T T + G T T G T T +G+T T
Sbjct: 133 IGPTGANGMTGPTGATGITGATGPTGSRGNTGSTGATGITGPTGSTGSTGAMGSTGPTGA 192
Query: 92 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 151
+GAT T + G T T ++G T T +G T T G T
Sbjct: 193 TGVIGATGPTGNIGATGPTGSTGATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGADGVTGPTGPRGN 252
Query: 152 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
GAT T + + G T GAT T G T + G T
Sbjct: 253 TGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDT---GPTGSNGPIGPTGPTGADGP 309
Query: 212 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
GA +T + G+T GAT T GAT T G T
Sbjct: 310 TGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGETGPVGA 369
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL---TAKVFTLGATELT-AKSVILEVEY 327
GA T + GAT T G T + T ++ +GAT T A E
Sbjct: 370 TGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGATGETGP 429
Query: 328 YKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLGATELTAKVFT 384
+ AT T GAT T + GAT T + G+T T +
Sbjct: 430 TGATGPTGSDGATGPT------GATGATGEAGVAGATGATGADGATGSTGSTGATGATGS 483
Query: 385 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKN 430
GAT T +GAT T + GA T GAT T N
Sbjct: 484 DGATGPTGATGAVGATGPTGSIGATGADGATGSTGPTGATGATGAN 529
Score = 68.2 bits (165), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 104/410 (25%), Positives = 129/410 (31%), Gaps = 26/410 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T T +G+T T +GAT T + G T T ++G T T +
Sbjct: 173 GPTGSTGSTGAMGSTGPTGATGVIGATGPTGNIGATGPTGSTGATGSIGNTGPTGADGVI 232
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T GAT T + + G T GAT T
Sbjct: 233 GPTGATGADGVTGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDT--- 289
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T + G T GA +T + G+T GAT T
Sbjct: 290 GPTGSNGPIGPTGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGAD 349
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T G T GA T + GAT T G T +T +
Sbjct: 350 GATGATGADGPTGETGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEI 409
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T GAT T G T GAT T + GAT T
Sbjct: 410 GPVGATGATGADGATGETGPTGATGPTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGATGATGADGAT 469
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G+T T + + AT T +GAT T ++GAT
Sbjct: 470 GSTGSTGATGATGSD-----------GATGPTGATGAVGATGPTG---SIGAT------- 508
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
GA T GAT T + G+T T GAT T L
Sbjct: 509 --GADGATGSTGPTGATGATGANGSTGSTGATGATGADGATGPTGPAGGL 556
Score = 62.8 bits (151), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 81/313 (25%), Positives = 100/313 (31%), Gaps = 3/313 (0%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GA T +G+T T G T T G T + G
Sbjct: 244 TGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGPIGPTGP 303
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T GA +T + G+T GAT T GAT T G
Sbjct: 304 TGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGE 363
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTAKVFT 178
T GA T + GAT T G T +T ++ +GAT T
Sbjct: 364 TGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGA 423
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G T T G+ T GAT GAT + G+T T +
Sbjct: 424 TGETGPTGATGPTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGATGATGADGATGSTGSTGATGATGS 483
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT T +GAT T + GA T GAT T + G+T T
Sbjct: 484 DGATGPTGATGAVGATGPTGSIGATGADGATGSTGPTGATGATGANGSTGSTGATGATGA 543
Query: 299 LGATELTAKVFTL 311
GAT T L
Sbjct: 544 DGATGPTGPAGGL 556
>gi|68482880|ref|XP_714666.1| putative cell wall adhesin [Candida albicans SC5314]
gi|33310026|gb|AAQ03243.1|AF414112_1 putative cell wall protein FLO11p [Candida albicans]
gi|46436253|gb|EAK95619.1| putative cell wall adhesin [Candida albicans SC5314]
Length = 1121
Score = 79.7 bits (195), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 136/449 (30%), Positives = 171/449 (38%), Gaps = 47/449 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
ATE T + ATE T + ATE T +TE T + ATE T +
Sbjct: 233 ATESTPATKSTPATESTPATESTPATESTPCTT---STESTPATESTPATESTPATESTP 289
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVF 117
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 290 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATE 349
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 350 STPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 409
Query: 175 KVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLG 228
+ +TE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 410 ATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTP 469
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
ATE T + ATE T + ATE T + +TE T + ATE T
Sbjct: 470 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATE 529
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAK 345
+ ATE T + ATE T + ATE T ATE T
Sbjct: 530 STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP--------------------ATESTPA 569
Query: 346 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---------TLGATELTAKVFT 396
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 570 TESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPATES 629
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
ATE T + ATE T + ATE
Sbjct: 630 TPATESTPATESTPATESTPATESTPATE 658
Score = 79.0 bits (193), Expect = 5e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 120/386 (31%), Positives = 152/386 (39%), Gaps = 32/386 (8%)
Query: 49 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 197 STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATKSTPATESTPATESTP 256
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
ATE T +TE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 257 ATESTPCTT---STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 313
Query: 169 ATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 314 ATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT 373
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T +TE T
Sbjct: 374 ---STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT---STESTPATE 427
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAK 345
+ ATE T + ATE T + ATE T P ++TE T
Sbjct: 428 STPATESTPATESTPATESTPATESTPATEST-----------------PCTTSTESTPA 470
Query: 346 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 402
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE
Sbjct: 471 TESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATES 530
Query: 403 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
T + ATE T + ATE T
Sbjct: 531 TPATESTPATESTPATESTPATESTP 556
Score = 62.0 bits (149), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 100/324 (30%), Positives = 128/324 (39%), Gaps = 21/324 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T +TE T +
Sbjct: 374 STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT---STESTPATESTP 430
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
ATE T + ATE T + ATE T +TE T + ATE T +
Sbjct: 431 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT---STESTPATESTPATESTPATESTP 487
Query: 121 ATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 488 ATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATE 547
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 548 STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT 607
Query: 238 ---------TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 608 STETTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTE 667
Query: 289 AT---ELTAKVFTLGATELTAKVF 309
T E TA T +T + + V
Sbjct: 668 TTPATESTASTETASSTPVESTVI 691
>gi|238883813|gb|EEQ47451.1| predicted protein [Candida albicans WO-1]
Length = 2013
Score = 79.3 bits (194), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 132/446 (29%), Positives = 168/446 (37%), Gaps = 44/446 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 197 STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 256
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
ATE T +TE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 257 ATESTPCTT---STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 313
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 314 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATE 373
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
+ ATE T + ATE T + T+ T + +T T T ATE T
Sbjct: 374 STPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTQATESIPATKSTPCTPSTETTPATESTPATE 433
Query: 238 TLGATELTA---------------KVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE
Sbjct: 434 STPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATE 493
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA 339
T + ATE T + ATE T + ATE T P +
Sbjct: 494 STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATEST-----------------PATES 536
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
T T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 537 TPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT---S 593
Query: 400 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
TE T + ATE T + ATE
Sbjct: 594 TESTPATESTPATESTPATESTPATE 619
Score = 75.1 bits (183), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/440 (29%), Positives = 163/440 (37%), Gaps = 53/440 (12%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1025 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT--- 1081
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVF 117
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1082 STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTE 1141
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTA---------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1142 STPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1201
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+ ATE T + ATE T + +TE T + ATE T + ATE
Sbjct: 1202 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATE 1261
Query: 220 LTAKVF---------TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1262 STPCTTSTETTPATASTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1321
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 1322 ATESTPATESTPCTTSTETTPATEGTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT 1381
Query: 322 ILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
E ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1382 STE-----------STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPA 1430
Query: 382 VFTLGATELTAKVFTLGATE 401
+ ATE T + ATE
Sbjct: 1431 TESTPATESTPATESTPATE 1450
Score = 72.0 bits (175), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/372 (30%), Positives = 144/372 (38%), Gaps = 19/372 (5%)
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 197 STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 256
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
ATE T +TE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 257 ATESTPCTT---STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 313
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 314 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATE 373
Query: 250 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 309
+ ATE T + ATE T + T+ T + +T T T ATE T
Sbjct: 374 STPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTQATESIPATKSTPCTPSTETTPATESTPATE 433
Query: 310 TLGATELTA----------KSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
+ ATE T E + P ++TE T + ATE T
Sbjct: 434 STPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATE 493
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTA 416
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 494 STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTP 553
Query: 417 KVFTLGATELTA 428
+ ATE T
Sbjct: 554 ATESTPATESTP 565
Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 121/410 (29%), Positives = 155/410 (37%), Gaps = 29/410 (7%)
Query: 25 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 84
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 197 STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 256
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
ATE T +TE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 257 ATESTPCTT---STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 313
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 201
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 314 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATE 373
Query: 202 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 261
+ ATE T + ATE T + T+ T + +T T T ATE T
Sbjct: 374 STPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTQATESIPATKSTPCTPSTETTPATESTPATE 433
Query: 262 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
+ ATE T + T T +T T +TE T + ATE T
Sbjct: 434 STPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTP--- 490
Query: 322 ILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 491 -----------------ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPA 533
Query: 382 VFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
+ +TE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 534 TESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 583
Score = 67.4 bits (163), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 139/461 (30%), Positives = 170/461 (36%), Gaps = 56/461 (12%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--- 54
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1202 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATE 1261
Query: 55 ------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1262 STPCTTSTETTPATASTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1321
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTA 150
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1322 ATESTPATESTPCTTSTETTPATEGTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT 1381
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1382 STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1441
Query: 211 KVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
+ ATE T T ATE T + ATE T T + ATE
Sbjct: 1442 ATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPATESTP---------CTTSTESTPATE 1492
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILE 324
T + ATE T + ATE T T ATE T + ATE T + E
Sbjct: 1493 STPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPATESTPCTTSTE 1552
Query: 325 VEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 384
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 1553 -----------STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATES 1601
Query: 385 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
ATE T + ATE T + ATE T + ATE
Sbjct: 1602 TPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATE 1642
Score = 64.7 bits (156), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 121/416 (29%), Positives = 152/416 (36%), Gaps = 44/416 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVF 57
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 290 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTE 349
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------------------ 99
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE
Sbjct: 350 STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTQATESIP 409
Query: 100 ------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 153
T T ATE T + ATE T + T T +T T
Sbjct: 410 ATKSTPCTPSTETTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTP 469
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 213
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 470 CTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATE 529
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
+ ATE T T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 530 STPATESTP---------CTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATE 580
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
+ ATE T +TE T + ATE T + ATE T + E +
Sbjct: 581 STPATESTPCTT---STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPA--TES 635
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 389
P ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + + ATE
Sbjct: 636 TP---ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPAIESTPATE 688
Score = 63.9 bits (154), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 139/492 (28%), Positives = 176/492 (35%), Gaps = 64/492 (13%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVF 57
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1094 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATE 1153
Query: 58 TLGATELTA---------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1154 STPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1213
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------ 153
+ ATE T + +TE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1214 ATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTP 1273
Query: 154 ---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1274 ATASTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1333
Query: 211 KVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTA 258
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1334 CTTSTETTPATEGTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTP 1393
Query: 259 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE--- 315
+ ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE
Sbjct: 1394 ATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1453
Query: 316 -LTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 374
T+ E + P +T T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 1454 CTTSTETTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTPATESTP 1513
Query: 375 ATEL---------------TAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1514 ATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTPATESTPATESTPATESTP 1573
Query: 417 KVFTLGATELTA 428
+ ATE T
Sbjct: 1574 ATESTPATESTP 1585
Score = 58.9 bits (141), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 97/324 (29%), Positives = 123/324 (37%), Gaps = 35/324 (10%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1024 PATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT-- 1081
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1082 -STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT-- 1138
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---------TLGATELTAKVFTLGAT 290
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + AT
Sbjct: 1139 -STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPATESTPATESTPATESTPAT 1197
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
E T + ATE T + ATE T + P ++TE T +
Sbjct: 1198 ESTPATESTPATESTPATESTPATESTPA-----------TESTPCTTSTESTPATESTP 1246
Query: 351 ATELTAKVFTLGATELTAKVF---------TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 401
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE
Sbjct: 1247 ATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPATASTPATESTPATESTPATESTPATESTPATE 1306
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
T + ATE T + ATE
Sbjct: 1307 STPATESTPATESTPATESTPATE 1330
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/258 (29%), Positives = 92/258 (35%), Gaps = 44/258 (17%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
ATE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1024 PATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTT-- 1081
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKV 308
+TE T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T
Sbjct: 1082 -STESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTST 1140
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL-------------- 354
+ ATE T ATE T + ATE
Sbjct: 1141 ESTPATESTP--------------------ATESTPATESTPATESTPCTTSTETTPATE 1180
Query: 355 -TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLG 410
T + ATE T + ATE T + ATE T + ATE T +
Sbjct: 1181 STPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPATESTPCTTSTESTP 1240
Query: 411 ATELTAKVFTLGATELTA 428
ATE T + ATE T
Sbjct: 1241 ATESTPATESTPATESTP 1258
>gi|196040783|ref|ZP_03108081.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
NVH0597-99]
gi|196028237|gb|EDX66846.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
NVH0597-99]
Length = 910
Score = 78.6 bits (192), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/480 (23%), Positives = 157/480 (32%), Gaps = 55/480 (11%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G+T +T G T T + GAT T + G T T + G
Sbjct: 73 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGV 132
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T + GAT T ++GAT T + G T T + G T T G
Sbjct: 133 TGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGP 192
Query: 122 TELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
T T + +G AT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 193 TGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGP 252
Query: 176 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
+ GA T + GAT T G T T + GAT T G+T +T
Sbjct: 253 TGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPT---GSTGVTGN 309
Query: 236 VFTLGA------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
G T +T G+T +T G+T +T
Sbjct: 310 TGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGS 369
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-------SVILE 324
G+T +T G+T T G+T +T G T T E
Sbjct: 370 TGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGE 429
Query: 325 VEYYKPIKIVPQNSA---------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 369
P + A T +T G+T +T G+T +T
Sbjct: 430 TGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGS 489
Query: 370 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G+T +T G+T T G+T +T G T T G+T T +
Sbjct: 490 TGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGE 549
Score = 77.8 bits (190), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/416 (25%), Positives = 144/416 (34%), Gaps = 23/416 (5%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 73
T +T G T T + G+T +T G T +T G+T +T G
Sbjct: 37 TGITGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGP 96
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T T + GAT T + G T T + G T T + GAT T ++GA
Sbjct: 97 TGSTGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGA 156
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T T + G T T + G T T G T T + +G T T GA
Sbjct: 157 TGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGST------GA 210
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T T + GAT T GAT T GAT T + GA T + GA
Sbjct: 211 TGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGA 270
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
T T G T T + GAT T G+T +T G T T +
Sbjct: 271 TGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPT---GSTGVTGNTGATGPTGSTGETGAT-G 326
Query: 314 TELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 373
+ E T +T G+T +T G+T +T
Sbjct: 327 GTGVTGNTGPTGE-------------TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGAT 373
Query: 374 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G+T +T G+T T G+T +T G T T G+T T +
Sbjct: 374 GSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGE 429
Score = 74.3 bits (181), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 118/488 (24%), Positives = 160/488 (32%), Gaps = 76/488 (15%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T G T +T G+T +T G T T + GAT T + G
Sbjct: 60 STGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGSTG 119
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T + G T T + GAT T ++GAT T + G T T + G
Sbjct: 120 VTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTG 179
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G T T + +G T T GAT T + GAT T G
Sbjct: 180 VTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGST------GATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETG 233
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T GAT T + GA T + GAT T G T T + G
Sbjct: 234 ATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTG 293
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------------------------TELTAKVFTLG 276
AT T G+T +T G T +T G
Sbjct: 294 ATGSTGPT---GSTGVTGNTGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTG 350
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
+T +T G+T +T G+T +T G+T T + P
Sbjct: 351 STGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNT--------GPTG---- 398
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA--------------------- 375
+T +T G T T G+T T + G
Sbjct: 399 --STGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGP 456
Query: 376 ---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIR 432
T +T G+T +T G+T +T G+T +T G+T T
Sbjct: 457 TGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATG---- 512
Query: 433 SNTGTVGS 440
NTG GS
Sbjct: 513 -NTGPTGS 519
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 97/416 (23%), Positives = 139/416 (33%), Gaps = 47/416 (11%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T T + G+T +T G T +T G+T +T G
Sbjct: 37 TGITGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGP 96
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T + GAT T + G T T + G T T + GAT T ++GA
Sbjct: 97 TGSTGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGA 156
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G+T +T G+T +T + G T T +G T G+
Sbjct: 157 TGSTGAT---GSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGS 213
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T T + G+T +T GAT T +G T T G+
Sbjct: 214 TGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPT------GS 267
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------------ 289
T T G T +T G+T T G+T +T G
Sbjct: 268 TGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGETGATGG 327
Query: 290 ------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN 337
T +T G+T +T G+T +T +
Sbjct: 328 TGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATG------------- 374
Query: 338 SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
+T +T G+T T G+T +T G T T G+T T +
Sbjct: 375 -STGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGE 429
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 97/403 (24%), Positives = 135/403 (33%), Gaps = 40/403 (9%)
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T G T T + G+T +T G T +T G+T +T G
Sbjct: 37 TGITGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGP 96
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T + GAT T + G T T + G T T + GAT T ++GA
Sbjct: 97 TGSTGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGA 156
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G+T +T G+T +T + G T T +G T G+
Sbjct: 157 TGSTGAT---GSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGS 213
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T G T T + G+T +T GAT T +G T T G
Sbjct: 214 TGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGN 273
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA---------- 351
T T + G+T T P +T +T G
Sbjct: 274 TGPTGETGVTGSTGPTGS--TGATGSTGPTG------STGVTGNTGATGPTGSTGETGAT 325
Query: 352 --------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
T +T G+T +T G+T +T G+T +T
Sbjct: 326 GGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGAT 385
Query: 398 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGS 440
G+T T G+T +T G T T NTG GS
Sbjct: 386 GSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATG-----NTGPTGS 423
Score = 62.0 bits (149), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/436 (23%), Positives = 136/436 (31%), Gaps = 80/436 (18%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T ++GAT T + G T T + G T T G T T + +G
Sbjct: 144 ATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIG 203
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T GAT T + GAT T GAT T GAT T + G
Sbjct: 204 PTGST------GATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTG 257
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A T + GAT T G T T + GAT T G+T +T G
Sbjct: 258 AIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPT---GSTGVTGNTGATG 314
Query: 181 A------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
T +T G+T +T G+T +T G
Sbjct: 315 PTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATG 374
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
+T +T G+T T G+T +T G T T G+T T + G
Sbjct: 375 STGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATG 434
Query: 277 A------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
T +T G+T +T G+T +T G
Sbjct: 435 PTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATG 494
Query: 313 ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 372
+T +T T + GAT T + G T T
Sbjct: 495 STGVTGN-----------------------TGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGN 531
Query: 373 LGATELTAKVFTLGAT 388
GAT T + G T
Sbjct: 532 TGATGNTGPTGSTGPT 547
Score = 52.4 bits (124), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/419 (21%), Positives = 136/419 (32%), Gaps = 68/419 (16%)
Query: 26 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 85
T +T G+T +T G+T +T G+T +T G+T T G+
Sbjct: 340 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 399
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------------------------ 121
T +T G T T G+T T + G
Sbjct: 400 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGE 459
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T +T G+T +T G+T +T G+T +T G+T T G+
Sbjct: 460 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 519
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------------------- 215
T +T G T T G+T T +
Sbjct: 520 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGP 579
Query: 216 -GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
G+T +T G+T T +G T T + G+T T G+ T +
Sbjct: 580 TGSTGVT------GSTGATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGA 633
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIV 334
G+T T + G+T +T + G+T +T G T T E P
Sbjct: 634 TGSTGPTGEAGATGSTGVTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATG-----ETGVTGPTG-- 686
Query: 335 PQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
+T T + G+T +T G+T T G+ T + G+T +T
Sbjct: 687 ----STGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGS 741
Score = 51.6 bits (122), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/371 (21%), Positives = 118/371 (31%), Gaps = 57/371 (15%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T G+T +T G+T +T G+T T G+T +T G
Sbjct: 351 STGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATG 410
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------------------------TELTAKVFTLG 96
T T G+T T + G T +T G
Sbjct: 411 NTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTG 470
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
+T +T G+T +T G+T +T G+T T G+T +T G
Sbjct: 471 STGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATG 530
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------------------------------GATE 183
T T G+T T + G+T
Sbjct: 531 NTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGPTGSTGVTGSTG 590
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
T +G T T + G+T T G+ T + G+T T + G+T
Sbjct: 591 ATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGPTGEAGATGSTG 650
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
+T + G+T +T G T T + G T T G T T GAT
Sbjct: 651 VTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATGETGPTGSTGVTGNTGATG 710
Query: 304 LTAKVFTLGAT 314
T + GAT
Sbjct: 711 STGPTGSTGAT 721
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/371 (21%), Positives = 121/371 (32%), Gaps = 63/371 (16%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T G+T +T G+T T G+T +T G T T G
Sbjct: 363 STGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTG 422
Query: 61 ATELTAKVFTLGA------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
+T T + G T +T G+T +T G
Sbjct: 423 STGPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATG 482
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
+T +T G+T +T G+T T G+T +T G T T G
Sbjct: 483 STGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTG 542
Query: 157 ATELTAKVFTL---------------------------------GATELTAKVFTLGATE 183
+T T + G+T T +G T
Sbjct: 543 STGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGPTGSTGVTGSTGATGNTGAMGNTG 602
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
T + G+T T G+ T + G+T T + G+T +T + G+T
Sbjct: 603 PTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGEAGATGSTG 662
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
+T G+T +T G T +T + GAT T + G T T + G T
Sbjct: 663 VT------GSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGPTG 716
Query: 304 LTAKVFTLGAT 314
T ++G T
Sbjct: 717 STGATGSIGPT 727
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/284 (23%), Positives = 95/284 (33%), Gaps = 33/284 (11%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G+T +T G+T +T G+T +T G+T T G+
Sbjct: 460 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 519
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------------------- 95
T +T G T T G+T T +
Sbjct: 520 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGP 579
Query: 96 -GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
G+T +T G+T T +G T T + G+T T G+ T +
Sbjct: 580 TGSTGVT------GSTGATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGA 633
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
G+T T + G+T +T + G+T +T G T T + G T T
Sbjct: 634 TGSTGPTGEAGATGSTGVTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATGE 693
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
G T T GAT T + GAT GAT T
Sbjct: 694 TGPTGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTG 737
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/297 (22%), Positives = 103/297 (34%), Gaps = 42/297 (14%)
Query: 26 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 85
T +T G+T +T G+T +T G+T +T G+T T G+
Sbjct: 460 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 519
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------------------- 119
T +T G T T G+T T +
Sbjct: 520 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGP 579
Query: 120 -GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G+T +T G+T T +G T T + G+T T G+ T +
Sbjct: 580 TGSTGVT------GSTGATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGA 633
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G+T T + G+T +T + G+T +T G+T +T G T +T +
Sbjct: 634 TGSTGPTGEAGATGSTGVTGEAGATGSTGVT------GSTGVTGNTGATGETGVTGPTGS 687
Query: 239 LGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 292
GAT T + G T T G+T T + G T T G+T +
Sbjct: 688 TGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGV 744
>gi|49481374|ref|YP_038772.1| hypothetical protein BT9727_4458 [Bacillus thuringiensis serovar
konkukian str. 97-27]
gi|49332930|gb|AAT63576.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis serovar konkukian
str. 97-27]
Length = 1055
Score = 77.4 bits (189), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/431 (24%), Positives = 149/431 (34%), Gaps = 32/431 (7%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T + GAT T GAT T GAT T G+T +T G+
Sbjct: 38 TGMTGITGSTGATGETGATGPTGATGETGSTGNTGATGATGPT---GSTGVTGSTGATGS 94
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T +G T T + T +T G+T T G+T T + G
Sbjct: 95 TGPTGNTGAMGNTGPTGE------TGVTGSTGPTGSTGATGNTGVTGSTGPTGETGATGP 148
Query: 122 TELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
T T + GA T T GAT T G+T +T G+T T
Sbjct: 149 TGSTGAIGNTGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGP 208
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G+T +T GA T G T +T G T +T +G T +T
Sbjct: 209 TGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVT----- 263
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
G+T T G+T T + G+T T G T T + G+T +T
Sbjct: 264 -GSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGA 322
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
G+T T G T T + + +T T + G+T T
Sbjct: 323 TGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVT--------------GSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 368
Query: 359 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 418
G+T T G+T T + G+T T G+T T + G+T T
Sbjct: 369 GVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 428
Query: 419 FTLGATELTAK 429
G T T +
Sbjct: 429 GATGNTGPTGE 439
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/322 (25%), Positives = 107/322 (33%), Gaps = 3/322 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVF 57
+T T G+T T + G T T + GAT T GAT T
Sbjct: 124 STGATGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTG 183
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
G+T +T G+T T G+T +T GA T G T +T
Sbjct: 184 PTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTG 243
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
G T +T +G T +T G T T G T +T G+T T
Sbjct: 244 PTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTG 303
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G T T G+T T G T T + G T +T G T +T
Sbjct: 304 ATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTG 363
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 364 PTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTG 423
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T T G T +T
Sbjct: 424 PTGNTGATGNTGPTGETGVTGS 445
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/464 (24%), Positives = 146/464 (31%), Gaps = 31/464 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G+T +T G+T T G+T +T GA T G
Sbjct: 175 ATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTG 234
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T +T +G T +T G T T G T +T G
Sbjct: 235 ETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTG 294
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T T G T T G+T T G T T + G T +T G
Sbjct: 295 STGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTG 354
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T +T G T +T G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 355 ETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTG 414
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------G 276
T +T G T T G T +T G
Sbjct: 415 ETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATG 474
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
+T T + G+T +T G T T + G T T + + P
Sbjct: 475 STGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGV--TGSTGPTGETGA 532
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
+T +T G T T G T T G T T G+T +T
Sbjct: 533 TGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNT-- 590
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGS 440
GAT T + GAT T G T T + NTG GS
Sbjct: 591 -GATGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTG--VTGNTGATGS 631
Score = 68.6 bits (166), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/439 (24%), Positives = 137/439 (31%), Gaps = 35/439 (7%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 73
T T GAT T G+T +T G+T T G+T +T GA
Sbjct: 164 TGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGA 223
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T G T +T G T +T +G T +T G T T G
Sbjct: 224 IGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGE 283
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T +T G+T T G T T G+T T G T T + G
Sbjct: 284 TGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGN 343
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T +T G T +T G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 344 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 403
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------- 299
T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 404 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGS 463
Query: 300 ----------GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTL 349
G+T T + G+T +T + P + AT T
Sbjct: 464 TGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGST--------GPTG---ETGATGSTGSTGET 512
Query: 350 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 409
GAT T + G T T + G T T GAT T GAT T
Sbjct: 513 GATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGET 572
Query: 410 GATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT T + G T T
Sbjct: 573 GATGNTGPTGSTGVTGNTG 591
Score = 68.2 bits (165), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/312 (25%), Positives = 103/312 (33%), Gaps = 3/312 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 57
+T T + G T T + GAT T GAT T G+T +T
Sbjct: 136 STGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTG 195
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
G+T T G+T +T GA T G T +T G T +T
Sbjct: 196 ATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTG 255
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
+G T +T G T T G T +T G+T T G T T
Sbjct: 256 PIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTG 315
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G+T T G T T + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 316 VTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTG 375
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G T +T G T +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 376 PTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTG 435
Query: 298 TLGATELTAKVF 309
G T +T
Sbjct: 436 PTGETGVTGSTG 447
Score = 66.6 bits (161), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/420 (25%), Positives = 139/420 (33%), Gaps = 37/420 (8%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G+T T + G+T +T G T T + G T T G+T T +
Sbjct: 474 GSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGAT 533
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T +T G T T G T T G T T G+T +T
Sbjct: 534 GSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGAT 593
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 200
G T T G T T G+T +T + GAT T + G T T
Sbjct: 594 GETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNT 653
Query: 201 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
G T +T G T T + G T T G+T T G T T +
Sbjct: 654 GPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGET 713
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
G T +T G+T +T GAT T + G T +T G T +T +
Sbjct: 714 GPTGNTGVTGSTGPTGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGETGVTGNTGPTGETGVTGST 770
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
AT T GAT T GAT T + + GAT T
Sbjct: 771 -----------------GATGNTGPTGETGATGET------GATGSTGVIGSTGATGNTG 807
Query: 381 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGS 440
GAT T GAT T G T T + G + NTG GS
Sbjct: 808 ATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTGSTG--------VTGNTGATGS 859
Score = 62.8 bits (151), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/445 (24%), Positives = 142/445 (31%), Gaps = 26/445 (5%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + G+T +T G+T T G T T G+T T + G+
Sbjct: 302 TGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGS 361
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G+T T G+T T + G+T T G+T T + G+
Sbjct: 362 TGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGS 421
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAK 163
T T G T T + G+T T G+T T +
Sbjct: 422 TGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTGE 481
Query: 164 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G+T +T G T T + G T T G+T T + G+T +T
Sbjct: 482 AGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGS 541
Query: 224 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
G T T G T T G T T G+T +T G T T
Sbjct: 542 TGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGS 601
Query: 284 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELT 343
G T T G+T +T G+T T + P + AT T
Sbjct: 602 TGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNT--------GPTGSTGETGATGNT 653
Query: 344 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 403
G T T GAT T + G T T + G T T GAT T
Sbjct: 654 GPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGET 713
Query: 404 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G T T + G T T
Sbjct: 714 GPTGNTGVTGSTGPTGSTGVTGNTG 738
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 113/461 (24%), Positives = 150/461 (32%), Gaps = 22/461 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T G+T T + G+T T G T T + G+T +T G
Sbjct: 265 STGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATG 324
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T T G T T G+T T + G+T T G+T T G
Sbjct: 325 STGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTG 384
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T T + G+T T G+T T + G+T T G T T + G
Sbjct: 385 STGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTG 444
Query: 181 ATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+T T G+T T + G+T +T G T T
Sbjct: 445 STGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATG 504
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
+ G T T G+T T + G+T +T G T T G T T
Sbjct: 505 STGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATG 564
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA--T 340
G T T G+T +T G T T S E P S T
Sbjct: 565 NTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTG-STGATGETGSTGNTGPTGSTGVT 623
Query: 341 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 400
T + GAT T + G T T G T +T G T T + G T
Sbjct: 624 GNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVT 683
Query: 401 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-NIRSNTGTVGS 440
T G+T T G T T + NTG GS
Sbjct: 684 GPTGSTGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGETGPTGNTGVTGS 724
Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/457 (23%), Positives = 140/457 (30%), Gaps = 28/457 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T G+T +T GA T G T +T G T +T +G
Sbjct: 199 STGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIG 258
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T T G T +T G+T T G T T G
Sbjct: 259 ETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTG 318
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T T G T T + G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 319 STGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTG 378
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T +T G T +T G T +T G T +T G T T G
Sbjct: 379 NTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTG 438
Query: 241 ATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T +T G+T T + G+T +T G
Sbjct: 439 ETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTG 498
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVILEVEYYKPIKIVP 335
T T + G T T G+T T + G+T +T E
Sbjct: 499 ETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTG 558
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 392
AT T GAT T + G T T + G+T T + + G T T
Sbjct: 559 NTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTG 618
Query: 393 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T G T T GAT T
Sbjct: 619 STGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGP 655
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/294 (25%), Positives = 99/294 (33%), Gaps = 6/294 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---T 58
T T G+T +T G T T G T T G+T +T +
Sbjct: 572 TGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGS 631
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
GAT T + G T T G T +T G T T + G T T
Sbjct: 632 TGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGV 691
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G+T T G T T + G T +T G+T +T GAT T +
Sbjct: 692 TGSTGPTGSTGAPGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGSTGVTGNT---GATGETGPTGS 748
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G T +T G T +T G T T + G T T +G+T T
Sbjct: 749 TGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGATGNTGPTGETGATGETGATGSTGVIGSTGATGNTGA 808
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 292
G T T G T T G T T + G+T +T G+T +
Sbjct: 809 TGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGV 862
>gi|156103341|ref|XP_001617363.1| hypothetical protein [Plasmodium vivax Sal-1]
gi|148806237|gb|EDL47636.1| hypothetical protein, conserved [Plasmodium vivax]
Length = 2343
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 17 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 76
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 77 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 29 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 88
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 41 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 100
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 53 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 112
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 113 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 77 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 136
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 137 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 148
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 160
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 113 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 172
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 137 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 196
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 197 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 220
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 233 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 197 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 256
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 257 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 75.1 bits (183), Expect = 6e-11, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/105 (40%), Positives = 62/105 (59%)
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T F LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTTFPLGG 306
Score = 70.1 bits (170), Expect = 2e-09, Method: Composition-based stats.
Identities = 40/97 (41%), Positives = 59/97 (60%)
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 280
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 281 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 317
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG ++T
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKIT 298
Score = 63.9 bits (154), Expect = 2e-07, Method: Composition-based stats.
Identities = 38/100 (38%), Positives = 56/100 (56%)
Query: 343 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 402
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 403 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGSPT 442
T K F+LG ++T VF+LG + + K+ G + T
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGGKITHTT 301
Score = 62.4 bits (150), Expect = 5e-07, Method: Composition-based stats.
Identities = 37/91 (40%), Positives = 53/91 (58%)
Query: 233 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 292
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 293 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
T K F+LG ++T VF+LG + + K L
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSL 292
Score = 61.6 bits (148), Expect = 8e-07, Method: Composition-based stats.
Identities = 44/131 (33%), Positives = 64/131 (48%), Gaps = 26/131 (19%)
Query: 293 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGAT 352
T VF+LG + T K F+LG +N+ T VF+LG
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGG---------------------KNTHT-----VFSLGGG 235
Query: 353 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 412
+ T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG
Sbjct: 236 KNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKITHTVFSLGGGKNSHKDFSLGGG 295
Query: 413 ELTAKVFTLGA 423
++T F LG
Sbjct: 296 KITHTTFPLGG 306
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Composition-based stats.
Identities = 43/131 (32%), Positives = 62/131 (47%), Gaps = 26/131 (19%)
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 304
T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG + T K F+LG + T VF+LG +
Sbjct: 202 THTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKNTHTVFSLGGGKNTHKDFSLGGGKSTHTVFSLGGGKN 261
Query: 305 TAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 364
T K F+LG ++T VF+LG + + K F+LG
Sbjct: 262 THKDFSLGGGKITHT--------------------------VFSLGGGKNSHKDFSLGGG 295
Query: 365 ELTAKVFTLGA 375
++T F LG
Sbjct: 296 KITHTTFPLGG 306
>gi|258516276|ref|YP_003192498.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Desulfotomaculum
acetoxidans DSM 771]
gi|257779981|gb|ACV63875.1| Collagen triple helix repeat protein [Desulfotomaculum acetoxidans
DSM 771]
Length = 1580
Score = 75.1 bits (183), Expect = 8e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 143/470 (30%), Positives = 145/470 (30%), Gaps = 83/470 (17%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG- 60
T T T GAT T T GA T G T T T GAT T T G
Sbjct: 815 TGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGAT------GPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGV 868
Query: 61 --ATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGA 109
AT T T GA T T T GAT T T GAT T T GA
Sbjct: 869 DGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGA 928
Query: 110 TELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFT 154
T G T T GAT T T GA T T T
Sbjct: 929 DGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGT 988
Query: 155 LGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFT 202
GAT T T GA T T T GAT T T GA T T
Sbjct: 989 NGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGA 1048
Query: 203 LGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGA 253
GAT T T GA T T GAT T T GA T T T GA
Sbjct: 1049 DGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGA 1108
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAK 307
T G T G T T GAT T T GA T T
Sbjct: 1109 DGATGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGT 1168
Query: 308 VFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTL 361
GAT T + V+ AT T T GA T T
Sbjct: 1169 AGADGATGPTGPTGTAGVD-----------GATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGAD 1217
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
GAT T T GA T G TA V GAT T T GA
Sbjct: 1218 GATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTG----TAGVD--GATGPTGPTGTAGA 1261
Score = 70.1 bits (170), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 140/452 (30%), Positives = 141/452 (31%), Gaps = 85/452 (18%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGATELTAKV 92
GAT T T GA GAT T T GAT T T GA T
Sbjct: 675 GATGPTGPTGTAGA---------DGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPT 725
Query: 93 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTL 143
G TA V GAT T T GAT T T GA T T
Sbjct: 726 GPTG----TAGVD--GATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGAD 779
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
GAT T T GA T G TA V G T T T GAT T T
Sbjct: 780 GATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTG----TAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGT 835
Query: 203 LGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGA------TELTAK 247
GA T T T GAT T T GAT T T GA T T
Sbjct: 836 AGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGT 895
Query: 248 VFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------GATELTAK 295
T GAT T T GAT T T GA T G T T
Sbjct: 896 AGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGT 955
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA---- 351
GAT T T GA T + P N AT T T GA
Sbjct: 956 AGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPT--------GPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGAT 1007
Query: 352 --TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---- 399
T T T GAT T T GA T T GAT T T GA
Sbjct: 1008 GPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 1067
Query: 400 --TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T T GAT T T GA T
Sbjct: 1068 GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 1099
Score = 68.9 bits (167), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 150/499 (30%), Positives = 153/499 (30%), Gaps = 82/499 (16%)
Query: 1 ATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA-- 49
AT T T G AT T T GA T T T GAT T T GA
Sbjct: 946 ATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADG 1005
Query: 50 ----TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA-- 97
T T T GAT T T GA T T GAT T T GA
Sbjct: 1006 ATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG 1065
Query: 98 ----TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
T T GAT T T GA T T T GA T G T
Sbjct: 1066 ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPTGPTGTAG 1125
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
G T T GAT T T GA T T T GA T G
Sbjct: 1126 ADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTG--- 1182
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 261
TA V GAT T T GA T T GAT T T GA T
Sbjct: 1183 -TAGVD--GATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1239
Query: 262 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTLGA-- 313
G TA V GAT T T GA T GAT T T GA
Sbjct: 1240 PTG----TAGVD--GATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG 1293
Query: 314 -TELTAKSVILEVEYY----KPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLG 362
T T + V+ P + AT T T GA T T G
Sbjct: 1294 ATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG 1353
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLG 410
AT T T GA T GAT T T GA T T G
Sbjct: 1354 ATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTTGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG 1413
Query: 411 ATELTAKVFTLGATELTAK 429
AT T T GA T
Sbjct: 1414 ATGPTGPTGTAGADGATGP 1432
Score = 68.2 bits (165), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 147/499 (29%), Positives = 151/499 (30%), Gaps = 89/499 (17%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKV 68
G T T T GAT T T GA T T GAT T T GAT T
Sbjct: 354 GPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGANGATGPTGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPT 413
Query: 69 FTL---GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTL---GATELTAKV 116
T GAT T T GA T GAT T T GAT T
Sbjct: 414 GTSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPT 473
Query: 117 FTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKV 164
T GA T T GAT T T GA T T GAT T
Sbjct: 474 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 533
Query: 165 FTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKV 212
T GA T T GAT T T GA T T GAT T
Sbjct: 534 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 593
Query: 213 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG------- 264
T GA T G TA V G T T + GAT T T G
Sbjct: 594 GTAGADGATGPTGPTG----TAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGP 649
Query: 265 --------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGA------ 301
T T GAT T T GAT T T GA
Sbjct: 650 TGPTGTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 709
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY----KPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA------ 351
T T GAT T + V+ P + AT T T GA
Sbjct: 710 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 769
Query: 352 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-GATELTAKVFTLG 410
T T GAT T T GA T G TA V G T T T G
Sbjct: 770 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTG----TAGVDGATGPTGPTGTAGTDG 825
Query: 411 ATELTAKVFTLGATELTAK 429
AT T T GA T
Sbjct: 826 ATGPTGPTGTAGADGATGP 844
Score = 65.5 bits (158), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 160/551 (29%), Positives = 161/551 (29%), Gaps = 134/551 (24%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------ 49
T T GAT T T GA T T GAT T T GA
Sbjct: 500 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 559
Query: 50 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATEL 100
T T GAT T T GA T T GAT T T GAT
Sbjct: 560 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGP 619
Query: 101 TAKVFTL---GATELTAKVFTLG---------------------ATELTAKVFTLGATEL 136
T T GAT T T G T T GAT
Sbjct: 620 TGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGP 679
Query: 137 TAKVFTL---GATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATEL 184
T T GAT T T GA T T GAT T T GAT
Sbjct: 680 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGP 739
Query: 185 TAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATEL 232
T T GA T T GAT T T GA T T GAT
Sbjct: 740 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 799
Query: 233 TAKVFTL------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATEL 280
T T G T T T GAT T T GA T T T GAT
Sbjct: 800 TGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGP 859
Query: 281 TAKVFTL---GATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
T T GAT T T GA T T T GAT T +
Sbjct: 860 TGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGT------ 913
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLG------------------ATELTAKVFTL---GATELTAKV 370
N AT T T G AT T T GAT T
Sbjct: 914 -----NGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPT 968
Query: 371 FTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKV 418
T GA T T T GAT T T GA T T T GAT T
Sbjct: 969 GTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPT 1028
Query: 419 FTLGATELTAK 429
T GA T
Sbjct: 1029 GTAGADGATGP 1039
Score = 58.5 bits (140), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 134/442 (30%), Positives = 136/442 (30%), Gaps = 86/442 (19%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 54
AT T T GA T T GAT T T GA T GAT T
Sbjct: 1066 ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT------GATGPTG 1119
Query: 55 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
T GA GAT T T GA T G T T GAT T
Sbjct: 1120 PTGTAGA---------DGATGPTGPTGTAGADGAT------GPTGPTGTAGADGATGPTG 1164
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
T GA T G TA V GAT T T GA T G T T
Sbjct: 1165 PTGTAGADGATGPTGPTG----TAGVD--GATGPTGPTGTAGADGAT------GPTGPTG 1212
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT T T GA T G TA V GAT T T GA T
Sbjct: 1213 TAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTG----TAGVD--GATGPTGPTGTAGADGTTG 1266
Query: 235 KVFTL------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
GAT T T GA T G TA V GAT T T G
Sbjct: 1267 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTG----TAGVD--GATGPTGPTGTAG 1320
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFT 348
A GAT T T GA T + P + AT T T
Sbjct: 1321 A---------DGATGPTGPTGTAGADGATGPT--------GPTGTAGADGATGPTGPTGT 1363
Query: 349 LGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 402
GA T GAT T T GA T G T T GAT
Sbjct: 1364 AGADGTTGPTGPTGTTGVDGATGPTGPTGTAGADGAT------GPTGPTGTAGADGATGP 1417
Query: 403 TAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
T T GA T GAT
Sbjct: 1418 TGPTGTAGADGATGPTGPTGAT 1439
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 144/524 (27%), Positives = 148/524 (28%), Gaps = 138/524 (26%)
Query: 44 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTL---GATELTAKVFT 94
T GAT T T GA T GAT T T GAT T T
Sbjct: 261 AGTSGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGIAGANGATGPTGPTGTAGANGATGPTGPTGT 320
Query: 95 LGA--------------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
GA T T T GAT T T GA
Sbjct: 321 AGADGAIGPTGPTGTGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGAN 380
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGA------- 169
T T GAT T T GAT T T GAT T T GA
Sbjct: 381 GATGPTGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPT 440
Query: 170 --------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGA------T 206
T T + GAT T T GAT T T GA T
Sbjct: 441 GPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPT 500
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------T 254
T GAT T T GA T T GAT T T GA T
Sbjct: 501 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPT 560
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELT 305
T GAT T T GA T T GAT T T GAT T
Sbjct: 561 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPT 620
Query: 306 AKVFTL---GATELTAKSVILEVE-------------------YYKPIKIVPQNSATELT 343
T GAT T + V+ P + AT T
Sbjct: 621 GPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGPT 680
Query: 344 AKVFTL---GATELTAKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELT 391
T GAT T T GA T T GAT T T GAT T
Sbjct: 681 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPT 740
Query: 392 AKVFTLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T GA T T GAT T T GA T
Sbjct: 741 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 784
>gi|118479861|ref|YP_897012.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis str. Al Hakam]
gi|118419086|gb|ABK87505.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis str. Al Hakam]
Length = 863
Score = 73.6 bits (179), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/452 (22%), Positives = 151/452 (33%), Gaps = 44/452 (9%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + G+T +T + G+T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 227 TGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 286
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---------------------- 99
T +T G T +T G T T GAT
Sbjct: 287 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGA 346
Query: 100 --LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T + G T T + G+T +T G+T T + G T T + G
Sbjct: 347 TGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGE 406
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T T G T T G+T +T G T T + G+T T G
Sbjct: 407 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGE 466
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
T T G+T T + G+T +T G+T +T G+T T + + G+
Sbjct: 467 TGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGS 526
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN 337
T G+T +T + G+T +T G+T T
Sbjct: 527 TGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN------------------ 568
Query: 338 SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
T T + G+T +T G T +T + G+T +T G+T +T
Sbjct: 569 --TGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGAT 626
Query: 398 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T G T T + G+T T
Sbjct: 627 GNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGN 658
Score = 72.4 bits (176), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 105/452 (23%), Positives = 153/452 (33%), Gaps = 35/452 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T + G+T +T G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 238 STGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 297
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------------------------LTAKVFTLG 96
T +T G T T GAT T + G
Sbjct: 298 ETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTG 357
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
T T + G+T +T G+T T + G T T + G T T G
Sbjct: 358 PTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTG 417
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
T T G+T +T G T T + G+T T G T T G
Sbjct: 418 NTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTG 477
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
+T T + G+T +T G+T +T G+T T + + G+T G
Sbjct: 478 STGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATG 537
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
+T +T + G+T +T G+T T G T T + +
Sbjct: 538 STGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVT------- 590
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
T +T + G+T +T G+T +T G T T G T T +
Sbjct: 591 -GNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGP 649
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G+T T GAT T ++GAT T
Sbjct: 650 TGSTGATGNT---GATGETGPTGSIGATGNTG 678
Score = 71.2 bits (173), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 91/370 (24%), Positives = 128/370 (34%), Gaps = 23/370 (6%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + G T T + G+T +T G+T T + G T T + G T
Sbjct: 350 TGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGA 409
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T G T T G+T +T G T T + G+T T G T
Sbjct: 410 TGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGA 469
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T G+T T + G+T +T G+T +T G+T T + + G+T
Sbjct: 470 TGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGA 529
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
G+T +T + G+T +T G+T T G T T G+T +
Sbjct: 530 PGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGV 589
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 304
T G T T G+T T G T T G+T +T GAT
Sbjct: 590 TGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNT---GATGE 646
Query: 305 TAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 364
T + GAT T AT T ++GAT T G T
Sbjct: 647 TGPTGSTGATGNTG--------------------ATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGET 686
Query: 365 ELTAKVFTLG 374
+T + G
Sbjct: 687 GVTGPTGSTG 696
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 105/458 (22%), Positives = 149/458 (32%), Gaps = 45/458 (9%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
T G T T G T T + G+T +T + G+T +T G T
Sbjct: 205 PTGSTGPTGETGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETG 264
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+T G T +T G T +T G T +T G T T GAT
Sbjct: 265 VTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATG 324
Query: 124 ------------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
T + G T T + G+T +T G+T
Sbjct: 325 NTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTG 384
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
T + G T T + G T T G T T G+T +T G T
Sbjct: 385 ETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTG 444
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
T + G+T T G T T G+T T + G+T +T G+T
Sbjct: 445 ATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTG 504
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA 339
+T G+T T + + G+T G+T +T
Sbjct: 505 VTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGN-------------------- 544
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
T T G+T T G T T + G+T +T G T +T + G+
Sbjct: 545 TGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGS 604
Query: 400 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-NIRSNTG 436
T +T G+T +T G T T + NTG
Sbjct: 605 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTG 642
Score = 67.4 bits (163), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/374 (24%), Positives = 131/374 (35%), Gaps = 26/374 (6%)
Query: 29 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 88
T + G T T + G+T +T G+T T + G T T + G T
Sbjct: 350 TGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGA 409
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 148
T G T T G+T +T G T T + G+T T G T
Sbjct: 410 TGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGA 469
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T G+T T + G+T +T G+T +T G+T T + + G+T
Sbjct: 470 TGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGA 529
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
G+T +T + G+T +T G+T T G T T G+T +
Sbjct: 530 PGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGV 589
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY 328
T G T T G+T T G T T G+T +T +
Sbjct: 590 TGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNT-------- 641
Query: 329 KPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 388
AT T + GAT T GAT T ++GAT T G T
Sbjct: 642 ---------GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGET 686
Query: 389 ELTAKVFTLGATEL 402
+T G+T +
Sbjct: 687 GVTGPT---GSTGV 697
Score = 63.9 bits (154), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/442 (23%), Positives = 147/442 (33%), Gaps = 41/442 (9%)
Query: 28 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
T G T T G T T + G+T +T + G+T +T G T
Sbjct: 205 PTGSTGPTGETGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETG 264
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+T G T +T G T +T G T +T G T T GAT
Sbjct: 265 VTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATG 324
Query: 148 ------------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T + G T T + G+T +T G+T
Sbjct: 325 NTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTG 384
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
T + G T T + G T T G T T G+T +T G T
Sbjct: 385 ETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTG 444
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T + G+T T G T T G+T T + G+T +T G+T
Sbjct: 445 ATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTG 504
Query: 304 LTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN----SATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
+T G+T T ++ P N +T +T + G+T +T
Sbjct: 505 VTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTG------APGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTG 558
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
G+T T G T T G+T +T T +T + G+T +T
Sbjct: 559 PTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGN------TGVTGETGPTGSTGVTGSTG 612
Query: 420 TLGATELTAK-NIRSNTGTVGS 440
G+T +T NTG GS
Sbjct: 613 ATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 634
>gi|225866715|ref|YP_002752093.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB102]
gi|225789290|gb|ACO29507.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB102]
Length = 883
Score = 73.6 bits (179), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/458 (23%), Positives = 156/458 (34%), Gaps = 38/458 (8%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + G+T +T + G+T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 229 TGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 288
Query: 62 TELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK--- 115
T +T G AT T GAT T + GAT T + GAT T
Sbjct: 289 TGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGNTGP 348
Query: 116 ------------------------VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 151
+ G T T + G+T +T G+T T
Sbjct: 349 TGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGA 408
Query: 152 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
+ G T T + G T T G T T G+T +T G T T +
Sbjct: 409 TGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGE 468
Query: 212 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
G+T T G T T G+T T + G+T +T G+T +T
Sbjct: 469 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGS 528
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T + P
Sbjct: 529 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGST--------GPT 580
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 391
T T + G+T +T G T +T + G+T +T G+T +T
Sbjct: 581 GSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVT 640
Query: 392 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T G T T + G+T T
Sbjct: 641 GNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGN 678
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/455 (23%), Positives = 156/455 (34%), Gaps = 53/455 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T + G+T T + G+T T + G+T T + G+T +T G
Sbjct: 270 STGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGST---G 326
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAK---------------------------VFTLGATELTAKVF 93
AT T + GAT T + G T T +
Sbjct: 327 ATGETGPTGSTGATGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETG 386
Query: 94 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 153
G+T +T G+T T + G T T + G T T G T T
Sbjct: 387 ATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTG 446
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 213
G+T +T G T T + G+T T G T T G+T T +
Sbjct: 447 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETG 506
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
G+T +T G+T +T G+T T + + G+T G+T +T
Sbjct: 507 PTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTG 566
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
+ G+T +T G+T T G T T G+T +T
Sbjct: 567 STGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGN-------------- 612
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
T +T + G+T +T G+T +T G T T G T T +
Sbjct: 613 ------TGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGE 666
Query: 394 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G+T T GAT T ++GAT T
Sbjct: 667 TGPTGSTGATGNT---GATGETGPTGSIGATGNTG 698
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 91/370 (24%), Positives = 128/370 (34%), Gaps = 23/370 (6%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + G T T + G+T +T G+T T + G T T + G T
Sbjct: 370 TGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGA 429
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T G T T G+T +T G T T + G+T T G T
Sbjct: 430 TGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGA 489
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T G+T T + G+T +T G+T +T G+T T + + G+T
Sbjct: 490 TGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGA 549
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
G+T +T + G+T +T G+T T G T T G+T +
Sbjct: 550 PGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGV 609
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 304
T G T T G+T T G T T G+T +T GAT
Sbjct: 610 TGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNT---GATGE 666
Query: 305 TAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 364
T + GAT T AT T ++GAT T G T
Sbjct: 667 TGPTGSTGATGNTG--------------------ATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGET 706
Query: 365 ELTAKVFTLG 374
+T + G
Sbjct: 707 GVTGPTGSTG 716
Score = 66.6 bits (161), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 91/374 (24%), Positives = 134/374 (35%), Gaps = 26/374 (6%)
Query: 29 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 88
T + G T T + G+T +T G+T T + G T T + G T
Sbjct: 370 TGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGA 429
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 148
T G T T G+T +T G T T + G+T T G T
Sbjct: 430 TGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGA 489
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T G+T T + G+T +T G+T +T G+T T + + G+T
Sbjct: 490 TGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGA 549
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
G+T +T + G+T +T G+T T G T T G+T +
Sbjct: 550 PGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGV 609
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY 328
T T +T + G+T +T G+T +T G T T + +
Sbjct: 610 TGN------TGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTG---- 659
Query: 329 KPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 388
AT T + GAT T GAT T ++GAT T G T
Sbjct: 660 -------NTGATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGET 706
Query: 389 ELTAKVFTLGATEL 402
+T G+T +
Sbjct: 707 GVTGPT---GSTGV 717
Score = 63.2 bits (152), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/466 (22%), Positives = 150/466 (32%), Gaps = 56/466 (12%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTL 47
G+T +T G+T +T G+T T +
Sbjct: 155 GSTGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGGTGNTGSTGETGPTGSTGPTGETGAT 214
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G+T T G T T + G+T +T + G+T +T G T +T
Sbjct: 215 GSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPT 274
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 164
G T +T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 275 GETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGETGPT 334
Query: 165 FTLGATELTAK---------------------VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
+ GAT T + GAT T + G T T
Sbjct: 335 GSTGATGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVT 394
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T GAT T G T T + G+T +T G+T T
Sbjct: 395 GNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVT 454
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
G+T T G T T G T T + G+T +T G T T + +
Sbjct: 455 GSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVT 514
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
+T +T G+T T + + G+T G+T +T
Sbjct: 515 GNTGLT--------GSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTG 566
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
+ G+T +T G+T T G T T G+T +T
Sbjct: 567 STGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGN 612
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 101/429 (23%), Positives = 141/429 (32%), Gaps = 61/429 (14%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTL 95
G+T +T G+T +T G+T T +
Sbjct: 155 GSTGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGGTGNTGSTGETGPTGSTGPTGETGAT 214
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G+T T G T T + G+T +T + G+T +T G T +T
Sbjct: 215 GSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPT 274
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 212
G T +T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 275 GETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGETGPT 334
Query: 213 FTLGATELTAK---------------------VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
+ GAT T + GAT T + G T T
Sbjct: 335 GSTGATGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVT 394
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T GAT T G T T + G+T +T G+T T
Sbjct: 395 GNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVT 454
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G+T T + + P S T T G T T G+T T +
Sbjct: 455 GSTGATGNTGATG-------ETGPTGS-TGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETG 506
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
G+T +T G+T +T G+T T + + G+T G+T +T
Sbjct: 507 PTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTG--- 563
Query: 432 RSNTGTVGS 440
NTG+ GS
Sbjct: 564 --NTGSTGS 570
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 94/408 (23%), Positives = 134/408 (32%), Gaps = 58/408 (14%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------GATELTAKVFTL 119
G+T +T G+T +T G+T T +
Sbjct: 155 GSTGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGGTGNTGSTGETGPTGSTGPTGETGAT 214
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T G T T + G+T +T + G+T +T G T +T
Sbjct: 215 GSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPT 274
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
G T +T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 275 GETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGETGPT 334
Query: 237 FTLGATELTAK---------------------VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
+ GAT T + GAT T + G T T
Sbjct: 335 GSTGATGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVT 394
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G T T GAT T G T T + G+T +T + P
Sbjct: 395 GNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNT--------GPTGSTG 446
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
+T +T G T T + G+T T G T T G+T T +
Sbjct: 447 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETG 506
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGSPTH 443
G+T +T G+T +T G+T T + +TG+ G+P +
Sbjct: 507 PTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGE--TGSTGSTGAPGN 552
>gi|156390356|ref|XP_001635237.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156222328|gb|EDO43174.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 247
Score = 73.2 bits (178), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/245 (26%), Positives = 107/245 (43%), Gaps = 5/245 (2%)
Query: 8 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 67
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 1 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 60
Query: 68 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 61 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 120
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELTA 186
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G T+ V+T G T+
Sbjct: 121 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCCVYTSGCVYTSGCCGYTS 180
Query: 187 -KVFTLGATELTA-KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATE 243
V+T G T+ V+T G + T+ V+T G + +T +G + V+T G
Sbjct: 181 GCVYTSGCCVYTSGCVYTSGC-DYTSCVYTSGCVYTSGCDYTSVGCVCTSGCVYTSGCDY 239
Query: 244 LTAKV 248
+ +V
Sbjct: 240 TSVRV 244
Score = 69.3 bits (168), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/213 (27%), Positives = 94/213 (44%), Gaps = 4/213 (1%)
Query: 92 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 151
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 1 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 60
Query: 152 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 61 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 120
Query: 212 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELTA 270
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G T+ V+T G T+
Sbjct: 121 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCCVYTSGCVYTSGCCGYTS 180
Query: 271 -KVFTLGATELTA-KVFTLGATELTAKVFTLGA 301
V+T G T+ V+T G + T+ V+T G
Sbjct: 181 GCVYTSGCCVYTSGCVYTSGC-DYTSCVYTSGC 212
Score = 65.1 bits (157), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/257 (23%), Positives = 103/257 (40%), Gaps = 15/257 (5%)
Query: 140 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 1 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 60
Query: 200 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 61 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 120
Query: 260 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELTA 318
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G T+ V+T G T+
Sbjct: 121 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCCVYTSGCVYTSGCCGYTS 180
Query: 319 KSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-LGATE 377
V + V+T G + T+ V+T G + +T +G
Sbjct: 181 GCVY------------TSGCCVYTSGCVYTSGC-DYTSCVYTSGCVYTSGCDYTSVGCVC 227
Query: 378 LTAKVFTLGATELTAKV 394
+ V+T G + +V
Sbjct: 228 TSGCVYTSGCDYTSVRV 244
Score = 64.3 bits (155), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/257 (23%), Positives = 103/257 (40%), Gaps = 15/257 (5%)
Query: 152 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 1 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 60
Query: 212 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 61 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 120
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G T+ V
Sbjct: 121 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCCVYTSGCVY--------- 171
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-LGATE 389
+ V+T G T+ V+T G + T+ V+T G + +T +G
Sbjct: 172 ---TSGCCGYTSGCVYTSGCCVYTSGCVYTSGC-DYTSCVYTSGCVYTSGCDYTSVGCVC 227
Query: 390 LTAKVFTLGATELTAKV 406
+ V+T G + +V
Sbjct: 228 TSGCVYTSGCDYTSVRV 244
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/181 (23%), Positives = 71/181 (39%), Gaps = 14/181 (7%)
Query: 248 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G +
Sbjct: 1 VYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVL 60
Query: 308 VFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 367
V+T G Y + +V N + V+T G + V+T G +
Sbjct: 61 VYTNGCV-------------YTSV-LVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTS 106
Query: 368 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 427
V+T G + V+T G + V+T G + V+T G + V+T G T
Sbjct: 107 VLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCVYTSVLVYTNGCCVYT 166
Query: 428 A 428
+
Sbjct: 167 S 167
>gi|126697904|ref|YP_001086801.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
gi|115249341|emb|CAJ67154.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
Length = 693
Score = 73.2 bits (178), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/403 (25%), Positives = 144/403 (35%), Gaps = 44/403 (10%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
+T + GAT T + G T T ++G T T G+ T G+T
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPMGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGST 250
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
T + G T T G+ T G T +T + G T T +G T
Sbjct: 251 GATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPT 310
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
T G T +T + GAT T ++ GAT T + GAT T G
Sbjct: 311 GAT------GPTGVTGSIGPTGATGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEI 364
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
T ++ GAT T ++G T T GAT G T +T + GAT
Sbjct: 365 GPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPT---GATGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT 421
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T +G T T G T +T ++ GAT T G T +T ++ GAT
Sbjct: 422 GPTGATGEIGPTGAT------GPTGVTGEIGPTGATGPT------GNTGVTGEIGPTGAT 469
Query: 315 ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 374
T T +T ++ GAT T +G T T ++G
Sbjct: 470 GPTGN--------------------TGVTGEIGPTGATGPTGVTGEIGPTGNTGATGSIG 509
Query: 375 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
T +T GAT GAT +T GAT +++
Sbjct: 510 PTGVTGPT---GATGSIGPTGATGATGVTGPTGPTGATGNSSQ 549
Score = 68.6 bits (166), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/390 (25%), Positives = 137/390 (35%), Gaps = 50/390 (12%)
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
+T + GAT T + G T T ++G T T G+ T G+T
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPMGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGST 250
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
T + G T T G+ T G T +T + G T T +G T
Sbjct: 251 GATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPT 310
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
T G T +T + GAT T ++ GAT T + GAT T G
Sbjct: 311 GAT------GPTGVTGSIGPTGATGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEI 364
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
T ++ GAT T ++G T T GAT G T +T + GAT
Sbjct: 365 GPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPT---GATGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT 421
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS 338
T +G T T G T +T ++ GAT T
Sbjct: 422 GPTGATGEIGPTGAT------GPTGVTGEIGPTGATGPTGN------------------- 456
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
T +T ++ GAT T G T +T ++ GAT G T +T ++ G
Sbjct: 457 -TGVTGEIGPTGATGPT------GNTGVTGEIGPTGAT---------GPTGVTGEIGPTG 500
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
T T + G T T ++G T T
Sbjct: 501 NTGATGSIGPTGVTGPTGATGSIGPTGATG 530
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/310 (26%), Positives = 114/310 (36%), Gaps = 12/310 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T + G T T ++G T +T + GAT G T T ++G
Sbjct: 216 STGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIG 275
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVF 117
T T G T G T T ++ GAT +T + GAT T ++
Sbjct: 276 PTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPTGEIG 335
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT T + GAT T G T ++ GAT T ++G T T
Sbjct: 336 PTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPT- 394
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT G T +T + GAT T +G T T G T +T ++
Sbjct: 395 --GATGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPTGATGEIGPTGAT------GPTGVTGEIG 446
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
GAT T G T G T +T ++ GAT T +G T T
Sbjct: 447 PTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGVTGEIGPTGNTGATG 506
Query: 298 TLGATELTAK 307
++G T +T
Sbjct: 507 SIGPTGVTGP 516
Score = 67.4 bits (163), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 104/409 (25%), Positives = 148/409 (36%), Gaps = 56/409 (13%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTL 59
+T + GAT T + G T T ++G T T ++G T +T +
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPMGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGST 250
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT G T T ++G T T G T G T T ++
Sbjct: 251 GATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPT 310
Query: 120 GATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 176
GAT +T + GAT T ++ GAT T + GAT T G T ++
Sbjct: 311 GATGPTGVTGSIGPTGATGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEI 370
Query: 177 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
GAT T ++G T T GAT G T +T + GAT T
Sbjct: 371 GPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPT---GATGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPTGAT 427
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
+G T T G T +T ++ GAT T G T +T ++ GAT T
Sbjct: 428 GEIGPTGAT------GPTGVTGEIGPTGATGPT------GNTGVTGEIGPTGATGPT--- 472
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
G T +T ++ GAT T +T ++ G T T
Sbjct: 473 ---GNTGVTGEIGPTGATGPTG-----------------------VTGEIGPTGNTGATG 506
Query: 357 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 405
+ G T T ++G T T GAT +T GAT +++
Sbjct: 507 SIGPTGVTGPTGATGSIGPTGAT------GATGVTGPTGPTGATGNSSQ 549
Score = 67.0 bits (162), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/355 (24%), Positives = 124/355 (34%), Gaps = 29/355 (8%)
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
+T + GAT T + G T T ++G T T G+ T G+T
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPMGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGST 250
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
T + G T T G+ T G T +T + G T T +G T
Sbjct: 251 GATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPT 310
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
T G T +T + GAT T ++ GAT T + GAT T G
Sbjct: 311 GAT------GPTGVTGSIGPTGATGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEI 364
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T ++ GAT T ++G T T G T T ++ GAT T ++G T
Sbjct: 365 GPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT------GPTGATGEIGPTGATGPTGVTGSIGPT 418
Query: 315 ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 374
T + AT G T +T ++ GAT T G
Sbjct: 419 GATGPT-----------------GATGEIGPTGATGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTG 461
Query: 375 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T G T +T ++ GAT T +G T T ++G T +T
Sbjct: 462 EIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGVTGEIGPTGNTGATGSIGPTGVTGP 516
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/330 (26%), Positives = 121/330 (36%), Gaps = 15/330 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T T ++G T +T + GAT G T T ++G T T G
Sbjct: 228 PTGNTGATGSIGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTG 287
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
T G T T ++ GAT +T + GAT T ++ GAT T +
Sbjct: 288 VTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPTGEIGPTGATGATGSIG 347
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT T G T ++ GAT T ++G T T GAT
Sbjct: 348 PTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPT---GATGEIGPTG 404
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G T +T + GAT T +G T T G T G T +T ++
Sbjct: 405 ATGPTGVTGSIGPTGATGPTGATGEIGPTGATGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIG 464
Query: 238 TLGA------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
GA T +T ++ GAT T +G T T ++G T +T GAT
Sbjct: 465 PTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGVTGEIGPTGNTGATGSIGPTGVTGPT---GATG 521
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
GAT +T GAT +++ V
Sbjct: 522 SIGPTGATGATGVTGPTGPTGATGNSSQPV 551
>gi|156331259|ref|XP_001619178.1| hypothetical protein NEMVEDRAFT_v1g224421 [Nematostella vectensis]
gi|156201856|gb|EDO27078.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 398
Score = 72.8 bits (177), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/308 (28%), Positives = 114/308 (37%), Gaps = 32/308 (10%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
+V LG +V LG +VF LG +V LG +V TLG
Sbjct: 118 QVLALGQVSALGQVLALGQVLALGQVFALGQVLAIGQVLALGQVLALGQVLTLG------ 171
Query: 67 KVFTLGAT--ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
+V TLG L + LG ++V LG +V TLG +V TLG
Sbjct: 172 QVLTLGQVLLALGQVLLALGQVLDLSQVLALGQVLALGQVLTLG------QVLTLGQVLA 225
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
+V LG +V LG +V LG +V TLG +V TLG
Sbjct: 226 LGQVLALGQALALGQVLALG------QVLALGQVLALGQVLTLG------QVLTLGQVLA 273
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
+V LG +V LG +V LG +V TLG +V LG
Sbjct: 274 LGQVLALGQALALGQVLDLGQVLALGQVLALGQVLTLGQVLTLGQVLALGQVLALGQALA 333
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 304
+V LG +V LG +V TLG +V LG +V LG
Sbjct: 334 LGQVLALGQVLALGQVLALGQVLTLGQVLTLGQVLALGQVLALGQALALGQVLALG---- 389
Query: 305 TAKVFTLG 312
+V LG
Sbjct: 390 --QVLALG 395
Score = 52.8 bits (125), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/289 (26%), Positives = 105/289 (36%), Gaps = 23/289 (7%)
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
+VF LG +V LG +V LG ++V LG ++ LG
Sbjct: 11 QVFALGQVLALGQVLALG------QVLALGQVLALSQVSALGQVLALSQALALGQALALG 64
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-----AKVFTLGA 253
+V LG +V LG +V LG +V LG ++ +V LG
Sbjct: 65 QVLALGQVLALGQVLALGQVLALGQVLALGQVLALGQVLALGQVFISPWSTLGQVLALGQ 124
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
+V LG +VF LG +V LG +V TLG +V TLG
Sbjct: 125 VSALGQVLALGQVLALGQVFALGQVLAIGQVLALGQVLALGQVLTLG------QVLTLGQ 178
Query: 314 TELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 373
L V+L + + V +V TLG +V TLG +V L
Sbjct: 179 VLLALGQVLLALGQVLDLSQVLALGQVLALGQVLTLG------QVLTLGQVLALGQVLAL 232
Query: 374 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
G +V LG +V LG +V TLG +V LG
Sbjct: 233 GQALALGQVLALGQVLALGQVLALGQVLTLGQVLTLGQVLALGQVLALG 281
>gi|196044087|ref|ZP_03111324.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB108]
gi|196025423|gb|EDX64093.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB108]
Length = 748
Score = 72.8 bits (177), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/447 (25%), Positives = 156/447 (34%), Gaps = 28/447 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T + G+T T + G+T T + G+T T + G+T T + G
Sbjct: 138 STGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTG 197
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------------TLG 96
+T T + G+T T + G+T T + G
Sbjct: 198 STGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTG 257
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
AT T + G T T G T T GAT T + GAT T + G
Sbjct: 258 ATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTG 317
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
T T GAT T + GAT T GAT T G+T T + G
Sbjct: 318 VTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVT---GSTGPTGETGPTG 374
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
+T +T G+T +T G+T T + + G+T G+T +T + G
Sbjct: 375 STGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTG 434
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVILEVEYYKPIKIVP 335
+T +T G+T T G T T G+T +T V E +
Sbjct: 435 STGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTG 494
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
AT T GAT T + G T T G T T GAT T
Sbjct: 495 STGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTG 554
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
++GAT T G T +T + G
Sbjct: 555 SIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGSTG 581
Score = 61.6 bits (148), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 97/396 (24%), Positives = 131/396 (33%), Gaps = 23/396 (5%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
T G T T G T T + G+T +T + G+T +T G T
Sbjct: 87 PTGSTGPTGETGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETG 146
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
+T G T +T G T +T G T +T G T +T G T
Sbjct: 147 VTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETG 206
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVF 213
+T G T T GAT T + GAT T
Sbjct: 207 VTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTG 266
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
+ G T T G T T GAT T + GAT T + G T T
Sbjct: 267 STGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGVTGSTGATG 326
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
GAT T + GAT T GAT T + G T T + V +
Sbjct: 327 NTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLT- 385
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
+T +T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T
Sbjct: 386 ----GSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGS 441
Query: 394 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G+T T G T T G+T +T
Sbjct: 442 TGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGN 477
>gi|384182539|ref|YP_005568301.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
gi|324328623|gb|ADY23883.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
Length = 394
Score = 72.8 bits (177), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/255 (28%), Positives = 102/255 (40%), Gaps = 18/255 (7%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
+L F T +T + GAT +T + G T T GAT +T GAT
Sbjct: 23 DLVGPTFPPVPTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGST------GATGVTGPTGDTGAT 76
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
T + G T +T G+T T + GAT +T + G T T G+T
Sbjct: 77 GDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGST 136
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+T G T T G+T T + GAT T + GAT +T + G T
Sbjct: 137 GVT------GPTGATGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPT 190
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
T G+T T + GAT T + G+T +T + GAT +T + G T
Sbjct: 191 GNT------GSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGSTGVTGPTGSTGATGVTGLTGSTGVT 244
Query: 243 ELTAKVFTLGATELT 257
T + GAT ++
Sbjct: 245 GDTGPTGSTGATGVS 259
Score = 72.8 bits (177), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/255 (28%), Positives = 102/255 (40%), Gaps = 18/255 (7%)
Query: 27 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 86
+L F T +T + GAT +T + G T T GAT +T GAT
Sbjct: 23 DLVGPTFPPVPTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGST------GATGVTGPTGDTGAT 76
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
T + G T +T G+T T + GAT +T + G T T G+T
Sbjct: 77 GDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGST 136
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+T G T T G+T T + GAT T + GAT +T + G T
Sbjct: 137 GVT------GPTGATGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPT 190
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
T G+T T + GAT T + G+T +T + GAT +T + G T
Sbjct: 191 GNT------GSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGSTGVTGPTGSTGATGVTGLTGSTGVT 244
Query: 267 ELTAKVFTLGATELT 281
T + GAT ++
Sbjct: 245 GDTGPTGSTGATGVS 259
Score = 72.8 bits (177), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/255 (28%), Positives = 102/255 (40%), Gaps = 18/255 (7%)
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+L F T +T + GAT +T + G T T GAT +T GAT
Sbjct: 23 DLVGPTFPPVPTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGST------GATGVTGPTGDTGAT 76
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
T + G T +T G+T T + GAT +T + G T T G+T
Sbjct: 77 GDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGST 136
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
+T G T T G+T T + GAT T + GAT +T + G T
Sbjct: 137 GVT------GPTGATGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPT 190
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
T G+T T + GAT T + G+T +T + GAT +T + G T
Sbjct: 191 GNT------GSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGSTGVTGPTGSTGATGVTGLTGSTGVT 244
Query: 303 ELTAKVFTLGATELT 317
T + GAT ++
Sbjct: 245 GDTGPTGSTGATGVS 259
Score = 72.0 bits (175), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/245 (28%), Positives = 99/245 (40%), Gaps = 18/245 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T + GAT +T + G T T GAT +T GAT T + G
Sbjct: 33 PTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGST------GATGVTGPTGDTGATGDTGSTGSTG 86
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G+T T + GAT +T + G T T G+T +T G
Sbjct: 87 PTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGSTGVT------G 140
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G+T T + GAT T + GAT +T + G T T G
Sbjct: 141 PTGATGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGNT------G 194
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+T T + GAT T + G+T +T + GAT +T + G T T + G
Sbjct: 195 STGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGSTGVTGPTGSTGATGVTGLTGSTGVTGDTGPTGSTG 254
Query: 241 ATELT 245
AT ++
Sbjct: 255 ATGVS 259
Score = 62.4 bits (150), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/281 (25%), Positives = 101/281 (35%), Gaps = 44/281 (15%)
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+L F T +T + GAT +T + G T T GAT +T GAT
Sbjct: 23 DLVGPTFPPVPTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGST------GATGVTGPTGDTGAT 76
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
T + G T +T G+T T + GAT +T + G T T G+T
Sbjct: 77 GDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGST 136
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVE 326
+T G T T G+T T + GAT T + GAT +T
Sbjct: 137 GVT------GPTGATGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGIT--------- 181
Query: 327 YYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 386
G T T G+T T + GAT T + G
Sbjct: 182 -----------------------GPTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTG 218
Query: 387 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 427
+T +T + GAT +T + G T T + GAT ++
Sbjct: 219 STGVTGPTGSTGATGVTGLTGSTGVTGDTGPTGSTGATGVS 259
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/246 (26%), Positives = 91/246 (36%), Gaps = 32/246 (13%)
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
+L F T +T + GAT +T + G T T GAT +T GAT
Sbjct: 23 DLVGPTFPPVPTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGST------GATGVTGPTGDTGAT 76
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
T + G T +T G+T T + GAT +T + G T T G+T
Sbjct: 77 GDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGST 136
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+T G T T +T T + GAT T + G
Sbjct: 137 GVTGPTGATGPTGNTG--------------------STGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTG 176
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
AT +T + G T T G+T T + GAT T + G+T +T + G
Sbjct: 177 ATGITGPTGSTGPTGNT------GSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGSTGVTGPTGSTG 230
Query: 423 ATELTA 428
AT +T
Sbjct: 231 ATGVTG 236
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/222 (26%), Positives = 78/222 (35%), Gaps = 28/222 (12%)
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
+L F T +T + GAT +T + G T T GAT +T GAT
Sbjct: 23 DLVGPTFPPVPTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGST------GATGVTGPTGDTGAT 76
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS 338
T + G T +T G+T T + GAT +T +
Sbjct: 77 GDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGST--------------G 122
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
T T G+T +T G T T G+T T + GAT T + G
Sbjct: 123 PTGSTGPTGNTGSTGVT------GPTGATGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTG 176
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGS 440
AT +T + G T T G T T NTG GS
Sbjct: 177 ATGITGPTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGA--TGNTGPTGS 216
>gi|296451979|ref|ZP_06893694.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP08]
gi|296259170|gb|EFH06050.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP08]
Length = 561
Score = 72.8 bits (177), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 91/316 (28%), Positives = 107/316 (33%), Gaps = 12/316 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GA +T +GAT + G T T G T T GA
Sbjct: 46 TGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGA 105
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
+T GAT A T G+T T GA +T GAT T GA
Sbjct: 106 NGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGA 162
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T G T T + GAT T V GA +T +GA
Sbjct: 163 TGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGA 222
Query: 182 TELT---AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
T T +V GA T +G T T GA L GAT V
Sbjct: 223 TGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGP 282
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
G T T +G T T+GAT T +G T T GAT T V
Sbjct: 283 TGPTGATGVAGAIGPTG------TVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGA 336
Query: 299 LGATELTAKVFTLGAT 314
GAT + + G T
Sbjct: 337 TGATGVAGPIGPTGPT 352
Score = 65.5 bits (158), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 93/332 (28%), Positives = 110/332 (33%), Gaps = 23/332 (6%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GA +T GAT GA +T +GAT + G T T
Sbjct: 41 GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGAN 91
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T GA +T GAT A T G+T T GA +T
Sbjct: 92 GITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNT 148
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT T GAT T G T T G T T + GAT T V
Sbjct: 149 GATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGAT 208
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
GA +T +GAT T +V GA T +G T T GA L
Sbjct: 209 GANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPT 268
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
GAT V G T T + + P V AT T +G T T
Sbjct: 269 GPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAI-----GPTGTV---GATGPTGADGAVGPTGATG 320
Query: 357 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 388
GAT T V GAT + + G T
Sbjct: 321 ATGANGATGPTGAVGATGATGVAGPIGPTGPT 352
Score = 65.5 bits (158), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/311 (28%), Positives = 105/311 (33%), Gaps = 24/311 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
A +T +GAT + G T T G T T GA +T G
Sbjct: 57 ANGITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKG 116
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTA 114
AT A T G+T T GA +T GAT LT GA +T
Sbjct: 117 ATG--ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITG 173
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT- 173
GAT G T T + GAT T V GA +T +GAT T
Sbjct: 174 PTGNTGATGAN------GVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTG 227
Query: 174 --AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
+V GA T +G T T GA L GAT V G T
Sbjct: 228 ADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTG 287
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
T +G T T+GAT T +G T T GAT T V GAT
Sbjct: 288 ATGVAGAIGPTG------TVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGATGATG 341
Query: 292 LTAKVFTLGAT 302
+ + G T
Sbjct: 342 VAGPIGPTGPT 352
Score = 65.1 bits (157), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/414 (26%), Positives = 129/414 (31%), Gaps = 53/414 (12%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GA +T GAT GA +T +GAT + G T T
Sbjct: 41 GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGAN 91
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T GA +T GAT A T G+T T GA +T
Sbjct: 92 GITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNT 148
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT T G T T G T T + GAT T V
Sbjct: 149 GATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGAT 208
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
GA +T +GAT T +V GA T +G T T GA L
Sbjct: 209 GANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPT 268
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
GAT V G T T +G T T+GAT T +G T T +
Sbjct: 269 GPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPTG------TVGATGPTGADGAVGPTGATGAT 322
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA------------ 368
N AT T V GAT + + G T
Sbjct: 323 G--------------ANGATGPTGAVGATGATGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATG 368
Query: 369 ------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
+GAT +G T T GAT T GAT T
Sbjct: 369 ANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVTGATGNTGATGANGATGPTG 422
Score = 62.8 bits (151), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 90/325 (27%), Positives = 106/325 (32%), Gaps = 29/325 (8%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GA +T GAT GA +T +GAT + G T T
Sbjct: 41 GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGAN 91
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T GA +T GAT A T G+T T GA +T
Sbjct: 92 GITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNT 148
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T GAT T G T T G T T + GAT T V
Sbjct: 149 GATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGAT 208
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GA +T +GAT T +G T V P ++ T T
Sbjct: 209 GANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGA--------VGATGPDGVI---GPTGPTGATG 257
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT------AKVFTLGATELTAKVFTLGATE 401
GA L GAT V G T T T+GAT T +G T
Sbjct: 258 ATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPTGTVGATGPTGADGAVGPTG 317
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T GAT T V GAT +
Sbjct: 318 ATGATGANGATGPTGAVGATGATGV 342
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/316 (27%), Positives = 101/316 (31%), Gaps = 39/316 (12%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G+T T GA +T GAT T G T LT GA +T
Sbjct: 125 GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGAT------GPTGLTGATGATGANGITGPTGNT 178
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKV 128
GAT G T T + GAT T V GA +T +GAT T +V
Sbjct: 179 GATGAN------GVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEV 232
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
GA T +G T T GA L GAT V G T T
Sbjct: 233 GPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVA 292
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
+G T T+GAT T +G T T GAT T V GAT + +
Sbjct: 293 GAIGPTG------TVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGATGATGVAGPI 346
Query: 249 FTLGATELTA------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
G T +GAT +G T T GAT
Sbjct: 347 GPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVTGAT 406
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTA 306
T GAT T
Sbjct: 407 GNTGATGANGATGPTG 422
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/278 (26%), Positives = 88/278 (31%), Gaps = 33/278 (11%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T LT GA +T GAT G T T + GAT T V GA
Sbjct: 157 TGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGAN------GVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGA 210
Query: 62 TELTAKVFTLGATELT---AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
+T +GAT T +V GA T +G T T GA L
Sbjct: 211 NGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGP 270
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
GAT V G T T +G T T+GAT T +G T T
Sbjct: 271 TGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPTG------TVGATGPTGADGAVGPTGATGATGA 324
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA------------------KVFTLGATEL 220
GAT T V GAT + + G T +GAT
Sbjct: 325 NGATGPTGAVGATGATGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGPTGAVGATGA 384
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
+G T T GAT T GAT T
Sbjct: 385 NGVAGPIGPTGPTGANGVTGATGNTGATGANGATGPTG 422
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 66/213 (30%), Gaps = 26/213 (12%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GA +T GAT GA +T +GAT + G T T
Sbjct: 41 GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGAN 91
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G T T GA +T GAT + G T T +
Sbjct: 92 GITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGAT--------------- 136
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
A +T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 137 --GANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTG 194
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
+ GAT T V GA +T +GAT T
Sbjct: 195 STGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTG 227
>gi|423459539|ref|ZP_17436336.1| hypothetical protein IEI_02679, partial [Bacillus cereus BAG5X2-1]
gi|401143460|gb|EJQ50995.1| hypothetical protein IEI_02679, partial [Bacillus cereus BAG5X2-1]
Length = 248
Score = 71.6 bits (174), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/151 (39%), Positives = 62/151 (41%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVT 122
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 123 GATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 71.6 bits (174), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/151 (39%), Positives = 62/151 (41%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVT 122
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
GAT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 123 GATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 71.6 bits (174), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/151 (39%), Positives = 62/151 (41%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVT 122
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 123 GATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 71.6 bits (174), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/151 (39%), Positives = 62/151 (41%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVT 122
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
GAT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 123 GATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 71.6 bits (174), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/151 (39%), Positives = 62/151 (41%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVT 122
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
GAT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 123 GATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 71.6 bits (174), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/151 (39%), Positives = 62/151 (41%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVT 122
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
GAT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 123 GATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 70.1 bits (170), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/167 (37%), Positives = 67/167 (40%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVT 122
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
GAT LT GAT LT GAT LT G T + + T
Sbjct: 123 GATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGAT---GPTGVIGPITT 166
Score = 70.1 bits (170), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/150 (39%), Positives = 61/150 (40%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT G
Sbjct: 4 PTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVTG 63
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T LT GAT LT G+ LT GAT LT G T LT G
Sbjct: 64 PTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVTG 123
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
AT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 124 ATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 62.4 bits (150), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/165 (35%), Positives = 62/165 (37%), Gaps = 14/165 (8%)
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT +
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGV- 61
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
T LT GAT LT G+ LT GAT LT
Sbjct: 62 -------------TGPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPG 108
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT
Sbjct: 109 VTGPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTG 153
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/181 (34%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 17/181 (9%)
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT +GAT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVIGATGLTGSPGVT 62
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
G T LT GAT LT + + LT GAT LT
Sbjct: 63 GPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGV--------------TGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPG 108
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
G T LT GAT LT GAT LT GAT LT G T + +
Sbjct: 109 VTGPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGAT---GPTGVIGPIT 165
Query: 420 T 420
T
Sbjct: 166 T 166
Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/155 (34%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 15/155 (9%)
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G T LT GAT LT GAT LT + AT LT
Sbjct: 3 GPTGLTGSSGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSPGV--------------TGATGLTGSPG 48
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
+GAT LT G T LT GAT LT G+ LT GAT LT
Sbjct: 49 VIGATGLTGSPGVTGPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGSPGLTGSPGVTGATGLTGSPG 108
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELT-AKNIRSNTGTVGSP 441
G T LT GAT LT + + TG GSP
Sbjct: 109 VTGPTGLTGSPGVTGATGLTGSPGVTGATGLTGSP 143
>gi|150017445|ref|YP_001309699.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium beijerinckii
NCIMB 8052]
gi|149903910|gb|ABR34743.1| Collagen triple helix repeat [Clostridium beijerinckii NCIMB 8052]
Length = 914
Score = 71.6 bits (174), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/432 (25%), Positives = 125/432 (28%), Gaps = 11/432 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 219 ATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGATGPTG 278
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T GAT T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 279 DTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 338
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G T +T G T T G T T G T +T G
Sbjct: 339 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 398
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVF 237
AT T G T T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 399 ATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTG 458
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G T +T G T T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 459 DTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTG 518
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
G T T G T +T + V T +T GAT T
Sbjct: 519 VTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT--------GDTGVTGPTGDTGATGPTGD 570
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
G T T G T +T GAT T G T T G T +T
Sbjct: 571 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 630
Query: 418 VFTLGATELTAK 429
G T T
Sbjct: 631 TGDTGVTGPTGD 642
Score = 70.5 bits (171), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 108/418 (25%), Positives = 120/418 (28%), Gaps = 29/418 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T G T T G T +T G T T G T T
Sbjct: 218 GATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGATGPT 277
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T GAT T G T T G T +T G T T
Sbjct: 278 GDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 337
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 338 GPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 397
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T G T T G T +T GAT T G T
Sbjct: 398 GATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPT--------- 448
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T +T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 449 GDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 508
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GAT T T +T GAT T G T T
Sbjct: 509 GATGPTGD--------------------TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 548
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T +T GAT T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 549 PTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 606
Score = 69.7 bits (169), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 108/420 (25%), Positives = 122/420 (29%), Gaps = 11/420 (2%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 242 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVT 301
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 302 GPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 361
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T T G T +T GAT T G T T
Sbjct: 362 GVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 421
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T +T GAT T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 422 GDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 481
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
G T T G T +T GAT T G T T G T +T
Sbjct: 482 GATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPT 541
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 368
G T T + + P AT T G T T G T +T
Sbjct: 542 GDTGVTGPTGDTGVT-----GPTG---DTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTG 593
Query: 369 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT T G T T G T +T G T T G T T
Sbjct: 594 PTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 653
Score = 68.2 bits (165), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/427 (25%), Positives = 123/427 (28%), Gaps = 11/427 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 256 TGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 315
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T G T T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 316 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 375
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T +T GAT T G T T G T +T GA
Sbjct: 376 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 435
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 436 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDT---GV 492
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 493 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 552
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T +T GAT T + + P AT T G T T
Sbjct: 553 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVT-----GPTG---DTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPT 604
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T +T G T T G T T G T +T G T T
Sbjct: 605 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 664
Query: 422 GATELTA 428
G T T
Sbjct: 665 GPTGDTG 671
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 105/421 (24%), Positives = 122/421 (28%), Gaps = 14/421 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 350 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVT 409
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
G T T G T +T GAT T G T +T G T +T
Sbjct: 410 GPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPT 469
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
G T T G T T G T +T GAT T G T T
Sbjct: 470 GDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGAT 529
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T +T G T T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 530 GPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDT 589
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 590 GVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 649
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 368
G T T + + T +T G T T G T T
Sbjct: 650 GDTGVTGPTGDTGVTG-----------PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 698
Query: 369 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
+ G T +T G T T G T T + G T +T G T T
Sbjct: 699 VTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTG 758
Query: 429 K 429
Sbjct: 759 D 759
Score = 67.0 bits (162), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/431 (25%), Positives = 124/431 (28%), Gaps = 7/431 (1%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T GAT T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 280 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 339
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G T +T G T T G T T G T +T GA
Sbjct: 340 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 399
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFT 178
T T G T T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 400 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 459
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G T +T G T T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 460 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGV 519
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 520 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 579
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELT-AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
GAT T G T T A + P T T G T T
Sbjct: 580 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTG---DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 636
Query: 358 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
G T +T G T T G T T G T +T G T T
Sbjct: 637 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 696
Query: 418 VFTLGATELTA 428
G+T T
Sbjct: 697 TGVTGSTGDTG 707
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/420 (25%), Positives = 120/420 (28%), Gaps = 20/420 (4%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T GAT T G T T G T +T G T T
Sbjct: 278 GDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 337
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 338 GPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 397
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKV 188
GAT T G T T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 398 GATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 457
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T +T G T T G T T G T +T GAT T
Sbjct: 458 GDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDT 517
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 518 GVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPT 577
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 368
GAT T + + T T G T T G T +T
Sbjct: 578 GDTGATGPTGDTGV-----------------TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 620
Query: 369 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G T T G T T G T +T G T T G T T
Sbjct: 621 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 680
Score = 65.1 bits (157), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/427 (25%), Positives = 124/427 (29%), Gaps = 8/427 (1%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 316 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 375
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G T +T GAT T G T T G T +T GA
Sbjct: 376 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 435
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 436 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDT---GV 492
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 493 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 552
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T +T GAT T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 553 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 612
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T T G T +T + + P T T G T T
Sbjct: 613 TGDTGVTGPTGDTGVTGPT--GDTGVTGPTG---DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 667
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T +T G T T G T T + G T +T G T T
Sbjct: 668 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 727
Query: 422 GATELTA 428
G T T
Sbjct: 728 GPTGDTG 734
Score = 64.7 bits (156), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/427 (25%), Positives = 124/427 (29%), Gaps = 11/427 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 364 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 423
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T GAT T G T T G T T G T +T GA
Sbjct: 424 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 483
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 484 TGPTGDT---GVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 540
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T +T GAT T G T T G T +T GA
Sbjct: 541 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGA 600
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T G T T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 601 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 660
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T +T G T T + + P T T G+T T
Sbjct: 661 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT-----GPTG---DTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPT 712
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T +T G T T G+T T G T +T G T T
Sbjct: 713 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 772
Query: 422 GATELTA 428
G T T
Sbjct: 773 GPTGATG 779
Score = 64.7 bits (156), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/427 (25%), Positives = 124/427 (29%), Gaps = 11/427 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T G T T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 328 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 387
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T GAT T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 388 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 447
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 448 TGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDT---GVTGPTGDTGVTGP 504
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T +T GAT T G T T G T +T GA
Sbjct: 505 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 564
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 565 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 624
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T +T G T T + + P T T G T T
Sbjct: 625 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT-----GPTG---DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 676
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T +T G T T G+T T G T +T G T T
Sbjct: 677 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGAT 736
Query: 422 GATELTA 428
G+T T
Sbjct: 737 GSTGDTG 743
Score = 62.4 bits (150), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/428 (25%), Positives = 123/428 (28%), Gaps = 5/428 (1%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 352 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 411
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G T +T GAT T G T T G T T G
Sbjct: 412 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGD 471
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T +T GAT T G T T G T T G T +T GA
Sbjct: 472 TGVTGPTGDTGATGPTGDT---GVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGA 528
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 529 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 588
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T +T GAT T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 589 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 648
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T T G T +T + + P T T G T +T
Sbjct: 649 TGDTGVTGPTGDTGVTGPT--GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDT 706
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 707 GVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 766
Query: 422 GATELTAK 429
G T +T
Sbjct: 767 GDTGVTGP 774
Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/328 (25%), Positives = 97/328 (29%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 463 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 522
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G T +T G T T G T T G T +T GA
Sbjct: 523 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGA 582
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 583 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 642
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T +T G T T G T T G T +T G T T G+
Sbjct: 643 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGS 702
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T G T +T G T T G+T T G T +T G
Sbjct: 703 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 762
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYK 329
T T G T T + + Y+
Sbjct: 763 TGPTGDTGVTGPTGATGAGLAADGYVYE 790
Score = 56.6 bits (135), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/319 (26%), Positives = 96/319 (30%), Gaps = 6/319 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 435 ATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDT---G 491
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G T T G T +T GAT T G T T G
Sbjct: 492 VTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTG 551
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T +T GAT T G T T G T +T GAT T G
Sbjct: 552 DTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTG 611
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T G T +T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 612 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPT---GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTG 668
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T +T G T T G T T + G T +T G T T G
Sbjct: 669 DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 728
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAK 319
T T + G T +T
Sbjct: 729 PTGDTGATGSTGDTGVTGP 747
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/270 (25%), Positives = 79/270 (29%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 510 ATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTG 569
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T GAT T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 570 DTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 629
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G T +T G T T G T T G T +T G
Sbjct: 630 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 689
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T G+T T G T +T G T T G+T T G
Sbjct: 690 VTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTG 749
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
T +T G T T G T T
Sbjct: 750 DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGATG 779
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.96, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/281 (24%), Positives = 77/281 (27%), Gaps = 14/281 (4%)
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+T G T +T G T T G T T G T T GAT
Sbjct: 216 VTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGATG 275
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
T G T T G T +T GAT T G T T G T
Sbjct: 276 PTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 335
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEY 327
+T G T T G T T G T +T G T T + +
Sbjct: 336 VTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT---- 391
Query: 328 YKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 387
T T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 392 ----------GPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 441
Query: 388 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
T +T G T T G T T G T T
Sbjct: 442 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 482
>gi|448117024|ref|XP_004203156.1| Piso0_000757 [Millerozyma farinosa CBS 7064]
gi|359384024|emb|CCE78728.1| Piso0_000757 [Millerozyma farinosa CBS 7064]
Length = 970
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/224 (21%), Positives = 77/224 (34%), Gaps = 3/224 (1%)
Query: 8 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 67
+FT G + F+ G + + G + FT G + FT G +
Sbjct: 543 LFTSGDKKEEKPSFSFGEKKEDKPTLSFGQKKEEKPAFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKP 602
Query: 68 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
FT G + FT G + F+ G + FT G + + G +
Sbjct: 603 AFTFGEKKDDKPAFTFGEKKEDKSTFSFGDKKEDKPAFTFGEKKDDKPSLSFGEKKDDKP 662
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
+ G + +F+ G + FT G + FTLG + T G +
Sbjct: 663 TLSFGEKKDDKPLFSFGQKKDDKPAFTFGEKKEDKPAFTLGEKKEDKPTLTFGEKKEIKP 722
Query: 188 VFTLGAT--ELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
FT G + +AK F+ G + FT G + FT G
Sbjct: 723 AFTFGEKKEDDSAKPSFSFGGKKDEKPAFTFGEKKDDKPSFTFG 766
Score = 63.9 bits (154), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/247 (20%), Positives = 78/247 (31%), Gaps = 23/247 (9%)
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
+FT G + F+ G + + G + FT G + FT G +
Sbjct: 543 LFTSGDKKEEKPSFSFGEKKEDKPTLSFGQKKEEKPAFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKP 602
Query: 188 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
FT G + FT G + F+ G + FT G + + G +
Sbjct: 603 AFTFGEKKDDKPAFTFGEKKEDKSTFSFGDKKEDKPAFTFGEKKDDKPSLSFGEKKDDKP 662
Query: 248 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
+ G + +F+ G + FT G + FTLG + T G +
Sbjct: 663 TLSFGEKKDDKPLFSFGQKKDDKPAFTFGEKKEDKPAFTLGEKKEDKPTLTFGEKKEIKP 722
Query: 308 VFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 367
FT G + E + KP F+ G + FT G +
Sbjct: 723 AFTFGEKK--------EDDSAKP---------------SFSFGGKKDEKPAFTFGEKKDD 759
Query: 368 AKVFTLG 374
FT G
Sbjct: 760 KPSFTFG 766
Score = 62.0 bits (149), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/185 (21%), Positives = 62/185 (33%)
Query: 116 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
+FT G + F+ G + + G + FT G + FT G +
Sbjct: 543 LFTSGDKKEEKPSFSFGEKKEDKPTLSFGQKKEEKPAFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKP 602
Query: 176 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
FT G + FT G + F+ G + FT G + + G +
Sbjct: 603 AFTFGEKKDDKPAFTFGEKKEDKSTFSFGDKKEDKPAFTFGEKKDDKPSLSFGEKKDDKP 662
Query: 236 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
+ G + +F+ G + FT G + FTLG + T G +
Sbjct: 663 TLSFGEKKDDKPLFSFGQKKDDKPAFTFGEKKEDKPAFTLGEKKEDKPTLTFGEKKEIKP 722
Query: 296 VFTLG 300
FT G
Sbjct: 723 AFTFG 727
Score = 55.8 bits (133), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/227 (21%), Positives = 76/227 (33%), Gaps = 19/227 (8%)
Query: 200 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
+FT G + F+ G + + G + FT G + FT G +
Sbjct: 543 LFTSGDKKEEKPSFSFGEKKEDKPTLSFGQKKEEKPAFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKP 602
Query: 260 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
FT G + FT G + F+ G + FT G + + G +
Sbjct: 603 AFTFGEKKDDKPAFTFGEKKEDKSTFSFGDKKEDKPAFTFGEKKDDKPSLSFGEKKDDKP 662
Query: 320 SVIL-EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 378
++ E + KP+ F+ G + FT G + FTLG +
Sbjct: 663 TLSFGEKKDDKPL---------------FSFGQKKDDKPAFTFGEKKEDKPAFTLGEKKE 707
Query: 379 TAKVFTLGATELTAKVFTLGAT--ELTAKV-FTLGATELTAKVFTLG 422
T G + FT G + +AK F+ G + FT G
Sbjct: 708 DKPTLTFGEKKEIKPAFTFGEKKEDDSAKPSFSFGGKKDEKPAFTFG 754
>gi|218232576|ref|YP_002369322.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus B4264]
gi|218160533|gb|ACK60525.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus B4264]
Length = 459
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/296 (31%), Positives = 103/296 (34%), Gaps = 9/296 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
KV GAT T GAT T G+T T GAT T GAT T
Sbjct: 35 KVGPTGATGATGPT---GATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTG 91
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
GAT +T + G T T G+T T + GAT T GAT T
Sbjct: 92 PT---GATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATG 148
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
GAT T G T T GAT +T + G T T G+T T
Sbjct: 149 PTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTG 208
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
GAT T G T T GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 209 ATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGITG 268
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
G T T GAT T G T T GAT +T + GAT
Sbjct: 269 AT---GPTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGAT 321
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/291 (29%), Positives = 99/291 (34%)
Query: 31 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 90
KV GAT T G+T T + G T T GAT T G+T T
Sbjct: 35 KVGPTGATGATGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTG 94
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
GAT T G T T GAT T GAT T G T +T
Sbjct: 95 ATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGITG 154
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ G T T G+T T GAT T G T T GAT +T
Sbjct: 155 ATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITG 214
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
+ G T T G+T T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 215 ATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGITGATGPTG 274
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
G T T GAT +T + G T T G+T T S+
Sbjct: 275 PTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGATGTSI 325
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/289 (30%), Positives = 98/289 (33%), Gaps = 6/289 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GAT T G+T T GAT T GAT T G
Sbjct: 39 TGATGATGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGI 98
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T GAT +T G+T T + GAT T GAT T GA
Sbjct: 99 TGATGSTGPTGATGITGAT---GSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGITGA 155
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T GAT +T + G T T G+T T GA
Sbjct: 156 TGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGA 215
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T T GAT T GAT T GAT +T G
Sbjct: 216 TGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGITGAT---GP 272
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
T T GAT T G T T GAT +T + GAT
Sbjct: 273 TGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGAT 321
Score = 65.9 bits (159), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/278 (30%), Positives = 95/278 (34%), Gaps = 6/278 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G+T T GAT T GAT T G T T G
Sbjct: 50 ATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTG 109
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T G+T T + GAT T GAT T GAT T G
Sbjct: 110 ATGITGAT---GSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATG 166
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T GAT +T + G T T G+T T GAT T G
Sbjct: 167 ITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATG 226
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T GAT T GAT T GAT +T G T T G
Sbjct: 227 ITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGITGAT---GPTGPTGATGITG 283
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
AT T G T T GAT +T + GAT
Sbjct: 284 ATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGAT 321
Score = 62.0 bits (149), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/305 (28%), Positives = 100/305 (32%), Gaps = 14/305 (4%)
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
KV GAT T GAT T G+T T GAT T GAT T
Sbjct: 35 KVGPTGATGATGPT---GATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTG 91
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
G T T GAT +T + G T T G T T GAT T
Sbjct: 92 PTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTG 151
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
G+T T GAT T G T T GAT +T + G T T
Sbjct: 152 ITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATG 211
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
G+T T + I +T T GAT T GAT
Sbjct: 212 ITGATGSTGPTGATGITGAT-----------GSTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGP 260
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T GAT T G T T GAT +T + G T T G+T
Sbjct: 261 TGATGITGATGPTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGA 320
Query: 427 TAKNI 431
T +I
Sbjct: 321 TGTSI 325
>gi|449282724|gb|EMC89535.1| Cysteine-rich, acidic integral membrane protein [Columba livia]
Length = 438
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/231 (25%), Positives = 80/231 (34%), Gaps = 21/231 (9%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 287 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILE--VEYYKPIKIVP 335
G TEL G T+L + G TEL S+ L + Y +++ P
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCG-SLRLPPALRLYPALRLYP 406
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 82
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 18/214 (8%)
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
G T+L + T+L + G TEL G T+L G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLCS------CTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------ 356
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
G TEL G T+L + G TEL +
Sbjct: 357 CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCGSL 390
Score = 65.5 bits (158), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 62/188 (32%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T+L G T+L G TE G T+L G T+L G
Sbjct: 209 CTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCG 268
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
TE G T+L G T+L G TE T+L + G
Sbjct: 269 CTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCSCTQLCSCTQLCG 328
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
TEL G T+L G T+L G TEL G T+L + G
Sbjct: 329 CTELCGCTEPCGCTQLCGCTQLCGCTQL------CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCG 382
Query: 181 ATELTAKV 188
TEL +
Sbjct: 383 CTELCGSL 390
Score = 63.9 bits (154), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/238 (25%), Positives = 75/238 (31%), Gaps = 44/238 (18%)
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
G TE G T+L G T+L G TE G T+L
Sbjct: 195 CGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEP 254
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
G T+L G TE G T+L G T+L G T+L
Sbjct: 255 CGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQLCGCTDLCGCTEPCGCTQL------CGCTDLCGCTEP 308
Query: 311 LGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 370
G T+L S T+L + G TEL G T+L
Sbjct: 309 CGCTQLC--------------------SCTQLCSCTQLCGCTELCGCTEPCGCTQL---- 344
Query: 371 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G T+L G T+L G TEL G T+L + G TEL
Sbjct: 345 --CGCTQL------CGCTQL------CGCTELCGCTEPCGCTQLCSCTQLCGCTELCG 388
>gi|270013391|gb|EFA09839.1| hypothetical protein TcasGA2_TC011986 [Tribolium castaneum]
Length = 21117
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-09, Method: Composition-based stats.
Identities = 110/392 (28%), Positives = 169/392 (43%), Gaps = 82/392 (20%)
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE-----LTAKVFTLGATELTAKV 140
TE V L T T K +T ++ T+G+T TA+V GAT +T
Sbjct: 5064 TETPVTVVGLPETTPTPKSI------VTEEIVTVGSTTKLPEGTTAEVIETGATLVT--- 5114
Query: 141 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE-----LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
+G E T K +T +V T+G+T T +V GAT +T V L AT
Sbjct: 5115 -VVGLPETTPKSL------VTEEVVTVGSTTKLNEGTTTEVIETGATPVT--VAGLPATT 5165
Query: 196 ----LTAKVFTLGATE-----LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+T +V T+G+T TA+V GAT +T +G +E T K +T
Sbjct: 5166 PKSLVTEEVVTVGSTTKLPEGTTAEVIETGATPVT----VVGLSETTPKSL------ITE 5215
Query: 247 KVFTLGATE-----LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
+V T G+T TA+V GAT +T +G E T K F +T +V T+G+
Sbjct: 5216 EVVTAGSTTKLHEGTTAEVIQTGATPVT----VVGLPETTPKSF------VTEEVVTVGS 5265
Query: 302 TEL-------TAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL 354
T + TA++ GAT + E PI + ++ T LT K T +T+L
Sbjct: 5266 TTMQPLPEGTTAEIIQTGATGIKYVPETTTKEITSPIMVQEGSTVTVLTTKETTPMSTQL 5325
Query: 355 TAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
+E+T K+ T A ELT T+ + E T + T E ++ T
Sbjct: 5326 V--------SEITTKLPETTQAQELTP--VTVVSPEATHAIDT--KNESVTQIQTTEFAT 5373
Query: 414 LTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGSPTHMS 445
++K FT E+T ++ + + +P ++
Sbjct: 5374 TSSKYFTEKIPEITTSSVTTPETSYSTPERLT 5405
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Composition-based stats.
Identities = 72/294 (24%), Positives = 117/294 (39%), Gaps = 28/294 (9%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGA--TELTA 114
G E T ++ T+ T +V G +E AK T G TE+ +V T+G TE
Sbjct: 4437 GLPESTKLLYNESETKSTTEV---GTSEFVAKSTTAGKEVTTEIIQEVTTVGGFGTEPVE 4493
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLG-ATELTA--KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
K+ T T++ + + G ATE + KV +G TEL ++ T G +E + T G +
Sbjct: 4494 KIST--KTKIPEDISSTGFATEESTETKVTKIGTTELRSEYTTQGVSETYSTPATSGGLK 4551
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
T ++ G T +T L + L E T FT + L TE
Sbjct: 4552 TTKEI--EGLTPVTTTGLPLTTKPSVTQTEKLTTLEGTNTYFT----HIPKTTHMLSTTE 4605
Query: 232 LTA----KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
+ +L T + + T +++ KV + T +T F + +T+ + T
Sbjct: 4606 MEGLTPVSTISLPETTVEYENATTSEPKVSEKVESSTVTTPVTISEFISSTSSVTSALHT 4665
Query: 287 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSAT 340
G T T T + TAK + T + E+ +VPQ + +
Sbjct: 4666 EGTTTFTQMPETYPSRTETAKALSTSREPTTTEKSFGEIS----TTVVPQRNES 4715
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.19, Method: Composition-based stats.
Identities = 102/399 (25%), Positives = 151/399 (37%), Gaps = 45/399 (11%)
Query: 44 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 103
V T+G T T K +T + K T+ +T +T TE V T
Sbjct: 6147 VTTVGETFTTGKEYT----SASPKESTISIKYVTEPKYTF-VTETEKTVPTSEVVPHETI 6201
Query: 104 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
+ T T K T+ ++T T + T + + T T+K F E+T
Sbjct: 6202 TTSGTPTAFTEKYVTIPGVKVTETETTKPLEKYTTPIISTVETVKTSKSFET-TPEITTS 6260
Query: 164 VF----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
V+ TL ++T ++ T G T + FT T + + F TE V T A
Sbjct: 6261 VYSKPTTLSTEKITPEIIT-GKYIPTTEYFTQKTTSFSTGSTPFVGTTTEKHVTVVTASA 6319
Query: 218 TELTAK-VFTLGAT-----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELTA 270
LT K + T+G T E + K + +E T + TE + K A E T
Sbjct: 6320 ELLTTKPIITIGTTVGLETEKSTKPLEIVLSETTT--LEVPTTEKMQTKPTVTFAPETTT 6377
Query: 271 KVFTLGAT----ELTAKVFTLGATELTAK-------VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
+T G T + +A+ T T K V T+ + + +V T ATE T+
Sbjct: 6378 TNYTAGITTEGVKTSAEYLTSHPETETTKPGFYSTPVSTVYTSPIKTEVTTSKATEFTSP 6437
Query: 320 SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-ATELTAKVFTLGATEL 378
I + KPI TE T+ + AT TA T G TE T+ V T
Sbjct: 6438 PKIETTTHEKPI--------TEFTSPIKIETATPPTAIFVTEGITTEYTSPVIKTIGTTT 6489
Query: 379 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
+ T TE +++T +T K T G + K
Sbjct: 6490 ETEGKTYSTTE---QLYTSATASITEKGTTPGMISSSQK 6525
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.37, Method: Composition-based stats.
Identities = 71/271 (26%), Positives = 106/271 (39%), Gaps = 36/271 (13%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGA--TELTA 186
G E T ++ T+ T +V G +E AK T G TE+ +V T+G TE
Sbjct: 4437 GLPESTKLLYNESETKSTTEV---GTSEFVAKSTTAGKEVTTEIIQEVTTVGGFGTEPVE 4493
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLG-ATELTA--KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
K+ T T++ + + G ATE + KV +G TEL ++ T G +E + T G +
Sbjct: 4494 KIST--KTKIPEDISSTGFATEESTETKVTKIGTTELRSEYTTQGVSETYSTPATSGGLK 4551
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T ++ G T +T L + L E T FT + L TE
Sbjct: 4552 TTKEI--EGLTPVTTTGLPLTTKPSVTQTEKLTTLEGTNTYFT----HIPKTTHMLSTTE 4605
Query: 304 LTA--KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS--------ATELTAKVFTLGATE 353
+ V T+ E T VEY P+ S T +T F +
Sbjct: 4606 MEGLTPVSTISLPETT-------VEYENATTSEPKVSEKVESSTVTTPVTISEFISSTSS 4658
Query: 354 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 384
+T+ + T G T T T + TAK +
Sbjct: 4659 VTSALHTEGTTTFTQMPETYPSRTETAKALS 4689
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.1, Method: Composition-based stats.
Identities = 66/258 (25%), Positives = 106/258 (41%), Gaps = 34/258 (13%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGA--TELTA 246
G E T ++ T+ T +V G +E AK T G TE+ +V T+G TE
Sbjct: 4437 GLPESTKLLYNESETKSTTEV---GTSEFVAKSTTAGKEVTTEIIQEVTTVGGFGTEPVE 4493
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLG-ATELTA--KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
K+ T T++ + + G ATE + KV +G TEL ++ T G +E + T G +
Sbjct: 4494 KIST--KTKIPEDISSTGFATEESTETKVTKIGTTELRSEYTTQGVSETYSTPATSGGLK 4551
Query: 304 LTAKV-----FTLGATELTAKSVILEVE----------YYKPI-KIVPQNSATELTA--- 344
T ++ T LT K + + E Y+ I K S TE+
Sbjct: 4552 TTKEIEGLTPVTTTGLPLTTKPSVTQTEKLTTLEGTNTYFTHIPKTTHMLSTTEMEGLTP 4611
Query: 345 -KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 402
+L T + + T +++ KV + T +T F + +T+ + T G T
Sbjct: 4612 VSTISLPETTVEYENATTSEPKVSEKVESSTVTTPVTISEFISSTSSVTSALHTEGTTTF 4671
Query: 403 TAKVFTLGATELTAKVFT 420
T T + TAK +
Sbjct: 4672 TQMPETYPSRTETAKALS 4689
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.2, Method: Composition-based stats.
Identities = 122/497 (24%), Positives = 187/497 (37%), Gaps = 85/497 (17%)
Query: 16 LTAKVFTLGAT----ELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 68
+TAKV L E T K F ATE + TL TE LG T+ T
Sbjct: 5827 ITAKVGELTPATIVPETTTKTFVSEVSNATETSIPETTLKVTEKATSPSVLGNTKPTTVS 5886
Query: 69 FTLGATELTA----KVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+ E+T K++T+ G + T + L T+K L T + K +T+G T+
Sbjct: 5887 EYVTVQEITGIPTIKIYTIPGEAQKTTESSGLTKQSTTSKE-ELPPTSYSTKQYTVGTTK 5945
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------TAKVFTLGATE----LT 173
T TE++ E+ FT E + V T +TE LT
Sbjct: 5946 -TLPTTEKSETEISVTTSGTEKGEIPGS-FTTSTPERYKTVAPISTVHTYISTERNQFLT 6003
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV---FTLGAT 230
+ T+ + T+ + TEL T G T+ + T +E T K+ +T T
Sbjct: 6004 TEFETIATEKTTSGYTSHIPTELYV---TTGLTKAPKEEIT--TSEYTTKISTEYTAIPT 6058
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTL---GATELTAK--------VF 273
E T K E T T G TE +T + T+ A+E T K +
Sbjct: 6059 EKTTKYLETVVPESTVSSATRGTTETFISESITPEYVTMTTTKASEETTKPERGTPEFMT 6118
Query: 274 TLGATELTAKVFT-------LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV----- 321
+ G TE T ++T V T+G T T K +T + + + S+
Sbjct: 6119 SQGITE-TPTLYTNPVTTTGTKKETTKPPVTTVGETFTTGKEYTSASPKESTISIKYVTE 6177
Query: 322 -----ILEVEYYKPI-KIVPQN------SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 369
+ E E P ++VP + T T K T+ ++T T + T
Sbjct: 6178 PKYTFVTETEKTVPTSEVVPHETITTSGTPTAFTEKYVTIPGVKVTETETTKPLEKYTTP 6237
Query: 370 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
+ + T T+K F E+T V+ TL ++T ++ T G T + FT T
Sbjct: 6238 IISTVETVKTSKSFET-TPEITTSVYSKPTTLSTEKITPEIIT-GKYIPTTEYFTQKTTS 6295
Query: 426 LTAKNIRSNTGTVGSPT 442
+ +T VG+ T
Sbjct: 6296 FST----GSTPFVGTTT 6308
>gi|193709419|ref|XP_001951969.1| PREDICTED: nucleoporin nsp1-like [Acyrthosiphon pisum]
Length = 693
Score = 71.2 bits (173), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/340 (28%), Positives = 160/340 (47%), Gaps = 33/340 (9%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T+ T+ F+LG T + F+LG T T+ F+LG T + F+ G T + TLG
Sbjct: 38 TQPTSTGFSLGGTTQKSTGFSLGGTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQASTGSTLGV 97
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-------------------KVFTLGATELTA 102
T + F+ G T + F+ +T T+ F+LG + T+
Sbjct: 98 TNQLSTGFSSGTTSASTG-FSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLGRYK-TS 155
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
F+ GAT + F+ +T T+ +L +T + F+LG + T+ F+
Sbjct: 156 TAFSSGATPTASTGFSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLGRYK-TSTAFSS 214
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT + F+L +T T+ F+LG T + F+ G T + F LG T + F+L
Sbjct: 215 GATPTASTGFSLASTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQASTGFLLGVTNQPSTGFSL 274
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T + F+LG T+ + +LG + T+ F++ AT ++L +T T+ F+L
Sbjct: 275 GTTSASTG-FSLGTTQA-SNTISLGKNQ-TSTTFSMCATPTVFTGYSLASTTQTSTGFSL 331
Query: 276 GA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
G+ T+ T+ F+LG T + TLG T + F+LG T
Sbjct: 332 GSNTQPTSTGFSLGGTTQASPGSTLGVTNQPSTGFSLGTT 371
Score = 66.6 bits (161), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/372 (27%), Positives = 170/372 (45%), Gaps = 48/372 (12%)
Query: 57 FTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 115
F+LG+ T+ T+ F+LG T + F+LG T T+ F+LG T + F+ G T +
Sbjct: 32 FSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQKSTGFSLGGTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQAST 91
Query: 116 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------GATELTAKVFTLG 168
TLG T + F+ G T + F+ +T T+ +L +T + F+LG
Sbjct: 92 GSTLGVTNQLSTGFSSGTTSASTG-FSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLG 150
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------GATELTAKVFTLGATELT 221
+ T+ F+ GAT + F+ +T T+ +L +T + F+LG + T
Sbjct: 151 RYK-TSTAFSSGATPTASTGFSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLGRYK-T 208
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
+ F+ GAT + F+L +T T+ F+LG T + F+ G T + F LG T
Sbjct: 209 STAFSSGATPTASTGFSLASTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQASTGFLLGVTNQP 268
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE 341
+ F+LG T + F+LG T+ + +LG +
Sbjct: 269 STGFSLGTTSASTG-FSLGTTQA-SNTISLGKNQ-------------------------- 300
Query: 342 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 400
T+ F++ AT ++L +T T+ F+LG+ T+ T+ F+LG T + TLG T
Sbjct: 301 -TSTTFSMCATPTVFTGYSLASTTQTSTGFSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQASPGSTLGVT 359
Query: 401 ELTAKVFTLGAT 412
+ F+LG T
Sbjct: 360 NQPSTGFSLGTT 371
Score = 65.5 bits (158), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/423 (27%), Positives = 196/423 (46%), Gaps = 38/423 (8%)
Query: 9 FTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 67
F+LG+ T+ T+ F+LG T + F+LG T T+ F+LG T + F+ G T +
Sbjct: 32 FSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQKSTGFSLGGTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQAST 91
Query: 68 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------GATELTAKVFTLG 120
TLG T + F+ G T + F+ +T T+ +L +T + F+LG
Sbjct: 92 GSTLGVTNQLSTGFSSGTTSASTG-FSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLG 150
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------GATELTAKVFTLGATELT 173
+ T+ F+ GAT + F+ +T T+ +L +T + F+LG + T
Sbjct: 151 RYK-TSTAFSSGATPTASTGFSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLGRYK-T 208
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 233
+ F+ GAT + F+L +T T+ F+LG T + F+ G T + F LG T
Sbjct: 209 STAFSSGATPTASTGFSLASTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQASTGFLLGVTNQP 268
Query: 234 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 293
+ F+LG T + F+LG T+ + +LG + T+ F++ AT ++L +T T
Sbjct: 269 STGFSLGTTSASTG-FSLGTTQA-SNTISLGKNQ-TSTTFSMCATPTVFTGYSLASTTQT 325
Query: 294 AKVFTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGAT 352
+ F+LG+ T+ T+ F+LG T + L V T + F+LG T
Sbjct: 326 STGFSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQASPGSTLGV--------------TNQPSTGFSLGTT 371
Query: 353 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL-TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
+ F+ +T + +L T+ TA F+ G T + +L T + F+L
Sbjct: 372 SASTG-FSFASTTRASNGLSLITTQASTASTFSSGTTPTMSTSLSLAGTTQASTGFSLAT 430
Query: 412 TEL 414
T++
Sbjct: 431 TKV 433
Score = 54.7 bits (130), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/230 (29%), Positives = 114/230 (49%), Gaps = 6/230 (2%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T+ F+ GAT + F+L +T T+ F+LG T + F+ G T + F LG T
Sbjct: 208 TSTAFSSGATPTASTGFSLASTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQASTGFLLGVTNQ 267
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
+ F+LG T + F+LG T+ + +LG + T+ F++ AT ++L +T
Sbjct: 268 PSTGFSLGTTSASTG-FSLGTTQA-SNTISLGKNQ-TSTTFSMCATPTVFTGYSLASTTQ 324
Query: 125 TAKVFTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T+ F+LG+ T+ T+ F+LG T + TLG T + F+LG T + F+ +T
Sbjct: 325 TSTGFSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQASPGSTLGVTNQPSTGFSLGTTSASTG-FSFASTT 383
Query: 184 LTAKVFTLGATEL-TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
+ +L T+ TA F+ G T + +L T + F+L T++
Sbjct: 384 RASNGLSLITTQASTASTFSSGTTPTMSTSLSLAGTTQASTGFSLATTKV 433
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/261 (28%), Positives = 122/261 (46%), Gaps = 16/261 (6%)
Query: 165 FTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
F+LG+ T+ T+ F+LG T + F+LG T T+ F+LG T + F+ G T +
Sbjct: 32 FSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQKSTGFSLGGTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQAST 91
Query: 224 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
TLG T + F+ G T + F+ +T T+ + L + +T +
Sbjct: 92 GSTLGVTNQLSTGFSSGTTSASTG-FSFASTTRTSNGLS-----LITTQASTASTTQASN 145
Query: 284 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELT 343
F+LG + T+ F+ GAT + F+ +T T+ + L I ++T
Sbjct: 146 AFSLGRYK-TSTAFSSGATPTASTGFSFASTTRTSNGLSL-------ITTQASTASTTQA 197
Query: 344 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 403
+ F+LG + T+ F+ GAT + F+L +T T+ F+LG T + F+ G T
Sbjct: 198 SNAFSLGRYK-TSTAFSSGATPTASTGFSLASTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQA 256
Query: 404 AKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
+ F LG T + F+LG T
Sbjct: 257 STGFLLGVTNQPSTGFSLGTT 277
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/335 (25%), Positives = 144/335 (42%), Gaps = 70/335 (20%)
Query: 141 FTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
F+LG+ T+ T+ F+LG T + F+LG T T+ F+LG T + F+ G T +
Sbjct: 32 FSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQKSTGFSLGGTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQAST 91
Query: 200 VFTLGATELTAKVFTLGATELT------------------------------AKVFTLGA 229
TLG T + F+ G T + + F+LG
Sbjct: 92 GSTLGVTNQLSTGFSSGTTSASTGFSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLGR 151
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-------------------KVFTLGATELTA 270
+ T+ F+ GAT + F+ +T T+ F+LG + T+
Sbjct: 152 YK-TSTAFSSGATPTASTGFSFASTTRTSNGLSLITTQASTASTTQASNAFSLGRYK-TS 209
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
F+ GAT + F+L +T T+ F+LG T + F+ G T + +L V
Sbjct: 210 TAFSSGATPTASTGFSLASTTQTSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQASTGFLLGV----- 264
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 390
T + F+LG T + F+LG T+ + +LG + T+ F++ AT
Sbjct: 265 ---------TNQPSTGFSLGTTSASTG-FSLGTTQA-SNTISLGKNQ-TSTTFSMCATPT 312
Query: 391 TAKVFTLGATELTAKVFTLGA-TELTAKVFTLGAT 424
++L +T T+ F+LG+ T+ T+ F+LG T
Sbjct: 313 VFTGYSLASTTQTSTGFSLGSNTQPTSTGFSLGGT 347
Score = 38.1 bits (87), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/106 (34%), Positives = 56/106 (52%), Gaps = 4/106 (3%)
Query: 320 SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 378
S L V+Y I +V S+T+ +A F+LG+ T+ T+ F+LG T + F+LG T
Sbjct: 8 SCKLLVDYQLDIVVV--RSSTQASAG-FSLGSNTQPTSTGFSLGGTTQKSTGFSLGGTTQ 64
Query: 379 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
T+ F+LG T + F+ G T + TLG T + F+ G T
Sbjct: 65 TSTGFSLGGTTQASTGFSFGKTTQASTGSTLGVTNQLSTGFSSGTT 110
>gi|222097993|ref|YP_002532050.1| hypothetical protein BCQ_4335 [Bacillus cereus Q1]
gi|221242051|gb|ACM14761.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 447
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/218 (31%), Positives = 84/218 (38%), Gaps = 24/218 (11%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 96 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 137
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 138 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 197
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPTGATGVT 258
Query: 198 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 259 GSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/218 (31%), Positives = 84/218 (38%), Gaps = 24/218 (11%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 108 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 149
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 150 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 209
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPTGATGVT 258
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 259 GSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/218 (31%), Positives = 84/218 (38%), Gaps = 24/218 (11%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 132 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 173
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 233
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPTGATGVT 258
Query: 234 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 259 GSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/218 (31%), Positives = 84/218 (38%), Gaps = 24/218 (11%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 144 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPTGATGVT 258
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 259 GSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 70.5 bits (171), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/218 (31%), Positives = 84/218 (38%), Gaps = 24/218 (11%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 180 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 221
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPTGATGVT 258
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 259 GSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 38/232 (16%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 216 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 257
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 258 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 317
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPTGATGVT 258
Query: 318 AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 369
+ P AT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 259 GST--------GPTG------ATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/232 (28%), Positives = 82/232 (35%), Gaps = 38/232 (16%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 228 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 269
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 270 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYK 329
GAT +T GAT +T GAT +T G T T +
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGVTGSTGPT--------- 252
Query: 330 PIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 253 --------GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 38/232 (16%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 252 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 293
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 294 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATE 353
GAT +T GAT +T + P AT +T GAT
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST--------GPTG------ATGITGST---GATG 244
Query: 354 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 405
+T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 245 VTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 38/232 (16%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 264 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 365
GAT +T + P AT +T GAT +T GAT
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGST--------GPTG------ATGITGSTGPTGATGITGST---GATG 244
Query: 366 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
+T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 245 VTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 38/232 (16%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 85 GATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGVTGSTGPT 141
Query: 276 GATELTAKVFTLGATE------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 317
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 142 GATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 201
Query: 318 AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 377
+ P AT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 202 GST--------GPTG------ATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATG 244
Query: 378 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
+T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 245 VTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
>gi|385263864|ref|ZP_10041951.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus sp. 5B6]
gi|385148360|gb|EIF12297.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus sp. 5B6]
Length = 2307
Score = 69.3 bits (168), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 95/362 (26%), Positives = 134/362 (37%), Gaps = 8/362 (2%)
Query: 41 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 100
T G+T +T GAT T GAT +T GA+ +T G+T +
Sbjct: 587 TGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTGATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGI 646
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 160
T G T LT +G T +T G+T +T + GAT T + G T +
Sbjct: 647 TGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGA---TGSTGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGV 703
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 220
T G+T +T + G T T + G T T G+T +T + T +
Sbjct: 704 TGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGV 763
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGA 277
T G+T +T GAT +T + G T +T + GAT +T G
Sbjct: 764 TGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGE 823
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN 337
T + GAT +T G T +T G+T T V P I +
Sbjct: 824 NGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTG--VTGPTGAAGPTGITGET 881
Query: 338 SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
T T G T +T + G T T G T T + GAT T + +
Sbjct: 882 GPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGST 941
Query: 398 GA 399
GA
Sbjct: 942 GA 943
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 95/367 (25%), Positives = 137/367 (37%), Gaps = 14/367 (3%)
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T G+T +T GAT T GAT +T GA+ +T G+T +
Sbjct: 587 TGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTGATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGI 646
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T G T LT +G T +T G+T +T + GAT T + G T +
Sbjct: 647 TGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGA---TGSTGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGV 703
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
T G+T +T + G T T + G T T G+T +T + T +
Sbjct: 704 TGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGV 763
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGA 301
T G+T +T GAT +T + G T +T + GAT +T G
Sbjct: 764 TGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGE 823
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T + GAT +T + P + +T +T + G T T
Sbjct: 824 NGPTGETGETGATGVTGAT-----GATGPTGVT---GSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPT 875
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T T G+T +T GAT T G+T +T + GAT T +
Sbjct: 876 GITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGST 935
Query: 422 GATELTA 428
G T T
Sbjct: 936 GETGSTG 942
Score = 58.5 bits (140), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 113/466 (24%), Positives = 164/466 (35%), Gaps = 52/466 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GA+ +T G+T +T G T LT +G T +T G
Sbjct: 619 ATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGA---TG 675
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T +T + GAT T + G T +T G+T +T + G T T + G
Sbjct: 676 STGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTG 735
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G+T +T + T +T G+T +T GAT +T + G
Sbjct: 736 VTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTG 795
Query: 181 ATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
T +T + GAT +T G T + GAT +T G T +T
Sbjct: 796 VTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTG 855
Query: 238 ---TLGATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
+ G+T +T G T +T G+T +T GAT T G+T
Sbjct: 856 VTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTG 915
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS----------------------------VIL 323
+T + GAT T + G T T S V
Sbjct: 916 VTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGSTGASGATGATGITGATGTTGPTGVTGSTGATGVTG 975
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
P + T T G+T +T + G T T GAT T +
Sbjct: 976 ATGETGPTGV------TGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGP---TGATGATGAIG 1026
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T G+T +T G+T +T G T +T +
Sbjct: 1027 PTGETGSTGPTGVTGSTGVTGS---TGSTGVTGPTGAAGPTGITGE 1069
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/465 (24%), Positives = 162/465 (34%), Gaps = 47/465 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T GAT T GAT +T GA+ +T G+T +T G
Sbjct: 595 STGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTGATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTG 654
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T LT +G T +T G+T +T + GAT T + G T +T G
Sbjct: 655 PTGLTGVTGEIGPTGVTGA---TGSTGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTG 711
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T +T + G T T + G T T G+T +T + T +T G
Sbjct: 712 STGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETG 771
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
+T +T GAT +T + G T +T + GAT +T G T +
Sbjct: 772 STGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETG 831
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T G T +T + G+T +T G T +T + G T T
Sbjct: 832 ETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGE---TGPTGDTG 888
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA--- 351
G T +T + G T T + + V AT T + + GA
Sbjct: 889 STGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGST--GATGSTGATGSTGETGSTGASGA 946
Query: 352 ---------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 384
T T + G T T G+T +T +
Sbjct: 947 TGATGITGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGP 1006
Query: 385 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T GAT T + G T T G+T +T
Sbjct: 1007 AGPTGATGP---TGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGS 1048
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/434 (25%), Positives = 155/434 (35%), Gaps = 32/434 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T + GAT T + G T +T G+T +T + G T T + G
Sbjct: 676 STGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTG 735
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G+T +T + T +T G+T +T GAT +T + G
Sbjct: 736 VTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTG 795
Query: 121 ATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
T +T + GAT +T G T + GAT +T GAT T
Sbjct: 796 VTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVT------GATGATGPTG 849
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G+T +T + G T T G T T G+T +T GAT T
Sbjct: 850 VTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTG 909
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT---------------ELTA 282
G+T +T + GAT T GAT T + + GA+ T
Sbjct: 910 ATGSTGVTGVTGSTGATGST------GATGSTGETGSTGASGATGATGITGATGTTGPTG 963
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATEL 342
+ GAT +T G T +T + G E + V + P AT
Sbjct: 964 VTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTG--ETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGA 1021
Query: 343 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 402
T + G T T G+T +T + G T T G T T G+T +
Sbjct: 1022 TGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGV 1081
Query: 403 TAKVFTLGATELTA 416
T GAT T
Sbjct: 1082 TGPTGVTGATGSTG 1095
Score = 51.6 bits (122), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 110/466 (23%), Positives = 158/466 (33%), Gaps = 50/466 (10%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T G+T +T GAT T GAT +T GA+ +T G+T +
Sbjct: 587 TGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTGATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGI 646
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T G T LT +G T +T G+T +T + GAT T + G T +
Sbjct: 647 TGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGA---TGSTGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGV 703
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T G+T +T + G T T + G T T G+T +T + T +
Sbjct: 704 TGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGV 763
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGA 241
T G+T +T GAT +T + G T +T + GAT +T G
Sbjct: 764 TGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGE 823
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
T + GAT +T G T +T + G+T +T G T +T +
Sbjct: 824 NGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGP 883
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
G T T G T T + + + V T T + GAT T +
Sbjct: 884 TGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGV-----TGSTGATGSTGATGSTGET 938
Query: 359 FTLGA------------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 388
+ GA T T + G T T G+T
Sbjct: 939 GSTGASGATGATGITGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGST 998
Query: 389 ELTAKVFTLGATELTAKVF------TLGATELTAKVFTLGATELTA 428
+T + G T T +G T T G T T
Sbjct: 999 GVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTG 1044
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/441 (25%), Positives = 149/441 (33%), Gaps = 53/441 (12%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + + GAT +T G T + GAT +T GAT T G+
Sbjct: 800 TGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVT------GATGATGPTGVTGS 853
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T + G T T G T T G+T +T GAT T G+
Sbjct: 854 TGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGS 913
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-------------- 167
T +T + GAT T GAT T + + GA+ T
Sbjct: 914 TGVTGVTGSTGATGST------GATGSTGETGSTGASGATGATGITGATGTTGPTGVTGS 967
Query: 168 ----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G T T + G T T G+T +T + G T T GAT T
Sbjct: 968 TGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGP---TGATGATGA 1024
Query: 224 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
+ G T T G+T +T G+T +T G T +T + G T T
Sbjct: 1025 IGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGS---TGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGV 1081
Query: 284 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELT 343
G T T GAT T + + G T T S AT +T
Sbjct: 1082 TGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGAS-----------------GATGIT 1124
Query: 344 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 403
++ G T T + G T T G+T +T + G T T GAT
Sbjct: 1125 GEIGPTGVTGSTGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAI 1184
Query: 404 AKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
G T +T + G T
Sbjct: 1185 GPTGAAGPTGITGETGPTGDT 1205
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT +T G T +T GAT T G T T GAT +T
Sbjct: 1785 GATGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGATGIT 1844
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G+T T GAT T GAT +T GAT +T GAT LT +
Sbjct: 1845 GSTGSTGDTGVTGATGSTGP---TGATGVTGPTGETGATGVT------GATGLTGSTGST 1895
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
G T T GAT +T + G T LT + G+T
Sbjct: 1896 GVTGATGSTGPTGATGVTGPTGSTGPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT +T G T +T GAT T G T T GAT +T
Sbjct: 1785 GATGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGATGIT 1844
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G+T T GAT T GAT +T GAT +T GAT LT +
Sbjct: 1845 GSTGSTGDTGVTGATGSTGP---TGATGVTGPTGETGATGVT------GATGLTGSTGST 1895
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
G T T GAT +T + G T LT + G+T
Sbjct: 1896 GVTGATGSTGPTGATGVTGPTGSTGPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/171 (31%), Positives = 70/171 (40%), Gaps = 21/171 (12%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT +T GAT +T G T T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 1785 GATGVTGS---TGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGS---TGATGVTGATGIT 1838
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T + G T +T + G T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1839 GATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPT---------GATGVTGPTGETGATGVT------ 1883
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
GAT LT + G T T GAT +T + G T LT + G+T
Sbjct: 1884 GATGLTGSTGSTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGSTGPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/171 (31%), Positives = 70/171 (40%), Gaps = 21/171 (12%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT +T GAT +T G T T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 1785 GATGVTGS---TGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGS---TGATGVTGATGIT 1838
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T + G T +T + G T GAT +T GAT +T
Sbjct: 1839 GATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPT---------GATGVTGPTGETGATGVT------ 1883
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
GAT LT + G T T GAT +T + G T LT + G+T
Sbjct: 1884 GATGLTGSTGSTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGSTGPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/158 (31%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T G T +T GAT T G T T GAT +T G
Sbjct: 1786 ATGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGATGITG 1845
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T T GAT T GAT +T GAT +T GAT LT + G
Sbjct: 1846 STGSTGDTGVTGATGSTGP---TGATGVTGPTGETGATGVT------GATGLTGSTGSTG 1896
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
T T GAT +T + G T LT + G+T
Sbjct: 1897 VTGATGSTGPTGATGVTGPTGSTGPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/155 (32%), Positives = 65/155 (41%), Gaps = 15/155 (9%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T GAT +T G T T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 1785 GATGVTGS---TGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGS---TGATGVTGATGIT 1838
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
GAT +T + G T +T + GAT +T GAT +T GAT LT
Sbjct: 1839 GATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGETGATGVT------GATGLTGST 1892
Query: 285 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
+ G T T GAT +T + G T LT +
Sbjct: 1893 GSTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGSTGPTGLTGE 1927
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/310 (24%), Positives = 104/310 (33%), Gaps = 39/310 (12%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + G T T G+T +T G+T +T G T +T + G
Sbjct: 1018 ATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGS---TGSTGVTGPTGAAGPTGITGE---TG 1071
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G T +T + G T T G+T T GAT +T ++ G
Sbjct: 1072 PTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGATGITGEIGPTG 1131
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T + G T T G+T +T + G T T GAT G
Sbjct: 1132 VTGSTGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGAAG 1191
Query: 181 ATELTAKVFTLG---------------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVF 213
T +T + G AT +T G T T
Sbjct: 1192 PTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGSTGETGPTGETGPTG 1251
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
G+T T G+T +T GAT +T GAT +T G T T +
Sbjct: 1252 VTGSTGATGSTGVTGSTGITGSTGDTGATGVT------GATGVTGSSGATGVTGATGETG 1305
Query: 274 TLGATELTAK 283
+ G T T +
Sbjct: 1306 STGDTGATGE 1315
>gi|296503149|ref|YP_003664849.1| hypothetical protein BMB171_C2317 [Bacillus thuringiensis BMB171]
gi|296324201|gb|ADH07129.1| hypothetical protein BMB171_C2317 [Bacillus thuringiensis BMB171]
Length = 397
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/208 (30%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 10/208 (4%)
Query: 23 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 77
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 78 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATEL 136
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 137 T-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/208 (30%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 10/208 (4%)
Query: 35 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 89
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 90 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATEL 148
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 149 TA-KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/208 (30%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 10/208 (4%)
Query: 47 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 101
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 102 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATEL 160
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 161 T-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/208 (30%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 10/208 (4%)
Query: 59 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 113
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 114 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATEL 172
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 173 T-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/208 (30%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 10/208 (4%)
Query: 71 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATEL 184
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 185 T-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/208 (30%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 10/208 (4%)
Query: 83 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 137
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 138 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATEL 196
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 197 TA-KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 255
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 256 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/208 (30%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 10/208 (4%)
Query: 119 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 173
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATEL 232
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 233 T-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 68.6 bits (166), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/190 (31%), Positives = 76/190 (40%), Gaps = 5/190 (2%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATELTAKVF 129
GAT +T G T +T G T + G T + + GAT +T +
Sbjct: 100 GATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGPSGGPIGPTGATGITGPIG 159
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 160 PTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTG 219
Query: 190 TLGATELTAK 199
G T +T
Sbjct: 220 PTGVTGITGP 229
Score = 67.4 bits (163), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/208 (29%), Positives = 79/208 (37%), Gaps = 8/208 (3%)
Query: 227 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE 341
GAT +T GAT +T G T +T + V P
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 342 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 401
+ GAT +T + GAT +T + GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
+T G T +T G T +T
Sbjct: 202 ITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 66.6 bits (161), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/189 (30%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 5/189 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T T GAT LT GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 44 ATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTG 100
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATELT-AKVFTLGATELTAKVFT 118
AT +T G T +T G T + G T + + GAT +T +
Sbjct: 101 ATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGPSGGPIGPTGATGITGPIGP 160
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 161 TGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGP 220
Query: 179 LGATELTAK 187
G T +T
Sbjct: 221 TGVTGITGP 229
Score = 65.5 bits (158), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/220 (30%), Positives = 83/220 (37%), Gaps = 20/220 (9%)
Query: 203 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 257
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 258 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 317
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGP--AGPTGPT 139
Query: 318 AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 377
S PI AT +T + GAT +T + GAT +T GAT
Sbjct: 140 GPS-------GGPIG---PTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATG 189
Query: 378 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
+T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 190 ITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 57.4 bits (137), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/222 (28%), Positives = 82/222 (36%), Gaps = 24/222 (10%)
Query: 167 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 221
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATEL 280
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 281 T-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA 339
+ + GAT +T + GAT +T + GAT +T + A
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTG--------------PTGA 187
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
T +T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 188 TGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
Score = 56.6 bits (135), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/222 (29%), Positives = 82/222 (36%), Gaps = 24/222 (10%)
Query: 179 LGATELTAKVFTL-----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 233
+G T FTL GAT T T GAT LT GAT +T GAT +T
Sbjct: 25 IGPTLPPISSFTLPTGASGATGPTGPTGTSGATGLTGPT---GATGITGPTGPTGATGIT 81
Query: 234 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFTLGATEL 292
GAT +T GAT +T G T +T G T + G T
Sbjct: 82 GPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSGGPAGPTGPTGP 141
Query: 293 T-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA 351
+ + GAT +T + GAT +T PI AT +T GA
Sbjct: 142 SGGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITG-----------PIG---PTGATGITGPTGPTGA 187
Query: 352 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
T +T GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 188 TGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGP 229
>gi|229192724|ref|ZP_04319683.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
gi|228590814|gb|EEK48674.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
Length = 358
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/224 (30%), Positives = 84/224 (37%), Gaps = 6/224 (2%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
KV G T T GAT +T GAT T + G+T T + G T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGITGAT---GATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATG 59
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
GAT T G+T T + + G T T G+T T GAT T
Sbjct: 60 STGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTG 119
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
G+T LT GAT +T + G T T + GAT T G T T
Sbjct: 120 ATGITGSTGLTGPT---GATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTG 176
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
GAT +T GAT +T GAT T + GAT
Sbjct: 177 PTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGSTGAT 220
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/224 (30%), Positives = 84/224 (37%), Gaps = 6/224 (2%)
Query: 31 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 90
KV G T T GAT +T GAT T + G+T T + G T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGITGAT---GATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATG 59
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
GAT T G+T T + + G T T G+T T GAT T
Sbjct: 60 STGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTG 119
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
G+T LT GAT +T + G T T + GAT T G T T
Sbjct: 120 ATGITGSTGLTGPT---GATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTG 176
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
GAT +T GAT +T GAT T + GAT
Sbjct: 177 PTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGSTGAT 220
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/224 (30%), Positives = 84/224 (37%), Gaps = 6/224 (2%)
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
KV G T T GAT +T GAT T + G+T T + G T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGITGAT---GATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATG 59
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
GAT T G+T T + + G T T G+T T GAT T
Sbjct: 60 STGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTG 119
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
G+T LT GAT +T + G T T + GAT T G T T
Sbjct: 120 ATGITGSTGLTGPT---GATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTG 176
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
GAT +T GAT +T GAT T + GAT
Sbjct: 177 PTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGSTGAT 220
Score = 65.9 bits (159), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/227 (30%), Positives = 85/227 (37%), Gaps = 12/227 (5%)
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
KV G T T GAT +T GAT T G+T T G+T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGIT------GATGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTG 56
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ G T T GAT T +G+T T + GAT T GAT T
Sbjct: 57 ATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPT---GATGPTG 113
Query: 211 KVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
+ GAT +T GAT +T + G T T + GAT T G T
Sbjct: 114 ATGSTGATGITGSTGLTGPTGATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITG 173
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T GAT +T GAT +T GAT T + GAT
Sbjct: 174 STGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGSTGAT 220
Score = 64.7 bits (156), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/216 (30%), Positives = 80/216 (37%), Gaps = 6/216 (2%)
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
KV G T T GAT +T GAT T + G+T T + G T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGITGAT---GATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATG 59
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
GAT T G+T T + + G T T G+T T GAT T
Sbjct: 60 STGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTG 119
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
G+T LT GAT +T + G T T + GAT T G T T
Sbjct: 120 ATGITGSTGLTGPT---GATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTG 176
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
GAT +T GAT +T GAT T
Sbjct: 177 PTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTG 212
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/217 (30%), Positives = 81/217 (37%), Gaps = 6/217 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GAT +T GAT T + G+T T + G T T GA
Sbjct: 10 TGATGSTGPTGATGITGAT---GATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGA 66
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G+T T + + G T T G+T T GAT T G+
Sbjct: 67 TGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTGATGITGS 126
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T LT GAT +T + G T T + GAT T G T T GA
Sbjct: 127 TGLTGPT---GATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTGPTGPTGA 183
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
T +T GAT +T GAT T + GAT
Sbjct: 184 TGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGSTGAT 220
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/238 (28%), Positives = 84/238 (35%), Gaps = 20/238 (8%)
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
KV G T T GAT +T GAT T + G+T T + G T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGITGAT---GATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATG 59
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
GAT T G+T T + + G T T G+T T GAT T
Sbjct: 60 STGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTG 119
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
G+T LT + AT +T + G T T + GAT
Sbjct: 120 ATGITGSTGLTGPT-----------------GATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGS 162
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
T G T T GAT +T GAT +T GAT T + GAT
Sbjct: 163 TGPTGATGITGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGSTGAT 220
Score = 59.7 bits (143), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/194 (30%), Positives = 73/194 (37%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + G+T T + G T T GAT T G+T T + + G
Sbjct: 30 ATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTG 89
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G+T T GAT T G+T LT GAT +T + G
Sbjct: 90 PTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTGATGITGSTGLTGPT---GATGITGATGSTG 146
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T + GAT T G T T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 147 PTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 206
Query: 181 ATELTAKVFTLGAT 194
AT T + GAT
Sbjct: 207 ATGPTGATGSTGAT 220
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/262 (29%), Positives = 93/262 (35%), Gaps = 44/262 (16%)
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
KV G T T GAT +T GAT T G+T T G+T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGIT------GATGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTG 56
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+ G T T GAT T +G+T T + GAT T GAT T
Sbjct: 57 ATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPT---GATGPTG 113
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
+ GAT +T G+T LT GAT +T + G T T + GAT T
Sbjct: 114 ATGSTGATGIT------GSTGLTGPT---GATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTG 164
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
GAT +T T GAT +T GAT +
Sbjct: 165 PT---GATGITGS-----------------------TGPTGPTGATGITGATGPTGATGI 198
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 388
T GAT T + GAT
Sbjct: 199 TGATGPTGATGPTGATGSTGAT 220
Score = 51.6 bits (122), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/221 (28%), Positives = 77/221 (34%), Gaps = 26/221 (11%)
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
KV G T T GAT +T GAT T G+T T G+T T
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGIT------GATGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTG 56
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
+ G T T GAT T +G+T T + GAT T +
Sbjct: 57 ATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPT---------- 106
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 387
AT T + GAT +T GAT +T + G T T + GA
Sbjct: 107 -------GATGPTGATGSTGATGITGSTGLTGPTGATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGA 159
Query: 388 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
T T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 160 TGSTGPTGATGITGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITG 200
>gi|392534507|ref|ZP_10281644.1| RNase E [Pseudoalteromonas arctica A 37-1-2]
Length = 1058
Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/141 (48%), Positives = 70/141 (49%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
TE AKV TE +A V
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSAPHV 992
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTA 138
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 13 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 72
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTA 150
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 25 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 84
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTA 162
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 37 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTA 174
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 49 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTA 186
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTA 198
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTA 210
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTA 222
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTA 234
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTA 246
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTA 258
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTA 270
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTA 282
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/138 (49%), Positives = 69/138 (50%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AKV ATE AKV T
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVATEEPAKVETPV 911
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 912 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPV 971
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTA 306
TE AKV TE +A
Sbjct: 972 VTEEPAKVEAKVKTEKSA 989
Score = 58.5 bits (140), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/156 (44%), Positives = 75/156 (48%), Gaps = 17/156 (10%)
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQ 336
A E AKV A E AKV T ATE AKV T TE AK VE P+
Sbjct: 855 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVATEEPAKVETPVVTEEPAK-----VEA--PV----- 899
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
ATE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 900 --ATEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVET 957
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIR 432
TE AKV T TE AKV TE +A +++
Sbjct: 958 PVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAKVKTEKSAPHVK 993
>gi|219129102|ref|XP_002184736.1| predicted protein [Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1]
gi|217403845|gb|EEC43795.1| predicted protein [Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1]
Length = 1034
Score = 67.4 bits (163), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 133/439 (30%), Positives = 186/439 (42%), Gaps = 54/439 (12%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
E TA+ G +E TA+ GA TA G T+ TA LG TA+ G T
Sbjct: 338 EGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGTADGIADGTTDGTADGAWLG----TAEGIADGTT 393
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G
Sbjct: 394 DGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADGTA 445
Query: 123 ELTAKVFTLGA----TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
+ TA +LG E TA+ G +E TA+ GA A+ G T+ TA +
Sbjct: 446 DGTADGASLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIADGTTDGTADGAS 505
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
LG TA+ G T+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A
Sbjct: 506 LG----TAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAA 557
Query: 239 LGATE--------LTAKVFTLGA----TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
LG E TA +LG E TA+ G +E TA+ GA A+
Sbjct: 558 LGTAEGIADGTADGTADGASLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIA 617
Query: 287 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKV 346
G T+ TA +LG TA+ G TE TA+ + P++ +A + A+
Sbjct: 618 DGTTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTAEGI-----AEGPVEGNADGAALGI-AEG 667
Query: 347 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 406
G T+ TA GA++ A+ LG TA G+++ +A +G ++ A+
Sbjct: 668 IADGTTDGTAD----GASDGDAEGSALG----TADGRAEGSSDGSADGSEVGTSDGDAEG 719
Query: 407 FTLGATELTAKVFTLGATE 425
+LG E TA+ + G E
Sbjct: 720 SSLGTAEGTAEGTSEGNCE 738
Score = 66.2 bits (160), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 137/434 (31%), Positives = 174/434 (40%), Gaps = 50/434 (11%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
TA+ LG E A LG E A LG TA+ G T+ TA LG E
Sbjct: 280 TAEGIALGTAEGCADGAALGTAEGCADGAALG----TAEGIADGTTDGTADGAWLGTAEG 335
Query: 65 ----TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
TA+ G +E TA+ GA TA G T+ TA LG TA+ G
Sbjct: 336 IAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGTADGIADGTTDGTADGAWLG----TAEGIADG 391
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G
Sbjct: 392 TTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADG 443
Query: 181 ATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
+ TA +LG E TA+ G +E TA+ GA A+ G T+ TA
Sbjct: 444 TADGTADGASLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIADGTTDGTADG 503
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
+LG TA+ G T+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A
Sbjct: 504 ASLG----TAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADG 555
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
LG TA+ G + TA L + I E TA+ G +E TA
Sbjct: 556 AALG----TAEGIADGTADGTADGASLGT--AEGIA--------EGTAEGCAEGISEGTA 601
Query: 357 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
+ GA A+ G T+ TA +LG TA+ G TE TA+ G E A
Sbjct: 602 EGCADGAALGIAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTAEGIAEGPVEGNA 657
Query: 417 KVFTLGATELTAKN 430
LG E A
Sbjct: 658 DGAALGIAEGIADG 671
Score = 64.7 bits (156), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 130/428 (30%), Positives = 179/428 (41%), Gaps = 46/428 (10%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
E TA+ G +E TA+ GA TA G T+ TA LG TA+ G T
Sbjct: 338 EGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGTADGIADGTTDGTADGAWLG----TAEGIADGTT 393
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G
Sbjct: 394 DGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADGTA 445
Query: 135 ELTAKVFTLGA----TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
+ TA +LG E TA+ G +E TA+ GA A+ G T+ TA +
Sbjct: 446 DGTADGASLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIADGTTDGTADGAS 505
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
LG TA+ G T+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A
Sbjct: 506 LG----TAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAA 557
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA----TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
LG TA+ G + TA +LG E TA+ G +E TA+ GA A
Sbjct: 558 LG----TAEGIADGTADGTADGASLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIA 613
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
+ G T+ TA L + + + + TE TA+ G E A LG E
Sbjct: 614 EGIADGTTDGTADGASLGT-----AEGIAEGT-TEGTAEGIAEGPVEGNADGAALGIAEG 667
Query: 367 TAKVFT----LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
A T GA++ A+ LG TA G+++ +A +G ++ A+ +LG
Sbjct: 668 IADGTTDGTADGASDGDAEGSALG----TADGRAEGSSDGSADGSEVGTSDGDAEGSSLG 723
Query: 423 ATELTAKN 430
E TA+
Sbjct: 724 TAEGTAEG 731
Score = 64.7 bits (156), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 137/439 (31%), Positives = 170/439 (38%), Gaps = 66/439 (15%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
TA+ LG E A LG E A LG TA+ LG E A LG
Sbjct: 208 TAEGIALGTAEGCADGAALGTAEGCADGAALG----TAEGIALGTAEGCADGAVLG---- 259
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
TA+ G + TA LG TA+ LG E A LG E A LG
Sbjct: 260 TAEGIADGTPDGTADGAWLG----TAEGIALGTAEGCADGAALGTAEGCADGAALG---- 311
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
TA+ G T+ TA LG E TA+ G +E TA+ GA TA G
Sbjct: 312 TAEGIADGTTDGTADGAWLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGTADGIADG 371
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T+ TA LG TA+ G T+ TA +LG TA+ G TE TA G
Sbjct: 372 TTDGTADGAWLG----TAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEG 423
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTLGATELTAKV 296
E +A LG TA+ G + TA +LG E TA+ G +E TA+
Sbjct: 424 TAEGSADGAALG----TAEGIADGTADGTADGASLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEG 479
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
GA A+ G T+ TA L TA+ G T+ TA
Sbjct: 480 CADGAALGIAEGIADGTTDGTADGASL------------------GTAEGIADGTTDGTA 521
Query: 357 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
+LG TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G + TA
Sbjct: 522 DGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADGTADGTA 573
Query: 417 KVFTLGATELTAKNIRSNT 435
+LG TA+ I T
Sbjct: 574 DGASLG----TAEGIAEGT 588
Score = 62.4 bits (150), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/439 (31%), Positives = 163/439 (37%), Gaps = 70/439 (15%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTLG 60
TA+ LG E A LG E A G E TA LG E TA+ LG
Sbjct: 88 TAEGIALGTAEGCADGAALGIAEGIAD----GTPEGTADGAWLGTAEGIALGTAEGIALG 143
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
E A LG E A LG TA+ LG E A LG TA+ G
Sbjct: 144 TAEGCADGAALGTAEGCADGAALG----TAEGIALGTAEGCADGAVLG----TAEGIADG 195
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+ TA LG TA+ LG E A LG E A LG TA+ LG
Sbjct: 196 TPDGTADGAWLG----TAEGIALGTAEGCADGAALGTAEGCADGAALG----TAEGIALG 247
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
E A LG TA+ G + TA LG TA+ LG E A LG
Sbjct: 248 TAEGCADGAVLG----TAEGIADGTPDGTADGAWLG----TAEGIALGTAEGCADGAALG 299
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFTLGATELTAKV 296
E A LG TA+ G T+ TA LG E TA+ G +E TA+
Sbjct: 300 TAEGCADGAALG----TAEGIADGTTDGTADGAWLGTAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEG 355
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
GA TA G T+ TA L TA+ G T+ TA
Sbjct: 356 CADGAALGTADGIADGTTDGTADGAWL------------------GTAEGIADGTTDGTA 397
Query: 357 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
+LG TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G + TA
Sbjct: 398 DGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADGTADGTA 449
Query: 417 KVFTLGATELTAKNIRSNT 435
+LG TA+ I T
Sbjct: 450 DGASLG----TAEGIAEGT 464
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 126/434 (29%), Positives = 180/434 (41%), Gaps = 52/434 (11%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G + TA +LG E
Sbjct: 404 TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADGTADGTADGASLGTAEG 459
Query: 65 ----TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
TA+ G +E TA+ GA A+ G T+ TA +LG TA+ G
Sbjct: 460 IAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIADG 515
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G
Sbjct: 516 TTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADG 567
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+ TA +LG TA+ G E A+ + G E A LG E A G
Sbjct: 568 TADGTADGASLG----TAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIAD----G 619
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T+ TA +LG TA+ G TE TA+ G E A LG E A G
Sbjct: 620 TTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTAEGIAEGPVEGNADGAALGIAEGIAD----G 671
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
T+ TA GA++ A+ L + +++ +A +G ++ A+ +
Sbjct: 672 TTDGTAD----GASDGDAEGSALGTADGR------AEGSSDGSADGSEVGTSDGDAEGSS 721
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF--TLGATELTAKVFTLGATELTAKV 418
LG E TA+ + G E + + GA + A + G ++ A+ + GATE T++
Sbjct: 722 LGTAEGTAEGTSEGNCEGACEGTSDGALDGGALIVGDCDGESDGNAEGKSDGATEGTSE- 780
Query: 419 FTLGATELTAKNIR 432
G +E TA +
Sbjct: 781 ---GTSEGTADGVS 791
Score = 59.7 bits (143), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 111/383 (28%), Positives = 162/383 (42%), Gaps = 48/383 (12%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
E TA+ G +E TA+ GA A+ G T+ TA +LG TA+ G T
Sbjct: 462 EGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIADGTT 517
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+ TA +LG TA+ G TE TA G E +A LG TA+ G
Sbjct: 518 DGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTADGIAEGTAEGSADGAALG----TAEGIADGTA 569
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+ TA +LG TA+ G E A+ + G E A LG E A G T
Sbjct: 570 DGTADGASLG----TAEGIAEGTAEGCAEGISEGTAEGCADGAALGIAEGIAD----GTT 621
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---- 238
+ TA +LG TA+ G TE TA+ G E A LG E A T
Sbjct: 622 DGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTAEGIAEGPVEGNADGAALGIAEGIADGTTDGTA 677
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GA++ A+ LG TA G+++ +A +G ++ A+ +LG E TA
Sbjct: 678 DGASDGDAEGSALG----TADGRAEGSSDGSADGSEVGTSDGDAEGSSLGTAEGTA---- 729
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
E T++ GA E T+ + + + + ++ A+ + GATE T++
Sbjct: 730 ----EGTSEGNCEGACEGTSDGAL----DGGALIVGDCDGESDGNAEGKSDGATEGTSE- 780
Query: 359 FTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
G +E TA ++G +E T +
Sbjct: 781 ---GTSEGTADGVSVGVSEGTPE 800
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/224 (29%), Positives = 102/224 (45%), Gaps = 22/224 (9%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
+E TA+ GA A+ G T+ TA +LG TA+ G TE TA+ G
Sbjct: 597 SEGTAEGCADGAALGIAEGIADGTTDGTADGASLG----TAEGIAEGTTEGTAEGIAEGP 652
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
E A LG E A G T+ TA GA++ A+ LG TA G+
Sbjct: 653 VEGNADGAALGIAEGIAD----GTTDGTAD----GASDGDAEGSALG----TADGRAEGS 700
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF--TL 179
++ +A +G ++ A+ +LG E TA+ + G E + + GA + A +
Sbjct: 701 SDGSADGSEVGTSDGDAEGSSLGTAEGTAEGTSEGNCEGACEGTSDGALDGGALIVGDCD 760
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G ++ A+ + GATE T++ G +E TA ++G +E T +
Sbjct: 761 GESDGNAEGKSDGATEGTSE----GTSEGTADGVSVGVSEGTPE 800
>gi|389574131|ref|ZP_10164200.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus sp. M 2-6]
gi|388426320|gb|EIL84136.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus sp. M 2-6]
Length = 553
Score = 67.0 bits (162), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/167 (32%), Positives = 72/167 (43%), Gaps = 4/167 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 56
T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T + GAT +T
Sbjct: 186 GTPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGITGST 245
Query: 57 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 116
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T + GAT +T
Sbjct: 246 GPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGSTGATGITGST 305
Query: 117 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 306 GPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGITGS 352
Score = 67.0 bits (162), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/167 (32%), Positives = 72/167 (43%), Gaps = 4/167 (2%)
Query: 13 ATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 68
T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T + GAT +T
Sbjct: 186 GTPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGITGST 245
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T + GAT +T
Sbjct: 246 GPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGSTGATGITGST 305
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 306 GPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGITGS 352
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/192 (32%), Positives = 80/192 (41%), Gaps = 17/192 (8%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 67
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 68 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GAT----- 284
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 285 ----GATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGS 340
Query: 188 VFTLGATELTAK 199
GAT +T
Sbjct: 341 TGPTGATGITGS 352
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/192 (32%), Positives = 80/192 (41%), Gaps = 17/192 (8%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 79
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 80 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 139
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GAT----- 284
Query: 140 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 285 ----GATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGS 340
Query: 200 VFTLGATELTAK 211
GAT +T
Sbjct: 341 TGPTGATGITGS 352
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/192 (32%), Positives = 80/192 (41%), Gaps = 17/192 (8%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 91
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 92 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 151
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GAT----- 284
Query: 152 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 285 ----GATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGS 340
Query: 212 VFTLGATELTAK 223
GAT +T
Sbjct: 341 TGPTGATGITGS 352
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/192 (32%), Positives = 80/192 (41%), Gaps = 17/192 (8%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 103
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 104 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GAT----- 284
Query: 164 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 285 ----GATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGS 340
Query: 224 VFTLGATELTAK 235
GAT +T
Sbjct: 341 TGPTGATGITGS 352
Score = 58.5 bits (140), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 77/183 (42%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 200 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TEL 256
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GA T +
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGST---GATGATGI 289
Query: 257 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 316
T + GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +
Sbjct: 290 TGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGI 349
Query: 317 TAK 319
T
Sbjct: 350 TGS 352
Score = 55.5 bits (132), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 19/194 (9%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 236 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGA 292
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELT 355
+ GAT +T GAT +T + AT +T GAT +T
Sbjct: 293 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGAT--------------GATGITGATGPTGATGIT 338
Query: 356 AKVFTLGATELTAK 369
GAT +T
Sbjct: 339 GSTGPTGATGITGS 352
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 19/194 (9%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 224 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGA 292
Query: 284 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELT 343
+ GAT +T GAT +T GAT +T + AT +T
Sbjct: 293 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPT--------------GATGIT 338
Query: 344 AKVFTLGATELTAK 357
GAT +T
Sbjct: 339 GSTGPTGATGITGS 352
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 19/194 (9%)
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 284 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELT 343
+ GAT +T GAT +T GAT +T + AT +T
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPT--------------GATGIT 278
Query: 344 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 403
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 279 GSTGATGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGIT 338
Query: 404 AKVFTLGATELTAK 417
GAT +T
Sbjct: 339 GSTGPTGATGITGS 352
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 19/194 (9%)
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELT 355
+ GAT +T GAT +T + AT +T GAT +T
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPT--------------GATGITGSTGPTGATGIT 278
Query: 356 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 415
GAT +T + GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 279 GSTGATGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGIT 338
Query: 416 AKVFTLGATELTAK 429
GAT +T
Sbjct: 339 GSTGPTGATGITGS 352
Score = 54.7 bits (130), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 19/194 (9%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
G T + LG T T+ +TL GA T + GAT +T GAT +T
Sbjct: 174 GGTYIVNSAPPLG-TPDTSPDYTLLAASGAPGSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGA 232
Query: 260 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
+ GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 233 TGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGA 292
Query: 320 SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 379
+ AT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 293 TG--------------STGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGIT 338
Query: 380 AKVFTLGATELTAK 393
GAT +T
Sbjct: 339 GSTGPTGATGITGS 352
>gi|148668597|gb|EDL00916.1| WD repeat domain 41, isoform CRA_b [Mus musculus]
Length = 466
Score = 66.2 bits (160), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/212 (30%), Positives = 91/212 (42%), Gaps = 7/212 (3%)
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
V T+G+ V T GA V T+G+ V T GA V T+G+
Sbjct: 349 LTAGSVLTMGS------VLTAGAVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGAVLTAGSVLTMGSV 402
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
V T+G+ V T G+ LTA SV+
Sbjct: 403 LTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGSV-LTAGSVL 433
Score = 65.1 bits (157), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/225 (29%), Positives = 95/225 (42%), Gaps = 7/225 (3%)
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
V T+G+ V T GA V T+G+ V T GA V T+G+
Sbjct: 349 LTAGSVLTMGSVLTAGAVLTAGA------VLTMGSVLTAGSVLTAGAVLTAGSVLTMGSV 402
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
V T+G+ V T G+ LTA +L ++SV L
Sbjct: 403 LTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGSV-LTAGSVLTADLDLESRSVFL 446
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/203 (29%), Positives = 85/203 (41%), Gaps = 6/203 (2%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
V T+G+ V T GA V T+G+ V T GA V T+G+
Sbjct: 349 LTAGSVLTMGS------VLTAGAVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGAVLTAGSVLTMGSV 402
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
V T+G+ V T G+
Sbjct: 403 LTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGS 425
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/203 (29%), Positives = 85/203 (41%), Gaps = 6/203 (2%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
V T+G+ V T GA V T+G+ V T GA V T+G+
Sbjct: 349 LTAGSVLTMGS------VLTAGAVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGAVLTAGSVLTMGSV 402
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
V T+G+ V T G+
Sbjct: 403 LTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGS 425
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/203 (29%), Positives = 85/203 (41%), Gaps = 6/203 (2%)
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
V T+G+ V T GA V T+G+ V T GA V T+G+
Sbjct: 349 LTAGSVLTMGS------VLTAGAVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGAVLTAGSVLTMGSV 402
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
V T+G+ V T G+
Sbjct: 403 LTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGS 425
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/203 (29%), Positives = 85/203 (41%), Gaps = 6/203 (2%)
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
V T+G+ V T GA V T+G+ V T GA V T+G+
Sbjct: 349 LTAGSVLTMGS------VLTAGAVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGAVLTAGSVLTMGSV 402
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
V T+G+ V T G+
Sbjct: 403 LTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGS 425
Score = 56.2 bits (134), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/218 (28%), Positives = 89/218 (40%), Gaps = 22/218 (10%)
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAK-VFTLGATELTAKVFTL 361
V T+G+ LTA +V LTA V T+G+ V T
Sbjct: 349 LTAGSVLTMGSV-LTAGAV--------------------LTAGAVLTMGSVLTAGSVLTA 387
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
GA V T+G+ V T+G+ V T G+
Sbjct: 388 GAVLTAGSVLTMGSVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGS 425
Score = 55.8 bits (133), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/217 (28%), Positives = 86/217 (39%), Gaps = 20/217 (9%)
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSV 348
Query: 315 ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 374
LTA SV+ V T GA V T+G+ V T G
Sbjct: 349 -LTAGSVLT-------------------MGSVLTAGAVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAG 388
Query: 375 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
A V T+G+ V T+G+ V T G+
Sbjct: 389 AVLTAGSVLTMGSVLTAGAVLTMGSVLTAGSVLTAGS 425
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/225 (27%), Positives = 88/225 (39%), Gaps = 33/225 (14%)
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
+ V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ T V T G+ V T G+
Sbjct: 229 NINGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSVLTTGSVLTAGSVLTMGSVLTAGSV 288
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVE 326
V T GA V T+G+ T V T+G+ T V T+G+ LT
Sbjct: 289 LTMGSVLTAGAVLPAGSVLTMGSVLTTGSVLTIGSVLTTGSVLTMGSV-LT--------- 338
Query: 327 YYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 386
T V T G+ V T+G+ V T GA V T+G
Sbjct: 339 ----------------TGSVLTAGSVLTAGSVLTMGSVLTAGAVLTAGA------VLTMG 376
Query: 387 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
+ V T GA V T+G+ V T+G+ LTA ++
Sbjct: 377 SVLTAGSVLTAGAVLTAGSVLTMGSVLTAGAVLTMGSV-LTAGSV 420
>gi|325290147|ref|YP_004266328.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
gi|324965548|gb|ADY56327.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
Length = 559
Score = 65.9 bits (159), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/253 (25%), Positives = 67/253 (26%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T G T G T T G T T
Sbjct: 174 GATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 233
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 234 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 293
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 294 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 353
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 354 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 413
Query: 312 GATELTAKSVILE 324
G T T + +L
Sbjct: 414 GNTGPTGPTSVLR 426
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/248 (25%), Positives = 64/248 (25%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T G T G T T G T T
Sbjct: 174 GATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 233
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 234 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 293
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 294 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 353
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 354 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 413
Query: 252 GATELTAK 259
G T T
Sbjct: 414 GNTGPTGP 421
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/248 (25%), Positives = 64/248 (25%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T G T G T T G T T
Sbjct: 174 GATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 233
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 234 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 293
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 294 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 353
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 354 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 413
Query: 264 GATELTAK 271
G T T
Sbjct: 414 GNTGPTGP 421
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/248 (25%), Positives = 64/248 (25%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T G T G T T G T T
Sbjct: 174 GATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 233
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 234 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 293
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 294 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 353
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 354 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 413
Query: 276 GATELTAK 283
G T T
Sbjct: 414 GNTGPTGP 421
Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/248 (25%), Positives = 64/248 (25%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T G T G T T G T T
Sbjct: 174 GATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 233
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 234 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 293
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 294 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 353
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 354 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 413
Query: 288 GATELTAK 295
G T T
Sbjct: 414 GNTGPTGP 421
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/260 (24%), Positives = 66/260 (25%)
Query: 9 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 68
FT + T GAT G T T G T G T T
Sbjct: 165 FTSDPSGPTGATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPT 224
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 225 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 284
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 285 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 344
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 345 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 404
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATEL 268
G T T G T +
Sbjct: 405 GNTGPTGPTGNTGPTGPTSV 424
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/260 (24%), Positives = 66/260 (25%)
Query: 21 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 80
FT + T GAT G T T G T G T T
Sbjct: 165 FTSDPSGPTGATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPT 224
Query: 81 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 140
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 225 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 284
Query: 141 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 200
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 285 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 344
Query: 201 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 345 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 404
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATEL 280
G T T G T +
Sbjct: 405 GNTGPTGPTGNTGPTGPTSV 424
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/260 (24%), Positives = 66/260 (25%)
Query: 33 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 92
FT + T GAT G T T G T G T T
Sbjct: 165 FTSDPSGPTGATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPT 224
Query: 93 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 152
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 225 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 284
Query: 153 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 212
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 285 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 344
Query: 213 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 345 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 404
Query: 273 FTLGATELTAKVFTLGATEL 292
G T T G T +
Sbjct: 405 GNTGPTGPTGNTGPTGPTSV 424
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/260 (24%), Positives = 66/260 (25%)
Query: 45 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 104
FT + T GAT G T T G T G T T
Sbjct: 165 FTSDPSGPTGATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPT 224
Query: 105 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 164
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 225 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 284
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 285 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 344
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 345 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 404
Query: 285 FTLGATELTAKVFTLGATEL 304
G T T G T +
Sbjct: 405 GNTGPTGPTGNTGPTGPTSV 424
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/260 (24%), Positives = 66/260 (25%)
Query: 57 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 116
FT + T GAT G T T G T G T T
Sbjct: 165 FTSDPSGPTGATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPT 224
Query: 117 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 176
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 225 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 284
Query: 177 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 285 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 344
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 345 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 404
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATEL 316
G T T G T +
Sbjct: 405 GNTGPTGPTGNTGPTGPTSV 424
Score = 58.2 bits (139), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/251 (24%), Positives = 63/251 (25%)
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
FT + T GAT G T T G T G T T
Sbjct: 165 FTSDPSGPTGATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPT 224
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 225 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPT 284
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 285 GPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 344
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
G T T G T T G T T G T T G T T
Sbjct: 345 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 404
Query: 309 FTLGATELTAK 319
G T T
Sbjct: 405 GNTGPTGPTGN 415
>gi|308172611|ref|YP_003919316.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus
amyloliquefaciens DSM 7]
gi|307605475|emb|CBI41846.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus
amyloliquefaciens DSM 7]
Length = 2083
Score = 65.9 bits (159), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/342 (24%), Positives = 128/342 (37%), Gaps = 36/342 (10%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + G T +T + + G T T + G+T T G T +T + G+
Sbjct: 1139 TGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGET---GS 1195
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTAKVFT 118
T +T + G T T G T +T + G T +T ++ + G+T +T +
Sbjct: 1196 TGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGP 1255
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------KVFTLGA 157
G+T +T G+T +T + G T T GA
Sbjct: 1256 TGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGA 1315
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T T G T T GAT +T + G T +T GAT T + GA
Sbjct: 1316 TGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGA 1375
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
T T G+T T + G T T + +G+T +T + G+T +T G+
Sbjct: 1376 TGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGE---IGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGS 1432
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
T T G T +T + G T LT G+T +T
Sbjct: 1433 TGAT------GPTGVTGPTGSTGPTGLTGSTGATGSTGVTGP 1468
Score = 58.5 bits (140), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/307 (25%), Positives = 113/307 (36%), Gaps = 33/307 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T GAT T G+T +T + G T T G T +T + G
Sbjct: 1171 STGSTGATGPTGATGPTGVTGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETG 1230
Query: 61 ATELTA---KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--- 114
T +T ++ + G+T +T + G+T +T G+T +T + G T T
Sbjct: 1231 VTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTG 1290
Query: 115 ------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
GAT T G T T GAT +T + G
Sbjct: 1291 SPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTG 1350
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
T +T GAT T + GAT T G+T T + G T T + +G
Sbjct: 1351 PTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGE---IG 1407
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
+T +T + G+T +T G+T T G T +T + G T LT G
Sbjct: 1408 STGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGAT------GPTGVTGPTGSTGPTGLTGSTGATG 1461
Query: 277 ATELTAK 283
+T +T
Sbjct: 1462 STGVTGP 1468
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/349 (25%), Positives = 130/349 (37%), Gaps = 32/349 (9%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T + G T +T + + G T T + G+T T G T +T +
Sbjct: 1137 GVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGET--- 1193
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTAKV 200
G+T +T + G T T G T +T + G T +T ++ + G+T +T +
Sbjct: 1194 GSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGET 1253
Query: 201 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
G+T +T G+T +T G+T T G+ T G+T T
Sbjct: 1254 GPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPT---GSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPT 1310
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
GAT T G T T GAT +T + G T +T GAT
Sbjct: 1311 GVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGAT------ 1364
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
P I AT T G+T T + G T T + +G+T +T
Sbjct: 1365 --------GPTGITGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGE---IGSTGVTG 1413
Query: 381 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
+ G+T +T G+T T G T +T + G T LT
Sbjct: 1414 ETGPTGSTGITGSTGPTGSTGAT------GPTGVTGPTGSTGPTGLTGS 1456
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.51, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/287 (24%), Positives = 100/287 (34%), Gaps = 29/287 (10%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T +T + + G T T + G+T T G T +T + +
Sbjct: 1137 GVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGETGST 1196
Query: 240 GATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGA---------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T + GAT T G T T ++ + G+T +T +
Sbjct: 1197 GVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPT 1256
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA----------KSVILEVEYYKPIKIVPQN 337
G+T +T G+T +T + G T T P +
Sbjct: 1257 GSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVT--- 1313
Query: 338 SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
AT T G T T GAT +T + G T +T GAT T +
Sbjct: 1314 GATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGST 1373
Query: 398 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT----ELTAKNIRSNTGTVGS 440
GAT T G+T T + G T E+ + + TG GS
Sbjct: 1374 GATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGS 1420
>gi|52140776|ref|YP_086053.1| hypothetical protein BCZK4476 [Bacillus cereus E33L]
gi|51974245|gb|AAU15795.1| collagen-like protein [Bacillus cereus E33L]
Length = 815
Score = 65.5 bits (158), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/317 (26%), Positives = 113/317 (35%), Gaps = 9/317 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T T + G+T +T G T +T G+T T + + G
Sbjct: 41 TGITGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVT------GSTGPTGETGSTGN 94
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T + G+T T G+T T G T +T G T T + G+
Sbjct: 95 TGATGETGPTGSTGATGSTGVTGSTGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGS 154
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T + G+T +T GAT T + G T T G T T GA
Sbjct: 155 TGPTGETGVTGSTGVTGPT---GATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGA 211
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G+T +T G+T +T G T T + G T T G
Sbjct: 212 TGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGP 271
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T + G T T GAT T G+T +T G+T +T G+
Sbjct: 272 TGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGS 331
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTA 318
T T GAT T
Sbjct: 332 TGATGNTGPTGATGSTG 348
Score = 62.8 bits (151), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/454 (24%), Positives = 140/454 (30%), Gaps = 31/454 (6%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GAT T G+T +T G+T +T G T T + G
Sbjct: 200 TGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGP 259
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G T T + G T T GAT T G+T +T G+
Sbjct: 260 TGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGS 319
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA------------ 169
T +T G+T T GAT T G T T + G
Sbjct: 320 TGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGA 379
Query: 170 ---------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
T T G T +T G+T T + G T +T
Sbjct: 380 TGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGP 439
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
G T T G T T G T T + G+T T G T T +
Sbjct: 440 TGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGV 499
Query: 275 LGATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVILEVEYYKP 330
G+T T G T T + G+T +T G+T T E P
Sbjct: 500 TGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGP 559
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 390
+T T G T T G+T +T G T T G T
Sbjct: 560 TGATGVTGSTGPTGNTGPTGETGSTGSTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGA 619
Query: 391 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
T + GAT +T + G T T + GAT
Sbjct: 620 TGETGPTGATGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGAT 653
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/303 (25%), Positives = 101/303 (33%), Gaps = 3/303 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T G T +T G T T G T T G+T +T G
Sbjct: 64 STGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGSTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGSTGPTG 123
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T + G+T T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 124 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTGPTGATGNTGATG 183
Query: 121 ATELTAKVFTLGATEL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
+T +T G T + T GAT T G+T +T G+T +T
Sbjct: 184 STGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTG 243
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G T T + G T T G T T + G T T GAT T
Sbjct: 244 VTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTG 303
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G+T +T G+T +T G+T T GAT T G T T
Sbjct: 304 VTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTG 363
Query: 298 TLG 300
+ G
Sbjct: 364 STG 366
Score = 59.7 bits (143), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/462 (24%), Positives = 139/462 (30%), Gaps = 38/462 (8%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T G T T + G+T T G T T G T +T G
Sbjct: 112 STGVTGSTGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTG 171
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
T T G+T +T G T + T GAT T G+T +T
Sbjct: 172 PTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTG 231
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
G+T +T G T T + G T T G T T + G T T
Sbjct: 232 ATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATG 291
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT T G+T +T G+T +T G+T T GAT T
Sbjct: 292 NTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTG 351
Query: 238 TLGATELTAKVFTLG---------------------------ATELTAKVFTLGATELTA 270
G T T + G T T G T +T
Sbjct: 352 NTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTG 411
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
G+T T + G T +T G T T G E A E P
Sbjct: 412 STGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTG--ETGATGSTGETGETGP 469
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 390
+ T T GAT T G T T GAT T G T +
Sbjct: 470 TG---ETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGV 526
Query: 391 TAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T GAT T G T T GAT +T
Sbjct: 527 TGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGS 568
Score = 59.3 bits (142), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/458 (23%), Positives = 140/458 (30%), Gaps = 32/458 (6%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL---TAKVFTLGATELTAKVFT 58
T +T G T T G+T +T G T + T GAT T
Sbjct: 161 TGVTGSTGVTGPTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGE 220
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
G+T +T G+T +T G T T + G T T G T T +
Sbjct: 221 TGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGS 280
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G T T GAT T G+T +T G+T +T G+T T
Sbjct: 281 TGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGP 340
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---------------------------ATELTAK 211
GAT T G T T + G T T
Sbjct: 341 TGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGA 400
Query: 212 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
G T +T G+T T + G T +T G T T G T T
Sbjct: 401 TGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATGS 460
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
G T T + G+T T G T T + G+T T P
Sbjct: 461 TGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGN--TGATGNTGPT 518
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 391
+ T T GAT T G T T GAT +T G T T
Sbjct: 519 GETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPT 578
Query: 392 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
+ + G+T T G T T + G+T T
Sbjct: 579 GETGSTGSTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGN 616
Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/455 (24%), Positives = 141/455 (30%), Gaps = 38/455 (8%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + G T T G T T GAT T G+T +T G
Sbjct: 175 ATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATG 234
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T +T G T T + G T T G T T + G T T G
Sbjct: 235 STGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTG 294
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T G+T +T G+T +T G+T T GAT T G
Sbjct: 295 ATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTG 354
Query: 181 ATELTAKVFTLGA---------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVF 213
T T + G T T G T +T
Sbjct: 355 PTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTG 414
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
G+T T + G T +T G T T G T T G T T +
Sbjct: 415 PTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETG 474
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
G+T T G T T + G+T T G T T ++ V +
Sbjct: 475 VTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGV-- 532
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
T T + GAT T GAT T G+T T G T T
Sbjct: 533 ------TGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGETGSTGS 586
Query: 394 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G+T +T GAT T + GAT T
Sbjct: 587 TGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNTG 618
Score = 54.7 bits (130), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/256 (27%), Positives = 87/256 (33%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T G+T T G T T + G+T T G T T +
Sbjct: 399 GATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGAT 458
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G+T T + G T +T G T T G T +T G T T
Sbjct: 459 GSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPT 518
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + G T T + GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 519 GETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPT 578
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T G+T +T G T T G T T + GAT +T +
Sbjct: 579 GETGSTGSTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGATGVTGPTGST 638
Query: 276 GATELTAKVFTLGATE 291
G T T + GAT
Sbjct: 639 GVTGSTGPTGSTGATG 654
Score = 54.7 bits (130), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/256 (27%), Positives = 87/256 (33%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T G+T T G T T + G+T T G T T +
Sbjct: 399 GATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGAT 458
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G+T T + G T +T G T T G T +T G T T
Sbjct: 459 GSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPT 518
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + G T T + GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 519 GETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPT 578
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T G+T +T G T T G T T + GAT +T +
Sbjct: 579 GETGSTGSTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGATGVTGPTGST 638
Query: 288 GATELTAKVFTLGATE 303
G T T + GAT
Sbjct: 639 GVTGSTGPTGSTGATG 654
Score = 54.7 bits (130), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/256 (27%), Positives = 87/256 (33%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T G+T T G T T + G+T T G T T +
Sbjct: 399 GATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGAT 458
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T + G T +T G T T G T +T G T T
Sbjct: 459 GSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPT 518
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T T + GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 519 GETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPT 578
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T T G+T +T G T T G T T + GAT +T +
Sbjct: 579 GETGSTGSTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGATGVTGPTGST 638
Query: 300 GATELTAKVFTLGATE 315
G T T + GAT
Sbjct: 639 GVTGSTGPTGSTGATG 654
Score = 52.0 bits (123), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/340 (25%), Positives = 107/340 (31%), Gaps = 21/340 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G+T +T G+T +T G+T T GAT T G
Sbjct: 295 ATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTG 354
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTA---------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATE 99
T T + G T T GAT T G+T
Sbjct: 355 PTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTG 414
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
T G T T + G+T T G T T + G+T T + G T
Sbjct: 415 PTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETG 474
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+T G T T G T +T G T T G T T + G T
Sbjct: 475 VTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTG 534
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
T + GAT T GAT T G+T T G T T G+T
Sbjct: 535 NTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGETGSTGSTGATGSTG 594
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
+T G T T G T T + GAT +T
Sbjct: 595 VTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGATGVTGP 634
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/425 (24%), Positives = 128/425 (30%), Gaps = 47/425 (11%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +T G T T G T +T G T T GAT T G+
Sbjct: 251 TGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNT---GATGETGSTGVTGS 307
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +T G+T +T G+T T GAT T G T T + G
Sbjct: 308 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGSTGP 367
Query: 122 ---------------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
T T G T +T G+T T +
Sbjct: 368 TGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGP 427
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
G T +T G T T G T T G T T + G+T T
Sbjct: 428 TGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGA 487
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
G T T + G+T T G T T + G T T GAT T
Sbjct: 488 TGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGN 547
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIV 334
G T T GAT +T G T T + + G+T T + +
Sbjct: 548 TGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGETGSTGSTGATGSTGVTG---------- 597
Query: 335 PQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 394
AT T + GAT T GAT T G T T G+T T
Sbjct: 598 -NTGATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGATGVTGPTGSTGVTGSTGPTGST 650
Query: 395 FTLGA 399
GA
Sbjct: 651 GATGA 655
>gi|301774030|ref|XP_002922417.1| PREDICTED: protein FAM186A-like [Ailuropoda melanoleuca]
Length = 2258
Score = 65.1 bits (157), Expect = 6e-08, Method: Composition-based stats.
Identities = 104/446 (23%), Positives = 170/446 (38%), Gaps = 21/446 (4%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
K TL + A ++ + A+ TL + A+ TL + A TL ++ A
Sbjct: 1072 KFLTLTPQQAQALGISVTPQQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGITLTPQQVQA 1131
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
+ TL + A T+ + + A+ TL + A TL + A ++ + + A
Sbjct: 1132 QGITLTPDQAQALGTTVTSEQAQAQGITLTPQQAQALGMTLTPQQAQALGISVTSEQAQA 1191
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
+ TL + A+ TL + A T+ + + A+ TL + A+ TL + A
Sbjct: 1192 QGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGITVTSEQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQA 1251
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+ TL + A+ TL + A TL + A ++ + + A+ TL + A
Sbjct: 1252 QGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGMTLTPQQAQALGISVTSEQAQAQGITLTPQQAQA 1311
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
+ TL + A LG T + TLG T + LG T + TLG T
Sbjct: 1312 QGITLTPQQAQA----LGITLTPQQAQTLGITFTPQQAQALGITLTPQQAQTLGITFTPQ 1367
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSAT--------ELTAKVFTLGATELTAKV 358
+ LG T + L I + PQ + + A+ TL + A+
Sbjct: 1368 QAQALGITLTPQQGQALG------ITLTPQQAQALGMTLTPEQAQAQGITLSPQQAQAQG 1421
Query: 359 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 418
TL + A+ TL + A TL + A TL ++ A TL + A V
Sbjct: 1422 ITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGITLTPQQAQALGLTLTPQQIQAHGITLSPEQFKALV 1481
Query: 419 FTLGATELTAKNIRSNTGTV---GSP 441
TL + + G V GSP
Sbjct: 1482 VTLTPEKCQSLGFALTPGKVQASGSP 1507
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Composition-based stats.
Identities = 102/423 (24%), Positives = 165/423 (39%), Gaps = 18/423 (4%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
A+ TL + A TL ++ A+ TL + A T+ + + A+ TL +
Sbjct: 1107 AQGITLTPQQAQALGITLTPQQVQAQGITLTPDQAQALGTTVTSEQAQAQGITLTPQQAQ 1166
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
A TL + A ++ + + A+ TL + A+ TL + A T+ + +
Sbjct: 1167 ALGMTLTPQQAQALGISVTSEQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGITVTSEQAQ 1226
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
A+ TL + A+ TL + A+ TL + A+ TL + A TL +
Sbjct: 1227 AQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGMTLTPQQAQ 1286
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
A ++ + + A+ TL + A+ TL + A LG T + TLG T
Sbjct: 1287 ALGISVTSEQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQA----LGITLTPQQAQTLGITFTP 1342
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT--- 302
+ LG T + TLG T + LG T + LG T + LG T
Sbjct: 1343 QQAQALGITLTPQQAQTLGITFTPQQAQALGITLTPQQGQALGITLTPQQAQALGMTLTP 1402
Query: 303 -ELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP--IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
+ A+ TL + A+ + L + + I + PQ + A TL + A
Sbjct: 1403 EQAQAQGITLSPQQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQA----QALGITLTPQQAQALGL 1458
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
TL ++ A TL + A V TL K +LG KV G+ A+ +
Sbjct: 1459 TLTPQQIQAHGITLSPEQFKALVVTL----TPEKCQSLGFALTPGKVQASGSPLTGAQAW 1514
Query: 420 TLG 422
LG
Sbjct: 1515 ELG 1517
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-05, Method: Composition-based stats.
Identities = 85/375 (22%), Positives = 145/375 (38%), Gaps = 11/375 (2%)
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
K F L T K TL + A ++ + A+ TL + A+ TL + A
Sbjct: 1061 KAFPLSGQSPT-KFLTLTPQQAQALGISVTPQQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQA 1119
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
TL ++ A+ TL + A T+ + + A+ TL + A TL + A
Sbjct: 1120 LGITLTPQQVQAQGITLTPDQAQALGTTVTSEQAQAQGITLTPQQAQALGMTLTPQQAQA 1179
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
++ + + A+ TL + A+ TL + A T+ + + A+ TL + A
Sbjct: 1180 LGISVTSEQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGITVTSEQAQAQGITLTPQQAQA 1239
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
+ TL + A+ TL + A+ TL + A TL + A ++ + + A
Sbjct: 1240 QGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGMTLTPQQAQALGISVTSEQAQA 1299
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFT------LGATELTAKVFT 360
+ TL + A+ + L + + + I + FT LG T + T
Sbjct: 1300 QGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQALGITLTPQQAQTLGITFTPQQAQALGITLTPQQAQT 1359
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT----ELTAKVFTLGATELTA 416
LG T + LG T + LG T + LG T + A+ TL + A
Sbjct: 1360 LGITFTPQQAQALGITLTPQQGQALGITLTPQQAQALGMTLTPEQAQAQGITLSPQQAQA 1419
Query: 417 KVFTLGATELTAKNI 431
+ TL + A+ I
Sbjct: 1420 QGITLTPQQAQAQGI 1434
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.009, Method: Composition-based stats.
Identities = 100/421 (23%), Positives = 156/421 (37%), Gaps = 37/421 (8%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
A+ TL + A TL + A ++ + + A+ TL + A+ TL +
Sbjct: 1263 AQGITLTPQQAQALGMTLTPQQAQALGISVTSEQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTPQQAQ 1322
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
A LG T + TLG T + LG T + TLG T + LG T
Sbjct: 1323 A----LGITLTPQQAQTLGITFTPQQAQALGITLTPQQAQTLGITFTPQQAQALGITLTP 1378
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
+ LG T + LG T + A+ TL + A+ TL + A+ TL
Sbjct: 1379 QQGQALGITLTPQQAQALGMTLTPEQAQAQGITLSPQQAQAQGITLTPQQAQAQGITLTP 1438
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
+ A TL + A TL ++ A TL + A V TL K +LG
Sbjct: 1439 QQAQALGITLTPQQAQALGLTLTPQQIQAHGITLSPEQFKALVVTL----TPEKCQSLGF 1494
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELTAKVFTLG 300
KV G+ A+ + LG +T + L A LT + LGA + + LG
Sbjct: 1495 ALTPGKVQASGSPLTGAQAWELG-IPITPESALLSAVTLTPEQTQALGAPLSSEQAQALG 1553
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
+ + G + K +E + + TLGA + +
Sbjct: 1554 VSFSPEHFWKFGVPLTSDKFHAIESPF----------------EQAQTLGAPFIPGQSHP 1597
Query: 361 LGAT-------ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
+G T + + + LGA + +G +T K T GA ++ +V TL +
Sbjct: 1598 MGITLMSEEDQQSSEQPSPLGAHSSLEQTLKVGIIPVTDKFITPGAPHISKQVPTLAPSS 1657
Query: 414 L 414
L
Sbjct: 1658 L 1658
>gi|325264601|ref|ZP_08131331.1| hypothetical protein HMPREF0240_03608 [Clostridium sp. D5]
gi|324030263|gb|EGB91548.1| hypothetical protein HMPREF0240_03608 [Clostridium sp. D5]
Length = 347
Score = 64.7 bits (156), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/217 (18%), Positives = 89/217 (41%), Gaps = 5/217 (2%)
Query: 22 TLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 78
TL T+G TEL + L A ++ E A+ + T +TA
Sbjct: 31 TLDVQSPPEDEITVGPPPETELQEILQDLSAEDIQVPTSDNIEAETQAESNSSSETNVTA 90
Query: 79 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 138
F + + F ++ + F+ + F+ ++ +VFTL ++
Sbjct: 91 DAFNDPQNVMHSDAFNSPEDDMPPEDFSFPGDNTPPEDFSFTEDDMPPEVFTLSKDDIQP 150
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
+VFTL ++ ++ F L ++ ++ +L + ++ F+L ++ ++ + ++
Sbjct: 151 EVFTLSKDDIESEAFGLSEDDIQSEALSLSKDNIQSEAFSLSEEDIQSEAVSSPEIDIQP 210
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
+ FT TE+ + G++E + L TE A+
Sbjct: 211 EAFT--PTEIDIQPELRGSSETDIQSRELPPTEQKAE 245
Score = 64.7 bits (156), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/217 (18%), Positives = 89/217 (41%), Gaps = 5/217 (2%)
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
TL T+G TEL + L A ++ E A+ + T +TA
Sbjct: 31 TLDVQSPPEDEITVGPPPETELQEILQDLSAEDIQVPTSDNIEAETQAESNSSSETNVTA 90
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
F + + F ++ + F+ + F+ ++ +VFTL ++
Sbjct: 91 DAFNDPQNVMHSDAFNSPEDDMPPEDFSFPGDNTPPEDFSFTEDDMPPEVFTLSKDDIQP 150
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
+VFTL ++ ++ F L ++ ++ +L + ++ F+L ++ ++ + ++
Sbjct: 151 EVFTLSKDDIESEAFGLSEDDIQSEALSLSKDNIQSEAFSLSEEDIQSEAVSSPEIDIQP 210
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
+ FT TE+ + G++E + L TE A+
Sbjct: 211 EAFT--PTEIDIQPELRGSSETDIQSRELPPTEQKAE 245
Score = 64.7 bits (156), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/217 (18%), Positives = 89/217 (41%), Gaps = 5/217 (2%)
Query: 94 TLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
TL T+G TEL + L A ++ E A+ + T +TA
Sbjct: 31 TLDVQSPPEDEITVGPPPETELQEILQDLSAEDIQVPTSDNIEAETQAESNSSSETNVTA 90
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
F + + F ++ + F+ + F+ ++ +VFTL ++
Sbjct: 91 DAFNDPQNVMHSDAFNSPEDDMPPEDFSFPGDNTPPEDFSFTEDDMPPEVFTLSKDDIQP 150
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
+VFTL ++ ++ F L ++ ++ +L + ++ F+L ++ ++ + ++
Sbjct: 151 EVFTLSKDDIESEAFGLSEDDIQSEALSLSKDNIQSEAFSLSEEDIQSEAVSSPEIDIQP 210
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
+ FT TE+ + G++E + L TE A+
Sbjct: 211 EAFT--PTEIDIQPELRGSSETDIQSRELPPTEQKAE 245
Score = 64.7 bits (156), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/198 (18%), Positives = 84/198 (42%), Gaps = 2/198 (1%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
TEL + L A ++ E A+ + T +TA F + + F
Sbjct: 50 TELQEILQDLSAEDIQVPTSDNIEAETQAESNSSSETNVTADAFNDPQNVMHSDAFNSPE 109
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
++ + F+ + F+ ++ +VFTL ++ +VFTL ++ ++ F L
Sbjct: 110 DDMPPEDFSFPGDNTPPEDFSFTEDDMPPEVFTLSKDDIQPEVFTLSKDDIESEAFGLSE 169
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
++ ++ +L + ++ F+L ++ ++ + ++ + FT TE+ + G+
Sbjct: 170 DDIQSEALSLSKDNIQSEAFSLSEEDIQSEAVSSPEIDIQPEAFT--PTEIDIQPELRGS 227
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAK 199
+E + L TE A+
Sbjct: 228 SETDIQSRELPPTEQKAE 245
Score = 62.0 bits (149), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/209 (18%), Positives = 86/209 (41%), Gaps = 5/209 (2%)
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
TL T+G TEL + L A ++ E A+ + T +TA
Sbjct: 31 TLDVQSPPEDEITVGPPPETELQEILQDLSAEDIQVPTSDNIEAETQAESNSSSETNVTA 90
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
F + + F ++ + F+ + F+ ++ +VFTL ++
Sbjct: 91 DAFNDPQNVMHSDAFNSPEDDMPPEDFSFPGDNTPPEDFSFTEDDMPPEVFTLSKDDIQP 150
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
+VFTL ++ ++ F L ++ ++ +L + ++ F+L ++ ++ + ++
Sbjct: 151 EVFTLSKDDIESEAFGLSEDDIQSEALSLSKDNIQSEAFSLSEEDIQSEAVSSPEIDIQP 210
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
+ FT TE+ + G++E +S L
Sbjct: 211 EAFT--PTEIDIQPELRGSSETDIQSREL 237
Score = 58.5 bits (140), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/231 (18%), Positives = 90/231 (38%), Gaps = 19/231 (8%)
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
TL T+G TEL + L A ++ E A+ + T +TA
Sbjct: 31 TLDVQSPPEDEITVGPPPETELQEILQDLSAEDIQVPTSDNIEAETQAESNSSSETNVTA 90
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
F + + F ++ + F+ + F+ ++ +VFTL ++
Sbjct: 91 DAFNDPQNVMHSDAFNSPEDDMPPEDFSFPGDNTPPEDFSFTEDDMPPEVFTLSKDDIQP 150
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
+VFTL ++ ++ F L ++ ++ +L + ++ F+L ++ +++V
Sbjct: 151 EVFTLSKDDIESEAFGLSEDDIQSEALSLSKDNIQSEAFSLSEEDIQSEAV--------- 201
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
S+ E+ + TE+ + G++E + L TE A+
Sbjct: 202 -------SSPEIDIQPEAFTPTEIDIQPELRGSSETDIQSRELPPTEQKAE 245
>gi|384163166|ref|YP_005544545.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus amyloliquefaciens LL3]
gi|328910721|gb|AEB62317.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus amyloliquefaciens LL3]
Length = 2200
Score = 64.7 bits (156), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/335 (25%), Positives = 124/335 (37%), Gaps = 30/335 (8%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T T + G T +T + + G T T + G+T T G T +T +
Sbjct: 1233 GVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGET--- 1289
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---KVFTLGATELTAKV 128
G+T +T + G T T G T +T + G T +T ++ + G+T +T +
Sbjct: 1290 GSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGET 1349
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA---------------------KVFTL 167
G+T +T G+T +T + G T T
Sbjct: 1350 GPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVT 1409
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T G T T GAT +T + G T +T GAT T +
Sbjct: 1410 GATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGST 1469
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T G+T T + G T T ++ + G T T + G T T +
Sbjct: 1470 GATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGST 1529
Query: 288 GA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GA T +T + G T LT G+T +T
Sbjct: 1530 GATGPTGVTGPTGSTGPTGLTGSTGATGSTGVTGP 1564
Score = 58.2 bits (139), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/307 (25%), Positives = 113/307 (36%), Gaps = 33/307 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T GAT T G+T +T + G T T G T +T + G
Sbjct: 1267 STGSTGATGPTGATGPTGVTGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETG 1326
Query: 61 ATELTA---KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--- 114
T +T ++ + G+T +T + G+T +T G+T +T + G T T
Sbjct: 1327 VTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTG 1386
Query: 115 ------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
GAT T G T T GAT +T + G
Sbjct: 1387 SPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTG 1446
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
T +T GAT T + GAT T G+T T + G T T + +G
Sbjct: 1447 PTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGE---IG 1503
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
+T +T + G+T +T G+T T G T +T + G T LT G
Sbjct: 1504 STGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGAT------GPTGVTGPTGSTGPTGLTGSTGATG 1557
Query: 277 ATELTAK 283
+T +T
Sbjct: 1558 STGVTGP 1564
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/314 (22%), Positives = 110/314 (35%), Gaps = 28/314 (8%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T + G T +T + + G T T + G+T T G T +T + +
Sbjct: 1233 GVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGETGST 1292
Query: 204 GATELTAKVF---TLGATELTAKVFTLGA---------TELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + GAT T G T T ++ + G+T +T +
Sbjct: 1293 GVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPT 1352
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------------GATELTAKV 296
G+T +T G+T +T + G T T + G T +T
Sbjct: 1353 GSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGAT 1412
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELT 355
G T +T G+T E A + + P + AT T G+T T
Sbjct: 1413 GATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGAT 1472
Query: 356 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 415
+ G T T G T +T +G+T +T + G+T +T G+T T
Sbjct: 1473 GPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGAT 1532
Query: 416 AKVFTLGATELTAK 429
G T T
Sbjct: 1533 GPTGVTGPTGSTGP 1546
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/293 (24%), Positives = 106/293 (36%), Gaps = 29/293 (9%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + G T +T + + G T T + G+T T G T +T + +
Sbjct: 1233 GVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGETGST 1292
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------TAKVFTLGATELT 281
G T T G+T +T GAT T +G T + T ++ + G+T +T
Sbjct: 1293 GVTGST------GSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVT 1346
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA----------KSVILEVEYYKPI 331
+ G+T +T G+T +T + G T T P
Sbjct: 1347 GETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPT 1406
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 391
+ AT T G T T GAT +T + G T +T GAT T
Sbjct: 1407 GVT---GATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPT 1463
Query: 392 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT----ELTAKNIRSNTGTVGS 440
+ GAT T G+T T + G T E+ + + TG GS
Sbjct: 1464 GITGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGS 1516
>gi|448119474|ref|XP_004203739.1| Piso0_000757 [Millerozyma farinosa CBS 7064]
gi|359384607|emb|CCE78142.1| Piso0_000757 [Millerozyma farinosa CBS 7064]
Length = 973
Score = 63.9 bits (154), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/234 (21%), Positives = 75/234 (32%), Gaps = 6/234 (2%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT+ ++ FT G + F+ G + FT G + T G + FT
Sbjct: 537 GATKTSS--FTSGEKKEEKPTFSFGEKKANKPAFTFGEKKEDKPALTFGQRKEEKPAFTF 594
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G + F+ G + F+ G + FT + T + FT
Sbjct: 595 GEKKEDKPAFSFGEKKEDKPAFSFGEKKDDKPAFTFDEKKEDKPTLTFDEKKEDKPAFTF 654
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G + FT G + FT G + FT G + FT G + T
Sbjct: 655 GEKKQDKPAFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKPTLTF 714
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
G + FT+G + FT + FT G + F G
Sbjct: 715 GEKKEDKPAFTVGEKKEAKPAFTFEKKEDGKKDEKPAFTFGEKKDDKPTFKFGG 768
Score = 63.9 bits (154), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/234 (21%), Positives = 75/234 (32%), Gaps = 6/234 (2%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT+ ++ FT G + F+ G + FT G + T G + FT
Sbjct: 537 GATKTSS--FTSGEKKEEKPTFSFGEKKANKPAFTFGEKKEDKPALTFGQRKEEKPAFTF 594
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G + F+ G + F+ G + FT + T + FT
Sbjct: 595 GEKKEDKPAFSFGEKKEDKPAFSFGEKKDDKPAFTFDEKKEDKPTLTFDEKKEDKPAFTF 654
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G + FT G + FT G + FT G + FT G + T
Sbjct: 655 GEKKQDKPAFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKPTLTF 714
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
G + FT+G + FT + FT G + F G
Sbjct: 715 GEKKEDKPAFTVGEKKEAKPAFTFEKKEDGKKDEKPAFTFGEKKDDKPTFKFGG 768
Score = 63.9 bits (154), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/234 (21%), Positives = 75/234 (32%), Gaps = 6/234 (2%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT+ ++ FT G + F+ G + FT G + T G + FT
Sbjct: 537 GATKTSS--FTSGEKKEEKPTFSFGEKKANKPAFTFGEKKEDKPALTFGQRKEEKPAFTF 594
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G + F+ G + F+ G + FT + T + FT
Sbjct: 595 GEKKEDKPAFSFGEKKEDKPAFSFGEKKDDKPAFTFDEKKEDKPTLTFDEKKEDKPAFTF 654
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G + FT G + FT G + FT G + FT G + T
Sbjct: 655 GEKKQDKPAFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKPTLTF 714
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
G + FT+G + FT + FT G + F G
Sbjct: 715 GEKKEDKPAFTVGEKKEAKPAFTFEKKEDGKKDEKPAFTFGEKKDDKPTFKFGG 768
Score = 63.9 bits (154), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/204 (22%), Positives = 68/204 (33%), Gaps = 2/204 (0%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT+ ++ FT G + F+ G + FT G + T G + FT
Sbjct: 537 GATKTSS--FTSGEKKEEKPTFSFGEKKANKPAFTFGEKKEDKPALTFGQRKEEKPAFTF 594
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G + F+ G + F+ G + FT + T + FT
Sbjct: 595 GEKKEDKPAFSFGEKKEDKPAFSFGEKKDDKPAFTFDEKKEDKPTLTFDEKKEDKPAFTF 654
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G + FT G + FT G + FT G + FT G + T
Sbjct: 655 GEKKQDKPAFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKPTLTF 714
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G + FT+G + FT
Sbjct: 715 GEKKEDKPAFTVGEKKEAKPAFTF 738
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/225 (20%), Positives = 69/225 (30%), Gaps = 4/225 (1%)
Query: 9 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 68
FT G + F+ G + FT G + T G + FT G +
Sbjct: 544 FTSGEKKEEKPTFSFGEKKANKPAFTFGEKKEDKPALTFGQRKEEKPAFTFGEKKEDKPA 603
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
F+ G + F+ G + FT + T + FT G +
Sbjct: 604 FSFGEKKEDKPAFSFGEKKDDKPAFTFDEKKEDKPTLTFDEKKEDKPAFTFGEKKQDKPA 663
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
FT G + FT G + FT G + FT G + T G +
Sbjct: 664 FTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPAFTFGEKKEDKPTLTFGEKKEDKPA 723
Query: 189 FTLGATELTAKVFTL----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
FT+G + FT + FT G + F G
Sbjct: 724 FTVGEKKEAKPAFTFEKKEDGKKDEKPAFTFGEKKDDKPTFKFGG 768
Score = 52.8 bits (125), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/208 (21%), Positives = 69/208 (33%), Gaps = 18/208 (8%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT+ ++ FT G + F+ G + FT G + T G + FT
Sbjct: 537 GATKTSS--FTSGEKKEEKPTFSFGEKKANKPAFTFGEKKEDKPALTFGQRKEEKPAFTF 594
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL-EVEYYKPIKIV 334
G + F+ G + F+ G + FT + ++ E + KP
Sbjct: 595 GEKKEDKPAFSFGEKKEDKPAFSFGEKKDDKPAFTFDEKKEDKPTLTFDEKKEDKP---- 650
Query: 335 PQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 394
FT G + FT G + FT G + FT G +
Sbjct: 651 -----------AFTFGEKKQDKPAFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPSFTFGEKKEDKPA 699
Query: 395 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
FT G + T G + FT+G
Sbjct: 700 FTFGEKKEDKPTLTFGEKKEDKPAFTVG 727
>gi|254389585|ref|ZP_05004811.1| hypothetical protein SSCG_02138 [Streptomyces clavuligerus ATCC
27064]
gi|294816858|ref|ZP_06775500.1| Hypothetical protein SCLAV_p0317 [Streptomyces clavuligerus ATCC
27064]
gi|326445800|ref|ZP_08220534.1| hypothetical protein SclaA2_32267 [Streptomyces clavuligerus ATCC
27064]
gi|197703298|gb|EDY49110.1| hypothetical protein SSCG_02138 [Streptomyces clavuligerus ATCC
27064]
gi|294321673|gb|EFG03808.1| Hypothetical protein SCLAV_p0317 [Streptomyces clavuligerus ATCC
27064]
Length = 414
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 27 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 86
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 51 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 110
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 2/179 (1%)
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L VFT GA
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKLARTVFTGGA 385
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/170 (25%), Positives = 66/170 (38%), Gaps = 2/170 (1%)
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 316
+L V + G + VF G + T V + G + VF+ G +L
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGGTVKL 376
Score = 52.0 bits (123), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/193 (24%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 16/193 (8%)
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
+FT G + VF+ G VF+ G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFSGGTVTFARAVFSGGGVDFTRAVLSRGVVDFKGAVFSGGTV 326
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
+L V + G + VF G + T + V + VF+ G
Sbjct: 327 DLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFT--------------QAVLSGGVIDFRNAVFSGG 372
Query: 351 ATELTAKVFTLGA 363
+L VFT GA
Sbjct: 373 TVKLARTVFTGGA 385
Score = 51.6 bits (122), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/193 (25%), Positives = 72/193 (37%), Gaps = 16/193 (8%)
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
+ T VF G + T VF+ G + VF +FT G + VF G
Sbjct: 209 DFTGVVFDGG--DFTRAVFSGGIVDFGRAVFRDARVSFENALFTGGIVDFGRAVFPDGTV 266
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
+FT G + VF+ G T A++V + T V + G
Sbjct: 267 SFENALFTGGIVDFRRAVFS-GGTVTFARAVF-------------SGGGVDFTRAVLSRG 312
Query: 351 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 410
+ VF+ G +L V + G + VF G + T V + G + VF+ G
Sbjct: 313 VVDFKGAVFSGGTVDLVRTVLSGGWADFRQAVFKGGIVDFTQAVLSGGVIDFRNAVFSGG 372
Query: 411 ATELTAKVFTLGA 423
+L VFT GA
Sbjct: 373 TVKLARTVFTGGA 385
>gi|403224317|dbj|BAM42447.1| conserved hypothetical protein [Theileria orientalis strain
Shintoku]
Length = 1611
Score = 62.4 bits (150), Expect = 5e-07, Method: Composition-based stats.
Identities = 75/321 (23%), Positives = 155/321 (48%), Gaps = 1/321 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T++ A+ AT+ T + +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 191 STDVFARNDASSATDPTTQRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 250
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT++T+K T AT+ T+K +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 251 ATDVTSKRDTSSATDATSKRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 310
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT++T+K T AT++T K TE++ K T T++T+K T AT+ T+K
Sbjct: 311 ATDVTSKRDTSSATDVTLKRDAGVFTEISPKRDTSSTTDVTSKRDTSSATDATSKRDACV 370
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
TE++ K T ATE+ A+ TE + + +TE + ATE +
Sbjct: 371 FTEISPKRNTSSATEVLARKDAAVCTEFSIRKNVASSTEPPNRKDASSATETPCRSDASS 430
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
TE+ ++ +TE+++K AT++ + +TE + + +T+++ +
Sbjct: 431 YTEVPSRKDVASSTEVSSKRDVSCATDIAFRKDASSSTERSIRN-AASSTDVSVRKDASS 489
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
+TE+ ++ +TE + ++V
Sbjct: 490 STEVVSRKNAFSSTERSIRNV 510
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Composition-based stats.
Identities = 70/291 (24%), Positives = 138/291 (47%), Gaps = 2/291 (0%)
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
+T++ A+ AT+ T + +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 191 STDVFARNDASSATDPTTQRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 250
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
AT++T+K T AT+ T+K +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 251 ATDVTSKRDTSSATDATSKRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 310
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILE 324
AT++T+K T AT++T K TE++ K T T++T+K T AT+ T+K
Sbjct: 311 ATDVTSKRDTSSATDVTLKRDAGVFTEISPKRDTSSTTDVTSKRDTSSATDATSKRDACV 370
Query: 325 VEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 384
P + +SATE+ A+ TE + + +TE + ATE +
Sbjct: 371 FTEISPKR--NTSSATEVLARKDAAVCTEFSIRKNVASSTEPPNRKDASSATETPCRSDA 428
Query: 385 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNT 435
TE+ ++ +TE+++K AT++ + +TE + +N S+T
Sbjct: 429 SSYTEVPSRKDVASSTEVSSKRDVSCATDIAFRKDASSSTERSIRNAASST 479
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Composition-based stats.
Identities = 69/293 (23%), Positives = 134/293 (45%), Gaps = 14/293 (4%)
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T++ A+ AT+ T + +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 191 STDVFARNDASSATDPTTQRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 250
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT++T+K T AT+ T+K +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 251 ATDVTSKRDTSSATDATSKRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 310
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
AT++T+K T AT++T K TE++ K T T++T+K T AT+ T+K
Sbjct: 311 ATDVTSKRDTSSATDVTLKRDAGVFTEISPKRDTSSTTDVTSKRDTSSATDATSKRDACV 370
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
TE++ K T ATE+ A+ TE + + +TE +
Sbjct: 371 FTEISPKRNTSSATEVLARK--------------DAAVCTEFSIRKNVASSTEPPNRKDA 416
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
ATE + TE+ ++ +TE+++K AT++ + +TE
Sbjct: 417 SSATETPCRSDASSYTEVPSRKDVASSTEVSSKRDVSCATDIAFRKDASSSTE 469
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Composition-based stats.
Identities = 63/265 (23%), Positives = 124/265 (46%), Gaps = 2/265 (0%)
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+T++ A+ AT+ T + +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 191 STDVFARNDASSATDPTTQRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 250
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
AT++T+K T AT+ T+K +T+++ + TE++ + + E++ K
Sbjct: 251 ATDVTSKRDTSSATDATSKRDAGVSTDISFRKDASSCTEVSVRKDASSSIEVSPKRDASS 310
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
AT++T+K T AT++T K P + +S T++T+K T AT+ T+K
Sbjct: 311 ATDVTSKRDTSSATDVTLKRDAGVFTEISPKR--DTSSTTDVTSKRDTSSATDATSKRDA 368
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
TE++ K T ATE+ A+ TE + + +TE + ATE +
Sbjct: 369 CVFTEISPKRNTSSATEVLARKDAAVCTEFSIRKNVASSTEPPNRKDASSATETPCRSDA 428
Query: 421 LGATELTAKNIRSNTGTVGSPTHMS 445
TE+ ++ +++ V S +S
Sbjct: 429 SSYTEVPSRKDVASSTEVSSKRDVS 453
>gi|167757186|ref|ZP_02429313.1| hypothetical protein CLORAM_02736 [Clostridium ramosum DSM 1402]
gi|167703361|gb|EDS17940.1| BclB domain protein [Clostridium ramosum DSM 1402]
Length = 578
Score = 62.0 bits (149), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/352 (27%), Positives = 107/352 (30%), Gaps = 11/352 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T +G T T G T + GAT T
Sbjct: 31 GATGATGPTGVTGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGAT 90
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T G+T T + G T T G T LT GAT T +
Sbjct: 91 GEDGATGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGATGPTGLTGATGEDGATGPTGPTGST 150
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + GAT T G T GAT T GAT
Sbjct: 151 GPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGAT 210
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T GAT T GAT G T LT GAT T
Sbjct: 211 GPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGLTGATGEDGATGPTGPTGAT 270
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T GAT T GAT G T T GAT T
Sbjct: 271 GEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 330
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 363
GAT T P ++ AT T + GAT T T GA
Sbjct: 331 GATGPTG-----------PTGATGEDGATGPTGPTGSTGATGSTGPTGTNGA 371
Score = 58.5 bits (140), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 100/355 (28%), Positives = 111/355 (31%), Gaps = 17/355 (4%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T +G T T G T + GAT T
Sbjct: 31 GATGATGPTGVTGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGAT 90
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T G+T T + G T T G T LT GAT T +
Sbjct: 91 GEDGATGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGATGPTGLTGATGEDGATGPTGPTGST 150
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + GAT T G T GAT T GAT
Sbjct: 151 GPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGAT 210
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T GAT T GAT G T LT GAT T
Sbjct: 211 GPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGLTGATGEDGATGPT------ 264
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G T T + GAT T G T T GAT T + P
Sbjct: 265 GPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPT--------GPTGATG 316
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 387
++ AT T GAT T G AT T + GAT T T GA
Sbjct: 317 EDGATGPTGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGSTGATGSTGPTGTNGA 371
Score = 58.5 bits (140), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/364 (28%), Positives = 113/364 (31%), Gaps = 23/364 (6%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T +G T T G T +T + GAT T
Sbjct: 31 GATGATGPTGVTGATGPTGVTGVIGPTGATGAT---GPTGVTGVIGPTGATGATGPTGPT 87
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT G T T GAT T GAT G T LT
Sbjct: 88 GATGEDGATGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGAT---------GPTGLTGATGED 138
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + G T T + GAT T G T GAT T
Sbjct: 139 GATGPTGPTGSTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPT 198
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT G T T GAT T GAT G T LT
Sbjct: 199 GATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGLTGATGED 258
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT T G T GAT T + P ++ AT T
Sbjct: 259 GATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPT--------GPTGATGEDGATGATGPTG 310
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
GAT G T T G T T + GAT T + GAT T
Sbjct: 311 PTGATGEDGATGPTGPTGATGATGPTGPTGATGE---DGATGPTGPTGSTGATGSTGPTG 367
Query: 408 TLGA 411
T GA
Sbjct: 368 TNGA 371
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 100/358 (27%), Positives = 109/358 (30%), Gaps = 23/358 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T +G T T G T +T + GAT T
Sbjct: 31 GATGATGPTGVTGATGPTGVTGVIGPTGATGAT---GPTGVTGVIGPTGATGATGPTGPT 87
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT G T T GAT T GAT G T LT
Sbjct: 88 GATGEDGATGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGAT---------GPTGLTGATGED 138
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T + G T T + GAT T G T GAT T
Sbjct: 139 GATGPTGPTGSTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPT 198
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT G T T GAT T GAT G T LT
Sbjct: 199 GATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGLTGATGED 258
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GAT T P ++ AT T GAT T G T
Sbjct: 259 GATGPTG-----------PTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATG 307
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T + G T T G T T GAT T + GAT T
Sbjct: 308 PTGPTGATGEDGATGPTGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGSTGATGSTGP 365
>gi|426250004|ref|XP_004018733.1| PREDICTED: sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3 [Ovis
aries]
Length = 904
Score = 62.0 bits (149), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 81/313 (25%), Positives = 133/313 (42%), Gaps = 1/313 (0%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 41 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 100
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 101 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 160
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 161 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 220
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 221 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 280
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 281 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 340
Query: 312 GATE-LTAKSVIL 323
GA + L A+S L
Sbjct: 341 GARKVLGARSAFL 353
Score = 61.6 bits (148), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/305 (25%), Positives = 128/305 (41%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++
Sbjct: 45 VLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARK 104
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++
Sbjct: 105 VLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARK 164
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++
Sbjct: 165 VLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARK 224
Query: 190 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++
Sbjct: 225 VLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARK 284
Query: 250 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 309
LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++
Sbjct: 285 VLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARK 344
Query: 310 TLGAT 314
LGA
Sbjct: 345 VLGAR 349
Score = 51.6 bits (122), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/320 (24%), Positives = 131/320 (40%), Gaps = 16/320 (5%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 41 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 100
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 101 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 160
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ L
Sbjct: 161 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL 220
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE-LTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKV 346
GA ++ LGA ++ LGA + L A+ V+ A ++
Sbjct: 221 GARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVL---------------GARKVLGAR 265
Query: 347 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 406
LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++ LGA ++
Sbjct: 266 KVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGARKVLGAR 325
Query: 407 FTLGATELTAKVFTLGATEL 426
LGA ++ LGA ++
Sbjct: 326 KVLGARKVLGARKVLGARKV 345
>gi|350553503|ref|ZP_08922675.1| phage SPO1 DNA polymerase-related protein [Thiorhodospira sibirica
ATCC 700588]
gi|349790382|gb|EGZ44294.1| phage SPO1 DNA polymerase-related protein [Thiorhodospira sibirica
ATCC 700588]
Length = 442
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 255
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 61.2 bits (147), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 78/208 (37%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 315
GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 74/198 (37%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT L + GAT L + GAT L + GAT + GAT +
Sbjct: 162 GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLGVAGATRSQEDLCVA 221
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELT 317
GAT + GAT L
Sbjct: 222 GATRSQEDLGVAGATRLQ 239
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/222 (27%), Positives = 77/222 (34%), Gaps = 14/222 (6%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
GAT + GAT L + GAT + GAT + GAT L +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVA 161
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
AT L + GAT L + GAT L + GAT +
Sbjct: 162 --------------GATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLG 207
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
GAT + GAT + GAT L + GAT
Sbjct: 208 VAGATRSQEDLCVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATR 249
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/212 (26%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 14/212 (6%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT + GAT + GAT + GAT L + GAT +
Sbjct: 42 GATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRSQEDLCVA 101
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
GAT + GAT L + GAT + GAT + + +
Sbjct: 102 GATRSQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRSQEDLGVAGATR-----------SQEDLGVA- 149
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
AT L + GAT L + GAT L + GAT L + GAT +
Sbjct: 150 --GATRLQEDLGVAGATRLQEDLGVAGATRLQEDLCVAGATRLQEDLGVAGATRSQEVLG 207
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 427
GAT + GAT + GAT L
Sbjct: 208 VAGATRSQEDLCVAGATRSQEDLGVAGATRLQ 239
>gi|156378037|ref|XP_001630951.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156217982|gb|EDO38888.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 183
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
LGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HA 114
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
LGA + TLGA TLGA TLGA TLG T
Sbjct: 115 LGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHT 168
Query: 191 LG 192
LG
Sbjct: 169 LG 170
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
LGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HA 114
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
LGA + TLGA TLGA TLGA TLG T
Sbjct: 115 LGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHT 168
Query: 215 LG 216
LG
Sbjct: 169 LG 170
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
LGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HA 114
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
LGA + TLGA TLGA TLGA TLG T
Sbjct: 115 LGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHT 168
Query: 239 LG 240
LG
Sbjct: 169 LG 170
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
LGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HA 114
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
LGA + TLGA TLGA TLGA TLG T
Sbjct: 115 LGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHT 168
Query: 263 LG 264
LG
Sbjct: 169 LG 170
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
LGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HA 114
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
LGA + TLGA TLGA TLGA TLG T
Sbjct: 115 LGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHT 168
Query: 287 LG 288
LG
Sbjct: 169 LG 170
Score = 60.8 bits (146), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
LGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HA 114
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
LGA + TLGA TLGA TLGA TLG T
Sbjct: 115 LGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHT 168
Query: 311 LG 312
LG
Sbjct: 169 LG 170
Score = 58.9 bits (141), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/172 (32%), Positives = 58/172 (33%), Gaps = 12/172 (6%)
Query: 9 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 68
TLGA TLGA TLGA TLGA TLGA
Sbjct: 11 HTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHTLGADHALGSD 70
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
TLGA TLG+ TLGA TLGA LGA +
Sbjct: 71 RTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HALGANHTSGSD 124
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
TLGA TLGA TLGA TLG TLG
Sbjct: 125 RTLGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHTLG 170
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/149 (32%), Positives = 52/149 (34%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
LGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------HA 114
Query: 287 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 315
LGA + TLGA TLGA
Sbjct: 115 LGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGANH 143
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/209 (28%), Positives = 62/209 (29%), Gaps = 44/209 (21%)
Query: 202 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 261
TLGA TLGA TLGA TLGA TLGA
Sbjct: 6 TLGADHTLGADHTLGAN------HTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDH 59
Query: 262 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
TLGA TLGA TLG+ TLGA TLGA
Sbjct: 60 TLGADHALGSDRTLGANHTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNHTLGAD------- 112
Query: 322 ILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
LGA + TLGA TLGA
Sbjct: 113 -------------------------HALGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN----- 142
Query: 382 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 410
TLGA TLG TLG
Sbjct: 143 -HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHTLG 170
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/208 (29%), Positives = 64/208 (30%), Gaps = 38/208 (18%)
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
LGA + TLGA TLGA TLGA TLGA T
Sbjct: 1 LGAEQTLGADHTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHT 60
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIV 334
LGA TLGA TLGA TLGA L +
Sbjct: 61 LGADHALGSDRTLGAN------HTLGADHTLGSDRTLGANHTLGADHALGTNH------- 107
Query: 335 PQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 394
TLGA LGA + TLGA TLGA
Sbjct: 108 -------------TLGAD------HALGANHTSGSDRTLGADHALGSDRTLGAN------ 142
Query: 395 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
TLGA TLG TLG
Sbjct: 143 HTLGADHTLGTGHTLGIDHTLGTGHTLG 170
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/79 (34%), Positives = 28/79 (35%)
Query: 347 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 406
TLGA TLGA TLGA TLGA TLGA
Sbjct: 11 HTLGADHTLGANHTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHTLGADHALGSD 70
Query: 407 FTLGATELTAKVFTLGATE 425
TLGA TLG+
Sbjct: 71 RTLGANHTLGADHTLGSDR 89
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/79 (34%), Positives = 28/79 (35%)
Query: 347 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 406
TLGA TLGA TLGA TLGA TLGA
Sbjct: 23 HTLGANHTLGANHTLGADHTLGADHTLGANHTLGSDHTLGADHALGSDRTLGANHTLGAD 82
Query: 407 FTLGATELTAKVFTLGATE 425
TLG+ TLGA
Sbjct: 83 HTLGSDRTLGANHTLGADH 101
>gi|423426649|ref|ZP_17403680.1| hypothetical protein IE5_04338, partial [Bacillus cereus BAG3X2-2]
gi|401110393|gb|EJQ18300.1| hypothetical protein IE5_04338, partial [Bacillus cereus BAG3X2-2]
Length = 423
Score = 60.5 bits (145), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/341 (24%), Positives = 106/341 (31%), Gaps = 45/341 (13%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LG T T + GAT T G+T T GAT T G+T T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGATGATGSTGATGPTGSTGPTGSTGP 95
Query: 71 LGATELTAKVFTLG------------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
G+T T G AT T G+T T
Sbjct: 96 TGSTGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGPTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGP 155
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G+T T + G T T + G+T T + G T T + GAT T +
Sbjct: 156 TGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGATGS 215
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------- 213
G+T T + G T T + GAT T + G T T
Sbjct: 216 TGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGS 275
Query: 214 --------TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
GAT T +GAT T G+T T + G T T + GA
Sbjct: 276 TGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGPTGATGPTGSTGA 335
Query: 266 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
T T G T T + G T T + G T T
Sbjct: 336 TGSTGSTGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTG 376
Score = 59.7 bits (143), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/249 (26%), Positives = 83/249 (33%), Gaps = 8/249 (3%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T T + G T T G+T T + GAT T
Sbjct: 136 GPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPT 195
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T G T T + G T T G+T +T + G+T T +
Sbjct: 196 GATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGAT------GSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGST 249
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
G+T T GAT T + AT T +GAT T
Sbjct: 250 GSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGP--TGATGPTGSTGPIGATGPTGATG 307
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
G+T T + G T T + GAT T G T T + G T T
Sbjct: 308 PTGSTGPTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTG 367
Query: 420 TLGATELTA 428
+ G T T
Sbjct: 368 STGPTGPTG 376
Score = 59.3 bits (142), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/232 (24%), Positives = 73/232 (31%), Gaps = 33/232 (14%)
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T G+T T G+T T + G T T + G+T T + G
Sbjct: 134 ATGPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTG 193
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T + GAT T + G+T T + G T T + GAT T + G
Sbjct: 194 PTGATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTGSTG 253
Query: 241 ---------------------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
AT T +GAT T G+T
Sbjct: 254 PTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGSTG 313
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
T + G T T + GAT T G T T + G T T
Sbjct: 314 PTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGSTGPTGATGS 365
Score = 55.8 bits (133), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/259 (25%), Positives = 79/259 (30%), Gaps = 35/259 (13%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + G T T + G T T G+T T + GAT T
Sbjct: 136 GPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPT 195
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T GAT T + G+T T + G T T + GAT T +
Sbjct: 196 GATGPTGST---GATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTGST 252
Query: 252 GATELTAKVF---------------------TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
G T T GAT T +GAT T G+T
Sbjct: 253 GPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGST 312
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
T + G T T + GAT T P AT T G
Sbjct: 313 GPTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTG-----STGATGPTG------ATGPTGSTGPTG 361
Query: 351 ATELTAKVFTLGATELTAK 369
AT T G T T
Sbjct: 362 ATGSTGSTGPTGPTGATGP 380
Score = 55.1 bits (131), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/274 (27%), Positives = 90/274 (32%), Gaps = 29/274 (10%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T + G T T + G T T G+T T + GAT T
Sbjct: 136 GPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPT 195
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T G T T + G T T G+T +T + G+T T +
Sbjct: 196 GATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGAT------GSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGST 249
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
G+T T GAT T + G+T T GAT T +GAT T
Sbjct: 250 GSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTG----- 304
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
AT T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 305 ---------------ATGPTGSTGPTGATGSTGPT---GATGPTGSTGATGSTGSTGATG 346
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 417
GAT T GAT T G T T
Sbjct: 347 PTGATGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGATGP 380
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/226 (23%), Positives = 66/226 (29%), Gaps = 44/226 (19%)
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T + G T T + G T T G+T T + GAT T
Sbjct: 136 GPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPT 195
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT T G T T + G T T T +T
Sbjct: 196 GATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGS--------------------TGVTGPTG 235
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG------------------------ATELTAKVF 383
+ G+T T + G+T T G AT T
Sbjct: 236 STGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTG 295
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
+GAT T G+T T + G T T + GAT T
Sbjct: 296 PIGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTGS 341
>gi|89893368|ref|YP_516855.1| hypothetical protein DSY0622 [Desulfitobacterium hafniense Y51]
gi|89332816|dbj|BAE82411.1| hypothetical protein [Desulfitobacterium hafniense Y51]
Length = 705
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/225 (32%), Positives = 75/225 (33%), Gaps = 2/225 (0%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 211 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGET 270
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 271 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGET 330
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 331 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGET 390
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
GAT T GAT T G T GAT +S
Sbjct: 391 GATGATGPAGETGATGATGPAGEPGG--PTGPTGATGATGPAGES 433
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/206 (33%), Positives = 69/206 (33%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 211 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGET 270
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 271 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGET 330
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 331 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGET 390
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
GAT T GAT T G
Sbjct: 391 GATGATGPAGETGATGATGPAGEPGG 416
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/227 (31%), Positives = 73/227 (32%), Gaps = 19/227 (8%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 211 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGET 270
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
GAT T GAT T GAT T GAT T +
Sbjct: 271 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG-------------- 316
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
+ AT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 317 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 376
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGSPT 442
GAT T GAT T GAT T G G PT
Sbjct: 377 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGP-----AGEPGGPT 418
>gi|423430626|ref|ZP_17407630.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401119249|gb|EJQ27072.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 60.5 bits (145), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT +T+ G T +T GAT +T GAT +T G +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLT 159
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 160 GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/127 (29%), Positives = 52/127 (40%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T+ G T +T G
Sbjct: 65 ATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTG 124
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T G +T G T +T + + GAT + G
Sbjct: 125 ATGITGPTGPTGATGITGPTGLTGVNGITGPTGLTGVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTG 184
Query: 121 ATELTAK 127
AT +T
Sbjct: 185 ATGITGP 191
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 29/178 (16%)
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 43 GATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPT 99
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GAT +T+ + + V T +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 100 GATGITSPTGLTGV--------------TGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIT---- 141
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T LT G T LT G T +T + + GAT + GAT +T
Sbjct: 142 --GPTGLTGVNGITGPTGLT------GVTGITGPIGSTGATGIAGPTGPTGATGITGP 191
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/95 (33%), Positives = 40/95 (42%), Gaps = 6/95 (6%)
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
Q AT +T GAT +T GAT +T GAT +T+ G T +T
Sbjct: 62 QTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITSPTGLTGVTGITGPTG 121
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKN 430
GAT +T GAT +T G T LT N
Sbjct: 122 PTGATGITGPTGPTGATGIT------GPTGLTGVN 150
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/93 (32%), Positives = 39/93 (41%), Gaps = 3/93 (3%)
Query: 337 NSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
+ AT T GAT T + GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 42 SGATGPTGPTGISGATGPTGQT---GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGP 98
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T+ G T +T GAT +T
Sbjct: 99 TGATGITSPTGLTGVTGITGPTGPTGATGITGP 131
>gi|407706108|ref|YP_006829693.1| hypothetical protein MC28_2872 [Bacillus thuringiensis MC28]
gi|407383793|gb|AFU14294.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis MC28]
Length = 1295
Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/356 (27%), Positives = 98/356 (27%), Gaps = 75/356 (21%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T G T T GAT T GAT T G
Sbjct: 174 ATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGAT------GATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRG 227
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T GAT T T GAT T G T T G T G
Sbjct: 228 NTGAT------GATGPTGPRGTRGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATG 281
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T GAT T GAT T G T T GAT T G
Sbjct: 282 PTGPTGPRGNTGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGAT------GATGPTGPRGNTG 335
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------------------G 204
AT T G T T G
Sbjct: 336 ATGATGPTGPRGNTGATGPTGPRGTAGAAGATGPTGSRGNTGGTGATGPPGPGGAPVATG 395
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
AT T GAT GAT T GAT T G T T G
Sbjct: 396 ATGPTGPRGNTGAT---------GATGPTGPRGNTGATGATGPPGPRGNTGAT------G 440
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
AT T GAT T G T T GAT T GAT T S
Sbjct: 441 ATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGAT------GATGPTGPRGNTGATGATGPS 490
>gi|402556166|ref|YP_006597437.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus FRI-35]
gi|401797376|gb|AFQ11235.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus FRI-35]
Length = 1231
Score = 59.3 bits (142), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 126/475 (26%), Positives = 133/475 (28%), Gaps = 54/475 (11%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T GAT T GAT T GAT T GAT T GAT
Sbjct: 169 TGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGA 228
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T GAT T GAT T GAT T GAT T GAT +
Sbjct: 229 TGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGI 288
Query: 125 ---------------------TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
GAT GAT T GAT
Sbjct: 289 GVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGI 348
Query: 164 VFTLGATELTAK---VFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
GAT T GAT T GAT T GAT GA
Sbjct: 349 QGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGA 408
Query: 218 TELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
T T GAT T G T T GA T G +
Sbjct: 409 TGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 468
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
GAT GAT T GAT T G T T + V+
Sbjct: 469 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPA-- 526
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 385
AT T G T T GAT T GAT
Sbjct: 527 ------GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNT 580
Query: 386 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KNIRSNTGTVG 439
GAT T G T T GAT GAT T + ++ NTG G
Sbjct: 581 GATGATGPQGVQGNTGAT------GATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG 629
>gi|206977353|ref|ZP_03238250.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
gi|206744504|gb|EDZ55914.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
Length = 524
Score = 58.2 bits (139), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/254 (23%), Positives = 88/254 (34%), Gaps = 30/254 (11%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T G+T T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGPTGNTGSTGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNT 180
Query: 72 ------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 113
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T
Sbjct: 181 GSTGSTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVT 234
Query: 114 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 173
+ G T +T G+T +T + G T +T + G T +T G+T T
Sbjct: 235 GSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGST 294
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 233
G + T + G T +T G T +T G T T + G T +T
Sbjct: 295 GPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGIT------GPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGIT 348
Query: 234 AKVFTLGATELTAK 247
G+T T
Sbjct: 349 GPTGITGSTGPTGS 362
Score = 58.2 bits (139), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/254 (23%), Positives = 88/254 (34%), Gaps = 30/254 (11%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T G+T T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGPTGNTGSTGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNT 180
Query: 84 ------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T
Sbjct: 181 GSTGSTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVT 234
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
+ G T +T G+T +T + G T +T + G T +T G+T T
Sbjct: 235 GSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGST 294
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
G + T + G T +T G T +T G T T + G T +T
Sbjct: 295 GPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGIT------GPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGIT 348
Query: 246 AKVFTLGATELTAK 259
G+T T
Sbjct: 349 GPTGITGSTGPTGS 362
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/268 (23%), Positives = 87/268 (32%), Gaps = 45/268 (16%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T G+T T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGPTGNTGSTGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNT 180
Query: 252 ------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 293
G+T +T + G T +T G+T +T G+T T
Sbjct: 181 GSTGSTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGST 240
Query: 294 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATE 353
G+T +T G+T T T +T + G T
Sbjct: 241 GPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGP--------------------TGITGSTGSTGPTG 280
Query: 354 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
+T G+T T G T +T G+T T G T +T G T
Sbjct: 281 ITGPSGNTGSTGST------GPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGPTGNTGPTG 334
Query: 414 LTAKVFTLGATELTAK-NIRSNTGTVGS 440
T + G T +T I +TG GS
Sbjct: 335 NTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGS 362
>gi|291226474|ref|XP_002733218.1| PREDICTED: hypothetical protein [Saccoglossus kowalevskii]
Length = 1030
Score = 58.2 bits (139), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/314 (24%), Positives = 134/314 (42%), Gaps = 8/314 (2%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
+ VF++ T VF++ T VF++ L ++ T+ L + T+ +
Sbjct: 679 QWCGTVFSVYLTSRRGAVFSVHLTSRRGAVFSV---HLPSRRGTVVTVHLASVFCTVVSV 735
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
L ++ T+ + LT++ T+ + L ++ T+ + LT++ + + L + +T+ +
Sbjct: 736 HLASRRSTVVSVHLTSRRGTVFSVHLASRRGTVFSVHLTSRRGAVFSVHLASVCYTVVSV 795
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-----VFTLGATELTAKVF 177
L ++ T+ + L ++ T+ + LT+ T+ + LT + VFTL + VF
Sbjct: 796 HLASRRGTVVSVHLVSRRGTVVSVHLTSVCGTVFSIHLTLRRVQCLVFTLHQGVVQCLVF 855
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
T + VFT + VFT + VFT + VFTL + VF
Sbjct: 856 TSHQDVVQCLVFTSHQDVVQCLVFTSHQDVVQWLVFTSHQGVVQWIVFTLHQGVVQWLVF 915
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
TL + VFTL + VFTL + VFTL + VFT + VF
Sbjct: 916 TLHQGVVQWIVFTLHQGVVQCLVFTLHQGVVQCLVFTLHQCVVQWLVFTSHQCVVQWLVF 975
Query: 298 TLGATELTAKVFTL 311
L VFTL
Sbjct: 976 ISHQGVLQCLVFTL 989
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/292 (24%), Positives = 126/292 (43%), Gaps = 5/292 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+ LT++ + + L ++ T+ L + T+ + L ++ T+ + LT++ T+
Sbjct: 698 SVHLTSRRGAVFSVHLPSRRGTVVTVHLASVFCTVVSVHLASRRSTVVSVHLTSRRGTVF 757
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+ L ++ T+ + LT++ + + L + +T+ + L ++ T+ + L ++ T+
Sbjct: 758 SVHLASRRGTVFSVHLTSRRGAVFSVHLASVCYTVVSVHLASRRGTVVSVHLVSRRGTVV 817
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAK-----VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
+ LT+ T+ + LT + VFTL + VFT + VFT +
Sbjct: 818 SVHLTSVCGTVFSIHLTLRRVQCLVFTLHQGVVQCLVFTSHQDVVQCLVFTSHQDVVQCL 877
Query: 176 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
VFT + VFT + VFTL + VFTL + VFTL +
Sbjct: 878 VFTSHQDVVQWLVFTSHQGVVQWIVFTLHQGVVQWLVFTLHQGVVQWIVFTLHQGVVQCL 937
Query: 236 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
VFTL + VFTL + VFT + VF L VFTL
Sbjct: 938 VFTLHQGVVQCLVFTLHQCVVQWLVFTSHQCVVQWLVFISHQGVLQCLVFTL 989
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/442 (20%), Positives = 201/442 (45%), Gaps = 25/442 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+ LT++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + ++ T+ + L ++ T+
Sbjct: 526 SVHLTSRRGTVVSVHLASRRGTVFSVHLASRRGTVVSVHPASRCGTVFSVHLASRRGTVF 585
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+ L ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+
Sbjct: 586 SVHLASRRGTVVSVHLASRRGTVVSVHLASRCGTVVSVHLASRRGTVVSVHLASRRGTVV 645
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-------VFTLGATELTAKVFTLGATELT 173
+ L + T+ + L ++ T+ + L ++ VF++ T VF++ T
Sbjct: 646 SVHLALRRGTVFSVHLASRRGTVLSVHLASRRVQWCGTVFSVYLTSRRGAVFSVHLTSRR 705
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 233
VF++ L ++ T+ L + T+ + L ++ T+ + LT++ T+ + L
Sbjct: 706 GAVFSV---HLPSRRGTVVTVHLASVFCTVVSVHLASRRSTVVSVHLTSRRGTVFSVHLA 762
Query: 234 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 293
++ T+ + LT++ + + L + +T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + LT
Sbjct: 763 SRRGTVFSVHLTSRRGAVFSVHLASVCYTVVSVHLASRRGTVVSVHLVSRRGTVVSVHLT 822
Query: 294 AKVFTLGATELTAK-----VFTL--GATEL---TAKSVILEVEYYKPIKIVPQN----SA 339
+ T+ + LT + VFTL G + T+ +++ + + V Q S
Sbjct: 823 SVCGTVFSIHLTLRRVQCLVFTLHQGVVQCLVFTSHQDVVQCLVFTSHQDVVQCLVFTSH 882
Query: 340 TELTAK-VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
++ VFT + VFTL + VFTL + VFTL + VFTL
Sbjct: 883 QDVVQWLVFTSHQGVVQWIVFTLHQGVVQWLVFTLHQGVVQWIVFTLHQGVVQCLVFTLH 942
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
+ VFTL + VFT
Sbjct: 943 QGVVQCLVFTLHQCVVQWLVFT 964
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/440 (20%), Positives = 198/440 (45%), Gaps = 19/440 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+ LT++ T+ + L ++ T+ + LT++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+
Sbjct: 502 SVHLTSRRGTVVSVHLASRRGTVFSVHLTSRRGTVVSVHLASRRGTVFSVHLASRRGTVV 561
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+ ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+
Sbjct: 562 SVHPASRCGTVFSVHLASRRGTVFSVHLASRRGTVVSVHLASRRGTVVSVHLASRCGTVV 621
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK----- 175
+ L ++ T+ + L ++ T+ + L + T+ + L ++ T+ + L ++
Sbjct: 622 SVHLASRRGTVVSVHLASRRGTVVSVHLALRRGTVFSVHLASRRGTVLSVHLASRRVQWC 681
Query: 176 --VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG--------ATELTAKVF-TLGATELTAKV 224
VF++ T VF++ T VF++ T A VF T+ + L ++
Sbjct: 682 GTVFSVYLTSRRGAVFSVHLTSRRGAVFSVHLPSRRGTVVTVHLASVFCTVVSVHLASRR 741
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
T+ + LT++ T+ + L ++ T+ + LT++ + + L + +T+ + L ++
Sbjct: 742 STVVSVHLTSRRGTVFSVHLASRRGTVFSVHLTSRRGAVFSVHLASVCYTVVSVHLASRR 801
Query: 285 FTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE 341
T+ + L ++ V ++ T + VF++ T + ++ + +V +
Sbjct: 802 GTVVSVHLVSRRGTVVSVHLTSVCGTVFSIHLTLRRVQCLVFTLHQGVVQCLVFTSHQDV 861
Query: 342 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 401
+ VFT + VFT + VFT + VFTL + VFTL
Sbjct: 862 VQCLVFTSHQDVVQCLVFTSHQDVVQWLVFTSHQGVVQWIVFTLHQGVVQWLVFTLHQGV 921
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
+ VFTL + VFTL
Sbjct: 922 VQWIVFTLHQGVVQCLVFTL 941
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.081, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/433 (19%), Positives = 199/433 (45%), Gaps = 31/433 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 57
+ L ++ T+ + LT++ T+ + L ++ VF++ LT++ T+ + L ++
Sbjct: 466 SVHLASRRGTVFSVHLTSRRGTVVSVHLASRRGTVFSV---HLTSRRGTVVSVHLASRRG 522
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
T+ + LT++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + ++ T+ + L ++
Sbjct: 523 TVFSVHLTSRRGTVVSVHLASRRGTVFSVHLASRRGTVVSVHPASRCGTVFSVHLASRRG 582
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + L ++ T+ + L ++
Sbjct: 583 TVFSVHLASRRGTVVSVHLASRRGTVVSVHLASRCGTVVSVHLASRRGTVVSVHLASRRG 642
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
T+ + L + T+ + L ++ T+ + L ++ + VF++ T VF
Sbjct: 643 TVVSVHLALRRGTVFSVHLASRRGTVLSVHLASR-----RVQWCGTVFSVYLTSRRGAVF 697
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
++ T VF++ L ++ T+ L + T+ + L ++ T+ + LT++
Sbjct: 698 SVHLTSRRGAVFSV---HLPSRRGTVVTVHLASVFCTVVSVHLASRRSTVVSVHLTSRRG 754
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAK-----SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGAT 352
T+ + L ++ T+ + LT++ SV L Y + + L ++ T+ +
Sbjct: 755 TVFSVHLASRRGTVFSVHLTSRRGAVFSVHLASVCYTVVSV-------HLASRRGTVVSV 807
Query: 353 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-----VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
L ++ T+ + LT+ T+ + LT + VFTL + VFT + VF
Sbjct: 808 HLVSRRGTVVSVHLTSVCGTVFSIHLTLRRVQCLVFTLHQGVVQCLVFTSHQDVVQCLVF 867
Query: 408 TLGATELTAKVFT 420
T + VFT
Sbjct: 868 TSHQDVVQCLVFT 880
>gi|344238963|gb|EGV95066.1| hypothetical protein I79_017150 [Cricetulus griseus]
Length = 240
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 13 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 72
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 25 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 84
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 37 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 49 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 114/226 (50%)
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/234 (24%), Positives = 116/234 (49%), Gaps = 3/234 (1%)
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 181
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE + L + + P
Sbjct: 182 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLR---LMTDQHVP 232
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/240 (23%), Positives = 115/240 (47%), Gaps = 14/240 (5%)
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
+TE ++ T +TE ++++ S TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STECGLRLMTAMSTEC-------------GLRLMTAMS-TECGLRLMTAMSTECGLRLMT 167
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 168 AMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 227
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/233 (24%), Positives = 112/233 (48%), Gaps = 14/233 (6%)
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 2 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 61
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 62 STECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAM 121
Query: 313 ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 372
+TE ++++ S TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T
Sbjct: 122 STEC-------------GLRLMTAMS-TECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMT 167
Query: 373 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
+TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE ++ T +TE
Sbjct: 168 AMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTECGLRLMTAMSTE 220
>gi|359442984|ref|ZP_09232839.1| ribonuclease E [Pseudoalteromonas sp. BSi20429]
gi|358035192|dbj|GAA69088.1| ribonuclease E [Pseudoalteromonas sp. BSi20429]
Length = 1044
Score = 57.8 bits (138), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/129 (47%), Positives = 62/129 (48%), Gaps = 3/129 (2%)
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 313 ATELTAKSV 321
TE +A V
Sbjct: 970 KTEKSAPHV 978
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 121 ATELTA 126
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 13 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 72
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 133 ATELTA 138
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 25 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 84
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 145 ATELTA 150
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 37 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 157 ATELTA 162
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 49 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 169 ATELTA 174
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 181 ATELTA 186
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 193 ATELTA 198
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 205 ATELTA 210
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 217 ATELTA 222
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 229 ATELTA 234
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 241 ATELTA 246
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 253 ATELTA 258
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 265 ATELTA 270
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 277 ATELTA 282
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/126 (47%), Positives = 61/126 (48%), Gaps = 3/126 (2%)
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
A E AKV A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV
Sbjct: 853 AVEDLAKV---EAVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPV 909
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
TE AKV T TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV
Sbjct: 910 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKV 969
Query: 301 ATELTA 306
TE +A
Sbjct: 970 KTEKSA 975
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/90 (50%), Positives = 45/90 (50%)
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
TE AKV T TE AKV T ATE AKV TE AKV T TE AKV T
Sbjct: 875 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVV 934
Query: 400 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
TE AKV TE AKV T TE AK
Sbjct: 935 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAK 964
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/91 (49%), Positives = 45/91 (49%)
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
A E AKV T TE AKV T TE AKV T ATE AKV TE AKV T
Sbjct: 862 AVEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVATEEQAKVEAPVVTEEPAKVETPV 921
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
TE AKV T TE AKV TE AK
Sbjct: 922 VTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPAK 952
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/93 (46%), Positives = 47/93 (50%)
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
TE AKV T ATE AKV TE AKV T TE AKV T TE AKV
Sbjct: 887 TEEPAKVETPVATEEQAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVV 946
Query: 400 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIR 432
TE AKV T TE AKV TE +A +++
Sbjct: 947 TEEPAKVETPVVTEEPAKVKAKVKTEKSAPHVK 979
>gi|414068910|ref|ZP_11404907.1| ribonuclease E [Pseudoalteromonas sp. Bsw20308]
gi|410808749|gb|EKS14718.1| ribonuclease E [Pseudoalteromonas sp. Bsw20308]
Length = 1061
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 59
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 152
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 13 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 164
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 25 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 176
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 37 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 49 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 200
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 212
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/153 (39%), Positives = 68/153 (44%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 55.5 bits (132), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/152 (38%), Positives = 67/152 (44%), Gaps = 5/152 (3%)
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT- 898
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
E AKV TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 899 ---EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAP 955
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
TE AKV TE AKV TE AK
Sbjct: 956 VVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAK 987
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/167 (34%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 19/167 (11%)
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
A + + KV A E AKV + + E+ A V T A E+ A V T T++ A V T
Sbjct: 840 AVDASEKVEQALAVEDLAKVEAVKESAEVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVTE 899
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
++ A V TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 900 QPAKVEAPVV------------------TEQPAKVEAPAVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVE 941
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 418
TE AKV TE AKV TE AKV TE AKV
Sbjct: 942 APVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAKV 988
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/89 (40%), Positives = 40/89 (44%), Gaps = 4/89 (4%)
Query: 341 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 400
E+ A V T A E+ A V T T++ A V T E AKV TE AKV T
Sbjct: 867 EVEAPVVTEQAAEIEAPVVTEQPTKVEAPVVT----EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPAVT 922
Query: 401 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
E AKV TE AKV TE AK
Sbjct: 923 EQPAKVEAPVVTEQPAKVEAPVVTEQPAK 951
>gi|77360756|ref|YP_340331.1| RNase E [Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125]
gi|76875667|emb|CAI86888.1| RNase E: endoribonuclease for rRNA processing and mRNA degradation;
member of the degradosome; involved in the production of
deoxyribonucleotides via the formation of NDPs
[Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125]
Length = 1071
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 122 TELTAKVFT 130
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 73
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 134 TELTAKVFT 142
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 26 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 85
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 146 TELTAKVFT 154
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 38 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 97
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 158 TELTAKVFT 166
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 50 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 170 TELTAKVFT 178
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 182 TELTAKVFT 190
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 194 TELTAKVFT 202
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 206 TELTAKVFT 214
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 218 TELTAKVFT 226
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 230 TELTAKVFT 238
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 242 TELTAKVFT 250
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 254 TELTAKVFT 262
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 266 TELTAKVFT 274
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 278 TELTAKVFT 286
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 290 TELTAKVFT 298
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/129 (46%), Positives = 60/129 (46%)
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 302 TELTAKVFT 310
TE AKV T
Sbjct: 988 TEEPAKVET 996
Score = 54.7 bits (130), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/126 (46%), Positives = 58/126 (46%)
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T TE KV
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVV 987
Query: 314 TELTAK 319
TE AK
Sbjct: 988 TEEPAK 993
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/143 (43%), Positives = 63/143 (44%), Gaps = 14/143 (9%)
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN 337
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AK VE P+
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAK-----VEA--PV------ 914
Query: 338 SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T
Sbjct: 915 -VTEEPAKVETPLVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETP 973
Query: 398 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
TE KV TE AKV T
Sbjct: 974 VVTEEPTKVEAPVVTEEPAKVET 996
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/90 (48%), Positives = 44/90 (48%)
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
TE AKV T TE AKV T A E AKV T A E AKV TE AKV T
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLV 927
Query: 400 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
TE AKV TE AKV T TE AK
Sbjct: 928 TEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAK 957
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.070, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/106 (45%), Positives = 48/106 (45%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
A E AKV T A E AKV TE AKV T TE AKV TE AKV T
Sbjct: 891 AAEEPAKVETPVAAEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPLVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPV 950
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
TE AKV TE KV T TE KV TE AKV T
Sbjct: 951 VTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETPVVTEEPTKVEAPVVTEEPAKVET 996
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/140 (42%), Positives = 60/140 (42%), Gaps = 14/140 (10%)
Query: 290 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTL 349
TE AKV T TE AKV T A E AK VE P+ A E AKV
Sbjct: 868 TEEPAKVETPVVTEEPAKVETPVAAEEPAK-----VET--PV-------AAEEPAKVEAP 913
Query: 350 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 409
TE AKV T TE AKV TE AKV T TE AKV TE KV T
Sbjct: 914 VVTEEPAKVETPLVTEEPAKVEAPVVTEEPAKVETPVVTEEPAKVEAPVVTEEPTKVETP 973
Query: 410 GATELTAKVFTLGATELTAK 429
TE KV TE AK
Sbjct: 974 VVTEEPTKVEAPVVTEEPAK 993
>gi|229190516|ref|ZP_04317513.1| hypothetical protein bcere0002_21830 [Bacillus cereus ATCC 10876]
gi|228592861|gb|EEK50683.1| hypothetical protein bcere0002_21830 [Bacillus cereus ATCC 10876]
Length = 366
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/266 (26%), Positives = 88/266 (33%), Gaps = 6/266 (2%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGIT 81
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T G T +T G T T + G +T GAT +T
Sbjct: 82 GPTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGIT------ 135
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + G T +T G + T +G T +T G T +T
Sbjct: 136 GPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGIT 195
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T +T G T T G T T G T T
Sbjct: 196 GPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGET 255
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
G T +T G T T +G
Sbjct: 256 GPTGITGPTGETGPTGATGPTGGIGP 281
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/266 (26%), Positives = 88/266 (33%), Gaps = 6/266 (2%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGIT 81
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T +T G T +T G T T + G +T GAT +T
Sbjct: 82 GPTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGIT------ 135
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + G T +T G + T +G T +T G T +T
Sbjct: 136 GPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGIT 195
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T G T +T G T T G T T G T T
Sbjct: 196 GPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGET 255
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
G T +T G T T +G
Sbjct: 256 GPTGITGPTGETGPTGATGPTGGIGP 281
Score = 55.8 bits (133), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/260 (26%), Positives = 86/260 (33%), Gaps = 6/260 (2%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGIT 81
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T G T +T G T T + G +T GAT +T
Sbjct: 82 GPTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGIT------ 135
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T +T G + T +G T +T G T +T
Sbjct: 136 GPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGIT 195
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T T G T +T G T T G T T G T T
Sbjct: 196 GPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGET 255
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T +T G T T
Sbjct: 256 GPTGITGPTGETGPTGATGP 275
Score = 55.5 bits (132), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/266 (25%), Positives = 87/266 (32%), Gaps = 6/266 (2%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVT 75
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T G T +T G T +T G +T + G +T
Sbjct: 76 GPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGIT 135
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + G T +T G + T +G T +T G T +T
Sbjct: 136 GPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGIT 195
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T G T +T G T T G T T G T T
Sbjct: 196 GPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGET 255
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
G T +T G T T +G
Sbjct: 256 GPTGITGPTGETGPTGATGPTGGIGP 281
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/265 (26%), Positives = 87/265 (32%), Gaps = 6/265 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T G
Sbjct: 23 ATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGITG 82
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T +T G T T + G +T GAT +T G
Sbjct: 83 PTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGIT------G 136
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T + G T +T G + T +G T +T G T +T G
Sbjct: 137 PTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGITG 196
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T G T +T G T T G T T G T T G
Sbjct: 197 PTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGETG 256
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
T +T G T T +G
Sbjct: 257 PTGITGPTGETGPTGATGPTGGIGP 281
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/239 (26%), Positives = 80/239 (33%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGIT 81
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T G T +T G T T + G +T GAT +T
Sbjct: 82 GPTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPTGAT 141
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G +T G T T GAT + G T T G+ +T
Sbjct: 142 GPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGITGPTGET 201
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
G T T G T T G T +T G T +T G+T T + I
Sbjct: 202 GPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGETGPTGI 260
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.077, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/262 (24%), Positives = 83/262 (31%), Gaps = 20/262 (7%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVT 75
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T +T G T +T G T +T G +T + G +T
Sbjct: 76 GPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGIT 135
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G T T + G T +T G + T + I+ T +T
Sbjct: 136 GPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIM--------------GPTGVTGLTG 181
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
G T +T G T T G T +T G T T G T T
Sbjct: 182 ATGPTGITGSPGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTG 241
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T G T +T
Sbjct: 242 ITGPTGETGSTGETGPTGITGP 263
>gi|359411481|ref|ZP_09203946.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
gi|357170365|gb|EHI98539.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
Length = 701
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/319 (26%), Positives = 95/319 (29%), Gaps = 3/319 (0%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T GAT +T G T T G T T G T +T G
Sbjct: 234 PTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 293
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T +T G T T G T +T G T T G
Sbjct: 294 DTGVTGPT---GDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 350
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G T +T G T T G T T G T +T G
Sbjct: 351 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 410
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T +T G T T G T T G T T G T +T G
Sbjct: 411 DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 470
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T T G T T G T +T G T T G T T G
Sbjct: 471 VTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTG 530
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAK 319
T +T GAT LT
Sbjct: 531 DTGVTGPTGDTGATGLTGD 549
Score = 53.9 bits (128), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/308 (25%), Positives = 89/308 (28%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T GAT +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 233 GPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 292
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T G T T G T +T G T T G T T
Sbjct: 293 GDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 352
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T G T T G T T G T +T G T T
Sbjct: 353 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDT 412
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T T G T T G T +T G T T
Sbjct: 413 GVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 472
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 473 GPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 532
Query: 312 GATELTAK 319
G T T
Sbjct: 533 GVTGPTGD 540
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/334 (24%), Positives = 98/334 (29%), Gaps = 17/334 (5%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T GAT +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 233 GPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 292
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T G T +T G T T G T +T G T T
Sbjct: 293 GDTGVTGPT---GDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 349
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 350 GPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 409
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T +T G T T G T T G T T G T +T
Sbjct: 410 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 469
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G T T + + T +T G T T G T T
Sbjct: 470 GVTGPTGDTGVTG-----------PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 518
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 405
G T +T G T +T GAT LT
Sbjct: 519 PTGDTGVTGPT---GDTGVTGPTGDTGATGLTGD 549
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/309 (24%), Positives = 86/309 (27%), Gaps = 17/309 (5%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T GAT +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 233 GPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 292
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T +T G T T G T +T G T T G T T
Sbjct: 293 GDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPT 352
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T +T G T T G T T G T +T G T T
Sbjct: 353 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDT 412
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
G T T G T T + + T T G T T
Sbjct: 413 GVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGV-----------------TGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 455
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
G T +T G T T G T T G T +T G T T
Sbjct: 456 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 515
Query: 420 TLGATELTA 428
G T T
Sbjct: 516 VTGPTGDTG 524
>gi|194015823|ref|ZP_03054438.1| collagen triple helix repeat [Bacillus pumilus ATCC 7061]
gi|194012178|gb|EDW21745.1| collagen triple helix repeat [Bacillus pumilus ATCC 7061]
Length = 903
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 99/298 (33%), Positives = 114/298 (38%), Gaps = 18/298 (6%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT LT GAT T G T T GAT LT GAT T
Sbjct: 406 GATGLTGATGETGATGATGVTGDTGVTGATGVTGITGATGLTGATGETGATGATGVTGDT 465
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 466 GVTGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGIT 519
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 520 GATGVTGDTGVTGATGATGIT---GATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDTGVT 573
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T GAT +T + GAT LT GAT T GAT +T
Sbjct: 574 GATGATGIT---GATGVTGETGITGATGLTGATGVTGATGATGVTGNTGATGVTGATGAT 630
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
G T T GAT +T G T +T GAT +T GAT T
Sbjct: 631 GVTGDTGVTGVTGATGITGATGVTGDTGVTGVTGATGITGATGVTGDTGVTGATGATG 688
Score = 55.5 bits (132), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/294 (33%), Positives = 116/294 (39%), Gaps = 27/294 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT LT GAT T G T +T G
Sbjct: 422 ATGVTGDTGVTGATGVTGIT---GATGLTGATGETGATGATGVTGDTGVTGVTGATGITG 478
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 479 ATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDTGVTG 532
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT T G
Sbjct: 533 ATGATG---ITGATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDTGVTGATGATG---ITG 583
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT +T + GAT LT GAT T GAT +T G T T G
Sbjct: 584 ATGVTGETGITGATGLTGATGVTGATGATGVTGNTGATGVTGATGATGVTGDTGVTGVTG 643
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
AT +T GAT +T G T +T GAT +T GAT T
Sbjct: 644 ATGIT------GATGVTGDT---GVTGVTGATGITGATGVTGDTGVTGATGATG 688
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 101/309 (32%), Positives = 118/309 (38%), Gaps = 26/309 (8%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT LT GAT T G T T GAT LT GAT T
Sbjct: 406 GATGLTGATGETGATGATGVTGDTGVTGATGVTGITGATGLTGATGETGATGATGVTGDT 465
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 466 GVTGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGIT 519
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 520 GATGVTGDTGVTGATGATGIT---GATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDTGVT 573
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T GAT +T + GAT LT GAT T GAT +T
Sbjct: 574 GATGATGIT---GATGVTGETGITGATGLTGATGVTGATGATGVTGNTGATGVTGATGAT 630
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G T T GAT +T GAT +T + + V I AT +T
Sbjct: 631 GVTGDTGVTGVTGATGIT------GATGVTGDTGVTGVTGATGIT-----GATGVTGDTG 679
Query: 348 TLGATELTA 356
GAT T
Sbjct: 680 VTGATGATG 688
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 100/321 (31%), Positives = 116/321 (36%), Gaps = 38/321 (11%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT LT GAT T G T T GAT LT GAT T
Sbjct: 406 GATGLTGATGETGATGATGVTGDTGVTGATGVTGITGATGLTGATGETGATGATGVTGDT 465
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 466 GVTGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGIT 519
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT +T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 520 GATGVTGDTGVTGATGATGIT---GATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDTGVT 573
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT T GAT +T + GAT LT AT +T
Sbjct: 574 GATGATGIT---GATGVTGETGITGATGLTG--------------------ATGVTGAT- 609
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
GAT +T G T T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 610 --GATGVTGNTGATGVTGATGATGVTGDTGVTGVTGATGITGATGVTGDTGVTGVTGATG 667
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT +T GAT T
Sbjct: 668 ITGATGVTGDTGVTGATGATG 688
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 105/348 (30%), Positives = 125/348 (35%), Gaps = 53/348 (15%)
Query: 60 GATELTAKVFTL---------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKV 92
GAT +T + GAT LT GAT T
Sbjct: 367 GATGVTGETGITGATGLTGTTGATGATGATGVTGETGITGATGLTGATGETGATGATGVT 426
Query: 93 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 152
G T T GAT LT GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 427 GDTGVTGATGVTGITGATGLTGATGETGATGATGVTGDTGVTGVTGATGITGATGVTGDT 486
Query: 153 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 212
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT T
Sbjct: 487 ---GATGVTGATGITGATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDTGVTGATGATG-- 538
Query: 213 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
GAT +T GAT +T GAT +T GAT T GAT +T +
Sbjct: 539 -ITGATGVTGDT---GATGVTGATGITGATGVTGDTGVTGATGATG---ITGATGVTGET 591
Query: 273 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIK 332
GAT LT GAT T GAT +T GAT +T + + V I
Sbjct: 592 GITGATGLTGATGVTGATGATGVTGNTGATGVTGAT---GATGVTGDTGVTGVTGATGIT 648
Query: 333 IVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
AT +T G T +T GAT +T GAT T
Sbjct: 649 -----GATGVTGDT---GVTGVTGATGITGATGVTGDTGVTGATGATG 688
>gi|423521392|ref|ZP_17497865.1| hypothetical protein IGC_00775, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
gi|401178070|gb|EJQ85253.1| hypothetical protein IGC_00775, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
Length = 361
Score = 56.6 bits (135), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/271 (25%), Positives = 84/271 (30%), Gaps = 45/271 (16%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T G+T +T G+T T G+T +T + G+T
Sbjct: 104 GATGATGDTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGPTGDTGPTGSTGVTGNTGSTGST--------- 154
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T G+T T GAT T G+T T G T T +
Sbjct: 155 GATGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGST 214
Query: 180 G------------------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 209
G AT T G T T GAT T
Sbjct: 215 GVTGSTGPTGSTGTTGSTGTTGSTGPTGNTGATGSTGPTGVTGPTGNTGVTGNTGATGST 274
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 269
GAT T G T +T G+T T GAT T G T T
Sbjct: 275 GPTGNTGATGNTGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTGNTGATGST------GPTGST 328
Query: 270 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
+ GAT T + G+T +T G
Sbjct: 329 GPTGSTGATGSTGPTGSTGSTGVTGPTGNTG 359
Score = 56.6 bits (135), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/271 (25%), Positives = 84/271 (30%), Gaps = 45/271 (16%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T G+T +T G+T T G+T +T + G+T
Sbjct: 104 GATGATGDTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGPTGDTGPTGSTGVTGNTGSTGST--------- 154
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T G+T T GAT T G+T T G T T +
Sbjct: 155 GATGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGST 214
Query: 192 G------------------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 221
G AT T G T T GAT T
Sbjct: 215 GVTGSTGPTGSTGTTGSTGTTGSTGPTGNTGATGSTGPTGVTGPTGNTGVTGNTGATGST 274
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
GAT T G T +T G+T T GAT T G T T
Sbjct: 275 GPTGNTGATGNTGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTGNTGATGST------GPTGST 328
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
+ GAT T + G+T +T G
Sbjct: 329 GPTGSTGATGSTGPTGSTGSTGVTGPTGNTG 359
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/248 (24%), Positives = 76/248 (30%), Gaps = 33/248 (13%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKV 164
GAT T G+T +T G+T T G+T +T + GAT T
Sbjct: 104 GATGATGDTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGPTGDTGPTGSTGVTGNTGSTGSTGATGSTGPT 163
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-------- 216
G+T T GAT T G+T T G T T + G
Sbjct: 164 GNTGSTGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTGSTGPT 223
Query: 217 ----------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
AT T G T T GAT T GAT
Sbjct: 224 GSTGTTGSTGTTGSTGPTGNTGATGSTGPTGVTGPTGNTGVTGNTGATGSTGPTGNTGAT 283
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T G T +T G+T T GAT T + G T T + G T
Sbjct: 284 GNTGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGPTGSTGATGSTGPT 343
Query: 315 ELTAKSVI 322
T + +
Sbjct: 344 GSTGSTGV 351
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/271 (22%), Positives = 82/271 (30%), Gaps = 53/271 (19%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T G+T +T G+T T G+T +T + G+T
Sbjct: 104 GATGATGDTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGPTGDTGPTGSTGVTGNTGSTGST--------- 154
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T G+T T GAT T G+T T G T T +
Sbjct: 155 GATGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGST 214
Query: 312 G------------------------------ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE 341
G AT T + + T
Sbjct: 215 GVTGSTGPTGSTGTTGSTGTTGSTGPTGNTGATGSTGPTGVTGPTGN-----------TG 263
Query: 342 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLG 398
+T G+T T G T T G T T + G+T +T + G
Sbjct: 264 VTGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTGNTGATGSTG 323
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T T + GAT T + G+T +T
Sbjct: 324 PTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGSTGVTGP 354
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/285 (23%), Positives = 82/285 (28%), Gaps = 59/285 (20%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T G+T +T G+T T G+T +T + G+T
Sbjct: 104 GATGATGDTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGPTGDTGPTGSTGVTGNTGSTGST--------- 154
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T G+T T GAT T G+T T G T T +
Sbjct: 155 GATGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGST 214
Query: 288 G------------------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 317
G AT T G T T GAT T
Sbjct: 215 GVTGSTGPTGSTGTTGSTGTTGSTGPTGNTGATGSTGPTGVTGPTGNTGVTGNTGATGST 274
Query: 318 AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 377
T T GAT T G T T + G T
Sbjct: 275 GP--------------------TGNTGATGNTGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTG 314
Query: 378 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
T + G T T + GAT T + G+T +T G
Sbjct: 315 NTGATGSTGPTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGSTGVTGPTGNTG 359
>gi|346315884|ref|ZP_08857396.1| hypothetical protein HMPREF9022_03053 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
gi|345904246|gb|EGX73995.1| hypothetical protein HMPREF9022_03053 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
Length = 537
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/317 (27%), Positives = 109/317 (34%), Gaps = 18/317 (5%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T G T T GAT T + GAT + + GA+ T GAT
Sbjct: 104 TGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPT------GATGN 157
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T + GAT T + G+T T GA ++ G T T + G
Sbjct: 158 TGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGA 214
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T + G T GAT T GAT GAT T GAT
Sbjct: 215 TGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGATGP 274
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
+ GAT +T GAT ++ GAT T + GA +T G+T
Sbjct: 275 IGPTGSTGATGIT------GATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGA 328
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T GAT T T G+T T ++G T T GAT GA
Sbjct: 329 TGLSGIQGATGATGNTGTNGSTGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGA 388
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTA 318
+T G+T TA
Sbjct: 389 NGITGPTGATGSTGATA 405
Score = 51.6 bits (122), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/284 (27%), Positives = 98/284 (34%), Gaps = 18/284 (6%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGAT 257
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT + GAT +T GAT ++ GAT T +
Sbjct: 258 GATGNTGADGIQGATGPIGPTGSTGATGIT------GATGISGITGADGATGPTGATGST 311
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GA +T G+T T GAT T T G+T T
Sbjct: 312 GANGITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGTNGSTGPTGP 355
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 97/364 (26%), Positives = 123/364 (33%), Gaps = 30/364 (8%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGAT 257
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T GAT + GAT +T GAT ++ GAT T +
Sbjct: 258 GATGNTGADGIQGATGPIGPTGSTGATGIT------GATGISGITGADGATGPTGATGST 311
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GA +T P AT L+ GAT T + G T T
Sbjct: 312 GANGITG-----------PTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGTNGSTGPTGPTGATG 360
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
++G T T GAT GA +T G+T TA G + A +I
Sbjct: 361 SIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGITGPTGATGSTGATATAQN-GQFSVNASSI 419
Query: 432 RSNT 435
SN+
Sbjct: 420 SSNS 423
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/237 (26%), Positives = 78/237 (32%), Gaps = 3/237 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T G T T GA +T + G G
Sbjct: 169 ATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAG 228
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T T G T T GA + +G T T G
Sbjct: 229 NTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGATGPIGPTGSTGATGITG 288
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT ++ GAT T + GA +T G+T T GAT T T G
Sbjct: 289 ATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGTNG 348
Query: 181 ATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
+T T ++G T T GAT GA +T G+T TA
Sbjct: 349 STGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGITGPTGATGSTGATA 405
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/309 (26%), Positives = 100/309 (32%), Gaps = 49/309 (15%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGAT 257
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GAT T I GAT + GAT +T
Sbjct: 258 GATGNTGADGIQ--------------------------GATGPIGPTGSTGATGIT---- 287
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
GAT ++ GAT T + GA +T G+T T GAT T
Sbjct: 288 --GATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATG--- 342
Query: 432 RSNTGTVGS 440
NTGT GS
Sbjct: 343 --NTGTNGS 349
>gi|427780143|gb|JAA55523.1| Putative nuclear pore complex protein [Rhipicephalus pulchellus]
Length = 1153
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/207 (32%), Positives = 91/207 (43%), Gaps = 38/207 (18%)
Query: 247 KVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTA-KVFTLG-ATELTAKVFTLGAT--ELTAKVFTLG- 300
K F G++ E +K G++ A K F G TE A F G + E K F G
Sbjct: 578 KDFKFGSSSEEPSKAINFGSSASEASKAFKFGTGTEEPATPFKFGTSTNEPATKPFKFGT 637
Query: 301 -ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG-ATELTAKV 358
A+E K FT GA+ +P K N+ TE AK+F+ G ++E +K
Sbjct: 638 TASEQHTKSFTFGASS------------EEPTKRAKPNTTTEEAAKLFSFGSSSEQPSKP 685
Query: 359 FTLGAT-ELTAKVFTLGA-TELTAKVFTLGA-TELTAKV-------------FTLGATEL 402
G T + AK+ G+ +E++AK F GA T+ AK F LG
Sbjct: 686 LKFGCTADEPAKLPQAGSGSEVSAKAFKFGASTDEPAKPSPIASTAESASGGFKLGHMAE 745
Query: 403 TAKVFTLGAT--ELTAKVFTLGATELT 427
K FT G+T + AK FT GAT T
Sbjct: 746 PGKGFTFGSTTVKEPAKPFTFGATPST 772
>gi|311067243|ref|YP_003972166.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus atrophaeus
1942]
gi|310867760|gb|ADP31235.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus atrophaeus
1942]
Length = 1335
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/294 (28%), Positives = 119/294 (40%), Gaps = 18/294 (6%)
Query: 25 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 84
AT T G+T T + G T +T + GAT +T G+T +T G
Sbjct: 322 ATGETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTG 381
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
T T +G T T + T +T + G+T +T + GAT +T + G
Sbjct: 382 ETGSTGVTGVMGVTGSTGE------TGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTG 435
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
T T + +GAT +T G T +T GAT +T G T T G
Sbjct: 436 ETGPTGE---MGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGATGVTGPTG 492
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
AT +T G+T +T GAT +T G+T +T G+T +T G
Sbjct: 493 ATGVT------GSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGS---TG 543
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
AT T G+T +T + GAT T + G+T T +GAT +T
Sbjct: 544 ATGETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTG 597
Score = 55.5 bits (132), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/282 (28%), Positives = 110/282 (39%), Gaps = 6/282 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G+T T + G T +T + GAT +T G+T +T G
Sbjct: 322 ATGETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTG 381
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T +G T T + T +T + G+T +T + GAT +T + G
Sbjct: 382 ETGSTGVTGVMGVTGSTGE------TGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTG 435
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T ++ G T +T + G T +T G T T GAT +T G
Sbjct: 436 ETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGATGVTGPTGATG 495
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T + GAT T GAT T G T T + GAT T G
Sbjct: 496 VTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGPTGVTG 555
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
+T +T + GAT T + G+T T +GAT +T
Sbjct: 556 STGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTG 597
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 103/386 (26%), Positives = 136/386 (35%), Gaps = 39/386 (10%)
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T +T + G+T +T GAT +T + G T T G+T T +GA
Sbjct: 665 TGVTGPTGSTGSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGA 724
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T +T G T +T GAT +T G T T + GAT T GA
Sbjct: 725 TGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGA 784
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T +T G+T +T G+T +T G+T T + G+T +T + GA
Sbjct: 785 TGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVT------GSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGA 838
Query: 254 TE---------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 292
T T + G+T +T G+T T GAT
Sbjct: 839 TGETGPTGSTGSTGSTGVTGVTGATGVTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGE 898
Query: 293 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGAT 352
T GAT T +GAT +T V E P + T T + G+T
Sbjct: 899 TGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTG--VTGET---GPTGVTGSTGVTGETGETGPTGST 953
Query: 353 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 412
T GAT T GAT T GAT T GAT T G T
Sbjct: 954 GATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGET 1013
Query: 413 ELTAKVFTLGAT-------ELTAKNI 431
T G T E+ AK +
Sbjct: 1014 GATGPTGPTGVTGETGPTGEMGAKGV 1039
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/297 (26%), Positives = 115/297 (38%), Gaps = 23/297 (7%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T T + GAT +T G T +T + GAT +T G+T +T
Sbjct: 324 GETGPTGVTGSTGATGVTGS---TGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPT 380
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T +G T T + T +T + G+T +T + GAT +T +
Sbjct: 381 GETGSTGVTGVMGVTGSTGE------TGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGST 434
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T + +GAT +T G T +T GAT +T G T T
Sbjct: 435 GETGPTGE---MGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGATGVTGPT 491
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT +T G+T T G T T + + V + +T +T
Sbjct: 492 GATGVTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTG--------ETGSTGVTGS-- 541
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 404
GAT T G+T +T + GAT T + G+T T +GAT +T
Sbjct: 542 -TGATGETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTG 597
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/309 (26%), Positives = 120/309 (38%), Gaps = 35/309 (11%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T + GAT +T G T +T + GAT +T G+T +T
Sbjct: 324 GETGPTGVTGSTGATGVTGS---TGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPT 380
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T +G T T + T +T + G+T +T + GAT +T +
Sbjct: 381 GETGSTGVTGVMGVTGSTGE------TGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGST 434
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T + +GAT +T G T +T GAT +T G T T
Sbjct: 435 GETGPTGE---MGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGATGVTGPT 491
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
GAT +T G+T +T GAT +T G+T +T G+T +T +
Sbjct: 492 GATGVT------GSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGST--- 542
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
AT T G+T +T + GAT T + G+T T
Sbjct: 543 --------------GATGETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTG 588
Query: 384 TLGATELTA 392
+GAT +T
Sbjct: 589 EMGATGVTG 597
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/288 (27%), Positives = 110/288 (38%), Gaps = 17/288 (5%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + GAT +T G T T G T +T + G T T
Sbjct: 324 GETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTGET 383
Query: 192 GATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G+T +T + G+ T +T + G+T +T + GAT +T + G T T +
Sbjct: 384 GSTGVTGVMGVTGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTGETGPTGE- 442
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
+GAT +T G T +T GAT +T G T T GAT +T
Sbjct: 443 --MGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGST 500
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 368
G+T T + + V AT T G T T + GAT T
Sbjct: 501 GVTGSTGATGATGVTGV-----------TGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETG 549
Query: 369 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
G+T +T + GAT T + G+T T +GAT +T
Sbjct: 550 PTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTG 597
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/284 (26%), Positives = 108/284 (38%), Gaps = 8/284 (2%)
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
AT T G+T T + G T +T + GAT +T G+T +T G
Sbjct: 322 ATGETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTG 381
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
T T +G T T + T +T + G+T +T + GAT +T + G
Sbjct: 382 ETGSTGVTGVMGVTGSTGE------TGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTG 435
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILE 324
T T ++ G T +T + G T +T G T T GAT +T +
Sbjct: 436 ETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGATGVTGPTGATG 495
Query: 325 VEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 384
V + AT T GAT T G T T + GAT T
Sbjct: 496 VTGST--GVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGPTGV 553
Query: 385 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G+T +T + GAT T + G+T T +GAT +T
Sbjct: 554 TGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTG 597
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/261 (26%), Positives = 99/261 (37%), Gaps = 8/261 (3%)
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
AT T G+T T + G T +T + GAT +T G+T +T G
Sbjct: 322 ATGETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTG 381
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
T T +G T T + T +T + G+T +T + GAT +T + G
Sbjct: 382 ETGSTGVTGVMGVTGSTGE------TGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTG 435
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFT 348
T T ++ G T +T + G T +T + V P + AT +T
Sbjct: 436 ETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGV--TGPTGVTGPTGATGVTGPTGA 493
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
G T T + GAT T GAT T G T T + GAT T
Sbjct: 494 TGVTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGPTGV 553
Query: 409 LGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G+T +T + GAT T
Sbjct: 554 TGSTGVTGETGVTGATGETGP 574
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 115/417 (27%), Positives = 155/417 (37%), Gaps = 22/417 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T G T T + GAT T GAT +T G+T +T G
Sbjct: 748 ATGVTGPTGVTGPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETG 807
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+T +T G+T T + G+T +T + GAT T + G+T T G
Sbjct: 808 STGVT------GSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGSTGVTGVTG 861
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT +T + G T T + + GAT T GAT T GAT T +G
Sbjct: 862 ATGVTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGV---TGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMG 918
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT +T G T +T G T T + GAT G T +T G
Sbjct: 919 ATGVTGVTGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGAT---------GPTGVTGATGETG 969
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
+T +T G T +T G+T +T G T +T + GAT T G
Sbjct: 970 STGVTGATGETGPTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGE---TGATGPTGPTGVTG 1026
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELT-AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
T T ++ G T +T A + AT +T GAT T
Sbjct: 1027 ETGPTGEMGAKGVTGVTGATGSTGSTGVTGVTGVTGSTGATGVTGSTGVTGATGSTGSTG 1086
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 416
GAT T + G T T + G T +T + G T +T GAT T
Sbjct: 1087 VTGATGATGSTGSTGVTGATGVTGSTGPTGVTGVTGSTGPTGVTGSTGVTGATGSTG 1143
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.71, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/295 (28%), Positives = 102/295 (34%), Gaps = 24/295 (8%)
Query: 49 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
AT +T + G T T + + GAT T GAT T GAT T +G
Sbjct: 862 ATGVTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGV---TGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMG 918
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
AT +T G T +T G T T + GAT T GAT T G
Sbjct: 919 ATGVTGVTGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGV---TGATGETGSTGVTG 975
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
AT T GAT T GAT T G T T G T T +G
Sbjct: 976 ATGETGPTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGETGATGPTGPTGVTGETGPTGEMG 1035
Query: 229 ATELTA------------------KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
A +T + GAT +T GAT T GAT T
Sbjct: 1036 AKGVTGVTGATGSTGSTGVTGVTGVTGSTGATGVTGSTGVTGATGSTGSTGVTGATGATG 1095
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEV 325
+ G T T + G T +T + G T +T GAT T + + V
Sbjct: 1096 STGSTGVTGATGVTGSTGPTGVTGVTGSTGPTGVTGSTGVTGATGSTGATGVTGV 1150
>gi|421732567|ref|ZP_16171686.1| triple helix repeat-containing collagen, partial [Bacillus
amyloliquefaciens subsp. plantarum M27]
gi|407073579|gb|EKE46573.1| triple helix repeat-containing collagen, partial [Bacillus
amyloliquefaciens subsp. plantarum M27]
Length = 951
Score = 55.8 bits (133), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 107/398 (26%), Positives = 144/398 (36%), Gaps = 46/398 (11%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT +T GAT T G+T T + + G T T G T LT +
Sbjct: 87 GATGVTGPTGITGATGATGVTGATGSTGATGAIGSTGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGST 146
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------ 107
GAT +T + GAT LT + G+T T
Sbjct: 147 GATGVTGVTGSTGATGLTGETGATGSTGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTGATGET 206
Query: 108 ---GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 164
GAT +T ++ G+T GAT T + GAT +T G+T T
Sbjct: 207 GATGATGVTGEIGPTGST---------GATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVT 257
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
GAT T + G+T T GAT T GA+ T GAT +T +
Sbjct: 258 GPTGATGSTGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGAT------GATGITGET 311
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
G+T +T G+T T + G+T +T + G T T GAT T
Sbjct: 312 GATGSTGVTGVTGATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVT 371
Query: 285 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEV-EYYKPIKIVPQNSATELT 343
G T T GAT T + G T +T + I V P + AT +T
Sbjct: 372 GATGPTGSTGSTGVTGATGSTGSIGETGLTGVTGSTGITGVTGSTGPTG---ETGATGVT 428
Query: 344 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
G+T T GAT +T G+T +T
Sbjct: 429 GPTGVTGSTGETGPTGATGATGVTGATGVTGSTGITGS 466
Score = 54.7 bits (130), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 116/448 (25%), Positives = 161/448 (35%), Gaps = 68/448 (15%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT +T + +GAT T +G+T T GAT +T GAT T
Sbjct: 57 GATGVTGETGPIGATGSTGATGEIGSTGDT------GATGVTGPTGITGATGATGVTGAT 110
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G+T T + + G T T G T LT + GAT +T + GAT LT +
Sbjct: 111 GSTGATGAIGSTGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGSTGATGVTGVTGSTGATGLTGETGAT 170
Query: 132 GATELTAKVFTL---------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKV 164
G+T T GAT +T ++ G+T T +
Sbjct: 171 GSTGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTGATGETGATGATGVTGEIGPTGSTGATGET 230
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
+ G+T T GAT T G T T GAT T G T T +
Sbjct: 231 GSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTGPTGATGSTGETGATGSTGATGPTGVTGATGET 290
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
+ GAT + GAT +T + G+T +T +T + G+T +T
Sbjct: 291 GSTGATGASGA---TGATGITGETGATGSTGVTG---------VTGATGSTGSTGVTGST 338
Query: 285 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTA 344
+ G T T G+T T GAT +T AT T
Sbjct: 339 GSTGVTGATGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVTG--------------------ATGPTG 378
Query: 345 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATE 401
+ G T T ++G T LT + G T +T GAT +T G+T
Sbjct: 379 STGSTGVTGATGSTGSIGETGLTGVTGSTGITGVTGSTGPTGETGATGVTGPTGVTGSTG 438
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T GAT +T G+T +T
Sbjct: 439 ETGPTGATGATGVTGATGVTGSTGITGS 466
Score = 52.0 bits (123), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 114/430 (26%), Positives = 157/430 (36%), Gaps = 48/430 (11%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT------AKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 101
GAT +T GAT +T + +GAT T GAT +T GAT T
Sbjct: 48 GATGVTGP---TGATGVTGETGPIGATGSTGATGEIGSTGDTGATGVTGPTGITGATGAT 104
Query: 102 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 161
G+T T + + G T T G T LT + GAT +T + GAT LT
Sbjct: 105 GVTGATGSTGATGAIGSTGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGSTGATGVTGVTGSTGATGLT 164
Query: 162 AKVFTLGATELTAKVFTL---------------------------GATELTAKVFTLGAT 194
+ G+T T GAT +T ++ G+T
Sbjct: 165 GETGATGSTGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTGATGETGATGATGVTGEIGPTGST 224
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
T + + G+T T GAT T G T T GAT T G T
Sbjct: 225 GATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTGPTGATGSTGETGATGSTGATGPTGVT 284
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T + + GAT + G T T + G T +T + G+T +T + G T
Sbjct: 285 GATGETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGVTGVTGATGSTGSTGVTGSTGSTGVT 344
Query: 315 ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 374
T + + + AT +T GAT T + G T T ++G
Sbjct: 345 GATGSTGVTGSTGS--TGVTGATGATGVT------GATGPTGSTGSTGVTGATGSTGSIG 396
Query: 375 ATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKN 430
T LT + G T +T GAT +T G+T T GAT +T A
Sbjct: 397 ETGLTGVTGSTGITGVTGSTGPTGETGATGVTGPTGVTGSTGETGPTGATGATGVTGATG 456
Query: 431 IRSNTGTVGS 440
+ +TG GS
Sbjct: 457 VTGSTGITGS 466
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/262 (27%), Positives = 104/262 (39%), Gaps = 9/262 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T ++ G+T T + + G+T T GAT T G T T G
Sbjct: 211 ATGVTGEIGPTGSTGATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTGPTGATGSTGETG 270
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G T T + + GAT + GAT +T + G+T +T G
Sbjct: 271 ATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGA---TGATGITGETGATGSTGVTGVTGATG 327
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T T + G+T +T G+T +T + G T T GAT T + G
Sbjct: 328 STGSTGVTGSTGSTGVTGA---TGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVTGATGPTGSTGSTG 384
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
T T ++G T LT + G T +T GAT +T G+T T
Sbjct: 385 VTGATGSTGSIGETGLTGVTGSTGITGVTGSTGPTGETGATGVTGPTGVTGSTGETGPTG 444
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
GAT +T G+T +T
Sbjct: 445 ATGATGVTGATGVTGSTGITGS 466
Score = 40.4 bits (93), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/231 (27%), Positives = 87/231 (37%), Gaps = 11/231 (4%)
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T T GAT +T G+T T G+T +T + G+T T G+
Sbjct: 731 TGPTGSTGDTGATGVTGATGVTGSTGETGATGVTGSTGITGATGSTGSTGETGPTGVTGS 790
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
T +T G T +T + G+T +T GAT +T G+T T + GA
Sbjct: 791 TGVTGATGEAGPTGVTGETGATGSTGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGSTGATGVTGSTGA 850
Query: 314 TELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 373
T +T + I AT +T G T +T G T T
Sbjct: 851 TGVTGATGITGATG-----------ATGVTGSTGETGPTGVTGLTGATGVTGPTGPTGVT 899
Query: 374 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 900 GATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGAT 950
>gi|156381281|ref|XP_001632194.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156219246|gb|EDO40131.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 1851
Score = 55.5 bits (132), Expect = 5e-05, Method: Composition-based stats.
Identities = 82/252 (32%), Positives = 87/252 (34%), Gaps = 1/252 (0%)
Query: 9 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 68
+ L T +AKV L AKV L AKV L L AKV L AKV
Sbjct: 756 YNLTTTGCSAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVLHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKV 815
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 816 NVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKV 875
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 876 NVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKV 935
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
L AKV L AKV L AK + T G T+LT
Sbjct: 936 NMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKVNVSHDMTLVAKASASALLTQKGECVT-GVTQLTGDG 994
Query: 249 FTLGATELTAKV 260
L A L A +
Sbjct: 995 ILLLAARLVAVI 1006
Score = 55.5 bits (132), Expect = 5e-05, Method: Composition-based stats.
Identities = 82/252 (32%), Positives = 87/252 (34%), Gaps = 1/252 (0%)
Query: 57 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 116
+ L T +AKV L AKV L AKV L L AKV L AKV
Sbjct: 756 YNLTTTGCSAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVLHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKV 815
Query: 117 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 176
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 816 NVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKV 875
Query: 177 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 876 NVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKV 935
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
L AKV L AKV L AK + T G T+LT
Sbjct: 936 NMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKVNVSHDMTLVAKASASALLTQKGECVT-GVTQLTGDG 994
Query: 297 FTLGATELTAKV 308
L A L A +
Sbjct: 995 ILLLAARLVAVI 1006
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-04, Method: Composition-based stats.
Identities = 81/247 (32%), Positives = 85/247 (34%), Gaps = 1/247 (0%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +AKV L AKV L AKV L L AKV L AKV
Sbjct: 761 TGCSAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVLHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHD 820
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 821 MTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKVNVSHD 880
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 881 MTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNMSHD 940
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
L AKV L AKV L AK + T G T+LT L A
Sbjct: 941 MSLVAKVNVSHEMTLVAKVNVSHDMTLVAKASASALLTQKGECVT-GVTQLTGDGILLLA 999
Query: 242 TELTAKV 248
L A +
Sbjct: 1000 ARLVAVI 1006
Score = 52.4 bits (124), Expect = 5e-04, Method: Composition-based stats.
Identities = 73/216 (33%), Positives = 76/216 (35%)
Query: 105 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 164
+ L T +AKV L AKV L AKV L L AKV L AKV
Sbjct: 756 YNLTTTGCSAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVLHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKV 815
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 816 NVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKV 875
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
L AKV L AKV L AKV L AKV L AKV
Sbjct: 876 NVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKV 935
Query: 285 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
L AKV L AKV L AK+
Sbjct: 936 NMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKVNVSHDMTLVAKA 971
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.21, Method: Composition-based stats.
Identities = 73/229 (31%), Positives = 76/229 (33%), Gaps = 14/229 (6%)
Query: 201 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
+ L T +AKV L AKV L AKV L L AKV L AKV
Sbjct: 756 YNLTTTGCSAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVLHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKV 815
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
L AKV L AKV L AKV L AKV L AK
Sbjct: 816 NVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAK- 874
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
V + L AKV L AKV L AKV L A
Sbjct: 875 -------------VNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVAKVNVSHDMTLVA 921
Query: 381 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
KV L AKV L AKV L AKV L AK
Sbjct: 922 KVNVSHDMTLVAKVNMSHDMSLVAKVNVSHEMTLVAKVNVSHDMTLVAK 970
>gi|228917378|ref|ZP_04080931.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar pulsiensis BGSC 4CC1]
gi|228842305|gb|EEM87400.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar pulsiensis BGSC 4CC1]
Length = 404
Score = 55.1 bits (131), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/228 (28%), Positives = 75/228 (32%), Gaps = 6/228 (2%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T GAT T T T + G+T +T + G T T GA
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGN------TGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGA 115
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T G T T G T T + G T T GAT T G+
Sbjct: 116 TGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGATGSTGPTGS 175
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T +T G+T +T G+T T GAT T GA
Sbjct: 176 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 55.1 bits (131), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/228 (28%), Positives = 75/228 (32%), Gaps = 6/228 (2%)
Query: 50 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
T T GAT T T T + G+T +T + G T T GA
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGN------TGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGA 115
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T T G T T G T T + G T T GAT T G+
Sbjct: 116 TGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGATGSTGPTGS 175
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
T +T G+T +T G+T T GAT T GA
Sbjct: 176 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/228 (28%), Positives = 76/228 (33%), Gaps = 6/228 (2%)
Query: 26 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 85
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
T T + G+T +T GAT +T G T T GAT T G+
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGVTGNTGPTGNT---GATGATGSTGPTGS 175
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T +T G+T +T G+T T GAT T GA
Sbjct: 176 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/228 (28%), Positives = 76/228 (33%), Gaps = 6/228 (2%)
Query: 38 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 97
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T T + G+T +T GAT +T G T T GAT T G+
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGVTGNTGPTGNT---GATGATGSTGPTGS 175
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
T +T G+T +T G+T T GAT T GA
Sbjct: 176 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/228 (28%), Positives = 76/228 (33%), Gaps = 6/228 (2%)
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T + G+T +T GAT +T G T T GAT T G+
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGVTGNTGPTGNT---GATGATGSTGPTGS 175
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
T +T G+T +T G+T T GAT T GA
Sbjct: 176 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/228 (28%), Positives = 76/228 (33%), Gaps = 6/228 (2%)
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T T + G+T +T GAT +T G T T GAT T G+
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGVTGNTGPTGNT---GATGATGSTGPTGS 175
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T +T G+T +T G+T T GAT T GA
Sbjct: 176 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 52.8 bits (125), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/222 (28%), Positives = 74/222 (33%), Gaps = 6/222 (2%)
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
T T + G+T +T GAT +T G T T GAT T G+
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGVTGNTGPTGNT---GATGATGSTGPTGS 175
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
T +T G+T +T G+T T GAT T
Sbjct: 176 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGN 217
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 25 ATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGN----- 79
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T + G+T +T + G T T GAT T G T T G
Sbjct: 80 -TGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTG 138
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T + G T T GAT T G+T +T G+T +T G
Sbjct: 139 NTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATG 198
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
+T T GAT T GA
Sbjct: 199 STGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/242 (26%), Positives = 77/242 (31%), Gaps = 20/242 (8%)
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 290 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTL 349
T T + G+T +T GAT +T + + T T
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGV-----------------TGNTGPTGNT 161
Query: 350 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 409
GAT T G+T +T G+T +T G+T T GAT T
Sbjct: 162 GATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPT 221
Query: 410 GA 411
GA
Sbjct: 222 GA 223
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/242 (26%), Positives = 76/242 (31%), Gaps = 20/242 (8%)
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN 337
T T + G+T +T GAT +T G T T +
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGVTGNTGPTGNT----------------- 161
Query: 338 SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
AT T G+T +T G+T +T G+T T GAT T
Sbjct: 162 GATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPT 221
Query: 398 GA 399
GA
Sbjct: 222 GA 223
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/242 (26%), Positives = 76/242 (31%), Gaps = 20/242 (8%)
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
T T GAT T G T T G T T G T T + G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 266 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEV 325
T T + G+T +T GAT +T G T T GAT T +
Sbjct: 122 TGPTGETGPTGSTGVTGNT---GATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGATGSTGPT----- 173
Query: 326 EYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 385
+T +T G+T +T G+T T GAT T
Sbjct: 174 ------------GSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPT 221
Query: 386 GA 387
GA
Sbjct: 222 GA 223
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.75, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/242 (26%), Positives = 75/242 (30%), Gaps = 20/242 (8%)
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T T G T T GAT T GAT T GAT T GA
Sbjct: 2 TGSTGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T T GAT T G T T + G T T G T T + G+
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNT---GPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGS 118
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 361
T T G T T + AT +T G T T
Sbjct: 119 TGNTGPTGETGPTGSTG--------------VTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNT--- 161
Query: 362 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
GAT T G+T +T G+T +T G+T T GAT T
Sbjct: 162 GATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPT 221
Query: 422 GA 423
GA
Sbjct: 222 GA 223
>gi|296879503|ref|ZP_06903491.1| collagen triple helix repeat protein, partial [Clostridium
difficile NAP07]
gi|296429495|gb|EFH15354.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP07]
Length = 252
Score = 55.1 bits (131), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/258 (28%), Positives = 87/258 (33%), Gaps = 12/258 (4%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
A T G+T T GA +T GAT T GAT T G T
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTG 119
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLG 180
T G T T + GAT T V GA +T +GAT T +V G
Sbjct: 120 NTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTG 179
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
A T +G T T GA L GAT V G T T +G
Sbjct: 180 AVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIG 239
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTA 258
T T+GAT T
Sbjct: 240 PT------GTVGATGPTG 251
Score = 55.1 bits (131), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/258 (28%), Positives = 87/258 (33%), Gaps = 12/258 (4%)
Query: 16 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 75
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 135
A T G+T T GA +T GAT T GAT T G T
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTG 119
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLG 192
T G T T + GAT T V GA +T +GAT T +V G
Sbjct: 120 NTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTG 179
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
A T +G T T GA L GAT V G T T +G
Sbjct: 180 AVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIG 239
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTA 270
T T+GAT T
Sbjct: 240 PT------GTVGATGPTG 251
Score = 55.1 bits (131), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/258 (28%), Positives = 87/258 (33%), Gaps = 12/258 (4%)
Query: 28 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
A T G+T T GA +T GAT T GAT T G T
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTG 119
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLG 204
T G T T + GAT T V GA +T +GAT T +V G
Sbjct: 120 NTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTG 179
Query: 205 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
A T +G T T GA L GAT V G T T +G
Sbjct: 180 AVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIG 239
Query: 265 ATELTAKVFTLGATELTA 282
T T+GAT T
Sbjct: 240 PT------GTVGATGPTG 251
Score = 55.1 bits (131), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/258 (28%), Positives = 87/258 (33%), Gaps = 12/258 (4%)
Query: 40 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 99
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
A T G+T T GA +T GAT T GAT T G T
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTG 119
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLG 216
T G T T + GAT T V GA +T +GAT T +V G
Sbjct: 120 NTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTG 179
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
A T +G T T GA L GAT V G T T +G
Sbjct: 180 AVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIG 239
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTA 294
T T+GAT T
Sbjct: 240 PT------GTVGATGPTG 251
Score = 55.1 bits (131), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/258 (28%), Positives = 87/258 (33%), Gaps = 12/258 (4%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
A T G+T T GA +T GAT T GAT T G T
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTG 119
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLG 228
T G T T + GAT T V GA +T +GAT T +V G
Sbjct: 120 NTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTG 179
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
A T +G T T GA L GAT V G T T +G
Sbjct: 180 AVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIG 239
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTA 306
T T+GAT T
Sbjct: 240 PT------GTVGATGPTG 251
Score = 55.1 bits (131), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/258 (28%), Positives = 87/258 (33%), Gaps = 12/258 (4%)
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
A T G+T T GA +T GAT T GAT T G T
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTG 119
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLG 240
T G T T + GAT T V GA +T +GAT T +V G
Sbjct: 120 NTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTG 179
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
A T +G T T GA L GAT V G T T +G
Sbjct: 180 AVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIG 239
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTA 318
T T+GAT T
Sbjct: 240 PT------GTVGATGPTG 251
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/273 (27%), Positives = 88/273 (32%), Gaps = 28/273 (10%)
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 255
A T G+T T GA +T GAT T G T LT GA
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGAT------GPTGLTGATGATGANG 113
Query: 256 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 315
+T GAT G T T + GAT T V GA +T +GAT
Sbjct: 114 ITGPTGNTGATGAN------GVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATG 167
Query: 316 LTAK----SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
T V P ++ T T GA L GAT V
Sbjct: 168 PTGADGEVGPTGAVGATGPDGVI---GPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVG 224
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 404
G T T +G T T+GAT T
Sbjct: 225 PTGPTGATGVAGAIGPT------GTVGATGPTG 251
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/250 (27%), Positives = 80/250 (32%), Gaps = 35/250 (14%)
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+T +GAT + G T T G T T GA +T GAT
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
A T G+T T GA +T GAT T G T LT GA
Sbjct: 63 --ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGAT------GPTGLTGATGATGANG 113
Query: 304 LTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 363
+T GAT N T T + GAT T V GA
Sbjct: 114 ITGPTGNTGATGA--------------------NGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGA 153
Query: 364 TELTAKVFTLGATELT---AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
+T +GAT T +V GA T +G T T GA L V
Sbjct: 154 NGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGL---VGP 210
Query: 421 LGATELTAKN 430
G T T N
Sbjct: 211 TGPTGATGAN 220
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/224 (29%), Positives = 76/224 (33%), Gaps = 12/224 (5%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GA +T GAT A T G+T T GA +T GA
Sbjct: 37 TGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGA 93
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T GAT T G T T G T T + GAT T V GA
Sbjct: 94 TGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGA 153
Query: 122 TELTAKVFTLGATELT---AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
+T +GAT T +V GA T +G T T GA L
Sbjct: 154 NGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGP 213
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
GAT V G T T +G T T+GAT T
Sbjct: 214 TGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPT------GTVGATGPTG 251
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
A +T GAT T GAT T G T T G T T + G
Sbjct: 81 ANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTG 140
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT---AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
AT T V GA +T +GAT T +V GA T +G T T
Sbjct: 141 ATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATG 200
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GA L GAT V G T T +G T T+GAT T
Sbjct: 201 ATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPT------GTVGATGPTG 251
>gi|291221762|ref|XP_002730872.1| PREDICTED: hypothetical protein [Saccoglossus kowalevskii]
Length = 824
Score = 54.7 bits (130), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/212 (25%), Positives = 79/212 (37%), Gaps = 18/212 (8%)
Query: 78 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 137
V T+ + V T+G+ V T+G+ V TL A V TL
Sbjct: 544 CSVVTMCSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------ 597
Query: 138 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 197
V T+G+ V TL V T+ + V T+G+ V T+G+
Sbjct: 598 CPVVTMGSVVTLCSVVTL------CPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 651
Query: 198 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 257
V T+G+ V TL A V TL V T+G+ V T+G+
Sbjct: 652 CPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------CPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 705
Query: 258 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
V T+G+ V T+ + V T+G+
Sbjct: 706 CPVVTMGSVVTLCPVVTMDSVVTLCPVVTMGS 737
Score = 54.7 bits (130), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/212 (25%), Positives = 79/212 (37%), Gaps = 18/212 (8%)
Query: 102 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 161
V T+ + V T+G+ V T+G+ V TL A V TL
Sbjct: 544 CSVVTMCSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------ 597
Query: 162 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 221
V T+G+ V TL V T+ + V T+G+ V T+G+
Sbjct: 598 CPVVTMGSVVTLCSVVTL------CPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 651
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
V T+G+ V TL A V TL V T+G+ V T+G+
Sbjct: 652 CPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------CPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 705
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
V T+G+ V T+ + V T+G+
Sbjct: 706 CPVVTMGSVVTLCPVVTMDSVVTLCPVVTMGS 737
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/182 (25%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 18/182 (9%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGA-----TELT-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 59
V T+G+ V TL A + +T V T+G+ V TL V T+
Sbjct: 568 CPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTLCPVVTMGSVVTLCSVVTL------CPVVTM 621
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
+ V T+G+ V T+G+ V T+G+ V TL A V TL
Sbjct: 622 DSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL 681
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
V T+G+ V T+G+ V T+G+ V T+ + V T+
Sbjct: 682 ------CPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMDSVVTLCPVVTM 735
Query: 180 GA 181
G+
Sbjct: 736 GS 737
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/290 (24%), Positives = 105/290 (36%), Gaps = 24/290 (8%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
V T+ + V T+G+ V T+G+ V TL A V TL
Sbjct: 544 CSVVTMCSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------ 597
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
V T+G+ V TL V T+ + V T+G+ V T+G+
Sbjct: 598 CPVVTMGSVVTLCSVVTL------CPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 651
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
V T+G+ V TL A V TL V T+G+ V T+G+
Sbjct: 652 CPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------CPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 705
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---- 241
V T+G+ V T+ + V T+G+ V + + V T+ +
Sbjct: 706 CPVVTMGSVVTLCPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLYPVVAIDSVVTFCPVVTIDSAVTM 765
Query: 242 --TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
+ V TL + + V TLG TLG+ V TLG+
Sbjct: 766 GSVVVMGSVVTLSSVVIVGSVVTLGIVGSLGSALTLGSVASLGSVVTLGS 815
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/290 (24%), Positives = 105/290 (36%), Gaps = 24/290 (8%)
Query: 18 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 77
V T+ + V T+G+ V T+G+ V TL A V TL
Sbjct: 544 CSVVTMCSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------ 597
Query: 78 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 137
V T+G+ V TL V T+ + V T+G+ V T+G+
Sbjct: 598 CPVVTMGSVVTLCSVVTL------CPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 651
Query: 138 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 197
V T+G+ V TL A V TL V T+G+ V T+G+
Sbjct: 652 CPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------CPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 705
Query: 198 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---- 253
V T+G+ V T+ + V T+G+ V + + V T+ +
Sbjct: 706 CPVVTMGSVVTLCPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLYPVVAIDSVVTFCPVVTIDSAVTM 765
Query: 254 --TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
+ V TL + + V TLG TLG+ V TLG+
Sbjct: 766 GSVVVMGSVVTLSSVVIVGSVVTLGIVGSLGSALTLGSVASLGSVVTLGS 815
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/290 (24%), Positives = 105/290 (36%), Gaps = 24/290 (8%)
Query: 30 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 89
V T+ + V T+G+ V T+G+ V TL A V TL
Sbjct: 544 CSVVTMCSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------ 597
Query: 90 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 149
V T+G+ V TL V T+ + V T+G+ V T+G+
Sbjct: 598 CPVVTMGSVVTLCSVVTL------CPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 651
Query: 150 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 209
V T+G+ V TL A V TL V T+G+ V T+G+
Sbjct: 652 CPVVTMGSVVTLCPVVTLCAVVTIDSVVTL------CPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTL 705
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---- 265
V T+G+ V T+ + V T+G+ V + + V T+ +
Sbjct: 706 CPVVTMGSVVTLCPVVTMDSVVTLCPVVTMGSVVTLYPVVAIDSVVTFCPVVTIDSAVTM 765
Query: 266 --TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
+ V TL + + V TLG TLG+ V TLG+
Sbjct: 766 GSVVVMGSVVTLSSVVIVGSVVTLGIVGSLGSALTLGSVASLGSVVTLGS 815
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/251 (21%), Positives = 91/251 (36%), Gaps = 13/251 (5%)
Query: 78 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 137
V T+G+ V T+ + V + + V T+G+ V TL
Sbjct: 242 CPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVTLCPVVAIDSVVTLCSVVTMGSVVTIDSVVTL------ 295
Query: 138 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 197
V T+G+ V T+ + V T+G+ V T+ + V T+ +
Sbjct: 296 CPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVALCPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVALCPVVTMCSVVTL 355
Query: 198 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 257
V T+G+ V T+ + V T+ + V T+ + V T+ +
Sbjct: 356 CSVVTMGSVVTLCSVVTIDSVVTLCSVVTMDSLVTLCPVVTIDSVVTLCPVVTMCSVVTL 415
Query: 258 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 317
T+G+ V T+G+ V TL + V TL V T+G+ +T
Sbjct: 416 CSAVTMGSVVTLCPVGTMGSVVTIDSVVTLCSVVTMCSVVTL------CPVVTMGSV-VT 468
Query: 318 AKSVILEVEYY 328
V+ V YY
Sbjct: 469 LCPVLPWVLYY 479
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/275 (21%), Positives = 96/275 (34%), Gaps = 24/275 (8%)
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
V T+G+ V T+ + V + + V T+G+ V TL
Sbjct: 242 CPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVTLCPVVAIDSVVTLCSVVTMGSVVTIDSVVTL------ 295
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
V T+G+ V T+ + V T+G+ V T+ + V T+ +
Sbjct: 296 CPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVALCPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVALCPVVTMCSVVTL 355
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
V T+G+ V T+ + V T+ + V T+ + V T+ +
Sbjct: 356 CSVVTMGSVVTLCSVVTIDSVVTLCSVVTMDSLVTLCPVVTIDSVVTLCPVVTMCSVVTL 415
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
T+G+ V T+G+ V TL + V TL V T+G+
Sbjct: 416 CSAVTMGSVVTLCPVGTMGSVVTIDSVVTLCSVVTMCSVVTL------CPVVTMGSVVTL 469
Query: 306 AKV-----------FTLGATELTAKSVILEVEYYK 329
V TL A +T SV+ V YY
Sbjct: 470 CPVLPWVLYYIVSCITLCAV-VTIDSVLHCVLYYH 503
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/337 (24%), Positives = 118/337 (35%), Gaps = 28/337 (8%)
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
V TL V TLG+ V TL V TLG+ V T G+
Sbjct: 3 SVVTLCPVVTIDCVVTLGSVVTIGCVVTLCPVVTIDCVVTLGSVVTIDCVVTSGSVVNND 62
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELT 221
V TL V T+G+ V T+G+ V + + E+T V TLG+
Sbjct: 63 SVVTL------CPVVTMGSVVKLCPVVTMGSVVTLYPVVAIDS-EVTIGCVVTLGSVVTI 115
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
V TLG+ V TLG+ V TL V TL V TL
Sbjct: 116 DCVVTLGSVVTIDCVVTLGSVVTMGSVVTLCPIVTMCSVVTLCPVVTIDSVVTLCPVVTM 175
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY---------KPIK 332
V TL + V TL V TL S I+ Y+ K
Sbjct: 176 GSVVTLCPVVTMSSVVTLCPVVTMCSVVTLCPVVTGFCSYIMSCSYHGFCSYIVFCK--- 232
Query: 333 IVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA----- 387
+P +S L V T+G+ V T+ + V + + V T+G+
Sbjct: 233 -LPWDSVVTL-CPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVTLCPVVAIDSVVTLCSVVTMGSVVTID 290
Query: 388 TELT-AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
+ +T V T+G+ V T+ + V T+G+
Sbjct: 291 SVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVALCPVVTMGS 327
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 91/457 (19%), Positives = 150/457 (32%), Gaps = 66/457 (14%)
Query: 6 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 65
V T+G+ V T+ + V + + V T+G+ V TL
Sbjct: 242 CPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVTLCPVVAIDSVVTLCSVVTMGSVVTIDSVVTL------ 295
Query: 66 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
V T+G+ V T+ + V T+G+ V T+ + V T+ +
Sbjct: 296 CPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVALCPVVTMGSVVTLCPVVTIDSVVALCPVVTMCSVVTL 355
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
V T+G+ V T+ + V T+ + V T+ + V T+ +
Sbjct: 356 CSVVTMGSVVTLCSVVTIDSVVTLCSVVTMDSLVTLCPVVTIDSVVTLCPVVTMCSVVTL 415
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
T+G+ V T+G+ V TL + V TL V T+G+
Sbjct: 416 CSAVTMGSVVTLCPVGTMGSVVTIDSVVTLCSVVTMCSVVTL------CPVVTMGSVVTL 469
Query: 246 AKV------FTLGATELTAKV----------------FTLGATELTAKVF---------- 273
V + + L A V TL + +T V
Sbjct: 470 CPVLPWVLYYIVSCITLCAVVTIDSVLHCVLYYHGFCITL-CSVVTCSVLHXXXXXXXXX 528
Query: 274 -------TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVE 326
+ + V T+ + V T+G+ V T+G+ V L
Sbjct: 529 XXXXXXXXIDSVVTLCSVVTMCSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLC-- 586
Query: 327 YYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 386
+V +S L V T+G+ V TL V T+ + V T+G
Sbjct: 587 -----AVVTIDSVVTL-CPVVTMGSVVTLCSVVTL------CPVVTMDSVVTLCPVVTMG 634
Query: 387 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 423
+ V T+G+ V T+G+ V TL A
Sbjct: 635 SVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTMGSVVTLCPVVTLCA 671
>gi|355559731|gb|EHH16459.1| hypothetical protein EGK_11743, partial [Macaca mulatta]
Length = 283
Score = 54.7 bits (130), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/308 (25%), Positives = 127/308 (41%), Gaps = 40/308 (12%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
TE+T +TE+ + TE+T +TE+T +TE+T
Sbjct: 4 WPTEVTWPTVMTHSTEV------IQVTEVT------HSTEVTCSTEVTHSTEVTLPTEVT 51
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
+TE+T+ TE T +TE+T TE+T +TE+T +
Sbjct: 52 CSTEVTSSPAETWPTEATCSTEVTSSTEVT------WPTEVTCSTDVTHSTEVTWRTEVT 105
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
+TE+T+ TE+T +TE+T ATE+T +TE+T
Sbjct: 106 CSTEVTSSTEVTWPTEVTCSTEATHSTEVT------QATEMT------HSTEVTCSTDVT 153
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
+TE+T + TE+T +TE+T + +TE T ATE+T
Sbjct: 154 HSTEVTWR------TEVTCSTDVTHSTEVTWRTEVTCSTEATHSTEVTQATEMTHSTEVT 207
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--KVFTLGATELTAKVF 309
+TE+T+ TE T +TE+T +TE+ KV + +E+T
Sbjct: 208 CSTEVTSSPAETWPTEATCSTEVTSSTEVTWPTEVTCSTEVVCFTKV--IWPSEVTHSTE 265
Query: 310 TLGATELT 317
+ TE+T
Sbjct: 266 VIQCTEVT 273
Score = 54.7 bits (130), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/307 (25%), Positives = 127/307 (41%), Gaps = 40/307 (13%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
TE+T +TE+ + TE+T +TE+T +TE+T
Sbjct: 5 PTEVTWPTVMTHSTEV------IQVTEVT------HSTEVTCSTEVTHSTEVTLPTEVTC 52
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+TE+T+ TE T +TE+T TE+T +TE+T +
Sbjct: 53 STEVTSSPAETWPTEATCSTEVTSSTEVT------WPTEVTCSTDVTHSTEVTWRTEVTC 106
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+TE+T+ TE+T +TE+T ATE+T +TE+T
Sbjct: 107 STEVTSSTEVTWPTEVTCSTEATHSTEVT------QATEMT------HSTEVTCSTDVTH 154
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+TE+T + TE+T +TE+T + +TE T ATE+T
Sbjct: 155 STEVTWR------TEVTCSTDVTHSTEVTWRTEVTCSTEATHSTEVTQATEMTHSTEVTC 208
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--KVFTLGATELTAKVFT 298
+TE+T+ TE T +TE+T +TE+ KV + +E+T
Sbjct: 209 STEVTSSPAETWPTEATCSTEVTSSTEVTWPTEVTCSTEVVCFTKV--IWPSEVTHSTEV 266
Query: 299 LGATELT 305
+ TE+T
Sbjct: 267 IQCTEVT 273
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/310 (24%), Positives = 124/310 (40%), Gaps = 42/310 (13%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
TE+T +TE+ + TE+T +TE+T +TE+T
Sbjct: 4 WPTEVTWPTVMTHSTEV------IQVTEVT------HSTEVTCSTEVTHSTEVTLPTEVT 51
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
+TE+T+ TE T +TE+T TE+T +TE+T +
Sbjct: 52 CSTEVTSSPAETWPTEATCSTEVTSSTEVT------WPTEVTCSTDVTHSTEVTWRTEVT 105
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
+TE+T+ TE+T +TE+T +TE+T +TE+T +
Sbjct: 106 CSTEVTSSTEVTWPTEVTCSTEATHSTEVTQATEMTHSTEVTCSTDVTHSTEVTWR---- 161
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
TE+T +TE+T ++ + +TE T ATE+T
Sbjct: 162 --TEVTCSTDVTHSTEVTWRTEV--------------TCSTEATHSTEVTQATEMTHSTE 205
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--KVFTLGATELTAK 417
+TE+T+ TE T +TE+T +TE+ KV + +E+T
Sbjct: 206 VTCSTEVTSSPAETWPTEATCSTEVTSSTEVTWPTEVTCSTEVVCFTKV--IWPSEVTHS 263
Query: 418 VFTLGATELT 427
+ TE+T
Sbjct: 264 TEVIQCTEVT 273
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/274 (24%), Positives = 106/274 (38%), Gaps = 50/274 (18%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
TE+T +TE+ + TE+T +TE+T +TE+T
Sbjct: 4 WPTEVTWPTVMTHSTEV------IQVTEVT------HSTEVTCSTEVTHSTEVTLPTEVT 51
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
+TE+T+ TE T +TE+T TE+T +TE+T +
Sbjct: 52 CSTEVTSSPAETWPTEATCSTEVTSSTEVT------WPTEVTCSTDVTHSTEVTWRTEVT 105
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
+TE+T+ TE+T +TE+T ATE+T
Sbjct: 106 CSTEVTSSTEVTWPTEVTCSTEATHSTEVT------QATEMTH----------------- 142
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
+TE+T +TE+T + TE+T +TE+T + +TE T
Sbjct: 143 ---STEVTCSTDVTHSTEVTWR------TEVTCSTDVTHSTEVTWRTEVTCSTEATHSTE 193
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
ATE+T +TE+T+ TE T
Sbjct: 194 VTQATEMTHSTEVTCSTEVTSSPAETWPTEATCS 227
>gi|194768529|ref|XP_001966364.1| GF22130 [Drosophila ananassae]
gi|190617128|gb|EDV32652.1| GF22130 [Drosophila ananassae]
Length = 392
Score = 54.7 bits (130), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/332 (20%), Positives = 159/332 (47%), Gaps = 35/332 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLG--ATELTAKV 56
AT + +++ G+T + +++ G+T + +++ G AT + +++ G AT + ++
Sbjct: 49 ATAVRPRLYGYGSTAVRPRLYGYGSTAVRPRLYGYGCTATAVRPRLYGYGSTATAVRLRL 108
Query: 57 FTLG--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---- 108
+ G AT + +++ G T ++ G AT + +++ G+T ++ G
Sbjct: 109 YGYGCTATAVRLRLYGHGCTATAVRLRQYGCTATAVRPRLYGYGSTTTAVRLRQYGHGCT 168
Query: 109 ATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA--TELTAKVFTLG--ATELTA 162
AT + +++ G AT + +++ G+T + +++ G+ T + +++ G AT +
Sbjct: 169 ATAVRLRLYGYGCTATAVRLRLYGYGSTAVRPRLYGYGSTTTAVRLRLYGYGCTATAVRP 228
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLG 216
+++ G T ++ G AT + + + G AT + +++ G AT + +++ G
Sbjct: 229 RLYGYGCTATAVRLRQYGCTATAVRLRQYDHGCTATAVRPRLYGYGSTATAVRLRLYGYG 288
Query: 217 --ATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG----ATELTAKVFTLG--AT 266
AT + +++ G AT + +++ G+T ++ G AT + +++ G AT
Sbjct: 289 CTATAVRLRLYGYGCTATAVRPRLYGYGSTTTAVRLRQYGHGCTATAVRLRLYGHGCTAT 348
Query: 267 ELTAKVFTLGATEL-TAKVFTLGATELTAKVF 297
+ ++++ G L TA L TA++
Sbjct: 349 AVQSRLYGYGYGSLATAPRLQLNGFGCTARLH 380
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/196 (19%), Positives = 94/196 (47%), Gaps = 22/196 (11%)
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
AT + ++ G T +++ G AT + +++ G+T + +++ G+T + +++
Sbjct: 23 ATAVRYMLYGHGCTATAVRLYGHGCTATAVRPRLYGYGSTAVRPRLYGYGSTAVRPRLYG 82
Query: 299 LG--ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
G AT + +++ G+ TA +V L + Y +AT + +++ G T
Sbjct: 83 YGCTATAVRPRLYGYGS---TATAVRLRLYGYG-------CTATAVRLRLYGHGCTATAV 132
Query: 357 KVFTLG--ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG----ATELTAKVFTLG--ATELTAKVFT 408
++ G AT + +++ G+T ++ G AT + +++ G AT + +++
Sbjct: 133 RLRQYGCTATAVRPRLYGYGSTTTAVRLRQYGHGCTATAVRLRLYGYGCTATAVRLRLYG 192
Query: 409 LGATELTAKVFTLGAT 424
G+T + +++ G+T
Sbjct: 193 YGSTAVRPRLYGYGST 208
>gi|423513882|ref|ZP_17490411.1| hypothetical protein IG3_05377, partial [Bacillus cereus HuA2-1]
gi|402444009|gb|EJV75900.1| hypothetical protein IG3_05377, partial [Bacillus cereus HuA2-1]
Length = 296
Score = 54.7 bits (130), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 20/187 (10%)
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
+G T +T +G T +T +G T T +G T T +G T +T
Sbjct: 3 IGPTGVTGPTGDIGPTGVTGPTGDIGPTGATGSTGDIGPTGATGSTGDIGPTGVTGPTGD 62
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
+G T +T G T T +G T +T +G T +T GAT T +
Sbjct: 63 IGPTGVTGPTGVTGPTGATGPTGDIGPTGVTGSTGDIGPTGVTGPT---GATGSTGDIGP 119
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILE-VEYYKPIKI 333
G T T GAT T + G T LT GAT T +L+ ++Y +
Sbjct: 120 TGVTGPT------GATGPTGDIGPTGVTGLT------GATGSTGG--VLDFADFYA--LM 163
Query: 334 VPQNSAT 340
P N+AT
Sbjct: 164 PPDNAAT 170
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/159 (27%), Positives = 60/159 (37%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
+G T +T +G T +T +G T T +G T T +G T +T
Sbjct: 3 IGPTGVTGPTGDIGPTGVTGPTGDIGPTGATGSTGDIGPTGATGSTGDIGPTGVTGPTGD 62
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
+G T +T G T T +G T +T +G T +T GAT T +
Sbjct: 63 IGPTGVTGPTGVTGPTGATGPTGDIGPTGVTGSTGDIGPTGVTGPT---GATGSTGDIGP 119
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
G T T GAT T + G T LT + G
Sbjct: 120 TGVTGPT------GATGPTGDIGPTGVTGLTGATGSTGG 152
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/157 (26%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T +G T +T +G T T +G T T +G T +T +G
Sbjct: 5 PTGVTGPTGDIGPTGVTGPTGDIGPTGATGSTGDIGPTGATGSTGDIGPTGVTGPTGDIG 64
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T T +G T +T +G T +T GAT T + G
Sbjct: 65 PTGVTGPTGVTGPTGATGPTGDIGPTGVTGSTGDIGPTGVTGPT---GATGSTGDIGPTG 121
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T T GAT T + G T LT + G
Sbjct: 122 VTGPT------GATGPTGDIGPTGVTGLTGATGSTGG 152
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 60/164 (36%), Gaps = 12/164 (7%)
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
+ G T T + G T T + GAT T + GAT T + G T +T
Sbjct: 1 GDIGPTGVTGPTGDIGPTGVTGPTGDIGPTGATGSTGDIGPTGATGSTGDI---GPTGVT 57
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
+G T +T G T T +G T +T +G T +T GAT T
Sbjct: 58 GPTGDIGPTGVTGPTGVTGPTGATGPTGDIGPTGVTGSTGDIGPTGVTGPT---GATGST 114
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
+ G T T GAT T + G T LT + G
Sbjct: 115 GDIGPTGVTGPT------GATGPTGDIGPTGVTGLTGATGSTGG 152
>gi|373124346|ref|ZP_09538187.1| hypothetical protein HMPREF0982_03116 [Erysipelotrichaceae
bacterium 21_3]
gi|371659314|gb|EHO24579.1| hypothetical protein HMPREF0982_03116 [Erysipelotrichaceae
bacterium 21_3]
Length = 537
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/321 (26%), Positives = 105/321 (32%), Gaps = 9/321 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T T G T G T T GAT T + GAT + + G
Sbjct: 91 ATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPG 147
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
A+ T G T T GAT T + GAT T G T T G
Sbjct: 148 ASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTG 204
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A +T + G G T +T G T T G T T G
Sbjct: 205 AIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTG 264
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VF 237
A + +G T T GAT ++ GAT T + GA +T
Sbjct: 265 ADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATG 324
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
+ GAT L+ GAT T + G T T ++G T T GAT
Sbjct: 325 STGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTG 384
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTA 318
GA + G+T TA
Sbjct: 385 VTGANGIAGPTGATGSTGATA 405
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/272 (26%), Positives = 88/272 (32%), Gaps = 6/272 (2%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GA+ T G T T GAT T + GAT T G T T
Sbjct: 147 GASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPT 203
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GA +T + G G T +T G T T G T T
Sbjct: 204 GAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNT 263
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GA + +G T T GAT ++ GAT T + GA +T
Sbjct: 264 GADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGAT 323
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G+T T GAT T G+T T
Sbjct: 324 GSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGP 355
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 95/364 (26%), Positives = 122/364 (33%), Gaps = 30/364 (8%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGAT 257
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T G+T + GAT +T GAT ++ GAT T +
Sbjct: 258 GATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGIT------GATGISGITGADGATGPTGATGST 311
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GA +T P AT L+ GAT T + G T T
Sbjct: 312 GANGITG-----------PTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATG 360
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
++G T T GAT GA + G+T TA G + A +I
Sbjct: 361 SIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGIAGPTGATGSTGATATAQN-GQFSVNASSI 419
Query: 432 RSNT 435
SN+
Sbjct: 420 SSNS 423
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/325 (25%), Positives = 109/325 (33%), Gaps = 26/325 (8%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT + + GA+ T G T T GAT T + G
Sbjct: 124 ATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTG 180
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVF 117
AT T G T T GA +T + G T G T T
Sbjct: 181 ATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTG 240
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
G T T GAT T GA + +G T T GAT ++
Sbjct: 241 PTGNTGATGNDGNTGATGATGNT---GADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITG 297
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT T + GA +T G+T GAT L+ GAT T
Sbjct: 298 ADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGST---------GATGLSGIQGATGATGNTGANG 348
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
+ G T T ++G T T GAT GA + G+T TA
Sbjct: 349 STGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGIAGPTGATGSTGATATAQ 408
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
F++ A+ +++ S+I
Sbjct: 409 N--------GQFSVNASSISSNSLI 425
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/329 (26%), Positives = 110/329 (33%), Gaps = 34/329 (10%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGAT 257
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT T G+T + GAT +T + I + AT T
Sbjct: 258 GATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGAD--------GATGPTGATG 309
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
+ GA +T G+T GAT L+ GAT T + G T T
Sbjct: 310 STGANGITGPTGATGST---------GATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATG 360
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTG 436
++G T T GAT + NTG
Sbjct: 361 SIGNTGATGTNGVTGATGP-----QGNTG 384
>gi|325289692|ref|YP_004265873.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
gi|324965093|gb|ADY55872.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
Length = 764
Score = 53.9 bits (128), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/394 (26%), Positives = 134/394 (34%), Gaps = 14/394 (3%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G T +T + + GAT T G T +T + GAT T G T T
Sbjct: 212 GPTGVTGETGSTGATGET------GPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGET 265
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT +T + G T T G T T G T +T + G T T
Sbjct: 266 GATGVTGEAGPTGETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVT 325
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T G T +T + GAT T G T T G T +T +
Sbjct: 326 GETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGET--- 382
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T +T + GAT T G T T G T +T + GAT T
Sbjct: 383 GPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVT 442
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G T T G T +T + GAT T G T T V E P +
Sbjct: 443 GETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTG--VTGEA---GPTGVTG 497
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
+ T +T + G T T G T T G T +T + G T T
Sbjct: 498 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTG 557
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T T G T +T + + GAT T
Sbjct: 558 ATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTGATGETGP 591
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 112/451 (24%), Positives = 146/451 (32%), Gaps = 47/451 (10%)
Query: 9 FTLGATELTAKVFTL------------------------------GATELTAKVFTLGAT 38
+++GAT +T G T +T + + GAT
Sbjct: 167 YSIGATGVTGPTGATGVTGPTGGTGETGPTGGTGETGPTGATGETGPTGVTGETGSTGAT 226
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
T G T +T + GAT T G T T GAT +T + G T
Sbjct: 227 GET------GPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGATGVTGEAGPTGET 280
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
T G T T G T +T + G T T G T T G T
Sbjct: 281 GETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPT 340
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
+T + GAT T G T T G T +T + G T +T + GAT
Sbjct: 341 GVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGET---GPTGVTGETGPTGAT 397
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
T G T T G T +T + GAT T G T T G T
Sbjct: 398 GETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPT 457
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS 338
+T + GAT T G T T G T +T ++ P + +
Sbjct: 458 GVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGET--------GPTGVTGETG 509
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
T +T + GAT T G T T G T +T + GAT T G
Sbjct: 510 PTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATG 569
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
T T G+T T + G T T
Sbjct: 570 ETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGP 600
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/319 (26%), Positives = 107/319 (33%), Gaps = 6/319 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T + G T T G T T G T +T + GAT T G
Sbjct: 303 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTG 362
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G T +T + G T +T + GAT T G T T G
Sbjct: 363 ETGPTGVTGETGPTGVTGET---GPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 419
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T +T + GAT T G T T G T +T + GAT T G
Sbjct: 420 PTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTG 479
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T G T +T + G T +T + G T T G T T G
Sbjct: 480 ETGPTGVTGEAGPTGVTGET---GPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETG 536
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T +T + G T T G T T G T +T + + GAT T G
Sbjct: 537 PTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTG 596
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAK 319
T T G T T +
Sbjct: 597 ETGPTGVTGETGPTGATGE 615
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/306 (26%), Positives = 103/306 (33%), Gaps = 6/306 (1%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T + + GAT T G T T G T +T + G T T
Sbjct: 320 GPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVT 379
Query: 72 G---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
G T +T + GAT T G T T G T +T + GAT T
Sbjct: 380 GETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPT 439
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
G T T G T +T + GAT T G T T G T +T +
Sbjct: 440 GVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGET 499
Query: 189 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T +T + G T T G T T G T +T + G T T
Sbjct: 500 ---GPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPT 556
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
G T T G T +T + + GAT T G T T G T T +
Sbjct: 557 GATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGET 616
Query: 309 FTLGAT 314
G T
Sbjct: 617 GPTGET 622
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/318 (27%), Positives = 109/318 (34%), Gaps = 12/318 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T G T +T + + GAT T G T +T + G
Sbjct: 297 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGET------GPTGVTGETGPTG 350
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G T T G T +T + G T +T + GAT T G
Sbjct: 351 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGET---GPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTG 407
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G T +T + GAT T G T T G T +T + G
Sbjct: 408 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTG 467
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T G T T G T +T + G T +T + G T T G
Sbjct: 468 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGET---GPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATG 524
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T T G T +T + G T T G T T G T +T + + G
Sbjct: 525 ETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTG 584
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTA 318
AT T G T T
Sbjct: 585 ATGETGPTGVTGETGPTG 602
>gi|328718580|ref|XP_001946895.2| PREDICTED: hypothetical protein LOC100163571 [Acyrthosiphon pisum]
Length = 489
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/245 (30%), Positives = 126/245 (51%), Gaps = 13/245 (5%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
G+T+ A F+LG+ A F+L T F+L +T + F+LG T + F
Sbjct: 28 WGSTQAPAG-FSLGSNTQPAPTGFSLANTTQATTGFSLSSTTQASTGFSLGVTNQPSTGF 86
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
TLG T + F+LG T+ + VF+LG+ + T+ F+LGAT + F+L +T F
Sbjct: 87 TLGTTPASTG-FSLGTTQ-ASNVFSLGSNQ-TSTAFSLGATPTVSTGFSLASTTQAPTGF 143
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
+L T+ +A L T++ + F+LG + + F+LG T + F+L T + F
Sbjct: 144 SLVTTQASA-ALPLATTQV-SNAFSLGTVQ-ASTAFSLGTTPAVSTSFSLAGTTQVSTGF 200
Query: 190 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
++G T+ + F+L T+ + F+L AT ++ F+LG + F+LG T T F
Sbjct: 201 SMGTTQASTG-FSLTTTQASTG-FSL-ATTKSSTGFSLGTSPAAPTGFSLGTTSATG--F 255
Query: 250 TLGAT 254
+L ++
Sbjct: 256 SLSSS 260
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/210 (26%), Positives = 91/210 (43%), Gaps = 42/210 (20%)
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
G+T+ A F+LG+ A F+L T F+L +T + F+LG T + F
Sbjct: 28 WGSTQAPAG-FSLGSNTQPAPTGFSLANTTQATTGFSLSSTTQASTGFSLGVTNQPSTGF 86
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAK 345
TLG T + F+LG T+ + VF+LG+ + T+
Sbjct: 87 TLGTTPASTG-FSLGTTQ-ASNVFSLGSNQ---------------------------TST 117
Query: 346 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA----------KVFTLGATELTAKVF 395
F+LGAT + F+L +T F+L T+ +A F+LG + + F
Sbjct: 118 AFSLGATPTVSTGFSLASTTQAPTGFSLVTTQASAALPLATTQVSNAFSLGTVQ-ASTAF 176
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
+LG T + F+L T + F++G T+
Sbjct: 177 SLGTTPAVSTSFSLAGTTQVSTGFSMGTTQ 206
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/200 (28%), Positives = 93/200 (46%), Gaps = 22/200 (11%)
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
G+T+ A F+LG+ A F+L T F+L +T + F+LG T + F
Sbjct: 28 WGSTQAPAG-FSLGSNTQPAPTGFSLANTTQATTGFSLSSTTQASTGFSLGVTNQPSTGF 86
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
TLG T + F+LG T+ + VF+LG+ + T+ F+LGAT + L P
Sbjct: 87 TLGTTPASTG-FSLGTTQ-ASNVFSLGSNQ-TSTAFSLGATPTVSTGFSLASTTQAPTG- 142
Query: 334 VPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
F+L T+ +A L T++ + F+LG + + F+LG T +
Sbjct: 143 -------------FSLVTTQASA-ALPLATTQV-SNAFSLGTVQ-ASTAFSLGTTPAVST 186
Query: 394 VFTLGATELTAKVFTLGATE 413
F+L T + F++G T+
Sbjct: 187 SFSLAGTTQVSTGFSMGTTQ 206
>gi|422329030|ref|ZP_16410056.1| hypothetical protein HMPREF0981_03376 [Erysipelotrichaceae
bacterium 6_1_45]
gi|371658074|gb|EHO23358.1| hypothetical protein HMPREF0981_03376 [Erysipelotrichaceae
bacterium 6_1_45]
Length = 537
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/328 (26%), Positives = 112/328 (34%), Gaps = 22/328 (6%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GAT T + GAT + + GA+ T G T T GA
Sbjct: 113 TGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGA 169
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFT 118
T T + GAT T G T T GA +T + G T
Sbjct: 170 TGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGN 229
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G T T G T T GAT T GA + +G T T
Sbjct: 230 TGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNT---GADGIQGSTGPIGPTGSTGATGI 286
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
GAT ++ GAT T + GA +T G+T T LGAT
Sbjct: 287 TGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGILGAT-------- 338
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT T + G T T ++G T T GAT GA +
Sbjct: 339 -GATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGIAGPTGA 397
Query: 299 LGATELTA----KVFTLGATELTAKSVI 322
G+T TA F++ A+ +++ S+I
Sbjct: 398 TGSTGATATAQNGQFSVNASSISSNSLI 425
Score = 53.1 bits (126), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/301 (26%), Positives = 97/301 (32%), Gaps = 6/301 (1%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GA+ T G T T GAT T + GAT T G T T
Sbjct: 147 GASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPT 203
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA +T + G G T +T G T T G T T
Sbjct: 204 GAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNT 263
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GA + +G T T GAT ++ GAT T + GA +T
Sbjct: 264 GADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGAT 323
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G+T T LGAT T G+T T G+ T T G T T
Sbjct: 324 GSTGATGLSGILGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNT 383
Query: 312 G 312
G
Sbjct: 384 G 384
Score = 52.8 bits (125), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/317 (26%), Positives = 110/317 (34%), Gaps = 18/317 (5%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T G T T GAT T + GAT + + GA+ T GAT
Sbjct: 104 TGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPT------GATGN 157
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T + GAT T + G+T T GA ++ G T T + G
Sbjct: 158 TGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGA 214
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T + G T GAT T GAT GAT T G+T
Sbjct: 215 TGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGP 274
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGA 241
+ GAT +T GAT ++ GAT T + GA +T + GA
Sbjct: 275 IGPTGSTGATGIT------GATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGA 328
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T L+ + GAT T + G T T ++G T T GAT GA
Sbjct: 329 TGLSGILGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGA 388
Query: 302 TELTAKVFTLGATELTA 318
+ G+T TA
Sbjct: 389 NGIAGPTGATGSTGATA 405
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/350 (25%), Positives = 114/350 (32%), Gaps = 21/350 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA+ T G T T GAT T + GAT T G T T
Sbjct: 147 GASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPT 203
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GA +T + G G T +T G T T G T T
Sbjct: 204 GAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNT 263
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GA + +G T T GAT ++ GAT T + GA +T
Sbjct: 264 GADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGAT 323
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G+T T S IL AT T + G T T ++G T T
Sbjct: 324 GSTGATGLSGILGAT-----------GATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTGATGTNG 372
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA----KVFTLGATELTAK 417
GAT GA + G+T TA F++ A+ +++
Sbjct: 373 VTGATGPQGNTGVTGANGIAGPTGATGSTGATATAQNGQFSVNASSISSN 422
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/260 (26%), Positives = 85/260 (32%), Gaps = 6/260 (2%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GA+ T G T T GAT T + GAT T G T T
Sbjct: 147 GASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPT 203
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GA +T + G G T +T G T T G T T
Sbjct: 204 GAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNT 263
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GA + +G T T GAT ++ GAT T + GA +T
Sbjct: 264 GADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGAT 323
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAK 319
G+T T LGAT T
Sbjct: 324 GSTGATGLSGILGATGATGN 343
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/329 (26%), Positives = 111/329 (33%), Gaps = 34/329 (10%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGAT 257
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT T G+T + GAT +T + I + AT T
Sbjct: 258 GATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGAD--------GATGPTGATG 309
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
+ GA +T G+T GAT L+ + GAT T + G T T
Sbjct: 310 STGANGITGPTGATGST---------GATGLSGILGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATG 360
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTG 436
++G T T GAT + NTG
Sbjct: 361 SIGNTGATGTNGVTGATGP-----QGNTG 384
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/254 (24%), Positives = 85/254 (33%), Gaps = 7/254 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T G T T GA +T + G G
Sbjct: 169 ATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAG 228
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T T G T T GA + +G T T G
Sbjct: 229 NTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITG 288
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT ++ GAT T + GA +T G+T T LGAT T G
Sbjct: 289 ATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGILGATGATGNTGANG 348
Query: 181 ATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA--- 234
+T T ++G T T GAT GA + G+T TA
Sbjct: 349 STGPTGPTGATGSIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGIAGPTGATGSTGATATAQ 408
Query: 235 -KVFTLGATELTAK 247
F++ A+ +++
Sbjct: 409 NGQFSVNASSISSN 422
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/297 (25%), Positives = 96/297 (32%), Gaps = 37/297 (12%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATG-------- 249
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
+ T T GA + +G T T GAT ++
Sbjct: 250 ------------NDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITG 297
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGTVGS 440
GAT T + GA +T G+T T LGAT T NTG GS
Sbjct: 298 ADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGILGATGATG-----NTGANGS 349
>gi|217962264|ref|YP_002340834.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus AH187]
gi|217063654|gb|ACJ77904.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH187]
Length = 524
Score = 53.1 bits (126), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/242 (23%), Positives = 83/242 (34%), Gaps = 30/242 (12%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 83
G + T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 133 GPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTGST 192
Query: 84 ------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 137
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T + G T +T
Sbjct: 193 GPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVTGSTGSTGPTGIT 246
Query: 138 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 197
G+T +T + G T +T + G T +T G+T T G T +T
Sbjct: 247 GSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGST------GPTGIT 300
Query: 198 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 257
G+T T G T +T G T T + G T +T G+T T
Sbjct: 301 GPSGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPT 360
Query: 258 AK 259
Sbjct: 361 GS 362
Score = 52.0 bits (123), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/242 (22%), Positives = 83/242 (34%), Gaps = 30/242 (12%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 59
G + T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 133 GPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTGST 192
Query: 60 ------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 113
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T + G T +T
Sbjct: 193 GPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVTGSTGSTGPTGIT 246
Query: 114 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 173
G+T +T + G T +T + G T +T G+T T G + T
Sbjct: 247 GSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNT 306
Query: 174 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 233
+ G T +T G T +T G T T + G T +T G+T T
Sbjct: 307 GSTGSTGPTGIT------GPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPT 360
Query: 234 AK 235
Sbjct: 361 GS 362
Score = 52.0 bits (123), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/242 (22%), Positives = 83/242 (34%), Gaps = 30/242 (12%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 71
G + T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 133 GPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTGST 192
Query: 72 ------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 125
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T + G T +T
Sbjct: 193 GPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVTGSTGSTGPTGIT 246
Query: 126 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
G+T +T + G T +T + G T +T G+T T G + T
Sbjct: 247 GSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNT 306
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
+ G T +T G T +T G T T + G T +T G+T T
Sbjct: 307 GSTGSTGPTGIT------GPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPT 360
Query: 246 AK 247
Sbjct: 361 GS 362
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/237 (22%), Positives = 81/237 (34%), Gaps = 30/237 (12%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL----------------- 47
T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 138 TGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTGSTGPTGI 197
Query: 48 -GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T + G T +T
Sbjct: 198 TGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGI 251
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G+T +T + G T +T + G T +T G+T T G + T +
Sbjct: 252 TGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGS 311
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G T +T G T +T G T T + G T +T G+T T
Sbjct: 312 TGPTGIT------GPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGS 362
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/335 (21%), Positives = 112/335 (33%), Gaps = 68/335 (20%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 131
G + T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 133 GPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTGST 192
Query: 132 ------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 185
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T + G T +T
Sbjct: 193 GPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVTGSTGSTGPTGIT 246
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
G+T +T + G T +T + G T +T G+T T G T +T
Sbjct: 247 GSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGST------GPTGIT 300
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
G+T T G T +T G T T + G T +T G+T T
Sbjct: 301 GPSGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPT 360
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILE--------------VEYYKPIKIVPQ-----NSATELTAKV 346
A +AKS++ + ++ ++P S TA +
Sbjct: 361 GS-----AGSASAKSIVFQGTNAGFQRIAGSPGIDS----NVIPYVTAGFGSIVGFTASI 411
Query: 347 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
L A +T+ ++ V T LTA
Sbjct: 412 N---VNNLPAAAYTI---DICRNV----PTNLTAP 436
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.088, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/371 (21%), Positives = 119/371 (32%), Gaps = 70/371 (18%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---------------- 55
G+ T G T +T G+T +T G T +T
Sbjct: 16 GSNGNTGPTGITGPTGITGPSGITGSTGITGPTGITGPTGITGSTGPTGATGATGGTGAG 75
Query: 56 -----VFTLGATE---------LTAKVFTL------GATELTAKVFTL---GATELTAKV 92
F+L A T+ + + G ++ L GAT T
Sbjct: 76 LQSTTAFSLAAAPNYKAGQVVTYTSSGYVVKKDAPQGFPNVSPDYIVLVESGATGSTGPS 135
Query: 93 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL--------- 143
G+T T G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 136 GNTGSTGST------GPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGST 189
Query: 144 ---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
G+T +T + G T +T G+T +T G T +T + G T
Sbjct: 190 GSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGIT------GPTGVTGSTGSTGPT 243
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
+T G+T +T + G T +T + G T +T G+T T G +
Sbjct: 244 GITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPS 303
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-A 313
T + G T +T G T T G+T T G T +T G A
Sbjct: 304 GNTGSTGSTGPTGITGPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGSA 363
Query: 314 TELTAKSVILE 324
+AKS++ +
Sbjct: 364 GSASAKSIVFQ 374
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/256 (22%), Positives = 82/256 (32%), Gaps = 45/256 (17%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------ 251
G + T + G T +T G+T T G+T T
Sbjct: 133 GPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTGST 192
Query: 252 ------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
G+T +T + G T +T G+T +T G+T T G+T +T
Sbjct: 193 GPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGIT 252
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 365
G+T T T +T + G T +T G+T
Sbjct: 253 GSTGVTGSTGSTGP--------------------TGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTG 292
Query: 366 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 425
T G T +T G+T T G T +T G T T + G T
Sbjct: 293 ST------GPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTG 346
Query: 426 LTAK-NIRSNTGTVGS 440
+T I +TG GS
Sbjct: 347 ITGPTGITGSTGPTGS 362
>gi|313900704|ref|ZP_07834197.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
gi|312954766|gb|EFR36441.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
Length = 537
Score = 53.1 bits (126), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/311 (26%), Positives = 101/311 (32%), Gaps = 9/311 (2%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GA+ T G T T GAT T + GAT T G T T
Sbjct: 147 GASGPTGAT---GNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPT 203
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA +T + G G T +T G T T G T T
Sbjct: 204 GAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNT 263
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---V 248
GA + +G T T GAT ++ GAT T + GA +T
Sbjct: 264 GADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGAT 323
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
+ GAT L+ GAT T + G T T +G T T GAT
Sbjct: 324 GSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGAIGNTGATGTNGVTGATGPQGNT 383
Query: 309 FTLGATELTAK 319
GA +T
Sbjct: 384 GVTGANGITGP 394
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/364 (26%), Positives = 122/364 (33%), Gaps = 30/364 (8%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T T G T G T T GAT T + GAT + +
Sbjct: 90 GATGPTGANGTAG---PTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLP 146
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA+ T GAT T + GAT T + G+T T GA ++
Sbjct: 147 GASGPT------GATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGAT---GADGVSGPTGAT 197
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + G T + G T GAT T GAT
Sbjct: 198 GNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGAT 257
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T G+T + GAT +T GAT ++ GAT T +
Sbjct: 258 GATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGIT------GATGISGITGADGATGPTGATGST 311
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
GA +T P AT L+ GAT T + G T T
Sbjct: 312 GANGITG-----------PTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATG 360
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
+G T T GAT GA +T G+T TA G + A +I
Sbjct: 361 AIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGITGPTGATGSTGATATAQN-GQFSVNASSI 419
Query: 432 RSNT 435
SN+
Sbjct: 420 SSNS 423
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/234 (26%), Positives = 73/234 (31%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T G T T GA +T + G G
Sbjct: 169 ATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAG 228
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T T G T T GA + +G T T G
Sbjct: 229 NTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITG 288
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT ++ GAT T + GA +T G+T T GAT T G
Sbjct: 289 ATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGANG 348
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
+T T GA T T G T T G T GAT T
Sbjct: 349 STGPTGPTGATGAIGNTGATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANGITGPTGATGSTG 402
>gi|313898782|ref|ZP_07832316.1| BclB C-terminal domain protein [Clostridium sp. HGF2]
gi|312956364|gb|EFR37998.1| BclB C-terminal domain protein [Clostridium sp. HGF2]
Length = 578
Score = 52.8 bits (125), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/297 (26%), Positives = 96/297 (32%), Gaps = 29/297 (9%)
Query: 57 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
FT+ G T T + GAT T + GAT T GAT T G T T
Sbjct: 134 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTG 190
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLG 156
+ GA ++ GAT T + G T T + G
Sbjct: 191 PMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTG 250
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+T T + G+T +T GAT T G T T GA T G
Sbjct: 251 STGATGGIGPTGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATG 307
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T LT GA T G T T GA T G+T LT G
Sbjct: 308 NTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTG 367
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
AT T G T T GA +T GAT L S I+ P+ +
Sbjct: 368 ATGNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGAT---GATGLAGSSAIIPYSSGIPLSL 421
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/282 (26%), Positives = 90/282 (31%), Gaps = 32/282 (11%)
Query: 9 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
FT+ G T T + GAT T + GAT T GAT T G T T
Sbjct: 134 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTG 190
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLG 108
+ GA ++ GAT T + G T T + G
Sbjct: 191 PMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTG 250
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
+T T + G+T +T GAT T G T T GA T G
Sbjct: 251 STGATGGIGPTGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATG 307
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
T LT GA T G T T GA T G+T LT G
Sbjct: 308 NTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTG 367
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
AT T GA T GAT + GAT T
Sbjct: 368 ATGNT------GADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 403
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/272 (25%), Positives = 82/272 (30%), Gaps = 27/272 (9%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + G+T T +G T G T T G T T + GA +
Sbjct: 141 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANGV 200
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFT 106
+ GAT T + G T T + G+T T +
Sbjct: 201 SGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGP 260
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G+T +T GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 261 TGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGP 317
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
GA T G T T GA T G+T LT GAT T
Sbjct: 318 TGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT------GATGPTGATGN 371
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 372 TGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 403
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.88, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/264 (26%), Positives = 82/264 (31%), Gaps = 30/264 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T GAT T G T T + GA ++ G
Sbjct: 152 ATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTG 208
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFTLGATELTA 102
AT T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 209 ATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTG 268
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT T G T T GA T G T LT GA T
Sbjct: 269 PT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTG 325
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
G T T GA T G+T LT GAT T GA T
Sbjct: 326 ADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGNT------GADGATG 379
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
GAT + GAT T
Sbjct: 380 PTGATGATGADGAIGVTGATGATG 403
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/397 (25%), Positives = 120/397 (30%), Gaps = 63/397 (15%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT V G T T G L G+T T
Sbjct: 42 GATGPTGSTGATGATGP--GVGATGPTGATGATGNTGPAGLRGNTGPTGSTGATGNT--- 96
Query: 120 GATELTAKVFTL-----GATELTAKV---FTLGATELTAKVFTL--GATELTAKVFTLGA 169
GAT +T V T+ G A V FT L +FT+ G T T + GA
Sbjct: 97 GATGMT-PVITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASL---LFTIPAGPTGPTGSTGSTGA 152
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T T + GAT T GAT T G T T + GA ++ GA
Sbjct: 153 TGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTGA 209
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
T T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 210 TGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGP 269
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 270 T---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTG------------- 313
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 391
AT T + GA T G T G T T GAT T
Sbjct: 314 -------ATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPT 366
Query: 392 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 367 GATGNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 403
>gi|422330226|ref|ZP_16411249.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium
6_1_45]
gi|371654788|gb|EHO20151.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium
6_1_45]
Length = 575
Score = 52.8 bits (125), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/297 (26%), Positives = 96/297 (32%), Gaps = 29/297 (9%)
Query: 57 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
FT+ G T T + GAT T + GAT T GAT T G T T
Sbjct: 131 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTG 187
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLG 156
+ GA ++ GAT T + G T T + G
Sbjct: 188 PMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTG 247
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+T T + G+T +T GAT T G T T GA T G
Sbjct: 248 STGATGGIGPTGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATG 304
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T LT GA T G T T GA T G+T LT G
Sbjct: 305 NTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTG 364
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
AT T G T T GA +T GAT L S I+ P+ +
Sbjct: 365 ATGNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGAT---GATGLAGSSAIIPYSSGIPLSL 418
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/282 (26%), Positives = 90/282 (31%), Gaps = 32/282 (11%)
Query: 9 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
FT+ G T T + GAT T + GAT T GAT T G T T
Sbjct: 131 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTG 187
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLG 108
+ GA ++ GAT T + G T T + G
Sbjct: 188 PMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTG 247
Query: 109 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
+T T + G+T +T GAT T G T T GA T G
Sbjct: 248 STGATGGIGPTGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATG 304
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
T LT GA T G T T GA T G+T LT G
Sbjct: 305 NTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTG 364
Query: 229 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
AT T GA T GAT + GAT T
Sbjct: 365 ATGNT------GADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 400
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/272 (25%), Positives = 82/272 (30%), Gaps = 27/272 (9%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + G+T T +G T G T T G T T + GA +
Sbjct: 138 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANGV 197
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFT 106
+ GAT T + G T T + G+T T +
Sbjct: 198 SGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGP 257
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G+T +T GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 258 TGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGP 314
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
GA T G T T GA T G+T LT GAT T
Sbjct: 315 TGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT------GATGPTGATGN 368
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 369 TGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 400
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.91, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/264 (26%), Positives = 82/264 (31%), Gaps = 30/264 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T GAT T G T T + GA ++ G
Sbjct: 149 ATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTG 205
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFTLGATELTA 102
AT T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 206 ATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTG 265
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT T G T T GA T G T LT GA T
Sbjct: 266 PT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTG 322
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
G T T GA T G+T LT GAT T GA T
Sbjct: 323 ADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGNT------GADGATG 376
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
GAT + GAT T
Sbjct: 377 PTGATGATGADGAIGVTGATGATG 400
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/397 (25%), Positives = 120/397 (30%), Gaps = 63/397 (15%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT V G T T G L G+T T
Sbjct: 39 GATGPTGSTGATGATGP--GVGATGPTGATGATGNTGPAGLRGNTGPTGSTGATGNT--- 93
Query: 120 GATELTAKVFTL-----GATELTAKV---FTLGATELTAKVFTL--GATELTAKVFTLGA 169
GAT +T V T+ G A V FT L +FT+ G T T + GA
Sbjct: 94 GATGMT-PVITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASL---LFTIPAGPTGPTGSTGSTGA 149
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T T + GAT T GAT T G T T + GA ++ GA
Sbjct: 150 TGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTGA 206
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
T T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 207 TGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGP 266
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 267 T---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTG------------- 310
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 391
AT T + GA T G T G T T GAT T
Sbjct: 311 -------ATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPT 363
Query: 392 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 364 GATGNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 400
>gi|346313117|ref|ZP_08854648.1| hypothetical protein HMPREF9022_00305 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
gi|345899319|gb|EGX69168.1| hypothetical protein HMPREF9022_00305 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
Length = 578
Score = 52.4 bits (124), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/297 (26%), Positives = 96/297 (32%), Gaps = 29/297 (9%)
Query: 57 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
FT+ G T T + GAT T + GAT T GAT T G T T
Sbjct: 134 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTG 190
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLG 156
+ GA ++ GAT T + G T T + G
Sbjct: 191 PMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTG 250
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+T T + G+T +T GAT T G T T GA T G
Sbjct: 251 STGATGGIGPTGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATG 307
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T LT GA T G T T GA T G+T LT G
Sbjct: 308 NTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTG 367
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
AT T G T T GA +T GAT L S I+ P+ +
Sbjct: 368 ATGNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGAT---GATGLAGSSAIIPYSSGIPLSL 421
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/272 (25%), Positives = 82/272 (30%), Gaps = 27/272 (9%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + G+T T +G T G T T G T T + GA +
Sbjct: 141 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANGV 200
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK------------------VFTLGATELTAKVFT 106
+ GAT T + G T T + G+T T +
Sbjct: 201 SGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGP 260
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G+T +T GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 261 TGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGP 317
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
GA T G T T GA T G+T LT GAT T
Sbjct: 318 TGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT------GATGPTGATGN 371
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 372 TGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 403
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/264 (26%), Positives = 82/264 (31%), Gaps = 30/264 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T GAT T G T T + GA ++ G
Sbjct: 152 ATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTG 208
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAK------------------VFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
AT T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 209 ATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTG 268
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT T G T T GA T G T LT GA T
Sbjct: 269 PT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTG 325
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
G T T GA T G+T LT GAT T GA T
Sbjct: 326 ADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT------GATGPTGATGNTGADGATG 379
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
GAT + GAT T
Sbjct: 380 PTGATGATGADGAIGVTGATGATG 403
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 100/394 (25%), Positives = 119/394 (30%), Gaps = 61/394 (15%)
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T + GAT T +GAT T G T T G T T + G T
Sbjct: 41 TGPTGSTGATGATGPG--VGATGPTGATGPTGNTGNTGPAGLRGNTGPTGSIGATGNTGA 98
Query: 125 TA--KVFTL-----GATELTAKV---FTLGATELTAKVFTL--GATELTAKVFTLGATEL 172
T V T+ G A V FT L +FT+ G T T + GAT
Sbjct: 99 TGMTPVITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASL---LFTIPAGPTGPTGSTGSTGATGN 155
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
T + GAT T GAT T G T T + GA ++ GAT
Sbjct: 156 TGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTGATGP 212
Query: 233 TAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 213 TGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPT-- 270
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIV 334
GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 271 -GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTG---------------- 313
Query: 335 PQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 394
AT T + GA T G T G T T GAT T
Sbjct: 314 ----ATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGAT 369
Query: 395 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 370 GNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 403
>gi|373122607|ref|ZP_09536469.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium 21_3]
gi|371663038|gb|EHO28230.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium 21_3]
Length = 575
Score = 52.0 bits (123), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/297 (26%), Positives = 96/297 (32%), Gaps = 29/297 (9%)
Query: 57 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
FT+ G T T + GAT T + GAT T GAT T G T T
Sbjct: 131 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTG 187
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLG 156
+ GA ++ GAT T + G T T + G
Sbjct: 188 PMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTG 247
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+T T + G+T +T GAT T G T T GA T G
Sbjct: 248 STGATGGIGPTGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATG 304
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T LT GA T G T T GA T G+T LT G
Sbjct: 305 NTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTG 364
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
AT T G T T GA +T GAT L S I+ P+ +
Sbjct: 365 ATGNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGAT---GATGLAGSSAIIPYSSGIPLSL 418
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/272 (25%), Positives = 82/272 (30%), Gaps = 27/272 (9%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + G+T T +G T G T T G T T + GA +
Sbjct: 138 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANGV 197
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK------------------VFTLGATELTAKVFT 106
+ GAT T + G T T + G+T T +
Sbjct: 198 SGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGP 257
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G+T +T GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 258 TGSTGVTGPT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGP 314
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
GA T G T T GA T G+T LT GAT T
Sbjct: 315 TGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT------GATGPTGATGN 368
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 369 TGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 400
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.74, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/264 (26%), Positives = 82/264 (31%), Gaps = 30/264 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T GAT T G T T + GA ++ G
Sbjct: 149 ATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTG 205
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAK------------------VFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
AT T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 206 ATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTG 265
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT T G T T GA T G T LT GA T
Sbjct: 266 PT---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTG 322
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
G T T GA T G+T LT GAT T GA T
Sbjct: 323 ADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT------GATGPTGATGNTGADGATG 376
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
GAT + GAT T
Sbjct: 377 PTGATGATGADGAIGVTGATGATG 400
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/397 (25%), Positives = 120/397 (30%), Gaps = 63/397 (15%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT V G T T G L G+T T
Sbjct: 39 GATGPTGSTGATGATGP--GVGATGPTGATGATGNTGPAGLRGNTGPTGSTGATGNT--- 93
Query: 120 GATELTAKVFTL-----GATELTAKV---FTLGATELTAKVFTL--GATELTAKVFTLGA 169
GAT +T V T+ G A V FT L +FT+ G T T + GA
Sbjct: 94 GATGMT-PVITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASL---LFTIPAGPTGPTGSTGSTGA 149
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T T + GAT T GAT T G T T + GA ++ GA
Sbjct: 150 TGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGA---NGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTGA 206
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVF------------------TLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
T T + G T T + G+T T + G+T +T
Sbjct: 207 TGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGP 266
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
GAT T G T T GA T G T LT
Sbjct: 267 T---GATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTG------------- 310
Query: 332 KIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 391
AT T + GA T G T G T T GAT T
Sbjct: 311 -------ATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPT 363
Query: 392 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GA T GAT + GAT T
Sbjct: 364 GATGNTGADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATG 400
>gi|395516040|ref|XP_003762204.1| PREDICTED: centlein-like, partial [Sarcophilus harrisii]
Length = 1602
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Composition-based stats.
Identities = 59/244 (24%), Positives = 119/244 (48%)
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
+L A++ T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ +
Sbjct: 1016 QLPAQLPAQIPTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSA 1075
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNS 338
+L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT S++ E +P S
Sbjct: 1076 QLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQVQLPAQS 1135
Query: 339 ATEL 342
+L
Sbjct: 1136 LIQL 1139
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Composition-based stats.
Identities = 64/253 (25%), Positives = 125/253 (49%), Gaps = 7/253 (2%)
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
+L A++ T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ +
Sbjct: 1016 QLPAQLPAQIPTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSA 1075
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
+L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT L A+V
Sbjct: 1076 QLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQV------ 1129
Query: 315 ELTAKSVI-LEVE 326
+L A+S+I L+VE
Sbjct: 1130 QLPAQSLIQLQVE 1142
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.010, Method: Composition-based stats.
Identities = 57/234 (24%), Positives = 114/234 (48%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+L A++ T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ +
Sbjct: 1016 QLPAQLPAQIPTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSA 1075
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
+L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT L A+V
Sbjct: 1076 QLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQV 1129
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.010, Method: Composition-based stats.
Identities = 57/234 (24%), Positives = 114/234 (48%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+L A++ T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ +
Sbjct: 1016 QLPAQLPAQIPTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSA 1075
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
+L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT L A+V
Sbjct: 1076 QLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQV 1129
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.010, Method: Composition-based stats.
Identities = 57/234 (24%), Positives = 114/234 (48%)
Query: 27 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 86
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+L A++ T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ +
Sbjct: 1016 QLPAQLPAQIPTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSA 1075
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
+L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT L A+V
Sbjct: 1076 QLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQV 1129
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.010, Method: Composition-based stats.
Identities = 57/234 (24%), Positives = 114/234 (48%)
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
+L A++ T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ +
Sbjct: 1016 QLPAQLPAQIPTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSA 1075
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
+L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT L A+V
Sbjct: 1076 QLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQV 1129
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.010, Method: Composition-based stats.
Identities = 57/234 (24%), Positives = 114/234 (48%)
Query: 51 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 110
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
+L A++ T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ +
Sbjct: 1016 QLPAQLPAQIPTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSA 1075
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
+L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT L A+V
Sbjct: 1076 QLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQV 1129
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.014, Method: Composition-based stats.
Identities = 56/223 (25%), Positives = 110/223 (49%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T+L A++
Sbjct: 907 TQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPTQLPARLPAQVP 966
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T+L A++
Sbjct: 967 TQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPTQLPAQLPAQIP 1026
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T+L ++ T+L A++ T+L+A++ T+L ++ + +L A++
Sbjct: 1027 TQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQIPTQLSARLPAQLPTQLPVQLPIQLSAQLPAQLPVQLP 1086
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
TE+ A++ T +L ++ T +LT L A+V
Sbjct: 1087 TEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSLVQPPELLPAQV 1129
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.12, Method: Composition-based stats.
Identities = 57/237 (24%), Positives = 114/237 (48%), Gaps = 14/237 (5%)
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
+L ++ T+L A++ +LTA++ T+L A+ T+L A++ T
Sbjct: 896 QLPVQLSAQAPTQLPAQLPIQLPIQLTAQLPAQIPTQLPARSPAQLPTQLPAQLPAQIPT 955
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
+L A++ T+L A++ AT+L A++ T+L A++ AT+L A++ T T
Sbjct: 956 QLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPAQVPTQLPAQLPAQIATQLPARLPTQVPT 1015
Query: 315 ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 374
+L A+ P +I P L A++ T +L A++ T+L+A++
Sbjct: 1016 QLPAQL---------PAQI-PTQLPKRLPAQLLTQLPAQLPAQI----PTQLSARLPAQL 1061
Query: 375 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
T+L ++ + +L A++ TE+ A++ T +L ++ T +LT ++
Sbjct: 1062 PTQLPVQLPIQLSAQLPAQLPVQLPTEIPAQLPTQPPAQLPIQLPTEFPAQLTTHSL 1118
>gi|296502973|ref|YP_003664673.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
BMB171]
gi|296324025|gb|ADH06953.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
BMB171]
Length = 315
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 51.2 bits (121), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 72/204 (35%), Gaps = 9/204 (4%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T GAT T + +
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/199 (27%), Positives = 70/199 (35%), Gaps = 9/199 (4%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T T G T T G T +T G T +T G T LT +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPT 207
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTA 318
GAT T GAT T
Sbjct: 208 GATGPTGITGPTGATGPTG 226
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/203 (26%), Positives = 71/203 (34%), Gaps = 9/203 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T G T +T G T +T G T +T G T +T + G
Sbjct: 38 PTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT---G 94
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T G
Sbjct: 95 ATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGITG 151
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G T T G T +T G T +T G T LT + G
Sbjct: 152 PTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---GVTGLTGETGPTG 208
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
AT T GAT T + +
Sbjct: 209 ATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/218 (25%), Positives = 72/218 (33%), Gaps = 23/218 (10%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G T T G T T G T +T + AT T
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT-----------------GATGPTGITG 193
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 385
G T LT + GAT T GAT T + +
Sbjct: 194 LTGVTGLTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/218 (27%), Positives = 78/218 (35%), Gaps = 23/218 (10%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + GAT T ++
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRT---GATGPTGET--- 144
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
P I AT T GAT T + G T T G T LT
Sbjct: 145 -----GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT---- 195
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T LT + GAT T GAT T + +
Sbjct: 196 --GVTGLTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/218 (25%), Positives = 73/218 (33%), Gaps = 23/218 (10%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T + G T +T G T +T + G T +T + G T T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGIT 150
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G T T + I T T G T +T G T +T
Sbjct: 151 GPTGATGPTGIT--------------GPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLT- 195
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 409
G T LT + GAT T GAT T + +
Sbjct: 196 --GVTGLTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI 231
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/213 (26%), Positives = 74/213 (34%), Gaps = 35/213 (16%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRT--- 93
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
GAT T + G T +T G T +T + G T +T ++
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRT--------------- 135
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
AT T + G T +T G T +T GAT T + G T T
Sbjct: 136 --GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPT---GATGPTGETGPTGITGPTGATG 187
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
G T LT G T LT + GAT T
Sbjct: 188 PTGITGLT------GVTGLTGETGPTGATGPTG 214
>gi|254976827|ref|ZP_05273299.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-66c26]
gi|255315967|ref|ZP_05357550.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-76w55]
gi|255518624|ref|ZP_05386300.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-97b34]
gi|260684773|ref|YP_003216058.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile CD196]
gi|260688431|ref|YP_003219565.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile R20291]
gi|384362444|ref|YP_006200296.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile BI1]
gi|260210936|emb|CBA66179.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile CD196]
gi|260214448|emb|CBE06900.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile R20291]
Length = 546
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/332 (25%), Positives = 99/332 (29%), Gaps = 42/332 (12%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T G T T GA +T +GAT +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGATGA---NGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTGST 76
Query: 84 ---------GATELTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GA +T GAT +T GAT GAT T
Sbjct: 77 GPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGIT 136
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T GAT LT GA +T GAT G T T
Sbjct: 137 GPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGAN------GVTGATGPTGNT 190
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------------------- 232
GAT T + GA +T +GAT T V G L
Sbjct: 191 GATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLV 250
Query: 233 --TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
T GA L GAT + + GA T GA T GA
Sbjct: 251 GPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGAN 310
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
T +GAT +G T T + +
Sbjct: 311 GATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGV 342
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/335 (25%), Positives = 101/335 (30%), Gaps = 26/335 (7%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T G T T GA +T +GAT +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGATGA---NGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTGST 76
Query: 168 ---------GATELTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GA +T GAT +T GAT GAT T
Sbjct: 77 GPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGIT 136
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T GAT LT GA +T GAT G T T
Sbjct: 137 GPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGAN------GVTGATGPTGNT 190
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
GAT T + GA +T +GAT T V G L + P
Sbjct: 191 GATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPDGL-----VGPTGPTGPTGATG 245
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
N T GA L GAT + + GA T GA T
Sbjct: 246 ANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATG 305
Query: 396 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKN 430
GA T +GAT +G T T N
Sbjct: 306 ATGANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGAN 340
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/316 (26%), Positives = 99/316 (31%), Gaps = 36/316 (11%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATEL 52
T T GA +T +GAT + GA +T GAT
Sbjct: 43 TGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT-- 100
Query: 53 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 112
GA +T GAT GAT T G T T GAT L
Sbjct: 101 -------GANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGL 153
Query: 113 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 172
T GA +T GAT G T T GAT T + GA +
Sbjct: 154 TGATGATGANGITGPTGATGATGAN------GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGV 207
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
T +GAT T V G L T GA L GAT V
Sbjct: 208 TGATGPIGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGP 267
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
GAT T +G T +GAT T +G T T GAT T V
Sbjct: 268 TGATGATGVAGAIGPTGA------VGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGA 321
Query: 287 LGATELTAKVFTLGAT 302
GA + + G T
Sbjct: 322 TGANGVAGPIGPTGPT 337
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/316 (26%), Positives = 99/316 (31%), Gaps = 36/316 (11%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATEL 64
T T GA +T +GAT + GA +T GAT
Sbjct: 43 TGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT-- 100
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
GA +T GAT GAT T G T T GAT L
Sbjct: 101 -------GANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGL 153
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T GA +T GAT G T T GAT T + GA +
Sbjct: 154 TGATGATGANGITGPTGATGATGAN------GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGV 207
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
T +GAT T V G L T GA L GAT V
Sbjct: 208 TGATGPIGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGP 267
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT T +G T +GAT T +G T T GAT T V
Sbjct: 268 TGATGATGVAGAIGPTGA------VGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGA 321
Query: 299 LGATELTAKVFTLGAT 314
GA + + G T
Sbjct: 322 TGANGVAGPIGPTGPT 337
>gi|165869802|ref|ZP_02214460.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0488]
gi|167638181|ref|ZP_02396459.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0193]
gi|177651110|ref|ZP_02933941.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0174]
gi|190568327|ref|ZP_03021235.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Tsiankovskii-I]
gi|227817518|ref|YP_002817527.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. CDC 684]
gi|254736838|ref|ZP_05194544.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Western North America USA6153]
gi|254754529|ref|ZP_05206564.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Vollum]
gi|164714631|gb|EDR20150.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0488]
gi|167513998|gb|EDR89366.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0193]
gi|172082936|gb|EDT67998.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0174]
gi|190560583|gb|EDV14560.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Tsiankovskii-I]
gi|227004119|gb|ACP13862.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. CDC 684]
Length = 763
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 422 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 481
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 482 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 541
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
GAT T + G T T G T T + GAT +T G+T T
Sbjct: 542 GATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGSTGATG 596
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 422 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 481
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 482 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 541
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT T + G T T G T T + GAT +T G+T T
Sbjct: 542 GATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGSTGATG 596
Score = 50.8 bits (120), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 422 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 481
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 482 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 541
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
GAT T + G T T G T T + GAT +T G+T T
Sbjct: 542 GATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGSTGATG 596
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 64/185 (34%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T T + G+T T G+T +T +G+T GAT T ++GA
Sbjct: 421 TGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGST---------GATGETGPTGSMGA 471
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T T G T T GAT T GAT T G T T G
Sbjct: 472 TGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGV 531
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T T GAT T + G T T G T T + GAT +T G+
Sbjct: 532 TGSTGPTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGS 591
Query: 254 TELTA 258
T T
Sbjct: 592 TGATG 596
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/229 (24%), Positives = 71/229 (31%), Gaps = 33/229 (14%)
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------------------------- 155
+T G+T +T G+T T +
Sbjct: 357 VTGNTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPIGETGGTGSTGPTGETGGTGSTGVTGSTG 416
Query: 156 -----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 417 VTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTG 476
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 477 ATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTG 536
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT T + G T T G T T + GAT +T
Sbjct: 537 PTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN 585
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/192 (26%), Positives = 66/192 (34%), Gaps = 20/192 (10%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 422 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 481
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G T T GAT T GAT T G T T +
Sbjct: 482 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPT--------------- 526
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTA 392
T +T G T T + G+T +T + G T T + GAT +T
Sbjct: 527 --GETGVTGSTGPTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTG 584
Query: 393 KVFTLGATELTA 404
G+T T
Sbjct: 585 NTGPTGSTGATG 596
>gi|355672101|ref|ZP_09058257.1| hypothetical protein HMPREF9469_01294, partial [Clostridium
citroniae WAL-17108]
gi|354815386|gb|EHE99979.1| hypothetical protein HMPREF9469_01294, partial [Clostridium
citroniae WAL-17108]
Length = 336
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/222 (28%), Positives = 77/222 (34%), Gaps = 6/222 (2%)
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+ GAT +T +GAT T G T T + GA+ T GAT T
Sbjct: 101 PTGSTGATGVTGATGAIGATGPTGA---DGVTGPTGAIGATGASGATGPTGPTGATGSTG 157
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
++G T T G T T GAT T +G T T + G T
Sbjct: 158 STGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGATGAIGPTGPTGADG 217
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
+ GAT T GAT GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 218 ATGSTGATGPTGANGADGATGAIGPTGAAGATGPTGLTGAAGATGPTGATGVAGATGPTG 277
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILE 324
G T GAT +T GAT TA S+ +
Sbjct: 278 VTGPTGPTGAAGATGPTGATGVT---GVAGATGPTAPSIYAQ 316
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/217 (29%), Positives = 74/217 (34%), Gaps = 6/217 (2%)
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
+ GAT +T +GAT T G T T + GA+ T GAT T
Sbjct: 101 PTGSTGATGVTGATGAIGATGPTGA---DGVTGPTGAIGATGASGATGPTGPTGATGSTG 157
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
++G T T G T T GAT T +G T T + G T
Sbjct: 158 STGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGATGAIGPTGPTGADG 217
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+ GAT T GAT GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 218 ATGSTGATGPTGANGADGATGAIGPTGAAGATGPTGLTGAAGATGPTGATGVAGATGPTG 277
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
G T GAT +T GAT TA
Sbjct: 278 VTGPTGPTGAAGATGPTGATGVT---GVAGATGPTAP 311
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/229 (28%), Positives = 78/229 (34%), Gaps = 18/229 (7%)
Query: 31 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 90
+ GAT +T +GAT T GA +T +GAT GA+ T
Sbjct: 101 PTGSTGATGVTGATGAIGATGPT------GADGVTGPTGAIGAT---------GASGATG 145
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
GAT T ++G T T G T T GAT T +G T T
Sbjct: 146 PTGPTGATGSTGSTGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGATG 205
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ G T + GAT T GAT GAT T GAT T
Sbjct: 206 AIGPTGPTGADGATGSTGATGPTGANGADGATGAIGPTGAAGATGPTGLTGAAGATGPTG 265
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
GAT T G T GAT +T GAT TA
Sbjct: 266 ATGVAGATGPTGVTGPTGPTGAAGATGPTGATGVT---GVAGATGPTAP 311
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/229 (28%), Positives = 78/229 (34%), Gaps = 18/229 (7%)
Query: 43 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
+ GAT +T +GAT T GA +T +GAT GA+ T
Sbjct: 101 PTGSTGATGVTGATGAIGATGPT------GADGVTGPTGAIGAT---------GASGATG 145
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT T ++G T T G T T GAT T +G T T
Sbjct: 146 PTGPTGATGSTGSTGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGATG 205
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+ G T + GAT T GAT GAT T GAT T
Sbjct: 206 AIGPTGPTGADGATGSTGATGPTGANGADGATGAIGPTGAAGATGPTGLTGAAGATGPTG 265
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
GAT T G T GAT +T GAT TA
Sbjct: 266 ATGVAGATGPTGVTGPTGPTGAAGATGPTGATGVT---GVAGATGPTAP 311
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/223 (29%), Positives = 76/223 (34%), Gaps = 18/223 (8%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T +GAT T GA +T +GAT GA+ T G
Sbjct: 107 ATGVTGATGAIGATGPT------GADGVTGPTGAIGAT---------GASGATGPTGPTG 151
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T ++G T T G T T GAT T +G T T + G
Sbjct: 152 ATGSTGSTGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGATGAIGPTG 211
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T + GAT T GAT GAT T GAT T G
Sbjct: 212 PTGADGATGSTGATGPTGANGADGATGAIGPTGAAGATGPTGLTGAAGATGPTGATGVAG 271
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
AT T G T GAT +T GAT TA
Sbjct: 272 ATGPTGVTGPTGPTGAAGATGPTGATGVT---GVAGATGPTAP 311
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/233 (27%), Positives = 77/233 (33%), Gaps = 20/233 (8%)
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
+ GAT +T +GAT T G T T + GA+ T GAT T
Sbjct: 101 PTGSTGATGVTGATGAIGATGPTGA---DGVTGPTGAIGATGASGATGPTGPTGATGSTG 157
Query: 259 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
++G T T G T T GAT T +G T T + G T A
Sbjct: 158 STGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGATGAIGPTGPTG--A 215
Query: 319 KSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 378
P N A T + GA T G T LT G T
Sbjct: 216 DGATGSTGATGPTGA---NGADGATGAIGPTGAAGAT------GPTGLTGAAGATGPTGA 266
Query: 379 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
T G T +T GA T GAT +T GAT TA +I
Sbjct: 267 TGVAGATGPTGVTGPTGPTGAAGATGPT---GATGVT---GVAGATGPTAPSI 313
>gi|228954796|ref|ZP_04116816.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. T03a001]
gi|423502801|ref|ZP_17479393.1| hypothetical protein IG1_00367 [Bacillus cereus HD73]
gi|449091478|ref|YP_007423919.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. HD73]
gi|228804785|gb|EEM51384.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. T03a001]
gi|402459766|gb|EJV91497.1| hypothetical protein IG1_00367 [Bacillus cereus HD73]
gi|449025235|gb|AGE80398.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. HD73]
Length = 594
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/247 (27%), Positives = 87/247 (35%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G+T T G+T T + G T T + G+T T + G
Sbjct: 134 ATGPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTG 193
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T + GAT T + G+T T G+T +T G+T T + G
Sbjct: 194 PTGATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTG 253
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+T T GAT T + G+T T G T T + G T T + G
Sbjct: 254 STGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGSTG 313
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T T GAT T G+T T GAT T GAT T G
Sbjct: 314 PTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTG 373
Query: 301 ATELTAK 307
T T
Sbjct: 374 PTGATGP 380
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/247 (26%), Positives = 83/247 (33%), Gaps = 12/247 (4%)
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
AT T G+T T G+T T + G T T + G+T T + G
Sbjct: 134 ATGPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTG 193
Query: 145 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
T T + GAT T + G+T +T G+T T + G
Sbjct: 194 PTGATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTG 253
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
+T T GAT T + G+T T G T T + G T T + G
Sbjct: 254 STGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGSTG 313
Query: 253 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
T T GAT T G+T T GAT T GAT T G
Sbjct: 314 PTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTG 373
Query: 313 ATELTAK 319
T T
Sbjct: 374 PTGATGP 380
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.090, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/341 (25%), Positives = 110/341 (32%), Gaps = 33/341 (9%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LG T T + GAT T G+T T GAT T G+T T
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGATGATGSTGATGPTGSTGPTGSTGP 95
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
G+T T GAT T G T T GAT T G+T T
Sbjct: 96 TGSTGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGPTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGP 155
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
G+T T + G T T + G+T T + G T T + GAT T +
Sbjct: 156 TGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGATGS 215
Query: 191 L------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---------- 228
G+T +T G+T T + G+T T G
Sbjct: 216 TGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGS 275
Query: 229 -----------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
AT T +GAT T G+T T + G T T + GA
Sbjct: 276 TGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGPTGATGPTGSTGA 335
Query: 278 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
T T G T T + G T T + G T T
Sbjct: 336 TGSTGSTGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTG 376
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/249 (26%), Positives = 84/249 (33%), Gaps = 8/249 (3%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T T + G T T G+T T + GAT T
Sbjct: 136 GPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPT 195
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T GAT T + G+T T G+T +T G+T T +
Sbjct: 196 GATGPTGST---GATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGST 252
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
G+T T GAT T + AT T +GAT T
Sbjct: 253 GSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTG-----ATGPTGSTGPIGATGPTGATG 307
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
G+T T + G T T + GAT T G T T + G T T
Sbjct: 308 PTGSTGPTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTG 367
Query: 420 TLGATELTA 428
+ G T T
Sbjct: 368 STGPTGPTG 376
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/267 (23%), Positives = 82/267 (30%), Gaps = 41/267 (15%)
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
AT T G+T T G+T T + G T T + G+T T + G
Sbjct: 134 ATGPTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTG 193
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
T T + GAT T + G+T T G+T +T G+T T + G
Sbjct: 194 PTGATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTG 253
Query: 253 ATELTAKVFTLGA---------------------TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
+T T GA T T +GAT T G+T
Sbjct: 254 STGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGSTG 313
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGA 351
T + G T T + GAT T T T G
Sbjct: 314 PTGATGSTGPTGATGPTGSTGATGSTGS--------------------TGATGPTGATGP 353
Query: 352 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 378
T T G+T T GAT
Sbjct: 354 TGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGATGP 380
>gi|386738627|ref|YP_006211808.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. H9401]
gi|384388479|gb|AFH86140.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. H9401]
Length = 728
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 387 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 446
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 447 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 506
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
GAT T + G T T G T T + GAT +T G+T T
Sbjct: 507 GATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGSTGATG 561
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 387 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 446
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 447 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 506
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT T + G T T G T T + GAT +T G+T T
Sbjct: 507 GATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGSTGATG 561
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 387 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 446
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 447 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 506
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
GAT T + G T T G T T + GAT +T G+T T
Sbjct: 507 GATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGSTGATG 561
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 64/185 (34%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T T + G+T T G+T +T +G+T GAT T ++GA
Sbjct: 386 TGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGST---------GATGETGPTGSMGA 436
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T T G T T GAT T GAT T G T T G
Sbjct: 437 TGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGV 496
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T T GAT T + G T T G T T + GAT +T G+
Sbjct: 497 TGSTGPTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGS 556
Query: 254 TELTA 258
T T
Sbjct: 557 TGATG 561
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/229 (24%), Positives = 71/229 (31%), Gaps = 33/229 (14%)
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------------------------- 155
+T G+T +T G+T T +
Sbjct: 322 VTGNTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPIGETGGTGSTGPTGETGGTGSTGVTGSTG 381
Query: 156 -----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 382 VTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTG 441
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 442 ATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTG 501
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT T + G T T G T T + GAT +T
Sbjct: 502 PTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN 550
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/181 (27%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 10/181 (5%)
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 387 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 446
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEV-EYYKPIKIVPQNSATELTAKV 346
G T T GAT T GAT T + V P T +T
Sbjct: 447 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTG------ETGVTGST 500
Query: 347 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 403
G T T + G+T +T + G T T + GAT +T G+T T
Sbjct: 501 GPTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGNTGPTGSTGAT 560
Query: 404 A 404
Sbjct: 561 G 561
>gi|209523568|ref|ZP_03272122.1| uncharacterized protein with threonine repeats [Arthrospira
maxima CS-328]
gi|209495973|gb|EDZ96274.1| uncharacterized protein with threonine repeats [Arthrospira
maxima CS-328]
Length = 96
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 82
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 46/86 (53%)
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 287 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/89 (34%), Positives = 46/89 (51%)
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEY 327
LG+T +T LG+T +TAK + Y
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVGFHY 90
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/81 (37%), Positives = 44/81 (54%)
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 409 LGATELTAKVFTLGATELTAK 429
LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 62 LGSTTVTENPLMLGSTTVTAK 82
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/84 (34%), Positives = 44/84 (52%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG
Sbjct: 4 STTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLG 63
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 84
+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 64 STTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/84 (34%), Positives = 44/84 (52%)
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG
Sbjct: 4 STTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLG 63
Query: 399 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 64 STTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
>gi|297622009|ref|YP_003710146.1| hypothetical protein wcw_1801 [Waddlia chondrophila WSU 86-1044]
gi|297377310|gb|ADI39140.1| hypothetical protein wcw_1801 [Waddlia chondrophila WSU 86-1044]
Length = 440
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/211 (29%), Positives = 83/211 (39%), Gaps = 9/211 (4%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKV 68
G T +GAT T +V +G T T A V + GAT T +GAT T +
Sbjct: 125 GPRGPTGPTGPVGATGATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGET 184
Query: 69 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
++G T T G T +G T T +V +G T T V GAT +
Sbjct: 185 GSIGPTGPTGAAGIDGVDGATGP---MGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAI 241
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELT 185
G T + GAT T +GAT T + +G T T A V + GAT T
Sbjct: 242 GPTGPTGVAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPT 301
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
+GAT T + +G T +G
Sbjct: 302 GPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPAGPTGPIG 332
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/211 (29%), Positives = 83/211 (39%), Gaps = 9/211 (4%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKV 80
G T +GAT T +V +G T T A V + GAT T +GAT T +
Sbjct: 125 GPRGPTGPTGPVGATGATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGET 184
Query: 81 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 140
++G T T G T +G T T +V +G T T V GAT +
Sbjct: 185 GSIGPTGPTGAAGIDGVDGATGP---MGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAI 241
Query: 141 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELT 197
G T + GAT T +GAT T + +G T T A V + GAT T
Sbjct: 242 GPTGPTGVAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPT 301
Query: 198 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
+GAT T + +G T +G
Sbjct: 302 GPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPAGPTGPIG 332
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/211 (29%), Positives = 83/211 (39%), Gaps = 9/211 (4%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKV 92
G T +GAT T +V +G T T A V + GAT T +GAT T +
Sbjct: 125 GPRGPTGPTGPVGATGATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGET 184
Query: 93 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 152
++G T T G T +G T T +V +G T T V GAT +
Sbjct: 185 GSIGPTGPTGAAGIDGVDGATGP---MGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAI 241
Query: 153 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELT 209
G T + GAT T +GAT T + +G T T A V + GAT T
Sbjct: 242 GPTGPTGVAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPT 301
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+GAT T + +G T +G
Sbjct: 302 GPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPAGPTGPIG 332
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/206 (29%), Positives = 82/206 (39%), Gaps = 9/206 (4%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +GAT T +V +G T T A V + GAT T +GAT T + ++G
Sbjct: 130 TGPTGPVGATGATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGETGSIGP 189
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T G T +G T T +V +G T T V GAT + G
Sbjct: 190 TGPTGAAGIDGVDGATGP---MGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGP 246
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFT 178
T + GAT T +GAT T + +G T T A V + GAT T
Sbjct: 247 TGVAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPTGPTGP 306
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
+GAT T + +G T +G
Sbjct: 307 VGATGATGEAGAIGPTGPAGPTGPIG 332
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/198 (29%), Positives = 79/198 (39%), Gaps = 9/198 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 57
AT T +V +G T T A V + GAT T +GAT T + ++G T T
Sbjct: 138 ATGATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGETGSIGPTGPTGAAG 197
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
G T +G T T +V +G T T V GAT + G T +
Sbjct: 198 IDGVDGATGP---MGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGVAGVDG 254
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT T +GAT T + +G T T A V + GAT T +GAT T
Sbjct: 255 IDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPTGPTGPVGATGATG 314
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLG 192
+ +G T +G
Sbjct: 315 EAGAIGPTGPAGPTGPIG 332
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/234 (26%), Positives = 86/234 (36%), Gaps = 29/234 (12%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT--AKVFTL-GATELTAKVFTLGATELTAKV 248
G T +GAT T +V +G T T A V + GAT T +GAT T +
Sbjct: 125 GPRGPTGPTGPVGATGATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGET 184
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
++G T T G T +G T T +V +G T T V GAT T +
Sbjct: 185 GSIGPTGPTGAAGIDGVDGATGP---MGPTGATGEVGAIGPTGPTGPV---GATGATGEA 238
Query: 309 FTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 368
+G T T + + ++ AT T +GAT T + +G T T
Sbjct: 239 GAIGPTGPTGVAGVDGID-----------GATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTG 287
Query: 369 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
G GAT T +GAT T + +G T +G
Sbjct: 288 AAGVDGVD---------GATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPAGPTGPIG 332
>gi|350422357|ref|XP_003493139.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: papilin-like [Bombus impatiens]
Length = 2962
Score = 50.4 bits (119), Expect = 0.002, Method: Composition-based stats.
Identities = 87/323 (26%), Positives = 121/323 (37%), Gaps = 30/323 (9%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK--VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GATE + + G+TE T + GATE T + V T + GAT
Sbjct: 954 GATEESTES---GSTEPTMSTES-GATEETTESGVMTESTPIEITESTEYGATTEPGATT 1009
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT +A GAT +A ATE+T + GATE+T + GAT +
Sbjct: 1010 ESGATAESAATTEPGATTESA------ATEITESTES-GATEVTESTES-GATTESGATT 1061
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
GAT + GAT + GAT + GAT + AT
Sbjct: 1062 ESGATTESGATTESGATTESGATIESGATTESGATTESGATTESGATTESAATTEPGTTI 1121
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGA-TELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATEL-----TAKVFTLGA 351
GAT + GA TE T E+ P + TE K T
Sbjct: 1122 ESGATTESGATTESGATTESTESGATTEITESGPTETTESGMTTESGMTTEPGKTMT-EQ 1180
Query: 352 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
T ++ + GAT + + GAT + + G T+ T T E ++V
Sbjct: 1181 TTVSGETTESGATTESGETTESGATTESGETTMSGVTDTTVSGLTPITEEAKSEV----- 1235
Query: 412 TELTAKVF----TLGATELTAKN 430
TE ++F T+G E T K+
Sbjct: 1236 TEKIDRLFGFWTTIGPEETTRKH 1258
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.12, Method: Composition-based stats.
Identities = 66/241 (27%), Positives = 91/241 (37%), Gaps = 20/241 (8%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
ATE+T + GATE+T + GAT + GAT + GAT + G
Sbjct: 1031 ATEITESTES-GATEVTESTES-GATTESGATTESGATTESGATTESGATTESGATIESG 1088
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT + GAT + AT GAT + GAT T +
Sbjct: 1089 ATTESGATTESGATTESGATTESAATTEPGTTIESGATTESGATTESGAT--TESTESGA 1146
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
TE+T G TE T T G T K T T ++ + GAT + +
Sbjct: 1147 TTEITES----GPTETTESGMTTESGMTTEPGKTMT-EQTTVSGETTESGATTESGETTE 1201
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF----TLGATELTA 234
GAT + + G T+ T T E ++V TE ++F T+G E T
Sbjct: 1202 SGATTESGETTMSGVTDTTVSGLTPITEEAKSEV-----TEKIDRLFGFWTTIGPEETTR 1256
Query: 235 K 235
K
Sbjct: 1257 K 1257
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.9, Method: Composition-based stats.
Identities = 64/246 (26%), Positives = 89/246 (36%), Gaps = 34/246 (13%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK--VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 261
GATE + + G+TE T + GATE T + V T + GAT
Sbjct: 954 GATEESTES---GSTEPTMSTES-GATEETTESGVMTESTPIEITESTEYGATTEPGATT 1009
Query: 262 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
GAT +A GAT +A ATE+T + GATE+T + TE A +
Sbjct: 1010 ESGATAESAATTEPGATTESA------ATEITESTES-GATEVTESTESGATTESGATT- 1061
Query: 322 ILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 381
++ AT + GAT + GAT + GAT +
Sbjct: 1062 --------------ESGATTESGATTESGATTESGATIESGATTESGATTESGATTESGA 1107
Query: 382 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE------LTAKVFTLGATELTAKNIRSNT 435
AT GAT + GAT T ++ G TE T + + +
Sbjct: 1108 TTESAATTEPGTTIESGATTESGATTESGATTESTESGATTEITESGPTETTESGMTTES 1167
Query: 436 GTVGSP 441
G P
Sbjct: 1168 GMTTEP 1173
>gi|342186240|emb|CCC95726.1| unnamed protein product [Trypanosoma congolense IL3000]
Length = 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 123 ELTAK 127
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 135 ELTAK 139
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 27 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 86
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 147 ELTAK 151
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 159 ELTAK 163
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 51 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 110
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 171 ELTAK 175
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 183 ELTAK 187
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 195 ELTAK 199
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 207 ELTAK 211
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 219 ELTAK 223
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 231 ELTAK 235
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 243 ELTAK 247
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 255 ELTAK 259
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 267 ELTAK 271
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 279 ELTAK 283
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 291 ELTAK 295
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 303 ELTAK 307
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
Score = 50.1 bits (118), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 59/125 (47%)
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
++ ++V L + E GA+ TA+ F+ A +T GA+ TA+ F+ A
Sbjct: 103 KMHSQVIQLQSCESHRSARIQGASGSTARRFSCRAASVTEVARIQGASGSTARRFSCRAA 162
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
+T GA+ TA+ F+ + +T + GA+ TA F+ + +T + GA+
Sbjct: 163 RVTEVARIQGASGSTARRFSCRSARVTEATWIQGASRCTAGRFSCRSARVTEATWIQGAS 222
Query: 315 ELTAK 319
TA+
Sbjct: 223 RCTAR 227
>gi|229098983|ref|ZP_04229918.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-29]
gi|228684481|gb|EEL38424.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-29]
Length = 342
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/173 (31%), Positives = 65/173 (37%), Gaps = 3/173 (1%)
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
T GAT T + GAT T G T T G T T S+
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGATGTSI 208
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 29 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 88
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 148
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 41 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 100
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 160
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 53 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 112
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 113 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 172
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 77 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 136
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 137 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 196
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 197 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 89 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 148
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 160
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 220
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 113 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 172
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 233 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGS 155
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
T GAT T + GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 156 TGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 206
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 10/182 (5%)
Query: 17 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 76
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGP 95
Query: 77 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 136
T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT
Sbjct: 96 TGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGIT------GATGP 149
Query: 137 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 196
T + GAT +T GAT T G T T GAT T G T +
Sbjct: 150 TGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGATG-TSI 208
Query: 197 TA 198
TA
Sbjct: 209 TA 210
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.058, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/157 (32%), Positives = 61/157 (38%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
K+ G T T + GAT T + GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 35 KLGPTGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATG 94
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 95 PT---GATGIT------GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITG 145
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 146 ATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGP 182
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/174 (32%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 10/174 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T + GAT T + GAT T GAT T G
Sbjct: 47 ATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITG 103
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT +T G T +T GAT T + G
Sbjct: 104 ATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGIT------GATGPTGATGSTG 157
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
AT +T GAT T G T T GAT T G T +TA
Sbjct: 158 ATGITGATGPTGATGSTGATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGATG-TSITA 210
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 66/185 (35%), Gaps = 11/185 (5%)
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
K+ G T T + GAT T + GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 35 KLGPTGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATG 94
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
GAT +T + I P AT +T GAT +T G T +
Sbjct: 95 PT---GATGITGATGITGAT--GPTG------ATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGI 143
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
T GAT T GAT T + GAT T G T T G T
Sbjct: 144 TGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 203
Query: 427 TAKNI 431
T +I
Sbjct: 204 TGTSI 208
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/206 (29%), Positives = 73/206 (35%), Gaps = 30/206 (14%)
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
K+ G T T + GAT T + GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 35 KLGPTGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATG 94
Query: 259 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G T +T
Sbjct: 95 PT---GATGIT------GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITG 145
Query: 319 KSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 378
AT T + GAT +T GAT T G T
Sbjct: 146 --------------------ATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPTGA 185
Query: 379 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 404
T GAT T G T +TA
Sbjct: 186 TGITGPTGATGDTGPTGATG-TSITA 210
>gi|70725041|ref|YP_251955.1| hypothetical protein SH0040 [Staphylococcus haemolyticus JCSC1435]
gi|68445765|dbj|BAE03349.1| unnamed protein product [Staphylococcus haemolyticus JCSC1435]
Length = 1563
Score = 49.7 bits (117), Expect = 0.003, Method: Composition-based stats.
Identities = 67/270 (24%), Positives = 92/270 (34%)
Query: 51 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 110
++T +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 90 DVTKDTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 149
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 150 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 209
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 210 EEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 269
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 270 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 329
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
E A +TE A +TE A +
Sbjct: 330 EEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANT 359
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Composition-based stats.
Identities = 67/268 (25%), Positives = 91/268 (33%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
++T +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 90 DVTKDTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 149
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 150 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 209
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 210 EEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 269
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 270 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 329
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
E A +TE A +TE A
Sbjct: 330 EEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKA 357
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Composition-based stats.
Identities = 67/268 (25%), Positives = 91/268 (33%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
++T +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 90 DVTKDTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 149
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 150 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 209
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 210 EEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 269
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 270 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 329
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
E A +TE A +TE A
Sbjct: 330 EEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKA 357
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Composition-based stats.
Identities = 67/268 (25%), Positives = 91/268 (33%)
Query: 27 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 86
++T +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 90 DVTKDTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 149
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 150 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 209
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 210 EEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 269
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 270 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 329
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
E A +TE A +TE A
Sbjct: 330 EEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKA 357
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Composition-based stats.
Identities = 67/268 (25%), Positives = 91/268 (33%)
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
++T +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 90 DVTKDTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 149
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 150 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 209
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 210 EEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 269
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 270 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQAST 329
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
E A +TE A +TE A
Sbjct: 330 EEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKA 357
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Composition-based stats.
Identities = 66/258 (25%), Positives = 88/258 (34%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+TE A +TE A +TE A +TE A +TE A
Sbjct: 100 STEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQA 159
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
+TE A +TE A +TE A +TE A +TE A
Sbjct: 160 STEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQA 219
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+TE A +TE A +TE A +TE A +TE A
Sbjct: 220 STEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQA 279
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+TE A +TE A +TE A +TE A +TE A
Sbjct: 280 STEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQA 339
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTA 258
+TE A +TE A
Sbjct: 340 STEEKADTTEQASTEEKA 357
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.33, Method: Composition-based stats.
Identities = 67/282 (23%), Positives = 94/282 (33%), Gaps = 14/282 (4%)
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
++T +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 90 DVTKDTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 149
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +T
Sbjct: 150 EEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQAST 209
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVE 326
E A +TE A +TE A +TE A +TE A +
Sbjct: 210 EEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKANTT----- 264
Query: 327 YYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 386
+ ++TE A +TE A +TE A +TE A
Sbjct: 265 ---------EQASTEEKADTTEQASTEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQA 315
Query: 387 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
+TE A +TE A +TE A +TE A
Sbjct: 316 STEEKANTTEQASTEEKADTTEQASTEEKADTTEQASTEEKA 357
>gi|321311377|ref|YP_004203664.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus subtilis
BSn5]
gi|320017651|gb|ADV92637.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus subtilis
BSn5]
Length = 650
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 6/232 (2%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G T LT G T T + G T T + G T T + G+T LT
Sbjct: 296 GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLT 355
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G+T T GAT T G T LT G T T + G T T +
Sbjct: 356 GSTGPTGPTGETGATGSTGLT---GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGST 412
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + G+T LT G+T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 413 GPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGATGVTGATGET 472
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
GAT T GAT T + G T +T GAT +T + GA
Sbjct: 473 GATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTGVTGPT---GATGVTGPTGSTGANP 521
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 6/232 (2%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G T LT G T T + G T T + G T T + G+T LT
Sbjct: 296 GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLT 355
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G+T T GAT T G T LT G T T + G T T +
Sbjct: 356 GSTGPTGPTGETGATGSTGLT---GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGST 412
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + G+T LT G+T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 413 GPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGATGVTGATGET 472
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
GAT T GAT T + G T +T GAT +T + GA
Sbjct: 473 GATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTGVTGPT---GATGVTGPTGSTGANP 521
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 6/232 (2%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T LT G T T + G T T + G T T + G+T LT
Sbjct: 296 GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLT 355
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T GAT T G T LT G T T + G T T +
Sbjct: 356 GSTGPTGPTGETGATGSTGLT---GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGST 412
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G+T LT G+T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 413 GPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGATGVTGATGET 472
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
GAT T GAT T + G T +T GAT +T + GA
Sbjct: 473 GATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTGVTGPT---GATGVTGPTGSTGANP 521
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/232 (29%), Positives = 85/232 (36%), Gaps = 6/232 (2%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T LT G T T + G T T + G T T + G+T LT
Sbjct: 296 GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLT 355
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G+T T GAT T G T LT G T T + G T T +
Sbjct: 356 GSTGPTGPTGETGATGSTGLT---GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGST 412
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + G+T LT G+T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 413 GPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGATGVTGATGET 472
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
GAT T GAT T + G T +T GAT +T + GA
Sbjct: 473 GATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTGVTGPT---GATGVTGPTGSTGANP 521
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/244 (29%), Positives = 90/244 (36%), Gaps = 12/244 (4%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G+T LT G+T T GAT T G T LT G T T +
Sbjct: 290 GSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLT---GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGST 346
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + G T T + G+T LT G T LT G T T +
Sbjct: 347 GLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLT------GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGST 400
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + G T T + G+T LT G+T T GAT +T
Sbjct: 401 GLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGAT 460
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT +T GAT T GAT T + G T +T GAT +T +
Sbjct: 461 GATGVTGATGETGATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTGVTGPT---GATGVTGPTGST 517
Query: 312 GATE 315
GA
Sbjct: 518 GANP 521
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/226 (28%), Positives = 79/226 (34%), Gaps = 11/226 (4%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G+T LT G+T T GAT T G T LT G T T +
Sbjct: 290 GSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLT---GPTGLTGSTGPTGPTGETGATGST 346
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
G T T + G T T + G+T LT G+T T GAT T
Sbjct: 347 GLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTG----- 401
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
P + T T + G+T LT G+T T GAT +T
Sbjct: 402 ---LTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTG 458
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
GAT +T GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 459 ATGATGVTGATGETGATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTGVTGP 504
>gi|328770683|gb|EGF80724.1| hypothetical protein BATDEDRAFT_88400 [Batrachochytrium
dendrobatidis JAM81]
Length = 1164
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTA 150
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 82
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTA 162
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTA 174
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTA 186
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTA 198
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTA 210
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTA 222
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTA 234
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTA 246
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A
Sbjct: 164 PGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASA 223
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T
Sbjct: 224 PGTTDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGT 283
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTA 258
G T+ T G + +A
Sbjct: 284 PGTTDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/137 (29%), Positives = 58/137 (42%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A G
Sbjct: 167 TDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGT 226
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T+ TA T G T+ TA T G T+ T G + +A T G + +A T G
Sbjct: 227 TDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPTPGASAPGTADASAGAGTPGTADASAGAGTPGT 286
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTA 138
T+ T G + +A
Sbjct: 287 TDPTPGASAPGTADASA 303
Score = 38.1 bits (87), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/88 (32%), Positives = 40/88 (45%)
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
T+ TA T G + +A G + +A T G T+ TA T G + +A G
Sbjct: 167 TDPTAGAGTPGTADASAGASAPGTADASAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTADASAGASAPGT 226
Query: 400 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 427
T+ TA T G T+ TA T G T+ T
Sbjct: 227 TDPTAGAGTPGTTDPTAGAGTPGTTDPT 254
>gi|423437957|ref|ZP_17414938.1| hypothetical protein IE9_04138 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
gi|401119940|gb|EJQ27745.1| hypothetical protein IE9_04138 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
Length = 588
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/365 (23%), Positives = 109/365 (29%), Gaps = 78/365 (21%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------------------TAKVF 45
T GAT T + GAT T G+T T
Sbjct: 98 PTGSTGPTGATGATGPTGSTGATGATGPTGPTGSTGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTG 157
Query: 46 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------------GATE 75
G+T T + GAT T GAT
Sbjct: 158 PTGSTGATGSTGSTGATGPTGSTGPTGATGATGPTGATGATGATGSTGSTGATGPTGATG 217
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 135
+T GAT +T G T +T GAT T GAT T G+T
Sbjct: 218 ITGVTGPTGATGIT------GVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTG 271
Query: 136 LTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
T GAT T + GAT T G+T +T
Sbjct: 272 STGPTGATGATGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTG 331
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
G T T + G T T + G+T T G+T T GAT T
Sbjct: 332 ATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPT------GSTGPTGSTGPTGATGATGPTG 385
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
+ G+T T G+T T + G T T + GAT T + G T T
Sbjct: 386 STGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGSTG 445
Query: 298 TLGAT 302
+ GAT
Sbjct: 446 STGAT 450
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/314 (25%), Positives = 98/314 (31%), Gaps = 63/314 (20%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------- 35
AT T + GAT T GAT T
Sbjct: 152 ATGSTGPTGSTGATGSTGST---GATGPTGSTGPTGATGATGPTGATGATGATGSTGSTG 208
Query: 36 -----GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 90
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T
Sbjct: 209 ATGPTGATGITGVTGPTGATGIT------GVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTG 262
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
G+T T GAT T + GAT T G
Sbjct: 263 STGPTGSTGSTGPTGATGATGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATG 322
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
+T +T G T T + G T T + G+T T G+T T G
Sbjct: 323 STGVTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPT------GSTGPTGSTGPTG 376
Query: 193 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
AT T + G+T T G+T T + G T T + GAT T + G
Sbjct: 377 ATGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGSTGSTG 436
Query: 253 ATELTAKVFTLGAT 266
T T + GAT
Sbjct: 437 PTGATGSTGSTGAT 450
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/263 (25%), Positives = 83/263 (31%), Gaps = 44/263 (16%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T
Sbjct: 214 GATGITGVTGPTGATGIT------GVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPT 267
Query: 240 GATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
G+T T GAT T + GAT T G+T +T
Sbjct: 268 GSTGSTGPTGATGATGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVT 327
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATE 341
G T T + G T T + G+T T + T
Sbjct: 328 GSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPTGST-----------------GPTG 370
Query: 342 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 401
T GAT T + G T T + G T T GAT T GAT
Sbjct: 371 STGPTGATGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGPTGST---GATG 427
Query: 402 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 424
T + G T T + GAT
Sbjct: 428 PTGSTGSTGPTGATGSTGSTGAT 450
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/340 (22%), Positives = 97/340 (28%), Gaps = 78/340 (22%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------------------TAKVF 93
T GAT T + GAT T G+T T
Sbjct: 98 PTGSTGPTGATGATGPTGSTGATGATGPTGPTGSTGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTG 157
Query: 94 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------------GATE 123
G+T T + GAT T GAT
Sbjct: 158 PTGSTGATGSTGSTGATGPTGSTGPTGATGATGPTGATGATGATGSTGSTGATGPTGATG 217
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---- 179
+T GAT +T G T T GAT T G+T T +
Sbjct: 218 ITGVTGPTGATGITGVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGSTGPTG 277
Query: 180 --------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
GAT T + GAT T G+T +T G T
Sbjct: 278 ATGATGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTG 337
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
T + G T T + G+T T G+T T GAT T + G+T
Sbjct: 338 ATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPT------GSTGPTGSTGPTGATGATGPTGSTGSTG 391
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
T G+T T + G T T + GAT T
Sbjct: 392 PTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGS 431
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/373 (23%), Positives = 111/373 (29%), Gaps = 68/373 (18%)
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------------------TAKVF 129
T GAT T + GAT T G+T T
Sbjct: 98 PTGSTGPTGATGATGPTGSTGATGATGPTGPTGSTGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTG 157
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------------------GATE 159
G+T T + GAT T GAT
Sbjct: 158 PTGSTGATGSTGSTGATGPTGSTGPTGATGATGPTGATGATGATGSTGSTGATGPTGATG 217
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+T GAT +T G T T GAT T G+T T + G T
Sbjct: 218 ITGVTGPTGATGITGVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGSTGPTG 277
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
T G+T T GAT T + GAT T G+T +T G T
Sbjct: 278 ATGATGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTG 337
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSA 339
T + G T T + G+T T G+T T A
Sbjct: 338 ATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTG--------------------A 377
Query: 340 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 399
T T + G+T T G+T T + G T T + GAT T + G
Sbjct: 378 TGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGSTGSTGP 437
Query: 400 TELTAKVFTLGAT 412
T T + GAT
Sbjct: 438 TGATGSTGSTGAT 450
>gi|384252261|gb|EIE25737.1| hypothetical protein COCSUDRAFT_40018 [Coccomyxa subellipsoidea
C-169]
Length = 4971
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/316 (34%), Positives = 131/316 (41%), Gaps = 21/316 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T G T T + GAT +T GAT T FT
Sbjct: 4383 GATGFTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTG--FT- 4439
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T G T T + + GAT +T + G+T T GAT LT
Sbjct: 4440 GATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT---GATGLTGATGFT 4496
Query: 132 GATELT-AKVFT--LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 188
GAT T A FT GAT T G T T + + GAT +T + G+T T
Sbjct: 4497 GATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT 4556
Query: 189 FTLGATELT-AKVFT--LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
GAT LT A FT GAT T G T T + + GAT +T + G+T T
Sbjct: 4557 ---GATGLTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGAT 4613
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFT--LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
GAT LT GAT T A FT GAT T G T T + + GAT
Sbjct: 4614 GIT---GATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGAT 4670
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTA 318
+T + G+T T
Sbjct: 4671 GVTGATGSTGSTGATG 4686
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 118/367 (32%), Positives = 143/367 (38%), Gaps = 25/367 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T G T T + GAT +T GAT T FT
Sbjct: 4383 GATGFTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTG--FT- 4439
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T G T T + + GAT +T + G+T T GAT LT
Sbjct: 4440 GATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT---GATGLTGATGFT 4496
Query: 192 GATELT-AKVFT--LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
GAT T A FT GAT T G T T + + GAT +T + G+T T
Sbjct: 4497 GATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT 4556
Query: 249 FTLGATELT-AKVFT--LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
GAT LT A FT GAT T G T T + + GAT +T + G+T T
Sbjct: 4557 ---GATGLTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGAT 4613
Query: 306 AKVFTLGATELT-AKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 364
GAT LT A + AT T G T T + + GAT
Sbjct: 4614 GIT---GATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGAT 4670
Query: 365 EL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
+ T + GAT +T GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 4671 GVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGST---GATGVTGATGAT 4727
Query: 422 GATELTA 428
G+T T
Sbjct: 4728 GSTGFTG 4734
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 114/337 (33%), Positives = 137/337 (40%), Gaps = 24/337 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T + GAT +T GAT T FT GAT T G
Sbjct: 4396 ATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTG--FT-GATGFTGSTGATG 4452
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFT- 118
T T + + GAT +T + G+T T GAT LT GAT T A FT
Sbjct: 4453 FTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT---GATGLTGATGFTGATGFTGATGFTG 4509
Query: 119 -LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKV 176
GAT T G T T + + GAT +T + G+T T GAT LT A
Sbjct: 4510 FTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT---GATGLTGATG 4566
Query: 177 FT--LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
FT GAT T G T T + + GAT +T + G+T T GAT LT
Sbjct: 4567 FTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT---GATGLTG 4623
Query: 235 KVFTLGATELT-AKVFT--LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL---TAKVFTLG 288
GAT T A FT GAT T G T T + + GAT + T + G
Sbjct: 4624 ATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTG 4683
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEV 325
AT +T GAT T GAT T + V
Sbjct: 4684 ATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGSTGATGV 4720
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 140/448 (31%), Positives = 165/448 (36%), Gaps = 48/448 (10%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
E A FT GAT T GAT T G T T + GAT T GAT
Sbjct: 728 ETGATGFT-GATGFTGST---GATGFTGDTGATGFTGATGFTGSTGATGFTGDT---GAT 780
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV----FTLGATELTAKVFT 118
T + GAT T G+T T GAT T + FT GAT T +
Sbjct: 781 GFTGFTGSTGATGFTGATGATGSTGATGFTGETGATGFTGETGATGFT-GATGFTGETGA 839
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G T T + GAT +T + G T T + GAT T + G T T +
Sbjct: 840 TGFTGATGFTGSTGATGVTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGETGATGFTGATGITGS 899
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
GAT T + G T T + GAT T + GAT T G+T T
Sbjct: 900 TGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGET---GATGFTGATGFTGSTGFTGFTGE 956
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELT-AKVFT--------LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
GAT T G T T A FT GAT T + GAT T + G
Sbjct: 957 TGATGFTGST---GPTGFTGASGFTGSTGATGETGATGFTGSTGSTGATGFTGETGATGF 1013
Query: 290 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL-EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFT 348
T T GAT T + GAT T + E + AT T
Sbjct: 1014 TGATGSTGNTGATGFTGET---GATGFTGSTGFTGETGATGATGFTGETGATGFTGST-- 1068
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKVFT--LGATELTAKVFTLGATELTAK 405
G+T T + GAT T G T +T A FT GAT T + GAT T
Sbjct: 1069 -GSTGFTGETGATGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGSTGATGFTGET---GATGFTGS 1124
Query: 406 VFTLGATELT----AKVFTLGATELTAK 429
GAT T A+ FT GAT T
Sbjct: 1125 T---GATGFTGETGARGFT-GATGFTGS 1148
>gi|219666653|ref|YP_002457088.1| collagen [Desulfitobacterium hafniense DCB-2]
gi|219536913|gb|ACL18652.1| Collagen triple helix repeat protein [Desulfitobacterium hafniense
DCB-2]
Length = 606
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/220 (31%), Positives = 72/220 (32%), Gaps = 6/220 (2%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 148 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGET 207
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T GAT T G T T GAT T
Sbjct: 208 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGATGATGPAGET 267
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT T GAT T GAT T A E
Sbjct: 268 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGP-----AGEPGGPTGPT 322
Query: 204 GATELTAKVF-TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
GAT T + G T T + GAT T GAT
Sbjct: 323 GATGATGPAGESGGPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGAT 362
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/220 (31%), Positives = 72/220 (32%), Gaps = 6/220 (2%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 148 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGET 207
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T GAT T G T T GAT T
Sbjct: 208 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGATGATGPAGET 267
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T GAT T GAT T A E
Sbjct: 268 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGP-----AGEPGGPTGPT 322
Query: 216 GATELTAKVF-TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
GAT T + G T T + GAT T GAT
Sbjct: 323 GATGATGPAGESGGPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGAT 362
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/215 (31%), Positives = 70/215 (32%), Gaps = 8/215 (3%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 148 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGET 207
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T GAT T GAT T G T T GAT T
Sbjct: 208 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGATGATGPAGET 267
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-------ELTAKVFTLGATEL 280
GAT T GAT T GAT T GAT E GAT
Sbjct: 268 GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGEPGGPTGPTGATGA 327
Query: 281 TAKVF-TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T + G T T + GAT T GAT
Sbjct: 328 TGPAGESGGPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGAT 362
>gi|194014775|ref|ZP_03053392.1| hypothetical protein BAT_2218, partial [Bacillus pumilus ATCC 7061]
gi|194013801|gb|EDW23366.1| hypothetical protein BAT_2218, partial [Bacillus pumilus ATCC 7061]
Length = 342
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/298 (25%), Positives = 87/298 (29%), Gaps = 42/298 (14%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T +T GAT +T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 48 GPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGD---TGPTGVTGDTGVT 104
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELT 161
GAT T G T T GAT T GAT T
Sbjct: 105 GATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDT 164
Query: 162 AKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT +T G T T
Sbjct: 165 GPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPT 224
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
G T +T G T T G T +T GAT T GAT T
Sbjct: 225 GPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGATGPT 284
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
G T T G T +T G T +T GAT T GAT T
Sbjct: 285 GDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGDTGPTGDTGATGATG 342
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.058, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/309 (24%), Positives = 89/309 (28%), Gaps = 50/309 (16%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T GAT +T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 48 GPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGD---TGPTGVTGDTGVT 104
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELT 245
GAT T G T T GAT T GAT T
Sbjct: 105 GATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDT 164
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT +T GAT +T G T T
Sbjct: 165 GPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPT 224
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G T +T G T T G T +T + P + AT T
Sbjct: 225 GPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDT--------GPTGVT---GATGDTGPTG 273
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
GAT T G T T G T +T G T +T GAT T
Sbjct: 274 VTGATGATGPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGDTGPTG 333
Query: 408 TLGATELTA 416
GAT T
Sbjct: 334 DTGATGATG 342
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/309 (24%), Positives = 91/309 (29%), Gaps = 50/309 (16%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T GAT +T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 48 GPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGD---TGPTGVTGDTGVT 104
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELT 185
GAT T G T T GAT T GAT T
Sbjct: 105 GATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDT 164
Query: 186 AKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T GAT +T G T T
Sbjct: 165 GPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPT 224
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T +T G T T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 225 GPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGD---TGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGAT 281
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G T T GAT T GAT +T + + P + AT T
Sbjct: 282 GPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGPTGVT-----GPTGVT---GATGDTGPTG 333
Query: 348 TLGATELTA 356
GAT T
Sbjct: 334 DTGATGATG 342
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/309 (24%), Positives = 88/309 (28%), Gaps = 50/309 (16%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T GAT +T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 48 GPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGD---TGPTGVTGDTGVT 104
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELT 233
GAT T G T T GAT T GAT T
Sbjct: 105 GATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDT 164
Query: 234 AKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT +T GAT +T G T T
Sbjct: 165 GPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPT 224
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
G T +T G T T G T +T G T T + P +
Sbjct: 225 GPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDT--------GPTGVT- 275
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 395
AT T G T T G T +T G T +T GAT T
Sbjct: 276 --GATGATGPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGDTGPTG 333
Query: 396 TLGATELTA 404
GAT T
Sbjct: 334 DTGATGATG 342
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/309 (24%), Positives = 88/309 (28%), Gaps = 50/309 (16%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T +T GAT +T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 48 GPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGD---TGPTGVTGDTGVT 104
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELT 257
GAT T G T T GAT T GAT T
Sbjct: 105 GATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDT 164
Query: 258 AKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT +T GAT +T G T T
Sbjct: 165 GPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPT 224
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
G T +T G T T + P + T T GAT T
Sbjct: 225 GPTGVTGDTGPTGVTGATG-----DTGPTGPTGV------TGDTGPTGVTGATGDTGPTG 273
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
GAT T G T T G T +T G T +T GAT T
Sbjct: 274 VTGATGATGPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGDTGPTG 333
Query: 420 TLGATELTA 428
GAT T
Sbjct: 334 DTGATGATG 342
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/315 (24%), Positives = 87/315 (27%), Gaps = 62/315 (19%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T GAT +T G T +T GAT T G T +T
Sbjct: 48 GPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGD---TGPTGVTGDTGVT 104
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELT 209
GAT T G T T GAT T GAT T
Sbjct: 105 GATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDT 164
Query: 210 AKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT +T GAT +T G T T
Sbjct: 165 GPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPT 224
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT------LGATELT 305
G T +T G T T G T +T G T T GAT T
Sbjct: 225 GPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGATGPT 284
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 365
GAT T + T +T G T +T GAT
Sbjct: 285 GDTGPTGATGATGDT-----------------GPTGVTGATGVTGPTGVTGPTGVTGATG 327
Query: 366 LTAKVFTLGATELTA 380
T GAT T
Sbjct: 328 DTGPTGDTGATGATG 342
>gi|150017446|ref|YP_001309700.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium beijerinckii
NCIMB 8052]
gi|149903911|gb|ABR34744.1| Collagen triple helix repeat [Clostridium beijerinckii NCIMB 8052]
Length = 2411
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 81/306 (26%), Positives = 101/306 (33%), Gaps = 36/306 (11%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T GAT T G T T GAT T G T T + G
Sbjct: 1988 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGD 2047
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
T +T G T T GAT +T G AT T + GAT +T
Sbjct: 2048 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 2107
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---------------------- 156
G T T G+T T + G T T G
Sbjct: 2108 TGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGP 2167
Query: 157 --ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
T +T + GAT +T GAT +T + GAT GAT +T +
Sbjct: 2168 TGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGSTGAT---------GATGVTGSTGS 2218
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
GAT T + G+T T G+T T + G T T GAT +T
Sbjct: 2219 TGATGATGITGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGSTGVTGSTGSTGATGATGVTGVTGP 2278
Query: 275 LGATEL 280
GA +L
Sbjct: 2279 TGAPQL 2284
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/314 (26%), Positives = 105/314 (33%), Gaps = 45/314 (14%)
Query: 50 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
T T GAT T G T T GAT T G T T + G
Sbjct: 1988 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGD 2047
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
T +T G T T GAT +T G AT T + GAT +T
Sbjct: 2048 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 2107
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---------------------- 204
G T T G+T T + G T T G
Sbjct: 2108 TGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGP 2167
Query: 205 --ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
T +T + GAT +T GAT +T + GAT T + G+T T
Sbjct: 2168 TGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGVTGSTGSTGAT----- 2222
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
GAT +T + GAT GAT +T + GAT T + G+T T + +
Sbjct: 2223 -GATGITGSTGSTGAT---------GATGITGSTGSTGATGSTGVTGSTGSTGATGATGV 2272
Query: 323 LEVEYYKPIKIVPQ 336
V P PQ
Sbjct: 2273 TGV--TGPTG-APQ 2283
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/243 (28%), Positives = 82/243 (33%), Gaps = 12/243 (4%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G+T T GAT T + GAT +T G T +T G T T
Sbjct: 183 GSTGPTGDTGATGATGDTGVTGSTGATGITGH---TGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVT 239
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + GAT +T G T T G+T T G T +T
Sbjct: 240 GATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDT 299
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T G T T + G T +T G T +T G T T
Sbjct: 300 GATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGS---TGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGIT 356
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T G T +T G T T GAT +T G T T
Sbjct: 357 GATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGST------GATGITGPTGDTGVTGATGDTGVT 410
Query: 252 GAT 254
G T
Sbjct: 411 GPT 413
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 87/346 (25%), Positives = 102/346 (29%), Gaps = 27/346 (7%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
+T G T T GAT T G T T G+T T G T
Sbjct: 1198 ITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTG 1257
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+T G T T GAT T + GAT +T G T T G T
Sbjct: 1258 VTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTG 1317
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T G T +T G T T G T T G T +T GAT
Sbjct: 1318 DTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATG 1377
Query: 184 ------------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKVFTLG 216
+T G T T GA T +T G
Sbjct: 1378 STGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTG 1437
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T T GAT T G T T G+T T G T +T G
Sbjct: 1438 VTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 1497
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
T T GAT T + GAT +T G T T + +
Sbjct: 1498 VTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGV 1543
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/215 (28%), Positives = 74/215 (34%), Gaps = 6/215 (2%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G+T T GAT T + GAT +T G T +T G T T
Sbjct: 183 GSTGPTGDTGATGATGDTGVTGSTGATGITGH---TGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVT 239
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + GAT +T G T T G+T T G T +T
Sbjct: 240 GATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDT 299
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T G T T + G T +T G T +T G T T
Sbjct: 300 GATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGS---TGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGIT 356
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
GAT T G T +T G T T + I
Sbjct: 357 GATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGI 391
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/242 (28%), Positives = 79/242 (32%), Gaps = 9/242 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T G+T T G T +T G T T G
Sbjct: 181 ATGSTGPTGDTGATGATGDTGVTGSTGATGITGHTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTG 240
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T + GAT +T G T T G+T T G T +T G
Sbjct: 241 ATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTG 300
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T G T T + G T +T G T +T G T T G
Sbjct: 301 ATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGS---TGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITG 357
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT T G T +T G T T GAT +T G T T G
Sbjct: 358 ATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGST------GATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTG 411
Query: 241 AT 242
T
Sbjct: 412 PT 413
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/320 (25%), Positives = 100/320 (31%), Gaps = 50/320 (15%)
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T T GAT T G T T GAT T G T T + G
Sbjct: 1988 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGD 2047
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
T +T G T T GAT +T G AT T + GAT +T
Sbjct: 2048 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 2107
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---------------------- 276
G T T G+T T + G T T G
Sbjct: 2108 TGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGP 2167
Query: 277 --ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIV 334
T +T + GAT +T GAT +T + GAT
Sbjct: 2168 TGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGSTGAT-------------------- 2207
Query: 335 PQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 394
AT +T + GAT T + G+T T G+T T + G T T
Sbjct: 2208 ---GATGVTGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGSTGVTGSTGST 2264
Query: 395 FTLGATELTAKVFTLGATEL 414
GAT +T GA +L
Sbjct: 2265 GATGATGVTGVTGPTGAPQL 2284
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/335 (25%), Positives = 98/335 (29%), Gaps = 33/335 (9%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T T GAT T + GAT +T G T T
Sbjct: 1254 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVT 1313
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T +T G T T G T T G T +T
Sbjct: 1314 GPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDT 1373
Query: 132 GATE------------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T G T T GAT
Sbjct: 1374 GATGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGAT--------- 1424
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T G T T GAT T G T T G+T T
Sbjct: 1425 GDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPT 1484
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T +T G T T GAT T + GAT +T G T T
Sbjct: 1485 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVT 1544
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
G T T G T +T G T T + I
Sbjct: 1545 GPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGI 1579
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 91/366 (24%), Positives = 106/366 (28%), Gaps = 28/366 (7%)
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+T G T T GAT T G T T G+T T G T
Sbjct: 1198 ITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTG 1257
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+T G T T GAT T + GAT +T G T T G T
Sbjct: 1258 VTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTG 1317
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
T G T +T G T T G T T G T +T GAT
Sbjct: 1318 DTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATG 1377
Query: 268 ------------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
+T G T T GAT T G T
Sbjct: 1378 STGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTG 1437
Query: 304 LTAKVFTLGATELTAK-SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+T G T T V + P +T T G T +T G
Sbjct: 1438 VTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 1497
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 422
T T GAT T + GAT +T G T +T G T T G
Sbjct: 1498 VTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGP---TGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTG 1554
Query: 423 ATELTA 428
AT T
Sbjct: 1555 ATGDTG 1560
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/243 (27%), Positives = 74/243 (30%), Gaps = 3/243 (1%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
+T G T T G+T T G T +T G T T GAT
Sbjct: 619 ITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG 678
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
+T G T T G T T G T +T GAT T GAT
Sbjct: 679 VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGD---TGATG 735
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
T G T G T +T G T T GAT T G T
Sbjct: 736 PTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTG 795
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
T GAT T GAT T G T +T G T T G+T
Sbjct: 796 ATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTG 855
Query: 292 LTA 294
T
Sbjct: 856 DTG 858
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/236 (26%), Positives = 78/236 (33%), Gaps = 8/236 (3%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G+T T GAT T + GAT +T G T +T G T T
Sbjct: 183 GSTGPTGDTGATGATGDTGVTGSTGATGITGH---TGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVT 239
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T + GAT +T G T T G+T T G T +T
Sbjct: 240 GATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDT 299
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIK---IVPQNSATELTA 344
GAT T G T T + G T +T + E P + T +T
Sbjct: 300 GATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGST--GETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITG 357
Query: 345 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 400
G T T G T T + GAT +T G T T G T
Sbjct: 358 ATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPT 413
>gi|288559262|ref|YP_003422748.1| adhesin-like protein [Methanobrevibacter ruminantium M1]
gi|288541972|gb|ADC45856.1| adhesin-like protein [Methanobrevibacter ruminantium M1]
Length = 745
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/248 (26%), Positives = 104/248 (41%), Gaps = 13/248 (5%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL-TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
L T T+L TL + L + T+ TEL T + L + F L T
Sbjct: 256 LNGDSLTFNWTDLLGDNLTLNMSSLLGGESTTINWTELLGDNLTFNMSSLLGEDFNLNMT 315
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
L + F L T +F T + + T EL FT+ T+L + L +
Sbjct: 316 SLLGEDFKLNLT----NIFGDNLTAIFGENLTNKLEELFGDDFTINMTDLFGEDLALNMS 371
Query: 123 EL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
++ +F L + + + T+ T+L + TL +++ + TL T+L + TL
Sbjct: 372 DIFGDDSIFNL--SNILGESTTINWTDLLGEGSTLNISKILGESLTLNLTDLFGESSTLN 429
Query: 181 ATE-LTAKVFTLGATE-LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATE-LTAKV 236
TE L + TL TE L FT+ T+L T+ T+L + T+ T+ L
Sbjct: 430 WTELLGGESLTLNWTELLGGDSFTINWTDLLGNSTTINWTDLLGRDSLTVNWTDLLGGDS 489
Query: 237 FTLGATEL 244
FT+ T+L
Sbjct: 490 FTINWTDL 497
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/299 (26%), Positives = 119/299 (39%), Gaps = 39/299 (13%)
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGAT 194
L+ FTL T+L LG LT L E T TL T+L + T+ T
Sbjct: 166 LSGDSFTLNWTDL------LGGDSLTVNWTDLLGGEST----TLNWTDLLGRDSLTVNWT 215
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
+L + FTL T+L + T+ T+L LG LT L L T
Sbjct: 216 DLLGEDFTLNLTDLLGRDSLTVNWTDL------LGGDSLTVNWTDL----LNGDSLTFNW 265
Query: 254 TELTAKVFTLGATEL-TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
T+L TL + L + T+ TEL T + L + F L T L + F L
Sbjct: 266 TDLLGDNLTLNMSSLLGGESTTINWTELLGDNLTFNMSSLLGEDFNLNMTSLLGEDFKLN 325
Query: 313 ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQN---SATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--T 367
T + ++ I +N EL FT+ T+L + L +++
Sbjct: 326 LTNIFGDNLT---------AIFGENLTNKLEELFGDDFTINMTDLFGEDLALNMSDIFGD 376
Query: 368 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
+F L + + + T+ T+L + TL +++ + TL T+L + TL TEL
Sbjct: 377 DSIFNL--SNILGESTTINWTDLLGEGSTLNISKILGESLTLNLTDLFGESSTLNWTEL 433
>gi|255099505|ref|ZP_05328482.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-63q42]
Length = 615
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/319 (26%), Positives = 120/319 (37%), Gaps = 36/319 (11%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
+T + GAT T G T T ++G T T GAT G T
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNT---GATGSIGPTGVTGPT 247
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
T ++G T +T G T +T G T +T + GAT T +G T
Sbjct: 248 GSTGATGSIGPTGVTGPT---GNTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGATGPTGVTGEIGPT 304
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
+T G T +T ++ GAT GAT +T + GAT T G
Sbjct: 305 GVT------GPTGVTGEIGPTGAT---------GATGVTGSIGPTGATGPTGATGVTGEI 349
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
T ++ G T T +G T T G T +T ++ GAT T G T
Sbjct: 350 GPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPT---GNTGVTGEIGPTGATGPT------GNT 400
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
+T ++ GAT T G T +T ++ GAT T G+ T GAT
Sbjct: 401 GVTGEIGPTGATGPT------GNTGVTGEIGLTGATGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGAT 454
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSV 321
+T GAT +++ V
Sbjct: 455 GVTGPTGPTGATGNSSQPV 473
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/283 (26%), Positives = 107/283 (37%), Gaps = 27/283 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T + G T T ++G T +T + GAT ++G T +T G
Sbjct: 216 STGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGSTGATG------SIGPTGVTGPT---G 266
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T +T G T +T + GAT T +G T +T G T +T ++ G
Sbjct: 267 NTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGATGPTGVTGEIGPTGVT------GPTGVTGEIGPTG 320
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT GAT +T + GAT T G T ++ G T T +G
Sbjct: 321 AT---------GATGVTGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIG 371
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T G T +T ++ GAT T G T G T +T ++ G
Sbjct: 372 PTGATGPT---GNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGLTG 428
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
AT T G+ T GAT +T GAT +++
Sbjct: 429 ATGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGATGVTGPTGPTGATGNSSQ 471
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 84/331 (25%), Positives = 118/331 (35%), Gaps = 50/331 (15%)
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
+T + GAT T G T T ++G T T GAT G T
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNT---GATGSIGPTGVTGPT 247
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
T ++G T +T G T +T G T +T + GAT T +G T
Sbjct: 248 GSTGATGSIGPTGVTGPT---GNTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGATGPTGVTGEIGPT 304
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
+T G T +T ++ GAT GAT +T + GAT T G
Sbjct: 305 GVT------GPTGVTGEIGPTGAT---------GATGVTGSIGPTGATGPTGATGVTGEI 349
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
T ++ G T T +G T T G T +T ++ GAT T G T
Sbjct: 350 GPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPT---GNTGVTGEIGPTGATGPT------GNT 400
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 362
+T ++ GAT T T +T ++ GAT T G
Sbjct: 401 GVTGEIGPTGATGPTGN--------------------TGVTGEIGLTGATGPTGNTGATG 440
Query: 363 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 393
+ T GAT +T GAT +++
Sbjct: 441 SIGPTGVTGPTGATGVTGPTGPTGATGNSSQ 471
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/283 (26%), Positives = 100/283 (35%), Gaps = 22/283 (7%)
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+T + GAT T G T T ++G T T GAT G T
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNT---GATGSIGPTGVTGPT 247
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
T ++G T +T G T +T G T +T + GAT T +G T
Sbjct: 248 GSTGATGSIGPTGVTGPT---GNTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGATGPTGVTGEIGPT 304
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT-AKSVILEV 325
+T G T +T ++ GAT GAT +T + GAT T A V E+
Sbjct: 305 GVT------GPTGVTGEIGPTGAT---------GATGVTGSIGPTGATGPTGATGVTGEI 349
Query: 326 EYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 385
I T +T ++ GAT T G T G T +T ++
Sbjct: 350 GPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPT 409
Query: 386 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT T G LT G T T + G T T
Sbjct: 410 GATGPTGNTGVTGEIGLTGATGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTG 452
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 81/321 (25%), Positives = 116/321 (36%), Gaps = 38/321 (11%)
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
+T + GAT T G T T ++G T T GAT G T
Sbjct: 191 RITGPMGPRGATGSTGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNT---GATGSIGPTGVTGPT 247
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
T ++G T +T G T +T G T +T + GAT T +G T
Sbjct: 248 GSTGATGSIGPTGVTGPT---GNTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGATGPTGVTGEIGPT 304
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
+T G T +T ++ GAT T ++G T T GAT +T ++ G T
Sbjct: 305 GVT------GPTGVTGEIGPTGATGATGVTGSIGPTGATGPT---GATGVTGEI---GPT 352
Query: 291 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
T G T +T ++ GAT T T +T ++ G
Sbjct: 353 GEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPTGN--------------------TGVTGEIGPTG 392
Query: 351 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 410
AT T G T G T +T ++ GAT T G+ T G
Sbjct: 393 ATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGLTGATGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTG 452
Query: 411 ATELTAKVFTLGATELTAKNI 431
AT +T GAT +++ +
Sbjct: 453 ATGVTGPTGPTGATGNSSQPV 473
>gi|423529526|ref|ZP_17505971.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus HuB1-1]
gi|402448008|gb|EJV79856.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus HuB1-1]
Length = 195
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 62/166 (37%), Gaps = 10/166 (6%)
Query: 33 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 90
FTL GA+ T G T +T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 35 FTLPTGASGATGPTGPTGVTGITGPIGPTGATGITGPT---GVTGITGPTGPTGVTGITG 91
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-GATELT 149
G T +T G T +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 92 PTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPT---GITGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPAGPTGPT 148
Query: 150 AKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+G T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 149 GPSGGPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGAT 194
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 62/166 (37%), Gaps = 10/166 (6%)
Query: 69 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
FTL GA+ T G T +T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 35 FTLPTGASGATGPTGPTGVTGITGPIGPTGATGITGPT---GVTGITGPTGPTGVTGITG 91
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-GATELT 185
G T +T G T +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 92 PTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPT---GITGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPAGPTGPT 148
Query: 186 AKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
+G T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 149 GPSGGPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGAT 194
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 62/166 (37%), Gaps = 10/166 (6%)
Query: 141 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
FTL GA+ T G T +T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 35 FTLPTGASGATGPTGPTGVTGITGPIGPTGATGITGPT---GVTGITGPTGPTGVTGITG 91
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-GATELT 257
G T +T G T +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 92 PTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPT---GITGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPAGPTGPT 148
Query: 258 AKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
+G T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 149 GPSGGPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGAT 194
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.068, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/160 (27%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 8/160 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
A+ T G T +T + GAT +T G T +T G T +T G
Sbjct: 41 ASGATGPTGPTGVTGITGPIGPTGATGITGPT---GVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTG 97
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL-GATELTAKV-FT 118
T +T G T +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 98 VTGITGPTGPTGVTGITGPT---GITGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPAGPTGPTGPSGGP 154
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
+G T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 155 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGAT 194
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/178 (26%), Positives = 61/178 (34%), Gaps = 20/178 (11%)
Query: 213 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
FTL GA+ T G T +T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 35 FTLPTGASGATGPTGPTGVTGITGPIGPTGATGITGPT---GVTGITGPTGPTGVTGITG 91
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP 330
G T +T G T +T G T +T G T +T S
Sbjct: 92 PTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPT---GITGITGPTGPTGVTGVTGPSG--------- 139
Query: 331 IKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 388
P +G T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 140 ---GPAGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGAT 194
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/180 (26%), Positives = 63/180 (35%), Gaps = 24/180 (13%)
Query: 237 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
FTL GA+ T G T +T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 35 FTLPTGASGATGPTGPTGVTGITGPIGPTGATGITGPT---GVTGITGPTGPTGVTGITG 91
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATEL 354
G T +T G T +T + I T +T G T +
Sbjct: 92 PTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGI-----------------TGITGPTGPTGVTGV 134
Query: 355 TAKVFTL-GATELTAKVF-TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 412
T G T T +G T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 135 TGPSGGPAGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGAT 194
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/178 (25%), Positives = 60/178 (33%), Gaps = 20/178 (11%)
Query: 225 FTL--GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
FTL GA+ T G T +T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 35 FTLPTGASGATGPTGPTGVTGITGPIGPTGATGITGPT---GVTGITGPTGPTGVTGITG 91
Query: 283 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATEL 342
G T +T G T +T G T T + + V P
Sbjct: 92 PTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGITGITGPTGPTGVTGVTG-------PSGGPAGP 144
Query: 343 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 400
T G +G T +T GAT +T GAT +T GAT
Sbjct: 145 TGPTGPSGGP--------IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGAT 194
>gi|443691694|gb|ELT93476.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_222902 [Capitella teleta]
Length = 1271
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/397 (24%), Positives = 127/397 (31%), Gaps = 30/397 (7%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT + + GAT + G T T + G T T + G T +T +
Sbjct: 20 GATGTSGRDGQTGATGADGATGSDGRTGATGRDGNDGRTGATGRDGNDGRTGVTGATGSS 79
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKV 164
G T T G T T + G T + GAT + + GAT L +
Sbjct: 80 GRTGATGNDGRDGRTGATGQQGNDGRDGSTGRT---GATGTSGRDGQTGATGERGLDGRD 136
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
+ G T T + G T T G + G+ T + GAT
Sbjct: 137 GSTGRTGATGRNGLDGETGSTGASGRDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIE 196
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
GAT G+T L G+T T T G+T + GAT + +V
Sbjct: 197 GRTGATGNRGPTGETGSTGL------PGSTGRTGATGTRGSTGADGRT---GATGIEGRV 247
Query: 285 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTA 344
GAT GAT + G T T S I + T T
Sbjct: 248 GRTGATGRNGVDGRTGATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGR-----------TGATG 296
Query: 345 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 404
G T T GAT G T T K G T + + G +
Sbjct: 297 DAGRDGRTGATGGSGRSGATGRDGATGRDGVTGATGK---DGRTGIDGRTGATGDRGIDG 353
Query: 405 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKN-IRSNTGTVGS 440
+ GAT T GAT ++ I TG GS
Sbjct: 354 REGRTGATGQTGGPGRTGATGNDGRDGIDGRTGATGS 390
>gi|344266849|ref|XP_003405491.1| PREDICTED: protein FAM186A-like [Loxodonta africana]
Length = 2327
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.012, Method: Composition-based stats.
Identities = 92/407 (22%), Positives = 147/407 (36%), Gaps = 14/407 (3%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
K TL + + A TL ++ + L ++ A T + + TL + A
Sbjct: 1047 KWITLTSEQPQALGMTLTLEQVQREGIILTPEQVQALGITFAPEQAQTEKITLTPRQAQA 1106
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
TL + A+ TL + A+ L + A+ TL + A TL + A
Sbjct: 1107 LGITLTPQQAQAQGVTLTPQQAQAQGVALTPQQAQAQGVTLTPQQAQALGITLTPQQAQA 1166
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
+ TL + A+ TL + A L + + A+ TL + A TL + A
Sbjct: 1167 QGVTLTPQQAQAQGVTLTPQQAQALGIKLTSEQAQAQGITLTPQQAQALGITLAPQQAHA 1226
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+ TL + A TL E + + + A T E A T+ E A
Sbjct: 1227 QGITLTPQQAQALGITLTPEEAQVQGLSFTPQQAQALGITFTPEEAQALGITVTLEEAHA 1286
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
+ TL + A LG T +V +LG T + LG T + + LG T
Sbjct: 1287 RGITLTLQQAQA----LGITLTPQQVESLGITLTPQQAQALGITLIPQQAQELGIT---- 1338
Query: 307 KVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 366
T ++I E + + I + P+ T+ TL + E A+ T E
Sbjct: 1339 --LTPEQAHAQRITLICEQVHAQGITVSPKQVETQ----GITLTSEEAQAQSITFTPEEA 1392
Query: 367 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 413
A T + A+ TL + A +L + A+ TL E
Sbjct: 1393 RALGITFTPEKAQAQGITLTLQQAQALGTSLTPQQAQAQGITLTPEE 1439
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.032, Method: Composition-based stats.
Identities = 74/328 (22%), Positives = 123/328 (37%), Gaps = 8/328 (2%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
TL + A+ TL + A+ TL + A L + + A+ TL + A
Sbjct: 1158 TLTPQQAQAQGVTLTPQQAQAQGVTLTPQQAQALGIKLTSEQAQAQGITLTPQQAQALGI 1217
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
TL + A+ TL + A TL E + + + A T E A
Sbjct: 1218 TLAPQQAHAQGITLTPQQAQALGITLTPEEAQVQGLSFTPQQAQALGITFTPEEAQALGI 1277
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
T+ E A+ TL + A LG T +V +LG T + LG T + +
Sbjct: 1278 TVTLEEAHARGITLTLQQAQA----LGITLTPQQVESLGITLTPQQAQALGITLIPQQAQ 1333
Query: 190 TLGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 245
LG T + A+ TL ++ A+ T+ ++ + TL + E A+ T E
Sbjct: 1334 ELGITLTPEQAHAQRITLICEQVHAQGITVSPKQVETQGITLTSEEAQAQSITFTPEEAR 1393
Query: 246 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
A T + A+ TL + A +L + A+ TL E +L +
Sbjct: 1394 ALGITFTPEKAQAQGITLTLQQAQALGTSLTPQQAQAQGITLTPEEAQELGISLTPQHVQ 1453
Query: 306 AKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKI 333
A + + V L E+ +P+++
Sbjct: 1454 ALGVSQAPRQFQDFRVTLTSEHAQPLRV 1481
>gi|423430554|ref|ZP_17407558.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401119481|gb|EJQ27296.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 388
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 69
GAT +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 70 GATGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 129
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 130 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 189
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 190 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 220
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVF 93
GAT +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 70 GATGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 129
Query: 94 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 153
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 130 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 189
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 190 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 220
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 117
GAT +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 70 GATGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 129
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 130 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 189
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 190 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 220
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 165
GAT +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 70 GATGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 129
Query: 166 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 130 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 189
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 190 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 220
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 213
GAT +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 70 GATGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 129
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 130 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 189
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 190 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 220
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 225
GAT +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 70 GATGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 129
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 130 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 189
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 190 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 220
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 42/105 (40%), Gaps = 3/105 (2%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
+G T +T GAT +T GAT +T GAT + GAT +
Sbjct: 119 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGP 178
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 115
GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 179 TGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 220
>gi|206977718|ref|ZP_03238609.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
gi|206744019|gb|EDZ55435.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
Length = 432
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T +T + GAT T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 121 GVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGITGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGAT 180
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 181 GATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGATGATGITGATGPTGATGITGATGPT 240
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT T GAT T GAT +T + GAT T + G+T T
Sbjct: 241 GATGPTGATGPTGATGSTGPT---GATGITGAMGVTGATGPTGATGSTGSTGPTG 292
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T +T + GAT T + GAT +T G T +T G T +T
Sbjct: 121 GVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGITGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGAT 180
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 181 GATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGATGATGITGATGPTGATGITGATGPT 240
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
GAT T GAT T GAT +T + GAT T + G+T T
Sbjct: 241 GATGPTGATGPTGATGSTGPT---GATGITGAMGVTGATGPTGATGSTGSTGPTG 292
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 73/187 (39%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T + GAT T + GAT +T GAT T G T +T
Sbjct: 121 GVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGIT------GATGATGPT---GVTGITGATGPT 171
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T G T +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 172 GVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGAT---GATGITGATGPT 228
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT +T GAT T GAT T GAT +T + GAT T +
Sbjct: 229 GATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPT---GATGITGAMGVTGATGPTGATGST 285
Query: 288 GATELTA 294
G+T T
Sbjct: 286 GSTGPTG 292
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 68/175 (38%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T + GAT T + GAT +T GAT T G T +T
Sbjct: 121 GVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGIT------GATGATGPT---GVTGITGATGPT 171
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T +T G T +T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 172 GVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGAT---GATGITGATGPT 228
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
GAT +T GAT T GAT T GAT +T + GAT T
Sbjct: 229 GATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPT---GATGITGAMGVTGATGPTG 280
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/255 (27%), Positives = 83/255 (32%), Gaps = 39/255 (15%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------- 47
AT T +GAT T GAT T G T +T
Sbjct: 44 ATGPTGATGPMGATGPTGATGPTGATGPTGAT---GPTGVTGSTGATGITGATGATGATG 100
Query: 48 --------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
G T +T + GAT T + GAT +T G T
Sbjct: 101 ITGATGATGATGITGATGPTGVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGITGATGATGPTG 160
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+T G T +T GAT T GAT T G T T GAT
Sbjct: 161 VTGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGATGATG 220
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+T GAT +T GAT T GAT T GAT +T + GAT
Sbjct: 221 ITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPT---GATGITGAMGVTGATG 277
Query: 208 LTAKVFTLGATELTA 222
T + G+T T
Sbjct: 278 PTGATGSTGSTGPTG 292
>gi|443691690|gb|ELT93472.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_111571, partial [Capitella teleta]
Length = 369
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/235 (24%), Positives = 87/235 (37%), Gaps = 15/235 (6%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G+T T GAT + + G+T ++ + GAT + G T +
Sbjct: 147 GSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGATGRNGQTGATGREGATGRDGQT 206
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT + + GAT L+ + T T + GAT + GAT LT
Sbjct: 207 GATGSSGRDGRSGATGLSGE------TGATGRDGRTGATGTDGRDGQTGATGLTGADGRD 260
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + GAT + + G + T + G T T + GA T ++
Sbjct: 261 GQTGATGRNGQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERGPGGDTGSTGRDGRTGA---TGQIGAT 317
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
G LT T G T T ++ + T + GAT L + G+ T
Sbjct: 318 GTNGLTGATGTNGRTGATGEIGS------TGRDGRTGATGLAGQTGATGSNGQTG 366
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/235 (24%), Positives = 87/235 (37%), Gaps = 15/235 (6%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G+T T GAT + + G+T ++ + GAT + G T +
Sbjct: 147 GSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGATGRNGQTGATGREGATGRDGQT 206
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT + + GAT L+ + T T + GAT + GAT LT
Sbjct: 207 GATGSSGRDGRSGATGLSGE------TGATGRDGRTGATGTDGRDGQTGATGLTGADGRD 260
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + GAT + + G + T + G T T + GA T ++
Sbjct: 261 GQTGATGRNGQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERGPGGDTGSTGRDGRTGA---TGQIGAT 317
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
G LT T G T T ++ + T + GAT L + G+ T
Sbjct: 318 GTNGLTGATGTNGRTGATGEIGS------TGRDGRTGATGLAGQTGATGSNGQTG 366
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/235 (24%), Positives = 87/235 (37%), Gaps = 15/235 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G+T T GAT + + G+T ++ + GAT + G T +
Sbjct: 147 GSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGATGRNGQTGATGREGATGRDGQT 206
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT + + GAT L+ + T T + GAT + GAT LT
Sbjct: 207 GATGSSGRDGRSGATGLSGE------TGATGRDGRTGATGTDGRDGQTGATGLTGADGRD 260
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + GAT + + G + T + G T T + GA T ++
Sbjct: 261 GQTGATGRNGQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERGPGGDTGSTGRDGRTGA---TGQIGAT 317
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
G LT T G T T ++ + T + GAT L + G+ T
Sbjct: 318 GTNGLTGATGTNGRTGATGEIGS------TGRDGRTGATGLAGQTGATGSNGQTG 366
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/235 (24%), Positives = 87/235 (37%), Gaps = 15/235 (6%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T T GAT + + G+T ++ + GAT + G T +
Sbjct: 147 GSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGATGRNGQTGATGREGATGRDGQT 206
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT + + GAT L+ + T T + GAT + GAT LT
Sbjct: 207 GATGSSGRDGRSGATGLSGE------TGATGRDGRTGATGTDGRDGQTGATGLTGADGRD 260
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T + GAT + + G + T + G T T + GA T ++
Sbjct: 261 GQTGATGRNGQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERGPGGDTGSTGRDGRTGA---TGQIGAT 317
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
G LT T G T T ++ + T + GAT L + G+ T
Sbjct: 318 GTNGLTGATGTNGRTGATGEIGS------TGRDGRTGATGLAGQTGATGSNGQTG 366
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 81/306 (26%), Positives = 110/306 (35%), Gaps = 12/306 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T T + GAT GAT + + GAT + GAT +
Sbjct: 15 GQTGATGQNGQTGATGRDGIDGRTGATGVDGRDGQTGATGRDGQDGRTGATGADGRDGAK 74
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T + GAT GAT T + GAT T + GAT
Sbjct: 75 GDTGATGQNGLTGATGQDGIDGRTGATGSTGQSGQTGATGTTGRDGQTGATGGVGPTGPT 134
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT G+T T GAT + + G+T ++ + GAT +
Sbjct: 135 GATGSRGNDGRTGSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGAT---GRNGQT 191
Query: 192 GATEL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
GAT T + GAT + + GAT L+ + T T + GAT +
Sbjct: 192 GATGREGATGRDGQTGATGSSGRDGRSGATGLSGE------TGATGRDGRTGATGTDGRD 245
Query: 249 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
GAT LT G T T + GAT + + G + T + G T T +
Sbjct: 246 GQTGATGLTGADGRDGQTGATGRNGQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERGPGGDTGSTGRD 305
Query: 309 FTLGAT 314
GAT
Sbjct: 306 GRTGAT 311
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/304 (26%), Positives = 109/304 (35%), Gaps = 12/304 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T T + GAT GAT + + GAT + GAT + G
Sbjct: 17 TGATGQNGQTGATGRDGIDGRTGATGVDGRDGQTGATGRDGQDGRTGATGADGRDGAKGD 76
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T T + GAT GAT T + GAT T + GAT GA
Sbjct: 77 TGATGQNGLTGATGQDGIDGRTGATGSTGQSGQTGATGTTGRDGQTGATGGVGPTGPTGA 136
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T G+T T GAT + + G+T ++ + GAT + GA
Sbjct: 137 TGSRGNDGRTGSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGAT---GRNGQTGA 193
Query: 182 TEL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
T T + GAT + + GAT L+ + T T + GAT +
Sbjct: 194 TGREGATGRDGQTGATGSSGRDGRSGATGLSGE------TGATGRDGRTGATGTDGRDGQ 247
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT LT G T T + GAT + + G + T + G T T +
Sbjct: 248 TGATGLTGADGRDGQTGATGRNGQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERGPGGDTGSTGRDGR 307
Query: 299 LGAT 302
GAT
Sbjct: 308 TGAT 311
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/371 (24%), Positives = 127/371 (34%), Gaps = 23/371 (6%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T T + GAT GAT + + GAT + GAT +
Sbjct: 15 GQTGATGQNGQTGATGRDGIDGRTGATGVDGRDGQTGATGRDGQDGRTGATGADGRDGAK 74
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T + GAT GAT T + GAT T + GAT
Sbjct: 75 GDTGATGQNGLTGATGQDGIDGRTGATGSTGQSGQTGATGTTGRDGQTGATGGVGPTGPT 134
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT G+T T GAT + + G+T ++ + GAT +
Sbjct: 135 GATGSRGNDGRTGSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGATGRNGQTGAT 194
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T + GAT + + GAT L+ + T T + GAT +
Sbjct: 195 GREGATGRDGQTGATGSSGRDGRSGATGLSGE------TGATGRDGRTGATGTDGRDGQT 248
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
GAT LT G T T ++ Q AT + + G + T +
Sbjct: 249 GATGLTGADGRDGQTGATGRN--------------GQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERG 294
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 419
G T T + GA T ++ G LT T G T T ++ + G T
Sbjct: 295 PGGDTGSTGRDGRTGA---TGQIGATGTNGLTGATGTNGRTGATGEIGSTGRDGRTGATG 351
Query: 420 TLGATELTAKN 430
G T T N
Sbjct: 352 LAGQTGATGSN 362
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 86/334 (25%), Positives = 118/334 (35%), Gaps = 9/334 (2%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T T + GAT GAT + + GAT + GAT +
Sbjct: 15 GQTGATGQNGQTGATGRDGIDGRTGATGVDGRDGQTGATGRDGQDGRTGATGADGRDGAK 74
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + GAT GAT T + GAT T + GAT
Sbjct: 75 GDTGATGQNGLTGATGQDGIDGRTGATGSTGQSGQTGATGTTGRDGQTGATGGVGPTGPT 134
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT G+T T GAT + + G+T ++ + GAT +
Sbjct: 135 GATGSRGNDGRTGSTGATGSNGQTGATGVDGRDGVTGSTGVSGRDGQTGATGRNGQTGAT 194
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
G T + GAT + + GAT L+ ++ + AT +
Sbjct: 195 GREGATGRDGQTGATGSSGRDGRSGATGLSGETGATGRDGRT--------GATGTDGRDG 246
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
GAT LT G T T + GAT + + G + T + G T T +
Sbjct: 247 QTGATGLTGADGRDGQTGATGRNGQTGATGRDGQTGSTGRSGATGERGPGGDTGSTGRDG 306
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSN-TGTVGS 440
GAT T G T T N R+ TG +GS
Sbjct: 307 RTGATGQIGATGTNGLTGATGTNGRTGATGEIGS 340
>gi|163119293|ref|YP_078025.2| hypothetical protein BL03072 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
gi|145902799|gb|AAU22387.2| Hypothetical protein BL03072 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
Length = 1259
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 58/176 (32%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T GAT T GAT GAT T +
Sbjct: 272 GATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGAT---------GATGPTGATGAM 322
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T +T GAT T +G T T G T +T
Sbjct: 323 GPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGAT 382
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
GAT T +G T T G T +T GAT T G T T
Sbjct: 383 GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGATGPTGVTGATGP 438
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 57/176 (32%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T GAT T GAT T GA T
Sbjct: 272 GATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPT 331
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T + GAT T GA +G T T G T +T
Sbjct: 332 GATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGA---------MGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGAT 382
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
GAT T +G T T G T +T GAT T G T T
Sbjct: 383 GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGATGPTGVTGATGP 438
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/265 (26%), Positives = 78/265 (29%), Gaps = 30/265 (11%)
Query: 28 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
+T GAT T GA T G T +T GAT T G T
Sbjct: 183 VTGPTGVTGATGPTGVTGPTGAMGPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTGVTGPTG 242
Query: 88 ---------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 243 AMGPTGATGATGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTG 302
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
GAT GAT T +G T T G T +T GAT T
Sbjct: 303 ATGPTGAT---------GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTG 353
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+G T T G T +T GAT T +G T T G T +T
Sbjct: 354 ATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTG 413
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
GAT T G T T
Sbjct: 414 PTGETGATGPTGATGPTGVTGATGP 438
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/255 (26%), Positives = 76/255 (29%), Gaps = 33/255 (12%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---------- 51
T +T +G T T G T +T GAT T G T
Sbjct: 196 TGVTGPTGAMGPTGATGAT---GPTGVTGSTGVTGATGATGPTGVTGPTGAMGPTGATGA 252
Query: 52 -----------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 100
T GAT T GAT T GAT T GAT
Sbjct: 253 TGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGAT-- 310
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 160
GAT T +G T T G T +T GAT T +G T
Sbjct: 311 -------GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGA 363
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 220
T G T +T GAT T +G T T G T +T GAT
Sbjct: 364 TGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGP 423
Query: 221 TAKVFTLGATELTAK 235
T G T T
Sbjct: 424 TGATGPTGVTGATGP 438
>gi|254725100|ref|ZP_05186883.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A1055]
Length = 670
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/166 (27%), Positives = 65/166 (39%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKV 164
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T +
Sbjct: 320 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 379
Query: 165 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
G+T +T G T T G T T + G+T T + G+T T
Sbjct: 380 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 439
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G+T T + G+T +T + G T T G+T T
Sbjct: 440 GATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATG 485
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/166 (27%), Positives = 65/166 (39%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKV 176
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GA T T +
Sbjct: 320 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 379
Query: 177 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
G+T +T G T T G T T + G+T T + G+T T
Sbjct: 380 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 439
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
G+T T + G+T +T + G T T G+T T
Sbjct: 440 GATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATG 485
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 63/176 (35%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 320 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 379
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 380 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 439
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
GAT T GAT T G+T T + G T T GAT +T
Sbjct: 440 GATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGST------GATGVTGN 489
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 63/176 (35%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 320 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 379
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 380 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 439
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
GAT T GAT T G+T T + G T T GAT +T
Sbjct: 440 GATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGST------GATGVTGN 489
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 20/190 (10%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GAT T
Sbjct: 320 GATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGET 379
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 380 GPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNT 439
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT T GAT T G+T T T T
Sbjct: 440 GATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGP--------------------TGSTGPTG 479
Query: 348 TLGATELTAK 357
+ GAT +T
Sbjct: 480 STGATGVTGN 489
>gi|229186983|ref|ZP_04314137.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus BGSC
6E1]
gi|228596537|gb|EEK54203.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus BGSC
6E1]
Length = 359
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 16 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 75
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 135
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 28 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 40 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 99
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 268 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
T G+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATG 171
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T G T +T + G
Sbjct: 172 NTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/192 (26%), Positives = 71/192 (36%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T T G
Sbjct: 10 STGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTG 69
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G+T +T G T T G+T T G T T G
Sbjct: 70 ETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATG 129
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
+T +T GAT T + GAT T GAT T ++GAT T G
Sbjct: 130 STGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNT------GATGETGPTGSIGATGNTGATGNTG 180
Query: 181 ATELTAKVFTLG 192
T +T + G
Sbjct: 181 ETGVTGPTGSTG 192
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/192 (25%), Positives = 67/192 (34%), Gaps = 1/192 (0%)
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 292 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG 350
T G T T G+T +T V E + AT T G
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 351 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 410
AT T + G T T G T T GAT T ++GAT T G
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTG 180
Query: 411 ATELTAKVFTLG 422
T +T + G
Sbjct: 181 ETGVTGPTGSTG 192
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/159 (25%), Positives = 58/159 (36%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 280 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
T G+T +T GAT T + GAT T
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT---GATGETGPTGSTGATGNTG 156
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/215 (24%), Positives = 74/215 (34%), Gaps = 23/215 (10%)
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 244 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
T G T T G+T +T G T T G+T T G T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 120
Query: 304 LTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 363
T G+T +T + AT T + GAT T GA
Sbjct: 121 ATGNTGATGSTGVTGNT-----------------GATGETGPTGSTGATGNT------GA 157
Query: 364 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
T T ++GAT T G T +T + G
Sbjct: 158 TGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/215 (23%), Positives = 75/215 (34%), Gaps = 23/215 (10%)
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 255
+T G+T T + + G+T G+T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 1 MTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTG 60
Query: 256 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 315
T G T T G+T +T T +T + G+T +T G+T
Sbjct: 61 PTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGN------TGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTG 114
Query: 316 LTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 375
+T + AT T + G T T G T T GA
Sbjct: 115 VTGNT-----------------GATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGA 157
Query: 376 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 410
T T ++GAT T G T +T + G
Sbjct: 158 TGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGSTG 192
>gi|404488100|ref|YP_006712206.1| hypothetical protein BLi00800 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
gi|52347101|gb|AAU39735.1| hypothetical protein BLi00800 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
Length = 1292
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 58/176 (32%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T GAT T GAT GAT T +
Sbjct: 290 GATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGAT---------GATGPTGATGAM 340
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T +T GAT T +G T T G T +T
Sbjct: 341 GPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGAT 400
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
GAT T +G T T G T +T GAT T G T T
Sbjct: 401 GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGATGPTGVTGATGP 456
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 57/176 (32%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T GAT T GAT T GA T
Sbjct: 290 GATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPT 349
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T + GAT T GA +G T T G T +T
Sbjct: 350 GATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGA---------MGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGAT 400
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
GAT T +G T T G T +T GAT T G T T
Sbjct: 401 GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGATGPTGVTGATGP 456
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.52, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/265 (26%), Positives = 78/265 (29%), Gaps = 30/265 (11%)
Query: 28 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
+T GAT T GA T G T +T GAT T G T
Sbjct: 201 VTGPTGVTGATGPTGVTGPTGAMGPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTGVTGPTG 260
Query: 88 ---------------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
T GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 261 AMGPTGATGATGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTG 320
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
GAT GAT T +G T T G T +T GAT T
Sbjct: 321 ATGPTGAT---------GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTG 371
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+G T T G T +T GAT T +G T T G T +T
Sbjct: 372 ATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTG 431
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
GAT T G T T
Sbjct: 432 PTGETGATGPTGATGPTGVTGATGP 456
Score = 40.4 bits (93), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/256 (26%), Positives = 75/256 (29%), Gaps = 30/256 (11%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE--------- 51
AT T GA T G T +T GAT T G T
Sbjct: 210 ATGPTGVTGPTGAMGPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTGVTGPTGAMGPTGATG 269
Query: 52 ------------LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 99
T GAT T GAT T GAT T GAT
Sbjct: 270 ATGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGAT- 328
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
GAT T +G T T G T +T GAT T +G T
Sbjct: 329 --------GATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTG 380
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
T G T +T GAT T +G T T G T +T GAT
Sbjct: 381 ATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATG 440
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAK 235
T G T T
Sbjct: 441 PTGATGPTGVTGATGP 456
>gi|359323099|ref|XP_003639997.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: protein FAM186A [Canis lupus
familiaris]
Length = 2534
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Composition-based stats.
Identities = 97/426 (22%), Positives = 147/426 (34%), Gaps = 26/426 (6%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
LG T +V TLG T + + TL + A TL + + L + A
Sbjct: 1139 LGITLTRQQVQTLGITPTPQQAQERGITLTPEQAQALGITLTPQQAQEQGIILTPQQAQA 1198
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
T+ + A T + + TL + A TL + + L + A
Sbjct: 1199 PGITVTPQQAQAGGITPTPQQAQERGITLTPEQAQALGITLTPQQAQEQGIILTPQQAQA 1258
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
T+ + A TL ++ A+ TL + +L + A TL + A
Sbjct: 1259 PGITVTPQQAQAGGITLTPEQIQARRITLTPQQAQTLGISLTPQQAQAPGITLSPQQAQA 1318
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL--------GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
+ TL ++ A+ TL + A+ TL G T + TLG T +
Sbjct: 1319 RGITLTPEQIQARRITLTPQQAQARGITLTPQQAQAGGRTHTPQQAQTLGVTLTPEQAQA 1378
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
G T + G T + T + TLG T + LG T + T
Sbjct: 1379 QGITLTPEQAQEWGITHTPEQAQAGRITFTPEEAQTLGVTLTPEQAQALGITLTPQQAQT 1438
Query: 299 LGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKV 358
LG T LG T T ++ + I + PQ + A TL + A
Sbjct: 1439 LGVTLTPEPAQALGITLTTQQA------QEQGIILTPQQA----QAPGITLSPQQAQAGG 1488
Query: 359 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 418
TL ++ A+ TL + TLG T + TLG T + G T +
Sbjct: 1489 ITLTPEQIQARRITLTPQQAQ----TLGITLTPQQAQTLGITLTPQQAQAGGRTHTPQQA 1544
Query: 419 FTLGAT 424
TLG T
Sbjct: 1545 QTLGVT 1550
>gi|423627470|ref|ZP_17603219.1| hypothetical protein IK5_00322, partial [Bacillus cereus VD154]
gi|401271689|gb|EJR77696.1| hypothetical protein IK5_00322, partial [Bacillus cereus VD154]
Length = 282
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGET 174
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T GAT T + +
Sbjct: 175 GPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/211 (29%), Positives = 78/211 (36%), Gaps = 15/211 (7%)
Query: 41 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 100
T + GAT T GAT T + G T +T G T LT + +G T
Sbjct: 3 TGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGP 56
Query: 101 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 160
T + GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT
Sbjct: 57 TGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGP 116
Query: 161 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 220
T + G T T + G T LT + G T +T G T +T G T +
Sbjct: 117 TGETGPTGITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGI 167
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
T G T T GAT T + +
Sbjct: 168 TGPTGETGPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 67/187 (35%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGAT 180
Query: 312 GATELTA 318
G T +T
Sbjct: 181 GPTGVTG 187
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/203 (29%), Positives = 75/203 (36%), Gaps = 15/203 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T + G T +T G T LT + +G T T + G
Sbjct: 11 ATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPTG 64
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T + G
Sbjct: 65 ATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPTG 124
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T + G T LT + G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 125 ITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVT------GPTGITGPTGETG 175
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
T T GAT T + +
Sbjct: 176 PTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 149 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
T + GAT T GAT T + G T +T G T LT + +G T
Sbjct: 3 TGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGP 56
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
T + GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT
Sbjct: 57 TGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGP 116
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
T + G T T + G T LT + G T +T G T +T + I
Sbjct: 117 TGETGPTGITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVTGPTGI 167
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 63/176 (35%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T T + G T LT + G T +T G T +T G T T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET---GPTGITGPTGATGPTGVTGPTGITGPTGETGP 176
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/206 (27%), Positives = 70/206 (33%), Gaps = 14/206 (6%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVF 359
G T T + G T LT ++ P I T T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGETGPTGITGLTGET--------GPTGIT---GPTGATGPTGVTGPTGITGPTG 172
Query: 360 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 385
G T T GAT T + +
Sbjct: 173 ETGPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/218 (26%), Positives = 72/218 (33%), Gaps = 26/218 (11%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVIL 323
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T ++
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGET--- 120
Query: 324 EVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 383
T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 121 --------------GPTGITGPTGETGPTGITGLTGETGPTGITGPTGATGPTGVT---- 162
Query: 384 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 421
G T +T G T T GAT T + +
Sbjct: 163 --GPTGITGPTGETGPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 38.1 bits (87), Expect = 9.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/206 (27%), Positives = 68/206 (33%), Gaps = 14/206 (6%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T T G T +T G T LT + +G T T +
Sbjct: 7 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GETGLTGETGPIGITGPTGETGPT 63
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T + GAT T + GAT T G T LT GAT T +
Sbjct: 64 GATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPT 123
Query: 312 GATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
G T T ++ P I T T G T T G T +T
Sbjct: 124 GITGPTGET--------GPTGIT---GLTGETGPTGITGPTGATGPTGVTGPTGITGPTG 172
Query: 372 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 397
G T T GAT T + +
Sbjct: 173 ETGPTGATGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
>gi|338174587|ref|YP_004651397.1| hypothetical protein PUV_05930 [Parachlamydia acanthamoebae UV-7]
gi|336478945|emb|CCB85543.1| hypothetical protein PUV_05930 [Parachlamydia acanthamoebae UV-7]
Length = 1690
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 89/336 (26%), Positives = 97/336 (28%), Gaps = 48/336 (14%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
+GAT T GAT T +G + GAT T G T
Sbjct: 638 MGATGPTGPAGPTGATGATGDAGPIG------PIGPTGATGATGDAGPTGPTGAIGNTGA 691
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
GAT T + GAT T GAT T + GAT T G T T
Sbjct: 692 TGATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGD 751
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------------------GATEL 172
GAT T +G T T G T T GAT
Sbjct: 752 TGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATGD 811
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---------------------GATELTAK 211
GAT T G T LT GAT
Sbjct: 812 AGPTGPTGATGNTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATGDAGP 871
Query: 212 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
+GAT T G T LT + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 872 TGPIGATGDTGATGATGPTGLTG---STGATGNTGDTGATGATGPTGPAGPTGATGATGD 928
Query: 272 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
G T T GAT T GAT T
Sbjct: 929 AGPAGPTGATGNTGATGATGPTGPAGPTGATGATGD 964
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/322 (29%), Positives = 106/322 (32%), Gaps = 15/322 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF---TLGATELTAKVF 57
AT + +G T T G T T + GAT T + GAT T
Sbjct: 655 ATGDAGPIGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGAIGNTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGDTG 714
Query: 58 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
GAT T + GAT T G T T GAT GAT T +
Sbjct: 715 ATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGDTGAT---------GATGPTGPIG 765
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT T G T T G T T + GAT T G T T
Sbjct: 766 PTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTG 825
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
GAT T + GAT T T G T GAT +GAT T
Sbjct: 826 ATGATGPTGLTGSTGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPIGATGDTGATG 885
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G T LT + GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 886 ATGPTGLTG---STGATGNTGDTGATGATGPTGPAGPTGATGATGDAGPAGPTGATGNTG 942
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT T GAT T
Sbjct: 943 ATGATGPTGPAGPTGATGATGD 964
>gi|206971433|ref|ZP_03232383.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1134]
gi|206733418|gb|EDZ50590.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1134]
Length = 321
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 67/204 (32%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T LT + GAT T + +
Sbjct: 214 GLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 63/191 (32%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T GAT +T GAT T G T +T G T T G
Sbjct: 53 ATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITG 112
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T G T +T G T T G T T G T +T G
Sbjct: 113 PTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETG 172
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T +T G T T + G T T G T +T G T LT + G
Sbjct: 173 PTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGET------GPTGITGPTGVTGLTGLTGETGPTG 226
Query: 181 ATELTAKVFTL 191
AT T + +
Sbjct: 227 ATGPTGGIGPI 237
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 61/188 (32%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T GAT +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGIT 93
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 94 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGET 153
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 154 GPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 312 GATELTAK 319
G T LT +
Sbjct: 214 GLTGLTGE 221
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/179 (28%), Positives = 60/179 (33%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGIT 87
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T +T G T T G T T G T +T G T T
Sbjct: 88 GPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGIT 147
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
G T T G T +T G T +T G T T + G T T + I
Sbjct: 148 GPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGI 206
Score = 38.1 bits (87), Expect = 9.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/202 (27%), Positives = 66/202 (32%), Gaps = 6/202 (2%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELTAKV 176
GAT T GAT +T G T +T G T LT GA T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGAT---GVTGLTGITGATGATGPTGITGPT 90
Query: 177 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
G T +T G T +T G+T T G T T G T +T
Sbjct: 91 GITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPT 150
Query: 237 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
G T T G T T G T T G +T G T +T
Sbjct: 151 GETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPT 210
Query: 297 FTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
G T LT + GAT T
Sbjct: 211 GVTGLTGLTGETGPTGATGPTG 232
>gi|237735727|ref|ZP_04566208.1| conserved hypothetical protein [Mollicutes bacterium D7]
gi|229381472|gb|EEO31563.1| conserved hypothetical protein [Coprobacillus sp. D7]
Length = 424
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/241 (27%), Positives = 76/241 (31%), Gaps = 6/241 (2%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT +G T T G+T T GAT T
Sbjct: 30 GATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGST--- 86
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 87 GPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 146
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T G T G T T GAT T G T T +
Sbjct: 147 GEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGAT 206
Query: 276 GATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIK 332
GAT T T GA T GAT T G+T S I+ P+
Sbjct: 207 GATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGSTGAAGASAIIPFASGLPVS 266
Query: 333 I 333
+
Sbjct: 267 L 267
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/222 (28%), Positives = 70/222 (31%), Gaps = 6/222 (2%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT +G T T G+T T GAT T
Sbjct: 30 GATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGST--- 86
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T T + GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 87 GPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 146
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T G T G T T GAT T G T T +
Sbjct: 147 GEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGAT 206
Query: 216 GATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
GAT T T GA T GAT T G+T
Sbjct: 207 GATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGST 248
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/222 (28%), Positives = 70/222 (31%), Gaps = 6/222 (2%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT +G T T G+T T GAT T
Sbjct: 30 GATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGST--- 86
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T T + GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 87 GPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 146
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T G T G T T GAT T G T T +
Sbjct: 147 GEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGAT 206
Query: 228 GATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
GAT T T GA T GAT T G+T
Sbjct: 207 GATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGST 248
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/222 (28%), Positives = 70/222 (31%), Gaps = 6/222 (2%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT +G T T G+T T GAT T
Sbjct: 30 GATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGST--- 86
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T + GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 87 GPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 146
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T G T G T T GAT T G T T +
Sbjct: 147 GEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGAT 206
Query: 240 GATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
GAT T T GA T GAT T G+T
Sbjct: 207 GATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGST 248
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/222 (28%), Positives = 70/222 (31%), Gaps = 6/222 (2%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT +G T T G+T T GAT T
Sbjct: 30 GATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGST--- 86
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 87 GPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 146
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T G T G T T GAT T G T T +
Sbjct: 147 GEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGAT 206
Query: 252 GATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
GAT T T GA T GAT T G+T
Sbjct: 207 GATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGST 248
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/222 (28%), Positives = 70/222 (31%), Gaps = 6/222 (2%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT +G T T G+T T GAT T
Sbjct: 30 GATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGST--- 86
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T + GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 87 GPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 146
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T G T G T T GAT T G T T +
Sbjct: 147 GEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGAT 206
Query: 264 GATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
GAT T T GA T GAT T G+T
Sbjct: 207 GATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGST 248
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/226 (28%), Positives = 73/226 (32%), Gaps = 7/226 (3%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T GAT +G T T G+T T GAT T
Sbjct: 30 GATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGST--- 86
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVI 322
G T T + GAT T + GAT T GAT T GAT T
Sbjct: 87 GPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGAT 146
Query: 323 LEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 382
E P ++ AT T G T T + GAT T G T T +
Sbjct: 147 GEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGE---DGATGATGSTGPTGPTGATGED 203
Query: 383 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 428
GAT T T GA G T T + G T T
Sbjct: 204 GATGATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGSTG 249
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/224 (27%), Positives = 72/224 (32%), Gaps = 6/224 (2%)
Query: 36 GATEL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 92
G T L T + + GA T + GAT T G T + G T T +
Sbjct: 36 GPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGATGED 95
Query: 93 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 152
GAT T + GAT T GAT T GAT T G T
Sbjct: 96 GATGATGSTGPTGSTGATGPTGPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGPT 155
Query: 153 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 212
G T G T T GAT T G T T + GAT T
Sbjct: 156 GATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPT 215
Query: 213 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 256
T GA G T +T G+T T GA+ +
Sbjct: 216 GTNGA---NGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGSTGAAGASAI 256
>gi|423413661|ref|ZP_17390781.1| hypothetical protein IE1_02965, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|401100388|gb|EJQ08383.1| hypothetical protein IE1_02965, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
Length = 344
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 69
G T +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 26 GVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 85
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 86 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 145
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 146 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 176
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGATELTAKV-FTLGATELTAKVF 93
G T +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 26 GVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 85
Query: 94 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 153
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 86 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 145
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 146 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 176
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 117
G T +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 26 GVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 85
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 86 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 145
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 146 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 176
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 165
G T +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 26 GVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 85
Query: 166 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 86 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 145
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 146 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 176
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 213
G T +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 26 GVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 85
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 86 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 145
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 307
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 146 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 176
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 5/154 (3%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF-TLGATELTAKVF 225
G T +T G T +T G T +T +G T T +G T +T
Sbjct: 26 GVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSGGPVGPTGPTGPSGGPIGPTGITGPTG 85
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
GAT +T GAT +T GAT + GAT + GAT +T
Sbjct: 86 PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGITGPTG 145
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 146 PTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 176
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 42/105 (40%), Gaps = 3/105 (2%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
+G T +T GAT +T GAT +T GAT + GAT +
Sbjct: 75 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGP 134
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 115
GAT +T GAT +T G T +T GAT +T
Sbjct: 135 TGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GATGITGP 176
>gi|427793917|gb|JAA62410.1| Putative nucleoporin, partial [Rhipicephalus pulchellus]
Length = 1644
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.041, Method: Composition-based stats.
Identities = 63/195 (32%), Positives = 85/195 (43%), Gaps = 26/195 (13%)
Query: 259 KVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTA-KVFTLG-ATELTAKVFTLGAT--ELTAKVFTLG- 312
K F G++ E +K G++ A K F G TE A F G + E K F G
Sbjct: 1080 KDFKFGSSSEEPSKAINFGSSASEASKAFKFGTGTEEPATPFKFGTSTNEPATKPFKFGT 1139
Query: 313 -ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLG-ATELTAKVFTLGAT------ 364
A+E KS +P K N+ TE AK+F+ G ++E +K G T
Sbjct: 1140 TASEQHTKSFTFGASSEEPTKRAKPNTTTEEAAKLFSFGSSSEQPSKPLKFGCTADEPAK 1199
Query: 365 --------ELTAKVFTLGA-TELTAKVFTLGAT-ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 414
E++AK F GA T+ AK + +T E + F LG K FT G+T +
Sbjct: 1200 LPQAGSGSEVSAKAFKFGASTDEPAKPSPIASTAESASGGFKLGHMAEPGKGFTFGSTTV 1259
Query: 415 T--AKVFTLGATELT 427
AK FT GAT T
Sbjct: 1260 KEPAKPFTFGATPST 1274
>gi|319791964|ref|YP_004153604.1| yada domain-containing protein [Variovorax paradoxus EPS]
gi|315594427|gb|ADU35493.1| YadA domain-containing protein [Variovorax paradoxus EPS]
Length = 657
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.045, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 89/299 (29%), Positives = 137/299 (45%), Gaps = 99/299 (33%)
Query: 170 TELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
+ LTA V TL AT ++ T+LTA + TL AT++++ T LTA
Sbjct: 186 SNLTASNGTVNTLSATNVST-------TDLTANSGTINTLSATDVSS-------TNLTAN 231
Query: 224 ---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFT 274
+ TL AT+++ T LTA + TL AT+++ T LTA + T
Sbjct: 232 SGTINTLSATDVST-------TNLTANSGTINTLSATDVST-------TNLTANSGTINT 277
Query: 275 LGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPI 331
+ AT+++ T LTA + TL AT+++ T LTA S + +
Sbjct: 278 MSATDVST-------TNLTANSGTINTLSATDVST-------TNLTANSGTINTLSATDV 323
Query: 332 KIVPQNSATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTL 385
S T LTA + TL AT+++ T LTA + TL AT+++
Sbjct: 324 ------STTNLTANSGTINTLSATDVST-------TNLTANSGTINTLSATDVST----- 365
Query: 386 GATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKNIRSNTGTV 438
T LTA + TL AT+++ T LTA + TL AT+++ N+ +N+GT+
Sbjct: 366 --TNLTANSGTINTLSATDVST-------TNLTANSGTINTLSATDVSTTNLTANSGTI 415
>gi|443705985|gb|ELU02281.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_56976, partial [Capitella teleta]
Length = 150
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/117 (26%), Positives = 63/117 (53%), Gaps = 5/117 (4%)
Query: 68 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
+ TL A E+T ++ + +TE+T + + E+T + TL A E+T ++ + ++E+T
Sbjct: 4 IQTLSA-EITTEISPISSTEITTDIPPTTSAEITTAIQTLSA-EITTEISPISSSEITTD 61
Query: 128 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
+ +TE+T + + E+T T A E+T ++ + T A +F+ +TE+
Sbjct: 62 IPPTSSTEITTDIPPTTSAEITTDKQTSSA-EITTEIPSSAGTN--AAIFSSSSTEI 115
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/117 (26%), Positives = 63/117 (53%), Gaps = 5/117 (4%)
Query: 116 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
+ TL A E+T ++ + +TE+T + + E+T + TL A E+T ++ + ++E+T
Sbjct: 4 IQTLSA-EITTEISPISSTEITTDIPPTTSAEITTAIQTLSA-EITTEISPISSSEITTD 61
Query: 176 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
+ +TE+T + + E+T T A E+T ++ + T A +F+ +TE+
Sbjct: 62 IPPTSSTEITTDIPPTTSAEITTDKQTSSA-EITTEIPSSAGTN--AAIFSSSSTEI 115
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/117 (26%), Positives = 63/117 (53%), Gaps = 5/117 (4%)
Query: 188 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
+ TL A E+T ++ + +TE+T + + E+T + TL A E+T ++ + ++E+T
Sbjct: 4 IQTLSA-EITTEISPISSTEITTDIPPTTSAEITTAIQTLSA-EITTEISPISSSEITTD 61
Query: 248 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 304
+ +TE+T + + E+T T A E+T ++ + T A +F+ +TE+
Sbjct: 62 IPPTSSTEITTDIPPTTSAEITTDKQTSSA-EITTEIPSSAGTN--AAIFSSSSTEI 115
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/110 (25%), Positives = 59/110 (53%), Gaps = 4/110 (3%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
E+T ++ + +TE+T + + E+T + TL A E+T ++ + ++E+T + +T
Sbjct: 10 EITTEISPISSTEITTDIPPTTSAEITTAIQTLSA-EITTEISPISSSEITTDIPPTSST 68
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 112
E+T + + E+T T A E+T ++ + T A +F+ +TE+
Sbjct: 69 EITTDIPPTTSAEITTDKQTSSA-EITTEIPSSAGTN--AAIFSSSSTEI 115
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/131 (23%), Positives = 64/131 (48%), Gaps = 19/131 (14%)
Query: 236 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
+ TL A E+T ++ + +TE+T + + E+T + TL A E+T ++ + ++E+T
Sbjct: 4 IQTLSA-EITTEISPISSTEITTDIPPTTSAEITTAIQTLSA-EITTEISPISSSEITTD 61
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELT 355
+ +TE+T + + E+T Q S+ E+T ++ + T
Sbjct: 62 IPPTSSTEITTDIPPTTSAEITTDK---------------QTSSAEITTEIPSSAGTN-- 104
Query: 356 AKVFTLGATEL 366
A +F+ +TE+
Sbjct: 105 AAIFSSSSTEI 115
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/97 (27%), Positives = 53/97 (54%), Gaps = 3/97 (3%)
Query: 341 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 400
E+T ++ + +TE+T + + E+T + TL A E+T ++ + ++E+T + +T
Sbjct: 10 EITTEISPISSTEITTDIPPTTSAEITTAIQTLSA-EITTEISPISSSEITTDIPPTSST 68
Query: 401 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKNIRSNTGT 437
E+T + + E+T T A E+T + I S+ GT
Sbjct: 69 EITTDIPPTTSAEITTDKQTSSA-EITTE-IPSSAGT 103
>gi|118478934|ref|YP_896085.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
str. Al Hakam]
gi|118418159|gb|ABK86578.1| conserved hypothetical protein [Bacillus thuringiensis str. Al
Hakam]
Length = 845
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/452 (24%), Positives = 118/452 (26%), Gaps = 24/452 (5%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T + GA T G GAT G
Sbjct: 258 ATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 317
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G T T G T T + GA T G G
Sbjct: 318 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 377
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL------GATELTA 174
AT GAT GAT GAT T GAT
Sbjct: 378 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 437
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT T G T T GA T G + GAT
Sbjct: 438 AQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 497
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELT------AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
GAT GAT T GAT GAT G
Sbjct: 498 AQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAG 557
Query: 289 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFT 348
AT T G T T GA T + V+ P AT T
Sbjct: 558 ATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQ--GPA------GATGATGPQGA 609
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
G T T GAT GAT T G T G +
Sbjct: 610 QGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 666
Query: 409 LGATELTAKVFTLGATELTA-KNIRSNTGTVG 439
GAT GAT T + ++ NTG G
Sbjct: 667 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG 698
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 109/440 (24%), Positives = 115/440 (26%), Gaps = 18/440 (4%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T GA T G GAT G
Sbjct: 168 ATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 227
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G T T GAT GAT T G T T + G
Sbjct: 228 ATGATGPQGAQGNTGAT------GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQG 281
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
A T G GAT GAT T G T T G
Sbjct: 282 AQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 341
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T T + GA T G GAT GAT G
Sbjct: 342 NTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 401
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
AT GAT T G T T GA T GAT G
Sbjct: 402 ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT---GATGPQGAQGNTG 458
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
AT T G T T + V+ P AT GAT
Sbjct: 459 ATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQ--GPAGAT---GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGP 513
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
GAT T G T GA T GA GAT
Sbjct: 514 AGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGAQGN 570
Query: 421 LGATELTA-KNIRSNTGTVG 439
GAT T + + NTG G
Sbjct: 571 TGATGATGPQGAQGNTGATG 590
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.052, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 105/423 (24%), Positives = 110/423 (26%), Gaps = 33/423 (7%)
Query: 21 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 80
F G T T GAT GAT T G T T GA T
Sbjct: 155 FIQGPTGPTGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT 214
Query: 81 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 140
GAT GAT T G T T GAT GAT T
Sbjct: 215 ---GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT------GATGPQGAQGNTGATGATGPQ 265
Query: 141 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 200
G T T + GA T G GAT GAT T
Sbjct: 266 GAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 325
Query: 201 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
G T T G T T + GA T G GAT
Sbjct: 326 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ 385
Query: 261 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
GAT GAT GAT T G T T GA T
Sbjct: 386 GNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT--- 442
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
AT T G T T GA T G +
Sbjct: 443 -----------------GATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQG 485
Query: 381 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTA-KNIRSNTG 436
GAT GAT GAT T GAT T + + NTG
Sbjct: 486 PAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTG 545
Query: 437 TVG 439
G
Sbjct: 546 ATG 548
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.092, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 104/435 (23%), Positives = 108/435 (24%), Gaps = 11/435 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T G T T GA T G GAT G
Sbjct: 198 ATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 257
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G T T + GA T G GAT G
Sbjct: 258 ATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 317
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
AT T G T T G T T + GA T G G
Sbjct: 318 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 377
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
AT GAT GAT GAT T G T T G
Sbjct: 378 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 437
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVF 297
A T G GAT GAT T GAT T
Sbjct: 438 AQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 497
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAK 357
G T T G T + V+ P AT GAT
Sbjct: 498 AQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ--GPAGAT---GATGPQGAQGNTGATGPQGA 552
Query: 358 VFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 414
GAT T GAT T G T T G T GA
Sbjct: 553 QGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGN 612
Query: 415 TAKVFTLGATELTAK 429
T GAT T
Sbjct: 613 TGATGPAGATGATGP 627
>gi|423411693|ref|ZP_17388813.1| hypothetical protein IE1_00997, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|401104841|gb|EJQ12811.1| hypothetical protein IE1_00997, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
Length = 285
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGIT------GATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGIT------GATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGIT------GATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTG---IT 188
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/145 (33%), Positives = 55/145 (37%), Gaps = 9/145 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T G T T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 79 ATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTG 138
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T G
Sbjct: 139 ATGITGATGPTGATGIT------GATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTG---ITG 189
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
AT +T GAT +T GA
Sbjct: 190 ATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.99, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/148 (31%), Positives = 54/148 (36%), Gaps = 11/148 (7%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVP 335
GAT +T GAT +T GAT T GAT +T + P I
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGAT--------GPTGIT- 188
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 363
AT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 --GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
>gi|255094214|ref|ZP_05323692.1| hypothetical protein CdifC_16361, partial [Clostridium difficile
CIP 107932]
Length = 303
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/242 (27%), Positives = 77/242 (31%), Gaps = 39/242 (16%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T GA +T GAT GA +T +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNM 64
Query: 72 GATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
GAT + GA +T GAT GA +T GAT
Sbjct: 65 GATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT---------GANGITGPTGNKGAT 115
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
GAT T G T T GAT LT GA +T GAT
Sbjct: 116 GANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGAT 175
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
G T T GAT T + GA +T +GAT T V G
Sbjct: 176 GAN------GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPD 229
Query: 243 EL 244
L
Sbjct: 230 GL 231
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/242 (27%), Positives = 77/242 (31%), Gaps = 39/242 (16%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T GA +T GAT GA +T +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNM 64
Query: 84 GATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
GAT + GA +T GAT GA +T GAT
Sbjct: 65 GATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT---------GANGITGPTGNKGAT 115
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
GAT T G T T GAT LT GA +T GAT
Sbjct: 116 GANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGAT 175
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
G T T GAT T + GA +T +GAT T V G
Sbjct: 176 GAN------GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPD 229
Query: 255 EL 256
L
Sbjct: 230 GL 231
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/242 (27%), Positives = 77/242 (31%), Gaps = 39/242 (16%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T GA +T GAT GA +T +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNM 64
Query: 108 GATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
GAT + GA +T GAT GA +T GAT
Sbjct: 65 GATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT---------GANGITGPTGNKGAT 115
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
GAT T G T T GAT LT GA +T GAT
Sbjct: 116 GANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGAT 175
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
G T T GAT T + GA +T +GAT T V G
Sbjct: 176 GAN------GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPD 229
Query: 279 EL 280
L
Sbjct: 230 GL 231
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/242 (27%), Positives = 77/242 (31%), Gaps = 39/242 (16%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T GA +T GAT GA +T +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNM 64
Query: 132 GATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
GAT + GA +T GAT GA +T GAT
Sbjct: 65 GATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT---------GANGITGPTGNKGAT 115
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
GAT T G T T GAT LT GA +T GAT
Sbjct: 116 GANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGAT 175
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
G T T GAT T + GA +T +GAT T V G
Sbjct: 176 GAN------GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPD 229
Query: 303 EL 304
L
Sbjct: 230 GL 231
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/242 (27%), Positives = 77/242 (31%), Gaps = 39/242 (16%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T GA +T GAT GA +T +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNM 64
Query: 144 GATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
GAT + GA +T GAT GA +T GAT
Sbjct: 65 GATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT---------GANGITGPTGNKGAT 115
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
GAT T G T T GAT LT GA +T GAT
Sbjct: 116 GANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGAT 175
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
G T T GAT T + GA +T +GAT T V G
Sbjct: 176 GAN------GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPD 229
Query: 315 EL 316
L
Sbjct: 230 GL 231
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/217 (27%), Positives = 70/217 (32%), Gaps = 27/217 (12%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVF 57
AT T GAT T GA +T GAT +T +GAT
Sbjct: 21 ATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTG 74
Query: 58 TL---------GATELTAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 105
+ GA +T GAT +T GAT GAT T
Sbjct: 75 STGPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANG 134
Query: 106 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------TAKVFTLGATE 159
G T T GAT LT GA +T GAT T GAT
Sbjct: 135 ITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATG 194
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 196
T + GA +T +GAT T V G L
Sbjct: 195 PTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPDGL 231
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/256 (26%), Positives = 77/256 (30%), Gaps = 53/256 (20%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT T GA +T GAT GA +T +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGAT---------GANGITGPTGNM 64
Query: 204 GATELTAKVFTL---------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
GAT + GA +T GAT GA +T GAT
Sbjct: 65 GATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGAT---------GANGITGPTGNKGAT 115
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
GAT T G T T GAT LT GA +T GAT
Sbjct: 116 GANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGAT 175
Query: 315 ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 374
N T T GAT T + GA +T +G
Sbjct: 176 GA--------------------NGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIG 215
Query: 375 ATELTAKVFTLGATEL 390
AT T V G L
Sbjct: 216 ATGPTGAVGATGPDGL 231
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/226 (26%), Positives = 72/226 (31%), Gaps = 29/226 (12%)
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKV 272
GAT T GAT T GA +T GAT +T +GAT
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGAT------GANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGANGTT 73
Query: 273 FTL---------GATELTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
+ GA +T GAT +T GAT GAT T +
Sbjct: 74 GSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGAN 133
Query: 321 VILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 380
I N AT LT GA +T GAT G T T
Sbjct: 134 GITGPTGN--TGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGAN------GVTGATG 185
Query: 381 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 426
GAT T + GA +T +GAT T V G L
Sbjct: 186 PTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPDGL 231
>gi|423533158|ref|ZP_17509576.1| hypothetical protein IGI_00990, partial [Bacillus cereus HuB2-9]
gi|402464199|gb|EJV95897.1| hypothetical protein IGI_00990, partial [Bacillus cereus HuB2-9]
Length = 288
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.056, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/154 (32%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 3/154 (1%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + GAT T + GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITGATGITGATGPT 60
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T +
Sbjct: 61 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGST 120
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
GAT T G T T G T T S+
Sbjct: 121 GATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGATGTSI 154
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/155 (32%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T + GAT T + GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITGATGITGATGPT 60
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T +
Sbjct: 61 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGST 120
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 152
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/155 (32%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T + GAT T + GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITGATGITGATGPT 60
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T +
Sbjct: 61 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGST 120
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 152
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/155 (32%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T + GAT T + GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITGATGITGATGPT 60
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T +
Sbjct: 61 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGST 120
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 152
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/155 (32%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + GAT T + GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITGATGITGATGPT 60
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T +
Sbjct: 61 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGST 120
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 152
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/155 (32%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T + GAT T + GAT T GAT T GAT +T
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITGATGITGATGPT 60
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T +
Sbjct: 61 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGST 120
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 152
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/154 (32%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 6/154 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T + GAT T GAT T GAT +T G
Sbjct: 5 ATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGAT---GATGPTGATGITGATGITGATGPTG 61
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T G T +T GAT T GAT T + G
Sbjct: 62 ATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTG 121
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
AT T GAT +T G T T T
Sbjct: 122 ATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 152
>gi|423360591|ref|ZP_17338094.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD022]
gi|401081587|gb|EJP89861.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD022]
Length = 282
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 64/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/163 (28%), Positives = 62/163 (38%), Gaps = 6/163 (3%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
G T T GAT +T G T +T GAT T
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTG 193
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/167 (26%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T + G
Sbjct: 38 PTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGITG 97
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T + G
Sbjct: 98 ATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGITG 151
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
T T GAT +T G T +T GAT T + +
Sbjct: 152 PTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIGPI 198
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/152 (27%), Positives = 58/152 (38%), Gaps = 6/152 (3%)
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T T GAT +T G T +T
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGP 182
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/182 (24%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 20/182 (10%)
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVF 347
GAT T + GAT T G+T +T + + T LT +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLTGV-----------------TGLTGETG 139
Query: 348 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
+G +T + G T T GAT +T G T +T GAT T +
Sbjct: 140 PIG---ITGPIGITGPTGATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTGATGPTGGIG 196
Query: 408 TL 409
+
Sbjct: 197 PI 198
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/143 (27%), Positives = 56/143 (39%), Gaps = 6/143 (4%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T +T G T +T G T +T G T +T G+T +T +
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGIT 96
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T + GAT T G+T +T G T LT + +G +T +
Sbjct: 97 GATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLT---GVTGLTGETGPIG---ITGPIGIT 150
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
G T T GAT +T + I
Sbjct: 151 GPTGATGPTGVTGATGITGPTGI 173
>gi|34528578|dbj|BAC85535.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 1139
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 95/407 (23%), Positives = 179/407 (43%), Gaps = 52/407 (12%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELTA-KVFTLG-ATELTAKVFTLGATELTA-KVF 57
T TA++ +G L A ++ +G L A ++ +G T A++ +G L A ++
Sbjct: 721 THRTARLTMMGTRTLRAARLMMMGTRTLRAARLMMMGTRTHRAARLMMMGTRTLRAARLM 780
Query: 58 TLGATELTA-KVFTLGATELTA-KVFTLG-ATELTAKVFTLGATEL-TAKVFT------- 106
+G L A ++ +G L A ++ +G T TA++ G L TA++
Sbjct: 781 MMGTRTLRAARLMMMGTRTLRAARLMMMGTRTHRTARLMMRGTRTLRTARLMMRGTRTRR 840
Query: 107 -------------------LG-ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT--ELTAKVFTLG 144
+G T TA++ +G L A T+ T TA++ +G
Sbjct: 841 AARLTIMGTRTRRTARLTMMGTRTHRTARLTMMGTRTLRAARLTMMGTRTHRTARLTMMG 900
Query: 145 ATELTA-KVFTLGATELTA-KVFTLG-ATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLG-ATELTAK 199
L A ++ +G L A ++ +G T A++ +G L A ++ +G T A+
Sbjct: 901 TRTLRAARLMMMGTRTLRAARLMMMGTRTHRAARLMMMGTRTLRAARLMMMGTRTRRAAR 960
Query: 200 VFTLGATELTA-KVFTLG-ATELTAKVFTLG-ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT-- 254
+ +G+ L A ++ +G T TA++ +G T TA++ +G L A T+ T
Sbjct: 961 LMMMGSRTLRAARLMMMGTRTHRTARLTMMGTRTHRTARLTMMGTRTLRAARLTMMGTRT 1020
Query: 255 ELTAKVFTLG-ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT--ELTAKVFTLGATELTA-KVFT 310
A++ +G T A++ +G L A T+ T TA++ +G L A ++
Sbjct: 1021 HRAARLTMMGTRTHRAARLTMMGTRTLRAARLTMMGTRTHRTARLTMMGTRTLRAARLMM 1080
Query: 311 LG-ATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTA 356
+G T+ TA+ ++ + +++ + T TA++ +G L A
Sbjct: 1081 MGTRTDRTARLTMMGTRTLRAARLMMMGTRTLRTARLMIMGTRTLRA 1127
>gi|291222761|ref|XP_002731383.1| PREDICTED: tetrameric potassium-selective cyclic nucleotide gated
channel-like, partial [Saccoglossus kowalevskii]
Length = 2240
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 15 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 74
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
F +G T F + T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 ------FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGTFAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 27 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 86
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 39 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 98
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 51 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 110
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 63 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 122
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 75 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 134
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 87 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
F +G T F + T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 ------FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGTFAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 99 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 158
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 111 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
F +G T F + T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 ------FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGTFAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 123 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 183 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 135 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 195 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
F +G T F + T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 ------FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGTFAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 255 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 267 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.069, Method: Composition-based stats.
Identities = 33/156 (21%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 159 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
++ A+++ ++ + + + + +F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2087 DIAAEMYGESSSSFAENNGLIQGSNVFSHIFAVGGTFAVGGTFAVGDTFAVGNTFAVGGT 2146
Query: 219 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
F + T F +G T F +G T F +G T F +G T
Sbjct: 2147 FAVGGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT------FAVGGTLAVGDTFAVGGTFAVDGTFAVGNT 2200
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
FT+G T F + T F +G T
Sbjct: 2201 FAVGGTFTVGGTFAVDGTFAVDGTFAVDGTFAVGGT 2236
>gi|229150630|ref|ZP_04278844.1| hypothetical protein bcere0011_21810 [Bacillus cereus m1550]
gi|228632717|gb|EEK89332.1| hypothetical protein bcere0011_21810 [Bacillus cereus m1550]
Length = 306
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/216 (28%), Positives = 79/216 (36%), Gaps = 15/216 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGIT 75
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 76 GATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGIT 129
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T G T +T G T +T G T T + G T T +
Sbjct: 130 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPT---GETGPTGETGPTGITGPTGETGPT 186
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + G T T + GAT T + +
Sbjct: 187 GITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGPTGGIGPI 222
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/216 (28%), Positives = 79/216 (36%), Gaps = 15/216 (6%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGIT 75
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 76 GATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGIT 129
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T G T +T G T +T G T T + G T T +
Sbjct: 130 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPT---GETGPTGETGPTGITGPTGETGPT 186
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T T + GAT T + +
Sbjct: 187 GITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGPTGGIGPI 222
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/216 (28%), Positives = 79/216 (36%), Gaps = 15/216 (6%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGIT 75
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 76 GATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGIT 129
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T G T +T G T +T G T T + G T T +
Sbjct: 130 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPT---GETGPTGETGPTGITGPTGETGPT 186
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T + G T T + GAT T + +
Sbjct: 187 GITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGPTGGIGPI 222
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/216 (28%), Positives = 79/216 (36%), Gaps = 15/216 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGIT 75
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 76 GATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGIT 129
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T +T G T +T G T +T G T T + G T T +
Sbjct: 130 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPT---GETGPTGETGPTGITGPTGETGPT 186
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T + G T T + GAT T + +
Sbjct: 187 GITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGPTGGIGPI 222
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/216 (28%), Positives = 79/216 (36%), Gaps = 15/216 (6%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGIT 75
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 76 GATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGIT 129
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T +T G T +T G T +T G T T + G T T +
Sbjct: 130 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPT---GETGPTGETGPTGITGPTGETGPT 186
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T + G T T + GAT T + +
Sbjct: 187 GITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGPTGGIGPI 222
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/212 (28%), Positives = 77/212 (36%), Gaps = 15/212 (7%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGIT 75
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 76 GATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGIT 129
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T +T G T +T G T +T G T T + G T T +
Sbjct: 130 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPT---GETGPTGETGPTGITGPTGETGPT 186
Query: 288 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T T + G T T + GAT T
Sbjct: 187 GITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGPTGG 218
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/215 (27%), Positives = 78/215 (36%), Gaps = 15/215 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 23 ATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGITG 76
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T G T +T G T +T G T +T G T +T G
Sbjct: 77 ATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGITG 130
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T +T G T +T G T +T G T T + G T T + G
Sbjct: 131 PTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPT---GETGPTGETGPTGITGPTGETGPTG 187
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
T T + G T T + GAT T + +
Sbjct: 188 ITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGPTGGIGPI 222
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 62/167 (37%), Gaps = 12/167 (7%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGIT------GATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGIT 75
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 76 GATGVT------GLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGIT 129
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
G T +T G T +T G T +T G T T + I
Sbjct: 130 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGI 176
>gi|423642552|ref|ZP_17618170.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD166]
gi|401276401|gb|EJR82356.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD166]
Length = 294
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 192 GATELTAKVFTL 203
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 204 GATELTAKVFTL 215
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 216 GATELTAKVFTL 227
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 228 GATELTAKVFTL 239
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 240 GATELTAKVFTL 251
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 252 GATELTAKVFTL 263
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 264 GATELTAKVFTL 275
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 276 GATELTAKVFTL 287
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 288 GATELTAKVFTL 299
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 300 GATELTAKVFTL 311
GAT T + +
Sbjct: 199 GATGPTGGIGPI 210
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T +T G T +T G T T G T +T G T LT +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPT 198
Query: 312 GATELTA 318
GAT T
Sbjct: 199 GATGPTG 205
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/179 (29%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T + GAT T GAT T + G T T G
Sbjct: 35 ATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTG 94
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T T +G T T GAT +T GAT +T + G T +T G
Sbjct: 95 ITGATGVTGAIGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGAIGITGPTGITGPTGETG 154
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
T +T G T T G T +T G T LT + GAT T + +
Sbjct: 155 PTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPT---GVTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 210
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 12/167 (7%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T + GAT T GAT T + G T +T
Sbjct: 34 GATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGET---GPTGITGPTGAT 90
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T +T GA +T GAT +T GAT +T GAT +T +
Sbjct: 91 GPTGITGATGVTGAIGITGPT---GATGIT------GATGITGPTGITGATGVTGAIGIT 141
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
G T +T G T +T G T T G T +T + +
Sbjct: 142 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGV 188
>gi|225388265|ref|ZP_03757989.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_02000 [Clostridium asparagiforme
DSM 15981]
gi|225045675|gb|EEG55921.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_02000 [Clostridium asparagiforme
DSM 15981]
Length = 390
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/160 (26%), Positives = 53/160 (33%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T T T G + GAT +G T T GAT T
Sbjct: 72 GPTGPTGATGTNGMNGIMGPTGPTGATGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPT--- 128
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GA +T GAT +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 129 GANGITGPTGANGATGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPT 188
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
GA +T GA +T GAT +T G T
Sbjct: 189 GANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGATGVTGPTGPTGNTN 228
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/160 (26%), Positives = 53/160 (33%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G T T T G + GAT +G T T GAT T
Sbjct: 72 GPTGPTGATGTNGMNGIMGPTGPTGATGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPT--- 128
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GA +T GAT +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 129 GANGITGPTGANGATGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPT 188
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
GA +T GA +T GAT +T G T
Sbjct: 189 GANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGATGVTGPTGPTGNTN 228
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/160 (26%), Positives = 53/160 (33%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T T G + GAT +G T T GAT T
Sbjct: 72 GPTGPTGATGTNGMNGIMGPTGPTGATGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPT--- 128
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GA +T GAT +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 129 GANGITGPTGANGATGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPT 188
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
GA +T GA +T GAT +T G T
Sbjct: 189 GANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGATGVTGPTGPTGNTN 228
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/160 (26%), Positives = 53/160 (33%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T T G + GAT +G T T GAT T
Sbjct: 72 GPTGPTGATGTNGMNGIMGPTGPTGATGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPT--- 128
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GA +T GAT +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 129 GANGITGPTGANGATGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPT 188
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
GA +T GA +T GAT +T G T
Sbjct: 189 GANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGATGVTGPTGPTGNTN 228
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/160 (26%), Positives = 53/160 (33%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T T G + GAT +G T T GAT T
Sbjct: 72 GPTGPTGATGTNGMNGIMGPTGPTGATGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPT--- 128
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GA +T GAT +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 129 GANGITGPTGANGATGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPT 188
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 315
GA +T GA +T GAT +T G T
Sbjct: 189 GANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGATGVTGPTGPTGNTN 228
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/159 (26%), Positives = 52/159 (32%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T T T G + GAT +G T T GAT T G
Sbjct: 73 PTGPTGATGTNGMNGIMGPTGPTGATGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPT---G 129
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
A +T GAT +T GA +T GA +T GA +T G
Sbjct: 130 ANGITGPTGANGATGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTG 189
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
A +T GA +T GAT +T G T
Sbjct: 190 ANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGATGVTGPTGPTGNTN 228
>gi|396475880|ref|XP_003839882.1| hypothetical protein LEMA_P106680.1 [Leptosphaeria maculans JN3]
gi|312216453|emb|CBX96403.1| hypothetical protein LEMA_P106680.1 [Leptosphaeria maculans JN3]
Length = 888
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.095, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/332 (17%), Positives = 148/332 (44%), Gaps = 26/332 (7%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L ++ + T+L + + G
Sbjct: 167 PTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTELLSALPTDLIPGILS-G 225
Query: 61 -------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 113
T + ++ + T+L V + T+L ++ + T L ++ + T+L
Sbjct: 226 LPTDVPLPTNIVPEILSAIPTDLLPGVLSALPTDLVPEILSGLPTALPTEILSALPTDLI 285
Query: 114 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
++ + T L ++ + T+L +V + G T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 286 PEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSAL 344
Query: 169 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAK 223
T+L ++ + T L ++ + T+L +V + G T+L ++ + T L +
Sbjct: 345 PTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTE 403
Query: 224 VFTLGATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
+ + T+L +V + G T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T
Sbjct: 404 ILSALPTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPT 462
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
L ++ + T+L ++ + T+L ++ +
Sbjct: 463 ALPTEILSALPTDLIPEILSAIPTDLVPEILS 494
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/408 (17%), Positives = 172/408 (42%), Gaps = 44/408 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T L ++ + T+L + + T L ++ ++ T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 131 PTNLVPEILSGLPTDLVPGILSALPTALPTEILSVLPTDLIPEILSGLPTALPTEILSAL 190
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T+L ++ + T L ++ + T+L + + T++ T + ++ +
Sbjct: 191 PTDLIPEILSGLPTALPTELLSALPTDLIPGILSGLPTDVPLP------TNIVPEILSAI 244
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T+L V + T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 245 PTDLLPGVLSALPTDLVPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSAL 304
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T+L +V + AT L T+L ++ + T L ++ + T+L ++ +
Sbjct: 305 PTDLIPEVLSGLATAL--------PTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGL 356
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
T L ++ + T+L +V + AT L T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 357 PTALPTEILSALPTDLIPEVLSGLATAL--------PTDLIPEILSGLPTALPTEILSAL 408
Query: 301 ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFT 360
T+L +V + AT L T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 409 PTDLIPEVLSGLATAL----------------------PTDLIPEILSGLPTALPTEILS 446
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T+L ++ +
Sbjct: 447 ALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSAIPTDLVPEILS 494
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/305 (18%), Positives = 134/305 (43%), Gaps = 22/305 (7%)
Query: 25 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 84
T + ++ + T+L V + T+L ++ + T L ++ + T+L ++ +
Sbjct: 233 PTNIVPEILSAIPTDLLPGVLSALPTDLVPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGL 292
Query: 85 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 139
T L ++ + T+L +V + G T+L ++ + T L ++ + T+L +
Sbjct: 293 PTALPTEILSALPTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPE 351
Query: 140 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
+ + T L ++ + T+L +V + G T+L ++ + T L ++ + T
Sbjct: 352 ILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPT 410
Query: 195 ELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
+L +V + G T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L ++
Sbjct: 411 DLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTEIL 469
Query: 250 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVF----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 305
+ T+L ++ + T+L ++ T T + ++ + T+L V + T L
Sbjct: 470 SALPTDLIPEILSAIPTDLVPEILSALPTALPTNIVPEILSALPTDLVPGVLSALPTNLL 529
Query: 306 AKVFT 310
V +
Sbjct: 530 PGVIS 534
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/372 (17%), Positives = 164/372 (44%), Gaps = 20/372 (5%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
T L ++ + T+L + + T L ++ ++ T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 131 PTNLVPEILSGLPTDLVPGILSALPTALPTEILSVLPTDLIPEILSGLPTALPTEILSAL 190
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T+L ++ + T L ++ + T+L + + T++ T + ++ +
Sbjct: 191 PTDLIPEILSGLPTALPTELLSALPTDLIPGILSGLPTDVPLP------TNIVPEILSAI 244
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
T+L V + T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 245 PTDLLPGVLSALPTDLVPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSAL 304
Query: 241 ATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
T+L +V + G T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L +
Sbjct: 305 PTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTE 363
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKP-------IKIVPQNSATELTAKVFT 348
+ + T+L +V + AT L +I E+ P + +P + E+ + + T
Sbjct: 364 ILSALPTDLIPEVLSGLATAL-PTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEVLSGLAT 422
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L ++ + T+L ++ +
Sbjct: 423 ALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILS 482
Query: 409 LGATELTAKVFT 420
T+L ++ +
Sbjct: 483 AIPTDLVPEILS 494
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/329 (18%), Positives = 142/329 (43%), Gaps = 30/329 (9%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
T+L V + T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L ++ +
Sbjct: 245 PTDLLPGVLSALPTDLVPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSAL 304
Query: 61 ATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 115
T+L +V + G T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L +
Sbjct: 305 PTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTE 363
Query: 116 VFTLGATELTAKVFTLG-----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG-- 168
+ + T+L +V + G T+L ++ + T L ++ + T+L +V + G
Sbjct: 364 ILSALPTDLIPEVLS-GLATALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEVLS-GLA 421
Query: 169 ---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
T+L ++ + T L ++ + T+L ++ + T L ++ + T+L ++
Sbjct: 422 TALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEILSGLPTALPTEILSALPTDLIPEIL 481
Query: 226 TLGATELTAKVF----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 281
+ T+L ++ T T + ++ + T+L V + T L V + ++L
Sbjct: 482 SAIPTDLVPEILSALPTALPTNIVPEILSALPTDLVPGVLSALPTNLLPGVISALPSQL- 540
Query: 282 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
T+L V + T+L + +
Sbjct: 541 -------PTDLLPGVISAIPTDLLPGILS 562
>gi|423631238|ref|ZP_17606985.1| hypothetical protein IK5_04088 [Bacillus cereus VD154]
gi|401264018|gb|EJR70132.1| hypothetical protein IK5_04088 [Bacillus cereus VD154]
Length = 297
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/135 (32%), Positives = 53/135 (39%), Gaps = 6/135 (4%)
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 94
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 95 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 148
Query: 307 KVFTLGATELTAKSV 321
G T T S+
Sbjct: 149 ATGATGPTGATGTSI 163
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 94
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 95 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 148
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFT 142
G T T T
Sbjct: 149 ATGATGPTGATGTSIT 164
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 43 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 94
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 95 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 148
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFT 178
G T T T
Sbjct: 149 ATGATGPTGATGTSIT 164
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 79 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 138
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 94
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 95 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 148
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFT 214
G T T T
Sbjct: 149 ATGATGPTGATGTSIT 164
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 94
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 95 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 148
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFT 250
G T T T
Sbjct: 149 ATGATGPTGATGTSIT 164
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 94
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 95 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 148
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFT 286
G T T T
Sbjct: 149 ATGATGPTGATGTSIT 164
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 35 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 94
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 95 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 148
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFT 310
G T T T
Sbjct: 149 ATGATGPTGATGTSIT 164
>gi|410658573|ref|YP_006910944.1| hypothetical protein DHBDCA_p1933 [Dehalobacter sp. DCA]
gi|410661560|ref|YP_006913931.1| hypothetical protein DCF50_p1944 [Dehalobacter sp. CF]
gi|409020928|gb|AFV02959.1| hypothetical protein DHBDCA_p1933 [Dehalobacter sp. DCA]
gi|409023916|gb|AFV05946.1| hypothetical protein DCF50_p1944 [Dehalobacter sp. CF]
Length = 1323
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 123/462 (26%), Positives = 193/462 (41%), Gaps = 119/462 (25%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
T G E+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++V A E T G E
Sbjct: 771 TFGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEV---AAIEGAVFSPTFGLAE 825
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++V A E T G E+ +VF
Sbjct: 826 IKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEV---AAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVF 880
Query: 118 TLG------ATELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--TLGATELTAKVFTLG------AT 158
++G T L F+LG + + VF T G E+ +VF++G T
Sbjct: 881 SIGTLVEGIYTTLVGSTFSLGEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYT 940
Query: 159 ELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--TLGATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGA 205
L F+L + + VF T G E+ +VF++G T L F+LG
Sbjct: 941 ALVGSTFSLQEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVGSTFSLGE 1000
Query: 206 TE-----LTAKVF--TLGATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATE-----LTAK 247
+ + VF T G E+ +VF++G T L + F+LG + +
Sbjct: 1001 IKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVSSTFSLGEIKSEVAAIEGA 1060
Query: 248 VF--TLGATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--TLGATEL 292
VF T G E+ +VF++G T L F+LG + + VF T G E+
Sbjct: 1061 VFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVGSTFSLGEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEI 1120
Query: 293 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEY---YKPIKIVPQNSATELTAKVFTL 349
+VF++G L +FT E + S +E Y Y P T
Sbjct: 1121 KTEVFSIGT--LVEAIFT--TVENLSGSTFIEAIYTAVYSP-----------------TF 1159
Query: 350 GATELTAKVFTLGATELTAKVF------TLGATELTAKVFTL 385
G E+ +VF++G L V+ T G E+ +VF L
Sbjct: 1160 GLAEIKTEVFSIGT--LVEGVYTAIYSPTFGLEEIKTEVFQL 1199
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 138/528 (26%), Positives = 235/528 (44%), Gaps = 138/528 (26%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKV---------FTLGATELTA 54
T G E+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++V T G E+
Sbjct: 281 TFGLAEIKTEVFSIGT--LLESIYTSIIGATFGLAEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKT 338
Query: 55 KVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKV---------FTLGATELTAKVFTLGATE 99
+VF++G L ++T +GAT E+ ++V T G E+ +VF++G
Sbjct: 339 EVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGT-- 394
Query: 100 LTAKVFT--LGAT----ELTAKV---------FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-- 142
L ++T +GAT E+ ++V T G E+ +VF++G L ++T
Sbjct: 395 LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSI 452
Query: 143 LGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT-- 194
+GAT E+ ++V A E T G E+ +VF++G L ++T +GAT
Sbjct: 453 IGATFGLAEIKSEV---AAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFG 507
Query: 195 --ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATE--- 243
E+ ++V A E T G E+ +VF++G T L F+LG +
Sbjct: 508 LAEIKSEV---AAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVGSTFSLGEIKSEV 564
Query: 244 --LTAKVF--TLGATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--T 286
+ VF T G E+ +VF++G T L + F+L + + VF T
Sbjct: 565 AAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVSSTFSLQEIKSEVAAIEGAVFSPT 624
Query: 287 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSAT 340
G E+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++ +E + P
Sbjct: 625 FGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEVAAIEGAVFS-----PTFGLA 677
Query: 341 ELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--TLGATELTAKVFTLG- 386
E+ +VF++G T L + F+LG + + VF T G E+ +VF++G
Sbjct: 678 EIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVSSTFSLGEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGT 737
Query: 387 -----ATELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--TLGATELTAKVFTLG 422
T L + F+LG + + VF T G E+ +VF++G
Sbjct: 738 LVEGIYTTLVSSTFSLGEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIG 785
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 141/532 (26%), Positives = 233/532 (43%), Gaps = 140/532 (26%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
T G E+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++V A E T G E
Sbjct: 379 TFGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEV---AAIEGAVFSPTFGLAE 433
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++V A E T G E+ +VF
Sbjct: 434 IKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEV---AAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVF 488
Query: 118 TLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKV---------FTLGATELTAKVFTLG------ 156
++G L ++T +GAT E+ ++V T G E+ +VF++G
Sbjct: 489 SIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGI 546
Query: 157 ATELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--TLGATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTL 203
T L F+LG + + VF T G E+ +VF++G T L + F+L
Sbjct: 547 YTTLVGSTFSLGEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVSSTFSL 606
Query: 204 GATE-----LTAKVF--TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKV-- 248
+ + VF T G E+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++V
Sbjct: 607 QEIKSEVAAIEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEVAA 664
Query: 249 -------FTLGATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATE-----LTAKVF--TLG 288
T G E+ +VF++G T L + F+LG + + VF T G
Sbjct: 665 IEGAVFSPTFGLAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVSSTFSLGEIKSEVAAIEGAVFSPTFG 724
Query: 289 ATELTAKVFTLG------ATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATEL 342
E+ +VF++G T L + F+LG E+ ++ +E + P
Sbjct: 725 LAEIKTEVFSIGTLVEGIYTTLVSSTFSLG--EIKSEVAAIEGAVFSP------------ 770
Query: 343 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGAT----ELTAKVFTLGATELTAKVFT 396
T G E+ +VF++G L ++T +GAT E+ ++V A E T
Sbjct: 771 -----TFGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGATFGLAEIKSEV---AAIEGAVFSPT 820
Query: 397 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFT--LGATELTAKNIRSNT----GTVGSPT 442
G E+ +VF++G L ++T +GAT I+S G V SPT
Sbjct: 821 FGLAEIKTEVFSIGT--LIESIYTSIIGAT-FGLAEIKSEVAAIEGAVFSPT 869
>gi|423065841|ref|ZP_17054631.1| hypothetical protein SPLC1_S360350 [Arthrospira platensis C1]
gi|406712599|gb|EKD07783.1| hypothetical protein SPLC1_S360350 [Arthrospira platensis C1]
Length = 96
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 11 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 23 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 81
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 82 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 108
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 35 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 93
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 94 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 47 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 105
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 106 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 59 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 144
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 71 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 83 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 141
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 142 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 168
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 95 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 153
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 154 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 107 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 165
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 166 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 192
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 119 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 178 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 204
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 131 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 190 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 216
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 143 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 201
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 202 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 228
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 155 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 213
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 214 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 167 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 226 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 252
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 179 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 237
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 238 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 264
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 191 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 250 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 203 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 261
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 262 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 288
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 215 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 300
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/87 (33%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 1/87 (1%)
Query: 227 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 286 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
LG+T +T LG+T +TAK +G
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 14 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 73
Query: 409 LGATELTAKVFTLG 422
LG+T +TAK +G
Sbjct: 74 LGSTTVTAKPPDVG 87
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/90 (32%), Positives = 45/90 (50%), Gaps = 1/90 (1%)
Query: 239 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 298 TLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEY 327
LG+T +T LG+T +TAK + Y
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPDVGFHY 90
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/82 (34%), Positives = 43/82 (52%), Gaps = 1/82 (1%)
Query: 349 LGATELTAKVFT-LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 407
+G+T + LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 1 MGSTLYPPNLLNMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPL 60
Query: 408 TLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 61 MLGSTTVTENPLMLGSTTVTAK 82
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/72 (34%), Positives = 38/72 (52%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG
Sbjct: 16 STTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLG 75
Query: 61 ATELTAKVFTLG 72
+T +TAK +G
Sbjct: 76 STTVTAKPPDVG 87
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/72 (34%), Positives = 38/72 (52%)
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG
Sbjct: 16 STTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLG 75
Query: 399 ATELTAKVFTLG 410
+T +TAK +G
Sbjct: 76 STTVTAKPPDVG 87
>gi|209523569|ref|ZP_03272123.1| uncharacterized protein with threonine repeats [Arthrospira
maxima CS-328]
gi|209495974|gb|EDZ96275.1| uncharacterized protein with threonine repeats [Arthrospira
maxima CS-328]
Length = 84
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 71 LGATELTAKVFTLG 84
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 82
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 83 LGATELTAKVFTLG 96
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 95 LGATELTAKVFTLG 108
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 107 LGATELTAKVFTLG 120
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 119 LGATELTAKVFTLG 132
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 131 LGATELTAKVFTLG 144
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 143 LGATELTAKVFTLG 156
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 155 LGATELTAKVFTLG 168
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 167 LGATELTAKVFTLG 180
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 179 LGATELTAKVFTLG 192
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 191 LGATELTAKVFTLG 204
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 203 LGATELTAKVFTLG 216
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 215 LGATELTAKVFTLG 228
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 227 LGATELTAKVFTLG 240
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 239 LGATELTAKVFTLG 252
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 251 LGATELTAKVFTLG 264
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 263 LGATELTAKVFTLG 276
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 275 LGATELTAKVFTLG 288
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 287 LGATELTAKVFTLG 300
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 299 LGATELTAKVFTLG 312
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/74 (36%), Positives = 40/74 (54%)
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 409 LGATELTAKVFTLG 422
LG+T +TAK +G
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVG 75
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/77 (35%), Positives = 40/77 (51%)
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 311 LGATELTAKSVILEVEY 327
LG+T +TAK + Y
Sbjct: 62 LGSTTVTAKPPDVGFHY 78
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/69 (37%), Positives = 38/69 (55%)
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLM 61
Query: 421 LGATELTAK 429
LG+T +TAK
Sbjct: 62 LGSTTVTAK 70
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/72 (34%), Positives = 38/72 (52%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG
Sbjct: 4 STTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLG 63
Query: 61 ATELTAKVFTLG 72
+T +TAK +G
Sbjct: 64 STTVTAKPPDVG 75
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/72 (34%), Positives = 38/72 (52%)
Query: 339 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 398
+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG
Sbjct: 4 STTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLG 63
Query: 399 ATELTAKVFTLG 410
+T +TAK +G
Sbjct: 64 STTVTAKPPDVG 75
>gi|423549522|ref|ZP_17525849.1| hypothetical protein IGW_00153, partial [Bacillus cereus ISP3191]
gi|401191062|gb|EJQ98092.1| hypothetical protein IGW_00153, partial [Bacillus cereus ISP3191]
Length = 282
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/283 (22%), Positives = 94/283 (33%), Gaps = 33/283 (11%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G+T T + G T T G+T +T G T +T G T T
Sbjct: 7 GSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGVT 66
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAK------------------------VFTLGATELTAKVFTL 119
G+T T + G T T + G T T
Sbjct: 67 GSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGVT 126
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T + G T T + G+T T G+T T + G+T T
Sbjct: 127 GSTGPTGETGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGNTGVT 186
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G+T T G T T + G T T + G+T +T G+T +T +
Sbjct: 187 GSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGETGPT 246
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
G+T +T +T G+T +T + GAT T
Sbjct: 247 GSTGVTG---------VTGNTGATGSTGVTGPTGSTGATGSTG 280
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/283 (22%), Positives = 94/283 (33%), Gaps = 33/283 (11%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G+T T + G T T G+T +T G T +T G T T
Sbjct: 7 GSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGVT 66
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAK------------------------VFTLGATELTAKVFTL 131
G+T T + G T T + G T T
Sbjct: 67 GSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGVT 126
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G+T T + G T T + G+T T G+T T + G+T T
Sbjct: 127 GSTGPTGETGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGNTGVT 186
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G+T T G T T + G T T + G+T +T G+T +T +
Sbjct: 187 GSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGETGPT 246
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
G+T +T +T G+T +T + GAT T
Sbjct: 247 GSTGVTG---------VTGNTGATGSTGVTGPTGSTGATGSTG 280
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/283 (22%), Positives = 94/283 (33%), Gaps = 33/283 (11%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G+T T + G T T G+T +T G T +T G T T
Sbjct: 7 GSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGVT 66
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAK------------------------VFTLGATELTAKVFTL 143
G+T T + G T T + G T T
Sbjct: 67 GSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGVT 126
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G+T T + G T T + G+T T G+T T + G+T T
Sbjct: 127 GSTGPTGETGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGNTGVT 186
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G+T T G T T + G T T + G+T +T G+T +T +
Sbjct: 187 GSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGETGPT 246
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
G+T +T +T G+T +T + GAT T
Sbjct: 247 GSTGVTG---------VTGNTGATGSTGVTGPTGSTGATGSTG 280
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/283 (22%), Positives = 94/283 (33%), Gaps = 33/283 (11%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G+T T + G T T G+T +T G T +T G T T
Sbjct: 7 GSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGVT 66
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAK------------------------VFTLGATELTAKVFTL 155
G+T T + G T T + G T T
Sbjct: 67 GSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGVT 126
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G+T T + G T T + G+T T G+T T + G+T T
Sbjct: 127 GSTGPTGETGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGNTGVT 186
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G+T T G T T + G T T + G+T +T G+T +T +
Sbjct: 187 GSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGETGPT 246
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
G+T +T +T G+T +T + GAT T
Sbjct: 247 GSTGVTG---------VTGNTGATGSTGVTGPTGSTGATGSTG 280
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.92, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/264 (23%), Positives = 92/264 (34%), Gaps = 27/264 (10%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T +T G T T + G+T T + G+T +T G T T G
Sbjct: 26 STGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGNTGSTGNTGPTG 85
Query: 61 ATEL------------------TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
+T + T + G T T G+T T + G T T
Sbjct: 86 STGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGNTGPTG 145
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+ G+T T G+T T + G+T T G+T T G T T
Sbjct: 146 ETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGNTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTG 205
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+ G T T + G+T +T G+T +T + G+T +T +T
Sbjct: 206 ETGAPGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGETGPTGSTGVTG---------VTG 256
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
G+T +T + GAT T
Sbjct: 257 NTGATGSTGVTGPTGSTGATGSTG 280
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/263 (23%), Positives = 92/263 (34%), Gaps = 21/263 (7%)
Query: 77 TAKVFTLGATE---LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T + GAT T + G+T +T G T T + G+T T + G+
Sbjct: 3 TGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGS 62
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL------------------TAKVFTLGATELTAK 175
T +T G T T G+T + T + G T T
Sbjct: 63 TGVTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGS 122
Query: 176 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
G+T T + G T T + G+T T G+T T + G+T T
Sbjct: 123 TGVTGSTGPTGETGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGN 182
Query: 236 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
G+T T G T T + G T T + G+T +T G+T +T +
Sbjct: 183 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGE 242
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
G+T +T GAT T
Sbjct: 243 TGPTGSTGVTGVTGNTGATGSTG 265
>gi|228960792|ref|ZP_04122429.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar pakistani str. T13001]
gi|228798877|gb|EEM45854.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar pakistani str. T13001]
Length = 311
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/135 (32%), Positives = 53/135 (39%), Gaps = 6/135 (4%)
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 49 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 108
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 109 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 162
Query: 307 KVFTLGATELTAKSV 321
G T T S+
Sbjct: 163 ATGATGPTGATGTSI 177
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 49 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 108
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 109 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 162
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFT 142
G T T T
Sbjct: 163 ATGATGPTGATGTSIT 178
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 43 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 102
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 49 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 108
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 109 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 162
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFT 178
G T T T
Sbjct: 163 ATGATGPTGATGTSIT 178
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 79 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 138
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 49 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 108
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 109 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 162
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFT 214
G T T T
Sbjct: 163 ATGATGPTGATGTSIT 178
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 49 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 108
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 109 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 162
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFT 250
G T T T
Sbjct: 163 ATGATGPTGATGTSIT 178
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 49 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 108
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 109 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 162
Query: 271 KVFTLGATELTAKVFT 286
G T T T
Sbjct: 163 ATGATGPTGATGTSIT 178
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/136 (32%), Positives = 52/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
KV G T T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 49 KVGPTGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 108
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT T + GAT T G T +T GAT +T
Sbjct: 109 ATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGVTGDTGPTGITGATGPTGATGVTG 162
Query: 295 KVFTLGATELTAKVFT 310
G T T T
Sbjct: 163 ATGATGPTGATGTSIT 178
>gi|423640407|ref|ZP_17616025.1| hypothetical protein IK9_00352 [Bacillus cereus VD166]
gi|401280902|gb|EJR86818.1| hypothetical protein IK9_00352 [Bacillus cereus VD166]
Length = 378
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 82
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 143 LGATEL 148
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 155 LGATEL 160
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 167 LGATEL 172
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 179 LGATEL 184
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 191 LGATEL 196
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 203 LGATEL 208
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 215 LGATEL 220
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 227 LGATEL 232
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 239 LGATEL 244
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 251 LGATEL 256
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 275 LGATEL 280
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 287 LGATEL 292
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/126 (33%), Positives = 52/126 (41%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
G T T + GAT T GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 299 LGATEL 304
GAT +
Sbjct: 177 TGATGI 182
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.51, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/120 (32%), Positives = 49/120 (40%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T T + I
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGI 182
>gi|313898774|ref|ZP_07832308.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
gi|312956356|gb|EFR37990.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
Length = 541
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 57/170 (33%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T +GAT T G T GAT T GAT T
Sbjct: 133 GATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGAT 192
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T + G T T GAT +T +G T T GAT T
Sbjct: 193 GVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPT------GATGSTGAAGAT 246
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
G T T + G T T GAT +T +G T T GA
Sbjct: 247 GVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 296
>gi|423541579|ref|ZP_17517970.1| hypothetical protein IGK_03671 [Bacillus cereus HuB4-10]
gi|401171423|gb|EJQ78653.1| hypothetical protein IGK_03671 [Bacillus cereus HuB4-10]
Length = 339
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT +T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
GAT +T G T T T
Sbjct: 181 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT +T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
GAT +T G T T T
Sbjct: 181 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T GAT +T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
GAT +T G T T T
Sbjct: 181 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T GAT +T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
GAT +T G T T T
Sbjct: 181 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T GAT +T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
GAT +T G T T T
Sbjct: 181 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/128 (32%), Positives = 48/128 (37%)
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T GAT +T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 312 GATELTAK 319
GAT +T
Sbjct: 181 GATGITGP 188
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/142 (30%), Positives = 51/142 (35%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 62 STGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 121
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T GAT +T GAT T GAT T G+T T G
Sbjct: 122 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPTG 181
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
AT +T G T T T
Sbjct: 182 ATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.99, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/154 (32%), Positives = 57/154 (37%), Gaps = 9/154 (5%)
Query: 13 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 72
AT T + GAT T GAT T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 59 ATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPT---GATGIT------GATGITGATGPTG 109
Query: 73 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 132
AT +T GAT T GAT +T GAT T GAT T G
Sbjct: 110 ATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATG 169
Query: 133 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
+T T GAT +T G T T T
Sbjct: 170 STGATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/145 (31%), Positives = 53/145 (36%), Gaps = 3/145 (2%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T GAT +T GAT T GAT T G+T T
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 300 GATELTAKVF---TLGATELTAKSV 321
GAT +T G T T S+
Sbjct: 181 GATGITGPTGATGDTGPTGATGTSI 205
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/155 (31%), Positives = 58/155 (37%), Gaps = 12/155 (7%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT +T GAT T + GAT +T G T T +
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGITGAT---GPTGPTGATGST 171
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 172 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/155 (31%), Positives = 58/155 (37%), Gaps = 12/155 (7%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT +T GAT T + GAT +T G T T +
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGITGAT---GPTGPTGATGST 171
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 172 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/155 (31%), Positives = 58/155 (37%), Gaps = 12/155 (7%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT T GAT +T GAT T + GAT +T G T T +
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGITGAT---GPTGPTGATGST 171
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 172 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/155 (31%), Positives = 58/155 (37%), Gaps = 12/155 (7%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT +T GAT T + GAT +T G T T +
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGIT------GATGPTGATGSTGATGITGAT---GPTGPTGATGST 171
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
GAT T GAT +T G T T T
Sbjct: 172 GATGATGPT---GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 203
>gi|150864554|ref|XP_001383416.2| Nucleoskeletal protein [Scheffersomyces stipitis CBS 6054]
gi|149385810|gb|ABN65387.2| Nucleoskeletal protein [Scheffersomyces stipitis CBS 6054]
Length = 1019
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/220 (32%), Positives = 99/220 (45%), Gaps = 25/220 (11%)
Query: 123 ELTAKV-FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV-FTLGA--TELTAKVFT 178
E+T K FT G + T +L + +F+ T K F+ GA +E + FT
Sbjct: 666 EITPKSTFTFG-DKNTPPTLSLEKEKKDQIIFSKPDENSTDKPAFSFGAPISEKKTEGFT 724
Query: 179 LGA--TELTAKVFTLGA--TELTAKVFTLGA--TELTAKVFTLGA--TELTAKVFTLGA- 229
GA +E + FT GA +E + FT GA +E + FT GA +E ++ FT GA
Sbjct: 725 FGAPSSEKKTEGFTFGAPSSEKKTEGFTFGAPSSEKKTEGFTFGAPSSEKKSEGFTFGAP 784
Query: 230 -TELTAKVFTLGATELTAKV--FTLGA--TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
+E ++ FT GA K FT GA TE + T G +E AK G + A
Sbjct: 785 SSEKKSEGFTFGAPSAEKKTEGFTFGAPSTEKKTEGITFG-SEKPAKSSIFGDS-TGAPK 842
Query: 285 FTLG----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKS 320
F+ G E A G+T L F+LG + T KS
Sbjct: 843 FSFGNVDKPQETKASAAMTGSTSLAKPTFSLGESNSTPKS 882
>gi|229048232|ref|ZP_04193800.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH676]
gi|228722957|gb|EEL74334.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH676]
Length = 351
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 82
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 139
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 151
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 163
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 235
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/117 (32%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 3/117 (2%)
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT-- 123
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T T + GAT T GAT +T GAT T G+T +T
Sbjct: 124 -GPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
>gi|423432520|ref|ZP_17409524.1| hypothetical protein IE7_04336 [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401116127|gb|EJQ23970.1| hypothetical protein IE7_04336 [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 449
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGIT------GATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/146 (34%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T G T T GAT +T GAT +T
Sbjct: 78 GATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT 137
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T
Sbjct: 138 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPT------GATGLTGATGVTGATGPTGIT--- 188
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
GAT +T GAT +T GA
Sbjct: 189 GATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/145 (33%), Positives = 55/145 (37%), Gaps = 9/145 (6%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T GAT T G T T GAT +T GAT +T G
Sbjct: 79 ATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTG 138
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT +T GAT +T GAT T GAT LT GAT T G
Sbjct: 139 ATGITGATGPTGATGIT------GATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTGIT---G 189
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
AT +T GAT +T GA
Sbjct: 190 ATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
>gi|359413068|ref|ZP_09205533.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
gi|357171952|gb|EHJ00127.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
Length = 1550
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.51, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 90/299 (30%), Positives = 103/299 (34%), Gaps = 45/299 (15%)
Query: 60 GATELTAKVFTLG---ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 116
GAT LT G +T LT GAT T + G T T + G T T
Sbjct: 885 GATGLTGDTGVTGVTGSTGLTGAAGVTGATGSTGDTGSTGVTGPTGLTGSTGVTGDTGAT 944
Query: 117 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 176
GAT LT + G T T + G+T +T G+T +T G T T
Sbjct: 945 GITGATGLTGSTGSTGVTGATGLTGSTGSTGVTGATGLTGSTGVTGVTGATGLTGDTGST 1004
Query: 177 FTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
GAT LT GAT LT + GAT LT + G T T GAT
Sbjct: 1005 GVTGATGLTGDTGATGVTGATGLTGSTGSTGVTGATGLTGDTGSTGVTGATGLTGDTGAT 1064
Query: 231 ELTAKVFTL---------------------------GATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
LT + GAT LT GAT LT
Sbjct: 1065 GLTGDTGSTGVTGATGLTGTTGSTGVTGATGLTGDTGATGLT------GATGLTGSTGAT 1118
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
G T T GAT LT + GAT LT G T T GAT LT
Sbjct: 1119 GVTGATGATGVTGATGLTGSTGSTGVTGATGLTGSTGVTGITGATGATGDTGATGLTGD 1177
>gi|222095309|ref|YP_002529369.1| collagen-like protein [Bacillus cereus Q1]
gi|221239367|gb|ACM12077.1| collagen-like protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 1261
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.51, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/141 (26%), Positives = 41/141 (29%)
Query: 37 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 96
AT T G T +T G T +T GAT T G T +T G
Sbjct: 400 ATGNTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGITGPTGDTG 459
Query: 97 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 156
T T G T T G T T GA T G T T G
Sbjct: 460 PTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDTGPTGNTG 519
Query: 157 ATELTAKVFTLGATELTAKVF 177
T T + G T T
Sbjct: 520 PTGATGNTGSTGVTGPTGSTG 540
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.51, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/141 (26%), Positives = 41/141 (29%)
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 120
AT T G T +T G T +T GAT T G T +T G
Sbjct: 400 ATGNTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGITGPTGDTG 459
Query: 121 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 180
T T G T T G T T GA T G T T G
Sbjct: 460 PTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDTGPTGNTG 519
Query: 181 ATELTAKVFTLGATELTAKVF 201
T T + G T T
Sbjct: 520 PTGATGNTGSTGVTGPTGSTG 540
>gi|423521393|ref|ZP_17497866.1| hypothetical protein IGC_00776, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
gi|401178031|gb|EJQ85215.1| hypothetical protein IGC_00776, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
Length = 419
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/148 (27%), Positives = 48/148 (32%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
+T GAT T GAT T GAT T G T T GAT
Sbjct: 76 VTGPTGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTGATG 135
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
T G T T G+T T G T T + G T +T G+T
Sbjct: 136 STGPTGNTGVTGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVT------GSTG 189
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
T G T T + G+T T
Sbjct: 190 ATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGPTGN 217
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/148 (27%), Positives = 48/148 (32%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 135
+T GAT T GAT T GAT T G T T GAT
Sbjct: 76 VTGPTGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTGATG 135
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
T G T T G+T T G T T + G T +T G+T
Sbjct: 136 STGPTGNTGVTGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVT------GSTG 189
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
T G T T + G+T T
Sbjct: 190 ATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGPTGN 217
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/148 (27%), Positives = 48/148 (32%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
+T GAT T GAT T GAT T G T T GAT
Sbjct: 76 VTGPTGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTGATG 135
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
T G T T G+T T G T T + G T +T G+T
Sbjct: 136 STGPTGNTGVTGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVT------GSTG 189
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
T G T T + G+T T
Sbjct: 190 ATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGPTGN 217
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/148 (27%), Positives = 50/148 (33%), Gaps = 9/148 (6%)
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+T GAT T GAT T GAT T G+T +T GAT
Sbjct: 76 VTGPTGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGST------GSTGVTGPT---GATG 126
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
T G+T T G+T T + G+T T G T T G T
Sbjct: 127 PTGNTGATGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVTG 186
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
T G T +T G+T T
Sbjct: 187 STGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGP 214
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/123 (28%), Positives = 39/123 (31%)
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 255
+T GAT T GAT T GAT T G T T GAT
Sbjct: 76 VTGPTGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTGATG 135
Query: 256 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 315
T G T T G+T T G T T + G T +T G T
Sbjct: 136 STGPTGNTGVTGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVTGSTGATGNTG 195
Query: 316 LTA 318
T
Sbjct: 196 PTG 198
>gi|366162574|ref|ZP_09462329.1| Kelch repeat-containing protein [Acetivibrio cellulolyticus CD2]
Length = 487
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 83/455 (18%), Positives = 175/455 (38%), Gaps = 56/455 (12%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE---------- 51
T L++ ++ + + K++T+G ++K + ++ KV+ A
Sbjct: 35 TNLSSARYSHCSAVIGDKIYTIGGYNGSSKFNIIDEYDVNQKVWKRKANMPLACSNASCA 94
Query: 52 -LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA- 109
K++ G T+ + L + +T T + + + EL K++ +G
Sbjct: 95 VYDGKIYVFGGVN-TSPMNDLQVYDPATDTWTK-KTNMPTPRYGADSVELNGKIYVIGGY 152
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
T + + + + +T + T + + L A K++ +G +A + T+
Sbjct: 153 TSVNGNLDNVEVYDPINDKWTTKQSMPTKRRY-LKAIVFDNKIYAIGGLN-SAALNTIEE 210
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
+T A + + + GA + K++ G + + + + + T
Sbjct: 211 YNPDTNTWTTKAGMIVPR-YGFGAGIINNKIYIFGGKSSSNVLNNVEYFDPISNNSTQKE 269
Query: 230 TELTAK-----------VFTLGATELTAKVFTLGATELT----AKVFTLGA-------TE 267
+ +TAK + +G T + T A + AK + A T+
Sbjct: 270 SVITAKFLFTCEVINNIAYIIGGYNGTKALNTFEAYDYREDNWAKKMPMKAARQAPASTQ 329
Query: 268 LTAKVFTLGAT--------ELTAKVFTLGATEL---TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 316
+K++ G E+ V +T L TAK + + K++++G
Sbjct: 330 YESKIYVSGGNNGSIVNSVEVYDPVTNNWSTSLSMPTAK-YCHAMVTVDGKIYSIGGLNG 388
Query: 317 TAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 376
+A + +VE Y PIK + + TA+ + + A L K++ LG T + V TL
Sbjct: 389 SA---LKKVEVYDPIKNAWETKSDMPTAR-YNISAVVLNKKIYVLGGTTGSVTVNTLEVY 444
Query: 377 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 411
+ +++ TA++ L A EL K++ +G
Sbjct: 445 DTENNIWSKRTGMPTARL-GLDAVELNGKIYAIGG 478
>gi|423521591|ref|ZP_17498064.1| hypothetical protein IGC_00974, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
gi|401176839|gb|EJQ84032.1| hypothetical protein IGC_00974, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
Length = 269
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/131 (31%), Positives = 47/131 (35%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T T GAT +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 3 GITGATGATGPTGATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPT 62
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T GAT T GAT +T GAT T GAT +T
Sbjct: 63 GATGVTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVTGATGIT 122
Query: 132 GATELTAKVFT 142
GAT T T
Sbjct: 123 GATGPTGATGT 133
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/131 (31%), Positives = 47/131 (35%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G T T GAT +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 3 GITGATGATGPTGATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPT 62
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T GAT T GAT +T GAT T GAT +T
Sbjct: 63 GATGVTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVTGATGIT 122
Query: 168 GATELTAKVFT 178
GAT T T
Sbjct: 123 GATGPTGATGT 133
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/131 (31%), Positives = 47/131 (35%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T GAT +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 3 GITGATGATGPTGATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPT 62
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T GAT T GAT +T GAT T GAT +T
Sbjct: 63 GATGVTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVTGATGIT 122
Query: 204 GATELTAKVFT 214
GAT T T
Sbjct: 123 GATGPTGATGT 133
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/131 (31%), Positives = 47/131 (35%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T GAT +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 3 GITGATGATGPTGATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPT 62
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT +T GAT T GAT +T GAT T GAT +T
Sbjct: 63 GATGVTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVTGATGIT 122
Query: 240 GATELTAKVFT 250
GAT T T
Sbjct: 123 GATGPTGATGT 133
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/131 (31%), Positives = 47/131 (35%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 3 GITGATGATGPTGATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPT 62
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT +T GAT T GAT +T GAT T GAT +T
Sbjct: 63 GATGVTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVTGATGIT 122
Query: 276 GATELTAKVFT 286
GAT T T
Sbjct: 123 GATGPTGATGT 133
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/119 (31%), Positives = 44/119 (36%)
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T GAT +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 3 GITGATGATGPTGATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPT 62
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
GAT +T GAT T GAT +T GAT T GAT +T + I
Sbjct: 63 GATGVTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVTGATGI 121
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/118 (31%), Positives = 43/118 (36%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT +T G T +T G T +T G T T GAT +T G
Sbjct: 16 ATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPTGATGVTGPTGPTG 75
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
AT T GAT +T GAT T GAT +T GAT T T
Sbjct: 76 ATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVTGATGITGATGPTGATGT 133
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/142 (30%), Positives = 52/142 (36%), Gaps = 9/142 (6%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T GAT +T G T +T G T +T G T T
Sbjct: 3 GITGATGATGPTGATGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGVTGPTGPTGVTGATGPTGPT 62
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT +T GAT T GAT +T GAT T GAT +T
Sbjct: 63 GATGVTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGVT------ 116
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
GAT +T G T T S+
Sbjct: 117 GATGITGAT---GPTGATGTSI 135
>gi|398309823|ref|ZP_10513297.1| GXT repeat-containing collagen-like protein, partial [Bacillus
mojavensis RO-H-1]
Length = 300
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.75, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/116 (31%), Positives = 47/116 (40%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 127
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGP 118
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.75, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/116 (31%), Positives = 47/116 (40%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGP 118
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/115 (31%), Positives = 46/115 (40%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 60
AT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T G
Sbjct: 4 ATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGATG 63
Query: 61 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 115
+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T
Sbjct: 64 STGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGP 118
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T +
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGPTGST 122
Query: 168 G------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 201
G AT T G+T +T G T ++F
Sbjct: 123 GATGSTGSTGSTGPTGSTGATGSTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGPTGANPQLF 174
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T +
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGPTGST 122
Query: 192 G------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 225
G AT T G+T +T G T ++F
Sbjct: 123 GATGSTGSTGSTGPTGSTGATGSTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGPTGANPQLF 174
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T +
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGPTGST 122
Query: 216 G------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
G AT T G+T +T G T ++F
Sbjct: 123 GATGSTGSTGSTGPTGSTGATGSTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGPTGANPQLF 174
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T +
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGPTGST 122
Query: 240 G------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 273
G AT T G+T +T G T ++F
Sbjct: 123 GATGSTGSTGSTGPTGSTGATGSTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGPTGANPQLF 174
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T +
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGPTGST 122
Query: 252 G------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 285
G AT T G+T +T G T ++F
Sbjct: 123 GATGSTGSTGSTGPTGSTGATGSTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGPTGANPQLF 174
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T +
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGPTGST 122
Query: 264 G------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 297
G AT T G+T +T G T ++F
Sbjct: 123 GATGSTGSTGSTGPTGSTGATGSTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGPTGANPQLF 174
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T + GAT T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 3 GATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGAT 62
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G+T T + G+T +T G+T T + GAT +T + GAT T +
Sbjct: 63 GSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGPTGST 122
Query: 276 G------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 309
G AT T G+T +T G T ++F
Sbjct: 123 GATGSTGSTGSTGPTGSTGATGSTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGPTGANPQLF 174
>gi|126700850|ref|YP_001089747.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
gi|115252287|emb|CAJ70128.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
Length = 558
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.75, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 94/348 (27%), Positives = 110/348 (31%), Gaps = 16/348 (4%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T G T T GA +T +GAT +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGATGA---NGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPNGTTGST 76
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T G T T GA +T GAT A T G+T T
Sbjct: 77 GPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGAT 133
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GA +T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 134 GANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNT 193
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK-SVI 322
GAT T + GAT T +GAT GAT +V GA T ++
Sbjct: 194 GATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGAT---------GATGADGEVGPTGAVGATGPDGLV 244
Query: 323 LEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 382
P N T GA L GAT + + GA T
Sbjct: 245 GPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPT 304
Query: 383 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKN 430
GA T GA T +GAT +G T T +N
Sbjct: 305 GADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGEN 352
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 90/336 (26%), Positives = 104/336 (30%), Gaps = 39/336 (11%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T G T T GA +T +GAT +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGATGA---NGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPNGTTGST 76
Query: 72 ---------GATELTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GA +T GAT +T GAT A T G+T T
Sbjct: 77 GPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGAT 133
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GA +T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 134 GANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNT 193
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG----------- 228
GAT T + GAT T +GAT T +G T G
Sbjct: 194 GATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPT 253
Query: 229 ----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT------AKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
A L GAT V GAT T +GAT T +G T
Sbjct: 254 GATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPT 313
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T GAT T V GA + + G T
Sbjct: 314 GATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPT 349
>gi|423449091|ref|ZP_17425970.1| hypothetical protein IEC_03699 [Bacillus cereus BAG5O-1]
gi|401128540|gb|EJQ36229.1| hypothetical protein IEC_03699 [Bacillus cereus BAG5O-1]
Length = 366
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/143 (33%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 6/143 (4%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT +T GAT +T GAT T GAT T GAT T +
Sbjct: 94 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGDTGPT---GATGPTGVTGST 150
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T + GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 151 GATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 207
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
GAT +T G T T T
Sbjct: 208 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 230
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/143 (33%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 6/143 (4%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT +T GAT +T GAT T GAT T GAT T +
Sbjct: 94 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGDTGPT---GATGPTGVTGST 150
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T GAT T + GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 151 GATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 207
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
GAT +T G T T T
Sbjct: 208 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 230
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/143 (33%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 6/143 (4%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT +T GAT +T GAT T GAT T GAT T +
Sbjct: 94 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGDTGPT---GATGPTGVTGST 150
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T GAT T + GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 151 GATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 207
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
GAT +T G T T T
Sbjct: 208 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 230
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/143 (33%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 6/143 (4%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT +T GAT +T GAT T GAT T GAT T +
Sbjct: 94 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGDTGPT---GATGPTGVTGST 150
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT T + GAT +T GAT T + GAT T
Sbjct: 151 GATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 207
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT +T G T T T
Sbjct: 208 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 230
>gi|323141010|ref|ZP_08075919.1| hypothetical protein HMPREF9443_00687 [Phascolarctobacterium
succinatutens YIT 12067]
gi|322414512|gb|EFY05322.1| hypothetical protein HMPREF9443_00687 [Phascolarctobacterium
succinatutens YIT 12067]
Length = 438
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 68/164 (41%), Gaps = 10/164 (6%)
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL----TAKVFT 226
ELT KV GA LTA + E A G + + LG ++ A ++
Sbjct: 259 ELTGKV---GALNLTAGYYEFKDIEADAHAEAWG-FDYMGRPVHLGDKDVHFAEDATIWA 314
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
LGA K F LGA L + L + + + A+ AK G+ L AK +
Sbjct: 315 LGANYAFDKNFKLGALYLKGED-KLATASVDDDGYVVTASYKGAKAVEPGSWGLVAKYYD 373
Query: 287 LGATELTAKVFTLGATELTA-KVFTLGATELTAKSVILEVEYYK 329
GAT A ++ K +++ A AK+++ +VEYY
Sbjct: 374 QGATTYVHHTMNGVANDIFGFKGYSVAANYAFAKNIVGQVEYYD 417
>gi|423539706|ref|ZP_17516097.1| hypothetical protein IGK_01798, partial [Bacillus cereus HuB4-10]
gi|401173241|gb|EJQ80453.1| hypothetical protein IGK_01798, partial [Bacillus cereus HuB4-10]
Length = 306
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 69/174 (39%), Gaps = 12/174 (6%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-----LGATELTAKVFTLGA 61
K+ +G+ ++ +L A+E LGAT T +G T T + GA
Sbjct: 139 KLGQIGSPDVVVDDISLLASEQ------LGATGPTGPTGATGFGVIGPTGATGRTGPTGA 192
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T + GA
Sbjct: 193 TGF-GIIGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGA 251
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
T T GAT T GAT T + GAT T + GAT T +
Sbjct: 252 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGE 305
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 69/174 (39%), Gaps = 12/174 (6%)
Query: 31 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-----LGATELTAKVFTLGA 85
K+ +G+ ++ +L A+E LGAT T +G T T + GA
Sbjct: 139 KLGQIGSPDVVVDDISLLASEQ------LGATGPTGPTGATGFGVIGPTGATGRTGPTGA 192
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T + GA
Sbjct: 193 TGF-GIIGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGA 251
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 199
T T GAT T GAT T + GAT T + GAT T +
Sbjct: 252 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGE 305
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 69/174 (39%), Gaps = 12/174 (6%)
Query: 43 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-----LGATELTAKVFTLGA 97
K+ +G+ ++ +L A+E LGAT T +G T T + GA
Sbjct: 139 KLGQIGSPDVVVDDISLLASEQ------LGATGPTGPTGATGFGVIGPTGATGRTGPTGA 192
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T + GA
Sbjct: 193 TGF-GIIGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGA 251
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 211
T T GAT T GAT T + GAT T + GAT T +
Sbjct: 252 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGE 305
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 69/174 (39%), Gaps = 12/174 (6%)
Query: 55 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-----LGATELTAKVFTLGA 109
K+ +G+ ++ +L A+E LGAT T +G T T + GA
Sbjct: 139 KLGQIGSPDVVVDDISLLASEQ------LGATGPTGPTGATGFGVIGPTGATGRTGPTGA 192
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T + GA
Sbjct: 193 TGF-GIIGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGA 251
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 223
T T GAT T GAT T + GAT T + GAT T +
Sbjct: 252 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGE 305
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 69/174 (39%), Gaps = 12/174 (6%)
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT-----LGATELTAKVFTLGA 205
K+ +G+ ++ +L A+E LGAT T +G T T + GA
Sbjct: 139 KLGQIGSPDVVVDDISLLASEQ------LGATGPTGPTGATGFGVIGPTGATGRTGPTGA 192
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T + GA
Sbjct: 193 TGF-GIIGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGA 251
Query: 266 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
T T GAT T GAT T + GAT T + GAT T +
Sbjct: 252 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGE 305
>gi|423463805|ref|ZP_17440573.1| hypothetical protein IEK_00992, partial [Bacillus cereus BAG6O-1]
gi|402421012|gb|EJV53279.1| hypothetical protein IEK_00992, partial [Bacillus cereus BAG6O-1]
Length = 279
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/142 (30%), Positives = 51/142 (35%)
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPTGAT 123
Query: 300 GATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
G T T G T T S+
Sbjct: 124 GITGPTGATGDTGPTGATGTSI 145
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 120
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 143
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 120
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 143
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 120
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 143
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 120
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 143
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 120
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 143
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 52/143 (36%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G+T T G+T T GAT T GAT +T GAT +T
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T G T +T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPT--- 120
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
GAT +T G T T T
Sbjct: 121 GATGITGPTGATGDTGPTGATGT 143
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/151 (33%), Positives = 57/151 (37%), Gaps = 4/151 (2%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T + GAT T GAT T GAT +T GAT T
Sbjct: 1 GATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPT---GATGITGATGITGATGPTGATGIT 57
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + GAT T GAT T + GAT +T GAT T
Sbjct: 58 GATGPTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGAT 117
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
G T T GAT T G T +TA
Sbjct: 118 GPTGATGITGPTGATGDTGPTGATG-TSITA 147
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/151 (33%), Positives = 57/151 (37%), Gaps = 4/151 (2%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + GAT T GAT T GAT +T GAT T
Sbjct: 1 GATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPT---GATGITGATGITGATGPTGATGIT 57
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + GAT T GAT T + GAT +T GAT T
Sbjct: 58 GATGPTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGAT 117
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
G T T GAT T G T +TA
Sbjct: 118 GPTGATGITGPTGATGDTGPTGATG-TSITA 147
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/151 (33%), Positives = 57/151 (37%), Gaps = 4/151 (2%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T + GAT T GAT T GAT +T GAT T
Sbjct: 1 GATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPT---GATGITGATGITGATGPTGATGIT 57
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + GAT T GAT T + GAT +T GAT T
Sbjct: 58 GATGPTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGAT 117
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
G T T GAT T G T +TA
Sbjct: 118 GPTGATGITGPTGATGDTGPTGATG-TSITA 147
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/151 (33%), Positives = 57/151 (37%), Gaps = 4/151 (2%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T + GAT T GAT T GAT +T GAT T
Sbjct: 1 GATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPT---GATGITGATGITGATGPTGATGIT 57
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T + GAT T GAT T + GAT +T GAT T
Sbjct: 58 GATGPTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGAT 117
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
G T T GAT T G T +TA
Sbjct: 118 GPTGATGITGPTGATGDTGPTGATG-TSITA 147
>gi|239627466|ref|ZP_04670497.1| conserved hypothetical protein [Clostridiales bacterium 1_7_47_FAA]
gi|239517612|gb|EEQ57478.1| conserved hypothetical protein [Clostridiales bacterium 1_7_47FAA]
Length = 230
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 59/188 (31%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GA +T GA +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 13 GAAGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPTGADGVTGPTGPT 72
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GA +T GA +T GA +T GA GAT T
Sbjct: 73 GANGVTGPTGPTGADGVTGPTGPAGADGMTGPTGPTGAD---------GATGSTGPT--- 120
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GA +T GA T GA +T GA T GA T
Sbjct: 121 GADGVTGPTGPAGADGTTGPTGPTGADGVTGPTGPTGADGATGPTGPTGADGATGPTGPT 180
Query: 216 GATELTAK 223
GA +T
Sbjct: 181 GADGVTGP 188
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 59/188 (31%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GA +T GA +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 13 GAAGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPTGADGVTGPTGPT 72
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GA +T GA +T GA +T GA GAT T
Sbjct: 73 GANGVTGPTGPTGADGVTGPTGPAGADGMTGPTGPTGAD---------GATGSTGPT--- 120
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GA +T GA T GA +T GA T GA T
Sbjct: 121 GADGVTGPTGPAGADGTTGPTGPTGADGVTGPTGPTGADGATGPTGPTGADGATGPTGPT 180
Query: 252 GATELTAK 259
GA +T
Sbjct: 181 GADGVTGP 188
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 59/188 (31%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GA +T GA +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 13 GAAGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPTGADGVTGPTGPT 72
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GA +T GA +T GA +T GA GAT T
Sbjct: 73 GANGVTGPTGPTGADGVTGPTGPAGADGMTGPTGPTGAD---------GATGSTGPT--- 120
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
GA +T GA T GA +T GA T GA T
Sbjct: 121 GADGVTGPTGPAGADGTTGPTGPTGADGVTGPTGPTGADGATGPTGPTGADGATGPTGPT 180
Query: 288 GATELTAK 295
GA +T
Sbjct: 181 GADGVTGP 188
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/179 (25%), Positives = 57/179 (31%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GA +T GA +T GA +T GA +T GA +T
Sbjct: 13 GAAGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPTGADGVTGPTGPT 72
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT---LGATELTAKVFTLGATELTAKV 128
GA +T GA +T GA +T GAT T GA +T
Sbjct: 73 GANGVTGPTGPTGADGVTGPTGPAGADGMTGPTGPTGADGATGSTGPT---GADGVTGPT 129
Query: 129 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 187
GA T GA +T GA T GA T GA +T
Sbjct: 130 GPAGADGTTGPTGPTGADGVTGPTGPTGADGATGPTGPTGADGATGPTGPTGADGVTGP 188
>gi|297466188|ref|XP_001250651.3| PREDICTED: protein FAM186A [Bos taurus]
Length = 2450
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Composition-based stats.
Identities = 97/426 (22%), Positives = 145/426 (34%), Gaps = 11/426 (2%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
TL + A TL + A TL + A TL + A TL + A
Sbjct: 1331 TLAPEQAQAPGITLTPQQAQALGITLAPEQAQAPGITLTPQQAQALGITLAPEQAQAPGI 1390
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
TL + A TL + TL + A TL + A TL + A
Sbjct: 1391 TLTPQQAQALGITLAPEQAQVPGITLTPQQAQALGITLTPEQAQAPGITLTPQQAQALGI 1450
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
TL + TL + A TL + TL + A TL +
Sbjct: 1451 TLTPEQAQPPGITLTPQQARALGITLTPEQAQPPGITLTPQQARALGITLTPEQAQPPGI 1510
Query: 190 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
TL + A TL + TL + A TL + TL + A
Sbjct: 1511 TLTPQQAQALGITLTPEQAQPPGITLTPQQAQALGITLTPEQAQPPGITLTPQQAQALGI 1570
Query: 250 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 309
TL + A TL T A+ + T A+ L T + + AT VF
Sbjct: 1571 TLAPEQAQAPRITL--TPQQAQALGIPITPQPAEAQGLTLTPQQTQDLGIPATP-QGIVF 1627
Query: 310 TLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 369
T + + E + I + PQ S L V T+ T+ FTLG +
Sbjct: 1628 TPQQAQALGIHITPEQAQAQDITLTPQQSQA-LRIPV-TIPQTQDLGAPFTLGQAQ---- 1681
Query: 370 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
LG + + LG + KV+TL + ++ + A + ++LG T + +
Sbjct: 1682 --ALGVSLSHEQFAELGVPLTSDKVYTLEYPHIPEQIQPVEAPLTPGEAWSLGITVRSVQ 1739
Query: 430 NIRSNT 435
++ S T
Sbjct: 1740 DLTSRT 1745
>gi|301056235|ref|YP_003794446.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus biovar anthracis str. CI]
gi|300378404|gb|ADK07308.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus biovar
anthracis str. CI]
Length = 853
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/164 (29%), Positives = 56/164 (34%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G+T T GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 503 GSTGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGET 562
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T GAT T GAT T G+T T + GAT T +
Sbjct: 563 GVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGST 622
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 247
G T T + G T T ++GAT T G T T
Sbjct: 623 GVTGNTGATGSTGVTGNTGATGSIGATGNTGATGETGPTGSTGP 666
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/164 (29%), Positives = 56/164 (34%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G+T T GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 503 GSTGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGET 562
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT T GAT T G+T T + GAT T +
Sbjct: 563 GVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGST 622
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 259
G T T + G T T ++GAT T G T T
Sbjct: 623 GVTGNTGATGSTGVTGNTGATGSIGATGNTGATGETGPTGSTGP 666
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/164 (29%), Positives = 56/164 (34%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G+T T GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 503 GSTGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGET 562
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T GAT T GAT T G+T T + GAT T +
Sbjct: 563 GVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGST 622
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 271
G T T + G T T ++GAT T G T T
Sbjct: 623 GVTGNTGATGSTGVTGNTGATGSIGATGNTGATGETGPTGSTGP 666
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/164 (29%), Positives = 56/164 (34%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T GAT T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 503 GSTGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGET 562
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T GAT T GAT T G+T T + GAT T +
Sbjct: 563 GVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGST 622
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 283
G T T + G T T ++GAT T G T T
Sbjct: 623 GVTGNTGATGSTGVTGNTGATGSIGATGNTGATGETGPTGSTGP 666
>gi|291237194|ref|XP_002738521.1| PREDICTED: hypothetical protein [Saccoglossus kowalevskii]
Length = 536
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 4 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 63
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 122
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 123 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 16 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 75
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 134
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 135 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 28 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 87
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 146
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 147 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 40 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 99
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 158
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 159 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 52 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 111
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 170
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 171 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 64 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 123
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 182
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 183 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 76 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 135
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 194
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 195 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 88 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 147
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 206
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 207 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 100 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 159
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 218
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 219 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 112 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 230
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 231 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 124 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 184 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 242
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 243 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 136 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 196 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 254
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 255 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 148 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 208 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 266
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 267 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 306
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 71/161 (44%), Gaps = 4/161 (2%)
Query: 160 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 220 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 278
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 279 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
+TA V L +TA V L +TA V L +TA
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA 159
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 70/157 (44%), Gaps = 4/157 (2%)
Query: 172 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
+TA V L +TA V L +TA V L +TA F +G T + VF +G T
Sbjct: 1 MTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQSMTA--FVIGLTIQSMTVFVIGLTI 58
Query: 232 LTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT- 290
+ F +G T + F +G T + F +G T + F +G T + F +G T
Sbjct: 59 QSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIGLTI 118
Query: 291 -ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVE 326
+TA V L +TA V L +TA + L ++
Sbjct: 119 QSMTAFVIDLTIQSMTAFVIGLTIQSMTAFVIDLTIQ 155
>gi|386388482|ref|ZP_10073347.1| hypothetical protein STSU_33370 [Streptomyces tsukubaensis
NRRL18488]
gi|385664042|gb|EIF87920.1| hypothetical protein STSU_33370 [Streptomyces tsukubaensis
NRRL18488]
Length = 466
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 72 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 184
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 185 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 212
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 84 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 138
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 196
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 197 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 96 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 208
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 209 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 236
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 108 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 220
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 221 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 248
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 120 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 233 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 260
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 132 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 244
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 245 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 272
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 144 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 256
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 257 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 284
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 156 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 268
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 269 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 296
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 41.2 bits (95), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/208 (18%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 14/208 (6%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 168 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 280
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 281 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 308
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/205 (18%), Positives = 71/205 (34%), Gaps = 14/205 (6%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G + + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 240 GDIDFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCG 299
Query: 180 GATELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + +
Sbjct: 300 ALVDFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNS 354
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 292
FT G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 355 SEFTGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDF 412
Query: 293 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 317
VF+ GA +FT G +
Sbjct: 413 KRAVFSHGAVNFDDALFTGGRVNFS 437
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/205 (18%), Positives = 71/205 (34%), Gaps = 14/205 (6%)
Query: 3 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 62
+ + +F G F VF G VF+ G+ + +F
Sbjct: 243 DFSGAIFAEGTVNFQGAEFAECTVNFNRAVFADGVVNFGRSVFSSGSVTFNSGMFCGALV 302
Query: 63 ELTAKVF-----TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 117
+ + +F + ++E + ++ + E+T G +FT G + + F
Sbjct: 303 DFSGAIFAGSTVSFNSSEFSKEMVIFSSCEITG-----GGINFHHSMFTGGLVDFNSSEF 357
Query: 118 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL--TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 175
T G + F G EL+ ++ + + F+ GA F+ G +
Sbjct: 358 TGGMINFRSTHFNTG--ELSFDGVSMSGSRVIFNEAEFSGGAVSFRETEFSEGNVDFKRA 415
Query: 176 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 200
VF+ GA +FT G + V
Sbjct: 416 VFSHGAVNFDDALFTGGRVNFSNAV 440
>gi|297474514|ref|XP_002687347.1| PREDICTED: protein FAM186A [Bos taurus]
gi|296487849|tpg|DAA29962.1| TPA: family with sequence similarity 186, member A-like [Bos taurus]
Length = 2436
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.5, Method: Composition-based stats.
Identities = 97/426 (22%), Positives = 145/426 (34%), Gaps = 11/426 (2%)
Query: 10 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 69
TL + A TL + A TL + A TL + A TL + A
Sbjct: 1317 TLAPEQAQAPGITLTPQQAQALGITLAPEQAQAPGITLTPQQAQALGITLAPEQAQAPGI 1376
Query: 70 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 129
TL + A TL + TL + A TL + A TL + A
Sbjct: 1377 TLTPQQAQALGITLTPEQAQVPGITLTPQQAQALGITLTPEQAQAPGITLTPQQAQALGI 1436
Query: 130 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 189
TL + TL + A TL + TL + A TL +
Sbjct: 1437 TLTPEQAQPPGITLTPQQARALGITLTPEQAQPPGITLTPQQARALGITLTPEQAQPPGI 1496
Query: 190 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 249
TL + A TL + TL + A TL + TL + A
Sbjct: 1497 TLTPQQAQALGITLTPEQAQPPGITLTPQQAQALGITLTPEQAQPPGITLTPQQAQALGI 1556
Query: 250 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 309
TL + A TL T A+ + T A+ L T + + AT VF
Sbjct: 1557 TLAPEQAQAPRITL--TPQQAQALGIPITPQPAEAQGLTLTPQQTQDLGIPATP-QGIVF 1613
Query: 310 TLGATELTAKSVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 369
T + + E + I + PQ S L V T+ T+ FTLG +
Sbjct: 1614 TPQQAQALGIHITPEQAQAQDITLTPQQSQA-LRIPV-TIPQTQDLGAPFTLGQAQ---- 1667
Query: 370 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 429
LG + + LG + KV+TL + ++ + A + ++LG T + +
Sbjct: 1668 --ALGVSLSHEQFAELGVPLTSDKVYTLEYPHIPEQIQPVEAPLTPGEAWSLGITVRSVQ 1725
Query: 430 NIRSNT 435
++ S T
Sbjct: 1726 DLTSRT 1731
>gi|385263866|ref|ZP_10041953.1| Collagen triple helix repeat (20 copies) protein [Bacillus sp. 5B6]
gi|385148362|gb|EIF12299.1| Collagen triple helix repeat (20 copies) protein [Bacillus sp. 5B6]
Length = 665
Score = 40.8 bits (94), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/307 (28%), Positives = 111/307 (36%), Gaps = 46/307 (14%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT +T G+T +T GAT LT GAT +T GAT LT +
Sbjct: 21 GATGVTGATGVTGSTGVTGATGVTGATGLTGATGVTGATGVTGATGITGATGLTGETGVT 80
Query: 204 G---------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
G AT +T G T T GAT +T GAT
Sbjct: 81 GLTGVTGATGVTGTTGITGDTGATGITGATGVTGVTGETGITGATGATGVTGDTGVTGAT 140
Query: 243 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
+T + GAT + T GAT +T GAT +T GAT +T G+
Sbjct: 141 GVTGVTGSTGATG--SNGIT-GATGVTGATGITGATGVTGVT---GATGVTGSTGATGSN 194
Query: 303 ELTAKVFTLGATELTAKSVILEV-------------EYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTL 349
+T GAT +T + + V AT LT
Sbjct: 195 GITGATGVTGATGITGATGVTGVTGATGVTGATGITGTTGVTGATGSTGATGLTGATGVT 254
Query: 350 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 409
GAT +T GAT +T GAT LT GAT LT G+T +T
Sbjct: 255 GATGVTGSTGVTGATGVTGVTGATGATGLTGATGITGATGLTGSTGVTGSTGVT------ 308
Query: 410 GATELTA 416
GAT +T
Sbjct: 309 GATGITG 315
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 85/299 (28%), Positives = 106/299 (35%), Gaps = 54/299 (18%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT +T G+T +T GAT LT GAT +T GAT LT +
Sbjct: 21 GATGVTGATGVTGSTGVTGATGVTGATGLTGATGVTGATGVTGATGITGATGLTGETGVT 80
Query: 132 G---------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
G AT +T G T T GAT +T GAT
Sbjct: 81 GLTGVTGATGVTGTTGITGDTGATGITGATGVTGVTGETGITGATGATGVTGDTGVTGAT 140
Query: 171 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
+T + GAT + T GAT +T GAT +T GAT +T G+
Sbjct: 141 GVTGVTGSTGATG--SNGIT-GATGVTGATGITGATGVTGVT---GATGVTGSTGATGSN 194
Query: 231 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---------------------------ATELTAKVFTL 263
+T GAT +T G AT LT
Sbjct: 195 GITGATGVTGATGITGATGVTGVTGATGVTGATGITGTTGVTGATGSTGATGLTGATGVT 254
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
GAT +T GAT +T GAT LT GAT LT G+T +T + I
Sbjct: 255 GATGVTGSTGVTGATGVTGVTGATGATGLTGATGITGATGLTGSTGVTGSTGVTGATGI 313
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/307 (28%), Positives = 109/307 (35%), Gaps = 60/307 (19%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT +T G+T +T GAT LT GAT +T GAT LT +
Sbjct: 21 GATGVTGATGVTGSTGVTGATGVTGATGLTGATGVTGATGVTGATGITGATGLTGETGVT 80
Query: 108 G---------------------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 146
G AT +T G T T GAT +T GAT
Sbjct: 81 GLTGVTGATGVTGTTGITGDTGATGITGATGVTGVTGETGITGATGATGVTGDTGVTGAT 140
Query: 147 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
+T + GAT + T GAT +T GAT +T GAT +T G+
Sbjct: 141 GVTGVTGSTGATG--SNGIT-GATGVTGATGITGATGVTGVT---GATGVTGSTGATGSN 194
Query: 207 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLG---------------------------ATELTAKVFTL 239
+T GAT +T G AT LT
Sbjct: 195 GITGATGVTGATGITGATGVTGVTGATGVTGATGITGTTGVTGATGSTGATGLTGATGVT 254
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
GAT +T GAT +T GAT LT GAT LT G+T +T
Sbjct: 255 GATGVTGSTGVTGATGVTGVTGATGATGLTGATGITGATGLT------GSTGVTGSTGVT 308
Query: 300 GATELTA 306
GAT +T
Sbjct: 309 GATGITG 315
>gi|423582736|ref|ZP_17558847.1| hypothetical protein IIA_04251 [Bacillus cereus VD014]
gi|401211551|gb|EJR18298.1| hypothetical protein IIA_04251 [Bacillus cereus VD014]
Length = 333
Score = 40.4 bits (93), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/166 (31%), Positives = 59/166 (35%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSV 321
GAT T G T T G+T +T + GAT T S+
Sbjct: 160 GATGAT------GITGATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGATGTSI 199
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 170
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 182
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 194
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 206
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 218
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 230
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 242
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 254
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 266
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 290
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
Score = 39.7 bits (91), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 56/159 (35%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 43 GATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDT 102
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T GAT T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 103 GPTGATGDTGPTGATGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGVTGPT 159
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 302
GAT T GAT T + G T +T GAT
Sbjct: 160 GATGATGIT---GATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGAT 195
>gi|423650420|ref|ZP_17625990.1| hypothetical protein IKA_04207 [Bacillus cereus VD169]
gi|401282318|gb|EJR88221.1| hypothetical protein IKA_04207 [Bacillus cereus VD169]
Length = 336
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/104 (34%), Positives = 44/104 (42%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 122
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
GAT +T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 123 TGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG 160
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/104 (34%), Positives = 44/104 (42%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 122
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 138
GAT +T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 123 TGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG 160
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/104 (34%), Positives = 44/104 (42%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 122
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GAT +T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 123 TGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG 160
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/104 (34%), Positives = 44/104 (42%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 122
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
GAT +T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 123 TGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG 160
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/104 (34%), Positives = 44/104 (42%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 122
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
GAT +T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 123 TGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG 160
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/104 (34%), Positives = 44/104 (42%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 122
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 282
GAT +T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 123 TGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG 160
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/104 (34%), Positives = 44/104 (42%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
+GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 122
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 294
GAT +T GAT T + GAT T GAT T
Sbjct: 123 TGATGIT------GATGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG 160
>gi|294892541|ref|XP_002774115.1| GRA11, putative [Perkinsus marinus ATCC 50983]
gi|239879319|gb|EER05931.1| GRA11, putative [Perkinsus marinus ATCC 50983]
Length = 366
Score = 40.0 bits (92), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 4/182 (2%)
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 198
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 258
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 259 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTEAPT 355
Query: 319 KS 320
+S
Sbjct: 356 ES 357
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 66
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 67 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 126
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 78
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 79 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 138
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 195
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 90
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 91 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 150
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 207
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 102
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 103 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 162
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 219
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 114
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 231
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 126
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 127 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 186
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 243
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 138
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 139 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 198
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 199 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 255
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 150
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 151 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 210
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 211 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 267
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 162
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 163 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 222
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 223 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 279
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 174
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 234
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 235 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 291
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 4/177 (2%)
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTA 186
+ +TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE
Sbjct: 176 VDSTEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPT 235
Query: 187 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 246
+V T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE
Sbjct: 236 EVPTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPT 295
Query: 247 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 303
+ T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 296 EAPTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
Score = 38.1 bits (87), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/175 (26%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 4/175 (2%)
Query: 1 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE----LTAKV 56
+TE + T +TE + T +TE + T +TE + +V TE +V
Sbjct: 178 STEAPTEAPTEASTEARTETPTPASTEAPTETSTEASTEASTEVPIEDPTETPTGAPTEV 237
Query: 57 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 116
T TE +V TE T TE + T+ TE+ + T TE +
Sbjct: 238 PTEAPTEAPTEVPIEDPTETPTGAPTEAPTEAPYEAPTVAPTEVPTEAPTEAPTEAPTEA 297
Query: 117 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 171
T TE+ +V T TE T TE + T TE + T G TE
Sbjct: 298 PTEVPTEVPTEVPTEAPTEAPTDAPTEAPTEAPTEAPTEVPTEAPTEAPTEGPTE 352
>gi|410964439|ref|XP_003988762.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: protein FAM186A [Felis catus]
Length = 2321
Score = 39.7 bits (91), Expect = 2.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 70/310 (22%), Positives = 116/310 (37%), Gaps = 12/310 (3%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T A+ TL + A TL + A TL + A+ +L + A TL
Sbjct: 1316 TPQQAQAITLTPQQAQALGITLTPEQAQAGGITLTPEKAQAQGISLTPEQAQALGITLTP 1375
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
+ A TL + A+ +L + A TL + A+ TL + A+ T+
Sbjct: 1376 QQAQAGGITLTPEKAQAQGISLTPEQAQALGITLTPQQAQAQGVTLTPQQAQAQGVTMTP 1435
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTL--------GATELTAKVFTLGAT----ELTAKVFTLGA 169
+ A+ TL + A TL G + A+ LG T + A+ +L
Sbjct: 1436 EQTQAQGITLTPEKAQALGITLTPEQAQAQGISLTPAQAQALGITLTPQQAQAQGISLTP 1495
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
+ A+ +L + A+ TL + A+ T+ A+ L + A+ TL
Sbjct: 1496 QQAQAQGISLTPQQAQAQGITLTPEQAQAQGVTMTLEHTQARGIPLIPEQAQAQAITLTP 1555
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
+ A TL + A+ TL + A TL + A+ +L + A TL
Sbjct: 1556 QQAQALGITLTPQQAQAQRITLTPQQAQALGITLTPEQAQAQGISLTPEQAQALGITLTP 1615
Query: 290 TELTAKVFTL 299
+ A+ TL
Sbjct: 1616 QQAQAQRITL 1625
>gi|156389543|ref|XP_001635050.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156222140|gb|EDO42987.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 143
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 61
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 122 TELTAKV 128
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 14 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 73
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 134 TELTAKV 140
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 26 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 85
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 146 TELTAKV 152
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 38 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 97
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 158 TELTAKV 164
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 50 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 109
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 170 TELTAKV 176
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 62 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 121
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 182 TELTAKV 188
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 74 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 133
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 194 TELTAKV 200
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 86 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 145
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 206 TELTAKV 212
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 98 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 157
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 218 TELTAKV 224
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 110 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 169
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 230 TELTAKV 236
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 122 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 181
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 242 TELTAKV 248
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 134 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 193
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 254 TELTAKV 260
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 146 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 205
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 206 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 265
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 266 TELTAKV 272
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 158 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 217
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 218 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 277
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 278 TELTAKV 284
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 170 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 229
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 230 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 289
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 290 TELTAKV 296
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 39.3 bits (90), Expect = 3.8, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/127 (36%), Positives = 57/127 (44%)
Query: 182 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 241
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 242 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 301
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 302 TELTAKV 308
T +KV
Sbjct: 128 THPASKV 134
Score = 38.1 bits (87), Expect = 8.4, Method: Composition-based stats.
Identities = 46/134 (34%), Positives = 59/134 (44%)
Query: 194 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 253
T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L T T+KV L
Sbjct: 8 THPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVI 67
Query: 254 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA 313
T +KV L T +KV L T T+KV L T +KV L T +KV L
Sbjct: 68 THPASKVCYLVITHPASKVCYLVITHPTSKVCYLVITHPASKVCYLVITHPASKVCYLVI 127
Query: 314 TELTAKSVILEVEY 327
T +K L + +
Sbjct: 128 THPASKVCYLVITH 141
>gi|255102377|ref|ZP_05331354.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-63q42]
Length = 552
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 90/336 (26%), Positives = 104/336 (30%), Gaps = 39/336 (11%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT T GAT T G T T GA +T +GAT +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGATGATGA---NGITGPTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPNGTTGST 76
Query: 72 ---------GATELTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
GA +T GAT +T GAT A T G+T T
Sbjct: 77 GPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTGNTGAT 133
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GA +T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 134 GANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNT 193
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG----------- 228
GAT T + GAT T +GAT T +G T G
Sbjct: 194 GATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPT 253
Query: 229 ----ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT------AKVFTLGATELTAKVFTLGAT 278
A L GAT V GAT T +GAT T +G T
Sbjct: 254 GATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPT 313
Query: 279 ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
T GAT T V GA + + G T
Sbjct: 314 GATGATGVNGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPT 349
>gi|156322099|ref|XP_001618288.1| hypothetical protein NEMVEDRAFT_v1g155055 [Nematostella vectensis]
gi|156198325|gb|EDO26188.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 164
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/162 (23%), Positives = 67/162 (41%), Gaps = 9/162 (5%)
Query: 217 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 276
T+L +F + T+L +F T+L +F + T+L + T+L +
Sbjct: 1 MTDLLTIIFCIYMTDLLTIIFCSYMTDLLTIIFCIYMTDLLTIISCSYMTDLLTIISCSY 60
Query: 277 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL-------TAKSVILEVEYYK 329
T+L +F T+L +F T+L +F T+L T S IL Y
Sbjct: 61 MTDLLTIIFCSYMTDLLTIIFCSYMTDLLTILFCSYTTDLLTILHYMTDLSTILFCNY-- 118
Query: 330 PIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVF 371
+ I+ + + L +F T+L +F + T+L +F
Sbjct: 119 ILTIIFCSYVSVLLTIIFCSYMTDLLTIIFCIYMTDLLTIIF 160
>gi|170724942|ref|YP_001758968.1| outer membrane adhesin-like protein [Shewanella woodyi ATCC 51908]
gi|169810289|gb|ACA84873.1| outer membrane adhesin like proteiin [Shewanella woodyi ATCC 51908]
Length = 2074
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.3, Method: Composition-based stats.
Identities = 103/422 (24%), Positives = 147/422 (34%), Gaps = 33/422 (7%)
Query: 2 TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 58
TE T K TL AT++ A T +K TL T + GA T KV
Sbjct: 754 TEDTPKTITLIATDVEADSLTFSLISSPSKGVLTGTLPNLTYTPNLNETGADSFTFKV-N 812
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFT----LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
GA + ++ + + + E T K TL AT++ A T +
Sbjct: 813 DGAIDSNIATVSININAINDAPISNNQSVTVAEDTPKAITLIATDVEADSLTFSLISSPS 872
Query: 115 K---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT----L 167
K TL T + GA T KV GA + ++ + + +
Sbjct: 873 KGVLTGTLPNLTYTPNLNETGADSFTFKV-NDGAIDSNIATVSININAINDAPISNNQSV 931
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 224
E T K TL AT++ A T +K TL T + GA T KV
Sbjct: 932 TVAEDTPKAITLIATDVEADSLTFSLISSPSKGVLTGTLPNLTYTPNLNETGADSFTFKV 991
Query: 225 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT----LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 280
GA + ++ + + + E T K TL AT++ A T
Sbjct: 992 -NDGAIDSNIATVSININAINDAPISNNQSVTVAEDTPKAITLIATDVEANSLTFSLISS 1050
Query: 281 TAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYYK--PIKIVP 335
+K TL T + GA T KV GA + +V + ++ PI
Sbjct: 1051 ASKGALTGTLPNLTYTPNLNETGADSFTFKV-NDGALDSNIATVSINIDAINDAPISNNQ 1109
Query: 336 QNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK---VFTLGATELTAKVFTLGATELTA 392
+ TE T K TL AT++ A T +K TL T + GA T
Sbjct: 1110 SVTVTEDTPKAITLTATDVEASSLTFSVISAPSKGVLTGTLPNLTYTPNLNETGADSFTF 1169
Query: 393 KV 394
KV
Sbjct: 1170 KV 1171
>gi|13470790|ref|NP_102359.1| hypothetical protein mlr0585 [Mesorhizobium loti MAFF303099]
gi|14021533|dbj|BAB48145.1| hypothetical glycine-rich protein [Mesorhizobium loti MAFF303099]
Length = 2147
Score = 39.3 bits (90), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/195 (31%), Positives = 76/195 (38%)
Query: 53 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 112
T + GAT T + GAT T + GAT T GAT T + GAT
Sbjct: 476 TGATGSTGATGSTGATGSTGATGDTGATGSTGATGSTGSTGATGATGDTGATGSTGATGA 535
Query: 113 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 172
T GAT T + G T T + G+T T GAT T + GAT
Sbjct: 536 TGATGDTGATGSTGATGSTGDTGATGATGSTGSTGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGS 595
Query: 173 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 232
T + GAT T + GAT T + GAT T + GAT T G+T
Sbjct: 596 TGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGATGDTGATGSTGA 655
Query: 233 TAKVFTLGATELTAK 247
T + GAT T
Sbjct: 656 TGSTGSTGATGATGD 670
>gi|423436064|ref|ZP_17413045.1| hypothetical protein IE9_02245, partial [Bacillus cereus BAG4X12-1]
gi|401122678|gb|EJQ30462.1| hypothetical protein IE9_02245, partial [Bacillus cereus BAG4X12-1]
Length = 285
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/81 (32%), Positives = 34/81 (41%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
+G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 37 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGP 96
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAK 91
G T +T GAT +T
Sbjct: 97 TGVTGITGPTGPTGATGITGP 117
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/81 (32%), Positives = 34/81 (41%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
+G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 37 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGP 96
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAK 139
G T +T GAT +T
Sbjct: 97 TGVTGITGPTGPTGATGITGP 117
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/81 (32%), Positives = 34/81 (41%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
+G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 37 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGP 96
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAK 187
G T +T GAT +T
Sbjct: 97 TGVTGITGPTGPTGATGITGP 117
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/81 (32%), Positives = 34/81 (41%)
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
+G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 37 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGP 96
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAK 235
G T +T GAT +T
Sbjct: 97 TGVTGITGPTGPTGATGITGP 117
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/81 (32%), Positives = 34/81 (41%)
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
+G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 37 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGP 96
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAK 283
G T +T GAT +T
Sbjct: 97 TGVTGITGPTGPTGATGITGP 117
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/81 (32%), Positives = 34/81 (41%)
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
+G T +T GAT +T GAT +T GAT +T GAT +T
Sbjct: 37 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGP 96
Query: 409 LGATELTAKVFTLGATELTAK 429
G T +T GAT +T
Sbjct: 97 TGVTGITGPTGPTGATGITGP 117
>gi|423065843|ref|ZP_17054633.1| uncharacterized protein with threonine repeat protein
[Arthrospira platensis C1]
gi|406712601|gb|EKD07785.1| uncharacterized protein with threonine repeat protein
[Arthrospira platensis C1]
Length = 72
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 11 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 70
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 71 LG 72
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 23 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 82
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 83 LG 84
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 35 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 94
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 95 LG 96
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 47 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 106
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 107 LG 108
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 59 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 118
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 119 LG 120
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 71 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 130
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 131 LG 132
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 83 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 142
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 143 LG 144
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 95 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 154
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 155 LG 156
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 107 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 166
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 167 LG 168
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 119 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 178
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 179 LG 180
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 131 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 190
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 191 LG 192
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 143 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 202
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 203 LG 204
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 155 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 214
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 215 LG 216
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 167 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 226
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 227 LG 228
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 238
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 239 LG 240
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 191 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 250
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 251 LG 252
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 203 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 262
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 263 LG 264
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 215 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 274
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 275 LG 276
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 227 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 286
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 287 LG 288
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 239 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 298
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 299 LG 300
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 251 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 310
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 311 LG 312
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 349 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 408
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 409 LG 410
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/62 (37%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 361 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFT 420
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 421 LG 422
+G
Sbjct: 62 VG 63
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/65 (35%), Positives = 34/65 (52%)
Query: 263 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +T LG+T +TAK
Sbjct: 2 LGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTENPLMLGSTTVTAKPPD 61
Query: 323 LEVEY 327
+ Y
Sbjct: 62 VGFHY 66
>gi|167633997|ref|ZP_02392320.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0442]
gi|254741873|ref|ZP_05199560.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Kruger B]
gi|167530798|gb|EDR93500.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0442]
Length = 553
Score = 38.9 bits (89), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/289 (24%), Positives = 103/289 (35%), Gaps = 30/289 (10%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G+T +T G+T +T + G+T T G T T G+T +T
Sbjct: 80 GSTGVTGSTGVTGSTGVTGETGPTGSTGATGNTGPTGETGGTGSTGATGSTGVTGNTGPT 139
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL---------------------------TAKV 104
G+T +T G+T T +G T T +
Sbjct: 140 GSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPIGETGGTGSTGPTGETGGTGSTGVTGSTGVTGNTGPI 199
Query: 105 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGA---TELT 161
+ GAT T + GAT T + G T T + + GAT T ++GA T T
Sbjct: 200 GSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGAT 259
Query: 162 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT 221
+ G+T +T G T T G T T + G+T T + G+T T
Sbjct: 260 GETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPT 319
Query: 222 AKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 270
G+T T + G+T +T + G T T G+T T
Sbjct: 320 GNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATG 368
>gi|30020512|ref|NP_832143.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cereus ATCC
14579]
gi|29896063|gb|AAP09344.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus ATCC 14579]
Length = 279
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 24 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 83
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 48 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 107
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 239
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 240 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 287
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 299
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 56/168 (33%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T G T T G T +T GAT T + +
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPT---GATGPTGGIGPI 195
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/173 (25%), Positives = 55/173 (31%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
G T +T G T +T G T +T G T +T G T +T
Sbjct: 37 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGITGPT--- 93
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T + G T +T G T +T G T T G T +T
Sbjct: 94 GATGPTGET---GPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGETGPTGVTGPTGIT 150
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVILEVEYY 328
G T T G T T G T +T G T + YY
Sbjct: 151 GPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGGIGPITTTNLLYY 203
>gi|260807905|ref|XP_002598748.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_186621 [Branchiostoma floridae]
gi|229284023|gb|EEN54760.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_186621 [Branchiostoma floridae]
Length = 289
Score = 38.9 bits (89), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/280 (24%), Positives = 92/280 (32%), Gaps = 13/280 (4%)
Query: 5 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 64
TA+ T E T++ G TE + G TE + G TE + G T
Sbjct: 10 TAQNRTTEQDEATSQDKPGGTTEQDGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTVQ 69
Query: 65 TAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 124
+ G TE + G TE + G TE + G TE + G TE
Sbjct: 70 DGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTEQ 129
Query: 125 TAKVFTLGATELTAKVFTLGA-TELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATE 183
+ G TE G TE + G TE G E + G TE
Sbjct: 130 DGTIEHGGTTEQADGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTEQDGTTEQDGTAEQDGTIEHGGTTE 189
Query: 184 LTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 240
+ G T + TA+ G E + G TE + G TE + G
Sbjct: 190 QDGTIE-HGGTAVQDGTAEQD--GTAEQDGTIEHGGTTEQDGTIEHGGTTEQDGTIEHGG 246
Query: 241 ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATEL 280
TE + G TE G TE + + G TE
Sbjct: 247 TTEQDGTIEHGGTTEQ------DGTTEHSGTIEHGGTTEQ 280
>gi|402560379|ref|YP_006603103.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-771]
gi|401789031|gb|AFQ15070.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-771]
Length = 291
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/139 (28%), Positives = 55/139 (39%), Gaps = 3/139 (2%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
G T +T G T +T G+T +T + GAT T + GAT T
Sbjct: 37 GPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTGIT 96
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
G+T T G+T +T + GAT T + G T T G+T +T
Sbjct: 97 GSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLT--- 153
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTA 150
G T LT + +G T T
Sbjct: 154 GVTGLTGETGPIGITGPTG 172
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/139 (28%), Positives = 55/139 (39%), Gaps = 3/139 (2%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
G T +T G T +T G+T +T + GAT T + GAT T
Sbjct: 37 GPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTGIT 96
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
G+T T G+T +T + GAT T + G T T G+T +T
Sbjct: 97 GSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLT--- 153
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTA 174
G T LT + +G T T
Sbjct: 154 GVTGLTGETGPIGITGPTG 172
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/139 (28%), Positives = 55/139 (39%), Gaps = 3/139 (2%)
Query: 60 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 119
G T +T G T +T G+T +T + GAT T + GAT T
Sbjct: 37 GPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTGIT 96
Query: 120 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 179
G+T T G+T +T + GAT T + G T T G+T +T
Sbjct: 97 GSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLT--- 153
Query: 180 GATELTAKVFTLGATELTA 198
G T LT + +G T T
Sbjct: 154 GVTGLTGETGPIGITGPTG 172
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/139 (28%), Positives = 55/139 (39%), Gaps = 3/139 (2%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
G T +T G T +T G+T +T + GAT T + GAT T
Sbjct: 37 GPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTGIT 96
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
G+T T G+T +T + GAT T + G T T G+T +T
Sbjct: 97 GSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLT--- 153
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTA 222
G T LT + +G T T
Sbjct: 154 GVTGLTGETGPIGITGPTG 172
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/139 (28%), Positives = 55/139 (39%), Gaps = 3/139 (2%)
Query: 108 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 167
G T +T G T +T G+T +T + GAT T + GAT T
Sbjct: 37 GPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTGIT 96
Query: 168 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 227
G+T T G+T +T + GAT T + G T T G+T +T
Sbjct: 97 GSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLT--- 153
Query: 228 GATELTAKVFTLGATELTA 246
G T LT + +G T T
Sbjct: 154 GVTGLTGETGPIGITGPTG 172
>gi|150391175|ref|YP_001321224.1| triple helix repeat-containing collagen [Alkaliphilus
metalliredigens QYMF]
gi|149951037|gb|ABR49565.1| Collagen triple helix repeat [Alkaliphilus metalliredigens QYMF]
Length = 863
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/229 (31%), Positives = 79/229 (34%), Gaps = 18/229 (7%)
Query: 84 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 143
GAT T G T GAT T + GAT T GAT T +
Sbjct: 518 GATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPT---GATGPTGEDGAD 574
Query: 144 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 203
GAT T GAT T GAT T G T GAT T +
Sbjct: 575 GATGATGPT---GATGPTGADGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGED 631
Query: 204 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 263
GAT T GAT T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 632 GATGATGPT---GATGPTGDDGEDGATGATGPT---GATGPTGEDGEDGATGATGPT--- 682
Query: 264 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG 312
GAT T + GAT T GAT T + GAT T G
Sbjct: 683 GATGPTGEDGEDGATGATGPT---GATGPTGEDGEDGATGATGPTGPTG 728
Score = 38.5 bits (88), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/224 (31%), Positives = 76/224 (33%), Gaps = 15/224 (6%)
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T G T GAT T + GAT T GAT T +
Sbjct: 518 GATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPT---GATGPTGEDGAD 574
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T GAT T G T GAT T +
Sbjct: 575 GATGATGPT---GATGPTGADGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGED 631
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T GAT T GAT T GAT T + GAT T
Sbjct: 632 GATGATGPT---GATGPTGDDGEDGATGATGPT---GATGPTGEDGEDGATGATGPT--- 682
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 319
GAT T + GAT T G T + GAT T
Sbjct: 683 GATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGP 726
>gi|255308277|ref|ZP_05352448.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile ATCC 43255]
Length = 558
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 88/341 (25%), Positives = 103/341 (30%), Gaps = 36/341 (10%)
Query: 7 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 66
V G T T G +T G T T GA +T +GAT
Sbjct: 12 DVGPTGPTGATGPTGPTGPRGVTGATGANGITGSTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPNG 71
Query: 67 KVFTL---------GATELTAKVFTLGAT---ELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 114
+ GA +T GAT +T GAT A T G+T T
Sbjct: 72 TTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT-GSTGPTG 128
Query: 115 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTA 174
GA +T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 129 NTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATG 188
Query: 175 KVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLG------ 228
GAT T + GAT T +GAT T +G T G
Sbjct: 189 PTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTG 248
Query: 229 ---------ATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELT------AKVFTLGATELTAKVF 273
A L GAT V GAT T +GAT T
Sbjct: 249 PTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADG 308
Query: 274 TLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGAT 314
+G T T GAT T V GA + + G T
Sbjct: 309 AVGPTGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPT 349
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 96/360 (26%), Positives = 113/360 (31%), Gaps = 28/360 (7%)
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T G T T GA +T GAT GA +T +
Sbjct: 20 GATGPTGPTGPRGVTGAT------GANGITGSTGNTGAT---------GANGITGPTGNM 64
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT + G T T G T T GA +T GAT A T
Sbjct: 65 GATGPNGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG--ANGIT- 121
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
G+T T GA +T GAT T GAT T G T T
Sbjct: 122 GSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGAN 181
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
G T T GAT T + GAT T +GAT GAT +V
Sbjct: 182 GVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGAT---------GATGADGEVGPT 232
Query: 312 GATELTAK-SVILEVEYYKPIKIVPQNSATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKV 370
GA T ++ P N T GA L GAT + +
Sbjct: 233 GAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAI 292
Query: 371 FTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKN 430
GA T GA T GA T +GAT +G T T +N
Sbjct: 293 GPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGEN 352
>gi|434376766|ref|YP_006611410.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-789]
gi|401875323|gb|AFQ27490.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-789]
Length = 983
Score = 38.5 bits (88), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/301 (26%), Positives = 80/301 (26%), Gaps = 18/301 (5%)
Query: 12 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 71
GAT GAT GAT GAT T GAT
Sbjct: 677 GATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNT 736
Query: 72 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 131
GAT T GAT T G T T G T GAT
Sbjct: 737 GATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT------GATGPQGPQGNT 790
Query: 132 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 191
GAT T GAT T G T T G T GAT
Sbjct: 791 GATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT------GATGPQGPQGNT 844
Query: 192 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 251
GAT T G T T G T G + GAT
Sbjct: 845 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNT 904
Query: 252 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 311
GAT T G T T GAT GAT T G T T
Sbjct: 905 GATGATGPQGVQGNTGAT------GATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 958
Query: 312 G 312
G
Sbjct: 959 G 959
Score = 38.1 bits (87), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/287 (26%), Positives = 77/287 (26%), Gaps = 18/287 (6%)
Query: 36 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 95
GAT GAT GAT GAT T GAT
Sbjct: 677 GATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNT 736
Query: 96 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 155
GAT T GAT T G T T G T GAT
Sbjct: 737 GATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT------GATGPQGPQGNT 790
Query: 156 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 215
GAT T GAT T G T T G T GAT
Sbjct: 791 GATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT------GATGPQGPQGNT 844
Query: 216 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL 275
GAT T G T T G T G + GAT
Sbjct: 845 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNT 904
Query: 276 GATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKSVI 322
GAT T G T T GAT GAT T +
Sbjct: 905 GATGATGPQGVQGNTGAT------GATGPQGPQGNTGATGATGPQGV 945
>gi|170685625|ref|ZP_02876848.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0465]
gi|254687535|ref|ZP_05151391.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. CNEVA-9066]
gi|170670089|gb|EDT20829.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0465]
Length = 577
Score = 38.1 bits (87), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/143 (29%), Positives = 51/143 (35%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 179 LGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTL---GATELTAKVFTLGATELTAK 235
+G+T T + G+T T G+T +T + GAT T ++GAT T
Sbjct: 223 IGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGA 282
Query: 236 VFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAKVFTLGATELTAK 295
G T T GAT T GAT T G T T G T T
Sbjct: 283 TGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 342
Query: 296 VFTLGATELTAKVFTLGATELTA 318
GAT T GAT T
Sbjct: 343 TGNTGATGSTGPTGETGATGSTG 365
Database: nr
Posted date: Mar 3, 2013 10:45 PM
Number of letters in database: 999,999,864
Number of sequences in database: 2,912,245
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.01
Posted date: Mar 3, 2013 10:52 PM
Number of letters in database: 999,999,666
Number of sequences in database: 2,912,720
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.02
Posted date: Mar 3, 2013 10:58 PM
Number of letters in database: 999,999,938
Number of sequences in database: 3,014,250
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.03
Posted date: Mar 3, 2013 11:03 PM
Number of letters in database: 999,999,780
Number of sequences in database: 2,805,020
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.04
Posted date: Mar 3, 2013 11:08 PM
Number of letters in database: 999,999,551
Number of sequences in database: 2,816,253
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.05
Posted date: Mar 3, 2013 11:13 PM
Number of letters in database: 999,999,897
Number of sequences in database: 2,981,387
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.06
Posted date: Mar 3, 2013 11:18 PM
Number of letters in database: 999,999,649
Number of sequences in database: 2,911,476
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.07
Posted date: Mar 3, 2013 11:24 PM
Number of letters in database: 999,999,452
Number of sequences in database: 2,920,260
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.08
Posted date: Mar 3, 2013 11:25 PM
Number of letters in database: 64,230,274
Number of sequences in database: 189,558
Lambda K H
0.315 0.127 0.330
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 4,611,037,067
Number of Sequences: 23463169
Number of extensions: 157200490
Number of successful extensions: 753275
Number of sequences better than 100.0: 1000
Number of HSP's better than 100.0 without gapping: 721
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 751
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 583641
Number of HSP's gapped (non-prelim): 33285
length of query: 447
length of database: 8,064,228,071
effective HSP length: 146
effective length of query: 301
effective length of database: 8,933,572,693
effective search space: 2689005380593
effective search space used: 2689005380593
T: 11
A: 40
X1: 16 ( 7.3 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (21.6 bits)
S2: 78 (34.7 bits)