Diaphorina citri psyllid: psy4875

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Paired box protein Pax-6 Involved in eye morphogenesis.very confidentO18381
Paired box protein Pax-8 Thought to encode a transcription factor. It may have a role in kidney cell differentiation. May play a regulatory role in mammalian development.confidentP47240
Paired box protein Pax-6 Transcription factor with important functions in the development of the eye, nose, central nervous system and pancreas. Required for the differentiation of pancreatic islet alpha cells. Competes with PAX4 in binding to a common element in the glucagon, insulin and somatostatin promoters (By similarity). Regulates specification of the ventral neuron subtypes by establishing the correct progenitor domains.confidentP63016

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0048708 [BP]astrocyte differentiationprobableGO:0032502, GO:0048856, GO:0044707, GO:0007399, GO:0009987, GO:0048869, GO:0030154, GO:0042063, GO:0008150, GO:0032501, GO:0044763, GO:0010001, GO:0048731, GO:0022008, GO:0007275, GO:0044699, GO:0007417
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GO:0002052 [BP]positive regulation of neuroblast proliferationprobableGO:0042127, GO:0030154, GO:0050789, GO:0044699, GO:0050767, GO:0048869, GO:0060284, GO:0050769, GO:2000177, GO:0065007, GO:2000648, GO:0048518, GO:2000179, GO:0008284, GO:0032501, GO:0010720, GO:0050793, GO:0009987, GO:0050794, GO:0045597, GO:0045595, GO:0008150, GO:0051239, GO:0022008, GO:0048699, GO:0044707, GO:0007399, GO:0051094, GO:0048856, GO:0044763, GO:0072091, GO:0032502, GO:0051960, GO:2000026, GO:0007275, GO:0048731, GO:0048522
GO:0009415 [BP]response to water stimulusprobableGO:1901700, GO:0009628, GO:0050896, GO:0008150, GO:0042221, GO:0010035
GO:0021798 [BP]forebrain dorsal/ventral pattern formationprobableGO:0032502, GO:0007389, GO:0032501, GO:0009953, GO:0007420, GO:0044707, GO:0008150, GO:0048856, GO:0044767, GO:0048513, GO:0030900, GO:0003002, GO:0048731, GO:0007399, GO:0007417, GO:0007275, GO:0044699, GO:0021871
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GO:0032993 [CC]protein-DNA complexprobableGO:0005575, GO:0032991
GO:0072108 [BP]positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesisprobableGO:0022604, GO:0022603, GO:0090183, GO:0051128, GO:0050789, GO:0060284, GO:0010769, GO:0030856, GO:0010720, GO:0048518, GO:0065007, GO:0051130, GO:0050793, GO:0050794, GO:0045597, GO:0045595, GO:0008150, GO:0051239, GO:0003339, GO:0051094, GO:0072215, GO:2000026, GO:2000027, GO:0010770, GO:0048522

Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 2K27, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 5-79
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Template: 2H8R, chain A
Confidence level:probable
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