BLASTP 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for compositional score matrix adjustment: Altschul, Stephen F.,
John C. Wootton, E. Michael Gertz, Richa Agarwala, Aleksandr Morgulis,
Alejandro A. Schaffer, and Yi-Kuo Yu (2005) "Protein database searches
using compositionally adjusted substitution matrices", FEBS J. 272:5101-5109.
Query= psy5765
(205 letters)
Database: nr
23,463,169 sequences; 8,064,228,071 total letters
Searching..................................................done
>gi|150017445|ref|YP_001309699.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium beijerinckii
NCIMB 8052]
gi|149903910|gb|ABR34743.1| Collagen triple helix repeat [Clostridium beijerinckii NCIMB 8052]
Length = 914
Score = 130 bits (328), Expect = 3e-28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/184 (33%), Positives = 84/184 (45%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 283 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 342
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 343 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGP 402
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 403 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGD 462
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 463 TGVT 466
Score = 129 bits (324), Expect = 7e-28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 82/182 (45%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 484 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 543
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 544 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGP 603
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 604 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 663
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 664 TG 665
Score = 129 bits (323), Expect = 8e-28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 82/182 (45%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 466 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 525
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 526 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGP 585
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 586 TGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 645
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 646 TG 647
Score = 128 bits (322), Expect = 1e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/191 (32%), Positives = 85/191 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 520 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 579
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 580 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 639
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 640 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 699
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 700 TGSTGDTGVTG 710
Score = 127 bits (320), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 511 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 570
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 571 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 630
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 631 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 690
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 691 TG 692
Score = 127 bits (320), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 220 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGD 279
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 280 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 339
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 340 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 399
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 400 TG 401
Score = 127 bits (320), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 229 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 288
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 289 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 348
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 349 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGV 408
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 409 TG 410
Score = 127 bits (320), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 238 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 297
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 298 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 357
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 358 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGV 417
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 418 TG 419
Score = 127 bits (320), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 265 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 324
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 325 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 384
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 385 TGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGV 444
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 445 TG 446
Score = 127 bits (320), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 493 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 552
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 553 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 612
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 613 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 672
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 673 TG 674
Score = 127 bits (320), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 502 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 561
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 562 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 621
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 622 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 681
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 682 TG 683
Score = 127 bits (319), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 256 TGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 315
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 316 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 375
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 376 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 435
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 436 TG 437
Score = 127 bits (319), Expect = 2e-27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 81/182 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 475 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 534
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 535 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 594
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 595 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 654
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 655 TG 656
Score = 124 bits (312), Expect = 2e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/191 (32%), Positives = 84/191 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 556 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 615
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 616 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 675
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 676 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 735
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 736 TGSTGDTGVTG 746
Score = 124 bits (312), Expect = 2e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/182 (32%), Positives = 80/182 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 538 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 597
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 598 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 657
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 658 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGV 717
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 718 TG 719
Score = 124 bits (311), Expect = 2e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/182 (32%), Positives = 80/182 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 457 TGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 516
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 517 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 576
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 577 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 636
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 637 TG 638
Score = 124 bits (311), Expect = 2e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 82/185 (44%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 319 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 378
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 379 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGP 438
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 439 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 498
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 499 TGVTG 503
Score = 124 bits (310), Expect = 3e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 82/185 (44%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 364 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 423
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 424 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 483
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 484 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 543
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 544 TGVTG 548
Score = 123 bits (309), Expect = 3e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 82/185 (44%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 391 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 450
Query: 73 LRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 451 TGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 510
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 511 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 570
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 571 TGVTG 575
Score = 123 bits (309), Expect = 3e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 82/185 (44%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 409 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGP 468
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 469 TGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGA 528
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 529 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 588
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 589 TGVTG 593
Score = 123 bits (309), Expect = 3e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 82/185 (44%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 445 TGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 504
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 505 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 564
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 565 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 624
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 625 TGVTG 629
Score = 123 bits (309), Expect = 4e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/184 (32%), Positives = 82/184 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 292 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 351
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 352 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 411
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 412 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGD 471
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 472 TGVT 475
Score = 123 bits (309), Expect = 4e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 346 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 405
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG- 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 406 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGV 465
Query: 132 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 466 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 525
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 526 TGATG 530
Score = 122 bits (307), Expect = 7e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 310 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 369
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 370 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 429
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 430 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 489
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 490 TGVTG 494
Score = 122 bits (306), Expect = 8e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 301 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 360
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 361 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 420
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G GP+G GP+G GP +G GP+G GP+G
Sbjct: 421 TGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 480
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 481 TGATG 485
Score = 122 bits (306), Expect = 8e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 328 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 387
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 388 TGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 447
Query: 133 SGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 448 TGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 507
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 508 TGATG 512
Score = 122 bits (306), Expect = 9e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 355 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 414
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP +G GP+G
Sbjct: 415 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGV 474
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 475 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 534
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 535 TGVTG 539
Score = 122 bits (306), Expect = 9e-26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 373 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 432
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 433 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGV 492
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 493 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 552
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 553 TGVTG 557
Score = 122 bits (305), Expect = 1e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 382 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 441
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 442 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGV 501
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 502 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 561
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 562 TGATG 566
Score = 122 bits (305), Expect = 1e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 400 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 459
Query: 73 LR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 460 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGV 519
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 520 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 579
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 580 TGATG 584
Score = 122 bits (305), Expect = 1e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 436 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 495
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 496 TGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 555
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 556 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 615
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 616 TGVTG 620
Score = 122 bits (305), Expect = 1e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGP 69
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 418 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGP 477
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 478 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGV 537
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 538 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 597
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 598 TGATG 602
Score = 122 bits (305), Expect = 1e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 427 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGP 486
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 487 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGV 546
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 547 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGD 606
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 607 TGVTG 611
Score = 121 bits (303), Expect = 2e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 79/182 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 583 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 642
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 643 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGS 702
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 703 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 762
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 763 TG 764
Score = 121 bits (303), Expect = 2e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 79/182 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 574 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 633
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 634 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 693
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 694 TGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTGDTGV 753
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 754 TG 755
Score = 120 bits (300), Expect = 5e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/178 (32%), Positives = 78/178 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 601 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 660
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 661 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGP 720
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 721 TGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGAT 778
Score = 103 bits (257), Expect = 5e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/161 (32%), Positives = 69/161 (42%), Gaps = 5/161 (3%)
Query: 39 YLGPSGR-----LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 205 ETGPAGNTGSAVTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGA 264
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 265 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 324
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 325 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 365
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/153 (32%), Positives = 67/153 (43%), Gaps = 5/153 (3%)
Query: 47 RYLGPSGS-----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 204 GETGPAGNTGSAVTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 263
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 264 ATGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTG 323
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 324 DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 356
>gi|291235606|ref|XP_002737736.1| PREDICTED: hypothetical protein [Saccoglossus kowalevskii]
Length = 277
Score = 120 bits (302), Expect = 3e-25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 81/205 (39%), Gaps = 17/205 (8%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS----GSLRYLGPSG 62
+ + PS + Y PS + Y PS ++Y PS + Y PS + Y PS
Sbjct: 51 IVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVEVKYTSPSVDVMYTSPSVDVIVDVMYTSPSV 110
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+ Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y+ PS + Y PS + Y
Sbjct: 111 DVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYISPSVDVMYTSPSVDVMYTS 170
Query: 123 PSGRL-------------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
PS + PS Y PS + Y PS + Y PS Y PS
Sbjct: 171 PSVDVVYTSASVDVVVDVVYTSPSVDAMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDAMYTSPS 230
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ Y PS + Y PS + Y
Sbjct: 231 VDVMYTSPSVEVMYTSPSVDVMYTS 255
Score = 117 bits (292), Expect = 3e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 78/198 (39%), Gaps = 17/198 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS--- 70
PS + Y P + Y PS + Y PS + Y PS ++Y PS + Y PS
Sbjct: 40 SPSMEVMYTSPIVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVEVKYTSPSVDVMYTSPSVDV 99
Query: 71 -GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y+ PS +
Sbjct: 100 IVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYISPSVDVMY 159
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRL-------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
PS + Y PS + Y PS Y PS + Y PS + Y
Sbjct: 160 TSPSVDVMYTSPSVDVVYTSASVDVVVDVVYTSPSVDAMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTS 219
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
PS Y PS + Y
Sbjct: 220 PSVDAMYTSPSVDVMYTS 237
Score = 112 bits (281), Expect = 7e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 80/205 (39%), Gaps = 19/205 (9%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYL--GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+ + PS + Y+ PS + Y P + Y PS + Y PS + Y PS ++Y
Sbjct: 24 EVMYTSPSVEVMYMYTSPSMEVMYTSPIVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVEVKY 83
Query: 67 LGPSGRLRYLGPS----GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y
Sbjct: 84 TSPSVDVMYTSPSVDVIVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTS 143
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-------------RYLGPSGRLRYLGPS 169
PS + PS + Y PS + Y PS + Y PS Y PS
Sbjct: 144 PSVDVMYISPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVVYTSASVDVVVDVVYTSPSVDAMYTSPS 203
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ Y PS + Y PS Y
Sbjct: 204 VDVMYTSPSVDVMYTSPSVDAMYTS 228
Score = 110 bits (274), Expect = 5e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/165 (30%), Positives = 71/165 (43%), Gaps = 6/165 (3%)
Query: 38 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL--GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
Y PS + Y PS + Y+ PS + Y P + Y PS + Y PS + Y
Sbjct: 17 MYTSPSVEVMYTSPSVEVMYMYTSPSMEVMYTSPIVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTS 76
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
PS ++Y PS + Y PS + Y PS + PS + Y PS + Y PS
Sbjct: 77 PSVEVKYTSPSVDVMYTSPSVDVIVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPS 136
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ Y PS + Y+ PS + Y PS + Y PS + Y S
Sbjct: 137 VDVMYTSPSVDVMYISPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVVYTSAS 181
Score = 108 bits (270), Expect = 1e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/165 (31%), Positives = 69/165 (41%), Gaps = 4/165 (2%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
+ Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y+ PS + Y
Sbjct: 102 DVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYISPSVDVMYTS 161
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS----GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
PS + Y PS + Y S + Y PS Y PS + Y PS + PS
Sbjct: 162 PSVDVMYTSPSVDVVYTSASVDVVVDVVYTSPSVDAMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPS 221
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y PS
Sbjct: 222 VDAMYTSPSVDVMYTSPSVEVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPS 266
Score = 107 bits (267), Expect = 3e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/168 (30%), Positives = 70/168 (41%), Gaps = 4/168 (2%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V+ + PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y+ PS +
Sbjct: 99 VIVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYISPSVDVM 158
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS----GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
Y PS + Y PS + Y S + Y PS Y PS + Y PS + Y
Sbjct: 159 YTSPSVDVMYTSPSVDVVYTSASVDVVVDVVYTSPSVDAMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYT 218
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
PS PS + Y PS + Y PS + Y PS + Y PS
Sbjct: 219 SPSVDAMYTSPSVDVMYTSPSVEVMYTSPSVDVMYTSPSVDVMYTSPS 266
>gi|288870437|ref|ZP_06114100.2| hypothetical Membrane Spanning Protein [Clostridium hathewayi DSM
13479]
gi|288867183|gb|EFC99481.1| hypothetical Membrane Spanning Protein [Clostridium hathewayi DSM
13479]
Length = 474
Score = 115 bits (289), Expect = 8e-24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/176 (34%), Positives = 85/176 (48%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 259 TGPTGAAGATGPTGAAGATGPTGAAGATGPTGADGVTGPTGADGVTGPTGAAGATGPTGA 318
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 319 AGATGPTGAAGATGPTGAAGVTGPTGADGVTGPTGADGVTGPTGAAGATGPTGADGATGP 378
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 379 TGAAGATGPTGAAGATGPTGADGATGPTGAAGATGPTGADGATGPTGAAGATGPTG 434
Score = 112 bits (279), Expect = 1e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/174 (33%), Positives = 82/174 (47%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 258 VTGPTGAAGATGPTGAAGATGPTGAAGATGPTGADGVTGPTGADGVTGPTGAAGATGPTG 317
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G G
Sbjct: 318 AAGATGPTGAAGATGPTGAAGVTGPTGADGVTGPTGADGVTGPTGAAGATGPTGADGATG 377
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 378 PTGAAGATGPTGAAGATGPTGADGATGPTGAAGATGPTGADGATGPTGAAGATG 431
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/121 (33%), Positives = 58/121 (47%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
A GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G G
Sbjct: 318 AAGATGPTGAAGATGPTGAAGVTGPTGADGVTGPTGADGVTGPTGAAGATGPTGADGATG 377
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 378 PTGAAGATGPTGAAGATGPTGADGATGPTGAAGATGPTGADGATGPTGAAGATGPTGPAG 437
Query: 129 S 129
S
Sbjct: 438 S 438
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/93 (32%), Positives = 42/93 (45%)
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 258 VTGPTGAAGATGPTGAAGATGPTGAAGATGPTGADGVTGPTGADGVTGPTGAAGATGPTG 317
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G GP+G G + V+G
Sbjct: 318 AAGATGPTGAAGATGPTGAAGVTGPTGADGVTG 350
>gi|359411481|ref|ZP_09203946.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
gi|357170365|gb|EHI98539.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
Length = 701
Score = 114 bits (286), Expect = 2e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/190 (32%), Positives = 83/190 (43%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 358 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGP 417
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 418 TGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 477
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 478 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 537
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G GL+
Sbjct: 538 TGDTGATGLT 547
Score = 114 bits (284), Expect = 3e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/188 (32%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 313 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 372
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 373 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGD 432
Query: 130 DG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 433 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 492
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 493 TGDTGVTG 500
Score = 112 bits (281), Expect = 7e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/188 (32%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 322 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 381
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP +G GP+G GP +G GP+G
Sbjct: 382 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGD 441
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 442 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 501
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 502 TGDTGVTG 509
Score = 112 bits (281), Expect = 7e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/188 (32%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 331 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 390
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 391 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 450
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 451 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 510
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 511 TGDTGVTG 518
Score = 112 bits (281), Expect = 7e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/188 (32%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 340 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 399
Query: 73 LRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 400 TGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 459
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 460 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 519
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 520 TGDTGVTG 527
Score = 112 bits (281), Expect = 7e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/188 (32%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 349 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 408
Query: 73 LR---YLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 409 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 468
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 469 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 528
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 529 TGDTGVTG 536
Score = 112 bits (280), Expect = 9e-23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/184 (32%), Positives = 82/184 (44%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 TGPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 291
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 292 TGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 351
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 352 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGD 411
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 412 TGVT 415
Score = 108 bits (271), Expect = 9e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 250 TGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGD 309
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 310 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 369
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G GP+G GP+G GP +G GP+G GP+G
Sbjct: 370 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 429
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 430 TGDTGVT 436
Score = 108 bits (270), Expect = 1e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 80/184 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 241 TGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGP 300
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 301 TGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 360
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 361 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGD 420
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 421 TGVT 424
Score = 106 bits (265), Expect = 5e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/182 (31%), Positives = 79/182 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 223 TGATGPTGVTGPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 282
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 283 TGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 342
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 343 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGV 402
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 403 TG 404
Score = 105 bits (263), Expect = 7e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/188 (31%), Positives = 80/188 (42%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 298 TGPTGDTGVTGDTG---VTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 354
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS--- 129
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 355 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGV 414
Query: 130 DGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 415 TGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 474
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 475 TGDTGVTG 482
Score = 103 bits (258), Expect = 3e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/180 (32%), Positives = 77/180 (42%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLR---Y 66
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 376 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGV 435
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 436 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 495
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 496 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGLTGDTGATGP 555
Score = 103 bits (256), Expect = 6e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/188 (31%), Positives = 79/188 (42%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 268 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 327
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 328 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 387
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G GP+G GP +G GP+G GP +G GP+G GP
Sbjct: 388 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGP 447
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 448 TGDTGVTG 455
Score = 103 bits (256), Expect = 6e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/188 (31%), Positives = 79/188 (42%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 277 TGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 336
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 337 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 396
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 397 TGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 456
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 457 TGDTGVTG 464
Score = 103 bits (256), Expect = 6e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/188 (31%), Positives = 79/188 (42%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 286 TGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 345
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 346 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 405
Query: 133 SGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 406 TGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 465
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 466 TGDTGVTG 473
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 78/184 (42%), Gaps = 2/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRL--RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+
Sbjct: 212 TGPAGNTGSAVTGATGPTGVTGPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTGPT 271
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 272 GDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVT 331
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 332 GPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT 391
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 392 GVTG 395
Score = 86.3 bits (212), Expect = 7e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/159 (30%), Positives = 66/159 (41%), Gaps = 2/159 (1%)
Query: 38 RYLGPSGRL--RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 210 GETGPAGNTGSAVTGATGPTGVTGPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTG 269
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 270 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 329
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 330 VTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 368
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/89 (30%), Positives = 38/89 (42%), Gaps = 2/89 (2%)
Query: 110 RYLGPSGRL--RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 210 GETGPAGNTGSAVTGATGPTGVTGPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGDTGVTG 269
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G GP+G GP+G G++
Sbjct: 270 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVT 298
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/110 (30%), Positives = 47/110 (42%), Gaps = 7/110 (6%)
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G S GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 212 TGPAG---NTG-SAVTGATGPTG---VTGPTGVTGPTGPTGATGVTGPTGDTGDTGPTGD 264
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G GP+G GP+G G +G G++ V+G
Sbjct: 265 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGDTGVTGPTGDTGVTGDTGVTG 314
>gi|150017446|ref|YP_001309700.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium beijerinckii
NCIMB 8052]
gi|149903911|gb|ABR34744.1| Collagen triple helix repeat [Clostridium beijerinckii NCIMB 8052]
Length = 2411
Score = 110 bits (274), Expect = 4e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 74/182 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 680 TGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGD 739
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 740 TGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGS 799
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 800 TGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGV 859
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 860 TG 861
Score = 108 bits (269), Expect = 2e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 74/183 (40%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 670 DTGITGATGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTG 729
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 730 DTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTG 789
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 790 PTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTG 849
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 850 ATG 852
Score = 104 bits (260), Expect = 2e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 74/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 620 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG- 678
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G + GP
Sbjct: 679 --VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGP 736
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 737 TGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGA 796
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 797 TG 798
Score = 103 bits (258), Expect = 3e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 73/182 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 230 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGD 289
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G GP
Sbjct: 290 TGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGP 349
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 350 TGDTGITGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGV 409
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 410 TG 411
Score = 103 bits (256), Expect = 5e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 73/184 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 221 TGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGD 280
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 281 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGP 340
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 341 TGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGV 400
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 401 TGAT 404
Score = 103 bits (256), Expect = 6e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 73/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 656 TGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGD 712
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 713 TGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGP 772
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 773 TGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGI 832
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 833 TG 834
Score = 102 bits (254), Expect = 9e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 75/190 (39%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +G G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 629 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGATGDTGV 688
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 689 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 748
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 749 AGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGP 808
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G +
Sbjct: 809 TGDTGVTGAT 818
Score = 100 bits (248), Expect = 5e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 647 TGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 703
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 704 TGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGA 763
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 764 TGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGV 823
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 824 TG 825
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/179 (27%), Positives = 71/179 (39%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +G GP+G G +G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 215 TGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGV 274
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 275 TGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGE 334
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 335 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITG 393
Score = 99.0 bits (245), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 73/182 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 185 TGPTGDTGATGATGDTGVTGSTGATGITGHTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGD 244
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G + G
Sbjct: 245 TGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGS 304
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 305 TGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGV 364
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 365 TG 366
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1199 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTG---VTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGD 1255
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 1256 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGP 1315
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1316 TGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGA 1375
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 1376 TG 1377
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 71/182 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 203 TGSTGATGITGHTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 262
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 263 TGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGS 322
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 323 TGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGV 382
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 383 TG 384
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 68/168 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 248 TGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGD 307
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 308 TGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGVTGP 367
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 368 TGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGD 415
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G G +GS GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 235 DTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTG 294
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G +G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 295 PTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTG 354
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 355 ITGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTG 414
Query: 189 R 189
Sbjct: 415 D 415
Score = 95.9 bits (237), Expect = 8e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 71/182 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 194 TGATGDTGVTGSTGATGITGHTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGA 253
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 254 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGP 313
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 314 TGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGVTGPTGDTGI 373
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 374 TG 375
Score = 94.0 bits (232), Expect = 3e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 67/167 (40%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 619 ITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG 678
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 679 ---VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATG 735
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G GP+G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 736 PTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGAT 782
Score = 92.8 bits (229), Expect = 7e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 73/206 (35%), Gaps = 24/206 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 266 TGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGD 325
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 326 TGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGS 385
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------RLRYLGP 168
+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 386 TGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGATGTTGDTGATGSTGDTGVTGA 445
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G GP+G G
Sbjct: 446 TGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTG 471
Score = 92.8 bits (229), Expect = 7e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/173 (28%), Positives = 68/173 (39%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1205 TGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 1264
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1265 TGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGA 1324
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1325 TGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATG 1377
Score = 92.8 bits (229), Expect = 8e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 74/209 (35%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------- 64
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 539 TGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGD 598
Query: 65 -------------------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 599 TGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGP 658
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 659 TGDTGVTGPTGDTGITGATGVT---GATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGV 715
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 716 TGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTG 744
Score = 92.8 bits (229), Expect = 8e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/174 (28%), Positives = 68/174 (39%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1198 ITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTG---VTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTG 1254
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1255 DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTG 1314
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 1315 PTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITG 1368
Score = 92.4 bits (228), Expect = 9e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/224 (25%), Positives = 77/224 (34%), Gaps = 42/224 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 530 TGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGD 589
Query: 73 L---------------------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 590 TGVTGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGA 649
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-----------NSD----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+G GP+G GP+G D GP+G GP+G G
Sbjct: 650 TGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGA 709
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 710 TGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITG 753
Score = 92.4 bits (228), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/209 (25%), Positives = 73/209 (34%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1232 TGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGA 1291
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 1292 TGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGP 1351
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRY 165
+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1352 TGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGV 1411
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1412 TGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTG 1440
Score = 92.0 bits (227), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 75/209 (35%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1757 TGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGA 1816
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------- 125
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1817 TGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGP 1876
Query: 126 --------------------RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1877 TGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD--- 1933
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 1934 TGATGDTGLTGPTGDTGVTGPTGDTGATG 1962
Score = 92.0 bits (227), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/211 (24%), Positives = 74/211 (35%), Gaps = 27/211 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1241 TGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 1300
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + GP
Sbjct: 1301 TGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGP 1360
Query: 133 SGRLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1361 TGDTGITGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGV 1420
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 1421 TGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGAT 1451
Score = 91.3 bits (225), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1403 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTG- 1461
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1462 --VTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGS 1519
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1520 TGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDT 1577
Score = 90.5 bits (223), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/200 (27%), Positives = 74/200 (37%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGS 54
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 575 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGD 634
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G G +G GP+G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 635 TGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGATGDTGVTGP 691
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 692 TGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGI 751
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G
Sbjct: 752 TGPTGNTGVTGATGDTGITG 771
Score = 90.1 bits (222), Expect = 5e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/209 (24%), Positives = 73/209 (34%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 1250 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGD 1309
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 1310 TGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGP 1369
Query: 133 SGRL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1370 TGDTGATGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGI 1429
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G +G G
Sbjct: 1430 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTG 1458
Score = 90.1 bits (222), Expect = 5e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/174 (27%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1402 ITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTG 1461
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1462 ---VTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTG 1518
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1519 STGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTG 1572
Score = 89.4 bits (220), Expect = 8e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/209 (24%), Positives = 73/209 (34%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 716 TGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGD 775
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 776 TGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGP 835
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRY 165
+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 836 TGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGV 895
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G G
Sbjct: 896 TGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTG 924
Score = 89.0 bits (219), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/221 (25%), Positives = 76/221 (34%), Gaps = 39/221 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRL-- 64
GP+G GP+G GP+G GP+G G P+G GP+G
Sbjct: 1901 TGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGDTGLTGPTGDTGVTGPTGDTGA 1960
Query: 65 -------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1961 TGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGD 2020
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR------YLGPSGR 153
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 2021 TGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGPTGD 2080
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 2081 TGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 2121
Score = 89.0 bits (219), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 72/201 (35%), Gaps = 30/201 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1766 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 1825
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------- 116
G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1826 TGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGT 1885
Query: 117 -----------RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1886 TGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD---TGATGDTGL 1942
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP
Sbjct: 1943 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGP 1963
Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/218 (24%), Positives = 75/218 (34%), Gaps = 27/218 (12%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1436 TGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 1495
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1496 TGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGA 1555
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRY 156
+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1556 TGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGI 1615
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1616 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTG 1653
Score = 88.6 bits (218), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/200 (26%), Positives = 73/200 (36%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGS 54
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1943 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGATGD 2002
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 2003 TGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGP 2062
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 2063 TGDTGITGATGVT---GPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGV 2119
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G
Sbjct: 2120 TGSTGDTGVTGSTGDTGATG 2139
Score = 88.2 bits (217), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------------YLGPSG 53
+ G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1933 DTGATGDTGLTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTG 1992
Query: 54 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1993 DTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITG 2052
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P+G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2053 PTGDTGVTGPTGDT---GITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTG 2109
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G
Sbjct: 2110 VTGPTGDTGVTGSTGDTGVTG 2130
Score = 87.4 bits (215), Expect = 3e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/161 (28%), Positives = 64/161 (39%), Gaps = 3/161 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1987 ITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTG 2046
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 2047 DTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITG 2103
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2104 PTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDT 2144
Score = 87.4 bits (215), Expect = 3e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/209 (24%), Positives = 72/209 (34%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1313 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGD 1372
Query: 73 L---------------------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 1373 TGATGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGP 1432
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1433 TGDTGVTGSTGDTGVTGATGDT---GVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGV 1489
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1490 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTG 1518
Score = 86.3 bits (212), Expect = 6e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/204 (24%), Positives = 70/204 (34%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G G
Sbjct: 970 DTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGATGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 1029
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
P+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1030 PTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTG 1089
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1090 VTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTG 1149
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G
Sbjct: 1150 DTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTG 1173
Score = 86.3 bits (212), Expect = 7e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/209 (24%), Positives = 71/209 (33%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 725 TGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGATGD 784
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 785 TGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGP 844
Query: 133 SGRLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 845 TGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGV 904
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G G
Sbjct: 905 TGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTG 933
Score = 85.9 bits (211), Expect = 8e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/197 (26%), Positives = 74/197 (37%), Gaps = 24/197 (12%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1897 DTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT---GATGDTGLTGPTGDTGVTG 1953
Query: 78 PSGSLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G GP +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1954 PTGDTGATGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTG 2013
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G + GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 2014 ATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG 2073
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 2074 ---VTGPTGDTGVTGAT 2087
Score = 85.1 bits (209), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/211 (24%), Positives = 73/211 (34%), Gaps = 30/211 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---------------------------RYLGPSGR 45
GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1349 TGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGD 1408
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 1409 TGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTG---VTGP 1465
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1466 TGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGI 1525
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 1526 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGAT 1556
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/215 (24%), Positives = 73/215 (33%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1259 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGD 1318
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG- 131
G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G + G
Sbjct: 1319 TGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGS 1378
Query: 132 --------------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
P+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1379 TGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGV 1438
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1439 TGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITG 1473
Score = 84.3 bits (207), Expect = 3e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/209 (24%), Positives = 72/209 (34%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1430 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTG---VTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGD 1486
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 1487 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGP 1546
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRY 165
+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1547 TGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGA 1606
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1607 TGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 1635
Score = 84.0 bits (206), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/202 (25%), Positives = 71/202 (35%), Gaps = 27/202 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 302 TGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGD 361
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS--- 129
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 362 TGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGP 421
Query: 130 ---------------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 422 TGATGTTGDTGATGSTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTG---VTGS 478
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G G +G
Sbjct: 479 TGATGITGPTGDTGVTGATGDT 500
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/191 (25%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 27/191 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 983 TGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGATGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGD 1042
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1043 TGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGS 1102
Query: 133 SG---------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1103 TGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGA 1162
Query: 166 LGPSGRLRYLG 176
G +G G
Sbjct: 1163 TGSTGDTGVTG 1173
Score = 83.2 bits (204), Expect = 6e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 21/185 (11%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 529 ATGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTG 588
Query: 90 RLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 589 DTGVTGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTG 648
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 649 ATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 705
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 706 VTGAT 710
Score = 82.8 bits (203), Expect = 8e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/215 (24%), Positives = 72/215 (33%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL----------------- 55
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1331 TGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGT 1390
Query: 56 ----------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1391 TGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGA 1450
Query: 106 SGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+G G P+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1451 TGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGA 1510
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1511 TGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTG 1545
Score = 82.4 bits (202), Expect = 9e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 61/157 (38%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1988 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGD 2047
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2048 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 2107
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2108 TGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDT 2144
Score = 81.6 bits (200), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/215 (23%), Positives = 71/215 (33%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------- 62
GP+G G +G G +G G +G G +G+ G +G
Sbjct: 887 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGV 946
Query: 63 -----------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 947 TGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGA 1006
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1007 TGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGS 1066
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1067 TGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTG 1101
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/186 (25%), Positives = 65/186 (34%), Gaps = 27/186 (14%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1756 VTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTG 1815
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG------ 143
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1816 ATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITG 1875
Query: 144 ---------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1876 PTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 1935
Query: 183 YLGPSG 188
G +G
Sbjct: 1936 ATGDTG 1941
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/233 (23%), Positives = 77/233 (33%), Gaps = 54/233 (23%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------- 63
GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 365 TGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGA 424
Query: 64 ---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 425 TGTTGDTGATGSTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTG---VTGSTGA 481
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G + GP+G GP
Sbjct: 482 TGITGPTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGP 541
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 542 TGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTG 594
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/238 (23%), Positives = 78/238 (32%), Gaps = 57/238 (23%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 443 TGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTG---VTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGD 499
Query: 73 LR---------------------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 500 TGITGPTGDTGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGP 559
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL---------------------------RY 138
+G G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 560 TGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGI 619
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +
Sbjct: 620 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGAT 677
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/183 (25%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 27/183 (14%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1756 VTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTG 1815
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------ 152
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1816 ATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITG 1875
Query: 153 ---------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1876 PTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 1935
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 1936 ATG 1938
Score = 80.5 bits (197), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/235 (23%), Positives = 77/235 (32%), Gaps = 51/235 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------------------- 47
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1838 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGD 1897
Query: 48 --YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGR 99
GP+G GP+G GP+G GP+G G P+G GP+G
Sbjct: 1898 TGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGDTGLTGPTGDTGVTGPTGD 1957
Query: 100 LRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1958 TGATGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGS 2017
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +
Sbjct: 2018 TGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGAT 2072
Score = 80.1 bits (196), Expect = 4e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/210 (23%), Positives = 69/210 (32%), Gaps = 33/210 (15%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---------------------- 55
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1132 DTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITG 1191
Query: 56 -----RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
GP+G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1192 ATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTG 1251
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1252 PTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTG 1311
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1312 VTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTG 1341
Score = 80.1 bits (196), Expect = 5e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/200 (25%), Positives = 71/200 (35%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------------- 56
GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1136 TGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGD 1195
Query: 57 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 1196 TGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTG---VTGPTGDTGITGSTGDTGVTGP 1252
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1253 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGV 1312
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G
Sbjct: 1313 TGPTGDTGVTGATGDTGVTG 1332
Score = 79.7 bits (195), Expect = 7e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/227 (24%), Positives = 76/227 (33%), Gaps = 48/227 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1820 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGD 1879
Query: 66 --------------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1880 TGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD---TGA 1936
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP------------------SGRLRYLGPSGRLRY 147
+G GP+G GP+G + GP +G GP+G
Sbjct: 1937 TGDTGLTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGV 1996
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 1997 TGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGATG 2043
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/233 (24%), Positives = 77/233 (33%), Gaps = 51/233 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------- 56
GP+G GP+G GP+G + GP+G G +G
Sbjct: 452 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGV 511
Query: 57 -----------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 512 TGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGVTGD 571
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------------------DGPSGRLRYLGP 141
GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 572 TGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGP 631
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 632 TGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGATG 684
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/191 (25%), Positives = 69/191 (36%), Gaps = 21/191 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---------------------RLRYLG 50
+ G +G G +GS G +GS G +G G
Sbjct: 916 DTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTG 975
Query: 51 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
+G GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 976 STGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGATGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG 1035
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1036 VTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTG 1095
Query: 171 RLRYLGPSGRL 181
G +G
Sbjct: 1096 DTGVTGSTGDT 1106
Score = 78.6 bits (192), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/250 (21%), Positives = 78/250 (31%), Gaps = 66/250 (26%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 320 TGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGD 379
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------R 108
G +G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 380 TGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGATGTTGDTGATGSTGD 439
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------- 152
G +G GP+G + GP+G GP+G G +G
Sbjct: 440 TGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGD 499
Query: 153 --------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 500 TGITGPTGDTGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGP 559
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 560 TGDTGATGVT 569
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/227 (23%), Positives = 75/227 (33%), Gaps = 48/227 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1793 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGD 1852
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---------------------------YLGPSGRLRYLGP 105
GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 1853 TGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGP 1912
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------ 159
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 1913 TGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDT---GATGDTGLTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGV 1969
Query: 160 ------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1970 TGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATG 2016
Score = 77.4 bits (189), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/200 (23%), Positives = 68/200 (34%), Gaps = 24/200 (12%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G +G G +G G +G+ G +G G +G G +G
Sbjct: 886 ITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTG 945
Query: 81 ------------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 946 VTGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG 1005
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1006 ATGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTG 1065
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G +
Sbjct: 1066 STGDTGVTGPTGDTGVTGAT 1085
Score = 75.9 bits (185), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/194 (23%), Positives = 66/194 (34%), Gaps = 24/194 (12%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 71
GP+G G +G G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 1678 ITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATG 1737
Query: 72 ---------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1738 ITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTG 1797
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1798 DTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTG 1857
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRL 190
P+G G +G
Sbjct: 1858 PTGDTGVTGSTGDT 1871
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/236 (22%), Positives = 73/236 (30%), Gaps = 54/236 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 1481 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGD 1540
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------------- 110
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1541 TGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGP 1600
Query: 111 -----YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------- 154
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1601 TGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGV 1660
Query: 155 ----------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 1661 TGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTG 1716
Score = 75.1 bits (183), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/193 (23%), Positives = 65/193 (33%), Gaps = 24/193 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------- 62
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1679 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGI 1738
Query: 63 --------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1739 TGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGD 1798
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 1799 TGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGP 1858
Query: 169 SGRLRYLGPSGRL 181
+G G +G
Sbjct: 1859 TGDTGVTGSTGDT 1871
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/235 (22%), Positives = 73/235 (31%), Gaps = 51/235 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------- 64
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 806 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGD 865
Query: 65 -------------------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 866 TGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGD 925
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------------------------DGPSGRLRYLGP 141
+G G +G G +G S G +G GP
Sbjct: 926 TGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGP 985
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +
Sbjct: 986 TGDTGVTGPTGDTGITGATGATGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGAT 1040
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/189 (23%), Positives = 63/189 (33%), Gaps = 24/189 (12%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 80
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1678 ITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATG 1737
Query: 81 ---------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1738 ITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTG 1797
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1798 DTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTG 1857
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P+G G
Sbjct: 1858 PTGDTGVTG 1866
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/177 (24%), Positives = 59/177 (33%), Gaps = 27/177 (15%)
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1753 DTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTG 1812
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--- 161
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1813 STGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTG 1872
Query: 162 ------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1873 ITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 1929
Score = 73.6 bits (179), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/244 (21%), Positives = 73/244 (29%), Gaps = 60/244 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL----------------- 55
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1607 TGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGT 1666
Query: 56 ----------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------- 98
GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1667 TGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTGD 1726
Query: 99 --------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 1727 TGVTGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 1786
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1787 TGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGV 1846
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1847 TGAT 1850
Score = 72.8 bits (177), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/222 (22%), Positives = 71/222 (31%), Gaps = 57/222 (25%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS------------------ 54
GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 374 TGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGATGTTGDTGA 433
Query: 55 ------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRY 102
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 434 TGSTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGDTGV 493
Query: 103 LGPSGRLR---------------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G GP+G GP+G + GP+G
Sbjct: 494 TGATGDTGITGPTGDTGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGD 553
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 554 TGITGPTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGP 595
Score = 72.8 bits (177), Expect = 8e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/236 (22%), Positives = 72/236 (30%), Gaps = 57/236 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1055 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGD 1114
Query: 66 --------------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----- 100
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1115 TGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGS 1174
Query: 101 ----------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1175 TGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDT---GVTGDTGV 1231
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1232 TGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTG 1287
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/208 (23%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 27/208 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 2024 TGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGPTGD 2080
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP+G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 2081 TGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGP 2140
Query: 133 SGRL------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 2141 TGDTGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGPTGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGS 2200
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G++
Sbjct: 2201 TGSTGATGATGVTGSTGSTGATGATGIT 2228
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 70/173 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1001 TGATGATGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 1060
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 1061 TGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGT 1120
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1121 TGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTG 1173
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/262 (20%), Positives = 75/262 (28%), Gaps = 78/262 (29%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1019 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGD 1078
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRYLGP 105
G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 1079 TGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGP 1138
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------------------------ 141
+G GP+G GP+G + G +G G
Sbjct: 1139 TGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGI 1198
Query: 142 ---------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1199 TGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGV 1258
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G +
Sbjct: 1259 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGAT 1280
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/251 (21%), Positives = 75/251 (29%), Gaps = 69/251 (27%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 1010 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGD 1069
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------------------------ 102
GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1070 TGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGP 1129
Query: 103 ------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL-------------------- 136
GP+G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 1130 TGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGI 1189
Query: 137 -------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1190 TGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGV 1249
Query: 184 LGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 1250 TGPTGDTGVTG 1260
Score = 70.1 bits (170), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 68/182 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 761 TGATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGD 820
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 821 TGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGA 880
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 881 TGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGS 940
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 941 TG 942
Score = 70.1 bits (170), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/260 (20%), Positives = 73/260 (28%), Gaps = 78/260 (30%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 770 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGD 829
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------------------------RYLGP 96
GP+G GP+G GP
Sbjct: 830 TGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGP 889
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG---------------------- 134
+G G +G G +G G +G S G +G
Sbjct: 890 TGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGS 949
Query: 135 --------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 950 TGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGATGV 1009
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G
Sbjct: 1010 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTG 1029
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/212 (23%), Positives = 70/212 (33%), Gaps = 48/212 (22%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 442 VTGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTG---VTGSTGATGITGPTGDTGVTGATG 498
Query: 90 RLR---------------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 499 DTGITGPTGDTGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITG 558
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLR 164
P+G + G +G GP+G GP+G GP +G
Sbjct: 559 PTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTG 618
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G +G G +
Sbjct: 619 ITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGAT 650
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/242 (21%), Positives = 72/242 (29%), Gaps = 60/242 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------------------------- 46
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 824 TGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGD 883
Query: 47 -RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------- 98
GP+G G +G G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 884 TGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGSTGD 943
Query: 99 --------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 944 TGVTGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGA 1003
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1004 TGATGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGV 1063
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 1064 TG 1065
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/228 (21%), Positives = 68/228 (29%), Gaps = 51/228 (22%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------- 64
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1603 DTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTG 1662
Query: 65 --------------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1663 STGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTG 1722
Query: 111 YLGPSG------------------------RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1723 STGDTGVTGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTG 1782
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1783 VTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTG 1830
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/214 (22%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 33/214 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 2033 TGPTGDTGATGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGPTGDTGVTGATGD 2089
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----- 127
G +G+ GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2090 TGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGP 2149
Query: 128 ------------------NSD-------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
D G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 2150 TGNTGATGTTGDTGITGPTGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGSTGATGA 2209
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G G++
Sbjct: 2210 TGVTGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGIT 2243
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/251 (22%), Positives = 77/251 (30%), Gaps = 72/251 (28%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------------------------LRYLGPSGRLRY 48
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 392 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGATGTTGDTGATGSTGDTGVTGATGDTGV 451
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------- 101
GP+G GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 452 TGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTG---VTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGITGPTGD 508
Query: 102 --------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 509 TGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGV 568
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRY 183
+G GP+G GP+G GP +G GP+G
Sbjct: 569 TGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGV 628
Query: 184 LGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 629 TGPTGDTGVTG 639
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/206 (23%), Positives = 68/206 (33%), Gaps = 27/206 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2051 TGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG---VTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGD 2107
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------------------- 109
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2108 TGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGP 2167
Query: 110 -RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G S G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 2168 TGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGVTGSTGSTGATGATGI 2227
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G G
Sbjct: 2228 TGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATG 2253
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/271 (19%), Positives = 74/271 (27%), Gaps = 87/271 (32%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------------- 56
G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1535 TGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGD 1594
Query: 57 -----------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------------- 91
GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1595 TGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGS 1654
Query: 92 ----------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 1655 TGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGS 1714
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSG------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1715 TGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGITGPTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGV 1774
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G GP+G G +
Sbjct: 1775 TGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGAT 1805
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/224 (21%), Positives = 69/224 (30%), Gaps = 51/224 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1508 TGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGD 1567
Query: 73 LRYLGPSGSL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 1568 TGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGP 1627
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---------------------LRYLGPSGR 144
+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1628 TGDTGVTGPTGDTGATGSTGDT---GVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGD 1684
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1685 TGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTG 1728
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/213 (21%), Positives = 70/213 (32%), Gaps = 32/213 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 2075 TGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGD 2134
Query: 73 LRYLGPSGSL------------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
GP+G G +G G +G
Sbjct: 2135 TGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGPTGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGA 2194
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G G +G + G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 2195 TGITGSTGSTGATGATGVTGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGS 2254
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--RLRYL 193
G +G G +G GP+G +L +
Sbjct: 2255 TGVTGSTGSTGATGATGVTGVTGPTGAPQLAFT 2287
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/206 (22%), Positives = 68/206 (33%), Gaps = 21/206 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 2065 DTGITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTG 2124
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLR 110
G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 2125 DTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGPTGDTGVTGVTGSTGATG 2184
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G G +G S G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 2185 ITGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGVTGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGITG 2244
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +
Sbjct: 2245 STGSTGATGSTGVTGSTGSTGATGAT 2270
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/209 (23%), Positives = 69/209 (33%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1517 TGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGD 1576
Query: 73 LR---------------------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 1577 TGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGP 1636
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1637 TGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGV 1696
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G G
Sbjct: 1697 TGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTG 1725
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/212 (21%), Positives = 69/212 (32%), Gaps = 32/212 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2084 TGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGD 2143
Query: 73 ------------------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
G +G+ G +G G +G
Sbjct: 2144 TGVTGPTGNTGATGTTGDTGITGPTGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGS 2203
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G G +G S G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 2204 TGATGATGVTGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGSTGVTGSTGS 2263
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSG--RLRYLGPSGRLRY 192
G +G GP+G +L + G L
Sbjct: 2264 TGATGATGVTGVTGPTGAPQLAFTDAGGTLAA 2295
>gi|325289692|ref|YP_004265873.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
gi|324965093|gb|ADY55872.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
Length = 764
Score = 109 bits (272), Expect = 8e-22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 381 ETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTG 440
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 441 VTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETG 500
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 501 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATG 560
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 561 ETG 563
Score = 108 bits (271), Expect = 1e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 354 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTG 413
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 414 VTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETG 473
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 474 PTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATG 533
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 534 ETG 536
Score = 108 bits (271), Expect = 1e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 363 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTG 422
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 423 VTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETG 482
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 483 PTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTG 542
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 543 EAG 545
Score = 108 bits (270), Expect = 1e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 372 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTG 431
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 432 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAG 491
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 492 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTG 551
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 552 ETG 554
Score = 108 bits (269), Expect = 2e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 336 ETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTG 395
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 396 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAG 455
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 456 PTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTG 515
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 516 ETG 518
Score = 108 bits (269), Expect = 2e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 81/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 345 ETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTG 404
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 405 VTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETG 464
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 465 PTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATG 524
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 525 ETG 527
Score = 107 bits (266), Expect = 4e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 81/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 273 EAGPTGETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTG 332
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 333 ATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 392
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 393 PTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTG 452
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 453 EAG 455
Score = 106 bits (265), Expect = 5e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 81/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 390 ETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTG 449
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 450 VTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETG 509
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 510 PTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATG 569
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 570 ETG 572
Score = 106 bits (264), Expect = 6e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 282 ETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTG 341
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 342 VTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETG 401
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 402 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTG 461
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 462 ETG 464
Score = 106 bits (264), Expect = 6e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 309 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTG 368
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 369 VTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 428
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 429 PTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTG 488
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 489 EAG 491
Score = 106 bits (264), Expect = 6e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 82/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 327 ETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTG 386
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 387 VTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETG 446
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 447 PTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTG 506
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 507 ETG 509
Score = 106 bits (264), Expect = 7e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 81/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 291 ETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTG 350
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 351 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETG 410
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 411 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATG 470
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 471 ETG 473
Score = 105 bits (263), Expect = 8e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 81/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 399 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTG 458
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 459 VTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 518
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 519 PTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATGETGPTGVTG 578
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 579 ETG 581
Score = 105 bits (262), Expect = 1e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 81/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 318 ETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTG 377
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 378 VTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETG 437
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 438 PTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTG 497
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 498 ETG 500
Score = 105 bits (261), Expect = 1e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 81/185 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 444 ETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTG 503
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 504 VTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETG 563
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 564 STGATGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGETG 623
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 624 ETGAT 628
Score = 104 bits (260), Expect = 2e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 80/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 300 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTG 359
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 360 VTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 419
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 420 PTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTG 479
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 480 ETG 482
Score = 104 bits (260), Expect = 2e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 81/183 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 228 ETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGATGVTGEAGPTGETGETGPTG 287
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 288 VTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETG 347
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 348 PTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTG 407
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 408 ETG 410
Score = 103 bits (257), Expect = 4e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 80/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 255 ETGPTGVTGETGATGVTGEAGPTGETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTG 314
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 315 VTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 374
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 375 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATG 434
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 435 ETG 437
Score = 103 bits (257), Expect = 4e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 80/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 264 ETGATGVTGEAGPTGETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTG 323
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 324 VTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 383
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 384 PTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTG 443
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 444 ETG 446
Score = 103 bits (256), Expect = 5e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 80/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 408 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTG 467
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 468 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETG 527
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 528 PTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTGATG 587
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 588 ETG 590
Score = 103 bits (256), Expect = 5e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 80/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 417 ETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTG 476
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 477 VTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETG 536
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 537 PTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTG 596
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 597 ETG 599
Score = 102 bits (255), Expect = 6e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 80/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 426 ETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTG 485
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 486 VTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAG 545
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 546 PTGVTGETGPTGATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGVTG 605
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 606 ETG 608
Score = 102 bits (255), Expect = 7e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 79/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 237 ETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGATGVTGEAGPTGETGETGPTGVTGETGPTG 296
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 297 ATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETG 356
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 357 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTG 416
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 417 ETG 419
Score = 102 bits (254), Expect = 8e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 79/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 246 ETGPTGVTGETGPTGVTGETGATGVTGEAGPTGETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTG 305
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 306 VTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETG 365
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 366 PTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTG 425
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 426 ETG 428
Score = 102 bits (254), Expect = 9e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 79/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 435 ETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTG 494
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 495 VTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETG 554
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 555 PTGATGETGSTGATGETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATG 614
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 615 ETG 617
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 79/178 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 453 EAGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGVTGETGPTG 512
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 513 VTGETGPTGATGETGPTGATGETGPTGVTGEAGPTGVTGETGPTGATGETGSTGATGETG 572
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 573 PTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGETGETGATGA 630
Score = 101 bits (251), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 79/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G GP+G GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 219 ETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGATGVTGEAGPTG 278
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 279 ETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGSTGATGETG 338
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 339 PTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGATG 398
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 399 ETG 401
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 79/183 (43%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 210 ETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGATG 269
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 270 VTGEAGPTGETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 329
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 330 STGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTG 389
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 390 ETG 392
Score = 89.7 bits (221), Expect = 6e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/166 (31%), Positives = 70/166 (42%)
Query: 29 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +
Sbjct: 209 GETGPTGVTGETGSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGAT 268
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 269 GVTGEAGPTGETGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETGPTGVTGET 328
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 329 GSTGATGETGPTGVTGETGPTGATGETGPTGVTGETGPTGVTGETG 374
>gi|294931678|ref|XP_002779967.1| spliceosome-associated protein, putative [Perkinsus marinus ATCC
50983]
gi|239889740|gb|EER11762.1| spliceosome-associated protein, putative [Perkinsus marinus ATCC
50983]
Length = 347
Score = 108 bits (270), Expect = 1e-21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/185 (52%), Positives = 109/185 (58%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
LGPS RL LGPS + LGPS + LGPS R LGPS + LG S RL S
Sbjct: 161 PLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQKLSL 220
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
RL LGPS LGPS R LGPS RL LGPS R+ LGPS R+ LGPS R G
Sbjct: 221 RLPLLGPSLRPPPLGPSLRPPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLG 280
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
PS R+ LGPS R+ LGP R+ LGPS R+ LGPS R+ LGPS RL LGPS R+
Sbjct: 281 PSRRVPLLGPSRRVPLLGPLPRVPLLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSHRLPPLGPSHRVP 340
Query: 192 YLGLS 196
LG S
Sbjct: 341 LLGPS 345
Score = 91.7 bits (226), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 99/194 (51%), Positives = 107/194 (55%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
LGPS RL LGPS L LGPS + LGPS R+ L PS LGPS R+ LG S
Sbjct: 80 PLGPSLRLPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLRPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSL 139
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
RL S L L PS R LGPS RL LGPS R+ LGPS R+ LGPS R G
Sbjct: 140 RLPVQKLSLRLPPLEPSLRPPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLG 199
Query: 132 PSGRLRYLG-----P----SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
PS R+ LG P S RL LGPS R LGPS R LGPS RL LGPS R+
Sbjct: 200 PSHRVPLLGLSLRLPVQKLSLRLPLLGPSLRPPPLGPSLRPPPLGPSLRLPPLGPSRRVP 259
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
LGPS R+ LG S
Sbjct: 260 LLGPSRRVPLLGPS 273
Score = 91.3 bits (225), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 98/192 (51%), Positives = 104/192 (54%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
L PS R LGPS L PS LGPS R L PS LG S R LGPS R
Sbjct: 27 LEPSLRPPPLGPSLRPPPLEPSLRPPPLGPSLRPPPLEPSLRPPPLGLSLRPPPLGPSLR 86
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L LGPS L LGPS R+ LGPS R+ L PS R LGPS R+ LG S RL
Sbjct: 87 LPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLRPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQKL 146
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
S RL L PS R LGPS RL LGPS R+ LGPS R+ LGPS R LGPS R+
Sbjct: 147 SLRLPPLEPSLRPPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLGPSHRVPL 206
Query: 193 LGLSDGLRVSGL 204
LGLS L V L
Sbjct: 207 LGLSLRLPVQKL 218
Score = 90.9 bits (224), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 99/221 (44%), Positives = 110/221 (49%), Gaps = 36/221 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------------------PSG 53
LGPS R+ LGPS + L PS LGPS R+ LG PS
Sbjct: 98 PLGPSRRVPLLGPSRRVPLLRPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQKLSLRLPPLEPSL 157
Query: 54 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--------------- 98
LGPS RL LGPS R+ LGPS + LGPS R LGPS
Sbjct: 158 RPPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQK 217
Query: 99 ---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
RL LGPS R LGPS R LGPS RL GPS R+ LGPS R+ LGPS R
Sbjct: 218 LSLRLPLLGPSLRPPPLGPSLRPPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPP 277
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
LGPS R+ LGPS R+ LGP R+ LGPS R+ LG S
Sbjct: 278 PLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPLPRVPLLGPSRRVPLLGPS 318
Score = 87.0 bits (214), Expect = 4e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 104/220 (47%), Positives = 113/220 (51%), Gaps = 30/220 (13%)
Query: 7 VEKALNLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS-------GSLR 56
+E +L P G R LGPS L LGPS L LGPS R+ LGPS SLR
Sbjct: 63 LEPSLRPPPLGLSLRPPPLGPSLRLPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLRPSLR 122
Query: 57 --YLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
LGPS R+ LG PS R LGPS L LGPS R+ LGP
Sbjct: 123 PPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQKLSLRLPPLEPSLRPPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGP 182
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
S R+ LGPS R LGPS R+ LG S RL S RL LGPS R LGPS R
Sbjct: 183 SRRVPLLGPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQKLSLRLPLLGPSLRPPPLGPSLRPPP 242
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
LGPS RL LGPS R+ LGPS R+ LGPS R LG S
Sbjct: 243 LGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLGPS 282
Score = 82.4 bits (202), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 95/194 (48%), Positives = 104/194 (53%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 6 VVEKAL---NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
++E +L LGPS R L PS LGPS L PS R LG S LGPS
Sbjct: 26 LLEPSLRPPPLGPSLRPPPLEPSLRPPPLGPSLRPPPLEPSLRPPPLGLSLRPPPLGPSL 85
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
RL LGPS RL LGPS + LGPS R+ L PS R LGPS R+ LG S RL
Sbjct: 86 RLPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLRPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQK 145
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
S RL PS R LGPS RL LGPS R+ LGPS R+ LGPS R LGPS R+
Sbjct: 146 LSLRLPPLEPSLRPPPLGPSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLGPSHRVP 205
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
LG S RL LS
Sbjct: 206 LLGLSLRLPVQKLS 219
Score = 77.8 bits (190), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 92/185 (49%), Positives = 98/185 (52%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
L PS R LGPS L PS LG S R LGPS L LGPS RL LGPS
Sbjct: 44 PLEPSLRPPPLGPSLRPPPLEPSLRPPPLGLSLRPPPLGPSLRLPPLGPSLRLPPLGPSR 103
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R+ LGPS + L PS R LGPS R+ LG S RL S RL L PS R G
Sbjct: 104 RVPLLGPSRRVPLLRPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQKLSLRLPPLEPSLRPPPLG 163
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
PS RL LGPS R+ LGPS R+ LGPS R LGPS R+ LG S RL S RL
Sbjct: 164 PSLRLPPLGPSRRVPLLGPSRRVPLLGPSLRPPPLGPSHRVPLLGLSLRLPVQKLSLRLP 223
Query: 192 YLGLS 196
LG S
Sbjct: 224 LLGPS 228
>gi|168333610|ref|ZP_02691870.1| hypothetical protein Epulo_01906 [Epulopiscium sp. 'N.t. morphotype
B']
Length = 2187
Score = 105 bits (261), Expect = 1e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/176 (34%), Positives = 86/176 (48%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + GP G + GP G + +GP G + +GP G + GP G + GP G
Sbjct: 362 AGPQGEIGQAGPQGEVGPAGPQGEVGSVGPQGEVGPVGPQGEVGPAGPQGEVGPAGPQGE 421
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G + +GP G + +GP G + GP G + +GP G + +GP G + S GP
Sbjct: 422 VGPAGPQGEVGPVGPQGEIGPVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEIGPVGPQGEVGSVGP 481
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP G + GP G + +GP G + GP G + GP G G G
Sbjct: 482 QGEVGSVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEVGPAGPQGEVGTQGPKGESGAKGDQG 537
Score = 102 bits (254), Expect = 8e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/179 (33%), Positives = 88/179 (49%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPS---GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP+ G + GP G + GP G + +GP G + +GP G + GP
Sbjct: 351 GPKGEVGPAGPAGPQGEIGQAGPQGEVGPAGPQGEVGSVGPQGEVGPVGPQGEVGPAGPQ 410
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G + GP G + +GP G + +GP G + GP G + +GP G +
Sbjct: 411 GEVGPAGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEIGPVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEIGPV 470
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G + +GP G + +GP G + GP G + +GP G + GP G + GP G
Sbjct: 471 GPQGEVGSVGPQGEVGSVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEVGPAGPQGEVGTQGPKGE 529
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 86/175 (49%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
SG GP G + GP+ GP G + GP G + GP G + +GP G +
Sbjct: 344 SGGTGIQGPKGEVGPAGPA------GPQGEIGQAGPQGEVGPAGPQGEVGSVGPQGEVGP 397
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+GP G + GP G + GP G + GP G + +GP G + +GP G + GP G
Sbjct: 398 VGPQGEVGPAGPQGEVGPAGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEIGPVGPQGEVGPAGPQGE 457
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+ +GP G + +GP G + +GP G + +GP G + GP G + +GP G +
Sbjct: 458 VGPVGPQGEIGPVGPQGEVGSVGPQGEVGSVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEV 512
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/150 (30%), Positives = 64/150 (42%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + +GP G + +GP G + GP G + +GP G + +GP G + +GP G
Sbjct: 425 AGPQGEVGPVGPQGEIGPVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEIGPVGPQGEVGSVGPQGE 484
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ +GP G + GP G + +GP G + GP G + GP G G G G
Sbjct: 485 VGSVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEVGPAGPQGEVGTQGPKGESGAKGDQGVKGDQGN 544
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G G G G G G G
Sbjct: 545 KGDQGDKGDPGEKGDQGIKGDQGDKGDKGD 574
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 24/175 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G G +GP G +GP G +GP G GP G + GP G +
Sbjct: 657 GDQGNKGDKGDKGDSGLIGPQGIQGEIGPKGEKGEVGPQG---IQGPQGEM---GPKGDI 710
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G +G G GP G GP G GP G GP G + GP
Sbjct: 711 GETGPQGEKGEVGLQG---LQGPQGET---GPKGDTGETGPQG---IQGPQGEM---GPK 758
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP G +G G GP G GP G GP G +GP G
Sbjct: 759 GDIGEIGPQGEKGEVGLQG---LQGPQGE---TGPKGDTGETGPQGIQGEIGPQG 807
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 24/158 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G +GP G +GP G GP G + GP G + GP G +G G
Sbjct: 674 IGPQGIQGEIGPKGEKGEVGPQG---IQGPQGEM---GPKGDIGETGPQGEKGEVGLQG- 726
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G GP G GP G +GP G + +GP G G
Sbjct: 727 --LQGPQGET---GPKGDTGETGPQG---IQGPQGE---MGPKGDIGEIGPQGEK---GE 772
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP G GP G GP G +GP G
Sbjct: 773 VGLQGLQGPQGE---TGPKGDTGETGPQGIQGEIGPQG 807
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/168 (32%), Positives = 65/168 (38%), Gaps = 24/168 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G G +GP G +GP G +GP G GP G + GP G + GP G
Sbjct: 664 DKGDKGDSGLIGPQGIQGEIGPKGEKGEVGPQG---IQGPQGEM---GPKGDIGETGPQG 717
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+G G GP G GP G GP G GP G +GP G + G
Sbjct: 718 EKGEVGLQG---LQGPQGET---GPKGDTGETGPQG---IQGPQGE---MGPKGDIGEIG 765
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G +G G GP G GP G GP G +GP G
Sbjct: 766 PQGEKGEVGLQG---LQGPQGE---TGPKGDTGETGPQGIQGEIGPQG 807
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/147 (31%), Positives = 55/147 (37%), Gaps = 18/147 (12%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G G G G G G +GP G +GP G +GP G GP G +
Sbjct: 648 GEKGDQGIKGDQGNKGDKGDKGDSGLIGPQGIQGEIGPKGEKGEVGPQG---IQGPQGEM 704
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G + GP G G G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 705 ---GPKGDIGETGPQGEK---GEVGLQGLQGPQGE---TGPKGDTGETGPQG---IQGPQ 752
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP G + +GP G +GL
Sbjct: 753 GE---MGPKGDIGEIGPQGEKGEVGLQ 776
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 57/177 (32%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + +GP G + +GP G + GP G + +GP G + GP G + GP G
Sbjct: 470 VGPQGEVGSVGPQGEVGSVGPQGEVGPAGPQGEVGPVGPQGEVGPAGPQGEVGTQGPKGE 529
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G G G G G G G G G G G
Sbjct: 530 SGAKGDQGVKGDQGNKGDQGDKGDPGEKGDQGIKGDQGDKGDKGDPGEKGDQGIKGDQGN 589
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G G G G G G G G G G G
Sbjct: 590 KGDQGDKGDPGEKGDQGIKGDQGNKGDKGDKGDPGEKGDQGIKGDQGNKGDKGDKGD 646
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.86, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G + G G+ LGP+G GP G + G G +G +G
Sbjct: 1642 VGPKGDTGEQGLKGDIGPQGLQGNRGLLGPAGPKGDKGPKGDIGDTGAQGPKGDIGDTGA 1701
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD-- 130
G G GP G + G G +G +G G +G GP G +
Sbjct: 1702 QGPKGDIGDTGAQGPKGDIGDTGAQGPKGDIGDTGAQGPKGDTGEQGLXGPKGDIGEQGL 1761
Query: 131 ----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP G G G G +G G +G GP G + GP
Sbjct: 1762 QGPKGDTGEQGLQGPKGDTGEQGLQGPKGDTGDTGAQGPKGDTGEQGLQGPKGDIGPAGP 1821
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 1822 GG 1823
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/148 (31%), Positives = 54/148 (36%), Gaps = 15/148 (10%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G +G GP G + G +G G G +GP G GP G GP G
Sbjct: 1347 GNNGDQGIQGPQGEMGPKGDAGETGPQGXQGPQGEMGPKGDAGETGPQG---LQGPQGEX 1403
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
G +G G G +GP G GP G GP G +GP G GP
Sbjct: 1404 GPKGDAGETGXQGXQGPQGEMGPKGDAGETGPQG---LQGPQGE---MGPKGDAGETGPQ 1457
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G +GP G GP G
Sbjct: 1458 G---LQGPQGE---MGPKGDTGETGPRG 1479
>gi|325290147|ref|YP_004266328.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
gi|324965548|gb|ADY56327.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Syntrophobotulus
glycolicus DSM 8271]
Length = 559
Score = 104 bits (260), Expect = 2e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/188 (33%), Positives = 88/188 (46%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 239 TGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGN 298
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 299 TGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGP 358
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 359 TGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGP 418
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + LR
Sbjct: 419 TGPTSVLR 426
Score = 103 bits (258), Expect = 3e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/178 (33%), Positives = 84/178 (47%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 212 TGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGN 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 272 TGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGP 331
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 332 TGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 389
Score = 103 bits (258), Expect = 3e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/178 (33%), Positives = 84/178 (47%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 221 TGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGN 280
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 281 TGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGP 340
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 341 TGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 398
Score = 103 bits (258), Expect = 3e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/178 (33%), Positives = 84/178 (47%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 230 TGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGN 289
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 290 TGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGP 349
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 350 TGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 407
Score = 103 bits (257), Expect = 4e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/177 (33%), Positives = 84/177 (47%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 204 GPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 263
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+
Sbjct: 264 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 323
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 324 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 380
Score = 103 bits (257), Expect = 5e-20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/178 (33%), Positives = 84/178 (47%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 194 TGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGN 253
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 254 TGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGP 313
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 314 TGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 371
Score = 100 bits (249), Expect = 3e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/182 (34%), Positives = 83/182 (45%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 244 NTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTG 303
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + G
Sbjct: 304 PTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTG 363
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 364 PTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTS 423
Query: 192 YL 193
L
Sbjct: 424 VL 425
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/177 (33%), Positives = 82/177 (46%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 186 GATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 245
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+
Sbjct: 246 GPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPT 305
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 306 GNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 362
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/183 (33%), Positives = 83/183 (45%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 217 NTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTG 276
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + G
Sbjct: 277 PTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTG 336
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 337 PTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTG 396
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 397 NTG 399
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/183 (33%), Positives = 83/183 (45%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 226 NTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTG 285
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + G
Sbjct: 286 PTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTG 345
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 346 PTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTG 405
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 406 NTG 408
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/183 (33%), Positives = 83/183 (45%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 235 NTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTG 294
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + G
Sbjct: 295 PTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTG 354
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 355 PTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTG 414
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 415 NTG 417
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/178 (33%), Positives = 81/178 (45%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 176 TGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGN 235
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 236 TGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGP 295
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 296 TGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 353
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/183 (33%), Positives = 83/183 (45%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 208 NAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTG 267
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + G
Sbjct: 268 PTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTG 327
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 328 PTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTG 387
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 388 NTG 390
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/176 (33%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
PSG GP+G+ G +G GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 169 PSGPTGATGPTGATGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTG 228
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 229 PTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTG 288
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 289 NTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNT 344
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 82/182 (45%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 182 TGPAGATGDTGPTGPTGDTGPAGPTGNAGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGP 241
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 242 TGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGP 301
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 302 TGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGNTGPTGPTGN 361
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 362 TG 363
>gi|190694321|gb|ACE88727.1| polymorphic mucin truncated splice variant C4/2/100r2.1
[Schistosoma mansoni]
Length = 1129
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 206 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 265
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 266 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 325
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 326 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 381
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 215 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 274
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 275 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 334
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 335 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 390
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 224 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 283
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 284 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 343
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 344 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 399
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 233 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 292
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 293 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 352
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 353 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 408
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 242 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 301
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 302 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 361
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 362 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 417
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 251 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 310
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 311 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 370
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 371 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 426
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 379
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 380 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 435
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 269 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 328
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 329 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 388
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 389 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 444
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 278 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 337
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 338 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 397
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 398 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 453
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 287 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 346
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 347 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 406
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 407 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 462
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 296 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 355
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 356 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 415
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 416 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 471
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 305 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 364
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 365 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 424
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 425 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 480
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 314 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 373
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 374 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 433
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 434 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 489
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 323 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 382
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 383 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 442
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 443 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 498
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 332 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 391
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 392 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 451
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 452 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 507
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 341 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 400
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 401 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 460
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 461 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 516
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 350 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 409
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 410 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 469
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 470 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 525
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 359 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 418
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 419 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 478
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 479 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 534
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 368 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 427
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 428 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 487
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 488 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 543
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 377 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 436
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 437 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 496
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 497 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 552
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 386 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 445
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 446 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 505
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 506 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 561
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 395 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 454
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 455 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 514
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 515 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 570
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 404 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 463
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 464 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 523
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 524 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 579
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 413 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 472
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 473 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 532
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 533 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 588
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 422 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 481
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 482 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 541
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 542 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 597
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 431 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 490
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 491 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 550
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 551 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 606
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 440 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 499
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 500 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 559
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 560 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 615
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 449 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 508
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 509 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 568
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 569 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 624
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 458 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 517
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 518 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 577
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 578 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 633
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 467 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 526
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 527 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 586
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 587 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 642
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 476 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 535
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 536 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 595
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 596 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 651
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 485 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 544
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 545 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 604
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 605 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 660
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 494 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 553
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 554 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 613
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 614 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 669
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 503 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 562
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 563 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 622
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 623 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 678
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 512 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 571
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 572 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 631
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 632 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 687
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 521 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 580
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 581 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 640
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 641 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 696
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 530 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 589
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 590 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 649
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 650 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 705
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 539 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 598
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 599 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 658
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 659 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 714
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 548 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 607
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 608 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 667
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 668 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 723
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 557 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 616
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 617 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 676
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 677 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 732
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 566 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 625
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 626 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 685
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 686 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 741
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 575 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 634
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 635 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 694
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 695 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 750
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 584 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 643
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 644 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 703
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 704 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 759
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 593 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 652
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 653 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 712
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 713 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 768
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 602 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 661
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 662 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 721
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 722 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 777
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 611 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 670
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 671 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 730
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 731 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 786
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 620 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 679
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 680 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 739
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 740 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 795
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 629 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 688
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 689 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 748
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 749 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 804
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 638 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 697
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 698 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 757
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 758 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 813
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 647 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 706
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 707 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 766
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 767 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 822
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 656 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 715
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 716 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 775
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 776 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 831
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 665 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 724
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 725 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 784
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 785 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 840
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 674 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 733
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 734 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 793
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 794 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 849
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 683 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 742
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 743 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 802
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 803 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 858
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 692 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 751
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 752 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 811
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 812 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 867
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 701 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 760
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 761 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 820
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 821 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 876
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 710 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 769
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 770 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 829
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 830 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 885
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 719 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 778
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 779 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 838
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 839 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 894
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 728 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 787
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 788 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 847
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 848 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 903
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 737 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 796
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 797 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 856
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 857 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 912
Score = 94.4 bits (233), Expect = 2e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 800 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 859
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 860 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 918
>gi|190694323|gb|ACE88728.1| polymorphic mucin truncated splice variant C4/2/100r2.2
[Schistosoma mansoni]
Length = 1129
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 206 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 265
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 266 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 325
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 326 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 381
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 215 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 274
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 275 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 334
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 335 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 390
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 224 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 283
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 284 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 343
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 344 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 399
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 233 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 292
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 293 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 352
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 353 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 408
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 242 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 301
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 302 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 361
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 362 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 417
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 251 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 310
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 311 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 370
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 371 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 426
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 379
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 380 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 435
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 269 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 328
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 329 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 388
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 389 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 444
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 278 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 337
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 338 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 397
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 398 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 453
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 287 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 346
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 347 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 406
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 407 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 462
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 296 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 355
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 356 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 415
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 416 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 471
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 305 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 364
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 365 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 424
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 425 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 480
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 314 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 373
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 374 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 433
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 434 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 489
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 323 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 382
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 383 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 442
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 443 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 498
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 332 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 391
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 392 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 451
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 452 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 507
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 341 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 400
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 401 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 460
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 461 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 516
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 350 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 409
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 410 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 469
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 470 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 525
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 359 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 418
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 419 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 478
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 479 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 534
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 368 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 427
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 428 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 487
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 488 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 543
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 377 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 436
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 437 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 496
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 497 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 552
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 386 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 445
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 446 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 505
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 506 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 561
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 395 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 454
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 455 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 514
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 515 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 570
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 404 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 463
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 464 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 523
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 524 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 579
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 413 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 472
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 473 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 532
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 533 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 588
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 422 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 481
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 482 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 541
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 542 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 597
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 431 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 490
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 491 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 550
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 551 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 606
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 440 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 499
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 500 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 559
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 560 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 615
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 449 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 508
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 509 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 568
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 569 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 624
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 458 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 517
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 518 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 577
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 578 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 633
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 467 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 526
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 527 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 586
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 587 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 642
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 476 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 535
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 536 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 595
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 596 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 651
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 485 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 544
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 545 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 604
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 605 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 660
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 494 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 553
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 554 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 613
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 614 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 669
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 503 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 562
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 563 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 622
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 623 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 678
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 512 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 571
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 572 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 631
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 632 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 687
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 521 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 580
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 581 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 640
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 641 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 696
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 530 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 589
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 590 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 649
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 650 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 705
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 539 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 598
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 599 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 658
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 659 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 714
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 548 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 607
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 608 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 667
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 668 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 723
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 557 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 616
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 617 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 676
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 677 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 732
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 566 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 625
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 626 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 685
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 686 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 741
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 575 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 634
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 635 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 694
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 695 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 750
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 584 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 643
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 644 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 703
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 704 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 759
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 593 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 652
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 653 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 712
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 713 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 768
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 602 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 661
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 662 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 721
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 722 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 777
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 611 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 670
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 671 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 730
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 731 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 786
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 620 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 679
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 680 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 739
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 740 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 795
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 629 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 688
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 689 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 748
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 749 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 804
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 638 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 697
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 698 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 757
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 758 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 813
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 647 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 706
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 707 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 766
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 767 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 822
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 656 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 715
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 716 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 775
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 776 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 831
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 665 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 724
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 725 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 784
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 785 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 840
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 674 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 733
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 734 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 793
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 794 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 849
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 683 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 742
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 743 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 802
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 803 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 858
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 692 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 751
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 752 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 811
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 812 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 867
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 701 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 760
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 761 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 820
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 821 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 876
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 710 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 769
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 770 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 829
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 830 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 885
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 719 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 778
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 779 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 838
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 839 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 894
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 728 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 787
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 788 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 847
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 848 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 903
Score = 102 bits (253), Expect = 1e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 737 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 796
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 797 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 856
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 857 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 912
Score = 99.0 bits (245), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDPASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 91.7 bits (226), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/165 (34%), Positives = 75/165 (45%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDPASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 800 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 859
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 860 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 918
>gi|190694445|gb|ACE88789.1| polymorphic mucin variant C6/2/80r2 [Schistosoma mansoni]
Length = 972
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 206 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 265
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 266 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 325
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 326 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 381
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 215 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 274
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 275 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 334
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 335 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 390
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 224 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 283
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 284 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 343
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 344 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 399
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 233 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 292
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 293 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 352
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 353 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 408
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 242 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 301
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 302 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 361
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 362 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 417
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 251 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 310
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 311 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 370
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 371 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 426
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 379
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 380 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 435
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 269 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 328
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 329 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 388
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 389 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 444
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 278 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 337
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 338 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 397
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 398 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 453
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 287 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 346
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 347 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 406
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 407 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 462
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 296 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 355
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 356 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 415
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 416 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 471
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 305 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 364
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 365 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 424
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 425 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 480
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 314 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 373
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 374 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 433
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 434 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 489
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 323 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 382
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 383 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 442
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 443 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 498
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 332 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 391
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 392 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 451
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 452 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 507
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 341 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 400
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 401 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 460
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 461 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 516
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 350 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 409
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 410 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 469
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 470 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 525
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 359 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 418
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 419 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 478
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 479 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 534
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 368 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 427
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 428 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 487
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 488 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 543
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 377 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 436
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 437 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 496
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 497 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 552
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 386 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 445
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 446 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 505
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 506 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 561
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 395 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 454
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 455 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 514
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 515 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 570
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 404 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 463
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 464 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 523
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 524 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 579
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 413 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 472
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 473 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 532
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 533 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 588
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 422 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 481
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 482 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 541
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 542 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 597
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 431 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 490
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 491 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 550
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 551 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 606
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 440 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 499
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 500 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 559
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 560 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 615
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 449 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 508
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 509 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 568
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 569 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 624
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 458 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 517
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 518 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 577
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 578 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 633
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 467 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 526
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 527 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 586
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 587 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 642
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 476 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 535
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 536 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 595
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 596 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 651
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 485 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 544
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 545 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 604
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 605 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 660
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 494 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 553
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 554 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 613
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 614 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 669
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 503 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 562
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 563 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 622
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 623 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 678
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 512 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 571
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 572 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 631
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 632 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 687
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 521 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 580
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 581 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 640
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 641 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 696
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 530 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 589
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 590 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 649
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 650 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 705
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 539 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 598
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 599 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 658
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 659 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 714
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 548 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 607
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 608 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 667
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 668 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 723
Score = 101 bits (252), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 557 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 616
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 617 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 676
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 677 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 732
Score = 94.0 bits (232), Expect = 3e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 620 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 679
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 680 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 738
>gi|423483303|ref|ZP_17459993.1| hypothetical protein IEQ_03081, partial [Bacillus cereus BAG6X1-2]
gi|401141723|gb|EJQ49275.1| hypothetical protein IEQ_03081, partial [Bacillus cereus BAG6X1-2]
Length = 231
Score = 100 bits (249), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/198 (30%), Positives = 73/198 (36%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G+ GP G+ GP G GP G+ GP G GP+G
Sbjct: 1 GPQGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPAGAT 60
Query: 74 RYLGPSGSLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
GP+GS GP G GP+G GP G
Sbjct: 61 GAQGPAGSTGATGIGVTGSTGPQGPAGGATGPTGPQGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQ 120
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G GP+G + GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 121 GPRGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGTQGPAGATGAQGPQGNT 180
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G
Sbjct: 181 GAQGPTGATGAQGPQGNT 198
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/203 (30%), Positives = 74/203 (36%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------------- 59
GP G GP G+ GP G+ GP+G GP+GS G
Sbjct: 27 QGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPAGATGAQGPAGSTGATGIGVTGSTGPQGPA 86
Query: 60 --------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
P G GP+G GP G+ GP G GP+G GP G
Sbjct: 87 GGATGPTGPQGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQGPRGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGA 146
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G GP G + GP+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 147 QGPAGATGAQGPQGNTGTQGPAGATGAQGPQGNTGAQGPTGATGAQGPQGNTGARGPRGN 206
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G G
Sbjct: 207 TGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQG 229
Score = 94.7 bits (234), Expect = 2e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/187 (32%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG-----------PSGRLRY-LGPSGSLRYLGP 60
GP G GP+G+ GP+GS G P+G GP G+ GP
Sbjct: 45 QGPQGNTGAQGPAGATGAQGPAGSTGATGIGVTGSTGPQGPAGGATGPTGPQGNTGAQGP 104
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G GP G GP G+ GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 105 AGATGAQGPQGNTGAQGPRGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGT 164
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G + GP G GP+G GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 165 QGPAGATGAQGPQGNTGAQGPTGATGAQGPQGNTGARGPRGNTGAQGPAGATGAQGPQGN 224
Query: 181 LRYLGPS 187
GP+
Sbjct: 225 TGAQGPA 231
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/74 (33%), Positives = 30/74 (40%)
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G + GP+G GP G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 1 GPQGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPAGAT 60
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G+
Sbjct: 61 GAQGPAGSTGATGI 74
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/74 (31%), Positives = 28/74 (37%)
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G GP G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 1 GPQGNTGAQGPAGATGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPQGNTGAQGPAGAT 60
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGL 204
G + +G+
Sbjct: 61 GAQGPAGSTGATGI 74
>gi|190694319|gb|ACE88726.1| polymorphic mucin truncated splice variant C3/2/45r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 534
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 206 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 265
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 266 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 325
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 326 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 381
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 215 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 274
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 275 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 334
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 335 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 390
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 224 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 283
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 284 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 343
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 344 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 399
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 233 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 292
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 293 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 352
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 353 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 408
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 242 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 301
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 302 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 361
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 362 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 417
Score = 92.8 bits (229), Expect = 7e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 70.1 bits (170), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 305 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 364
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 365 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 423
>gi|190694317|gb|ACE88725.1| polymorphic mucin truncated splice variant C3/2/40r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 489
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 92.8 bits (229), Expect = 7e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 378
>gi|156386927|ref|XP_001634162.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156221242|gb|EDO42099.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 295
Score = 100 bits (248), Expect = 4e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/171 (42%), Positives = 75/171 (43%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
L YL S L YL S L YL S L YL S L YL S L YL S L YL
Sbjct: 24 LVYLARSAWLDYLARSAWLVYLARSAWLVYLARSAWLDYLARSAWLVYLARSAWLDYLAR 83
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
S L YL S L YL S L YL S L YL S L+ S L YL S L Y
Sbjct: 84 SAWLDYLARSAWLDYLARSDWLDYLASSSWLDYLARSDWLDYLARSAWLDYLVRSDWLDY 143
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
L S L YL S L Y+ S L YL S L YL S L + SD
Sbjct: 144 LVRSAWLDYLVRSDWLDYIVRSFWLDYLVRSALLVYLEHSDWLDLVSCSDD 194
Score = 99.0 bits (245), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/174 (41%), Positives = 76/174 (43%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
+ R L L YL S L YL S L YL S L YL S L YL S L YL
Sbjct: 13 STFRDLSCPALLVYLARSAWLDYLARSAWLVYLARSAWLVYLARSAWLDYLARSAWLVYL 72
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
S L YL S L YL S L YL S L YL S L+ S L YL S L
Sbjct: 73 ARSAWLDYLARSAWLDYLARSAWLDYLARSDWLDYLASSSWLDYLARSDWLDYLARSAWL 132
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
YL S L YL S L YL S L Y+ S L YL S L YL SD L
Sbjct: 133 DYLVRSDWLDYLVRSAWLDYLVRSDWLDYIVRSFWLDYLVRSALLVYLEHSDWL 186
Score = 94.4 bits (233), Expect = 3e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/167 (41%), Positives = 72/167 (43%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
L S L YL S L YL S L YL S L YL S L YL S L YL S
Sbjct: 27 LARSAWLDYLARSAWLVYLARSAWLVYLARSAWLDYLARSAWLVYLARSAWLDYLARSAW 86
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L YL S L YL S L YL S L YL S L YL S L YL S L+
Sbjct: 87 LDYLARSAWLDYLARSDWLDYLASSSWLDYLARSDWLDYLARSAWLDYLVRSDWLDYLVR 146
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
S L YL S L Y+ S L YL S L YL S L + S
Sbjct: 147 SAWLDYLVRSDWLDYIVRSFWLDYLVRSALLVYLEHSDWLDLVSCSD 193
>gi|190694415|gb|ACE88774.1| polymorphic mucin variant C10/1/40r2.2 [Schistosoma mansoni]
Length = 612
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 92.0 bits (227), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 378
>gi|190694443|gb|ACE88788.1| polymorphic mucin variant C6/1/40r2.3 [Schistosoma mansoni]
Length = 612
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 92.0 bits (227), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 378
>gi|190694413|gb|ACE88773.1| polymorphic mucin variant C10/1/40r2.1 [Schistosoma mansoni]
Length = 612
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 99.8 bits (247), Expect = 6e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 92.0 bits (227), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 378
>gi|190694441|gb|ACE88787.1| polymorphic mucin variant C6/1/40r2.2 [Schistosoma mansoni]
Length = 612
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 99.4 bits (246), Expect = 7e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 92.0 bits (227), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 378
>gi|190694439|gb|ACE88786.1| polymorphic mucin variant C6/1/40r2.1 [Schistosoma mansoni]
Length = 612
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 116 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 176 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 236 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 291
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 244
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 245 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 300
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 193
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 194 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 253
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 254 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 309
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 202
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 203 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 262
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 263 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 318
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 211
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 212 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 271
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 272 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 327
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 220
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 221 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 280
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 281 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 336
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 289
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 290 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 345
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 238
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 239 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 298
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 299 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 354
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 247
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 248 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 307
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 308 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 363
Score = 99.4 bits (246), Expect = 8e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 256
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 257 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 316
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 317 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 372
Score = 92.0 bits (227), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 260 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 319
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 320 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 378
>gi|190694385|gb|ACE88759.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC7/2/35r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 433
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 105 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 164
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 165 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 224
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 225 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 280
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 233
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 234 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 289
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 123 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 182
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 183 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 242
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 243 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 298
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 132 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 191
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 192 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 251
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 252 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 307
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 141 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 200
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 201 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 260
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 261 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 316
Score = 91.7 bits (226), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/115 (34%), Positives = 53/115 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 204 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 263
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L S
Sbjct: 264 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLAS 318
>gi|190694377|gb|ACE88755.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC6/2/25r2.4
[Schistosoma mansoni]
Length = 300
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 99.0 bits (245), Expect = 9e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 91.7 bits (226), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694345|gb|ACE88739.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC11/2/30r2.4
[Schistosoma mansoni]
Length = 388
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 91.3 bits (225), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694361|gb|ACE88747.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC4/2/30r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 388
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 91.3 bits (225), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694511|gb|ACE88822.1| polymorphic mucin variant IC3/2/40r2 [Schistosoma mansoni]
Length = 601
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 105 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 164
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 165 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 224
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 225 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 280
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 233
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 234 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 289
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 123 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 182
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 183 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 242
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 243 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 298
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 132 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 191
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 192 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 251
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 252 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 307
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 141 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 200
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 201 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 260
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 261 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 316
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 150 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 209
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 210 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 269
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 270 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 325
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 278
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 279 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 334
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 168 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 227
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 228 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 287
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 288 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 343
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 177 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 236
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 237 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 296
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 297 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 352
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 186 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 245
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 246 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 305
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 306 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 361
Score = 91.3 bits (225), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 249 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 308
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 309 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 367
>gi|190694343|gb|ACE88738.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC11/2/30r2.3
[Schistosoma mansoni]
Length = 388
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 91.3 bits (225), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694341|gb|ACE88737.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC11/2/30r2.1
[Schistosoma mansoni]
gi|190694381|gb|ACE88757.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC7/2/30r2.1
[Schistosoma mansoni]
Length = 388
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 98.6 bits (244), Expect = 1e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 91.3 bits (225), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694351|gb|ACE88742.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC2/2/25r2.1
[Schistosoma mansoni]
Length = 350
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 13 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 72
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 73 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 132
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 133 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 188
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 22 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 81
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 82 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 141
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 142 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 197
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 31 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 90
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 91 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 150
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 151 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 206
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 40 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 99
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 100 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 159
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 160 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 215
Score = 98.2 bits (243), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 49 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 108
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 109 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 168
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 169 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 224
Score = 96.3 bits (238), Expect = 6e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 58 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 117
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 118 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 177
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ L
Sbjct: 178 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTSDL 233
Score = 90.9 bits (224), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 6 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 65
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 66 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 125
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 126 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 170
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/119 (34%), Positives = 55/119 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 121 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 180
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ L SD P+
Sbjct: 181 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTSDLASDKPT 239
>gi|190694333|gb|ACE88733.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC10/2/30r2.3
[Schistosoma mansoni]
Length = 488
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 90.5 bits (223), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694373|gb|ACE88753.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC6/2/25r2.1
[Schistosoma mansoni]
Length = 343
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 90.5 bits (223), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694359|gb|ACE88746.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC4/2/25r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 329
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 90.5 bits (223), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694315|gb|ACE88724.1| polymorphic mucin truncated splice variant C3/2/25r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 354
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 97.8 bits (242), Expect = 2e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 90.5 bits (223), Expect = 4e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 243
>gi|190694493|gb|ACE88813.1| polymorphic mucin variant IC11/2/30r2.2 [Schistosoma mansoni]
Length = 510
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 14 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 73
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 74 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 133
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 134 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 189
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 23 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 82
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 83 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 142
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 143 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 198
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 32 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 91
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 92 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 151
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 152 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 207
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 41 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 100
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 101 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 160
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 161 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 216
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 50 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 109
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 110 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 169
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 225
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 59 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 118
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 119 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 178
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 179 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 234
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 68 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 127
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 128 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 187
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 188 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 243
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 77 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 136
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 137 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 196
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 197 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 252
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 86 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 145
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 146 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 205
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 206 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 261
Score = 97.4 bits (241), Expect = 3e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 95 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 154
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 155 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 214
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 215 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 270
Score = 90.1 bits (222), Expect = 5e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 7 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 66
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 67 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 126
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 127 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 171
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 158 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 217
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 218 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 276
>gi|190694457|gb|ACE88795.1| polymorphic mucin variant C7/2/30r2 [Schistosoma mansoni]
Length = 522
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 71 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 130
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 131 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 190
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 191 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 246
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 80 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 139
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 140 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 199
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 200 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 255
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 148
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 149 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 208
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 264
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 98 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 157
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 158 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 217
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 218 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 273
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 166
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 167 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 226
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 282
Score = 89.7 bits (221), Expect = 6e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 170 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 229
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 230 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 288
>gi|190694509|gb|ACE88821.1| polymorphic mucin variant IC3/2/30r2 [Schistosoma mansoni]
Length = 511
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 89.7 bits (221), Expect = 6e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694483|gb|ACE88808.1| polymorphic mucin variant IC10/2/30r2.2 [Schistosoma mansoni]
Length = 511
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 89.7 bits (221), Expect = 6e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694481|gb|ACE88807.1| polymorphic mucin variant IC10/2/30r2.1 [Schistosoma mansoni]
Length = 511
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 97.1 bits (240), Expect = 4e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 89.7 bits (221), Expect = 6e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694479|gb|ACE88806.1| polymorphic mucin variant IC10/2/25r2 [Schistosoma mansoni]
Length = 443
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 89.4 bits (220), Expect = 8e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694401|gb|ACE88767.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC9/2/25r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 443
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 96.7 bits (239), Expect = 5e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 89.4 bits (220), Expect = 8e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694449|gb|ACE88791.1| polymorphic mucin variant C7/2/25r2.2 [Schistosoma mansoni]
Length = 477
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 243
>gi|190694455|gb|ACE88794.1| polymorphic mucin variant C7/2/25r2.5 [Schistosoma mansoni]
Length = 477
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 243
>gi|190694453|gb|ACE88793.1| polymorphic mucin variant C7/2/25r2.4 [Schistosoma mansoni]
Length = 477
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 243
>gi|190694383|gb|ACE88758.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC7/2/30r2.2
[Schistosoma mansoni]
Length = 488
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+ L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+ L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+ L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+ L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 60 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 119
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+ L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 120 SDKPTXDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 179
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 180 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 235
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ L
Sbjct: 69 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLA 128
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 129 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 188
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 189 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 244
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ L P+G L
Sbjct: 78 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTGDLA 137
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 138 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 197
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 198 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 253
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+ L P+G L P+G L
Sbjct: 87 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 146
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 147 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 206
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 207 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 262
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+ L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 96 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 155
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 156 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 215
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 216 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 271
Score = 88.6 bits (218), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/165 (34%), Positives = 75/165 (45%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+ L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 159 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 218
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 219 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 277
>gi|190694529|gb|ACE88831.1| polymorphic mucin variant IC6/2/25r2.3 [Schistosoma mansoni]
Length = 466
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 95.9 bits (237), Expect = 9e-18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694447|gb|ACE88790.1| polymorphic mucin variant C7/2/25r2.1 [Schistosoma mansoni]
Length = 477
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 88.2 bits (217), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 243
>gi|190694451|gb|ACE88792.1| polymorphic mucin variant C7/2/25r2.3 [Schistosoma mansoni]
Length = 477
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 201
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 94
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 95 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 154
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 210
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 44 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 103
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 104 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 163
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 164 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 219
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 53 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 112
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 113 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 172
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 173 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 228
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 121
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 122 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 181
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 182 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 237
Score = 88.2 bits (217), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 183
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 125 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 184
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 185 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 243
>gi|190694495|gb|ACE88814.1| polymorphic mucin variant IC2/2/25r2.2 [Schistosoma mansoni]
gi|190694507|gb|ACE88820.1| polymorphic mucin variant IC3/2/25r2 [Schistosoma mansoni]
Length = 466
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 95.5 bits (236), Expect = 1e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/176 (35%), Positives = 82/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 88.2 bits (217), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/165 (35%), Positives = 76/165 (46%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694375|gb|ACE88754.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC6/2/25r2.2
[Schistosoma mansoni]
Length = 343
Score = 94.7 bits (234), Expect = 2e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDPASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 190
Score = 94.7 bits (234), Expect = 2e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G P+G L P+G L
Sbjct: 24 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDPASDKPTGDLASDKPTGDLA 83
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 84 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 144 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 199
Score = 94.7 bits (234), Expect = 2e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 33 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDPASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 93 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 153 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 208
Score = 94.7 bits (234), Expect = 2e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 42 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDPASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 101
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 102 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 161
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 162 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 217
Score = 94.7 bits (234), Expect = 2e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/176 (34%), Positives = 81/176 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 51 PTGDLASDKPTGDPASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 110
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 111 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 170
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 226
Score = 87.4 bits (215), Expect = 3e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/165 (34%), Positives = 75/165 (45%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDPASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 172
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 114 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 173
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 174 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 232
>gi|190694339|gb|ACE88736.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC11/2/20r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 298
Score = 93.6 bits (231), Expect = 4e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/174 (35%), Positives = 80/174 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLTSDKPTGDL 181
Score = 93.2 bits (230), Expect = 5e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/173 (34%), Positives = 80/173 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLTSDKPTGDLASDKPT 187
>gi|156118915|gb|ABU49847.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 432
Score = 92.8 bits (229), Expect = 7e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/174 (35%), Positives = 80/174 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 192
Score = 92.8 bits (229), Expect = 8e-17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/173 (34%), Positives = 80/173 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 198
>gi|156118977|gb|ABU49878.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 523
Score = 92.4 bits (228), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/177 (35%), Positives = 82/177 (46%), Gaps = 1/177 (0%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS-GRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L SD P+
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXGDLASDKPT 145
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 202
Score = 92.4 bits (228), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/177 (35%), Positives = 82/177 (46%), Gaps = 1/177 (0%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPS-GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P+G L P+G L P+G L P+ G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 166
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 167 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 226
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 227 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 283
Score = 85.1 bits (209), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/166 (34%), Positives = 76/166 (45%), Gaps = 1/166 (0%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS-GR 144
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+ G
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXGD 138
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 LASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 184
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 171 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 230
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 231 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 289
>gi|156118957|gb|ABU49868.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 432
Score = 92.4 bits (228), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/174 (35%), Positives = 80/174 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 192
Score = 92.4 bits (228), Expect = 1e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/173 (34%), Positives = 80/173 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 198
>gi|156118959|gb|ABU49869.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 443
Score = 90.9 bits (224), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/178 (34%), Positives = 82/178 (46%), Gaps = 2/178 (1%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPS--GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
P+ G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P
Sbjct: 86 SDKPTXXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKP 145
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 TGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 203
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/167 (34%), Positives = 76/167 (45%), Gaps = 2/167 (1%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPS--GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
P+G L P+ G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTXXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 138
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 185
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/117 (35%), Positives = 54/117 (46%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 93 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 152
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 153 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 209
>gi|156118917|gb|ABU49848.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 482
Score = 90.9 bits (224), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/181 (34%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 5/181 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS---- 70
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXX 85
Query: 71 -GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L S
Sbjct: 86 XGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLAS 145
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
D P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G
Sbjct: 146 DKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGD 205
Query: 190 L 190
L
Sbjct: 206 L 206
Score = 90.9 bits (224), Expect = 2e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/181 (34%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 5/181 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPS-----GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
P+G L P+G L P+ G L P+G L P+G L P+G L P
Sbjct: 62 PTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXXXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKP 121
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L S
Sbjct: 122 TGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLAS 181
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
D P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G
Sbjct: 182 DKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGD 241
Query: 190 L 190
L
Sbjct: 242 L 242
Score = 86.7 bits (213), Expect = 6e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/162 (34%), Positives = 74/162 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 87 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 146
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 147 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 206
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 207 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 248
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/170 (34%), Positives = 76/170 (44%), Gaps = 5/170 (2%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPS-----GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
P+ G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 79 KPTXXXXXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDK 138
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 188
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 130 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 189
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 190 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 248
>gi|156118975|gb|ABU49877.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 527
Score = 90.9 bits (224), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/181 (34%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 5/181 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS-----GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
P+G L P+G L P+G L P+ G L P+G L P+G L S
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXXXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLAS 145
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
D P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G
Sbjct: 146 DKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGD 205
Query: 190 L 190
L
Sbjct: 206 L 206
Score = 90.9 bits (224), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/181 (34%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 5/181 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPS-----GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
P+G L P+ G L P+G L P+G L P+G L P+G L P
Sbjct: 107 PTGDLASDKPTXXXXXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKP 166
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L S
Sbjct: 167 TGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLAS 226
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
D P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G
Sbjct: 227 DKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGD 286
Query: 190 L 190
L
Sbjct: 287 L 287
Score = 90.5 bits (223), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/171 (34%), Positives = 78/171 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 123 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 182
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 183 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 242
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 243 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 293
Score = 83.6 bits (205), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/170 (34%), Positives = 76/170 (44%), Gaps = 5/170 (2%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS-----GRLNSDGPSGRLRYLG 140
P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L SD P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXXXGDLASDKPTGDLASDK 138
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 188
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 175 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 234
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 235 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 293
>gi|167757186|ref|ZP_02429313.1| hypothetical protein CLORAM_02736 [Clostridium ramosum DSM 1402]
gi|167703361|gb|EDS17940.1| BclB domain protein [Clostridium ramosum DSM 1402]
Length = 578
Score = 90.9 bits (224), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/194 (30%), Positives = 80/194 (41%), Gaps = 10/194 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G +GP+G+ GP+G +GP+G+ GP+G G G
Sbjct: 36 TGPTGVTGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGA 95
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+GS G G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 96 TGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGATGPTGLTGATGEDGATGPTGPTGSTGPTGA 155
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
DG +G GP+G G G GP+G GP+G G G GP
Sbjct: 156 TGEDGATG---ATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGP 212
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLR 200
+G G DG
Sbjct: 213 TGPTGATG-EDGAT 225
Score = 87.0 bits (214), Expect = 4e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/188 (30%), Positives = 78/188 (41%), Gaps = 7/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTGVTGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGP 86
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP+G G G GP+G GP+G G +G + GP
Sbjct: 87 TGATGEDGATGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGATGPTG---LTGATGEDGATGP 143
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 144 TGPTGSTGPTG---ATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGA 200
Query: 193 LGLSDGLR 200
G DG
Sbjct: 201 TG-EDGAT 207
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 78/194 (40%), Gaps = 10/194 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G +GP+G+ GP+G G G+ GP+G G G
Sbjct: 54 IGPTGATGATGPTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGSTGATGEDGA 113
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 114 TGPTGPTGVTGATGPTGLTGATGEDGATGPTGPTGSTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGA 173
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
DG +G GP+G GP+G G G GP+G G G GP
Sbjct: 174 TGEDGATG---ATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGP 230
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLR 200
+G G DG
Sbjct: 231 TGPTGATG-EDGAT 243
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ GP+G G G+ GP+G G G
Sbjct: 165 TGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGA 224
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G GP+G G +G GP+G G G + GP
Sbjct: 225 TGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG---LTGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGATGP 281
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 282 TGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGATGATGPTGPTGA 341
Query: 193 LGLSDGLR 200
G DG
Sbjct: 342 TG-EDGAT 348
Score = 78.6 bits (192), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 4/191 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G G G+ GP+G G G+ GP+G GP+G
Sbjct: 72 IGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGATGPTGL 131
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G+ GP+G G +G GP+G G G GP+G +
Sbjct: 132 TGATGEDGATGPTGPTGSTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGA 191
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 192 TGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGL 251
Query: 190 LRYLGLSDGLR 200
G DG
Sbjct: 252 TGATG-EDGAT 261
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G G+ GP+G G G+ GP+G G G
Sbjct: 183 TGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGA 242
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G G GP+G GP+G + G
Sbjct: 243 TGATGPTG---LTGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGE 299
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G G G GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 300 DGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGSTGA 359
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 360 TG 361
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 7/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ G G+ GP+G G G+ GP+G GP+G
Sbjct: 141 TGPTGPTGSTGPTGAT---GEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGP 197
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP+G G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 198 TGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGLT---GA 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G G GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 255 TGEDGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGA 314
Query: 193 LGLSDGLR 200
G DG
Sbjct: 315 TG-EDGAT 321
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/196 (28%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 12/196 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+GS G G GP+G GP+G G G
Sbjct: 81 TGPTGPTGATGEDGATGATGPTGSTGATGEDGATGPTGPTGVTGATGPTGLTGATGEDGA 140
Query: 73 LRYLGPSGSLR------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
GP+GS GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 141 TGPTGPTGSTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGA 200
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 201 TGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGLTGATGEDGA 260
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 261 TGPTGPTGATGEDGAT 276
Score = 72.8 bits (177), Expect = 8e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 7/191 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G GP+G G G+ GP+G G G+ GP+G G
Sbjct: 117 TGPTGVTGATGPTGLTGATGEDGATGPTGPTGSTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGE 176
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP+G+ GP+G G G GP+G G G GP+G +
Sbjct: 177 DGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGA 236
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G GP+G G +G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 237 TGEDGATGATGPTG---LTGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGP 293
Query: 190 LRYLGLSDGLR 200
G DG
Sbjct: 294 TGATG-EDGAT 303
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG- 71
GP+G G G+ GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 192 TGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGL 251
Query: 72 -----RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G G GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 252 TGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGP 311
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G G GP+G GP+G G G GP+G G +G G
Sbjct: 312 TGATGEDGATGPTGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGSTGATGSTGPTGTNGA 371
Query: 187 SGR 189
+G
Sbjct: 372 NGD 374
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/174 (28%), Positives = 65/174 (37%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G G G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 210 TGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG---LTGATGEDGATGPTGP 266
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP+G GP+G G G GP+G G G GP
Sbjct: 267 TGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGP 326
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G GP+G G G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 327 TGATGATGPTGPTGATGEDGATGPTGPTGSTGATGSTGPTGTNGANGDRGPTGP 380
>gi|156118931|gb|ABU49855.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 508
Score = 90.5 bits (223), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/180 (34%), Positives = 82/180 (45%), Gaps = 4/180 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS----GRLNSD 130
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L SD
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXXGDLASD 145
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 205
Score = 90.5 bits (223), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/180 (34%), Positives = 82/180 (45%), Gaps = 4/180 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS----GRLRYLGPS 70
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L P+
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXXGDLASDKPT 148
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD
Sbjct: 149 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 208
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 209 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 268
Score = 83.2 bits (204), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/169 (34%), Positives = 76/169 (44%), Gaps = 4/169 (2%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS--- 142
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXX 138
Query: 143 -GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 XGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 187
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 156 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 215
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 216 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 274
>gi|156118923|gb|ABU49851.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 432
Score = 90.5 bits (223), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/174 (35%), Positives = 80/174 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 192
Score = 90.5 bits (223), Expect = 3e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/173 (34%), Positives = 80/173 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 198
>gi|156118971|gb|ABU49875.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 451
Score = 90.1 bits (222), Expect = 5e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/177 (35%), Positives = 82/177 (46%), Gaps = 1/177 (0%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS-GRL 73
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXGDL 85
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 86 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 145
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 202
Score = 90.1 bits (222), Expect = 5e-16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/177 (35%), Positives = 82/177 (46%), Gaps = 1/177 (0%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS-GRLRYLGPSGRL 73
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L P+G L
Sbjct: 35 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXGDLASDKPTGDL 94
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 95 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 154
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 155 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 211
Score = 82.8 bits (203), Expect = 8e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/166 (34%), Positives = 76/166 (45%), Gaps = 1/166 (0%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPS-GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
P+ G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G
Sbjct: 79 KPTXGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGD 138
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 LASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 184
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 56/119 (47%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 99 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 158
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+
Sbjct: 159 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 217
>gi|156118927|gb|ABU49853.1| mucin [Schistosoma mansoni]
Length = 444
Score = 88.6 bits (218), Expect = 1e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/179 (34%), Positives = 82/179 (45%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLNSDG 131
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L SD
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXGDLASDK 145
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 146 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 204
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/168 (34%), Positives = 76/168 (45%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS--- 142
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXX 138
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 186
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/122 (34%), Positives = 56/122 (45%), Gaps = 3/122 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS---GRLRYLGPSG 71
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+ G L P+G
Sbjct: 89 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTXXXGDLASDKPTG 148
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD
Sbjct: 149 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDK 208
Query: 132 PS 133
P+
Sbjct: 209 PT 210
>gi|355672101|ref|ZP_09058257.1| hypothetical protein HMPREF9469_01294, partial [Clostridium
citroniae WAL-17108]
gi|354815386|gb|EHE99979.1| hypothetical protein HMPREF9469_01294, partial [Clostridium
citroniae WAL-17108]
Length = 336
Score = 88.2 bits (217), Expect = 2e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/190 (30%), Positives = 87/190 (45%), Gaps = 12/190 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G++ G SG+ GP+G G +GS+ GP+G GP+G
Sbjct: 120 TGPTGADGVTGPTGAIGATGASGATGPTGPTGATGSTGSTGSIGPTGPTGVSGATGPTGA 179
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G +GP+G +GP+G G +G GP+G +DG
Sbjct: 180 TGATGADGATGSTGATG---VIGPTGATGAIGPTGPTGADGATGSTGATGPTGANGADGA 236
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G +GP+G GP +G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 237 TG---AIGPTGAAGATGPTGLTGAAGATGPTGATGVAGATGPTGVTGPTGPTGAAGATGP 293
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 294 TGATGVTGVA 303
Score = 85.1 bits (209), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/193 (28%), Positives = 84/193 (43%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G++ GP+G+ GP+G + G SG+ GP+G G +G
Sbjct: 102 TGSTGATGVTGATGAIGATGPTGADGVTGPTGAIGATGASGATGPTGPTGATGSTGSTGS 161
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G GP+G G G G +G +GP+G +GP+G +DG
Sbjct: 162 IGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATG---VIGPTGATGAIGPTGPTGADGA 218
Query: 133 SGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G GP+ G +GP+G GP +G GP+G G +G
Sbjct: 219 TGSTGATGPTGANGADGATGAIGPTGAAGATGPTGLTGAAGATGPTGATGVAGATGPTGV 278
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 279 TGPTGPTGAAGAT 291
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 78/178 (43%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G SG GP+G+ G +GS+ GP+G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 138 TGASGATGPTGPTGATGSTGSTGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATG- 196
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G+ +GP+G G +G GP+G G G +GP+G + GP
Sbjct: 197 --VIGPTGATGAIGPTGPTGADGATGSTGATGPTG---ANGADGATGAIGPTGAAGATGP 251
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 252 TG---LTGAAGATGPTGATGVAGATGPTGVTGPTGPTGAAGATGPTGATGVTGVAGAT 306
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/202 (26%), Positives = 82/202 (40%), Gaps = 21/202 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY--------------- 57
GP+G G +G+ GP+G+ G G + GP+G+
Sbjct: 39 TGPTGATGATGINGATGPTGPTGATGATGVPGIIGPTGPTGADGATGPTGAAGATGANGA 98
Query: 58 ---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G G +G + GP+G+ GP+G + G SG GP+G G
Sbjct: 99 TGPTGSTGATGVTGATGAIGATGPTGADGVTGPTGAIGATGASGATGPTGPTGATGSTGS 158
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G + GP+G + GP+G G G G +G +GP+G +GP+G
Sbjct: 159 TGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATG---VIGPTGATGAIGPTGPTGA 215
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 216 DGATGSTGATGPTGANGADGAT 237
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 74/175 (42%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS +GP+G G +G G +G+ G +G +GP+G
Sbjct: 144 TGPTGPTGATGSTGSTGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGA 203
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G G +G GP+G G G +GP+G GP+G G
Sbjct: 204 TGAIGPTGPTGADGATGSTGATGPTG---ANGADGATGAIGPTGAAGATGPTGLT---GA 257
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G PS
Sbjct: 258 AGATGPTGATGVAGATGPTGVTGPTGPTGAAGATGPTGATGVTGVAGATGPTAPS 312
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 83/213 (38%), Gaps = 33/213 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLR------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GP+G GP+G+ GP+G+ G +G GP+G+ G
Sbjct: 10 GPTGATGATGPTGADGGIGPTGPTGADGVTGPTGATGATGINGATGPTGPTGATGATGVP 69
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRY------------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G G +G+ G +G + GP+G
Sbjct: 70 GIIGPTGPTGADGATGPTGAAGATGANGATGPTGSTGATGVTGATGAIGATGPTGADGVT 129
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G + G SG GP+G S G +G + GP+G GP+G G G
Sbjct: 130 GPTGAIGATGASGATGPTGPTGATGSTGSTGSIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGAT 189
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G +GP+G +GP+G G +
Sbjct: 190 GSTGATG---VIGPTGATGAIGPTGPTGADGAT 219
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/158 (28%), Positives = 70/158 (44%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G +G G +G+ G +G +GP+G+ +GP+G G +G
Sbjct: 161 SIGPTGPTGVSGATGPTGATGATGADGATGSTGATGVIGPTGATGAIGPTGPTGADGATG 220
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ G G +GP+G GP+G G +G G +G + G
Sbjct: 221 STGATGPTGA---NGADGATGAIGPTGAAGATGPTG---LTGAAGATGPTGATGVAGATG 274
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
P+G GP+G GP+G G +G PS
Sbjct: 275 PTGVTGPTGPTGAAGATGPTGATGVTGVAGATGPTAPS 312
>gi|156368219|ref|XP_001627593.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156214507|gb|EDO35493.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 881
Score = 87.4 bits (215), Expect = 3e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/185 (36%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 10/185 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
LRY G Y P LRY LRY LRY RY LRY
Sbjct: 218 EDDLRYTEIDGGCHYSEPDVDLRYTENDDGLRYTENDDGLRYTENDDGFRYTENDDGLRY 277
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
LRY G L Y LRY LRY P G LRY R N DG
Sbjct: 278 TENDDGLRYTENDG-LCYTENDDGLRYTENDDGLRYTEPDGDLRY-----RENDDG---- 327
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
LRY P G LRY LRY P G LRY LRY RY LRY G
Sbjct: 328 LRYTEPDGALRYRENDDGLRYTEPDGDLRYRENDDGLRYTELYDDARYHESDDYLRYTGR 387
Query: 196 SDGLR 200
LR
Sbjct: 388 DCDLR 392
Score = 87.4 bits (215), Expect = 3e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/159 (37%), Positives = 63/159 (39%), Gaps = 1/159 (0%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
LRY LRY G Y P LRY LRY LRY RY
Sbjct: 212 LRYTEREDDLRYTEIDGGCHYSEPDVDLRYTENDDGLRYTENDDGLRYTENDDGFRYTEN 271
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
LRY LRY G ++ G LRY LRY P G LRY LRY
Sbjct: 272 DDGLRYTENDDGLRYTENDGLCYTENDDG-LRYTENDDGLRYTEPDGDLRYRENDDGLRY 330
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
P G LRY LRY P G LRY DGLR + L
Sbjct: 331 TEPDGALRYRENDDGLRYTEPDGDLRYRENDDGLRYTEL 369
Score = 87.0 bits (214), Expect = 4e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/180 (37%), Positives = 68/180 (37%), Gaps = 10/180 (5%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P LRY LRY LRY RY LRY LRY G L
Sbjct: 235 PDVDLRYTENDDGLRYTENDDGLRYTENDDGFRYTENDDGLRYTENDDGLRYTENDG-LC 293
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
Y LRY LRY P G LRY LRY P G LRY R N DG
Sbjct: 294 YTENDDGLRYTENDDGLRYTEPDGDLRYRENDDGLRYTEPDGALRY-----RENDDG--- 345
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
LRY P G LRY LRY RY LRY G LR + LRY G
Sbjct: 346 -LRYTEPDGDLRYRENDDGLRYTELYDDARYHESDDYLRYTGRDCDLRDQKRNAILRYTG 404
Score = 82.8 bits (203), Expect = 8e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/203 (35%), Positives = 74/203 (36%), Gaps = 3/203 (1%)
Query: 2 FGTCVVEKAL-NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
FGT EK LG +G S LRY LRY G Y P LRY
Sbjct: 186 FGTIETEKDHPILGIEQEYDGIGES-ILRYTEREDDLRYTEIDGGCHYSEPDVDLRYTEN 244
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
LRY LRY RY LRY LRY G L Y LRY
Sbjct: 245 DDGLRYTENDDGLRYTENDDGFRYTENDDGLRYTENDDGLRYTENDG-LCYTENDDGLRY 303
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
L P G LRY LRY P G LRY LRY P G LRY
Sbjct: 304 TENDDGLRYTEPDGDLRYRENDDGLRYTEPDGALRYRENDDGLRYTEPDGDLRYRENDDG 363
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
LRY RY D LR +G
Sbjct: 364 LRYTELYDDARYHESDDYLRYTG 386
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/159 (35%), Positives = 60/159 (37%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
LRY LRY P G LRY LRY P G+LRY LRY P G LRY
Sbjct: 301 LRYTENDDGLRYTEPDGDLRYRENDDGLRYTEPDGALRYRENDDGLRYTEPDGDLRYREN 360
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLNSDGPSGRLR 137
LRY RY LRY G LR + LRY G + R N+D LR
Sbjct: 361 DDGLRYTELYDDARYHESDDYLRYTGRDCDLRDQKRNAILRYTGRNALRRNAD-----LR 415
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
Y L L Y LR LRY
Sbjct: 416 YTRRDADLCDQQRKADLCYTRCDADLRDKQRDADLRYTN 454
>gi|384252261|gb|EIE25737.1| hypothetical protein COCSUDRAFT_40018 [Coccomyxa subellipsoidea
C-169]
Length = 4971
Score = 86.3 bits (212), Expect = 7e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/184 (22%), Positives = 83/184 (45%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + G +G + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G G +G
Sbjct: 2429 TGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGDTGATGFTGATGETGATGFTGA 2485
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 2486 TGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGPTGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGF 2542
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 2543 TGATGFTGETGATGFTGATG---FNGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGA 2599
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 2600 TGFT 2603
Score = 85.5 bits (210), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/179 (22%), Positives = 79/179 (44%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 3077 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 3136
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G G +G
Sbjct: 3137 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 3193
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ GP+G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G
Sbjct: 3194 TGFTGPTG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTG 3249
Score = 85.5 bits (210), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 82/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 1718 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGDTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 1777
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + + G +G + G +G +
Sbjct: 1778 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGAIGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 1834
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 1835 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGITGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 1894
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 1895 TGFTGAT 1901
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/187 (21%), Positives = 83/187 (44%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 3044 TGATGFTGSTGATGFTGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGF 3100
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ + G +G G +G + G +G + G +G + G +G G +G
Sbjct: 3101 TGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGA 3157
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGR 189
+ G +G + G +G G +G + G +G + GP +G + G +G
Sbjct: 3158 TGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGPTGFTGSTGATGFTGSTGA 3217
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G++
Sbjct: 3218 TGFTGVT 3224
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 82/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 1778 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGAIGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 1837
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 1838 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGITGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 1894
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 1895 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 1954
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 1955 TGFTGAT 1961
Score = 84.0 bits (206), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 1898 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 1957
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 1958 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2014
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2015 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2074
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2075 TGFTGAT 2081
Score = 84.0 bits (206), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 1958 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2017
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2018 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2074
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2075 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2134
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2135 TGFTGAT 2141
Score = 84.0 bits (206), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2018 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2077
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2078 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2134
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2135 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2194
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2195 TGFTGAT 2201
Score = 84.0 bits (206), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2618 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2677
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2678 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2734
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2735 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2794
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2795 TGFTGAT 2801
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 3989 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 4048
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 4049 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 4105
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 4106 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGAAGFTGATGFTGETGA 4165
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 4166 TGFTGAT 4172
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 4049 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 4108
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 4109 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGAAGFTGATGFTGETGA 4165
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 4166 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGAAGFTGATGFTGETGA 4225
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 4226 TGFTGAT 4232
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 4109 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGAAGFTGATGFTGETGATGF 4168
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 4169 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGAAGFTGATGFTGETGA 4225
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 4226 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 4285
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 4286 TGFTGAT 4292
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/181 (22%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G + G +G +
Sbjct: 3950 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGATG---FTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGF 4003
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G + G +G S G +G
Sbjct: 4004 TGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATG- 4062
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+ G +G + G +G + G +G G +G + G +G + G +G G
Sbjct: 4063 --FTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGA 4120
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 4121 T 4121
Score = 83.6 bits (205), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 1838 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGITGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 1897
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 1898 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 1954
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 1955 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2014
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2015 TGFTGAT 2021
Score = 83.2 bits (204), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2678 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2737
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2738 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2794
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2795 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGLTGATGFTGETGA 2854
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2855 TGFTGAT 2861
Score = 82.8 bits (203), Expect = 7e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/196 (21%), Positives = 84/196 (42%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + GP+G + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G G +G
Sbjct: 3188 TGETGATGFTGPTG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGA 3244
Query: 73 LRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP 123
+ G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 3245 TGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGA 3304
Query: 124 ---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G
Sbjct: 3305 TGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGA 3364
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +
Sbjct: 3365 TGFTGETGATGFTGAT 3380
Score = 82.4 bits (202), Expect = 9e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2558 TGATGFNGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2617
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2618 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2674
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2675 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2734
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2735 TGFTGAT 2741
Score = 82.4 bits (202), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/187 (22%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G + G +G S G + G +G + G +G+ + G +G G
Sbjct: 3128 TGETGATGFTGATGFTGSTGATG------FTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGF 3181
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G + G +G+ + GP+G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 3182 TGATGFTGETGATGFTGPTG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGA 3238
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 3239 TGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGE 3295
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 3296 TGATGFT 3302
Score = 82.0 bits (201), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/179 (22%), Positives = 78/179 (43%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2078 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2137
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G G +G
Sbjct: 2138 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2194
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ G +G GP+G + G +G + G +G + G +G G +G + G
Sbjct: 2195 TGFTGATGFTGSTGPTG---FTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTG 2250
Score = 81.6 bits (200), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 83/187 (44%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2924 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2983
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2984 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 3040
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 3041 TGFTGATGFTGSTGATGFTGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGA 3097
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G++
Sbjct: 3098 TGFTGVT 3104
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2138 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2197
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2198 TGATG---FTGSTGPTGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2254
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2255 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2314
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2315 TGFTGAT 2321
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/190 (23%), Positives = 79/190 (41%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G + G +G + G SG S G +G + G +GS G +G G
Sbjct: 954 TGETGATGFTGSTGPTGFTGASGFTGSTGATGETGATGFTGSTGSTGATGFTGETGATGF 1013
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 126
+G G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 1014 TGATGSTGNTGATGFTGETGATGFTGSTGFTGETGATGATGFTGETGATGFTGSTGSTGF 1073
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 1074 TGETGATGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGSTGATGFTGETGATGFTGSTGATGFTGE 1133
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G + G +
Sbjct: 1134 TGARGFTGAT 1143
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/187 (21%), Positives = 81/187 (43%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2984 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 3043
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP--- 132
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G S G
Sbjct: 3044 TGATG---FTGSTGATGFTGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGF 3100
Query: 133 ---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G + G +G G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 3101 TGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGA 3157
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G++
Sbjct: 3158 TGFTGVT 3164
Score = 80.5 bits (197), Expect = 4e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/179 (22%), Positives = 79/179 (44%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 3497 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 3556
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G G +G
Sbjct: 3557 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 3613
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 3614 TGFTGATG---FTGSTGATGFTGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTG 3666
Score = 80.1 bits (196), Expect = 4e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 80/187 (42%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2198 TGATGFTGSTGPTGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2257
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2258 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2314
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2315 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2374
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2375 TGFTGAT 2381
Score = 79.7 bits (195), Expect = 6e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/181 (23%), Positives = 79/181 (43%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 915 TGATGFTGSTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGFTGFTGETGATGFTGSTGPTGF 971
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G SG + G +G G +G G +G + G +G + G +G S G +G
Sbjct: 972 TGASG---FTGSTGATGETGATGFTGSTGSTGATGFTGETGATGFTGATG---STGNTGA 1025
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+ G +G + G +G G +G + G +G + G +G + G +G G
Sbjct: 1026 TGFTGETGATGFTGSTGFTGETGATGATGFTGETGATGFTGSTGSTGFTGETGATGATGF 1085
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 1086 T 1086
Score = 79.7 bits (195), Expect = 7e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/179 (22%), Positives = 81/179 (45%), Gaps = 12/179 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G + G +G+ + G +G + + G +G + G +G+ + G +G + G
Sbjct: 2033 TGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATG---FTGETGATGFTGATG---FTGS 2086
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G + G +G S
Sbjct: 2087 TGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGS 2146
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 2147 TGATG---FTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG 2202
Score = 79.3 bits (194), Expect = 8e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/189 (21%), Positives = 81/189 (42%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 4169 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGAAGFTGATGFTGETGATGF 4228
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 4229 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 4285
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G + G
Sbjct: 4286 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGS 4345
Query: 187 SGRLRYLGL 195
+G + G+
Sbjct: 4346 TGATGFTGV 4354
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/187 (21%), Positives = 80/187 (42%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2498 TGATGFTGSTGPTGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2557
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNS 129
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2558 TGATG---FNGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2614
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2615 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2674
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 2675 TGFTGAT 2681
Score = 77.8 bits (190), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/180 (22%), Positives = 81/180 (45%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 20 RYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
++GP+G GP +G+ G +G G +G+ + G +G G +G +
Sbjct: 1650 AFIGPTGPQGLPGPYGQNGTFGATGATGITGTKGDTGATGFTGATGETGATGFTGATGFT 1709
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 1710 GETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGDTGATGFTGATGETGATGFTGAT 1766
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + + G +G G +
Sbjct: 1767 GFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGAIGFTGATGETGATGFT 1823
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/197 (21%), Positives = 80/197 (40%), Gaps = 18/197 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG- 71
G +G + G +G+ + G +G + G +G + G +G+ + G +G + G SG
Sbjct: 921 TGSTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGFTGFTGETGATGFTGSTGPTGFTGASGF 977
Query: 72 -----------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+ G +GS G +G G +G G +G + G +G +
Sbjct: 978 TGSTGATGETGATGFTGSTGSTGATGFTGETGATGFTGATGSTGNTGATGFTGETGATGF 1037
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 1038 TGSTGFTGETGATGATGFTGETGATGFTGSTGSTGFTGETGATGATGFTGSTGATGFTGV 1097
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G + G +G + G
Sbjct: 1098 TGATGFTGSTGATGFTG 1114
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/167 (22%), Positives = 75/167 (44%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+ G +G+ + G +G + G +G+ + G +G + G +G + G +G G +G
Sbjct: 2428 FTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGDTGATGFTGATGETGATGFTG 2484
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
+ G +G + G +G GP+G + G +G G +G + G +G G
Sbjct: 2485 ATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGPTG---FTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATG 2541
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G + G +G + G +G + G +G + G +G + G++
Sbjct: 2542 FTGATGFTGETGATGFTGATG---FNGSTGATGFTGSTGATGFTGVT 2585
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/214 (19%), Positives = 83/214 (38%), Gaps = 33/214 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
G +G + G +G+ + G +G+ + G +G G +G+ + G +G + G
Sbjct: 2264 TGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGF 2323
Query: 70 ---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 2324 TGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGF 2383
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGR------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
S G +G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 2384 TGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGTTGETGATGFTGPTGFTGETGATGFTGATG- 2442
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +G + G +G + G +
Sbjct: 2443 --FTGSTGATGFTGSTGATGFTGDTGATGFTGAT 2474
Score = 72.8 bits (177), Expect = 8e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/205 (20%), Positives = 80/205 (39%), Gaps = 30/205 (14%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 3557 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 3616
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG- 134
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G S G +G
Sbjct: 3617 TGATG---FTGSTGATGFTGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGF 3673
Query: 135 -----------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 3674 TGVTGATGFTGGTGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGFTGA 3730
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +G G +
Sbjct: 3731 TGFTGVTGATGFTGATGETGATGFT 3755
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/175 (22%), Positives = 75/175 (42%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGP---------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ Y G +G + G +G+ + G +G + G +G + G +G+
Sbjct: 333 FGDTGATGYTGAVGDTGATGFTGEVGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGA 389
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ G +G + G +G + G +G + G +G + G +G S G +G + G
Sbjct: 390 TGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGDTGATGFTGATGFTGSTGATG---FTGD 443
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G + G +G G +G G +G + G +G + G SG + G +
Sbjct: 444 TGATGFTGATGATGSTGATGFTGDTGATGFTGFTGSTGATGFTGASGATGFTGAT 498
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/181 (23%), Positives = 76/181 (41%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 4439 TGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGA 4498
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ + G +G + G +G + G +G+ G +G G +G S G +G
Sbjct: 4499 TGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQT---GSTGATGVTGATGSTGSTGATGI 4555
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G + G +G + G +G + G +G+ G +G G +G G+
Sbjct: 4556 TGATGLTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGI 4615
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 4616 T 4616
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/205 (20%), Positives = 78/205 (38%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2318 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2377
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------------------LGPSGRLRY 111
G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 2378 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGTTGETGATGFTGPTGFTGETGA 2434
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G + G +G G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 2435 TGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGDTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 2494
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G GP+G G +
Sbjct: 2495 TGFTGATGFTGSTGPTGFTGSTGAT 2519
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/159 (22%), Positives = 70/159 (44%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2738 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 2797
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G G +G
Sbjct: 2798 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGLTGATGFTGETGA 2854
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+ G +G + G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 2855 TGFTGATG---FTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGF 2887
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/218 (20%), Positives = 84/218 (38%), Gaps = 36/218 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G + G +G+ + G +GS + G +G + G +G+ + G +G + G
Sbjct: 1046 ETGATGATGFTGETGATGFTGSTGSTGFTGETGATGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTG 1105
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP----- 123
+G + G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 1106 STGATGFTGETGATGFTGSTGATGFTGETGARGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATG 1162
Query: 124 ----------------------SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS- 160
+G + + G +G G +G + G +G G S
Sbjct: 1163 FTGATGGTGATGFTGFTGATGITGDIGATGVTGATGLTGATGATGFTGATGFTGNTGASG 1222
Query: 161 --GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + G +G + G +G G +G G+S
Sbjct: 1223 FTGATGFTGSTGATGFTGATGFTGATGFTGSTGATGVS 1260
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/150 (22%), Positives = 66/150 (44%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 3257 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 3316
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G G +G
Sbjct: 3317 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGA 3373
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+ G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 3374 TGFTGATG---FTGNTGATGFTGSTGATGF 3400
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/188 (22%), Positives = 80/188 (42%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G G +G+ + G +G + + G +G + G +G+ + G +G+ G
Sbjct: 4477 STGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTG 4536
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G G +G + G +G + G +G + G +G+
Sbjct: 4537 ATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGFTGATG---FTGSTGATGFTGATGQTG 4593
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G G +G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 4594 STGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTG 4653
Query: 189 RLRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 4654 ATGFTGAT 4661
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/217 (19%), Positives = 84/217 (38%), Gaps = 39/217 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
G +G + G +G+ + G +G + + G +G G +G+ + G +G +
Sbjct: 2333 TGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGF 2392
Query: 67 LGPSGR---------------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G + G +G+ + G +G + G +G
Sbjct: 2393 TGSTGATGFTGVTGATGFTGTTGETGATGFTGPTGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGA 2449
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+ G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G GP
Sbjct: 2450 TGFTGSTGATGFTGDTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGP 2509
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G + G +G + G +G + G +G G +
Sbjct: 2510 TG---FTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFT 2543
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/187 (21%), Positives = 78/187 (41%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+G + G +G+ + G +G+ + G +G+ G +GS G +G G
Sbjct: 4502 TGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGL 4561
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G + G +G+ + G +G + G +G+ G +G G +G G +G
Sbjct: 4562 TGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGL 4621
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G + G +G + G +G + G +G+ G +G G +G
Sbjct: 4622 TGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGS 4681
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 4682 TGATGIT 4688
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/206 (20%), Positives = 80/206 (38%), Gaps = 30/206 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------ 66
G +G G +G+ + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G +
Sbjct: 2351 TGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGA 2407
Query: 67 ------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G G +G+ + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 2408 TGFTGTTGETGATGFTGPTGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGDTGA 2467
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ G +G G +G G +G + G +G GP+G + G +G + G
Sbjct: 2468 TGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGPTG---FTGSTGATGFTGV 2524
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G + G +G G +G + G
Sbjct: 2525 TGATGFTGATGETGATGFTGATGFTG 2550
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/217 (18%), Positives = 83/217 (38%), Gaps = 33/217 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY--- 66
G +G G +G+ + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G +
Sbjct: 2831 TGATGETGATGLTGATGFTGETGATGFTGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGV 2890
Query: 67 ---------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +G G +G+ + G +G + G +G + G
Sbjct: 2891 TGATGFTGTTGETGATGFTGATGFTGETGATGLTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGV 2950
Query: 106 SGRLRYLGPSGR---LRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 2951 TGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGV 3010
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G + G +G G +G + G +G + G +
Sbjct: 3011 TGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGAT 3047
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/171 (22%), Positives = 73/171 (42%), Gaps = 15/171 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLR 65
+ G +G + G +G+ + G +GS G +G G +GS + G +G
Sbjct: 995 STGSTGATGFTGETGATGFTGATGSTGNTGATGFTGETGATGFTGSTGFTGETGATGATG 1054
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+ G +G + G +GS + G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 1055 FTGETGATGFTGSTGSTGFTGET------GATGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGSTG 1108
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 1109 ATGFTGETGATGFTGSTGATGFTGETGARGFTGATG---FTGSTGATGFTG 1156
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/196 (20%), Positives = 80/196 (40%), Gaps = 21/196 (10%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 2798 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGLTGATGFTGETGATGF 2857
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 2858 TGATG---FTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGTTGETGATGFTGA 2911
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G
Sbjct: 2912 TGFTGETGATGLTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGA 2971
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +
Sbjct: 2972 TGFTGETGATGFTGAT 2987
Score = 65.1 bits (157), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/181 (23%), Positives = 75/181 (41%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 4571 TGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGA 4630
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ + G +G + G +G + G +G+ G +G G +G S G +G
Sbjct: 4631 TGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQT---GSTGATGVTGATGSTGSTGATGI 4687
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G + G +G + G +G G +G G +G + G +G G+
Sbjct: 4688 TGATGLTGATGFTGATG---FTGATGFTGSTGATGVTGATGATGSTGFTGATGFTGSTGV 4744
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 4745 T 4745
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/208 (19%), Positives = 81/208 (38%), Gaps = 39/208 (18%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 4229 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 4288
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G S G +G
Sbjct: 4289 TGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGATG---FTGETGATGFTGATGFTGSTGATG- 4341
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLG---------------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 4342 --FTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGGTGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGA 4396
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G+ G +G G +G G++
Sbjct: 4397 TGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT 4424
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/239 (19%), Positives = 86/239 (35%), Gaps = 45/239 (18%)
Query: 12 NLGPSG---RLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSG 62
N G +G G +GS + G +G+ + G +G + G +GS + G +G
Sbjct: 1022 NTGATGFTGETGATGFTGSTGFTGETGATGATGFTGETGATGFTGSTGSTGFTGETGATG 1081
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+ G +G + G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 1082 ATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGSTGATGFTGETGATGFTGSTGATGFTGETGARGFTG 1141
Query: 123 PSGRLNSDGP---------------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLG 149
+G S G +G + G +G G
Sbjct: 1142 ATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGATGGTGATGFTGFTGATGITGDIGATGVTGATGLTG 1201
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G + G +G G S G + G +G + G +G G + +G+
Sbjct: 1202 ATGATGFTGATGFTGNTGASGFTGATGFTGSTGATGFTGATGFTGATGFTGSTGATGVS 1260
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/196 (21%), Positives = 78/196 (39%), Gaps = 18/196 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G G +G+ + G +G + G +G+ + G +G+ G +G
Sbjct: 4409 TGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQT---GSTGA 4465
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GS G +G G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 4466 TGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGF 4525
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G +G+ S G +G G +G G +G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 4526 TGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGFTGATG---FTGSTGA 4582
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G+ G +
Sbjct: 4583 TGFTGATGQTGSTGAT 4598
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/208 (19%), Positives = 82/208 (39%), Gaps = 39/208 (18%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G + G +G +
Sbjct: 4289 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGATG---FTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGF 4342
Query: 76 LGPSGSLRYLG---------------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G+ + G +G + G +G + G +G+
Sbjct: 4343 TGSTGATGFTGVTGATGFTGATGGTGATGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGATGQ 4399
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G S G +G G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 4400 ---TGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGA 4456
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G+ G +G G +G G++
Sbjct: 4457 TGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGIT 4484
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/196 (21%), Positives = 75/196 (38%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G G +G+ + G +G + G +G+ + G +G+ G +G
Sbjct: 4541 TGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQT---GSTGA 4597
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GS G +G G +G + G +G + G +G +
Sbjct: 4598 TGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGF 4657
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G +G+ S G +G G +G G +G G +G G +G + G +G
Sbjct: 4658 TGATGQTGSTGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGSTGA 4717
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +
Sbjct: 4718 TGVTGATGATGSTGFT 4733
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/219 (19%), Positives = 80/219 (36%), Gaps = 39/219 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G + G
Sbjct: 1065 TGSTGSTGFTGETGATGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGSTGATGFTGETGATGFTGS 1124
Query: 70 SGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGP--------------------------- 96
+G + G +G+ + G +G + G
Sbjct: 1125 TGATGFTGETGARGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGATGGTGATGFTGFTGATGI 1184
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+G + G +G G +G + G +G + G S G + G +G + G +G
Sbjct: 1185 TGDIGATGVTGATGLTGATGATGFTGATGFTGNTGASGFTGATGFTGSTGATGFTGATGF 1244
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G SG + G +G G +G +
Sbjct: 1245 TGATGFTGSTGATGVSGATGFTGATGSTGSTGVTGATGF 1283
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/137 (21%), Positives = 58/137 (42%), Gaps = 9/137 (6%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLG 122
+ G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 3487 FTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTG 3543
Query: 123 P---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G
Sbjct: 3544 ATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTG 3603
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +
Sbjct: 3604 ATGFTGETGATGFTGAT 3620
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/232 (17%), Positives = 79/232 (34%), Gaps = 57/232 (24%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G G +G + G +G +
Sbjct: 3317 TGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF 3376
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGR 108
G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 3377 TGATG---FTGNTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGTTGETGATGFTGATGFTGETGA 3433
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG------------------------RLRYLGPSGR 144
G +G G +G S G +G + G +G
Sbjct: 3434 TGLTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGGTGETGATGFTGATGFTGETGA 3493
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +
Sbjct: 3494 TGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFT 3542
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/140 (20%), Positives = 59/140 (42%), Gaps = 12/140 (8%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLG 122
+ G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 3880 FTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGFTGATGFTGVTGATGFTGATGETGATGFTG 3936
Query: 123 P---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G
Sbjct: 3937 ATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGSTGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTG 3996
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G + G +G + G++
Sbjct: 3997 STGATGFTGSTGATGFTGVT 4016
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/177 (19%), Positives = 70/177 (39%), Gaps = 30/177 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------ 66
G +G + G +G+ + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G +
Sbjct: 3623 TGSTGATGFTGFTGATGFTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGATGFTGVTGA 3679
Query: 67 ------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G G +G+ + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 3680 TGFTGGTGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGFTGATGFTGVTGA 3739
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+ G +G G +G + G +G G +G + + G +G + G +G +
Sbjct: 3740 TGFTGATGE---TGATGFTGATGFTGETGATGFTGAMGFTGSTGATGFTGSTGATGF 3793
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/241 (17%), Positives = 81/241 (33%), Gaps = 63/241 (26%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + G +G+ + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 4295 TGSTGATGFTGSTGATGFTGATG---FTGETGATGFTGATG---FTGSTGATGFTGSTGA 4348
Query: 73 LRYLGP---------------------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 96
+ G +G+ + G +G+ G
Sbjct: 4349 TGFTGVTGATGFTGATGGTGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGATGQTGSTGATGV 4408
Query: 97 ---------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+G + G +G + G +G + G +G+ S G +G
Sbjct: 4409 TGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTGATGV 4468
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G G +G G +G G +G + G +G + G +G + G
Sbjct: 4469 TGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGA 4528
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 4529 T 4529
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/224 (19%), Positives = 77/224 (34%), Gaps = 39/224 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G G +G+ + G +G+ + G +G + G +G+ + G +G+ G
Sbjct: 4609 STGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGFTGATGFTGSTGATGFTGATGQTGSTG 4668
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G G +G G +G + G +G G +G
Sbjct: 4669 ATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGSTGATGVTGATGATG 4728
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSG------------------------------------RLRYLGPSG 152
S G +G + G +G G +G
Sbjct: 4729 STGFTGATGFTGSTGVTGATGFTGATGATGVTGATGATGTTGFTGATGFTGSTGVTGATG 4788
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G + G +G G +G + G +
Sbjct: 4789 FTGATGATGVTGATGATGSTGFTGATGSTGSTGVTGATGFTGAT 4832
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/235 (17%), Positives = 82/235 (34%), Gaps = 57/235 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + G +G G +G+ + G +G + +G++ + G +G + G +G
Sbjct: 3734 TGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGF---TGAMGFTGSTGATGFTGSTGA 3790
Query: 73 LRY---------------------------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+ G +G+ + G +G + G +G
Sbjct: 3791 TGFTGVTGATGFTGTTGGTGATGFTGATGFTGETGATGLTGATGFTGSTGATGFTGSTGA 3850
Query: 100 LRY------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ G +G + G +G + G +G S G +G + G
Sbjct: 3851 TGFTGVTGATGFTGGTGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGATGFTGFTGA 3910
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G + G +G + G +G G +G + G +G + G +G G +
Sbjct: 3911 TG---FTGVTGATGFTGATGETGATGFTGATGFTGETGATGFTGATGFTGSTGAT 3962
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/194 (20%), Positives = 64/194 (32%), Gaps = 30/194 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G G +G+ + G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 4673 TGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGSTGATGVTGATGATGSTGF 4732
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSG------------------------------RLRYLGPSGRLRY 102
G +GS G +G G +G
Sbjct: 4733 TGATGFTGSTGVTGATGFTGATGATGVTGATGATGTTGFTGATGFTGSTGVTGATGFTGA 4792
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G + G +G S G +G + G +G G +G + + G +G
Sbjct: 4793 TGATGVTGATGATGSTGFTGATGSTGSTGVTGATGFTGATGATGSTGFTGAMGFTGSTGV 4852
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLG 176
G +G G
Sbjct: 4853 TGATGLTGATGATG 4866
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.89, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/201 (19%), Positives = 67/201 (33%), Gaps = 33/201 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +GS G +G+ G +G G +G+ + G +G G +G
Sbjct: 4666 STGATGVTGATGSTGSTGATGITGATGLTGATGFTGATGFTGATGFTGSTGATGVTGATG 4725
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---------------------------------PSG 98
G +G+ + G +G G +G
Sbjct: 4726 ATGSTGFTGATGFTGSTGVTGATGFTGATGATGVTGATGATGTTGFTGATGFTGSTGVTG 4785
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
+ G +G G +G G +G S G +G G +G G +G +G
Sbjct: 4786 ATGFTGATGATGVTGATGATGSTGFTGATGSTGSTGVTGATGFTGATGATGSTGFTGAMG 4845
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G +G G +G
Sbjct: 4846 FTGSTGVTGATGLTGATGATG 4866
>gi|190694379|gb|ACE88756.1| polymorphic mucin truncated splice variant IC7/2/18r2 [Schistosoma
mansoni]
Length = 280
Score = 85.5 bits (210), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/162 (34%), Positives = 74/162 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 169
Score = 85.5 bits (210), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/162 (34%), Positives = 74/162 (45%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 169
Score = 84.3 bits (207), Expect = 3e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/155 (34%), Positives = 72/155 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 15 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 74
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 75 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 134
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 135 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 169
Score = 84.3 bits (207), Expect = 3e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/156 (35%), Positives = 72/156 (46%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 8 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 67
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 68 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 127
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 128 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 163
>gi|49481374|ref|YP_038772.1| hypothetical protein BT9727_4458 [Bacillus thuringiensis serovar
konkukian str. 97-27]
gi|49332930|gb|AAT63576.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis serovar konkukian
str. 97-27]
Length = 1055
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 77/188 (40%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ GP+GS G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 577 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATG 636
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN--- 128
GP+GS G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 637 NT---GPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTG 693
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S GP+G G +G GP+G G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 694 STGPTGSTGAPGNTGATGETGPTGNTGVTG------STGPTGSTGVTGNTGATGETGPTG 747
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 748 STGETGVT 755
Score = 84.3 bits (207), Expect = 3e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/190 (28%), Positives = 82/190 (43%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +G+ GP+G ++ GP+G GP+GS G +G
Sbjct: 77 TGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGVTGS 136
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+GS +G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 137 TGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGA 196
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S G +G GP+G G +G +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 197 TGSTGATGN---TGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGN 253
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G + G++
Sbjct: 254 TGPIGETGVT 263
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 77/186 (41%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G P+GS G +G GP+G GP+GS +G +G G
Sbjct: 106 NTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGATGETG 165
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +G+ GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 166 STGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNT---GPTGSTGVTGNTGATG 222
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP+G G +G GP+G G +G + G +G G +G GP+G
Sbjct: 223 AIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTG 282
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 283 ETGVTG 288
Score = 80.5 bits (197), Expect = 4e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 515 TGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGA 574
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G GP+G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 575 TGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGA 634
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 635 TGNT---GPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGV 691
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 692 TG 693
Score = 80.1 bits (196), Expect = 5e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/201 (27%), Positives = 78/201 (38%), Gaps = 18/201 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +GS GP+GS G +G GP+GS G +G
Sbjct: 596 TGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGP 655
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GP+G+ G +G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 656 TGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGETGP 715
Query: 124 SGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G S GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 716 TGNTGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGATGN 775
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G G+
Sbjct: 776 TGPTGETGATGETGATGSTGV 796
Score = 79.7 bits (195), Expect = 7e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/188 (28%), Positives = 77/188 (40%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRY 66
G +G GP+GS G +G+ GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 68 TGNTGATGATGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGA 127
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G GP+G GP+G +G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 128 TGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTG- 186
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S G +G G +G GP+G G +G +GP+G G +G GP
Sbjct: 187 --STGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGP 244
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 245 TGNTGVTG 252
Score = 79.3 bits (194), Expect = 9e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 76/193 (39%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 542 TGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGS 601
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +GS GP +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 602 TGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGV 661
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
S GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 662 TGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGETGPTGNTGV 721
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
G +G G++
Sbjct: 722 TGSTGPTGSTGVT 734
Score = 78.6 bits (192), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 75/178 (42%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+GS G +G GP+G+ +G +G G +G
Sbjct: 59 TGATGETGSTGNTGATGATGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGNTGAMGNTGPTGETGVTGS 118
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G GP+G GP+G +G +G G +G GP
Sbjct: 119 T---GPTGSTGATGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGATGETGSTGNT---GP 172
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 173 TGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGST 230
Score = 77.8 bits (190), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 77/184 (41%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+GS +G +G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 137 TGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTG- 195
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 196 --ATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGN 253
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 254 TGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGS 313
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 314 TGVT 317
Score = 77.4 bits (189), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 80/194 (41%), Gaps = 6/194 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+GS +G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 128 TGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGNTG---ATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGP 184
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G +GP+G G +G S GP
Sbjct: 185 TGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGP 244
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G + G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 245 TGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGA 304
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 305 TGETGATGSTGVTG 318
Score = 77.4 bits (189), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 524 TGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGS 583
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 584 TGVTGNTGATGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGN---TGP 640
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 641 TGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGS 700
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 701 TGA 703
Score = 76.3 bits (186), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 78/201 (38%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 68
GP+G G +G GP+GS G P+G G +G+ GP+G G
Sbjct: 665 TGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGETGPTGNTGVTGS 724
Query: 69 --PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
P+G G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 725 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGATGNTGPTGETGA 784
Query: 121 LGPSGR------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G + S G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 785 TGETGATGSTGVIGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGATGNTGPTGE--- 841
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G G+
Sbjct: 842 TGPTGSTGVTGNTGATGSTGV 862
Score = 75.1 bits (183), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 161 TGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGA 220
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+GS G +G GP+G G +G + G +G G +G S GP
Sbjct: 221 TGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGP 280
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 281 TGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGP 340
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 341 TGNTGVT 347
Score = 75.1 bits (183), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/194 (27%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 6/194 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 494 TGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGS 553
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G G +G +
Sbjct: 554 TGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGETGSTGN 613
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 614 TGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGN---TGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGN 670
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 671 TGATGETGETGVTG 684
Score = 75.1 bits (183), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 533 TGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGA 592
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+GS G +G GP +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 593 TGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGN 652
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 653 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGE 712
Query: 184 LGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 713 TGPTGNTGVTG 723
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/195 (26%), Positives = 75/195 (38%), Gaps = 15/195 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG--- 68
N GP+G G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 637 NTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGSTGVTGSTG 696
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G +G+ GP+G G P+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 697 PTGSTGAPGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGETGVTG 756
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G G +G GP+G G +G + G +G G +G
Sbjct: 757 N---TGPTGETGVTGSTGATGNTGPTGETGATGETGATGSTGVIGSTGATGNTGATGNTG 813
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 814 ATGSTGPTGNTGATG 828
Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/187 (27%), Positives = 73/187 (39%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 629 TGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGETGVTGPTGS 688
Query: 73 LRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 689 TGVTGSTGPTGSTGAPGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGS 748
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G G +G GP+G G +G G G G +G
Sbjct: 749 TGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGATGNTGPTGETGATGETGATGSTGVIGSTGATGNTGA 808
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 809 TGNTGAT 815
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/187 (26%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ +GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 197 TGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGP 256
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 257 IGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGV 316
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G G +G GP+G G P+G G +G
Sbjct: 317 TGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGP 376
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 377 TGNTGVT 383
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 76/191 (39%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G G +G+ G +G GP+GS G +G +GP+G
Sbjct: 169 NTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTG 228
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +G GP+G G +G + G +G G +G GP+G
Sbjct: 229 STGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTG 288
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLG 185
S GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 289 STGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTG 348
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 349 STGPTGETGVT 359
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 74/184 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+GS G +G +GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 188 TGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 247
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G + G +G G +G GP+G G +G G +G + G
Sbjct: 248 TGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGE 307
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 308 TGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 367
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 368 TGVT 371
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 78/191 (40%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ +GP+GS G +G GP+G+ G +G + G +G
Sbjct: 205 NTGPTGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTG 264
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 265 STGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATG 324
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLG 185
S G +G G +G G +G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 325 STGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTG 384
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 385 STGPTGETGVT 395
Score = 73.2 bits (178), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/181 (25%), Positives = 72/181 (39%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +GS GP+G+ G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 156 GNTGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVT 215
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ +GP+G G +G GP+G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 216 GNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGAT 275
Query: 137 RYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
GP+G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 276 GSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGAT 335
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 336 G 336
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/180 (26%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLR 74
GP+G G +G GP+G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 472 ATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETG 531
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 532 ATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTG 591
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 592 ATGETGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATG 651
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/165 (29%), Positives = 68/165 (41%), Gaps = 9/165 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+GS G +G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 706 NTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGETGVTGNT---GPTG 762
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G + G +G G +G S G
Sbjct: 763 ETGVTGSTGATGNTGPTGET---GATGETGATGSTGVIGSTGATGNTGATGNTGATGSTG 819
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
P+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 820 PTGNTGATGSTGATGNTGPTGE---TGPTGSTGVTGNTGATGSTG 861
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/160 (26%), Positives = 61/160 (38%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 96
GP+G G +G GP+G G +G G +GS G P+G G
Sbjct: 476 TGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGS 535
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 536 TGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTGNTGATGE 595
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 596 TGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGSTGAT 635
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/166 (26%), Positives = 69/166 (41%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS G +G+ G +G G +G+ GP+G G +G GP+G+
Sbjct: 44 TGSTGATGETGATGPTGATGETGSTGNTGATGATGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGNTGA 103
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+G +G G +G GP+G G +G GP+G + GP+G +G +G
Sbjct: 104 MGNTGPTGETGVTGST---GPTGSTGATGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGA 160
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 161 TGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNT 206
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 73/188 (38%), Gaps = 15/188 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G+ G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 47 TGATGETGATGPTGATGETGSTGNTGATG------ATGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGN 100
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GR 126
+G +G G +G GP+G G +G GP+G GP+ G
Sbjct: 101 TGAMGNTG---PTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGN 157
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 158 TGATGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGN 217
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G +G
Sbjct: 218 TGATGAIG 225
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 73/185 (39%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G GP+G+ G +G + G +GS G +G GP+G
Sbjct: 224 IGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGE 283
Query: 73 LRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G +
Sbjct: 284 TGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGN 343
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 344 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 403
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 404 TGVTG 408
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 74/191 (38%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G G +G+ G +GS G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 253 NTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATG 312
Query: 72 RLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 313 STGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTG 372
Query: 129 SDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S GP+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 373 STGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATG 432
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 433 NTGPTGETGVT 443
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/182 (25%), Positives = 70/182 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS G +G GP+G G +G + G +G G +G
Sbjct: 215 TGNTGATGAIGPTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGA 274
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 275 TGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGA 334
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 335 TGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGV 394
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 395 TG 396
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/152 (26%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G G +G+ G +G G +G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 44 TGSTGATGETGATGPTGATGETGSTGNTGATGATGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGNTGA 103
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
+G +G G +G GP+G + G +G GP+G GP+G +G +G
Sbjct: 104 MGNTGPTGETGVTGST---GPTGSTGATGNTGVTGSTGPTGETGATGPTGSTGAIGNTGA 160
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G
Sbjct: 161 TGETGSTGNTGPTGATGATGSTGPTGSTGVTG 192
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/209 (24%), Positives = 71/209 (33%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------- 62
GP+G G +G G +GS G +G GP+G G +G
Sbjct: 398 TGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGN 457
Query: 63 --------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 458 TGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGS 517
Query: 109 LRYLG---PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G P+G G +G S GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 518 TGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGN 577
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 578 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATG 606
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/190 (25%), Positives = 72/190 (37%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G + G +GS G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 242 TGPTGNTGVTGNTGPIGETGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGN 301
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNS 129
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G S
Sbjct: 302 TGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGS 361
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGP 186
GP+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 362 TGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGS 421
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G +
Sbjct: 422 TGPTGNTGAT 431
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 67/177 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 271 NTGATGSTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATG 330
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 331 NTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTG 390
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 391 ETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTG 447
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/210 (24%), Positives = 73/210 (34%), Gaps = 27/210 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 379 NTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTG 438
Query: 72 RLRYLGPSG------------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G + GP+G G +G GP+G
Sbjct: 439 ETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTG 498
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
G +G G +G S GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 499 ETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTG 558
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G
Sbjct: 559 NTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGSTGVTG 588
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/222 (24%), Positives = 77/222 (34%), Gaps = 30/222 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG 68
N G +G G +G G +GS G +G GP+G+ G P+G G
Sbjct: 301 NTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTG 360
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 361 STGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTG 420
Query: 129 SDGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSG------------------------RLRYLGPSG 161
S GP+G G P+G G +G GP+G
Sbjct: 421 STGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTG 480
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 481 EAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTG 522
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/214 (24%), Positives = 73/214 (34%), Gaps = 30/214 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 69
GP+G G +G G +GS G +G GP+G G P+G G
Sbjct: 350 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGS 409
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------- 107
+G G +GS G +G GP+G G +G
Sbjct: 410 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGP 469
Query: 108 --RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGR 162
GP+G G +G S GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 470 TGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGE 529
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 530 TGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGNTGAT 563
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/205 (23%), Positives = 71/205 (34%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 362 TGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGS 421
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------RLRYLGPSGR 108
G +G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 422 TGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTGE 481
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G GP+G S G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 482 AGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGS 541
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G +G G +G
Sbjct: 542 TGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNT 566
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/210 (23%), Positives = 72/210 (34%), Gaps = 27/210 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 343 NTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 402
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------------- 116
G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 403 NTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTG 462
Query: 117 ---------RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-- 165
GP+G + G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 463 STGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGSTGETGATGSTGVTG 522
Query: 166 -LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 523 STGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATG 552
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/215 (23%), Positives = 73/215 (33%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +GS G +G G +G+ GP+G G
Sbjct: 290 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGS 349
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 350 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGS 409
Query: 130 DGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------- 161
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 410 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGP 469
Query: 162 --RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 470 TGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATG 504
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/213 (24%), Positives = 75/213 (35%), Gaps = 24/213 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 331 NTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGST---GPTGNTGVTGSTG 387
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 388 PTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTG 447
Query: 132 PSG---------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
P+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 448 PTGSTGVTGNTGTTGSTGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTG 507
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G + V+G
Sbjct: 508 STGETGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGVTG 540
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/215 (23%), Positives = 72/215 (33%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 281 TGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGNTGATGETGP 340
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 341 TGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 400
Query: 133 SGRLRYLG---PSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSG------------- 170
+G G P+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 401 TGNTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGT 460
Query: 171 -----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G
Sbjct: 461 TGSTGNTGPTGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGSTG 495
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/98 (25%), Positives = 37/98 (37%), Gaps = 6/98 (6%)
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G S G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 44 TGSTGATGETGATGPTGATGETGSTGNTGATGATGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGNTGA 103
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 104 MG------NTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGNTGVTG 135
>gi|190694421|gb|ACE88777.1| polymorphic mucin variant C11/1/18r2 [Schistosoma mansoni]
Length = 414
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/162 (34%), Positives = 74/162 (45%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 180
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/162 (34%), Positives = 74/162 (45%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
P+G L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 180
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/155 (34%), Positives = 72/155 (46%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 26 PTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLA 85
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G
Sbjct: 86 SDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
L P+G L P+G L P+G L P+
Sbjct: 146 DLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPT 180
Score = 83.6 bits (205), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/156 (35%), Positives = 72/156 (46%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 19 GDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASD 78
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
P+G L P+G L P+G L P+G L SD P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 79 KPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 138
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G L P+G L P+G L P+G L
Sbjct: 139 ASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDLASDKPTGDL 174
>gi|296451979|ref|ZP_06893694.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP08]
gi|296259170|gb|EFH06050.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP08]
Length = 561
Score = 84.7 bits (208), Expect = 2e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/190 (28%), Positives = 89/190 (46%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+GS GP+G + G +G
Sbjct: 154 TGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGV 213
Query: 73 ------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+ GP+G+ +GP+G + GP G + GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 214 TGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGA 273
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
++G G G +G +GP+G + GP+G +GP+G G +G GP
Sbjct: 274 TGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPTGTVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGA---TGP 330
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G + G +
Sbjct: 331 TGAVGATGAT 340
Score = 82.8 bits (203), Expect = 7e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/199 (27%), Positives = 86/199 (43%), Gaps = 15/199 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 127 TGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGV 186
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+GS GP+G + G +G + GP+G +GP+G + GP G
Sbjct: 187 TGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGV 246
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ GP+G G +G + GP+G G +G +GP+G + GP
Sbjct: 247 IGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPTGTVGATGP 306
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G G +
Sbjct: 307 TGADGAVGPTGATGATGAN 325
Score = 82.8 bits (203), Expect = 8e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 81/184 (44%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 99 NTGATGANGITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTG 158
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G GP+G GP+G + G +G + G
Sbjct: 159 LTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATG 218
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P + GP+G +GP+G + GP G + GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 219 P---IGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATG 275
Query: 192 YLGL 195
GL
Sbjct: 276 ANGL 279
Score = 81.6 bits (200), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 88/192 (45%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+GS GP+G + G +G GP + GP+G
Sbjct: 172 TGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGP---IGATGPTGA 228
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLNS 129
+GP+G++ GP G + GP+G G +G + GP+G +GP+G
Sbjct: 229 DGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPT-- 286
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G +G +GP+G + GP+G +GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 287 -GATGVAGAIGPTGTVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGATGPTGAVGATGATGVAGP 345
Query: 184 LGPSGRLRYLGL 195
+GP+G G+
Sbjct: 346 IGPTGPTGANGV 357
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/202 (27%), Positives = 85/202 (42%), Gaps = 18/202 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRY------LGPSGSLRYLGP 60
GP+G + GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ G
Sbjct: 61 TGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATGA 120
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 121 NGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGA 180
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G S GP+G GP+G + G +G + GP+G +GP+G +
Sbjct: 181 TGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGA 240
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + GP+G G +
Sbjct: 241 TGPDGVIGPTGPTGATGATGAN 262
Score = 79.3 bits (194), Expect = 8e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 84/187 (44%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 109 TGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGA 168
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G GP+G + G +G GP + + GP
Sbjct: 169 NGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGP---IGATGP 225
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGR 189
+G +GP+G + GP G + GP+G G +G + GP+G +GP+G
Sbjct: 226 TGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGP 285
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 286 TGATGVA 292
Score = 75.9 bits (185), Expect = 9e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 77/176 (43%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 94 TGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGA 150
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G + + G
Sbjct: 151 TGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGA 210
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP + GP+G +GP+G + GP G + GP+G G +G
Sbjct: 211 NGVTGATGP---IGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANG 263
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 77/182 (42%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G++ GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 46 TGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANG---ITGPTGN 99
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 100 TGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGP 156
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 157 TGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGA 216
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 217 TG 218
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 78/184 (42%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G GP+G + GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 37 TGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANG- 92
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 93 --ITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGN 147
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 148 TGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGA 207
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 208 TGAN 211
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/202 (26%), Positives = 89/202 (44%), Gaps = 21/202 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G G +G + GP+G+ +GP+G + GP G + GP+G G +G
Sbjct: 205 VGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGL 264
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G+ G G G +G +GP+G + GP+G +GP+G + G
Sbjct: 265 VGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPTGTVGATGPTGADGAVGPTGATGATGA 324
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRY 174
+G GP+G + G +G +GP+G G P+G +
Sbjct: 325 NGA---TGPTGAVGATGATGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGPTGAVGA 381
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G +GP+G G++
Sbjct: 382 TGANGVAGPIGPTGPTGANGVT 403
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 93/213 (43%), Gaps = 27/213 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G++ GP G +GP+G G +G+ +GP+G G +G
Sbjct: 223 TGPTGADGEVGPTGAVGATGPDG---VIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGL 279
Query: 73 LRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ GP+G+ +GP+G + GP+G +GP+G G +G GP+G + +
Sbjct: 280 VGPTGPTGATGVAGAIGPTGTVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGAT---GPTGAVGA 336
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G +GP+G G P+G + G +G +GP+G
Sbjct: 337 TGATGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGP 396
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G G +G G + +G+
Sbjct: 397 TGANGVTGATGNTGATGANGATGPTGATGATGV 429
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/179 (25%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 15/179 (8%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY----- 93
G +G GP+G+ G +G GP+G + GP+G+ GP+G
Sbjct: 36 ATGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANG 92
Query: 94 -LGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
GP+G GP+G G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 93 ITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATG 152
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G + + +G +
Sbjct: 153 ATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGAN 211
>gi|229192724|ref|ZP_04319683.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
gi|228590814|gb|EEK48674.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
Length = 358
Score = 84.0 bits (206), Expect = 3e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 79/176 (44%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ G +G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 7 TGPTGATGSTGPTGATGITGATGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGA 66
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G + GP+G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 67 TGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGST---GPTGATGPTGATGSTGATGI 123
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 124 TGSTGLTGPTGATGITGATGS---TGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTG 176
Score = 84.0 bits (206), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 78/177 (44%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
++ GP+G+ GP+G+ G +G GP+GS GP+G GP+G G
Sbjct: 3 KVGPTGPTGATGSTGPTGATGITGATGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTG 62
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
P+G+ GP+G GP+G + GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 63 PTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGST---GPTGATGPTGATGSTG 119
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 120 ATGITGSTGLTGPTGATGITGATGS---TGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITG 173
Score = 81.6 bits (200), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G+ GP+GS GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 15 STGPTGATGITGATGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTG 74
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G++ GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 75 ATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGPTGATGSTGATGITGSTGLTGPTG 134
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 135 ATGITGATGSTGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTGPTGPTGATGITGATGPTG 194
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 195 ATGITGAT 202
Score = 80.5 bits (197), Expect = 4e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 82/191 (42%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G + GP+G
Sbjct: 33 STGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTG 92
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSG 125
G +GS GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 93 ATGSTGATGS---TGPTGATGPTGATGSTGATGITGSTGLTGPTGATGITGATGSTGPTG 149
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 150 STGATGSTGATGSTGPTGATGITGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATG 209
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P+G G +
Sbjct: 210 PTGATGSTGAT 220
Score = 77.4 bits (189), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 79/184 (42%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG--- 68
+ GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G++ GP+G G
Sbjct: 42 STGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATG 101
Query: 69 ---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G +GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 102 STGPTGATGPTGATGSTGATGITGSTGLTGPTGATGITGATGS---TGPTGSTGATGSTG 158
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 159 ATGSTGPTGATGITGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGSTG 218
Query: 186 PSGR 189
+G
Sbjct: 219 ATGT 222
Score = 72.8 bits (177), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/139 (30%), Positives = 61/139 (43%), Gaps = 3/139 (2%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 7 TGPTGATGSTGPTGATGITGATGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGA 66
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G S GP+G + GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 67 TGSTGPTGATGSTGPTGAIGSTGPTGATGSTGATGST---GPTGATGPTGATGSTGATGI 123
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G +
Sbjct: 124 TGSTGLTGPTGATGITGAT 142
>gi|52140776|ref|YP_086053.1| hypothetical protein BCZK4476 [Bacillus cereus E33L]
gi|51974245|gb|AAU15795.1| collagen-like protein [Bacillus cereus E33L]
Length = 815
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 73/183 (39%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+GS G +G G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 403 NTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATGSTG 462
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 463 ETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETG 522
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 523 ETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGETG 582
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 583 STG 585
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 76/195 (38%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 448 NTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTG 507
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +G G +G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 508 NTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTG 567
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 568 STGPTGNTGPTGETGSTGSTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTG 627
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 628 ATGVTGPTGSTGVTG 642
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 72/182 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+GS G +G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 395 TGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGE 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 455 TGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGN 514
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 515 TGPTGETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGN 574
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 575 TG 576
Score = 77.8 bits (190), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/192 (27%), Positives = 76/192 (39%), Gaps = 3/192 (1%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSG 71
P+G G +G+ GP+G G +G GP+G G P+G G +G
Sbjct: 37 PTGMTGITGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGSTGNTG 96
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G GP+G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 97 ATGETGPTGSTGATGSTGVTGSTGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTG 156
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 157 PTGETGVTGSTGVTGPTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTG 216
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 217 PTGETGSTGVTG 228
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 74/185 (40%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+GS G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 83 TGPTGETGSTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGSTGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGN 142
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNS 129
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G S
Sbjct: 143 TGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTGPTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGS 202
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 203 TGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGN 262
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 263 TGATG 267
Score = 76.6 bits (187), Expect = 6e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 74/188 (39%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +G GP+G G P+G G +G+ GP+G G
Sbjct: 52 NTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGSTGNTGATGETGPTGSTGATG 111
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 112 STGVTGSTGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTG 171
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 172 PTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTG 231
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 232 ATGSTGVT 239
Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/187 (26%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 467 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGV 526
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG- 131
G +G+ G +G GP+G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 527 TGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGETGSTGS 586
Query: 132 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 587 TGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGATGVTGPTGSTGVTGSTGP 646
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 647 TGSTGAT 653
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G P+G G +G+ GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 70 NTGPTGETGVTGSTGPTGETGSTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGSTGPTGNTGPTG 129
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 130 ETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTGPTGATGNTGATGSTGVTG 189
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 190 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTG 249
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 250 ETGVTG 255
Score = 73.2 bits (178), Expect = 6e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/190 (25%), Positives = 72/190 (37%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G P+G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 425 TGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGN 484
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 485 TGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGA 544
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 545 TGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGETGSTGSTGATGSTGVTGNTGATGE 604
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G +
Sbjct: 605 TGPTGSTGAT 614
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/173 (27%), Positives = 69/173 (39%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G+ GP+G GP+GS G +G G +G GP+G+ GP+G
Sbjct: 395 TGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGE 454
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 455 TGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGN 514
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G +G G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 515 TGPTGETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTG 567
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 71/180 (39%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 479 TGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGST---GPTGNTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTGN 535
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 536 TGATGSTGATGNTGPTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGETGSTGSTGATGSTGV 595
Query: 133 SGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G P+G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 596 TGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGATGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGA 655
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 69/182 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 119 TGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTGPTGATGN 178
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 179 TGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGV 238
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 239 TGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGE 298
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 299 TG 300
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/172 (26%), Positives = 68/172 (39%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G P+G+ G +G G +G G +G+ G +G G
Sbjct: 490 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTGNTGATGSTGATGNTG 549
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G GP+G+ G +G GP+G +G G +G G +G
Sbjct: 550 PTGETGATGPTGATGVTGSTGPTGNTGPTGE------TGSTGSTGATGSTGVTGNTGATG 603
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 604 ETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGATGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGA 655
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/197 (26%), Positives = 76/197 (38%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 110 TGSTGVTGSTGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGV 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G GP+G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 170 TGPTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGS 229
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 230 TGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGA 289
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G + V+G
Sbjct: 290 TGNTGATGETGSTGVTG 306
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 101 TGPTGSTGATGSTGVTGSTGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGE 160
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G GP+G G GP+G + G
Sbjct: 161 TGVTGSTGVTGPTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTG------STGPTGNTGATGN 214
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 215 TGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGE 274
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 275 TGVT 278
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 73/190 (38%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 161 TGVTGSTGVTGPTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGE 220
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 221 TGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGS 280
Query: 130 DGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 281 TGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGP 340
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 341 TGATGSTGVT 350
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 137 TGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTGPTGATGNTGATGSTGVTGNTGPTGE 196
Query: 73 LRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G P+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G S
Sbjct: 197 TGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGS 256
Query: 130 DGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 257 TGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGA 316
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 317 TGSTGVTG 324
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G GP+G+ G +G G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 190 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGSTGATGSTGVTGPTG---VTG 246
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 247 PTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTG 306
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 307 STGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGE---TGPTG 363
Query: 189 RL 190
Sbjct: 364 ST 365
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/222 (23%), Positives = 75/222 (33%), Gaps = 39/222 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS G +G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 292 NTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTG 351
Query: 72 R---LRYLGPSGS------------------------------------LRYLGPSGRLR 92
GP+GS GP+G
Sbjct: 352 NTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTG 411
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G +G G +G GP+G + GP+G G +G GP+G
Sbjct: 412 STGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTG 471
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 472 ETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATG 513
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/204 (25%), Positives = 77/204 (37%), Gaps = 15/204 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------LGPSGSLRYLGPSG 62
N GP+G G P+G+ G +G GP+G GP+G+ G +G
Sbjct: 124 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGSTGVTGPTGATGNTGATG 183
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G G +GS G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 184 STGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGSTGVTGS---TGATGSTGVTG 240
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P+G G +G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 241 PTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETG 300
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G + V+G
Sbjct: 301 STGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTG 324
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/221 (23%), Positives = 77/221 (34%), Gaps = 36/221 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------------ 60
G +G G +G+ GP+G+ G +G G +G GP
Sbjct: 320 TGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGA 379
Query: 61 ------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G GP+G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 380 TGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGP 439
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 440 TGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGV 499
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G +G GP+G G++ V+G
Sbjct: 500 TGSTGPTGN------TGATGNTGPTGETGETGVTGSTGVTG 534
Score = 59.7 bits (143), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/221 (23%), Positives = 74/221 (33%), Gaps = 36/221 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---------PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS G +G
Sbjct: 268 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 327
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------- 100
G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 328 ATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGATGATGATG 387
Query: 101 -----RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
G +G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 388 ATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGPTGATG 447
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 448 NTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETGVTGSTGPTGNTGAT 488
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 62/157 (39%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS G +GS GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 214 NTGPTGETGSTGVTGST---GATGSTGVTGPTGVTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTG 270
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 271 PTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATG 330
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 331 STGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGSTGP 367
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/218 (23%), Positives = 73/218 (33%), Gaps = 36/218 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 260 TGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGS 319
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-------------- 118
G +G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 320 TGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGA 379
Query: 119 ----------RYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRY------ 156
GP+G + GP+G GP +G GP+G
Sbjct: 380 TGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVTGSTGP 439
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 440 TGPTGATGNTGPTGETGATGSTGETGETGPTGETGVTG 477
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/215 (23%), Positives = 73/215 (33%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 245 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGATGETGSTGV 304
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---S 129
G +GS G +G G +G G +G G +G GP+G S
Sbjct: 305 TGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGSTGVTGNTGPTGETGPTGS 364
Query: 130 DGP------------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP +G GP+G GP+G G
Sbjct: 365 TGPTGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGVTGSTGPTGSTGETGE 424
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 425 TGPTGETGVTGSTGPTGPTGATGNTGPTGETGATG 459
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/208 (23%), Positives = 73/208 (35%), Gaps = 27/208 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 230 TGATGSTGVTGPTG---VTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGN 286
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G S
Sbjct: 287 TGATGNTGATGETGSTGVTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGATGS 346
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 347 TGVTGNTGPTGETGPTGSTGPTGNTGATGNTGATGATGATGATGSTGPTGNTGATGNTGP 406
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G +G G++
Sbjct: 407 TGVTGSTGPTGSTGETGETGPTGETGVT 434
>gi|296879503|ref|ZP_06903491.1| collagen triple helix repeat protein, partial [Clostridium
difficile NAP07]
gi|296429495|gb|EFH15354.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP07]
Length = 252
Score = 83.6 bits (205), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 81/184 (44%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 42 NTGATGANGITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTG 101
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G GP+G GP+G + G +G + G
Sbjct: 102 LTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATG 161
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P + GP+G +GP+G + GP G + GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 162 P---IGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATG 218
Query: 192 YLGL 195
GL
Sbjct: 219 ANGL 222
Score = 83.6 bits (205), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/202 (27%), Positives = 85/202 (42%), Gaps = 18/202 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLG------PSGSLRYLGP 60
GP+G + GP+G+ GP+G+ G P+G G P+G+ G
Sbjct: 4 TGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATGA 63
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 64 NGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGA 123
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G S GP+G GP+G + G +G + GP+G +GP+G +
Sbjct: 124 TGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGA 183
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + GP+G G +
Sbjct: 184 TGPDGVIGPTGPTGATGATGAN 205
Score = 82.4 bits (202), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 83/186 (44%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 70 TGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGV 129
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS GP+G + G +G GP + GP+G +GP+G + + GP
Sbjct: 130 TGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGP---IGATGPTGADGEVGPTGAVGATGP 186
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRY---LGPSGRLRY 183
G + GP+G G +G + GP+G GP+G +GP+G +
Sbjct: 187 DGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAIGPTGTVGA 246
Query: 184 LGPSGR 189
GP+G
Sbjct: 247 TGPTGA 252
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 84/187 (44%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 52 TGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGA 111
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G GP+G + G +G GP + + GP
Sbjct: 112 NGITGPTGNTGATGANGVTGSTGPTGSTGATGPTGAVGATGANGVTGATGP---IGATGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGR 189
+G +GP+G + GP G + GP+G G +G + GP+G +GP+G
Sbjct: 169 TGADGEVGPTGAVGATGPDGVIGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGP 228
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 229 TGATGVA 235
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.041, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/114 (26%), Positives = 46/114 (40%), Gaps = 3/114 (2%)
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G + GP+G GP+G G +G + G +G GP+G G
Sbjct: 3 ITGPTGNMGATGPNGATGSTGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATG 62
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G GP+G G +G G +G GP+G G + ++G
Sbjct: 63 ANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITG 116
>gi|196032756|ref|ZP_03100169.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus W]
gi|195994185|gb|EDX58140.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus W]
Length = 1297
Score = 83.2 bits (204), Expect = 5e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 75/186 (40%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G +GS G +G +GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 696 NTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTG 755
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 756 STGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTG 815
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 816 PTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTG 875
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 876 NTGVTG 881
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLR 65
N GP+G G +GS G +GS G +G GP+GS G +G
Sbjct: 240 NTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTG 299
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G +GP+GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 300 VTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTG 359
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 360 VTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTG 419
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P+G G
Sbjct: 420 PTGSTGVTG 428
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLR 65
N GP+G G +GS G +GS G +G GP+GS G +G
Sbjct: 663 NTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTG 722
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G +GP+GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 723 VTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTG 782
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 783 VTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTG 842
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P+G G
Sbjct: 843 PTGSTGVTG 851
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G++ GP+GS G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 202 TGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGN 261
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G G +G G +G +GP+G + G
Sbjct: 262 TGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGE 321
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 322 TGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 381
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 382 TGETGAT 388
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 74/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 601 TGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGA 660
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 661 IGNTGPTGSTGETGVTGS---TGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGA 717
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G +GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 718 TGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGA 777
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 778 TG 779
Score = 80.9 bits (198), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/185 (27%), Positives = 73/185 (39%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G +GS G +G +GP+G
Sbjct: 684 NTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATG------NTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTG 737
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS GP+G G +G GP+G G +G G +G + G
Sbjct: 738 STGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATG 797
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 798 NTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTG 857
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 858 STGAT 862
Score = 79.3 bits (194), Expect = 9e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/200 (26%), Positives = 77/200 (38%), Gaps = 15/200 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 591 NTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTG 650
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
G +G++ GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 651 ETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTG 710
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G S G +G +GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 711 ATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETG 770
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G +G G +
Sbjct: 771 PTGSTGATGSTGVTGNTGAT 790
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 74/191 (38%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +G++ GP+GS G P+G G +G G +G
Sbjct: 646 TGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGP 705
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +GS G +G +GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 706 TGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGA 765
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 766 TGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGS 825
Query: 184 LGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 826 TGPTGNTGATG 836
Score = 78.6 bits (192), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/185 (27%), Positives = 74/185 (40%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 936 NTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATG 995
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 996 STGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGPTG---STG 1052
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G GP+G G +G +G +G GP+G
Sbjct: 1053 VTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSIGATGATGSTGPTGSTG 1112
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 1113 ATGAT 1117
Score = 77.8 bits (190), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + GP+GS G +GS +G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 211 TGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGV 270
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G G +G G +G +GP+G G +G + GP
Sbjct: 271 TGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGP 330
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 331 TGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGN 390
Query: 190 L 190
Sbjct: 391 T 391
Score = 77.4 bits (189), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/221 (25%), Positives = 81/221 (36%), Gaps = 30/221 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGP 69
+GP+G G +GS GP+GS G +G GP+GS G +G G
Sbjct: 733 IGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGS 792
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+GS G +G G +G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 793 TGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGS 852
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSGR 162
GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 853 TGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGS 912
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G +G G++ V+G
Sbjct: 913 TGVTGNTGATGATGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTG 953
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 75/195 (38%), Gaps = 12/195 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GP+G G +GS +G P+GS G P+G G +G G +G
Sbjct: 219 NTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTG 278
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G G +GS G +G +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 279 ATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTG 338
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 339 NTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETG 398
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 399 VTGSTGPTGNTGATG 413
Score = 77.0 bits (188), Expect = 5e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 73/182 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G++ GP+G G +GS +G +G G +G
Sbjct: 193 TGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGV 252
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G G +G G +G + GP
Sbjct: 253 TGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGP 312
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 313 TGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGA 372
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 373 TG 374
Score = 75.9 bits (185), Expect = 9e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 74/186 (39%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +GS G +GS G +G GP+GS G +G G
Sbjct: 570 NTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTG 629
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +G GP+G G +G + GP+G G +G GP+G
Sbjct: 630 VTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGST---GPTGNTG 686
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G G +G G +G G +G G +G +GP+G G +G
Sbjct: 687 ATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETG 746
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 747 STGNTG 752
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/185 (27%), Positives = 75/185 (40%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G + GP+GS G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 562 TGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGN 621
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ G +G GP+G G +G + GP+G G +G S
Sbjct: 622 TGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTG---S 678
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G +GP+G
Sbjct: 679 TGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGS 738
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 739 TGATG 743
Score = 75.1 bits (183), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 67/168 (39%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
S G +G GP+G G +G++ GP+G G +G +G +G G
Sbjct: 189 STGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTG 248
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
+G GP+G G +G G +G G +G + G +G G +G
Sbjct: 249 ETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATG 308
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 309 AIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATG 356
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G++ GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 637 TGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGST---GPTGNTGATGSTGV 693
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G G +G G +G +GP+G G +G + GP
Sbjct: 694 TGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGP 753
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 754 TGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGN 813
Query: 190 L 190
Sbjct: 814 T 814
Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/212 (25%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 30/212 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS G +GS GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 724 TGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGV 783
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 784 TGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGP 843
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-------------------------- 163
+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 844 TGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGV 903
Query: 164 -RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 904 TGSTGPTGSTGVTGNTGATGATGPTGETGVTG 935
Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 954 NTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGVTGSTGATGNTGATG 1013
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 1014 STGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNT---G 1070
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G G +G +G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1071 ATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSIGATGATGSTGPTGSTGATGATGS---TGPTGSTG 1127
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 1128 ATGV 1131
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/176 (26%), Positives = 69/176 (39%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G GP+G G +G + GP+GS G +G +G +G G +G
Sbjct: 192 ATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETG 251
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G +G
Sbjct: 252 VTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIG 311
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G +G GP+G G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 312 PTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGAT 367
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 73/187 (39%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G GP+G G +G + GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 628 TGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGST---GPTGN 684
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G G +G G +G +GP+G + G
Sbjct: 685 TGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGE 744
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 745 TGSTGNTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 804
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 805 TGETGAT 811
Score = 73.6 bits (179), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 77/184 (41%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G++ GP+GS G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 553 TGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGST---GPTG---NTGATGSTGVTGNTGS 606
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G +G G +G GP+G G +G + + GP
Sbjct: 607 TGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGP 666
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 667 TGSTGETGVTGS---TGPTGN---TGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGS 720
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 721 TGVT 724
Score = 72.8 bits (177), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/216 (25%), Positives = 75/216 (34%), Gaps = 33/216 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ GP+GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 750 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGETG 809
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 810 ATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATG 869
Query: 129 SDGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 870 ETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGATGPTG 929
Query: 162 RLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 930 ETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATG 965
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/193 (25%), Positives = 73/193 (37%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ GP+G G P+G G +G GP+G G
Sbjct: 907 TGPTGSTGVTGNTGATGATGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGN 966
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G G +G G +G G +G G +G S
Sbjct: 967 TGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGS 1026
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1027 TGPTGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGV 1086
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
G +G +G +
Sbjct: 1087 TGSTGATGSIGAT 1099
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLR 83
S G +G GP+G G +G++ GP+G G +G G +GS
Sbjct: 540 STGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTG 599
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G G +G
Sbjct: 600 VTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTG 659
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 660 AIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATG 713
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/216 (24%), Positives = 74/216 (34%), Gaps = 36/216 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +G G +G GP+G GP+GS G +G G
Sbjct: 813 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETG 872
Query: 69 PSGRL---------------------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 873 PTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGATGPTGETG 932
Query: 102 Y---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G G +G GP+G + G +G G +G G +G G
Sbjct: 933 VTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTG 992
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 993 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGS---TGPTGNTGATG 1025
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/207 (25%), Positives = 74/207 (35%), Gaps = 24/207 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP-------- 60
N G +G GP+GS GP+GS G +G GP+G+ G
Sbjct: 831 NTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETG 890
Query: 61 ----------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 107
+G GP+G G +G+ GP+G GP+G G +G
Sbjct: 891 VTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGATGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTG 950
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 951 VTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGVTGSTGATGNTG 1010
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G G
Sbjct: 1011 ATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATG 1037
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/161 (27%), Positives = 65/161 (40%), Gaps = 6/161 (3%)
Query: 36 SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
S G +G GP+G G +G + GP+G G +GS GP+G G
Sbjct: 540 STGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGS---TGPTGN---TG 593
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
+G G +G GP+G G +G S G +G G +G GP+G
Sbjct: 594 ATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGPTGETG 653
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G + GP+G G +G G +G G++
Sbjct: 654 ATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVT 694
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/212 (24%), Positives = 73/212 (34%), Gaps = 30/212 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------------------------- 46
G +G GP+GS G +G+ GP+G
Sbjct: 844 TGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGV 903
Query: 47 -RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
GP+GS G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 904 TGSTGPTGSTGVTGNTGATGATGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGA 963
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G G +G + G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 964 TGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 1023
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1024 TGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTG 1055
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/171 (23%), Positives = 62/171 (36%), Gaps = 27/171 (15%)
Query: 51 PSGSLRYL---------------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+GS+ + GP+G G +G + GP+GS
Sbjct: 168 PTGSIGAMGTTGATGETGPTGSTGATGSTGVTGSTGPTGETGATGSTGAIGNTGPTGSTG 227
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G +G +G G +G GP+G G +G + G +G G +G
Sbjct: 228 ETGATGSTGAIGNTGPTGSTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGVTGNTGSTGATGPTGSTG 287
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 288 ATGNTGATGSTGVTGNTGATGAIGPTGSTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTG 338
>gi|15811172|gb|AAL08844.1|AF308673_2 cell surface mucin-like protein [Ehrlichia ruminantium]
Length = 351
Score = 82.4 bits (202), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/182 (24%), Positives = 67/182 (36%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
A+ P G + P GS+ P GS+ P G + P GS+ P G +
Sbjct: 145 AAVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSS 204
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G + P GS+ P G + P G + P G + P G + P G +
Sbjct: 205 PEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVV 264
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ P G + P G + P G + P G + P G + P G + P G
Sbjct: 265 TSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEG 324
Query: 189 RL 190
+
Sbjct: 325 SV 326
Score = 81.6 bits (200), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/184 (24%), Positives = 67/184 (36%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
V+ + P G P GS+ P GS+ P G + P GS+ P G +
Sbjct: 134 VDTTVTNSPEGAAVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVT 193
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
P G + P GS+ P G + P G + P G + P G + P G
Sbjct: 194 SSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGS 253
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ + P G + P G + P G + P G + P G + P G + P
Sbjct: 254 VVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSP 313
Query: 187 SGRL 190
G +
Sbjct: 314 EGSV 317
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/124 (25%), Positives = 46/124 (37%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ P G + P GS+ P GS+ P G + P GS+ P G +
Sbjct: 208 SVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSS 267
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G + P GS+ P G + P G + P G + P G + P G +
Sbjct: 268 PEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVVTSSPEGSVV 327
Query: 129 SDGP 132
+ P
Sbjct: 328 TSSP 331
>gi|163119293|ref|YP_078025.2| hypothetical protein BL03072 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
gi|145902799|gb|AAU22387.2| Hypothetical protein BL03072 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
Length = 1259
Score = 82.0 bits (201), Expect = 1e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 80/176 (45%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 271 TGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGA 327
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP+G +GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 328 TGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGP 387
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G +GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 388 TGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGA---TGPTGVTGATGPTG 440
Score = 77.8 bits (190), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 74/167 (44%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+G+ GP+G GP+G GP+G+ +GP+G
Sbjct: 270 VTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTG 326
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G GP+G +GP+G G +G G +G G
Sbjct: 327 ATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATG 386
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G +GP+G G +G GP+G GP+G G++
Sbjct: 387 PTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGATGPTGVT 433
Score = 76.6 bits (187), Expect = 5e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 77/174 (44%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 270 VTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTG 326
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G +G G +G GP+G +GP+G G +G G +G G
Sbjct: 327 ATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATG 386
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G +GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 387 PTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGA---TGPTGVTGATG 437
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/215 (26%), Positives = 86/215 (40%), Gaps = 30/215 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------------- 56
+GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G++
Sbjct: 205 MGPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG---VTGPTGAMGPTGATGATGATGATGA 261
Query: 57 --------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G G +G GP+G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 262 TGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGA 318
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+GP+G G +G G +G GP+G +GP+G G +G G
Sbjct: 319 TGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGS 378
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G GP+G +GP+G G + V+G
Sbjct: 379 TGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTG 413
Score = 67.4 bits (163), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/206 (26%), Positives = 81/206 (39%), Gaps = 33/206 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G + GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 199 TGPTGAM---GPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG---VTGPTGAMGPTGATGA 252
Query: 66 -----------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G G +G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 253 TGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGA---TGPTGA 309
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G +GP+G G +G G +G GP+G +GP+G G
Sbjct: 310 TGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGA 369
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G +G
Sbjct: 370 TGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMG 395
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/208 (26%), Positives = 85/208 (40%), Gaps = 39/208 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G++ GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 184 TGPTGVTGATGPTG---VTGPTGAM---GPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG- 236
Query: 73 LRYLGPSGSLR------------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G++ G +G G +G GP+G
Sbjct: 237 --VTGPTGAMGPTGATGATGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGA 294
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP+G + GP+G +GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 295 TGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGP 351
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G GP+G G++
Sbjct: 352 TGATGAMGPTGA---TGPTGATGPTGVT 376
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/207 (26%), Positives = 82/207 (39%), Gaps = 36/207 (17%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G GP+G GP+G + GP+G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 183 VTGPTGVTGATGPTG---VTGPTGAM---GPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG 236
Query: 81 SLRYLGPSGRLR------------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G + G +G G +G GP+G
Sbjct: 237 ---VTGPTGAMGPTGATGATGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTG 293
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP+G + GP+G GP+G +GP+G G +G G +G G
Sbjct: 294 ATGATGPTG---ATGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATG 350
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P+G +GP+G G + V+G
Sbjct: 351 PTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTG 377
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 148 LGPSGRLRYLGP 159
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 166 LGPSGRLRYLGP 177
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 34/72 (47%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G+ GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 112 LGPSGRLRYLGP 123
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTG---ATGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 157 LGPSGRLRYLGP 168
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 32/72 (44%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 130 DGPSGRLRYLGP 141
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.38, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 34/72 (47%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G+ +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 94 LGPSGRLRYLGP 105
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.81, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G GP+G GP+G GP+G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 76 LGPSGSLRYLGP 87
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.00, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 32/72 (44%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 121 LGPSGRLNSDGP 132
G +G GP
Sbjct: 688 TGATGPTGVTGP 699
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/66 (33%), Positives = 32/66 (48%), Gaps = 3/66 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G+ +GP+G G +G
Sbjct: 637 TGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGP 693
Query: 73 LRYLGP 78
GP
Sbjct: 694 TGVTGP 699
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/71 (30%), Positives = 32/71 (45%), Gaps = 3/71 (4%)
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 631 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 687
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 688 TGATGPTGVTG 698
>gi|196040783|ref|ZP_03108081.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
NVH0597-99]
gi|196028237|gb|EDX66846.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
NVH0597-99]
Length = 910
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/180 (27%), Positives = 73/180 (40%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 33 PTGMTGITGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTG 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G
Sbjct: 93 ATGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ G +G G +G G +G G +G G +G + +GP+G G
Sbjct: 153 SIGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATG 212
Score = 80.5 bits (197), Expect = 3e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 79/195 (40%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 48 NTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGATGSTG 107
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G G +G G +G GP+G + G +G S G
Sbjct: 108 ATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTG 167
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G G +G G +G + +GP+G GP+G G +G
Sbjct: 168 VTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGATGNTG 227
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 228 PTGETGATGSTGVTG 242
Score = 77.8 bits (190), Expect = 3e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 78/195 (40%), Gaps = 12/195 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GP+G G P+GS G P+GS G +G GP+GS G +G
Sbjct: 66 NTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTG 125
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G G +G+ GP+G + G +G G +G G +G G
Sbjct: 126 ATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTG 185
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G +G + +GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 186 STGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTG 245
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G +G
Sbjct: 246 ATGATGPTGSTGAIG 260
Score = 76.3 bits (186), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 76/182 (41%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 94 TGPTGSTGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGS 153
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G +G+ G +G G +G G +G G +G + +GP+G S G
Sbjct: 154 IGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTG---STGA 210
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 211 TGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGA 270
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 271 TG 272
Score = 76.3 bits (186), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 73/184 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 40 TGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGS 99
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G + + G
Sbjct: 100 TGATGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGS 159
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G + +GP+G G +G
Sbjct: 160 TGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGS 219
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 220 TGAT 223
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 77/184 (41%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ G +G G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 103 TGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGA 162
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G + +GP+G G +G S G
Sbjct: 163 TGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGA 222
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 223 TGN---TGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGE 279
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 280 TGVT 283
Score = 69.3 bits (168), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 75/182 (41%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+GS+ G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 130 TGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGE 189
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G++ +GP+G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 190 TGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGATGN---TGPTGETGATGSTGVTGNTGA 246
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G + GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 247 TGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGV 306
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 307 TG 308
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 73/188 (38%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---- 68
GP+G G +G+ G +G+ G +G GP+GS+ G +G G
Sbjct: 112 TGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTGVTGS 171
Query: 69 --PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G +GS GP+G + G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 172 TGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAI---GNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGATGNTGP 228
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G GP+G +G +G G +G G +G GP
Sbjct: 229 TGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGP 288
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 289 TGSTGATG 296
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 69/168 (41%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + G +G+ G +GS G +G G +G G +G + +GP+G
Sbjct: 148 TGPTGSIGATGSTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGS 207
Query: 73 LRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+GS G +G G +G G +G GP+G +G +G S
Sbjct: 208 TGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGS 267
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 268 TGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGP 315
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/169 (26%), Positives = 69/169 (40%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P+GS G +G G +G++ GP+G G +G G +GS+ G +G
Sbjct: 579 PTGSTGVTGSTG---ATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATG 635
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LG 149
GP+G G +G G +G G +G + G +G GP+G G
Sbjct: 636 STGPTGEAGATGSTGVTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATGETG 695
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
P+G G +G GP+G +GP+G G +G G+
Sbjct: 696 PTGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGV 744
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/173 (25%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 12/173 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G++ GP+G G +G G +GS+ G +G GP+G
Sbjct: 583 TGVTGSTGATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGPTGE 642
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G G +G GP+G G + GP
Sbjct: 643 AGATGSTGVTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATGET------GP 696
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G G +G GP+G G +GP+G G +G G
Sbjct: 697 TGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGATG------SIGPTGETGATGSTGVTGSTG 743
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/210 (24%), Positives = 75/210 (35%), Gaps = 27/210 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +G++ +GP+GS G P+G G +G G +G G
Sbjct: 183 NTGSTGETGPTGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTG 242
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+GS +G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 243 NTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPTG 302
Query: 129 SDGPSGRLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
S G +G GP +G GP+G G +G
Sbjct: 303 STGVTGNTGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATG 362
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G G
Sbjct: 363 STGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATG 392
Score = 60.5 bits (145), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/227 (21%), Positives = 75/227 (33%), Gaps = 42/227 (18%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G +G+ G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 477 NTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATG 536
Query: 72 RLR------------------------------------------YLGPSGSLRYLGPSG 89
G +GS G +G
Sbjct: 537 NTGPTGSTGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGPTGSTGVTGSTGATGNTG 596
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
+ GP+G G +G G +G + G +G S GP+G G +G G
Sbjct: 597 AMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGEAG 656
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 657 ATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATGETGPTGSTGVT 703
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/222 (22%), Positives = 76/222 (34%), Gaps = 39/222 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGR----------------------- 45
N GP+G G +G+ G +G+ GP+G
Sbjct: 513 NTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATG 572
Query: 46 -------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +GS G +G + GP+G G +G G +G + G +G
Sbjct: 573 AGGSTGPTGSTGVTGSTGATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETG 632
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-- 156
GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 633 ATGSTGPTGEAGATGSTGVTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATG 692
Query: 157 -LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G +GP+G G
Sbjct: 693 ETGPTGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATG 734
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/203 (24%), Positives = 72/203 (35%), Gaps = 27/203 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS G +G+ GP+G +G +G G +G G +G
Sbjct: 225 NTGPTGET---GATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETG 281
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SG 107
GP+GS G +G G +G GP +G
Sbjct: 282 VTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETG 341
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G S G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 342 VTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTG 401
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G GP+G
Sbjct: 402 VTGSTGATGNTGATGNTGPTGST 424
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/223 (24%), Positives = 79/223 (35%), Gaps = 39/223 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G + +GP+GS G P+GS G +G G +GS G +G GP
Sbjct: 193 TGSTGAIGNIGPTGSTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGP 252
Query: 70 SGRLRYLG---PSGSLRY---LGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G +G P+GS GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 253 TGSTGAIGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGVTGNTGA 312
Query: 121 LGP------------------------SGRLNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 153
GP +G S GP+G G +G G +G
Sbjct: 313 TGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGA 372
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 373 TGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGAT 415
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/205 (25%), Positives = 74/205 (36%), Gaps = 39/205 (19%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G +G+ G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 357 NTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATG 416
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSG 107
GP+GS GP+G GP +G GP+G
Sbjct: 417 NT---GPTGST---GPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTG 470
Query: 108 RLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
G +G G +G S G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 471 STGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATG 530
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G GP+G
Sbjct: 531 NTGATGN---TGPTGS---TGPTGE 549
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/205 (23%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS G +G GP+GS +G +G G +G
Sbjct: 214 TGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGAIGNTGPTGSTGATGN 273
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------ 114
G +G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 274 TGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGETGATGGTGVTGN 333
Query: 115 ------SGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G + G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 334 TGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGN 393
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G +G G +G
Sbjct: 394 TGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNT 418
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/205 (23%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 30/205 (14%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP+GS G +GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 340 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 399
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGP------------------------ 105
G +G+ G +G GP+G GP
Sbjct: 400 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGE 459
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G G +G S G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 460 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 519
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G GP+G
Sbjct: 520 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGST 544
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/221 (22%), Positives = 73/221 (33%), Gaps = 42/221 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 466 TGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGS 525
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------------------- 101
G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 526 TGATGNTGATGNTGPTGST---GPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGPTGS 582
Query: 102 --------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G + GP+G G +G S G +G + G +G GP+G
Sbjct: 583 TGVTGSTGATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGPTGE 642
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 643 AGATGSTGVTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTG 683
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/156 (25%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 21/156 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---------PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GP+G G +GS+ G +G+ GP+G G +G G +G
Sbjct: 600 NTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGPTGEAGATGSTGVTGEAGATG 659
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G G +G GP+G G GP+G G +G G
Sbjct: 660 STGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATG------ETGPTGSTGVTGNTGATGSTG 713
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
P+G G +GP+G G +G G
Sbjct: 714 PTGST------GATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTG 743
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/209 (22%), Positives = 71/209 (33%), Gaps = 33/209 (15%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G +G+ G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 460 TGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGS 519
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--------------------------- 108
G +GS G +G GP+G GP+G
Sbjct: 520 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGS---TGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGS 576
Query: 109 ---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G G +G + + GP+G G +G G +G + G +G
Sbjct: 577 TGPTGSTGVTGSTGATGNTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGS 636
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G +G G
Sbjct: 637 TGPTGEAGATGSTGVTGEAGATGSTGVTG 665
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/252 (21%), Positives = 79/252 (31%), Gaps = 63/252 (25%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------------------SGSLRYLGPSG 44
N GP+G GP+G GP +GS G +G
Sbjct: 417 NTGPTGST---GPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTG 473
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G +GS G +G G +G G +G+ GP+G G +G G
Sbjct: 474 VTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTG 533
Query: 105 PSGR---LRYLGPSGR------------------------------LRYLGPSGRLNSDG 131
+G GP+G G +G + G
Sbjct: 534 ATGNTGPTGSTGPTGETGATGPTGNTGTTGETGPTGATGAGGSTGPTGSTGVTGSTGATG 593
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G + GP+G G +G G +G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 594 NTGAMGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSIGPTGETGATGSTGPTGEAGATGSTGVTG 653
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 654 EAGATGSTGVTG 665
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/192 (23%), Positives = 65/192 (33%), Gaps = 33/192 (17%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +GS G +G G +GS G +G G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 339 ETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTG 398
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP----------------- 132
G +G G +G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 399 STGVTGSTGATGNTGATGNT---GPTGST---GPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTG 452
Query: 133 -------SGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 453 NTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATG 512
Query: 183 YLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 513 NTGPTGSTGVTG 524
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/235 (21%), Positives = 72/235 (30%), Gaps = 54/235 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGP------------------------SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 48
G +G GP +G GP+GS G +G
Sbjct: 304 TGVTGNTGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGS 363
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 364 TGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGS 423
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLNSDGPSGRLRY---LGP 141
GP+G GP +G S GP+G G
Sbjct: 424 ---TGPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGA 480
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 481 TGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGAT 535
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/178 (25%), Positives = 61/178 (34%), Gaps = 33/178 (18%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP-- 69
N GP+G G +G G +GS G +G GP+GS G +G GP
Sbjct: 261 NTGPTGSTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGVTGNTG---ATGPTG 317
Query: 70 ----------------------SGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
+G GP+GS G +G G +G G
Sbjct: 318 STGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTG 377
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+G G +G GP+G S G +G G +G GP+G GP
Sbjct: 378 VTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGSTGPTGETGATGP 435
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/230 (21%), Positives = 71/230 (30%), Gaps = 51/230 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP------------------------SGRLRY 48
GP+G G +G G +G+ GP +G
Sbjct: 286 TGPTGSTGATGSTGPTGSTGVTGNTGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGVTGS 345
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 346 TGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATGNTGPTGSTGVTGS 405
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------------------------SGR 144
G +G GP+G S GP+G GP +G
Sbjct: 406 TGATGNTGATGNTGPTG---STGPTGETGATGPTGSTGETGATGGTGVTGNTGPTGETGV 462
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 463 TGSTGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGATG 512
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/108 (27%), Positives = 42/108 (38%), Gaps = 9/108 (8%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLR 65
+A G +G G +GS G +G G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 642 EAGATGSTGVTGEAGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGPTGSTGATGETGPTGSTG 701
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G +G GP+GS G +GP+G G +G G
Sbjct: 702 VTGNTGATGSTGPTGSTGATG------SIGPTGETGATGSTGVTGSTG 743
>gi|404488100|ref|YP_006712206.1| hypothetical protein BLi00800 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
gi|52347101|gb|AAU39735.1| hypothetical protein BLi00800 [Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC
14580]
Length = 1292
Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 80/176 (45%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 289 TGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGA 345
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP+G +GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 346 TGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGP 405
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G +GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 406 TGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGA---TGPTGVTGATGPTG 458
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 74/167 (44%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+G+ GP+G GP+G GP+G+ +GP+G
Sbjct: 288 VTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTG 344
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G GP+G +GP+G G +G G +G G
Sbjct: 345 ATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATG 404
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G +GP+G G +G GP+G GP+G G++
Sbjct: 405 PTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGATGPTGVT 451
Score = 75.9 bits (185), Expect = 8e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 77/174 (44%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 288 VTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTG 344
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G +G G +G GP+G +GP+G G +G G +G G
Sbjct: 345 ATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATG 404
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G +GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 405 PTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGETGATGPTGA---TGPTGVTGATG 455
Score = 70.1 bits (170), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/215 (26%), Positives = 86/215 (40%), Gaps = 30/215 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------------- 56
+GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G++
Sbjct: 223 MGPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG---VTGPTGAMGPTGATGATGATGATGA 279
Query: 57 --------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G G +G GP+G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 280 TGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGA 336
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+GP+G G +G G +G GP+G +GP+G G +G G
Sbjct: 337 TGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGS 396
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G GP+G +GP+G G + V+G
Sbjct: 397 TGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTG 431
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/206 (26%), Positives = 81/206 (39%), Gaps = 33/206 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G + GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 217 TGPTGAM---GPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG---VTGPTGAMGPTGATGA 270
Query: 66 -----------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G G +G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 271 TGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGPTGA---TGPTGA 327
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G +GP+G G +G G +G GP+G +GP+G G
Sbjct: 328 TGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGA 387
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G +G
Sbjct: 388 TGPTGVTGSTGATGATGPTGATGAMG 413
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/208 (26%), Positives = 85/208 (40%), Gaps = 39/208 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G++ GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 202 TGPTGVTGATGPTG---VTGPTGAM---GPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG- 254
Query: 73 LRYLGPSGSLR------------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G++ G +G G +G GP+G
Sbjct: 255 --VTGPTGAMGPTGATGATGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTGA 312
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP+G + GP+G +GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 313 TGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATGP 369
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G GP+G G++
Sbjct: 370 TGATGAMGPTGA---TGPTGATGPTGVT 394
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/207 (26%), Positives = 82/207 (39%), Gaps = 36/207 (17%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G GP+G GP+G + GP+G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 201 VTGPTGVTGATGPTG---VTGPTGAM---GPTGATGATGPTGVTGSTGVTGATGATGPTG 254
Query: 81 SLRYLGPSGRLR------------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G + G +G G +G GP+G
Sbjct: 255 ---VTGPTGAMGPTGATGATGATGATGATGATGPTGVTGATGATGPTGVTGATGATGPTG 311
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP+G + GP+G GP+G +GP+G G +G G +G G
Sbjct: 312 ATGATGPTG---ATGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGATG 368
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P+G +GP+G G + V+G
Sbjct: 369 PTGATGAMGPTGATGPTGATGPTGVTG 395
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 148 LGPSGRLRYLGP 159
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 166 LGPSGRLRYLGP 177
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 34/72 (47%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G+ GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 112 LGPSGRLRYLGP 123
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTG---ATGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 157 LGPSGRLRYLGP 168
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 32/72 (44%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 130 DGPSGRLRYLGP 141
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 34/72 (47%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G+ +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 94 LGPSGRLRYLGP 105
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.98, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G GP+G GP+G GP+G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 76 LGPSGSLRYLGP 87
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/72 (31%), Positives = 32/72 (44%), Gaps = 3/72 (4%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGP 132
G +G GP
Sbjct: 706 TGATGPTGVTGP 717
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/66 (33%), Positives = 32/66 (48%), Gaps = 3/66 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G+ +GP+G G +G
Sbjct: 655 TGPTGVTGATGPTGETGATGPTGA---TGPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGPTGATGP 711
Query: 73 LRYLGP 78
GP
Sbjct: 712 TGVTGP 717
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/71 (30%), Positives = 32/71 (45%), Gaps = 3/71 (4%)
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 649 TGATGATGPTGVTGATGPTGETGATGPTGAT---GPTGATGATGPTGATGAMGPTGATGP 705
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 706 TGATGPTGVTG 716
>gi|126697904|ref|YP_001086801.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
gi|115249341|emb|CAJ67154.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
Length = 693
Score = 79.7 bits (195), Expect = 6e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 93/187 (49%), Gaps = 18/187 (9%)
Query: 13 LGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G + GP+G +GP+G+ GP+G +GP+G+ GP+G +GP
Sbjct: 364 IGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGAT---GPTGVTGSIGP 417
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G+ +GP+G GP+G +GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 418 TGAT---GPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGP 471
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G +GP+G GP+G +GP+G G G GP+G +GP+G
Sbjct: 472 TGNTGVTGEIGPTGA---TGPTGVTGEIGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGATGSIGPTGA 528
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 529 TGATGVT 535
Score = 76.3 bits (186), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 91/184 (49%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G +GP+G+ G +GS+ GP+G + G +G+ +GP+G G
Sbjct: 298 TGPTGNTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGA 357
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G +GP+G + GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 358 TGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGAT---GPTGV 411
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G G +G +GP
Sbjct: 412 TGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGP 465
Query: 187 SGRL 190
+G
Sbjct: 466 TGAT 469
Score = 75.9 bits (185), Expect = 9e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 93/187 (49%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G +GP+G GP+G +GP+G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 274 IGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTG---VTGPTGNTGEIGPTGAT---GPTGVTGSIGPTGA 327
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLNS 129
GP+G + G +G +GP+G G +G +GP+G + GP+G S
Sbjct: 328 T---GPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGS 384
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 385 IGPTGA---TGPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGATGEIGPTGA 435
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 436 TGPTGVT 442
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 93/187 (49%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G+ +GP+G G +G +GP+G+ G +G +GP+G
Sbjct: 238 IGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTG- 296
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ +GP+G GP+G +GP+G GP+G + G +G S GP
Sbjct: 297 --VTGPTGNTGEIGPTGAT---GPTGVTGSIGPTGAT---GPTGEIGPTGATGATGSIGP 348
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G +GP+G + GP+G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 349 TGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGA 405
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 406 TGPTGVT 412
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 93/181 (51%), Gaps = 24/181 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G+ +GP+G+ GP+G +GP+G+ GP+G + G +G
Sbjct: 292 IGPTG---VTGPTGNTGEIGPTGAT---GPTGVTGSIGPTGAT---GPTGEIGPTGATGA 342
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GP+G+ G +G +GP+G + GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 343 TGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGE 399
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 400 IGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGEIGPTGA 450
Query: 190 L 190
Sbjct: 451 T 451
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 92/184 (50%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + G +G+ +GP+G+ G +G +GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 328 TGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEI---GPTGAT---GPTGV 381
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G+ GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G GP
Sbjct: 382 TGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGATGEIGP 432
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G +GP+G G +G +GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 433 TGA---TGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGP 489
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 490 TGVT 493
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 85/176 (48%), Gaps = 15/176 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G+ GP+G+ +GP+G GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 376 TGPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGA 426
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G+ GP+G +GP+G G +G +GP+G GP+G G
Sbjct: 427 TGEIGPTGA---TGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGA---TGPTGNTGVTGE 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G +GP+G G G GP+G +GP+G G +G
Sbjct: 481 IGPTGATGPTGVTGEIGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGATGSIGPTGATGATGVTG 536
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/197 (29%), Positives = 95/197 (48%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G +GP+G+ G +G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 256 IGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTG---VTGPTGNTGEIGPTGA 312
Query: 73 LRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-- 127
G +GS+ GP+G + G +G +GP+G G +G +GP+G +
Sbjct: 313 TGPTGVTGSIGPTGATGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGP 372
Query: 128 -NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G G
Sbjct: 373 TGATGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGATGPTGA 426
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G + G + V+G
Sbjct: 427 TGEIGPTGATGPTGVTG 443
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 88/179 (49%), Gaps = 15/179 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G +G +GP+G + GP+G +GP+G+ GP+G +GP
Sbjct: 346 IGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGP 402
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 403 TGAT---GPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGEIGPTGATGP 453
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G +GP+G G +G +GP+G G +G + G +G +GP+G
Sbjct: 454 TGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGVTGEIGPTGNTGATGSIGPTG 512
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 89/185 (48%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G +GP+G+ G +G +GP+G + GP+G +GP+G GP
Sbjct: 337 TGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT---GP 393
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G +GP+G+ GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 394 TGATGEIGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGATGEIGPTGA---TGPTGVTGE 444
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G +GP+G G +G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 445 IGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGA---TGPTGVTGEIGPTGN 501
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 502 TGATG 506
Score = 72.8 bits (177), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 87/177 (49%), Gaps = 15/177 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G+ +GP+G+ GP+G +GP+G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 385 IGPTGAT---GPTGATGEIGPTGAT---GPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGA 435
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G +GP+G G +G +GP+G G +G +GP+G + GP
Sbjct: 436 ---TGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTG---ATGP 489
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G +GP+G G G GP+G +GP+G G +G G +G
Sbjct: 490 TGVTGEIGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGATGSIGPTGATGATGVTGPTGPTGATGN 546
Score = 72.4 bits (176), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/194 (29%), Positives = 84/194 (43%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G GP+GS G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 226 TGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGN 285
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G + G
Sbjct: 286 TGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPTGAT---GPTGVTGSIGPTGA---TGPTGEIGPTGA 339
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G +GP+G G +G +GP+G + GP+G +GP+G G +G
Sbjct: 340 TGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGATGPTGATGE 399
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
+ G + V+G
Sbjct: 400 IGPTGATGPTGVTG 413
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/185 (30%), Positives = 85/185 (45%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 244 TGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGN 303
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G+ GP+G +GP+G GP+G + G +G +GP+G G
Sbjct: 304 TGEIGPTGAT---GPTGVTGSIGPTGAT---GPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGA 357
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G +GP+G + GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 358 TGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGAT---GPTGATGEIGPTGA---TGPTGV 411
Query: 190 LRYLG 194
+G
Sbjct: 412 TGSIG 416
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 88/181 (48%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +GS+ GP+G G +G +GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 223 IGPTGPTGNTGATGSI---GPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGA 279
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G +GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G + GP
Sbjct: 280 TGPTGNTGVTGSIGPTG---VTGPTGNTGEIGPTGA---TGPTGVTGSIGPTG---ATGP 330
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G + G +G +GP+G G +G +GP+G + GP+G +GP+G
Sbjct: 331 TGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGATGPTGVTGSIGPTGA 390
Query: 190 L 190
Sbjct: 391 T 391
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/191 (29%), Positives = 85/191 (44%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + GP+GS G +GS+ GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 202 TGSTGPMGVTGPTGST---GATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGSTGATGSIGP 258
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G GP+G G G GP+G +GP+G + GP
Sbjct: 259 TGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGPTG---ATGP 315
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G +GP+G GP+G + G +G +GP+G G +G +GP+G +
Sbjct: 316 TGVTGSIGPTGA---TGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGP 372
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 373 TGATGPTGVTG 383
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/172 (30%), Positives = 74/172 (43%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+R GP G G +G + GP+G G +GS+ GP+G G G GP
Sbjct: 190 IRITGPMGPRGATGSTGPMGVTGPTGST---GATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGP 246
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+GS G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 247 TGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGE 306
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+GP+G GP+G +GP+G GP+G + G +G +GP+G
Sbjct: 307 IGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGEIGPTGATGATGSIGPTGAT 352
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 76/167 (45%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+R GP G G +G + GP+GS G G G +G +GP+G G
Sbjct: 190 IRITGPMGPRGATGSTGPMGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGS 249
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G +GP+G G +G +GP+G G +G S GP+G GP+G
Sbjct: 250 TGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTG---VTGPTGNTGE 306
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+GP+G GP+G +GP+G GP+G + G +G +G
Sbjct: 307 IGPTGA---TGPTGVTGSIGPTGA---TGPTGEIGPTGATGATGSIG 347
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/131 (30%), Positives = 59/131 (45%), Gaps = 7/131 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G+ G +G +GP+G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 436 TGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGA---TGPTGV 492
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-NSDG 131
+GP+G+ G G GP+G +GP+G G +G GP+G NS
Sbjct: 493 TGEIGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGATGSIGPTGATGATGVTGP---TGPTGATGNSSQ 549
Query: 132 PSGRLRYLGPS 142
P PS
Sbjct: 550 PVANFLVNAPS 560
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/130 (27%), Positives = 51/130 (39%), Gaps = 6/130 (4%)
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+R GP G G +G + GP +G + GP+G G G GP+G
Sbjct: 190 IRITGPMGPRGATGSTGPMGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGS 249
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G G GP+G G G GP+G G G GP+G +GP
Sbjct: 250 TGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGSIGPTGATGPTGNTGVTGSIGPTGVTGPTGNTGEIGP 309
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 310 TGATGPTGVT 319
>gi|302387815|ref|YP_003823637.1| Collagen triple helix repeat protein [Clostridium saccharolyticum
WM1]
gi|302198443|gb|ADL06014.1| Collagen triple helix repeat protein [Clostridium saccharolyticum
WM1]
Length = 383
Score = 79.7 bits (195), Expect = 7e-13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/176 (34%), Positives = 82/176 (46%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP+G +GP+G +GP+G GP G GP G
Sbjct: 7 TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGEIGPTGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGL 63
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G GP+G +GP+G +GP G GP G + GP+G GP
Sbjct: 64 IGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGP---IGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGP 120
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G +GP+G GP G GP G + GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 121 TGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTG 173
Score = 77.0 bits (188), Expect = 5e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/176 (34%), Positives = 80/176 (45%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + GP G + GP+G GP+G +GP+G GP G GP G
Sbjct: 28 TGPQGEIGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGL 84
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP+G +GP+G GP G GP G + GP+G GP
Sbjct: 85 IGPTGPIGPQGETGPTGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGP 141
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G +GP+G GP G GP G + GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 142 TGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTG 194
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 85/185 (45%), Gaps = 12/185 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + GP+G +GP+G +GP+G GP G GP G + GP+G
Sbjct: 16 TGPQGLIGPTGPTGPQGEIGPTGPQGLIGPTGPT---GPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGP 72
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G +GP+G + GP+G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 73 QGETGPTGPQGLIGPTGPIGPQGETGPTGPQGLIGPTGPT---GPQGETGPTGPQGLIGP 129
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G +GP+G GP G GP G + GP+G GP+G
Sbjct: 130 TGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGP 186
Query: 190 LRYLG 194
+G
Sbjct: 187 QGLIG 191
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/173 (33%), Positives = 79/173 (45%), Gaps = 9/173 (5%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G GP G + GP+G +GP+G +GP+G GP G GP G
Sbjct: 7 TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGEIGPTGPQGLIGPTGPT---GPQGETGPTGPQGL 63
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP+G GP+G +GP+G + GP G GP G + GP+G GP
Sbjct: 64 IGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGPI---GPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGP 120
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G +GP+G GP G GP G + GP+G GP+G +G
Sbjct: 121 TGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIG 170
Score = 73.2 bits (178), Expect = 6e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 83/183 (45%), Gaps = 15/183 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G +GP+G GP G GP G + GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 33 EIGPTGPQGLIGPTGPT---GPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTG 89
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSG 125
+ GP G GP G + GP+G GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 90 PI---GPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQG 146
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP+G +GP+G GP G GP G + GP+G G
Sbjct: 147 LIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGLQGETG 203
Query: 186 PSG 188
P+G
Sbjct: 204 PTG 206
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 71/158 (44%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP+G +GP+G GP G + GP G + GP+G GP
Sbjct: 1 MTPAGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGPT---GPQGEIGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGP 57
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G +GP+G GP G GP G + GP G GP+G +GP+G
Sbjct: 58 TGPQGLIGPTGP---TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPIGPQGETGPTGPQGLIGPTGP--- 111
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP G + GP+G GP+G +G
Sbjct: 112 TGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIG 149
>gi|384182335|ref|YP_005568097.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
gi|324328419|gb|ADY23679.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
Length = 696
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 77/188 (40%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP+GS G +G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 360 TGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGA 419
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 420 TGVTGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGP 479
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 480 TGATGPTGITGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGATGPTGATGITGATGITGP 539
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 540 TGATGSTG 547
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/197 (28%), Positives = 81/197 (41%), Gaps = 9/197 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+GS G +G+ G +G GP+G+ G GP+G
Sbjct: 320 STGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITG------ATGPAG 373
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 374 ATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPTG 433
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 434 ATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTG 493
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + V+G+
Sbjct: 494 ATGITGSTGPTGVTGIT 510
Score = 76.6 bits (187), Expect = 6e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/193 (28%), Positives = 79/193 (40%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +G GP+G GP+G+ GP+G G
Sbjct: 330 TGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGA 389
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 126
+G GP+G+ GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 390 TGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGV 449
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRY 183
S GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 450 TGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGSTGPTGVTGI 509
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 510 TGPTGSTGVTGAT 522
Score = 75.9 bits (185), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/191 (28%), Positives = 80/191 (41%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 351 TGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGI 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 411 TGATGPTGATGVTGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGV 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 471 TGSTGATGPTGA---TGPTGITGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGATGPTGA 527
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ ++G
Sbjct: 528 TGITGATGITG 538
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/199 (28%), Positives = 81/199 (40%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ G P+G+ G +G G +GS G +G GP
Sbjct: 264 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 323
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G GP+GS G +G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 324 TGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGS 383
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 384 TGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPTGATGVTGSTGP 443
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G + V+G+
Sbjct: 444 TGATGVTGSTGPTGVTGIT 462
Score = 73.9 bits (180), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 77/185 (41%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G G +GS GP+G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 296 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGST---GPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATG 352
Query: 72 RLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 353 PTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITG 412
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 413 ATGPTGATGVTGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTG 472
Query: 186 PSGRL 190
+G
Sbjct: 473 STGAT 477
Score = 73.6 bits (179), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/185 (28%), Positives = 78/185 (42%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 284 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTG 343
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G G +G + G
Sbjct: 344 A---TGPTGA---TGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATG 397
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 398 PTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTG 457
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 458 VTGIT 462
Score = 72.4 bits (176), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/191 (28%), Positives = 77/191 (40%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG 68
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G P+G G
Sbjct: 236 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 295
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSG 125
+G G +GS G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 296 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTG 355
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 356 ITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATG 415
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P+G G +
Sbjct: 416 PTGATGVTGAT 426
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 74/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 248 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 307
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN--- 128
G +G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 308 STGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITG 367
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 368 ATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATG 427
Query: 189 RL 190
Sbjct: 428 ST 429
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 76/182 (41%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ GP+G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 378 TGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPTGATGV 437
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN- 128
GP+G+ G P+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 438 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGI 497
Query: 129 --SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 498 TGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGATGPTGATGITGATGITGPTGA---TGSTGSTGATGP 554
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 555 TG 556
Score = 71.2 bits (173), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 79/187 (42%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+GS G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 312 TGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGAT---GPTGAT---GPTGITGPTGATGI 365
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 366 TGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGA 425
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 426 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGA---TGPTGA 482
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 483 TGPTGIT 489
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 78/195 (40%), Gaps = 6/195 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 260 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 319
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLN 128
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 320 ST---GPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATG 376
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 377 ETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGPTGITGATGPTGATGVTGATGSTGPTGATG 436
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 437 VTGSTGPTGATGVTG 451
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/199 (27%), Positives = 78/199 (39%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ G P+G+ G +G G +GS G +G GP
Sbjct: 228 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 287
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 288 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGP 347
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 348 TGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTGATGITGP 407
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G + V+G
Sbjct: 408 TGITGATGPTGATGVTGAT 426
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/191 (27%), Positives = 76/191 (39%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG 68
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G P+G G
Sbjct: 200 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 259
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 260 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 319
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLG 185
S GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 320 STGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETG 379
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P+G G +
Sbjct: 380 PTGSTGITGAT 390
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 75/186 (40%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 224 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 283
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN--- 128
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 284 ST---GPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTG 340
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 341 STGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATGITGATGPTG 400
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 401 ATGITG 406
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG 68
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G P+G G
Sbjct: 164 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 223
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 224 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 283
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S GP+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 284 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTG 343
Query: 189 RL 190
Sbjct: 344 AT 345
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 212 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 271
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 272 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITG 331
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 332 PTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTGITGPTGATGITGATGPAGATGETGPTGSTGITGATG 391
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 392 ITGATG 397
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/194 (26%), Positives = 75/194 (38%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG 68
+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G P+G G
Sbjct: 176 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 235
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 236 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 295
Query: 129 SDGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
S GP+G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 296 STGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATGPTGATGPTG 355
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 356 ITGPTGATGITGAT 369
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 155 STGSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTG 214
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 215 PTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTG 274
Query: 132 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP+G G +G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 275 PTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTG 334
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 335 STGVTG 340
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 72/185 (38%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---P 78
G +G GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G G P
Sbjct: 156 TGSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 215
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G + G +G
Sbjct: 216 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 275
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 276 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGITGPTGS 335
Query: 199 LRVSG 203
V+G
Sbjct: 336 TGVTG 340
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/175 (25%), Positives = 67/175 (38%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G+ G +G
Sbjct: 156 TGSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 215
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G G +G GP+G G +G + G +G G +G GP
Sbjct: 216 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 275
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G +G G +G G +G GP+G G + V+G+
Sbjct: 276 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGVTGIT 330
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/229 (22%), Positives = 76/229 (33%), Gaps = 45/229 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ +GP+G+ GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 42 TGATGSTGATGPTGATGDIGPTGATGDTGPTGSTGSTGATGSTGSTGATGVTGSTGATGS 101
Query: 73 LRYLGPSGS------------------------------------------LRYLGPSGR 90
G +GS G +G
Sbjct: 102 TGSTGATGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGI 161
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRY 147
GP+G G +G G +G G +G S GP+G GP+G
Sbjct: 162 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGV 221
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 222 TGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 270
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/141 (29%), Positives = 59/141 (41%), Gaps = 9/141 (6%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP+G G +G G +GS GP+G GP+GS G +G
Sbjct: 422 VTGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGST---GPTGVTGITGPTGSTGVTGSTGATG 478
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G GP+G+ G P+G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 479 PTGATGPTGITGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGSTGVTGATGPTGATGITGATGITG 538
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
P+G S G +G GP+G
Sbjct: 539 PTGATGSTGSTGA---TGPTG 556
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/226 (22%), Positives = 76/226 (33%), Gaps = 45/226 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +GS GP+G+ +GP+G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 36 VGPTGPT---GATGSTGATGPTGATGDIGPTGATGDTGPTGSTGSTGATGSTGSTGATGV 92
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---------------------------------------- 92
G +GS G +G
Sbjct: 93 TGSTGATGSTGSTGATGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGATGATGP 152
Query: 93 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 153 TGSTGSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGS 212
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 213 TGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 258
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/225 (22%), Positives = 74/225 (32%), Gaps = 42/225 (18%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------ 65
++GP+G GP+GS G +GS G +G G +GS G +G
Sbjct: 59 DIGPTGATGDTGPTGSTGSTGATGSTGSTGATGVTGSTGATGSTGSTGATGSTGPTGATG 118
Query: 66 ------------------------------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G GP+G+ G +G
Sbjct: 119 ATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGVTGSTG 178
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G GP+G G +G + G +G G +G G
Sbjct: 179 PTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTG 238
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 239 PTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 283
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/207 (22%), Positives = 69/207 (33%), Gaps = 48/207 (23%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G++ +GP+G G +GS GP+G +GP+G GP+GS G +G
Sbjct: 31 GTVPKVGPTGP---TGATGSTGATGPTGATGDIGPTGATGDTGPTGSTGSTGATGSTGST 87
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------------------------- 117
G +G G +G G +G
Sbjct: 88 GATGVTGSTGATGSTGSTGATGSTGPTGATGATGATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGAT 147
Query: 118 -----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G S GP+G GP+G G +G G +G G +
Sbjct: 148 GATGPTGSTGSTGITGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGAT 207
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G G +G G++
Sbjct: 208 GVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVT 234
>gi|301628717|ref|XP_002943495.1| PREDICTED: non-lysosomal glucosylceramidase [Xenopus (Silurana)
tropicalis]
Length = 692
Score = 79.0 bits (193), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/176 (27%), Positives = 55/176 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P G+ P G P G P G+ P G P G+ P G+
Sbjct: 55 DPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQT 114
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P G P G+ P G+ P G+ P GR P GR
Sbjct: 115 AVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAERDSE 174
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GR P GR P GR P GR P GR P GR P GR
Sbjct: 175 GRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGR 230
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/176 (27%), Positives = 55/176 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P G+ P G P G P G+ P G P G+ P G+
Sbjct: 64 DPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAVRDPEGQT 123
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P G P G+ P G+ P GR P GR GR P
Sbjct: 124 AVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAERDSEGRTAVRDPE 183
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GR P GR P GR P GR P GR P GR P G+
Sbjct: 184 GRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGQ 239
Score = 76.6 bits (187), Expect = 5e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 55/176 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P G+ P G P G P G+ P G P G+ P G+
Sbjct: 46 DPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQT 105
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P G P G+ P G+ P G+ P G+ P GR P
Sbjct: 106 AERDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGRTAVRDPE 165
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GR GR P GR P GR P GR P GR P GR
Sbjct: 166 GRTAERDSEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGR 221
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/176 (26%), Positives = 55/176 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P G+ P G P G P G+ P G P G+ P G+
Sbjct: 37 DPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQT 96
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P G P G+ P G+ P G+ P G+ P G+ P
Sbjct: 97 AERDPEGQTAERDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPE 156
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GR P GR GR P GR P GR P GR P GR
Sbjct: 157 GRTAVRDPEGRTAERDSEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGR 212
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/176 (25%), Positives = 55/176 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P G+ P G P G P G+ P G P G+ P G+
Sbjct: 28 DPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQT 87
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P G P G+ P G+ P G+ P G+ P G+ P
Sbjct: 88 AERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPE 147
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G+ P GR P GR GR P GR P GR P GR
Sbjct: 148 GQTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAERDSEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGR 203
Score = 72.8 bits (177), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/176 (25%), Positives = 55/176 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P G+ P G P G P G+ P G P G+ P G+
Sbjct: 19 DPEGQTAVRDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQT 78
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P G P G+ P G+ P G+ P G+ P G+ P
Sbjct: 79 AERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPE 138
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G+ P G+ P GR P GR GR P GR P GR
Sbjct: 139 GQTAVRDPEGQTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAERDSEGRTAVRDPEGRTAVRDPEGR 194
Score = 72.0 bits (175), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/176 (24%), Positives = 55/176 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
P G+ P G P G P G+ P G P G+ P G+
Sbjct: 10 DPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQT 69
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P G P G+ P G+ P G+ P G+ P G+ P
Sbjct: 70 AERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAERDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPE 129
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G+ P G+ P G+ P GR P GR GR P GR
Sbjct: 130 GQTAVRDPEGQTAVRDPEGQTAVRDPEGRTAVRDPEGRTAERDSEGRTAVRDPEGR 185
>gi|218903581|ref|YP_002451415.1| BclA protein [Bacillus cereus AH820]
gi|218535560|gb|ACK87958.1| BclA protein [Bacillus cereus AH820]
Length = 348
Score = 78.6 bits (192), Expect = 1e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/157 (32%), Positives = 69/157 (43%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTG 124
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G G
Sbjct: 125 ITGATGPAGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATG 184
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 185 PAGITGATGPTGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGP 221
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/157 (32%), Positives = 69/157 (43%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTG 124
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G G
Sbjct: 125 ITGATGPAGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATG 184
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
P+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 185 PAGITGATGPTGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGP 221
Score = 77.8 bits (190), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/155 (32%), Positives = 69/155 (44%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 67 GATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGIT 126
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+
Sbjct: 127 GATGPAGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPA 186
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 187 GITGATGPTGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGP 221
Score = 76.6 bits (187), Expect = 5e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/150 (32%), Positives = 67/150 (44%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTG 124
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 125 ITGATGPAGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATG 184
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 185 PAGITGATGPTGITGVTGPTGITGATGPTG 214
>gi|218905956|ref|YP_002453790.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH820]
gi|218536305|gb|ACK88703.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH820]
Length = 1219
Score = 78.2 bits (191), Expect = 2e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+G G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 867 NTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATG 926
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN--- 128
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 927 STGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGATGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTG 986
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G GP+G G +G +G +G GP+G
Sbjct: 987 STGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSIGATGATGSTGPTG 1046
Query: 189 RLRYLGL 195
+G+
Sbjct: 1047 STGAMGV 1053
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 74/191 (38%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +GS GP+G G +G GP +G+ GP+G G
Sbjct: 202 TGPTGETGATGETGSTGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGN 261
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGP 123
+G G +GS G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 262 TGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGS 321
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G + GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 322 TGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGN 381
Query: 184 LGPSGRLRYLG 194
G +G G
Sbjct: 382 TGATGNTGATG 392
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 12/194 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG- 68
GP+G G +G G +GS G +G GP+GS G P+G G
Sbjct: 250 TGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGN 309
Query: 69 --PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGP 123
P+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 310 TGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGS 369
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G S G +G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 370 TGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTGP 429
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 430 TGATGPTGSTGATG 443
Score = 75.1 bits (183), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/195 (26%), Positives = 76/195 (38%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+G G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 309 NTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATG 368
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 369 STGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTG 428
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 429 PTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTG 488
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 489 PTGETGATGSTGVTG 503
Score = 75.1 bits (183), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 73/188 (38%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G G +GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 819 NTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTG 878
Query: 72 RLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 879 ETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATG 938
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 939 STGVTGSTGATGNTGATGSTGATGNTGATGSTGATGNTGPTGE---TGPTGSTGVTGNTG 995
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 996 ATGSTGVT 1003
Score = 75.1 bits (183), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 75/195 (38%), Gaps = 12/195 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 189 NTGPTGSTGVTG------STGPTGETGATGETGSTGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGPTG 242
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 243 E---TGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATGPTGSTGATGSTG 299
Query: 132 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 300 PTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTG 359
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 360 PTGETGATGSTGVTG 374
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 73/189 (38%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+GS G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 540 NTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTG 599
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +GS G +G GP+G G P+G G +G G +G
Sbjct: 600 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATG 659
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 660 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETG 719
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P+G G
Sbjct: 720 PTGNTGVTG 728
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/198 (28%), Positives = 81/198 (40%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS G +G+ GP+G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 237 NTGPTGET---GATGSTGPTGNTGATGNTGPTGE---TGATGSTGVTGNTGATGATGPTG 290
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G GP+G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 291 S---TGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTG 347
Query: 132 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LG 185
P+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 348 PTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTG 407
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P+G G++ V+G
Sbjct: 408 PTGNTGATGVTGSTGVTG 425
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 73/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+GS G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+GS
Sbjct: 754 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGS 813
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G G +G G +G G +G S GP+G G
Sbjct: 814 TGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGN---TGA 870
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G G + V
Sbjct: 871 TGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGV 930
Query: 202 SG 203
+G
Sbjct: 931 TG 932
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/194 (26%), Positives = 75/194 (38%), Gaps = 6/194 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+GS G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 754 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGS 813
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 814 TGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNT---GA 870
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 871 TGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGV 930
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 931 TGSTGATGSTGVTG 944
Score = 73.6 bits (179), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 73/188 (38%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 789 NTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTG 848
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 849 STGATGNTGATGSTGPTGN---TGATGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTG 905
Query: 132 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 906 PTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGATGNTG 965
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 966 ATGSTGAT 973
Score = 72.8 bits (177), Expect = 8e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 70/182 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 535 TGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGV 594
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 595 TGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGE 654
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 655 TGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGA 714
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 715 TG 716
Score = 72.4 bits (176), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/198 (26%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 9/198 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +G+ GP+G G P+G G +G GP+G G
Sbjct: 279 NTGATGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTG 338
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+G GP+GS GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 339 STGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTG 398
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 399 NT---GATGNTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTG 455
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G++ V+G
Sbjct: 456 NTGPTGETGVTGSTGVTG 473
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/191 (27%), Positives = 75/191 (39%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 327 NTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATG 386
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +GS G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 387 NT---GATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATG 443
Query: 129 SDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 444 STGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTG 503
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 504 STGATGSTGVT 514
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/189 (26%), Positives = 72/189 (38%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G G +G GP+GS GP+G G +GS G +G
Sbjct: 456 NTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTG 515
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G G +G+ GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 516 STGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTG 575
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 576 ATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTG 635
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P+G G
Sbjct: 636 PTGSTGATG 644
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/182 (25%), Positives = 70/182 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G+ G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 517 TGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGA 576
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 577 TGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGP 636
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 637 TGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGV 696
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 697 TG 698
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/186 (26%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G G +GS G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 486 NTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATG 545
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 546 NTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTG 605
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP+G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 606 VTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTG 665
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 666 ETGVTG 671
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/225 (24%), Positives = 81/225 (36%), Gaps = 33/225 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL------------- 55
N G +G GP+GS G P+GS G +G GP+G+
Sbjct: 678 NTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETG 737
Query: 56 --------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
GP+G G +G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 738 VTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETG 797
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G GP+G GP+G + G +G G +G G +G G
Sbjct: 798 VTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTG 857
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G GP+G G +G G++ V+G
Sbjct: 858 ATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGVTG 902
Score = 71.2 bits (173), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/213 (24%), Positives = 74/213 (34%), Gaps = 30/213 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +G G +G GP+G G P+GS G +G G
Sbjct: 660 NTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETG 719
Query: 69 PSGRL---------------------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 720 PTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTG 779
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G GP+G G +G + GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 780 PTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTG 839
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G
Sbjct: 840 ATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATG 872
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 77/204 (37%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRY---LGPSGRLR 65
N GP+G G +GS G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 405 NTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETG 464
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G GP+GS GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 465 VTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTG 524
Query: 123 PSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G S GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 525 ATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTG 584
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G + V+G
Sbjct: 585 ETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTG 608
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/213 (25%), Positives = 74/213 (34%), Gaps = 33/213 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G G +GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 579 NTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTG 638
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 639 STGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTG 698
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSG 161
S GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 699 STGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTG 758
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 759 STGVTGNTGATGETGPTGS---TGPTGETGVTG 788
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 301 TGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGP 360
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 361 TGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVTGS 420
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 421 TGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGS 480
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 481 TGATG 485
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G G +G+ G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 522 NTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTG 581
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLN 128
G +GS G +G G +G G +G GP+G G P+G
Sbjct: 582 PTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTG 641
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 642 ATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTG 701
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 702 PTGSTGAT 709
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/204 (25%), Positives = 75/204 (36%), Gaps = 21/204 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+GS G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 615 NTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTG 674
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G GP+G G P+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 675 PTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTG 734
Query: 129 ------------------SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
S GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 735 ETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTG 794
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G
Sbjct: 795 ETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATG 818
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +GS G +G GP+G + GP+G G
Sbjct: 838 TGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGNTGPTGETGVTGS 897
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G S
Sbjct: 898 TGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGS 957
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 958 TGATGNTGATGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGATGSTGP 1017
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 1018 TGSTGVTG 1025
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/196 (26%), Positives = 75/196 (38%), Gaps = 12/196 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ GP +G+ GP+G G +GS G +G GP
Sbjct: 376 TGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGATGP 435
Query: 70 SGRLRY---LGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRY 120
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 436 TGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGA 495
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G +G S G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 496 TGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGSTGA 555
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G++
Sbjct: 556 TGNTGPTGSTGATGVT 571
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/189 (26%), Positives = 71/189 (37%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY-- 66
N GP+G G P+G G +G G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 345 NTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATG 404
Query: 67 -LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 405 NTGPTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETG 464
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G +G G +G GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 465 VTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTG 524
Query: 186 PSGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 525 ATGNTGATG 533
Score = 67.4 bits (163), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/224 (24%), Positives = 77/224 (34%), Gaps = 33/224 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 625 TGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGE 684
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-------------------- 109
GP+GS G P+G G +G GP+G
Sbjct: 685 TGVTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGP 744
Query: 110 -------RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 745 TGETGVTGSTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGV 804
Query: 163 LRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 805 TGNTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTG 848
Score = 66.6 bits (161), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/189 (25%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 474 NTGPTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATG 533
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G+ GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 534 STGPTGNTGATGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTGETGATGSTG 593
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G +G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 594 VTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGPTGSTGATGNTGPTGSTG 653
Query: 186 PSGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 654 ETGATGNTG 662
Score = 66.6 bits (161), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/191 (25%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 12/191 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +G G +G+ G +G GP+G + GP+G G
Sbjct: 357 NTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGNTGATG 416
Query: 69 PSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+G G P+G+ G +G GP+G G P+G G +G G
Sbjct: 417 VTGSTGVTGNTGPTGATGPTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTG 476
Query: 123 PSGRLNS---DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P+G + GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 477 PTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTG 536
Query: 180 RLRYLGPSGRL 190
G +G
Sbjct: 537 PTGNTGATGNT 547
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G G P+G G +G GP+GS G +G G
Sbjct: 436 TGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGS---TGATGNTGPTGE 492
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S
Sbjct: 493 TGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGS 552
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 553 TGATGNTGPTGSTGATGVTGSTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGA 612
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 613 TGNTGAT 619
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/215 (23%), Positives = 75/215 (34%), Gaps = 30/215 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 645 NTGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGVTGPTGSTGVTGSTGPTG 704
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRYLG 104
G +G+ GP+G GP+G G
Sbjct: 705 STGATGNTGATGETGPTGNTGVTGSTGPTGETGVTGGTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTG 764
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSG 161
+G GP+G G +G + GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 765 NTGATGETGPTGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPTG 824
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G G +
Sbjct: 825 ETGATGSTGVTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGAT 859
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/171 (25%), Positives = 62/171 (36%), Gaps = 18/171 (10%)
Query: 42 PSGRLRYL---------------GPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+G + + GP+GS GP+G G +G GP+G
Sbjct: 168 PTGSIGAMGTTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGSTGPTGETGATGETGSTGNTGPTGETG 227
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G GP+G G +G G +G G +G S G +G G +G
Sbjct: 228 ATGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATG 287
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 288 PTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTGNTGPTGETGVTG 338
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/159 (25%), Positives = 59/159 (37%), Gaps = 24/159 (15%)
Query: 69 PSGRLRYL---------------GPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
P+G + + GP+GS GP+G G +G GP+G
Sbjct: 168 PTGSIGAMGTTGATGETGSTGNTGPTGSTGVTGSTGPTGETGATGETGSTGNTGPTGETG 227
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G GP+G S GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 228 ATGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGVTGNTGATGATG 287
Query: 168 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P+G GP+G G +G G++ V+G
Sbjct: 288 PTGSTGATGSTGPTGETGVTGNTGPTGETGVTGSTGVTG 326
>gi|154685229|ref|YP_001420390.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus
amyloliquefaciens FZB42]
gi|154351080|gb|ABS73159.1| collagen like triple helix protein with GXT repeats [Bacillus
amyloliquefaciens FZB42]
Length = 665
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/226 (25%), Positives = 83/226 (36%), Gaps = 54/226 (23%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY----- 66
+ GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G
Sbjct: 307 DTGPTGVTGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGVTGATGPTG 366
Query: 67 -------------------------------------------LGPSGRLRYLGPSGSLR 83
+G +G GP+G
Sbjct: 367 ATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGATGPTGITGDIGSTGATGATGPTGVTG 426
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G GP+G +G GP+G GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 427 ATGPTGATGITGPTGA------TGDTGATGPTGATGDTGPTGATGATGPTGATGDTGPTG 480
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 481 ATGATGPTGVTGATGPTGVTGDTGPTGATGDTGPTGATGATGPTGA 526
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/214 (25%), Positives = 74/214 (34%), Gaps = 51/214 (23%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY------- 84
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 309 GPTGVTGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGVTGATGPTGAT 368
Query: 85 -----------------------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
+G +G GP+G
Sbjct: 369 GATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGATGPTGITGDIGSTGATGATGPTGVTGAT 428
Query: 104 GPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP+G GP +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+
Sbjct: 429 GPTGATGITGPTGATGDTGATGPTGATGDTGPTGATGATGPTGATGDTGPTGATGATGPT 488
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 489 GVTGATGPTGVTGDTGPTGATGDTGPTGATGATG 522
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/85 (34%), Positives = 44/85 (51%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 165 GPTGATGATGSTGATGATGPTGATGDTGPTGVTGATGPTGATGATGPTGVTGDIGPTGAT 224
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 225 GATGPTGATGATGPTGATGATGPTG 249
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 21/60 (35%), Positives = 32/60 (53%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G+ GP+G +GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 190 DTGPTGVTGATGPTGATGATGPTGVTGDIGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTG 249
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.088, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/78 (28%), Positives = 35/78 (44%)
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+ ++ +G + GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 151 DVAFVEVTGITGATGPTGATGATGSTGATGATGPTGATGDTGPTGVTGATGPTGATGATG 210
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G +GP+G G
Sbjct: 211 PTGVTGDIGPTGATGATG 228
>gi|311067243|ref|YP_003972166.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus atrophaeus
1942]
gi|310867760|gb|ADP31235.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus atrophaeus
1942]
Length = 1335
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 79/193 (40%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +GS G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 329 TGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTGETGSTGV 388
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G +GS G +G G +G G +G G +G GP+G + + G
Sbjct: 389 TGVMGVTGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGV 448
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 449 TGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGATGVTGPTGATGVTGSTGVTGS 505
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G + V+G+
Sbjct: 506 TGATGATGVTGVT 518
Score = 75.9 bits (185), Expect = 9e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G G +GS G +G G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 866 TGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTGV 925
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 926 TGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGET---GP 982
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+ GP+G GP+G +
Sbjct: 983 TGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGETGATGPT------GPTGVTGETGPTGEMGA 1036
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 1037 KGVT 1040
Score = 73.2 bits (178), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS GP+G + G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 419 TGSTGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG- 477
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 478 --VTGPTGATGVTGPTGATGVTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVT---GE 532
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G +
Sbjct: 533 TGSTGVTGSTGATGETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGA 592
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 593 TGVT 596
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G G +G G +GS GP+G + G +G
Sbjct: 395 TGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTG---VTGSTGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGV 451
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G S G
Sbjct: 452 TGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGATGVTGPTGATGVTGSTGVTGSTGA 508
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 509 TGATGVTGVTGA---TGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGPTGVTGSTGVTGETGV 565
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 566 TGAT 569
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/159 (27%), Positives = 64/159 (40%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +GS G +G G +GS G +G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 865 VTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTG 924
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G G +G GP+G GP+G + G +G G +G G
Sbjct: 925 VTGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGE---TG 981
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 982 PTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGETGATGPTG 1020
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 436 ETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGATGVTGPTG 492
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 493 A---TGVTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETG 549
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P+G G +G G +G G +G GP+G + G +G GP
Sbjct: 550 PTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGP 604
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/176 (27%), Positives = 71/176 (40%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +G G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 875 TGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGV 934
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP+G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 935 TGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGET---GPTGVTGATGE 991
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G G +G GP+ GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 992 TGSTGVTGATGETGPTGVTGETGATGPT------GPTGVTGETGPTGEMGAKGVTG 1041
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 74/185 (40%), Gaps = 12/185 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +GS GP+ GP+G G +G + G +G GP+G
Sbjct: 355 STGATGVTGVTGATGSTGVTGPT------GPTGETGSTGVTGVMGVTGSTGETGVTGPTG 408
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP+G + G +G GP+G G
Sbjct: 409 STGSTGVTG---VTGSTGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTG 465
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 466 ATGATGVTGPTG---VTGPTGATGVTGPTGATGVTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATG 522
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 523 STGVT 527
Score = 69.3 bits (168), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 70/175 (40%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G +G + G +G GP+GS G +G G +G G +GS
Sbjct: 377 TGPTGETGSTGVTGVMGVTGSTGETGVTGPTGS---TGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGS 433
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 434 TGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVT---GPTGATGVTGP 490
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +
Sbjct: 491 TGATGVTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGAT 545
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/168 (28%), Positives = 71/168 (42%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +G+ GP+G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 883 STGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGSTGVTG 942
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS GP+G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 943 ETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGE---TGPTG---VTGATGETGSTG 996
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP+G G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 997 VTGATGETGPTG---VTGETGATGPTGPTGVTGETGPTGEMGAKGVTG 1041
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/191 (26%), Positives = 75/191 (39%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G + G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 377 TGPTGETGSTGVTGVMGVTGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTG---VTGSTGATGVTGVTGS 433
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 434 TGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGATGVTGP 490
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 491 TGATGVTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGP 550
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 551 TGVTGSTGVTG 561
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 323 TGETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTG---- 378
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
P+G G +G + G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 379 --PTGETGSTGVTGVMGVTGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTGE 436
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 437 TGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGATGVTGPTGA 493
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 494 TGVTG 498
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/205 (23%), Positives = 72/205 (35%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------- 53
G +G G +GS G +G G +G G +G
Sbjct: 800 TGVTGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGSTGVTGV 859
Query: 54 --SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+ G +G G +G G +GS G +G G +G GP+G +
Sbjct: 860 TGATGVTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGA 919
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G GP+G S G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 920 TGVTGVTGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGE 979
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +
Sbjct: 980 ---TGPTGVTGATGETGSTGVTGAT 1001
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/205 (22%), Positives = 71/205 (34%), Gaps = 21/205 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 782 TGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATGE 841
Query: 73 ---------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +GS G +G G +G G +G
Sbjct: 842 TGPTGSTGSTGSTGVTGVTGATGVTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGS 901
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G GP+G + + G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 902 TGVTGATGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGV 961
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G++
Sbjct: 962 TGATGETGSTGVTGATGETGPTGVT 986
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/156 (25%), Positives = 60/156 (38%), Gaps = 3/156 (1%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G G +G G +G G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 865 VTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTG 924
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G G +G GP+G + GP+G G +G G +G G
Sbjct: 925 VTGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGE---TG 981
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 982 PTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGETGATG 1017
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/149 (26%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +GS G +G G +G G +G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 865 VTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTG 924
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 925 VTGETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGE---TG 981
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G +G G +G G++
Sbjct: 982 PTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVT 1010
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/220 (22%), Positives = 74/220 (33%), Gaps = 27/220 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 758 TGPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGA 817
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +GS G +G G +G G
Sbjct: 818 TGETGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGSTGVTGVTGATGVTGSTGSTGVTGA 877
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G S G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 878 TGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGS 937
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP+G GP+G G + V+G
Sbjct: 938 TGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGAT 977
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/173 (25%), Positives = 67/173 (38%), Gaps = 3/173 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G+ G +G G +G+ G +G GP+G + G +G
Sbjct: 671 TGSTGSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGV 730
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G GP+G GP+G G +G + G +G G
Sbjct: 731 TGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGV 787
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 788 TGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATG 840
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/173 (25%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 3/173 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +G G +G G +GS GP+G + G +G
Sbjct: 671 TGSTGSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGV 730
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G +G + G
Sbjct: 731 TGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGV 787
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 788 TGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATG 840
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/204 (25%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 30/204 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G GP+GS GP+G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 928 ETGPTGVTGSTGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGET---GPTG 984
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G G +G GP+ GP+G GP+G + + G
Sbjct: 985 VTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGETGATGPT------GPTGVTGETGPTGEMGAKG 1038
Query: 132 PSGRL---------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1039 VTGVTGATGSTGSTGVTGVTGVTGSTGATGVTGSTGVTGATGSTGSTGVTGATGATGSTG 1098
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G
Sbjct: 1099 STGVTGATGVTGSTGPTGVTGVTG 1122
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/216 (23%), Positives = 76/216 (35%), Gaps = 27/216 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------------------ 47
GP+G + G +G+ G +GS G +G
Sbjct: 262 ETGPTGEMGATGVTGATGATGETGSTGVTGVTGETGPTGVTGVTGVTGVTGVTGSTGVTG 321
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G G +G G +GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 322 ATGETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTG 381
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G + G +G GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 382 ETGSTGVTGVMGVTGSTGETGVTGPTGST---GSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGSTGETG 438
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P+G + G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 439 PTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTG 474
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/151 (27%), Positives = 60/151 (39%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +GS GP+G + G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 697 STGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG 756
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 757 ---VTGPTGSTGVTGSTGA---TGATGVTGVTGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTG 810
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
+G G +G G +G G +G
Sbjct: 811 VTGSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATGE 841
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/213 (23%), Positives = 75/213 (35%), Gaps = 21/213 (9%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G GP+G G +GS G +G G +G+ G +G
Sbjct: 938 TGVTGETGETGPTGSTGATGPTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGVTGATGETGSTGV 997
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-------------- 109
G +G G +G+ GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 998 TGATGETGPTGVTGETGATGPTGPTGVTGETGPTGEMGAKGVTGVTGATGSTGSTGVTGV 1057
Query: 110 -------RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G S G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1058 TGVTGSTGATGVTGSTGVTGATGSTGSTGVTGATGATGSTGSTGVTGATGVTGSTGPTGV 1117
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G G +G G +G G+
Sbjct: 1118 TGVTGSTGPTGVTGSTGVTGATGSTGATGVTGV 1150
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/168 (25%), Positives = 65/168 (38%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 39 YLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
GP +G G +G+ G +G G +G G +GS GP+G + G
Sbjct: 667 VTGPTGSTGSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATG 726
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 727 VTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVT---GPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTG 783
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G +G G +G G++ V+G
Sbjct: 784 ATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTGVTG 831
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/215 (21%), Positives = 71/215 (33%), Gaps = 36/215 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 715 ETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGSTGVTGSTG 771
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 772 ATGATGVTG---VTGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTG 828
Query: 132 PSGRLRYLGPSGR------------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G G +G G +G G +G
Sbjct: 829 VTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGSTGVTGVTGATGVTGSTGSTGVTGATGETGSTGATG 888
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G + G++
Sbjct: 889 STGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGATGVT 923
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/209 (22%), Positives = 69/209 (33%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP+GS G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 743 TGATGATGVTGPTG---VTGPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATGVTGVTGATGSTGV 799
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------- 107
G +GS G +G G +G G +G
Sbjct: 800 TGVTGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGSTGVTGV 859
Query: 108 --RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G G +G S G +G G +G G +G GP+G +
Sbjct: 860 TGATGVTGSTGSTGVTGATGETGSTGATGSTGVTGATGETGSTGVTGATGETGPTGEMGA 919
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G G
Sbjct: 920 TGVTGVTGETGPTGVTGSTGVTGETGETG 948
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/159 (25%), Positives = 61/159 (38%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +GS GP+G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 689 TGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGA 748
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 749 TGVTGPTG---VTGPTGSTGVTGSTGA---TGATGVTGVTGATGVTGVTGATGSTGVTGV 802
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 803 TGETGSTGVTGSTGATGETGVTGSTGVTGETGVTGATGE 841
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/159 (26%), Positives = 61/159 (38%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
GP+GS G +G G +G G +GS G +G G +G G
Sbjct: 664 ETGVTGPTGST---GSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGET---G 717
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 718 PTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG---VTGPTGSTGVTGSTGATG 774
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G +G G + V+G
Sbjct: 775 ATGVTGVTGATGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTG 813
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/242 (21%), Positives = 77/242 (31%), Gaps = 51/242 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G G +GS G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 512 TGVTGVTGATGSTGVTGVTGETGSTGVTGSTGATGETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGE 571
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--------------------- 111
G +GS GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 572 TGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGATGATGATGATGA 631
Query: 112 ---------LGPSG------------------RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G GP+G S G +G G +G
Sbjct: 632 TGATGVTGPTGPTGETGATGVTGVTGVTGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTGVTGATGATGV 691
Query: 145 LRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G +G G +G GP+G + G +G GP+G G + V
Sbjct: 692 TGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGV 751
Query: 202 SG 203
+G
Sbjct: 752 TG 753
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/244 (21%), Positives = 78/244 (31%), Gaps = 51/244 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G G +G G +GS GP+G + G +G
Sbjct: 539 TGSTGATGETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTGV 598
Query: 73 LRYLGPSGSLRY------------------------------LGPSG------------- 89
GP+G GP+G
Sbjct: 599 TGETGPTGVTGVTGATGATGATGATGATGATGATGATGVTGPTGPTGETGATGVTGVTGV 658
Query: 90 -----RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G G +G G +G + G +G GP
Sbjct: 659 TGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGP 718
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G + G +G GP+G G +G GP+G G +G G + V
Sbjct: 719 TGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGSTGVTGSTGATGATGV 778
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 779 TGVT 782
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/227 (21%), Positives = 71/227 (31%), Gaps = 51/227 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 530 TGETGSTGVTGSTGATGETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGE 589
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------------------------LGPSGRLRY 102
+ G +G GP+G GP+G
Sbjct: 590 MGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGATGATGATGATGATGATGVTGPTGPTGETGA 649
Query: 103 ---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G G +G S G +G G
Sbjct: 650 TGVTGVTGVTGSTGETGVTGPTGSTGSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGV 709
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G + G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 710 TGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTG 756
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/245 (21%), Positives = 78/245 (31%), Gaps = 51/245 (20%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G G +G G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 547 ETGPTGVTGSTGVTGETGVTGATGETGPTGSTGSTGETGPTGEMGATGVTGVTGETGPTG 606
Query: 72 RLRY------------------------------LGPSG------------------SLR 83
GP+G
Sbjct: 607 VTGVTGATGATGATGATGATGATGATGATGVTGPTGPTGETGATGVTGVTGVTGSTGETG 666
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLG 140
GP+G G +G G +G G +G G +G S GP+G + G
Sbjct: 667 VTGPTGSTGSTGVTGVTGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGVTGSTGETGPTGEMGATG 726
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G++
Sbjct: 727 VTGVTGETGPTGVTGVTGATGATGVTGPTGVTGPTGSTGVTGSTGATGATGVTGVTGATG 786
Query: 201 VSGLH 205
V+G+
Sbjct: 787 VTGVT 791
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/250 (18%), Positives = 73/250 (29%), Gaps = 72/250 (28%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------- 63
G +G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 173 TGVTGATGVTGATGATGETGPTGVTGVTGATGVTGPTGPTGETGVTGVTGETGPTGVTGV 232
Query: 64 ---------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
GP+G + G +G+ G +G G
Sbjct: 233 TGVTGPTGPTGEMGATGVTGVTGVTGSTGETGPTGEMGATGVTGATGATGETGSTGVTGV 292
Query: 97 SGRLRY------------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G +G G +G G +G
Sbjct: 293 TGETGPTGVTGVTGVTGVTGVTGSTGVTGATGETGPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGS 352
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S G +G G +G GP+ GP+G G +G + G +G GP
Sbjct: 353 TGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPT------GPTGETGSTGVTGVMGVTGSTGETGVTGP 406
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 407 TGSTGSTGVT 416
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/258 (18%), Positives = 77/258 (29%), Gaps = 66/258 (25%)
Query: 5 CVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 64
+VE +G +G G +G+ G +G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 147 SIVEFVNGIGVTGPTGVTGVTGATGPTGVTGATGVTGATGATGETGPTGVTGVTGATGVT 206
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLR------------------------------------YLGPS 88
GP+G G +G GP+
Sbjct: 207 GPTGPTGETGVTGVTGETGPTGVTGVTGVTGPTGPTGEMGATGVTGVTGVTGSTGETGPT 266
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------------------LRYL 121
G + G +G G +G G +G
Sbjct: 267 GEMGATGVTGATGATGETGSTGVTGVTGETGPTGVTGVTGVTGVTGVTGSTGVTGATGET 326
Query: 122 GPSGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP+G S G +G G +G G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 327 GPTGVTGSTGATGVTGSTGVTGVTGSTGSTGATGVTGVTGATGSTGVTGPTGPTGETGST 386
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G +G G++
Sbjct: 387 GVTGVMGVTGSTGETGVT 404
>gi|321311377|ref|YP_004203664.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus subtilis
BSn5]
gi|320017651|gb|ADV92637.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus subtilis
BSn5]
Length = 650
Score = 76.6 bits (187), Expect = 6e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/200 (29%), Positives = 82/200 (41%), Gaps = 6/200 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +GS GP+G GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 303 STGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTG 362
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 363 PTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETG 422
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G GP+G GP +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 423 ATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGATGVTGATGETGATGSTGSTG 482
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G + V+G+
Sbjct: 483 ETGATGSTGATGSTGVTGVT 502
Score = 76.3 bits (186), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 75/182 (41%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +GS GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 295 TGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGL 354
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G S GP
Sbjct: 355 TGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGP 414
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 415 TGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGATGVTGATGETGA 474
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 475 TG 476
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 76/181 (41%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS GP+G GP+G G +GS GP+G GP+G G +GS
Sbjct: 289 TGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGL 348
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 349 TGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGL 408
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 409 TGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGATGVTGA 468
Query: 205 H 205
Sbjct: 469 T 469
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 75/188 (39%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +GS GP+G GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 330 STGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTG 389
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 390 PTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETG 449
Query: 132 PSG---------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 450 ATGVTGPTGATGATGVTGATGETGATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTGVTGPTGATG 509
Query: 183 YLGPSGRL 190
GP+G
Sbjct: 510 VTGPTGST 517
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 75/181 (41%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 289 TGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGL 348
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 349 TGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGL 408
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G+
Sbjct: 409 TGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATG---VTGPTGATGATGV 465
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 466 T 466
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/230 (23%), Positives = 76/230 (33%), Gaps = 48/230 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------------------------SLRYLGPSGRLRY 48
GP+G G +G+ G +G + G +G
Sbjct: 202 TGPTGETGATGVTGATGVTGATGVTGLTGLTGPTGPTGPTGPTGETGATGVTGATGVTGA 261
Query: 49 LG------------------------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
G +GS GP+G GP+G G +GS
Sbjct: 262 TGVTGLTGLTGPTGPTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGL 321
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 322 TGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGL 381
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 382 TGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTG 431
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/124 (27%), Positives = 49/124 (39%), Gaps = 12/124 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP+G G +GS GP+G GP+G + GP+G
Sbjct: 403 TGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGSTGLTGPTGLTGSTGPTGPTGETGATGVTGPTGATGA 462
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +GS G +G G +G G GP+G GP+G
Sbjct: 463 TGVTGATGETGATGSTGSTGETGATGSTGATGSTGVTG------VTGPTGATGVTGPTGS 516
Query: 127 LNSD 130
++
Sbjct: 517 TGAN 520
>gi|7510076|pir||T31613 hypothetical protein Y50E8A.i - Caenorhabditis elegans
Length = 836
Score = 76.3 bits (186), Expect = 7e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/190 (29%), Positives = 94/190 (49%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G R+ Y G ++Y G ++Y G R++Y G ++Y G R++Y G R+
Sbjct: 198 GKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRV 257
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+Y G + Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R+ G
Sbjct: 258 KYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKP 317
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
R++Y G R++Y G R++Y+ R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y
Sbjct: 318 QRVKYGGKQQRVKYSGKPQRVKYVWKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYS 377
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
G ++ G
Sbjct: 378 GKPQRVKYGG 387
Score = 75.9 bits (185), Expect = 8e-12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/190 (30%), Positives = 93/190 (48%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G R+ Y G + Y G ++Y G R++Y G ++Y G R++Y G R+
Sbjct: 189 GKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRV 248
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+Y G ++Y G R+ Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R+ G
Sbjct: 249 KYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKP 308
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y+ R+ Y G R++Y G R++Y
Sbjct: 309 QRVEYGGKPQRVKYGGKQQRVKYSGKPQRVKYVWKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYG 368
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
G ++ SG
Sbjct: 369 GKPQRVKYSG 378
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 91/186 (48%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y G + Y G + Y G R++Y G ++Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 184 RVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGG 243
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R+ Y G R+ G R++
Sbjct: 244 KPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVK 303
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y+ R+ Y G R++Y G
Sbjct: 304 YGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKQQRVKYSGKPQRVKYVWKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQ 363
Query: 198 GLRVSG 203
++ G
Sbjct: 364 RVKYGG 369
Score = 73.6 bits (179), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 91/186 (48%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y G + Y G R+ Y G ++Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 175 RVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSG 234
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R+ G R++
Sbjct: 235 KPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVK 294
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y+ R+ Y G
Sbjct: 295 YGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKQQRVKYSGKPQRVKYVWKPQRVEYGGKPQ 354
Query: 198 GLRVSG 203
++ G
Sbjct: 355 RVKYGG 360
Score = 72.4 bits (176), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 89/179 (49%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G R++Y G ++Y G ++Y G R++Y G ++Y G R+ Y G R+
Sbjct: 216 GKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRV 275
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+Y G + Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R+ G
Sbjct: 276 KYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKQQRVKYSGKP 335
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
R++Y+ R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ Y
Sbjct: 336 QRVKYVWKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVPY 394
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 87/176 (49%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y ++Y G R+ Y G + Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 166 RVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGG 225
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R+ G R+
Sbjct: 226 KPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVE 285
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y+
Sbjct: 286 YGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKQQRVKYSGKPQRVKYV 341
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 89/183 (48%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y ++Y R++Y G + Y G R+ Y G R++Y G
Sbjct: 157 RVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSG 216
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ G R++
Sbjct: 217 KPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVK 276
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 277 YGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKQQRVKYSGKPQ 336
Query: 198 GLR 200
++
Sbjct: 337 RVK 339
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 89/186 (47%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y ++Y R++Y ++Y G R+ Y G R+ Y G
Sbjct: 148 RVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGG 207
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ G R+
Sbjct: 208 KPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVE 267
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G
Sbjct: 268 YGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKQQ 327
Query: 198 GLRVSG 203
++ SG
Sbjct: 328 RVKYSG 333
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 87/179 (48%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G R++Y G ++Y G ++Y G R++Y G + Y G R++Y G R+
Sbjct: 225 GKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRV 284
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
Y G ++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R+
Sbjct: 285 EYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKQQRVKYSGKPQRVKYVWKP 344
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ Y R++Y
Sbjct: 345 QRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVPYDVKPQRVQY 403
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 87/188 (46%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y ++Y R++Y ++Y R++Y G R+ Y G
Sbjct: 139 RVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGG 198
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ G R++
Sbjct: 199 KPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVK 258
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R+ Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R+ Y G
Sbjct: 259 YSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQ 318
Query: 198 GLRVSGLH 205
++ G
Sbjct: 319 RVKYGGKQ 326
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 87/186 (46%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y G ++Y ++Y R++Y ++Y R++Y R++Y
Sbjct: 121 RVKYGGKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGW 180
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y G R+ Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R+ G R++
Sbjct: 181 KPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVK 240
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R+ Y G R++Y G
Sbjct: 241 YGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQ 300
Query: 198 GLRVSG 203
++ G
Sbjct: 301 RVKYGG 306
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 84/179 (46%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G R++Y ++Y ++Y R++Y ++Y R++Y R+
Sbjct: 126 GKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRV 185
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+Y G + Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ G
Sbjct: 186 KYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKP 245
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R++Y
Sbjct: 246 QRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKY 304
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/175 (26%), Positives = 83/175 (47%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y G ++Y ++Y G R++Y ++Y R++Y R++Y
Sbjct: 103 RVKYGGKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSW 162
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y R++Y R++Y G R+ Y G R+ Y G R+ G R++
Sbjct: 163 KPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVK 222
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y
Sbjct: 223 YGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKY 277
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 87/190 (45%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G R++Y ++Y G ++Y R++Y ++Y R++Y R+
Sbjct: 108 GKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRV 167
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+Y ++Y R++Y G R+ Y G R+ Y G R++Y G R+ G
Sbjct: 168 KYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKP 227
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ Y G R++Y G R+ Y
Sbjct: 228 QRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVEYG 287
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
G ++ G
Sbjct: 288 GKPQRVKYGG 297
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/186 (25%), Positives = 87/186 (46%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y G ++Y R++Y G ++Y R++Y R++Y
Sbjct: 94 RVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSW 153
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y R++Y R++Y R++Y G R+ Y G R+ G R++
Sbjct: 154 KPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVK 213
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R+ Y G
Sbjct: 214 YSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQ 273
Query: 198 GLRVSG 203
++ G
Sbjct: 274 RVKYGG 279
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/177 (25%), Positives = 84/177 (47%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y ++Y G R++Y ++Y G R++Y R++Y
Sbjct: 85 RVKYGWKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYSWKPQRVKYSW 144
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y R++Y R++Y R++Y R++Y G R+ G R+
Sbjct: 145 KPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVE 204
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 205 YGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSG 261
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/186 (25%), Positives = 86/186 (46%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y ++Y R++Y G ++Y R++Y G R++Y
Sbjct: 76 RVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYSW 135
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y R++Y R++Y R++Y R++Y R+ G R+
Sbjct: 136 KPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVE 195
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 196 YGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQ 255
Query: 198 GLRVSG 203
++ SG
Sbjct: 256 RVKYSG 261
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/186 (24%), Positives = 84/186 (45%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R++Y ++Y ++Y R++Y ++Y G R++Y R++Y G
Sbjct: 67 RVKYGWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVKYGWKPQRVKYGG 126
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
++Y R++Y R++Y R++Y R++Y R+ R++
Sbjct: 127 KPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVK 186
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
Y G R+ Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 187 YSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQ 246
Query: 198 GLRVSG 203
++ G
Sbjct: 247 RVKYGG 252
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/189 (23%), Positives = 84/189 (44%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P R++Y ++Y ++Y R++Y ++Y R++Y G R++
Sbjct: 55 PQRRVKYGWKPQRVKYGWKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVK 114
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
Y ++Y G R++Y R++Y R++Y R++Y R+
Sbjct: 115 YGWKPQRVKYGGKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYSWKPQRVKYGWTPQ 174
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
R++Y R++Y G R+ Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G
Sbjct: 175 RVKYGWKPQRVKYSGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKYSG 234
Query: 195 LSDGLRVSG 203
++ G
Sbjct: 235 KPQRVKYGG 243
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/178 (24%), Positives = 81/178 (45%), Gaps = 1/178 (0%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
E + L + +L + S +L + S + + +L + S + P R++
Sbjct: 447 ATESKIWLDATESKIWLEATESKIWLEATESKIWWEATESKIWLEATESKIWWKPQ-RVK 505
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
Y R++Y ++Y G R++Y G R++Y R++Y R++Y G
Sbjct: 506 YSWKPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVKYSGKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQ 565
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
R+ G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y
Sbjct: 566 RVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKY 623
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/172 (25%), Positives = 79/172 (45%), Gaps = 1/172 (0%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+L + S +L + S +L + + + S +L + + P R++Y
Sbjct: 453 WLDATESKIWLEATESKIWLEATESKIWWEATESKIWLEATESKIWWKPQ-RVKYSWKPQ 511
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
++Y R++Y G R++Y G R++Y R++Y R+ G R+ Y G
Sbjct: 512 RVKYGWKPQRVKYSGKPQRVKYSGKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYGGKPQRVEYGG 571
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y
Sbjct: 572 KPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVKY 623
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/183 (22%), Positives = 80/183 (43%), Gaps = 1/183 (0%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+ + S +L + S +L + +L + S + + +L + + P
Sbjct: 444 WWEATESKIWLDATESKIWLEATESKIWLEATESKIWWEATESKIWLEATESKIWWKPQ- 502
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
++Y R++Y R++Y G R++Y G R++Y R+ R++Y G
Sbjct: 503 RVKYSWKPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVKYSGKPQRVKYGWTPQRVKYGWKPQRVKYGG 562
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
R+ Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G R++Y G ++
Sbjct: 563 KPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVKYGGKPQRVK 622
Query: 201 VSG 203
G
Sbjct: 623 YGG 625
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/183 (22%), Positives = 79/183 (43%), Gaps = 1/183 (0%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+ + S + + S +L + +L + S +L + + + +L +
Sbjct: 435 WWEATESKIWWEATESKIWLDATESKIWLEATESKIWLEATESKIWWEATESKIWLEATE 494
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S + P R++Y R++Y R++Y G R++Y G R+ R++Y
Sbjct: 495 SKIWWKPQ-RVKYSWKPQRVKYGWKPQRVKYSGKPQRVKYSGKPQRVKYGWTPQRVKYGW 553
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
R++Y G R+ Y G R+ Y G R++Y G R++Y G R++Y G ++
Sbjct: 554 KPQRVKYGGKPQRVEYGGKPQRVEYGGKPQRVKYGGKPQRVKYGGKPQRVKYSGKPQRVK 613
Query: 201 VSG 203
G
Sbjct: 614 YGG 616
>gi|307190569|gb|EFN74551.1| hypothetical protein EAG_11073 [Camponotus floridanus]
Length = 131
Score = 75.9 bits (185), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/119 (25%), Positives = 57/119 (47%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ + G +G + G +GS + G +GS + G +G + G +GS + G +G + G
Sbjct: 12 TSESTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTG 71
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+G + G +GS + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 72 STGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGST 130
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/117 (25%), Positives = 54/117 (46%)
Query: 20 RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
G +GS + G +GS + G +G + G +GS + G +G + G +G + G +
Sbjct: 14 ESTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGST 73
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GS + G +G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G
Sbjct: 74 GSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGST 130
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/117 (24%), Positives = 53/117 (45%)
Query: 29 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
G +GS + G +G + G +GS + G +G + G +G + G +GS + G +
Sbjct: 14 ESTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGST 73
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G + G +G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 74 GSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGST 130
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/117 (23%), Positives = 52/117 (44%)
Query: 38 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 97
G +G + G +GS + G +G + G +G + G +GS + G +G + G +
Sbjct: 14 ESTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGST 73
Query: 98 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G + G +G + G +G + G +G G +G + G +G + G +G
Sbjct: 74 GSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGST 130
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/117 (23%), Positives = 52/117 (44%)
Query: 47 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
G +GS + G +G + G +G + G +GS + G +G + G +G + G +
Sbjct: 14 ESTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGST 73
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G + G +G + G +G G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 74 GSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGSTGFTGSTGST 130
>gi|313900704|ref|ZP_07834197.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
gi|312954766|gb|EFR36441.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
Length = 537
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/204 (27%), Positives = 82/204 (40%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
GP+G GP+GS GP+G+ G G G +G+ G SG GP
Sbjct: 92 TGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGP 151
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+G GP+GS G +G G +G G P+G GP+G + GP
Sbjct: 152 TGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGP 211
Query: 124 ---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G+ GP+G G +G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGS 271
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+GP+G G++ +SG+
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGI 295
Score = 73.9 bits (180), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 77/186 (41%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+GS G +G+ G +G G +G+ GP+G GP+G +
Sbjct: 150 GPTGATGNTGPTGS---DGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAI 206
Query: 74 RYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP +G GP+G G +G GP+G G G G +G +D
Sbjct: 207 GVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGAD 266
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 267 GIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGST 326
Query: 191 RYLGLS 196
GLS
Sbjct: 327 GATGLS 332
Score = 66.6 bits (161), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/201 (28%), Positives = 82/201 (40%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR------------YLGPS 61
G +G GP+G+ GP+G+ GP+G GP G+ GP+
Sbjct: 36 GATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGISGATGPT 95
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRL 118
G GP+G GP+G+ G G G +G G SG GP+G
Sbjct: 96 GANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGAT 155
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP- 177
GP+G SDG +G G +G G +G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 156 GNTGPTG---SDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPI 212
Query: 178 --SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G+ GP+G G++
Sbjct: 213 GATGQNGEAGPTGPAGNTGVT 233
Score = 66.2 bits (160), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 78/206 (37%), Gaps = 21/206 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------------PSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N GP+G G G+ G +G+ G P+G GP+GS G
Sbjct: 109 NTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGATGNTGPTGSDGATG 168
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLR 110
+G G +G GP+G+ GP+G + GP +G+ GP+G
Sbjct: 169 ATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAG 228
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G GP+G + G G G +G G G +GP+G G +G
Sbjct: 229 NTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITG 288
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 289 ATGISGITGADGATGPTGATGSTGAN 314
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ GP+GS GP+G G G+ G +G G SG G SG
Sbjct: 91 ATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASG 150
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
P+G GP+G G +G G +G G G GP+G G
Sbjct: 151 ------PTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGV---SGPTGATGNTG 201
Query: 141 PSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
P+G + GP +G+ GP+G G +G GP+G G G G +
Sbjct: 202 PTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATG 261
Query: 198 GLRVSGLH 205
G+
Sbjct: 262 NTGADGIQ 269
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/195 (26%), Positives = 80/195 (41%), Gaps = 6/195 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP+G++ GP +G+ GP+G G +G GP
Sbjct: 182 TGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGP 241
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G+ G +G G G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 242 TGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGS---TGATGITGATGISGITGA 298
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
DG +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 299 DGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGA 358
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+G + +G+
Sbjct: 359 TGAIGNTGATGTNGV 373
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 75/185 (40%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G + GP +G +G GP+G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 199 NTGPTGAIGVTGP------IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDG 252
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G +GP+G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 253 NTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTG 312
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G +G +G
Sbjct: 313 ANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGAIGNTGATG 369
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 370 TNGVT 374
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G+ GP+G G +G+ GP+G G G+ G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGS 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+GS G +G G +G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGA 328
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G +G +G G +G GP G
Sbjct: 329 TGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGAIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGV 385
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 386 TGAN 389
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/187 (27%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A N G +G GP+G+ G G+ G +G G GS +GP+G G
Sbjct: 227 AGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGI 286
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 287 TGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGN 343
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G +G +G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 344 TGANGSTGPTGPTGATGAIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANG---ITGPTGA 397
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 398 TGSTGAT 404
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G+ G G G +G+ G G +GP+G
Sbjct: 221 AGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGS 280
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 281 TGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGA 337
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP+G +G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 338 TGATGNTGANGSTGPTGPTGATGAIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANG 390
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 68/182 (37%), Gaps = 21/182 (11%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------- 83
+GS G +G GP+G+ GP+G GP+G GP G+
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 84 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRY 138
GP+G GP+G GP+G G G G +G + G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGV 208
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 209 TG 210
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 62/164 (37%), Gaps = 16/164 (9%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------- 101
+GS G +G GP+G GP+G+ GP+G GP G
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 102 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRY 156
GP+G GP+G GP+G + G G G +G G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP+G GP+G G +G G +G G +DG+
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATG-ADGVS 191
>gi|407473259|ref|YP_006787659.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Clostridium
acidurici 9a]
gi|407049767|gb|AFS77812.1| collagen triple helix repeat domain protein [Clostridium acidurici
9a]
Length = 436
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/191 (29%), Positives = 83/191 (43%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS--LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR-------- 63
GP+G +GP G GP+G+ + GP+G +GP G GP+G
Sbjct: 94 GPTGATGLIGPIGPTGATGPTGAGIIGPTGPTGATGLIGPIGPTGATGPTGAGIIGPTGP 153
Query: 64 -----LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
LG +G +GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 154 TGPTGPTGLGITGATGPIGPTGPTGADGATGPTGATGPTGANGVTGPTGATGATGPTGAN 213
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
+GP+G +DG +G G +G GP+G GP+G +GP+G G +
Sbjct: 214 GLIGPTGATGADGATGPTGATGATGADGATGPTGATGATGPTGANGLIGPTGPTGADGAT 273
Query: 179 GRLRYLGPSGR 189
G GP+G
Sbjct: 274 GPTGATGPTGA 284
Score = 72.8 bits (177), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 82/186 (44%), Gaps = 13/186 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY-------------LGPSGSLRYLGPSG 62
+G + GP+G+ +GP G GP+G LG +G+ +GP+G
Sbjct: 116 AGIIGPTGPTGATGLIGPIGPTGATGPTGAGIIGPTGPTGPTGPTGLGITGATGPIGPTG 175
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G GP+G+ GP+G GP+G +GP+G G +G G
Sbjct: 176 PTGADGATGPTGATGPTGANGVTGPTGATGATGPTGANGLIGPTGATGADGATGPTGATG 235
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+G + GP+G GP+G +GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 236 ATGADGATGPTGATGATGPTGANGLIGPTGPTGADGATGPTGATGPTGANGATGPTGPTG 295
Query: 183 YLGPSG 188
GP+G
Sbjct: 296 ATGPTG 301
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 80/182 (43%), Gaps = 19/182 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS----------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 57
GP+G +GP G GP+G+ L G +G + GP+G+
Sbjct: 123 GPTGATGLIGPIGPTGATGPTGAGIIGPTGPTGPTGPTGLGITGATGPIGPTGPTGADGA 182
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G GP+G GP+G+ GP+G +GP+G G +G G +G
Sbjct: 183 TGPTGA---TGPTGANGVTGPTGATGATGPTGANGLIGPTGATGADGATGPTGATGATGA 239
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G + GP+G +GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 240 DGATGPTGATGATGPTGANGLIGPTGPTGADGATGPTGATGPTGANGATGPTGPTGATGP 299
Query: 178 SG 179
+G
Sbjct: 300 TG 301
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 78/183 (42%), Gaps = 20/183 (10%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
SG + GP+G+ +GP G GP+G+ +GP+G P+G +GP G
Sbjct: 87 SGIIGPTGPTGATGLIGPIGPTGATGPTGA-GIIGPTG------PTGATGLIGPIGPTGA 139
Query: 85 LGPSGRLRY-------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G LG +G +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 140 TGPTGAGIIGPTGPTGPTGPTGLGITGATGPIGPTGPTGADGATGPTGATGPTGANGVTG 199
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G +GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 200 PTGATGATGPTGANGLIGPTGATGADGATGPTGATGATGADGATGPTGATGATGPTGANG 259
Query: 192 YLG 194
+G
Sbjct: 260 LIG 262
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/119 (31%), Positives = 55/119 (46%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ GP+G+ +GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 190 GPTGANGVTGPTGATGATGPTGANGLIGPTGATGADGATGPTGATGATGADGATGPTGAT 249
Query: 74 RYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ + GP+G GP+G G +G GP+G GP+ NS
Sbjct: 250 GATGPTGANGLIGPTGPTGADGATGPTGATGPTGANGATGPTGPTGATGPTGPAVTSNS 308
>gi|239626004|ref|ZP_04669035.1| conserved hypothetical protein [Clostridiales bacterium 1_7_47_FAA]
gi|239520234|gb|EEQ60100.1| conserved hypothetical protein [Clostridiales bacterium 1_7_47FAA]
Length = 393
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/195 (33%), Positives = 77/195 (39%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP GR GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP GR
Sbjct: 41 GPEGRQGATGPTGPRGIPGPEGRQGATGPAGPRGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQ 100
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLNSD 130
GP+G GP GR GP+G GP GR GP+G + GP G
Sbjct: 101 GETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPMGLQGVTGPRGATGDT 160
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP+G +GP G G G GP G
Sbjct: 161 GPQGATGEDGPRGNTGATGPQGEAGPTGPAGPQGPMGPQGDPGPEGVQGLRGATGPQGPA 220
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGLH 205
G + +G+
Sbjct: 221 GPQGDAGNTGAAGIQ 235
Score = 75.1 bits (183), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/196 (35%), Positives = 79/196 (40%), Gaps = 10/196 (5%)
Query: 5 CVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 64
C A +GP G GP G GP+G GP GR GP+G GP GR
Sbjct: 26 CCPGPAGPMGPQG---IPGPEGRQGATGPTGPRGIPGPEGRQGATGPAGPRGIPGPEGRQ 82
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G GP G GP+G GP GR GP+G GP GR GP+
Sbjct: 83 GETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPT 142
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP G GP G GP G GP G GP G GP+G +
Sbjct: 143 ------GPMGLQGVTGPRGATGDTGPQGATGEDGPRGNTGATGPQGEAGPTGPAGPQGPM 196
Query: 185 GPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP G G+ GLR
Sbjct: 197 GPQGDPGPEGVQ-GLR 211
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/196 (33%), Positives = 77/196 (39%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G GP GR GP+G GP GR GP+G
Sbjct: 49 TGPTGPRGIPGPEGRQGATGPAGPRGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGP 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G GP+G GP GR GP+G + GP G GP G
Sbjct: 109 QGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPMGLQGVTGPRGATGDTGPQGATGE 168
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
DGP G GP G GP+G +GP G G G GP G G +G
Sbjct: 169 DGPRGNTGATGPQGEAGPTGPAGPQGPMGPQGDPGPEGVQGLRGATGPQGPAGPQGDAGN 228
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ +GL
Sbjct: 229 TGAAGIQGPTGPTGLQ 244
Score = 66.2 bits (160), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/179 (32%), Positives = 73/179 (40%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP G GP+G GP GR GP+G GP GR GP+G
Sbjct: 84 ETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTG 143
Query: 72 RLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+ GP G+ GP G GP G GP G GP+G +GP G
Sbjct: 144 PMGLQGVTGPRGATGDTGPQGATGEDGPRGNTGATGPQGEAGPTGPAGPQGPMGPQGDPG 203
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+G G GP GP+G G +G GP+G GP+G + GP+
Sbjct: 204 PEGVQGLRGATGPQ------GPAGPQGDAGNTGAAGIQGPTGPTGLQGPTGPMGPTGPT 256
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/120 (36%), Positives = 53/120 (44%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP GR GP+G GP GR GP+G GP GR GP+G
Sbjct: 31 AGPMGPQGIPGPEGRQGATGPTGPRGIPGPEGRQGATGPAGPRGIPGPEGRQGETGPTGP 90
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP GR GP+G GP GR GP+G GP GR G + + + G+
Sbjct: 91 QGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPQGIPGPEGRQGETGPTGPMGLQGV 150
>gi|373124346|ref|ZP_09538187.1| hypothetical protein HMPREF0982_03116 [Erysipelotrichaceae
bacterium 21_3]
gi|371659314|gb|EHO24579.1| hypothetical protein HMPREF0982_03116 [Erysipelotrichaceae
bacterium 21_3]
Length = 537
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/204 (27%), Positives = 82/204 (40%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
GP+G GP+GS GP+G+ G G G +G+ G SG GP
Sbjct: 92 TGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGP 151
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+G GP+GS G +G G +G G P+G GP+G + GP
Sbjct: 152 TGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGP 211
Query: 124 ---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G+ GP+G G +G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGS 271
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+GP+G G++ +SG+
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGI 295
Score = 73.9 bits (180), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 77/186 (41%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+GS G +G+ G +G G +G+ GP+G GP+G +
Sbjct: 150 GPTGATGNTGPTGS---DGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAI 206
Query: 74 RYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP +G GP+G G +G GP+G G G G +G +D
Sbjct: 207 GVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGAD 266
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 267 GIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGST 326
Query: 191 RYLGLS 196
GLS
Sbjct: 327 GATGLS 332
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/201 (28%), Positives = 82/201 (40%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR------------YLGPS 61
G +G GP+G+ GP+G+ GP+G GP G+ GP+
Sbjct: 36 GATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGISGATGPT 95
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRL 118
G GP+G GP+G+ G G G +G G SG GP+G
Sbjct: 96 GANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGAT 155
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP- 177
GP+G SDG +G G +G G +G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 156 GNTGPTG---SDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPI 212
Query: 178 --SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G+ GP+G G++
Sbjct: 213 GATGQNGEAGPTGPAGNTGVT 233
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 78/206 (37%), Gaps = 21/206 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------------PSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N GP+G G G+ G +G+ G P+G GP+GS G
Sbjct: 109 NTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGATGNTGPTGSDGATG 168
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLR 110
+G G +G GP+G+ GP+G + GP +G+ GP+G
Sbjct: 169 ATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAG 228
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G GP+G + G G G +G G G +GP+G G +G
Sbjct: 229 NTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITG 288
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 289 ATGISGITGADGATGPTGATGSTGAN 314
Score = 65.9 bits (159), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ GP+GS GP+G G G+ G +G G SG G SG
Sbjct: 91 ATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASG 150
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
P+G GP+G G +G G +G G G GP+G G
Sbjct: 151 ------PTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGV---SGPTGATGNTG 201
Query: 141 PSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
P+G + GP +G+ GP+G G +G GP+G G G G +
Sbjct: 202 PTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATG 261
Query: 198 GLRVSGLH 205
G+
Sbjct: 262 NTGADGIQ 269
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/195 (26%), Positives = 80/195 (41%), Gaps = 6/195 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP+G++ GP +G+ GP+G G +G GP
Sbjct: 182 TGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGP 241
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G+ G +G G G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 242 TGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGS---TGATGITGATGISGITGA 298
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
DG +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 299 DGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGA 358
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+G + +G+
Sbjct: 359 TGSIGNTGATGTNGV 373
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 75/185 (40%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G + GP +G +G GP+G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 199 NTGPTGAIGVTGP------IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDG 252
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G +GP+G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 253 NTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTG 312
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G +G +G
Sbjct: 313 ANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTGATG 369
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 370 TNGVT 374
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G+ GP+G G +G+ GP+G G G+ G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGS 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+GS G +G G +G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGA 328
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G +G +G G +G GP G
Sbjct: 329 TGLSGIQGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGV 385
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 386 TGAN 389
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/187 (27%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A N G +G GP+G+ G G+ G +G G GS +GP+G G
Sbjct: 227 AGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGI 286
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 287 TGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGN 343
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G +G +G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 344 TGANGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANG---IAGPTGA 397
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 398 TGSTGAT 404
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G+ G G G +G+ G G +GP+G
Sbjct: 221 AGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGS 280
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 281 TGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGA 337
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP+G +G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 338 TGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANG 390
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 68/182 (37%), Gaps = 21/182 (11%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------- 83
+GS G +G GP+G+ GP+G GP+G GP G+
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 84 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRY 138
GP+G GP+G GP+G G G G +G + G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGV 208
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 209 TG 210
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 62/164 (37%), Gaps = 16/164 (9%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------- 101
+GS G +G GP+G GP+G+ GP+G GP G
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 102 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRY 156
GP+G GP+G GP+G + G G G +G G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP+G GP+G G +G G +G G +DG+
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATG-ADGVS 191
>gi|422329030|ref|ZP_16410056.1| hypothetical protein HMPREF0981_03376 [Erysipelotrichaceae
bacterium 6_1_45]
gi|371658074|gb|EHO23358.1| hypothetical protein HMPREF0981_03376 [Erysipelotrichaceae
bacterium 6_1_45]
Length = 537
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/204 (27%), Positives = 82/204 (40%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
GP+G GP+GS GP+G+ G G G +G+ G SG GP
Sbjct: 92 TGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGP 151
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+G GP+GS G +G G +G G P+G GP+G + GP
Sbjct: 152 TGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGP 211
Query: 124 ---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G+ GP+G G +G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGS 271
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+GP+G G++ +SG+
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGI 295
Score = 73.9 bits (180), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 77/186 (41%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+GS G +G+ G +G G +G+ GP+G GP+G +
Sbjct: 150 GPTGATGNTGPTGS---DGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAI 206
Query: 74 RYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP +G GP+G G +G GP+G G G G +G +D
Sbjct: 207 GVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGAD 266
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 267 GIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGST 326
Query: 191 RYLGLS 196
GLS
Sbjct: 327 GATGLS 332
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 81/195 (41%), Gaps = 6/195 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP+G++ GP +G+ GP+G G +G GP
Sbjct: 182 TGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGP 241
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G+ G +G G G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 242 TGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGS---TGATGITGATGISGITGA 298
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
DG +G G +G GP+G G +G LG +G G +G GP+G
Sbjct: 299 DGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGILGATGATGNTGANGSTGPTGPTGA 358
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+G + +G+
Sbjct: 359 TGSIGNTGATGTNGV 373
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 77/186 (41%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
G +G G +GS G +G+ GP+G GP+G++ GP +G+ GP+
Sbjct: 165 GATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPT 224
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ GP+G G G G +G G G +GP+G +
Sbjct: 225 GPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGAT 284
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G LG +G
Sbjct: 285 GITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGILGATGAT 341
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 342 GNTGAN 347
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 78/206 (37%), Gaps = 21/206 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------------PSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N GP+G G G+ G +G+ G P+G GP+GS G
Sbjct: 109 NTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGATGNTGPTGSDGATG 168
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLR 110
+G G +G GP+G+ GP+G + GP +G+ GP+G
Sbjct: 169 ATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAG 228
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G GP+G + G G G +G G G +GP+G G +G
Sbjct: 229 NTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITG 288
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 289 ATGISGITGADGATGPTGATGSTGAN 314
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ GP+GS GP+G G G+ G +G G SG G SG
Sbjct: 91 ATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASG 150
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
P+G GP+G G +G G +G G G GP+G G
Sbjct: 151 ------PTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGV---SGPTGATGNTG 201
Query: 141 PSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
P+G + GP +G+ GP+G G +G GP+G G G G +
Sbjct: 202 PTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATG 261
Query: 198 GLRVSGLH 205
G+
Sbjct: 262 NTGADGIQ 269
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/199 (28%), Positives = 81/199 (40%), Gaps = 24/199 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------YLGPSGSLRYLGP 60
GP+G GP+G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP
Sbjct: 44 TGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGISGATGPTGANGTAGP 103
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G GP+G G G+ G +G G SG G S GP+G
Sbjct: 104 TGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGAS------GPTGATGN 157
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--- 177
GP+G SDG +G G +G G +G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 158 TGPTG---SDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGA 214
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G+ GP+G G++
Sbjct: 215 TGQNGEAGPTGPAGNTGVT 233
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/189 (27%), Positives = 77/189 (40%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP+G++ GP G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 192 GPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGD---TGPTGNTGAT 248
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G G +G+ G G +GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 249 GNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGAT 308
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
S G +G GP+G G +G LG +G G +G GP+G +G +
Sbjct: 309 GSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGILGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNT 365
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G++
Sbjct: 366 GATGTNGVT 374
Score = 63.9 bits (154), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 75/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G+ GP+G G +G+ GP+G G G+ G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGS 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+GS G +G G +G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGA 328
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G LG +G G +G GP+G +G +G G +G GP G
Sbjct: 329 TGLSGILGATGATGNTGANGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGV 385
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 386 TGAN 389
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 76/187 (40%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A N G +G GP+G+ G G+ G +G G GS +GP+G G
Sbjct: 227 AGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGSTGPIGPTGSTGATGI 286
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G LG +G +
Sbjct: 287 TGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGILGATGATGN 343
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G +G +G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 344 TGANGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANG---IAGPTGA 397
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 398 TGSTGAT 404
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 68/182 (37%), Gaps = 21/182 (11%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------- 83
+GS G +G GP+G+ GP+G GP+G GP G+
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 84 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRY 138
GP+G GP+G GP+G G G G +G + G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGV 208
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 209 TG 210
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 62/164 (37%), Gaps = 16/164 (9%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------- 101
+GS G +G GP+G GP+G+ GP+G GP G
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 102 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRY 156
GP+G GP+G GP+G + G G G +G G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP+G GP+G G +G G +G G +DG+
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATG-ADGVS 191
>gi|346315884|ref|ZP_08857396.1| hypothetical protein HMPREF9022_03053 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
gi|345904246|gb|EGX73995.1| hypothetical protein HMPREF9022_03053 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
Length = 537
Score = 75.5 bits (184), Expect = 1e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/204 (27%), Positives = 82/204 (40%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
GP+G GP+GS GP+G+ G G G +G+ G SG GP
Sbjct: 92 TGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGP 151
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+G GP+GS G +G G +G G P+G GP+G + GP
Sbjct: 152 TGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGP 211
Query: 124 ---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G+ GP+G G +G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGA 271
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+GP+G G++ +SG+
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGI 295
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 77/186 (41%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+GS G +G+ G +G G +G+ GP+G GP+G +
Sbjct: 150 GPTGATGNTGPTGS---DGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAI 206
Query: 74 RYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP +G GP+G G +G GP+G G G G +G +D
Sbjct: 207 GVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGAD 266
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 267 GIQGATGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGST 326
Query: 191 RYLGLS 196
GLS
Sbjct: 327 GATGLS 332
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/201 (28%), Positives = 82/201 (40%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR------------YLGPS 61
G +G GP+G+ GP+G+ GP+G GP G+ GP+
Sbjct: 36 GATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGISGATGPT 95
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRL 118
G GP+G GP+G+ G G G +G G SG GP+G
Sbjct: 96 GANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGAT 155
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP- 177
GP+G SDG +G G +G G +G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 156 GNTGPTG---SDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPI 212
Query: 178 --SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G+ GP+G G++
Sbjct: 213 GATGQNGEAGPTGPAGNTGVT 233
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 78/206 (37%), Gaps = 21/206 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------------PSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N GP+G G G+ G +G+ G P+G GP+GS G
Sbjct: 109 NTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASGPTGATGNTGPTGSDGATG 168
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLR 110
+G G +G GP+G+ GP+G + GP +G+ GP+G
Sbjct: 169 ATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAG 228
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G GP+G + G G G +G G G +GP+G G +G
Sbjct: 229 NTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGATGPIGPTGSTGATGITG 288
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 289 ATGISGITGADGATGPTGATGSTGAN 314
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ GP+GS GP+G G G+ G +G G SG G SG
Sbjct: 91 ATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGASG 150
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
P+G GP+G G +G G +G G G GP+G G
Sbjct: 151 ------PTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGV---SGPTGATGNTG 201
Query: 141 PSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
P+G + GP +G+ GP+G G +G GP+G G G G +
Sbjct: 202 PTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATG 261
Query: 198 GLRVSGLH 205
G+
Sbjct: 262 NTGADGIQ 269
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/195 (26%), Positives = 80/195 (41%), Gaps = 6/195 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP+G++ GP +G+ GP+G G +G GP
Sbjct: 182 TGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGP 241
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G+ G +G G G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 242 TGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGATGPIGPTGS---TGATGITGATGISGITGA 298
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
DG +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 299 DGATGPTGATGSTGANGITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGTNGSTGPTGPTGA 358
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+G + +G+
Sbjct: 359 TGSIGNTGATGTNGV 373
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 76/189 (40%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP+G++ GP G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 192 GPTGATGNTGPTGAIGVTGPIGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGD---TGPTGNTGAT 248
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G G +G+ G G +GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 249 GNDGNTGATGATGNTGADGIQGATGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGAT 308
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
S G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G +G +
Sbjct: 309 GSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGTNGSTGPTGPTGATGSIGNT 365
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G++
Sbjct: 366 GATGTNGVT 374
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G+ GP+G G +G+ GP+G G G+ G +G G G
Sbjct: 212 IGATGQNGEAGPTGPAGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGA 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+GS G +G G +G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 272 TGPIGPTGSTGATGITGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGA 328
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G +G +G G +G GP G
Sbjct: 329 TGLSGIQGATGATGNTGTNGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGV 385
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 386 TGAN 389
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/187 (26%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A N G +G GP+G+ G G+ G +G G G+ +GP+G G
Sbjct: 227 AGNTGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGATGPIGPTGSTGATGI 286
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 287 TGATGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGN 343
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G +G +G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 344 TGTNGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANG---ITGPTGA 397
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 398 TGSTGAT 404
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/189 (25%), Positives = 73/189 (38%), Gaps = 9/189 (4%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G+ G +G+ G G +GP+GS G +G
Sbjct: 230 TGVTGATGDTGPTGNTGATGNDGNTGATGATGNTGADGIQGATGPIGPTGSTGATGITGA 289
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 290 TGISGITGADGATGPTGATGSTGANG---ITGPTGATGSTGATGLSGIQGATGATGNTGT 346
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G GP+G +G +G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 347 NGSTGPTGPTGATGSIGNTG---ATGTNGVTGATGPQGNTGVTGANG---ITGPTGATGS 400
Query: 184 LGPSGRLRY 192
G + +
Sbjct: 401 TGATATAQN 409
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 68/182 (37%), Gaps = 21/182 (11%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------- 83
+GS G +G GP+G+ GP+G GP+G GP G+
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 84 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRY 138
GP+G GP+G GP+G G G G +G + G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATGADGVSGPTGATGNTGPTGAIGV 208
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 209 TG 210
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 62/164 (37%), Gaps = 16/164 (9%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------- 101
+GS G +G GP+G GP+G+ GP+G GP G
Sbjct: 29 TGSTGANGATGISGATGPTGANGSTGPTGARGATGPNGATGETGPKGTTGATGLTGATGI 88
Query: 102 --YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRY 156
GP+G GP+G GP+G + G G G +G G SG
Sbjct: 89 SGATGPTGANGTAGPTGSRGNTGPTGATGNTGIQGATGATGENGATGATGASGEPGLPGA 148
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP+G GP+G G +G G +G G +DG+
Sbjct: 149 SGPTGATGNTGPTGSDGATGATGETGAAGSTGATGATG-ADGVS 191
>gi|423437957|ref|ZP_17414938.1| hypothetical protein IE9_04138 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
gi|401119940|gb|EJQ27745.1| hypothetical protein IE9_04138 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
Length = 588
Score = 74.7 bits (182), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/169 (33%), Positives = 76/169 (44%), Gaps = 15/169 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G+ GP+G G +GS GP+G G +G GP+GS
Sbjct: 297 TGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGS 356
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G S GP+G GP
Sbjct: 357 TGSTGPTGST---GPTGST---GPTGATGATGPTGSTGSTGPTG---STGPTGST---GP 404
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 405 TGSTGSTGPTGA---TGPTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGSTGSTGAT 450
Score = 72.8 bits (177), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/169 (31%), Positives = 76/169 (44%), Gaps = 15/169 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 297 TGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGS 356
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G S GP
Sbjct: 357 TGSTGPTGS---TGPTGS---TGPTGATGATGPTGSTGSTGPTGS---TGPTG---STGP 404
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 405 TGSTGSTGPTGA---TGPTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGSTGSTGAT 450
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/206 (27%), Positives = 77/206 (37%), Gaps = 24/206 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------------LGP 51
GP+G G +G GP+GS G +G G
Sbjct: 240 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGATGATGSTGATGSTGPTGA 299
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+GS G +G GP+G G +GS GP+G G +G GP+G
Sbjct: 300 TGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGS 359
Query: 112 LGPSGRLR---YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP+G + GP+G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 360 TGPTGSTGPTGSTGPTGATGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGP 419
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G GP+G G
Sbjct: 420 TGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGSTG 445
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/152 (32%), Positives = 70/152 (46%), Gaps = 15/152 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +GS GP+G+ G +G GP+GS GP+G GP+G
Sbjct: 314 STGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPTGS---TGPTG 370
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 371 S---TGPTGATGATGPTGSTGSTGPTGS---TGPTGS---TGPTGSTGSTGPTGAT---G 418
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
P+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 419 PTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGSTGSTGAT 450
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/215 (25%), Positives = 77/215 (35%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL----------------- 55
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+GS
Sbjct: 222 TGPTGATGITGVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGA 281
Query: 56 -------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
G +G G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 282 TGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGATGS 341
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G GP+G GP+G S GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 342 TGSTGPTGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGATGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGS 401
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 402 TGPTGSTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGSTGSTG 436
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/208 (25%), Positives = 77/208 (37%), Gaps = 33/208 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 213 TGATGITGVTGPTGATGITGVTGITGVTGPTGAT---GPTGATGPTGATGPTGSTGPTGS 269
Query: 73 LRY------------------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +GS G +G GP+G G +G
Sbjct: 270 TGSTGPTGATGATGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGS 329
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP+G G +G + GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 330 TGATGPTGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGATGATGPTGSTGS 389
Query: 166 LGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 390 TGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGAT 417
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/236 (22%), Positives = 73/236 (30%), Gaps = 63/236 (26%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------------------------------------ 45
GP+GS G +GS GP+G
Sbjct: 156 TGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGSTGPTGATGATGPTGATGATGATGSTGSTGATGPTGA 215
Query: 46 ---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 216 TGITGVTGPTGATGITGVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGSTGP 275
Query: 103 ---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G GP+G S G +G GP
Sbjct: 276 TGATGATGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGP 335
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 336 TGATGSTGSTGPTGATGPTGSTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGATGATGPTGSTGSTG 391
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/242 (21%), Positives = 74/242 (30%), Gaps = 69/242 (28%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP---------------SGSLRYLGPSGR 63
GP+G+ GP+GS GP+G GP +G+ GP+G
Sbjct: 102 TGPTGATGATGPTGSTGATGATGPTGPTGSTGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGPTGS 161
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY------------------------------LGPSGRLRY 93
G +G GP+GS G +G
Sbjct: 162 TGATGSTGSTGATGPTGSTGPTGATGATGPTGATGATGATGSTGSTGATGPTGATGITGV 221
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------ 147
GP+G G +G GP+G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 222 TGPTGATGITGVTGITGVTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGA 281
Query: 148 ---------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 282 TGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGATGS 341
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 342 TG 343
>gi|302387903|ref|YP_003823725.1| Collagen triple helix repeat protein [Clostridium saccharolyticum
WM1]
gi|302198531|gb|ADL06102.1| Collagen triple helix repeat protein [Clostridium saccharolyticum
WM1]
Length = 252
Score = 74.3 bits (181), Expect = 2e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/189 (34%), Positives = 88/189 (46%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GPSG +GP G GP G + GP+G L GP+G GP+G GP+
Sbjct: 72 GPSGCRGPMGPRGCPGPTGPQGPMGPRGCPGPTGPLGPTGPTGPRGDTGPTGPQGVTGPT 131
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +GP+G GP G GP G + GP+G +GP+G GP G +
Sbjct: 132 GPQGLIGPTGPT---GPHGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGIIGPTG---AAGPQGAIGPT 185
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G GP G + GP+
Sbjct: 186 GPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGLQGDTGPTGPQGLIGPTG---PTGPQGDIGPTGPT 242
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G +GLS
Sbjct: 243 GDSVIIGLS 251
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/165 (33%), Positives = 75/165 (45%), Gaps = 9/165 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP G GP G GP+G +GP G GP+G L GP+G GP+G
Sbjct: 68 VGPEGPSGCRGPMGPRGCPGPTGPQGPMGPRG---CPGPTGPLGPTGPTGPRGDTGPTGP 124
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G +GP+G GP G GP G + GP+G +GP+G GP
Sbjct: 125 QGVTGPTGPQGLIGPTG---PTGPHGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGIIGPTG---AAGP 178
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP+G GP+G +GP+G G +G GL
Sbjct: 179 QGAIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPTGPTGLQGDTGPTGPQGL 223
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/148 (33%), Positives = 68/148 (45%), Gaps = 9/148 (6%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP G GP G GP+G +GP G GP+G L GP+G GP+G
Sbjct: 68 VGPEGPSGCRGPMGPRGCPGPTGPQGPMGPRG---CPGPTGPLGPTGPTGPRGDTGPTGP 124
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G +GP+G GP G GP G + GP+G +GP+G GP
Sbjct: 125 QGVTGPTGPQGLIGPTGPT---GPHGETGPTGPQGLIGPTGPTGPQGIIGPTG---AAGP 178
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + GP+G GP+G +G +
Sbjct: 179 QGAIGPTGPTGPQGETGPTGPQGLIGPT 206
>gi|407475204|ref|YP_006789604.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium acidurici 9a]
gi|407051712|gb|AFS79757.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium acidurici 9a]
Length = 692
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/202 (29%), Positives = 81/202 (40%), Gaps = 19/202 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGP------SGR 63
GP+G + GP+GS G +GS+ GP+G +GP+G+ GP +G
Sbjct: 199 TGPTGNIGATGPTGST---GATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGADGVTGPTGPRGNTGA 255
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGR 117
G +G + GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 256 DGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGPIGPTGPTGADGPTGPTGA 315
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G S G G G +G G G G G GP G G
Sbjct: 316 DGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGETGPVGATGATGA 375
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G GP+G G SDG+
Sbjct: 376 DGATGETGPTGATGSTG-SDGI 396
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 83/188 (44%), Gaps = 7/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+GS G G G +G + GP+G + GP+G
Sbjct: 154 TGPTGSRGNTGSTGATGITGPTGSTGSTGAMGSTGPTGATGVIGATGPTGNIGATGPTGS 213
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS+ GP+G +GP+G G +G G +G G +G + S GP
Sbjct: 214 T---GATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGADGVTGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGP 270
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 271 TGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGP---IGPTGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGS 327
Query: 193 LGLSDGLR 200
G +DG
Sbjct: 328 TG-ADGAA 334
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 81/185 (43%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G GS G +G + GP+G++ GP+G G +G
Sbjct: 162 NTGSTGATGITGPTGSTGSTGAMGSTGPTGATGVIGATGPTGNIGATGPTGST---GATG 218
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G+ +GP+G G +G G +G G +G + GP+G + G
Sbjct: 219 SIGNTGPTGADGVIGPTGATGADGVTGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTG 278
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G GP + GP+G GP+G GP+G G G
Sbjct: 279 PTGATGATGDTGPTGSNGP---IGPTGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAG 335
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 336 ETGAT 340
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/199 (28%), Positives = 88/199 (44%), Gaps = 27/199 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G GP+G+ GP+GS G +G GP+GS G +G + GP
Sbjct: 133 IGPTGANGMTGPTGATGITGATGPTGSRGNTGSTGATGITGPTGST---GSTGAMGSTGP 189
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G +G GP+G + GP+G G +G + GP+G +GP+G +
Sbjct: 190 TGATGVIG------ATGPTGNIGATGPTGST---GATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGA 240
Query: 130 D---------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGP 177
D G +G G +G + GP+G GP+G GP+G +GP
Sbjct: 241 DGVTGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGPIGP 300
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G++
Sbjct: 301 TGPTGADGPTGPTGADGIT 319
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 80/186 (43%), Gaps = 4/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + GP+G+ +G +G +G +G G +GS+ GP+G +GP+G
Sbjct: 178 TGSTGAMGSTGPTGATGVIGATGPTGNIGATGPTGSTGATGSIGNTGPTGADGVIGPTGA 237
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G + GP+G GP+G G +G S+GP
Sbjct: 238 TGADGVTGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGP 297
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+ GP+G GP+G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 298 ---IGPTGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGA 354
Query: 193 LGLSDG 198
G +DG
Sbjct: 355 TG-ADG 359
Score = 70.1 bits (170), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/203 (28%), Positives = 85/203 (41%), Gaps = 24/203 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
+GP+G GP+G S GP+GS +GP+G GP+G+
Sbjct: 88 IGPTGANGITGPTGATGSTGATGPTGSRGNTGSTGTTGATGSTGAIGPTGANGMTGPTGA 147
Query: 55 LR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP+G G +G GP+GS G G G +G + GP+G +
Sbjct: 148 TGITGATGPTGSRGNTGSTGATGITGPTGSTGSTGAMGSTGPTGATGVIGATGPTGNIGA 207
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G G +G + + GP+G +GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 208 TGPTGS---TGATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGADGVTGPTGPRGNTGADGATGATGA 264
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ GP+G GP+G G
Sbjct: 265 IGSTGPTGANGNTGPTGATGATG 287
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 71/193 (36%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+GS G G+ G +G G G+ G G GP G
Sbjct: 310 TGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGETGPVGA 369
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G G+ GP+G G +G +GP G G G GP
Sbjct: 370 TGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGATGETGP 429
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G + GP+G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 430 TG---ATGPTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGATGATGADGATGSTGSTGATGATGSDGA 486
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP+G +G +
Sbjct: 487 TGPTGATGAVGAT 499
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/190 (28%), Positives = 71/190 (37%), Gaps = 5/190 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+GS G G G +G+ G G G G
Sbjct: 301 TGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGP 360
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G G GP+G G G G +G +GP G + G
Sbjct: 361 TGETGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGA 420
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 421 DGATGETGPTG---ATGPTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGATGATGADGATGSTGSTGA 477
Query: 193 LGL--SDGLR 200
G SDG
Sbjct: 478 TGATGSDGAT 487
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G+ GP+G+ G G G +G+ +GP G G G
Sbjct: 364 TGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGA 423
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 424 TGETGPTGAT---GPTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGATGATGADGATGSTGSTGATGA 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G +G + GP+G + G G GP+G G +G
Sbjct: 481 TGSDGATGPTGA------TGAVGATGPTGSIGATGADGATGSTGPTGATGATGANGSTGS 534
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 535 TGAT 538
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP+G+ G P+GS +GP+G GP+G+ GP+G
Sbjct: 268 TGPTGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGPIGPTGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGS 327
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G G G +G+ G G G G GP G G G GP+G
Sbjct: 328 TGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGETGPVGATGATGADGATGETGPTGA 387
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S G G G +G +GP G G G GP+G GP+G GP
Sbjct: 388 TGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGATGETGPTG---ATGPTGSDGATGP 444
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 445 TGATGATG 452
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + GP+G+ GP+G+ G +G GP + GP+G GP+G
Sbjct: 259 TGATGAIGSTGPTGANGNTGPTGATGATGDTGPTGSNGP---IGPTGPTGADGPTGPTGA 315
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G G G +G G G G G GP G + G
Sbjct: 316 DGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGETGPVGATGATGA 375
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G G G G +G +GP G G G GP+G
Sbjct: 376 DGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGATGETGPTGATGP 435
Query: 193 LGLSDGLR 200
G SDG
Sbjct: 436 TG-SDGAT 442
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G G P+GS + GP+G+ GP+G GP+GS G G
Sbjct: 276 NTGPTGATGATGDTGPTGSNGPIGPTGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAG 335
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G G G+ G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 336 ETGATGATGPTGADGATGATGADGPTGETGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDG 395
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G +GP G G G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 396 IPGPTGVTGATGEIGPVGATGATGADGATGETGPTG---ATGPTGSDGATGPTGATGATG 452
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
+G G +
Sbjct: 453 EAGVAGATGAT 463
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/187 (26%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G G G G GP G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 346 TGADGATGATGADGPTGETGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPGPTGVTGA 405
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP G+ G G GP+G GP+G GP+G G +G + G
Sbjct: 406 TGEIGPVGATGATGADGATGETGPTG---ATGPTGSDGATGPTGATGATGEAGVAGATGA 462
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G GP +G + GP+G + G G GP+G
Sbjct: 463 TGADGATGSTGSTGATGATGSDGATGPTGATGAVGATGPTGSIGATGADGATGSTGPTGA 522
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 523 TGATGAN 529
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/207 (27%), Positives = 81/207 (39%), Gaps = 22/207 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GP+G +GP+G+ GP+G + G +G + GP+G+ GP+G
Sbjct: 222 NTGPTGADGVIGPTGATGADGVTGPTGPRGNTGADGATGATGAIGSTGPTGANGNTGPTG 281
Query: 63 RLRYLGPSGRLRY------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +G GP+G+ GP+G GP+G G G G +G
Sbjct: 282 ATGATGDTGPTGSNGPIGPTGPTGADGPTGPTGADGITGPTGSTGSTGADGAAGETGATG 341
Query: 117 R---LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G +G +DGP+G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 342 ATGPTGADGATGATGADGPTGE---TGPVGATGATGADGATGETGPTGATGSTGSDGIPG 398
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G +G +GP G G +DG
Sbjct: 399 PTGVTGATGEIGPVGATGATG-ADGAT 424
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/167 (28%), Positives = 67/167 (40%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V +GP G G G+ GP+G+ GP+G GP+G+ G +G
Sbjct: 400 TGVTGATGEIGPVGATGATGADGATGETGPTGAT---GPTGSDGATGPTGATGATGEAGV 456
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G G +GS G +G GP+G +G P+G + G G
Sbjct: 457 AGATGATGADGATGSTGSTGATGATGSDGATGPTGATGAVGATGPTGSIGATGADGATGS 516
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G + G +G G +G G G GP+G L G
Sbjct: 517 TGPTGATGATGANGSTGSTGATG---ATGADGATGPTGPAGGLSAYG 560
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/167 (26%), Positives = 69/167 (41%), Gaps = 27/167 (16%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGRLR 92
+GP+G+ GP+G +G GP+GS +GP+G
Sbjct: 87 AIGPTGANGITGPTGA------TGSTGATGPTGSRGNTGSTGTTGATGSTGAIGPTGANG 140
Query: 93 YLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G GP+G G +G GP+G S G G G +G + G
Sbjct: 141 MTGPTGATGITGATGPTGSRGNTGSTGATGITGPTGSTGSTGAMGSTGPTGATGVIGATG 200
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G + GP+G G +G + GP+G +GP+G G++
Sbjct: 201 PTGNIGATGPTGS---TGATGSIGNTGPTGADGVIGPTGATGADGVT 244
>gi|385263864|ref|ZP_10041951.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus sp. 5B6]
gi|385148360|gb|EIF12297.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus sp. 5B6]
Length = 2307
Score = 74.3 bits (181), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 75/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ +GP+G GP+G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 1007 AGPTGATGPTGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGI 1066
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G +G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 1067 TGETGPTGD------TGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGA 1120
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G +GP+G G +G G +G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 1121 TGITGEIGPTGVTGSTGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGA 1180
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 1181 TGA 1183
Score = 72.4 bits (176), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/194 (26%), Positives = 79/194 (40%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V GP+G G +G G +G++ GP+G G +G+ +GP+G
Sbjct: 971 TGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGE 1030
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRY 120
GP+G G +GS G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1031 TGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGA 1090
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G +G + G +G G +G G +G +GP+G G +G G +G
Sbjct: 1091 TGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGATGITGEIGPTGVTGSTGETGPTGVTGATGS 1150
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLG 194
G +G +G
Sbjct: 1151 TGETGSTGVTGAIG 1164
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 77/184 (41%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G G +GS G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1025 IGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGP 1084
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSG---RLRYLGPSGR 126
G +GS G +G G +G G SG +GP+G GP+G
Sbjct: 1085 TGVTGATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGATGITGEIGPTGVTGSTGETGPTGV 1144
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G +G G +G + GP+G G +G +GP+G GP+G GP
Sbjct: 1145 TGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGA---AGPTGITGETGP 1201
Query: 187 SGRL 190
+G
Sbjct: 1202 TGDT 1205
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/196 (27%), Positives = 79/196 (40%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +GS GP+G + G +GS G +G G +G
Sbjct: 725 TGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGA 784
Query: 73 LRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 785 TGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVTGATGA 844
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 845 TGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGS 904
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + V+G+
Sbjct: 905 TGVTGATGSTGVTGVT 920
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G GP+G S GP+G G +G G +G GP+G GP
Sbjct: 578 AGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTGATGITGVTGPTGASGVTGP 637
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G G G G +G G +G G +G S
Sbjct: 638 TGESGSTGITGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGATGSTGATGS 697
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 698 TGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGE 757
Query: 190 LRYLGLS 196
+ G++
Sbjct: 758 IVPTGVT 764
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 75/188 (39%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLG 68
+ G +G GP G GP+G G +G G +GS GP+G + G
Sbjct: 706 STGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTG 765
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +G+ G +G +GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 766 STGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENG 825
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 826 PTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTG 885
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 886 DTGSTGVT 893
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/179 (26%), Positives = 73/179 (40%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ GP+G G +G G +G++ GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 970 ATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTG 1029
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLR 137
GP+G G +G G +G GP+G GP+G S GP+G
Sbjct: 1030 ETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTG 1089
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G G +G +GP+G G +G G +
Sbjct: 1090 ATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGATGITGEIGPTGVTGSTGETGPTGVTGAT 1148
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 75/188 (39%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +GS GP G GP+G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 697 STGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTG 756
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G +GS G +G G +G GP +GP+G G +G S G
Sbjct: 757 EIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGP------IGPTGVTGVTGSTGETGSTG 810
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G +G G +G GP +G G +G GP+G
Sbjct: 811 ATGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTG 870
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 871 AAGPTGIT 878
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/156 (26%), Positives = 64/156 (41%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G+ GP+G G +G G +G++ GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 970 ATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTG 1029
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G S G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1030 ETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTG 1089
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G +G G S ++G
Sbjct: 1090 ATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGATGITG 1125
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 73/191 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 599 TGPTGVTGATGSTGSTGVTGATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTGPTGL 658
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G +G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 659 TGVTGEIGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGSTGVTGP 718
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G G +G G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 719 IGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGA 778
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 779 TGITGATGVTG 789
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/211 (24%), Positives = 75/211 (35%), Gaps = 27/211 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 872 AGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGA 931
Query: 73 LRYLGPSGSL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +GS G +G GP+G G
Sbjct: 932 TGSTGETGSTGASGATGATGITGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGS 991
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G + GP+G G +G +GP+G GP+G G +G
Sbjct: 992 TGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGS 1051
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G GP+G G++
Sbjct: 1052 TGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVT 1082
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G G +GS G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 653 TGPTGLTGVTGEIGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGS 712
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLNS 129
GP G GP+G G +G G +G GP+G + G +G S
Sbjct: 713 TGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGS 772
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G +GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 773 TGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETGE 832
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 833 TGATGVT 839
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +G G +G GP G GP+G G +G
Sbjct: 680 TGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGS 739
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS GP+G + G +G G +G G +G +GP+G
Sbjct: 740 TGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGV 799
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 800 TGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGS 859
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 860 TGSTGVT 866
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/176 (27%), Positives = 68/176 (38%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +GS GP+G+ G +G G +GS GP+G G +G G +G
Sbjct: 562 ATGVTGSTGETGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTGATG 621
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G GP+G G +G GP+G G G G +G G
Sbjct: 622 ITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGATGSTGVTG 681
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +G GP G GP+G G++
Sbjct: 682 ATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVT 737
Score = 62.0 bits (149), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 71/184 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP+G G +G GP+G G G G +G
Sbjct: 617 TGATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGATGS 676
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G GP G GP+G S G
Sbjct: 677 TGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGV 736
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G + G +G G +G G +G GP G
Sbjct: 737 TGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGV 796
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 797 TGVT 800
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/209 (24%), Positives = 73/209 (34%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL----------------- 55
G +G G +GS G +GS G +G G +GS
Sbjct: 899 TGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGSTGASGATGATGITGATGT 958
Query: 56 ----------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +G GP+G G +G G +G + GP+G G
Sbjct: 959 TGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGA 1018
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G +GP+G GP+G S G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1019 TGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGS 1078
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G G
Sbjct: 1079 TGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGETG 1107
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/211 (23%), Positives = 75/211 (35%), Gaps = 27/211 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 845 TGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGS 904
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------------------- 109
G +GS G +G G +G G +G
Sbjct: 905 TGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGSTGASGATGATGITGATGTTGPTGV 964
Query: 110 ----RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G GP+G + G +G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 965 TGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGA 1024
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G GP+G G +G G++
Sbjct: 1025 IGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVT 1055
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/178 (25%), Positives = 67/178 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +G +GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 764 TGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGE 823
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G GP
Sbjct: 824 NGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGP 883
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 884 TGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGST 941
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G+ GP+G G G G +G G +G
Sbjct: 626 TGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGATGSTGVTGATGS 685
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G G +G GP G GP+G G +G G
Sbjct: 686 TGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGA 745
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G + G +G G +G G +G +GP+G G +G
Sbjct: 746 TGSTGVTGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGE 805
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 806 TGSTGAT 812
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/211 (23%), Positives = 74/211 (35%), Gaps = 27/211 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +GS G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 836 TGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGP 895
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-------------- 118
G +GS G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 896 TGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGSTGASGATGATGITGA 955
Query: 119 -------------RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 956 TGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGP 1015
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G +GP+G GP+G G++
Sbjct: 1016 TGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVT 1046
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/208 (24%), Positives = 73/208 (35%), Gaps = 24/208 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------- 63
GP+G G +G G +G G +G G +GS G +G
Sbjct: 893 TGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGSTGASGATGATGI 952
Query: 64 ---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 953 TGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGA 1012
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G +GP+G S GP+G G +G G +G GP+G GP
Sbjct: 1013 TGPTGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGP 1072
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +
Sbjct: 1073 TGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGAT 1100
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 13 LGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G + G +G G +G+ G +G +GP+G G +G G
Sbjct: 752 TGPTGEIVPTGVTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGA 811
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 812 TGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGA 871
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 872 A---GPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGS 928
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 929 TGATGSTG 936
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/221 (23%), Positives = 77/221 (34%), Gaps = 27/221 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 880 ETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETG 939
Query: 72 RL---------------------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G +G+ GP+G G +G G
Sbjct: 940 STGASGATGATGITGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTGATGSTGETGSTG 999
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
+G + GP+G G +G + GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1000 VTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTG 1059
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 1060 AAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGAT 1100
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/180 (27%), Positives = 71/180 (39%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G +GP+G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 650 TGPTGPTGLTGVTG---EIGPTG---VTGATGSTGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGV 703
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---NS 129
G +GS GP G GP+G G +G G +G GP+G +
Sbjct: 704 TGSTGVTGSTGVTGPIGITGVTGPTGVTGSTGVTGSTGPTGATGSTGVTGPTGEIVPTGV 763
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G +GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 764 TGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGE 823
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/172 (26%), Positives = 67/172 (38%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G +GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 772 STGVTGATGITGATGVTGPIGPTGVTGVTGSTGETGSTGATGVTGSTGPTGENGPTGETG 831
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
G +G+ GP+G G +G G +G GP+G GP+G S
Sbjct: 832 ETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTG 891
Query: 130 -DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 892 VTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATGSTGATGSTGETGSTGA 943
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/160 (28%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---R 72
+G G +GS G +G GP+G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 1781 TGETGATGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGA 1840
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G GP+G GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 1841 TGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGETGATGVTGATGLTGSTG---STGV 1897
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1898 TGATGSTGPTGATGVTGPTGST---GPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/156 (27%), Positives = 62/156 (39%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +GS GP+G G +G G +GS GP+G G +G G +G
Sbjct: 562 ATGVTGSTGETGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTGATG 621
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G GP+G S G +G GP+G G +GP+G G
Sbjct: 622 ITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTGPTGLTGVTG------EIGPTGVTGATG 675
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G +G G++ V+G
Sbjct: 676 STGVTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVTGSTGVTG 711
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/211 (25%), Positives = 75/211 (35%), Gaps = 33/211 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +GS G +GS G +G G SG+ +GP+G G
Sbjct: 1082 TGPTG---VTGATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGATGITGEIGPTGVTGSTGE 1138
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G +GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 1139 TGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGAAGPTGITGE 1198
Query: 130 DGPSGRL------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1199 TGPTGDTGSTGVTGPTGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGSTGETGPTGE---TGPTGVTGS 1255
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G G +
Sbjct: 1256 TGATGSTGVTGSTGITGSTGDTGATGVTGAT 1286
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/206 (24%), Positives = 72/206 (34%), Gaps = 24/206 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 866 TGPTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGA 925
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 926 TGSTGATGSTGETGSTGASGATGATGITGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGV 985
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G + GP+G G +G +GP+G GP+G G
Sbjct: 986 TGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGETGSTGPTGVTGSTGV 1045
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G G
Sbjct: 1046 TGSTGSTGVTGPTGAAGPTGITGETG 1071
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/166 (26%), Positives = 64/166 (38%), Gaps = 12/166 (7%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G G
Sbjct: 1781 TGETGATGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTG------A 1834
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G +G G +G G +G GP+G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 1835 TGITGATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGETGATGVTGATGLTGSTGS 1894
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1895 TGVTGATGST---GPTGATGVTGPTGST---GPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/154 (26%), Positives = 60/154 (38%), Gaps = 9/154 (5%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G G +GS G +G GP+G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 1781 TGETGATGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTGATGI--- 1837
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
+G G +G G +G S GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1838 ---TGATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGETGATGVTGATGLTGSTGS 1894
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G GP+G GL+
Sbjct: 1895 TGVTGATGST---GPTGATGVTGPTGSTGPTGLT 1925
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/217 (24%), Positives = 80/217 (36%), Gaps = 30/217 (13%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +GS G +G+ G +G + G +GS GP+G
Sbjct: 1085 TGVTGATGSTGVTGATGSTGETGSTGETGATGASGATGITGEIGPTGVTGSTGETGPTGV 1144
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G G +G++ GP+G G +G +GP+G GP+G GP
Sbjct: 1145 TGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGA---AGPTGITGETGP 1201
Query: 124 SGRLNS------------------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+G S G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 1202 TGDTGSTGVTGPTGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGSTGETGPTGE---TGPTGVTGSTGA 1258
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +G G +
Sbjct: 1259 TGSTGVTGSTGITGSTGDTGATGVTGATGVTGSSGAT 1295
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/198 (24%), Positives = 71/198 (35%), Gaps = 30/198 (15%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G +GS GP+G G +G G +G++ GP+G G +G
Sbjct: 1124 TGEIGPTGVTGSTGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGA 1183
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------------RYLGPSGRLRY 111
+GP+G+ GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1184 IGPTGA---AGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGSTGE 1240
Query: 112 LGPSGR---LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G G +G S G +G G +G G +G G SG G
Sbjct: 1241 TGPTGETGPTGVTGSTGATGSTGVTGSTGITGSTGDTGATGVTGATGVTGSSGATGVTGA 1300
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G G +G GP
Sbjct: 1301 TGETGSTGDTGATGETGP 1318
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/154 (27%), Positives = 62/154 (40%), Gaps = 9/154 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGP 69
G +G G +G GP+G+ G +G G +G+ G +G G
Sbjct: 1787 TGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGATGITGS 1846
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 1847 TGSTGDTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGETGATGVTGATGLTGSTGSTGVTGATG---S 1903
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1904 TGPTGATGVTGPTGS---TGPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/202 (25%), Positives = 75/202 (37%), Gaps = 24/202 (11%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G G +GS GP+G G +G++ G +G G +G
Sbjct: 289 PTGATGVTGITG---VTGSTGSAGATGPTGVTGSTGVTGTIGLTGVTGPTGLTGSTGETG 345
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------------PSGRLR 119
G +G+ G +G +GP+G GP+G G P+G
Sbjct: 346 STGVTGATGITGATGVTGPIGPTGATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGPTGITG 405
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
GP+G S G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 406 VTGPTGLTGSTGATGLTGATGSTGVTGPTGITGVTGPTGESGSTGSTGETGSTGATGATG 465
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G G
Sbjct: 466 ETGPTGVTGSTGETGSTGVTGA 487
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/212 (23%), Positives = 76/212 (35%), Gaps = 33/212 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G +GP+G G +G G +GS G +G +GP+G
Sbjct: 1108 STGETGATGASGATGITGEIGPTGVTGSTGETGPTGVTGATGSTGETGSTGVTGAIGPAG 1167
Query: 72 RLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------- 109
GP+G+ +GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1168 PTGATGPTGATGATGAIGPTGA---AGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGATGTTGPTG 1224
Query: 110 -----RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
G +G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1225 VTGSTGATGVTGSTGETGPTGET---GPTGVTGSTGATGSTGVTGSTGITGSTGDTGATG 1281
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G G +
Sbjct: 1282 VTGATGVTGSSGATGVTGATGETGSTGDTGAT 1313
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/212 (23%), Positives = 73/212 (34%), Gaps = 33/212 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G +GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1100 TGSTGETGSTGETGATGASGATGITGEIGPTGVTGSTGETGPTGVTGATGSTGETGSTGV 1159
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------- 118
+G + GP+G+ G +G +GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1160 TGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGA---AGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGA 1216
Query: 119 -------------RYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1217 TGTTGPTGVTGSTGATGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATGSTGVTGSTGITGSTGD 1276
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G SG G +G G
Sbjct: 1277 TGATGVTGATGVTGSSGATGVTGATGETGSTG 1308
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/206 (23%), Positives = 70/206 (33%), Gaps = 27/206 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 808 STGATGVTGSTGPTGENGPTGETGETGATGVTGATGATGPTGVTGSTGVTGSTGSTGVTG 867
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 868 PTGAAGPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGVTGATGSTGVTGVTGSTGATG 927
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGR------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
S G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 928 STGATGSTGETGSTGASGATGATGITGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGATGETGPTGVTG 987
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G + GP+G
Sbjct: 988 ATGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGAT 1013
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/188 (25%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 18/188 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G++ G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 302 TGSTGSAGATGPTGVTGSTGVTGTIGLTGVTGPTGLTGSTGETGSTGVTGATGITGATGV 361
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP---------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+GP+G+ GP +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 362 TGPIGPTGATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGPTGITGVTGPTG---LTGSTGA 418
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G GP+G GP+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 419 TGLTGATGSTGVTGPTGITGVTGPTGESGSTGSTGETGSTGATGATGETGPTGVTGSTGE 478
Query: 178 SGRLRYLG 185
+G G
Sbjct: 479 TGSTGVTG 486
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/116 (29%), Positives = 50/116 (43%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G+ G +GS G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 1825 STGATGVTGATGITGATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGETGATGVTG 1884
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +GS G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1885 ATGLTGSTGSTGVTGATGST---GPTGATGVTGPTGS---TGPTGLTGETGPAGST 1934
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/183 (24%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 27/183 (14%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
A GP+G G +G++ G +G G +G G +G+ G +G +G
Sbjct: 307 SAGATGPTGVTGSTGVTGTIGLTGVTGPTGLTGSTGETGSTGVTGATGITGATGVTGPIG 366
Query: 69 PSGRLRYLGP------------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
P+G GP +G GP+G G +G G
Sbjct: 367 PTGATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGPTGITGVTGPTG---LTGSTGATGLTG 423
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
+G GP+G GP+G S G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 424 ATGSTGVTGPTGITGVTGPTGESGSTGSTGETGSTGATGATGETGPTGVTGSTGETGSTG 483
Query: 165 YLG 167
G
Sbjct: 484 VTG 486
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/146 (26%), Positives = 58/146 (39%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G GP+G+ GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 562 ATGVTGSTGETGPTGAA---GPTGITGETGPTGDTGSTGVTGPTGVTGATGSTGSTGVTG 618
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP+G GP+G G +G GP +G +GP+G G +G
Sbjct: 619 ATGITGVTGPTGASGVTGPTGESGSTGITGATGPTGPTGLTGVTGEIGPTGVTGATGSTG 678
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G G + V+G+
Sbjct: 679 VTGATGSTGATGSTGATGSTGVTGVT 704
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/180 (24%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 33/180 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G++ GP+G+ G +G +GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 1148 TGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGATGPTGATGATGAIGPTGA---AGPTGITGETGPTGD 1204
Query: 73 L------------------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +GS GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1205 TGSTGVTGPTGATGTTGPTGVTGSTGATGVTGSTGETGPTGE---TGPTGVTGSTGATGS 1261
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G + G +G G SG G +G G +G GP
Sbjct: 1262 TGVTGSTG---ITGSTGDTGATGVTGATGVTGSSGATGVTGATGETGSTGDTGATGETGP 1318
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/202 (23%), Positives = 70/202 (34%), Gaps = 33/202 (16%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P+G+ G +G G +GS GP+G G +G + G +G G +G
Sbjct: 289 PTGATGVTGITG---VTGSTGSAGATGPTGVTGSTGVTGTIGLTGVTGPTGLTGSTGETG 345
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------------PSGRLN 128
G +G G +G +GP+G G P+G
Sbjct: 346 STGVTGATGITGATGVTGPIGPTGATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGPTGITG 405
Query: 129 SDGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
GP +G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 406 VTGPTGLTGSTGATGLTGATGSTGVTGPTGITGVTGPTGESGSTGSTGETGSTGATGATG 465
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP+G G + V+G
Sbjct: 466 ETGPTGVTGSTGETGSTGVTGA 487
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/244 (21%), Positives = 85/244 (34%), Gaps = 51/244 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G +G++ G G+ G +G GP+G+ GP+G G
Sbjct: 1394 IGPAGPTGSTGATGAIGPTGEIGATGVTGATGITGAAGPTGATGLTGVTGPTGVTGAAGS 1453
Query: 70 SGRLRYLGPSGS------------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+G +GP+G+ + GP+G G +G
Sbjct: 1454 TGPTGEIGPTGATGPTGITGTTGATGVTGTTGVTGPTGSTGVIGSTGPTGVAGSTGETGA 1513
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--------- 150
G +G G +G G +G G +G +GP+G GP
Sbjct: 1514 TGLTGATGVTGSTGVTGSTGATGVTGSTGITGATGATGPIGPTGATGITGPTGDTGATGV 1573
Query: 151 ---------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G +G +G GP+G GP+G G +G + G + V
Sbjct: 1574 TGTTGVTGSTGVTGAIGETGATGLTGPTGFTGVTGPTGETGATGSTGEIGSTGSTGATGV 1633
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 1634 TGIT 1637
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/153 (24%), Positives = 57/153 (37%), Gaps = 24/153 (15%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G G +G+ G +G G +GS G +G G +G +GP
Sbjct: 1496 IGSTGPTGVAGSTGETGATGLTGATGVTGSTGVTGSTGATGVTGSTGITGATGATGPIGP 1555
Query: 79 SGSLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G+ GP +G +G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1556 TGATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGAIGETGATGLTGPTGFTGVTGPTGETGA 1615
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G + S G +G G GP+G
Sbjct: 1616 TGSTGEIGSTGSTGATGVTG------ITGPTGE 1642
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/195 (23%), Positives = 71/195 (36%), Gaps = 36/195 (18%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G +GP+G G +G++ GP+G + G +G G +G
Sbjct: 1376 TGVTGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGSTGATGAI---GPTGEIGATGVTGATGITGAAG- 1431
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------------ 117
G +G GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 1432 --PTGATGLTGVTGPTGVTGAAGSTGPTGEIGPTGATGPTGITGTTGATGVTGTTGVTGP 1489
Query: 118 ------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP+G S G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1490 TGSTGVIGSTGPTGVAGSTGETGATGLTGATGVTGSTGVTGSTGATGVTGSTGITGATGA 1549
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGP 186
+GP+G GP
Sbjct: 1550 TGPIGPTGATGITGP 1564
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.076, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/151 (24%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 24/151 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G+ G +G G +G G +GS G +G +GP+G
Sbjct: 1498 STGPTGVAGSTGETGATGLTGATGVTGSTGVTGSTGATGVTGSTGITGATGATGPIGPTG 1557
Query: 72 RLRYLGP------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP +G +G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 1558 ATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGAIGETGATGLTGPTGFTGVTGPTGETGATG 1617
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+G + G S G +G GP+G
Sbjct: 1618 STGEI------GSTGSTGATGVTGITGPTGE 1642
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/143 (26%), Positives = 58/143 (40%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G G +G G +G G +GS G +G G +G +GP
Sbjct: 1496 IGSTGPTGVAGSTGETGATGLTGATGVTGSTGVTGSTGATGVTGSTGITGATGATGPIGP 1555
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G G +G G +G +G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1556 TGATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGAIGETGATGLTGPTGFTGVTGPTGETGA 1615
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G + G +G G +G
Sbjct: 1616 TGSTGEIGSTGSTGATGVTGITG 1638
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/189 (23%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 36/189 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G++ GP+GS +GP+G + G +G+ G +G G
Sbjct: 1379 TGSTGETGSTGVTGAIGPAGPTGSTGATGAIGPTGEIGATGVTGATGITGAAGPT---GA 1435
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------------------ 99
+G GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 1436 TGLTGVTGPTGVTGAAGSTGPTGEIGPTGATGPTGITGTTGATGVTGTTGVTGPTGSTGV 1495
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+ GP+G G +G G +G S G +G G +G G +G +GP
Sbjct: 1496 IGSTGPTGVAGSTGETGATGLTGATGVTGSTGVTGSTGATGVTGSTGITGATGATGPIGP 1555
Query: 160 SGRLRYLGP 168
+G GP
Sbjct: 1556 TGATGITGP 1564
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/153 (22%), Positives = 55/153 (35%), Gaps = 24/153 (15%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G G +G G +G G +G G +G G +G+ +GP
Sbjct: 1496 IGSTGPTGVAGSTGETGATGLTGATGVTGSTGVTGSTGATGVTGSTGITGATGATGPIGP 1555
Query: 88 SGRLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP +G +G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 1556 TGATGITGPTGDTGATGVTGTTGVTGSTGVTGAIGETGATGLTGPTGFTGVTGPTGETGA 1615
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G + G +G G GP+G
Sbjct: 1616 TGSTGEIGSTGSTGATGVTG------ITGPTGE 1642
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/121 (24%), Positives = 44/121 (36%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+G G +G G +G GP+G G +G S G +G G +G
Sbjct: 1781 TGETGATGVTGSTGATGVTGITGVTGPTGATGATGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGA 1840
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G G +G GP+G GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 1841 TGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGPTGATGVTGPTGETGATGVTGATGLTGSTGSTGVTGA 1900
Query: 205 H 205
Sbjct: 1901 T 1901
>gi|381150967|ref|ZP_09862836.1| hypothetical protein Metal_0997 [Methylomicrobium album BG8]
gi|380882939|gb|EIC28816.1| hypothetical protein Metal_0997 [Methylomicrobium album BG8]
Length = 539
Score = 73.9 bits (180), Expect = 3e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/162 (33%), Positives = 74/162 (45%), Gaps = 3/162 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G++ GP G +GP G +GP G +GP G +GP G +GP G
Sbjct: 247 GPQGAV---GPQGPAGAIGPQGLQGLIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLQ 303
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP G +GP G +GP G +GP G +GP G + GP G +GP
Sbjct: 304 GLIGPQGLAGAIGPQGLEGAIGPQGLQGLVGPQGLQGLVGPQGLAGAIGPQGLQGAIGPQ 363
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G +GP G +GP G +GP G + L
Sbjct: 364 GLQGLVGPQGLQGLVGPQGLQGVIGPQGVQGLIGPQGPIGQL 405
Score = 72.8 bits (177), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/162 (33%), Positives = 73/162 (45%), Gaps = 3/162 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G +GP G +GP G +GP G +GP G +GP G
Sbjct: 247 GPQGAV---GPQGPAGAIGPQGLQGLIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLQ 303
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP G +GP G +GP G +GP G +GP G +GP G + GP
Sbjct: 304 GLIGPQGLAGAIGPQGLEGAIGPQGLQGLVGPQGLQGLVGPQGLAGAIGPQGLQGAIGPQ 363
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP G +GP G +GP G +GP G + L
Sbjct: 364 GLQGLVGPQGLQGLVGPQGLQGVIGPQGVQGLIGPQGPIGQL 405
Score = 72.4 bits (176), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/162 (33%), Positives = 73/162 (45%), Gaps = 3/162 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G++ GP G +GP G +GP G +GP G +GP G +GP G
Sbjct: 247 GPQGAV---GPQGPAGAIGPQGLQGLIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLQ 303
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
+GP G +GP G +GP G +GP G GP G +GP G +GP
Sbjct: 304 GLIGPQGLAGAIGPQGLEGAIGPQGLQGLVGPQGLQGLVGPQGLAGAIGPQGLQGAIGPQ 363
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +GP G +GP G +GP G +GP G + L
Sbjct: 364 GLQGLVGPQGLQGLVGPQGLQGVIGPQGVQGLIGPQGPIGQL 405
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/145 (33%), Positives = 66/145 (45%), Gaps = 3/145 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G++ GP G +GP G +GP G +GP G +GP G +GP G
Sbjct: 247 GPQGAV---GPQGPAGAIGPQGLQGLIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLAGAIGPQGLQ 303
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+GP G +GP G + GP G +GP G +GP G +GP G +GP
Sbjct: 304 GLIGPQGLAGAIGPQGLEGAIGPQGLQGLVGPQGLQGLVGPQGLAGAIGPQGLQGAIGPQ 363
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +GP G +GP G +G
Sbjct: 364 GLQGLVGPQGLQGLVGPQGLQGVIG 388
>gi|225865686|ref|YP_002751064.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus 03BB102]
gi|225788605|gb|ACO28822.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus 03BB102]
Length = 1191
Score = 73.9 bits (180), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/185 (31%), Positives = 75/185 (40%), Gaps = 12/185 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ GP+G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 758 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAG 814
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 815 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGV---QG 868
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 869 PAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQG 925
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 926 PAGAT 930
Score = 72.4 bits (176), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 74/181 (40%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 784 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGAT 843
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G G +G + GP+
Sbjct: 844 GATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPA 897
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 898 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGAT 948
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 949 G 949
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 77/193 (39%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 774 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGP 833
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G
Sbjct: 834 QGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGA 887
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 888 TGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGP 941
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G + G+
Sbjct: 942 AGATGATGPQGIQ 954
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/182 (31%), Positives = 73/182 (40%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 750 TGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGP 806
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 807 QGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGP 863
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 864 QG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGA 917
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 918 TG 919
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 70/175 (40%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 742 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ 798
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G G +G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 799 GNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPA 855
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 856 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG 907
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP +G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 727 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQ 783
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 784 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGAT 843
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+
Sbjct: 844 GATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPA 897
Query: 188 GRLRYLG 194
G G
Sbjct: 898 GATGATG 904
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 769 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQ 825
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 826 GNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 879
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 880 GAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGAT 933
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 934 G 934
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/189 (30%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 18/189 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP G GP+G+ GP +G GP G+ G +G
Sbjct: 712 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQ 768
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G+ GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 769 GPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQ 825
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 826 GNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 879
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 880 GAQGNTGAT 888
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 811 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG-- 865
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 866 -VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 921
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 922 G---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG 967
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/189 (30%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 18/189 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 682 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 732
Query: 74 RYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP +G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 733 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 789
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 790 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQ 849
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 850 GAQGPAGAT 858
Score = 70.1 bits (170), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/181 (31%), Positives = 72/181 (39%), Gaps = 18/181 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYL 67
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP +G
Sbjct: 697 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 750
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 751 GPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQ 807
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 808 GAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 864
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 865 G 865
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 800 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAG 856
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G G
Sbjct: 857 ATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGV---QG 910
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 911 PAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATG 961
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 962 ATG 964
Score = 67.4 bits (163), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 667 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 717
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G G +G GP G G +G GP+
Sbjct: 718 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPA 771
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 772 GATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNT 828
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 829 GAT 831
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 73/188 (38%), Gaps = 18/188 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 672 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG- 724
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G+ GP +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 725 --VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG- 781
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G GP G G +G GP+G GP G G +G GP
Sbjct: 782 --AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGP 839
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 840 AGATGATG 847
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/178 (32%), Positives = 73/178 (41%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 819 TGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 872
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G + GP
Sbjct: 873 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGP 926
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 927 AGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 975
Score = 63.2 bits (152), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/170 (32%), Positives = 70/170 (41%), Gaps = 21/170 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 827 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 880
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 881 AQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATG 934
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
P G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 935 PQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 975
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/186 (31%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 21/186 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 637 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 693
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 694 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNT 744
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 745 GATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQ 798
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 799 GNTGAT 804
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 21/184 (11%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 652 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 705
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP+G GP G GP+G GP +G GP G +
Sbjct: 706 GPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNT 759
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 760 GATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGAT 816
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 817 GATG 820
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/189 (30%), Positives = 74/189 (39%), Gaps = 24/189 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP G GP+G+ GP G G +
Sbjct: 577 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 630
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 631 GPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 687
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 688 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 738
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 739 GVQGNTGAT 747
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 73/192 (38%), Gaps = 18/192 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 475 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQ 528
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 529 GVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGAT 585
Query: 131 GP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 586 GPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGAT 645
Query: 185 GPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 646 GPQGVQGNTGAT 657
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 622 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG-- 679
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 680 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV---QGPA 729
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 730 GATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGPA 786
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 787 GAT 789
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/186 (30%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 21/186 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 430 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQ 486
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G GP+G GP G G +G G +G +
Sbjct: 487 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGAT 540
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G +G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 541 GPQG---VQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQ 591
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 592 GNTGAT 597
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/190 (30%), Positives = 73/190 (38%), Gaps = 24/190 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 562 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQ 618
Query: 71 GRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G G +G+ GP+G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 619 GVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQ 678
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 679 GV---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQ 726
Query: 185 GPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 727 GPAGATGATG 736
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 18/182 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 597 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGA 656
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 657 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV 710
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP G GP+G GP G G +G G G GP
Sbjct: 711 ---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGP 764
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 765 QG 766
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 71/192 (36%), Gaps = 18/192 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 445 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 501
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRL 127
G GP+G+ GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 502 G---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 558
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 559 GVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGAT 615
Query: 185 GPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 616 GPQGVQGNTGAT 627
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 547 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 603
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 604 GAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 663
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 664 GAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPA 714
Query: 188 GRLRYLG 194
G G
Sbjct: 715 GATGATG 721
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/189 (29%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G G +G GP G G +G G +G
Sbjct: 346 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGAT 405
Query: 74 RYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RL 127
GP G + G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 406 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNT 462
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 463 GATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 516
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 517 GVQGNTGAT 525
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 331 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 387
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G G +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 388 GNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGI---Q 444
Query: 131 GPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 445 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 501
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 502 G 502
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 415 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 471
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G +
Sbjct: 472 GAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 525
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 526 GPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGAT 582
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 583 GATG 586
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G G +G G G+ G +G GP+G
Sbjct: 374 NTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAG 433
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 434 ATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGV-- 488
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G GP+G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 489 -QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 544
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 545 VQGNTGAT 552
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 388 GNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQ 444
Query: 77 GPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 445 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 501
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 502 G---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 558
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 559 GV 560
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/188 (28%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 15/188 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP G G +G G +G+ GP G G
Sbjct: 495 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGA 554
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 555 TGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGA 611
Query: 127 LNSDGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+ GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 612 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGA 671
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 672 TGATGPQG 679
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 70/180 (38%), Gaps = 18/180 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLG 68
N G +G G +G+ GP G G +G G +G+ GP G G
Sbjct: 362 NTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 421
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 422 ATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG--- 472
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 473 AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG 526
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 316 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQ 372
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G +G GP G G +G GP+
Sbjct: 373 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPA 432
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 433 GATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG 487
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 18/182 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 525 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGA 581
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G G +G GP G GP+G GP G G +G +
Sbjct: 582 TGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGA 635
Query: 130 DGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 636 QGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGP 692
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 693 QG 694
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 73/205 (35%), Gaps = 45/205 (21%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 853 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG-- 907
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 908 -VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGI---QGPA 957
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------------RYLGPSGRLRYLGPS 169
G GP G GP+G G +G GP+
Sbjct: 958 GATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGIQGPA 1014
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP G GP+G G
Sbjct: 1015 GATGATGPQG---AQGPAGATGATG 1036
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 68/189 (35%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 302 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 358
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLN 128
G +G G +G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 359 VQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTG 418
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 419 ATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQG 475
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P+G G
Sbjct: 476 PAGATGATG 484
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 70/191 (36%), Gaps = 20/191 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 210 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG 269
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLG--------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G +G+ G P G G +G G +G GP G
Sbjct: 270 PQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPPGPTGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG- 328
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G + GP G GP+G GP G G +G G +G GP
Sbjct: 329 --AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGP 383
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
G G +G
Sbjct: 384 QGVQGNTGATG 394
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/207 (28%), Positives = 74/207 (35%), Gaps = 50/207 (24%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 868 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 922
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-------- 125
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 923 -AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGPTGAT 975
Query: 126 ----------------------RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 976 GIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 1032
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 1033 GATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 1056
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/203 (25%), Positives = 70/203 (34%), Gaps = 23/203 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 221 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGAT 280
Query: 74 RYLG-----------------PSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G +G+ GP G G +G GP+G G
Sbjct: 281 GATGIGVTGPTGPPGPTGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATG 340
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P G GP+G + GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 341 PQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 397
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP G G +
Sbjct: 398 VQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 420
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/205 (25%), Positives = 71/205 (34%), Gaps = 26/205 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ GP+G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 195 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAG 251
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-----------------GPSGRLRYLGP 114
GP G+ G +G G +G G +G GP
Sbjct: 252 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPPGPTGPQGNTGATGATGP 311
Query: 115 ---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G +G + GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 312 QGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGP 368
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP G G +
Sbjct: 369 QGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 393
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 15/177 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G G +G GP G+ GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 301 GNTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 351
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GP G G +G G +G GP G GP G + G +G
Sbjct: 352 GATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 411
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G +G GP+G GP G GP+G GP G G +
Sbjct: 412 GVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 465
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/196 (25%), Positives = 65/196 (33%), Gaps = 35/196 (17%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ GP G G +G+ G G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 177 VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 233
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG----RLNS---------------- 129
G +G GP+G GP G G +G + N+
Sbjct: 234 AQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGP 293
Query: 130 ------DGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G +G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 294 PGPTGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 350
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 351 TGATGPQGVQGNTGAT 366
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/112 (26%), Positives = 40/112 (35%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G +G GP G G +G G G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 177 VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 233
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G GP+G GP G G +G G + +G+
Sbjct: 234 AQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGI 285
>gi|237735727|ref|ZP_04566208.1| conserved hypothetical protein [Mollicutes bacterium D7]
gi|229381472|gb|EEO31563.1| conserved hypothetical protein [Coprobacillus sp. D7]
Length = 424
Score = 73.9 bits (180), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/189 (30%), Positives = 78/189 (41%), Gaps = 13/189 (6%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G GP+G G GS +GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 28 PTGATGATGPTGLTGATGEDGSTGAIGPTGPTGSTGATGS---TGPTGATGEDGATGATG 84
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G+ G +G GP+G GP+ GP+G GP+G DG +G
Sbjct: 85 STGPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPT------GPTGATGATGPTGATGEDGATG 138
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 139 PTGPTGATGEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTG 198
Query: 192 YLGLSDGLR 200
G DG
Sbjct: 199 ATG-EDGAT 206
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+GS GP+G P+G
Sbjct: 67 STGPTGATGEDGATGATGSTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTG------PTG 120
Query: 72 RLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G+ GP+G G G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 121 ATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGPTGPTGATG 180
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGRLRYLGPSGRLR 182
DG +G GP+G G G G +G GP+G G +G
Sbjct: 181 EDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATG 240
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G S
Sbjct: 241 STGPTGSTGAAGAS 254
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 75/177 (42%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +GS GP+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 53 IGPTGPTGSTGATGST---GPTGATGEDGATGATGSTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGS 109
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+ GP+G GP+G G +G G +G GP+G DG
Sbjct: 110 TGATGPT------GPTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGPTGATGEDGA 163
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 164 TGPTGATGPTGP---TGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGT 217
Score = 63.9 bits (154), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/187 (27%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G+ GP+G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 59 TGSTGATGSTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGSTGATGPTG- 117
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
P+G+ GP+G GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 118 -----PTGATGATGPTGATGEDGATGPTGPTGATGEDGATGPTGATGEDGATGPTGATGP 172
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G GP+G G G G +G G +G GP+G
Sbjct: 173 TGPTGATGEDGATGATGSTGPTGPTGATGEDGATGATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGI 232
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 233 TGATGAT 239
>gi|417072229|gb|AFX59378.1| wsv001 [White spot syndrome virus]
Length = 1636
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 87/175 (49%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G++ GP G +GP+G+ +GP+G P G +GP+G+
Sbjct: 161 GPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAIGPAGKD 214
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP G G +GR GR +GP G +GP+G+ +GP G + GP+
Sbjct: 215 GAVGPQGPPGERGENGR------PGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPA 268
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G+ +GP+G G +GR G G + GP G +GP+GR +GP+G
Sbjct: 269 GKDGAVGPAGPQGERGENGR---PGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAG 320
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/201 (30%), Positives = 90/201 (44%), Gaps = 30/201 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS- 70
GP+G + GP G +GP+G +GP+ GP G +GP+G+ +GP
Sbjct: 168 ETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPA------GPQGERGAIGPAGKDGAVGPQG 221
Query: 71 -----------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
GR +GP G +GP+G+ +GP G +GP+G+ +GP+G
Sbjct: 222 PPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQG 281
Query: 120 YLGPSGRLNSD------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +GR D GP G +GP+GR +GP+ G G G +G
Sbjct: 282 ERGENGRPGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVG 341
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +G GR +GP+G
Sbjct: 342 PQGERGEIGRPGRDGAVGPAG 362
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/146 (32%), Positives = 72/146 (49%), Gaps = 13/146 (8%)
Query: 45 RLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
++R L GP G GP+G + GP G +GP+G +GP+G P G +
Sbjct: 155 KVRKLHGPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAI 208
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G+ +GP G P G +G GR +GP G +GP+G+ +GP G
Sbjct: 209 GPAGKDGAVGPQG------PPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGER 262
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP+G+ +GP+G G +GR
Sbjct: 263 GAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR 288
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/200 (29%), Positives = 87/200 (43%), Gaps = 18/200 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
GP G +GP+G +GP G +GP G +GP+G +GP
Sbjct: 199 AGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGPPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGP 258
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +GP+G+ +GP+G G +GR + GP G +GP+GR +GP
Sbjct: 259 QGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGRPGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGP 318
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G DG G + G G + G G + GP GR G +G+
Sbjct: 319 AGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPQGERGEIGRPGRDGAVGPAGPQGRRGATGRAGKDGA 378
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+GP+G G +G+ +G
Sbjct: 379 VGPAGPQGEKGEAGKDGSIG 398
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/172 (31%), Positives = 80/172 (46%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GR +GP G +GP+G +GP G +GP+G +GP+G G +GR
Sbjct: 233 GRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGRP--- 289
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G G++ GP G +GP+GR +GP+G G +G G G + G G +
Sbjct: 290 GRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPQGERGEI 349
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G + GP GR G +G+ +GP+G G +G+ +GP G
Sbjct: 350 GRPGRDGAVGPAGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPQGEKGEAGKDGSIGPQG 401
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/193 (30%), Positives = 83/193 (43%), Gaps = 21/193 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
GP+GR +GP+G G +G + +GP G +G +G +GP GR
Sbjct: 549 ETGPAGRDGSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRG 608
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----P--SGRLRYLGPSG 116
G +G+ +GP+G GP+GR +GP+G G P G +GP+G
Sbjct: 609 ATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAG 668
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +GR DG +G + GP G G GR GP +GP G +G
Sbjct: 669 PQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMG 722
Query: 177 PSGRLRYLGPSGR 189
+G GP GR
Sbjct: 723 KNGVDGSTGPQGR 735
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 78/178 (43%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+GR +GP+G G +GS G +G +GP+G G +GR G +G
Sbjct: 630 ETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATG---PIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATG 686
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G G GR GP +GP G +G +G GP GR + G
Sbjct: 687 PIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATG 740
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G GR +GP G
Sbjct: 741 RAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGE 798
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/159 (32%), Positives = 76/159 (47%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP GR G +G +GP+G G +G G GS+ GP G GP+G
Sbjct: 498 SIGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSV---GPPGERGETGPAG 554
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R +GP+G G +GR G +G +GP G +G +G +GP GR + G
Sbjct: 555 RDGSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATG---PIGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATG 611
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G+ +GP+G P G GP+GR +GP+G
Sbjct: 612 RAGKDGAVGPAG------PPGERGETGPAGRDGSVGPAG 644
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 77/183 (42%), Gaps = 15/183 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
++GP G GP+G +GP+G G +GR +GP G +G +G
Sbjct: 540 SVGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDG 599
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP GR G +G +GP+G P G GP+GR +GP+G G +G
Sbjct: 600 SMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAG------PPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTG 653
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
DG +G + GP G G GR GP G GP G G GR G
Sbjct: 654 SPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIG---PAGPQGETGLTGRPGRDGATG 710
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 711 PIG 713
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 18/181 (9%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
K +GP G +GP+G +GP+G G +GR G G++ GP G +G
Sbjct: 252 KDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR---PGRDGAVGPAGPPGERGAIG 308
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+GR +GP+G G +G G G +GP G +G GR +GP+
Sbjct: 309 PAGRDGAVGPAGPPGERGATG---IPGRDGVDGSVGPQGERGEIGRPGRDGAVGPA---- 361
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP GR G +G+ +GP+G G +G+ +GP G GP G GP G
Sbjct: 362 --GPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPQGEKGEAGKDGSIGPQG---IQGPRGE---TGPPG 413
Query: 189 R 189
R
Sbjct: 414 R 414
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 83/183 (45%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G +G +G +GP G G +G+ +GP+G GP+GR +GP
Sbjct: 583 IGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGP 642
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G +GS G +G + GP G G GR +GP+G G +GR
Sbjct: 643 AGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGR 702
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
DG +G +GP G +G +G GP GR G +G+ +GP+G G
Sbjct: 703 PGRDGATG---PIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGE 759
Query: 187 SGR 189
+GR
Sbjct: 760 NGR 762
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/124 (32%), Positives = 60/124 (48%), Gaps = 13/124 (10%)
Query: 72 RLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
++R L GP G GP+G + GP G +GP+G+ +GP+G P G +
Sbjct: 155 KVRKLHGPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAI 208
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G+ +GP G G +GR GR +GP G +GP+G+ +GP G
Sbjct: 209 GPAGKDGAVGPQGPPGERGENGR------PGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGER 262
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 263 GAIG 266
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 75/178 (42%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP GR G +G +GP+G G +GR G +G + GP G G G
Sbjct: 729 STGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPG 788
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R +GP G G G+ GP G G +G + GP G G G S G
Sbjct: 789 RDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVG 848
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G+ +G +GR +GP G G +G G G+ +GP G + +GP G
Sbjct: 849 PQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGE 906
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 72/174 (41%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G +G +G GP GR G +G +GP+G G +GR G +G
Sbjct: 712 IGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGP 771
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G G GR +GP G G G+ GP G G +G + GP
Sbjct: 772 IGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGP 831
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G +GP G+ +G +GR +GP G GP G GL
Sbjct: 832 QGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVG---PAGPKGETGLAGL 882
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/160 (32%), Positives = 75/160 (46%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP GR G +G +GP+G G +G G GS +GP G GP+GR
Sbjct: 499 IGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGS---VGPPGERGETGPAGR 555
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+GP+G G +GR G +G + GP G +G +G +GP GR G
Sbjct: 556 DGSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPI---GPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGR 612
Query: 160 SGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G+ +GP+ G GP+GR +GP+G GL+
Sbjct: 613 AGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLT 652
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/161 (29%), Positives = 69/161 (42%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G+ +GP G +G +G GP GR G +G+ +GP+G G +GR
Sbjct: 706 DGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGR 765
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G + GP G G GR +GP G +G G+ GP G G +G
Sbjct: 766 DGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGP 825
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ GP G G G +GP G+ +G +GR +G
Sbjct: 826 IGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIG 866
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 12/180 (6%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G +G G +G + GP G G GR GP +GP G
Sbjct: 664 IGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGE 717
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+G +G GP GR G +G+ +GP+G G +GR DG +G + GP
Sbjct: 718 TGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGP 777
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GR +GP G G G+ GP G +GP+G GL
Sbjct: 778 QGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGL 837
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +GR G +G + GP G G GR +GP G G G+ GP G
Sbjct: 758 GENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPP 817
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G + GP G G G +GP G+ +G +GR +GP G G +
Sbjct: 818 GERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGET 877
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G+ +GP G + +GP G G +GR G G +GP G
Sbjct: 878 GLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGE---RGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQG 929
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.076, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 7/181 (3%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
EK N P G+ GP G G +G + GP G G G +GP G+ +
Sbjct: 798 EKGENGRP-GKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLI 856
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +GR +GP G G +G G G+ +GP G + +GP G G GR
Sbjct: 857 GRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRD 916
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
DG +G + G G GP G G G+ GP GR GR +GP
Sbjct: 917 GEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPR 970
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 971 G 971
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.095, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +GR +GP G G +G G G+ +GP G++ +GP G G GR
Sbjct: 856 IGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGR 915
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G + G G GP G G G+ GP GR +GP G
Sbjct: 916 DGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGETGPPGRQGRDGIMGPRGLRGE 975
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G GP GR GP+G + G G G GR +GP+G+ GP G+
Sbjct: 976 KGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGPIGPQGIRGLKGIQGRPGRDGEMGPAGKDGIEGPRGQ 1035
Query: 190 LRYLGLS 196
G
Sbjct: 1036 DGTTGAK 1042
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 80/187 (42%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYL 67
GP G+ GP +GP G G GR +GP+G + G +G +
Sbjct: 446 GPQGKRGETGP------VGPRGEPGLAGLPGRDGAIGPAGPPGERGATGLPGRNGVDGSI 499
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP GR G +G +GP+G G +G G G +GP G GP+GR
Sbjct: 500 GPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGATG---IPGRDGVDGSVGPPGERGETGPAGRD 556
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
S GP+G G +GR +GP G +G +G +GP GR G +G+
Sbjct: 557 GSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKD 616
Query: 182 RYLGPSG 188
+GP+G
Sbjct: 617 GAVGPAG 623
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP G +G +GR +GP G G +G G G+
Sbjct: 829 AGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGK 888
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP G++ +GP G G GR G +G + G G GP G G
Sbjct: 889 DGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGR 948
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G+ GP GR GR +GP G G G GP GR GP+G +
Sbjct: 949 PGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPRGLRGEKGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGPIGP 1002
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 1003 QGI 1005
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +GR G +G + GP G G GR GP +GP G +G +G
Sbjct: 672 EKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNG 725
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G
Sbjct: 726 VDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAG 785
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GR +GP G G G+ GP G G +G + GP G
Sbjct: 786 LPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQG 833
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 65/164 (39%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G+ +GP G++ +GP G G GR G +G + G G GP G
Sbjct: 886 DGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGL 945
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G GP GR GR +GP G G G GP GR + GP+G
Sbjct: 946 KGRPGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPRGLRGEKGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGP 999
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ G G G GR +GP+G+ GP G+ G G
Sbjct: 1000 IGPQGIRGLKGIQGRPGRDGEMGPAGKDGIEGPRGQDGTTGAKG 1043
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 73/192 (38%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP G G G+ GP G G +G + GP G
Sbjct: 775 AGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGA 834
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP G+ +G +GR +GP G G +G G G+ S GP
Sbjct: 835 TGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGP 894
Query: 133 SGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + +GP +GR G G +GP G GP G G G+
Sbjct: 895 QGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGE 954
Query: 184 LGPSGRLRYLGL 195
GP GR G+
Sbjct: 955 TGPPGRQGRDGI 966
>gi|15021422|gb|AAK77699.1|AF369029_30 ORF30, putative collagen [shrimp white spot syndrome virus]
Length = 1684
Score = 73.6 bits (179), Expect = 4e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 87/175 (49%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G++ GP G +GP+G+ +GP+G P G +GP+G+
Sbjct: 161 GPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAIGPAGKD 214
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP G G +GR GR +GP G +GP+G+ +GP G + GP+
Sbjct: 215 GAVGPQGPPGERGENGR------PGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPA 268
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G+ +GP+G G +GR G G + GP G +GP+GR +GP+G
Sbjct: 269 GKDGAVGPAGPQGERGENGR---PGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAG 320
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/201 (30%), Positives = 90/201 (44%), Gaps = 30/201 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS- 70
GP+G + GP G +GP+G +GP+ GP G +GP+G+ +GP
Sbjct: 168 ETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPA------GPQGERGAIGPAGKDGAVGPQG 221
Query: 71 -----------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
GR +GP G +GP+G+ +GP G +GP+G+ +GP+G
Sbjct: 222 PPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQG 281
Query: 120 YLGPSGRLNSD------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +GR D GP G +GP+GR +GP+ G G G +G
Sbjct: 282 ERGENGRPGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVG 341
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +G GR +GP+G
Sbjct: 342 PQGERGEIGRPGRDGAVGPAG 362
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/146 (32%), Positives = 72/146 (49%), Gaps = 13/146 (8%)
Query: 45 RLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
++R L GP G GP+G + GP G +GP+G +GP+G P G +
Sbjct: 155 KVRKLHGPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAI 208
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G+ +GP G P G +G GR +GP G +GP+G+ +GP G
Sbjct: 209 GPAGKDGAVGPQG------PPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGER 262
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP+G+ +GP+G G +GR
Sbjct: 263 GAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR 288
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/200 (29%), Positives = 87/200 (43%), Gaps = 18/200 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
GP G +GP+G +GP G +GP G +GP+G +GP
Sbjct: 199 AGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGPPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGP 258
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +GP+G+ +GP+G G +GR + GP G +GP+GR +GP
Sbjct: 259 QGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGRPGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGP 318
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G DG G + G G + G G + GP GR G +G+
Sbjct: 319 AGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPQGERGEIGRPGRDGAVGPAGPQGRRGATGRAGKDGA 378
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+GP+G G +G+ +G
Sbjct: 379 VGPAGPQGEKGEAGKDGSIG 398
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/172 (31%), Positives = 80/172 (46%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GR +GP G +GP+G +GP G +GP+G +GP+G G +GR
Sbjct: 233 GRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR---P 289
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G G++ GP G +GP+GR +GP+G G +G G G + G G +
Sbjct: 290 GRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPQGERGEI 349
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G + GP GR G +G+ +GP+G G +G+ +GP G
Sbjct: 350 GRPGRDGAVGPAGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPQGEKGEAGKDGSIGPQG 401
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/188 (31%), Positives = 84/188 (44%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP GR G +G +GP+G G +G G GS +GP G GP+G
Sbjct: 498 SIGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGS---VGPPGERGETGPAG 554
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R +GP+G G +GR G +G + GP G G GR GP G
Sbjct: 555 RDGSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPI------G 608
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +G +G +GP GR G +G+ +GP+ G GP+GR +GP+G
Sbjct: 609 PRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAG 668
Query: 189 RLRYLGLS 196
GL+
Sbjct: 669 PQGETGLT 676
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 79/183 (43%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G +G +G +GP G G +G+ +GP+ G GP+GR +GP
Sbjct: 607 IGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGP 666
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G +GS G +G + GP G G GR +GP+G G +GR
Sbjct: 667 AGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGR 726
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
DG +G + GP G G GR GP +GP G +G +G GP
Sbjct: 727 PGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNGVDGSTGP 780
Query: 187 SGR 189
GR
Sbjct: 781 QGR 783
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/162 (31%), Positives = 73/162 (45%), Gaps = 9/162 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP G GP+GR +GP+G G +GR G +G + GP G G GR
Sbjct: 541 VGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGR 600
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS---GRLRY 147
GP +GP G +G +G +GP GR + G +G+ +GP+ G
Sbjct: 601 DGATGP------IGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGE 654
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+GR +GP+G G +G G +G + GP G
Sbjct: 655 TGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGE 696
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 78/180 (43%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G GP+G +GP+G G +GR G +G + GP G G G
Sbjct: 540 SVGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPG 599
Query: 72 RLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
R +GP G +G +G +GP GR G +G+ +GP+ GP G
Sbjct: 600 RDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPA------GPPGERG 653
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+GR +GP+G G +G G +G + GP G G GR GP G
Sbjct: 654 ETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIG 713
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 18/181 (9%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
K +GP G +GP+G +GP+G G +GR G G++ GP G +G
Sbjct: 252 KDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR---PGRDGAVGPAGPPGERGAIG 308
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+GR +GP+G G +G G G +GP G +G GR +GP+
Sbjct: 309 PAGRDGAVGPAGPPGERGATG---IPGRDGVDGSVGPQGERGEIGRPGRDGAVGPA---- 361
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP GR G +G+ +GP+G G +G+ +GP G GP G GP G
Sbjct: 362 --GPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPQGEKGEAGKDGSIGPQG---IQGPRGE---TGPPG 413
Query: 189 R 189
R
Sbjct: 414 R 414
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/124 (32%), Positives = 60/124 (48%), Gaps = 13/124 (10%)
Query: 72 RLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
++R L GP G GP+G + GP G +GP+G+ +GP+G P G +
Sbjct: 155 KVRKLHGPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAI 208
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G+ +GP G G +GR GR +GP G +GP+G+ +GP G
Sbjct: 209 GPAGKDGAVGPQGPPGERGENGR------PGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGER 262
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 263 GAIG 266
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 75/178 (42%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP GR G +G +GP+G G +GR G +G + GP G G G
Sbjct: 777 STGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPG 836
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R +GP G G G+ GP G G +G + GP G G G S G
Sbjct: 837 RDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVG 896
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G+ +G +GR +GP G G +G G G+ +GP G + +GP G
Sbjct: 897 PQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGE 954
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 72/174 (41%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G +G +G GP GR G +G +GP+G G +GR G +G
Sbjct: 760 IGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGP 819
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G G GR +GP G G G+ GP G G +G + GP
Sbjct: 820 IGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGP 879
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G +GP G+ +G +GR +GP G GP G GL
Sbjct: 880 QGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVG---PAGPKGETGLAGL 930
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 81/193 (41%), Gaps = 15/193 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------SGSLRYLG 59
GP+GR +GP+G G +GS G +G + GP G+ +G
Sbjct: 654 ETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIG 713
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 116
P+G G +GR G +G + GP G G GR +GP G +G +G
Sbjct: 714 PAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP GR + G +G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G
Sbjct: 774 VDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAG 833
Query: 177 PSGRLRYLGPSGR 189
GR +GP G
Sbjct: 834 LPGRDGAIGPQGE 846
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/161 (29%), Positives = 69/161 (42%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G+ +GP G +G +G GP GR G +G+ +GP+G G +GR
Sbjct: 754 DGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGR 813
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G + GP G G GR +GP G +G G+ GP G G +G
Sbjct: 814 DGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGP 873
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ GP G G G +GP G+ +G +GR +G
Sbjct: 874 IGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIG 914
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 78/183 (42%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 12 NLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
++GP GR G G++ GP G GP+GR +GP+G G +G G
Sbjct: 624 SMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDG 683
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G + GP G G GR GP +GP+G G +GR G +G +
Sbjct: 684 ATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGP------IGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIG 737
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G G GR +GP G +G +G GP GR G +G+ +G
Sbjct: 738 PAGPQGETGLTGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVG 797
Query: 186 PSG 188
P+G
Sbjct: 798 PAG 800
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 74/180 (41%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGS 81
G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G GR +GP G
Sbjct: 706 DGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGPIGPRGE 765
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+G +G GP GR G +G+ +GP+G G +GR DG +G + GP
Sbjct: 766 TGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGP 825
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GR +GP G G G+ GP G +GP+G GL
Sbjct: 826 QGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGL 885
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 76/185 (41%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G G G+ +GP G +G +G +GP GR G +G+
Sbjct: 580 TGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGK 639
Query: 73 LRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GP+G GP+GR +GP+G G +G G +G + GP G
Sbjct: 640 DGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGE 699
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GR GP +GP+G G +GR G +G + GP G G GR
Sbjct: 700 NGRPGRDGATGP------IGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGR 753
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 754 DGATG 758
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 78/183 (42%), Gaps = 15/183 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G +GP+G G +G G GS+ GP GR G +G+
Sbjct: 457 VGPRGEPGLAGLPGRDGAIGPAGPPGERGATGLPGRNGVDGSI---GPQGRRGATGRAGK 513
Query: 73 LRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP+G + G G +GP G GP+GR +GP+G G +GR
Sbjct: 514 DGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGERGENGR 573
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
DG +G + GP G G GR GP +GP G +G +G +GP
Sbjct: 574 PGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNGVDGSMGP 627
Query: 187 SGR 189
GR
Sbjct: 628 QGR 630
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +GR G +G + GP G G GR +GP G G G+ GP G
Sbjct: 806 GENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPP 865
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G + GP G G G +GP G+ +G +GR +GP G G +
Sbjct: 866 GERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGET 925
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G+ +GP G + +GP G G +GR G G +GP G
Sbjct: 926 GLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGE---RGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQG 977
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 7/181 (3%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
EK N P G+ GP G G +G + GP G G G +GP G+ +
Sbjct: 846 EKGENGRP-GKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLI 904
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +GR +GP G G +G G G+ +GP G + +GP G G GR
Sbjct: 905 GRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRD 964
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
DG +G + G G GP G G G+ GP GR GR +GP
Sbjct: 965 GEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPR 1018
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 1019 G 1019
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.097, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +GR +GP G G +G G G+ +GP G++ +GP G G GR
Sbjct: 904 IGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGR 963
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G + G G GP G G G+ GP GR +GP G
Sbjct: 964 DGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGETGPPGRQGRDGIMGPRGLRGE 1023
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G GP GR GP+G + G G G GR +GP+G+ GP G+
Sbjct: 1024 KGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGPIGPQGIRGLKGIQGRPGRDGEMGPAGKDGIEGPRGQ 1083
Query: 190 LRYLGLS 196
G
Sbjct: 1084 DGTTGAK 1090
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 72/179 (40%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G G G+ +GP+G G +G G +G + GP G
Sbjct: 685 TGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGE 744
Query: 73 LRYLG-P--SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G P G+ +GP G +G +G GP GR G +G+ +GP+G
Sbjct: 745 TGLTGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGE 804
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +GR G +G + GP G G GR +GP G G G+ GP G
Sbjct: 805 RGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMG 863
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP G +G +GR +GP G G +G G G+
Sbjct: 877 AGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGK 936
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP G++ +GP G G GR G +G + G G GP G G
Sbjct: 937 DGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGR 996
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G+ GP GR GR +GP G G G GP GR GP+G +
Sbjct: 997 PGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPRGLRGEKGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGPIGP 1050
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 1051 QGI 1053
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.51, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +GR G +G + GP G G GR GP +GP G +G +G
Sbjct: 720 EKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNG 773
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G
Sbjct: 774 VDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAG 833
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GR +GP G G G+ GP G G +G + GP G
Sbjct: 834 LPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQG 881
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 65/164 (39%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G+ +GP G++ +GP G G GR G +G + G G GP G
Sbjct: 934 DGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGL 993
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G GP GR GR +GP G G G GP GR + GP+G
Sbjct: 994 KGRPGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPRGLRGEKGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGP 1047
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ G G G GR +GP+G+ GP G+ G G
Sbjct: 1048 IGPQGIRGLKGIQGRPGRDGEMGPAGKDGIEGPRGQDGTTGAKG 1091
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 73/192 (38%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP G G G+ GP G G +G + GP G
Sbjct: 823 AGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGA 882
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP G+ +G +GR +GP G G +G G G+ S GP
Sbjct: 883 TGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGP 942
Query: 133 SGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + +GP +GR G G +GP G GP G G G+
Sbjct: 943 QGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGE 1002
Query: 184 LGPSGRLRYLGL 195
GP GR G+
Sbjct: 1003 TGPPGRQGRDGI 1014
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/155 (30%), Positives = 67/155 (43%), Gaps = 15/155 (9%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GSLRYLGPSGRLRYL 94
GP G+ GP +GP G G GR +GP+ G+ G +G +
Sbjct: 446 GPQGKRGETGP------VGPRGEPGLAGLPGRDGAIGPAGPPGERGATGLPGRNGVDGSI 499
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP GR G +G+ +GP+G G +G DG G +GP G GP+GR
Sbjct: 500 GPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDG---SVGPPGERGETGPAGRD 556
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP+G G +GR G +G + GP G
Sbjct: 557 GSVGPAGPQGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGE 591
>gi|118478934|ref|YP_896085.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
str. Al Hakam]
gi|118418159|gb|ABK86578.1| conserved hypothetical protein [Bacillus thuringiensis str. Al
Hakam]
Length = 845
Score = 73.6 bits (179), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 75/185 (40%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 632 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 682
Query: 74 RYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP +G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 683 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 739
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 740 GATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQ 799
Query: 188 GRLRY 192
G RY
Sbjct: 800 GSSRY 804
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 475 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 531
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G GP+G GP G G +G G G + GP
Sbjct: 532 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGP 591
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G G +G G +G GP+G GP G
Sbjct: 592 QG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 644
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G+ G +G G G
Sbjct: 527 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 586
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G G +G G +G GP+G + GP
Sbjct: 587 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQ 643
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 644 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNT 694
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 695 GAT 697
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 493 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGP 549
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G G G GP G GP+G + GP
Sbjct: 550 QGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGP 606
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 607 QGAQGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 659
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 440 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ 499
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G + GP+
Sbjct: 500 GNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPA 556
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 557 GATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNT 613
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 614 GAT 616
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 12/175 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 512 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQ 568
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G GP G GP+G GP G G +G + G +
Sbjct: 569 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGAT 625
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 626 GPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 674
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 69/180 (38%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 456 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAG 515
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G + G
Sbjct: 516 ATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQG 569
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 570 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQG 629
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 448 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGP 507
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 508 QGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGP 564
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 565 QGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGA 621
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 622 TGAT 625
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G GP+G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 467 GAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG-- 524
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 525 -VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ 583
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP+G GP G G +G G +G GP+G
Sbjct: 584 GNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGAT 640
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 641 G 641
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G+ G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 395 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ 454
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G + GP+
Sbjct: 455 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPA 514
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 515 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNT 571
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 572 GAT 574
Score = 66.2 bits (160), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/188 (31%), Positives = 74/188 (39%), Gaps = 21/188 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G GP+G+ GP G+ GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 585 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 641
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 642 PQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQG 692
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G G G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 693 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 746
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 747 AQGNTGAT 754
Score = 66.2 bits (160), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 73/187 (39%), Gaps = 18/187 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 596 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 652
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP+G GP G GP+G GP +G GP G
Sbjct: 653 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 706
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+
Sbjct: 707 GNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPA 763
Query: 188 GRLRYLG 194
G G
Sbjct: 764 GATGATG 770
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/185 (30%), Positives = 74/185 (40%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ G +G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 543 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAG 599
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G G +G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 600 ATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 656
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 657 PQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQG 707
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 708 NTGAT 712
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G GP+G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 569 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQ 628
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 629 GVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV---QGPA 679
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 680 GATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGPA 736
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 737 GAT 739
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 425 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGA---TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 481
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 482 GVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 538
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 539 GAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG 593
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 67/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 403 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGA 462
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 463 TGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGP 522
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 523 QG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGAT 577
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 411 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 470
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G GP G G +G GP+G GP G G
Sbjct: 471 NTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGV---QG 527
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP G G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 528 PAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 587
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 588 ATG 590
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPS 70
G G GP G+ G +G G +G GP G+ G +G G +
Sbjct: 383 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 442
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G+ G +G G G G +G GP+G GP G +
Sbjct: 443 GATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNT 502
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 503 GATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGAT 559
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 560 GATG 563
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 63/184 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 222
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G S G
Sbjct: 223 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGA 282
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 283 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 342
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 343 TGAT 346
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 67/180 (37%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 372 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 431
Query: 72 RLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 432 ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATG 491
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 492 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG 548
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/179 (26%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGP 69
G +G G +G+ GP G+ G +G G G+ GP G GP
Sbjct: 346 TGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGP 405
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +G+ G G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 406 QGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGP 465
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G +G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 466 QGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG 524
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 356 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT 415
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G+ G +G G +G GP G G +G G G +
Sbjct: 416 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT 475
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 476 GATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 532
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 533 GATG 536
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +GS G +G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 338 GAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 397
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G +G GP G G +G G G G +G + G +
Sbjct: 398 GNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 457
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 458 GATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGAT 517
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 518 GATG 521
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/183 (25%), Positives = 61/183 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 209 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ 268
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 269 GNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ 328
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G G +G G +G GP G
Sbjct: 329 GNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 388
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 389 GAT 391
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/191 (25%), Positives = 65/191 (34%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ G +G G G+ G +G G +G
Sbjct: 315 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 374
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G+ G +G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 375 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATG 434
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G GP G G +G G G G +G GP+G G
Sbjct: 435 PQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATG 494
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 495 PQGAQGNTGAT 505
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/185 (24%), Positives = 61/185 (32%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 180 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 239
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G G +G G G G +G + G
Sbjct: 240 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQG 299
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP G G +G G G GP G G +G G G
Sbjct: 300 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTG 359
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 360 ATGAT 364
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +GS G +G GP G
Sbjct: 239 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQ 298
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G G GP G G +G S G
Sbjct: 299 GNTGATGA---TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQ 355
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G G +G GP G G +G G +G G G
Sbjct: 356 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT 415
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 416 GAT 418
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/180 (25%), Positives = 61/180 (33%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 254 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ 313
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G GP G G +G G G G +G + G +
Sbjct: 314 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 373
Query: 134 GRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 374 GATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGAT 433
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/192 (24%), Positives = 64/192 (33%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 172 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGA 231
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G G +G GP G G +G G G + G
Sbjct: 232 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGA 291
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 292 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGS 351
Query: 193 LGLSDGLRVSGL 204
G +G
Sbjct: 352 QGAQGNTGATGA 363
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/176 (25%), Positives = 61/176 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 217 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGA 276
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G G +G GP G G +G G G + GP
Sbjct: 277 TGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGP 336
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 337 QGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 392
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/184 (25%), Positives = 63/184 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ G G G +G
Sbjct: 292 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGS 351
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G G +G G G GP G G +G + G
Sbjct: 352 QGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 411
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G G +G G G G +G G +G GP G
Sbjct: 412 TGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGN 471
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 472 TGAT 475
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/187 (25%), Positives = 63/187 (33%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 262 TGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGA 321
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G G +G G G G +G G +G + GP
Sbjct: 322 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGP 381
Query: 133 ---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G G +G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 382 QGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGN 441
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 442 TGATGAT 448
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/185 (25%), Positives = 64/185 (34%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
G +G GP G+ G +G+ G G GP G+ G +G G +
Sbjct: 299 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNT 358
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G+ G +G G G GP G G +G G +G +
Sbjct: 359 GATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGAT 418
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G +G G G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 419 GPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGAT 478
Query: 191 RYLGL 195
G+
Sbjct: 479 GPQGV 483
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/191 (24%), Positives = 63/191 (32%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 270 NTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 329
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G G G G +G G +G GP G + G
Sbjct: 330 NTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 389
Query: 132 PS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G GP G G +G G G G +G G +G G
Sbjct: 390 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATG 449
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 450 PQGAQGNTGAT 460
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/175 (25%), Positives = 59/175 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 191 GAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 250
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G G G +G G +G + GP
Sbjct: 251 GAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 310
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 311 GAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATG 365
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/100 (33%), Positives = 44/100 (44%), Gaps = 3/100 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ GP+G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 708 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAG 764
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP G+ G +G GP+G GP G RY
Sbjct: 765 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGSSRY 804
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/191 (24%), Positives = 62/191 (32%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 225 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQG 284
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G G +G G G GP G + G
Sbjct: 285 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 344
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLG 185
+G G G G +G G +G GP G G + G G
Sbjct: 345 ATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 404
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 405 PQGAQGNTGAT 415
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/182 (24%), Positives = 62/182 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP G+ G +G G G+ G +G G +G
Sbjct: 199 TGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGA 258
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G G G G +G G +G GP G + G
Sbjct: 259 TGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGA 318
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G GP G G +G G G G +G G +G
Sbjct: 319 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGA 378
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 379 TG 380
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/183 (25%), Positives = 62/183 (33%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +G G +G G G
Sbjct: 284 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNT 343
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +GS G +G GP G G +G G G GP G + G +
Sbjct: 344 GATGATGSQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT 403
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 404 GPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT 460
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 461 GAT 463
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/127 (29%), Positives = 49/127 (38%), Gaps = 15/127 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 693 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG------------VQGPAGATGATGPQG---AQGPAG 737
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G + G
Sbjct: 738 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATG 797
Query: 132 PSGRLRY 138
P G RY
Sbjct: 798 PQGSSRY 804
>gi|17158634|ref|NP_477523.1| wsv001 [Shrimp white spot syndrome virus]
gi|17016928|gb|AAL33534.1| wsv001 [shrimp white spot syndrome virus]
gi|19481644|gb|AAL88920.1| WSSV052 [shrimp white spot syndrome virus]
gi|22074292|gb|AAL06238.1| ORF2311 [White spot syndrome virus]
Length = 1684
Score = 73.2 bits (178), Expect = 5e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 87/175 (49%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G++ GP G +GP+G+ +GP+G P G +GP+G+
Sbjct: 161 GPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAIGPAGKD 214
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP G G +GR GR +GP G +GP+G+ +GP G + GP+
Sbjct: 215 GAVGPQGPPGERGENGR------PGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPA 268
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G+ +GP+G G +GR G G + GP G +GP+GR +GP+G
Sbjct: 269 GKDGAVGPAGPQGERGENGR---PGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAG 320
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/201 (30%), Positives = 90/201 (44%), Gaps = 30/201 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS- 70
GP+G + GP G +GP+G +GP+ GP G +GP+G+ +GP
Sbjct: 168 ETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPA------GPQGERGAIGPAGKDGAVGPQG 221
Query: 71 -----------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
GR +GP G +GP+G+ +GP G +GP+G+ +GP+G
Sbjct: 222 PPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQG 281
Query: 120 YLGPSGRLNSD------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +GR D GP G +GP+GR +GP+ G G G +G
Sbjct: 282 ERGENGRPGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVG 341
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +G GR +GP+G
Sbjct: 342 PQGERGEIGRPGRDGAVGPAG 362
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/146 (32%), Positives = 72/146 (49%), Gaps = 13/146 (8%)
Query: 45 RLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
++R L GP G GP+G + GP G +GP+G +GP+G P G +
Sbjct: 155 KVRKLHGPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAI 208
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G+ +GP G P G +G GR +GP G +GP+G+ +GP G
Sbjct: 209 GPAGKDGAVGPQG------PPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGER 262
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP+G+ +GP+G G +GR
Sbjct: 263 GAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR 288
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/200 (29%), Positives = 87/200 (43%), Gaps = 18/200 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
GP G +GP+G +GP G +GP G +GP+G +GP
Sbjct: 199 AGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGPPGERGENGRPGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGP 258
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +GP+G+ +GP+G G +GR + GP G +GP+GR +GP
Sbjct: 259 QGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGRPGRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGP 318
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G DG G + G G + G G + GP GR G +G+
Sbjct: 319 AGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPQGERGEIGRPGRDGAVGPAGPQGRRGATGRAGKDGA 378
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+GP+G G +G+ +G
Sbjct: 379 VGPAGPQGEKGEAGKDGSIG 398
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/172 (31%), Positives = 80/172 (46%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GR +GP G +GP+G +GP G +GP+G +GP+G G +GR
Sbjct: 233 GRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR---P 289
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G G++ GP G +GP+GR +GP+G G +G G G + G G +
Sbjct: 290 GRDGAVGPAGPPGERGAIGPAGRDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPQGERGEI 349
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G + GP GR G +G+ +GP+G G +G+ +GP G
Sbjct: 350 GRPGRDGAVGPAGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPQGEKGEAGKDGSIGPQG 401
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/188 (31%), Positives = 84/188 (44%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP GR G +G +GP+G G +G G GS +GP G GP+G
Sbjct: 498 SIGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGS---VGPPGERGETGPAG 554
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R +GP+G G +GR G +G + GP G G GR GP G
Sbjct: 555 RDGSVGPAGPHGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPI------G 608
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +G +G +GP GR G +G+ +GP+ G GP+GR +GP+G
Sbjct: 609 PRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAG 668
Query: 189 RLRYLGLS 196
GL+
Sbjct: 669 PQGETGLT 676
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 79/183 (43%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G +G +G +GP G G +G+ +GP+ G GP+GR +GP
Sbjct: 607 IGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGP 666
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G +GS G +G + GP G G GR +GP+G G +GR
Sbjct: 667 AGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGR 726
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
DG +G + GP G G GR GP +GP G +G +G GP
Sbjct: 727 PGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNGVDGSTGP 780
Query: 187 SGR 189
GR
Sbjct: 781 QGR 783
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 82/181 (45%), Gaps = 18/181 (9%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
K +GP G +GP+G +GP+G G +GR G G++ GP G +G
Sbjct: 252 KDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAGPQGERGENGR---PGRDGAVGPAGPPGERGAIG 308
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+GR +GP+G G +G G G +GP G +G GR +GP+
Sbjct: 309 PAGRDGAVGPAGPPGERGATG---IPGRDGVDGSVGPQGERGEIGRPGRDGAVGPA---- 361
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP GR G +G+ +GP+G G +G+ +GP G GP G GP G
Sbjct: 362 --GPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPQGEKGEAGKDGSIGPQG---IQGPRGE---TGPPG 413
Query: 189 R 189
R
Sbjct: 414 R 414
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/162 (31%), Positives = 73/162 (45%), Gaps = 9/162 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP G GP+GR +GP+G G +GR G +G + GP G G GR
Sbjct: 541 VGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPHGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGR 600
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS---GRLRY 147
GP +GP G +G +G +GP GR + G +G+ +GP+ G
Sbjct: 601 DGATGP------IGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGE 654
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+GR +GP+G G +G G +G + GP G
Sbjct: 655 TGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGE 696
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 78/180 (43%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G GP+G +GP+G G +GR G +G + GP G G G
Sbjct: 540 SVGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPHGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPG 599
Query: 72 RLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
R +GP G +G +G +GP GR G +G+ +GP+ GP G
Sbjct: 600 RDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPA------GPPGERG 653
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+GR +GP+G G +G G +G + GP G G GR GP G
Sbjct: 654 ETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIG 713
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/124 (32%), Positives = 60/124 (48%), Gaps = 13/124 (10%)
Query: 72 RLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
++R L GP G GP+G + GP G +GP+G+ +GP+G P G +
Sbjct: 155 KVRKLHGPRGERGETGPAGAVGPAGPQGERGAIGPAGKDGAVGPAG------PQGERGAI 208
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G+ +GP G G +GR GR +GP G +GP+G+ +GP G
Sbjct: 209 GPAGKDGAVGPQGPPGERGENGR------PGRDGAVGPQGERGAIGPAGKDGAVGPQGER 262
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 263 GAIG 266
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 75/178 (42%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP GR G +G +GP+G G +GR G +G + GP G G G
Sbjct: 777 STGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPG 836
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R +GP G G G+ GP G G +G + GP G G G S G
Sbjct: 837 RDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVG 896
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G+ +G +GR +GP G G +G G G+ +GP G + +GP G
Sbjct: 897 PQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGE 954
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 72/174 (41%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G +G +G GP GR G +G +GP+G G +GR G +G
Sbjct: 760 IGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGP 819
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G G GR +GP G G G+ GP G G +G + GP
Sbjct: 820 IGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGP 879
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G +GP G+ +G +GR +GP G GP G GL
Sbjct: 880 QGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVG---PAGPKGETGLAGL 930
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 81/193 (41%), Gaps = 15/193 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------SGSLRYLG 59
GP+GR +GP+G G +GS G +G + GP G+ +G
Sbjct: 654 ETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIG 713
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 116
P+G G +GR G +G + GP G G GR +GP G +G +G
Sbjct: 714 PAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP GR + G +G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G
Sbjct: 774 VDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAG 833
Query: 177 PSGRLRYLGPSGR 189
GR +GP G
Sbjct: 834 LPGRDGAIGPQGE 846
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/161 (29%), Positives = 69/161 (42%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G+ +GP G +G +G GP GR G +G+ +GP+G G +GR
Sbjct: 754 DGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGR 813
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G + GP G G GR +GP G +G G+ GP G G +G
Sbjct: 814 DGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGP 873
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ GP G G G +GP G+ +G +GR +G
Sbjct: 874 IGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIG 914
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 78/183 (42%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 12 NLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
++GP GR G G++ GP G GP+GR +GP+G G +G G
Sbjct: 624 SMGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDG 683
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G + GP G G GR GP +GP+G G +GR G +G +
Sbjct: 684 ATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGP------IGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIG 737
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G G GR +GP G +G +G GP GR G +G+ +G
Sbjct: 738 PAGPQGETGLTGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVG 797
Query: 186 PSG 188
P+G
Sbjct: 798 PAG 800
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 74/180 (41%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGS 81
G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G GR +GP G
Sbjct: 706 DGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGPIGPRGE 765
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+G +G GP GR G +G+ +GP+G G +GR DG +G + GP
Sbjct: 766 TGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGP 825
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GR +GP G G G+ GP G +GP+G GL
Sbjct: 826 QGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGL 885
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 76/185 (41%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G G G+ +GP G +G +G +GP GR G +G+
Sbjct: 580 TGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSMGPQGRRGATGRAGK 639
Query: 73 LRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GP+ G GP+GR +GP+G G +G G +G + GP G
Sbjct: 640 DGAVGPAGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPQGETGLTGSPGRDGATGPIGPAGPQGEKGE 699
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GR GP +GP+G G +GR G +G + GP G G GR
Sbjct: 700 NGRPGRDGATGP------IGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGR 753
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 754 DGATG 758
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 78/183 (42%), Gaps = 15/183 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G +GP+G G +G G GS+ GP GR G +G+
Sbjct: 457 VGPRGEPGLAGLPGRDGAIGPAGPPGERGATGLPGRNGVDGSI---GPQGRRGATGRAGK 513
Query: 73 LRYLGPS------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP+ G+ G G +GP G GP+GR +GP+G G +GR
Sbjct: 514 DGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDGSVGPPGERGETGPAGRDGSVGPAGPHGERGENGR 573
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
DG +G + GP G G GR GP +GP G +G +G +GP
Sbjct: 574 PGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNGVDGSMGP 627
Query: 187 SGR 189
GR
Sbjct: 628 QGR 630
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +GR G +G + GP G G GR +GP G G G+ GP G
Sbjct: 806 GENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPP 865
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G + GP G G G +GP G+ +G +GR +GP G G +
Sbjct: 866 GERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGET 925
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G+ +GP G + +GP G G +GR G G +GP G
Sbjct: 926 GLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGE---RGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQG 977
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.089, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 7/181 (3%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
EK N P G+ GP G G +G + GP G G G +GP G+ +
Sbjct: 846 EKGENGRP-GKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLI 904
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +GR +GP G G +G G G+ +GP G + +GP G G GR
Sbjct: 905 GRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRD 964
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
DG +G + G G GP G G G+ GP GR GR +GP
Sbjct: 965 GEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPR 1018
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 1019 G 1019
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +GR +GP G G +G G G+ +GP G++ +GP G G GR
Sbjct: 904 IGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGR 963
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G + G G GP G G G+ GP GR +GP G
Sbjct: 964 DGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGETGPPGRQGRDGIMGPRGLRGE 1023
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G GP GR GP+G + G G G GR +GP+G+ GP G+
Sbjct: 1024 KGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGPIGPQGIRGLKGIQGRPGRDGEMGPAGKDGIEGPRGQ 1083
Query: 190 LRYLGLS 196
G
Sbjct: 1084 DGTTGAK 1090
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 72/179 (40%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G G G+ +GP+G G +G G +G + GP G
Sbjct: 685 TGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGEKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGE 744
Query: 73 LRYLG-P--SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G P G+ +GP G +G +G GP GR G +G+ +GP+G
Sbjct: 745 TGLTGRPGRDGATGPIGPRGETGAMGKNGVDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGE 804
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +GR G +G + GP G G GR +GP G G G+ GP G
Sbjct: 805 RGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMG 863
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP G +G +GR +GP G G +G G G+
Sbjct: 877 AGPQGATGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGK 936
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP G++ +GP G G GR G +G + G G GP G G
Sbjct: 937 DGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGR 996
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G+ GP GR GR +GP G G G GP GR GP+G +
Sbjct: 997 PGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPRGLRGEKGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGPIGP 1050
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 1051 QGI 1053
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +GR G +G + GP G G GR GP +GP G +G +G
Sbjct: 720 EKGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLTGRPGRDGATGP------IGPRGETGAMGKNG 773
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G+ +GP+G G +GR G +G + GP G G
Sbjct: 774 VDGSTGPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGETGLAG 833
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GR +GP G G G+ GP G G +G + GP G
Sbjct: 834 LPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQG 881
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 65/164 (39%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G+ +GP G++ +GP G G GR G +G + G G GP G
Sbjct: 934 DGKDGSVGPQGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGL 993
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G GP GR GR +GP G G G GP GR + GP+G
Sbjct: 994 KGRPGKDGETGPPGR------QGRDGIMGPRGLRGEKGAPGNDGLEGPEGRDGAPGPAGP 1047
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ G G G GR +GP+G+ GP G+ G G
Sbjct: 1048 IGPQGIRGLKGIQGRPGRDGEMGPAGKDGIEGPRGQDGTTGAKG 1091
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 73/192 (38%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP G G G+ GP G G +G + GP G
Sbjct: 823 AGPQGETGLAGLPGRDGAIGPQGEKGENGRPGKDGATGPMGPPGERGETGPIGPAGPQGA 882
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP G+ +G +GR +GP G G +G G G+ S GP
Sbjct: 883 TGLPGRDGVDGSVGPQGKRGLIGRTGRDGAIGPVGPAGPKGETGLAGLPGIDGKDGSVGP 942
Query: 133 SGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + +GP +GR G G +GP G GP G G G+
Sbjct: 943 QGAIGPIGPRGERGETGRPGRDGEDGSTGPMGPQGLRGATGAPGPQGERGLKGRPGKDGE 1002
Query: 184 LGPSGRLRYLGL 195
GP GR G+
Sbjct: 1003 TGPPGRQGRDGI 1014
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/155 (30%), Positives = 67/155 (43%), Gaps = 15/155 (9%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GSLRYLGPSGRLRYL 94
GP G+ GP +GP G G GR +GP+ G+ G +G +
Sbjct: 446 GPQGKRGETGP------VGPRGEPGLAGLPGRDGAIGPAGPPGERGATGLPGRNGVDGSI 499
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP GR G +G+ +GP+G G +G DG G +GP G GP+GR
Sbjct: 500 GPQGRRGATGRAGKDGAVGPAGPPGERGATGIPGRDGVDG---SVGPPGERGETGPAGRD 556
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP+G G +GR G +G + GP G
Sbjct: 557 GSVGPAGPHGERGENGRPGRDGATGPIGPAGPQGE 591
>gi|218232576|ref|YP_002369322.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus B4264]
gi|218160533|gb|ACK60525.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus B4264]
Length = 459
Score = 73.2 bits (178), Expect = 6e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 36 VGPTGATGATGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGA 95
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 96 TGITGATGS---TGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGI 152
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 153 TGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGI 212
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 213 TGAT 216
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 76/180 (42%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + +GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 31 GTVPKVGPTGATGATGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGST 90
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 91 GPTGATGITGATGS---TGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGAT 147
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 148 GPTGITGATGSTGPTGATGITGATGS---TGPTGATGITGATGS---TGPTGATGITGAT 201
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 73/178 (41%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 45 TGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGS 104
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G +G G +G S GP
Sbjct: 105 ---TGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGP 161
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 162 TGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGST 219
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +GS GP+G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 105 TGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGA 164
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 165 TGITGATGST---GPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGP 221
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 222 TGATGITGATGS---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGITGATGPTGPTGA 278
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 279 TGIT 282
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS GP+G+ G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 90 TGPTGATGITGATGST---GPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGA 146
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 147 TGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGP 206
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 207 TGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGI 266
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 267 TGAT 270
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 120 TGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGA 179
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 180 TGITGATGS---TGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGP 236
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 237 TGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGITGATGPTGPTGATGITGATGSTGPTGATGI 296
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 297 TGAT 300
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRY 66
GP+G GP+G+ G +G+ G +G GP+G+ G P+G
Sbjct: 54 TGPTGATGSTGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGI 113
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +GS GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 114 TGATGSTGPTGATGSTGATGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATG- 172
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 173 --STGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGA 230
Query: 187 SGRL 190
+G
Sbjct: 231 TGST 234
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/178 (26%), Positives = 71/178 (39%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 78 TGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGSTGATGPTGA 137
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 138 TGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGI 197
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 198 TGATGSTGPTGATGITGATGS---TGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGAT 252
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/187 (27%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +G+ GP+G G +GS G +G GP
Sbjct: 132 TGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGP 191
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G +
Sbjct: 192 TGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGA 251
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 252 TGPTGATGPTGATGITGATGPTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGS---TGPTGA 308
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 309 TGITGAT 315
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/178 (25%), Positives = 69/178 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 69 TGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGS 128
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G +G G +G + G
Sbjct: 129 TGATGPTGATGDTGATGATGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGS 188
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 189 TGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGAT 246
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 147 TGPTGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGST---GPTGATGITGATGS 203
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G + GP
Sbjct: 204 T---GPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGP 260
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 261 TGATGITGATGPTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGPTGATGITGATGSTGA 320
Query: 193 LGLS 196
G S
Sbjct: 321 TGTS 324
>gi|434376766|ref|YP_006611410.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-789]
gi|401875323|gb|AFQ27490.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-789]
Length = 983
Score = 72.8 bits (177), Expect = 7e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 69/183 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 710 GNTGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNT 769
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G G G G +G + GP+
Sbjct: 770 GAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPA 829
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 830 GATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQGVQGNT 889
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 890 GAT 892
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/192 (27%), Positives = 69/192 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G G +G+ GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 718 TGPRGNTGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGA 777
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP+G G G G +G GP+G + GP
Sbjct: 778 TGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGP 837
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 838 QGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 897
Query: 193 LGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 898 QGVQGNTGATGA 909
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 70/183 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 699 NTGATGPQGVQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQG 758
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G GP G G +G GP+G G G + G
Sbjct: 759 PQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTG 818
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 819 ATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATG 878
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 879 ATG 881
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 71/193 (36%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 735 NTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG 794
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ G G G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 795 NTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQG 854
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G GP+G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 855 VQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATG 911
Query: 192 YLGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 912 PQGVQGNTGATGA 924
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 65/180 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G G +G G +G GP G+ GP G G +G
Sbjct: 686 GNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNTGATGNTGAQ 745
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G + GP+G
Sbjct: 746 GPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT 805
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G +G GP+G GP G G +G G G G +
Sbjct: 806 GATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 865
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 69/184 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 727 TGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGP 786
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G G G +G GP+G GP G + G
Sbjct: 787 QGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGA 846
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 847 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 906
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 907 TGAT 910
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 69/191 (36%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G GP G + GP G G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 674 GNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGPQ 733
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G GP G G +G GP+G GP G + G +
Sbjct: 734 GNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGAT 793
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 794 GNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQ 853
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 854 GVQGNTGATGA 864
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 762 NTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATG 821
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G G +G G G G +G GP+G + G
Sbjct: 822 NTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATG 881
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G GP G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 882 PQG---VQGNTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGPQGNTG 935
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 936 ATGAT 940
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/163 (28%), Positives = 61/163 (37%), Gaps = 3/163 (1%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+
Sbjct: 179 GNTGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGAT 238
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G G +G GP+G G G G +G + GP+G GP G
Sbjct: 239 GPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQ 298
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 299 GNTGATG---ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 338
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 58/150 (38%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 192 NTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG 251
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ G G G +G GP+G GP G G +G + G
Sbjct: 252 NTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG---ATG 308
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P G G +G G G GP G
Sbjct: 309 PQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 338
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/162 (27%), Positives = 60/162 (37%), Gaps = 6/162 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G+ GP G G +G+ GP+G GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 179 GNTGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGAT 238
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G G +G GP+G G G + G +G GP+G GP
Sbjct: 239 GPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQ--- 295
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +G G +G GP G G +
Sbjct: 296 ---GPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 334
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 184 TGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGP 243
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G G G +G GP+G GP G + G
Sbjct: 244 QGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGA 303
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 304 TG---ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 338
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 773 GPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT 832
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSD 130
GP G G +G G G G +G GP+G GP G +
Sbjct: 833 GATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQGVQGNTGAT 892
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G GP G G +G GP G G +G G +G
Sbjct: 893 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 952
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 953 GATG 956
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ G G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 789 NTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG 848
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G +G GP+G GP G G +G GP G + G
Sbjct: 849 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTG 905
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 906 ATG---ATGPQGVQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 959
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/204 (25%), Positives = 66/204 (32%), Gaps = 21/204 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 203 GPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT 262
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G G +G GP+G GP +G GP G G +G
Sbjct: 263 GATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 322
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGR---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 323 GPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQ 382
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP G G +
Sbjct: 383 GVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 406
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 69/193 (35%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 219 NTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATG 278
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G G +G GP G G +G G G + G
Sbjct: 279 NTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG---ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 335
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 336 PQGVQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATG 395
Query: 192 YLGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 396 PQGVQGNTGATGA 408
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/215 (23%), Positives = 68/215 (31%), Gaps = 30/215 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLR 65
N G +G GP+G+ G G G +G GP+G+ GP +G
Sbjct: 246 NTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG 305
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLR 101
GP G G +G+ G G GP +G
Sbjct: 306 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATG 365
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G G +G G +G + GP G G +G G G GP G
Sbjct: 366 ATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 425
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP G G +
Sbjct: 426 LQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 460
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/204 (25%), Positives = 66/204 (32%), Gaps = 21/204 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 230 GPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT 289
Query: 74 RYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGR---------- 117
GP G + G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 290 GATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGAT 349
Query: 118 -----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G +G + GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 350 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 409
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G +
Sbjct: 410 GPQGVQGNTGATGPQGLQGNTGAT 433
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/194 (25%), Positives = 66/194 (34%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 375 NTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGLQGNTGATG 434
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP G G +G G G G +G G +G + G
Sbjct: 435 PQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATG 494
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 495 PQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQG 554
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G + GL
Sbjct: 555 NTGATGATGPQGLQ 568
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/185 (25%), Positives = 62/185 (33%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ GP G G +G G +G+ GP G G +G G G
Sbjct: 357 VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 416
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP G G +G G +G GP G G +G G G G
Sbjct: 417 NTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 476
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+G G +G GP G G +G G +G GP G G +
Sbjct: 477 ATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATG 536
Query: 201 VSGLH 205
GL
Sbjct: 537 PQGLQ 541
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/190 (25%), Positives = 63/190 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 359 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNT 418
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G G +G GP G G +G G G + G +
Sbjct: 419 GATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 478
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 479 GPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 538
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
GL +G
Sbjct: 539 GLQGNTGATG 548
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/195 (25%), Positives = 64/195 (32%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 421 TGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 480
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 481 QGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGL 540
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G G +G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 541 QGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGA 600
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
GL +G
Sbjct: 601 TGPQGLQGNTGATGA 615
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/194 (25%), Positives = 65/194 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G G +G G G+ G +G G +G
Sbjct: 429 NTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTG 488
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G G +G GP G G +G G G + G
Sbjct: 489 ATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATG 548
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G G G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 549 PQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQG 608
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G + GL
Sbjct: 609 NTGATGATGPQGLQ 622
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/227 (23%), Positives = 69/227 (30%), Gaps = 33/227 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N G +G GP+G+ GP +G+ GP G G +G+ G G
Sbjct: 273 NTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTG 332
Query: 66 YLGP------------------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
GP +G GP G G +G G +G
Sbjct: 333 ATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATG 392
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP G G +G G G + GP G GP G G +G G
Sbjct: 393 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 452
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G +G G +G GP G G + GL
Sbjct: 453 VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQ 499
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/190 (25%), Positives = 63/190 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ G G GP G G +G G +G
Sbjct: 386 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGAT 445
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G G G G +G G +G GP G + G +
Sbjct: 446 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGAT 505
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 506 GPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQ 565
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
GL +G
Sbjct: 566 GLQGNTGATG 575
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 63/185 (34%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 402 NTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 461
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G +G G +G GP G G +G G +G + G
Sbjct: 462 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATG 521
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 522 PQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQG 581
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 582 NTGAT 586
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.93, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/190 (25%), Positives = 63/190 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 440 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQ 499
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G +G GP G G +G G G GP G + G +
Sbjct: 500 GNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGAT 559
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 560 GATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQ 619
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
GL +G
Sbjct: 620 GLQGNTGATG 629
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/192 (25%), Positives = 60/192 (31%), Gaps = 3/192 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G G +G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 416 GNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 475
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G G +G GP G G +G G +G GP G + G +G
Sbjct: 476 GATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 535
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G GP G G +G G G GP G GP G
Sbjct: 536 GPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNT 595
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + GL
Sbjct: 596 GATGATGPQGLQ 607
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 59/177 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G G +G G +G
Sbjct: 456 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTG 515
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G G G GP G G +G G G + G
Sbjct: 516 ATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATG 575
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 576 PQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQG 632
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 64/187 (34%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 394 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGLQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGV 453
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G G G +G G +G GP G GP G +
Sbjct: 454 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGN 513
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP G G +G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 514 TGATG---ATGPQG---VQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGL 567
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 568 QGNTGAT 574
>gi|376268663|ref|YP_005121375.1| Phage tail fiber protein [Bacillus cereus F837/76]
gi|364514463|gb|AEW57862.1| Phage tail fiber protein [Bacillus cereus F837/76]
Length = 883
Score = 72.8 bits (177), Expect = 8e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 71/184 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 313 TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGA 372
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 373 TGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 432
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 433 TGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGS 492
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 493 TGVT 496
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/197 (27%), Positives = 77/197 (39%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS G +GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 220 TGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 279
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS G +G GP+G G P+G G +G GP+G
Sbjct: 280 TGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGE 339
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP 186
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 340 TGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGP 399
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G + V+G
Sbjct: 400 TGSTGETGATGSTGVTG 416
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 72/185 (38%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ +GP+GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 211 TGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 270
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 271 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 330
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 331 TGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGS 390
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 391 TGVTG 395
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 69
GP+G G +G G +GS G +G GP+G G P+G G
Sbjct: 265 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS 324
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+GS G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 325 TGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGE 384
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 385 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGS 444
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 445 TGATG 449
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 289 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGST---GPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGN 345
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 346 TGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGE 405
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 406 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGA 465
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 466 TG 467
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRY--- 66
GP+G G +G+ GP+GS G +G GP+GS G +G
Sbjct: 358 TGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGN 417
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G +GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 418 TGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGA 477
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 478 TGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGP 537
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 538 TGETGSTG 545
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G GP+G G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 345 NTGPTGETGVTG------STGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTG 398
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 399 PTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTG 458
Query: 132 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 459 ATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTG 518
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 519 LTGSTGVT 526
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +G GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 331 TGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGS 390
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNS 129
G +G G +G G +G G +G G +G GP+G S
Sbjct: 391 TGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGS 450
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 451 TGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGS 510
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 511 TGVTG 515
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G G P+G G +G GP+GS G +G G
Sbjct: 292 TGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGE 351
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 352 TGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 411
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 412 TGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGP 471
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 472 TGSTGAT 478
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 277 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGS 336
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 337 TGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGN 396
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 397 TGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGS 456
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 457 TGAT 460
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS+ GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 205 TGPTGETGATGSTGATGNTGATGSM---GPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGV 261
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G G +G GP+G G S GP
Sbjct: 262 TGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTG------STGP 315
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 316 TGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGATGS 375
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 376 TG 377
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 535 TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGE 594
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 595 TGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 654
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 655 TGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGS 714
Query: 190 L 190
Sbjct: 715 T 715
Score = 65.9 bits (159), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 78/201 (38%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G G +GS G P+GS G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 417 NTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTG 476
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G G +GS G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 477 ATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTG 536
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G S G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 537 PTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETG 596
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G++ V+G
Sbjct: 597 ATGSTGVTGSTGVTGNTGVTG 617
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/203 (26%), Positives = 75/203 (36%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG- 68
GP+G G +G G +GS G +G GP+G G P+G G
Sbjct: 253 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS 312
Query: 69 --PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
P+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 313 TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGA 372
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
S GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 373 TGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 432
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G + V+G
Sbjct: 433 TGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTG 455
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G G G +G G +G G +G
Sbjct: 520 TGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGP 579
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 580 TGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGV 639
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 640 TGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGA 699
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 700 TGNTG 704
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 469 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTG---LTGSTGV 525
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 526 TGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGP 585
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 586 TGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGA 645
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 646 TG 647
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +GS G P+GS G +G G P+GS G +G
Sbjct: 376 TGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGV 435
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 436 TGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGV 495
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 496 TGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGA 555
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 556 TGSTGVTG 563
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 529 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 588
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 589 TGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGN 648
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 649 TGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETG 707
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/174 (28%), Positives = 70/174 (40%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+GS GP+G G +G G +GS+ GP+G G +G G +GS
Sbjct: 201 PTGST---GPTGETGATGSTGATGNTGATGSM---GPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTG 254
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---LG 140
G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G G
Sbjct: 255 PTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTG 314
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 315 PTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGATG 368
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/192 (26%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +G S G +G+ GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 438 NTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTG 497
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+G GP+GS G +G GP+G G +G G G G
Sbjct: 498 STGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATG 557
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+G + G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 558 STGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTG 617
Query: 183 YLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 618 ETGPTGSTGVTG 629
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 409 TGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGE 468
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 469 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGS 528
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 529 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 588
Query: 190 L 190
Sbjct: 589 T 589
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 73/185 (39%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS G +G G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 396 NTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTG 455
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 456 STGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTG---STG 512
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 513 VTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGS---TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTG 569
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 570 STGVT 574
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/164 (26%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +GS G +GS GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 552 NTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTG 611
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 612 NTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTG 671
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 672 STGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGST 715
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 516 NTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTG 575
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
GP+GS GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 576 S---TGPTGS---TGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTG 629
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 630 STGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTG 689
Query: 189 RLRYLG 194
+ G
Sbjct: 690 SIGATG 695
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 460 TGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGL 519
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G G G +G G +G G
Sbjct: 520 TGSTGVTGS---TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGS 576
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 577 TGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGS 636
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 637 TGVT 640
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/186 (25%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 480 NTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTG 539
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 540 ETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATG 599
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 600 STGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTG 659
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 660 NTGATG 665
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+GS G +G G +G GP+GS GP+G G +G
Sbjct: 499 TGPTGET---GPTGSTGVTGNTG---LTGSTGVTGSTGPTGS---TGPTGETGSTGSTGA 549
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 550 PGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGV 609
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 610 TGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGET 667
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/150 (28%), Positives = 61/150 (40%), Gaps = 9/150 (6%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+GS GP+G G +G G +GS +GP+G G +G G +G
Sbjct: 200 GPTGS---TGPTGETGATGSTGATGNTGATGS---MGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGST 253
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G +G GP+G S GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 254 GPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGST 313
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 314 GPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGAT 343
>gi|359411480|ref|ZP_09203945.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
gi|357170364|gb|EHI98538.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium sp.
DL-VIII]
Length = 1746
Score = 72.4 bits (176), Expect = 9e-11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 721 DTGATGITGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTG 780
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 781 DTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTG 840
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 841 DTGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTG 900
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 901 DTGSTGVT 908
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 616 DTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTG 675
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 676 DTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDT---GATGITGSTG 732
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 733 PTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTG 792
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 793 STG 795
Score = 71.2 bits (173), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 73/193 (37%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------ 66
GP+G G +GS G +GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 671 TGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGS 730
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 731 TGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGS 790
Query: 127 LNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
S G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 791 TGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGS 850
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G++
Sbjct: 851 TGPTGDTGATGVT 863
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/199 (25%), Positives = 75/199 (37%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGSLRY 57
T V + GP+G G +GS G +G+ G +G G +GS
Sbjct: 737 TGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGD 796
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G +G GP+G G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 797 TGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGSTGPTGD 856
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G S G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 857 TGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGD 916
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G++
Sbjct: 917 TGATGVAGSTGPTGDTGVT 935
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 731 TGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGS 790
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G P+G G +G G +G G +G G +G S
Sbjct: 791 TGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGS 850
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 851 TGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGS 910
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 911 TGSTG 915
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/191 (26%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 661 DTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTG 720
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS GP+G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 721 DTGATGITGS---TGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTG 777
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
P+G G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 778 PTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTG 837
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P+G G++
Sbjct: 838 PTGDTGDTGIT 848
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/187 (25%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +GS G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 542 TGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGA 601
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 602 TGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGD 661
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 662 TGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGD 721
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 722 TGATGIT 728
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/179 (25%), Positives = 67/179 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 553 DTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTG 612
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 613 DTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTG 672
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 673 PTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGST 731
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/202 (24%), Positives = 76/202 (37%), Gaps = 9/202 (4%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +GS G +G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 587 TGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTGPTGN 646
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G G +G+ GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 647 TGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGD 706
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G S GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 707 TGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGD 766
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G++
Sbjct: 767 TGATGVTGSTGPTGDTGSTGVT 788
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/178 (26%), Positives = 68/178 (38%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 572 TGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGD 631
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 632 TGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGD 691
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 692 TGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGS---TGPTGDTGVTGATGST 746
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 65/174 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +GS G +GS G +G G +GS G +G G +G G +G
Sbjct: 517 VTGSTGSTGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTG 576
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S G +G G +G G +G G +G G +G S GP+G G
Sbjct: 577 STGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATG 636
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 637 ATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTG 690
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/188 (25%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G GP+G G +GS G +G G +GS G +G G
Sbjct: 310 DTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGSTGATGSTGPTGDTGATGVTGSTG 369
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 370 STGDTGVTGATGSTGSTGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITGSTGSTGDTGVT- 428
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 429 --GATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTG 486
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 487 DTGSTGVT 494
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/203 (26%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 6/203 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +GS G +G GP+G G +GS GP+G
Sbjct: 680 TGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGST---GPTGD 736
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G G +GS G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 737 TGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGD 796
Query: 124 SGRLN---SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G S GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 797 TGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGSTGPTGD 856
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G + V+G
Sbjct: 857 TGATGVTGSTGSTGDTGATGVTG 879
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/196 (25%), Positives = 71/196 (36%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +G G +GS G +G G +GS G +G
Sbjct: 515 TGVTGSTGSTGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGV 574
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G G +GS G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 575 TGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGA 634
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G S GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 635 TGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGS 694
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +
Sbjct: 695 TGVTGSTGSTGDTGAT 710
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/168 (26%), Positives = 64/168 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +G GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 779 TGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGP 838
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 839 TGDTGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGP 898
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 899 TGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVAGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGD 946
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +GS GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 706 DTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGST---GPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTG 762
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G GP+G G +G G +G G P+G G +G
Sbjct: 763 STGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTG 822
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 823 STGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTG 882
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 883 STGDTGAT 890
Score = 65.9 bits (159), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/181 (25%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G GP+G S G +GS G +G GP+G G +G G
Sbjct: 766 DTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTG 825
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 826 DTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTG 885
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 886 DTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVAGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTG 945
Query: 189 R 189
Sbjct: 946 D 946
Score = 65.1 bits (157), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/180 (26%), Positives = 69/180 (38%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G GP+G+ G +GS G +G GP+G G +G G
Sbjct: 631 DTGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTG 690
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 691 DTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGS---TGPTGDTGVTGATGSTG 747
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 748 PTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTG 807
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/191 (25%), Positives = 71/191 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +G GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 644 TGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGS 703
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 704 TGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGSTGATGSTGS 763
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 764 TGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGS 823
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 824 TGDTGATGVTG 834
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/176 (24%), Positives = 65/176 (36%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +GS G +G GP+G G +GS G +G G +G G +G
Sbjct: 301 VTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGSTGATGSTGPTGDTG 360
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G +G G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 361 ATGVTGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITGSTG 420
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 421 STGDTGVTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVT 476
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/181 (25%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 761 TGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGS 820
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 821 TGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGS 880
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 881 TGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVAGSTGPTGDTGVTGATGS 940
Query: 190 L 190
Sbjct: 941 T 941
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/193 (25%), Positives = 72/193 (37%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 572 TGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGD 631
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G G +G+ G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 632 TGATGATGSTGPTGNTGATGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGD 691
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 692 TGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGITGS---TGPTGDTGVTGATGS--- 745
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 746 TGPTGDTGSTGAT 758
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/178 (25%), Positives = 67/178 (37%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +G+ GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 325 DTGATGITGSTGSTGDTGDTGSTGATGSTGPTGDTGATGVTGS---TGSTGDTGVTGATG 381
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 382 STGSTGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITGS---TGSTGDTGVTGATGSTGSTG 438
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 439 DTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGD 496
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/152 (26%), Positives = 59/152 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 796 DTGATGITGSTGPTGDTGSTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGDTGITGSTGPTG 855
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 856 DTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTG 915
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 916 DTGATGVAGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDT 947
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/155 (26%), Positives = 58/155 (37%), Gaps = 3/155 (1%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G G +GS G +G GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 1388 TGVTGATGITGSTGSTGDTGSTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGS 1447
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G G +G G +G S G +G G +G G +G GP
Sbjct: 1448 TGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGAAGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGP 1507
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1508 TGDTGATGVTGS---TGPTGDTGVTGVTGSTGSTG 1539
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/202 (22%), Positives = 67/202 (33%), Gaps = 18/202 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGS 54
GP+G G +GS G +G G +G G +GS
Sbjct: 464 TGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGS 523
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G G +G G +GS G +G G +G G +G G
Sbjct: 524 TGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGD 583
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 584 TGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGATGSTGP 643
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +
Sbjct: 644 TGNTGATGITGSTGSTGDTGAT 665
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/159 (27%), Positives = 60/159 (37%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +GS G +GS G P+G G +GS G +G G
Sbjct: 1385 TGPTGVTGATGITGSTGSTGDTGSTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGS 1444
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G S
Sbjct: 1445 TGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGAAGITGSTGSTGDTGATGVTGS 1504
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1505 TGPTGDTGATGVTGS---TGPTGDTGVTGVTGSTGSTGD 1540
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/205 (22%), Positives = 66/205 (32%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
G +G G +GS G +G GP+G G +GS G +G
Sbjct: 437 TGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGD 496
Query: 66 --------------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +G G +GS G +G G +G G
Sbjct: 497 TGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGA 556
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G S G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 557 TGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGITGSTGSTGDTGD 616
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G G +G
Sbjct: 617 TGATGVTGSTGPTGDTGATGATGST 641
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/199 (23%), Positives = 69/199 (34%), Gaps = 18/199 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 395 TGSTGATGSTGPTGDTGATGITGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGD 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--------------- 117
G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 455 TGATGVTGS---TGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGSTGSTGD 511
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G S G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 512 TGATGVTGSTGSTGATGITGSTGATGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGA 571
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G++
Sbjct: 572 TGVTGSTGSTGDTGATGVT 590
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/206 (22%), Positives = 69/206 (33%), Gaps = 15/206 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 419 TGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGS 478
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 479 TGSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITGSTGATGD 538
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G S G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 539 TGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGD 598
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G + V+G
Sbjct: 599 TGATGITGSTGSTGDTGDTGATGVTG 624
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/203 (21%), Positives = 68/203 (33%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +GS G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 358 DTGATGVTGSTGSTGDTGVTGATGSTGSTGDTGVTGVTGSTGATGSTGPTGDTGATGITG 417
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 418 STGSTGDTG---VTGATGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATG 474
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 475 VTGSTGSTGDTGDTGSTGVTGDTGVTGSTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGATGITGSTG 534
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +
Sbjct: 535 ATGDTGATGVTGSTGSTGDTGAT 557
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/205 (22%), Positives = 68/205 (33%), Gaps = 30/205 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +GS G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1415 TGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGS 1474
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGR 126
G +G+ G +G G +G GP+G G P+G G +G
Sbjct: 1475 TGSTGDTGAAGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGPTGDTGVTGVTGS 1534
Query: 127 LNSDG------------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
S G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1535 TGSTGDTGATGVTGSTGTTGDTGATGPTGDTGSTGVTGSTGPTGVTGATGVTGSTGPTGD 1594
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G G +G L P+
Sbjct: 1595 TGVTGATGSTGSTGVTGAGSTLAPT 1619
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/214 (21%), Positives = 69/214 (32%), Gaps = 30/214 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 1397 TGSTGSTGDTGSTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGV 1456
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 126
G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1457 TGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGAAGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGV 1516
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------------PSGRLRYLGPSGR 162
S GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1517 TGSTGPTGDTGVTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGTTGDTGATGPTGDTGSTGVTGSTGP 1576
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 1577 TGVTGATGVTGSTGPTGDTGVTGATGSTGSTGVT 1610
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/130 (24%), Positives = 48/130 (36%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1388 TGVTGATGITGSTGSTGDTGSTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGS 1447
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G G +G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 1448 TGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGAAGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGP 1507
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 1508 TGDTGATGVT 1517
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/148 (25%), Positives = 54/148 (36%), Gaps = 9/148 (6%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+G G +G G +GS GP+G G +G G +G G
Sbjct: 1385 TGPTGVTGATGITGSTGSTGDTGSTGITGSTGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGSTGVTGS 1444
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G S G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1445 TGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGAAGITGSTGSTGDTGATGVTGS 1504
Query: 175 LGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G++
Sbjct: 1505 TGPTGDTGATGVTGSTGPTGDTGVTGVT 1532
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/199 (23%), Positives = 66/199 (33%), Gaps = 27/199 (13%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +GS G +G G +G G +GS G +G
Sbjct: 1424 TGVTGSTGSTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGA 1483
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----- 118
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1484 AGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGATGVTGSTGPTGDTGVTGVTGSTGSTGDTGA 1543
Query: 119 -------------------RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G S GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1544 TGVTGSTGTTGDTGATGPTGDTGSTGVTGSTGPTG---VTGATGVTGSTGPTGDTGVTGA 1600
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
+G G +G L P+
Sbjct: 1601 TGSTGSTGVTGAGSTLAPT 1619
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/235 (20%), Positives = 72/235 (30%), Gaps = 54/235 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 851 TGPTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGS 910
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------------------- 109
G +G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 911 TGSTGDTGATGVAGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGATGPTGSTGTTGDTGVTGVTGS 970
Query: 110 ----------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G S G +G G
Sbjct: 971 TGTTGDTGATGITGSTGTTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGVTGSTGSTGD 1030
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G GP+G GP+G G +G G++
Sbjct: 1031 TGATGVTGSTGPTSDTGATGVTGSTGPTGD---TGPTGVTGSTGSTGDTGSTGIT 1082
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/123 (25%), Positives = 45/123 (36%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G +G G +G G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1001 TGSTGDTGDTGATGVTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGATGVTGSTGPTGD 1060
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G S G +G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 1061 TGPTGVTGSTGSTGDTGSTGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGA 1120
Query: 178 SGR 180
+G
Sbjct: 1121 TGD 1123
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/123 (26%), Positives = 46/123 (37%), Gaps = 3/123 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +GS G +G GP G +G GP+G
Sbjct: 1004 TGDTGDTGATGVTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGP---TSDTGATGVTGSTGPTGD 1060
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 1061 TGPTGVTGSTGSTGDTGSTGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGA 1120
Query: 133 SGR 135
+G
Sbjct: 1121 TGD 1123
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/123 (25%), Positives = 45/123 (36%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G G +G G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1001 TGSTGDTGDTGATGVTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGATGVTGSTGPTGD 1060
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G G +G G +G G +G S G +G G +G G
Sbjct: 1061 TGPTGVTGSTGSTGDTGSTGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGA 1120
Query: 151 SGR 153
+G
Sbjct: 1121 TGD 1123
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/115 (25%), Positives = 44/115 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +GS G +G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1009 DTGATGVTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGATGVTGSTGPTGDTGPTGVTG 1068
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1069 STGSTGDTGSTGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGATGD 1123
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/127 (24%), Positives = 44/127 (34%), Gaps = 3/127 (2%)
Query: 36 SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
S G +G G +GS G +G G +G GP G +G G
Sbjct: 1000 STGSTGDTGDTGATGVTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGP---TSDTGATGVTGSTG 1056
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1057 PTGDTGPTGVTGSTGSTGDTGSTGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGDTGATGVTGSTGPTS 1116
Query: 156 YLGPSGR 162
G +G
Sbjct: 1117 DTGATGD 1123
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.74, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/236 (19%), Positives = 68/236 (28%), Gaps = 51/236 (21%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +GS G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 886 DTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVAGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTG 945
Query: 72 RL---------------------------------------------------RYLGPSG 80
G +G
Sbjct: 946 DTGATGPTGSTGTTGDTGVTGVTGSTGTTGDTGATGITGSTGTTGDTGATGVTGSTGSTG 1005
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G +G G +G G +G G +G G +G S GP+G G
Sbjct: 1006 DTGDTGATGVTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGATGVTGSTGPTGDTGPTG 1065
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +
Sbjct: 1066 VTGSTGSTGDTGSTGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGAT 1121
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/242 (20%), Positives = 71/242 (29%), Gaps = 54/242 (22%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G G +GS G +G GP+G G +GS G +G
Sbjct: 860 TGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGA 919
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------------------------------- 91
G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 920 TGVAGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGATGPTGSTGTTGDTGVTGVTGSTGTTGDTGA 979
Query: 92 -------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 980 TGITGSTGTTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGATGVTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGS 1039
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1040 TGPTSDTGATGVTGSTGPTGD---TGPTGVTGSTGSTGDTGSTGITGSTGSTGDTGATGV 1096
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 1097 TG 1098
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/228 (19%), Positives = 66/228 (28%), Gaps = 51/228 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------- 64
GP+G G +GS G +G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 896 TGPTGDTGSTGVTGSTGSTGDTGATGVAGSTGPTGDTGVTGATGSTGPTGDTGATGPTGS 955
Query: 65 -------------------------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G G +G
Sbjct: 956 TGTTGDTGVTGVTGSTGTTGDTGATGITGSTGTTGDTGATGVTGSTGSTGDTGDTGATGV 1015
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1016 TGSTGVTGSTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGATGVTGSTGPTGDTGPTGVTGSTGSTGD 1075
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 1076 TGSTGITGSTGSTGDTGATGVTGSTGDTGATGVTGSTGPTSDTGATGD 1123
>gi|229098983|ref|ZP_04229918.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-29]
gi|228684481|gb|EEL38424.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-29]
Length = 342
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/169 (29%), Positives = 70/169 (41%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 39 TGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGA 98
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 99 TGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGA 158
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 159 TGITGATGPTGATGSTGATGAT---GPTGATGITGPTGATGDTGPTGAT 204
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/173 (28%), Positives = 73/173 (42%), Gaps = 3/173 (1%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
+L GP+GS G +G+ G +G G +G+ G +G GP+G G
Sbjct: 35 KLGPTGPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATG 94
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
P+G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 95 PTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATG 154
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 155 STGATGITGATGPTGATGSTGATGA---TGPTGATGITGPTGATGDTGPTGAT 204
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/153 (27%), Positives = 61/153 (39%), Gaps = 6/153 (3%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + LGP+ GP+G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 31 GTVPKLGPT------GPTGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGAT 84
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G GP+G G +G + GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 85 GPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGIT 144
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 145 GATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGAT 177
>gi|386738627|ref|YP_006211808.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. H9401]
gi|384388479|gb|AFH86140.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. H9401]
Length = 728
Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+GS G +G +G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 385 NTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGP---IGSTGATGETGPTGSMGATGNTG 441
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 442 ATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTG 501
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 502 PTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTG 558
Query: 192 YLGL 195
G
Sbjct: 559 ATGA 562
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/163 (26%), Positives = 66/163 (40%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP+G G +G G +G +G +G GP+GS+ G +G
Sbjct: 386 TGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGE 445
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 446 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 505
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 506 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVT 548
>gi|165869802|ref|ZP_02214460.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0488]
gi|167638181|ref|ZP_02396459.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0193]
gi|177651110|ref|ZP_02933941.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0174]
gi|190568327|ref|ZP_03021235.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Tsiankovskii-I]
gi|227817518|ref|YP_002817527.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. CDC 684]
gi|254736838|ref|ZP_05194544.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Western North America USA6153]
gi|254754529|ref|ZP_05206564.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Vollum]
gi|164714631|gb|EDR20150.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0488]
gi|167513998|gb|EDR89366.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0193]
gi|172082936|gb|EDT67998.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0174]
gi|190560583|gb|EDV14560.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Tsiankovskii-I]
gi|227004119|gb|ACP13862.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. CDC 684]
Length = 763
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+GS G +G +G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 420 NTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGP---IGSTGATGETGPTGSMGATGNTG 476
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 477 ATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTG 536
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 537 PTGNTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTG 593
Query: 192 YLGL 195
G
Sbjct: 594 ATGA 597
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/163 (26%), Positives = 66/163 (40%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP+G G +G G +G +G +G GP+GS+ G +G
Sbjct: 421 TGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGE 480
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 481 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 540
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 541 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVT 583
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/136 (25%), Positives = 54/136 (39%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+GS G +G G +G +G +G GP+G + G +G
Sbjct: 421 TGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGE 480
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 481 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 540
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + +G+
Sbjct: 541 TGATGETGATGSTGVT 556
>gi|258516276|ref|YP_003192498.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Desulfotomaculum
acetoxidans DSM 771]
gi|257779981|gb|ACV63875.1| Collagen triple helix repeat protein [Desulfotomaculum acetoxidans
DSM 771]
Length = 1580
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 2/194 (1%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT V+ A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 954 GTAGVDGAT--GPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1011
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 1012 PTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1071
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 1072 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPTGPTGTAGADGATG 1131
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 1132 PTGPTGTAGADGAT 1145
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 73/184 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 992 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 1051
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G G GP+G +DG
Sbjct: 1052 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 1111
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G GP+G G G GP+G
Sbjct: 1112 TGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGA 1171
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1172 DGAT 1175
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 73/184 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 947 TGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGA 1006
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G G GP+G +DG
Sbjct: 1007 TGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 1066
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1067 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPTGPTGTAGA 1126
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1127 DGAT 1130
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 78/194 (40%), Gaps = 5/194 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT V+ A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 729 GTAGVDGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 786
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 787 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 846
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G +DG +G GP+G G +G G +G GP+G G G
Sbjct: 847 PTGTAGTDGATGP---TGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATG 903
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 904 PTGPTGTAGTNGAT 917
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 5/194 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 669 GTAAADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 726
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 727 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 786
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G +DG +G GP+G G +G G +G GP+G G G
Sbjct: 787 PTGTAGADGATGP---TGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATG 843
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 844 PTGPTGTAGTDGAT 857
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 76/195 (38%), Gaps = 4/195 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT + A GP+G G +G G +G+ GP+G G G+ GP+
Sbjct: 1014 GTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 1073
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G +G G +G+ GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 1074 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPTGPTGTAGADGATGPT 1133
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 1134 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGP- 1192
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 1193 --TGPTGTAGADGAT 1205
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 76/195 (38%), Gaps = 4/195 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT + A GP+G G +G G +G+ GP+G G G+ GP+
Sbjct: 999 GTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 1058
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G +G G +G+ GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 1059 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPT 1118
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 1119 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATGPTGPTGTAGADGAT 1175
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 1176 GPTGPTGTAGVDGAT 1190
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 467 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 526
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G G GP+G +DG
Sbjct: 527 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG- 585
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G G G GP+G G +G G SG GP+G
Sbjct: 586 -----ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGT 640
Query: 193 LGLS 196
G+
Sbjct: 641 AGVD 644
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 73/184 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 977 TGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGA 1036
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G G GP+G +DG
Sbjct: 1037 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 1096
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G G GP+G
Sbjct: 1097 TGPTGPTGTAGADGATGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGA 1156
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1157 DGAT 1160
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/194 (27%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 2/194 (1%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 1044 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1101
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G G G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 1102 PTGTAGADGATGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATG 1161
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G + G G GP+G G +G G +G GP+G G G
Sbjct: 1162 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATG 1221
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 1222 PTGPTGTAGADGAT 1235
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/197 (27%), Positives = 77/197 (39%), Gaps = 8/197 (4%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 1029 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1086
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLR 119
G G GP+G+ G +G GP+G GP+G G G
Sbjct: 1087 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATG 1146
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 1147 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDG---ATGPTGPTGTAGADG 1203
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 1204 ATGPTGPTGTAGADGAT 1220
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 74/195 (37%), Gaps = 4/195 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT + A GP+G G +G G +G+ GP+G G G+ GP+
Sbjct: 1059 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPT 1118
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G
Sbjct: 1119 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPT 1178
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G DG +G G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 1179 GPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATGPTGPTGTAGADGAT 1235
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 1236 GPTGPTGTAGVDGAT 1250
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 71/182 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 452 TGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 511
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G G GP+G +DG
Sbjct: 512 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 571
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G G GP+G G +G G SG
Sbjct: 572 TGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGA 631
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 632 TG 633
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 5/194 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 699 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 756
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 757 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 816
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 817 PTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGP-- 874
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 875 -TGPTGTAGADGAT 887
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 75/190 (39%), Gaps = 5/190 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLG 59
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G GP+G+ G
Sbjct: 1074 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGATGPTGPTGTAGADGATG 1131
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G
Sbjct: 1132 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATG 1191
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 1192 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATG 1251
Query: 180 RLRYLGPSGR 189
G +G
Sbjct: 1252 PTGPTGTAGA 1261
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 5/194 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 714 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 771
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 772 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTG 831
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 832 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDG---ATGPTGPTGTAGADGATG 888
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 889 PTGPTGTAGTDGAT 902
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 5/194 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 684 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 741
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 742 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 801
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G DG +G G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 802 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADG---ATGPTGPTGTAGTDGATG 858
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 859 PTGPTGTAGVDGAT 872
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/188 (28%), Positives = 74/188 (39%), Gaps = 5/188 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 744 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 801
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 802 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTG 861
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G DG +G G +G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 862 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDG---ATGPTGPTGTAGTNGATG 918
Query: 183 YLGPSGRL 190
GP+G
Sbjct: 919 PTGPTGTA 926
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 2/170 (1%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 474 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 531
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 532 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 591
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
P+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G
Sbjct: 592 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTA 641
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 67/172 (38%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G G GP+G+
Sbjct: 449 DGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGA 508
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G +G G +G GP+G G G GP+G +DG +G G +G
Sbjct: 509 DGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGA 568
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G G GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 569 DGATGPTGPTGTAGADG---ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGAT 617
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/215 (26%), Positives = 80/215 (37%), Gaps = 23/215 (10%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT V+ A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 804 GTAGVDGAT--GPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTG 861
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 862 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTG 921
Query: 123 PSGRLNSD---------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P+G +D GP+G G +G G SG GP+G
Sbjct: 922 PTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTG 981
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 982 PTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTA 1016
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/207 (26%), Positives = 76/207 (36%), Gaps = 13/207 (6%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+
Sbjct: 1104 GTAGADGATGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPT 1163
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G
Sbjct: 1164 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPT 1223
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------YLGPS 169
GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP+
Sbjct: 1224 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPT 1283
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G GP+G G +
Sbjct: 1284 GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGAT 1310
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/209 (27%), Positives = 77/209 (36%), Gaps = 20/209 (9%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGRLR 47
GT V+ A GP+G G G+ GP+G+ G +G
Sbjct: 399 GTAGVDGAT--GPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPTGPTGTAGVDGATGPTG 456
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G SGS GP+G G G GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 457 PTGTSGSDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 516
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G G GP+G +DG +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 517 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATG 573
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G G GP+G G +
Sbjct: 574 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 602
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/218 (25%), Positives = 79/218 (36%), Gaps = 26/218 (11%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 774 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTG 831
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 832 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 891
Query: 123 PSGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------------LG 158
P+G +D GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 892 PTGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTG 951
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G +G G SG GP+G G +
Sbjct: 952 PTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTN 989
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 65/164 (39%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P+G+ G +G G +G+ GP+G G G GP+G+ G +G
Sbjct: 667 PTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 726
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G +G GP+G G G GP+G +DG +G G +G GP+G
Sbjct: 727 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 786
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 787 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGP---TGPTGTAGTDGAT 827
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/180 (26%), Positives = 67/180 (37%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G G +G+ GP+G G G+ GP+G G +G
Sbjct: 667 PTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 726
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G GP+G G G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 727 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 786
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G GP+G G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 787 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 846
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 79/222 (35%), Gaps = 27/222 (12%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 489 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 546
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 547 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 606
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------------ 158
P+G DG +G G SG GP+G G
Sbjct: 607 PTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTTGTDGATGPTG 666
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
P+G G +G G +G GP+G G +DG
Sbjct: 667 PTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAG-ADGAT 707
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/213 (26%), Positives = 78/213 (36%), Gaps = 28/213 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT V+ A GP+G G +G G +G+ GP+G G +G+ GP+
Sbjct: 864 GTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPT 923
Query: 62 GRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G GP+G G G+ GP+G SG
Sbjct: 924 GTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGT------SGADGAT 977
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G G +G GP+G +DG +G G +G GP+G G G
Sbjct: 978 GPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADG-- 1035
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 1036 -ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 1067
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/221 (25%), Positives = 78/221 (35%), Gaps = 29/221 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 504 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 561
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 562 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 621
Query: 123 PSGRLNSD---GPSGRLRYLG------------------------PSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G SD GP+G G P+G G +G
Sbjct: 622 PTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGPTG 681
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 682 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 722
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/215 (25%), Positives = 76/215 (35%), Gaps = 23/215 (10%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 1137 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 1194
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 1195 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 1254
Query: 123 PSGRLNSD------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSG 161
P+G +D GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 1255 PTGTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 1314
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +G G +
Sbjct: 1315 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTA 1349
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 77/209 (36%), Gaps = 20/209 (9%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 1152 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1209
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------- 115
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1210 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGTTGPTG 1269
Query: 116 --------GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G GP+G +DG +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 1270 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP---TGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATG 1326
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G G GP+G G +
Sbjct: 1327 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 1355
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 79/222 (35%), Gaps = 27/222 (12%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 1122 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1179
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 1180 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1239
Query: 123 PSGRLNSD------GPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
P+G D GP+G GP+G G G G
Sbjct: 1240 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1299
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
P+G G +G G +G GP+G G +DG
Sbjct: 1300 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAG-ADGAT 1340
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/208 (25%), Positives = 72/208 (34%), Gaps = 27/208 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRY------------ 57
GP+G GP+G G G+ GP SG GP+G
Sbjct: 383 TGPTGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPTGP 442
Query: 58 ---------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G G G GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 443 TGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGP 502
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP
Sbjct: 503 TGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATGP 559
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G G GP+G G +
Sbjct: 560 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 587
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/221 (25%), Positives = 79/221 (35%), Gaps = 29/221 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
GT + A GP+G G G+ GP+G+ GP+G G G+ G
Sbjct: 834 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 891
Query: 60 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------------LG 95
P+G GP+G G +G+ GP+G G
Sbjct: 892 PTGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTG 951
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G G +G G SG GP+G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 952 PTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1011
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 1012 PTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 1052
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/208 (25%), Positives = 73/208 (35%), Gaps = 27/208 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------------LGP 51
G +G GP+G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 893 TGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGP 952
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGR 108
+G+ G +G G SG GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 953 TGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTGP 1012
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP
Sbjct: 1013 TGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATGP 1069
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G G GP+G G +
Sbjct: 1070 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 1097
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 77/222 (34%), Gaps = 31/222 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT + A GP+G G +G G +G+ GP+G G G+ GP+
Sbjct: 549 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 608
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------------------------PS 97
G G +G G SGS GP+G G P+
Sbjct: 609 GTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTTGTDGATGPTGPT 668
Query: 98 GRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G GP+G G G GP+G +DG +G G +G GP+G
Sbjct: 669 GTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 728
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 729 GTAGVDG---ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 767
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 77/222 (34%), Gaps = 31/222 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG----------- 50
GT + A GP+G G +G G SGS GP+G G
Sbjct: 594 GTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPT 653
Query: 51 -------------PSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
P+G+ GP+G G G GP+G+ G +G
Sbjct: 654 GTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 713
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G +G GP+G G G GP+G +DG +G G +G GP+G
Sbjct: 714 GTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPT 773
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 774 GTAGADG---ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGAT 812
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/221 (24%), Positives = 79/221 (35%), Gaps = 29/221 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 789 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 846
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 847 PTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTG 906
Query: 123 PSGRLNSD------GPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G ++ GP+G GP+G G +G
Sbjct: 907 PTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 966
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G SG GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 967 PTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGAT 1007
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/215 (25%), Positives = 76/215 (35%), Gaps = 23/215 (10%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---------------------LG 41
GT + A GP+G G +G+ GP+G+ G
Sbjct: 894 GTAGTDGAT--GPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTG 951
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G G +G G SG GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 952 PTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1011
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G GP+G G G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1012 PTGTAGTDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1071
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +G G +
Sbjct: 1072 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTA 1106
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/215 (25%), Positives = 77/215 (35%), Gaps = 23/215 (10%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 849 GTAGTDGAT--GPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTG 906
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLR 101
G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 907 PTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 966
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G SG GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 967 PTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTG 1026
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +G G +
Sbjct: 1027 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTA 1061
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 80/222 (36%), Gaps = 27/222 (12%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
GT + A GP+G G G+ GP+G+ GP+G G G+ G
Sbjct: 819 GTAGTDGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 876
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-------- 111
P+G G +G G +G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 877 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTG 936
Query: 112 -------------LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G G +G G SG GP+G G +G G
Sbjct: 937 PTGTAGTNGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTAGTNGATGPTG 996
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
P+G G +G G +G GP+G G +DG
Sbjct: 997 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAG-ADGAT 1037
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/206 (27%), Positives = 77/206 (37%), Gaps = 20/206 (9%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G +G+ GP+G+ GP+G G G+ GP+G
Sbjct: 360 GTAGTDGAT--GPTGPTGTAGANGAT---GPTGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTG 414
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGS------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
G +G G SG+ G +G G SG GP+G
Sbjct: 415 TSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTG 474
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G
Sbjct: 475 TAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATGPTG 531
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +
Sbjct: 532 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 557
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 79/222 (35%), Gaps = 27/222 (12%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 519 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 576
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G+ G +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 577 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTG 636
Query: 123 PSGRLNSD---------------------GPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
P+G D GP+G GP+G G G G
Sbjct: 637 PTGTAGVDGATGPTGPTGTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 696
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
P+G G +G G +G GP+G G+ DG
Sbjct: 697 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGV-DGAT 737
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 23/188 (12%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT V+ A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 1182 GTAGVDGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1239
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G G GP+G+ GP+G G G G
Sbjct: 1240 PTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1299
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P+G G +G GP+G +DG +G G +G GP+G G G
Sbjct: 1300 PTGTAGVDGATGPT---GPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATG 1356
Query: 165 YLGPSGRL 172
GP+G
Sbjct: 1357 PTGPTGTA 1364
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/224 (25%), Positives = 79/224 (35%), Gaps = 35/224 (15%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 534 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 591
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG--------- 113
G G GP+G+ G +G G SG GP+G G
Sbjct: 592 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTG 651
Query: 114 ---------------PSGRLRY------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
P+G GP+G +DG +G G +G GP+G
Sbjct: 652 PTGTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 711
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 712 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGP---TGPTGTAGADGAT 752
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/224 (25%), Positives = 76/224 (33%), Gaps = 35/224 (15%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G SGS GP+G
Sbjct: 579 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGPTG 636
Query: 63 RLRYLG------------------------PSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
G P+G GP+G G G G
Sbjct: 637 PTGTAGVDGATGPTGPTGTTGTDGATGPTGPTGTAAADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 696
Query: 96 PSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
P+G GP+G G G GP+G DG +G G +G GP+G
Sbjct: 697 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 756
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 757 PTGTAGADG---ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 797
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/203 (26%), Positives = 73/203 (35%), Gaps = 20/203 (9%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 1167 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1224
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSG 107
G G GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 1225 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPTG 1284
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G G GP+G DG +G G +G GP+G G G G
Sbjct: 1285 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATG 1341
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G G G GP+G
Sbjct: 1342 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTA 1364
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/205 (24%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 21/205 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G G+ GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 773 TGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGP 832
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP+G G +G G +G GP+G G G GP
Sbjct: 833 TGTAGADGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGP 892
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGR 171
+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 893 TGTAGTDGATGPTGPTGTAGTNGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGTNGATGPTGP 952
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +
Sbjct: 953 TGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGAT 977
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/202 (25%), Positives = 70/202 (34%), Gaps = 18/202 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS---------------GSLRY 57
GP+G G +G G SG+ GP+G G G+
Sbjct: 395 TGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPTGPTGTAGVDGATGP 454
Query: 58 LGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP SG GP+G G G+ GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 455 TGPTGTSGSDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 514
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G GP+G G +G G +G GP+G G G
Sbjct: 515 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGP 574
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +
Sbjct: 575 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTA 596
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G GP+G+ G +G G +G GP+G+ GP+G G G
Sbjct: 350 DGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGANGATGPTGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGP 409
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G+ G +G G SG GP+G G G GP+G SDG +G
Sbjct: 410 TGPTGTSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGP 469
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G GP+G G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 470 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGA 526
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 527 T 527
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/196 (25%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 27/196 (13%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G GP+G G G+
Sbjct: 350 DGATGPTGPTGTAGTDGATGPTGPTGTAGANGATGPTGTDGATGPTGPTGTAGVDGATGP 409
Query: 85 LGP---SGRLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
GP SG GP+G GP+G G G
Sbjct: 410 TGPTGTSGADGATGPTGPTGTSGADGTTGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTSGSDGATGP 469
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G +DG +G G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 470 TGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATGPTGPTGTAGADGA 526
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 527 TGPTGPTGTAGADGAT 542
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/221 (23%), Positives = 76/221 (34%), Gaps = 29/221 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR------ 56
GT + A GP+G G G+ GP+G+ G +G G +G+
Sbjct: 1212 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGTTGPTG 1269
Query: 57 ---------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP+G G G GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 1270 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTG 1329
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR------------LRYLGPSGRLR 155
G G GP+G +DG +G G +G G +G
Sbjct: 1330 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTTGVDGATGPTG 1389
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G G GP+G G +
Sbjct: 1390 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGAT 1430
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/221 (24%), Positives = 75/221 (33%), Gaps = 35/221 (15%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------------LGPSG 44
GT + A GP+G G G+ GP+G+ GP+G
Sbjct: 1227 GTAGADGAT--GPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPTG 1284
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G G+ GP+G G +G G +G+ GP+G G G G
Sbjct: 1285 PTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADG---ATG 1341
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
P+G G G GP+G +DG G GP+G G +G
Sbjct: 1342 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPTGTTGVDGATGPTGPTGTAGADGATG 1401
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G GP+G G G GP+G +
Sbjct: 1402 PTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGATGEV 1442
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.052, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/228 (23%), Positives = 74/228 (32%), Gaps = 34/228 (14%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT + A GP+G G +G G +G+ GP+G G G+ GP+
Sbjct: 1197 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPT 1256
Query: 62 GRLRY------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G GP+G G G+ GP+G G +G
Sbjct: 1257 GTAGADGTTGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGVDGATGPTGPT 1316
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR-------- 155
G +G GP+G G G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1317 GTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGTTGPTGPT 1376
Query: 156 -------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G G GP+G G +G G +
Sbjct: 1377 GTTGVDGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTAGADGATGPTGPTGTA 1424
>gi|423627470|ref|ZP_17603219.1| hypothetical protein IK5_00322, partial [Bacillus cereus VD154]
gi|401271689|gb|EJR77696.1| hypothetical protein IK5_00322, partial [Bacillus cereus VD154]
Length = 282
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/192 (28%), Positives = 80/192 (41%), Gaps = 3/192 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 1 GPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGETGLTGETGPIGITGPTGE- 59
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G + GP+
Sbjct: 60 --TGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPT 117
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 118 GETGPTGITGPTGETGPTGITGLTGETGPTGITGPTGATGPTGVTGPTGITGPTGETGPT 177
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + V+G
Sbjct: 178 GATGPTGVTGAT 189
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 75/184 (40%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G GP+G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 9 TGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGETGLTGETGPIGITGPTGETGPTGATGP 68
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 69 TGETGPTGA---TGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPTGI 125
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 126 TGPTGETGPTGITGLTGETGPTGITGPTGATGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGATGPTGV 185
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 186 TGAT 189
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/196 (28%), Positives = 78/196 (39%), Gaps = 8/196 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G + GP+G G +G GP+G
Sbjct: 18 TGPTGATGPTGETGPTGITGPTGETGLTGETGPIGITGPTGETGPTGATGPTGETGPTGA 77
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 78 TGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGLTGATGPTGATGPTGETGPTGITGPTGETGPTGI 137
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---- 188
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 138 TGLTGETGPTGITGPTGATGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGATGPTGVTGATGPTGGIGP 197
Query: 189 ----RLRYLGLSDGLR 200
L Y +DG +
Sbjct: 198 ITTTNLLYYTFADGEK 213
>gi|170685625|ref|ZP_02876848.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0465]
gi|254687535|ref|ZP_05151391.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. CNEVA-9066]
gi|170670089|gb|EDT20829.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0465]
Length = 577
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 74/178 (41%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+GS G +G G +G +G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 223 IGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGA 282
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 283 TGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 342
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 343 TGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGS---TGPTGSTGATGVTGNT 397
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 77/185 (41%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP +G +G+ GP+GS G +G G +G+ +G +G GP+G
Sbjct: 219 NTGP------IGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTG 272
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 273 SMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNT---GATGNTGPTGETGVTGSTG 329
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 330 PTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTG 389
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 390 ATGVT 394
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/173 (26%), Positives = 70/173 (40%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+G +G+ GP+G G +G G +G +G +G GP+GS+ G +G
Sbjct: 223 IGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGA 282
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 283 TGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 342
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G +G G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 343 TGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTG 395
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/158 (27%), Positives = 64/158 (40%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRY------LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G +G +G+ GP+GS+ G +G GP+GS G +G
Sbjct: 243 NTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATG 302
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 303 ETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATG 362
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 363 STGVTGNTGSTGETGPTGS---TGPTGSTGATGVTGNT 397
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/129 (27%), Positives = 52/129 (40%), Gaps = 6/129 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ GP+G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 277 TGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGN------TGATGNTGPTGETGVTGSTGP 330
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 331 TGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGA 390
Query: 133 SGRLRYLGP 141
+G GP
Sbjct: 391 TGVTGNTGP 399
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/132 (25%), Positives = 51/132 (38%), Gaps = 12/132 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + G +G+ GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 268 TGPTGSMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGS 327
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---- 128
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 328 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGS 387
Query: 129 --------SDGP 132
+ GP
Sbjct: 388 TGATGVTGNTGP 399
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/156 (22%), Positives = 52/156 (33%), Gaps = 36/156 (23%)
Query: 75 YLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY----------------------------- 102
GP+GS GP+G G +G +
Sbjct: 159 NTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGATGNTGPIGETGGTGSTGPTGETGGTGSTGVTGSTGVTG 218
Query: 103 ----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
+G +G GP+G G +G S G +G +G +G GP+G + G
Sbjct: 219 NTGPIGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATG 278
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 279 NTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATG 314
>gi|384182539|ref|YP_005568301.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
gi|324328623|gb|ADY23883.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
Length = 394
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 78/187 (41%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 40 TGSTGATGVTGPTGSTGPTGSTGATGVTGPTGDTGATGDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGS 99
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G GP+G G +G GP+G GP+G S G
Sbjct: 100 TGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGSTGVTGPTGAT---GPTGNTGSTGN 156
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGR 189
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 157 TGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGS 216
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 217 TGSTGVT 223
Score = 71.2 bits (173), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/180 (28%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G+ GP+GS G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 33 PTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGSTGATGVTGPTGDTGATGDTGSTGSTGPTGVTG 92
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +GS GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 93 PTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGSTGVTGPTGAT---GPTG 149
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 150 NTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATG 209
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 75/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +GS GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 58 TGSTGATGVTGPTGDTGATGDTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGP 117
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G GP+G G +G GP+G +G + GP
Sbjct: 118 TGSTGPTGSTGPTGNTGSTGVTGPTGATGPTGNTGSTGNTGPTGS------TGATGNTGP 171
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 172 TGSTGATGITGPTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGNTGPTGSTGSTGVTGPTGSTGA 231
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 232 TGVT 235
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS GP+GS G +G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 85 TGPTGVTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGSTGVTGPTGA 144
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G +G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 145 TGPTGNTGSTGNTGPTGS------TGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGNTGSTGN 198
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 199 TGPTGSTGATGNTGPTGSTGSTGVTGPTGS---TGATGVTGLTGSTGVTGDTGPTGSTGA 255
Query: 193 LGLS 196
G+S
Sbjct: 256 TGVS 259
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 71/181 (39%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 94 TGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGSTGVTGPTGATGPTGNTGS 153
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS +G GP+G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 154 TGNTGPTGS------TGATGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGA 207
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G S Y
Sbjct: 208 TGNTGPTGSTGSTGVTGPTGS---TGATGVTGLTGSTGVTGDTGPTGSTGATGVSTTATY 264
Query: 193 L 193
Sbjct: 265 A 265
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/110 (28%), Positives = 46/110 (41%), Gaps = 3/110 (2%)
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
P+G G +G GP+G G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 33 PTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGSTGATGVTGPTGDTGATGDTGSTGSTGPTGVTG 92
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G++
Sbjct: 93 PTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGST---GPTGNTGSTGVT 139
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/108 (27%), Positives = 43/108 (39%)
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 33 PTGMTGITGSTGATGVTGPTGSTGPTGSTGATGVTGPTGDTGATGDTGSTGSTGPTGVTG 92
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 93 PTGNTGSTGNTGPTGSTGATGITGPTGSTGPTGSTGPTGNTGSTGVTG 140
>gi|228917378|ref|ZP_04080931.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar pulsiensis BGSC 4CC1]
gi|228842305|gb|EEM87400.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar pulsiensis BGSC 4CC1]
Length = 404
Score = 71.6 bits (174), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/192 (28%), Positives = 78/192 (40%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+G G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 10 NTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGST---GPTGNTGATGNTG 66
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS GP+G GP+G GP+G G +G G +G + G
Sbjct: 67 PTGETGATGSTGNTGPTGE---TGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGNTG 123
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 124 PTGE---TGPTGSTGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGATGSTGPTGSTGVTG 180
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 181 STGATGSTGVTG 192
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 72/177 (40%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS GP+G GP+GS GP+G G +G
Sbjct: 53 TGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGET---GPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGP 109
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G GP+G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 110 TGETGATGSTGNTGPTGE---TGPTGSTGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGA 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 167 TGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGA 223
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 72/178 (40%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G+ G +G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 35 TGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGET---GPTGS 91
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 92 TGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGE---TGPTGSTGVTGNTGATGVTGS 148
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 149 TGVTGNTGPTGNTGATGATGS---TGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNT 203
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 69/160 (43%), Gaps = 15/160 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+GS GP+GS G +G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 79 NTGPTGET---GPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGE---TGPTG 132
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 133 STGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGATGS---TGPTGSTGVTGSTGATGSTG 189
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 190 VTGNTGATGSTGN---TGPTGETGATGSTGN---TGPTGA 223
Score = 65.1 bits (157), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 44 TGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGPTGETGATGSTGNTGPTG---ETGPTGSTGVTGPTGS 100
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP+G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 101 TGVTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGE---TGPTGSTGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGP 157
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 158 TGNTGATGATGS---TGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGN---TGPTGETGA 211
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 212 TG 213
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/172 (26%), Positives = 68/172 (39%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G+
Sbjct: 5 TGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGST---GPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGA 61
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 62 TGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 122 TGPTGE---TGPTGSTGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATGATGST 170
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/149 (27%), Positives = 59/149 (39%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+G G +G G +GS G +G G +G GP+G G
Sbjct: 5 TGPTGNTGVTGSTGATGNTGATGSTGPTGETGATGNTGATGNTGATGSTGPTGNTGATGN 64
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G + GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 65 TGPTGETGATGSTGNTGPTGE---TGPTGSTGVTGPTGSTGVTGNTGPTGETGATGSTGN 121
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G GP+G G + V+G
Sbjct: 122 TGPTGE---TGPTGSTGVTGNTGATGVTG 147
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/119 (26%), Positives = 46/119 (38%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +G+ GP+GS G +G G +G GP+G G
Sbjct: 106 NTGPTGETGATGSTGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGVTGSTGVTGNTGPTGNTGATG 165
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 166 ATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGSTGNTGPTGETGATGSTGNTGPTGAT 224
>gi|255102377|ref|ZP_05331354.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-63q42]
Length = 552
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/217 (24%), Positives = 88/217 (40%), Gaps = 33/217 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 106 TGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGA 165
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGR 117
GP+G+ G +G GP+G GP+G + GP+G
Sbjct: 166 NGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGPTGA 225
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGP 159
+GP+G + + GP G + +GP+G G +G + G
Sbjct: 226 DGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGA 285
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G + GP+G +GP+G G++
Sbjct: 286 TGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGVN 322
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/217 (24%), Positives = 86/217 (39%), Gaps = 36/217 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 124 TGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGV 183
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G+ GP+G + GP+G +GP+G + GP G
Sbjct: 184 TGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGL 243
Query: 118 LRY------------------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+ GP+G ++G G G +G +GP+G + GP
Sbjct: 244 VGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGP 303
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G G +G GP+G + G +
Sbjct: 304 TGADGAVGPTGATGATGVNGA---TGPTGAVGATGAN 337
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 90/213 (42%), Gaps = 39/213 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+G+ GP+G +
Sbjct: 151 TGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGT 210
Query: 66 --------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 102
GP+G +GP+G++ GP G + +GP+G
Sbjct: 211 TGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGA 270
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G +GP+G G +G + GP+G + GP+G +GP+G G +G
Sbjct: 271 TGANG---LVGPTGATGATGVAGAI---GPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGVNGA 324
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G + G +G +GP+G G+
Sbjct: 325 ---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGV 354
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 76/193 (39%), Gaps = 21/193 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G + GP
Sbjct: 16 TGPTGATGPTGPTGPRGATGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGT 72
Query: 70 ------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 73 TGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGN 129
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 130 TGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGP 189
Query: 178 SGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G +
Sbjct: 190 TGNTGATGPTGSI 202
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/198 (25%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 33/198 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
N G +G GP+G++ GP +G+ GP+G G +G
Sbjct: 48 NTGATGANGITGPTGNMGATGPNGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG--- 104
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 105 ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATG 164
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSG 161
GP+G + G +G GP+G GP+G + GP+G
Sbjct: 165 ANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGPTG 224
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+GP+G + GP G
Sbjct: 225 ADGEVGPTGAVGATGPDG 242
Score = 63.9 bits (154), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/217 (25%), Positives = 84/217 (38%), Gaps = 37/217 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGSLRY 57
G +G GP+G+ G +G GP+G + GP +G+
Sbjct: 34 TGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGTTGSTGPTGNTGATGANGI 90
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 91 TGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGA 147
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---- 173
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 148 TGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGA 207
Query: 174 -----------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
GP+G +GP+G + G DGL
Sbjct: 208 TGTTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATG-PDGL 243
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/211 (24%), Positives = 82/211 (38%), Gaps = 36/211 (17%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 85 TGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGP 141
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 142 TGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGS 201
Query: 136 LR---------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--------------- 165
+ GP+G +GP+G + GP G +
Sbjct: 202 IGATGATGTTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGL 261
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G G +G +GP+G G++
Sbjct: 262 VGPTGPTGATGANG---LVGPTGATGATGVA 289
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/232 (24%), Positives = 91/232 (39%), Gaps = 57/232 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 57
GP+G GP+GS+ GP+G+ +GP+G + GP G +
Sbjct: 187 TGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGP 246
Query: 58 ---------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+GP+G G +G +GP+G+ G +G +GP+G +
Sbjct: 247 TGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANG---LVGPTGA---TGATGVAGAIGPTGAVGA 300
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---- 158
GP+G +GP+G G +G GP+G + G +G +GP+G G
Sbjct: 301 TGPTGADGAVGPTGATGATGVNGAT---GPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVAGA 357
Query: 159 --------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G + G +G +GP+G G +G G +
Sbjct: 358 TGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGAIGPTGPTGANGATGATGANGAT 409
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/209 (24%), Positives = 82/209 (39%), Gaps = 45/209 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------------LGPSGRLRYLGPSGS 54
GP+G +GP+G++ GP G + GP+G G G
Sbjct: 220 TGPTGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGP 279
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G +GP+G + GP+G+ +GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 280 TGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGVNGA---TGPTGAVGATGA 336
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G +GP+G ++G P+G + G +G +GP+
Sbjct: 337 NGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGPTGAVGATGANGVAGAIGPT----- 391
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 392 -GPTGANGATGATGANGATGPTGATGATG 419
Score = 52.8 bits (125), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/172 (26%), Positives = 65/172 (37%), Gaps = 21/172 (12%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 96
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + GP
Sbjct: 16 TGPTGATGPTGPTGPRGATGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGT 72
Query: 97 ------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+G GP+G G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 73 TGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGN 129
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 130 TGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGAN 181
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/162 (25%), Positives = 71/162 (43%), Gaps = 24/162 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+G+ G +G++ GP+G + GP+G+ +GP+G G +G
Sbjct: 268 TGATGANGLVGPTGATGATGVAGAI---GPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGVNGA 324
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLGP 114
GP+G++ G +G +GP+G G P+G + G
Sbjct: 325 T---GPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGPTGAVGATGA 381
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G +GP+G ++G +G G +G G +G L
Sbjct: 382 NGVAGAIGPTGPTGANGATGATGANGATGPTGATGATGVLAA 423
>gi|167633997|ref|ZP_02392320.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0442]
gi|254741873|ref|ZP_05199560.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Kruger B]
gi|167530798|gb|EDR93500.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0442]
Length = 553
Score = 71.2 bits (173), Expect = 2e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 74/178 (41%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+GS G +G G +G +G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 199 IGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGA 258
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 259 TGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 318
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 319 TGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGS---TGPTGSTGATGVTGNT 373
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 77/185 (41%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP +G +G+ GP+GS G +G G +G+ +G +G GP+G
Sbjct: 195 NTGP------IGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTG 248
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G +G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 249 SMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNT---GATGNTGPTGETGVTGSTG 305
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 306 PTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTG 365
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 366 ATGVT 370
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/173 (26%), Positives = 70/173 (40%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+G +G+ GP+G G +G G +G +G +G GP+GS+ G +G
Sbjct: 199 IGSTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGA 258
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 259 TGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 318
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G +G G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 319 TGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTG 371
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/158 (27%), Positives = 64/158 (40%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRY------LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G +G +G+ GP+GS+ G +G GP+GS G +G
Sbjct: 219 NTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATG 278
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 279 ETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATG 338
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 339 STGVTGNTGSTGETGPTGS---TGPTGSTGATGVTGNT 373
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/129 (27%), Positives = 52/129 (40%), Gaps = 6/129 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ GP+G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 253 TGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGN------TGATGNTGPTGETGVTGSTGP 306
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 307 TGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGA 366
Query: 133 SGRLRYLGP 141
+G GP
Sbjct: 367 TGVTGNTGP 375
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/132 (25%), Positives = 51/132 (38%), Gaps = 12/132 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + G +G+ GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 244 TGPTGSMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGS 303
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---- 128
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 304 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGS 363
Query: 129 --------SDGP 132
+ GP
Sbjct: 364 TGATGVTGNTGP 375
>gi|313898774|ref|ZP_07832308.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
gi|312956356|gb|EFR37990.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sp. HGF2]
Length = 541
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 79/177 (44%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G + GP+G+ GP+G + G +G+ GP+ GP+G
Sbjct: 129 TGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPA------GPTGA 182
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G + GP+G G +G G +G + GP+G S G
Sbjct: 183 TGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGA 242
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G + GP+G G +G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 243 AGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGD---IGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/169 (27%), Positives = 74/169 (43%), Gaps = 6/169 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ G +G + GP+G GP+G++ G +G GP+G P+G+
Sbjct: 129 TGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAG------PTGA 182
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP+G + GP+G G +G G +G + GP+G G
Sbjct: 183 TGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGA 242
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G + GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 243 AGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGAT 291
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/169 (28%), Positives = 75/169 (44%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G + GP+G+ GP+G++ G +G GP+ GP+G G +G
Sbjct: 137 NTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPA------GPTGATGSTGAAG 190
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G + GP+G G +G G +G + GP+G G +G G
Sbjct: 191 ATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTG 250
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G + GP+G G +G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 251 ATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGD---IGPTGPTGATGPTGA 296
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 83/190 (43%), Gaps = 13/190 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYL---GPSGSLRYLGPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRY 66
GP+ L ++ G +G GP+G + GP+G G +G+ + GP+G
Sbjct: 96 GPNHVLDFVIPRGDTGITGATGPTGPGVGATGPTGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGN 155
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G + G +G+ GP+G P+G G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 156 TGPTGAIGATGENGATGPTGPAG------PTGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGA 209
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S G +G G +G + GP+G G +G G +G + GP+G G
Sbjct: 210 TGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGA 269
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G +
Sbjct: 270 AGATGVTGAT 279
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 13/188 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYL---GPSGSLRYLGPSGR-LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
GP+ L ++ G +G GP+G + GP+G+ +G G +G + GP
Sbjct: 96 GPNHVLDFVIPRGDTGITGATGPTGPGVGATGPTGA------TGATGNTGATGPIGATGP 149
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+G+ GP+G + G +G GP+G G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 150 TGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGA 209
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G G +G + GP+G G +G G +G + GP+G G
Sbjct: 210 TGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGA 269
Query: 196 SDGLRVSG 203
+ V+G
Sbjct: 270 AGATGVTG 277
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/157 (26%), Positives = 64/157 (40%), Gaps = 18/157 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + GP+G+ G +G+ G +G + GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 195 TGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGD 254
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------- 119
+ GP+G+ G +G G +G + GP+G GP+G
Sbjct: 255 IGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDI---GPTGPTGATGPTGAPGNTGATGTTGVTGA 311
Query: 120 --YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
+GP+G + GP G G G GP G
Sbjct: 312 DGAIGPTGPIGDPGPQGEPGPQGEPGPQGEQGPQGET 348
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/149 (25%), Positives = 61/149 (40%), Gaps = 15/149 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G +G+ G +G+ +GP+G G +G+ G +G +GP+G
Sbjct: 200 DIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTG 259
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSG 116
G +G+ G +G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 260 PTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGAPGNTGATGTTGVTGADGAIGPTG 319
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
+ GP G G G GP G
Sbjct: 320 PIGDPGPQGEPGPQGEPGPQGEQGPQGET 348
>gi|254725100|ref|ZP_05186883.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A1055]
Length = 670
Score = 70.9 bits (172), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/179 (28%), Positives = 75/179 (41%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+GS G +G + G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 318 NTGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPI---GSTGATGETGPTGSMGATGNTG 374
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 375 ATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTG 434
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 435 PTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGS---TGPTGSTGATGVTGNT 490
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/170 (26%), Positives = 68/170 (40%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP+G G +G G +G +G +G GP+GS+ G +G
Sbjct: 319 TGATGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGE 378
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 379 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 438
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 439 TGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTG 488
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/129 (27%), Positives = 52/129 (40%), Gaps = 6/129 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ GP+G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 370 TGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGN------TGATGNTGPTGETGVTGSTGP 423
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 424 TGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGA 483
Query: 133 SGRLRYLGP 141
+G GP
Sbjct: 484 TGVTGNTGP 492
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/132 (25%), Positives = 51/132 (38%), Gaps = 12/132 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + G +G+ GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 361 TGPTGSMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGS 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---- 128
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 421 TGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGS 480
Query: 129 --------SDGP 132
+ GP
Sbjct: 481 TGATGVTGNTGP 492
>gi|300855075|ref|YP_003780059.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Clostridium
ljungdahlii DSM 13528]
gi|300435190|gb|ADK14957.1| putative collagen triple helix repeat protein [Clostridium
ljungdahlii DSM 13528]
Length = 800
Score = 70.5 bits (171), Expect = 4e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 72/176 (40%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 464 TGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGA 523
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 524 TGVTGPTGET---GPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGV 580
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 581 TGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGPTG 636
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 76/187 (40%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 404 TGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGE---TGPTGV 460
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 461 TGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGV 520
Query: 133 SGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 521 TGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGV 580
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 581 TGATGVT 587
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/191 (28%), Positives = 77/191 (40%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 437 TGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGE 496
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 497 TGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGET---GPTGVTGPTGETGATGVTGP 553
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 554 TGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGA 613
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 614 TGVTGPTGVTG 624
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 82/191 (42%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 203 TGPTGATGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGE 262
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 263 TGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGV 322
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 323 TGPTGETGPTG---VTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGPTGVTGPIGPTGETGP 379
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 380 TGVTGPTGVTG 390
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 454 ETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTG 513
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 514 VTGPTGVTGATGVTGPTGET---GPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTG 570
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 571 PTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTG 630
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 631 ATG 633
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/197 (28%), Positives = 81/197 (41%), Gaps = 9/197 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G GP+G GP+G +GP+G GP+G G
Sbjct: 335 TGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGPTGVTGPIGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGV 394
Query: 70 SGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G GP+G + GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 395 TGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGE 454
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 455 ---TGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGP 511
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G++ V+G
Sbjct: 512 TGVTGPTGVTGATGVTG 528
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/190 (28%), Positives = 78/190 (41%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRY 66
GP+G GP+G +GP+G GP+G G +G+ GP+G
Sbjct: 353 TGPTGVTGETGPTGVTGPIGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGV 412
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 413 TGPTGETGATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGE---TGPTGVTGPTGETGA 469
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 470 TGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGP 529
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 530 TGETGPTGVT 539
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 80/191 (41%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 425 TGPTG---VTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGET---GPTGVTGPTGETGATGVTGPTGV 478
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 479 TGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGET---GP 535
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 536 TGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGA 595
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 596 TGVTGPTGVTG 606
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/191 (28%), Positives = 78/191 (40%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G GP+G +GP+G G +G
Sbjct: 326 TGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGPTGVTGPIGPTGETGPTGVTGP 385
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 386 TGVTGPTG---VTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGV 442
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 443 TGATGVTGPTGE---TGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGA 499
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 500 TGVTGPTGVTG 510
Score = 67.4 bits (163), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 78/187 (41%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 233 TGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTG---VTGPTGETGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGP 289
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 290 TGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTG---VTGPTGETGPTGV 346
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G GP+G +GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 347 TGPTGVTGPTGVTGETGPTGVTGPIGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGE 406
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 407 TGATGVT 413
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 77/187 (41%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 311 TGPTGVTGATGVTGPTGETGPTG---VTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGPTGV 367
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 368 TGPIGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTG---VTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGV 424
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 425 TGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGE 484
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 485 TGATGVT 491
Score = 65.9 bits (159), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 75/182 (41%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G GP+G GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 181 PTGATGVTGPTGPTGETGPTG---VTGPTGATGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTG 237
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 238 ETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGETGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTG 297
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 298 VTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTG 357
Query: 195 LS 196
++
Sbjct: 358 VT 359
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/201 (27%), Positives = 81/201 (40%), Gaps = 12/201 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLR 65
GP+G +GP+G GP+G G +G GP +G+ GP+G
Sbjct: 361 ETGPTGVTGPIGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETG 420
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 421 ATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGE---TGPTGVTGPTGETGATGVTGPTG 477
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LR 182
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 478 VTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTG 537
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G++ V+G
Sbjct: 538 VTGPTGETGATGVTGPTGVTG 558
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/194 (27%), Positives = 78/194 (40%), Gaps = 12/194 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G +G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 392 TGVTGATGVTGPTGE------TGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGA 445
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 446 TGVTGPTGE---TGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGV 502
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 503 TGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPTGE 562
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 563 TGATGVTGPTGVTG 576
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/197 (28%), Positives = 80/197 (40%), Gaps = 9/197 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 257 TGPTGETGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGV 316
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 317 TGATGVTGPTGETGPTG---VTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGPTGVTGPIGP 373
Query: 133 SGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 374 TGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGP 433
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G++ V+G
Sbjct: 434 AGVTGPTGVTGATGVTG 450
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 77/187 (41%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGP 69
G +G GP+G G +G GP+G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 278 TGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGP 337
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G GP+G GP+G +GP+G G +G GP+G +
Sbjct: 338 TGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGPTGVTGPIGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGA 397
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 398 TGVTGP---TGETGATGVTGPTGETGATGVTGPTGVTGPAGVTGPTGVTGATGVTGPTGE 454
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 455 TGPTGVT 461
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 79/194 (40%), Gaps = 6/194 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 212 TGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGETGPTGVTGA 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 272 TGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGP 331
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 332 TG---VTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGPTGVTGPIGPTGETGPTGVTGPTGV 388
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 389 TGPTGVTGATGVTG 402
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 80/191 (41%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 251 TGPTG---VTGPTGETGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTGVTGPTGVTGP 307
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 308 TGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTG---VTGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGETGP 364
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G +GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 365 TGVTGPIGPTGETGPTGVTGPTGVTGPTG---VTGATGVTGPTGETGATGVTGPTGETGA 421
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 422 TGVTGPTGVTG 432
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/180 (28%), Positives = 76/180 (42%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+G+ GP+G GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 181 PTGATGVTGPTGPTGETGPTG---VTGPTGATGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTG 237
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 238 ETGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPTGETGPTGVTGATGVTGPTGETGPTGVTGPTGETGPTG 297
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G++ V+G
Sbjct: 298 VTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGATGVTGPTGETGPTG---VTGPTGETGPTGVTGPTGVTG 354
>gi|449267617|gb|EMC78539.1| Collagen alpha-2(I) chain, partial [Columba livia]
Length = 124
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/114 (39%), Positives = 63/114 (55%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+ GP GR R GP G ++G GR ++GP GR +GP G+ +GP GR +GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ GP GR +GP G+ +GP GR +GP G+ +GP G+ +GP G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/114 (39%), Positives = 62/114 (54%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+ GP GR R GP G ++G GR ++GP GR +GP G +GP GR +GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
+ +GP GR +GP G+ +GP GR GP G+ +GP G+ +GP G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/114 (38%), Positives = 63/114 (55%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+ GP GR R GP G+ ++G G ++GP GR +GP G+ +GP GR +GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+ +GP GR GP G+ +GP GR +GP G+ +GP G+ +GP G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/114 (38%), Positives = 63/114 (55%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
+ GP G R GP G+ ++G GR ++GP GR +GP G+ +GP GR GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ +GP GR +GP G+ +GP GR +GP G+ +GP G+ +GP G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/111 (38%), Positives = 62/111 (55%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+ GP GR R GP G+ ++G GR ++GP GR +GP G+ GP GR +GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ +GP GR +GP G+ +GP GR +GP G+ +GP G+ +G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMG 119
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/114 (37%), Positives = 62/114 (54%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
+ GP G R GP G+ ++G GR ++GP G +GP G+ +GP GR +GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ +GP GR +GP G+ GP GR +GP G+ +GP G+ +GP G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 65.1 bits (157), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/113 (38%), Positives = 60/113 (53%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP GR R GP G ++G G ++GP GR +GP G +GP GR +GP G+
Sbjct: 10 TGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLGK 69
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP G +GP G+ +GP GR +GP G+ +GP G+ +GP G
Sbjct: 70 DGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/114 (37%), Positives = 60/114 (52%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+ GP G R GP G ++G GR ++GP G +GP G+ +GP GR +GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
+GP GR +GP G+ +GP GR +GP G+ +GP G+ GP G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/114 (36%), Positives = 61/114 (53%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+ GP G R GP G+ ++G G ++GP GR +GP G+ +GP G +GP G
Sbjct: 9 WTGPPGRDRQTGPPGKDGWMGSPGRHGWMGPLGRDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLG 68
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+ +GP GR +GP G+ +GP GR +GP G+ GP G+ +GP G
Sbjct: 69 KDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/81 (35%), Positives = 42/81 (51%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ + +GP G+ +GP G +GP G +GP GR +GP G +GP GR +G
Sbjct: 42 RDVRMGPPGKDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMGPLGKDGRMGPPGRDGRMG 101
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
P G+ +GP G +GP G
Sbjct: 102 PPGKDGQMGPPGKDGQMGPPG 122
>gi|449271459|gb|EMC81820.1| Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, partial [Columba livia]
Length = 1462
Score = 70.1 bits (170), Expect = 5e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 89/231 (38%), Positives = 124/231 (53%), Gaps = 60/231 (25%)
Query: 14 GPSGR--LRYLGP---SGSLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GP G+ +R+ GP +G+ ++ GP +G+LR+ GP G+L +G+LR+ GP G
Sbjct: 720 GPPGQAAMRFEGPLVGAGASQFDGPLAGTGAAGALRFDGPPGQL-----AGALRFEGPPG 774
Query: 63 R------LRYLGPSGR----LRYLGPSGS----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+ LR+ GP G+ LR+ GP+G R+ GP LR+ GP G+ PSG
Sbjct: 775 QVAGGGPLRFEGPLGQIGGPLRFEGPAGQPVGGPRFEGPGVGLRFEGPRGQ-----PSGG 829
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLR 164
LR+ GP G+ LGP G+ P G LR+ GP G+ LGP G+ LR+ GP L+
Sbjct: 830 LRFEGPHGQP--LGPRGQ-----PGGGLRFDGPHGQP--LGPHGQPGGGLRFEGP--HLQ 878
Query: 165 YLGPSGR----LRYLGPSGR-LRYLGPSGR-LRYLGLS----DGLRVSGLH 205
LGP G LR+ GP G+ + GPSG LR+ G GLR+ G H
Sbjct: 879 PLGPHGPSGAGLRFEGPHGQPIGPHGPSGAGLRFEGPHGPSGAGLRLDGPH 929
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/219 (37%), Positives = 106/219 (48%), Gaps = 58/219 (26%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSL----RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G LR+ GP+G R+ GP LR+ GP G+ PSG LR+ GP G+ LGP G+
Sbjct: 793 GPLRFEGPAGQPVGGPRFEGPGVGLRFEGPRGQ-----PSGGLRFEGPHGQP--LGPRGQ 845
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS 124
P G LR+ GP G+ LGP G+ LR+ GP L+ LGP G LR+ GP
Sbjct: 846 -----PGGGLRFDGPHGQP--LGPHGQPGGGLRFEGP--HLQPLGPHGPSGAGLRFEGPH 896
Query: 125 GR-LNSDGPSGR-LRYLGPSGRLRYLGPSGR-LRYLGPSGR------------------L 163
G+ + GPSG LR+ GP GPSG LR GP G+ L
Sbjct: 897 GQPIGPHGPSGAGLRFEGPH------GPSGAGLRLDGPHGQPGVGPRLIDGPIHQGAGGL 950
Query: 164 RYLGPSGRL--RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
R+ GP GR R+ G + G G+L +L DG+
Sbjct: 951 RFDGPLGRAGPRFDG-CHAAGFDGQPGQLSFLQRFDGIH 988
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/123 (37%), Positives = 62/123 (50%), Gaps = 30/123 (24%)
Query: 110 RYLGPSGR--LRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP----SGRLRYLGPS 160
R GP G+ +R+ GP +G DGP L G +G LR+ GP +G LR+ GP
Sbjct: 717 RIDGPPGQAAMRFEGPLVGAGASQFDGP---LAGTGAAGALRFDGPPGQLAGALRFEGPP 773
Query: 161 GR------LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLG----LSDGLRVS 202
G+ LR+ GP G+ LR+ GP+G+ R+ GP LR+ G S GLR
Sbjct: 774 GQVAGGGPLRFEGPLGQIGGPLRFEGPAGQPVGGPRFEGPGVGLRFEGPRGQPSGGLRFE 833
Query: 203 GLH 205
G H
Sbjct: 834 GPH 836
>gi|384163166|ref|YP_005544545.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus amyloliquefaciens LL3]
gi|328910721|gb|AEB62317.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus amyloliquefaciens LL3]
Length = 2200
Score = 70.1 bits (170), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 73/167 (43%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +G +GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 1415 TGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGP 1474
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS GP+G G +G +G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 1475 TGSTGPTGST---GPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGA 1531
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1532 TGPTGVTGPTGST---GPTGLTGSTGATGSTGVTGPTGLTGETGPTG 1575
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 74/176 (42%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +GS G +G +GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1406 TGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGI 1465
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G G +G + G +G G +G S GP
Sbjct: 1466 TGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGP 1525
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1526 TGSTGATGPTG---VTGPTGS---TGPTGLTGSTGATGSTGVTGPTGLTGETGPTG 1575
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 82/205 (40%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGSLRY 57
G +G GP+GS GP+GS GP+G GP+G
Sbjct: 1352 TGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGA 1411
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G GP+G G +G+ +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1412 TGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGA 1471
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGR 171
+G GP+G S GP+G G +G +G +G GP+G G P+G
Sbjct: 1472 TGPTGSTGPTG---STGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGS 1528
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G GL+
Sbjct: 1529 TGATGPTG---VTGPTGSTGPTGLT 1550
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/198 (28%), Positives = 79/198 (39%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--------------- 53
+ G +G GP+GS G P+GS GP+G GP+G
Sbjct: 1339 STGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTG 1398
Query: 54 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
S GP+G G +G GP +GS G +G +GP+G G +G
Sbjct: 1399 STGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATG 1458
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP+G G +G S GP+G G +G G +G + G +G G +G
Sbjct: 1459 ATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTG 1518
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G
Sbjct: 1519 ITGSTGPTGSTGATGPTG 1536
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/205 (26%), Positives = 79/205 (38%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL----- 64
G +G + G +G GP+GS GP+G GP+GS GP+G
Sbjct: 1331 TGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGT 1390
Query: 65 ----------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRY 111
GP+G G +G GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 1391 TGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGV 1450
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G GP+G S G +G GP+G GP+G G +G +G +G
Sbjct: 1451 TGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGS---TGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGV 1507
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +
Sbjct: 1508 TGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGAT 1532
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/205 (26%), Positives = 80/205 (39%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G +G +G G +G + G +G GP+G
Sbjct: 1295 TGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGS 1354
Query: 73 LRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGP 114
G P+GS GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1355 TGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGA 1414
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G GP+G S G +G +GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1415 TGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGP 1474
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G++
Sbjct: 1475 TGSTGPTGS---TGPTGETGVTGVT 1496
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/165 (29%), Positives = 69/165 (41%), Gaps = 12/165 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +GS G +G GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 1231 PTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGAT---GPTG--- 1284
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +GS G +G G +G GP+G +G +G G +G + S G +G
Sbjct: 1285 VTGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTG 1344
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1345 VTGETGPTGSTGITG------STGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTG 1383
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/199 (26%), Positives = 76/199 (38%), Gaps = 21/199 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +G+ GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1286 TGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGV 1345
Query: 73 LRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------RYLGP 114
GP+GS GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 1346 TGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGP 1405
Query: 115 ---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G GP+G G +G G +G +GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1406 TGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGI 1465
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G
Sbjct: 1466 TGSTGATGPTGSTGPTGST 1484
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/215 (25%), Positives = 81/215 (37%), Gaps = 24/215 (11%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T + + + GP+G G +GS GP+G+ G +G G +GS G
Sbjct: 1247 TGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGETGSTGVTGSTGSTGVTGS 1306
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGR 117
+G GP+G +G +G G +G + G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1307 TGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGS 1366
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1367 TGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGA 1426
Query: 163 LRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G +GP+G G +G G
Sbjct: 1427 TGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATG 1461
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/212 (25%), Positives = 79/212 (37%), Gaps = 33/212 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 69
GP+G +G +G G +G + G +G GP+GS G P+G GP
Sbjct: 1313 TGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGP 1372
Query: 70 SGRLRYLGP---------------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G GP +G+ GP+G G +G
Sbjct: 1373 TGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGE 1432
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G +GP+G G +G + GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1433 TGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGS---TGPTGE 1489
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G +G +G GP+G G
Sbjct: 1490 TGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITG 1521
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/202 (25%), Positives = 75/202 (37%), Gaps = 24/202 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +GS G +G GP+G +G +G G +G
Sbjct: 1277 TGATGPTGVTGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGE 1336
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS--- 129
+ G +G GP+G G GP+G GP+G GP+G S
Sbjct: 1337 IGSTGSTGVTGETGPTGSTGITG------STGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGT 1390
Query: 130 ------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRY 174
GP+G G +G GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 1391 TGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGV 1450
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 1451 TGSTGATGATGPTGITGSTGAT 1472
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/214 (25%), Positives = 74/214 (34%), Gaps = 45/214 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY--- 66
GP+G GP+GS GP+GS G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 1850 TGPTGSTGVTGPTGPTGSTGATGPTGSTGVTGATGVTGPTGPTGSTGATGPTGSTGVTGA 1909
Query: 67 ------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---------------------P 87
G +G GP+GS G P
Sbjct: 1910 TGPTGTTGITGATGATGPTGSTGVTGATGPTGSTGATGATGVTGSTGSTGSTGVTGSTGP 1969
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G GP+G GP+G GP+G GP+G S G +G G +G
Sbjct: 1970 TGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGATGPTGSTGSTGATGITGSTGVTGPTGS 2029
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2030 TGITGSTGITGSTGATGPTGVTGSTGVTGPTGST 2063
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 65/150 (43%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G +GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1432 ETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGST---GPTG 1488
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ +G +G GP+G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 1489 ETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGATGPTGVTGPTG---STG 1545
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1546 PTGLTGSTGATGSTGVTGPTGLTGETGPTG 1575
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/156 (28%), Positives = 64/156 (41%), Gaps = 9/156 (5%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G G +GS G +G GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 1231 PTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGAT---GPTG--- 1284
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G G +G G +G + GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1285 VTGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTG 1344
Query: 162 RLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1345 VTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETG 1380
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/229 (24%), Positives = 79/229 (34%), Gaps = 54/229 (23%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +G GP+GS GP+ GP+GS GP+G G +G
Sbjct: 1835 TGATGSTGVTGVTGPTGPTGSTGVTGPT------GPTGSTGATGPTGSTGVTGATGVTGP 1888
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 113
GP+GS GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1889 TGPTGSTGATGPTGSTGVTGATGPTGTTGITGATGATGPTGSTGVTGATGPTGSTGATGA 1948
Query: 114 --------------------PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
P+G GP+G S GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1949 TGVTGSTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGATGPTGS 2008
Query: 154 LRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G GP+G G++
Sbjct: 2009 TGSTGATGITGSTGVTGPTGSTGITGSTGITGSTGATGPTGVTGSTGVT 2057
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/161 (26%), Positives = 64/161 (39%), Gaps = 9/161 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGP 87
+GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G+ G
Sbjct: 1229 IGPTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGE 1288
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G G +G G +G GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1289 TGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGE 1348
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1349 TGPTGSTGITG------STGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTG 1383
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/212 (23%), Positives = 74/212 (34%), Gaps = 48/212 (22%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ G +G GP+GS GP+G P+G GP+GS G +G
Sbjct: 1835 TGATGSTGVTGVTGPTGPTGSTGVTGPTG------PTGSTGATGPTGSTGVTGATGVTGP 1888
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLNSDG- 131
GP+G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 1889 TGPTGSTGATGPTGSTGVTGATGPTGTTGITGATGATGPTGSTGVTGATGPTGSTGATGA 1948
Query: 132 --------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1949 TGVTGSTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGATGPTGS 2008
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G++ ++G
Sbjct: 2009 TGSTGATGITGSTGVTGPTGSTGITGSTGITG 2040
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/131 (27%), Positives = 53/131 (40%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP+G G +GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1229 IGPTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGE 1288
Query: 127 LNS---DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
S G +G G +G GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1289 TGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGE 1348
Query: 184 LGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 1349 TGPTGSTGITG 1359
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/107 (31%), Positives = 46/107 (42%), Gaps = 9/107 (8%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+GS GP+GS GP+G GP+GS GP+G +G G +GS
Sbjct: 1969 PTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGATGPTGS------TGSTGATGITGSTG 2022
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G G +G G +G G +G GP+G S
Sbjct: 2023 VTGPTGSTGITGSTG---ITGSTGATGPTGVTGSTGVTGPTGSTGST 2066
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/118 (29%), Positives = 50/118 (42%), Gaps = 6/118 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+GS GP+G G +G +G +G GP+G G +G
Sbjct: 1468 STGATGPTGSTGPTGST---GPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTG 1524
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G S
Sbjct: 1525 PTGSTGATGPTGVTGPTGS---TGPTGLTGSTGATGSTGVTGPTGLTGETGPTGVTGS 1579
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/191 (22%), Positives = 64/191 (33%), Gaps = 33/191 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 425 TGPTGETGVTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGATGVTGPTGATGVTGATGATGVTGSTGS 484
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 117
G +G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 485 TGAAGVTGATGVTGSTGSTGSTGITGVTGSTGITGSTGATGVTGATGLTGITGPTGATGS 544
Query: 118 ------------------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G + G +G GP+G G +G G
Sbjct: 545 TGVTGVTGVTGSTGVTGSTGETGPTGVTGATGVTGETGPTGPTGSTGVTGATGVTGETGV 604
Query: 160 SGRLRYLGPSG 170
+G G +G
Sbjct: 605 TGETGATGVTG 615
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/203 (21%), Positives = 65/203 (32%), Gaps = 33/203 (16%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
S G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G+ G
Sbjct: 412 STGATGVTGETGPTGPTGETGVTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGATGVTGPTGATGVTG 471
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 472 ATGATGVTGSTGSTGAAGVTGATGVTGSTGSTGSTGITGVTGSTGITGSTGATGVTGATG 531
Query: 135 RLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 532 LTGITGPTGATGSTGVTGVTGVTGSTGVTGSTGETGPTGVTGATGVTGETGPTGPTGSTG 591
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G++
Sbjct: 592 VTGATGVTGETGVTGETGATGVT 614
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/200 (22%), Positives = 65/200 (32%), Gaps = 33/200 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 416 TGVTGETGPTGPTGETGVTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGATGVTGPTGATGVTGATGA 475
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GS G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 476 TGVTGSTGSTGAAGVTGATGVTGSTGSTGSTGITGVTGSTGITGSTGATGVTGATGLTGI 535
Query: 121 LGPSGR---------------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 536 TGPTGATGSTGVTGVTGVTGSTGVTGSTGETGPTGVTGATGVTGETGPTGPTGSTGVTGA 595
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G +G G +G
Sbjct: 596 TGVTGETGVTGETGATGVTG 615
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/119 (26%), Positives = 47/119 (39%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GP+G G +G G +G GP+G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 1229 IGPTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGE 1288
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G +G GP G G +G +G + V+G
Sbjct: 1289 TGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTG 1347
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/84 (33%), Positives = 37/84 (44%), Gaps = 3/84 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+GS GP+GS G +G G +GS GP+G G +G G +GS
Sbjct: 1016 TGPTGSTGVTGPTGSTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTG---VTGSTGETGPTGVTGS 1072
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G G +G GP
Sbjct: 1073 TGETGPTGETGPTGVTGSTGATGP 1096
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/86 (31%), Positives = 37/86 (43%), Gaps = 6/86 (6%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+GS GP+G G +G G +GS GP+G +G GP+G
Sbjct: 1016 TGPTGSTGVTGPTGSTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGV------TGSTGETGPTGV 1069
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G GP+G S G +G
Sbjct: 1070 TGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATG 1095
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/195 (24%), Positives = 65/195 (33%), Gaps = 45/195 (23%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------SGRLRYLGP 69
+GS G +GS G +G G +GS GP +G +GP
Sbjct: 905 TGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGVTGPTGATGATGVTGVTGVTGSTGAIGP 964
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRY 102
+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 965 TGVTGPTGVTGSTGATGPTGVTGPTGVTGATGTTGPTGTTGVTGVTGPTGSTGPTGSTGV 1024
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G GP+G S G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1025 TGPTGSTGVTGSTGE---TGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGE 1081
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G GP
Sbjct: 1082 TGPTGVTGSTGATGP 1096
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/84 (28%), Positives = 33/84 (39%), Gaps = 3/84 (3%)
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1016 TGPTGSTGVTGPTGSTGVTGSTGET---GPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGS 1072
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G G +G GP
Sbjct: 1073 TGETGPTGETGPTGVTGSTGATGP 1096
>gi|384179244|ref|YP_005565006.1| hypothetical protein YBT020_06710 [Bacillus thuringiensis serovar
finitimus YBT-020]
gi|324325328|gb|ADY20588.1| hypothetical protein YBT020_06710 [Bacillus thuringiensis serovar
finitimus YBT-020]
Length = 247
Score = 69.7 bits (169), Expect = 6e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/179 (23%), Positives = 80/179 (44%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + + P G + + P + +GP + +GP G + + P G +GP
Sbjct: 4 VGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGP---VGPVAP 60
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ +GP G + + P G + + P + +GP + +GP G + + P G + P
Sbjct: 61 VSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAP 120
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+ +GP + +GP G + + P G + + P + +GP + +GP G +
Sbjct: 121 VSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVAPVSPVGPVGPVA 179
>gi|123478181|ref|XP_001322254.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3]
gi|121905097|gb|EAY10031.1| conserved hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3]
Length = 921
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/216 (37%), Positives = 108/216 (50%), Gaps = 34/216 (15%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG-------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
PSG++ LG +R PSG + LG PSG++ LG +R PSG++ L
Sbjct: 418 PSGKITLLGDGSGIRS-SPSGKIALLGRNGIRNSPSGKISLLGGGNGIRG-SPSGKITLL 475
Query: 68 G------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------PS 115
G PSGR+ LG G ++ PSGR+ LG G ++ PSG++ LG PS
Sbjct: 476 GDGIRSSPSGRIALLGEGGGIKS-SPSGRIALLGDGGGIKS-SPSGKITLLGDGIRSSPS 533
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
GR+ LG G + S PSGR+ LG G ++ PSGR+ LG G PSGR+ L
Sbjct: 534 GRIALLGDGGGIKS-SPSGRIALLGDGGGIKS-SPSGRIALLGDGGGGIRSSPSGRITLL 591
Query: 176 G----PSGRLRY-----LGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G PS + PSGR+ LG +G+R S
Sbjct: 592 GDGIRPSPSKNFGDGIRSSPSGRITLLGEGNGIRSS 627
>gi|308172611|ref|YP_003919316.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus
amyloliquefaciens DSM 7]
gi|307605475|emb|CBI41846.1| GXT repeat-containing collagen-like protein [Bacillus
amyloliquefaciens DSM 7]
Length = 2083
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 73/167 (43%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +G +GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 1319 TGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGP 1378
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS GP+G G +G +G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 1379 TGSTGPTGST---GPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGA 1435
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1436 TGPTGVTGPTGST---GPTGLTGSTGATGSTGVTGPTGLTGETGPTG 1479
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 82/205 (40%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGSLRY 57
G +G GP+GS GP+GS GP+G GP+G
Sbjct: 1256 TGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGA 1315
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G GP+G G +G+ +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1316 TGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGA 1375
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGR 171
+G GP+G S GP+G G +G +G +G GP+G G P+G
Sbjct: 1376 TGPTGSTGPTG---STGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGS 1432
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G GL+
Sbjct: 1433 TGATGPTG---VTGPTGSTGPTGLT 1454
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/198 (28%), Positives = 79/198 (39%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--------------- 53
+ G +G GP+GS G P+GS GP+G GP+G
Sbjct: 1243 STGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTG 1302
Query: 54 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
S GP+G G +G GP +GS G +G +GP+G G +G
Sbjct: 1303 STGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATG 1362
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP+G G +G S GP+G G +G G +G + G +G G +G
Sbjct: 1363 ATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTG 1422
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G
Sbjct: 1423 ITGSTGPTGSTGATGPTG 1440
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/205 (26%), Positives = 79/205 (38%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL----- 64
G +G + G +G GP+GS GP+G GP+GS GP+G
Sbjct: 1235 TGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGT 1294
Query: 65 ----------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRY 111
GP+G G +G GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 1295 TGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGV 1354
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G GP+G S G +G GP+G GP+G G +G +G +G
Sbjct: 1355 TGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGS---TGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGV 1411
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +
Sbjct: 1412 TGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGAT 1436
Score = 66.6 bits (161), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/205 (26%), Positives = 80/205 (39%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G +G +G G +G + G +G GP+G
Sbjct: 1199 TGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGS 1258
Query: 73 LRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGP 114
G P+GS GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1259 TGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGA 1318
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G GP+G S G +G +GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1319 TGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGP 1378
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G++
Sbjct: 1379 TGSTGPTGS---TGPTGETGVTGVT 1400
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/165 (29%), Positives = 69/165 (41%), Gaps = 12/165 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +GS G +G GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 1135 PTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGAT---GPTG--- 1188
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +GS G +G G +G GP+G +G +G G +G + S G +G
Sbjct: 1189 VTGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTG 1248
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1249 VTGETGPTGSTGITG------STGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTG 1287
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/199 (26%), Positives = 76/199 (38%), Gaps = 21/199 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS G +G+ GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1190 TGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGV 1249
Query: 73 LRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------RYLGP 114
GP+GS GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 1250 TGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGP 1309
Query: 115 ---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G GP+G G +G G +G +GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1310 TGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGI 1369
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G
Sbjct: 1370 TGSTGATGPTGSTGPTGST 1388
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/215 (25%), Positives = 81/215 (37%), Gaps = 24/215 (11%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T + + + GP+G G +GS GP+G+ G +G G +GS G
Sbjct: 1151 TGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGETGSTGVTGSTGSTGVTGS 1210
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGR 117
+G GP+G +G +G G +G + G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1211 TGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGS 1270
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1271 TGVTGPTGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGA 1330
Query: 163 LRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G +GP+G G +G G
Sbjct: 1331 TGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATG 1365
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/212 (25%), Positives = 79/212 (37%), Gaps = 33/212 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 69
GP+G +G +G G +G + G +G GP+GS G P+G GP
Sbjct: 1217 TGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGP 1276
Query: 70 SGRLRYLGP---------------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G GP +G+ GP+G G +G
Sbjct: 1277 TGSTGETGPTGVTGSPGTTGATGPTGSTGATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGE 1336
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G +GP+G G +G + GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1337 TGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGS---TGPTGE 1393
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G +G +G GP+G G
Sbjct: 1394 TGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITG 1425
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 70/175 (40%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 20 RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GP+G G +G GP+G G +G+ +GP+G G +G
Sbjct: 1305 GATGPTGVTGATGATGPTGVTGPTGATGSTGETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGAT 1364
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G G +G GP+G G +G G +G + G +G G +G
Sbjct: 1365 GPTGITGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGIT 1424
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1425 GSTGPTGSTGATGPTGVTGPTGSTGPTGLTGSTGATGSTGVTGPTGLTGETGPTG 1479
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 65/150 (43%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G +GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1336 ETGATGITGTMGPTGPTGVTGSTGATGATGPTGITGSTGATGPTGSTGPTGST---GPTG 1392
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ +G +G GP+G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 1393 ETGVTGVTGATGEIGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGATGPTGVTGPTG---STG 1449
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1450 PTGLTGSTGATGSTGVTGPTGLTGETGPTG 1479
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/156 (28%), Positives = 64/156 (41%), Gaps = 9/156 (5%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G G +GS G +G GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 1135 PTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGAT---GPTG--- 1188
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G G +G G +G + GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1189 VTGETGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTG 1248
Query: 162 RLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 1249 VTGETGPTGSTGITGSTGPTGSTGVTGPTGSTGETG 1284
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/161 (26%), Positives = 64/161 (39%), Gaps = 9/161 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGP 87
+GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G+ G
Sbjct: 1133 IGPTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGE 1192
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G G +G G +G GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1193 TGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGE 1252
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1253 TGPTGSTGITG------STGPTGSTGVTGPTGSTGETGPTG 1287
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/182 (25%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 48/182 (26%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+GS GP+G P+G GP+GS G +G GP+G GP+GS
Sbjct: 1730 TGPTGSTGVTGPTG------PTGSTGATGPTGSTGVTGATGVTGPTGPTGSTGATGPTGS 1783
Query: 82 LRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------------- 104
G +G GP+G G
Sbjct: 1784 TGVTGATGPTGTTGITGATGATGPTGSTGVTGATGPTGSTGATGATGVTGSTGSTGSTGV 1843
Query: 105 -----PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
P+G G +G GP+G S GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 1844 TGSTGPTGSTGSTGQTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGATGPTGSTGVTGATGVTGATGA 1903
Query: 160 SG 161
+G
Sbjct: 1904 TG 1905
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/200 (25%), Positives = 68/200 (34%), Gaps = 54/200 (27%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+ GP+GS GP+ GP+GS GP+G G +G
Sbjct: 1718 TGSTGVTGVTGPT------GPTGSTGVTGPT------GPTGSTGATGPTGSTGVTGATGV 1765
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP+GS GP+G G +G GP+G
Sbjct: 1766 TGPTGPTGSTGATGPTGSTGVTGATGPTGTTGITGATGATGPTGSTGVTGATGPTGSTGA 1825
Query: 112 LG---------------------PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G P+G G +G S GP+G GP+G GP
Sbjct: 1826 TGATGVTGSTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGSTGQTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGATGP 1885
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G G +G G +G
Sbjct: 1886 TGSTGVTGATGVTGATGATG 1905
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/131 (27%), Positives = 53/131 (40%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP+G G +GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1133 IGPTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGE 1192
Query: 127 LNS---DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
S G +G G +G GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 1193 TGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTGE 1252
Query: 184 LGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 1253 TGPTGSTGITG 1263
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/196 (22%), Positives = 64/196 (32%), Gaps = 48/196 (24%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G G +G GP+G GP+G P+GS GP+G G +G
Sbjct: 1715 TGATGSTGVTGVTGPTGPTGSTGVTGPTG------PTGSTGATGPTGSTGVTGATGVTGP 1768
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLG- 140
GP+G GP+G G +G + GP+G G
Sbjct: 1769 TGPTGSTGATGPTGSTGVTGATGPTGTTGITGATGATGPTGSTGVTGATGPTGSTGATGA 1828
Query: 141 --------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 1829 TGVTGSTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGSTGQTGSTGSTGPTGSTGSTGPTGSTGATGPTGS 1888
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +
Sbjct: 1889 TGVTGATGVTGATGAT 1904
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.090, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/191 (22%), Positives = 64/191 (33%), Gaps = 33/191 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 416 TGPTGETGVTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGATGVTGPTGATGVTGATGATGVTGSTGS 475
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 117
G +G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 476 TGAAGVTGATGVTGSTGSTGSTGITGVTGSTGITGSTGATGVTGATGLTGITGPTGATGS 535
Query: 118 ------------------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G + G +G GP+G G +G G
Sbjct: 536 TGVTGVTGVTGSTGVTGSTGETGPTGVTGATGVTGETGPTGPTGSTGVTGATGVTGETGV 595
Query: 160 SGRLRYLGPSG 170
+G G +G
Sbjct: 596 TGETGATGVTG 606
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/203 (21%), Positives = 65/203 (32%), Gaps = 33/203 (16%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
S G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G+ G
Sbjct: 403 STGATGVTGETGPTGPTGETGVTGSTGVTGETGPTGSTGITGSTGATGVTGPTGATGVTG 462
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 463 ATGATGVTGSTGSTGAAGVTGATGVTGSTGSTGSTGITGVTGSTGITGSTGATGVTGATG 522
Query: 135 RLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 523 LTGITGPTGATGSTGVTGVTGVTGSTGVTGSTGETGPTGVTGATGVTGETGPTGPTGSTG 582
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G++
Sbjct: 583 VTGATGVTGETGVTGETGATGVT 605
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/119 (26%), Positives = 47/119 (39%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GP+G G +G G +G GP+G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 1133 IGPTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGE 1192
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G +G GP G G +G +G + V+G
Sbjct: 1193 TGSTGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGATGEIGSTGSTGVTG 1251
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/101 (28%), Positives = 41/101 (40%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+GS G +G G +G G +GS GP+G G +G G +G
Sbjct: 899 TGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGP 958
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G +G GP+G S G +G GP+G G +G
Sbjct: 959 TGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATG 999
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/103 (27%), Positives = 39/103 (37%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G S G +G
Sbjct: 898 ITGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETG 957
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 958 PTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATGP 1000
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/101 (28%), Positives = 41/101 (40%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS G +GS G +G G +GS GP+G G +G G +G
Sbjct: 899 TGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGP 958
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 959 TGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATG 999
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/104 (25%), Positives = 40/104 (38%), Gaps = 3/104 (2%)
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSG 161
P+G G +G G +G S GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1135 PTGVTGSTGATGSTGVTGITGETGSTGPTGPTGATGSTGSTGATGPTGATGPTGVTGETG 1194
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G G +G GP+G +G + V+G
Sbjct: 1195 STGVTGSTGSTGVTGSTGATGATGPTGITGPIGETGVTGVTGAT 1238
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/103 (26%), Positives = 38/103 (36%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 898 ITGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETG 957
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 958 PTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATGP 1000
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/103 (27%), Positives = 39/103 (37%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G GP+G G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 898 ITGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETG 957
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 958 PTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATGP 1000
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/101 (27%), Positives = 40/101 (39%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 899 TGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGP 958
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +GS GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 959 TGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATG 999
Score = 35.8 bits (81), Expect = 10.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/103 (26%), Positives = 38/103 (36%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 898 ITGSTGVTGVTGSTGLTGSTGPTGITGSTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETG 957
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 958 PTGVTGSTGETGPTGVTGSTGETGPTGETGPTGVTGSTGATGP 1000
>gi|76262843|gb|ABA41496.1| collagen-like protein F [Streptococcus equi subsp. equi]
Length = 364
Score = 69.7 bits (169), Expect = 7e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/174 (33%), Positives = 61/174 (35%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G+ GP +GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 124 GPAGQQGEAGP------VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDR 177
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 178 GEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPK 237
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 238 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPK 291
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/157 (33%), Positives = 54/157 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 135 VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGE 194
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 195 RGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGP 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 255 KGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPK 291
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/166 (33%), Positives = 58/166 (34%), Gaps = 6/166 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP +GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 124 GPAGQQGEAGP------VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDR 177
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 178 GEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPK 237
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 238 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKG 283
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/176 (32%), Positives = 61/176 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP+G G GR G G +GP G GP G
Sbjct: 90 QGPKGDKGDPGEPGPQGPVGPAGPKGDRGLDGRRGPAGQQGEAGPVGPQGPQGEQGPKGD 149
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 150 RGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGP 209
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 210 KGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKG 265
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/184 (33%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 11/184 (5%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRL 64
K GP+G G G GP G + GP G R L GP+G GP
Sbjct: 80 KNGKQGPAGPQGPKGDKGDPGEPGPQGPVGPAGPKG-DRGLDGRRGPAGQQGEAGP---- 134
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
+GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 135 --VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPK 192
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 193 GERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQ 252
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 253 GPKG 256
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/119 (32%), Positives = 39/119 (32%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 179 EQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKG 238
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP G GP G GP G GP G GP D
Sbjct: 239 DRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKKEPEKD 297
>gi|156406949|ref|XP_001641307.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156228445|gb|EDO49244.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 279
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/188 (41%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
L L YL LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL
Sbjct: 96 LSVLIELHYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIG 155
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LRYL +LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL
Sbjct: 156 LRYLSVLIALRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSV--------L 207
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G LRYL LRYL LRYL LRYL RYL LR+L LRY
Sbjct: 208 IG-LRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIALRYLSVLIGFRYLFVLIGLRFLSVLIGLRY 266
Query: 193 LGLSDGLR 200
L + GLR
Sbjct: 267 LSVLIGLR 274
Score = 67.4 bits (163), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/172 (41%), Positives = 73/172 (42%)
Query: 29 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
YL L YL LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL
Sbjct: 94 HYLSVLIELHYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVL 153
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
LRYL LRYL LRYL LRYL L LRYL LRYL
Sbjct: 154 IGLRYLSVLIALRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYL 213
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
LRYL LRYL LRYL RYL LR+L + GLR
Sbjct: 214 SVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIALRYLSVLIGFRYLFVLIGLRFLSVLIGLR 265
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/166 (42%), Positives = 72/166 (43%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL
Sbjct: 111 LRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIALRYLSV 170
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL L LRY
Sbjct: 171 LIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRY 230
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
L LRYL RYL LR+L LRYL LRYL
Sbjct: 231 LSVLIALRYLSVLIGFRYLFVLIGLRFLSVLIGLRYLSVLIGLRYL 276
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/182 (39%), Positives = 73/182 (40%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
LRYL RYL YL R YL YL L YL LRYL
Sbjct: 57 LRYLIVPKKFRYLLELIGPHYLLVMIRFCYLSVLIGPHYLSVLIELHYLSVLIGLRYLSV 116
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL L LRY
Sbjct: 117 LIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIALRYLSVLIGLRY 176
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
L LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL LRYL +
Sbjct: 177 LSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIGLRYLSVLIA 236
Query: 199 LR 200
LR
Sbjct: 237 LR 238
>gi|423656567|ref|ZP_17631866.1| hypothetical protein IKG_03555, partial [Bacillus cereus VD200]
gi|401291089|gb|EJR96773.1| hypothetical protein IKG_03555, partial [Bacillus cereus VD200]
Length = 323
Score = 69.3 bits (168), Expect = 8e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 64/158 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNTGATGNAGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGN 222
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G + GP
Sbjct: 223 TGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGP 282
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 283 AGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQG 320
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 62/158 (39%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G+ GP G GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNTGATGNAGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGN 222
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G GP G G +G GP+G + GP G G +G GP
Sbjct: 223 TGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGP 282
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 283 AGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQG 320
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 65/158 (41%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ GP G+ GP G G +G+ GP+G GP G G +G+
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPRGNTGATGPQGPQGNTGATGNAGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGN 222
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G GP G G +G GP+G GP G + G +G GP
Sbjct: 223 TGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGP 282
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 283 AGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQG 320
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/132 (31%), Positives = 55/132 (41%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 189 NTGATGNAGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG 248
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G + G
Sbjct: 249 NTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQG 308
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
P+G GP G
Sbjct: 309 PAGATGATGPQG 320
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/124 (30%), Positives = 49/124 (39%), Gaps = 3/124 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 200 GPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGAT 259
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---D 130
GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 260 GATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQ 319
Query: 131 GPSG 134
GP G
Sbjct: 320 GPQG 323
>gi|334327770|ref|XP_003340997.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Monodelphis
domestica]
Length = 1569
Score = 69.3 bits (168), Expect = 9e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/203 (37%), Positives = 107/203 (52%), Gaps = 54/203 (26%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
LR+ G +G LR+ GP+G LR+ GP+G+ LRY GP G P G LR+ GP G+
Sbjct: 858 LRFEGTAG-LRFEGPTGGLRFEGPAGQSVGGLRYEGPRGQ-----PVGGLRFEGPHGQ-- 909
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR 126
P G+LR+ P G+ P G LR+ G G +R+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 910 ---PVGALRFENPRGQ-----PVGGLRFEGSHGASGSGIRFEGPHGQPGGGIRFEGP--- 958
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP-----S 169
L G G +R+ GP G+ LR+ G G LR+ GP G+ +R+ GP S
Sbjct: 959 LLQQG--GGMRFEGPHGQSVAGLRFEGQHNQLGGSLRFEGPHGQPGVGVRFEGPLVQQGS 1016
Query: 170 GRLRYLGPS---GRLRYLGPSGR 189
G +R+ GPS G +R+ GP G+
Sbjct: 1017 G-MRFEGPSVQGGNMRFEGPLGQ 1038
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/226 (34%), Positives = 110/226 (48%), Gaps = 75/226 (33%)
Query: 37 LRYLGPSGR------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G +G LR+ GP+G
Sbjct: 816 MRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPQGPAGTPLRFEGPLGQAGGGGLRFEGTAG-LRFEGPTGG 874
Query: 73 LRYLGPSGS----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSG 116
LR+ GP+G LRY GP G+ LR+ GP G+ LR+ P G+ LR+ G G
Sbjct: 875 LRFEGPAGQSVGGLRYEGPRGQPVGGLRFEGPHGQPVGALRFENPRGQPVGGLRFEGSHG 934
Query: 117 R----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP----SGRLRYLGPSGR----LRYLGPS---- 160
+R+ GP G+ P G +R+ GP G +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 935 ASGSGIRFEGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGGGMRFEGPHGQSVAGLRFEGQHNQLG 989
Query: 161 GRLRYLGPSGR----LRYLGP-----SGRLRYLGPS---GRLRYLG 194
G LR+ GP G+ +R+ GP SG +R+ GPS G +R+ G
Sbjct: 990 GSLRFEGPHGQPGVGVRFEGPLVQQGSG-MRFEGPSVQGGNMRFEG 1034
>gi|225870244|ref|YP_002746191.1| collagen-like surface-anchored protein SclF [Streptococcus equi
subsp. equi 4047]
gi|37498972|gb|AAQ91577.1| collagen-like protein 3 [Streptococcus equi]
gi|225699648|emb|CAW93328.1| putative collagen-like surface-anchored protein SclF [Streptococcus
equi subsp. equi 4047]
Length = 364
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/174 (33%), Positives = 61/174 (35%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G+ GP +GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 124 GPAGQQGEAGP------VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDR 177
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 178 GEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPK 237
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 238 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPK 291
Score = 67.8 bits (164), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/157 (33%), Positives = 54/157 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 135 VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGE 194
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 195 RGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGP 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 255 KGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPK 291
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/166 (33%), Positives = 58/166 (34%), Gaps = 6/166 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP +GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 124 GPAGQQGEAGP------VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDR 177
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 178 GEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPK 237
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 238 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKG 283
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/176 (32%), Positives = 61/176 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +GP+G G GR G G +GP G GP G
Sbjct: 90 QGPKGDKGDPGEPGPQGPVGPAGPKGDRGLDGRRGPAGQQGEAGPVGPQGPQGEQGPKGD 149
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 150 RGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGP 209
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 210 KGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKG 265
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/184 (33%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 11/184 (5%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRL 64
K GP+G G G GP G + GP G R L GP+G GP
Sbjct: 80 KNGKQGPAGPQGPKGDKGDPGEPGPQGPVGPAGPKG-DRGLDGRRGPAGQQGEAGP---- 134
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
+GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 135 --VGPQGPQGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPK 192
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 193 GERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQ 252
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 253 GPKG 256
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/119 (32%), Positives = 39/119 (32%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 179 EQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKG 238
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP G GP G GP G GP G GP D
Sbjct: 239 DRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKKEPEKD 297
>gi|254976827|ref|ZP_05273299.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-66c26]
gi|255315967|ref|ZP_05357550.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-76w55]
gi|255518624|ref|ZP_05386300.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-97b34]
gi|260684773|ref|YP_003216058.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile CD196]
gi|260688431|ref|YP_003219565.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile R20291]
gi|384362444|ref|YP_006200296.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile BI1]
gi|260210936|emb|CBA66179.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile CD196]
gi|260214448|emb|CBE06900.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile R20291]
Length = 546
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/198 (27%), Positives = 86/198 (43%), Gaps = 27/198 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G GP+G GP+GS+ G +G GP
Sbjct: 157 TGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP--- 213
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+ GP+G++ GP G + +GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 214 IGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANG---LVGPTGA 270
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G + GP+G + GP+G +GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 271 TGATGVAGAI---GPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGA 324
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+G +GP+G G+
Sbjct: 325 NGVAGPIGPTGPTGANGV 342
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/205 (25%), Positives = 84/205 (40%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ G +G+ G +G GP+G+ G +G GP
Sbjct: 127 TGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGP 186
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--------- 120
+G GP+GS+ G +G GP + GP+G + GP G +
Sbjct: 187 TGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP---IGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGA 243
Query: 121 ---------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G ++G G G +G +GP+G + GP+G +GP+G
Sbjct: 244 TGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGA 303
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G + G +
Sbjct: 304 TGATGANGA---TGPTGAVGATGAN 325
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 84/206 (40%), Gaps = 27/206 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LG 68
N G +G GP+G+ G +G GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 111 NKGATGANGITGPTGATGATGANG---ITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITG 167
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G +G GP+G GP+G + G +G GP + GP+G +
Sbjct: 168 PTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP---IGATGPTGAVG 224
Query: 129 SDGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSG 170
+ GP G + +GP+G G +G + G +G +GP+G
Sbjct: 225 ATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTG 284
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ GP+G +GP+G G +
Sbjct: 285 AVGATGPTGADGAVGPTGATGATGAN 310
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/200 (25%), Positives = 76/200 (38%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 16 TGPTGATGPTGPTGPRGATGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGANGT 72
Query: 70 ------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+G GP+G+ G +G G +G GP+G G
Sbjct: 73 TGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGA 132
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G ++G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 133 NGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGA 192
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G + G +G G
Sbjct: 193 TGPTGSIGATGANGVTGATG 212
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/186 (25%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 21/186 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
N G +G GP+G++ G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 48 NTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITG 107
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LG 113
G G G +G G +G+ GP+G G +G G +G G
Sbjct: 108 PTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITG 167
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P+G G +G + GP+G GP+G + G +G GP + GP+G +
Sbjct: 168 PTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP---IGATGPTGAVG 224
Query: 174 YLGPSG 179
GP G
Sbjct: 225 ATGPDG 230
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/199 (25%), Positives = 80/199 (40%), Gaps = 27/199 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 91 TGPTGATGATGANG---ITGPTGNKGATGANG---ITGPTGATGATGANGITGPTGNTGA 144
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP+G G +G GP+G GP+G + + G
Sbjct: 145 TGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGA 204
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGP 177
+G GP + GP+G + GP G + +GP+G G
Sbjct: 205 NGVTGATGP---IGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGA 261
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G G++
Sbjct: 262 NG---LVGPTGATGATGVA 277
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/205 (25%), Positives = 79/205 (38%), Gaps = 25/205 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGSLRY 57
G +G GP+G+ G +G GP+G + G +G+
Sbjct: 34 TGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGI 90
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G +G G G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 91 TGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGA 150
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G ++G P+G G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 151 TGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGA 210
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
GP + GP+G + G DGL
Sbjct: 211 TGP---IGATGPTGAVGATG-PDGL 231
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/200 (27%), Positives = 86/200 (43%), Gaps = 27/200 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP+GS+ G +G + GP+G + GP G + GP+G
Sbjct: 184 TGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGA 243
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G + GP+G+ G G G +G +GP+G + GP+G +GP+G
Sbjct: 244 TGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGA 303
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------P 168
+ G +G GP+G + G +G +GP+G G P
Sbjct: 304 TGATGANGA---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGP 360
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G + G +G +GP+G
Sbjct: 361 TGAVGATGANGVAGPIGPTG 380
>gi|407707041|ref|YP_006830626.1| Small, acid-soluble spore protein B [Bacillus thuringiensis MC28]
gi|407384726|gb|AFU15227.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
MC28]
Length = 723
Score = 68.9 bits (167), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/192 (28%), Positives = 82/192 (42%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 230 DTGPTGAT---GPTGATGDTGPTGAT---GPTGATGDTGPTGAT---GPTGATGDTGPTG 280
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS GP+G G +G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 281 ATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTG 340
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 341 ATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 400
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G++ ++G
Sbjct: 401 ATGITGATGITG 412
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 80/188 (42%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 216 TGSTGATGPTGATGDTGPTGA---TGPTGATGDTGPTGA---TGPTGATGDTGPTGA--- 266
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 267 TGPTGATGDTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 326
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G+
Sbjct: 327 TGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGI 386
Query: 196 SDGLRVSG 203
+ ++G
Sbjct: 387 TGATGITG 394
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 78/184 (42%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 222 TGPTGATGDTGPTGAT---GPTGATGDTGPTGAT---GPTGATGDTGPTGA---TGPTGA 272
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + GP
Sbjct: 273 TGDTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 332
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 333 TGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGI 392
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 393 TGAT 396
Score = 63.9 bits (154), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 237 TGPTGATGDTGPTGAT---GPTGATGDTGPTGA---TGPTGATGDTGPTGATGPTGVTGS 290
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 291 TGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGI 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 351 TGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGI 410
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 411 TGAT 414
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/192 (26%), Positives = 78/192 (40%), Gaps = 6/192 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 245 DTGPTGAT---GPTGATGDTGPTGA---TGPTGATGDTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTG 298
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 299 ATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTG 358
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 359 ATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 418
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G++ ++G
Sbjct: 419 ATGITGATGITG 430
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 78/191 (40%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 252 TGPTGATGDTGPTGA---TGPTGATGDTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGP 308
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 309 TGATGITGA---TGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGA 365
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 366 TGPTGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGA 425
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ ++G
Sbjct: 426 TGITGATGITG 436
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 71/184 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 267 TGPTGATGDTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 326
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 327 TGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGI 386
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 387 TGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGI 446
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 447 TGAT 450
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/192 (25%), Positives = 76/192 (39%), Gaps = 3/192 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G+ GP+G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 260 DTGPTGAT---GPTGATGDTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 316
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 317 ATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITG 376
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 377 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 436
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G++ ++G
Sbjct: 437 ATGITGATGITG 448
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/192 (24%), Positives = 74/192 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +GS GP+G+ G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 275 DTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTG 334
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 335 ATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITG 394
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 395 ATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITG 454
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G++ ++G
Sbjct: 455 ATGITGATGITG 466
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/184 (24%), Positives = 69/184 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 294 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGA 353
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 354 TGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGA 413
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 414 TGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGA 473
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 474 TGIT 477
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/184 (23%), Positives = 68/184 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 285 TGVTGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGP 344
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 345 TGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGI 404
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 405 TGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGI 464
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 465 TGAT 468
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/174 (24%), Positives = 64/174 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 309 TGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGP 368
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 369 TGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGI 428
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G G +G G +G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 429 TGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGITGATGP 482
>gi|302384710|ref|YP_003820532.1| mucin 17-like protein [Clostridium saccharolyticum WM1]
gi|302195338|gb|ADL02909.1| mucin 17-like protein [Clostridium saccharolyticum WM1]
Length = 524
Score = 68.6 bits (166), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/187 (23%), Positives = 84/187 (44%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
V +GP G + + P G + + P + +GP + +GP G + + P G +
Sbjct: 76 VSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSPIGPVGP 135
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+ P + +GP + +GP G + + P G + + P G +GP + +GP G
Sbjct: 136 VSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPVGPVSPVSPIGP---VGPVSPVSPIGPVGP 192
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
++ P G + + P + +GP + +GP G + + P G + +GP + +GP
Sbjct: 193 VSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSPIGPVGPVGPVSPVSPIGP 252
Query: 187 SGRLRYL 193
G + +
Sbjct: 253 VGPVTPV 259
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/185 (23%), Positives = 84/185 (45%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + + P G + + P + +GP + +GP G + + P G + + P
Sbjct: 58 IGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSP 117
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ +GP + +GP G + + P G + + P + +GP + +GP ++ GP
Sbjct: 118 MGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPVGPVSPVSPIGP 177
Query: 133 SG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G + +GP G + + P G + + P + +GP + +GP G + + P G
Sbjct: 178 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSPIGP 237
Query: 190 LRYLG 194
+ +G
Sbjct: 238 VGPVG 242
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/180 (24%), Positives = 80/180 (44%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
V +GP G + + P G + GP + +GP G + + P G + + P +
Sbjct: 88 VSPVSPIGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVSPMGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGP 144
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP + +GP G + + P G + + P G +GP + +GP G + + P G
Sbjct: 145 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPVGPVSPVSPIGP---VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPIGP 201
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ P + +GP + +GP G + + P G + +GP + +GP G + + P
Sbjct: 202 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSPIGPVGPVGPVSPVSPIGPVGPVTPVSP 261
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.95, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/93 (27%), Positives = 45/93 (48%), Gaps = 6/93 (6%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G + GP + +GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGPV---GPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ + P + +GP + +GP G + + P
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSP 432
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/91 (27%), Positives = 44/91 (48%), Gaps = 6/91 (6%)
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G + GP + +GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGPV---GPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
+ + P + +GP + +GP G + +
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPV 430
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/93 (27%), Positives = 45/93 (48%), Gaps = 6/93 (6%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP +R +GP G + + P G +GP +R +GP G +GP + +GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGP---VGPVSPVRPIGPVGP---VGPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ + P + +GP + +GP G + + P
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSP 432
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/93 (27%), Positives = 44/93 (47%), Gaps = 6/93 (6%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G +GP + +GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGP---VGPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+ P + +GP + +GP G + + P
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSP 432
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/94 (27%), Positives = 45/94 (47%), Gaps = 6/94 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G +GP + +GP G
Sbjct: 345 PVGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGP---VGPVSPVSPIGPVG 398
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ + P + +GP + +GP G + + P
Sbjct: 399 PVGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSP 432
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/93 (27%), Positives = 45/93 (48%), Gaps = 6/93 (6%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G +GP + +GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGP---VGPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ + P + +GP + +GP G + + P
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSP 432
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/89 (28%), Positives = 44/89 (49%), Gaps = 6/89 (6%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G +GP + +GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGP---VGPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+ + P + +GP + +GP G ++
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVS 428
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/93 (27%), Positives = 45/93 (48%), Gaps = 6/93 (6%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G +GP ++ GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGP---VGPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ + P + +GP + +GP G + + P
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSP 432
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/93 (27%), Positives = 45/93 (48%), Gaps = 6/93 (6%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP +R +GP G + + P G + GP +R +GP G +GP + +GP G
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPV---GPVSPVRPIGPVGP---VGPVSPVSPIGPVGP 399
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ + P + +GP ++ GP G + + P
Sbjct: 400 VGPVSPVSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSP 432
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/88 (25%), Positives = 41/88 (46%)
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+GP +R +GP G + + P G + + P + GP G + + P G + +GP
Sbjct: 346 VGPVSPVRPVGPVGPVSPVSPIGPVGPVSPVRPIGPVGPVGPVSPVSPIGPVGPVGPVSP 405
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+ +GP G + + P G + + P +
Sbjct: 406 VSPIGPVGPVSPVSPMGPVGPVSPVSPI 433
>gi|365830131|ref|ZP_09371715.1| BclB domain-containing protein, partial [Coprobacillus sp.
3_3_56FAA]
gi|365263686|gb|EHM93510.1| BclB domain-containing protein, partial [Coprobacillus sp.
3_3_56FAA]
Length = 362
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 75/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ GP+G G G+ GP+G G +G
Sbjct: 15 TGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGP---TGATGE 71
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G + GP+G GP+G G G GP+G GP
Sbjct: 72 DGATGPTGATGEDGATGAIGPTGPTGSTGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGAT---GP 128
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 129 TGATGPTGATGEDGATGATGSTGPTGTNGANGDRGPTGPTGITGATGATGSTGPTGSTGA 188
Query: 193 LGLS 196
G S
Sbjct: 189 AGAS 192
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/167 (29%), Positives = 71/167 (42%), Gaps = 12/167 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ G G+ GP+G G G+ GP+G GP+G G G+
Sbjct: 1 GPTGAT---GEDGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGEDGAT 57
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G +G GP+G G +G + GP+G + GP+G G
Sbjct: 58 GATGPTGP---TGATGEDGATGPTGATGEDGATGAIGPTGPTGSTGATGPTGPTGATGED 114
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 115 GATGATGPTGA---TGPTGA---TGPTGATGEDGATGATGSTGPTGT 155
>gi|402555349|ref|YP_006596620.1| hypothetical protein BCK_12595 [Bacillus cereus FRI-35]
gi|401796559|gb|AFQ10418.1| hypothetical protein BCK_12595 [Bacillus cereus FRI-35]
Length = 498
Score = 68.6 bits (166), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/199 (27%), Positives = 80/199 (40%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
LGP+G GP+G+ GP+G+ G +G GP+G G +G G
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGI 95
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 126
+G G +GS GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 96 TGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTGVTGP 155
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 156 TGVTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGE 215
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G++ V+G
Sbjct: 216 TGPTGVTGITGATGVTGAT 234
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/181 (27%), Positives = 74/181 (40%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS GP+G+ G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 96 TGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTG---ETGPTGVTGITGATGPTGV 152
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 153 TGPTG---VTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGA 209
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G+
Sbjct: 210 TGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGPTGV 269
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 270 T 270
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 78/193 (40%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 153 TGPTG---VTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGA 209
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 210 TGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGE---TGP 266
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 267 TGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGATGA---TGPTGVTGI 323
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G + V+G
Sbjct: 324 TGATGATGVTGAT 336
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 76/190 (40%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +G GP+G + GP+G G +G GP+G
Sbjct: 135 TGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVTGATGPTGATGP 194
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 195 TGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGP 254
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 255 TGATGPTGE---TGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGA 311
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 312 TGATGPTGVT 321
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 75 TGPTGVTGITGATGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGE 134
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G + GP
Sbjct: 135 T---GPTGVTGITGATGPTGVTGPTG---VTGSTGATGITGPTGATGATGVTGVTGATGP 188
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 189 TGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGI 248
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 249 TGAT 252
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/196 (26%), Positives = 77/196 (39%), Gaps = 6/196 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 168 TGPTGATGATGVTGVTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGA 227
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 228 TGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGE---TGPTGVTGITGATGPTGVTGP 284
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 285 TGVTGSTGATGITGATGPTGATGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGVTGATGATGPTGA 344
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + +G+
Sbjct: 345 TGITGATGSTGATGVT 360
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/196 (26%), Positives = 77/196 (39%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
G +G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 102 TGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGS 161
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 162 TGATGITGPTGATGATGVTGVTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGV 221
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 222 TGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTGV 281
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G++ +G+
Sbjct: 282 TGPTGVTGSTGATGIT 297
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 78/193 (40%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 129 TGPTGET---GPTGVTGITGATGPTGVTGPTG---VTGSTGATGITGPTGATGATGVTGV 182
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + GP
Sbjct: 183 TGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGP 242
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 243 TGATGITGATGPTGATGPTGE---TGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGA 299
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G + V+G
Sbjct: 300 TGPTGATGVTGAT 312
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/196 (25%), Positives = 75/196 (38%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 57 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGA 116
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G +
Sbjct: 117 TGITGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGPTGATGA 176
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 177 TGVTGVTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGS 236
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + ++G
Sbjct: 237 TGATGPTGATGITGAT 252
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/177 (27%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 195 TGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTGVTGITGATGVTGATGSTGATGPTGATGITGATGP 254
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 255 TGATGPTG---ETGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGITGATGPTG---ATGV 308
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 309 TGATGATGPTGVTGITGATGATGVTGATGA---TGPTGATGITGATGSTGATGVTGT 362
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/135 (27%), Positives = 53/135 (39%), Gaps = 6/135 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 240 TGPTGATGITGATGPTGATGPTG---ETGPTGVTGITGATGPTGVTGPTGVTGSTGATGI 296
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 297 TGATGPTGATGVTGATGA---TGPTGVTGITGATGATGVTGATGATGPTGATGITGATGS 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRY 147
+G G S Y
Sbjct: 354 TGATGVTGTSITATY 368
>gi|218902666|ref|YP_002450500.1| group-specific protein [Bacillus cereus AH820]
gi|218536464|gb|ACK88862.1| group-specific protein [Bacillus cereus AH820]
Length = 512
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 67/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 67 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGAT 126
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G G G G +G + G
Sbjct: 127 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQ 186
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G G +G GP+G G G
Sbjct: 187 GPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPA 246
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 247 GAT 249
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 67/183 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 57 AGATGATGPQGPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGP 116
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G G G
Sbjct: 117 QGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGA 176
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 177 TGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGA 236
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 237 TGA 239
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP GP+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQ------GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G G +
Sbjct: 109 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAG---ATGAT 165
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP+G G G G +G GP+G G G G +
Sbjct: 166 GAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQ 225
Query: 203 GLH 205
G
Sbjct: 226 GAQ 228
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 85 GPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGAT 144
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP+G G G G +G GP+G G G +
Sbjct: 145 GATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGAT 204
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G G G G +G G G GP G GP+G
Sbjct: 205 GATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGAT 264
Query: 191 RYLGL 195
G
Sbjct: 265 GATGA 269
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 75 TGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGP 134
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G G G G +G G G + GP
Sbjct: 135 QGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGP 194
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G G G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 195 QG---IQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGAT 249
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 103 GPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAG-- 160
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G G G G +G GP+G G G G +
Sbjct: 161 -ATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGAT 219
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 220 GATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQ 279
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 280 GI 281
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G +G
Sbjct: 111 TGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAG---ATGATGA 167
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G G +G GP+G G G G +G + G
Sbjct: 168 QGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGA 227
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G GP+G G G GP G
Sbjct: 228 QGPAGATGATGAQGAQGPAG---ATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQG 280
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 121 GPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGAT---GATGAQGAQGPAGAT 177
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ G +G GP+G G G G +G G G + G +
Sbjct: 178 GATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGAT 237
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP+G G G GP G GP+G
Sbjct: 238 GAQGAQGPAGAT---GPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQG---IQGPAGATGAT 291
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 292 GA 293
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/195 (26%), Positives = 69/195 (35%), Gaps = 5/195 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G+ G +G G G GP G GP+G
Sbjct: 204 TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGA 263
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G G +G G G G +G GP+G + G
Sbjct: 264 TGATGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGA 323
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---- 188
G G +G G G GP G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 324 QGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGATGPAGTPIP 383
Query: 189 -RLRYLGLSDGLRVS 202
+ +G S+ +S
Sbjct: 384 VTIAAIGNSNAQTIS 398
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP G GP+G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 129 TGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGA 185
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G G G +G G G G +G + GP
Sbjct: 186 QGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGP 245
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G G +G GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 246 AGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGA 305
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 306 TGA 308
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/181 (27%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G+ G +G+ G G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 199 GPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAG---ATGPQGPQ 255
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP G G +G G G G +G + GP+
Sbjct: 256 GIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPA 315
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G +G G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 316 GATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGAT 375
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 376 G 376
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/204 (25%), Positives = 68/204 (33%), Gaps = 12/204 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP G GP+G+ G P+G G G+ G +G
Sbjct: 139 GPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQ 198
Query: 68 GPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G G P+G+ G G G +G G G GP G
Sbjct: 199 GPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQ 258
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G + G G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 259 GPAGATGATGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGAT 318
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G
Sbjct: 319 GATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQ 342
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 66/182 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G+ G +G GP+G G G+ G +G G G
Sbjct: 172 GPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPA 231
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G GP G G +G GP+G G G + G +
Sbjct: 232 GATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGAT 291
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G G G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 292 GAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQ 351
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 352 GI 353
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 162 TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGAT---GATGAQGAQGPAGA 218
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G G G GP G GP+G G G + GP
Sbjct: 219 TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGP 278
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G G G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 279 QG---IQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGA 335
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 336 TGA 338
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 60/176 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G G +G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 177 TGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGA 236
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G GP+G G G GP G G +G + G
Sbjct: 237 TGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGA 296
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G G G G +G G G GP G
Sbjct: 297 QGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQG 352
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G+ GP+G G G+ G +G G G
Sbjct: 187 GPAGATGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPA 246
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G G G GP G GP+G G G G +
Sbjct: 247 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPAGATGPQG---IQGPAGATGATGAQGAQGPAGAT 303
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G +G GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 304 GATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGIQGPAGATGAT 363
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 364 GA 365
>gi|260819447|ref|XP_002605048.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_85194 [Branchiostoma floridae]
gi|229290378|gb|EEN61058.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_85194 [Branchiostoma floridae]
Length = 331
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/129 (36%), Positives = 73/129 (56%), Gaps = 25/129 (19%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
S S L +G LRY P+G++ SG+L L +G+LRY+ P+G++ SG+L
Sbjct: 164 STSFHLLAWTGKLRYAPPAGQVN----SGTLHLLTWTGKLRYVPPAGQVN----SGTLHL 215
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
L +G+LRY P+G++ SG+LRY P+G++N SG L L +G+
Sbjct: 216 LTWTGKLRYAPPAGQVN-------------SGKLRYAPPAGQVN----SGTLHLLTWTGK 258
Query: 145 LRYLGPSGR 153
LRY+ P+G+
Sbjct: 259 LRYVPPAGQ 267
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/127 (37%), Positives = 74/127 (58%), Gaps = 21/127 (16%)
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
S S L +G+LRY P+G++ SG L L +G+LRY+ P+G++N SG L
Sbjct: 164 STSFHLLAWTGKLRYAPPAGQVN----SGTLHLLTWTGKLRYVPPAGQVN----SGTLHL 215
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR-----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
L +G+LRY P+G++ SG+LRY P+G+ L L +G+LRY+ P+G+
Sbjct: 216 LTWTGKLRYAPPAGQVN----SGKLRYAPPAGQVNSGTLHLLTWTGKLRYVPPAGQ---- 267
Query: 194 GLSDGLR 200
+DGL+
Sbjct: 268 PCTDGLK 274
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/93 (39%), Positives = 53/93 (56%), Gaps = 12/93 (12%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
SG L L +G LRY+ P+G + SG L L +G LRY P+G++ SG+LRY
Sbjct: 187 SGTLHLLTWTGKLRYVPPAGQVN----SGTLHLLTWTGKLRYAPPAGQVN----SGKLRY 238
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
P+G + SG L L +G+LRY+ P+G+
Sbjct: 239 APPAGQVN----SGTLHLLTWTGKLRYVPPAGQ 267
>gi|395521102|ref|XP_003764659.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Sarcophilus
harrisii]
Length = 1549
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/203 (37%), Positives = 107/203 (52%), Gaps = 54/203 (26%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
LR+ G +G LR+ GP+G LR+ GP+G+ LRY GP G P G LR+ GP G+
Sbjct: 838 LRFEGAAG-LRFEGPTGGLRFEGPAGQNVGGLRYEGPRGQ-----PVGGLRFEGPHGQ-- 889
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR 126
P G+LR+ P G+ P G LR+ G G +R+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 890 ---PVGALRFENPRGQ-----PVGGLRFEGSHGASGSGIRFEGPHGQPGGGIRFEGP--- 938
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP-----S 169
L G G +R+ GP G+ LR+ G G LR+ GP G+ +R+ GP S
Sbjct: 939 LLQQG--GGMRFEGPHGQSVAGLRFEGQHNQLGGSLRFEGPHGQPGVGVRFEGPLVQQGS 996
Query: 170 GRLRYLGPS---GRLRYLGPSGR 189
G +R+ GPS G +R+ GP G+
Sbjct: 997 G-MRFEGPSVQGGSMRFEGPLGQ 1018
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/226 (34%), Positives = 110/226 (48%), Gaps = 75/226 (33%)
Query: 37 LRYLGPSGR------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G +G LR+ GP+G
Sbjct: 796 MRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPQGPGGTPLRFEGPLGQAGGGGLRFEGAAG-LRFEGPTGG 854
Query: 73 LRYLGPSGS----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSG 116
LR+ GP+G LRY GP G+ LR+ GP G+ LR+ P G+ LR+ G G
Sbjct: 855 LRFEGPAGQNVGGLRYEGPRGQPVGGLRFEGPHGQPVGALRFENPRGQPVGGLRFEGSHG 914
Query: 117 R----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP----SGRLRYLGPSGR----LRYLGPS---- 160
+R+ GP G+ P G +R+ GP G +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 915 ASGSGIRFEGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGGGMRFEGPHGQSVAGLRFEGQHNQLG 969
Query: 161 GRLRYLGPSGR----LRYLGP-----SGRLRYLGPS---GRLRYLG 194
G LR+ GP G+ +R+ GP SG +R+ GPS G +R+ G
Sbjct: 970 GSLRFEGPHGQPGVGVRFEGPLVQQGSG-MRFEGPSVQGGSMRFEG 1014
>gi|376267602|ref|YP_005120314.1| flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus cereus
F837/76]
gi|364513402|gb|AEW56801.1| Flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus cereus
F837/76]
Length = 1063
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/191 (30%), Positives = 76/191 (39%), Gaps = 21/191 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ GP+G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 567 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAG 623
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 624 ATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 674
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
P G GP+G GP +G GP G G +G GP+G G
Sbjct: 675 PQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATG 731
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 732 PQGAQGPAGAT 742
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 71/175 (40%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 491 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 541
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP G G +G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 542 GATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPA 595
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 596 GATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 647
Score = 67.4 bits (163), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 73/183 (39%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 536 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 590
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 591 -AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 646
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 647 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNT 697
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 698 GAT 700
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 521 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQ 574
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 575 GVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQ 631
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 632 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 677
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 506 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGAT 556
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G + G +
Sbjct: 557 GATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGAT 613
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 614 GPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 662
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 593 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 647
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G +
Sbjct: 648 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 700
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 701 GATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGPA 754
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 755 GAT 757
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 15/176 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 559 TGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGP 615
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 616 QGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV---QGP 666
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 667 AGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG 719
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/189 (31%), Positives = 76/189 (40%), Gaps = 27/189 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 635 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 685
Query: 74 RYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP +G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 686 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 742
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 743 GATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 793
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 794 GAQGPAGAT 802
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 72/177 (40%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 609 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 662
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP G + G
Sbjct: 663 ---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTG 713
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 714 ATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 764
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/181 (32%), Positives = 75/181 (41%), Gaps = 27/181 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP +G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 680 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQ 736
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 737 GPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 787
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 788 GATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQ 838
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 839 G 839
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/189 (31%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 27/189 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 620 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 670
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP+G GP +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 671 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGAT 727
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 728 GATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 778
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 779 GAQGPAGAT 787
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/181 (32%), Positives = 74/181 (40%), Gaps = 27/181 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP G GP+G+ GP +G GP G+ G +G
Sbjct: 665 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQ 721
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 722 GPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 772
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 773 GATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 823
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 824 G 824
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/198 (30%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 27/198 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYL 67
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP +G
Sbjct: 650 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 703
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 704 GPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 757
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 758 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 808
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G + G+
Sbjct: 809 GAQGPAGATGATGPQGIQ 826
Score = 63.9 bits (154), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 551 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ 607
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 608 GNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 661
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 662 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNT 712
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 713 GAT 715
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 21/184 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 461 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 517
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP+G+ GP G GP+G GP +G GP G G +
Sbjct: 518 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT 571
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 572 GPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGAT 628
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 629 GPQG 632
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/186 (31%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 21/186 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 446 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQ 502
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 503 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNT 553
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 554 GATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQ 607
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 608 GNTGAT 613
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 73/177 (41%), Gaps = 24/177 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 695 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG-- 749
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 750 -AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPA 799
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 800 GATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 847
Score = 59.7 bits (143), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/169 (33%), Positives = 69/169 (40%), Gaps = 24/169 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 703 TGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGA 756
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 757 TGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGP 807
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 808 QG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 847
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/161 (33%), Positives = 69/161 (42%), Gaps = 24/161 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 711 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG 764
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G
Sbjct: 765 ---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQG 812
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
P+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 813 PAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 847
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 431 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 487
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 488 GVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV---QGPA 538
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 539 GATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGPA 595
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 596 GAT 598
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 382 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 441
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 442 QGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGA 498
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 499 TGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV 549
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 550 QGNTGAT 556
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 68/179 (37%), Gaps = 15/179 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 409 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGA 465
Query: 73 LRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 466 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV--- 519
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G GP+G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 520 QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG 575
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 12/181 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 359 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNT 418
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP---S 133
G +G+ G G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 419 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQ 475
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 476 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 529
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 530 G 530
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 18/183 (9%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 404 GNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQ 460
Query: 77 GPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 461 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 517
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 518 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNT 568
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 569 GAT 571
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 59/164 (35%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +G+ GP G G +G+ G G GP G G +G G +G
Sbjct: 179 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGAT 238
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G G +G G G GP G + GP+G GP G G +
Sbjct: 239 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGAT 295
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP+G GP G G +G G +G G+
Sbjct: 296 GPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGI 339
Score = 52.8 bits (125), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/164 (26%), Positives = 59/164 (35%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G +G GP G+ G +G G G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 179 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGAT 238
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP G G +G G G + GP G GP+G GP G G +
Sbjct: 239 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGAT 295
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G GP+G GP G G +G G + +G+
Sbjct: 296 GPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGI 339
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/198 (26%), Positives = 67/198 (33%), Gaps = 24/198 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLG 68
N G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G G
Sbjct: 264 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG 323
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
P G G +G+ G +G GP G GP+G
Sbjct: 324 PQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATG 380
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP G G +G G G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 381 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATG 440
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G
Sbjct: 441 PQGVQGPAGATGATGPQG 458
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/203 (25%), Positives = 70/203 (34%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 195 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 254
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G + G
Sbjct: 255 ---ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATG 311
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLR 173
P G G +G G +G G P G G +G
Sbjct: 312 PQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGNTGATGATGPQG 371
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G G +
Sbjct: 372 AQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 394
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/211 (28%), Positives = 76/211 (36%), Gaps = 54/211 (25%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 722 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 772
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 773 GATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 823
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------------RLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G G +G
Sbjct: 824 G---IQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQ 880
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 881 GIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATG 908
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/202 (25%), Positives = 70/202 (34%), Gaps = 21/202 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 238 TGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGP 297
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------P 114
GP+G+ GP G G +G G +G G P
Sbjct: 298 QGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGP 357
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G G +G + GP+G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 358 QGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGV 414
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP G G +
Sbjct: 415 QGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 436
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/217 (24%), Positives = 71/217 (32%), Gaps = 24/217 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N G +G G +G+ GP +G+ GP G G +G GP+G
Sbjct: 222 NTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATG 281
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG--- 122
GP G G +G GP+G GP G G +G G +G G
Sbjct: 282 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGV 341
Query: 123 ---------------PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
P G + G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 342 TGPTGPSGGPPGPTGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 401
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G GP G G +G G+ +G
Sbjct: 402 VQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGA 438
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/202 (25%), Positives = 67/202 (33%), Gaps = 24/202 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGSL 55
GP+G GP G+ G +G G +G G P G+
Sbjct: 302 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGNT 361
Query: 56 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G +G GP+G GP G G +G G G GP G G +
Sbjct: 362 GATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGAT 421
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRL 172
G G G + G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 422 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNT 478
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G
Sbjct: 479 GATGATGPQGVQGPAGATGATG 500
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 47/183 (25%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 767 GPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 817
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------------ 109
GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 818 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQ 871
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLG 167
G +G GP+G + GP G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 872 GNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTG 925
Query: 168 PSG 170
P+G
Sbjct: 926 PTG 928
>gi|150391175|ref|YP_001321224.1| triple helix repeat-containing collagen [Alkaliphilus
metalliredigens QYMF]
gi|149951037|gb|ABR49565.1| Collagen triple helix repeat [Alkaliphilus metalliredigens QYMF]
Length = 863
Score = 68.2 bits (165), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G G G +G GP+G G G
Sbjct: 520 TGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGED---GADGA 576
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G GP+G GP+G G +G GP+G DG
Sbjct: 577 TGATGPTGATGPTGADGATGATGPTGAT---GPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGA 633
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G G GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 634 TGATGPTGATGPTGDDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGE 693
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 694 DGAT 697
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 70/177 (39%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G + GP+G G G+ GP+G G G
Sbjct: 187 TGATGPTGATGPTGEDGATGATGPMGATGPTGDD---GEDGATGATGPTGATGPTGEDGE 243
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G DG
Sbjct: 244 DGVTGVTGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGDDGATGATGPTGATGPTGE---DGE 300
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 301 DGATGATGPTGA---TGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGE 354
Score = 66.6 bits (161), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 67/184 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G+ G +G G G+ GP+G G G
Sbjct: 535 TGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGADGATGATGPTGATGPTGADGA 594
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G GP+G G G G +G GP+G DG
Sbjct: 595 TGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGDDGEDGA 654
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G G GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 655 TGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGE 714
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 715 DGAT 718
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G G GP+G+ G G+ GP+G G G+ GP+G G
Sbjct: 551 GEDGATGATGPTGATGPTGEDGADGATGATGPTGATGPTGADGATGATGPTGATGPTGED 610
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G G G +G GP+G G +G G +G D
Sbjct: 611 GATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGDDGEDGATGATGPTGATGPTGED 670
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP+G G G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 671 GEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGPTG 728
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/209 (24%), Positives = 69/209 (33%), Gaps = 24/209 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G G GP+G+ G G GP+G G G+ GP+G G
Sbjct: 219 DDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGVTGVTGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTG 278
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G GP+G+ G G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 279 DDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDG 338
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
DG +G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 339 EDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTG 398
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G GP+G G +
Sbjct: 399 EDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGAT 427
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/202 (25%), Positives = 67/202 (33%), Gaps = 21/202 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------- 63
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G
Sbjct: 439 TGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGA 498
Query: 64 ---------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G G GP+G+ G G GP+G G G G
Sbjct: 499 TGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGA 558
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G GP+G +DG +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 559 TGPTGATGPTGEDGADGATGA---TGPTGATGPTGADGATGATGPTGATGPTGEDGATGA 615
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G G G +
Sbjct: 616 TGPTGATGPTGEDGEDGATGAT 637
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/204 (25%), Positives = 69/204 (33%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP+G+ G G+ GP+G G G+ GP+G G G
Sbjct: 242 GEDGVTGVTGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGDDGATGATGPTGATGPTGEDGED 301
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------- 126
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 302 GATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGAT 361
Query: 127 --------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
DG G GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 362 GATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGA---TGPTGE---DGEDGATGATGPTGAT 415
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +
Sbjct: 416 GPTGEDGATGATGPTGEDGEDGAT 439
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/165 (27%), Positives = 62/165 (37%), Gaps = 3/165 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G G+ GP+G GP+G G +G + GP+G G +G+ G +G
Sbjct: 182 GEDGATGATGPTGAT---GPTGEDGATGATGPMGATGPTGDDGEDGATGATGPTGATGPT 238
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G GP+G G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 239 GEDGEDGVTGVTGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGDDGATGATGPTGATGPTGED 298
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 299 GEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGAT 343
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/211 (25%), Positives = 72/211 (34%), Gaps = 30/211 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G G G +G GP+G G +G
Sbjct: 268 TGPTGATGPTGDDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGP 327
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRY 111
GP+G G +G GP+G G G
Sbjct: 328 TGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGA 387
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSD------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP+G GP+G D GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 388 TGPTGA---TGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGEDGEDGATGPTGA 444
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 445 TGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGAT 475
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/186 (26%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 24/186 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------- 63
GP+G G G+ GP+G+ G G GP+G+ G G
Sbjct: 307 TGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGA 366
Query: 64 ---------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G G GP+G+ GP+G G G GP+G G
Sbjct: 367 TGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGA---TGPTGE---DGEDGATGATGPTGATGPTGE 420
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP+G DG +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 421 DGATGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGA 480
Query: 175 LGPSGR 180
GP+G
Sbjct: 481 TGPTGE 486
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/206 (24%), Positives = 67/206 (32%), Gaps = 24/206 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G G GP+G+ G G+ GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 259 TGEDGATGATGPTGATGPTGDDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGE 318
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------------LRY 111
G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 319 DGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGE 378
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G GP+G DG G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 379 DGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGEDGEDGA 438
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G G
Sbjct: 439 TGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATG 464
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/204 (25%), Positives = 69/204 (33%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP+G+ GP+G G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 380 GEDGATGATGPTGAT---GPTG---EDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGED 433
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------- 126
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 434 GEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGAT 493
Query: 127 --------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
DG G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 494 GATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGED 553
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 554 GATGATGPTGATGPTGEDGADGAT 577
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/174 (27%), Positives = 62/174 (35%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G+ GP+G+ G G GP+G+ G G G +G GP+G
Sbjct: 512 GEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTG-- 569
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP+G G G GP+G G G + GP+G G
Sbjct: 570 -EDGADGATGATGPTGATGPTGADGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGED 628
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G GP+G G G GP+G G G G +
Sbjct: 629 GEDGATGATGPTGATGPTGD---DGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGAT 679
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/211 (24%), Positives = 71/211 (33%), Gaps = 30/211 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 250 TGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGDDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGP 309
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------ 120
GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 310 TGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGP 369
Query: 121 ---------------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G + GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 370 TGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGE---DGEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGA 426
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 427 TGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGAT 457
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/199 (25%), Positives = 68/199 (34%), Gaps = 24/199 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 409 TGPTGATGPTGEDGATGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGE 468
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +G GP+G G G GP+G
Sbjct: 469 DGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGAT-- 526
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G G +G + GP+G G +G G +G G G GP+G
Sbjct: 527 -GPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGEDGADGATGATGPTGA 585
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G GP+G
Sbjct: 586 TGPTGADGATGATGPTGAT 604
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/202 (24%), Positives = 65/202 (32%), Gaps = 21/202 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGS 54
GP+G G G GP+G+ G G G G+
Sbjct: 457 TGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGEDGEDGA 516
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+G G G GP+G+ G G G +G GP+G G
Sbjct: 517 TGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGPTGE---DGA 573
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 574 DGATGATGPTGATGPTGADGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGA 633
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 634 TGATGPTGATGPTGDDGEDGAT 655
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/204 (25%), Positives = 70/204 (34%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP+G+ G G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 401 GEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPT 460
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYL 112
GP+G G +G GP+G G G
Sbjct: 461 GATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGAT 520
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G GP+G + G +G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 521 GPTGAT---GPTGEDGATGATGPTGATGPTGE---DGEDGATGATGPTGATGPTGEDGAD 574
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 575 GATGATGPTGATGPTGADGATGAT 598
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/199 (25%), Positives = 69/199 (34%), Gaps = 27/199 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 394 TGPTGED---GEDGATGATGPTGATGPTGEDGATGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGE 450
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------------LRY 111
G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 451 DGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGATGPTGATGPTGE 510
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G GP+G + GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 511 DGEDGATGATGPTG---ATGPTGEDGATGATGPTGATGPTGEDGEDGATGATGPTGATGP 567
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G GP+G
Sbjct: 568 TGEDGADGATGATGPTGAT 586
>gi|373122607|ref|ZP_09536469.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium 21_3]
gi|371663038|gb|EHO28230.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium 21_3]
Length = 575
Score = 67.8 bits (164), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/205 (26%), Positives = 78/205 (38%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G SG G +G+ GP+G + G +G GP+G GP+G
Sbjct: 156 IGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG---VSGPTGNTGATGPTGA 212
Query: 73 LRYLGPSG---------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP+G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 213 TGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGN 272
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G G +G +DG +G G +G G +G +G +G GP+G
Sbjct: 273 TGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGA 332
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP+G GL+
Sbjct: 333 TGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT 357
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 79/213 (37%), Gaps = 30/213 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------------------SLRYLGPSGRLRYLGPS 52
GP+G GP+G+ GP+G G +G +GP+
Sbjct: 199 GPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPT 258
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
GS GP+G G G GP+G+ G G GP+G G +G
Sbjct: 259 GSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGA---AGPTGPTGATGNTGLTGAT 312
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G + G G GP+G GP G GP+G G +G G +G
Sbjct: 313 GPTGAMGNTGADGAT---GPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGNT 369
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G G +G +G++ +GL
Sbjct: 370 GADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLA 402
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 246 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 302
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G + G G GP+G GP G GP+G S G
Sbjct: 303 TGNTGLTGAT---GPTGAMGNTGADGA---TGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGL 356
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S + Y
Sbjct: 357 TGA---TGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSSAIIPY 410
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ +GP+GS GP+G G G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 246 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 302
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP+G + G G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 303 T---GNTGLTGATGPTGAMGNTGADGAT---GPTGATGNTGPDGAA---GPTGPTGATGS 353
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S
Sbjct: 354 TGLTGATGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSS 405
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 30/184 (16%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+GS G +G +GP+G+ G SG G +G GP+G + G +G
Sbjct: 138 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG- 196
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------RLNSDGP 132
GP+G GP+G GP+G P+G S G
Sbjct: 197 --VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTG------PTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGS 248
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G +GP+G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 249 TGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGN 305
Query: 193 LGLS 196
GL+
Sbjct: 306 TGLT 309
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 86/222 (38%), Gaps = 46/222 (20%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL-----------RYLGP 60
N GP+G GP+GS +G+ G +G + +G++ P
Sbjct: 71 NTGPAGLRGNTGPTGS------TGATGNTGATGMTPVITVAGTITGDPGTQASVTETFTP 124
Query: 61 SGR-LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
SG L + P+G GP+GS G +G +GP+G G SG G +G
Sbjct: 125 SGASLLFTIPAGPT---GPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANG 181
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------ 161
GP+G + + G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 182 VTGPTGPMGNTGANG---VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIG 238
Query: 162 ---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G +G +GP+G GP+G G +DG+
Sbjct: 239 PIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTG-ADGVT 279
>gi|423426649|ref|ZP_17403680.1| hypothetical protein IE5_04338, partial [Bacillus cereus BAG3X2-2]
gi|401110393|gb|EJQ18300.1| hypothetical protein IE5_04338, partial [Bacillus cereus BAG3X2-2]
Length = 423
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 80/203 (39%), Gaps = 33/203 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+GS GP+G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 141 TGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGATGSTGSTGPTG- 196
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS GP+G G +G G +G G +G GP+G S GP
Sbjct: 197 --ATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTGSTGP 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G GP+G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 255 TG---ATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGS 311
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G
Sbjct: 312 ---TGPTGATGSTGPTGATGPTG 331
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/207 (27%), Positives = 77/207 (37%), Gaps = 33/207 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+GS GP+GS G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 158 STGPTGSTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGATGSTGSTGPTG---ATGPTGSTGATGPTG 211
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG--------- 122
G +G G +G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 212 ATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTG 271
Query: 123 ---------------PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+G S GP G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 272 STGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGSTGPTGATGSTGPTG---ATG 328
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G G +G GP+G G
Sbjct: 329 PTGSTGATGSTGSTGATGPTGATGPTG 355
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/210 (27%), Positives = 80/210 (38%), Gaps = 39/210 (18%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +GS GP+G GP+G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 173 STGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTG---ATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTG 229
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------------RYLG 104
G +GS GP+G GP+G G
Sbjct: 230 VTGPTGSTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATG 289
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P+G +G +G GP+G S GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 290 PTGSTGPIGATGPTGATGPTG---STGPTGATGSTGPTG---ATGPTGSTGATGSTGSTG 343
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 344 ATGPTG---ATGPTGSTGPTGATGSTGSTG 370
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 76/195 (38%), Gaps = 33/195 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ G +G G +G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 198 TGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTGSTGPTG- 256
Query: 73 LRYLGPSGS---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP+G+ GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 257 --ATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGS--- 311
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 312 TGPTGATGSTGPTGAT---GPTGSTGATGSTGSTGATGPTG---ATGPTGSTGPTGATGS 365
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP
Sbjct: 366 TGSTGPTGPTGATGP 380
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/197 (27%), Positives = 76/197 (38%), Gaps = 33/197 (16%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G GP+GS G +G GP+GS GP+G GP+G G +G
Sbjct: 134 ATGPTG---ATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGATG 187
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP+G GP+G GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 188 STGSTGPTG---ATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATG 244
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P+G GP+G GP+G GP+G +G +G
Sbjct: 245 PTGSTGSTGPTG---ATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATG 301
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 302 PTGATGPTGSTGPTGAT 318
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/187 (27%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 30/187 (16%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------------------YLGPSGRLRYLG 68
GP+GS G +G GP+G+ GP+G G
Sbjct: 86 STGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGPTGSTGPTGATGPTGATGPTG 145
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+GS GP+G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 146 STGPTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGPTGS---TGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGAT- 198
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G G +G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 199 --GPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTGSTGPTG 256
Query: 189 RLRYLGL 195
G
Sbjct: 257 ATGPTGA 263
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 33/183 (18%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---------------------YLGPSG 71
P+GS G +G GP+GS GP+G GP+G
Sbjct: 83 PTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGST---GPTGATGSTGSTGPTGPTGPTGSTGPTGATGPTG 139
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G GP+G GP+G GP+G G +G S G
Sbjct: 140 ---ATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGS---TGPTGSTGSTGATGSTGSTG 193
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 194 PTG---ATGPTGSTGATGPTGATGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGATGPTGSTG 250
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 251 STG 253
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/225 (24%), Positives = 76/225 (33%), Gaps = 57/225 (25%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------------------LGPS 52
G + LGP+G G +G+ GP+G GP+
Sbjct: 31 GTVPKLGPTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGATGATGSTGATGPTGSTGPT 90
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------------YLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GS G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 91 GSTGPTGSTGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGPTGSTGPTGATGPTG---ATGPTGST 147
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G GP+G GP+G GP+G S G +G GP+G GP+
Sbjct: 148 GPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGS---TGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTG---ATGPT 201
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G G G +G GP+G G +
Sbjct: 202 GSTGATGPTGATGST---GSTGPTGATGSTGVTGPTGSTGSTGAT 243
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/76 (32%), Positives = 34/76 (44%), Gaps = 6/76 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G GP+GS G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 311 STGPTGATGSTGPTG---ATGPTGSTGATGSTGSTGATGPTG---ATGPTGSTGPTGATG 364
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGP 87
GP+G GP
Sbjct: 365 STGSTGPTGPTGATGP 380
>gi|402560999|ref|YP_006603723.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis HD-771]
gi|401789651|gb|AFQ15690.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis HD-771]
Length = 698
Score = 67.4 bits (163), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 74/176 (42%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G +GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 203 GPTGEFGPTGPTGITGLIGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPE 262
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G + +G +G GP G +GP+G G
Sbjct: 263 GEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGTIGPIGLTGSEGEQGPQGMTGPIGPTGPEGVQGAQ 322
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +GP+G GP G GP+G G G G G +GP+G+
Sbjct: 323 GITGPIGPTGSEGEQGPQGMTGPTGPTGPEGEQGSQGMTGEQGKVGMTGSIGPAGK 378
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/193 (29%), Positives = 82/193 (42%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 220 IGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGP 279
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G++ +G +G GP G +GP+G G G +GP+G GP
Sbjct: 280 EGEQGPQGTIGPIGLTGSEGEQGPQGMTGPIGPTGPEGVQGAQGITGPIGPTGSEGEQGP 339
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G G G G G +GP+G+ P R+ ++ S +
Sbjct: 340 QGMTGPTGPTGPEGEQGSQGMTGEQGKVGMTGSIGPAGKSGIELPINRIYFMNNSALID- 398
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
++DG+ S ++
Sbjct: 399 --VADGVTNSIIN 409
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/170 (32%), Positives = 73/170 (42%), Gaps = 2/170 (1%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+ +GP+G G G L GP+G GP+G +GP+G GP G GP
Sbjct: 183 STTVGPTGPTGDNG--GPLGPTGPTGEFGPTGPTGITGLIGPTGPEGEQGPQGITGPTGP 240
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP G GP+G GP G GP+G GP G + +G +G
Sbjct: 241 TGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGTIGPIGLTGSEGE 300
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G +GP+G G G +GP+G GP G GP+G
Sbjct: 301 QGPQGMTGPIGPTGPEGVQGAQGITGPIGPTGSEGEQGPQGMTGPTGPTG 350
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/189 (30%), Positives = 78/189 (41%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 212 GPTGITGLIGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGIT 271
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G GP G + +G +G GP G +GP+G G G GP+
Sbjct: 272 GPTGPTGPEGEQGPQGTIGPIGLTGSEGEQGPQGMTGPIGPTGPEGVQGAQGITGPIGPT 331
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP+G G G G G +GP+G+ P R+ ++
Sbjct: 332 GSEGEQGPQGMTGPTGPTGPEGEQGSQGMTGEQGKVGMTGSIGPAGKSGIELPINRIYFM 391
Query: 194 GLSDGLRVS 202
S + V+
Sbjct: 392 NNSALIDVA 400
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 74/180 (41%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L GP+G GP+G +GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 197 GPLGPTGPTGEFGPTGPTGITGLIGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPT 256
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G GP G GP+G GP G + +G +G GP G GP+G
Sbjct: 257 GPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGTIGPIGLTGSEGEQGPQGMTGPIGPTGPE 316
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +GP+G GP G GP+ GP G G +G +G++
Sbjct: 317 GVQGAQGITGPIGPTGSEGEQGPQGMTGPTGPT------GPEGEQGSQGMTGEQGKVGMT 370
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/186 (32%), Positives = 81/186 (43%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP G +G +G GP G +GP G GP G G SG
Sbjct: 113 IGSTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQGPQGITGPIGPIGPEGAQGPQGITGPSGSSGP 172
Query: 73 LRYLGPSGSL--RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+ LG +G++ +GP+G G G L GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 173 IS-LGVTGAIGSTTVGPTGPTGDNG--GPLGPTGPTGEFGPTGPTGITGLIGPTGPEGEQ 229
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 230 GPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGITGPTGPTGPEGEQGPQGTI 289
Query: 191 RYLGLS 196
+GL+
Sbjct: 290 GPIGLT 295
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 79/184 (42%), Gaps = 13/184 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G GP G+ G +G + GP G+ G +G + GP G
Sbjct: 45 GPEGAQGSQGITGPTGPTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQ 104
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +GS+ GP G G +G + GP G GP G +GP G + GP
Sbjct: 105 GPQGITGSIGSTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQ---GPQGITGPIGPIGPEGAQGPQ 161
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPS-------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G G SG + LG +G + +GP+ G L GP+G GP+G +
Sbjct: 162 GITGPSGSSGPIS-LGVTGAIGSTTVGPTGPTGDNGGPLGPTGPTGEFGPTGPTGITGLI 220
Query: 185 GPSG 188
GP+G
Sbjct: 221 GPTG 224
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 74/188 (39%), Gaps = 14/188 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G +GS GP+G G G GP+G GP G +G +G GP G
Sbjct: 32 VGETGSTGITGPTGPEGAQGSQGITGPTGPTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQGPQGI 91
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+G +G GP G +G +G GP G +G +G + GP G +GP
Sbjct: 92 TGPIGSTGPEGAQGPQGITGSIGSTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQGPQGITGPIGP 151
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------RYLGPSGRLRY----LGPSGRLRYLGPS 187
G GP G G SG + +GP+G LGP+G GP+
Sbjct: 152 IGPEGAQGPQGITGPSGSSGPISLGVTGAIGSTTVGPTGPTGDNGGPLGPTGPTGEFGPT 211
Query: 188 GRLRYLGL 195
G GL
Sbjct: 212 GPTGITGL 219
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/146 (30%), Positives = 60/146 (41%), Gaps = 4/146 (2%)
Query: 36 SLRY-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
S ++ +G +G GP+G G G GP+G GP G +G +G
Sbjct: 27 SFKFPVGETGSTGITGPTGPEGAQGSQGITGPTGPTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQ 86
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G +G +G GP G +G +G + GP G +G +G GP G
Sbjct: 87 GPQGITGPIGSTGPEGAQGPQGITGSIGSTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQGPQGIT 146
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+GP G GP G GPSG
Sbjct: 147 GPIGPIGPEGAQGPQG---ITGPSGS 169
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/144 (29%), Positives = 61/144 (42%), Gaps = 7/144 (4%)
Query: 54 SLRY-LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
S ++ +G +G GP+G G GS GP+G GP G G +G +
Sbjct: 27 SFKFPVGETGSTGITGPTGPE---GAQGSQGITGPTGP---TGPEGAQGPQGITGPIGST 80
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G G +G + S GP G G +G + GP G G +G + GP G
Sbjct: 81 GPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQGPQGITGSIGSTGPEGAQGPQGITGPIGSTGPEGAQ 140
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G + +GP G G++
Sbjct: 141 GPQGITGPIGPIGPEGAQGPQGIT 164
>gi|196044087|ref|ZP_03111324.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB108]
gi|196025423|gb|EDX64093.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB108]
Length = 748
Score = 67.4 bits (163), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 70/183 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS G +G+ G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 282 NTGPTGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTG 341
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 342 ATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTG 401
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 402 PTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETG 461
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 462 ATG 464
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 400 TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGE 459
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 460 TGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 519
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 520 TGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGS 579
Query: 190 L 190
Sbjct: 580 T 580
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G G G +G G +G G +G
Sbjct: 385 TGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGP 444
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 445 TGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGV 504
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 505 TGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGA 564
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 565 TGNTG 569
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP+GS G +GS G P+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 256 TGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGS 315
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 316 TGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGS 375
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 376 TGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGS 435
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 436 TGVT 439
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 274 TGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGE 333
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 334 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGS 393
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 394 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 453
Query: 190 L 190
Sbjct: 454 T 454
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 334 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGST---GVTGNTGLTGSTGV 390
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 391 TGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGP 450
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 451 TGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGA 510
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 511 TG 512
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 394 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 453
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 454 TGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGN 513
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 514 TGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETG 572
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 73/190 (38%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 316 TGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGS 375
Query: 73 LRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 376 TGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGS 435
Query: 130 DGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 436 TGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGS 495
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 496 TGATGSTGVT 505
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/164 (26%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +GS G +GS GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 417 NTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTG 476
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 477 NTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTG 536
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 537 STGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGST 580
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 381 NTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTG 440
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 441 S---TGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTG 497
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G +
Sbjct: 498 ATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIG 557
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 558 ATG 560
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/206 (24%), Positives = 72/206 (34%), Gaps = 24/206 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 69
+GP+G G +GS G +GS G +G GP+G G P+G G
Sbjct: 115 MGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS 174
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 126
+G G +GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 175 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGP 234
Query: 127 ------------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
S G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 235 TGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGA 294
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G G
Sbjct: 295 TGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGVTG 320
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/215 (24%), Positives = 75/215 (34%), Gaps = 24/215 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS G +GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 106 TGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 165
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS G +G GP+G G P+G G +G GP+G
Sbjct: 166 TGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGE 225
Query: 130 DGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 226 TGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGP 285
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G +G G + V+G
Sbjct: 286 TGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGVTG 320
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/186 (25%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 345 NTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTG 404
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 405 ETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATG 464
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 465 STGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTG 524
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 525 NTGATG 530
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/199 (24%), Positives = 68/199 (34%), Gaps = 24/199 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 175 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS---TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGN 231
Query: 73 ---------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 232 TGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGE 291
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 292 TGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGE 351
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G
Sbjct: 352 TGATGSTGVTGSTGPTGET 370
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/212 (23%), Positives = 71/212 (33%), Gaps = 30/212 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------------------------- 45
GP+G G +G GP+GS G +G
Sbjct: 199 TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGA 258
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
GP+GS G +G GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 259 TGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGV 318
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G G +G + G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 319 TGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGV 378
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G
Sbjct: 379 TGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTG 410
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/212 (24%), Positives = 74/212 (34%), Gaps = 21/212 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 69
GP+G G +G G +GS G +G GP+G G P+G G
Sbjct: 151 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS 210
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G GP+GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 211 TGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGE 270
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 271 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGSTGATGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGA 330
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 331 TGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTG 362
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/206 (23%), Positives = 71/206 (34%), Gaps = 24/206 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ +GP+GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 97 TGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 156
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 157 TGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 216
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 217 TGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGS 276
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G G
Sbjct: 277 TGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTG 302
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/203 (26%), Positives = 76/203 (37%), Gaps = 27/203 (13%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG------------------RLRYLGPSGSLR 56
P+G G +G+ GP+GS G +G GP+GS
Sbjct: 33 PTGMTGITGSTGATGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGGTGNTGSTGETGPTGST- 91
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G G +G G +GS+ GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 92 --GPTGETGATGSTGATGNTGATGSM---GPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETG 146
Query: 117 RLRYLGPSGRLN---SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
GP+G S GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 147 VTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETG 206
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 207 VTGSTGPTGETGPTGSTGETGAT 229
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/150 (28%), Positives = 60/150 (40%), Gaps = 9/150 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS+ GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 91 TGPTGETGATGSTGATGNTGATGSM---GPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGV 147
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G G +G GP+G G S GP
Sbjct: 148 TGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTG------STGP 201
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 202 TGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGN 231
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 64/158 (40%), Gaps = 12/158 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+GS GP+G G +G G +GS +GP+G G +G G +GS
Sbjct: 86 GPTGS---TGPTGETGATGSTGATGNTGATGS---MGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGST 139
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G G
Sbjct: 140 GPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTG-- 197
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 198 ----STGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGN 231
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 65/157 (41%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P+GS GP+G G +GS G +G +GP+G G +GS G +G
Sbjct: 87 PTGST---GPTGET---GATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGST- 139
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G +G G +G G +G S GP+G G +G G +G
Sbjct: 140 --GPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTG 197
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 198 S---TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGN 231
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/214 (22%), Positives = 71/214 (33%), Gaps = 24/214 (11%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 121 TGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE 180
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 117
G +G G +GS GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 181 TGVTGSTGPTGETGVTGS---TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGE 237
Query: 118 ---------------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 238 TGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 297
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G G +
Sbjct: 298 TGVTGSTGATGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGAT 331
>gi|225388008|ref|ZP_03757732.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_01742 [Clostridium asparagiforme
DSM 15981]
gi|225045930|gb|EEG56176.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_01742 [Clostridium asparagiforme
DSM 15981]
Length = 373
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 77/180 (42%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
++GP G +GP G + +GP G +GP G +GP+G +G +G G
Sbjct: 4 DVGPKGDPGDIGPQGVRGNPGPVGPQGDQGPMGPKGDPGPVGPAGPQGEIGDTGERGPAG 63
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G + G G GP G GP G G +G G +G GP+G
Sbjct: 64 EQGPMGEQGIQGETGPQGPRGEKGCAGPQGE---QGATGTQGVTGAAGAQGITGPTGAQG 120
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G +GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 121 ITGPTGAQGIMGPTGEQGVAGPTGAQGITGPTGAQGITGPTGAQGMTGPTGAQGATGPTG 180
>gi|421732567|ref|ZP_16171686.1| triple helix repeat-containing collagen, partial [Bacillus
amyloliquefaciens subsp. plantarum M27]
gi|407073579|gb|EKE46573.1| triple helix repeat-containing collagen, partial [Bacillus
amyloliquefaciens subsp. plantarum M27]
Length = 951
Score = 67.0 bits (162), Expect = 4e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/185 (25%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G+ GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 223 STGATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTGPTGATGSTGETGATGSTGATGPTG 282
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G SG G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 283 VTGATGETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGVTGVTGATGSTGSTGVTGSTGSTG 342
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G +G G +G G +G G +G G +G G +G +
Sbjct: 343 ------VTGATGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVTGATGPTGSTGSTGVTGATGSTGSIG 396
Query: 192 YLGLS 196
GL+
Sbjct: 397 ETGLT 401
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 209 TGATGVTGEIGPTGSTGATGETGSTGSTGATG---VTGPTGATGSTGATGVTGPTGATGS 265
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G SG G G +G S G
Sbjct: 266 TGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGATGATG------ITGETGATGSTGV 319
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGR 189
+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 320 TGVTGATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVTGATGPTGS 379
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 380 TGSTGVT 386
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/200 (25%), Positives = 74/200 (37%), Gaps = 9/200 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +GS GP+G G +G G SG+ G +G G +G
Sbjct: 260 TGATGSTGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGV 319
Query: 73 LRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G S
Sbjct: 320 TGVTGATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVTGATGPTGS 379
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRY 183
G +G G +G + G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 380 TGSTGVTGATGSTGSIGETGLTGVTGSTGITGVTGSTGPTGETGATGVTGPTGVTGSTGE 439
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G++ V+G
Sbjct: 440 TGPTGATGATGVTGATGVTG 459
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/197 (24%), Positives = 74/197 (37%), Gaps = 3/197 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +GS GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 754 STGETGATGVTGSTGITGATGSTGSTGETGPTGVTGSTGVTGATGEAGPTGVTGETGATG 813
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
G +G G +G G +G G +G G +G G +G S
Sbjct: 814 STGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGATGATGVTGSTG 873
Query: 130 -DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 874 ETGPTGVTGLTGATGVTGPTGPTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATG 933
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G++ V+G
Sbjct: 934 VTGATGVTGATGVTGAT 950
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/167 (24%), Positives = 64/167 (38%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G +GP+GS G +G G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 208 ATGATGVTGEIGPTGST---GATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTGPTGATG 264
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G GP+G G +G + G SG G +G G +G G
Sbjct: 265 STGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGVTGVTG 324
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G +G G +G G +G G++ +G+
Sbjct: 325 ATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVT 371
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/167 (25%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G +GP+G G +GS G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 208 ATGATGVTGEIGPTGSTGATGETGSTGSTGATG---VTGPTGATGSTGATGVTGPTGATG 264
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G GP+G G +G G SG + G +G G +G G
Sbjct: 265 STGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGVTGVTG 324
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G +G G +G G +G G++
Sbjct: 325 ATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATGSTGVTGSTGSTGVTGATGATGVT 371
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/230 (22%), Positives = 80/230 (34%), Gaps = 39/230 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR--- 65
+ G +G GP+G + G +G+ G +G + GP+GS GP+G
Sbjct: 82 STGDTGATGVTGPTGITGATGATGVTGATGSTGATGAIGSTGPTGSTGATGPTGVTGLTG 141
Query: 66 ---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------ 98
G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 142 VTGSTGATGVTGVTGSTGATGLTGETGATGSTGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTG 201
Query: 99 ---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
G +G +GP+G G +G S G +G GP+G G +G
Sbjct: 202 ATGETGATGATGVTGEIGPTGS---TGATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTG 258
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G G +G GP+G G +G G S +G+
Sbjct: 259 PTGATGSTGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGATGATGIT 308
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/193 (24%), Positives = 72/193 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 746 TGATGVTGSTGETGATGVTGSTGITGATGSTGSTGETGPTGVTGSTGVTGATGEAGPTGV 805
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 806 TGETGATGSTGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGSTGATGVTGSTGATGVTGATGITGATGA 865
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 866 TGVTGSTGETGPTGVTGLTGATGVTGPTGPTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGA 925
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G++ V+G
Sbjct: 926 TGVTGATGVTGAT 938
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/197 (24%), Positives = 74/197 (37%), Gaps = 3/197 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +G+ G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 736 STGDTGATGVTGATGVTGSTGETGATGVTGSTGITGATGSTGSTGETGPTGVTGSTGVTG 795
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 796 ATGEAGPTGVTGETGATGSTGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGSTGATGVTGSTGATGVTG 855
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 856 ATGITGATGATGVTGSTGETGPTGVTGLTGATGVTGPTGPTGVTGATGVTGATGVTGATG 915
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G++ V+G
Sbjct: 916 VTGATGVTGATGVTGAT 932
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/187 (25%), Positives = 69/187 (36%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS G +G GP+G G +G G SG
Sbjct: 242 TGPTGATGSTGATGVTGPTGATGSTGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGA 301
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G G +G G +G G +G S G
Sbjct: 302 TGATGITGETGATGSTGVTGVTGATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATGSTGVTGSTGSTGV 361
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 362 TGATGATGVTGATGPTGSTGSTGVTGATGSTGSIGETGLTGVTGSTGITGVTGSTGPTGE 421
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 422 TGATGVT 428
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/227 (22%), Positives = 75/227 (33%), Gaps = 45/227 (19%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
+ G +G + GP+GS GP+G G +G G +G+
Sbjct: 112 STGATGAIGSTGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGSTGATGVTGVTGSTGATGLTGETGATG 171
Query: 57 YLGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G G +G +GP+GS G +G
Sbjct: 172 STGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTGATGETGATGATGVTGEIGPTGST---GATG 228
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 229 ETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTGPTGATGSTGETGATGSTGATGPTGVTGATG 288
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G SG G +G G +G G +G G++
Sbjct: 289 ETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGVTGVTGATGSTGSTGVT 335
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/181 (24%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G G +G+ G +G+ G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 289 ETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGVTGVTGATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATG 348
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G G +G G +G G +G + G +G S G
Sbjct: 349 STGVTGSTGSTGVTGATGATGVTGATGPTGSTGSTGVTGATGSTGSIGETGLTGVTGSTG 408
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G GP+G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 409 ITGVTGSTGPTGETGATGVTGPTGVTGSTGETGPTGATGATGVTGATGVTGSTGITGSTG 468
Query: 186 P 186
P
Sbjct: 469 P 469
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/191 (25%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
GP+GS G +G+ G +G G +G+ G +G G +G G
Sbjct: 727 ATGETGPTGS---TGDTGATGVTGATGVTGSTGETGATGVTGSTGITGATGSTGSTGETG 783
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P+G G +G GP+G G +G G +G G +G S G +G
Sbjct: 784 PTGVTGSTGVTGATGEAGPTGVTGETGATGSTGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGSTGATG 843
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 844 VTGSTGATGVTGATGITGATGATGVTGSTGETGPTGVTGLTGATGVTGPTGPTGVTGATG 903
Query: 195 LSDGLRVSGLH 205
++ V+G
Sbjct: 904 VTGATGVTGAT 914
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/152 (24%), Positives = 57/152 (37%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G +G +GP+G G +G G +G+ GP+G G +G G
Sbjct: 205 ETGATGATGVTGEIGPTGST---GATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATGVTGPTG 261
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
+G G +G GP+G + G +G G SG G +G G +G
Sbjct: 262 ATGSTGETGATGSTGATGPTGVTGATGETGSTGATGASGATGATGITGETGATGSTGVTG 321
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G G++
Sbjct: 322 VTGATGSTGSTGVTGSTGSTGVTGATGSTGVT 353
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/194 (24%), Positives = 73/194 (37%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G G +GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 730 ETGPTGSTGDTGATGVTGATGVTGSTGETGATGVTGSTGITGATGSTGSTGET---GPTG 786
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 787 VTGSTGVTGATGEAGPTGVTGETGATGSTGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGSTGATGVTG 846
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 847 STGATGVTGATGITGATGATGVTGSTGETGPTGVTGLTGATGVTGPTGPTGVTGATGVTG 906
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G++ V+G
Sbjct: 907 ATGVTGATGVTGAT 920
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/206 (23%), Positives = 73/206 (35%), Gaps = 36/206 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP G+ G +G + G +G GP+G + G +G G
Sbjct: 56 TGATGVTGETGPIGATGSTGATGEIGSTGDTGATGVTGPTGITGATGATGVTGATGSTGA 115
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G + GP+GS GP+G G +G G +G G +G G +G S
Sbjct: 116 TGAIGSTGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGS---TGATGVTGVTGSTGATGLTGETGATGS 172
Query: 130 DGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G +GP+G G +G
Sbjct: 173 TGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTGATGETGATGATGVTGEIGPTGS---TGATGE 229
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G G +G
Sbjct: 230 TGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGATG 255
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/220 (23%), Positives = 77/220 (35%), Gaps = 45/220 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ G P G+ G +G + G +G+ GP+G G
Sbjct: 44 TGETGATGVTGPTGATGVTGETGPIGATGSTGATGEIGSTGDTGATGVTGPTG---ITGA 100
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G + GP+G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 101 TGATGVTGATGST---GATGAIGSTGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGSTGATGVTGVTGS 157
Query: 130 DGP------SGRLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRY 156
G +G GP+G G +G
Sbjct: 158 TGATGLTGETGATGSTGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTGATGETGATGATGVTGE 217
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 218 IGPTGS---TGATGETGSTGSTGATGVTGPTGATGSTGAT 254
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/200 (22%), Positives = 69/200 (34%), Gaps = 36/200 (18%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLR 83
G +G+ GP+G GP G+ G +G + G +G GP +G+
Sbjct: 43 ATGETGATGVTGPTGATGVTGETGPIGATGSTGATGEIGSTGDTGATGVTGPTGITGATG 102
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G G +G + GP+G GP+G G +G S G +G G +G
Sbjct: 103 ATGVTGATGSTGATGAIGSTGPTGSTGATGPTG---VTGLTGVTGSTGATGVTGVTGSTG 159
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G GP+G G +G +G
Sbjct: 160 ATGLTGETGATGSTGPTGATGPTGLTGSTGATGTTGSTGVTGATGETGATGATGVTGEIG 219
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G +G G +
Sbjct: 220 PTGSTGATGETGSTGSTGAT 239
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/181 (23%), Positives = 63/181 (34%), Gaps = 33/181 (18%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGS------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 2 TGPTGSTGATGPTGATGSTGETGVTGPTGETGTTGSAGVTGATGETGATGVTGPTGATGV 61
Query: 76 ---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G+ G +G + G +G GP +G G +G G +G + S
Sbjct: 62 TGETGPIGATGSTGATGEIGSTGDTGATGVTGPTGITGATGATGVTGATGSTGATGAIGS 121
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 122 TGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGS---TGATGVTGVTGSTGATGLTGETGATGSTGPTGA 178
Query: 190 L 190
Sbjct: 179 T 179
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/151 (23%), Positives = 54/151 (35%), Gaps = 21/151 (13%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G GP+G+ G +G G +G G +G
Sbjct: 2 TGPTGSTGATGPTGATGSTGETGVTGPTGETGTTGSAGVTGATGETGATGVTGPTGATGV 61
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP G G +G + S G +G GP +G G +G G +G +
Sbjct: 62 TGETGPIGATGSTGATGEIGSTGDTGATGVTGPTGITGATGATGVTGATGSTGATGAIGS 121
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G +G G++
Sbjct: 122 TGPTGSTGATGPTGVTGLTGVTGSTGATGVT 152
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.52, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/233 (21%), Positives = 72/233 (30%), Gaps = 45/233 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------------------------------------ 36
G +G G +GS G +GS
Sbjct: 662 TGSTGSTGETGATGSTGVTGVTGSTGATGVTGVTGVTGSTGATGVTGITGGTGTTGPTGA 721
Query: 37 ------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G G +G+ G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 722 TGITGATGETGPTGS---TGDTGATGVTGATGVTGSTGETGATGVTGSTGITGATGSTGS 778
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G G
Sbjct: 779 TGETGPTGVTGSTGVTGATGEAGPTGVTGETGATGSTGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGS 838
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G +G G +G G +G G +G GL+ V+G
Sbjct: 839 TGATGVTGSTGATGVTGATGITGATGATGVTGSTGETGPTGVTGLTGATGVTG 891
>gi|345322918|ref|XP_001513906.2| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Ornithorhynchus
anatinus]
Length = 1536
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/230 (35%), Positives = 111/230 (48%), Gaps = 72/230 (31%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS------------- 81
GSLR+ GPSG+ LG G +R+ GP G+L G LR+ GP G
Sbjct: 806 GSLRFEGPSGQ---LGAGGPMRFEGPQGQL-----GGHLRFEGPQGQGGAPLRFEGPLGQ 857
Query: 82 ------LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR---LRYLG----PSGRLRY 120
LR+ GP G+ LR+ GP G+ LR+ GP G+ LR+ G P G LR+
Sbjct: 858 GGGGGGLRFEGPVGQSVGGLRFEGPRGQLVGGLRFEGPHGQPVGLRFEGARGQPVGGLRF 917
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS----GRLRYLGP 168
GP G+ P G LR+ GP G+ +R+ GP G LR+ GP R+++ GP
Sbjct: 918 EGPHGQ-----PVGGLRFEGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGGGLRFEGPPRLSGARMKFNGP 972
Query: 169 SGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS---GRLRYLGL--SDGLRVSGLH 205
G+ +R+ GP G +R+ GPS G LR+ G G R G H
Sbjct: 973 HGQPAGGMRFEGPLVQQGGGIRFEGPSVQGGGLRFEGPLGQSGPRFDGCH 1022
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/185 (33%), Positives = 86/185 (46%), Gaps = 49/185 (26%)
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRYLGPS- 115
P+ R L + RL L L + GPS + R GP+ ++ + GP+ R GP
Sbjct: 747 PASRFAGLDTNQRLTALAEDRPL-FDGPSRQPVTRGEGPT-KILFEGPNKLNSRLDGPPT 804
Query: 116 -GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------ 162
G LR+ GPSG+L + GP +R+ GP G+L G LR+ GP G+
Sbjct: 805 PGSLRFEGPSGQLGAGGP---MRFEGPQGQL-----GGHLRFEGPQGQGGAPLRFEGPLG 856
Query: 163 -------LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR---LRYLGL----SDGLR 200
LR+ GP G+ LR+ GP G+ LR+ GP G+ LR+ G GLR
Sbjct: 857 QGGGGGGLRFEGPVGQSVGGLRFEGPRGQLVGGLRFEGPHGQPVGLRFEGARGQPVGGLR 916
Query: 201 VSGLH 205
G H
Sbjct: 917 FEGPH 921
>gi|225866715|ref|YP_002752093.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB102]
gi|225789290|gb|ACO29507.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
03BB102]
Length = 883
Score = 66.6 bits (161), Expect = 5e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 535 TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGE 594
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 595 TGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 654
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 655 TGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGS 714
Query: 190 L 190
Sbjct: 715 T 715
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 78/201 (38%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G G +GS G P+GS G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 417 NTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTG 476
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G G +GS G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 477 ATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTG 536
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G S G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 537 PTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETG 596
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G++ V+G
Sbjct: 597 ATGSTGVTGSTGVTGNTGVTG 617
Score = 65.1 bits (157), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G G G +G G +G G +G
Sbjct: 520 TGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGP 579
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 580 TGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGV 639
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 640 TGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGA 699
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 700 TGNTG 704
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 469 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTG---LTGSTGV 525
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 526 TGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGP 585
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 586 TGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGA 645
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 646 TG 647
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +GS G P+GS G +G G P+GS G +G
Sbjct: 376 TGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGV 435
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 436 TGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGV 495
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 496 TGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGA 555
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 556 TGSTGVTG 563
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 529 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 588
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 589 TGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGN 648
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 649 TGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETG 707
Score = 62.8 bits (151), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 409 TGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGE 468
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 469 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGS 528
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 529 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 588
Query: 190 L 190
Sbjct: 589 T 589
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/192 (26%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G G +G S G +G+ GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 438 NTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTG 497
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+G GP+GS G +G GP+G G +G G G G
Sbjct: 498 STGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATG 557
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+G + G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 558 STGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTG 617
Query: 183 YLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 618 ETGPTGSTGVTG 629
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 73/185 (39%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS G +G G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 396 NTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTG 455
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 456 STGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTG---STG 512
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 513 VTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGS---TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTG 569
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 570 STGVT 574
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/164 (26%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +GS G +GS GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 552 NTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTG 611
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 612 NTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTG 671
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 672 STGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGST 715
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 69/179 (38%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G +GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 370 TGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGN---TGPTGSTGE 426
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G + G +G
Sbjct: 427 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGE 486
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 487 TGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTG 545
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 516 NTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTG 575
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
GP+GS GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 576 S---TGPTGS---TGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTG 629
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 630 STGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTG 689
Query: 189 RLRYLG 194
+ G
Sbjct: 690 SIGATG 695
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/203 (24%), Positives = 70/203 (34%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---------------------LRYLGP 51
G +G G +G+ GP+GS G +G G
Sbjct: 313 TGATGSTGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGA 372
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+GS G +G G +G GP+GS G +G G +G G +G
Sbjct: 373 TGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 432
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 433 TGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGS 492
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G
Sbjct: 493 TGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTG 515
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 460 TGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGL 519
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G G G +G G +G G
Sbjct: 520 TGSTGVTGS---TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGS 576
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 577 TGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGS 636
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 637 TGVT 640
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/202 (23%), Positives = 71/202 (35%), Gaps = 18/202 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------- 63
GP+G G +G G +GS G +G GP+GS G +G
Sbjct: 295 TGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGNTGPTGETGS 354
Query: 64 ---------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G GP+GS G +G G +G G +G G
Sbjct: 355 TGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGV 414
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G + G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 415 TGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGS 474
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G++
Sbjct: 475 TGATGNTGATGETGATGSTGVT 496
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 61/149 (40%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+GS G +G G +GS G +G +GP+G G +GS G +G
Sbjct: 200 GPTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGS- 258
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP+G G +G G +G G +G S GP+G G +G G +
Sbjct: 259 --TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGAT 316
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G +G GP+G G +G
Sbjct: 317 GSTGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGN 345
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/148 (27%), Positives = 61/148 (41%), Gaps = 3/148 (2%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+GS G +G+ G +G G +G+ +GP+G G +G G +GS
Sbjct: 201 PTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTG 260
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G G +G
Sbjct: 261 PTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGE---TGATG 317
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G GP+G G +G
Sbjct: 318 STGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGN 345
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/186 (25%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 480 NTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTG 539
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 540 ETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATG 599
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 600 STGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTG 659
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 660 NTGATG 665
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/212 (23%), Positives = 72/212 (33%), Gaps = 21/212 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 286 TGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGN 345
Query: 73 ---------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 346 TGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGE 405
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 406 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGA 465
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 466 TGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTG 497
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/148 (27%), Positives = 59/148 (39%), Gaps = 3/148 (2%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G+ G +GS G +G +GP+GS G +G G +G
Sbjct: 201 PTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTG 260
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 261 PTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGET---GATG 317
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G GP+G G +G
Sbjct: 318 STGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGN 345
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/148 (26%), Positives = 58/148 (39%), Gaps = 3/148 (2%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G G +G+ G +G G +G +GP+GS G +G G +G
Sbjct: 201 PTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTG 260
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 261 PTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPT---GETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATG 317
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G G +G
Sbjct: 318 STGVTGSTGATGETGPTGSTGATGATGN 345
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/215 (24%), Positives = 76/215 (35%), Gaps = 27/215 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS G +GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 226 TGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 285
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 286 TGETGVTGST---GPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGATGETGPTGSTGATGA 342
Query: 133 SGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 343 TGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGS 402
Query: 172 LRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 403 TGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTG 437
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+GS G +G G +G GP+GS GP+G G +G
Sbjct: 499 TGPTGET---GPTGSTGVTGNTG---LTGSTGVTGSTGPTGS---TGPTGETGSTGSTGA 549
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 550 PGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGV 609
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 610 TGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGET 667
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/200 (24%), Positives = 69/200 (34%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 271 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGST---GPTGETGATGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGA 327
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+GS G +G G +G GP+G G
Sbjct: 328 TGETGPTGSTGATGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGA 387
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G S G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 388 TGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGA 447
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G
Sbjct: 448 TGSTGVTGSTGATGNTGATG 467
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/143 (26%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 6/143 (4%)
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G +G G +GS G +G +GP+G G +G G +G
Sbjct: 201 PTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTG 260
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G +G S GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 261 PTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATGSTG 320
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 321 VTGSTGATGETGPTGSTGATGAT 343
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/212 (21%), Positives = 65/212 (30%), Gaps = 51/212 (24%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL------------------------RYLGPSGRLRYLGP 69
+GS G +G G +GS+ G +G GP
Sbjct: 106 TGSTGVTGSTGATGNTGATGSMGVTGNTGPTGSTGGTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGP 165
Query: 70 SGRLRYLG---------------------------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G G P+GS G +G G +G
Sbjct: 166 TGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGGTGNTGSTGETGPTGSTGPTGETGATGSTGATGSTGA 225
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G +GP+G G +G S G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 226 TGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGP 285
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G G
Sbjct: 286 TGETGVTGSTGPTGETGATGSTGPTGETGATG 317
>gi|118479861|ref|YP_897012.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis str. Al Hakam]
gi|118419086|gb|ABK87505.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis str. Al Hakam]
Length = 863
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 515 TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGE 574
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 575 TGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 634
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 635 TGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGS 694
Query: 190 L 190
Sbjct: 695 T 695
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 78/201 (38%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G G +GS G P+GS G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 397 NTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTG 456
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G G +GS G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 457 ATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTG 516
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G S G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 517 PTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETG 576
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G++ V+G
Sbjct: 577 ATGSTGVTGSTGVTGNTGVTG 597
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G G G +G G +G G +G
Sbjct: 500 TGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGP 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 560 TGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGV 619
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 620 TGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGA 679
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 680 TGNTG 684
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +GS G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 449 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTG---LTGSTGV 505
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 506 TGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGP 565
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 566 TGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGA 625
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 626 TG 627
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G G +GS G P+GS G +G G P+GS G +G
Sbjct: 356 TGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGV 415
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G +GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 416 TGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGV 475
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 476 TGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGA 535
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 536 TGSTGVTG 543
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 509 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 568
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 569 TGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGN 628
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 629 TGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETG 687
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 73/190 (38%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+GS G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 431 TGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGS 490
Query: 73 LRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 491 TGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGS 550
Query: 130 DGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 551 TGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGS 610
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 611 TGATGSTGVT 620
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +GS G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 389 TGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGE 448
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 449 TGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGS 508
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 509 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 568
Query: 190 L 190
Sbjct: 569 T 569
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 73/185 (39%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS G +G G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 376 NTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTG 435
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 436 STGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTG---STG 492
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 493 VTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGS---TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTG 549
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 550 STGVT 554
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/164 (26%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +GS G +GS GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 532 NTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTG 591
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 592 NTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTG 651
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 652 STGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGST 695
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 69/179 (38%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G +GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 350 TGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGN---TGPTGSTGE 406
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +GS G +G G +G G +G G +G G +G + G +G
Sbjct: 407 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGE 466
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 467 TGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTG 525
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G G +G
Sbjct: 496 NTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTG 555
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
GP+GS GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 556 S---TGPTGS---TGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTG 609
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 610 STGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTG 669
Query: 189 RLRYLG 194
+ G
Sbjct: 670 SIGATG 675
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/203 (24%), Positives = 70/203 (34%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---------------------LRYLGP 51
GP+G G +G GP+GS G +G G
Sbjct: 293 TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGA 352
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+GS G +G G +G GP+GS G +G G +G G +G
Sbjct: 353 TGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 412
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 413 TGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGS 472
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G
Sbjct: 473 TGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTG 495
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/186 (25%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 460 NTGATGETGATGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGVTGNTGLTGSTGVTGSTGPTGSTGPTG 519
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LN 128
G +G+ G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 520 ETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATG 579
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G +G G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 580 STGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTG 639
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 640 NTGATG 645
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/205 (24%), Positives = 74/205 (36%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ +GP+GS G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 215 TGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGST---GPTGETGVTGSTGP 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 126
G +GS G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 272 TGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGE 331
Query: 127 ---------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
S G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 332 TGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 391
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G++
Sbjct: 392 TGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVT 416
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+GS G +G G +G GP+GS GP+G G +G
Sbjct: 479 TGPTGET---GPTGSTGVTGNTG---LTGSTGVTGSTGPTGS---TGPTGETGSTGSTGA 529
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G S G
Sbjct: 530 PGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGV 589
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 590 TGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGET 647
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/212 (24%), Positives = 73/212 (34%), Gaps = 24/212 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 269 TGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS---TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGN 325
Query: 73 ---------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 326 TGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGE 385
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 386 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGA 445
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G +G G + V+G
Sbjct: 446 TGETGPTGSTGATGNTGATGETGATGSTGVTG 477
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/215 (23%), Positives = 72/215 (33%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRY--- 66
+GP+G G +GS G +GS G +G GP+G GP+G
Sbjct: 233 MGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS 292
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR--------------------------- 99
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 293 TGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGA 352
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G G +G G +G S G +G G +G G +G G
Sbjct: 353 TGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGS 412
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 413 TGVTGNTGPTGSTGATGSTGVTGSTGATGNTGATG 447
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/212 (24%), Positives = 73/212 (34%), Gaps = 33/212 (15%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G +GS G +G +GP+GS G +G G +G G +G
Sbjct: 209 TGPTG---ETGATGSTGATGNTGATGSMGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGETGV 265
Query: 82 LRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 266 TGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGPTGSTGETGATGN 325
Query: 136 ---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 326 TGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTGNTGPTGSTGE 385
Query: 175 LGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 386 TGATGSTGVTGNTGPTGSTGETGATGSTGVTG 417
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/201 (25%), Positives = 73/201 (36%), Gaps = 30/201 (14%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+GS GP+G G +G G +GS +GP+G G +G G +GS
Sbjct: 205 PTGS---TGPTGETGATGSTGATGNTGATGS---MGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTG 258
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G GP+G
Sbjct: 259 PTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGE---TGPTG 315
Query: 144 RLRYLGPSGR---------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 316 STGETGATGNTGPTGETGSTGTTGPTGETGATGSTGATGSTGPTGSTGETGATGSTGVTG 375
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G + V+G
Sbjct: 376 NTGPTGSTGETGATGSTGVTG 396
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/134 (29%), Positives = 54/134 (40%), Gaps = 15/134 (11%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+GS GP+G G +G G +GS +GP+G G +G G +G
Sbjct: 204 GPTGS---TGPTGETGATGSTGATGNTGATGS---MGPTGSTGVTGNTGSTGSTGVTGST 257
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G +G GP+G S GP+G G GP+G G +G
Sbjct: 258 GPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTG------STGPTGETGVTGSTGPTGET 311
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G +G
Sbjct: 312 GPTGSTGETGATGN 325
>gi|126700850|ref|YP_001089747.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
gi|115252287|emb|CAJ70128.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile 630]
Length = 558
Score = 66.6 bits (161), Expect = 6e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/217 (24%), Positives = 86/217 (39%), Gaps = 33/217 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 106 TGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGA 165
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGR 117
GP+G+ G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 166 NGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGA 225
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGP 159
+GP+G + + GP G + +GP+G G +G + G
Sbjct: 226 DGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGA 285
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G + GP+G +GP+G G +
Sbjct: 286 TGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGAN 322
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 76/193 (39%), Gaps = 21/193 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G + GP
Sbjct: 16 TGPTGATGPTGPTGPRGATGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGT 72
Query: 70 ------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 73 TGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGN 129
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 130 TGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGP 189
Query: 178 SGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G +
Sbjct: 190 TGNTGATGPTGSI 202
Score = 63.9 bits (154), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 87/206 (42%), Gaps = 39/206 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+G+ GP+G +
Sbjct: 151 TGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGT 210
Query: 66 --------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 102
G +G +GP+G++ GP G + +GP+G
Sbjct: 211 TGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGA 270
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G +GP+G G +G + GP+G + GP+G +GP+G G +G
Sbjct: 271 TGANG---LVGPTGATGATGVAGAI---GPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGA 324
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G + G +G +GP+G
Sbjct: 325 ---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTG 347
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/212 (25%), Positives = 87/212 (41%), Gaps = 30/212 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G GP+G + GP+G G +G GP+G+ G +G G
Sbjct: 129 NTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATG 188
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---- 109
P+G GP+GS+ G +G +GP+G + GP G +
Sbjct: 189 PTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTG 248
Query: 110 -----RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
G +G + GP+G ++G G G +G +GP+G + GP+G
Sbjct: 249 PTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADG 308
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G G +G GP+G + G +
Sbjct: 309 AVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGAN 337
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/198 (25%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 33/198 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
N G +G GP+G++ GP +G+ GP+G G +G
Sbjct: 48 NTGATGANGITGPTGNMGATGPNGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG--- 104
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 105 ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATG 164
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSG 161
GP+G + G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 165 ANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATG 224
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+GP+G + GP G
Sbjct: 225 ADGEVGPTGAVGATGPDG 242
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/217 (25%), Positives = 83/217 (38%), Gaps = 37/217 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGSLRY 57
G +G GP+G+ G +G GP+G + GP +G+
Sbjct: 34 TGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGTTGSTGPTGNTGATGANGI 90
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 91 TGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGA 147
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---- 173
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 148 TGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGA 207
Query: 174 -----------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G +G +GP+G + G DGL
Sbjct: 208 TGTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATG-PDGL 243
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 87/209 (41%), Gaps = 36/209 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 57
GP+G GP+GS+ G +G+ +GP+G + GP G +
Sbjct: 187 TGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGP 246
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G +G + GP+G+ G G G +G +GP+G + GP+G
Sbjct: 247 TGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGA 306
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------- 167
+GP+G + G +G GP+G + G +G +GP+G G
Sbjct: 307 DGAVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGENGVAGATGATGA 363
Query: 168 --------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G + G +G +GP+G
Sbjct: 364 TGANGATGPTGAVGATGANGVAGAIGPTG 392
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/172 (26%), Positives = 65/172 (37%), Gaps = 21/172 (12%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 96
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + GP
Sbjct: 16 TGPTGATGPTGPTGPRGATGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGPNGT 72
Query: 97 ------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+G GP+G G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 73 TGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGN 129
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 130 TGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGAN 181
>gi|255308277|ref|ZP_05352448.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile ATCC 43255]
Length = 558
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/217 (24%), Positives = 85/217 (39%), Gaps = 36/217 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 124 TGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGV 183
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G+ GP+G + G +G +GP+G + GP G
Sbjct: 184 TGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGL 243
Query: 118 LRY------------------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+ GP+G ++G G G +G +GP+G + GP
Sbjct: 244 VGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGP 303
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G G +G GP+G + G +
Sbjct: 304 TGADGAVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGAN 337
Score = 66.2 bits (160), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/217 (24%), Positives = 86/217 (39%), Gaps = 33/217 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 106 TGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGA 165
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGR 117
GP+G+ G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 166 NGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGA 225
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGP 159
+GP+G + + GP G + +GP+G G +G + G
Sbjct: 226 DGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGA 285
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G + GP+G +GP+G G +
Sbjct: 286 TGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGAN 322
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/194 (26%), Positives = 78/194 (40%), Gaps = 18/194 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP-- 69
++GP+G GP+G G +G+ G +G G +G+ GP+G + GP
Sbjct: 12 DVGPTGPTGATGPTGPTGPRGVTGATGANGITGSTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPNG 71
Query: 70 -------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 72 TTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTG 128
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 129 NTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATG 188
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRL 190
P+G GP+G +
Sbjct: 189 PTGNTGATGPTGSI 202
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 87/206 (42%), Gaps = 39/206 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+G+ GP+G +
Sbjct: 151 TGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGT 210
Query: 66 --------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 102
G +G +GP+G++ GP G + +GP+G
Sbjct: 211 TGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGA 270
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G +GP+G G +G + GP+G + GP+G +GP+G G +G
Sbjct: 271 TGANG---LVGPTGATGATGVAGAI---GPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGA 324
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G + G +G +GP+G
Sbjct: 325 ---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTG 347
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/198 (25%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 33/198 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
N G +G GP+G++ GP +G+ GP+G G +G
Sbjct: 48 NTGATGANGITGPTGNMGATGPNGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANG--- 104
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 105 ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATG 164
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSG 161
GP+G + G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 165 ANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATG 224
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+GP+G + GP G
Sbjct: 225 ADGEVGPTGAVGATGPDG 242
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/216 (25%), Positives = 83/216 (38%), Gaps = 34/216 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGSLRYL 58
G +G G +GS G +G+ GP+G + GP +G+
Sbjct: 32 GVTGATGANGITGSTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPNGTTGSTGPTGNTGATGANGIT 91
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 92 GPTGNTGATGANG---ITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGAT 148
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR----- 173
GP+G + G +G GP+G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 149 GATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGAT 208
Query: 174 ----------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G +G +GP+G + G DGL
Sbjct: 209 GTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATG-PDGL 243
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 87/209 (41%), Gaps = 36/209 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 57
GP+G GP+GS+ G +G+ +GP+G + GP G +
Sbjct: 187 TGPTGNTGATGPTGSIGATGATGTTGATGPIGATGATGADGEVGPTGAVGATGPDGLVGP 246
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G +G + GP+G+ G G G +G +GP+G + GP+G
Sbjct: 247 TGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGA 306
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------- 167
+GP+G + G +G GP+G + G +G +GP+G G
Sbjct: 307 DGAVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGENGVAGATGATGA 363
Query: 168 --------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G + G +G +GP+G
Sbjct: 364 TGANGATGPTGAVGATGANGVAGAIGPTG 392
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/171 (25%), Positives = 64/171 (37%), Gaps = 21/171 (12%)
Query: 47 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP- 105
+ +GP+G GP+G G +G G +GS G +G GP+G + GP
Sbjct: 11 QDVGPTGPTGATGPTGPTGPRGVTGATGANGITGSTGNTGATGANGITGPTGNMGATGPN 70
Query: 106 --------------SGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
+G GP+G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 71 GTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGNTGATGANGITGPTGNKGATGANGITGSTGPTGNT 130
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 131 GATGANGITGPTGNTGATGATGPTGLTGATGATGANGITGPTGNTGATGAN 181
>gi|255094214|ref|ZP_05323692.1| hypothetical protein CdifC_16361, partial [Clostridium difficile
CIP 107932]
Length = 303
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/199 (26%), Positives = 82/199 (41%), Gaps = 27/199 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LG 68
N G +G GP+G+ G +G GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 111 NKGATGANGITGPTGATGATGANG---ITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITG 167
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G +G GP+G GP+G + G +G GP + GP+G +
Sbjct: 168 PTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP---IGATGPTGAVG 224
Query: 129 SDGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSG 170
+ GP G + +GP+G G +G + G +G +GP+G
Sbjct: 225 ATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTG 284
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP+G +GP+G
Sbjct: 285 AVGATGPTGADGAVGPTGA 303
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/212 (24%), Positives = 81/212 (38%), Gaps = 33/212 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 91 TGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGA 150
Query: 73 LRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ GP+G G +G GP+G GP+G + G +G +
Sbjct: 151 TGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGA 210
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------------LGPSGRLRY---LGP 168
GP + GP+G + GP G + GP+G +GP
Sbjct: 211 TGP---IGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGP 267
Query: 169 SGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G +GP+G + GP+G +G
Sbjct: 268 TGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVG 299
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/200 (25%), Positives = 76/200 (38%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
GP+G GP+G G +G+ GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 16 TGPTGATGPTGPTGPRGATGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGANGT 72
Query: 70 ------------SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+G GP+G+ G +G G +G GP+G G
Sbjct: 73 TGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGA 132
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G ++G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 133 NGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGA 192
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G + G +G G
Sbjct: 193 TGPTGSIGATGANGVTGATG 212
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/186 (25%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 21/186 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
N G +G GP+G++ G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 48 NTGATGANGITGPTGNMGATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGITGPTGATGATGANGITG 107
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LG 113
G G G +G G +G+ GP+G G +G G +G G
Sbjct: 108 PTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGATGLTGATGATGANGITG 167
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P+G G +G + GP+G GP+G + G +G GP + GP+G +
Sbjct: 168 PTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP---IGATGPTGAVG 224
Query: 174 YLGPSG 179
GP G
Sbjct: 225 ATGPDG 230
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/205 (25%), Positives = 79/205 (38%), Gaps = 25/205 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGSLRY 57
G +G GP+G+ G +G GP+G + G +G+
Sbjct: 34 TGATGANGITGPTGNTGATGANG---ITGPTGNMGATGANGTTGSTGPTGNTGATGANGI 90
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G +G G G+ G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 91 TGPTGATGATGANGITGPTGNKGATGANGITGPTGATGATGANGITGPTGNTGATGANGA 150
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G ++G P+G G +G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 151 TGLTGATGATGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGA 210
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
GP + GP+G + G DGL
Sbjct: 211 TGP---IGATGPTGAVGATG-PDGL 231
>gi|423411693|ref|ZP_17388813.1| hypothetical protein IE1_00997, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|401104841|gb|EJQ12811.1| hypothetical protein IE1_00997, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
Length = 285
Score = 66.2 bits (160), Expect = 7e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 64/145 (44%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
++ GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G G +G G
Sbjct: 70 KVGPTGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATG 129
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 130 ITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTGITG 189
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G GP+G
Sbjct: 190 ATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/148 (29%), Positives = 63/148 (42%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V K GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ G +G
Sbjct: 67 TVPKVGPTGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTG 126
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 127 ATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTG 186
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 187 ITGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/156 (28%), Positives = 66/156 (42%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G++ +GP+ GP+G+ GP+G GP+G GP+G+ GP+G
Sbjct: 65 DGTVPKVGPT------GPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGV 118
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 119 TGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGV 178
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 179 TGATGPTGITGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/156 (28%), Positives = 65/156 (41%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + +GP+G P+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 65 DGTVPKVGPTG------PTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGV 118
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 119 TGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGV 178
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 179 TGATGPTGITGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/125 (28%), Positives = 54/125 (43%)
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
++ GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G + G
Sbjct: 70 KVGPTGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATG 129
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 130 ITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTGITG 189
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 190 ATGIT 194
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/121 (28%), Positives = 51/121 (42%), Gaps = 12/121 (9%)
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G++ +GP+G P+G GP+G GP+G GP+G + GP+G
Sbjct: 65 DGTVPKVGPTG------PTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGV 118
Query: 139 LG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G P+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 119 TGDTGPTGATGITGATGP---TGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGA 175
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 176 T 176
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.84, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/70 (28%), Positives = 31/70 (44%)
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ DG ++ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 62 FSCDGTVPKVGPTGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGD 121
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 122 TGPTGATGIT 131
>gi|402553063|ref|YP_006594334.1| hypothetical protein BCK_01095 [Bacillus cereus FRI-35]
gi|401794273|gb|AFQ08132.1| hypothetical protein BCK_01095 [Bacillus cereus FRI-35]
Length = 575
Score = 65.9 bits (159), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 212 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGPQ 271
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 272 GPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGA---TGATGAQGVQ 328
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 329 GPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGAT 388
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 389 GATG 392
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 68/176 (38%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 230 GPAGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ 289
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G G GP+G G +G GP+G GP G
Sbjct: 290 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQ 346
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP G GP+G GP G GP+G G G GP
Sbjct: 347 GPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGP 402
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 15/178 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---- 78
GP+G+ GP G G +G GP+G+ G G GP+G GP
Sbjct: 185 GPAGAQGATGPQGPAGAQGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAQGPQGIQ 244
Query: 79 --------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 245 GPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGAT 304
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP+G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 305 GAQGPQGIQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQG 359
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G P+G+ GP G G +G GP+G G G
Sbjct: 173 GPAGAQGATGPQG------PAGAQGATGPQGPAGAQGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 226
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 227 GVQGPAGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGAT 286
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G G G GP+G G +G GP+G GP G
Sbjct: 287 GPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQG 341
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/138 (31%), Positives = 54/138 (39%), Gaps = 3/138 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 268 TGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGA---TGATGA 324
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 325 QGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGP 384
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+G G G GP
Sbjct: 385 AGATGATGAQGPQGIQGP 402
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/163 (30%), Positives = 64/163 (39%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP G P+G+ GP G G +G GP+G+ G G
Sbjct: 173 GPAGAQGATGPQG------PAGAQGATGPQGPAGAQGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 226
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP+G GP G GP+G G +G GP+G GP G GP+
Sbjct: 227 GVQGPAGATGAQGPQG---IQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPA 280
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 281 GATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATG 323
>gi|328701310|ref|XP_001950899.2| PREDICTED: hypothetical protein LOC100165925 [Acyrthosiphon pisum]
Length = 869
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/130 (38%), Positives = 59/130 (45%), Gaps = 3/130 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
LGP+ GPS S GPSGS+ GPS + GPS S PSG + GPS
Sbjct: 171 LGPTPSTNLPGPSSSTSIPGPSGSINLPGPSSSINLPGPSSSNSIPDPSGSINLPGPSSS 230
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GPS S GPS SG + GP+ + GPS GPSG +N GP
Sbjct: 231 INLPGPSSSTSIPGPSCSTNL---SGSINLPGPTSSINLPGPSSSTSIAGPSGSINLPGP 287
Query: 133 SGRLRYLGPS 142
S GPS
Sbjct: 288 SSSTSIPGPS 297
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/119 (36%), Positives = 52/119 (43%), Gaps = 6/119 (5%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
LGP+ S GPS GPSG + GPS + GPS PSG +N GPS
Sbjct: 171 LGPTPSTNLPGPSSSTSIPGPSGSINLPGPSSSINLPGPSSSNSIPDPSGSINLPGPSSS 230
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GPS GP SG + GP+ + GPS GPSG + GPS
Sbjct: 231 INLPGPSSSTSIPGPSCSTNLSGSINLPGPTSSINLPGPSSSTSIAGPSGSINLPGPSS 289
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/79 (39%), Positives = 38/79 (48%), Gaps = 7/79 (8%)
Query: 10 ALNL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
++NL GPS + GPS S GPS GS+ GP+ + GPS S GPSG
Sbjct: 221 SINLPGPSSSINLPGPSSSTSIPGPSCSTNLSGSINLPGPTSSINLPGPSSSTSIAGPSG 280
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+ GPS GPS S
Sbjct: 281 SINLPGPSSSTSIPGPSCS 299
>gi|187779024|ref|ZP_02995497.1| hypothetical protein CLOSPO_02619 [Clostridium sporogenes ATCC
15579]
gi|187772649|gb|EDU36451.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium sporogenes ATCC
15579]
Length = 283
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/136 (33%), Positives = 62/136 (45%), Gaps = 1/136 (0%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T G C + + GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 6 TCGRCTCPRGV-TGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGP 64
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 TGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGI 124
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G GP+G L
Sbjct: 125 TGPTGPQGITGPTGPL 140
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/125 (34%), Positives = 57/125 (45%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 16 VTGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGITGPTG 75
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 76 PQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITG 135
Query: 177 PSGRL 181
P+G L
Sbjct: 136 PTGPL 140
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/125 (34%), Positives = 57/125 (45%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 16 VTGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGITGPTG 75
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 76 PQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITG 135
Query: 150 PSGRL 154
P+G L
Sbjct: 136 PTGPL 140
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/125 (34%), Positives = 57/125 (45%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 16 VTGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGITGPTG 75
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 76 PQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITG 135
Query: 186 PSGRL 190
P+G L
Sbjct: 136 PTGPL 140
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/125 (34%), Positives = 57/125 (45%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 16 VTGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGITGPTG 75
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 76 PQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITG 135
Query: 159 PSGRL 163
P+G L
Sbjct: 136 PTGPL 140
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/125 (34%), Positives = 57/125 (45%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 16 VTGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGITGPTG 75
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 76 PQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITG 135
Query: 168 PSGRL 172
P+G L
Sbjct: 136 PTGPL 140
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/125 (34%), Positives = 57/125 (45%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 16 VTGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGITGPTG 75
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 76 PQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITG 135
Query: 141 PSGRL 145
P+G L
Sbjct: 136 PTGPL 140
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/88 (34%), Positives = 37/88 (42%), Gaps = 3/88 (3%)
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
R P G GP G GP G GP+G GP+G GP+G GP+
Sbjct: 9 RCTCPRGVTGPTGPQGITGPTGPQGVT---GPTGPQGVTGPTGPQGITGPTGPQGITGPT 65
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 66 GPQGITGPTGPQGITGPTGPQGVTGPTG 93
>gi|444729990|gb|ELW70388.1| hypothetical protein TREES_T100002597 [Tupaia chinensis]
Length = 409
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/201 (36%), Positives = 96/201 (47%), Gaps = 32/201 (15%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A+ GP+G L + PSGS L +G GP+G L + PSGS L +G GP
Sbjct: 140 AMAGGPAGELIGVDPSGSACGLAVAG-----GPAGELIGVDPSGSACGLAVAG-----GP 189
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
+G L + PSGS L GP+G L + PSG L GP+G L + PSG L
Sbjct: 190 AGELIGVDPSGSACGLAVAGGPAGELIGVDPSGSACGLAVAGGPAGELIGVDPSGSACGL 249
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G GP+G L + PSG L GP+G L + PSG L +G GP
Sbjct: 250 AVAG-----GPAGELIGVDPSGSACGLAVAGGPAGELIGVDPSGSACGLAVAG-----GP 299
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
+G L + PSG L ++ G
Sbjct: 300 AGELIGVDPSGSACGLAVAGG 320
>gi|386362622|ref|YP_006071953.1| LPXTG-motif cell wall anchor domain protein [Streptococcus pyogenes
Alab49]
gi|350277031|gb|AEQ24399.1| LPXTG-motif cell wall anchor domain protein [Streptococcus pyogenes
Alab49]
Length = 501
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/188 (32%), Positives = 80/188 (42%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
++K G GR GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 116 IQKHAFDGKDGRDGETGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGL 175
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G+
Sbjct: 176 TGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQ 232
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G+ +GP G GP
Sbjct: 233 DGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGQPGQVGPRGLQGPQGP 289
Query: 187 SGRLRYLG 194
G G
Sbjct: 290 RGDKGETG 297
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/177 (33%), Positives = 76/177 (42%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 130 ETGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQG 189
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G
Sbjct: 190 PRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPRGLT---G 243
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G+ GP G GP+G+ GP G+ +GP G GP G GP G
Sbjct: 244 PAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGQPGQVGPRGLQGPQGPRGDKGETGPQG 300
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/176 (33%), Positives = 76/176 (43%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 140 TGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQ 199
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP
Sbjct: 200 DGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGP 253
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G+ GP G+ +GP G GP G GP G G +G
Sbjct: 254 QGPRGLTGPAGQDGKQGPQGQPGQVGPRGLQGPQGPRGDKGETGPQGPAGKDGEAG 309
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/167 (33%), Positives = 73/167 (43%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 158 TGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQ 217
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP
Sbjct: 218 DGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGP 271
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G+ +GP G GP G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 272 QGQPGQVGPRGLQGPQGPRGDKGETGPQGPAGKDGEAGAQGPVGPAG 318
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/189 (32%), Positives = 80/189 (42%), Gaps = 8/189 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 176 TGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQ 232
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G+ +GP G GP
Sbjct: 233 DGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGQPGQVGPRGLQGPQGP 289
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G G +G +GP+G G G GP+G+ GP G
Sbjct: 290 RGDKGETGPQGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPQGPRGDKGETGPQGPAGKDGERGPVGPAGK 349
Query: 193 LGLS--DGL 199
G + DGL
Sbjct: 350 DGQNGKDGL 358
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/187 (32%), Positives = 79/187 (42%), Gaps = 7/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 194 TGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQ 247
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G+ GP G+ +GP G GP G GP G DG
Sbjct: 248 DGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGQPGQVGPRGLQGPQGPRGDKGETGPQGPAGKDGE 307
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G +GP+G G G GP+G+ GP G G +G+ G G+
Sbjct: 308 AGAQGPVGPAGPQGPRGDKGETGPQGPAGKDGERGPVGPAGKDGQNGKDGLPGKDGKDGQ 367
Query: 193 LGLSDGL 199
G DGL
Sbjct: 368 NG-KDGL 373
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/176 (32%), Positives = 74/176 (42%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 168 GPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPRG-- 225
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G+ GP
Sbjct: 226 -LTGPAGQDGKQGPRG---LTGPAGQDGKQGPQGPRGLTGPAGQDGKQGPQGQPGQVGPR 281
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G G +G +GP+G G G GP+G+
Sbjct: 282 GLQGPQGPRGDKGETGPQGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPQGPRGDKGETGPQGPAGK 337
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/123 (30%), Positives = 49/123 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G+ GP G +GP G GP G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 260 TGPAGQDGKQGPQGQPGQVGPRGLQGPQGPRGDKGETGPQGPAGKDGEAGAQGPVGPAGP 319
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G+ GP G G +G+ G G+ G G DG
Sbjct: 320 QGPRGDKGETGPQGPAGKDGERGPVGPAGKDGQNGKDGLPGKDGKDGQNGKDGLPGKDGK 379
Query: 133 SGR 135
G+
Sbjct: 380 DGQ 382
>gi|218232715|ref|YP_002367122.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus B4264]
gi|218160672|gb|ACK60664.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus B4264]
Length = 300
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 79/196 (40%), Gaps = 14/196 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 42 TGPTGATGITGPTG---ITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGE 98
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 99 TGSTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPAGETGPTGI 158
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---- 188
+G GP+G +G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 159 TGPTGATGPTGETGPIGITGPTGETGPTG---ITGPTGVTGLTGETGPTGATGPTGGIGP 215
Query: 189 ----RLRYLGLSDGLR 200
L Y +DG +
Sbjct: 216 ITTTNLLYYTFADGEK 231
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/180 (28%), Positives = 74/180 (41%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 11 LNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
+ G +G GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 31 IPTGATGPTGITGPTGATGITGPTG---ITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGITGPTGET 87
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 88 GPTGITGPTGETGSTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGIT 147
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G +G GP+G +G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 148 GPAGETGPTGITGPTGATGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVTGLTGETGPTGAT 207
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 33 TGATGPTGITGPTGATGITGPTG---ITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGP 89
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 90 TGITGPTGETGSTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGP 149
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G GP+G +G +G GP+G GP+G G +
Sbjct: 150 AGETGPTGITGPTGATGPTGETGPIGITGPTGETGPTG---ITGPTGVTGLTGET 201
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 33 TGATGPTGITGPTGATGITGPTG---ITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGP 89
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 90 TGITGPTGETGSTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGP 149
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G GP+G GP+G G +G + GP+G G++ V+GL
Sbjct: 150 AGE---TGPTG---ITGPTGATGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVTGLT 198
>gi|423521392|ref|ZP_17497865.1| hypothetical protein IGC_00775, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
gi|401178070|gb|EJQ85253.1| hypothetical protein IGC_00775, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
Length = 361
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/216 (26%), Positives = 77/216 (35%), Gaps = 42/216 (19%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G +G GP+G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 102 NTGATGATGDTGPTGSTGVTGNTGPTGSTGPTGD---TGPTGSTGVTGNTGSTGSTGATG 158
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--- 125
G +GS GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 159 STGPTGNTGSTGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTG 218
Query: 126 ---------------------------RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
S GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 219 STGPTGSTGTTGSTGTTGSTGPTGNTGATGSTGPTG---VTGPTGNTGVTGNTGATGSTG 275
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 276 PTGNTGATGNTGATGNTGPTG---VTGPTGNTGSTG 308
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/216 (25%), Positives = 75/216 (34%), Gaps = 33/216 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G GP+GS G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 123 NTGPTGSTGPTGDTGPTGSTGVTGNTGSTGSTGATGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGATG 182
Query: 69 ---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--------------------------- 98
P+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 183 DTGPTGNTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGTTGSTGTTGSTGPTG 242
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G GP+G G +G S GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 243 NTGATGSTGPTGVTGPTGNTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGATGNTGPTGVTGPTG 302
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 303 NTGSTGSTGVTGNTGATGSTGPTGSTGPTGSTGATG 338
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/226 (23%), Positives = 78/226 (34%), Gaps = 39/226 (17%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRY 57
T V + G +G GP+G S GP+G+ G P+G G +G
Sbjct: 142 TGVTGNTGSTGSTGATGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGSTGSTGPTGV 201
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 202 TGPTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGTTGSTGTTGSTGPTGNTGATGSTGPTGVTGPTGN 261
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 262 TGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGNTGATGNTGPTGVT---GPTGN---TGSTGSTGVTGN 315
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 316 TGATGSTGPTGSTGPTGSTGATGSTGPTGSTGSTGVTGPTGNTGVT 361
>gi|225868100|ref|YP_002744048.1| collagen-binding collagen-like surface-anchored protein FneF
[Streptococcus equi subsp. zooepidemicus]
gi|225701376|emb|CAW98441.1| putative collagen-binding collagen-like surface-anchored protein
FneF [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus]
Length = 750
Score = 65.1 bits (157), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 59/176 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G+ GP G G G G GR G G GP G GP G
Sbjct: 468 GQNGKDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGRDGKDGEKGERGEQGPQGERGEQGPQGER 527
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 528 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 587
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 588 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 643
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/117 (33%), Positives = 41/117 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 530 QGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 589
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G GP G GP G GP G GP G GP G ++
Sbjct: 590 RGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGENHT 646
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 59/176 (33%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G+ GP G G G GP G GP G G GR G +G+
Sbjct: 420 GQNGKDGQPGPKGEK---GDPGKPGERGPKGEPGIPGPRGENGKDGAPGRD---GQNGKD 473
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G G GR G G GP G GP G GP
Sbjct: 474 GQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGRDGKDGEKGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 533
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 534 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 589
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 57/182 (31%), Gaps = 18/182 (9%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---------------SGRLRYL 67
G +G GP G G G+ GP G GP +G+
Sbjct: 420 GQNGKDGQPGPKGEK---GDPGKPGERGPKGEPGIPGPRGENGKDGAPGRDGQNGKDGQP 476
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G G G GR G G GP G GP G GP G
Sbjct: 477 GPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGRDGKDGEKGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 536
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 537 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 596
Query: 188 GR 189
G
Sbjct: 597 GE 598
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 61/182 (33%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G G G+ G +G+ GP G G G+ GP G
Sbjct: 396 GPKGEPGIPGPRGEN---GKDGAPGRDGQNGKDGQPGPKGEK---GDPGKPGERGPKGEP 449
Query: 74 RYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G+ G +G+ GP G G G G GR G G
Sbjct: 450 GIPGPRGENGKDGAPGRDGQNGKDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGRDGKDGEKGER 509
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 510 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 569
Query: 188 GR 189
G
Sbjct: 570 GE 571
>gi|256822387|ref|YP_003146350.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Kangiella
koreensis DSM 16069]
gi|256795926|gb|ACV26582.1| collagen triple helix repeat protein [Kangiella koreensis DSM
16069]
Length = 647
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 70/176 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 258 VGPAGPQGDTGPAGPQGDAGPAGPQGDAGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGP 317
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +G GP G GP G G +G GP
Sbjct: 318 QGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGATGPQGPAGPQGETGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGP 377
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G +G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 378 KGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATG 433
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 70/179 (39%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
L +GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 254 TLGAVGPAGPQGDTGPAGPQGDAGPAGPQGDAGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTG 313
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
P+G GP+G GP+G G +G GP G GP G G +G
Sbjct: 314 PAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGATGPQGPAGPQGETGATGPQGPKGDTGDTGATG 373
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +G G +G GP G G +G GP G G +
Sbjct: 374 PQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGAT 432
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 69/179 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 275 DAGPAGPQGDAGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAG 334
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP G GP G G +G GP G G +G G
Sbjct: 335 PQGDTGATGPQGPAGPQGETGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKG 394
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP G G +G GP G G +G G +G GP G +
Sbjct: 395 DTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPM 453
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G GP G GP G
Sbjct: 302 DTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGATGPQGPAGPQGETGATGPQG 361
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSG 125
G +G+ GP G G +G G +G GP +G GP G
Sbjct: 362 PKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQG 421
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G GP G G +G +GP G G +G GPSG + G
Sbjct: 422 PKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPMGPQGAKGDTGDTGATGPQGPSGPMGPQG 481
Query: 186 PSGR 189
P G
Sbjct: 482 PQGE 485
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/185 (28%), Positives = 70/185 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 284 DAGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGATG 343
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G G +G GP G G +G G +G + G
Sbjct: 344 PQGPAGPQGETGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATG 403
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G GP G G +G G +G GP G + G G
Sbjct: 404 PQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPMGPQGAKGDTG 463
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 464 DTGAT 468
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 297 AGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGPAGPQGDTGATGPQGP---AGPQGE 353
Query: 73 LRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP +G GP G G +G GP G G +G G +G
Sbjct: 354 TGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGD 413
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G G +G GP G G +G +GP G G +G GP
Sbjct: 414 TGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPMGPQGAKGDTGDTGATGPQGP 473
Query: 187 SGRL 190
SG +
Sbjct: 474 SGPM 477
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRY 66
GP G GP G GP G GP G GP +G GP G
Sbjct: 324 AGPQGDTGPAGPQGDTGATGPQGP---AGPQGETGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGD 380
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G GP G G +G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 381 TGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGD 440
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G +GP G G +G GPSG + GP G G +G +GP
Sbjct: 441 TGDTGATGPQGPMGPQGAKGDTGDTGATGPQGPSGPMGPQGPQGEKGDTGDTGATGPMGP 500
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 501 QG 502
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G G +G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 348 AGPQGETGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGP 407
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G G +G G +G GP G + GP G G
Sbjct: 408 KGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPM---GPQGAKGDTGD 464
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GPSG + GP G G +G +GP G G +G GP+G
Sbjct: 465 TGATGPQGPSGPMGPQGPQGEKGDTGDTGATGPMGPQGPQGEKGDTGD---TGPAG 517
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.00, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/123 (29%), Positives = 49/123 (39%), Gaps = 3/123 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G GP G G +G GP G G +G +GP G
Sbjct: 398 DTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPKGDTGDTGATGPQGPMGPQG 457
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GPSG + GP G G +G +GP G G +G G
Sbjct: 458 AKGDTGDTGATGPQGPSGPMGPQGPQGEKGDTGDTGATGPMGPQGPQGEKGDTGDT---G 514
Query: 132 PSG 134
P+G
Sbjct: 515 PAG 517
>gi|196034034|ref|ZP_03101444.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus W]
gi|195993108|gb|EDX57066.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus W]
Length = 910
Score = 64.7 bits (156), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/175 (34%), Positives = 74/175 (42%), Gaps = 27/175 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 524 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 574
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 575 GATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 625
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 626 G---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 671
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/175 (34%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 27/175 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 539 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 589
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 590 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 640
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 641 G---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG 686
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPQGAQGNTGATGAT---GPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGP 219
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G G G GP G G +G + GP
Sbjct: 220 QGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGP 279
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 280 AGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGN 336
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 337 TGAT 340
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 71/178 (39%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 452 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQ 508
Query: 74 RYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 509 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 562
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 563 GPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 611
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/189 (31%), Positives = 74/189 (39%), Gaps = 24/189 (12%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 509 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 562
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP G
Sbjct: 563 GPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 611
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +
Sbjct: 612 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGPAGAT 664
Query: 197 DGLRVSGLH 205
G+
Sbjct: 665 GATGPQGIQ 673
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/178 (33%), Positives = 74/178 (41%), Gaps = 27/178 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 544 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG- 596
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP
Sbjct: 597 --VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGP 645
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 646 AGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 694
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 71/178 (39%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 437 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 490
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 491 GPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 547
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 548 GPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 596
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 24/177 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 490 TGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 543
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 544 TGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGP 594
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 595 QG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGA 642
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 27/181 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP +G+ GP G+ G +G G +G+ GP G
Sbjct: 467 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQ 523
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 524 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 574
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 575 GATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 625
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 626 G 626
Score = 60.5 bits (145), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 68/180 (37%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G G +G+ GP G GP+G
Sbjct: 384 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAG 440
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 441 ATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 494
Query: 132 PSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 495 AQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 551
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 72/181 (39%), Gaps = 24/181 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G G +G GP G GP+G GP G
Sbjct: 482 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 536
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 537 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPA 586
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 587 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 637
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 638 G 638
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/177 (31%), Positives = 70/177 (39%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 427 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG- 479
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G G +G G +G GP G GP+G + GP
Sbjct: 480 --VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGP 534
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 535 QG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGA 582
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 66/185 (35%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 195 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 254
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G + G
Sbjct: 255 NTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATG 314
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP+G GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 315 PQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQG 371
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 372 NTGAT 376
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 294 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATG 353
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G GP G G +G GP+G GP G + G
Sbjct: 354 PQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTG 413
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 414 ATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 464
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/180 (28%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 259 TGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG- 317
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ GP G GP G G +G G +G G G +
Sbjct: 318 --AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGA 375
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G +G GP+G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 376 TGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGA 435
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 70/186 (37%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 267 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAG 323
Query: 72 RLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP G+ GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 324 ATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQG 383
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G GP+G GP G G +G G +G GP G GP+G
Sbjct: 384 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAG 440
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 441 ATGATG 446
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 66/184 (35%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 224 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGAT 283
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSD 130
GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 284 GATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 340
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G +G G +G G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 341 GPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGAT 400
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 401 GATG 404
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/177 (31%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 411 NTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 464
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G G +G GP G G +G G +G + G
Sbjct: 465 ---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATG 518
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 519 PQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 566
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/180 (28%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 240 NTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG 299
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G G +G G
Sbjct: 300 PQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQG 356
Query: 132 PSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 357 VQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG 416
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 376 TGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG- 434
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G
Sbjct: 435 --AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGA 486
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 487 TGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 543
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 544 TGATG 548
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 179 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQ 238
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G GP G G +G GP+G GP G + G +
Sbjct: 239 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 298
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP+G GP G G +G G +G
Sbjct: 299 GPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQ 355
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 356 GV 357
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 206 GAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQ 265
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G G +G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 266 GNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPA 322
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 323 GATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATG 377
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 67/187 (35%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 232 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGV 291
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G GP+G GP G GP+G GP G GP G +
Sbjct: 292 QGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGN 348
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 349 TGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGV 408
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 409 QGNTGAT 415
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 278 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGVQ 334
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G G +G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 335 GNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQ 394
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G G +G G +G GP G GP+G GP G
Sbjct: 395 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 449
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 187 TGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 246
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G G +G GP+G GP G G +G + GP
Sbjct: 247 TGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGP 306
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP+G GP G G +G G +G G G
Sbjct: 307 AGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGA 363
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 364 TG 365
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G GP+G
Sbjct: 172 TGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQG---VQGPAGA 228
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 229 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGP 288
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 289 QGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG 341
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 67/180 (37%), Gaps = 12/180 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G + GP G G +G G +G+ G G GP
Sbjct: 320 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQ 379
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G GP+G GP G G +G G +G GP G +
Sbjct: 380 GVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQ 436
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 437 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 490
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 348 NTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 407
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 408 VQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 461
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP+G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 462 PQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATG 518
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 519 PQGV 522
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 12/185 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 286 TGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGP 342
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G G GP G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 343 QGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGA 402
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G +G G +G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 403 TGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 456
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 457 TGATG 461
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 69/187 (36%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG- 71
G +G GP+G+ GP G G +G G +G+ G G GP G
Sbjct: 310 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGV 369
Query: 72 --RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G G +G GP+G GP G G +G G +G +
Sbjct: 370 QGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGA 429
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 430 TGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV 480
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 481 QGNTGAT 487
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 214 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGP 273
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 274 QGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGP 330
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G +G G G GP G G +G G +G
Sbjct: 331 QGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGP 390
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 391 QGV 393
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 15/184 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G G +G G +G G G
Sbjct: 305 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNT 361
Query: 74 RYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G + GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 362 GATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQ 421
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 422 GNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 472
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 473 GATG 476
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 61/178 (34%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 254 GNTGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGAT 313
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G+ G +G G G GP G G +G G +G G G
Sbjct: 314 GPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNT 373
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G +G GP+G GP G G +G G +G G
Sbjct: 374 GATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATG 431
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 340 TGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGA 399
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G +G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 400 TGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGV---QGP 453
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP+G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 454 AGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGN 510
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 511 TGAT 514
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/172 (29%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 12/172 (6%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G G +G+
Sbjct: 371 GNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGAT 430
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 431 GPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV---QGPAGATGATGPQGVQ 481
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G G GP G G +G GP+G G
Sbjct: 482 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATG 533
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/180 (28%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 12/180 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G G +G G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 335 GNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGPQGVQ 394
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ GP G G +G G +G GP G GP+G + GP G
Sbjct: 395 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG-- 449
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G GP+G GP G G +G GP G G +
Sbjct: 450 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT 502
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/211 (28%), Positives = 75/211 (35%), Gaps = 54/211 (25%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 569 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 619
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 620 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 670
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------------RLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G G +G
Sbjct: 671 G---IQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQ 727
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 728 GIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATG 755
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/201 (29%), Positives = 76/201 (37%), Gaps = 50/201 (24%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 599 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 649
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 650 GATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTG 700
Query: 128 ------------------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+ G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 701 PTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 757
Query: 170 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
G GP+G + GP+G
Sbjct: 758 G---VQGPTGATGIGVTGPTG 775
>gi|49478336|ref|YP_037777.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
serovar konkukian str. 97-27]
gi|49329892|gb|AAT60538.1| conserved hypothetical protein, possible collagen-like triple helix
repeat protein [Bacillus thuringiensis serovar konkukian
str. 97-27]
Length = 1168
Score = 64.3 bits (155), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/188 (31%), Positives = 76/188 (40%), Gaps = 24/188 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G GP+G+ GP G+ GP+G GP G+ G +G G
Sbjct: 699 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 755
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 756 PAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATG 806
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 807 ATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 857
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 858 VQGNTGAT 865
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 24/187 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 625 TGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 675
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP G GP G GP+G GP G + GP
Sbjct: 676 TGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGP 726
Query: 133 SGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 727 AGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGA 783
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 784 QGPAGAT 790
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 67/178 (37%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 485 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 541
Query: 74 RYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ GP+G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 542 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 601
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G G +G GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 602 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 653
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G G
Sbjct: 490 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 549
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G+ GP G G +G G G G +G GP+G +
Sbjct: 550 TGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGA 609
Query: 130 DGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP +G GP G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 610 TGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGA 663
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 664 TGPQG 668
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/193 (29%), Positives = 72/193 (37%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGP 69
GP G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 508 TGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGP 567
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGP 123
G G +G+ G G G +G GP+G GP +G GP
Sbjct: 568 QGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 627
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 628 QGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGA 678
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 679 TGPQGVQGNTGAT 691
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 71/178 (39%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 785 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 835
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G G +G GP G G +G + GP+
Sbjct: 836 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPA 889
Query: 134 GRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 890 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 944
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/178 (32%), Positives = 72/178 (40%), Gaps = 24/178 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 656 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG-- 707
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 708 -VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGAT 763
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 764 GPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 812
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 71/178 (39%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 770 GPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 820
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 821 GATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 874
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 875 GNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG 929
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/186 (31%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 27/186 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP-- 69
N G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 630 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 683
Query: 70 ----SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 123
+G GP G+ GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 684 VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 737
Query: 124 -SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G + G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 738 VQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATG 791
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 792 ATGPQG 797
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/186 (31%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 24/186 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 671 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 722
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 723 -AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGAT 778
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 779 GPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ 829
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 830 GPAGAT 835
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/177 (32%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 755 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 805
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 806 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 856
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 857 G---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 910
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 65/175 (37%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 470 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQ 526
Query: 77 GPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 527 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 586
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 587 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG 638
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 21/184 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 745 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG- 797
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 798 --VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGV---QGP 846
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G G +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 847 AGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGN 903
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 904 TGAT 907
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/186 (31%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 21/186 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 725 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQ 781
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 782 G---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQ 829
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G GP+G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 830 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 886
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 887 GPAGAT 892
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/189 (30%), Positives = 71/189 (37%), Gaps = 21/189 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 557 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 614
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 615 -VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 667
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP+G GP +G GP G GP G GP+G GP
Sbjct: 668 G---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 721
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 722 GAQGPAGAT 730
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/178 (32%), Positives = 72/178 (40%), Gaps = 24/178 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ GP G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 686 GNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGVQ 739
Query: 74 RYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 740 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGAT 793
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 794 GPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 842
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 27/184 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 602 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 653
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ GP G GP+G GP +G GP G GP G
Sbjct: 654 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGV- 708
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 709 --QGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGAT 763
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 764 GPQG 767
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 440 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 497
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G +
Sbjct: 498 -VQGPAGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 556
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 557 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQ 616
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 617 GNTGAT 622
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 70/180 (38%), Gaps = 21/180 (11%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 587 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQ 640
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G +G
Sbjct: 641 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG-- 692
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +
Sbjct: 693 -ATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 745
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 21/183 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G G +G GP G+ GP G GP+G
Sbjct: 592 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGA 645
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G + GP
Sbjct: 646 TGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGP 696
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 697 QGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 750
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 751 QGV 753
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 67/178 (37%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 542 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 601
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ GP G G +G GP G GP G GP+G + GP G
Sbjct: 602 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 653
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G GP+G GP +G GP G GP G
Sbjct: 654 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG 707
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 24/187 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G GP
Sbjct: 715 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGP 771
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 772 AGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGA 822
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 823 TGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGA 873
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 874 QGNTGAT 880
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 72/194 (37%), Gaps = 12/194 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 410 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 466
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G +
Sbjct: 467 GVQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGNTGATGAT 520
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 521 GPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 580
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 581 GPQGVQGNTGATGA 594
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/177 (32%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 24/177 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 800 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 850
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP G G +G GP+G GP G + G +
Sbjct: 851 GATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 907
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 908 G---ATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 952
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/201 (27%), Positives = 73/201 (36%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGP------SGSLRYLGP---- 60
GP+G GP G G +G+ GP+G GP +G+ GP
Sbjct: 380 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 439
Query: 61 --SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 440 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 497
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYL 175
GP+G + GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 498 -VQGPAGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 556
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G G +
Sbjct: 557 GPAGATGATGPQGVQGNTGAT 577
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 67/186 (36%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 365 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 424
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 425 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 484
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 485 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 541
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 542 GNTGAT 547
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G GP+G
Sbjct: 433 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGPAGA 489
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNS 129
GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G +
Sbjct: 490 TGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGA 546
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 547 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGA 606
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 607 TGATG 611
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/200 (27%), Positives = 73/200 (36%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 340 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGA 399
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G GP+G+ GP +G GP +G GP G G
Sbjct: 400 TGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 459
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G + G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 460 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGNTGA 516
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G
Sbjct: 517 TGATGPQGAQGPAGATGATG 536
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 68/189 (35%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 335 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 394
Query: 74 RYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +G+ GP+G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 395 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 454
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ G +G G G G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 455 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 511
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 512 GNTGATGAT 520
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/165 (28%), Positives = 61/165 (36%), Gaps = 12/165 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G+ GP G G +G+ G G GP G G +G+ GP G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGA 219
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G G G GP G GP+G + GP G G +G GP
Sbjct: 220 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGP 273
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP+G GP G G +G G +G G+
Sbjct: 274 QG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGI 315
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/155 (27%), Positives = 55/155 (35%), Gaps = 3/155 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ G +G+ G G GP G G +G GP G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGA 219
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G G +G G G G +G + GP
Sbjct: 220 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGP 279
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+G GP G G +G G +G G
Sbjct: 280 AGATGATGPQGVQGNTGATGPQGIQGNTGATGATG 314
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/214 (26%), Positives = 74/214 (34%), Gaps = 48/214 (22%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 815 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGAT 865
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 866 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGAT 925
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------------RLRYLGPS 160
GP G GP+G GP G G +
Sbjct: 926 GPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGAT 982
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 983 GPQGIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATG 1013
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/159 (27%), Positives = 58/159 (36%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G+ GP G G +G GP G+ G +G G +G GP G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGA 219
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RY 165
G +G G G + GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 220 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 276
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP+G GP G G +G G + +G+
Sbjct: 277 QGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGI 315
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/212 (25%), Positives = 72/212 (33%), Gaps = 27/212 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G G
Sbjct: 237 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTG 296
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
+G G +G+ G P G G +G GP+G
Sbjct: 297 ATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATG 356
Query: 111 YLGPSG---RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
GP G G +G + GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 357 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATG 416
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +G G G G +
Sbjct: 417 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 448
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/204 (25%), Positives = 67/204 (32%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGSL 55
GP+G GP G G +G G +G G P G+
Sbjct: 278 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGNT 337
Query: 56 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP- 114
G +G GP+G GP G G +G GP G GP+G GP
Sbjct: 338 GATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 391
Query: 115 --SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G +G + GP+G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 392 GVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 451
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP G G +
Sbjct: 452 GVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 475
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 41/186 (22%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G +G GP G+ G +G GP+G GP G + G +G GP+
Sbjct: 860 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPA 919
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------------- 109
G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 920 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQ 973
Query: 110 ---RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LR 164
G +G GP+G + GP G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 974 GPQGNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIG 1027
Query: 165 YLGPSG 170
GP+G
Sbjct: 1028 VTGPTG 1033
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/178 (26%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 41/178 (23%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGP 69
GP G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 868 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGP 927
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------------RYLGP 105
G GP+G+ GP G GP+G G
Sbjct: 928 QG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGA 981
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 161
+G GP+G GP G + GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 982 TGPQGIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 1033
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/230 (23%), Positives = 73/230 (31%), Gaps = 39/230 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP G+ G +G+ GP+G GP G + GP G
Sbjct: 248 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGIQGNT 307
Query: 68 GPSG------------------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RL 100
G +G G +G GP+G GP G
Sbjct: 308 GATGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNT 367
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRL 154
G +G GP+G GP G + G +G GP+G GP G
Sbjct: 368 GATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNT 427
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G G +G GP G G +G G+ +G
Sbjct: 428 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGA 477
>gi|297622009|ref|YP_003710146.1| hypothetical protein wcw_1801 [Waddlia chondrophila WSU 86-1044]
gi|297377310|gb|ADI39140.1| hypothetical protein wcw_1801 [Waddlia chondrophila WSU 86-1044]
Length = 440
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/164 (29%), Positives = 73/164 (44%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +GS+ GP+G+ G G +GP+G+ +G G GP G
Sbjct: 173 GPVGATGATGETGSIGPTGPTGAAGIDGVDGATGPMGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGAT 232
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---D 130
G +G++ GP+G G G GP+G + G +G +GP+G + D
Sbjct: 233 GATGEAGAIGPTGPTGVAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVD 292
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G G GP+G + G +G +GP+G GP G + Y
Sbjct: 293 GVDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPAGPTGPIGTIIY 336
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 78/179 (43%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +GS+ GP+G G G+ +GP+G G G +
Sbjct: 164 GATGPTGPTGPVGATGATGETGSIGPTGPTGAAGIDGVDGATGPMGPTGA---TGEVGAI 220
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G + G +G +GP+G G G GP+G GP G + G +
Sbjct: 221 GPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGVAGVDGIDGATGPTGP---TGPVGATGATGEA 277
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP+G G G GP+G + G +G +GP+G GP G + Y
Sbjct: 278 GAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPAGPTGPIGTIIY 336
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 76/181 (41%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G + +GP+G G G GP+G GP G+ G +G + GP+G
Sbjct: 140 GATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPT---GPVGATGATGETGSIGPTGPTGAA 196
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ +GP+G +G G GP G G +G + GP+G DG
Sbjct: 197 GIDGVDGATGPMGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGVAGVDGID 256
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G + G +G +GP+G G G GP+G +G +G
Sbjct: 257 GATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPTGPTGPVGATGATGEA 316
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 317 G 317
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 74/175 (42%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G + G +G + +GP+G G G GP+G GP G G +G +
Sbjct: 131 GPTGPVGATGATGEVGAIGPTGPTGAAGVDGIDGATGPTGPT---GPVGATGATGETGSI 187
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G +GP+G +G G GP G G +G + GP+
Sbjct: 188 GPTGPTGAAGIDGVDGATGPMGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPT 247
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP+G + G +G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 248 GVAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGVDGVDGATGPTG 302
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 78/178 (43%), Gaps = 13/178 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G + G +G + +GP+G P+G+ G G GP+G + G +G
Sbjct: 131 GPTGPVGATGATGEVGAIGPTG------PTGAAGVDGIDGATGPTGPTGPVGATGATGET 184
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP+G G G GP G G G + GP+G + + G +G +GP+
Sbjct: 185 GSIGPTGPTGAAGIDGVDGATGPMGPTGATGEVGAIGPTGPTGPVGATGATGEAGAIGPT 244
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G G G GP+ GP+G + G +G +GP+G G+ DG+
Sbjct: 245 GPTGVAGVDGIDGATGPT------GPTGPVGATGATGEAGAIGPTGPTGAAGV-DGVD 295
>gi|337745522|ref|YP_004639684.1| hypothetical protein KNP414_01249 [Paenibacillus mucilaginosus
KNP414]
gi|336296711|gb|AEI39814.1| hypothetical protein KNP414_01249 [Paenibacillus mucilaginosus
KNP414]
Length = 603
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/137 (31%), Positives = 65/137 (47%), Gaps = 18/137 (13%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G + +GP+G+ GP+G GP+G +GP +GP+G GP+G
Sbjct: 385 TGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGA 438
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G +GP +GP+G + GP+G GP+G +GP +GP
Sbjct: 439 TGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGP 486
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+G GP+G R G
Sbjct: 487 TGATGATGPTGADRTGG 503
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/144 (31%), Positives = 67/144 (46%), Gaps = 24/144 (16%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G +GP +GP+G+ GP+G GP+G +GP +GP+G
Sbjct: 384 PTGDTGAVGP------IGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATG 431
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G+ GP+G +GP +GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 432 ATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP-- 483
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
+GP+G GP+G R G
Sbjct: 484 ----IGPTGATGATGPTGADRTGG 503
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/142 (31%), Positives = 66/142 (46%), Gaps = 18/142 (12%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G + +GP+G+ GP+G GP+G +GP +GP+G GP+G
Sbjct: 385 TGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGA 438
Query: 127 LNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+ GP+G +GP+G GP+G GP+G +GP +GP+G
Sbjct: 439 TGATGPAGDTGAVGPIGPTGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGA 492
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G R G G R G H
Sbjct: 493 TGPTGADRTGG---GDRPGGTH 511
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/92 (32%), Positives = 45/92 (48%), Gaps = 12/92 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G+ GP+G +GP +GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 424 IGPTGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGATGATGPAGD 477
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
+GP +GP+G GP+G R G
Sbjct: 478 TGAVGP------IGPTGATGATGPTGADRTGG 503
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/229 (24%), Positives = 81/229 (35%), Gaps = 63/229 (27%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G G GP+G+ GP+G P+G + GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 253 TGAPGATGATGPAGATGDTGPTG------PAGDIGPAGPTGATGATGPVGDTGATGPVGP 306
Query: 73 LRY---------------------LGPSG------------SLRYLGPSGRLRYLGPSG- 98
GP G + +GP+G GP G
Sbjct: 307 TGATGAVGATGATGATGATGDTGPTGPVGLTGDTGATGATGATGPMGPAGDTGPTGPVGL 366
Query: 99 -----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
GP+G +GP +GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 367 TGATGATGATGATGSTGPTGDTGAVGP------IGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGA 420
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP +GP+G GP+G GP+G +GP G G +
Sbjct: 421 VGP------IGPTGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGPIGPTGATGAT 463
>gi|42783700|ref|NP_980947.1| hypothetical protein BCE_4654 [Bacillus cereus ATCC 10987]
gi|42739629|gb|AAS43555.1| hypothetical protein BCE_4654 [Bacillus cereus ATCC 10987]
Length = 462
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
LGP+G GP+G+ GP+G+ G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGA---TGPTGVTGITGATGA 89
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 90 TGPTGVTGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGV 149
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 150 TGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGV 209
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 210 TGIT 213
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 71/184 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 57 TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGITGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGSTGATGI 116
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 117 TGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGV 176
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 177 TGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 236
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 237 TGAT 240
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 102 TGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTGA 161
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 162 TGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGA 221
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 222 TGITGATGPTGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGSTGATGATGSTGPTGA 281
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 282 TGITGAT 288
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/189 (26%), Positives = 76/189 (40%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + LGP+G P+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 31 GTVPKLGPTG------PTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGIT 84
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 85 GATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGAT 144
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 145 GPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGAT 204
Query: 197 DGLRVSGLH 205
V+G+
Sbjct: 205 GPTGVTGIT 213
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 73/187 (39%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 75 TGPTGVTGITGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGP 134
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + GP
Sbjct: 135 TGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGP 194
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 195 TGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGVTGATGP 254
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 255 TGATGIT 261
Score = 59.7 bits (143), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/187 (25%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 120 TGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGA 179
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---S 129
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G +
Sbjct: 180 TGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGA 239
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 240 TGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGA 299
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 300 TGSTGAT 306
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/185 (25%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 111 TGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGV 170
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + GP
Sbjct: 171 TGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGP 230
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 231 TGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGS 290
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 291 TGATG 295
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 66 TGATGPTGATGPTGVTGITGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGA 125
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 126 TGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGA 185
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 186 TGVTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGA 245
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 246 TGVT 249
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 147 TGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGP 206
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G GP+G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 207 TGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGS 266
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G G +G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 267 TGATGATGSTGPTGATGITGATGS------TGATGSTGATGSTGATGPTGATGSTGSTGP 320
Query: 190 LRYLGLS 196
G S
Sbjct: 321 TGITGTS 327
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 93 TGVTGITGATGPTGVTGSTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGVTGATGPTGVTGI 152
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 153 TGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGATGITGATGP---TGV 209
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 210 TGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGITGATGSTGA 269
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 270 TGAT 273
Score = 56.2 bits (134), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/182 (25%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G GP+G+ G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 138 TGVTGATGPTGVTGITGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGA 197
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 198 TGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPT---GATGVTGATGP 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 255 TGATGITGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGS 314
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 315 TG 316
>gi|229197471|ref|ZP_04324198.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1293]
gi|228586095|gb|EEK44186.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1293]
Length = 824
Score = 64.3 bits (155), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/195 (28%), Positives = 80/195 (41%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 489 IGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGP 548
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G + G +G G +G G G +G G GP
Sbjct: 549 QGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGP 608
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G +GP+G GP G + G +G
Sbjct: 609 TGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPIGAVGPTGATGSAGS 668
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+ +LG++ V+GL
Sbjct: 669 IGFLGIAGATGVTGL 683
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 68/167 (40%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G GP+G GP G+L
Sbjct: 481 GPKGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNL 540
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G GP G + G +G G +G + G G +G
Sbjct: 541 GENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQ 600
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G G G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 601 GSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGA 647
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/158 (29%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G+ GP G +GP+G++ GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 474 TGPQGA---QGPKGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGA 530
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G L G +G G G GP G + + G +G G +G G
Sbjct: 531 QGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGI 590
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G GP+G G G GP G
Sbjct: 591 QGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQG 628
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 71/190 (37%), Gaps = 2/190 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 435 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGLQGITGLTGPQGAQGPKGVQGIIGPTGA 494
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 495 IGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 554
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G + G +G G +G G G +G G GP+G
Sbjct: 555 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 614
Query: 193 LGL--SDGLR 200
G+ S G++
Sbjct: 615 TGIQGSQGIQ 624
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G+
Sbjct: 435 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGLQGITGLTGPQGAQGPKGVQGIIGPTGA 494
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L +G +G G
Sbjct: 495 IGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 554
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G GP G + G +G G +G G G +G G G + V
Sbjct: 555 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 614
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 615 TGIQ 618
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/180 (28%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G + GP G GP+GS GP G +G G G G + G +G
Sbjct: 92 NQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITG 151
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G G G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 152 VTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQG 211
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G + GPSG G +G + G G GP+G GP G
Sbjct: 212 PQGISGIKGITGVVGPQGPSGIQGIQGINGSTGFQGAKGVRGITGATGPTGTQGAEGPPG 271
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.082, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/151 (27%), Positives = 62/151 (41%), Gaps = 8/151 (5%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 8 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGSQGPQGIRGIQGPRG---TTGA 62
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G +G GP+G + G G +G + GP G GP+G
Sbjct: 63 QGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLIG---DIGVQGPEGIQGITGPTGSQGI 119
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G G+ G G + G++
Sbjct: 120 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGIT 150
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 68/190 (35%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP G GP G+ +G +G GP+G G G +
Sbjct: 36 TGPTGATGSQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGN 92
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G G + GP G GP+G GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 93 QGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGV 152
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G G G G G G +G + G G +GP+G GP
Sbjct: 153 TGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGP 212
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G++
Sbjct: 213 QGISGIKGIT 222
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G
Sbjct: 59 TTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTG 115
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G +G G+ G G + G +G G G G G G
Sbjct: 116 SQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQG 175
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G + GPSG
Sbjct: 176 EEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVVGPQGPSGIQG 235
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 236 IQGIN 240
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/155 (29%), Positives = 61/155 (39%), Gaps = 10/155 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G L G +G G G GP G + G +G G +G G G
Sbjct: 535 GPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQ 594
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------L 127
+G GS GP+G G G GP G G +G +GP+G +
Sbjct: 595 GIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPI 654
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-PSG 161
+ GP+G G +G + +LG +G G PSG
Sbjct: 655 GAVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGVTGLPSG 686
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 69 IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGI 125
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G + G +G G G G G G G G
Sbjct: 126 QGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGI 185
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G + GPSG G +G +
Sbjct: 186 TGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVVGPQGPSGIQGIQGINGSTGF 245
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 246 QG-AKGVR 252
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/201 (25%), Positives = 72/201 (35%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G + + G G + G +G+ GP G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 346 GAVGFQGAQGPQGFQGITGATGVEGPQGIQGPQGEIGPTGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQ 405
Query: 74 RYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G G
Sbjct: 406 GMQGLQGIQGPTGVAGAAGAQGAQGIQGATGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQ 465
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G +G + GP G +GP+G + GP G +GP+G G G
Sbjct: 466 GLQGITGLTGPQGAQGPKGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGIT 525
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G L G++
Sbjct: 526 GPTGAQGIRGPQGNLGENGIT 546
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/174 (28%), Positives = 63/174 (36%), Gaps = 14/174 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRY 66
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 11 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGSQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGA 68
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 69 IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGI 125
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G+ G G +G +G GP G G G G G
Sbjct: 126 QGEIGERGQ---TGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGE 176
>gi|229186983|ref|ZP_04314137.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus BGSC
6E1]
gi|228596537|gb|EEK54203.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus BGSC
6E1]
Length = 359
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 11 TGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGE 70
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G S
Sbjct: 71 TGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGS 130
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 131 TGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGS 190
Query: 190 L 190
Sbjct: 191 T 191
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 5 TGPTGSTGPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGN 64
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 65 TGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGN 124
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G GP+G G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 125 TGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETG 183
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/164 (26%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +GS G +GS GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 28 NTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGSTGPTGSTGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTG 87
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+GS G +G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 88 NTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTG 147
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S G +G G +G +G +G G +G GP+G
Sbjct: 148 STGATGNTGATGETGPTGSIGATGNTGATGNTGETGVTGPTGST 191
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/173 (27%), Positives = 68/173 (39%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+GS GP+G G +G G +GS G +G G +G GP+GS
Sbjct: 5 TGPTGST---GPTGETGSTGSTGAPGNTGATGSTGVTGNTGSTGSTGVTGST---GPTGS 58
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G G +G G +G G +G S G +G G
Sbjct: 59 TGPTGNTGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGVTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGN 118
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 119 TGATGNTGATGSTGVTGNTGATGETGPTGSTGATGNTGATGETGPTGSIGATG 171
>gi|255651745|ref|ZP_05398647.1| exosporium glycoprotein, partial [Clostridium difficile QCD-37x79]
Length = 387
Score = 63.9 bits (154), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 80/182 (43%), Gaps = 24/182 (13%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G+ G +G GP+G GP+GS+ G +G GP +
Sbjct: 1 TGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP---IGA 57
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGR 117
GP+G++ GP G + +GP+G G +G + G +G
Sbjct: 58 TGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGV 117
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP+G + + GP+G +GP+G G +G GP+G + G +G +GP
Sbjct: 118 AGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGANGVAGPIGP 174
Query: 178 SG 179
+G
Sbjct: 175 TG 176
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/172 (29%), Positives = 81/172 (47%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP+G+ G +G GP+G+ GP+G + G +G GP G+
Sbjct: 1 TGANGITGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGAT-- 58
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G + GP G + GP+G G +G + GP+G ++G G G +G
Sbjct: 59 -GPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGV 117
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G + GP+G +GP+G G +G GP+G + G +
Sbjct: 118 AGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGAN 166
Score = 62.0 bits (149), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 83/179 (46%), Gaps = 12/179 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G+ GP+G + G +G GP + GP+G
Sbjct: 7 TGPTGATGATGANGVTGATGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGP---IGATGPTGA 63
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ GP G + GP+G G +G + GP+G +GP+G G +G +
Sbjct: 64 VGATGPDGLVGPTGPTGPTGATGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAI-- 121
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G + GP+G +GP+G G +G GP+G + G +G +GP+G
Sbjct: 122 -GPTGAVGATGPTGADGAVGPTGATGATGANGA---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTG 176
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/200 (27%), Positives = 86/200 (43%), Gaps = 27/200 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP+GS+ G +G + GP+G + GP G + GP+G
Sbjct: 25 TGPTGNTGATGPTGSIGATGANGVTGATGPIGATGPTGAVGATGPDGLVGPTGPTGPTGA 84
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G + GP+G+ G G G +G +GP+G + GP+G +GP+G
Sbjct: 85 TGANGLVGPTGPTGATGANGLVGPTGATGATGVAGAIGPTGAVGATGPTGADGAVGPTGA 144
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------P 168
+ G +G GP+G + G +G +GP+G G P
Sbjct: 145 TGATGANGA---TGPTGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGP 201
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G + G +G +GP+G
Sbjct: 202 TGAVGATGANGVAGPIGPTG 221
>gi|423549522|ref|ZP_17525849.1| hypothetical protein IGW_00153, partial [Bacillus cereus ISP3191]
gi|401191062|gb|EJQ98092.1| hypothetical protein IGW_00153, partial [Bacillus cereus ISP3191]
Length = 282
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/215 (25%), Positives = 77/215 (35%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 15 IGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGN 74
Query: 73 LR---YLGPSGSLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+GS +GP+G G +G GP+G
Sbjct: 75 TGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGE 134
Query: 109 ---LRYLGPSGRLRY---LGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G GP+G S GP+G G +G G +G G
Sbjct: 135 TGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGNTGVTGSTGATGN 194
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 195 TGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGVTG 229
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/176 (27%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 111 IGPTGETGATGSTGVTGSTGPTG---ETGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGP 167
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G +G G +G G G G +G S G
Sbjct: 168 TGETGPTGSTGATGNTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGV 227
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 228 TGNTGATGSTGVTGETGPTGSTGVTGVTGN---TGATGSTGVTGPTGSTGATGSTG 280
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/211 (25%), Positives = 78/211 (36%), Gaps = 33/211 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRY--------------------- 48
GP+G G +G GP+G S GP+G
Sbjct: 51 TGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGS 110
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP+G G +G GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 111 IGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGE---TGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGP 167
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP+G G +G S G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 168 TGETGPTGSTGATGNTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGV 227
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 228 TGNTGATGSTGVTGE---TGPTGSTGVTGVT 255
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/207 (24%), Positives = 73/207 (35%), Gaps = 27/207 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 6 TGSTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGV 65
Query: 73 LRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRY---------------------LGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G S GP+G +GP+G G +G
Sbjct: 66 TGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGV 125
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 126 TGSTGPTGET---GPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGN 182
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+G G +G G +G G
Sbjct: 183 TGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGETGA 209
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/170 (27%), Positives = 66/170 (38%), Gaps = 9/170 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+GS G +G
Sbjct: 111 IGPTGETGATGSTGVTGSTGPTG---ETGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGP 167
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
GP+G G +G G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 168 TGETGPTGSTGATGNTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGNTGATGETGPTGSTGV 227
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 228 TGNTGATGSTGVTGETGPTGSTGVTGVTGNTGATGSTGVTGPTGSTGATG 277
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/208 (24%), Positives = 74/208 (35%), Gaps = 30/208 (14%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRY------ 66
+G G +G GP+G G +G GP+G S GP+G
Sbjct: 36 TGNTGATGETGVTGSTGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGA 95
Query: 67 ---------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 96 TGSTGATGTTGATGSIGPTGETGATGSTGVTGSTGPTGE---TGPTGNTGPTGETGVTGS 152
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGP 168
GP+G G +G GP+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 153 TGPTGSTGVTGSTGPTGETGPTGSTGATGNTGVTGSTGATGNTGATGNTGPTGETGAPGN 212
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G +G G++
Sbjct: 213 TGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVT 240
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/200 (25%), Positives = 71/200 (35%), Gaps = 33/200 (16%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+GS G +GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 2 ETGPTGSTGATG------SIGPTGETGATGSTGVTGSTGVTGNTGATGETGVTGSTGPTG 55
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRY---------------------LGPSG 116
G +G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 56 ETGATGSTGVTGSTGPTGNTGSTGNTGPTGSTGVTGSTGATGSTGATGTTGATGSIGPTG 115
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G S GP+G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 116 ETGATGSTGVTGSTGPTGE---TGPTGNTGPTGETGVTGSTGPTGSTGVTGSTGPTGETG 172
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G +G G +
Sbjct: 173 PTGSTGATGNTGVTGSTGAT 192
>gi|423522465|ref|ZP_17498938.1| hypothetical protein IGC_01848, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
gi|401174401|gb|EJQ81609.1| hypothetical protein IGC_01848, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
Length = 498
Score = 63.5 bits (153), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 62/178 (34%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ +GP G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 235 TGPQGNTGAQGNTGATGAIGPRGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGATGPQGNTGAQGNTGA 294
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G G G GP G G G GP G + GP
Sbjct: 295 TGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNT---GAQGNTGATGPQGNTGATGP 351
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 352 QGN---TGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGAQGNTGAQGNTGATGPQGNTGTQGNTGAT 406
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/181 (27%), Positives = 63/181 (34%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ +GP G GP G+ G +G GP G
Sbjct: 227 GNTGATGATGPQGNTGAQGNTGATGAIGPRGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGATGPQGNT 286
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G +G G +G G G GP G G G + GP
Sbjct: 287 GAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNT---GAQGNTGATGPQ 343
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 344 GNTGATGPQGN---TGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGAQGNTGAQGNTGATGPQGNTGTQ 400
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 401 G 401
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G+ G +G+ GP G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 253 IGPRGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGP 312
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G G G GP G GP G G G + GP
Sbjct: 313 QGNTGAQGNTGATGPQGNT---GAQGNTGATGPQGNTGATGPQGNT---GAQGNTGATGP 366
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G GP G G G GP G G +G
Sbjct: 367 QGNTGAQGNTGAQGNTGAQGNTGATGPQGN---TGTQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGA 423
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 424 TGI 426
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 65/191 (34%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G +GP G+ GP G+ G +G GP G+ G G GP G
Sbjct: 245 GNTGATGAIGPRGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGATGPQGN---TGAQGNTGATGPQGNT 301
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G +G G +G G G GP G GP G G
Sbjct: 302 GAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGATGPQGNT---GAQ 358
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G G G GP G
Sbjct: 359 GNTGATGPQGNTGAQGNTGAQGNTGAQGNTGATGPQGN---TGTQGNTGATGPQGNTGAQ 415
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G + +G+
Sbjct: 416 GNTGATGATGI 426
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 60/172 (34%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G+ G +G+ GP G G +G+ +GP G GP G G +G+
Sbjct: 219 PQGNTGAQGNTGATGATGPQGNTGAQGNTGATGAIGPRGNTGATGPQGNTGAQGNTGATG 278
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP G G +G G +G G +G G G + GP G G G
Sbjct: 279 ATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNT---GAQG 335
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP G G G GP G G +G G
Sbjct: 336 NTGATGPQGNTGATGPQGN---TGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGAQGNTGA 384
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 7/181 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ GP G G G+ GP G G +G
Sbjct: 321 NTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGATGPQGNT---GAQGNTGATGPQGNTGAQGNTG 377
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLNS 129
G G+ GP G G +G G +G G +G + GP+G S
Sbjct: 378 AQGNTGAQGNTGATGPQGNTGTQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGATGIGVTGPTGP--S 435
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GPSG GP G GP G G +G G G G +G G G
Sbjct: 436 GGPSGPTGPTGPQGNTGATGPQGNTGAQGNTGAQGNTGAQGNTGAQGNTGAQGNTGAQGN 495
Query: 190 L 190
Sbjct: 496 T 496
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 60/184 (32%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G GP G+ G +G G G G P G+ G +G GP
Sbjct: 179 GNTGVTGPQGNTGATGATGPRGNTGAQGNTGATGATGATGPQGNTGAQGNTGATGATGPQ 238
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ +GP G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 239 GNTGAQGNTGATGAIGPRGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGATGPQGNTGAQGNTGATGPQ 298
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G G G GP G G G GP G GP G
Sbjct: 299 GNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGN---TGAQGNTGATGPQGNTGATGPQGNT 355
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 356 GAQG 359
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 59/177 (33%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G G +G G G+ GP G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 267 NTGAQGNTGATGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATG 326
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ GP G GP G G G GP G G +G + G
Sbjct: 327 PQGNTGAQGNTGATGPQGNTGATGPQGN---TGAQGNTGATGPQGNTGAQGNTGAQGNTG 383
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G GP G G +G G + GP+G
Sbjct: 384 AQGNTGATGPQGN---TGTQGNTGATGPQGNTGAQGNTGATGATG----IGVTGPTG 433
>gi|260841663|ref|XP_002614030.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_67386 [Branchiostoma floridae]
gi|229299420|gb|EEN70039.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_67386 [Branchiostoma floridae]
Length = 438
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/202 (32%), Positives = 93/202 (46%), Gaps = 18/202 (8%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T T EK +GP+G GP G +GP+GS GP G +GP+GS GP
Sbjct: 217 TPETNEGEKGA-MGPAGSAGPSGPPGEKGAMGPAGSAGPSGPPGEKGAMGPAGSAGPPGP 275
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP-----SGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G +GP+G + GP L + GP G +GP S + + +GP GP
Sbjct: 276 LGEKGAMGPTGPMGMTGP---LGHGGPRG---LMGPIKLPESNKGQPVGPV-SFGPSGPP 328
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNS--DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G +GP+G +++ GP G + P+G GP G R + P+G Y G G
Sbjct: 329 GEKGQMGPAGPVSAWHPGPPGEKGAMEPTGSAGPSGPPGEKRAMWPAG---YTGLPGEKE 385
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+GP+G + GP G+ GL
Sbjct: 386 AMGPTGLIGMAGPPGQAGPRGL 407
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/209 (28%), Positives = 87/209 (41%), Gaps = 28/209 (13%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGP----------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
+GP+G + GP G +GP G +GP+GS GP G +
Sbjct: 187 AMGPAGPMGMAGPPGQAGPRGLMGPVGLPGTPETNEGEKGAMGPAGSAGPSGPPGEKGAM 246
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 125
GP+G GP G +GP+G GP G +GP+G + GP L + GP G
Sbjct: 247 GPAGSAGPSGPPGEKGAMGPAGSAGPPGPLGEKGAMGPTGPMGMTGP---LGHGGPRGLM 303
Query: 126 ------RLNSDGPSGRLRY--LGPSGRLRYLGPSGRLR--YLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
N P G + + GP G +GP+G + + GP G + P+G
Sbjct: 304 GPIKLPESNKGQPVGPVSFGPSGPPGEKGQMGPAGPVSAWHPGPPGEKGAMEPTGSAGPS 363
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP G R + P+G G + + +GL
Sbjct: 364 GPPGEKRAMWPAGYTGLPGEKEAMGPTGL 392
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/226 (28%), Positives = 92/226 (40%), Gaps = 51/226 (22%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGR--- 63
++GP+G LGP G + P+G S+ GP G +GP +GS R GP G
Sbjct: 68 DMGPTGSAGPLGPPGEKGAMAPAGPVSVGPPGPRGEKGDMGPIGSAGSARPPGPPGEEGT 127
Query: 64 LR-----------------YLGPSGRLRY--LGPSGSLRYLGPS-----------GRLRY 93
+R +GP+G + LGP G +GP+ G
Sbjct: 128 MRPAGPVSVGPPGPPGKRGAMGPAGPVFVGPLGPPGEKGAMGPAGPVSVGPPGPPGEKGA 187
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP----------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+GP+G + GP G+ +GP G +GP+G GP G +G
Sbjct: 188 MGPAGPMGMAGPPGQAGPRGLMGPVGLPGTPETNEGEKGAMGPAGSAGPSGPPGEKGAMG 247
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P+G GP G +GP+G GP G +GP+G + GP
Sbjct: 248 PAGSAGPSGPPGEKGAMGPAGSAGPPGPLGEKGAMGPTGPMGMTGP 293
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/224 (26%), Positives = 87/224 (38%), Gaps = 60/224 (26%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--SLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGP---SGSL 82
+GP+GS LGP G + P+G S+ GP G +GP +G R GP G++
Sbjct: 69 MGPTGSAGPLGPPGEKGAMAPAGPVSVGPPGPRGEKGDMGPIGSAGSARPPGPPGEEGTM 128
Query: 83 R-----------------YLGPSGRLRY--LGPSGRLRYLGPS-----------GRLRYL 112
R +GP+G + LGP G +GP+ G +
Sbjct: 129 RPAGPVSVGPPGPPGKRGAMGPAGPVFVGPLGPPGEKGAMGPAGPVSVGPPGPPGEKGAM 188
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRL----------------------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G + GP G+ + GP+G GP G +GP
Sbjct: 189 GPAGPMGMAGPPGQAGPRGLMGPVGLPGTPETNEGEKGAMGPAGSAGPSGPPGEKGAMGP 248
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G GP G +GP+G GP G +GP+G + G
Sbjct: 249 AGSAGPSGPPGEKGAMGPAGSAGPPGPLGEKGAMGPTGPMGMTG 292
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/207 (27%), Positives = 86/207 (41%), Gaps = 44/207 (21%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR-----------YLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G + ++GP LGP G +GP+G + +GP+G + GP
Sbjct: 147 AMGPAGPV-FVGP------LGPPGEKGAMGPAGPVSVGPPGPPGEKGAMGPAGPMGMAGP 199
Query: 70 SGRLRY---LGP----------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G+ +GP G +GP+G GP G +GP+G GP G
Sbjct: 200 PGQAGPRGLMGPVGLPGTPETNEGEKGAMGPAGSAGPSGPPGEKGAMGPAGSAGPSGPPG 259
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL--------GP 168
+GP+G GP G +GP+G + GP L + GP G + + P
Sbjct: 260 EKGAMGPAGSAGPPGPLGEKGAMGPTGPMGMTGP---LGHGGPRGLMGPIKLPESNKGQP 316
Query: 169 SGRLRY--LGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + + GP G +GP+G +
Sbjct: 317 VGPVSFGPSGPPGEKGQMGPAGPVSAW 343
>gi|443691693|gb|ELT93475.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_198019 [Capitella teleta]
Length = 340
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 76/193 (39%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---------LRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
G SGR G +G G +G G +G G +G+ G GR
Sbjct: 46 TGASGRDGQTGATGMNGNTGATGQNGQTGATGERGLDGRDGATGRAGQTGATGRDGVDGR 105
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G SGR G +G+ +G +G+ G +GR G +GR G +G + G
Sbjct: 106 TGATGSSGRNGETGSTGATGEVGATGQDGRSGATGRDGQTGATGRSGQTGATGNVGQTGA 165
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+GR DG GR G SGR G +G G +GR G SG GP+G
Sbjct: 166 TGR---DGVDGRTGATGSSGRDGQTGSTGSSGQTGATGRDGRTGASGNRGPTGPTGATGS 222
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
G GR G +
Sbjct: 223 RGFDGRTGATGTN 235
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
GR G SG G SG G +G G +G G +G G G
Sbjct: 31 DGRTGATGSSGRDGQTGASGRDGQTGATGMNGNTGATGQNGQTGATGERGLDGRDGATGR 90
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ G GR G SGR G +G +G +G+ G +GR G +GR
Sbjct: 91 AGQTGATGRDGVDGRTGATGSSGRNGETGSTGATGEVGATGQDGRSGATGRDGQTGATGR 150
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G + G +GR G GR G SGR G +G G +GR G
Sbjct: 151 SGQTGATGNVGQTGATGR---DGVDGRTGATGSSGRDGQTGSTGSSGQTGATGRDGRTGA 207
Query: 196 S 196
S
Sbjct: 208 S 208
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 75/175 (42%), Gaps = 10/175 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+G +G G +GR G +G+ G GR G SGR G SG G +G
Sbjct: 1 MGSTGRDGRTGATGRDGVDGRTGATGSSGLDGRTGATGSSGRDGQTGASGRDGQTGATGM 60
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G +G+ G +G R L G +GR G +GR DG GR G SGR
Sbjct: 61 NGNTGATGQNGQTGATGE-RGLDGRDGATGRAGQTGATGR---DGVDGRTGATGSSGRNG 116
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS--DGL 199
G +G +G +G+ G +GR G +GR G +G + G + DG+
Sbjct: 117 ETGSTGATGEVGATGQDGRSGATGRDGQTGATGRSGQTGATGNVGQTGATGRDGV 171
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 74/180 (41%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G SGR G +G+ +G +G G +GR G +G G +G + G +GR
Sbjct: 109 TGSSGRNGETGSTGATGEVGATGQDGRSGATGRDGQTGATGRSGQTGATGNVGQTGATGR 168
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G SGR G +G G +GR G SG GP+G S G
Sbjct: 169 DGVDGRTGAT---GSSGRDGQTGSTGSSGQTGATGRDGRTGASGNRGPTGPTGATGSRGF 225
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GR G +GR G +G G +G GP+G G GR G +GR
Sbjct: 226 DGRTGATGTNGRDGQTGATGVRGNNGETGSTGAQGPTGPTGATGTRGTDGRTGATGATGR 285
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G+ G +G G G+ G +G G G G SGR G +G
Sbjct: 63 NTGATGQNGQTGATGERGLDGRDGATGRAGQTGATGRDGVDGRTGATGSSGRNGETGSTG 122
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSG 125
+G +G G +GR G +GR G +G + G +GR G SG
Sbjct: 123 ATGEVGATGQDGRSGATGRDGQTGATGRSGQTGATGNVGQTGATGRDGVDGRTGATGSSG 182
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
R G +G G +GR G SG GP+G G GR G +GR G
Sbjct: 183 RDGQTGSTGSSGQTGATGRDGRTGASGNRGPTGPTGATGSRGFDGRTGATGTNGRDGQTG 242
Query: 186 PSG 188
+G
Sbjct: 243 ATG 245
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/188 (30%), Positives = 77/188 (40%), Gaps = 11/188 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +GR G +G G +G+ G GR G SG G SGR G +G
Sbjct: 1 MGSTGRDGRTGATGRDGVDGRTGATGSSGLDGRTGATGSSGRDGQTGASGRDGQTGATGM 60
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G G +G R L G +GR G +GR G GR G SGR
Sbjct: 61 NGNTGATGQNGQTGATGE-RGLDGRDGATGRAGQTGATGRD---GVDGRTGATGSSGRNG 116
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G +G +G+ G +GR G +GR G +G + G +GR G G
Sbjct: 117 ETGSTGATGEVGATGQDGRSGATGRDGQTGATGRSGQTGATGNVGQTGATGR---DGVDG 173
Query: 189 RLRYLGLS 196
R G S
Sbjct: 174 RTGATGSS 181
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 74/180 (41%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+A G +GR G +G+ G +G G +G + G G G +GR G
Sbjct: 90 RAGQTGATGRDGVDGRTGATGSSGRNGETGSTGATGEVGATGQDG---RSGATGRDGQTG 146
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+GR G +G++ G +GR G GR G SGR G +G G +GR
Sbjct: 147 ATGRSGQTGATGNVGQTGATGR---DGVDGRTGATGSSGRDGQTGSTGSSGQTGATGRDG 203
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G SG GP+G G GR G +GR G +G G +G GP+G
Sbjct: 204 RTGASGNRGPTGPTGATGSRGFDGRTGATGTNGRDGQTGATGVRGNNGETGSTGAQGPTG 263
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 74/177 (41%), Gaps = 8/177 (4%)
Query: 5 CVVEKALN--LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
E+ L+ G +GR G +G G +G+ G SGR G +G+ +G +G
Sbjct: 75 ATGERGLDGRDGATGRAGQTGATGRDGVDGRTGAT---GSSGRNGETGSTGATGEVGATG 131
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+ G +GR G +G G +G + G +GR G GR G SGR G
Sbjct: 132 QDGRSGATGRDGQTGATGRSGQTGATGNVGQTGATGRD---GVDGRTGATGSSGRDGQTG 188
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G +GR G SG GP+G G GR G +GR G +G
Sbjct: 189 STGSSGQTGATGRDGRTGASGNRGPTGPTGATGSRGFDGRTGATGTNGRDGQTGATG 245
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/190 (28%), Positives = 74/190 (38%), Gaps = 12/190 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRY 66
G +G +G +G G +G G +GR G +G++ G +GR
Sbjct: 118 TGSTGATGEVGATGQDGRSGATGRDGQTGATGRSGQTGATGNVGQTGATGRDGVDGRTGA 177
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G SGR G +GS G +GR G SG GP+G G GR G +GR
Sbjct: 178 TGSSGRDGQTGSTGSSGQTGATGRDGRTGASGNRGPTGPTGATGSRGFDGRTGATGTNGR 237
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G GP+ GP+G G GR G +GR G
Sbjct: 238 DGQTGATGVRGNNGETGSTGAQGPT------GPTGATGTRGTDGRTGATGATGRNGIDGR 291
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G GL
Sbjct: 292 TGATGERGLD 301
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/170 (30%), Positives = 67/170 (39%), Gaps = 9/170 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G +G +G+ G G G SGR G +GS G +GR G SG
Sbjct: 152 GQTGATGNVGQTGATGRDGVDGRTGATGSSGRDGQTGSTGSSGQTGATGRDGRTGASGNR 211
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G GR G +GR G +G G +G GP+ GP+
Sbjct: 212 GPTGPTGATGSRGFDGRTGATGTNGRDGQTGATGVRGNNGETGSTGAQGPT------GPT 265
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G GR G +GR G +G G +GR G GR
Sbjct: 266 GATGTRGTDGRTGATGATGRNGIDGRTGATGERGLDGSTGRTGATGNDGR 315
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 71/180 (39%), Gaps = 12/180 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +GR G +G++ G +G G GR G SG G +G G +GR
Sbjct: 145 TGATGRSGQTGATGNVGQTGATG---RDGVDGRTGATGSSGRDGQTGSTGSSGQTGATGR 201
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G SG+ GP+G G GR G +GR G +G G +G + GP
Sbjct: 202 DGRTGASGNRGPTGPTGATGSRGFDGRTGATGTNGRDGQTGATGVRGNNGETGSTGAQGP 261
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP+G G GR G +GR G +G G +GR G GR
Sbjct: 262 T------GPTGATGTRGTDGRTGATGATGRNGIDGRTGATGERGLDGSTGRTGATGNDGR 315
>gi|423605001|ref|ZP_17580894.1| hypothetical protein IIK_01582 [Bacillus cereus VD102]
gi|401244149|gb|EJR50513.1| hypothetical protein IIK_01582 [Bacillus cereus VD102]
Length = 433
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/195 (28%), Positives = 80/195 (41%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 98 IGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGP 157
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G + G +G G +G G G +G G GP
Sbjct: 158 QGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGP 217
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G +GP+G GP G + G +G
Sbjct: 218 TGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPIGAVGPTGATGSAGS 277
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+ +LG++ V+GL
Sbjct: 278 IGFLGIAGATGVTGL 292
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 68/167 (40%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G GP+G GP G+L
Sbjct: 90 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNL 149
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G GP G + G +G G +G + G G +G
Sbjct: 150 GENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQ 209
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G G G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 210 GSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGA 256
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 62/157 (39%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G+ GP G +GP+G++ GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 84 GPQGA---QGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQ 140
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G L G +G G G GP G + + G +G G +G G
Sbjct: 141 GIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQ 200
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G GP+G G G GP G
Sbjct: 201 GVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQG 237
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 71/189 (37%), Gaps = 2/189 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G +
Sbjct: 45 GPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGLQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGAI 104
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 105 GLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQ 164
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G + G +G G +G G G +G G GP+G
Sbjct: 165 GIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVT 224
Query: 194 GL--SDGLR 200
G+ S G++
Sbjct: 225 GIQGSQGIQ 233
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 70/183 (38%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G++
Sbjct: 45 GPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGLQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGAI 104
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G +GP+G G G GP+G GP G L +G +G G
Sbjct: 105 GLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQ 164
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP G + G +G G +G G G +G G G + V+
Sbjct: 165 GIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVT 224
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 225 GIQ 227
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 56/131 (42%), Gaps = 7/131 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G++ G +G G +G+ G G +G G GP+G+ G G
Sbjct: 171 GPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQ 230
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G G +G +GP+G GP + + GP+G G +G + +LG +
Sbjct: 231 GIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGP---IGAVGPTGA---TGSAGSIGFLGIA 284
Query: 152 GRLRYLG-PSG 161
G G PSG
Sbjct: 285 GATGVTGLPSG 295
>gi|423533158|ref|ZP_17509576.1| hypothetical protein IGI_00990, partial [Bacillus cereus HuB2-9]
gi|402464199|gb|EJV95897.1| hypothetical protein IGI_00990, partial [Bacillus cereus HuB2-9]
Length = 288
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/149 (30%), Positives = 62/149 (41%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +GS G +G G +GS GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGAT 63
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G G +G G +G GP+G S G +G GP+G G +
Sbjct: 64 GITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGAT 123
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 124 GAT---GPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 149
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/149 (29%), Positives = 63/149 (42%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G+ G +GS GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGAT 63
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G S G +
Sbjct: 64 GITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGAT 123
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 124 GA---TGPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 149
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 64/149 (42%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +GS G +G+ G +G GP+G+ GP+G G +G GP+G+
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGAT 63
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G +G G +G GP+G G +G + GP+G G +
Sbjct: 64 GITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGAT 123
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 124 GAT---GPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 149
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/149 (28%), Positives = 62/149 (41%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G +G G +G+ G +G GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 4 GATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGAT 63
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
G +G G +G G +G + GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 64 GITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGAT 123
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 124 GA---TGPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 149
>gi|423606741|ref|ZP_17582634.1| hypothetical protein IIK_03322, partial [Bacillus cereus VD102]
gi|401241395|gb|EJR47785.1| hypothetical protein IIK_03322, partial [Bacillus cereus VD102]
Length = 172
Score = 63.5 bits (153), Expect = 5e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G GP+G+ GP G G +G+ GP+G G
Sbjct: 1 GPAGATGATGAQGPAGVQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGAQ 60
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP+G G +G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 61 GPQGVQGPAGATGAQGPAG---ATGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGAT 117
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 118 GPQG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQG 172
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 61/161 (37%), Gaps = 18/161 (11%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G G G GP+G GP G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 1 GPAGATGATGAQGPAGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGAQG---VQGPAGAT 54
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP+G GP+G + GP+G GP G GP+G
Sbjct: 55 GATGAQGPQGVQGPAGATGAQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGAT 114
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 115 GATGPQG---VQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGATGA 149
>gi|326324002|gb|ADZ54066.1| virulence-associated trimeric autotransporter [Haemophilus parasuis
SH0165]
Length = 1360
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/189 (31%), Positives = 77/189 (40%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP+G GP+G + G +G +GP G + GP+G
Sbjct: 836 GPAGERGETGPAGPAGVAGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAG---PR 892
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G GP +GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 893 GPAGEPGKQGPRGDKGETGP------VGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTA 946
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G +GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 947 GIQGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQGPQGTAGIQGPK 1006
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G + +S
Sbjct: 1007 GERGNVSVS 1015
Score = 63.2 bits (152), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 75/183 (40%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G+ G +G +GP G
Sbjct: 825 ETGPAGPAGPRGPAGERGETGPAGPAGVAGPAG---PKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQG 881
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G+ G G +GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 882 PVGAAGPAGPRGPAGEPGKQGPRGDKGETGPVGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQG 941
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G GP+G +GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 942 PQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQGPQGTAG 1001
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 1002 IQG 1004
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 71/181 (39%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP+G GP+G GP+G GP+G G G
Sbjct: 809 GPKGNDGAPGARGEKGETGPAGPAGPRGPAGERGETGPAGPAGVAGPAGPKGEAGAKGEK 868
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G +GP G + GP+G G G+ G G +GP+G GP
Sbjct: 869 ---GDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAGPRGPAGEPGKQGPRGDKGETGPVGPAGAKGEPGPR 925
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP G GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 926 GEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQ 985
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 986 G 986
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/132 (32%), Positives = 55/132 (41%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + GP+G G G G G +GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 877 VGPQGPVGAAGPAGPRGPAGEPGKQGPRGDKGETGPVGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGP 936
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ GP G GP+G +GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 937 TGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQGP 996
Query: 133 SGRLRYLGPSGR 144
G GP G
Sbjct: 997 QGTAGIQGPKGE 1008
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/177 (32%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 15/177 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP+G+ GP G G +G GP+G + GP G GP G
Sbjct: 445 AGPRGERGEIGPAGAAGPRGPEGPK---GDTGERGATGPAGPVGPAGPRGAPGPAGPKGE 501
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP G GP G GP+G GP+G GP G + G
Sbjct: 502 AGAKGETGPAGARGPQGEKGAQGPMG---PAGPAGERGQQGPTG---PQGPQGTPGTPGQ 555
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G +GP G GP G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 556 KGDKGDPGPAGPKGDVGPKGD---TGPRGEAGPAGPRGPAGERGPAGE---TGPAGE 606
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 63/158 (39%), Gaps = 12/158 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + GP G+ GP G G +G GP G GP G GP+G
Sbjct: 478 TGPAGPVGPAGPRGAPGPAGPKGEAGAKGETGPAGARGPQGEKGAQGPMG---PAGPAGE 534
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP G G G GP+G +GP G GP G GP
Sbjct: 535 RGQQGPTGP---QGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDVGPKGD---TGPRGEAGPAGP 588
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP+G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 589 RGPAGERGPAGE---TGPAGEPGKQGPKGEQGAPGPTG 623
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 12/176 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G + GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 460 AGPRGPEGPKGDTGERGATGPAGPVGPAGPRGAPGPAGPKGEAGAKGETGPAGARGPQGE 519
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G GP+G GP G G G GP+G GP
Sbjct: 520 KGAQGPMGP---AGPAGERGQQGPTG---PQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDVGP 573
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP+G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 574 KGD---TGPRGEAGPAGPRGPAGERGPAGE---TGPAGEPGKQGPKGEQGAPGPTG 623
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 68/176 (38%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP G +GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 428 GPKGDKGEQGLRGETGPAGPRGERGEIGPAGAAGPRGPEGPK---GDTGERGATGPAGPV 484
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G +G GP G GP G GP+G GP+
Sbjct: 485 GPAGPRGAPGPAGPKGEAGAKGETGPAGARGPQGEKGAQGPMG---PAGPAGERGQQGPT 541
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G G G GP+G +GP G G +G GP+G
Sbjct: 542 G---PQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDVGPKGDTGPRGEAGPAGPRGPAGE 594
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 70/198 (35%), Gaps = 30/198 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G GP G GP G GP+G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 570 DVGPKGDT---GPRGEAGPAGPRGPAGERGPAGET---GPAGEPGKQGPKGEQGAPGPTG 623
Query: 72 ------------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP+G GP G GP G G +G+ G
Sbjct: 624 PRGERGEAGPAGAAGPAGPQGTPGPAGPRGEPGPKGEPGIQGPKGD---KGDTGQKGEAG 680
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
P+G GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP G
Sbjct: 681 PAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGEQGLPGVAGPKGDRGDVGPMGPVGPTGPQGAPGPAGPKG 740
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G
Sbjct: 741 EAGAKGDRGDRGETGPEG 758
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/207 (26%), Positives = 71/207 (34%), Gaps = 30/207 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G+ GP+G GP+G+ GP G GP G +GP G + G
Sbjct: 669 DKGDTGQKGEAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGEQGLPGVAGPKGDRGDVGPMGPVGPTG 728
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
P G GP G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 729 PQGAPGPAGPKGEAGAKGDRGDRGETGPEGPQGPRGEQGLRGEQGPAGPTGPRGEQGPEG 788
Query: 117 RL---------------RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G + G G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 789 KQGIQGPAGPAGPAGAQGIQGPKGNDGAPGARGEKGETGPAGPAGPRGPAGERGETGPAG 848
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G G G +G
Sbjct: 849 PAGVAGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAG 875
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 21/185 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG- 71
GP G +GP G + GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 709 AGPKGDRGDVGPMGPVGPTGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDRGDRGETGPEGPQGPRGEQGL 768
Query: 72 --RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+G GP G+ GP G G G GP
Sbjct: 769 RGEQGPAGPTGPRGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPAGAQGIQGPKGNDGAPGARGEKGETGP 828
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G GP+G GP+G GP+G G G G +G +GP G +
Sbjct: 829 AGPAGPRGPAGERGETGPAGPAGVAGPAGPKGEAGAKGEK---GDTGEAGPVGPQGPVGA 885
Query: 175 LGPSG 179
GP+G
Sbjct: 886 AGPAG 890
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 33/205 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPS 70
GP G GP G G +G GP+G GP+G+ GP G GP
Sbjct: 656 GPKGEPGIQGPKGDK---GDTGQKGEAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGEQGLPGVAGPK 712
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------------GRL 118
G +GP G + GP G GP G G G GP G
Sbjct: 713 GDRGDVGPMGPVGPTGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDRGDRGETGPEGPQGPRGEQGLRGEQ 772
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G GP G+ GP G G G GP+G
Sbjct: 773 GPAGPTGPRGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPAGAQGIQGPKGNDGAPGARGEKGETGPAGPA 832
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 833 GPRGPAGERGETGPAGPAGVAGPAG 857
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/191 (29%), Positives = 70/191 (36%), Gaps = 30/191 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G +GP G GP G GP G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 561 DPGPAGPKGDVGPKGDT---GPRGEAGPAGPRGPAGERGPAGET---GPAGEPGKQGPKG 614
Query: 72 RLRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP+G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 615 EQGAPGPTGPRGERGEAGPAGAAGPAGPQGTPGPAGPRGEPGPKGEPGIQGPKGD---KG 671
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G+ GP+G +GP+G GP G GP G +GP G + GP G
Sbjct: 672 DTGQKGEAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGEQGLPGVAGPKGDRGDVGPMGPVGPTGPQG 731
Query: 171 RLRYLGPSGRL 181
GP G
Sbjct: 732 APGPAGPKGEA 742
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.89, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/204 (27%), Positives = 73/204 (35%), Gaps = 33/204 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------SLRYLG 59
++GP G + GP G+ GP G G G GP G G
Sbjct: 717 DVGPMGPVGPTGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDRGDRGETGPEGPQGPRGEQGLRGEQGPAG 776
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
P+G GP G+ GP G+ G G GP+G G
Sbjct: 777 PTGPRGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPAGAQGIQGPKGNDGAPGARGEKGETGPAGPAGPRG 836
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P+G GP+G GP+G G +G G +G +GP G + GP+G
Sbjct: 837 PAGERGETGPAGPAGVAGPAG---PKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAG--- 890
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G GP G
Sbjct: 891 PRGPAGEPGKQGPRGDKGETGPVG 914
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/173 (30%), Positives = 67/173 (38%), Gaps = 15/173 (8%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP----- 78
P+G +GP G+ GP G G G GP G +GP+G GP
Sbjct: 414 PTGPAGPIGPQGAP---GPKGDKGEQGLRGETGPAGPRGERGEIGPAGAAGPRGPEGPKG 470
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G GP+G + GP G GP G G +G GP G + GP G
Sbjct: 471 DTGERGATGPAGPVGPAGPRGAPGPAGPKGEAGAKGETGPAGARGPQGEKGAQGPMG--- 527
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G GP G G G GP+G +GP G
Sbjct: 528 PAGPAGERGQQGPTG---PQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDVGPKGDT 577
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 64/186 (34%), Gaps = 21/186 (11%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS- 79
GP G +GP G + GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 708 VAGPKGDRGDVGPMGPVGPTGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDRGDRGETGPEGPQGPRGEQG 767
Query: 80 --GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G GP+G GP G+ GP G G G G
Sbjct: 768 LRGEQGPAGPTGPRGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPAGAQGIQGPKGNDGAPGARGEKGETG 827
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G GP+G GP+G GP+G G G G +G +GP G +
Sbjct: 828 PAGPAGPRGPAGERGETGPAGPAGVAGPAGPKGEAGAKGE---KGDTGEAGPVGPQGPVG 884
Query: 183 YLGPSG 188
GP+G
Sbjct: 885 AAGPAG 890
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 30/186 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP G+ G G GP+G +GP G GP G
Sbjct: 529 AGPAGERGQQGPTGP---QGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDVGPKGD---TGPRGE 582
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------- 116
GP G GP+G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 583 AGPAGPRGPAGERGPAGE---TGPAGEPGKQGPKGEQGAPGPTGPRGERGEAGPAGAAGP 639
Query: 117 --RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
GP+G GP G GP G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 640 AGPQGTPGPAGPRGEPGPKGEPGIQGPKGD---KGDTGQKGEAGPAGPRGPEGPAGAKGE 696
Query: 175 LGPSGR 180
GP G
Sbjct: 697 QGPRGE 702
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/209 (27%), Positives = 76/209 (36%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G G+ +GP+G G G GP G+ G G GP+G
Sbjct: 507 ETGPAGARGPQGEKGAQGPMGPAGPAGERGQQGPTGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAG 566
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+GP G GP G GP G GP+G GP+G GP G + G
Sbjct: 567 PKGDVGPKGDT---GPRGEAGPAGPRGPAGERGPAGET---GPAGEPGKQGPKGEQGAPG 620
Query: 132 PSG------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLG 167
P+G GP+G GP G GP +G+ G
Sbjct: 621 PTGPRGERGEAGPAGAAGPAGPQGTPGPAGPRGEPGPKGEPGIQGPKGDKGDTGQKGEAG 680
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G GP+G GP G G++
Sbjct: 681 PAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGEQGLPGVA 709
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 59/152 (38%), Gaps = 12/152 (7%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G GP G GP G G +G+ GP+G GP+G+ GP G
Sbjct: 647 GPAGPRGEPGPKGEPGIQGPKGDK---GDTGQKGEAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGEQ 703
Query: 92 ---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
GP G +GP G + GP G GP G + G G GP G
Sbjct: 704 GLPGVAGPKGDRGDVGPMGPVGPTGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDRGDRGETGPEGPQGPR 763
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G GP+ GP+G GP G+
Sbjct: 764 GEQGLRGEQGPA------GPTGPRGEQGPEGK 789
>gi|218904837|ref|YP_002452671.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH820]
gi|218539677|gb|ACK92075.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH820]
Length = 706
Score = 63.2 bits (152), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/181 (33%), Positives = 75/181 (41%), Gaps = 27/181 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 326 GPAGTTGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG-- 377
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 378 -AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGV---QGPA 427
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 428 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 478
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 479 G 479
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/177 (33%), Positives = 74/177 (41%), Gaps = 27/177 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP G+ GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 341 GPAGATGATGPQGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG-- 392
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 393 -VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV---QGPA 442
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 443 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 490
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/179 (33%), Positives = 74/179 (41%), Gaps = 28/179 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 410 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 460
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G GP+G + GP+G GP+G G
Sbjct: 461 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSG--GPTGPTGPQG 512
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 513 PQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 562
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 28/183 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 395 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 445
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--RLNSDG 131
GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 446 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTG 499
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
PSG GP+G GP G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 500 PSG-----GPTGPTGPQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATG 548
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 549 ATG 551
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 71/193 (36%), Gaps = 36/193 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR----------------- 56
G +G GP G+ G +G+ G G GP G+
Sbjct: 263 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGATGATGPQ 322
Query: 57 -YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP+G GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP
Sbjct: 323 GVQGPAGTTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 376
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP+G + GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 377 G---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQ 424
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G
Sbjct: 425 GPAGATGATGPQG 437
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/201 (28%), Positives = 73/201 (36%), Gaps = 36/201 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------ 65
N G +G G +G+ GP G+ G +G G G+ GP G
Sbjct: 252 NTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATG 311
Query: 66 ------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP+G GP G+ GP+G GP G GP G G
Sbjct: 312 ATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGATGATGPQG---AQG 365
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P+G GP G + GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 366 PAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATG 416
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP+G G
Sbjct: 417 ATGPQG---VQGPAGATGATG 434
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 69/194 (35%), Gaps = 33/194 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 244 TGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGA 303
Query: 73 LR------------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+G+ GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 304 QGPAGATGATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGATGATGP 360
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP+G + GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 361 QG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---A 408
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G
Sbjct: 409 QGPAGATGATGPQG 422
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 27/193 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 209 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGAT 268
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------YLGPS 115
GP G+ G +G G G GP G GP+
Sbjct: 269 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGATGATGPQGVQGPA 328
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP G + GP+G GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 329 GTTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQ 379
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G
Sbjct: 380 GPAGATGATGPQG 392
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/196 (28%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 30/196 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 225 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 284
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G G+ GP G GP+G GP G G
Sbjct: 285 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQG---AQG 341
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P+G GP G + GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 342 PAGATGATGPQGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG--- 392
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP G
Sbjct: 393 VQGPAGATGATGPQGA 408
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/199 (28%), Positives = 69/199 (34%), Gaps = 33/199 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G+ G +G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 236 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 295
Query: 74 RYLGPSGSLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 296 GATGPQGAQGPAGATGATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 352
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP G + GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 353 GATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 403
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP+G G
Sbjct: 404 GPQG---AQGPAGATGATG 419
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/200 (27%), Positives = 68/200 (34%), Gaps = 30/200 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 217 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGA 276
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGP 114
G +G+ G G GP G GP+G GP
Sbjct: 277 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGP 336
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP+G + GP G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 337 QG---AQGPAGATGATGPQGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGA 387
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP+G G
Sbjct: 388 TGPQG---VQGPAGATGATG 404
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/200 (25%), Positives = 65/200 (32%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 222
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G G +G G +G GP G + G
Sbjct: 223 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGA 282
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 283 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQG---A 339
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G G
Sbjct: 340 QGPAGATGATGPQGATGATG 359
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 69/167 (41%), Gaps = 30/167 (17%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 425 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 475
Query: 74 RYLGPSG--------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP+G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 476 GATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSG--GPTGPTGPQGPQGNTGATGPQG---IQGPAG 530
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 170
+ GP G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 531 ATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 571
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/195 (25%), Positives = 63/195 (32%), Gaps = 21/195 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 172 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGA 231
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 232 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 291
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 292 QGNTGATGPQGAQGPAGATGATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQG---AQGPAGATGA 348
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G
Sbjct: 349 TGPQGATGATGPQGA 363
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/201 (25%), Positives = 66/201 (32%), Gaps = 24/201 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 180 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 239
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G G +G GP G G +G G G + G
Sbjct: 240 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 299
Query: 132 PSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 300 PQGAQGPAGATGATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGATG 356
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP+G G
Sbjct: 357 ATGPQG---AQGPAGATGATG 374
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/194 (26%), Positives = 62/194 (31%), Gaps = 24/194 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G G +G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 191 GAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 250
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN----- 128
G +G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 251 GNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGAT 310
Query: 129 -------------SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
GP+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 311 GATGATGATGPQGVQGPAGTTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGATGATGPQG---AQ 364
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP G
Sbjct: 365 GPAGATGATGPQGA 378
>gi|423582736|ref|ZP_17558847.1| hypothetical protein IIA_04251 [Bacillus cereus VD014]
gi|401211551|gb|EJR18298.1| hypothetical protein IIA_04251 [Bacillus cereus VD014]
Length = 333
Score = 62.8 bits (151), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/173 (26%), Positives = 70/173 (40%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + +GP+G G +G G +G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 31 GTVPKVGPTGPTGATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDT 90
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ +G GP+G GP+G GP+G G +G + G +G
Sbjct: 91 GPTGA------TGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT 144
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 145 GITGATGITGVTGPTGATGATGITGATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGATGT 197
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/162 (26%), Positives = 67/162 (41%), Gaps = 6/162 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G++ +GP+G G +G G +G G +G GP+G+ GP+G
Sbjct: 31 GTVPKVGPTGPTGATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDT 90
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP+G +G GP+G GP+G + GP+G G +G G +G
Sbjct: 91 GPTGA------TGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT 144
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G +G G++
Sbjct: 145 GITGATGITGVTGPTGATGATGITGATGPTGATGSTGVTGVT 186
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/162 (27%), Positives = 65/162 (40%), Gaps = 3/162 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G G +G G +G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 36 VGPTGPTGATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDTGPTGA 95
Query: 73 LRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G P+G+ GP+G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 96 TGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGITGATGITGV 155
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 156 TGPTGATGATGITGATGPTGATGSTGVTGVTGSTGATGATGT 197
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/161 (26%), Positives = 65/161 (40%), Gaps = 6/161 (3%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + +GP+G G +G G +G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 31 GTVPKVGPTGPTGATGATGDTSPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGATGDTGPTGATGDT 90
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 91 GPTGA------TGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGITGAT 144
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G GP+G G +G G + V+G+
Sbjct: 145 GITGATGITGVTGPTGATGATGITGATGPTGATGSTGVTGV 185
>gi|423374834|ref|ZP_17352172.1| hypothetical protein IC5_03888 [Bacillus cereus AND1407]
gi|401093540|gb|EJQ01635.1| hypothetical protein IC5_03888 [Bacillus cereus AND1407]
Length = 711
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/195 (28%), Positives = 79/195 (40%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 376 IGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGP 435
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G + G +G G +G G G +G G GP
Sbjct: 436 QGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGP 495
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G +GP+G GP G + G +G
Sbjct: 496 TGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPIGAVGPTGATGSAGS 555
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+ +LG++ +GL
Sbjct: 556 IGFLGIAGATGATGL 570
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 68/167 (40%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G GP+G GP G+L
Sbjct: 368 GPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNL 427
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G GP G + G +G G +G + G G +G
Sbjct: 428 GENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQ 487
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G G G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 488 GSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGA 534
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/158 (29%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G+ GP G +GP+G++ GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 361 TGPQGA---QGPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGA 417
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G L G +G G G GP G + + G +G G +G G
Sbjct: 418 QGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGI 477
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G GP+G G G GP G
Sbjct: 478 QGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQG 515
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 71/190 (37%), Gaps = 2/190 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 322 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 381
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 382 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 441
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G + G +G G +G G G +G G GP+G
Sbjct: 442 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 501
Query: 193 LGL--SDGLR 200
G+ S G++
Sbjct: 502 TGIQGSQGIQ 511
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G+
Sbjct: 322 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 381
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L +G +G G
Sbjct: 382 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 441
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G GP G + G +G G +G G G +G G G + V
Sbjct: 442 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 501
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 502 TGIQ 505
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/160 (28%), Positives = 67/160 (41%), Gaps = 8/160 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGI 76
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G+ +G +G GP+G G G + G G + G G + GP+G
Sbjct: 77 QGA---IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGI 130
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G +G G+ G G + G +G +GPS
Sbjct: 131 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGATGPIGPS 170
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/201 (25%), Positives = 72/201 (35%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G + + G G + G +G+ GP G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 233 GAVGFQGAQGPQGFQGITGATGVEGPQGIQGPQGAIGPTGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQ 292
Query: 74 RYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G G
Sbjct: 293 GMQGLQGIQGPTGVAGAAGAQGAQGIQGATGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQ 352
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G +G + GP G +GP+G + GP G +GP+G G G
Sbjct: 353 GIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGIT 412
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G L G++
Sbjct: 413 GPTGAQGIRGPQGNLGENGIT 433
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/155 (29%), Positives = 61/155 (39%), Gaps = 10/155 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G L G +G G G GP G + G +G G +G G G
Sbjct: 422 GPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQ 481
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------L 127
+G GS GP+G G G GP G G +G +GP+G +
Sbjct: 482 GIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPI 541
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-PSG 161
+ GP+G G +G + +LG +G G PSG
Sbjct: 542 GAVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGATGLPSG 573
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/142 (28%), Positives = 59/142 (41%), Gaps = 5/142 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G+ G G + G G
Sbjct: 31 IGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGI 88
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G+ +G G + +G G +GP+G GP G +G G+ +
Sbjct: 89 TGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGA 148
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G + G +G +GPS
Sbjct: 149 QGIQGVIGEAGITGATGPIGPS 170
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/144 (26%), Positives = 56/144 (38%), Gaps = 5/144 (3%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGI 76
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G + G G G G +G G + +G G +GP+G GP G
Sbjct: 77 QGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGI 136
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+G G+ G+ + +G+
Sbjct: 137 QGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGI 160
>gi|217960768|ref|YP_002339332.1| hypothetical protein BCAH187_A3387 [Bacillus cereus AH187]
gi|423353057|ref|ZP_17330684.1| hypothetical protein IAU_01133 [Bacillus cereus IS075]
gi|423567750|ref|ZP_17543997.1| hypothetical protein II7_00973 [Bacillus cereus MSX-A12]
gi|217064810|gb|ACJ79060.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus AH187]
gi|401090217|gb|EJP98377.1| hypothetical protein IAU_01133 [Bacillus cereus IS075]
gi|401212800|gb|EJR19542.1| hypothetical protein II7_00973 [Bacillus cereus MSX-A12]
Length = 835
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/195 (28%), Positives = 79/195 (40%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 500 IGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGP 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G + G +G G +G G G +G G GP
Sbjct: 560 QGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGP 619
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G +GP+G GP G + G +G
Sbjct: 620 TGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPIGAVGPTGATGSAGS 679
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+ +LG++ +GL
Sbjct: 680 IGFLGIAGATGATGL 694
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 68/167 (40%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G GP+G GP G+L
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNL 551
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G GP G + G +G G +G + G G +G
Sbjct: 552 GENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQ 611
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G G G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 612 GSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGA 658
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/158 (29%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G+ GP G +GP+G++ GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 485 TGPQGAQ---GPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGA 541
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G L G +G G G GP G + + G +G G +G G
Sbjct: 542 QGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGI 601
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G GP+G G G GP G
Sbjct: 602 QGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQG 639
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 71/190 (37%), Gaps = 2/190 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 446 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 506 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 565
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G + G +G G +G G G +G G GP+G
Sbjct: 566 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 625
Query: 193 LGL--SDGLR 200
G+ S G++
Sbjct: 626 TGIQGSQGIQ 635
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G+
Sbjct: 446 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L +G +G G
Sbjct: 506 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 565
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G GP G + G +G G +G G G +G G G + V
Sbjct: 566 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 625
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 626 TGIQ 629
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/201 (25%), Positives = 72/201 (35%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G + + G G + G +G+ GP G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 357 GAVGFQGAQGPQGFQGITGATGVEGPQGIQGPQGAIGPTGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQ 416
Query: 74 RYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G G
Sbjct: 417 GMQGLQGIQGPTGVAGAAGAQGAQGIQGATGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQ 476
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G +G + GP G +GP+G + GP G +GP+G G G
Sbjct: 477 GIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGIT 536
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G L G++
Sbjct: 537 GPTGAQGIRGPQGNLGENGIT 557
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/155 (29%), Positives = 61/155 (39%), Gaps = 10/155 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G L G +G G G GP G + G +G G +G G G
Sbjct: 546 GPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQ 605
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------L 127
+G GS GP+G G G GP G G +G +GP+G +
Sbjct: 606 GIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPI 665
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-PSG 161
+ GP+G G +G + +LG +G G PSG
Sbjct: 666 GAVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGATGLPSG 697
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/177 (27%), Positives = 62/177 (35%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G + G G +GP+GS GP G +G G G G + G +G
Sbjct: 103 NQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITG 162
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G G G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 163 VTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQG 222
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G GP G G SG + G G G +G G G
Sbjct: 223 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGSTGTQGVEG 279
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/177 (27%), Positives = 70/177 (39%), Gaps = 11/177 (6%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGI 76
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G+ +G +G GP+G G G + G G + G G + GP+G
Sbjct: 77 QGA---IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGI 130
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +G G+ G G +G +G GP G G G G+
Sbjct: 131 QGPQGIQGEIGERGQ---TGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGI 184
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.73, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/197 (25%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 23/197 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRY 66
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 22 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGIQGA 79
Query: 67 LGPSGRLRYLGPS---------------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G +G GP+ G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 80 IGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGE 139
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G G+ G G + G +G G G G G G G G +G
Sbjct: 140 IGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGE 199
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G +GP+G
Sbjct: 200 QGHQGDQGIQGVVGPTG 216
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.94, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/151 (27%), Positives = 62/151 (41%), Gaps = 8/151 (5%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRG---TTGA 73
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G +G GP+G + G G + G + G G +GP+G
Sbjct: 74 QGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLI---GDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGI 130
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G G+ G G + G++
Sbjct: 131 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGIT 161
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.99, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G+ G G + G G G G +G G
Sbjct: 47 TGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGL 106
Query: 73 LRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ +G G +GP+G GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 107 IGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGP 166
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G G G G G +G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 167 QGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGI 226
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 227 SGIKGIT 233
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/171 (25%), Positives = 58/171 (33%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G + G G +GP+GS GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 108 GDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQ 167
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G G G G G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 168 GSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGIS 227
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP G G SG + G G G + G+
Sbjct: 228 GIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGSTGTQGVE 278
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + G G + G G +GP+G
Sbjct: 70 TTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAG 126
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G +G G+ G G + G +G G G G G G
Sbjct: 127 SQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQG 186
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 187 EEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQG 246
Query: 192 YLGLS 196
G+S
Sbjct: 247 IQGVS 251
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + G G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 80 IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGI 136
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G + G +G G G G G G G G
Sbjct: 137 QGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGI 196
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 197 TGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 256
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 257 QG-AKGVR 263
>gi|206977353|ref|ZP_03238250.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
gi|206744504|gb|EDZ55914.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
Length = 524
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 70/169 (41%), Gaps = 6/169 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS GP+G G +G GP+G G +G G +G G +GS
Sbjct: 201 TGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGS 260
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G GPSG G +G GPSG S G +G GP
Sbjct: 261 TGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGP 320
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 321 TG---ITGPTGN---TGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGSA 363
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/160 (30%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 210 TGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGI 269
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GPSG G +G GPSG G +G GP+G GP
Sbjct: 270 TGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPTGI---TGP 326
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 327 TGN---TGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGSA 363
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/200 (28%), Positives = 73/200 (36%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---- 71
SG GP+G+ G +GS GP+G G +GS GPSG G +G
Sbjct: 120 SGATGSTGPTGNTGSTGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGN 179
Query: 72 -----------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +GS GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 180 TGSTGSTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGS 239
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G S G +G GP+G G +G GPSG G +G
Sbjct: 240 TGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGI 299
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GPSG G +G G
Sbjct: 300 TGPSGNTGSTGSTGPTGITG 319
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/197 (27%), Positives = 72/197 (36%), Gaps = 21/197 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------- 62
GP+G G +GS GP+G G +G GPSG+ G +G
Sbjct: 126 TGPTGNTGSTGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGS 185
Query: 63 -----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 186 TGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGI 245
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S GP+G G +G GPSG G +G GPSG
Sbjct: 246 TGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGN 305
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G
Sbjct: 306 TGSTGSTGPTGITGPTG 322
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/203 (28%), Positives = 73/203 (35%), Gaps = 27/203 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR------------ 56
N G +G G +G GPSG S GPSG G +G
Sbjct: 131 NTGSTGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTG 190
Query: 57 ---------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G GP+G G +GS GP+G G +G G +G
Sbjct: 191 STGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTG 250
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G GP+G S G +G GPSG G +G GPSG G
Sbjct: 251 ITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTG 310
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G
Sbjct: 311 STGPTGITGPTG---ITGPTGNT 330
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 68/166 (40%), Gaps = 12/166 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +GS GP+G G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 201 TGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGS 260
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G G +G GPSG +G S GP+G GPSG G
Sbjct: 261 TGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGN------TGSTGSTGPTG---ITGPSGNTGSTGS 311
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G GP+G G +G GP+G G++
Sbjct: 312 TGPTGITGPTG---ITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGIT 354
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/142 (31%), Positives = 60/142 (42%), Gaps = 9/142 (6%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G +GS G +GS G +G GP+G GPSG
Sbjct: 231 TGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTG---ITGPSGN 287
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GPSG+ G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 288 TGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPTG---ITGPTGN---TGPTGNTGSTGS 341
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
+G GP+G GP+G
Sbjct: 342 TGPTGITGPTGITGSTGPTGSA 363
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/117 (31%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 6/117 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GPSG G +G GPSG G +G
Sbjct: 255 TGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGP 314
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G S
Sbjct: 315 TGITGPTG---ITGPTGN---TGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGSAGS 365
>gi|229139971|ref|ZP_04268535.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST26]
gi|375285272|ref|YP_005105711.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus NC7401]
gi|228643486|gb|EEK99753.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST26]
gi|358353799|dbj|BAL18971.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus NC7401]
Length = 824
Score = 62.8 bits (151), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/195 (28%), Positives = 79/195 (40%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 489 IGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGP 548
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G + G +G G +G G G +G G GP
Sbjct: 549 QGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGP 608
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G +GP+G GP G + G +G
Sbjct: 609 TGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPIGAVGPTGATGSAGS 668
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+ +LG++ +GL
Sbjct: 669 IGFLGIAGATGATGL 683
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 68/167 (40%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G GP+G GP G+L
Sbjct: 481 GPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNL 540
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G GP G + G +G G +G + G G +G
Sbjct: 541 GENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQ 600
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G G G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 601 GSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGA 647
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 71/190 (37%), Gaps = 2/190 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 435 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 494
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 495 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 554
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G + G +G G +G G G +G G GP+G
Sbjct: 555 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 614
Query: 193 LGL--SDGLR 200
G+ S G++
Sbjct: 615 TGIQGSQGIQ 624
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G+
Sbjct: 435 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 494
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L +G +G G
Sbjct: 495 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 554
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G GP G + G +G G +G G G +G G G + V
Sbjct: 555 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 614
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 615 TGIQ 618
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/201 (25%), Positives = 72/201 (35%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G + + G G + G +G+ GP G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 346 GAVGFQGAQGPQGFQGITGATGVEGPQGIQGPQGAIGPTGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQ 405
Query: 74 RYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G G
Sbjct: 406 GMQGLQGIQGPTGVAGAAGAQGAQGIQGATGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQ 465
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G +G + GP G +GP+G + GP G +GP+G G G
Sbjct: 466 GIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGIT 525
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G L G++
Sbjct: 526 GPTGAQGIRGPQGNLGENGIT 546
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/155 (29%), Positives = 61/155 (39%), Gaps = 10/155 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G L G +G G G GP G + G +G G +G G G
Sbjct: 535 GPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGVTGEAGATGAQGIQGVQ 594
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------L 127
+G GS GP+G G G GP G G +G +GP+G +
Sbjct: 595 GIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPI 654
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-PSG 161
+ GP+G G +G + +LG +G G PSG
Sbjct: 655 GAVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGATGLPSG 686
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/177 (27%), Positives = 62/177 (35%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G + G G +GP+GS GP G +G G G G + G +G
Sbjct: 92 NQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITG 151
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G G G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 152 VTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQG 211
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G GP G G SG + G G G +G G G
Sbjct: 212 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGSTGTQGVEG 268
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/177 (27%), Positives = 70/177 (39%), Gaps = 11/177 (6%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 8 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGI 65
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G+ +G +G GP+G G G + G G + G G + GP+G
Sbjct: 66 QGA---IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGI 119
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +G G+ G G +G +G GP G G G G+
Sbjct: 120 QGPQGIQGEIGERGQ---TGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGI 173
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/199 (25%), Positives = 69/199 (34%), Gaps = 23/199 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRY 66
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 11 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGIQGA 68
Query: 67 LGPSGRLRYLGPS---------------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G +G GP+ G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 69 IGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGE 128
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G G+ G G + G +G G G G G G G G +G
Sbjct: 129 IGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGE 188
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+ G G +GP+G
Sbjct: 189 QGHQGDQGIQGVVGPTGST 207
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/151 (27%), Positives = 62/151 (41%), Gaps = 8/151 (5%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 8 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRG---TTGA 62
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G +G GP+G + G G + G + G G +GP+G
Sbjct: 63 QGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLI---GDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGI 119
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G G+ G G + G++
Sbjct: 120 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGIT 150
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G+ G G + G G G G +G G
Sbjct: 36 TGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGL 95
Query: 73 LRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ +G G +GP+G GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 96 IGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGP 155
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G G G G G +G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 156 QGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGI 215
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 216 SGIKGIT 222
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/171 (25%), Positives = 58/171 (33%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G + G G +GP+GS GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 97 GDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQ 156
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G G G G G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 157 GSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGIS 216
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP G G SG + G G G + G+
Sbjct: 217 GIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGSTGTQGVE 267
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + G G + G G +GP+G
Sbjct: 59 TTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAG 115
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G +G G+ G G + G +G G G G G G
Sbjct: 116 SQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQG 175
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 176 EEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQG 235
Query: 192 YLGLS 196
G+S
Sbjct: 236 IQGVS 240
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 64/187 (34%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSG----- 62
GP G GP+G+ GP G GP G +G +G GP+G
Sbjct: 28 GPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIKGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQ 87
Query: 63 ----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
+ G G +GP+GS GP G +G G+ G G +
Sbjct: 88 GLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGIQGVIGEA 147
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G +G G G G G G G G +G + G G +GP+G
Sbjct: 148 GITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGST 207
Query: 173 RYLGPSG 179
GP G
Sbjct: 208 GPQGPQG 214
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + G G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 69 IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGI 125
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G + G +G G G G G G G G
Sbjct: 126 QGEIGERGQTGAQGIQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGI 185
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 186 TGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 245
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 246 QG-AKGVR 252
>gi|217962264|ref|YP_002340834.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus AH187]
gi|217063654|gb|ACJ77904.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH187]
Length = 524
Score = 62.4 bits (150), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 70/169 (41%), Gaps = 6/169 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS GP+G G +G GP+G G +G G +G G +GS
Sbjct: 201 TGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGS 260
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G GPSG G +G GPSG S G +G GP
Sbjct: 261 TGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGP 320
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 321 TG---ITGPTGNT---GPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGSA 363
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/160 (30%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 210 TGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGI 269
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GPSG G +G GPSG G +G GP+G GP
Sbjct: 270 TGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPTGIT---GP 326
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 327 TGN---TGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGSA 363
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/202 (28%), Positives = 73/202 (36%), Gaps = 27/202 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR------------- 56
GPSG G +G GPSG S GPSG G +G
Sbjct: 132 TGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGSTGSTGS 191
Query: 57 --------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G GP+G G +GS GP+G G +G G +G
Sbjct: 192 TGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGI 251
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G GP+G S G +G GPSG G +G GPSG G
Sbjct: 252 TGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGS 311
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G GP+G
Sbjct: 312 TGPTGITGPTG---ITGPTGNT 330
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/197 (27%), Positives = 71/197 (36%), Gaps = 24/197 (12%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSG---------- 62
SG GPSG+ G +G GPSG G PSG+ G +G
Sbjct: 126 SGATGSTGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGNTGSTGS 185
Query: 63 -----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 186 TGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGI 245
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S GP+G G +G GPSG G +G GPSG
Sbjct: 246 TGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGN 305
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G
Sbjct: 306 TGSTGSTGPTGITGPTG 322
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 68/166 (40%), Gaps = 12/166 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +GS GP+G G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 201 TGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGS 260
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G G +G GPSG +G S GP+G GPSG G
Sbjct: 261 TGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGN------TGSTGSTGPTG---ITGPSGNTGSTGS 311
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G GP+G G +G GP+G G++
Sbjct: 312 TGPTGITGPTG---ITGPTGNTGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGIT 354
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/142 (31%), Positives = 60/142 (42%), Gaps = 9/142 (6%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G +GS G +GS G +G GP+G GPSG
Sbjct: 231 TGVTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTG---ITGPSGN 287
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GPSG+ G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 288 TGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPTG---ITGPTGN---TGPTGNTGSTGS 341
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
+G GP+G GP+G
Sbjct: 342 TGPTGITGPTGITGSTGPTGSA 363
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/117 (31%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 6/117 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GPSG G +G GPSG G +G
Sbjct: 255 TGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGP 314
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G S
Sbjct: 315 TGITGPTG---ITGPTGN---TGPTGNTGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGPTGSAGS 365
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/182 (25%), Positives = 60/182 (32%), Gaps = 36/182 (19%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------ 96
SG GPSG+ G +G GPSG +GS GPSG G
Sbjct: 126 SGATGSTGPSGNTGSTGSTGPTGITGPSGN------TGSTGSTGPSGNTGSTGSTGPTGN 179
Query: 97 ------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 180 TGSTGSTGSTGSTGPTGITGSTGITGSTGSTGPTGITGPTGITGSTGITGPTGVTGSTGS 239
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP+G G +G GPSG G +G
Sbjct: 240 TGPTGITGSTGITGSTGVTGSTGSTGPTGITGSTGSTGPTGITGPSGNTGSTGSTGPTGI 299
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 300 TG 301
>gi|322437342|ref|YP_004219554.1| Tail Collar domain-containing protein [Granulicella tundricola
MP5ACTX9]
gi|321165069|gb|ADW70774.1| Tail Collar domain protein [Granulicella tundricola MP5ACTX9]
Length = 354
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/149 (31%), Positives = 73/149 (48%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ +GP+G GP+G GP+G++ +GP+G G +G + G +G+
Sbjct: 96 GATGTTGPVGPAGVAGAKGPAGPTGIAGPAGAIGPIGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGAT 155
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP+G GP+G G +G +GP+G G G + GP+G + GP+
Sbjct: 156 GSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAGPNGATGAIGPIGPSGPAGTIGATGPA 215
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G LGP+G GP+G GP G
Sbjct: 216 GP---LGPAGVQGPTGPTGPAGAQGPQGT 241
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/149 (31%), Positives = 73/149 (48%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +G+ +GP+G GP+G GP+G + +GP+G G +G + G +G
Sbjct: 96 GATGTTGPVGPAGVAGAKGPAGPTGIAGPAGAIGPIGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGAT 155
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
+GP+G GP+G G +G +GP+G +G +G + +GPSG +G +
Sbjct: 156 GSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAGP---NGATGAIGPIGPSGPAGTIGAT 212
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G LGP+G GP+G GP G
Sbjct: 213 GPAGPLGPAGVQGPTGPTGPAGAQGPQGT 241
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/146 (30%), Positives = 71/146 (48%), Gaps = 6/146 (4%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +G+ +GP+G GP+G GP+G++ +GP+G G +G + G +G
Sbjct: 96 GATGTTGPVGPAGVAGAKGPAGPTGIAGPAGAIGPIGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGAT 155
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+GP+G GP+G + G +G +GP +G + +GPSG +G +G
Sbjct: 156 GSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAGPNGATGAIGPIGPSGPAGTIGATGPA 215
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
LGP+G GP+G GP G
Sbjct: 216 GPLGPAGVQGPTGPTGPAGAQGPQGT 241
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/128 (31%), Positives = 61/128 (47%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +G +GP+G GP+G GP+G + +GP+G G +G + G +G
Sbjct: 96 GATGTTGPVGPAGVAGAKGPAGPTGIAGPAGAIGPIGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGAT 155
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
S GP+G GP+G G +G +GP+G G G + GP+G + GP+
Sbjct: 156 GSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAGPNGATGAIGPIGPSGPAGTIGATGPA 215
Query: 188 GRLRYLGL 195
G L G+
Sbjct: 216 GPLGPAGV 223
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/122 (31%), Positives = 61/122 (50%), Gaps = 3/122 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G + +GP+G+ G +G + G +G +GP+G GP+G G +G
Sbjct: 123 GPAGAIGPIGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGATGSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGAN 182
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G G +G + +GPSG +G +G LGP+G GP+G + GP
Sbjct: 183 GAIGPAGP---NGATGAIGPIGPSGPAGTIGATGPAGPLGPAGVQGPTGPTGPAGAQGPQ 239
Query: 134 GR 135
G
Sbjct: 240 GT 241
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/136 (30%), Positives = 63/136 (46%), Gaps = 12/136 (8%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G +G +GP+G GP+G GP+G + +GP+G G +G + G +G
Sbjct: 96 GATGTTGPVGPAGVAGAKGPAGPTGIAGPAGAIGPIGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGAT 155
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
+GP+G GP+G G +G +GP+G P+G +GP +GPS
Sbjct: 156 GSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAG------PNGATGAIGP------IGPS 203
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G +G LG
Sbjct: 204 GPAGTIGATGPAGPLG 219
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/120 (30%), Positives = 59/120 (49%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ +GP+G GP+G GP+G + +GP+G G +G + G +G
Sbjct: 96 GATGTTGPVGPAGVAGAKGPAGPTGIAGPAGAIGPIGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGAT 155
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G GP+G G +G +GP+G G +G + +GPSG +G +
Sbjct: 156 GSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAGP---NGATGAIGPIGPSGPAGTIGAT 212
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/114 (31%), Positives = 55/114 (48%), Gaps = 3/114 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G + G +G+ +GP+G GP+G+ G +G +GP+G
Sbjct: 131 IGPAGAKGATGANGPVGPAGVAGATGSIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAGP 190
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G G + GP+G + GP+G LGP+G GP+G GP G
Sbjct: 191 NGATGAIGPIGPSGPAGTIGATGPAGP---LGPAGVQGPTGPTGPAGAQGPQGT 241
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/88 (32%), Positives = 44/88 (50%), Gaps = 3/88 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G GP+G+ G +G+ +GP+G G G + GP+G + GP+G
Sbjct: 157 SIGPAGVAGPTGPAGTAGAKGATGANGAIGPAGPNGATGAIGPIGPSGPAGTIGATGPAG 216
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
LGP+G GP+G GP G
Sbjct: 217 P---LGPAGVQGPTGPTGPAGAQGPQGT 241
>gi|124490693|gb|ABN12763.1| collagen-like surface protein B [Streptococcus pyogenes]
Length = 456
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/177 (31%), Positives = 83/177 (46%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + +GP+G GP G G G+ GP+G GP+G + +GP+G+
Sbjct: 141 QGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGP---QGPAGPVGPVGPAGK 197
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G+ GP+G GP+G + +GP+G+ GP G G
Sbjct: 198 DGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGE 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G+ GP+G GP G G G+ GP+G GP+G + +GP+G+
Sbjct: 255 QGQRGETGPAG---PQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGK 305
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/190 (29%), Positives = 82/190 (43%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G+ GP G G G GP+G GP+G + +GP+G+ GP G
Sbjct: 150 VGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGD 206
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G GP+G + +GP+G+ GP G G G+ GP
Sbjct: 207 KGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGP 263
Query: 133 S------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G G G+ GP+G GP+G + +GP+G+ G G GP
Sbjct: 264 AGPQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGAKGDRGETGPAGP 320
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G+ G
Sbjct: 321 AGKDGEAGAQ 330
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/198 (28%), Positives = 85/198 (42%), Gaps = 18/198 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + +GP+G GP G G G+ GP+G GP+G + +GP+G+
Sbjct: 183 QGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGP---QGPAGPVGPVGPAGK 239
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
GP G G G+ GP +G G +G GP+G +
Sbjct: 240 DGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGPQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGPQGPAGPVGP 299
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+GP+G+ + G G GP+G+ G G + GP G G +G GP+G+
Sbjct: 300 VGPAGKDGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAGAQGPMGPAGPQGPRGDKGETGDKGEQGPAGK 359
Query: 181 LRY---LGPSGRLRYLGL 195
+GP+G+ GL
Sbjct: 360 DGERGPVGPAGKDGQDGL 377
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 80/179 (44%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G GP+G + +GP+G+ GP G G G+ GP+G
Sbjct: 164 DKGETGEQGQRGETGPAGPQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG 223
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G + +GP+G+ GP G G G+ GP+G GP G G
Sbjct: 224 ---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPRGDKGETG 277
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G+ GP+G GP+G + +GP+G+ G G GP+G+ G G +
Sbjct: 278 EQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAGAQGPM 333
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/189 (31%), Positives = 83/189 (43%), Gaps = 13/189 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G + +GP+G GP G G G GP+G GP+G
Sbjct: 134 ETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAG 187
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ +GP+G GP G G G+ GP+G GP+G + +GP+G+ + G
Sbjct: 188 PVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQG 244
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G G+ GP+G GP G G G+ GP+G GP G +
Sbjct: 245 PRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGPQGPAGPVGPVG 301
Query: 192 YLGLSDGLR 200
G DG +
Sbjct: 302 PAG-KDGAK 309
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 77/177 (43%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G + +GP+G GP G G G GP+G GP+G
Sbjct: 176 ETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAG 229
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ +GP+G GP G G G+ GP+G GP G G G+ G
Sbjct: 230 PVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPRGDKGETGEQGQRGETG 286
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP+G + +GP+G+ G G GP+G+ G G + GP G
Sbjct: 287 PAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAGAQGPMGPAGPQG 340
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 76/177 (42%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + +GP+G GP G G G+ GP+G GP G G G+
Sbjct: 225 QGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGP---QGPRGDKGETGEQGQ 281
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G + +GP+G+ G G GP+G+ G G + GP
Sbjct: 282 RGETGPAGP---QGPAGPVGPVGPAGKDGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAGAQGPMGPAGP 338
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +G GP+G+ GP +GP+G+ G G+ G G+
Sbjct: 339 QGPRGDKGETGDKGEQGPAGKDGERGP------VGPAGKDGQDGLPGKDGKDGQDGK 389
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 78/187 (41%), Gaps = 13/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G+ GP G G G GP+G GP G G G+ GP+G
Sbjct: 234 VGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGP 290
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G + +GP+G+ G G GP+G+ G G + GP G G
Sbjct: 291 Q---GPAGPVGPVGPAGKDGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAGAQGPMGPAGPQGPRGDKGE 347
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G+ GP +GP+G+ G G+ G G+ G G+
Sbjct: 348 TGDKGEQGPAGKDGERGP------VGPAGKDGQDGLPGKDGKDGQDGKDGLPGKDGKDGQ 401
Query: 193 LGLSDGL 199
G DGL
Sbjct: 402 DG-KDGL 407
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 73/174 (41%), Gaps = 15/174 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP+G + +GP+G GP G G G GP+G GP G
Sbjct: 218 ETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPRG 271
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G GP+G GP+G + +GP+G+ G G GP+G+ G
Sbjct: 272 DKGETGEQGQRGETGPAG---PQGPAGPVGPVGPAGKDGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAG 328
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G + GP G G +G GP+G+ GP +GP+G+ G
Sbjct: 329 AQGPMGPAGPQGPRGDKGETGDKGEQGPAGKDGERGP------VGPAGKDGQDG 376
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/141 (27%), Positives = 59/141 (41%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G GP+G + +GP+G+ G G GP+G+ G G
Sbjct: 272 DKGETGEQGQRGETGPAGPQGPAGPVGPVGPAGKDGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAGAQG 331
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G G +G GP+G+ GP +GP+G+ G G+ DG
Sbjct: 332 PMGPAGPQGPRGDKGETGDKGEQGPAGKDGERGP------VGPAGKDGQDGLPGKDGKDG 385
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G+ G G+ G G
Sbjct: 386 QDGKDGLPGKDGKDGQDGKDG 406
>gi|222095187|ref|YP_002529247.1| collagen-like protein [Bacillus cereus Q1]
gi|221239245|gb|ACM11955.1| collagen-like protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 733
Score = 62.4 bits (150), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 66/182 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 402 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 461
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 462 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 521
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 522 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGAT 581
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 582 GA 583
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 64/177 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 420 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 479
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 480 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 539
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G G G GP+G GP+G G G G +G
Sbjct: 540 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGATGAQGATGAT 596
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/174 (28%), Positives = 62/174 (35%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 420 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 479
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP+G G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 480 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 539
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G G G GP+G GP+G G G G +
Sbjct: 540 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGATGAQGAT 593
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 63/178 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 392 AGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGP 451
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP
Sbjct: 452 QGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGP 511
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 512 AGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 569
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G GP+G+ GP+G G G GP+G G
Sbjct: 372 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 431
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 432 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQ 491
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 492 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 551
Query: 191 RYLGL 195
G
Sbjct: 552 GATGA 556
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 384 GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 443
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 444 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 503
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 504 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 558
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/176 (28%), Positives = 63/176 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ GP G G +G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 365 TGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGA 424
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 425 TGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGA 484
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 485 QGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 540
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 342 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT---GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQ 398
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 399 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 458
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 459 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 518
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 519 GA 520
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 306 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAG-- 363
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP G G +G GP+G G G GP+
Sbjct: 364 -ATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 422
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 423 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 482
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 483 GA 484
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G GP+G G G
Sbjct: 360 GPAG---ATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 416
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 417 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 476
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 477 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 536
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 537 GA 538
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 324 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT---GPQGVQGPAGATGAT 380
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 381 GAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 440
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 441 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 500
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 501 GA 502
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 71/194 (36%), Gaps = 11/194 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ GP G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 432 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 488
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 489 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 548
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG----- 188
G G G GP+G GP+G G +G G G GP+G
Sbjct: 549 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAG---ATGATGAQGATGAQGATGATGPAGTPIPV 605
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVS 202
+ +G S+ +S
Sbjct: 606 TIAAIGNSNPQTIS 619
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/212 (25%), Positives = 70/212 (33%), Gaps = 30/212 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 189 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGAT 248
Query: 74 RYLGPSGSLR------------YLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPS 106
GP G+ GP+G G G GP+
Sbjct: 249 GAQGPQGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGATGATGATGAQGPQGVQGPA 308
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--- 163
G G G GP+G + G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 309 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQ 368
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G G GP+G G+
Sbjct: 369 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGV 400
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 68/209 (32%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR-------- 65
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP G
Sbjct: 207 GPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGATGATGATGAQ 266
Query: 66 ----YLGPSGRLRYLGPSGSLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 267 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 326
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G GP+G + G G GP+G GP G G +G
Sbjct: 327 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQGVQGPAGATGATGAQ 383
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G +G GP+G G
Sbjct: 384 GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGA 412
>gi|423635932|ref|ZP_17611585.1| hypothetical protein IK7_02341 [Bacillus cereus VD156]
gi|401276482|gb|EJR82434.1| hypothetical protein IK7_02341 [Bacillus cereus VD156]
Length = 546
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 69/193 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 181 TGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGI 240
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G G +G G +G GP G GP G G
Sbjct: 241 QGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGA 300
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G+ GP G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 301 TGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGQTGV 360
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 361 TGATGPTGIQGIQ 373
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/179 (31%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 163 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 222
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP G GP G G +G G +G GP
Sbjct: 223 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGP 282
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G+ GP G GP +G+ GP+G GP G
Sbjct: 283 QGPQGIQGPQGETGPTGATGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGPTGETGPQGPQG 341
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 64/175 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G GS+ GP G G G GP+G G G
Sbjct: 137 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPS 196
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP
Sbjct: 197 GPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGPQ 256
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G +G GP G GP G G +G+ GP G
Sbjct: 257 GLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGQTGVTGPQG 311
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 68/187 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP G G G
Sbjct: 122 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGAT 181
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 182 GPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQ 241
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP G G +G G +G GP G GP G G +
Sbjct: 242 GVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGAT 301
Query: 197 DGLRVSG 203
V+G
Sbjct: 302 GQTGVTG 308
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/191 (30%), Positives = 71/191 (37%), Gaps = 14/191 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL----------GPSG 62
GP+G G GS+ GP G G G GP+G L+ L GP G
Sbjct: 145 TGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGIQGPSGPTGPQG 203
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G G
Sbjct: 204 VQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITG 263
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SG 179
+G G +G GP G GP G G +G+ GP G GP +G
Sbjct: 264 QAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITG 323
Query: 180 RLRYLGPSGRL 190
+ GP+G
Sbjct: 324 QAGATGPTGET 334
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 63/176 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP G
Sbjct: 109 TGATGLTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGV 168
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 169 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 228
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G GP G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 229 QGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQG 284
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/124 (30%), Positives = 45/124 (36%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP G
Sbjct: 109 TGATGLTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGV 168
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 169 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 228
Query: 187 SGRL 190
G +
Sbjct: 229 QGSI 232
>gi|13235586|emb|CAC33776.1| SclB protein [Streptococcus pyogenes]
Length = 434
Score = 62.0 bits (149), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 78/177 (44%), Gaps = 15/177 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP+G GP G G G+ +GP+G GP +GP+G+
Sbjct: 121 AGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAGPQGPAGP------VGPAGK 174
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G+ +GP+ GP G +GP+G+ GP G G
Sbjct: 175 DGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGE 228
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G+ GP+G GP+G+ +GP G GP+G +GP G GP+G+
Sbjct: 229 QGQRGETGPAGPQGPQGPAGKAGEVGPRGDRGETGPAG---PVGPRGERGEAGPAGK 282
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/189 (31%), Positives = 81/189 (42%), Gaps = 17/189 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G+ GP G G G +GP+ GP G +GP+G+ GP G
Sbjct: 130 VGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGD 183
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+ GP G +GP+G+ GP G G G+ GP
Sbjct: 184 KGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGP 237
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G+ +GP G GP+G +GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 238 AGPQGPQGPAGKAGEVGPRGDRGETGPAG---PVGPRGERGEAGPAGKDGERGPVGPAGK 294
Query: 193 LGLS--DGL 199
G DGL
Sbjct: 295 DGQDGKDGL 303
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/163 (31%), Positives = 74/163 (45%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + GP G +GP+G+ GP G G G+ +GP+ GP G +
Sbjct: 116 GEVGPAGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPV 169
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP+G+ GP G G G+ +GP+G GP+G + GP+G+ GP G
Sbjct: 170 GPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAG---PQGPAGPV---GPAGKDGTQGPRGDK 223
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G+ GP+G GP+G+ +GP G GP+G
Sbjct: 224 GETGEQGQRGETGPAGPQGPQGPAGKAGEVGPRGDRGETGPAG 266
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 75/182 (41%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G G + GP G +GP+G+ GP G G G+ +GP+
Sbjct: 143 GDKGETGEQGQRGEVGPAGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA--- 199
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G +GP+G+ GP G G G+ GP+G GP+G+ GP
Sbjct: 200 ---GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGPQGPQGPAGKAGEVGPR 256
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G +GP G GP+G+ GP G G G+ G G+
Sbjct: 257 GDRGETGPAG---PVGPRGERGEAGPAGKDGERGPVGPAGKDGQDGKDGLPGKDGQDGKD 313
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 314 GL 315
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/145 (29%), Positives = 62/145 (42%), Gaps = 9/145 (6%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP G +GP+G+ GP G G G+ +GP+G P G +
Sbjct: 116 GEVGPAGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAG------PQGPAGPV 169
Query: 113 GPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP+G+ GP G G G + GP G +GP+G+ GP G G
Sbjct: 170 GPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQ 229
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G+ GP+G GP+G+ +G
Sbjct: 230 GQRGETGPAGPQGPQGPAGKAGEVG 254
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/123 (31%), Positives = 54/123 (43%), Gaps = 9/123 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP+G GP G G G+ GP+G GP+G+ +GP G
Sbjct: 199 AGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGPQGPQGPAGKAGEVGPRGD 258
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G + GP G GP+G+ GP +GP+G+ G G DG
Sbjct: 259 RGETGPAGPV---GPRGERGEAGPAGKDGERGP------VGPAGKDGQDGKDGLPGKDGQ 309
Query: 133 SGR 135
G+
Sbjct: 310 DGK 312
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/119 (31%), Positives = 52/119 (43%), Gaps = 12/119 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G+ GP G G G GP+G GP+G +GP G GP+G
Sbjct: 208 VGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGETGPAGPQGPQGPAGKAGEVGPRGDRGETGPAG- 266
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+GP G GP+G+ GP +GP+G+ G G+ G G+ DG
Sbjct: 267 --PVGPRGERGEAGPAGKDGERGP------VGPAGK---DGQDGKDGLPGKDGQDGKDG 314
>gi|255099505|ref|ZP_05328482.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-63q42]
Length = 615
Score = 62.0 bits (149), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 81/188 (43%), Gaps = 21/188 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP+G GP+G +GP+G G +GS+ GP+G G +G
Sbjct: 293 GPTGVTGEIGPTG---VTGPTGVTGEIGPTGATGATGVTGSI---GPTGATGPTGATGVT 346
Query: 74 RYLGPSGSLR------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
+GP+G + +GP+G G +G +GP+G G +G +
Sbjct: 347 GEIGPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEI 406
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G + GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 407 GPTG---ATGPTGNTGVTGEIGLTGATGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGATGVTGPTGPT 463
Query: 182 RYLGPSGR 189
G S +
Sbjct: 464 GATGNSSQ 471
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 80/188 (42%), Gaps = 24/188 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G+ G +G + GP+G
Sbjct: 286 IGPTGAT---GPTGVTGEIGPTG---VTGPTGVTGEIGPTGATGATGVTGSI---GPTGA 336
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G +GP+G + +GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 337 TGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGAT-- 394
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 395 -GPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGLTGATGPTGNTGATGSIGPTGVTGPTGA 453
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP+G
Sbjct: 454 TGVTGPTG 461
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/201 (27%), Positives = 84/201 (41%), Gaps = 27/201 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G +GP+G+ GP+G +GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 267 NTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGAT---GPTGVTGEIGPTG---VTGPTGVTGEIGPTG 320
Query: 72 RLRY------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLG 113
+GP+G+ G +G +GP+G + +GP+G G
Sbjct: 321 ATGATGVTGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPTG 380
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
+G +GP+G G +G +GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 381 NTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGA---TGPTGNTGVTGEIGLTGATGPTGNTG 437
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G GP+G G
Sbjct: 438 ATGSIGPTGVTGPTGATGVTG 458
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 83/178 (46%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP+G G +G+ +GP+G G +GS +GP+G G +G
Sbjct: 196 MGPRGATGSTGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGS---IGPTGVTGPTGSTGA 252
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G GP+G G +G G +G +GP+G GP+G GP
Sbjct: 253 TGSIGPTG---VTGPTGN---TGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGA---TGPTGVTGEIGP 303
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G +GP+G G +G +GP+G G +G +GP+G +
Sbjct: 304 TG---VTGPTGVTGEIGPTGATGATGVTGS---IGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEI 355
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 86/189 (45%), Gaps = 27/189 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G+ +GP+G GP+G G +G+ G +G +GP+G
Sbjct: 238 IGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTG---VTGPTGNT---GVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGA 291
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G +GP+G GP+G +GP+G G +G +GP+G G
Sbjct: 292 T---GPTGVTGEIGPTG---VTGPTGVTGEIGPTGATGATGVTGS---IGPTGATGPTGA 342
Query: 133 SGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G +GP+G + +GP+G G +G +GP+G G +G
Sbjct: 343 TGVTGEIGPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGV 402
Query: 181 LRYLGPSGR 189
+GP+G
Sbjct: 403 TGEIGPTGA 411
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/189 (29%), Positives = 87/189 (46%), Gaps = 30/189 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +GS+ GP+G G +G +GP+G GP+G G +G
Sbjct: 223 IGPTGPTGNTGATGSI---GPTGVTGPTGSTGATGSIGPTG---VTGPTGNTGVTGNTGV 276
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS+ GP+G GP+G +GP+G GP+G +GP+G + G
Sbjct: 277 TGNTGVTGSI---GPTGAT---GPTGVTGEIGPTG---VTGPTGVTGEIGPTGATGATGV 327
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G +GP+G G +G +GP+G + +GP+G G +G
Sbjct: 328 TGS---IGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGTTGPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGV 384
Query: 181 LRYLGPSGR 189
+GP+G
Sbjct: 385 TGEIGPTGA 393
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/202 (27%), Positives = 83/202 (41%), Gaps = 27/202 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G GP+G+ G +G G +GS+ GP+G +GP+
Sbjct: 245 GPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGATGPTGVTGEIGPT 304
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 118
G GP+G +GP+G +GP+G G +G +GP+G +
Sbjct: 305 G---VTGPTGVTGEIGPTGATGATGVTGSIGPTGATGPTGATGVTGEIGPTGEIGPTGTT 361
Query: 119 ------RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+GP+G G +G +GP+G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 362 GPTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGATGPTGNTGVTGEIGPTGA---TGPTGNT 418
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G GP+G G
Sbjct: 419 GVTGEIGLTGATGPTGNTGATG 440
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 70/160 (43%), Gaps = 21/160 (13%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+R GP +GP G+ GP+G GP+G G +GS+ GP+G G
Sbjct: 190 IRITGP------MGPRGATGSTGPTG---VTGPTGST---GATGSIGPTGPTGNTGATGS 237
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G GP+G G G GP+G G +G G +G +GP+G
Sbjct: 238 IGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNT---GVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGA--- 291
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G +GP+G GP+G +GP+G G++
Sbjct: 292 TGPTGVTGEIGPTG---VTGPTGVTGEIGPTGATGATGVT 328
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/152 (27%), Positives = 64/152 (42%), Gaps = 15/152 (9%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+R GP +GP G GP+G G +G +GP+G G +G + GP
Sbjct: 190 IRITGP------MGPRGATGSTGPTGVTGPTGSTGATGSIGPTGPTGNTGATGSI---GP 240
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR 171
+G GP+G + G G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 241 TG---VTGPTGSTGATGSIGPTGVTGPTGNTGVTGNTGVTGNTGVTGSIGPTGATGPTGV 297
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+GP+G G +G + G + V+G
Sbjct: 298 TGEIGPTGVTGPTGVTGEIGPTGATGATGVTG 329
>gi|313898782|ref|ZP_07832316.1| BclB C-terminal domain protein [Clostridium sp. HGF2]
gi|312956364|gb|EFR37998.1| BclB C-terminal domain protein [Clostridium sp. HGF2]
Length = 578
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/211 (27%), Positives = 80/211 (37%), Gaps = 36/211 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GP+G G SG G +G+ GP+G + G P+G+ GP+G
Sbjct: 159 IGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGS 218
Query: 67 LGPSGRLRYLGP---------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G GP +G+ +GP+G GP+G G
Sbjct: 219 TGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGA 278
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G G G GP+G G +G GP+G + G G
Sbjct: 279 DG---VTGPTGATGNTGADGAA---GPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTGADGA--- 329
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G GP+G GL+
Sbjct: 330 TGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT 360
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/213 (26%), Positives = 80/213 (37%), Gaps = 30/213 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---------------------SGRLRYLGPS 52
GP+G GP+G+ GP+G GP +G +GP+
Sbjct: 202 GPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPT 261
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
GS GP+G G G GP+G+ G G GP+G G +G
Sbjct: 262 GSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGA---AGPTGPTGATGNTGLTGAT 315
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G + G G GP+G GP G GP+G G +G G +G
Sbjct: 316 GPTGAMGNTGADGAT---GPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGNT 372
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G G +G +G++ +GL
Sbjct: 373 GADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLA 405
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 249 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 305
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G + G G GP+G GP G GP+G S G
Sbjct: 306 TGNTGLTGAT---GPTGAMGNTGADGA---TGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGL 359
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S + Y
Sbjct: 360 TGA---TGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSSAIIPY 413
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ +GP+GS GP+G G G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 249 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 305
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP+G + G G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 306 T---GNTGLTGATGPTGAMGNTGADGA---TGPTGATGNTGPDGAA---GPTGPTGATGS 356
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S
Sbjct: 357 TGLTGATGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSS 408
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 19/194 (9%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+GS G +G+ +GP+G G SG G +G GP+G + G +G
Sbjct: 141 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG- 199
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------YLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 200 --VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGG 257
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G G G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 258 IGPTGSTGVTGPTGATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGP 317
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLR 200
+G + G +DG
Sbjct: 318 TGAMGNTG-ADGAT 330
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/242 (25%), Positives = 85/242 (35%), Gaps = 60/242 (24%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS-----------------------LRYLGPSG-RLR 47
N GP+G GP+GS G +G+ PSG L
Sbjct: 74 NTGPAGLRGNTGPTGSTGATGNTGATGMTPVITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASLL 133
Query: 48 Y------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
+ GP+GS G +G +GP+G G SG G +G GP+G +
Sbjct: 134 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMG 193
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP-------------------- 141
G +G GP+G GP+G S GP+G GP
Sbjct: 194 NTGANG---VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTG 250
Query: 142 -SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G +GP+G GP+G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 251 STGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTG 310
Query: 195 LS 196
L+
Sbjct: 311 LT 312
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/243 (25%), Positives = 88/243 (36%), Gaps = 59/243 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG-SLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR----- 63
GP+G G +G + GP+G+ G P+G GP+GS G +G
Sbjct: 44 TGPTGSTGATGATGPGVGATGPTGATGATGNTGPAGLRGNTGPTGSTGATGNTGATGMTP 103
Query: 64 ------------------LRYLGPSG-RLRY------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
PSG L + GP+GS G +G +GP+G
Sbjct: 104 VITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASLLFTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAG 163
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G SG G +G GP+G + + G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 164 ATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG---VSGPTGNTGATGPTGATGSTG 220
Query: 159 PSGRLRYLGP---------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
P+G GP +G +GP+G GP+G G +D
Sbjct: 221 PTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTG-AD 279
Query: 198 GLR 200
G+
Sbjct: 280 GVT 282
>gi|423432520|ref|ZP_17409524.1| hypothetical protein IE7_04336 [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401116127|gb|EJQ23970.1| hypothetical protein IE7_04336 [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 449
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 62/140 (44%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G G +G G +G+
Sbjct: 75 GPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGAT 134
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G GP+G G +G GP+G G +G + GP+G G +
Sbjct: 135 GPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTGITGATGIT 194
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G G +G GP+G
Sbjct: 195 GATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 61/140 (43%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 75 GPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGATGITGAT 134
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + G +
Sbjct: 135 GPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTGITGATGIT 194
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G G +G GP+G
Sbjct: 195 GATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/155 (28%), Positives = 66/155 (42%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G++ +GP+ GP+G+ GP+G GP+G GP+G+ GP+G
Sbjct: 66 GTVPKVGPT------GPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVT 119
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 120 GDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVT 179
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 180 GATGPTGITGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/155 (28%), Positives = 65/155 (41%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + +GP+G P+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 66 GTVPKVGPTG------PTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVT 119
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 120 GDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVT 179
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 180 GATGPTGITGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGA 214
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/135 (28%), Positives = 58/135 (42%), Gaps = 6/135 (4%)
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + +GP+G P+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 66 GTVPKVGPTG------PTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVT 119
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +G + G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 120 GDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGLTGATGVT 179
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G++
Sbjct: 180 GATGPTGITGATGIT 194
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/70 (28%), Positives = 31/70 (44%)
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ DG ++ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 62 FSCDGTVPKVGPTGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGD 121
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 122 TGPTGATGIT 131
>gi|422330226|ref|ZP_16411249.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium
6_1_45]
gi|371654788|gb|EHO20151.1| BclB domain-containing protein [Erysipelotrichaceae bacterium
6_1_45]
Length = 575
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/211 (27%), Positives = 80/211 (37%), Gaps = 36/211 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GP+G G SG G +G+ GP+G + G P+G+ GP+G
Sbjct: 156 IGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGS 215
Query: 67 LGPSGRLRYLGP---------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G GP +G+ +GP+G GP+G G
Sbjct: 216 TGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGA 275
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G G G GP+G G +G GP+G + G G
Sbjct: 276 DG---VTGPTGATGNTGADGAA---GPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTGADGA--- 326
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G GP+G GL+
Sbjct: 327 TGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT 357
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/213 (26%), Positives = 80/213 (37%), Gaps = 30/213 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---------------------SGRLRYLGPS 52
GP+G GP+G+ GP+G GP +G +GP+
Sbjct: 199 GPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPT 258
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
GS GP+G G G GP+G+ G G GP+G G +G
Sbjct: 259 GSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGA---AGPTGPTGATGNTGLTGAT 312
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G + G G GP+G GP G GP+G G +G G +G
Sbjct: 313 GPTGAMGNTGADGAT---GPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGNT 369
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G G +G +G++ +GL
Sbjct: 370 GADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLA 402
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 246 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 302
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G + G G GP+G GP G GP+G S G
Sbjct: 303 TGNTGLTGAT---GPTGAMGNTGADGA---TGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGL 356
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S + Y
Sbjct: 357 TGA---TGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSSAIIPY 410
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ +GP+GS GP+G G G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 246 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 302
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP+G + G G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 303 T---GNTGLTGATGPTGAMGNTGADGA---TGPTGATGNTGPDGAA---GPTGPTGATGS 353
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S
Sbjct: 354 TGLTGATGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSS 405
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 19/194 (9%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+GS G +G+ +GP+G G SG G +G GP+G + G +G
Sbjct: 138 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG- 196
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------YLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 197 --VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGG 254
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G G G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 255 IGPTGSTGVTGPTGATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTGLTGATGP 314
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLR 200
+G + G +DG
Sbjct: 315 TGAMGNTG-ADGAT 327
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/242 (25%), Positives = 85/242 (35%), Gaps = 60/242 (24%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS-----------------------LRYLGPSG-RLR 47
N GP+G GP+GS G +G+ PSG L
Sbjct: 71 NTGPAGLRGNTGPTGSTGATGNTGATGMTPVITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASLL 130
Query: 48 Y------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
+ GP+GS G +G +GP+G G SG G +G GP+G +
Sbjct: 131 FTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMG 190
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP-------------------- 141
G +G GP+G GP+G S GP+G GP
Sbjct: 191 NTGANG---VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTG 247
Query: 142 -SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G +GP+G GP+G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 248 STGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGATGNTG 307
Query: 195 LS 196
L+
Sbjct: 308 LT 309
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/243 (25%), Positives = 88/243 (36%), Gaps = 59/243 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG-SLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR----- 63
GP+G G +G + GP+G+ G P+G GP+GS G +G
Sbjct: 41 TGPTGSTGATGATGPGVGATGPTGATGATGNTGPAGLRGNTGPTGSTGATGNTGATGMTP 100
Query: 64 ------------------LRYLGPSG-RLRY------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
PSG L + GP+GS G +G +GP+G
Sbjct: 101 VITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASLLFTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAG 160
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G SG G +G GP+G + + G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 161 ATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG---VSGPTGNTGATGPTGATGSTG 217
Query: 159 PSGRLRYLGP---------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
P+G GP +G +GP+G GP+G G +D
Sbjct: 218 PTGPTGPAGPTGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTG-AD 276
Query: 198 GLR 200
G+
Sbjct: 277 GVT 279
>gi|225868801|ref|YP_002744749.1| collagen-like cell surface-anchored protein SclF [Streptococcus
equi subsp. zooepidemicus]
gi|225702077|emb|CAW99704.1| putative collagen-like cell surface-anchored protein SclF
[Streptococcus equi subsp. zooepidemicus]
Length = 347
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/176 (32%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 101 GPQGETGPAGPAGPQ---GPRGETGSAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPAGQPGAQGPKGDK 157
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 158 GDKGDTGAT---GPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPK 211
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 212 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGE 267
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP G GP+G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 105 ETGPAGPAGPQGPRGETGSAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPAGQPGAQGPKGDKGDKGDTG 164
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 165 ---ATGPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQG 218
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 219 PKGDRGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGP 273
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/118 (33%), Positives = 39/118 (33%), Gaps = 3/118 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 166 TGPKGDTGATGPQGPA---GPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGD 222
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP G GP G GP G GP G GP D
Sbjct: 223 RGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPKKEPEKD 280
>gi|87882922|emb|CAJ58480.1| hypothetical protein BA_2450 [Bacillus anthracis]
Length = 224
Score = 61.6 bits (148), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 64/174 (36%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP----------------- 141
GP+G GP+G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTG 152
Query: 142 -------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 PTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 206
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 63/174 (36%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP----------------- 123
GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTG 152
Query: 124 -------SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 PTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 206
>gi|87882924|emb|CAJ58481.1| hypothetical protein BA_2450 [Bacillus anthracis]
Length = 224
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 64/174 (36%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------- 150
GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G GP
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGVTGPTGITGATG 152
Query: 151 ----------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 PTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 206
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/173 (26%), Positives = 63/173 (36%), Gaps = 24/173 (13%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------- 159
GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGVTGPTGITGATG 152
Query: 160 ----------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G GP+G GP+G G +
Sbjct: 153 PTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGATGLAGAT 205
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 64/174 (36%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP-------- 141
GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGVTGPTGITGATG 152
Query: 142 ----------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 PTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 206
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 63/174 (36%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP-------- 132
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGVTGPTGITGATG 152
Query: 133 ----------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 PTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 206
>gi|42780654|ref|NP_977901.1| hypothetical protein BCE_1581 [Bacillus cereus ATCC 10987]
gi|42736574|gb|AAS40509.1| hypothetical protein BCE_1581 [Bacillus cereus ATCC 10987]
Length = 585
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 210 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGAT 266
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 267 GATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQ 326
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 327 G---VQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGA---TGPQGPQGVQGPAGATGATGPQG 375
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 186 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT---GATGAQ 239
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G G GP+
Sbjct: 240 GVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 299
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G GP+G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 300 GATGATGAQGPQGIQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGAT 353
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP+G+ G G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 194 TGPQGPQGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGA 247
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G GP G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 248 TGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGA 307
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 308 QGPQGIQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGPQGPQG 360
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/156 (31%), Positives = 61/156 (39%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 233 TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGP 292
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G GP+G G +G GP+G GP G GP
Sbjct: 293 QGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGP 349
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 350 AGA---TGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGP 382
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/199 (29%), Positives = 73/199 (36%), Gaps = 27/199 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 261 GPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGAT 320
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 321 ---GATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGA---TGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ 374
Query: 134 GRLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G P G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 375 GPQGVQGPAGATGATGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGAQGPQG---IQGPAGATGAT 431
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP+G G
Sbjct: 432 GPQGPQGIQGPAGATGATG 450
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 251 TGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGP 310
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 311 QGIQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGA---TGPQGPQGVQGP 364
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G G +G GP G GP+G GP G
Sbjct: 365 AGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGAQGPQG 420
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/200 (30%), Positives = 79/200 (39%), Gaps = 17/200 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYL 67
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G P+G
Sbjct: 279 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGAT 338
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G +G
Sbjct: 339 GPQGPQGVQGPAGAT---GPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGATGAT 395
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP+
Sbjct: 396 GATGPQGPQGIQGPAGATGAQGPQG---IQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPA 452
Query: 188 G-----RLRYLGLSDGLRVS 202
G LG ++ VS
Sbjct: 453 GTPIPVTTAVLGNTNAQTVS 472
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/163 (30%), Positives = 63/163 (38%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP GP+G+ GP G GP G GP+G+ G G
Sbjct: 174 GPAGAQGATGPQ------GPAGAQGATGPQGPQGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQ 224
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP+G G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 225 GVQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPA 281
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 282 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATG 324
>gi|301056235|ref|YP_003794446.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus biovar anthracis str. CI]
gi|300378404|gb|ADK07308.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus biovar
anthracis str. CI]
Length = 853
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/160 (26%), Positives = 62/160 (38%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +GS G +G G +G+ GP+G G +G G +GS G +G
Sbjct: 505 TGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGV 564
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 565 TGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGSTGV 624
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G G +G + G +G GP+G
Sbjct: 625 TGNTGATGSTGVTGNTGATGSIGATGNTGATGETGPTGST 664
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/177 (25%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP+G+ G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 502 TGSTGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGE 561
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 562 TGVTG------STGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGE 615
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G G +G G +G + G +G GP+G GP+G
Sbjct: 616 TGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGSIGATGNTGATGETGPTGS---TGPTGS 669
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/151 (27%), Positives = 62/151 (41%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP+G G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 525 NTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS---TGPTGNTGATGSTG 581
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS G +G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 582 PTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNTG 641
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
+G + G +G GP+G GP+G
Sbjct: 642 ATGSIGATGNTGATGETGPTGS---TGPTGS 669
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/200 (23%), Positives = 70/200 (35%), Gaps = 24/200 (12%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------------RYLGPSGS 54
+G G +G+ GP+GS G +G + G +G+
Sbjct: 448 TGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGPTGETGGTGSTGVTGNTGATGSTGA 507
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 508 TGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS 567
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G +G S GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 568 TGPTGNTGATG---STGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGSTGV 624
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G
Sbjct: 625 TGNTGATGSTGVTGNTGATG 644
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/159 (24%), Positives = 59/159 (37%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G+ GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 501 ATGSTGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTG 560
Query: 99 RLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 561 ETGVTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTG 620
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G + G +G G
Sbjct: 621 STGVTGNTGATGSTGVTGNTGATGSIGATGNTGATGETG 659
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/194 (23%), Positives = 68/194 (35%), Gaps = 33/194 (17%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------------RYLG 68
GP+GS +G GP+GS G +G + G
Sbjct: 450 ETGPTGS------TGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGPTGETGGTGSTGVTGNTGATG 503
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR-- 126
+G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 504 STGATGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETG 563
Query: 127 -LNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
S GP+G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 564 VTGSTGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGSTG 623
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G++
Sbjct: 624 VTGNTGATGSTGVT 637
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/178 (22%), Positives = 62/178 (34%), Gaps = 24/178 (13%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------RYLGPSGS 81
+G G +G+ GP+G G +G + G +G+
Sbjct: 448 TGETGPTGSTGATGNTGPTGSTGVTGNTGPIGSTGPTGETGGTGSTGVTGNTGATGSTGA 507
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY--- 138
G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G
Sbjct: 508 TGSTGVTGATGETGPTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGS 567
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 568 TGPTGNTGATGSTGPTGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGATGETGPTGSTGVT 625
>gi|229110769|ref|ZP_04240332.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
Rock1-15]
gi|228672648|gb|EEL27929.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
Rock1-15]
Length = 837
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/196 (29%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP GS+ GP G GP +G+ GP G GP G G
Sbjct: 469 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 528
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G +G GPSG GP G GP G
Sbjct: 529 QGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGP 588
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 589 TGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQ 648
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 649 TGLTGATGPTGIQGIQ 664
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLG 68
+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP +G+ G
Sbjct: 450 STGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATG 509
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G G G GP G GP G G +G GPSG
Sbjct: 510 PQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAG 569
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G G +G G G GP G G +G GP G
Sbjct: 570 ATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQG 629
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 415 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGI 474
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP GS+ GP G GP +G+ GP G GP G G G
Sbjct: 475 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 534
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G G +G GPSG GP G GP G G +G
Sbjct: 535 QGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGE 594
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 595 TGATG 599
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/167 (33%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---S 88
GPSGS GP G GPSG GP G GP G + GP G GP +
Sbjct: 446 GPSGST---GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVT 502
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G+ GP G GP G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 503 GQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPT 562
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GP G GP+G G +G G+
Sbjct: 563 GPSGEAGATGPQGPQGIQGPQG---ATGPTGATGETGATGSQGPQGI 606
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 65/179 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPT 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP G G +G G G + GP G G+
Sbjct: 476 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 534
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G S GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 460
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGI 516
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/189 (32%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP +
Sbjct: 446 GPSGST---GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVT 502
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRL 127
G+ GP G GP G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 503 GQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPT 562
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GPSG GP G GP G G +G G G GP G GP+
Sbjct: 563 ---GPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQG---ITGPT 616
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 617 GATGPTGAT 625
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/179 (31%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 397 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGV 456
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
GPSG GP G GP G + GP G GP +G+ GP G
Sbjct: 457 QGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGI 516
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G GP G G +G GPSG GP G
Sbjct: 517 QGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGATGPQG 575
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 392 GPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGST 451
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPS 133
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP +G+ + GP
Sbjct: 452 GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQ 511
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G G GP G GP G G +G GPSG
Sbjct: 512 GIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGAT 571
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 572 G 572
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 460
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GPSG GP G GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQ 517
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/189 (31%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 14/189 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G L+ L GP G GPSG GP G G
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQG 479
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G + GP G GP +G+ GP G GP G G G GP G
Sbjct: 480 PQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQG 539
Query: 180 RLRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 540 PTGQAGPQG 548
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 229
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 230 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 277
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 247
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 248 GV 249
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/156 (30%), Positives = 55/156 (35%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V +A GP G GP G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 501 VTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTG 560
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GPSG GP G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 561 PTGPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATG 620
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 621 PTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQTGLTGATG 656
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGNL---GGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 225
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 226 QGL 228
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/211 (27%), Positives = 79/211 (37%), Gaps = 18/211 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR-----L 64
GP G +GP+G G G GP+G GP GS GP G +
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGPIGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGI 99
Query: 65 RYL-------GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+ + GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 100 QGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGV 159
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP+G + G G LG SG G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 160 QGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGP 219
Query: 178 SGRLRY---LGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP G + +G + + G+
Sbjct: 220 QGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQ 250
>gi|423513882|ref|ZP_17490411.1| hypothetical protein IG3_05377, partial [Bacillus cereus HuA2-1]
gi|402444009|gb|EJV75900.1| hypothetical protein IG3_05377, partial [Bacillus cereus HuA2-1]
Length = 296
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 75/160 (46%), Gaps = 12/160 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G GP+G + GP+G GP+G + G +GS +GP+G G G
Sbjct: 2 DIGPTG---VTGPTGDI---GPTG---VTGPTGDIGPTGATGSTGDIGPTGATGSTGDIG 52
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G + G +G GP+G GP+G + G +G +GP+G G
Sbjct: 53 PTGVTGPTGDIGPTGVTGPTGVTGPTGA---TGPTGDIGPTGVTGSTGDIGPTGVTGPTG 109
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G +GP+G G +G +GP+G G +G
Sbjct: 110 ATGSTGDIGPTGVTGPTGATGPTGDIGPTGVTGLTGATGS 149
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/159 (29%), Positives = 74/159 (46%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP+G GP+G + GP+G GP+G + G +G +GP+G+ G G
Sbjct: 3 IGPTG---VTGPTGDI---GPTG---VTGPTGDIGPTGATGSTGDIGPTGATGSTGDIGP 53
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G + G +G GP+G GP+G + G +G +GP+G G
Sbjct: 54 TGVTGPTGDIGPTGVTGPTGVTGPTGA---TGPTGDIGPTGVTGSTGDIGPTGVTGPTGA 110
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G +GP+G G +G +GP+G G +G
Sbjct: 111 TGSTGDIGPTGVTGPTGATGPTGDIGPTGVTGLTGATGS 149
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 73/157 (46%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP+G GP+G + GP+G GP+G + G +GS +GP+G G G
Sbjct: 3 IGPTG---VTGPTGDI---GPTG---VTGPTGDIGPTGATGSTGDIGPTGATGSTGDIGP 53
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G + G +G GP+G GP+G + G +G +GP+G G
Sbjct: 54 TGVTGPTGDIGPTGVTGPTGVTGPTGAT---GPTGDIGPTGVTGSTGDIGPTGVTGPTGA 110
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +GP+G G +G +GP+G G +
Sbjct: 111 TGSTGDIGPTGVTGPTGATGPTGDIGPTGVTGLTGAT 147
>gi|423642552|ref|ZP_17618170.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD166]
gi|401276401|gb|EJR82356.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD166]
Length = 294
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 82/187 (43%), Gaps = 10/187 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G+ GP+G G +G +
Sbjct: 49 GPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGAT---GPTGITGATGVTGAI 105
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G +G GP+G G +G + GP+G GP+G G +
Sbjct: 106 GITGPTGATGITGATG---ITGPTGITGATGVTGAIGITGPTG---ITGPTGETGPTGIT 159
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + + + L Y
Sbjct: 160 GPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGVTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI-TTTNLLYY 218
Query: 194 GLSDGLR 200
+DG +
Sbjct: 219 TFADGEK 225
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/165 (29%), Positives = 72/165 (43%), Gaps = 9/165 (5%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G+
Sbjct: 32 PTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGA-- 89
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G +G + GP+G G +G GP+G + G +G + GP+G
Sbjct: 90 -TGPTGITGATGVTGAIGITGPTGATGITGATG---ITGPTGITGATGVTGAIGITGPTG 145
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 146 ---ITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTG 187
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 77/185 (41%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 32 PTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGAT- 90
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G G +G + GP+G G +G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 91 --GPTGITGATGVTGAIGITGPTGATGITGATG---ITGPTGITGATGVTGAIGITGPTG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 146 ---ITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGVTGLTGETGPTGATG 202
Query: 195 LSDGL 199
+ G+
Sbjct: 203 PTGGI 207
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 74/173 (42%), Gaps = 12/173 (6%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 32 PTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGA-- 89
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G +G + GP+G G +G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 90 -TGPTGITGATGVTGAIGITGPTGATGITGATGIT---GPTGITGATGVTGAIGITGPTG 145
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G +G GP+G GP+G G++ V+GL
Sbjct: 146 ---ITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGE---TGPTGETGPTGITGPTGVTGLT 192
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/160 (27%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 19/160 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G G +G+ GP+G G +G + GP+G GP+G G +G
Sbjct: 105 IGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGAIGITGPTG---ITGPTGETGPTGITGP 161
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---- 128
GP+G G +G GP+G G +G GP+G +GP N
Sbjct: 162 TGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGVTGLTGETGPTGATGPTGG---IGPITTTNLLYY 218
Query: 129 --SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
+DG +L Y G +Y G L PS + Y+
Sbjct: 219 TFADGE--KLIYTDADGIPQY----GTTNILSPS-EVSYI 251
>gi|206977718|ref|ZP_03238609.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
gi|206744019|gb|EDZ55435.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus H3081.97]
Length = 432
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +GS GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 119 PTGVTGVTGATGSTGATGPTG---VTGSTGATGITGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTG 175
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G+ G +G G +G GP+G G +G G +G + G +G
Sbjct: 176 VTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGATGATGITGATGPTGATGITG 235
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP+G G G GP+G G +G G
Sbjct: 236 ATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTGATGITGAMGVTGATGPTGATGSTGSTGPTGITG 295
Query: 195 LS 196
S
Sbjct: 296 TS 297
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/162 (26%), Positives = 66/162 (40%), Gaps = 6/162 (3%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G G +GS GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 119 PTGVTGVTGATGSTGATGPTG---VTGSTGATGITGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTG 175
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G G +G G +G + GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 176 VTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGATGATGITGATGPTGATGITG 235
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G GP+G G++ + V+G
Sbjct: 236 ATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTGA---TGITGAMGVTG 274
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/219 (23%), Positives = 75/219 (34%), Gaps = 45/219 (20%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG-------- 68
G + LGP+G GP+G+ +G +G GP+G+ G +G G
Sbjct: 31 GTVPKLGPTGPTGATGPTGATGPMGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGIT 90
Query: 69 ----------------------------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 97
P+G G +GS GP+G G +
Sbjct: 91 GATGATGATGITGATGATGATGITGATGPTGVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGIT 150
Query: 98 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRL 154
G GP+G G +G G +G + GP+G G +G GP+G
Sbjct: 151 GATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGAT 210
Query: 155 RYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 211 GITGATGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGAT 249
>gi|423463805|ref|ZP_17440573.1| hypothetical protein IEK_00992, partial [Bacillus cereus BAG6O-1]
gi|402421012|gb|EJV53279.1| hypothetical protein IEK_00992, partial [Bacillus cereus BAG6O-1]
Length = 279
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/142 (29%), Positives = 60/142 (42%), Gaps = 3/142 (2%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +GS GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 2 ATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATG 61
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G +G G +G GP+G G +G GP+G S G +G G
Sbjct: 62 PTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGAT---G 118
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
P+G GP+G GP+G
Sbjct: 119 PTGATGITGPTGATGDTGPTGA 140
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/142 (29%), Positives = 58/142 (40%), Gaps = 3/142 (2%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +GS GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 2 ATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATG 61
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G G +G GP+G S G +G GP+G G +G G
Sbjct: 62 PTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGA---TG 118
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P+G GP+G GP+G
Sbjct: 119 PTGATGITGPTGATGDTGPTGA 140
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/140 (29%), Positives = 60/140 (42%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +GS GP+G+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 4 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 63
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G + GP+
Sbjct: 64 GATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGAT---GSTGATGATGPT 120
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G GP+G GP+G
Sbjct: 121 GATGITGPTGATGDTGPTGA 140
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/142 (28%), Positives = 60/142 (42%), Gaps = 3/142 (2%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+G+ GP+G G +G GP+G+ G +G
Sbjct: 2 ATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATG 61
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G GP+G G +G + GP+G G +G G
Sbjct: 62 PTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGA---TG 118
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
P+G GP+G GP+G
Sbjct: 119 PTGATGITGPTGATGDTGPTGA 140
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/142 (28%), Positives = 59/142 (41%), Gaps = 3/142 (2%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G+ G +G GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 2 ATGSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATG 61
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G G +G + GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 62 PTGATGSTGATGPTGVTGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGATGSTGATGAT---G 118
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P+G GP+G GP+G
Sbjct: 119 PTGATGITGPTGATGDTGPTGA 140
>gi|423529526|ref|ZP_17505971.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus HuB1-1]
gi|402448008|gb|EJV79856.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus HuB1-1]
Length = 195
Score = 61.2 bits (147), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 77/185 (41%), Gaps = 25/185 (13%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
L G SG GP+G GP +GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 36 TLPTGASGATGPTGPTGVTGITGP------IGPTGATGITGPTGVTGITGPTGPTGVTGI 89
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G GP+G GP+G GP+ GP+G GPSG
Sbjct: 90 TGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGITGITGPT------GPTGVTGVTGPSG---- 139
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GPSG +GP+G GP+G GP+ GP+G GP+G
Sbjct: 140 -GPAGPTGPTGPSG--GPIGPTGITGPTGPTGATGITGPT------GPTGATGITGPTGP 190
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 191 TGATG 195
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/163 (31%), Positives = 71/163 (43%), Gaps = 19/163 (11%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
SG+ GP+G GP +GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 42 SGATGPTGPTGVTGITGP------IGPTGATGITGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGP 95
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G GP+G GP+G GP+G P+G GPSG GP+G
Sbjct: 96 TGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGITGITGPTG------PTGVTGVTGPSG-----GPAGP 144
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GPSG +GP+G GP+G GP+G G++
Sbjct: 145 TGPTGPSGG--PIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIT 185
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/101 (28%), Positives = 43/101 (42%), Gaps = 3/101 (2%)
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P+G GP+G G +G + GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 38 PTGASGATGPTGPTGVTGITGPI---GPTGATGITGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTG 94
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP+G GP+G G + V+G+
Sbjct: 95 PTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGITGITGPTGPTGVTGVT 135
>gi|30021453|ref|NP_833084.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cereus ATCC
14579]
gi|229128627|ref|ZP_04257605.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-Cer4]
gi|29897007|gb|AAP10285.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus ATCC
14579]
gi|228654820|gb|EEL10680.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-Cer4]
Length = 837
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 65/175 (37%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP GP+G+ GP G
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQTGATGPQGIQ 514
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G GP G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 515 GIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGATGPQ 574
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G+ GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 575 GPQGIQGPQGATGQAGATGQTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQG 629
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/189 (31%), Positives = 71/189 (37%), Gaps = 9/189 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPS 70
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP+
Sbjct: 446 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 502
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G+ GP G GP G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 503 GQTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPT 562
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPS 187
G +G GP G GP G G +G+ GP G GP +G+ GP+
Sbjct: 563 GATGPTGATGPQGPQGIQGPQGATGQAGATGQTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGPT 622
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G+
Sbjct: 623 GATGPQGIQ 631
Score = 53.5 bits (127), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 355 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGP 414
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 415 TGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 474
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP GP+G+ GP G GP G G+
Sbjct: 475 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 528
Query: 196 S 196
Sbjct: 529 Q 529
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGL 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP GP+G+ GP G GP +GP+G
Sbjct: 481 QGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQTGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGI 528
Query: 193 LGLS 196
G+
Sbjct: 529 QGIQ 532
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 67/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 415 TGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 474
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP G P+G+ GP G GP G G
Sbjct: 475 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQG------PTGQTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 528
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP+G GP+G GP G G +G+
Sbjct: 529 QGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGATGQ 588
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 589 AGATGQT 595
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQ 460
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGIQ 517
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQ 460
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GPSG GP G GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGIQ 517
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---L 148
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 229
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 230 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 277
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 61/172 (35%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGP--------- 60
GP G GP GS+ GP G GP +G+ GP G GP
Sbjct: 469 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 528
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G GP G GP G GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 529 QGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTG---ATGPQGPQGIQGPQGA 585
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G+ + GP G GP G G +G GP G GP
Sbjct: 586 TGQAGATGQTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQGIQGIQGPQ 637
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 247
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 397 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGV 456
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP G GP GP+G+ + GP
Sbjct: 457 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQTGATGP 510
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G G G GP G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 511 QGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGA 570
Query: 190 L 190
Sbjct: 571 T 571
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/211 (27%), Positives = 79/211 (37%), Gaps = 18/211 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR-----L 64
GP G +GP+G G G GP+G GP GS GP G +
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGPIGPTGPQGIQGVQGMQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGI 99
Query: 65 RYL-------GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+ + GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 100 QGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGV 159
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP+G + G G LG SG G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 160 QGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGP 219
Query: 178 SGRLRY---LGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP G + +G + + G+
Sbjct: 220 QGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQ 250
>gi|85817487|gb|EAQ38667.1| hypothetical protein MED134_12241 [Dokdonia donghaensis MED134]
Length = 496
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/182 (31%), Positives = 79/182 (43%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G + GP+G+ GP G + G G+ GP+G G +G
Sbjct: 154 VGPAGADGATGPQGPI---GPAGADGATGPQGPIGPAGADGATGPQGPTGPAGADGATGP 210
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G +DG
Sbjct: 211 QGPVGPKGADGATGPQGPA---GPAGTDGATGPQGPA---GPAGADGATGPQGPAGADGA 264
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP G +GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 265 TGPQGPAGPAGADGATGPQGP---VGPAGADGATGPAGPAGADGATGPQGPAGPAGADGA 321
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 322 TG 323
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/177 (31%), Positives = 75/177 (42%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G + G G+ GP+G G +G +GP G GP G
Sbjct: 169 IGPAGADGATGPQGPIGPAGADGATGPQGPTGPAGADGATGPQGPVGPKGADGATGPQGP 228
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G G GP+G GP G P+G +DG
Sbjct: 229 A---GPAGTDGATGPQGPAGPAGADGATGPQGPAGADGATGPQG------PAGPAGADGA 279
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G +GP+G GP+G G +G GP+G GP G +GPSG
Sbjct: 280 TGPQGPVGPAGADGATGPAGPAGADGATGPQGPAGPAGADGATGPQGP---VGPSGT 333
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 72/177 (40%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G G+ GP G G +G +GP+G GP G +
Sbjct: 125 GPAGADGATGPQGPTGPAGADGATGPQGPVGPAGADGATGPQGPIGPAGADGATGPQGPI 184
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G + G G GP+G +DG +
Sbjct: 185 ---GPAGADGATGPQGPT---GPAGADGATGPQGPVGPKGADGATGPQGPAGPAGTDGAT 238
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G GP G G +G GP+G GP G + G G
Sbjct: 239 GPQGPAGPAGADGATGPQGPAGADGATGPQGPAGPAGADGATGPQGPVGPAGADGAT 295
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 73/179 (40%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G+ GP G + GP+G+ GP G + G G
Sbjct: 139 TGPAGADGATGPQGPV---GPAGADGATGPQGPI---GPAGADGATGPQGPIGPAGADGA 192
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD-- 130
GP+G G +G +GP G GP G G G GP+G +D
Sbjct: 193 TGPQGPTGPAGADGATGPQGPVGPKGADGATGPQGPAGPAGTDGATGPQGPAGPAGADGA 252
Query: 131 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G +G GP+G GP G + G G GP+G GP G
Sbjct: 253 TGPQGPAGADGATGPQGPAGPAGADGATGPQGPVGPAGADGATGPAGPAGADGATGPQG 311
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G G +G GP+G GP G +GP+G GP G
Sbjct: 112 AGPAGADGAQGPQGPAGADGATGPQGPTGPAGADGATGPQGP---VGPAGADGATGPQGP 168
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G+ GP G +GP+G GP G G G GP G +DG
Sbjct: 169 ---IGPAGADGATGPQGP---IGPAGADGATGPQGPTGPAGADGATGPQGPVGPKGADGA 222
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP+G GP G G G GP+G GP G
Sbjct: 223 TGPQGPAGPAGTDGATGPQGPAGPAGADGATGPQGPAGADGATGPQG 269
>gi|449485049|ref|XP_004176035.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: pre-mRNA cleavage complex 2 protein
Pcf11 [Taeniopygia guttata]
Length = 1526
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 82/221 (37%), Positives = 113/221 (51%), Gaps = 68/221 (30%)
Query: 14 GPSGR--LRYLGP---SGSLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---- 58
GP+G+ +R+ GP +G+ ++ GP +G+LR+ GP G+L +GSLR+
Sbjct: 800 GPAGQAAMRFEGPLVGTGASQFDGPLAGAGGAGALRFDGPPGQL-----AGSLRFEGPPG 854
Query: 59 --GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---- 108
G G LR+ GP G LR+ GP+G R+ GP GPSG LR+ GP G+
Sbjct: 855 QVGGGGPLRFEGPLGPLRFEGPAGQPVGGARFEGP-------GPSGGLRFEGPHGQPNGX 907
Query: 109 --------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRY 156
LR+ GP G+ LGP G+ P G LR+ GP L+ LGP G+ LR+
Sbjct: 908 PRGQPGGGLRFEGPHGQP--LGPHGQ-----PGGSLRFEGP--HLQPLGPHGQLGGGLRF 958
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR 189
GP G+ +GP G LR+ GP G LR GP G+
Sbjct: 959 EGPHGQP--MGPHGPSGGGLRFEGPHGPSGGGLRLDGPRGQ 997
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/211 (37%), Positives = 104/211 (49%), Gaps = 56/211 (26%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR----------- 72
LR+ GP G LR+ GP+G+ R+ GP GPSG LR+ GP G+
Sbjct: 862 LRFEGPLGPLRFEGPAGQPVGGARFEGP-------GPSGGLRFEGPHGQPNGXPRGQPGG 914
Query: 73 -LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR- 126
LR+ GP G + LGP G+ P G LR+ GP L+ LGP G+ LR+ GP G+
Sbjct: 915 GLRFEGPHG--QPLGPHGQ-----PGGSLRFEGP--HLQPLGPHGQLGGGLRFEGPHGQP 965
Query: 127 LNSDGPS-GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGP----------SGRLRYLGPSGR 171
+ GPS G LR+ GP G LR GP G+ LGP +G LR+ GP GR
Sbjct: 966 MGPHGPSGGGLRFEGPHGPSGGGLRLDGPRGQP-GLGPRLIDGPVHQGAGGLRFDGPLGR 1024
Query: 172 L--RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
R+ G G + G G+L L DG+
Sbjct: 1025 AGPRFDGCHG-AGFDGQPGQLSLLQRFDGIH 1054
>gi|113474275|ref|YP_720336.1| phage tail Collar [Trichodesmium erythraeum IMS101]
gi|110165323|gb|ABG49863.1| phage Tail Collar [Trichodesmium erythraeum IMS101]
Length = 1873
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/155 (32%), Positives = 79/155 (50%), Gaps = 12/155 (7%)
Query: 17 GRLRYLGPSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS------LRYLGPSGRLRYL 67
G + GPSG+ + +GPSG+ +GP G + +GP+G+ +GP+G
Sbjct: 66 GPVGPAGPSGAPGPVGPIGPSGAPGPVGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPAGADGVP 125
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +G + +GPSG+ +GP G GP+G + G G GP+G + +GP+G
Sbjct: 126 GLTGPIGPIGPSGAPGPVGPVGPTGAPGPAGPVGPAGADGVPGLAGPAGPIGPVGPAGAD 185
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G + +GPSG GP G + +GP+G
Sbjct: 186 GVPGLTGPIGPIGPSGA---PGPVGPIGPVGPAGA 217
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/138 (32%), Positives = 70/138 (50%), Gaps = 9/138 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GPSG +GP G + +GP+G+ +GP+G G +G + +GPSG
Sbjct: 83 IGPSGAPGPVGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGP 142
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP G GP+G + G G GP+G + +GP+G G +G + +GPSG
Sbjct: 143 VGPVGPTGAPGPAGPVGPAGADGVPGLAGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSG- 201
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+ GP G + +GP+G
Sbjct: 202 --APGPVGPIGPVGPAGA 217
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/233 (25%), Positives = 96/233 (41%), Gaps = 63/233 (27%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR---------- 63
GP+G + +GP+G+ G +G + +GPSG GP+G + +GP+G
Sbjct: 285 GPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGA---PGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPV 341
Query: 64 --------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
GP+G + +GP+G+ G +G + +GPSG
Sbjct: 342 GPVGPVGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGA---P 398
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGR---------------------------LRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G + +GP+G +GP G + GP+G
Sbjct: 399 GPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPVGPAGADGVPGLAGPVGPIGPVGPVGPTGAP 458
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G + +GP+G G +G + +GP+G GP G + +GP+G
Sbjct: 459 GPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGA 511
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/214 (26%), Positives = 91/214 (42%), Gaps = 37/214 (17%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G + +GP+G+ GP G + +GP+G+ G +G + +GP+G GP G
Sbjct: 443 VGPIGPVGPVGPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGAPGPAGPVGP 502
Query: 82 LRYLGPSGR------------------------------------LRYLGPSGRLRYLGP 105
+ +GP+G + +G +G G
Sbjct: 503 IGPVGPAGADGVPGLAGPAGAPGPAGPVGPVGPTGAPGPAGPAGPIGPVGSAGADGVPGL 562
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G + +GPSG GP G + G G GP+G GP G + +GP+G
Sbjct: 563 TGPIGPIGPSGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGASGPAGPVGPIGPVGPAGADGV 622
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G +G + +GP+G +GP G + G +DG+
Sbjct: 623 PGLAGPVGPVGPTGAPGPVGPIGPVGPAG-ADGV 655
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/242 (25%), Positives = 100/242 (41%), Gaps = 65/242 (26%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---- 72
G GP+G + +GP+G+ G +G + +GPSG+ GP+G + +GP+G
Sbjct: 279 GPAGLAGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGA---PGPAGPIGPVGPAGADGVP 335
Query: 73 --------------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G + +GP+G G +G + +GPS
Sbjct: 336 GLAGPVGPVGPVGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPS 395
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G GP+G + +GP+G +DG G +GP G + +
Sbjct: 396 GA---PGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPVGPAGADGVPGLAGPVGPIGPVGPV 452
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL--SD 197
GP+G GP G + +GP+G + +GP+G GP G + +G +D
Sbjct: 453 GPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGAD 512
Query: 198 GL 199
G+
Sbjct: 513 GV 514
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/261 (23%), Positives = 97/261 (37%), Gaps = 78/261 (29%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGS------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS------------- 54
GP+G + +GP+G+ +GP G GP+G + +GP+G+
Sbjct: 366 GPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPV 425
Query: 55 --------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
+GP G + +GP+G GP G + +GP+G G +G +
Sbjct: 426 GPVGPAGADGVPGLAGPVGPIGPVGPVGPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPV 485
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------------------------- 126
+GP+G GP G + +GP+G
Sbjct: 486 GPVGPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGAPGPAGPVGPVGPTGAPGPAGPA 545
Query: 127 --------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYL 175
+DG G +GP G GP+G + +GP+G GP+G
Sbjct: 546 GPIGPVGSAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGASGPA 605
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + +GP+G GL+
Sbjct: 606 GPVGPIGPVGPAGADGVPGLA 626
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/204 (25%), Positives = 87/204 (42%), Gaps = 39/204 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G + +GP+G+ G +G + +GP+G+ GP G + +GP+G
Sbjct: 452 VGPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGAPGPAGPVGPIGPVGPAGA 511
Query: 73 ------------------------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ +G +G+ G +G + +GP
Sbjct: 512 DGVPGLAGPAGAPGPAGPVGPVGPTGAPGPAGPAGPIGPVGSAGADGVPGLTGPIGPIGP 571
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
SG GP+G + +GP+G G +G + GP+G + +GP G G G
Sbjct: 572 SGA---PGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGASGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGP 628
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+GP G GP G + +GP+G
Sbjct: 629 VGPVGPTGAPGPVGPIGPVGPAGA 652
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/230 (26%), Positives = 93/230 (40%), Gaps = 44/230 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G GP+G + +GP+G+ GP+G GP G + +GP+G G
Sbjct: 566 IGPIGPSGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGASGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGL 625
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------RLRYLGPSGR 108
+G + +GP+G+ +GP G + G G G G
Sbjct: 626 AGPVGPVGPTGAPGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGAPGPAGPIGPVGPAGTDGVPGL 685
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP-------------------SGRLRYLG 149
+GP G GP+G + GP+G GP G + G
Sbjct: 686 AGPVGPVGPSGAPGPAGPIGPVGPTGAPGPAGPIGPVGPAGPAGGPAGPAGPIGPVGPAG 745
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
P+G + +GP+G G +G + +GPSG +GP G + G +DG+
Sbjct: 746 PAGPIGPVGPAGSDGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPVGSAG-ADGV 794
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/102 (32%), Positives = 50/102 (49%), Gaps = 9/102 (8%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+GPSG+ +GP +GP+G G +G + +GP+G + GP G +D G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGP------VGPAGADGAPGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGAD---GA 1697
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ GP G + GP G +GP+G + GP G +GP
Sbjct: 1698 PGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPAGPVGPTGPIGP 1739
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 48/96 (50%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GPSG+ +GP G G+ + GP G + GP G +GP+G+ G +G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGPVGPAGA---DGAPGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGADGAPGFTGP 1703
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+ +GP+G + GP G +GP+G + GP G
Sbjct: 1704 VGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPAGPVGPTGPIGP 1739
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/203 (25%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 49/203 (24%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 99
+G + +GPSG+ GP G + G G GP+G+ GP G + +GP+G
Sbjct: 563 TGPIGPIGPSGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGASGPAGPVGPIGPVGPAGADGV 622
Query: 100 ---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------------LNSDGP 132
+GP G GP G + +GP+G +DG
Sbjct: 623 PGLAGPVGPVGPTGAPGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGAPGPAGPIGPVGPAGTDGV 682
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------------------SGRLR 173
G +GP G GP+G + +GP+G GP G +
Sbjct: 683 PGLAGPVGPVGPSGAPGPAGPIGPVGPTGAPGPAGPIGPVGPAGPAGGPAGPAGPIGPVG 742
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G + +GP+G GL+
Sbjct: 743 PAGPAGPIGPVGPAGSDGVPGLT 765
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 47/96 (48%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+GPSG +GP G G+ + GP G + GP G +GP+G G +G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGPVGPAGA---DGAPGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGADGAPGFTGP 1703
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+ +GP+G + + GP G +GP+G + GP G
Sbjct: 1704 VGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPAGPVGPTGPIGP 1739
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.031, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 47/96 (48%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GPSG +GP G G+ + GP G + GP G+ +GP+G G +G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGPVGPAGA---DGAPGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGADGAPGFTGP 1703
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+ +GP+G + GP G +GP+G + GP G
Sbjct: 1704 VGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPAGPVGPTGPIGP 1739
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 46/96 (47%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GPSG +GP G G + GP G + GP G+ +GP+G G +G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGPVGPAGA---DGAPGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGADGAPGFTGP 1703
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+ +GP+G + GP G +GP+G + GP G
Sbjct: 1704 VGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPAGPVGPTGPIGP 1739
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.047, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 46/96 (47%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GPSG+ +GP G G + GP G + GP G +GP+G G +G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGPVGPAGA---DGAPGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGADGAPGFTGP 1703
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+ +GP+G + GP G +GP+G + GP G
Sbjct: 1704 VGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPAGPVGPTGPIGP 1739
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.055, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 64/129 (49%), Gaps = 18/129 (13%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS-- 88
+GP+G+ G +G + +GPSG+ GP G + +GP+G G +G + +GP+
Sbjct: 1197 VGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGA 1256
Query: 89 -------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G GP+G + +GP+G G +G + +GPSG + GP+G
Sbjct: 1257 PGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSG---APGPAGP 1313
Query: 136 LRYLGPSGR 144
+ +GP+G
Sbjct: 1314 IGPVGPAGA 1322
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.069, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 62/129 (48%), Gaps = 18/129 (13%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS-- 124
+GP+G G +G + +GPSG GP G + +GP+G G +G + +GP+
Sbjct: 1197 VGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGA 1256
Query: 125 -------------GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G + GP+G + +GP+G G +G + +GPSG GP+G
Sbjct: 1257 PGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGA---PGPAGP 1313
Query: 172 LRYLGPSGR 180
+ +GP+G
Sbjct: 1314 IGPVGPAGA 1322
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 63/129 (48%), Gaps = 18/129 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS-- 70
+GP+G G +G + +GPSG+ GP G + +GP+G+ G +G + +GP+
Sbjct: 1197 VGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGA 1256
Query: 71 -------------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G GP+G + +GP+G G +G + +GPSG GP+G
Sbjct: 1257 PGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAP---GPAGP 1313
Query: 118 LRYLGPSGR 126
+ +GP+G
Sbjct: 1314 IGPVGPAGA 1322
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 62/129 (48%), Gaps = 18/129 (13%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS-- 106
+GP+G+ G +G + +GPSG GP G + +GP+G G +G + +GP+
Sbjct: 1197 VGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGA 1256
Query: 107 -------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G GP+G + +GP+G G +G + +GPSG GP+G
Sbjct: 1257 PGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGA---PGPAGP 1313
Query: 154 LRYLGPSGR 162
+ +GP+G
Sbjct: 1314 IGPVGPAGA 1322
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/102 (31%), Positives = 48/102 (47%), Gaps = 9/102 (8%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GPSG +GP +GP+G G +G + +GP+G + + GP G G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGP------VGPAGADGAPGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGA---DGA 1697
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G + GP G +GP+G + GP G +GP
Sbjct: 1698 PGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPAGPVGPTGPIGP 1739
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/85 (31%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 3/85 (3%)
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+GPSG +GP G +DG + GP G + GP G +GP+G G +G
Sbjct: 1647 IGPSGAPGPVGPVGPAGADG---APGFTGPVGPVGPAGPIGATGPVGPAGADGAPGFTGP 1703
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ +GP+G + GP G +G +
Sbjct: 1704 VGPVGPAGPIGATGPVGPTGPVGPA 1728
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 61/129 (47%), Gaps = 18/129 (13%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS-- 97
+GP+G G +G + +GPSG GP G + +GP+G+ G +G + +GP+
Sbjct: 1197 VGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGA 1256
Query: 98 -------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G GP+G + +GP+G G +G + GPSG GP+G
Sbjct: 1257 PGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGA---PGPAGP 1313
Query: 145 LRYLGPSGR 153
+ +GP+G
Sbjct: 1314 IGPVGPAGA 1322
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 61/129 (47%), Gaps = 18/129 (13%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS-- 79
+GP+G+ G +G + +GPSG GP G + +GP+G G +G + +GP+
Sbjct: 1197 VGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPTGA 1256
Query: 80 -------------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G GP+G + +GP+G G +G + +GPSG GP+G
Sbjct: 1257 PGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAP---GPAGP 1313
Query: 127 LNSDGPSGR 135
+ GP+G
Sbjct: 1314 IGPVGPAGA 1322
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/212 (25%), Positives = 85/212 (40%), Gaps = 55/212 (25%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS------------------ 81
+GP+G G +G + +GPSG GP G + +GP+G+
Sbjct: 1119 VGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGA---PGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPVGPVGPVGP 1175
Query: 82 ------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ +GP+G G +G + +GPSG GP G + +GP
Sbjct: 1176 VGPVGPTGAPGPAGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSGAPGPAGPVGPIGPVGP 1235
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPS---------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G G +G + +GP+ G GP+G + +GP+G G
Sbjct: 1236 AGADGVPGLAGPVGPVGPTGAPGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGL 1295
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+G + +GPSG GP G + G +DG+
Sbjct: 1296 TGPIGPIGPSGAPGPAGPIGPVGPAG-ADGVP 1326
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/116 (29%), Positives = 52/116 (44%), Gaps = 15/116 (12%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G + +GP G G GP+G + +GP+G+ +GP G GP G +
Sbjct: 1420 GPAGPVGPIGPVGPAGA---DGVPGLAGPAGPIGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPI 1476
Query: 101 RYLGPSGRLRYLG------------PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GP+G G P+G +GP G + GP G + +GP+G
Sbjct: 1477 GPVGPAGADGIPGLAGPVGPVGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPVGPAGA 1532
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/117 (27%), Positives = 50/117 (42%), Gaps = 31/117 (26%)
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
GP+G + +GP G +DG P+G + +GP+G +GP G GP G + +
Sbjct: 1420 GPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGPIGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPV 1479
Query: 167 GPSGR------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
GP+G + +GPSG +GP G + G +DG+
Sbjct: 1480 GPAGADGIPGLAGPVGPVGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPVGPAG-ADGV 1535
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/110 (30%), Positives = 51/110 (46%), Gaps = 15/110 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + +GP+G+ GP+G + +GP+G +GP G GP G + +GP+
Sbjct: 1423 GPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGPIGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPVGPA 1482
Query: 71 GRLRYLG------------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G G P+G+ +GP G GP G + +GP+G
Sbjct: 1483 GADGIPGLAGPVGPVGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPVGPAGA 1532
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/113 (29%), Positives = 50/113 (44%), Gaps = 18/113 (15%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GP+G + +GP G GP+G + +GP+G +GP G + GP G + +
Sbjct: 1420 GPAGPVGPIGPVGPAGADGVPGLAGPAGPIGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPV 1479
Query: 140 GPSGRLRYLG------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G P+G +GP G GP G + +GP+G
Sbjct: 1480 GPAGADGIPGLAGPVGPVGPVGPTGAPGPIGPIGPSGAPGPVGPIGPVGPAGA 1532
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/142 (26%), Positives = 59/142 (41%), Gaps = 34/142 (23%)
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR---- 144
G GP+G + +GP+G G +G + +GPSG + GP+G + +GP+G
Sbjct: 279 GPAGLAGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPSG---APGPAGPIGPVGPAGADGVP 335
Query: 145 --------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP+G + +GP+G G +G + +GPS
Sbjct: 336 GLAGPVGPVGPVGPVGPVGPVGPIGLTGAPGPAGPIGPVGPAGADGVPGLTGPIGPIGPS 395
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G GP G + G +DG+
Sbjct: 396 GAPGPAGPIGPVGPAG-ADGVP 416
>gi|423641644|ref|ZP_17617262.1| hypothetical protein IK9_01589 [Bacillus cereus VD166]
gi|401277594|gb|EJR83533.1| hypothetical protein IK9_01589 [Bacillus cereus VD166]
Length = 835
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/196 (29%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP GS+ GP G GP +G+ GP G GP G G
Sbjct: 467 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 526
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G +G GPSG GP G GP G
Sbjct: 527 QGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGP 586
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 587 TGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQ 646
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 647 TGLTGATGPTGIQGIQ 662
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLG 68
+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP +G+ G
Sbjct: 448 STGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATG 507
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G G G GP G GP G G +G GPSG
Sbjct: 508 PQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAG 567
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G G +G G G GP G G +G GP G
Sbjct: 568 ATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQG 627
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 413 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGI 472
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP GS+ GP G GP +G+ GP G GP G G G
Sbjct: 473 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 532
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G G +G GPSG GP G GP G G +G
Sbjct: 533 QGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGE 592
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 593 TGATG 597
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/167 (33%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---S 88
GPSGS GP G GPSG GP G GP G + GP G GP +
Sbjct: 444 GPSGST---GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVT 500
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G+ GP G GP G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 501 GQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPT 560
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GP G GP+G G +G G+
Sbjct: 561 GPSGEAGATGPQGPQGIQGPQG---ATGPTGATGETGATGSQGPQGI 604
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 65/179 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP G G +G G G + GP G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 532
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G S GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 458
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGI 514
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/189 (32%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP +
Sbjct: 444 GPSGST---GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVT 500
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRL 127
G+ GP G GP G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 501 GQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPT 560
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GPSG GP G GP G G +G G G GP G GP+
Sbjct: 561 ---GPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQG---ITGPT 614
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 615 GATGPTGAT 623
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/179 (31%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 395 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGV 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
GPSG GP G GP G + GP G GP +G+ GP G
Sbjct: 455 QGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGI 514
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G GP G G +G GPSG GP G
Sbjct: 515 QGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGATGPQG 573
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 390 GPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGST 449
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPS 133
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP +G+ + GP
Sbjct: 450 GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQ 509
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G G GP G GP G G +G GPSG
Sbjct: 510 GIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGPSGEAGAT 569
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 570 G 570
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 458
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GPSG GP G GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQ 515
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/189 (31%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 14/189 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G L+ L GP G GPSG GP G G
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQG 477
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G + GP G GP +G+ GP G GP G G G GP G
Sbjct: 478 PQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGVTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQG 537
Query: 180 RLRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 538 PTGQAGPQG 546
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 275
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/156 (30%), Positives = 55/156 (35%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V +A GP G GP G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 499 VTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTG 558
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GPSG GP G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 559 PTGPSGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATG 618
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 619 PTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQTGLTGATG 654
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 245
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 246 GV 247
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+ G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 68/172 (39%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 167
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG-- 131
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 132 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
P G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/161 (29%), Positives = 65/161 (40%), Gaps = 9/161 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G LG SG
Sbjct: 125 IGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGL 184
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +GP+G G G +GP G GP G + +GP+G
Sbjct: 185 QGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGI 244
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G + GP+G GP+ GP+G GP+G
Sbjct: 245 QGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPT------GPTGATGITGPTG 279
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP G
Sbjct: 167 TGNTGIQGVQGNL---GGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 223
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 224 QGL 226
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/200 (28%), Positives = 75/200 (37%), Gaps = 18/200 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR-----L 64
GP G +GP+G G G GP+G GP GS GP G +
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGPIGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGI 97
Query: 65 RYL-------GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+ + GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 98 QGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGV 157
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP+G + G G LG SG G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 158 QGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGP 217
Query: 178 SGRLRY---LGPSGRLRYLG 194
G GP G + +G
Sbjct: 218 QGETGVQGLQGPQGEMGQVG 237
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 148
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPI---GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 163
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G V
Sbjct: 164 TGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 223
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 224 QGLQ 227
>gi|222097167|ref|YP_002531224.1| hypothetical protein BCQ_3507 [Bacillus cereus Q1]
gi|221241225|gb|ACM13935.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 621
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/186 (30%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 18/186 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 85 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGAT 135
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 136 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGTQGPAGATGATGPQGI---Q 189
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 190 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 249
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 250 GNTGAT 255
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 25 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQG-- 82
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 83 -IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGI---QGPA 132
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 133 GATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGTQGPAGATGATGPQG 187
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP G GP+G
Sbjct: 130 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---TQGPAGAT 180
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G G +G G G G +G + GP+
Sbjct: 181 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPA 237
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 238 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNT 297
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 298 GAT 300
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +
Sbjct: 115 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 168
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G GP+G GP G G +G G G +
Sbjct: 169 GPQGTQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 225
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 226 GATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGAT 285
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 286 GATG 289
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 70 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGAT 120
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G +
Sbjct: 121 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGTQ 174
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G GP+G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 175 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATG 229
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/191 (29%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 18/191 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 100 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGAT 150
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 151 GATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---TQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQ 201
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 202 GVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 261
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 262 GVQGNTGATGA 272
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/191 (29%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 21/191 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 55 GNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGAT 108
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP---S 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 109 GPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQ 159
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 160 GNTGATGATGPQGTQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 216
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 217 GVQGNTGATGA 227
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 145 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGTQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQ 201
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 202 GVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 261
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G G +G GP+G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 262 GVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQ 321
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 322 G 322
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/185 (30%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 75 TGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG- 127
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 128 --IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGTQGPAGATGA 182
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 183 TGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGA 239
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 240 TGATG 244
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 60 TGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG- 112
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNS 129
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 113 --IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGA 164
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 165 TGATGPQGTQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGN 221
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 222 TGATGAT 228
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 20 RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
+ GP+G+ GP G G +G G G+ G +G GP+G GP
Sbjct: 22 AFKGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQ 81
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP G
Sbjct: 82 G---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQ 129
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G G
Sbjct: 130 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGTQGPAGATGATG 184
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 67/178 (37%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G G +G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 135 TGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGT---QGPAGATGATGPQG- 187
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G G G G +G GP+G + GP
Sbjct: 188 --IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGP 245
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 246 QGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 303
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 15/186 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 105 TGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGV 158
Query: 73 LRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 159 QGNTGATGATGPQGTQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 215
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G +G GP+G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 216 QGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGA 272
Query: 190 LRYLGL 195
G+
Sbjct: 273 TGPQGI 278
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 190 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 249
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G +
Sbjct: 250 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 309
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G G +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 310 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG 367
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 69/193 (35%), Gaps = 15/193 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 175 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 231
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP- 132
GP+G+ GP G G +G G G G +G GP+G + GP
Sbjct: 232 GAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQ 291
Query: 133 --SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G +G GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 292 GVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGNTGATGATGPQ 351
Query: 182 RYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 352 GAQGPAGATGATG 364
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 198 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 257
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 258 TGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGA 317
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G +G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 318 TGPQGVQGNTGATGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPTGA 374
Query: 190 L 190
Sbjct: 375 T 375
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/173 (28%), Positives = 63/173 (36%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 206 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 265
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 266 NTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQG 325
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+ G +G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 326 NTGATGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 375
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/207 (26%), Positives = 71/207 (34%), Gaps = 36/207 (17%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 265 GNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 324
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN----- 128
G +G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 325 GNTGATGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTG 381
Query: 129 -------------------SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+ G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 382 PTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 438
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G GP G G +
Sbjct: 439 G---VQGPAGATGATGPQGAQGPAGAT 462
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/219 (26%), Positives = 74/219 (33%), Gaps = 56/219 (25%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSG---------SLRYLGPS 61
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G + GP
Sbjct: 280 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQ 339
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------------------------------RL 91
G G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 340 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQ 399
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G GP+G GP G GP+G + GP G GP+G GP
Sbjct: 400 GNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 453
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 454 G---AQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 486
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/208 (24%), Positives = 66/208 (31%), Gaps = 39/208 (18%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 220 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQ 279
Query: 77 GPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------RLRYLGPS 124
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP
Sbjct: 280 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQ 339
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG----------------------- 161
G + G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 340 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQ 399
Query: 162 -RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G
Sbjct: 400 GNTGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG 424
>gi|206978267|ref|ZP_03239145.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus H3081.97]
gi|206743516|gb|EDZ54945.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus H3081.97]
Length = 644
Score = 60.8 bits (146), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 66/181 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 313 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 372
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 373 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 432
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 433 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGAT 492
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 493 G 493
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 64/177 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 331 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 390
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 391 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 450
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G G G GP+G GP+G G G G +G
Sbjct: 451 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGATGAQGATGAT 507
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/174 (28%), Positives = 62/174 (35%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 331 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 390
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP+G G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 391 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 450
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G G G GP+G GP+G G G G +
Sbjct: 451 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGATGAQGAT 504
Score = 56.6 bits (135), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 63/177 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 304 GATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 363
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 364 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 423
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 424 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 480
Score = 56.2 bits (134), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G GP+G+ GP+G G G GP+G G
Sbjct: 283 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 343 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQ 402
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 403 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 462
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 463 GATG 466
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 295 GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 354
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 355 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 414
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 415 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 469
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 193 GPQGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 252
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN---SD 130
G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 253 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQ 312
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 313 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 372
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 373 GATG 376
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 64/181 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ GP G G +G GP+G G G
Sbjct: 268 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 327
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 328 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 387
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 388 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 447
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 448 G 448
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 63/175 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ GP G G +G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 277 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 336
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 337 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 396
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 397 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 451
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 65/181 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 250 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQ 309
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 310 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 369
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 370 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 429
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 430 G 430
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 66/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ GP G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 175 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 234
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSD 130
G G GP+G G G GP+G G G GP +G +
Sbjct: 235 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 294
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G +G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 295 GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 354
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 355 GATG 358
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 211 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 270
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 271 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQG---VQGPAGATGATGAQ 324
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 325 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 379
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 229 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 288
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G GP G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 289 GATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 342
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 343 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 397
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 64/181 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 232 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 291
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 292 GAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 351
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 352 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 411
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 412 G 412
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ GP G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 343 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 399
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 400 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 459
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G GP+G GP+G G +G G G GP+G
Sbjct: 460 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAG---ATGATGAQGATGAQGATGATGPAGT 512
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 64/181 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 214 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 273
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP G G +G GP+G G G GP+
Sbjct: 274 GAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 333
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 334 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 393
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 394 G 394
>gi|296503149|ref|YP_003664849.1| hypothetical protein BMB171_C2317 [Bacillus thuringiensis BMB171]
gi|296324201|gb|ADH07129.1| hypothetical protein BMB171_C2317 [Bacillus thuringiensis BMB171]
Length = 397
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 80/184 (43%), Gaps = 16/184 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G P+G+ GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 60 TGPTGATGITGPTG------PTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGV 113
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GPSG GP+G GPSG +GP+G GP G + G
Sbjct: 114 TGITGPTGPTGVTGPSG-----GPAGPTGPTGPSGG--PIGPTGATGITGPIGPTGATGI 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 167 TGPI---GPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGV 223
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 224 TGIT 227
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 78/180 (43%), Gaps = 16/180 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G P+G+ GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 72 TGPTGATGITGPTG------PTGATGITGPTGPTGATGITGST---GPTGVTGITGPTGP 122
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP+G GPSG +GP+G GP G G +G + G
Sbjct: 123 TGVTGPSG-----GPAGPTGPTGPSGG--PIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGA 175
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 176 TGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGF 235
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/182 (31%), Positives = 78/182 (42%), Gaps = 16/182 (8%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G GP+G G SG+ GP+G GP+G P+G GP+G
Sbjct: 38 PTGASGATGPTGPT---GTSGATGLTGPTGATGITGPTG------PTGATGITGPTGPTG 88
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G G +G GP+G GP+G GPSG GP+G GPSG
Sbjct: 89 ATGITGPTGPTGATGITGSTGPTGVTGITGPTGPTGVTGPSG-----GPAGPTGPTGPSG 143
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+GP+G GP G G +G + G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 144 --GPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPIGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATG 201
Query: 195 LS 196
++
Sbjct: 202 IT 203
>gi|157692573|ref|YP_001487035.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus pumilus SAFR-032]
gi|157681331|gb|ABV62475.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus pumilus SAFR-032]
Length = 1865
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGP 69
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G P+G G
Sbjct: 1322 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGA 1381
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ G +G G +G G +G GP+G G +G S
Sbjct: 1382 TGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGITGS 1441
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G G +G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1442 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGA 1501
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 1502 TGITG 1506
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/181 (25%), Positives = 70/181 (38%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS GP+GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 1079 TGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGI 1138
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1139 TGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 1198
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G+
Sbjct: 1199 TGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGI 1258
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 1259 T 1259
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1070 TGPTGATGITGSTGST---GATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 1126
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 1127 TGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGI 1186
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1187 TGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGI 1246
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1247 TGAT 1250
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 73/188 (38%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+GS G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1084 STGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATG 1143
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 1144 PTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATG 1203
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 1204 PTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATG 1263
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 1264 PTGVTGIT 1271
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/183 (25%), Positives = 68/183 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1334 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGATGSTGATGITGA 1393
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1394 TGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGA 1453
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1454 TGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGA 1513
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 1514 TGI 1516
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 1106 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGST---GATGS 1162
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+GS G +G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 1163 TGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGI 1222
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1223 TGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGI 1282
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1283 TGAT 1286
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 1118 TGPTGATGITGATGPTGVTGITGAT---GPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGI 1174
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 1175 TGATGPTGATGITGATGP---TGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGA 1231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1232 TGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGA 1291
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 1292 TGIT 1295
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 73/187 (39%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ GP+G+ G +G G +G+ G +G G
Sbjct: 1097 TGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGS 1156
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G S
Sbjct: 1157 TGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGS 1216
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1217 TGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGP 1276
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 1277 TGATGIT 1283
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/179 (25%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G +GS G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1069 VTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 1128
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LR 137
+ G +G GP+G G +G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 1129 ATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG 1188
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 1189 ATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGIT 1247
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/185 (25%), Positives = 72/185 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1090 STGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATG 1149
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 1150 ITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATG 1209
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1210 ITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTG 1269
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 1270 ITGAT 1274
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/173 (25%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLG 86
GP+G+ G +G G +G+ G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 1321 ATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITG 1380
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
+G G +G G +G G +G G +G S GP+G G +G
Sbjct: 1381 ATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGITG 1440
Query: 147 YLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G +G G +G G +G G++
Sbjct: 1441 STGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGIT 1493
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/173 (27%), Positives = 68/173 (39%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+GS G +G G +G
Sbjct: 1130 TGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPT---GATGI 1186
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G G +G G +G G +G GP+G S G
Sbjct: 1187 TGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGI 1246
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1247 TGA---TGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG 1296
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/152 (26%), Positives = 59/152 (38%), Gaps = 6/152 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +GS G +G+ G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 1369 STGPTGVTGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTG 1428
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G G GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 1429 ATGITGATGITGSTGPTGATGITG------ATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTG 1482
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1483 ATGITGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGAT 1514
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/214 (22%), Positives = 74/214 (34%), Gaps = 30/214 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL----------------- 55
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+
Sbjct: 1250 TGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGT 1309
Query: 56 ----------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 104
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G
Sbjct: 1310 TGSTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGS 1369
Query: 105 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
P+G G +G G +G S G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1370 TGPTGVTGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGA 1429
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 1430 TGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGIT 1463
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 12/185 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G GP+G+ G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 1121 TGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGS---TGATGSTGPTGPTGSTGITGA 1177
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1178 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGP 1237
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1238 TGPTGSTGITG------ATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGA 1291
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 1292 TGITG 1296
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/221 (22%), Positives = 76/221 (34%), Gaps = 30/221 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +GS G +G+ G +G GP+GS GP+G G
Sbjct: 1202 TGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGA 1261
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------------RY 102
+G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 1262 TGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGA 1321
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1322 TGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGA 1381
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G +G G++ ++G
Sbjct: 1382 TGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITG 1422
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/147 (27%), Positives = 58/147 (39%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS GP+GS G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 1151 TGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 1210
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +GS G +G G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1211 TGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGI 1270
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G G +G
Sbjct: 1271 TGATGPTGATGITGATGPTGATGITGS 1297
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/166 (24%), Positives = 61/166 (36%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1325 TGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGATGS 1384
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G G +G G +G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 1385 TGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGITGSTGP 1444
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G +G G +G G +G G + ++G
Sbjct: 1445 TGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGAT 1490
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/217 (23%), Positives = 75/217 (34%), Gaps = 24/217 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1415 TGATGITGSTGPTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGI 1474
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------ 114
G +G+ G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1475 TGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGSTGATGTTGATGP 1534
Query: 115 ------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G G +G S GP+G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 1535 TGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGP 1594
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G +G GP+G G + V+G+
Sbjct: 1595 TGVTGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGIT 1631
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/214 (22%), Positives = 74/214 (34%), Gaps = 30/214 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 1166 TGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGA 1225
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS GP+G GP+G G +G G +G G +G +
Sbjct: 1226 TGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGA 1285
Query: 130 DGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1286 TGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGA 1345
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 1346 TGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGIT 1379
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/236 (21%), Positives = 77/236 (32%), Gaps = 42/236 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP+G G +G GP+G+ GP+G G +GS G +G G
Sbjct: 1423 STGPTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTG 1482
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-------------------------- 102
+G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 1483 ATGITGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGSTGATGTTGATGPTGATGITG 1542
Query: 103 -------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1543 ATGPTGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITG 1602
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G GP+G G +G G +G G +G G++ ++G
Sbjct: 1603 ATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGPTGVTGITGATGITGAT 1658
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/215 (23%), Positives = 77/215 (35%), Gaps = 24/215 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 1454 TGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGA 1513
Query: 73 LRYLGP---------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
G +G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 1514 TGITGSTGSTGATGTTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGV 1573
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G + GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 1574 TGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGA 1633
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G GP+G G +G G + ++G
Sbjct: 1634 TGITGATGPTGVTGITGATGITGATGSTGATGITG 1668
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/214 (23%), Positives = 72/214 (33%), Gaps = 33/214 (15%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G +GS GP+GS GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1223 TGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGI 1282
Query: 73 LRYLGPSGSL---------------------------RYLGPSGR---LRYLGPSGRLRY 102
GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 1283 TGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 1342
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G G +G S GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1343 TGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGATGSTGATGITGATGSTGATGI 1402
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 1403 TGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGAT 1436
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/205 (23%), Positives = 73/205 (35%), Gaps = 27/205 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +GS G +G G +GS GP+G G
Sbjct: 1193 TGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITG---- 1248
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--------- 123
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 1249 --ATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGI 1306
Query: 124 ---------SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G + GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1307 TGTTGSTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGI 1366
Query: 175 ---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G++
Sbjct: 1367 TGSTGPTGVTGITGATGSTGATGIT 1391
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/203 (22%), Positives = 70/203 (34%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 988 PTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGATG 1047
Query: 75 ---------------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP+G+ G +G G +G G +G G
Sbjct: 1048 PTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATG 1107
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P+G G +G + G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1108 PTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTG 1167
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +
Sbjct: 1168 PTGSTGITGATGPTGATGITGAT 1190
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.077, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/227 (22%), Positives = 78/227 (34%), Gaps = 42/227 (18%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G GP+GS GP+G+ G +G G +G+ G +G G
Sbjct: 1228 STGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATG 1287
Query: 69 PSGRL---------------------------RYLGPSGSLR---YLGPSGR---LRYLG 95
P+G GP+G+ GP+G G
Sbjct: 1288 PTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATG 1347
Query: 96 PSGR---LRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
P+G GP+G GP+G G +G + G +G G +G G
Sbjct: 1348 PTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATG 1407
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 1408 STGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGAT 1454
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.081, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/211 (23%), Positives = 73/211 (34%), Gaps = 27/211 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--- 63
G +G GP+G+ GP+G+ GP+G G +G G +G
Sbjct: 989 TGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGATGP 1048
Query: 64 ------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G G +GS G +G G +G GP
Sbjct: 1049 TGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGP 1108
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 1109 TGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGP 1168
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 1169 TGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGIT 1199
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.081, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/218 (22%), Positives = 76/218 (34%), Gaps = 24/218 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 1162 STGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATG 1221
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G G +G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 1222 ITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATG 1281
Query: 132 PSGRLRYLGPSG------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 1282 ITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATG 1341
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G +G GP+G G + V+G+
Sbjct: 1342 ITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGIT 1379
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/131 (25%), Positives = 52/131 (39%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 1541 TGATGPTGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGI 1600
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G GP+G G +G + GP+G G +G G
Sbjct: 1601 TGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGS 1660
Query: 151 SGRLRYLGPSG 161
+G G +G
Sbjct: 1661 TGATGITGSTG 1671
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/131 (25%), Positives = 51/131 (38%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 1547 TGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGI 1606
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G GP+G G +G GP+G G +G + G
Sbjct: 1607 TGSTGPTGATGITG------ATGPTGVTGITGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGS 1660
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
+G G +G
Sbjct: 1661 TGATGITGSTG 1671
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/200 (23%), Positives = 69/200 (34%), Gaps = 30/200 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------------ 60
G +G G +G GP+G+ G GP+G+ G
Sbjct: 1478 TGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITG------STGPTGATGITGSTGSTGATGTTGA 1531
Query: 61 ---------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G G +G GP+G+ G +G G +G G +G
Sbjct: 1532 TGPTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGA 1591
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G G +G S GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 1592 TGPTGVTGITGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGPTGVTGITGA 1651
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G G +G
Sbjct: 1652 TGITGATGSTGATGITGSTG 1671
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/236 (21%), Positives = 74/236 (31%), Gaps = 57/236 (24%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSG 71
P+G G +GS G +G G +G GP+G+ G P+G G +G
Sbjct: 550 PTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGITGATG 609
Query: 72 ------------------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
+GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 610 PTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPT---GATGITGATGPTG 666
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL---------------------- 145
G +G G +G S G +G GP+G
Sbjct: 667 ATGITGATGSTGATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITGTTGSTG 726
Query: 146 -----RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 727 STGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGAT 782
>gi|229190516|ref|ZP_04317513.1| hypothetical protein bcere0002_21830 [Bacillus cereus ATCC 10876]
gi|228592861|gb|EEK50683.1| hypothetical protein bcere0002_21830 [Bacillus cereus ATCC 10876]
Length = 366
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 78/186 (41%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G +G GP+G+ +G +G + GP +G+ GP+G +G +
Sbjct: 88 GPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPTGATGPIGIT 147
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G +G +GP+G G +G G G G +G
Sbjct: 148 GLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGITGPTGETGPTGET 207
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 208 GPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGETGPTGITGPTGET 267
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 268 GPTGAT 273
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/199 (26%), Positives = 83/199 (41%), Gaps = 14/199 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP+G+ +G +G + GP +G GP+G+ +G +G GP+G
Sbjct: 99 TGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPTGATGPIGITGLTGITGPTGA 158
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G+ +GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 159 TGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGE 218
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 219 TGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGG 278
Query: 184 LGP--SGRLRYLGLSDGLR 200
+GP + L Y +DG +
Sbjct: 279 IGPITTTNLLYYTFADGEK 297
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/199 (26%), Positives = 80/199 (40%), Gaps = 24/199 (12%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G G +G+ GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 51 TGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTG---ITGPTG---ITGPTGITGPTGITGPTGV 104
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ +G +G + GP +G GP+G +G +G GP+G G
Sbjct: 105 TGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGA 164
Query: 133 SGRLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G +GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 165 TGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGA 224
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G++
Sbjct: 225 TGPTGITGPTGETGPTGIT 243
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 83/194 (42%), Gaps = 12/194 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGR 72
+G GP+G GP+G G +G GP+G+ +G +G + GP +G
Sbjct: 75 TGPTGITGPTG---ITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGA 131
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ +G +G GP+G G +G +GP+G GP+G S
Sbjct: 132 TGITGPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGS 191
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 192 PGITGPTGETGPTGE---TGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGE 248
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + ++G
Sbjct: 249 TGSTGETGPTGITG 262
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/172 (27%), Positives = 70/172 (40%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G GP+G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTG-- 79
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G +G GP+G G +G + GP G G +G GP+
Sbjct: 80 -ITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPT 138
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G +G GP+G G +G +GP+G G +G G
Sbjct: 139 GATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITG 190
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/202 (26%), Positives = 81/202 (40%), Gaps = 12/202 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP+G G +G G +G GP+G G +G+ GP +G GP+
Sbjct: 31 GPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGPT 90
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G +G GP+G +G +G + GP +G GP+G +G +G
Sbjct: 91 GITGPTGITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPTGATGPIGITGLT 150
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G G +G +GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 151 GITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPGITGPTGETGPTGETGPT 210
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G + ++G
Sbjct: 211 GITGPTGETGPTGATGPTGITG 232
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 71/175 (40%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 11 LNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
+ G +G GP+G+ G +G G +G GP+G G +G GP+
Sbjct: 19 IPTGATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPT 78
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G GP+G GP+G G +G + GP G G +G
Sbjct: 79 GITGPTGITGPTGITGPTG---ITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGIT 135
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G +G +G GP+G G +G +GP+G G +G G
Sbjct: 136 GPTGATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITG 190
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 71/172 (41%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G+ GP+G
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGIT 81
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G GP+G GP+G G +G + GP G G +G GP+
Sbjct: 82 GPTGITGPTGITGPTG---ITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPT 138
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G +G GP+G G +G +GP+G G + ++G
Sbjct: 139 GATGPIGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITG 190
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/165 (29%), Positives = 68/165 (41%), Gaps = 6/165 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G +G GP+G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 22 GATGPTGITGPTGATGITGATGITGATGVTGPTGITGPTGITGATGITGATGVTGPTGIT 81
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
G +G GP+G GP+G G +G + GP G G +G GP+
Sbjct: 82 GPTGITGPTGITGPTG---ITGPTGVTGPTGATGPIGITGPIGITGPPGITGATGITGPT 138
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G +G GP+G GPSG G+ V+GL
Sbjct: 139 GATGPIGITGLTGITGPTGA---TGPSGATGATGIMGPTGVTGLT 180
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/147 (29%), Positives = 63/147 (42%), Gaps = 9/147 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G+ G +G+ +GP+G G +G G G GP+G
Sbjct: 144 IGITGLTGITGPTGATGPSGATGATGIMGPTGVTGLTGATGPTGITGSPG---ITGPTGE 200
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G S G
Sbjct: 201 TGPTGETGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGE---TGPTG---ITGPTGETGSTGE 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+G GP+G G +G +GP
Sbjct: 255 TGPTGITGPTGETGPTGATGPTGGIGP 281
>gi|423581556|ref|ZP_17557667.1| hypothetical protein IIA_03071 [Bacillus cereus VD014]
gi|401215046|gb|EJR21766.1| hypothetical protein IIA_03071 [Bacillus cereus VD014]
Length = 838
Score = 60.5 bits (145), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/196 (29%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP GS+ GP G GP +G GP G GP G G
Sbjct: 470 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 529
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 530 QGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGP 589
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G+ GP G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 590 TGVTGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGQ 649
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 650 TGVTGATGPTGIQGIQ 665
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/186 (31%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP G G +G G G +
Sbjct: 462 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPI 521
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G GP+G G +G+ GP+G GP+G GP
Sbjct: 522 GPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTG---ATGPTGETGPQGPQ 578
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G G +G+ GP G GP +G+ GP+G GP G
Sbjct: 579 G---IQGPQGETGPTGVTGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGPTGETGPQGPQGIQ 635
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 636 GPQGIT 641
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPS 70
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP+
Sbjct: 447 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 503
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G G G GP G GP G G +G
Sbjct: 504 GEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPT 563
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPS 187
G +G GP G GP G G +G+ GP G GP +G+ GP+
Sbjct: 564 GATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGVTGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGPT 623
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 624 GET 626
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 356 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGP 415
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 416 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 475
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G G+
Sbjct: 476 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 529
Query: 196 S 196
Sbjct: 530 Q 530
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/191 (30%), Positives = 67/191 (35%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 416 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 475
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP GP+G GP G GP G G
Sbjct: 476 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 530 QGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGP 589
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G++ V+G
Sbjct: 590 TGVTGQTGVTG 600
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 362 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGV 421
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 422 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 481
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP GP+G GP G GP +GP+G
Sbjct: 482 QGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGI 529
Query: 193 LGLS 196
G+
Sbjct: 530 QGIQ 533
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/163 (30%), Positives = 60/163 (36%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 356 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGP 415
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 416 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 475
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 476 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQ 518
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 67/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G GS+ GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 372 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVR 431
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP
Sbjct: 432 GATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQ 491
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 492 GIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQ 551
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 552 GIT 554
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 392 QGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGP 451
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G
Sbjct: 452 TGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGP 511
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G + GP G G G GP+G G +G+ GP+G G
Sbjct: 512 QGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGE 571
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 572 T 572
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/153 (29%), Positives = 54/153 (35%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+A GP G GP G G G GP G GP G G +G G
Sbjct: 505 EAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTG 564
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP G GP G G +G+ GP G GP G G +G
Sbjct: 565 ATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGVTGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGPTG 624
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 625 ETGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGQTGVTGATG 657
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/207 (27%), Positives = 77/207 (37%), Gaps = 27/207 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------L 67
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G +
Sbjct: 75 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 131
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------- 120
GP+G G G + +GP+G G G GP+G G G L
Sbjct: 132 GPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVT 191
Query: 121 --------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+GP+G S G G +GP G GP G + +GP+G G
Sbjct: 192 GIQGLQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQ 251
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 252 GVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 278
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/169 (28%), Positives = 68/169 (40%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G G G +GP+G G G + +GP+G G G GP+G+
Sbjct: 114 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNT 173
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 174 GIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGLQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQ 233
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 234 GEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 282
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 65/158 (41%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G + +GP+G G G GP+G+ G G L G G
Sbjct: 131 IGPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGV 190
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G G
Sbjct: 191 TGIQGLQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGV 250
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G + GP+G GP+ GP+G GP+G
Sbjct: 251 QGVIGPTGPTGLQGDPGPT------GPTGATGITGPTG 282
>gi|195977861|ref|YP_002123105.1| hypothetical protein Sez_0729 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
gi|195974566|gb|ACG62092.1| collagen-like protein SclZ.8 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
Length = 343
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 66/175 (37%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 97 GPQGETGPAGPAGPQ---GPRGETGPAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPAGQPGVQGPKGDK 153
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 154 GDKGDTGAT---GPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPK 207
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 208 GERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKG 262
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP G GP+G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 101 ETGPAGPAGPQGPRGETGPAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPAGQPGVQGPKGDKGDKGDTG 160
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 161 ---ATGPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQG 214
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 215 PKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGP 269
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/166 (31%), Positives = 60/166 (36%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 29 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
R GP+G G G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+
Sbjct: 82 RNQGPAGPAGPRGERGPQGETGPAGPAGPQGPRGETGPAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPA 141
Query: 89 GRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 142 GQPGVQGPKGDKGDKGDTGATGPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGERGEQGPK 198
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 199 GDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKG 244
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/118 (33%), Positives = 39/118 (33%), Gaps = 3/118 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 162 TGPKGDTGATGPQGPA---GPKGERGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGD 218
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP G GP G GP G GP G GP D
Sbjct: 219 RGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKKEPEKD 276
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.081, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/134 (32%), Positives = 51/134 (38%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 56 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
R GP+G G G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+
Sbjct: 82 RNQGPAGPAGPRGERGPQGETGPAGPAGPQGPRGETGPAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPA 141
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G+ GP G G +G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 142 GQPGVQGPKGDKGDKGDTG---ATGPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGERGEQ 195
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G
Sbjct: 196 GPKGDRGEQGPKGE 209
>gi|423413661|ref|ZP_17390781.1| hypothetical protein IE1_02965, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|401100388|gb|EJQ08383.1| hypothetical protein IE1_02965, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
Length = 344
Score = 60.1 bits (144), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 75/175 (42%), Gaps = 10/175 (5%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R GP+G GP+G G +G GP+G GPSG GP G G
Sbjct: 18 RTGATGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPT---GPTGVTGVTGPSG-----GPVGPTGPTG 69
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
PSG +GP+G GP+G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 70 PSGG--PIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATG 127
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 128 IIGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPTGATGITGPTGPTGF 182
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 73/167 (43%), Gaps = 13/167 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP+G G P+G GPSG GP G GPSG +
Sbjct: 23 GPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSG-----GPVGPTGPTGPSGG--PI 75
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP+G+ GP+G G +G G +G + GP+G +GP+G
Sbjct: 76 GPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPT 135
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+ G +G G +G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 136 GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPTGATGITGPTGPTGF 182
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/156 (32%), Positives = 70/156 (44%), Gaps = 13/156 (8%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP+G G +G GP+G GPSG GP G GPSG
Sbjct: 23 GPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPT---GPTGVTGVTGPSG-----GPVGPTGPTGPSG-- 72
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
+GP+G GP+G GP+G + G +G G +G + GP+G +GP+
Sbjct: 73 GPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPT 132
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G GP+G GP+G G++
Sbjct: 133 GPTGATGITGP---TGPTGATGITGPTGPTGVTGIT 165
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/113 (30%), Positives = 53/113 (46%), Gaps = 9/113 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G+ GP+G G +G G +G + GP+G +GP+G
Sbjct: 75 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTG- 133
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G+ GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 134 -----PTGATGITGPTGPTGATGITGP---TGPTGVTGITGPTGATGITGPTG 178
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/134 (32%), Positives = 58/134 (43%), Gaps = 10/134 (7%)
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
R GP+G GP+G G +G GP+G GPSG GP G G
Sbjct: 18 RTGATGPTGVTGITGPTGPTGVTGITGPT---GPTGVTGVTGPSG-----GPVGPTGPTG 69
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
PSG GP+G GP+G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 70 PSG--GPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATG 127
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G G++
Sbjct: 128 IIGPTGPTGATGIT 141
>gi|47569234|ref|ZP_00239920.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
gi|47554108|gb|EAL12473.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
Length = 1285
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 65/185 (35%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 618 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 677
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP G GP G G +G G +G G G + G
Sbjct: 678 PQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 737
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 738 PQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQG 797
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 798 NTGAT 802
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 62/184 (33%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 568 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGA 627
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G G +G G G GP G + G
Sbjct: 628 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGN 684
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 685 TGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 744
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 745 TGAT 748
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/186 (26%), Positives = 64/186 (34%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ GP G+ G +G G +G+ G G GP G
Sbjct: 683 GNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 742
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G GP G G +G G G GP G + G +
Sbjct: 743 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGAT 802
Query: 134 GRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 803 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQ 862
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 863 GNTGAT 868
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 65/188 (34%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 474 NTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 533
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ G G GP G GP G G +G G +G
Sbjct: 534 PQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 593
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G G +G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 594 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG 653
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 654 AQGNTGAT 661
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 60/184 (32%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 637 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGN 696
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G G +G G G GP G G +G G
Sbjct: 697 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGV 756
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G G +G G G GP G G +G G G
Sbjct: 757 QGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGA 816
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 817 TGAT 820
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 61/184 (33%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 664 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGA 723
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G G +G G G GP G G +G G
Sbjct: 724 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGV 783
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 784 QGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 840
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 841 TGAT 844
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 62/184 (33%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 595 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGA 654
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G G +G GP G GP G + G
Sbjct: 655 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGNTGATGPQGAQGNTGA 711
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 712 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGN 771
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 772 TGAT 775
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/190 (25%), Positives = 65/190 (34%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G G +G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 602 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT 661
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G +G G +G GP G GP G G +G + G +
Sbjct: 662 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNT 721
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 722 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 781
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
G+ +G
Sbjct: 782 GVQGNTGATG 791
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 61/184 (33%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ G G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 532 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGA 591
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G GP G G +G G G + GP
Sbjct: 592 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGP 651
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 652 QGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGNTGATGPQGAQGN 708
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 709 TGAT 712
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 61/184 (33%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ GP G G +G G +G G G
Sbjct: 505 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 564
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G G +G GP G G +G G G + GP
Sbjct: 565 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGP 624
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 625 QGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 684
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 685 TGAT 688
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/193 (25%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 759 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 818
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G G +G GP G GP G G +G + G
Sbjct: 819 ---ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 875
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 876 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATG 935
Query: 192 YLGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 936 PQGVQGNTGATGA 948
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 62/184 (33%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 724 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGV 783
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G GP G G +G G G GP G + G
Sbjct: 784 QGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQGN 840
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 841 TGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 900
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 901 TGAT 904
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 61/177 (34%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 645 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQG 704
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G G GP G G +G G G + G
Sbjct: 705 AQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 764
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G G G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 765 PQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATG 821
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/192 (26%), Positives = 67/192 (34%), Gaps = 3/192 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 732 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 791
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP G G +G G G GP G G +G + G
Sbjct: 792 PQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATG 848
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G G +G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 849 PQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATG 908
Query: 192 YLGLSDGLRVSG 203
G+ +G
Sbjct: 909 PQGVQGNTGATG 920
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 62/184 (33%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 751 TGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 810
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G G +G GP G GP G + G
Sbjct: 811 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGNTGATGPQGAQGNTGA 867
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 868 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGN 927
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 928 TGAT 931
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/177 (27%), Positives = 62/177 (35%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 540 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 599
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G GP G G +G G G GP G + G
Sbjct: 600 VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG---AQG 656
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G G +G GP G GP G G +G
Sbjct: 657 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATG 713
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 65/184 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ GP G+ G +G G +G+ G +G GP G
Sbjct: 160 TGPTGPAGATGPRGNTGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGN 219
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +G G +G GP G G +G G +G G
Sbjct: 220 TGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGN 279
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 280 TGATGATGPRGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 339
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 340 TGAT 343
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/180 (26%), Positives = 61/180 (33%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G+ GP G+ G +G G G+ GP G G +
Sbjct: 485 GPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT 544
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ G G GP G G +G G +G GP G +
Sbjct: 545 GPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNT 604
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 605 GATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGAT 664
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/179 (26%), Positives = 60/179 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ G +G G +G+ G G GP G
Sbjct: 513 NTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQG 572
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G G +G G G GP G + G
Sbjct: 573 AQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTG 632
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 633 ATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGAT 691
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP G GP G+ G +G + GP G G +G G +G
Sbjct: 691 TGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGA 750
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G G +G G +G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 751 TGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 810
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G +G G G GP G G +G GP G GP G G
Sbjct: 811 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGNTGATGPQGAQGNTGA 867
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 868 TG 869
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 70/191 (36%), Gaps = 4/191 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 907 TGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGA 966
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 967 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 1026
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 1027 TGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGIQGP 1083
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + G+ V+G
Sbjct: 1084 TGAT-GIGVTG 1093
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/191 (25%), Positives = 65/191 (34%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS------GSLRYLGPSGRLR 65
N G +G G +G+ GP G+ GP G G + G+ GP G
Sbjct: 828 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 887
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G G +G+ GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 888 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 947
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G GP G G +G G G G +G G +G G
Sbjct: 948 ATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATG 1007
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 1008 PQGAQGNTGAT 1018
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 62/183 (33%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G GP G+ G +G GP G
Sbjct: 797 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGNT 853
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G +G G +G G G GP G G +G G
Sbjct: 854 GATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQ 913
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 914 GNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNT 970
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 971 GAT 973
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 61/183 (33%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G+ G +G+ G G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 497 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT 556
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 557 GPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 616
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G G +G GP G
Sbjct: 617 GNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNT 673
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 674 GAT 676
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/198 (25%), Positives = 69/198 (34%), Gaps = 6/198 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +G+ GP +G+ GP G G +G G +G G
Sbjct: 426 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQG 485
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P G GP G+ G +G G +G GP G GP G G +G
Sbjct: 486 PQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 545
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G G G GP G G +G G +G GP G G
Sbjct: 546 PQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTG 605
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G G+ +G
Sbjct: 606 ATGATGPQGVQGNTGATG 623
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 64/177 (36%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ G +G GP G
Sbjct: 195 NTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRG 254
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP G GP G G +G + G
Sbjct: 255 NTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 314
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 315 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATG 371
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 62/181 (34%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 457 TGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGA 516
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G+ G +G G +G G G GP G GP G +
Sbjct: 517 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 576
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 577 TGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGA 636
Query: 190 L 190
Sbjct: 637 T 637
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 62/183 (33%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G G +G GP G+ GP G G +G
Sbjct: 812 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQ 871
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G GP G G +G G G GP G + G +
Sbjct: 872 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG---AQGNT 928
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G G +G G G
Sbjct: 929 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT 988
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 989 GAT 991
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 66/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 350 GNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQ 409
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G +G G +G GP G + G +
Sbjct: 410 GPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGAT 469
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 470 GPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNT 529
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 530 GAT 532
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 65/183 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G G +G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 386 GNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGAT 445
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G +G GP G GP G + G +
Sbjct: 446 GPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGAT 505
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 506 GPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNT 565
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 566 GAT 568
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/192 (26%), Positives = 62/192 (32%), Gaps = 12/192 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G G GP G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +
Sbjct: 548 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 607
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G G+ GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 608 GATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 667
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYL 184
G G GP G G +G GP G GP G G + G
Sbjct: 668 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGAT 724
Query: 185 GPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 725 GPQGAQGNTGAT 736
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 66/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G+ G +G+ G +G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 323 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGAT 382
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G +G GP G G +G + G +
Sbjct: 383 GPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGAT 442
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 443 GATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNT 502
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 503 GAT 505
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 62/176 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G G +G G +G
Sbjct: 394 TGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGA 453
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G G +G GP G GP G G +G + G
Sbjct: 454 TGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 513
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 514 TGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 569
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 62/185 (33%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ GP G+ G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 771 NTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 827
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G GP G GP G G +G G +G G
Sbjct: 828 NTGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQG 884
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G GP G G +G G G GP G G +G G G
Sbjct: 885 AQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTG 944
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 945 ATGAT 949
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 63/187 (33%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G+ G +G G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 847 TGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGA 906
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G+ GP G G +G G +G GP G G +G +
Sbjct: 907 TGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGA 966
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 967 QGNTGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGA 1023
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 1024 QGNTGAT 1030
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 61/184 (33%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 820 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGA 879
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G G +G G G GP G G +G G
Sbjct: 880 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGV 939
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G +G G G G +G G +G GP G
Sbjct: 940 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGN 999
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1000 TGAT 1003
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/194 (26%), Positives = 67/194 (34%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +G+ GP +G+ GP G G +G G +G G
Sbjct: 351 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQG 410
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P G G +G G +G G +G GP +G GP G G +G
Sbjct: 411 PQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATG 470
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ G +G GP G GP G GP G G +G G G
Sbjct: 471 PRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTG 530
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 531 ATGPQGAQGNTGAT 544
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 915 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATG 974
Query: 72 RLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 975 ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQG 1034
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 1035 AQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPTG 1085
Query: 189 RL 190
Sbjct: 1086 AT 1087
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/180 (27%), Positives = 63/180 (35%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 888 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 947
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G+ GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 948 ATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATG 1007
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G G +G G +G GP G GP+G GP G
Sbjct: 1008 PQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 1064
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ G +G GP G
Sbjct: 183 NTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQG 242
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G G +G G +G GP +G GP G GP G
Sbjct: 243 NTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGAQG 302
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G G +G G G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 303 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQG 362
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 363 NTGATGAT 370
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 375 NTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATG 434
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G GP G G +G G +G GP G + G
Sbjct: 435 PQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATG 494
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 495 PQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG---PQGAQGNTGATGPQGAQG 551
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 552 NTGAT 556
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 65/187 (34%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ G +G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 421 TGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGA 480
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ GP G G +G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 481 TGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 540
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G G GP G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 541 TGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGV 600
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 601 QGNTGAT 607
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 363 NTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATG 422
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ G +G GP +G GP G G +G G +G
Sbjct: 423 PRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATG 482
Query: 129 SDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G GP G GP G G +G G G GP G G
Sbjct: 483 PQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 542
Query: 186 PSG 188
+G
Sbjct: 543 ATG 545
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 62/183 (33%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLG 68
N G +G GP G+ G +G G +G G +G+ GP +G G
Sbjct: 399 NTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATG 458
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P G G +G G +G GP G GP G GP G G +G
Sbjct: 459 PQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 518
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G GP G G +G G +G G G GP G G
Sbjct: 519 ATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTG 578
Query: 186 PSG 188
+G
Sbjct: 579 ATG 581
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 65/184 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G+ G +G G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 286 TGPRGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGA 345
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G G +G G +G G +G GP G + G
Sbjct: 346 TGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGA 405
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP G G +G G +G G +G GP G
Sbjct: 406 TGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGA 465
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 466 TGAT 469
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/182 (25%), Positives = 62/182 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 880 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGV 939
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G G +G G G G +G + G
Sbjct: 940 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGN 999
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G G +G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 1000 TGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGA 1059
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 1060 TG 1061
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 72/180 (40%), Gaps = 24/180 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 991 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQG- 1049
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G + GP+G S
Sbjct: 1050 --VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPTGATGIGVTGPTGP--SG 1099
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
GP G GP G GP G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 1100 GPQG---PTGPQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPTGATGIGVTGPTG 1150
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/186 (26%), Positives = 65/186 (34%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G G +G G +G+ G +G GP +G+ GP G G +
Sbjct: 410 GPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGAT 469
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ GP G GP G G +G G +G GP G +
Sbjct: 470 GPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQG---AQ 526
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G G GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 527 GNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQ 586
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 587 GNTGAT 592
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/178 (26%), Positives = 63/178 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G+ G +G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 169 TGPRGNTGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGP 228
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP G G +G G +G G +G + GP
Sbjct: 229 QGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGP 288
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G G +G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 289 RGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGAT 346
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 77/194 (39%), Gaps = 22/194 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP G+ G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 973 TGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGP 1032
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 1033 QGAQGNTGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGI---QGP 1083
Query: 133 SGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G + GP+ GPSG + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 1084 TGATGIGVTGPT------GPSGGPQGPTGPQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGI 1134
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + G+ V+G
Sbjct: 1135 QGPTGAT-GIGVTG 1147
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/191 (25%), Positives = 66/191 (34%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ G +G GP G
Sbjct: 231 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRG 290
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G G +G G G GP G G +G G
Sbjct: 291 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRG 350
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G GP G G +G GP G G +G G +G G
Sbjct: 351 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQG 410
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 411 PQGNTGATGAT 421
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/180 (26%), Positives = 64/180 (35%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ GP G G +G G +G G G
Sbjct: 267 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 326
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G G +G GP G G +G G +G G
Sbjct: 327 NTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRG 386
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G G +G GP +G GP G G +G
Sbjct: 387 NTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATG 446
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 3/188 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP-- 69
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ G +G GP
Sbjct: 219 NTGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQG 278
Query: 70 -SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP G+ GP G G +G G +G G G GP G
Sbjct: 279 NTGATGATGPRGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 338
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G G +G GP G G +G G +G G +G GP G
Sbjct: 339 NTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQG 398
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 399 NTGATGAT 406
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 68/178 (38%), Gaps = 14/178 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 931 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG- 989
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G G G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 990 --ATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGP 1047
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 1048 QG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---IQGPTGATGIGVTGPTG 1096
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/191 (26%), Positives = 69/191 (36%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G +G+ GP +G+ GP G GP G+ G +G G
Sbjct: 255 NTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQG 314
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G G+ GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 315 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRG 374
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLG 185
+ G +G G +G GP G G +G G +G GP +G G
Sbjct: 375 NTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATG 434
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 435 PQGNTGATGAT 445
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 63/176 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G +G+ GP G G +G G +G G +G
Sbjct: 331 TGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGA 390
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G G +G GP G G +G G +G G
Sbjct: 391 TGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGN 450
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G G +G GP G GP G G +G
Sbjct: 451 TGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATG 506
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 66/183 (36%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ G +G GP G
Sbjct: 339 NTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQG 398
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 399 NTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATG 458
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G G +G GP G GP G G +G G +G
Sbjct: 459 PQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 518
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 519 ATG 521
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 65/184 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ G +G GP G+ GP G G +G
Sbjct: 250 TGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGAQGNTGATGP 309
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G G +G G +G GP G + G
Sbjct: 310 QGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGA 369
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G +G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 370 TGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGA 429
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 430 TGAT 433
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/178 (26%), Positives = 59/178 (33%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G+ G +G G +G GP G G +G G +G
Sbjct: 872 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGAT 931
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLNSD 130
GP G G +G G G GP G G +G G +G +
Sbjct: 932 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGAT 991
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G +G G G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 992 GPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 1049
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G G GP G+ G +G G +G GP +G+ GP G G +
Sbjct: 311 GAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGAT 370
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ G +G GP G G +G G +G GP G +
Sbjct: 371 GPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPRGNTGAT 430
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G G +G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 431 GATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGPQGNT 490
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 491 GATG 494
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 65/187 (34%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ G G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 295 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPRGNTGA 354
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ G +G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 355 TGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGPQGN 414
Query: 133 SGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP +G GP G G +G G +G G +G GP G
Sbjct: 415 TGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGN 474
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 475 TGATGAT 481
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/183 (25%), Positives = 62/183 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 864 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 923
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G G +G G +G G G G +G + G
Sbjct: 924 AQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 983
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP G G +G G G GP G G +G G +G
Sbjct: 984 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATG 1043
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 1044 ATG 1046
>gi|449276825|gb|EMC85211.1| Collagen-like protein 2, partial [Columba livia]
Length = 260
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/175 (34%), Positives = 87/175 (49%), Gaps = 12/175 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
YLG G+ +G G + +G SG + G SG++ LG SG L G G L +G SG
Sbjct: 96 YLGTLGTSGIVGDIGDIGDMGTSGTV---GTSGTMGMLGTSGMLGTSGMLGTLGMMGTSG 152
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
++ +G SG +G SG + +G G L LG G L +G SG + G L +G
Sbjct: 153 TMGMMGTSGS---MGTSGTMEMMGTLGMLGTLGMLGTLGTMGTSGTI------GMLGMMG 203
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
SG + LG G + +G G + +G G + +G G LR +G SG + LG+
Sbjct: 204 TSGTMGTLGTMGIMGTMGIMGTMGMMGTLGIMGTMGMLGTLRIMGTSGMMGTLGI 258
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/161 (34%), Positives = 82/161 (50%), Gaps = 9/161 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G + +G SG++ G SG++ LG SG L G G+L +G SG + +G SG
Sbjct: 106 VGDIGDIGDMGTSGTV---GTSGTMGMLGTSGMLGTSGMLGTLGMMGTSGTMGMMGTSGS 162
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G SG++ +G G L LG G L +G SG L +G SG + LG G + +
Sbjct: 163 ---MGTSGTMEMMGTLGMLGTLGMLGTLGTMGTSGTIGMLGMMGTSGTMGTLGTMGIMGT 219
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G + +G G + +G G LR +G SG + LG G
Sbjct: 220 MGIMGTMGMMGTLGIMGTMGMLGTLRIMGTSGMMGTLGIMG 260
>gi|228922074|ref|ZP_04085385.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar huazhongensis BGSC 4BD1]
gi|228837682|gb|EEM83012.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar huazhongensis BGSC 4BD1]
Length = 813
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/196 (29%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 3/196 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP GS+ GP G GP +G GP G GP G G
Sbjct: 445 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 504
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 505 QGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGP 564
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G+ GP G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 565 TGATGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGLTGETGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGQ 624
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 625 TGVTGATGPTGIQGIQ 640
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP G G +G G G +
Sbjct: 437 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPI 496
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G GP+G G +G+ GP+G GP+G GP
Sbjct: 497 GPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTG---ATGPTGETGPQGPQ 553
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G+ GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 554 G---IQGPQGETGPTGATGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGLTGETGPQG 605
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP G
Sbjct: 422 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 478
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G + GP G G G GP+G G +G+ + GP+
Sbjct: 479 GEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPT 538
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 539 G---ATGPTGET---GPQGPQGIQGPQGETGPTGATGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQA 592
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 593 GAT 595
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 62/176 (35%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 409 TGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGI 468
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GP+G GP G GP G G G GP G GP
Sbjct: 469 QGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGP 522
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G +G GP G GP G G +G+ GP G
Sbjct: 523 QGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGQTGVTGPQG 578
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/191 (30%), Positives = 66/191 (34%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 391 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 450
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP GP+G GP G GP G G
Sbjct: 451 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 504
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 505 QGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGP 564
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 565 TGATGQTGVTG 575
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 66/181 (36%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP G G G
Sbjct: 349 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGA 408
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 409 TGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGI 468
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G +G G G + GP G G G GP+G G+
Sbjct: 469 QGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGI 528
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 529 T 529
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 67/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G GS+ GP G G G GP+G G G
Sbjct: 365 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPS 424
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G G +
Sbjct: 425 GPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGAT 484
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP G G G GP+G G +G+ GP+G
Sbjct: 485 GPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTGATGPT 544
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 545 GET 547
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 67/174 (38%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G G G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQ 130
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G + +GP+G G G GP+G G G L G G G
Sbjct: 131 GIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGLQ 190
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G G+
Sbjct: 191 GPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQ 244
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/153 (29%), Positives = 54/153 (35%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+A GP G GP G G G GP G GP G G +G G
Sbjct: 480 EAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQAGATGPTG 539
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP G GP G G +G+ GP G GP G G +G
Sbjct: 540 ATGPTGETGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGQTGVTGPQGIQGIQGPQGITGQAGATGLTG 599
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 600 ETGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGQTGVTGATG 632
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/190 (30%), Positives = 66/190 (34%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 355 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGL 414
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 126
G G GP G GPSG GP G GP G + GP+G
Sbjct: 415 QGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSI---GPTGPQGIQGV 471
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP G GP G G G GP G GP G G
Sbjct: 472 QGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGPTGPQGLQGITGQ 531
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G +
Sbjct: 532 AGATGPTGAT 541
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + +GP+G G G GP+G+
Sbjct: 106 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGN 165
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 166 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGLQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 225
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 226 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 275
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/145 (29%), Positives = 52/145 (35%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G + GP+G GP G GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 349 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGA 408
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 409 TGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGI 468
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G + + G+
Sbjct: 469 QGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQ 493
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 66/175 (37%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G GP+G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGERGPTGP 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G +GP+G G G +GP G G G +GP+G G
Sbjct: 109 TGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGI 168
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G LG SG G G +GP+G G G +GP G GL
Sbjct: 169 QGVQGNLGGSGLQGVTGIQGLQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 223
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + +GP+G G G GP+G
Sbjct: 106 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGN 165
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 166 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGLQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 225
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 226 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 275
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/207 (27%), Positives = 75/207 (36%), Gaps = 30/207 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G G G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQ 130
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------- 120
G G + +GP+G G G GP+G G G L
Sbjct: 131 GIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGLQ 190
Query: 121 --LGPSGRL------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+GP+G GP +GP G GP G + +GP+G G
Sbjct: 191 GPIGPTGPTGSQGIQGEQGP------MGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQ 244
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 245 GVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 271
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/139 (29%), Positives = 52/139 (37%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP+G G G GP+G GP G GP G G G GP+G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGIQGERGPTGPTGI 111
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP+G G G + +GP+G G G GP+G G
Sbjct: 112 QGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGIQGV 171
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G L GL + GL
Sbjct: 172 QGNLGGSGLQGVTGIQGLQ 190
>gi|423430554|ref|ZP_17407558.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401119481|gb|EJQ27296.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 388
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 76/175 (43%), Gaps = 10/175 (5%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
R GP+G+ GP+G G +G GP+G GPSG GP G G
Sbjct: 62 RTGATGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GPTGVTGVTGPSG-----GPVGPTGPTG 113
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
PSG +GP+G GP+G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 114 PSGG--PIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATG 171
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 172 IIGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPTGATGITGPTGPTGF 226
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 73/167 (43%), Gaps = 13/167 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP+G G P+G GPSG GP G GPSG +
Sbjct: 67 GPTGATGITGPTGPTGVTGITGPTGPTGVTGVTGPSG-----GPVGPTGPTGPSGG--PI 119
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP+G+ GP+G G +G G +G + GP+G +GP+G
Sbjct: 120 GPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTGPT 179
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+ G +G G +G GP+G GP+G GP+G +
Sbjct: 180 GATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPTGATGITGPTGPTGF 226
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/165 (31%), Positives = 74/165 (44%), Gaps = 22/165 (13%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP+G P+G GP+G P+G GPSG GP G
Sbjct: 67 GPTGATGITGPTG------PTGVTGITGPTG------PTGVTGVTGPSG-----GPVGPT 109
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GPSG +GP+G GP+G GP+G + G +G G +G + GP+
Sbjct: 110 GPTGPSG--GPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPT 167
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP+G G +G GP+G GP+G G++
Sbjct: 168 GATGIIGPTGPTGATGITGP---TGPTGATGITGPTGPTGVTGIT 209
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/113 (30%), Positives = 53/113 (46%), Gaps = 9/113 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G+ GP+G G +G G +G + GP+G +GP+G
Sbjct: 119 IGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATGIIGPTG- 177
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G+ GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 178 -----PTGATGITGPTGPTGATGITGP---TGPTGVTGITGPTGATGITGPTG 222
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/134 (32%), Positives = 58/134 (43%), Gaps = 10/134 (7%)
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
R GP+G GP+G G +G GP+G GPSG GP G G
Sbjct: 62 RTGATGPTGATGITGPTGPTGVTGITGPT---GPTGVTGVTGPSG-----GPVGPTGPTG 113
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
PSG GP+G GP+G GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 114 PSG--GPIGPTGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGITGPTGPTGATGIIGPTGPTGATG 171
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G G++
Sbjct: 172 IIGPTGPTGATGIT 185
>gi|222096820|ref|YP_002530877.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus Q1]
gi|221240878|gb|ACM13588.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 835
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 78/195 (40%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 500 IGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGP 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + G +G G G G G +G G GP
Sbjct: 560 QGVQGAQGNQGPQGAQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGP 619
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G +GP+G GP G + G +G
Sbjct: 620 TGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGTTGVSGSVGPAGAQGSQGPIGAVGPTGATGSAGS 679
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+ +LG++ +GL
Sbjct: 680 IGFLGIAGATGATGL 694
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 66/166 (39%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G GP+G GP G+L
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNL 551
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G G G + G +G G G + G G +G
Sbjct: 552 GENGITGPQGVQGAQGNQGPQGAQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQ 611
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 612 GSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGTTGVSGSVGPAG 657
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 60/158 (37%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G+ GP G +GP+G++ GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 485 TGPQGA---QGPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGA 541
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G L G +G G G G G + + G +G G G G
Sbjct: 542 QGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQGNQGPQGAQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGI 601
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G GP+G G G GP G
Sbjct: 602 QGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQG 639
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 60/158 (37%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G+ GP G +GP+G + GP G +GP+G G G GP+G+
Sbjct: 485 TGPQGAQ---GPQGVQGIIGPTGAIGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGA 541
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G L G +G G G G G + G +G + G G G
Sbjct: 542 QGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQGNQGPQGAQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGI 601
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G G GP+G G G GP G
Sbjct: 602 QGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQG 639
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 69/190 (36%), Gaps = 2/190 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 446 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 506 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 565
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G + G +G G G G G +G G GP+G
Sbjct: 566 QGNQGPQGAQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 625
Query: 193 LGL--SDGLR 200
G+ S G++
Sbjct: 626 TGIQGSQGIQ 635
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 68/184 (36%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G+
Sbjct: 446 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L +G +G G
Sbjct: 506 IGSQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 565
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G G G + G +G G G G G +G G G + V
Sbjct: 566 QGNQGPQGAQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 625
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 626 TGIQ 629
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/177 (27%), Positives = 62/177 (35%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G + GP G GP+GS GP G +G G G G + G +G
Sbjct: 103 NQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITG 162
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G G G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 163 VTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQG 222
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G GP G G SG + G G G +G G G
Sbjct: 223 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGSTGTQGVEG 279
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.056, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/205 (25%), Positives = 73/205 (35%), Gaps = 23/205 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRY 66
+GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G+ +G +G
Sbjct: 31 IGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGI 88
Query: 67 LGPSG---------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP+G + GP G GP+G GP G +G G+
Sbjct: 89 TGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGA 148
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G + G +G G G G G G G G +G + G G
Sbjct: 149 QGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGI 208
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G GP G G++
Sbjct: 209 QGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGIT 233
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/197 (25%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 23/197 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRY 66
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 22 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGA 79
Query: 67 LGPSGRLRYLGPS---------------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G +G GP+ G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 80 IGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGE 139
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G G+ G G + G +G G G G G G G G +G
Sbjct: 140 IGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGE 199
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G +GP+G
Sbjct: 200 QGHQGDQGIQGVVGPTG 216
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/151 (27%), Positives = 62/151 (41%), Gaps = 8/151 (5%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRG---TTGA 73
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G +G GP+G + G G + G + GP G GP+G
Sbjct: 74 QGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLI---GDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGI 130
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G G+ G G + G++
Sbjct: 131 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGIT 161
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G
Sbjct: 70 TTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTG 126
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G +G G+ G G + G +G G G G G G
Sbjct: 127 SQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQG 186
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 187 EEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQG 246
Query: 192 YLGLS 196
G+S
Sbjct: 247 IQGVS 251
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/171 (26%), Positives = 58/171 (33%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G + GP G GP+GS GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 108 GDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQ 167
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G G G G G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 168 GSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGIS 227
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP G G SG + G G G + G+
Sbjct: 228 GIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGSTGTQGVE 278
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 64/154 (41%), Gaps = 10/154 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLG 68
NLG +G G G+ GP G+ +G +G G +G + G G +G
Sbjct: 550 NLGENGITGPQGVQGAQGNQGPQGAQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMG 609
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G GP+G+ G G GP G G +G +GP+G GP +
Sbjct: 610 IQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGTTGVSGSVGPAGAQGSQGP---IG 666
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-PSG 161
+ GP+G G +G + +LG +G G PSG
Sbjct: 667 AVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGATGLPSG 697
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 80 IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGI 136
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G + G +G G G G G G G G
Sbjct: 137 QGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGI 196
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 197 TGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 256
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 257 QG-AKGVR 263
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/171 (26%), Positives = 58/171 (33%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + GP G GP+G GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 108 GDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQ 167
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G G G G G G +G + G G GP+G GP G
Sbjct: 168 GSQGAQGIQGEEGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGIS 227
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP G G SG + G G G +G G+
Sbjct: 228 GIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGSTGTQGVE 278
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/150 (28%), Positives = 60/150 (40%), Gaps = 8/150 (5%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRG---TTGA 73
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G
Sbjct: 74 QGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGI 130
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP G +G G+ G+ + +G+
Sbjct: 131 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGI 160
>gi|52141777|ref|YP_085052.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cereus E33L]
gi|51975246|gb|AAU16796.1| collagen-like triple helix repeat protein, glycine-rich [Bacillus
cereus E33L]
Length = 748
Score = 59.7 bits (143), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 202 TGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGA 261
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 262 TGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 321
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 322 QGNTGATGPQG---AQGPAGVTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGN 378
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 379 TGAT 382
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 69/193 (35%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 210 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQG 269
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ G +G G +G GP G G +G G G + G
Sbjct: 270 NTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATG 329
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP+G GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 330 PQG---AQGPAGVTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQG 386
Query: 192 YLGLSDGLRVSGL 204
G + +G+
Sbjct: 387 IQGNTGATGATGI 399
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/181 (27%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 194 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 253
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G GP G G +G G +G GP G + G +
Sbjct: 254 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGNT 310
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 311 GATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGVTGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGATGAT 370
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 371 G 371
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/193 (25%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 163 TGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGA 222
Query: 73 LRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ G +G GP G G +G G G GP G +
Sbjct: 223 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGN 282
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G +G G +G GP +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 283 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGAQGPAGVTGA 342
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 343 TGPQGAQGNTGAT 355
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 67/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 526 TGPQGVQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGV 585
Query: 73 LRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G+ GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 586 QGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 642
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G G +G GP+G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 643 QGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGA 702
Query: 187 SGRLRYL 193
G RY
Sbjct: 703 QGTRRYW 709
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G GP G G +G G +G
Sbjct: 491 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGNTGAT 550
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G G +G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 551 GATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGAT 610
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 611 GPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGAT 667
Query: 191 RYLGL 195
G+
Sbjct: 668 GPQGV 672
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 461 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 514
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G G +G G +G GP G G +G GP+
Sbjct: 515 GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPA 574
Query: 134 GRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 575 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQ 631
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 632 GNTGAT 637
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/191 (27%), Positives = 69/191 (36%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G GP G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 507 NTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATG 566
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 567 PQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATG 623
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLG 185
+ GP G G +G G G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 624 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATG 683
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 684 PQGVQGNTGAT 694
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/179 (29%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP G GP+G
Sbjct: 442 TGPQGVQGPAGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---AQGPAGA 495
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 496 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGP 555
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 556 QGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 614
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGP 69
G +G G +G+ GP G G +G GP+G+ GP G G
Sbjct: 424 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 483
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G+ GP G G +G G G GP G G +G +
Sbjct: 484 TGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGA 543
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP G G +G GP+G GP G G +G GP
Sbjct: 544 QGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGP 603
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 604 AGATGATG 611
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 419 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQ 475
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ GP G GP+G GP G G +G G G + GP G
Sbjct: 476 GNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQ 532
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP G G +G GP+G GP G G +
Sbjct: 533 GPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 592
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/206 (25%), Positives = 71/206 (34%), Gaps = 24/206 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------------ 59
N G +G GP+G+ GP G+ G +G G +G+ G
Sbjct: 351 NTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGIQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGG 410
Query: 60 ------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
P G G +G G +G+ GP G G +G GP+G G
Sbjct: 411 PPGPTGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGPAGATGATG 470
Query: 114 P---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
P G G +G + GP+G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 471 PQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGPAGATG 527
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G G G +
Sbjct: 528 PQGVQGPAGATGPQGAQGNTGATGAT 553
>gi|346313117|ref|ZP_08854648.1| hypothetical protein HMPREF9022_00305 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
gi|345899319|gb|EGX69168.1| hypothetical protein HMPREF9022_00305 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
Length = 578
Score = 59.7 bits (143), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/211 (26%), Positives = 79/211 (37%), Gaps = 36/211 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GP+G G SG G +G+ GP+G + G P+G+ GP+G
Sbjct: 159 IGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANGVSGPTGNTGATGPTGATGS 218
Query: 67 LGPSG---------------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
GP+G G +G+ +GP+G GP+G G
Sbjct: 219 TGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGA 278
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G G G GP+G G +G GP+G + G G
Sbjct: 279 DG---VTGPTGATGNTGADGAA---GPTGPTGATGNTGLTGATGPTGAMGNTGADGA--- 329
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G GP+G GL+
Sbjct: 330 TGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLT 360
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 79/213 (37%), Gaps = 30/213 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------------------SLRYLGPSGRLRYLGPS 52
GP+G GP+G+ GP+G G +G +GP+
Sbjct: 202 GPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPT 261
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
GS GP+G G G GP+G+ G G GP+G G +G
Sbjct: 262 GSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGA---AGPTGPTGATGNTGLTGAT 315
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G + G G GP+G GP G GP+G G +G G +G
Sbjct: 316 GPTGAMGNTGADGAT---GPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGNT 372
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G G +G +G++ +GL
Sbjct: 373 GADGATGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLA 405
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G +GP+GS GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 249 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 305
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G + G G GP+G GP G GP+G S G
Sbjct: 306 TGNTGLTGAT---GPTGAMGNTGADGA---TGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGL 359
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S + Y
Sbjct: 360 TGA---TGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSSAIIPY 413
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ +GP+GS GP+G G G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 249 TGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGAAGPTGPTGA 305
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP+G + G G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 306 T---GNTGLTGATGPTGAMGNTGADGAT---GPTGATGNTGPDGAA---GPTGPTGATGS 356
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G G G GP+G G G + G +G G S
Sbjct: 357 TGLTGATGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGATGATGLAGSS 408
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/200 (27%), Positives = 76/200 (38%), Gaps = 31/200 (15%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+GS G +G+ +GP+G G SG G +G GP+G + G +G
Sbjct: 141 TGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG- 199
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------RLRYLGPSGRLRY 120
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 200 --VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGG 257
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+GP+G GP+G G G GP+G G G GP+G G +G
Sbjct: 258 IGPTGSTGVTGPTGATGNTGADG---VTGPTGATGNTGADGA---AGPTGPTGATGNTGL 311
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP+G + G +DG
Sbjct: 312 TGATGPTGAMGNTG-ADGAT 330
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/219 (25%), Positives = 79/219 (36%), Gaps = 33/219 (15%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------- 53
GP+G + G +G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 186 TGPTGPMGNTGANG---VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGITGAAGGIGP 242
Query: 54 --SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +G +GP+G GP+G+ GP+G G G GP
Sbjct: 243 IGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTGADGVTGPTGATGNTGADGAAGPTGP 302
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G G +DG +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 303 TGATGNTGLTGATGPTGAMGNTGADGATGPTGATGNTGPDGAAGPTGPTGATGSTGLTGA 362
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP+G G G GP+G G + V+G
Sbjct: 363 TGPTGATGNTGADGA---TGPTGATGATGADGAIGVTGA 398
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/230 (24%), Positives = 84/230 (36%), Gaps = 55/230 (23%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR------------------ 63
+G +G GP+G+ GP+G GP+GS+ G +G
Sbjct: 57 VGATGPTGATGPTGNTGNTGPAGLRGNTGPTGSIGATGNTGATGMTPVITVAGTITGDPG 116
Query: 64 -----LRYLGPSGR-LRY------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
PSG L + GP+GS G +G +GP+G G SG
Sbjct: 117 TQASVTETFTPSGASLLFTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNTGPIGPAGATGATGASGITGA 176
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------- 161
G +G GP+G + + G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 177 TGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG---VSGPTGNTGATGPTGATGSTGPTGPTGPAGATGI 233
Query: 162 -----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G +G +GP+G GP+G G +DG+
Sbjct: 234 TGAAGGIGPIGPTGSTGSTGATGGIGPTGSTGVTGPTGATGNTG-ADGVT 282
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 75/190 (39%), Gaps = 37/190 (19%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSG-RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+GS G +G + GP+G+ GP+G GP+G GP+GS+ G +
Sbjct: 40 ATGPTGSTGATGATGPGVGATGPTGAT---GPTGNTGNTGPAGLRGNTGPTGSIGATGNT 96
Query: 89 GR-----------------------LRYLGPSGR-LRY------LGPSGRLRYLGPSGRL 118
G PSG L + GP+G G +G
Sbjct: 97 GATGMTPVITVAGTITGDPGTQASVTETFTPSGASLLFTIPAGPTGPTGSTGSTGATGNT 156
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
+GP+G + G SG G +G GP+G + G +G GP+G GP+
Sbjct: 157 GPIGPAGATGATGASGITGATGNTGANGVTGPTGPMGNTGANG---VSGPTGNTGATGPT 213
Query: 179 GRLRYLGPSG 188
G GP+G
Sbjct: 214 GATGSTGPTG 223
>gi|217959033|ref|YP_002337581.1| hypothetical protein BCAH187_A1618 [Bacillus cereus AH187]
gi|217067284|gb|ACJ81534.1| group-specific protein [Bacillus cereus AH187]
Length = 643
Score = 59.7 bits (143), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 192 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT---GATGAQGVQGPAG-- 246
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G G G GP+G G G GP+G GP+
Sbjct: 247 -ATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPA 305
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP+G GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 306 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPQG 360
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 210 GPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGAT 263
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G GP+G G G GP+
Sbjct: 264 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 323
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 324 GATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG 375
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 71/175 (40%), Gaps = 12/175 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 228 GPAG---ATGATGAQGVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 281
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G GP+G G G GP+G GP+G + G
Sbjct: 282 GATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQ 341
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 342 GPQGVQGPAG---ATGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQG 390
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 18/187 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ GP+G G G
Sbjct: 258 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQ 317
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP+G G G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 318 GVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQ 374
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP+G GP G GP G G +G GP+G
Sbjct: 375 G---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGAT 431
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 432 GAQGPQG 438
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 303 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQGPQ 359
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G+ GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 360 GVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPA 416
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +G + GP+G GP G GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 417 GATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 473
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 474 GATGPQG 480
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 67/172 (38%), Gaps = 12/172 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP G P+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 180 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 233
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G GP+G G +G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 234 ---GATGAQGVQGPAG---ATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 287
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G GP+G G G GP+G GP+G G
Sbjct: 288 GPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATG 339
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 66/167 (39%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G+ GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 233 TGATGAQGVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGP 289
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G G G GP+G GP+G G G GP
Sbjct: 290 QGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGP 349
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 350 AG---ATGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQG 390
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 71/193 (36%), Gaps = 21/193 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 276 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGAT 335
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 336 GATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQ 389
Query: 134 G------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 390 GVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGAT 446
Query: 182 RYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 447 GPQGPAGATGATG 459
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP+G+ G G GP+G+ GP+G G G GP+G+
Sbjct: 294 GPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 353
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLNSD 130
GP G GP+G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 354 ---GPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQ 407
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G +G GP+G GP G GP+G GP+G G G
Sbjct: 408 GPQGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGPQGPAGATGATGAQG 462
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 24/184 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ G G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 321 GPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAG---ATGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG-- 375
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G+ GP G GP G G +G GP+G
Sbjct: 376 -VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQ 434
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G GP+G G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 435 GPQGV---QGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 488
Query: 182 RYLG 185
G
Sbjct: 489 GATG 492
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/149 (29%), Positives = 56/149 (37%), Gaps = 21/149 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------SLRYLGP 60
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G + GP
Sbjct: 353 TGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGP 409
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G +G GP+G+ GP G GP+G GP+G G G
Sbjct: 410 QGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGV 466
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 467 QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 492
>gi|190565163|ref|ZP_03018083.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str.
Tsiankovskii-I]
gi|190563190|gb|EDV17155.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str.
Tsiankovskii-I]
Length = 420
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/174 (27%), Positives = 65/174 (37%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTGITGATGPTG 124
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP------------------------SG 134
GP+G GP+G GP+G + GP +G
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAG 184
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 185 ATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 238
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/173 (26%), Positives = 64/173 (36%), Gaps = 24/173 (13%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTGITGATGPTG 124
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------------------------SG 143
GP+G GP+G + GP+G GP +G
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAG 184
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +
Sbjct: 185 ATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGAT 237
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 65/172 (37%), Gaps = 24/172 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 67 GATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTGITGATGPTGIT 126
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRL 109
GP+G GP+G GP+G GP +G
Sbjct: 127 GATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGAT 186
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G GP+G + GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 187 GPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 238
>gi|423384851|ref|ZP_17362107.1| hypothetical protein ICE_02597 [Bacillus cereus BAG1X1-2]
gi|401639521|gb|EJS57260.1| hypothetical protein ICE_02597 [Bacillus cereus BAG1X1-2]
Length = 835
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/203 (28%), Positives = 81/203 (39%), Gaps = 11/203 (5%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT V+ A GP G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G
Sbjct: 357 GTVGVQGAQ--GPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTG 414
Query: 63 RLRYLG------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+G P+G G G+ G +G G G G +G GP G
Sbjct: 415 AQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQG 474
Query: 117 RLRYLGPSG---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G +G + + GP G +GP+G + GP G GP+G G G
Sbjct: 475 VQGIQGTTGLTGKQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGFQGITGPTGAQGVQGIQGVQG 534
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G GP G +G++
Sbjct: 535 IIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGIT 557
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G+ GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 470 QGPQGVQGIQGTTGLTGKQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGFQGITGPTGAQGVQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 530 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 578
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/173 (27%), Positives = 68/173 (39%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G GP+G G G+ G +G G G G +G
Sbjct: 409 VIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETG 465
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+ GP G G +G + GP G +GP+G + GP G GP+G
Sbjct: 466 AAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGKQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGFQGITGPTGAQG 525
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 526 VQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 578
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/195 (28%), Positives = 72/195 (36%), Gaps = 6/195 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G GS G G GP G GP+G+ G G L GP+G
Sbjct: 339 GPIGHQGVRGAQGSQGVDGTVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAE 398
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G +G G GP+G G G G +G + G
Sbjct: 399 GPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQ 455
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G GP G G +G + GP G +GP+G + GP G
Sbjct: 456 GVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGKQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGFQ 515
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGLH 205
G + V G+
Sbjct: 516 GITGPTGAQGVQGIQ 530
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/166 (28%), Positives = 66/166 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G G +G+ G G GP+G
Sbjct: 393 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQ 452
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G G +G G G G +G+ GP G +GP+G + GP
Sbjct: 453 GIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGKQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQ 512
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 513 GFQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 558
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 18/186 (9%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G SG + +G G GP G G GS G G GP G GP+G+
Sbjct: 321 GVSGGIGPIGAQGVQGITGPIGHQGVRGAQGSQGVDGTVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 380
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGRLNSDGPSGRL 136
G G L GP+G G G +GP+G + GP+G ++G G
Sbjct: 381 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGTQ 440
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +G G G G +G GP +G+ GP G +
Sbjct: 441 GIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGKQGAQGPQGVQGII 500
Query: 185 GPSGRL 190
GP+G +
Sbjct: 501 GPTGAI 506
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 70/195 (35%), Gaps = 8/195 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYL----GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP+G+ GP S+R + G +G GP G G +G + GP
Sbjct: 39 GPVGPTGVTGPTGATGPQGPQ-SIRGIQGPRGTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G + GP G + G G GP+G G G +G G G G
Sbjct: 98 QGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGE---TGAQGMQGE 154
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP G G G +G G + G G GP G G G
Sbjct: 155 RGITGVAGVTGPQGSQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGP 214
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
G+ +SG+
Sbjct: 215 TGSTGMQGAQGISGI 229
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G + GP G + GP G + G G GP+GS G G +G G
Sbjct: 87 GITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGET 146
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G G +G GP G G G +G G + G G +GP
Sbjct: 147 GAQGMQGERGITGVAG---VTGPQGSQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQ 203
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +GP+G G G G +G + GP G G +G +
Sbjct: 204 GAQGIQG------EVGPTGSTGMQGAQGISGIKGITGVIGLQGPQGVQGIQGITGATGFQ 257
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 258 GI 259
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/186 (26%), Positives = 65/186 (34%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G + GP G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 69 GTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +G G G G G +G GP G G G + G
Sbjct: 129 GIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGERGITGVAG---VTGPQGSQGVQGIQGEQGAIGIQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G + G G GP G +GP+G G G G +G + GP G
Sbjct: 186 GEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPTGSTGMQGAQGISGIKGITGVIGLQGPQGVQ 245
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 246 GIQGIT 251
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 62/183 (33%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G G +G + GP G + GP G + G G GP+GS
Sbjct: 69 GTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQ 128
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G +G G G G G +G GP G G G +G
Sbjct: 129 GIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGERGITGVAG---VTGPQGSQGVQGIQGEQGAIGIQ 185
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G + G G GP G G G G G G G +GL V
Sbjct: 186 GEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPTGSTGMQGAQGISGIKGITGVIGLQGPQGVQ 245
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 246 GIQ 248
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 70/186 (37%), Gaps = 19/186 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL----GPSGRLRYLGP 69
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP S+R + G +G GP
Sbjct: 23 GPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQ-SIRGIQGPRGTTGAQGIQGP 79
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G +G GP G GP G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 80 ------VGDTGEQGITGPVG---LQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGI 130
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +G G G G G +G GP G G G +G G
Sbjct: 131 QGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGERGITGVAG---VTGPQGSQGVQGIQGEQGAIGIQGE 187
Query: 190 LRYLGL 195
+ G+
Sbjct: 188 DGFQGI 193
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/181 (25%), Positives = 61/181 (33%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP G + GP G + G G GP+G G G +G G G G
Sbjct: 96 GPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGER 155
Query: 73 -----LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPS 124
GP GS G G +G G + G G GP G +GP+
Sbjct: 156 GITGVAGVTGPQGSQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPT 215
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G G G G +G + GP G G +G + G G G +G +
Sbjct: 216 GSTGMQGAQGISGIKGITGVIGLQGPQGVQGIQGITGATGFQGIKGIRGITGATGSIGAQ 275
Query: 185 G 185
G
Sbjct: 276 G 276
>gi|229047020|ref|ZP_04192644.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH676]
gi|228724311|gb|EEL75644.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH676]
Length = 837
Score = 59.7 bits (143), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/197 (30%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP GP+G GP G
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQ 514
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G G GP G GP +G+ GP+G GP G
Sbjct: 515 GIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQ 574
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G G +G G G GP G G +G GP G GP
Sbjct: 575 GIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQ 634
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G G + V+G
Sbjct: 635 GVTGQAGATGQTGVTGA 651
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/184 (32%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPS 70
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP+
Sbjct: 446 GPSGST---GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 502
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPS 124
G GP G GP G G G GP G GP +G+ GP+
Sbjct: 503 GEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPT 562
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G + GP G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 563 GEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGAT 622
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 623 GPQG 626
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 355 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGP 414
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 415 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGI 474
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G G+
Sbjct: 475 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 528
Query: 196 S 196
Sbjct: 529 Q 529
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 479 GPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQ 532
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G L+ + +G+ GP+G GP G GP G G +
Sbjct: 533 GVQGPQGPTGQAGPQG-LQGI--TGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGAT 589
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 590 GETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQTGVT 649
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 650 GAT 652
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/188 (30%), Positives = 65/188 (34%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 415 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGI 474
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP GP+G GP G GP G G
Sbjct: 475 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 528
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G GP G GP +G+ GP+G GP G GP G G
Sbjct: 529 QGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGA 588
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 589 TGETGATG 596
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G S GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 460
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQ 517
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP GP+G GP G GP +GP+G
Sbjct: 481 QGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGI 528
Query: 193 LGLS 196
G+
Sbjct: 529 QGIQ 532
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 460
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GPSG GP G GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 461 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQ 517
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 397 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGV 456
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GPSG GP G GP G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 457 QGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGI 516
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP G G G GP G GP +G+ GP+G GP G
Sbjct: 517 QGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGI 576
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 577 QGPQGATGPTGAT 589
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---L 148
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPIGPQGETGVQGLQ 229
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 230 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 277
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPIGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 247
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 55/154 (35%), Gaps = 6/154 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYL 67
GP+G GP G GP G G G GP G GP +G+
Sbjct: 500 GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPT 559
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G GP G G +G G G GP G G +G
Sbjct: 560 GPTGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPT 619
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 620 GATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQTGVTGATG 653
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/185 (28%), Positives = 62/185 (33%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGP--------- 60
GP G GP GS+ GP G GP +G GP G GP
Sbjct: 469 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 528
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G GP G GP +G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 529 QGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGA 588
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 589 TGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQTGV 648
Query: 175 LGPSG 179
G +G
Sbjct: 649 TGATG 653
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPIGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+ G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPIGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.076, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/150 (28%), Positives = 52/150 (34%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSG 62
+A GP G GP G G G GP G GP +G GP+G
Sbjct: 504 EAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTG 563
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP G+ G +G G G GP G G +G G
Sbjct: 564 EAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATG 623
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
P G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 624 PQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQTGVTGATG 653
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNL 181
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPI---GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 165
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G V
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPIGPQGETGV 225
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 66/195 (33%), Gaps = 24/195 (12%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GP+G G G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 GPTGPQGIQGVQGPIGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE---R 94
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 95 GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQ 154
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G + GP+G G G L +GP+G G G
Sbjct: 155 GIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQ 214
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP G GL
Sbjct: 215 GPIGPQGETGVQGLQ 229
>gi|423541579|ref|ZP_17517970.1| hypothetical protein IGK_03671 [Bacillus cereus HuB4-10]
gi|401171423|gb|EJQ78653.1| hypothetical protein IGK_03671 [Bacillus cereus HuB4-10]
Length = 339
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 63/149 (42%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ G +GS GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G GP+G G + GP+G G +G + GP+G G +
Sbjct: 121 ---GATGSTGATGPTGATGITGAT------GPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGST 171
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 172 GATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 200
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 63/149 (42%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +G+ G +G GP+G+ GP+G G +G GP+G+ G +G
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATG-- 118
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
P+G G +G G +G GP+G S G +G GP+G G +
Sbjct: 119 ----PTGATGSTGATGP---TGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGST 171
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 172 GATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 200
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 61/149 (40%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G +G G +GS GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATG-- 118
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
P+G G +G G +G + GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 119 ----PTGATGSTGATGP---TGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGST 171
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 172 GATGATGPTGATGITGPTGATGDTGPTGA 200
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/125 (29%), Positives = 54/125 (43%), Gaps = 6/125 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP+G+ G +G GP+G G P+G+ G +G G +
Sbjct: 79 GPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGP---TGAT 135
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 136 GITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPTGATGITGPTGATGDT 195
Query: 131 GPSGR 135
GP+G
Sbjct: 196 GPTGA 200
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/136 (28%), Positives = 53/136 (38%), Gaps = 9/136 (6%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PS 124
G +G G +GS GP+G GP+G G +G GP+G G P+
Sbjct: 61 GSTGATGSTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGITGATGITGATGPTGATGITGATGPT 120
Query: 125 GRLNS------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G S G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+
Sbjct: 121 GATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGPTGPTGATGSTGATGATGPT 180
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G G
Sbjct: 181 GATGITGPTGATGDTG 196
>gi|206971433|ref|ZP_03232383.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1134]
gi|206733418|gb|EDZ50590.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1134]
Length = 321
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/191 (27%), Positives = 78/191 (40%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G G +G+ GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 32 PTGATGPTGITGPTGATGITGATGITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTG 91
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 92 ITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTG 151
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP+G GP+G G +G + GP+G G
Sbjct: 152 ETGPTGATGPTGITGPTGE---TGPTG---ITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTG 205
Query: 195 LSDGLRVSGLH 205
++ V+GL
Sbjct: 206 ITGPTGVTGLT 216
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 77/195 (39%), Gaps = 8/195 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 58 GPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGET 117
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 118 GSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGIT 177
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG----- 188
G GP+G +G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 178 GPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVTGLTGLTGETGPTGATGPTGGIGPI 237
Query: 189 ---RLRYLGLSDGLR 200
L Y +DG +
Sbjct: 238 TTTNLLYYTFADGEK 252
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 75/183 (40%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 43 GPTGATGITGATG---ITGPTGITGATGVTGLTGITGATGATGPTGITGPTGITGPTGIT 99
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 100 GPTGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGAT 159
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP+G GP+G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 160 GPTGITGPTGET---GPTG---ITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTGITGPTGVT 213
Query: 194 GLS 196
GL+
Sbjct: 214 GLT 216
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 74/181 (40%), Gaps = 12/181 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 51 TGATGITGPTG---ITGATGVTGLTGITGATGATGPTG---ITGPTG---ITGPTGITGP 101
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 102 TGETGPTGITGPTGETGSTGATGPTGITGPTGETGPTGATGPTGITGPTGETGPTGATGP 161
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G GP+G +G +G GP+G GP+G GL
Sbjct: 162 TGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPIGITGPTGETGPTG---ITGPTGVTGLTGL 218
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 219 T 219
>gi|392959575|ref|ZP_10325058.1| Collagen triple helix repeat-containing protein, partial [Pelosinus
fermentans DSM 17108]
gi|392456514|gb|EIW33263.1| Collagen triple helix repeat-containing protein, partial [Pelosinus
fermentans DSM 17108]
Length = 249
Score = 59.3 bits (142), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/129 (27%), Positives = 53/129 (41%), Gaps = 9/129 (6%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G+ GP+G GP+G+ G +G G +G GP+G+ GP+G
Sbjct: 1 TGDAGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGDAGVTGATGDTGPTGATGDTGPTGD 60
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G GP+G G +G G +G +G G +G GP
Sbjct: 61 T---GPTGATGDTGPTGATGDAGATGDAGATGATGD------AGATGDAGATGATGDTGP 111
Query: 151 SGRLRYLGP 159
+G GP
Sbjct: 112 TGATGDTGP 120
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/129 (27%), Positives = 52/129 (40%), Gaps = 9/129 (6%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G GP+G+ GP+G G +G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 1 TGDAGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGDAGVTGATGDTGPTGATGDTGPTGD 60
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G GP+G G +G +G G +G G +G GP
Sbjct: 61 T---GPTGATGDTGPTGATGDAGATGD------AGATGATGDAGATGDAGATGATGDTGP 111
Query: 160 SGRLRYLGP 168
+G GP
Sbjct: 112 TGATGDTGP 120
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/129 (27%), Positives = 52/129 (40%), Gaps = 9/129 (6%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ GP+G+ GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1 TGDAGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGDAGVTGATGDTGPTGATGDTGPTGD 60
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G GP+G G +G G +G G +G +G GP
Sbjct: 61 T---GPTGATGDTGPTGATGDAGATGDAGATGATGDAGATGDAGA------TGATGDTGP 111
Query: 142 SGRLRYLGP 150
+G GP
Sbjct: 112 TGATGDTGP 120
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/129 (27%), Positives = 51/129 (39%), Gaps = 9/129 (6%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G+ GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1 TGDAGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGDAGVTGATGDTGPTGATGDTGPTGD 60
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP+G +G G +G G +G G +G GP
Sbjct: 61 ---TGPTGATGDTGPTGA------TGDAGATGDAGATGATGDAGATGDAGATGATGDTGP 111
Query: 169 SGRLRYLGP 177
+G GP
Sbjct: 112 TGATGDTGP 120
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/115 (28%), Positives = 49/115 (42%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP+G+ G +G G +G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 9 DTGPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGDAGVTGATGDTGPTGATGDTGPTGD---TGPTG 65
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGP 123
GP+G+ G +G G +G G +G GP+G GP
Sbjct: 66 ATGDTGPTGATGDAGATGDAGATGATGDAGATGDAGATGATGDTGPTGATGDTGP 120
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/123 (28%), Positives = 52/123 (42%), Gaps = 6/123 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 1 TGDAGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGDAGVTGATGDTGPTGATGDTGPTGD 60
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLNS 129
GP+G+ GP+G G +G G +G G +G G P+G
Sbjct: 61 T---GPTGATGDTGPTGATGDAGATGDAGATGATGDAGATGDAGATGATGDTGPTGATGD 117
Query: 130 DGP 132
GP
Sbjct: 118 TGP 120
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/121 (27%), Positives = 48/121 (39%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ GP+G GP+G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 1 TGDAGATGDTGPTGATGDTGPTGATGATGDTGPTGDAGVTGATGDTGPTGATGDTGPTGD 60
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 61 T---GPTGATGDTGPTGATGDAGATGDAGATGATGDAGATGDAGATGATGDTGPTGATGD 117
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 118 T 118
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/82 (26%), Positives = 33/82 (40%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP+G GP+G G +G G +G G +G+ G +G
Sbjct: 39 VTGATGDTGPTGATGDTGPTGDTGPTGATGDTGPTGATGDAGATGDAGATGATGDAGATG 98
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
G +G GP+G+ GP
Sbjct: 99 DAGATGATGDTGPTGATGDTGP 120
>gi|402556166|ref|YP_006597437.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus FRI-35]
gi|401797376|gb|AFQ11235.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus FRI-35]
Length = 1231
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 70/190 (36%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 442 TGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 498
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 499 TGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGA 558
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G GP G G +G G G G +G GP+G GP
Sbjct: 559 TGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGP 618
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 619 QGVQGNTGAT 628
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 69/190 (36%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSG---RLRY 66
G +G GP+G+ GP G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 484 TGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGA 543
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G GP+G+ GP G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 544 TGATGPQGIQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 603
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G GP G G +G G G G +G G +G GP
Sbjct: 604 QGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 663
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 664 QGNTGATGAT 673
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 524 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQ 577
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 578 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 637
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G G +G GP G G +G GP+G G G
Sbjct: 638 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGNTGAT 697
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 698 GAT 700
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/199 (27%), Positives = 71/199 (35%), Gaps = 9/199 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 450 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 506
Query: 72 RLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G+ GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 507 AQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPRG 566
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP G G +G G G G +G GP+G GP G G
Sbjct: 567 NTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTG 626
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+G G+ +G
Sbjct: 627 ATGATGPQGVQGNTGATGA 645
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 67/184 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 544 TGATGPQGIQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 603
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G G G G +G G +G + GP
Sbjct: 604 QGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 663
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP+G G G G +G G +G GP G
Sbjct: 664 QGNTGATGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGN 723
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 724 TGAT 727
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 812 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 865
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ G +G GP+G GP G G +G G G + G +
Sbjct: 866 GPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 925
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 926 GPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNT 979
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 980 GAT 982
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 419 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 475
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 476 GAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGAT 532
Query: 131 GP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G G +G GP+G GP G GP G G +G G
Sbjct: 533 GPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQ 592
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 593 GNTGATGAT 601
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/195 (28%), Positives = 72/195 (36%), Gaps = 18/195 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRL 64
GP+G GP G+ GP G + G +G GP+G+ GP +G
Sbjct: 326 GPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 385
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP G GP G + G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 386 GATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 445
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G + G +G G +G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 446 GAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 499
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 500 GATGPQGAQGNTGAT 514
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/189 (28%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP G GP G+ G +G GP+
Sbjct: 365 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGIQGPA 421
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G G +G GP G G +G G G G +G +
Sbjct: 422 GATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 478
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPS 187
GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 479 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQ 535
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 536 GVQGNTGAT 544
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 842 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQ 901
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 902 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 958
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 959 G---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGAT 1012
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/180 (27%), Positives = 64/180 (35%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPS 70
G G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 506 GAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPR 565
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G G +G G G G +G GP+G GP G +
Sbjct: 566 GNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNT 625
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G G G +G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 626 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGAT 685
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 67/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 434 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG-- 491
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS- 129
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 492 -VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 550
Query: 130 --DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP+G GP G GP G G +G G G G +G GP+
Sbjct: 551 GIQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPA 610
Query: 188 GRLRYLG 194
G G
Sbjct: 611 GATGATG 617
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 69/187 (36%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G G +G GP G+ G +G G G
Sbjct: 409 TGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGN 465
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G + GP
Sbjct: 466 TGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGP 519
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP G
Sbjct: 520 QG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGI 576
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 577 QGNTGAT 583
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 66/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPS 70
G G G +G GP+G+ GP G G +G+ G +G GP
Sbjct: 794 GAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 853
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 854 GVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 913
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 914 GVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 967
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 968 GATG 971
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 65/182 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP G G +G G G+ G +G GP+G
Sbjct: 554 GPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGAT 613
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G G G G +G G +G GP G + G +
Sbjct: 614 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGAT 673
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G G G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 674 GPQGAQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 733
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 734 GV 735
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/189 (28%), Positives = 69/189 (36%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 393 NTGATGPQGIQGNTGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG 446
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G G +G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 447 AQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 503
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
P G G +G GP+G GP G G +G GP+G G
Sbjct: 504 PQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATG 563
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P G G
Sbjct: 564 PRGNTGATG 572
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/185 (27%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGP 69
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G G
Sbjct: 775 TGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 834
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP G G +G G G G +G GP+G +
Sbjct: 835 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGA 894
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G +G G G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 895 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGA 951
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 952 TGATG 956
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/169 (28%), Positives = 63/169 (37%), Gaps = 6/169 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 850 TGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 909
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 910 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGV---QGP 963
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 964 AGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGAT 1012
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 61/176 (34%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 769 TGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGN 828
Query: 76 LGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP G G +G G G G +G GP
Sbjct: 829 TGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGP 888
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 889 AGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 944
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G GP+G+ GP G GP G+ G +G GP+G
Sbjct: 313 TGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGIQGPAGA 369
Query: 73 LRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP +G+ GP G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 370 TGATGPQGVQGNTGATGATGPRGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGP 429
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + G +G G G G +G G +G GP G GP+G
Sbjct: 430 QGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGA 486
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 487 TGPQG 491
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/161 (28%), Positives = 59/161 (36%), Gaps = 6/161 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 858 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 917
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 918 NTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 971
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
P G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 972 PQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGAT 1012
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP G G +G G G+ G +G GP+G
Sbjct: 832 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGA 891
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G G +G GP+G GP G GP
Sbjct: 892 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGV---QGP 948
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP+G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 949 AGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 1002
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 1003 QGV 1005
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/178 (26%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 571 TGPQGIQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 630
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G G +G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 631 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAG---ATGP 687
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G G G G +G G +G GP G GP+G
Sbjct: 688 QGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGPTGAT 742
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/170 (27%), Positives = 60/170 (35%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 579 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 638
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G G +G GP+G GP G + G
Sbjct: 639 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGAQGPAG---ATGPQGAQGNTG 695
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G G +G G +G GP G GP+G
Sbjct: 696 ATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGPTGAT 742
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/163 (29%), Positives = 61/163 (37%), Gaps = 18/163 (11%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP G GP+G+ GP G GP G G +G+ GP G
Sbjct: 313 TGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPRGNTGATGPQG---IQGNTGATGATGPQG---I 363
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G GP G G +G GP G + GP G G +G GP G
Sbjct: 364 QGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPRGNTGATGPQG---IQGNTGATGATGPQG- 416
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G G +G G G G +
Sbjct: 417 --IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGAT 457
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/176 (26%), Positives = 62/176 (35%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGP--- 78
+G+ GP G G +G GP G+ G +G GP+G GP
Sbjct: 769 TGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGV 825
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G+ G +G G +G GP G G +G G G + G +G
Sbjct: 826 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGV 885
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G G +G G G G +G GP+G G
Sbjct: 886 QGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATG 941
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/199 (25%), Positives = 64/199 (32%), Gaps = 39/199 (19%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 887 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 944
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G G G + G +
Sbjct: 945 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 1000
Query: 134 GRLRYLGPSGRLR------------------------------YLGPSG---RLRYLGPS 160
G GP+G GP G G +
Sbjct: 1001 GPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 1060
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GP G
Sbjct: 1061 GPQGVQGPAGATGATGPQG 1079
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/207 (24%), Positives = 68/207 (32%), Gaps = 27/207 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G+ G +G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 160 TGPTGPAGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGATGP 219
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP G G +G G +G G +G + GP
Sbjct: 220 QGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGP 279
Query: 133 SGRLRYLG------------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G +G GP G GP+G GP
Sbjct: 280 QGNTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGATGPQG---IQGPAGATGATGP 336
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP G G +G G+
Sbjct: 337 RGNTGATGPQGIQGNTGATGATGPQGI 363
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/189 (25%), Positives = 65/189 (34%), Gaps = 35/189 (18%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 917 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAT 970
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------ 118
GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 971 GPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPT 1030
Query: 119 ------RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 171
G +G G G G +G GP+G GP G +R GP+G
Sbjct: 1031 GPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-VR--GPTGAT 1087
Query: 172 -LRYLGPSG 179
+ GP+G
Sbjct: 1088 GIGVTGPTG 1096
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/199 (23%), Positives = 65/199 (32%), Gaps = 30/199 (15%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G +G+ GP G +G+ GP G G +G G +G+
Sbjct: 163 TGPAGATGPRGNTGATGATGPQGN------TGATGATGPRGNTGATGATGPRGNTGATGA 216
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP G G +G G +G G +G + GP G G
Sbjct: 217 TGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGA 276
Query: 142 SGRLRYLGPSG------------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G G +G G +G GP+G GP
Sbjct: 277 TGPQGNTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGP 336
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G G +
Sbjct: 337 RGNTGATGPQGIQGNTGAT 355
>gi|89893368|ref|YP_516855.1| hypothetical protein DSY0622 [Desulfitobacterium hafniense Y51]
gi|89332816|dbj|BAE82411.1| hypothetical protein [Desulfitobacterium hafniense Y51]
Length = 705
Score = 59.3 bits (142), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 288 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 347
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 348 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 407
Query: 133 SGRLRY----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 408 TGPAGEPGGPTGPTGATGATGPAGESG--GPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGATGETG 465
Query: 189 RL 190
Sbjct: 466 AT 467
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 216 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 275
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 276 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 335
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 336 TGPAGETGATGA---TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGA 392
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 393 TGAT 396
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 228 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 287
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 288 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 347
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 348 TGPAGETGATGA---TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGA 404
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 405 TGAT 408
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/185 (24%), Positives = 69/185 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G G +G+ GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 209 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 268
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 269 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 328
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 329 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 388
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 389 ETGAT 393
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/185 (24%), Positives = 69/185 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G G +G+ GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 221 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 280
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 281 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 340
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 341 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 400
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 401 ETGAT 405
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/177 (25%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 240 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 299
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 300 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 359
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 360 TGPAGETGATGA---TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGE 413
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 300 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 359
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-DG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 360 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGEPGGPTG 419
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G P+
Sbjct: 420 PTGATGATGPAGESG--GPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGATGETGATGTFEPNPFAV 477
Query: 192 YL 193
Y+
Sbjct: 478 YV 479
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/177 (25%), Positives = 67/177 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G G +G+ GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 233 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 292
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 293 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 352
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 353 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATG 409
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 10/184 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +G+ GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 252 TGPAGET---GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGA 308
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G +
Sbjct: 309 TGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGA 368
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----LGPSGRLRYLG 185
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 369 TGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGEPGGPTGPTGATGATG 428
Query: 186 PSGR 189
P+G
Sbjct: 429 PAGE 432
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/177 (25%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G G +G+ GP+G G +G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 305 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAG 364
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----LGPSGRL 127
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 365 ETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGEPGGPTGPTGAT 424
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G P+ Y+
Sbjct: 425 GATGPAGESG--GPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGATGETGATGTFEPNPFAVYV 479
>gi|451818787|ref|YP_007454988.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium
saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)]
gi|451784766|gb|AGF55734.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium
saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)]
Length = 751
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/149 (36%), Positives = 56/149 (37%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGP 105
G G+ GP GR G GR G GS GP GR GP GR GP
Sbjct: 141 QGAQGAQGSQGPQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGAQGP 200
Query: 106 SGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGP 159
GR GP GR G G S G G GP GR GP GR GP
Sbjct: 201 QGRQGSQGAQGPQGRQGSQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRRGAQGP 260
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GR GP GR GP GR G G
Sbjct: 261 QGRQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGAQG 289
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/228 (32%), Positives = 74/228 (32%), Gaps = 45/228 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRY 66
G GR G GS GP G S GP GR GP G S GP GR
Sbjct: 159 QGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGS 218
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G G G G+ GP GR GP GR GP GR GP GR GP
Sbjct: 219 QGRQGAQGSQGRQGAQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRRGAQGPQGRQGAQGPQGRQGAQGP 278
Query: 124 SGRLNS---DGPSGR------------------------------LRYLGPSGRLRYLGP 150
GR S GP GR GP GR G
Sbjct: 279 QGRQGSQGAQGPQGRQGSQGRQGAQGAQGAQGSQGAQGPQGAQGAQGSQGPQGRQGAQGS 338
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GR G G GP GR GP GR GP GR G
Sbjct: 339 QGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGA 386
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/153 (35%), Positives = 57/153 (37%), Gaps = 15/153 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP GR G G G GS GP GR GS GP GR GP G
Sbjct: 149 SQGPQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQ------GSQGAQGPQGRQGAQGPQG 202
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLN 128
R GS GP GR G G G G GP GR GP GR
Sbjct: 203 RQ------GSQGAQGPQGRQGSQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRRG 256
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP GR GP GR GP GR G G
Sbjct: 257 AQGPQGRQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGAQG 289
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/214 (30%), Positives = 68/214 (31%), Gaps = 42/214 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP GR G G+ G G+ GP GR GS GP GR GP GR
Sbjct: 210 QGPQGRQGSQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGPQGRQ------GSQGAQGPQGRRGAQGPQGR 263
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGR------------------------------ 99
GP G GP GR GP GR
Sbjct: 264 QGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGSQGRQGAQGAQGAQGSQGAQGPQGAQGA 323
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
GP GR G GR G G + GP GR GP GR GP GR
Sbjct: 324 QGSQGPQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGS 383
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G GR G G GP GR
Sbjct: 384 QGAQGPQGRQGSQGRQGVQGAQGSQGAQGPQGRQ 417
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/147 (32%), Positives = 50/147 (34%), Gaps = 27/147 (18%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP GR G GR G G GP GR GP GR + GP
Sbjct: 141 QGAQGAQGSQGPQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGAQGP 200
Query: 133 SGR---LRYLGPSGR------------------LRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGP 168
GR GP GR GP GR GP GR GP
Sbjct: 201 QGRQGSQGAQGPQGRQGSQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRRGAQGP 260
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GR GP GR GP GR G
Sbjct: 261 QGRQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGA 287
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/238 (28%), Positives = 70/238 (29%), Gaps = 48/238 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRY--------------------- 48
GP GR GP G GP G S GP GR
Sbjct: 258 QGPQGRQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGSQGRQGAQGAQGAQGSQGAQGP 317
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGP 105
G G+ GP GR G GR G GS GP GR GP GR GP
Sbjct: 318 QGAQGAQGSQGPQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGAQGP 377
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------------------ 147
GR G G G GR G G GP GR
Sbjct: 378 QGRQGSQGAQGPQGRQGSQGRQGVQGAQGSQGAQGPQGRQDVQGAQGAQGAQGPQGRQGA 437
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G G GP GR G G GP GR G+ L G+
Sbjct: 438 QGVQGSQGRQGVQGSQGAQGPQGRQGAQGVQG---AQGPQGRQGAQGVQGSLGAQGVQ 492
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.094, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/177 (33%), Positives = 61/177 (34%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP GR G G G GS GP GR GS GP GR GP G
Sbjct: 326 SQGPQGRQGAQGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQ------GSQGAQGPQGRQGAQGPQG 379
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R G G G GR G G GP GR G G GP GR + G
Sbjct: 380 RQGSQGAQGPQGRQGSQGRQGVQGAQGSQGAQGPQGRQDVQGAQGAQGAQGPQGRQGAQG 439
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP GR G G GP GR G G L G G
Sbjct: 440 VQGSQGRQGVQGSQGAQGPQGRQGAQGVQG---AQGPQGRQGAQGVQGSLGAQGVQG 493
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/214 (30%), Positives = 67/214 (31%), Gaps = 30/214 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRY 66
G GR G GS GP G S GP GR GP GS GP GR
Sbjct: 336 QGSQGRQGAQGAQGSQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGRQGAQGPQGRQGSQGAQGPQGR--- 392
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G GR G GS GP GR G G G GR G
Sbjct: 393 QGSQGRQGVQGAQGSQGAQGPQGRQDVQGAQGAQGAQGPQGRQGAQGVQGSQGRQGVQGS 452
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G GP GR + G G GP GR G G L GP G G G
Sbjct: 453 QG---AQGPQGRQGAQGVQG---AQGPQGRQGAQGVQGSLGAQGVQGPQGSQGAQGAQGS 506
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GR G G G+ V G
Sbjct: 507 QGAQGSQGRQGVQGSQGSQGAQGVQGAQGVQGSQ 540
>gi|37523076|ref|NP_926453.1| hypothetical protein gll3507 [Gloeobacter violaceus PCC 7421]
gi|35214079|dbj|BAC91448.1| gll3507 [Gloeobacter violaceus PCC 7421]
Length = 208
Score = 59.3 bits (142), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/123 (34%), Positives = 54/123 (43%), Gaps = 10/123 (8%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G G Y+GP+ + P GR GP G Y+ GR GP+G Y+G ++
Sbjct: 83 GERGGKAYVGPNDGKVLVAPDGRKYVSGPDGGRLYVDEDGRKYAEGPNGAKVYVGDDVKV 142
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
Y GP G +GP G Y GP G +GP GR RY GP G Y GP
Sbjct: 143 ----------YKGPQGGTAVEGPDGGRVYQGPRGGEAAVGPEGRKRYEGPEGTKVYSGPR 192
Query: 170 GRL 172
G +
Sbjct: 193 GTV 195
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/110 (36%), Positives = 50/110 (45%), Gaps = 1/110 (0%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
Y+GP+ + P G GP G Y+ G GP+G Y+G ++ Y GP G
Sbjct: 90 YVGPNDGKVLVAPDGRKYVSGPDGGRLYVDEDGRKYAEGPNGAKVYVGDDVKV-YKGPQG 148
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G Y GP G +GP GR RY GP G Y GP G + D
Sbjct: 149 GTAVEGPDGGRVYQGPRGGEAAVGPEGRKRYEGPEGTKVYSGPRGTVIKD 198
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/106 (36%), Positives = 50/106 (47%), Gaps = 1/106 (0%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+ + P G GP G Y+ GR GP+G+ Y+G ++ Y GP G
Sbjct: 91 VGPNDGKVLVAPDGRKYVSGPDGGRLYVDEDGRKYAEGPNGAKVYVGDDVKV-YKGPQGG 149
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G Y GP G +GP GR RY GP G Y GP G +
Sbjct: 150 TAVEGPDGGRVYQGPRGGEAAVGPEGRKRYEGPEGTKVYSGPRGTV 195
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/102 (38%), Positives = 50/102 (49%), Gaps = 1/102 (0%)
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
Y+GP+ + P GR GP G Y+ GR ++GP+G Y+G ++ Y GP G
Sbjct: 90 YVGPNDGKVLVAPDGRKYVSGPDGGRLYVDEDGRKYAEGPNGAKVYVGDDVKV-YKGPQG 148
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G Y GP G +GP GR RY GP G Y G
Sbjct: 149 GTAVEGPDGGRVYQGPRGGEAAVGPEGRKRYEGPEGTKVYSG 190
>gi|363729402|ref|XP_417214.3| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Gallus
gallus]
Length = 1509
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/173 (40%), Positives = 94/173 (54%), Gaps = 38/173 (21%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
LR+ GP G+LR+ G +G G LR+ GP G+ LR+ GP+G+ P G R
Sbjct: 821 LRFDGPPGALRF---EGPQGQVGGGGPLRFEGPIGQIGGPLRFEGPAGQ-----PVGGPR 872
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+ GP LR+ GP G+ PSG LR+ GP G+ LGP G+ P G LR+ GP G
Sbjct: 873 FEGPGVGLRFEGPRGQ-----PSGGLRFEGPHGQP--LGPRGQ-----PGGGLRFEGPHG 920
Query: 144 RLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ LGP G+ LR+ GP L+ LGP G+ LR+ GP G+ +GP G
Sbjct: 921 QP--LGPHGQAGGGLRFEGP--HLQPLGPHGQPGGGLRFEGPHGQP--MGPHG 967
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/128 (38%), Positives = 67/128 (52%), Gaps = 27/128 (21%)
Query: 81 SLRYLGPSGR--LRYLGP---SGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
S R GP G+ LR+ GP +G ++ GP +G LR+ GP G LR+ G
Sbjct: 782 SSRIDGPPGQAALRFEGPLVGAGASQFDGPLAGAGGAGALRFDGPPGALRF---EGPQGQ 838
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G LR+ GP G+ LR+ GP+G+ R+ GP LR+ GP G+ PSG L
Sbjct: 839 VGGGGPLRFEGPIGQIGGPLRFEGPAGQPVGGPRFEGPGVGLRFEGPRGQ-----PSGGL 893
Query: 182 RYLGPSGR 189
R+ GP G+
Sbjct: 894 RFEGPHGQ 901
>gi|423656222|ref|ZP_17631521.1| hypothetical protein IKG_03210 [Bacillus cereus VD200]
gi|401291341|gb|EJR97017.1| hypothetical protein IKG_03210 [Bacillus cereus VD200]
Length = 643
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/198 (29%), Positives = 69/198 (34%), Gaps = 6/198 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GPSG GP G GP GS+ GP G GP +G GP G GP
Sbjct: 273 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQGPI 332
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G G GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 333 GPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQGAT 392
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G G G GP G G +G GP G GP G G +
Sbjct: 393 GPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGAT 452
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G + + G+
Sbjct: 453 GQTGLTGATGPTGIQGIQ 470
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/181 (32%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP +
Sbjct: 258 GPSGST---GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 314
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRL 127
G GP G GP G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 315 GEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGEA 374
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP G G +G G G GP G G +G GP
Sbjct: 375 GATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPQ 434
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 435 G 435
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/172 (31%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 168 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPT 227
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 228 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQ 287
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G
Sbjct: 288 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGPIG 333
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/185 (31%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 227 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGI 286
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP G P+G GP G GP G G
Sbjct: 287 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQG------PTGEAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 340
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 341 QGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGE 400
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 401 TGATG 405
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 153 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 212
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G S GP G
Sbjct: 213 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 272
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 273 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGI 328
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 173 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 232
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 233 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 292
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP GP+G GP G GP +GP+G
Sbjct: 293 QGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGEAGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGI 340
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 341 QGI 343
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 153 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 212
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 213 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 272
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GPSG GP G GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 273 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGIQ 329
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/190 (30%), Positives = 65/190 (34%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 209 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGV 268
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GPSG GP G GP G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 269 QGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGEAGATGPQGIQGI 328
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP G G G GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 329 QGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGEAGATGPQGPQGIQGP 388
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 389 QGATGPTGAT 398
>gi|296502973|ref|YP_003664673.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
BMB171]
gi|296324025|gb|ADH06953.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
BMB171]
Length = 315
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 78/184 (42%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G GP+G+ G +GR GP+G
Sbjct: 42 TGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGE 101
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP+G G +GR GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 102 ---TGPTG---ITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGITGPTGA 155
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 156 TGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGA---TGPTGITGLTGVTGLTGETGPTGATGP 212
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 213 TGIT 216
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 75/175 (42%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G+ G +GR
Sbjct: 33 TGATGPTGITGPTGATGPTGITGPTGVTGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGR 92
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G GP+G GP+G G +GR + GP+G G +G GP
Sbjct: 93 TGATGPTGET---GPTG---ITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGP 146
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G +G GP+G G +G GP+G G++ V+GL
Sbjct: 147 TGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGLTGVTGLT 201
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 80/191 (41%), Gaps = 7/191 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G GP+G+ G +GR GP+G GP+G G
Sbjct: 60 TGPTGITGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGI 119
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GR GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 120 TGRTGATGPTGITGRTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGPTGA---TGPTGETGP 176
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + + +
Sbjct: 177 TGITGPTGATGPTGITGLTGVTGLTGETGPTGATGPTGITGPTGATGPTGGIGPI-TTTN 235
Query: 190 LRYLGLSDGLR 200
L Y +DG +
Sbjct: 236 LLYYTFADGEK 246
>gi|301055201|ref|YP_003793412.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus biovar anthracis str. CI]
gi|300377370|gb|ADK06274.1| collagen-like triple helix repeat protein, glycine-rich [Bacillus
cereus biovar anthracis str. CI]
Length = 568
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/193 (32%), Positives = 79/193 (40%), Gaps = 22/193 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 254 GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGAT 307
Query: 74 ---RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 308 GPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGV---Q 358
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 359 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 415
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G + G+ V+G
Sbjct: 416 GPTGAT-GIGVTG 427
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/194 (30%), Positives = 84/194 (43%), Gaps = 23/194 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 284 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGAT---GPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGAT 334
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 335 GATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 385
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G GP+G GP G GP+G + GP+G GPS +
Sbjct: 386 GVQGNTGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPTGPSGPSFPVA 442
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
+ +++ ++ + L
Sbjct: 443 TIVVTNNIQQTVLQ 456
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 21/184 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 245 GATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ 298
Query: 74 RYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 299 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGAT 352
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 353 GPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGPAGAT 406
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 407 GATG 410
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 71/180 (39%), Gaps = 21/180 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 225 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG 281
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 282 ---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATG 335
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 336 ATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 386
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 209 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG-- 266
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 267 -IQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGAT 322
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 323 GPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 371
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 194 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 250
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G +
Sbjct: 251 GAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGAT 304
Query: 134 GRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 305 GATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 356
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G+ G +G+ GP+G GP G G +G GP
Sbjct: 164 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQ 220
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +G+ G G G +G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 221 GAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGAT 277
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP G G +G GP G GP+G GP G
Sbjct: 278 GPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 326
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 15/158 (9%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP G G +G+ GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 164 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGAT---GPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGAT 214
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G G +G G G G +G + GP+G GP G GP+
Sbjct: 215 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPA 271
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 272 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGA 306
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 18/167 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP G+ G +G GP G GP+G GP G G +G+
Sbjct: 164 GPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGAT 214
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G G +G G G G +G GP+G + GP G GP+
Sbjct: 215 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPA 271
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 272 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGA 312
>gi|254722434|ref|ZP_05184222.1| hypothetical protein BantA1_08204 [Bacillus anthracis str. A1055]
Length = 408
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/121 (31%), Positives = 52/121 (42%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 124
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGVTG 184
Query: 159 P 159
P
Sbjct: 185 P 185
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/121 (31%), Positives = 52/121 (42%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 124
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGVTG 184
Query: 168 P 168
P
Sbjct: 185 P 185
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/121 (31%), Positives = 52/121 (42%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 124
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G G
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGVTG 184
Query: 141 P 141
P
Sbjct: 185 P 185
>gi|222095309|ref|YP_002529369.1| collagen-like protein [Bacillus cereus Q1]
gi|221239367|gb|ACM12077.1| collagen-like protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 1261
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/143 (29%), Positives = 59/143 (41%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +GS GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 400 ATGNTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTG---ITGPTG 456
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G GP+G S G +G GP+G +G +G GP+G G
Sbjct: 457 DTGPTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDTGPTG 516
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G GP+G
Sbjct: 517 NTGPTGATGNTGSTGVTGPTGST 539
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/228 (23%), Positives = 75/228 (32%), Gaps = 51/228 (22%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G +G +G
Sbjct: 445 NTGPTG---ITGPTGDTGPTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTG 501
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------- 109
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 502 PTGITGPTGDTGPTGNTGPTGATGNTGSTGVTGPTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGPTGITG 561
Query: 110 --RYLGPSGRLR---------------------YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 562 PTGNTGPTGNTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGATGNTGPTGNT---GPTGDTGATGDTGPTG 618
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 619 NTGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGATGNTGPTGNTGPTGDTGSTGSTG 666
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/211 (24%), Positives = 71/211 (33%), Gaps = 51/211 (24%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +GS GP+G GP+G +G +G GP+G G +G
Sbjct: 463 NTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTG---NTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDTGPTGNTG 519
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------------RYLGPSGR-------- 99
G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 520 PTGATGNTGSTGVTGPTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGPTGITGPTGNTGPTGNTGPTGNTG 579
Query: 100 -------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 580 PTGVTGTTGPSGATGNTGPTGNTGPTGDTGATGDTGPTGNT---GPTGITGATGDTGPTG 636
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 637 NTGPTGATGNTGPTGNTGPTGDTGSTGSTGP 667
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/143 (28%), Positives = 58/143 (40%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +GS GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 400 ATGNTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTG---ITGPTG 456
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G GP+G G +G GP+G + G +G GP+G G
Sbjct: 457 DTGPTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDTGPTG 516
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G G +G GP+G
Sbjct: 517 NTGPTGATGNTGSTGVTGPTGST 539
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/147 (28%), Positives = 59/147 (40%), Gaps = 6/147 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 401 TGNTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTG---ITGPTGD 457
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G GP+G +G +G GP+G GP
Sbjct: 458 TGPTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDT---GP 514
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+G G +G G +G GP
Sbjct: 515 TGNTGPTGATGNTGSTGVTGPTGSTGP 541
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 56/134 (41%), Gaps = 3/134 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 409 NTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGITGPTGDTGPTGNTGPTG 468
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +GS GP+G G +G + GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 469 NTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDTGPTGNTGPTGAT---G 525
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRL 145
+G GP+G
Sbjct: 526 NTGSTGVTGPTGST 539
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/237 (23%), Positives = 79/237 (33%), Gaps = 57/237 (24%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLR 65
N GP+G G +G+ GP+G+ G SG G P+G+ GP+G
Sbjct: 283 NTGPTGNTGPTGITGATGATGPTGNTGSTGDSGPTGNTGSTGDSGPTGNTGITGPTGATG 342
Query: 66 YLG------------------------------PSGRL------------------RYLG 77
G P+G G
Sbjct: 343 NTGSTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGITGPTGNTGPTGNTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGATG 402
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+GS GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 403 NTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGIT---GPTGDTG 459
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G GP+G +G +G GP+G G
Sbjct: 460 PTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGDTGPTG 516
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/233 (23%), Positives = 78/233 (33%), Gaps = 54/233 (23%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---------------- 55
N G +G G +GS GP+G+ GP+G G +GS
Sbjct: 307 NTGSTGDSGPTGNTGSTGDSGPTGNTGITGPTGATGNTGSTGSTGPTGNTGPTGVTGTTG 366
Query: 56 --------------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
G +G GP+G G +G
Sbjct: 367 ITGPTGNTGPTGNTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGATGNTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTG 426
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G +G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 427 ITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGITGPTGDTGPTGNTGPTGNT---GPTGNTGSTGDTG 483
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G +G +G GP+G GP+G G +G G++
Sbjct: 484 PTGNTGPAGNTGAIGNTGPTGITGPTGD---TGPTGNTGPTGATGNTGSTGVT 533
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/225 (23%), Positives = 78/225 (34%), Gaps = 48/225 (21%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T + + GP+G GP+G+ G +GS GP+G G +G++ GP+G
Sbjct: 449 TGITGPTGDTGPTGNT---GPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTG- 504
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------------------- 100
GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 505 --ITGPTGDTGPTGNTGPTGATGNTGSTGVTGPTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGPTGITGP 562
Query: 101 -RYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G GP+G + G +G GP
Sbjct: 563 TGNTGPTGNTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGATGNTGPTGNTGPTGDTGATGDTGPTGNTGP 622
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G G +G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 623 TGITGATGDTGPTGNTGPTGATGNTGPTGNTGPTGDTGSTGSTGP 667
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/115 (32%), Positives = 48/115 (41%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+GS G +G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 43 ITGPTGSTGSTGATGDTGATGDTGPTGNTGPTGNTGPTGDTGATGDTGPTGNT---GPTG 99
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G G +G GPSG GP+G GPSG
Sbjct: 100 ITGSTGDTGPTGNTGPAGITGSTGDTGPTGATGPSGATGNTGPTG---VTGPSGA 151
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/123 (30%), Positives = 51/123 (41%), Gaps = 6/123 (4%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T +V GP+G G +G G +G GP+G G +G+ GP+G
Sbjct: 35 TTIVSPTGITGPTGSTGSTGATGDTGATGDTGPTGNTGPTGNTGPTGDTGATGDTGPTGN 94
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GP+G GP+G G +G GPSG GP+G GP
Sbjct: 95 TGPTGITGSTGDTGPTG---NTGPAGITGSTGDTGPTGATGPSGATGNTGPTG---VTGP 148
Query: 124 SGR 126
SG
Sbjct: 149 SGA 151
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/115 (33%), Positives = 50/115 (43%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+GS G +G G +G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 43 ITGPTGSTGSTGATGDTGATGDTGPTGNTGPTGNTGPTGDTGATGDTGPTGNTGPTGITG 102
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
S GP+G GP+G G +G GPSG GP+G GPSG
Sbjct: 103 STGDTGPTGNT---GPAGITGSTGDTGPTGATGPSGATGNTGPTGV---TGPSGA 151
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/115 (32%), Positives = 48/115 (41%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 43 ITGPTGSTGSTGATGDTGATGDTGPTGNTGPTGNT---GPTGDTGATGDTGPTGNTGPTG 99
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
S G +G GP+G G +G GPSG GP+G GPSG
Sbjct: 100 ITGSTGDTGPTGNTGPAGITGSTGDTGPTGATGPSGATGNTGPTG---VTGPSGA 151
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/115 (32%), Positives = 49/115 (42%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+GS G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 43 ITGPTGSTGSTGATGDTGATGDTGPTGNTGPTGNT---GPTGDTGATGDTGPTGNTGPTG 99
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G +G GP+G G +G GPSG + GP+G GPSG
Sbjct: 100 ITGSTGDTGPTGNTGPAGITGSTGDTGPTGATGPSGATGNTGPTG---VTGPSGA 151
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/222 (23%), Positives = 75/222 (33%), Gaps = 48/222 (21%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS------GSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G+ G +G+ GP+G G S GS GP+G GP+G
Sbjct: 280 NTGNTGPTGNTGPTGITGATGATGPTGNTGSTGDSGPTGNTGSTGDSGPTGNTGITGPTG 339
Query: 72 RLRYLGPSGSL---------------------RYLGPSGRL------------------R 92
G +GS GP+G
Sbjct: 340 ATGNTGSTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGITGPTGNTGPTGNTGPTGNTGPTGVTGTTGPSG 399
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G +G GP+G G +G GP+G + G +G GP+G GP+G
Sbjct: 400 ATGNTGSTGNTGPTGITGATGDTGPTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTG---ITGPTG 456
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G G +G GP+G +G
Sbjct: 457 DTGPTGNTGPTGNTGPTGNTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIG 498
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/258 (21%), Positives = 77/258 (29%), Gaps = 81/258 (31%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 595 NTGPTGNTGPTGDTGATGDTGPTG---NTGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGATGNTGPTG 651
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGP-------------------------------------------- 87
G +GS GP
Sbjct: 652 NTGPTGDTGSTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGNTGPTGVTGTTGPTGITGPTGITGPTG 711
Query: 88 ----SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 712 ITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGN---TGPTGNTGPTGDTGSTGDTGPTGNTGPAGNTG 768
Query: 144 RLRYLGPSGRL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+ GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 769 AIGNTGPTGNTGSTGDTGPTGSTGVTGTTGPTGNTGATGDTGATGDTGSTGPTGNTGSTG 828
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P+G G +G G
Sbjct: 829 PTGPTGNTGATGDTGSTG 846
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/250 (20%), Positives = 73/250 (29%), Gaps = 78/250 (31%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G GP+G G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 601 NTGPTGDTGATGDTGPTGNTGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGATGNTGPTGNTGPTGDTG 660
Query: 72 RLRYLGP------------------------------------------------SGSLR 83
GP +G
Sbjct: 661 STGSTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGNTGPTGVTGTTGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITG 720
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 721 ATGDTGPTGNTGPTGN---TGPTGNTGPTGDTGSTGDTGPTGNTGPAGNTGAIGNTGPTG 777
Query: 144 RL---------------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 778 NTGSTGDTGPTGSTGVTGTTGPTGNTGATGDTGATGDTGSTGPTGNTGSTGPTGPTGNTG 837
Query: 177 PSGRLRYLGP 186
+G GP
Sbjct: 838 ATGDTGSTGP 847
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/198 (21%), Positives = 62/198 (31%), Gaps = 54/198 (27%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
+ GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G+ G
Sbjct: 592 ATGNTGPTG---NTGPTGDTGATGDTGPTGNTGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGATGNTG 648
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP----------------------------------------- 105
P+G G +G GP
Sbjct: 649 PTGNTGPTGDTGSTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGNTGPTGVTGTTGPTGITGPTGITG 708
Query: 106 -------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
+G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 709 PTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGNT---GPTGNTGPTGDTGSTGDTGPTGNTGPAG 765
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+G + GP+G G
Sbjct: 766 NTGAIGNTGPTGNTGSTG 783
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/198 (21%), Positives = 63/198 (31%), Gaps = 54/198 (27%)
Query: 36 SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
+ GP+G G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 592 ATGNTGPTGNTGPTGDTGATGDTGPTGN---TGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGATGNTG 648
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP----------------------------------------- 114
P+G G +G GP
Sbjct: 649 PTGNTGPTGDTGSTGSTGPTGNTGPTGVTGTTGPSGNTGPTGVTGTTGPTGITGPTGITG 708
Query: 115 -------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+G G +G + GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 709 PTGITGPTGITGATGDTGPTGNTGPTGN---TGPTGNTGPTGDTGSTGDTGPTGNTGPAG 765
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G + GP+G G
Sbjct: 766 NTGAIGNTGPTGNTGSTG 783
>gi|91795029|ref|YP_564680.1| triple helix repeat-containing collagen [Shewanella denitrificans
OS217]
gi|91717031|gb|ABE56957.1| Collagen triple helix repeat [Shewanella denitrificans OS217]
Length = 468
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/164 (32%), Positives = 69/164 (42%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 1 TFGT-CVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
TFG+ C A+ LGP G GP G +G +G G +G +GP+G G
Sbjct: 229 TFGSDCAT--AIGLGPRGEQGAQGPKGPAGIMGEAGPRGLQGATGDQGAMGPTGEAGPQG 286
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P G + +G G G +GS G +G GP GR+ GP G + GPSG
Sbjct: 287 PRGDIGPIGNQGVKGANGANGSDGVNGLAGATGAKGPQGRVGATGPQGDIGATGPSGPKG 346
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G GP G GP G G +G GP G +
Sbjct: 347 VTGPRGEQGDTGPRGDAGAQGPIGARGITGATGASGRRGPDGAI 390
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 1/177 (0%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRY-LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 64
+ A ++G G L G + LGP G GP G +G +G G +G
Sbjct: 214 IAPTAYSIGQIGCLATFGSDCATAIGLGPRGEQGAQGPKGPAGIMGEAGPRGLQGATGDQ 273
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
+GP+G GP G + +G G G +G G +G GP GR+ GP
Sbjct: 274 GAMGPTGEAGPQGPRGDIGPIGNQGVKGANGANGSDGVNGLAGATGAKGPQGRVGATGPQ 333
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G + + GPSG GP G GP G GP G G +G GP G +
Sbjct: 334 GDIGATGPSGPKGVTGPRGEQGDTGPRGDAGAQGPIGARGITGATGASGRRGPDGAI 390
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/170 (30%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 1/170 (0%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRY-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+G G L G + LGP G GP G +G +G G +G +GP+G
Sbjct: 221 IGQIGCLATFGSDCATAIGLGPRGEQGAQGPKGPAGIMGEAGPRGLQGATGDQGAMGPTG 280
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP G + +G G G +G G +G GP GR+ + GP G + G
Sbjct: 281 EAGPQGPRGDIGPIGNQGVKGANGANGSDGVNGLAGATGAKGPQGRVGATGPQGDIGATG 340
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
PSG GP G GP G GP G G +G GP G +
Sbjct: 341 PSGPKGVTGPRGEQGDTGPRGDAGAQGPIGARGITGATGASGRRGPDGAI 390
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/124 (30%), Positives = 50/124 (40%), Gaps = 6/124 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G +GP G+ G +G+ +G G +G+ GP GR+ GP G
Sbjct: 281 EAGPQGPRGDIGPIGNQGVKGANGA------NGSDGVNGLAGATGAKGPQGRVGATGPQG 334
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GPSG GP G GP G GP G G +G GP G + + G
Sbjct: 335 DIGATGPSGPKGVTGPRGEQGDTGPRGDAGAQGPIGARGITGATGASGRRGPDGAIGNPG 394
Query: 132 PSGR 135
G
Sbjct: 395 APGD 398
>gi|156341276|ref|XP_001620711.1| hypothetical protein NEMVEDRAFT_v1g147315 [Nematostella vectensis]
gi|156205955|gb|EDO28611.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 122
Score = 58.9 bits (141), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/122 (33%), Positives = 53/122 (43%), Gaps = 2/122 (1%)
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
PSG+ PSG PSG PSG ++ Y ++ YL PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYL-PSGEIIVYSPSSEK 59
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
PSG + PSG + PSG PSG++ PSG PSG + PS
Sbjct: 60 IVYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPS 119
Query: 188 GR 189
G+
Sbjct: 120 GK 121
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/121 (33%), Positives = 48/121 (39%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
PSG+ PSG PSG PSG SG PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYLPSGEIIVYSPSSEKI 60
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
PSG + PSG + PSG PSG++ PSG PSG + PSG
Sbjct: 61 VYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPSG 120
Query: 162 R 162
+
Sbjct: 121 K 121
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/122 (33%), Positives = 52/122 (42%), Gaps = 2/122 (1%)
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
PSG+ PSG PSG PSG ++ Y ++ YL PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYL-PSGEIIVYSPSSEK 59
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
PSG PSG + PSG PSG++ PSG PSG + PS
Sbjct: 60 IVYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPS 119
Query: 179 GR 180
G+
Sbjct: 120 GK 121
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/122 (33%), Positives = 52/122 (42%), Gaps = 2/122 (1%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
PSG PSG PSG PSG ++ Y ++ YL PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYL-PSGEIIVYSPSSEK 59
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
PSG + PSG + PSG PSG++ PSG PSG + PS
Sbjct: 60 IVYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPS 119
Query: 152 GR 153
G+
Sbjct: 120 GK 121
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/121 (33%), Positives = 48/121 (39%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
PSG+ PSG PSG PSG SG PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYLPSGEIIVYSPSSEKI 60
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
PSG + PSG + PSG PSG++ PSG PSG + PSG
Sbjct: 61 VYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPSG 120
Query: 135 R 135
+
Sbjct: 121 K 121
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/121 (33%), Positives = 47/121 (38%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
PSG PSG PSG PSG SG PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYLPSGEIIVYSPSSEKI 60
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
PSG + PSG + PSG PSG++ PSG PSG + PSG
Sbjct: 61 VYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPSG 120
Query: 144 R 144
+
Sbjct: 121 K 121
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/118 (32%), Positives = 46/118 (38%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
K + PSG PSG PSG SG PSG + PS
Sbjct: 4 KKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYLPSGEIIVYSPSSEKIVYS 63
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
PSG + PSG + PSG PSG++ PSG PSG + PSG+
Sbjct: 64 PSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPSGK 121
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/121 (33%), Positives = 46/121 (38%)
Query: 51 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
PSG PSG PSG PSG SG PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYLPSGEIIVYSPSSEKI 60
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
PSG + PSG PSG PSG++ PSG PSG + PSG
Sbjct: 61 VYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEIIVYSPSG 120
Query: 171 R 171
+
Sbjct: 121 K 121
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/114 (33%), Positives = 48/114 (42%), Gaps = 2/114 (1%)
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
PSG PSG PSG PSG ++ Y ++ YL PSG + PS
Sbjct: 1 PSGKKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSPSGEKIVYSSSGEKIVYL-PSGEIIVYSPSSEK 59
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
PSG + PSG + PSG PSG++ PSG PSG +
Sbjct: 60 IVYSPSGEKIFYSPSGEKIFYSPSGEKIVYSPSGKIIVYSPSGEKIIYSPSGEI 113
>gi|426251513|ref|XP_004019466.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Ovis aries]
Length = 1554
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 113/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 845 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 903
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 904 ENPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAMRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 958
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ +R+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 959 HGQSVAGMRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1013
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1014 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFEGQPGQSSLLPRFDGLH 1055
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 803 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 861
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 862 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFENPRGQ-----PV 911
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP G+ +
Sbjct: 912 GGLRFEGGHGPSGAAMRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGM 966
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 967 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1011
>gi|423521393|ref|ZP_17497866.1| hypothetical protein IGC_00776, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
gi|401178031|gb|EJQ85215.1| hypothetical protein IGC_00776, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
Length = 419
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/151 (29%), Positives = 60/151 (39%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP+G G +GS G +G GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 76 VTGPTGNT---GATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTG 132
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G G GP+G S G +G GP+G G +G G
Sbjct: 133 ATGSTGPTGNTGVTG------STGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVTG 186
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 187 STGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGPTGN 217
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/144 (29%), Positives = 61/144 (42%), Gaps = 6/144 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS G +G+ GP+G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 77 TGPTGNT---GATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTGA 133
Query: 73 LRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ GP+G G +G GP+G G +G G +G +
Sbjct: 134 TGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVTGSTGATGN 193
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G +G GP+G
Sbjct: 194 TGPTGVTGPTGNTGSTGSTGPTGN 217
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/215 (24%), Positives = 75/215 (34%), Gaps = 39/215 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------- 53
G +G GP+G+ G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 2 TGSTGSTGVTGPTGNTGVTGSTGATGSTGPTGNTGATGDTGPTGNTGATGSTGPTGSTGP 61
Query: 54 -----------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
GP+G G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 62 TGSTGSTGSTGPTGVTGPTGNTGATGSTGVTGNTGATGS---TGPTGNTGATGSTGSTGV 118
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G G +G GP+G S GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 119 TGPTGATGPTGNTGATGSTGPTGNTGVTGSTGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGS 178
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 179 TGPTGVTGSTGATGNTGPTG---VTGPTGNTGSTG 210
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/151 (27%), Positives = 61/151 (40%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G +GS G +G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 76 VTGPTGNT---GATGSTGVTGNTGATGSTGPTGNTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTG 132
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP+G G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 133 ATGSTGPTGNTGVTG------STGPTGNTGSTGSTGPTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVTG 186
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 187 STGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGPTGN 217
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/115 (28%), Positives = 48/115 (41%), Gaps = 3/115 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G GP+G+ G +G G +GS GP+G G +G
Sbjct: 106 NTGATGSTGSTGVTGPTGATGPTGNTGATGSTGPTGNTGVTGS---TGPTGNTGSTGSTG 162
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 163 PTGNTGPTGNTGPTGSTGPTGVTGSTGATGNTGPTGVTGPTGNTGSTGSTGPTGN 217
>gi|386362618|ref|YP_006071949.1| LPXTG-motif cell wall anchor domain protein [Streptococcus pyogenes
Alab49]
gi|350277027|gb|AEQ24395.1| LPXTG-motif cell wall anchor domain protein [Streptococcus pyogenes
Alab49]
Length = 433
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 76/176 (43%), Gaps = 18/176 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP+G GP G G G+ +GP+G P G +GP+G+
Sbjct: 96 AGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAG------PQGPAGPVGPAGK 149
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G+ +GP+ GP G +GP+G+ GP G G
Sbjct: 150 DGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGE 203
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G+ +GP+ GP G +GP+G+ GP G G G+ +GP+G
Sbjct: 204 QGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAG 253
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 80/187 (42%), Gaps = 25/187 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP+G GP G G G+ +GP+G GP +GP+G+
Sbjct: 135 AGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAGPQGPAGP------VGPAGK 188
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G+ +GP+G P G +GP+G+ GP G G
Sbjct: 189 DGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAG------PQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGE 242
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G+ +GP+ GP G +GP G GP+G+ GP +GP+G+
Sbjct: 243 QGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPRGERGEAGPAGKDGERGP------VGPAGKDGQ 290
Query: 193 LGLSDGL 199
G DGL
Sbjct: 291 DG-KDGL 296
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 76/187 (40%), Gaps = 19/187 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G+ GP G G G +GP+ GP G +GP+G+ GP G
Sbjct: 144 VGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGD 197
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+ GP G +GP+G+ GP G G G+ GP
Sbjct: 198 KGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGP 251
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+ GP G +GP G GP+G+ GP G G G+ G G+
Sbjct: 252 A------GPQGPAGPVGPRGERGEAGPAGKDGERGPVGPAGKDGQDGKDGLPGKDGKDGQ 305
Query: 193 LGLSDGL 199
G DGL
Sbjct: 306 DG-KDGL 311
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/136 (30%), Positives = 60/136 (44%), Gaps = 12/136 (8%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP G +GP+G+ GP G G G+ +GP+ GP G +
Sbjct: 91 GEVGPAGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPV 144
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G+ GP G G G+ +GP+ GP G +GP+G+ GP G
Sbjct: 145 GPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPA------GPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDK 198
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G+ +GP+G
Sbjct: 199 GETGEQGQRGEVGPAG 214
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/133 (29%), Positives = 57/133 (42%), Gaps = 12/133 (9%)
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + GP G +GP+G GP G G G+ +GP+G P G +
Sbjct: 91 GEVGPAGPQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAG------PQGPAGPV 144
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G+ + GP G G G+ +GP+G P G +GP+G+ GP G
Sbjct: 145 GPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGQRGEVGPAG------PQGPAGPVGPAGKDGTQGPRGDK 198
Query: 182 RYLGPSGRLRYLG 194
G G+ +G
Sbjct: 199 GETGEQGQRGEVG 211
>gi|379719601|ref|YP_005311732.1| hypothetical protein PM3016_1665 [Paenibacillus mucilaginosus 3016]
gi|378568273|gb|AFC28583.1| hypothetical protein PM3016_1665 [Paenibacillus mucilaginosus 3016]
Length = 358
Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/182 (35%), Positives = 80/182 (43%), Gaps = 21/182 (11%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G+ G +G++ GP G LGP G +G GSL GP G LGP G
Sbjct: 50 NGQQFLQGLAGAIAEAGPRGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPQGLAGALGPQGVAGL 106
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GSL GP G LGP G + LGP G LGP G +G G L
Sbjct: 107 VGAIGSL---GPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSLGPEGLAGALGPQGVAGLVGAIGAL-- 161
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGP 186
GP G LGP G G +G + +GP G LGP G + GP+G GP
Sbjct: 162 -GPEGLAGALGPQG---LAGLAGAIGAIGPEGLAGALGPQGLVGATGATGPAGATGATGP 217
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 218 AG 219
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/162 (35%), Positives = 72/162 (44%), Gaps = 27/162 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS------GSLRYLGPSGRLR 65
+LGP G LGP G +G GS LGP G LGP G++ LGP G
Sbjct: 88 SLGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGS---LGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSLGPEGLAG 144
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
LGP G G G++ LGP G LGP G G +G + +GP G LGP G
Sbjct: 145 ALGPQG---VAGLVGAIGALGPEGLAGALGPQG---LAGLAGAIGAIGPEGLAGALGPQG 198
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+ + G + GP+G GP+ GP+G L G
Sbjct: 199 LVGATGAT------GPAGATGATGPA------GPAGGLAQFG 228
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/166 (34%), Positives = 71/166 (42%), Gaps = 21/166 (12%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---- 98
+G+ G +G++ GP G LGP G +G GSL GP G LGP G
Sbjct: 50 NGQQFLQGLAGAIAEAGPRGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPQGLAGALGPQGVAGL 106
Query: 99 --RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+ LGP G LGP G +G G L GP G LGP G G G +
Sbjct: 107 VGAIGSLGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPEGLAGALGPQG---VAGLVGAIGA 160
Query: 157 LGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
LGP G LGP +G + +GP G LGP G + G +
Sbjct: 161 LGPEGLAGALGPQGLAGLAGAIGAIGPEGLAGALGPQGLVGATGAT 206
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/135 (35%), Positives = 58/135 (42%), Gaps = 9/135 (6%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G+ G +G++ GP G LGP G +G G L GP G LGP G
Sbjct: 50 NGQQFLQGLAGAIAEAGPRGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPQGLAGALGPQGV--- 103
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G + LGP G LGP G +G G L GP G LGP G +G G
Sbjct: 104 AGLVGAIGSLGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPEGLAGALGPQGVAGLVGAIGA 160
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
L GL+ L GL
Sbjct: 161 LGPEGLAGALGPQGL 175
>gi|225388265|ref|ZP_03757989.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_02000 [Clostridium asparagiforme
DSM 15981]
gi|225045675|gb|EEG55921.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_02000 [Clostridium asparagiforme
DSM 15981]
Length = 390
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/202 (28%), Positives = 84/202 (41%), Gaps = 11/202 (5%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
N GP+G +GP+G GP G GP+G G +G +GP+G
Sbjct: 41 CNCCCNRGPTGPQGPVGPAGPR---GPQGFPGIPGPTGPTGATGTNGMNGIMGPTGPTGA 97
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRY 120
G +G +GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 98 TGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPTGANGITGPTGANGATGVTGPTGPTGANGV 157
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G ++G +G G +G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 158 TGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGATGV 217
Query: 181 LRYLGPSGRLR--YLGLSDGLR 200
GP+G G ++ +R
Sbjct: 218 TGPTGPTGNTNSACCGCTEQIR 239
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/156 (28%), Positives = 70/156 (44%), Gaps = 5/156 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G +GP+G GP+G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 89 MGPTGPTGATGANGLNGAMGPTGPTGANGPTGATGATGPTGANGITGPTGANGATGVTGP 148
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G G +G G +G GP+G GP+G ++G
Sbjct: 149 T---GPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGANGV 205
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR--YLGPSGRLRYL 166
+G G +G GP+G G + ++R +
Sbjct: 206 TGPTGPTGATGVTGPTGPTGNTNSACCGCTEQIRNI 241
>gi|335294600|ref|XP_003129756.2| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Sus scrofa]
Length = 1552
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/222 (35%), Positives = 113/222 (50%), Gaps = 52/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR---LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS--- 160
G+ +R+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSPGMRFEGQHSQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVPG 1014
Query: 161 GRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGLRIEGPLGQSGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1055
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/224 (33%), Positives = 106/224 (47%), Gaps = 71/224 (31%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR---LR 155
G LR+ GPSG +R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP G+ +R
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSPGMR 967
Query: 156 YLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 FEGQHSQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1011
>gi|423635930|ref|ZP_17611583.1| hypothetical protein IK7_02339 [Bacillus cereus VD156]
gi|401276480|gb|EJR82432.1| hypothetical protein IK7_02339 [Bacillus cereus VD156]
Length = 835
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 76/186 (40%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G+ GP+G+ G G +GP+G+ +G G GP+G
Sbjct: 375 GPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVT 431
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLNSD 130
G G+ G +G G G G +G GP G G +G +
Sbjct: 432 GAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGATGLTGTQGAQ 491
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNT 551
Query: 191 RYLGLS 196
+G++
Sbjct: 552 GEVGIT 557
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 69/175 (39%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G+ GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G+ G G GP+G G G G +G G G + G +G
Sbjct: 427 PAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGATGLTG 486
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 487 TQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGA 541
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/177 (27%), Positives = 68/177 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGI 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G +GP+G G
Sbjct: 470 QGPQGVQGIQGATGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G G
Sbjct: 530 QGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAPGSQGPQGPQGNVGITGAMGE 586
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/166 (28%), Positives = 66/166 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G G +G+ G G GP+G
Sbjct: 393 GPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQ 452
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G G +G G G G +G GP G +GP+G + GP
Sbjct: 453 GIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGATGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQ 512
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 513 GLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 558
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/171 (27%), Positives = 65/171 (38%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G+ GP+G+ G G GP+G+ G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 427 PAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGATGLTG 486
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G +GP+G + GP G +GP+G G G +G
Sbjct: 487 TQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIG 537
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/219 (26%), Positives = 84/219 (38%), Gaps = 39/219 (17%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G +GP+G
Sbjct: 485 TGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQGI 544
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------------PSGRLRY 120
GP G+ +G +G G G GP G + G P G +
Sbjct: 545 RGPQGNTGEVGITGPQGVQGAPGSQGPQGPQGNVGITGAMGETGATGATGATGPQGLQGF 604
Query: 121 LGPSGRLNS---------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G G G GPSG +G SG +GP G
Sbjct: 605 QGITGIQGITGTTGNTGATGPQGIQGIQGVQGLQGPSGVSGVIGASGS---IGPVGAQGS 661
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GPSG +GP+G G +G + +LG++ +GL
Sbjct: 662 QGPSG---VVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGATGL 694
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/167 (26%), Positives = 62/167 (37%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P G GP+G+ G G GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 423
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G G G G +G + G G G +G GP G G +G
Sbjct: 424 IAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGATG 483
Query: 162 ---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +GP+G + GP G +G + V G+
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQ 530
>gi|337745619|ref|YP_004639781.1| hypothetical protein KNP414_01347 [Paenibacillus mucilaginosus
KNP414]
gi|336296808|gb|AEI39911.1| hypothetical protein KNP414_01347 [Paenibacillus mucilaginosus
KNP414]
Length = 359
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/182 (35%), Positives = 80/182 (43%), Gaps = 21/182 (11%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G+ G +G++ GP G LGP G +G GSL GP G LGP G
Sbjct: 51 NGQQFLQGLAGAIAEAGPRGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPQGLAGALGPQGVAGL 107
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GSL GP G LGP G + LGP G LGP G +G G L
Sbjct: 108 VGAIGSL---GPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSLGPEGLAGALGPQGVAGLVGAIGAL-- 162
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGP 186
GP G LGP G G +G + +GP G LGP G + GP+G GP
Sbjct: 163 -GPEGLAGALGPQG---LAGLAGAIGAIGPEGLAGALGPQGLVGATGATGPAGATGATGP 218
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 219 AG 220
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/162 (35%), Positives = 72/162 (44%), Gaps = 27/162 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS------GSLRYLGPSGRLR 65
+LGP G LGP G +G GS LGP G LGP G++ LGP G
Sbjct: 89 SLGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGS---LGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSLGPEGLAG 145
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
LGP G G G++ LGP G LGP G G +G + +GP G LGP G
Sbjct: 146 ALGPQG---VAGLVGAIGALGPEGLAGALGPQG---LAGLAGAIGAIGPEGLAGALGPQG 199
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+ + G + GP+G GP+ GP+G L G
Sbjct: 200 LVGATGAT------GPAGATGATGPA------GPAGGLAQFG 229
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/166 (34%), Positives = 71/166 (42%), Gaps = 21/166 (12%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---- 98
+G+ G +G++ GP G LGP G +G GSL GP G LGP G
Sbjct: 51 NGQQFLQGLAGAIAEAGPRGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPQGLAGALGPQGVAGL 107
Query: 99 --RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+ LGP G LGP G +G G L GP G LGP G G G +
Sbjct: 108 VGAIGSLGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPEGLAGALGPQG---VAGLVGAIGA 161
Query: 157 LGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
LGP G LGP +G + +GP G LGP G + G +
Sbjct: 162 LGPEGLAGALGPQGLAGLAGAIGAIGPEGLAGALGPQGLVGATGAT 207
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/135 (35%), Positives = 58/135 (42%), Gaps = 9/135 (6%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G+ G +G++ GP G LGP G +G G L GP G LGP G
Sbjct: 51 NGQQFLQGLAGAIAEAGPRGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPQGLAGALGPQGV--- 104
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G + LGP G LGP G +G G L GP G LGP G +G G
Sbjct: 105 AGLVGAIGSLGPQGLAGALGPQGVAGLVGAIGSL---GPEGLAGALGPQGVAGLVGAIGA 161
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
L GL+ L GL
Sbjct: 162 LGPEGLAGALGPQGL 176
>gi|423384850|ref|ZP_17362106.1| hypothetical protein ICE_02596 [Bacillus cereus BAG1X1-2]
gi|401639520|gb|EJS57259.1| hypothetical protein ICE_02596 [Bacillus cereus BAG1X1-2]
Length = 835
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/197 (30%), Positives = 74/197 (37%), Gaps = 9/197 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP G G +G G G +
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQAGATGPQGIQGIQGPI 518
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--RLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G G GP+G L+ + GP+G GP+G GP G
Sbjct: 519 GPTGPQGIQGIQGVQGSQGPTGPTGPQGLQGITGQSGPTGPTGVTGPTG---ATGPQGPQ 575
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G G +G GP G GP G G +G+ GP G GP
Sbjct: 576 GIQGPQGVTGPTGATGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGQTGATGPQGPQGIQGPQ 635
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G G + V+G
Sbjct: 636 GITGQAGATGQTGVTGA 652
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/195 (28%), Positives = 72/195 (36%), Gaps = 12/195 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G GP GP+G+ GP G +GP+G G
Sbjct: 477 GPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQ 530
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G G G GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 531 GVQGSQGPTGPTGPQGLQGITGQSGPTGPTGVTGPTG---ATGPQGPQGIQGPQGVTGPT 587
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP G GP G G +G+ GP G GP G G +G+
Sbjct: 588 GATGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGQTGATGPQGPQGIQGPQGITGQAGATGQT 647
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 648 GVTGATGPTGIQGIQ 662
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGVTGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP GP+G+ GP G GP G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 526
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 66/175 (37%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP G
Sbjct: 444 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQG-- 498
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P+G GP G GP +GP+G G G GP+G G
Sbjct: 499 ----PTGQAGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGSQGPTGPTGPQGLQ 548
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP+G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 549 GITGQSGPTGPTGVTGPTG---ATGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGEAGATGPQG 600
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP GP+G+ GP G GP +GP+G
Sbjct: 479 QGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQAGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGI 526
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 527 QGI 529
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/190 (30%), Positives = 66/190 (34%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 431 TGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGI 490
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 126
GP G G +G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 491 QGVQGPQGPTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGSQGPTGPTGPQGLQGI 550
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP G GP G G +G GP G GP
Sbjct: 551 TGQSGPTGPTGVTGPTG---ATGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGEAGATGPQGPQGIQGP 607
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 608 QGATGPTGAT 617
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/162 (29%), Positives = 59/162 (36%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGVTGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 474 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQAGATGPQGIQGIQ 515
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGVTGPTGSQGIQ 245
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 246 GV 247
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/190 (31%), Positives = 71/190 (37%), Gaps = 12/190 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 413 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 472
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 126
GP GS+ GP G GP+G+ GP G +GP+G G G
Sbjct: 473 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQAGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 532
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
S GP+G G G GP+G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 533 QGSQGPTGPTGPQGLQGITGQSGPTGPTGVTGPTG---ATGPQGPQGIQGPQG---VTGP 586
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G +
Sbjct: 587 TGATGEAGAT 596
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP+G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + GP+G G G + +G +G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGVTGPTGSQGIQGVQGVIGPIGATGLQGDPGPTGSTGPTGVT 275
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 395 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGV 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP G GP G P+G+ + GP
Sbjct: 455 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQG------PTGQAGATGP 508
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 509 QGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGSQGPTGPTGPQGLQGITGQSGPTGPTGVTGPTGA 568
Query: 190 L 190
Sbjct: 569 T 569
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 65/180 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 390 GPIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPT 449
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G
Sbjct: 450 GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQAGATGPQ 509
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G + GP G G G GP+G G +G+ GP+G G +
Sbjct: 510 GIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGSQGPTGPTGPQGLQGITGQSGPTGPTGVTGPTGAT 569
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/140 (30%), Positives = 53/140 (37%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 518 IGPTGPQGIQGIQGVQGSQGPTGPTGPQGLQGITGQSGPTGPTGVTGPTG---ATGPQGP 574
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP G GP G G +G+ GP G GP
Sbjct: 575 QGIQGPQGVTGPTGATGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGQTGATGPQGPQGIQGP 634
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G G +G+ G +G
Sbjct: 635 QGITGQAGATGQTGVTGATG 654
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G G G + GP+G G G + G +G GP G + G + +
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGVTGPTGSQGIQ 245
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 246 GVQ 248
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 71/176 (40%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + +G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGVTGPTGSQGIQGVQGVIGPIGATGLQGDPGPTGS---TGPTG---VTGPTG 279
>gi|254721136|ref|ZP_05182927.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus anthracis str.
A1055]
Length = 583
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/175 (34%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 27/175 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 212 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGAT 262
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 263 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQ 313
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 314 G---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG 359
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/175 (33%), Positives = 74/175 (42%), Gaps = 27/175 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 197 GNTGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 247
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 248 GATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 298
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 299 G---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 344
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/176 (33%), Positives = 74/176 (42%), Gaps = 27/176 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 218 GATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG-- 269
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 270 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPA 319
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 320 GATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGA 366
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/176 (33%), Positives = 72/176 (40%), Gaps = 27/176 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 182 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 232
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 233 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 283
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 284 G---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGA 330
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/211 (27%), Positives = 74/211 (35%), Gaps = 57/211 (27%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 242 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 292
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 293 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQ 343
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------------RLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G G +G
Sbjct: 344 G---IQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQ 400
Query: 164 RYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP G
Sbjct: 401 GIQGPAGATGATGPQDAQGPAGATGATGPQG 431
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/201 (28%), Positives = 75/201 (37%), Gaps = 50/201 (24%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 272 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGAT 322
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 323 GATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTG 373
Query: 128 ------------------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+ G +G GP+G GP GP+G GP
Sbjct: 374 PTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQ---DAQGPAGATGATGPQ 430
Query: 170 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
G GP+G + GP+G
Sbjct: 431 G---VQGPTGATGIGVTGPTG 448
>gi|87882928|emb|CAJ58483.1| hypothetical protein BA_2450 [Bacillus anthracis]
Length = 206
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/155 (26%), Positives = 57/155 (36%), Gaps = 24/155 (15%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPTG 92
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSG 161
+ GP+G GP+G GP +G G +G
Sbjct: 93 ITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATG 152
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G GP+G G +
Sbjct: 153 LAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGAT 187
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/156 (26%), Positives = 57/156 (36%), Gaps = 24/156 (15%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPTG 92
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLNSDGPSG 134
GP+G GP+G GP +G G +G
Sbjct: 93 ITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 LAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 188
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/156 (26%), Positives = 58/156 (37%), Gaps = 24/156 (15%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPTG 92
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSG 125
GP+G GP+G GP +G G +G
Sbjct: 93 ITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATG 152
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 LAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 188
>gi|218232264|ref|YP_002368064.1| hypothetical protein BCB4264_A3360 [Bacillus cereus B4264]
gi|218160221|gb|ACK60213.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus B4264]
Length = 835
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G
Sbjct: 448 STGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATG 507
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G GS+ GP G GP G GP G G +G G +G
Sbjct: 508 PQGIQGIQGSIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTG 567
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G G +G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 568 ATGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQG 627
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/188 (31%), Positives = 76/188 (40%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPS 70
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP+
Sbjct: 444 GPSGST---GPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 500
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G+ GP G +GP+G G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 501 GQTGATGPQGIQGIQGSIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPT 560
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP+G GP G G +G GP+G GP G G +G+ GP+
Sbjct: 561 GATGPTGATGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGPT 620
Query: 188 GRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 621 GATGPQGI 628
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 65/179 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP G G +G G G + GP G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGIQGSIGPTGPQGIQGIQGV 532
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G S GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 458
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGI 514
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 341 TGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGP 400
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP G G G GP+G G G GP G GP
Sbjct: 401 QGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGP 460
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP GP+G+ GP G
Sbjct: 461 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQTGATGPQG 510
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQ 458
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GPSG GP G GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGIQ 515
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 413 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGI 472
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 126
GP GS+ GP G GP+G+ GP G +GP+G G G
Sbjct: 473 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGIQGSIGPTGPQGIQGIQGV 532
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G+ G G GP+G GP+G GP G G +G GP
Sbjct: 533 QGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGP 592
Query: 187 SGRL 190
+G
Sbjct: 593 TGAT 596
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/196 (30%), Positives = 74/196 (37%), Gaps = 20/196 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP+G L+ L GP G GPSG GP G G
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGIQGPSGSTGPQGVQGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQG 477
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
P G + GP G GP GP+G+ GP G +GP+G G G
Sbjct: 478 PQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQTGATGPQGIQGIQGSIGPTGPQGIQGIQG 531
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G+ GL
Sbjct: 532 VQGPQGPTGQAGPQGL 547
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 395 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGSTGPQGV 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP G GP GP+G+ + GP
Sbjct: 455 QGIQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGQTGATGP 508
Query: 133 SGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +GP+G G G GP+G+ G G GP+G GP+G
Sbjct: 509 QGIQGIQGSIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGA 568
Query: 190 L 190
Sbjct: 569 T 569
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 59/161 (36%), Gaps = 9/161 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG----- 68
GP G + GP G GP G G +G G GS+ GP G G
Sbjct: 477 GPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGQTGATGPQGIQGIQGSIGPTGPQGIQGIQGVQGPQ 536
Query: 69 -PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
P+G+ G G GP+G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 537 GPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGPTGAT 596
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G GP G G +G GP G GP
Sbjct: 597 GPQGPQG---IQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQGIQGIQGP 634
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/207 (27%), Positives = 75/207 (36%), Gaps = 24/207 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP GS GP G G G GP+G G G +GP+
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPT 128
Query: 71 GRLRY------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------YL 112
G GP+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 129 GPTGIQGIQGIQGPIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVT 188
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G +GP+G S G G +GP G GP G + +GP+G G
Sbjct: 189 GIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQ 248
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 249 GVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 275
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/134 (29%), Positives = 54/134 (40%), Gaps = 3/134 (2%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G G + GP+G+ G G L G G G G + GP+G
Sbjct: 146 TGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGS 205
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRY 174
G G + G +G GP G + +GP+G G G + GP+ G
Sbjct: 206 QGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGP 265
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G
Sbjct: 266 TGPTGATGITGPTG 279
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/198 (26%), Positives = 73/198 (36%), Gaps = 24/198 (12%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR-----LRYL-------GP 69
+GP+G G G GP+G GP GS GP G ++ + GP
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGIQGVQGIQGERGP 109
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+G G G +GP+G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGIQGPIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + +GP+G G+
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGV 247
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.76, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGIQGPIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/121 (30%), Positives = 45/121 (37%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G GP+G G G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 517 SIGPTGPQGIQGIQGVQGPQGPTGQAGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTG---ATGPQG 573
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G GP G GP G G +G GP G G
Sbjct: 574 PQGIQGPQGETGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQGIQGIQG 633
Query: 132 P 132
P
Sbjct: 634 P 634
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGIQGPIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP G
Sbjct: 167 TGNTGIQGVQGNL---GGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 223
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 224 QGL 226
>gi|297491732|ref|XP_002699113.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Bos taurus]
gi|296471936|tpg|DAA14051.1| TPA: mKIAA0824 protein-like [Bos taurus]
Length = 1489
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 113/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 780 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 838
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 839 ENPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAMRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 893
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ +R+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 894 HGQSVAGMRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 948
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 949 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHPLRFEGQPGQSSLLPRFDGLH 990
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 738 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 796
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 797 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFENPRGQ-----PV 846
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP G+ +
Sbjct: 847 GGLRFEGGHGPSGAAMRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGM 901
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 902 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 946
>gi|42782789|ref|NP_980036.1| hypothetical protein BCE_3739 [Bacillus cereus ATCC 10987]
gi|42738716|gb|AAS42644.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus ATCC 10987]
Length = 1147
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 12/181 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 620 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 676
Query: 71 GRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G +G+ GP+G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 677 GVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 736
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP+G GP G G +G GP G G +G GP G GP
Sbjct: 737 GAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGPQ 793
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 794 G 794
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/192 (28%), Positives = 71/192 (36%), Gaps = 15/192 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 530 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 586
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 587 GAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 646
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
+ GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 647 GAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGAT 703
Query: 185 GPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 704 GPQGVQGNTGAT 715
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 18/186 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP G GP+G+ GP G G +
Sbjct: 590 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 643
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP G +
Sbjct: 644 GPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG---AQ 694
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 695 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQ 754
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 755 GNTGAT 760
Score = 56.6 bits (135), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/189 (27%), Positives = 68/189 (35%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 605 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG-- 662
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 663 -VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 721
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G G +G GP+G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 722 GAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQ 781
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 782 GPQGNTGAT 790
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/191 (27%), Positives = 69/191 (36%), Gaps = 12/191 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 501 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG 557
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 558 AQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 617
Query: 129 SDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 618 AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 674
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 675 PQGVQGNTGAT 685
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 71/213 (33%), Gaps = 24/213 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP
Sbjct: 650 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQ 706
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPS 124
G G +G+ G G G +G GP+G GP +G GP
Sbjct: 707 GVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 766
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G +G GP G GP G GP G G +G
Sbjct: 767 GAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQ 826
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP G G + G+
Sbjct: 827 GVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGIQ 859
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/207 (25%), Positives = 68/207 (32%), Gaps = 30/207 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 695 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG-- 752
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------- 114
G +G+ GP G G +G GP G GP
Sbjct: 753 -VQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQ 811
Query: 115 -----SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+G GP G + G +G G G G +G GP+G GP
Sbjct: 812 GPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQ 871
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G GP G G +
Sbjct: 872 G---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGAT 895
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/201 (25%), Positives = 67/201 (33%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 680 GNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQ 739
Query: 77 GPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS- 129
GP+G+ GP +G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 740 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGPQGVQGNT 799
Query: 130 -----------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYL 175
GP G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 800 GATGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGIQ 859
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G G +
Sbjct: 860 GPAGATGATGPQGAQGPAGAT 880
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 24/187 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G GP+G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 722 GAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGAT 778
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP G+ GP G GP G G +G G +G
Sbjct: 779 GPQGPQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGAT 838
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G + G +G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 839 GPQG---AQGNTGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQ 889
Query: 182 RYLGPSG 188
G +G
Sbjct: 890 GNTGATG 896
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/198 (26%), Positives = 68/198 (34%), Gaps = 24/198 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG------------RLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GP+G GP G+ G +G+ GP G G G+ G +
Sbjct: 452 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGA---TGPQGVQGPAGATGATGATGPQGAQGNTGATGAT 508
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G +G GP G+ GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 509 GPQGVQGNTGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNT 562
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G +G G G G +G GP+G GP G G +G GP+
Sbjct: 563 GATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPA 622
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G G +
Sbjct: 623 GATGATGPQGVQGNTGAT 640
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/169 (27%), Positives = 61/169 (36%), Gaps = 15/169 (8%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGSLRYL 85
G G+ G +G G +G+ GP G GP+G GP +G+
Sbjct: 497 GAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 553
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP---SGRLRYLGPS 142
GP G G +G G G G +G GP+G + GP G G +
Sbjct: 554 GPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 613
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 614 GPQGAQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQG 662
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/196 (26%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 12/196 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 180 NTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGATGPQGNTGATGATGPQGNTGATGATG 239
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------RLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G+ G +G GP G G +G GP G G
Sbjct: 240 PQGNTGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGPRGNTGATGATGATGPQGIQGNTG 299
Query: 123 PSGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP +G GP G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 300 ATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGAQGPAG 359
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 360 ATGATGPQGNTGATGI 375
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/203 (24%), Positives = 68/203 (33%), Gaps = 24/203 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ G G+ G +G G +G+ GP G GP+G
Sbjct: 399 NTGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAG 455
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ G +G G G G +G G
Sbjct: 456 ATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQG 515
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
+G GP G + GP+G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 516 NTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQG 572
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP G G +
Sbjct: 573 AQGNTGATGATGPQGAQGPAGAT 595
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.055, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/197 (24%), Positives = 64/197 (32%), Gaps = 24/197 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------- 64
N G +G G G+ G +G GP+G GP G+ G +G
Sbjct: 423 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQG 482
Query: 65 -----------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G G G +G G +G GP G GP+G G
Sbjct: 483 PAGATGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATG 539
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P G G +G + GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 540 PQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGPAGATG 596
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G +G
Sbjct: 597 ATGPQGVQGNTGATGAT 613
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP G+ +G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 297 NTGATGATGPQGPQGN------TGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATG 350
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G G G GP G G +G + G
Sbjct: 351 PQGAQGPAGATGATGPQGNTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGAQG 410
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G G G +G G +G GP G GP+G GP G
Sbjct: 411 PAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQG 467
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 468 NTGAT 472
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/230 (22%), Positives = 69/230 (30%), Gaps = 51/230 (22%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---------------- 55
N G +G GP G+ G +G GP+G GP G+
Sbjct: 327 NTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGNTGATGIGVTGPTGPSGG 386
Query: 56 -----------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G +G GP+G G G+ G +G G +G G
Sbjct: 387 PPGPTGPQGPQGNTGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATG 446
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL------------------RYLGPSGRLR 146
P G GP+G GP G + G +G G G
Sbjct: 447 PQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGATGPQGAQGNTG 503
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP G GP+G GP G G +
Sbjct: 504 ATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 550
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/171 (25%), Positives = 56/171 (32%), Gaps = 27/171 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 311 GNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGPQGNTGATGATGPQGAQGPAGATGATGPQGNT 370
Query: 74 RYLG---------------------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G P G+ GP G GP+G G G
Sbjct: 371 GATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQG---AQGPAGATGPQGAQGNTGAT 427
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G +G G +G + GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 428 GATGPQGVQGNTGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGAT 475
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/137 (27%), Positives = 49/137 (35%), Gaps = 18/137 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------LGPSGSLRYLGP 60
GP G G +G+ GP G+ GP G GP G+ G
Sbjct: 763 TGPQGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGPQGNTGATGA 822
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+G G +G GP G+ G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 823 TGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---AQGPAGA 879
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP G + G +G
Sbjct: 880 TGATGPQGAQGNTGATG 896
>gi|194679733|ref|XP_001788248.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Bos taurus]
Length = 1429
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 113/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 720 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 778
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 779 ENPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAMRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 833
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ +R+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 834 HGQSVAGMRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 888
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 889 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHPLRFEGQPGQSSLLPRFDGLH 930
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 678 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 736
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 737 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFENPRGQ-----PV 786
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ PSG +R+ GP + +R+ GP G+ +
Sbjct: 787 GGLRFEGGHGPSGAAMRFDGPHGQ-----PSGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGM 841
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 842 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 886
>gi|423477426|ref|ZP_17454141.1| hypothetical protein IEO_02884 [Bacillus cereus BAG6X1-1]
gi|402430429|gb|EJV62506.1| hypothetical protein IEO_02884 [Bacillus cereus BAG6X1-1]
Length = 835
Score = 58.2 bits (139), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 76/205 (37%), Gaps = 12/205 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------------LRYLGPSGSLRYLGP 60
GP+G G +G+ G G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 311 TGPTGATGATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGVTGLTGLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGP 370
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G + GP+G G G + GP+G G G + GP G G G +
Sbjct: 371 QGVMGVTGPTGLQGLQGVQGPVGATGPTGLQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGMQGEQGVMGA 430
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G G + GP G GPSG GP G GP G + GP+G
Sbjct: 431 TGPTGLQGLQGIQGPIGPTGPQGLQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGI 490
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G + + G+
Sbjct: 491 QGIQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQ 515
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/201 (28%), Positives = 78/201 (38%), Gaps = 24/201 (11%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP G GPSG GP G GP G++ GP+G GP G
Sbjct: 444 GPIGPTGPQGLQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGIQGIQGPQGPT--- 500
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G+ G G GP+G GP+G G +G GP+
Sbjct: 501 GPTGATGPQGIQGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGST---GPT 557
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G+ + GP+G GP G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 558 GQAGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGATGATGPTGATGPQGVQGIQGPQG---IV 611
Query: 185 GPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G++ + G+
Sbjct: 612 GPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 632
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G+ GP + GP G G G +GP+G G G
Sbjct: 67 EIGPTGPTGLTGPRGAQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPIGPTGIQGIQGIPG 123
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L S G
Sbjct: 124 PMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSG 183
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 184 LQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQG 243
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 244 IQGV 247
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP G++ GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGIQGIQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQ 515
Query: 74 RYLGPS------------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP+ G + GP+G G +G GP+G+ GP+G
Sbjct: 516 GLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS---TGPTGQAGATGPTG---VT 569
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP G G +G GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 570 GPQGPQGIQGPQGVTGATGATGPTGATGPQGVQGIQGPQGIVGPTGATGVTGITGPQGIQ 629
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 630 GIQGPQG 636
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/210 (27%), Positives = 72/210 (34%), Gaps = 30/210 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 395 TGPTGLQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGMQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGPTGPQGL 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 455 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGIQGIQGPQGP---TGPTGATGPQGI 511
Query: 133 SGRLRYLGPS---------------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+ G GP+G+ GP+G
Sbjct: 512 QGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGQAGATGPTGVTGP 571
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G +G GP+G G+
Sbjct: 572 QGPQGIQGPQGVTGATGATGPTGATGPQGV 601
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.088, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/208 (25%), Positives = 73/208 (35%), Gaps = 33/208 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRY---- 66
GP G + GP+GS G G + G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 228 GPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQAGVTGPTGSATGPTGA 287
Query: 67 -----------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
GP+G G +G+ G G GP+G
Sbjct: 288 TGPTGPPGGPTGPTGPAGSPGGPTGPTGATGATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGVTGLT 347
Query: 104 G---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G
Sbjct: 348 GLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGVQGPVGATGPTGLQGVQGAQ 407
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G G G + GP+G
Sbjct: 408 GPIGPTGPQGIQGMQGEQGVMGATGPTG 435
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.090, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 67/167 (40%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 110 IGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + S G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQAGVTG 276
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 70/183 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G +GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 93 GPQGIQGVQGIQGERGPIGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQ 152
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP+G G G L G G G G + GP+G G
Sbjct: 153 GIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQ 212
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + G +G GP G + GP+G G G + G +G GP+G
Sbjct: 213 GPIGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQA 272
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 273 GVT 275
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/176 (27%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 IGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + G +G GP+G +G+ GP+G
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGS------TGQAGVTGPTG 279
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.63, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/219 (24%), Positives = 73/219 (33%), Gaps = 42/219 (19%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G G + G +G GP G + GP+GS G G + G +G
Sbjct: 199 QAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATG 258
Query: 72 RLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRY---------------------------LGPSGRLR 101
GP+GS GP+G GP+G
Sbjct: 259 LQGDPGPTGSTGQAGVTGPTGSATGPTGATGPTGPPGGPTGPTGPAGSPGGPTGPTGATG 318
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G G GP+G + GP+G GP G + G
Sbjct: 319 ATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGVTGLTGLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGVTG 378
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 379 PTGLQGLQGVQGPVGATGPTGLQGVQGAQGPIGPTGPQG 417
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/218 (24%), Positives = 72/218 (33%), Gaps = 42/218 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+L G G G G + GP+GS G G + G +G
Sbjct: 164 TGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGV 223
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS--- 129
GP G + GP+G G G + G +G GP+G G +G S
Sbjct: 224 QGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQAGVTGPTGSATG 283
Query: 130 ---------------------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G G G GP+G
Sbjct: 284 PTGATGPTGPPGGPTGPTGPAGSPGGPTGPTGATGATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGV 343
Query: 163 ------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP+G GP G + GP+G
Sbjct: 344 TGLTGLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTG 381
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/104 (32%), Positives = 41/104 (39%), Gaps = 6/104 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS GP+G GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 539 TGPTGPQGIQGITGST---GPTGQAGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGATGATGP 592
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G + G +G GP G GP G
Sbjct: 593 TGATGPQGVQGIQGPQGIVGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQG 636
>gi|219666653|ref|YP_002457088.1| collagen [Desulfitobacterium hafniense DCB-2]
gi|219536913|gb|ACL18652.1| Collagen triple helix repeat protein [Desulfitobacterium hafniense
DCB-2]
Length = 606
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 189 TGPAGETGVTGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGA 248
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 249 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGA 308
Query: 133 SGRLRY----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 309 TGPAGEPGGPTGPTGATGATGPAGESG--GPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGATGETG 366
Query: 189 RL 190
Sbjct: 367 AT 368
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 201 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGATGA 260
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-DG 131
G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 261 TGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGEPGGPTG 320
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G P+
Sbjct: 321 PTGATGATGPAGESG--GPTGPTGETGPTGATGETGPTGPTGATGETGATGTFEPNPFAV 378
Query: 192 YL 193
Y+
Sbjct: 379 YV 380
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/168 (25%), Positives = 64/168 (38%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 147 TGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGE 206
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 207 TGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGATGATGPAGE 266
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 267 TGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGE 314
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 10/184 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ G +G+ GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 153 TGPAGET---GATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGA 209
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G +
Sbjct: 210 TGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGATGATGPAGETGA 269
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----LGPSGRLRYLG 185
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 270 TGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGEPGGPTGPTGATGATG 329
Query: 186 PSGR 189
P+G
Sbjct: 330 PAGE 333
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/166 (25%), Positives = 65/166 (39%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP+G G +G G +G+ GP+G G +G G +G+
Sbjct: 147 TGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGAT---GPAGETGATGATGPAGETGVTGATGP 203
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G +G GP+G G +G G +G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 204 AGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGETGATGATGP 263
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 264 AGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGAT 309
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/109 (24%), Positives = 41/109 (37%), Gaps = 6/109 (5%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G GP+G G +G G +G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 147 TGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGATGATGPAGETGVTGATGPAGE 206
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G +G GP+G G +
Sbjct: 207 TGATGATGPAGETGATGATGPAGE------TGATGATGPAGETGVTGAT 249
>gi|423401867|ref|ZP_17379040.1| hypothetical protein ICW_02265 [Bacillus cereus BAG2X1-2]
gi|401652469|gb|EJS70025.1| hypothetical protein ICW_02265 [Bacillus cereus BAG2X1-2]
Length = 835
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 76/205 (37%), Gaps = 12/205 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------------LRYLGPSGSLRYLGP 60
GP+G G +G+ G G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 311 TGPTGATGATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGVTGLTGLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGP 370
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G + GP+G G G + GP+G G G + GP G G G +
Sbjct: 371 QGVMGVTGPTGLQGLQGVQGPVGATGPTGLQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGMQGEQGVMGA 430
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G G + GP G GPSG GP G GP G + GP+G
Sbjct: 431 TGPTGLQGLQGIQGPIGPTGPQGLQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGI 490
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G + + G+
Sbjct: 491 QGIQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQ 515
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/208 (28%), Positives = 74/208 (35%), Gaps = 21/208 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G GPSG GP G GP G + GP+G
Sbjct: 431 TGPTGLQGLQGIQGPIGPTGPQGLQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGI 490
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGR 117
GP G GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 491 QGIQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGI 547
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G G +G GP G GP G G +G GP G GP
Sbjct: 548 QGITGPTGPTGQAGATGPTGVTGPQGPQGIQGPQGVTGATGATGPTGATGPQGVQGIQGP 607
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +GP+G G++ + G+
Sbjct: 608 QG---IVGPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 632
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/191 (29%), Positives = 66/191 (34%), Gaps = 18/191 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GPSG GP G GP G + GP+G GP G GP+G
Sbjct: 449 TGPQGLQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGIQGIQGPQGP---TGPTGA 505
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G GP+G GP G GP+G G +G
Sbjct: 506 TGPQGIQGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGPTGPTGQAGATGP 565
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G GP G G +G GP G GP G + G +G GP
Sbjct: 566 TGVTGPQGPQGIQGPQGVTGATGATGPTGATGPQGVQGIQGPQGIVGPTGATGVTGITGP 625
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
G GP G
Sbjct: 626 QGIQGIQGPQG 636
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G+ GP + GP G G G +GP+G G G
Sbjct: 67 EIGPTGPTGLTGPRGAQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPIGPTGIQGIQGIPG 123
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L S G
Sbjct: 124 PMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSG 183
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 184 LQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQG 243
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 244 IQGV 247
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/199 (28%), Positives = 69/199 (34%), Gaps = 18/199 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 395 TGPTGLQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGMQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGPTGPQGL 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 455 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGAIGPTGPTGIQGIQGPQGP---TGPTGATGPQGI 511
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G GP+G GP G GP+G G +G GP
Sbjct: 512 QGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGPTGPTGQAGATGPTGVTGP 571
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G G +
Sbjct: 572 QGPQGIQGPQGVTGATGAT 590
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/208 (25%), Positives = 73/208 (35%), Gaps = 33/208 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRY---- 66
GP G + GP+GS G G + G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 228 GPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQAGVTGPTGSATGPTGA 287
Query: 67 -----------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
GP+G G +G+ G G GP+G
Sbjct: 288 TGPTGPPGGPTGPTGPAGSPGGPTGPTGATGATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGVTGLT 347
Query: 104 G---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G
Sbjct: 348 GLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGVQGPVGATGPTGLQGVQGAQ 407
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G G G + GP+G
Sbjct: 408 GPIGPTGPQGIQGMQGEQGVMGATGPTG 435
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 67/167 (40%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 110 IGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + S G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQAGVTG 276
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 70/183 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G +GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 93 GPQGIQGVQGIQGERGPIGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQ 152
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP+G G G L G G G G + GP+G G
Sbjct: 153 GIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQ 212
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + G +G GP G + GP+G G G + G +G GP+G
Sbjct: 213 GPIGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQA 272
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 273 GVT 275
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/176 (27%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 IGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + G +G GP+G +G+ GP+G
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGS------TGQAGVTGPTG 279
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.70, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/219 (24%), Positives = 73/219 (33%), Gaps = 42/219 (19%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G G + G +G GP G + GP+GS G G + G +G
Sbjct: 199 QAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATG 258
Query: 72 RLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRY---------------------------LGPSGRLR 101
GP+GS GP+G GP+G
Sbjct: 259 LQGDPGPTGSTGQAGVTGPTGSATGPTGATGPTGPPGGPTGPTGPAGSPGGPTGPTGATG 318
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G G GP+G + GP+G GP G + G
Sbjct: 319 ATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGVTGLTGLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGVTG 378
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 379 PTGLQGLQGVQGPVGATGPTGLQGVQGAQGPIGPTGPQG 417
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/218 (24%), Positives = 72/218 (33%), Gaps = 42/218 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+L G G G G + GP+GS G G + G +G
Sbjct: 164 TGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGQAGPTGSQGIQGEQGPIGSTGATGV 223
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS--- 129
GP G + GP+G G G + G +G GP+G G +G S
Sbjct: 224 QGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQAGVTGPTGSATG 283
Query: 130 ---------------------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G G G GP+G
Sbjct: 284 PTGATGPTGPPGGPTGPTGPAGSPGGPTGPTGATGATGSTGATGATGIQGVQGIQGPTGV 343
Query: 163 ------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP+G GP G + GP+G
Sbjct: 344 TGLTGLQGVQGPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTG 381
>gi|423576727|ref|ZP_17552846.1| hypothetical protein II9_03948, partial [Bacillus cereus MSX-D12]
gi|401207723|gb|EJR14502.1| hypothetical protein II9_03948, partial [Bacillus cereus MSX-D12]
Length = 333
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/166 (31%), Positives = 66/166 (39%), Gaps = 6/166 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 174 GPAGATGPQGPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQ 233
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G GP G GP+G GP G GP+G + G G GP+
Sbjct: 234 GVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQG---VQGPA 287
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 288 GATGATGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQG 333
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/163 (31%), Positives = 65/163 (39%), Gaps = 9/163 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ G G
Sbjct: 174 GPAGATGPQGPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQ 233
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP+G GP G GP+G GP G GP+G G +G GP+
Sbjct: 234 GVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGVQGPA 287
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 288 GATGATGPQG---IQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATG 327
>gi|228986436|ref|ZP_04146572.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar tochigiensis BGSC 4Y1]
gi|228773257|gb|EEM21687.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar tochigiensis BGSC 4Y1]
Length = 824
Score = 57.8 bits (138), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/195 (27%), Positives = 77/195 (39%), Gaps = 3/195 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + G G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 489 IGPTGAIGLQGVQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGP 548
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G + G +G G G G G +G G GP
Sbjct: 549 QGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGP 608
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGR 189
+G G G GP G G +G +GP+G GP G + G +G
Sbjct: 609 TGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGPIGAVGPIGATGSAGS 668
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGL 204
+ +LG++ +GL
Sbjct: 669 IGFLGIAGATGATGL 683
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 66/167 (39%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ G G +GP+G+ G G GP+G GP G+L
Sbjct: 481 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGVQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNL 540
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G GP G + G +G G G + G G +G
Sbjct: 541 GENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQ 600
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G G G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 601 GSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGA 647
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 60/158 (37%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G+ GP G +GP+G++ G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 474 TGPQGA---QGPQGVQGIIGPTGAIGLQGVQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGA 530
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G L G +G G G GP G + + G +G G G G
Sbjct: 531 QGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGI 590
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G GP+G G G GP G
Sbjct: 591 QGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQG 628
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 69/190 (36%), Gaps = 2/190 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 435 TGPTGVQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 494
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 495 IGLQGVQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 554
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G + G +G G G G G +G G GP+G
Sbjct: 555 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 614
Query: 193 LGL--SDGLR 200
G+ S G++
Sbjct: 615 TGIQGSQGIQ 624
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/151 (29%), Positives = 65/151 (43%), Gaps = 8/151 (5%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 8 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGSQGPQGIRGIQGPRG---TTGA 62
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G +G GP+G GP G + GP+G + G G +GP+G
Sbjct: 63 QGIQGAIGNTGEQGVTGPTGL---QGPQGLIGNQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGI 119
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G G+ G G + G++
Sbjct: 120 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGIT 150
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 67/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G+ GP G GP G G G++ G +G GP
Sbjct: 28 GPVGPTGVTGPTGATGSQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGAIGNTGEQGVTGPTGLQGPQ 87
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP+G + G G +GP+G GP G +G G+ G G +
Sbjct: 88 GLIGNQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEA 147
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G G G G G G +G + G G +GP+G
Sbjct: 148 GITGVTGPQGSQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGIVGPTG 205
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 67/184 (36%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G G +G G G G +G GP G +GP+G+
Sbjct: 435 TGPTGVQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 494
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ G G +GP+G G G GP+G GP G L +G +G G
Sbjct: 495 IGLQGVQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGPQGVQGA 554
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G GP G + G +G G G G G +G G G + V
Sbjct: 555 QGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMGIQGSTGMTGPTGATGV 614
Query: 202 SGLH 205
+G+
Sbjct: 615 TGIQ 618
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/150 (28%), Positives = 63/150 (42%), Gaps = 8/150 (5%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 8 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGSQGPQGIRGIQGPRG---TTGA 62
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G +G GP+G GP G + GP+G + G G +GP+G
Sbjct: 63 QGIQGAIGNTGEQGVTGPTG---LQGPQGLIGNQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGI 119
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP G +G G+ G+ + +G+
Sbjct: 120 QGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGI 149
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 11/188 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRY 66
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 11 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGSQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGA 68
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G +G GP+G GP G + GP+G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 69 IGNTGEQGVTGPTG---LQGPQGLIGNQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGI 125
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G+ G G + G +G G G G G G G G
Sbjct: 126 QGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGI 185
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G + G
Sbjct: 186 TGEQGHQG 193
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G GP G + GP+G + G G +GP+G
Sbjct: 59 TTGAQGIQGAIGNTGEQGVTGPTG---LQGPQGLIGNQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAG 115
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G +G G+ G G + G +G G G G G G
Sbjct: 116 SQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEDGTTGIQG 175
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G G G G +G + GPSG
Sbjct: 176 EEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGIVGPTGSTGPQGSQGISGIKGITGVIGPQGPSGIQG 235
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 236 IQGIN 240
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/168 (27%), Positives = 63/168 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G + G G +GP+GS GP G +G G G G + G +G
Sbjct: 92 NQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITG 151
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G G G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 152 VTGPQGSQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGIVGPTGSTGPQG 211
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G + GPSG G +G + G G G +G
Sbjct: 212 SQGISGIKGITGVIGPQGPSGIQGIQGINGSTGFQGAKGTRGITGVTG 259
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/174 (27%), Positives = 65/174 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP+G + G G +GP+GS GP G +G G+ G G +
Sbjct: 85 GPQGLIGNQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVI 144
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G G G G G G +G G G +GP+
Sbjct: 145 GEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGIVGPT 204
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G +G + GPSG G +G + G G G++
Sbjct: 205 GSTGPQGSQGISGIKGITGVIGPQGPSGIQGIQGINGSTGFQGAKGTRGITGVT 258
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 68/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G GP G + GP+G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 69 IGNTGEQGVTGPTG---LQGPQGLIGNQGPTGDIGVQGLEGVQGAIGPAGSQGIQGPQGI 125
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G + G +G G G G G G G G
Sbjct: 126 QGEIGERGQTGAQGMQGVIGEAGITGVTGPQGSQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGI 185
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G G G G +G + GPSG G +G +
Sbjct: 186 TGEQGHQGDQGIQGIVGPTGSTGPQGSQGISGIKGITGVIGPQGPSGIQGIQGINGSTGF 245
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 246 QG 247
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/154 (27%), Positives = 62/154 (40%), Gaps = 10/154 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLG 68
NLG +G G G+ GP G +G +G G +G + G G +G
Sbjct: 539 NLGENGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNIGATGVTGETGATGEVGATGAQGIQGVQGIMG 598
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G GP+G+ G G GP G G +G +GP+G GP +
Sbjct: 599 IQGSTGMTGPTGATGVTGIQGSQGIQGPQGPTGARGATGVSGSVGPAGAQGSQGP---IG 655
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-PSG 161
+ GP + G +G + +LG +G G PSG
Sbjct: 656 AVGP---IGATGSAGSIGFLGIAGATGATGLPSG 686
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/201 (24%), Positives = 71/201 (35%), Gaps = 21/201 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G + + G G + G +G+ GP G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 346 GAVGFQGAQGPQGFQGITGATGVEGPQGIQGPQGAIGPTGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQ 405
Query: 74 RYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G G
Sbjct: 406 GMQGLQGIQGPTGVAGAAGAQGAQGIQGATGPTGVQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQ 465
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G +G + GP G +GP+G + G G +GP+G G G
Sbjct: 466 GIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGVQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGIT 525
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G L G++
Sbjct: 526 GPTGAQGIRGPQGNLGENGIT 546
>gi|423604663|ref|ZP_17580556.1| hypothetical protein IIK_01244, partial [Bacillus cereus VD102]
gi|401245283|gb|EJR51641.1| hypothetical protein IIK_01244, partial [Bacillus cereus VD102]
Length = 318
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/196 (31%), Positives = 79/196 (40%), Gaps = 25/196 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G G +G+ GP+G GP G+ GP+G GP
Sbjct: 4 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGTQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQ 60
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 61 G---IQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 114
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 115 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGA---QGPVGATGATGPQ 165
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSG 203
G G + G+ V+G
Sbjct: 166 GVQGPTGAT-GIGVTG 180
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/177 (33%), Positives = 74/177 (41%), Gaps = 29/177 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 34 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGNTGAT 84
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 85 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQ 135
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 136 G---VQGPAGATGATGPQGA---QGPVGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 183
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/115 (33%), Positives = 48/115 (41%), Gaps = 17/115 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 84 TGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG- 136
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 125
GP+G+ GP G GP G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 137 --VQGPAGATGATGPQGA---QGPVGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 183
>gi|351696038|gb|EHA98956.1| Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Heterocephalus glaber]
Length = 1550
Score = 57.8 bits (138), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/215 (32%), Positives = 99/215 (46%), Gaps = 71/215 (33%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G +R+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-MRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
LR+ GP + P G LR+ G P GSLR+ GP G+ P G LR+ P G+
Sbjct: 863 LRFEGPG-----VQPVGGLRFEGHRGQPVGSLRFEGPHGQ-----PVGGLRFDNPRGQ-- 910
Query: 111 YLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 159
P G LR+ GPSG G +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 911 ---PVGGLRFEGGHGPSG--------GAIRFDGPHGQPGSGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 160 SGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
G+ LR+ G +LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 960 HGQSVGGLRFEGQHNQLRFDGPHGQPGVGIRFDGP 994
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/192 (34%), Positives = 95/192 (49%), Gaps = 50/192 (26%)
Query: 37 LRYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
LR+ GP G+ LR+ GP G LR+ G R+ G G +R+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-MRFEGSAGG 862
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLNSDGPS 133
LR+ GP + P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPG-----VQPVGGLRFEGHRGQPVGSLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 134 GRLRYL---GPS-GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 177
G LR+ GPS G +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGGAIRFDGPHGQPGSGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVGGLRFEGQ 972
Query: 178 SGRLRYLGPSGR 189
+LR+ GP G+
Sbjct: 973 HNQLRFDGPHGQ 984
>gi|417406669|gb|JAA49981.1| Putative mrna cleavage and polyadenylation factor i/ii complex
subunit pcf11 [Desmodus rotundus]
Length = 1684
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/222 (35%), Positives = 113/222 (50%), Gaps = 52/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +GSLR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 976 FRFEGSPG-LRFEGSAGSLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1034
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1035 DNPRGQPIGGLRFEGGHGPSGPAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFDGP 1089
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GP
Sbjct: 1090 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPVPG 1144
Query: 161 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1145 GGLRIEGPLGQGGPRFDG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1185
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/201 (34%), Positives = 99/201 (49%), Gaps = 57/201 (28%)
Query: 37 LRYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
LR+ GP + LR+ GP G LR+ G R+ G G LR+ G +GS
Sbjct: 934 LRFEGPQSQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGS 992
Query: 82 LRYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYL---G 122
LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ LR+ G
Sbjct: 993 LRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQPIGGLRFEGGHG 1052
Query: 123 PSG-RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPS---- 169
PSG + DGP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 1053 PSGPAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFDGPHGQSVAGLRFEGQHNQLG 1107
Query: 170 GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 1108 GNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 1128
>gi|49477241|ref|YP_035673.1| hypothetical protein BT9727_1339 [Bacillus thuringiensis serovar
konkukian str. 97-27]
gi|49328797|gb|AAT59443.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis serovar konkukian
str. 97-27]
Length = 712
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 15/182 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP GP G
Sbjct: 309 GPQGPAGATGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ------GPQGPA 362
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G GP G GP+G G G G +G + GP+
Sbjct: 363 GATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPA 422
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP+G GP G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 423 G---ATGATGAQGAQGPAG---ATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGVQGPAGATGAT 473
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 474 GA 475
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 12/176 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP G G +G+ GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 299 AGATGATGAQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQG- 357
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
P G G +G GP+G GP G GP+G G +G + GP
Sbjct: 358 -----PQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGP 409
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G G +G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 410 AGATGATGAQGPAGATGATGAQGAQGPAG---ATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQG 462
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 12/174 (6%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ GP G G +G GP+G+ GP G GP+G GP
Sbjct: 299 AGATGATGAQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ-- 356
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G G +G GP+G GP G GP+G + G G G
Sbjct: 357 ----GPQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGA 412
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+G GP+G G +G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 413 TGATGAQGPAG---ATGATGAQGAQGPAG---ATGPQGPQGIQGPAGATGATGA 460
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ GP+G+ GP G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 357 GPQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGAT 416
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ G G GP G GP+G G G G +G +
Sbjct: 417 GAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGAQ 476
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G +G GP+G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 477 GAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPAGATGPQGPQG 534
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP GP G G +G
Sbjct: 317 TGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ------GPQGPAGATGATGA 370
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G G +G GP+G G G + G
Sbjct: 371 QGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPAGATGA 427
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 428 TGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGA 487
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 488 TGA 490
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/192 (27%), Positives = 68/192 (35%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G P G G +G GP+G
Sbjct: 327 GPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQG------PQGPAGATGATGAQGAQGPAGAT 380
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G G +G GP+G G G G +G + GP+
Sbjct: 381 GATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPAGATGATGAQGAQGPA 437
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G G +G GP+G G G
Sbjct: 438 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPA 497
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + G
Sbjct: 498 GATGATGAQGAQ 509
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 65/175 (37%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G+ GP G G +G+ GP+G GP G GP+G+ GP
Sbjct: 299 AGATGATGAQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ-- 356
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G +G GP+G GP G GP+G G +G GP
Sbjct: 357 ----GPQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGP 409
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G G +G GP+G GP G G + G+
Sbjct: 410 AGATGATGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQ 464
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G GP G GP+G+ G G G +G+ GP+G G G
Sbjct: 375 GPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPAGATGATGAQGAQ 434
Query: 73 --LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP+G G +G GP+G G G G +G +
Sbjct: 435 GPAGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQ 491
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G +G GP+G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 492 GAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQG 549
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/197 (27%), Positives = 74/197 (37%), Gaps = 14/197 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G+ GP+G GP G GP+G G +G
Sbjct: 408 GPAGATGATGAQGPAGATGATGAQGAQGPAG---ATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQ 461
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G G +G G G G +G GP+G + G
Sbjct: 462 GVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQ 521
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 188
G GP G GP+G GP G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 522 GPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPAGTP 581
Query: 189 ---RLRYLGLSDGLRVS 202
+ +G S+ +S
Sbjct: 582 IPVTIAAIGNSNAQTIS 598
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 24/193 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG------------------RLRYLGPSGSL 55
GP+G G G GP+G+ GP G G +G+
Sbjct: 246 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGATGAQGAQGPAGATGAT 305
Query: 56 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G GP G P
Sbjct: 306 GAQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQG------PQ 359
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G +G + GP+G GP G GP+G G G G +G
Sbjct: 360 GPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQ 419
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G G
Sbjct: 420 GPAGATGATGAQG 432
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 70/203 (34%), Gaps = 24/203 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG----------- 62
GP+G GP G GP+G+ G G GP+G+ GP G
Sbjct: 231 GPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGAT 287
Query: 63 -------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G +G GP G G +G GP+G GP G GP+
Sbjct: 288 GATGAQGAQGPAGATGATGAQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPA 347
Query: 116 GRLRYL---GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G GP G + G +G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 348 GATGATGPQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQ 407
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G GP+G G
Sbjct: 408 GPAGATGATGAQGPAGATGATGA 430
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP GP G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 335 TGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ------GPQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGP 388
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G G G G +G GP+G GP
Sbjct: 389 QGIQGPAGA---TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGP 445
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G G G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 446 QG---IQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGA 502
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 503 TGA 505
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 398 TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGAT---GPQGPQGIQGPAG- 453
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G G G +G G G G +G + GP
Sbjct: 454 --ATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGP 511
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 512 AGATGATGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAG---ATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQG 564
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/198 (27%), Positives = 68/198 (34%), Gaps = 30/198 (15%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 218 AGATGATGPQG---VQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGP 271
Query: 76 LGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP G + G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 272 QGPQGIQGPAGATGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGT 331
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G GP+G GP GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 332 TGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ------GPQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGP 385
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP+G G
Sbjct: 386 QGPQGIQGPAGATGATGA 403
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/197 (25%), Positives = 64/197 (32%), Gaps = 42/197 (21%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS---------------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GP+G+ GP G G + G+ GP G GP+G
Sbjct: 183 GPAGATGATGPQGPAGAQGATGPQGPQGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGAQ 239
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------RL 118
GP G GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 240 GPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGATGAQGAQ 296
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G +G + GP G G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 297 GPAGATGATGAQGPQGPAGATGATGAQGAQGPAGTTGATGPQGPQGVQGPAGATGATGPQ 356
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP+G G
Sbjct: 357 GP---QGPAGATGATGA 370
>gi|414563750|ref|YP_006042711.1| collagen-like protein [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC
35246]
gi|338846815|gb|AEJ25027.1| collagen-like protein [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC
35246]
Length = 337
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/173 (32%), Positives = 65/173 (37%), Gaps = 9/173 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 100 GPQGETGPAGPAGPQ---GPRGETGPAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPAGQPGAQGPKGDK 156
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 157 GDKGDTGAT---GPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPK 210
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 211 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGP 263
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 61/166 (36%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP+G GP G GP+G G +G GP+G+ GP G
Sbjct: 100 GPQGETGPAGPAGPQ---GPRGETGPAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPAGQPGAQGPKGDK 156
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 157 GDKGDTG---ATGPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPK 210
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 211 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKG 256
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 58/158 (36%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G GP G
Sbjct: 100 GPQGETGPAGPAG---PQGPRGETGPAGPAGQQGQPGEAGPAGPQGPAGQPGAQGPKGDK 156
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 157 GDKGDTG---ATGPKGDTGATGPQG---PAGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPK 210
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 211 GDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGE 248
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/119 (31%), Positives = 39/119 (32%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 155 DKGDKGDTGATGPKGDTGATGPQGPA---GPKGERGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKG 211
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP G GP G GP G GP G GP D
Sbjct: 212 DRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGDRGEQGPKGERGEQGPKGDRGEQGPKKEPEKD 270
>gi|281339636|gb|EFB15220.1| hypothetical protein PANDA_014947 [Ailuropoda melanoleuca]
Length = 1652
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/222 (35%), Positives = 113/222 (50%), Gaps = 53/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 943 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1001
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1002 DNPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1056
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1057 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1111
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1112 GGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGL 1152
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 901 LRFEGPQGQLGSGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 959
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 960 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 1009
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 1010 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1064
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1065 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1109
>gi|417413858|gb|JAA53239.1| Putative mrna cleavage and polyadenylation factor i/ii complex
subunit pcf11, partial [Desmodus rotundus]
Length = 1489
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/222 (35%), Positives = 113/222 (50%), Gaps = 52/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +GSLR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 781 FRFEGSPG-LRFEGSAGSLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 839
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 840 DNPRGQPIGGLRFEGGHGPSGPAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFDGP 894
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GP
Sbjct: 895 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPVPG 949
Query: 161 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 950 GGLRIEGPLGQGGPRFDG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 990
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/201 (34%), Positives = 99/201 (49%), Gaps = 57/201 (28%)
Query: 37 LRYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
LR+ GP + LR+ GP G LR+ G R+ G G LR+ G +GS
Sbjct: 739 LRFEGPQSQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGS 797
Query: 82 LRYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYL---G 122
LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ LR+ G
Sbjct: 798 LRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQPIGGLRFEGGHG 857
Query: 123 PSG-RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPS---- 169
PSG + DGP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 858 PSGPAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFDGPHGQSVAGLRFEGQHNQLG 912
Query: 170 GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 913 GNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 933
>gi|359322346|ref|XP_533992.4| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Canis lupus
familiaris]
Length = 1374
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 113/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 665 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 723
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 724 DNPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 778
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 779 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 833
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 834 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 875
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 623 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 681
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 682 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 731
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 732 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 786
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 787 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 831
>gi|296216935|ref|XP_002754799.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11-like [Callithrix
jacchus]
Length = 1825
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 80/223 (35%), Positives = 112/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 1116 FRFEG-SPSLRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1174
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1175 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1229
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1230 HGQSVSGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1284
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1285 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1326
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/220 (35%), Positives = 108/220 (49%), Gaps = 62/220 (28%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
LR+ GP G LR+ GP G LR+ G R+ G S SLR+ G +G
Sbjct: 1074 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEG-SPSLRFEGSAGG 1132
Query: 64 LRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P G LR+
Sbjct: 1133 LRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PVGGLRF 1187
Query: 112 L---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 159
GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 1188 EGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVSGLRFEGQ 1242
Query: 160 S----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1243 HNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1282
>gi|410972561|ref|XP_003992727.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: pre-mRNA cleavage complex 2 protein
Pcf11 [Felis catus]
Length = 1562
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 113/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 853 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 911
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 912 DNPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 966
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 967 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1021
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1022 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1063
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 811 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 869
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 870 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 919
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 920 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 974
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 975 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1019
>gi|194213385|ref|XP_001917240.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Equus caballus]
Length = 1521
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/223 (34%), Positives = 113/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G +R+ GP G+ LR+
Sbjct: 812 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGIRFEGPHGQPVGGLRF 870
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 871 DNPRGQPVGGLRFEGAHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 925
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 926 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 980
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 981 GGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1022
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 770 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 828
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G +R+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 829 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGIRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 878
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 879 GGLRFEGAHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 933
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 934 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 978
>gi|414564528|ref|YP_006043489.1| collagen-like protein with amino-end fibronectin-binding domain
SclZ.9 [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC
35246]
gi|338847593|gb|AEJ25805.1| collagen-like protein with amino-end fibronectin-binding domain
SclZ.9 [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC
35246]
Length = 623
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 55/158 (34%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G G G+ G +G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 369 GPKGDPGKPGPRGEN---GKDGAPGRDGQNGKDGQPGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 425
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 426 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 485
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 486 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 523
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 55/158 (34%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G G G+ G +G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 369 GPKGDPGKPGPRGEN---GKDGAPGRDGQNGKDGQPGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 425
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 426 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 485
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 486 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 523
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/176 (32%), Positives = 60/176 (34%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP G GP G GP G G GR G +G+
Sbjct: 345 GPKGDTGKDGEPGKPGIPGPQG---LPGPKGDPGKPGPRGENGKDGAPGR---DGQNGKD 398
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 399 GQPGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 458
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 459 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 514
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 57/167 (34%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G G G GP G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 327 GPAGPQGPRGDKGETGEKGPKGDTGKDGEPGKPGIPGPQG---LPGPKGDPGKPGPRGEN 383
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G GR G +G+ GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 384 GKDGAPGR---DGQNGKDGQPGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 440
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 441 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 487
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 56/173 (32%), Gaps = 18/173 (10%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---- 87
GP+G G G GP G G G+ GP G GP G GP
Sbjct: 327 GPAGPQGPRGDKGETGEKGPKGDTGKDGEPGKPGIPGPQG---LPGPKGDPGKPGPRGEN 383
Query: 88 -----------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
+G+ GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 384 GKDGAPGRDGQNGKDGQPGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 443
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 444 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 496
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 57/159 (35%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP+G G G+ GP+G G G GP G G G+
Sbjct: 302 AGPKGEPGARGPAGEKGEPGKPGAR---GPAGPQGPRGDKGETGEKGPKGDTGKDGEPGK 358
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G GP G G GR DG +G+ GP G GP
Sbjct: 359 PGIPGPQG---LPGPKGDPGKPGPRGENGKDGAPGR---DGQNGKDGQPGPQGERGEQGP 412
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 413 QGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 451
>gi|87882926|emb|CAJ58482.1| hypothetical protein BA_2450 [Bacillus anthracis]
Length = 215
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/165 (26%), Positives = 60/165 (36%), Gaps = 24/165 (14%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP------------------------SG 134
GP+G GP+G GP+G + GP +G
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAG 152
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 ATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 197
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/165 (26%), Positives = 60/165 (36%), Gaps = 24/165 (14%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------------------------SG 143
GP+G GP+G + GP+G GP +G
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAG 152
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 ATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 197
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/165 (26%), Positives = 59/165 (35%), Gaps = 24/165 (14%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 92
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------------SG 125
GP+G GP+G GP+G GP +G
Sbjct: 93 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAG 152
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 153 ATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 197
>gi|152976105|ref|YP_001375622.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cytotoxicus NVH
391-98]
gi|152024857|gb|ABS22627.1| Collagen triple helix repeat [Bacillus cytotoxicus NVH 391-98]
Length = 842
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G GP
Sbjct: 532 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA---TGPQGPQGIQGP 588
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP G GP+G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 589 TG---ATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGIQGPTGATGP 645
Query: 130 DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 646 QGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGIQGPTGATGPQGP 705
Query: 187 SGRL 190
+G
Sbjct: 706 TGAT 709
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 487 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA 546
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 547 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGIQGP 603
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 604 TGATGPQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTGATGP 660
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 661 QGPQG 665
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 21/183 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 156 TIGPTGATGPTGPQGPQGVQGPTGAT---GPQGPQGVQGPTGAT---GPQGPQGVQGPTG 209
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 210 ---ATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGIQGPTGATGPQG 260
Query: 132 P---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
P G GP G GP+G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 261 PQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQG 320
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 321 PQG 323
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 472 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA 531
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 532 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGIQGP 588
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G GP G GP+G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 589 TGATGPQGPQG---IQGPTGATGPQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGIQGPTGATGP 645
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 646 QGPQG 650
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 517 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA 576
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 577 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGI 636
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 637 QGPTGATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGI 693
Query: 184 LGPSGRL 190
GP+G
Sbjct: 694 QGPTGAT 700
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 256 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA 315
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 316 TGPQGPQGVQGPTGA---TGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGIQGPTGATGPTGPQGI 369
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 370 QGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGP 429
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 430 QGPQG 434
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 226 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGA 285
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 286 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGVQGP 342
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G GP G GP+G GP G G G GP G GP+G
Sbjct: 343 TGATGPQGPQG---IQGPTGATGPTGPQGIQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGP 399
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 400 QGPQG 404
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 286 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGA 345
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--- 123
GP G GP+G+ GP G G G GP G GP+G GP
Sbjct: 346 TGPQGPQGIQGPTGATGPTGPQGIQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGV 405
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 406 QGPTGATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTGATGP 459
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 460 QGPQG 464
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G G
Sbjct: 316 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPTGPQGIQGPQGI 375
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 376 QGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTGATGP 429
Query: 130 DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 430 QGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGP 489
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 490 QGPQG 494
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/193 (31%), Positives = 71/193 (36%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 427 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA 486
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 487 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGIQGP 543
Query: 124 SGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 544 TGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGP 603
Query: 178 SGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G
Sbjct: 604 TGATGPQGPTGAT 616
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G GP
Sbjct: 301 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGAT---GPQGPQGIQGP 357
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP G G G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 358 TGATGPTGPQGIQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTGATGP 414
Query: 130 DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 415 QGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGP 474
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 475 QGPQG 479
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 331 TGPQGPQGVQGPTGAT---GPQGPQGIQGPTGATGPTGPQGIQGPQGIQGPTGATGPQGP 387
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 388 QGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTGATGP 444
Query: 130 DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 445 QGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGP 504
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 505 QGPQG 509
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 346 TGPQGPQGIQGPTGATGPTGPQGIQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGP 402
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 403 QGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTGATGP 459
Query: 130 DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 460 QGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGP 519
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 520 QGPQG 524
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/191 (31%), Positives = 70/191 (36%), Gaps = 18/191 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 166 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA 225
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 226 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGVQGP 282
Query: 124 SGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 283 TGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGP 342
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
+G GP G
Sbjct: 343 TGATGPQGPQG 353
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/190 (31%), Positives = 69/190 (36%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 211 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGA 270
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 271 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGVQGP 327
Query: 124 SGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G GP G GP G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 328 TGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPTGPQGIQGPQGIQGPTGATGPQGP 387
Query: 181 LRYLGPSGRL 190
GP+G
Sbjct: 388 QGIQGPTGAT 397
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/191 (31%), Positives = 70/191 (36%), Gaps = 18/191 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 397 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGA 456
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 457 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGIQGP 513
Query: 124 SGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 514 TGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGP 573
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
+G GP G
Sbjct: 574 TGATGPQGPQG 584
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/185 (32%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 21/185 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 196 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGA 255
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 256 TGPQGPQGVQGPTGA---TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGP 312
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 313 TGATGPQGPQG---VQGPTG---ATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGIQGPTGATGP 363
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 364 TGPQG 368
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/191 (31%), Positives = 70/191 (36%), Gaps = 18/191 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 382 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGA 441
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 442 TGPQGPQGVQGPTGA---TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGP 498
Query: 124 SGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 499 TGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGP 558
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
+G GP G
Sbjct: 559 TGATGPQGPQG 569
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/191 (31%), Positives = 70/191 (36%), Gaps = 18/191 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRY 66
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 412 TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGA 471
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 472 TGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTG---ATGPQGPQGIQGP 528
Query: 124 SGRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+G GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 529 TGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGP 588
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
+G GP G
Sbjct: 589 TGATGPQGPQG 599
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/187 (32%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP
Sbjct: 377 GPTGAT---GPQGPQGIQGPTGA---TGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQ 430
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G GP+G+ GP G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 431 GPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTGATGPQGPQGVQGPTG---ATGPQGPQGIQGPTGAT 487
Query: 128 NSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 488 GPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGATGPQGPQGIQGPTGAT 547
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 548 GPQGPQG 554
>gi|301780044|ref|XP_002925437.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11-like [Ailuropoda
melanoleuca]
Length = 1554
Score = 57.0 bits (136), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 113/223 (50%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 845 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 903
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 904 DNPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 958
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 959 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1013
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1014 GGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1055
Score = 56.6 bits (135), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 106/225 (47%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 803 LRFEGPQGQLGSGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 861
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 862 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 911
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 912 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 966
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 967 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1011
>gi|196039119|ref|ZP_03106426.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus NVH0597-99]
gi|196030264|gb|EDX68864.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus NVH0597-99]
Length = 590
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 117 AGATGATGPQGPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQG- 175
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G G +G G G GP G GP+G GP
Sbjct: 176 --VQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGP 233
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G GP G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 234 QGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGA 290
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 291 TGA 293
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 145 GPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQ 204
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 205 GAQGPAGAT---GPQGPQGIQGPAGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQ 261
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G +G G G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 262 GPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGAT 321
Query: 191 RYLGL 195
G
Sbjct: 322 GATGA 326
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 64/173 (36%), Gaps = 9/173 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP GP+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 115 GPAGATGATGPQ------GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 168
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP+G G G G +G G G + GP G GP+
Sbjct: 169 GATGPQG---VQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPA 225
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP G G +G G G GP G GP+G G
Sbjct: 226 GATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGA 278
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/192 (28%), Positives = 66/192 (34%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G P+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 115 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 168
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G G G G +G G G GP G GP+
Sbjct: 169 GATGPQG---VQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPA 225
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G GP+G G G
Sbjct: 226 GATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPA 285
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + G
Sbjct: 286 GATGATGAQGAQ 297
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 127 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 183
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ G +G G G GP G GP+G GP G G +
Sbjct: 184 GATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQGVQGPAGAT 243
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 244 GATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGAT 303
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 304 GAT 306
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 135 TGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGAQGA 191
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G GP G GP+G GP G G +G + G
Sbjct: 192 QGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGA 251
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 252 QGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQG 310
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 65/182 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 253 GPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQ 312
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G G +G G G G +G GP+G + G
Sbjct: 313 GIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQ 372
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G G G GP+G G G GP G GP+G
Sbjct: 373 GAQGPAGATGATGAQGAQGPQGIQGPAGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGAT 432
Query: 194 GL 195
G
Sbjct: 433 GA 434
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/192 (28%), Positives = 69/192 (35%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ G G G +G+ G G GP G
Sbjct: 163 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQ 219
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G G G GP G GP+G + G
Sbjct: 220 GIQGPAGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQ 279
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G G +G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 280 G---AQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPA 333
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + G
Sbjct: 334 GATGATGAQGTQ 345
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/179 (27%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP+G+ G G+ G +G GP+G+ GP G GP
Sbjct: 258 TGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGP 317
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G+ G +G G G G +G GP+G G G
Sbjct: 318 AGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGAQGP 377
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G GP+G G G GP G GP+G G G
Sbjct: 378 AGATGATGAQGAQGPQGIQGPAGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQG 436
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ G +G+ GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 228 TGPQGPQGVQGPAGAT---GATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGP 284
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G GP G GP+G G G G +G + G
Sbjct: 285 AGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGT 344
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP+G G G G +G G G GP+G
Sbjct: 345 QGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPQGIQGPAGATGA 404
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 405 QGA 407
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/176 (27%), Positives = 61/176 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 243 TGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGA 302
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G G G G +G G G G +G + GP
Sbjct: 303 TGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGTQGP 362
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G G +G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 363 AGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPQGIQGPAGATGAQGAQGPAGATGPQG 418
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G+ G +G+ G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 178 GPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQGVQ 237
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLNSD 130
G +G+ G G GP G GP+G G G G +G +
Sbjct: 238 GPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQ 297
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 298 GPAGATGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGPAG---ATGATGAQGTQGPAGAT 351
Query: 191 RYLGL 195
G
Sbjct: 352 GATGA 356
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP+G+ GP G GP+G G +G+ GP+G GP G
Sbjct: 213 TGPQGPQGIQGPAGAT---GPQGPQGVQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGI 266
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G G +G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 267 QGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGA 326
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 327 QGAQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGTQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGA 383
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 384 TGA 386
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G+ G +G G G GP G GP+G
Sbjct: 168 TGATGPQGVQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGA 227
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G G +G GP+G GP G G +G + G
Sbjct: 228 T---GPQGPQGVQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGA 281
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP+G GP G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 282 QGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGA 338
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 339 TGA 341
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 66/189 (34%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ G G+ GP G GP+G+ GP G G
Sbjct: 183 TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGPQGPQGVQGPAGA 242
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G G GP G GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 243 TGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGA 302
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G GP+G G G G +G G G G +G GP
Sbjct: 303 TGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGTQGP 362
Query: 187 SGRLRYLGL 195
+G G
Sbjct: 363 AGATGATGA 371
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 65/175 (37%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G+ GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 238 GPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQ 294
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G G G G +G G G + G +
Sbjct: 295 GAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGAT 354
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G G +G G G GP+G G G
Sbjct: 355 GAQGTQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPQGIQGPAGATGAQGAQG 409
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 66/166 (39%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G+ GP+G+ GP G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 283 GPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGA---TGATGAQGAQGPAG-- 334
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G G G G +G G G G +G + GP
Sbjct: 335 -ATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGTQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPQ 393
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 394 GIQGPAGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQG 439
>gi|348565557|ref|XP_003468569.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11-like [Cavia
porcellus]
Length = 1553
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/216 (33%), Positives = 102/216 (47%), Gaps = 69/216 (31%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G +R+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGAPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-MRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P+G LR+ G P GSLR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PAGGLRFEGHRGQPVGSLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVGGL 967
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
R+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 968 RFEGQHNQL-----GGNLRFDGPHGQPGVGIRFEGP 998
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/222 (35%), Positives = 111/222 (50%), Gaps = 52/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G +R+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P GSLR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-MRFEGSAGGLRFEGPGGQPAGGLRFEGHRGQPVGSLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GP
Sbjct: 960 HGQSVGGLRFEGQHNQL-----GGNLRFDGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPVPG 1014
Query: 161 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1055
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/196 (34%), Positives = 97/196 (49%), Gaps = 54/196 (27%)
Query: 37 LRYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
LR+ GP G+ LR+ GP G LR+ G R+ G G +R+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGAPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-MRFEGSAGG 862
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLNSDGPS 133
LR+ GP G+ P+G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PAGGLRFEGHRGQPVGSLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 134 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 177
G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVGGLRFEGQ 972
Query: 178 S----GRLRYLGPSGR 189
G LR+ GP G+
Sbjct: 973 HNQLGGNLRFDGPHGQ 988
>gi|315647409|ref|ZP_07900518.1| hypothetical protein PVOR_18859 [Paenibacillus vortex V453]
gi|315277201|gb|EFU40534.1| hypothetical protein PVOR_18859 [Paenibacillus vortex V453]
Length = 999
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/192 (25%), Positives = 74/192 (38%), Gaps = 27/192 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------- 64
GP+G G +G+ GP+G++ GP + G +GS GP+G
Sbjct: 739 TGPTGITGVTGATGAAGVTGPAGAIGATGP---IGVTGNTGSTGVTGPTGATGTAGVTGP 795
Query: 65 -------------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G +G G +G G +G GP+G +G +G
Sbjct: 796 TGLTGGTGSTGPTGAIGATGVTGATGVTGLAGPTGITGATGITGPTGVTGAIGLTGNTGP 855
Query: 112 LGPSGR---LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP+G S G +G + G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 856 TGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTGAIGATGSTGATGVTGPTGSTGVTGATGITGVTGP 915
Query: 169 SGRLRYLGPSGR 180
+G + G +G
Sbjct: 916 TGPIGVTGNTGA 927
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/209 (23%), Positives = 78/209 (37%), Gaps = 30/209 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ G P+G G +G GP+G++ GP + G
Sbjct: 718 TGSTGVTGSTGPTGATGVTGLTGPTGITGVTGATGAAGVTGPAGAIGATGP---IGVTGN 774
Query: 70 SGRLRYLGPSGSL---------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+G GP+G+ +G +G G +G G +G
Sbjct: 775 TGSTGVTGPTGATGTAGVTGPTGLTGGTGSTGPTGAIGATGVTGATGVTGLAGPTGITGA 834
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP+G +G +G GP+G GP+G G +G + G +G
Sbjct: 835 TGITGPTGVTGAIGLTGNTGPTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTGAIGATGSTGATGV 894
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 895 TGPTGSTGVTGATGITGVTGPTGPIGVTG 923
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/186 (24%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 24/186 (12%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPS 88
G+ G +G GP+G + GP+G +G +G GP+G S GP+
Sbjct: 812 GATGVTGATGVTGLAGPTGITGATGITGPTGVTGAIGLTGNTGPTGPTGATGSTGVTGPT 871
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR---- 144
G G +G + G +G GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 872 GATGSTGVTGAIGATGSTGATGVTGPTGSTGVTGATGITGVTGPTGPIGVTGNTGATGVT 931
Query: 145 --------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G + G +G GP+G +G +G G SG
Sbjct: 932 GSTGSTGSTGVTGVTGSTGPTGPIGVTGNTGSTGVTGPTGSTGAIGVTGATGSTGSSGPT 991
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 992 GATGVT 997
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/194 (24%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 30/194 (15%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPS 70
G G +G GP+G + GP+G +G +G+ GP+G GP+
Sbjct: 812 GATGVTGATGVTGLAGPTGITGATGITGPTGVTGAIGLTGNTGPTGPTGATGSTGVTGPT 871
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---- 126
G G +G++ G +G GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 872 GATGSTGVTGAIGATGSTGATGVTGPTGSTGVTGATGITGVTGPTGPIGVTGNTGATGVT 931
Query: 127 --------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S GP+G + G +G GP+G +G + G +G
Sbjct: 932 GSTGSTGSTGVTGVTGSTGPTGPIGVTGNTGSTGVTGPTGS------TGAIGVTGATGST 985
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP
Sbjct: 986 GSSGPTGATGVTGP 999
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/180 (24%), Positives = 69/180 (38%), Gaps = 30/180 (16%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G +G +G+ GP+G +GS GP+G G +G +
Sbjct: 832 TGATGITGPTGVTGAIGLTGNTGPTGPTGA------TGSTGVTGPTGATGSTGVTGAIGA 885
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------ 117
G +G+ GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 886 TGSTGATGVTGPTGSTGVTGATGITGVTGPTGPIGVTGNTGATGVTGSTGSTGSTGVTGV 945
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G + G +G GP+G +G + G +G GP+G GP
Sbjct: 946 TGSTGPTGPIGVTGNTGSTGVTGPTGS------TGAIGVTGATGSTGSSGPTGATGVTGP 999
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/224 (23%), Positives = 81/224 (36%), Gaps = 39/224 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G G +GS G +G + G +GS G +G GP+G
Sbjct: 93 NTGSTGVTGSTGPTG---VTGSTGSTGVTGATGAIGATGVTGSTGLAGATG---VTGPTG 146
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------YLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
+ G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 147 GIGVTGATGPTGVTGVTG---LAGPTGVAGTTGPTGLTGVTGSTGPTGATGSTGATGSTG 203
Query: 120 ------------------YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G GP+G +G +G G +G + G +G
Sbjct: 204 ATGVTGTTGITGPTGSTGVTGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATG 263
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G +G + GP+G GL+ +G+
Sbjct: 264 STGVTGPTGATGSTGVTGPMGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVT 307
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/241 (21%), Positives = 82/241 (34%), Gaps = 57/241 (23%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ +G +GS G +G + G +GS GP+G G +G
Sbjct: 223 TGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTGP 282
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--------------------------- 105
+ GP+G+ G +G G +G GP
Sbjct: 283 MGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTGPTGATGSTGSTGATGATGATGPTGSTGS 342
Query: 106 ------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+G GP G G +G + + G +G + G +G G +G
Sbjct: 343 TGVTGGTGATGATGSTGVTGPIGVTGATGVTGAIGATGSTGAIGATGVAGLTGSTGVTGA 402
Query: 154 LRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+GP+G + GP+G G +G GP+G G+
Sbjct: 403 TGVIGPTGPIGATGATGPTGGTGVTGVTGLTGPTGSAGVTGATGATGVTGPTGATGSTGV 462
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 463 T 463
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/94 (28%), Positives = 41/94 (43%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G GP+G+ +G +G G +G + G +GS GP+G G +G
Sbjct: 222 VTGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTG 281
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G G +G G +G S GP
Sbjct: 282 PMGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTGP 315
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/94 (27%), Positives = 39/94 (41%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G GP+G +G +G G +G + G +G GP+G S G +G
Sbjct: 222 VTGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTG 281
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 282 PMGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTGP 315
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.055, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/193 (22%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 39/193 (20%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------ 96
+G G +GS G +G GP+G G +G+ GP+G + GP
Sbjct: 715 TGVTGSTGVTGSTGPTGATGVTGLTGPTGITGVTGATGAAGVTGPAGAIGATGPIGVTGN 774
Query: 97 SGRLRYLGPS---------------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+ G G +G GP+G +
Sbjct: 775 TGSTGVTGPTGATGTAGVTGPTGLTGGTGSTGPTGAIGATGVTGATGVTGLAGPTGITGA 834
Query: 130 ---DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G +G +G GP+G GP+G G +G + G +G
Sbjct: 835 TGITGPTGVTGAIGLTGNTGPTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTGAIGATGSTGATGV 894
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 895 TGPTGSTGVTGAT 907
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.056, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/94 (27%), Positives = 40/94 (42%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G GP+G +G +GS G +G + G +G GP+G+ G +G
Sbjct: 222 VTGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTG 281
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 282 PMGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTGP 315
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.065, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/251 (20%), Positives = 81/251 (32%), Gaps = 66/251 (26%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------SLRYLG 59
+ GP+G + G +GS G +GS +G +G GP+G +G
Sbjct: 30 STGPTGPIGVTGNTGSTGVTGLTGSTGAIGVTGVTGSTGPTGVTGSIGGTGATGVTGAIG 89
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
+G G +G G +GS G +G +G +G G +G GP+G +
Sbjct: 90 ATGNTGSTGVTGSTGPTGVTGSTGSTGVTGATGAIGATGVTGSTGLAGATGVTGPTGGIG 149
Query: 120 YLGPSG---------------------------RLNSDGPSGRL---------------- 136
G +G S GP+G
Sbjct: 150 VTGATGPTGVTGVTGLAGPTGVAGTTGPTGLTGVTGSTGPTGATGSTGATGSTGATGVTG 209
Query: 137 -----------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G GP+G +G +G G +G + G +G G
Sbjct: 210 TTGITGPTGSTGVTGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTG 269
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P+G G++
Sbjct: 270 PTGATGSTGVT 280
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/94 (27%), Positives = 39/94 (41%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +G GP+G +G +GS G +G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 222 VTGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTG 281
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+ GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 282 PMGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTGP 315
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/233 (21%), Positives = 79/233 (33%), Gaps = 57/233 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +G +GS G +G++ G +G GP+G+ G +G + GP+G
Sbjct: 232 TGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTGPMGLTGPTGA 291
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------------------- 101
G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 292 TGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTGPTGATGSTGSTGATGATGATGPTGSTGSTGVTGGTGA 351
Query: 102 --------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP G G +G + G +G + + G +G G +G +GP+G
Sbjct: 352 TGATGSTGVTGPIGVTGATGVTGAIGATGSTGAIGATGVAGLTGSTGVTGATGVIGPTGP 411
Query: 154 LRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G P+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 412 IGATGATGPTGGTGVTGVTGLTGPTGSAGVTGATGATGVTGPTGATGSTGVTG 464
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/94 (26%), Positives = 40/94 (42%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G GP+G +G +G G +G++ G +G GP+G G +G
Sbjct: 222 VTGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTG 281
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP+G G +G + G +G GP
Sbjct: 282 PMGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTGP 315
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/212 (23%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 36/212 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G++ G +GS G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 109 TGSTGSTGVTGATGAIGATGVTGSTGLAGATG---VTGPTGGIGVTGATGPTGVTGVTG- 164
Query: 73 LRYLGPSG------------SLRYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLRY 102
GP+G GP+G G +G
Sbjct: 165 --LAGPTGVAGTTGPTGLTGVTGSTGPTGATGSTGATGSTGATGVTGTTGITGPTGSTGV 222
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G GP+G +G +G S G +G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 223 TGATGITGVTGPTGATGAIGATGSTGSTGATGAIGVTGATGSTGVTGPTGATGSTGVTGP 282
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ GP+G G +G G +G G
Sbjct: 283 MGLTGPTGATGVTGLTGATGAAGVTGVTGSTG 314
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/187 (24%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 24/187 (12%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP G G +G + G +G++ G +G G +G +GP+G + G +G
Sbjct: 360 VTGPIGVTGATGVTGAIGATGSTGAIGATGVAGLTGSTGVTGATGVIGPTGPIGATGATG 419
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY----------- 138
G +G GP+G G +G GP+G S G +G +
Sbjct: 420 PTGGTGVTGVTGLTGPTGSAGVTGATGATGVTGPTGATGSTGVTGPIGVTGGTGATGVTG 479
Query: 139 -------LGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+GP +G GP+G +G +G GP+G G +G + G +G
Sbjct: 480 ATGVTGLVGPTGITGVTGITGPTGATGAVGATGSTGVTGPTG---VTGNTGSIGVTGSTG 536
Query: 189 RLRYLGL 195
G+
Sbjct: 537 STGATGV 543
>gi|228954796|ref|ZP_04116816.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. T03a001]
gi|423502801|ref|ZP_17479393.1| hypothetical protein IG1_00367 [Bacillus cereus HD73]
gi|449091478|ref|YP_007423919.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. HD73]
gi|228804785|gb|EEM51384.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. T03a001]
gi|402459766|gb|EJV91497.1| hypothetical protein IG1_00367 [Bacillus cereus HD73]
gi|449025235|gb|AGE80398.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar kurstaki str. HD73]
Length = 594
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/227 (26%), Positives = 82/227 (36%), Gaps = 57/227 (25%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------------ 60
G +G GP+GS G +GS GP+G GP+GS GP
Sbjct: 165 TGSTGPTGSTGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGAT---GPTGSTGATGPTGATGSTGSTGS 221
Query: 61 ------SGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------------------- 91
+G GP +G GP+GS GP+G
Sbjct: 222 TGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGS 281
Query: 92 ----RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
GP+G +G +G GP+G GP+G S GP+G GP+G
Sbjct: 282 TGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGS---TGPTGATGSTGPTGA---TGPTGSTGA 335
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 336 TGSTGSTGATGPTGA---TGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGATG 379
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/227 (26%), Positives = 83/227 (36%), Gaps = 60/227 (26%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
GP+G GP+GS GP+GS G +G GP+G+ GP+G GP
Sbjct: 159 TGPTGSTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGAT---GPTGSTGATGPTGA 212
Query: 70 ---------------SGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------- 100
+G GP +GS GP+G GP+G
Sbjct: 213 TGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGS 272
Query: 101 -------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
GP+G +G +G GP+G S GP+G GP+G
Sbjct: 273 TGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTG---STGPTGATGSTGPTGA--- 326
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 327 TGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGA---TGPTGSTGPTGATGSTGSTG 370
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/218 (26%), Positives = 80/218 (36%), Gaps = 48/218 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+GS GP+G GP+GS G +G GP+G
Sbjct: 141 TGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGA 197
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP+GS GP +G GP+G G +G G
Sbjct: 198 T---GPTGSTGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTGS 254
Query: 115 SGRLRYLGPSGR------------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G GP+G + GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 255 TGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGS--- 311
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 312 TGPTGATGSTGPTGA---TGPTGSTGATGSTGSTGATG 346
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/214 (27%), Positives = 78/214 (36%), Gaps = 48/214 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS GP+GS GP+G G +GS GP+G GP+G
Sbjct: 150 TGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGS---TGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGA---TGPTGS 203
Query: 73 LRYLGP------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP +GS GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 204 TGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGP 263
Query: 115 SGR------------------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G GP+G S GP G G +G GP+G
Sbjct: 264 TGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTG---STGPIGATGPTGATGPTGSTGPTGATGS 320
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 321 TGPTGA---TGPTGSTGATGSTGSTGATGPTGAT 351
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/206 (27%), Positives = 77/206 (37%), Gaps = 48/206 (23%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ GP+GS G +G GP+GS GP+G GP+G G +G
Sbjct: 134 ATGPTGAT---GPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGSTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGATG 187
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLG 122
S GP+G GP+G GP +G GP+G G
Sbjct: 188 STGSTGPTGAT---GPTGSTGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTG 244
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
+G S G +G GP+G GP+G +G +G
Sbjct: 245 ATGPTGSTGSTGPTGATGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTGATGPTGSTGPIGATGPTG 304
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 305 ATGPTGS---TGPTGATGSTGPTGAT 327
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/222 (25%), Positives = 79/222 (35%), Gaps = 63/222 (28%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--------------------- 51
GP+G G +GS GP+G+ GP+G GP
Sbjct: 174 TGPTGSTGSTGATGSTGSTGPTGAT---GPTGSTGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGS 230
Query: 52 ---------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS------------------LRY 84
+GS GP+G GP+G GP+G+
Sbjct: 231 TGVTGPTGATGSTGATGPTGSTGSTGPTGA---TGPTGATGPTGSTGSTGSTGSTGPTGA 287
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G +G +G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 288 TGPTGSTGPIGATGPTGATGPTGS---TGPTGATGSTGPTGAT---GPTGSTGATGSTGS 341
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 342 TGATGPTGA---TGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGATGP 380
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.061, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/196 (28%), Positives = 75/196 (38%), Gaps = 36/196 (18%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---------------------YLGPSG 62
P+GS GP+GS G +G GP+G+ GP+G
Sbjct: 83 PTGST---GPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGATGSTGSTGPTGPTGPTGSTGPTGATGPTG 139
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G GP+GS GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 140 ATGPTGSTGPTGSTGPTGST---GPTGSTGSTGPTGS---TGPTGSTGSTGATGSTGSTG 193
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSG 179
P+G GP+G GP+G G +G G +G GP +G GP+G
Sbjct: 194 PTGAT---GPTGSTGATGPTGATGSTGSTGSTGPTGATGSTGVTGPTGATGSTGATGPTG 250
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G
Sbjct: 251 STGSTGPTGATGPTGA 266
>gi|423449091|ref|ZP_17425970.1| hypothetical protein IEC_03699 [Bacillus cereus BAG5O-1]
gi|401128540|gb|EJQ36229.1| hypothetical protein IEC_03699 [Bacillus cereus BAG5O-1]
Length = 366
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/142 (30%), Positives = 60/142 (42%), Gaps = 6/142 (4%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G GP+G+ G +G G +GS GP+G GP+G G +G
Sbjct: 92 ITGATGITGATGPTGATGITGATGP---TGATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGVTG 148
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP+G G +G G +G G +G GP+G S G +G G
Sbjct: 149 STGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGA---TG 205
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
P+G GP+G GP+G
Sbjct: 206 PTGATGITGPTGATGDTGPTGA 227
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/142 (28%), Positives = 58/142 (40%), Gaps = 6/142 (4%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G GP+G G +G G +GS GP+G GP+G G +G
Sbjct: 92 ITGATGITGATGPTGATGITGATGPT---GATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGVTG 148
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G + G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 149 STGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGA---TG 205
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P+G GP+G GP+G
Sbjct: 206 PTGATGITGPTGATGDTGPTGA 227
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/142 (28%), Positives = 58/142 (40%), Gaps = 6/142 (4%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G GP+G+ G +G G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 92 ITGATGITGATGPTGATGITGATGP---TGATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGVTG 148
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 149 STGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGA---TG 205
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P+G GP+G GP+G
Sbjct: 206 PTGATGITGPTGATGDTGPTGA 227
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 55/131 (41%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G G +GS GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 103 GPTGATGITGATGPT---GATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGVTGSTGATGPTGAT 159
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G GP+
Sbjct: 160 GITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGA---TGPTGATGITGPT 216
Query: 134 GRLRYLGPSGR 144
G GP+G
Sbjct: 217 GATGDTGPTGA 227
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/135 (26%), Positives = 52/135 (38%), Gaps = 9/135 (6%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G GP+G+ G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 92 ITGATGITGATGPTGATGITGATGPT---GATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGVTG 148
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSG 179
+ GP+G G +G G +G G +G GP +G GP+G
Sbjct: 149 STGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGATGATGPTG 208
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G
Sbjct: 209 ATGITGPTGATGDTG 223
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/113 (26%), Positives = 43/113 (38%), Gaps = 3/113 (2%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G GP+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 92 ITGATGITGATGPTGATGITGATGPT---GATGSTGATGPTGATGDTGPTGATGPTGVTG 148
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +G G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 149 STGATGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGITGATGITGATGPTGATGSTGAT 201
>gi|293344222|ref|XP_001062815.2| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Rattus
norvegicus]
gi|293356045|ref|XP_341884.4| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Rattus
norvegicus]
Length = 1551
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 71/192 (36%), Positives = 99/192 (51%), Gaps = 51/192 (26%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 846 FRFEG-SPSLRFEGSAGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-- 897
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P GSLR+ P G+ P G LR+ G G GPSG +R+ GP G+ P
Sbjct: 898 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEG--GH----GPSGAAIRFDGPHGQ-----PG 938
Query: 134 GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP- 177
G +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 939 GGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPL 998
Query: 178 ---SGRLRYLGP 186
G +R+ GP
Sbjct: 999 VQQGGGMRFEGP 1010
>gi|150391143|ref|YP_001321192.1| triple helix repeat-containing collagen [Alkaliphilus
metalliredigens QYMF]
gi|149951005|gb|ABR49533.1| Collagen triple helix repeat [Alkaliphilus metalliredigens QYMF]
Length = 485
Score = 56.6 bits (135), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/169 (33%), Positives = 67/169 (39%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + +GP G GP G +GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 69 VGPQGPIGPIGPEGPQ---GPQGIPGAVGPQGPIGPQGPQGIPGATGPQGPQGVPGPIGS 125
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP G + GP G G G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 126 QGPIGPQGPIGAQGPIGPQGPQGVPGATGPQGPVGATGPQGPQGVPGTTGPQGPAGPQGP 185
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP G +GP G GP G GP G + +GP+G
Sbjct: 186 QGVPGTTGPQGP---VGPQGIPGATGPEGP---TGPQGPIGPVGPTGAT 228
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/166 (31%), Positives = 64/166 (38%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP G + +GP G GP G +GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 69 VGPQGPIGPIGPEGPQ---GPQGIPGAVGPQGPIGPQGPQGIPGATGPQGPQGVPGPIGS 125
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+GP G + GP G G G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 126 QGPIGPQGPIGAQGPIGPQGPQGVPGATGPQGPVGATGPQGPQGVPGTTGPQGPAGPQGP 185
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G + G G GP+G +GP G G +
Sbjct: 186 QGVPGTTGPQGPVGPQGIPGATGPEGPTGPQGPIGPVGPTGATGAT 231
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/155 (32%), Positives = 59/155 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G +GP G + GP G GP G GP G +GP G
Sbjct: 75 IGPIGPEGPQGPQGIPGAVGPQGPIGPQGPQGIPGATGPQGPQGVPGPIGSQGPIGPQGP 134
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G G G GP G GP G GP G GP G + GP
Sbjct: 135 IGAQGPIGPQGPQGVPGATGPQGPVGATGPQGPQGVPGTTGPQGPAGPQGPQGVPGTTGP 194
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G + G G GP+G +GP G G
Sbjct: 195 QGPVGPQGIPGATGPEGPTGPQGPIGPVGPTGATG 229
>gi|344293729|ref|XP_003418573.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: pre-mRNA cleavage complex 2 protein
Pcf11-like [Loxodonta africana]
Length = 1575
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 823 LRFEGPQGQLGGGCPLRFDGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGAAGG 881
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR-- 108
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ P G LR+ P G+
Sbjct: 882 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-----PVGSLRFDNPRGQPV 931
Query: 109 --LRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 932 GGLRFEGGHGPSGTTIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVGGL 986
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 987 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1031
>gi|375283530|ref|YP_005103968.1| hypothetical protein BCN_1435 [Bacillus cereus NC7401]
gi|358352056|dbj|BAL17228.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus NC7401]
Length = 622
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 71/181 (39%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 180 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGAT 236
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 237 ---GATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 293
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP+G G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 294 GPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGA---TGPQGPQGVQGPAGATGAQ 350
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 351 G 351
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP+G+ G G G +G+ GP+G G
Sbjct: 198 GPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGATGAQ 257
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G G GP+G G G GP+G GP+G +
Sbjct: 258 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGAT 317
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 318 GAQGPQGVQGPAGA---TGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQG 369
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 68/175 (38%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G +G
Sbjct: 171 GATGATGPQGPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT---GATGAQ 227
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G +G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 228 GVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 284
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP+G GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 285 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPQG 339
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 168 GPAGATGATGPQ------GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGA- 220
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G G +G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 221 --TGATGAQGVQGPAGA---TGATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 275
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G G G GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 276 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 332
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 282 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGA---TGPQGPQ 338
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G+ GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 339 GVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPA 395
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +G + GP+G GP G GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 396 GATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 452
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 453 GATGPQG 459
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 18/188 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 236 TGATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGP 295
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G G G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 296 QGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT---GPQGPQGVQGPAGATGAQGP 352
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP+G GP G GP G G +G GP+G
Sbjct: 353 QG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGA 409
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 410 TGAQGPQG 417
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/163 (30%), Positives = 64/163 (39%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP G P+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 168 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 221
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G GP+G G +G GP+G + G G GP+G G
Sbjct: 222 ---GATGAQGVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 275
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G G G GP+G GP+G G
Sbjct: 276 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATG 318
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G +G+ GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 221 TGATGAQGVQGPAGAT---GATGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGP 277
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G GP+G GP+G G G GP+G GP
Sbjct: 278 QGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGP 337
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 338 QG---VQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQG 369
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ GP+G G G
Sbjct: 264 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQ 323
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-------- 125
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 324 GVQGPAGAT---GPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGAT 377
Query: 126 ----RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+ GP G G +G GP+G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 378 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGPQGPAGAT 434
Query: 182 RYLGPSG 188
G G
Sbjct: 435 GATGAQG 441
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/199 (28%), Positives = 72/199 (36%), Gaps = 24/199 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 246 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 305
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ G G GP+G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 306 GPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGAT 362
Query: 128 NSDGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
+ GP G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 363 GAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQ 419
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G G
Sbjct: 420 GPAGATGPQGPAGATGATG 438
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 15/184 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ G G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 300 GPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGA---TGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG-- 354
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G G +G GP G G +G GP+G +
Sbjct: 355 -VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQ 413
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G GP+G G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 414 GPQG---VQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 467
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 468 GATG 471
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/149 (29%), Positives = 56/149 (37%), Gaps = 21/149 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------SLRYLGP 60
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G + GP
Sbjct: 332 TGPQGPQGVQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGAQGP 388
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G +G GP+G+ GP G GP+G GP+G G G
Sbjct: 389 QGVQGPAGATGATGAQGPAGATGAQGPQG---VQGPAGATGPQGPAGATGATGAQGPQGV 445
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 446 QGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATG 471
>gi|402556500|ref|YP_006597771.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus FRI-35]
gi|401797710|gb|AFQ11569.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus FRI-35]
Length = 835
Score = 56.6 bits (135), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/172 (31%), Positives = 64/172 (37%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGPTGATGPQGIQGIQGPQG 519
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/167 (31%), Positives = 62/167 (37%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G + GP G GP GP+G GP G GP G
Sbjct: 479 QGNIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGPTGATGPQGIQGIQGPQG 519
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 60/161 (37%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGI 514
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/162 (29%), Positives = 60/162 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQ 515
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G G + GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGAI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L S G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGIQGEVGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSGGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTG 240
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/188 (29%), Positives = 66/188 (35%), Gaps = 18/188 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 395 TGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGI 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP G GP GP+G + GP
Sbjct: 455 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGPTGATGP 508
Query: 133 SGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 509 QGIQGIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTGV 568
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 569 TGPQGPQG 576
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.074, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 71/178 (39%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G++ GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 105 GEIGPTGPTGIQGIQGIPGAIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGIQGEVGPT 164
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ G G L G G G G + GP+G G G + G +G
Sbjct: 165 GPTGNTGIQGVQGNLGSGGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQ 224
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G + GP+G G G + GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 225 GLQGPQGEMGLTGPTGFQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGS---TGPTGVTGATG 279
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 106 EIGPTGPTGIQGIQGIPGAIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGIQGEVGPTG 165
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
G G LG G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 166 PTGNTGIQGVQGNLGSGGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQG 225
Query: 130 -DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP+G G G + GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 226 LQGPQGEMGLTGPTGFQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGS---TGPTGVTGATG 279
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/196 (29%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 24/196 (12%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G GPSG GP G GP G++ GP G GP G P+G
Sbjct: 449 TGPQGIQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTGPQGIQGVQGPQG------PTGP 502
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G GP G G P+G G G GP+G +
Sbjct: 503 TGATGPQGIQGIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGA 562
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP G GP G G +G GP G GP G GP+G
Sbjct: 563 TGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGATGATGPQGVQGIQGPQG---ITGPTGA 616
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G++ + G+
Sbjct: 617 TGVTGITGPQGIQGIQ 632
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGP 78
+GP+G G G GP+G GP GS GP G G G +GP
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGIQGVQGIQGEIGP 109
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G G G +GP+G G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGAIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGIQGEVGPTGPTGN 169
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G LG G G G +GP+G G G +GP+G GL
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSGGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGL 226
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/162 (30%), Positives = 56/162 (34%), Gaps = 21/162 (12%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 430 ATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTGPQG 489
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLN 128
GP GP+G GP G GP G +GP+G
Sbjct: 490 IQGVQGPQ------GPTGPTGATGPQGIQGIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTG 543
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 544 PQGIQGITGSTGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQG 582
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 57/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGAIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 149 TGIQGIQGIQGEVGPTGPTGNTGIQGVQGNL 179
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGAIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L GL
Sbjct: 149 TGIQGIQGIQGEVGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSGGLQ 185
>gi|354997383|gb|AER48719.1| gp7 [Mycobacterium phage Alma]
Length = 343
Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 63/176 (35%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + LGP G GP+G+ GP+G GP G GP G GP G
Sbjct: 140 AGPQGAVGPLGPKGDPGDTGPTGAT---GPAGPQGATGPKGDTGAQGPQGIQGATGPQG- 195
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G LGP G G G G +G G G G
Sbjct: 196 --LQGPKGDQGIQGEKGDKGDLGPQGPKGDKGDKGDPGTAGATGLTGSAGAPGAPGPQGE 253
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G G G GP G GP+G GPSG
Sbjct: 254 PGPTGPQGPKGDTGATGPQGPKGDTGAQGPAGATGPKGDTGAQGPTGATGAQGPSG 309
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 62/177 (35%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
L GP G GP G++ LGP G GP+G+ GP+G GP G G
Sbjct: 130 ELDVRGPQGPA---GPQGAVGPLGPKGDPGDTGPTGAT---GPAGPQGATGPKGDTGAQG 183
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
P G GP G GP G G G LGP G G G + G +G
Sbjct: 184 PQGIQGATGPQG---LQGPKGDQGIQGEKGDKGDLGPQGPKGDKGDKGDPGTAGATGLTG 240
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G G G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 241 SAGAPGAPGPQGEPGPTGPQGPKGDTGATGPQGPKGDTGAQGPAGATGPKGDTGAQG 297
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/116 (32%), Positives = 43/116 (37%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
L GP G GP G + LGP G GP+G GP+G + GP G G
Sbjct: 130 ELDVRGPQG---PAGPQGAVGPLGPKGDPGDTGPTG---ATGPAGPQGATGPKGDTGAQG 183
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G GP G G G G G L GP G G G GL+
Sbjct: 184 PQGIQGATGPQGLQGPKGDQGIQGEKGDKGDLGPQGPKGDKGDKGDPGTAGATGLT 239
>gi|168202290|ref|ZP_02629860.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens C
str. JGS1495]
gi|169298682|gb|EDS80761.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens C
str. JGS1495]
Length = 466
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/192 (31%), Positives = 77/192 (40%), Gaps = 30/192 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G + GP G + GP G + GP G + GP G GP
Sbjct: 99 GPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGPV---GPQGEQ---GPQ 152
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G + GP G +GP G GP G + GP G + GP G + GP G +
Sbjct: 153 GERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQGERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGPV 206
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP G + GP G +GP G GP G + GP G +GP G +
Sbjct: 207 GPQGEQGPQGERGFTGPQGP---IGPQGE---QGPQGERGFTGPQGP---IGPQGNQGPI 257
Query: 185 GPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 258 GPQGEQGPQGAT 269
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/199 (31%), Positives = 78/199 (39%), Gaps = 30/199 (15%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
C K GP G GP G + GP G + GP G + GP G + GP
Sbjct: 47 NCNCCKPGPRGPRGPQGEQGPQGERGFTGPQGPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPV---GP 103
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G GP G + GP G + GP G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 104 QGEQ---GPQGERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQGE 154
Query: 118 LRYLGPSGRL---NSDGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP G + GP G + GP G + GP G + GP G +GP G
Sbjct: 155 RGFTGPQGPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGP---VGPQGE 211
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G + GP G +
Sbjct: 212 ---QGPQGERGFTGPQGPI 227
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 30/183 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G + GP G + GP G + GP G +GP G GP
Sbjct: 120 GPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQ 173
Query: 71 GRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G + GP G + GP G + GP G +GP G GP G + GP G +
Sbjct: 174 GERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQGERGFTGPQGPI 227
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP G + GP G +GP G +GP G GP G GP
Sbjct: 228 ---GPQGE---QGPQGERGFTGPQGP---IGPQGNQGPIGPQGE---QGPQGATGPQGPQ 275
Query: 188 GRL 190
G +
Sbjct: 276 GPV 278
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/164 (32%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 27/164 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYL 67
GP G GP G + GP G + GP G + GP G + GP G +
Sbjct: 141 GPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFT 200
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G +GP G GP G + GP G +GP G GP G + GP G +
Sbjct: 201 GPQGP---VGPQGE---QGPQGERGFTGPQGP---IGPQGE---QGPQGERGFTGPQGPI 248
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP G +GP G GP G GP G +GP G
Sbjct: 249 ---GPQGNQGPIGPQGE---QGPQG---ATGPQGPQGPVGPQGN 283
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/140 (32%), Positives = 56/140 (40%), Gaps = 18/140 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G + GP G + GP G + GP G +GP G GP
Sbjct: 162 GPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQ 215
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G +GP G GP G + GP G +GP G +GP G
Sbjct: 216 GERGFTGPQGP---IGPQGE---QGPQGERGFTGPQGP---IGPQGNQGPIGPQGEQGPQ 266
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP G GP
Sbjct: 267 GATGPQGPQGPVGPQGNQGP 286
>gi|332211154|ref|XP_003254685.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Nomascus
leucogenys]
Length = 1555
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 111/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|225869058|ref|YP_002745006.1| collagen and fibronectin-binding collagen-like cell
surface-anchored protein FneE [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus]
gi|225702334|emb|CAX00145.1| putative collagen and fibronectin-binding collagen-like cell
surface-anchored protein FneE [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus]
Length = 731
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/167 (31%), Positives = 53/167 (31%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G G G GP G G G G G G G GP G
Sbjct: 382 GPKGDPGKDGQDGKDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGHDGKDGEKGERGEQGPQGER 441
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 442 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 501
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 502 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 548
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/185 (30%), Positives = 60/185 (32%), Gaps = 12/185 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS--- 70
GP G G G GP G G G+ GP G G G+ GP
Sbjct: 349 GPKGDPGKDGQDGKDGQPGPKGE---KGDPGQQGIPGPKGDPGKDGQDGKDGQPGPKGEK 405
Query: 71 ---GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G+ GP G + G G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 406 GDPGQQGIPGPKGDPGHDGKDGEKGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 465
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 466 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQ 525
Query: 185 GPSGR 189
GP G
Sbjct: 526 GPQGE 530
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 55/176 (31%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G GR GP G G G GP G G G GP G G G+
Sbjct: 325 GKPGRDGQPGPKGEK---GDPGQQGIPGPKGDPGKDGQDGKDGQPGPKGE---KGDPGQQ 378
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G+ GP G G G G G G G GP
Sbjct: 379 GIPGPKGDPGKDGQDGKDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGHDGKDGEKGERGEQGPQ 438
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 439 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 494
>gi|297622019|ref|YP_003710156.1| hypothetical protein wcw_1811 [Waddlia chondrophila WSU 86-1044]
gi|297377320|gb|ADI39150.1| conserved hypothetical protein [Waddlia chondrophila WSU 86-1044]
Length = 603
Score = 56.2 bits (134), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/179 (29%), Positives = 74/179 (41%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G +G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 237 TGPTGATGANGADGATGPTGPAGAAGTDGATGATGPTGPTGATGANGADGATGPTGPAGA 296
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G +
Sbjct: 297 TGATGPTGPTGVTGATGANGADGATGPTGPAGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATGANGA 356
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
DG +G G +G GP+G G +G GP+G P+G GP+G
Sbjct: 357 DGATGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATGANGADGATGPTG------PAGATGATGPTG 409
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/200 (29%), Positives = 82/200 (41%), Gaps = 22/200 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ GP+G P+G G +G GP+G
Sbjct: 273 TGPTGATGANGADGATGPTGPAGATGATGPTG------PTGVTGATGANGADGATGPTGP 326
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 327 AGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATGANGADGATGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATGA 386
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+DG +G GP+G GP+G G +G G G GP+G GP
Sbjct: 387 NGADGATGPT---GPAGATGATGPTGPTGVTGATGA---NGADGATGPTGPAGATGATGP 440
Query: 187 SG-RLRYLGLS---DGLRVS 202
+G + G S D L VS
Sbjct: 441 TGPEAVHEGFSASKDVLTVS 460
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/174 (28%), Positives = 70/174 (40%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G G+ GP+G+ G G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 221 PTGATGANGADGATGPTGPTGATGANGADGATGPTGPAGAAGTDGATGATGPTGPTGATG 280
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G G+ GP+G GP+ GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 281 ANGADGATGPTGPAGATGATGPT------GPTGVTGATGANGADGATGPTGPAGPTGPAG 334
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G G G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 335 ATGATGPTGPTGVTGATGA---NGADGATGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATG 385
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/176 (28%), Positives = 73/176 (41%), Gaps = 12/176 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP+G+ G G GP+G+ GP+G P+G
Sbjct: 255 TGPAGAAGTDGATGATGPTGPTGATGANGADGATGPTGPAGATGATGPTG------PTGV 308
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G GP+G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 309 TGATGANGADGATGPTGPAGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATGANGADGATGPTGPAGA 368
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G +G GP+ GP+G GP+G G +G
Sbjct: 369 TGATGPTGPTGVTGATGANGADGATGPT------GPAGATGATGPTGPTGVTGATG 418
>gi|380813624|gb|AFE78686.1| pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Macaca mulatta]
gi|383419051|gb|AFH32739.1| pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Macaca mulatta]
gi|384947592|gb|AFI37401.1| pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Macaca mulatta]
Length = 1555
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 111/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|403287863|ref|XP_003935143.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Saimiri
boliviensis boliviensis]
Length = 1703
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/222 (35%), Positives = 111/222 (50%), Gaps = 52/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 995 FRFEG-SPSLRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1053
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGR-LRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1054 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGTAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1108
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GP
Sbjct: 1109 HGQSVSGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPVPG 1163
Query: 161 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1164 GGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1204
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/211 (35%), Positives = 103/211 (48%), Gaps = 59/211 (27%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
LR+ GP G LR+ GP G LR+ G R+ G S SLR+ G +G
Sbjct: 953 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEG-SPSLRFEGSAGG 1011
Query: 64 LRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P G LR+
Sbjct: 1012 LRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PVGGLRF 1066
Query: 112 L---GPSGR-LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 159
GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 1067 EGGHGPSGTAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVSGLRFEGQ 1121
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
+L G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 1122 HNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 1147
>gi|291384167|ref|XP_002708710.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex II protein Pcf11 [Oryctolagus
cuniculus]
Length = 1553
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 111/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGR-- 72
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ P G+LR+ G P G +R+ GP G+
Sbjct: 844 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQ-----PVGALRFEGHRGQPVGGIRFEGPHGQPV 897
Query: 73 --LRYLGPSGS----LRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
LR+ P G LR+ GP+G +R+ GP G+ +R+ GP + LR+ GP
Sbjct: 898 GGLRFDSPRGQPVGGLRFEGGHGPAGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGLRFEGP 957
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 958 HGQSVGGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1012
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LRY G G+ L DGL
Sbjct: 1013 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRYDGQPGQPSLLPRIDGLH 1054
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 802 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGAPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 860
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G +R+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 861 LRFEGPGGQ-----PVGALRFEGHRGQPVGGIRFEGPHGQPVGGLRFDSPRGQ-----PV 910
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GP+G +R+ GP G+ P G +R+ GP + LR+ GP G+ L
Sbjct: 911 GGLRFEGGHGPAGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGLRFEGPHGQSVGGL 965
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 966 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1010
>gi|355752503|gb|EHH56623.1| hypothetical protein EGM_06074 [Macaca fascicularis]
Length = 1555
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 111/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|355566911|gb|EHH23290.1| hypothetical protein EGK_06728 [Macaca mulatta]
Length = 1555
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 111/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|402894808|ref|XP_003910536.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Papio anubis]
Length = 1555
Score = 55.8 bits (133), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 111/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|431838481|gb|ELK00413.1| Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Pteropus alecto]
Length = 1685
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/216 (33%), Positives = 103/216 (47%), Gaps = 69/216 (31%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 935 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPLGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 993
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 994 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 1043
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 1044 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1098
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
R+ G+ +LG G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 1099 RF---EGQHNHLG--GNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 1129
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/222 (34%), Positives = 111/222 (50%), Gaps = 52/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 977 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1035
Query: 67 LGPSGR----LRYL---GPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ LR+ GPSG ++R+ GP G+ P+G +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1036 DNPRGQPVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PAGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1090
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GP
Sbjct: 1091 HGQSVAGLRFEGQHNHL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPVPG 1145
Query: 161 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G +R GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1146 GGMRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1186
>gi|186472261|ref|YP_001859603.1| triple helix repeat-containing collagen [Burkholderia phymatum
STM815]
gi|184194593|gb|ACC72557.1| Collagen triple helix repeat [Burkholderia phymatum STM815]
Length = 582
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 71/178 (39%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
G G+ GP+G+ GP G G +G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 76 GNDGKDGATGPAGARGPAGPQGDAGPQGVAGPAGTTGPQGATGPAGPRGDPGVAGPQGAQ 135
Query: 73 -LR-YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
L+ GP G GP+G GP+G + GP G GP G + G +G
Sbjct: 136 GLKGDQGPKGDAGPQGPAGATGSQGPAGAMGLTGPQGAKGDPGPVGPMGPEGDTGPAGDQ 195
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP+G + GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 196 GPEGDTGAQGPQGATGSQGPAGPVGQTGPQG---VKGDTGATGEQGPKGDTGAQGPQG 250
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/194 (30%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--LR-YLGP 69
GP+G GP G G +G GP G GP G GP G L+ GP
Sbjct: 84 TGPAGARGPAGPQGDAGPQGVAGPAGTTGPQGATGPAGPRGDPGVAGPQGAQGLKGDQGP 143
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP+G+ GP+G + GP G GP G + G +G GP G +
Sbjct: 144 KGDAGPQGPAGATGSQGPAGAMGLTGPQGAKGDPGPVGPMGPEGDTGPAGDQGPEGDTGA 203
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP+G + GP G G +G GP G GP G +GP+
Sbjct: 204 QGPQGATGSQGPAGPVGQTGPQG---VKGDTGATGEQGPKGDTGAQGPQGP---VGPAAD 257
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G ++G
Sbjct: 258 TSTFVQKSGDTMTG 271
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 74/185 (40%), Gaps = 14/185 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS--LR-YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G GP G GP G+ L+ GP G GP+G+ GP+G + GP
Sbjct: 111 TGPQGATGPAGPRGDPGVAGPQGAQGLKGDQGPKGDAGPQGPAGATGSQGPAGAMGLTGP 170
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G + G +G GP G GP G GP+G + GP G
Sbjct: 171 QGAKGDPGPVGPMGPEGDTGPAGDQGPEGDTGAQGPQGATGSQGPAGPVGQTGPQGVKGD 230
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP G GP G +GP+ ++ SG +G+LR SG
Sbjct: 231 TGATGE---QGPKGDTGAQGPQGP---VGPAADTSTFVQKSGDTM----TGQLRIAPASG 280
Query: 189 RLRYL 193
L
Sbjct: 281 DASLL 285
>gi|383493868|ref|YP_005411544.1| streptococcal collagen-like protein (B) SclB [Streptococcus
pyogenes MGAS1882]
gi|378929596|gb|AFC68013.1| streptococcal collagen-like protein (B) SclB [Streptococcus
pyogenes MGAS1882]
Length = 424
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/179 (28%), Positives = 77/179 (43%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G+ +GP G GP+G + G G G G GP G P+G+
Sbjct: 123 VGPAGKDGEVGPRGDRGETGPAGPVGPRGDKGEQGLPGKDGEQGERGPQG------PAGK 176
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G GP G GP+G+ +GP+G+ G G +GP+G+
Sbjct: 177 DGEAGAQGPAGPKGPRGDKGEQGPAGKDGERGPVGPAGKDGQNGKDGERGPVGPAGKDGQ 236
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +GP+G+ G G +GP+G+ G G +GP+G+ G G
Sbjct: 237 NGKDGERGPVGPAGKDGQNGKDGERGPVGPAGKDGQNGKDGERGPVGPAGKDGQDGKDG 295
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 73/178 (41%), Gaps = 13/178 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G +GP+G +GP G GP+G + G G G G GP G
Sbjct: 115 GEKGDQGPVGPAGKDGEVGPRGDRGETGPAGPVGPRGDKGEQGLPGKDGEQGERGPQG-- 172
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
P+G+ G G GP G GP+G+ GP G DG +G+ GP
Sbjct: 173 ----PAGKDGEAGAQGPAGPKGPRGDKGEQGPAGKDGERGPVGPAGKDGQNGKDGERGP- 227
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+GP+G+ G G +GP+G+ G G +GP+G+ G DG R
Sbjct: 228 -----VGPAGKDGQNGKDGERGPVGPAGKDGQNGKDGERGPVGPAGKDGQNG-KDGER 279
>gi|167641402|ref|ZP_02399653.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0193]
gi|177649375|ref|ZP_02932377.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0174]
gi|254737475|ref|ZP_05195178.1| hypothetical protein BantWNA_20159 [Bacillus anthracis str. Western
North America USA6153]
gi|167510679|gb|EDR86074.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0193]
gi|172084449|gb|EDT69507.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0174]
Length = 420
Score = 55.8 bits (133), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 64/174 (36%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 124
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP----------------- 141
GP+G GP+G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTG 184
Query: 142 -------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 185 PTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 238
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 64/174 (36%), Gaps = 24/174 (13%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 124
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP----------------- 132
GP+G GP+G GP+G GP+G + GP
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTG 184
Query: 133 -------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 185 PTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 238
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/173 (26%), Positives = 63/173 (36%), Gaps = 24/173 (13%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGVTGPTG 124
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP----------------- 150
GP+G GP+G + GP+G GP+G GP
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGATGPTGITGATGPTGTTGVTG 184
Query: 151 -------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G GP+G GP+G GP+G G +
Sbjct: 185 PTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGAT 237
>gi|18202034|sp|O42350.1|CO1A2_RANCA RecName: Full=Collagen alpha-2(I) chain; AltName: Full=Alpha-2 type
I collagen; Flags: Precursor
gi|2443342|dbj|BAA22380.1| alpha 2 type I collagen [Rana catesbeiana]
Length = 1355
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/159 (33%), Positives = 63/159 (39%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GPSG G G GP+G + GP G + G G GP G GP G
Sbjct: 690 AGPSGVAGPRGAPGERGEAGPAGPTGFAGPPGAAGHTGAKGDRGAKGPKGEAGSPGPLGA 749
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G +G GPSG + GP+GR GP G + GP+G DG
Sbjct: 750 HGSAGPAGPNGPAGSTGARGDAGPSGATGFPGPAGRAGAPGPPGNVGPSGPTGHPGKDGS 809
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G GP GR G GP G GPSG
Sbjct: 810 RGPRGDSGPVGR------PGEQGQHGPVGLAGDKGPSGE 842
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/153 (33%), Positives = 63/153 (41%), Gaps = 3/153 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GPSG G G GP+G + GP G + G G GP G GP G
Sbjct: 690 AGPSGVAGPRGAPGERGEAGPAGPTGFAGPPGAAGHTGAKGDRGAKGPKGEAGSPGPLGA 749
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS---GRLRY 147
GP+G G +G GPSG + GP+GR + GP G + GP+ G+
Sbjct: 750 HGSAGPAGPNGPAGSTGARGDAGPSGATGFPGPAGRAGAPGPPGNVGPSGPTGHPGKDGS 809
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G +G G GP G GPSG
Sbjct: 810 RGPRGDSGPVGRPGEQGQHGPVGLAGDKGPSGE 842
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/114 (35%), Positives = 49/114 (42%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GPSG G G GP+G + GP G + G G GP G S GP G
Sbjct: 690 AGPSGVAGPRGAPGERGEAGPAGPTGFAGPPGAAGHTGAKGDRGAKGPKGEAGSPGPLGA 749
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G GPSG + GP+GR GP G + GP+G
Sbjct: 750 HGSAGPAGPNGPAGSTGARGDAGPSGATGFPGPAGRAGAPGPPGNVGPSGPTGH 803
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/146 (32%), Positives = 59/146 (40%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GPSG G G GP+G + GP G+ + G G GP G GP G
Sbjct: 690 AGPSGVAGPRGAPGERGEAGPAGPTGFAGPPGAAGHTGAKGDRGAKGPKGEAGSPGPLGA 749
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G G +G GPSG + GP+GR GP G + GP+G G
Sbjct: 750 HGSAGPAGPNGPAGSTGARGDAGPSGATGFPGPAGRAGAPGPPGNVGPSGPTGHPGKDGS 809
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP GR G G + G
Sbjct: 810 RGPRGDSGPVGRPGEQGQHGPVGLAG 835
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/142 (33%), Positives = 62/142 (43%), Gaps = 6/142 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G + GP G+ + G G GP G GP G+ GP+G G +G
Sbjct: 707 EAGPAGPTGFAGPPGAAGHTGAKGDRGAKGPKGEAGSPGPLGAHGSAGPAGPNGPAGSTG 766
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GPSG+ + GP+GR GP G + GPSG + G G G SG + G
Sbjct: 767 ARGDAGPSGATGFPGPAGRAGAPGPPGNV---GPSGPTGHPGKDGSRGPRGDSGPVGRPG 823
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G+ GP G GPSG
Sbjct: 824 EQGQ---HGPVGLAGDKGPSGE 842
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/200 (31%), Positives = 75/200 (37%), Gaps = 24/200 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GPSG G G G +GS G G+ GPSG GP+G GPSG
Sbjct: 327 AGPSGARGLAGDPGIAGGKGDTGSKGEPGSVGQQGPAGPSGEEGKRGPNGEAGSSGPSGN 386
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGR 126
G G+ GP GR +GP+G GP G G +GR L G G
Sbjct: 387 AGIRGVPGTRGLPGPDGRAGGIGPAGSRGSSGPPGARGPNGDAGRPGEPGLLGARGLPGF 446
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPS------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
S+GP G+ GP G + + GP G G +G GP
Sbjct: 447 SGSNGPQGKEGPAGPQGIEGRSGAAGPAGARGEPGAIGFPGPKGPNGEPGKNGDKGNQGP 506
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP+G
Sbjct: 507 SGNRGAPGPDGNNGAQGPAG 526
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/151 (36%), Positives = 61/151 (40%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGS 81
+GS GP GS+ GP G G G GP GR G G Y GPSG
Sbjct: 891 AGSSGPRGPPGSVGSPGPVGHSGEAGRDGHPGNDGPPGRDGLPGAKGERGYPGNTGPSGL 950
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G SG GPSG GPSG GP G G +G G
Sbjct: 951 AGAPGPAGSAGPAGKSGNRGEGGPSGPAGITGPSGPRGPAGPQGVRGDKGEAGERGARGL 1010
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GR + G SG GPSG GPSG +
Sbjct: 1011 DGRKGHNGLSG---LPGPSGTPGETGPSGSV 1038
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/126 (32%), Positives = 53/126 (42%), Gaps = 6/126 (4%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A + G G GP G GP G+ GP+G G +G+ GPSG + GP
Sbjct: 723 AGHTGAKGDRGAKGPKGEAGSPGPLGAHGSAGPAGPNGPAGSTGARGDAGPSGATGFPGP 782
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GR GP G++ GP+G G+ GP G +G G GP G
Sbjct: 783 AGRAGAPGPPGNVGPSGPTGH------PGKDGSRGPRGDSGPVGRPGEQGQHGPVGLAGD 836
Query: 130 DGPSGR 135
GPSG
Sbjct: 837 KGPSGE 842
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/147 (36%), Positives = 58/147 (39%), Gaps = 9/147 (6%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
GS GPSG GP GP GS+ GP G G G GP GR
Sbjct: 880 GSNGEPGPSGLAGSSGP------RGPPGSVGSPGPVGHSGEAGRDGHPGNDGPPGRDGLP 933
Query: 113 GPSGRLRY---LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G Y GPSG + GP+G G SG GPSG GPSG GP
Sbjct: 934 GAKGERGYPGNTGPSGLAGAPGPAGSAGPAGKSGNRGEGGPSGPAGITGPSGPRGPAGPQ 993
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G G GR + GLS
Sbjct: 994 GVRGDKGEAGERGARGLDGRKGHNGLS 1020
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/216 (30%), Positives = 79/216 (36%), Gaps = 39/216 (18%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPS---GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GPSG + GP+G GP G++ GP+ G+ GP G +G G G
Sbjct: 770 DAGPSGATGFPGPAGRAGAPGPPGNVGPSGPTGHPGKDGSRGPRGDSGPVGRPGEQGQHG 829
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYL------------------------------GPSGRLRYLGPSG 98
P G GPSG G G GPSG
Sbjct: 830 PVGLAGDKGPSGEAGPAGPPGAAGPSGVLGARGILGLPGTRGERGLPGGPGSNGEPGPSG 889
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSG 152
GP G +G G + + G +GR +DGP GR G G Y GPSG
Sbjct: 890 LAGSSGPRGPPGSVGSPGPVGHSGEAGRDGHPGNDGPPGRDGLPGAKGERGYPGNTGPSG 949
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G SG GPSG GPSG
Sbjct: 950 LAGAPGPAGSAGPAGKSGNRGEGGPSGPAGITGPSG 985
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/172 (33%), Positives = 70/172 (40%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G GPSG+ G G+ GP GR +GP+GS GP G G +GR
Sbjct: 373 GPNGEAGSSGPSGNAGIRGVPGTRGLPGPDGRAGGIGPAGSRGSSGPPGARGPNGDAGRP 432
Query: 73 -----LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
L G G GP G+ GP G G +G G G + + GP G
Sbjct: 433 GEPGLLGARGLPGFSGSNGPQGKEGPAGPQGIEGRSGAAGPAGARGEPGAIGFPGPKGPN 492
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G GPSG GP G GP+G G +G GPSG
Sbjct: 493 GEPGKNGDKGNQGPSGNRGAPGPDGNNGAQGPAG---LGGATGEKGEQGPSG 541
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/165 (34%), Positives = 62/165 (37%), Gaps = 15/165 (9%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
GS GPSG GP GP G + GP G G G GP GR
Sbjct: 880 GSNGEPGPSGLAGSSGP------RGPPGSVGSPGPVGHSGEAGRDGHPGNDGPPGRDGLP 933
Query: 95 GPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G Y GPSG GP+G G SG GPSG GPSG GP
Sbjct: 934 GAKGERGYPGNTGPSGLAGAPGPAGSAGPAGKSGNRGEGGPSGPAGITGPSGPRGPAGPQ 993
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------GPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G G GR + GPSG GPSG +
Sbjct: 994 GVRGDKGEAGERGARGLDGRKGHNGLSGLPGPSGTPGETGPSGSV 1038
Score = 35.8 bits (81), Expect = 10.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/141 (34%), Positives = 55/141 (39%), Gaps = 9/141 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G G G GP GR G G Y GPSG GP+
Sbjct: 898 GPPGSVGSPGPVGHSGEAGRDGHPGNDGPPGRDGLPGAKGERGYPGNTGPSGLAGAPGPA 957
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G SG+ GPSG GPSG GP G G +G G GR +
Sbjct: 958 GSAGPAGKSGNRGEGGPSGPAGITGPSGPRGPAGPQGVRGDKGEAGERGARGLDGRKGHN 1017
Query: 131 G------PSGRLRYLGPSGRL 145
G PSG GPSG +
Sbjct: 1018 GLSGLPGPSGTPGETGPSGSV 1038
>gi|339781449|gb|AEK07281.1| gp7 [Mycobacterium phage PackMan]
Length = 347
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/179 (31%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 12/179 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + LGP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 141 AGPQGAVGPLGPKGDPGDTGPKGDTGATGPQG---ATGPKGDTGAQGPQGIQGATGPQGL 197
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G G +G L GP G G G G P+G GP+G +
Sbjct: 198 QGPKGDTGPKGDKGDTGDLGPQGPKGDKGDKGDPGTAGLTGLQGPAGAPGEPGPTGATGA 257
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G P G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 258 TGPQG------PKGDTGPQGPKGDTGAQGPKGDTGAQGPKGDTGATGAQGPTGATGPQG 310
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/185 (31%), Positives = 64/185 (34%), Gaps = 21/185 (11%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
+L GP G GP G++ LGP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 131 QLDVRGPQGPA---GPQGAVGPLGPKGDPGDTGPKGDTGATGPQG---ATGPKGDTGAQG 184
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------DG 131
P G GP G GP G G G LGP G G G + G
Sbjct: 185 PQGIQGATGPQG---LQGPKGDTGPKGDKGDTGDLGPQGPKGDKGDKGDPGTAGLTGLQG 241
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP+G GP G P G GP G GP G GP G
Sbjct: 242 PAGAPGEPGPTGATGATGPQG------PKGDTGPQGPKGDTGAQGPKGDTGAQGPKGDTG 295
Query: 192 YLGLS 196
G
Sbjct: 296 ATGAQ 300
>gi|47569126|ref|ZP_00239814.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
gi|47554197|gb|EAL12560.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
Length = 502
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/181 (32%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 180 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT---GATGAQGAQGPAGAT 236
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 237 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGA---TGPQGA---QGPAGATGATGPQ 290
Query: 134 GRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP+G GP+G GP G GP+G GP+G GP
Sbjct: 291 GPQGIQGPAGATGAQGAQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGAQGAQGPAGATGATGPQ 350
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 351 G 351
>gi|89071264|ref|ZP_01158437.1| type I secretion target repeat protein [Oceanicola granulosus
HTCC2516]
gi|89043212|gb|EAR49444.1| type I secretion target repeat protein [Oceanicola granulosus
HTCC2516]
Length = 1396
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/194 (33%), Positives = 79/194 (40%), Gaps = 6/194 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G SG+ R G +G+ R G SG R G SG G SG+ + G G R G GR
Sbjct: 707 TGGSGKDRLSGGNGNDRLKGESGDDRLWGRSGADSLSGSSGADKLWGGDGNDRLAGGDGR 766
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD-- 130
G G+ R G + G SG R G GR R G G R LG + ++D
Sbjct: 767 DSLHGEIGNDRLAGGNADDALDGGSGDDRLEGEDGRDRLTGGDGDDRLLGGA---DADSL 823
Query: 131 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G R G SG G S G SG R G SGR + G G
Sbjct: 824 YGGNGDDTLDGSTGADRLEGGSGADSLSGGSSADLLYGGSGHDRVKGGSGRDKLYGHGGN 883
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G D +SG
Sbjct: 884 DALWGGFDADTLSG 897
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/176 (32%), Positives = 72/176 (40%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G GR LG +G+ R G G+ G +G G S R G R G G
Sbjct: 1142 GQGGRDALLGGTGNDRLRGGDGADSLWGGNGHDALYGGSSGDRLWGGDKNDRLFGNGGAD 1201
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
R G SG+ G +GR R G SG R G + G SG+ R G G G S
Sbjct: 1202 RLYGESGADSLEGGTGRDRLYGGSGGDRLWGDEDKDLLKGQSGKDRLYGGGGADKIKGGS 1261
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
R G G+ R G GR + G G R G +G R G +GR + G SG+
Sbjct: 1262 DNDRLEGGGGKDRIDGGKGRDKIDGGKGNDRLDGGAGSDRIKGGAGRDKIEGGSGK 1317
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/155 (33%), Positives = 65/155 (41%), Gaps = 1/155 (0%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
Y G SG R G R G G+ R G SG G +GR R G SG R G
Sbjct: 1177 YGGSSGD-RLWGGDKNDRLFGNGGADRLYGESGADSLEGGTGRDRLYGGSGGDRLWGDED 1235
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
+ G SG+ R G G + G S R G G+ DG GR + G G R G
Sbjct: 1236 KDLLKGQSGKDRLYGGGGADKIKGGSDNDRLEGGGGKDRIDGGKGRDKIDGGKGNDRLDG 1295
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
+G R G +GR + G SG+ G SG ++
Sbjct: 1296 GAGSDRIKGGAGRDKIEGGSGKDVLTGGSGADDFI 1330
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/148 (34%), Positives = 58/148 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G G SG R G +G R G SG R G SG+ G SG + G G
Sbjct: 699 GGDGDDTLTGGSGKDRLSGGNGNDRLKGESGDDRLWGRSGADSLSGSSGADKLWGGDGND 758
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
R G GR G G R G + DG SG R G GR R G G R LG +
Sbjct: 759 RLAGGDGRDSLHGEIGNDRLAGGNADDALDGGSGDDRLEGEDGRDRLTGGDGDDRLLGGA 818
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G +G R G SG
Sbjct: 819 DADSLYGGNGDDTLDGSTGADRLEGGSG 846
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/148 (33%), Positives = 59/148 (39%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G G G SG+ R G +G+ R G SG R G SG G SG+ + G G
Sbjct: 699 GGDGDDTLTGGSGKDRLSGGNGNDRLKGESGDDRLWGRSGADSLSGSSGADKLWGGDGND 758
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
R G GR G G R G + G SG +G GR R G G R LG +
Sbjct: 759 RLAGGDGRDSLHGEIGNDRLAGGNADDALDGGSGDDRLEGEDGRDRLTGGDGDDRLLGGA 818
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G G +G R G SG
Sbjct: 819 DADSLYGGNGDDTLDGSTGADRLEGGSG 846
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/181 (32%), Positives = 72/181 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G SG R G +G+ R G G LG +G R G G+ G +G G S
Sbjct: 1124 GGSGADRLSGGAGNDRLSGQGGRDALLGGTGNDRLRGGDGADSLWGGNGHDALYGGSSGD 1183
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
R G + R G G R G SG G +GR R G SG R G + G S
Sbjct: 1184 RLWGGDKNDRLFGNGGADRLYGESGADSLEGGTGRDRLYGGSGGDRLWGDEDKDLLKGQS 1243
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G+ R G G + G S R G G+ R G GR + G G R G +G R
Sbjct: 1244 GKDRLYGGGGADKIKGGSDNDRLEGGGGKDRIDGGKGRDKIDGGKGNDRLDGGAGSDRIK 1303
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 1304 G 1304
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/121 (35%), Positives = 47/121 (38%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G G G SG+ R G +G R G SG R G SG G SG G G
Sbjct: 699 GGDGDDTLTGGSGKDRLSGGNGNDRLKGESGDDRLWGRSGADSLSGSSGADKLWGGDGND 758
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
R G GR G G R G + G SG R G GR R G G R LG +
Sbjct: 759 RLAGGDGRDSLHGEIGNDRLAGGNADDALDGGSGDDRLEGEDGRDRLTGGDGDDRLLGGA 818
Query: 197 D 197
D
Sbjct: 819 D 819
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/212 (30%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 23/212 (10%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
E G +GR + SG +G GS G G G SG+ R G SG R
Sbjct: 1025 EDEAETGSAGRDQIRAGSGRDTVIGRGGSDLIWGEDGADSLAGGSGADRLYGGSGDDRIA 1084
Query: 68 ----------GPSGRLRYLGPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G G LG +G R+ G SG R G +G R G
Sbjct: 1085 AGDHADEVTGGSGGDWADLG-AGDDRFEAGRSDRSADTVAGGSGADRLSGGAGNDRLSGQ 1143
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GR LG +G R G G + G +G G S R G R G G R
Sbjct: 1144 GGRDALLGGTGNDRLRGGDGADSLWGGNGHDALYGGSSGDRLWGGDKNDRLFGNGGADRL 1203
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
G SG G +GR R G SG R G D
Sbjct: 1204 YGESGADSLEGGTGRDRLYGGSGGDRLWGDED 1235
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/192 (29%), Positives = 68/192 (35%), Gaps = 17/192 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G R G + G SG R G GR R G G R LG + G +G
Sbjct: 771 GEIGNDRLAGGNADDALDGGSGDDRLEGEDGRDRLTGGDGDDRLLGGADADSLYGGNGDD 830
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSG----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G+ R G SG L Y G SG R G SGR + G G G
Sbjct: 831 TLDGSTGADRLEGGSGADSLSGGSSADLLY-GGSGHDRVKGGSGRDKLYGHGGNDALWGG 889
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
++D G +G R G SG R G G G G R G G +G
Sbjct: 890 ---FDADTLSGSTGNDRLYGGSGNDRLDGDGGNDVLRGDDGNDRIDAGHGDDDVEGGAGS 946
Query: 181 LRYLGPSGRLRY 192
GR R+
Sbjct: 947 DTVRLGDGRDRF 958
>gi|228909164|ref|ZP_04072992.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
IBL 200]
gi|228850485|gb|EEM95311.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
IBL 200]
Length = 822
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/196 (30%), Positives = 72/196 (36%), Gaps = 9/196 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP G G +G G G +
Sbjct: 446 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPI 505
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G G + GP+G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 506 GPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQ 565
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G GP+G GP G GP G G +G GP G GP
Sbjct: 566 GPQGITGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGPQ 622
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSG 203
G G + V+G
Sbjct: 623 GITGSTGATGQTGVTG 638
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 341 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 400
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 460
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G G+
Sbjct: 461 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGI 513
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/175 (33%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP G
Sbjct: 431 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 487
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G +GP+G G G +GP+G G G GP+
Sbjct: 488 ---GPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPT 544
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 545 GPTGATGPTGE---TGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGPQG 596
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/186 (31%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 436 TGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT---GPTGA 492
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G G G +GP+G G G GP+G + GP
Sbjct: 493 TGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGP 552
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGR 189
+G GP G GP G G +G GP G GP +G GP+G
Sbjct: 553 TGE---TGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGE 609
Query: 190 LRYLGL 195
GL
Sbjct: 610 TGPQGL 615
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 73/192 (38%), Gaps = 6/192 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G GP G GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 464 GPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQ 520
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G G G GP+G GP+G GP G G +G + GP+
Sbjct: 521 GPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGPT 580
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP G G +G GP G GP G G +G+
Sbjct: 581 GE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGPQGITGSTGATGQTGVT 637
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 638 GATGPTGIQGIQ 649
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 68/183 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G GS+ GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 356 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVR 415
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP
Sbjct: 416 GATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQ 475
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G + GP G G G + GP+G
Sbjct: 476 GIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQ 535
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 536 GIT 538
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/162 (30%), Positives = 60/162 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 341 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 400
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 460
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 461 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQ 502
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G GP+G+ G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 468 SIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTG 527
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G GP+G GP+G GP G GP G G +G G
Sbjct: 528 PTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGE---TGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGETG 584
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G G +G GP G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 585 PQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGPQGITGSTGATGQTGVTGATGPTG 644
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 645 IQGI 648
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/189 (30%), Positives = 68/189 (35%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 400 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 459
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP G G +G G G + GP G G
Sbjct: 460 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 519
Query: 133 SGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + GP+G GP+G GP+G GP G G +G GP
Sbjct: 520 QGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGPQGITGPTGATGP 579
Query: 187 SGRLRYLGL 195
+G GL
Sbjct: 580 TGETGPQGL 588
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 382 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGV 441
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 442 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT---GPTGATGPQGI 498
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G G G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 499 QGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGET 556
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 66/180 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 377 GSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPT 436
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G
Sbjct: 437 GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQ 496
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G + GP G G G + GP+G G +G+ GP+G G +
Sbjct: 497 GIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGET 556
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS+ GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 364 TGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGL 423
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 424 QGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGP 483
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G GP G GP +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 484 Q------GPTGPTGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGP 531
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 532 QGL 534
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 95 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 154
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 155 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGGTGVQGLQ 214
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + G +G GP+G G++
Sbjct: 215 GPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGLTGSTGVT 262
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 56 GPTGPTGLTGPQGSQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 112
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G + GP+G G G GP+G G G L S G
Sbjct: 113 GPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQ 172
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 173 GITGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGGTGVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQ 232
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 233 GV 234
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PS 79
GP+G G G GP+G GP GS GP G G G G P+
Sbjct: 38 GPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGSQGPMGEQGPQGIQGVQGIQGERGPT 97
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 98 GPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGNT 157
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G GL
Sbjct: 158 GIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGGTGVQGL 213
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/178 (29%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 95 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 154
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G LG SG G G +GP+G P+G G G + G +
Sbjct: 155 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGPIGPTG------PTGSQGIQGEQGPMGPQGGT 208
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSG 188
G GP G + +GP+G G G + G +G GP +G GP+G
Sbjct: 209 GVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGLTGSTGVTGPTG 266
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/161 (29%), Positives = 63/161 (39%), Gaps = 9/161 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G +GP+G G G GP+G G G LG SG
Sbjct: 112 IGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGL 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +GP+G G G +GP G GP G + +GP+G S
Sbjct: 172 QGITGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGGTGVQGLQGPQGEMGQVGPTG---S 228
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G +GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 229 QGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGLTGSTG---VTGPTG 266
>gi|229145933|ref|ZP_04274312.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST24]
gi|228637541|gb|EEK93992.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST24]
Length = 539
Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 74/183 (40%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 79 GPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAE 138
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G G +G G G G +G + GP
Sbjct: 139 GAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGIQGAQGPQ 198
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 199 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGIQGVIGPTGAQGIRGPQGNTGEV 258
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 259 GIT 261
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 67/172 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 114 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 173
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 174 QGPQGVQGIQGTTGLTGIQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 233
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + +
Sbjct: 234 QGIQGVIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGII 285
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/173 (27%), Positives = 67/173 (38%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G +G +G G G GP+G G G G +G
Sbjct: 113 VIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAG 172
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 173 TQGPQGVQGIQGTTGLTGIQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQG 232
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + +
Sbjct: 233 IQGIQGVIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGII 285
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/171 (28%), Positives = 66/171 (38%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G+ GP+G+ G G L GP+G+ G G +GP+G +G G
Sbjct: 71 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 130
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+G +G G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 131 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTG 190
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G +GP+G + GP G GP+G G G +G
Sbjct: 191 IQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGIQGVIG 241
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/166 (28%), Positives = 66/166 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 97 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQ 156
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G G +G G G G +G GP G +GP+G + GP
Sbjct: 157 GIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGIQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQ 216
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 217 GLQGITGPTGAQGVQGIQGIQGVIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 262
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 61/164 (37%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 71 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 130
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G +G G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 131 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTG 190
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 191 IQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 234
>gi|195729205|gb|ACG50753.1| VtaA3 [Haemophilus parasuis str. Nagasaki]
Length = 1194
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/190 (30%), Positives = 78/190 (41%), Gaps = 12/190 (6%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T G+ K G G + GP+G+ GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 350 TDGSSDTIKKGEKGDQGPMGPAGPAGAQGIQGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPVGPAGP 409
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G + GP+G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 410 VGPVGAQGPAGPRGEAGPAGAT---GPQG---ATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAG---- 459
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P G + G G GP G +G +G + GP+G GP G GP+G
Sbjct: 460 --PKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGP 517
Query: 181 LRYLGPSGRL 190
+GP G
Sbjct: 518 AGPIGPQGET 527
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/192 (30%), Positives = 78/192 (40%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G G +G GP+G + GP G + GP+G GP+G
Sbjct: 371 AGPAGAQGIQGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPVGPAGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAGA 430
Query: 73 LR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP G GP G G G GP G +G +G
Sbjct: 431 TGPQGATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGP 490
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LR-YLGPSGRLRY 183
+ GP+G GP G GP+G +GP G G G LR GP+G
Sbjct: 491 VGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQGETGPKGDKGEQGLRGEQGPAGERGE 550
Query: 184 LGPSGRLRYLGL 195
+GP+G + G+
Sbjct: 551 IGPAGPIGPQGV 562
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 75/185 (40%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRY 66
GP G + GP+G GP+G+ GP+G GP G GP G
Sbjct: 407 AGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAGATGPQGATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGA 466
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G G GP G +G +G + GP+G GP G GP+G +GP G
Sbjct: 467 KGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQGE 526
Query: 127 LNSDGPSGR--LR-YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G G LR GP+G +GP+G + G G G G GP+G
Sbjct: 527 TGPKGDKGEQGLRGEQGPAGERGEIGPAGPIGPQGVPGPKGDKGEQGLRGETGPAGERGE 586
Query: 184 LGPSG 188
+GP+G
Sbjct: 587 IGPAG 591
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/189 (30%), Positives = 73/189 (38%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G GP G GP G G G GP G +G +G + GP
Sbjct: 437 TGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGP 496
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LR-YLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G GP G GP+G +GP G G G LR GP+G +GP+G
Sbjct: 497 AGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQGETGPKGDKGEQGLRGEQGPAGERGEIGPAGP 556
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ G G G G GP+G +GP+G GP G G G+ GP
Sbjct: 557 IGPQGVPGPKGDKGEQGLRGETGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGQKGDTGP 616
Query: 187 SGRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 617 KGDRGQQGI 625
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G +GP+G GP+G G G+ G G GP G GP G
Sbjct: 720 GQKGDTGPVGPTGPRGEPGPTGPQGPQGIPGAQGPKGDKGDPGQAGPKGEKGDTGPRGET 779
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GP+G GP G GP G GP+G + GP G + G G+
Sbjct: 780 GPAGPAGAKGEQGPRGEQGLPGVAGPKGDRGEAGPAGPVGPAGPQGPQGTAGAQGQKGDK 839
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G+ G +G+ GP+G GP G GP+G GP+G G++
Sbjct: 840 GEPGQAGPKGDTGQKGETGPAG---PTGPKGDKGDTGPAGSQGPTGPTGNSELKGIT 893
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 69/179 (38%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G GP G GP+ GP G G G GP G
Sbjct: 428 AGATGPQGATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPA------GPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGP 481
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---NS 129
+G +G + GP+G GP G GP+G +GP G G G
Sbjct: 482 QGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQGETGPKGDKGEQGLRGE 541
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G +GP+G + G G G G GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 542 QGPAGERGEIGPAGPIGPQGVPGPKGDKGEQGLRGETGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEG 600
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 74/193 (38%), Gaps = 21/193 (10%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYL-----GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
EK N G L+ GS + G G + GP+G GP G G +
Sbjct: 337 AEKEAN----GDLKITYTDGSSDTIKKGEKGDQGPMGPAGPAGAQGIQGPKGDRGPKGDT 392
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G GP+G + GP G + GP+G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 393 GERGATGPAGPVGPAGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAG---ATGPQG---ATGPAGEPGKQ 446
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G + GP+G P G G G GP G +G +G + GP+G
Sbjct: 447 GPRGEQGAPGPAG------PKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGER 500
Query: 182 RYLGPSGRLRYLG 194
GP G G
Sbjct: 501 GEQGPRGDKGETG 513
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/167 (29%), Positives = 64/167 (38%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G G G+ G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 728 VGPTGPRGEPGPTGPQGPQGIPGAQGPKGDKGDPGQAGPKGEKGDTGPRGETGPAGPAGA 787
Query: 73 LRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G GP G GP+G + GP G G G+ G G+
Sbjct: 788 KGEQGPRGEQGLPGVAGPKGDRGEAGPAGPVGPAGPQGPQGTAGAQGQKGDKGEPGQAGP 847
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G+ GP+G GP G GP+G GP+G G
Sbjct: 848 KGDTGQKGETGPAG---PTGPKGDKGDTGPAGSQGPTGPTGNSELKG 891
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.097, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/170 (31%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 9/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + GP G GP+G GP G GP+G +GP G G G
Sbjct: 479 VGPQGPVGATGPVGPA---GPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQGETGPKGDKGE 535
Query: 73 --LR-YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
LR GP+G +GP+G + G G G G GP+G +GP+G
Sbjct: 536 QGLRGEQGPAGERGEIGPAGPIGPQGVPGPKGDKGEQGLRGETGPAGERGEIGPAGPAGP 595
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G+ GP G G G GP G +GP G
Sbjct: 596 RGPEGPAGAKGEQGQKGDTGPKGDRGQQGIPG---VAGPKGDRGDVGPMG 642
>gi|426369980|ref|XP_004051957.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Gorilla gorilla
gorilla]
Length = 1666
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 110/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 1017 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1075
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1076 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1130
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1131 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1185
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1186 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1227
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 104/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 975 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 1033
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 1034 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 1083
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 1084 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1138
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1139 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1183
>gi|218230964|ref|YP_002368515.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus B4264]
gi|218158921|gb|ACK58913.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus B4264]
Length = 1451
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/192 (25%), Positives = 68/192 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 841 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 900
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G G +G G G G +G G +G + GP
Sbjct: 901 QGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 960
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G G +G GP+G GP G G +G
Sbjct: 961 QGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 1020
Query: 193 LGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 1021 QGVQGNTGATGA 1032
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/192 (26%), Positives = 66/192 (34%), Gaps = 3/192 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G+ G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 859 TGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGV 918
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 919 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGV 978
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP+G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 979 QGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 1035
Query: 193 LGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 1036 QGVQGNTGATGA 1047
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 62/183 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G G +G+ GP G GP G+ G +G G G
Sbjct: 833 GAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNT 892
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G G +G G G G +G G +
Sbjct: 893 GATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNT 952
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 953 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNT 1012
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 1013 GAT 1015
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 64/183 (34%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ GP G+ G +G G G+ G +G GP+G
Sbjct: 851 GNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGAT 910
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G G G G +G G +G GP G + G +
Sbjct: 911 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 970
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 971 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 1030
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 1031 GAT 1033
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 64/183 (34%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G+ GP G G +G
Sbjct: 822 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATG 881
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G +G GP+G GP G G +G G G + G
Sbjct: 882 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 941
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G G +G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 942 ATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATG 1001
Query: 192 YLG 194
G
Sbjct: 1002 ATG 1004
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/183 (25%), Positives = 62/183 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G G +G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 788 GAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 847
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP G G +G G G G +G GP+
Sbjct: 848 GVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPT 907
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G G +G G +G GP G
Sbjct: 908 GATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNT 967
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 968 GAT 970
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 64/183 (34%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 814 TGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGA 873
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 874 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGV 933
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G +G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 934 QGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 990
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 991 QGI 993
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/183 (25%), Positives = 62/183 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 806 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNT 865
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G +G G G G +G GP+G GP G + G +
Sbjct: 866 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGAT 925
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G +G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 926 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 985
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 986 GAT 988
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/192 (25%), Positives = 66/192 (34%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ GP G G +G G G+ G +G G +G
Sbjct: 796 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 855
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ GP G G +G G G G +G GP+G + GP
Sbjct: 856 TGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGP 915
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 916 QGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 975
Query: 193 LGLSDGLRVSGL 204
G+ +G
Sbjct: 976 QGVQGNTGATGA 987
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/190 (25%), Positives = 65/190 (34%), Gaps = 3/190 (1%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 771 PQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATG 830
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G G+ G +G G +G GP G GP G G +G G G
Sbjct: 831 PQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQG 890
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP G G +G GP G G +G G
Sbjct: 891 NTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 947
Query: 195 LSDGLRVSGL 204
+ +G
Sbjct: 948 VQGNTGATGA 957
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 62/185 (33%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 777 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQG 836
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G GP G G +G G G + G
Sbjct: 837 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 896
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G GP+G GP G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 897 ATGPQGIQGPTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTG 953
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 954 ATGAT 958
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/179 (25%), Positives = 63/179 (35%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 890 GNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 949
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ GP G G +G G G G +G GP+G + GP G
Sbjct: 950 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQ 1009
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G G G G +G G +G GP G G +G G+
Sbjct: 1010 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGV 1068
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 868 TGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGA 927
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G G +G GP G G +G G G + G
Sbjct: 928 TGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGA 987
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP+G GP G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 988 TGPQGIQGPTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 1044
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 1045 TGAT 1048
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 62/185 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 876 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 935
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G +G GP G G +G G G G +G G
Sbjct: 936 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQG 995
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G GP G G +G G G G +G G +G GP G
Sbjct: 996 PTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 1055
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 1056 NTGAT 1060
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/166 (27%), Positives = 58/166 (34%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G G +G GP G
Sbjct: 905 GPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 964
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 965 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 1024
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 1025 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG 1067
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/176 (26%), Positives = 62/176 (35%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G G +G G G+ G +G G +G
Sbjct: 895 TGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 954
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G G +G GP+G GP G + G
Sbjct: 955 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGA 1014
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G G +G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 1015 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG 1067
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.069, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/185 (25%), Positives = 61/185 (32%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 714 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQG 773
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 774 VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 833
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G G +G GP G GP G G +G G G
Sbjct: 834 AQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTG 893
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 894 ATGAT 898
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/187 (25%), Positives = 60/187 (32%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGSLRYLGPSGRLRYL 67
G +G GP G+ G +G+ G G G P G G +G
Sbjct: 728 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 787
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G G +G G +G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 788 GAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 847
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G GP G GP G G +G G G G +G GP+
Sbjct: 848 GVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGIQGPT 907
Query: 188 GRLRYLG 194
G G
Sbjct: 908 GATGATG 914
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/187 (24%), Positives = 60/187 (32%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------------PS 61
G +G GP G+ G +G+ G G G +G G P
Sbjct: 713 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQ 772
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G +G G G+ G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 773 GVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 832
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G + G +G G +G GP G GP G G +G G G
Sbjct: 833 GAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNT 892
Query: 182 RYLGPSG 188
G +G
Sbjct: 893 GATGATG 899
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/168 (26%), Positives = 57/168 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G G +G GP G
Sbjct: 372 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQG 431
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 432 VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 491
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G G +G GP G GP G G +G
Sbjct: 492 AQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPRGNTGATGATG 539
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.55, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/150 (26%), Positives = 51/150 (34%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G G +G GP G G +G G G
Sbjct: 921 NTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQG 980
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G GP G G +G GP G G +G G
Sbjct: 981 NTGATGATGPQGIQGPTGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 1037
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G +G G +G GP G
Sbjct: 1038 VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 1067
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 62/174 (35%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G+ G +G GP G+ G +G GP G G +G+
Sbjct: 371 GNTGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGVQGNTGATGAT 424
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G G +G G G G +G G +G + GP G G +
Sbjct: 425 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 484
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G +G G +G GP G GP G G +
Sbjct: 485 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPRGNTGATGAT 538
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.65, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/175 (26%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 371 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGAT---GPQGAQGNTGATGAT---GPQGVQGNTGATGAT 424
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G G G G +G G +G GP G + G +
Sbjct: 425 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGAT 484
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G +G G +G GP G GP G G +G
Sbjct: 485 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGNTGATGPRGNTGATGATG 539
>gi|379719508|ref|YP_005311639.1| putative collagen triple helix repeat-containing protein
[Paenibacillus mucilaginosus 3016]
gi|378568180|gb|AFC28490.1| putative collagen triple helix repeat-containing protein
[Paenibacillus mucilaginosus 3016]
Length = 624
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/153 (26%), Positives = 67/153 (43%), Gaps = 36/153 (23%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G++ +GP+G GP+G+ GP+G +GP +GP+G+ GP+G
Sbjct: 290 TGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGA 343
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G +GP +G + +GP+G GP+G
Sbjct: 344 TGATGPAGDTGAVGPIGATGATGAAGATGATGTTGPTGDTGAVGPIGPAGATGPAGPTGA 403
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+ GP+G +GP +GP+G +GP
Sbjct: 404 TGATGPTGDTGPVGP------IGPTGATGAVGP 430
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/153 (26%), Positives = 64/153 (41%), Gaps = 36/153 (23%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G + +GP+G+ GP+G GP+G +GP +GP+G GP+G
Sbjct: 290 TGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGA 343
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G +GP +G + +GP+G GP+G
Sbjct: 344 TGATGPAGDTGAVGPIGATGATGAAGATGATGTTGPTGDTGAVGPIGPAGATGPAGPTGA 403
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G +GP +GP+G +GP
Sbjct: 404 TGATGPTGDTGPVGP------IGPTGATGAVGP 430
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/159 (26%), Positives = 66/159 (41%), Gaps = 42/159 (26%)
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G +GP +GP+G+ GP+G GP+G +GP +GP+G
Sbjct: 289 PTGDTGAVGP------IGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATG 336
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSGRLR 155
GP+G + GP+G +GP +G + +GP+G
Sbjct: 337 ATGPTGATGATGPAGDTGAVGPIGATGATGAAGATGATGTTGPTGDTGAVGPIGPAGATG 396
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G +GP +GP+G +G
Sbjct: 397 PAGPTGATGATGPTGDTGPVGP------IGPTGATGAVG 429
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/153 (28%), Positives = 67/153 (43%), Gaps = 27/153 (17%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G++ +GP+G GP+G GP+G +GP +GP+G GP+G
Sbjct: 290 TGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGATGATGPTGA 343
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G +GP +G G +G + +GP+G GP+G
Sbjct: 344 TGATGPAGDTGAVGPIGATGATGAAGATGATGTTGPTGDTGAVGPIGPAGATGPAGPTGA 403
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G +GP +GP+G +GP
Sbjct: 404 TGATGPTGDTGPVGP------IGPTGATGAVGP 430
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/209 (24%), Positives = 74/209 (35%), Gaps = 60/209 (28%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G+ GP+G P+G + GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 162 GATGATGPAGATGDTGPTG------PAGDIGPAGPTGATGATGPVGDTGATGPVGPTGAT 215
Query: 76 --------------------LGPSG------------SLRYLGPSGRLRYLGPSG----- 98
GP G + +GP+G GP G
Sbjct: 216 GAVGATGATGATGATGDTGPTGPVGLTGDTGATGATGATGPMGPAGDTGPTGPVGLTGAT 275
Query: 99 ----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G +G + +GP+G GP+G + GP+G +GP +
Sbjct: 276 GATGATGATGSTGPTGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------I 329
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G GP+G GP+G +GP
Sbjct: 330 GPTGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP 358
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 78/204 (38%), Gaps = 42/204 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G +GP+ GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 167 TGPAGATGDTGPTGPAGDIGPA------GPTGATGATGPVGDTGATGPVGPTGATGAVGA 220
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSG---------- 107
G +G+ GP+G + +GP+G GP G
Sbjct: 221 TGATGATGATGDTGPTGPVGLTGDTGATGATGATGPMGPAGDTGPTGPVGLTGATGATGA 280
Query: 108 -----RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G + +GP+G + GP+G GP+G +GP +GP+G
Sbjct: 281 TGATGSTGPTGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP------IGPTGA 334
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G +GP
Sbjct: 335 TGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP 358
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/132 (26%), Positives = 59/132 (44%), Gaps = 30/132 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G GP+G+ GP +G++ +GP+G GP+G+ GP+G +GP
Sbjct: 299 IGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGPIGPTGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGP 358
Query: 70 ------------------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRY 102
+G + +GP+G+ GP+G GP+G +
Sbjct: 359 IGATGATGAAGATGATGTTGPTGDTGAVGPIGPAGATGPAGPTGATGATGPTGDTGPVGP 418
Query: 103 LGPSGRLRYLGP 114
+GP+G +GP
Sbjct: 419 IGPTGATGAVGP 430
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/202 (22%), Positives = 65/202 (32%), Gaps = 66/202 (32%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 111
G+ GP+G GP+G P+G + GP+G GP G GP G
Sbjct: 162 GATGATGPAGATGDTGPTG------PAGDIGPAGPTGATGATGPVGDTGATGPVGPTGAT 215
Query: 112 -----------------------------------------LGPSGRLRYLGPSG----- 125
+GP+G GP G
Sbjct: 216 GAVGATGATGATGATGDTGPTGPVGLTGDTGATGATGATGPMGPAGDTGPTGPVGLTGAT 275
Query: 126 ----------RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRL 172
G +G + +GP+G GP+G GP+G + +GP+G
Sbjct: 276 GATGATGATGSTGPTGDTGAVGPIGPAGATGATGPTGATGATGPAGDTGAVGPIGPTGAT 335
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G +G
Sbjct: 336 GATGPTGATGATGPAGDTGAVG 357
>gi|423641643|ref|ZP_17617261.1| hypothetical protein IK9_01588 [Bacillus cereus VD166]
gi|401277593|gb|EJR83532.1| hypothetical protein IK9_01588 [Bacillus cereus VD166]
Length = 835
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/194 (27%), Positives = 75/194 (38%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 543
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G++
Sbjct: 544 IRGPQGNTGEIGIT 557
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 67/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G +GP+G G
Sbjct: 470 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 530 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 578
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 69/185 (37%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 374 TGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGA 433
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGP 114
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 434 EGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGP 493
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 494 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 553
Query: 175 LGPSG 179
+G +G
Sbjct: 554 IGITG 558
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 70/190 (36%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 392 TGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGA 451
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 452 QGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 508
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 509 QGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGS 568
Query: 181 LRYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 569 QGPQGPQGNV 578
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/212 (25%), Positives = 79/212 (37%), Gaps = 39/212 (18%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G +GP+G GP G+
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNT 551
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSG-- 125
+G +G G G GP G + GP G G +G
Sbjct: 552 GEIGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGITGATGETGATGATGATGPQGVQGVQGITGIQ 611
Query: 126 -------------RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G GP+G G SG +GP G GPSG
Sbjct: 612 GITGTTGNTGATGSQGIQGIQGVQGLQGPTGASGVTGASGS---IGPVGAQGSQGPSG-- 666
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+GP+G G +G + + G++ +GL
Sbjct: 667 -VVGPTG---ATGSAGSIGFFGIAGATGATGL 694
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 62/164 (37%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G +G G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTG 486
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +GP+G + GP G +G + V G+
Sbjct: 487 TQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQ 530
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 8/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 22 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPQG---TTGAQGI 76
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G +G GP+G G G + G G + G G GP+G G
Sbjct: 77 QGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGT 133
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G+ G G G SG GP G G G + G G
Sbjct: 134 QGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGI 193
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 194 QGIT 197
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/205 (24%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 18/205 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS--- 70
GP G GP+G+ GP G GP G G G+ +G +G GP+
Sbjct: 39 GPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPQGTTGAQGIQGA---IGDTGEQGITGPTGLQ 95
Query: 71 ------------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G + G G GP+G G G +G G+ G G
Sbjct: 96 GAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQGER 155
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G SG GP G G G + G G G +G G G +GP+
Sbjct: 156 GITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPT 215
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G G G G++ + + G
Sbjct: 216 GSTGMQGAQGISGIKGITGAIGLQG 240
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/177 (26%), Positives = 60/177 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G + G G GP+GS G G +G G G G G SG
Sbjct: 103 NQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSG 162
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G + G G G +G G G +GP+G G
Sbjct: 163 VTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPTGSTGMQG 222
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G + GP G G +G + G G G +G + G G
Sbjct: 223 AQGISGIKGITGAIGLQGPQGVQGIQGITGATGFQGIKGIRGITGATGSIGTQGSEG 279
>gi|423581557|ref|ZP_17557668.1| hypothetical protein IIA_03072 [Bacillus cereus VD014]
gi|401215047|gb|EJR21767.1| hypothetical protein IIA_03072 [Bacillus cereus VD014]
Length = 835
Score = 55.1 bits (131), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/194 (26%), Positives = 73/194 (37%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G+ GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 423
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
GP+G G G G +G G G G +G GP G
Sbjct: 424 IAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQG 543
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G++
Sbjct: 544 IRGPQGNTGEVGIT 557
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G GP+G G G+ G +G G G G +G
Sbjct: 409 VIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETG 465
Query: 81 SLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+ GP G GP G +GP+G + GP G +GP+G
Sbjct: 466 AAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQG 525
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G G
Sbjct: 526 VQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGITGAMG 585
Query: 189 R 189
Sbjct: 586 E 586
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/212 (26%), Positives = 82/212 (38%), Gaps = 39/212 (18%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G +GP+G GP G+
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNT 551
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------------PSGRLRYLGPSGRL 127
+G +G G G GP G + G P G + G +G
Sbjct: 552 GEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGITGAMGETGATGATGATGPQGLQGFQGITGIQ 611
Query: 128 NS---------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G GPSG +G SG +GP G GPSG
Sbjct: 612 GITGTTGNTGATGPQGIQGIQGVQGLQGPSGVSGVIGASGS---IGPVGAQGSQGPSG-- 666
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+GP+G G +G + +LG++ +GL
Sbjct: 667 -VVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGATGL 694
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYL 67
GP+G G G+ GP+G+ G G +GP+G+ +G P+G
Sbjct: 375 GPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAE 434
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPS 115
G G G +G G G G +G GP G GP
Sbjct: 435 GAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 494
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 495 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEV 554
Query: 176 GPSG 179
G +G
Sbjct: 555 GITG 558
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/205 (26%), Positives = 74/205 (36%), Gaps = 15/205 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 329 IGAQGVQGITGPTGPQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGT 388
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G +GP+G +G G G +G G G + GP
Sbjct: 389 RGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGP 448
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G G G G +G GP G GP G +GP+G
Sbjct: 449 AGAQGIQGVQG---IQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+ GP G +G + V G+
Sbjct: 506 IGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQ 530
>gi|358394383|gb|EHK43776.1| hypothetical protein TRIATDRAFT_284537 [Trichoderma atroviride IMI
206040]
Length = 986
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/218 (26%), Positives = 92/218 (42%), Gaps = 48/218 (22%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G G + +GP+G+ +GP+G GP G + GP+G+ +GP+G + G +G
Sbjct: 463 AGADGAVGPVGPAGADGAVGPTGD---AGPEGPIGPAGPAGADGAVGPAGPVGPTGDAGP 519
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------LRYLGPS----------- 106
G G++ +GP+G +GP+G +GP+
Sbjct: 520 EGPAGADGAVGPVGPAGPAGDVGPTGDAGPEGPAGPAGPAGADGAVGPTGADGADGADGA 579
Query: 107 -------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +GP G +GP+G +DG G + GP+G + GP+G
Sbjct: 580 PGPAGPAGPAGPAGADGAVGPEGP---IGPAGADGTDGADGAVGPAGPAGPIGPAGPAGA 636
Query: 154 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP+G +GP G +GP+G GP+G
Sbjct: 637 DGAVGPAGPAGADGAVGPVGPAGPVGPTGDAGPEGPAG 674
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/149 (30%), Positives = 71/149 (47%), Gaps = 15/149 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G++ GP+G + GP+G +GP+ GP+G +GP G
Sbjct: 604 IGPAGADGTDGADGAVGPAGPAGPIGPAGPAGADGAVGPA------GPAGADGAVGPVGP 657
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G GP+G + GP+G +GP+G GP+G +DG
Sbjct: 658 AGPVGPTGDAGPEGPAGADG------AVGPAGPAGPAGDVGPTGDPGPEGPAGPAGADGA 711
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 712 VGPAGPVGPAGD---VGPAGDAGPEGPAG 737
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/152 (29%), Positives = 68/152 (44%), Gaps = 24/152 (15%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP G + GP+G G G + GP+G + GP+G +GP+G P+G
Sbjct: 598 VGPEGPI---GPAGADGTDGADGAVGPAGPAGPIGPAGPAGADGAVGPAG------PAGA 648
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+GP G +GP+G +GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 649 DGAVGPVGPAGPVGPTGDAGPEGPAGADGAVGPAGPAGPAGDVGPTGDPGPEGPAGPAGA 708
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 709 DGAVGPAGPVGPAGD---VGPAGDAGPEGPAG 737
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/163 (29%), Positives = 75/163 (46%), Gaps = 33/163 (20%)
Query: 29 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
+GP G +GP+G G G++ GP+G + GP+G +GP+ GP+
Sbjct: 596 GAVGPEGP---IGPAGADGTDGADGAVGPAGPAGPIGPAGPAGADGAVGPA------GPA 646
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +GP G +GP+G GP+G +GP+G +GP+
Sbjct: 647 GADGAVGPVGPAGPVGPTGDAGPEGPAGADGAVGPAGPAGPAGDVGPTGDPGPEGPA--- 703
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G +GP+G +GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 704 ---GPAGADGAVGPAGP---VGPAGD---VGPAGDAGPEGPAG 737
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/239 (23%), Positives = 91/239 (38%), Gaps = 60/239 (25%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G + GP+G+ +GP+G + G +G G G++ +GP+G +GP+G
Sbjct: 486 DAGPEGPIGPAGPAGADGAVGPAGPVGPTGDAGPEGPAGADGAVGPVGPAGPAGDVGPTG 545
Query: 72 R---------------LRYLGPS------------------------------GSLRYLG 86
+GP+ G +G
Sbjct: 546 DAGPEGPAGPAGPAGADGAVGPTGADGADGADGAPGPAGPAGPAGPAGADGAVGPEGPIG 605
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD---GPSGRLRYLGPSG 143
P+G G G + GP+G + GP+G +GP+G +D GP G +GP+G
Sbjct: 606 PAGADGTDGADGAVGPAGPAGPIGPAGPAGADGAVGPAGPAGADGAVGPVGPAGPVGPTG 665
Query: 144 RLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G +GP+G GP+G G G +GP+G +
Sbjct: 666 DAGPEGPAGADGAVGPAGPAGPAGDVGPTGDPGPEGPAGPAGADGAVGPAGPVGPAGDV 724
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/113 (31%), Positives = 58/113 (51%), Gaps = 18/113 (15%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G G++ GP+G +GP +GP+G+ +GP+G GP G + GP+G
Sbjct: 452 GADGAVGPAGPAGADGAVGP------VGPAGADGAVGPTGDA---GPEGPIGPAGPAGAD 502
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
+GP+G + GP+G +GP+G +GP +GP+G +GP+G
Sbjct: 503 GAVGPAGPV---GPTGDAGPEGPAGADGAVGP------VGPAGPAGDVGPTGD 546
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/104 (30%), Positives = 54/104 (51%), Gaps = 9/104 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G++ GP+G+ +GP +GP+G+ +GP+G GP G + GP+G+
Sbjct: 452 GADGAVGPAGPAGADGAVGP------VGPAGADGAVGPTGD---AGPEGPIGPAGPAGAD 502
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP+G + G +G G G + +GP+G +GP+G
Sbjct: 503 GAVGPAGPVGPTGDAGPEGPAGADGAVGPVGPAGPAGDVGPTGD 546
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/113 (31%), Positives = 56/113 (49%), Gaps = 18/113 (15%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G G++ GP+G +GP +GP+G +GP+G GP G + GP+G
Sbjct: 452 GADGAVGPAGPAGADGAVGP------VGPAGADGAVGPTGDA---GPEGPIGPAGPAGAD 502
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP+G +GP+G GP+G +GP +GP+G +GP+G
Sbjct: 503 GAVGPAGP---VGPTGDAGPEGPAGADGAVGP------VGPAGPAGDVGPTGD 546
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/212 (26%), Positives = 77/212 (36%), Gaps = 42/212 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G G G+ GP G+ + GP G GP G GP+G GP
Sbjct: 328 TGPKGDQGIQGFPGATGSQGPQGNRGPQGFTGPKGDQGNQGPQGLTGSQGPAGNR---GP 384
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRY------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRY--------- 102
G GP+G+ G G + GP+G
Sbjct: 385 QGLTGPAGPTGADGAVGPVGPVGPVGPVGPAGADGADGAVGPAGPAGADGAVGPVGPVGP 444
Query: 103 ------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G G + GP+G +GP G +DG G GP G + GP+G
Sbjct: 445 VGPAGADGADGAVGPAGPAGADGAVGPVGPAGADGAVGPTGDAGPEGPIGPAGPAGADGA 504
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+GP+G +GP+G GP+G +GP G
Sbjct: 505 VGPAGP---VGPTGDAGPEGPAGADGAVGPVG 533
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.054, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 59/131 (45%), Gaps = 21/131 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + GP+G+ +GP+ GP+G +GP G +GP+G GP+G
Sbjct: 622 AGPAGPIGPAGPAGADGAVGPA------GPAGADGAVGPVGPAGPVGPTGDAGPEGPAGA 675
Query: 73 L------------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+GP+G GP+G G G +GP+G +GP+G
Sbjct: 676 DGAVGPAGPAGPAGDVGPTGDPGPEGPAGPAGADGAVGPAGPVGPAGD---VGPAGDAGP 732
Query: 121 LGPSGRLNSDG 131
GP+G +DG
Sbjct: 733 EGPAGPAGADG 743
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/217 (26%), Positives = 74/217 (34%), Gaps = 42/217 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRY 66
G G GP G GP+GS + GP G G G+ GP G +
Sbjct: 298 TGTKGDQGTQGPQGLTGSQGPAGSRGPQGFTGPKGDQGIQGFPGATGSQGPQGNRGPQGF 357
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--------------- 111
GP G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 358 TGPKGDQGNQGPQGLTGSQGPAGNR---GPQGLTGPAGPTGADGAVGPVGPVGPVGPVGP 414
Query: 112 ---LGPSGRLRYLGPSGRL---------------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G G + GP+G +DG G + GP+G +GP G
Sbjct: 415 AGADGADGAVGPAGPAGADGAVGPVGPVGPVGPAGADGADGAVGPAGPAGADGAVGPVGP 474
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G GP G + GP+G +GP+G +
Sbjct: 475 AGADGAVGPTGDAGPEGPIGPAGPAGADGAVGPAGPV 511
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/220 (25%), Positives = 80/220 (36%), Gaps = 54/220 (24%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYL 67
GP G GP+GS + GP G G G GP G+ + GP G
Sbjct: 308 GPQGLTGSQGPAGSRGPQGFTGPKGDQGIQGFPGATGSQGPQGNRGPQGFTGPKGDQGNQ 367
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------------LGPSGRL 109
GP G GP+G+ GP G GP+G G G +
Sbjct: 368 GPQGLTGSQGPAGNR---GPQGLTGPAGPTGADGAVGPVGPVGPVGPVGPAGADGADGAV 424
Query: 110 RYLGPSGRLR---------------------YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
GP+G +GP+G +DG + +GP+G +
Sbjct: 425 GPAGPAGADGAVGPVGPVGPVGPAGADGADGAVGPAGPAGADG---AVGPVGPAGADGAV 481
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G + GP+G +GP+G + G +G
Sbjct: 482 GPTGDA---GPEGPIGPAGPAGADGAVGPAGPVGPTGDAG 518
>gi|228922075|ref|ZP_04085386.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar huazhongensis BGSC 4BD1]
gi|228837683|gb|EEM83013.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar huazhongensis BGSC 4BD1]
Length = 824
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/194 (26%), Positives = 73/194 (37%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G+ GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 356 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 412
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
GP+G G G G +G G G G +G GP G
Sbjct: 413 IAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTG 472
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 473 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQG 532
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G++
Sbjct: 533 IRGPQGNTGEVGIT 546
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G GP+G G G+ G +G G G G +G
Sbjct: 398 VIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETG 454
Query: 81 SLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+ GP G GP G +GP+G + GP G +GP+G
Sbjct: 455 AAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQG 514
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G G
Sbjct: 515 VQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGITGAMG 574
Query: 189 R 189
Sbjct: 575 E 575
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/212 (26%), Positives = 82/212 (38%), Gaps = 39/212 (18%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G +GP+G GP G+
Sbjct: 481 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNT 540
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------------PSGRLRYLGPSGRL 127
+G +G G G GP G + G P G + G +G
Sbjct: 541 GEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGITGAMGETGATGATGATGPQGLQGFQGITGIQ 600
Query: 128 NS---------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G GPSG +G SG +GP G GPSG
Sbjct: 601 GITGTTGNTGATGPQGIQGIQGVQGLQGPSGVSGVIGASGS---IGPVGAQGSQGPSG-- 655
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+GP+G G +G + +LG++ +GL
Sbjct: 656 -VVGPTG---ATGSAGSIGFLGIAGATGATGL 683
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYL 67
GP+G G G+ GP+G+ G G +GP+G+ +G P+G
Sbjct: 364 GPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAE 423
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPS 115
G G G +G G G G +G GP G GP
Sbjct: 424 GAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 483
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 484 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGEQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEV 543
Query: 176 GPSG 179
G +G
Sbjct: 544 GITG 547
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/205 (26%), Positives = 74/205 (36%), Gaps = 15/205 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 318 IGAQGVQGITGPTGPQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGT 377
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G +GP+G +G G G +G G G + GP
Sbjct: 378 RGVTGPTGAEGSKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGATGP 437
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G G G G +G GP G GP G +GP+G
Sbjct: 438 AGAQGIQGVQG---IQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGA 494
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+ GP G +G + V G+
Sbjct: 495 IGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQ 519
>gi|444728497|gb|ELW68954.1| Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Tupaia chinensis]
Length = 2286
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/222 (35%), Positives = 110/222 (49%), Gaps = 52/222 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G +G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 981 FRFEGSPG-LRFEGSAGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1039
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1040 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFDGPLLQQGVGMRFEGP 1094
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GP
Sbjct: 1095 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPVPG 1149
Query: 161 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1150 GGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1190
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/216 (33%), Positives = 100/216 (46%), Gaps = 69/216 (31%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 939 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 997
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 998 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 1047
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 1048 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFDGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1102
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
R+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 1103 RFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 1133
>gi|4240137|dbj|BAA74847.1| KIAA0824 protein [Homo sapiens]
Length = 1644
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 110/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 935 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 993
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 994 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1048
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1049 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1103
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1104 GGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1145
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 104/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 893 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 951
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 952 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 1001
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 1002 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1056
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1057 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1101
>gi|344203491|ref|YP_004788634.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Muricauda
ruestringensis DSM 13258]
gi|343955413|gb|AEM71212.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Muricauda
ruestringensis DSM 13258]
Length = 538
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 154 DKGPQGDPGIQGPQGPTGEQGPQGPVGEQGPVGA---QGPQGDPGVQGPQGPTGEQGPVG 210
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G GP G GP G + G G G G GP G G
Sbjct: 211 DKGETGDKGETGDKGPQGDPGIQGPQGPVGEQGLVGDKGETGDKGETGDKGPQGDPGVQG 270
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G + GP+G +G G G G GP G GP G + GP+G
Sbjct: 271 PQGPVGLQGPTGEQGLVGDKGD---TGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQGPVGLQGPTGE 325
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/188 (31%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 8/188 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G + GP G+ GP G GP G GP G G G
Sbjct: 165 GPQGPTGEQGPQGPVGEQGPVGA---QGPQGDPGVQGPQGPTGEQGPVGDKGETGDKGET 221
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G + G G G G GP G GP G + GP+
Sbjct: 222 GDKGPQGDPGIQGPQGPVGEQGLVGDKGETGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQGPVGLQGPT 281
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G G G G GP G GP G + GP+G GP G +
Sbjct: 282 GEQGLVGDKGD---TGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQGPVGLQGPTGEQGPQGPIGEQGPI 338
Query: 194 GLS--DGL 199
G DGL
Sbjct: 339 GEQGPDGL 346
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G + GP G GP G GP G G G GP G GP G
Sbjct: 179 VGEQGPVGAQGPQGDPGVQGPQGPTGEQGPVGDKGETGDKGETGDKGPQGDPGIQGPQGP 238
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G G G G GP G GP G + GP+G +G G G
Sbjct: 239 VGEQGLVGDKGETGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQGPVGLQGPTGEQGLVGDKGDTGDKGE 298
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP G + GP+G GP G + GP G GP G
Sbjct: 299 TGD---KGPQGDPGVQGPQGPVGLQGPTGE---QGPQGPIGEQGPIGE---QGPDG 345
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G+ GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 174 GPQGPVGEQGPVGAQ---GPQGDPGVQGPQGPTGEQGPVGDKGETGDKGETGDKGPQGDP 230
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + G G G G GP G GP G + GP+G G
Sbjct: 231 GIQGPQGPVGEQGLVGDKGETGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQGPVGLQGPTGEQ---GLV 287
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G GP G + GP+G GP G + GP G
Sbjct: 288 GDKGDTGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQGPVGLQGPTGE---QGPQGPIGEQGPIGEQGPD 344
Query: 194 GLSD 197
GL++
Sbjct: 345 GLAN 348
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/141 (31%), Positives = 50/141 (35%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G GP G GP G + GP G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 156 GPQGDPGIQGPQGPTGEQGPQGPVGEQGPVGA---QGPQGDPGVQGPQGPTGEQGPVGDK 212
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G GP G GP G + G G G G GP G GP
Sbjct: 213 GETGDKGETGDKGPQGDPGIQGPQGPVGEQGLVGDKGETGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQ 272
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G + GP+G +G G
Sbjct: 273 GPVGLQGPTGEQGLVGDKGDT 293
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/136 (31%), Positives = 48/136 (35%), Gaps = 3/136 (2%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 156 GPQGDPGIQGPQGPTGEQGPQGPVGEQGPVGAQ---GPQGDPGVQGPQGPTGEQGPVGDK 212
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G G GP G GP G + G G G G GP G GP
Sbjct: 213 GETGDKGETGDKGPQGDPGIQGPQGPVGEQGLVGDKGETGDKGETGDKGPQGDPGVQGPQ 272
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLG 194
G + GP+G +G
Sbjct: 273 GPVGLQGPTGEQGLVG 288
>gi|158319159|ref|YP_001511666.1| triple helix repeat-containing collagen [Alkaliphilus oremlandii
OhILAs]
gi|158139358|gb|ABW17670.1| Collagen triple helix repeat [Alkaliphilus oremlandii OhILAs]
Length = 440
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/165 (27%), Positives = 66/165 (40%), Gaps = 6/165 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 103 ATGPTGATGVNGVTGAT---GPTGA---TGANGVTGATGPTGPTGATGANGVTGATGPTG 156
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G GP+G G +G GP+G +DG +G G +G G
Sbjct: 157 PTGATGANGVTGATGPTGPTGATGANGVTGATGPTGATGADGVTGATGPTGATGADGVTG 216
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 217 ATGPTGATGADGVTGATGPTGATGANGVTGATGPTGPTGSTGATG 261
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/173 (29%), Positives = 71/173 (41%), Gaps = 15/173 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G+ GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 105 GPTGATGVNGVTGAT---GPTGAT---GANGVTGATGPTGPTGATGANGVTGATGPTGPT 158
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G G +G GP+G G G GP+G +DG +
Sbjct: 159 GATGANGVTGATGPTGPTGATGANGVTGATGPTGAT---GADGVTGATGPTGATGADGVT 215
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G GP+G G G GP+G G +G GP+G GP
Sbjct: 216 GAT---GPTGAT---GADGVTGATGPTGATGANGVTGATGPTGPTGSTGATGP 262
>gi|410213438|gb|JAA03938.1| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog [Pan
troglodytes]
gi|410253572|gb|JAA14753.1| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog [Pan
troglodytes]
gi|410295410|gb|JAA26305.1| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog [Pan
troglodytes]
gi|410352513|gb|JAA42860.1| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog [Pan
troglodytes]
Length = 1555
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 110/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 104/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|297268866|ref|XP_002808130.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: pre-mRNA cleavage complex 2 protein
Pcf11-like [Macaca mulatta]
Length = 1651
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 974 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 1032
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 1033 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 1082
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 1083 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1137
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1138 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1182
>gi|218898435|ref|YP_002446846.1| hypothetical protein BCG9842_B1866 [Bacillus cereus G9842]
gi|402559351|ref|YP_006602075.1| hypothetical protein BTG_02715 [Bacillus thuringiensis HD-771]
gi|218542513|gb|ACK94907.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus G9842]
gi|401788003|gb|AFQ14042.1| hypothetical protein BTG_02715 [Bacillus thuringiensis HD-771]
Length = 835
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT---GPTGATGPQGIQGIQ 515
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G G G +GP+G G G GP+G GP+G GP
Sbjct: 516 GPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQ 575
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 576 GIQGSQGEMGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQ 632
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 633 GL 634
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/172 (31%), Positives = 64/172 (37%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGPTGATGPQGIQGIQGPIG 519
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/175 (33%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP G
Sbjct: 444 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT 500
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G +GP+G G G +GP+G G G GP+
Sbjct: 501 ---GPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPT 557
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 558 GPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQG 609
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP GS+ GP G GP G GP+G+ G G +GP+G
Sbjct: 467 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGP 523
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G G G GP+G GP+G GP G S G
Sbjct: 524 QGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGE 583
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 584 MGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQG 627
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 68/183 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G GS+ GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 369 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVR 428
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP
Sbjct: 429 GATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQ 488
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G + GP G G G + GP+G
Sbjct: 489 GIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQ 548
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 549 GIT 551
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/162 (30%), Positives = 60/162 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 474 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQ 515
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/189 (30%), Positives = 67/189 (35%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 413 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 472
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP G G +G G G + GP G G
Sbjct: 473 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 532
Query: 133 SGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + GP+G GP+G GP+G GP G G G GP
Sbjct: 533 QGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGP 592
Query: 187 SGRLRYLGL 195
+G GL
Sbjct: 593 TGETGPQGL 601
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 59/161 (36%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGI 514
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 395 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGV 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 455 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT---GPTGATGPQGI 511
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G G G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 512 QGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGET 569
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + G +G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGSTGIT 275
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 66/180 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 390 GSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPT 449
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G
Sbjct: 450 GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQ 509
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G + GP G G G + GP+G G +G+ GP+G G +
Sbjct: 510 GIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGET 569
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS+ GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 377 TGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGL 436
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 437 QGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGP 496
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G GP G GP +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 497 Q------GPTGPTGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGP 544
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 545 QGL 547
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/192 (28%), Positives = 71/192 (36%), Gaps = 6/192 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G GP G GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 477 GPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQ 533
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G G G GP+G GP+G GP G G G + GP+
Sbjct: 534 GPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPT 593
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP G G +G GP G G G G +G+
Sbjct: 594 GE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGLQGITGSTGATGQTGVT 650
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 651 GATGPTGIQGIQ 662
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G + GP+G G G GP+G G G L S G
Sbjct: 126 GPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 186 GITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQ 245
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 246 GV 247
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---P 78
+GP+G G G GP+G GP GS GP G G G G P
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGSQGPMGEQGPQGIQGVQGIQGERGP 109
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGN 169
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G GL
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGL 226
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G GP+G+ G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 481 SIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTG 540
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G GP+G GP+G GP G G G GP+G G
Sbjct: 541 PTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET---G 597
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G G +G GP G G G G +G+ G +G
Sbjct: 598 PQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGLQGITGSTGATGQTGVTGATGPTG 657
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 658 IQGI 661
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 167
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G LG SG G G +GP+G P+G G G + G +
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTG------PTGSQGIQGEQGPMGPQGET 221
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G + +GP+G G G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 222 GVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGSTGITG 276
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.043, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/202 (27%), Positives = 74/202 (36%), Gaps = 12/202 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G +GP+G G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGP 166
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 185
+ G G LG SG G G +GP+G G G +GP G G
Sbjct: 167 TGNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGL 226
Query: 186 --PSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G + +G + + G+
Sbjct: 227 QGPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQ 248
>gi|395743316|ref|XP_002822351.2| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Pongo abelii]
Length = 1731
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 110/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 1022 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 1080
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 1081 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1135
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1136 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPAVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1190
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1191 GGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1232
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 104/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 980 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 1038
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 1039 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 1088
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 1089 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1143
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1144 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPAVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1188
>gi|119595490|gb|EAW75084.1| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog (S.
cerevisiae), isoform CRA_b [Homo sapiens]
Length = 1555
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 110/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 104/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|395814753|ref|XP_003780906.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Otolemur
garnettii]
Length = 1555
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 105/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G +G
Sbjct: 803 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQVGGGGFRFEGSPG-LRFEGSAGG 861
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 862 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 911
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 912 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 966
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 967 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1011
>gi|33620745|ref|NP_056969.2| pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Homo sapiens]
gi|160370000|sp|O94913.3|PCF11_HUMAN RecName: Full=Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11; AltName:
Full=Pre-mRNA cleavage complex II protein Pcf11
gi|119595489|gb|EAW75083.1| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog (S.
cerevisiae), isoform CRA_a [Homo sapiens]
gi|127798078|gb|AAH65384.2| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog (S.
cerevisiae) [Homo sapiens]
gi|148922145|gb|AAI46779.1| PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog (S.
cerevisiae) [Homo sapiens]
Length = 1555
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 110/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 104/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|410045711|ref|XP_508673.4| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Pan
troglodytes]
Length = 1608
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 79/223 (35%), Positives = 110/223 (49%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 899 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 957
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ GP
Sbjct: 958 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGP 1012
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1013 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1067
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1068 GGGLRIEGPLGQGGPRFEGCHA-LRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1109
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 76/225 (33%), Positives = 104/225 (46%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 857 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 915
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 916 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 965
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ GP G+ L
Sbjct: 966 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGL 1020
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 1021 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1065
>gi|47564495|ref|ZP_00235540.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus G9241]
gi|47558647|gb|EAL16970.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus G9241]
Length = 580
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G G + GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGSI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 248 GV 249
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 71/183 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 95 GPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQ 154
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP+G G G L G G G G + GP+G G
Sbjct: 155 GIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQ 214
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + G +G GP G + GP+G G G + GP+G GP+G
Sbjct: 215 GPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGSTGPT 274
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 275 GVT 277
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 73/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G GS+ GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 107 GEIGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPT 166
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ G G L G G G G + GP+G G G + G +G
Sbjct: 167 GPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQ 226
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + GP+G G G + GP+G GP+G GP+G G +
Sbjct: 227 GLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGS---TGPTGVTGPTGSA 283
Query: 197 DG 198
G
Sbjct: 284 TG 285
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G GP G G G + GP+G G GS+ GP+G G G
Sbjct: 87 NQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQG 143
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G + GP+G G G L G G G G + G
Sbjct: 144 EIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTG 203
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G G + G +G GP G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 204 PTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGPTG 260
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G GP G G G + GP+G G GS+
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGSI 127
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G G G + GP+G G G + G +G GP G + G + +
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 70/186 (37%), Gaps = 10/186 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL----------RYLGPSGRLR 182
G + GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGSTGPTGVTGPTGSATGPTGATG 291
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 292 PTGPQG 297
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 72/181 (39%), Gaps = 4/181 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G LG SG
Sbjct: 126 SIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSG 185
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G +GP+G G G +GP+G GP G + GP+G
Sbjct: 186 LQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQG 245
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G + GP+G GP+G G +G GP+G GP G GP
Sbjct: 246 IQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGSTGPTGVTGPTGSATGPTGATGPTGPQGVQGAQGPI 305
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 306 G 306
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 IGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGD---LGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 226 QGL 228
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 77/184 (41%), Gaps = 24/184 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G G +GP+G+ G P G + GP+GS G G + GP
Sbjct: 199 IGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGP 258
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLR----YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+G GP+GS GP+G GP+G G G + GP G G
Sbjct: 259 TGLQGDPGPTGSTGPTGVTGPTGSATGPTGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQG 318
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYL-------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G + GP+G L+ L GP+G GP G GP+G GP+G +
Sbjct: 319 EQGVRGATGPTG-LQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGPQG---ITGPTG---ATGPTGATGPI 371
Query: 176 GPSG 179
GP G
Sbjct: 372 GPQG 375
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 59/157 (37%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G +GP
Sbjct: 109 IGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEI---GPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 165
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G + V
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 57/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGEIGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDL 181
>gi|423412915|ref|ZP_17390035.1| hypothetical protein IE1_02219 [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|423431300|ref|ZP_17408304.1| hypothetical protein IE7_03116 [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401102475|gb|EJQ10461.1| hypothetical protein IE1_02219 [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|401118325|gb|EJQ26157.1| hypothetical protein IE7_03116 [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 835
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G+ GP + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 67 EIGPTGPTGLTGPQGAQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPG 123
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G + GP G G G + GP+G G G L S G
Sbjct: 124 PMGETGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPIGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSG 183
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 184 LQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGVTGPTGSQG 243
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 244 VQGV 247
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/199 (27%), Positives = 72/199 (36%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GP+G G G +GP+G GP G + GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQGAQGSQGPMGEQGPQGIQGVQGIQGERGP 109
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G G + GP+G G G + GP G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPIGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGSTGATGVQGLQGP 229
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + G + V G+
Sbjct: 230 QGEMGVTGPTGSQGVQGVQ 248
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP G G G + GP+G+
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPIGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + S G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGSTGATGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGVTGPTGSQGVQGVQG---VIGPTGATGLQGDPGPTGSTGPTG 273
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPIGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGSTGATGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G + GP+G G G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGVTGPTGSQGVQGVQG---VIGPTGATGLQGDPGPTGSTGPTG---VTGPTGS 280
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 68/183 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 93 GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPIGIQ 152
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP+G G G L G G G G + GP+G G
Sbjct: 153 GIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQ 212
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + G +G GP G + GP+G G G + G +G GP+G
Sbjct: 213 GPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGVTGPTGSQGVQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGPT 272
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 273 GVT 275
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 67/172 (38%), Gaps = 8/172 (4%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP+G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 22 TGATGPTGPTGSVG--GPTGPQGIQGVQGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTG---L 76
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP G GP G GP G G G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 77 TGPQGAQGSQGPMGE---QGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPMGETGPTGI 133
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G + GP G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 134 QGIQGVQGEIGLTGPIGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQ 185
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.71, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/227 (25%), Positives = 74/227 (32%), Gaps = 39/227 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G G G + GP+G G G L GP G G SG GP G
Sbjct: 412 QAGPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQG 471
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-------------------- 111
GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 472 IQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQG 528
Query: 112 -------LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
+GP+G G G S GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 529 LQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTG 585
Query: 165 YLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP G GP+G G++ + G+
Sbjct: 586 PTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 632
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/185 (28%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 21/185 (11%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL----------- 64
SG GP G GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 461 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQGI 517
Query: 65 -RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G G G + GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 518 QGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS---TGPTGATGATGPTG---VTGP 571
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G GP G G +G GP G G G G +G GP G
Sbjct: 572 QGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGI 631
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 632 QGPQG 636
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/163 (29%), Positives = 62/163 (38%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS- 70
GP+G G G + GP G G G + GP+G G G LG S
Sbjct: 127 ETGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPIGIQGIQGVQGEI---GPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSG 183
Query: 71 --GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 184 LQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGVTGPTG--- 240
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
S G G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 241 SQGVQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGPTG---VTGPTGS 280
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/170 (30%), Positives = 62/170 (36%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP G G G + GP+G G G L GP G G SG GP
Sbjct: 410 IGQAGPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGP 469
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G GP G + G +G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 470 QGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGL 529
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G + GP+G G +G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 530 QGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGST---GPTGATGATGPTGVTGPQGPQG 576
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/162 (27%), Positives = 58/162 (35%), Gaps = 18/162 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
++GP+G G G GP+G+ GP G G G + G
Sbjct: 481 DIGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTG 540
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G +G GP+G+ GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 541 PTGPQGIQGITGST---GPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTG 594
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G G G G +G GP G GP G
Sbjct: 595 VTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQG 636
>gi|168335602|ref|ZP_02693659.1| possible large adhesin [Epulopiscium sp. 'N.t. morphotype B']
Length = 1205
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/191 (31%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 12/191 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP G + GP G + GP G GP G+ GP+G
Sbjct: 205 GPAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGVP 264
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G + GP G L L G GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 265 GPQGPIGATGPQG-LAGL--DGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPA 321
Query: 128 NSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
D GP G + GP G + GP G G G +GP G GP G
Sbjct: 322 GLDGTPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGPQGPEGAT 381
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 382 GPMGPQGPAGV 392
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 18/181 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G + GP G + GP G G G +GP G GP G
Sbjct: 319 GPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGPQG-- 376
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD--- 130
P G+ +GP G G +GP G GP G + GP G D
Sbjct: 377 ----PEGATGPMGPQGPAGVPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTP 432
Query: 131 ---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G GP G + GP GP+G GP G + GP
Sbjct: 433 GPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQ------GPAGLDGTPGPQGPIGATGPQ 486
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 487 G 487
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/190 (30%), Positives = 72/190 (37%), Gaps = 27/190 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP G GP+G GP G + GP G GP G+ GP+G
Sbjct: 247 GPIGATGPQGPAGLDGVPGPQGPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTP 306
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G + GP GP+G GP G + GP G + GP GP+G
Sbjct: 307 GPQGPIGATGPQ------GPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQ------GPAGVP 354
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------LGPSGRLRYLGPS 178
DG G + GP+G GP G +GP G +GP G GP
Sbjct: 355 GLDGIPGPMGPQGPAGVPGPQGPEGATGPMGPQGPAGVPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQ 414
Query: 179 GRLRYLGPSG 188
G + GP G
Sbjct: 415 GPIGATGPQG 424
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 22/181 (12%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------ 87
G+ GP G + GP GP+G GP G + GP G + GP
Sbjct: 186 DGAPGVPGPQGPIGATGPQ------GPAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGLAGL 239
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD------GPSGRLRYLGP 141
G GP G GP+G GP G + GP G D GP G GP
Sbjct: 240 DGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGVPGPQGPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGATGPQGP 299
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
+G GP G + GP G GP G + GP G + GP G GL DG
Sbjct: 300 AGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGPAGVPGL-DG 358
Query: 199 L 199
+
Sbjct: 359 I 359
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G + GP G P+G GP G + GP G +
Sbjct: 289 GPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQG------PAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPI 342
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G +GP G GP G GP G GP+G D
Sbjct: 343 GATGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGPQGPEGATGPMGP---QGPAGVPGLDNVP 399
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + GP+G GP G GP+G GP G + GP G G G +
Sbjct: 400 GPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPI 459
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 460 GAT 462
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + GP+G G + GP+G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 525 MGPMGPIGPQGPAGIPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGP 584
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G G G + GP+G G G + GP+G +GP G G
Sbjct: 585 IGATGPQGPAGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGATGPMGPQGPAGVPGL 644
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+GP G GP G + GP GP+G GP G + GP G
Sbjct: 645 DNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQ------GPAGLDGTPGPQGPIGATGPQG 694
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 74/193 (38%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G + GP G G+ GP+G GP G
Sbjct: 457 GPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGL---DGTPGPQGPAGLDGTPGPQGPA 513
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G +GP G + GP+G +GP G GP G + GP G
Sbjct: 514 GVPGLDGIPGPMGPMGPIGPQGPAGIPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPA 573
Query: 128 NSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
D GP G + GP G G G + GP+G G G + GP+G +
Sbjct: 574 GLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGATGPM 633
Query: 185 GPSGRLRYLGLSD 197
GP G GL +
Sbjct: 634 GPQGPAGVPGLDN 646
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 74/192 (38%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G G +GP G + GP+G G + GP+G
Sbjct: 499 GPAGLDGTPGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPMGPIGPQGPAGIPGLDNVPGPIGPQGPAGVP 558
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP+G GP G + GP G G G + GP+G DG
Sbjct: 559 GPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGVP 618
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G + GP+G +GP G +GP G GP G + GP G
Sbjct: 619 GPMGPQGPAGATGPMGPQGPAGVPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLD 678
Query: 185 GPSGRLRYLGLS 196
G G +G +
Sbjct: 679 GTPGPQGPIGAT 690
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G + GP G G GP G+ GP+G GP G
Sbjct: 651 IGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGL---DGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGP 707
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G DG
Sbjct: 708 AGLDGVPGPIGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGV 767
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + GP+G GP G + GP G + GP G
Sbjct: 768 PGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQG 823
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/190 (30%), Positives = 72/190 (37%), Gaps = 10/190 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G GP G + GP G GP G + GP G G G + GP
Sbjct: 549 IGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGIPGPMGPQGP 608
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G + GP+G +GP G G +GP G GP G + +
Sbjct: 609 AGVPGLDGVPGPMGPQGPAGATGPMGPQGPAGVPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGA 668
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP GP+G GP G + GP G G G G G +GP G
Sbjct: 669 TGPQ------GPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPAGLDGVPGPIGPQGP 722
Query: 190 LRYLGLSDGL 199
GL DG+
Sbjct: 723 AGVPGL-DGI 731
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/210 (29%), Positives = 76/210 (36%), Gaps = 24/210 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G G G+ GP G GP G + GP G P+
Sbjct: 154 GPQGPIGATGPMGPAGVPGLDGTPGVPGPQGLDGAPGVPGPQGPIGATGPQG------PA 207
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G + GP G GP G GP+G GP
Sbjct: 208 GLDGVPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGVPGPQ 267
Query: 125 GRLNSDGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G + + GP +G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 268 GPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTP 327
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + GP G + G V GL
Sbjct: 328 GPQGPIGATGPQGPIGATGPQGPAGVPGLD 357
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 73/198 (36%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGR 63
+GP G GP G + GP G GP G + GP G+ GP G
Sbjct: 402 IGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGA 461
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G GP G + GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 462 TGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPAGLDGTPGPQGPAGVPGLDGI 521
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP G + GP+G G + GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 522 PGPMGPMGPIGPQGPAGIPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGP 581
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP G G+
Sbjct: 582 QGPIGATGPQGPAGLDGI 599
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/192 (31%), Positives = 70/192 (36%), Gaps = 13/192 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G +GP G GP G GP G G G
Sbjct: 337 GPQGPIGATGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGPQGPEGATGPMGPQGPAGVPGLD 396
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD--- 130
GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP G D
Sbjct: 397 NVPGPIGP---QGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTP 453
Query: 131 ---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G GP G + GP G G GP+G GP
Sbjct: 454 GPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGL---DGTPGPQGPAGLDGTPGPQ 510
Query: 188 GRLRYLGLSDGL 199
G GL DG+
Sbjct: 511 GPAGVPGL-DGI 521
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 69/181 (38%), Gaps = 15/181 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ +GP G G +GP G GP G + GP G
Sbjct: 367 GPAGVPGPQGPEGATGPMGPQGPAGVPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPA 426
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G+ GP G GP+G GP G + GP GP+G + GP
Sbjct: 427 GL---DGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQ------GPAGLDGTPGPQ 477
Query: 134 GRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G GP+G GP G G G +GP G + GP+
Sbjct: 478 GPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPAGLDGTPGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPMGPIGPQGPA 537
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 538 G 538
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 73/187 (39%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP G + GP G+ GP G+ GP+G GP G G G +
Sbjct: 661 GPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPAGLDGVPGPIGPQ 720
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 721 GPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGVP 780
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRL 181
DG G + GP+G GP G + GP G + GP G GP G +
Sbjct: 781 GLDGVPGPMGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGPAGLDGAPGVPGPQGPI 840
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 841 GATGPQG 847
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 21/184 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G +GP G G G+ GP G + GP G G G GP
Sbjct: 127 GPIGATGPMGPQGDQGCRGLDGAPGVPGPQGPIGATGPMGPAGVPGLDGTPGVPGPQGLD 186
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G + GP GP+G GP G + GP G + GP G D
Sbjct: 187 GAPGVPGPQGPIGATGPQ------GPAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGLAGLD 240
Query: 131 ---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP G + GP GP+G GP G + GP +G GP G +
Sbjct: 241 GVPGPQGPIGATGPQ------GPAGLDGVPGPQGPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGAT 294
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 295 GPQG 298
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/198 (30%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 16/198 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP G + GP G+ GP G GP+G GP G +
Sbjct: 424 GPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGAT 483
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G+ GP+G GP G G G +GP G + GP+G
Sbjct: 484 GPQGPAGL---DGTPGPQGPAGLDGTPGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPMGPIGPQGPAGIP 540
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---- 183
D G + GP+G GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 541 GLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGIP 600
Query: 184 --LGPSGRLRYLGLSDGL 199
+GP G GL DG+
Sbjct: 601 GPMGPQGPAGVPGL-DGV 617
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G + GP G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 571 GPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGAT 630
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLNSD 130
+GP G G +GP G GP G + GP G GP G + +
Sbjct: 631 GPMGPQGPAGVPGLDNVPGPIGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGAT 690
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP GP+G GP G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 691 GPQ------GPAGLDGTPGPQGPAGLDGVPGPIGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAG 742
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 66/185 (35%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G +GP G G G+ GP G + GP +GP G G G
Sbjct: 99 AGATGPMGPQGDQGCRGLDGAPGIPGPQGPIGATGP------MGPQGDQGCRGLDGAPGV 152
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD-- 130
GP G + GP G G G GP G GP G + GP G D
Sbjct: 153 PGPQGPIGATGPMGPAGVPGLDGTPGVPGPQGLDGAPGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGV 212
Query: 131 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP G + GP G + GP G GP G GP+G GP G +
Sbjct: 213 PGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGVPGPQGPIGA 272
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 273 TGPQG 277
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/166 (30%), Positives = 66/166 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 685 GPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPAGLDGVPGPIGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVP 744
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G + GP
Sbjct: 745 GLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGLDGTPGPQ 804
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G + GP G + GP G G G GP G GP+G
Sbjct: 805 GPIGATGPQGPIGATGPQGPAGLDGAPGVPGPQGPIGATGPQGPAG 850
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/195 (30%), Positives = 69/195 (35%), Gaps = 16/195 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------LGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP G GP+G GP G + GP G +GP G G G +
Sbjct: 562 GPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGVPGPM 621
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G G G GP +GP G GP G + GP G
Sbjct: 622 GPQGPAGATGPMGPQGPAGVPGLDNVPGP------IGPQGPAGVPGPQGPIGATGPQGPA 675
Query: 128 NSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
D GP G + GP G G G G G +GP G G G +
Sbjct: 676 GLDGTPGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPAGLDGVPGPIGPQGPAGVPGLDGIPGPM 735
Query: 185 GPSGRLRYLGLSDGL 199
GP G GL DG+
Sbjct: 736 GPQGPAGVPGL-DGI 749
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/171 (28%), Positives = 63/171 (36%), Gaps = 15/171 (8%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ +GP G G G+ GP G + GP +GP G G G
Sbjct: 99 AGATGPMGPQGDQGCRGLDGAPGIPGPQGPIGATGP------MGPQGDQGCRGLDGAPGV 152
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------DGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
GP G + GP G G G GP G + GP G GP+G
Sbjct: 153 PGPQGPIGATGPMGPAGVPGLDGTPGVPGPQGLDGAPGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGV 212
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G + GP +G GP G + GP G G+
Sbjct: 213 PGPQGPIGATGPQGPIGATGPQGLAGLDGVPGPQGPIGATGPQGPAGLDGV 263
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G +GP G GP G G G GP G GP+G
Sbjct: 603 MGPQGPAGVPGLDGVPGPMGPQGPAGATGPMGPQGPAGVPGLDNVPGPIGP---QGPAGV 659
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ GP+G GP G + GP GP+G GP G DG
Sbjct: 660 PGPQGPIGATGPQGPAGLDGTPGPQGPIGATGPQ------GPAGLDGTPGPQGPAGLDGV 713
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 714 PGPIGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAGVPGLDGIPGPMGPQGPAG 760
>gi|300122250|emb|CBK22823.2| unnamed protein product [Blastocystis hominis]
Length = 554
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/187 (33%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 24/187 (12%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GPSG +G GR+ GP+G+ GP+G G G GPSG
Sbjct: 332 VGPTGPTGEEGPSGEPGDVGVQGRMGPRGPAGADGRAGPAGPTGPSGEPGPSGEPGPSGV 391
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G + GPSG GPSG GPSG Y G G GPSG GP
Sbjct: 392 PGIEGDVGEMGEQGPSGEP---GPSGEPGPTGPSGEPGYTGEPGPT---GPSGEPGTQGP 445
Query: 142 SGR---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
SG +GPSG G G GP G +GPSG G
Sbjct: 446 SGEPGPTGPTGPTGPSGPSGPMGPSGDPGVTGEQGPSGEPGPQGP---MGPSGEPGVTGA 502
Query: 187 SGRLRYL 193
+G L
Sbjct: 503 TGPAPSL 509
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/161 (34%), Positives = 65/161 (40%), Gaps = 30/161 (18%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP+G GPSG +G GR+ GP+G+ GR GP+G GPSG
Sbjct: 332 VGPTGPTGEEGPSGEPGDVGVQGRMGPRGPAGA------DGRAGPAGPTGPSGEPGPSGE 385
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GPSG G G + GPSG GPSG GPSG Y G G GP
Sbjct: 386 P---GPSGVPGIEGDVGEMGEQGPSGEP---GPSGEPGPTGPSGEPGYTGEPGPT---GP 436
Query: 169 SGRLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLG 194
SG GPSG +GPSG G
Sbjct: 437 SGEPGTQGPSGEPGPTGPTGPTGPSGPSGPMGPSGDPGVTG 477
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/173 (32%), Positives = 67/173 (38%), Gaps = 30/173 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++G GR+ GP+G+ GP+G G G GPSG G G + GPSG
Sbjct: 349 DVGVQGRMGPRGPAGADGRAGPAGPTGPSGEPGPSGEPGPSGVPGIEGDVGEMGEQGPSG 408
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------- 118
GPSG GPSG Y G G GPSG GPSG
Sbjct: 409 EP---GPSGEPGPTGPSGEPGYTGEPGPT---GPSGEPGTQGPSGEPGPTGPTGPTGPSG 462
Query: 119 --RYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
+GPSG GPSG GP +GPSG G +G L
Sbjct: 463 PSGPMGPSGDPGVTGEQGPSGEPGPQGP------MGPSGEPGVTGATGPAPSL 509
>gi|402559350|ref|YP_006602074.1| hypothetical protein BTG_02710 [Bacillus thuringiensis HD-771]
gi|401788002|gb|AFQ14041.1| hypothetical protein BTG_02710 [Bacillus thuringiensis HD-771]
Length = 808
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ GP G +GP+G+ +G G GP+G
Sbjct: 374 TGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAE---GPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGV 427
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 428 TGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGL 487
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 488 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 547
Query: 193 LGLS 196
+G++
Sbjct: 548 VGIT 551
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/164 (28%), Positives = 63/164 (38%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G
Sbjct: 459 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQ 518
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 519 GVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 578
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 579 GETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 619
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 407 IGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGA 463
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 464 AGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 523
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +G
Sbjct: 524 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGA 583
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 584 TGAT 587
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G +GP+G+ +G G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 399 GPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQ 455
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+
Sbjct: 456 GIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPT 515
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 516 GVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGIT 575
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 576 GAT 578
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G G G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 423 GPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLT 482
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP
Sbjct: 483 GAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQ 542
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G +G G G GP G + G +G G +G GP G
Sbjct: 543 GNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQ 599
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G++ ++G+
Sbjct: 600 GITGIQGITGM 610
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/164 (28%), Positives = 63/164 (38%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G G G +GP+G++ GP G GP+G
Sbjct: 459 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQ 518
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 519 GVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 578
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 579 GETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 619
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G G G +G GP G G +G G G +GP+G
Sbjct: 442 ATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTG 498
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
++ GP G GP+G G G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 499 AIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQG 558
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G GP G + G +G G +G GP G G +G G++ +
Sbjct: 559 AQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIG 615
Query: 201 VSG 203
+G
Sbjct: 616 ATG 618
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G +GP+G+ +G G GP+G G G G +G
Sbjct: 392 TGPTG---AEGPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGP 445
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G G +G G G +GP+G + GP
Sbjct: 446 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGP 505
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 506 QGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 552
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 53/129 (41%), Gaps = 3/129 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G GP+G G G +GP+G+ GP G +G +G
Sbjct: 494 IGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGP 553
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS GP G + G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 554 QGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGM 610
Query: 133 SGRLRYLGP 141
+G + GP
Sbjct: 611 TGDIGATGP 619
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/160 (27%), Positives = 59/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------G 95
P G GP+G+ G G GP+G GP G +GP+G + G
Sbjct: 367 PQGNPGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTG---AEGPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 423
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G G G G +G G G G +G GP G G +G
Sbjct: 424 PAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTG 483
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G +GP+G + GP G GP+G G+
Sbjct: 484 AQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 523
>gi|165868594|ref|ZP_02213254.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0488]
gi|227814741|ref|YP_002814750.1| hypothetical protein BAMEG_2151 [Bacillus anthracis str. CDC 684]
gi|254751790|ref|ZP_05203827.1| hypothetical protein BantV_04966 [Bacillus anthracis str. Vollum]
gi|164715320|gb|EDR20837.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0488]
gi|227004133|gb|ACP13876.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. CDC 684]
Length = 408
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/162 (27%), Positives = 61/162 (37%), Gaps = 21/162 (12%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGVTGPAGITGVTGPTG 124
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR------------ 146
GP+G GP+G GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGVTGPTGITGATGPTGTTGVTG 184
Query: 147 ---------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 185 PTGDTGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 226
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/162 (27%), Positives = 61/162 (37%), Gaps = 21/162 (12%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 65 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGVTGPAGITGVTGPTG 124
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------ 155
GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 125 ITGATGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTGITGVTGPTGITGATGPTGTTGVTG 184
Query: 156 ---------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 185 PTGDTGLAGATGPTGDTGATGPTGDTGATGPTGATGLAGATG 226
>gi|170689284|ref|ZP_02880479.1| group-specific protein [Bacillus anthracis str. A0465]
gi|254683582|ref|ZP_05147442.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus anthracis str.
CNEVA-9066]
gi|170666742|gb|EDT17510.1| group-specific protein [Bacillus anthracis str. A0465]
Length = 538
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/166 (34%), Positives = 71/166 (42%), Gaps = 27/166 (16%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP G GP+G GP G+ GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 182 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 232
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP+G GP
Sbjct: 233 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 283
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 284 GA---QGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTG 320
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/166 (34%), Positives = 70/166 (42%), Gaps = 27/166 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 182 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 232
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 233 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQ 283
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 284 GA---QGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTG 320
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/211 (28%), Positives = 75/211 (35%), Gaps = 54/211 (25%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 197 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 247
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 248 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQ 298
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------------RLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G G +G
Sbjct: 299 G---IQGPAGATGATGPQGVQGPTGATGIGVTGPTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQ 355
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 356 GIQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATG 383
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/201 (29%), Positives = 76/201 (37%), Gaps = 50/201 (24%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 227 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGAT 277
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
GP G+ GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 278 GATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTG 328
Query: 128 ------------------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+ G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 329 PTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQ 385
Query: 170 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
G GP+G + GP+G
Sbjct: 386 G---VQGPTGATGIGVTGPTG 403
>gi|195728815|gb|ACG50728.1| VtaA12 precursor [Haemophilus parasuis str. Nagasaki]
Length = 1681
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 67/167 (40%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G +GP+G G G + GP+G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 1011 MGPAGPAGAIGPAGPAGPKGDQGLVGPQGPTGAKGEQGPRGEPGIQGPRGEA---GPKGE 1067
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP+G G G GP+G GP G G G GP G GP
Sbjct: 1068 VGPAGPTGPTGARGEKGDTGPAGPAGAQGEQGPIGPAGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGP 1127
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G +GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 1128 QGPAGATGPEG---PVGPTGPAGPTGPKGDTGPEGPKGEQGPVGPQG 1171
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP+G +GP+G G G + GP+G GP G GP G GP G
Sbjct: 1011 MGPAGPAGAIGPAGPAGPKGDQGLVGPQGPTGAKGEQGPRGEPGIQGPRGE---AGPKGE 1067
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+ GP+G G G GP+G GP G G G GP G GP
Sbjct: 1068 VGPAGPTGPTGARGEKGDTGPAGPAGAQGEQGPIGPAGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGP 1127
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G +GP+G GP G GP G
Sbjct: 1128 QGPAGATGPEG---PVGPTGPAGPTGPKGDTGPEGPKGE 1163
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/158 (32%), Positives = 63/158 (39%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G + GP+G+ GP G GP G GP G + GP+G
Sbjct: 1020 IGPAGPAGPKGDQGLVGPQGPTGAKGEQGPRGEPGIQGPRGEA---GPKGEVGPAGPTGP 1076
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G GP G G G GP G GP G + GP
Sbjct: 1077 TGARGEKGDTGPAGPAGAQGEQGPIGPAGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGP 1136
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 1137 EG---PVGPTGPAGPTGPKGDTGPEGPKGEQGPVGPQG 1171
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/150 (31%), Positives = 58/150 (38%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G GP+G GP G G G GP+G GP G
Sbjct: 789 MGPQGPQGKEGPVGPRGPAGPAGEQGPAGPRGEKGLKGDKGEQGDRGPTGE---AGPKGE 845
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP+G G G+ G G G
Sbjct: 846 ---AGPAGAKGDQGPPGERGERGPAGATGQTGPAGPRGPKGDPGQKGDAGLQGPAGERGE 902
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G GP+G + +GP G GP G
Sbjct: 903 RGETGERGPAGPVGPVGPRGPAGETGPRGE 932
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/157 (31%), Positives = 59/157 (37%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP G GP G GP+G GP G G G GP+G GP G
Sbjct: 789 MGPQGPQGKEGPVGPRGPAGPAGEQGPAGPRGEKGLKGDKGEQGDRGPTGEA---GPKGE 845
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G GP G GP+G GP+G G G+ G G G
Sbjct: 846 A---GPAGAKGDQGPPGERGERGPAGATGQTGPAGPRGPKGDPGQKGDAGLQGPAGERGE 902
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G + +GP G GP G GL
Sbjct: 903 RGETGERGPAGPVGPVGPRGPAGETGPRGERGEQGLQ 939
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/150 (31%), Positives = 57/150 (38%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G GP G GP+G GP G G G GP+G GP G
Sbjct: 789 MGPQGPQGKEGPVGPRGPAGPAGEQGPAGPRGEKGLKGDKGEQGDRGPTGEA---GPKGE 845
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G GP G GP+G GP+G G G+ G G G
Sbjct: 846 A---GPAGAKGDQGPPGERGERGPAGATGQTGPAGPRGPKGDPGQKGDAGLQGPAGERGE 902
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G GP+G + +GP G GP G
Sbjct: 903 RGETGERGPAGPVGPVGPRGPAGETGPRGE 932
>gi|354489837|ref|XP_003507067.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11-like [Cricetulus
griseus]
Length = 1622
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/192 (35%), Positives = 98/192 (51%), Gaps = 51/192 (26%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S S+R+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 915 FRFEG-SPSMRFEGSAGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFDGPHGQ-- 966
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P GSLR+ P G+ P G LR+ G G GPSG +R+ GP G+ P
Sbjct: 967 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEG--GH----GPSGAAIRFDGPHGQ-----PG 1007
Query: 134 GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP- 177
G +R+ GP + +R+ GP + LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 1008 GGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHSQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPL 1067
Query: 178 ---SGRLRYLGP 186
G +R+ GP
Sbjct: 1068 VQQGGGMRFEGP 1079
>gi|365159965|ref|ZP_09356140.1| hypothetical protein HMPREF1014_01603 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
gi|363624496|gb|EHL75568.1| hypothetical protein HMPREF1014_01603 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
Length = 835
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 76/203 (37%), Gaps = 15/203 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 543
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +G++ V G
Sbjct: 544 IRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQ 566
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 470 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 530 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 578
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 375 GPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAE 434
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 435 GAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 494
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 495 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEV 554
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G
Sbjct: 555 GITGSQGVQGAQG 567
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 393 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQ 452
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 453 GIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQ 509
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 510 GPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQ 569
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 570 GPQGPQGNV 578
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 18/201 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+GS G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 329 IGAQGVQGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGP 388
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G G + GP
Sbjct: 389 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGP 448
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G G +G GP G +GP+G +
Sbjct: 449 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 508
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP+G G+
Sbjct: 509 QGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 529
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.88, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/212 (25%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 18/212 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG + +G G GP+GS G G +G G GP G GP+G
Sbjct: 319 STGVSGGIGPIGAQGVQGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTG 378
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G L GP+G G G +GP+G +G G +G +G + G
Sbjct: 379 AEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQG 438
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLR 173
G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 439 TQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQG 498
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 499 IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 530
>gi|167856703|ref|ZP_02479384.1| putative large adhesin [Haemophilus parasuis 29755]
gi|167852173|gb|EDS23506.1| putative large adhesin [Haemophilus parasuis 29755]
Length = 763
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/192 (30%), Positives = 71/192 (36%), Gaps = 6/192 (3%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T + + G G GP+G +GP G+ GP G G +G GP G
Sbjct: 279 TDGTDNTIKKGEKGDRGETGPAGPAGPIGPQGATGPAGPKGEAGAKGETGPAGARGPQGE 338
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G GP+G GP+G GP+G G G G G GP
Sbjct: 339 KGAQGPMG---PAGPAGERGQQGPTGPRGEPGPTGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGP 395
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G G +G GP+G GP G GP G GP+G +GP G
Sbjct: 396 KGDAGPKGDTGPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGVPGPRGEKGETGPAGPAGPIGPQG---A 452
Query: 184 LGPSGRLRYLGL 195
GP G GL
Sbjct: 453 PGPKGDKGEQGL 464
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/195 (29%), Positives = 66/195 (33%), Gaps = 21/195 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G +GP G GP G G G GP G
Sbjct: 508 GPAGEPGKQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQG---APGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEA 564
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPS------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP G G G GP+G GP
Sbjct: 565 GAKGEKGDTGEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPR 624
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP+G GP G GP G GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 625 GEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQ 684
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP G
Sbjct: 685 GPTGPTGPQGPQGTA 699
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G GP G GP G GP+G +GP G+ G G G +G
Sbjct: 410 EAGPAGATGPQGPKGDNGVPGPRGEKGETGPAGPAGPIGPQGAPGPKGDKGEQGLRGETG 469
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G +GP G + GP+G GP+G GP G G
Sbjct: 470 PAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAG---PRGPAGEPGKQGPRGDKGETG 526
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P+G +GP G GP G G G GP G G G GP
Sbjct: 527 PAGPAGPIGPQG---APGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGP 578
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 64/169 (37%), Gaps = 6/169 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP G+ G G GP+G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 373 GPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDAGPKGDTGPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGVPGPR 432
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G GP+G +GP G GP G G G GP G + G G
Sbjct: 433 GEKGETGPAGPAGPIGPQG---APGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEA 489
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G +G +G GP+G GP G GP+G +GP G
Sbjct: 490 GPVGPQGPVGAAGPAGPRGPAGEPGKQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQG 538
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G+ GP G GP G GP+G +GP G
Sbjct: 393 AGPKGDAGPKGDTGPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGVPGPRGEKGETGPAGPAGPIGPQG- 451
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G GP G G G GP G +G +G GP
Sbjct: 452 --APGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAGPRGP 509
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP+G +GP G GP G G G GP G
Sbjct: 510 AGEPGKQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQG---APGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGA 566
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 567 KG 568
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G GP+G+ GP G GP G GP+G +GP G G
Sbjct: 398 DAGPKGDTGPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGVPGPRGEKGETGPAGPAGPIGPQGAPGPKG 457
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G +G G +G G +G +GP G + GP+G GP+G
Sbjct: 458 DKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAG---PRGPAGEPG 514
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G +GP G GP G G G GP G G G
Sbjct: 515 KQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQG---APGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKG 571
Query: 189 RLRYLG 194
G
Sbjct: 572 DTGEAG 577
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G G +G GP G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 306 IGPQGATGPAGPKGEAGAKGETGPAGARGPQGEKGAQGPMGPA---GPAGERGQQGPTGP 362
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 363 RGEPGPTGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDAGPKGDTGPRGEAGPAGATGPQGP 422
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G GP+G +GP G GP G G G GP G
Sbjct: 423 KGDNGVPGPRGEKGETGPAGPAGPIGPQG---APGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGA 479
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 480 KG 481
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G G G G G GP G G +G
Sbjct: 348 AGPAGERGQQGPTGPRGEPGPTGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPKGDAGPKGDTGP 407
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP G GP+G +GP G GP G G
Sbjct: 408 RGEAGPAGATGPQGPKGDNGVPGPRGEKGETGPAGPAGPIGPQG---APGPKGDKGEQGL 464
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G G G GP G +G +G GP+G GP G
Sbjct: 465 RGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAGPRGPAGEPGKQGPRGDKGE 524
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 525 TG 526
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/203 (27%), Positives = 67/203 (33%), Gaps = 30/203 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP G +G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 471 AGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGPAGPRGPAGEPGKQGPRGDKGETGPAGP 530
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--------- 123
+GP G+ GP G G G GP G G G GP
Sbjct: 531 AGPIGPQGA---PGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPMGPQGPAGA 587
Query: 124 ------------------SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 588 AGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGI 647
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G +GP+G
Sbjct: 648 QGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAG 670
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 68/178 (38%), Gaps = 15/178 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G GP+G GP+G GP G+ G G GP+G
Sbjct: 340 GAQGPMGPAGPAGERGQQGPTGPRGEPGPTG---PQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPK 396
Query: 74 RYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP+G GP G GP G GP+G +GP G +
Sbjct: 397 GDAGPKGDTGPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGVPGPRGEKGETGPAGPAGPIGPQG---AP 453
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G GP +GP G + GP+G
Sbjct: 454 GPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGP------VGPQGPVGAAGPAG 505
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/112 (32%), Positives = 46/112 (41%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP+G+ GP G GP+G GP G+ GP G GP+G
Sbjct: 604 GDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAA 663
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+GP+G GP G GP+G GP +G GP+G G
Sbjct: 664 GPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQGPQGTAGSQDPAGPTGNSELKG 715
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/114 (32%), Positives = 45/114 (39%), Gaps = 6/114 (5%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP+G P+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 599 EQGPRGDKGETGPAG------PAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKG 652
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G +GP+G GP G GP+G GP G P+G
Sbjct: 653 DRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQGPQGTAGSQDPAG 706
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/129 (31%), Positives = 50/129 (38%), Gaps = 12/129 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G GP+G P+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 599 EQGPRGDKGETGPAG------PAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKG 652
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G +GP+G GP G GP+G P+G G +G G
Sbjct: 653 DRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTG------PTGPQGPQGTAGSQDPAG 706
Query: 141 PSGRLRYLG 149
P+G G
Sbjct: 707 PTGNSELKG 715
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.96, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/213 (26%), Positives = 70/213 (32%), Gaps = 42/213 (19%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G +GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 517 GPRGDKGETGPAGPAGPIGPQGAP---GPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDT 573
Query: 74 RYLGP---------------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 574 GEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPA 633
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP G GP G GP+G + GP+G GP G GP+G
Sbjct: 634 GPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPV---GPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPT 690
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G GP+G G++
Sbjct: 691 GPQGPQGT------AGSQDPAGPTGNSELKGIT 717
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/224 (25%), Positives = 66/224 (29%), Gaps = 42/224 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G G G GP G G G GP G +G +G
Sbjct: 444 AGPIGPQGAPGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGEAGAKGEKGDTGEAGPVGPQGPVGAAGP 503
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---------------GRLRYLGPSGR 117
GP+G GP G GP+G +GP G GP G
Sbjct: 504 AGPRGPAGEPGKQGPRGDKGETGPAGPAGPIGPQGAPGPKGDKGEQGLRGETGPAGPKGE 563
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGP---------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G GP G GP+G GP
Sbjct: 564 AGAKGEKGDTGEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGP 623
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G GP G GP G GP+G +G
Sbjct: 624 RGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVG 667
>gi|228966256|ref|ZP_04127316.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar sotto str. T04001]
gi|228793440|gb|EEM40983.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar sotto str. T04001]
Length = 797
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ GP G +GP+G+ +G G GP+G
Sbjct: 363 TGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAE---GPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGV 416
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 417 TGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGL 476
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 477 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 536
Query: 193 LGLS 196
+G++
Sbjct: 537 VGIT 540
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/164 (28%), Positives = 63/164 (38%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G
Sbjct: 448 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQ 507
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 508 GVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 567
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 568 GETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 608
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 396 IGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGA 452
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 453 AGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 512
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +G
Sbjct: 513 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGA 572
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 573 TGAT 576
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G +GP+G+ +G G GP+G G G G +G G G
Sbjct: 388 GPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQ 444
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+
Sbjct: 445 GIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPT 504
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 505 GVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGIT 564
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 565 GAT 567
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G G G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 412 GPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLT 471
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP
Sbjct: 472 GAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQ 531
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G +G G G GP G + G +G G +G GP G
Sbjct: 532 GNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQ 588
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G++ ++G+
Sbjct: 589 GITGIQGITGM 599
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/164 (28%), Positives = 63/164 (38%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G G G +GP+G++ GP G GP+G
Sbjct: 448 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQ 507
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 508 GVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 567
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 568 GETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 608
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G G G +G GP G G +G G G +GP+G
Sbjct: 431 ATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTG 487
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
++ GP G GP+G G G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 488 AIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQG 547
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G GP G + G +G G +G GP G G +G G++ +
Sbjct: 548 AQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIG 604
Query: 201 VSG 203
+G
Sbjct: 605 ATG 607
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/167 (28%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G +GP+G+ +G G GP+G G G G +G
Sbjct: 381 TGPTG---AEGPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGP 434
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G G +G G G +GP+G + GP
Sbjct: 435 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGP 494
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 495 QGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 541
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/129 (29%), Positives = 53/129 (41%), Gaps = 3/129 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G GP+G G G +GP+G+ GP G +G +G
Sbjct: 483 IGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGP 542
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS GP G + G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 543 QGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGM 599
Query: 133 SGRLRYLGP 141
+G + GP
Sbjct: 600 TGDIGATGP 608
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/160 (27%), Positives = 59/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------G 95
P G GP+G+ G G GP+G GP G +GP+G + G
Sbjct: 356 PQGNPGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTG---AEGPKGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 412
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G G G G +G G G G +G GP G G +G
Sbjct: 413 PAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTG 472
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G +GP+G + GP G GP+G G+
Sbjct: 473 AQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 512
>gi|239627466|ref|ZP_04670497.1| conserved hypothetical protein [Clostridiales bacterium 1_7_47_FAA]
gi|239517612|gb|EEQ57478.1| conserved hypothetical protein [Clostridiales bacterium 1_7_47FAA]
Length = 230
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 72/176 (40%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G +G G G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 21 TGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPTGADGVTGPTGPT---GANGV 77
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP+G G +G G G GP+G GP+G +DG
Sbjct: 78 TGPTGPTGADGVTGPTGPAGADGMTGPTGPTGADGATGSTGPTGADGVTGPTGPAGADGT 137
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G GP+G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 138 TGPTGPTGADGVTGPTGPTGADGATGPTGP---TGADGATGPTGPTGADGVTGPTG 190
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 73/190 (38%), Gaps = 30/190 (15%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G GP+G+ GP+G P+G+ GP+G G G GP+G+
Sbjct: 12 TGAAGVTGPTGPAGADGVTGPTG------PAGADGVTGPTGP---AGADGVTGPTGPTGA 62
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G G G GP+G GP+G +DG +G G
Sbjct: 63 DGVTGPTGPTGANGVTGPTGPTGADGVTGPTGPAGADGMTGPTGPTGADGATGSTGPTGA 122
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G GP+G GP+G GP+ GP+G GP
Sbjct: 123 DGVTGPTGPAGADGTTGPTGPTGADGVTGPTGPTGADGATGPT------GPTGADGATGP 176
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
+G G++
Sbjct: 177 TGPTGADGVT 186
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/179 (26%), Positives = 68/179 (37%), Gaps = 22/179 (12%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G GP+G+ GP+G G G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 12 TGAAGVTGPTGPAGADGVTGPTGPA---GADGVTGPTGPAGADGVTGPTGPTGADGVTGP 68
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G GP+G GP+G +DG +G G G GP+G GP
Sbjct: 69 TGPTGANGVTGPTGPTGADGVTGPTGPAGADGMTGPTGPTGADGATGSTGPTGADGVTGP 128
Query: 160 SGRLRY------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+G GP+G GP+G G +G G +DG+
Sbjct: 129 TGPAGADGTTGPTGPTGADGVTGPTGPTGADGATGPTGPTGADGATGPTGPTG-ADGVT 186
>gi|402555142|ref|YP_006596413.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus FRI-35]
gi|401796352|gb|AFQ10211.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
FRI-35]
Length = 1279
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/193 (30%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G + GP
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGHQGPQ 339
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 340 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 396
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 397 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQ 456
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G G+ +G
Sbjct: 457 GVQGAQGGIGPTG 469
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 72/205 (35%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 243 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 302
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G + GP G GPSG GP G
Sbjct: 303 QGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGHQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGL 359
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 360 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 419
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 420 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 292
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP +G + GP G GPSG
Sbjct: 293 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGHQGPQGIQGVPGPSG--- 349
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 350 ATGPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 409
Query: 189 RL 190
Sbjct: 410 AT 411
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 69/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ + GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGHQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGLQGPMG 364
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 365 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 424
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 425 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGP------MGPQGVQG 478
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 479 VQGIQGATGAQGVQ 492
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G +GP G+ +G + GP G GPSG GP G
Sbjct: 307 GATGATGDQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGHQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQ 357
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 358 GLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQ 417
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 418 GIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGPQGVQ 477
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 478 GV 479
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/170 (32%), Positives = 65/170 (38%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G GP G L GP G GP GS+ GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGELGPTGPQGVQGIQGPVGSIGATGPEGQQGSQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP+G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGMQGPAGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGMQGLQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---VTGPTG 200
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G + GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 328 GATGATGHQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 384
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 385 GVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 445 GEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 504
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 505 GAT 507
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/156 (31%), Positives = 57/156 (36%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL-- 94
+ GP+G GP G GP G L GP G GP GS+ GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGELGPTGPQGVQGIQGPVGSIGATGPEGQQGSQGL 94
Query: 95 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP G GP G GP+G G G G G + GP G G G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGMQGPAGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGL 154
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G GPSG G +G+
Sbjct: 155 PGATGPQG---IQGAQGMQGLQGPSGNTGATGATGQ 187
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 231 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 287
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G + GP G GP
Sbjct: 288 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGHQGPQGIQGVPGP 347
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 348 SG---ATGPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 400
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 61/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 612 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGVQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 671
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 672 GTGAQGPQGIQGPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 731
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 732 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 791
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 792 PEGPQGVQGV 801
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 683 GPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 742
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 743 GIQGVQGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 802
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G + GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 803 GEI---GPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 847
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 66/194 (34%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 648 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQG 704
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 705 EIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQGIQGIQG 764
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 765 VQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGEIGPTGP------MGPQGVQG 818
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 819 VQGIQGATGAQGVQ 832
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 60/164 (36%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 233 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 292
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP G + GP G GPSG
Sbjct: 293 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGHQGPQGIQGVPGPSG--- 349
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 350 ATGPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 393
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 683 GPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 742
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 743 GIQGVQGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 802
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 803 GE---IGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 847
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 644 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDVGPTGPQGPT 697
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G GP G GP G GP G G G S GP
Sbjct: 698 GIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQ 757
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 758 GIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGEIGPTGPMGPQGVQ 817
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 818 GV 819
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.068, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 56/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 351 TGPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 411 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGI---GP 467
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 468 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 507
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.089, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 583 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGV 642
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 643 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDVGPTGPQGPTGI 699
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 700 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQGI 759
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 760 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 784
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/141 (31%), Positives = 52/141 (36%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G GP G GP G L GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGELGPTGPQGVQGIQGPVGSIGATGPEGQQGSQG- 93
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
LR GP G + GP G GP+G G G G G + GP G
Sbjct: 94 ---LR--GPQGETGATGPQGVQGMQGPAGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQGIQGAQGM 169
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.73, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 62/189 (32%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 577 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 636
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 637 QGPQGVQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDVGPTGPQGP 696
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 697 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGP 756
Query: 187 SGRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 757 QGIQGIQGV 765
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/160 (28%), Positives = 52/160 (32%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 691 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 750
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 751 TGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGEIGPTGP 810
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 811 MGPQGVQGVQG---IQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 847
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/100 (31%), Positives = 37/100 (37%), Gaps = 3/100 (3%)
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 166
+ GP+G GP G GP G L GP G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGELGPTGPQGVQGIQGPVGSIGATGPEGQQGSQGL 94
Query: 167 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP+G G + GL
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGMQGPAGPTGATGAQGIQGIQGLQ 134
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 952 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1011
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1012 ATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG 1044
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 38/96 (39%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 952 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1011
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1012 ATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG 1044
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 38/96 (39%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+GP+G GP G G +G G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 952 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1011
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1012 ATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG 1044
>gi|423436815|ref|ZP_17413796.1| hypothetical protein IE9_02996 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
gi|401122551|gb|EJQ30338.1| hypothetical protein IE9_02996 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
Length = 835
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 76/203 (37%), Gaps = 15/203 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGIAGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 543
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +G++ V G
Sbjct: 544 IRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQ 566
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 470 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 530 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 578
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 375 GPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAE 434
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 435 GAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 494
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 495 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEV 554
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G
Sbjct: 555 GITGSQGVQGAQG 567
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 393 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQ 452
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 453 GIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQ 509
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 510 GPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQ 569
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 570 GPQGPQGNV 578
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.089, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 18/201 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+GS G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 329 IGAQGVQGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGIAGPTGAEGSQGIQGP 388
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G G + GP
Sbjct: 389 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGP 448
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G G +G GP G +GP+G +
Sbjct: 449 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 508
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP+G G+
Sbjct: 509 QGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 529
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.94, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/212 (25%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 18/212 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG + +G G GP+GS G G +G G GP G GP+G
Sbjct: 319 STGVSGGIGPIGAQGVQGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGIAGPTG 378
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G L GP+G G G +GP+G +G G +G +G + G
Sbjct: 379 AEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQG 438
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLR 173
G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 439 TQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQG 498
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 499 IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 530
>gi|344240430|gb|EGV96533.1| Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Cricetulus griseus]
Length = 1611
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/192 (35%), Positives = 98/192 (51%), Gaps = 51/192 (26%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S S+R+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 904 FRFEG-SPSMRFEGSAGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFDGPHGQ-- 955
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPS 133
P GSLR+ P G+ P G LR+ G G GPSG +R+ GP G+ P
Sbjct: 956 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEG--GH----GPSGAAIRFDGPHGQ-----PG 996
Query: 134 GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP- 177
G +R+ GP + +R+ GP + LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 997 GGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHSQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPL 1056
Query: 178 ---SGRLRYLGP 186
G +R+ GP
Sbjct: 1057 VQQGGGMRFEGP 1068
>gi|229070806|ref|ZP_04204034.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus F65185]
gi|228712196|gb|EEL64143.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus F65185]
Length = 824
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 76/203 (37%), Gaps = 15/203 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 356 PQGNQGIAGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 415
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 416 PVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 472
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 473 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 532
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +G++ V G
Sbjct: 533 IRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQ 555
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 399 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 458
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 459 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 518
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 519 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 567
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 364 GPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAE 423
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 424 GAQGTQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 483
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 484 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEV 543
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G
Sbjct: 544 GITGSQGVQGAQG 556
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 382 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGPAGAQ 441
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 442 GIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQ 498
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 499 GPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQ 558
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 559 GPQGPQGNV 567
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.098, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 18/201 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+GS G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 318 IGAQGVQGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGIAGPTGAEGSQGIQGP 377
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G G + GP
Sbjct: 378 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGTQGIRGATGP 437
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G G +G GP G +GP+G +
Sbjct: 438 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 497
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP+G G+
Sbjct: 498 QGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 518
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/212 (25%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 18/212 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG + +G G GP+GS G G +G G GP G GP+G
Sbjct: 308 STGVSGGIGPIGAQGVQGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGIAGPTG 367
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G L GP+G G G +GP+G +G G +G +G + G
Sbjct: 368 AEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLR 173
G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 428 TQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQG 487
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 488 IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 519
>gi|304313179|ref|YP_003812777.1| hypothetical protein HDN1F_35650 [gamma proteobacterium HdN1]
gi|301798912|emb|CBL47148.1| hypothetical protein HDN1F_35650 [gamma proteobacterium HdN1]
Length = 352
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/159 (30%), Positives = 67/159 (42%), Gaps = 7/159 (4%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ GP+G + GP+G G +G+ G +G G +G +GP G
Sbjct: 200 VTGPAGAT---GPTG-VGVTGPAGPQGVQGVAGATGATGMTGPTGPAGIAGEQGPVGPQG 255
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G +G GP+G G G + GP G GP G GP G G
Sbjct: 256 VQGVAGATGATGMTGPTGPAGIAGEQGPV---GPQGATGMTGPQGMQGEQGPQGMPGMQG 312
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G +GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 313 PMGPQGSVGPTGATGAWGPTGPTGATGPTGPAGATGPTG 351
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 67/164 (40%), Gaps = 13/164 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G + GP+G G +G G +G G +G +GP G
Sbjct: 202 GPAG---ATGPTG-VGVTGPAGPQGVQGVAGATGATGMTGPTGPAGIAGEQGPVGPQGVQ 257
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP+G G G + GP G GP G GP G GP
Sbjct: 258 GVAGATGATGMTGPTGPAGIAGEQGPV---GPQGATGMTGPQGMQGEQGPQGMPGMQGPM 314
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +GP+G GP+G P+G GP+G GP
Sbjct: 315 GPQGSVGPTGATGAWGPTG------PTGATGPTGPAGATGPTGP 352
>gi|229047021|ref|ZP_04192645.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH676]
gi|228724312|gb|EEL75645.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH676]
Length = 822
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/194 (27%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 354 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVAG 413
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 414 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 470
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 471 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 530
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G++
Sbjct: 531 IRGPQGNTGEIGIT 544
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 397 IGPTGAQGMVGIQGVAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 456
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 457 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 516
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 517 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 565
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 362 GPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVAGPVGVTGAE 421
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 422 GAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 481
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 482 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEI 541
Query: 176 GPSG 179
G +G
Sbjct: 542 GITG 545
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 380 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQ 439
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 440 GIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQ 496
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 497 GPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGSQ 556
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 557 GPQGPQGNV 565
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/207 (28%), Positives = 81/207 (39%), Gaps = 27/207 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G GP+G+ G G +GP+G+ GP G +G +G
Sbjct: 487 IGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGP 546
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G GS GP G + GP G G +G G +G
Sbjct: 547 QGVQGAQGSQGPQGPQGNVGITGATGETGATGATGATGPQGVQGVQGITGIQGITGTTGN 606
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G G G GP+G G SG +GP G GPSG +GP
Sbjct: 607 TGATGPQGIQGIQGVQG---LQGPTGASGVTGASGS---IGPVGAQGSQGPSG---VVGP 657
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+G G +G + + G++ +GL
Sbjct: 658 TG---ATGSAGSIGFFGIAGATGATGL 681
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 61/164 (37%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 354 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVAG 413
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G +G G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 414 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTG 473
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 474 TQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 517
>gi|228966255|ref|ZP_04127315.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar sotto str. T04001]
gi|228793439|gb|EEM40982.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar sotto str. T04001]
Length = 783
Score = 53.9 bits (128), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/172 (31%), Positives = 64/172 (37%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 416 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP GP+G GP G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGPTGATGPQGIQGIQGPIG 521
Score = 52.8 bits (125), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/196 (30%), Positives = 74/196 (37%), Gaps = 6/196 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 415 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 474
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP G GP+G G G +GP+G G
Sbjct: 475 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGI 531
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGR 189
G +GP+G G G GP+G GP+G GP G +GP+G
Sbjct: 532 QGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGA 591
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G++ +G+
Sbjct: 592 TGQTGVTGATGPTGIQ 607
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 68/183 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G GS+ GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 371 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVR 430
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G GP G GPSG GP G GP G + GP
Sbjct: 431 GATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQ 490
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G + GP G G G + GP+G
Sbjct: 491 GIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQ 550
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 551 GIT 553
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/162 (30%), Positives = 60/162 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 415
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 416 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 476 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQ 517
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 59/161 (36%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPT 415
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 416 GPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 476 GIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGI 516
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 397 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPQGV 456
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 457 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPT---GPTGATGPQGI 513
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G G G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 514 QGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGET 571
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 229
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + G +G GP+G G++
Sbjct: 230 GPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGSTGIT 277
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 66/180 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 392 GSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPT 451
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G
Sbjct: 452 GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQ 511
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G + GP G G G + GP+G G +G+ GP+G G +
Sbjct: 512 GIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGET 571
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS+ GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 379 TGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGL 438
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 439 QGLQGVQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGP 498
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G GP G GP +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 499 Q------GPTGPTGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGP 546
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 547 QGL 549
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G + GP+G G G GP+G G G L S G
Sbjct: 128 GPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 188 GITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQ 247
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 248 GV 249
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---P 78
+GP+G G G GP+G GP GS GP G G G G P
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGSQGPMGEQGPQGIQGVQGIQGERGP 111
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGN 171
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G GL
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGL 228
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 169
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G LG SG G G +GP+G P+G G G + G +
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTG------PTGSQGIQGEQGPMGPQGET 223
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G + +GP+G G G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 224 GVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGSTGITG 278
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/123 (29%), Positives = 50/123 (40%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G GP+G+ G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 483 SIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTG 542
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G GP+G GP+G GP G G G G +G + G
Sbjct: 543 PTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGQTGVTGATG 602
Query: 132 PSG 134
P+G
Sbjct: 603 PTG 605
>gi|218231450|ref|YP_002368065.1| hypothetical protein BCB4264_A3361 [Bacillus cereus B4264]
gi|218159407|gb|ACK59399.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus B4264]
Length = 835
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/194 (27%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGVVGIQGIAG 426
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 543
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G++
Sbjct: 544 IRGPQGNTGEVGIT 557
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGVVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 470 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 530 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 578
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 374 TGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGVVGIQGIAGPVGVTGA 433
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGP 114
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 434 EGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGP 493
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 494 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 553
Query: 175 LGPSG 179
+G +G
Sbjct: 554 VGITG 558
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 70/190 (36%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 392 TGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGVVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGA 451
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 452 QGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 508
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 509 QGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGS 568
Query: 181 LRYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 569 QGPQGPQGNV 578
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.00, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 61/164 (37%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGVVGIQGIAG 426
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G +G G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTG 486
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 487 TQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 530
>gi|449265908|gb|EMC77036.1| Collagen-like protein 2, partial [Columba livia]
Length = 227
Score = 53.5 bits (127), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/217 (29%), Positives = 90/217 (41%), Gaps = 33/217 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++G +G L G +G+L LG +G + G G + G G+L G +G L LG +G
Sbjct: 2 DVGDTGTLGTAGATGTLGTLGTAGDVGDAGTLGTRGHWGQQGTLGTAGDTGTLGTLGTAG 61
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSG-RLRY----LGPS----GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
LG +G LG G R R+ +G + GR G G Y G +G R G
Sbjct: 62 DAGMLGTAGDTGTLGTQGTRGRWGHWDIGDTGDGRGRWEQQGTRGHWGY-GNTGDGRGRG 120
Query: 123 PS----GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGRL 163
S GR + G G L G +G L LG +G + LG +G +
Sbjct: 121 DSRGHWGREGTWGQQGTLGTAGDTGTLGTLGTAGDAGTLGQQGTLGTGGDVGTLGMAGDV 180
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPS----GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G + G S G+ LG +G LG++
Sbjct: 181 GTAGDIGDSKGHGDSRGHWGQQGTLGTAGDTGTLGMA 217
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/215 (27%), Positives = 84/215 (39%), Gaps = 42/215 (19%)
Query: 9 KALNLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSG 62
A ++G +G L + G G+L G +G+L LG +G L G +G+L G G
Sbjct: 23 TAGDVGDAGTLGTRGHWGQQGTLGTAGDTGTLGTLGTAGDAGMLGTAGDTGTLGTQGTRG 82
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS----GRL 118
R + +G +G R GR G G Y G +G R G S GR
Sbjct: 83 RWGHW-------DIGDTGDGR-----GRWEQQGTRGHWGY-GNTGDGRGRGDSRGHWGRE 129
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G G L + G +G L LG +G + LG +G + G G
Sbjct: 130 GTWGQQGTLGTAGDTGTLGTLGTAGDAGTLGQQGTLGTGGDVGTLGMAGDVGTAGDIGDS 189
Query: 164 RYLGPS----GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+ G S G+ LG +G LG +G + G
Sbjct: 190 KGHGDSRGHWGQQGTLGTAGDTGTLGMAGDMGTAG 224
>gi|229179637|ref|ZP_04306988.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus 172560W]
gi|228603840|gb|EEK61310.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus 172560W]
Length = 752
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 76/203 (37%), Gaps = 15/203 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 356 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 415
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 416 PVGVTGAEGAQGIQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 472
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 473 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 532
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +G++ V G
Sbjct: 533 IRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQ 555
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 399 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGIQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 458
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 459 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 518
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 519 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 567
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 364 GPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAE 423
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPS 115
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 424 GAQGIQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 483
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 484 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEV 543
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G
Sbjct: 544 GITGSQGVQGAQG 556
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 382 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGIQGIRGATGPAGAQ 441
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 442 GIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQ 498
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 499 GPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGSQGVQGAQGSQ 558
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 559 GPQGPQGNV 567
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/201 (26%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 18/201 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+GS G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 318 IGAQGVEGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGP 377
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G G + GP
Sbjct: 378 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGIQGIRGATGP 437
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G G +G GP G +GP+G +
Sbjct: 438 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 497
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP+G G+
Sbjct: 498 QGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 518
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/212 (25%), Positives = 75/212 (35%), Gaps = 18/212 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG + +G G GP+GS G G +G G GP G GP+G
Sbjct: 308 STGVSGGIGPIGAQGVEGITGPTGSQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTG 367
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G L GP+G G G +GP+G +G G +G +G + G
Sbjct: 368 AEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLR 173
G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 428 IQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQG 487
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 488 IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 519
>gi|30020512|ref|NP_832143.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cereus ATCC
14579]
gi|29896063|gb|AAP09344.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus ATCC 14579]
Length = 279
Score = 53.5 bits (127), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/190 (27%), Positives = 80/190 (42%), Gaps = 10/190 (5%)
Query: 11 LNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
+ G +G GP+G G +G GP+G GP+G+ GP+G G +
Sbjct: 31 IPTGATGPTGITGPTGETGPTGITGPTGVTGPTG---ITGPTGA---TGPTGITGPTGAT 84
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 85 GPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGE---TGPTGETGPT 141
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G + + + L
Sbjct: 142 GVTGPTGITGPTGATGPTGITGPTGATGPTGETGPTGITGPTGATGPTGGIGPIT-TTNL 200
Query: 191 RYLGLSDGLR 200
Y +DG +
Sbjct: 201 LYYTFADGEK 210
>gi|390960052|ref|YP_006423809.1| IPT/TIG domain-containing protein,collagen triple helix repeat
protein [Terriglobus roseus DSM 18391]
gi|390414970|gb|AFL90474.1| IPT/TIG domain-containing protein,collagen triple helix repeat
protein [Terriglobus roseus DSM 18391]
Length = 409
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 76/179 (42%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A+ LG G GP+G GP+G G +G GP G G +G +GP
Sbjct: 104 AVTLGTQGVQGATGPAGLPGLPGPAGPAGVPGRAGLTGATGPVGPAGATGLTGAAGPVGP 163
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G +G +G+ +GP+G +GP+G GP G GP G GP G +
Sbjct: 164 AGAAGPIGLTGATGPVGPAGATGPVGPAGAAGTTGPVGPAGAAGPIGLTGLAGPQGATGA 223
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLG 185
GP G GP G +GP+G GP G L +G + + PS Y+G
Sbjct: 224 TGPIG---LTGPQGTAGVIGPAGPSGPTGPQGTAGPLVLNGNTTFPATVTPSQNDAYVG 279
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/141 (31%), Positives = 58/141 (41%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
LG G GP+G GP+G G +G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 106 TLGTQGVQGATGPAGLPGLPGPAGPAGVPGRAGLTGATGPVGPAGATGLTGAAGPVGPAG 165
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+G +G +GP+G GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 166 AAGPIGLTGATGPVGPAGATGPVGPAGAAGTTGPVGPAGAAGPIGLTGLAGPQGATGATG 225
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP G +GP+G
Sbjct: 226 PIG---LTGPQGTAGVIGPAG 243
>gi|195729077|gb|ACG50748.1| VtaA2 [Haemophilus parasuis str. Nagasaki]
Length = 1225
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 76/176 (43%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G + GP+G+ GP G G +G GP+G + GP G + GP+G
Sbjct: 493 VGAQGPMGPAGPAGAQGIQGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPVGPAGPVGPVGAQGPAGP 552
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G G G G
Sbjct: 553 RGEAGPAGAT---GPQG---ATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGE 606
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G + GP G +GP+G G G G +G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 607 AGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGDTGQKGEAGPAGERGEIGPAG 662
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/199 (29%), Positives = 67/199 (33%), Gaps = 18/199 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP G G G GP+G +GP G GP G
Sbjct: 671 GPAGAKGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEA 730
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPS------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP G G G GP+G GP
Sbjct: 731 GAKGDKGDTGEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPR 790
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP+G GP G GP G GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 791 GEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQ 850
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP G G
Sbjct: 851 GPTGPTGPQGPQGTAGIQG 869
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/201 (28%), Positives = 69/201 (34%), Gaps = 18/201 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G G G GP+G +GP G+ GP G G G
Sbjct: 680 GPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDT 739
Query: 74 RYLGPS------------------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP G G G GP+G GP G GP+
Sbjct: 740 GEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPA 799
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP G GP G GP+G +GP+G GP G GP+G
Sbjct: 800 GPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQ 859
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP G + +S
Sbjct: 860 GPQGTAGIQGPKGERGNVSVS 880
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/181 (31%), Positives = 77/181 (42%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP+G+ GP G GP+G GP+G + GP G GP+
Sbjct: 449 GPAGERGETGPAGAAGPKGEQGPEGKQGIQGPTGPAGPRGPAGPVGAQGPMG---PAGPA 505
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--- 127
G GP G G +G GP+G + GP G + GP+G GP+G
Sbjct: 506 GAQGIQGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPVGPAGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAGATGPQ 565
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP+G GP G GP+G G G G +G + GP G +GP+
Sbjct: 566 GATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPA 625
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 626 G 626
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/207 (28%), Positives = 72/207 (34%), Gaps = 30/207 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G +GP+G GP+G+ GP G GP G G G G
Sbjct: 648 EAGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETG 707
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP----------------------- 105
P+G +GP G+ GP G G G GP
Sbjct: 708 PAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQG 767
Query: 106 ----SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G GP+G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 768 PRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAG 827
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+GP+G GP G GP+G
Sbjct: 828 AAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTG 854
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 71/181 (39%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G GP+G GP G GP+G G G G +G
Sbjct: 550 AGPRGEAGPAGATGPQGATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGEAGP 609
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---NS 129
+ GP G+ +GP+G G G G +G+ GP+G +GP+G
Sbjct: 610 VGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGDTGQKGEAGPAGERGEIGPAGPAGPRGP 669
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP+G GP G GP G G G GP+G +GP G GP G
Sbjct: 670 EGPAGAKGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGE 729
Query: 190 L 190
Sbjct: 730 A 730
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 73/178 (41%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPS 70
G +G GP+G + GP G + GP+G GP+G+ GP+G GP
Sbjct: 521 GDTGERGATGPAGPVGPAGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAGATGPQGATGPAGEPGKQGPR 580
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G G G G +G + GP G +GP+G G G
Sbjct: 581 GEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDK 640
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G+ GP+G +GP+G GP GP+G GP G GP G
Sbjct: 641 GDTGQKGEAGPAGERGEIGPAGPAGPRGPE------GPAGAKGEQGPRGDKGETGPVG 692
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/208 (27%), Positives = 71/208 (34%), Gaps = 30/208 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G+ GP+G +GP+G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 639 DKGDTGQKGEAGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAG 698
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------------- 114
G GP+G +GP G GP G G G GP
Sbjct: 699 AKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGPMGPQGPAGAAGPAG 758
Query: 115 -------------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G GP+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 759 PAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKG 818
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 819 DRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGE 846
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 63/169 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G +GP G+ GP G G G GP G G +G G G
Sbjct: 705 ETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERG 764
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G GP+G GP G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 765 EQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGDRGETG 824
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P+G +GP+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 825 PAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQGPQGTAGIQGPKGE 873
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 68/182 (37%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G G +G + GP G +GP+G
Sbjct: 568 TGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGP 627
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G+ GP+G +GP+G GP G P+G GP
Sbjct: 628 AGERGEQGPRGDKGDTGQKGEAGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEG------PAGAKGEQGP 681
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G G G GP+G +GP G GP G G G
Sbjct: 682 RGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGE 741
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 742 AG 743
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 60/178 (33%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS---------- 61
G G GP+G +GP G+ GP G G G GP
Sbjct: 696 EAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGPMGPQGPAGAAG 755
Query: 62 --------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G G G GP+G+ GP G GP+G GP G G
Sbjct: 756 PAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGPQGPQGTAGIQG 815
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
P G GP+G GP+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 816 PKGDRGETGPAGAAGPVGPAGPRGEQGPKGEQGIQGPTGPTGPQGPQGTAGIQGPKGE 873
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 65/173 (37%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G G +G + GP G+ +GP+G G G
Sbjct: 578 GPRGEQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPR 637
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G +GP+G GP GP+G GP G GP
Sbjct: 638 GDKGDTGQKGEAGPAGERGEIGPAGPAGPRGPE------GPAGAKGEQGPRGDKGETGPV 691
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G G GP+G +GP G GP G G G GP
Sbjct: 692 GPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGP 744
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/209 (27%), Positives = 67/209 (32%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G G G G G + GP+G GP+G GP G
Sbjct: 625 AGPAGERGEQGPRGDKGDTGQKGEAGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGD 684
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G GP+G +GP G GP G G G GP
Sbjct: 685 KGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGP 744
Query: 133 ---------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 745 MGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPAGPTGP 804
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP G GP+G +G
Sbjct: 805 QGPQGTAGIQGPKGDRGETGPAGAAGPVG 833
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 72/182 (39%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP G + GP+G GP+G+ GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 538 AGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAGATGPQGATGPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAGPKGEAGA 597
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +G + GP G +GP+G G G G +G+ GP+G
Sbjct: 598 KGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGDTGQKGEAGPAGERGE 657
Query: 130 DGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP+G GP G GP G G G GP+G +GP
Sbjct: 658 IGPAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGP 717
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 718 QG 719
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/156 (30%), Positives = 56/156 (35%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP G +G +G + GP+G GP G G G
Sbjct: 589 AGPKGEAGAKGDKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGDTGQKGE 648
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP+G GP+G GP G GP G G G GP
Sbjct: 649 AGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGP 708
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G +GP G GP G G G GP
Sbjct: 709 AGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGP 744
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/204 (26%), Positives = 67/204 (32%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G + GP+G GP G G G G G + GP+G GP+G
Sbjct: 616 VGATGPVGPAGPAGERGEQGPRGDKGDTGQKGEAGPAGERGEIGPAGPAGPRGPEGPAGA 675
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G G G GP+G +GP G GP G + G
Sbjct: 676 KGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIGPQGAPGPAGPKGEAGAKGD 735
Query: 133 SGRLRYLGP---------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP G GP+G GP G
Sbjct: 736 KGDTGEAGPMGPQGPAGAAGPAGPAGERGEQGPRGDKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGI 795
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP G GP G
Sbjct: 796 QGPAGPTGPQGPQGTAGIQGPKGD 819
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/172 (32%), Positives = 72/172 (41%), Gaps = 15/172 (8%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR--LR-YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
P+G + +GP G G G LR GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 420 PTGPVGPIGPQGVPGPKGDKGEQGLRGEQGPAGERGETGPAG---AAGPKGEQ---GPEG 473
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G GP+G + GP G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 474 KQGIQGPTGPAGPRGPAGPVGAQGPMG---PAGPAGAQGIQGPKGDRGPKGDTGERGATG 530
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P+G + GP G + GP+G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 531 PAGPVGPAGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAGATGPQGATGPAGEPGKQGPRGE 582
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/202 (30%), Positives = 81/202 (40%), Gaps = 36/202 (17%)
Query: 14 GPSGRLRY------------------LGPSGSLRYLGPSGS-----LR-YLGPSGRLRYL 49
GP+G + +GP G GP G LR GP+G
Sbjct: 398 GPAGPIGPVGPAGAAGATGPQGPTGPVGPIGPQGVPGPKGDKGEQGLRGEQGPAGERGET 457
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ GP G GP G+ GP+G GP+G + GP G GP+G
Sbjct: 458 GPAGA---AGPKGE---QGPEGKQGIQGPTGPAGPRGPAGPVGAQGPMG---PAGPAGAQ 508
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYL 166
GP G G +G + GP+G + GP G + GP+G GP+G
Sbjct: 509 GIQGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPVGPAGPVGPVGAQGPAGPRGEAGPAGATGPQGAT 568
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G GP+G
Sbjct: 569 GPAGEPGKQGPRGEQGAPGPAG 590
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/148 (30%), Positives = 53/148 (35%), Gaps = 3/148 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G G +GP G + GP G GP+G GP G G G G G
Sbjct: 600 DKGDPGEAGPVGPQGPVGATGPVGPA---GPAGERGEQGPRGDKGDTGQKGEAGPAGERG 656
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G GP+G GP G GP G G G GP+G G
Sbjct: 657 EIGPAGPAGPRGPEGPAGAKGEQGPRGDKGETGPVGPKGEAGAKGDRGETGPAGPAGPIG 716
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
P G GP G G G GP
Sbjct: 717 PQGAPGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGP 744
>gi|30021454|ref|NP_833085.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cereus ATCC
14579]
gi|229128628|ref|ZP_04257606.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-Cer4]
gi|29897008|gb|AAP10286.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus ATCC
14579]
gi|228654821|gb|EEL10681.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-Cer4]
Length = 824
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/194 (27%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 356 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 415
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 416 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 472
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 473 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 532
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G++
Sbjct: 533 IRGPQGNTGEIGIT 546
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 399 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGT 458
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 459 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGI 518
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 519 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 567
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 363 TGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGA 422
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGP 114
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 423 EGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGP 482
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 483 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 542
Query: 175 LGPSG 179
+G +G
Sbjct: 543 IGITG 547
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/206 (25%), Positives = 76/206 (36%), Gaps = 27/206 (13%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G GP+G+ G G +GP+G GP G+
Sbjct: 481 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNT 540
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---------------------RYLGPSGRLRYL 121
+G +G G G GP G + G G
Sbjct: 541 GEIGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNVGITGATGETGATGATGATGPQGVQGVQGITGIQ 600
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +G + G + G G GP+G G SG +GP G GPSG +
Sbjct: 601 GITGTAGNTGATSSQGIQGIQGVQGLQGPTGASGVTGASGS---IGPVGAQGSQGPSGVV 657
Query: 182 ---RYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G + + G++ +GL
Sbjct: 658 GPTGATGSAGSIGFFGIAGATGATGL 683
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 70/190 (36%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 381 TGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGA 440
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 441 QGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 497
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 498 QGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGS 557
Query: 181 LRYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 558 QGPQGPQGNV 567
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/164 (27%), Positives = 61/164 (37%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 356 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 415
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G +G G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 416 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTG 475
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +GP+G + GP G G + V G+
Sbjct: 476 TQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 519
>gi|423562259|ref|ZP_17538535.1| hypothetical protein II5_01663 [Bacillus cereus MSX-A1]
gi|401200424|gb|EJR07309.1| hypothetical protein II5_01663 [Bacillus cereus MSX-A1]
Length = 814
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G G +GP+G+ +G G GP+G
Sbjct: 356 TGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGV 412
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 413 TGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGL 472
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 473 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 532
Query: 193 LGLS 196
+G++
Sbjct: 533 VGIT 536
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/164 (28%), Positives = 63/164 (38%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G
Sbjct: 444 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQ 503
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 504 GVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 563
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 564 GETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 604
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 392 IGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGA 448
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 449 AGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 508
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +G
Sbjct: 509 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGA 568
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 569 TGAT 572
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 73/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G GP+G G G +GP+G+ GP G +G +G
Sbjct: 479 IGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGP 538
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS GP G + G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 539 QGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGM 595
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + GP G G G +G SG G G + G G+ +GP+G
Sbjct: 596 TGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGN 655
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 656 VG 657
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G G G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 408 GPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLT 467
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP
Sbjct: 468 GAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQ 527
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G +G G G GP G + G +G G +G GP G
Sbjct: 528 GNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQ 584
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G++ ++G+
Sbjct: 585 GITGIQGITGM 595
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/164 (28%), Positives = 63/164 (38%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G G G +GP+G++ GP G GP+G
Sbjct: 444 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQ 503
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 504 GVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 563
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 564 GETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 604
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 24/188 (12%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G++ GP G GP+G G G +GP+G GP G+ +G +G
Sbjct: 478 IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 537
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G G GP G + G +G G +G S GP G G +G G
Sbjct: 538 PQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGE---TGATGATGSTGPQGVQGVQGITGIQGITG 594
Query: 150 PSGRLRYLGP---------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G + GP +G +GP G G +G + G +G
Sbjct: 595 MTGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATG 654
Query: 189 RLRYLGLS 196
+ +G S
Sbjct: 655 NVGSIGFS 662
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/176 (27%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 391 VIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETG 447
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 448 AAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQG 507
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 508 IQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 563
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G G G +G GP G G +G G G +GP+G
Sbjct: 427 ATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTG 483
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
++ GP G GP+G G G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 484 AIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQG 543
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G GP G + G +G G +G GP G G +G G++ +
Sbjct: 544 AQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIG 600
Query: 201 VSG 203
+G
Sbjct: 601 ATG 603
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/167 (28%), Positives = 64/167 (38%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G +GP+G+ +G G GP+G G G G +G
Sbjct: 374 TGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGP 430
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G G +G G G +GP+G + GP
Sbjct: 431 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGP 490
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 491 QGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 537
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 76/191 (39%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G +GP+G GP G+ +G +G G G
Sbjct: 489 GPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQ 548
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G++ G +G G +G GP G G +G G +G + + GP
Sbjct: 549 GPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGPQ 605
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G +G SG G G + G G+ +GP+G + G + +
Sbjct: 606 GIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGNV---GSIGFS 662
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G++ +GL
Sbjct: 663 GIAGATGATGL 673
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/171 (27%), Positives = 65/171 (38%), Gaps = 3/171 (1%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G+ GP+G+ G G GP+G+ G G +GP+G +G G
Sbjct: 349 PQGNPGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 405
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G G G +G G G G +G + GP G G +G
Sbjct: 406 IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTG 465
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G +GP+G + GP G GP+G G G +G
Sbjct: 466 LTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIG 516
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/163 (27%), Positives = 62/163 (38%), Gaps = 3/163 (1%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P G+ GP+G G G+ GP+G G G +GP+G+ +G G
Sbjct: 349 PQGNPGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 405
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G G G +G G G G +G GP G G +G
Sbjct: 406 IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTG 465
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G +GP+G + GP G GP+G G+
Sbjct: 466 LTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 508
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/161 (26%), Positives = 63/161 (39%), Gaps = 15/161 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G+ +G +G G G GP G++ G +G G +G
Sbjct: 515 IGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS 574
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------LRYLGPSGRLRY 120
GP G G +G G +G + GP G + G +G
Sbjct: 575 ---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGS 631
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+GP G S G +G + G +G + +G SG G +G
Sbjct: 632 IGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGNVGSIGFSGIAGATGATG 672
>gi|255657182|ref|ZP_05402591.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-23m63]
Length = 301
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/174 (28%), Positives = 82/174 (47%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G +G+ +GP+G G +G++ GP+G + GP+G +GP+G+
Sbjct: 2 VGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPTGATGVAGAI---GPTGTVGATGPTGADGAVGPTGA 58
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP+G + G +G +GP+G G +G + G +G GP
Sbjct: 59 TGATGANGA---TGPTGAVGATGATGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGP 115
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+G + G +G +GP+G G +G G +G GP+G G+
Sbjct: 116 TGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVTGATGNTGATGANGATGPTGATGATGV 169
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/173 (28%), Positives = 81/173 (46%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +G+ +GP+G G +G +GP+G++ GP+G +GP+G
Sbjct: 2 VGPTGPTGATGATGANGLVGPTGPT---GATGVAGAIGPTGTVGATGPTGADGAVGPTGA 58
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G + G +G +GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 59 TGATGANGA---TGPTGAVGATGATGVAGPIGPTGPTGANGVAGATGATGATGANGATGP 115
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+G + G +G +GP+G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 116 TGAVGATGANGVAGPIGPTGPTGANGVTGATGNTGATGANGATGPTGATGATG 168
>gi|423539706|ref|ZP_17516097.1| hypothetical protein IGK_01798, partial [Bacillus cereus HuB4-10]
gi|401173241|gb|EJQ80453.1| hypothetical protein IGK_01798, partial [Bacillus cereus HuB4-10]
Length = 306
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/146 (29%), Positives = 67/146 (45%), Gaps = 10/146 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRY--LGPSGSLRYLGPSGSLRY--LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G + +GP+G+ GP+G+ + +GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 167 TGPTGATGFGVIGPTGATGRTGPTGATGFGIIGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTG 226
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 227 ATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETGPTG 286
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 287 ATGPTGE---TGPTGA---TGPTGET 306
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/146 (29%), Positives = 66/146 (45%), Gaps = 10/146 (6%)
Query: 49 LGPSGSLRY--LGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
GP+G+ + +GP+G GP+G + +GP+G+ G +G GP+G G
Sbjct: 167 TGPTGATGFGVIGPTGATGRTGPTGATGFGIIGPTGATGPTGETGPTGATGPTGETGPTG 226
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
+G GP+G G +G + GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 227 ATGPTGETGPTGATGPTGETGPTGATGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGETG 283
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G GP+G
Sbjct: 284 PTGATGPTGETGPTGA---TGPTGET 306
>gi|195978560|ref|YP_002123804.1| hypothetical protein Sez_1457 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
gi|195975265|gb|ACG62791.1| collagen-like protein with amino-end fibronectin-binding domain
SclZ.10 [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus
MGCS10565]
Length = 666
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 58/176 (32%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G G G+ G +G+ GP G G G G G
Sbjct: 390 GPKGEPGIPGPRGEN---GKDGAPGRDGQNGKDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGHD 446
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 447 GKDGEKGERGEKGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 506
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 507 GERGEKGPQGERGEQGPQGEREEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 562
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/206 (28%), Positives = 63/206 (30%), Gaps = 30/206 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPS------GRLRYLGPSGSLRYLGP------- 60
GP G GP G G G GP G+ GP G GP
Sbjct: 348 GPKGEPGIPGPKGEDGKDGAPGHDGQPGPKGEKGDPGKPGERGPKGEPGIPGPRGENGKD 407
Query: 61 --------SGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYL 103
+G+ GP G+ GP G + G G GP G
Sbjct: 408 GAPGRDGQNGKDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGDPGHDGKDGEKGERGEKGPQGERGEQ 467
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 468 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEKGPQGERGEQGPQGER 527
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G
Sbjct: 528 EEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 553
>gi|449091693|ref|YP_007424134.1| BclA [Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73]
gi|449025450|gb|AGE80613.1| BclA [Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73]
Length = 1333
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/193 (30%), Positives = 68/193 (35%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 286 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGVTGDQGPQ 345
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 346 GIQGVPGPSGAT---GPQGVEGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPE 402
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 403 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQ 462
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G G+ +G
Sbjct: 463 GVQGAQGGIGPTG 475
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 60/175 (34%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 315 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVEGIQGPMGD 371
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 372 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 431
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 432 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGSQGVQGIQ 486
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGAIGPQGATGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVEGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---GIGPTGPMGSQGVQGIQGIQGPTG 493
Query: 189 R 189
Sbjct: 494 T 494
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G+ G
Sbjct: 286 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGVTG----- 340
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP
Sbjct: 341 -DQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVEGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPV 396
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP G GP G GP G G G G+ + G+
Sbjct: 397 GATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/198 (26%), Positives = 64/198 (32%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P G G+ + +G
Sbjct: 798 PEGPQGVQGIQGAIGPTG 815
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/200 (27%), Positives = 66/200 (33%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + G G G G +
Sbjct: 654 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIG 713
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G GP G GP G G G
Sbjct: 714 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G + GP G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 774 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGVQGATG 833
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G
Sbjct: 834 AQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 853
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 650 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPT 703
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 704 GIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQ 763
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 764 GIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQ 823
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 824 GIQ 826
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 65/194 (33%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G + G G G G + GP G GP G G
Sbjct: 678 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPG 734
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 735 PVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIG 794
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G V G+
Sbjct: 795 ATGPEGPQGVQGIQ 808
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 583 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 642
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + G G
Sbjct: 643 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGP 702
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 703 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGP 762
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G+
Sbjct: 763 QGIQGIQGVQ 772
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/179 (28%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 582 DTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATG 641
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + G
Sbjct: 642 DQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTG 698
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 699 SQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGAT 757
>gi|218231261|ref|YP_002369524.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus B4264]
gi|218159218|gb|ACK59210.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus B4264]
Length = 1297
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 64/180 (35%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 312 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G S GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGI 422
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 423 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGI 482
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 68/187 (36%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 373
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 374 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITG 433
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTG 490
Query: 189 RLRYLGL 195
G
Sbjct: 491 AQGVQGA 497
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+GS GP G GP+G G G G +G GP G +GP G+
Sbjct: 276 IGPTGSE---GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGA 332
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 333 ------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGP 383
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G GP+G GP G GP G GP G G G G+ +
Sbjct: 384 QGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGI 443
Query: 202 SGLH 205
G+
Sbjct: 444 QGIQ 447
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 331 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 387
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 388 GVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 447
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G GP+G G G GP+
Sbjct: 448 GEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPT 507
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 508 GAT 510
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 60/172 (34%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETG 854
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 62/177 (35%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETGSTGAT 859
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGI 804
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/168 (30%), Positives = 61/168 (36%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP G
Sbjct: 274 GPIGPTGSEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGAT 333
Query: 101 RYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 157
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 334 GATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 390
Query: 158 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G GP G GP G GP G G+ +G+
Sbjct: 391 GPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 438
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 57/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 338 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAG 394
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 395 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 454
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 455 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/197 (27%), Positives = 63/197 (31%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------L 58
GP G G +G G G +GP+G GP GS
Sbjct: 626 GPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQ 685
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP G G+
Sbjct: 806 GAIGPTGPMGAQGVQGI 822
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 56/150 (37%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 955 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGTTG 1014
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G + GP G GP G G +G GP G G
Sbjct: 1015 ATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQGIQGPTGATGVTGATGPQGIQGPQG 1071
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G GP+G G +G GP G
Sbjct: 1072 IQGPQGIQGPTGVTGATGATGPQGIQGPQG 1101
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 7/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ + G G G +G GP G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 814 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETGSTGATGE-GSTGPTGVTGP 872
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 873 TG 874
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 56/150 (37%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 955 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGTTG 1014
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP G + GP G GP G G +G GP G G
Sbjct: 1015 ATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQGIQGPTGATGVTGATGPQGIQGPQG 1071
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G +G GP G
Sbjct: 1072 IQGPQGIQGPTGVTGATGATGPQGIQGPQG 1101
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 62/176 (35%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP GS G +G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 675 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPG 731
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 732 PVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ G +G GP G G +GP+G GP G
Sbjct: 916 VTGDTGATGSTGVTGATGATGSTGVTGLQGPQGIQGVQG------EIGPTGPQGIQGPQG 969
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G +G G G +GP+G GP G G +G + GP G G
Sbjct: 970 IQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGTTGATGAQGPQG---IQG 1026
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
P G + GP G GP G GP+G G +G GP G G+
Sbjct: 1027 PQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGATGVTGATGPQGIQGPQGIQGPQGIQGPTG 1083
Query: 201 VSGL 204
V+G
Sbjct: 1084 VTGA 1087
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.077, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 7/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G+ GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 712 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 771
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 772 TGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGA 828
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 829 TGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETGSTGATGE-GSTGPTGVTGPTG---VTGPSG 880
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 55/150 (36%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 955 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGTTG 1014
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP G GP G + GP G GP G G +G GP G G
Sbjct: 1015 ATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQGIQGPTGATGVTGATGPQGIQGPQG 1071
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G +G GP G
Sbjct: 1072 IQGPQGIQGPTGVTGATGATGPQGIQGPQG 1101
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.097, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G+ G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 919 DTGATGSTGVTGATGATGSTGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATG 978
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + G
Sbjct: 979 AQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGTTGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTG 1035
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP G G +G GP G G G GP+G G +G
Sbjct: 1036 PQGPQGIQGPQGIQGPTGATGVTGATGPQGIQGPQGIQGPQGIQGPTGVTGATGATG 1092
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 65/193 (33%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G+ G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 576 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 635
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLG 122
+G G G +GP+G GP G GP G + G
Sbjct: 636 ATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTG 695
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 696 PQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 755
Query: 183 YLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 756 PQGPQGIQGIQGV 768
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G+ G +G G G +GP+G GP G G +G+
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGATGSTGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 82 LR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
GP G + GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 980 QGPQGIQGPQGDI---GPTGPQGIQGPQGPQGIQGTTGATGAQGPQGI---QGPQGDIGP 1033
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP G G +G GP G G G GP+G G +
Sbjct: 1034 TGPQGPQGIQGPQGIQGPTGATGVTGATGPQGIQGPQGIQGPQGIQGPTGVTGATGAT 1091
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 637 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 693
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 190 L 190
Sbjct: 754 T 754
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/147 (29%), Positives = 52/147 (35%), Gaps = 9/147 (6%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G G G G GPSG
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQGIQGAQGIQGPSGN 178
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/147 (29%), Positives = 52/147 (35%), Gaps = 9/147 (6%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G G G GPSG
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQGIQGAQGIQGPSGN 178
>gi|228941906|ref|ZP_04104450.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar berliner ATCC 10792]
gi|228981429|ref|ZP_04141728.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|452201203|ref|YP_007481284.1| Phage tail fiber protein [Bacillus thuringiensis serovar
thuringiensis str. IS5056]
gi|228778312|gb|EEM26580.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|228817739|gb|EEM63820.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar berliner ATCC 10792]
gi|452106596|gb|AGG03536.1| Phage tail fiber protein [Bacillus thuringiensis serovar
thuringiensis str. IS5056]
Length = 1225
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 63/180 (35%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 295 GATGDQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQ 345
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G S GP G
Sbjct: 346 GPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQ 405
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 406 GIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 465
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 299 DQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 355
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 356 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITG 415
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 416 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTG 472
Query: 189 RLRYLGLS 196
G
Sbjct: 473 AQGVQGAQ 480
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 67/186 (36%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 369
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 370 GVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 429
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G GP+G G G GP+
Sbjct: 430 GEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPT 489
Query: 188 GRLRYL 193
G +
Sbjct: 490 GATGDM 495
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G G GP G +GP G G P
Sbjct: 265 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 324
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 325 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPE 381
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 382 GPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 439
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 59/166 (35%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 668 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 727
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 728 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 787
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 788 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 830
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 64/183 (34%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G G GP G +GP G+
Sbjct: 256 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGA- 314
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 315 -----TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQ 366
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP+G GP G GP G GP G G G G+ +
Sbjct: 367 GIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQ 426
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 427 GIQ 429
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/163 (29%), Positives = 58/163 (35%), Gaps = 3/163 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 336 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 395
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 396 TGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 452
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
+G + G G GP+G G G GP+G +
Sbjct: 453 TGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPTGATGDM 495
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAG 376
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 377 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 436
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
+GP G +GP+G + G G GP+G G G GP+G +
Sbjct: 437 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPTGATGDM 495
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 59/166 (35%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 668 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 727
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 728 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 787
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 788 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 830
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/204 (27%), Positives = 68/204 (33%), Gaps = 18/204 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 597 EIGPTGPQGVQGPQG---IQGVTGATGDQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGIQGLQGSQG 650
Query: 72 RLR------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
GP G + GP G G G + GP G GP G
Sbjct: 651 IQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 710
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G +GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 711 VQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQG 770
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+ GP G G+ + +G
Sbjct: 771 EIGATGPEGPQGVQGVQGAIGPTG 794
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/158 (29%), Positives = 55/158 (34%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 676 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 735
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 736 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAI---GP 792
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 793 TGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 830
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 60/175 (34%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G GS G +G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 634 IGPTGPQGIQGLQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGE 690
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 691 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 750
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 751 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAIGPTGPMGTQGVQGIQ 805
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 568 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 627
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G G GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 628 QGPQGDIGPTGPQGIQGLQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 684
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 685 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 744
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 745 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 769
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.75, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/196 (27%), Positives = 64/196 (32%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 556 TGVTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 615
Query: 76 LGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------YLGPSGRLRY 120
G +G GP G + GP G G G GP G +
Sbjct: 616 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGLQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 675
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 676 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 735
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 736 TGPQGPQGIQGIQGVQ 751
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 19/164 (11%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQ---GPQG-LR--GPQGETGATGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL---GPSGR 144
G GP +GP+G G G GP G +GP G G +G
Sbjct: 92 QGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGP 145
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 146 QGIQGAQGVQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 185
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 13/158 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGV 94
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G + GP G G G GP G + G
Sbjct: 95 QGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGPQGIQGAQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QG---TQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 185
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/142 (31%), Positives = 52/142 (36%), Gaps = 9/142 (6%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGP 91
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP G + G G G G + GP G G G GP G
Sbjct: 92 QGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGPQG---I 148
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GPSG G +
Sbjct: 149 QGAQGVQGTQGPSGNTGATGAT 170
>gi|153955045|ref|YP_001395810.1| hypothetical protein CKL_2427 [Clostridium kluyveri DSM 555]
gi|219855484|ref|YP_002472606.1| hypothetical protein CKR_2141 [Clostridium kluyveri NBRC 12016]
gi|146347903|gb|EDK34439.1| Hypothetical protein CKL_2427 [Clostridium kluyveri DSM 555]
gi|219569208|dbj|BAH07192.1| hypothetical protein [Clostridium kluyveri NBRC 12016]
Length = 849
Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/220 (23%), Positives = 76/220 (34%), Gaps = 36/220 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G+ G +G GP
Sbjct: 186 TGPTGPTGDTGPTGPTGDTGATGATGDTGPTGATGETGPTGATGDTGATGATGDTGPTGA 245
Query: 70 ------------------------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 246 TGDTGATGATGATGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGA 305
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G G +G G +G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 306 TGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGDTGATGDTGP 365
Query: 160 ---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G GP+G G +G G +
Sbjct: 366 TGATGDTGATGPTGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGAT 405
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/136 (26%), Positives = 55/136 (40%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G+ G +G+ GP+G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 284 PTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATG 343
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G+ G +G GP+G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 344 DTGATGATGDTGDTGATGDTGPTGA------TGDTGATGPTGATGDTGPTGATGDTGATG 397
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP
Sbjct: 398 ATGDTGATGATGDTGP 413
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/136 (26%), Positives = 53/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G G +G+ G +G GP+G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 284 PTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATG 343
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G G +G GP+G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 344 DTGATGATGDTGDTGATGDTGPTGA------TGDTGATGPTGATGDTGPTGATGDTGATG 397
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G GP
Sbjct: 398 ATGDTGATGATGDTGP 413
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/136 (26%), Positives = 53/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 51 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
P+G+ G +G G +G GP+G+ G +G G +G GP+G
Sbjct: 284 PTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATG 343
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G G +G GP+G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 344 DTGATGATGDTGDTGATGDTGPTGA------TGDTGATGPTGATGDTGPTGATGDTGATG 397
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP
Sbjct: 398 ATGDTGATGATGDTGP 413
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/138 (26%), Positives = 56/138 (40%), Gaps = 6/138 (4%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G GP+G+
Sbjct: 282 TGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGA 341
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G +G GP+G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 342 TGDTGATGATGDTGDTGATGDTGPTGA------TGDTGATGPTGATGDTGPTGATGDTGA 395
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+G G +G GP
Sbjct: 396 TGATGDTGATGATGDTGP 413
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/138 (26%), Positives = 56/138 (40%), Gaps = 6/138 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 282 TGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGA 341
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G G +G GP+G +G + GP+G GP+G G
Sbjct: 342 TGDTGATGATGDTGDTGATGDTGPTGA------TGDTGATGPTGATGDTGPTGATGDTGA 395
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G G +G GP
Sbjct: 396 TGATGDTGATGATGDTGP 413
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/130 (26%), Positives = 53/130 (40%), Gaps = 6/130 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G+ GP+G+ G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 290 DTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTGATGATGDTGPTGATGDTGATG 349
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP+G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 350 ATGDTGDTGATGDTGPTGA------TGDTGATGPTGATGDTGPTGATGDTGATGATGDTG 403
Query: 132 PSGRLRYLGP 141
+G GP
Sbjct: 404 ATGATGDTGP 413
>gi|308070529|ref|YP_003872134.1| hypothetical protein PPE_03798 [Paenibacillus polymyxa E681]
gi|305859808|gb|ADM71596.1| Conserved hypothetical protein [Paenibacillus polymyxa E681]
Length = 374
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/160 (28%), Positives = 67/160 (41%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP G G +G +GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 198 VGPTGDTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPA---GPTGATGVTGVTGP 254
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ G +G GP+G G +G +GP+G G +G + G +G GP
Sbjct: 255 VGPTGATGVTGVTGPAGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGDTGATGP 314
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G +G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 315 VGPTGATGDTGDTGATGPVGPTGATGDTGATGPIGPTGDT 354
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/160 (28%), Positives = 67/160 (41%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G G +G +GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 198 VGPTGDTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPA---GPTGATGVTGVTGP 254
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G +G GP+G G +G +GP+G G +G + G +G + GP
Sbjct: 255 VGPTGATGVTGVTGPAGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGDTGATGP 314
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G +G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 315 VGPTGATGDTGDTGATGPVGPTGATGDTGATGPIGPTGDT 354
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/151 (27%), Positives = 62/151 (41%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP+G GP G G +G +GP+G G +G G +G GP G
Sbjct: 198 VGPTGDTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPAGPTGATGVTGVTGPVGP 257
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G GP+G G +G + G +G GP G G +G +GP
Sbjct: 258 TGATGVTGVTGPAGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGDTGATGPVGP 317
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G +G +GP+G G +G +
Sbjct: 318 TGATGDTGDTGATGPVGPTGATGDTGATGPI 348
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/148 (27%), Positives = 61/148 (41%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP+G GP G G +G +GP+G+ G +G G +G GP G
Sbjct: 198 VGPTGDTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPAGPTGATGVTGVTGPVGP 257
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G GP+G G +G + G +G GP G G +G +GP
Sbjct: 258 TGATGVTGVTGPAGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGVTGVTGPVGPTGATGDTGATGPVGP 317
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G +GP+G G +
Sbjct: 318 TGATGDTGDTGATGPVGPTGATGDTGAT 345
>gi|423562260|ref|ZP_17538536.1| hypothetical protein II5_01664 [Bacillus cereus MSX-A1]
gi|401200425|gb|EJR07310.1| hypothetical protein II5_01664 [Bacillus cereus MSX-A1]
Length = 808
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/182 (31%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP GP+G GP G
Sbjct: 432 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQ------GPTGPTGATGPQGIQ 485
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP +GP+G G G +GP+G G G GP+G + GP+
Sbjct: 486 GIQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPT 539
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G G GP+G G G + G +G GP+G
Sbjct: 540 GETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGHQGITGPTGATGPTGETGPQ 599
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 600 GL 601
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + G +G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDTGPTGSTGSTGIT 275
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 15/177 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+GS G PSG GP G GP GS+ GP G GP G P+
Sbjct: 420 GPTGSQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQG------PT 473
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G GP G GP +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 474 GPTGATGPQGIQGIQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQA 527
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G GP G G G GP+G G G + G++
Sbjct: 528 GPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGHQGIT 584
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 63/160 (39%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP GS+ GP G GP G GP+G+ G G +GP+G
Sbjct: 440 TGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGP 496
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G G G GP+G GP+G GP G S G
Sbjct: 497 QGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGE 556
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G GP+G G G + G +G GP+G
Sbjct: 557 MGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGHQGITGPTGATGPTGET 596
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 66/180 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP G G G
Sbjct: 345 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGAT 404
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G G G G G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 405 GPTGLQGLQGVQGPSGPTGSQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQ 464
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +G G G + GP G G G + GP+G G++
Sbjct: 465 GVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGIT 524
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/188 (30%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 11/188 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 350 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTG- 408
Query: 73 LRYL-------GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
L+ L GP+GS G PSG GP G GP G + GP G G
Sbjct: 409 LQGLQGVQGPSGPTGSQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQG 468
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G +G G G + GP G G G + GP+G G +G+
Sbjct: 469 PQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAG 528
Query: 183 YLGPSGRL 190
GP+G
Sbjct: 529 PTGPTGAT 536
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/187 (32%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 14/187 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GP 69
GP G GP+G G GS+ GP G G G GP+G L+ L GP
Sbjct: 360 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGVQGP 418
Query: 70 SGRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
SG GPSG GP G GP G + GP G GP G GP
Sbjct: 419 SGPTGSQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGP---TGP 475
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G G G +GP+G G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 476 TGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGA 535
Query: 184 LGPSGRL 190
GP+G
Sbjct: 536 TGPTGET 542
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G + GP+G G G GP+G G G L S G
Sbjct: 126 GPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 186 GITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQ 245
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 246 GV 247
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/189 (30%), Positives = 66/189 (34%), Gaps = 6/189 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G G G G G GPSG GP G
Sbjct: 386 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGSQGVQGVQGPSGITGPTGPQGI 445
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP GS+ GP G GP G G +G G G + GP G G
Sbjct: 446 QGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGV 505
Query: 133 SGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + GP+G GP+G GP+G GP G G G GP
Sbjct: 506 QGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGP 565
Query: 187 SGRLRYLGL 195
+G GL
Sbjct: 566 TGETGPQGL 574
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---P 78
+GP+G G G GP+G GP GS GP G G G G P
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGSQGPMGEQGPQGIQGVQGIQGERGP 109
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGN 169
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G GL
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGL 226
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 167
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G LG SG G G +GP+G P+G G G + G +
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTG------PTGSQGIQGEQGPMGPQGET 221
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G + +GP+G G G + G +G GP+G G +G
Sbjct: 222 GVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDTGPTGSTGSTGITG 276
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/192 (28%), Positives = 72/192 (37%), Gaps = 6/192 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G GP G GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 450 GPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGP---TGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQ 506
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G G G GP+G GP+G GP G G G + GP+
Sbjct: 507 GPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPT 566
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + G +G GP+G GP G G G G +G+
Sbjct: 567 GETGPQGLQGIQGHQGITGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGLQGITGSTGATGQTGVT 623
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G + + G+
Sbjct: 624 GATGPTGIQGIQ 635
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/186 (31%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 14/186 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL----GPSGRLR--- 65
GP+G G GS+ GP G G G GP+G L+ L GPSG
Sbjct: 368 TGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGVQGPSGPTGSQG 426
Query: 66 ---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G
Sbjct: 427 VQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQG 486
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G + GP G G G + GP+G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 487 IQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQ---AGPTGPTGATGPTGETG 543
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 544 PQGPQG 549
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 68/177 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G GP+G+ G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 454 SIGPTGPQGIQGVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQGPIGPTGPQGIQGIQGVQGPIGPTG 513
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G GP+G GP+G GP G G G GP+G G
Sbjct: 514 PTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGETGPQG 573
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + G +G GP+G G G G +G G +G GP+G
Sbjct: 574 LQGIQGHQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGLQGITGSTGATGQTGVTGATGPTG 630
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/144 (29%), Positives = 51/144 (35%)
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + GP+G GP G GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 345 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPQGVQGIQGEQGVRGAT 404
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G G G G G GPSG GP G GP G + GP G
Sbjct: 405 GPTGLQGLQGVQGPSGPTGSQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQ 464
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G + + G+
Sbjct: 465 GVQGPQGPTGPTGATGPQGIQGIQ 488
>gi|397502821|ref|XP_003822040.1| PREDICTED: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 [Pan paniscus]
Length = 1555
Score = 53.1 bits (126), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/223 (34%), Positives = 109/223 (48%), Gaps = 53/223 (23%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRY 66
R+ G G LR+ G G LR+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ LR+
Sbjct: 846 FRFEGSPG-LRFEGSPGGLRFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRF 904
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSG-RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLGP 114
P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP G+ +R+ GP + +R+ P
Sbjct: 905 DNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEDP 959
Query: 115 SGR----LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS-- 160
G+ LR+ G +L G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 960 HGQSVAGLRFEGQHNQL-----GGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPSVP 1014
Query: 161 -GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 1015 GGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHALRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 1056
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 75/225 (33%), Positives = 103/225 (45%), Gaps = 72/225 (32%)
Query: 19 LRYLGPSGS------LRYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
LR+ GP G LR+ GP G R+ G G LR+ G G
Sbjct: 804 LRFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQAGGGGFRFEGSPG-LRFEGSPGG 862
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPS 106
LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+ LR+ P G+ P
Sbjct: 863 LRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQPVGGLRFDNPRGQ-----PV 912
Query: 107 GRLRYL---GPSG-RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----L 154
G LR+ GPSG +R+ GP G+ P G +R+ GP + +R+ P G+ L
Sbjct: 913 GGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQ-----PGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEDPHGQSVAGL 967
Query: 155 RYLGPS----GRLRYLGPSGR----LRYLGP----SGRLRYLGPS 187
R+ G G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+ GPS
Sbjct: 968 RFEGQHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPLVQQGGGMRFEGPS 1012
>gi|118404410|ref|NP_001072718.1| collagen, type 1, alpha 2 precursor [Xenopus (Silurana) tropicalis]
gi|116487368|gb|AAI25682.1| collagen, type 1, alpha 2 [Xenopus (Silurana) tropicalis]
gi|197246659|gb|AAI68447.1| collagen, type 1, alpha 2 [Xenopus (Silurana) tropicalis]
Length = 1354
Score = 52.8 bits (125), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/184 (34%), Positives = 76/184 (41%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GPSG G G GP+GS + GP G + G G GP G SG
Sbjct: 690 AGPSGLAGPRGAPGERGEAGPAGSTGFAGPPGAAGHTGVKGERGPKGPKGE------SGS 743
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LG GS GP+G GP G G +G + GP+GR GP+G + G
Sbjct: 744 PGALGAVGSHGPAGPNGPAGTTGPRGDGGAPGANG---FPGPAGRTGAPGPAGIVGPSGA 800
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP GR G G +G G GP+G GPSG L
Sbjct: 801 TGHPGKDGPRGPRGDSGPVGRPGEQGIGGPQGLIGEKGSSGESGPAGPPGASGPSGVLGA 860
Query: 193 LGLS 196
LG+S
Sbjct: 861 LGIS 864
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/183 (32%), Positives = 73/183 (39%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G G GPSG GPSG GP+G GP+G+ G G GP G
Sbjct: 347 DTGAKGEPGSAGPSGPA---GPSGEEGRRGPNGEAGSSGPAGNAGIRGVPGTRGLPGPDG 403
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
R +G GS GP+G G +GR L G G GP+G+ GP G
Sbjct: 404 RAGGMGAPGSRGASGPAGARGPNGDAGRPGEPGLLGARGLPGFSGSTGPAGKEGPAGPQG 463
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G G G + + GP G G +G GPSG GP G G
Sbjct: 464 IEGRSGPAGASGPRGEPGSIGFPGPKGPAGEPGKNGDKGSQGPSGNRGAPGPDGNNGAQG 523
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 524 PPG 526
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/203 (31%), Positives = 80/203 (39%), Gaps = 18/203 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------------PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
GP+G + GP G+ + G SGS LG G GP+G G
Sbjct: 707 EAGPAGSTGFAGPPGAAGHTGVKGERGPKGPKGESGSPGALGAVGSHGPAGPNGPAGTTG 766
Query: 60 P------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
P G + GP+GR GP+G + G +G GP G GP GR G
Sbjct: 767 PRGDGGAPGANGFPGPAGRTGAPGPAGIVGPSGATGHPGKDGPRGPRGDSGPVGRPGEQG 826
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G +G G GP+G GPSG L LG SG G G G +G
Sbjct: 827 IGGPQGLIGEKGSSGESGPAGPPGASGPSGVLGALGISGLPGARGERGTPGGPGANGESG 886
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GPSG + GL+
Sbjct: 887 PAGPAGSAGSRGPSGPVGSPGLT 909
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/188 (33%), Positives = 77/188 (40%), Gaps = 15/188 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GP+GR GP+G +GPSG+ + GP GR G G +G
Sbjct: 781 GPAGRTGAPGPAG---IVGPSGATGHPGKDGPRGPRGDSGPVGRPGEQGIGGPQGLIGEK 837
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G GP+G GPSG L LG SG G G G +G GP+G
Sbjct: 838 GSSGESGPAGPPGASGPSGVLGALGISGLPGARGERGTPGGPGANGESGPAGPAGSAGSR 897
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GPSG + S G +G G G GP GR G G Y G +G LG G
Sbjct: 898 GPSGPVGSPGLTGVHGEAGRDGNPGNDGPPGRDGLPGVKGERGYPGGTGPAGSLGAVGAP 957
Query: 182 RYLGPSGR 189
+GPSG+
Sbjct: 958 GAVGPSGK 965
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/172 (31%), Positives = 70/172 (40%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G GP+G+ G G+ GP GR +G GS GP+G G +GR
Sbjct: 373 GPNGEAGSSGPAGNAGIRGVPGTRGLPGPDGRAGGMGAPGSRGASGPAGARGPNGDAGRP 432
Query: 73 -----LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
L G G GP+G+ GP G GP+G G G + + GP G
Sbjct: 433 GEPGLLGARGLPGFSGSTGPAGKEGPAGPQGIEGRSGPAGASGPRGEPGSIGFPGPKGPA 492
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G GPSG GP G GP G G +G GP+G
Sbjct: 493 GEPGKNGDKGSQGPSGNRGAPGPDGNNGAQGPPG---LAGNTGDKGEQGPAG 541
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/178 (33%), Positives = 73/178 (41%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP GR G G +G GS GP+G GPSG L LG SG G G
Sbjct: 815 DSGPVGRPGEQGIGGPQGLIGEKGSSGESGPAGPPGASGPSGVLGALGISGLPGARGERG 874
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G GPSG + G +G G G GP GR G
Sbjct: 875 TPGGPGANGESGPAGPAGSAGSRGPSGPVGSPGLTGVHGEAGRDGNPGNDGPPGRDGLPG 934
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G Y G +G LG G +GPSG+ G G + + G G GPSG+
Sbjct: 935 VKGERGYPGGTGPAGSLGAVGAPGAVGPSGKSGNRGEPGPVGHAGAVGPAGPRGPSGQ 992
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G G G GPSG GPSG GP+G GP+G G G+
Sbjct: 342 AGGKGDTGAKGEPGSAGPSG---PAGPSGEEGRRGPNGEAGSSGPAGNAGIRGVPGTRGL 398
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLNS 129
GP GR +G G GP+G G +GR GP+G+
Sbjct: 399 PGPDGRAGGMGAPGSRGASGPAGARGPNGDAGRPGEPGLLGARGLPGFSGSTGPAGKEGP 458
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP+G G G + + GP G G +G GPSG GP G
Sbjct: 459 AGPQGIEGRSGPAGASGPRGEPGSIGFPGPKGPAGEPGKNGDKGSQGPSGNRGAPGPDGN 518
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 519 NGAQG 523
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G G +G + GP+GR GP+G + G +G GP G
Sbjct: 756 AGPNGPAGTTGPRGDGGAPGANG---FPGPAGRTGAPGPAGIVGPSGATGHPGKDGPRGP 812
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G +G G GP+G GPSG L LG SG + G
Sbjct: 813 RGDSGPVGRPGEQGIGGPQGLIGEKGSSGESGPAGPPGASGPSGVLGALGISGLPGARGE 872
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP+G GPSG + G +G G G GP GR
Sbjct: 873 RGTPGGPGANGESGPAGPAGSAGSRGPSGPVGSPGLTGVHGEAGRDGNPGNDGPPGRDGL 932
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 933 PGV 935
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/125 (33%), Positives = 53/125 (42%), Gaps = 4/125 (3%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GPSG G G GP+G + GP G + G G GP G S G G
Sbjct: 690 AGPSGLAGPRGAPGERGEAGPAGSTGFAGPPGAAGHTGVKGERGPKGPKGESGSPGALGA 749
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+ GP+G G +G G G + GP+GR GP+G +GPSG + G
Sbjct: 750 VGSHGPAGPNGPAGTTGPRGDGGAPGANGFPGPAGRTGAPGPAG---IVGPSGATGHPG- 805
Query: 196 SDGLR 200
DG R
Sbjct: 806 KDGPR 810
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/172 (33%), Positives = 70/172 (40%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G GPSG L LG SG G G+ G +G GP+G
Sbjct: 834 IGEKGSSGESGPAGPPGASGPSGVLGALGISGLPGARGERGTPGGPGANGESGPAGPAGS 893
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLNS 129
GPSG + G +G G G GP GR G G Y GP+G L +
Sbjct: 894 AGSRGPSGPVGSPGLTGVHGEAGRDGNPGNDGPPGRDGLPGVKGERGYPGGTGPAGSLGA 953
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G + G SG GP G +GP+G GPSG+ G G
Sbjct: 954 VGAPGAVGPSGKSGNRGEPGPVGHAGAVGPAG---PRGPSGQQGTRGDKGEA 1002
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/160 (33%), Positives = 68/160 (42%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+GS GPSG + G +G G G+ GP GR G G
Sbjct: 880 GANGESGPAGPAGSAGSRGPSGPVGSPGLTGVHGEAGRDGNPGNDGPPGRDGLPGVKGER 939
Query: 74 RY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
Y GP+GSL +G G + G SG GP G +GP+G GPSG+ +
Sbjct: 940 GYPGGTGPAGSLGAVGAPGAVGPSGKSGNRGEPGPVGHAGAVGPAG---PRGPSGQQGTR 996
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 997 GDKGEAGERGARGLDGRKGHNGLQGLPGPAGSPGETGPAG 1036
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/214 (29%), Positives = 76/214 (35%), Gaps = 28/214 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGSLRYL 58
GP GR +G GS GP+G+ G +GR GP+G
Sbjct: 400 GPDGRAGGMGAPGSRGASGPAGARGPNGDAGRPGEPGLLGARGLPGFSGSTGPAGKEGPA 459
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP+G G GS+ + GP G G +G GPSG GP G
Sbjct: 460 GPQGIEGRSGPAGASGPRGEPGSIGFPGPKGPAGEPGKNGDKGSQGPSGNRGAPGPDGNN 519
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
GP G + G G G G L G G GP+G
Sbjct: 520 GAQGPPGLAGNTGDKGEQGPAGAPGFQGLPGPGGAAGELGKHGERGAPGDFGPAGPAGPR 579
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G G G +G L LGP G G SDG +
Sbjct: 580 GERGAPGESGAAGPLGALGPRGPTGAPG-SDGAK 612
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G GP G GP+G G GS+ + GP G G +G GPSG+
Sbjct: 450 TGPAGKEGPAGPQGIEGRSGPAGASGPRGEPGSIGFPGPKGPAGEPGKNGDKGSQGPSGN 509
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G GP G G +G GP+G + G G + G G+ G
Sbjct: 510 RGAPGPDGNNGAQGPPG---LAGNTGDKGEQGPAGAPGFQGLPGPGGAAGELGKHGERGA 566
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G GP+G G G GP G L GP+G G G GL+ L
Sbjct: 567 PGDFGPAGPAGPRGERGAPGESGAAGPLGALGPRGPTGAPGSDGAKGEPGAAGLNGAL 624
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G+ GP G GP+G+ G G + + GP G G +G GPSG
Sbjct: 449 STGPAGKEGPAGPQGIEGRSGPAGASGPRGEPGSIGFPGPKGPAGEPGKNGDKGSQGPSG 508
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G +G GP+G + G G G G+ G
Sbjct: 509 NRGAPGPDGNNGAQGPPG---LAGNTGDKGEQGPAGAPGFQGLPGPGGAAGELGKHGERG 565
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G G G GP G L GP+G G G G +G L
Sbjct: 566 APGDFGPAGPAGPRGERGAPGESGAAGPLGALGPRGPTGAPGSDGAKGEPGAAGLNGAL 624
>gi|384179488|ref|YP_005565250.1| group-specific protein [Bacillus thuringiensis serovar finitimus
YBT-020]
gi|324325572|gb|ADY20832.1| group-specific protein [Bacillus thuringiensis serovar finitimus
YBT-020]
Length = 622
Score = 52.8 bits (125), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 65/193 (33%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG----------- 62
GP+G GP G GP+G+ G G GP+G+ G G
Sbjct: 186 GPAGAQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 245
Query: 63 -------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP+G G G GP+G G G GP G G
Sbjct: 246 GATGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPVGATGATGAQ 305
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP+G + GP G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 306 GPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQ 365
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G
Sbjct: 366 GPAGATGAQGPQG 378
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/195 (26%), Positives = 64/195 (32%), Gaps = 18/195 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 71
G +G GP+G+ GP G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 177 GATGATGPQGPAGAQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQ 236
Query: 72 ----------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP+G+ G G GP+G G G GP
Sbjct: 237 GVQGPAGATGATGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPV 296
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G G GP+G GP G GP+G G G GP+G
Sbjct: 297 GATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 356
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRL 190
G G GP+G
Sbjct: 357 GAQGPQGVQGPAGAT 371
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 64/193 (33%), Gaps = 24/193 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G P+G+ GP G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 174 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 227
Query: 74 RYLGPSG------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 228 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 287
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP G + G G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 288 GPQGVQGPVGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQ 347
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G G
Sbjct: 348 GPAGATGATGAQG 360
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/215 (25%), Positives = 67/215 (31%), Gaps = 39/215 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP G+ G G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 276 GPAGATGATGAQGPQGVQGPVGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGAT 335
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYL 121
G G GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 336 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAQGPQGIQGPAGATGATGATGPQ 395
Query: 122 GPSGRLNS---------------------------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP+G + GP+G G G GP+G
Sbjct: 396 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGAT 455
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP+G G G GP+G
Sbjct: 456 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGATGATGPAGT 490
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/211 (25%), Positives = 65/211 (30%), Gaps = 30/211 (14%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ G G GP G G G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 276 GPAGATGATGAQGPQGVQGPVGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGAT 335
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLNSD 130
G G GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 336 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAQGPQGIQGPAGATGATGATGPQ 395
Query: 131 GPSGRLRYLGPSG------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 396 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGAT 455
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP+G G +G
Sbjct: 456 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGATGATG 486
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP G P+G GP G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 174 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGAT 227
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP+G G +G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 228 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGATGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 287
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP G G G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 288 GPQGVQGPVGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGVQGPAGATGATG 339
>gi|162450842|ref|YP_001613209.1| hypothetical protein sce2570 [Sorangium cellulosum So ce56]
gi|161161424|emb|CAN92729.1| hypothetical protein sce2570 [Sorangium cellulosum So ce56]
Length = 556
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/207 (31%), Positives = 89/207 (42%), Gaps = 24/207 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G GP G GP+G +GP G + +GP G + GP G
Sbjct: 228 IGPTGAAGPTGPTGPEGVAGPRGPEGPAGPAGAAGPMGPEGPVGAIGPEGPM---GPEGP 284
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGR 117
+ GP G GP G GP G + +GP G GP G
Sbjct: 285 MGPTGPEGPTGATGPEGPRGPEGPVGAIGPEGPPGPRGPEGPVGAIGPEGPR---GPEGP 341
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ +GP G + GP G + +GP G + LGP G + +GP G GP G + GP
Sbjct: 342 VGAIGPEGPMGPRGPEGPVGAIGPEGPMGPLGPEGPVGPMGPVGP---TGPQGPVGPTGP 398
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G + GP+G G+ L V G+
Sbjct: 399 QGPRGFTGPTGPTGPQGVVLTLTVQGV 425
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/201 (28%), Positives = 81/201 (40%), Gaps = 38/201 (18%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------- 74
G + +GP G + GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 267 EGPVGAIGPEGPM---GPEGPMGPTGPEGPTGATGPEGPRGPEGPVGAIGPEGPPGPRGP 323
Query: 75 -----YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GP G GP G + +GP G + GP G + +GP G + LGP G +
Sbjct: 324 EGPVGAIGPEGPR---GPEGPVGAIGPEGPMGPRGPEGPVGAIGPEGPMGPLGPEGPV-- 378
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----------PSG 179
GP G + GP G + GP G + GP+G GP G + L P+G
Sbjct: 379 -GPMGPVGPTGPQGPVGPTGPQGPRGFTGPTGP---TGPQGVVLTLTVQGVGPHTVLPAG 434
Query: 180 R-LRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
R + + GP+ + S +
Sbjct: 435 RPVDFFGPTALVAVSSTSQSI 455
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/226 (26%), Positives = 84/226 (37%), Gaps = 63/226 (27%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGSL 55
GP G +GP+G +GP+G P GR+ +GP+G+
Sbjct: 181 GPQGLPGPIGPAGETGPVGPAG------PEGRVGATGPAGAAGPTGPAGPSGAIGPTGAA 234
Query: 56 RYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 97
GP+G GP G + +GP G + GP G + GP
Sbjct: 235 GPTGPTGPEGVAGPRGPEGPAGPAGAAGPMGPEGPVGAIGPEGPM---GPEGPMGPTGPE 291
Query: 98 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G GP G GP G + +GP G +GP G + GP
Sbjct: 292 GPTGATGPEGPRGPEGPVGAIGPEGPPGPRGPEGPVGAIGPEGPRGPEGPVGAI---GPE 348
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G + +GP G + LGP G + +GP G GP G
Sbjct: 349 GPMGPRGPEGPVGAIGPEGPMGPLGPEGPVGPMGPVGPTGPQGPVG 394
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/211 (25%), Positives = 76/211 (36%), Gaps = 66/211 (31%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGSL 82
GP G +GP+G +GP+G P GR+ +GP+G+
Sbjct: 181 GPQGLPGPIGPAGETGPVGPAG------PEGRVGATGPAGAAGPTGPAGPSGAIGPTGAA 234
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G GP G + +GP G +GP G + GP
Sbjct: 235 GPTGPTGPEGVAGPRGPEGPAGPAGAAGPMGPEGPVGAIGPEGP---MGPEGPMGPTGPE 291
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------------GPSGRLRYLGPSGRL 163
G + GP G GP G + GP G + +GP G +
Sbjct: 292 GPTGATGPEGPRGPEGPVGAIGPEGPPGPRGPEGPVGAIGPEGPRGPEGPVGAIGPEGPM 351
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G + +GP G + LGP G + +G
Sbjct: 352 GPRGPEGPVGAIGPEGPMGPLGPEGPVGPMG 382
>gi|410677126|ref|YP_006929497.1| hypothetical protein BTB_c48810 [Bacillus thuringiensis Bt407]
gi|409176255|gb|AFV20560.1| hypothetical protein BTB_c48810 [Bacillus thuringiensis Bt407]
Length = 633
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 63/180 (35%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 295 GATGDQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQ 345
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G S GP G
Sbjct: 346 GPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQ 405
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 406 GIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 465
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 299 DQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 355
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 356 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITG 415
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 416 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTG 472
Query: 189 RLRYLGLS 196
G
Sbjct: 473 AQGVQGAQ 480
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 67/186 (36%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 369
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 370 GVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 429
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G GP+G G G GP+
Sbjct: 430 GEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPT 489
Query: 188 GRLRYL 193
G +
Sbjct: 490 GATGDM 495
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G G GP G +GP G G P
Sbjct: 265 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 324
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 325 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPE 381
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 382 GPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 439
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 64/183 (34%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G G GP G +GP G+
Sbjct: 256 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGA- 314
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 315 -----TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQ 366
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP+G GP G GP G GP G G G G+ +
Sbjct: 367 GIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQ 426
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 427 GIQ 429
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAG 376
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 377 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 436
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
+GP G +GP+G + G G GP+G G G GP+G +
Sbjct: 437 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGAQGIQGIQGPTGATGDM 495
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 19/164 (11%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQ---GPQG-LR--GPQGETGATGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL---GPSGR 144
G GP +GP+G G G GP G +GP G G +G
Sbjct: 92 QGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGP 145
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 146 QGIQGAQGVQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 185
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 13/158 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGV 94
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G + GP G G G GP G + G
Sbjct: 95 QGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGPQGIQGAQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QG---TQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 185
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/142 (31%), Positives = 52/142 (36%), Gaps = 9/142 (6%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGP 91
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP G + G G G G + GP G G G GP G
Sbjct: 92 QGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGPQG---I 148
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GPSG G +
Sbjct: 149 QGAQGVQGTQGPSGNTGATGAT 170
>gi|423386244|ref|ZP_17363500.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG1X1-2]
gi|401633756|gb|EJS51527.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG1X1-2]
Length = 954
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/193 (30%), Positives = 69/193 (35%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 289 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQ 348
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 349 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 405
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 406 GPQGIQGIQGPIGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQ 465
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G G+ +G
Sbjct: 466 GVQGAQGGIGPTG 478
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 67/180 (37%), Gaps = 10/180 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPAGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G + GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPQGVQGFQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQGIQGAQGIQGAQGIQGAQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGVTGPTGI 210
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G +GP G +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 318 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGV------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 368
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G +GP G
Sbjct: 369 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPIGATGPEGPQGI 428
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 429 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGLQGVQGI 488
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/163 (29%), Positives = 59/163 (36%), Gaps = 9/163 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPAGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
P G GP G + GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPQGVQGFQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQGIQGAQGIQGAQGIQGAQGPSGNTGATGAT 194
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 67/179 (37%), Gaps = 13/179 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---P 69
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G P
Sbjct: 41 TGPTGPAGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGLRGP 100
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G + GP +GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 101 QGETGATGPQGVQGFQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QGLPGATGPQGIQGAQGIQGAQGIQGAQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---VTGPTG 209
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 339 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 395
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 396 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPIGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGE 455
Query: 136 LRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 456 IGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGLQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 515
Query: 190 L 190
Sbjct: 516 T 516
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 52/145 (35%), Gaps = 3/145 (2%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 122
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPAGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGL 97
Query: 123 --PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P G + GP G + GP G G G G G + GP G G G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPQGVQGFQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGL 157
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ + G
Sbjct: 158 PGATGPQGIQGAQGIQGAQGIQGAQ 182
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 61/177 (34%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---S 88
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP +
Sbjct: 280 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 339
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 340 GATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 396
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 397 GPVGATGPEGPQGIQGIQGPIGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 453
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 338 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 394
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 395 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPIGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQG 454
Query: 126 RLNS---DGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 455 EIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGLQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 514
Query: 180 RL 181
Sbjct: 515 AT 516
>gi|309777238|ref|ZP_07672201.1| collagen alpha-2(I) chain (Alpha-2 type I collagen)
[Erysipelotrichaceae bacterium 3_1_53]
gi|308915108|gb|EFP60885.1| collagen alpha-2(I) chain (Alpha-2 type I collagen)
[Erysipelotrichaceae bacterium 3_1_53]
Length = 369
Score = 52.8 bits (125), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/168 (30%), Positives = 69/168 (41%), Gaps = 7/168 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSG-SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G + GP+G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 55 GPAGPTGPMGPTGPGVGETGPTGPTGATGNTGADGATGPTGPRGVTGATGATGASGITGA 114
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G +G GP G + G +G GP+G +GP+G DGP
Sbjct: 115 TGATGADGATGPTGATGPAGSNGPQGPIGPTGATGAPGVTGPTGN---IGPTGMDGRDGP 171
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G G +G GP G G G GPSG GP G
Sbjct: 172 TGATGATGVTGATGATGPRGATGNTGADGA---TGPSGPTGATGPQGE 216
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 74/177 (41%), Gaps = 7/177 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG-SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + GP+G +GP+G + GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 46 GPRGPRGFRGPAGPTGPMGPTGPGVGETGPTGPTGATGNTGADGATGPTGPRGVTGATGA 105
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G SG G +G GP+G G +G +GP+G G +G + GP
Sbjct: 106 T---GASGITGATGATGADGATGPTGATGPAGSNGPQGPIGPTGATGAPGVTGPTGNIGP 162
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP G G G GPSG GP G
Sbjct: 163 TGMDGRDGPTGATGATGVTGATGATGPRGATGNTGADGA---TGPSGPTGATGPQGE 216
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/136 (30%), Positives = 54/136 (39%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G G GP +G+ G SG G +G GP+G+ G +G +G
Sbjct: 84 NTGADGATGPTGPRGVTGATGATGASGITGATGATGADGATGPTGATGPAGSNGPQGPIG 143
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G +G +GP+G GP+G G +G GP G G G
Sbjct: 144 PTGATGAPGVTGPTGNIGPTGMDGRDGPTGATGATGVTGATGATGPRGATGNTGADGAT- 202
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGR 144
GPSG GP G
Sbjct: 203 --GPSGPTGATGPQGE 216
>gi|423527422|ref|ZP_17503867.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuB1-1]
gi|402453097|gb|EJV84904.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuB1-1]
Length = 948
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/194 (29%), Positives = 68/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 317 NQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 367
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 368 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 428 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQG 481
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 482 IQGIQGATGAQGVQ 495
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 306 QGIQGATGATGNQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGI 422
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 423 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 447
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGNQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 239 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGNQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 412
Query: 189 RL 190
Sbjct: 413 TT 414
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 63/182 (34%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 310 GATGATGNQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQ 360
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 361 GIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQ 420
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 421 GIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQ 480
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 481 GI 482
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 331 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 387
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 388 GVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 447
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 448 GEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 507
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 508 GAT 510
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP G GP G GP
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGNQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 SG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 60/164 (36%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGNQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 396
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 338 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 394
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 395 ATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 454
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 455 PEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 67/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPRGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G + GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGFQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGVTGPTGI 204
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/170 (30%), Positives = 63/170 (37%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---P 69
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ G P
Sbjct: 41 TGPTGPRGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQGLRGP 100
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G + GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 101 QGETGATGPQGVQGFQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 160
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 161 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---VTGPTG 203
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.94, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 59/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPRGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G + GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGFQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 60/150 (40%), Gaps = 10/150 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G G GS+ +G +G GP G LR GP G GP G + GP G
Sbjct: 64 EMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGFQGPIG 120
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G G + GP G G G GP G G G + G
Sbjct: 121 PTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQG 177
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
PSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 178 PSGNTGATGATGQ-GITGPTG---VTGPTG 203
>gi|195728820|gb|ACG50731.1| VtaA29 [Haemophilus parasuis]
Length = 2032
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 69/181 (38%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G +GP+G G G GP+GS GP G GP G
Sbjct: 1027 DAGPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPTGSQGPAGPVGPRGEPGPEG 1086
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G GP G G +G + GP G G G G
Sbjct: 1087 KQGIQGPAGPTGPQGSQGIAGTQGPKGDKGDPGQAGPVGPAGPRGPAGPAGAKGEQGETG 1146
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP G+ GP+G G G GP G GP G+ GP G
Sbjct: 1147 PAGPRGEQGPEGKQGIQGPAGPTGPQGSQGIAGTQGPKGDKGDPGQAGPKGKKGDTGPRG 1206
Query: 189 R 189
Sbjct: 1207 E 1207
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/166 (31%), Positives = 66/166 (39%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP+G +GP G GP G +GP G +GP+G G G
Sbjct: 1005 GDKGEPGQAGPAGPRGPVGPKGDA---GPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDT 1061
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+GS GP G GP G+ GP+G G G GP G G +
Sbjct: 1062 GPAGPTGSQGPAGPVGPRGEPGPEGKQGIQGPAGPTGPQGSQGIAGTQGPKGDKGDPGQA 1121
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G + GP G G G GP+G GP G+ GP+G
Sbjct: 1122 GPVGPAGPRGPAGPAGAKGEQGETGPAGPRGEQGPEGKQGIQGPAG 1167
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP G GP G +GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 1013 AGPAGPRGPVGPKGDA---GPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPTGS 1069
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G+ GP+G G G GP G G +G + GP
Sbjct: 1070 QGPAGPVGPRGEPGPEGKQGIQGPAGPTGPQGSQGIAGTQGPKGDKGDPGQAGPVGPAGP 1129
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G GP+G GP G+ GP+G G G GP G
Sbjct: 1130 RGPAGPAGAKGEQGETGPAGPRGEQGPEGKQGIQGPAGPTGPQGSQGIAGTQGPKGD 1186
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/166 (31%), Positives = 66/166 (39%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G GP+G +GP G GP G +GP G +GP+G G G
Sbjct: 1005 GDKGEPGQAGPAGPRGPVGPKGDA---GPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDT 1061
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G GP G GP G+ GP+G G G + GP G G +
Sbjct: 1062 GPAGPTGSQGPAGPVGPRGEPGPEGKQGIQGPAGPTGPQGSQGIAGTQGPKGDKGDPGQA 1121
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G G G GP+G GP G+ GP+G
Sbjct: 1122 GPVGPAGPRGPAGPAGAKGEQGETGPAGPRGEQGPEGKQGIQGPAG 1167
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GP+G G G GP G +GP+G + +GP G GP G
Sbjct: 1252 DAGPRGETGPAGPAGPRGDKGEQGDRGETGPQGAPGPVGPAGPVGPVGPQGAKGEQGPRG 1311
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G G G G +G GP+G GP+G GP G G
Sbjct: 1312 ERGEQGPAGPTGAQGAPGERGPKGDTGPKGETGPAGPAGPQGPAG---ATGPKGDKGDAG 1368
Query: 132 PSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
P G GP G GP+G GP G GP G GP G +G
Sbjct: 1369 PQGETGATGPMGPAGARGEKGDTGPAGPEGPQGPRGEQGIQGPEG---PTGPQGAPGPVG 1425
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 1426 PQG 1428
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/191 (30%), Positives = 66/191 (34%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPS------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP G GP G GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 1349 AGPQGPAGATGPKGDKGDAGPQGETGATGPMGPAGARGEKGDTGPAGPEGPQGPRGEQGI 1408
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G G G + GP G G +G G +G + GP+G GP G
Sbjct: 1409 QGPEGPTGPQGAPGPVGPQGPRGEQGTPGVAGPKGDRGETGPMGPQGPAGAKGEPGPIGP 1468
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G GP G GP G GP G +GP+G GP G GP
Sbjct: 1469 TGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEG---PVGPTGPAGPTGPKGDTGPEGP 1525
Query: 187 SGRLRYLGLSD 197
G G D
Sbjct: 1526 KGEQGPAGAKD 1536
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/185 (30%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G + GP G + G G GP+G +GP G GP G +GP
Sbjct: 983 TGPTGPMGPRGPQGIPGTPGQKGDKGEPGQAGPAGPRGPVGPKGDA---GPRGEAGPVGP 1039
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GP+G G G GP+G GP G GP G+ GP+G
Sbjct: 1040 VGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPTGSQGPAGPVGPRGEPGPEGKQGIQGPAGPTGP 1099
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G GP G G +G + GP G G G GP+G GP G+
Sbjct: 1100 QGSQGIAGTQGPKGDKGDPGQAGPVGPAGPRGPAGPAGAKGEQGETGPAGPRGEQGPEGK 1159
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 1160 QGIQG 1164
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------GPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GP+G + +GP G+ GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 1289 VGPAGPVGPVGPQGAKGEQGPRGERGEQGPAGPTGAQGAPGERGPKGDTGPKGETGPAGP 1348
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G GP G GP G GP G G G GP G G G
Sbjct: 1349 AGPQGPAGATGPKGDKGDAGPQGETGATGPMGPAGARGEKGDTGPAGPEGPQGPRGEQGI 1408
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+GP+G GP G G G GP G GP G G G +GP
Sbjct: 1409 QGPEGPTGPQGAPGPVGPQGPRGEQGTPGVAGPKGDRGETGPMGPQGPAGAKGEPGPIGP 1468
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 1469 TG 1470
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/185 (31%), Positives = 72/185 (38%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP+G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 914 TGPAGPAGAQGPAGPAGATGPAGPAGPRGEQGLPGVAGPRGERGEAGPAGPAGPRGPQGE 973
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GS GP+G + GP G G G GP+G +GP G
Sbjct: 974 R---GETGSAGATGPTGPMGPRGPQGIPGTPGQKGDKGEPGQAGPAGPRGPVGPKGDA-- 1028
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G +GP G +GP+G G G GP+G GP G GP G+
Sbjct: 1029 -GPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPTGSQGPAGPVGPRGEPGPEGK 1087
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 1088 QGIQG 1092
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.061, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G+ GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 1343 TGPAGPAGPQGPAGAT---GPKGDKGDAGPQGETGATGPMGPAGARGEKGDTGPAGPEG- 1398
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G G G + GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 1399 --PQGPRGEQGIQGPEGPTGPQGAPGPVGPQGPRGEQGTPGVAGPKGDRGETGPMGPQGP 1456
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G G G GP G GP G GP G + GP+G
Sbjct: 1457 AGAKGEPGPIGPTGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEGPVGPTGPAG 1512
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 65/169 (38%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G GP+G GP G G +GS GP+G + GP G G G
Sbjct: 949 VAGPRGERGEAGPAGPAGPRGPQGER---GETGSAGATGPTGPMGPRGPQGIPGTPGQKG 1005
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G +G GP G GP G +GP G +GP+G + G G G
Sbjct: 1006 DKGEPGQAGPAGPRGPVGPKGDAGPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAG 1065
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P+G GP G GP G+ GP+G G G GP G
Sbjct: 1066 PTGSQGPAGPVGPRGEPGPEGKQGIQGPAGPTGPQGSQGIAGTQGPKGD 1114
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.098, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G G G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 882 GPAGEPGKQGPRGDKGETGPAGPAGAKGDRGETGPAGPAGAQGPAGPAG---ATGPAGPA 938
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G GP+G GP G G +G GP G G
Sbjct: 939 GPRGEQGLPGVAGPRGERGEAGPAGPAGPRGPQGERGETGSAGATGPTGPMGPRGPQGIP 998
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP+G +GP G G +G + +GP G + GP+G
Sbjct: 999 GTPGQKGDKGEPGQAGPAGPRGPVGPKGDAGPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAG 1053
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +GS GP+G + GP G G G G +G GP G
Sbjct: 965 AGPRGPQGERGETGSAGATGPTGPMGPRGPQGIPGTPGQKGDKGEPGQAGPAGPRGPVGP 1024
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G +GP G +GP+G G G GP+G GP G GP
Sbjct: 1025 KGDAGPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPTGSQGPAGPVGPRGEPGP 1084
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G+ GP+G GP G G G G G+ +GP+G GP+G
Sbjct: 1085 EGKQGIQGPAG---PTGPQGSQGIAGTQGPKGDKGDPGQAGPVGPAGPRGPAGPAG 1137
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 59/172 (34%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYL 76
GP G G +G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 1332 GPKGDTGPKGETGPAGPAGPQGPAGATGPKGDKGDAGPQGETGATGPMGPAGARGEKGDT 1391
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G GP G GP G G G + GP G G +G G +G +
Sbjct: 1392 GPAGPEGPQGPRGEQGIQGPEGPTGPQGAPGPVGPQGPRGEQGTPGVAGPKGDRGETGPM 1451
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 1452 GPQGPAGAKGEPGPIGPTGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEG 1503
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.63, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG-RLRY-----L 67
GP G GP+G G G GP+G GP+G+ GP+G R
Sbjct: 891 GPRGDKGETGPAGPAGAKGDRGETGPAGPAGAQGPAGPAGATGPAGPAGPRGEQGLPGVA 950
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP+G GP G G +G GP+G + GP G G G
Sbjct: 951 GPRGERGEAGPAGPAGPRGPQGE---RGETGSAGATGPTGPMGPRGPQGIPGTPGQKGDK 1007
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G GP G GP G +GP G +GP+G G G GP+
Sbjct: 1008 GEPGQAGPAGPRGPVGPKGDAGPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPT 1067
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 1068 G 1068
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G G GP+G GP+G GP+G G G GP G GP+G
Sbjct: 905 AGAKGDRGETGPAGPAGAQGPAGPAGATGPAGPAGPRGEQGLPGVAGPRGERGEAGPAGP 964
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP+G + GP G G G G +G GP
Sbjct: 965 AGPRGPQGER---GETGSAGATGPTGPMGPRGPQGIPGTPGQKGDKGEPGQAGPAGPRGP 1021
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G +GP G +GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 1022 VGPKGDAGPRGEAGPVGPVGPQGAIGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPTGSQGPAGPVG 1077
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 68/187 (36%), Gaps = 27/187 (14%)
Query: 13 LGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G GP+G GP G GP G GP G+ +GP G G
Sbjct: 1379 MGPAGARGEKGDTGPAGPEGPQGPRGEQGIQGPEG---PTGPQGAPGPVGPQG---PRGE 1432
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP +GP GP+G GP G G G
Sbjct: 1433 QGTPGVAGPKGDRGETGP------MGPQ------GPAGAKGEPGPIGPTGPKGDKGEQGD 1480
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G + GP+ GP+G GP G GP+G
Sbjct: 1481 QGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEGPVGPTGPA------GPTGPKGDTGPEGPKGEQGPAGA 1534
Query: 190 LRYLGLS 196
L+
Sbjct: 1535 KDLTNLN 1541
>gi|190015034|ref|YP_001966663.1| collagen triple helix repeat [Bacillus cereus]
gi|190015300|ref|YP_001966988.1| collagen triple helix repeat [Bacillus cereus]
gi|218848229|ref|YP_002455030.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH820]
gi|116584710|gb|ABK00825.1| collagen triple helix repeat [Bacillus cereus]
gi|116584981|gb|ABK01090.1| collagen triple helix repeat [Bacillus cereus]
gi|218540280|gb|ACK92676.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH820]
Length = 639
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/168 (27%), Positives = 63/168 (37%), Gaps = 24/168 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------------------YLGPSGRLRYLGP 51
GP+G G +GS GP+G GP+G G
Sbjct: 205 TGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGITGPTGATGTTGSTGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGA 264
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+GS GP+G GP+G G +GS GP+G G +G GP+G
Sbjct: 265 TGSTGVTGPTG---VTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGP 321
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G GP+G S G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 322 TGATGSTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGP 369
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/121 (28%), Positives = 51/121 (42%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP+G+ G +G GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 252 ATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTG---VTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATG 308
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G + GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 309 STGVTGPTGVTGPTGATGSTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTG 368
Query: 168 P 168
P
Sbjct: 369 P 369
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/239 (24%), Positives = 80/239 (33%), Gaps = 51/239 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------- 65
GP+G G +GS GP+G GP+G G +GS GP+G
Sbjct: 133 TGPTGATGPTGATGSTGVTGPTG---VTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGITGPTGATGT 189
Query: 66 --------------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------------------------ 87
GP+G G +GS GP
Sbjct: 190 TGSTGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGITGPTGATGTTGSTGPTGVTGP 249
Query: 88 ---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 250 TGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATGS 309
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 310 TGVTGPTGVTGPTGATGSTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTG 368
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/169 (26%), Positives = 61/169 (36%), Gaps = 24/169 (14%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---------------------YLGPSGRLRYLG 77
GP+G G +GS GP+G GP+G G
Sbjct: 204 ATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGITGPTGATGTTGSTGPTGVTGPTGATGPTGATGPTG 263
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+GS GP+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 264 ATGSTGVTGPTG---VTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTG 320
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 321 PTGATGSTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGP 369
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/224 (22%), Positives = 71/224 (31%), Gaps = 48/224 (21%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 120 ITGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTG 179
Query: 81 SLR---------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------------- 105
GP+G G +G GP
Sbjct: 180 ITGPTGATGTTGSTGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGITGPTGATGTTG 239
Query: 106 -------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
+G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 240 STGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTG 299
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G GP+G G++
Sbjct: 300 ATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTGATGSTGATGPTGATGSTGVT 343
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/133 (25%), Positives = 48/133 (36%), Gaps = 24/133 (18%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------- 100
GP+G+ G +G GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 48 ATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTG---VTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPSGATG 104
Query: 101 --------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
GP+G G +G GP+G S G +G GP+G
Sbjct: 105 STGTTGPTGDTGPTGITGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTGATG 164
Query: 147 YLGPSGRLRYLGP 159
G +G GP
Sbjct: 165 PTGATGSTGVTGP 177
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/269 (21%), Positives = 80/269 (29%), Gaps = 81/269 (30%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL-------- 64
GP+G G +GS GP+G GP+G G +GS GP+G
Sbjct: 49 TGPTGATGPTGATGSTGVTGPTG---VTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGATGPSGATGS 105
Query: 65 -------------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 106 TGTTGPTGDTGPTGITGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTGATGP 165
Query: 112 LGPSGRLRYLGP---------------------------SGRLNSDGPSGRLRY------ 138
G +G GP +G + GP+G
Sbjct: 166 TGATGSTGVTGPTGITGPTGATGTTGSTGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGP 225
Query: 139 ------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 226 TGITGPTGATGTTGSTGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTGATGP 285
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G + V+G
Sbjct: 286 TGATGSTGVTGPTGATGPTGATGSTGVTG 314
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/136 (27%), Positives = 53/136 (38%), Gaps = 21/136 (15%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G +GS GP+G GP+G+ G +G GP+G GPSG
Sbjct: 48 ATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTG---VTGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGAT---GPSG 101
Query: 81 S---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+ GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 102 ATGSTGTTGPTGDTGPTGITGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGSTGVTGPTGVTGPTG 161
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP
Sbjct: 162 ATGPTGATGSTGVTGP 177
>gi|229150630|ref|ZP_04278844.1| hypothetical protein bcere0011_21810 [Bacillus cereus m1550]
gi|228632717|gb|EEK89332.1| hypothetical protein bcere0011_21810 [Bacillus cereus m1550]
Length = 306
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/189 (27%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 5/189 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G+ GP G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 52 GATGVTGLTGITGATGVTGPPGITGATGVTGLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGIT 111
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 112 GPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGET 171
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--SGRLR 191
G GP+G G +G GP+G GP+G G +G +GP + L
Sbjct: 172 GPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGE---TGPTGETGPTGATGPTGGIGPITTTNLL 228
Query: 192 YLGLSDGLR 200
Y +DG +
Sbjct: 229 YYTFADGEK 237
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/176 (27%), Positives = 68/176 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G G +G G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 25 GPTGITGPTGATGITGATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGITGATGVTGLT 84
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+
Sbjct: 85 GITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPT 144
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 145 GITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGE 200
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G G +G G +G GP G G +G G +G
Sbjct: 39 TGATGITGPPG---ITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGITGATGVTGLTGITGATGETGP 95
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 96 TGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGP 155
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G G
Sbjct: 156 TGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGETGPTGATGP 215
Query: 196 SDGL 199
+ G+
Sbjct: 216 TGGI 219
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 71/183 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G G +G+ G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 31 GPTGATGITGATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGITGATGVTGLTGITGAT 90
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+
Sbjct: 91 GETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPT 150
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 151 GETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGETGPT 210
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 211 GAT 213
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/188 (26%), Positives = 74/188 (39%), Gaps = 7/188 (3%)
Query: 12 NLGPSGRL---RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N+GP+ + Y+ P+G+ G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 6 NIGPTFPILPPIYI-PTGATGPTGITGPTGATGITGATGITGPPG---ITGATGVTGLTG 61
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 62 ITGATGVTGPPGITGATGVTGLTGITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTG 121
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 122 ITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITGPTG 181
Query: 189 RLRYLGLS 196
G++
Sbjct: 182 ETGPTGIT 189
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/154 (25%), Positives = 58/154 (37%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G G +G G +G G +G G +G GP G G +G
Sbjct: 25 GPTGITGPTGATGITGATGITGPPGITGATGVTGLTGITGATGVTGPPGITGATGVTGLT 84
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+
Sbjct: 85 GITGATGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGETGPT 144
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G G +G GP+G G + ++G
Sbjct: 145 GITGPTGETGPTGITGPTGETGPTGETGPTGITG 178
>gi|443691694|gb|ELT93476.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_222902 [Capitella teleta]
Length = 1271
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/173 (30%), Positives = 65/173 (37%), Gaps = 9/173 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G+ G GR G SG G +G G GR G G+ G +GR
Sbjct: 4 TGQTGATGQQGIQGRTGATGTSGRDGQTGATGADGATGSDGRTGATGRDGNDGRTGATGR 63
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G +G G SGR G GR G +G+ + DG +GR G SGR
Sbjct: 64 DGNDGRTGVTGATGSSGRTGATGNDGRDGRTGATGQQGNDGRDGSTGRTGATGTSGRDGQ 123
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G G G +GR G SGR GP GR G
Sbjct: 124 TGATGERGLDGRDGSTGRTGATGRNGLDGETGSTGASGRDGRDGPEGRTGATG 176
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP 69
+GP+G+ G G G +G+ G +G G +GS G +GR G
Sbjct: 1 MGPTGQTGATGQQGIQGRTGATGTSGRDGQTGATGADGATGSDGRTGATGRDGNDGRTGA 60
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GR G +G G SGR G GR G +G+ G G G +G
Sbjct: 61 TGRDGNDGRTGVTGATGSSGRTGATGNDGRDGRTGATGQQGNDGRDGSTGRTGATGTSGR 120
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
DG +G G GR G +G G G G SGR GP GR G G
Sbjct: 121 DGQTGATGERGLDGRDGSTGRTGATGRNGLDGETGSTGASGRDGRDGPEGRTGATGSQGA 180
Query: 190 LRYLG 194
LG
Sbjct: 181 TGSLG 185
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G GR G SG G +G+ G GR G G+ G +GR G +G
Sbjct: 14 GIQGRTGATGTSGRDGQTGATGADGATGSDGRTGATGRDGNDGRTGATGRDGNDGRTGVT 73
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G SG G GR G +G+ G +GR G SGR G +G D
Sbjct: 74 GATGSSGRTGATGNDGRDGRTGATGQQGNDGRDGSTGRTGATGTSGRDGQTGATGERGLD 133
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G +GR G +G G SGR GP GR G G LG +G
Sbjct: 134 GRDGSTGRTGATGRNGLDGETG---STGASGRDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGAT 190
Query: 191 RYLGL 195
G+
Sbjct: 191 GQRGI 195
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G SGR G +G G GS G +GR G +GS G SGR GP GR
Sbjct: 115 TGTSGRDGQTGATGERGLDGRDGSTGRTGATGRNGLDGETGST---GASGRDGRDGPEGR 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G+ LG +G G GR G P+G G G G +G S
Sbjct: 172 TGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGETGSTGLPGSTGRTGATGTRGS 231
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GR G GR+ G +GR G +G GP+G G +G G GR
Sbjct: 232 TGADGRTGATGIEGRVGRTGATGRNGVDGRTGATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGR 291
Query: 190 LRYLGLS 196
G +
Sbjct: 292 TGATGDA 298
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 72/181 (39%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G SGR GP +G+ G +GSL G +G+ G +G+ GP+G G
Sbjct: 157 TGASGRDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGETGSTGL 216
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +G+ G GR G GR+ G +GR G +G GP+G
Sbjct: 217 PGSTGRTGATGTRGSTGADGRTGATGIEGRVGRTGATGRNGVDGRTGATGSSGPTGNDGR 276
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G GR G +GR G +G G +GR G G G GR
Sbjct: 277 TGATGVSGIDGRDGRTGATGDAGRDGRTGATGGSGRSGATGRDGATGRDGVTGATGKDGR 336
Query: 190 L 190
Sbjct: 337 T 337
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G GS G +G+ G GR G G + G +GR G +G
Sbjct: 204 NRGPTGETGSTGLPGSTGRTGATGTRGSTGADGRTGATGIEGRVGRTGATGRNGVDGRTG 263
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ G +G G GR G +GR G +G G +GR DG
Sbjct: 264 ATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGRTGATGDAGRDGRTGATGGSGRSGATGR---DG 320
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GR G +G+ G GR G G G +G G GR G GR
Sbjct: 321 ATGRDGVTGATGKDGRTGIDGRTGATGDRGIDGREGRTGATGQTGGPGRTGATGNDGR 378
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +GR G +GS G SG GP GR G G+ LG +G G GR
Sbjct: 142 TGATGRNGLDGETGST---GASGRDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGR 198
Query: 73 LRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G P+G G G G +G G GR G GR+ G +GR
Sbjct: 199 TGATGNRGPTGETGSTGLPGSTGRTGATGTRGSTGADGRTGATGIEGRVGRTGATGRNGV 258
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
DG +G GP+G G +G G GR G +GR G +G G +GR
Sbjct: 259 DGRTGATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGRTGATGDAGRDGRTGATGGSGRSGATGR 318
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 319 DGATG 323
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/198 (32%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 13/198 (6%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
E+ LN G GR G SGS G +G+ G GR G G G +G
Sbjct: 501 ERGLN-GVDGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGINGRDGRTGATGERGLDGRDGRTGASGST 559
Query: 68 GPSGRLRYLGPSG---------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GPSGR G G S G +G +GP GR G SG G SGR
Sbjct: 560 GPSGRTGATGQRGLTGRTGSTGSSGPSGETGATGDVGPIGRTGATGASG---DKGDSGRT 616
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G +G DG +G G +G GP+G GP+GR G G G +
Sbjct: 617 GATGSAGATGRDGATGSSGAAGRTGSTGSSGPTGSTGLPGPTGRTGATGFRGLNGVTGAT 676
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP GR G S
Sbjct: 677 GSDGATGPGGRTGATGSS 694
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/140 (32%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
+G+ +GP GR G SG G SGR G +G G +GS G +G
Sbjct: 588 ETGATGDVGPIGRTGATGASGDK---GDSGRTGATGSAGATGRDGATGSSGAAGRTGSTG 644
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G GP+GR G G G +G + GP GR G SG G G
Sbjct: 645 SSGPTGSTGLPGPTGRTGATGFRGLNGVTGATGSDGATGPGGRTGATGSSGAAGDPGRDG 704
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
R G G GP+GR
Sbjct: 705 RTGATGLQGEKGDAGPAGRT 724
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/195 (28%), Positives = 70/195 (35%), Gaps = 36/195 (18%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SGR G +G+ G +GS G +G GP+GS GP+GR G G
Sbjct: 609 DKGDSGRTGATGSAGATGRDGATGSSGAAGRTGSTGSSGPTGSTGLPGPTGRTGATGFRG 668
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD- 130
G +GS GP GR G SG G GR G G GP+GR +
Sbjct: 669 LNGVTGATGSDGATGPGGRTGATGSSGAAGDPGRDGRTGATGLQGEKGDAGPAGRTGATG 728
Query: 131 --------------GPSGRL---------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
GP+GR +GP GR G +GR
Sbjct: 729 VEGTGGVTGSTGLPGPTGRTGATGTPGPTGRTGGTGRTGATGAIGPVGRTGSTGVAGRAG 788
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSG 170
GP G G +G
Sbjct: 789 STGPQGSTGRTGATG 803
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G G +G+ G GR G +GS G +G G GR
Sbjct: 38 GATGSDGRTGATGRDGNDGRTGATGRDGNDGRTGVTGATGSSGRTGATGN---DGRDGRT 94
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ G +GR G SGR G +G G G G +GR DG +
Sbjct: 95 GATGQQGNDGRDGSTGRTGATGTSGRDGQTGATGERGLDGRDGSTGRTGATGRNGLDGET 154
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRL 190
G G SGR GP GR G G LG +G G GR GP+G
Sbjct: 155 G---STGASGRDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGET 211
Query: 191 RYLGL 195
GL
Sbjct: 212 GSTGL 216
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/188 (31%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G GR G G+ G +G G SGR G +G G G G +G
Sbjct: 87 NDGRDGRTGATGQQGNDGRDGSTGRTGATGTSGRDGQTGATGERGLDGRDGSTGRTGATG 146
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD- 130
R G +GS G SGR GP GR G G LG +G G GR +
Sbjct: 147 RNGLDGETGST---GASGRDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATG 203
Query: 131 --GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G G G +G G GR G GR+ G +GR G G
Sbjct: 204 NRGPTGETGSTGLPGSTGRTGATGTRGSTGADGRTGATGIEGRVGRTGATGR---NGVDG 260
Query: 189 RLRYLGLS 196
R G S
Sbjct: 261 RTGATGSS 268
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/140 (32%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 51 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
+G+ +GP GR G SG G +G+ G +GR G SG G +G
Sbjct: 588 ETGATGDVGPIGRTGATGASGDKGDSGRTGATGSAGATGRDGATGSSGAAGRTGSTG--- 644
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP+G GP+GR + G G G +G GP GR G SG G G
Sbjct: 645 SSGPTGSTGLPGPTGRTGATGFRGLNGVTGATGSDGATGPGGRTGATGSSGAAGDPGRDG 704
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
R G G GP+GR
Sbjct: 705 RTGATGLQGEKGDAGPAGRT 724
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGR 72
G G SG GP G G G LG +G+ G GR G P+G
Sbjct: 151 DGETGSTGASGRDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGE 210
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS G +G G GR G GR+ G +GR G +G S GP
Sbjct: 211 TGSTGLPGSTGRTGATGTRGSTGADGRTGATGIEGRVGRTGATGRNGVDGRTGATGSSGP 270
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G +G G GR G +GR G +G G +GR G +GR
Sbjct: 271 TGNDGRTGATGVSGIDGRDGRTGATGDAGRDGRTGATGGSGRSGATGR---DGATGRDGV 327
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 328 TGAT 331
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/185 (30%), Positives = 71/185 (38%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G GR G +GS G +G+ G GR G G+ G +GR G SGR
Sbjct: 65 GNDGRTGVTGATGSSGRTGATGND---GRDGRTGATGQQGNDGRDGSTGRTGATGTSGRD 121
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSD 130
G +G G G G +GR G +G G SGR GP GR S
Sbjct: 122 GQTGATGERGLDGRDGSTGRTGATGRNGLDGETG---STGASGRDGRDGPEGRTGATGSQ 178
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G L G +G+ G +G GP+G G G G +G G GR
Sbjct: 179 GATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGETGSTGLPGSTGRTGATGTRGSTGADGRT 238
Query: 191 RYLGL 195
G+
Sbjct: 239 GATGI 243
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/143 (32%), Positives = 58/143 (40%), Gaps = 12/143 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP GR G SG G +G+ G +GR G SG+ +GR G SG
Sbjct: 594 DVGPIGRTGATGASGDKGDSGRTGATGSAGATGRDGATGSSGA------AGRTGSTGSSG 647
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
P+GS GP+GR G G G +G GP GR G SG G
Sbjct: 648 ------PTGSTGLPGPTGRTGATGFRGLNGVTGATGSDGATGPGGRTGATGSSGAAGDPG 701
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GR G G GP+GR
Sbjct: 702 RDGRTGATGLQGEKGDAGPAGRT 724
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/140 (32%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
+G+ +GP G G SG G +G+ G +GR G SG G +GS
Sbjct: 588 ETGATGDVGPIGRTGATGASGDKGDSGRTGATGSAGATGRDGATGSSGAAGRTGSTGS-- 645
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G GP+GR G G G +G GP GR + G SG G G
Sbjct: 646 -SGPTGSTGLPGPTGRTGATGFRGLNGVTGATGSDGATGPGGRTGATGSSGAAGDPGRDG 704
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
R G G GP+GR
Sbjct: 705 RTGATGLQGEKGDAGPAGRT 724
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 68/173 (39%), Gaps = 3/173 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G L G +G G +G+ GP+G G GS G +G G GR
Sbjct: 179 GATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGETGSTGLPGSTGRTGATGTRGSTGADGRT 238
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + G +GR G +G GP+G G +G G GR + G +
Sbjct: 239 GATGIEGRVGRTGATGRNGVDGRTGATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGRTGATGDA 298
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GR G +G G +GR G +GR G +G+ G GR G
Sbjct: 299 GRDGRTGATGGSGRSGATGR---DGATGRDGVTGATGKDGRTGIDGRTGATGD 348
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 71/194 (36%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G G +G+ G +G+ G GR G +G+ G G G SG
Sbjct: 102 NDGRDGSTGRTGATGTSGRDGQTGATGERGLDGRDGSTGRTGATGRNGLDGETGSTGASG 161
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R GP G G G LG +G G GR G GP+G S G
Sbjct: 162 RDGRDGPEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATG------NRGPTGETGSTG 215
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G G GR G GR+ G +GR G +G GP+G
Sbjct: 216 LPGSTGRTGATGTRGSTGADGRTGATGIEGRVGRTGATGRNGVDGRTGATGSSGPTGNDG 275
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G + VSG+
Sbjct: 276 RTGAT---GVSGID 286
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G+ G +G+ GP+G G G G +G+ G GR G GR
Sbjct: 187 TGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGETGSTGLPGSTGRTGATGTRGSTGADGRTGATGIEGR 246
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G +G G +G GP+G G +G G GR G +GR DG
Sbjct: 247 VGRTGATGRNGVDGRTGATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGRTGATGDAGR---DGR 303
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGR 189
+G G SG G +GR G +G+ G GR G GR G +G+
Sbjct: 304 TGATGGSGRSGATGRDGATGRDGVTGATGKDGRTGIDGRTGATGDRGIDGREGRTGATGQ 363
Query: 190 L 190
Sbjct: 364 T 364
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/168 (30%), Positives = 62/168 (36%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G G +GS G +G G +G+ G GR G +G
Sbjct: 54 NDGRTGATGRDGNDGRTGVTGATGSSGRTGATGNDGRDGRTGATGQQGNDGRD---GSTG 110
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R G SG G +G G G G +GR G +G G SGR DG
Sbjct: 111 RTGATGTSGRDGQTGATGERGLDGRDGSTGRTGATGRNGLDGETG---STGASGRDGRDG 167
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P GR G G LG +G G GR G G G +G
Sbjct: 168 PEGRTGATGSQGATGSLGRTGATGQRGIEGRTGATGNRGPTGETGSTG 215
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 69/184 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G+ G SG+ G +GR G +G G GR G G
Sbjct: 292 TGATGDAGRDGRTGATGGSGRSGATGRDGATGRDGVTGATGKDGRTGIDGRTGATGDRGI 351
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G GR G GR G +G G +GR G +G +DG
Sbjct: 352 DGREGRTGATGQTGGPGRTGATGNDGRDGIDGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGLSGADGR 411
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G GR G +G G GR G G+ G +G G GR
Sbjct: 412 TGATGRNGNDGRDGRTGATGERGLDGREGRTGATGNDGQDGRDGRTGATGIDGREGRTGA 471
Query: 193 LGLS 196
GLS
Sbjct: 472 TGLS 475
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G GR+ G +G G +G+ GP+G G +G G GR G +GR
Sbjct: 241 TGIEGRVGRTGATGRNGVDGRTGATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGRTGATGDAGR 300
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G +GR G +GR G +G+ G GR G +G DG
Sbjct: 301 DGRTGATGGSGRSGATGRD---GATGRDGVTGATGKDGRTGIDGRT---GATGDRGIDGR 354
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GR G +G G +G G GR G SG G +G G GR
Sbjct: 355 EGRTGATGQTGGPGRTGATGNDGRDGIDGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGLSGADGRTGA 414
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 415 TG 416
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/163 (30%), Positives = 61/163 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G GR G +G+ G +G+ G GR G +G+ G GR G GR
Sbjct: 407 GADGRTGATGRNGNDGRDGRTGATGERGLDGREGRTGATGNDGQDGRDGRTGATGIDGRE 466
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G GR G +GR G +G G GR G SG DG +
Sbjct: 467 GRTGATGLSGSAGRDGRTGATGINGRDGRTGSTGERGLNGVDGRTGATGSSGSAGRDGRT 526
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G G GR G G G +G GPSGR G
Sbjct: 527 GATGINGRDGRTGATGERGLDGRDGRTGASGSTGPSGRTGATG 569
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/190 (30%), Positives = 70/190 (36%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G GR G SGS G +G+ G GR G +G+ G +G G GR
Sbjct: 380 GIDGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGLSGADGRTGATGRNGNDGRDGRTGATGERGLDGRE 439
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G GR G GR G +G G GR G +GR G +
Sbjct: 440 GRTGATGNDGQDGRDGRTGATGIDGREGRTGATGLSGSAGRDGRTGATGINGRDGRTGST 499
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---L 184
G G GR G S GR G +GR G +G G GR
Sbjct: 500 GERGLNGVDGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGINGRDGRTGATGERGLDGRDGRTGASGST 559
Query: 185 GPSGRLRYLG 194
GPSGR G
Sbjct: 560 GPSGRTGATG 569
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/174 (32%), Positives = 71/174 (40%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP GR G +G GP GS G +G GP+G G SGR G +GR
Sbjct: 772 IGPVGRTGSTGVAGRAGSTGPQGSTGRTGATGIQGGTGPTGRTGATGASGRA---GIAGR 828
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP+G G GR G GR GP+GR G SG G
Sbjct: 829 TGSTGAPGTTGPRGPAGATGERGFDGRTGATGEQGR---TGPTGRTGATGSSGVQGKTGS 885
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G G +G GP+G+ G +G LG +G GP G GP
Sbjct: 886 TGLRGPTGETGSTGASGPTGKTGATGSTGVRGELGFTG---STGPVGATGIAGP 936
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/207 (29%), Positives = 73/207 (35%), Gaps = 22/207 (10%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
E+ L+ G GR G G G +G+ G GR G SGS G GR
Sbjct: 432 ERGLD-GREGRTGATGNDGQDGRDGRTGATGIDGREGRTGATGLSGSA---GRDGRTGAT 487
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +GR G +G G GR G SG G +G G GR G G
Sbjct: 488 GINGRDGRTGSTGERGLNGVDGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGINGRDGRTGATGERGLD 547
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
DG +G GPSGR G +G +GP GR G S
Sbjct: 548 GRDGRTGASGSTGPSGRTGATGQRGLTGRTGSTGSSGPSGETGATGDVGPIGRTGATGAS 607
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G G +GR G S
Sbjct: 608 GDKGDSGRTGATGSAGATGRDGATGSS 634
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 69/187 (36%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G SGR G G+ G +G+ G +G G +G G GR G +G
Sbjct: 307 TGGSGRSGATGRDGATGRDGVTGATGKDGRTGIDGRTGATGDRGIDGREGRTGATGQTGG 366
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G GR G SG G GR G SG G +GR +DG
Sbjct: 367 PGRTGATGNDGRDGIDGRTGATGSSG---SAGRDGRTGATGLSGADGRTGATGRNGNDGR 423
Query: 133 SGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GR G GR G +G G GR G GR G +G G GR
Sbjct: 424 DGRTGATGERGLDGREGRTGATGNDGQDGRDGRTGATGIDGREGRTGATGLSGSAGRDGR 483
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 484 TGATGIN 490
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GR G +G G +G+ G GR G SGS G +G G GR
Sbjct: 356 GRTGATGQTGGPGRTGATGNDGRDGIDGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGLSGADGRTGAT 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ G +G G GR G +G G GR G GR G +G
Sbjct: 416 GRNGNDGRDGRTGATGERGLDGREGRTGATGNDGQDGRDGRTGATGIDGREGRTGATGLS 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GR G +GR G +G G GR G SG G GR G++
Sbjct: 476 GSAGRDGRTGATGINGRDGRTGSTGERGLNGVDGRTGATGSSG---SAGRDGRTGATGIN 532
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 18/154 (11%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 102
+GP GR G +GR GP GS G +G G +GR
Sbjct: 772 IGPVGRTGSTGVAGRAGSTGPQGSTGRTGATGIQGGTGPTGRTGATGASGRAGIAGRTGS 831
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G G GP+G G GR + G GR GP+GR G SG G +G
Sbjct: 832 TGAPGTTGPRGPAGATGERGFDGRTGATGEQGR---TGPTGRTGATGSSGVQGKTGSTGL 888
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G+ G +G LG +
Sbjct: 889 RGPTGETGSTGASGPTGKTGATGSTGVRGELGFT 922
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/124 (32%), Positives = 49/124 (39%), Gaps = 12/124 (9%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G+ G GR G SGR G +G G GR G +GR DG GR
Sbjct: 4 TGQTGATGQQGIQGRTGATGTSGRDGQTGATGADGATGSDGRT---GATGR---DGNDGR 57
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRY 192
G +GR G +G G SGR G GR G +G+ G +GR
Sbjct: 58 ---TGATGRDGNDGRTGVTGATGSSGRTGATGNDGRDGRTGATGQQGNDGRDGSTGRTGA 114
Query: 193 LGLS 196
G S
Sbjct: 115 TGTS 118
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 70/169 (41%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP G G +GR GP GS G +G GP+GR G SG G +GR
Sbjct: 772 IGPVGRTGSTGVAGRAGSTGPQGSTGRTGATGIQGGTGPTGRTGATGASG---RAGIAGR 828
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G GP+G G GR G GR GP+GR G SG G
Sbjct: 829 TGSTGAPGTTGPRGPAGATGERGFDGRTGATGEQGRT---GPTGRTGATGSSGVQGKTGS 885
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G GP+G+ G + G L + G +G + G++
Sbjct: 886 TGLRGPTGETGSTGASGPTGKTGATGSTGVRGELGFTGSTGPVGATGIA 934
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/171 (28%), Positives = 62/171 (36%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+G+ G +G G GR G +G G +G G +GR
Sbjct: 262 TGATGSSGPTGNDGRTGATGVSGIDGRDGRTGATGDAGRDGRTGATGGSGRSGATGRDGA 321
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G G GR G +G G GR G +G+ G +G +DG G
Sbjct: 322 TGRDGVTGATGKDGRTGIDGRTGATGDRGIDGREGRTGATGQTGGPGRTGATGNDGRDGI 381
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G GR G SG G +GR G GR G
Sbjct: 382 DGRTGATGSSGSAGRDGRTGATGLSGADGRTGATGRNGNDGRDGRTGATGE 432
>gi|110802900|ref|YP_698350.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium perfringens
SM101]
gi|110683401|gb|ABG86771.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens
SM101]
Length = 403
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/193 (32%), Positives = 76/193 (39%), Gaps = 30/193 (15%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLR---Y 57
C K GP G GP G + GP G + GP G + GP G +
Sbjct: 47 NCNCCKPGPRGPRGPQGEQGPQGERGFTGPQGPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPIGLQGE 106
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP G + GP G +GP G GP G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 107 QGPQGERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQGERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQGE 154
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ GP G + GP G GP G + GP G +GP G +GP G GP
Sbjct: 155 RGFTGPQGPI---GPQGE---QGPQGERGFTGPQGP---IGPQGNQGPIGPQGE---QGP 202
Query: 178 SGRLRYLGPSGRL 190
G GP G +
Sbjct: 203 QGATGPQGPQGPV 215
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/164 (32%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 27/164 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G + GP G + GP G + GP G + GP G GP
Sbjct: 78 GPVGPQGEQGPQGERGFTGPQGPIGLQGEQGPQGERGFTGPQGPV---GPQGEQ---GPQ 131
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G + GP G +GP G GP G + GP G + GP G + GP G +
Sbjct: 132 GERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQGERGFTGPQGPIGPQGEQGPQGERGFTGPQGPI 185
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP G +GP G GP G GP G +GP G
Sbjct: 186 ---GPQGNQGPIGPQGE---QGPQG---ATGPQGPQGPVGPQGN 220
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/137 (33%), Positives = 56/137 (40%), Gaps = 21/137 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G + GP G GP G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 108 GPQGERGFTGPQGPV---GPQGEQ---GPQGERGFTGPQGP---VGPQGE---QGPQGER 155
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+ GP G +GP G GP G + GP G +GP G +GP G G +
Sbjct: 156 GFTGPQGP---IGPQGE---QGPQGERGFTGPQGP---IGPQGNQGPIGPQGEQGPQGAT 206
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G GP G GP
Sbjct: 207 GPQGPQGPVGPQGNQGP 223
>gi|296451862|ref|ZP_06893581.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP08]
gi|296879742|ref|ZP_06903716.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP07]
gi|296259341|gb|EFH06217.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP08]
gi|296429213|gb|EFH15086.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium difficile NAP07]
Length = 678
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/226 (23%), Positives = 79/226 (34%), Gaps = 41/226 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G G +G+ GP+G G G+ GP+G G G
Sbjct: 281 TGPTGATGLIGPTG---VTGATGADGVTGPTGPTGATGADGATGVTGPTGATGATGADGL 337
Query: 73 LRYLGPSGSLRY-----------------------------------LGPSGRLRYLGPS 97
+ G +G+ +GP+G G
Sbjct: 338 VGPTGATGATGADGVTGPTGATGATGVGVTGATGATGATGPTGADGLVGPTGATGNTGAD 397
Query: 98 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 157
G GP+G G +G GP+G + G G GP+G G +G
Sbjct: 398 G---VAGPTGATGATGNTGADGATGPTGATGNTGADGATGPTGPTGATGVAGVTGATGPT 454
Query: 158 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G G +G G +G +GP+G G++ V+G
Sbjct: 455 GATGATGADGATGPTGATGATGADGLVGPTGATGATGITGATGVTG 500
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/131 (28%), Positives = 54/131 (41%), Gaps = 12/131 (9%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP+G+ G G GP+G+ G +G GP+G G G+ GP+G
Sbjct: 385 VGPTGATGNTGADG---VAGPTGATGATGNTGADGATGPTGATGNTGADGATGPTGPTGA 441
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G G G G +G +DG +GP+G G
Sbjct: 442 TGVAGVTGA---TGPTGATGATGADGATGPTGATGATGADG------LVGPTGATGATGI 492
Query: 151 SGRLRYLGPSG 161
+G GP+G
Sbjct: 493 TGATGVTGPTG 503
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/221 (23%), Positives = 76/221 (34%), Gaps = 41/221 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + GP+G+ +GP+G G +G GP+G G G GP+G
Sbjct: 272 TGATGLIGPTGPTGATGLIGPTG---VTGATGADGVTGPTGPTGATGADGATGVTGPTGA 328
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR-----------------------------YL 103
G +G+ +GP+G G G +
Sbjct: 329 T---GATGADGLVGPTGATGATGADGVTGPTGATGATGVGVTGATGATGATGPTGADGLV 385
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G G G GP+G + G +G GP+G G G GP+G
Sbjct: 386 GPTGATGNTGADG---VAGPTGATGATGNTGADGATGPTGATGNTGADGATGPTGPTGAT 442
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G GP+G G G G + GL
Sbjct: 443 GVAGVTGA---TGPTGATGATGADGATGPTGATGATGADGL 480
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/181 (24%), Positives = 69/181 (38%), Gaps = 29/181 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY-----------------------L 49
G +G +GP+G+ G +G+ GP+G +
Sbjct: 329 TGATGADGLVGPTGA---TGATGADGVTGPTGATGATGVGVTGATGATGATGPTGADGLV 385
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ G G GP+G G +G+ GP+G G G GP+G
Sbjct: 386 GPTGATGNTGADG---VAGPTGATGATGNTGADGATGPTGATGNTGADGATGPTGPTGAT 442
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G G +G +DG +G G +G +GP+G G +G GP+
Sbjct: 443 GVAGVTGATGPTGATGATGADGATGPTGATGATGADGLVGPTGATGATGITGATGVTGPT 502
Query: 170 G 170
G
Sbjct: 503 G 503
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/210 (22%), Positives = 72/210 (34%), Gaps = 38/210 (18%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG--RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
GP+G+ G GP+G +G +G+ +GP+G G G G
Sbjct: 243 VTGPTGATGATG----FGVTGPTGPTGATGVGVTGATGLIGPTGPTGATGLIGPTGVTGA 298
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G+ GP+G G G GP+G G G + G +G +DG +G
Sbjct: 299 TGADGVTGPTGPTGATGADGATGVTGPTGATGATGADGLVGPTGATGATGADGVTGPTGA 358
Query: 139 --------------------------LGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
+GP+G GP+G G +G
Sbjct: 359 TGATGVGVTGATGATGATGPTGADGLVGPTGATGNTGADGVAGPTGATGATGNTGADGAT 418
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G G GP+G G++
Sbjct: 419 GPTGATGNTGADGATGPTGPTGATGVAGVT 448
>gi|225388311|ref|ZP_03758035.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_02046, partial [Clostridium
asparagiforme DSM 15981]
gi|225045624|gb|EEG55870.1| hypothetical protein CLOSTASPAR_02046 [Clostridium asparagiforme
DSM 15981]
Length = 157
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/139 (29%), Positives = 63/139 (45%), Gaps = 12/139 (8%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+GP+G GP+G G +G++ GP+G +GP+G +GP+G G
Sbjct: 1 MGPTGPT---GPAGADGINGTNGAMGPTGPTGAPGTNGAMGPTGPAGPIGPTGTTGPAGA 57
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G G +G +DG +G + GP+G GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 58 DGATGPTGATGPAGADGLNGAVGPTGPTGATGATGPAGSNGAMGPTGPTGIEGPPG---- 113
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
P+G GP+G +
Sbjct: 114 --PTGATGATGPAGTNGIM 130
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/148 (29%), Positives = 68/148 (45%), Gaps = 21/148 (14%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP+G+ G +G + GP+G+ G +GP+G +GP+G+
Sbjct: 1 MGPTG---PTGPAGADGINGTNGAMGPTGPTGA------PGTNGAMGPTGPAGPIGPTGT 51
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G GP+G G G +GP+G P+G + GP+G +GP
Sbjct: 52 T---GPAGADGATGPTGATGPAGADGLNGAVGPTG------PTGATGATGPAGSNGAMGP 102
Query: 142 SGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYL 166
+G GP +G GP+G +
Sbjct: 103 TGPTGIEGPPGPTGATGATGPAGTNGIM 130
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/133 (29%), Positives = 59/133 (44%), Gaps = 15/133 (11%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP+G GP+G+ G +G + GP+G G +GP+G +GP+G
Sbjct: 1 MGPTGPT---GPAGADGINGTNGAMGPTGPTGA------PGTNGAMGPTGPAGPIGPTGT 51
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G GP+G G +G + GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 52 T---GPAGADGATGPTGATGPAGADGLNGAVGPTGPTGATGATGPAGSNGAMGPTGPTGI 108
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 109 EGPPGPTGATGAT 121
>gi|229151539|ref|ZP_04279742.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1550]
gi|228632082|gb|EEK88708.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1550]
Length = 835
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G GS+ GP+G GP G GP+G G G GP+G
Sbjct: 341 TGATGVTGLQGVQGSMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPAGATGPTGP 400
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP G G G GP+G G G GP G GP
Sbjct: 401 QGVQGAQGPIGPTGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGP 460
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 461 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGSTGPTGATGPQGIQGIQGPQG 519
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/194 (31%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 21/194 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GPSG GP G GP GS+ GP G GP G
Sbjct: 444 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGS- 499
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G+ GP G GP G +GP+G G G
Sbjct: 500 --TGPTGA---TGPQGIQGIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTGPQGIQGITGST 554
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G + GP+G GP G G +G GP+G GP G G +G++
Sbjct: 555 GPTGATGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQV 614
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G+
Sbjct: 615 GATGPTGATGPQGI 628
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G GS+ GP+G GP G GP+G G G GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGSMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPAGATGPT 398
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQ 458
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GP G + GP G GP G G +G G+
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGSTGPTGATGPQGIQGI 514
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 21/185 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP GS+ GP G GP GS GP+G GP G
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGS---TGPTG---ATGPQGIQ 512
Query: 74 RYLGPSGSL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 513 GIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTG---AT 569
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP G G +G GP G GP G +G +G GP G
Sbjct: 570 GPQGPQGIQGPQGETGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQVGATGPTGATGPQGIQ 629
Query: 182 RYLGP 186
GP
Sbjct: 630 GIQGP 634
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 275
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/188 (30%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 21/188 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 449 TGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGS---TGPTG- 504
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
GP G GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 505 --ATGPQGIQGIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGA 562
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G GP G GP G G +G GP G GP G +G +G
Sbjct: 563 TGPTGATGPQGPQG---IQGPQGETGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQVGATGP 619
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 620 TGATGPQG 627
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 11/176 (6%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G G GS+ GP+G GP G GP+G G G GP+G
Sbjct: 341 TGATGVTGLQGVQGSMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPAGATGPTGP 400
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL----------GPSGRLRYLG 149
G G + GP G G G + GP+G L+ L GP G G
Sbjct: 401 QGVQGAQGPIGPTGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQG 459
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
PSG GP G GP G + GP G GP G G + + G+
Sbjct: 460 PSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGSTGPTGATGPQGIQGIQ 515
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 64/180 (35%), Gaps = 21/180 (11%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR- 90
GPSG GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 444 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGST 500
Query: 91 --LRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GP G +GP+G G G S GP+G
Sbjct: 501 GPTGATGPQGIQGIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGAT 560
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G GP G G +G GP G GP G +G +
Sbjct: 561 GATGPTG---ATGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQVGAT 617
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/181 (27%), Positives = 68/181 (37%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
+GP+G GP G+ GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 67 EIGPTGPTGLTGPRGAQGNQGPMGERGSQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIG 126
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G G
Sbjct: 127 PTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQG 186
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G G
Sbjct: 187 VTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQG 246
Query: 195 L 195
+
Sbjct: 247 V 247
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G G +GP+G GP G GP G S G G GP
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPRGAQGNQGPMGERGSQGIQGVQGIQGERGP 109
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G +
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP 186
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 187 SGRLRYLG 194
G + +G
Sbjct: 230 QGEMGQVG 237
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/191 (30%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 18/191 (9%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP
Sbjct: 392 AGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGLQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGP 451
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 452 QGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGSIGPTGPQGIQGVQGPQGS---TGPTG---A 505
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G GP G +GP+G G G GP+G GP
Sbjct: 506 TGPQGIQGIQGPQGVTGPQGIQGIQGIQGVIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGP 565
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
+G GP G
Sbjct: 566 TGATGPQGPQG 576
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 9/196 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G +GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPRGAQGNQGPMGE 91
Query: 73 ---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 92 RGSQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGV 151
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G G G
Sbjct: 152 QGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGE 211
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G V GL
Sbjct: 212 QGPMGPQGETGVQGLQ 227
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/102 (32%), Positives = 41/102 (40%), Gaps = 6/102 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +GS GP+G+ GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 539 TGPTGPQGIQGITGST---GPTGATGATGPTG---ATGPQGPQGIQGPQGETGPTGATGP 592
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP G GP G +G +G GP G GP
Sbjct: 593 TGATGPQGPQGIQGPQGVTGQVGATGPTGATGPQGIQGIQGP 634
>gi|256396939|ref|YP_003118503.1| peptidase C60 sortase A and B [Catenulispora acidiphila DSM 44928]
gi|256363165|gb|ACU76662.1| peptidase C60 sortase A and B [Catenulispora acidiphila DSM 44928]
Length = 946
Score = 52.4 bits (124), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/116 (40%), Positives = 55/116 (47%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
S + + L PS +L P ++ L PS + PSG++ L PSGRL L PS L
Sbjct: 66 STKSQTLDPSAALPCPDPRRAVPNLNPSDAVPSPDPSGAVANLDPSGRLPGLDPSATLAV 125
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
L PSG GPS LR L PS L PSG L P L L SG L SD
Sbjct: 126 LDPSGGPPSPGPSAALRSLDPSRASANLNPSGTLPSPDPGDALPSLDTSGALPSDA 181
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/112 (41%), Positives = 52/112 (46%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
S + + L PS L P ++ L PS + PSG + L PSGRL L PS L
Sbjct: 66 STKSQTLDPSAALPCPDPRRAVPNLNPSDAVPSPDPSGAVANLDPSGRLPGLDPSATLAV 125
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
L PSG S GPS LR L PS L PSG L P L L SG L
Sbjct: 126 LDPSGGPPSPGPSAALRSLDPSRASANLNPSGTLPSPDPGDALPSLDTSGAL 177
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/112 (37%), Positives = 49/112 (43%), Gaps = 9/112 (8%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
S + + L PS +L P + L PS + PSG++ L PSGRL L PS L
Sbjct: 66 STKSQTLDPSAALPCPDPRRAVPNLNPSDAVPSPDPSGAVANLDPSGRLPGLDPSATLAV 125
Query: 103 LGPS---------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
L PS LR L PS L PSG L S P L L SG L
Sbjct: 126 LDPSGGPPSPGPSAALRSLDPSRASANLNPSGTLPSPDPGDALPSLDTSGAL 177
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/103 (40%), Positives = 47/103 (45%)
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
S + + L PS L P + L PS + S PSG + L PSGRL L PS L
Sbjct: 66 STKSQTLDPSAALPCPDPRRAVPNLNPSDAVPSPDPSGAVANLDPSGRLPGLDPSATLAV 125
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
L PSG GPS LR L PS L PSG L D L
Sbjct: 126 LDPSGGPPSPGPSAALRSLDPSRASANLNPSGTLPSPDPGDAL 168
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/112 (39%), Positives = 50/112 (44%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
S + + L PS +L P + L PS + PSG + L PSGRL L PS L
Sbjct: 66 STKSQTLDPSAALPCPDPRRAVPNLNPSDAVPSPDPSGAVANLDPSGRLPGLDPSATLAV 125
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
PSG GPS LR L PS L PSG L P L L SG L
Sbjct: 126 LDPSGGPPSPGPSAALRSLDPSRASANLNPSGTLPSPDPGDALPSLDTSGAL 177
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/108 (39%), Positives = 47/108 (43%)
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+ L PS L P + L PS + PSG + L PSGRL PS L L PS
Sbjct: 70 QTLDPSAALPCPDPRRAVPNLNPSDAVPSPDPSGAVANLDPSGRLPGLDPSATLAVLDPS 129
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GPS LR L PS L PSG L P L L SG L
Sbjct: 130 GGPPSPGPSAALRSLDPSRASANLNPSGTLPSPDPGDALPSLDTSGAL 177
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/109 (38%), Positives = 48/109 (44%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
S + + L PS L P + L PS + PSG + + PSGRL L PS L
Sbjct: 66 STKSQTLDPSAALPCPDPRRAVPNLNPSDAVPSPDPSGAVANLDPSGRLPGLDPSATLAV 125
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
L PSG GPS LR L PS L PSG L P L L S
Sbjct: 126 LDPSGGPPSPGPSAALRSLDPSRASANLNPSGTLPSPDPGDALPSLDTS 174
>gi|56565283|dbj|BAD77969.1| type 1 collagen alpha 2 [Paralichthys olivaceus]
Length = 1352
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/173 (32%), Positives = 75/173 (43%), Gaps = 27/173 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP+G G SG +GP+G + GP G+ G G GP+G
Sbjct: 682 GDKGESGSFGPAGPAGPRGASGERGEVGPAGAPGFAGPPGADGQPGARGER---GPAGIK 738
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
+GPSG GP+G+ GPSG + GP+GR+ GP+G +
Sbjct: 739 GEVGPSGPS---GPAGQSGPAGPNGPAGPPGARGDNGPSGLTGFPGPAGRVGTPGPAGIV 795
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G DGP G +GP GPSG +GP G + GPSG
Sbjct: 796 GPPGPTGAAGKDGPRGPRGDVGPG------GPSGEQGMVGPPGPVGEKGPSGE 842
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/173 (32%), Positives = 75/173 (43%), Gaps = 27/173 (15%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G G GP+G G SG +GP+G + GP G G G+ GP+G
Sbjct: 682 GDKGESGSFGPAGPAGPRGASGERGEVGPAGAPGFAGPPG---ADGQPGARGERGPAGIK 738
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
+GPSG GP+G+ GPSG + GP+GR+ + GP+G +
Sbjct: 739 GEVGPSG---PSGPAGQSGPAGPNGPAGPPGARGDNGPSGLTGFPGPAGRVGTPGPAGIV 795
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP G +GP GPSG +GP G + GPSG
Sbjct: 796 GPPGPTGAAGKDGPRGPRGDVGPG------GPSGEQGMVGPPGPVGEKGPSGE 842
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/159 (33%), Positives = 71/159 (44%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G GP+G G SG +GP+G + GP G+ G G G G +
Sbjct: 682 GDKGESGSFGPAGPAGPRGASGERGEVGPAGAPGFAGPPGADGQPGARGERGPAGIKGEV 741
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GPSG GP+G GP G +GPSG + GP+GR+ GP+G + GP+
Sbjct: 742 GPSGPSGPAGQSGPAGPNGPAGPPGARGDNGPSGLTGFPGPAGRVGTPGPAGIVGPPGPT 801
Query: 161 GRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G + GPSG +GP G + G S
Sbjct: 802 GAAGKDGPRGPRGDVGPGGPSGEQGMVGPPGPVGEKGPS 840
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/142 (30%), Positives = 58/142 (40%), Gaps = 24/142 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL------------- 58
+GP+G + GP G+ G G G G + GPSG
Sbjct: 707 EVGPAGAPGFAGPPGADGQPGARGERGPAGIKGEVGPSGPSGPAGQSGPAGPNGPAGPPG 766
Query: 59 -----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GPSG + GP+GR+ GP+G + GP+G GP G +GP G
Sbjct: 767 ARGDNGPSGLTGFPGPAGRVGTPGPAGIVGPPGPTGAAGKDGPRGPRGDVGPG------G 820
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
PSG +GP G + GPSG
Sbjct: 821 PSGEQGMVGPPGPVGEKGPSGE 842
>gi|423401866|ref|ZP_17379039.1| hypothetical protein ICW_02264 [Bacillus cereus BAG2X1-2]
gi|401652468|gb|EJS70024.1| hypothetical protein ICW_02264 [Bacillus cereus BAG2X1-2]
Length = 835
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/197 (28%), Positives = 74/197 (37%), Gaps = 3/197 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G GP G G G + GP G GP+G+ G G + G
Sbjct: 370 NQGITGATGVEGPQGIQGLQGEIGPIGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTG 429
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP G G +G G G G +G GP G +G +G
Sbjct: 430 TTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQG 489
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G G +GP+G + GP G +GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 490 SQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQG 549
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
L G++ V G
Sbjct: 550 NLGENGITGSQGVQGAQ 566
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/190 (30%), Positives = 82/190 (43%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 500 IGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGS 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS GP G + G +G G +G G G +G G S GP
Sbjct: 560 QGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITGVTGETGATGATGATGVQGIQGVQGIMGIQGSTGSTGP 619
Query: 133 SGRLRYLGPSGR--LRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGP 186
+G G G ++ L GP+G G SG + +G G + +GP+G +GP
Sbjct: 620 TGATGATGIQGAQGIQGLQGPTGVSGMTGISGSIGPVGAQGSQGPIGAVGPTGATGSIGP 679
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G L +G +
Sbjct: 680 IGFLGIVGAT 689
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 66/173 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + G +G+ GP G G +G G G G +G
Sbjct: 410 TGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAGV 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G +G +G G G +GP+G + GP G +GP+G S G
Sbjct: 470 QGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGM 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G GP G L G +G G G GP G + G
Sbjct: 530 QGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITG 582
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 65/175 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G G + G +G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 409 VTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAG 468
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP G +G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 469 VQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQG 528
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP+G GP G L G +G G G GP G + G+
Sbjct: 529 MQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITGV 583
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 67/177 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP G G G GP+G+ G G + G +G+ GP G G +G
Sbjct: 391 EIGPIGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAG 450
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G +G GP G +G +G G G +GP+G + G
Sbjct: 451 PQGAQGIQGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQG 510
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G G
Sbjct: 511 PQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQG 567
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G GP G +G +G G G +GP+G + GP G +GP+G
Sbjct: 463 IAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTG 522
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G G GP+G GP G L G +G G G +GP G + G
Sbjct: 523 AQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITG 582
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+G G +G G G +G G GP+G G G GL
Sbjct: 583 VTGETGATGATGATGVQGIQGVQGIMGIQGSTGSTGPTGATGATGIQGAQGIQGLQGPTG 642
Query: 201 VSGL 204
VSG+
Sbjct: 643 VSGM 646
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 65/175 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + G G GP+GS G G +G G G G + G +G +
Sbjct: 105 GPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVI 164
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G G G G G +G + G G +GP+G GP
Sbjct: 165 GPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQ 224
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G + GP G G +G + G G G +G + GP G
Sbjct: 225 GISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQGLNGSTGFQGAKGVRGITGATGSIGIQGPEG 279
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/194 (26%), Positives = 71/194 (36%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G G G G +G GP G +G +G+ G G +GP+G
Sbjct: 445 ETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTG 504
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 505 AIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQG 564
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G GP G + G +G G +G G G +G G GP+G
Sbjct: 565 AQGSQGPEGPQGNVGITGVTGETGATGATGATGVQGIQGVQGIMGIQGSTGSTGPTGATG 624
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + GL
Sbjct: 625 ATGIQGAQGIQGLQ 638
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 67/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G G G +G + GP G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 69 GTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +G G+ G G + G +G + GP G G G G
Sbjct: 129 GIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEE 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G + G G +GP+G GP G G +G + GP G
Sbjct: 189 GPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQ 248
Query: 194 GLS 196
GL+
Sbjct: 249 GLN 251
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G+ G G++ G +G GP G GP G + GP G +
Sbjct: 57 GPQGIEGIQGPRGTTGAQGIQGAV---GDTGEQGITGPVG---LQGPQGLIGEQGPVGDI 110
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G +G G+ G G + G +G + GP
Sbjct: 111 GLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQ 170
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G +G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 171 GAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQGISGIK 230
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 231 GIT 233
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 69/188 (36%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + GP G + GP G + G G GP+GS G G +G G+
Sbjct: 89 TGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGA 148
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G + G +G + GP G G G G G G +G G G
Sbjct: 149 QGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGI 208
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+GP+G GP G G +G + GP G G +G + G G G
Sbjct: 209 QGVIGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQGLNGSTGFQGAKGVRGITGA 268
Query: 196 SDGLRVSG 203
+ + + G
Sbjct: 269 TGSIGIQG 276
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP G+ GP G GP G G G++ G +G + GP
Sbjct: 39 GPVGPPGITGPRGATGPQGPQGIEGIQGPRGTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPVGLQGPQ 98
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G + G G GP+G G G +G G+ G G +
Sbjct: 99 GLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEG 158
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G + GP G G G G G G +G + G G +GP+G
Sbjct: 159 GITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGST 218
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 219 GIQG 222
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 66/182 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS +G +G G G G +G G G +GP G
Sbjct: 338 TGPTGPQGVRGAQGSQGVIGVAGVQGAQGSQGNQGITGATGVEGPQGIQGLQGEIGPIGA 397
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G + G +G GP G G +G + G
Sbjct: 398 EGPKGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGI 457
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP G +G +G G G +GP+G + GP G
Sbjct: 458 QGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGI 517
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 518 VG 519
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 8/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G + GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 22 TGPTGNSGPVGPTGG--HEGPVGPPGITGPRGATGPQGPQGIEGIQGPRG---TTGAQGI 76
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G +G GP G GP G + GP G + G G GP+G G
Sbjct: 77 QGAVGDTGEQGITGPVG---LQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGS 133
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G+ G G + G +G + GP G G G G G
Sbjct: 134 PGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGI 193
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 194 QGIT 197
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/158 (26%), Positives = 59/158 (37%), Gaps = 2/158 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+G G+ G G + G +G + GP G G G+ G G G +G
Sbjct: 139 EIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITG 198
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G +GP+G GP G G +G + GP G G +G G
Sbjct: 199 EQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQGLNGSTGFQG 258
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G +G + GP G P+G +GPS
Sbjct: 259 AKGVRGITGATGSIGIQGPEGPPGA--PTGTTGPIGPS 294
>gi|229072232|ref|ZP_04205439.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
F65185]
gi|228710889|gb|EEL62857.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
F65185]
Length = 1309
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 306 QGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 422
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 423 QGIQGVQGITGTTGVQGATGIQGIQ 447
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGTTGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 68/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 367
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 368 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 428 VQGITGTTGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQG 481
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 482 VQGIQGATGAQGVQ 495
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 310 GATGATGDQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQ 360
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 361 GIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQ 420
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 421 GIQGIQGVQGITGTTGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQ 480
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 481 GVQ 483
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 239 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 412
Query: 189 RL 190
Sbjct: 413 AT 414
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAPGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---VIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 331 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 387
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 388 GVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGTTGVQGATGIQGIQ 447
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 448 GEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 507
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 508 GAT 510
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 62/191 (32%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAPG 794
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGIQ 805
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAPGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---VIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP G GP G GP
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 SG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 56/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGTTGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 60/164 (36%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 396
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 64/183 (34%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 647 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPT 700
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 701 GIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQ 760
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 761 GIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAPGPEGPQGVQGIQGVIGPTGPMGTQGVQ 820
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 821 GIQ 823
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.067, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/196 (27%), Positives = 65/196 (33%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 574 TGVTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 633
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 634 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 693
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQ 769
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAPGPEGPQGVQGIQGVIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 637 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 693
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 190 L 190
Sbjct: 754 T 754
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP G G G G G + GP G G
Sbjct: 97 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
>gi|402563758|ref|YP_006606482.1| hypothetical protein BTG_25220 [Bacillus thuringiensis HD-771]
gi|401792410|gb|AFQ18449.1| hypothetical protein BTG_25220 [Bacillus thuringiensis HD-771]
Length = 930
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G G +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQ 336
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G +GP
Sbjct: 337 GIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQ 396
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 397 GIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQ 456
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 457 GI 458
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAG 370
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G G G G G G G + + G
Sbjct: 371 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 430
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P G G G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 431 PEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 486
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 67/192 (34%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G+ GP G GPSG+ GP G GP G +
Sbjct: 289 GPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDI 345
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 346 GPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQ 405
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 406 GITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGIQ 459
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 460 GIQGATGAQGVQ 471
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/166 (31%), Positives = 60/166 (36%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G +G GP G GPSG+
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT 330
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G + GP G GP G GP+G +GP G GP
Sbjct: 331 ---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPV 387
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 388 GATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 433
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 62/177 (35%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G GPSG
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG-- 328
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 329 -ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPV 387
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 388 GATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 444
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQG- 93
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 94 ---LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTGITGPTGI 201
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 63/181 (34%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 365
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G GP G GP G GP G G G + G G G G
Sbjct: 366 PGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 425
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
+ GP G G G + GP +GP G G G G+ + G+
Sbjct: 426 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGI 479
Query: 205 H 205
Sbjct: 480 Q 480
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 64/170 (37%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTG---ITGPTG 200
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/156 (30%), Positives = 55/156 (35%), Gaps = 3/156 (1%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G GP G GP+G G G G +G GP G GPSG
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG-- 328
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 329 -ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPV 387
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP G G G G+ + G+
Sbjct: 388 GATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 423
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/163 (30%), Positives = 58/163 (35%), Gaps = 3/163 (1%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G GPSG
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG-- 328
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 329 -ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPV 387
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G GP G G G G G G+ + +G
Sbjct: 388 GATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 430
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 56/157 (35%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+ GP+G GP G + GP G +GP+G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGE---MGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGA 91
Query: 103 L---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP G GP G + G G G G + GP G G
Sbjct: 92 QGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 151
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 185
>gi|423358182|ref|ZP_17335685.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD022]
gi|401086301|gb|EJP94527.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD022]
Length = 778
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGTIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 359
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 360 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGI 419
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 420 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 479
Query: 196 S 196
Sbjct: 480 Q 480
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGTIGPQGATGATGDQGPQ 339
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 340 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPE 396
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 397 GPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 454
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 69/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGTIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 364
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 365 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQG 424
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 425 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQG 478
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 479 IQGIQGATGAQGVQ 492
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G+
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGTIGPQGA- 329
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 330 -----TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQ 381
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP+G GP G GP G GP G G G G+ +
Sbjct: 382 GIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQ 441
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 442 GIQ 444
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 328 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 384
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 385 GVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 445 GEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 504
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 505 GAT 507
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQG- 93
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 94 ---LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTGITGPTGI 201
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 57/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 351 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 411 TGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 467
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 468 TGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 507
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 64/170 (37%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTG---ITGPTG 200
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/100 (30%), Positives = 39/100 (39%), Gaps = 9/100 (9%)
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 158
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGL 94
Query: 159 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G GP G GP +GP+G G+
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQ 128
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 56/157 (35%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+ GP+G GP G + GP G +GP+G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGE---MGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGA 91
Query: 103 L---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP G GP G + G G G G + GP G G
Sbjct: 92 QGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 151
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 185
>gi|365158485|ref|ZP_09354679.1| hypothetical protein HMPREF1014_00142 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
gi|363626759|gb|EHL77731.1| hypothetical protein HMPREF1014_00142 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
Length = 1303
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 306 QGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 422
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 423 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 447
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 68/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 367
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 368 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 428 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQG 481
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 482 VQGIQGATGAQGVQ 495
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 239 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 412
Query: 189 RL 190
Sbjct: 413 AT 414
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGI 804
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---VIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 331 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 387
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 388 GVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 447
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 448 GEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 507
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 508 GAT 510
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---VIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP G GP G GP
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 SG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 60/164 (36%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 396
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 56/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 647 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPT 700
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 701 GIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQ 760
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 761 GIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGVIGPTGPMGTQGVQ 820
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 821 GI 822
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.043, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 66/194 (34%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 675 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 731
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 732 PVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIG 791
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G V G+
Sbjct: 792 ATGPEGPQGVQGIQ 805
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.073, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 65/195 (33%), Gaps = 15/195 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 574 TGVTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 633
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 634 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 693
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGV 768
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGVIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 637 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 693
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 190 L 190
Sbjct: 754 T 754
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 16/176 (9%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 136 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGSQGIQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/159 (28%), Positives = 57/159 (35%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 154 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G G GPSG G +G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGSQGIQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ 190
>gi|229193013|ref|ZP_04319969.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
gi|228590460|gb|EEK48323.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
Length = 1282
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/198 (27%), Positives = 66/198 (33%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 594 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGPTGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 653
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 654 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 713
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 714 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 773
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P G G+ + +G
Sbjct: 774 PEGPQGVQGIQGAIGPTG 791
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/197 (28%), Positives = 64/197 (32%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------L 58
GP G GP+G G G +GP+G GP GS
Sbjct: 605 GPQGIQGVTGPTGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQ 664
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 665 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 724
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 725 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 784
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP G G+
Sbjct: 785 GAIGPTGPMGAQGVQGI 801
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 71/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 565 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGPTGDQGPQGI 624
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 625 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 681
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 682 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 741
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 742 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 766
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 665 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 724
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 725 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 784
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 785 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 829
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 665 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 724
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 725 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 784
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 785 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 829
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 66/193 (34%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G+ G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 555 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 614
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLG 122
P+G G G +GP+G GP G GP G + G
Sbjct: 615 PTGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTG 674
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 675 PQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 734
Query: 183 YLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 735 PQGPQGIQGIQGV 747
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 62/181 (34%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G G GP G GPSG+
Sbjct: 274 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT 333
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G + GP G GP G GP G +G G GP
Sbjct: 334 ---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPV 390
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP G G G G G G G + GP G G G+ +
Sbjct: 391 GTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGAPGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPT 450
Query: 203 G 203
G
Sbjct: 451 G 451
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G GP
Sbjct: 556 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGP 615
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 616 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 672
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 673 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 732
Query: 190 L 190
Sbjct: 733 T 733
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 63/180 (35%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGS---TGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G G G G G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGD 347
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+ GP G GP G GP G G G GP G GP G G+
Sbjct: 348 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGV 407
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 60/182 (32%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQ 339
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G G G GP G GP
Sbjct: 340 GIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQ 399
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 400 GIQGIQGVQGITGAPGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGPQGVQ 459
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 460 GV 461
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 673 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 732
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 733 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 792
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 793 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 829
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/192 (28%), Positives = 64/192 (33%), Gaps = 9/192 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G G+ GP G GPSG+ GP G GP G +
Sbjct: 292 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDI 348
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G G G GP G GP G G
Sbjct: 349 GPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQ 408
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 409 GITGAPGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGP------MGPQGVQGVQ 462
Query: 194 GLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 463 GIQGATGAQGVQ 474
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.38, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 313 GATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 369
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G+ G G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 370 GPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGAPGVQGVTGIQGIQGEI 429
Query: 137 RYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 430 GATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 489
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 60/181 (33%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP+G G G G G+ GP G GPSG
Sbjct: 274 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGVPGPSG-- 331
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G + GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 332 -ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPV 390
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 391 GTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGAPGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPT 450
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 451 G 451
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/170 (30%), Positives = 62/170 (36%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQGLRGP 100
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 101 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 160
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 161 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/180 (28%), Positives = 60/180 (33%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 313 GATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 369
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G G G GP G GP G G G + G G G G +
Sbjct: 370 GPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGAPGVQGVTGIQGIQGEI 429
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G G + GP +GP G G G G+ + G+
Sbjct: 430 GATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQ 483
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/160 (29%), Positives = 55/160 (34%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ G G GP G
Sbjct: 333 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGT 392
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 393 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGAPGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGI---GP 449
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 450 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 489
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 63/176 (35%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 373
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
G G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 374 ATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGAPGVQGVTGIQGIQGEIGATG 433
Query: 130 -DGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 434 PEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 489
>gi|42783914|ref|NP_981161.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cereus ATCC
10987]
gi|42739844|gb|AAS43769.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus ATCC
10987]
Length = 1321
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/193 (30%), Positives = 68/193 (35%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 286 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 345
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 346 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 402
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 403 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQ 462
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G G+ +G
Sbjct: 463 GVQGAQGGIGPTG 475
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGL 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +G+ GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 243 TGVTGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGE 302
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G +GP G GP G GPSG + GP
Sbjct: 303 QGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGP 359
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 360 QGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGAT 417
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 63/182 (34%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQ 363
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 364 GLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQ 423
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 424 GIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGPQGVQ 483
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 484 GV 485
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/193 (29%), Positives = 68/193 (35%), Gaps = 15/193 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGLQGPMG 370
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 371 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 430
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 431 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGP------MGPQGVQG 484
Query: 192 YLGLSDGLRVSGL 204
G+ G+
Sbjct: 485 VQGIQGATGAQGV 497
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/170 (31%), Positives = 65/170 (38%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G GP G + GP G GP GS+ GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGSIGATGPEGQQGPQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP+G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPAGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGMQGLQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---VTGPTG 200
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/160 (32%), Positives = 61/160 (38%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G GP GS+ GP G+ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGSIGATGPEGQ---QGP 91
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP+G + G G G G + GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPAGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGMQGLQGPSGNTGATGAT 185
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/172 (30%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ G +G G +G GP+GS G G GP G GP G
Sbjct: 231 TGATGNTGATGSTGVTGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGI 290
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRY 138
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G
Sbjct: 291 QGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGV 350
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 351 PGPSG---ATGPQGVQGLQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 399
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 61/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 621 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGVQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 680
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 681 GTGAQGPQGIQGPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 740
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 741 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 800
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 801 PEGPQGVQGV 810
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 66/194 (34%), Gaps = 9/194 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 657 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQG 713
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 714 EIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQGIQGIQG 773
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 774 VQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGEIGPTGP------MGPQGVQG 827
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 828 VQGIQGATGAQGVQ 841
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 653 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDVGPTGPQGPT 706
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G GP G GP G GP G G G S GP
Sbjct: 707 GIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQ 766
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 767 GIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGEIGPTGPMGPQGVQ 826
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 827 GV 828
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.100, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 56/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 692 GPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 751
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 752 GIQGVQGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 811
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + GP+G + G G G +G GP G GP
Sbjct: 812 GEI---GPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGP 852
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 592 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGV 651
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 652 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDVGPTGPQGPTGI 708
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 709 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGPQGI 768
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 769 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 793
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 56/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 692 GPQGDVGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 751
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 752 GIQGVQGATGSQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 811
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +GP+G + G G G +G GP G GP
Sbjct: 812 GE---IGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGP 852
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 62/189 (32%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 586 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 645
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGVQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDVGPTGPQGP 705
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 706 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGSQGP 765
Query: 187 SGRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 766 QGIQGIQGV 774
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 50/131 (38%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 929 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 988
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G +GP+G GP G G +G + GP G GP G + GP
Sbjct: 989 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1045
Query: 151 SGRLRYLGPSG 161
G GP G
Sbjct: 1046 QGPQGIQGPQG 1056
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 49/131 (37%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 929 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 988
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 989 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1045
Query: 169 SGRLRYLGPSG 179
G GP G
Sbjct: 1046 QGPQGIQGPQG 1056
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 50/131 (38%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G+
Sbjct: 929 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 988
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 989 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQGI---QGPQGEIGPTGP 1045
Query: 142 SGRLRYLGPSG 152
G GP G
Sbjct: 1046 QGPQGIQGPQG 1056
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/132 (28%), Positives = 49/132 (37%), Gaps = 3/132 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 928 DTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATG 987
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + G
Sbjct: 988 AQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTG 1044
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
P G GP G
Sbjct: 1045 PQGPQGIQGPQG 1056
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/100 (30%), Positives = 37/100 (37%), Gaps = 3/100 (3%)
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 166
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGSIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 167 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP+G G + GL
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGPAGPTGATGAQGIQGIQGLQ 134
>gi|75762916|ref|ZP_00742723.1| Hypothetical membrane spanning protein [Bacillus thuringiensis
serovar israelensis ATCC 35646]
gi|74489593|gb|EAO53002.1| Hypothetical membrane spanning protein [Bacillus thuringiensis
serovar israelensis ATCC 35646]
Length = 690
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/141 (29%), Positives = 55/141 (39%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G G +G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 124 NTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATG 183
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ G G G +G GP+G GP GP G + G
Sbjct: 184 NTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQ------GPQGNTGATG 237
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
+G G +G GP G
Sbjct: 238 ATGPQGVQGNTGATGATGPQG 258
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/154 (28%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 6/154 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G+ GP G G +G+ GP+G GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 111 GNTGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGAT 170
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G G +G GP+G G G + G +G GP+G GP
Sbjct: 171 GPQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGSQGPQGNTGATGNTGAQGPAGATGATGPQ--- 227
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 228 ---GPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 258
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/165 (26%), Positives = 57/165 (34%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G G +G+ GP G G +G+ G G G +G G +G+
Sbjct: 364 PHGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATG 423
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP G G +G G +G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 424 ATGPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATG 483
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 484 PQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 528
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ G G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 366 GPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGLQGNTGATGAT 425
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G +G G G G +G G +G + GP
Sbjct: 426 GPQGLQGNTGATGPQGLQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 485
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G GP G G +G G +G GP G GP+G
Sbjct: 486 G---VQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGPQG---IQGPTGATGAT 539
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 540 GI 541
>gi|423477427|ref|ZP_17454142.1| hypothetical protein IEO_02885 [Bacillus cereus BAG6X1-1]
gi|402430430|gb|EJV62507.1| hypothetical protein IEO_02885 [Bacillus cereus BAG6X1-1]
Length = 835
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/197 (28%), Positives = 74/197 (37%), Gaps = 3/197 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G GP G G G + GP G GP+G+ G G + G
Sbjct: 370 NQGITGATGVEGPKGIQGLQGEIGPIGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTG 429
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP G G +G G G G +G GP G +G +G
Sbjct: 430 TTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQG 489
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G G +GP+G + GP G +GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 490 SQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQG 549
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
L G++ V G
Sbjct: 550 NLGENGITGSQGVQGAQ 566
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/190 (30%), Positives = 82/190 (43%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 500 IGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGS 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS GP G + G +G G +G G G +G G S GP
Sbjct: 560 QGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITGVTGETGATGATGATGVQGIQGVQGIMGIQGSTGSTGP 619
Query: 133 SGRLRYLGPSGR--LRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGP 186
+G G G ++ L GP+G G SG + +G G + +GP+G +GP
Sbjct: 620 TGATGATGIQGAQGIQGLQGPTGVSGMTGISGSIGPVGAQGSQGPIGAVGPTGATGSIGP 679
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G L +G +
Sbjct: 680 IGFLGIVGAT 689
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 66/173 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + G +G+ GP G G +G G G G +G
Sbjct: 410 TGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAGV 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G +G +G G G +GP+G + GP G +GP+G S G
Sbjct: 470 QGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGM 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G GP G L G +G G G GP G + G
Sbjct: 530 QGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITG 582
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 65/175 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G G + G +G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 409 VTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAG 468
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP G +G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 469 VQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQG 528
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP+G GP G L G +G G G GP G + G+
Sbjct: 529 MQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITGV 583
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 67/177 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP G G G GP+G+ G G + G +G+ GP G G +G
Sbjct: 391 EIGPIGAEGPKGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAG 450
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G +G GP G +G +G G G +GP+G + G
Sbjct: 451 PQGAQGIQGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQG 510
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G G
Sbjct: 511 PQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQG 567
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 70/184 (38%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G GP G +G +G G G +GP+G + GP G +GP+G
Sbjct: 463 IAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTG 522
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G G GP+G GP G L G +G G G +GP G + G
Sbjct: 523 AQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGSQGPEGPQGNVGITG 582
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+G G +G G G +G G GP+G G G GL
Sbjct: 583 VTGETGATGATGATGVQGIQGVQGIMGIQGSTGSTGPTGATGATGIQGAQGIQGLQGPTG 642
Query: 201 VSGL 204
VSG+
Sbjct: 643 VSGM 646
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 65/175 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + G G GP+GS G G +G G G G + G +G +
Sbjct: 105 GPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVI 164
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G G G G G +G + G G +GP+G GP
Sbjct: 165 GPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQ 224
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G + GP G G +G + G G G +G + GP G
Sbjct: 225 GISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQGLNGSTGFQGAKGVRGITGATGSIGIQGPEG 279
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/194 (26%), Positives = 71/194 (36%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G +G G G G +G GP G +G +G+ G G +GP+G
Sbjct: 445 ETGAAGPQGAQGIQGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTG 504
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G +GP+G G G GP+G GP G L G +G G
Sbjct: 505 AIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGSRGPQGNLGENGITGSQGVQG 564
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G GP G + G +G G +G G G +G G GP+G
Sbjct: 565 AQGSQGPEGPQGNVGITGVTGETGATGATGATGVQGIQGVQGIMGIQGSTGSTGPTGATG 624
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + GL
Sbjct: 625 ATGIQGAQGIQGLQ 638
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 67/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G G G +G + GP G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 69 GTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +G G+ G G + G +G + GP G G G G
Sbjct: 129 GIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEE 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G + G G +GP+G GP G G +G + GP G
Sbjct: 189 GPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQ 248
Query: 194 GLS 196
GL+
Sbjct: 249 GLN 251
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G+ G G++ G +G GP G GP G + GP G +
Sbjct: 57 GPQGIEGIQGPRGTTGAQGIQGAV---GDTGEQGITGPVG---LQGPQGLIGEQGPVGDI 110
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G +G G+ G G + G +G + GP
Sbjct: 111 GLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQ 170
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G +G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 171 GAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQGISGIK 230
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 231 GIT 233
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.059, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/188 (26%), Positives = 69/188 (36%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + GP G + GP G + G G GP+GS G G +G G+
Sbjct: 89 TGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGA 148
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G + G +G + GP G G G G G G +G G G
Sbjct: 149 QGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGI 208
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+GP+G GP G G +G + GP G G +G + G G G
Sbjct: 209 QGVIGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQGLNGSTGFQGAKGVRGITGA 268
Query: 196 SDGLRVSG 203
+ + + G
Sbjct: 269 TGSIGIQG 276
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP G+ GP G GP G G G++ G +G + GP
Sbjct: 39 GPVGPPGITGPRGATGPQGPQGIEGIQGPRGTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPVGLQGPQ 98
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G + G G GP+G G G +G G+ G G +
Sbjct: 99 GLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGSPGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEG 158
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G + GP G G G G G G +G + G G +GP+G
Sbjct: 159 GITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGHQGDQGIQGVIGPTGST 218
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 219 GIQG 222
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 66/182 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS +G +G G G G +G G G +GP G
Sbjct: 338 TGPTGPQGVRGAQGSQGVIGVAGVQGAQGSQGNQGITGATGVEGPKGIQGLQGEIGPIGA 397
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G + G +G GP G G +G + G
Sbjct: 398 EGPKGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGVQGPQGIRGETGAAGPQGAQGI 457
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP G +G +G G G +GP+G + GP G
Sbjct: 458 QGVQGIAGAAGVQGLQGPQGIQGEVGLTGAQGSQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGI 517
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 518 VG 519
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 8/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G + GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 22 TGPTGNSGPVGPTGG--HEGPVGPPGITGPRGATGPQGPQGIEGIQGPRG---TTGAQGI 76
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G +G GP G GP G + GP G + G G GP+G G
Sbjct: 77 QGAVGDTGEQGITGPVG---LQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGLEGIQGITGPAGSQGIQGS 133
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G+ G G + G +G + GP G G G G G
Sbjct: 134 PGIQGEIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGI 193
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 194 QGIT 197
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/158 (26%), Positives = 59/158 (37%), Gaps = 2/158 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+G G+ G G + G +G + GP G G G+ G G G +G
Sbjct: 139 EIGERGQTGAQGMQGVIGEGGITGVIGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITG 198
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G +GP+G GP G G +G + GP G G +G G
Sbjct: 199 EQGHQGDQGIQGVIGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVIGPQGPQGVQGIQGLNGSTGFQG 258
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G +G + GP G P+G +GPS
Sbjct: 259 AKGVRGITGATGSIGIQGPEGPPGA--PTGTTGPIGPS 294
>gi|228967830|ref|ZP_04128844.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar sotto str. T04001]
gi|228791880|gb|EEM39468.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar sotto str. T04001]
Length = 951
Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 64/180 (35%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGTIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 359
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 360 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGI 419
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 420 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 479
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGTIGPQGATGATGDQGPQ 339
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 340 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPE 396
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 397 GPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 454
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 69/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGTIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 364
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 365 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQG 424
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 425 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQG 478
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 479 IQGIQGATGAQGVQ 492
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G+
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGTIGPQGA- 329
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 330 -----TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQ 381
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP+G GP G GP G GP G G G G+ +
Sbjct: 382 GIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQ 441
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 442 GIQ 444
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 66/183 (36%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 328 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 384
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 385 GVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 445 GEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 504
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 505 GAT 507
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQG- 93
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 94 ---LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTGITGPTGI 201
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 64/170 (37%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTG---ITGPTG 200
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 57/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 351 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 411 TGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 467
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 468 TGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 507
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 335 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAG 391
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 392 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 451
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 507
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 56/157 (35%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+ GP+G GP G + GP G +GP+G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGSTGPQGPRGFQGPMGE---MGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGA 91
Query: 103 L---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP G GP G + G G G G + GP G G
Sbjct: 92 QGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 151
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 185
>gi|365159966|ref|ZP_09356141.1| hypothetical protein HMPREF1014_01604 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
gi|363624497|gb|EHL75569.1| hypothetical protein HMPREF1014_01604 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
Length = 781
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 36 GPTGPQGIQGVQGPIGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGVQGIQGVQGVQGENGPTGPT 95
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G S G
Sbjct: 96 GVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQ 155
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP G G P G + +GP+G G G + GP+G GP+G
Sbjct: 156 GEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPT 215
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 216 GATGIT 221
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 62/168 (36%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 285 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 344
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G L GP G
Sbjct: 345 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQ 404
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G SG GP G GP G + G +G GP G G +
Sbjct: 405 GISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPTGATGAT 452
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/179 (28%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G G G G +G GP+G G G
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGVQGIQGVQGVQGENGPT---GPTGVQGIQGVQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G+ G G L G G G G + GP+G G G + G
Sbjct: 107 IGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGE 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 167 TGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 225
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 55/151 (36%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 300 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPT 359
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G L GP G G SG GP G
Sbjct: 360 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQ 419
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G + G +G GP G G
Sbjct: 420 GIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPTGATG 450
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.095, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/146 (30%), Positives = 53/146 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 305 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 364
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G L GP G G SG GP G GP
Sbjct: 365 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGP 424
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G + G +G GP G G
Sbjct: 425 QGDIGPTGATGIQGVQGPEGPTGATG 450
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 66/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 315 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVR 374
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G L GP G G SG GP G GP G + G +
Sbjct: 375 GATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGAT 434
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G G G + GP+G
Sbjct: 435 GIQGVQGPEGPTGATGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQ 494
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 495 GIT 497
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/193 (28%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G SG GP G GP G + G +G GP G G +G
Sbjct: 395 TGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPTGATGATGP 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G G G + GP+G G +G GP+G + GP
Sbjct: 455 QGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS---TGPTGATGATGP 511
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP G G +G GP G G G GP+G
Sbjct: 512 TG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQG---IQGIQGSQGITGPTGATGV 565
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G++ + G+
Sbjct: 566 TGITGPQGIQGIQ 578
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G G L GP G G SG GP G GP G + G +G
Sbjct: 376 ATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATG 435
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP G G +G G G GP G G G + GP+G G
Sbjct: 436 IQGVQGPEGPTGATGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQG 495
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+G GP+G GP+G GP G GP G GP+G G++
Sbjct: 496 ITGS---TGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQG---VTGPTGATGSTGVTGPQG 546
Query: 201 VSGLH 205
+ G+
Sbjct: 547 IQGIQ 551
>gi|206974721|ref|ZP_03235637.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus H3081.97]
gi|206747364|gb|EDZ58755.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus H3081.97]
Length = 751
Score = 52.0 bits (123), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/202 (28%), Positives = 75/202 (37%), Gaps = 10/202 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSL-------RYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
GP G + GP+GS +GP+G+ G G + GP+G GP G
Sbjct: 230 GPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIIGPTGATGLTGLQGVQGEIGPTGPTGDQGIQGPQGV 289
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G G G + GP+G G G + GP G G G GP
Sbjct: 290 MGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGP 349
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G G G GP G G SG GP G GP G + G +G
Sbjct: 350 TGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQGMQGPQGNIGPTGSTGIQGV 409
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G + + G+
Sbjct: 410 QGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQ 431
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/188 (28%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ + +GP+G G G +GP+ GP+G GP G + GP+G G
Sbjct: 250 QGVIIGPTGATGLTGLQGVQGEIGPT------GPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQG 303
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 304 IQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQG 363
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G SG GP G GP G + G +G GP G G +G
Sbjct: 364 PTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQGMQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATG 423
Query: 189 RLRYLGLS 196
G+
Sbjct: 424 PQGIQGIQ 431
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G G G + GP+G G G + G +G GP G + G + +
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGD---LGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 193 LGLS 196
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G +GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEI---GPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 165
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G + V
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.65, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDL 181
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 64/189 (33%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G G G +GP+GS G G GP+G
Sbjct: 363 GPTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQGMQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGAT 422
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPS---------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G GP+ G + GP G G +G G +G+
Sbjct: 423 GPQGIQGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPIGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQA 482
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP G G +G G G GP G G +G GP+
Sbjct: 483 GVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPT 542
Query: 179 GRLRYLGPS 187
G GP
Sbjct: 543 GPQGIQGPQ 551
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/172 (27%), Positives = 61/172 (35%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS-- 70
GP G GP G++ GP+GS G G GP+G+ G G GP+
Sbjct: 383 TGPQGIQGMQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGLQGPTGP 439
Query: 71 -------------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G + GP G G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 440 QGIQGIQGIQGPIGPIGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 499
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G + G G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 500 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQ 551
>gi|229070805|ref|ZP_04204033.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus F65185]
gi|228712195|gb|EEL64142.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus F65185]
Length = 711
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + G +G GP G + +GP+G G G + GP G
Sbjct: 202 TGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPQGL 261
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ GP G GP + GP G G G GP+G G
Sbjct: 262 QGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGP---IGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGI 318
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GPSG GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 319 QGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 374
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 68/176 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIG 287
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/188 (30%), Positives = 69/188 (36%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLG 68
NLG SG G G +GP+G G G +GP G G P G + +G
Sbjct: 180 NLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVG 239
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G G + GP G GP G GP G GP + GP G
Sbjct: 240 PTGIQGIQGVQGVIGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGP---IGPTGPQGIQG 296
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 297 IQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQG 356
Query: 189 RLRYLGLS 196
+ G +
Sbjct: 357 DIGPTGAT 364
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 247
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/170 (30%), Positives = 66/170 (38%), Gaps = 9/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G LG SG
Sbjct: 127 IGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGL 186
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +GP+G G G +GP G G P G + +GP+G
Sbjct: 187 QGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGI 246
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G + GP G GP G GP G GP +GP+G
Sbjct: 247 QGVQGVIGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGP------IGPTG 290
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/162 (30%), Positives = 63/162 (38%), Gaps = 3/162 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---L 148
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 229
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G + +GP+G G G + GP G GP G
Sbjct: 230 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPQGLQGIQGPVGAT 271
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+L G G G G + GP+GS G G + G +G
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 225
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G + +GP+G G G + GP G GP G GP G + GP
Sbjct: 226 QGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGP 285
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G G G GP+G G G GP G GPSG
Sbjct: 286 ---IGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSG 338
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G+ G G L G G G G + GP+G
Sbjct: 148 TGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGS 207
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + G +G GP G + +GP+G G G + GP G GP
Sbjct: 208 QGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPQGLQGIQGP 267
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP G GP + GP G G G GP+G
Sbjct: 268 VGATGPTGPQGVQGAQGP---IGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTG 311
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGNL---GGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 225
Query: 193 LGLS 196
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/204 (28%), Positives = 76/204 (37%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GPSG GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 320 GPSGPT---GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP- 375
Query: 74 RYLGPSGSL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G+ GP G G G + GP+G G +G
Sbjct: 376 --TGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS---T 430
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G + GP+G GP G GP G GP+G G +G G G
Sbjct: 431 GPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQG---VTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQ 484
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G++ + G+
Sbjct: 485 GITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 508
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 65/187 (34%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL--------- 64
GPSG GP G GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 335 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQ 391
Query: 65 ---RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP G G G + GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 392 GIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS---TGPTGATGATGPTG---VT 445
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP G G +G GP G G G G +G GP G
Sbjct: 446 GPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQ 505
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 506 GIQGPQG 512
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.52, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 68/203 (33%), Gaps = 30/203 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G + GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 253 IGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGL 312
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G GPSG GP G GP G + G +G GP
Sbjct: 313 QGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGP 372
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRY---------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G +GP+G G G
Sbjct: 373 EGPT---GPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS 429
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP G
Sbjct: 430 TGPTGATGATGPTGVTGPQGPQG 452
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 151 TGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNL 181
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/215 (26%), Positives = 70/215 (32%), Gaps = 33/215 (15%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 265 QGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGP 324
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GPSG GP G GP G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 325 TGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGD---IGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGA 381
Query: 136 LRY---------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+GP+G G G GP+G GP
Sbjct: 382 TGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGP 441
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
+G GP G GP G G + V+G
Sbjct: 442 TG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTG 473
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPI---GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGP 165
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G V
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 225
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/162 (27%), Positives = 58/162 (35%), Gaps = 18/162 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
++GP+G G G GP+G+ GP G G G + G
Sbjct: 357 DIGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTG 416
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G +G GP+G+ GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 417 PTGPQGIQGITGST---GPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTG 470
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G G G G +G GP G GP G
Sbjct: 471 VTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQG 512
>gi|229019960|ref|ZP_04176753.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1273]
gi|229026194|ref|ZP_04182558.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1272]
gi|228735122|gb|EEL85753.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1272]
gi|228741344|gb|EEL91551.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1273]
Length = 955
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 67/173 (38%), Gaps = 10/173 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G GP G + GP G GP+G++ GP G+ G
Sbjct: 42 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEIGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 101
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G + G G GP G +GP G
Sbjct: 102 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGAIGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 155
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G + GP G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 156 QGVQGVPGATGSQGIQGAQGFQGPQGPSGSTGPTGATGQ-GVTGSTGITGPTG 207
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/163 (31%), Positives = 64/163 (39%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 42 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEIGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 98
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + + G G GP G
Sbjct: 99 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGAIGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 149
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G G G G + GP G GP+G
Sbjct: 150 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGFQGPQGPSGSTGPTGAT 192
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G GP+GS+ G P G GP G GP G GP
Sbjct: 238 TGATGNTGVTGSAGETGNTGPTGSIGETGAQGPQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGP 297
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G G +G GP G +GP G G G G G
Sbjct: 298 TGLTGEQGIQGIQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGE 357
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 358 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIG 416
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/192 (29%), Positives = 69/192 (35%), Gaps = 24/192 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G +G+ GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 321 DQGPQGIQGAIGPQGV------TGATGDQGPQGIQGVPGPTG---ETGPQGVQGIQGPMG 371
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------- 123
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 372 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQG 431
Query: 124 ----SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+G + GP G G G GP G +GP+G + G G G
Sbjct: 432 IQGVTGATGAQGPQGVQGIQGDIGATGPEGPQGVQGAQGDIGPTGPMGPQGVQGIQGIQG 491
Query: 177 PSGRLRYLGPSG 188
P+G GP G
Sbjct: 492 PTGAQGVQGPQG 503
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/171 (29%), Positives = 59/171 (34%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP G +GP G G G G G GP G GP G +
Sbjct: 316 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGP 375
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G G G
Sbjct: 376 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGV 435
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 436 TGATGAQGPQGVQGIQGDIGATGPEGPQGVQGAQGDIGPTGPMGPQGVQGI 486
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.045, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/174 (28%), Positives = 63/174 (36%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G GP G G +G+ G G GP+G G G G +G
Sbjct: 619 DIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGSTGNQGPQGNQGPQGIQGPTGPQGIQGDQGPQGIQGATG 678
Query: 72 RLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G G G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 679 ATGAQGPQGIQGIQGVQGPTGPQGPTGIQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGPQGPTGDTGPTG 738
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G G +G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 739 AQGPQGIQGPTGVTGATGSQGIQGPTG---VTGATGSQGIQGPTGATGSQGPTG 789
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/145 (31%), Positives = 56/145 (38%), Gaps = 7/145 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRY---L 67
GP G + GP G GP+G + GP G+ G P G GP G +
Sbjct: 64 GPMGEIGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGPI 123
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G + G G GP G GP G G G G G + GP G
Sbjct: 124 GPTGAIGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGFQGPQGPS 183
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
S GP+G G +G GP+G
Sbjct: 184 GSTGPTGATGQ-GVTGSTGITGPTG 207
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/198 (27%), Positives = 71/198 (35%), Gaps = 10/198 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
LG +G G +G+ G +G+ GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 580 ELGDTGVTGATGVTGATGETGATGATGLQGPQGIQGVQGDIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 639
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G G GP+G G G G +G GP G G G
Sbjct: 640 STGNQGPQGNQGPQGIQGPTGPQGIQGDQGPQGIQGATGATGAQGPQGIQGIQGVQGPTG 699
Query: 129 SDGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
GP+ G + GP G GP G GP+G G G G +G
Sbjct: 700 PQGPTGIQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGPQGPTGDTGPTGAQGPQGIQGPTGVTGATGSQG 759
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP+G G S G++
Sbjct: 760 IQGPTGVTGATG-SQGIQ 776
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/172 (30%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---------SLRYLG 59
N GP+G + G P G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 255 NTGPTGSIGETGAQGPQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGLTGEQGIQGIQGIQG 314
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+G GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 315 ITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGE---TGPQGVQGIQGPMG 371
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 372 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 423
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 68/203 (33%), Gaps = 15/203 (7%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 57
T T V G +G GP G +GP+G GP G G +G+
Sbjct: 587 TGATGVTGATGETGATGATGLQGPQGIQGVQGDIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGSTGNQGP 646
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRY 111
G G GP+G G G G +G GP G GP G
Sbjct: 647 QGNQGPQGIQGPTGPQGIQGDQGPQGIQGATGATGAQGPQGIQGIQGVQGPTGPQGPTGI 706
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G + GP G GP G GP+G G G G +G GP+G
Sbjct: 707 QGVQGDIGPTGPQGVQGLQGPQGPTGDTGPTGAQGPQGIQGPTGVTGATGSQGIQGPTGV 766
Query: 172 LRYL------GPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G
Sbjct: 767 TGATGSQGIQGPTGATGSQGPTG 789
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/178 (27%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
LG +G G +G G +G+ GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 580 ELGDTGVTGATGVTGATGETGATGATGLQGPQGIQGVQGDIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 639
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
+G G G GP+G G G G +G + GP G G G
Sbjct: 640 STGNQGPQGNQGPQGIQGPTGPQGIQGDQGPQGIQGATGATGAQGPQGIQGIQGVQGPTG 699
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP+G G G + GP G GP G GP+G G+ V+G
Sbjct: 700 PQGPTG---IQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGPQGPTGDTGPTGAQGPQGIQGPTGVTGA 754
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/100 (30%), Positives = 39/100 (39%), Gaps = 3/100 (3%)
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 166
+ GP+G GP G GP G + GP G GP+G++ GP G+
Sbjct: 42 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEIGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 101
Query: 167 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G +G + GL
Sbjct: 102 RGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGAIGAQGIQGIQGLQ 141
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 42 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGE---IGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 92
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 93 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGAIGAQGIQGIQGLQGPIGA 146
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 147 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 171
>gi|423560760|ref|ZP_17537036.1| hypothetical protein II5_00164 [Bacillus cereus MSX-A1]
gi|401203075|gb|EJR09918.1| hypothetical protein II5_00164 [Bacillus cereus MSX-A1]
Length = 948
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 68/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGTIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 364
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 365 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQG 424
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 425 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQG 478
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 479 VQGIQGATGAQGVQ 492
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGTIGPQGATGATGDQGPQ 339
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 340 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 396
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 397 GPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 454
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 65/183 (35%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 328 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 384
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 385 GVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 445 GEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 504
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 505 GAT 507
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 64/183 (34%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G+
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGTIGPQGA- 329
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 330 -----TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQ 381
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP G GP G GP G GP G G G G+ +
Sbjct: 382 GIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQ 441
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 442 GIQ 444
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQG- 93
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 94 ---LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTGITGPTGI 201
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 56/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 351 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGT 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 411 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEI---GP 467
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 468 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 507
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 64/170 (37%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTG---ITGPTG 200
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 56/157 (35%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+ GP+G GP G + GP G +GP+G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGA 91
Query: 103 L---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP G GP G + G G G G + GP G G
Sbjct: 92 QGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 151
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 185
>gi|228986435|ref|ZP_04146571.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar tochigiensis BGSC 4Y1]
gi|228773256|gb|EEM21686.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar tochigiensis BGSC 4Y1]
Length = 837
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGSI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 248 GV 249
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP+G G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQ 229
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 230 GPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGSTGPTGVT 277
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 71/176 (40%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGS---TGPTG---VTGPTG 281
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G GS+
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGSI 127
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G G G + GP+G G G + G +G GP G + G + +
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/163 (30%), Positives = 60/163 (36%), Gaps = 6/163 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G + G +G GP GP+G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPE------GPTGPTGATGPQG 512
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGD---LGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 226 QGL 228
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/162 (30%), Positives = 67/162 (41%), Gaps = 9/162 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G LG SG
Sbjct: 126 SIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSG 185
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G +GP+G G G +GP+G GP G + GP+G
Sbjct: 186 LQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQG 245
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G + GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 246 IQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGS---TGPTG---VTGPTG 281
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/162 (28%), Positives = 59/162 (36%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + G +G GP G G + + G+
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQ 517
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 58/158 (36%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G + G +G GP GP+G GP G
Sbjct: 481 QGNIGPTGSTGIQGVQGPE------GPTGPTGATGPQG 512
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G +GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEI---GPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 165
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G + V
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDL 181
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 66/191 (34%), Gaps = 24/191 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G SG GP G GP G + GP+GS G G GP+G
Sbjct: 451 TGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGA 507
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G GP+G GP G G +G G +G+
Sbjct: 508 TGPQGIQGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGQAGATGQ 567
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G GP G G +G G G GP G GP+G GP
Sbjct: 568 AGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQG---ITGPTG---ATGP 621
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
+G +GP G
Sbjct: 622 TGATGPIGPQG 632
>gi|423622188|ref|ZP_17597966.1| hypothetical protein IK3_00786 [Bacillus cereus VD148]
gi|401261743|gb|EJR67896.1| hypothetical protein IK3_00786 [Bacillus cereus VD148]
Length = 903
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 285 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQ 344
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 345 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 401
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 402 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEG 459
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 60/175 (34%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 314 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 370
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 371 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 430
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 431 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQ 485
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 67/197 (34%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 319 DQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 375
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 376 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 435
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 436 ATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGIQGIQG 489
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 490 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 506
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP G G P G GPS
Sbjct: 294 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPS 353
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 410
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 411 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 470
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 TGVTGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 391
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGE 451
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 511
Query: 190 L 190
Sbjct: 512 T 512
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 276 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 335
Query: 92 RYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G P G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 GVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 392
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 393 GPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 449
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/194 (31%), Positives = 72/194 (37%), Gaps = 13/194 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL----GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N G +G+ GP+GS G G L+ + GP G GP G GP+G
Sbjct: 242 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTG 300
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP G G P G GPSG G
Sbjct: 301 EQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATG 357
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 358 PQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 417
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 418 PQGPQGIQGIQGVQ 431
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 340 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 396
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 397 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 456
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 457 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 512
>gi|195977641|ref|YP_002122885.1| hypothetical protein Sez_0500 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
gi|195974346|gb|ACG61872.1| collagen-like protein with amino-end fibronectin-binding domain
SclZ.6 [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus
MGCS10565]
Length = 522
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/169 (31%), Positives = 58/169 (34%), Gaps = 12/169 (7%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
V EK + G G+ GP G GP +GP G GP+G GP G
Sbjct: 271 VSEKTVKHGKDGKPGLNGQRGPQGEEGKPGP------IGPKGDTGARGPAGPQ---GPKG 321
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 322 ENGKDGEKGERGEKGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQG 381
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
P G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 382 PQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 430
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/149 (32%), Positives = 51/149 (34%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP +GP G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 291 GPQGEEGKPGP------IGPKGDTGARGPAG---PQGPKGENGKDGEKGERGEKGPQGER 341
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 342 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 401
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G GP G GP G
Sbjct: 402 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 430
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/149 (32%), Positives = 51/149 (34%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G GP +GP G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 291 GPQGEEGKPGP------IGPKGDTGARGPAG---PQGPKGENGKDGEKGERGEKGPQGER 341
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 342 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 401
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G
Sbjct: 402 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 430
>gi|229118219|ref|ZP_04247577.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock1-3]
gi|423377425|ref|ZP_17354709.1| hypothetical protein IC9_00778 [Bacillus cereus BAG1O-2]
gi|228665266|gb|EEL20750.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock1-3]
gi|401638799|gb|EJS56544.1| hypothetical protein IC9_00778 [Bacillus cereus BAG1O-2]
Length = 926
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 285 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQ 344
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 345 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 401
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 402 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEG 459
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 60/175 (34%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 314 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 370
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 371 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 430
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 431 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQ 485
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 67/197 (34%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 319 DQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 375
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 376 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 435
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 436 ATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGIQGIQG 489
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 490 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 506
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP G G P G GPS
Sbjct: 294 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPS 353
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 410
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 411 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 470
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 TGVTGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 391
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGE 451
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 511
Query: 190 L 190
Sbjct: 512 T 512
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 276 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 335
Query: 92 RYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G P G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 GVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 392
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 393 GPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 449
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/194 (31%), Positives = 72/194 (37%), Gaps = 13/194 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL----GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
N G +G+ GP+GS G G L+ + GP G GP G GP+G
Sbjct: 242 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTG 300
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP G G P G GPSG G
Sbjct: 301 EQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATG 357
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 358 PQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 417
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 418 PQGPQGIQGIQGVQ 431
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 340 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 396
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 397 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 456
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 457 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 512
>gi|229110770|ref|ZP_04240333.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
Rock1-15]
gi|228672649|gb|EEL27930.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
Rock1-15]
Length = 824
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/191 (27%), Positives = 77/191 (40%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 356 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 415
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSG 125
+G +G+ G G GP+G G +G + GP G G +G
Sbjct: 416 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAVGTQGPQGVQGIQGTTGLTG 475
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G G
Sbjct: 476 TQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRG 535
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G +G++
Sbjct: 536 PQGNTGEIGIT 546
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 364 GPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAE 423
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------PSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPS 115
G G GP+G G +G + GP G GP
Sbjct: 424 GAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAVGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQ 483
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G GP G +
Sbjct: 484 GVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEI 543
Query: 176 GPSG 179
G +G
Sbjct: 544 GITG 547
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/173 (26%), Positives = 65/173 (37%), Gaps = 15/173 (8%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G GP G G G+ G +G G G G +G
Sbjct: 398 VIGPTGAQGMVGIQG---IAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETG 454
Query: 81 SLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
++ GP G GP G +GP+G + GP G +GP+G
Sbjct: 455 AVGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQG 514
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 515 VQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 567
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 71/189 (37%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 382 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQ 441
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G +G + GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 442 GIQGVQG---IQGETGAVGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQ 498
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 499 GPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGSQ 558
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 559 GPQGPQGNV 567
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/169 (26%), Positives = 64/169 (37%), Gaps = 18/169 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRY 66
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G +G +
Sbjct: 399 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAVGT 458
Query: 67 LGPSG------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
GP G GP G +GP+G + GP G +GP+G G
Sbjct: 459 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGI 518
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 519 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEIGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 567
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/167 (26%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 15/167 (8%)
Query: 51 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
P G+ GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G +G G
Sbjct: 356 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 415
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 161
+G +G G G + GP+G G G G +G + GP G
Sbjct: 416 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAVGTQGPQGVQGIQGTTG 472
Query: 162 ---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G +GP+G + GP G +G + V G+
Sbjct: 473 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGIMGPTGAQGVQGIQ 519
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 8/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 12 GPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPQG---TTGAQGIQ 66
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G +G GP+G G G + G G + G G GP+G G
Sbjct: 67 GAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQ 123
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G G+ G G G SG GP G G G + G G
Sbjct: 124 GIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQ 183
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 184 GIT 186
>gi|384181194|ref|YP_005566956.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
gi|324327278|gb|ADY22538.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar finitimus YBT-020]
Length = 835
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 275
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 69/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G GS+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGSI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 245
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 246 GVQ 248
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 69/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/162 (29%), Positives = 66/162 (40%), Gaps = 9/162 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G LG SG
Sbjct: 124 SIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSG 183
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G +GP+G G G +GP G GP G + +GP+G
Sbjct: 184 LQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQG 243
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G + GP+G GP+ GP+G GP+G
Sbjct: 244 IQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPT------GPTGATGITGPTG 279
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 341 TGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGP 400
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP G G G GP+G G G GP G G
Sbjct: 401 QGVQGVQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGL 460
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
SG GP G GP G +GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 461 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGN---IGPTGSTGIQGVQG---VIGPTGPTGATGPQGIQGI 514
Query: 193 LGLS 196
GL
Sbjct: 515 QGLQ 518
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP G
Sbjct: 167 TGNTGIQGVQGNL---GGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 223
Query: 193 LGLS 196
GL
Sbjct: 224 QGLQ 227
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGVQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQ 458
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G SG GP G GP G + GP+G G G + GP+G G+
Sbjct: 459 GLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGVIGPTGPTGATGPQGIQ 512
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNL 179
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G +GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGSIGPTGPTGIQGVQGVQGEI---GPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 163
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G V
Sbjct: 164 TGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 223
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 224 QGLQ 227
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 4/154 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGVQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQ 458
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G SG GP G GP G + G S G++
Sbjct: 459 GLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTG-STGIQ 491
>gi|407707241|ref|YP_006830826.1| hypothetical protein MC28_4005 [Bacillus thuringiensis MC28]
gi|407384926|gb|AFU15427.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
MC28]
Length = 950
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 65/179 (36%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 385
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 386 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGE 445
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G +GP+G + G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 446 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 504
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/186 (30%), Positives = 67/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 313 DQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 369
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 370 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 429
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G G + GP G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 430 VTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 489
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 490 VQGPQG 495
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G G GP G +GP +G GP
Sbjct: 279 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQ 338
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 339 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 395
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 396 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEG 453
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/173 (30%), Positives = 60/173 (34%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G +
Sbjct: 309 GATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEI 365
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 366 GPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQ 425
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 426 GITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 478
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 65/174 (37%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 334 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 390
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 391 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATG 450
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+GP G +GP+G + G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 451 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 504
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/200 (31%), Positives = 76/200 (38%), Gaps = 10/200 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 239 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQG 297
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 298 IQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQG 354
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 355 VQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQG 414
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G G+ V+G+
Sbjct: 415 PQGIQGIQGVQGITGVTGVQ 434
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 63/180 (35%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G G+ GP G +GP +G+ GP G GPS
Sbjct: 288 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPS 347
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 348 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 404
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 405 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 464
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/199 (29%), Positives = 70/199 (35%), Gaps = 9/199 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG--SLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G G ++ + GP G GP G GP+G G G G
Sbjct: 248 TGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGI 307
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 308 MGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 364
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 365 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 424
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G+ + G+
Sbjct: 425 QGITGVTGVQGETGIQGIQ 443
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/189 (27%), Positives = 65/189 (34%), Gaps = 24/189 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 611 EIGPTGPQGIQGPQG---IQGVTGATGDQGPQG---IQGPQGIQGPTGPQGIQGAQGPQG 664
Query: 72 RLRYLGPSGS------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
G +G+ GP G G G + GP G GP
Sbjct: 665 IQGATGATGAQGPQGIQGIQGIQGPTGPQGPTGIQGVQGEIGPTGPQGVQGLQGPQ---- 720
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G + G G GP+G G +G G G GP+G G G
Sbjct: 721 --GPTGDTGATGAQGPQGIQGPTGITGATGATGLQGIQGAQGPQGIQGPTGATGATGSQG 778
Query: 180 RLRYLGPSG 188
GP+G
Sbjct: 779 STGDTGPTG 787
>gi|195729136|gb|ACG50750.1| VtaA1 [Haemophilus parasuis str. Nagasaki]
Length = 2412
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 75/179 (41%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T T + K G +G GP+G + +GP+G+ GP+G GP G GP
Sbjct: 988 TDNTDSIIKKGEKGDTGPRGETGPAGPIGPVGPAGARGERGPAG---VAGPKGEKGDPGP 1044
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G GP G + GP G G G GP+G +GP G GP+G
Sbjct: 1045 KGETGPTGPRGPVGPQGPQGKAGAQGQKGERGETGPAG---AVGPQGVPGPAGPAGPRGE 1101
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G+ GP+G GP G G +G GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 1102 RGEPGQTGPAGPAGERGERGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAG 1160
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 68/159 (42%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G + +GP+G GP+G GP G GP G GP G + GP G
Sbjct: 1008 ETGPAGPIGPVGPAGARGERGPAG---VAGPKGEKGDPGPKGETGPTGPRGPVGPQGPQG 1064
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
+ G G GP+G +GP G GP+G G G+ GP+G G
Sbjct: 1065 KAGAQGQKGERGETGPAG---AVGPQGVPGPAGPAGPRGERGEPGQTGPAGPAGERGERG 1121
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 1122 PKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAG 1160
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 73/177 (41%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP+G GP G GP G GP G + GP G+ G G
Sbjct: 1018 VGPAGARGERGPAG---VAGPKGEKGDPGPKGETGPTGPRGPVGPQGPQGKAGAQGQKGE 1074
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G++ GP G GP+G G G+ GP+G GP G G
Sbjct: 1075 RGETGPAGAV---GPQGVPGPAGPAGPRGERGEPGQTGPAGPAGERGERGPKGDRGPKGD 1131
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G + GP+G GP+G G G G +G + GP G
Sbjct: 1132 TGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPRGE 1188
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
++ Y + S+ G G GP+G + +GP+G+ GP+G GP G
Sbjct: 984 KITYTDNTDSIIKKGEKGDTGPRGETGPAGPIGPVGPAGARGERGPAG---VAGPKGEKG 1040
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP G GP G + GP G+ G G GP+G +GP G GP+G
Sbjct: 1041 DPGPKGETGPTGPRGPVGPQGPQGKAGAQGQKGERGETGPAG---AVGPQGVPGPAGPAG 1097
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G+ GP+G GP G G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 1098 PRGERGEPGQTGPAGPAGERGERGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGE 1152
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 72/198 (36%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G GP G GP G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 1880 GPQGTAGAQGPKGERGPAGETGPKGEKGDPGPKGET---GPTGPVGPAGPAGERGEQGPR 1936
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL--------- 121
G GP+G GP+G G G G +G +GP+G
Sbjct: 1937 GEQGATGPAGPAGPRGPAGAAGPKGDKGDTGQKGETGPAGPVGPTGPQGAPGPAGPAGPA 1996
Query: 122 ---GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 1997 GERGPTGPKGDAGPKGDTGQKGETG---PAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPTGPTGPQGPQ 2053
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G + +S
Sbjct: 2054 GTAGIQGPKGERGNVSVS 2071
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/181 (31%), Positives = 72/181 (39%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G + GP G G G GP+G++ GP G GP+G
Sbjct: 1043 GPKGETGPTGPRGPVGPQGPQGKAGAQGQKGERGETGPAGAV---GPQGVPGPAGPAGPR 1099
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G GP G G +G GP+G + GP+G + GP+
Sbjct: 1100 GERGEPGQTGPAGPAGERGERGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPA 1159
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRY----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G G G +G + GP G LR GP G GP G + GP
Sbjct: 1160 GPKGDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPRGEQGLRGERGPAGPRGETGLTGPRGPVGPQGPQ 1219
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 1220 G 1220
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 71/193 (36%), Gaps = 33/193 (17%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL--------- 64
GP+G GP+G P+G+ GP G+ GP+G G G
Sbjct: 1802 GPAGERGETGPAG------PTGAKGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPRGERGETGPAGAAGPA 1855
Query: 65 ------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP+G GP+G + GP G GP G GP G GP
Sbjct: 1856 GPAGAVGPQGPTG---ATGPAGPVGPRGPQGTAGAQGPKGERGPAGETGPKGEKGDPGPK 1912
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP+G + GP+G GP G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 1913 GE---TGPTGPVGPAGPAGERGEQGPRGEQGATGPAGPAGPRGPAG---AAGPKGDKGDT 1966
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G
Sbjct: 1967 GQKGETGPAGPVG 1979
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/210 (26%), Positives = 76/210 (36%), Gaps = 54/210 (25%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---------------GPSGRLR 65
GP+G+ GP G GP G GP+G + + GP+G
Sbjct: 1749 EAGPAGATGPQGPKGDNGAPGPRGEKGEPGPAGPIGPVGPAGAAGPAGPAGERGPAGERG 1808
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------------RLR 101
GP+G P+G+ GP G+ GP+G +
Sbjct: 1809 ETGPAG------PTGAKGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPRGERGETGPAGAAGPAGPAGAVG 1862
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G GP+G + GP G + GP G GP G GP G G
Sbjct: 1863 PQGPTG---ATGPAGPVGPRGPQGTAGAQGPKGERGPAGETGPKGEKGDPGPKGE---TG 1916
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G + GP+G GP G GP+G
Sbjct: 1917 PTGPVGPAGPAGERGEQGPRGEQGATGPAG 1946
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/181 (30%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ G G GP+G++ GP G GP+G G G+ GP+G
Sbjct: 1061 GPQGKAGAQGQKGERGETGPAGAV---GPQGVPGPAGPAGPRGERGEPGQTGPAGPAGER 1117
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP+G + GP+G GP+G G G + G +
Sbjct: 1118 GERGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEA 1177
Query: 134 GRLRYLGPSGR--LRY----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G LR GP G GP G + GP G G G GP+
Sbjct: 1178 GPMGPQGPRGEQGLRGERGPAGPRGETGLTGPRGPVGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPA 1237
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 1238 G 1238
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/172 (31%), Positives = 70/172 (40%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G+ GP+G GP G G +G GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 1103 GEPGQTGPAGPAGERGERGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPK 1162
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRY----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G G +G + GP G LR GP G GP G + GP G
Sbjct: 1163 GDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPRGEQGLRGERGPAGPRGETGLTGPRGPVGPQGPQGTP 1222
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ G G GP+G GP G GP+G + GP+G GP+G
Sbjct: 1223 GTPGQKGDKGDPGPAG---PAGPRGERGETGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAG 1271
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 30/182 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGSLRY 57
GP+G GP G GP+G G G GP+G+
Sbjct: 1813 AGPTGAKGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPRGERGETGPAGAAGPAGPAGAVGPQGPTGA--- 1869
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G + GP G GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 1870 TGPAGPVGPRGPQGTAGAQGPKGE---RGPAGE---TGPKGEKGDPGPKGE---TGPTGP 1920
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ GP+G GP G GP+G GP+G GP G G G GP
Sbjct: 1921 VGPAGPAGERGEQGPRGEQGATGPAGPAGPRGPAG---AAGPKGDKGDTGQKGETGPAGP 1977
Query: 178 SG 179
G
Sbjct: 1978 VG 1979
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.63, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/171 (29%), Positives = 61/171 (35%), Gaps = 21/171 (12%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A GP G GP G GP+G + GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 1897 AGETGPKGEKGDPGPKGET---GPTGPVGPAGPAGERGEQGPRGEQGATGPAGPAGPRGP 1953
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------------GPSGRLRYLGPSGR 117
+G G G G +G +GP+G GP+G GP G
Sbjct: 1954 AGAAGPKGDKGDTGQKGETGPAGPVGPTGPQGAPGPAGPAGPAGERGPTGPKGDAGPKGD 2013
Query: 118 LRY------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 2014 TGQKGETGPAGPAGAKGEPGPRGEQGIQGPTGPTGPQGPQGTAGIQGPKGE 2064
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/189 (29%), Positives = 70/189 (37%), Gaps = 33/189 (17%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------- 73
GP+G GP+G P+G GP G GP+G G G
Sbjct: 1802 GPAGERGETGPAG------PTGAKGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPRGERGETGPAGAAGPA 1855
Query: 74 ------RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ GP+G + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 1856 GPAGAVGPQGPTGA---TGPAGPVGPRGPQGTAGAQGPKGE---RGPAGE---TGPKGEK 1906
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G + GP+G GP G GP+G GP+G G
Sbjct: 1907 GDPGPKGE---TGPTGPVGPAGPAGERGEQGPRGEQGATGPAGPAGPRGPAGAAGPKGDK 1963
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 1964 GDTGQKGET 1972
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/208 (27%), Positives = 74/208 (35%), Gaps = 45/208 (21%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYL---------------GPSGRLRYLGPSGSLRYL 58
GP G GP G GP+G + + GP+G GP+
Sbjct: 1760 GPKGDNGAPGPRGEKGEPGPAGPIGPVGPAGAAGPAGPAGERGPAGERGETGPA------ 1813
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------------RYLGPSGRLRYL 103
GP+G GP G+ GP+G G G GP+G
Sbjct: 1814 GPTGAKGEQGPEGKQGIQGPAGPAGPRGERGETGPAGAAGPAGPAGAVGPQGPTG---AT 1870
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP+G + GP G GP G GP G GP G GP+G + GP+
Sbjct: 1871 GPAGPVGPRGPQGTAGAQGPKGERGPAGETGPKGEKGDPGPKGE---TGPTGPVGPAGPA 1927
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 1928 GERGEQGPRGEQGATGPAGPAGPRGPAG 1955
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G GP+G + GP+G GP+G G G G +G +
Sbjct: 1121 GPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEAGPM 1180
Query: 74 RYLGPSGS--LRY----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G LR GP G GP G + GP G G G GP+G
Sbjct: 1181 GPQGPRGEQGLRGERGPAGPRGETGLTGPRGPVGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAGPA 1240
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G + GP+G GP+G G G G +G + GP
Sbjct: 1241 ---GPRGERGETGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPR 1297
Query: 188 GR 189
G
Sbjct: 1298 GE 1299
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/207 (27%), Positives = 69/207 (33%), Gaps = 39/207 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G GP G GP G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 1490 GPQGTAGAQGPKGERGPAGETGPKGEKGDPGPKGET---GPTGPVGPAGPAGERGEQGPR 1546
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------- 120
G GP+G GP G GP G G G+ G G+
Sbjct: 1547 GEQGATGPAGP---TGPRGEPGPTGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGQAGPAGPRGPAGAA 1603
Query: 121 -----------------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G G G +GP+G GP G GP+G
Sbjct: 1604 GPAGPAGPRGDRGETGPAGPTGAKGEQGQKGDTGPMGPAGPKGDAGPRGE---AGPAGAT 1660
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP+G +
Sbjct: 1661 GPQGPKGDNGATGPRGEKGEPGPAGPI 1687
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G +GP G GP+G G G+ GP+G GP G G +G
Sbjct: 1076 GETGPAGAVGPQGVPGPAGPAGPRGERGEPGQTGPAGPAGERGERGPKGDRGPKGDTGER 1135
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
GP+G + GP+G GP+G G G G +G + GP G
Sbjct: 1136 GATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPRGEQGLRGER 1195
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP G + GP G G G GP+G GP G GP+
Sbjct: 1196 GPAGPRGETGLTGPRGPVGPQGPQGTPGTPGQKGDKGDPGPAG---PAGPRGERGETGPA 1252
Query: 188 GRL 190
G +
Sbjct: 1253 GPM 1255
>gi|423449317|ref|ZP_17426196.1| hypothetical protein IEC_03925 [Bacillus cereus BAG5O-1]
gi|423541787|ref|ZP_17518178.1| hypothetical protein IGK_03879 [Bacillus cereus HuB4-10]
gi|401128369|gb|EJQ36062.1| hypothetical protein IEC_03925 [Bacillus cereus BAG5O-1]
gi|401170553|gb|EJQ77792.1| hypothetical protein IGK_03879 [Bacillus cereus HuB4-10]
Length = 953
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 282 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQ 341
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 342 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 398
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 399 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEG 456
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 311 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 367
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 368 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 427
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 428 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 481
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 67/197 (34%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 316 DQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 372
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 373 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 432
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 433 ATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGIQGIQG 486
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 487 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 503
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP G G P G GPS
Sbjct: 291 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPS 350
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 407
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 408 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 467
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 332 TGVTGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 388
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 389 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGE 448
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 449 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 508
Query: 190 L 190
Sbjct: 509 T 509
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/190 (31%), Positives = 72/190 (37%), Gaps = 10/190 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 242 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQG 300
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G +G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 301 IQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQG 357
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 358 VQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQG 417
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 418 PQGIQGIQGV 427
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 273 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 332
Query: 92 RYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G P G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 333 GVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 389
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 390 GPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 446
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 337 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 393
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 394 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 453
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 454 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 509
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 21/183 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 234 TGPTGATGNTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 291
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP G G P G GPSG
Sbjct: 292 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG 351
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP G GP G +GP+ GP G GP G GP G G
Sbjct: 352 ---ATGPQGVQGIQGPMGE---IGPT------GPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEG 399
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 400 PQG 402
>gi|423463597|ref|ZP_17440365.1| hypothetical protein IEK_00784 [Bacillus cereus BAG6O-1]
gi|402421366|gb|EJV53621.1| hypothetical protein IEK_00784 [Bacillus cereus BAG6O-1]
Length = 953
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 282 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQ 341
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 342 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 398
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 399 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEG 456
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 311 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 367
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 368 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 427
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 428 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 481
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 67/197 (34%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 316 DQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 372
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 373 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 432
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 433 ATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGIQGIQG 486
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 487 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 503
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP G G P G GPS
Sbjct: 291 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPS 350
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 407
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 408 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 467
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 332 TGVTGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 388
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 389 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGE 448
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 449 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 508
Query: 190 L 190
Sbjct: 509 T 509
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/190 (31%), Positives = 72/190 (37%), Gaps = 10/190 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 242 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQG 300
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G +G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 301 IQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQG 357
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 358 VQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQG 417
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 418 PQGIQGIQGV 427
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 273 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 332
Query: 92 RYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G P G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 333 GVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 389
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 390 GPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 446
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 337 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 393
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 394 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 453
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 454 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 509
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 21/183 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 234 TGPTGATGNTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 291
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP G G P G GPSG
Sbjct: 292 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG 351
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP G GP G +GP+ GP G GP G GP G G
Sbjct: 352 ---ATGPQGVQGIQGPMGE---IGPT------GPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEG 399
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 400 PQG 402
>gi|423440533|ref|ZP_17417439.1| hypothetical protein IEA_00863 [Bacillus cereus BAG4X2-1]
gi|423532949|ref|ZP_17509367.1| hypothetical protein IGI_00781 [Bacillus cereus HuB2-9]
gi|402418996|gb|EJV51281.1| hypothetical protein IEA_00863 [Bacillus cereus BAG4X2-1]
gi|402464478|gb|EJV96170.1| hypothetical protein IGI_00781 [Bacillus cereus HuB2-9]
Length = 953
Score = 51.6 bits (122), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 282 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQ 341
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 342 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 398
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 399 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEG 456
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 311 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 367
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 368 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 427
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 428 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 481
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 67/197 (34%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 316 DQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 372
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 373 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 432
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 433 ATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGIQGIQG 486
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 487 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 503
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/180 (30%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP G G P G GPS
Sbjct: 291 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPS 350
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 407
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 408 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 467
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/190 (31%), Positives = 72/190 (37%), Gaps = 10/190 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 242 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQG 300
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G +G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 301 IQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQG 357
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 358 VQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQG 417
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 418 PQGIQGIQGV 427
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 273 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 332
Query: 92 RYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G P G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 333 GVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 389
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 390 GPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 446
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 337 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 393
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 394 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 453
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP
Sbjct: 454 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGP 505
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 21/183 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 234 TGPTGATGNTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 291
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP G G P G GPSG
Sbjct: 292 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG 351
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP G GP G +GP+ GP G GP G GP G G
Sbjct: 352 ---ATGPQGVQGIQGPMGE---IGPT------GPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEG 399
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 400 PQG 402
>gi|206968668|ref|ZP_03229623.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus AH1134]
gi|206735709|gb|EDZ52867.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus AH1134]
Length = 709
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGP 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 107 IGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGL 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 167 QGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGI 226
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 227 QGV 229
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 90 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPT 149
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---L 148
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G
Sbjct: 150 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 209
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 210 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 257
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/171 (28%), Positives = 68/171 (39%), Gaps = 3/171 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 92 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 151
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 152 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 211
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 189
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 212 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTGS 262
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/171 (28%), Positives = 68/171 (39%), Gaps = 3/171 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 92 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 151
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 152 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 211
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 180
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 212 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTGS 262
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 88
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 89 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGP 148
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP G
Sbjct: 149 TGNTGIQGVQGNL---GGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 205
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 206 QGL 208
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.76, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/201 (27%), Positives = 72/201 (35%), Gaps = 24/201 (11%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G L GP G G SG GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 318 GSLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPT--- 374
Query: 77 GPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G+ GP G G G + GP+G G +G GP+
Sbjct: 375 GPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGST---GPT 431
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G + GP+G GP G GP G G +G GP G G G
Sbjct: 432 GATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQG---IQGIQGSQGIT 485
Query: 185 GPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G++ + G+
Sbjct: 486 GPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 506
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/173 (29%), Positives = 61/173 (35%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
SG GP G GP G + G +G GP G G +G G G
Sbjct: 335 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGP 394
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G G G + GP+G G +G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 395 TGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS---TGPTGATGATGPTGVTGPQGPQG- 450
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G +G GP G G G G +G GP G
Sbjct: 451 --IQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQG 501
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 62/166 (37%), Gaps = 6/166 (3%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGP 106
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
+ GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G LG
Sbjct: 107 I---GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGG 163
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
SG G G +GP+G G G +G V GL
Sbjct: 164 SGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 209
>gi|432862586|ref|XP_004069928.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain-like [Oryzias latipes]
Length = 494
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 72/185 (38%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G + G G +GP G+ +G GS +GP G GP G
Sbjct: 20 GPQGEIGAQGPKGKMGLKGAKGD---IGPQGQKGQMGSKGSKGEMGPKGLKGQTGPQGPK 76
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLNSD 130
GP G GPS GP G + G G GP G + G G +
Sbjct: 77 GETGPQGP---PGPSENKGAQGPKGDIGPKGAKGAKGQQGPKGEMGEKGLKGLPGLSGTP 133
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + GP+G + G G GP G GP+G G G L GP+G +
Sbjct: 134 GAKGDMGPQGPTGDVGQQGQKGDTGPQGPKGNEGSQGPTGTPGNPGLKGDLGPPGPTGDM 193
Query: 191 RYLGL 195
GL
Sbjct: 194 GLQGL 198
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP GS G G+ GP G + GP G + G G +GP G+ +G GS
Sbjct: 1 MGPKGSNGIPGMCGTPGPQGPQGEIGAQGPKGKMGLKGAKGD---IGPQGQKGQMGSKGS 57
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+GP G GP G GP G GPS GP G + G G GP
Sbjct: 58 KGEMGPKGLKGQTGPQGPKGETGPQG---PPGPSENKGAQGPKGDIGPKGAKGAKGQQGP 114
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + G G G G +GP G +G G+ GP G
Sbjct: 115 KGEMGEKGLKGLPGLSGTPGAKGDMGPQGPTGDVGQQGQKGDTGPQG 161
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G+ +G GS +GP G GP G GP G GPS GP G
Sbjct: 42 DIGPQGQKGQMGSKGSKGEMGPKGLKGQTGPQGPKGETGPQGPP---GPSENKGAQGPKG 98
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
+ G G+ GP G + G G G G +GP G +G G+
Sbjct: 99 DIGPKGAKGAKGQQGPKGEMGEKGLKGLPGLSGTPGAKGDMGPQGPTGDVGQQGQKGDTG 158
Query: 130 -DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G G G L GP+G + G G G G + G G
Sbjct: 159 PQGPKGNEGSQGPTGTPGNPGLKGDLGPPGPTGDMGLQGLKGDKGAKGQKGEIGEKGTKG 218
Query: 189 RLRYLGL 195
L +G+
Sbjct: 219 DLGPMGV 225
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 61/159 (38%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP GS G G GP G + GP G++ G G + GP G +G G
Sbjct: 1 MGPKGSNGIPGMCGTPGPQGPQGEIGAQGPKGKMGLKGAKGDI---GPQGQKGQMGSKGS 57
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+GP G GP G GP G GPS + GP G + G G GP
Sbjct: 58 KGEMGPKGLKGQTGPQGPKGETGPQG---PPGPSENKGAQGPKGDIGPKGAKGAKGQQGP 114
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G + G G G G +GP G +G G+
Sbjct: 115 KGEMGEKGLKGLPGLSGTPGAKGDMGPQGPTGDVGQQGQ 153
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/129 (31%), Positives = 50/129 (38%), Gaps = 6/129 (4%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP G G G+ GP G + GP G++ G G +GP G+ +G G
Sbjct: 1 MGPKGSNGIPGMCGTPGPQGPQGEIGAQGPKGKMGLKGAKGD---IGPQGQKGQMGSKGS 57
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP G GP G GP G GPS GP G + G G GP
Sbjct: 58 KGEMGPKGLKGQTGPQGPKGETGPQG---PPGPSENKGAQGPKGDIGPKGAKGAKGQQGP 114
Query: 187 SGRLRYLGL 195
G + GL
Sbjct: 115 KGEMGEKGL 123
>gi|332291184|ref|YP_004429793.1| collagen triple helix repeat-containing protein [Krokinobacter sp.
4H-3-7-5]
gi|332169270|gb|AEE18525.1| Collagen triple helix repeat-containing protein [Krokinobacter sp.
4H-3-7-5]
Length = 454
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/179 (29%), Positives = 73/179 (40%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G +G+ GP+G+ G +G G G+ GP G G +G
Sbjct: 106 VGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGA 165
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G+ G +G + GP+G G +G +GP G GP G +
Sbjct: 166 TGPQGPAGADGATGATGAIGPQGPAGADGATGATGPQGPIGPKGTDGATGATGPQGPAGA 225
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
DG +G G +G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 226 DGATGATGPQGDTGPQGPTGATGADGATGPAGPTGAQGPVGPQGPAGPTGAQGVEGPQG 284
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G+ G +G G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 116 GATGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGAD 175
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G++ GP+G G +G +GP G G +G G G + GP
Sbjct: 176 GATGATGAIGPQGPAGADGATGATGPQGPIGPKGTDGATGATGPQGPAGADGATGATGPQ 235
Query: 134 GRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP+G GP+G GP G GP+G GP G +GPSG
Sbjct: 236 GDTGPQGPTGATGADGATGPAGPTGAQGPVGPQGPAGPTGAQGVEGPQGP---VGPSGT 291
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/172 (26%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ Y + + +G G G G+ GP G G +G GP+G+
Sbjct: 88 NGTATYTNENNTAVTVGIVGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGA 147
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G +G G G GP G G +G +GP G +DG +G GP
Sbjct: 148 TGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGAIGPQGPAGADGATGATGPQGP--- 204
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP G G +G G G GP G GP+G G +
Sbjct: 205 ---IGPKGTDGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGDTGPQGPTGATGADGAT 253
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/182 (26%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G Y + + +G G G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 88 NGTATYTNENNTAVTVGIVGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGA 147
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRL-- 127
G +G G G GP G G +G +GP G GP G +
Sbjct: 148 TGATGPQGPAGADGATGATGPQGPAGADGATGATGAIGPQGPAGADGATGATGPQGPIGP 207
Query: 128 -NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+DG +G GP+G G +G GP G G G GP+G +GP
Sbjct: 208 KGTDGATGATGPQGPAGADGATGATGPQGDTGPQGPTGATGADGATGPAGPTGAQGPVGP 267
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 268 QG 269
>gi|91793279|ref|YP_562930.1| triple helix repeat-containing collagen [Shewanella denitrificans
OS217]
gi|91715281|gb|ABE55207.1| Collagen triple helix repeat [Shewanella denitrificans OS217]
Length = 466
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/152 (32%), Positives = 63/152 (41%), Gaps = 1/152 (0%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
TFG+ A+ LGP G GP G +G +G G +G +GP+G GP
Sbjct: 229 TFGSDCA-SAIGLGPRGEQGAQGPKGPAGIMGEAGPRGLQGATGDQGAMGPAGEAGPQGP 287
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G + +G G G +GS G +G GP GR+ GP G + GPSG
Sbjct: 288 RGDIGPIGNQGVKGANGANGSDGVNGLAGATGAKGPQGRVGATGPQGDIGATGPSGPKGV 347
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G G GP G GP G G +G
Sbjct: 348 TGLRGEQGDTGPRGDAGAQGPVGARGSTGATG 379
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/140 (31%), Positives = 57/140 (40%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
LGP G GP G +G +G G +G +GP+G GP G + +G G
Sbjct: 240 LGPRGEQGAQGPKGPAGIMGEAGPRGLQGATGDQGAMGPAGEAGPQGPRGDIGPIGNQGV 299
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G G +G + GP GR+ GP G + GPSG G G GP
Sbjct: 300 KGANGANGSDGVNGLAGATGAKGPQGRVGATGPQGDIGATGPSGPKGVTGLRGEQGDTGP 359
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G
Sbjct: 360 RGDAGAQGPVGARGSTGATG 379
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.077, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/111 (32%), Positives = 47/111 (42%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
LGP G GP G +G +G G +G +GP+G GP G + +G G
Sbjct: 240 LGPRGEQGAQGPKGPAGIMGEAGPRGLQGATGDQGAMGPAGEAGPQGPRGDIGPIGNQGV 299
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G G +G GP GR+ GP G + GPSG GL
Sbjct: 300 KGANGANGSDGVNGLAGATGAKGPQGRVGATGPQGDIGATGPSGPKGVTGL 350
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/121 (32%), Positives = 49/121 (40%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G +GP+G GP G + +G G G +GS G +G GP GR+
Sbjct: 268 GATGDQGAMGPAGEAGPQGPRGDIGPIGNQGVKGANGANGSDGVNGLAGATGAKGPQGRV 327
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLNSD 130
GP G + GPSG G G GP G GP G G +GR D
Sbjct: 328 GATGPQGDIGATGPSGPKGVTGLRGEQGDTGPRGDAGAQGPVGARGSTGATGANGRRGID 387
Query: 131 G 131
G
Sbjct: 388 G 388
>gi|423411478|ref|ZP_17388598.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|401107240|gb|EJQ15192.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG3O-2]
Length = 776
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 306 QGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 422
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 423 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 447
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 68/194 (35%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 367
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 368 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 428 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQG 481
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 482 VQGIQGATGAQGVQ 495
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 239 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 412
Query: 189 RL 190
Sbjct: 413 AT 414
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 333 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 389
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 390 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 449
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 450 IGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 509
Query: 190 L 190
Sbjct: 510 T 510
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP G GP G GP
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 SG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/168 (30%), Positives = 60/168 (35%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 349 GPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 405
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 406 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQ 465
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 466 GE---IGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 56/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/196 (27%), Positives = 65/196 (33%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 574 TGVTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 633
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 634 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 693
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQ 769
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---Y 57
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGP 699
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 700 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGP 759
Query: 178 SG 179
G
Sbjct: 760 QG 761
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.98, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 637 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 693
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 190 L 190
Sbjct: 754 T 754
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/179 (32%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 19/179 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 97 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGP 148
Query: 133 SGRLRYLG-P--SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G P +G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 149 QGIQGVQGLPGVTGPQGIQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
>gi|414563446|ref|YP_006042407.1| collagen-like protein with amino-end fibronectin-binding domain
SclZ.6 [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC
35246]
gi|338846511|gb|AEJ24723.1| collagen-like protein with amino-end fibronectin-binding domain
SclZ.6 [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC
35246]
Length = 223
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/117 (34%), Positives = 41/117 (35%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A + GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 3 AGSKGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGP 62
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 63 QGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 39/113 (34%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 7 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 66
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 67 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 39/113 (34%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 7 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 66
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 67 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 39/113 (34%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 7 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 66
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 67 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 39/113 (34%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 7 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 66
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 67 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 39/113 (34%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 7 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 66
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 67 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 39/113 (34%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 7 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 66
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 67 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 39/113 (34%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 7 GPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGER 66
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 67 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 119
>gi|384188802|ref|YP_005574698.1| hypothetical protein CT43_CH4748 [Bacillus thuringiensis serovar
chinensis CT-43]
gi|326942511|gb|AEA18407.1| hypothetical protein CT43_CH4748 [Bacillus thuringiensis serovar
chinensis CT-43]
Length = 885
Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 68/193 (35%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G G GP G +GP G G P
Sbjct: 265 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 324
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 325 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPE 381
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 382 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQ 441
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G+ + +G
Sbjct: 442 GVQGVQGAIGPTG 454
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G +GP G+ +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 295 GATGDQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQ 345
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G GP G
Sbjct: 346 GPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQ 405
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 406 GIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAIGPTGPMGTQGVQGIQ 465
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 63/174 (36%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 299 DQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 349
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 350 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 409
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G G G G + GP G G G + GP G G
Sbjct: 410 VQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAIGPTGPMGTQGVQG 463
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 369
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 370 GVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 429
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 430 GEIGATGPEGPQGVQGVQGAIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 489
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 490 G 490
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 57/158 (36%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 336 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 395
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 396 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAI---GP 452
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 TGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 490
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G G GP G +GP G+
Sbjct: 256 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGA- 314
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 315 -----TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQ 366
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP+G GP G GP G GP G G G G +
Sbjct: 367 GIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQ 426
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 427 GIQ 429
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 19/164 (11%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQ---GPQG-LR--GPQGETGATGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL---GPSGR 144
G GP +GP+G G G GP G +GP G G +G
Sbjct: 92 QGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGP 145
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 146 QGIQGAQGVQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 185
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/158 (32%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 13/158 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGV 94
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G + GP G G G GP G + G
Sbjct: 95 QGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGPQGIQGAQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QG---TQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 185
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/142 (31%), Positives = 52/142 (36%), Gaps = 9/142 (6%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G GP G GP G + GP G+ GP G LR GP G GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGP 91
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP G + G G G G + GP G G G GP G
Sbjct: 92 QGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGATGPQG---I 148
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GPSG G +
Sbjct: 149 QGAQGVQGTQGPSGNTGATGAT 170
>gi|229105358|ref|ZP_04236005.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-28]
gi|228678070|gb|EEL32300.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-28]
Length = 937
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 59/175 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G G
Sbjct: 293 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQ 352
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G GP G + GP G GP G GP G +GP
Sbjct: 353 GIQGVPGPEGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQ 412
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 413 GIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEG 467
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/172 (29%), Positives = 57/172 (33%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP G +GP G G G G G GP G GP G +
Sbjct: 322 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPEGATGPQGVQGIQGPMGDIGP 381
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 382 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 441
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 442 TGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQ 493
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 66/194 (34%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G +G+ GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 327 DQGPQGIQGAIGPQGV------TGATGDQGPQGIQGVPGPEGA---TGPQGVQGIQGPMG 377
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 378 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 437
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 438 VQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQG 491
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 492 IQGIQGATGAQGVQ 505
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 62/184 (33%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G G G GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 337 IGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPEGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGI 396
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 397 QGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGI 456
Query: 133 SGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP
Sbjct: 457 QGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGP 516
Query: 187 SGRL 190
+G
Sbjct: 517 TGAT 520
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 57/174 (32%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 284 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 343
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G G G GP G GP G + GP G GP G GP
Sbjct: 344 GATGDQGPQGIQGVPGPEGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPV 403
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 404 GATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 457
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/191 (30%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 10/191 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 253 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQG 311
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G +G+ GP G +GP +G GP G GP G GP G
Sbjct: 312 IQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPEG---ATGPQG 368
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 369 VQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQG 428
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G+
Sbjct: 429 PQGIQGIQGVQ 439
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 60/181 (33%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 284 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 343
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G G G GP G GP G + GP G GP G GP
Sbjct: 344 GATGDQGPQGIQGVPGPEGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPV 403
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP G GP G GP G G G G G G+ + +
Sbjct: 404 GATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAT 463
Query: 203 G 203
G
Sbjct: 464 G 464
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 245 TGPTGATGNTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 302
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G G G +G GP G +GP G G G G G
Sbjct: 303 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPEG 362
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 363 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 422
Query: 189 RL 190
Sbjct: 423 AT 424
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 63/176 (35%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GP G+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 348 DQGPQGIQGVPGPEGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 404
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 405 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 464
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 465 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 520
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/134 (32%), Positives = 53/134 (39%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G++ GP G+ GP
Sbjct: 49 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGQIGATGPEGQ---QGP 105
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G G G GP G +G G G G + + GP G
Sbjct: 106 QG-LR--GPQGETGATGLQGVQGLQGPIGPTGPIGVQGIQGVQGLQGPIGATGPEGSQGI 162
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSG 152
G G GP G
Sbjct: 163 QGVQGIPGATGPQG 176
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 51/134 (38%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 49 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGQIGATGPEGQ---QGP 105
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G G +G G G +GP+G + G G GP + GP G
Sbjct: 106 QGLRGPQGETGATGLQGVQGLQGPIGPTGPIGVQGIQGVQGLQGP---IGATGPEGSQGI 162
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSG 170
G G GP G
Sbjct: 163 QGVQGIPGATGPQG 176
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/131 (30%), Positives = 51/131 (38%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP G
Sbjct: 52 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGQIGATGPEGQ---QGPQGL 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G +GP+G + G G GP + GP G G
Sbjct: 109 RGPQGETGATGLQGVQGLQGPIGPTGPIGVQGIQGVQGLQGP---IGATGPEGSQGIQGV 165
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
G GP G
Sbjct: 166 QGIPGATGPQG 176
>gi|229197470|ref|ZP_04324197.1| Multiple banded antigen [Bacillus cereus m1293]
gi|228586094|gb|EEK44185.1| Multiple banded antigen [Bacillus cereus m1293]
Length = 365
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/193 (27%), Positives = 75/193 (38%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G + G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 69 EIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGPMGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPG 125
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 126 PIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSG 185
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 186 LQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQG 245
Query: 192 YLGLSDGLRVSGL 204
G+ + +GL
Sbjct: 246 IQGVQGVIGPTGL 258
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G +GP+G GP G + G G + GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGPMGERGPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGD---LGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 193 LGLS 196
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.069, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 60/157 (38%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G +GP+G GP G + G G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGP 90
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 91 MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/199 (28%), Positives = 73/199 (36%), Gaps = 15/199 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G +GP+G GP G + G G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGP 90
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+ GP G G G GP+G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 91 MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G G
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGI 210
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G + V GL
Sbjct: 211 QGEQGPMGPTGATGVQGLQ 229
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 65/175 (37%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G G G + GP+G G G + GP+G + G G + GP
Sbjct: 38 GPTGPQGIQGVQGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQGFQGSQGPMGERGPQ 97
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 98 GIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQ 157
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G + GP+G G G L G G G G + GP+G G
Sbjct: 158 GVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQG 212
>gi|222096819|ref|YP_002530876.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus Q1]
gi|221240877|gb|ACM13587.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 837
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 69/168 (41%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP+G G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQ 229
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + GP+G G G + +GP+G GP+G G++
Sbjct: 230 GPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPIGPTGLQGDPGPTGSTGPTGVT 277
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 248 GV 249
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 71/176 (40%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G G G + +GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPIGPTGLQGDPGPTGS---TGPTG---VTGPTG 281
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/161 (29%), Positives = 60/161 (37%), Gaps = 3/161 (1%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGVTGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + GP+G G G GP+G G+
Sbjct: 476 GIQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATGLQGI 513
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G G G + GP+G G G + G +G GP G + G + +
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/171 (29%), Positives = 63/171 (36%), Gaps = 3/171 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGVTGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G + G +G GP G GP+G G G GP+
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEGP---TGPTGATGLQGIQGIQGPQGPT 523
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGDL---GNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 226 QGL 228
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 61/166 (36%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGVTGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G + GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 481 QGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATGLQGIQGIQGPQGPT 523
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 4/154 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G+ G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGLTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGVTGPT 400
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQ 460
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G SG GP G GP G + G S G++
Sbjct: 461 GLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTG-STGIQ 493
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G +GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEI---GPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 165
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G + V
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 225
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 150
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDL 181
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.99, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/188 (29%), Positives = 69/188 (36%), Gaps = 18/188 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G SG GP G GP G + GP+GS G G GP+G
Sbjct: 451 TGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGA 507
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G GP+G GP+G G +G GP+G+
Sbjct: 508 TGLQGIQGIQGPQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGST---GPTGQAGA 564
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G GP G G +G+ G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 565 TGPTGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGA 624
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 625 TGPTGPQG 632
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 62/157 (39%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G G +GS GP+G+ GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 541 TGPTGPQGIQGITGST---GPTGQAGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGE 594
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G GP G G +G + GP+G GP G G +G +G
Sbjct: 595 TGATGSQGPQGIQGPQGITGPTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGATGATGVIGA 654
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G G G +GR GP+G GL+
Sbjct: 655 TGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGATGPTGLT 688
>gi|162450670|ref|YP_001613037.1| hypothetical protein sce2398 [Sorangium cellulosum So ce56]
gi|161161252|emb|CAN92557.1| hypothetical protein sce2398 [Sorangium cellulosum So ce56]
Length = 435
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 84/187 (44%), Gaps = 4/187 (2%)
Query: 3 GTCVVEKALNL--GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
G V++++ N SG +GP+G GP+G GP+G GP G+ GP
Sbjct: 144 GRVVIDESGNWVGDSSGIAGPMGPAGPTGPQGPTGPDGPTGPTGPEGPTGPVGATGPEGP 203
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G G G + GP G +GP G + +GP G + GP G + GP G
Sbjct: 204 AGPAGPPGERGPMGPEGPMGPQGPIGPEGPMGPMGPEGPMGPEGPEGPMGPEGPMGPEGP 263
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRLRYLGPS 178
+GP G + +GP G GP G GP+G + + +G + + G S ++GP
Sbjct: 264 MGPEGPMGPEGPMGPEGPTGPVGATGPQGPTGVVATIAIAGNMAPTFDGGSSAYVFVGPP 323
Query: 179 GRLRYLG 185
G + G
Sbjct: 324 GSVTITG 330
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/169 (30%), Positives = 77/169 (45%), Gaps = 8/169 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP+G GP+G GP+G GP G GP+G G G + GP G
Sbjct: 165 MGPAGPTGPQGPTGPDGPTGPTGPEGPTGPVGATGPEGPAGPAGPPGERGPMGPEGPMGP 224
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+GP G + +GP G +GP G +GP G + +GP G +GP G + GP
Sbjct: 225 QGPIGPEGPMGPMGPEGP---MGPEGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGP 281
Query: 151 SGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G + GP+G + + +G + + G S ++GP G + G
Sbjct: 282 TGPVGATGPQGPTGVVATIAIAGNMAPTFDGGSSAYVFVGPPGSVTITG 330
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/148 (31%), Positives = 67/148 (45%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
SG +GP+G GP+G GP+G GP G+ GP+G G G +
Sbjct: 159 SGIAGPMGPAGPTGPQGPTGPDGPTGPTGPEGPTGPVGATGPEGPAGPAGPPGERGPMGP 218
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G +GP G + +GP G + +GP G + GP G +GP G + GP G
Sbjct: 219 EGPMGPQGPIGPEGPMGPMGPEGPMGPEGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGPMGP 278
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G + + +G +
Sbjct: 279 EGPTGPVGATGPQGPTGVVATIAIAGNM 306
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/139 (31%), Positives = 61/139 (43%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+GP+G GP+G GP+G GP G GP+G G G + GP G
Sbjct: 165 MGPAGPTGPQGPTGPDGPTGPTGPEGPTGPVGATGPEGPAGPAGPPGERGPMGPEGPMGP 224
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP G + GP G + GP G + GP G +GP G + GP G GP
Sbjct: 225 QGPIGPEGPMGPMGPEGPMGPEGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGPMGPEGPTGP 284
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G + + ++
Sbjct: 285 VGATGPQGPTGVVATIAIA 303
>gi|255308397|ref|ZP_05352568.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile ATCC 43255]
Length = 684
Score = 51.2 bits (121), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/173 (27%), Positives = 72/173 (41%), Gaps = 13/173 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP+G+ +G GP+G G +G GP+G G +G+
Sbjct: 99 GPTGATGATGPTGATGAIG----FGVTGPTGPTGATGATGADGVTGPTGP---TGATGAD 151
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G GP+G +G +G +GP+G + G +G +G +
Sbjct: 152 GITGPTGATGATG-FGVTGPTGPTGATG-VGVTGATGLIGPTGATGTPGATGPTGAIGAT 209
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP+G G G GP+G G G GP+G G
Sbjct: 210 G-IGITGPTGATGATGADGATGVTGPTGATGATGADG---VTGPTGATGATGF 258
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/155 (27%), Positives = 64/155 (41%), Gaps = 10/155 (6%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ GP+G +G GP+G G +G GP+G G G
Sbjct: 99 GPTGATGATGPTGATGAIG----FGVTGPTGPTGATGATGADGVTGPTGPTGATGADGIT 154
Query: 110 RYLGPSGRLRY--LGPSGRLNSD--GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G + GP+G + G +G +GP+G G +G +G +G +
Sbjct: 155 GPTGATGATGFGVTGPTGPTGATGVGVTGATGLIGPTGATGTPGATGPTGAIGATG-IGI 213
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP+G G G GP+G G +DG+
Sbjct: 214 TGPTGATGATGADGATGVTGPTGATGATG-ADGVT 247
>gi|423426864|ref|ZP_17403895.1| hypothetical protein IE5_04553, partial [Bacillus cereus BAG3X2-2]
gi|423502585|ref|ZP_17479177.1| hypothetical protein IG1_00151, partial [Bacillus cereus HD73]
gi|401110113|gb|EJQ18028.1| hypothetical protein IE5_04553, partial [Bacillus cereus BAG3X2-2]
gi|402460191|gb|EJV91916.1| hypothetical protein IG1_00151, partial [Bacillus cereus HD73]
Length = 1062
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/193 (30%), Positives = 68/193 (35%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 286 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGVTGDQGPQ 345
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 346 GIQGVPGPSGAT---GPQGVEGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPE 402
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 403 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQ 462
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G G+ +G
Sbjct: 463 GVQGAQGGIGPTG 475
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 60/175 (34%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 315 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVEGIQGPMGD 371
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 372 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 431
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 432 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGSQGVQGIQ 486
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 67/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
V + GP G +GP G+ GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 314 VTGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVEGIQGPMG 370
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 371 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 430
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G + G G G G + GP G G G +GP+G + G G
Sbjct: 431 VQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---GIGPTGPMGSQGVQGIQG 487
Query: 183 YLGPSGR 189
GP+G
Sbjct: 488 IQGPTGT 494
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G+ G
Sbjct: 286 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGVTG----- 340
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP
Sbjct: 341 -DQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVEGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPV 396
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP G GP G GP G G G G+ + G+
Sbjct: 397 GATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.094, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 61/191 (31%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGIQ 808
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/200 (27%), Positives = 66/200 (33%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + G G G G +
Sbjct: 654 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIG 713
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G GP G GP G G G
Sbjct: 714 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G + GP G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 774 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGVQGATG 833
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G
Sbjct: 834 AQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 853
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.84, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 650 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPT 703
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 704 GIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQ 763
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 764 GIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQ 823
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 824 GIQ 826
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/194 (26%), Positives = 64/194 (32%), Gaps = 18/194 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G+ G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 579 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 638
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLG 122
+G G G +GP+G GP G GP G + G
Sbjct: 639 ATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTG 698
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 699 SQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 758
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 759 PQGPQGIQGIQGVQ 772
>gi|423374835|ref|ZP_17352173.1| hypothetical protein IC5_03889 [Bacillus cereus AND1407]
gi|401093541|gb|EJQ01636.1| hypothetical protein IC5_03889 [Bacillus cereus AND1407]
Length = 835
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 74/191 (38%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 245
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ + +GL
Sbjct: 246 GVQGVIGPTGL 256
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 185
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G G G + GP+G G G + G +G GP G + G + +
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 245
Query: 203 GLH 205
G+
Sbjct: 246 GVQ 248
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 167 TGNTGIQGVQGDL---GNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 223
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 224 QGL 226
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP + GP G G G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 77 TGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGI 133
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP+G G G + GP+G G G L G G G
Sbjct: 134 QGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGI 193
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G G G +
Sbjct: 194 QGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGP 253
Query: 193 LGLS 196
GL+
Sbjct: 254 TGLT 257
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + G +G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/143 (30%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G G G + GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +GP+G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGN---IGPTGSTGIQGV 493
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/140 (30%), Positives = 52/140 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 479 QGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 185
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G +GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEI---GPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 163
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G + V
Sbjct: 164 TGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 223
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 224 QGLQ 227
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDL 179
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 4/154 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G+ G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGLTGLQGVPGPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQ 458
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G SG GP G GP G + G S G++
Sbjct: 459 GLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTG-STGIQ 491
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/159 (27%), Positives = 57/159 (35%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP G G +G G +G+ GP G GP G G +G G G
Sbjct: 542 TGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGP 601
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G G +G GP+G GP G G +G +G +G G
Sbjct: 602 QGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGATGATGVIGATGPTGIQGI 661
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
G G +GR GP+G G +G +S G
Sbjct: 662 QG---ITGATGRTGVTGPTGATGPTGLTGATGSSAISTG 697
>gi|229179636|ref|ZP_04306987.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus 172560W]
gi|228603839|gb|EEK61309.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus 172560W]
Length = 837
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + +GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPIGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 247
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 72/183 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 95 GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQ 154
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP+G G G L G G G G + +GP+G G
Sbjct: 155 GIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPIGPTGSQGIQGEQ 214
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + G +G GP G + +GP+G G G + GP+G GP+G
Sbjct: 215 GPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPAGAT 274
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 275 GIT 277
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 69/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + +GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPIGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPAGATGITGPTG 281
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 69/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + +GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPIGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPAGATGITGPTG 281
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/160 (30%), Positives = 60/160 (37%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G L GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQ 460
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G SG GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 461 GISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 500
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/146 (30%), Positives = 54/146 (36%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 355 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGP 414
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G G G GP+G G G L GP G G SG GP G
Sbjct: 415 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGI 474
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 475 QGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 500
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 59/157 (37%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 343 TGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGP 402
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G + GP G G G + GP+G G G L GP G G
Sbjct: 403 QGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQGI 462
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
SG GP G GP G +GP+G G+
Sbjct: 463 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGD---IGPTGATGIQGVQ 496
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.055, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G G G G + +GP+G G G + GP G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPIGPTGSQGIQGEQGPM---GPQGETGV 225
Query: 193 LGLS 196
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.070, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/140 (31%), Positives = 52/140 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G L GP G G SG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 481 QGDIGPTGATGIQGVQGPEG 500
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/211 (28%), Positives = 75/211 (35%), Gaps = 27/211 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GSL GP G G SG GP G GP G + G +G
Sbjct: 433 TGPTGLQGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGI 492
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
GP G GP+G GP G G G + GP+G
Sbjct: 493 QGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGI 549
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--- 177
G +G S GP+G GP+G GP G GP G G +G GP
Sbjct: 550 QGITG---STGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGI 603
Query: 178 ---SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP+G G++ + G+
Sbjct: 604 QGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 634
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 56/150 (37%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G GP+G G G L GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQ 460
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G SG GP G GP G + G +
Sbjct: 461 GISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGAT 490
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 R---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G + GP+G G G L G G G G + +GP+G
Sbjct: 151 TGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPIGPTGSQGI 210
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 211 QG 212
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 66/183 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G G G
Sbjct: 371 GPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVR 430
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G L GP G G SG GP G GP G + G +
Sbjct: 431 GATGPTGLQGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGAT 490
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G G G + GP+G
Sbjct: 491 GIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQ 550
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 551 GIT 553
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/203 (27%), Positives = 68/203 (33%), Gaps = 30/203 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 379 TGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGL 438
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GSL GP G G SG GP G GP G + G +G GP
Sbjct: 439 QGLQGIQGSLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGP 498
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRY---------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G +GP+G G G
Sbjct: 499 EGPT---GPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS 555
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP G
Sbjct: 556 TGPTGATGATGPTGVTGPQGPQG 578
>gi|395851085|ref|XP_003798097.1| PREDICTED: collagen alpha-3(V) chain [Otolemur garnettii]
Length = 1696
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/149 (36%), Positives = 65/149 (43%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G+ LGPSG L GP+G + GP G LGP G GP G GP G
Sbjct: 934 EGAKGELGPSGPLGKEGPAGPRGFPGPQGHPGDLGPPGLKGDKGPPGPTGANGPPGERGP 993
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+GP+G + G SG +GP+G GP G DG G L LGPSG GP
Sbjct: 994 VGPAGGIGLPGQSGGQGPVGPAGEKGSPGERGPPGPTGKDGIPGPLGPLGPSG---PAGP 1050
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
SG G G + G G +GP G
Sbjct: 1051 SGEEGDKGEVGAPGHKGSKGDKGDVGPPG 1079
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/150 (35%), Positives = 65/150 (43%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
LGPSG L GP+G + GP G LGP G GP G GP G +GP+G
Sbjct: 939 ELGPSGPLGKEGPAGPRGFPGPQGHPGDLGPPGLKGDKGPPGPTGANGPPGERGPVGPAG 998
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G SG +GP+G G G GP+G+ GP L LGPSG G
Sbjct: 999 GIGLPGQSGGQGPVGPAGE---KGSPGERGPPGPTGKDGIPGP---LGPLGPSGPAGPSG 1052
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G G G G + GP+G
Sbjct: 1053 EEGDKGEVGAPGHKGSKGDKGDVGPPGPTG 1082
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/155 (34%), Positives = 66/155 (42%), Gaps = 9/155 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G LGPSG L GP+G + GP G LGP G GP G GP G
Sbjct: 934 EGAKGELGPSGPLGKEGPAGPRGFPGPQGHPGDLGPPGLKGDKGPPGPTGANGPPGERGP 993
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+GP+G + G SG +GP+G G G GP+G+ GP G L GP+
Sbjct: 994 VGPAGGIGLPGQSGGQGPVGPAGEK---GSPGERGPPGPTGKDGIPGPLGPLGPSGPA-- 1048
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GPSG G G + G G +GP G
Sbjct: 1049 ----GPSGEEGDKGEVGAPGHKGSKGDKGDVGPPG 1079
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/116 (36%), Positives = 55/116 (47%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G+ LGPSG L GP+G + GP G LGP G GP G ++GP G
Sbjct: 934 EGAKGELGPSGPLGKEGPAGPRGFPGPQGHPGDLGPPGLKGDKGPPGPTGANGPPGERGP 993
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+GP+G + G SG +GP+G GP+G+ GP G L GP+G
Sbjct: 994 VGPAGGIGLPGQSGGQGPVGPAGEKGSPGERGPPGPTGKDGIPGPLGPLGPSGPAG 1049
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/130 (35%), Positives = 57/130 (43%), Gaps = 3/130 (2%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G LGPSG L GP+G + GP G LGP G GP G GP G
Sbjct: 934 EGAKGELGPSGPLGKEGPAGPRGFPGPQGHPGDLGPPGLKGDKGPPGPTGANGPPGERGP 993
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+GP+G + G SG +GP+G G G GP+G+ GP G L GP+G
Sbjct: 994 VGPAGGIGLPGQSGGQGPVGPAGEK---GSPGERGPPGPTGKDGIPGPLGPLGPSGPAGP 1050
Query: 181 LRYLGPSGRL 190
G G +
Sbjct: 1051 SGEEGDKGEV 1060
>gi|327269257|ref|XP_003219411.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: pre-mRNA cleavage complex 2 protein
Pcf11-like [Anolis carolinensis]
Length = 1605
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/227 (32%), Positives = 107/227 (47%), Gaps = 71/227 (31%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLG-PSGSLRYL----------GPSGRL----RYLG--------- 50
P G LR+ GPSG +R+ G P G +R+ GP G+L R+ G
Sbjct: 929 PGGALRFDGPSG-IRFEGQPPGVMRFESHGQPGMRLEGPPGQLSDGIRFEGLHDQPPASM 987
Query: 51 -----PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR-----------LRYLG-PSGSLRYLGPSGRLRY 93
PSG +R+ GP +LR+ GP R +R+ G P LR+ GP +
Sbjct: 988 RFDSQPSGGMRFEGPHDQLRFEGPHERPLGPHGPPGGGMRFEGQPRPGLRFEGP-----H 1042
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+ P G L P G LR+ P G+ +GP G+ P+ LR+ GP G+ +GP G+
Sbjct: 1043 MQPVGLLGQ--PGGNLRFDAPHGQP--MGPHGQ-----PASGLRFEGPHGQP--VGPFGQ 1091
Query: 154 ----LRYLGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGP---SGRLRYLGPSGR 189
R+ GP G+ +GP G+ R+ GP SG +R+ GP G+
Sbjct: 1092 PGVGPRFEGPLGQT--VGPHGQPGMGPRFEGPSIQSGGMRFEGPIGQ 1136
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/133 (31%), Positives = 64/133 (48%), Gaps = 29/133 (21%)
Query: 80 GSLRYLGPSGR-----LRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GSL + GP L + GP+G+ +++ P G+ P G LR+ GPSG
Sbjct: 889 GSLIFDGPPAPMGGSPLHFEGPTGQVGAGMGMQFEDPIGQ-----PGGALRFDGPSGIRF 943
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG----PSGRLRYLG-PSGRL 181
P G +R+ G+ +R GP G+L S +R+ G P +R+ PSG +
Sbjct: 944 EGQPPGVMRFES-HGQPGMRLEGPPGQL-----SDGIRFEGLHDQPPASMRFDSQPSGGM 997
Query: 182 RYLGPSGRLRYLG 194
R+ GP +LR+ G
Sbjct: 998 RFEGPHDQLRFEG 1010
>gi|423438169|ref|ZP_17415150.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG4X12-1]
gi|401119251|gb|EJQ27073.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG4X12-1]
Length = 433
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 66/184 (35%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 249 TGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGI 308
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G +GP G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 309 QGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGP 365
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 MGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGI 425
Query: 193 LGLS 196
G+
Sbjct: 426 QGVQ 429
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 239 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 412
Query: 189 RL 190
Sbjct: 413 AT 414
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/179 (31%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 306 QGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQG 421
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP G GP G GP
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 SG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP G G G G G + GP G G
Sbjct: 97 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
>gi|423436814|ref|ZP_17413795.1| hypothetical protein IE9_02995 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
gi|401122550|gb|EJQ30337.1| hypothetical protein IE9_02995 [Bacillus cereus BAG4X12-1]
Length = 835
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGIT 275
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 70/182 (38%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 245
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 246 GV 247
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 230 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDPGPTGPTGATGITGPTG 279
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/160 (30%), Positives = 60/160 (37%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQ 458
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GPSG GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 498
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/156 (30%), Positives = 59/156 (37%), Gaps = 3/156 (1%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 341 TGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGP 400
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G + GP G G G + GP+G G G GP G GP
Sbjct: 401 QGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGP 460
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
SG GP G GP G +GP+G G+
Sbjct: 461 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGD---IGPTGATGIQGV 493
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/140 (31%), Positives = 52/140 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 479 QGDIGPTGATGIQGVQGPEG 498
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 74/193 (38%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GPSG GP G GP G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 449 TGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGD---IGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGA 505
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G +GP+G G G GP+G + GP
Sbjct: 506 TGPQGIQGIQGIQGPTGSQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGP 565
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G GP G GP+G G +G G G GP+G
Sbjct: 566 TG---VTGPQGPQGIQGPQG---VTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGV 619
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G++ + G+
Sbjct: 620 TGITGPQGIQGIQ 632
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.076, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 56/150 (37%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQ 458
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GPSG GP G GP G + G +
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGAT 488
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + G +G GP G GP+G G G GP+G GL
Sbjct: 474 GIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPT---GPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGSQGIQGL 529
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/182 (31%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP G + G +G GP G GP+G G G
Sbjct: 459 GPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQ 515
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+GS G G +GP+G G G GP+G GP+G GP
Sbjct: 516 GIQGPTGSQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTGVTGPQGPQ 575
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G GP G G G G +G GP G
Sbjct: 576 G---IQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 632
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 633 GL 634
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/167 (29%), Positives = 61/167 (36%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 341 TGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGP 400
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+ GP G G G GP+G G G GP
Sbjct: 401 QGVQGAQGP---IGPT------GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGP 451
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GPSG GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 452 QGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 498
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/200 (28%), Positives = 75/200 (37%), Gaps = 18/200 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR-----L 64
GP G +GP+G G G GP+G GP GS GP G +
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGPIGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQGI 97
Query: 65 RYL-------GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+ + GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 98 QGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGV 157
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+GP+G + G G LG SG G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 158 QGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGP 217
Query: 178 SGRLRY---LGPSGRLRYLG 194
G GP G + +G
Sbjct: 218 QGETGVQGLQGPQGEMGQVG 237
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 148
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 149 TGVQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 185
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.76, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/206 (28%), Positives = 68/206 (33%), Gaps = 18/206 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 395 TGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPTGPQGV 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 126
GPSG GP G GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 455 QGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGI 511
Query: 127 ---------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
S G G GP G GP G G +G G +G GP
Sbjct: 512 QGIQGIQGPTGSQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTGVTGP 571
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G GP G G + V+G
Sbjct: 572 QGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTG 597
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 67/203 (33%), Gaps = 30/203 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP G G G GP+G
Sbjct: 377 TGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGL 436
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G GPSG GP G GP G + G +G GP
Sbjct: 437 QGLQGIQGPSGPTGPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGP 496
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRY---------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP+G +GP+G G G
Sbjct: 497 EGP---TGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGSQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS 553
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP G
Sbjct: 554 TGPTGATGATGPTGVTGPQGPQG 576
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/219 (25%), Positives = 72/219 (32%), Gaps = 33/219 (15%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 390 GPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGPSGPT 449
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G GPSG GP G GP G + GP+G G G GP+G
Sbjct: 450 GPQGVQGVQGPSGITGPTGPQGIQGIQGPQGDI---GPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGAT 506
Query: 137 RY---------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+GP+G G G GP+G GP+
Sbjct: 507 GPQGIQGIQGIQGPTGSQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPT 566
Query: 170 GRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G GP G GP+G G++ + G+
Sbjct: 567 GVTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQ 605
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPI---GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGVQGIQGVQGEIGP 163
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G V
Sbjct: 164 TGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 223
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 224 QGLQ 227
>gi|423417355|ref|ZP_17394444.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG3X2-1]
gi|401107937|gb|EJQ15874.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG3X2-1]
Length = 927
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 10/173 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G GP G + GP G GP+G++ GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGVTGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G + GP G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 152 QGVQGVPGATGSQGIQGAQGFQGPQGPSGSTGPTGATGQ-GVTGSTGITGPTG 203
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/163 (31%), Positives = 63/163 (38%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 94
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGVTGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 145
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G G G G + GP G GP+G
Sbjct: 146 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGFQGPQGPSGSTGPTGAT 188
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.073, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 3/179 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYL---GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G GP+GS+ GP G GP G GP G GP
Sbjct: 234 TGATGNTGVTGSAGETGNTGPTGSIGETGAQGPQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGP 293
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G G +G GP G +GP G G G G G
Sbjct: 294 TGVTGEQGIQGIQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGLQGIQGVPGPTGD 353
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 354 TGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIG 412
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/145 (31%), Positives = 55/145 (37%), Gaps = 7/145 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRY---L 67
GP G + GP G GP+G + GP G+ G P G GP G +
Sbjct: 60 GPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGLRGPQGETGVTGPQGVQGLQGPI 119
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G G G GP G GP G G G G G + GP G
Sbjct: 120 GPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGFQGPQGPS 179
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
S GP+G G +G GP+G
Sbjct: 180 GSTGPTGATGQ-GVTGSTGITGPTG 203
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/171 (28%), Positives = 58/171 (33%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP G +GP G G G G G G G GP G +
Sbjct: 312 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGLQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGP 371
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G G G
Sbjct: 372 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGI 431
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 432 TGATGVQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPTGPMGPQGVQGI 482
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.60, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/169 (30%), Positives = 59/169 (34%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N GP+G + G P G GP G GP G GP+G G G G
Sbjct: 251 NTGPTGSIGETGAQGPQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGIQGIQG 310
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G GP G +GP G G G G G G G GP G +
Sbjct: 311 ITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGLQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIG 370
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 371 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 419
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G G G G G G G GP G + GP G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGLQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 376
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G GP G GP G G G + G
Sbjct: 377 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 436
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G G + GP G +GP+G + G G GP+G G
Sbjct: 437 VQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQG 496
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 497 PQG 499
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/100 (30%), Positives = 38/100 (38%), Gaps = 3/100 (3%)
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 166
+ GP+G GP G GP G + GP G GP+G++ GP G+
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 167 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G G + GL
Sbjct: 98 RGPQGETGVTGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQ 137
>gi|167773043|ref|ZP_02445096.1| hypothetical protein ANACOL_04432 [Anaerotruncus colihominis DSM
17241]
gi|167664976|gb|EDS09106.1| collagen triple helix repeat protein [Anaerotruncus colihominis DSM
17241]
Length = 390
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/227 (26%), Positives = 79/227 (34%), Gaps = 45/227 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS---GRLRYLGP 69
GP G + GP G + GP G +GP+G G G + GP G GP
Sbjct: 16 TGPQGPIGAAGPQG---FAGPQGPQGVVGPTGATGPQGAPGPIGLQGPQGIPGVTGATGP 72
Query: 70 SGRLRYLGP---------------------------SGSLRYLGPSGR------LRYLGP 96
G + GP +G+ +GP+G GP
Sbjct: 73 QGPIGAAGPQGFTGPTGPTGPTGPTGPTGPSGATGSTGATGPIGPTGDPGATGATGATGP 132
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G + GP G GP G GP G + +D GP+G GP G GP G
Sbjct: 133 QGPIGSAGPQGIAGPTGPQGITGATGPQGLIGADGPQGPTGPTGATGPQGSTGATGPQGP 192
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
+ GP G GP+G GP+G GP+ +R
Sbjct: 193 IGADGPQGP---TGPTGATGVAGPTGATGPAGPAATPASCACVQQMR 236
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/205 (27%), Positives = 72/205 (35%), Gaps = 33/205 (16%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS-- 79
+G +G GP G + GP G + GP G +GP+G G G + GP
Sbjct: 7 IGATGPTGVTGPQGPIGAAGPQG---FAGPQGPQGVVGPTGATGPQGAPGPIGLQGPQGI 63
Query: 80 -GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGR--- 117
G GP G + GP G G +G +GP+G
Sbjct: 64 PGVTGATGPQGPIGAAGPQGFTGPTGPTGPTGPTGPTGPSGATGSTGATGPIGPTGDPGA 123
Query: 118 ---LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGR 171
GP G + S GP G GP G GP G + GP+G GP G
Sbjct: 124 TGATGATGPQGPIGSAGPQGIAGPTGPQGITGATGPQGLIGADGPQGPTGPTGATGPQGS 183
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + GP G G +
Sbjct: 184 TGATGPQGPIGADGPQGPTGPTGAT 208
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/110 (30%), Positives = 44/110 (40%), Gaps = 6/110 (5%)
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P G + GP G GP G GP G + GP+G GP G GP G
Sbjct: 132 PQGPIGSAGPQGIAGPTGPQGITGATGPQGLIGADGPQGPTGPTGATGPQGSTGATGPQG 191
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
+ +DGP G GP+G GP+G GP+ ++R +
Sbjct: 192 PIGADGPQGP---TGPTGATGVAGPTGATGPAGPAATPASCACVQQMRNI 238
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/116 (31%), Positives = 46/116 (39%), Gaps = 9/116 (7%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G + GP G GP G GP G + GP G P+G GP GS
Sbjct: 132 PQGPIGSAGPQGIAGPTGPQGITGATGPQGLIGADGPQG------PTGPTGATGPQGSTG 185
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GP G + GP G GP+G GP+G GP+ S ++R +
Sbjct: 186 ATGPQGPIGADGPQGP---TGPTGATGVAGPTGATGPAGPAATPASCACVQQMRNI 238
>gi|228909165|ref|ZP_04072993.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
IBL 200]
gi|228850486|gb|EEM95312.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
IBL 200]
Length = 811
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G+ GP+G+ G G +GP+G+ +G G GP+G
Sbjct: 353 TGPPGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGV 409
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 410 TGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGL 469
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 470 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 529
Query: 193 LGLS 196
+G++
Sbjct: 530 VGIT 533
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/164 (28%), Positives = 65/164 (39%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G
Sbjct: 441 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQ 500
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G +GP+G GP G +G +G G G S GP G +G +
Sbjct: 501 GVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQG---SQGPQGPQGNIGIT 557
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 558 GAMGETGATGATGSTGPQGLQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 601
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 389 IGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGA 445
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 446 AGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 505
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G G
Sbjct: 506 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAMGETGA 565
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 566 TGAT 569
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 74/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G GP+G G G +GP+G+ GP G +G +G
Sbjct: 476 IGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGP 535
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS GP G +G +G + G +G GP G G +G G
Sbjct: 536 QGVQGAQGSQGPQGPQGN---IGITGAMGETGATGATGSTGPQGLQGVQGITGIQGITGM 592
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + GP G G G +G SG G G + G G+ +GP+G
Sbjct: 593 TGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGN 652
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 653 VG 654
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G G G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 405 GPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLT 464
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP
Sbjct: 465 GAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQ 524
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G +G G G GP G + G +G + G +G GP G
Sbjct: 525 GNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNI---GITGAMGETGATGATGSTGPQGLQGVQ 581
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G++ ++G+
Sbjct: 582 GITGIQGITGM 592
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 24/188 (12%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G++ GP G GP+G G G +GP+G GP G+ +G +G
Sbjct: 475 IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 534
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G G GP G +G +G + G +G S GP G G +G G
Sbjct: 535 PQGVQGAQGSQGPQGPQGN---IGITGAMGETGATGATGSTGPQGLQGVQGITGIQGITG 591
Query: 150 PSGRLRYLGP---------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G + GP +G +GP G G +G + G +G
Sbjct: 592 MTGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATG 651
Query: 189 RLRYLGLS 196
+ +G S
Sbjct: 652 NVGSIGFS 659
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/174 (27%), Positives = 66/174 (37%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 388 VIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETG 444
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 445 AAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQG 504
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G
Sbjct: 505 IQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITG 558
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/167 (28%), Positives = 64/167 (38%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G +GP+G+ +G G GP+G G G G +G
Sbjct: 371 TGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGP 427
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G GP G G +G G G +GP+G + GP
Sbjct: 428 AGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGP 487
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 488 QGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 534
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 77/191 (40%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G +GP+G GP G+ +G +G G G
Sbjct: 486 GPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQ 545
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ +G +G + G +G GP G G +G G +G + + GP
Sbjct: 546 GPQGPQGN---IGITGAMGETGATGATGSTGPQGLQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGPQ 602
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G +G SG G G + G G+ +GP+G + G + +
Sbjct: 603 GIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGNV---GSIGFS 659
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G++ +GL
Sbjct: 660 GIAGATGATGL 670
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G GS G G +G +G GP+G G G + GP G
Sbjct: 42 TGPQGPQGIRGIQGSRGTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGD 98
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G G+ GP+G G G +G G+ G G G G GP
Sbjct: 99 IGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGITGPQGP 158
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G + G G G +G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 159 QGVQGIQGEQGAIGIQGEDGPQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGI 218
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 219 KGIT 222
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/168 (27%), Positives = 59/168 (35%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G + G G+ GP+GS G G +G G G G G G
Sbjct: 92 NQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGIQGERGVTGVPG 151
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G + G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 152 ITGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGPQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQG 211
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G G +G GP G G SG + G G G +G
Sbjct: 212 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATG 259
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/171 (27%), Positives = 64/171 (37%), Gaps = 3/171 (1%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G+ GP G+ G G GP+G+ G G +GP+G +G G
Sbjct: 346 PQGNPGITGPPGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 402
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G G G +G G G G +G + GP G G +G
Sbjct: 403 IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTG 462
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G +GP+G + GP G GP+G G G +G
Sbjct: 463 LTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIG 513
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + GP G + G G+ GP+G G G
Sbjct: 69 VGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGTQGI 125
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G G G GP G G G + G G G
Sbjct: 126 QGEIGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGITGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGPQGIQGI 185
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 186 TGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 245
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 246 QG-AKGVR 252
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 64/185 (34%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 59 TTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAG 115
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +G G+ G G G G GP G G G + G
Sbjct: 116 SQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGITGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQG 175
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 176 EDGPQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQG 235
Query: 192 YLGLS 196
G+S
Sbjct: 236 IQGVS 240
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/163 (27%), Positives = 61/163 (37%), Gaps = 3/163 (1%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P G+ GP G G G+ GP+G G G +GP+G+ +G G
Sbjct: 346 PQGNPGITGPPGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 402
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G G G +G G G G +G GP G G +G
Sbjct: 403 IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTG 462
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G +GP+G + GP G GP+G G+
Sbjct: 463 LTGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 505
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/175 (26%), Positives = 60/175 (34%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP G + G G+ GP+G G G +G G+ G G
Sbjct: 85 GAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGIQGER 144
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G G G + G G G +G + G G GP+
Sbjct: 145 GVTGVPGITGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGPQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPT 204
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP G G SG + G G G +G
Sbjct: 205 GSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATG 259
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 70/180 (38%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G +R + G G
Sbjct: 8 IGATGPTGNSGPVGPTGG--HEGPVGPTGMTGPTGATGPQGPQG-IRGI--QGSRGTTGA 62
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G +G +G GP+G G G + GP G + G G + GP+G
Sbjct: 63 QGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGI 119
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
G G +G G+ G G G G GP G G G + G DG
Sbjct: 120 QGTQGIQGEIGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGITGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQG-EDG 178
>gi|365158695|ref|ZP_09354887.1| hypothetical protein HMPREF1014_00350 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
gi|363626568|gb|EHL77551.1| hypothetical protein HMPREF1014_00350 [Bacillus sp. 7_6_55CFAA_CT2]
Length = 384
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/137 (29%), Positives = 62/137 (45%), Gaps = 15/137 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + +GP+G P+G+ GP+G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 31 GTVPKVGPTG------PTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGAT 84
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ +GP+G GP+G G +G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 85 GITGA---MGPTGA---TGPTGATGLTGATGVTGATGPTG---ITGATGITGATGPTGAT 135
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G GP+G
Sbjct: 136 GVTGATGPTGATGPTGA 152
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/122 (29%), Positives = 53/122 (43%), Gaps = 9/122 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G G + GP+G G G
Sbjct: 40 GPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDT------GPTGATGITGAMGPT 93
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G +G GP+G G +G GP+G G +G + GP+
Sbjct: 94 GATGPTGATGLTGATGVTGATGPTG---ITGATGITGATGPTGATGVTGATGPTGATGPT 150
Query: 134 GR 135
G
Sbjct: 151 GA 152
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.055, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/120 (29%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 12/120 (10%)
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNSD-GPSGRL 136
G++ +GP+G P+G GP+G GP+G GP+G + D GP+G
Sbjct: 31 GTVPKVGPTG------PTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGVTGDTGPTGAT 84
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 85 GITGAMGPTGATGPTGATGLTGATGVTGATGPTG---ITGATGITGATGPTGATGVTGAT 141
>gi|443690277|gb|ELT92455.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_144817 [Capitella teleta]
Length = 184
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/171 (36%), Positives = 78/171 (45%), Gaps = 11/171 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GPSG LGP+G GP G GP+G+ GPSG G G
Sbjct: 16 GPAGPQGTRGPSG---PLGPTGESGSPGPQGPQGESGPTGQ---RGPSGATGVQGRKGLQ 69
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GPSG L +GPSG G +G G G+ G G + G +GR GP+
Sbjct: 70 GLQGPSGPLGPVGPSGPAGPTGATGEAGPQGFQGQQGPRGEIGESGATGGTGRQGERGPT 129
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-----RLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP+GR+ GPSG R GP+G +GPSG
Sbjct: 130 GNRGQTGPAGPEGPAGPAGRIGETGPSGETGDSRPGSPGPAGPRGPIGPSG 180
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/166 (36%), Positives = 72/166 (43%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS GP G GP+G GPSG LGP+G GP G GP+G
Sbjct: 3 TGSAGEPGPQG---PKGPAGPQGTRGPSG---PLGPTGESGSPGPQGPQGESGPTG---Q 53
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GPSG G G GPSG L +GPSG G +G G G+ G G
Sbjct: 54 RGPSGATGVQGRKGLQGLQGPSGPLGPVGPSGPAGPTGATGEAGPQGFQGQQGPRGEIGE 113
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GR GP+G GP+G GP+GR+ GPSG
Sbjct: 114 SGATGGTGRQGERGPTGNRGQTGPAGPEGPAGPAGRIGETGPSGET 159
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/158 (35%), Positives = 68/158 (43%), Gaps = 7/158 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
LGP+G GP G GP+G GPSG G G GPSG L +GPSG
Sbjct: 30 LGPTGESGSPGPQGPQGESGPTG---QRGPSGATGVQGRKGLQGLQGPSGPLGPVGPSGP 86
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G G G+ G G G +GR GP+G GP+G GP
Sbjct: 87 AGPTGATGEAGPQGFQGQQGPRGEIGESGATGGTGRQGERGPTGNRGQTGPAGPEGPAGP 146
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+GR+ GPSG R GP+G +GPSG
Sbjct: 147 AGRIGETGPSGETGDS----RPGSPGPAGPRGPIGPSG 180
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/165 (34%), Positives = 68/165 (41%), Gaps = 35/165 (21%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLG---------PS 61
GP+G GPSG L G SGS GP SG GPSG+ G PS
Sbjct: 16 GPAGPQGTRGPSGPLGPTGESGSPGPQGPQGESGPTGQRGPSGATGVQGRKGLQGLQGPS 75
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G L +GPSG G +G G +GR GP+G
Sbjct: 76 GPLGPVGPSGPAGPTGATGEAGPQGFQGQQGPRGEIGESGATGGTGRQGERGPTGNRGQT 135
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-----RLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G GP+GR+ GPSG R S GP+G +GPSG
Sbjct: 136 GPAGPEGPAGPAGRIGETGPSGETGDSRPGSPGPAGPRGPIGPSG 180
>gi|423605002|ref|ZP_17580895.1| hypothetical protein IIK_01583 [Bacillus cereus VD102]
gi|401244150|gb|EJR50514.1| hypothetical protein IIK_01583 [Bacillus cereus VD102]
Length = 835
Score = 50.8 bits (120), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/193 (27%), Positives = 75/193 (38%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G + G G + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 67 EIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGPMGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPG 123
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 124 PIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSG 183
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 184 LQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQG 243
Query: 192 YLGLSDGLRVSGL 204
G+ + +GL
Sbjct: 244 IQGVQGVIGPTGL 256
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/170 (30%), Positives = 62/170 (36%), Gaps = 6/170 (3%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G + G +G GP GP+G GP G GL
Sbjct: 474 GMQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPE------GPTGPTGATGPQGIQGIQGL 517
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G +GP+G GP G + G G + GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGPMGERGPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 166
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 167 TGNTGIQGVQGDL---GNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 223
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 224 QGL 226
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/163 (30%), Positives = 60/163 (36%), Gaps = 6/163 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G + G +G GP GP+G GP G
Sbjct: 474 GMQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPE------GPTGPTGATGPQG 510
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/162 (28%), Positives = 59/162 (36%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + G +G GP G G + + G+
Sbjct: 474 GMQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQ 515
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.041, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 58/158 (36%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQGMQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G + G +G GP GP+G GP G
Sbjct: 479 QGNIGPTGSTGIQGVQGPE------GPTGPTGATGPQG 510
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 60/157 (38%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G +GP+G GP G + G G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGP 88
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 89 MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 185
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/199 (28%), Positives = 73/199 (36%), Gaps = 15/199 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G +GP+G GP G + G G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQG---FQGSQGP 88
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+ GP G G G GP+G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 89 MGERGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGP 148
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G G
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGI 208
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G + V GL
Sbjct: 209 QGEQGPMGPTGATGVQGLQ 227
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 64/188 (34%), Gaps = 15/188 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G G G +GP+GS G G GP+G
Sbjct: 447 GPTGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQGMQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGAT 506
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPS---------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G GP+ G + GP G G +G G +G+
Sbjct: 507 GPQGIQGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPIGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQA 566
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP G G +G G G GP G G +G GP+
Sbjct: 567 GVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPT 626
Query: 179 GRLRYLGP 186
G GP
Sbjct: 627 GPQGIQGP 634
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/171 (27%), Positives = 61/171 (35%), Gaps = 18/171 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS-- 70
GP G GP G++ GP+GS G G GP+G+ G G GP+
Sbjct: 467 TGPQGIQGMQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGLQGPTGP 523
Query: 71 -------------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G + GP G G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 524 QGIQGIQGIQGPIGPIGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 583
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +G + G G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 584 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGP 634
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/159 (27%), Positives = 57/159 (35%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP G G +G G +G+ GP G GP G G +G G G
Sbjct: 542 TGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGP 601
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G G +G GP+G GP G G +G +G +G G
Sbjct: 602 QGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGATGATGVIGATGPTGIQGI 661
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
G G +GR GP+G G +G +S G
Sbjct: 662 QG---ITGATGRTGVTGPTGATGPTGLTGATGSSAISTG 697
>gi|218898436|ref|YP_002446847.1| hypothetical protein BCG9842_B1865 [Bacillus cereus G9842]
gi|218541712|gb|ACK94106.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus G9842]
Length = 838
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 73/182 (40%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G GP+G G G +GP+G+ GP G +G +G
Sbjct: 503 IGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGP 562
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS GP G + G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 563 QGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGM 619
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + GP G G G +G SG G G + G G+ +GP+G
Sbjct: 620 TGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGN 679
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 680 VG 681
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 72/184 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+ GP+G+ G G +GP+G+ +G G G +G
Sbjct: 377 TGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGA 436
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G G +G G G G +G + G
Sbjct: 437 EGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGAQGL 496
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 497 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGE 556
Query: 193 LGLS 196
+G++
Sbjct: 557 VGIT 560
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 24/188 (12%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G++ GP G GP+G G G +GP+G GP G+ +G +G
Sbjct: 502 IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 561
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G G GP G + G +G G +G S GP G G +G G
Sbjct: 562 PQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGE---TGATGATGSTGPQGVQGVQGITGIQGITG 618
Query: 150 PSGRLRYLGP---------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G + GP +G +GP G G +G + G +G
Sbjct: 619 MTGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATG 678
Query: 189 RLRYLGLS 196
+ +G S
Sbjct: 679 NVGSIGFS 686
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/184 (26%), Positives = 69/184 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 413 IGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGA 472
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 473 QGPQGVQGIQGTTGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 532
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +G
Sbjct: 533 QGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGA 592
Query: 193 LGLS 196
G +
Sbjct: 593 TGAT 596
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/167 (27%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
G +G+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+
Sbjct: 465 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPT 524
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 525 GVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGIT 584
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 585 GATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 628
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/194 (26%), Positives = 72/194 (37%), Gaps = 6/194 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G G G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 429 GPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLT 488
Query: 74 RYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 489 GAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIR 548
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G +G +G G G GP G + G +G G +G GP G
Sbjct: 549 GPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQ 605
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGL 204
G++ ++G+
Sbjct: 606 GVQGITGIQGITGM 619
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/167 (27%), Positives = 64/167 (38%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G +G GP G G +G + G G +GP+G++ GP G GP+
Sbjct: 465 GETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPT 524
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G G +GP+G GP G +G +G G G GP G +
Sbjct: 525 GVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGIT 584
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G GP G G +G G +G + GP
Sbjct: 585 GATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGP 628
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/183 (26%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G G G +G G G G +G G G +GP+G
Sbjct: 448 ATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTG 507
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
++ GP G GP+G G G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 508 AIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQG 567
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G GP G + G +G G +G GP G G +G G++ +
Sbjct: 568 AQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIG 624
Query: 201 VSG 203
+G
Sbjct: 625 ATG 627
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/179 (26%), Positives = 67/179 (37%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G+ +G G GP+G G G G +G G G G +G
Sbjct: 412 VIGPTGAQGMVGIQG---IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETG 468
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+ GP G G +G G G +GP+G + GP G GP+G
Sbjct: 469 AAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQG 528
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +GP+G GP G +G +G G G GP G + G +
Sbjct: 529 VQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGAT 587
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 76/191 (39%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G +GP+G GP G+ +G +G G G
Sbjct: 513 GPQGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQ 572
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G++ G +G G +G GP G G +G G +G + + GP
Sbjct: 573 GPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGPQ 629
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G +G SG G G + G G+ +GP+G + G + +
Sbjct: 630 GIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGSIGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGNV---GSIGFS 686
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G++ +GL
Sbjct: 687 GIAGATGATGL 697
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.092, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/167 (27%), Positives = 64/167 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G +GP+G+ +G G G +G+ G G GP+G
Sbjct: 395 TGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGA 454
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G G G +G G G +GP+G + GP
Sbjct: 455 QGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGP 514
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G
Sbjct: 515 QGLQGITGPTGVQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITG 561
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/168 (27%), Positives = 58/168 (34%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G + G G+ GP+GS G G +G G G G G G
Sbjct: 106 NQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPG 165
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 166 VTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQG 225
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G G +G GP G G SG + G G G +G
Sbjct: 226 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATG 273
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/172 (26%), Positives = 64/172 (37%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G+ GP+G+ G G GP+G+ G G +GP+G +G G
Sbjct: 370 PQGNPGITGPTGAEGSQGIQGTRGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQG--- 426
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G G G +G G G G +G + GP G G +G
Sbjct: 427 IAGPAGVTGAEGVQGEQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGAQGPQGVQGIQGTTG 486
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G +GP+G + GP G GP+G G+
Sbjct: 487 LTGAQGAQGLQGVQG------IIGPTGAIGLQGPQGLQGITGPTGVQGVQGI 532
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.89, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + GP G + G G+ GP+G G G
Sbjct: 83 VGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGI 139
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G G G GP G G G G G G
Sbjct: 140 QGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGI 199
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 200 TGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 259
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 260 QG-AKGVR 266
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 73 TTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAG 129
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +G G+ G G G G GP G G G G
Sbjct: 130 SQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQG 189
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 190 EDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQG 249
Query: 192 YLGLS 196
G+S
Sbjct: 250 IQGVS 254
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/161 (26%), Positives = 63/161 (39%), Gaps = 15/161 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G+ +G +G G G GP G++ G +G G +G
Sbjct: 539 IGPTGAQGIRGPQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNIGITGATGETGATGATGS 598
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------LRYLGPSGRLRY 120
GP G G +G G +G + GP G + G +G
Sbjct: 599 ---TGPQGVQGVQGITGIQGITGMTGDIGATGPQGIQGIQGIQGLQGPIGASGVTGASGS 655
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+GP G S G +G + G +G + +G SG G +G
Sbjct: 656 IGPVGAQGSQGQNGAVGPTGATGNVGSIGFSGIAGATGATG 696
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/193 (25%), Positives = 66/193 (34%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYL---------GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
GP+G G GS G G +G +G GP+G G G
Sbjct: 47 TGPTGATGPQGPQGPQGIRGIQGSRGTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGL 103
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP G + G G+ GP+G G G +G G+ G G G
Sbjct: 104 IGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGV 163
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G S GP G G G G G G +G + G G +GP+G
Sbjct: 164 PGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGI 223
Query: 184 LGPSGRLRYLGLS 196
GP G G++
Sbjct: 224 QGPQGISGIKGIT 236
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/175 (26%), Positives = 59/175 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP G + G G+ GP+G G G +G G+ G G
Sbjct: 99 GAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGER 158
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G G G G G G +G + G G GP+
Sbjct: 159 GVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPT 218
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP G G SG + G G G +G
Sbjct: 219 GSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATG 273
>gi|167639798|ref|ZP_02398067.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0193]
gi|177652132|ref|ZP_02934678.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0174]
gi|254735746|ref|ZP_05193452.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus anthracis str.
Western North America USA6153]
gi|167512199|gb|EDR87576.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0193]
gi|172082501|gb|EDT67566.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0174]
Length = 478
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/180 (33%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 34/180 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 182 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 232
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP G GP+G GP G GP+G GPSG GP+G
Sbjct: 233 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSG-----GPAGATG 281
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 282 PQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTG 332
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.054, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/161 (33%), Positives = 69/161 (42%), Gaps = 33/161 (20%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 212 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 262
Query: 73 -LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G PSG GP+G GP G GP G GP+G + G
Sbjct: 263 GIGVTGPTG------PSG-----GPAGATGPQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATG 308
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 170
P G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 309 PQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 343
>gi|115378370|ref|ZP_01465533.1| hypothetical protein STIAU_6254 [Stigmatella aurantiaca DW4/3-1]
gi|310823346|ref|YP_003955704.1| hypothetical protein STAUR_6120 [Stigmatella aurantiaca DW4/3-1]
gi|115364605|gb|EAU63677.1| hypothetical protein STIAU_6254 [Stigmatella aurantiaca DW4/3-1]
gi|309396418|gb|ADO73877.1| uncharacterized protein [Stigmatella aurantiaca DW4/3-1]
Length = 633
Score = 50.8 bits (120), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/207 (29%), Positives = 68/207 (32%), Gaps = 30/207 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 140 DTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQG 199
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---- 127
GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 200 LTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGAEGVATLAA 259
Query: 128 ---NSDGPS-----------------GRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSG 161
S GP+ G L +G L + GP G + GP G
Sbjct: 260 TTPESAGPNCAIGGTKVELGADNNRNGVLDTSEVTGTLTHYVCNGAQGPQGPIGTQGPKG 319
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G+ GP G LGP G
Sbjct: 320 DTGLAGPAGQTGPQGPEGSEGPLGPVG 346
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/211 (28%), Positives = 66/211 (31%), Gaps = 30/211 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 133 GDKGAKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDK 192
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 193 GDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGPQGLTGLTGPKGDKGDTGAE 252
Query: 134 GRL-------RYLGP-----------------SGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRL 163
G GP +G L +G L + GP G +
Sbjct: 253 GVATLAATTPESAGPNCAIGGTKVELGADNNRNGVLDTSEVTGTLTHYVCNGAQGPQGPI 312
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP+G+ GP G LG
Sbjct: 313 GTQGPKGDTGLAGPAGQTGPQGPEGSEGPLG 343
>gi|423528795|ref|ZP_17505240.1| hypothetical protein IGE_02347 [Bacillus cereus HuB1-1]
gi|402449663|gb|EJV81498.1| hypothetical protein IGE_02347 [Bacillus cereus HuB1-1]
Length = 835
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 69/168 (41%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G+
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGVQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGQT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP+G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + GP+G G G + +G +G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGVTGPTGSQGIQGVQGVIGPIGATGLQGDPGPTGSTGPTGVT 275
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 73/178 (41%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G+
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGVQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGQT 167
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG-- 131
G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQ 227
Query: 132 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G + GP+G G G + +G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 228 GPQGEMGVTGPTGSQGIQGVQGVIGPIGATGLQGDPGPTGS---TGPTG---VTGPTG 279
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.043, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 64/161 (39%), Gaps = 9/161 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G LG SG
Sbjct: 125 IGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGQTGNTGIQGVQGNLGGSGL 184
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +GP+G G G +GP+G GP G + GP+G S
Sbjct: 185 QGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGVTGPTG---S 241
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G +GP G G G GP+G GP+G
Sbjct: 242 QGIQGVQGVIGPIGATGLQGDPGPTGSTGPTG---VTGPTG 279
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGVQGIPGPI 125
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G + GP+G G G +GP+G+ + G G LG S
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGE---IGPTGQTGNTGIQGVQGNLGGS 182
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGLSDGL 199
G G G +GP+G G G +GP+G GP G + G +
Sbjct: 183 GLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGVTGPTGSQ 242
Query: 200 RVSGLH 205
+ G+
Sbjct: 243 GIQGVQ 248
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP + GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGP---MGERGPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 107 RGPTGPTGIQGVQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEI---GP 163
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G+ G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 164 TGQTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 223
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 224 QGL 226
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/145 (31%), Positives = 57/145 (39%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G+ G G +
Sbjct: 354 GPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGSTGPTGLQGLQGVQGPIGATGPTGQQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G + GP+G G G L GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 498
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 70/184 (38%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 50 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 106
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 107 R---GPTGPTGIQGVQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 163
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G+ G G LG SG G G +GP+G G G +G + V
Sbjct: 164 TGQTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGV 223
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 224 QGLQ 227
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/145 (31%), Positives = 57/145 (39%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G+ G G +
Sbjct: 354 GPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGSTGPTGLQGLQGVQGPIGATGPTGQQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G + GP+G G G L GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + G +G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 498
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/226 (26%), Positives = 74/226 (32%), Gaps = 39/226 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP+G G G L GP G G SG GP G
Sbjct: 413 TGPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGI 472
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--------------------- 111
GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 473 QGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGL 529
Query: 112 ------LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+GP+G G G S GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 530 QGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGP 586
Query: 166 LGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G GP G GP+G G++ + G+
Sbjct: 587 TGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 632
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.77, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/143 (30%), Positives = 58/143 (40%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G+ G G +
Sbjct: 354 GPMGVTGPTGDQGIQGPQGVMGSTGPTGLQGLQGVQGPIGATGPTGQQGVQGAQGPIGPT 413
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G G G + + GP+G G G L GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQ 473
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +GP+G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGD---IGPTGATGIQGV 493
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/140 (31%), Positives = 54/140 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGVMGSTGPTGLQGLQGVQGPIGATGPTGQQGVQGAQGPIGPTGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP+G G G L GP G G SG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 479 QGDIGPTGATGIQGVQGPEG 498
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 68/183 (37%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 92 R---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGVQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 148
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G + GP+G+ G G LG SG G G +GP+G
Sbjct: 149 TGIQGIQGVQGEI---GPTGQTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPMGPTGPTGS 205
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 206 QGI 208
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/185 (28%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 21/185 (11%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL----------- 64
SG GP G GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 461 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQGI 517
Query: 65 -RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G G G + GP+G G +G GP+G GP+G GP
Sbjct: 518 QGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS---TGPTGATGATGPTG---VTGP 571
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G GP G G +G GP G G G G +G GP G
Sbjct: 572 QGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGI 631
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 632 QGPQG 636
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/162 (27%), Positives = 58/162 (35%), Gaps = 18/162 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
++GP+G G G GP+G+ GP G G G + G
Sbjct: 481 DIGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTG 540
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G +G GP+G+ GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 541 PTGPQGIQGITGST---GPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTG 594
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G G G G +G GP G GP G
Sbjct: 595 VTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQG 636
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 69/183 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G G G + GP+G+ G G + GP G G G +
Sbjct: 369 GPQGVMGSTGPTGLQGLQGVQGPIGATGPTGQQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVM 428
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G L GP G G SG GP G GP G + G +
Sbjct: 429 GATGPTGLQGLQGIQGPLGPTGPQGLQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGAT 488
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G G G + GP+G
Sbjct: 489 GIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQ 548
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 549 GIT 551
>gi|195977744|ref|YP_002122988.1| hypothetical protein Sez_0608 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
gi|195974449|gb|ACG61975.1| collagen-like protein SclZ.7 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
Length = 441
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/174 (32%), Positives = 70/174 (40%), Gaps = 15/174 (8%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
+ EKA GP G GP G GP G +GP G +GP+G + G +G
Sbjct: 74 LEEKAEQPGPMG---PAGPRGERGEAGPQGP---VGPRGETGPIGPAGPIGPKGEAGPQG 127
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP+G +GP G GP+G +GP G GP G GP+G
Sbjct: 128 EPGPQGDPGKQGPTGPQGPVGPRGETGPAGPAG---PIGPKG---EAGPQGDPGKQGPTG 181
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G GP G GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 182 PQGPRGDKGETGEAGPKG---EQGPAGPMGPRGDKGETGEAGPKGEQGPAGPKG 232
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G +GP+G + G +G GP G GP+G +GP G GP+G
Sbjct: 102 VGPRGETGPIGPAGPIGPKGEAGPQGEPGPQGDPGKQGPTGPQGPVGPRGETGPAGPAG- 160
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP G GP G GP+G G G GP G GP+G + G
Sbjct: 161 --PIGPKGEA---GPQGDPGKQGPTGPQGPRGDKGETGEAGPKGEQ---GPAGPMGPRGD 212
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G G G G G G G G G
Sbjct: 213 KGETGEAGPKGEQGPAGPKGDRGERGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQ 270
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.078, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/178 (29%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + G +G GP G GP+G +GP G GP+G +GP G
Sbjct: 111 IGPAGPIGPKGEAGPQGEPGPQGDPGKQGPTGPQGPVGPRGET---GPAGPAGPIGPKG- 166
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G G G GP G GP+G + G G GP
Sbjct: 167 --EAGPQGDPGKQGPTGPQGPRGDKGETGEAGPKG---EQGPAGPMGPRGDKGETGEAGP 221
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G G G G G G G G G G G
Sbjct: 222 KGEQGPAGPKGDRGERGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQ 279
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/179 (29%), Positives = 59/179 (32%), Gaps = 12/179 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G GP+G +GP G GP+G +GP G GP G
Sbjct: 122 EAGPQG---EPGPQGDPGKQGPTGPQGPVGPRG---ETGPAGPAGPIGPKG---EAGPQG 172
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G G G GP G GP+G + G G GP G G
Sbjct: 173 DPGKQGPTGPQGPRGDKGETGEAGPKG---EQGPAGPMGPRGDKGETGEAGPKGEQGPAG 229
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P G G G G G G G G G G G G G
Sbjct: 230 PKGDRGERGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQ 288
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.74, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 58/177 (32%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G +GP G GP+G +GP G GP G GP+G
Sbjct: 130 GPQGDPGKQGPTGPQGPVGPRGETGPAGPAG---PIGPKGE---AGPQGDPGKQGPTGPQ 183
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G GP+G + G G GP G GP G G
Sbjct: 184 GPRGDKGETGEAGPKG---EQGPAGPMGPRGDKGETGEAGPKGEQGPAGPKGDRGERGEK 240
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G G G G G G G G G G
Sbjct: 241 GEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQ 297
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 56/182 (30%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G +GP G GP+G + GP G GP+G G G G
Sbjct: 137 KQGPTGPQGPVGPRGETGPAGPAGPIGPKGEAGPQGDPGKQGPTGPQGPRGDKGETGEAG 196
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP+G + G G GP G GP G G G G G
Sbjct: 197 PKGEQ---GPAGPMGPRGDKGETGEAGPKGEQGPAGPKGDRGERGEKGEQGQRGEKGEQG 253
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G G G G G G G G G G G
Sbjct: 254 QRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKGEQGQRGEKG 313
Query: 189 RL 190
Sbjct: 314 EQ 315
>gi|218899883|ref|YP_002448294.1| hypothetical protein BCG9842_B0398 [Bacillus cereus G9842]
gi|218544076|gb|ACK96470.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus G9842]
Length = 951
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQ 339
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 340 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 396
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 397 GPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 454
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 61/174 (35%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGD 365
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 366 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGV 425
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 426 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGV 479
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 370
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 371 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITG 430
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 431 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 484
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 485 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 501
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 330 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 386
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 387 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 446
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 447 IGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 506
Query: 190 L 190
Sbjct: 507 T 507
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/168 (30%), Positives = 60/168 (35%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 346 GPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 402
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 403 GIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQ 462
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 463 GE---IGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 507
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 9/178 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP--- 87
+GP+G GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 273 IGPTGPE---GPQGIQGIPGPTGITGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGV 329
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 330 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 386
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G+ + G+
Sbjct: 387 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 56/160 (35%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 351 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGT 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 411 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEI---GP 467
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 468 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 507
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQG- 93
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 94 ---LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIKGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTGITGPTGI 201
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 64/170 (37%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIKGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTG---ITGPTG 200
>gi|187776950|ref|ZP_02993423.1| hypothetical protein CLOSPO_00494 [Clostridium sporogenes ATCC
15579]
gi|187775609|gb|EDU39411.1| BclB domain protein [Clostridium sporogenes ATCC 15579]
Length = 344
Score = 50.4 bits (119), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/151 (31%), Positives = 66/151 (43%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 39 ITGPTGPRGVTGVTGLRGVTGPTGLRGITGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTG 98
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 99 LRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTG 158
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
P+G GP+G GP+G + + G
Sbjct: 159 PTGLRGVTGPTGLRGITGPTGASAIIPFASG 189
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/146 (32%), Positives = 64/146 (43%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 39 ITGPTGPRGVTGVTGLRGVTGPTGLRGITGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTG 98
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 99 LRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTG 158
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G GP+G GP+G +
Sbjct: 159 PTGLRGVTGPTGLRGITGPTGASAII 184
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/146 (32%), Positives = 64/146 (43%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 39 ITGPTGPRGVTGVTGLRGVTGPTGLRGITGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTG 98
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 99 LRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTGPTGLRGVTG 158
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
P+G GP+G GP+G +
Sbjct: 159 PTGLRGVTGPTGLRGITGPTGASAII 184
>gi|422330225|ref|ZP_16411248.1| hypothetical protein HMPREF0981_04568 [Erysipelotrichaceae
bacterium 6_1_45]
gi|371654787|gb|EHO20150.1| hypothetical protein HMPREF0981_04568 [Erysipelotrichaceae
bacterium 6_1_45]
Length = 487
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/158 (26%), Positives = 64/158 (40%), Gaps = 15/158 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G + GP+G+ GP+G++ G +G GP+G + G +G G +G
Sbjct: 137 NTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPIGATGSTGAAGATGVTG 196
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------ 119
+GP+G G +G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 197 PTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGAPGNTGATGTTGVTG 256
Query: 120 ---YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
+GP+G + GP G G G GP G
Sbjct: 257 ADGAIGPTGPIGDPGPQGEPGPQGEPGPQGEQGPQGET 294
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/166 (25%), Positives = 68/166 (40%), Gaps = 15/166 (9%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ G +G + GP+G GP+G++ G +G GP+G + G +G+
Sbjct: 129 TGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPIGATGSTGA 188
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR---- 137
G +G +GP+G G +G G +G +GP+G + GP+G
Sbjct: 189 AGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGAPGNTGA 248
Query: 138 -----------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+GP+G + GP G G G GP G
Sbjct: 249 TGTTGVTGADGAIGPTGPIGDPGPQGEPGPQGEPGPQGEQGPQGET 294
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/150 (28%), Positives = 66/150 (44%), Gaps = 4/150 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL-RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+ L ++ P G G +G +G +G G +G GP G+ GP+G
Sbjct: 96 GPNHVLDFVIPRGDTGITGATGPTGPGVGATGPTGATGATGNTGATGPIGAT---GPTGA 152
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP+G + G +G GP+G + G +G + G +G +GP+G G
Sbjct: 153 NGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPIGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGS 212
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G G +G +GP+G GP+G
Sbjct: 213 TGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGA 242
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/202 (25%), Positives = 81/202 (40%), Gaps = 28/202 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG----SLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRY 66
GP+ L ++ P G G +G + GP+G G +G+ + GP+G
Sbjct: 96 GPNHVLDFVIPRGDTGITGATGPTGPGVGATGPTGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGN 155
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP+G + G +G+ GP+G + G +G GP+G + GP+G G
Sbjct: 156 TGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPIGATGSTGAAGATGVTGPTGDI---GPTGPTGATGS 212
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGRLRYLGP 168
+G + G +G +GP+G GP+G +GP+G + GP
Sbjct: 213 TGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGAPGNTGATGTTGVTGADGAIGPTGPIGDPGP 272
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G GP G
Sbjct: 273 QGEPGPQGEPGPQGEQGPQGET 294
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/134 (26%), Positives = 59/134 (44%), Gaps = 13/134 (9%)
Query: 77 GPSGSLRYL---GPSGRLRYLGPSGR-LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+ L ++ G +G GP+G + GP+G +G G +G + + GP
Sbjct: 96 GPNHVLDFVIPRGDTGITGATGPTGPGVGATGPTGA------TGATGNTGATGPIGATGP 149
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G + G +G GP+G + G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 150 TGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPIGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGA 209
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 210 TGSTGAAGATGVTG 223
>gi|229145932|ref|ZP_04274311.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST24]
gi|228637540|gb|EEK93991.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST24]
Length = 696
Score = 50.4 bits (119), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 68/168 (40%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPT 169
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 170 GNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 229
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 230 GPQGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDRGPTGPTGATGIT 277
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGIQGIQ 247
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 248 GVQ 250
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 188
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDRGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 68/170 (40%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSG 179
G + +GP+G G G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 232 QGEMGQVGPTGIQGIQGVQGVIGPTGPTGLQGDRGPTGPTGATGITGPTG 281
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 9/177 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+G+ G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G G + GP G G G GP+G G +G++ + GP+G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVTGQVGATGPTG---AT 457
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP G +G +G GP G GP G GP+G GL+
Sbjct: 458 GPQGLQGIQGPQGVTGQVGATGATGATGPQGPQGIQGPQG---ITGPTGVTGQTGLT 511
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G
Sbjct: 343 TGATGVTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGP 402
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP G G G GP+G G +G++ GP+G + GP
Sbjct: 403 QGVQGAQGPIGPTGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVTGQVGATGPTG---ATGP 459
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP G +G +G GP G GP G G +G+ G +G
Sbjct: 460 QGLQGIQGPQGVTGQVGATGATGATGPQGPQGIQGPQGITGPTGVTGQTGLTGATGPTGN 519
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 520 QGI 522
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.041, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G L G SG G G +GP+G G G +GP G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGNL---GGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 225
Query: 193 LGLS 196
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.045, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/196 (27%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS--- 129
G G GP+G G +G++ GP+G GP G GP G
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVTGQVGATGPTG---ATGPQGLQGIQGPQGVTGQVGA 477
Query: 130 ---------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 478 TGATGATGPQGPQGIQGPQGITGPTGVTGQTGLTGATGPTGNQGIRGVTGPTGATGATGV 537
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G S
Sbjct: 538 TGATGPTGATGPTGSS 553
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.095, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 355 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGP 414
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G G G GP+G G +G++ GP+G GP G GP G
Sbjct: 415 TGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVTGQVGATGPTG---ATGPQGLQGIQGPQGV 471
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LR-YLGPSGR 189
+G +G GP G GP +G G +G GP+G +R GP+G
Sbjct: 472 TGQVGATGATGATGPQGPQGIQGPQGITGPTGVTGQTGLTGATGPTGNQGIRGVTGPTGA 531
Query: 190 LRYLGLS 196
G++
Sbjct: 532 TGATGVT 538
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.74, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/157 (29%), Positives = 58/157 (36%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + GP+G G+ L SGL
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 187
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP +GP+G G G GP+G GP GS GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 94 ---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGP 150
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G G G + GP+G G G L
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNL 181
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP GS GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G + GP+G G G +GP+G G G +GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPI---GPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGP 165
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
+G G G LG SG G G +GP+G G G +G V
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGV 225
Query: 202 SGLH 205
GL
Sbjct: 226 QGLQ 229
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/172 (29%), Positives = 62/172 (36%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GP+G G G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 GPTGPQGIQGVQGPIGPTGPQGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE---R 94
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 95 GPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQ 154
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G + GP+G G G L G G G G + GP+G
Sbjct: 155 GIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTG 206
>gi|319935417|ref|ZP_08009854.1| collagen triple helix repeat protein [Coprobacillus sp. 29_1]
gi|319809633|gb|EFW06046.1| collagen triple helix repeat protein [Coprobacillus sp. 29_1]
Length = 742
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/205 (23%), Positives = 76/205 (37%), Gaps = 45/205 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR--LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G +G GP+G+ GP+G + GP+G+ G +G GP+
Sbjct: 74 TGPTGNTGATGATGVTGATGPTGATGPTGPTGATGVGITGPTGATGATGANGITGPTGPT 133
Query: 71 GR-----------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G + GP+G+ GP+G P+G GP+G G
Sbjct: 134 GNTGPTGATGATGATGPTGIGITGPTGATGATGPTG------PTGANGITGPTGPTGNTG 187
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSD-----------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
P+G +GP+G ++ + GP+G G +G
Sbjct: 188 PTGANGLIGPTGPTGANGTTGVTGPTGATGATGATGPTGIGITGPTGATGATGANG---I 244
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G GP+G G G +
Sbjct: 245 TGPTGPTGATGPTGATGNTGADGAI 269
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/210 (26%), Positives = 81/210 (38%), Gaps = 49/210 (23%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
GP+G + GP G+ +GP + Y G+ GP+G+ GP G GP
Sbjct: 5 AGPTGPMGCPGPRGATGPMGP---MGY---PGKTGATGPTGA---TGPRGITGATGPRGC 55
Query: 70 ------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPS 115
+G GP+G+ G +G GP+G GP+G + GP+
Sbjct: 56 PGPRGCPGPRGITGATGPTGPTGNTGATGATGVTGATGPTGATGPTGPTGATGVGITGPT 115
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGR-----------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G G +G GP+G + GP+G GP+ G
Sbjct: 116 GATGATGANGITGPTGPTGNTGPTGATGATGATGPTGIGITGPTGATGATGPT------G 169
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP+G GP+G +GP+G
Sbjct: 170 PTGANGITGPTGPTGNTGPTGANGLIGPTG 199
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.070, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/223 (23%), Positives = 77/223 (34%), Gaps = 54/223 (24%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGR------ 63
GP+G GP+G P+G+ GP+G GP+G+ + GP+G
Sbjct: 156 TGPTGATGATGPTG------PTGANGITGPTGPTGNTGPTGANGLIGPTGPTGANGTTGV 209
Query: 64 --------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
+G +G G +G+ GP+G GP+G G G +
Sbjct: 210 TGPTGATGATGATGPTGIGITGPTGATGATGANGITGPTGPTGATGPTGATGNTGADGAI 269
Query: 110 R--------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR--LRY 147
GP G G +G +DG G GP+G +
Sbjct: 270 GPTGATGTTGPTGATGVGITGATGPIGATGPTGATGNTGADGAIGPTGATGPTGATGVGI 329
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP+G G G +GP+G G G +
Sbjct: 330 TGATGPTGATGPTGATGNTGADGA---IGPTGATGNTGADGAI 369
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/176 (25%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 31/176 (17%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--- 105
GP+G + GP G +GP + Y G +G+ G +G G +G GP
Sbjct: 5 AGPTGPMGCPGPRGATGPMGP---MGYPGKTGATGPTGATGPRGITGATGPRGCPGPRGC 61
Query: 106 ------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYL 157
+G GP+G G +G + GP+G GP+G + GP+G
Sbjct: 62 PGPRGITGATGPTGPTGNTGATGATGVTGATGPTGATGPTGPTGATGVGITGPTGATGAT 121
Query: 158 GPSGRLRYLGPSGR-----------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G + GP+G GP+G G++
Sbjct: 122 GANGITGPTGPTGNTGPTGATGATGATGPTGIGITGPTGATGATGPTGPTGANGIT 177
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/255 (21%), Positives = 85/255 (33%), Gaps = 72/255 (28%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL--------------------RYLGPSGRLRYL 49
A +G +G G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 106 ATGVGITGPTGATGATGANGITGPTGPTGNTGPTGATGATGATGPTGIGITGPTGATGAT 165
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG-------------------- 89
GP+ GP+G GP+G GP+G+ +GP+G
Sbjct: 166 GPT------GPTGANGITGPTGPTGNTGPTGANGLIGPTGPTGANGTTGVTGPTGATGAT 219
Query: 90 ------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP----------- 132
+ GP+G G +G GP+G G +G +DG
Sbjct: 220 GATGPTGIGITGPTGATGATGANGITGPTGPTGATGPTGATGNTGADGAIGPTGATGTTG 279
Query: 133 ---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYL 184
+ + G +G + GP+G G G + GP+G + G +G
Sbjct: 280 PTGATGVGITGATGPIGATGPTGATGNTGADGAIGPTGATGPTGATGVGITGATGPTGAT 339
Query: 185 GPSGRLRYLGLSDGL 199
GP+G G +DG
Sbjct: 340 GPTGATGNTG-ADGA 353
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/192 (22%), Positives = 69/192 (35%), Gaps = 47/192 (24%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG--------------------------SLRYLGPSGSLRYLGPSGR 45
N GP+G +GP+G + GP+G+ G +G
Sbjct: 185 NTGPTGANGLIGPTGPTGANGTTGVTGPTGATGATGATGPTGIGITGPTGATGATGANG- 243
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------RYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G GP+G G G + +G +G+ +G +G
Sbjct: 244 --ITGPTGPTGATGPTGATGNTGADGAIGPTGATGTTGPTGATGVGITGATGPIGATGPT 301
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G +GP+G G +G + G +G + GP+G G G +GP+
Sbjct: 302 GATGNTGADGAIGPTGATGPTGATG-VGITGATGPTGATGPTGATGNTGADGA---IGPT 357
Query: 152 GRLRYLGPSGRL 163
G G G +
Sbjct: 358 GATGNTGADGAI 369
>gi|225868146|ref|YP_002744094.1| collagen-binding collagen-like cell surface-anchored protein FneC
[Streptococcus equi subsp. zooepidemicus]
gi|225701422|emb|CAW98522.1| putative collagen-binding collagen-like cell surface-anchored
protein FneC [Streptococcus equi subsp. zooepidemicus]
Length = 677
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G +GP G G +G G G+ GP
Sbjct: 400 GPQGFPGKQGPAGEKGEPGKQGDRGPVGPQGPRGDKGETGEKGLQGNPGKDGKPGERGPK 459
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G GP G G GR + G G+ GP G GP G
Sbjct: 460 GDTGDRGPAGP---QGPRGENGKDGAPGRDGHDGQDGKDGQPGPKGERGEQGPKGERGEQ 516
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 517 GPQGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 575
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 62/179 (34%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G +GP G G +G G G GP G GP+
Sbjct: 409 GPAGEKGEPGKQGDRGPVGPQGPRGDKGETGEKGLQGNPGKDGKPGERGPKGDTGDRGPA 468
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G G GR + G G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 469 G---PQGPRGENGKDGAPGRDGHDGQDGKDGQPGPKGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQ 525
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 526 GPKGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 584
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/148 (33%), Positives = 53/148 (35%), Gaps = 5/148 (3%)
Query: 8 EKAL--NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
EK L N G G+ GP G GP+G GP G G G + G G+
Sbjct: 440 EKGLQGNPGKDGKPGERGPKGDTGDRGPAGP---QGPRGENGKDGAPGRDGHDGQDGKDG 496
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 497 QPGPKGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQGPKGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQGPQG 556
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP G GP G GP G
Sbjct: 557 ERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 584
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.031, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 367 GPAGPQGPKGENGKDGQPGPKGDTGARGPAG---PQGPQGFPGKQGPAGEKGEPGKQGDR 423
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP G G +G G G+ GP G GP+G GP G D
Sbjct: 424 GPVGPQGPRGDKGETGEKGLQGNPGKDGKPGERGPKGDTGDRGPAG---PQGPRGENGKD 480
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GR + G G+ GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 481 GAPGRDGHDGQDGKDGQPGPKGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQGPKGERGEQGPKGE 539
>gi|321474928|gb|EFX85892.1| hypothetical protein DAPPUDRAFT_313736 [Daphnia pulex]
Length = 474
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/172 (31%), Positives = 74/172 (43%), Gaps = 4/172 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG-PS---GSLRYLGPSGRLRYLG 68
+GP+G+ Y G G G G Y G G+ G PS G + GP G+ Y G
Sbjct: 249 VGPAGKNGYAGSPGIAGPKGEPGKPGYNGAPGKDGLPGAPSTQPGPVGPQGPVGKPGYNG 308
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G+ +GP G+ G +G GP G G G G G GP G
Sbjct: 309 APGKDGAVGPVGAPGKDGLNGAPGATGPQGEQGKPGKDGYPGSAGAPGTPGAQGPQGIQG 368
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G +GP G + +GP+G G +G+ Y GP G + +GP G+
Sbjct: 369 EQGPAGTPGSIGPQGEIGPVGPAGPEGKPGQAGKPGYPGPVGPVGQVGPVGQ 420
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/197 (27%), Positives = 76/197 (38%), Gaps = 16/197 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + G + + GP G+ Y G+ G +GS G G +GP+G+
Sbjct: 198 VGPKGEIGAPGITIESKIPGPPGATGY---PGKDGAPGAAGSPGPQGNPGTQGPVGPAGK 254
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR-------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
Y G G G G+ Y G G+ + GP G+ Y G G+
Sbjct: 255 NGYAGSPGIAGPKGEPGKPGYNGAPGKDGLPGAPSTQPGPVGPQGPVGKPGYNGAPGKDG 314
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+GP G DG +G GP G G G G G GP G GP+G
Sbjct: 315 AVGPVGAPGKDGLNGAPGATGPQGEQGKPGKDGYPGSAGAPGTPGAQGPQGIQGEQGPAG 374
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP G + +G +
Sbjct: 375 TPGSIGPQGEIGPVGPA 391
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/118 (30%), Positives = 52/118 (44%), Gaps = 3/118 (2%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G+ +GP G+ G +G+ GP G G G G G GP G
Sbjct: 311 GKDGAVGPVGAPGKDGLNGAPGATGPQGEQGKPGKDGYPGSAGAPGTPGAQGPQGIQGEQ 370
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDG 131
GP+G+ +GP G + +GP+G G +G+ Y GP G + +GP G+ DG
Sbjct: 371 GPAGTPGSIGPQGEIGPVGPAGPEGKPGQAGKPGYPGPVGPVGQVGPVGQEGKPGQDG 428
>gi|30022798|ref|NP_834429.1| hypothetical protein BC4725 [Bacillus cereus ATCC 14579]
gi|29898357|gb|AAP11630.1| hypothetical Membrane Spanning Protein [Bacillus cereus ATCC 14579]
Length = 1309
Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 62/176 (35%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPM 369
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 370 GDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQ 429
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 430 GVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGV 485
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GPS
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPS 354
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 355 GE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 411
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 412 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 471
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 472 GPTG 475
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGI 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 490
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 491 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TG 358
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 359 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 418
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 419 PQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 512
Query: 190 LRYL 193
+
Sbjct: 513 TGDM 516
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 391
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQG 451
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 511
Query: 180 RLRYL 184
+
Sbjct: 512 ATGDM 516
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 406
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 59/164 (35%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G G G GP+G
Sbjct: 239 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTG 298
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 299 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE-- 356
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 357 -TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 399
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 955 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1014
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1015 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1047
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/170 (28%), Positives = 62/170 (36%), Gaps = 9/170 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G G G +GP+G R G GR R G G + GP GP G
Sbjct: 693 DIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPRRPEGCRGRKRIQGVQGPVGATGPE------GPQG 746
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 747 IQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQG 806
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 807 IQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGAT 853
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 920 TGDTGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1036
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/163 (30%), Positives = 60/163 (36%), Gaps = 6/163 (3%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+GP+GS G G +GP+G R G GR R GP G GP G G
Sbjct: 694 IGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPRRPEGCRGRKRIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGV 753
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G GP G G G G G G G + + GP G G G
Sbjct: 754 QGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQG---A 810
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 811 IGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGAT 853
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +GS G +G G G G G + GP G GP G G +G
Sbjct: 923 TGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQG---IQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G +GP+G GP G G +G + GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1036
Query: 151 SGRLRYLGPSG 161
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/153 (32%), Positives = 56/153 (36%), Gaps = 9/153 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPGGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGSQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G GP G G G GPSG
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTPGPSGN 181
>gi|256420652|ref|YP_003121305.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein
[Chitinophaga pinensis DSM 2588]
gi|256035560|gb|ACU59104.1| collagen triple helix repeat protein [Chitinophaga pinensis DSM
2588]
Length = 1101
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 71/174 (40%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G GP+G+ GP+G GP G+ GP G + G G
Sbjct: 141 TGPQGPAGPTGAKGDAGATGPAGAKGDTGPAGAA---GPQGAPGVAGPVGPVGPAGAKGD 197
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G+ GP G + G G GP G + +GP G GP G GP
Sbjct: 198 AGAAGPQGAPGVAGPVGPVGPAGAKGDAGVAGPQGPVGAIGPVGPAGAAGPQGN---PGP 254
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + +GP G GP G GP+G + +GP+G GP G GP
Sbjct: 255 VGPIGPIGPVGPAGATGPQGDPGVAGPAGPVGPIGPAGA---TGPQGDAGVAGP 305
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 78/181 (43%), Gaps = 12/181 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G G +G+ GP+G GP+G+ GP G GP G +
Sbjct: 136 GPAGPTGPQGPAGPTGAKGDAGAT---GPAGAKGDTGPAGAA---GPQGAPGVAGPVGPV 189
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G GP G + G G GP G + +GP G + GP
Sbjct: 190 GPAGAKGDAGAAGPQGAPGVAGPVGPVGPAGAKGDAGVAGPQGPVGAIGPVGPAGAAGPQ 249
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +GP G + +GP+G GP G GP+G + +GP+G GP G
Sbjct: 250 GNPGPVGPIGPIGPVGPAGA---TGPQGDPGVAGPAGPVGPIGPAGA---TGPQGDAGVA 303
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 304 G 304
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/135 (30%), Positives = 55/135 (40%), Gaps = 18/135 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G + +GP G GP G +GP G + +GP+G GP G
Sbjct: 220 GAKGDAGVAGPQGPVGAIGPVGPAGAAGPQGNPGPVGPIGPIGPVGPAGAT---GPQGDP 276
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G + +GP+G GP G GP +G GP G +
Sbjct: 277 GVAGPAGPVGPIGPAGA---TGPQGDAGVAGPIGPVGPAGAAGVAGPAGPQGPVGPVGPA 333
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G +N G L
Sbjct: 334 GPAGEINGAAAGGDL 348
>gi|165881936|gb|ABY71234.1| Col1a2 [Squalus acanthias]
Length = 1192
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/164 (32%), Positives = 70/164 (42%), Gaps = 12/164 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G GP GS GPSG G SG + G +G+ G G GP
Sbjct: 490 VGPQGNTGIDGPRGAPGSAGAPGPSGPSGDRGESGSAGHSGAAGARGTPGERGEAGRAGP 549
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGR 126
+G + GP G+ G G G G + GP+G + G SG G G
Sbjct: 550 TG---FAGPPGADGQPGAKGETGVAGSKGEV---GPAGSIGLAGASGHPGVAGVPGLQGV 603
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+ S GPSG + GP+GR GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 604 IGSSGPSGMTGFPGPAGRAGAPGPAGPQGPIGPAGPFGNSGPQG 647
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/186 (31%), Positives = 75/186 (40%), Gaps = 15/186 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLR 65
+ GP G + G G GP G +GP G GP GS GPSG
Sbjct: 459 HQGPQGSMGMSGEQGGAGTPGPKGEKGDHGPVGPQGNTGIDGPRGAPGSAGAPGPSGPSG 518
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G SG + G +G+ G G GP+G + GP G G G G G
Sbjct: 519 DRGESGSAGHSGAAGARGTPGERGEAGRAGPTG---FAGPPGADGQPGAKGETGVAGSKG 575
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP+G + G SG G G + GPSG + GP+GR GP+G
Sbjct: 576 EV---GPAGSIGLAGASGHPGVAGVPGLQGVIGSSGPSGMTGFPGPAGRAGAPGPAGPQG 632
Query: 183 YLGPSG 188
+GP+G
Sbjct: 633 PIGPAG 638
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/160 (33%), Positives = 68/160 (42%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G SGS GP G + G SG G GS +G G+ GP+G + G SG+
Sbjct: 251 GESGSFGAKGPPGDIGRPGESGIPGARGLVGSTGNIGAPGKS---GPAGAVGEEGRSGAA 307
Query: 83 RYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GP +G + + GP G LG G +GPSG G G + + GP G +
Sbjct: 308 GSAGPRGQAGMMGFPGPKGATGALGKPGDRGGVGPSGARGAAGKDGEVGAQGPGGVSGAV 367
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G G SG GPSG + LG G G SG
Sbjct: 368 GARGESGPAGSSGFQGVPGPSGAVGELGKPGDRGIRGDSG 407
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/186 (30%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 24/186 (12%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
+G +G + GP GS+ G G GP G GP +GP G GP
Sbjct: 450 EVGVAGIPGHQGPQGSMGMSGEQGGAGTPGPKGEKGDHGP------VGPQGNTGIDGPRG 503
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---NSDGPSG 134
GS GPSG G SG + G +G G G GP+G +DG G
Sbjct: 504 APGSAGAPGPSGPSGDRGESGSAGHSGAAGARGTPGERGEAGRAGPTGFAGPPGADGQPG 563
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G +G +GP+G + G SG + GPSG + GP+GR
Sbjct: 564 AKGETGVAGSKGEVGPAGSIGLAGASGHPGVAGVPGLQGVIGSSGPSGMTGFPGPAGRAG 623
Query: 183 YLGPSG 188
GP+G
Sbjct: 624 APGPAG 629
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/154 (32%), Positives = 62/154 (40%), Gaps = 9/154 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G SGS GP G + G SG G G +G G+ GP+G++ G SG
Sbjct: 251 GESGSFGAKGPPGDIGRPGESGIPGARGLVGSTGNIGAPGKS---GPAGAVGEEGRSGAA 307
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G+ +G + GP G LG G GPSG G G + GP
Sbjct: 308 GSAGPRGQAGMMG------FPGPKGATGALGKPGDRGGVGPSGARGAAGKDGEVGAQGPG 361
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G G G SG GPSG + LG
Sbjct: 362 GVSGAVGARGESGPAGSSGFQGVPGPSGAVGELG 395
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/148 (33%), Positives = 62/148 (41%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G SGS GP G + G SG G GS +G G+ GP+G + G SG
Sbjct: 251 GESGSFGAKGPPGDIGRPGESGIPGARGLVGSTGNIGAPGK---SGPAGAVGEEGRSGAA 307
Query: 110 RYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
GP +G + + GP G + G G +GPSG G G + GP G +
Sbjct: 308 GSAGPRGQAGMMGFPGPKGATGALGKPGDRGGVGPSGARGAAGKDGEVGAQGPGGVSGAV 367
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G G SG GPSG + LG
Sbjct: 368 GARGESGPAGSSGFQGVPGPSGAVGELG 395
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/114 (33%), Positives = 52/114 (45%), Gaps = 6/114 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N+G G+ GP+G++ G SG+ GP +G + + GP G+ LG G +G
Sbjct: 285 NIGAPGKS---GPAGAVGEEGRSGAAGSAGPRGQAGMMGFPGPKGATGALGKPGDRGGVG 341
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
PSG G G + GP G +G G G SG GPSG + LG
Sbjct: 342 PSGARGAAGKDGEVGAQGPGGVSGAVGARGESGPAGSSGFQGVPGPSGAVGELG 395
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 71/191 (37%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G + G SG+ GP +G + + GP G LG G +GPSG G
Sbjct: 293 GPAGAVGEEGRSGAAGSAGPRGQAGMMGFPGPKGATGALGKPGDRGGVGPSGARGAAGKD 352
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G +G G G SG GPSG + LG G G SG +
Sbjct: 353 GEVGAQGPGGVSGAVGARGESGPAGSSGFQGVPGPSGAVGELGKPGDRGIRGDSGTPGAS 412
Query: 131 G------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G +G G G G G +G +G + GP G + G
Sbjct: 413 GSRGERGLPGERGAAGSQGLTGSRGAQGAPGSDGGKGEVGVAGIPGHQGPQGSMGMSGEQ 472
Query: 179 GRLRYLGPSGR 189
G GP G
Sbjct: 473 GGAGTPGPKGE 483
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/117 (33%), Positives = 52/117 (44%), Gaps = 12/117 (10%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+A GP+G + GP G+ G G G G + GP+GS+ G SG G
Sbjct: 543 EAGRAGPTG---FAGPPGADGQPGAKGETGVAGSKGEV---GPAGSIGLAGASGHPGVAG 596
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G S GPSG + GP+GR GP+G +GP+G GP G
Sbjct: 597 VPGLQGVIGSS------GPSGMTGFPGPAGRAGAPGPAGPQGPIGPAGPFGNSGPQG 647
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/131 (32%), Positives = 56/131 (42%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G +G++ G SG +G GR G +GS G +G + + GP G LG G
Sbjct: 280 VGSTGNIGAPGKSGPAGAVGEEGRS---GAAGSAGPRGQAGMMGFPGPKGATGALGKPGD 336
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+GPSG G G + GP G +G G G SG GPSG + LG
Sbjct: 337 RGGVGPSGARGAAGKDGEVGAQGPGGVSGAVGARGESGPAGSSGFQGVPGPSGAVGELGK 396
Query: 142 SGRLRYLGPSG 152
G G SG
Sbjct: 397 PGDRGIRGDSG 407
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 76/187 (40%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GPSG GP G GP G + G G G G+ G +GR +G G
Sbjct: 192 DAGPSG---VAGPRGEEGKQGPRGEVGSQGLIGISGERGSHGNRGIPGSNGRAGGMGLPG 248
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R G SGS GP G + G SG G G +G G+ GP+G + +G
Sbjct: 249 R---RGESGSFGAKGPPGDIGRPGESGIPGARGLVGSTGNIGAPGK---SGPAGAVGEEG 302
Query: 132 PSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP +G + + GP G LG G +GPSG G G + GP G
Sbjct: 303 RSGAAGSAGPRGQAGMMGFPGPKGATGALGKPGDRGGVGPSGARGAAGKDGEVGAQGPGG 362
Query: 189 RLRYLGL 195
+G
Sbjct: 363 VSGAVGA 369
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 18/187 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G LG G +GPSG+ G G + GP G +G G G SG
Sbjct: 323 GPKGATGALGKPGDRGGVGPSGARGAAGKDGEVGAQGPGGVSGAVGARGESGPAGSSGFQ 382
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GPSG++ LG G G SG G G G G G G
Sbjct: 383 GVPGPSGAVGELGKPGDRGIRGDSGTPGASGSRGERGLPGERGAAGSQGLTGSRGAQGAP 442
Query: 128 NSDGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
SDG G + + GP G + G G GP G GP +GP G
Sbjct: 443 GSDGGKGEVGVAGIPGHQGPQGSMGMSGEQGGAGTPGPKGEKGDHGP------VGPQGNT 496
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 497 GIDGPRG 503
>gi|194014775|ref|ZP_03053392.1| hypothetical protein BAT_2218, partial [Bacillus pumilus ATCC 7061]
gi|194013801|gb|EDW23366.1| hypothetical protein BAT_2218, partial [Bacillus pumilus ATCC 7061]
Length = 342
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/148 (27%), Positives = 58/148 (39%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 200 TGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTG---VTGATGDTGPTGPTGVTGD 256
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G G +G + GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 257 TGPTGVTGATGDTGPTGVTGATG---ATGPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGP 313
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G +G G +G
Sbjct: 314 TGVTGPTGVTGATGDTGPTGDTGATGAT 341
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/148 (27%), Positives = 58/148 (39%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 200 TGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTG---VTGATGDTGPTGPTGVTGD 256
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 257 TGPTGVTGATGDTGPTGVTGATG---ATGPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGP 313
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G G +G G +G
Sbjct: 314 TGVTGPTGVTGATGDTGPTGDTGATGAT 341
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/136 (27%), Positives = 53/136 (38%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 200 TGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTG---VTGATGDTGPTGPTGVTGD 256
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G G +G G +G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 257 TGPTGVT---GATGDTGPTGVTGATGATGPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVTGP 313
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G +
Sbjct: 314 TGVTGPTGVTGATGDT 329
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/221 (21%), Positives = 73/221 (33%), Gaps = 36/221 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGSLR 56
+ GP+G G +G+ G +G G +G G +G+
Sbjct: 91 DTGPTGVTGDTGVTGATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATG 150
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------------------SGRLRYLGPSG 98
GP+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 151 DTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTG 210
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
G +G GP+G GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 211 PTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDTG 270
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G GP+G G++
Sbjct: 271 PTGVTGATGATGPTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGATGVT 311
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/223 (21%), Positives = 73/223 (32%), Gaps = 39/223 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGP 69
GP+G GP+G+ G +G G +G G +G+ GP+G G
Sbjct: 47 TGPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGDTGVTGA 106
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G GP+G G P+G G +G G +G
Sbjct: 107 TGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDTGP 166
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGR------------------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G G +G + G +G G +G GP+G
Sbjct: 167 TGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGP 226
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G GP+G G +
Sbjct: 227 TGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDT 269
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/232 (21%), Positives = 73/232 (31%), Gaps = 51/232 (21%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------ 60
GP+G GP+G+ G +G G +G GP+G G
Sbjct: 71 TGPTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGDTGVTGATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGA 130
Query: 61 ---------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--------- 96
+G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 131 TGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGA 190
Query: 97 ---------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 191 TGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTG---VTGATGDTGP 247
Query: 148 LGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 248 TGPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGATGPTGDTGPTGATGATGDT 299
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/218 (22%), Positives = 71/218 (32%), Gaps = 39/218 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG--- 68
+ GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 67 DTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGDTGVTGATGDTGDTGPTGVTGATGDTG 126
Query: 69 ---------------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR--- 110
P+G G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 127 PTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGATGVTGATGDTGPTG 186
Query: 111 ------------YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G GP+G G +G GP+G GP+G G
Sbjct: 187 ATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTGVT---GATGDTGPTGPTGVTGDTGPTG---VTG 240
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G GP+G GP+G G +G G +
Sbjct: 241 ATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTGAT 278
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/221 (22%), Positives = 75/221 (33%), Gaps = 45/221 (20%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +G G +G GP+G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 43 DTGPTGPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGPTGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGVTGDTG 102
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G +G GP+G G P+G G +G G
Sbjct: 103 ---VTGATGDTGDTGPTGVTGATGDTGPTGATGATGATGDTGPTGVTGATGDTGPTGVTG 159
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
+G GP+G + G +G G +G GP+G
Sbjct: 160 ATGDT---GPTGVTGATGVTGATGDTGPTGATGATGATGPTGVTGATGVTGDTGPTG--- 213
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G GP+G G +G G++
Sbjct: 214 VTGATGDTGPTGPTGVTGDTGPTGVTGATGDTGPTGPTGVT 254
>gi|147898763|ref|NP_001080727.1| collagen, type 1, alpha 2 precursor [Xenopus laevis]
gi|29179577|gb|AAH49287.1| Col1a2-prov protein [Xenopus laevis]
Length = 1346
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/186 (32%), Positives = 73/186 (39%), Gaps = 30/186 (16%)
Query: 32 GPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------YL 76
GP+G GP G GP+G+ + GP G + G G L
Sbjct: 680 GPAGPAGIAGPRGTPGERGEAGPAGTTGFAGPPGAAGHTGVKGERGPKGPKGEGGSPGAL 739
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GS GP+G GP G + GP+GR GP+G + GP+G D
Sbjct: 740 GAVGSHGPAGPNGPAGTTGPRGDGGAPGATGFPGPAGRTGAPGPAGTVGPSGPTGHPGKD 799
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP GR G GP G GPSG GP+G GPSG L
Sbjct: 800 GPRGTRGDSGPVGR------PGEQGIGGPQGLSGEKGPSGE---SGPAGAPGASGPSGVL 850
Query: 191 RYLGLS 196
LG S
Sbjct: 851 GSLGFS 856
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 69/208 (33%), Positives = 84/208 (40%), Gaps = 36/208 (17%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+GR GP+G++ GP+G GP G GP G GP G GPS
Sbjct: 773 GPAGRTGAPGPAGTVGPSGPTGHPGKDGPRGTRGDSGPVGRPGEQGIGGPQGLSGEKGPS 832
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------------RLRYL 103
G GP+G+ GPSG L LG SG
Sbjct: 833 GES---GPAGAPGASGPSGVLGSLGFSGLPGSRGERGTPGGSGSNGEPGPSGPPGAAGAR 889
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GPSG + GP+G G G +DGPSGR G G Y G SG LG SG
Sbjct: 890 GPSGPMGSPGPNGVPGEAGRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAP 949
Query: 164 RYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSG 188
+GP+G+ GP G +GP+G
Sbjct: 950 GAVGPAGKSGNRGEPGPVGPAGVVGPAG 977
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/216 (31%), Positives = 82/216 (37%), Gaps = 45/216 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G G G+ + GP+GR GP+G++ GP+G GP G
Sbjct: 748 AGPNGPAGTTGPRGDG---GAPGATGFPGPAGRTGAPGPAGTVGPSGPTGHPGKDGPRGT 804
Query: 73 LRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-------- 121
GP G GP G GPSG GP+G GPSG L L
Sbjct: 805 RGDSGPVGRPGEQGIGGPQGLSGEKGPSGE---SGPAGAPGASGPSGVLGSLGFSGLPGS 861
Query: 122 ----------------------------GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GPSG + S GP+G G G GPSGR
Sbjct: 862 RGERGTPGGSGSNGEPGPSGPPGAAGARGPSGPMGSPGPNGVPGEAGRDGNPGNDGPSGR 921
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G Y G SG LG SG +GP+G+
Sbjct: 922 DGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGK 957
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/199 (30%), Positives = 75/199 (37%), Gaps = 18/199 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G G GPSG GPSG GP+G GP+G+ G G GP G
Sbjct: 339 DTGAKGEPGSSGPSGPA---GPSGEEGKRGPNGEAGSSGPAGNAGIRGVPGTRGLPGPDG 395
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR--------LRYL-------GPSGRLRYLGPSG 116
R +G GS GP G G +GR R L GP+G+ GP G
Sbjct: 396 RAGGMGAPGSRGASGPPGTRGPNGDAGRPGEPGLLGARGLPGLSGSPGPAGKEGLAGPQG 455
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP+G G G + + GP G G +G GP+G GP G G
Sbjct: 456 IEGRSGPAGPSGPRGEPGSIGFPGPKGPSGEPGKNGDKGNQGPAGNRGAPGPDGNNGAQG 515
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
P G + G G G
Sbjct: 516 PPGIVGNNGDKGEQGPAGA 534
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/183 (36%), Positives = 77/183 (42%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRL 73
G + GP+G GP+G++ GP+G GP G+ GP GR G P G
Sbjct: 767 GATGFPGPAGRTGAPGPAGTVGPSGPTGHPGKDGPRGTRGDSGPVGRPGEQGIGGPQGLS 826
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GPSG GP+G GPSG L LG SG G G G +G GP
Sbjct: 827 GEKGPSG---ESGPAGAPGASGPSGVLGSLGFSGLPGSRGERGTPGGSGSNGEPGPSGPP 883
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GPSG + GP+G G G GPSGR G G Y G SG L
Sbjct: 884 GAAGARGPSGPMGSPGPNGVPGEAGRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSL 943
Query: 194 GLS 196
G S
Sbjct: 944 GAS 946
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.076, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/162 (33%), Positives = 66/162 (40%), Gaps = 24/162 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
GP+G + GP G+ + G G S LG G GP+G G
Sbjct: 699 EAGPAGTTGFAGPPGAAGHTGVKGERGPKGPKGEGGSPGALGAVGSHGPAGPNGPAGTTG 758
Query: 60 P------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL- 112
P G + GP+GR GP+G++ GP+G GP G GP GR
Sbjct: 759 PRGDGGAPGATGFPGPAGRTGAPGPAGTVGPSGPTGHPGKDGPRGTRGDSGPVGRPGEQG 818
Query: 113 --GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP G GPSG GP+G GPSG L LG SG
Sbjct: 819 IGGPQGLSGEKGPSGE---SGPAGAPGASGPSGVLGSLGFSG 857
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +G+ G SG GPSG GP+G GP+G G G+ GP GR
Sbjct: 338 GDTGAKGEPGSSGPSGPAGPSGEEGKRGPNGEAGSSGPAGNAGIRGVPGTRGLPGPDGRA 397
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
+G G GP G G +GR L G G S GP+G+ GP G
Sbjct: 398 GGMGAPGSRGASGPPGTRGPNGDAGRPGEPGLLGARGLPGLSGSPGPAGKEGLAGPQGIE 457
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G G + + GP G G +G GP+G
Sbjct: 458 GRSGPAGPSGPRGEPGSIGFPGPKGPSGEPGKNGDKGNQGPAGN 501
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/225 (28%), Positives = 82/225 (36%), Gaps = 36/225 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------LRYL-------GPSGSLRYL 58
GP GR +G GS GP G+ G +GR R L GP+G
Sbjct: 392 GPDGRAGGMGAPGSRGASGPPGTRGPNGDAGRPGEPGLLGARGLPGLSGSPGPAGKEGLA 451
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP+G G GS+ + GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 452 GPQGIEGRSGPAGPSGPRGEPGSIGFPGPKGPSGEPGKNGDKGNQGPAGNRGAPGPDGNN 511
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL------------------GPSGRLRYLGPS 160
GP G + ++G G GP+G + G G GP+
Sbjct: 512 GAQGPPGIVGNNGDKGE---QGPAGAPGFQGLPGPGGAAGELGKPGERGAPGDFGPAGPA 568
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G GP G L GP+G G V+GL+
Sbjct: 569 GTRGERGTPGESGAAGPFGPLGPRGPTGAPGTDGAKGEPGVAGLN 613
>gi|42782207|ref|NP_979454.1| BclA protein [Bacillus cereus ATCC 10987]
gi|44004344|ref|NP_982012.1| BclA protein [Bacillus cereus ATCC 10987]
gi|42738132|gb|AAS42062.1| BclA protein [Bacillus cereus ATCC 10987]
gi|42741410|gb|AAS44855.1| BclA protein [Bacillus cereus ATCC 10987]
Length = 347
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/116 (31%), Positives = 52/116 (44%), Gaps = 3/116 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP+G+ G +G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 99 GPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGAT 158
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+ NS
Sbjct: 159 GFTGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGAT---GPTGATGSTGPTVTTNS 211
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/120 (30%), Positives = 53/120 (44%), Gaps = 9/120 (7%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G + GP+G
Sbjct: 94 FTGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGAT---GPTGATGPTGATGPTGATGPTG 150
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G + GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 151 AT---GPTGATGFTGPTGPTGATGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTG 204
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.031, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/101 (29%), Positives = 44/101 (43%), Gaps = 3/101 (2%)
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
+ GP+G GP+G GP+G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 93 GFTGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGAT 152
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G + GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 153 GPTGATGFTGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGA 193
>gi|208609645|dbj|BAG72200.1| collagen type I alpha 1 [Carassius auratus]
Length = 1448
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/144 (31%), Positives = 59/144 (40%), Gaps = 3/144 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +G+ +GP+G GP G G G + GP G G G G G
Sbjct: 767 GETGAPGLVGPNG---ARGPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 823
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP+G GP G + S GP G GP G + G +GR+ GP+G GPS
Sbjct: 824 GAPGPAGATGAPGPQGPVGSTGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPAGNAGPAGPS 883
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+GR +
Sbjct: 884 GAPGKEGQKGNRGETGPAGRTGEV 907
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/146 (30%), Positives = 62/146 (42%), Gaps = 3/146 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G +GP+G+ G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 765 DKGETGAPGLVGPNGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKG 821
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G + GP G GP G + G +GR+ GP+G G
Sbjct: 822 DAGAPGPAGATGAPGPQGPVGSTGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPAGNAGPAG 881
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 157
PSG G G GP+GR +
Sbjct: 882 PSGAPGKEGQKGNRGETGPAGRTGEV 907
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/144 (31%), Positives = 59/144 (40%), Gaps = 3/144 (2%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ +GP+G+ GP G G G + GP G G G G G
Sbjct: 767 GETGAPGLVGPNGA---RGPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 823
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+ GP+G GPS
Sbjct: 824 GAPGPAGATGAPGPQGPVGSTGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPAGNAGPAGPS 883
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G GP+GR +
Sbjct: 884 GAPGKEGQKGNRGETGPAGRTGEV 907
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/144 (31%), Positives = 61/144 (42%), Gaps = 3/144 (2%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G +G +GP+G+ G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 767 GETGAPGLVGPNGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 823
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP+G GP G + GP G + GP G + G +GR+ GP+G GPS
Sbjct: 824 GAPGPAGATGAPGPQGPVGSTGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPAGNAGPAGPS 883
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G G G GP+GR +
Sbjct: 884 GAPGKEGQKGNRGETGPAGRTGEV 907
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.058, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/121 (32%), Positives = 54/121 (44%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G GP+G+ GP G + GP G+ GP G + G +GR+ GP+G+
Sbjct: 818 GAKGDAGAPGPAGATGAPGPQGPVGSTGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPAGNA 877
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GPSG G G GP+GR +G +G G G ++G G GP+
Sbjct: 878 GPAGPSGAPGKEGQKGNRGETGPAGRTGEVGAAGPPGAPGEKGNPGAEGAPGSAGTPGPA 937
Query: 143 G 143
G
Sbjct: 938 G 938
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/120 (30%), Positives = 49/120 (40%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ +GP+G GP G G G + GP G G G +G G
Sbjct: 767 GETGAPGLVGPNG---ARGPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 823
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+ GP+G G S
Sbjct: 824 GAPGPAGATGAPGPQGPVGSTGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPAGNAGPAGPS 883
>gi|338174587|ref|YP_004651397.1| hypothetical protein PUV_05930 [Parachlamydia acanthamoebae UV-7]
gi|336478945|emb|CCB85543.1| hypothetical protein PUV_05930 [Parachlamydia acanthamoebae UV-7]
Length = 1690
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/149 (27%), Positives = 65/149 (43%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G +G GP+G+ G +G + +GP+G+ +G GP+G +G +G+
Sbjct: 638 MGATGPTGPAGPTGATGATGDAGPIGPIGPTGA------TGATGDAGPTGPTGAIGNTGA 691
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G +G G +G GP G G +G GP+G G
Sbjct: 692 TGATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGD 751
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 752 TGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTG 780
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/148 (28%), Positives = 63/148 (42%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G G +G+ GP G + G +G+ GP+G +G +G
Sbjct: 633 GAPGLMGATGPTGPAGPTGATGATGDAGPIGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGAIGNTGAT 692
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G +G G +G GP G G +G GP+G + G +
Sbjct: 693 GATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGDT 752
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 753 GATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTG 780
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/140 (28%), Positives = 59/140 (42%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G G +G+ GP G + G +G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 641 TGPTGPAGPTGATGATGDAGPIGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGAIGNTGATGATGPTGL 700
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G G +G GP G + G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 701 TGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGDTGATGATGP 760
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G + G +G GP+G
Sbjct: 761 TGPIGPTGATGATGDAGPTG 780
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/140 (28%), Positives = 60/140 (42%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G+ GP G + G +G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 641 TGPTGPAGPTGATGATGDAGPIGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGAIGNTGATGATGPTGL 700
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G +G GP G G +G GP+G G +G + GP
Sbjct: 701 TGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGDTGATGATGP 760
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
+G + G +G GP+G
Sbjct: 761 TGPIGPTGATGATGDAGPTG 780
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 74/177 (41%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G + G +G+ GP+G +G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 658 DAGPIGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGAIGNTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATG 717
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G GP+G G +G GP+G + G +G G
Sbjct: 718 ATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAG 777
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G G +G GP+G + G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 778 PTGPTGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGATGATGPTG 834
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/127 (28%), Positives = 55/127 (43%), Gaps = 3/127 (2%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+G +G GP+G+ G +G + +GP+G GP+G +G +G GP
Sbjct: 638 MGATGPTGPAGPTGATGATGDAGPIGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGAIGNTGATGATGP 697
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G S G +G G +G GP G G +G GP+G G +G
Sbjct: 698 TGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGDTGATGA 757
Query: 184 LGPSGRL 190
GP+G +
Sbjct: 758 TGPTGPI 764
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/215 (23%), Positives = 77/215 (35%), Gaps = 39/215 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------------S 54
GP+G G +G+ GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 740 TGPTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGATGTTGPTGP 799
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---------------------RLRY 93
+ G +G GP+G G +G+ GP+G +
Sbjct: 800 IGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGATGTTGPTGPIGP 859
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G GP+G + G +G GP+G S G +G G +G GP+G
Sbjct: 860 TGATGATGDAGPTGPIGATGDTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPAGP 919
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 920 TGATGATGDAGPAGPTGATGNTGATGATGPTGPAG 954
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/102 (27%), Positives = 45/102 (44%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ GP+G + G +G+ GP+G G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 863 TGATGDAGPTGPIGATGDTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPAGPTGA 922
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 923 TGATGDAGPAGPTGATGNTGATGATGPTGPAGPTGATGATGD 964
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/97 (27%), Positives = 43/97 (44%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G + G +G+ GP+G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 868 DAGPTGPIGATGDTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPAGPTGATGATG 927
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 928 DAGPAGPTGATGNTGATGATGPTGPAGPTGATGATGD 964
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/217 (23%), Positives = 76/217 (35%), Gaps = 39/217 (17%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG------------------RLRYLGPSG 53
N G +G GP+G + G +G+ GP+G + G +G
Sbjct: 748 NTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATG 807
Query: 54 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------------SLRYLGPSGRLR 92
+ GP+G G +G GP+G + G +G
Sbjct: 808 ATGDAGPTGPTGATGNTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATG 867
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G + G +G GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 868 DAGPTGPIGATGDTGATGATGPTGLTGSTGATGNTGDTGATGATGPTGPAGPTGATGATG 927
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 928 DAGPAGPTGATGNTGATGATGPTGPAGPTGATGATGD 964
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/223 (22%), Positives = 78/223 (34%), Gaps = 39/223 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG- 71
GP G G +G GP+G+ G +G GP+G + G +G GP+G
Sbjct: 722 TGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGDTGATGATGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGP 781
Query: 72 -----------------RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------- 107
+ G +G+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 782 TGATGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPTGATGNTGATGATGPTGLTGSTGA 841
Query: 108 --------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+ G +G GP+G + + G +G GP+G G +G
Sbjct: 842 TGNTGATGTTGPTGPIGPTGATGATGDAGPTGPIGATGDTGATGATGPTGLTGSTGATGN 901
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 902 TGDTGATGATGPTGPAGPTGATGATGDAGPAGPTGATGNTGAT 944
>gi|162453736|ref|YP_001616103.1| collagen alpha 2(I) chain [Sorangium cellulosum So ce56]
gi|161164318|emb|CAN95623.1| Collagen alpha 2(I) chain precursor [Sorangium cellulosum So ce56]
Length = 889
Score = 49.7 bits (117), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPS 70
GP G +GP G + GP+G G G GP G +GP G GP+
Sbjct: 197 GPQGPAGPMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGVDGARGPQGPAGPMGPKGERGEPGRQGPA 256
Query: 71 GRLRYLGPSG--SLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G +GP G L+ + GP G +GP G + GP+G G G GP
Sbjct: 257 GTAGLIGPQGLQGLKGVDGARGPQGPAGLMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGADGARGPQ 316
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G + G G +GP G + GP G G G GP G GP G ++
Sbjct: 317 GPVGPKGEMGPQGPVGPKGEMGPRGPVGPKGVDGARGPQGPAGPKGERGEPGPQGLAGHV 376
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 377 GPQG 380
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/192 (31%), Positives = 78/192 (40%), Gaps = 14/192 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G +GP G + G G+ GP G GP+G+ +GP G G
Sbjct: 131 GPAGTAGLIGPQGLQGFKGVDGARGPQGPKGERGERGPQGPAGTAGLIGPQGLQGLQGFK 190
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G +GP G + GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 191 GVDGARGPQGPAGPMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGVDGARGPQGPAGPMGPKGERGEP 250
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G +GP G L+ L G GP G +GP G + GP+G
Sbjct: 251 G------RQGPAGTAGLIGPQG-LQGL--KGVDGARGPQGPAGLMGPKGEMGPQGPAGHT 301
Query: 191 RYLGL--SDGLR 200
GL +DG R
Sbjct: 302 GLQGLKGADGAR 313
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 72/178 (40%), Gaps = 14/178 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP G G G GP G +GP G + GP+G G G
Sbjct: 170 GPAGTAGLIGPQGLQGLQGFKGVDGARGPQGPAGPMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGVD 229
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYL-------GPSGRLRYLGP 123
GP G +GP G GP+G +GP G L+ L GP G +GP
Sbjct: 230 GARGPQGPAGPMGPKGERGEPGRQGPAGTAGLIGPQG-LQGLKGVDGARGPQGPAGLMGP 288
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G + GP+G G G GP G +GP G + GP G +GP G +
Sbjct: 289 KGEMGPQGPAGHTGLQGLKGADGARGPQG---PVGPKGEMGPQGPVGPKGEMGPRGPV 343
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/187 (32%), Positives = 80/187 (42%), Gaps = 13/187 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ +GP G G G GP G +GP G + GP+G G G
Sbjct: 170 GPAGTAGLIGPQGLQGLQGFKGVDGARGPQGPAGPMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGVD 229
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GP G +GP G GP+G +GP G L+ L G + GP G +
Sbjct: 230 GARGPQGPAGPMGPKGERGEPGRQGPAGTAGLIGPQG-LQGL--KGVDGARGPQGPAGLM 286
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGR--LRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
GP G + GP+G L+ L G G +GP G + GP G +GP G +
Sbjct: 287 GPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGADGARGPQGPVGPKGEMGPQGPVGPKGEMGPRGPVGPK 346
Query: 194 GLSDGLR 200
G+ DG R
Sbjct: 347 GV-DGAR 352
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 8/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL-------GPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G + G G GP+G+ +GP G L+ L GP G +GP G +
Sbjct: 236 GPAGPMGPKGERGEPGRQGPAGTAGLIGPQG-LQGLKGVDGARGPQGPAGLMGPKGEMGP 294
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G G+ GP G + G G +GP G + GP G G G
Sbjct: 295 QGPAGHTGLQGLKGADGARGPQGPVGPKGEMGPQGPVGPKGEMGPRGPVGPKGVDGARGP 354
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP G GP G ++GP G G G G G GP+G +GP
Sbjct: 355 QGPAGPKGERGEPGPQGLAGHVGPQGLQGLKGVDGAPGLKGADGARGPQGPAGPKGEVGP 414
Query: 187 SGRL 190
G +
Sbjct: 415 QGPM 418
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 72/180 (40%), Gaps = 17/180 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGP 69
+GP G + GP+G G G GP G +GP G GP+G +GP
Sbjct: 205 MGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGVDGARGPQGPAGPMGPKGERGEPGRQGPAGTAGLIGP 264
Query: 70 SGRLRYL-------GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G L+ L GP G +GP G + GP+G G G GP G +G
Sbjct: 265 QG-LQGLKGVDGARGPQGPAGLMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGADGARGPQG---PVG 320
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G + GP G +GP G + G G GP G GP G ++GP G
Sbjct: 321 PKGEMGPQGPVGPKGEMGPRGPVGPKGVDGARGPQGPAGPKGERGEPGPQGLAGHVGPQG 380
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/187 (32%), Positives = 77/187 (41%), Gaps = 16/187 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G +GP G + GP+G G G GP G + GP G + GP G
Sbjct: 278 GPQGPAGLMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGADGARGPQGPV---GPKGEMGPQGPVGPK 334
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP G + GP G GP G GP G GP G ++GP G G
Sbjct: 335 GEMGPRGPV---GPKGVDGARGPQG---PAGPKGERGEPGPQGLAGHVGPQGLQGLKGVD 388
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G +GP G +GP G GP+G +GP G L+ L
Sbjct: 389 GAPGLKGADGARGPQGPAGPKGEVGPQG---PMGPKGERGERGPAG---IVGPQG-LQGL 441
Query: 194 GLSDGLR 200
+DG
Sbjct: 442 KGADGAH 448
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 67/209 (32%), Positives = 87/209 (41%), Gaps = 31/209 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSG--SLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G +GP G L+ + GP G +GP G + GP+G G G
Sbjct: 254 GPAGTAGLIGPQGLQGLKGVDGARGPQGPAGLMGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGADGAR 313
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G +GP G + GP G +GP G +GP G GP G GP G
Sbjct: 314 GPQG---PVGPKGEMGPQGPVGPKGEMGPRG---PVGPKGVDGARGPQG---PAGPKGER 364
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL----------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G ++GP G L+ L G G GP+G +GP G +GP
Sbjct: 365 GEPGPQGLAGHVGPQG-LQGLKGVDGAPGLKGADGARGPQGPAGPKGEVGPQG---PMGP 420
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR-VSGLH 205
G GP+G + GL GL+ G H
Sbjct: 421 KGERGERGPAGIVGPQGLQ-GLKGADGAH 448
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 63/158 (39%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + GP+G G G+ GP G + G G +GP G + GP G
Sbjct: 286 MGPKGEMGPQGPAGHTGLQGLKGADGARGPQGPVGPKGEMGPQGPVGPKGEMGPRGPVGP 345
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP G GP G ++GP G G G G G GP
Sbjct: 346 KGVDGARGPQGPAGPKGERGEPGPQGLAGHVGPQGLQGLKGVDGAPGLKGADGARGPQGP 405
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G +GP G +GP G GP+G +GP G
Sbjct: 406 AGPKGEVGPQG---PMGPKGERGERGPAG---IVGPQG 437
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/191 (30%), Positives = 74/191 (38%), Gaps = 13/191 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + G G+ GP G G G GP+G+ +GP G + G G
Sbjct: 97 IGPQGLQGFKGVDGARGPQGPQGPKGERGEPG---PQGPAGTAGLIGPQGLQGFKGVDGA 153
Query: 73 LRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G GP+G +GP G G G GP G +GP G +
Sbjct: 154 RGPQGPKGERGERGPQGPAGTAGLIGPQGLQGLQGFKGVDGARGPQGPAGPMGPKGEMGP 213
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G G GP G +GP G G GP+G +GP G
Sbjct: 214 QGPAGHTGLQGLKGVDGARGPQGPAGPMGPKGE------RGEPGRQGPAGTAGLIGPQG- 266
Query: 190 LRYLGLSDGLR 200
L+ L DG R
Sbjct: 267 LQGLKGVDGAR 277
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/195 (30%), Positives = 72/195 (36%), Gaps = 20/195 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYL 67
GP G + GP+G GP G GP G GP G +GP G +
Sbjct: 50 GPQGPMGQRGPAGPQGERGPQGPQ---GPKGERGEPGPQGPAGTAGAAGLIGPQGLQGFK 106
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G GP+G +GP G + G G GP G
Sbjct: 107 GVDG---ARGPQGPQGPKGERGEPGPQGPAGTAGLIGPQGLQGFKGVDGARGPQGPKGER 163
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G P+G +GP G G G GP G +GP G + GP+
Sbjct: 164 GERGPQG------PAGTAGLIGPQGLQGLQGFKGVDGARGPQGPAGPMGPKGEMGPQGPA 217
Query: 188 GRLRYLGLS--DGLR 200
G GL DG R
Sbjct: 218 GHTGLQGLKGVDGAR 232
>gi|94543910|gb|ABF33958.1| Collagen-like surface protein [Streptococcus pyogenes MGAS10270]
Length = 482
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 78/183 (42%), Gaps = 12/183 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G + GP G G +G GP+G+ G +G GP+G + GP G
Sbjct: 126 ETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQ---DGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQG 182
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G GP+G+ GP+G + GP G G +G GP+G
Sbjct: 183 PRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAG 242
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ DG +G GP+G + GP G G +G GP+G+ G G +G
Sbjct: 243 Q---DGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPVG 299
Query: 186 PSG 188
P+G
Sbjct: 300 PAG 302
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/189 (28%), Positives = 76/189 (40%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G G +G GP+G + GP G G +G GP+G+ G G
Sbjct: 108 EAGPQGPAGQDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRG 167
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G + GP G G +G GP+G+ GP+G + GP G
Sbjct: 168 ET---GPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQG 224
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +G GP+G+ G +G GP+G + GP G G +G G
Sbjct: 225 PRGDKGETGERGEQGPAGQ---DGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQG 281
Query: 186 PSGRLRYLG 194
P+G+ G
Sbjct: 282 PAGQDGKAG 290
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 70/181 (38%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G G +G GP+G + GP G G +G GP+G+
Sbjct: 101 GDQGERGEAGPQGPAGQDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQ- 159
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G + GP G G +G GP+G+ G G GP+
Sbjct: 160 --DGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGET---GPA 214
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + GP G G +G GP+G+ G G GP G GP G
Sbjct: 215 GPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGET 274
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 275 G 275
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 70/177 (39%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G + GP G G +G GP+G+ G +G GP+G + GP G
Sbjct: 168 ETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQD---GKAGDRGETGPAGPVGPAGPQG 224
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G+ G G GP+G + GP G G +G G
Sbjct: 225 PRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGET---GPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQG 281
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G+ G G +GP+G G G G G G G GP+G
Sbjct: 282 PAGQDGKAGDRGETGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKDGDRGETGPAG 338
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G+ G +G GP+G + GP G G +G GP+G+ G G
Sbjct: 153 EQGPAGQD---GKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRG 209
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G + GP G G +G GP+G+ G G GP G G
Sbjct: 210 ET---GPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQG 266
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G G G G G+ G +G + GP G G +G GP+G+
Sbjct: 267 PRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQ 324
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 61/150 (40%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G + GP G G +G GP+G+ G +G GP+G + GP G
Sbjct: 210 ETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQD---GKAGDRGETGPAGPVGPAGPQG 266
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G GP+G+ G G +GP+G G G G G DG
Sbjct: 267 PRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDG 326
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G GP+G +GP+G+ G G
Sbjct: 327 KDGDRGETGPAG---PVGPAGKDGQDGKDG 353
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 74/188 (39%), Gaps = 13/188 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G+ G +G GP+G + GP G G +G GP+G+ G G
Sbjct: 195 EQGPAGQD---GKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRG 251
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G + GP G G +G GP+G+ G G +GP+ G
Sbjct: 252 ET---GPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPVGPA------G 302
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G G +G GP+G+ G G GP G G G+ G G+
Sbjct: 303 PQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKDGDRGETGPAGPVGPAGKDGQDGKDGLPGKDGKDG 362
Query: 192 YLGLSDGL 199
G DGL
Sbjct: 363 QDG-KDGL 369
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/179 (27%), Positives = 68/179 (37%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A G +G GP+G + GP G G +G GP+G G +G GP
Sbjct: 199 AGQDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAG---QDGKAGDRGETGP 255
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G + GP G G +G GP+G+ G G +GP+ GP G
Sbjct: 256 AGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKAGDRGETGPVGPA------GPQGPRGD 309
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP+G+ G G GP G G G+ G G+ G G
Sbjct: 310 KGETGERGEQGPAGQDGKDGDRGETGPAGPVGPAGKDGQDGKDGLPGKDGKDGQDGKDG 368
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/188 (28%), Positives = 77/188 (40%), Gaps = 19/188 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G GP+G G +G GP+G + GP G G +G GP+G
Sbjct: 186 DKGETGERGEQGPAG---QDGKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAG 242
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G +G GP+G + GP G G +G GP+G+ G+ G
Sbjct: 243 QD---GKAGDRGETGPAGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQ------DGKAGDRG 293
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
+G + GP G G +G GP+G+ G G GP +GP+G+
Sbjct: 294 ETGPVGPAGPQGPRGDKGETGERGEQGPAGQDGKDGDRGETGPAGP------VGPAGKDG 347
Query: 192 YLGLSDGL 199
G DGL
Sbjct: 348 QDG-KDGL 354
>gi|229112190|ref|ZP_04241731.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock1-15]
gi|228671256|gb|EEL26559.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock1-15]
Length = 1282
Score = 49.7 bits (117), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 62/176 (35%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPM 369
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 370 GDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQ 429
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 430 GVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGV 485
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGI 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G+ GP G +GP G +G GP G
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGV------TGATGDQGPQGIQ 348
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G +GP
Sbjct: 349 GVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQ 405
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 406 GIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 460
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 490
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 491 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TG 358
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 359 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 418
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 419 PQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 512
Query: 190 LRYL 193
+
Sbjct: 513 TGDM 516
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 341 DQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 397
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 398 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 457
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 458 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 406
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 59/164 (35%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G G G GP+G
Sbjct: 239 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTG 298
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 299 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE-- 356
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 357 -TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 399
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/123 (30%), Positives = 48/123 (39%), Gaps = 6/123 (4%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP G GP G + GP G GP G GP+G G +G G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGVTGATGATGPQGIQG 1071
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 1072 PQG 1074
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/123 (31%), Positives = 48/123 (39%), Gaps = 6/123 (4%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+GP+G GP G G +G G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP G GP G + GP G GP G GP+G G +G G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGVTGATGATGPQGIQG 1071
Query: 159 PSG 161
P G
Sbjct: 1072 PQG 1074
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 60/190 (31%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGI 807
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/132 (30%), Positives = 49/132 (37%), Gaps = 3/132 (2%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP G + GP G GP G G +G GP G G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQGIQGPTGVTGATGATGPQGIQGPQG 1074
Query: 150 PSGRLRYLGPSG 161
G GP G
Sbjct: 1075 IQGPQGIQGPQG 1086
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/123 (30%), Positives = 47/123 (38%), Gaps = 6/123 (4%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G GP G + GP G GP G GP+G G +G G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGVTGATGATGPQGIQG 1071
Query: 168 PSG 170
P G
Sbjct: 1072 PQG 1074
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/123 (30%), Positives = 48/123 (39%), Gaps = 6/123 (4%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP G GP G + GP G GP G GP+G G +G G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQGI---QGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGVTGATGATGPQGIQG 1071
Query: 177 PSG 179
P G
Sbjct: 1072 PQG 1074
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/200 (26%), Positives = 65/200 (32%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + G G G G +
Sbjct: 654 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIG 713
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 714 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G + GP G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 774 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATG 833
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G
Sbjct: 834 AQGVQGPQGIQGVQGPTGAT 853
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 59/174 (33%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G G G
Sbjct: 655 IGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGE 711
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 712 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 771
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 772 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGI 825
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 68/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/127 (30%), Positives = 49/127 (38%), Gaps = 9/127 (7%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 957 GEIGPTGPQG---IQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQ 1013
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ GP G GP G + GP G GP G GP+G + G +G
Sbjct: 1014 GATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGVTGATGATGPQ 1067
Query: 137 RYLGPSG 143
GP G
Sbjct: 1068 GIQGPQG 1074
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/113 (30%), Positives = 43/113 (38%), Gaps = 6/113 (5%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP G + GP G GP G GP+G G +
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGVTGATGAT 1064
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/139 (28%), Positives = 49/139 (35%), Gaps = 18/139 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G GP G G +G+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 994 DIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------RLRYLGPSG 116
G +G+ GP G G G GP G GP G
Sbjct: 1051 IQGPTGVTGATGATGPQGIQGPQGIQGPQGIQGPQGIQGPTGATGATGATGPQGIQGPQG 1110
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G S GP+G
Sbjct: 1111 IQGVTGATGATGSQGPTGD 1129
>gi|165872778|ref|ZP_02217405.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0488]
gi|227813389|ref|YP_002813398.1| hypothetical protein BAMEG_0792 [Bacillus anthracis str. CDC 684]
gi|254751124|ref|ZP_05203163.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus anthracis str.
Vollum]
gi|164711456|gb|EDR17006.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0488]
gi|227006181|gb|ACP15924.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. CDC 684]
Length = 478
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/180 (33%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 34/180 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 182 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ---GPAGAT 232
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP G GP+G GP G GP+G GPSG GP+G
Sbjct: 233 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSG-----GPAGATG 281
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 282 PQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTG 332
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/161 (33%), Positives = 70/161 (43%), Gaps = 33/161 (20%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 212 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 262
Query: 73 -LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G PSG GP+G GP G GP G GP+G + G
Sbjct: 263 GIGVTGPTG------PSG-----GPAGATGPQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATG 308
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 170
P G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 309 PQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 343
>gi|49186559|ref|YP_029811.1| hypothetical protein BAS3557 [Bacillus anthracis str. Sterne]
gi|49180486|gb|AAT55862.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. Sterne]
Length = 481
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/180 (33%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 34/180 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 185 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ---GPAGAT 235
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP G GP+G GP G GP+G GPSG GP+G
Sbjct: 236 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSG-----GPAGATG 284
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 285 PQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTG 335
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.066, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/161 (33%), Positives = 70/161 (43%), Gaps = 33/161 (20%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 215 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 265
Query: 73 -LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G PSG GP+G GP G GP G GP+G + G
Sbjct: 266 GIGVTGPTG------PSG-----GPAGATGPQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATG 311
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 170
P G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 312 PQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 346
>gi|30263715|ref|NP_846092.1| hypothetical protein BA_3841 [Bacillus anthracis str. Ames]
gi|47529128|ref|YP_020476.1| hypothetical protein GBAA_3841 [Bacillus anthracis str. 'Ames
Ancestor']
gi|170706803|ref|ZP_02897261.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0389]
gi|190569251|ref|ZP_03022146.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str.
Tsiankovskii-I]
gi|229604596|ref|YP_002867951.1| hypothetical protein BAA_3864 [Bacillus anthracis str. A0248]
gi|254759441|ref|ZP_05211466.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus anthracis str.
Australia 94]
gi|30258359|gb|AAP27578.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. Ames]
gi|47504276|gb|AAT32952.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. 'Ames
Ancestor']
gi|170128221|gb|EDS97090.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0389]
gi|190559625|gb|EDV13615.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str.
Tsiankovskii-I]
gi|229269004|gb|ACQ50641.1| conserved hypothetical protein [Bacillus anthracis str. A0248]
Length = 478
Score = 49.3 bits (116), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/180 (33%), Positives = 73/180 (40%), Gaps = 34/180 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 182 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ---GPAGAT 232
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP G GP+G GP G GP+G GPSG GP+G
Sbjct: 233 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSG-----GPAGATG 281
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 282 PQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTG 332
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.066, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/161 (33%), Positives = 70/161 (43%), Gaps = 33/161 (20%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 212 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGAT 262
Query: 73 -LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G PSG GP+G GP G GP G GP+G + G
Sbjct: 263 GIGVTGPTG------PSG-----GPAGATGPQGPQGNTGATGPQG---IQGPAGATGATG 308
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 170
P G GP+G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 309 PQGA---QGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 343
>gi|229130006|ref|ZP_04258970.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
BDRD-Cer4]
gi|228653450|gb|EEL09324.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
BDRD-Cer4]
Length = 1249
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/195 (29%), Positives = 67/195 (34%), Gaps = 12/195 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G +G GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPM 369
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 370 GDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQ 429
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 430 GVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQ 483
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 484 GVQGIQGATGAQGVQ 498
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GPS
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPS 354
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 355 GE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 411
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 412 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 471
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 472 GPTG 475
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGI 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 490
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 491 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TG 358
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 359 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 418
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 419 PQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 512
Query: 190 LRYL 193
+
Sbjct: 513 TGDM 516
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/179 (29%), Positives = 64/179 (35%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 341 DQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 397
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 398 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATG 457
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 458 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.094, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 406
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 59/164 (35%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G G G GP+G
Sbjct: 239 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTG 298
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 299 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE-- 356
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 357 -TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 399
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 60/190 (31%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGI 807
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/200 (26%), Positives = 65/200 (32%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + G G G G +
Sbjct: 654 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIG 713
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 714 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G + GP G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 774 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATG 833
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G
Sbjct: 834 AQGVQGPQGIQGVQGPTGAT 853
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/197 (26%), Positives = 61/197 (30%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------L 58
GP G G +G G G +GP+G GP GS
Sbjct: 629 GPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQ 688
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + G G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 689 GPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 748
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G G GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 749 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 808
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP G G+
Sbjct: 809 GAIGPTGPMGAQGVQGI 825
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 68/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 955 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1014
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1015 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1047
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 920 TGDTGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1036
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/132 (28%), Positives = 51/132 (38%), Gaps = 3/132 (2%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 919 VTGDTGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATG 978
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + G
Sbjct: 979 AQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQGI---QGPQGEIGPTG 1035
Query: 141 PSGRLRYLGPSG 152
P G GP G
Sbjct: 1036 PQGPQGIQGPQG 1047
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 920 TGDTGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1036
Query: 169 SGRLRYLGPSG 179
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +GS G +G G G G G + GP G GP G G +G
Sbjct: 923 TGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQG---IQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G +GP+G GP G G +G + GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1036
Query: 151 SGRLRYLGPSG 161
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
>gi|423360591|ref|ZP_17338094.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD022]
gi|401081587|gb|EJP89861.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD022]
Length = 282
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/186 (26%), Positives = 77/186 (41%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G + G +G
Sbjct: 43 GPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIGITGATGET 102
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G +G+ GP+G G +G G +G +G +G + GP+G G +
Sbjct: 103 GPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLTGVTGLTGETGPIGITGPIGITGPTGATGPTGVT 162
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP+G GP+G GP+G GP+G + + + L Y G
Sbjct: 163 GATGITGPTG---ITGPTG---ITGPTGVTGATGPTGGIGPITTTNLLYYTFADGEKLIY 216
Query: 194 GLSDGL 199
+DG+
Sbjct: 217 TDTDGI 222
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/189 (27%), Positives = 78/189 (41%), Gaps = 10/189 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP G
Sbjct: 35 ETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPIG 94
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G + G +G GP+G G +G G +G +G +G + G
Sbjct: 95 ITGATGETGPIGITGATGET---GPTGITGSTGITGLTGVTGLTGETGPIGITGPIGITG 151
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G + + + L
Sbjct: 152 PTGATGPTGVTGATGITGPTG---ITGPTG---ITGPTGVTGATGPTGGIGPI-TTTNLL 204
Query: 192 YLGLSDGLR 200
Y +DG +
Sbjct: 205 YYTFADGEK 213
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/154 (25%), Positives = 63/154 (40%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +G GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G +
Sbjct: 34 GETGPTGITGPTGETGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGPTGITGATGETGSTGITGPI 93
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G +G +G GP+G G +G G +G +G +G + GP+
Sbjct: 94 GITGATGETGPIGITGATGETGPTGITGSTGITGLTGVTGLTGETGPIGITGPIGITGPT 153
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G G +G GP+G G++ V+G
Sbjct: 154 GATGPTGVTGATGITGPTGITGPTGITGPTGVTG 187
>gi|75762445|ref|ZP_00742312.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar israelensis ATCC 35646]
gi|434376292|ref|YP_006610936.1| hypothetical protein BTF1_14175 [Bacillus thuringiensis HD-789]
gi|74490071|gb|EAO53420.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar israelensis ATCC 35646]
gi|401874849|gb|AFQ27016.1| hypothetical protein BTF1_14175 [Bacillus thuringiensis HD-789]
Length = 583
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G +GP+GS GP G G +G GP G G SG + G G
Sbjct: 204 GDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVR 263
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G +GP+G G G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 264 GITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQ 323
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 324 GIQGSQGEMGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQ 380
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 381 GL 382
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 67/182 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G+ G G+ G +G + G G+ +GP+G GP G
Sbjct: 168 GPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGIS 227
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP G G SG + G G G +G G G GP+
Sbjct: 228 GIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPT 287
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G + GP+G GP G G G GP+G
Sbjct: 288 GPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGETGPQ 347
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 348 GL 349
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 64/167 (38%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G G +G GP G G SGS + G G G +G
Sbjct: 212 VGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGP 271
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G G G GP+G + GP+G GP G S G
Sbjct: 272 QGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGE 331
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 332 MGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQG 375
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 72/185 (38%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G + G G+ +GP+GS GP G G +G GP G G SG
Sbjct: 195 GITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGST 254
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+ G G G +G G G +GP+G G G GP+G + + GP+
Sbjct: 255 GFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPT 314
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRL 190
G GP G G G GP+G GP G GP +G GP+G
Sbjct: 315 GETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET---GPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGET 371
Query: 191 RYLGL 195
GL
Sbjct: 372 GPQGL 376
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 66/175 (37%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G + G G+ +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 186 GEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQ 245
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G SGS + G G G +G G G +GP+G G G GP+
Sbjct: 246 GIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPT 305
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G GP G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 306 GPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQG 357
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/166 (29%), Positives = 61/166 (36%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G SGS + G G G +G G G +GP+G G G
Sbjct: 240 GPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGIT 299
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G + GP+G GP G G G GP+G GP G GP
Sbjct: 300 GQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET---GPQGLQGIQGPQ 356
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G GP G G G G +G+ G +G
Sbjct: 357 GITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGLQGITGSTGATGQTGVTGATG 402
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G GS G G +G +G GP+G G G + GP G
Sbjct: 53 TGPQGPQGIRGIQGSRGTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGD 109
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G G+ GP+G G G +G G+ G G G G S GP
Sbjct: 110 IGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGP 169
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G G +G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 170 QGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGI 229
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 230 KGIT 233
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/179 (26%), Positives = 63/179 (35%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+G G+ G G G G GP G G G+ G G G +G
Sbjct: 139 EVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITG 198
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G+ +GP+G GP G G +G GP G G SG G
Sbjct: 199 EQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQG 258
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G +G G G +GP+G G G GP+G + GP+G
Sbjct: 259 AKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGET 317
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 65/186 (34%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GP G + G G+ GP+GS +G G+ G G G G
Sbjct: 103 NQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPG 162
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G G G+ G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 163 VTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQG 222
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G +G GP G G SG + G G G +G G G
Sbjct: 223 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQG 282
Query: 183 YLGPSG 188
+GP+G
Sbjct: 283 PIGPTG 288
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + GP G + G G+ GP+G G G
Sbjct: 80 VGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGI 136
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G G G GP G G G G G G
Sbjct: 137 QGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGI 196
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 197 TGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 256
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 257 QG-AKGVR 263
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 70 TTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAG 126
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +G G+ G G G G GP G G G G
Sbjct: 127 SQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQG 186
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 187 EDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQG 246
Query: 192 YLGLS 196
G+S
Sbjct: 247 IQGVS 251
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/149 (30%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 12/149 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP+G G +G+ GP+G + GP+G GP G
Sbjct: 269 TGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQA---GPTGPIGATGPTGETGPQGPQGI 325
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G GP G GP G GP+G GP+G G
Sbjct: 326 QGSQGEMGPTGATGPTGET---GPQGLQGIQGPQG---ITGPTG---ATGPTGETGPQGL 376
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G +G G +G GP+G
Sbjct: 377 QGIQGLQGITGSTGATGQTGVTGATGPTG 405
>gi|20071801|gb|AAH27361.1| Pcf11 protein, partial [Mus musculus]
Length = 814
Score = 49.3 bits (116), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/228 (34%), Positives = 107/228 (46%), Gaps = 63/228 (27%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 107 FRFEG-SPSLRFEGSTGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-- 158
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSG----------------RLRYLGPS 115
P GSLR+ P G+ P G LR+ GPSG +R+ GP
Sbjct: 159 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGPL 210
Query: 116 GR----LRYLGPSGR----LNSDGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGPS----GRLRY 156
+ +R+ GP G+ L +G + G LR+ GP G+ +R+ GP G +R+
Sbjct: 211 LQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPIVQQGGGMRF 270
Query: 157 LGPS--GRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP G LR GP G+ R+ G LR+ G G+ L DGL
Sbjct: 271 EGPVPGGGLRIEGPLGQGGPRFEG-CHSLRFDGQPGQPSLLPRFDGLH 317
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.055, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/206 (33%), Positives = 95/206 (46%), Gaps = 68/206 (33%)
Query: 38 RYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G G R+ G S LR+ G +G L
Sbjct: 66 RFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQGGGGGFRFEG-SPSLRFEGSTGGL 124
Query: 83 RYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
R+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ P G LR+ P G+ P G
Sbjct: 125 RFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-----PVGSLRFDNPRGQ-----PVG 174
Query: 135 RLRYL---GPSG----------------RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLG 167
LR+ GPSG +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 175 GLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEG 234
Query: 168 PS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
+ G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 235 HNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 260
>gi|423640207|ref|ZP_17615825.1| hypothetical protein IK9_00152 [Bacillus cereus VD166]
gi|401281490|gb|EJR87400.1| hypothetical protein IK9_00152 [Bacillus cereus VD166]
Length = 1312
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/195 (29%), Positives = 67/195 (34%), Gaps = 12/195 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G +G GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 313 GATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPM 369
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 370 GDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQ 429
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 430 GVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQ 483
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 484 GVQGIQGATGAQGVQ 498
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGI 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 490
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 491 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G+ GP G +GP G +G GP G
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGV------TGATGDQGPQGIQ 348
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G +GP
Sbjct: 349 GVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQ 405
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 406 GIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 460
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TG 358
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 359 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 418
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 419 PQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 512
Query: 190 LRYL 193
+
Sbjct: 513 TGDM 516
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 391
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQG 451
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 511
Query: 180 RLRYL 184
+
Sbjct: 512 ATGDM 516
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 406
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 59/164 (35%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G G G GP+G
Sbjct: 239 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTG 298
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 299 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE-- 356
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 357 -TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 399
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/198 (25%), Positives = 63/198 (31%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P G G+ + +G
Sbjct: 798 PEGPQGVQGIQGAIGPTG 815
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/200 (26%), Positives = 65/200 (32%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + G G G G +
Sbjct: 654 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIG 713
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 714 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G + GP G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 774 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATG 833
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G
Sbjct: 834 AQGVQGPQGIQGVQGPTGAT 853
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 59/174 (33%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G G G
Sbjct: 655 IGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGE 711
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 712 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 771
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 772 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGI 825
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 68/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 38/96 (39%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 38/96 (39%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+GP+G GP G G +G G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 38/96 (39%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 38/96 (39%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 37/96 (38%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
>gi|423478881|ref|ZP_17455596.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG6X1-1]
gi|402426594|gb|EJV58716.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG6X1-1]
Length = 954
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/186 (32%), Positives = 71/186 (38%), Gaps = 11/186 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
N G +G G +G+ GPSGS G G L+ + GP G GP G
Sbjct: 236 NTGVTGSTGVTGVTGNTGLTGPSGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIP 294
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GPS
Sbjct: 295 GPTGVTGSQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPS 354
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G + GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 355 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 411
Query: 185 GPSGRL 190
GP G
Sbjct: 412 GPVGAT 417
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 68/176 (38%), Gaps = 16/176 (9%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G+ GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGATGATGPEGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGM 148
Query: 136 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGSQGIQGPQGIQGPQGPSGSAGTTGATGQ-GVTGPTG---ITGPTG 200
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 68/193 (35%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 315 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGE 371
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 372 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGI 431
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 432 QGVTGATGAQGATGIQGVQGNIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 485
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ V G+
Sbjct: 486 QGIQGATGVQGVQ 498
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/173 (31%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 11/173 (6%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLRYLGPSG 80
+G+ G +GS G +G GPSGS G G L+ + GP G GP G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSTGVTGVTGNTGLTGPSGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQG 289
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLR 137
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G
Sbjct: 290 IQGIPGPTGVTGSQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQG 349
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 350 VPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 399
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/206 (28%), Positives = 72/206 (34%), Gaps = 27/206 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------------- 114
P G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGIQGVTG 436
Query: 115 ----SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G + + GP G G G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 437 ATGAQGATGIQGVQGNIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATG 493
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP+G G++
Sbjct: 494 VQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDTGVT 519
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 59/159 (37%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 95 RGPQGATGATGPEGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGM 148
Query: 154 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP G GPSG G +G+
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGSQGIQGPQGIQGPQGPSGSAGTTGATGQ 187
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.047, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/172 (32%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 11/172 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GPSG G G L+ + GP G GP G GP+G G G G
Sbjct: 255 TGPSGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGSQGIQGVQGIQG 313
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+G GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 314 ITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMG 370
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 371 EIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGP 422
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 357 TGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 416
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 417 TGPEGPQGIQGIQGIQGVTGATGAQGATGIQGVQGNIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 473
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 474 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGVQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDTGVTGATGEGATGPTGVT 533
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 534 GPTGVT 539
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/154 (31%), Positives = 60/154 (38%), Gaps = 16/154 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G GP G + GP G+ G P G+ GP G GP
Sbjct: 57 GPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGLRGPQGATGATGPEGVQGLQGP- 115
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP+G+ G G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 116 -----IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGMQGVQGVPGATGSQGIQGPQGIQ 170
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 171 GPQGPSGSAGTTGATGQ-GVTGPTG---ITGPTG 200
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 66/189 (34%), Gaps = 10/189 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G G G GP+G G G G +G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGLQGIQGPTGPQGIQGDQGPQGIQGVTG 677
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G GP G G G + GP G GP G
Sbjct: 678 ATGAQGPQG---IQGIQGVQGPTGPQGPTGIQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGP------QG 728
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G +G G GP G G +G G G GP+G GP+G
Sbjct: 729 PTGATGAIGAQGPQGIQGPQGLTGSTGATGATGPQGIQGPKGIQGPTGVTGLQGPTGDTG 788
Query: 192 YLGLSDGLR 200
G S G++
Sbjct: 789 PTG-SQGIQ 796
>gi|225870909|ref|YP_002746856.1| collagen-binding collagen-like cell surface-anchored protein FneC
[Streptococcus equi subsp. equi 4047]
gi|225700313|emb|CAW94597.1| putative collagen-binding collagen-like cell surface-anchored
protein FneC [Streptococcus equi subsp. equi 4047]
Length = 628
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/158 (31%), Positives = 50/158 (31%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G G GP G G G G GR G G
Sbjct: 370 GPKGEPGIPGPKDEDGKDGAPGHDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGEPGRDGKDGEKGER 429
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 430 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 489
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 490 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 527
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/158 (31%), Positives = 50/158 (31%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G G GP G G G G GR G G
Sbjct: 370 GPKGEPGIPGPKDEDGKDGAPGHDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGEPGRDGKDGEKGER 429
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 430 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 489
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 490 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 527
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/149 (31%), Positives = 47/149 (31%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G GP G G GP G G G G GR G G
Sbjct: 370 GPKGEPGIPGPKDEDGKDGAPGHDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGEPGRDGKDGEKGER 429
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 430 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 489
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G
Sbjct: 490 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 518
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 49/158 (31%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G G GP G G G G G G G
Sbjct: 370 GPKGEPGIPGPKDEDGKDGAPGHDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGEPGRDGKDGEKGER 429
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 430 GEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQ 489
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 490 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 527
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 52/174 (29%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G+ GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 309 DGKPGEKGPKGDTGKDGKDGQPGPQGPKGDPGRDGKDGEPGKPGERGEKGPQGERGPQGL 368
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GP G G GP G G G G GR DG G
Sbjct: 369 PGPKGEPGIPGPKDEDGKDGAPGHDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGEPGRDGKDGEKGE 428
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 429 RGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 482
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 52/176 (29%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP G G G G G G G GP G
Sbjct: 316 GPKGDTGKDGKDGQPGPQGPKGDPGRDGKDGEPGKPGERGEKGPQGERGPQGLPGPKGEP 375
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G GP G G G G GR G G GP
Sbjct: 376 GIPGPKDEDGKDGAPGHDGQPGPKGEKGDPGQQGIPGPKGEPGRDGKDGEKGERGEQGPQ 435
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 436 GERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGE 491
>gi|423557700|ref|ZP_17534002.1| hypothetical protein II3_02904 [Bacillus cereus MC67]
gi|401192542|gb|EJQ99556.1| hypothetical protein II3_02904 [Bacillus cereus MC67]
Length = 539
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 76 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGETGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGD 132
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP+G GP G GP G +G G G
Sbjct: 133 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGSQGIQGIQGV 192
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 193 QGVTGATGVQGATGIQGVQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQ 247
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/196 (29%), Positives = 68/196 (34%), Gaps = 6/196 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP G GP G GP G GP+G G G G +G
Sbjct: 19 TGSTGETGAQGPQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGLTGEQGIQGVQGIQGITGA 78
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G +
Sbjct: 79 TGDQGPQGIQGVIGPQGVTGETGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGP 135
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP+G GP G GP G G G G G
Sbjct: 136 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGSQGIQGIQGVQGV 195
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 196 TGATGVQGATGIQGVQ 211
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/199 (31%), Positives = 75/199 (37%), Gaps = 13/199 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G P G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 7 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGPQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGLTGEQG 65
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 66 IQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGETGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQG 122
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 123 VQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVG---ATG 179
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
P G G+ V+G
Sbjct: 180 PEGSQGIQGIQGVQGVTGA 198
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 65/179 (36%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 97 TGETGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 153
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G+ GP G GP G G G G G G G G G
Sbjct: 154 PGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGSQGIQGIQGVQGVTGATGVQGATGIQGVQGE 213
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G +GP+G + G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 214 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 272
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/186 (30%), Positives = 67/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 81 DQGPQGIQGVIGPQGVTGETGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 137
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP+G GP G GP G G G G G
Sbjct: 138 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGSQGIQGIQGVQGVTG 197
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ G G G G + GP G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 198 ATGVQGATGIQGVQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 257
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 258 VQGPQG 263
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 64/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 47 GPQGIQGIPGPTGLTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGETGDQGPQ 106
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 107 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPE 163
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G G G G G G G G G + GP G
Sbjct: 164 GPQGIQGIQGPVGATGPEGSQGIQGIQGVQGVTGATGVQGATGIQGVQGEIGATGPEG 221
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/166 (31%), Positives = 61/166 (36%), Gaps = 6/166 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 113 GPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQ 169
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 170 GIQGPVGATGPEGSQGIQGIQGVQGVTGATGVQGATGIQGVQGEIGATGPEGPQGVQGAQ 229
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +GP+G + G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 230 G---AIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 272
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 57/158 (36%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 118 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 177
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 178 TGPEGSQGIQGIQGVQGVTGATGVQGATGIQGVQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 234
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+G + G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 235 TGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 272
>gi|217962215|ref|YP_002340785.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus AH187]
gi|375286729|ref|YP_005107168.1| hypothetical protein BCN_4635 [Bacillus cereus NC7401]
gi|217063269|gb|ACJ77519.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH187]
gi|358355256|dbj|BAL20428.1| conserved hypothetical membrane spanning protein [Bacillus cereus
NC7401]
Length = 1170
Score = 49.3 bits (116), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/197 (30%), Positives = 71/197 (36%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 229 NTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQG 288
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 289 VQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQG 345
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 346 IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQG 405
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ +G+
Sbjct: 406 IQGIQGVQGITGATGIQ 422
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/208 (28%), Positives = 71/208 (34%), Gaps = 6/208 (2%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T T + + GP+G G G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 227 TGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGI 286
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 287 QGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGV 343
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 344 QGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 403
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G G+ + G+
Sbjct: 404 QGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQ 431
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/171 (32%), Positives = 64/171 (37%), Gaps = 9/171 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 223 NTGATGNTGITGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 279
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 280 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT- 338
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 339 --GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 387
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 267 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQ 326
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 327 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 383
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 384 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEG 441
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 317 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 373
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 374 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGE 433
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 434 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 493
Query: 190 LRYLGLS 196
+G +
Sbjct: 494 TGDMGAT 500
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/193 (28%), Positives = 66/193 (34%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 296 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGD 352
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 353 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 412
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 413 QGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 466
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 467 QGIQGATGAQGVQ 479
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 338 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 397
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 398 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 454
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 455 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 514
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 515 GPTGVT 520
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 670 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 729
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 730 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 789
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 790 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 834
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 61/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 599 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 658
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 659 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 718
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 719 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 778
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 779 PEGPQGVQGI 788
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 64/174 (36%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +G+ GP+G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 224 TGATGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGE 283
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP
Sbjct: 284 QGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGP 340
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP G + GP G GP G GP G GP G G+
Sbjct: 341 QGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGV 394
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 670 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 729
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 730 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 789
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 790 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 834
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.041, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 64/173 (36%), Gaps = 16/173 (9%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G GP GPSG G +G+ GP+G
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GITGPTG 197
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 322 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 378
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G G G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 379 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATG 438
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G +G
Sbjct: 439 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMG 498
Query: 186 PSGRL 190
+G
Sbjct: 499 ATGAT 503
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/159 (29%), Positives = 59/159 (37%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 154 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G G GPSG G +G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ 190
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 636 IGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGE 692
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 693 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 752
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 753 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGI 806
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 570 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 629
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 630 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 686
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 687 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 746
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 747 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 771
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 65/194 (33%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 599 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 658
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 659 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 715
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G G G GP G G G G G G G +
Sbjct: 716 PVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIG 775
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G V G+
Sbjct: 776 ATGPEGPQGVQGIQ 789
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 53/157 (33%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 678 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 737
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 738 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 797
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 798 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 834
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 62/189 (32%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 564 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 623
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 624 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGP 683
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 684 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 743
Query: 187 SGRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 744 QGIQGIQGV 752
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/99 (30%), Positives = 39/99 (39%), Gaps = 9/99 (9%)
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 158
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 159 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
P G GP G GP +GP+G G+
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGV 130
>gi|29566025|ref|NP_817595.1| gp4 [Mycobacterium phage Bxz2]
gi|29424750|gb|AAN01760.1| gp4 [Mycobacterium phage Bxz2]
gi|339781841|gb|AEK07669.1| gp4 [Mycobacterium phage Vix]
Length = 344
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/168 (30%), Positives = 60/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+ G +G GP+G GP G GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 145 FTGEAGPEGEQGPTGPQ---GPKGDTGSQGPQGPKGDTGPTGPAGPTGPQGPKGDKGDQG 201
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GPSG G G +GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 202 IQGPQGPSGPKGDKGDKGDTGPIGPTGDTGPEGPQGETGPQGPKGDTGDTGPQGPKGDTG 261
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G G +G G G GP G GP+G
Sbjct: 262 ATGAQGPKGDKGDKGDTGDTGPKGDKGDKGDTGAQGPQGIQGPQGPAG 309
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 53/151 (35%), Gaps = 9/151 (5%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+ G +G GP+G GP G GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 145 FTGEAGPEGEQGPTGPQ---GPKGDTGSQGPQGPKGDTGPTGPAGPTGPQGPKGDKGDQG 201
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GPSG G G +GP+G +GP G GP G GP G
Sbjct: 202 IQGPQGPSGPKGDKGDKGDTGPIGPTGDTGPEGPQGETGPQGPKGDTGDTGPQ------G 255
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G G G G G GP G
Sbjct: 256 PKGDTGATGAQGPKGDKGDKGDTGDTGPKGD 286
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/122 (31%), Positives = 45/122 (36%), Gaps = 3/122 (2%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
+ G +G GP+G GP G GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 145 FTGEAGPEGEQGPTGPQ---GPKGDTGSQGPQGPKGDTGPTGPAGPTGPQGPKGDKGDQG 201
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GPSG G G +GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 202 IQGPQGPSGPKGDKGDKGDTGPIGPTGDTGPEGPQGETGPQGPKGDTGDTGPQGPKGDTG 261
Query: 195 LS 196
+
Sbjct: 262 AT 263
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/109 (31%), Positives = 42/109 (38%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GPSG G G +GP+G GP G GP G GP G G +G+
Sbjct: 207 GPSGPKGDKGDKGDTGPIGPTGDTGPEGPQGETGPQGPKGDTGDTGPQGPKGDTGATGAQ 266
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G +G G G GP G GP+G +S+G
Sbjct: 267 GPKGDKGDKGDTGDTGPKGDKGDKGDTGAQGPQGIQGPQGPAGVPSSNG 315
>gi|291413262|ref|XP_002722890.1| PREDICTED: collagen, type V, alpha 3-like [Oryctolagus cuniculus]
Length = 1754
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 66/189 (34%), Positives = 79/189 (41%), Gaps = 10/189 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
LGP G L GP+G + GP G+ GP G GP G + G G LGP+G
Sbjct: 967 ELGPPGPLGKEGPAGPRGFPGPKGAPGDPGPVGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPLGPAG 1026
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G SG +GP+G LG G GP+G+ GP L GPSG + G
Sbjct: 1027 GIGLPGQSGGQGPVGPAGEKGSLGERG---AAGPTGKDGIPGP---LGLPGPSG---APG 1077
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
PSG G G + G G GP G GP+G G G GP G
Sbjct: 1078 PSGEEGDKGEVGAPGHKGNKGDKGEAGPPGPTGIRGPAGHPGSPGADGAQGRRGPPGLFG 1137
Query: 192 YLGLSDGLR 200
G DGLR
Sbjct: 1138 QKG-DDGLR 1145
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/159 (34%), Positives = 66/159 (41%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G+ LGP G L GP+G + GP G GP G GP G + G G
Sbjct: 962 EGAKGELGPPGPLGKEGPAGPRGFPGPKGAPGDPGPVGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGP 1021
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
LGP+G + G SG +GP+G LG +G DG G L GPSG GP
Sbjct: 1022 LGPAGGIGLPGQSGGQGPVGPAGEKGSLGERGAAGPTGKDGIPGPLGLPGPSG---APGP 1078
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
SG G G + G G GP G GP+G
Sbjct: 1079 SGEEGDKGEVGAPGHKGNKGDKGEAGPPGPTGIRGPAGH 1117
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 74/182 (40%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G + GP G+ GP G GP G + G G LGP+G + G SG
Sbjct: 978 GPAGPRGFPGPKGAPGDPGPVGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPLGPAGGIGLPGQSGGQ 1037
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G LG G GP+G+ GP L GPSG GPSG G
Sbjct: 1038 GPVGPAGEKGSLGERG---AAGPTGKDGIPGP---LGLPGPSG---APGPSGEEGDKGEV 1088
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + G G GP G GP+G G G GP G G G ++
Sbjct: 1089 GAPGHKGNKGDKGEAGPPGPTGIRGPAGHPGSPGADGAQGRRGPPGLFGQKGDDGLRGFV 1148
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 1149 GV 1150
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/169 (31%), Positives = 69/169 (40%), Gaps = 15/169 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
LGP+G + G SG +GP+G LG G+ GP+G+ GP L GPSG+
Sbjct: 1022 LGPAGGIGLPGQSGGQGPVGPAGEKGSLGERGAA---GPTGKDGIPGP---LGLPGPSGA 1075
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GPSG G G + G G GP G GP+G S G G GP
Sbjct: 1076 ---PGPSGEEGDKGEVGAPGHKGNKGDKGEAGPPGPTGIRGPAGHPGSPGADGAQGRRGP 1132
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G ++G +GP G GP G +G G +
Sbjct: 1133 PGLFGQKGDDGLRGFVG------VIGPPGLQGLPGPPGEKGEVGDVGSM 1175
>gi|407706108|ref|YP_006829693.1| hypothetical protein MC28_2872 [Bacillus thuringiensis MC28]
gi|407383793|gb|AFU14294.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis MC28]
Length = 1295
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 71/181 (39%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G +G+ GP +G+ GP+G G +G+ GP G G
Sbjct: 175 TGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGA 234
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G+ GP+G G +G GP G G +G GP G +
Sbjct: 235 TGPTGPRGTRGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPTGPRGNTGA 294
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G G +G GP +G GP+G G +G GP G GP
Sbjct: 295 TGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGP 354
Query: 187 S 187
+
Sbjct: 355 T 355
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 65/177 (36%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP G+ G +G G +G GP+G G +G GP G
Sbjct: 168 NTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRG 227
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G G G GP+G G +G GP G G +G G
Sbjct: 228 NTGATGATGPTGPRGTRGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPTG 287
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP+G G +G GP G G +G G +G GP+G
Sbjct: 288 PRGNTGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTG 344
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/196 (27%), Positives = 75/196 (38%), Gaps = 6/196 (3%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGP 60
T V + GP+G G +G+ GP+G G +G GP +G+ GP
Sbjct: 148 TLVNSASFGRGPTGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGP 207
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G G +G GP G+ G +G G G GP+G G +G
Sbjct: 208 TGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGTRGATGATGPTGPRGNTGATGATGP 267
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + G +G GP G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 268 TGPRGNTGATGATGPTGPTGPRGNTGATGPTGPRGNTGATG---ATGPTGPRGNTGATGA 324
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G +
Sbjct: 325 TGPTGPRGNTGATGAT 340
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/173 (28%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G GP +G+ GP+G G +G GP G+ G +G G
Sbjct: 183 NTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRG 242
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G GP+G G +G GP G G +G GP G GP+G
Sbjct: 243 TRGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPTGPRGNTGATGPTGPRG 302
Query: 129 SDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
+ G +G GP +G GP+G G +G GP G GP+
Sbjct: 303 NTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPTGPRGNTGATGPT 355
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/166 (27%), Positives = 62/166 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G +G+ GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 1101 NSGATGATGPTGPTGSRGNTGAAGATGPTGPRGTSGATGATGPTGPQGNTGATGATGPQG 1160
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP G G +G G +G G +G G +G + G
Sbjct: 1161 AQGNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATGATG 1220
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
P G G +G GP G G +G G +G GP
Sbjct: 1221 PQGAQGNTGATGATGPAGPRGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 1266
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/167 (28%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP+GS G +G GP G+ G +G G +G GP G+
Sbjct: 1103 GATGATGPTGPTGSRGNTGAAGATGPTGPRGTSGATGATGPTGPQGNTGATGATGPQGAQ 1162
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G +G GP +G GP G G +G GP G + G +G
Sbjct: 1163 GNTGATGATGPTGPRGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATG---AT 1219
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP G G +G GP G G +G G +G GP
Sbjct: 1220 GPQGAQGNTGATGATGPAGPRGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGP 1266
>gi|228901854|ref|ZP_04066024.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
IBL 4222]
gi|228857795|gb|EEN02285.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
IBL 4222]
Length = 572
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/182 (30%), Positives = 67/182 (36%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G +GP+GS GP G G +G GP G G SG + G G
Sbjct: 193 GDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVR 252
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G +GP+G G G GP+G + GP+G GP
Sbjct: 253 GITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQ 312
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 313 GIQGSQGEMGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQ 369
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 370 GL 371
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 67/182 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G+ G G+ G +G + G G+ +GP+G GP G
Sbjct: 157 GPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGIS 216
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP G G SG + G G G +G G G GP+
Sbjct: 217 GIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPT 276
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP+G + GP+G GP G G G GP+G
Sbjct: 277 GPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGETGPQ 336
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 337 GL 338
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 64/167 (38%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G G +G GP G G SGS + G G G +G
Sbjct: 201 VGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGP 260
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G G G GP+G + GP+G GP G S G
Sbjct: 261 QGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGE 320
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 321 MGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGPQG 364
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G G+ +GP+GS GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 186 TGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 245
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G G +G G G +GP+G G G GP+G + + GP+G
Sbjct: 246 QGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPIGATGPTGE 305
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRY 192
GP G G G GP+G GP G GP +G GP+G
Sbjct: 306 TGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET---GPQGLQGIQGPQGITGPTGATGPTGETGP 362
Query: 193 LGL 195
GL
Sbjct: 363 QGL 365
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 66/175 (37%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G G +G + G G+ +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 175 GEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQ 234
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G SGS + G G G +G G G +GP+G G G GP+
Sbjct: 235 GIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQAGPT 294
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G GP G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 295 GPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGE---TGPQGLQGIQGPQG 346
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/166 (29%), Positives = 61/166 (36%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G SGS + G G G +G G G +GP+G G G
Sbjct: 229 GPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGIT 288
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G + GP+G GP G G G GP+G GP G GP
Sbjct: 289 GQAGPTGPIGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET---GPQGLQGIQGPQ 345
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G GP G G G G +G+ G +G
Sbjct: 346 GITGPTGATGPTGETGPQGLQGIQGLQGITGSTGATGQTGVTGATG 391
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G GS G G +G +G GP+G G G + GP G
Sbjct: 42 TGPQGPQGIRGIQGSRGTTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGD 98
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ G G+ GP+G G G +G G+ G G G G S GP
Sbjct: 99 IGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGP 158
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G G +G + G G +GP+G GP G
Sbjct: 159 QGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGI 218
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 219 KGIT 222
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/186 (26%), Positives = 65/186 (34%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GP G + G G+ GP+GS +G G+ G G G G
Sbjct: 92 NQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPG 151
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G G G+ G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 152 VTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQG 211
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G +G GP G G SG + G G G +G G G
Sbjct: 212 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGFQGAKGVRGITGATGPQGIQGIQGVQG 271
Query: 183 YLGPSG 188
+GP+G
Sbjct: 272 PIGPTG 277
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 4/188 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G G G + GP G + G G+ GP+G G G
Sbjct: 69 VGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAGSQGIQGIQGI 125
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G G G G G G GP G G G G G G
Sbjct: 126 QGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQGEDGAQGIQGI 185
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G + G G +GP+G GP G G +G GP G G SG +
Sbjct: 186 TGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQGIQGVSGSTGF 245
Query: 193 LGLSDGLR 200
G + G+R
Sbjct: 246 QG-AKGVR 252
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/185 (26%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 59 TTGAQGIQGAVGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGTQGATGPAG 115
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +G G+ G G G G GP G G G G
Sbjct: 116 SQGIQGIQGIQGEVGERGQTGAQGIQGERGVTGVPGVTGSQGPQGVQGIQGEQGATGIQG 175
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 176 EDGAQGIQGITGEQGHQGDQGAQGVVGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGVQG 235
Query: 192 YLGLS 196
G+S
Sbjct: 236 IQGVS 240
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/149 (30%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 12/149 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP+G G +G+ GP+G + GP+G GP G
Sbjct: 258 TGPQGIQGIQGVQGPIGPTGPTGPQGLQGITGQA---GPTGPIGATGPTGETGPQGPQGI 314
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G GP G GP G GP+G GP+G G
Sbjct: 315 QGSQGEMGPTGATGPTGET---GPQGLQGIQGPQG---ITGPTG---ATGPTGETGPQGL 365
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G +G G +G GP+G
Sbjct: 366 QGIQGLQGITGSTGATGQTGVTGATGPTG 394
>gi|449664613|ref|XP_004205963.1| PREDICTED: collagen alpha-2(XI) chain-like [Hydra magnipapillata]
Length = 261
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 15/187 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG G GS Y G G + G +G G SGS+ GP+G+ G G
Sbjct: 38 DTGLSGEKGLQGAKGSKGYKGMQGYRGHPGKTGEKGQFGESGSI---GPAGKRGITGEKG 94
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLN 128
+GP G + GP G + G+ GP G Y+GP G Y G G +
Sbjct: 95 EEGPVGPMGHIGRQGPIGIV------GKPGQQGPPGEQGYVGPKGEKGYPGDPGIVGAVG 148
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
DGP G + GP GR +G G Y GP G G G GP G G G
Sbjct: 149 EDGPPGLMGKTGPPGR---MGEPGDHGYPGPPGAFGEQGQEGIAGDHGPPGNKGDKGVDG 205
Query: 189 RLRYLGL 195
+ G+
Sbjct: 206 AIGRTGV 212
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 12/160 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
++GP+G+ G G +GP G + GP G+ GP G Y+GP G Y G
Sbjct: 80 SIGPAGKRGITGEKGEEGPVGPMGHIGRQGPIGIVGKPGQQGPPGEQGYVGPKGEKGYPG 139
Query: 69 PSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G + +G P G + GP GR +G G Y GP G G G GP G
Sbjct: 140 DPGIVGAVGEDGPPGLMGKTGPPGR---MGEPGDHGYPGPPGAFGEQGQEGIAGDHGPPG 196
Query: 126 RLNS---DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
DG GR +G G G G + GP G+
Sbjct: 197 NKGDKGVDGAIGRTGVVGIKGERGVPGIKGNIGERGPKGK 236
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/130 (29%), Positives = 49/130 (37%), Gaps = 6/130 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
+V K GP G Y+GP G Y G G + +G G +G +G +G G
Sbjct: 113 IVGKPGQQGPPGEQGYVGPKGEKGYPGDPGIVGAVGEDGPPGLMGKTGPPGRMGEPGDHG 172
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
Y GP G G G GP G G G + GR +G G G G
Sbjct: 173 YPGPPGAFGEQGQEGIAGDHGPPGNKGDKGVDGAI------GRTGVVGIKGERGVPGIKG 226
Query: 126 RLNSDGPSGR 135
+ GP G+
Sbjct: 227 NIGERGPKGK 236
>gi|229141463|ref|ZP_04270000.1| Multiple banded antigen [Bacillus cereus BDRD-ST26]
gi|228642026|gb|EEK98320.1| Multiple banded antigen [Bacillus cereus BDRD-ST26]
Length = 1033
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/197 (30%), Positives = 71/197 (36%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 229 NTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQG 288
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 289 VQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQG 345
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 346 IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQG 405
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ +G+
Sbjct: 406 IQGIQGVQGITGATGIQ 422
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/208 (28%), Positives = 71/208 (34%), Gaps = 6/208 (2%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T T + + GP+G G G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 227 TGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGI 286
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 287 QGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGV 343
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 344 QGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 403
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G G+ + G+
Sbjct: 404 QGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQ 431
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/171 (32%), Positives = 64/171 (37%), Gaps = 9/171 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 223 NTGATGNTGITGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 279
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 280 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT- 338
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 339 --GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 387
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 317 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 373
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 374 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGE 433
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 434 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 493
Query: 190 LRYLGLS 196
+G +
Sbjct: 494 TGDMGAT 500
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 267 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQ 326
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 327 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 383
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 384 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEG 441
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/193 (28%), Positives = 66/193 (34%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 296 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGD 352
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 353 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 412
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 413 QGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 466
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 467 QGIQGATGAQGVQ 479
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/198 (26%), Positives = 64/198 (32%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 578 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 637
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 638 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 697
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 698 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 757
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P G G+ + +G
Sbjct: 758 PEGPQGVQGIQGAIGPTG 775
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 649 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 708
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 709 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 768
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 769 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 813
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 338 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 397
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 398 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 454
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 455 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 514
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 515 GPTGVT 520
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +G+ GP+G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 224 TGATGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGE 283
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP
Sbjct: 284 QGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGP 340
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G + GP G GP G GP G GP G G+
Sbjct: 341 QGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQ 395
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 649 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 708
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 709 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 768
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 769 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 813
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.070, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 322 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 378
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
GP G G G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 379 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATG 438
Query: 130 -DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G +G
Sbjct: 439 PEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMG 498
Query: 186 PSGRL 190
+G
Sbjct: 499 ATGAT 503
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.071, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 68/176 (38%), Gaps = 19/176 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 97 LR--GPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGP 148
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G G GP GPSG G +G+ GP+G
Sbjct: 149 QGIQGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GITGPTG 197
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/209 (26%), Positives = 65/209 (31%), Gaps = 24/209 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRY----- 57
+GP+G GP G G +G +GP+G GP GS
Sbjct: 578 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 637
Query: 58 ----------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 638 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 697
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 698 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 757
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G G G + GP G G+
Sbjct: 758 PEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 786
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG- 152
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 153 -RLRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
++ L G +G G G GPSG G +G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ 190
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 61/176 (34%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP GS G +G
Sbjct: 578 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 637
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 638 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 694
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G GP G G G GP G G G G + G+
Sbjct: 695 PVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 750
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 53/157 (33%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 657 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 716
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 717 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 776
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 777 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 813
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/100 (30%), Positives = 39/100 (39%), Gaps = 9/100 (9%)
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 158
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 159 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G GP G GP +GP+G G+
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQ 131
>gi|167856776|ref|ZP_02479435.1| hypothetical protein HPS_10952 [Haemophilus parasuis 29755]
gi|167852100|gb|EDS23455.1| hypothetical protein HPS_10952 [Haemophilus parasuis 29755]
Length = 370
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/157 (33%), Positives = 65/157 (41%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLR--YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 64
+E A N P+G L+ Y S S+ G G GP+G + +GP G +GP G
Sbjct: 220 IESANNE-PNGDLKITYTDGSHSIIKKGEKGDRGETGPAGPVGPIGPVGPAGPIGPQGET 278
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP G GP G GP G GP G +GP+G GP G GP
Sbjct: 279 GPAGPKGEAGAAGPKGEKGDPGPKGET---GPKGEAGPVGPTG---PRGPQGTTGAQGPK 332
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G +G GP+G Y GP G G +G
Sbjct: 333 GDKGEPGQAGPTGPRGPAGPKGYAGPKGDTGQRGETG 369
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/149 (32%), Positives = 60/149 (40%), Gaps = 8/149 (5%)
Query: 33 PSGSLR--YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
P+G L+ Y S + G G GP+G + +GP G +GP G GP G
Sbjct: 227 PNGDLKITYTDGSHSIIKKGEKGDRGETGPAGPVGPIGPVGPAGPIGPQGETGPAGPKGE 286
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G GP G +GP+G GP G GP G G
Sbjct: 287 AGAAGPKGEKGDPGPKGET---GPKGEAGPVGPTGPR---GPQGTTGAQGPKGDKGEPGQ 340
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G GP+G Y GP G G +G
Sbjct: 341 AGPTGPRGPAGPKGYAGPKGDTGQRGETG 369
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/144 (31%), Positives = 56/144 (38%), Gaps = 6/144 (4%)
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
++ Y S S+ G G GP+G + +GP G +GP G GP G G
Sbjct: 232 KITYTDGSHSIIKKGEKGDRGETGPAGPVGPIGPVGPAGPIGPQGETGPAGPKGEAGAAG 291
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P G GP G GP G GP G GP G GP G G +G
Sbjct: 292 PKGEKGDPGPKGET---GPKGEA---GPVGPTGPRGPQGTTGAQGPKGDKGEPGQAGPTG 345
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G Y GP G G +G
Sbjct: 346 PRGPAGPKGYAGPKGDTGQRGETG 369
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/142 (32%), Positives = 57/142 (40%), Gaps = 8/142 (5%)
Query: 51 PSGSLR--YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
P+G L+ Y S + G G GP+G + +GP G +GP G GP G
Sbjct: 227 PNGDLKITYTDGSHSIIKKGEKGDRGETGPAGPVGPIGPVGPAGPIGPQGETGPAGPKGE 286
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G GP G GP G +GP+G GP G GP G G
Sbjct: 287 AGAAGPKGEKGDPGPKGET---GPKGEAGPVGPTG---PRGPQGTTGAQGPKGDKGEPGQ 340
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP+G Y GP G
Sbjct: 341 AGPTGPRGPAGPKGYAGPKGDT 362
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/132 (31%), Positives = 52/132 (39%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
++ Y S + G G GP+G + +GP G +GP G GP G G
Sbjct: 232 KITYTDGSHSIIKKGEKGDRGETGPAGPVGPIGPVGPAGPIGPQGETGPAGPKGEAGAAG 291
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G GP G +GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 292 PKGEKGDPGPKGE---TGPKGEAGPVGPTG---PRGPQGTTGAQGPKGDKGEPGQAGPTG 345
Query: 183 YLGPSGRLRYLG 194
GP+G Y G
Sbjct: 346 PRGPAGPKGYAG 357
>gi|376265398|ref|YP_005118110.1| flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus cereus
F837/76]
gi|364511198|gb|AEW54597.1| Flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus cereus
F837/76]
Length = 596
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 68/188 (36%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 238 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAG-- 295
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS---- 129
G +G+ GP+G G G G +G G G GP+G +
Sbjct: 296 -ATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAQGAQ 354
Query: 130 --DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP+G G G GP+G G G GP+G G G GP+
Sbjct: 355 GVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPA 414
Query: 188 GRLRYLGL 195
G G
Sbjct: 415 GATGATGA 422
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ G +G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 274 GPAGATGATGPQGPQGIQGPAGA---TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGAT 330
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G G G GP+G G G GP+G + G
Sbjct: 331 GATGAQGPQGVQGPAG---ATGAQGAQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQ 387
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 388 GPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 442
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.070, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/236 (23%), Positives = 69/236 (29%), Gaps = 54/236 (22%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG----------- 62
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 67 GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGIQGPAGATGAT 126
Query: 63 -RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR-- 119
GP G G +G+ G G GP G GP+G G G
Sbjct: 127 GATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPA 186
Query: 120 ----------------YLGPSGRLNS------------------------DGPSGRLRYL 139
GP+G + GP+G
Sbjct: 187 GATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 246
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP+G G G GP+G GP G GP+G G
Sbjct: 247 GAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGA 302
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/133 (28%), Positives = 47/133 (35%), Gaps = 18/133 (13%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQ------GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 92 RYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GP G GP G G +G G G + GP G
Sbjct: 109 GATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQ 168
Query: 140 GPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G G
Sbjct: 169 GPAGATGATGAQG 181
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/139 (31%), Positives = 56/139 (40%), Gaps = 12/139 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP G P+G GP G GP+G GP G GP+G+
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G G +G GP G GP+G G +G + GP+G GP
Sbjct: 109 GATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGPAG---ATGPQ 162
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G GP+G G G
Sbjct: 163 GPQGIQGPAGATGATGAQG 181
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/133 (28%), Positives = 47/133 (35%), Gaps = 18/133 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQ------GPAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 74 RYLGPSG------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP G + GP G G +G G G GP G
Sbjct: 109 GATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQ 168
Query: 122 GPSGRLNSDGPSG 134
GP+G + G G
Sbjct: 169 GPAGATGATGAQG 181
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/133 (28%), Positives = 45/133 (33%), Gaps = 18/133 (13%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP G P+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 119 RYLGPSG------------RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
GP G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 109 GATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQ 168
Query: 167 GPSGRLRYLGPSG 179
GP+G G G
Sbjct: 169 GPAGATGATGAQG 181
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/237 (23%), Positives = 67/237 (28%), Gaps = 45/237 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG------------RLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GP+G GP G GP+G+ GP G GP G G +
Sbjct: 85 GPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGATGATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAGAT 144
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------YL 103
G G G GP G GP+G G G
Sbjct: 145 GATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGATGAQGPQGVQ 204
Query: 104 GPSGRLRYLGP---------------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
GP+G G G GP+G + G G GP+G
Sbjct: 205 GPAGATGATGAQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGAT 264
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G GP+G GP G GP+G G G G + G
Sbjct: 265 GAQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQ 321
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/133 (28%), Positives = 45/133 (33%), Gaps = 18/133 (13%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G P+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 128 NSDGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
+ GP G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 109 GATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQ 168
Query: 176 GPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G G
Sbjct: 169 GPAGATGATGAQG 181
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/133 (28%), Positives = 45/133 (33%), Gaps = 18/133 (13%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ GP G P+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 110 RYLGPSG------------RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 157
GP G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 109 GATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQ 168
Query: 158 GPSGRLRYLGPSG 170
GP+G G G
Sbjct: 169 GPAGATGATGAQG 181
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/131 (28%), Positives = 44/131 (33%), Gaps = 18/131 (13%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ GP G P+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 55 GPAGATGATGPQG------PAGAQGATGPQGPQGAQGPAGVQGATGPQGPQGIQGPAGAT 108
Query: 137 RYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 109 GATGPQGIQGPAGATGATGATGPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGPQGPQGIQ 168
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP+G G
Sbjct: 169 GPAGATGATGA 179
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ GP G GP+G G G+ G +G G G
Sbjct: 144 TGATGAQGAQGPAGAT---GPQGPQGIQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGATGAQGP 200
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G G +G GP G GP+G G G GP
Sbjct: 201 QGVQGPAGATGATGAQGPAGATGATGATGAQGPQG---VQGPAGATGATGAQGPQGVQGP 257
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G GP+G GP G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 258 AGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGPQGPQGIQGPAG---ATGATGAQGAQGPAGATGA 314
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 315 TGA 317
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/149 (27%), Positives = 53/149 (35%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+G+ G G+ G +G G G GP+G G G
Sbjct: 297 TGATGAQGAQGPAGATGATGAQGAQGPAGATGATGATGAQGPQGVQGPAG---ATGAQGA 353
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP
Sbjct: 354 QGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGP 413
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G G G GP+G G G
Sbjct: 414 AGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 442
>gi|229076236|ref|ZP_04209203.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock4-18]
gi|228706885|gb|EEL59091.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock4-18]
Length = 1289
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 696 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 755
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 756 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 815
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 816 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 860
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/198 (26%), Positives = 65/198 (32%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 625 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 684
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 685 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 744
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 745 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 804
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P G G+ + +G
Sbjct: 805 PEGPQGVQGVQGAIGPTG 822
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G G GP G +GP +G GP
Sbjct: 293 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQ 352
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 353 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 409
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 410 GSQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQ 469
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G G+ +G
Sbjct: 470 GVQGAQGGIGPTG 482
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 343 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 399
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ G G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 400 PGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGE 459
Query: 136 LRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 460 IGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 519
Query: 190 L 190
Sbjct: 520 T 520
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 696 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 755
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 756 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 815
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 816 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 860
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 61/175 (34%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 662 IGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGE 718
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 719 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 778
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 779 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAIGPTGPMGTQGVQGIQ 833
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 59/174 (33%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G +
Sbjct: 323 GATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEI 379
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G G G GP G GP G G
Sbjct: 380 GPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQ 439
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 440 GITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGAQGVQGIQ 493
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 596 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 655
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 656 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 712
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 713 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 772
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 773 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 797
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 348 DQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 404
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-- 129
G G GP G GP G G G G G G G + +
Sbjct: 405 ATGPEGSQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATG 464
Query: 130 -DGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+GP G +GP+G + G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 465 PEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 520
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 327 DQGPQGIQGAIGPQGV------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMG 377
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G G G GP G GP G G
Sbjct: 378 EIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 437
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G G G G + GP G G G + GP G G
Sbjct: 438 VQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGAQGVQG 491
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/196 (27%), Positives = 65/196 (33%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 584 TGATGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 643
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 644 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 703
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 704 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 763
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 764 TGPQGPQGIQGIQGVQ 779
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.031, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/200 (30%), Positives = 75/200 (37%), Gaps = 10/200 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 253 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQG 311
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 312 IQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQG 368
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 369 VQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGATGPQG 428
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G G+ V+G+
Sbjct: 429 PQGIQGIQGVQGITGVTGVQ 448
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/195 (29%), Positives = 66/195 (33%), Gaps = 6/195 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G G+ GP G +GP +G+ GP G GPS
Sbjct: 302 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGIMGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPS 361
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G G G
Sbjct: 362 G---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQ 418
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 419 GPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGI 478
Query: 191 RYLGLSDGLRVSGLH 205
G V G+
Sbjct: 479 GPTGPMGAQGVQGIQ 493
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.078, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/160 (29%), Positives = 55/160 (34%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 704 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 763
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 764 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAI---GP 820
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 821 TGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 860
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/199 (29%), Positives = 69/199 (34%), Gaps = 9/199 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG--SLRYL-GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G G G ++ + GP G GP G GP+G G G G
Sbjct: 262 TGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGI 321
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 322 MGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 378
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G GP G GP G G G GP G GP G G
Sbjct: 379 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 438
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G+ + G+
Sbjct: 439 QGITGVTGVQGETGIQGIQ 457
>gi|423548020|ref|ZP_17524378.1| hypothetical protein IGO_04455, partial [Bacillus cereus HuB5-5]
gi|401177585|gb|EJQ84774.1| hypothetical protein IGO_04455, partial [Bacillus cereus HuB5-5]
Length = 1101
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 68/193 (35%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 277 GPQGTQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGNQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQ 336
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G G G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 337 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGAMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 393
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 394 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQ 453
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G G+ +G
Sbjct: 454 GVQGAQGGIGPTG 466
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 62/191 (32%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 609 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 668
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 669 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 728
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 729 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 788
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G+
Sbjct: 789 PEGPQGVQGVQ 799
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 680 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 739
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 740 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 799
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 800 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 844
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G G G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 243 TGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGSIGPTGPEGPQGTQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGI 302
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G G
Sbjct: 303 QGITGATGNQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGA 359
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 360 MGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGI 419
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ V+G+
Sbjct: 420 QGVQGITGVTGVQ 432
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 680 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 739
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 740 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQ 799
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 800 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 844
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/209 (26%), Positives = 66/209 (31%), Gaps = 24/209 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRY----- 57
+GP+G GP G G +G +GP+G GP GS
Sbjct: 609 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 668
Query: 58 ----------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 669 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 728
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 729 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 788
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G G G + GP G G+
Sbjct: 789 PEGPQGVQGVQGAIGPTGPMGTQGVQGIQ 817
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G +GP G +G+ GP G GPSG+ GP G G G
Sbjct: 311 NQGPQGIQGAIGPQGV------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGAMG 361
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 362 EIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQG 421
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G G G G + GP G G G + GP G G
Sbjct: 422 VQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGAQGVQG 475
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 60/181 (33%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G +GP G +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 306 TGATGNQGPQGIQGAIGPQGV------TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 356
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 357 QGAMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 416
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 417 QGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGAQGVQGI 476
Query: 196 S 196
Sbjct: 477 Q 477
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 62/176 (35%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP GS G +G
Sbjct: 609 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 668
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 669 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 725
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G GP G GP G GP G G G G + G+
Sbjct: 726 PVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 781
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G G G GP G GP+G G G
Sbjct: 240 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGSIGPTGPEGPQGTQGIPGPTGVTGEQGIQGV 299
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 300 QGIQGITGATGNQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 356
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 357 QGAMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 416
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 417 QGIQGVQGITGVTGVQGETGIQGIQ 441
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/196 (27%), Positives = 65/196 (33%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 568 TGATGDTGATGSTGMTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 627
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 628 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 687
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 688 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 747
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 748 TGPQGPQGIQGIQGVQ 763
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 688 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 747
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 748 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGVQGAIGPTGP 807
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 808 MGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 844
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 228 TGATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGSIGPTG---PEGPQGTQGI 284
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 285 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGNQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 344
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 345 SG---ATGPQGVQGIQGAMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 397
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.91, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/169 (29%), Positives = 64/169 (37%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +GS G +G G +G+ G G +GP+G GP G+
Sbjct: 228 TGATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGSIGPTG---PEGPQGTQGI 284
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 285 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGNQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 344
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
SG GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 345 SG---ATGPQGVQGIQGAMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 390
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/156 (28%), Positives = 54/156 (34%), Gaps = 9/156 (5%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
V + GP G GPSG+ G G++ +GP+ GP G GP G
Sbjct: 326 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSGATGPQGVQGIQGAMGEIGPT------GPEGPEGLQGPQG 379
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 380 IQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGVTGVQGETGIQG 439
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G + + GP G G G + GP G G
Sbjct: 440 IQGEIGATGPEGPQGVQGAQGGIGPTGPMGAQGVQG 475
>gi|326324739|dbj|BAJ84553.1| collagen-like protein SclZ.3 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus]
Length = 308
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP+G GP G G +G GP+G + GP G +GP G
Sbjct: 74 TGPRGEPGPVGPAGPRGERGPQGLPGDKGETGERGETGPAGPIGPQGPKGDQGEMGPQG- 132
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP G +GP G G G + GP G +GP G G
Sbjct: 133 --PKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQG---PKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQG---PKGD 184
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G + GP G +GP G G G + GP G +GP G G G+
Sbjct: 185 QGEVGPQGPKGDQGEVGPQG---PKGDQGEMGPQGPKGDQGEVGPQGPDSSQGEQGQ 238
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 59/150 (39%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
L+ GP+G P G +GP+G GP G G +G GP+G + G
Sbjct: 67 ELKIPGPTG------PRGEPGPVGPAGPRGERGPQGLPGDKGETGERGETGPAGPIGPQG 120
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLG 158
P G +GP G G G + GP G +GP G + GP G +G
Sbjct: 121 PKGDQGEMGPQG---PKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEIG 177
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G G + GP G +GP G
Sbjct: 178 PQG---PKGDQGEVGPQGPKGDQGEVGPQG 204
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/133 (29%), Positives = 51/133 (38%), Gaps = 12/133 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSG------RLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GP+G + GP G +GP G +GP G + GP G +GP G
Sbjct: 109 ETGPAGPIGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQGPKGDQGEMGPQG 168
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G + GP G +GP G G G G G + GP G +G
Sbjct: 169 ---PKGDQGEIGPQGPKGDQGEVGPQGPKGDQGEVGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEVG 225
Query: 123 PSGRLNSDGPSGR 135
P G +S G G+
Sbjct: 226 PQGPDSSQGEQGQ 238
>gi|118478935|ref|YP_896086.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
str. Al Hakam]
gi|118418160|gb|ABK86579.1| conserved hypothetical protein [Bacillus thuringiensis str. Al
Hakam]
Length = 1269
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 757 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGAT 807
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G + G +
Sbjct: 808 GATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGAT 864
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 865 GPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 913
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 829 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 883
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP G + G +
Sbjct: 884 -VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGAT 936
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 937 GPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 985
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 71/175 (40%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 742 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 792
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G GP G G +G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 793 GATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPA 846
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 847 GATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 898
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 71/175 (40%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 844 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG-- 898
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 899 -VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQ 954
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 955 G---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 1000
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 70/175 (40%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 727 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 777
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G G +G GP G G +G GP+
Sbjct: 778 GATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPA 831
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 832 GATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 883
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 70/175 (40%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G GP+G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 811 GPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQ 867
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G +
Sbjct: 868 GVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGAT 921
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 922 GATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 970
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 72/177 (40%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 860 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 913
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + G
Sbjct: 914 ---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATG 967
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 968 PQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 1015
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/177 (31%), Positives = 71/177 (40%), Gaps = 15/177 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+G+ GP G+ G +G G +G GP+G GP G
Sbjct: 695 NTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 754
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + G
Sbjct: 755 ---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTG 805
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 806 ATGATGPQGAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG 856
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 24/175 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 886 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQ 939
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 940 GVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPA 990
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 991 GATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAG 1036
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 71/175 (40%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 772 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQ 825
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 826 GVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQ 882
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 883 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG 928
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/175 (33%), Positives = 72/175 (41%), Gaps = 24/175 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 901 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 955
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 956 -AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPA 1005
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 1006 GATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTG 1051
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/181 (32%), Positives = 73/181 (40%), Gaps = 27/181 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYL 67
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G+ GP +G
Sbjct: 871 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGAT 924
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 925 GPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---VQGPAGAT 978
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 979 GATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQ 1029
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 1030 G 1030
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 70/178 (39%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+
Sbjct: 706 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPA 759
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 760 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQ 813
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 814 GAQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG 865
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 70/175 (40%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 787 GPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 841
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 842 -AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 897
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G G +G GP G G +G GP+G
Sbjct: 898 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAG 946
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 68/175 (38%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G+ GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 766 GPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQ 816
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G GP+
Sbjct: 817 GNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPA 873
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 874 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATG 922
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 12/175 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G GP+G GP G+ G +G G +G
Sbjct: 679 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGPAGATGATGPQ 738
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+
Sbjct: 739 GVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPA 789
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 790 GATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 841
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 68/175 (38%), Gaps = 24/175 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GP G+ GP+G+ GP G G +G+ G G GP G
Sbjct: 649 GAQGTTGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG-- 703
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G GP+G GP G GP+G + GP
Sbjct: 704 -VQGPAGATGATGPQGA------QGNTGATGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQ 753
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 754 G---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 799
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/166 (31%), Positives = 68/166 (40%), Gaps = 15/166 (9%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP G+ G +G GP G+ G +G GP+G GP G+
Sbjct: 664 GPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ 720
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G +G GP+G GP G GP+G + GP G GP+
Sbjct: 721 GNTGATGPAGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPA 774
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 775 GATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGNTGATGATGPQG 814
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 18/178 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 71
GP+G GP G+ G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 664 GPAGATGATGPQGAQGNTGATGAT---GPQGAQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQ 720
Query: 72 -RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 721 GNTGATGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQ 771
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G GP+G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 772 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGPQG 826
>gi|222098199|ref|YP_002532256.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus Q1]
gi|221242257|gb|ACM14967.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 1330
Score = 48.9 bits (115), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/197 (30%), Positives = 71/197 (36%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 245 NTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQG 304
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 305 VQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQG 361
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 362 IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQG 421
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ +G+
Sbjct: 422 IQGIQGVQGITGATGIQ 438
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/208 (28%), Positives = 71/208 (34%), Gaps = 6/208 (2%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T T + + GP+G G G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 243 TGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGI 302
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 303 QGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGV 359
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 360 QGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 419
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G G+ + G+
Sbjct: 420 QGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQ 447
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 333 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 389
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 390 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGE 449
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 450 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 509
Query: 190 LRYLGLS 196
+G +
Sbjct: 510 TGDMGAT 516
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 312 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGD 368
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 369 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 428
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 429 QGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGV 482
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 530
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 531 GPTGVT 536
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/198 (26%), Positives = 64/198 (32%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P G G+ + +G
Sbjct: 795 PEGPQGVQGIQGAIGPTG 812
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ GP+G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 ATGNTGATGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G G+
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGV 410
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 19/183 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 97 LR--GPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGP 148
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G GP GPSG G +G+ GP+G
Sbjct: 149 QGIQGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGP 201
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 202 TGI 204
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.073, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 332 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 388
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 389 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQG 448
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 449 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 508
Query: 180 RLRYLGPSGRL 190
+G +G
Sbjct: 509 ATGDMGATGAT 519
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G + GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVMGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG- 152
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 153 -RLRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
++ L G +G G G GPSG G +G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ 190
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/209 (26%), Positives = 65/209 (31%), Gaps = 15/209 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY----- 66
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 67 ----------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G G G + G V G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 823
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 51/134 (38%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
G +GS G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGA 979
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G G G +GP+G GP G G +G + GP G GP G +
Sbjct: 980 TGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGP 1036
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSG 161
GP G GP G
Sbjct: 1037 TGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.92, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/192 (26%), Positives = 65/192 (33%), Gaps = 18/192 (9%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
G +G+ G +G+ G +G + GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVMGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGP 123
+G G G +GP+G GP G GP G + GP
Sbjct: 637 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGP 696
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G G G + GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 697 QGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGP 756
Query: 184 LGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 757 QGPQGIQGIQGV 768
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 53/157 (33%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 50/134 (37%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +GS G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGA 979
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 980 TGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGP 1036
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G
Sbjct: 1037 TGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 51/134 (38%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
G +GS G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGA 979
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G+ G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 980 TGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQGI---QGPQGDIGP 1036
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSG 152
GP G GP G
Sbjct: 1037 TGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/99 (30%), Positives = 39/99 (39%), Gaps = 9/99 (9%)
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 158
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 159 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
P G GP G GP +GP+G G+
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGV 130
>gi|206969563|ref|ZP_03230517.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1134]
gi|206735251|gb|EDZ52419.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1134]
Length = 1309
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 63/181 (34%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 249 TGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGI 308
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G+ GP G +GP G G G G G L GP G GP G
Sbjct: 309 QGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPLGATGPQGVQGIQGPMGD 368
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+ GP G GP G GP G GP G G G + GP G G+
Sbjct: 369 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG---ATGPEGSQGIQGIQGTVGTTGPQGPQGIQGI 425
Query: 196 S 196
Sbjct: 426 Q 426
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/198 (26%), Positives = 65/198 (32%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
P G G+ + +G
Sbjct: 795 PEGPQGVQGIQGAIGPTG 812
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/202 (29%), Positives = 68/202 (33%), Gaps = 3/202 (1%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G G GP G +GP G G G G G L GP G GP
Sbjct: 306 QGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPLGATGPQGVQGIQGP 365
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + GP G GP G GP G GP G G G + GP G
Sbjct: 366 MGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG---ATGPEGSQGIQGIQGTVGTTGPQGPQGI 422
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + V+G+
Sbjct: 423 QGIQGVQGITGATGVQGVTGIQ 444
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/198 (27%), Positives = 63/198 (31%), Gaps = 15/198 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------L 58
GP G G +G G G +GP+G GP GS
Sbjct: 626 GPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQ 685
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + GP G G+
Sbjct: 806 GAIGPTGPMGAQGVQGIQ 823
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/209 (26%), Positives = 66/209 (31%), Gaps = 15/209 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY----- 66
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 67 ----------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G G G + G V G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 823
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/171 (30%), Positives = 62/171 (36%), Gaps = 1/171 (0%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 ATGNTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G G G G GP G +GP G + G G G G L G
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPLGATG 355
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
P G GP G + GP G GP G GP G G S G++
Sbjct: 356 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEG-SQGIQ 405
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/188 (29%), Positives = 66/188 (35%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G G G G G GP G +GP G G G G G
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
L GP G GP G + GP G GP G GP G GP G G+
Sbjct: 351 LGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG---ATGPEGSQGIQGI 407
Query: 196 SDGLRVSG 203
+ +G
Sbjct: 408 QGTVGTTG 415
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 64/194 (32%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ G G G G L GP G GP G + GP G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPLGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 376
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G G G + GP GP G G
Sbjct: 377 PEGLQGPQGIQGVPGPVG---ATGPEGSQGIQGIQGTVGTTGPQ------GPQGIQGIQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 428 VQGITGATGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQG 481
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 482 VQGIQGATGAQGVQ 495
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 57/175 (32%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G G G GP G +GP G G G
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 342
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G L GP G GP G + GP G GP G GP G +G
Sbjct: 343 GIQGVPGPLGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQ 402
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 403 GIQGIQGTVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.062, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/171 (28%), Positives = 55/171 (32%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G+ GP G +GP G G G G G L GP G GP G +
Sbjct: 313 GATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPLGATGPQGVQGIQGPMGDIGPT 372
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G G G G G GP G G G
Sbjct: 373 GPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGTVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGIT 432
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 433 GATGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGVQ 483
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 62/183 (33%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP+G G G G G+ GP G +GP G
Sbjct: 274 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGAT 333
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G G G L GP G GP G + GP G GP G GP
Sbjct: 334 GATGDQGPQGIQGVPGPLGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPV 393
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G G + GP G G G G +G G G +
Sbjct: 394 G---ATGPEGSQGIQGIQGTVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGVTGIQGIQGEI 450
Query: 194 GLS 196
G +
Sbjct: 451 GAT 453
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 63/190 (33%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 580 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 639
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 640 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGP 699
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 700 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGP 759
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G+
Sbjct: 760 QGIQGIQGVQ 769
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 65/187 (34%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS-- 70
+GP G G G G G L GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 327 IGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPLGATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGI 386
Query: 71 ----GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GP 123
G + GP GS G G + GP G G G G +G G
Sbjct: 387 QGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGTVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGVTGIQGI 446
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + + GP G G G +GP+G + G G G +G GP G
Sbjct: 447 QGEIGATGPEGPQGVQGAQGE---IGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGI 503
Query: 184 LGPSGRL 190
GP+G
Sbjct: 504 QGPTGAT 510
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 637 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 693
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 190 L 190
Sbjct: 754 T 754
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/170 (30%), Positives = 62/170 (36%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGPQGLRGP 100
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 101 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 160
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 161 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
>gi|229174032|ref|ZP_04301568.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus MM3]
gi|228609364|gb|EEK66650.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus MM3]
Length = 824
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/202 (26%), Positives = 79/202 (39%), Gaps = 7/202 (3%)
Query: 2 FGTCVVEKALNL----GPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS 54
G V+ A + G +G GP G+ +GP+G+ G G GP+G+
Sbjct: 345 IGVAGVQGAQGIQGVQGITGATGAEGPQGTQGPQGEIGPTGAEGPKGVQGIQGITGPTGA 404
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G G + G +G GP G G +G GP G G +G GP
Sbjct: 405 QGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGAAGAQGIQGPQGIRGETGAAGVQGIQGP 464
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +G +G + G G +GP+G + GP G +GP+G G G
Sbjct: 465 QGIQGEIGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGI 524
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G G + G++
Sbjct: 525 TGPTGAQGIRGLQGNIGESGIT 546
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/172 (28%), Positives = 67/172 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G + G +G+ GP G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 400 GPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGAAGAQGIQGPQGIRGETGAAGVQ 459
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G +G +G G G +GP+G + GP G +GP+G S G
Sbjct: 460 GIQGPQGIQGEIGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQ 519
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G G G + G +G G G GP G + G
Sbjct: 520 GIQGITGPTGAQGIRGLQGNIGESGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNVGITG 571
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 6/191 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G G G GP+G+ G G + G +G+ GP G G +G
Sbjct: 380 EIGPTGAEGPKGVQGIQGITGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGAAG 439
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G GP G +G +G G G +GP+G + G
Sbjct: 440 AQGIQGPQGIRGETGAAGVQGIQGPQGIQGEIGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQG 499
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
P G +GP+G G G GP+G +G SG G G G
Sbjct: 500 PQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGLQGNIGESGITGPQGVQGAQGIEG 559
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G +G++
Sbjct: 560 PEGPQGNVGIT 570
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 72/191 (37%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GP+G G GS +G +G G G G +G+ G G +GP+G
Sbjct: 328 GPTGAQGARGAQGSQGIIGVAGVQGAQGIQGVQGITGATGAEGPQGTQGPQGEIGPTGAE 387
Query: 73 --------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G+ G G + G +G GP G G +G GP
Sbjct: 388 GPKGVQGIQGITGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGAAGAQGIQGPQ 447
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G G +G GP G +G +G G G +GP+G + GP G +
Sbjct: 448 GIRGETGAAGVQGIQGPQGIQGEIGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIV 507
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP+G G+
Sbjct: 508 GPTGAQGSQGM 518
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/175 (27%), Positives = 65/175 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G+ G G + G +G GP G G +G GP G G +G
Sbjct: 398 ITGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGAAGAQGIQGPQGIRGETGAAG 457
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP G +G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 458 VQGIQGPQGIQGEIGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQG 517
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP+G G G + G +G G G GP G + G+
Sbjct: 518 MQGIQGITGPTGAQGIRGLQGNIGESGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNVGITGV 572
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/178 (26%), Positives = 67/178 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G+ G GS +G +G G G G +G G G
Sbjct: 318 IGAQGLQGITGPTGAQGARGAQGSQGIIGVAGVQGAQGIQGVQGITGATGAEGPQGTQGP 377
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G+ G G GP+G G G + G +G GP G G
Sbjct: 378 QGEIGPTGAEGPKGVQGIQGITGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGA 437
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G GP G G +G GP G +G +G G G +GP+G +
Sbjct: 438 AGAQGIQGPQGIRGETGAAGVQGIQGPQGIQGEIGLTGAQGAQGLQGVQGIIGPTGAI 495
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/155 (27%), Positives = 58/155 (37%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T A GP G G +G+ GP G G +G GP G +G +G
Sbjct: 417 TGTTGAAGAQGPQGIRGETGAAGAQGIQGPQGIRGETGAAGVQGIQGPQGIQGEIGLTGA 476
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G G +GP+G++ GP G +GP+G G G GP+G G
Sbjct: 477 QGAQGLQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGL 536
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G + G +G G G GP G + G
Sbjct: 537 QGNIGESGITGPQGVQGAQGIEGPEGPQGNVGITG 571
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/174 (26%), Positives = 62/174 (35%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +G +G G GP+G+ G G +G +G G G G +G
Sbjct: 310 GVTGGTGAIGAQGLQGITGPTGAQGARGAQGSQGIIGVAGVQGAQGIQGVQGITGATGAE 369
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G +GP+G G G GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 370 GPQGTQGPQGEIGPTGAEGPKGVQGIQGITGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQ 429
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G +G GP G G +G GP G +GL+ GL
Sbjct: 430 GIRGETGAAGAQGIQGPQGIRGETGAAGVQGIQGPQGIQGEIGLTGAQGAQGLQ 483
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/173 (27%), Positives = 61/173 (35%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + GP G + GP G + G G G +GS G G +G G+
Sbjct: 78 TGPVGLQGPQGLIGGQGPVGDIGLQGLEGIQGITGSAGSQGIQGAQGIQGEIGERGQTGA 137
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G + G +G GP G G G G G G +G G G
Sbjct: 138 QGMQGVVGEAGITGVTGPQGPQGVQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGPQGDQGI 197
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G G +G + GP G G G + GP G
Sbjct: 198 QGVTGPTGSTGIQGPQGISGIKGITGVIGPQGPQGIQGIQGVRGSTGFQGPKG 250
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/186 (26%), Positives = 64/186 (34%), Gaps = 3/186 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G GP G+ G G + G +G + GP G + GP
Sbjct: 37 GPIGATGPQGPQGIEGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGGQGPV 96
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + G G G +G G G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 97 GDIGLQGLEGIQGITGSAGSQGIQGAQGIQGEIGERGQTGAQGMQGVVGEAGITGVTGPQ 156
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G G G G G +G G G GP+G GP G
Sbjct: 157 GPQGVQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIQGITGEQGPQGDQGIQGVTGPTGSTGIQGPQGIS 216
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 217 GIKGIT 222
>gi|49187616|ref|YP_030869.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus anthracis str.
Sterne]
gi|49181543|gb|AAT56919.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Sterne]
Length = 647
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 364 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 423
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 424 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 480
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 48/120 (40%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP+G G +G+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 364 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 423
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G G +G G +G S GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 424 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 480
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/121 (28%), Positives = 47/121 (38%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G
Sbjct: 364 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 423
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 424 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 480
Query: 195 L 195
Sbjct: 481 A 481
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 47/120 (39%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 364 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 423
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G G +G S G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 424 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 480
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 48/120 (40%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 364 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 423
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G G +G GP+G S G +G GP+G G
Sbjct: 424 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTG---STGATGVTGNTGPTGSTGATG 480
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/120 (26%), Positives = 47/120 (39%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 364 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 423
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 424 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 480
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/173 (24%), Positives = 59/173 (34%), Gaps = 30/173 (17%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------------------LGPSGR 63
G +GS G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 311 TGVTGSTGVTGSTGVTGETGPTGSTGATGNTGPTGETGGTGSTGATGSTGVTGNTGPTGS 370
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 371 TGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGE 430
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+G S G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 431 TGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 480
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/104 (25%), Positives = 40/104 (38%)
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 364 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 423
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 424 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVT 467
>gi|229018584|ref|ZP_04175440.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1273]
gi|229024838|ref|ZP_04181271.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1272]
gi|228736472|gb|EEL87034.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1272]
gi|228742723|gb|EEL92867.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus AH1273]
Length = 410
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/166 (29%), Positives = 62/166 (37%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G GP+G GP+G+ GP G GP G G +G
Sbjct: 111 IGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGLTGATGPTGAT---GPQGIQGIQGPQGVTGQAGATGP 167
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G GP G G +G GP G GP G S G +G G
Sbjct: 168 TGATGPQGVQGIQGPQGITGQAGATGATGVTGPQGIQGIQGPQGVTGSTGATGATGVTGA 227
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP+G G +G G +G GP+G G S
Sbjct: 228 T------GPTGLQGIRGATGATGQAGVTGPTGATGPTGLTGATGSS 267
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G+ G G++ G G +G GS + GP+G G
Sbjct: 46 GPQGIQGIQGPRGTTGAQGIQGAVGDTGAQGVTGPIGLQGSQGLIGNQGPTGPQGIQGLQ 105
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +GP+G G G GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 106 GIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGLTGATGPTGA---TGPQGIQGIQGPQGVTGQA 162
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G GP G GP G G +G GP G GP G G +G
Sbjct: 163 GATGPTGATGPQGVQGIQGPQGITGQAGATGATGVTGPQGIQGIQGPQGVTGSTGATGAT 222
Query: 191 RYLGLS 196
G +
Sbjct: 223 GVTGAT 228
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/194 (29%), Positives = 74/194 (38%), Gaps = 8/194 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGP 69
+GP+G GP+G + GP G GP G GP G GP +G G
Sbjct: 11 IGPAGNSGPTGPTGG--HEGPVGPPGITGPRGATGPQGPQGIQGIQGPRGTTGAQGIQGA 68
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +G + G G + GP+G G G +GP+G G G S
Sbjct: 69 VGDTGAQGVTGPIGLQGSQGLIGNQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGS 128
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G GP+G GP G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 129 TGPTGLTGATGPTGA---TGPQGIQGIQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQGVQGIQGPQGI 185
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 186 TGQAGATGATGVTG 199
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G G G +G + G G + GP+G G G +GP+G
Sbjct: 58 GTTGAQGIQGAVGDTGAQGVTGPIGLQGSQGLIGNQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPT 117
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP+G GP+G GP G GP G G +G + GP
Sbjct: 118 GPQGIQGITGSTGPTGLTGATGPTGAT---GPQGIQGIQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQ 174
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G GP G GP G G +G G +G
Sbjct: 175 GVQGIQGPQGITGQAGATGATGVTGPQGIQGIQGPQGVTGSTGATGATGVTGATGPTGLQ 234
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 235 GI 236
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/193 (29%), Positives = 70/193 (36%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G GP +G+ G G G +G + G G + GP+
Sbjct: 37 GPRGATGPQGPQGIQGIQGPRGTTGAQGIQGAVGDTGAQGVTGPIGLQGSQGLIGNQGPT 96
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G G +GP+G G G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 97 GPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGLTGATGPTGAT---GPQGIQGIQ 153
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G +G GP G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 154 GPQGVTGQAGATGPTGATGPQGVQGIQGPQGITGQAGATGATGVTGPQGIQGIQGPQGVT 213
Query: 191 RYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 214 GSTGATGATGVTG 226
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G G G +GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 85 GSQGLIGNQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGLTGATGPTGAT 144
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G G +G GP G GP G G +G GP
Sbjct: 145 ---GPQGIQGIQGPQGVTGQAGATGPTGATGPQGVQGIQGPQGITGQAGATGATGVTGPQ 201
Query: 134 GRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP +G G +G GP+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 202 GIQGIQGPQGVTGSTGATGATGVTGATGPTGLQGIRGATGATGQAGVTGPTGATGPTGLT 261
Query: 191 RYLGLS 196
G S
Sbjct: 262 GATGSS 267
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/160 (29%), Positives = 60/160 (37%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 111 IGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGLTGATGPTGAT---GPQGIQGIQGPQGVTGQAGATGP 167
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G GP G G +G GP G GP +G G +G +
Sbjct: 168 TGATGPQGVQGIQGPQGITGQAGATGATGVTGPQGIQGIQGPQGVTGSTGATGATGVTGA 227
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP+G G +G G +G GP+G G S
Sbjct: 228 TGPTGLQGIRGATGATGQAGVTGPTGATGPTGLTGATGSS 267
>gi|451927654|gb|AGF85532.1| repeat protein [Moumouvirus goulette]
Length = 2135
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 61/179 (34%), Gaps = 21/179 (11%)
Query: 23 GPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------------ 67
G SGS + +GP G G G G SGS + G G L
Sbjct: 389 GESGSAAFKGDIGPKGDKGDKGDQGVQGIKGESGSAAFKGEKGDLGEKGEKGEKGEKGDL 448
Query: 68 ---GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G G L G SGS + G G LG G L G G L G SG + G
Sbjct: 449 GTKGDKGDLGEKGESGSAAFKGDKGDKGDLGNKGNLGEKGDKGDLGEKGESGSAAFKGEK 508
Query: 125 GRL---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G L G G L G G L G G L LG G LG G LG G
Sbjct: 509 GDLGIKGDKGNKGDLGDKGDKGDLGTKGDKGDLGDLGDKGEKGDLGTKGDKGDLGTKGD 567
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 58/167 (34%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G L G SGS + G G LG G+L G G L G SG + G G L
Sbjct: 452 GDKGDLGEKGESGSAAFKGDKGDKGDLGNKGNLGEKGDKGDLGEKGESGSAAFKGEKGDL 511
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G LG G LG G LG L G G L + G G L G
Sbjct: 512 GIKGDKGNKGDLGDKGDKGDLGTKGDKGDLGD---LGDKGEKGDLGTKGDKGDLGTKGDK 568
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G LG G G SG G G G G LG G
Sbjct: 569 GDKGDLGTKGDKGDQGDSGIKGEKGEKGDKGDKGEKGDKGDLGTKGD 615
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/169 (31%), Positives = 59/169 (34%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
++GP G G G G SGS + G G L G G L G G L
Sbjct: 399 DIGPKGDKGDKGDQGVQGIKGESGSAAFKGEKGDLGEKGEKGEKGEKGDLGTKGDKGDLG 458
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G SG + G G LG G L G G L G SG + G G L G G
Sbjct: 459 EKGESGSAAFKGDKGDKGDLGNKGNLGEKGDKGDLGEKGESGSAAFKGEKGDLGIKGDKG 518
Query: 126 R---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
L G G L G G L LG G LG G LG G
Sbjct: 519 NKGDLGDKGDKGDLGTKGDKGDLGDLGDKGEKGDLGTKGDKGDLGTKGD 567
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 58/176 (32%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G SG + G G LG G+L G G L G SGS + G G L G G
Sbjct: 461 GESGSAAFKGDKGDKGDLGNKGNLGEKGDKGDLGEKGESGSAAFKGEKGDLGIKGDKGNK 520
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
LG G G L G G L LG G LG G LG G G
Sbjct: 521 GDLGDK------GDKGDLGTKGDKGDLGDLGDKGEKGDLGTKGDKGDLGTKGDK---GDK 571
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G L G G G G G G G G L G G LG G
Sbjct: 572 GDLGTKGDKGDQGDSGIKGEKGEKGDKGDKGEKGDKGDLGTKGDKGDKGDLGTKGD 627
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/155 (30%), Positives = 52/155 (33%), Gaps = 18/155 (11%)
Query: 50 GPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------------ 94
G SGS + +GP G G G G SGS + G G L
Sbjct: 389 GESGSAAFKGDIGPKGDKGDKGDQGVQGIKGESGSAAFKGEKGDLGEKGEKGEKGEKGDL 448
Query: 95 ---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G L G SG + G G LG G L G G L G SG + G
Sbjct: 449 GTKGDKGDLGEKGESGSAAFKGDKGDKGDLGNKGNLGEKGDKGDLGEKGESGSAAFKGEK 508
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G L G G LG G LG G LG
Sbjct: 509 GDLGIKGDKGNKGDLGDKGDKGDLGTKGDKGDLGD 543
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 61/184 (33%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+LG G L G G L G SGS + G G L G G+ LG G LG G
Sbjct: 477 DLGNKGNLGEKGDKGDLGEKGESGSAAFKGEKGDLGIKGDKGNKGDLGDKGDKGDLGTKG 536
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
LG L G G L G G L G G LG G G SG G
Sbjct: 537 DKGDLGD---LGDKGEKGDLGTKGDKGDLGTKGDKGDKGDLGTKGDKGDQGDSGIKGEKG 593
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G LG G G G G G L G G LG G
Sbjct: 594 EKGDKGDKGEKGDKGDLGTKGDKGDKGDLGTKGDKGDEGDLGTKGDKGDKGDLGTKGDKG 653
Query: 192 YLGL 195
LG
Sbjct: 654 DLGT 657
>gi|229152926|ref|ZP_04281108.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus m1550]
gi|228630539|gb|EEK87186.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus m1550]
Length = 1306
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 60/172 (34%), Gaps = 3/172 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 692 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 751
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 752 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 811
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G
Sbjct: 812 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETG 860
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 62/177 (35%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 692 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 751
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 752 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 811
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +G
Sbjct: 812 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETGSTGAT 865
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 621 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 680
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 681 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 740
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 741 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 800
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 801 PEGPQGVQGI 810
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/197 (27%), Positives = 63/197 (31%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------L 58
GP G G +G G G +GP+G GP GS
Sbjct: 632 GPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQ 691
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 692 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 751
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 752 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 811
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP G G+
Sbjct: 812 GAIGPTGPMGAQGVQGI 828
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/153 (30%), Positives = 52/153 (33%), Gaps = 3/153 (1%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
+ GP G G G + GP G G+
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGV 485
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 7/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 700 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 759
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 760 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 819
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ + G G G +G GP G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 820 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETGSTGATGE-GSTGPTGVTGP 878
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 879 TG 880
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 592 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 651
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 652 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 708
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 709 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 768
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 769 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 793
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/146 (31%), Positives = 52/146 (35%), Gaps = 3/146 (2%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP G GP G G G + G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+ GP G G G + GP G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMG 478
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 7/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G+ GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 718 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 777
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 778 TGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGA 834
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 835 TGAQGVQGPQGIQGVQGPTGATGETGSTGATGE-GSTGPTGVTGPTG---VTGPSG 886
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.059, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/146 (31%), Positives = 51/146 (34%), Gaps = 3/146 (2%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G G G + GP G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMG 478
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/147 (31%), Positives = 51/147 (34%), Gaps = 3/147 (2%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 391
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQG 451
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
+ + GP G G G + GP G
Sbjct: 452 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMG 478
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 65/193 (33%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G+ G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 582 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 641
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLG 122
+G G G +GP+G GP G GP G + G
Sbjct: 642 ATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTG 701
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 702 PQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 761
Query: 183 YLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 762 PQGPQGIQGIQGV 774
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 583 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 642
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 643 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 699
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 700 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 759
Query: 190 L 190
Sbjct: 760 T 760
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/118 (30%), Positives = 41/118 (34%), Gaps = 3/118 (2%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G GP G G G G+ + G+
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/206 (29%), Positives = 70/206 (33%), Gaps = 18/206 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G G G GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTG 298
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
G G G +G GP +G GP G GPSG
Sbjct: 299 VTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGGIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET- 357
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 358 --GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 180 RLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/125 (30%), Positives = 44/125 (35%), Gaps = 3/125 (2%)
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
GP G GP G GP G GP G G G G G G+
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 199 LRVSG 203
+ +G
Sbjct: 453 IGATG 457
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 923 TGDTGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 982
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 983 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGTTGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGP 1039
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
G GP G
Sbjct: 1040 QGPQGIQGPQG 1050
>gi|229181044|ref|ZP_04308379.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
172560W]
gi|228602601|gb|EEK60087.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
172560W]
Length = 1325
Score = 48.5 bits (114), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/190 (27%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGI 804
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---VIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---VIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 67/193 (34%), Gaps = 6/193 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 249 TGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGI 308
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ GP G +GP G GP G GPSG GP G GP
Sbjct: 309 QGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGP 365
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP G GP G GP G G G GP G GP G
Sbjct: 366 MGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGI 425
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ +G+
Sbjct: 426 QGVQGITGATGVQ 438
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 67/194 (34%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGA------TGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMG 367
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP G G G GP G GP G G
Sbjct: 368 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQG 427
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 428 VQGITGATGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGP------MGPQGVQG 481
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 482 VQGIQGATGAQGVQ 495
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 68/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 306 QGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G G G GP G GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGI 422
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 423 QGIQGVQGITGATGVQGVTGIQGIQ 447
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/197 (27%), Positives = 63/197 (31%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------L 58
GP G G +G G G +GP+G GP GS
Sbjct: 626 GPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQ 685
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP G G+
Sbjct: 806 GVIGPTGPMGTQGVQGI 822
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 61/178 (34%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G G GP G +GP G G P
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/205 (28%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/193 (30%), Positives = 69/193 (35%), Gaps = 15/193 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 239 NTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G G GP G +GP G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ GP G GP G + GP G GP G + GP G G G +
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVG 412
Query: 183 YLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 413 TTGPQGPQGIQGI 425
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 63/170 (37%), Gaps = 7/170 (4%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 240 TGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGE 299
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G G G GP G +GP +G GP G GPSG GP
Sbjct: 300 QGIQGVQGIQGAKGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGP 356
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G GP G + GP G GP G GP G G S G++
Sbjct: 357 QGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEG-SQGIQ 405
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.061, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/195 (27%), Positives = 65/195 (33%), Gaps = 15/195 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 574 TGVTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 633
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 634 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 693
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGV 768
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.068, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 64/183 (34%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 331 GATGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQ 387
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 388 GVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGTTGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGVTGIQGIQ 447
Query: 134 GRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+
Sbjct: 448 GEIGATGPEGPQGVQGAQGEIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPT 507
Query: 188 GRL 190
G
Sbjct: 508 GAT 510
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGVIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGTQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/160 (29%), Positives = 55/160 (34%), Gaps = 3/160 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ G G GP G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGSQGIQGIQGPVGT 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGVTGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGEI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 637 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 693
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 753
Query: 190 L 190
Sbjct: 754 T 754
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP G G G G G + GP G G
Sbjct: 97 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
>gi|162568972|gb|ABY19405.1| PclB [Pasteuria ramosa]
Length = 415
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 68/154 (44%), Gaps = 10/154 (6%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG-SLRYLGPSGRLRYL-----GPSGSLRYLGPS 61
ALN + + G+ GP G S GP+G Y+ GP+G +G +
Sbjct: 85 NMALNNQTEAIINTISQPGATGPTGPVGPSTGATGPTGSTGYVIQGATGPTGPTGLMGDA 144
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 120
G LGP G GPSG + GP+G +R +G G GP+G + +G + Y
Sbjct: 145 GLDGPLGPQGATGPTGPSGVI-ITGPTGIMRVIGNQGVTGATGPTGPIGTTTATGAMGYM 203
Query: 121 --LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
+GP+G + GP+G G +G G +G
Sbjct: 204 GNIGPTGNTGATGPTGNTGITGITGDTGLTGNTG 237
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/126 (32%), Positives = 59/126 (46%), Gaps = 12/126 (9%)
Query: 50 GPSGSLRYL-----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
GP+GS Y+ GP+G +G +G LGP G+ GPSG + GP+G +R +G
Sbjct: 119 GPTGSTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPQGATGPTGPSGVI-ITGPTGIMRVIG 177
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
G GP+G P G + G G + +GP+G GP+G G +G
Sbjct: 178 NQGVTGATGPTG------PIGTTTATGAMGYMGNIGPTGNTGATGPTGNTGITGITGDTG 231
Query: 165 YLGPSG 170
G +G
Sbjct: 232 LTGNTG 237
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/126 (30%), Positives = 59/126 (46%), Gaps = 12/126 (9%)
Query: 68 GPSGRLRYL-----GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP+G Y+ GP+G +G +G LGP G GPSG + GP+G +R +G
Sbjct: 119 GPTGSTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPQGATGPTGPSGVI-ITGPTGIMRVIG 177
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G + GP+G + +G + Y+G +GP+G GP+G G +G
Sbjct: 178 NQGVTGATGPTGPIGTTTATGAMGYMG------NIGPTGNTGATGPTGNTGITGITGDTG 231
Query: 183 YLGPSG 188
G +G
Sbjct: 232 LTGNTG 237
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/139 (30%), Positives = 64/139 (46%), Gaps = 16/139 (11%)
Query: 50 GPSG----SLRYLGPSGRLRYL-----GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G S GP+G Y+ GP+G +G +G LGP G GPSG +
Sbjct: 106 GPTGPVGPSTGATGPTGSTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPQGATGPTGPSGVI 165
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP+G +R +G G GP+G + + +G + Y+G +GP+G GP+
Sbjct: 166 -ITGPTGIMRVIGNQGVTGATGPTGPIGTTTATGAMGYMG------NIGPTGNTGATGPT 218
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G G +G
Sbjct: 219 GNTGITGITGDTGLTGNTG 237
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/129 (31%), Positives = 61/129 (47%), Gaps = 16/129 (12%)
Query: 77 GPSG----SLRYLGPSGRLRYL-----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G S GP+G Y+ GP+G +G +G LGP G GPSG +
Sbjct: 106 GPTGPVGPSTGATGPTGSTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPQGATGPTGPSGVI 165
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP+G +R +G G GP+G + +G + Y+G +GP+G GP+
Sbjct: 166 IT-GPTGIMRVIGNQGVTGATGPTGPIGTTTATGAMGYMG------NIGPTGNTGATGPT 218
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G++
Sbjct: 219 GNTGITGIT 227
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/115 (29%), Positives = 54/115 (46%), Gaps = 12/115 (10%)
Query: 95 GPSGRLRYL-----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G Y+ GP+G +G +G LGP G GPSG + GP+G +R +G
Sbjct: 119 GPTGSTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPQGATGPTGPSGVI-ITGPTGIMRVIG 177
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G GP+G + +G + Y+G +GP+G G + ++G+
Sbjct: 178 NQGVTGATGPTGPIGTTTATGAMGYMG------NIGPTGNTGATGPTGNTGITGI 226
>gi|146217473|gb|ABQ10835.1| PCF11 [Mus musculus]
Length = 1254
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/202 (36%), Positives = 101/202 (50%), Gaps = 52/202 (25%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 644 FRFEG-SPSLRFEGSTGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-- 695
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSG-RLRY------LGPSGRLRYLGPS 124
P GSLR+ P G+ P G LR+ GPSG +R+ G G +R+ GP
Sbjct: 696 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGP- 746
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGPS---- 169
L G +R+ GP G+ LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 747 --LLQQGVG--MRFEGPHGQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPIVQQG 802
Query: 170 GRLRYLGPS--GRLRYLGPSGR 189
G +R+ GP G LR GP G+
Sbjct: 803 GGMRFEGPVPGGGLRIEGPLGQ 824
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.066, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/206 (33%), Positives = 95/206 (46%), Gaps = 68/206 (33%)
Query: 38 RYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G G R+ G S LR+ G +G L
Sbjct: 603 RFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQGGGGGFRFEG-SPSLRFEGSTGGL 661
Query: 83 RYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
R+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ P G LR+ P G+ P G
Sbjct: 662 RFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-----PVGSLRFDNPRGQ-----PVG 711
Query: 135 RLRYL---GPSG----------------RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLG 167
LR+ GPSG +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 712 GLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEG 771
Query: 168 PS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
+ G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 772 HNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 797
>gi|170705586|ref|ZP_02896050.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0389]
gi|254757361|ref|ZP_05209388.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Australia 94]
gi|170129711|gb|EDS98574.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0389]
Length = 643
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 360 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 419
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 420 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 476
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 48/120 (40%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP+G G +G+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 360 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 419
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G G +G G +G S GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 420 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 476
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/121 (28%), Positives = 47/121 (38%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G
Sbjct: 360 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 419
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 420 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 476
Query: 195 L 195
Sbjct: 477 A 477
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 47/120 (39%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 360 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 419
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G G +G S G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 420 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 476
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 48/120 (40%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 360 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 419
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G G +G GP+G S G +G GP+G G
Sbjct: 420 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTG---STGATGVTGNTGPTGSTGATG 476
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/120 (26%), Positives = 47/120 (39%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 360 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 419
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 420 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 476
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.069, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/173 (24%), Positives = 59/173 (34%), Gaps = 30/173 (17%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------------------LGPSGR 63
G +GS G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 307 TGVTGSTGVTGSTGVTGETGPTGSTGATGNTGPTGETGGTGSTGATGSTGVTGNTGPTGS 366
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G
Sbjct: 367 TGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGE 426
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+G S G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 427 TGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 476
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/104 (25%), Positives = 40/104 (38%)
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 360 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 419
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 420 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVT 463
>gi|146217471|gb|ABQ10834.1| PCF11 [Mus musculus]
Length = 1254
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 74/202 (36%), Positives = 101/202 (50%), Gaps = 52/202 (25%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 644 FRFEG-SPSLRFEGSTGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-- 695
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSG-RLRY------LGPSGRLRYLGPS 124
P GSLR+ P G+ P G LR+ GPSG +R+ G G +R+ GP
Sbjct: 696 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGP- 746
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGPS---- 169
L G +R+ GP G+ LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 747 --LLQQGVG--MRFEGPHGQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPIVQQG 802
Query: 170 GRLRYLGPS--GRLRYLGPSGR 189
G +R+ GP G LR GP G+
Sbjct: 803 GGMRFEGPVPGGGLRIEGPLGQ 824
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.066, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/206 (33%), Positives = 95/206 (46%), Gaps = 68/206 (33%)
Query: 38 RYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G G R+ G S LR+ G +G L
Sbjct: 603 RFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQGGGGGFRFEG-SPSLRFEGSTGGL 661
Query: 83 RYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
R+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ P G LR+ P G+ P G
Sbjct: 662 RFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-----PVGSLRFDNPRGQ-----PVG 711
Query: 135 RLRYL---GPSG----------------RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLG 167
LR+ GPSG +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 712 GLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEG 771
Query: 168 PS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
+ G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 772 HNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 797
>gi|163942457|ref|YP_001647341.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus
weihenstephanensis KBAB4]
gi|163864654|gb|ABY45713.1| Collagen triple helix repeat [Bacillus weihenstephanensis KBAB4]
Length = 934
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 10/173 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G GP G G +G + G SG GP+G
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQGPSGNTGATG-VTGQGISGPTGITGPTG 200
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 65/169 (38%), Gaps = 18/169 (10%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G G G G GP GPSG G++
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGVT 185
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 69/180 (38%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G GP G GP+G
Sbjct: 236 NTGVTGSAGVTGNTGSTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPE---GPQGIQGIPGPTG 292
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 293 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTG 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 353 SQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIG 409
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.069, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 491 VQGPQG 496
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 65/173 (37%), Gaps = 12/173 (6%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +GS G +G G +G+ G G +GP+G GP G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGSTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPE---GPQGIQGI 287
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 288 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGP 347
Query: 142 SGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 348 TGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQG 400
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/151 (31%), Positives = 55/151 (36%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 385
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 386 VPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G G G GP G
Sbjct: 86 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGA 139
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 140 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 164
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ + G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQG 171
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/154 (30%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 16/154 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G GP+G + GP G+ G P G GP G GP
Sbjct: 57 GPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP- 115
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP+G+ G G GP G GP G G +G G G
Sbjct: 116 -----IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQ 170
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GPSG G +G+ G SG GP+G
Sbjct: 171 GPQGPSGNTGATGVTGQ----GISGPTGITGPTG 200
>gi|50510655|dbj|BAD32313.1| mKIAA0824 protein [Mus musculus]
Length = 1641
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/202 (36%), Positives = 101/202 (50%), Gaps = 52/202 (25%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 934 FRFEG-SPSLRFEGSTGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-- 985
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSG-RLRY------LGPSGRLRYLGPS 124
P GSLR+ P G+ P G LR+ GPSG +R+ G G +R+ GP
Sbjct: 986 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGP- 1036
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR-- 171
L G +R+ GP G+ LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP +
Sbjct: 1037 --LLQQGVG--MRFEGPHGQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPIVQQG 1092
Query: 172 --LRYLGPS--GRLRYLGPSGR 189
+R+ GP G LR GP G+
Sbjct: 1093 GGMRFEGPVPGGGLRIEGPLGQ 1114
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.054, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/206 (33%), Positives = 95/206 (46%), Gaps = 68/206 (33%)
Query: 38 RYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G G R+ G S LR+ G +G L
Sbjct: 893 RFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQGGGGGFRFEG-SPSLRFEGSTGGL 951
Query: 83 RYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
R+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ P G LR+ P G+ P G
Sbjct: 952 RFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-----PVGSLRFDNPRGQ-----PVG 1001
Query: 135 RLRYL---GPSG----------------RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLG 167
LR+ GPSG +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 1002 GLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEG 1061
Query: 168 PS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
+ G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 1062 HNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 1087
>gi|423388961|ref|ZP_17366187.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG1X1-3]
gi|401642560|gb|EJS60268.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG1X1-3]
Length = 936
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 68/180 (37%), Gaps = 16/180 (8%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G GP GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GISGPTGITGPTGI 201
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G + G +G G +G+ G G +GP+G GP G GP+G
Sbjct: 236 NTGVTGSVGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPE---GPQGIQGIPGPTG 292
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G +G GP G +GP G G G G G G
Sbjct: 293 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPTGETG 352
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 353 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIG 409
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 61/175 (34%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G G G G + GP G P G GP+G G G
Sbjct: 248 NTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEG------PQGIQGIPGPTGVTGEQGIQG 301
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP G +GP G G G G G GP G G
Sbjct: 302 VQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQG 361
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P G + GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 362 PMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/171 (29%), Positives = 59/171 (34%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP G +GP G G G G G GP G GP G +
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGP 368
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G G G
Sbjct: 369 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGV 428
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 429 TGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPTGPMGPQGVQGI 479
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G+ G G G G GP G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP+G GP G GP G GP G G G + G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGVTGATG 433
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 192 YLGL 195
G
Sbjct: 491 VQGT 494
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 60/176 (34%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G G GP+GS G G G G + GP G P G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSVGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEG------PQGI 284
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP G G G G
Sbjct: 285 QGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGV 344
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 345 PGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQG 400
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 61/176 (34%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G G G GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 324 IGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGI 383
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 384 QGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGVTGATGAQGATGVQGV 443
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G G G +GP+G + G G GP+G G G
Sbjct: 444 QGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGTQG 496
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/154 (30%), Positives = 58/154 (37%), Gaps = 16/154 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G GP+G + GP G+ G P G GP G GP
Sbjct: 57 GPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP- 115
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP+G+ G G GP G GP G G +G G G
Sbjct: 116 -----IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQ 170
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GPSG G +G+ G SG GP+G
Sbjct: 171 GPQGPSGNTGATGATGQ----GISGPTGITGPTG 200
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G G G GP G
Sbjct: 86 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGA 139
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 140 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 164
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ + G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQG 171
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 53/150 (35%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP+G+ GP G GP G
Sbjct: 350 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIG 409
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 410 VTGPEGPQGIQGIQGIQGVTGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDI---G 466
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P+G + G G GP+G G G
Sbjct: 467 PTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGTQG 496
>gi|423519417|ref|ZP_17495898.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuA2-4]
gi|401158436|gb|EJQ65827.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuA2-4]
Length = 934
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 66/173 (38%), Gaps = 10/173 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G GP G G +G + G SG GP+G
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQGPSGNTGATG-VTGQGISGPTGITGPTG 200
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 65/169 (38%), Gaps = 18/169 (10%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G G G G GP GPSG G++
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGVT 185
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/180 (31%), Positives = 69/180 (38%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G GP G GP+G
Sbjct: 236 NTGVTGSAGVTGNTGSTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPE---GPQGIQGIPGPTG 292
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 293 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTG 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 353 SQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIG 409
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.067, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 491 VQGPQG 496
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 65/173 (37%), Gaps = 12/173 (6%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +GS G +G G +G+ G G +GP+G GP G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGSTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPE---GPQGIQGI 287
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 288 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGP 347
Query: 142 SGRL------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 348 TGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQG 400
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/151 (31%), Positives = 55/151 (36%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 385
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 386 VPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G G G GP G
Sbjct: 86 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGA 139
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 140 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 164
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ + G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQG 171
>gi|423555954|ref|ZP_17532257.1| hypothetical protein II3_01159 [Bacillus cereus MC67]
gi|401196296|gb|EJR03242.1| hypothetical protein II3_01159 [Bacillus cereus MC67]
Length = 275
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/125 (30%), Positives = 62/125 (49%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GPSG+ +G +G+ GP+G +G +G GPSG + G +G+ + GPSG +
Sbjct: 36 GPSGTTGPIGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAI 95
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G + GP+G GP+G +G +G + GP+G R P+G + +
Sbjct: 96 GSTGATGPIGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSRLGLPAGLYAFNSAA 155
Query: 197 DGLRV 201
+ V
Sbjct: 156 SSINV 160
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/106 (33%), Positives = 53/106 (50%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GPSG +G +G GP+G +G +G GPSG + G +G+ GPSG +
Sbjct: 36 GPSGTTGPIGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAI 95
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
S G +G + GP+G GP+G +G +G + GP+G R
Sbjct: 96 GSTGATGPIGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSR 141
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/106 (33%), Positives = 54/106 (50%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GPSG +G +G+ GP+G+ +G +G GPSG + G +G+ GPSG +
Sbjct: 36 GPSGTTGPIGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAI 95
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
G +G + GP+G GP+G +G +G + GP+G R
Sbjct: 96 GSTGATGPIGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSR 141
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/106 (33%), Positives = 54/106 (50%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GPSG+ +G +G+ GP+G+ +G +G GPSG + G +G GPSG +
Sbjct: 36 GPSGTTGPIGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAI 95
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
G +G + GP+G GP+G +G +G + GP+G R
Sbjct: 96 GSTGATGPIGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSR 141
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/106 (33%), Positives = 55/106 (51%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GPSG+ +G +G+ GP+G +G +G GPSG + G +G+ GPSG +
Sbjct: 36 GPSGTTGPIGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAI 95
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
G +G + GP+G + GP+G +G +G + GP+G R
Sbjct: 96 GSTGATGPIGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSR 141
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/106 (33%), Positives = 54/106 (50%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG +G +G GP+G+ +G +G GPSG++ G +G+ GPSG +
Sbjct: 36 GPSGTTGPIGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAI 95
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
G +G + GP+G GP+G +G +G + GP+G R
Sbjct: 96 GSTGATGPIGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSR 141
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/123 (33%), Positives = 60/123 (48%), Gaps = 7/123 (5%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G GP +G +G+ GP+G +G +G GPSG + G +G+
Sbjct: 33 GPTGPSGTTGP------IGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQT 86
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GPSG + G +G + GP+G GP+G +G +G + GP+G R LGL
Sbjct: 87 GNTGPSGAIGSTGATGPIGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSR-LGLP 145
Query: 197 DGL 199
GL
Sbjct: 146 AGL 148
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.60, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/116 (29%), Positives = 56/116 (48%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G+ GP+G+ +G +G GPSG + G +G GPSG + G +G
Sbjct: 44 IGATGQTGNTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAIGSTGATGP 103
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+ GP+G GP+G +G +G + GP+G R P+G + + +N
Sbjct: 104 IGDTGPTGPSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSRLGLPAGLYAFNSAASSIN 159
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.73, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/90 (33%), Positives = 48/90 (53%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G +G +G GPSG++ G +G+ GPSG++ G +G + GP+G
Sbjct: 52 NTGPTGNTGPIGDTGLTGNTGPSGTIGPTGATGQTGNTGPSGAIGSTGATGPIGDTGPTG 111
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
GP+G+ +G +G + GP+G R
Sbjct: 112 PSGTTGPTGATGPIGDTGPIGDTGPTGPSR 141
>gi|268370153|ref|NP_083354.3| pre-mRNA cleavage complex II protein Pcf11 [Mus musculus]
gi|148674778|gb|EDL06725.1| cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae)
[Mus musculus]
Length = 1553
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/202 (36%), Positives = 101/202 (50%), Gaps = 52/202 (25%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 846 FRFEG-SPSLRFEGSTGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-- 897
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSG-RLRY------LGPSGRLRYLGPS 124
P GSLR+ P G+ P G LR+ GPSG +R+ G G +R+ GP
Sbjct: 898 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGP- 948
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR-- 171
L G +R+ GP G+ LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP +
Sbjct: 949 --LLQQGVG--MRFEGPHGQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPIVQQG 1004
Query: 172 --LRYLGPS--GRLRYLGPSGR 189
+R+ GP G LR GP G+
Sbjct: 1005 GGMRFEGPVPGGGLRIEGPLGQ 1026
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/206 (33%), Positives = 95/206 (46%), Gaps = 68/206 (33%)
Query: 38 RYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G G R+ G S LR+ G +G L
Sbjct: 805 RFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQGGGGGFRFEG-SPSLRFEGSTGGL 863
Query: 83 RYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
R+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ P G LR+ P G+ P G
Sbjct: 864 RFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-----PVGSLRFDNPRGQ-----PVG 913
Query: 135 RLRYL---GPSG----------------RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLG 167
LR+ GPSG +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 914 GLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEG 973
Query: 168 PS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
+ G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 974 HNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 999
>gi|187956545|gb|AAI50782.1| Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae)
[Mus musculus]
Length = 1553
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 73/202 (36%), Positives = 101/202 (50%), Gaps = 52/202 (25%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG----PSGRLRYLGPSGRLR 74
R+ G S SLR+ G +G LR+ GP G+ P G LR+ G P G LR+ GP G+
Sbjct: 846 FRFEG-SPSLRFEGSTGGLRFEGPGGQ-----PVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-- 897
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSG-RLRY------LGPSGRLRYLGPS 124
P GSLR+ P G+ P G LR+ GPSG +R+ G G +R+ GP
Sbjct: 898 ---PVGSLRFDNPRGQ-----PVGGLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGP- 948
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGR----LRYLGPS---GRLRYLGPSGR----LRYLGPSGR-- 171
L G +R+ GP G+ LR+ G + G LR+ GP G+ +R+ GP +
Sbjct: 949 --LLQQGVG--MRFEGPHGQSVAGLRFEGHNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGPIVQQG 1004
Query: 172 --LRYLGPS--GRLRYLGPSGR 189
+R+ GP G LR GP G+
Sbjct: 1005 GGMRFEGPVPGGGLRIEGPLGQ 1026
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/206 (33%), Positives = 95/206 (46%), Gaps = 68/206 (33%)
Query: 38 RYLGPSGR------LRYLGPSG----SLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
R+ GP G+ LR+ GP G LR+ G G R+ G S LR+ G +G L
Sbjct: 805 RFEGPQGQLGGGCPLRFEGPPGPVGTPLRFEGPIGQGGGGGFRFEG-SPSLRFEGSTGGL 863
Query: 83 RYLGPSGR----LRYLG----PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
R+ GP G+ LR+ G P G LR+ GP G+ P G LR+ P G+ P G
Sbjct: 864 RFEGPGGQPVGGLRFEGHRGQPVGGLRFEGPHGQ-----PVGSLRFDNPRGQ-----PVG 913
Query: 135 RLRYL---GPSG----------------RLRYLGPSGR----LRYLGPSGR----LRYLG 167
LR+ GPSG +R+ GP + +R+ GP G+ LR+ G
Sbjct: 914 GLRFEGGHGPSGAAIRFDGPHGQPGGGGGIRFEGPLLQQGVGMRFEGPHGQSVAGLRFEG 973
Query: 168 PS---GRLRYLGPSGR----LRYLGP 186
+ G LR+ GP G+ +R+ GP
Sbjct: 974 HNQLGGNLRFEGPHGQPGVGIRFEGP 999
>gi|116620471|ref|YP_822627.1| triple helix repeat-containing collagen [Candidatus Solibacter
usitatus Ellin6076]
gi|116223633|gb|ABJ82342.1| Collagen triple helix repeat [Candidatus Solibacter usitatus
Ellin6076]
Length = 434
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 66/183 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G GP GS GP G GP+G G +G G +G
Sbjct: 54 AGPAGAQGPAGPAGPQGPAGPQGSAGAQGPKGDTGAAGPAGEAGPKGETGAAGPKGDTGA 113
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G G +G G G GP G G +G G
Sbjct: 114 AGPAGPKGDTGAAGPAGPKGDTGAAGATGPKGEKGETGAAGPKGDKGETGAAGPKGDKGE 173
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G G G +GP G G +G G +G + G G +GP G
Sbjct: 174 TGAAGPKGEKGETGAVGPKGDKGETGAAGPKGDRGETGAVGPKGDKGETGAVGPKGDKGE 233
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 234 TGA 236
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.100, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 15/177 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G P+G GP+G+ GP+G GP GS GP G GP+G
Sbjct: 41 NQGPAG------PAGPQGPAGPAGAQGPAGPAGPQGPAGPQGSAGAQGPKGDTGAAGPAG 94
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G GP G GP+ GP G GP+G G +G G
Sbjct: 95 EAGP---KGETGAAGPKGDTGAAGPA------GPKGDTGAAGPAGPKGDTGAAGATGPKG 145
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G G +G G G +GP G G +G
Sbjct: 146 EKGETGAAGPKGDKGETGAAGPKGDKGETGAAGPKGEKGETGAVGPKGDKGETGAAG 202
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.38, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/157 (27%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---------GPSGR 99
GP+G GP+G GP+G GP GS GP G G +G
Sbjct: 45 AGPAGPQGPAGPAGAQGPAGPAGPQGPAGPQGSAGAQGPKGDTGAAGPAGEAGPKGETGA 104
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G GP G GP+G G +G G G GP G G
Sbjct: 105 AGPKGDTGAAGPAGPKGDTGAAGPAGPKGDTGAAGATGPKGEKGETGAAGPKGDKGETGA 164
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G +G G G +GP G G +
Sbjct: 165 AGPKGDKGETGAAGPKGEKGETGAVGPKGDKGETGAA 201
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/146 (26%), Positives = 50/146 (34%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GP G GP+G P G GP+G G +G G G
Sbjct: 100 GETGAAGPKGDTGAAGPAG------PKGDTGAAGPAGPKGDTGAAGATGPKGEKGETGAA 153
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G +G G +G G G +GP G G +G G +G +
Sbjct: 154 GPKGDKGETGAAGPKGDKGETGAAGPKGEKGETGAVGPKGDKGETGAAGPKGDRGETGAV 213
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGP 159
G G +GP G +GP
Sbjct: 214 GPKGDKGETGAVGPKGDKGETGAIGP 239
>gi|423650625|ref|ZP_17626195.1| hypothetical protein IKA_04412, partial [Bacillus cereus VD169]
gi|401281526|gb|EJR87435.1| hypothetical protein IKA_04412, partial [Bacillus cereus VD169]
Length = 1086
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 61/175 (34%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 315 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGD 371
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 372 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 431
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 432 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQ 486
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 490
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 491 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGSTGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGI 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGSTGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TG 358
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 359 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 418
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 419 PQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 512
Query: 190 LRYL 193
+
Sbjct: 513 TGDM 516
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.070, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 391
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQG 451
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 511
Query: 180 RLRYL 184
+
Sbjct: 512 ATGDM 516
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/191 (26%), Positives = 61/191 (31%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + +G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAIG 797
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGIQ 808
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGSTGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 406
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/200 (26%), Positives = 66/200 (33%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + G G G G +
Sbjct: 654 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIG 713
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 714 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G + +GP G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 774 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGAIGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATG 833
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G
Sbjct: 834 AQGVQGPQGIQGVQGPTGAT 853
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 66/209 (31%), Gaps = 24/209 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRY----- 57
+GP+G GP G G +G+ +GP+G GP GS
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 58 ----------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G G G GP G G G G G G G + +G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGAIG 797
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G G G + GP G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 826
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G+ G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGAQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 38/96 (39%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
>gi|167855575|ref|ZP_02478336.1| possible large adhesin [Haemophilus parasuis 29755]
gi|167853321|gb|EDS24574.1| possible large adhesin [Haemophilus parasuis 29755]
Length = 1579
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/179 (32%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 12/179 (6%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGP 78
GP G GP G GP G GP+G+ GP G GP G +GP
Sbjct: 1007 AGPEGPRGEQGPKGDT---GPKGETGPAGPAGAQGEQGPRGEQGIPGVAGPKGDRGEVGP 1063
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G GP+G GP G G G GP G GP G + GP G
Sbjct: 1064 MGPQ---GPAGAKGEPGPIGPAGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEG---P 1117
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
+GP+G GP G GP G GP+G GP G GP G G D
Sbjct: 1118 VGPTGPAGATGPKGDTGPEGPKGEQGPAGPTGPKGDTGPEGPKGEQGPVGPQGPTGAKD 1176
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 66/185 (35%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G G G+ GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 974 AGPKGDRGDKGEQGDRGETGAQGAPGERGPKGDA---GPEGPRGEQGPKGDT---GPKGE 1027
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---- 125
GP+G+ GP G GP G +GP G G G +GP+G
Sbjct: 1028 TGPAGPAGAQGEQGPRGEQGIPGVAGPKGDRGEVGPMGPQGPAGAKGEPGPIGPAGPKGD 1087
Query: 126 --RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP G GP G GP G +GP+G GP G GP G
Sbjct: 1088 KGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEG---PVGPTGPAGATGPKGDTGPEGPKGEQGP 1144
Query: 184 LGPSG 188
GP+G
Sbjct: 1145 AGPTG 1149
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.79, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 63/179 (35%), Gaps = 12/179 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G+ GP G G G G G+ GP G GP G
Sbjct: 956 AGPEGPQGPRGEQGTPGVAGPKGDRGDKGEQGDRGETGAQGAPGERGPKGDA---GPEGP 1012
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 1013 RGEQGPKGDT---GPKGETGPAGPAGAQGEQGPRGEQGIPGVAGPKGDRGEVGPMG---P 1066
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G G G GP G GP G GP G + GP+G
Sbjct: 1067 QGPAGAKGEPGPIGPAGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEGPVGPTGPAG 1125
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/186 (30%), Positives = 61/186 (32%), Gaps = 6/186 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP G GP G +GP G GP G GP G
Sbjct: 870 GPRGDKGEQGDQGLRGEAGPKGDAGPEGPRGEQGLVGPQGP---TGPRGERGEQGPEGPK 926
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G G G GP G G G GP G G
Sbjct: 927 GEPGPKGDIGLPGPMGPAGARGEKGDTGPAGPEGPQGPRGEQGTPGVAGPKGDRGDKGEQ 986
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G GP G GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 987 GDRGETGAQGAPGERGPKGDAGPEGPRGEQGPKGDTGPKGETGPAGPAGAQGEQGPRGEQ 1046
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 1047 GIPGVA 1052
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 61/178 (34%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G +GP G GP G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 897 GPRGEQGLVGPQGP---TGPRGERGEQGPEGPKGEPGPKGDIGLPGPMGPAGARGEKGDT 953
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G GP G G G G G GP G +GP
Sbjct: 954 GPAGPEGPQGPRGEQGTPGVAGPKGDRGDKGEQGDRGETGAQGAPGERGPKGDAGPEGPR 1013
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 1014 GE---QGPKGD---TGPKGETGPAGPAGAQGEQGPRGEQGIPGVAGPKGDRGEVGPMG 1065
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 60/179 (33%), Gaps = 9/179 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G + GP G G G GP G G G
Sbjct: 911 TGPRGERGEQGPEGPKGEPGPKGDIGLPGPMGPAGARGEKGDTGPAGPEGPQGPRGEQGT 970
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 971 PGVAGPKGDRGDKGEQGDRGETGAQGAPGERGPKGDA---GPEGPRGEQGPKGDT---GP 1024
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP G +GP G G G +GP+G
Sbjct: 1025 KGETGPAGPAGAQGEQGPRGEQGIPGVAGPKGDRGEVGPMGPQGPAGAKGEPGPIGPAG 1083
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/112 (33%), Positives = 42/112 (37%), Gaps = 9/112 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G G GP G GP G GP G +GP+G
Sbjct: 1068 GPAGAKGEPGPIGPAGPKGDKGEQGDQGPRGEAGPAGPQGPAGATGPEG---PVGPTGPA 1124
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP+ GP G GP G +GP G
Sbjct: 1125 GATGPKGDTGPEGPKGEQGPAGPT------GPKGDTGPEGPKGEQGPVGPQG 1170
>gi|229191456|ref|ZP_04318440.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
gi|228592031|gb|EEK49866.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus ATCC
10876]
Length = 436
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/204 (27%), Positives = 77/204 (37%), Gaps = 13/204 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLR-YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
N GP+G + GP G GP+G+ GP G GP +G+ GP G
Sbjct: 33 NSGPTGPTGGHEGPVGPPGITGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGPVGDTGEQ 92
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +G + GP G + GP G + G G GP+G G G +G G
Sbjct: 93 GITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGET 152
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRL 181
+ G G + G SG GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 153 GAQGMQGEIGVTGISG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGSTGVTGPQGIQGIQGSQ 209
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G++ + G+
Sbjct: 210 GITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 233
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/166 (29%), Positives = 60/166 (36%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G G +G + GP G + GP G + G G GP+GS
Sbjct: 75 GTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQ 134
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G +G G G G + G SG GP G GP G G +
Sbjct: 135 GIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGEIGVTGISG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGAT 191
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G G +G GP G GP G
Sbjct: 192 GSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQG 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 58/166 (34%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G + GP G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 75 GTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQ 134
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +G G G G + G SG GP G GP G G +
Sbjct: 135 GIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGEIGVTGISG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGAT 191
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP G G G G +G GP G GP G
Sbjct: 192 GSTGVTGPQGIQGIQGSQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQG 237
>gi|423631450|ref|ZP_17607197.1| hypothetical protein IK5_04300, partial [Bacillus cereus VD154]
gi|401263785|gb|EJR69905.1| hypothetical protein IK5_04300, partial [Bacillus cereus VD154]
Length = 1069
Score = 48.1 bits (113), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 61/174 (35%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 315 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGD 371
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 372 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 431
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 432 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGV 485
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 490
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 491 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGI 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G+ GP G +GP G +G GP G
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGV------TGATGDQGPQGIQ 348
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G +GP
Sbjct: 349 GVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQ 405
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 406 GIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 460
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TG 358
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 359 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 418
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 419 PQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 512
Query: 190 LRYL 193
+
Sbjct: 513 TGDM 516
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + G G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 689 GPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 748
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G G G G G G G + S GP G G
Sbjct: 749 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGSTGPEGPQGVQGIQ 808
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +
Sbjct: 809 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGTQGIQGPQGIQGVQGPTGATGETGAT 859
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.071, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 391
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQG 451
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 511
Query: 180 RLRYL 184
+
Sbjct: 512 ATGDM 516
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 61/177 (34%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + G G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 689 GPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 748
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 749 GIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGSTGPEGPQGVQGIQ 808
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +G
Sbjct: 809 G---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGATGTQGIQGPQGIQGVQGPTGATGETGATGAT 862
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 61/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G GP G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGSTG 797
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGI 807
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 67/186 (36%), Gaps = 10/186 (5%)
Query: 12 NLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
++GP+G G G + GP G GP G GP G+ GP G G
Sbjct: 693 DIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQG 752
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LG 122
P G GP G G G G G G G + GP G +G
Sbjct: 753 PVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGSTGPEGPQGVQGIQGAIG 812
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G + + G G G +G GP G GP+G G +G G +G
Sbjct: 813 PTGPMGTQGVQGIQGIQGATGTQGIQGPQGIQGVQGPTGATGETGATGATGE-GSTGPTG 871
Query: 183 YLGPSG 188
GP+G
Sbjct: 872 VTGPTG 877
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 7/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G+ GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 715 TGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 774
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 775 TGATGAQGATGIQGIQGEIGSTGPEGPQGVQGIQG---AIGPTGPMGTQGVQGIQGIQGA 831
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 832 TGTQGIQGPQGIQGVQGPTGATGETGATGATGE-GSTGPTGVTGPTG---VTGPSG 883
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 406
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G G G
Sbjct: 655 IGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGE 711
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 712 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 771
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 772 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGSTGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGTQGVQGI 825
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 49/131 (37%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 920 TGDTGATGSTGVTGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGSQGEIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1036
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 955 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGSQGEIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1014
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1015 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG 1047
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 64/193 (33%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G+ G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 579 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 638
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLG 122
+G G G +GP+G GP G GP G + G
Sbjct: 639 ATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTG 698
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 699 SQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 758
Query: 183 YLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 759 PQGPQGIQGIQGV 771
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 49/131 (37%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G+
Sbjct: 920 TGDTGATGSTGVTGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGSQGEIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQGI---QGPQGEIGPTGP 1036
Query: 142 SGRLRYLGPSG 152
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 920 TGDTGATGSTGVTGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 979
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 980 QGPQGIQGSQGEIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGP 1036
Query: 160 SGRLRYLGPSG 170
G GP G
Sbjct: 1037 QGPQGIQGPQG 1047
>gi|229081779|ref|ZP_04214271.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock4-2]
gi|228701367|gb|EEL53861.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock4-2]
Length = 387
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/150 (26%), Positives = 57/150 (38%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G +G G +G+ +G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 95 PTGSTGPTGATGATGSTGSTGATGPMGATGITGVTGPTGATGITGVTGITGVTGPTGAT- 153
Query: 120 YLGPSGRLN---------------SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
GP+G S GP+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 154 --GPTGSTGPTGATGATGATGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGSTGPTG 211
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 212 ATGPTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGSTG 241
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/141 (27%), Positives = 55/141 (39%), Gaps = 18/141 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRY 57
+G +G GP+G+ G +G GP+G GP+GS
Sbjct: 120 MGATGITGVTGPTGATGITGVTGITGVTGPTGA---TGPTGSTGPTGATGATGATGPTGS 176
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G GP+G G +GS G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 177 TGPTGSTGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGSTGSTGPTGA 236
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G +G + G S Y
Sbjct: 237 TGSTGSTGPTGATGTSITATY 257
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/188 (25%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 30/188 (15%)
Query: 36 SLRYLGPSGR------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
+ GP+G GP+GS G +G G +G +G +G
Sbjct: 68 ATGSTGPTGATGPTGSTGSTGSTGATGPTGSTGPTGATGATGSTGSTGATGPMGATGITG 127
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------LRYLGPSGRLN 128
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 128 VTGPTGATGITGVTGITGVTGPTGA---TGPTGSTGPTGATGATGATGPTGSTGPTGSTG 184
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
S GP+G G +G G +G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 185 STGPTGATGSTGATGSTGPTGSTGPTGATGPTGSTGATGPTGSTGSTGPTGATGSTGSTG 244
Query: 189 RLRYLGLS 196
G S
Sbjct: 245 PTGATGTS 252
>gi|423649212|ref|ZP_17624782.1| hypothetical protein IKA_02999 [Bacillus cereus VD169]
gi|401283785|gb|EJR89662.1| hypothetical protein IKA_02999 [Bacillus cereus VD169]
Length = 799
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/139 (30%), Positives = 59/139 (42%), Gaps = 9/139 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G +GP+G++ GP G G +G+ GP+G GP G GP G
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG-- 546
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G +G G G GP+G GP+G GP G G +
Sbjct: 547 -ATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTG---ATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVT 602
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G+ G +G GP+G
Sbjct: 603 GQAGATGQTGVTGATGPTG 621
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/139 (31%), Positives = 59/139 (42%), Gaps = 9/139 (6%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G +GP+G++ GP G G +G+ GP+G GP G GP G
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG-- 546
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP+G G +G GP G S G +G GP+G GP G G +
Sbjct: 547 -ATGPTGATGETGATGS---QGPQGIQGSQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVT 602
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G+ G +G GP+G
Sbjct: 603 GQAGATGQTGVTGATGPTG 621
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/139 (30%), Positives = 58/139 (41%), Gaps = 9/139 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G G +G GP+G GP G GP G+
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGQAGP---TGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQGA- 547
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G +G G G GP+G GP+G GP G G +
Sbjct: 548 --TGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTG---ATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVT 602
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G+ G +G GP+G
Sbjct: 603 GQAGATGQTGVTGATGPTG 621
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/198 (26%), Positives = 72/198 (36%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP+G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+ GP G +GP+G + GP +G+ GP+G GP G G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQG 543
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
P G G +G G
Sbjct: 544 PQGATGPTGATGETGATG 561
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/139 (31%), Positives = 57/139 (41%), Gaps = 9/139 (6%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G +GP+G + GP G G +G GP+G GP G GP G
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGQAGP---TGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG-- 546
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP+G G +G S GP G G +G GP+G GP G G +
Sbjct: 547 -ATGPTG---ATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVT 602
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G+ G +G GP+G
Sbjct: 603 GQAGATGQTGVTGATGPTG 621
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/139 (30%), Positives = 58/139 (41%), Gaps = 9/139 (6%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G +GP+G + GP G G +G+ GP+G GP G GP G
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG-- 546
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP+G G +G G G GP+G + GP+G GP G G +
Sbjct: 547 -ATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTG---ATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVT 602
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G+ G +G GP+G
Sbjct: 603 GQAGATGQTGVTGATGPTG 621
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 71/191 (37%), Gaps = 21/191 (10%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P G+ GP+G+ G G L GP+G+ G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQGITGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAG 426
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG--------- 134
+G +G G G GP+G G G G +G + GP G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 135 ---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G +GP+G + GP +G+ GP+G GP G G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQG 543
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G +
Sbjct: 544 PQGATGPTGAT 554
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/210 (26%), Positives = 75/210 (35%), Gaps = 27/210 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG----------- 62
GP G G G+ G +G G G G +G+ GP G
Sbjct: 426 GPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLT 485
Query: 63 -RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP G +GP+G++ GP +G+ GP+G GP G GP
Sbjct: 486 GTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQ 545
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G GP+G G +G G G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 546 G---ATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTG---ATGPTG---ATGPQGPQGIQ 596
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G +G+ G + + G+
Sbjct: 597 GPQGVTGQAGATGQTGVTGATGPTGIQGIQ 626
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/131 (31%), Positives = 55/131 (41%), Gaps = 9/131 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G G +G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 500 IGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG---ATGPTGA 553
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G G GP+G GP+G GP G G +G+ + G
Sbjct: 554 TGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTG---ATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQ 610
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
+G GP+G
Sbjct: 611 TGVTGATGPTG 621
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 74/209 (35%), Gaps = 21/209 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGETGA 466
Query: 73 LRYLGPSG------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGP 114
GP G + GP G +GP+G + GP +G+ GP
Sbjct: 467 AGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGLQGITGQAGPTGP 526
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G GP G GP G G +G G G G G G +G
Sbjct: 527 TGEAGATGPQGPQGIQGPQGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTGATGPTGA 586
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G + V+G
Sbjct: 587 TGPQGPQGIQGPQGVTGQAGATGQTGVTG 615
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/209 (25%), Positives = 76/209 (36%), Gaps = 24/209 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G L GP+G+ G G +GP+G+ +G G +G +G
Sbjct: 374 TGPTGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGA 433
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------RYLGP 114
G G GP+G G G G +G GP
Sbjct: 434 EGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGP 493
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G +GP+G + GP G G +G+ GP+G GP G GP G
Sbjct: 494 QGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG---A 547
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G G +G G+ ++G
Sbjct: 548 TGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITG 576
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/202 (26%), Positives = 71/202 (35%), Gaps = 24/202 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 392 TGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGA 451
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G G +G GP G GP G +GP+G +
Sbjct: 452 QGIQGVQG---IQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGL 508
Query: 121 LGPSG---RLNS---DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
GP G GP+G GP G GP G GP+G G +G
Sbjct: 509 QGPQGLQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG---ATGPTGATGETGATGSQGP 565
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP+G G +
Sbjct: 566 QGIQGSQGITGPTGATGPTGAT 587
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/184 (27%), Positives = 66/184 (35%), Gaps = 8/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + P+G + GP G GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 22 TGPTGNSGPIDPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPQG---TTGAQGI 76
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G +G GP+G G G + G G + G G GP+G G
Sbjct: 77 QGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGT 133
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G+ G G G SG GP G G G + G G
Sbjct: 134 QGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGVTGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGI 193
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 194 QGIT 197
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/191 (25%), Positives = 63/191 (32%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G+ GP G GP G G G++ G G G G
Sbjct: 39 GPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPQGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQ 98
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G G + +G G G +G G G G G G G G +
Sbjct: 99 GLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGVT 158
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G G +G G + G G GP G G G
Sbjct: 159 GVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPTGST 218
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ +SG+
Sbjct: 219 GMQGAQGISGI 229
>gi|423353056|ref|ZP_17330683.1| hypothetical protein IAU_01132 [Bacillus cereus IS075]
gi|401090216|gb|EJP98376.1| hypothetical protein IAU_01132 [Bacillus cereus IS075]
Length = 847
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 126 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 186 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 245
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ + +GL
Sbjct: 246 GVQGVIGPTGL 256
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G G GP+G GP G GP G G G GP
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQEIQGVQGIQGERGP 109
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G +
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 170 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 229
Query: 190 LRYLGLS 196
+GL+
Sbjct: 230 QGEMGLT 236
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + G +G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.091, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/143 (30%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G G G + GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +GP+G G+
Sbjct: 474 GIQGPQGN---IGPTGSTGIQGV 493
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/140 (30%), Positives = 52/140 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 479 QGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G + GP+G G G +GP+G
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQG---VIGPTG 255
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 9/196 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 73 ---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 92 RGPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGI 151
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G G G
Sbjct: 152 QGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGE 211
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G + V GL
Sbjct: 212 QGPMGPTGATGVQGLQ 227
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 60/166 (36%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP G GP G G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 542 TGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 601
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G G G GP G G +G + GP+G GP G G
Sbjct: 602 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGA 661
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +G +G G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 662 TGATGVIGATGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 704
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 4/154 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G+ G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+
Sbjct: 339 GPTGATGLTGLQGVPGPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPT 398
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 399 GPQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQ 458
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G SG GP G GP G + G S G++
Sbjct: 459 GLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTG-STGIQ 491
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 59/166 (35%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G GP G GP G G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 542 TGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 601
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G G GP G G +G GP+G GP G G
Sbjct: 602 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGA 661
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+G +G +G G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 662 TGATGVIGATGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 704
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/207 (26%), Positives = 63/207 (30%), Gaps = 36/207 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G SG GP G GP G + GP+GS G G GP+G
Sbjct: 449 TGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGA 505
Query: 73 LRY---------------------------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP G GP G GP G
Sbjct: 506 TGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGI 565
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G G +G+ GP G GP G G +G G G GP
Sbjct: 566 QGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGP 625
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +G GP+G GP
Sbjct: 626 QGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGP 652
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/169 (27%), Positives = 56/169 (33%), Gaps = 18/169 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 542 TGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 601
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 126
G +G G G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 602 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGA 661
Query: 127 ------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+ + GP+G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 662 TGATGVIGATGPTGIQGIQG------ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 704
>gi|423400415|ref|ZP_17377588.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG2X1-2]
gi|401655425|gb|EJS72956.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG2X1-2]
Length = 927
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/186 (31%), Positives = 67/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V N GP+G G G G G + GP G P G GP+G
Sbjct: 243 TGVTGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEG------PQGIQGIPGPTGV 296
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG
Sbjct: 297 TGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---A 353
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 MGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 413
Query: 181 LRYLGP 186
GP
Sbjct: 414 TGPEGP 419
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/193 (29%), Positives = 69/193 (35%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG++ GP G GP G
Sbjct: 312 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAM---GPQGVQGIQGPMGE 368
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 369 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGI 428
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 429 QGVTGATGAQGATGIQGVQGNIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 482
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ V G+
Sbjct: 483 QGIQGATGVQGVQ 495
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/182 (30%), Positives = 66/182 (36%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G +G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 NTGVTGSTGVTGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG +
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAM- 354
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 355 --GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 412
Query: 189 RL 190
Sbjct: 413 AT 414
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/179 (32%), Positives = 72/179 (40%), Gaps = 19/179 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+ GP G
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G+ GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 94 LR--GPQGATGATGPEGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGP 145
Query: 133 SGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 146 QGMQGVQGVPGATGSQGIQGPQGIQGPQGPSGSAGTTGATGQ-GVTGPTG---ITGPTG 200
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GPSG++ GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 338 DQGPQGIQGVPGPSGAM---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVG 394
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G G G G G G G + + G
Sbjct: 395 ATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGIQGVTGATGAQGATGIQGVQGNIGATG 454
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P G G G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 455 PEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGVQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 510
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G+ G +G G G GP G GP G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSTGVTGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG +GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 SG---AMGPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 70/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG +GP G GP G + G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---AMGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 373
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 374 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGIQGVTG 433
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 434 ATGAQGATGIQGVQGNIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 487
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 488 ATGVQGVQGPQGIQGIQ 504
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 59/159 (37%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 95 RGPQGATGATGPEGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGM 148
Query: 154 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP G GPSG G +G+
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGSQGIQGPQGIQGPQGPSGSAGTTGATGQ 187
>gi|315647473|ref|ZP_07900578.1| hypothetical protein PVOR_19179 [Paenibacillus vortex V453]
gi|315277137|gb|EFU40474.1| hypothetical protein PVOR_19179 [Paenibacillus vortex V453]
Length = 334
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/172 (25%), Positives = 72/172 (41%), Gaps = 33/172 (19%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G + GP+G+ +G +G++ GP+G +G +GS G +G + GP+G
Sbjct: 84 STGATGVMGLTGPTGATGAIGATGAI---GPTGATGAIGATGSTGVTGVTG---FTGPTG 137
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----------- 120
G +GS GP+G +GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 138 AAGVTGITGSTGVTGPTG---VIGPTGAT---GPTGPIGVTGNTGATGVTGSTGSTGSTG 191
Query: 121 ----------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G + GP+G GP G G +G + G +G
Sbjct: 192 VTGVTGSTGPTGATGVTGATGPTGLTGATGPIGVTGNTGSTGAIGATGVTGS 243
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.045, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/169 (24%), Positives = 67/169 (39%), Gaps = 33/169 (19%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G + GP+G +G +G + GP+G+ +G +G G +G + GP+G
Sbjct: 85 TGATGVMGLTGPTGATGAIGATGAI---GPTGATGAIGATGSTGVTGVTG---FTGPTGA 138
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------ 156
G +G GP+G + GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 139 AGVTGITGSTGVTGPTGVI---GPTGAT---GPTGPIGVTGNTGATGVTGSTGSTGSTGV 192
Query: 157 ---------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G GP G G +G + G++
Sbjct: 193 TGVTGSTGPTGATGVTGATGPTGLTGATGPIGVTGNTGSTGAIGATGVT 241
>gi|229139970|ref|ZP_04268534.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST26]
gi|375285271|ref|YP_005105710.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus NC7401]
gi|228643485|gb|EEK99752.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus
BDRD-ST26]
gi|358353798|dbj|BAL18970.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus NC7401]
Length = 849
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ + +GL
Sbjct: 248 GVQGVIGPTGL 258
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G G GP+G GP G GP G G G GP
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQEIQGVQGIQGERGP 111
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G +
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 172 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 231
Query: 190 LRYLGLS 196
+GL+
Sbjct: 232 QGEMGLT 238
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 500
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + G +G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 500
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/143 (30%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G G G + GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +GP+G G+
Sbjct: 476 GIQGPQGN---IGPTGSTGIQGV 495
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/140 (30%), Positives = 52/140 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 481 QGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 500
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G + GP+G G G +GP+G
Sbjct: 232 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQG---VIGPTG 257
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 9/196 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 73 ---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 94 RGPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGI 153
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G G G
Sbjct: 154 QGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGE 213
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G + V GL
Sbjct: 214 QGPMGPTGATGVQGLQ 229
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 60/166 (36%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G GP G GP G G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 544 TGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 603
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G G G GP G G +G + GP+G GP G G
Sbjct: 604 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGA 663
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +G +G G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 664 TGATGVIGATGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 706
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 4/154 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP+G+ G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+
Sbjct: 341 GPTGATGLTGLQGVPGPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPT 400
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G GP+G G G GP G
Sbjct: 401 GPQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQ 460
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
G SG GP G GP G + G S G++
Sbjct: 461 GLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNIGPTG-STGIQ 493
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.74, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 59/166 (35%), Gaps = 3/166 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G GP G GP G G +G G +G+ GP G GP G
Sbjct: 544 TGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 603
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G G G GP G G +G GP+G GP G G
Sbjct: 604 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGA 663
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+G +G +G G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 664 TGATGVIGATGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 706
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/207 (26%), Positives = 63/207 (30%), Gaps = 36/207 (17%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G SG GP G GP G + GP+GS G G GP+G
Sbjct: 451 TGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGA 507
Query: 73 LRY---------------------------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP G GP G GP G
Sbjct: 508 TGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGI 567
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G G +G+ GP G GP G G +G G G GP
Sbjct: 568 QGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGP 627
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +G GP+G GP
Sbjct: 628 QGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGP 654
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/169 (27%), Positives = 56/169 (33%), Gaps = 18/169 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G G +G G +G GP G GP G
Sbjct: 544 TGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGV 603
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------ 126
G +G G G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 604 TGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQGVTGATGA 663
Query: 127 ------LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+ + GP+G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 664 TGATGVIGATGPTGIQGIQG------ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 706
>gi|410917858|ref|XP_003972403.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XI) chain-like [Takifugu rubripes]
Length = 1718
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/173 (34%), Positives = 75/173 (43%), Gaps = 3/173 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GPSG + G G+ +GP G LGP+GS +GP+G GP+G + G +GSL
Sbjct: 911 GPSGMKGFRGNRGAPGVMGPHGLKGALGPAGSPGVIGPTGERGPSGPAGAIGQPGRAGSL 970
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G G G +GP+G+ GP G L GP+G DG G G
Sbjct: 971 GGAGPMGEKGEPGDKGP---IGPAGQDGEQGPLGALGPTGPAGLPGDDGDKGEQGEPGQK 1027
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G GP G LG G +GP G+ GP G + G
Sbjct: 1028 GSKGDKGEGGPPGPTGPQGPAGQLGVPGADGVVGPRGQQGMYGPKGDEGFRGF 1080
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/209 (30%), Positives = 85/209 (40%), Gaps = 27/209 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------ 66
+GP G LGP+GS +GP+G GP+G + G +GSL GP G
Sbjct: 928 MGPHGLKGALGPAGSPGVIGPTGERGPSGPAGAIGQPGRAGSLGGAGPMGEKGEPGDKGP 987
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------ 108
+GP+G+ GP G+L GP+G G G G G
Sbjct: 988 IGPAGQDGEQGPLGALGPTGPAGLPGDDGDKGEQGEPGQKGSKGDKGEGGPPGPTGPQGP 1047
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
LG G +GP G+ GP G + G G L G G G SG +
Sbjct: 1048 AGQLGVPGADGVVGPRGQQGMYGPKGDEGFRGFKGSPGPLGLQGMPGLSGEKGESGHVGL 1107
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+GP G+L G G + GP+GRL +G
Sbjct: 1108 MGPPGQLGPTGAQGPIGGQGPNGRLGMIG 1136
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/202 (30%), Positives = 80/202 (39%), Gaps = 30/202 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP GR GP GS G G + G G + GP G +GP G+ GP+
Sbjct: 812 GPQGRNGEPGPKGSNGPAGKDGLPGHPGQRGEAGFQGKTGPPGPTGVVGPQGKSGEPGPT 871
Query: 71 GRLRYLGPSG------------------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
G + G G + GPSG + G G +GP
Sbjct: 872 GDRGHPGAPGVPGEQGLPGSAGKEGGKGDPGLPGTPGKNGPSGMKGFRGNRGAPGVMGPH 931
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G LGP+G +GP+G GPSG +G GR LG +G + G G +
Sbjct: 932 GLKGALGPAGSPGVIGPTGER---GPSGPAGAIGQPGRAGSLGGAGPMGEKGEPGDKGPI 988
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G+ GP G L GP+G
Sbjct: 989 GPAGQDGEQGPLGALGPTGPAG 1010
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.052, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 77/183 (42%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG + G G+ +GP G LGP+G +GP+G GPSG +G GR
Sbjct: 911 GPSGMKGFRGNRGAPGVMGPHGLKGALGPAGSPGVIGPTGER---GPSGPAGAIGQPGRA 967
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
LG +G + G G +GP+G+ GP G L GP+G G G G
Sbjct: 968 GSLGGAGPMGEKGEPGDKGPIGPAGQDGEQGPLGALGPTGPAGLPGDDGDKGEQGEPGQK 1027
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G LG G +GP G+ GP G + G G L
Sbjct: 1028 GSKGDKGEGGPPGPTGPQGPAGQLGVPGADGVVGPRGQQGMYGPKGDEGFRGFKGSPGPL 1087
Query: 194 GLS 196
GL
Sbjct: 1088 GLQ 1090
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/200 (29%), Positives = 78/200 (39%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A +G GR LG +G + G G +GP+G+ GP G+L GP+G G
Sbjct: 958 AGAIGQPGRAGSLGGAGPMGEKGEPGDKGPIGPAGQDGEQGPLGALGPTGPAGLPGDDGD 1017
Query: 70 SGRLRYLGPSGS------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL-- 109
G G GS LG G +GP G+ GP G
Sbjct: 1018 KGEQGEPGQKGSKGDKGEGGPPGPTGPQGPAGQLGVPGADGVVGPRGQQGMYGPKGDEGF 1077
Query: 110 -RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ G G L G G G SG + +GP G+L G G + GP+GRL +G
Sbjct: 1078 RGFKGSPGPLGLQGMPGLSGEKGESGHVGLMGPPGQLGPTGAQGPIGGQGPNGRLGMIGQ 1137
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + G G GP+G
Sbjct: 1138 PGLVGEKGEDGEAGNPGPAG 1157
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/167 (33%), Positives = 72/167 (43%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP G GP+G + G G G GS G G G G+
Sbjct: 850 TGPPGPTGVVGPQGKSGEPGPTGDRGHPGAPGVPGEQGLPGSAGKEGGKGDPGLPGTPGK 909
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GPSG + G G +GP G LGP+G +GP+G GPSG + G
Sbjct: 910 N---GPSGMKGFRGNRGAPGVMGPHGLKGALGPAGSPGVIGPTGER---GPSGPAGAIGQ 963
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GR LG +G + G G +GP+G+ GP L LGP+G
Sbjct: 964 PGRAGSLGGAGPMGEKGEPGDKGPIGPAGQDGEQGP---LGALGPTG 1007
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/170 (29%), Positives = 66/170 (38%), Gaps = 3/170 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
LG G+ +GP G+ GP G + G G L G G G SG + +G
Sbjct: 1050 QLGVPGADGVVGPRGQQGMYGPKGDEGFRGFKGSPGPLGLQGMPGLSGEKGESGHVGLMG 1109
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
P G+L G G + GP+GRL +G G + G G + GP+G +G G
Sbjct: 1110 PPGQLGPTGAQGPIGGQGPNGRLGMIGQPGLVGEKGEDGEAGNPGPAGFSGMIGEKGDQG 1169
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G +GP G G G G+
Sbjct: 1170 EKGDMGLAGAPGPPGARGLQGEDGPKGSMGPIGATGDFGQQGEAGPNGVE 1219
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/155 (29%), Positives = 61/155 (39%), Gaps = 15/155 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLG------------PSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
+GP G+ GP G + G GS LG SG + +GP G L G
Sbjct: 1060 VGPRGQQGMYGPKGDEGFRGFKGSPGPLGLQGMPGLSGEKGESGHVGLMGPPGQLGPTGA 1119
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G + GP+GRL +G G + G G GP+G +G G G G
Sbjct: 1120 QGPIGGQGPNGRLGMIGQPGLVGEKGEDGEAGNPGPAGFSGMIGEKGDQGEKGDMGLAGA 1179
Query: 121 LGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP G DGP G + +G +G G +G
Sbjct: 1180 PGPPGARGLQGEDGPKGSMGPIGATGDFGQQGEAG 1214
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 71/179 (39%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G+ G SGS G G GP GR GP GS G G + G G
Sbjct: 786 PTGKPGEKGVSGSDGPPGSPGERGPQGPQGRNGEPGPKGSNGPAGKDGLPGHPGQRGEAG 845
Query: 75 Y---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G +GP G+ GP+G + G G G G G G G
Sbjct: 846 FQGKTGPPGPTGVVGPQGKSGEPGPTGDRGHPGAPG---VPGEQGLPGSAGKEGGKGDPG 902
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GPSG + G G +GP G LGP+G +GP+G GP+G +
Sbjct: 903 LPGTPGKNGPSGMKGFRGNRGAPGVMGPHGLKGALGPAGSPGVIGPTGERGPSGPAGAI 961
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/131 (30%), Positives = 50/131 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G SG + +GP G L G G + GP+GRL +G G + G G GP+G
Sbjct: 1100 GESGHVGLMGPPGQLGPTGAQGPIGGQGPNGRLGMIGQPGLVGEKGEDGEAGNPGPAGFS 1159
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G G G G GP G G G +GP G G G +G
Sbjct: 1160 GMIGEKGDQGEKGDMGLAGAPGPPGARGLQGEDGPKGSMGPIGATGDFGQQGEAGPNGVE 1219
Query: 134 GRLRYLGPSGR 144
G G SG
Sbjct: 1220 GLPGVKGDSGD 1230
>gi|423586256|ref|ZP_17562343.1| hypothetical protein IIE_01668 [Bacillus cereus VD045]
gi|401230999|gb|EJR37504.1| hypothetical protein IIE_01668 [Bacillus cereus VD045]
Length = 781
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 65/158 (41%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G +GP+G++ GP G G +G+ GP+G GP G GP G
Sbjct: 495 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG-- 549
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP+G G +G GP G S G +G GP+G GP G G +
Sbjct: 550 -ATGPTGATGETGATGS---QGPQGIQGSQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVT 605
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
G+ G +G GP+G G +G +S G
Sbjct: 606 GQAGATGQTGVTGATGPTGIQGIQGITGATGPSAISTG 643
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/148 (31%), Positives = 58/148 (39%), Gaps = 12/148 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G G +G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 503 IGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGPQG---ATGPTGA 556
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS G G GP+G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 557 TGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTG---ATGPTG---ATGPQGPQGIQGPQGVTGQAGA 610
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
+G+ G +G G G GPS
Sbjct: 611 TGQTGVTGATGPTGIQGIQGITGATGPS 638
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 69/191 (36%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G G G GP+G+ G G G +G+ G G G +G
Sbjct: 431 VGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGT 490
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G +GP+G + GP G G +G+ GP+G GP G GP
Sbjct: 491 QGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTGEAGATGPQGPQGIQGP 547
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G G G G G G +G GP G GP G
Sbjct: 548 QGATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTGATGPTGATGPQGPQGIQGPQGVTGQ 607
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 608 AGATGQTGVTG 618
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.60, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 69/182 (37%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 415 PTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQG 474
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G G G +G GP G +GP+G + GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 475 PQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTG 531
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G GP G GP+G G +G G G GP+G G
Sbjct: 532 EAGATGPQGPQGIQGPQG---ATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITGPTGATGPTG 588
Query: 195 LS 196
+
Sbjct: 589 AT 590
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/171 (26%), Positives = 66/171 (38%), Gaps = 6/171 (3%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P+G+ +G G +G +G+ G G GP+G G G G +G
Sbjct: 415 PTGAQGMVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGETGAAGTQG 474
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G G G +G GP G +GP+G + GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 475 PQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQG---LQGITGQAGPTGPTG 531
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G GP+G G +G G+ ++G
Sbjct: 532 EAGATGPQGPQGIQGPQG---ATGPTGATGETGATGSQGPQGIQGSQGITG 579
>gi|423484088|ref|ZP_17460778.1| hypothetical protein IEQ_03866 [Bacillus cereus BAG6X1-2]
gi|401139114|gb|EJQ46677.1| hypothetical protein IEQ_03866 [Bacillus cereus BAG6X1-2]
Length = 399
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/180 (26%), Positives = 75/180 (41%), Gaps = 12/180 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + LGP+G G +G+ G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 31 GTVPKLGPTGPT---GATGATGITGSTGETGATGPTGAT---GSTGETGATGATGITGAT 84
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ G +G G +G GP+G G +G + G +G S G +G
Sbjct: 85 GPTGAT---GSTGETGATGATGITGATGPTGST---GATGIMGETGATGATGSTGATGAT 138
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G +G G +G GP+G G +G GP+G +G +G G +
Sbjct: 139 GIMGETGATGATGATGSTGATGPTGATGITGATGSTGVTGPTGATGIMGATGSTGETGAT 198
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/163 (24%), Positives = 64/163 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G GP+G+ G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 43 GATGATGITGSTGETGATGPTGATGSTGETGATGATGITGATGPTGATGSTGETGATGAT 102
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G +G + G +G G +G +G +G G +G + GP+
Sbjct: 103 GITGATGPTGSTGATGIMGETGATGATGSTGATGATGIMGETGATGATGATGSTGATGPT 162
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G G +G GP+G +G +G G +G G
Sbjct: 163 GATGITGATGSTGVTGPTGATGIMGATGSTGETGATGSTGATG 205
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.074, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/166 (22%), Positives = 57/166 (34%), Gaps = 21/166 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +GS G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 40 GPTGATGATGITGSTGETGATGPTGATGSTGETGATGATGITGATGPTGATGSTGETGAT 99
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-------------------- 113
G +G+ G +G +G +G G +G G
Sbjct: 100 GATGITGATGPTGSTGATGIMGETGATGATGSTGATGATGIMGETGATGATGATGSTGAT 159
Query: 114 -PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
P+G G +G GP+G +G +G G +G G
Sbjct: 160 GPTGATGITGATGSTGVTGPTGATGIMGATGSTGETGATGSTGATG 205
>gi|423670296|ref|ZP_17645325.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VDM034]
gi|401297235|gb|EJS02847.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VDM034]
Length = 869
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GP+GS G G L+ + GP GS GP G G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGSTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP+G + GP G+ GP G
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGPQG- 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 94 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGP 145
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G G GP G G +G + G SG GP+G
Sbjct: 146 QGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQGPSGNTGATG-VTGQGISGPTGITGPTG 200
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 65/169 (38%), Gaps = 18/169 (10%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G G G G GP GPSG G++
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGVT 185
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 491 VQGPQG 496
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGSTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/151 (31%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP GS GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 269 VQGPIGSTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 385
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 386 VPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ + G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQG 171
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G G G GP G
Sbjct: 86 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGA 139
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 140 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 164
>gi|423673496|ref|ZP_17648435.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VDM062]
gi|401310677|gb|EJS15990.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VDM062]
Length = 866
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GP+GS G G L+ + GP GS GP G G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGSTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP+G + GP G+ GP G
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGPQG- 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 94 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGP 145
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G G GP G G +G + G SG GP+G
Sbjct: 146 QGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGVQGPQGPSGNTGATG-VTGQGISGPTGITGPTG 200
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 65/169 (38%), Gaps = 18/169 (10%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G G G G GP GPSG G++
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGVQGPQ------GPSGNTGATGVT 185
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 491 VQGPQG 496
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGSTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/151 (31%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP GS GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 269 VQGPIGSTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 385
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 386 VPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ V G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGVQG 171
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G G G GP G
Sbjct: 86 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGA 139
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 140 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 164
>gi|3242649|dbj|BAA29028.1| alpha 1 type I collagen [Rana catesbeiana]
Length = 1445
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/167 (32%), Positives = 67/167 (40%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G GPSG + GP G+ G G GP G G +G
Sbjct: 772 AGPAGPTGSRGAPGERGEPGPSGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGDAGPKGDAGPPGAAGP 831
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP+G + GP G GP G + G +GR+ GPSG GPSG G
Sbjct: 832 TGAPGPAGAVGATGPKGARGPAGPPGSTGFPGAAGRVGPPGPSGNAGPPGPSGPAGKEGQ 891
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+GR G +G G G GP+G GP G
Sbjct: 892 KGPRGETGPAGRPGEPGAAGPPGPSGEKGSPGSDGPAGAPGIPGPQG 938
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/148 (31%), Positives = 58/148 (39%), Gaps = 18/148 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG + GP G+ G G GP G G +G GP+G + GP G
Sbjct: 791 GPSGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGDAGPKGDAGPPGAAGPTGAPGPAGAVGATGPKGAR 850
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPS 115
GP GS + G +GR+ GPSG GP+GR G +
Sbjct: 851 GPAGPPGSTGFPGAAGRVGPPGPSGNAGPPGPSGPAGKEGQKGPRGETGPAGRPGEPGAA 910
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G SDGP+G GP G
Sbjct: 911 GPPGPSGEKGSPGSDGPAGAPGIPGPQG 938
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/139 (33%), Positives = 57/139 (41%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G G G GPSG + GP G G G GP G G +G
Sbjct: 772 AGPAGPTGSRGAPGERGEPGPSGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGDAGPKGDAGPPGAAGP 831
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G + + GP G GP G + G +GR+ GPSG GPSG G
Sbjct: 832 TGAPGPAGAVGATGPKGARGPAGPPGSTGFPGAAGRVGPPGPSGNAGPPGPSGPAGKEGQ 891
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+GR G +
Sbjct: 892 KGPRGETGPAGRPGEPGAA 910
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/115 (33%), Positives = 47/115 (40%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G GP+G G G GPSG + GP G G G GP G
Sbjct: 768 EAGPAGP---AGPTG---SRGAPGERGEPGPSGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGDAGPKG 821
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP+G + GP G GP G + G +GR+ GPSG
Sbjct: 822 DAGPPGAAGPTGAPGPAGAVGATGPKGARGPAGPPGSTGFPGAAGRVGPPGPSGN 876
>gi|217960767|ref|YP_002339331.1| hypothetical protein BCAH187_A3386 [Bacillus cereus AH187]
gi|217065568|gb|ACJ79818.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus AH187]
Length = 867
Score = 47.8 bits (112), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 73/191 (38%), Gaps = 3/191 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP G GP G G GP+G G G +
Sbjct: 71 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G
Sbjct: 128 GPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQ 247
Query: 194 GLSDGLRVSGL 204
G+ + +GL
Sbjct: 248 GVQGVIGPTGL 258
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 66/184 (35%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G GP G GP G G +G G +G+
Sbjct: 544 TGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQ 603
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G G +G G G GP G G +G + GP
Sbjct: 604 AGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGP 663
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
+G GP G G +G +G +G G G G +GR GP+G
Sbjct: 664 TGPQGIQGPQGVTGATGATGATGVIGATGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGLTGA 720
Query: 193 LGLS 196
G S
Sbjct: 721 TGSS 724
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 500
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 71/187 (37%), Gaps = 3/187 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G G GP+G GP G GP G G G GP
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQEIQGVQGIQGERGP 111
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G +
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G G G
Sbjct: 172 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 231
Query: 190 LRYLGLS 196
+GL+
Sbjct: 232 QGEMGLT 238
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + G +G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 500
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/143 (30%), Positives = 55/143 (38%), Gaps = 3/143 (2%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G G G + GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +GP+G G+
Sbjct: 476 GIQGPQGN---IGPTGSTGIQGV 495
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/138 (29%), Positives = 49/138 (35%), Gaps = 6/138 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+ GP G GP G GP G GP G GP G G +G
Sbjct: 541 TGPT------GPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGP 594
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G+ GP G GP G G +G + G G GP G G
Sbjct: 595 TGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGA 654
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+G GP+G GP
Sbjct: 655 TGPTGATGPTGPQGIQGP 672
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/151 (30%), Positives = 56/151 (37%), Gaps = 3/151 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G + GP+G G G GP+G
Sbjct: 481 QGNI---GPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGAT 508
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 112 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 171
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 172 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 231
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G + GP+G G G +GP+G
Sbjct: 232 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQG---VIGPTG 257
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 9/196 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 93
Query: 73 ---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 94 RGPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGI 153
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G G G
Sbjct: 154 QGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGE 213
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G + V GL
Sbjct: 214 QGPMGPTGATGVQGLQ 229
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/139 (30%), Positives = 53/139 (38%), Gaps = 1/139 (0%)
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 475
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP G + G S G++
Sbjct: 476 GIQGPQGNIGPTG-STGIQ 493
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/215 (26%), Positives = 65/215 (30%), Gaps = 36/215 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G SG GP G GP G +GP+GS G G GP+G
Sbjct: 451 TGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGN---IGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGA 507
Query: 73 LRY---------------------------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP G GP G GP G
Sbjct: 508 TGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGI 567
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP G G +G + G +G+ GP G GP G G
Sbjct: 568 QGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGA 627
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
+G G G GP G G +G G
Sbjct: 628 TGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATG 662
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/206 (25%), Positives = 63/206 (30%), Gaps = 36/206 (17%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY--------- 66
SG GP G GP G+ +GP+G G G GP+G
Sbjct: 463 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGN---IGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGI 519
Query: 67 ------------------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 520 QGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGP 579
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G G +G G +G+ GP G GP G G +G G G
Sbjct: 580 TGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGP 639
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G +G GP+G
Sbjct: 640 QGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTG 665
>gi|30264795|ref|NP_847172.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus anthracis str.
Ames]
gi|47530277|ref|YP_021626.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus anthracis str.
'Ames Ancestor']
gi|229604785|ref|YP_002869001.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0248]
gi|30259470|gb|AAP28658.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. Ames]
gi|47505425|gb|AAT34101.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. 'Ames Ancestor']
gi|229269193|gb|ACQ50830.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus anthracis
str. A0248]
Length = 469
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 186 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 245
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 246 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 302
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/119 (28%), Positives = 48/119 (40%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G G +G+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 187 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 246
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G G +G G +G S GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 247 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 302
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/119 (28%), Positives = 47/119 (39%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 187 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 246
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G G +G S G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 247 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 302
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/119 (28%), Positives = 48/119 (40%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 187 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 246
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G G +G GP+G S G +G GP+G G
Sbjct: 247 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTG---STGATGVTGNTGPTGSTGATG 302
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/119 (26%), Positives = 47/119 (39%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 187 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 246
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 247 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 302
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/103 (26%), Positives = 40/103 (38%)
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 187 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 246
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 247 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVT 289
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/170 (24%), Positives = 58/170 (34%), Gaps = 30/170 (17%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------------------LGPSGRLRY 66
+GS G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 136 TGSTGVTGSTGVTGETGPTGSTGATGNTGPTGETGGTGSTGATGSTGVTGNTGPTGSTGV 195
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 196 TGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGA 255
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
S G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 256 TGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 302
>gi|423657675|ref|ZP_17632974.1| hypothetical protein IKG_04663, partial [Bacillus cereus VD200]
gi|401288939|gb|EJR94671.1| hypothetical protein IKG_04663, partial [Bacillus cereus VD200]
Length = 1056
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/193 (29%), Positives = 66/193 (34%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 315 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGD 371
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 372 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGV 431
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 432 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 485
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 486 QGIQGATGAQGVQ 498
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/205 (29%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGET---GPQGVQGI 365
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGI 425
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 426 QGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/197 (28%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 376
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 377 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 436
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 437 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQG 490
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 491 ATGAQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 62/175 (35%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G G +G+ GP G +GP G +G GP G
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGV------TGATGDQGPQGIQ 348
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GPSG GP G GP G + GP G GP G GP G +GP
Sbjct: 349 GVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQ 405
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 406 GIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 460
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/203 (29%), Positives = 77/203 (37%), Gaps = 12/203 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGE---TG 358
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 359 PQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATG 418
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ +G+
Sbjct: 419 PQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 336 TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 392
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 393 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 452
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 453 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 512
Query: 190 LRYL 193
+
Sbjct: 513 TGDM 516
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.061, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 335 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 391
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G GP G GP G G G G G G G
Sbjct: 392 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQG 451
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 452 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 511
Query: 180 RLRYL 184
+
Sbjct: 512 ATGDM 516
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGP 353
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 406
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/191 (26%), Positives = 60/191 (31%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGLTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGIQGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGIQ 808
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 43/105 (40%), Gaps = 6/105 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTG 1056
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 42/105 (40%), Gaps = 6/105 (5%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+ GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTG 1056
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 68/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGLTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 59/175 (33%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G G G
Sbjct: 655 IGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGLTGSQGPTGIQGIQGE 711
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 712 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 771
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 772 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 826
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/164 (28%), Positives = 55/164 (33%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + G G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 689 GPQGDIGLTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQ 748
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 749 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 808
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +GP+G + G G G +G GP G GP
Sbjct: 809 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGVQGP 849
>gi|338531066|ref|YP_004664400.1| triple helix repeat-containing collagen [Myxococcus fulvus HW-1]
gi|337257162|gb|AEI63322.1| triple helix repeat-containing collagen [Myxococcus fulvus HW-1]
Length = 543
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/143 (31%), Positives = 66/143 (46%), Gaps = 6/143 (4%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
G VVE +++ +G L SL +G L +GP+G +GP G G G
Sbjct: 16 GGVVVETGVDVNRNGELEEAEVDASLTRYVCNGELGPVGPTGPQGPVGPQGLRGEQGVPG 75
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
+ G G LGP G +GP+G + GP G + +GP+G + GP+G+ G
Sbjct: 76 PVGPQGEQGIQGELGPMGPQGAVGPAGPVGPQGPMGEVGPVGPAGAVGPAGPTGQ---QG 132
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G GP+G GP G +
Sbjct: 133 PTGEQGPVGPAG---ATGPQGEV 152
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/112 (33%), Positives = 55/112 (49%), Gaps = 6/112 (5%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G L +GP+G +GP G G G + G G LGP G +GP+G +
Sbjct: 47 NGELGPVGPTGPQGPVGPQGLRGEQGVPGPVGPQGEQGIQGELGPMGPQGAVGPAGPVGP 106
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G + +GP+G + GP+G+ GP+G +GP+G GP G +
Sbjct: 107 QGPMGEVGPVGPAGAVGPAGPTGQ---QGPTGEQGPVGPAG---ATGPQGEV 152
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/122 (31%), Positives = 56/122 (45%), Gaps = 9/122 (7%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G L SL +G L +GP+G +GP G GP G G G
Sbjct: 29 NGELEEAEVDASLTRYVCNGELGPVGPTGPQGPVGPQGLRGEQGVPGPVGPQGEQGIQGE 88
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
L GP G +GP+G + GP G + +GP+G + GP+G+ GP+G +GP
Sbjct: 89 LGPMGPQG---AVGPAGPVGPQGPMGEVGPVGPAGAVGPAGPTGQ---QGPTGEQGPVGP 142
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 143 AG 144
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/84 (33%), Positives = 42/84 (50%)
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G L +GP+G +GP G G G + G G LGP G +GP+G +
Sbjct: 47 NGELGPVGPTGPQGPVGPQGLRGEQGVPGPVGPQGEQGIQGELGPMGPQGAVGPAGPVGP 106
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G + +GP+G + GP+G+
Sbjct: 107 QGPMGEVGPVGPAGAVGPAGPTGQ 130
>gi|195977309|ref|YP_002122553.1| hypothetical protein Sez_0162 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
gi|195974014|gb|ACG61540.1| collagen-like protein SclZ.3 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
Length = 335
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 69/177 (38%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G +GP+G GP G G +G GP+G + GP G +GP G
Sbjct: 101 TGPRGEPGPVGPAGPRGERGPQGLPGDKGETGERGETGPAGPIGPQGPKGDQGEMGPQG- 159
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP G +GP G G G + GP G +GP G G
Sbjct: 160 --PKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQG---PKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQG---PKGD 211
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G + GP G +GP G G G + GP G +GP G G G+
Sbjct: 212 QGEVGPQGPKGDQGEVGPQG---PKGDQGEMGPQGPKGDQGEVGPQGPDSSQGEQGQ 265
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 59/150 (39%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 45 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
L+ GP+G P G +GP+G GP G G +G GP+G + G
Sbjct: 94 ELKIPGPTG------PRGEPGPVGPAGPRGERGPQGLPGDKGETGERGETGPAGPIGPQG 147
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLG 158
P G +GP G G G + GP G +GP G + GP G +G
Sbjct: 148 PKGDQGEMGPQG---PKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEIG 204
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G G + GP G +GP G
Sbjct: 205 PQG---PKGDQGEVGPQGPKGDQGEVGPQG 231
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/133 (29%), Positives = 51/133 (38%), Gaps = 12/133 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSG------RLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GP+G + GP G +GP G +GP G + GP G +GP G
Sbjct: 136 ETGPAGPIGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEIGPQGPKGDQGEMGPQG 195
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G + GP G +GP G G G G G + GP G +G
Sbjct: 196 ---PKGDQGEIGPQGPKGDQGEVGPQGPKGDQGEVGPQGPKGDQGEMGPQGPKGDQGEVG 252
Query: 123 PSGRLNSDGPSGR 135
P G +S G G+
Sbjct: 253 PQGPDSSQGEQGQ 265
>gi|423570757|ref|ZP_17547002.1| hypothetical protein II7_03978 [Bacillus cereus MSX-A12]
gi|401203384|gb|EJR10223.1| hypothetical protein II7_03978 [Bacillus cereus MSX-A12]
Length = 378
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/211 (24%), Positives = 76/211 (36%), Gaps = 30/211 (14%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP--- 69
LGP+G GP+G+ +G +G GP+G GP+G+ G +G G
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPMGATGPTGATGPTGA---TGPTGATGPTGVTGSTGATGITGA 92
Query: 70 ------------------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 93 TGATGATGITGATGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGA 152
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G GP+G G +G + G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 153 TGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTGATGI 212
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G S
Sbjct: 213 TGATGVTGATGPTGATGSTGSTGPTGITGTS 243
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/211 (23%), Positives = 73/211 (34%), Gaps = 42/211 (19%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------- 69
G + LGP+G GP+G+ +G +G GP+G+ G +G G
Sbjct: 31 GTVPKLGPTGPTGATGPTGATGPMGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGIT 90
Query: 70 --------------------------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 91 GATGATGATGITGATGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGITGAT 150
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G +G GP+G G + GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 151 GATGSTGATGPTGATGITG------ATGPTGATGITGATGPTGATGPTGAT---GPTGAT 201
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 202 GSTGPTGATGITGATGVTGATGPTGATGSTG 232
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/189 (22%), Positives = 64/189 (33%), Gaps = 39/189 (20%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR-- 101
G + LGP+G GP+G +G +G GP+G+ GP+G G +G
Sbjct: 31 GTVPKLGPTGPTGATGPTGATGPMGATGPTGATGPTGA---TGPTGATGPTGVTGSTGAT 87
Query: 102 ----------------------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G G +G G +G
Sbjct: 88 GITGATGATGATGITGATGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGIT 147
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G GP+
Sbjct: 148 GATGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPT 207
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G +
Sbjct: 208 GATGITGAT 216
>gi|346313116|ref|ZP_08854647.1| hypothetical protein HMPREF9022_00304 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
gi|345899318|gb|EGX69167.1| hypothetical protein HMPREF9022_00304 [Erysipelotrichaceae
bacterium 2_2_44A]
Length = 487
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/115 (27%), Positives = 52/115 (45%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G + GP+G+ GP+G + G +G+ GP+G P+G
Sbjct: 129 TGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAG------PTGA 182
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +G+ GP+G + GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 183 TGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGAT 237
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/115 (27%), Positives = 52/115 (45%), Gaps = 6/115 (5%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G+ G +G + GP+G GP+G++ G +G GP+G P+G+
Sbjct: 129 TGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAG------PTGA 182
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G GP+G + GP+G G +G G +G + GP+G
Sbjct: 183 TGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGAT 237
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/159 (27%), Positives = 70/159 (44%), Gaps = 19/159 (11%)
Query: 23 GPSGSLRYL---GPSGSLRYLGPSGR-LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
GP+ L ++ G +G GP+G + GP+G+ +G G +G + GP
Sbjct: 96 GPNHVLDFVIPRGDTGVTGATGPTGPGVGATGPTGA------TGATGNTGATGPIGATGP 149
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G+ GP+G + G +G GP+G P+G G +G GP+G +
Sbjct: 150 TGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAG------PTGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGP 203
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+G G +G G +G + GP+G GP
Sbjct: 204 TGPTGATGSTGAAGATGVTGATGDI---GPTGPTGATGP 239
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/136 (27%), Positives = 59/136 (43%), Gaps = 10/136 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSG----SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G + G +G+ G +G + GP+G+ GP+G + G
Sbjct: 108 GDTGVTGATGPTGPGVGATGPTGATGATGNTGATGPIGATGPTGANGNTGPTGAIGATGE 167
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G P+G G +G GP+G + GP+G G +G
Sbjct: 168 NGATGPTGPAG------PTGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTGAAGATGV 221
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRL 145
G +G + GP+G
Sbjct: 222 TGATGDIGPTGPTGAT 237
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/148 (26%), Positives = 60/148 (40%), Gaps = 15/148 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G++ G +G+ GP+G G +G+ G +G +GP+G
Sbjct: 147 TGPTGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGP 206
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLRYLGPSGR 117
G +G+ G +G +GP+G GP +G +GP+G
Sbjct: 207 TGATGSTGAAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGATGNTGATGTTGVTGADGAIGPTGP 266
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
+ GP G G G GP G
Sbjct: 267 IGDPGPQGEPGPQGEPGPQGEQGPQGET 294
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/140 (26%), Positives = 55/140 (39%), Gaps = 15/140 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G + G +G+ GP+G G +G G +G +GP+G G +G
Sbjct: 155 NTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGATGSTG 214
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +G+ +GP+G GP +G +GP+G + GP G
Sbjct: 215 AAGATGVTGATGDIGPTGPTGATGPTGATGNTGATGTTGVTGADGAIGPTGPIGDPGPQG 274
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G G GP G
Sbjct: 275 EPGPQGEPGPQGEQGPQGET 294
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/134 (26%), Positives = 58/134 (43%), Gaps = 13/134 (9%)
Query: 77 GPSGSLRYL---GPSGRLRYLGPSGR-LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+ L ++ G +G GP+G + GP+G +G G +G + + GP
Sbjct: 96 GPNHVLDFVIPRGDTGVTGATGPTGPGVGATGPTGA------TGATGNTGATGPIGATGP 149
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G + G +G GP+G G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 150 TGANGNTGPTGAIGATGENGATGPTGPAGPTGATGSTGAAGATGVTGPTGDIGPTGPTGA 209
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSG 203
G + V+G
Sbjct: 210 TGSTGAAGATGVTG 223
>gi|83776774|gb|ABC46703.1| collagen-like protein [Streptococcus pyogenes]
Length = 433
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 70/175 (40%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G G GP+G +GP+G+ GP G G G GP+G
Sbjct: 97 GPRGDKGETGEQGPRGAQGPAGPQGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGPRGAQGPAGPQ 156
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G GP G G G GP+G +GP+G G G + G
Sbjct: 157 GPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGPRGAQGPAGPQGPMGPAGERGEKGEPGTQGAKGDR 216
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP+G+ G +G +GP+G+ G G
Sbjct: 217 GETGPAGPVGPRGDKGETGAKGEQGPAGK---DGKAGERGPVGPAGKDGQNGKDG 268
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 72/180 (40%), Gaps = 4/180 (2%)
Query: 20 RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
+ GP G G G GP+G +GP+G GP G G G GP+
Sbjct: 94 QLQGPRGDKGETGEQGPRGAQGPAGPQGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGPRGAQGPA 153
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G +GP+G+ GP G G G GP+G +GP+G G G
Sbjct: 154 GPQGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGPRGAQGPAGPQGPMGPAGERGEKGEPGTQGAK 213
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G G GP G G +G GP+G+ G +G +GP+G+ G DGL
Sbjct: 214 GDRGETGPAGPVGPRGDKGETGAKGEQGPAGK---DGKAGERGPVGPAGKDGQNG-KDGL 269
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/149 (29%), Positives = 60/149 (40%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G+ GP G G G GP+G +GP+G GP G G G
Sbjct: 123 VGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGPRGAQGPAGPQGPVGPAGKDGTQGPRGDKGETGEQGP 182
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G +GP+G G G G G GP G G +G GP
Sbjct: 183 RGAQGPAGPQGPMGPAGERGEKGEPGTQGAKGDRGETGPAGPVGPRGDKGETGAKGEQGP 242
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+G+ G +G +GP+G+ G G
Sbjct: 243 AGK---DGKAGERGPVGPAGKDGQNGKDG 268
>gi|398309823|ref|ZP_10513297.1| GXT repeat-containing collagen-like protein, partial [Bacillus
mojavensis RO-H-1]
Length = 300
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/117 (29%), Positives = 48/117 (41%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP+GS G +G G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 2 TGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGA 61
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +GS GP+G G +G GP+G G +G G +G S GP
Sbjct: 62 TGSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGP 118
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/117 (29%), Positives = 48/117 (41%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP+GS G +G G +GS G +G GP+G G +G
Sbjct: 2 TGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGA 61
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G +G GP+G G +G GP+G G +G S G +G GP
Sbjct: 62 TGSTGSTGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGP 118
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/111 (28%), Positives = 45/111 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 8 TGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGATGSTGS 67
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP+GS G +G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 68 TGETGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGP 118
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.043, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 48/120 (40%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G G +G+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 2 TGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGA 61
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G +G GP+G G +G S GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 62 TGSTGSTGE---TGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGATGVTGSTGSTGATGSTGP 118
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/103 (27%), Positives = 40/103 (38%), Gaps = 3/103 (2%)
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G +G G +G GP+G G +G S G +G G +G GP+G
Sbjct: 2 TGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGSTGATGSTGPTGATGATGSTGPTGA 61
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G GP+G G +
Sbjct: 62 TGSTGSTGE---TGPTGSTGVTGSTGATGSTGPTGVTGSTGAT 101
>gi|443919982|gb|ELU40001.1| hypothetical protein AG1IA_05968 [Rhizoctonia solani AG-1 IA]
Length = 1206
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/96 (42%), Positives = 43/96 (44%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT + G SG G SG RY G SG RY SG RY SG RY SG
Sbjct: 1070 GTVQSRDTRSTGRSGGSVMTGRSGDSRYTGRSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSG 1129
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
RY SG RY SG RY SG R+ G SG
Sbjct: 1130 DSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRHTGRSG 1165
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/71 (45%), Positives = 33/71 (46%)
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
SG RY G SG RY SG RY SG RY SG RY SG RY SG RY
Sbjct: 1092 SGDSRYTGRSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRY 1151
Query: 193 LGLSDGLRVSG 203
S R +G
Sbjct: 1152 TARSGDSRHTG 1162
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/88 (43%), Positives = 39/88 (44%)
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
R G SG G SG RY G SG RY SG RY SG RY SG S
Sbjct: 1078 RSTGRSGGSVMTGRSGDSRYTGRSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARS 1137
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G RY SG RY SG R+ G SG
Sbjct: 1138 GDSRYTARSGDSRYTARSGDSRHTGRSG 1165
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.73, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/92 (42%), Positives = 40/92 (43%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
S R G SG G SG RY G SG RY SG RY SG RY SG RY
Sbjct: 1074 SRDTRSTGRSGGSVMTGRSGDSRYTGRSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRY 1133
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
SG RY SG SG R+ G SG
Sbjct: 1134 TARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRHTGRSG 1165
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.93, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/92 (42%), Positives = 40/92 (43%)
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
S R G SG G SG RY G SG RY SG RY SG SG RY
Sbjct: 1074 SRDTRSTGRSGGSVMTGRSGDSRYTGRSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRY 1133
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
SG RY SG RY SG R+ G SG
Sbjct: 1134 TARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRHTGRSG 1165
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/74 (44%), Positives = 34/74 (45%)
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
SG RY G SG RY SG SG RY SG RY SG RY SG RY
Sbjct: 1092 SGDSRYTGRSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRY 1151
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSG 179
SG R+ G SG
Sbjct: 1152 TARSGDSRHTGRSG 1165
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/74 (44%), Positives = 34/74 (45%)
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
SG RY G SG SG RY SG RY SG RY SG RY SG RY
Sbjct: 1092 SGDSRYTGRSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRY 1151
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSG 188
SG R+ G SG
Sbjct: 1152 TARSGDSRHTGRSG 1165
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/64 (45%), Positives = 30/64 (46%)
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
SG RY SG RY SG RY SG RY SG RY SG RY SG R+
Sbjct: 1101 SGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRYTARSGDSRH 1160
Query: 193 LGLS 196
G S
Sbjct: 1161 TGRS 1164
>gi|423572718|ref|ZP_17548867.1| hypothetical protein II7_05843, partial [Bacillus cereus MSX-A12]
gi|401194540|gb|EJR01513.1| hypothetical protein II7_05843, partial [Bacillus cereus MSX-A12]
Length = 1065
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/197 (30%), Positives = 71/197 (36%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 245 NTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQG 304
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 305 VQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQG 361
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 362 IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQG 421
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ +G+
Sbjct: 422 IQGIQGVQGITGATGIQ 438
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/208 (28%), Positives = 71/208 (34%), Gaps = 6/208 (2%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T T + + GP+G G G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 243 TGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGI 302
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 303 QGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGV 359
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 360 QGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 419
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G G+ + G+
Sbjct: 420 QGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQ 447
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/203 (28%), Positives = 69/203 (33%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 373
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G G G GP G G G
Sbjct: 374 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 433
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLR 173
+ G G G G + GP G G G + GP +G
Sbjct: 434 ATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQG 493
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP+G +G +
Sbjct: 494 VQGPQGIQGIQGPTGATGDMGAT 516
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/193 (28%), Positives = 66/193 (34%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG+ GP G GP G
Sbjct: 312 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGD 368
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 369 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 428
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 429 QGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 482
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 483 QGIQGATGAQGVQ 495
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.043, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 16/176 (9%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG- 134
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 135 -RLRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
++ L G +G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.056, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/191 (26%), Positives = 61/191 (31%), Gaps = 15/191 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 186 PSGRLRYLGLS 196
P G G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGIQ 805
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +G+ GP+G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 240 TGATGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGE 299
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP
Sbjct: 300 QGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGP 356
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G + GP G GP G GP G GP G G+
Sbjct: 357 QGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQ 411
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.077, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 530
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 531 GPTGVT 536
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG- 152
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 153 -RLRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
++ L G +G G G GPSG G +G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ 190
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 332 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 388
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 389 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQG 448
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 449 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 508
Query: 180 RLRYLGPSGRL 190
+G +G
Sbjct: 509 ATGDMGATGAT 519
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/209 (26%), Positives = 65/209 (31%), Gaps = 24/209 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRY----- 57
+GP+G GP G G +G +GP+G GP GS
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 58 ----------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G G G + GP G G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQ 823
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 50/134 (37%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +GS G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGA 979
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 980 TGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGP 1036
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G
Sbjct: 1037 TGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/100 (30%), Positives = 39/100 (39%), Gaps = 9/100 (9%)
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 158
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 159 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G GP G GP +GP+G G+
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQ 131
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 53/157 (33%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 580 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 639
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 640 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGP 699
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 700 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 759
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G+
Sbjct: 760 QGIQGIQGVQ 769
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/143 (30%), Positives = 56/143 (39%), Gaps = 15/143 (10%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
G +GS G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQG---IQGV 976
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G+ GP G GP G + GP+G GP G G +G + GP G
Sbjct: 977 TGATGAQGPQG---IQGPQGDI---GPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---I 1027
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + GP G GP G
Sbjct: 1028 QGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG 1050
>gi|423457020|ref|ZP_17433817.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG5X2-1]
gi|401149073|gb|EJQ56554.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG5X2-1]
Length = 924
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 68/176 (38%), Gaps = 16/176 (9%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 76
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 77 -GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGATGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGVQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 149 QGVQGVPGSTGSQGIQGPQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ-GVTGPTG---ITGPTG 200
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 62/183 (33%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V N GP+G G G G G + GP G P G GP+G
Sbjct: 243 TGVTGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEG------PQGIQGIPGPTGV 296
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G G G +GS GP G +GP G G G G G GP
Sbjct: 297 TGEQGIQGVQGIQGITGSTGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGPTGETGP 356
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G G G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 357 QGVQGIQGTMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGP 416
Query: 184 LGP 186
GP
Sbjct: 417 EGP 419
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/171 (29%), Positives = 58/171 (33%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS GP G +GP G G G G G GP G G G +
Sbjct: 312 TGSTGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGPTGETGPQGVQGIQGTMGEIGP 371
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G G G
Sbjct: 372 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPEGPQGIQGIQGIQGV 431
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 432 TGATGAQGATGIQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGEIGPTGPMGAQGVQGI 482
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 59/159 (37%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL-- 94
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 95 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 95 RGPQGATGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGVQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 154 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G GP G GPSG G +G+
Sbjct: 149 QGVQGVPGSTGSQGIQGPQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ 187
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/179 (29%), Positives = 61/179 (34%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ G +G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 NTGVTGSTGVTGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G +G GP G +GP G G G G G G
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGITGSTGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGPTGETG 355
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P G G G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 356 PQGVQGIQGTMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGTT 414
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.090, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/181 (29%), Positives = 67/181 (37%), Gaps = 9/181 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G G G + G
Sbjct: 317 DQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGPTGE---TGPQGVQGIQGTMGEIGPTG 373
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 374 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGTTGPEGPQGIQGIQGIQGVTG 433
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 ATGAQGATGIQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGE---IGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTG 490
Query: 189 R 189
Sbjct: 491 A 491
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 60/173 (34%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G+ G +G G G GP G GP G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSTGVTGVTGNTGPTGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G G G G +G GP G +GP G G G G G
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGSTGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGP 350
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 351 TGETGPQGVQGIQGTMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQG 403
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 61/168 (36%), Gaps = 12/168 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP+G GP G G +G G G GP+G G G G +G
Sbjct: 615 DIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGSQGIQGPQGIQGPTGPQGVQGDQGPQGIQGVTG 674
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G GP G G G + GP G GP G
Sbjct: 675 ETGAQGPQG---IQGIQGVQGPTGPQGPTGIQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGP------QG 725
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P+G G G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 726 PTGDTGATGAQGPQGIQGPTGVTGSQGPTGS---TGPTGSQGIQGPTG 770
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/154 (31%), Positives = 60/154 (38%), Gaps = 16/154 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G GP G + GP G+ G P G+ GP G GP
Sbjct: 57 GPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGLRGPQGATGATGPQGVQGLQGP- 115
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP+G+ G G GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 116 -----IGPTGATGAQGIQGIQGVQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGSTGSQGIQGPQGIQ 170
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 171 GPQGPSGNTGATGATGQ-GVTGPTG---ITGPTG 200
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.52, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 57/158 (36%), Gaps = 3/158 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP+G GP G G +G G G GP+G G G G +G
Sbjct: 616 IGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGSQGIQGPQGIQGPTGPQGVQGDQGPQGIQGVTGE 675
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G G G GP+G G G G G GP+G G
Sbjct: 676 TGAQGPQGIQGIQGVQGPTGPQGPTGIQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGPQGPTGDTGATGA 735
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 736 QGPQGIQGPTGVTGSQGPTGS---TGPTGSQGIQGPTG 770
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 67/191 (35%), Gaps = 4/191 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 577 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGDIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 636
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G GP+G G G G +G GP G G G
Sbjct: 637 TGDQGSQGIQGPQGIQGPTGPQGVQGDQGPQGIQGVTGETGAQGPQGIQGIQGVQGPTGP 696
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G G G G G GP+G G G GP+G GP+G
Sbjct: 697 QGPTGIQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGPQGPTGDTGATGAQGPQGIQGPTGVTGSQGPTGS 756
Query: 190 LRYLGLSDGLR 200
G S G++
Sbjct: 757 TGPTG-SQGIQ 766
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/181 (26%), Positives = 64/181 (35%), Gaps = 3/181 (1%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 574 TGATGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGDIGPTGPQGVQGPQGIQGV 633
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G +G G G GP+G G G G +G + GP G G G
Sbjct: 634 TGATGDQGSQGIQGPQGIQGPTGPQGVQGDQGPQGIQGVTGETGAQGPQGIQGIQGVQGP 693
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
GP+G G G + GP G GP G G +G G+ V+G
Sbjct: 694 TGPQGPTG---IQGVQGDIGPTGPQGVQGLQGPQGPTGDTGATGAQGPQGIQGPTGVTGS 750
Query: 205 H 205
Sbjct: 751 Q 751
>gi|423368748|ref|ZP_17346180.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD142]
gi|401079991|gb|EJP88283.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD142]
Length = 922
Score = 47.4 bits (111), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 19/183 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G++ GP G GP+G + GP G+ GP G
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGAMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGPQG- 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 94 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGP 145
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G GP GPSG G +G+ GP+G
Sbjct: 146 QGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GISGPTGITGP 198
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 199 TGI 201
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/165 (31%), Positives = 66/165 (40%), Gaps = 15/165 (9%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G++ GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGAMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G +G G G GPSG G +G+
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ 187
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GPSGS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPSGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.058, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 491 VQGPQG 496
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 60/172 (34%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG------------PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N GPSG G P G GP G GP+G G G G
Sbjct: 248 NTGPSGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQG 307
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+G GP G +GP +G+ GP G GP+G G G GP G
Sbjct: 308 ITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMG 364
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 365 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/145 (27%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G + GP + +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGP---MGAMGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G G G GP G
Sbjct: 86 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGA 139
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 140 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 164
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/158 (29%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP + +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGP---MGAMGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ + G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQG 171
>gi|423373317|ref|ZP_17350656.1| hypothetical protein IC5_02372, partial [Bacillus cereus AND1407]
gi|401096632|gb|EJQ04674.1| hypothetical protein IC5_02372, partial [Bacillus cereus AND1407]
Length = 1083
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/197 (30%), Positives = 71/197 (36%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 254 NTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQG 313
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 314 VQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQG 370
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 371 IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQG 430
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ +G+
Sbjct: 431 IQGIQGVQGITGATGIQ 447
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/208 (28%), Positives = 71/208 (34%), Gaps = 6/208 (2%)
Query: 1 TFGTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T T + + GP+G G G GP G GP G GP+G G
Sbjct: 252 TGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGI 311
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 312 QGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGV 368
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 369 QGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 428
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G G+ + G+
Sbjct: 429 QGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQ 456
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/203 (28%), Positives = 69/203 (33%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 326 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 382
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G G G GP G G G
Sbjct: 383 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 442
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLR 173
+ G G G G + GP G G G + GP +G
Sbjct: 443 ATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQG 502
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP+G +G +
Sbjct: 503 VQGPQGIQGIQGPTGATGDMGAT 525
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 60/175 (34%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 321 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGD 377
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 378 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 437
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 438 QGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQ 492
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.047, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 63/178 (35%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 292 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQ 351
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 352 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 408
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 409 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEG 466
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.077, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G +G+ GP+G G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 249 TGATGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGE 308
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP
Sbjct: 309 QGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGP 365
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G + GP G GP G GP G GP G G+
Sbjct: 366 QGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQ 420
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 363 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 422
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 423 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 479
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 480 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 539
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 540 GPTGVT 545
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/194 (28%), Positives = 66/194 (34%), Gaps = 12/194 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
+GP+G GP G G +G +GP+G GP GS G +G
Sbjct: 624 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 683
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 684 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 740
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G +GP G G G GP G G G G G G G +
Sbjct: 741 PVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIG 800
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 801 ATGPEGPQGVQGIQ 814
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 341 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 397
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 398 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQG 457
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 458 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 517
Query: 180 RLRYLGPSGRL 190
+G +G
Sbjct: 518 ATGDMGATGAT 528
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/119 (31%), Positives = 46/119 (38%), Gaps = 9/119 (7%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQG 150
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/119 (31%), Positives = 46/119 (38%), Gaps = 9/119 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQG 150
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.52, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 595 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 654
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 655 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 711
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 712 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 771
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 772 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 796
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/185 (27%), Positives = 60/185 (32%), Gaps = 18/185 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + GP G G G +
Sbjct: 660 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIG 719
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 720 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQG 779
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G G G G + GP G G G G +G GP G G
Sbjct: 780 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQG---IQGATGAQGVQGPQGVQGIQG 836
Query: 177 PSGRL 181
P+G
Sbjct: 837 PTGAT 841
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/141 (28%), Positives = 53/141 (37%), Gaps = 9/141 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ G +G GP G G +GP+G GP G
Sbjct: 907 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQG------EIGPTGPQGIQGPQG 960
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G +G G G +GP+G GP G G +G + GP G G
Sbjct: 961 IQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQG 1017
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P G + GP G GP G
Sbjct: 1018 PQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG 1038
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 589 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 648
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 649 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGP 708
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 709 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 768
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G+
Sbjct: 769 QGIQGIQGVQ 778
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/192 (28%), Positives = 62/192 (32%), Gaps = 21/192 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 58
GP G + GP+G GP GS GP G + GP G
Sbjct: 656 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQ 712
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 713 GIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQ 772
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G G + G G G G + GP G G G G +G GP
Sbjct: 773 GIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQG---IQGATGAQGVQGPQ 829
Query: 179 GRLRYLGPSGRL 190
G GP+G
Sbjct: 830 GVQGIQGPTGAT 841
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 624 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 683
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 684 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 740
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
P G GP G G G GP G G G G G G+ +
Sbjct: 741 PVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIG 800
Query: 201 VSG 203
+G
Sbjct: 801 ATG 803
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 49/131 (37%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 911 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 970
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 971 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGP 1027
Query: 169 SGRLRYLGPSG 179
G GP G
Sbjct: 1028 QGPQGIQGPQG 1038
>gi|65322096|ref|ZP_00395055.1| COG3391: Uncharacterized conserved protein [Bacillus anthracis str.
A2012]
Length = 473
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/120 (28%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G G +G+ GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 190 NTGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTG 249
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ G +G G +G GP+G G +G GP+G + G
Sbjct: 250 NTGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 306
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/119 (28%), Positives = 48/119 (40%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G G +G+ GP+G G +G G +GS G +G GP+G
Sbjct: 191 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 250
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G +G G +G G +G S GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 251 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 306
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/119 (28%), Positives = 47/119 (39%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+GS G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 191 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 250
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G +G G +G S G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 251 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 306
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/119 (28%), Positives = 48/119 (40%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+GS G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 191 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 250
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G G +G G +G GP+G S G +G GP+G G
Sbjct: 251 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTG---STGATGVTGNTGPTGSTGATG 306
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/119 (26%), Positives = 47/119 (39%), Gaps = 3/119 (2%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G G +G+ GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 191 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 250
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ G +G G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 251 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 306
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/103 (26%), Positives = 40/103 (38%)
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 191 TGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGN 250
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G G +G GP+G G++
Sbjct: 251 TGATGETGATGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVT 293
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/170 (24%), Positives = 58/170 (34%), Gaps = 30/170 (17%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------------------LGPSGRLRY 66
+GS G +G GP+GS GP+G
Sbjct: 140 TGSTGVTGSTGVTGETGPTGSTGATGNTGPTGETGGTGSTGATGSTGVTGNTGPTGSTGV 199
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G GP+G+ G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 200 TGNTGATGETGPTGNTGATGNTGPTGETGVTGSTGPTGETGVTGSTGPTGNTGATGETGA 259
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
S G +G G +G GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 260 TGSTGVTGNTGSTGETGPTGSTGPTGSTGATGVTGN---TGPTGSTGATG 306
>gi|423359678|ref|ZP_17337181.1| hypothetical protein IC1_01658, partial [Bacillus cereus VD022]
gi|401083334|gb|EJP91594.1| hypothetical protein IC1_01658, partial [Bacillus cereus VD022]
Length = 506
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 167
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-- 149
G G LG SG G G +GP+G S G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Query: 150 -PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + +GP+G G G + G +G GP+G G++
Sbjct: 228 GPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGSTGIT 275
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/160 (30%), Positives = 59/160 (36%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 343 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGP 402
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRY 156
GP G G G GP+ G GPSG GP G GP+G
Sbjct: 403 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGVQGPSGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGA 462
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP G G G GP+G GL
Sbjct: 463 TGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGETGPQGLQ 502
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/161 (31%), Positives = 61/161 (37%), Gaps = 11/161 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + GP+G GP G GP+G G GS+ GP+G G G +
Sbjct: 343 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGP 402
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G GP+G L+ L GPSG GP G G G
Sbjct: 403 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGVQGPSGPTGPTGPQGLQGITG------QAG 455
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
P+G GP+G GP G G G GP+G
Sbjct: 456 PTGPTGATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET 496
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/155 (30%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 8/155 (5%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G + GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 343 QGPMGATGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGP 402
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLNSDGPSG---RLRYLGPSGRLR 146
GP G G G GP+G L+ L GPSG GP G GP+G
Sbjct: 403 TGPQGVQGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGVQGPSGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTG 461
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G GP G G G GP+G
Sbjct: 462 ATGPTGETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET 496
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP GS GP + GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPI 125
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G + GP+G G G GP+G G G L S G
Sbjct: 126 GPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQ 185
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G + GP+G G G + G +G GP G + +GP+G
Sbjct: 186 GITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQGPQGEMGQVGPTGSQGIQ 245
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 246 GVQ 248
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 66/178 (37%), Gaps = 3/178 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---P 78
+GP+G G G GP+G GP GS GP G G G G P
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGSQGPMGEQGPQGIQGVQGIQGERGP 109
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPTGN 169
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G GL
Sbjct: 170 TGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQGLQ 227
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.056, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/149 (31%), Positives = 57/149 (38%), Gaps = 8/149 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 349 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGPTGPQGLQGLQGSIGPTGPTGPQGVQGAQGPIGPTGPQGV 408
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G GP+G L+ L GPSG GP G GP+G GP+G
Sbjct: 409 QGIQGEQGVRGATGPTG-LQGLQGVQGPSGPTGPTGPQGLQGITGQAGPTGPTGATGPTG 467
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP G G G GP+G
Sbjct: 468 ETGPQGPQGIQGSQGEMGPTGATGPTGET 496
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/172 (29%), Positives = 65/172 (37%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+GS G G +GP+G G G GP+G
Sbjct: 108 GPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGSTGIQGIQGMQGEVGPTGPTGIQGIQGVQGDNGPTGPT 167
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G LG SG G G +GP+G G G +GP G G
Sbjct: 168 GNTGIQGVQGNLGSSGLQGITGIQGIQGLIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPQGETGVQG-- 225
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + +GP+G G G + G +G GP+G G
Sbjct: 226 ----LQGPQGEMGQVGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGSTG 273
>gi|406709099|ref|YP_006763825.1| collagen-like surface protein [Streptococcus agalactiae
GD201008-001]
gi|406649984|gb|AFS45385.1| collagen-like surface protein [Streptococcus agalactiae
GD201008-001]
Length = 1051
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/169 (29%), Positives = 71/169 (42%), Gaps = 12/169 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G+ G G + GP G GP+G+ G G + GP G GP+G
Sbjct: 547 ETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAG 606
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G +G+ +GP+G GP+G G G + GP G G G + G
Sbjct: 607 KD---GEAGAQGPVGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGEAGPAGERGETGAQG 663
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P +GP+G GP+G G G + GP G GP+G+
Sbjct: 664 P------MGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPAGK 703
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP+G G G + GP G GP+G+ G G + GP G
Sbjct: 540 GPKGDRGETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDR 599
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G+ G G + GP G GP+G G G + GP G GP+
Sbjct: 600 GETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGE---AGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPA 653
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G + GP G GP+G G G + GP G
Sbjct: 654 GERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGE 697
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 7/167 (4%)
Query: 26 GSLRYLG-PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G+ +LG P G PS R+ +G S GP G GP+G+ G G
Sbjct: 503 GNQTFLGLPIGKPEIKEPSPRIVKVGISQENMSQFPRGPKGDRGETGPAGKDGEAGAQGP 562
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP+G+ G G + GP G GP+G+ DG +G +GP
Sbjct: 563 VGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGK---DGEAGAQGPVGP 619
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G G + GP G G G GP G
Sbjct: 620 AGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMG 666
>gi|423656223|ref|ZP_17631522.1| hypothetical protein IKG_03211 [Bacillus cereus VD200]
gi|401291342|gb|EJR97018.1| hypothetical protein IKG_03211 [Bacillus cereus VD200]
Length = 835
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/194 (26%), Positives = 71/194 (36%), Gaps = 15/194 (7%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P G GP G+ G G L GP+G G G +GP+G +G G
Sbjct: 367 PQGNQDITGPMGAEGSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGIVGIQGIAG 426
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG--------- 125
+G +G+ G G GP+G G G G +G GP G
Sbjct: 427 PVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQG---IQGEAGAAGTQGPQGVQGIQGTTG 483
Query: 126 ---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
+ G G +GP+G + GP G GP+G G G +GP+G
Sbjct: 484 LTGTQGAQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQG 543
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G++
Sbjct: 544 IRGSQGNTGEVGIT 557
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGI 76
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G+ +G +G GP+G G G + GP G + G G + GP G
Sbjct: 77 QGA---IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGIQGATGPVGSQGI 130
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
G G +G G+ G G G SG GP G G G + G DG
Sbjct: 131 QGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQG-EDG 189
Query: 199 LR 200
+
Sbjct: 190 FQ 191
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/169 (26%), Positives = 64/169 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +G G +G +G+ G G GP+G+ G G G +G
Sbjct: 410 IGPTGAQGIVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQGIQGVQGIQGEAGAAGT 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G G +G G G +GP+G + GP G GP+G G
Sbjct: 470 QGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGSQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGITGPTGAQGVQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G G G +G +G G G GP G +
Sbjct: 530 QGVQGIIGPTGAQGIRGSQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQGPQGPQGNV 578
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/189 (25%), Positives = 68/189 (35%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP+G+ +G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 393 GPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGIVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGPAGAQ 452
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G G G +G GP G G G +GP+G +
Sbjct: 453 GIQGVQG---IQGEAGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGSQGVQGIIGPTGAIGLQ 509
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G GP+G G G +GP+G G G +G +G G G
Sbjct: 510 GPQGIQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGSQGNTGEVGITGPQGVQGAQGSQ 569
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 570 GPQGPQGNV 578
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.00, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/174 (27%), Positives = 59/174 (33%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G + G G GP GS G G +G G G G G SG
Sbjct: 103 NQGPIGDIGVQGLEGIQGATGPVGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSG 162
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G + G G G +G G G +GP+G G
Sbjct: 163 VTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPTGSTGMQG 222
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G +G + GP G G +G + G G G +G + G
Sbjct: 223 AQGISGIKGITGAIGLQGPQGVQGIQGITGATGFQGVKGIRGITGATGSIGIQG 276
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/197 (25%), Positives = 68/197 (34%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGS------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+G +G GP+G + GP G + G G GP GS G G
Sbjct: 80 IGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGIQGATGPVGSQGIQGTQGIQGE 139
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G+ G G G SG GP G G G + G G G +G
Sbjct: 140 IGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGE 199
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +GP+G G G G +G + GP G G +G + G
Sbjct: 200 EGPQGAQGIQGEVGPTGSTGMQGAQGISGIKGITGAIGLQGPQGVQGIQGITGATGFQGV 259
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G G + + + G
Sbjct: 260 KGIRGITGATGSIGIQG 276
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/185 (25%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + GP G + G G GP G
Sbjct: 70 TTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGIQGATGPVG 126
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G +G G+ G G G SG GP G G G + G
Sbjct: 127 SQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQG 186
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G G G +GP+G G G G +G + GP G
Sbjct: 187 EDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPTGSTGMQGAQGISGIKGITGAIGLQGPQGVQG 246
Query: 192 YLGLS 196
G++
Sbjct: 247 IQGIT 251
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/201 (25%), Positives = 71/201 (35%), Gaps = 18/201 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G G GS +G G GP G+ GP G G G
Sbjct: 329 IGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQDITGPMGAEGSQGIQGP 388
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G G + GP
Sbjct: 389 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGIVGIQGIAGPVGVTGAEGAQGAQGIRGATGP 448
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G G +G G G +GP+G +
Sbjct: 449 AGAQGIQGVQGIQGEAGAAGTQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGSQGVQGIIGPTGAIGL 508
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GP+G G+
Sbjct: 509 QGPQGIQGITGPTGAQGVQGI 529
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/197 (26%), Positives = 69/197 (35%), Gaps = 12/197 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G+ GP G GP G G G+ +G +G GP+G
Sbjct: 39 GPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGA---IGDTGEQGITGPTG-- 93
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G + G G GP G G G +G G+ + G
Sbjct: 94 -LQGAQGLIGNQGPIGDIGVQGLEGIQGATGPVGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQ 152
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G SG GP G +G G + G G GP G G
Sbjct: 153 GERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEV 212
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G G+ +SG+
Sbjct: 213 GPTGSTGMQGAQGISGI 229
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/196 (26%), Positives = 68/196 (34%), Gaps = 9/196 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP G GP G+ +G +G GP+G G G +
Sbjct: 48 GPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQ 104
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G + G G GP G G G +G G+ G G G SG
Sbjct: 105 GPIGDIGVQGLEGIQGATGPVGSQGIQGTQGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVT 164
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G G G + G G G +G G G +GP+G G
Sbjct: 165 GPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGIQGITGEEGPQGAQGIQGEVGPTGSTGMQGAQ 224
Query: 188 GRLRYLGLSDGLRVSG 203
G G++ + + G
Sbjct: 225 GISGIKGITGAIGLQG 240
>gi|423373522|ref|ZP_17350861.1| hypothetical protein IC5_02577 [Bacillus cereus AND1407]
gi|401095987|gb|EJQ04037.1| hypothetical protein IC5_02577 [Bacillus cereus AND1407]
Length = 414
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/169 (27%), Positives = 66/169 (39%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+G G +GS GP+G G +G G +G G +G G +GS
Sbjct: 119 PTGVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGITGATGATGATGPTGVTGITGATGATGSTG 178
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G +G G +G G +G G +G + GP+G GP+G
Sbjct: 179 ATGPTGATGITGATGATGITGATGATGITGATGPTGATGITGATGATGPTGA---TGPTG 235
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
GP+G G +G GP+G G +G G S Y
Sbjct: 236 ATGSTGPTGATGITGATGVTGATGPTGATGSTGSTGPTGITGTSITATY 284
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/113 (27%), Positives = 44/113 (38%), Gaps = 3/113 (2%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G +G GP+G G +G G +G G +G + G +G GP+G
Sbjct: 170 ATGATGSTGATGPTGATGITGATGATGITGATGATGITGATGPTGATGITGATGATGPTG 229
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G G +G GP+G G +G G S
Sbjct: 230 AT---GPTGATGSTGPTGATGITGATGVTGATGPTGATGSTGSTGPTGITGTS 279
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/153 (27%), Positives = 60/153 (39%), Gaps = 3/153 (1%)
Query: 42 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 101
P+G G +GS GP+G G +G G +G+ G +G G +G
Sbjct: 119 PTGVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGITGATGATGATGPTGVTGITGATGATGSTG 178
Query: 102 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G G +G G +G G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 179 ATGPTGATGITGATGATGITGATGATGITGATGPTGATGITGATGATGPTGAT---GPTG 235
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 236 ATGSTGPTGATGITGATGVTGATGPTGATGSTG 268
>gi|423597976|ref|ZP_17573976.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD078]
gi|401237946|gb|EJR44391.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD078]
Length = 889
Score = 47.0 bits (110), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 68/178 (38%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGP 69
G +G GP+GS G GS G G L GP G ++ + GP+G + G
Sbjct: 240 TGSTGVAGATGPTGSTGATGIQGSQGIQGIQGPLGPTGPEGPQGIQGIPGPTGIMGEQGI 299
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +G+ G G +GP G G G G G + GP G
Sbjct: 300 QGVQGIQGITGATGDQGTQGIQGAIGPQGVTGATGEQGPQGIQGVQGPIGATGPQGIQGI 359
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G L GP G GP G GP + GP G+ GP G + GP
Sbjct: 360 QGPMGELGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGP---IGPTGPEGQQGIQGPVGPVGATGPE 414
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 59/157 (37%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 76
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 77 -GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G G G +GP G G +G
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGPQGVQGVQGLIGPQGTSGSTGVTGAT 185
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/141 (32%), Positives = 56/141 (39%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGP 91
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G LR GP G + GP G GP G G G G G + GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G GL
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGPQGVQGVQGL 169
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/163 (31%), Positives = 63/163 (38%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G G G G +GP G G +G
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGPQGVQGVQGLIGPQGTSGSTGVTGAT 185
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 61/172 (35%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRY 66
A GP+G G GS G G L GP G G P+G + G G
Sbjct: 246 AGATGPTGSTGATGIQGSQGIQGIQGPLGPTGPEGPQGIQGIPGPTGIMGEQGIQGVQGI 305
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G +G G G +GP G G G G G + GP G GP G
Sbjct: 306 QGITGATGDQGTQGIQGAIGPQGVTGATGEQGPQGIQGVQGPIGATGPQGIQGIQGPMGE 365
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
L GP G GP G GP + GP G+ GP G + GP
Sbjct: 366 LGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGP---IGPTGPEGQQGIQGPVGPVGATGPE 414
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 60/168 (35%), Gaps = 6/168 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G GP+G G GS G G L GP G P G
Sbjct: 230 VTGSTGNTGATGSTGVAGATGPTGSTGATGIQGSQGIQGIQGPLGPTGPEG------PQG 283
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G + G G G +G G G +GP G + G G G
Sbjct: 284 IQGIPGPTGIMGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGTQGIQGAIGPQGVTGATGEQGPQGIQG 343
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G GP G L GP G GP G GP G
Sbjct: 344 VQGPIGATGPQGIQGIQGPMGELGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPIG 391
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.60, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/188 (28%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 18/188 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G G G + GP G GP G L GP G GP G
Sbjct: 324 IGPQGVTGATGEQGPQGIQGVQGPIGATGPQGIQGIQGPMGELGPTGPEGPEGLQGPQGI 383
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS--- 129
GP + GP G+ GP G + GP G+ G G G +G
Sbjct: 384 QGVQGP---IGPTGPEGQQGIQGPVGPVGATGPEGQQGIQGVQGIQGTTGATGAQGIQGI 440
Query: 130 ---------DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G GP G +GP+G + G G +G +G GP G
Sbjct: 441 QGIQGQIGPTGPEGPQGVQGPQG---TIGPTGPMGPQGVQGIQGEIGATGAQGVQGPQGI 497
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP+G
Sbjct: 498 QGIQGPTG 505
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/100 (30%), Positives = 38/100 (38%), Gaps = 3/100 (3%)
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 166
+ GP+G GP G GP G + GP G GP+G++ GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 167 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G GP G G + GL
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQ 134
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/129 (30%), Positives = 46/129 (35%), Gaps = 6/129 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G GP+G + GP G+ G P G GP G GP
Sbjct: 57 GPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGPI 116
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRL 127
G G G G G + GP G G G GP G +GP G
Sbjct: 117 GPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGPQGVQGVQGLIGPQGTS 176
Query: 128 NSDGPSGRL 136
S G +G
Sbjct: 177 GSTGVTGAT 185
>gi|423512831|ref|ZP_17489362.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuA2-1]
gi|402447755|gb|EJV79605.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuA2-1]
Length = 931
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 68/176 (38%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP+G + GP G+ GP G
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGPQG- 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 94 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGP 145
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G G GP G G +G G SG GP+G
Sbjct: 146 QGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQGPNGNTGATGATGQ-GISGPTGITGPTG 200
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/163 (31%), Positives = 62/163 (38%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G G G G G GP G G +G
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQGPNGNTGATGAT 185
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 231 TGAAGNTGVTGSAGVTGNTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPKGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/195 (28%), Positives = 71/195 (36%), Gaps = 21/195 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---------SGRLRYLG 113
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPKGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G G G + + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G
Sbjct: 491 VQGPQGIQGIQGPTG 505
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.054, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPKGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPKGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/151 (31%), Positives = 55/151 (36%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 385
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 386 VPGPAGATGPEGPKGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/145 (28%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 18/145 (12%)
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 124 SGRLNSD---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ GP G GP G GP +GP+G G G GP G
Sbjct: 86 EGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGA 139
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ G+
Sbjct: 140 TGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQ 164
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP G +GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---MGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ + G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQG 171
>gi|423584744|ref|ZP_17560831.1| hypothetical protein IIE_00156, partial [Bacillus cereus VD045]
gi|401235970|gb|EJR42437.1| hypothetical protein IIE_00156, partial [Bacillus cereus VD045]
Length = 1061
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/190 (28%), Positives = 62/190 (32%), Gaps = 6/190 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G +GP G G G G GS GP G GP G +
Sbjct: 315 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGSSGETGPQGVQGIQGPMGDIGP 374
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 375 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 434
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G + GP G G G + GP +GP G G+
Sbjct: 435 TGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGI 488
Query: 196 SDGLRVSGLH 205
G+
Sbjct: 489 QGATGAQGVQ 498
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/166 (30%), Positives = 57/166 (34%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G G G G +G GP G +GP G G G G GS
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGSS 354
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G + GP G GP G GP G +GP G GP
Sbjct: 355 GETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPV 414
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 415 GATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 460
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/202 (28%), Positives = 66/202 (32%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G G G GP+G G G
Sbjct: 249 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 308
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +G GP G +GP G G G G G GP G GP
Sbjct: 309 QGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGSSGETGPQGVQGIQGP 368
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 369 MGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGI 428
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G+ + G+
Sbjct: 429 QGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 450
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 63/187 (33%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G G GS GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 330 IGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGSSGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGI 389
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G GP G GP G G G G G G
Sbjct: 390 QGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGI 449
Query: 133 SGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G + GP G +GP+G + G G G +G GP G GP
Sbjct: 450 QGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGP 509
Query: 187 SGRLRYL 193
+G +
Sbjct: 510 TGATGDM 516
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 64/194 (32%), Gaps = 6/194 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G +GP G G G G G GP G GP G + GP G
Sbjct: 320 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGSSGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 379
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G GP G GP G G G + G
Sbjct: 380 PEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATG 439
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP G G G + GP +GP G G G
Sbjct: 440 VQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQGATG 493
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G+ + G+
Sbjct: 494 AQGVQGPQGIQGIQ 507
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/200 (28%), Positives = 73/200 (36%), Gaps = 6/200 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRYL-GPSGRLR 65
N G +G G +GS G +G+ G G +GP+G ++ + GP+G
Sbjct: 242 NTGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGIPGPTGVTG 301
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G G +G+ GP G +GP G G G G G GP G
Sbjct: 302 EQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGSSGETGPQG 361
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 362 VQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQG 421
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G G+ +G+
Sbjct: 422 PQGIQGIQGVQGITGATGVQ 441
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 65/191 (34%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPS------GRL 64
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G
Sbjct: 295 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGSS 354
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 355 GETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPV 414
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 415 GATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPT 474
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 475 GPMGPQGVQGV 485
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 56/164 (34%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 356 ETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQGIQGIQGPVG 415
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G G G G G G + GP G G G + G
Sbjct: 416 ATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---G 472
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P+G + G G G +G GP G GP+G +
Sbjct: 473 PTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDM 516
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 60/190 (31%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGI 807
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 60/173 (34%), Gaps = 3/173 (1%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G G G
Sbjct: 237 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGSQGIQGI 293
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G G G G +G GP G +GP G G G G G
Sbjct: 294 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGS 353
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 354 SGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGVTGPEGPQG 406
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/200 (26%), Positives = 65/200 (32%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGS---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 56
++GP+G GP GS GP G + G G G G +
Sbjct: 654 DIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIG 713
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP G GP G GP G+ GP G G G GP G G G
Sbjct: 714 PTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQG 773
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G G + GP G +GP+G + G G G +G
Sbjct: 774 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATG 833
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G
Sbjct: 834 AQGVQGPQGIQGVQGPTGAT 853
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/107 (31%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 6/107 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGAT 1058
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/208 (25%), Positives = 64/208 (30%), Gaps = 24/208 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRY----- 57
+GP+G GP G G +G +GP+G GP GS
Sbjct: 618 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 677
Query: 58 ----------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G + G G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 678 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 737
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 738 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 797
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
P G G G + GP G G+
Sbjct: 798 PEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGI 825
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/109 (30%), Positives = 43/109 (39%), Gaps = 6/109 (5%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ GP G GP G + GP G GP G GP+G +
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGATGA 1060
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 42/107 (39%), Gaps = 6/107 (5%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+ GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGAT 1058
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/107 (31%), Positives = 42/107 (39%), Gaps = 6/107 (5%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+GP+G GP G G +G G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 958 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1017
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G + GP G GP G GP+G
Sbjct: 1018 ATGAQGPQG---IQGPQGEIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGAT 1058
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 68/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 589 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 648
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + G G
Sbjct: 649 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGSQGPTGI 705
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 706 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 765
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 766 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 790
>gi|256069431|ref|XP_002571142.1| collagen alpha chain [Schistosoma mansoni]
Length = 263
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/169 (33%), Positives = 72/169 (42%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 76 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 135
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G + G G + GP G GP G Y GP G DG S
Sbjct: 136 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 195
Query: 134 GRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G+ GP G +G +GR GP G G G+ +GP G
Sbjct: 196 GKDGKPGPQGVPGEQGAVGKAGRRGDRGPPGPQGKRGYKGQEGVMGPPG 244
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/130 (33%), Positives = 57/130 (43%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 76 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 135
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G +GP+G + G G + GP G GP G Y GP G G S
Sbjct: 136 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 195
Query: 179 GRLRYLGPSG 188
G+ GP G
Sbjct: 196 GKDGKPGPQG 205
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/120 (34%), Positives = 52/120 (43%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 76 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 135
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP+G + G G + GP G GP G Y GP G GLS
Sbjct: 136 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 195
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/141 (32%), Positives = 59/141 (41%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 76 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 135
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
GP G GP+G + G G + GP G GP G Y GP G G S
Sbjct: 136 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 195
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G+ GP G G G+
Sbjct: 196 GKDGKPGPQGVPGEQGAVGKA 216
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/122 (33%), Positives = 53/122 (43%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 76 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 135
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G + G G + GP G GP G Y GP G G S
Sbjct: 136 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 195
Query: 188 GR 189
G+
Sbjct: 196 GK 197
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/156 (30%), Positives = 63/156 (40%), Gaps = 9/156 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G + +GP G +GP+G G +G G SG + GP G GP+G
Sbjct: 92 HAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDVGDPGPDGETGPEGPAG 151
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G + GP G GP G Y GP G G SG+ GP G G
Sbjct: 152 AVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLSGKDGKPGPQGVPGEQG 211
Query: 132 PSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G+ GP G+ Y G+ +GP G
Sbjct: 212 AVGKAGRRGDRGPPGPQGKRGY---KGQEGVMGPPG 244
>gi|229162241|ref|ZP_04290210.1| hypothetical protein bcere0009_30180 [Bacillus cereus R309803]
gi|228621291|gb|EEK78148.1| hypothetical protein bcere0009_30180 [Bacillus cereus R309803]
Length = 837
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/199 (29%), Positives = 72/199 (36%), Gaps = 15/199 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 40 TGPQGNQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPMGQVGLTGPQGAQGSQGPMGE 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G GP G G G + +GP+G G G + S GP
Sbjct: 94 Q---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPQGIQGIQGMPGPMGSIGPTGIQGIQGMQGEVGSTGP 150
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G G G + GP+G LG SG G G +GP+G G
Sbjct: 151 TGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGIQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGIEGT 210
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G +G+ V GL
Sbjct: 211 QGAQGPMGIKGETGVQGLQ 229
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/164 (29%), Positives = 63/164 (38%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G++ GP G+ GP G GP G G G GP G G G +
Sbjct: 71 GPMGQVGLTGPQGAQGSQGPMGEQ---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPQGIQGIQGMPGPM 127
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L S G
Sbjct: 128 GSIGPTGIQGIQGMQGEVGSTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGIQGNLGSSGLQ 187
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGIEGTQGAQGPMGIKGETGVQGLQGP 231
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/164 (29%), Positives = 61/164 (37%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G+ GP G GP G G G GP G G G +
Sbjct: 71 GPMGQVGLTGPQGAQGSQGPMGEQ---GPQGIQGVQGIQGERGPTGPQGIQGIQGMPGPM 127
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L G
Sbjct: 128 GSIGPTGIQGIQGMQGEVGSTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGIQGNLGSSGLQ 187
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 188 GVTGIQGIQGPIGPTGPTGIEGTQGAQGPMGIKGETGVQGLQGP 231
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/166 (29%), Positives = 57/166 (34%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
GP+G GP G GP G GP G GP G GP + GP
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGIQGVTGSTGPQGIQGIQGPIGPTGQAGPQGVQGAQGP---IGPTGP 417
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G G G G +G G G + G G GPSG GP G
Sbjct: 418 QGIQGIQGEQGVRGETGQAGLQGIQGIQGPIGQTGLQGVQGVQGPSGVTGPTGPQGIQGI 477
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G + G +G GP+G GP G GP G +
Sbjct: 478 QGPQGVIGATGVTGIQGVQGIQGPTGATGATGPQGIQGTQGPQGPV 523
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/187 (29%), Positives = 65/187 (34%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GP+G G G + GP+G GP G GP G GP G
Sbjct: 340 MGPTGVTGLTGLQGVQGPIGPTGPTGDQGIQGPQGIQGVTGSTGPQGIQGIQGPIGPTGQ 399
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G GP G GP G G G G +G G G + G G
Sbjct: 400 AGPQGVQGAQGPIGP---TGPQGIQGIQGEQGVRGETGQAGLQGIQGIQGPIGQTGLQGV 456
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GPSG GP G GP G + G + G GP+G GP G
Sbjct: 457 QGVQGPSGVTGPTGPQGIQGIQGPQGVIGATGVTGIQGVQGIQGPTGATGATGPQGIQGT 516
Query: 184 LGPSGRL 190
GP G +
Sbjct: 517 QGPQGPV 523
>gi|423489897|ref|ZP_17466579.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BtB2-4]
gi|423495620|ref|ZP_17472264.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus CER057]
gi|423497584|ref|ZP_17474201.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus CER074]
gi|401150209|gb|EJQ57671.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus CER057]
gi|401162515|gb|EJQ69871.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus CER074]
gi|402430766|gb|EJV62841.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BtB2-4]
Length = 931
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 67/180 (37%), Gaps = 16/180 (8%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G GP G GP+G++ GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEKGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G GP GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GISGPTGITGPTGI 201
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GPSGS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPSGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 491 VQGPQG 496
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 60/172 (34%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG------------PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N GPSG G P G GP G GP+G G G G
Sbjct: 248 NTGPSGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQG 307
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+G GP G +GP +G+ GP G GP+G G G GP G
Sbjct: 308 ITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMG 364
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 365 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/154 (30%), Positives = 57/154 (37%), Gaps = 16/154 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G GP+G + GP G+ G P G GP G GP
Sbjct: 57 GPMGEKGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP- 115
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP+G+ G G GP G GP G G +G G G
Sbjct: 116 -----IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQ 170
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GPSG G +G+ G SG GP+G
Sbjct: 171 GPQGPSGNTGATGATGQ----GISGPTGITGPTG 200
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 21/158 (13%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G GP G + GP G GP+ GP G GP+G++ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGE---KGPT------GPQGVQGIQGPAGQMGATGP 85
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G+ GP G LR GP G + GP G GP +GP+G G G
Sbjct: 86 EGQ---QGPQG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGL 133
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP G GP G G G G+ + G
Sbjct: 134 QGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQG 171
>gi|167856725|ref|ZP_02479400.1| putative large adhesin [Haemophilus parasuis 29755]
gi|167852151|gb|EDS23490.1| putative large adhesin [Haemophilus parasuis 29755]
Length = 654
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/172 (33%), Positives = 68/172 (39%), Gaps = 15/172 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP G GP G GP G GP+G + GP+G+ GP G G
Sbjct: 492 QAGPKGEKGDTGPRGETGPAGPVGPRGETGPAGPVGPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGSPG 551
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSG 125
G GP+G + GP+G GP+G GP G GP G LGP G
Sbjct: 552 ARGEKGEPGPAGPV---GPAGPRGPAGPAGAKGEPGPRGEQGLPGVAGPKGDKGDLGPKG 608
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
S GP G +GP G GP G GP+G Y GP G GP
Sbjct: 609 EAGSTGPRG---PVGPKGETGAQGPMG---PAGPAGPKGYTGPKGETSPAGP 654
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.094, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/190 (31%), Positives = 71/190 (37%), Gaps = 18/190 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G GP G GP G GP +GP G GP
Sbjct: 473 GPQGIAGAQGPKGDKGDPGQAGPKGEKGDTGPRGETGPAGP------VGPRGETGPAGPV 526
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G+ GP G G G GP+G +GP+G GP+G
Sbjct: 527 GPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGSPGARGEKGEPGPAG---PVGPAGPRGPAGPAGAKGEP 583
Query: 131 GPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYL 184
GP G GP G LGP G GP G + G +G +GP+G Y
Sbjct: 584 GPRGEQGLPGVAGPKGDKGDLGPKGEAGSTGPRGPVGPKGETGAQGPMGPAGPAGPKGYT 643
Query: 185 GPSGRLRYLG 194
GP G G
Sbjct: 644 GPKGETSPAG 653
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 69/178 (38%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G+ G G GP G GP G GP +GP G
Sbjct: 467 GPTGPQGPQGIAGAQGPKGDKGDPGQAGPKGEKGDTGPRGETGPAGP------VGPRGET 520
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G GP G G G GP+G +GP+G GP+
Sbjct: 521 GPAGPVGPRGEAGPAGATGPQGPKGDNGSPGARGEKGEPGPAG---PVGPAGPRGPAGPA 577
Query: 134 GRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G LGP G GP G + G +G +GP+G
Sbjct: 578 GAKGEPGPRGEQGLPGVAGPKGDKGDLGPKGEAGSTGPRGPVGPKGETGAQGPMGPAG 635
>gi|229032384|ref|ZP_04188355.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1271]
gi|228728947|gb|EEL79952.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
AH1271]
Length = 924
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/195 (29%), Positives = 71/195 (36%), Gaps = 21/195 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G GP G + G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 370
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------SG 116
P G GP G GP+G GP G GP G GP +G
Sbjct: 371 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGIQGVTG 430
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G +G G G GP G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 431 ATGAQGTTGIQGVQGIQGATGPEGPQGVQGTQGEIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G
Sbjct: 491 VQGPQGIQGIQGPTG 505
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/171 (29%), Positives = 58/171 (33%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ GP G +GP G G G G G GP G GP G +
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGP 368
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G GP+G GP G GP G +GP G G G
Sbjct: 369 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGIQGV 428
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G GP G G G + GP G G+
Sbjct: 429 TGATGAQGTTGIQGVQGIQGATGPEGPQGVQGTQGEIGPTGPMGAQGVQGI 479
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/137 (31%), Positives = 49/137 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G G
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQ 339
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GP G GP G + GP G GP G GP+G +GP
Sbjct: 340 GIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQ 399
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G GP G GP
Sbjct: 400 GIQGIQGPVGATGPEGP 416
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/148 (31%), Positives = 52/148 (35%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP G
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
G G G G GP G GP G + GP G GP G G
Sbjct: 329 VTGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPG 388
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
P+G GP G GP G GP
Sbjct: 389 PAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGP 416
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/148 (31%), Positives = 51/148 (34%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G G G G GP G GP G + GP G GP G G
Sbjct: 329 VTGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPG 388
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
P+G GP G GP G GP
Sbjct: 389 PAGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGP 416
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/146 (31%), Positives = 52/146 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP G
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQGVT 330
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G G G GP G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G GP G GP G GP
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGP 416
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/143 (30%), Positives = 49/143 (34%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP G
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGVTGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G G G G GP G GP G + GP G GP G G
Sbjct: 329 VTGATGDQGPQGIQGVPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPG 388
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G GP G GP G
Sbjct: 389 PAGATGPEGPQGIQGIQGPVGAT 411
>gi|443722194|gb|ELU11157.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_74934, partial [Capitella teleta]
Length = 191
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 72/166 (43%), Gaps = 9/166 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+GR G GS Y G G+ GP G GP+G+ G SG +G GR
Sbjct: 32 GPAGRDGATGRMGSTGYTGRPGAT---GPRGATGIAGPTGAKGDQGASGPQGRVGEGGRT 88
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + G +G G +G +GP G +GP+G GP+G S G
Sbjct: 89 GDKGQKGEIGRDGDTGPRGPQGLAGVTGAMGPQG---IVGPAGERGPRGPTGPRGSTGAE 145
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G G+ GP G LG +G Y GP G +GP+G
Sbjct: 146 GEKGEVGSQGQRGATGPEGVKGDLGSTG---YTGPQGEKGDIGPAG 188
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 73/178 (41%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+ GPSG PSG G +GR+ G +G GP G GP+G G SG
Sbjct: 24 FTGPSG------PSGPAGRDGATGRMGSTGYTGRPGATGPRGATGIAGPTGAKGDQGASG 77
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+G GR G G + G +G G +G +GP G + GP+G G
Sbjct: 78 PQGRVGEGGRTGDKGQKGEIGRDGDTGPRGPQGLAGVTGAMGPQGIV---GPAGERGPRG 134
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
P+G G G +G G+ GP G LG +G Y GP G +G + G
Sbjct: 135 PTGPRGSTGAEGEKGEVGSQGQRGATGPEGVKGDLGSTG---YTGPQGEKGDIGPAGG 189
>gi|423567751|ref|ZP_17543998.1| hypothetical protein II7_00974, partial [Bacillus cereus MSX-A12]
gi|401212801|gb|EJR19543.1| hypothetical protein II7_00974, partial [Bacillus cereus MSX-A12]
Length = 558
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/188 (28%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 6/188 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
GP+G GP GS GP G G G GP+G G G +
Sbjct: 69 GPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPT 128
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L + G G
Sbjct: 129 GPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVT 188
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G + GP+G G G + G +G GP G + GP+G G+
Sbjct: 189 GIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQ 248
Query: 197 DGLRVSGL 204
+ +GL
Sbjct: 249 GVIGPTGL 256
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.047, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 54/145 (37%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/199 (27%), Positives = 74/199 (37%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G G G GP+G GP G GP G G G GP
Sbjct: 50 IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGERGPQEIQGVQGIQGERGP 109
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G G G +GP+G G G +GP+G +
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP 186
G G LG SG G G +GP+G G G +GP+G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 229
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G + G + + G+
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQ 248
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.066, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/153 (29%), Positives = 56/153 (36%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + G +G GP G G +
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGAT 506
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/140 (30%), Positives = 52/140 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 359 TGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQAGPQGI 418
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G GP G G SG GP G GP
Sbjct: 419 QGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQGIQGP 478
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 479 QGNIGPTGSTGIQGVQGPEG 498
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 59/149 (39%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 229
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G + GP+G G G +GP+G
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQG---VIGPTG 255
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G + GP+G
Sbjct: 110 TGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGN 169
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G L G G G G + GP+G G G + G +G GP
Sbjct: 170 TGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGEQGPMGPTGATGVQGLQGP 229
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G + GP+G G G +GP+G
Sbjct: 230 QGEMGLTGPTGSQGIQGVQG---VIGPTG 255
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 9/196 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP +GP+G G G GP+G GP G GP G
Sbjct: 38 TGPQGIQGVQGP------IGPTGPTGIQGVQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGE 91
Query: 73 ---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G GP+G G G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 92 RGPQEIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGI 151
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G +GP+G G G LG SG G G +GP+G G G
Sbjct: 152 QGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGDLGNSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGE 211
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G + V GL
Sbjct: 212 QGPMGPTGATGVQGLQ 227
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/139 (30%), Positives = 53/139 (38%), Gaps = 1/139 (0%)
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G +
Sbjct: 354 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGVTGPTGLQGLQGIQGPVGATGPTGPQGVQGAQGPIGQA 413
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G G G GP+G G G GP G G SG GP G
Sbjct: 414 GPQGIQGIQGEQGVRGATGPTGLQGLQGIQGIQGPTGPQGIQGVQGLSGITGPTGPQGIQ 473
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLSDGLR 200
GP G + G S G++
Sbjct: 474 GIQGPQGNIGPTG-STGIQ 491
>gi|423614876|ref|ZP_17590710.1| hypothetical protein IIO_00202 [Bacillus cereus VD115]
gi|401262095|gb|EJR68240.1| hypothetical protein IIO_00202 [Bacillus cereus VD115]
Length = 906
Score = 46.6 bits (109), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 70/198 (35%), Gaps = 27/198 (13%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 313 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTG 369
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-------------- 114
P G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 370 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGIQGVTG 429
Query: 115 ----SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G + + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 430 ATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTG 486
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G
Sbjct: 487 AQGVQGPQGIQGIQGPTG 504
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/203 (28%), Positives = 68/203 (33%), Gaps = 24/203 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 279 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQ 338
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 339 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 395
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G GP G GP G G G + GP G
Sbjct: 396 GPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGIQGVTGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQ 455
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G + GP G G+
Sbjct: 456 GVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 478
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/171 (32%), Positives = 65/171 (38%), Gaps = 9/171 (5%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G G G
Sbjct: 248 TGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGI 307
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+G+ GP G +GP +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 308 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGD 364
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 365 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGP 415
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.082, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 63/167 (37%), Gaps = 11/167 (6%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
GP+GS G G L+ + GP G GP G GP+G G G G
Sbjct: 248 TGPTGSTGETGAQG-LQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQG 306
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+G GP G +GP +G GP G GPSG + GP G GP G
Sbjct: 307 ITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMG 363
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+ GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 364 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGAT 410
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/165 (29%), Positives = 60/165 (36%), Gaps = 5/165 (3%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQ---GP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G G +G G G +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 QGLRGSQGETGATGLQGVQGLQGPIGPTGPTGAQGIQGVQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGRL 181
G G G G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 155 QGIPGVTGPQGIQGAQGIQGPQGPSGSTGPTGATGQGLTGPTGST 199
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 56/154 (36%), Gaps = 3/154 (1%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G G +G G G +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 95 QGLRGSQGETGATGLQGVQGLQGPIGPTGPTGAQGIQGVQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G GP G GP+G
Sbjct: 155 QGIPGVTGPQGIQGAQGIQGPQGPSGSTGPTGAT 188
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/162 (30%), Positives = 59/162 (36%), Gaps = 5/162 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G GP G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQ---QGPQGL 97
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G +GP+G G G GP G GP G G
Sbjct: 98 RGSQGETGATGLQGVQGLQGPIGPTGPTGAQGIQGVQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGI 157
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGRL 172
G G G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 158 PGVTGPQGIQGAQGIQGPQGPSGSTGPTGATGQGLTGPTGST 199
>gi|229198891|ref|ZP_04325582.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus m1293]
gi|228584594|gb|EEK42721.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus m1293]
Length = 1246
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 18/160 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G GP+G+ GP G GP G + GP+G GP G
Sbjct: 952 EIGPTGPQGIQGPQG---IQGPTGATGAQGPQG---IQGPQGDI---GPTGPQGIQGPQG 1002
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G+ GP G GP G + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 1003 PQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGATGETG 1056
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+G GP G GP G G +G GP+G
Sbjct: 1057 ATGPQGIQGPQG---IQGPQGIQGPTGATGSTGSQGPTGD 1093
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/174 (28%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 683 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 742
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 743 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 802
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +
Sbjct: 803 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGAT 853
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/171 (30%), Positives = 68/171 (39%), Gaps = 18/171 (10%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G+ G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 913 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQG---IQG 969
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
P+G+ GP G GP G +GP+G GP G G +G + GP G
Sbjct: 970 PTGATGAQGPQG---IQGPQGD---IGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG--- 1020
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP G GP+G G +G GP G
Sbjct: 1021 IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGATGETGATGPQGIQGPQG 1068
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 61/177 (34%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 683 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 742
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 743 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 802
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +G
Sbjct: 803 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGATGAT 856
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 63/160 (39%), Gaps = 18/160 (11%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G GP+G+ GP G GP G + GP+G GP G
Sbjct: 952 EIGPTGPQGIQGPQG---IQGPTGATGAQGPQG---IQGPQGDI---GPTGPQGIQGPQG 1002
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G GP G GP G + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 1003 PQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGATGETG 1056
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP G GP G G +G GP+G
Sbjct: 1057 ATGPQGIQGPQG---IQGPQGIQGPTGATGSTGSQGPTGD 1093
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 61/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 612 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 671
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 672 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 731
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 732 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 791
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 792 PEGPQGVQGI 801
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/185 (29%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 15/185 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G GP
Sbjct: 914 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQG---IQGP 970
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP G GP G + GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 971 TGATGAQGPQG---IQGPQGDI---GPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQGI--- 1021
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G + GP G GP G G +G GP G G G GP+G
Sbjct: 1022 QGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQGIQGPTGATGETGATGPQGIQGPQGIQGPQGIQGPTGA 1081
Query: 190 LRYLG 194
G
Sbjct: 1082 TGSTG 1086
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.092, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 65/187 (34%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G G G + GP G GP G
Sbjct: 330 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGAMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 386
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 387 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGE 446
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 447 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 506
Query: 190 LRYLGLS 196
+G +
Sbjct: 507 TGDMGAT 513
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 62/178 (34%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQ 339
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G G G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 340 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGAMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 396
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 397 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 454
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.096, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 63/182 (34%), Gaps = 7/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 691 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 750
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 751 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 810
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ + G G G +G GP G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 811 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGATGATGE-GSTGPTGVTGP 869
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 870 TG 871
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.097, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 16/180 (8%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPRGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVEGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G GP GPSG G +G GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGE-GITGPTGITGPTGI 201
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/193 (27%), Positives = 65/193 (33%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG+ GP G G G
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGAMGD 365
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 366 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 425
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 426 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 479
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 480 QGIQGATGAQGVQ 492
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/174 (29%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 649 IGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGE 705
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 706 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 765
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 766 QGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGI 819
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 65/186 (34%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 351 TGPQGVQGIQGAMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 411 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 467
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 468 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 527
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 528 GPTGVT 533
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 61/176 (34%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP GS G +G
Sbjct: 612 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 671
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 672 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 728
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G GP G G G GP G G G G + G+
Sbjct: 729 PVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 784
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 7/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G+ GP G G G+ GP G G G
Sbjct: 709 TGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 768
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 769 TGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGA 825
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 826 TGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGATGATGE-GSTGPTGVTGPTG---VTGPSG 877
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 7/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G+ GP G G G+ GP G G G
Sbjct: 369 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 428
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 429 TGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGA 485
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G +G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 486 TGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGE-GATGPTGVTGPTG---VTGPSG 537
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/161 (29%), Positives = 61/161 (37%), Gaps = 18/161 (11%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 913 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQG---IQG 969
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P+G GP G GP G + GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 970 PTGATGAQGPQG---IQGPQGDI---GPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG--- 1020
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G + GP G GP G GP+G G +
Sbjct: 1021 IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG---IQGPTGATGETGAT 1058
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---S 88
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVT 330
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G GP G GPSG GP G G G + GP G GP G
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGAMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 387
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G G G GP G G G G+ + G+
Sbjct: 388 GPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 62/189 (32%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 577 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 636
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 637 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGP 696
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 697 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 756
Query: 187 SGRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 757 QGIQGIQGV 765
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/203 (27%), Positives = 72/203 (35%), Gaps = 38/203 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY--LGPS 70
+GP+G + G G G +G+ GP G GP+G+ G +G GP+
Sbjct: 805 IGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGATGATGEGSTGPT 864
Query: 71 GR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR----------------------YLGP 105
G GPSG GP+G GPSG G
Sbjct: 865 GVTGPTGVTGPSG-----GPAGPTGPTGPSGPAGVTGPSGGPPGPTGATGATGVTGDTGA 919
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G G G +GP+G GP G GP+G
Sbjct: 920 TGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQG---IQGPTGATGA 976
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G + GP G
Sbjct: 977 QGPQG---IQGPQGDIGPTGPQG 996
>gi|170031171|ref|XP_001843460.1| collagen alpha chain [Culex quinquefasciatus]
gi|167869236|gb|EDS32619.1| collagen alpha chain [Culex quinquefasciatus]
Length = 1839
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/193 (29%), Positives = 72/193 (37%), Gaps = 15/193 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GPSG +GP G GP G + GP G +G SG G G Y GP+G
Sbjct: 799 DMGPSGERGAIGPQGITGIEGPEGPKGFEGPRGEPGAMGLSGEKGKQGVQGFTGYPGPTG 858
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------PSGRLRYLGPSGRLR 119
G G G G G G +G G + G +G+
Sbjct: 859 DKGDKGSVGISGLTGDKGERGNTGLQGERGEVGPRGFRGPRGRRGADGTPGFKGDTGQPG 918
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP G + GP G ++G P G GP G GP G GP+G +G
Sbjct: 919 APGPQGEIGLQGPEGPRGFIGLPGPQGNNGKDGPQGTPGERGPPGENGNPGPTGAPGVIG 978
Query: 177 PSGRLRYLGPSGR 189
P G+ GP G
Sbjct: 979 PQGQTGEPGPVGE 991
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/155 (29%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 6/155 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G +GPSG +GP G GP G + GP G +G SG G G
Sbjct: 792 GHDGEKGDMGPSGERGAIGPQGITGIEGPEGPKGFEGPRGEPGAMGLSGEKGKQGVQGFT 851
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
Y GP+G G +G SG G G G G + G G G
Sbjct: 852 GYPGPTGD------KGDKGSVGISGLTGDKGERGNTGLQGERGEVGPRGFRGPRGRRGAD 905
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + G +G+ GP G + GP G ++GL
Sbjct: 906 GTPGFKGDTGQPGAPGPQGEIGLQGPEGPRGFIGL 940
>gi|76787944|ref|YP_329350.1| collagen-like surface protein [Streptococcus agalactiae A909]
gi|76563001|gb|ABA45585.1| collagen-like surface protein, putative [Streptococcus agalactiae
A909]
Length = 1774
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/169 (29%), Positives = 71/169 (42%), Gaps = 12/169 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP+G+ G G + GP G GP+G+ G G + GP G GP+G
Sbjct: 547 ETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAG 606
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G +G+ +GP+G GP+G G G + GP G G G + G
Sbjct: 607 KD---GEAGAQGPVGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGEAGPAGERGETGAQG 663
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P +GP+G GP+G G G + GP G GP+G+
Sbjct: 664 P------MGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPAGK 703
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.031, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 66/167 (39%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP+G G G + GP G GP+G+ G G + GP G
Sbjct: 540 GPKGDRGETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDR 599
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G+ G G + GP G GP+G G G + GP+G GP+
Sbjct: 600 GETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGE---AGPAGERGETGAQGPM---GPAGPKGEAGPA 653
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G + GP G GP+G G G + GP G
Sbjct: 654 GERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGE 697
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.054, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 7/167 (4%)
Query: 26 GSLRYLG-PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G+ +LG P G PS R+ +G S GP G GP+G+ G G
Sbjct: 503 GNQTFLGLPIGKPEIKEPSPRIVKVGISQENMSQFPRGPKGDRGETGPAGKDGEAGAQGP 562
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP+G+ G G + GP G GP+G+ DG +G +GP
Sbjct: 563 VGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGK---DGEAGAQGPVGP 619
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G G + GP G G G GP G
Sbjct: 620 AGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMG 666
>gi|340378960|ref|XP_003387995.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Amphimedon
queenslandica]
Length = 1092
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 18/184 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + G GS G G+ G +G G GS GP+G + GPSG +
Sbjct: 238 GDQGPIGEAGHPGSTGPQGAPGAPGKQGAAGNDGTPGLPGSAGAPGPNGDRGHPGPSGPI 297
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GPSG GP+ G +GP+G GP GP+G GP G +
Sbjct: 298 GEPGPSGDKGSDGPTGAPGDQGDVGPTGSAGATGPD------GPAGAPGDAGPQGEVGDK 351
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G Y G G G +G+ GP G GP G G G + GP+G L
Sbjct: 352 G------YPGSQGEPGTPGEAGKAGPQGPQGNAGDPGPRGEAGEPGAPG---HTGPAGDL 402
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 403 GEAG 406
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 70/173 (40%), Gaps = 18/173 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+G +G GP G+ G G+ G G GP+G + GPSG + GP
Sbjct: 243 IGEAGHPGSTGPQGAPGAPGKQGAAGNDGTPGLPGSAGAPGPNGDRGHPGPSGPIGEPGP 302
Query: 70 SGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGP 123
SG GP+G+ +GP+G GP GP+G GP G + Y G
Sbjct: 303 SGDKGSDGPTGAPGDQGDVGPTGSAGATGPD------GPAGAPGDAGPQGEVGDKGYPGS 356
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G + G +G+ GP G GP G G G + GP+G L G
Sbjct: 357 QGEPGTPGEAGKAGPQGPQGNAGDPGPRGEAGEPGAPG---HTGPAGDLGEAG 406
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.74, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/144 (30%), Positives = 57/144 (39%), Gaps = 12/144 (8%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G +G +G +G GP G+ G G G G GP+G + GPS
Sbjct: 235 GANGDQGPIGEAGHPGSTGPQGAPGAPGKQGAAGNDGTPGLPGSAGAPGPNGDRGHPGPS 294
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRL---RYL 166
G + GPSG SDGP+ G +GP+G GP G GP G + Y
Sbjct: 295 GPIGEPGPSGDKGSDGPTGAPGDQGDVGPTGSAGATGPDGPAGAPGDAGPQGEVGDKGYP 354
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G +G+ GP G
Sbjct: 355 GSQGEPGTPGEAGKAGPQGPQGNA 378
>gi|229013934|ref|ZP_04171060.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus mycoides DSM
2048]
gi|228747354|gb|EEL97231.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus mycoides DSM
2048]
Length = 922
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GPSGS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPSGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 19/183 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G GP G GP+G + GP G+ GP G
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEKGPTGPQGVHGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGPQG- 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP
Sbjct: 94 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGP 145
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G GP GPSG G +G+ GP+G
Sbjct: 146 QGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GISGPTGITGP 198
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 199 TGI 201
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/165 (31%), Positives = 64/165 (38%), Gaps = 15/165 (9%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
+ GP+G GP G + GP G GP G GP+G++ GP G GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEKGPTGPQGVHGIQGPAGQMGATGPEG---QQGP 91
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G LR GP G GP G GP +GP+G + G G GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGP 142
Query: 148 LGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G +G G G GPSG G +G+
Sbjct: 143 EGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGAQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ 187
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 469 GPMGPQGVQGI 479
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 68/186 (36%), Gaps = 12/186 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------RYLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G G G + GP G G G +GP+G + G G GP+G
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQG 490
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 491 VQGPQG 496
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/123 (32%), Positives = 49/123 (39%), Gaps = 6/123 (4%)
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP+G GP G + GP G GP G GP+G++ GP G+ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEKGPTGPQGVHGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGP 91
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G LR GP G GP G GP G G G G G + GP G
Sbjct: 92 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 193 LGL 195
G+
Sbjct: 149 QGV 151
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 60/172 (34%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG------------PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N GPSG G P G GP G GP+G G G G
Sbjct: 248 NTGPSGSTGETGAQGLQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQG 307
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+G GP G +GP +G+ GP G GP+G G G GP G
Sbjct: 308 ITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMG 364
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 365 DIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
>gi|195977337|ref|YP_002122581.1| hypothetical protein Sez_0190 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
gi|195974042|gb|ACG61568.1| collagen-like protein Sclz.4 [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus MGCS10565]
Length = 462
Score = 46.2 bits (108), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 63/177 (35%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G+ G G G G + GP G+ GP G GP G GP G +
Sbjct: 162 GPAGKDGEAGKPGERGPAGERGPVGPQGPEGKPGQQGPKGDT---GPQGEPGQQGPKGDI 218
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 219 GPQGPKGDT---GPQGEPGLPGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEPGQPGPK 269
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 270 GD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGDT 317
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/173 (33%), Positives = 61/173 (35%), Gaps = 21/173 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP G G G GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 177 GPAGERGPVGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQGPKGDIGPQGPKGD---TGPQGEP 233
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 234 GLPGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPK 284
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 285 GD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGP 328
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/188 (32%), Positives = 65/188 (34%), Gaps = 30/188 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ GP G GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 189 GPEGKPGQQGPKGD---TGPQGEPGQQGPKGDIGPQGPKGD---TGPQGEPGLPGPKGD- 241
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 242 --TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGDT---GPQ 290
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------RYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 291 GAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKSDTGPQGAPGQQGPK 344
Query: 188 GRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 345 GDTGPQGV 352
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 15/178 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G GP G+ G G G +G+ GP+G +GP G G G
Sbjct: 140 VGPAGPRGERGPQGAQGLRGERGPAGKDGEAGKPGERGPAGERGPVGPQGPEGKPGQQGP 199
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 200 KGDTGPQGEPGQQGPKGDIGPQGPKGD---TGPQGEPGLPGPKGD---TGPQGAPGQQGP 253
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 254 KGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT 302
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/185 (32%), Positives = 63/185 (34%), Gaps = 27/185 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 202 DTGPQGEPGQQGPKGDIGPQGPKGDT---GPQGEPGLPGPKGDT---GPQGAPGQQGPKG 255
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 256 DT---GPQGEPGQPGPKGDT---GPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT---G 303
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G GP G GP GP G GP G GP G
Sbjct: 304 PQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPK---SDTGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGVPG 354
Query: 192 YLGLS 196
G S
Sbjct: 355 QQGES 359
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPS---GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + GP G +GP+G GP G G G G +G+ GP+
Sbjct: 120 GPQGPMGPTGPQGLKGEQGPVGPAGPRGERGPQGAQGLRGERGPAGKDGEAGKPGERGPA 179
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +GP G G G GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 180 GERGPVGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQGPKGDIGPQGPKGD---TGPQGEPGLP 236
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 237 GPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGDT 287
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/167 (31%), Positives = 60/167 (35%), Gaps = 12/167 (7%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPS---GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
SL GP G + GP G +GP+G GP G G G G +G
Sbjct: 115 SLGIPGPQGPMGPTGPQGLKGEQGPVGPAGPRGERGPQGAQGLRGERGPAGKDGEAGKPG 174
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G +GP G G G GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 175 ERGPAGERGPVGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQGPKGDIGPQGPKGD---TGPQG 231
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 232 EPGLPGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGDT 272
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 57/164 (34%), Gaps = 24/164 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GP G GP G+ GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 226 DTGPQGEPGLPGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEPGQPGPKGDT---GPQG 276
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 277 EQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQG 327
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
P GP G GP G GP G G S ++ +
Sbjct: 328 PK---SDTGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGVPGQQGESQKVPEV 365
>gi|423355213|ref|ZP_17332838.1| hypothetical protein IAU_03287 [Bacillus cereus IS075]
gi|401084330|gb|EJP92577.1| hypothetical protein IAU_03287 [Bacillus cereus IS075]
Length = 1270
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 66/187 (35%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 333 TGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGV 389
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G+ GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 390 PGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGE 449
Query: 136 LRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 450 IGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGA 509
Query: 190 LRYLGLS 196
+G +
Sbjct: 510 TGDMGAT 516
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.012, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/197 (29%), Positives = 70/197 (35%), Gaps = 6/197 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 245 NTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQG 304
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G+ GP G +G +G GP G GPSG GP G
Sbjct: 305 VQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGAQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQG 361
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 362 IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQG 421
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ +G+
Sbjct: 422 IQGIQGVQGITGATGIQ 438
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/186 (28%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 354 TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 413
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 414 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 470
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 471 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 530
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 531 GPTGVT 536
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 61/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 615 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 675 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 734
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 735 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 794
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 795 PEGPQGVQGI 804
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.031, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/180 (29%), Positives = 66/180 (36%), Gaps = 16/180 (8%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 97
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 98 RGPQGETGATGPGGVQGLQGP------IGPTGATGAQGVQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G GP GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.045, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/171 (32%), Positives = 64/171 (37%), Gaps = 9/171 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +GS GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 239 NTGATGNTGITGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G G +G GP G +G +G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGAQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.059, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/191 (28%), Positives = 68/191 (35%), Gaps = 9/191 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
V + GP G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 332 VTGATGDQGPQGIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 388
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G G G GP G G G G G G G
Sbjct: 389 VPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQG 448
Query: 126 RLNS---DGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ + +GP G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 449 EIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTG 508
Query: 180 RLRYLGPSGRL 190
+G +G
Sbjct: 509 ATGDMGATGAT 519
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.090, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/197 (27%), Positives = 62/197 (31%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---------------L 58
GP G G +G G G +GP+G GP GS
Sbjct: 626 GPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQ 685
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G G GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G + GP G G+
Sbjct: 806 GAIGPTGPMGAQGVQGI 822
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 62/178 (34%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +G +G GP
Sbjct: 283 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGAQGVTGATGDQGPQ 342
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 343 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 399
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 400 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEG 457
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/180 (28%), Positives = 61/180 (33%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + G +G+ GP G GPSG+ GP G GP G + GP G
Sbjct: 325 GVIGAQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQ 381
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G G G GP G G G G G
Sbjct: 382 GPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGAT 441
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G + GP G G G + GP +GP G G+ G+
Sbjct: 442 GIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQ 495
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 59/174 (33%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +G +G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 312 TGATGDQGPQGIQGVIGAQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGD 368
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 369 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 428
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G G + GP G G G + GP G G+
Sbjct: 429 QGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGV 482
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/205 (28%), Positives = 69/205 (33%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V G +G GP G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 59/164 (35%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
G +G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 236 ATGNTGATGNTGITGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTG 295
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
G G G +G GP G +G +G GP G GPSG
Sbjct: 296 VTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGAQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG--- 352
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 353 ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 396
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 51/134 (38%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
G +GS G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGA 979
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G G G +GP+G GP G G +G + GP G GP G +
Sbjct: 980 TGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGP 1036
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSG 161
GP G GP G
Sbjct: 1037 TGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 63/184 (34%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +G +G+ GP G GPS
Sbjct: 292 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGAQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPS 351
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 352 G---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQ 408
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI 468
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 469 GPTG 472
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 53/157 (33%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGAT 850
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/134 (29%), Positives = 50/134 (37%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
G +GS G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGA 979
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 980 TGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGP 1036
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G
Sbjct: 1037 TGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/189 (26%), Positives = 62/189 (32%), Gaps = 15/189 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 580 TGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGD 639
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLGPSGR 126
G G +GP+G GP G GP G + GP G
Sbjct: 640 QGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGP 699
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 700 TGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGP 759
Query: 187 SGRLRYLGL 195
G G+
Sbjct: 760 QGIQGIQGV 768
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/135 (28%), Positives = 50/135 (37%), Gaps = 6/135 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G G +G G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 919 DTGATGSTGVTGATGETGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTG 978
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 979 ATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIG 1035
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSG 143
GP G GP G
Sbjct: 1036 PTGPQGPQGIQGPQG 1050
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/190 (28%), Positives = 65/190 (34%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +G G
Sbjct: 274 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGAQGV- 332
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G+ GP G GPSG GP G GP G + GP G GP
Sbjct: 333 -----TGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQ 384
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP G G G GP G G G G G
Sbjct: 385 GIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGIQGATGIQ 444
Query: 194 GLSDGLRVSG 203
G+ + +G
Sbjct: 445 GIQGEIGATG 454
>gi|354469200|ref|XP_003497018.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Cricetulus griseus]
Length = 1444
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 536 NVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHPGLAG 595
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 596 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGERGLPG 655
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GPSG + GPSG G G +G G G
Sbjct: 656 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGNAGASG 715
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 716 PGG 718
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 63/160 (39%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
GS +GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G G +G +
Sbjct: 532 GSPGNVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHP 591
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---- 150
G +G GP G GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 592 GLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGER 651
Query: 151 --SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GPSG + GPSG
Sbjct: 652 GLPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSG 691
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.96, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/204 (29%), Positives = 78/204 (38%), Gaps = 21/204 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G GR +GP GS +GPSG+ +
Sbjct: 487 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGGRGPNGDPGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPV 546
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 547 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHPGLAGARGAPGPDGNN 606
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 607 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPR 666
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GPSG + G S
Sbjct: 667 GERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPS 690
>gi|315306735|gb|ADU04112.1| collagen-like protein [Pasteuria ramosa]
Length = 412
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 67/145 (46%), Gaps = 14/145 (9%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL-----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
GP+G +GPS GP+G Y+ GP+G +G +G LGP G+ G
Sbjct: 106 GPTGPTGPIGPS--TGATGPTGPTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPHGATGPTG 163
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
P+G + GP+G + G +G GP+G P G + G G + +GP+G
Sbjct: 164 PAGAI-ITGPTGIIGATGNTGVTGATGPTG------PIGTTTAKGAMGAMGNIGPTGNTG 216
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G + +G +G G +G
Sbjct: 217 ATGPTGTMGIIGITGDTGLTGNTGA 241
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 66/145 (45%), Gaps = 14/145 (9%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-----GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
GP+G +GPS GP+G Y+ GP+G +G +G LGP G G
Sbjct: 106 GPTGPTGPIGPS--TGATGPTGPTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPHGATGPTG 163
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P+G + GP+G + G +G + GP+ GP G G G + +GP+G
Sbjct: 164 PAGAI-ITGPTGIIGATGNTGVTGATGPT------GPIGTTTAKGAMGAMGNIGPTGNTG 216
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP+G + +G +G G +G
Sbjct: 217 ATGPTGTMGIIGITGDTGLTGNTGA 241
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/143 (30%), Positives = 66/143 (46%), Gaps = 10/143 (6%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPS-GSLRYLGPSGRLRY--LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 97
GP+G +GPS G+ GP+G + GP+G +G +G LGP G GP+
Sbjct: 106 GPTGPTGPIGPSTGATGPTGPTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPHGATGPTGPA 165
Query: 98 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 157
G + GP+G + G +G GP+G P G G G + +GP+G
Sbjct: 166 GAI-ITGPTGIIGATGNTGVTGATGPTG------PIGTTTAKGAMGAMGNIGPTGNTGAT 218
Query: 158 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G + +G +G G +G
Sbjct: 219 GPTGTMGIIGITGDTGLTGNTGA 241
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 66/145 (45%), Gaps = 14/145 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYL-----GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G +GPS GP+G Y+ GP+G +G +G LGP G G
Sbjct: 106 GPTGPTGPIGPSTGAT--GPTGPTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPHGATGPTG 163
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G + GP+G + G +G GP+G P G G G + +GP+G
Sbjct: 164 PAGAI-ITGPTGIIGATGNTGVTGATGPTG------PIGTTTAKGAMGAMGNIGPTGNTG 216
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+ GP+G + +G +G G +G
Sbjct: 217 ATGPTGTMGIIGITGDTGLTGNTGA 241
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/132 (31%), Positives = 64/132 (48%), Gaps = 10/132 (7%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPS-GSLRYLGPSGRLRY--LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G +GPS G+ GP+G + GP+G +G +G LGP G GP+
Sbjct: 106 GPTGPTGPIGPSTGATGPTGPTGYVIQGATGPTGPTGLMGDAGLDGPLGPHGATGPTGPA 165
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G + + GP+G + G +G GP+G P G G G + +GP+G
Sbjct: 166 GAIIT-GPTGIIGATGNTGVTGATGPTG------PIGTTTAKGAMGAMGNIGPTGNTGAT 218
Query: 185 GPSGRLRYLGLS 196
GP+G + +G++
Sbjct: 219 GPTGTMGIIGIT 230
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/96 (30%), Positives = 45/96 (46%), Gaps = 7/96 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
LGP G GP+G++ GP+G + G +G GP+ GP G G G
Sbjct: 153 LGPHGATGPTGPAGAI-ITGPTGIIGATGNTGVTGATGPT------GPIGTTTAKGAMGA 205
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+ +GP+G+ GP+G + +G +G G +G
Sbjct: 206 MGNIGPTGNTGATGPTGTMGIIGITGDTGLTGNTGA 241
>gi|339755389|gb|AEJ95396.1| gp4 [Mycobacterium phage Microwolf]
Length = 404
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/161 (29%), Positives = 56/161 (34%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+ G +G GP+G G +GS GP G GP G GP G G G
Sbjct: 145 FTGDTGPQGEQGPTGPQGPKGDTGSQGPQGPKGDTGPAGPEGPTGPQGPKGDQGIQGIQG 204
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G G +G GP G + GP G GP G GP G G
Sbjct: 205 PQGPSGPKGDKGDKGDTGNPGPTGPQGDIGPAGPQGDPGPQGPKGDTGATGPQGPKGDTG 264
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+G G G G +G GP G G +G
Sbjct: 265 ATGAQGPKGDKGDKGDTGNTGPQGLQGPKGDKGDTGATGAT 305
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/158 (28%), Positives = 54/158 (34%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+ G +G GP+G G +G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 145 FTGDTGPQGEQGPTGPQGPKGDTGSQGPQGPKGDTGPAGPEGPTGPQGPKGDQGIQGIQG 204
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP G G +G GP G + GP G GP G GP G G
Sbjct: 205 PQGPSGPKGDKGDKGDTGNPGPTGPQGDIGPAGPQGDPGPQGPKGDTGATGPQGPKGDTG 264
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G G G +G GP G G +
Sbjct: 265 ATGAQGPKGDKGDKGDTGNTGPQGLQGPKGDKGDTGAT 302
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/149 (29%), Positives = 54/149 (36%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+ G +G GP+G GP G GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 145 FTGDTGPQGEQGPTGPQ---GPKGDTGSQGPQGPKGDTGPAGPEGPTGPQGPKGDQGIQG 201
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GPSG G G GP+G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 202 IQGPQGPSGPKGDKGDKGDTGNPGPTGPQGDIGPAGPQGDPGPQGPKGDTGATGPQGPKG 261
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G GP G G + GL
Sbjct: 262 DTGATGAQGPKGDKGDKGDTGNTGPQGLQ 290
>gi|118479619|ref|YP_896770.1| exosporium protein [Bacillus thuringiensis str. Al Hakam]
gi|118418844|gb|ABK87263.1| conserved hypothetical protein [Bacillus thuringiensis str. Al
Hakam]
Length = 433
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 54/112 (48%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPT 226
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GNPGPTGATGDPGATGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 278
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 53/112 (47%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPT 226
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GNPGPTGATGDPGATGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 278
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 53/112 (47%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPT 226
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GNPGPTGATGDPGATGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 278
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 53/112 (47%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPT 226
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GNPGPTGATGDPGATGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 278
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/114 (33%), Positives = 53/114 (46%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPT 226
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GNPGPTGATGDPGATGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTGPT 280
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/114 (33%), Positives = 52/114 (45%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPT 226
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GNPGPTGATGDPGATGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTGPT 280
>gi|225867777|ref|YP_002743725.1| cell surface-anchored protein SclH [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus]
gi|225701053|emb|CAW97852.1| putative cell surface-anchored protein SclH [Streptococcus equi
subsp. zooepidemicus]
Length = 423
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 62/177 (35%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G+ G G G G + GP G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 162 GPAGKDGEAGKPGERGPAGERGPVGPQGPEGKPGEPGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAP 218
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 219 GQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPK 269
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 270 GD---TGPQGEPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEPGQQGPKGDT 317
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/171 (32%), Positives = 60/171 (35%), Gaps = 24/171 (14%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP G GP G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 189 GPEGKPGEPGPQGEQGLQGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEPGQPGPKGDT 242
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 243 ---GPQGEQGLQGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEPGQQGPKGD---TGPQ 290
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP G GP G GP G G S ++ +
Sbjct: 291 GEPGQPGPKGD---TGPQGEPGQQGPKGD---TGPQGEPGQQGESQKVPEV 335
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/171 (32%), Positives = 60/171 (35%), Gaps = 24/171 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 189 GPEGKPGEPGPQGEQGLQGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEPGQPGPKGDT 242
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 243 ---GPQGEQGLQGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEPGQQGPKGDT---GPQ 290
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G GP G GP G GP G GP G G S ++ +
Sbjct: 291 GEPGQPGPKGD---TGPQGEPGQQGPKGD---TGPQGEPGQQGESQKVPEV 335
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.056, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/183 (33%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 30/183 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP G P G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 177 GPAGERGPVGPQG------PEGKPGEPGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD- 226
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 227 --TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT---GPQ 275
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 276 GEPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEPGQQGPKGD---TGPQGEPGQQ 326
Query: 194 GLS 196
G S
Sbjct: 327 GES 329
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 21/181 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGRLRYLGP 69
+GP+G GP G+ G G G +G+ GP+G + GP G+ GP
Sbjct: 140 VGPAGPRGERGPQGAQGLRGERGPAGKDGEAGKPGERGPAGERGPVGPQGPEGKPGEPGP 199
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 200 QGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGL 250
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 251 QGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD 301
Query: 190 L 190
Sbjct: 302 T 302
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/177 (31%), Positives = 65/177 (36%), Gaps = 24/177 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G GP +GP+G GP G+ G G G +G+
Sbjct: 120 GPQGPMGPTGPQGLKGEQGP------VGPAGPRGERGPQGAQGLRGERGPAGKDGEAGKP 173
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G +GP G P G+ GP G GP G GP G GP
Sbjct: 174 GERGPAGERGPVGPQG------PEGKPGEPGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPK 224
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 225 GD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT 272
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 60/164 (36%), Gaps = 21/164 (12%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
SL GP G + GP G GP +GP+G GP G G G G
Sbjct: 115 SLGIPGPQGPMGPTGPQGLKGEQGP------VGPAGPRGERGPQGAQGLRGERGPAGKDG 168
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
+G+ GP+G +GP G P G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 169 EAGKPGERGPAGERGPVGPQG------PEGKPGEPGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPG 219
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 220 QQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGDT 257
>gi|217962010|ref|YP_002340580.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus AH187]
gi|375286524|ref|YP_005106963.1| collagen triple helix repeat domain-containing protein [Bacillus
cereus NC7401]
gi|217064941|gb|ACJ79191.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH187]
gi|358355051|dbj|BAL20223.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
NC7401]
Length = 426
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/127 (26%), Positives = 49/127 (38%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G G +G G +G G +G GP+G G +G +
Sbjct: 165 TGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGITGATGPTGA 224
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G +G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 225 TGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTGATGITGATGVTGATGPTGATGSTGSTGP 284
Query: 190 LRYLGLS 196
G S
Sbjct: 285 TGITGTS 291
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/248 (21%), Positives = 77/248 (31%), Gaps = 69/248 (27%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------------- 59
LGP+G GP+G+ +G +G GP+G G +G G
Sbjct: 36 LGPTGPTGATGPTGATGPMGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGITGATGA 95
Query: 60 -----------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS--------------- 81
P+G G +G GP+G
Sbjct: 96 TGATGITGATGATGATGITGATGPTGVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGITGATGA 155
Query: 82 ------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--- 126
GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 156 TGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPTGATGI 215
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G GP
Sbjct: 216 TGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGA---TGPTGATGSTGPTGATGITGATGVTGATGP 272
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G G
Sbjct: 273 TGATGSTG 280
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/234 (21%), Positives = 76/234 (32%), Gaps = 54/234 (23%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG-------- 68
G + LGP+G GP+G+ +G +G GP+G+ G +G G
Sbjct: 31 GTVPKLGPTGPTGATGPTGATGPMGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGSTGATGIT 90
Query: 69 ----------------------------PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL--------- 91
P+G G +GS GP+G
Sbjct: 91 GATGATGATGITGATGATGATGITGATGPTGVTGVTGATGSTGATGPTGVTGSTGATGIT 150
Query: 92 ---------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G GP+G G +G G +G + G +G GP+
Sbjct: 151 GATGATGATGPTGVTGITGATGPTGVTGVTGATGATGPTGVTGITGATGATGSTGATGPT 210
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G G +G G +G GP+G GP+G G +
Sbjct: 211 GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTGATGITGAT 264
>gi|229174031|ref|ZP_04301567.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus MM3]
gi|228609363|gb|EEK66649.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus MM3]
Length = 837
Score = 45.8 bits (107), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/136 (29%), Positives = 55/136 (40%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G + GP+G G G + GP+G+ G G L G G G G +
Sbjct: 143 GEIGLTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPIGPT 202
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G GP G + S G +G GP G + GP+G G G + G +G
Sbjct: 203 GPTGSQGIQGPQGPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQ 262
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G
Sbjct: 263 GDPGPTGSTGQAGVTG 278
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/184 (29%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G+ GP + GP G G G GP+G G G
Sbjct: 69 EIGPTGPTGLTGPQGAQGSQGP---MGEQGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPG 125
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G G G + GP+G G G + GP+G G G L S G
Sbjct: 126 PMGGTGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSG 185
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G G + GP+G GP G + G +G GP G + GP+G
Sbjct: 186 LQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGPQGPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQG 245
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 246 IQGV 249
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/135 (28%), Positives = 53/135 (39%)
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + GP+G G G + GP+G G G L G G G G +
Sbjct: 143 GEIGLTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPIGPT 202
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G GP G + G +G GP G + GP+G G G + G +G
Sbjct: 203 GPTGSQGIQGPQGPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQ 262
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G G++
Sbjct: 263 GDPGPTGSTGQAGVT 277
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 57/145 (39%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G+ G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGATGPTGLQGLQGVQGPIGVTGPTGQQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G G G + GP+G G G + GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGISGITGPTGPQGIQ 475
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + G +G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 500
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/145 (30%), Positives = 57/145 (39%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G+ G G +
Sbjct: 356 GPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGATGPTGLQGLQGVQGPIGVTGPTGQQGVQGAQGPIGQA 415
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G G G + GP+G G G + GP G G SG GP G
Sbjct: 416 GPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGISGITGPTGPQGIQ 475
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G + G +G GP G
Sbjct: 476 GIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEG 500
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/122 (31%), Positives = 47/122 (38%), Gaps = 3/122 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G+ GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 538 IGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGA 594
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G G +G GP G GP G G +G S G
Sbjct: 595 TGVTGPQGIQGIQGPQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQGVTGATGATGSTGSTGA 654
Query: 133 SG 134
+G
Sbjct: 655 TG 656
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 18/180 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
++GP+G G G GP+G+ GP G G G + G
Sbjct: 483 DIGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTG 542
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G +G GP+G+ GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 543 PTGPQGIQGITGST---GPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGATG 596
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G G +G GP G GP G G +G G +G
Sbjct: 597 VTGPQGIQGIQGPQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQGVTGATGATGSTGSTGATG 656
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/201 (27%), Positives = 73/201 (36%), Gaps = 24/201 (11%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP G G SG GP G GP G + G +G GP G
Sbjct: 446 GPIGQTGPQGIQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGPT--- 502
Query: 77 GPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP+G+ GP G G G + GP+G G +G GP+
Sbjct: 503 GPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGST---GPT 559
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G + GP+G GP G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 560 GATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGATGVTGPQGIQGIQGPQG---IT 613
Query: 185 GPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP+G G++ + G+
Sbjct: 614 GPTGATGVTGITGPQGIQGIQ 634
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 66/186 (35%), Gaps = 18/186 (9%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP+G+ G G GP+G GP G G G + GP
Sbjct: 484 IGPTGATGIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGP 543
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G +GS GP+G GP+G GP G GP G G +G
Sbjct: 544 TGPQGIQGITGST---GPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTGPTGATGATGV 597
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G G +G GP G GP G G +G G +G
Sbjct: 598 TGPQGIQGIQGPQGITGPTGATGVTGITGPQGIQGIQGPQGVTGATGATGSTGSTGATGP 657
Query: 190 LRYLGL 195
G+
Sbjct: 658 TGIQGI 663
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/140 (28%), Positives = 56/140 (40%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G G G + GP+G G G+L G G G G +
Sbjct: 143 GEIGLTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPIGPT 202
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G GP G + G +G GP G + GP+G G G + G +G
Sbjct: 203 GPTGSQGIQGPQGPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQ 262
Query: 164 RYLGPSG---RLRYLGPSGR 180
GP+G + GP+G
Sbjct: 263 GDPGPTGSTGQAGVTGPTGS 282
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/204 (27%), Positives = 67/204 (32%), Gaps = 33/204 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G G G + GP+G G G + GP G G SG GP G
Sbjct: 414 QAGPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGISGITGPTGPQG 473
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-------------------- 111
GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 474 IQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQG 530
Query: 112 -------LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
+GP+G G G S GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 531 LQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGVTG 587
Query: 165 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP G GP G
Sbjct: 588 PTGATGATGVTGPQGIQGIQGPQG 611
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/202 (25%), Positives = 73/202 (36%), Gaps = 21/202 (10%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP+G G G +GP+G GP G+ GP G GP G G G
Sbjct: 52 IGPTGPTGIQGVQGVQGEIGPTGPTGLTGPQGAQGSQGPMGEQ---GPQGIQGVQGIQGE 108
Query: 82 LRYLGPSG-----------------RLRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP+G ++ + G G + GP+G G G + GP
Sbjct: 109 RGPTGPTGIQGIQGIPGPMGGTGPTGIQGIQGVQGEIGLTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGP 168
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G G G L G G G G + GP+G GP G + G +G
Sbjct: 169 TGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGPQGPMGSTGATGVQGL 228
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G + G + + G+
Sbjct: 229 QGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQ 250
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/146 (29%), Positives = 60/146 (41%), Gaps = 15/146 (10%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G G G + GP+G G G+L G G G G +
Sbjct: 143 GEIGLTGPTGIQGIQGVQGEIGPTGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPIGPT 202
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------YLGPSGR--LN 128
GP+GS GP G + G +G GP G + GP+G +GP+G L
Sbjct: 203 GPTGSQGIQGPQGPMGSTGATGVQGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQ 262
Query: 129 SD-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
D GP+G +G+ GP+G
Sbjct: 263 GDPGPTGS------TGQAGVTGPTGS 282
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/156 (29%), Positives = 62/156 (39%), Gaps = 3/156 (1%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G +G G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 343 TGATGLTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGATGPTGLQGLQGVQGPIGVTGPTGQ 402
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G + GP G G G + + GP+G G G + GP G G
Sbjct: 403 QGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGI 462
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
SG GP G GP G +GP+G G+
Sbjct: 463 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGD---IGPTGATGIQGV 495
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/140 (30%), Positives = 54/140 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP+G G G + GP+G G G + GP G
Sbjct: 361 TGPTGDQGIQGPQGVMGATGPTGLQGLQGVQGPIGVTGPTGQQGVQGAQGPIGQAGPQGI 420
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + GP+G G G + GP G G SG GP G GP
Sbjct: 421 QGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGP 480
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G +G GP G
Sbjct: 481 QGDIGPTGATGIQGVQGPEG 500
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/197 (26%), Positives = 64/197 (32%), Gaps = 33/197 (16%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP G G G + GP+G G G + GP G G SG GP
Sbjct: 412 IGQAGPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGISGITGPTGP 471
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------------ 120
G GP G + G +G GP G GP+G
Sbjct: 472 QGIQGIQGPQGDIGPTGATGIQGVQGPEGP---TGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGI 528
Query: 121 ---------LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+GP+G G G GP+G GP+G GP G GP G
Sbjct: 529 QGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGPTG---VTGPQGPQGIQGPQGV 585
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G GP G
Sbjct: 586 TGPTGATGATGVTGPQG 602
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/183 (28%), Positives = 69/183 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G G G + GP+G+ G G + GP G G G +
Sbjct: 371 GPQGVMGATGPTGLQGLQGVQGPIGVTGPTGQQGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVM 430
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G G G + GP G G SG GP G GP G + G +
Sbjct: 431 GATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGISGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGAT 490
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G G G GP G G G + GP+G
Sbjct: 491 GIQGVQGPEGPTGPTGATGPQGIQGIQGIQGPTGPQGIQGLQGIQGPIGPTGPTGPQGIQ 550
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 551 GIT 553
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/148 (27%), Positives = 55/148 (37%), Gaps = 9/148 (6%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G +G G G + GP+G GP G + GP+G G G + GP+G+
Sbjct: 343 TGATGLTGLQGVQGPMGATGPTGDQGIQGPQGVMGATGPTGLQGLQGVQGPIGVTGPTGQ 402
Query: 118 ---------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G G G + GP+G G G + GP G G
Sbjct: 403 QGVQGAQGPIGQAGPQGIQGIQGEQGVMGATGPTGLQGLQGIQGPIGQTGPQGIQGVQGI 462
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
SG GP G GP G + G +
Sbjct: 463 SGITGPTGPQGIQGIQGPQGDIGPTGAT 490
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/117 (29%), Positives = 47/117 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G+L G G G G + GP+GS GP G + G +G
Sbjct: 166 TGPTGNTGIQGVQGNLGSSGLQGVTGIQGIQGPIGPTGPTGSQGIQGPQGPMGSTGATGV 225
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP G + GP+G G G + G +G GP+G G +G S
Sbjct: 226 QGLQGPQGEMGLTGPTGSQGIQGVQGVIGPTGATGLQGDPGPTGSTGQAGVTGPTGS 282
>gi|443700218|gb|ELT99290.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_208647 [Capitella teleta]
Length = 653
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 63/208 (30%), Positives = 74/208 (35%), Gaps = 45/208 (21%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G + GP GPSG GP+G GPSG G +G G +G +
Sbjct: 359 GPNGEIGEQGP------TGPSGPSGPTGPTGEQGLTGPSGPKGNRGQTGESGDRGDTGDV 412
Query: 74 RYLGPS------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GPS G GP+G GPSG G GR SG+ G G
Sbjct: 413 GPTGPSGQPGRDGEPGPSGPTGETGSQGPSGPAGETGDKGRKGQ---SGQPGESGQQGTP 469
Query: 128 NSDGPSGR---------------------------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
+DG SG +GPSG GP G GPS
Sbjct: 470 GADGQSGAKGIKGEQGPSGPTGPSGPSGPSGPSGSKGEIGPSGETGSPGPGGERGVQGPS 529
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GPSG GP G GP+G
Sbjct: 530 G---PTGPSGPRGASGPKGTTGEAGPTG 554
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 63/166 (37%), Gaps = 24/166 (14%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS----- 70
+G G G GP+G GPSG G GS GPSG+ GP+
Sbjct: 73 TGESGDQGDQGEPGPAGPTGQTGNTGPSGDKGSKGEKGSS---GPSGQPGPSGPAGPSGP 129
Query: 71 -------------GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G GPSG GPSG G +G+ GPSG GPSG
Sbjct: 130 TGPSGPSGPSGQRGDDGQPGPSGPAGQPGPSGPRGQTGATGQTGQTGPSGPSGPTGPSG- 188
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G S G SG GPSG G G + GPSG
Sbjct: 189 --PSGPTGNKGSKGSSGPRGQTGPSGTTGPSGQPGEVGSPGPSGNT 232
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/229 (29%), Positives = 81/229 (35%), Gaps = 48/229 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGSLRYLGPS------------------GRLRY 48
GP+G+ GPSG G PSG GP+ G
Sbjct: 88 AGPTGQTGNTGPSGDKGSKGEKGSSGPSGQPGPSGPAGPSGPTGPSGPSGPSGQRGDDGQ 147
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GPSG GPSG G +G+ GPSG GPSG GP+G G SG
Sbjct: 148 PGPSGPAGQPGPSGPRGQTGATGQTGQTGPSGPSGPTGPSG---PSGPTGNKGSKGSSGP 204
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGR 153
GPSG G G + S GPSG GPSG+ G G
Sbjct: 205 RGQTGPSGTTGPSGQPGEVGSPGPSGNTGPTGPTGPTGPTGSRGEPGPSGQSGDSGDRGD 264
Query: 154 LRYLGPSGRLRYL------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G+ + GP+G GPSG GP+G G +
Sbjct: 265 AGTPGSDGQRGDIGNPGQQGPTGEPGRPGPSGPTGSRGPTGERGDQGDA 313
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/162 (31%), Positives = 59/162 (36%), Gaps = 27/162 (16%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPS-------- 79
+G G G GP+G GPS G GPSG+ GP+
Sbjct: 73 TGESGDQGDQGEPGPAGPTGQTGNTGPSGDKGSKGEKGSSGPSGQPGPSGPAGPSGPTGP 132
Query: 80 ----------GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GPSG GPSG G +G+ GPSG GPSG
Sbjct: 133 SGPSGPSGQRGDDGQPGPSGPAGQPGPSGPRGQTGATGQTGQTGPSGPSGPTGPSGPS-- 190
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G G SG GPSG G G + GPSG
Sbjct: 191 -GPTGNKGSKGSSGPRGQTGPSGTTGPSGQPGEVGSPGPSGN 231
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/161 (31%), Positives = 61/161 (37%), Gaps = 27/161 (16%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS----- 106
+G G G GP+G+ GPSG G GPSG+ GP+
Sbjct: 73 TGESGDQGDQGEPGPAGPTGQTGNTGPSGDKGSK---GEKGSSGPSGQPGPSGPAGPSGP 129
Query: 107 -------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G GPSG GPSG G +G+ GPSG GPSG
Sbjct: 130 TGPSGPSGPSGQRGDDGQPGPSGPAGQPGPSGPRGQTGATGQTGQTGPSGPSGPTGPSG- 188
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G SG GPSG GPSG+ +G
Sbjct: 189 --PSGPTGNKGSKGSSGPRGQTGPSG---TTGPSGQPGEVG 224
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/127 (35%), Positives = 52/127 (40%), Gaps = 15/127 (11%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
GS G GS GP+G + GP GPSG GP+G GPSG
Sbjct: 344 GSKGIKGEQGSQGPSGPNGEIGEQGP------TGPSGPSGPTGPTGEQGLTGPSGPKGNR 397
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G +G + GPSG R GPSG P+G S GPSG G
Sbjct: 398 GQTGESGDRGDTGDVGPTGPSGQPGRDGEPGPSG------PTGETGSQGPSGPAGETGDK 451
Query: 143 GRLRYLG 149
GR G
Sbjct: 452 GRKGQSG 458
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/191 (30%), Positives = 67/191 (35%), Gaps = 36/191 (18%)
Query: 28 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL-- 85
GPSGS GPSG GPSG GP G+ G G+ G G
Sbjct: 4 FNISGPSGSDGRPGPSG---DTGPSGPTGPQGPKGQTGESGQKGQSGDRGDPGPSGPTGP 60
Query: 86 ----------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G G G GP+G+ GPSG G S GPSG+
Sbjct: 61 SGPSGSPGSRGQTGESGDQGDQGEPGPAGPTGQTGNTGPSGDKGSK---GEKGSSGPSGQ 117
Query: 136 LRYLGPS------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP+ G GPSG GPSG G +G+ GP
Sbjct: 118 PGPSGPAGPSGPTGPSGPSGPSGQRGDDGQPGPSGPAGQPGPSGPRGQTGATGQTGQTGP 177
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
SG GPSG
Sbjct: 178 SGPSGPTGPSG 188
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/219 (29%), Positives = 74/219 (33%), Gaps = 45/219 (20%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR--------------- 63
GPSGS GPSG GP+G G +G G SG
Sbjct: 4 FNISGPSGSDGRPGPSGDTGPSGPTGPQGPKGQTGESGQKGQSGDRGDPGPSGPTGPSGP 63
Query: 64 ---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G G G GP+G+ GPSG GPSG+ GP
Sbjct: 64 SGSPGSRGQTGESGDQGDQGEPGPAGPTGQTGNTGPSGDKGSKGEKGSSGPSGQPGPSGP 123
Query: 115 S------------------GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+ G GPSG GPSG G +G+ GPSG
Sbjct: 124 AGPSGPTGPSGPSGPSGQRGDDGQPGPSGPAGQPGPSGPRGQTGATGQTGQTGPSGPSGP 183
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP+G G SG GPSG G
Sbjct: 184 TGPSG---PSGPTGNKGSKGSSGPRGQTGPSGTTGPSGQ 219
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/146 (32%), Positives = 58/146 (39%), Gaps = 21/146 (14%)
Query: 53 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
GS GP+G + GP GPSG GP+G GPSG G +G
Sbjct: 353 GSQGPSGPNGEIGEQGP------TGPSGPSGPTGPTGEQGLTGPSGPKGNRGQTGESGDR 406
Query: 113 GPSGRLRYLGPSG---RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G + GPSG R GPS GP+G GPSG G GR
Sbjct: 407 GDTGDVGPTGPSGQPGRDGEPGPS------GPTGETGSQGPSGPAGETGDKGRK------ 454
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G+ G SG+ G G+ G+
Sbjct: 455 GQSGQPGESGQQGTPGADGQSGAKGI 480
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 61/159 (38%), Gaps = 21/159 (13%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A GPSG G +G GPSG GPSG GP+G+ G SG GP
Sbjct: 154 AGQPGPSGPRGQTGATGQTGQTGPSGPSGPTGPSG---PSGPTGNKGSKGSSGPRGQTGP 210
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
SG G G + GPSG GPSG+ G G G
Sbjct: 211 SGTTGPSGQPGEVGSPGPSGNTGPTGPTGPTGPTGSRGEPGPSGQSGDSGDRGDAGTPGS 270
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G+ +G G+ GP+G GPSG GP+G
Sbjct: 271 DGQRGDIGNPGQQ---GPTGEPGRPGPSGPTGSRGPTGE 306
>gi|423412914|ref|ZP_17390034.1| hypothetical protein IE1_02218 [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|423431301|ref|ZP_17408305.1| hypothetical protein IE7_03117 [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401102474|gb|EJQ10460.1| hypothetical protein IE1_02218 [Bacillus cereus BAG3O-2]
gi|401118326|gb|EJQ26158.1| hypothetical protein IE7_03117 [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 835
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 63/182 (34%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G + GP G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 69 GTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +G G G G + G SG GP G G G G
Sbjct: 129 GIQGAQGIQGEIGERGETGVQGMQGEIGVTGISGVTGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEE 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G + G G GP G GP G G +G + GP G
Sbjct: 189 GPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGSTGIQGPQGISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQ 248
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 249 GV 250
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.025, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/184 (28%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP+G+ GP G GP +G GP G G +G + GP
Sbjct: 39 GPVGPPGITGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGPQ 98
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G + G G GP+G G G +G G G G +
Sbjct: 99 GLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGVQGMQGEIGVT 158
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G SG GP G G G G G G +G + G G GP G
Sbjct: 159 GISGVTGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGST 218
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 219 GIQG 222
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/185 (28%), Positives = 66/185 (35%), Gaps = 5/185 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGP 69
GP+G GP+G + GP G GP+G GP G GP +G GP
Sbjct: 22 TGPTGNSGPTGPTGG--HEGPVGPPGITGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGP 79
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +G + GP G + GP G + G G GP+G G G
Sbjct: 80 VGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGE 139
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G G + G SG GP G G G G G G +G
Sbjct: 140 IGERGETGVQGMQGEIGVTGISGVTGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGE 199
Query: 190 LRYLG 194
+ G
Sbjct: 200 QGHQG 204
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP G GP G+ +G +G GP G GP G +
Sbjct: 47 TGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVG---LQGPQGLIGE 103
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G + G G GP+G G G +G G G G + G SG
Sbjct: 104 QGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGVQGMQGEIGVTGISGV 163
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP G G G G G G +G + G G GP G GP
Sbjct: 164 TGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGSTGIQGP 223
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 224 QG 225
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.047, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/173 (28%), Positives = 60/173 (34%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + GP G + GP G + G G GP+GS G G +G G
Sbjct: 89 TGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGV 148
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G + G SG GP G G G G G G +G G G
Sbjct: 149 QGMQGEIGVTGISGVTGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGI 208
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G G +G + GP G G G + GP G
Sbjct: 209 QGVTGPPGSTGIQGPQGISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQGVRGSTGFQGPKG 261
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/183 (27%), Positives = 61/183 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G + G G GP+G G G +G G G G +
Sbjct: 96 GPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGVQGMQGEI 155
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G SG GP G G G G G G +G + G G GP
Sbjct: 156 GVTGISGVTGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPP 215
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G + GP G G G + GP G G +G
Sbjct: 216 GSTGIQGPQGISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQGVRGSTGFQGPKGIRGITGATGSTGTQ 275
Query: 194 GLS 196
G
Sbjct: 276 GAE 278
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 60/175 (34%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + G G GP+GS G G +G G G G + G SG
Sbjct: 105 GPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGVQGMQGEIGVTGISGVT 164
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G G G G G +G + G G GP G GP
Sbjct: 165 GPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGSTGIQGPQ 224
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G + GP G G G + GP G G +G G G
Sbjct: 225 GISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQGVRGSTGFQGPKGIRGITGATGSTGTQGAEG 279
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/193 (27%), Positives = 74/193 (38%), Gaps = 3/193 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G G + GP G + GP+G+ G G GP+G+ G G + G +G
Sbjct: 377 TGVEGPIGIQGPQGEI---GPTGAEGPRGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGA 433
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 434 AGAQGPQGIRGETGDAGPQGAQGIQGVQGITGAAGVQGIQGPQGIQGENGLTGPQGAQGI 493
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G GP G L
Sbjct: 494 QGVQGITGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGIQGIQGIIGPTGAQGIRGPQGNLGE 553
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G++ V G
Sbjct: 554 NGITGSQGVQGAQ 566
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/145 (28%), Positives = 56/145 (38%), Gaps = 5/145 (3%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRY 111
+ GP+G GP+G + GP G GP+G GP G GP +G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPTGPTGG--HEGPVGPPGITGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGI 76
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP G G +G + GP G + GP G + G G GP+G G G
Sbjct: 77 QGPVGDTGEQGITGPVGLQGPQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGI 136
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G G G + G+S
Sbjct: 137 QGEIGERGETGVQGMQGEIGVTGIS 161
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 66/182 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS +G +G G G G +G +G G +GP+G
Sbjct: 338 TGPTGAQGARGAQGSQGVIGVAGVQGAQGIQGAQGITGATGVEGPIGIQGPQGEIGPTGA 397
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G + G +G GP G G +G + G
Sbjct: 398 EGPRGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGDAGPQGAQGI 457
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP G G +G G G GP+G + GP G
Sbjct: 458 QGVQGITGAAGVQGIQGPQGIQGENGLTGPQGAQGIQGVQGITGPTGAIGLQGPQGIQGI 517
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 518 VG 519
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/177 (28%), Positives = 67/177 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G G G GP+G+ G G + G +G+ GP G G +G
Sbjct: 391 EIGPTGAEGPRGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGDAG 450
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G +G GP G G +G G G GP+G + G
Sbjct: 451 PQGAQGIQGVQGITGAAGVQGIQGPQGIQGENGLTGPQGAQGIQGVQGITGPTGAIGLQG 510
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G +GP+G G G +GP+G GP G L G +G G G
Sbjct: 511 PQGIQGIVGPTGAQGSQGIQGIQGIIGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQG 567
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/169 (28%), Positives = 64/169 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G + G +G+ GP G G +G G G G +G
Sbjct: 410 TGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGDAGPQGAQGIQGVQGITGAAGV 469
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G GP+G + GP G +GP+G S G
Sbjct: 470 QGIQGPQGIQGENGLTGPQGAQGIQGVQGITGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGI 529
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G GP G L G +G G G GP G +
Sbjct: 530 QGIQGIIGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGIEGPEGPQGNV 578
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/196 (26%), Positives = 72/196 (36%), Gaps = 21/196 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + GP G +GP+G+ G G +GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 500 TGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGIQGIQGIIGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGS 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G G GP G + G G G G +GP
Sbjct: 560 QGVQGAQGIEGPEGPQGNVGITGVTGATGATGATGATGAQGIQGVQGIQGIQGSTGMIGP 619
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G G G G +G +GP+G GP + +GP+G
Sbjct: 620 TGATGVTGIQGVQGIQGIQGPTGARGITGVNGSVGPAGVQGSQGP---IGAVGPTGATGS 676
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G L +G +G
Sbjct: 677 QGPIGFLGIVGATGAT 692
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/167 (26%), Positives = 63/167 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G G G+ G +G +G G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 356 IGVAGVQGAQGIQGAQGITGATGVEGPIGIQGPQGEIGPTGAEGPRGVQGIQGVTGPTGA 415
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + G +G GP G G +G G G G +G GP
Sbjct: 416 QGIQGLQGIIGPTGTTGAAGAQGPQGIRGETGDAGPQGAQGIQGVQGITGAAGVQGIQGP 475
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G G G GP+G + GP G +GP+G
Sbjct: 476 QGIQGENGLTGPQGAQGIQGVQGITGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTG 522
>gi|402556499|ref|YP_006597770.1| hypothetical protein BCK_18370 [Bacillus cereus FRI-35]
gi|401797709|gb|AFQ11568.1| hypothetical protein BCK_18370 [Bacillus cereus FRI-35]
Length = 835
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/164 (26%), Positives = 62/164 (37%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G+
Sbjct: 446 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G +GP+G G G GP+G G G L +G +G G
Sbjct: 506 IGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGSQGNLGENGITGSQGVQGA 565
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G G G + G +G +G +G G G +G
Sbjct: 566 QGSQGPQGLQGNVGITGEAGETGAMGATGATGLQGIQGVQGIIG 609
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/157 (26%), Positives = 59/157 (37%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 446 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ GP G +GP+G S G G GP+G G G L G +G G
Sbjct: 506 IGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGSQGNLGENGITGSQGVQGA 565
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G +G +G + + G+
Sbjct: 566 QGSQGPQGLQGNVGITGEAGETGAMGATGATGLQGIQ 602
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.034, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/204 (26%), Positives = 77/204 (37%), Gaps = 24/204 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + GP G +GP+G+ G G GP+G+ G G L G +G
Sbjct: 500 IGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGSQGNLGENGITGS 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G GS G G + G +G +G +G G G +G G G
Sbjct: 560 QGVQGAQGSQGPQGLQGNVGITGEAGETGAMGATGATGLQGIQGVQGIIGLQGITGPTGN 619
Query: 133 SGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G +G +G GP G GPSG +GP+G
Sbjct: 620 TGATGPQGIQGIQGIQGLQGQAGVIGMTGVSGSTGPVGAQGSQGPSG---VVGPTG---A 673
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDG 198
G +G + +LG +G GL G
Sbjct: 674 TGSAGSIGFLGIAGATGATGLPSG 697
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/206 (25%), Positives = 77/206 (37%), Gaps = 27/206 (13%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP+G++ GP G +GP+G+ G G GP+G G G+L
Sbjct: 492 GPQGVQGIIGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGSQGNL 551
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G G G + G +G +G +G G G +G
Sbjct: 552 GENGITGSQGVQGAQGSQGPQGLQGNVGITGEAGETGAMGATGATGLQGIQGVQGIIGLQ 611
Query: 143 GRLRYLGPSGRL---------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP+G +G +G GP G GPSG +
Sbjct: 612 G---ITGPTGNTGATGPQGIQGIQGIQGLQGQAGVIGMTGVSGSTGPVGAQGSQGPSGVV 668
Query: 182 ---RYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G +G + +LG++ +GL
Sbjct: 669 GPTGATGSAGSIGFLGIAGATGATGL 694
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.058, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/165 (27%), Positives = 61/165 (36%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G+ G G G +G G G G +G GP G +GP+G
Sbjct: 446 TGPAGAQGIQGAQGIRGETGAAGVQGIQGVQGIQGITGLTGPQGAQGPQGVQGIIGPTGA 505
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+ GP G +GP+G G G GP+G G G L G +G G
Sbjct: 506 IGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGMQGIQGITGPTGAQGIRGSQGNLGENGITGSQGVQGA 565
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G + G +G +G +G G G +GL
Sbjct: 566 QGSQGPQGLQGNVGITGEAGETGAMGATGATGLQGIQGVQGIIGL 610
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/190 (26%), Positives = 68/190 (35%), Gaps = 9/190 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSL------RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP G GP G+ +G +G GP+G G G +
Sbjct: 47 TGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGN 103
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G G + GP G GP+G GP G +G G+ G G + G +G
Sbjct: 104 QGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGVQGMQGVIGEAGITGV 163
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G G G G G G +G + G G +GP+G GP
Sbjct: 164 TGPQGAQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPKGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGP 223
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G++
Sbjct: 224 QGISGIKGIT 233
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 63/180 (35%), Gaps = 3/180 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G + GP G GP+GS GP G +G G G G + G +G
Sbjct: 103 NQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGVQGMQGVIGEAGITG 162
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G+ G G G G G +G + G G +GP+G G
Sbjct: 163 VTGPQGAQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPKGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQG 222
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G G +G GP G G G + G G GP+G GP G
Sbjct: 223 PQGISGIKGITGVTGPQGPQGIQGTQGVRGSTGFQGAKGVRGITGATGPTGTQGAEGPPG 282
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/151 (27%), Positives = 62/151 (41%), Gaps = 8/151 (5%)
Query: 46 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+ GP+G+ +GP+G + GP G GP+G+ GP G GP G G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRG---TTGA 73
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G +G +G GP+G + G G + G + GP G GP+G
Sbjct: 74 QGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLI---GDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGI 130
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G +G G+ G G + G++
Sbjct: 131 QGPQGIQGEIGERGQTGVQGMQGVIGEAGIT 161
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/187 (26%), Positives = 64/187 (34%), Gaps = 21/187 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRYLGPSGSLRYLGPSG----- 62
GP G GP+G+ GP G GP G +G +G GP+G
Sbjct: 39 GPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTGLQGAQ 98
Query: 63 ----------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
+ GP G GP+GS GP G +G G+ G G +
Sbjct: 99 GLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGIQGEIGERGQTGVQGMQGVIGEA 158
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G +G G G G G G G G +G + G G +GP+G
Sbjct: 159 GITGVTGPQGAQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPKGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGST 218
Query: 173 RYLGPSG 179
GP G
Sbjct: 219 GPQGPQG 225
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.70, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/184 (26%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G +G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G
Sbjct: 70 TTGAQGIQGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTG 126
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G +G G+ G G + G +G G G G G G
Sbjct: 127 SQGIQGPQGIQGEIGERGQTGVQGMQGVIGEAGITGVTGPQGAQGAQGIQGEDGTTGIQG 186
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G +G + G G +GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 187 EEGPKGIQGITGEQGHQGDQGIQGVVGPTGSTGPQGPQGISGIKGITGVTGPQGPQGIQG 246
Query: 192 YLGL 195
G+
Sbjct: 247 TQGV 250
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/188 (27%), Positives = 67/188 (35%), Gaps = 11/188 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP------SGRLRY 66
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 22 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGA 79
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G +G GP+G G G + G G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 80 IGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGPEGIQGITGPTGSQGIQGPQGI 136
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G+ G G + G +G G G G G G G G
Sbjct: 137 QGEIGERGQTGVQGMQGVIGEAGITGVTGPQGAQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPKGIQGI 196
Query: 187 SGRLRYLG 194
+G + G
Sbjct: 197 TGEQGHQG 204
>gi|390979787|gb|AFM30918.1| distal byssal thread collagen [synthetic construct]
Length = 1010
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/167 (31%), Positives = 66/167 (39%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G +GP G G G GP G GP+G +G G+ G +G
Sbjct: 517 GPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQ 576
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP G GP G + GP+G LGP G + GP G S+GP
Sbjct: 577 GARGEAGKAGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPV 633
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G + G G G G+ G G+ GP GR
Sbjct: 634 G---APGPKGSVGDQGAQGDQGATGADGKKGEPGERGQQGAAGPVGR 677
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 66/167 (39%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP G G G+ GP G GP+G +G G+ G +G
Sbjct: 517 GPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQ 576
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G+ GP G GP G + GP+G LGP G + GP G GP
Sbjct: 577 GARGEAGKAGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPV 633
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G + G G G G+ G G+ GP GR
Sbjct: 634 G---APGPKGSVGDQGAQGDQGATGADGKKGEPGERGQQGAAGPVGR 677
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G GP G GP+G +G G G +G G +G+
Sbjct: 525 VGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGK 584
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G + GP+G LGP G + GP G GP + + GP
Sbjct: 585 AGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGP---VGAPGP 638
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G + G G G G+ G G+ GP GR
Sbjct: 639 KGSVGDQGAQGDQGATGADGKKGEPGERGQQGAAGPVGR 677
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 13/188 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G GP G GP GP G +GP G G G+
Sbjct: 486 MGPQGPCGDRGAPGVPGKQGPVGGQGPAGP------RGPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGK 539
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G +G G+ G +G G +G+ GP G GP
Sbjct: 540 PGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGKAGEQGPGGIQ---GP 596
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP+G LGP G + GP G GP G GP G + G G
Sbjct: 597 KGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPVG---APGPKGSVGDQGAQGDQGA 653
Query: 193 LGLSDGLR 200
G +DG +
Sbjct: 654 TG-ADGKK 660
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/159 (30%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP G G G GP G GP GP G +GP G G G
Sbjct: 485 AMGPQGPCGDRGAPGVPGKQGPVGGQGPAGP------RGPRGDEGPVGPKGEPGAKGADG 538
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
+ GP G GP+G +G G+ G +G + G +G+ GP G G
Sbjct: 539 KPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGKAGEQGPGG---IQG 595
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G + GP+G LGP G + GP G GP G
Sbjct: 596 PKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPVG 634
>gi|110629868|gb|ABG80450.1| fibrillar collagen [Hydra vulgaris]
Length = 1883
Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.015, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/200 (29%), Positives = 78/200 (39%), Gaps = 21/200 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLG 68
+ G GR Y G G G G++ + GP G + +GP G + GP G + G
Sbjct: 676 DDGEDGRAGYAGEKGEQ---GDIGAIGFPGPEGVIGQVGPPGQVGIRGPDGTRGIIGETG 732
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G YLGP G + G SG G G +G +G GP+G + G +G+
Sbjct: 733 QDGNKGYLGPRGPQGFKGQSGATGAPGIKGETGDVGQTGE---QGPTGEPGFPGLNGQPG 789
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------RYLG 176
G G GP G +G G GP G L + G G L G
Sbjct: 790 EAGAEGATGLPGPVGLPGPIGMIGETGDSGPPGELGFKGIKGALGDRGQRGSPGTKGEFG 849
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP G++ GLS
Sbjct: 850 EPGDKGSIGPPGQIGKQGLS 869
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 70/172 (40%), Gaps = 6/172 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G G G G +G G G++ + GP G + +GP G++ GP G+
Sbjct: 665 TGPFGLTGLKGDDGEDGRAGYAGEKGEQGDIGAIGFPGPEGVIGQVGPPGQVGIRGPDGT 724
Query: 82 ---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+ G G YLGP G + G SG G G +G +G GP+G +
Sbjct: 725 RGIIGETGQDGNKGYLGPRGPQGFKGQSGATGAPGIKGETGDVGQTGEQ---GPTGEPGF 781
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G+ G G GP G +G G GP G L + G G L
Sbjct: 782 PGLNGQPGEAGAEGATGLPGPVGLPGPIGMIGETGDSGPPGELGFKGIKGAL 833
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 70/168 (41%), Gaps = 12/168 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G + GP G +G GR G G G +G G GR Y G G
Sbjct: 632 VGPEGPVGKAGPPGPTGDIGLRGRKGRTGAPGLTGPFGLTGLKGDDGEDGRAGYAGEKGE 691
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G + + GP G + +GP G++ GP G +G +G+ G YLGP
Sbjct: 692 Q---GDIGAIGFPGPEGVIGQVGPPGQVGIRGPDGTRGIIGETGQ------DGNKGYLGP 742
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G + G SG G G +G +G GP+G + G +G+
Sbjct: 743 RGPQGFKGQSGATGAPGIKGETGDVGQTGE---QGPTGEPGFPGLNGQ 787
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/160 (30%), Positives = 66/160 (41%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP G + GP G +G GR G G G +G G GR Y G G
Sbjct: 632 VGPEGPVGKAGPPGPTGDIGLRGRKGRTGAPGLTGPFGLTGLKGDDGEDGRAGYAGEKGE 691
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G G + + GP G + +GP G++ GP G + G G YLGP G +
Sbjct: 692 Q---GDIGAIGFPGPEGVIGQVGPPGQVGIRGPDGTRGIIGETGQDGNKGYLGPRGPQGF 748
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G SG G G +G +G GP+G + GL+
Sbjct: 749 KGQSGATGAPGIKGETGDVGQTGE---QGPTGEPGFPGLN 785
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/172 (30%), Positives = 69/172 (40%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + +GP G + GP G+ + G G YLGP G + G SG G
Sbjct: 702 GPEGVIGQVGPPGQVGIRGPDGTRGIIGETGQDGNKGYLGPRGPQGFKGQSGATGAPGIK 761
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G +G GP+G + G +G+ G G GP G +G G
Sbjct: 762 GETGDVGQTGE---QGPTGEPGFPGLNGQPGEAGAEGATGLPGPVGLPGPIGMIGETGDS 818
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G L + G G L G G G G +GP G++ G SG
Sbjct: 819 GPPGELGFKGIKGALGDRGQRGSPGTKGEFGEPGDKGSIGPPGQIGKQGLSG 870
>gi|229169461|ref|ZP_04297167.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH621]
gi|228614019|gb|EEK71138.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH621]
Length = 928
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ GP
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQ---GP 91
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G G +G G G +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 92 QGLRGTQGETGATGPQGVQGLQGSIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G GP GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGGPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GISGPTGITGPTGI 201
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGIQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP+G + GP G+ GP G
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGPQGL 94
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ G G +GP+G G G GP G GP G G
Sbjct: 95 RGTQGETGATGPQGVQGLQGSIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGG 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP GPSG G +G+ G SG GP+G
Sbjct: 155 PGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ----GISGPTGITGPTG 200
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGIQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GP 186
GP
Sbjct: 469 GP 470
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGIQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/151 (31%), Positives = 55/151 (36%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGIQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 385
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 386 VPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 56/157 (35%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGSLRYLGPSG 62
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G + GP G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGIQGIQGPMGDIGPTGPEG 373
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP+G+ GP G GP G GP G G G G
Sbjct: 374 PEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATG 433
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 434 AQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPTGP 470
>gi|389574131|ref|ZP_10164200.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus sp. M 2-6]
gi|388426320|gb|EIL84136.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus sp. M 2-6]
Length = 553
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/167 (28%), Positives = 66/167 (39%), Gaps = 9/167 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
L SG G +GS G +GS GP+G G +GS G +G G +G
Sbjct: 197 LAASGAPGSTGVTGSTGATGITGST---GPTGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGI 253
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G P+G G +G G +G G +G S GP
Sbjct: 254 TGSTGPTGATGITGSTG------PTGATGITGSTGATGATGITGATGSTGATGITGSTGP 307
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 308 TGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTG 354
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.027, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/135 (28%), Positives = 56/135 (41%), Gaps = 3/135 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLG 68
+ GP+G G +GS G +GS G +G GP+G+ GP+G G
Sbjct: 220 STGPTGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITG 279
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+G G +G+ G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 280 STGATGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGPTGATGITG 339
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSG 143
S GP+G G +G
Sbjct: 340 STGPTGATGITGSTG 354
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/123 (26%), Positives = 47/123 (38%), Gaps = 3/123 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G G +G GP+G G +G G +G G +G S GP+G
Sbjct: 204 GSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGAT 263
Query: 137 RYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G P+G G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 264 GITGSTGPTGATGITGSTGATGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGAT 323
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 324 GIT 326
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/145 (26%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 9/145 (6%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +G G +G GP+G G +GS G +G G +G GP+G
Sbjct: 204 GSTGVTGSTGATGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGAT 263
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G P+G G +G G +G G +G GP+G G +
Sbjct: 264 GITGSTG------PTGATGITGSTGATGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITGST 317
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G +G GP+G G
Sbjct: 318 GA---TGATGITGATGPTGATGITG 339
>gi|321470480|gb|EFX81456.1| hypothetical protein DAPPUDRAFT_188087 [Daphnia pulex]
Length = 400
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/166 (30%), Positives = 66/166 (39%), Gaps = 5/166 (3%)
Query: 20 RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
+ GP G +GP+G G G+ G G+ G G GP G G +
Sbjct: 211 KQAGPQG---PIGPTGVNGEAGLPGKDGLNGIPGAPGKNGKDGAPGSTGPKGDDGKSGEN 267
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GS +G G GP G GP G +G G + +GP G DG +G
Sbjct: 268 GSPGPIGEKGETGPQGPQGEPGIAGPQGFPGPIGEVGPVGPVGPEGETGPDGETGVTGAK 327
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G + +GPSG+ G G +GP G PSG +G
Sbjct: 328 GPVGPIGPIGPSGKQGETGAPGARGLIGPKGPTGS--PSGTYESVG 371
>gi|196042754|ref|ZP_03109993.1| BclA protein [Bacillus cereus 03BB108]
gi|196026238|gb|EDX64906.1| BclA protein [Bacillus cereus 03BB108]
Length = 275
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/107 (31%), Positives = 50/107 (46%), Gaps = 6/107 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ + GP+G GP+G GP+G+ G +G GP+G GP+G+
Sbjct: 39 GPTGATGFTGPTGPTGATGPTGAT---GPTGATGPTGATGPTGATGPTGAT---GPTGAT 92
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +G GP+G G +G GP+G GP+ NS
Sbjct: 93 GPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTVTTNS 139
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.074, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/114 (28%), Positives = 50/114 (43%), Gaps = 6/114 (5%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP+G + GP+G GP+G GP+G G +G + GP+G GP+G
Sbjct: 39 GPTGATGFTGPTGPTGATGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGA---TGPTGAT 92
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G +G GP+G G +G GP+G GP+ + S+ +
Sbjct: 93 GPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTVTTNSMFASNTI 146
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.088, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/108 (29%), Positives = 48/108 (44%), Gaps = 6/108 (5%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G + GP+G GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 39 GPTGATGFTGPTGPTGATGPTGA---TGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGAT 92
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G +G + GP+G G +G GP+G GP+ +
Sbjct: 93 GPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTVTTNSM 140
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/108 (29%), Positives = 48/108 (44%), Gaps = 6/108 (5%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G + GP+G GP+G GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 39 GPTGATGFTGPTGPTGATGPTGA---TGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGAT 92
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G +G GP+G G +G + GP+G GP+ +
Sbjct: 93 GPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTVTTNSM 140
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/108 (29%), Positives = 47/108 (43%), Gaps = 6/108 (5%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G + GP+G GP+G GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 39 GPTGATGFTGPTGPTGATGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPT 95
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+ +
Sbjct: 96 GATGPTGA---TGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGPTVTTNSM 140
>gi|21105303|gb|AAM34601.1|AF448526_1 precollagen-D [Mytilus galloprovincialis]
Length = 922
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/154 (29%), Positives = 61/154 (39%), Gaps = 8/154 (5%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP G G G+ GP G GP+G +G G+ G +G G +G+
Sbjct: 450 VGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGK 509
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP G GP G + GP+G GP G +GP G G G+ GP
Sbjct: 510 AGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAG---PRGPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGKPGDRGP 563
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS--DGLR 200
G GP+G +G G G S DG +
Sbjct: 564 DGETGPQGPAGPKGQVGDQGAQGDQGASGADGKK 597
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/149 (30%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G G G GP G GP+G +G G+ G +G G +G
Sbjct: 450 VGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGK 509
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G GP G + GP+G GP G +GP G + G G+ GP
Sbjct: 510 AGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAG---PRGPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGKPGDRGP 563
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP+G +G G G SG
Sbjct: 564 DGETGPQGPAGPKGQVGDQGAQGDQGASG 592
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/149 (30%), Positives = 58/149 (38%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP G G G+ GP G GP+G +G G+ G +G G +G+
Sbjct: 450 VGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGK 509
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G + GP+G GP G GP G G G+ GP
Sbjct: 510 AGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAG---PRGPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGKPGDRGP 563
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G +G G G SG
Sbjct: 564 DGETGPQGPAGPKGQVGDQGAQGDQGASG 592
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/149 (30%), Positives = 57/149 (38%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G GP G GP+G +G G G +G G +G+
Sbjct: 450 VGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGK 509
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G + GP+G GP G +GP G G G+ GP
Sbjct: 510 AGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAG---PRGPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGKPGDRGP 563
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G GP+G +G G G SG
Sbjct: 564 DGETGPQGPAGPKGQVGDQGAQGDQGASG 592
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/149 (29%), Positives = 55/149 (36%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP G G G GP G GP+G +G G G +G G +G+
Sbjct: 450 VGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGK 509
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP G GP G +GP +GP G G G+ GP
Sbjct: 510 AGEQGPGGIQGPKGPVGGQGPAGPRGPRGDEGP------VGPKGEPGAKGADGKPGDRGP 563
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G +G G G SG
Sbjct: 564 DGETGPQGPAGPKGQVGDQGAQGDQGASG 592
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/163 (28%), Positives = 61/163 (37%), Gaps = 12/163 (7%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
K + GP G GP+G +G G G +G G +G GP G G
Sbjct: 464 KPGDRGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGKAGEQGPGG---IQG 520
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G + GP+G GP G +GP G G G+ GP G GP+
Sbjct: 521 PKGPVGGQGPAGP---RGPRGDEGPVGPKGEPGAKGADGKPGDRGPDGETGPQGPA---- 573
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP G++ G G G G+ G+ GP GR
Sbjct: 574 --GPKGQVGDQGAQGDQGASGADGKKGEPRERGQQGAAGPVGR 614
>gi|229072031|ref|ZP_04205240.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
F65185]
gi|228710965|gb|EEL62931.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
F65185]
Length = 462
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/106 (29%), Positives = 44/106 (41%), Gaps = 3/106 (2%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 201 TGPTGSTGSTGPTGATGSTGATGS---TGPTGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGA 257
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 258 TGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGAT 303
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/148 (26%), Positives = 55/148 (37%), Gaps = 18/148 (12%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
GP+G+ G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 159 TGPTGATGITGVTGPTGATGITGVTGITGATGATGATGPTGSTGPTGSTGSTGPTGATGS 218
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +GS GP+G G +G G +G G +G GP+G S G +G
Sbjct: 219 TGATGS---TGPTGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGS 275
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G G +G GP+G
Sbjct: 276 TGATGPTGSTGPTGSTGPTGSTGPTGAT 303
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/88 (29%), Positives = 36/88 (40%), Gaps = 3/88 (3%)
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP+G G +G S GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 201 TGPTGSTGSTGPTGAT---GSTGATGSTGPTGATGSTGATGSTGPTGATGSTGVTGSTGA 257
Query: 163 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G G +G GP+G
Sbjct: 258 TGSTGPTGATGSTGVTGSTGATGPTGST 285
>gi|229062412|ref|ZP_04199728.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH603]
gi|228716883|gb|EEL68570.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH603]
Length = 900
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 173 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 231
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 232 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 291
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 292 DTGSQGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 348
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 349 PIG 351
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/146 (30%), Positives = 54/146 (36%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 213 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 272
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 273 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 332
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +GP G GP G GP
Sbjct: 333 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 358
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/211 (26%), Positives = 71/211 (33%), Gaps = 39/211 (18%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 231 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 290
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 291 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 350
Query: 125 GRLNSDGP---------------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 157
G +GP G + GP G G G +
Sbjct: 351 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGAAGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---I 407
Query: 158 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G + G G GP+G GP G
Sbjct: 408 GPTGPMGPQGVQGIQGIQGPTGAQGVQGPQG 438
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/151 (31%), Positives = 55/151 (36%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 211 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 270
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 271 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 327
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 328 VPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 358
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/148 (29%), Positives = 54/148 (36%), Gaps = 10/148 (6%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G + GP G GP+G++ GP G+ G P G GP G GP
Sbjct: 2 GEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGP---- 57
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
+GP+G G G GP G +GP G G G G G GP
Sbjct: 58 --IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGVPGATGSQGIQGTQGIQGPQ 115
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G SG GP+G
Sbjct: 116 GPNGNTGATGATGQ-GISGPTGITGPTG 142
>gi|221665294|gb|ACM24775.1| collagen alpha-2 type I chain [Equus asinus]
Length = 1364
Score = 45.1 bits (105), Expect = 0.019, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G G GS G GR +GP+GS GP+G G SGR
Sbjct: 380 GPNGEPGSTGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRP 439
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP GS +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 440 GEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPT 499
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G + G +G GP G GP G G G GP G GP+
Sbjct: 500 GEPGKPGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPA 559
Query: 188 GRLRYLG 194
G +G
Sbjct: 560 GTAGEVG 566
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 407 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPV 466
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 467 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 526
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 527 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGAR 586
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 587 GERGPPGESGAAGPAGPI 604
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 456 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGDKGHAGLAG 515
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G
Sbjct: 516 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPG 575
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GP+G + GPSG G G LG G G
Sbjct: 576 EFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPAGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVLGAPGTAGPSG 635
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 636 PSG 638
>gi|2772914|gb|AAB96638.1| precollagen D [Mytilus edulis]
Length = 922
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/164 (30%), Positives = 64/164 (39%), Gaps = 9/164 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G +GP G G G+ GP G GP+G +G G+ G +G
Sbjct: 449 GPRGDEGPVGPKGEPGARGADGKPGDKGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQ 508
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ GP G GP +G LGP G + GP G S+GP G
Sbjct: 509 GARGEAGKAGEQGPGGIQGPKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPVG-- 566
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G + G G G G+ G G+ GP GR
Sbjct: 567 -APGPKGSVGDQGAQGDQGATGADGKKGEPGERGQQGAAGPVGR 609
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/149 (30%), Positives = 59/149 (39%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G+ GP G GP+G +G G+ G +G G +G+ GP G
Sbjct: 467 GADGKPGDKGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGKAGEQGPGG-- 524
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP+G LGP G + GP G GP G GP G + G
Sbjct: 525 -IQGPKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPVG---APGPKGSVGDQGAQ 580
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G G G+ G G+ GP GR
Sbjct: 581 GDQGATGADGKKGEPGERGQQGAAGPVGR 609
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.70, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G GP G GP+G +G G G +G G +G+
Sbjct: 457 VGPKGEPGARGADGKPGDKGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGK 516
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G + GP+G LGP G + GP G GP + + GP
Sbjct: 517 AGEQGPGG---IQGPKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGP---VGAPGP 570
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G + G G G G+ G G+ GP GR
Sbjct: 571 KGSVGDQGAQGDQGATGADGKKGEPGERGQQGAAGPVGR 609
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/192 (27%), Positives = 66/192 (34%), Gaps = 18/192 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G +G G GP G +GP G G G+ GP G
Sbjct: 421 QGPCGDRGAPGVPGKQGPVGGQGPAGPRGPRGDEGPVGPKGEPGARGADGKPGDKGPDGE 480
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---------------R 117
GP+G +G G+ G +G G +G+ GP G
Sbjct: 481 TGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGKAGEQGPGGIQGPKGPVGGQGPAGP 540
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
LGP G + GP G GP G GP G + G G G G+ G
Sbjct: 541 AGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPVG---APGPKGSVGDQGAQGDQGATGADGKKGEPGE 597
Query: 178 SGRLRYLGPSGR 189
G+ GP GR
Sbjct: 598 RGQQGAAGPVGR 609
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 13/188 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G G G GP G GP GP G +GP G G G+
Sbjct: 418 MGPQGPCGDRGAPGVPGKQGPVGGQGPAGP------RGPRGDEGPVGPKGEPGARGADGK 471
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP+G +G G+ G +G G +G+ GP G GP
Sbjct: 472 PGDKGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGKAGEQGPGGIQ---GP 528
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G + GP+G LGP G + GP G GP G GP G + G G
Sbjct: 529 KGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPVG---APGPKGSVGDQGAQGDQGA 585
Query: 193 LGLSDGLR 200
G +DG +
Sbjct: 586 TG-ADGKK 592
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/159 (30%), Positives = 62/159 (38%), Gaps = 9/159 (5%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP G G G GP G GP GP G +GP G G G
Sbjct: 417 AMGPQGPCGDRGAPGVPGKQGPVGGQGPAGP------RGPRGDEGPVGPKGEPGARGADG 470
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
+ GP G GP+G +G G+ G +G + G +G+ GP G G
Sbjct: 471 KPGDKGPDGETGPQGPAGPKGQVGDQGKPGAKGETGDQGARGEAGKAGEQGPGG---IQG 527
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G + GP+G LGP G + GP G GP G
Sbjct: 528 PKGPVGGQGPAGPAGPLGPQGPMGERGPQGPTGSEGPVG 566
>gi|423432736|ref|ZP_17409740.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401114526|gb|EJQ22385.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 406
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 9/176 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS GP+G G G GP G GP G
Sbjct: 234 TGATGNTGATGSTGVTGATGST---GPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGI 290
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLNSDGP 132
GP+G G G G +G GP G +GP G GP G GP
Sbjct: 291 PGPTGVTGEQGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGP 350
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
SG GP G GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 351 SG---ATGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 59/160 (36%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G+ G +G GP+GS G G GP G GP G GP+G
Sbjct: 240 TGATGSTGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGE 299
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G G +G GP G +GP +G GP G GPSG GP
Sbjct: 300 QGIQGVQGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGP 356
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 357 QGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGAT 396
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/161 (31%), Positives = 57/161 (35%), Gaps = 6/161 (3%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
T V + GP+G G G GP G GP G GP+G G G
Sbjct: 246 TGVTGATGSTGPTGSTGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGV 305
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +G GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 306 QGIQGATGATGDQGPQGIQGAIGPQGATGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGI 362
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 363 QGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQG 403
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 204
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 9/160 (5%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G GP G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 QG-LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G GP G G G GPSG G +
Sbjct: 152 QGVQGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGAT 188
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 66/176 (37%), Gaps = 13/176 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ---QGPQG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G GP G GP G G G G G + GP G G
Sbjct: 97 LR--GPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 155 QGLPGVTGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 203
>gi|222097993|ref|YP_002532050.1| hypothetical protein BCQ_4335 [Bacillus cereus Q1]
gi|221242051|gb|ACM14761.1| conserved hypothetical protein [Bacillus cereus Q1]
Length = 447
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/211 (23%), Positives = 74/211 (35%), Gaps = 27/211 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G GP+G+ G P+G+ G +G G +GS G +G G
Sbjct: 84 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGVTGSTGPTGA 143
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRY------------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 105
+G GP+G+ G +G GP+G G
Sbjct: 144 TGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGS 203
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
+G G +G G +G S GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 204 TGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGP 263
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 264 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGIT 294
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/200 (24%), Positives = 71/200 (35%), Gaps = 18/200 (9%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 83 PTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGVTGSTGPTG 142
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +GS G +G G P+G G +G G +G
Sbjct: 143 ATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGATGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTG 202
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G +G S GP+G G +G G +G G +G G +G G
Sbjct: 203 STGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTG 262
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P+G G +G G++
Sbjct: 263 PTGATGVTGSTGPTGATGVT 282
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/114 (26%), Positives = 46/114 (40%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G +G GP+G+ G +G G +GS G +G GP+G G +G+
Sbjct: 183 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGA 242
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G +G G +G G +G GP+G G +G + G +G
Sbjct: 243 TGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/114 (26%), Positives = 43/114 (37%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G +G GP+G G +G G +GS G +G GP+G G +G
Sbjct: 183 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGA 242
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 243 TGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/185 (24%), Positives = 65/185 (35%), Gaps = 24/185 (12%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL----------------- 55
G +G G +GS G +GS G +G GP+G+
Sbjct: 114 TGSTGPTGATGITGSTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGDTGPTGSTGSTGSTGA 173
Query: 56 ----RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
GP+G G +G G +GS GP+G G +G G +G
Sbjct: 174 TGATGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGS---TGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGP 230
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G +G G +G S GP+G G +G G +G G +G GP+G
Sbjct: 231 TGATGITGSTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGA 290
Query: 172 LRYLG 176
G
Sbjct: 291 TGITG 295
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/105 (27%), Positives = 42/105 (40%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G G +GS G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 192 TGPTGATGVTGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGSTGATGVTGSTGP 251
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G +GS G +G GP+G G +G G +G
Sbjct: 252 TGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGVTGSTGPTGATGITGS 296
>gi|423660423|ref|ZP_17635592.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VDM022]
gi|401302643|gb|EJS08216.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VDM022]
Length = 893
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 60/154 (38%), Gaps = 3/154 (1%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQIGATGPEGQQ---GP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G +G +G G G +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 EGFRGPVGATGATGLQGVQGIQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G G G +GP G G +G
Sbjct: 155 QGVPGATGPQGVQGVQGLIGPQGTSGSTGVTGAT 188
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/154 (29%), Positives = 59/154 (38%), Gaps = 3/154 (1%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQIGATGPEGQQ---GP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G +G +G G G +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 95 EGFRGPVGATGATGLQGVQGIQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G +GP G G +G
Sbjct: 155 QGVPGATGPQGVQGVQGLIGPQGTSGSTGVTGAT 188
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/179 (31%), Positives = 66/179 (36%), Gaps = 12/179 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G GS G G L GP GP G GP+G
Sbjct: 243 TGSTGVAGATGPTGSTGATGIQGSQGIQGIQGPLGPTGPE------GPQGIQGIPGPTGI 296
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+ G G G +G G G +GP +G GP G GP+G S
Sbjct: 297 MGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGTQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGS 356
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 357 QGVQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIG 412
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.089, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/201 (27%), Positives = 71/201 (35%), Gaps = 9/201 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G + G G G +G+ G G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 292 GPTGIMGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGTQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPT 351
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 352 GDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 411
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 412 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 471
Query: 185 GPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G G+ + +G
Sbjct: 472 GPMGPQGVQGIQGEIGATGAQ 492
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/141 (30%), Positives = 54/141 (38%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQIGATGPEGQ---QGP 94
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G + GP G + G G GP G G G G G + GP G
Sbjct: 95 EG---FRGPVGATGATGLQGVQGIQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G GL
Sbjct: 152 QGVQGVPGATGPQGVQGVQGL 172
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 72/196 (36%), Gaps = 16/196 (8%)
Query: 3 GTCVVEKALN-LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GT ++ A+ G +G GP G GP+G G G GP G + GP
Sbjct: 319 GTQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGDT---GSQGVQGIQGPMGDIGPTGPE 375
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---------SGRLRYL 112
G GP G GP+G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 376 GPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGAT 435
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G G G + + GP G G G +GP+G + G G +G +G
Sbjct: 436 GAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGD---IGPTGPMGPQGVQGIQGEIGATGAQ 492
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G
Sbjct: 493 GVQGPQGIQGIQGPTG 508
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.83, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 60/176 (34%), Gaps = 6/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G +G GP+GS G G G G L GP G P G
Sbjct: 234 TGSTGNTGATGSTGVAGATGPTGSTGATGIQGSQGIQGIQGPLGPTGPEG------PQGI 287
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G + G G G +G G G +GP G G G G
Sbjct: 288 QGIPGPTGIMGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGTQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGV 347
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP G + GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 348 PGPTGDTGSQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQG 403
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/183 (28%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G G G++ G +G+ GP G GP+G G G GP G
Sbjct: 312 TGATGDQGTQGIQGAIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPTGD---TGSQGVQGIQGPMGD 368
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP+G GP G GP G GP G G
Sbjct: 369 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGI 428
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP G G G +
Sbjct: 429 QGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPTGPMGPQGVQGIQGEIGA 488
Query: 193 LGL 195
G
Sbjct: 489 TGA 491
>gi|293402423|ref|ZP_06646559.1| collagen triple helix repeat protein [Erysipelotrichaceae bacterium
5_2_54FAA]
gi|291304086|gb|EFE45339.1| collagen triple helix repeat protein [Erysipelotrichaceae bacterium
5_2_54FAA]
Length = 294
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/171 (28%), Positives = 69/171 (40%), Gaps = 14/171 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRY 75
GP+G+ GP + GP+G G +G+ GP+G G SG
Sbjct: 67 TGPTGATGATGPG--VGATGPTGPTGATGATGANGATGPTGLQGPTGATGTTGASGITGA 124
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 125 TGPTGANGATGPTGPQ---GPTGATGLQGFAGITGATGPAGAT---GPTGNTGPTGANGA 178
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 179 TGITGATGPTGITGATGATGLQGPTGNTGANGATGPTGATGVTGTIGPTGP 229
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/171 (28%), Positives = 67/171 (39%), Gaps = 14/171 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP + GP+G G +G GP+G + G SG
Sbjct: 67 TGPTGATGATGPG--VGATGPTGPTGATGATGANGATGPTGLQGPTGATGTTGASGITGA 124
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 125 TGPTGANGATGPTGPQ---GPTGATGLQGFAGITGATGPAGAT---GPTGNTGPTGANGA 178
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 179 TGITGATGPTGITGATGATGLQGPTGNTGANGATGPTGATGVTGTIGPTGP 229
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/198 (26%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 17/198 (8%)
Query: 5 CVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 64
C E + + +GP G + G +G GP+G GP + GP+G
Sbjct: 35 CSCEPCITPVNTCGCACIGPRGPRGFRGATGPT---GPTGATGATGPG--VGATGPTGPT 89
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G +G GP+G + G SG GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 90 GATGATGANGATGPTGLQGPTGATGTTGASGITGATGPTGANGATGPTGP---QGPTGAT 146
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G +G + GP+G GP+G G +G G +G G +G GP+
Sbjct: 147 GLQGFAGITGATGPAGA---TGPTGNTGPTGANGATGITGATGPTGITGATGATGLQGPT 203
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G G++
Sbjct: 204 GNTGANGATGPTGATGVT 221
>gi|47565152|ref|ZP_00236195.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
gi|47557938|gb|EAL16263.1| hypothetical protein membrane Spanning protein [Bacillus cereus
G9241]
Length = 1300
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/168 (29%), Positives = 58/168 (34%), Gaps = 3/168 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 686 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 745
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 746 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 805
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 806 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.058, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/183 (29%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 3/183 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G G G +GP+G GP GS G +G GP G
Sbjct: 626 GPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG-- 683
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G +GP
Sbjct: 684 -IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQ 742
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 743 GIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQ 802
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 803 GIQ 805
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.086, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/198 (27%), Positives = 67/198 (33%), Gaps = 18/198 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGPT 348
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 349 GE---TGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQ 405
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G +GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 406 GIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQ 465
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + GP G G+
Sbjct: 466 GAIGPTGPMGAQGVQGVQ 483
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 63/183 (34%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 647 GPQGDI---GPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPT 700
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP
Sbjct: 701 GIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQ 760
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G + GP G G G + GP G
Sbjct: 761 GIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQ 820
Query: 194 GLS 196
G+
Sbjct: 821 GIQ 823
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/187 (28%), Positives = 60/187 (32%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP G
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVT 330
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------LGPSGRLRYL 121
G G G G GP G GP G + GP G
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGIPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGPEGLQGPQGIQGVP 390
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEI 450
Query: 182 RYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GATGPEG 457
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 66/194 (34%), Gaps = 24/194 (12%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGPTG---ETGPQGVQGIQGPMGD 365
Query: 73 LRY------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+ GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 366 IGPTGPEGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGI 425
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G G + G G G G + GP G +GP+G + G G
Sbjct: 426 QGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGAQGVQGVQGI 485
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G
Sbjct: 486 QGPTGAQGVQGPQG 499
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 63/177 (35%), Gaps = 10/177 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQ------ 88
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
GS GP G GP G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 89 QGSQGLRGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP G G G GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQG---IQGAQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTGITGPTGI 201
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/205 (27%), Positives = 70/205 (34%), Gaps = 6/205 (2%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 60
T V ++G +G GP G +G +G GP G G +G G
Sbjct: 586 TGVTGATGSIGATGVTGLQGPQGIQGVQGDIGATGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGI 645
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G +GP+G GP GS G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 646 QGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGI 702
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G + GP G GP G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 703 QGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGI 762
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G G + G+
Sbjct: 763 QGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 787
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.98, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/196 (26%), Positives = 65/196 (33%), Gaps = 15/196 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +GS+ G +G G G +G +G GP G
Sbjct: 574 TGATGDTGATGSTGVTGATGSIGATGVTGLQGPQGIQGVQGDIGATGPQGVQGPQGIQGV 633
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 634 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 693
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 753
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G+
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQ 769
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/157 (28%), Positives = 53/157 (33%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 694 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 753
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 754 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 813
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
+ + G G G +G GP G GP+G
Sbjct: 814 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGAT 850
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/170 (30%), Positives = 62/170 (36%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G GP G + GP G G G + GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGLQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGSVGPIGATGPEGQQGSQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGIQGPQGPSGNTGATGATGQ-GITGPTG---ITGPTG 200
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/179 (27%), Positives = 58/179 (32%), Gaps = 15/179 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY------------LGP 60
+GP G G G G G GP G GP G + GP
Sbjct: 324 IGPQGVTGATGDQGPQGIQGIPGPTGETGPQGVQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGPEGLQGP 383
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G GP G GP G GP G GP G G G G G
Sbjct: 384 QGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGI 443
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G + + GP G G G +GP+G + G G GP+G GP G
Sbjct: 444 QGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGAQGVQGVQGIQGPTGAQGVQGPQG 499
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/194 (27%), Positives = 65/194 (33%), Gaps = 3/194 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++G +G GP G G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 615 DIGATGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 674
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 675 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 731
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G G G GP G G G G G G G +
Sbjct: 732 PVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIG 791
Query: 192 YLGLSDGLRVSGLH 205
G V G+
Sbjct: 792 ATGPEGPQGVQGIQ 805
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G GP G G +G+ G G +GP+GS GP G G +G
Sbjct: 952 EIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATG 1011
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 1012 ATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQG 1044
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G +G G +G GP G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 917 TGDTGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATGA 976
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + GP
Sbjct: 977 QGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGP 1033
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
G GP G
Sbjct: 1034 QGPQGIQGPQG 1044
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/132 (28%), Positives = 51/132 (38%), Gaps = 3/132 (2%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ G +G G G +GP+G GP G G +G
Sbjct: 916 VTGDTGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTGATG 975
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G G +GP+G GP G G +G GP G GP G + G
Sbjct: 976 AQGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQGI---QGPQGDIGPTG 1032
Query: 141 PSGRLRYLGPSG 152
P G GP G
Sbjct: 1033 PQGPQGIQGPQG 1044
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/131 (29%), Positives = 48/131 (36%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +GS G +G G G G G + GP G GP G G +G
Sbjct: 920 TGATGSTGVTGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQG---IQGPQGIQGVTGATGA 976
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G G +GP+G GP G G +G + GP G GP G + GP
Sbjct: 977 QGPQGIQGPQGDIGPTGSQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGP 1033
Query: 151 SGRLRYLGPSG 161
G GP G
Sbjct: 1034 QGPQGIQGPQG 1044
>gi|402560379|ref|YP_006603103.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-771]
gi|401789031|gb|AFQ15070.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
HD-771]
Length = 291
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/148 (27%), Positives = 60/148 (40%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
P+G G +G+ GP+G G +G GP G G +G + G +G
Sbjct: 32 PTGETGPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETG 91
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +GS GP+G+ +G GP G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 92 PTGITGSTGKTGPTGK------TGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITG 145
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G +G G +G + GP+G
Sbjct: 146 STGITGLTGVTGLTGETGPIGITGPTGA 173
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/140 (27%), Positives = 60/140 (42%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G +G GP+G G +G + G +G+ +G +G+ GP+G
Sbjct: 37 GPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTG-- 94
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G+ G +G GP G G +G + GP+G G +G G +
Sbjct: 95 -ITGSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLT 153
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G +G + GP+G
Sbjct: 154 GVTGLTGETGPIGITGPTGA 173
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/141 (26%), Positives = 59/141 (41%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G G +G GP+G G +G + G +G +G +G GP+G
Sbjct: 37 GPTGITGATGETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTG-- 94
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
G +G+ G +G GP G + G +G + GP+G G +G G +
Sbjct: 95 -ITGSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLT 153
Query: 161 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G +G + GP+G
Sbjct: 154 GVTGLTGETGPIGITGPTGAT 174
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/131 (27%), Positives = 57/131 (43%), Gaps = 3/131 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G G +G + G +G+ +G +G+ GP+G G +G+
Sbjct: 46 GETGPTGITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATGETGPTG---ITGSTGKT 102
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +GS GP G G +G + GP+G G +G G +G G +
Sbjct: 103 GPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTGITGSTGITGLTGVTGLTGET 162
Query: 134 GRLRYLGPSGR 144
G + GP+G
Sbjct: 163 GPIGITGPTGA 173
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/137 (26%), Positives = 60/137 (43%), Gaps = 9/137 (6%)
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G +G+ GP+G GP+G G +G + G +G+ +G +G
Sbjct: 32 PTGETGPTGITGATGETGPTG---ITGPTGITGSTGITGPIGITGATGKTGPIGITGATG 88
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G +G GP+G+ G +G + G +G +G +G GP+G
Sbjct: 89 ETGPTGI------TGSTGKTGPTGKTGSTGITGPIGITGATGETGPIGITGPTGETGPTG 142
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G++ V+GL
Sbjct: 143 ITGSTGITGLTGVTGLT 159
>gi|423591291|ref|ZP_17567322.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD048]
gi|401233230|gb|EJR39725.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus VD048]
Length = 940
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.021, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 69/183 (37%), Gaps = 11/183 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
G +G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 231 TGATGNTGVTGSAGVTGNTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGVQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 289
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP +G GP G GP+G
Sbjct: 290 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTG 349
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
S G G GP G + GP G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 350 DTGSQGIQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQG 406
Query: 186 PSG 188
P G
Sbjct: 407 PIG 409
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/180 (28%), Positives = 67/180 (37%), Gaps = 16/180 (8%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGTQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G G GP GPSG G +G+ GP+G G+
Sbjct: 149 QGVQGGPGATGSQGIQGAQGIQGPQ------GPSGNTGATGATGQ-GISGPTGITGPTGI 201
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/182 (29%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G G +G+ GP G +GP +G+ GP G GP+
Sbjct: 289 GPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPT 348
Query: 71 GRLR------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G + GP G GP G GP+G GP G GP
Sbjct: 349 GDTGSQGIQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPI 408
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G G G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 409 GVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPT 468
Query: 185 GP 186
GP
Sbjct: 469 GP 470
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---S 70
GP G GP G GP+G G G G +G+ GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGIT 330
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G GP G GP+G GP G + GP G GP G GP+
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGIQGIQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPA 390
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G +GP G GP G GP G G G G G G G +
Sbjct: 391 GATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITGATGAQGATGVQGVQGNIGAT 450
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 451 GPEG 454
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/151 (31%), Positives = 55/151 (36%), Gaps = 6/151 (3%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-- 78
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP
Sbjct: 269 VQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQG 328
Query: 79 -SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ GP G GP+G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 329 ITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGIQG---IQGPMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQG 385
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G GP G GP G GP
Sbjct: 386 VPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGP 416
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/160 (30%), Positives = 58/160 (36%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GP+G G G GP G + G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGAIGPQGITGATGDQGPQGIQGVPGPTGDTGSQGIQG---IQGPMGDIGPTG 370
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 371 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPAGATGPEGPQGIQGIQGPIGVTGPEGPQGIQGIQGIQGITG 430
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 431 ATGAQGATGVQGVQGNIGATGPEGPQGVQGTQGDIGPTGP 470
>gi|225869722|ref|YP_002745669.1| collagen-like cell surface-anchored protein SclH [Streptococcus
equi subsp. equi 4047]
gi|37498970|gb|AAQ91576.1| collagen-like protein 3 [Streptococcus equi]
gi|76262847|gb|ABA41498.1| collagen-like protein H [Streptococcus equi subsp. equi]
gi|225699126|emb|CAW92316.1| putative collagen-like cell surface-anchored protein SclH
[Streptococcus equi subsp. equi 4047]
Length = 414
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/182 (33%), Positives = 64/182 (35%), Gaps = 27/182 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ GP G GP G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 150 GPEGKPGQQGPKGDT---GPQGEPGQQGPKGDI---GPQGEPGLPGPKGD---TGPQGAP 200
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 201 GQQGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPK 251
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 252 GD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDTGPQ 302
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 303 GV 304
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/168 (33%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 21/168 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G +GP G G G GP G GP G +GP G GP G
Sbjct: 138 GPVGERGPIGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQGPKGD---IGPQGEPGLPGPKGD- 193
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 194 --TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT---GPQ 242
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 243 GEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT 284
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/168 (33%), Positives = 59/168 (35%), Gaps = 18/168 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G GP G +GP G G G GP G GP G +
Sbjct: 120 GPQGPMGPAGPQGLRGERGPVGERGPIGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQGPKGDI 179
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 180 ---GPQGEPGLPGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQ 227
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 228 GAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGDT 269
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/178 (33%), Positives = 61/178 (34%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G +GP G G G GP G GP G + GP G
Sbjct: 128 AGPQGLRGERGPVGERGPIGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQGPKGDI---GPQGE 184
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 185 PGLPGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEQGLQGPKGDT---GPQGAPGQQGP 235
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 236 KGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT 284
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/182 (32%), Positives = 65/182 (35%), Gaps = 27/182 (14%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G GP G + GP G GP G GP G+ GP G GP G
Sbjct: 163 DTGPQGEPGQQGPKGDI---GPQGEPGLPGPKGDT---GPQGAPGQQGPKGDT---GPQG 213
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 214 EQGLQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGEQGLQG 264
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G GP G GP G GP G GP G GP G G S ++
Sbjct: 265 PKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGVPGQQGESQKVP 315
Query: 192 YL 193
+
Sbjct: 316 EV 317
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/155 (33%), Positives = 55/155 (35%), Gaps = 15/155 (9%)
Query: 36 SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
SL GP G + GP G GP G +GP G G G GP G G
Sbjct: 115 SLGIPGPQGPMGPAGPQGLRGERGPVGERGPIGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQG 174
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P G +GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 175 PKGD---IGPQGEPGLPGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEQGLQGPKGD-- 223
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 224 -TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGDT 254
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.75, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/163 (33%), Positives = 58/163 (35%), Gaps = 18/163 (11%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
SL GP G + GP G GP G +GP G G G GP G G
Sbjct: 115 SLGIPGPQGPMGPAGPQGLRGERGPVGERGPIGPQGPEGKPGQQGPKGDTGPQGEPGQQG 174
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
P G + GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 175 PKGDI---GPQGEPGLPGPKGD---TGPQGAPGQQGPKGDT---GPQGEQGLQGPKGD-- 223
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 224 -TGPQGAPGQQGPKGD---TGPQGEPGQPGPKGD---TGPQGE 259
>gi|353231963|emb|CCD79318.1| putative collagen alpha chain [Schistosoma mansoni]
Length = 256
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/178 (32%), Positives = 75/178 (42%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 69 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP+G + G G + GP G GP G Y GP G DG S
Sbjct: 129 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 188
Query: 134 GRLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G+ GP G +G +GR GP G P G+ Y G+ +GP G
Sbjct: 189 GKDGKPGPQGVPGEQGAVGKAGRRGDRGPPG------PQGKRGY---KGQEGVMGPPG 237
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/120 (34%), Positives = 52/120 (43%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 69 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 128
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP+G + G G + GP G GP G Y GP G GLS
Sbjct: 129 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 188
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/122 (33%), Positives = 53/122 (43%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G + G SG + GP G + +GP G +GP+G G +G G SG +
Sbjct: 69 GPIGPVGLPGASGIPGHAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDV 128
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G + G G + GP G GP G Y GP G G S
Sbjct: 129 GDPGPDGETGPEGPAGAVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLS 188
Query: 188 GR 189
G+
Sbjct: 189 GK 190
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/156 (30%), Positives = 63/156 (40%), Gaps = 9/156 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G + +GP G +GP+G G +G G SG + GP G GP+G
Sbjct: 85 HAGPMGPMGPVGPRGPTGAIGPAGEQGMKGATGLPGGHGDSGDVGDPGPDGETGPEGPAG 144
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G + GP G GP G Y GP G G SG+ GP G G
Sbjct: 145 AVGPPGLPGPVGDQGPEGPEGASGPPGPAGYDGPPGMDGKDGLSGKDGKPGPQGVPGEQG 204
Query: 132 PSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G+ GP G+ Y G+ +GP G
Sbjct: 205 AVGKAGRRGDRGPPGPQGKRGY---KGQEGVMGPPG 237
>gi|195728955|gb|ACG50742.1| VtaA22 [Haemophilus parasuis]
Length = 1505
Score = 44.7 bits (104), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 15/175 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G + +GP+G+ GP G G +G+ GP+G GP+G GP G
Sbjct: 497 GPAGPIGPVGPAGTKGEQGPKGDTGPKGDTGQRGETGPAGPTGPRGPAG---AAGPKGEQ 553
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G G+ G G+ GP G GP G GP+G GP+
Sbjct: 554 GPTGPQGPQGTAGAQGQKGDKGDPGQ---AGPKGEKGDTGPRGE---TGPAGERGETGPA 607
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP G GP G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 608 G---AAGPKGE---QGPKGEQGIQGPKGDKGDTGPAGPQGATGPAGPAGAQGPAG 656
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/169 (31%), Positives = 64/169 (37%), Gaps = 12/169 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G G +G GP G GP G GP G G G+ G G
Sbjct: 519 DTGPKGDTGQRGETGPAGPTGPRGPAGAAGPKGEQGPTGPQGPQGTAGAQGQKGDKGDPG 578
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP G GP G GP+G GP+G GP G GP G G
Sbjct: 579 Q---AGPKGEKGDTGPRGE---TGPAGERGETGPAG---AAGPKGE---QGPKGEQGIQG 626
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
P G GP+G GP+G GP+G GP+G GP G
Sbjct: 627 PKGDKGDTGPAGPQGATGPAGPAGAQGPAGPRGEAGPAGATGPQGPKGD 675
>gi|229099206|ref|ZP_04230138.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-29]
gi|228684187|gb|EEL38133.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
Rock3-29]
Length = 956
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/185 (31%), Positives = 68/185 (36%), Gaps = 12/185 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL----GPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G G +G GP+GS G G L+ + GP G GP G G
Sbjct: 234 TGPTGATGNTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQG-LQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPG 291
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSG 125
P+G G G G +G GP G +GP G G P G GPSG
Sbjct: 292 PTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG 351
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G GP G + GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 352 AT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQG 408
Query: 186 PSGRL 190
P G
Sbjct: 409 PVGAT 413
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/176 (31%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 10/176 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G+ GP+GS G G ++ + GP G GP G GP+G G
Sbjct: 242 NTGATGQ-GLTGPTGSTGETGAQGLQGIQGIQGPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQG 300
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G G +G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G
Sbjct: 301 IQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQG 357
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 358 VQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGAT 413
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.082, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/206 (27%), Positives = 66/206 (32%), Gaps = 27/206 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP G G P
Sbjct: 282 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQ 341
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G GP G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 342 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGPMGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 398
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLR---------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G GP G G G G G + GP
Sbjct: 399 GPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPE 458
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G G + GP G G+
Sbjct: 459 GPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGI 484
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/199 (27%), Positives = 64/199 (32%), Gaps = 30/199 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G + G
Sbjct: 316 DQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGEIGPTG 372
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------------------ 110
P G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 373 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGPQGIQGIQGVQG 432
Query: 111 ---YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G G G G + + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 433 ITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGPQGVQGIQGVQG 489
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+G GP G GP
Sbjct: 490 ATGAQGVQGPQGIQGIQGP 508
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/196 (27%), Positives = 63/196 (32%), Gaps = 24/196 (12%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+G+ GP G +GP G G P G GPSG GP G GP G
Sbjct: 311 TGATGDQGPQGIQGAIGPQGVTGVTGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGPMGE 367
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP--------- 132
+ GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 368 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQGPQGIQGI 427
Query: 133 ---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 428 QGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGV 481
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 482 QGIQGVQGATGAQGVQ 497
>gi|302384744|ref|YP_003820566.1| Collagen triple helix repeat protein [Clostridium saccharolyticum
WM1]
gi|302195372|gb|ADL02943.1| Collagen triple helix repeat protein [Clostridium saccharolyticum
WM1]
Length = 383
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.028, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/123 (30%), Positives = 54/123 (43%), Gaps = 3/123 (2%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G + G +G GP G GP+G + G +G GP G GP+G +
Sbjct: 263 GPTGPIGITGDTGPTGPTGPIGITGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGPIGLTGDTGPTGPI 322
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
G +G +G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+
Sbjct: 323 GLTGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGLTGDTGPTGPTGLTGDTGP---TGPTGDTGPTGPT 379
Query: 161 GRL 163
G +
Sbjct: 380 GPV 382
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/121 (30%), Positives = 53/121 (43%), Gaps = 6/121 (4%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G + G +G GP G GP+G + G +G GP G GP+G +
Sbjct: 263 GPTGPIGITGDTGPTGPTGPIGITGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGPIGLTGDTGPTGPI 322
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G +G +G GP+G GP+ GP+G GP+G GP+
Sbjct: 323 GLTGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGLTGDTGPT------GPTGLTGDTGPTGPTGDTGPT 376
Query: 143 G 143
G
Sbjct: 377 G 377
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/121 (30%), Positives = 53/121 (43%), Gaps = 6/121 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G + G +G GP G GP+G + G +G GP G GP+G +
Sbjct: 263 GPTGPIGITGDTGPTGPTGPIGITGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGPIGLTGDTGPTGPI 322
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G +G +G GP+G GP+ GP+G GP+G GP+
Sbjct: 323 GLTGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGLTGDTGPT------GPTGLTGDTGPTGPTGDTGPT 376
Query: 134 G 134
G
Sbjct: 377 G 377
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.073, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/121 (30%), Positives = 53/121 (43%), Gaps = 6/121 (4%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G + G +G GP G GP+G + G +G GP G GP+G +
Sbjct: 263 GPTGPIGITGDTGPTGPTGPIGITGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGPIGLTGDTGPTGPI 322
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G +G +G +G GP+G GP+ GP+G GP+G GP+
Sbjct: 323 GLTGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGLTGDTGPT------GPTGLTGDTGPTGPTGDTGPT 376
Query: 152 G 152
G
Sbjct: 377 G 377
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/116 (30%), Positives = 51/116 (43%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP G GP+G + G +G GP G GP+G + G +G
Sbjct: 273 DTGPTGPT---GPIGITGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGPIGLTGDTGPTGPIGLTGDTG 329
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G +
Sbjct: 330 PTGPIGLTGDTGPTGPTGLTGDTGPTGPTGLTGDTGP---TGPTGDTGPTGPTGPV 382
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/94 (30%), Positives = 42/94 (44%)
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP+G + G +G GP G GP+G + G +G GP G GP+G +
Sbjct: 263 GPTGPIGITGDTGPTGPTGPIGITGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGPIGLTGDTGPTGPI 322
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G +G +G GP+G GP+G
Sbjct: 323 GLTGDTGPTGPIGLTGDTGPTGPTGLTGDTGPTG 356
>gi|339755094|gb|AEJ95104.1| gp4 [Mycobacterium phage JHC117]
Length = 323
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.029, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/132 (31%), Positives = 48/132 (36%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+ G +G GP+G G +GS GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 154 FTGDTGPQGEQGPTGPQGPKGDTGSQGPQGPKGDTGPAGPTGPTGPQGPKGDQGIQGIQG 213
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP G G +G GP G + GP G GP G GP G G
Sbjct: 214 PQGPSGPKGDKGDKGDTGNPGPTGPQGDIGPAGPQGDPGPQGPKGDTGDTGPQGPKGDTG 273
Query: 177 PSGRLRYLGPSG 188
G GP G
Sbjct: 274 AQGPQGVQGPQG 285
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.073, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/141 (30%), Positives = 51/141 (36%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
+ G +G GP+G G +G GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 154 FTGDTGPQGEQGPTGPQGPKGDTGSQGPQGPKGDTGPAGPTGPTGPQGPKGDQGIQGIQG 213
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP G G +G GP G + GP G GP G GP G
Sbjct: 214 PQGPSGPKGDKGDKGDTGNPGPTGPQGDIGPAGPQGDPGPQGPKGDTGDTGPQ------G 267
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
P G GP G GP+G
Sbjct: 268 PKGDTGAQGPQGVQGPQGPAG 288
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/141 (31%), Positives = 55/141 (39%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
+ G +G GP+G GP G GP G GP+G GP G G G
Sbjct: 154 FTGDTGPQGEQGPTGPQ---GPKGDTGSQGPQGPKGDTGPAGPTGPTGPQGPKGDQGIQG 210
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GPSG G G + GP+G +GP+G GP G G +G G
Sbjct: 211 IQGPQGPSGPKGDKGDKGDTGNPGPTGPQGDIGPAGPQGDPGPQGP---KGDTGDTGPQG 267
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP G GP+G
Sbjct: 268 PKGDTGAQGPQGVQGPQGPAG 288
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/118 (32%), Positives = 44/118 (37%), Gaps = 6/118 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G GP G G G GP G G +G GP G +
Sbjct: 183 GPKGDTGPAGPTGPTGPQGPKGDQGIQGIQGPQGPSGPKGDKGDKGDTGNPGPTGPQGDI 242
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G P G GP G GP+G +S+G
Sbjct: 243 GPAGPQGDPGPQGPKGDTGDTGPQG------PKGDTGAQGPQGVQGPQGPAGVPSSNG 294
>gi|228903247|ref|ZP_04067380.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
IBL 4222]
gi|434377881|ref|YP_006612525.1| conserved hypothetical membrane spanning protein [Bacillus
thuringiensis HD-789]
gi|228856421|gb|EEN00948.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
IBL 4222]
gi|401876438|gb|AFQ28605.1| conserved hypothetical membrane spanning protein [Bacillus
thuringiensis HD-789]
Length = 470
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/176 (30%), Positives = 67/176 (38%), Gaps = 16/176 (9%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-- 76
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGL 94
Query: 77 -GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 136 LRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGPQGIQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTG---ITGPTG 200
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 64/170 (37%), Gaps = 10/170 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GP 69
GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ GP
Sbjct: 38 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGLRGP 97
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G GP G G G G G + GP G G G +
Sbjct: 98 QGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGLPGA 157
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G G G GPSG G +G+ GP+G GP+G
Sbjct: 158 TGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ-GLTGPTG---ITGPTG 200
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.043, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/156 (30%), Positives = 56/156 (35%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL-- 94
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+
Sbjct: 35 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPVGPIGATGPEGQQGAQGL 94
Query: 95 -GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP G GP G GP G G G G G + GP G G G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGPIGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGVQGL 154
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G GPSG G +G+
Sbjct: 155 PGATGPQG---IQGAQGIQGTQGPSGNTGATGATGQ 187
>gi|326914548|ref|XP_003203587.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: pre-mRNA cleavage complex 2 protein
Pcf11-like [Meleagris gallopavo]
Length = 1471
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 77/208 (37%), Positives = 106/208 (50%), Gaps = 58/208 (27%)
Query: 14 GPSGR--LRYLGP---SGSLRYLGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---- 58
GP G+ LR+ GP +G ++ GP +G+LR+ GP G+L +G+LR+
Sbjct: 747 GPPGQAALRFEGPLVGAGGSQFDGPLAGAGGAGALRFDGPPGQL-----AGALRFEGPQG 801
Query: 59 --GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 112
G G LR+ GP G++ G LR+ GP+G+ R+ GP LR+ GP G+
Sbjct: 802 QVGGGGPLRFEGPLGQI-----GGPLRFEGPAGQPVGGPRFEGPGVGLRFEGPRGQ---- 852
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY----LGPSGR----LRYLGPSGRLR 164
PSG LR+ GP G+ P G G SG LR LGP G+ LR GP L+
Sbjct: 853 -PSGGLRFEGPHGQ-----PLGXESARGGSG-LRTARSALGPHGQPGSGLRXEGP--HLQ 903
Query: 165 YLGPSGR----LRYLGPSGRLRYLGPSG 188
LGP G+ LR+ GP G+ +GP G
Sbjct: 904 PLGPHGQPGSGLRFEGPHGQP--MGPHG 929
>gi|432904036|ref|XP_004077252.1| PREDICTED: collagen alpha-1(IX) chain-like [Oryzias latipes]
Length = 677
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/198 (29%), Positives = 75/198 (37%), Gaps = 12/198 (6%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------- 59
A +GP G GP+G + +GP G++ GP G GP G+ LG
Sbjct: 106 AAGVGPDGTPGSPGPAGLLGEVGKVGPPGAMGVRGPQGPRGPAGPRGAAGMLGNADLCPN 165
Query: 60 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
P G + G G + G G G G G G +G G + G G
Sbjct: 166 SCPPGTPGHPGLPGMKGHKGVKGEAGEPGKQGHKGEEGDQGSPGEVGSQGPMGPQGIRGS 225
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
LGP G L + GP G G +G + G G + LGP G GP G GP
Sbjct: 226 TGMLGPKGELGARGPDGDPGPQGVAGAIGDHGQRGVMGELGPKGETGVQGPRGITGLPGP 285
Query: 178 SGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GR+ GL
Sbjct: 286 KGEPGLPGVDGRVGIPGL 303
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
GS LGP G L GP G G +G++ G G + LGP G GP G
Sbjct: 224 GSTGMLGPKGELGARGPDGDPGPQGVAGAIGDHGQRGVMGELGPKGETGVQGPRGITGLP 283
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G G GR+ G G +G G +GP G S GP G G +
Sbjct: 284 GPKGEPGLPGVDGRVGIPGLPGAKGSVGKPGVPGEIGPQGLPGLPGSPGPKGLSGLKGDA 343
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G+ G G G G GP G + G G +GP+G+
Sbjct: 344 GQPGLPGELGSAGKTGERGEQGEFGPVGPIGEPGDIGEQGPVGPAGK 390
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/141 (31%), Positives = 56/141 (39%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
G G+ + G G G GS +GP G +R GS LGP G L GP G
Sbjct: 189 EAGEPGKQGHKGEEGDQGSPGEVGSQGPMGPQG-IR-----GSTGMLGPKGELGARGPDG 242
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G +G++ G G + LGP G GP G GP G G GR+ G
Sbjct: 243 DPGPQGVAGAIGDHGQRGVMGELGPKGETGVQGPRGITGLPGPKGEPGLPGVDGRVGIPG 302
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G +G G +GP G
Sbjct: 303 LPGAKGSVGKPGVPGEIGPQG 323
>gi|423573577|ref|ZP_17549696.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus MSX-D12]
gi|401214504|gb|EJR21233.1| exosporium leader peptide, partial [Bacillus cereus MSX-D12]
Length = 1065
Score = 44.3 bits (103), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/174 (28%), Positives = 60/174 (34%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 683 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 742
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G G G G G G G + + GP G G
Sbjct: 743 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 802
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +
Sbjct: 803 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGAT 853
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/177 (28%), Positives = 61/177 (34%), Gaps = 3/177 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 683 GPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQ 742
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G+ GP G G G G G G G + GP G G
Sbjct: 743 GIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQ 802
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +GP+G + G G G +G GP G GP+G G +G
Sbjct: 803 G---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGATGAT 856
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.076, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/190 (26%), Positives = 61/190 (32%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----- 75
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 612 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 671
Query: 76 ----------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 672 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 731
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 732 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 791
Query: 186 PSGRLRYLGL 195
P G G+
Sbjct: 792 PEGPQGVQGI 801
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/168 (29%), Positives = 63/168 (37%), Gaps = 18/168 (10%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
G +G+ G +G+ G +G GP G G +GP+G GP G
Sbjct: 913 VTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQG------EIGPTGPQGIQGPQG 966
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
GP+G GP G GP G + GP+G GP G G +G G
Sbjct: 967 ---IQGPTGATGAQGPQG---IQGPQGDI---GPTGPQGIQGPQGPQGIQGATGATGAQG 1017
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P G GP G + GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 1018 PQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQGIQGPTGATGETGATGPQG 1062
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 16/176 (9%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 77
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPRGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVEGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 78 --PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG- 134
P G GP G GP +GP+G G G GP G +GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 135 -RLRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
++ L G +G G G GPSG G +G GP+G GP+G
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQGPSGNTGATGATGE-GITGPTG---ITGPTG 200
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/203 (27%), Positives = 68/203 (33%), Gaps = 21/203 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP G +GP +G+ GP G GPSG GP G G G + G
Sbjct: 314 DQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGAMGDIGPTG 370
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G GP G GP G GP G G G GP G G G
Sbjct: 371 PEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITG 430
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLR 173
+ G G G G + GP G G G + GP +G
Sbjct: 431 ATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQG 490
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GP+G +G +
Sbjct: 491 VQGPQGIQGIQGPTGATGDMGAT 513
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/208 (26%), Positives = 65/208 (31%), Gaps = 24/208 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLR---------YLGPSGRLRYLGPSGSLRY----- 57
+GP+G GP G G +G +GP+G GP GS
Sbjct: 612 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 671
Query: 58 ----------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G + GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 672 GTGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVG 731
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G G G GP G G G G G G G + G
Sbjct: 732 ATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATG 791
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
P G G G + GP G G+
Sbjct: 792 PEGPQGVQGIQGAIGPTGPMGAQGVQGI 819
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/193 (27%), Positives = 65/193 (33%), Gaps = 12/193 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G GP G +GP +G+ GP G GPSG+ GP G G G
Sbjct: 309 TGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQGIQGVPGPSGA---TGPQGVQGIQGAMGD 365
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G GP G GP G GP G G G GP G G
Sbjct: 366 IGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGV 425
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G + GP G G G + GP +GP G
Sbjct: 426 QGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAIGPTGP------MGPQGVQGV 479
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G+ G+
Sbjct: 480 QGIQGATGAQGVQ 492
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 63/182 (34%), Gaps = 7/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 691 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 750
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------LGPSGR 126
GP G G G G G G G + GP G +GP+G
Sbjct: 751 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQGAIGPTGP 810
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ + G G G +G GP G GP+G G +G G +G GP
Sbjct: 811 MGAQGVQGIQGIQGATGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGATGATGE-GSTGPTGVTGP 869
Query: 187 SG 188
+G
Sbjct: 870 TG 871
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/117 (31%), Positives = 46/117 (39%), Gaps = 9/117 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+GP+G GP G GP+G+ GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 952 EIGPTGPQGIQGPQG---IQGPTGATGAQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGPQGIQG 1008
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+G GP G GP G + GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 1009 ATGATGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPQGIQGPQGIQGPTGATGETGATGPQG 1062
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 62/178 (34%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G G G G +G GP G +GP +G GP
Sbjct: 280 GPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVTGATGDQGPQ 339
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GPSG+ GP G G G + GP G GP G GP G +
Sbjct: 340 GIQGVPGPSGAT---GPQGVQGIQGAMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPE 396
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G G G GP G G G G G G G + GP G
Sbjct: 397 GPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEG 454
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/159 (30%), Positives = 61/159 (38%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG- 95
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPRGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVEGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 96 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG- 152
P G GP G GP +GP+G + G G GP G GP G
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 148
Query: 153 -RLRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
++ L G +G G G GPSG G +G
Sbjct: 149 QGVQGLPGATGSQGIQGVQGIQGPQGPSGNTGATGATGE 187
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.70, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/176 (28%), Positives = 61/176 (34%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP GS G +G
Sbjct: 612 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 671
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 672 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 728
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
P G GP G G G GP G G G G + G+
Sbjct: 729 PVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGAQGATGIQGIQ 784
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/186 (27%), Positives = 65/186 (34%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G G + GP G GP G GP G+ GP G G G
Sbjct: 351 TGPQGVQGIQGAMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGA 410
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G G G G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 411 TGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQGAI---GP 467
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--RYLGPSGRL 190
+G + G G G +G GP G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 468 TGPMGPQGVQGVQGIQGATGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGEGATGPTGVT 527
Query: 191 RYLGLS 196
G++
Sbjct: 528 GPTGVT 533
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 64/176 (36%), Gaps = 7/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G+ GP G G G+ GP G G G
Sbjct: 709 TGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 768
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 769 TGATGAQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGIQG---AIGPTGPMGAQGVQGIQGIQGA 825
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 826 TGAQGVQGPQGVQGIQGPTGATGETGATGATGE-GSTGPTGVTGPTG---VTGPSG 877
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/176 (29%), Positives = 65/176 (36%), Gaps = 7/176 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G+ GP G G G+ GP G G G
Sbjct: 369 TGPEGPEGLQGPQGIQGVPGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGI 428
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G+ G G + GP G G G +GP+G + G G G
Sbjct: 429 TGATGVQGATGIQGIQGEIGATGPEGPQGVQGAQG---AIGPTGPMGPQGVQGVQGIQGA 485
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP G GP+G +G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 486 TGAQGVQGPQGIQGIQGPTGATGDMGATGATGE-GATGPTGVTGPTG---VTGPSG 537
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 60/177 (33%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---S 88
GP G GP G GP+G G G G +G GP G +GP +
Sbjct: 271 GPIGPTGPEGPQGIQGIPGPTGVTGEQGIQGVQGIQGITGATGDQGPQGIQGVIGPQGVT 330
Query: 89 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
G GP G GPSG GP G G G + GP G GP G
Sbjct: 331 GATGDQGPQGIQGVPGPSG---ATGPQGVQGIQGAMGDIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVP 387
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
GP G GP G G G GP G G G G+ + G+
Sbjct: 388 GPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATGPQGPQGIQGIQGVQGITGATGVQGATGIQGIQ 444
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 64/193 (33%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
G +G+ G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 573 ITGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTG 632
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRYLG 122
+G G G +GP+G GP G GP G + G
Sbjct: 633 ATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGPTG 692
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G G + GP G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 693 PQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGVQGATG 752
Query: 183 YLGPSGRLRYLGL 195
GP G G+
Sbjct: 753 PQGPQGIQGIQGV 765
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/99 (30%), Positives = 39/99 (39%), Gaps = 9/99 (9%)
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG- 158
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP G + GP G+ G
Sbjct: 35 IGITGPTGPRGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVEGIQGPVGPIGATGPEGQQGPQGL 94
Query: 159 --PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
P G GP G GP +GP+G G+
Sbjct: 95 RGPQGETGATGPQGVQGLQGP------IGPTGATGAQGI 127
>gi|52141776|ref|YP_085053.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus cereus E33L]
gi|51975245|gb|AAU16795.1| collagen-like triple helix repeat protein, glycine-rich [Bacillus
cereus E33L]
Length = 813
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.036, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 63/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 325 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAG---ATGPQG-- 379
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ GP G G +G G G G +G GP+G G
Sbjct: 380 -VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQ 438
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 439 GPAGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG 493
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/178 (29%), Positives = 67/178 (37%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 421 GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGAT---GPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 477
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 478 GVQGPAGATGATGPQGAQGPAGATGATGSQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGPQ 534
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G G +G GP+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 535 GAQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG 589
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.045, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/166 (31%), Positives = 66/166 (39%), Gaps = 15/166 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 445 GPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAG-- 499
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +GS GP+G GP G GP+G G G GP G G +
Sbjct: 500 -ATGATGSQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAGAT 555
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 556 GPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTG 595
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 69/175 (39%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 439 GPAG---ATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG-- 493
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G +G GP+G GP G GP+G G G + GP
Sbjct: 494 -AQGPAGAT---GATGSQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQ 546
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 547 GAQGPAGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTG 595
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 310 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 366
Query: 74 RYLGPSGSL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+G+ GP+G GP G G +G G G G +G
Sbjct: 367 GVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQ 426
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G G GP G G +G G G G +G GP+G
Sbjct: 427 GPAGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAG 484
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 66/175 (37%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G GP+G+ GP G G +G+ G G G +G
Sbjct: 364 GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQ 423
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G+ G G GP G G +G G G G +G GP+
Sbjct: 424 GVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPA 483
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 484 GATGATGPQG---AQGPAG---ATGATGSQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAG 529
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G +G+ G G G +G GP+G G G
Sbjct: 382 GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPA 441
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G G G G +G GP+G GP G + GP+
Sbjct: 442 GATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPA 498
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G GP+G G G GP G
Sbjct: 499 G---ATGATGSQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQG 547
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 63/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 355 GNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNT 414
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G G G GP G G +G G G + G +
Sbjct: 415 GATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGAT 474
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GP+G G +G GP+G GP G
Sbjct: 475 GPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAG---ATGATGSQGVQGPAGATGATGPQG 523
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/180 (28%), Positives = 65/180 (36%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G G+ G +G GP+G G G GP G G +G
Sbjct: 398 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGNTGATG 457
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G G+ G +G GP+G GP G G +G GP+G
Sbjct: 458 ATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGPAGATGATGSQGVQGPAGATG 517
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ GP G GP+G G G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 518 ATGPQG---VQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAGATGATGPQG 574
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/171 (29%), Positives = 63/171 (36%), Gaps = 12/171 (7%)
Query: 18 RLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
L+ L G+ GP G GP+G GP G GP+G GP G G
Sbjct: 290 DLKVLKVHGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTG 343
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
+G+ G G G +G GP+G GP G GP+G + GP G
Sbjct: 344 ATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAG---ATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQG 397
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G G G G +G GP+G G G GP G
Sbjct: 398 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQG 448
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/175 (29%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 12/175 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP+G+ GP G GP+G GP G G +G G G
Sbjct: 301 GATGPQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNT 357
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 358 GATGATGPQGVQGPAG---ATGPQG---VQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGAQ 411
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G GP G G +G G +G GP G
Sbjct: 412 GNTGATGATGPQGVQGPAG---ATGPQGVQGPAGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 463
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.73, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 64/175 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G G +G+ G G+ G +G GP+G+ G G GP G
Sbjct: 391 GPQGVQGNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGVQ 450
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G GP+G GP G G +G S G
Sbjct: 451 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGPAGATGATGSQGVQ 510
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G GP+G G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 511 GPAGATGATGPQGVQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAG 565
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/153 (30%), Positives = 59/153 (38%), Gaps = 12/153 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLG 68
N G +G G G+ G +G GP+G GP G+ G +G G
Sbjct: 452 NTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGPAGATGATGSQGVQG 511
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G GP G GP+G G G GP G G +G GP+G
Sbjct: 512 PAGATGATGPQG---VQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQGPAGATG 568
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 569 ATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTG 595
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.86, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 64/175 (36%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G+ G +G+ GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 340 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGAT---GPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGATGPQGVQ 396
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G GP+G G G GP G + G +
Sbjct: 397 GNTGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGPAGATGPQGVQGNTGAT 456
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G G +G GP+G GP G GP+G G G
Sbjct: 457 GATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATGPQG---AQGPAGATGATGSQG 508
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/201 (28%), Positives = 74/201 (36%), Gaps = 44/201 (21%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +GS GP+G+ GP G GP+G+ G G GP G
Sbjct: 496 GPAG---ATGATGSQGVQGPAGATGATGPQG---VQGPAGATGPQGAQGPAGATGPQGAQ 549
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
G +G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 550 GPAGATGPQGAQGPAGATGATGPQG---IQGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTG 603
Query: 128 ------------------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+ G +G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 604 PTGPSGGPPGPTGPQGPQGNTGATGPQGIQGPAGATGATGPQG---TQGPAGATGATGPQ 660
Query: 170 GRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 188
G GP+G + GP+G
Sbjct: 661 G---VQGPTGATGIGVTGPTG 678
>gi|229151541|ref|ZP_04279744.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus m1550]
gi|228632084|gb|EEK88710.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus m1550]
Length = 666
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.037, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 73/184 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G G L +GP+G+ G G +GP+G+ +G G G +G
Sbjct: 327 TGPTGAEGSRGIQGPLGVIGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVAGPAGVTGA 386
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G G +G G G G +G + GP
Sbjct: 387 EGAQGAQGIRGVTGPAGSQGIPGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGP 446
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +GP+G + G G GP+G G G +GP+G GP G
Sbjct: 447 QGVQGIIGPTGAIGLQGSQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGSAGE 506
Query: 193 LGLS 196
+G++
Sbjct: 507 VGIT 510
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/193 (26%), Positives = 69/193 (35%), Gaps = 18/193 (9%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G L +GP+G+ G G +GP+G +G G G +G G G
Sbjct: 339 QGPLGVIGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGV 398
Query: 76 LGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+GS G +G GP G GP G +GP+G
Sbjct: 399 TGPAGSQGIPGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGA 458
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ G G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G
Sbjct: 459 IGLQGSQGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGSAGEVGITGPQGVQGA 518
Query: 178 SGRLRYLGPSGRL 190
G GP G +
Sbjct: 519 QGSQGPQGPQGNV 531
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.55, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/187 (25%), Positives = 68/187 (36%), Gaps = 18/187 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G +GP+G+ +G G G +G+ G G GP+G
Sbjct: 345 IGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGVTGPAGS 404
Query: 73 LRY------LGPSGSLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G +G+ GP G GP G +GP+G + G
Sbjct: 405 QGIPGVQGIQGETGAAGIQGPQGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGS 464
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
G GP+G G G +GP+G GP G +G +G G G
Sbjct: 465 QGLQGITGPTGAQGVQGIQGVQGIIGPTGAQGIRGPQGSAGEVGITGPQGVQGAQGSQGP 524
Query: 175 LGPSGRL 181
GP G +
Sbjct: 525 QGPQGNV 531
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/178 (26%), Positives = 65/178 (36%), Gaps = 15/178 (8%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G SG + +G G GP+G+ G G L +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 309 TGVSGGIGPIGAQGVQGITGPTGAEGSRGIQGPLGVIGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGA 368
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
+G G GP+G G G G +G S G G G +G GP
Sbjct: 369 QGMVGIQG---VAGPAGVTGAEGAQGAQGIRGVTGPAGSQGIPGVQGIQGETGAAGIQGP 425
Query: 151 SG------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G +GP+G + G G GP+G G+
Sbjct: 426 QGVQGIQGTTGLTGTQGAQGPQGVQGIIGPTGAIGLQGSQGLQGITGPTGAQGVQGIQ 483
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 67/184 (36%), Gaps = 8/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 11 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPQG---TTGAQGI 65
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+G +G GP+G G G + G G + G G GP+G G
Sbjct: 66 QGAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGT 122
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G+ G G G SG GP G G G + G G
Sbjct: 123 QGIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGFQGI 182
Query: 193 LGLS 196
G++
Sbjct: 183 QGIT 186
>gi|423528794|ref|ZP_17505239.1| hypothetical protein IGE_02346 [Bacillus cereus HuB1-1]
gi|402449662|gb|EJV81497.1| hypothetical protein IGE_02346 [Bacillus cereus HuB1-1]
Length = 835
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.038, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/185 (28%), Positives = 67/185 (36%), Gaps = 5/185 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGP 69
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP +G GP
Sbjct: 22 TGPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGP 79
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G +G + G G + GP G + G G GP+G G G
Sbjct: 80 VGDTGEQGITGPVGLQGSQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGE 139
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G G + G SG + GP G G G G G G +G
Sbjct: 140 IGERGETGAQGMQGEIGVTGISGVMGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGE 199
Query: 190 LRYLG 194
+ G
Sbjct: 200 QGHQG 204
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.061, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/184 (27%), Positives = 64/184 (34%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP+G+ GP G GP +G GP G G +G + G
Sbjct: 39 GPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGSQ 98
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G + GP G + G G GP+G G G +G G G G +
Sbjct: 99 GLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGEIGVT 158
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G SG + GP G G G G G G +G + G G GP G
Sbjct: 159 GISGVMGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGST 218
Query: 191 RYLG 194
G
Sbjct: 219 GIQG 222
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.065, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/193 (27%), Positives = 76/193 (39%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G +G G +GP+G+ G G GP+G+ G G + G +G
Sbjct: 374 IGATGVEGPIGIQGPQGEIGPTGAEGPRGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGA 433
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G G +G G G G +G GP G G +G + G
Sbjct: 434 VGAQGPQGIRGETGDAGPQGAQGIQGVQGITGAAGVQGIQGPQGIQGENGLTGPQGAQGI 493
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G + GP G +GP+G G G +GP+G GP G L
Sbjct: 494 QGVQGITGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGIQGIQGIIGPTGAQGIRGPQGNLGE 553
Query: 193 LGLSDGLRVSGLH 205
G++ V G
Sbjct: 554 NGITGSQGVQGAQ 566
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 63/182 (34%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G G +G + G G + GP G + G G GP+G
Sbjct: 69 GTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVGLQGSQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G +G G G G + G SG + GP G G G G
Sbjct: 129 GIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGEIGVTGISGVMGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEE 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G +G + G G GP G GP G G +G + GP G
Sbjct: 189 GPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGSTGIQGPQGISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQ 248
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 249 GV 250
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.089, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/175 (28%), Positives = 61/175 (34%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + G G GP+GS G G +G G G G + G SG +
Sbjct: 105 GPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGEIGVTGISGVM 164
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ G G G G G +G + G G GP G GP
Sbjct: 165 GPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGSTGIQGPQ 224
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G + GP G G G + GP G G +G G G
Sbjct: 225 GISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQGVRGSTGFQGPKGIRGITGATGSTGTQGAEG 279
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/182 (27%), Positives = 62/182 (34%), Gaps = 9/182 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP G GP G+ +G +G GP G G G +
Sbjct: 47 TGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQGIQGPVGDTGEQGITGPVG---LQGSQGLIGE 103
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G + G G GP+G G G +G G G G + G SG
Sbjct: 104 QGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGEIGVTGISGV 163
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP G G G G G G +G + G G GP G GP
Sbjct: 164 MGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPPGSTGIQGP 223
Query: 187 SG 188
G
Sbjct: 224 QG 225
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/173 (27%), Positives = 60/173 (34%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + G G + GP G + G G GP+GS G G +G G
Sbjct: 89 TGPVGLQGSQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGA 148
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
G G + G SG + GP G G G G G G +G G G
Sbjct: 149 QGMQGEIGVTGISGVMGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGI 208
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G G +G + GP G G G + GP G
Sbjct: 209 QGVTGPPGSTGIQGPQGISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQGVRGSTGFQGPKG 261
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.49, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/182 (26%), Positives = 68/182 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G GS +G +G G G +G +G +G G +GP+G
Sbjct: 338 TGPTGAQGARGAQGSQGVIGVAGVQGAQGIQGAQGIIGATGVEGPIGIQGPQGEIGPTGA 397
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G G G + G +G + GP G G +G + G
Sbjct: 398 EGPRGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAVGAQGPQGIRGETGDAGPQGAQGI 457
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G +G GP G G +G G G GP+G + GP G
Sbjct: 458 QGVQGITGAAGVQGIQGPQGIQGENGLTGPQGAQGIQGVQGITGPTGAIGLQGPQGIQGI 517
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 518 VG 519
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 61/183 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP G + G G GP+G G G +G G G G +
Sbjct: 96 GSQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQGIQGEIGERGETGAQGMQGEI 155
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G SG + GP G G G G G G +G + G G GP
Sbjct: 156 GVTGISGVMGPQGPQGAQGIQGEDGTTGIQGEEGPQGIRGITGEQGHQGDQGIQGVTGPP 215
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G G +G + GP G G G + GP G G +G
Sbjct: 216 GSTGIQGPQGISGIRGITGVIGPQGPQGIQGIQGVRGSTGFQGPKGIRGITGATGSTGTQ 275
Query: 194 GLS 196
G
Sbjct: 276 GAE 278
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/193 (26%), Positives = 72/193 (37%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP+G G G GP+G+ G G + G +G++ GP G G +G
Sbjct: 391 EIGPTGAEGPRGVQGIQGVTGPTGAQGIQGLQGIIGPTGTTGAVGAQGPQGIRGETGDAG 450
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G +G GP G G +G G G GP+G + G
Sbjct: 451 PQGAQGIQGVQGITGAAGVQGIQGPQGIQGENGLTGPQGAQGIQGVQGITGPTGAIGLQG 510
Query: 132 PSGRLRYLGPSGR---------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G +GP+G +GP+G GP G L G +G G G
Sbjct: 511 PQGIQGIVGPTGAQGSQGIQGIQGIIGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGSQGVQGAQGIEG 570
Query: 183 YLGPSGRLRYLGL 195
GP G + G+
Sbjct: 571 PEGPQGNVGITGV 583
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/167 (26%), Positives = 65/167 (38%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G G G+ +G +G +G G +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 356 IGVAGVQGAQGIQGAQGIIGATGVEGPIGIQGPQGEIGPTGAEGPRGVQGIQGVTGPTGA 415
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G + G +G + GP G G +G G G G +G GP
Sbjct: 416 QGIQGLQGIIGPTGTTGAVGAQGPQGIRGETGDAGPQGAQGIQGVQGITGAAGVQGIQGP 475
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G +G G G GP+G + GP G +GP+G
Sbjct: 476 QGIQGENGLTGPQGAQGIQGVQGITGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTG 522
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/196 (26%), Positives = 72/196 (36%), Gaps = 21/196 (10%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G + GP G +GP+G+ G G +GP+G+ GP G L G +G
Sbjct: 500 TGPTGAIGLQGPQGIQGIVGPTGAQGSQGIQGIQGIIGPTGAQGIRGPQGNLGENGITGS 559
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------------------SGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G G GP G + G G G G +GP
Sbjct: 560 QGVQGAQGIEGPEGPQGNVGITGVTGETGATGATGATGAQGIQGVQGIQGIQGSTGMIGP 619
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+G G G G G G +G +GP+G GP + +GP+G
Sbjct: 620 TGATGVTGIQGVQGIQGIQGPTGARGITGVNGSVGPAGVQGSQGP---IGAVGPTGATGS 676
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G L +G +G
Sbjct: 677 QGPIGFLGIVGATGAT 692
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/146 (28%), Positives = 57/146 (39%), Gaps = 7/146 (4%)
Query: 55 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLR 110
+ GP+G +GP+G +GP+G GP+G GP G GP +G
Sbjct: 19 IGATGPTGNSGPIGPTGGHEGPVGPTGV---TGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRGTTGAQG 75
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP G G +G + G G + GP G + G G GP+G G G
Sbjct: 76 IQGPVGDTGEQGITGPVGLQGSQGLIGEQGPVGDIGLQGMQGIQGITGPAGSQGIQGAQG 135
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+G G G G + G+S
Sbjct: 136 IQGEIGERGETGAQGMQGEIGVTGIS 161
>gi|355672418|ref|ZP_09058348.1| hypothetical protein HMPREF9469_01385 [Clostridium citroniae
WAL-17108]
gi|354815119|gb|EHE99715.1| hypothetical protein HMPREF9469_01385 [Clostridium citroniae
WAL-17108]
Length = 611
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.040, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/191 (27%), Positives = 71/191 (37%), Gaps = 39/191 (20%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G + GP G + GP G + +GP G GP G +GP G Y+GP+G
Sbjct: 112 TGPRGPMGPEGPRGPMGATGPRGPMGPVGPRGCPGIQGPVGPTGAMGPQG---YVGPTGP 168
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG----------------------------RLRYLG 104
+ GP+G+ G +G GP+G R G
Sbjct: 169 V---GPTGAQGVNGNTGSTGATGPTGPQGPRGITGTAGATGATGATGTSETITIRNTITG 225
Query: 105 PSGRLRYL-----GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G + GP L ++ P G GP+G +GP+G G G GP
Sbjct: 226 NPGEPAEVIDITGGPDHVLDFIIPRGATGPAGPTGNTGAMGPAGATGATGAQGIQGVAGP 285
Query: 160 SGRLRYLGPSG 170
+G GP G
Sbjct: 286 TGATGPQGPQG 296
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/196 (27%), Positives = 74/196 (37%), Gaps = 40/196 (20%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G + GP G + GP G + +GP G GP G +GP G Y+GP+G
Sbjct: 112 TGPRGPMGPEGPRGPMGATGPRGPMGPVGPRGCPGIQGPVGPTGAMGPQG---YVGPTGP 168
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG----------------------------RLRYLG 113
+GP+G G +G GP+G R G
Sbjct: 169 ---VGPTGAQGVNGNTGSTGATGPTGPQGPRGITGTAGATGATGATGTSETITIRNTITG 225
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLN-SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G P+ ++ + GP L ++ P G GP+G +GP+G G G
Sbjct: 226 NPGE-----PAEVIDITGGPDHVLDFIIPRGATGPAGPTGNTGAMGPAGATGATGAQGIQ 280
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP G
Sbjct: 281 GVAGPTGATGPQGPQG 296
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/184 (25%), Positives = 66/184 (35%), Gaps = 48/184 (26%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP G + GP G + GP G + +GP G GP G +GP G Y+GP+G
Sbjct: 112 TGPRGPMGPEGPRGPMGATGPRGPMGPVGPRGCPGIQGPVGPTGAMGPQG---YVGPTGP 168
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG--------------------------RLRYL--- 139
+GP+G G +G + GP+G +R
Sbjct: 169 ---VGPTGAQGVNGNTGSTGATGPTGPQGPRGITGTAGATGATGATGTSETITIRNTITG 225
Query: 140 -------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP L ++ P G GP+G +GP+G G G GP
Sbjct: 226 NPGEPAEVIDITGGPDHVLDFIIPRGATGPAGPTGNTGAMGPAGATGATGAQGIQGVAGP 285
Query: 187 SGRL 190
+G
Sbjct: 286 TGAT 289
>gi|168206909|ref|ZP_02632914.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens E
str. JGS1987]
gi|170661704|gb|EDT14387.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens E
str. JGS1987]
Length = 400
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.042, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 69/180 (38%), Gaps = 1/180 (0%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G + GP G GP G + GP G G +G +GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPVGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPV 188
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP G G +G GP G GP G + GP G + D L VS
Sbjct: 189 GPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGEPG-VDFDDTLSVS 247
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/167 (31%), Positives = 63/167 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G + GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPVGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPV 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 189 GPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 235
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/141 (31%), Positives = 53/141 (37%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + GP G GP G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 95 MGPMGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQGDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGP 154
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
+ GP G G +G GP+G GP G GP G G +G GP
Sbjct: 155 VGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPVGPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGP 214
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G GP G + GP G
Sbjct: 215 QGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 235
>gi|315647656|ref|ZP_07900757.1| triple helix repeat-containing collagen [Paenibacillus vortex V453]
gi|315276302|gb|EFU39645.1| triple helix repeat-containing collagen [Paenibacillus vortex V453]
Length = 531
Score = 43.9 bits (102), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/208 (24%), Positives = 75/208 (36%), Gaps = 30/208 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------- 66
GP+G G +G +G +GS G +G G +G+ GP+G
Sbjct: 325 GPTGVTGITGSTGVTGAIGATGSTGSTGATGVTGSTGVTGATGATGPTGATGVSGTTGVT 384
Query: 67 -----LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP+G + G +G GP+G G +G G +G + G +G
Sbjct: 385 GSTGVTGPTGAIGPTGITGITGVTGPTGVTGPTGSAGVTGATGITGATGHTGVTGSSGVT 444
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
GP+G S GP G G +G G +G GP+G
Sbjct: 445 GPTG---STGPIGVTGNTGSAGVTGPTGATGAAGATGPTGVTGITGVTGSTGPTGVTGAA 501
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G GP+G + G
Sbjct: 502 GATGVTGSTGATGATGITGPTGIMGLTG 529
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/198 (23%), Positives = 73/198 (36%), Gaps = 24/198 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY------------LGPS 61
G +G +G +GS G +G G +G GP+G+ GP+
Sbjct: 334 GSTGVTGAIGATGSTGSTGATGVTGSTGVTGATGATGPTGATGVSGTTGVTGSTGVTGPT 393
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + G +G GP+G G +G G +G + G +G GP+G +
Sbjct: 394 GAIGPTGITGITGVTGPTGVTGPTGSAGVTGATGITGATGHTGVTGSSGVTGPTGSTGPI 453
Query: 122 GPSGRLNSDG------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G +G S G +G G +G GP+G G +G G +
Sbjct: 454 GVTGNTGSAGVTGPTGATGAAGATGPTGVTGITGVTGSTGPTGVTGAAGATGVTGSTGAT 513
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP+G + G +
Sbjct: 514 GATGITGPTGIMGLTGST 531
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/140 (26%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G G +G +G +GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 325 GPTGVTGITGSTGVTGAIGATGSTGSTGATGVTGSTGVTGATGATGPTGATGVSGTTGVT 384
Query: 119 RYLG---PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G P+G + G +G GP+G G +G G +G + G +G
Sbjct: 385 GSTGVTGPTGAIGPTGITGITGVTGPTGVTGPTGSAGVTGATGITGATGHTGVTGSSGVT 444
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G +G +G G+
Sbjct: 445 GPTGSTGPIGVTGNTGSAGV 464
>gi|384264321|ref|YP_005420028.1| collagen like triple helix with GXT repeats [Bacillus
amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2]
gi|387897251|ref|YP_006327547.1| hypothetical protein MUS_0762 [Bacillus amyloliquefaciens Y2]
gi|380497674|emb|CCG48712.1| collagen like triple helix with GXT repeats [Bacillus
amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2]
gi|387171361|gb|AFJ60822.1| hypothetical protein MUS_0762 [Bacillus amyloliquefaciens Y2]
Length = 680
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.046, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/208 (24%), Positives = 74/208 (35%), Gaps = 27/208 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP+G G +G+ G +G GP+GS G +G G +G +
Sbjct: 255 GPIGITGVTGPTGVTGSTGSTGATGSTGLTGSTGDTGPTGSTGETGATGSTGSTGVTGAI 314
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG-- 131
GP+G+ G G G +G +GP+G G +G G +G S G
Sbjct: 315 GPAGPTGATGATGAIGPTGGSGSTGSTGEIGPTGATGSTGVTGATGITGATGVTGSSGVT 374
Query: 132 -------------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
P+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 375 GSTGITGATGVTGTTGVTGVTGATGPTGATGVTGVTGITGVTGSTGSAGATGPTGVAGPT 434
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G +G G +G +GP+G G
Sbjct: 435 GVTGSTGVTGSTGPTGEIGPTGVTGETG 462
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.082, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/213 (25%), Positives = 81/213 (38%), Gaps = 24/213 (11%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
A + GP+G + GP+G GP G GP+G G +G+ G +G G
Sbjct: 238 AAGSTGPTGEI---GPTG---VTGPIGITGVTGPTGVTGSTGSTGATGSTGLTGSTGDTG 291
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P+G G +GS G +G + GP+G G G G +G +GP+G
Sbjct: 292 PTGSTGETGATGSTGSTGVTGAIGPAGPTGATGATGAIGPTGGSGSTGSTGEIGPTGATG 351
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------------------LRYLGPSGRLRYLGPSG 170
S G +G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 352 STGVTGATGITGATGVTGSSGVTGSTGITGATGVTGTTGVTGVTGATGPTGATGVTGVTG 411
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
G +G GP+G G++ V+G
Sbjct: 412 ITGVTGSTGSAGATGPTGVAGPTGVTGSTGVTG 444
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/204 (24%), Positives = 74/204 (36%), Gaps = 27/204 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G+ G +GS GP+G G +GS G +G + GP+G
Sbjct: 264 GPTGVTGSTGSTGATGSTGLTGSTGDTGPTGSTGETGATGSTGSTGVTGAIGPAGPTGAT 323
Query: 74 RYLGPSG---------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------- 117
G G S +GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 324 GATGAIGPTGGSGSTGSTGEIGPTGATGSTGVTGATGITGATGVTGSSGVTGSTGITGAT 383
Query: 118 -----------LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 384 GVTGTTGVTGVTGATGPTGATGVTGVTGITGVTGSTGSAGATGPTGVAGPTGVTGSTGVT 443
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G +GP+G G +G +
Sbjct: 444 GSTGPTGEIGPTGVTGETGSTGEI 467
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/179 (24%), Positives = 68/179 (37%), Gaps = 18/179 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G G +GS G +G++ GP+G G G G +G +GP+G
Sbjct: 289 DTGPTGSTGETGATGSTGSTGVTGAIGPAGPTGATGATGAIGPTGGSGSTGSTGEIGPTG 348
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG------------------PSGRLRYLG 113
G +G+ G +G G +G G P+G G
Sbjct: 349 ATGSTGVTGATGITGATGVTGSSGVTGSTGITGATGVTGTTGVTGVTGATGPTGATGVTG 408
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
+G G +G + GP+G G +G G +G +GP+G G +G +
Sbjct: 409 VTGITGVTGSTGSAGATGPTGVAGPTGVTGSTGVTGSTGPTGEIGPTGVTGETGSTGEI 467
>gi|407437875|gb|AFU20632.1| gp4 [Mycobacterium phage Goose]
Length = 393
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.047, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/128 (33%), Positives = 51/128 (39%), Gaps = 6/128 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP+G GP G +
Sbjct: 133 GPAGPQGERGPQGPTGEQGPRGYTGEVGPQGPVGPAGPKGDQGVPGPTGP---TGPQGPV 189
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLNSD 130
+GP G GP G G G + GP G +GP G GP G D
Sbjct: 190 GPVGPKGDTGPQGPKGDRGDQGLVGPVGPAGPKGDQGEMGPQGPTGPQGPRGYDGDNGVD 249
Query: 131 GPSGRLRY 138
G GR Y
Sbjct: 250 GADGRSAY 257
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 46/112 (41%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP+G GP G +
Sbjct: 133 GPAGPQGERGPQGPTGEQGPRGYTGEVGPQGPVGPAGPKGDQGVPGPTGPT---GPQGPV 189
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+GP G GP G G G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 190 GPVGPKGDTGPQGPKGDRGDQGLVGPVGPAGPKGDQGEMGPQGPTGPQGPRG 241
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 46/112 (41%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP+G GP G +
Sbjct: 133 GPAGPQGERGPQGPTGEQGPRGYTGEVGPQGPVGPAGPKGDQGVPGPTGPT---GPQGPV 189
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
+GP G GP G G G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 190 GPVGPKGDTGPQGPKGDRGDQGLVGPVGPAGPKGDQGEMGPQGPTGPQGPRG 241
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.35, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 46/112 (41%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP+G GP G +
Sbjct: 133 GPAGPQGERGPQGPTGEQGPRGYTGEVGPQGPVGPAGPKGDQGVPGPTGPT---GPQGPV 189
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
+GP G GP G G G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 190 GPVGPKGDTGPQGPKGDRGDQGLVGPVGPAGPKGDQGEMGPQGPTGPQGPRG 241
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 46/112 (41%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP+G GP G +
Sbjct: 133 GPAGPQGERGPQGPTGEQGPRGYTGEVGPQGPVGPAGPKGDQGVPGPTGPT---GPQGPV 189
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+GP G GP G G G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 190 GPVGPKGDTGPQGPKGDRGDQGLVGPVGPAGPKGDQGEMGPQGPTGPQGPRG 241
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 45/112 (40%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP+G GP G +
Sbjct: 133 GPAGPQGERGPQGPTGEQGPRGYTGEVGPQGPVGPAGPKGDQGVPGPTGPT---GPQGPV 189
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G G G + GP G +GP G GP G
Sbjct: 190 GPVGPKGDTGPQGPKGDRGDQGLVGPVGPAGPKGDQGEMGPQGPTGPQGPRG 241
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 45/112 (40%), Gaps = 3/112 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G GP G GP G +GP G + GP G GP+G GP G +
Sbjct: 133 GPAGPQGERGPQGPTGEQGPRGYTGEVGPQGPVGPAGPKGDQGVPGPTGPT---GPQGPV 189
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
+GP G GP G G G + GP G GP G GP G
Sbjct: 190 GPVGPKGDTGPQGPKGDRGDQGLVGPVGPAGPKGDQGEMGPQGPTGPQGPRG 241
>gi|195386310|ref|XP_002051847.1| GJ10166 [Drosophila virilis]
gi|194148304|gb|EDW64002.1| GJ10166 [Drosophila virilis]
Length = 1839
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/115 (35%), Positives = 53/115 (46%)
Query: 11 LNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
+ +GP GR G SGS+ G G +G G+ G GS+ Y G +GR+ GP+
Sbjct: 870 IVVGPPGRQGEPGRSGSVALHGVKGQKGEVGYPGQFGQNGAKGSIGYPGRAGRVGDPGPA 929
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G GPSG G G +G GR LGP G + GP G +GP G
Sbjct: 930 GYPGEPGPSGLAGIPGEQGDRGDIGFDGRTGDLGPRGAVGDFGPKGLTGDIGPFG 984
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/113 (35%), Positives = 52/113 (46%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP GR G SGS+ G G+ +G G+ G GS+ Y G +GR+ GP+G
Sbjct: 872 VGPPGRQGEPGRSGSVALHGVKGQKGEVGYPGQFGQNGAKGSIGYPGRAGRVGDPGPAGY 931
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GPSG G G +G GR GP G + GP G +GP G
Sbjct: 932 PGEPGPSGLAGIPGEQGDRGDIGFDGRTGDLGPRGAVGDFGPKGLTGDIGPFG 984
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/113 (34%), Positives = 49/113 (43%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
+GP G G SGS+ G G+ +G G G G + Y G +GR+ GP+G
Sbjct: 872 VGPPGRQGEPGRSGSVALHGVKGQKGEVGYPGQFGQNGAKGSIGYPGRAGRVGDPGPAGY 931
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GPSG G G +G GR LGP G + GP G GP G
Sbjct: 932 PGEPGPSGLAGIPGEQGDRGDIGFDGRTGDLGPRGAVGDFGPKGLTGDIGPFG 984
>gi|423550540|ref|ZP_17526867.1| hypothetical protein IGW_01171, partial [Bacillus cereus ISP3191]
gi|401189210|gb|EJQ96267.1| hypothetical protein IGW_01171, partial [Bacillus cereus ISP3191]
Length = 177
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.048, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/177 (27%), Positives = 63/177 (35%), Gaps = 27/177 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G +G G +G+ GP G+ G +G G +G+ GP G G +G
Sbjct: 10 NTGATGATGSQGNTGATGATGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATG 69
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLG 113
GP+G+ GP G G +G GP G G
Sbjct: 70 PQGVQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPTGPTGPTGPQGNTGATG 129
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
P G GP+G + GP G G +G GP G GP+G GP G
Sbjct: 130 PQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQG---VQGPAGATGATGPQG 177
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/186 (27%), Positives = 64/186 (34%), Gaps = 30/186 (16%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G+ G +GS G +G GP G+ G +G G +G GP G
Sbjct: 4 ATGPQGNTGATGATGSQGNTGATG---ATGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 60
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------RYLG 122
G +G GP+G GP G G +G G
Sbjct: 61 VQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPTGPTGPTG 120
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G + GP G GP+G GP G G +G GP G GP+G
Sbjct: 121 PQGNTGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQGNTGATG---ATGPQG---VQGPAGATG 171
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 172 ATGPQG 177
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/174 (23%), Positives = 55/174 (31%), Gaps = 30/174 (17%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G+ G +G G +G GP G+ G +G G +G GP G
Sbjct: 4 ATGPQGNTGATGATGSQGNTGATG---ATGPQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQG 60
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL---------------------- 145
G +G GP+G + GP G G +G
Sbjct: 61 VQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGPQGNTGATGATGIGVTGPTGPSGGPTGPTGPTG 120
Query: 146 --RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLG 194
G +G GP+G GP G G +G GP+G G
Sbjct: 121 PQGNTGATGPQGVQGPAGATGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGPAGATGATG 174
>gi|395841602|ref|XP_003793623.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 5 [Otolemur
garnettii]
Length = 1442
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.050, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 59/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 756 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 815
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 816 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 875
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 876 GPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 930
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 781 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 840
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP G + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 841 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 900
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G GPSG GP G
Sbjct: 901 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 930
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 781 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 840
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 841 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 900
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 901 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 930
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 80
GP G+ +GP+G+ GP G G G+ GP G +G G G G
Sbjct: 684 GPKGASGPVGPTGAQ---GPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGR 740
Query: 81 ----------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G + GP+G G G GP G + GP G
Sbjct: 741 GLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQP 800
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 801 GAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 860
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/171 (29%), Positives = 61/171 (35%), Gaps = 3/171 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G G G+ GP G + GP G+ G G +GP
Sbjct: 690 GPVGPTGAQGPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPP 749
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G G + GP+G G G GP G + GP G G G
Sbjct: 750 GPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEA 809
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 810 GQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 860
>gi|56962251|ref|YP_173975.1| hypothetical protein ABC0473 [Bacillus clausii KSM-K16]
gi|56908487|dbj|BAD63014.1| hypothetical protein [Bacillus clausii KSM-K16]
Length = 881
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/169 (28%), Positives = 70/169 (41%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 258 VTGPTGVTGPTGDTGPTGVTGPTGDTGPTGNTGPTGVTGPTGDTGPTGDTGPTGVTGPTG 317
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ G +G GP+G G +G + GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 318 ATGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGGTGPMGVTGPTGVTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTG 377
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G +G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 378 VTGPTGDTGPTGDTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPMGDTGPTGDTGPTGN 426
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.088, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/168 (28%), Positives = 69/168 (41%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G G +G GP+G G +G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 259 TGPTGVTGPTGDTGPTGVTGPTGDTGPTGNTGPTGVTGPTGDTGPTGDTGPTGVTGPTGA 318
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G GP+G G +G + GP+G G +G GP+G G
Sbjct: 319 TGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGGTGPMGVTGPTGVTGPTGDTGPTGDTGPTGDTGPTGV 378
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G GP+G G +G GP+G +G +G GP+G
Sbjct: 379 TGPTGDTGPTGDTGPTGVTGPTGVTGPTGVTGPMGDTGPTGDTGPTGN 426
>gi|395841600|ref|XP_003793622.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 4 [Otolemur
garnettii]
Length = 1453
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 59/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 767 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 826
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 827 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 886
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 887 GPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 941
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 792 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 851
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP G + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 852 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 911
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G GPSG GP G
Sbjct: 912 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 941
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 792 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 851
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 852 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 911
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 912 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 941
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 80
GP G+ +GP+G+ GP G G G+ GP G +G G G G
Sbjct: 695 GPKGASGPVGPTGAQ---GPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGR 751
Query: 81 ----------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G + GP+G G G GP G + GP G
Sbjct: 752 GLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQP 811
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 812 GAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 871
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/171 (29%), Positives = 61/171 (35%), Gaps = 3/171 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP G G G+ GP G + GP G+ G G +GP
Sbjct: 701 GPVGPTGAQGPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPP 760
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G G + GP+G G G GP G + GP G G G
Sbjct: 761 GPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEA 820
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 821 GQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 871
>gi|149705490|ref|XP_001492989.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 1 [Equus caballus]
Length = 1364
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.054, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G G GS G GR +GP+GS GP+G G SGR
Sbjct: 380 GPNGEPGSTGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPAGSRGASGPAGVRGPNGDSGRP 439
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP GS +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 440 GEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPS 499
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G + G +G GP G GP G G G GP G GP+
Sbjct: 500 GEPGKPGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPA 559
Query: 188 GRLRYLG 194
G +G
Sbjct: 560 GTAGEVG 566
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 407 GADGRAGVMGPAGSRGASGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPV 466
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 467 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGEPGKPGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 526
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 527 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGAR 586
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 587 GERGPPGESGAAGPAGPI 604
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 456 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGEPGKPGDKGHAGLAG 515
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G
Sbjct: 516 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPG 575
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GP+G + GPSG G G LG G G
Sbjct: 576 EFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPAGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVLGAPGTAGPSG 635
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 636 PSG 638
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/132 (33%), Positives = 61/132 (46%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G + GP G +GP+G + G G + +GP G++ GPSG G G
Sbjct: 951 NAGPVGAVGAPGPHGP---VGPTGKHGHRGEPGPVGSVGPVGAVGPRGPSGPQGVRGDKG 1007
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G G G +GP+G GP+G + DG
Sbjct: 1008 EPGDKGPRGLPGIKGHNG-LQGL--PGLAGQHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPTGPVGKDG 1064
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
SG+ +GP+G
Sbjct: 1065 RSGQPGTVGPAG 1076
>gi|340344575|ref|ZP_08667707.1| Collagen triple helix repeat protein [Candidatus Nitrosoarchaeum
koreensis MY1]
gi|339519716|gb|EGP93439.1| Collagen triple helix repeat protein [Candidatus Nitrosoarchaeum
koreensis MY1]
Length = 535
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.056, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/184 (32%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G +G + GP G LGP G GP+G GP G G G
Sbjct: 216 FGPPGEKGDKGSTGPMGDKGPEGIRGPLGPPGDKGLTGPTGDK---GPIGLRGIPGDKGD 272
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G + GP+G+ G G GP G GP+G + GP
Sbjct: 273 KGPQGDKGERGLTGPTGPIGDKGPTGQSGVQGEKGIQGLPGPIGEK---GPTGPIGDKGP 329
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GP+G GP+G L GP G +G G GP G GP G
Sbjct: 330 IG---MQGPTGDKGLTGPTGPLGDKGPIGPPGLIGEKGPRGPEGPVGEKGPQGPQGPAGA 386
Query: 193 LGLS 196
GL+
Sbjct: 387 KGLT 390
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/188 (31%), Positives = 70/188 (37%), Gaps = 9/188 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP G LGP G GP+G GP G G G G G GP+G
Sbjct: 233 DKGPEGIRGPLGPPGDKGLTGPTGDK---GPIGLRGIPGDKGDKGPQGDKGERGLTGPTG 289
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
+ GP+G G G GP G GP G + GP+G GP+G L
Sbjct: 290 PIGDKGPTGQSGVQGEKGIQGLPGPIGEKGPTGPIGDKGPIGMQGPTGDKGLTGPTGPLG 349
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G +G G GP G + GP G G G GP G GP G
Sbjct: 350 DKGPIGPPGLIGEKG---PRGPEGPVGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGPVG 406
Query: 189 RLRYLGLS 196
GL+
Sbjct: 407 LQGDKGLT 414
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/168 (30%), Positives = 65/168 (38%), Gaps = 15/168 (8%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G G +G + GP G LGP G GP+G GP G G G
Sbjct: 215 IFGPPGEKGDKGSTGPMGDKGPEGIRGPLGPPGDKGLTGPTGDK---GPIGLRGIPGDKG 271
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G G GP+G + GP+G+ G G GP G GP +G
Sbjct: 272 DKGPQGDKGERGLTGPTGPIGDKGPTGQSGVQGEKGIQGLPGPIGEKGPTGP------IG 325
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP+G GP+G L GP +GP G + GP G
Sbjct: 326 DKGPIGMQGPTGDKGLTGPTGPLGDKGP------IGPPGLIGEKGPRG 367
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/186 (31%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGP 69
GP+G + GP+G G G GP G GP G + GP+G GP
Sbjct: 285 TGPTGPIGDKGPTGQSGVQGEKGIQGLPGPIGEKGPTGPIGDKGPIGMQGPTGDKGLTGP 344
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLG------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+G L GP G +G P G + GP G G G GP G GP
Sbjct: 345 TGPLGDKGPIGPPGLIGEKGPRGPEGPVGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGP 404
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G G +G +G G GP G GPSG GP G G G+
Sbjct: 405 VGLQGDKGLTGPTGPVGEKGPQGPQGPQGERGASGPSGEEGPQGPQGIQGPQGERGQTGP 464
Query: 184 LGPSGR 189
LGP G
Sbjct: 465 LGPQGE 470
>gi|395841604|ref|XP_003793624.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 6 [Otolemur
garnettii]
Length = 1458
Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.057, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 59/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 772 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 831
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 832 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 891
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 892 GPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 946
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 797 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 856
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP G + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 857 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 916
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G GPSG GP G
Sbjct: 917 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 946
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 797 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 856
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 857 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 916
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 917 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 946
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 80
GP G+ +GP+G+ GP G G G+ GP G +G G G G
Sbjct: 700 GPKGASGPVGPTGAQ---GPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGR 756
Query: 81 ----------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G + GP+G G G GP G + GP G
Sbjct: 757 GLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQP 816
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 876
>gi|395841594|ref|XP_003793619.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Otolemur
garnettii]
Length = 1487
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 59/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 975
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP G + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 886 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 945
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G GPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 975
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 886 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 945
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 975
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 80
GP G+ +GP+G+ GP G G G+ GP G +G G G G
Sbjct: 729 GPKGASGPVGPTGAQ---GPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGR 785
Query: 81 ----------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G + GP+G G G GP G + GP G
Sbjct: 786 GLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQP 845
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 846 GAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|386875911|ref|ZP_10118062.1| collagen triple helix repeat protein [Candidatus Nitrosopumilus
salaria BD31]
gi|386806290|gb|EIJ65758.1| collagen triple helix repeat protein [Candidatus Nitrosopumilus
salaria BD31]
Length = 542
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/180 (32%), Positives = 72/180 (40%), Gaps = 6/180 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G GP+GS GP+ GS G G +G G GP+G GP+
Sbjct: 248 GPPGDKGDKGPTGSTGDKGPTGLRGSPGDKGDDGPQGIIGDKGLTGLTGPTGD---KGPT 304
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G G GP G +GP G +GP+G G +G LG G+
Sbjct: 305 GLSGVQGEKGIQGPPGPIGEKGPVGPLGDKGPVGPAGVSGDKGLTGPTGPLGDKGQQGPP 364
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G L GP G G G GP G GP G + GP+G++
Sbjct: 365 GPLGEKGNKGPEGPLGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGPLGPIGEKGPTGQI 424
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/173 (31%), Positives = 70/173 (40%), Gaps = 6/173 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ GP+G GP+G S G G +G G GP+G GP+G G
Sbjct: 255 DKGPTGSTGDKGPTGLRGSPGDKGDDGPQGIIGDKGLTGLTGPTGDK---GPTGLSGVQG 311
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G GP G +GP G +GP+G G +G LG G+ GP G
Sbjct: 312 EKGIQGPPGPIGEKGPVGPLGDKGPVGPAGVSGDKGLTGPTGPLGDKGQQGPPGPLGEKG 371
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+ GP G L GP G G G GP G GP G + GP+G++
Sbjct: 372 NKGPEGPLGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGPLGPIGEKGPTGQI 424
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/174 (33%), Positives = 70/174 (40%), Gaps = 10/174 (5%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
EK + GP G + GP G L GP +GP+G G +G LG G+
Sbjct: 312 EKGIQ-GPPGPIGEKGPVGPLGDKGP------VGPAGVSGDKGLTGPTGPLGDKGQQGPP 364
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G L GP G G G GP G GP G + GP+G++
Sbjct: 365 GPLGEKGNKGPEGPLGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGPLGPIGEKGPTGQI 424
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+ G G GP G GPSG GP G GP G GP G +
Sbjct: 425 GAPGDKGPQGPQGPQGERGTTGPSGEKGPQGPQG---IQGPQGERGPTGPMGSI 475
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/175 (33%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G GP G + GP G L GP G G SG GP+G LG G+
Sbjct: 310 QGEKGIQGPPGPIGEKGPVGPLGDKGPVG---PAGVSGDKGLTGPTG---PLGDKGQQGP 363
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP G GP G L GP G G G GP G GP G + GP+G+
Sbjct: 364 PGPLGEKGNKGPEGPLGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGPLGPIGEKGPTGQ 423
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
+ G G GP G GPSG GP G GP G GP G +
Sbjct: 424 IGAPGDKGPQGPQGPQGERGTTGPSGEKGPQGPQG---IQGPQGERGPTGPMGSI 475
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP+G G G GP G +GP G +GP+G G +G
Sbjct: 295 TGPTGDK---GPTGLSGVQGEKGIQGPPGPIGEKGPVGPLGDKGPVGPAGVSGDKGLTGP 351
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LG G GP G GP G L GP G G G GP G GP
Sbjct: 352 TGPLGDKGQQGPPGPLGEKGNKGPEGPLGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGP 411
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G + GP+G++ G G GP G GPSG GP G GP G
Sbjct: 412 LGPIGEKGPTGQIGAPGDKGPQGPQGPQGERGTTGPSGEKGPQGPQG---IQGPQGE 465
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/176 (32%), Positives = 69/176 (39%), Gaps = 3/176 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G GP+G G G GP G +GP G +GP+G
Sbjct: 286 IGDKGLTGLTGPTGDK---GPTGLSGVQGEKGIQGPPGPIGEKGPVGPLGDKGPVGPAGV 342
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G LG G+ GP G GP G L GP G G G GP
Sbjct: 343 SGDKGLTGPTGPLGDKGQQGPPGPLGEKGNKGPEGPLGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGP 402
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G + GP+G++ G G GP G GPSG GP G
Sbjct: 403 QGEKGEKGPLGPIGEKGPTGQIGAPGDKGPQGPQGPQGERGTTGPSGEKGPQGPQG 458
>gi|296232847|ref|XP_002807839.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: collagen alpha-3(V) chain [Callithrix
jacchus]
Length = 1720
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.060, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/149 (33%), Positives = 61/149 (40%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G+ LG G L GP+G + GP G GP+G GP G + G G
Sbjct: 948 EGAKGELGSPGPLGKEGPAGPRGFPGPKGAPGDPGPTGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGP 1007
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
LGP+G + G SG +GP+G GP G DG G L LGPSG G
Sbjct: 1008 LGPAGGIGLPGQSGNQGPIGPAGEKGSPGERGPPGATGKDGIPGPLGPLGPSGAAGPSGE 1067
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G G G G GP+G
Sbjct: 1068 EGDKGDVGAPGHKGIKGDKGDAGPPGPAG 1096
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/141 (33%), Positives = 58/141 (41%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
LG G L GP+G + GP G+ GP+G GP G + G G LGP+G
Sbjct: 953 ELGSPGPLGKEGPAGPRGFPGPKGAPGDPGPTGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPLGPAG 1012
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G SG+ +GP+G G G G G LGP G GPSG G
Sbjct: 1013 GIGLPGQSGNQGPIGPAGEKGSPGERGPPGATGKDGIPGPLGPLGPSGAAGPSGEEGDKG 1072
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G G GP G
Sbjct: 1073 DVGAPGHKGIKGDKGDAGPPG 1093
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/149 (32%), Positives = 59/149 (39%), Gaps = 3/149 (2%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G LG G L GP+G + GP G GP+G GP G + G G
Sbjct: 948 EGAKGELGSPGPLGKEGPAGPRGFPGPKGAPGDPGPTGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGP 1007
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LGP+G + G SG +GP+G GP G G G L LGPSG G
Sbjct: 1008 LGPAGGIGLPGQSGNQGPIGPAGEKGSPGERGPPGATGKDGIPGPLGPLGPSGAAGPSGE 1067
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G G G G GP+G
Sbjct: 1068 EGDKGDVGAPGHKGIKGDKGDAGPPGPAG 1096
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/113 (35%), Positives = 51/113 (45%), Gaps = 3/113 (2%)
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G+ LG G L GP+G + GP G GP+G GP G + ++G G
Sbjct: 948 EGAKGELGSPGPLGKEGPAGPRGFPGPKGAPGDPGPTGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGP 1007
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
LGP+G + G SG +GP+G GP G G G L LGPSG
Sbjct: 1008 LGPAGGIGLPGQSGNQGPIGPAGEKGSPGERGPPGATGKDGIPGPLGPLGPSG 1060
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/135 (32%), Positives = 54/135 (40%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G LG G L GP+G + GP G GP+G GP G + G G
Sbjct: 948 EGAKGELGSPGPLGKEGPAGPRGFPGPKGAPGDPGPTGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGP 1007
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
LGP+G + G SG +GP+G G G G G LGP G GPSG
Sbjct: 1008 LGPAGGIGLPGQSGNQGPIGPAGEKGSPGERGPPGATGKDGIPGPLGPLGPSGAAGPSGE 1067
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGL 195
G G + G+
Sbjct: 1068 EGDKGDVGAPGHKGI 1082
>gi|449280419|gb|EMC87737.1| Collagen alpha-2(I) chain [Columba livia]
Length = 1363
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.061, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 79/198 (39%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP------SGSLRYLGPSGRL 64
G GR +GP+GS GP+G+ G +GR +GP GS G G +
Sbjct: 408 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGAKGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPV 467
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGS------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
+ G GR+ +GP+G+ + + GP G G G +G +G GP G
Sbjct: 468 GFPGADGRVGPIGPAGNRGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGERGNVGVAGPRGAPGPEGNN 527
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRL 172
GP G + G G GP G GPSG G G GP+G
Sbjct: 528 GAQGPPGVTGNQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEAGKPGERGLHGEFGVPGPAGPR 587
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G +GP+G +
Sbjct: 588 GERGPPGESGAVGPAGPI 605
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.78, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 72/188 (38%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G G GS G GR +GP+GS GP+G G +GR
Sbjct: 383 NGEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMGPAGSRGATGPAGAKGPNGDAGRPGE 442
Query: 76 ---LGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP GS G G + + G GR+ +GP+G G G + + GP G
Sbjct: 443 PGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPIGPAGN---RGEPGNIGFPGPKGP 499
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +G +G GP G GP G G G GP G GP
Sbjct: 500 TGEPGKPGERGNVGVAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGP 559
Query: 187 SGRLRYLG 194
SG G
Sbjct: 560 SGPAGEAG 567
>gi|384247971|gb|EIE21456.1| hypothetical protein COCSUDRAFT_56672 [Coccomyxa subellipsoidea
C-169]
Length = 2484
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.064, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/157 (23%), Positives = 66/157 (42%), Gaps = 6/157 (3%)
Query: 15 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 74
+G + G +G G +G + G +G Y G +GS + G +G + G +G
Sbjct: 356 ATGDTGFTGDTGFTGKTGFTGDTGFTGDTGFTGYTGDTGSTGFTGSTG---FTGDTGFTG 412
Query: 75 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G + G +G + G +G G +G G +G + G +G G +G
Sbjct: 413 ATGDTGFTGFTGATGGSGFTGATGLTGSTGFTGFTGGTGNTGDSGFTGATGFT---GDTG 469
Query: 135 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 470 STGFTGATGFTGFTGDTGFTGFTGSTGATGFTGATGS 506
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.95, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/155 (20%), Positives = 58/155 (37%), Gaps = 24/155 (15%)
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
+G + G +G G +G + G +G Y G +G + G +G + G +G
Sbjct: 356 ATGDTGFTGDTGFTGKTGFTGDTGFTGDTGFTGYTGDTGSTGFTGSTG---FTGDTGFTG 412
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG------------------RLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G +G G +G + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 413 ATGDTGFTGFTGATGGSGFTGATGLTGSTGFTGFTGGTGNTGDSGFTGATG---FTGDTG 469
Query: 162 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+ G +G + G +G + G +G + G +
Sbjct: 470 STGFTGATGFTGFTGDTGFTGFTGSTGATGFTGAT 504
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/138 (20%), Positives = 52/138 (37%), Gaps = 27/138 (19%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G + G +G Y G +GS + G +G + G +G G +G + G +G
Sbjct: 372 TGFTGDTGFTGDTGFTGYTGDTGSTGFTGSTG---FTGDTGFTGATGDTGFTGFTGATGG 428
Query: 73 LRYLGP------------------------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+ G +G+ + G +G + G +G + G +G
Sbjct: 429 SGFTGATGLTGSTGFTGFTGGTGNTGDSGFTGATGFTGDTGSTGFTGATGFTGFTGDTGF 488
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+ G +G + G +G
Sbjct: 489 TGFTGSTGATGFTGATGS 506
>gi|195728818|gb|ACG50730.1| VtaA19 precursor [Haemophilus parasuis]
Length = 1598
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.064, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 75/177 (42%), Gaps = 12/177 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G +GS GP G + GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 630 IGPTGARGEKGDTGSAGPTGPQGPMGPAGPAGPRGEQGPAGARGERGETGLQGVTGPAGP 689
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G + +GP G GP+ GP+G GP G +G+ GP
Sbjct: 690 QGPAGATGPMGPVGPKGEKGDQGPA------GPAGAQGIQGPKGD------TGQRGETGP 737
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G + +GP G GP G +GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 738 AGPVGPIGPQGATGPAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGD 794
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 69/161 (42%), Gaps = 12/161 (7%)
Query: 20 RYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
+GP+G+ G +GS GP G + GP+G GP+G G +G GP+
Sbjct: 628 GPIGPTGARGEKGDTGSAGPTGPQGPMGPAGPAGPRGEQGPAGARGERGETGLQGVTGPA 687
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
G G +G + +GP G GP+ GP+G GP G +G+
Sbjct: 688 GPQGPAGATGPMGPVGPKGEKGDQGPA------GPAGAQGIQGPKGD------TGQRGET 735
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G + +GP G GP G +GP G GP G
Sbjct: 736 GPAGPVGPIGPQGATGPAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGD 776
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/155 (30%), Positives = 68/155 (43%), Gaps = 9/155 (5%)
Query: 38 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 97
+GP+G G +GS GP G + GP+G GP+G+ G +G GP+
Sbjct: 628 GPIGPTGARGEKGDTGSAGPTGPQGPMGPAGPAGPRGEQGPAGARGERGETGLQGVTGPA 687
Query: 98 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRL 154
G G +G + +GP G GP+ GP+G GP +G+ GP+G +
Sbjct: 688 GPQGPAGATGPMGPVGPKGEKGDQGPA------GPAGAQGIQGPKGDTGQRGETGPAGPV 741
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP G GP G +GP G GP G
Sbjct: 742 GPIGPQGATGPAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGD 776
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 12/160 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP+G G +G + +GP G GP+G P+G
Sbjct: 667 GPAGARGERGETGLQGVTGPAGPQGPAGATGPMGPVGPKGEKGDQGPAG------PAGAQ 720
Query: 74 RYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP G GP+G + +GP G GP G +GP G GP G
Sbjct: 721 GIQGPKGDTGQRGETGPAGPVGPIGPQGATGPAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDP 780
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 781 GQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 817
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/178 (30%), Positives = 74/178 (41%), Gaps = 15/178 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G GP G + GP+G GP+G G +G GP+G G +G +
Sbjct: 640 GDTGSAGPTGPQGPMGPAGPAGPRGEQGPAGARGERGETGLQGVTGPAGPQGPAGATGPM 699
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP G GP+ GP+G GP +G+ GP+G + +GP G
Sbjct: 700 GPVGPKGEKGDQGPA------GPAGAQGIQGPKGDTGQRGETGPAGPVGPIGPQGATGPA 753
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G +GP G GP G G +G GP G GP +GP+G
Sbjct: 754 GPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGP------MGPAG 805
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/178 (31%), Positives = 74/178 (41%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ G +G GP+G GP+G+ +GP +GP G
Sbjct: 658 GPAGPRGEQGPAGARGERGETGLQGVTGPAGPQ---GPAGATGPMGP------VGPKGEK 708
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
GP+ GP+G GP +G+ GP+G + +GP G GP G
Sbjct: 709 GDQGPA------GPAGAQGIQGPKGDTGQRGETGPAGPVGPIGPQGATGPAGPKGEAGPV 762
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G G +G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 763 GPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 817
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/125 (32%), Positives = 53/125 (42%), Gaps = 12/125 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G GP+G P+G+ GP +G+ GP+G + +GP G GP
Sbjct: 702 VGPKGEKGDQGPAG------PAGAQGIQGPKGDTGQRGETGPAGPVGPIGPQGATGPAGP 755
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G +GP G GP G G +G GP G GP G GP G S
Sbjct: 756 KGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGS 812
Query: 130 DGPSG 134
GP+G
Sbjct: 813 AGPAG 817
>gi|395841596|ref|XP_003793620.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Otolemur
garnettii]
Length = 1418
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.065, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 59/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 906
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.55, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP G + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 817 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 876
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G GPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 906
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 817 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 876
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 906
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 80
GP G+ +GP+G+ GP G G G+ GP G +G G G G
Sbjct: 660 GPKGASGPVGPTGAQ---GPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGR 716
Query: 81 ----------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G + GP+G G G GP G + GP G
Sbjct: 717 GLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQP 776
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 777 GAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|395841598|ref|XP_003793621.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 3 [Otolemur
garnettii]
Length = 1417
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.069, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 59/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 731 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 790
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 791 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 850
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 851 GPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 905
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 756 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 815
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP G + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 816 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 875
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G G G GPSG GP G
Sbjct: 876 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 905
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 756 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 815
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 816 SRGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGSRGDSGPAGRAGDPG 875
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 876 LQGPAGPPGEKGEPGDEGPSGADGPPGPQG 905
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/180 (27%), Positives = 62/180 (34%), Gaps = 15/180 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-- 80
GP G+ +GP+G+ GP G G G+ GP G +G G G G
Sbjct: 659 GPKGASGPVGPTGAQ---GPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGR 715
Query: 81 ----------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G G + GP+G G G GP G + GP G
Sbjct: 716 GLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQP 775
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 776 GAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGATGFPGAAGRV 835
>gi|410895143|ref|XP_003961059.1| PREDICTED: collagen alpha-1(I) chain-like isoform 2 [Takifugu
rubripes]
Length = 1448
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/190 (28%), Positives = 74/190 (38%), Gaps = 24/190 (12%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G + GPSG+ G G + GP+G G G GP+G + GP G+
Sbjct: 750 TGPMGAPGPSGAQGEKGEPGPVGVAGPTGPRGAPGDRGEA---GPAGHAGFAGPPGADGQ 806
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGR 126
G G GP G GP+G GP+G + GP+GR
Sbjct: 807 PGAKGESGETGPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKGATGGAGAPGATGFPGPAGR 866
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G GP G + G G GP+GR G +G + GPSG G
Sbjct: 867 VGPPGPAGVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGR---PGEAGAVGAPGPSGEKGSPGA 923
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G+S
Sbjct: 924 DGAPGPAGIS 933
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/153 (30%), Positives = 60/153 (39%), Gaps = 24/153 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSG------ 62
GP+G + GP G+ G G GP G GP+GS GP+G
Sbjct: 788 EAGPAGHAGFAGPPGADGQPGAKGESGETGPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKG 847
Query: 63 ---------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
+ GP+GR+ GP+G GP G + G G GP+GR G
Sbjct: 848 ATGGAGAPGATGFPGPAGRVGPPGPAGVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGR---PG 904
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLGPSG 143
+G + GPSG S DG G GP G
Sbjct: 905 EAGAVGAPGPSGEKGSPGADGAPGPAGISGPQG 937
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/207 (28%), Positives = 77/207 (37%), Gaps = 27/207 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GPSG G G + GP+G GP+G + GP G+ G G
Sbjct: 757 GPSGAQGEKGEPGPVGVAGPTGPRGAPGDRGEAGPAGHAGFAGPPGADGQPGAKGESGET 816
Query: 68 GPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G GP+GS GP+G + GP+GR+ GP G
Sbjct: 817 GPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKGATGGAGAPGATGFPGPAGRV---GPPGPA 873
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G + +G G + G +G G +G + GPSG G G G S
Sbjct: 874 GVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGRPGEAGAVGAPGPSGEKGSPGADGAPGPAGIS 933
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G + G G + GL+
Sbjct: 934 GPQGIGGQRGTVGIPGQRGERGFPGLA 960
>gi|410895145|ref|XP_003961060.1| PREDICTED: collagen alpha-1(I) chain-like isoform 3 [Takifugu
rubripes]
Length = 1453
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.073, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/190 (28%), Positives = 74/190 (38%), Gaps = 24/190 (12%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G + GPSG+ G G + GP+G G G GP+G + GP G+
Sbjct: 755 TGPMGAPGPSGAQGEKGEPGPVGVAGPTGPRGAPGDRGEA---GPAGHAGFAGPPGADGQ 811
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGR 126
G G GP G GP+G GP+G + GP+GR
Sbjct: 812 PGAKGESGETGPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKGATGGAGAPGATGFPGPAGR 871
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G GP G + G G GP+GR G +G + GPSG G
Sbjct: 872 VGPPGPAGVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGR---PGEAGAVGAPGPSGEKGSPGA 928
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G+S
Sbjct: 929 DGAPGPAGIS 938
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/153 (30%), Positives = 60/153 (39%), Gaps = 24/153 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSG------ 62
GP+G + GP G+ G G GP G GP+GS GP+G
Sbjct: 793 EAGPAGHAGFAGPPGADGQPGAKGESGETGPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKG 852
Query: 63 ---------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
+ GP+GR+ GP+G GP G + G G GP+GR G
Sbjct: 853 ATGGAGAPGATGFPGPAGRVGPPGPAGVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGR---PG 909
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLGPSG 143
+G + GPSG S DG G GP G
Sbjct: 910 EAGAVGAPGPSGEKGSPGADGAPGPAGISGPQG 942
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/207 (28%), Positives = 77/207 (37%), Gaps = 27/207 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GPSG G G + GP+G GP+G + GP G+ G G
Sbjct: 762 GPSGAQGEKGEPGPVGVAGPTGPRGAPGDRGEAGPAGHAGFAGPPGADGQPGAKGESGET 821
Query: 68 GPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G GP+GS GP+G + GP+GR+ GP G
Sbjct: 822 GPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKGATGGAGAPGATGFPGPAGRV---GPPGPA 878
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G + +G G + G +G G +G + GPSG G G G S
Sbjct: 879 GVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGRPGEAGAVGAPGPSGEKGSPGADGAPGPAGIS 938
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G + G G + GL+
Sbjct: 939 GPQGIGGQRGTVGIPGQRGERGFPGLA 965
>gi|431908920|gb|ELK12511.1| Collagen alpha-2(I) chain [Pteropus alecto]
Length = 1369
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.073, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/198 (30%), Positives = 78/198 (39%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 412 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNVGPAGKEGPM 471
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 472 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKSGEKGHAGLAGPRGAPGPDGNN 531
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 532 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTTGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPR 591
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G +GPSG +
Sbjct: 592 GERGPPGESGAVGPSGPI 609
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.60, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 412 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNVGPAGKEGPM 471
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 472 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKSGEKGHAGLAGPRGAPGPDGNN 531
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GP+G +G
Sbjct: 532 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTTGEVG 571
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 61/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G SG + G +G
Sbjct: 461 NVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKSGEKGHAGLAG 520
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G G
Sbjct: 521 PRGAPGPDGNNGAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTTGEVGKPGER---G 577
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G +GPSG +
Sbjct: 578 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAVGPSGPI 609
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/147 (30%), Positives = 57/147 (38%), Gaps = 15/147 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP GR G G Y G G + LG G +GP+G G G +GP+G
Sbjct: 935 NDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNPGPVGALGAPGPHGPVGPTGKHGNRGEPGPAGSVGPTG 994
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+ GPSG G G GP G + G G +GP+G
Sbjct: 995 AVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGPRGLPGLKGHNGLQGLPGLAGHHGDQGSPGSVGPAG 1054
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GPSG DG +G +GP+G
Sbjct: 1055 PRGPAGPSGPAGKDGRTGHPGTVGPAG 1081
>gi|443700208|gb|ELT99280.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_130099 [Capitella teleta]
Length = 206
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.075, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/189 (30%), Positives = 73/189 (38%), Gaps = 21/189 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG------------ 59
+ GPSG+ GP+G G GS+ G +G+ GP+G G
Sbjct: 16 SAGPSGQPGVAGPTGPQGPQGQRGSIGLSGQTGQSGITGPTGVDGQKGSQGPTGQQGPQG 75
Query: 60 ------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
P GR GPSG GPSG G G GPSG GP G G
Sbjct: 76 QSGVQGPKGRQGESGPSGPQGLQGPSGQSGQRGERGEAGPTGPSG---PSGPQGPRGPTG 132
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G G +G S G +GR+ GP G GPSG G G G G +
Sbjct: 133 TRGEPGSPGATGGPGSKGETGRIGPSGPDGPSGPTGPSGPSGEAGSQGSRGETGQRGEIG 192
Query: 174 YLGPSGRLR 182
GP+G+++
Sbjct: 193 VSGPTGKIQ 201
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/200 (27%), Positives = 72/200 (36%), Gaps = 33/200 (16%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G+ G G GPSG+ GP+G G G + G +G+ GP+G
Sbjct: 2 TGATGLDGEKGEKGSAGPSGQPGVAGPTGPQGPQGQRGSIGLSGQTGQSGITGPTGVDGQ 61
Query: 85 LG------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G P GR GPSG GPSG+ G G GPSG
Sbjct: 62 KGSQGPTGQQGPQGQSGVQGPKGRQGESGPSGPQGLQGPSGQSGQRGERGEAGPTGPSGP 121
Query: 127 LNSDGP---------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP +G G +GR+ GP G GPSG G G
Sbjct: 122 SGPQGPRGPTGTRGEPGSPGATGGPGSKGETGRIGPSGPDGPSGPTGPSGPSGEAGSQGS 181
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G G + GP+G+++
Sbjct: 182 RGETGQRGEIGVSGPTGKIQ 201
>gi|384188601|ref|YP_005574497.1| hypothetical protein CT43_CH4546 [Bacillus thuringiensis serovar
chinensis CT-43]
gi|410676920|ref|YP_006929291.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|452200996|ref|YP_007481077.1| BclA protein [Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str.
IS5056]
gi|326942310|gb|AEA18206.1| hypothetical protein CT43_CH4546 [Bacillus thuringiensis serovar
chinensis CT-43]
gi|409176049|gb|AFV20354.1| collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|452106389|gb|AGG03329.1| BclA protein [Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str.
IS5056]
Length = 354
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.078, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/132 (28%), Positives = 53/132 (40%), Gaps = 12/132 (9%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+G +G GP+G G +G P+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATG------PTGATGITGATGPTGATGITGITGATGPTGA 116
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G G +G GP+G S G +G GP+G G
Sbjct: 117 TGVTGITGITGATGPTGATGVTGSTGAT---GPTGATGSTGATGPTGATGPTGA---TGA 170
Query: 151 SGRLRYLGPSGR 162
+G GP+G
Sbjct: 171 TGSTGVTGPTGA 182
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/126 (27%), Positives = 53/126 (42%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+G +G GP+G+ G P+G+ G +G G +G GP+G G
Sbjct: 63 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGITGATGPTGATGVTGI 122
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G+ G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 123 TGITGATGPTGATGVTGSTGATGPTGATGSTGATGPTGA---TGPTGATGATGSTGV--- 176
Query: 130 DGPSGR 135
GP+G
Sbjct: 177 TGPTGA 182
>gi|443690258|gb|ELT92436.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_144868, partial [Capitella teleta]
Length = 169
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.079, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/172 (30%), Positives = 63/172 (36%), Gaps = 25/172 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR-YLGPSGR 72
GP G GPSG GP G G +G G G GP+G R G G+
Sbjct: 1 GPDGETGQQGPSGPSGVSGPKGEAGETGATGATGERGSPGESGPSGPTGPKRGDNGQRGQ 60
Query: 73 LR------------------YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
G G GP+G + GP+G G +G GP
Sbjct: 61 TGPSGPSGPSGPSGPSGSRGETGQPGDTGATGPAGPIGPSGPTGPSGQSGQTGERGDTGP 120
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
SG+ GPS GP+GR GPSG G SG+ GPSG L
Sbjct: 121 SGQPGDSGPS------GPTGRPGETGPSGPSGPTGQSGQRGDTGPSGDTGKL 166
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/168 (35%), Positives = 71/168 (42%), Gaps = 7/168 (4%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR-YLGPSGRLRYL 67
+ GPSG GP G G +G+ G G GP+G R G G+
Sbjct: 5 ETGQQGPSGPSGVSGPKGEAGETGATGATGERGSPGESGPSGPTGPKRGDNGQRGQTGPS 64
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GPSG GPSGS G G GP+G + GP+G G +G GPSG+
Sbjct: 65 GPSGPSGPSGPSGSRGETGQPGDTGATGPAGPIGPSGPTGPSGQSGQTGERGDTGPSGQP 124
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
GPS GP+GR GPSG G SG+ GPSG L
Sbjct: 125 GDSGPS------GPTGRPGETGPSGPSGPTGQSGQRGDTGPSGDTGKL 166
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 54/157 (34%), Gaps = 34/157 (21%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR-------- 119
GP G GPSG GP G G +G G G GP+G R
Sbjct: 1 GPDGETGQQGPSGPSGVSGPKGEAGETGATGATGERGSPGESGPSGPTGPKRGDNGQRGQ 60
Query: 120 --------------------YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G + GP+G + GP+G G +G GP
Sbjct: 61 TGPSGPSGPSGPSGPSGSRGETGQPGDTGATGPAGPIGPSGPTGPSGQSGQTGERGDTGP 120
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
SG+ GPS GP+GR GPSG G S
Sbjct: 121 SGQPGDSGPS------GPTGRPGETGPSGPSGPTGQS 151
>gi|410046784|ref|XP_003952258.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Pan troglodytes]
Length = 1443
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.079, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 876
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 877 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 782 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 841
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 842 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 901
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 902 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
>gi|426372321|ref|XP_004053074.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 6 [Gorilla gorilla
gorilla]
Length = 1443
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 876
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 877 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.83, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 782 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 841
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 842 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 901
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 902 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
>gi|410895141|ref|XP_003961058.1| PREDICTED: collagen alpha-1(I) chain-like isoform 1 [Takifugu
rubripes]
Length = 1449
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/190 (28%), Positives = 74/190 (38%), Gaps = 24/190 (12%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G + GPSG+ G G + GP+G G G GP+G + GP G+
Sbjct: 751 TGPMGAPGPSGAQGEKGEPGPVGVAGPTGPRGAPGDRGEA---GPAGHAGFAGPPGADGQ 807
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGR 126
G G GP G GP+G GP+G + GP+GR
Sbjct: 808 PGAKGESGETGPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKGATGGAGAPGATGFPGPAGR 867
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
+ GP+G GP G + G G GP+GR G +G + GPSG G
Sbjct: 868 VGPPGPAGVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGR---PGEAGAVGAPGPSGEKGSPGA 924
Query: 187 SGRLRYLGLS 196
G G+S
Sbjct: 925 DGAPGPAGIS 934
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/153 (30%), Positives = 60/153 (39%), Gaps = 24/153 (15%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSG------ 62
GP+G + GP G+ G G GP G GP+GS GP+G
Sbjct: 789 EAGPAGHAGFAGPPGADGQPGAKGESGETGPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKG 848
Query: 63 ---------RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
+ GP+GR+ GP+G GP G + G G GP+GR G
Sbjct: 849 ATGGAGAPGATGFPGPAGRVGPPGPAGVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGR---PG 905
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNS---DGPSGRLRYLGPSG 143
+G + GPSG S DG G GP G
Sbjct: 906 EAGAVGAPGPSGEKGSPGADGAPGPAGISGPQG 938
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/207 (28%), Positives = 77/207 (37%), Gaps = 27/207 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GPSG G G + GP+G GP+G + GP G+ G G
Sbjct: 758 GPSGAQGEKGEPGPVGVAGPTGPRGAPGDRGEAGPAGHAGFAGPPGADGQPGAKGESGET 817
Query: 68 GPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSG---------------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G GP+GS GP+G + GP+GR+ GP G
Sbjct: 818 GPKGDAGPPGTTGPAGSSGPQGPAGPSGPKGATGGAGAPGATGFPGPAGRV---GPPGPA 874
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G + +G G + G +G G +G + GPSG G G G S
Sbjct: 875 GVAGPPGPIGAVGKDGARGARGETGPAGRPGEAGAVGAPGPSGEKGSPGADGAPGPAGIS 934
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G G + G G + GL+
Sbjct: 935 GPQGIGGQRGTVGIPGQRGERGFPGLA 961
>gi|450394|gb|AAC41772.1| alpha-1 type II collagen [Homo sapiens]
Length = 1487
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.084, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.84, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|426372311|ref|XP_004053069.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Gorilla gorilla
gorilla]
Length = 1487
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.83, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|111118976|ref|NP_001835.3| collagen alpha-1(II) chain isoform 1 precursor [Homo sapiens]
gi|124056489|sp|P02458.3|CO2A1_HUMAN RecName: Full=Collagen alpha-1(II) chain; AltName: Full=Alpha-1
type II collagen; Contains: RecName: Full=Collagen
alpha-1(II) chain; Contains: RecName:
Full=Chondrocalcin; Flags: Precursor
gi|95132445|gb|AAI16450.1| Collagen, type II, alpha 1 [Homo sapiens]
Length = 1487
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.085, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|332206393|ref|XP_003252275.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Nomascus
leucogenys]
Length = 1487
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.086, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.85, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|301765712|ref|XP_002918275.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Ailuropoda melanoleuca]
Length = 1367
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.086, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GPSG G GS G GR +GP G GP+G G SGR
Sbjct: 383 GPNGEAGSAGPSGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGPRGSTGPAGVRGPNGDSGRP 442
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP G+ +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 443 GEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPS 502
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G + G +G GP G GP G G G GP G GP+
Sbjct: 503 GEPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPA 562
Query: 188 GRLRYLG 194
G +G
Sbjct: 563 GTAGEVG 569
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/152 (30%), Positives = 60/152 (39%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 459 NVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGEPGKAGEKGHAGLAG 518
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G G
Sbjct: 519 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGER---G 575
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GPSG +
Sbjct: 576 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPI 607
>gi|119578372|gb|EAW57968.1| collagen, type II, alpha 1 (primary osteoarthritis,
spondyloepiphyseal dysplasia, congenital), isoform CRA_c
[Homo sapiens]
Length = 1488
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.086, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 921
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 922 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 976
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.86, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 827 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 886
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 887 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 946
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 947 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 976
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 906
>gi|111118974|ref|NP_149162.2| collagen alpha-1(II) chain isoform 2 precursor [Homo sapiens]
Length = 1418
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.086, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|410046788|ref|XP_003952260.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Pan troglodytes]
Length = 1459
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 892
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 893 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.89, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 798 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 857
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 858 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 917
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 918 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|281342930|gb|EFB18514.1| hypothetical protein PANDA_006699 [Ailuropoda melanoleuca]
Length = 1003
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GPSG G GS G GR +GP G GP+G G SGR
Sbjct: 19 GPNGEAGSAGPSGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGPRGSTGPAGVRGPNGDSGRP 78
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP G+ +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 79 GEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPS 138
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G + G +G GP G GP G G G GP G GP+
Sbjct: 139 GEPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPA 198
Query: 188 GRLRYLG 194
G +G
Sbjct: 199 GTAGEVG 205
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/152 (30%), Positives = 60/152 (39%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 95 NVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGEPGKAGEKGHAGLAG 154
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G G
Sbjct: 155 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGER---G 211
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GPSG +
Sbjct: 212 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPI 243
>gi|119578373|gb|EAW57969.1| collagen, type II, alpha 1 (primary osteoarthritis,
spondyloepiphyseal dysplasia, congenital), isoform CRA_d
[Homo sapiens]
Length = 1387
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 701 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 760
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 761 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 820
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 821 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 875
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.86, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 726 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 785
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 786 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 845
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 846 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 875
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 701 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 760
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 761 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 805
>gi|426372319|ref|XP_004053073.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 5 [Gorilla gorilla
gorilla]
Length = 1459
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 892
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 893 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.88, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 798 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 857
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 858 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 917
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 918 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|114645047|ref|XP_509026.2| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 6 [Pan troglodytes]
Length = 1487
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.88, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|397510913|ref|XP_003825828.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Pan paniscus]
Length = 1487
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.090, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|119578371|gb|EAW57967.1| collagen, type II, alpha 1 (primary osteoarthritis,
spondyloepiphyseal dysplasia, congenital), isoform CRA_b
[Homo sapiens]
Length = 1418
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.090, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|225019527|ref|ZP_03708719.1| hypothetical protein CLOSTMETH_03480 [Clostridium methylpentosum
DSM 5476]
gi|224947748|gb|EEG28957.1| hypothetical protein CLOSTMETH_03480 [Clostridium methylpentosum
DSM 5476]
Length = 220
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.092, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/145 (26%), Positives = 60/145 (41%), Gaps = 29/145 (20%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 114
+GP G + +GP+G +GP+G + +GP G + P G + +GP G + L P
Sbjct: 34 IGPVGPVAPVGPAGPAAPVGPTGPIAPSAPVGPVGPMSPSSPVGPVAPIGPVGPVT-LAP 92
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY--LGPSGRLRYL--------------------GPSG 152
G + +GP G GP + +GP G + GP G
Sbjct: 93 VGPVAPVGPIGPAGPVGPMSPMPAAPVGPVGPIGPAGPVPPVGPVGPVDPVVPLPRGPVG 152
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
+ +GP +R +GP + GP
Sbjct: 153 PVAPVGP---VRPVGPVAPVAPFGP 174
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/151 (25%), Positives = 62/151 (41%), Gaps = 32/151 (21%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+GP G + +GP+G +GP+G + P +GP G + P G + +GP G
Sbjct: 34 IGPVGPVAPVGPAGPAAPVGPTGPIAPSAP------VGPVGPMSPSSPVGPVAPIGPVGP 87
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY--LGPSGRLNSD------------------ 130
+ L P G + +GP G +GP + +GP G +
Sbjct: 88 VT-LAPVGPVAPVGPIGPAGPVGPMSPMPAAPVGPVGPIGPAGPVPPVGPVGPVDPVVPL 146
Query: 131 --GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G + +GP +R +GP + GP
Sbjct: 147 PRGPVGPVAPVGP---VRPVGPVAPVAPFGP 174
>gi|395744177|ref|XP_002823196.2| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Pongo abelii]
Length = 1418
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|426372313|ref|XP_004053070.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Gorilla gorilla
gorilla]
Length = 1418
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|119578374|gb|EAW57970.1| collagen, type II, alpha 1 (primary osteoarthritis,
spondyloepiphyseal dysplasia, congenital), isoform CRA_e
[Homo sapiens]
Length = 1487
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.093, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.93, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|332206395|ref|XP_003252276.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Nomascus
leucogenys]
Length = 1418
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.095, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.89, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|114645049|ref|XP_001161825.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 5 [Pan troglodytes]
Length = 1418
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.095, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.91, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|410046782|ref|XP_003952257.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Pan troglodytes]
Length = 1443
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.096, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 876
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 877 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.98, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 782 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 841
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 842 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 901
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 902 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
>gi|410952290|ref|XP_003982814.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 2 [Felis catus]
Length = 1372
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.097, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GPSG G GS G GR +GP G GP+G G +GR
Sbjct: 388 GPNGEAGSAGPSGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGPRGATGPAGVRGPNGDAGRP 447
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP G+ +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 448 GEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPT 507
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G + G +G GP G GP G G G GP G GP+
Sbjct: 508 GDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPA 567
Query: 188 GRLRYLG 194
G +G
Sbjct: 568 GTAGEVG 574
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 464 NVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 523
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G
Sbjct: 524 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPG 583
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GPSG + GPSG G G LG G G
Sbjct: 584 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVLGAPGTAGPSG 643
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 644 PSG 646
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/198 (28%), Positives = 75/198 (37%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G GP+G G +GR +GP G+ +GP+G+ +
Sbjct: 415 GADGRAGVMGPPGPRGATGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPM 474
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 475 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 534
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 535 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPR 594
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GPSG +
Sbjct: 595 GERGPPGESGAAGPSGPI 612
>gi|410952288|ref|XP_003982813.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 1 [Felis catus]
Length = 1367
Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.098, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/187 (30%), Positives = 74/187 (39%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GPSG G GS G GR +GP G GP+G G +GR
Sbjct: 383 GPNGEAGSAGPSGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGPRGATGPAGVRGPNGDAGRP 442
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP G+ +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 443 GEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPT 502
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G + G +G GP G GP G G G GP G GP+
Sbjct: 503 GDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPA 562
Query: 188 GRLRYLG 194
G +G
Sbjct: 563 GTAGEVG 569
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 459 NVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 518
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G
Sbjct: 519 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPG 578
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GPSG + GPSG G G LG G G
Sbjct: 579 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVLGAPGTAGPSG 638
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 639 PSG 641
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/198 (28%), Positives = 75/198 (37%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G GP+G G +GR +GP G+ +GP+G+ +
Sbjct: 410 GADGRAGVMGPPGPRGATGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPM 469
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 470 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 529
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 530 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPR 589
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GPSG +
Sbjct: 590 GERGPPGESGAAGPSGPI 607
>gi|410903702|ref|XP_003965332.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXVII) chain A-like [Takifugu rubripes]
Length = 1692
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/186 (29%), Positives = 72/186 (38%), Gaps = 5/186 (2%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+ +A N+G G + G G GP+G G G + G G G G+
Sbjct: 1045 IGQAGNIGEQGLIGQRGEPGLEGEAGPAGPDGAKGDKGDMGQEGDKGEKGENGLKGKEGT 1104
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G SG GP G G G+L G G LG +G + GP G + G G
Sbjct: 1105 PGSSGLTGVRGPEGKPGKFGERGKLGSKGSKGHQGQLGETGPVGKTGPPGFVGQKGSRGT 1164
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+ G GR+ G G Y GP G + GP G G G++ GP G
Sbjct: 1165 IGHVGAPGRMGQQGEPGIAGYEGHQGPQGSMGRPGPKGEKGEQGDDGKVE--GPPGPQGD 1222
Query: 184 LGPSGR 189
+GPSG
Sbjct: 1223 IGPSGD 1228
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 68/178 (38%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP G + G G G G+ +G G + G G GP+G
Sbjct: 1019 GEIGQKGPPGKVGEPGLPGEPGEKGDIGQAGNIGEQGLIGQRGEPGLEGEAGPAGPDGAK 1078
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G G + G G G G+ G SG GP G+ G G+L S G G
Sbjct: 1079 GDKGDMGQEGDKGEKGENGLKGKEGTPGSSGLTGVRGPEGKPGKFGERGKLGSKGSKGHQ 1138
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
LG +G + GP G + G G + ++G GR+ G G Y G G +G
Sbjct: 1139 GQLGETGPVGKTGPPGFVGQKGSRGTIGHVGAPGRMGQQGEPGIAGYEGHQGPQGSMG 1196
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.84, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/193 (30%), Positives = 79/193 (40%), Gaps = 9/193 (4%)
Query: 8 EKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
EK N G G+ G SG GP G G G+L G G LG +G +
Sbjct: 1092 EKGEN-GLKGKEGTPGSSGLTGVRGPEGKPGKFGERGKLGSKGSKGHQGQLGETGPVGKT 1150
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
GP G + G G++ ++G GR+ G G Y GP G + GP G G
Sbjct: 1151 GPPGFVGQKGSRGTIGHVGAPGRMGQQGEPGIAGYEGHQGPQGSMGRPGPKGEKGEQGDD 1210
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G++ +GP G +GPSG G G Y +G G G G + GP G+
Sbjct: 1211 GKV--EGPPGPQGDIGPSGDRGERGEPGDPGYKGQVGVDGERGRPGAPGLPGHPGPRGQQ 1268
Query: 182 RYLGPSGRLRYLG 194
+ G G ++G
Sbjct: 1269 GHKGAKGDQGHIG 1281
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/124 (32%), Positives = 54/124 (43%), Gaps = 9/124 (7%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GR + G GS G G +GP+G + ++GP G G G G G
Sbjct: 875 GRKGFPGKVGSEGLKGEPGVTGSIGPTGERGLVGFIGPVGESGIPGEKGDRGETGLPGPP 934
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYL 157
GP+G +GP G G G+ SDGP G++ + GP G++ GP G
Sbjct: 935 GEKGPTG---AIGPDGPTGESGLEGKKASDGPPGKMGFPGPQGKIGEPGEPGPKGFPGVQ 991
Query: 158 GPSG 161
GPSG
Sbjct: 992 GPSG 995
>gi|119578370|gb|EAW57966.1| collagen, type II, alpha 1 (primary osteoarthritis,
spondyloepiphyseal dysplasia, congenital), isoform CRA_a
[Homo sapiens]
Length = 1418
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.099, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|410046786|ref|XP_003952259.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Pan troglodytes]
Length = 1459
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 892
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 893 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 798 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 857
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 858 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 917
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 918 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|452854730|ref|YP_007496413.1| Exosporium glycoprotein BclA3 [Bacillus amyloliquefaciens subsp.
plantarum UCMB5036]
gi|452078990|emb|CCP20743.1| Exosporium glycoprotein BclA3 [Bacillus amyloliquefaciens subsp.
plantarum UCMB5036]
Length = 569
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/128 (28%), Positives = 53/128 (41%), Gaps = 6/128 (4%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G G +G G +G + GP+GS G +G + G SG G +G
Sbjct: 239 TGVTGITGSTGVTGATGSTGAIGSTGPTGSTGATGATGPIGATGASGATGATGITGVTGS 298
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G +GP+G GP+G + G SG G +G G +G G +G
Sbjct: 299 TGPTGE---IGPTGV---TGPTGEIGPTGSSGSTGITGATGSTGETGATGSTGVTGATGV 352
Query: 172 LRYLGPSG 179
G +G
Sbjct: 353 TGATGVTG 360
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/128 (27%), Positives = 53/128 (41%), Gaps = 6/128 (4%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G G +G G +G++ GP+G G +G + G SG G +G
Sbjct: 239 TGVTGITGSTGVTGATGSTGAIGSTGPTGSTGATGATGPIGATGASGATGATGITGVTGS 298
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G + GP+G GP+G + G SG G +G G +G G +G
Sbjct: 299 TGPTGEI---GPTG---VTGPTGEIGPTGSSGSTGITGATGSTGETGATGSTGVTGATGV 352
Query: 181 LRYLGPSG 188
G +G
Sbjct: 353 TGATGVTG 360
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/128 (28%), Positives = 53/128 (41%), Gaps = 6/128 (4%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G G +G G +G + GP+GS G +G + G SG G +G
Sbjct: 239 TGVTGITGSTGVTGATGSTGAIGSTGPTGSTGATGATGPIGATGASGATGATGITGVTGS 298
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G + GP+G GP+G + G SG G +G G +G G +G
Sbjct: 299 TGPTGEI---GPTG---VTGPTGEIGPTGSSGSTGITGATGSTGETGATGSTGVTGATGV 352
Query: 145 LRYLGPSG 152
G +G
Sbjct: 353 TGATGVTG 360
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/121 (25%), Positives = 49/121 (40%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+G G +G G +G + GP+G G +G + G SG + G +G
Sbjct: 239 TGVTGITGSTGVTGATGSTGAIGSTGPTGSTGATGATGPIGATGASGATGATGITGVTGS 298
Query: 139 LGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G + GP+G + G SG G +G G +G G +G G+
Sbjct: 299 TGPTGEIGPTGVTGPTGEIGPTGSSGSTGITGATGSTGETGATGSTGVTGATGVTGATGV 358
Query: 196 S 196
+
Sbjct: 359 T 359
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/116 (25%), Positives = 49/116 (42%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G G +G G +G + GP+G G +G + + G SG G +G
Sbjct: 239 TGVTGITGSTGVTGATGSTGAIGSTGPTGSTGATGATGPIGATGASGATGATGITGVTGS 298
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSG 203
GP+G + G +G +GP+G G +G G +G G++ V+G
Sbjct: 299 TGPTGEIGPTGVTGPTGEIGPTGSSGSTGITGATGSTGETGATGSTGVTGATGVTG 354
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/106 (29%), Positives = 45/106 (42%), Gaps = 3/106 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPS 70
G +G + GP+GS G +G + G SG G +G GP+G + GP+
Sbjct: 255 GSTGAIGSTGPTGSTGATGATGPIGATGASGATGATGITGVTGSTGPTGEIGPTGVTGPT 314
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G + G SGS G +G G +G G +G G +G
Sbjct: 315 GEIGPTGSSGSTGITGATGSTGETGATGSTGVTGATGVTGATGVTG 360
>gi|426372317|ref|XP_004053072.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 4 [Gorilla gorilla
gorilla]
Length = 1459
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 892
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 893 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 798 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 857
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 858 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 917
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 918 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 947
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|426372315|ref|XP_004053071.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 3 [Gorilla gorilla
gorilla]
Length = 1443
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 876
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 877 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 782 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 841
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 842 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 901
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 902 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 931
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
>gi|386737527|ref|YP_006210708.1| hypothetical protein [Bacillus anthracis str. H9401]
gi|384387379|gb|AFH85040.1| Hypothetical Protein H9401_3654 [Bacillus anthracis str. H9401]
Length = 386
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/150 (34%), Positives = 62/150 (41%), Gaps = 31/150 (20%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP G GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 114 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGA---QGPAGAT 164
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GP G GP+G GP G GP+G + GP+ GPSG G
Sbjct: 165 GATGPQG---IQGPAGATGATGPQGV---QGPTGATGIGVTGPT------GPSG-----G 207
Query: 159 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP G GP+G GP G
Sbjct: 208 PAGATGATGPQGA---QGPAGATGATGPQG 234
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/146 (33%), Positives = 63/146 (43%), Gaps = 30/146 (20%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ GP+G+ GP G GP+G+ GP G GP+G
Sbjct: 129 GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQG---IQGPAGAT 179
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRY-----LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
GP G GP+G GPSG GP+G GP G GP+G
Sbjct: 180 GATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTGPSG-----GPAGATGATGPQGA---QGPAGATG 228
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSG 152
+ GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 229 ATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPTG 251
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/133 (33%), Positives = 55/133 (41%), Gaps = 28/133 (21%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 114 GPAGATGATGPQG---VQGPAGATGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGA---QGPAGAT 164
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP G GP+G GP G GP+G + GP+ GPSG G
Sbjct: 165 GATGPQGI---QGPAGATGATGPQG---VQGPTGATGIGVTGPT------GPSG-----G 207
Query: 177 PSGRLRYLGPSGR 189
P+G GP G
Sbjct: 208 PAGATGATGPQGA 220
>gi|403301638|ref|XP_003941493.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Saimiri
boliviensis boliviensis]
Length = 1487
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 975
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|258774|gb|AAB23914.1| type II collagen alpha 1 chain, COL2A1 [human, Peptide Partial
Mutant, 346 aa]
Length = 346
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 57/172 (33%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 53 GEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAP 112
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------ 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 113 GPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPS 172
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 173 GKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 224
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 75 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 134
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 135 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 194
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 195 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 224
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/112 (30%), Positives = 42/112 (37%), Gaps = 6/112 (5%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G +GP GP+GS G G GP G + GP G G G
Sbjct: 49 NGEKGEVGP------PGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGE 102
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G + GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 103 AGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 154
>gi|403301640|ref|XP_003941494.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Saimiri
boliviensis boliviensis]
Length = 1418
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 906
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|109096331|ref|XP_001100559.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain-like isoform 3 [Macaca
mulatta]
Length = 1418
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 906
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|317419610|emb|CBN81647.1| Collagen type I alpha 3 chain [Dicentrarchus labrax]
Length = 1450
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/141 (31%), Positives = 59/141 (41%), Gaps = 3/141 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +GS G G+ G +GS+ GP G G +G + GPSG G G
Sbjct: 732 GDAGSKGGEGAPGKDGVRGITGSIGVPGPHGAQGEKGEAGAVGTSGPSGPR---GAPGER 788
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP+G + GP G G G GP G + GP+G + GP G GP
Sbjct: 789 GETGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDTGPKGDAGAPGPAGPVGAAGPQGNAGPPGPK 848
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G G + GP+GR+
Sbjct: 849 GARGGAGTPGATGFPGPAGRV 869
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/121 (32%), Positives = 52/121 (42%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS+ GP G+ G +G + GPSG G G GP+G + GP G+
Sbjct: 752 TGSIGVPGPHGAQGEKGEAGAVGTSGPSGPR---GAPGERGETGPAGPAGFAGPPGADGQ 808
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G G GP G GP+G + GP G GP G G G + GP+GR
Sbjct: 809 PGAKGESGDTGPKGDAGAPGPAGPVGAAGPQGNAGPPGPKGARGGAGTPGATGFPGPAGR 868
Query: 145 L 145
+
Sbjct: 869 V 869
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/140 (31%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 3/140 (2%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +GS G G+ G +G + GP G+ G +G + GPSG G G
Sbjct: 732 GDAGSKGGEGAPGKDGVRGITGSIGVPGPHGAQGEKGEAGAVGTSGPSG---PRGAPGER 788
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP+G + GP G G G GP G GP+G + GP G GP
Sbjct: 789 GETGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDTGPKGDAGAPGPAGPVGAAGPQGNAGPPGPK 848
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G + GP+GR
Sbjct: 849 GARGGAGTPGATGFPGPAGR 868
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/111 (31%), Positives = 46/111 (41%), Gaps = 6/111 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP G G +G++ GPSG GP+G + GP G+ G G
Sbjct: 759 GPHGAQGEKGEAGAVGTSGPSGPRGAPGERGETGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDT 818
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP+G + GP G GP G G G + GP+GR+
Sbjct: 819 GPKGDAGAPGPAGPVGAAGPQGNAGPPGPKGARGGAGTPGATGFPGPAGRV 869
>gi|229150662|ref|ZP_04278876.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1550]
gi|228632749|gb|EEK89364.1| Collagen triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1550]
Length = 310
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/124 (30%), Positives = 54/124 (43%), Gaps = 9/124 (7%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+G G +G GP+G + GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 42 ITGPTGVTGPTGSTGPTGLTGPTGLTGFTGPTGD---TGPTGNTGPTGVTGLTGVTGPTG 98
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 99 NTGNTGPTG---VTGPTGITGLTGDTGPTGNTGPTG---VTGPTGSTGPTGITGLTGDTG 152
Query: 141 PSGR 144
P+G
Sbjct: 153 PTGD 156
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/122 (31%), Positives = 54/122 (44%), Gaps = 9/122 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G +G GP+G + GP+G GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 44 GPTGVTGPTGSTGPTGLTGPTGLTGFTGPTGDT---GPTGNTGPTGVTGLTGVTGPTGNT 100
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G GP+
Sbjct: 101 GNTGPTG---VTGPTGITGLTGDTGPTGNTGPTG---VTGPTGSTGPTGITGLTGDTGPT 154
Query: 134 GR 135
G
Sbjct: 155 GD 156
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/124 (30%), Positives = 53/124 (42%), Gaps = 9/124 (7%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G G +G GP+G + GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 42 ITGPTGVTGPTGSTGPTGLTGPTGLTGFTGPTGD---TGPTGNTGPTGVTGLTGVTGPTG 98
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 99 NTGNTGPTGVT---GPTGITGLTGDTGPTGNTGPTG---VTGPTGSTGPTGITGLTGDTG 152
Query: 177 PSGR 180
P+G
Sbjct: 153 PTGD 156
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/124 (30%), Positives = 53/124 (42%), Gaps = 9/124 (7%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP+G G +G GP+G + GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 42 ITGPTGVTGPTGSTGPTGLTGPTGLTGFTGPTGD---TGPTGNTGPTGVTGLTGVTGPTG 98
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP+G G +G GP+G GP+G GP+G G +G G
Sbjct: 99 NTGNTGPTGVTGPTGITGLTGDTGPTGN---TGPTG---VTGPTGSTGPTGITGLTGDTG 152
Query: 168 PSGR 171
P+G
Sbjct: 153 PTGD 156
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 42/96 (43%), Gaps = 6/96 (6%)
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G G +G GP+G + GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 42 ITGPTGVTGPTGSTGPTGLTGPTGLTGFTGPTGDT---GPTGNTGPTGVTGLTGVTGPTG 98
Query: 153 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 99 NTGNTGPTG---VTGPTGITGLTGDTGPTGNTGPTG 131
>gi|410675658|ref|YP_006928029.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|452199710|ref|YP_007479791.1| Phage tail fiber protein [Bacillus thuringiensis serovar
thuringiensis str. IS5056]
gi|409174787|gb|AFV19092.1| collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|452105103|gb|AGG02043.1| Phage tail fiber protein [Bacillus thuringiensis serovar
thuringiensis str. IS5056]
Length = 625
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/165 (29%), Positives = 65/165 (39%), Gaps = 3/165 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G SG + +G G GP+G G GS +G G GP G GP+G+
Sbjct: 321 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 380
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G L GP+G G G +GP+G +G G G +G G +
Sbjct: 381 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 440
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 441 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETGPTG---ATGPTGLTGATGSS 482
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 64/157 (40%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 329 IGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGP 388
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G +G + GP
Sbjct: 389 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQTGATGATGP 448
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 449 TGIQGIQGITGATGETGPTG---ATGPTGLTGATGSS 482
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/145 (28%), Positives = 56/145 (38%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G SG + +G G GP+G G GS +G G GP G GP+G
Sbjct: 321 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 380
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G L GP+G G G +GP+G +G G +G +G G +
Sbjct: 381 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 440
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G G +G G
Sbjct: 441 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETG 465
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/199 (25%), Positives = 71/199 (35%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+G +G GP+G + +G G + +G G GP+GS G G
Sbjct: 80 IGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQGIQGE 139
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G+ G G G SG GP G G G + G G G +G
Sbjct: 140 IGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGLQGIQGITGE 199
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +GP+G G G G +G + GP G G +G + G
Sbjct: 200 EGPQGAQGIQGEVGPTGSTGIQGAQGISGIKGITGAIGLQGPQGVQGIQGITGATGFQGI 259
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G + + + GL
Sbjct: 260 KGIRGITGATGSIGIQGLE 278
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/165 (29%), Positives = 64/165 (38%), Gaps = 3/165 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G SG + +G G GP+G G G +G G GP G+ GP+G
Sbjct: 321 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 380
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G L GP+G G G +GP+G G G +G +G G +
Sbjct: 381 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 440
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 441 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETGPTG---ATGPTGLTGATGSS 482
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 8/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 23 GPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRG---TTGAQGIQ 77
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G +G GP+G G G + G G + G G GP+G G
Sbjct: 78 GAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQ 134
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G G+ G G G SG GP G G G + G G
Sbjct: 135 GIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGLQGIQ 194
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 195 GIT 197
>gi|109096329|ref|XP_001100739.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain-like isoform 5 [Macaca
mulatta]
Length = 1487
Score = 42.4 bits (98), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 975
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|402885768|ref|XP_003906318.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Papio anubis]
Length = 1487
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 975
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|344283345|ref|XP_003413432.1| PREDICTED: collagen alpha-3(V) chain [Loxodonta africana]
Length = 1633
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/183 (30%), Positives = 73/183 (39%), Gaps = 15/183 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG--- 68
+ GP+G GP G GP G +GP+G + G SG+ +GP+G G
Sbjct: 872 DPGPTGLKGDKGPPGPTGANGPPGERGPVGPAGGIGLPGQSGAQGPVGPAGEKGSPGQRG 931
Query: 69 ---PSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
P+G+ GP G +GPSG G G + G G GP G + G
Sbjct: 932 SPGPTGKDGIPGPLGLPGPTGAVGPSGEEGDKGEVGAPGHKGSKGDKGDAGPPGPIGVRG 991
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P+G S G G GP G G G ++G +GP G GPSG
Sbjct: 992 PAGHPGSPGADGAQGRRGPPGLFGQKGDDGVRGFVG------VIGPPGLQGMPGPSGEKG 1045
Query: 183 YLG 185
+G
Sbjct: 1046 EVG 1048
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.76, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/158 (30%), Positives = 65/158 (41%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP G GP G +GP+G + G SG+ +GP+G G G+
Sbjct: 874 GPTGLKGDKGPPGPTGANGPPGERGPVGPAGGIGLPGQSGAQGPVGPAGEK---GSPGQR 930
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGP---SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 157
GP+G+ GP G +GPSG G G + G G GP G +
Sbjct: 931 GSPGPTGKDGIPGPLGLPGPTGAVGPSGEEGDKGEVGAPGHKGSKGDKGDAGPPGPIGVR 990
Query: 158 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP+G G G GP G G G ++G+
Sbjct: 991 GPAGHPGSPGADGAQGRRGPPGLFGQKGDDGVRGFVGV 1028
>gi|423640407|ref|ZP_17616025.1| hypothetical protein IK9_00352 [Bacillus cereus VD166]
gi|401280902|gb|EJR86818.1| hypothetical protein IK9_00352 [Bacillus cereus VD166]
Length = 378
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/123 (27%), Positives = 52/123 (42%), Gaps = 9/123 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+G+ G +G G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGA 122
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G+ G +G GP+G G + GP+G G +G S GP
Sbjct: 123 TGPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGAT------GPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 133 SGR 135
+G
Sbjct: 177 TGA 179
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/123 (27%), Positives = 50/123 (40%), Gaps = 9/123 (7%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+G +G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 125
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
GP+G G +G S GP+G G + GP+G G +G GP
Sbjct: 126 T---GPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGAT------GPTGATGSTGATGATGSTGP 176
Query: 169 SGR 171
+G
Sbjct: 177 TGA 179
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/117 (28%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 6/117 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+G +G GP+G G +G G +G G +G GP+G+ G +G
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 125
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G G +G GP+G GP+G S G +G GP+G
Sbjct: 126 T---GPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGPTGA 179
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/117 (27%), Positives = 49/117 (41%), Gaps = 6/117 (5%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+G +G GP+G+ G +G G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGA 122
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G G +G GP+G + GP+G G +G GP+G
Sbjct: 123 TGPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGPTGA 179
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/110 (26%), Positives = 43/110 (39%), Gaps = 3/110 (2%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+G +G GP+G G +G G +G G +G + GP+G G +G
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 125
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP+G G +G GP+G G +G G +G G
Sbjct: 126 T---GPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATG 172
>gi|228941704|ref|ZP_04104251.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar berliner ATCC 10792]
gi|228974630|ref|ZP_04135196.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar thuringiensis str. T01001]
gi|228981225|ref|ZP_04141525.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|228778425|gb|EEM26692.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|228785033|gb|EEM33046.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar thuringiensis str. T01001]
gi|228817916|gb|EEM63994.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus thuringiensis
serovar berliner ATCC 10792]
Length = 368
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/132 (28%), Positives = 53/132 (40%), Gaps = 12/132 (9%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
+G +G GP+G G +G P+G G +G G +G GP+G
Sbjct: 77 MGATGVTGDTGPTGATGITGATG------PTGATGITGATGPTGATGITGITGATGPTGA 130
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G G +G GP+G S G +G GP+G G
Sbjct: 131 TGVTGITGITGATGPTGATGVTGSTGAT---GPTGATGSTGATGPTGATGPTGA---TGA 184
Query: 151 SGRLRYLGPSGR 162
+G GP+G
Sbjct: 185 TGSTGVTGPTGA 196
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/126 (27%), Positives = 53/126 (42%), Gaps = 9/126 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+G +G GP+G+ G P+G+ G +G G +G GP+G G
Sbjct: 77 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGITGATGPTGATGVTGI 136
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GP+G+ G +G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 137 TGITGATGPTGATGVTGSTGATGPTGATGSTGATGPTGA---TGPTGATGATGSTGV--- 190
Query: 130 DGPSGR 135
GP+G
Sbjct: 191 TGPTGA 196
>gi|402885770|ref|XP_003906319.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Papio anubis]
Length = 1418
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 906
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|56565281|dbj|BAD77968.1| type 1 collagen alpha 1 [Paralichthys olivaceus]
Length = 1447
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/161 (30%), Positives = 69/161 (42%), Gaps = 6/161 (3%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
LGP GS G +G G +GS GP G++ G G+ GP GS+ G
Sbjct: 501 LGPKGSTGEPGRTGEAGLPGAKGMTGSPGSPGPDGKMGAAGAPGQDGRPGPPGSVGARGQ 560
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
G + + GP G G G +GP+G + G G + + GPSG GP+G
Sbjct: 561 PGVMGFPGPKGAAGEGGKPGERGVMGPTGPVGAPGKDGDVGAQGPSG---PSGPAGERGE 617
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G + G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 618 QGAAGGPGFQGLPGPQGAVGETGKPGEQGLPGEAGATGPAG 658
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/169 (29%), Positives = 70/169 (41%), Gaps = 6/169 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G++ G G GP GS+ G G + + GP G+ G G +GP+G +
Sbjct: 532 GPDGKMGAAGAPGQDGRPGPPGSVGARGQPGVMGFPGPKGAAGEGGKPGERGVMGPTGPV 591
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GPSG GP+G G +G + G G +G +G+ G
Sbjct: 592 GAPGKDGDVGAQGPSG---PSGPAGERGEQGAAGGPGFQGLPGPQGAVGETGKPGEQGLP 648
Query: 134 GRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+ G + G G GP+G GPSG G +G
Sbjct: 649 GEAGATGPAGARGDRGFPGERGAPGINGPAGARGSPGPSGNDGAKGDAG 697
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/172 (29%), Positives = 65/172 (37%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS GP G + G G+ GP GS+ G G + + GP G G G
Sbjct: 525 TGSPGSPGPDGKMGAAGAPGQDGRPGPPGSVGARGQPGVMGFPGPKGAAGEGGKPGERGV 584
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GP+G + G G + GPSG G G G G GP G + G G
Sbjct: 585 MGPTGPVGAPGKDGDVGAQGPSGPSGPAGERGEQGAAGGPGFQGLPGPQGAVGETGKPGE 644
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G G + G G GP+G GPSG G +
Sbjct: 645 QGLPGEAGATGPAGARGDRGFPGERGAPGINGPAGARGSPGPSGNDGAKGDA 696
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/135 (33%), Positives = 56/135 (41%), Gaps = 6/135 (4%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP G GP G+ + G +GR+ GPSG GP G+ G G GP+G
Sbjct: 842 NTGPKGARGPAGPPGATGFPGSAGRVGPPGPSGNAGPAGPPGATGKEGQKGNRGETGPAG 901
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-- 156
R +G +G GPSG G G S G G G G + G G +
Sbjct: 902 RPGEMGAAG---LPGPSGEKGNPGAEGAPGSSGIPGPQGINGGRGIVGLPGQRGERGFPG 958
Query: 157 -LGPSGRLRYLGPSG 170
GPSG + GPSG
Sbjct: 959 LPGPSGEVGKHGPSG 973
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/161 (29%), Positives = 65/161 (40%), Gaps = 6/161 (3%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
LGP GS G +G G +G GP G + G G+ GP G + G
Sbjct: 501 LGPKGSTGEPGRTGEAGLPGAKGMTGSPGSPGPDGKMGAAGAPGQDGRPGPPGSVGARGQ 560
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G + + GP G G G +GP+G + G G + GPSG GP+G
Sbjct: 561 PGVMGFPGPKGAAGEGGKPGERGVMGPTGPVGAPGKDGDVGAQGPSG---PSGPAGERGE 617
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G +G + G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 618 QGAAGGPGFQGLPGPQGAVGETGKPGEQGLPGEAGATGPAG 658
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/146 (29%), Positives = 56/146 (38%), Gaps = 6/146 (4%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
LGP GS G +G G G +GS GP G++ G G+ GP G
Sbjct: 501 LGPKGSTGEPGRTGEAGLPGAKGM------TGSPGSPGPDGKMGAAGAPGQDGRPGPPGS 554
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
+ G G + + GP G G G +GP+G + G G + GPSG G
Sbjct: 555 VGARGQPGVMGFPGPKGAAGEGGKPGERGVMGPTGPVGAPGKDGDVGAQGPSGPSGPAGE 614
Query: 169 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G G GP G + G
Sbjct: 615 RGEQGAAGGPGFQGLPGPQGAVGETG 640
>gi|49477705|ref|YP_036568.1| BclA protein [Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27]
gi|49329261|gb|AAT59907.1| BclA protein [Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27]
Length = 285
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/84 (32%), Positives = 38/84 (45%)
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G +G G +G GP+G GP+G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 67 GATGITGVTGATGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPTGIT 126
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP+G GP+G GP+
Sbjct: 127 GATGPTGITGATGPTGITGATGPA 150
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/84 (32%), Positives = 38/84 (45%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 67 GATGITGVTGATGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPTGIT 126
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G GP+G + GP+
Sbjct: 127 GATGPTGITGATGPTGITGATGPA 150
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/87 (32%), Positives = 38/87 (43%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 67 GATGITGVTGATGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPAGITGATGPTGIT 126
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 127 GATGPTGITGATGPTGITGATGPAGIT 153
>gi|30041|emb|CAA34683.1| COL2A1 [Homo sapiens]
Length = 1160
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 57/172 (33%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 735 GEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAP 794
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------ 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 795 GPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPS 854
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 855 GKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
>gi|355786042|gb|EHH66225.1| Alpha-1 type II collagen [Macaca fascicularis]
Length = 1488
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 921
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 922 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 976
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 827 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 886
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 887 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 946
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 947 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 976
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 906
>gi|423432735|ref|ZP_17409739.1| hypothetical protein IE7_04551, partial [Bacillus cereus BAG4O-1]
gi|401115106|gb|EJQ22962.1| hypothetical protein IE7_04551, partial [Bacillus cereus BAG4O-1]
Length = 352
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.16, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/188 (27%), Positives = 63/188 (33%), Gaps = 15/188 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G G +GS G +G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 159 TGVTGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGV 218
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------------LGPSGRLRY 120
G +G G G +GP+G GP G GP G +
Sbjct: 219 TGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQGIQGPQGDIGP 278
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 279 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 338
Query: 181 LRYLGPSG 188
GP G
Sbjct: 339 TGPQGPQG 346
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 53/150 (35%), Gaps = 12/150 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------- 64
+GP+G GP G G +G G G +GP+G GP G
Sbjct: 200 EIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGATGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATG 259
Query: 65 --RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
GP G GP G + GP G G G + GP G GP G G
Sbjct: 260 GTGAQGPQG---IQGPQGDIGPTGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQG 316
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
P G +GP G GP G GP G
Sbjct: 317 PVGATGPEGPQGIQGIQGPVGATGPQGPQG 346
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/181 (29%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
G +G G +G+ G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 162 TGDTGATGSTGVTGATGETGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGVQGPQGIQGVTGA 221
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G G G +GP+G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 222 TGDQGPQGIQGPQGDIGPTGPQGIQGPQGSQGIQGATGGTGAQGPQG---IQGPQGDIGP 278
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GP G G G + GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 279 TGPQGPTGIQGIQGEIGPTGPEGPEGLQGPQGIQGVQGPVGATGPEGPQGIQGIQGPVGA 338
Query: 190 L 190
Sbjct: 339 T 339
>gi|422345652|ref|ZP_16426566.1| hypothetical protein HMPREF9476_00639 [Clostridium perfringens
WAL-14572]
gi|422873783|ref|ZP_16920268.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium perfringens
F262]
gi|373227317|gb|EHP49631.1| hypothetical protein HMPREF9476_00639 [Clostridium perfringens
WAL-14572]
gi|380305248|gb|EIA17527.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium perfringens
F262]
Length = 400
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 68/180 (37%), Gaps = 1/180 (0%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G + GP G GP G GP G G +G +GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPV 188
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP G G +G GP G GP G + GP G + D L VS
Sbjct: 189 GPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGEPG-VDFDDTLLVS 247
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.68, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/167 (31%), Positives = 62/167 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPV 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 189 GPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 235
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/141 (31%), Positives = 52/141 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + GP G GP G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 95 MGPMGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQGDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGP 154
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP+G GP G GP G G +G GP
Sbjct: 155 AGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPVGPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGP 214
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G GP G + GP G
Sbjct: 215 QGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 235
>gi|225867983|ref|YP_002743931.1| cell surface-anchored protein SclI [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus]
gi|225701259|emb|CAW98232.1| putative cell surface-anchored protein SclI [Streptococcus equi
subsp. zooepidemicus]
Length = 480
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/177 (29%), Positives = 62/177 (35%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G +GP G GP G+ GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 97 GPAGPRGERGPQGPAGPVGPKGLDGARGPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETGPQGPR 156
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G G +G GP G GP+G+ GP
Sbjct: 157 GDKGDTGETGKQGPAGERGPAGPQGPRGDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQGERGPK 216
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G G G G G G G G G G
Sbjct: 217 GDKGERGEKGEQGLRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQ 273
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/178 (28%), Positives = 58/178 (32%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G GP G GP G GP+G+ GP G G +G GP+G
Sbjct: 114 VGPKGLDGARGPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETGPQGPRGDKGDTGETGKQGPAGE 173
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP G GP+G+ GP G G G G
Sbjct: 174 RGPAGPQGPRGDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQGERGPKGDKGERGEKGEQGLRGE 233
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G G G G G G G G G G G G
Sbjct: 234 KGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQ 291
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/182 (28%), Positives = 60/182 (32%), Gaps = 3/182 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 124 GPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETGPQGPRGDKGDTGETGKQGPAGERGPAGPQGPR 183
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP+G+ GP G G G G G G
Sbjct: 184 GDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQGERGPKGDKGERGEKGEQGLRGEKGEQGLRGEK 243
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G G G G G G G G G G G GP G
Sbjct: 244 GEQGQRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKG---EQGPRGEKGEQ 300
Query: 194 GL 195
GL
Sbjct: 301 GL 302
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/119 (31%), Positives = 48/119 (40%)
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
L GP+G GP G +GP G GP G+ GP G GP+G+ G
Sbjct: 92 ELTKPGPAGPRGERGPQGPAGPVGPKGLDGARGPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETG 151
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P G G +G GP+G GP G G +G GP G GP+G+
Sbjct: 152 PQGPRGDKGDTGETGKQGPAGERGPAGPQGPRGDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQ 210
>gi|6978677|ref|NP_037061.1| collagen alpha-1(II) chain precursor [Rattus norvegicus]
gi|83301579|sp|P05539.2|CO2A1_RAT RecName: Full=Collagen alpha-1(II) chain; AltName: Full=Alpha-1
type II collagen; Contains: RecName: Full=Collagen
alpha-1(II) chain; Contains: RecName:
Full=Chondrocalcin; Flags: Precursor
gi|1032389|gb|AAA79780.1| collagen alpha 1 type II [Rattus norvegicus]
Length = 1419
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 61/178 (34%), Gaps = 15/178 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 733 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 792
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+ GP G
Sbjct: 793 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV---GPPGSNGNPGPA 849
Query: 128 ------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G G GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 850 GPPGPAGKDGPKGARGDTGAPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGSDGPPGPQG 907
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/150 (28%), Positives = 49/150 (32%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 758 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 817
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G G GR G
Sbjct: 818 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPAGPPGPAGKDGPKGARGDTGAPGRAGDPG 877
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 878 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGSDGPPGPQG 907
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 733 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 792
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 793 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 837
>gi|355564168|gb|EHH20668.1| Alpha-1 type II collagen [Macaca mulatta]
Length = 1488
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 921
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 922 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 976
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 827 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 886
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 887 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGDPG 946
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 947 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 976
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 906
>gi|196044816|ref|ZP_03112050.1| exosporium protein H [Bacillus cereus 03BB108]
gi|196024304|gb|EDX62977.1| exosporium protein H [Bacillus cereus 03BB108]
Length = 424
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/103 (33%), Positives = 50/103 (48%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G+ G +G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 269
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/103 (33%), Positives = 48/103 (46%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 269
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/103 (33%), Positives = 48/103 (46%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 269
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/103 (33%), Positives = 48/103 (46%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 269
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/103 (33%), Positives = 48/103 (46%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G G +G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTG 269
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/105 (33%), Positives = 50/105 (47%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTGPT 271
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.53, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/105 (33%), Positives = 50/105 (47%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G+
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTGPT 271
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/105 (33%), Positives = 48/105 (45%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G GP+G+ GP+G GP+G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 167 GPTGATGDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGNPGPTGPTGNPGPTGATGDPGATGAT 226
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 227 GDPGPTGATGDPGPTGATGDPGPTGPTGDPGPTGATGDPGPTGPT 271
>gi|327281190|ref|XP_003225332.1| PREDICTED: collagen alpha-2(V) chain-like, partial [Anolis
carolinensis]
Length = 1466
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 71/183 (38%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+GS GP GS LG +G GP G +G G + G +G
Sbjct: 390 GTDGSMGAKGPTGSPGTSGPHGSPGPLGSTGPQGSTGPPGIRGQMGDPGVPGFKGEAGPK 449
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G +GP G GP G +GP G L GP G + G G G
Sbjct: 450 GEPGPHGPQGPIGPVGEEGKRGPRGDPGSVGPPGPLGERGPPGNRGFPGSDGLPGPKGAQ 509
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-P-----SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G SG G GR G P +G GP G+ LG G GP+
Sbjct: 510 GERGLAGASGPKGSQGDPGRTGEPGLPGARGLTGNPGVSGPEGKSGPLGAPGEDGRPGPA 569
Query: 188 GRL 190
G +
Sbjct: 570 GPI 572
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/187 (31%), Positives = 69/187 (36%), Gaps = 9/187 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
GP+G GP G P G GP SG G GS+ GP+G G
Sbjct: 355 EAGPTGARGPEGPQG------PRGETGQPGPAGLSGLPGAPGTDGSMGAKGPTGSPGTSG 408
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
P G LG +G GP G +G G + G +G GP G +GP G
Sbjct: 409 PHGSPGPLGSTGPQGSTGPPGIRGQMGDPGVPGFKGEAGPKGEPGPHGPQGPIGPVGEEG 468
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G +GP G L GP G + G G G G G SG G G
Sbjct: 469 KRGPRGDPGSVGPPGPLGERGPPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGLAGASGPKGSQGDPG 528
Query: 189 RLRYLGL 195
R GL
Sbjct: 529 RTGEPGL 535
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/181 (31%), Positives = 69/181 (38%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G LG +G GP G +G G + G +G GP G +GP G
Sbjct: 408 GPHGSPGPLGSTGPQGSTGPPGIRGQMGDPGVPGFKGEAGPKGEPGPHGPQGPIGPVGEE 467
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G +GP G L GP G + G G G G G SG S G
Sbjct: 468 GKRGPRGDPGSVGPPGPLGERGPPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGLAGASGPKGSQGDP 527
Query: 134 GRLRYLG-P-----SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GR G P +G GP G+ LG G GP+G + G G + GP
Sbjct: 528 GRTGEPGLPGARGLTGNPGVSGPEGKSGPLGAPGEDGRPGPAGPIGIRGQPGSMGLPGPK 587
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 588 G 588
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/178 (33%), Positives = 72/178 (40%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + LG GS + G G GP+G+ GP G P G GP+G L L
Sbjct: 333 GPMGPLGIPGSAGFPGVPGMKGEAGPTGARGPEGPQG------PRGETGQPGPAG-LSGL 385
Query: 86 ----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G + GP+G GP G LG +G GP G G G + G
Sbjct: 386 PGAPGTDGSMGAKGPTGSPGTSGPHGSPGPLGSTGPQGSTGPPGIRGQMGDPGVPGFKGE 445
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
+G GP G +GP G GP G +GP G L GP G + G SDGL
Sbjct: 446 AGPKGEPGPHGPQGPIGPVGEEGKRGPRGDPGSVGPPGPLGERGPPGNRGFPG-SDGL 502
>gi|930050|emb|CAA32030.1| alpha-1 type 2 collagen (714 AA) [Homo sapiens]
Length = 714
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/172 (29%), Positives = 57/172 (33%), Gaps = 18/172 (10%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 304 GEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAP 363
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------------------ 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 364 GPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPS 423
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 424 GKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 475
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 326 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 385
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 386 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 445
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 446 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 475
>gi|29516|emb|CAA34488.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 1418
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G+ GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGTSGIAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 49/150 (32%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGTSGIAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDSGPPGRAGEPG 876
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGAEGPPGPQG 906
>gi|148672265|gb|EDL04212.1| procollagen, type II, alpha 1, isoform CRA_a [Mus musculus]
Length = 1385
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 699 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 758
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 759 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPP 818
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 819 GPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 873
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 724 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 783
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 784 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 843
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 844 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 873
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 699 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 758
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 759 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 803
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/150 (30%), Positives = 55/150 (36%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 26 GSLRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G+ GP G + GP G G G +GP G G G + GPSGS
Sbjct: 654 GAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPSGST 713
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G + GP G G G G G + GP G GP
Sbjct: 714 GARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQ 773
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 774 GPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 803
>gi|424049829|ref|ZP_17787380.1| hypothetical protein WY5_07210, partial [Streptococcus agalactiae
ZQ0910]
gi|389648672|gb|EIM70166.1| hypothetical protein WY5_07210, partial [Streptococcus agalactiae
ZQ0910]
Length = 888
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/149 (30%), Positives = 61/149 (40%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP+G+ G G + GP G GP+G+ G G + GP G
Sbjct: 540 GPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDR 599
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP+G+ G G + GP G G G + GP +GP+G GP+
Sbjct: 600 GETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGP------MGPAGPKGEAGPA 653
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G G + GP G GP+G+
Sbjct: 654 GERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPAGK 679
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 7/167 (4%)
Query: 26 GSLRYLG-PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G+ +LG P G PS R+ +G S GP G GP+G+ G G
Sbjct: 503 GNQTFLGLPIGKPEIKEPSPRIVKVGISQENMSQFPRGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGP 562
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+ GP G GP+G+ G G + GP G GP+G+ DG +G +GP
Sbjct: 563 VGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGK---DGEAGAQGPVGP 619
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G GP+G G G + GP G G G GP G
Sbjct: 620 AGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMG 666
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/141 (29%), Positives = 61/141 (43%), Gaps = 9/141 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G+ G G + GP G GP+G+ G G + GP G GP+G+
Sbjct: 548 TGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGK 607
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ +GP+G GP+G G G + GP G G G + GP
Sbjct: 608 D---GEAGAQGPVGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGEAGPAGERGETGAQGP 664
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+GP+G GP+G+
Sbjct: 665 ------MGPAGPKGEAGPAGK 679
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/149 (30%), Positives = 61/149 (40%), Gaps = 9/149 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP+G G G + GP G GP+G+ G G + GP G
Sbjct: 540 GPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDR 599
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G+ G G + GP G GP+G G G + GP+G GP+
Sbjct: 600 GETGPAGKDGEAGAQGPVGPAGPKGE---AGPAGERGETGAQGPM---GPAGPKGEAGPA 653
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G G + GP G GP+G+
Sbjct: 654 GERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPAGK 679
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/140 (30%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 6/140 (4%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G GP+G+ G G + GP G GP+G+ G G + GP G
Sbjct: 540 GPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDRGETGPAGKDGEAGTQGPVGPAGPKGDR 599
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP+G+ G G + GP+G GP+G G G + GP G GP+
Sbjct: 600 GETGPAGKDGEAGAQGPV---GPAGPKGEAGPAGERGETGAQGPMGPAGPKGE---AGPA 653
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G + GP G
Sbjct: 654 GERGETGAQGPMGPAGPKGE 673
>gi|21105301|gb|AAM34600.1|AF448525_1 precollagen-P [Mytilus galloprovincialis]
Length = 894
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/111 (36%), Positives = 50/111 (45%), Gaps = 6/111 (5%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G + GPSG GP G+ GP+G GP G+ GP G GP+G
Sbjct: 469 NGEVGPQGPSGPAGPQGPQGKNGVKGPAGDQGARGPEGKAGPGGPQGEQGPKGPTGAQGP 528
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G GP G + GP G GPSG GP+G + GPSG
Sbjct: 529 AGPAGPSGEQGPGGERGAQGPQG---AEGPSGPAGPRGPAG---HQGPSGE 573
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/111 (36%), Positives = 49/111 (44%), Gaps = 6/111 (5%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G + GPSG GP G+ GP+G GP G+ GP G GP+G
Sbjct: 469 NGEVGPQGPSGPAGPQGPQGKNGVKGPAGDQGARGPEGKAGPGGPQGEQGPKGPTGAQGP 528
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
GP+G GP G GP G GPSG GP+G + GPSG
Sbjct: 529 AGPAGPSGEQGPGGERGAQGPQG---AEGPSGPAGPRGPAG---HQGPSGE 573
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/111 (36%), Positives = 48/111 (43%), Gaps = 6/111 (5%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G + GPSG GP G GP+G GP G+ GP G GP+G
Sbjct: 469 NGEVGPQGPSGPAGPQGPQGKNGVKGPAGDQGARGPEGKAGPGGPQGEQGPKGPTGAQGP 528
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP+G GP G GP G GPSG GP+G + GPSG
Sbjct: 529 AGPAGPSGEQGPGGERGAQGPQG---AEGPSGPAGPRGPAG---HQGPSGE 573
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/120 (35%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 6/120 (5%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G + GPSG GP G GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 469 NGEVGPQGPSGPAGPQGPQGKNGVKGPAGDQGARGPEGKAGPGGPQGEQGPKGPTGAQGP 528
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G GP G GP G GPSG GP+G + GPSG + G G+
Sbjct: 529 AGPAGPSGEQGPGGERGAQGPQG---AEGPSGPAGPRGPAG---HQGPSGERGAPGSPGK 582
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/105 (34%), Positives = 45/105 (42%), Gaps = 3/105 (2%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
+G + GPSG GP G+ GP+G GP G+ GP G GP+G
Sbjct: 469 NGEVGPQGPSGPAGPQGPQGKNGVKGPAGDQGARGPEGKAGPGGPQGEQGPKGPTGAQGP 528
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLGPSGR 189
GP+G GP G GP G GP+ G + GPSG
Sbjct: 529 AGPAGPSGEQGPGGERGAQGPQGAEGPSGPAGPRGPAGHQGPSGE 573
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/119 (35%), Positives = 50/119 (42%), Gaps = 6/119 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GPSG GP G GP+G GP G+ GP G GP+G GP+G
Sbjct: 475 QGPSGPAGPQGPQGKNGVKGPAGDQGARGPEGKAGPGGPQGEQGPKGPTGAQGPAGPAGP 534
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GPSG GP+G + GPSG G G+ +G
Sbjct: 535 SGEQGPGGERGAQGPQG---AEGPSGPAGPRGPAG---HQGPSGERGAPGSPGKKGPNG 587
>gi|228940414|ref|ZP_04102984.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar berliner ATCC 10792]
gi|228973330|ref|ZP_04133919.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar thuringiensis str. T01001]
gi|228979893|ref|ZP_04140214.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|228779908|gb|EEM28154.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
Bt407]
gi|228786526|gb|EEM34516.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar thuringiensis str. T01001]
gi|228819256|gb|EEM65311.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis
serovar berliner ATCC 10792]
Length = 614
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/165 (29%), Positives = 65/165 (39%), Gaps = 3/165 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G SG + +G G GP+G G GS +G G GP G GP+G+
Sbjct: 310 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 369
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G L GP+G G G +GP+G +G G G +G G +
Sbjct: 370 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 429
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 430 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETGPTG---ATGPTGLTGATGSS 471
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 64/157 (40%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 318 IGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGP 377
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G +G + GP
Sbjct: 378 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQTGATGATGP 437
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 438 TGIQGIQGITGATGETGPTG---ATGPTGLTGATGSS 471
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/145 (28%), Positives = 56/145 (38%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G SG + +G G GP+G G GS +G G GP G GP+G
Sbjct: 310 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 369
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G L GP+G G G +GP+G +G G +G +G G +
Sbjct: 370 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 429
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G G +G G
Sbjct: 430 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETG 454
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/199 (25%), Positives = 71/199 (35%), Gaps = 6/199 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+G +G GP+G + +G G + +G G GP+GS G G
Sbjct: 69 IGDTGEQGITGPTGLQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQGIQGE 128
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+G G+ G G G SG GP G G G + G G G +G
Sbjct: 129 IGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGLQGIQGITGE 188
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +GP+G G G G +G + GP G G +G + G
Sbjct: 189 EGPQGAQGIQGEVGPTGSTGIQGAQGISGIKGITGAIGLQGPQGVQGIQGITGATGFQGI 248
Query: 187 SGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
G G + + + GL
Sbjct: 249 KGIRGITGATGSIGIQGLE 267
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/165 (29%), Positives = 64/165 (38%), Gaps = 3/165 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G SG + +G G GP+G G G +G G GP G+ GP+G
Sbjct: 310 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 369
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G L GP+G G G +GP+G G G +G +G G +
Sbjct: 370 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 429
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 430 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETGPTG---ATGPTGLTGATGSS 471
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/183 (27%), Positives = 67/183 (36%), Gaps = 8/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G +GP+G + GP G GP+G GP G GP G G G
Sbjct: 12 GPTGNSGPIGPTGG--HEGPVGPTGVTGPTGATGPQGPQGIRGIQGPRG---TTGAQGIQ 66
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G +G GP+G G G + G G + G G GP+G G
Sbjct: 67 GAIGDTGEQGITGPTG---LQGAQGLIGNQGLIGDIGVQGLEGIQGATGPAGSQGIQGTQ 123
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G +G G+ G G G SG GP G G G + G G
Sbjct: 124 GIQGEIGERGQTGAQGMQGERGITGVSGVTGPQGPQGVQGIQGEQGAIGIQGEDGLQGIQ 183
Query: 194 GLS 196
G++
Sbjct: 184 GIT 186
>gi|149032176|gb|EDL87088.1| procollagen, type II, alpha 1, isoform CRA_a [Rattus norvegicus]
gi|149032177|gb|EDL87089.1| procollagen, type II, alpha 1, isoform CRA_a [Rattus norvegicus]
Length = 1326
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/178 (30%), Positives = 61/178 (34%), Gaps = 15/178 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 640 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 699
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+ GP G
Sbjct: 700 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV---GPPGSNGNPGPA 756
Query: 128 ------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G G GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 757 GPPGPAGKDGPKGARGDTGAPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGSDGPPGPQG 814
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/150 (28%), Positives = 49/150 (32%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 665 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 724
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G G GR G
Sbjct: 725 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPAGPPGPAGKDGPKGARGDTGAPGRAGDPG 784
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 785 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGSDGPPGPQG 814
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 640 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 699
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 700 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 744
>gi|351710670|gb|EHB13589.1| Collagen alpha-1(II) chain [Heterocephalus glaber]
Length = 1488
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 921
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 922 GPSGKDGPKGARGDGGPPGRAGDPGLQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 976
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 827 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 886
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 887 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPKGARGDGGPPGRAGDPG 946
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 947 LQGPAGPPGEKGEPGDDGPSGADGPPGPQG 976
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/150 (30%), Positives = 55/150 (36%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 26 GSLRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G+ GP G + GP G G G +GP G G G + GP+GS
Sbjct: 757 GAAGITGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSA 816
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G + GP G G G G G S GP G GP
Sbjct: 817 GARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGSPGPQGPSGAPGPQ 876
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 877 GPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 802 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 861
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 862 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 906
>gi|168213955|ref|ZP_02639580.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens CPE
str. F4969]
gi|170714589|gb|EDT26771.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens CPE
str. F4969]
Length = 397
Score = 41.6 bits (96), Expect = 0.22, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/199 (30%), Positives = 73/199 (36%), Gaps = 1/199 (0%)
Query: 4 TCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
C +E N + GP G GP G +G G +GP G + +GP G
Sbjct: 47 DCYLEINCNCCDCCKPGPRGPRGPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGP 106
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP G G G GP G + GP G GP G GP G G
Sbjct: 107 QGLTGPQGPAGPQGEQGPQGDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGATGPQGA 166
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G +GP+G GP G GP G G +G GP G GP G +
Sbjct: 167 TGPQGPEGPTGAQGDQGPVGPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGP 226
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
GP G + D L VS
Sbjct: 227 QGPQGEPG-VDFDDTLLVS 244
>gi|200217|gb|AAA68101.1| pro-alpha-1 type II collagen [Mus musculus]
Length = 1459
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 60/166 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 782 GPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPS 841
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP G DGP
Sbjct: 842 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPK 901
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 902 GVRGDSGPPGRAGDPGLEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 947
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.81, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 773 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 832
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 798 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 857
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 858 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 917
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 918 LEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 947
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 832
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 37/105 (35%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|345308945|ref|XP_003428766.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Ornithorhynchus
anatinus]
Length = 925
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/189 (31%), Positives = 78/189 (41%), Gaps = 12/189 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G G GS G GR +GP+G+ GPSG G SGR
Sbjct: 372 GPNGEPGSTGPTGPPGLRGVPGSRGLPGADGRAGGMGPAGNRGSAGPSGARGPSGDSGRP 431
Query: 74 RY---LGPSGSLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP G + +GP+G+ +G G GP+G G G + + GP G
Sbjct: 432 GEPGLVGPRGLPGFPGNVGPAGKEGPVGLPGSEGRPGPTGPAGARGEPGNIGFPGPKGPN 491
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G SG + G +G GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 492 GEPGKSGERGHAGLAGSRGAPGPDGNNGAHGPPGLTGLPGEFGLPGPAGPRGERGPPGES 551
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GP+G L
Sbjct: 552 GAAGPTGPL 560
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/185 (31%), Positives = 78/185 (42%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A + G SG G +G+ GP+G GP+G GP+G G G G
Sbjct: 341 AGSKGESGSKGEPGSAGAQGPPGPNGEEGKRGPNGEPGSTGPTGPPGLRGVPGSRGLPGA 400
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGP 123
GR +GP+G+ GPSG G SGR +GP G + +GP+G+ +G
Sbjct: 401 DGRAGGMGPAGNRGSAGPSGARGPSGDSGRPGEPGLVGPRGLPGFPGNVGPAGKEGPVGL 460
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G GP+G G G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 461 PGSEGRPGPTGPAGARGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKSGERGHAGLAGSRGAPGPDGNNGA 520
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 521 HGPPG 525
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.76, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/178 (32%), Positives = 76/178 (42%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+GS G SGS G +G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 335 VGEPGPAGSK---GESGSKGEPGSAGAQGPPGPNGEEGKRGPNGEPGSTGPTGPPGLRGV 391
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
GS G GR +GP+G GPSG GPSG G G + G G
Sbjct: 392 PGSRGLPGADGRAGGMGPAGNRGSAGPSG---ARGPSGDSGRPGEPGLVGPRGLPGFPGN 448
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
+GP+G+ +G G GP+G G G + + GP G G SG + GL+
Sbjct: 449 VGPAGKEGPVGLPGSEGRPGPTGPAGARGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKSGERGHAGLA 506
>gi|123703924|ref|NP_001074044.1| collagen alpha-1(XXVII) chain B precursor [Danio rerio]
gi|166218146|sp|A0MSJ1.1|CRA1B_DANRE RecName: Full=Collagen alpha-1(XXVII) chain B; Flags: Precursor
gi|117169176|gb|ABK32518.1| procollagen type XXVII alpha I b [Danio rerio]
Length = 1658
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/187 (27%), Positives = 72/187 (38%), Gaps = 17/187 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+G G + G G GPSG G G + G SG +G G G G
Sbjct: 974 NIGEQGLIGPRGDPGVDGEAGPSGPDGAKGEQGDVGLEGESGEKGVIGFKGTEGRTGDPG 1033
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---GRLRYLG 122
+ GP G +G G+ + G G + LG G ++GP G ++G
Sbjct: 1034 LIGVKGPEGKPGKIGERGKPGEKGSKGHQGQLGEMGALGEQGDTGFIGPKGSRGTTGFMG 1093
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G++ G G + Y G + GP G L GP G G G++ GP G
Sbjct: 1094 APGKMGQQGEPGLVGYEG------HQGPQGSLGSPGPKGEKGEQGDDGKVE--GPPGPSG 1145
Query: 183 YLGPSGR 189
+GP G
Sbjct: 1146 DIGPVGN 1152
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/160 (29%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 4/160 (2%)
Query: 39 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GPSG G G + G SG +G G G G + GP G+ +G G
Sbjct: 992 EAGPSGPDGAKGEQGDVGLEGESGEKGVIGFKGTEGRTGDPGLIGVKGPEGKPGKIGERG 1051
Query: 99 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-- 156
+ G G LG G L G +G + G G ++G G++ G G + Y
Sbjct: 1052 KPGEKGSKGHQGQLGEMGALGEQGDTGFIGPKGSRGTTGFMGAPGKMGQQGEPGLVGYEG 1111
Query: 157 -LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR-YLGPSGRLRYLG 194
GP G L GP G G G++ GPSG + +G
Sbjct: 1112 HQGPQGSLGSPGPKGEKGEQGDDGKVEGPPGPSGDIGPVG 1151
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/195 (28%), Positives = 75/195 (38%), Gaps = 8/195 (4%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
KA + G G G GS +G G + G G GPSG G G + G
Sbjct: 953 KAGDQGLPGEPGEKGAVGSPGNIGEQGLIGPRGDPGVDGEAGPSGPDGAKGEQGDVGLEG 1012
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
SG +G G+ G G + GP G+ +G G+ G G LG G L
Sbjct: 1013 ESGEKGVIGFKGTEGRTGDPGLIGVKGPEGKPGKIGERGKPGEKGSKGHQGQLGEMGALG 1072
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G + G G ++G G++ G G + Y G + GP G L GP G
Sbjct: 1073 EQGDTGFIGPKGSRGTTGFMGAPGKMGQQGEPGLVGYEG------HQGPQGSLGSPGPKG 1126
Query: 189 RLRYLGLSDGLRVSG 203
G D +V G
Sbjct: 1127 EKGEQG--DDGKVEG 1139
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 69/181 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G L GP GS LGP G + +G G+ G G G G +G G +
Sbjct: 922 GAKGILGEPGPQGSPGVLGPLGEIGAIGLPGKAGDQGLPGEPGEKGAVGSPGNIGEQGLI 981
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GPSG G G + G SG +G G G G + GP
Sbjct: 982 GPRGDPGVDGEAGPSGPDGAKGEQGDVGLEGESGEKGVIGFKGTEGRTGDPGLIGVKGPE 1041
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G+ +G G+ G G LG G L G +G + G G ++G G++
Sbjct: 1042 GKPGKIGERGKPGEKGSKGHQGQLGEMGALGEQGDTGFIGPKGSRGTTGFMGAPGKMGQQ 1101
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 1102 G 1102
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/185 (29%), Positives = 70/185 (37%), Gaps = 3/185 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+G G GP+G GP+G G G L GP GS LGP G + +G G
Sbjct: 896 QMGKIGETGEAGPTGFTGVQGPTGPP---GAKGILGEPGPQGSPGVLGPLGEIGAIGLPG 952
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G G G +G G + G G GPSG G G + +G
Sbjct: 953 KAGDQGLPGEPGEKGAVGSPGNIGEQGLIGPRGDPGVDGEAGPSGPDGAKGEQGDVGLEG 1012
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
SG +G G G G + GP G+ +G G+ G G LG G L
Sbjct: 1013 ESGEKGVIGFKGTEGRTGDPGLIGVKGPEGKPGKIGERGKPGEKGSKGHQGQLGEMGALG 1072
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 1073 EQGDT 1077
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/182 (29%), Positives = 71/182 (39%), Gaps = 6/182 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G + GP G G SG + +G +G GP+G GP+G G G
Sbjct: 873 VGEKGMMGMKGPEGPPGKQGLSGQMGKIGETGEA---GPTGFTGVQGPTGPP---GAKGI 926
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP GS LGP G + +G G+ G G G G +G G + G
Sbjct: 927 LGEPGPQGSPGVLGPLGEIGAIGLPGKAGDQGLPGEPGEKGAVGSPGNIGEQGLIGPRGD 986
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G GPSG G G + G SG +G G G G + GP G+
Sbjct: 987 PGVDGEAGPSGPDGAKGEQGDVGLEGESGEKGVIGFKGTEGRTGDPGLIGVKGPEGKPGK 1046
Query: 193 LG 194
+G
Sbjct: 1047 IG 1048
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/181 (28%), Positives = 68/181 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G LGP G + +G G G G G GS +G G + G G
Sbjct: 931 GPQGSPGVLGPLGEIGAIGLPGKAGDQGLPGEPGEKGAVGSPGNIGEQGLIGPRGDPGVD 990
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GPSG G G + G SG +G G G G + GP G+ G
Sbjct: 991 GEAGPSGPDGAKGEQGDVGLEGESGEKGVIGFKGTEGRTGDPGLIGVKGPEGKPGKIGER 1050
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G+ G G LG G L G +G + G G ++G G++ G G + Y
Sbjct: 1051 GKPGEKGSKGHQGQLGEMGALGEQGDTGFIGPKGSRGTTGFMGAPGKMGQQGEPGLVGYE 1110
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 1111 G 1111
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 73/184 (39%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N G G G +G+ LG G + ++GP G + G G G +G+ G G
Sbjct: 770 NPGEEGMKGEPGMTGNPGMLGERGPVGFVGPFGEMGLAGEKGDR---GETGQPGPPGEKG 826
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ + G G GP+G G G GP G GP G + G G +G
Sbjct: 827 AMGHPGAPGERGLSGPAGAPGPHGSRGLSGTRGPKGTRGARGPDGPVGEKGMMGMKGPEG 886
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P G+ G G++ G +G + G G G G L GP G LGP G +
Sbjct: 887 PPGKQGLSGQMGKIGETGEAGPTGFTGVQGPTGPPGAKGILGEPGPQGSPGVLGPLGEIG 946
Query: 192 YLGL 195
+GL
Sbjct: 947 AIGL 950
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/173 (30%), Positives = 68/173 (39%), Gaps = 9/173 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G+ GP G + G G + GP G G SG++ +G +G GP+G
Sbjct: 859 GPKGTRGARGPDGPV---GEKGMMGMKGPEGPPGKQGLSGQMGKIGETGEA---GPTGFT 912
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G G G L GP G LGP G + +G G+ G G G
Sbjct: 913 GVQGPTGPP---GAKGILGEPGPQGSPGVLGPLGEIGAIGLPGKAGDQGLPGEPGEKGAV 969
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +G G + G G GPSG G G + G SG +G
Sbjct: 970 GSPGNIGEQGLIGPRGDPGVDGEAGPSGPDGAKGEQGDVGLEGESGEKGVIGF 1022
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/181 (28%), Positives = 66/181 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ G G + G +G + G G G G L GP G LGP G +
Sbjct: 886 GPPGKQGLSGQMGKIGETGEAGPTGFTGVQGPTGPPGAKGILGEPGPQGSPGVLGPLGEI 945
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+G G G G G G +G G + G G GPSG + G
Sbjct: 946 GAIGLPGKAGDQGLPGEPGEKGAVGSPGNIGEQGLIGPRGDPGVDGEAGPSGPDGAKGEQ 1005
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + G SG +G G G G + GP G+ +G G+ G G L
Sbjct: 1006 GDVGLEGESGEKGVIGFKGTEGRTGDPGLIGVKGPEGKPGKIGERGKPGEKGSKGHQGQL 1065
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 1066 G 1066
>gi|47220653|emb|CAG06575.1| unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Length = 1545
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/120 (31%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G + GPSG+ G G + GP+G G +G GP+G + GP G
Sbjct: 774 TGPMGAPGPSGAQGERGEPGPVGIAGPTGPR---GSNGERGEAGPAGPAGFAGPPGADGQ 830
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G GP G GP+G + GP G GP G +G G + GP+GR
Sbjct: 831 PGAKGETGDTGPKGDAGPAGPTGPVGAAGPQGPAGPTGPKGATGGVGAPGATGFPGPTGR 890
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/120 (31%), Positives = 50/120 (41%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+G + GPSG G G + GP+G G +G GP+G + GP G
Sbjct: 774 TGPMGAPGPSGAQGERGEPGPVGIAGPTGPR---GSNGERGEAGPAGPAGFAGPPGADGQ 830
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G G GP G GP+G + GP G GP G +G G + GP+GR
Sbjct: 831 PGAKGETGDTGPKGDAGPAGPTGPVGAAGPQGPAGPTGPKGATGGVGAPGATGFPGPTGR 890
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/120 (31%), Positives = 52/120 (43%), Gaps = 3/120 (2%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G + GPSG+ G G + GP+G G +G GP+G + GP G
Sbjct: 774 TGPMGAPGPSGAQGERGEPGPVGIAGPTGPR---GSNGERGEAGPAGPAGFAGPPGADGQ 830
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G G GP G GP+G + + GP G GP G +G G + GP+GR
Sbjct: 831 PGAKGETGDTGPKGDAGPAGPTGPVGAAGPQGPAGPTGPKGATGGVGAPGATGFPGPTGR 890
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/121 (31%), Positives = 52/121 (42%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G + GPSG+ G G + GP+G G +G GP+G + GP G+
Sbjct: 774 TGPMGAPGPSGAQGERGEPGPVGIAGPTGPR---GSNGERGEAGPAGPAGFAGPPGADGQ 830
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G G GP G GP+G + GP G GP G G G + GP+GR
Sbjct: 831 PGAKGETGDTGPKGDAGPAGPTGPVGAAGPQGPAGPTGPKGATGGVGAPGATGFPGPTGR 890
Query: 145 L 145
+
Sbjct: 891 V 891
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/121 (31%), Positives = 51/121 (42%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
+G + GPSG G G + GP+G G +G GP+G + GP G
Sbjct: 774 TGPMGAPGPSGAQGERGEPGPVGIAGPTGPR---GSNGERGEAGPAGPAGFAGPPGADGQ 830
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G GP G GP+G + GP G GP G +G G + GP+GR
Sbjct: 831 PGAKGETGDTGPKGDAGPAGPTGPVGAAGPQGPAGPTGPKGATGGVGAPGATGFPGPTGR 890
Query: 181 L 181
+
Sbjct: 891 V 891
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/114 (32%), Positives = 48/114 (42%), Gaps = 3/114 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG G G + GP+G G +G GP+G + GP G G G
Sbjct: 781 GPSGAQGERGEPGPVGIAGPTGPR---GSNGERGEAGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGET 837
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP+G + GP G GP G +G G + GP+GR+
Sbjct: 838 GDTGPKGDAGPAGPTGPVGAAGPQGPAGPTGPKGATGGVGAPGATGFPGPTGRV 891
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/121 (31%), Positives = 51/121 (42%), Gaps = 3/121 (2%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 111
+G + GPSG G G + GP+G G +G GP+G + GP G
Sbjct: 774 TGPMGAPGPSGAQGERGEPGPVGIAGPTGPR---GSNGERGEAGPAGPAGFAGPPGADGQ 830
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G GP G GP+G + GP G GP G +G G + GP+GR
Sbjct: 831 PGAKGETGDTGPKGDAGPAGPTGPVGAAGPQGPAGPTGPKGATGGVGAPGATGFPGPTGR 890
Query: 172 L 172
+
Sbjct: 891 V 891
>gi|110799319|ref|YP_695648.1| triple helix repeat-containing collagen [Clostridium perfringens
ATCC 13124]
gi|110673966|gb|ABG82953.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens ATCC
13124]
Length = 400
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 68/180 (37%), Gaps = 1/180 (0%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGDQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G + GP G GP G GP G G +G +GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPV 188
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G GP G G +G GP G GP G + GP G + D L VS
Sbjct: 189 GPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGEPG-VDFDDTLLVS 247
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/167 (31%), Positives = 62/167 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGDQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPV 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 189 GPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 235
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/141 (31%), Positives = 52/141 (36%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP G + GP G GP G G G GP G + GP G GP G
Sbjct: 95 MGPMGPIGPQGPQGDQGLTGPQGPAGPQGEQGPQGDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGP 154
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP+G GP G GP G G +G GP
Sbjct: 155 AGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPVGPQGAQGPQGPQGPQGATGPTGPQGP 214
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
G GP G + GP G
Sbjct: 215 QGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 235
>gi|384187338|ref|YP_005573234.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
serovar chinensis CT-43]
gi|326941047|gb|AEA16943.1| triple helix repeat-containing collagen [Bacillus thuringiensis
serovar chinensis CT-43]
Length = 475
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/165 (29%), Positives = 65/165 (39%), Gaps = 3/165 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G SG + +G G GP+G G GS +G G GP G GP+G+
Sbjct: 171 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 230
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G L GP+G G G +GP+G +G G G +G G +
Sbjct: 231 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 290
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G GP+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 291 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETGPTGA---TGPTGLTGATGSS 332
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 64/157 (40%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G G GP+G G GS +G G GP G+ GP+G G G
Sbjct: 179 IGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAEGSQGIQGP 238
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
L GP+G+ G G +GP+G +G G +G +G G +G + GP
Sbjct: 239 LGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQTGATGATGP 298
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
+G G +G GP+G GP+G G S
Sbjct: 299 TGIQGIQGITGATGETGPTGA---TGPTGLTGATGSS 332
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/145 (28%), Positives = 56/145 (38%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G SG + +G G GP+G G GS +G G GP G GP+G
Sbjct: 171 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 230
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
G G L GP+G G G +GP+G +G G +G +G G +
Sbjct: 231 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 290
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G GP+G G +G G
Sbjct: 291 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETG 315
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/157 (29%), Positives = 62/157 (39%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G SG + +G G GP+G G G +G G GP G+ GP+G
Sbjct: 171 GVSGEIGPIGAQGVQGITGPTGHQGVRGAQGSQGVVGAVGVQGAQGPQGNQGITGPTGAE 230
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G L GP+G G G +GP+G G G +G +G G +
Sbjct: 231 GSQGIQGPLGVTGPTGAEGPKGIQGIQGVIGPTGAQGMVGIQGVSGPVGVTGATGATGQT 290
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 291 GATGATGPTGIQGIQGITGATGETGPTGA---TGPTG 324
>gi|200215|gb|AAA68100.1| pro-alpha-1 type II collagen [Mus musculus]
Length = 1459
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.24, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 60/166 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 782 GPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPS 841
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP G DGP
Sbjct: 842 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPK 901
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 902 GVRGDSGPPGRAGDPGLEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 947
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.84, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 773 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 832
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 798 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 857
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 858 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 917
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 918 LEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 947
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 832
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 37/105 (35%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|30410850|gb|AAH51383.1| Col2a1 protein [Mus musculus]
Length = 1419
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 733 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 792
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 793 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPP 852
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 853 GPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 907
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 758 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 817
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 818 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 877
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 878 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 907
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 733 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 792
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 793 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 837
>gi|363580592|ref|ZP_09313402.1| hypothetical protein FbacHQ_03636, partial [Flavobacteriaceae
bacterium HQM9]
Length = 311
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/173 (28%), Positives = 78/173 (45%), Gaps = 15/173 (8%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL---------RYLGPSGRLRY 75
+G++ Y +G+ + SG GP+G GP+G + GP GR
Sbjct: 142 NGTISYFDEAGNETIVNLSGITGRTGPTGPTGRRGPAGLIGPQGLTGRTGTTGPDGR--- 198
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G +GP GR G +GR + G +G G +GR + G +G G +GR
Sbjct: 199 RGPAG---LIGPQGRSGATGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGR 255
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+ G +G G +GR + G +G G +GR + G +GR + G +G
Sbjct: 256 TGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGRTGFTGRTGRTGFTGRTG 308
>gi|414564657|ref|YP_006043618.1| cell surface-anchored protein SclI [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus ATCC 35246]
gi|338847722|gb|AEJ25934.1| cell surface-anchored protein SclI [Streptococcus equi subsp.
zooepidemicus ATCC 35246]
Length = 393
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.26, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/169 (30%), Positives = 60/169 (35%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
L GP+G GP G GP G GP G+ GP G GP+G G
Sbjct: 92 ELTKPGPAGPRGERGPQGPAGPAGPKGLDGARGPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETG 151
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLR 146
P G G +G GP+G GP G G +G GP G GP+G+
Sbjct: 152 PQGPRGDKGDTGETGKQGPAGERGPAGPQGPRGDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQG 211
Query: 147 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G G G G G G GP G GL
Sbjct: 212 ERGPKGDKGERGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQ---GPRGEKGEQGL 257
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.47, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/149 (30%), Positives = 55/149 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP G GP G+ GP G GP+G+ GP G
Sbjct: 97 GPAGPRGERGPQGPAGPAGPKGLDGARGPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETGPQGPR 156
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G GP G G +G GP G GP+G+ GP
Sbjct: 157 GDKGDTGETGKQGPAGERGPAGPQGPRGDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQGERGPK 216
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
G G G G G G G
Sbjct: 217 GDKGERGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGE 245
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/176 (27%), Positives = 59/176 (33%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ GP G GP+G GP G G +G GP+G GP G
Sbjct: 124 GPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETGPQGPRGDKGDTGETGKQGPAGERGPAGPQGPR 183
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ GP G GP+G+ GP G G G G G G
Sbjct: 184 GDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQGERGPKGDKGERGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEK 243
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G G G G G G G G G G + G G+
Sbjct: 244 GEQGPRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQQPKGDQGK 299
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 59/182 (32%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G GP G GP G GP+G+ GP G G +G GP+G
Sbjct: 114 AGPKGLDGARGPEGQQGKPGPVGPQGPAGPAGQKGETGPQGPRGDKGDTGETGKQGPAGE 173
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G GP G GP+G+ GP G G G G
Sbjct: 174 RGPAGPQGPRGDKGENGAPGEQGPIGPKGETGPAGKQGERGPKGDKGERGEKGEQGLRGE 233
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G G G G G G G G G G G G G +
Sbjct: 234 KGEQGQRGEKGEQGPRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQGLRGEKGEQGQRGEKGEQQP 293
Query: 193 LG 194
G
Sbjct: 294 KG 295
>gi|443700206|gb|ELT99278.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_130157, partial [Capitella teleta]
Length = 166
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/111 (31%), Positives = 48/111 (43%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
SG GP G GP GS +G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 2 SGEPGPQGPRGETGPSGPQGSRGGVGATGEAGPTGGAGPQGQRGPTGLPGPSGPTGEPGP 61
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G+ + GP G G G GP+G + GP+G + G +G
Sbjct: 62 AGPTGQTGNRGPQGSQGVQGVQGNSGATGPTGSIGERGPTGEVGSPGATGE 112
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/104 (32%), Positives = 46/104 (44%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP GS +G +G G +G GP+G GP+G GP+G+
Sbjct: 9 GPRGETGPSGPQGSRGGVGATGEAGPTGGAGPQGQRGPTGLPGPSGPTGEPGPAGPTGQT 68
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP GS G G GP+G + GP+G + G +G
Sbjct: 69 GNRGPQGSQGVQGVQGNSGATGPTGSIGERGPTGEVGSPGATGE 112
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/109 (30%), Positives = 45/109 (41%)
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
SG GP G GP G +G +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 2 SGEPGPQGPRGETGPSGPQGSRGGVGATGEAGPTGGAGPQGQRGPTGLPGPSGPTGEPGP 61
Query: 148 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G+ GP G G G GP+G + GP+G + G +
Sbjct: 62 AGPTGQTGNRGPQGSQGVQGVQGNSGATGPTGSIGERGPTGEVGSPGAT 110
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/120 (32%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 9/120 (7%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
SG GP G GP GS +G +G G +G GP+G GPSG
Sbjct: 2 SGEPGPQGPRGETGPSGPQGSRGGVGATGEAGPTGGAGPQGQRGPTG---LPGPSGPTGE 58
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+ GP+G+ GP G G G GP+G + GP+G + S G +G
Sbjct: 59 PGPA------GPTGQTGNRGPQGSQGVQGVQGNSGATGPTGSIGERGPTGEVGSPGATGE 112
>gi|47215142|emb|CAG12433.1| unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Length = 1321
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/166 (30%), Positives = 67/166 (40%), Gaps = 8/166 (4%)
Query: 5 CVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 64
C +E A + G G G G G G G G GP G +G G+L
Sbjct: 197 CDIEFAHSQGDKGDTGQEGDKGEKGETGLKGKEGPPGSPGLTGVRGPEGKPGKIGERGKL 256
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G G +LG +GS+ GP G + G G + ++G GR+ G G Y G
Sbjct: 257 GSKGAKGHQGHLGETGSVGKTGPPGFVGQKGSRGTIGHVGAPGRMGQQGEPGIAGYEG-- 314
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP G + LGP G G G++ GP G +GPSG
Sbjct: 315 ----HQGPQGPIGRLGPKGEKGEQGDDGKVE--GPPGPQGDIGPSG 354
>gi|200214|gb|AAA68099.1| pro-alpha-1 type II collagen [Mus musculus]
Length = 1442
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 60/166 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 765 GPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPS 824
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP G DGP
Sbjct: 825 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPK 884
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 885 GVRGDSGPPGRAGDPGLEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 930
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.94, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 756 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 815
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 816 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 860
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 781 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 840
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 841 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 900
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 901 LEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 930
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 756 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 815
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 816 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 860
>gi|200216|gb|AAA68102.1| pro-alpha-1 type II collagen [Mus musculus]
Length = 1442
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.28, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 60/166 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 765 GPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPS 824
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP G DGP
Sbjct: 825 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPK 884
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 885 GVRGDSGPPGRAGDPGLEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 930
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.00, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 756 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 815
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 816 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 860
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 781 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 840
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 841 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 900
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 901 LEGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 930
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 756 GEKGEAGPPGPSGSTGARGAPGEPGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 815
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 816 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 860
>gi|148672266|gb|EDL04213.1| procollagen, type II, alpha 1, isoform CRA_b [Mus musculus]
Length = 1439
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 753 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 812
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 813 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPP 872
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 873 GPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 927
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 778 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 837
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 838 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 897
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 898 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 927
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 753 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 812
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 813 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 857
>gi|166064040|ref|NP_112440.2| collagen alpha-1(II) chain isoform 1 precursor [Mus musculus]
gi|125987808|sp|P28481.2|CO2A1_MOUSE RecName: Full=Collagen alpha-1(II) chain; AltName: Full=Alpha-1
type II collagen; Contains: RecName: Full=Collagen
alpha-1(II) chain; Contains: RecName:
Full=Chondrocalcin; Flags: Precursor
gi|51895991|gb|AAH82331.1| Col2a1 protein [Mus musculus]
Length = 1487
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.29, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPP 920
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 975
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 945
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 975
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|327274794|ref|XP_003222161.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Anolis carolinensis]
Length = 1477
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/156 (31%), Positives = 67/156 (42%), Gaps = 9/156 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G SGS G GS+ GP GR +GP+G ++ + GP G G G ++
Sbjct: 567 GQSGSPGPAGKEGSVGLPGPDGRPGPVGPAGPRGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKPGDRGHV 626
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ GP G GP+G + G G GP G GPSG + G +G+
Sbjct: 627 GVTGNRGAPGPDGNNGAQGPAGVIGNTGSKGETGPAGPPGFQGLPGPSGPV---GEAGKP 683
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G GP+G G G +GPSG +
Sbjct: 684 GERGLHGDFGLPGPAGARGERGAPGESGAVGPSGPI 719
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/156 (30%), Positives = 64/156 (41%), Gaps = 9/156 (5%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G SG G GS+ GP GR +GP+G G G++ + GP G G G
Sbjct: 567 GQSGSPGPAGKEGSVGLPGPDGRPGPVGPAG---PRGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKPGDR 623
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 160
++G +G GP G GP+G + + G G GP G GPSG + G
Sbjct: 624 GHVGVTGNRGAPGPDGNNGAQGPAGVIGNTGSKGETGPAGPPGFQGLPGPSGPVGEAGKP 683
Query: 161 GR------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G G G +GPSG +
Sbjct: 684 GERGLHGDFGLPGPAGARGERGAPGESGAVGPSGPI 719
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/141 (31%), Positives = 60/141 (42%), Gaps = 6/141 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP GR +GP+G G G++ + GP G G G ++G +G GP G
Sbjct: 585 GPDGRPGPVGPAGPR---GEPGNIGFPGPKGPNGEPGKPGDRGHVGVTGNRGAPGPDGNN 641
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G + G G GP G GPSG +G +G+ G G GP+
Sbjct: 642 GAQGPAGVIGNTGSKGETGPAGPPGFQGLPGPSG---PVGEAGKPGERGLHGDFGLPGPA 698
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G G +GPSG +
Sbjct: 699 GARGERGAPGESGAVGPSGPI 719
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/118 (32%), Positives = 49/118 (41%), Gaps = 3/118 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G SGS G G + GP GR +GP+G G G + + GP G G G
Sbjct: 567 GQSGSPGPAGKEGSVGLPGPDGRPGPVGPAG---PRGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKPGDR 623
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
++G +G GP G GP+G + G G GP G GPSG + G
Sbjct: 624 GHVGVTGNRGAPGPDGNNGAQGPAGVIGNTGSKGETGPAGPPGFQGLPGPSGPVGEAG 681
>gi|169658375|ref|NP_001106987.2| collagen alpha-1(II) chain isoform 2 precursor [Mus musculus]
gi|30353888|gb|AAH52326.1| Col2a1 protein [Mus musculus]
Length = 1419
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 733 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 792
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 793 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPP 852
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 853 GPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 907
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 758 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 817
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 818 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 877
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 878 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 907
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 733 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 792
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 793 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 837
>gi|16758080|ref|NP_445808.1| collagen alpha-2(I) chain precursor [Rattus norvegicus]
gi|19855071|sp|P02466.3|CO1A2_RAT RecName: Full=Collagen alpha-2(I) chain; AltName: Full=Alpha-2 type
I collagen; Flags: Precursor
gi|5305687|gb|AAD41775.1|AF121217_1 pro-alpha-2(I) collagen [Rattus norvegicus]
Length = 1372
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 68/174 (39%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 464 NVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHPGLAG 523
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG + G+ G
Sbjct: 524 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEV---GKPGERG 580
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G GP G GPSG + GPSG GP G G
Sbjct: 581 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGIRGPSG---APGPDGNKGEAG 631
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 62/160 (38%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
GS +GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G G +
Sbjct: 460 GSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHP 519
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---- 150
G +G GP G GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 520 GLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGER 579
Query: 151 --SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GPSG + GPSG
Sbjct: 580 GLPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGIRGPSG 619
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 391 GEPGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGVRGPNGDAGRPGEP 450
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G
Sbjct: 451 GLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDP 510
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 511 GKPGEKGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTA 570
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 571 GEVG 574
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 79/205 (38%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+G GR G G++ GP+G+ G G GPSG G G +GP+G
Sbjct: 671 EIGNPGRDGARGAPGAIGAPGPAGAS---GDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEVGPAG 727
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+GS G G GP G +GP+G + GPSG GP+G G
Sbjct: 728 PNGFAGPAGSAGQPGAKGEKGTKGPKGENGIVGPTGPVGAAGPSGPNGPPGPAGSRGDGG 787
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYL---------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
P G + G +GR GP G +G +G + GP G
Sbjct: 788 PPGMTGFPGAAGRTGPPGPSGITGPPGPPGAAGKEGIRGPRGDQGPVGRTGEIGASGPPG 847
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GL
Sbjct: 848 FAGEKGPSGEPGTTGPPGTAGPQGL 872
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/195 (29%), Positives = 75/195 (38%), Gaps = 12/195 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 415 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPV 474
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 475 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHPGLAGARGAPGPDGNN 534
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR------LRYLGPSGRL 181
+ GP G G G GP G GPSG +G G GP+G
Sbjct: 535 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPR 594
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G G S
Sbjct: 595 GERGPPGESGAAGPS 609
>gi|373453527|ref|ZP_09545419.1| hypothetical protein HMPREF0984_02461 [Eubacterium sp. 3_1_31]
gi|371963625|gb|EHO81176.1| hypothetical protein HMPREF0984_02461 [Eubacterium sp. 3_1_31]
Length = 518
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/171 (28%), Positives = 69/171 (40%), Gaps = 14/171 (8%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRY 75
GP+G+ GP + GP+G G +G+ GP+G G SG
Sbjct: 61 TGPTGATGATGPG--VGATGPTGPTGATGATGANGATGPTGLQGPTGATGTTGASGITGA 118
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 119 TGPTGANGATGPTGPQ---GPTGATGLQGFAGITGATGPAGAT---GPTGNTGPTGANGA 172
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G +G G +G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 173 TGITGATGPTGITGATGATGLQGPTGNTGANGATGPTGATGVTGTIGPTGP 223
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/171 (28%), Positives = 67/171 (39%), Gaps = 14/171 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP + GP+G G +G GP+G + G SG
Sbjct: 61 TGPTGATGATGPG--VGATGPTGPTGATGATGANGATGPTGLQGPTGATGTTGASGITGA 118
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 119 TGPTGANGATGPTGPQ---GPTGATGLQGFAGITGATGPAGAT---GPTGNTGPTGANGA 172
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
G +G G +G GP+G G +G G +G + GP
Sbjct: 173 TGITGATGPTGITGATGATGLQGPTGNTGANGATGPTGATGVTGTIGPTGP 223
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/163 (27%), Positives = 65/163 (39%), Gaps = 14/163 (8%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRY 93
GP+G GP + GP+G G +G GP+G + G SG
Sbjct: 61 TGPTGATGATGPG--VGATGPTGPTGATGATGANGATGPTGLQGPTGATGTTGASGITGA 118
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G GP+G GP+G G +G + GP+G GP+G G +G
Sbjct: 119 TGPTGANGATGPTGP---QGPTGATGLQGFAGITGATGPAGA---TGPTGNTGPTGANGA 172
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +G G +G GP+G G +G G++
Sbjct: 173 TGITGATGPTGITGATGATGLQGPTGNTGANGATGPTGATGVT 215
>gi|441631274|ref|XP_004089605.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 2 [Nomascus
leucogenys]
Length = 1368
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/198 (29%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 411 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 470
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 471 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 530
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 531 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 590
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 591 GERGPPGESGAAGPTGPI 608
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.65, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 411 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 470
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 471 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 530
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 531 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 570
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 75/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G
Sbjct: 460 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHAGLAG 519
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 520 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 579
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 580 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 639
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 640 PSG 642
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 955 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1011
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1012 EPGDKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1068
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1069 RTGHPGTVGPAG 1080
>gi|414564440|ref|YP_006043401.1| collagen-binding collagen-like surface-anchored protein FneF
[Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246]
gi|338847505|gb|AEJ25717.1| collagen-binding collagen-like surface-anchored protein FneF
[Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246]
Length = 531
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.32, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 61/177 (34%), Gaps = 8/177 (4%)
Query: 6 VVEKALN--LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 63
V++ LN GP G G G GP G G G GP+G GP G
Sbjct: 265 VIKHGLNGQRGPKGEEGKPGVPGPQGIPGPKGED---GKPGERDERGPAGPQ---GPRGD 318
Query: 64 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
GP+G+ G G GP G G G G G+ GP G GP
Sbjct: 319 KGETGPAGKDGKPGDKGERGPAGPQGPRGENGKDGAPGRDGQDGKDGQPGPQGERGEQGP 378
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 379 QGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPRGE 435
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 63/184 (34%), Gaps = 9/184 (4%)
Query: 6 VVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
+ E+ + G +G+ G G GP G GP G G G GP+G
Sbjct: 261 IKEEVIKHGLNGQRGPKGEEGKPGVPGPQG---IPGPKGED---GKPGERDERGPAG--- 311
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP+G G G GP G G G G G+ GP G
Sbjct: 312 PQGPRGDKGETGPAGKDGKPGDKGERGPAGPQGPRGENGKDGAPGRDGQDGKDGQPGPQG 371
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G GP G GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 372 ERGEQGPQGERGEQGPKGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQGPQGERGEQG 431
Query: 186 PSGR 189
P G
Sbjct: 432 PRGE 435
>gi|332206944|ref|XP_003252555.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 1 [Nomascus
leucogenys]
Length = 1366
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.33, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/198 (29%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 75/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGDKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|358334141|dbj|GAA43024.2| collagen type I/II/III/V/XI alpha [Clonorchis sinensis]
Length = 1427
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/136 (31%), Positives = 59/136 (43%), Gaps = 6/136 (4%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
+GP GR G G+ G P+G LGP GRL G G++ +GP GR G
Sbjct: 554 MGPEGRAGAEGAPGTPGKPGDPGPAGEPGSLGPRGRLGERGAPGQMGPMGPPGRQGPKGT 613
Query: 124 SGRLNSDGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G + +DGP G +G +G + GP G GP G+ G +G GP G
Sbjct: 614 AGPIGNDGPKGDRGEKGNMGEAGPVGLNGPPGNAGIRGPRGQKGEQGETGPRGDPGPIGP 673
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G + +G
Sbjct: 674 AGERGSDGNIGPMGQQ 689
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/136 (31%), Positives = 56/136 (41%), Gaps = 12/136 (8%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
K + GP+G LGP G L G G + +GP GR G +G + GP G
Sbjct: 571 KPGDPGPAGEPGSLGPRGRLGERGAPGQMGPMGPPGRQGPKGTAGPIGNDGPKGD----- 625
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G +G +G + GP G GP G+ G GP G +GP+G
Sbjct: 626 -RGEKGNMGEAGPVGLNGPPGNAGIRGPRGQ------KGEQGETGPRGDPGPIGPAGERG 678
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGR 144
SDG G + GP G
Sbjct: 679 SDGNIGPMGQQGPPGN 694
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/159 (30%), Positives = 64/159 (40%), Gaps = 15/159 (9%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+GP GR G G+ G P+G LGP GRL G G + +GP GR G
Sbjct: 554 MGPEGRAGAEGAPGTPGKPGDPGPAGEPGSLGPRGRLGERGAPGQMGPMGPPGRQGPKGT 613
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
+G + GP G G +G +G + +GP G GP G+ G
Sbjct: 614 AGPIGNDGPKGD------RGEKGNMGEAGPVGLNGPPGNAGIRGPRGQ------KGEQGE 661
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G +GP+G G G + GP G GL
Sbjct: 662 TGPRGDPGPIGPAGERGSDGNIGPMGQQGPPGNKGQPGL 700
>gi|423635931|ref|ZP_17611584.1| hypothetical protein IK7_02340 [Bacillus cereus VD156]
gi|401276481|gb|EJR82433.1| hypothetical protein IK7_02340 [Bacillus cereus VD156]
Length = 239
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/161 (31%), Positives = 62/161 (38%), Gaps = 10/161 (6%)
Query: 22 LGPSGSLRY-LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GP+GSL GP G GP +GP+G G G GP+G GP G
Sbjct: 38 TGPTGSLGGPTGPQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGENGPTGPTGLTGPQG 91
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
S GP G GP G G G GP+G G G + GP+G G
Sbjct: 92 SQGNQGPMGE---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQG 148
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G + +GP+G G G GP+G G G L
Sbjct: 149 VQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGIQGVQGNL 189
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.77, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 17/175 (9%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+GSL GP+G P G GP +GP+G G G GP+G
Sbjct: 38 TGPTGSLG--GPTG------PQGIQGVQGP------IGPTGPQGIQGIQGVQGENGPTGP 83
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G GP G G G GP+G G G + GP
Sbjct: 84 TGLTGPQGSQGNQGPMGE---RGPQGIQGVQGIQGERGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGP 140
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G G G + +GP+G G G GP+G G+ L SGL
Sbjct: 141 TGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGPTGNTGIQGVQGNLGGSGLQ 195
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/133 (30%), Positives = 50/133 (37%), Gaps = 3/133 (2%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G G G GP+G GP G GP G GP G G G
Sbjct: 60 IGPTGPQGIQGIQGVQGENGPTGPTGLTGPQGSQGNQGPMGER---GPQGIQGVQGIQGE 116
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G G G + GP+G G G + +GP+G G G GP
Sbjct: 117 RGPTGPTGIQGIQGIPGPIGPTGPTGIQGIQGVQGPIGPIGPTGIQGIQGVQGENGPTGP 176
Query: 133 SGRLRYLGPSGRL 145
+G G G L
Sbjct: 177 TGNTGIQGVQGNL 189
>gi|360043236|emb|CCD78649.1| putative collagen alpha-1(V) chain precursor [Schistosoma mansoni]
Length = 1524
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.34, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/173 (31%), Positives = 72/173 (41%), Gaps = 9/173 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G G G +GP G GPSG+ +GP+G +G G + GP G+
Sbjct: 912 GPAGDKGERGDPGLPGTVGPIGPDGDQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNA 968
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G++ GP G GP G GP G GP G +GP+
Sbjct: 969 GLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRGEEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPT 1028
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP G + GP G+ G GR GP G GP G + G+
Sbjct: 1029 G---MRGPPGLIGQPGPPGK---QGSQGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEIGAPGV 1075
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.89, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 69/170 (40%), Gaps = 9/170 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GPSG +GP+G +G G + GP G G +G G G++ GP G
Sbjct: 937 DQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNAGLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRG 993
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G GP G +GP+G GP G + GP G+ S
Sbjct: 994 EEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPTG---MRGPPGLIGQPGPPGKQGS-- 1048
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GR GP G GP G + G G +G G G SG +
Sbjct: 1049 -QGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEIGAPGVPGNKGPVGDEGEPGSRGASGNM 1097
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/168 (32%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP G GPSG +GP+G +G G + GP G
Sbjct: 912 GPAGDKGERGDPGLPGTVGPIGPDGDQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNA 968
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G++ GP G GP G GP G GP G S GP
Sbjct: 969 GLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRGEEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPG---SRGPV 1025
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP G + GP G+ G GR GP G GP G +
Sbjct: 1026 GPTGMRGPPGLIGQPGPPGK---QGSQGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEI 1070
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 67/169 (39%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP G GPSG+ +GP+G +G G + GP G G +G G G
Sbjct: 928 TVGPIGPDGDQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNAGLPGRTGLPGPPGKDG 984
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP G GP G GP G GP G +GP+G GP G + G
Sbjct: 985 QVGKQGPRGEEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPTGMR---GPPGLIGQPG 1041
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G+ G GR GP G GP G + G G +G G
Sbjct: 1042 PPGK---QGSQGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEIGAPGVPGNKGPVGDEGE 1087
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 12/167 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G GP+GS G GP+G G G +GP G GPSG+
Sbjct: 891 GEAGDPGLEGPAGS------DGMAGLPGPAGDKGERGDPGLPGTVGPIGPDGDQGPSGAP 944
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP+G +G G + GP G G +G G G++ GP G GP
Sbjct: 945 GKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNAGLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRGEEGPRGPD 1001
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G +GP+G GP G + GP G+
Sbjct: 1002 GNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPTG---MRGPPGLIGQPGPPGK 1045
>gi|365830129|ref|ZP_09371714.1| hypothetical protein HMPREF1021_00478, partial [Coprobacillus sp.
3_3_56FAA]
gi|365263883|gb|EHM93705.1| hypothetical protein HMPREF1021_00478, partial [Coprobacillus sp.
3_3_56FAA]
Length = 188
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/79 (31%), Positives = 36/79 (45%), Gaps = 12/79 (15%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
GP+G+ GP+G P+G +GP+G GP+G P+G DG +G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTG------PTGVTGVIGPTGATGATGPTG------PTGATGEDGATGA 74
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP+G GP+G
Sbjct: 75 TGPTGPTGATGATGPTGAT 93
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/82 (30%), Positives = 36/82 (43%), Gaps = 12/82 (14%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GP+G+ GP+G P+G +GP+G+ GP+G G G GP+G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTG------PTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG- 79
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
P+G GP+G D
Sbjct: 80 -----PTGATGATGPTGATGED 96
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/79 (30%), Positives = 35/79 (44%), Gaps = 12/79 (15%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP+G+ GP+ GP+G +GP+G+ GP+G G G GP+
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPT------GPTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPT-- 78
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP+G
Sbjct: 79 ----GPTGATGATGPTGAT 93
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/79 (30%), Positives = 35/79 (44%), Gaps = 12/79 (15%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G+ GP+G P+G +GP+G GP+G G G+ GP+G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTG------PTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG- 79
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
P+G GP+G
Sbjct: 80 -----PTGATGATGPTGAT 93
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/79 (30%), Positives = 33/79 (41%), Gaps = 12/79 (15%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP+G GP+G P+G +GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTG------PTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG- 79
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
P+G GP+G
Sbjct: 80 -----PTGATGATGPTGAT 93
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/79 (30%), Positives = 33/79 (41%), Gaps = 12/79 (15%)
Query: 112 LGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
GP+G GP+G P+G +GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTG------PTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG- 79
Query: 172 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P+G GP+G
Sbjct: 80 -----PTGATGATGPTGAT 93
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/79 (30%), Positives = 34/79 (43%), Gaps = 12/79 (15%)
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
GP+G GP+G P+G +GP+G + GP+G G G GP+G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTG------PTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG- 79
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
P+G GP+G
Sbjct: 80 -----PTGATGATGPTGAT 93
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/79 (30%), Positives = 34/79 (43%), Gaps = 12/79 (15%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G GP+G P+G +GP+G GP+G G G GP+G
Sbjct: 27 TGPTGATGATGPTG------PTGVTGVIGPTGATGATGPTGPTGATGEDGATGATGPTG- 79
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
P+G + GP+G
Sbjct: 80 -----PTGATGATGPTGAT 93
>gi|256085618|ref|XP_002579013.1| Collagen alpha-1(V) chain precursor [Schistosoma mansoni]
Length = 1524
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/173 (31%), Positives = 72/173 (41%), Gaps = 9/173 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G G G +GP G GPSG+ +GP+G +G G + GP G+
Sbjct: 912 GPAGDKGERGDPGLPGTVGPIGPDGDQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNA 968
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G G G++ GP G GP G GP G GP G +GP+
Sbjct: 969 GLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRGEEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPT 1028
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G GP G + GP G+ G GR GP G GP G + G+
Sbjct: 1029 G---MRGPPGLIGQPGPPGK---QGSQGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEIGAPGV 1075
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 69/170 (40%), Gaps = 9/170 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GPSG +GP+G +G G + GP G G +G G G++ GP G
Sbjct: 937 DQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNAGLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRG 993
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G GP G +GP+G GP G + GP G+ S
Sbjct: 994 EEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPTG---MRGPPGLIGQPGPPGKQGS-- 1048
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GR GP G GP G + G G +G G G SG +
Sbjct: 1049 -QGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEIGAPGVPGNKGPVGDEGEPGSRGASGNM 1097
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/168 (32%), Positives = 67/168 (39%), Gaps = 9/168 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G +GP G GPSG +GP+G +G G + GP G
Sbjct: 912 GPAGDKGERGDPGLPGTVGPIGPDGDQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNA 968
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G++ GP G GP G GP G GP G S GP
Sbjct: 969 GLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRGEEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPG---SRGPV 1025
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G GP G + GP G+ G GR GP G GP G +
Sbjct: 1026 GPTGMRGPPGLIGQPGPPGK---QGSQGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEI 1070
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/169 (31%), Positives = 67/169 (39%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
+GP G GPSG+ +GP+G +G G + GP G G +G G G
Sbjct: 928 TVGPIGPDGDQGPSGAPGKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNAGLPGRTGLPGPPGKDG 984
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP G GP G GP G GP G +GP+G GP G + G
Sbjct: 985 QVGKQGPRGEEGPRGPDGNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPTGMR---GPPGLIGQPG 1041
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G+ G GR GP G GP G + G G +G G
Sbjct: 1042 PPGK---QGSQGRPGKPGPDGFEGKRGPPGEIGAPGVPGNKGPVGDEGE 1087
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 12/167 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G GP+GS G GP+G G G +GP G GPSG+
Sbjct: 891 GEAGDPGLEGPAGS------DGMAGLPGPAGDKGERGDPGLPGTVGPIGPDGDQGPSGAP 944
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP+G +G G + GP G G +G G G++ GP G GP
Sbjct: 945 GKIGPTGPPGNVGKPGEM---GPPGNAGLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRGEEGPRGPD 1001
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G GP G +GP+G GP G + GP G+
Sbjct: 1002 GNPGIQGPPGASGVKGPPGSRGPVGPTG---MRGPPGLIGQPGPPGK 1045
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/178 (32%), Positives = 72/178 (40%), Gaps = 12/178 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
G +G GP+GS G P+G G G +GP G GPSG +GP+
Sbjct: 891 GEAGDPGLEGPAGSDGMAGLPGPAGDKGERGDPGLPGTVGPIGPDGDQGPSGAPGKIGPT 950
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G +G G + GP G G +G G G++ GP G GP G
Sbjct: 951 GPPGNVGKPGEM---GPPGNAGLPGRTGLPGPPGKDGQVGKQGPRGEEGPRGPDGNPGIQ 1007
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G +GP+G GP G + GP G+ G GR GP G
Sbjct: 1008 GPPGASGVKGPPGSRGPVGPTG---MRGPPGLIGQPGPPGK---QGSQGRPGKPGPDG 1059
>gi|65736617|dbj|BAD98524.1| type I procollagen alpha 1 chain [Raja kenojei]
Length = 1463
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 69/157 (43%), Gaps = 9/157 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G+ GP+G GP+G++ G G + + GP G+ G +G +GP+G +
Sbjct: 547 GADGKPGPSGPAGQDGRPGPAGAIGQRGQPGVMGFPGPKGTAGESGKTGERGIVGPAGLV 606
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + G +G GP+G G +G + GP G++ G G+ G
Sbjct: 607 GLPGKDGDIGAPGATG---PAGPAGERGEQGITGAPGFQGPPGQVGAAGEHGKSGEQGIP 663
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +GP G GP G + G G +GP+G
Sbjct: 664 G---AVGPPG---STGPRGERGFTGERGSPGAMGPTG 694
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/182 (28%), Positives = 76/182 (41%), Gaps = 12/182 (6%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-P-----S 79
GS G +G+ + GP G + G G GP+G G SGR G P +
Sbjct: 481 GSPGERGSAGNRGFPGPEGLVGAKGIPGERGSPGPAGPKGATGESGRTGEPGLPGTRGLT 540
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GS G G+ GP+G+ GP+G + G G + + GP G G +G +
Sbjct: 541 GSPGSPGADGKPGPSGPAGQDGRPGPAGAIGQRGQPGVMGFPGPKGTAGESGKTGERGIV 600
Query: 140 GPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
GP+ G+ +G G GP+G G +G + GP G++ G G+
Sbjct: 601 GPAGLVGLPGKDGDIGAPGATGPAGPAGERGEQGITGAPGFQGPPGQVGAAGEHGKSGEQ 660
Query: 194 GL 195
G+
Sbjct: 661 GI 662
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/158 (27%), Positives = 68/158 (43%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+GS G G+ GP+G GP+G + G G + + GP G+ G +G
Sbjct: 540 TGSPGSPGADGKPGPSGPAGQDGRPGPAGAIGQRGQPGVMGFPGPKGTAGESGKTGERGI 599
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+GP+G + G G + G +G GP+G G +G + GP G++ G G+
Sbjct: 600 VGPAGLVGLPGKDGDIGAPGATG---PAGPAGERGEQGITGAPGFQGPPGQVGAAGEHGK 656
Query: 154 LRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G + GP G + G G +GP+G
Sbjct: 657 SGEQGIPGAVGPPGSTGPRGERGFTGERGSPGAMGPTG 694
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.52, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/190 (28%), Positives = 73/190 (38%), Gaps = 18/190 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP G+ G G+ G G GP G+ GPSG G G
Sbjct: 418 GPQGAVGATGPKGNNGDSGAPGAKGEAGAKGDSGIAGPQGAP---GPSGEEGKRGSRGEP 474
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL------ 127
G GS G +G + GP G + G G GP+G G SGR
Sbjct: 475 GVQGLPGSPGERGSAGNRGFPGPEGLVGAKGIPGERGSPGPAGPKGATGESGRTGEPGLP 534
Query: 128 ---------NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
S G G+ GP+G+ GP+G + G G + + GP G G +
Sbjct: 535 GTRGLTGSPGSPGADGKPGPSGPAGQDGRPGPAGAIGQRGQPGVMGFPGPKGTAGESGKT 594
Query: 179 GRLRYLGPSG 188
G +GP+G
Sbjct: 595 GERGIVGPAG 604
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.77, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/169 (28%), Positives = 73/169 (43%), Gaps = 9/169 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG-P-----SGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP G + G G GP+G G SGR G P +GS G G+
Sbjct: 496 GPEGLVGAKGIPGERGSPGPAGPKGATGESGRTGEPGLPGTRGLTGSPGSPGADGKPGPS 555
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ GP+G++ G G + + GP G G +G +GP+G + G G +
Sbjct: 556 GPAGQDGRPGPAGAIGQRGQPGVMGFPGPKGTAGESGKTGERGIVGPAGLVGLPGKDGDI 615
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+ G +G GP+G G +G + GP G++ G G+ G
Sbjct: 616 GAPGATG---PAGPAGERGEQGITGAPGFQGPPGQVGAAGEHGKSGEQG 661
>gi|443682379|gb|ELT87002.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_100338 [Capitella teleta]
Length = 225
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.37, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/189 (34%), Positives = 83/189 (43%), Gaps = 27/189 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR- 72
GPSG+ +G+ Y G G GPSGR+ G+ Y G G+ GPSGR
Sbjct: 9 GPSGK------TGATGYTGMRGPAGVKGPSGRM------GATGYRGMRGQAGVKGPSGRT 56
Query: 73 --LRYLGPSGSLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
Y G G GPSGR+ Y G G GPSG+ G +G + GP+G
Sbjct: 57 GATGYTGMRGPAGVRGPSGRMGATGYKGMRGPAGVRGPSGK---TGATGYIGMRGPAGVR 113
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR-----LRYL-GPSGRLRYLGPSGRL 181
G +G Y G G GPSG+ G +G +R L G +G Y G G+
Sbjct: 114 GPSGKTGATGYTGMKGPAGVSGPSGKTGATGYTGMRGQAGVRGLSGKTGATGYTGMRGQA 173
Query: 182 RYLGPSGRL 190
GPSGR+
Sbjct: 174 GVKGPSGRM 182
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 68/204 (33%), Positives = 86/204 (42%), Gaps = 34/204 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG-- 68
GPSGR+ G+ Y G G GPSGR Y G G GPSGR+ G
Sbjct: 30 GPSGRM------GATGYRGMRGQAGVKGPSGRTGATGYTGMRGPAGVRGPSGRMGATGYK 83
Query: 69 ----PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
P+G G +G+ Y+G G GPSG+ +G Y G G GPS
Sbjct: 84 GMRGPAGVRGPSGKTGATGYIGMRGPAGVRGPSGK------TGATGYTGMKGPAGVSGPS 137
Query: 125 GRLNSDGPSGR-----LRYL-GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYL 175
G+ + G +G +R L G +G Y G G+ GPSGR+ G G
Sbjct: 138 GKTGATGYTGMRGQAGVRGLSGKTGATGYTGMRGQAGVKGPSGRMGATEREGMRGLTGAT 197
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
GPSGR G G+ G+ DG
Sbjct: 198 GPSGRTGATGQQGQ----GVPDGA 217
>gi|392347136|ref|XP_003749739.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like isoform 2 [Rattus
norvegicus]
Length = 1395
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.38, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 68/174 (39%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 464 NVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHPGLAG 523
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG + G+ G
Sbjct: 524 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEV---GKPGERG 580
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G GP G GPSG + GPSG GP G G
Sbjct: 581 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSG---APGPDGNKGEAG 631
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 62/160 (38%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
GS +GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G G +
Sbjct: 460 GSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHP 519
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---- 150
G +G GP G GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 520 GLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGER 579
Query: 151 --SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GPSG + GPSG
Sbjct: 580 GLPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSG 619
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/204 (29%), Positives = 78/204 (38%), Gaps = 21/204 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 415 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPV 474
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 475 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHPGLAGARGAPGPDGNN 534
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 535 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPR 594
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GPSG + G S
Sbjct: 595 GERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPS 618
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 391 GEPGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGVRGPNGDAGRPGEP 450
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G
Sbjct: 451 GLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDP 510
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 511 GKPGEKGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTA 570
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 571 GEVG 574
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/195 (30%), Positives = 76/195 (38%), Gaps = 24/195 (12%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
LG G++ GP+G+ G G GPSG G G +GP+G + GP+GS
Sbjct: 704 LGAPGAIGAPGPAGA---SGDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEVGPAGPNGFAGPAGS 760
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
G G GP G +GP+G + GPSG GP+G GP G + G
Sbjct: 761 AGQPGAKGEKGTKGPKGENGIVGPTGPVGAAGPSGPNGPPGPAGSRGDGGPPGMTGFPGA 820
Query: 142 SGRLRYL---------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+GR GP G +G +G + GP G GPSG
Sbjct: 821 AGRTGPPGPSGITGPPGPPGAAGKEGIRGPRGDQGPVGRTGEIGASGPPGFAGEKGPSGE 880
Query: 181 LRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G GL
Sbjct: 881 PGTTGPPGTAGPQGL 895
>gi|357625679|gb|EHJ76042.1| putative Collagen alpha-1(XI) chain precursor [Danaus plexippus]
Length = 807
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/133 (29%), Positives = 57/133 (42%), Gaps = 15/133 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRY------------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N+GP G GP G++ GP+G + G G + GPSGS G
Sbjct: 431 NMGPRGLQGEQGPPGAIGPVGPEGPPGLRGLAGPTGDVGAPGVMGPMGVPGPSGSPGQQG 490
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
G G G + G +G++ G G + GP+G + +GP G +GP G
Sbjct: 491 IKGEKGNRGAKG---HTGDTGNIGIKGDQGEIGKQGPTGPIGPMGPKGDTGPIGPPGSKG 547
Query: 120 YLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G +GP
Sbjct: 548 DVGPAGLAGLEGP 560
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/137 (29%), Positives = 57/137 (41%), Gaps = 6/137 (4%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSL--RYLGPSGRLRYL-GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G +GP G GP G++ LR L GP+G + G G + GPSG
Sbjct: 427 GEKGNMGPRGLQGEQGPPGAIGPVGPEGPPGLRGLAGPTGDVGAPGVMGPMGVPGPSGSP 486
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G G G + G +G + G G + GP+G + +GP G +GP
Sbjct: 487 GQQGIKGEKGNRGAKG---HTGDTGNIGIKGDQGEIGKQGPTGPIGPMGPKGDTGPIGPP 543
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G +GP+G GP
Sbjct: 544 GSKGDVGPAGLAGLEGP 560
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/142 (28%), Positives = 55/142 (38%), Gaps = 15/142 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRY------------LGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 59
N G G +GP G GP G++ GP+G + G G + G
Sbjct: 422 NPGNPGEKGNMGPRGLQGEQGPPGAIGPVGPEGPPGLRGLAGPTGDVGAPGVMGPMGVPG 481
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
PSG G G G G + G +G + G G + GP+G + +GP G
Sbjct: 482 PSGSPGQQGIKGEKGNRGAKG---HTGDTGNIGIKGDQGEIGKQGPTGPIGPMGPKGDTG 538
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
+GP G GP+G GP
Sbjct: 539 PIGPPGSKGDVGPAGLAGLEGP 560
>gi|327275855|ref|XP_003222687.1| PREDICTED: collagen alpha-1(I) chain-like [Anolis carolinensis]
Length = 1450
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/112 (31%), Positives = 44/112 (39%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
G G GP+G G G GP+G + GP G G G G G
Sbjct: 764 TGDKGEAGPSGPAGPTGARGAPGDRGEPGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDAGAKGD 823
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G GP+G + GP G GP G + G +GR+ GPS
Sbjct: 824 AGAPGPAGATGPPGPAGAVGAPGPKGSRGSAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPS 875
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/115 (31%), Positives = 48/115 (41%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G G GP+G G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 764 TGDKGEAGPSGPAGPTGARGAPGDRGEPGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDAGAKGD 823
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ GP+G + GP G GP G + G +GR+ GPSG +
Sbjct: 824 AGAPGPAGATGPPGPAGAVGAPGPKGSRGSAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPSGNI 878
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.44, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/115 (32%), Positives = 48/115 (41%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
G G GP+G G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 764 TGDKGEAGPSGPAGPTGARGAPGDRGEPGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDAGAKGD 823
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP+G GP+G + GP G S GP G + G +GR+ GPSG +
Sbjct: 824 AGAPGPAGATGPPGPAGAVGAPGPKGSRGSAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPSGNI 878
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/115 (31%), Positives = 46/115 (40%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G GP+G G G GP+G + GP G G G G G
Sbjct: 764 TGDKGEAGPSGPAGPTGARGAPGDRGEPGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDAGAKGD 823
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G GP+G + GP G GP G + G +GR+ GPSG +
Sbjct: 824 AGAPGPAGATGPPGPAGAVGAPGPKGSRGSAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPSGNI 878
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/118 (31%), Positives = 47/118 (39%), Gaps = 6/118 (5%)
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+G GPS GP+G G G GP+G + GP G G G
Sbjct: 764 TGDKGEAGPS------GPAGPTGARGAPGDRGEPGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGD 817
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G GP+G GP+G + GP G GP G + G +GR+ GPS
Sbjct: 818 AGAKGDAGAPGPAGATGPPGPAGAVGAPGPKGSRGSAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPS 875
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/106 (30%), Positives = 41/106 (38%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
G G GP+G G G GP+G + GP G G G G G
Sbjct: 764 TGDKGEAGPSGPAGPTGARGAPGDRGEPGPAGPAGFAGPPGADGQPGAKGESGDAGAKGD 823
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 824 AGAPGPAGATGPPGPAGAVGAPGPKGSRGSAGPPGATGFPGAAGRV 869
>gi|47216921|emb|CAG02093.1| unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Length = 1399
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/178 (28%), Positives = 75/178 (42%), Gaps = 6/178 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G+ GP G+ G +G G +GS GP G++ G
Sbjct: 451 GPAGPKGATGERGAPGVAGPKGATGETGRTGEPGLPGAKGMTGSPGSPGPDGKMGPAGAP 510
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G+ GP G++ G G + + GP G G +G +GPSG + G G + +
Sbjct: 511 GQDGRPGPPGAVGARGQPGVMGFPGPKGAAGEPGKTGERGAMGPSGAVGAPGKDGEVGAQ 570
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G G GP+G + G G +G +G+ G G GP+G
Sbjct: 571 GPAGPAGLQGERGE---QGPAGATGFQGLPGPQGAVGETGKPGEQGVPGEAGLPGPAG 625
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/169 (28%), Positives = 70/169 (41%), Gaps = 6/169 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G++ G G GP G++ G G + + GP G+ G +G +GPSG +
Sbjct: 499 GPDGKMGPAGAPGQDGRPGPPGAVGARGQPGVMGFPGPKGAAGEPGKTGERGAMGPSGAV 558
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP+G G G GP+G + G G +G +G+ G
Sbjct: 559 GAPGKDGEVGAQGPAGPAGLQGERGE---QGPAGATGFQGLPGPQGAVGETGKPGEQGVP 615
Query: 134 GRLRYLGPS---GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+ G + G G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 616 GEAGLPGPAGSRGDRGFPGERGAPGAAGPTGARGSPGPAGNDGAKGDAG 664
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/165 (28%), Positives = 65/165 (39%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS GP G + G G+ GP G++ G G + + GP G G +G
Sbjct: 492 TGSPGSPGPDGKMGPAGAPGQDGRPGPPGAVGARGQPGVMGFPGPKGAAGEPGKTGERGA 551
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GPSG + G G + GP+G G G G +G GP G + G G
Sbjct: 552 MGPSGAVGAPGKDGEVGAQGPAGPAGLQGERGEQGPAGATGFQGLPGPQGAVGETGKPGE 611
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G G G + G G GP+G GP+G
Sbjct: 612 QGVPGEAGLPGPAGSRGDRGFPGERGAPGAAGPTGARGSPGPAGN 656
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/163 (28%), Positives = 63/163 (38%), Gaps = 6/163 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G G G GP G+ G +G G G +GS GP G++
Sbjct: 451 GPAGPKGATGERGAPGVAGPKGATGETGRTGEPGLPGAKGM------TGSPGSPGPDGKM 504
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G+ GP G + G G + + GP G G +G +GPSG + G
Sbjct: 505 GPAGAPGQDGRPGPPGAVGARGQPGVMGFPGPKGAAGEPGKTGERGAMGPSGAVGAPGKD 564
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G + GP+G G G G +G GP G + G
Sbjct: 565 GEVGAQGPAGPAGLQGERGEQGPAGATGFQGLPGPQGAVGETG 607
>gi|449676568|ref|XP_002164888.2| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Hydra magnipapillata]
Length = 1475
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 65/181 (35%), Gaps = 12/181 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G GPSG G G G +G GP+G GP G +GP+G +
Sbjct: 272 GNKGEQGPSGEKGSSGKEGEKGQEGENGLKGDTGPAGPRGLQGPPGPQGQMGPTG---LM 328
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP GS+ GP G G G GP G GP G G G+ G G
Sbjct: 329 GPIGSIGLPGPQGSAGLPGTPGDQGERGPKGETGATGPRGERGEQGERGKAGEPGQKGSK 388
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
LG GR + G G +GP G G G + GP G L GP
Sbjct: 389 GPLGSRGRDGFRGDKGSSGSPGSQGPRGLVGPRGHQGLQGSDGSIGEPGPRGALGEQGPQ 448
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 449 G 449
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/202 (29%), Positives = 74/202 (36%), Gaps = 15/202 (7%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP G +GP+G +GP G + GP GS G G GP G
Sbjct: 303 DTGPAGPRGLQGPPGPQGQMGPTG---LMGPIGSIGLPGPQGSAGLPGTPGDQGERGPKG 359
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------LG 122
GP G G G+ G G LG GR + G G +G
Sbjct: 360 ETGATGPRGERGEQGERGKAGEPGQKGSKGPLGSRGRDGFRGDKGSSGSPGSQGPRGLVG 419
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
P G G G + GP G L GP G GP G G G GP+G +
Sbjct: 420 PRGHQGLQGSDGSIGEPGPRGALGEQGPQG---LQGPKGMTGDPGSPGSSGAPGPTGSVG 476
Query: 183 YLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGL 204
G G + G +SG+
Sbjct: 477 KPGRDGNIGPAGPDGPPGISGI 498
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/145 (31%), Positives = 56/145 (38%), Gaps = 3/145 (2%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GPSG G G+ GPSG G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 260 GPSGLDGPQGYKGNKGEQGPSGEKGSSGKEGEKGQEGENGLKGDTGPAGPRGLQGPPGPQ 319
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP+G +GP G + GP G G G GP G + GP G G
Sbjct: 320 GQMGPTG---LMGPIGSIGLPGPQGSAGLPGTPGDQGERGPKGETGATGPRGERGEQGER 376
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
G+ G G LG GR + G
Sbjct: 377 GKAGEPGQKGSKGPLGSRGRDGFRG 401
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/145 (31%), Positives = 54/145 (37%), Gaps = 3/145 (2%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GPSG G G GPSG G G G +G GP+G GP G
Sbjct: 260 GPSGLDGPQGYKGNKGEQGPSGEKGSSGKEGEKGQEGENGLKGDTGPAGPRGLQGPPGPQ 319
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
+GP+G +GP G + GP G G G GP G GP G G
Sbjct: 320 GQMGPTG---LMGPIGSIGLPGPQGSAGLPGTPGDQGERGPKGETGATGPRGERGEQGER 376
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G+ G G LG GR + G
Sbjct: 377 GKAGEPGQKGSKGPLGSRGRDGFRG 401
>gi|168209553|ref|ZP_02635178.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens B
str. ATCC 3626]
gi|170712297|gb|EDT24479.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens B
str. ATCC 3626]
Length = 391
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.40, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/158 (31%), Positives = 60/158 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGDQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G + GP G GP G GP G G +G +GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPQ 188
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 189 GPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 226
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/171 (31%), Positives = 64/171 (37%), Gaps = 1/171 (0%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGDQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G + GP G GP G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPQ 188
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVS 202
G G +G GP G GP G + GP G + D L VS
Sbjct: 189 GPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGEPG-VDFDDTLLVS 238
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/158 (31%), Positives = 59/158 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 69 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGDQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 128
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G + GP G GP G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 129 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGPQ 188
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G G +G GP G GP G + GP G
Sbjct: 189 GPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQGPQGE 226
>gi|392347134|ref|XP_003749738.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like isoform 1 [Rattus
norvegicus]
Length = 1372
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 68/174 (39%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 464 NVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHPGLAG 523
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG + G+ G
Sbjct: 524 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEV---GKPGERG 580
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G GP G GPSG + GPSG GP G G
Sbjct: 581 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSG---APGPDGNKGEAG 631
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 62/160 (38%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
GS +GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G G +
Sbjct: 460 GSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHP 519
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---- 150
G +G GP G GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 520 GLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGER 579
Query: 151 --SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP+G GP G GPSG + GPSG
Sbjct: 580 GLPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPSG 619
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/204 (29%), Positives = 78/204 (38%), Gaps = 21/204 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 415 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPV 474
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 475 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGEKGHPGLAGARGAPGPDGNN 534
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 535 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPR 594
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP G GPSG + G S
Sbjct: 595 GERGPPGESGAAGPSGPIGSRGPS 618
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 391 GEPGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGVRGPNGDAGRPGEP 450
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G
Sbjct: 451 GLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDP 510
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 511 GKPGEKGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTA 570
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 571 GEVG 574
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/205 (29%), Positives = 79/205 (38%), Gaps = 24/205 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+G GR G G++ GP+G+ G G GPSG G G +GP+G
Sbjct: 671 EIGNPGRDGARGAPGAIGAPGPAGAS---GDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEVGPAG 727
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+GS G G GP G +GP+G + GPSG GP+G G
Sbjct: 728 PNGFAGPAGSAGQPGAKGEKGTKGPKGENGIVGPTGPVGAAGPSGPNGPPGPAGSRGDGG 787
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYL---------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
P G + G +GR GP G +G +G + GP G
Sbjct: 788 PPGMTGFPGAAGRTGPPGPSGITGPPGPPGAAGKEGIRGPRGDQGPVGRTGEIGASGPPG 847
Query: 171 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GPSG GP G GL
Sbjct: 848 FAGEKGPSGEPGTTGPPGTAGPQGL 872
>gi|395537651|ref|XP_003775379.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: collagen alpha-2(I) chain
[Sarcophilus harrisii]
Length = 1212
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.42, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/188 (30%), Positives = 74/188 (39%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSL------RYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N GPSG GP+G +GP GS +GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 409 NRGPSGPAGARGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPTGKEGPAGLPGIDGRPGPTG 468
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G G + + GP G G +G + G +G GP G GP G G
Sbjct: 469 PAGNRGEPGNIGFPGPKGPNGDPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPTGVQG 528
Query: 123 PSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
G GP G GPSG G G++ G G GP+G GP G
Sbjct: 529 GKGEQGPAGPPGFQGLPGPSG---PAGEGGKVGERGLPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESG 585
Query: 183 YLGPSGRL 190
+GP+G +
Sbjct: 586 AVGPTGSI 593
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/181 (31%), Positives = 72/181 (39%), Gaps = 6/181 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 369 GPNGEPGSTGPMGPPGLRGVPGSRGLPGADGRAGGMGPPGNRGPSGPAGARGPNGDAGRP 428
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP GS +GP+G+ G G GP+G G G + + GP G
Sbjct: 429 GEPGLMGPRGLPGSPGNVGPTGKEGPAGLPGIDGRPGPTGPAGNRGEPGNIGFPGPKGPN 488
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G +G + G +G GP G GP G G G GP G GPS
Sbjct: 489 GDPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPTGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPS 548
Query: 188 G 188
G
Sbjct: 549 G 549
>gi|423567752|ref|ZP_17543999.1| hypothetical protein II7_00975, partial [Bacillus cereus MSX-A12]
gi|401212270|gb|EJR19014.1| hypothetical protein II7_00975, partial [Bacillus cereus MSX-A12]
Length = 321
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 63/174 (36%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP G GP G G +G G +G+ GP G
Sbjct: 8 GPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQ 67
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G G +G G G GP G G +G + GP+G GP
Sbjct: 68 GIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQ 127
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G +G +G +G G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 128 GVTGATGATGATGVIGATGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 178
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.73, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/174 (29%), Positives = 62/174 (35%), Gaps = 3/174 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP G GP G G +G G +G+ GP G
Sbjct: 8 GPIGPTGPTGPQGIQGIQGPIGPTGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQAGVTGPQGPQ 67
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G G +G G G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 68 GIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGPTGPQGIQGPQ 127
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G +G +G +G G G G +GR GP+G G S
Sbjct: 128 GVTGATGATGATGVIGATGPTGIQGIQG---ITGATGRTGVTGPTGLTGATGSS 178
>gi|350536279|ref|NP_001233588.1| collagen type II A precursor [Oryzias latipes]
gi|344313139|dbj|BAK64232.1| Type II collagen A precursor isoform 2 [Oryzias latipes]
Length = 1421
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/161 (33%), Positives = 64/161 (39%), Gaps = 3/161 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GPSG G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 743 AGPSGAPGTRGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGTKGEQGEPGQKGEAGAPGPQGP 802
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP G GP G + G +GR+ GP+G GP+G DGP
Sbjct: 803 SGAPGPAGPTGVSGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGPNGNPGPAGPAGPPGKDGP 862
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP+GR GP+G G +G GPSG
Sbjct: 863 KGVRGDPGPAGRQGDAGLRGPAGAPGEKGDAGEDGPNGPSG 903
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/150 (28%), Positives = 52/150 (34%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 760 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGTKGEQGEPGQKGEAGAPGPQGPSGAPGPAGPTGVSGPKG 819
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP+GR G
Sbjct: 820 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGPNGNPGPAGPAGPPGKDGPKGVRGDPGPAGRQGDAG 879
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGP+G GP G
Sbjct: 880 LRGPAGAPGEKGDAGEDGPNGPSGPSGPQG 909
>gi|165881930|gb|ABY71231.1| Col1a1 [Leucoraja erinacea]
Length = 664
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.45, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/139 (30%), Positives = 59/139 (42%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G+ GP+G++ G G + + GP G G SG +GP+G + G G +
Sbjct: 489 GPAGQDGRPGPAGAVGQRGQPGVMGFPGPKGAAGEAGKSGERGIIGPAGLVGLPGKDGDI 548
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G G GP+G GP G G SG G G S GP
Sbjct: 549 GAPGSTGPAGPSGERGEQGITGPTGFQGLPGPPGAAGEHGKSGEQGIPGDVGPPGSSGPR 608
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G + G G +GP+G
Sbjct: 609 GERGFTGERGSPGAMGPTG 627
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 75/187 (40%), Gaps = 6/187 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG-P-----SGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP G + G G GP+G G SGR G P +GS G G+
Sbjct: 429 GPEGLVGVKGIPGERGSPGPAGPKGATGESGRTGEAGLPGTRGLTGSPGSPGADGKPGPS 488
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G+ GP+G++ G G + + GP G G SG +GP+G + G G +
Sbjct: 489 GPAGQDGRPGPAGAVGQRGQPGVMGFPGPKGAAGEAGKSGERGIIGPAGLVGLPGKDGDI 548
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ G +G G G GP+G GP G G SG G G GP
Sbjct: 549 GAPGSTGPAGPSGERGEQGITGPTGFQGLPGPPGAAGEHGKSGEQGIPGDVGPPGSSGPR 608
Query: 188 GRLRYLG 194
G + G
Sbjct: 609 GERGFTG 615
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/155 (29%), Positives = 63/155 (40%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+GS G G+ GP+G GP+G + G G + + GP G+ G SG
Sbjct: 473 TGSPGSPGADGKPGPSGPAGQDGRPGPAGAVGQRGQPGVMGFPGPKGAAGEAGKSGERGI 532
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+GP+G + G G + G +G G G GP+G GP G G SG
Sbjct: 533 IGPAGLVGLPGKDGDIGAPGSTGPAGPSGERGEQGITGPTGFQGLPGPPGAAGEHGKSGE 592
Query: 154 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GP G + G G +GP+G
Sbjct: 593 QGIPGDVGPPGSSGPRGERGFTGERGSPGAMGPTG 627
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/177 (30%), Positives = 72/177 (40%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG-P-----S 79
GS G SG+ + GP G + G G GP+G G SGR G P +
Sbjct: 414 GSPGERGSSGNRGFPGPEGLVGVKGIPGERGSPGPAGPKGATGESGRTGEAGLPGTRGLT 473
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GS G G+ GP+G+ GP+G + G G + + GP G G SG +
Sbjct: 474 GSPGSPGADGKPGPSGPAGQDGRPGPAGAVGQRGQPGVMGFPGPKGAAGEAGKSGERGII 533
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G + G G + G +G G G GP+G GP G G S
Sbjct: 534 GPAGLVGLPGKDGDIGAPGSTGPAGPSGERGEQGITGPTGFQGLPGPPGAAGEHGKS 590
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/155 (29%), Positives = 63/155 (40%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+GS G G GP+G+ GP+G++ G G + + GP G G SG
Sbjct: 473 TGSPGSPGADGKPGPSGPAGQDGRPGPAGAVGQRGQPGVMGFPGPKGAAGEAGKSGERGI 532
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GP+G + G G + G +G G G GP+G GP G G SG
Sbjct: 533 IGPAGLVGLPGKDGDIGAPGSTGPAGPSGERGEQGITGPTGFQGLPGPPGAAGEHGKSGE 592
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G G GP G + G G +GP+G
Sbjct: 593 QGIPGDVGPPGSSGPRGERGFTGERGSPGAMGPTG 627
>gi|47551003|ref|NP_999675.1| alpha-2 collagen [Strongylocentrotus purpuratus]
gi|161449|gb|AAA30040.1| alpha-2 collagen [Strongylocentrotus purpuratus]
Length = 3198
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/114 (35%), Positives = 55/114 (48%), Gaps = 9/114 (7%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ LGPSG GP G + GP+G +GP+GR G GR+ S GP G
Sbjct: 2605 GETGNQGALGPSGSAGMNGPPGVVGEPGPTGP---VGPTGR---SGEDGRMGSRGPQGNQ 2658
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G +G G G GR ++GP G + +G +G L LG G +
Sbjct: 2659 GVRGPPGVQGLMGSQGS---SGEDGRDGHVGPPGPMGSVGQAGNLGNLGSHGFM 2709
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/105 (36%), Positives = 52/105 (49%), Gaps = 9/105 (8%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ LGPSGS GP G + GP+G + GP+GR G GR+ GP G+
Sbjct: 2605 GETGNQGALGPSGSAGMNGPPGVVGEPGPTGPV---GPTGRS---GEDGRMGSRGPQGNQ 2658
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G +G G G GR ++GP G + +G +G L
Sbjct: 2659 GVRGPPGVQGLMGSQGS---SGEDGRDGHVGPPGPMGSVGQAGNL 2700
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/139 (33%), Positives = 61/139 (43%), Gaps = 12/139 (8%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
G G G GR GP G++ G +G LGPSG GP G + GP+
Sbjct: 2575 GEKGEAGPFGSQGRPGRSGPQGNMGARGERGETGNQGALGPSGSAGMNGPPGVVGEPGPT 2634
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G +GP+GR G GR+ GP G GP G +G G G GR ++
Sbjct: 2635 GP---VGPTGR---SGEDGRMGSRGPQGNQGVRGPPGVQGLMGSQGS---SGEDGRDGHV 2685
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G + +G +G L LG
Sbjct: 2686 GPPGPMGSVGQAGNLGNLG 2704
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/114 (35%), Positives = 53/114 (46%), Gaps = 9/114 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G LGPSGS GP G + GP+G +GP+G G GR+ GP G
Sbjct: 2605 GETGNQGALGPSGSAGMNGPPGVVGEPGPTGP---VGPTG---RSGEDGRMGSRGPQGNQ 2658
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G +G G G GR ++GP G + +G +G L LG G +
Sbjct: 2659 GVRGPPGVQGLMGSQGS---SGEDGRDGHVGPPGPMGSVGQAGNLGNLGSHGFM 2709
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/111 (35%), Positives = 51/111 (45%), Gaps = 12/111 (10%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G +G LGPSG GP G + GP+G +GP+GR G GR+ GP G
Sbjct: 2605 GETGNQGALGPSGSAGMNGPPGVVGEPGPTGP---VGPTGR---SGEDGRMGSRGPQGNQ 2658
Query: 119 RYLGP------SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G S G GR ++GP G + +G +G L LG G +
Sbjct: 2659 GVRGPPGVQGLMGSQGSSGEDGRDGHVGPPGPMGSVGQAGNLGNLGSHGFM 2709
>gi|157109781|ref|XP_001650820.1| collagen alpha chain, anopheles [Aedes aegypti]
gi|108878922|gb|EAT43147.1| AAEL005386-PA [Aedes aegypti]
Length = 1746
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/196 (28%), Positives = 69/196 (35%), Gaps = 21/196 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G +G G+ GP G + GP G ++G G G G Y GP+G
Sbjct: 706 DMGPPGERGLIGLQGTAGIEGPEGPKGFEGPRGETGHMGLPGEKGKQGVQGFAGYPGPTG 765
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL------------------GPSGRLRYLG 113
G G G G G G + GP G G
Sbjct: 766 DKGDKGIVGIPGLAGDKGERGNTGLQGERGEVGPRGFRGARGRRGADGTPGPKGDTGQPG 825
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
SG +GP G +GP G + GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 826 SSGPQGEMGPQGM---EGPRGFIGLPGPQGNNGKDGPQGTPGERGPPGENGNPGPTGHPG 882
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP G GP G
Sbjct: 883 VIGPQGPTGEPGPVGE 898
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/187 (28%), Positives = 64/187 (34%), Gaps = 26/187 (13%)
Query: 3 GTCVVEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
GT +E GP G + GP G ++G G G G Y GP+G G G
Sbjct: 720 GTAGIE-----GPEGPKGFEGPRGETGHMGLPGEKGKQGVQGFAGYPGPTGDKGDKGIVG 774
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G G G G + GP G G SG +G
Sbjct: 775 IPGLAGDKGERGNTGLQGERGEVGPRGFRGARGRRGADGTPGPKGDTGQPGSSGPQGEMG 834
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
P G GP G + GP G DGP G GP G GP+G +GP G
Sbjct: 835 PQG---MEGPRGFIGLPGPQGNNGKDGPQGTPGERGPPGENGNPGPTGHPGVIGPQGPTG 891
Query: 165 YLGPSGR 171
GP G
Sbjct: 892 EPGPVGE 898
>gi|443721860|gb|ELU10985.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_4177 [Capitella teleta]
Length = 312
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 70/226 (30%), Positives = 87/226 (38%), Gaps = 42/226 (18%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGP------SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGS-----LR-YLGP 60
GP G+ +GP GS GPSG GP+G +GPSGS +R G
Sbjct: 37 TGPIGQNGAIGPIGATGLQGSPGISGPSGPTGPRGPTG---PVGPSGSKGDSGIRGDPGQ 93
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL----- 112
SG GP+GR + GPSG GP G GPSG LGP+G +
Sbjct: 94 SGPEGPSGPTGREGPIGPRGPSGPSGLQGPEG---PKGPSGPTGPLGPTGAIGSTGPEGP 150
Query: 113 -------------GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
G G +GP G DGP+G G +G G G LGP
Sbjct: 151 GGPAGPAGPHGPSGQKGDPGPVGPEGERGPDGPTGPSGQPGETGAQGIKGEKGDAGDLGP 210
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
+G GP G + GP+G G G + G+ V G
Sbjct: 211 TG---STGPQGGIGPSGPTGPAGDKGDQGGIGATGVQGSQGVQGNQ 253
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 64/220 (29%), Positives = 82/220 (37%), Gaps = 36/220 (16%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G + G G + G GS GPSG GP+G + G G G G+
Sbjct: 34 VGPTGPIGQNGAIGPIGATGLQGSPGISGPSGPTGPRGPTGPVGPSGSKGDSGIRGDPGQ 93
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD-- 130
GPSG GP + GPSG GP G GPSG LGP+G + S
Sbjct: 94 SGPEGPSGPTGREGP---IGPRGPSGPSGLQGPEG---PKGPSGPTGPLGPTGAIGSTGP 147
Query: 131 -------------------------GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
GP G GP+G G +G G G
Sbjct: 148 EGPGGPAGPAGPHGPSGQKGDPGPVGPEGERGPDGPTGPSGQPGETGAQGIKGEKGDAGD 207
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRVSGLH 205
LGP+G GP G + GP+G G G+ +G+
Sbjct: 208 LGPTG---STGPQGGIGPSGPTGPAGDKGDQGGIGATGVQ 244
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/196 (29%), Positives = 70/196 (35%), Gaps = 24/196 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL------------------GPSGSL 55
GPSG GP G GPSG LGP+G + G G
Sbjct: 113 GPSGPSGLQGPEG---PKGPSGPTGPLGPTGAIGSTGPEGPGGPAGPAGPHGPSGQKGDP 169
Query: 56 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYL 112
+GP G GP+G G +G+ G G LGP+G +GPSG
Sbjct: 170 GPVGPEGERGPDGPTGPSGQPGETGAQGIKGEKGDAGDLGPTGSTGPQGGIGPSGPTGPA 229
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G G +G +G S G G GP+G GP G G G G +G
Sbjct: 230 GDKGDQGGIGATGVQGSQGVQGNQGPAGPTGPQGSTGPRGANGEQGGIGATGLPGATGGF 289
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G
Sbjct: 290 GPAGPVGATGSAGPQG 305
>gi|354501757|ref|XP_003512955.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Cricetulus
griseus]
Length = 1418
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 791
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 791
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 791
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|344313137|dbj|BAK64231.1| Type II collagen A precursor isoform 1 [Oryzias latipes]
Length = 1491
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.50, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/161 (33%), Positives = 64/161 (39%), Gaps = 3/161 (1%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GPSG G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 813 AGPSGAPGTRGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGTKGEQGEPGQKGEAGAPGPQGP 872
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP+G GP G GP G + G +GR+ GP+G GP+G DGP
Sbjct: 873 SGAPGPAGPTGVSGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGPNGNPGPAGPAGPPGKDGP 932
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP+GR GP+G G +G GPSG
Sbjct: 933 KGVRGDPGPAGRQGDAGLRGPAGAPGEKGDAGEDGPNGPSG 973
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/150 (28%), Positives = 52/150 (34%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP+G GP G
Sbjct: 830 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGTKGEQGEPGQKGEAGAPGPQGPSGAPGPAGPTGVSGPKG 889
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP+GR G
Sbjct: 890 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGPNGNPGPAGPAGPPGKDGPKGVRGDPGPAGRQGDAG 949
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGP+G GP G
Sbjct: 950 LRGPAGAPGEKGDAGEDGPNGPSGPSGPQG 979
>gi|307548928|ref|NP_001182600.1| collagen alpha-1(II) chain precursor [Oryctolagus cuniculus]
Length = 1487
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.54, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 65/175 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+GS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 920
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 921 GPSGKEGPKGARGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGLKGEPGDSGPSGADGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 826 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 885
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 886 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKEGPKGARGDSGPAGRAGDPG 945
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 946 LQGPAGPPGLKGEPGDSGPSGADGPPGPQG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|260834063|ref|XP_002612031.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_87005 [Branchiostoma floridae]
gi|229297404|gb|EEN68040.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_87005 [Branchiostoma floridae]
Length = 374
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.55, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/196 (31%), Positives = 77/196 (39%), Gaps = 23/196 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLR-YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
+ GP G R GP+G +GP R GP G LG G +G G P
Sbjct: 184 SAGPPGETRGAKGPAGERGDMGPQ-CPRLSGPPGEKGALGTPGEKGIMGLPGPCFRCVP- 241
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGRLR--------------YLGPSGRLRYLG 113
G R +G G +GP G +GP G + +GP
Sbjct: 242 GEKRAMGSPGEKGAMGPPGEKGAMGPPREKGVMGPPGLGLAGPPGGKGAMGPPNPGFACA 301
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P G +G G + GP G GPSGR +GP G +GP G Y GP G
Sbjct: 302 P-GEKGAMGSPGEKGAMGPPGEKGARGPSGR-GLVGPPGNKGAMGPPGH-GYDGPPGEKG 358
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGR 189
+GP G+ +GPSGR
Sbjct: 359 AMGPPGKKGAMGPSGR 374
>gi|307548922|ref|NP_001182597.1| collagen alpha-2(I) chain precursor [Oryctolagus cuniculus]
Length = 1364
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP GS GP+G G SGR
Sbjct: 383 GEPGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGSRGSTGPAGVRGPNGDSGRPGEP 442
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 443 GLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDP 502
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G +G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 503 GKNGDKGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTA 562
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 563 GEVG 566
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 407 GADGRAGVMGPPGSRGSTGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPV 466
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 467 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHPGLAGARGAPGPDGNN 526
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 527 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTAGEVGKPGE 570
>gi|354501755|ref|XP_003512954.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Cricetulus
griseus]
Length = 1486
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.57, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 800 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 859
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 860 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 904
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.00, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 800 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 859
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 860 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 904
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 800 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 859
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 860 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 904
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 800 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 859
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 860 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 904
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 800 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 859
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 860 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 904
>gi|323483847|ref|ZP_08089224.1| BclA protein, partial [Clostridium symbiosum WAL-14163]
gi|323402801|gb|EGA95122.1| BclA protein [Clostridium symbiosum WAL-14163]
Length = 282
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/96 (33%), Positives = 47/96 (48%), Gaps = 6/96 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G G +GS GP+G GP+G+ +G +G GPSG
Sbjct: 2 GPTGTTGANGPAGPTGPTGATGSTGATGPAGP---TGPTGAAGLIGATGPAGPTGPSGPT 58
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ ++G +G GP+G GP+G
Sbjct: 59 GATGPTGAAGFIGATGP---AGPTGPTGATGPTGAT 91
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.74, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/96 (33%), Positives = 46/96 (47%), Gaps = 6/96 (6%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ GP+G G +GS GP+G GP+G +G +G GPSG
Sbjct: 2 GPTGTTGANGPAGPTGPTGATGSTGATGPAGPT---GPTGAAGLIGATGPAGPTGPSGPT 58
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G ++G +G GP+G GP+G
Sbjct: 59 GATGPTGAAGFIGATGP---AGPTGPTGATGPTGAT 91
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.96, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 46/96 (47%), Gaps = 6/96 (6%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP+G G +G GP+G GP+G+ +G +G GPSG
Sbjct: 2 GPTGTTGANGPAGPTGPTGATGSTGATGPAGPT---GPTGAAGLIGATGPAGPTGPSGPT 58
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G ++G +G GP+G + GP+G
Sbjct: 59 GATGPTGAAGFIGATGPA---GPTGPTGATGPTGAT 91
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 45/96 (46%), Gaps = 3/96 (3%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ GP+G G +G GP+G GP+G +G +G GPSG
Sbjct: 2 GPTGTTGANGPAGPTGPTGATGSTGATGPAGPT---GPTGAAGLIGATGPAGPTGPSGPT 58
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP+G ++G +G GP+G G +G +
Sbjct: 59 GATGPTGAAGFIGATGPAGPTGPTGATGPTGATGLI 94
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/96 (32%), Positives = 44/96 (45%), Gaps = 6/96 (6%)
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP+G GP+G GP+G G +G GP+G +G +G GPSG
Sbjct: 2 GPTGTTGANGPAGPT---GPTGATGSTGATGPAGPTGPTGAAGLIGATGPAGPTGPSGPT 58
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G ++G +G GP+G GP+G
Sbjct: 59 GATGPTGAAGFIGATGP---AGPTGPTGATGPTGAT 91
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/75 (32%), Positives = 37/75 (49%), Gaps = 3/75 (4%)
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G ++GP+G G +G GP+G GP+G +G +G GPSG
Sbjct: 2 GPTGTTGANGPAGPTGPTGATGSTGATGPAGPT---GPTGAAGLIGATGPAGPTGPSGPT 58
Query: 182 RYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G ++G +
Sbjct: 59 GATGPTGAAGFIGAT 73
>gi|21410158|gb|AAH30913.1| Col2a1 protein [Mus musculus]
Length = 826
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.59, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/166 (33%), Positives = 60/166 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 149 GPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPS 208
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP G DGP
Sbjct: 209 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPK 268
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 269 GVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 314
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.97, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GPSGS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 140 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 199
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 200 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 244
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 165 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 224
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 225 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 284
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 285 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 314
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GPSG G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 140 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 199
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 200 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 244
>gi|348578547|ref|XP_003475044.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Cavia porcellus]
Length = 1393
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.62, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/198 (29%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS GP+G+ +
Sbjct: 436 GADGRSGVMGPPGSRGATGPAGVRGPNGDTGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNAGPAGKEGPM 495
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 496 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHPGLAGARGAPGPDGNN 555
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 556 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGAR 615
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G +GP+G +
Sbjct: 616 GERGPPGESGAVGPAGPI 633
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 61/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G
Sbjct: 485 NAGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHPGLAG 544
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G G
Sbjct: 545 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGER---G 601
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G +GP+G +
Sbjct: 602 LPGEFGLPGPAGARGERGPPGESGAVGPAGPI 633
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS GP+G+ +
Sbjct: 436 GADGRSGVMGPPGSRGATGPAGVRGPNGDTGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNAGPAGKEGPM 495
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G +G + + GP G G SG + G +G GP G
Sbjct: 496 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKSGDKGHPGLAGARGAPGPDGNN 555
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 556 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 595
>gi|26390235|dbj|BAC25865.1| unnamed protein product [Mus musculus]
Length = 886
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.63, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/175 (30%), Positives = 58/175 (33%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GPSGS G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 200 GEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDA 259
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--------------- 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 260 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPP 319
Query: 128 ---NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
DGP G GP GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 320 GPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 374
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/150 (29%), Positives = 50/150 (33%), Gaps = 18/150 (12%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 225 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 284
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRL------------------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
GP G+ + G +GR+ GP G GP GR G
Sbjct: 285 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPG 344
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 345 LQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQG 374
>gi|348580237|ref|XP_003475885.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Cavia porcellus]
Length = 1418
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 42/105 (40%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+GS G G GP G + GP G+ G G G G +
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 791
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 836
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+GS G G GP G + GP G+ G G G G +
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 791
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 836
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G +
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 836
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G +
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 791
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 836
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/150 (30%), Positives = 56/150 (37%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 26 GSLRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G+ GP G + GP G G G +GP G G G + GP+GS
Sbjct: 687 GAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSA 746
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G + GP G G G G G + S GP G GP
Sbjct: 747 GARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDVGSPGPQGPSGAPGPQ 806
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 807 GPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 836
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G +
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 836
>gi|152975486|ref|YP_001375003.1| hypothetical protein Bcer98_1704 [Bacillus cytotoxicus NVH 391-98]
gi|152024238|gb|ABS22008.1| 40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein [Bacillus
cytotoxicus NVH 391-98]
Length = 689
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.65, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/142 (33%), Positives = 49/142 (34%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 221 GPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPE 280
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 281 GPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQ 340
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G GP G GP+G
Sbjct: 341 GVQGIQGPEGPQGPTGPTGDCE 362
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/142 (33%), Positives = 49/142 (34%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 221 GPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPE 280
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP G GP G GP G GP G GP G GP
Sbjct: 281 GPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQGVQGIQGPEGPEGPQGPQ 340
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 164
G GP G GP+G
Sbjct: 341 GVQGIQGPEGPQGPTGPTGDCE 362
>gi|334135425|ref|ZP_08508916.1| collagen triple helix repeat protein [Paenibacillus sp. HGF7]
gi|333607085|gb|EGL18408.1| collagen triple helix repeat protein [Paenibacillus sp. HGF7]
Length = 358
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/109 (34%), Positives = 51/109 (46%), Gaps = 9/109 (8%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G+ G +G++ GP G LGP G G G++ LGP G LGP G
Sbjct: 72 TGQQLLQGLAGAIAQAGPQGVAGALGPQG---LAGLVGAIGALGPQGLAGALGPQG---L 125
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G G++ LGP G LGP G G +G + +GP G + LGP
Sbjct: 126 AGLVGAIGALGPQGLAGALGPQG---LAGLAGAIGAIGPQGLVGALGPQ 171
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/109 (34%), Positives = 50/109 (45%), Gaps = 9/109 (8%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 102
+G+ G +G++ GP G LGP G G G++ LGP G LGP G
Sbjct: 72 TGQQLLQGLAGAIAQAGPQGVAGALGPQG---LAGLVGAIGALGPQGLAGALGPQG---L 125
Query: 103 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G + LGP G LGP G G +G + +GP G + LGP
Sbjct: 126 AGLVGAIGALGPQGLAGALGPQGL---AGLAGAIGAIGPQGLVGALGPQ 171
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/140 (31%), Positives = 56/140 (40%), Gaps = 27/140 (19%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+G + GP G LGP G ++ LGP G LGP G G G + LGP
Sbjct: 81 AGAIAQAGPQGVAGALGPQGLAGLVGAIGALGPQGLAGALGPQG---LAGLVGAIGALGP 137
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS---------------GRLRYLGP 114
G LGP G G +G + +GP G + LGP G GP
Sbjct: 138 QGLAGALGPQG---LAGLAGAIGAIGPQGLVGALGPQGIAGIAGAIGAAGLAGPAGPTGP 194
Query: 115 SGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
+G GP+G GP+G
Sbjct: 195 AGSAGPTGPTGATGPAGPAG 214
>gi|402864189|ref|XP_003896357.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain [Papio anubis]
Length = 1366
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.66, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
D GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G +G G
Sbjct: 578 DFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAAGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPGDFGLPGPAGAR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
>gi|348580235|ref|XP_003475884.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Cavia porcellus]
Length = 1487
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 42/105 (40%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+GS G G GP G + GP G+ G G G G +
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 860
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 905
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+GS G G GP G + GP G+ G G G G +
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 860
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 905
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+GS G G GP G + GP G G G G G +
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 905
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G +
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 860
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 905
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/150 (30%), Positives = 56/150 (37%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 26 GSLRYLGPS---GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G+ GP G + GP G G G +GP G G G + GP+GS
Sbjct: 756 GAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPAGSA 815
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G G GP G + GP G G G G G + S GP G GP
Sbjct: 816 GARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDVGSPGPQGPSGAPGPQ 875
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 876 GPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 905
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G +
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDV 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GSPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGSRGAQGPPGVTGFPGAAGRV 905
>gi|423470928|ref|ZP_17447672.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG6O-2]
gi|402434316|gb|EJV66359.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus BAG6O-2]
Length = 323
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/134 (32%), Positives = 53/134 (39%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G++ GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGP 94
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G LR GP G G G GP G G G G G + + GP G
Sbjct: 95 EG-LR--GPVGATGATGLQGVQGIQGPIGSTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSG 152
G G GP G
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG 165
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/134 (32%), Positives = 52/134 (38%), Gaps = 6/134 (4%)
Query: 37 LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
+ GP+G GP G + GP G + GP G GP+G + GP G+ GP
Sbjct: 38 IGITGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGP 94
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G LR GP G G G GP G + G G G G + GP G
Sbjct: 95 EG-LR--GPVGATGATGLQGVQGIQGPIGSTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGI 151
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSG 170
G G GP G
Sbjct: 152 QGVQGLPGATGPQG 165
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/131 (32%), Positives = 51/131 (38%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G + GP G + GP G GP+G + GP G+ GP G
Sbjct: 41 TGPTGPQGPTGPQGPRGFQGPMGEMGPTGPQGVQGIQGPAGQMGATGPEGQ---QGPEG- 96
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
LR GP G+ G G GP G G G G G + GP G G
Sbjct: 97 LR--GPVGATGATGLQGVQGIQGPIGSTGATGAQGIQGIQGLQGPIGATGPEGPQGIQGV 154
Query: 133 SGRLRYLGPSG 143
G GP G
Sbjct: 155 QGLPGATGPQG 165
>gi|114614542|ref|XP_001168894.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 9 [Pan troglodytes]
Length = 1366
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.67, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPTGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPTGEVG 568
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPTGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|440893297|gb|ELR46121.1| Collagen alpha-2(I) chain [Bos grunniens mutus]
Length = 1366
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEAGKPGERGIPGEFGLPGPAGAR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GP+G G
Sbjct: 529 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEAG 568
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/152 (29%), Positives = 61/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G G +G+ G
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAG---TAGEAGKPGERG 574
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 575 IPGEFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPTGPI 606
>gi|397476767|ref|XP_003809763.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain [Pan paniscus]
Length = 1366
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|291414477|ref|XP_002723485.1| PREDICTED: type II Collagen isoform 2 [Oryctolagus cuniculus]
Length = 1418
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.69, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/175 (32%), Positives = 65/175 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+GS G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPP 851
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 852 GPSGKEGPKGARGDSGPAGRAGDPGLQGPAGPPGLKGEPGDSGPSGADGPPGPQG 906
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 56/150 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
GP G + GP G+ G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 757 ETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKG 816
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ + G +GR+ G +G GP G GP G GP+GR G
Sbjct: 817 ARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKEGPKGARGDSGPAGRAGDPG 876
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
G G G GPSG GP G
Sbjct: 877 LQGPAGPPGLKGEPGDSGPSGADGPPGPQG 906
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGSAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|288871232|ref|ZP_06116850.2| BclA protein [Clostridium hathewayi DSM 13479]
gi|288864270|gb|EFC96568.1| BclA protein [Clostridium hathewayi DSM 13479]
Length = 205
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.70, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/179 (30%), Positives = 70/179 (39%), Gaps = 15/179 (8%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRY------LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
+GP+G GP G + GP+G+ GP G G G+ GP G
Sbjct: 1 MGPAGPQGITGPPGPIGSRGTAGLQGPTGAQGDRGPIGPTGAQGCRGATGPAGPQGDPGP 60
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
GP G G +GS GP+G GP G GP G + GP G G G
Sbjct: 61 TGPQGVRGLKGDTGSQGPTGPAGSTGPAGPQGIAGPTGPEGPMGLQGPRGATGIQGLQGL 120
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+GP G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 121 PGPEGPRGIQGSTGPAGPTGAAGATGEAGPTGPRGDQGPAG---VPGPAGITGATGPTG 176
>gi|423521590|ref|ZP_17498063.1| hypothetical protein IGC_00973, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
gi|401177583|gb|EJQ84773.1| hypothetical protein IGC_00973, partial [Bacillus cereus HuA4-10]
Length = 171
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/89 (29%), Positives = 38/89 (42%), Gaps = 6/89 (6%)
Query: 61 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G + LGP+G GP+G+ GP+G P+G G +G GP+G
Sbjct: 26 DGTVPKLGPTGPTGATGPTGATGVTGPTG------PTGATGITGATGPTGATGPTGATGP 79
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
G +G + GP+G G +G G
Sbjct: 80 TGATGVTGATGPTGSTGITGATGPTGSTG 108
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/89 (29%), Positives = 38/89 (42%), Gaps = 6/89 (6%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
G++ LGP+G GP+G GP+ GP+G G +G GP+G+
Sbjct: 26 DGTVPKLGPTGPTGATGPTGATGVTGPT------GPTGATGITGATGPTGATGPTGATGP 79
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
G +G GP+G G +G G
Sbjct: 80 TGATGVTGATGPTGSTGITGATGPTGSTG 108
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/89 (29%), Positives = 38/89 (42%), Gaps = 6/89 (6%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G++ LGP+G GP+G+ GP+ GP+G G +G GP+G
Sbjct: 26 DGTVPKLGPTGPTGATGPTGATGVTGPT------GPTGATGITGATGPTGATGPTGATGP 79
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 122
G +G GP+G G +G G
Sbjct: 80 TGATGVTGATGPTGSTGITGATGPTGSTG 108
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/89 (29%), Positives = 38/89 (42%), Gaps = 6/89 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + LGP+G GP+G+ GP+ GP+G+ G +G GP+G
Sbjct: 26 DGTVPKLGPTGPTGATGPTGATGVTGPT------GPTGATGITGATGPTGATGPTGATGP 79
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
G +G GP+G G +G G
Sbjct: 80 TGATGVTGATGPTGSTGITGATGPTGSTG 108
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/83 (31%), Positives = 36/83 (43%), Gaps = 6/83 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
LGP+G GP+G+ GP+ GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 32 LGPTGPTGATGPTGATGVTGPT------GPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGV 85
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
GP+GS G +G G
Sbjct: 86 TGATGPTGSTGITGATGPTGSTG 108
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/83 (30%), Positives = 36/83 (43%), Gaps = 3/83 (3%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
G++ LGP+G GP+G GP+G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 26 DGTVPKLGPTGPTGATGPTGATGVTGPTGPTGATGITGATGPTGATGPTGATGPTGATGV 85
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G G +G S G
Sbjct: 86 TGATGPTGSTGITGATGPTGSTG 108
>gi|313220533|emb|CBY31383.1| unnamed protein product [Oikopleura dioica]
Length = 1423
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/175 (29%), Positives = 73/175 (41%), Gaps = 6/175 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GPSG G +G +GP G G GS + G++ G G
Sbjct: 416 GDQGMMGMPGPSGERGKRGETGEPGAVGPQGPAGERGQQGSRGF---PGKMGNPGIKGNH 472
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G G +G GP+G G SGR +GPSG+ GP+G DG
Sbjct: 473 GARGVAGERGQSGKTGEQGQPGPTGTPGSRGMSGRPGKMGPSGKPGPTGPTGL---DGRP 529
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G + GP G++ +G G G G+ G +G +G +G+ GP G
Sbjct: 530 GPIGPAGPIGQMGQMGLPGEKGMAGEDGKPGLKGSNGEPGQMGATGKEGVSGPQG 584
>gi|2735715|gb|AAB93981.1| pro-alpha 2(I) collagen [Homo sapiens]
Length = 1366
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.72, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G + G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPVGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.98, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 61/132 (46%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G + G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGFKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G + G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPVGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 75/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G + G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPVGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
>gi|179596|gb|AAB59374.1| pre-pro-alpha-2 type I collagen [Homo sapiens]
Length = 1366
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.76, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 77/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G + G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPVGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.99, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 61/132 (46%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G + G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGFKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G + G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPVGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 75/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G + G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPVGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
>gi|50978940|ref|NP_001003187.1| collagen alpha-2(I) chain precursor [Canis lupus familiaris]
gi|8134352|sp|O46392.2|CO1A2_CANFA RecName: Full=Collagen alpha-2(I) chain; AltName: Full=Alpha-2 type
I collagen; Flags: Precursor
gi|3386334|gb|AAC64485.1| type I procollagen pro-alpha 2 chain [Canis lupus familiaris]
Length = 1366
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.76, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/190 (31%), Positives = 77/190 (40%), Gaps = 12/190 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GPSG G GS G G +GP G GP+G G SGR
Sbjct: 382 GPNGEAGSAGPSGPPGLRGSPGSRGLPGADGPAGVMGPPGPRGATGPAGVRGPNGDSGRP 441
Query: 74 RY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLG-P--SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
+GP G+ +GP+G+ +G P GR +GP+G G G + + GP
Sbjct: 442 GEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAG---ARGEPGNIGFPGPK 498
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G G +G + G +G GP G GP G G G GP G
Sbjct: 499 GPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLP 558
Query: 185 GPSGRLRYLG 194
GP+G +G
Sbjct: 559 GPAGTAGEVG 568
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/185 (30%), Positives = 73/185 (39%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 10 ALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
A + G SG G +G+ GPSG GP+G GPSG G G G
Sbjct: 351 AGSKGESGNKGEPGSAGAQGPPGPSGEEGKRGPNGEAGSAGPSGPPGLRGSPGSRGLPGA 410
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G +GP G GP+G G SGR +GP G +GP+G+ +G
Sbjct: 411 DGPAGVMGPPGPRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKEGPMGL 470
Query: 124 SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 471 PGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGA 530
Query: 184 LGPSG 188
GP G
Sbjct: 531 QGPPG 535
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/152 (30%), Positives = 60/152 (39%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NVGPAGKEGPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G G
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGER---G 574
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GPSG +
Sbjct: 575 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPI 606
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/171 (30%), Positives = 69/171 (40%), Gaps = 9/171 (5%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+GS G SG G +G+ GPSG GP+G GPSG G G
Sbjct: 349 GPAGSK---GESGNKGEPGSAGAQGPPGPSGEEGKRGPNGEAGSAGPSGPPGLRGSPGSR 405
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G +GP G GP+G G SGR G G + G G + G
Sbjct: 406 GLPGADGPAGVMGPPGPRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGAPGNVGPAGKE 465
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G + G GR +GP+ G + + GP G G +G + GL+
Sbjct: 466 GPMGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLA 516
>gi|156394356|ref|XP_001636792.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156223898|gb|EDO44729.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 1112
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.80, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/167 (29%), Positives = 70/167 (41%), Gaps = 3/167 (1%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
G++ +G SGS G G GP+G+L G G + +GPSG + G G
Sbjct: 94 KGAIGIIGKSGSPGKDGSEGPTGESGPTGALGAKGQKGGVGSIGPSGLQGFQGRMGLKGD 153
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGP 141
G G + G +G GP G + +G G L +G G + S GPSG + G
Sbjct: 154 AGYDGVDGFKGHAGNTGIPGPQGTMGPIGAKGILGDVGAPGMPGGVGSIGPSGLQGFQGR 213
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G + G +G GP G + +G G L +G G
Sbjct: 214 MGLKGDAGYDGVDGFKGHAGNTGIPGPQGTMGPIGAKGILGDVGAPG 260
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/180 (30%), Positives = 74/180 (41%), Gaps = 9/180 (5%)
Query: 9 KALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
K + GP+G GP+G+L G G + +GPSG + G G G G + G
Sbjct: 108 KDGSEGPTGES---GPTGALGAKGQKGGVGSIGPSGLQGFQGRMGLKGDAGYDGVDGFKG 164
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
+G GP G++ +G G L +G G + +GPSG + GR+ G +G
Sbjct: 165 HAGNTGIPGPQGTMGPIGAKGILGDVGAPGMPGGVGSIGPSGLQGF---QGRMGLKGDAG 221
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
DG G G G +GP G LG G G G GP G L + G
Sbjct: 222 YDGVDGFKGHAGNTGIPGPQGTMGPIGAKGILGDVGAPGMPGSRGLNGTRGPEGDLGHSG 281
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/164 (28%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 3/164 (1%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
G++ +G SG G G GP+G L G G + +GPSG + G G
Sbjct: 94 KGAIGIIGKSGSPGKDGSEGPTGESGPTGALGAKGQKGGVGSIGPSGLQGFQGRMGLKGD 153
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGP 150
G G + G +G GP G + +G G L G G + +GPSG + G
Sbjct: 154 AGYDGVDGFKGHAGNTGIPGPQGTMGPIGAKGILGDVGAPGMPGGVGSIGPSGLQGFQGR 213
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
G G G + G +G GP G + +G G L +G
Sbjct: 214 MGLKGDAGYDGVDGFKGHAGNTGIPGPQGTMGPIGAKGILGDVG 257
>gi|195729051|gb|ACG50747.1| VtaA9 [Haemophilus parasuis str. Nagasaki]
Length = 953
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.81, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/154 (32%), Positives = 62/154 (40%), Gaps = 3/154 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +GS GP+G+ +GP+G GP G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 561 GETGSAGPAGPAGAQGPVGPAGPAGPTGPQGATGPAGPKGEAGAAGPKGEKGDPGPKGEA 620
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP+G GP G GP G G +G GP G G G GP+
Sbjct: 621 GSTGPTGP---AGPKGDPGQAGPKGDTGQKGETGPAGPAGPQGPAGPAGAKGDKGDTGPA 677
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
G GP+G GP+G GP+G G
Sbjct: 678 GPRGPAGPTGPQGPAGPAGPQDPAGPTGNSELKG 711
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/153 (30%), Positives = 64/153 (41%), Gaps = 6/153 (3%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +GS GP+G +GP+G GP G+ GP G GP G GP G
Sbjct: 561 GETGSAGPAGPAGAQGPVGPAGPAGPTGPQGATGPAGPKGEAGAAGPKGEKGDPGPKGEA 620
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS------GRLRYLGPSGRL 163
GP+G G G+ G +G+ GP+G GP+ G GP+G
Sbjct: 621 GSTGPTGPAGPKGDPGQAGPKGDTGQKGETGPAGPAGPQGPAGPAGAKGDKGDTGPAGPR 680
Query: 164 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
GP+G GP+G GP+G G++
Sbjct: 681 GPAGPTGPQGPAGPAGPQDPAGPTGNSELKGIT 713
>gi|27806257|ref|NP_776945.1| collagen alpha-2(I) chain precursor [Bos taurus]
gi|8039779|sp|P02465.2|CO1A2_BOVIN RecName: Full=Collagen alpha-2(I) chain; AltName: Full=Alpha-2 type
I collagen; Flags: Precursor
gi|2967448|dbj|BAA25171.1| alpha2(I) collagen [Bos taurus]
gi|151555719|gb|AAI49096.1| Collagen, type I, alpha 2 [Bos taurus]
gi|296488668|tpg|DAA30781.1| TPA: collagen alpha-2(I) chain precursor [Bos taurus]
Length = 1364
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.82, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 407 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPV 466
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 467 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 526
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG---------------PSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G G P+G
Sbjct: 527 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEAGKPGERGIPGEFGLPGPAGAR 586
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 587 GERGPPGESGAAGPTGPI 604
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 407 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPV 466
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 467 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 526
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GP+G G
Sbjct: 527 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEAG 566
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/152 (29%), Positives = 61/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 456 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGEKGHAGLAG 515
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G G +G+ G
Sbjct: 516 ARGAPGPDGNNGAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAG---TAGEAGKPGERG 572
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 573 IPGEFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPTGPI 604
>gi|390466740|ref|XP_003733643.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: collagen alpha-2(I) chain-like
[Callithrix jacchus]
Length = 1366
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.86, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGSIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG LG
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGELG 568
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 70/183 (38%), Gaps = 15/183 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLG---------PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 62
N+GP+G+ +G P G G GS+ + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGSIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 63 RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 116
GP G GP G G G GP G GPSG LG G
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGELGKPGERGLPG 577
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G +G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAAGTAGPSG 637
Query: 177 PSG 179
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/201 (28%), Positives = 73/201 (36%), Gaps = 27/201 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------------------------SLRYLGPSGRLRYL 49
G GR +GP+GS GP+G S +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGSIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G G G GP G GPSG LG G R L G GP+
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGELGKPGE-RGL--PGEFGLPGPA 585
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G GP+G +
Sbjct: 586 GPRGERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGDKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGLAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|443690259|gb|ELT92437.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_144839, partial [Capitella teleta]
Length = 135
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.87, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 41/86 (47%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+GP G+ GPSG + G G GP+G GP+G++ G +G GPSG
Sbjct: 38 IGPVGATGGTGPSGPIGNTGQPGPSGPSGPTGPSGQPGPTGQIGDSGATGFTGPAGPSGP 97
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G +G+ GP G DGPSG
Sbjct: 98 RGDTGETGQRGPSGPQGERGPDGPSG 123
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/86 (34%), Positives = 39/86 (45%)
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
+GP G GPSG + G G GP+G GP+G++ G +G GPSG
Sbjct: 38 IGPVGATGGTGPSGPIGNTGQPGPSGPSGPTGPSGQPGPTGQIGDSGATGFTGPAGPSGP 97
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G +G+ GP G GPSG
Sbjct: 98 RGDTGETGQRGPSGPQGERGPDGPSG 123
>gi|300854800|ref|YP_003779784.1| hypothetical protein CLJU_c16180 [Clostridium ljungdahlii DSM
13528]
gi|300434915|gb|ADK14682.1| conserved hypothetical protein [Clostridium ljungdahlii DSM 13528]
Length = 948
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.90, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/99 (30%), Positives = 41/99 (41%), Gaps = 9/99 (9%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SLRYLG 86
GP+GS GP+G +GS GP+G G +G GP+G S G
Sbjct: 185 VTGPTGSTGATGPTGV------TGSTGATGPTGETGATGATGSTGATGPTGVTGSTGVTG 238
Query: 87 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
P+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 239 PTGVTGSTGATGPTGETGATGATGETGPTGATGVTGSTG 277
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/99 (32%), Positives = 43/99 (43%), Gaps = 9/99 (9%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSG---SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
GP+GS GP+G S GP+G G +GS GP+G G +G G
Sbjct: 185 VTGPTGSTGATGPTGVTGSTGATGPTGETGATGATGSTGATGPTG---VTGSTGVTGPTG 241
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+GS GP+G G +G GP+G G +G
Sbjct: 242 VTGSTGATGPTGETGATGATGE---TGPTGATGVTGSTG 277
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/105 (28%), Positives = 42/105 (40%), Gaps = 12/105 (11%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GP+G GP+G +GS GP+G G +G GP+G +G
Sbjct: 185 VTGPTGSTGATGPTGV------TGSTGATGPTGETGATGATGSTGATGPTGV------TG 232
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G S G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 233 STGVTGPTGVTGSTGATGPTGETGATGATGETGPTGATGVTGSTG 277
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/99 (29%), Positives = 40/99 (40%), Gaps = 9/99 (9%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 104
GP+GS GP+G GP+G G +GS GP+G +G G
Sbjct: 185 VTGPTGSTGATGPTGVTGSTGATGPTGETGATGATGSTGATGPTGV------TGSTGVTG 238
Query: 105 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
P+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 239 PTGVTGSTGATGPTGETGATGATGETGPTGATGVTGSTG 277
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/92 (30%), Positives = 39/92 (42%), Gaps = 6/92 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSG---SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRY 66
GP+G GP+G S GP+G G +G GP +GS GP+G
Sbjct: 186 TGPTGSTGATGPTGVTGSTGATGPTGETGATGATGSTGATGPTGVTGSTGVTGPTGVTGS 245
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
G +G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 246 TGATGPTGETGATGATGETGPTGATGVTGSTG 277
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/105 (26%), Positives = 41/105 (39%), Gaps = 12/105 (11%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G GP+G +G GP+G G +G + GP+G +G
Sbjct: 185 VTGPTGSTGATGPTGV------TGSTGATGPTGETGATGATGSTGATGPTGV------TG 232
Query: 144 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+G G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 233 STGVTGPTGVTGSTGATGPTGETGATGATGETGPTGATGVTGSTG 277
>gi|337293956|emb|CCB91943.1| hypothetical protein WCH_DD19570 [Waddlia chondrophila 2032/99]
Length = 507
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.93, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/130 (30%), Positives = 57/130 (43%), Gaps = 15/130 (11%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ G +G+ GP+G G G+ GP+G GP+G P+G
Sbjct: 232 GPAGAAGTDGATGATGPTGPTGATGANGADGATGPTGPAGATGATGPTG------PTGVT 285
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
G +G GP+G P+G GP+G G +G +DG +G GP+
Sbjct: 286 GATGANGADGATGPTG------PAGATGATGPTGPTGVTGATGANGADGATGP---TGPA 336
Query: 143 GRLRYLGPSG 152
G GP+G
Sbjct: 337 GATGATGPTG 346
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/139 (30%), Positives = 58/139 (41%), Gaps = 10/139 (7%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP+G G +G+ GP+G G G GP+G GP+G G +G
Sbjct: 232 GPAGAAGTDGATGATGPTGPTGATGANGADGATGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATGAN 291
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+DG +G G +G GP+G G +G GP+ GP+G GP+
Sbjct: 292 GADGATGPTGPAGATGATGPTGPTGVTGATGANGADGATGPT------GPAGATGATGPT 345
Query: 188 G-RLRYLGLS---DGLRVS 202
G + G S D L VS
Sbjct: 346 GPEAMHEGFSASKDVLTVS 364
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/166 (27%), Positives = 67/166 (40%), Gaps = 25/166 (15%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G G+ GP+G G +G+ GP+G G G GP+G+ GP+G
Sbjct: 223 GADGATGPTGPAGAAGTDGATGATGPTGPTGATGANGADGATGPTGPAGATGATGPTG-- 280
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
P+G G +G GP+G P+G + GP+ GP+G G +
Sbjct: 281 ----PTGVTGATGANGADGATGPTG------PAGATGATGPT------GPTGVTGATGAN 324
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+ GP+G GP+G + G S L +S
Sbjct: 325 GADGATGPT------GPAGATGATGPTGPEAMHEGFSASKDVLTVS 364
>gi|355560823|gb|EHH17509.1| hypothetical protein EGK_13930 [Macaca mulatta]
Length = 1240
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.93, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 337 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 396
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 397 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 456
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 457 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGAR 516
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 517 GERGPPGESGAAGPTGPI 534
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 386 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 445
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 446 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPG 505
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G +G G
Sbjct: 506 EFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAAGTAGPSG 565
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 566 PSG 568
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 337 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 396
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 397 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 456
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 457 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 496
>gi|432855207|ref|XP_004068125.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXIV) chain-like [Oryzias latipes]
Length = 1250
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.94, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/178 (32%), Positives = 69/178 (38%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+LGP G + Y GP GS G G G G+ +GP G GP G + GPSG
Sbjct: 820 SLGPRGLMGYPGPDGSPGLTGLPGLPGKQGRQGQRGLVGPEGPAGRPGPRGETGFPGPSG 879
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G G G G G + G +G G G G G G
Sbjct: 880 ENGSPGQKGEPGLPGDRGAPGMKGMEGAVGDQGKTGDPGLKGQPGEPGDSGMLGLQGFPG 939
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
P G LGP G GP G L GP G +GP G+ GP G +GP G+
Sbjct: 940 PKGPNGDLGPRGYPGPKGPVGALGIAGPVGPDGMIGPIGKPGPQGPKGNSGEMGPQGQ 997
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/181 (32%), Positives = 67/181 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G LGP G + Y GP GS G G G G +GP G GP G
Sbjct: 813 GAEGPTGSLGPRGLMGYPGPDGSPGLTGLPGLPGKQGRQGQRGLVGPEGPAGRPGPRGET 872
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+ GPSG G G G G G G + G +G G G G
Sbjct: 873 GFPGPSGENGSPGQKGEPGLPGDRGAPGMKGMEGAVGDQGKTGDPGLKGQPGEPGDSGML 932
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G + GP G LGP G GP G L GP G +GP G+ GP G +
Sbjct: 933 GLQGFPGPKGPNGDLGPRGYPGPKGPVGALGIAGPVGPDGMIGPIGKPGPQGPKGNSGEM 992
Query: 194 G 194
G
Sbjct: 993 G 993
>gi|195728878|gb|ACG50736.1| VtaA21 [Haemophilus parasuis]
Length = 1605
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.95, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 67/177 (37%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP G +GP+G P G G G GP +GP G
Sbjct: 654 DTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAG------PKGEAGAKGDKGDTGEAGP------IGPQG 701
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G G +G+ GP+G + GP G G
Sbjct: 702 PAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPVGPAGPQGVP---G 752
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP G +GP G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 753 PAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMG 809
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 72/180 (40%), Gaps = 24/180 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS--LR-YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G GP+G+ GP G L+ GP+G GP G +GP+G P
Sbjct: 625 VGPEGPRGPAGPTGAQGPAGPRGEQGLKGDTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAG------P 678
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G G GP +GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 679 KGEAGAKGDKGDTGEAGP------IGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK-- 727
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G+ GP+G + GP+G GP+G GP G +GP G GP G
Sbjct: 728 -GDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGD 783
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/159 (31%), Positives = 63/159 (39%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G GP G +GP+G G G G +G +GP G GP G
Sbjct: 655 TGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAGPKGEAGAKGDK---GDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGE 711
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G G +G+ GP+G + GP+G GP+G GP
Sbjct: 712 Q---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGP 762
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 763 KGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGD 801
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/157 (31%), Positives = 62/157 (39%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G +GP G GP G GP G GP G G +G+
Sbjct: 680 GEAGAKGDKGDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQK 733
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G + GP+G GP+G GP G +GP G GP G G +
Sbjct: 734 GETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQA 790
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 791 GPKGDTGPKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 824
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 60/150 (40%), Gaps = 12/150 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G +GP G GP G GP G GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 687 DKGDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAG 740
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G GP+G GP G +GP G GP G G +G G
Sbjct: 741 PV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTG 797
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P G GP G GP G GP+G
Sbjct: 798 PKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 824
>gi|149240247|ref|XP_001525999.1| hypothetical protein LELG_02558 [Lodderomyces elongisporus NRRL
YB-4239]
gi|146450122|gb|EDK44378.1| hypothetical protein LELG_02558 [Lodderomyces elongisporus NRRL
YB-4239]
Length = 349
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.99, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/62 (32%), Positives = 34/62 (54%)
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+GP G + P G + +GP G + +GP G ++S+ P G + +GP G + +GP G
Sbjct: 73 VGPVGSVDSEEPVGPVGSVGPVGPVGSVGPVGSVDSEEPVGPVGSVGPVGPVGSVGPVGS 132
Query: 154 LR 155
+
Sbjct: 133 VD 134
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/64 (31%), Positives = 34/64 (53%)
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP G + P G + +GP G + +GP G + P G + +GP G + +GP G
Sbjct: 73 VGPVGSVDSEEPVGPVGSVGPVGPVGSVGPVGSVDSEEPVGPVGSVGPVGPVGSVGPVGS 132
Query: 127 LNSD 130
++S+
Sbjct: 133 VDSE 136
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 21/66 (31%), Positives = 33/66 (50%)
Query: 27 SLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG 86
S +GP GS+ P G + +GP G + +GP G + P G + +GP G + +G
Sbjct: 69 SEDPVGPVGSVDSEEPVGPVGSVGPVGPVGSVGPVGSVDSEEPVGPVGSVGPVGPVGSVG 128
Query: 87 PSGRLR 92
P G +
Sbjct: 129 PVGSVD 134
>gi|355747841|gb|EHH52338.1| hypothetical protein EGM_12766 [Macaca fascicularis]
Length = 1240
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 337 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 396
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 397 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 456
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 457 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGAR 516
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 517 GERGPPGESGAAGPTGPI 534
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 386 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 445
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 446 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPG 505
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G +G G
Sbjct: 506 EFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAAGTAGPSG 565
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 566 PSG 568
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 337 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 396
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 397 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 456
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 457 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 496
>gi|326324006|gb|ADZ54070.1| virulence-associated trimeric autotransporter [Haemophilus parasuis
SH0165]
Length = 2159
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/159 (31%), Positives = 64/159 (40%), Gaps = 6/159 (3%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP G + GP+G + G G +GP+G GP G GP G GP+G
Sbjct: 1004 AGPRGPVGERGPTGPMGPRGEQGLKGDMGPAG---PQGPQGTAGARGPKGDRGETGPAGP 1060
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G GP+G GP G G +G GP+G + GP
Sbjct: 1061 AGPTGPQGEKGDQGPMG---PAGPAGERGERGPKGDRGPKGDTGERGATGPAGPMGPAGP 1117
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+G GP+G G G G +G + GP G
Sbjct: 1118 AGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPRGE 1156
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/178 (33%), Positives = 76/178 (42%), Gaps = 21/178 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP+G P+G+ GP G+ GP+G GP G GP+G
Sbjct: 1446 GPAGERGETGPAG------PTGAKGEQGPEGKQGIQGPAGPA---GPRGERGETGPAGAA 1496
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLNSD 130
GP+G++ GP+G GP+G + GP G GP G GP G
Sbjct: 1497 GPAGPAGAVGPQGPTG---ATGPAGPVGPRGPQGTAGAQGPKGERGPAGETGPKGEKGDP 1553
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G + GP+G GP G GP+G GP G GP G
Sbjct: 1554 GPKGE---TGPTGPVGPAGPAGERGEQGPRGEQGATGPAG---PTGPRGEPGPTGPQG 1605
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 62/197 (31%), Positives = 80/197 (40%), Gaps = 15/197 (7%)
Query: 1 TFGT-CVVEKALN--LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 57
T GT +++K GP G + GP+G + G G +GP+G GP G+
Sbjct: 989 TDGTYSIIQKGETGPAGPRGPVGERGPTGPMGPRGEQGLKGDMGPAG---PQGPQGTAGA 1045
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP G GP+G GP G GP G GP+G GP G G +G
Sbjct: 1046 RGPKGDRGETGPAGPAGPTGPQGEKGDQGPMG---PAGPAGERGERGPKGDRGPKGDTGE 1102
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRY- 174
GP+G + GP+G GP+G G G G +G + GP G LR
Sbjct: 1103 RGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPRGEQGLRGE 1162
Query: 175 ---LGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G
Sbjct: 1163 RGPAGPRGETGLTGPRG 1179
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/175 (31%), Positives = 66/175 (37%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G GP+G GP G GP G GP+G GP G
Sbjct: 1038 GPQGTAGARGPKGDRGETGPAGPAGPTGPQGEKGDQGPMGPA---GPAGERGERGPKGDR 1094
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G GP+G + GP+G GP+G G G G +G + GP
Sbjct: 1095 GPKGDTGERGATGPAGPMGPAGPAGERGAPGPAGPKGDAGEKGDKGARGEAGPMGPQGPR 1154
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G G GP G GP G +GP G G G GP+G
Sbjct: 1155 GEQGLRGERG---PAGPRGETGLTGPRG---PVGPQGTPGTQGQKGDKGDPGPAG 1203
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/132 (31%), Positives = 54/132 (40%), Gaps = 9/132 (6%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GP G GP G GP+G + GP+G + GP+G GP G G +G
Sbjct: 1234 VAGPKGDRGEAGPRGEA---GPAGPVGAQGPTGPMGPAGPAGERGEQGPKGDTGERGATG 1290
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
GP G GP+ GP G GP G GP+G G G+ G
Sbjct: 1291 PAGPAGPRGDRGETGPA------GPRGPAGAAGPQGVPGPAGPAGARGERGEPGQTGPAG 1344
Query: 168 PSGRLRYLGPSG 179
P G + +GP+G
Sbjct: 1345 PRGPVGPMGPAG 1356
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 42/132 (31%), Positives = 54/132 (40%), Gaps = 9/132 (6%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP G GP G GP+G + GP+G + GP+G GP G G +G
Sbjct: 1234 VAGPKGDRGEAGPRGEA---GPAGPVGAQGPTGPMGPAGPAGERGEQGPKGDTGERGATG 1290
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP G GP+ GP G GP G GP+G G G+ G
Sbjct: 1291 PAGPAGPRGDRGETGPA------GPRGPAGAAGPQGVPGPAGPAGARGERGEPGQTGPAG 1344
Query: 150 PSGRLRYLGPSG 161
P G + +GP+G
Sbjct: 1345 PRGPVGPMGPAG 1356
>gi|55742776|ref|NP_001006952.1| collagen alpha-1(II) chain precursor [Canis lupus familiaris]
gi|10947027|gb|AAC62178.2| type IIA procollagen [Canis lupus familiaris]
Length = 1487
Score = 39.3 bits (90), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|30023|emb|CAA68709.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 765
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/156 (31%), Positives = 62/156 (39%), Gaps = 3/156 (1%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
GS +GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G +
Sbjct: 454 GSPGNIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHA 513
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G +G GP G GP G G G DGP G GPSG +G G
Sbjct: 514 GLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPDGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGE- 572
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
R L G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 573 RGL--HGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 63/158 (39%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +G
Sbjct: 411 DGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPVGL 470
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 471 PGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGA 530
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 531 QGPPGPQGVQGGKGEQGPDGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
>gi|410964223|ref|XP_003988655.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 4 [Felis catus]
Length = 1443
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
>gi|421639341|ref|ZP_16079934.1| hypothetical protein BABF1_19764 [Bacillus anthracis str. BF1]
gi|403393760|gb|EJY91003.1| hypothetical protein BABF1_19764 [Bacillus anthracis str. BF1]
Length = 287
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 21/70 (30%), Positives = 33/70 (47%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+G +G GP+GS+ G +G+ GP+G G +G+ GP+G G +G
Sbjct: 211 IGSTGATGETGPTGSMGATGNTGATGETGPTGSTGVTGNTGATGETGPTGNTGATGNTGP 270
Query: 73 LRYLGPSGSL 82
G +GS
Sbjct: 271 TGETGVTGST 280
>gi|423529735|ref|ZP_17506180.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuB1-1]
gi|402448217|gb|EJV80065.1| exosporium leader peptide [Bacillus cereus HuB1-1]
Length = 282
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/210 (24%), Positives = 79/210 (37%), Gaps = 33/210 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG-------------------- 53
GP+G G +G GP G G +G +GP+G
Sbjct: 37 GPTGETGPTGITGPTGETGPIGVTGPTGITGLTGEMGPTGITGLTGETGPTGITGATGGT 96
Query: 54 -SLRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
+ GP+G +GP+G G +G G +G +G +G GP+G
Sbjct: 97 GPIGVTGPTGITGLTGEMGPTGITGLTGETGPTGITGATGITGSIGETGPTGITGPTGET 156
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGR---LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-RLRY 165
G +G + GP+G + GP+G GP+G + + + L Y G +L Y
Sbjct: 157 GPTGETGSIGITGPTGATGITGAKGPTGETGATGPTGGIGPITTTNLLYYTFADGEKLIY 216
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G +Y G L PS + Y+ L
Sbjct: 217 TDADGIPQY----GTTNILSPS-EVSYINL 241
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/183 (26%), Positives = 78/183 (42%), Gaps = 7/183 (3%)
Query: 24 PSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
P+G+ G +G GP+G +G +G G +G + G +G GP+G
Sbjct: 32 PTGATGPTGETGPTGITGPTGETGPIGVTGPTGITGLTGEMGPTGITGLTGETGPTGITG 91
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
G +G + GP+G +GP+G G +G G +G S G +G G
Sbjct: 92 ATGGTGPIGVTGPTGITGLTGEMGPTGITGLTGETGPTGITGATGITGSIGETGPTGITG 151
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSD 197
P+G G +G + GP+G GP+G GP+G + + + L Y +D
Sbjct: 152 PTGETGPTGETGSIGITGPTGATGITGAKGPTGETGATGPTGGIGPI-TTTNLLYYTFAD 210
Query: 198 GLR 200
G +
Sbjct: 211 GEK 213
>gi|344267878|ref|XP_003405792.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: collagen alpha-1(II) chain-like
[Loxodonta africana]
Length = 1487
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|443722825|gb|ELU11530.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_123042, partial [Capitella teleta]
Length = 179
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/109 (37%), Positives = 52/109 (47%), Gaps = 7/109 (6%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGS---LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 79
GP+GS GP+GS + GPSG GP G GP+GR GP+G + GP
Sbjct: 4 GPNGSEGPRGPTGSKGPIGQPGPSGPSGLQGPEGPQGPSGPTGRP---GPTGPVGPTGPE 60
Query: 80 GSLRYLGPSGRL-RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G GP+G L GP+G G GR +G SG GP+G+
Sbjct: 61 GPDGPAGPAGPLGAAEGPTGPSGPRGADGREGPMGLSGPTGPTGPAGQT 109
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/115 (35%), Positives = 54/115 (46%), Gaps = 10/115 (8%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+GS GP+G +G GPSG GP G GP+GR GP+G +
Sbjct: 4 GPNGSEGPRGPTGSKGPIG------QPGPSGPSGLQGPEGPQGPSGPTGRP---GPTGPV 54
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G GP+G L + +GP+G G GR +G SG GP+G+
Sbjct: 55 GPTGPEGPDGPAGPAGPLGAAEGPTGPSGPRGADGREGPMGLSGPTGPTGPAGQT 109
>gi|388453461|ref|NP_001253266.1| collagen alpha-2(I) chain precursor [Macaca mulatta]
gi|383413767|gb|AFH30097.1| collagen alpha-2(I) chain precursor [Macaca mulatta]
Length = 1366
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGAR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/183 (30%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SG 125
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLPG 577
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G +G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAAGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
>gi|376268363|ref|YP_005121075.1| flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus cereus
F837/76]
gi|364514163|gb|AEW57562.1| Flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus cereus
F837/76]
Length = 421
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/114 (33%), Positives = 53/114 (46%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 152 GVTGATGATGPTGDPGPTGPTGDPGPTGLTGDSGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDP 211
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G + GP+G L
Sbjct: 212 GPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGATGPTGDL 265
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/114 (33%), Positives = 52/114 (45%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G +G+ GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 152 GVTGATGATGPTGDPGPTGPTGDPGPTGLTGDSGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDP 211
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G L
Sbjct: 212 GPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGATGPTGDL 265
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/126 (31%), Positives = 56/126 (44%), Gaps = 5/126 (3%)
Query: 7 VEKALNLGP-----SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
V + +N+ P +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+
Sbjct: 140 VIQLINVTPIPTGVTGATGATGPTGDPGPTGPTGDPGPTGLTGDSGPTGPTGDPGPTGPT 199
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 200 GDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGAT 259
Query: 122 GPSGRL 127
GP+G L
Sbjct: 260 GPTGDL 265
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/121 (32%), Positives = 53/121 (43%), Gaps = 6/121 (4%)
Query: 60 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 119
P+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 150 PTGVTGATGATGPTGDPGPTGPTGDPGPTGLTGDSGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTG 209
Query: 120 YLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP+G GP+ GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 210 DPGPTGPTGDPGPT------GPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGATGPTG 263
Query: 180 R 180
Sbjct: 264 D 264
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/114 (33%), Positives = 51/114 (44%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G +G GP+G GP+G G +G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 152 GVTGATGATGPTGDPGPTGPTGDPGPTGLTGDSGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDP 211
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G L
Sbjct: 212 GPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGATGPTGDL 265
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/121 (32%), Positives = 53/121 (43%), Gaps = 6/121 (4%)
Query: 33 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
P+G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 150 PTGVTGATGATGPTGDPGPTGPTGDPGPTGLTGDSGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTG 209
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G GP+G GP+G GP+G GP+ GP+G GP+G
Sbjct: 210 DPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPTGPTGDPGPT------GPTGDPGATGPTG 263
Query: 153 R 153
Sbjct: 264 D 264
>gi|148229056|ref|NP_001081260.1| collagen, type II, alpha 1 precursor [Xenopus laevis]
gi|214044|gb|AAA49679.1| alpha-1 type II' collagen [Xenopus laevis]
Length = 1491
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/148 (30%), Positives = 52/148 (35%), Gaps = 18/148 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP GS G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 833 GPPGPAGFAGPPGSDGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVNGPKGAR 892
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP+G+ + G +GR+ GP G GP+GR G
Sbjct: 893 GAQGPAGATGFPGAAGRVGTPGPNGNPGPPGPPGSAGKEGPKGVRGDAGPTGRAGDPGLQ 952
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 953 GPAGAPGEKGEPGEDGPSGPDGPSGPQG 980
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 57/166 (34%), Gaps = 18/166 (10%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G + G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 815 GPPGIVGARGAPGDRGENGPPGPAGFAGPPGSDGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPS 874
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------------------DGPS 133
GP G GP G GP+G + G +GR+ + +GP
Sbjct: 875 GAPGPQGPTGVNGPKGARGAQGPAGATGFPGAAGRVGTPGPNGNPGPPGPPGSAGKEGPK 934
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 935 GVRGDAGPTGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGEDGPSGPDGPSGPQG 980
>gi|426224601|ref|XP_004006457.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Ovis aries]
Length = 1488
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|410964227|ref|XP_003988657.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 6 [Felis catus]
Length = 1459
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/132 (32%), Positives = 49/132 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 782 GPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAPGPQGPS 841
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP G DGP
Sbjct: 842 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGSNGNPGPPGPPGPSGKDGPK 901
Query: 134 GRLRYLGPSGRL 145
G GP GR
Sbjct: 902 GARGDSGPPGRA 913
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|27924402|gb|AAH44962.1| Col2a1b protein [Xenopus laevis]
Length = 1491
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/148 (30%), Positives = 52/148 (35%), Gaps = 18/148 (12%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G + GP GS G G G G GP G GP G GP G
Sbjct: 833 GPPGPAGFAGPPGSDGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVNGPKGAR 892
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRY------------------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP+G+ + G +GR+ GP G GP+GR G
Sbjct: 893 GAQGPAGATGFPGAAGRVGTPGPNGNPGPPGPPGSAGKEGPKGVRGDAGPTGRAGDPGLQ 952
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
G G G DGPSG GP G
Sbjct: 953 GPAGAPGEKGEPGEDGPSGPDGPSGPQG 980
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/166 (28%), Positives = 57/166 (34%), Gaps = 18/166 (10%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP G + G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 815 GPPGIVGARGAPGDRGENGPPGPAGFAGPPGSDGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPS 874
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------------------DGPS 133
GP G GP G GP+G + G +GR+ + +GP
Sbjct: 875 GAPGPQGPTGVNGPKGARGAQGPAGATGFPGAAGRVGTPGPNGNPGPPGPPGSAGKEGPK 934
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+GR G G G G GPSG GP G
Sbjct: 935 GVRGDAGPTGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGEDGPSGPDGPSGPQG 980
>gi|229048232|ref|ZP_04193800.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH676]
gi|228722957|gb|EEL74334.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus AH676]
Length = 351
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/113 (27%), Positives = 46/113 (40%), Gaps = 3/113 (2%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
+G +G GP+G G +G G +G+ G +G GP+G G +G
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGP 125
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP+G G +G S GP+G G +G G +G G +G
Sbjct: 126 T---GPTGATGSTGATGATGSTGPTGATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTG 175
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/120 (26%), Positives = 49/120 (40%), Gaps = 6/120 (5%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+G +G GP+G+ G +G G +G GP+G+ G +G G +G
Sbjct: 66 MGATGVTGDTGPTGATGITGATGPT---GATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGA 122
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP+G G +G GP+G + G +G G +G G +G GP
Sbjct: 123 TGPTGPTGATGSTGATGATGSTGPTG---ATGITGATGPTGATGSTGATGATGSTGVTGP 179
>gi|410964221|ref|XP_003988654.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 3 [Felis catus]
Length = 1443
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 757 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 816
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 817 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 861
>gi|423364956|ref|ZP_17342389.1| hypothetical protein IC3_00058 [Bacillus cereus VD142]
gi|401092395|gb|EJQ00524.1| hypothetical protein IC3_00058 [Bacillus cereus VD142]
Length = 315
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/184 (28%), Positives = 68/184 (36%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G +G G GPSG +GP GS +G G G G G G
Sbjct: 82 TGVTGAIGIQGIQGITGPSGPQGVIGPRGSQGVVGAVGVQGPQGNQGITGATGVEGPQGI 141
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRL---RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G + +GP+G G G + GP G G G GP+G G
Sbjct: 142 QGPQGEIGPIGPTGLTGPRGSQGSQGLMGEQGPQGIQGVQGIQGERGPAGPTGIQGIQGI 201
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
G + G +G G G + GP+G G G L GP+G G+ L
Sbjct: 202 PGPMGETGLTGIQGIQGMQGEIGPTGPTGIQGIQGVQGELGPTGPTGNTGIQGMQGDLGS 261
Query: 202 SGLH 205
SGL
Sbjct: 262 SGLQ 265
>gi|126352361|ref|NP_001075233.1| collagen alpha-1(II) chain precursor [Equus caballus]
gi|1480744|gb|AAB05773.1| type II collagen [Equus caballus]
Length = 1418
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|440897609|gb|ELR49258.1| Collagen alpha-1(II) chain, partial [Bos grunniens mutus]
Length = 1457
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 774 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 833
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 834 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 878
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 774 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 833
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 834 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 878
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 774 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 833
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 834 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 878
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 774 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 833
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 834 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 878
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 774 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 833
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 834 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 878
>gi|164414427|ref|NP_001106695.1| collagen alpha-1(II) chain isoform 2 precursor [Bos taurus]
gi|296487749|tpg|DAA29862.1| TPA: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Bos taurus]
Length = 1418
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|164414425|ref|NP_001001135.2| collagen alpha-1(II) chain isoform 1 precursor [Bos taurus]
gi|313104300|sp|P02459.4|CO2A1_BOVIN RecName: Full=Collagen alpha-1(II) chain; AltName: Full=Alpha-1
type II collagen; Flags: Precursor
gi|296487748|tpg|DAA29861.1| TPA: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Bos taurus]
Length = 1487
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|410964225|ref|XP_003988656.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 5 [Felis catus]
Length = 1459
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 773 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 832
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 833 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 877
>gi|410964219|ref|XP_003988653.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 2 [Felis catus]
Length = 1418
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 732 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 791
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 792 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 836
>gi|350596634|ref|XP_003484300.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like, partial [Sus scrofa]
Length = 831
Score = 38.9 bits (89), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 75/198 (37%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+
Sbjct: 376 GADGRAGVMGPPGSRGPTGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNVGPAGKEGPA 435
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 436 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 495
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 496 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGIPGEFGLPGPAGPR 555
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 556 GERGPPGESGAAGPAGPI 573
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 63/160 (39%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+
Sbjct: 376 GADGRAGVMGPPGSRGPTGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNVGPAGKEGPA 435
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 436 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 495
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GP+G +G
Sbjct: 496 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVG 535
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/152 (28%), Positives = 59/152 (38%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 425 NVGPAGKEGPAGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGEKGHAGLAG 484
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G + G+ G
Sbjct: 485 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEV---GKPGERG 541
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 542 IPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPAGPI 573
>gi|410964217|ref|XP_003988652.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain isoform 1 [Felis catus]
Length = 1487
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 41/105 (39%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 40/105 (38%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 39/105 (37%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 38/105 (36%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 801 GEKGEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDA 860
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 861 GAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 905
>gi|426227338|ref|XP_004007775.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain [Ovis aries]
Length = 1364
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 75/198 (37%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+
Sbjct: 407 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPA 466
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 467 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKAGEKGHAGLAGPRGAPGPDGNN 526
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G GP+G
Sbjct: 527 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEAGKPGERGIPGEFGLPGPAGAR 586
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 587 GERGPPGESGAAGPTGPI 604
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 63/160 (39%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+
Sbjct: 407 GADGRAGVMGPAGSRGATGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNIGPAGKEGPA 466
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 467 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKAGEKGHAGLAGPRGAPGPDGNN 526
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GP+G G
Sbjct: 527 GAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEAG 566
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/152 (29%), Positives = 60/152 (39%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 456 NIGPAGKEGPAGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKAGEKGHAGLAG 515
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G G +G+ G
Sbjct: 516 PRGAPGPDGNNGAQGPPGLQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAG---TAGEAGKPGERG 572
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 573 IPGEFGLPGPAGARGERGPPGESGAAGPTGPI 604
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/147 (29%), Positives = 59/147 (40%), Gaps = 15/147 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP GR G G Y G +G + G G +GP+G G G + +GP+G
Sbjct: 930 NDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNAGPVGAAGAPGPQGPVGPTGKHGSRGEPGPVGAVGPAG 989
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---------------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
+ GPSG G G GP G + G G +GP+G
Sbjct: 990 AVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGPRGLPGLKGHNGLQGLPGLAGHHGDQGAPGAVGPAG 1049
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP+G DG +G+ +GP+G
Sbjct: 1050 PRGPAGPTGPAGKDGRTGQPGAVGPAG 1076
>gi|1418930|emb|CAA98969.1| prepro-alpha2(I) collagen [Homo sapiens]
Length = 1366
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|315306687|gb|ADU04088.1| collagen-like protein [Pasteuria ramosa]
Length = 323
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/145 (32%), Positives = 62/145 (42%), Gaps = 23/145 (15%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPS--GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG-----SLRY 84
GP GS+ GPS GR+ GP G P G Y+GP G GP G +
Sbjct: 22 GPQGSIGPTGPSVIGRMGNKGPDG------PRGPQGYIGPVG---LPGPQGLPGINGISI 72
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL-------GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
GP+G + +GP G G +G++ + GP+G + +G G S GP G +
Sbjct: 73 TGPTGLMGAIGPVGLRGITGTTGKMGPVIFITGPTGPTGSIGDMGEPGIPGSQGPQGPIG 132
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G G G GPSG
Sbjct: 133 NTGPMGSQGLQGNQGEQGQDGPSGD 157
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/164 (31%), Positives = 68/164 (41%), Gaps = 25/164 (15%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS--GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 88
+GP G + GP G GP GS+ GPS GR+ GP G P G Y+GP
Sbjct: 5 IGPKGPIGPRGPQGLPG--GPQGSIGPTGPSVIGRMGNKGPDG------PRGPQGYIGPV 56
Query: 89 GRLRYLGPSGR-----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS-------DGPSGRL 136
G GP G + GP+G + +GP G G +G++ GP+G +
Sbjct: 57 G---LPGPQGLPGINGISITGPTGLMGAIGPVGLRGITGTTGKMGPVIFITGPTGPTGSI 113
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G G GP G + GP G G G GPSG
Sbjct: 114 GDMGEPGIPGSQGPQGPIGNTGPMGSQGLQGNQGEQGQDGPSGD 157
>gi|195729001|gb|ACG50745.1| VtaA27 [Haemophilus parasuis]
Length = 1645
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP G +GP+G P G G G GP +GP G
Sbjct: 694 DTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAG------PKGEAGAKGDKGDTGEAGP------IGPQG 741
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G G +G+ GP+G + GP+G G
Sbjct: 742 PAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPG 792
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP G +GP G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 793 PAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMG 849
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/182 (31%), Positives = 73/182 (40%), Gaps = 18/182 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSG-----SLR-YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 67
GP+G GP+G L+ GP+G GP G +GP+G G G
Sbjct: 672 GPAGPTDAQGPAGPRGEQGLKGDTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAGPKGEAGAKGDK--- 728
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +G +GP G GP G GP G GP G G +G+ GP+G +
Sbjct: 729 GDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPV 782
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP+G GP+G GP G +GP G GP G G +G GP
Sbjct: 783 ---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPK 839
Query: 188 GR 189
G
Sbjct: 840 GD 841
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/157 (31%), Positives = 62/157 (39%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G +GP G GP G GP G GP G G +G+
Sbjct: 720 GEAGAKGDKGDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQK 773
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G + GP+G GP+G GP G +GP G GP G G +
Sbjct: 774 GETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQA 830
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 831 GPKGDTGPKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 864
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 60/150 (40%), Gaps = 12/150 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G +GP G GP G GP G GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 727 DKGDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAG 780
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G GP+G GP G +GP G GP G G +G G
Sbjct: 781 PV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTG 837
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P G GP G GP G GP+G
Sbjct: 838 PKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 864
>gi|32451581|gb|AAH54498.1| Collagen, type I, alpha 2 [Homo sapiens]
gi|45708783|gb|AAH42586.1| Collagen, type I, alpha 2 [Homo sapiens]
gi|119597202|gb|EAW76796.1| collagen, type I, alpha 2, isoform CRA_c [Homo sapiens]
gi|168277724|dbj|BAG10840.1| collagen alpha-2(I) chain precursor [synthetic construct]
Length = 1366
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|229124295|ref|ZP_04253486.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
95/8201]
gi|228659196|gb|EEL14845.1| Collagen triple helix repeat domain protein [Bacillus cereus
95/8201]
Length = 329
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/151 (29%), Positives = 63/151 (41%), Gaps = 15/151 (9%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
GP+GS G +G P+GS G +G GP+G G +G+ G +G
Sbjct: 1 MTGPTGSTGVTGSTG------PTGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTG 54
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
GP+G G +G GP+G G +G S G +G GP+G + G
Sbjct: 55 NT---GPTGNTGATGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGPTGSIGATG 111
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
+G GP+G G +G GP+G
Sbjct: 112 ATGS---TGPTGSTGATGVTGN---TGPTGS 136
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/145 (29%), Positives = 62/145 (42%), Gaps = 12/145 (8%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLG---PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 77
GP+GS G P+GS G +G GP+GS G +G G +G G
Sbjct: 1 MTGPTGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNT---G 57
Query: 78 PSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLR 137
P+G+ G +G GP+G G +G G +G GP+G + + G +G
Sbjct: 58 PTGNTGATGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGPTGSIGATGATGS-- 115
Query: 138 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP+G G +G GP+G
Sbjct: 116 -TGPTGSTGATGVTGN---TGPTGS 136
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/141 (29%), Positives = 60/141 (42%), Gaps = 9/141 (6%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G +G GP+GS G +G GP+G G +G+ G +G GP+G
Sbjct: 5 TGSTGVTGSTGPTGSTGATGNTGPTGETGPTGSTGVTGNTGATGSTGVTGNT---GPTGN 61
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G+ GP+G G +G G +G GP+G +G +G S GP
Sbjct: 62 TGATGATGATGSTGPTGSTGVTGSTGATGSTGVTGNTGATGPTGS---IGATGATGSTGP 118
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 153
+G G +G GP+G
Sbjct: 119 TGSTGATGVTGN---TGPTGS 136
>gi|195728965|gb|ACG50744.1| VtaA17 [Haemophilus parasuis]
Length = 1655
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/177 (31%), Positives = 68/177 (38%), Gaps = 21/177 (11%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ GP+G GP G +GP+G P G G G GP +GP G
Sbjct: 704 DTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAG------PKGEAGAKGDKGDTGEAGP------IGPQG 751
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G GP G GP G G +G+ GP+G + GP+G G
Sbjct: 752 PAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPG 802
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
P+G GP G +GP G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 803 PAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMG 859
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/180 (31%), Positives = 72/180 (40%), Gaps = 24/180 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS--LR-YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G GP+G+ GP G L+ GP+G GP G +GP+G P
Sbjct: 675 VGPEGPRGPAGPTGAQGPAGPRGEQGLKGDTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAG------P 728
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G G GP +GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 729 KGEAGAKGDKGDTGEAGP------IGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK-- 777
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G+ GP+G + GP+G GP+G GP G +GP G GP G
Sbjct: 778 -GDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGD 833
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/159 (31%), Positives = 63/159 (39%), Gaps = 12/159 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G GP G +GP+G G G G +G +GP G GP G
Sbjct: 705 TGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAGPKGEAGAKGDK---GDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGE 761
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G G +G+ GP+G + GP+G GP+G GP
Sbjct: 762 Q---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGP 812
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +GP G GP G G +G GP G
Sbjct: 813 KGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGD 851
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/157 (31%), Positives = 62/157 (39%), Gaps = 12/157 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G G +G +GP G GP G GP G GP G G +G+
Sbjct: 730 GEAGAKGDKGDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQK 783
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP+G + GP+G GP+G GP G +GP G GP G G +
Sbjct: 784 GETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQA 840
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 841 GPKGDTGPKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 874
Score = 35.8 bits (81), Expect = 10.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/150 (32%), Positives = 60/150 (40%), Gaps = 12/150 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G +GP G GP G GP G GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 737 DKGDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAG 790
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ GP+G GP+G GP G +GP G GP G G +G G
Sbjct: 791 PV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTG 847
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
P G GP G GP G GP+G
Sbjct: 848 PKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 874
>gi|351695700|gb|EHA98618.1| Collagen alpha-2(I) chain [Heterocephalus glaber]
Length = 1363
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/152 (30%), Positives = 62/152 (40%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 455 NVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHPGLAG 514
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G G
Sbjct: 515 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPTGEVGKPGER---G 571
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G +GPSG +
Sbjct: 572 LPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAVGPSGPI 603
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/156 (31%), Positives = 63/156 (40%), Gaps = 3/156 (1%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL 94
GS +GP+G+ +G G GP G G +G + + GP G G +G +
Sbjct: 451 GSPGNVGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHP 510
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G +G GP G GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 511 GLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPTGEVGKPGE- 569
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
R L G GP+G GP G +GPSG +
Sbjct: 570 RGL--PGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAVGPSGPI 603
>gi|426356959|ref|XP_004045817.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain [Gorilla gorilla gorilla]
Length = 1366
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 59/132 (44%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G G +G G SG +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGLKGHNGLQGLPGIAGHHGDQGASG---SVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|297681047|ref|XP_002818294.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 1 [Pongo abelii]
Length = 1366
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPSGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPSGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
>gi|74144541|dbj|BAE36107.1| unnamed protein product [Mus musculus]
Length = 1372
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 391 GEAGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEP 450
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G
Sbjct: 451 GLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDP 510
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 511 GKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTT 570
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 571 GEVG 574
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/174 (31%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 464 NVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAG 523
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G G
Sbjct: 524 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGER---G 580
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G G G GPSG + GPSG GP G G
Sbjct: 581 LPGEFGLPGPAGPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSG---APGPDGNKGEAG 631
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GPSG+ +
Sbjct: 415 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPV 474
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 475 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNN 534
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 535 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGE 578
>gi|111120329|ref|NP_031769.2| collagen alpha-2(I) chain precursor [Mus musculus]
gi|17865659|sp|Q01149.2|CO1A2_MOUSE RecName: Full=Collagen alpha-2(I) chain; AltName: Full=Alpha-2 type
I collagen; Flags: Precursor
gi|13938086|gb|AAH07158.1| Collagen, type I, alpha 2 [Mus musculus]
gi|37514842|gb|AAH42503.2| Collagen, type I, alpha 2 [Mus musculus]
gi|74144285|dbj|BAE36010.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|74144287|dbj|BAE36011.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|74144291|dbj|BAE36013.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|74145402|dbj|BAE36150.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|74179829|dbj|BAE36488.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|74197009|dbj|BAE35059.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|74208906|dbj|BAE21203.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|74224835|dbj|BAE37930.1| unnamed protein product [Mus musculus]
gi|148682036|gb|EDL13983.1| procollagen, type I, alpha 2 [Mus musculus]
Length = 1372
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 391 GEAGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEP 450
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G
Sbjct: 451 GLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDP 510
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 511 GKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTT 570
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 571 GEVG 574
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/174 (31%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 464 NVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAG 523
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G G
Sbjct: 524 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGER---G 580
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G G G GPSG + GPSG GP G G
Sbjct: 581 LPGEFGLPGPAGPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSG---APGPDGNKGEAG 631
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GPSG+ +
Sbjct: 415 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPV 474
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 475 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNN 534
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 535 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGE 578
>gi|160933902|ref|ZP_02081289.1| hypothetical protein CLOLEP_02764 [Clostridium leptum DSM 753]
gi|156866575|gb|EDO59947.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium leptum DSM 753]
Length = 371
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/174 (30%), Positives = 70/174 (40%), Gaps = 22/174 (12%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSG--SLRYLGPSGRLRYLGP------------SGRLRYLGPSG 80
G+ GP+G GP+G L GP+G GP G GP+G
Sbjct: 26 GATGATGPTGATGTAGPTGPAGLGITGPTGA---AGPRGATGPAGAAGPQGATGATGPTG 82
Query: 81 SLRYLGPSGR--LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
+ GP+G L GP+G G +G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 83 ATGTAGPTGPAGLGITGPTGAAGPRGATGPTGAAGPQGATGATGPTGATGAAGPTGPAG- 141
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYLGPSGRL 190
LG +G GP G G +G GP+G GP+G L GP+G
Sbjct: 142 LGITGPTGAAGPRGATGPAGAAGPQGATGPTGATGAAGPTGPAGLGITGPTGAA 195
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/219 (26%), Positives = 80/219 (36%), Gaps = 52/219 (23%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSG--SLRYLGPSGRLRYLGP------------SGSLRYLGPSG 62
G GP+G+ GP+G L GP+G GP G+ GP+G
Sbjct: 26 GATGATGPTGATGTAGPTGPAGLGITGPTGAA---GPRGATGPAGAAGPQGATGATGPTG 82
Query: 63 RLRYLGPSGR--LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--L 118
GP+G L GP+G+ G +G GP G GP+G GP+G L
Sbjct: 83 ATGTAGPTGPAGLGITGPTGAAGPRGATGPTGAAGPQGATGATGPTGATGAAGPTGPAGL 142
Query: 119 RYLGPSGRLN---------------SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP---- 159
GP+G + GP+G GP+G LG +G GP
Sbjct: 143 GITGPTGAAGPRGATGPAGAAGPQGATGPTGATGAAGPTGPAG-LGITGPTGAAGPRGAT 201
Query: 160 --------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP+G GP+G + G +G
Sbjct: 202 GPAGAAGPQGATGATGPTGA---TGPTGVMGPTGAAGEA 237
>gi|74144331|dbj|BAE36029.1| unnamed protein product [Mus musculus]
Length = 1241
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 260 GEAGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEP 319
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G
Sbjct: 320 GLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDP 379
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 380 GKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTT 439
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 440 GEVG 443
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/174 (31%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 333 NVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAG 392
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G G
Sbjct: 393 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGER---G 449
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G G G GPSG + GPSG GP G G
Sbjct: 450 LPGEFGLPGPAGPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSG---APGPDGNKGEAG 500
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GPSG+ +
Sbjct: 284 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPV 343
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 344 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNN 403
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 404 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGE 447
>gi|291227105|ref|XP_002733527.1| PREDICTED: fibrillar collagen [Saccoglossus kowalevskii]
Length = 2341
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/177 (31%), Positives = 72/177 (40%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
G GR G GS GP G + G +G + GPSG G SG GP G
Sbjct: 1317 AGEDGRRGERGEPGSQGTPGPQGEM---GAAGVRGFPGPSGPAGAKGESGEPGRPGPIGS 1373
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G +G +GP G G GR G G G G+ GPSGR + G
Sbjct: 1374 KGSSGNTGDSGEIGPQGGKGTTGDPGRAGQQGMPGARGLTGSPGK---EGPSGRPGTPGE 1430
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G+ GP+G G SG+ GP G GP+G G +G ++G +G+
Sbjct: 1431 PGKDGDPGPAGARGARGESGKDGDAGPVGPTGPRGPAGERGATGATGSPGFVGQTGQ 1487
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/172 (33%), Positives = 68/172 (39%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP GS GP GS G +G GP+G GP G G GR G GS
Sbjct: 1273 GPQGSNGATGPKGSQGNPGVAGMKGAQGPTGLTGDSGPRGLPGPAGEDGRRGERGEPGSQ 1332
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G +G +G + GPSG G SG GP G S G +G +GP
Sbjct: 1333 GTPGPQGE---MGAAGVRGFPGPSGPAGAKGESGEPGRPGPIGSKGSSGNTGDSGEIGPQ 1389
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G GR G +G GPSGR G G+ GP+G
Sbjct: 1390 GGKGTTGDPGRAGQQGMPGARGLTGSPGKEGPSGRPGTPGEPGKDGDPGPAG 1441
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/179 (30%), Positives = 74/179 (41%), Gaps = 6/179 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+G +G + GPSG G SG GP G G +G +GP G G G
Sbjct: 1340 EMGAAGVRGFPGPSGPAGAKGESGEPGRPGPIGSKGSSGNTGDSGEIGPQGGKGTTGDPG 1399
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
R G G+ G G+ GPSGR G G+ GP+G G SG+ G
Sbjct: 1400 RAGQQGMPGARGLTGSPGKE---GPSGRPGTPGEPGKDGDPGPAGARGARGESGKDGDAG 1456
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
P G GP+G G +G ++G +G+ G G+ G G GP+G++
Sbjct: 1457 PVGPTGPRGPAGERGATGATGSPGFVGQTGQPGLPGEPGQPGEQGVQGE---AGPAGQI 1512
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/165 (32%), Positives = 68/165 (41%), Gaps = 6/165 (3%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
G GS GP G + G +G + GPSG G SG GP GS G +G
Sbjct: 1327 GEPGSQGTPGPQGEM---GAAGVRGFPGPSGPAGAKGESGEPGRPGPIGSKGSSGNTGDS 1383
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
+GP G G GR G G G G+ +GPSGR G G+ GP+
Sbjct: 1384 GEIGPQGGKGTTGDPGRAGQQGMPGARGLTGSPGK---EGPSGRPGTPGEPGKDGDPGPA 1440
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G SG+ GP G GP+G G +G ++G +
Sbjct: 1441 GARGARGESGKDGDAGPVGPTGPRGPAGERGATGATGSPGFVGQT 1485
>gi|171544947|ref|NP_001116390.1| collagen type I alpha 1 precursor [Oryzias latipes]
gi|158936960|dbj|BAF91497.1| collagen type I alpha 1 [Oryzias latipes]
Length = 1446
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/148 (31%), Positives = 61/148 (41%), Gaps = 6/148 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G G G+ +GP GS G +G G +GS GP G+ G
Sbjct: 483 GPAGAKGAPGERGAPGLVGPKGSTGEPGRTGEPGLPGAKGMTGSPGSPGPDGKTGPAGAP 542
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G+ GP GS+ G G + + GP G G G +GP+G G G
Sbjct: 543 GQDGRPGPPGSVGARGQPGVMGFPGPKGAAGDAGKPGERGVMGPTGPAGAPGKDGDSGPQ 602
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 158
GPSG GP+G GP+G + G
Sbjct: 603 GPSG---PSGPAGERGEQGPAGAPGFQG 627
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/158 (29%), Positives = 62/158 (39%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 34 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 93
+GS GP G+ G G GP G + G G + + GP G+ G G
Sbjct: 524 TGSPGSPGPDGKTGPAGAPGQDGRPGPPGSVGARGQPGVMGFPGPKGAAGDAGKPGERGV 583
Query: 94 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGP 150
+GP+G G G GPSG GP+G GP+G + GP G + G
Sbjct: 584 MGPTGPAGAPGKDGDSGPQGPSG---PSGPAGERGEQGPAGAPGFQGLPGPQGAIGEPGK 640
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G G + G G +GP+G
Sbjct: 641 PGEQGLPGDAGAPGLTGARGDRGFPGERGAPGPVGPAG 678
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/175 (28%), Positives = 67/175 (38%), Gaps = 9/175 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G+ G G GP GS+ G G + + GP G+ G G +GP+G
Sbjct: 531 GPDGKTGPAGAPGQDGRPGPPGSVGARGQPGVMGFPGPKGAAGDAGKPGERGVMGPTGPA 590
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G GPSG GP+G GP+G + G GP G + G
Sbjct: 591 GAPGKDGDSGPQGPSG---PSGPAGERGEQGPAGAPGFQG------LPGPQGAIGEPGKP 641
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G +G G G + G G +GP+G G +G G +G
Sbjct: 642 GEQGLPGDAGAPGLTGARGDRGFPGERGAPGPVGPAGARGSPGSAGNDGAKGDAG 696
>gi|444726060|gb|ELW66608.1| Collagen alpha-2(V) chain [Tupaia chinensis]
Length = 1394
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/194 (30%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 28/194 (14%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
+G +GS GP+G + +GP G G GR LGP G LG +GS + G G
Sbjct: 259 EVGATGSKGEAGPTGPMGAMGPLGPRGMPGERGR---LGPQGAPGPLGLAGSPGFPGNPG 315
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD------GPSGRL------- 136
GP+G GP G+ GP G + G G + +D GP+G
Sbjct: 316 MKGEAGPTGARGPEGPQGQRGETGPPGPVGSQGLPGAIGTDGTPGAKGPTGSQGTSGPPG 375
Query: 137 -----------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
GP G GP G +GP G GP G +GP G + G
Sbjct: 376 SAGPPGSPGPQGSTGPQGIRGQPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERG 435
Query: 186 PSGRLRYLGLSDGL 199
G + G SDGL
Sbjct: 436 APGNRGFPG-SDGL 448
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 61/213 (28%), Positives = 78/213 (36%), Gaps = 28/213 (13%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP G + G G GP G++ LGP G LGP G+ LG +G + G
Sbjct: 255 GPKGEVGATGSKGEAGPTGPMGAMGPLGPRGMPGERGRLGPQGAPGPLGLAGSPGFPGNP 314
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR------YLGPSGRLRYLGPSGRL------ 118
G GP+G+ GP G+ GP G + +G G GP+G
Sbjct: 315 GMKGEAGPTGARGPEGPQGQRGETGPPGPVGSQGLPGAIGTDGTPGAKGPTGSQGTSGPP 374
Query: 119 ------------RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
GP G GP G +GP G GP G +GP G +
Sbjct: 375 GSAGPPGSPGPQGSTGPQGIRGQPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGER 434
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGL 199
G G + G G G G + G SDGL
Sbjct: 435 GAPGNRGFPGSDGLPGPKGAPGNRGFPG-SDGL 466
>gi|403257303|ref|XP_003921263.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain [Saimiri boliviensis
boliviensis]
Length = 1366
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/160 (31%), Positives = 65/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP+GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPAGSRGASGPAGVRGPSGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGSIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG LG
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGELG 568
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/149 (31%), Positives = 60/149 (40%), Gaps = 6/149 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGSIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG LG G L
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGELGKPGERGLPG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
D GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 578 DFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPAGPI 606
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPTGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGDKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGLAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|195728810|gb|ACG50724.1| VtaA10 precursor [Haemophilus parasuis str. Nagasaki]
Length = 1648
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/174 (31%), Positives = 69/174 (39%), Gaps = 15/174 (8%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG------SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
+ GP+G GP G +GP+G + G +G +GP G GP G
Sbjct: 703 DTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAGPKGEAGAKGDKGDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGEQ- 761
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP G G +G+ GP+G + GP G GP G +GP G
Sbjct: 762 --GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPVGPAGPQGVPGPAGPKGEAGPVGPQG 816
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+ GP G G +G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 817 PAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMGP---AGPKGETGSAGPAG 867
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/158 (31%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 9/158 (5%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G GP G +GP+G G G G +G +GP G GP G
Sbjct: 704 TGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAGPKGEAGAKGDK---GDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGE 760
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G G +G+ GP+G + GP G GP G +GP
Sbjct: 761 Q---GPKGEQGIQGPKGD---KGDTGQKGETGPAGPVGPAGPQGVPGPAGPKGEAGPVGP 814
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G GP G G +G GP G GP G
Sbjct: 815 QGPAGATGPKGDKGDPGQAGPKGDTGPKGDRGEAGPMG 852
>gi|50489|emb|CAA41205.1| pro-alpha-2(I) collagen [Mus musculus]
Length = 1373
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 72/184 (39%), Gaps = 6/184 (3%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP+G G GS G GR +GP G+ GP+G G +GR
Sbjct: 391 GEAGSAGPAGPPGLRGSPGSRGLPGADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEP 450
Query: 76 --LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
+GP GS +GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G
Sbjct: 451 GLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDP 510
Query: 131 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 511 GKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTT 570
Query: 191 RYLG 194
+G
Sbjct: 571 GEVG 574
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/174 (31%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 464 NVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAG 523
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G G
Sbjct: 524 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGER---G 580
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G GP+G G G GPSG + GPSG GP G G
Sbjct: 581 LPGEFGLPGPAGPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSG---APGPDGNKGEAG 631
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GPSG+ +
Sbjct: 415 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPV 474
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 475 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNN 534
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 535 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGE 578
>gi|229197469|ref|ZP_04324196.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1293]
gi|228586093|gb|EEK44184.1| Collagen-like triple helix repeat protein [Bacillus cereus m1293]
Length = 462
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/189 (28%), Positives = 64/189 (33%), Gaps = 18/189 (9%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP G G SG GP G GP G +GP+GS G G GP+G
Sbjct: 76 TGPQGIQGEQGLSGITGPTGPQGIQGIQGPQGN---IGPTGSTGIQGVQGPEGPTGPTGA 132
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPS---------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
G G GP+ G + GP G G +G G +G+
Sbjct: 133 TGPQGIQGIQGLQGPTGPQGIQGIQGIQGPIGPIGPTGPQGIQGITGSTGPTGATGATGQ 192
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G GP G G +G G G GP G G +G GP
Sbjct: 193 AGVTGPQGPQGIQGPQGVTGQTGATGETGATGSQGPQGIQGPQGITGSTGATGPTGATGP 252
Query: 178 SGRLRYLGP 186
+G GP
Sbjct: 253 TGPQGIQGP 261
>gi|5354049|gb|AAD42346.1| type II collagen cyanogen bromide fragment CB10 [Bos taurus]
Length = 347
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/102 (30%), Positives = 40/102 (39%)
Query: 44 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 103
G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 54 GEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAP 113
Query: 104 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 114 GPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 155
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/102 (30%), Positives = 39/102 (38%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 76
G + GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G
Sbjct: 54 GEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAP 113
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 114 GPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 155
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/102 (30%), Positives = 38/102 (37%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G + GP+G+ G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 54 GEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAP 113
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GP G GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 114 GPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 155
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/102 (30%), Positives = 38/102 (37%)
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G + GP+G G G GP G + GP G G G G G
Sbjct: 54 GEVGPPGPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGEAGQKGDAGAP 113
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
GP G + GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 114 GPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 155
>gi|343887367|ref|NP_001230584.1| collagen, type I, alpha 2 precursor [Sus scrofa]
Length = 1366
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 75/198 (37%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGPTGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNVGPAGKEGPA 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GP+G + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGERGIPGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPAGPI 606
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 63/160 (39%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G SGR +GP GS +GP+G+
Sbjct: 409 GADGRAGVMGPPGSRGPTGPAGVRGPNGDSGRPGEPGLMGPRGFPGSPGNVGPAGKEGPA 468
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GP+G +G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVG 568
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/152 (29%), Positives = 59/152 (38%), Gaps = 3/152 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NVGPAGKEGPAGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGEKGHAGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GP+G +G G G
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGER---G 574
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G GP+G +
Sbjct: 575 IPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPAGPI 606
>gi|325260864|gb|ADZ04657.1| collagen type I alpha 2 [Ambystoma mexicanum]
Length = 1362
Score = 38.5 bits (88), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/184 (32%), Positives = 71/184 (38%), Gaps = 3/184 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GPSG GP+G GP+G G G GP G +GP G GP+G
Sbjct: 368 NAGPSGEEGKRGPNGEPGSSGPAGPAGIRGVPGTRGLPGPDGRAGGMGPPGSRGSSGPAG 427
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GPSG G G L G G GP G+ GP+G G +G + G
Sbjct: 428 ---VRGPSGDAGRPGEPGLLGQRGLPGFPGNTGPVGKEGPAGPAGIEGRTGAAGPTGARG 484
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
G + + GP G G +G GPSG GP G GP G + G G
Sbjct: 485 EPGSIGFPGPKGPGGEPGKNGDKGSAGPSGARGAPGPDGNNGAQGPPGVVGNTGEKGEQG 544
Query: 192 YLGL 195
G
Sbjct: 545 PAGA 548
>gi|119597201|gb|EAW76795.1| collagen, type I, alpha 2, isoform CRA_b [Homo sapiens]
Length = 1039
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/196 (29%), Positives = 75/196 (38%), Gaps = 21/196 (10%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +G
Sbjct: 411 DGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPVGL 470
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G +
Sbjct: 471 PGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGA 530
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRLRY 174
GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 531 QGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPRGE 590
Query: 175 LGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 591 RGPPGESGAAGPTGPI 606
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 63/158 (39%), Gaps = 6/158 (3%)
Query: 43 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGP 96
GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +G
Sbjct: 411 DGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPVGL 470
Query: 97 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 156
G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 471 PGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNNGA 530
Query: 157 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 531 QGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 568
>gi|395818630|ref|XP_003782725.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain [Otolemur garnettii]
Length = 1364
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 63/132 (47%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G +G GS +GP+G G G + +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NVGPAG---AVGAPGSHGPVGPAGKHGNRGEPGAVGPVGPTGAVGPRGPSGAQGVRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G L L G L+ L G + G G +GP+G GPSG + DG
Sbjct: 1010 EPGDKGPRG-LPGLKGHGGLQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPVGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RNGHPGTVGPAG 1078
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/185 (31%), Positives = 72/185 (38%), Gaps = 6/185 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GPSG G GS G GR +GP G+ GP+G G SGR
Sbjct: 384 NGEPGSAGPSGPPGLRGSPGSRGLPGADGRGGVMGPPGNRGQSGPAGVRGPSGDSGRPGE 443
Query: 76 ---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
+GP GS +GP+G+ G G GP G G G + + GP G
Sbjct: 444 PGLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPAGLPGVDGRPGPVGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGD 503
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G +G + G +G GP G GP G G G GP G GPSG
Sbjct: 504 PGKAGDKGHPGLAGARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGP 563
Query: 190 LRYLG 194
+G
Sbjct: 564 AGEVG 568
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 73/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 458 NVGPAGKEGPAGLPGVDGRPGPVGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGDKGHPGLAG 517
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 518 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 577
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GPSG L GPSG G G +G G G
Sbjct: 578 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPSGPLGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAPGTAGPSG 637
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 638 PSG 640
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/198 (30%), Positives = 75/198 (37%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G SGR +GP GS +GP+G+
Sbjct: 409 GADGRGGVMGPPGNRGQSGPAGVRGPSGDSGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPAGKEGPA 468
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 469 GLPGVDGRPGPVGPAGARGEPGNIGFPGPKGPSGDPGKAGDKGHPGLAGARGAPGPDGNN 528
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 529 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 588
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GPSG L
Sbjct: 589 GERGPPGESGAAGPSGPL 606
>gi|395738734|ref|XP_003777140.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain isoform 2 [Pongo abelii]
Length = 1371
Score = 38.1 bits (87), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/198 (29%), Positives = 76/198 (38%), Gaps = 21/198 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 414 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPSGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 473
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 474 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 533
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRL 172
+ GP G G G GP G GPSG + GP+G
Sbjct: 534 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPR 593
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP G GP+G +
Sbjct: 594 GERGPPGESGAAGPTGPI 611
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/160 (31%), Positives = 64/160 (40%), Gaps = 6/160 (3%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 94
G GR +GP GS GP+G G +GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 414 GADGRAGVMGPPGSRGASGPAGVRGPSGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 473
Query: 95 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G GP G G G + + GP G G +G + G +G GP G
Sbjct: 474 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAGARGAPGPDGNN 533
Query: 155 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 194
GP G G G GP G GPSG +G
Sbjct: 534 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVG 573
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G+ +G G GP G G G + + GP G G +G + G +G
Sbjct: 463 NIGPAGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGARGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKNGDKGHAGLAG 522
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LNS 129
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G L+
Sbjct: 523 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEVGKPGERGLHG 582
Query: 130 D----GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
+ GP+G GP G GP+G + GPSG G G +G G G
Sbjct: 583 EFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPSG 642
Query: 186 PSG 188
PSG
Sbjct: 643 PSG 645
>gi|326324000|gb|ADZ54064.1| virulence-associated trimeric autotransporter [Haemophilus parasuis
SH0165]
Length = 1329
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/179 (31%), Positives = 72/179 (40%), Gaps = 24/179 (13%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS--LR-YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
+GP G GP+G+ GP G L+ GP+G GP G +GP+G P
Sbjct: 633 VGPEGPRGPAGPTGAQGPAGPRGEQGLKGDTGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAG------P 686
Query: 70 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
G G G GP +GP G GP G GP G GP G
Sbjct: 687 KGEAGAKGDKGDTGEAGP------IGPQGPAGAAGPKGEQ---GPKGEQGIQGPKG---D 734
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +G+ GP+G + GP+G GP+G GP G +GP G GP G
Sbjct: 735 KGDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGPKGEAGPVGPQGPAGPAGPQG 790
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/158 (32%), Positives = 64/158 (40%), Gaps = 12/158 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G GP G +GP+G G G G +G +GP G GP G
Sbjct: 663 TGPAGEPGKQGPRGEKGEIGPAGPKGEAGAKGDK---GDTGEAGPIGPQGPAGAAGPKGE 719
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
GP G GP G G +G+ GP+G + GP+G GP+G GP
Sbjct: 720 Q---GPKGEQGIQGPKGDK---GDTGQKGETGPAGPV---GPAGPQGVPGPAGPKGEAGP 770
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G +GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 771 KGEAGPVGPQGPAGPAGPQGPQGPAGPQGPTGPTGPAG 808
>gi|291226130|ref|XP_002733049.1| PREDICTED: collagen type XXVII proalpha 1 chain-like [Saccoglossus
kowalevskii]
Length = 1303
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/170 (31%), Positives = 69/170 (40%), Gaps = 12/170 (7%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G GS + G G++ Y GP +GP G + G G+ GP G G G
Sbjct: 135 GTHGSHGFTGQKGNMGYTGP------MGPEGEMGSPGEDGKPGLPGPKGEQGLPGQKGLQ 188
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP GR G G +G +G + +G G GP G + S GP G+ ++G
Sbjct: 189 GGTGPIGRQGPPGAIGHPGRVGETGAIGLMGLKGDEGPKGPKGMIGSPGPPGKTGHMGFR 248
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
GR G SG+ G G + GP G GP G Y G GR
Sbjct: 249 GR---QGDSGKPAPDGSPGEPGFAGRKGPPGIPGNEGPPGERGYPGSRGR 295
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/190 (31%), Positives = 77/190 (40%), Gaps = 15/190 (7%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRY---LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP 69
GP GR GP G++ + +G +G++ +G G GP G + GP G+ ++G
Sbjct: 191 TGPIGRQ---GPPGAIGHPGRVGETGAIGLMGLKGDEGPKGPKGMIGSPGPPGKTGHMGF 247
Query: 70 SGRLRYLG---PSGS------LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
GR G P GS GP G GP G Y G GR G G
Sbjct: 248 RGRQGDSGKPAPDGSPGEPGFAGRKGPPGIPGNEGPPGERGYPGSRGRKGLDGDIGLPGE 307
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
LG G S GP G G +G + G G G +GR G GR +GPSG
Sbjct: 308 LGEKGSRGSKGPGGETGDPGETGDIGLQGSMGEQGESGKNGRKGNKGIKGRPGPIGPSGP 367
Query: 181 LRYLGPSGRL 190
+G G+
Sbjct: 368 QGEMGAMGKT 377
>gi|357625680|gb|EHJ76043.1| putative Collagen alpha-1(XI) chain precursor [Danaus plexippus]
Length = 918
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/131 (33%), Positives = 53/131 (40%), Gaps = 6/131 (4%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP GS G G+ GP+G + GP G L + GP G GP G G G
Sbjct: 683 GPEGSPGTPGTPGQQ---GPAGDVGLPGPQGMLGFPGPRGLKGDDGPRGPPGDKGDKGIR 739
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
G G + G G GP+G GP G+ S+GP G +GP G GP
Sbjct: 740 GIEGEKGEMGQKGERGVAGEPGPAG---IEGPEGQKGSEGPRGETGSIGPVGEKGATGPQ 796
Query: 152 GRLRYLGPSGR 162
G Y G G
Sbjct: 797 GPSGYPGAQGE 807
>gi|405951824|gb|EKC19703.1| Collagen alpha-2(I) chain [Crassostrea gigas]
Length = 1321
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/194 (30%), Positives = 76/194 (39%), Gaps = 24/194 (12%)
Query: 14 GPSGR---LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+GR + G SGS G G G G GP G G G+ G
Sbjct: 742 GPTGRDGPQGFPGKSGSPGSQGTPGQDGITGMRGEPGSPGPRGQEGMPGNPGQPGQKGAR 801
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSD 130
G GP+G + LG SG + G G GP +GP+G + G +G+ SD
Sbjct: 802 GEDGAEGPTGPVGPLGNSGEVGLPGDPGTRGERGP------MGPAGAVGLPGEAGKSGSD 855
Query: 131 GPSGRLR---------YLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G+ +G G GP +GR GP+G + GPSG +
Sbjct: 856 GAPGKQGPQGPPGNPGSVGNVGSPGNPGPDGAPGITGRTGEKGPAGEMGQSGPSGLPGFA 915
Query: 176 GPSGRLRYLGPSGR 189
GP G GPSG
Sbjct: 916 GPPGVTGATGPSGE 929
>gi|206597434|ref|NP_001073182.2| collagen alpha-2(I) chain precursor [Gallus gallus]
Length = 1363
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/167 (29%), Positives = 67/167 (40%), Gaps = 12/167 (7%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP------SGSLRYLGPSGRL 64
G GR +GP+G+ GP G+ G +GR +GP GS G G +
Sbjct: 408 GADGRAGVMGPAGNRGASGPVGAKGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPV 467
Query: 65 RYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
+ G GR+ +GP+G+ G G + + GP G G G +G +G GP
Sbjct: 468 GFPGADGRVGPIGPAGNR---GEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGEKGNVGLAGPRGAPGPE 524
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
G + GP G G G GP G GPSG G G
Sbjct: 525 GNNGAQGPPGVTGNQGAKGETGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEAGKPGE 571
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/188 (29%), Positives = 71/188 (37%), Gaps = 12/188 (6%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
+G GP G G GS G GR +GP+G+ GP G G +GR
Sbjct: 383 NGEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMGPAGNRGASGPVGAKGPNGDAGRPGE 442
Query: 76 ---LGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
+GP GS G G + + G GR+ +GP+G G G + + GP G
Sbjct: 443 PGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPIGPAGN---RGEPGNIGFPGPKGP 499
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G +G +G GP G GP G G G GP G GP
Sbjct: 500 TGEPGKPGEKGNVGLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQGAKGETGPAGPPGFQGLPGP 559
Query: 187 SGRLRYLG 194
SG G
Sbjct: 560 SGPAGEAG 567
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/116 (35%), Positives = 53/116 (45%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL---RYLG 140
G +G LG SG GPSG + GP+G G G +DGP GR + G
Sbjct: 886 IAGATGEPGPLGVSGPPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKG 945
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GPSG L GP G+ +GPSG+ G G + +GP+G GL+
Sbjct: 946 ERGAPGNPGPSGALGAPGPHGQ---VGPSGKPGNRGDPGPVGPVGPAGAFGPRGLA 998
>gi|410676029|ref|YP_006928400.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis Bt407]
gi|452200087|ref|YP_007480168.1| Flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus thuringiensis
serovar thuringiensis str. IS5056]
gi|409175158|gb|AFV19463.1| collagen triple helix repeat protein [Bacillus thuringiensis Bt407]
gi|452105480|gb|AGG02420.1| Flagellar hook-length control protein FliK [Bacillus thuringiensis
serovar thuringiensis str. IS5056]
Length = 710
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 59/167 (35%), Gaps = 8/167 (4%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GPSG GP G GP G GP G+ GP+G GP G G +G+
Sbjct: 354 TGPSG-----GPQGPTGPQGPQGNTGATGPQGA---QGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 405
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G G +G G G G +G G +G + GP G G
Sbjct: 406 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 465
Query: 142 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
+G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 466 TGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 512
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/157 (28%), Positives = 55/157 (35%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G+ GP G+ GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 359 GPQGPTGPQGPQGNTGATGPQGAQ---GPAGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGVQ 415
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G +G+ G G G +G G +G GP G G +G G
Sbjct: 416 GNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQ 475
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 476 GNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 512
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/167 (29%), Positives = 59/167 (35%), Gaps = 8/167 (4%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GPSG GP G GP G+ GP G GP+G+ GP G G +G
Sbjct: 354 TGPSG-----GPQGPTGPQGPQGNTGATGPQG---AQGPAGATGATGPQGVQGNTGATGA 405
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G G +G G G G +G G +G GP G + G
Sbjct: 406 TGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGPQGVQGNTGA 465
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G G GP G G +G G G GP G
Sbjct: 466 TGATGPQGVQGNTGATGPQGAQGNTGATGATGPQGVQGNTGATGPQG 512
>gi|326925148|ref|XP_003208782.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXIV) chain-like [Meleagris gallopavo]
Length = 1509
Score = 38.1 bits (87), Expect = 2.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/91 (34%), Positives = 43/91 (47%)
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GS GP+G + G +G G G + GP G +G G L GP+G++ Y+
Sbjct: 1167 GSQGDQGPAGEVGAKGQTGEDGDQGLMGLQGFPGPKGPAGDVGLIGILGPKGPTGQIGYI 1226
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP G+ GP+GR G G +GP G
Sbjct: 1227 GPVGKEGITGPTGRPGPRGEKGTRGEMGPQG 1257
>gi|345326409|ref|XP_001509910.2| PREDICTED: collagen alpha-1(XXIV) chain, partial [Ornithorhynchus
anatinus]
Length = 1206
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/164 (32%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 5/164 (3%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G +GP+G + GP G+L GP G+ GP+G L +GP G G G
Sbjct: 991 GEKGQMGPAGEVGSTGPPGQLGEGGPKGARGTRGPAGPLGSMGPEGEPGIPGYGGHQGQP 1050
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GPSG GP G + G R GP G L GP G G G Y G G
Sbjct: 1051 GPSG---LPGPKGEKGFPGEDSGSR--GPPGALGEPGPIGERGDRGDHGDEGYKGHRGVP 1105
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ G G+ G G L G G GP G+ GP G+
Sbjct: 1106 GHRGAIGQQGPPGEPGDLGQPGLKGERGSQGPKGKKGASGPPGK 1149
>gi|403296321|ref|XP_003939060.1| PREDICTED: collagen alpha-3(V) chain [Saimiri boliviensis
boliviensis]
Length = 1608
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/130 (30%), Positives = 53/130 (40%), Gaps = 15/130 (11%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR---------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 92
GP G LGP G+ +GP G G G+ LGP G L
Sbjct: 794 QTGPPGPAGVLGPQGKTGEVGPLGERGSPGPPGPPGEQGLPGMEGREGAKGELGPPGPLG 853
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP+G + GP G G +G GP G + ++G G LGP+G + G SG
Sbjct: 854 KEGPTGPRGFPGPKGAPGDPGSTGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPLGPAGGIGLPGQSG 913
Query: 153 RLRYLGPSGR 162
+GP+G
Sbjct: 914 NQGPIGPAGE 923
>gi|18309937|ref|NP_561871.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens str.
13]
gi|18144615|dbj|BAB80661.1| collagen-like protein [Clostridium perfringens str. 13]
Length = 397
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/119 (31%), Positives = 46/119 (38%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 63 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPKGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 122
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGP 141
GP G + GP G GP G GP G G +G +GP+G GP
Sbjct: 123 GEQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGP 181
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/119 (31%), Positives = 45/119 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 63 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPKGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 122
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
GP G + GP G GP G GP G G +G GP+G GP
Sbjct: 123 GEQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGPTGPQGATGPQGPEGPTGAQGDQGP 181
>gi|110629866|gb|ABG80449.1| fibrillar collagen [Hydra vulgaris]
Length = 1476
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/184 (29%), Positives = 65/184 (35%), Gaps = 12/184 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G G GPSG G G G +G GP+G GP G +GP+G
Sbjct: 270 GNKGEQGEQGPSGEKGSSGKEGEKGQEGENGLKGDTGPAGPRGLQGPPGPQGQMGPTG-- 327
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+GP GS+ GP G G G GP G G G G G+ G
Sbjct: 328 -LMGPIGSIGLPGPQGSAGLPGTPGDQGERGPKGETGATGSRGERGEQGERGKAGEPGQK 386
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY---------LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
G LG GR + G G +GP G G G + GP G L
Sbjct: 387 GSKGPLGSRGRDGFRGDKGSSGSPGSQGPRGLVGPRGHQGLQGSDGSIGEPGPRGALGEQ 446
Query: 185 GPSG 188
GP G
Sbjct: 447 GPQG 450
>gi|432454144|ref|ZP_19696369.1| hypothetical protein A13W_05138 [Escherichia coli KTE193]
gi|430971302|gb|ELC88323.1| hypothetical protein A13W_05138 [Escherichia coli KTE193]
Length = 705
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/184 (31%), Positives = 74/184 (40%), Gaps = 19/184 (10%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
E+ PSG GP G GP+G GP G GP G P+G+
Sbjct: 449 AEEVATTRPSGE-SIPGPKGDRGEQGPAGPT---GPKGERGEPGPQG------PAGQKGE 498
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G G GP+G++ GP G GP G GP+G+ G G+ GP+G
Sbjct: 499 QGLRGLQGATGPAGAVGPAGPRGPAGAAGPKGDAGPAGPAGKDGTAGAEGKA---GPAGP 555
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
GP+G GP +GP+G GP G GP G G +G GP
Sbjct: 556 RGERGPAGAQGVPGP------VGPAGPAGKTGPQGPAGGRGPMGPPGVDGKTGPQGPQGP 609
Query: 187 SGRL 190
+GRL
Sbjct: 610 TGRL 613
>gi|82175621|sp|Q9YIB4.1|CO1A1_CYNPY RecName: Full=Collagen alpha-1(I) chain; AltName: Full=Alpha-1 type
I collagen; Flags: Precursor
gi|4140029|dbj|BAA36973.1| alpha 1 type I collagen [Cynops pyrrhogaster]
Length = 1450
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/105 (34%), Positives = 45/105 (42%), Gaps = 6/105 (5%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG GP+G+ G G GP+G GP G+ G G GP G
Sbjct: 771 GPSGPA---GPTGARGSPGERGEPGAPGPAG---ICGPPGADGQPGAKGESGDAGPKGDA 824
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP+G + GP G GP G + G +GRL
Sbjct: 825 GAPGPAGPTGAPGPAGNVGAPGPKGTRGAAGPPGATGFPGAAGRL 869
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/107 (33%), Positives = 46/107 (42%), Gaps = 6/107 (5%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GPSG GP+G+ G G GP+G GP G+ G G GP G
Sbjct: 771 GPSG---PAGPTGARGSPGERGEPGAPGPAG---ICGPPGADGQPGAKGESGDAGPKGDA 824
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRY 147
GP+G GP+G + GP G + GP G + G +GRL
Sbjct: 825 GAPGPAGPTGAPGPAGNVGAPGPKGTRGAAGPPGATGFPGAAGRLGP 871
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/107 (33%), Positives = 45/107 (42%), Gaps = 6/107 (5%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
GPSG GP+G+ G G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 771 GPSG---PAGPTGARGSPGERGEPGAPGPAG---ICGPPGADGQPGAKGESGDAGPKGDA 824
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 174
+ GP+G GP+G + GP G GP G + G +GRL
Sbjct: 825 GAPGPAGPTGAPGPAGNVGAPGPKGTRGAAGPPGATGFPGAAGRLGP 871
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/105 (34%), Positives = 44/105 (41%), Gaps = 6/105 (5%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GPSG GP+G G G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 771 GPSGPA---GPTGARGSPGERGEPGAPGPAG---ICGPPGADGQPGAKGESGDAGPKGDA 824
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
GP+G GP+G + + GP G GP G + G +GRL
Sbjct: 825 GAPGPAGPTGAPGPAGNVGAPGPKGTRGAAGPPGATGFPGAAGRL 869
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/107 (33%), Positives = 44/107 (41%), Gaps = 6/107 (5%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GPSG GP+G+ G G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 771 GPSGPA---GPTGARGSPGERGEPGAPGPAG---ICGPPGADGQPGAKGESGDAGPKGDA 824
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP+G + GP G GP G + G +GRL
Sbjct: 825 GAPGPAGPTGAPGPAGNVGAPGPKGTRGAAGPPGATGFPGAAGRLGP 871
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/184 (30%), Positives = 69/184 (37%), Gaps = 21/184 (11%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G+ G G GP G GP+G GP+G + GP G
Sbjct: 795 GPAG---ICGPPGADGQPGAKGESGDAGPKGDAGAPGPAGPTGAPGPAGNVGAPGPKGTR 851
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLR------------------YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 115
GP G+ + G +GRL G G GP+GR GP+
Sbjct: 852 GAAGPPGATGFPGAAGRLGPPGPSGNAGPPGPPGPGGKEGAKGSRGETGPAGRSGEPGPA 911
Query: 116 GRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 175
G G G SDGP+G GP G G G G G GP+G
Sbjct: 912 GPPGPSGEKGSPGSDGPAGAPGIPGPQGIAGQRGVVGLPGQRGERGFSGLPGPAGEPGKQ 971
Query: 176 GPSG 179
GPSG
Sbjct: 972 GPSG 975
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/105 (34%), Positives = 43/105 (40%), Gaps = 6/105 (5%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GPSG GP+G G G GP+G GP G G G GP G
Sbjct: 771 GPSG---PAGPTGARGSPGERGEPGAPGPAG---ICGPPGADGQPGAKGESGDAGPKGDA 824
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
GP+G GP+G + GP G GP G + G +GRL
Sbjct: 825 GAPGPAGPTGAPGPAGNVGAPGPKGTRGAAGPPGATGFPGAAGRL 869
>gi|242017800|ref|XP_002429374.1| collagen alpha-1 precursor, putative [Pediculus humanus corporis]
gi|212514287|gb|EEB16636.1| collagen alpha-1 precursor, putative [Pediculus humanus corporis]
Length = 1727
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/133 (30%), Positives = 50/133 (37%), Gaps = 3/133 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G +GP G + + G G G G+ G G GP G LG G
Sbjct: 626 NSGPKGDTGPVGPQGPVGFPGTRG---VKGDEGKRGPSGEKGEKGDRGPDGEKGDLGMKG 682
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP+G+ GP G + GP G GP G +G G Y G G G
Sbjct: 683 DRGVPGPAGATGLEGPEGPKGFEGPRGETGPPGPQGEKGKIGSPGFAGYPGAPGEKGDKG 742
Query: 132 PSGRLRYLGPSGR 144
GR+ G G
Sbjct: 743 TEGRIGQPGEKGD 755
>gi|159962|gb|AAA29440.1| 2-alpha collagen precursor (COLL 2-alpha), partial [Paracentrotus
lividus]
Length = 1051
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/141 (36%), Positives = 62/141 (43%), Gaps = 12/141 (8%)
Query: 21 YLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 80
GPSGS G SG +G G +G G++ GP G+ GP G + GP+G
Sbjct: 431 EAGPSGSQGRTGRSGPQGNMGARGSRGDVGNQGAI---GPMGQPGMNGPPGVVGEPGPAG 487
Query: 81 SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLG 140
+ GP+GR G GR GP G GP G + GP G S G GR +G
Sbjct: 488 PV---GPNGRP---GEDGRAGSRGPQGNQGLRGPPGVMGLSGPQG---SSGEDGRDGPMG 538
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
PSG L G G LG G
Sbjct: 539 PSGPLGPQGTPGTFGRLGAGG 559
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/141 (36%), Positives = 62/141 (43%), Gaps = 12/141 (8%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
GPSGS G SG +G G +G G++ GP G+ GP G + GP+G
Sbjct: 431 EAGPSGSQGRTGRSGPQGNMGARGSRGDVGNQGAI---GPMGQPGMNGPPGVVGEPGPAG 487
Query: 108 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 167
+GP+GR G GR S GP G GP G + GP G G GR +G
Sbjct: 488 ---PVGPNGRP---GEDGRAGSRGPQGNQGLRGPPGVMGLSGPQG---SSGEDGRDGPMG 538
Query: 168 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
PSG L G G LG G
Sbjct: 539 PSGPLGPQGTPGTFGRLGAGG 559
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/139 (35%), Positives = 59/139 (42%), Gaps = 12/139 (8%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
GPSG G SG +G GS +G G +GP G+ GP G + GP+G
Sbjct: 431 EAGPSGSQGRTGRSGPQGNMGARGSRGDVGNQG---AIGPMGQPGMNGPPGVVGEPGPAG 487
Query: 117 RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 176
+GP+GR D GR GP G GP G + GP G G GR +G
Sbjct: 488 ---PVGPNGRPGED---GRAGSRGPQGNQGLRGPPGVMGLSGPQG---SSGEDGRDGPMG 538
Query: 177 PSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
PSG L G G LG
Sbjct: 539 PSGPLGPQGTPGTFGRLGA 557
>gi|419395645|ref|ZP_13936426.1| collagen triple helix repeat family protein [Escherichia coli
DEC15B]
gi|378248690|gb|EHY08601.1| collagen triple helix repeat family protein [Escherichia coli
DEC15B]
Length = 453
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/131 (33%), Positives = 54/131 (41%), Gaps = 15/131 (11%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 245 TGPAGATGERGPAGDAGPAGPQGPKGDRGETGLTGAAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG- 300
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G + GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 301 --PQGPKGDTGAAGPAG---PQGPKGDAGVAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG---PQGP 349
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
G GP+G
Sbjct: 350 KGDAGVAGPAG 360
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/140 (34%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 18/140 (12%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 245 TGPAGATGERGPAGDAGPAGPQGPKGDRGETGLTGAAGPAGP---QGPKGDTGAAGPAG- 300
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 301 --PQGPKGDTGAAGPAG---PQGPKGDAGVAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG---PQGP 349
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GPSG
Sbjct: 350 KGDAGVAGPAG---PQGPSG 366
>gi|168215950|ref|ZP_02641575.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens NCTC
8239]
gi|182381753|gb|EDT79232.1| collagen triple helix repeat protein [Clostridium perfringens NCTC
8239]
Length = 388
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/157 (32%), Positives = 59/157 (37%), Gaps = 3/157 (1%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP G GP G + G G + +GP G + GP G GP G G G
Sbjct: 66 GPQGPRGPQGPRGPMGCQGERGPIGPMGPMGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGPQGEQGPQ 125
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G + GP G GP G GP G GP G GP G + G
Sbjct: 126 GDQGPVGPIGPQGPQGEQGLTGPQGPAGSQGPEGP---TGPQGATGPQGPEGPVGPQGAQ 182
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP G GP G GP+G +GP G
Sbjct: 183 GPQGPQGPQGATGPTGPQGPQGNQGPAGPQGPVGPQG 219
>gi|295815591|gb|ADG36303.1| collagen type V alpha-1 [Danio rerio]
Length = 2010
Score = 37.7 bits (86), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GPSG LGP GP G + Y GP G G G G G
Sbjct: 930 GPPGHPGKEGPSGEKGNLGPH------GPQGPIGYPGPRGVKGADGVRGLKGNKGEKGED 983
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+ G G + G G L GP G GP GR G G L LG G+L G
Sbjct: 984 GFPGFKGDMGVKGDKGELGAAGPRGEDGPEGPKGRSGLPGDPGPLGPLGEKGKLGVPGLP 1043
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G + G G G G GP G+ GP G GP+G+
Sbjct: 1044 GYPGRQGPKGSQGFQGFQGTSGEKGTRGTAGKPGPRGQRGPTGPRGERGPRGPTGKA 1100
>gi|224044919|ref|XP_002196734.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain [Taeniopygia guttata]
Length = 1364
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/150 (30%), Positives = 61/150 (40%), Gaps = 3/150 (2%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G+ +G G+ +GP G G G + + GP G G G +G +G
Sbjct: 459 GPAGKEGPVGFPGADGRVGPIGPAGNRGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGEKGNVGLAGPR 518
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G+ GP G G G GP G GPSG G +G+ G
Sbjct: 519 GAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQGGKGETGPAGPPGFQGLPGPSG---PAGEAGKPGERGLH 575
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 163
G GP+G GP G +GP+G +
Sbjct: 576 GEFGVPGPAGPRGERGPPGESGAVGPAGPI 605
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/156 (30%), Positives = 63/156 (40%), Gaps = 6/156 (3%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
GS G G + + G GR+ +GP+G+ G G + + GP G G G +
Sbjct: 456 GSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPIGPAGN---RGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGEKGNV 512
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
G +G GP G GP G G G GP G GPSG G +G+
Sbjct: 513 GLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQGGKGETGPAGPPGFQGLPGPSG---PAGEAGKP 569
Query: 146 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G GP+G GP G +GP+G +
Sbjct: 570 GERGLHGEFGVPGPAGPRGERGPPGESGAVGPAGPI 605
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/114 (35%), Positives = 52/114 (45%), Gaps = 6/114 (5%)
Query: 86 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL---RYLGPS 142
G +G LG SG GPSG + GP+G G G +DGP GR + G
Sbjct: 888 GATGEPGPLGVSGPPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKGER 947
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GPSG L GP G+ +GPSG+ G G +GP+G GL+
Sbjct: 948 GAPGSPGPSGALGAPGPHGQ---VGPSGKPGNRGEPGPAGAVGPAGAFGPRGLA 998
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/187 (29%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY- 75
G GP G G GS G GR +GP+G+ GP G G +GR
Sbjct: 384 GEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMGPAGNRGASGPVGAKGPNGDAGRPGEP 443
Query: 76 --LGP------SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP GS G G + + G GR+ +GP+G G G + + GP G
Sbjct: 444 GLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPIGPAGN---RGEPGNIGFPGPKGPT 500
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
G G +G +G GP G GP G G G GP G GPS
Sbjct: 501 GEPGKPGEKGNVGLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQGGKGETGPAGPPGFQGLPGPS 560
Query: 188 GRLRYLG 194
G G
Sbjct: 561 GPAGEAG 567
>gi|307196424|gb|EFN78013.1| Collagen alpha-1(XI) chain [Harpegnathos saltator]
Length = 1817
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/175 (30%), Positives = 68/175 (38%), Gaps = 18/175 (10%)
Query: 12 NLGPSGRLRY------LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR 65
++GP G + +GP G GP G +GP G GP G + GP G
Sbjct: 1124 DIGPPGEKGFKGSQGEMGPPGPQGIQGPRGEPGLMGPFGEK---GPPGEMGRQGPKGEE- 1179
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP+G + GP GS GP G +G SG +G G GP G + G G
Sbjct: 1180 --GPAGAIGLAGPIGSQGLPGPPGTKGEVGDSGTTGPMGSPGAPGERGPKGPKGFKGTQG 1237
Query: 126 RLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
S GP GR G +G GP G +G + G G G SG
Sbjct: 1238 ---SSGPEGRQGVKGDNGS---SGPPGVPGAVGKQAERGFPGAKGEEGKAGSSGH 1286
>gi|47218941|emb|CAF98139.1| unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Length = 1557
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/97 (36%), Positives = 47/97 (48%), Gaps = 3/97 (3%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
SG + G G+ +GP G LGP+GS LGPSG GP+G + G +G+L
Sbjct: 919 SGMKGFRGNRGAPGVMGPHGLKGALGPAGSPGALGPSGERGPPGPAGAIGQPGRAGALGV 978
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
GP G G G +GP+G+ GP G L +
Sbjct: 979 AGPMGE---KGEPGEKGPVGPAGKDGEQGPLGALGVI 1012
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/198 (29%), Positives = 78/198 (39%), Gaps = 30/198 (15%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR---YLGPSGRLRYLGPS 70
GP GR GP GS +G G + G G + G +G L +GP G+ GP+
Sbjct: 818 GPQGRNGEPGPKGSNGPVGKDGLPGHPGQRGEPGFQGKTGPLGPPGVVGPQGKSGEPGPT 877
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLG------------------------PSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
G + G G G PSG + G G +GP
Sbjct: 878 GDRGHPGAPGVPGEQGLPGSAGKEGGKGDPGPPGSPGKNGPSGMKGFRGNRGAPGVMGPH 937
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G LGP+G LGPSG GP+G +G GR LG +G + G G +
Sbjct: 938 GLKGALGPAGSPGALGPSGERGPPGPAG---AIGQPGRAGALGVAGPMGEKGEPGEKGPV 994
Query: 167 GPSGRLRYLGPSGRLRYL 184
GP+G+ GP G L +
Sbjct: 995 GPAGKDGEQGPLGALGVI 1012
>gi|260794194|ref|XP_002592094.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_84963 [Branchiostoma floridae]
gi|229277309|gb|EEN48105.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_84963 [Branchiostoma floridae]
Length = 215
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/194 (28%), Positives = 82/194 (42%), Gaps = 33/194 (17%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRY 84
+G +GPSG +G +G + G G++ GP G GP G +GPSG
Sbjct: 16 TGPTGPVGPSGGRGAIGQTGPIGPPGEKGAIGPAGPVGPTGEKGPRGPTGPVGPSGEKGA 75
Query: 85 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG------------RLRYLGPSGRLNSDGP 132
+GP+G + GP G GP+G +R LG G +GP G GP
Sbjct: 76 MGPTGPVEPPGPPGEKASTGPTGAMRPLGEKGIMGPTGPMGPPGEKGAMGPPGEKGVTGP 135
Query: 133 SGRL---------RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
+G + R +GP +GP G+ +GP GP+G +G G
Sbjct: 136 TGPMGPPRFPEEKRAIGP------VGPPGKKGDVGPH------GPAGETGPVGARGSPGL 183
Query: 184 LGPSGRLRYLGLSD 197
+GP G + G+S+
Sbjct: 184 MGPIGPPGHNGVSN 197
>gi|348539638|ref|XP_003457296.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like isoform 2 [Oreochromis
niloticus]
Length = 1352
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/162 (31%), Positives = 63/162 (38%), Gaps = 18/162 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
+GP G GP G GP+G G G G G GP G + GP
Sbjct: 596 IGPRGPAGAPGPDGGKGEPGPAGVAGAPGHQGAGGMPGERGGAGTPGPKGEKGEPGHKGP 655
Query: 70 SGRLRYLGPSG---------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G GP G G G GP+G GPSG +GP+G +
Sbjct: 656 DGNPGRDGPRGLAGPAGPPGPTGANGDKGEGGSFGPAGPAGPRGPSGERGEVGPAGAPGF 715
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G +DG +G GPSG +GPSG GP+G+
Sbjct: 716 AGPPG---ADGQAGARGERGPSGAKGEVGPSG---LAGPAGQ 751
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/174 (32%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G+ GP G + GP+G GP G GP+G G G G G
Sbjct: 585 GAAGSAGPQGPIGPRGPAG---APGPDGGKGEPGPAGVAGAPGHQGAGGMPGERGGAGTP 641
Query: 86 GPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G + GP G GP G GP G G G S GP+G GPS
Sbjct: 642 GPKGEKGEPGHKGPDGNPGRDGPRGLAGPAGPPGPTGANGDKGEGGSFGPAGPAGPRGPS 701
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP+G + GP G G G GPSG +GPSG G S
Sbjct: 702 GERGEVGPAGAPGFAGPPGADGQAGARGE---RGPSGAKGEVGPSGLAGPAGQS 752
>gi|239627459|ref|ZP_04670490.1| predicted protein [Clostridiales bacterium 1_7_47_FAA]
gi|239517605|gb|EEQ57471.1| predicted protein [Clostridiales bacterium 1_7_47FAA]
Length = 475
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/111 (32%), Positives = 48/111 (43%), Gaps = 6/111 (5%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
+GP+G +GP G GP+G+ +GP G Y+GP+G+ GP G + GP+G
Sbjct: 60 MGPTGPAGPMGPRGCPGVQGPTGATGAMGPQG---YVGPTGATGARGPQGYIGATGPAGP 116
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 123
G G GP G G G GP+G G G GP
Sbjct: 117 QGLQGVQGP---AGPRGATGATGLQGLQGIQGPTGVTGIQGIQGPQGIQGP 164
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/120 (31%), Positives = 51/120 (42%), Gaps = 15/120 (12%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
+GP+G +GP G GP+G +GP G Y+GP+G+ GP G + GP+
Sbjct: 60 MGPTGPAGPMGPRGCPGVQGPTGATGAMGPQG---YVGPTGATGARGPQGYIGATGPA-- 114
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP+ GP G + G G GP+G G G GP
Sbjct: 115 ----GPQGLQGVQGPA------GPRGATGATGLQGLQGIQGPTGVTGIQGIQGPQGIQGP 164
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/111 (32%), Positives = 47/111 (42%), Gaps = 6/111 (5%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
+GP+G +GP G GP+G+ +GP G Y+GP+G GP G + GP+G
Sbjct: 60 MGPTGPAGPMGPRGCPGVQGPTGATGAMGPQG---YVGPTGATGARGPQGYIGATGPAGP 116
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 168
G G GP G G G GP+G G G GP
Sbjct: 117 QGLQGVQGPA---GPRGATGATGLQGLQGIQGPTGVTGIQGIQGPQGIQGP 164
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/111 (32%), Positives = 47/111 (42%), Gaps = 6/111 (5%)
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR 135
+GP+G +GP G GP+G +GP G Y+GP+G GP G + + GP+G
Sbjct: 60 MGPTGPAGPMGPRGCPGVQGPTGATGAMGPQG---YVGPTGATGARGPQGYIGATGPAGP 116
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 186
G G GP G G G GP+G G G GP
Sbjct: 117 QGLQGVQGP---AGPRGATGATGLQGLQGIQGPTGVTGIQGIQGPQGIQGP 164
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/85 (35%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 12/85 (14%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G + GP+G +GP G GP+G +GP G Y+GP+G GP G +
Sbjct: 55 GPTGPM---GPTGPAGPMGPRGCPGVQGPTGATGAMGPQG---YVGPTGATGARGPQGYI 108
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 98
GP+ GP G GP+G
Sbjct: 109 GATGPA------GPQGLQGVQGPAG 127
>gi|165881926|gb|ABY71229.1| Col5a2 [Scyliorhinus canicula]
Length = 739
Score = 37.7 bits (86), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/141 (33%), Positives = 59/141 (41%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G L G GS GP+G + + GP G G G G G GP G
Sbjct: 65 SIGPPGPLGSRGSPGSRGETGPTGPVGFSGPPGNDGQPGGKGETGEPGQKGDSGSPGPQG 124
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G + G G GP G + GP+GR+ G +G +GP G +G
Sbjct: 125 LAGSPGPPGPVGVTGLKGGRGTQGPPGATGFPGPAGRVGPPGATGDPGPIGPLGAPGKEG 184
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
P G GP G GPSG
Sbjct: 185 PPGLRGDTGPPGNTGDHGPSG 205
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/187 (31%), Positives = 70/187 (37%), Gaps = 12/187 (6%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGS------------LRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPS 61
GP G G GS LG GS G G +GP G L G
Sbjct: 19 GPKGERGIAGKKGSEGSLGNEGSRGLPGPSGPPGIAGPAGDKGEHGSIGPPGPLGSRGSP 78
Query: 62 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 121
G GP+G + + GP G+ G G G G GP G GP G +
Sbjct: 79 GSRGETGPTGPVGFSGPPGNDGQPGGKGETGEPGQKGDSGSPGPQGLAGSPGPPGPVGVT 138
Query: 122 GPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
G G + GP G + GP+GR+ G +G +GP G GP G GP G
Sbjct: 139 GLKGGRGTQGPPGATGFPGPAGRVGPPGATGDPGPIGPLGAPGKEGPPGLRGDTGPPGNT 198
Query: 182 RYLGPSG 188
GPSG
Sbjct: 199 GDHGPSG 205
>gi|348539636|ref|XP_003457295.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like isoform 1 [Oreochromis
niloticus]
Length = 1355
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/162 (31%), Positives = 63/162 (38%), Gaps = 18/162 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
+GP G GP G GP+G G G G G GP G + GP
Sbjct: 599 IGPRGPAGAPGPDGGKGEPGPAGVAGAPGHQGAGGMPGERGGAGTPGPKGEKGEPGHKGP 658
Query: 70 SGRLRYLGPSG---------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G GP G G G GP+G GPSG +GP+G +
Sbjct: 659 DGNPGRDGPRGLAGPAGPPGPTGANGDKGEGGSFGPAGPAGPRGPSGERGEVGPAGAPGF 718
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G +DG +G GPSG +GPSG GP+G+
Sbjct: 719 AGPPG---ADGQAGARGERGPSGAKGEVGPSG---LAGPAGQ 754
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/174 (32%), Positives = 67/174 (38%), Gaps = 9/174 (5%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYL 85
G+ GP G + GP+G GP G GP+G G G G G
Sbjct: 588 GAAGSAGPQGPIGPRGPAG---APGPDGGKGEPGPAGVAGAPGHQGAGGMPGERGGAGTP 644
Query: 86 GPSGRLR---YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G + GP G GP G GP G G G S GP+G GPS
Sbjct: 645 GPKGEKGEPGHKGPDGNPGRDGPRGLAGPAGPPGPTGANGDKGEGGSFGPAGPAGPRGPS 704
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G +GP+G + GP G G G GPSG +GPSG G S
Sbjct: 705 GERGEVGPAGAPGFAGPPGADGQAGARGE---RGPSGAKGEVGPSGLAGPAGQS 755
>gi|171846460|gb|AAI61663.1| Col1a1 protein [Danio rerio]
Length = 1366
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 46/107 (42%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG +GP+G+ G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 764 DKGESGAQGLVGPTGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKG 820
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G+ GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 821 DAGAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRV 867
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G SG+ +GP+G GP G G G + GP G G G +G G
Sbjct: 766 GESGAQGLVGPTG---ARGPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 822
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 823 GAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGP 869
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 45/105 (42%), Gaps = 3/105 (2%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
G SG +GP+G+ G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 766 GESGAQGLVGPTGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 822
Query: 101 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP+G GP G + GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 823 GAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRV 867
Score = 35.8 bits (81), Expect = 10.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G SG+ +GP+G+ GP G G G + GP G G G G G
Sbjct: 766 GESGAQGLVGPTGAR---GPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 822
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS 129
GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 823 GAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGP 869
>gi|398309821|ref|ZP_10513295.1| GXT repeat-containing collagen-like protein, partial [Bacillus
mojavensis RO-H-1]
Length = 316
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/151 (31%), Positives = 64/151 (42%), Gaps = 3/151 (1%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+GS GP+G GP+GS G +G G +G GP+G G +G
Sbjct: 169 TGPTGSTGATGPTGATGSTGPTGSTGSTGATGATGSTGATGSTGSPGPTGPTGETGATGS 228
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 150
G +G GP+G G +G GP+G S GP+G GP+G GP
Sbjct: 229 TGATGATGATGETGPTGATGLTGATG---VTGPTGVTGSTGPTGANGTTGPTGATGSTGP 285
Query: 151 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
+G GP+G G +G G +G
Sbjct: 286 TGATGVTGPTGVTGSTGATGPTGVTGVTGST 316
>gi|74218968|dbj|BAE37849.1| unnamed protein product [Mus musculus]
Length = 959
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/159 (32%), Positives = 63/159 (39%), Gaps = 3/159 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GPSG+ +G G GP G G +G + + GP G G G + G +G
Sbjct: 51 NVGPSGKEGPVGLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAG 110
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G+ GP G G G GP G GPSG +G G G
Sbjct: 111 ARGAPGPDGNNGAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGER---G 167
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
G GP+G G G GPSG + GPSG
Sbjct: 168 LPGEFGLPGPAGPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSG 206
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/164 (31%), Positives = 66/164 (40%), Gaps = 6/164 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GP+G G +GR +GP GS +GPSG+ +
Sbjct: 2 GADGRAGVMGPPGNRGSTGPAGIRGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNVGPSGKEGPV 61
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 62 GLPGIDGRPGPIGPAGPRGEAGNIGFPGPKGPSGDPGKPGERGHPGLAGARGAPGPDGNN 121
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 171
+ GP G G G GP G GPSG +G G
Sbjct: 122 GAQGPPGPQGVQGGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGE 165
>gi|423470927|ref|ZP_17447671.1| hypothetical protein IEM_02233 [Bacillus cereus BAG6O-2]
gi|402434315|gb|EJV66358.1| hypothetical protein IEM_02233 [Bacillus cereus BAG6O-2]
Length = 573
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/199 (25%), Positives = 64/199 (32%), Gaps = 18/199 (9%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSG---RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
+ G +G G +G + G +G GP G +GP+G GP G G
Sbjct: 245 DTGATGATGVTGATGDIGATGATGVTGLQGPQGIQGVQGEIGPTGPQGIQGPQGIQGVTG 304
Query: 69 PSGRLR---YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY------------LG 113
+G GP G GP G GP G G +G G
Sbjct: 305 ATGDQGPQGIQGPQGIQGPTGPQGIQGEQGPQGIQGATGATGAQGPQGIQGIQGIQGPTG 364
Query: 114 PSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
P G G G + GP G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 365 PQGPTGIQGVQGEIGPTGPQGVQGLQGPTGDTGATGSQGPQGIQGPTGVTGATGLQGTQG 424
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRY 192
G +G G S Y
Sbjct: 425 PTGATGATGVTGVSTTATY 443
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/180 (26%), Positives = 60/180 (33%), Gaps = 21/180 (11%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
G +G+ G +G + G +G GP G G +GP+G GP G
Sbjct: 246 TGATGATGVTGATGDIGATGATGVTGLQGPQGIQGVQG------EIGPTGPQGIQGPQGI 299
Query: 91 LRYLGPSGR---LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGR------------ 135
G +G GP G GP G GP G + G +G
Sbjct: 300 QGVTGATGDQGPQGIQGPQGIQGPTGPQGIQGEQGPQGIQGATGATGAQGPQGIQGIQGI 359
Query: 136 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
GP G G G + GP G GP+G G G GP+G GL
Sbjct: 360 QGPTGPQGPTGIQGVQGEIGPTGPQGVQGLQGPTGDTGATGSQGPQGIQGPTGVTGATGL 419
>gi|395540497|ref|XP_003772190.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain [Sarcophilus harrisii]
Length = 1490
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 38/96 (39%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G GP G
Sbjct: 813 GPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGESGQKGDAGAPGPQGPS 872
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 873 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 908
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 37/96 (38%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GP+G+ G G GP G + GP G+ G G G G GP G
Sbjct: 813 GPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGESGQKGDAGAPGPQGPS 872
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 873 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 908
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/132 (32%), Positives = 49/132 (37%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 813 GPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGESGQKGDAGAPGPQGPS 872
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G GP G + G +GR+ G +G GP G DGP
Sbjct: 873 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPPGPPGASGKDGPK 932
Query: 134 GRLRYLGPSGRL 145
G GP GR
Sbjct: 933 GARGDSGPPGRA 944
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/96 (31%), Positives = 37/96 (38%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G+ G G GP G + GP G G G G G + GP G
Sbjct: 813 GPAGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEQGESGQKGDAGAPGPQGPS 872
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 873 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 908
>gi|355680245|ref|ZP_09061661.1| hypothetical protein HMPREF9469_04698 [Clostridium citroniae
WAL-17108]
gi|354811831|gb|EHE96455.1| hypothetical protein HMPREF9469_04698 [Clostridium citroniae
WAL-17108]
Length = 357
Score = 37.4 bits (85), Expect = 3.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/160 (30%), Positives = 59/160 (36%), Gaps = 18/160 (11%)
Query: 41 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 100
GP+G GP G+ G +G GP G GP G+ G +G GP G
Sbjct: 46 GPAGPAGPRGPRGAAGPQGATGPQGAAGPQGAT---GPQGAAGPQGATGPQGLQGPMGLR 102
Query: 101 RYLGPSGRLR------------YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
+GP+G +GP G GP G + GP G GP G
Sbjct: 103 GEVGPTGAQGATGATGATGSTGVMGPIGAQGPAGPQGNTGATGPQGAAGPTGPQGIQGPA 162
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP G GP G GP G GP+G
Sbjct: 163 GPQGNPGITGPQGPSGATGPQGP---AGPQGNQGDTGPAG 199
>gi|56790315|ref|NP_954684.1| collagen alpha-1(I) chain precursor [Danio rerio]
gi|38570069|gb|AAR24536.1| chihuahua [Danio rerio]
Length = 1447
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 46/107 (42%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG +GP+G+ G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 764 DKGESGAQGLVGPTGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKG 820
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G+ GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 821 DAGAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRV 867
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G SG+ +GP+G GP G G G + GP G G G +G G
Sbjct: 766 GESGAQGLVGPTG---ARGPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 822
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 823 GAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGP 869
>gi|165881920|gb|ABY71226.1| Col2a1 [Scyliorhinus canicula]
Length = 744
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/95 (32%), Positives = 37/95 (38%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ G G GP G + GP GS G G G G GP G
Sbjct: 67 GPTGAAGSRGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGSDGQAGAKGEAGETGQKGDAGAPGPQGPS 126
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G + GP G + G +GR
Sbjct: 127 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGR 161
>gi|156360672|ref|XP_001625150.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156211968|gb|EDO33050.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 829
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/196 (28%), Positives = 75/196 (38%), Gaps = 6/196 (3%)
Query: 16 SGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 75
G + +G SGS G G GP+G L G G + +GPSG + G G
Sbjct: 455 KGAIGIIGKSGSPGKDGSEGPTGESGPTGALGAKGQKGGVGSIGPSGLQGFQGRMGLKGD 514
Query: 76 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR--LRYL----GPSGRLNS 129
G G + G +G GP G + +G G L +G G R L GP G L
Sbjct: 515 AGYDGVDGFKGHAGNTGIPGPQGTMGPIGAKGILGDVGAPGMPGSRGLNGTRGPEGDLGH 574
Query: 130 DGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G G + G G+ G G G +G + G G + GPSG G G
Sbjct: 575 SGLPGPPGFQGDPGKPGIRGHEGLQGVSGKAGSIGDPGKKGNIGEKGPSGEQGMKGDPGD 634
Query: 190 LRYLGLSDGLRVSGLH 205
GL + + G+
Sbjct: 635 EGNEGLPGDIGIIGMQ 650
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/186 (30%), Positives = 69/186 (37%), Gaps = 9/186 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP G LG G+ G G GP G L + G G + G G+ G G
Sbjct: 538 TMGPIGAKGILGDVGAPGMPGSRGLNGTRGPEGDLGHSGLPGPPGFQGDPGKPGIRGHEG 597
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---GPSGRLN 128
G +GS+ G G + GPSG G G G G + + GP G
Sbjct: 598 LQGVSGKAGSIGDPGKKGNIGEKGPSGEQGMKGDPGDEGNEGLPGDIGIIGMQGPPGVTG 657
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 182
DG G GP G L + GP G GP SG +G GR+ G G
Sbjct: 658 KDGQQGAAGPSGPRGALGHPGPQGLEGDRGPIGKPGVSGTKGNIGAKGRIGLQGDRGEQG 717
Query: 183 YLGPSG 188
GP G
Sbjct: 718 PFGPKG 723
>gi|359804082|dbj|BAL40988.1| collagen type I alpha 2 [Oreochromis niloticus]
Length = 1350
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/162 (31%), Positives = 63/162 (38%), Gaps = 18/162 (11%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLR---YLGP 69
+GP G GP G GP+G G G G G GP G + GP
Sbjct: 594 IGPRGPAGAPGPDGGKGEPGPAGVAGAPGHQGAGGMPGERGGAGTPGPKGEKGEPGHKGP 653
Query: 70 SGRLRYLGPSG---------SLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 120
G GP G G G GP+G GPSG +GP+G +
Sbjct: 654 DGNPGRDGPRGLAGPAGPPGPTGANGDKGEGGSFGPAGPAGPRGPSGERGEVGPAGAPGF 713
Query: 121 LGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G +DG +G GPSG +GPSG GP+G+
Sbjct: 714 AGPPG---ADGQAGARGERGPSGAKGEVGPSG---LAGPAGQ 749
>gi|47222238|emb|CAG11117.1| unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Length = 1403
Score = 37.4 bits (85), Expect = 4.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/181 (30%), Positives = 66/181 (36%), Gaps = 30/181 (16%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N GP G G G GPSG G SG +GP+G + GP G G G
Sbjct: 722 NAGPPGPTGANGDKGESGAFGPSGPAGPRGASGERGEVGPAGPAGFAGPPGADGQTGARG 781
Query: 72 R---------------------LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 110
GP+G GP G GPSG + G +GR+
Sbjct: 782 ERGPAGVKGESGPSGPAGPPGPSGLAGPAGVSGAAGPRGD---TGPSGLTGFPGAAGRVG 838
Query: 111 YLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP+G + GP+G DGP GP G +G G L GP G G SG
Sbjct: 839 TPGPAGIVGPPGPAGPAGKDGP------RGPRGDAGPMGAPGDLGMAGPVGPAGEKGTSG 892
Query: 171 R 171
Sbjct: 893 E 893
>gi|419406495|ref|ZP_13947189.1| collagen triple helix repeat family protein [Escherichia coli
DEC15D]
gi|419411658|ref|ZP_13952325.1| collagen triple helix repeat family protein [Escherichia coli
DEC15E]
gi|378256267|gb|EHY16119.1| collagen triple helix repeat family protein [Escherichia coli
DEC15D]
gi|378260586|gb|EHY20387.1| collagen triple helix repeat family protein [Escherichia coli
DEC15E]
Length = 485
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/131 (33%), Positives = 54/131 (41%), Gaps = 15/131 (11%)
Query: 58 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 117
GP+G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 277 TGPAGATGERGPAGDAGPAGPQGPKGDRGETGLTGAAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG- 332
Query: 118 LRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 177
GP G + GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 333 --PQGPKGDTGAAGPAG---PQGPKGDAGVAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG---PQGP 381
Query: 178 SGRLRYLGPSG 188
G GP+G
Sbjct: 382 KGDAGVAGPAG 392
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/140 (34%), Positives = 57/140 (40%), Gaps = 18/140 (12%)
Query: 40 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 99
GP+G GP+G GP G G +G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 277 TGPAGATGERGPAGDAGPAGPQGPKGDRGETGLTGAAGPAGP---QGPKGDTGAAGPAG- 332
Query: 100 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 159
GP G GP+G GP G GP+G GP G GP+G GP
Sbjct: 333 --PQGPKGDTGAAGPAG---PQGPKGDAGVAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG---PQGP 381
Query: 160 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GPSG
Sbjct: 382 KGDAGVAGPAG---PQGPSG 398
>gi|313236370|emb|CBY11688.1| unnamed protein product [Oikopleura dioica]
Length = 1179
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/167 (30%), Positives = 68/167 (40%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 30 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG 89
++G G + + G G+ GP+G + GP+G G GR +G SG+ G G
Sbjct: 556 FIGMPGGVGFRGELGKKGEPGPTG---FHGPTGAKGKEGTPGRQGPMGISGNQGGFGDPG 612
Query: 90 RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 149
++G G+ LGP G + G G G G + DG G + G G LG
Sbjct: 613 ---HIGLHGKAGPLGPPGVMGRPGDRGDRGIKGKPGPIGPDGNRGFVGMTGNPGPKGKLG 669
Query: 150 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
P G + G G GP G GP G GP G LGL
Sbjct: 670 PQGSEGFKGQIGFPGIQGPPGLSGDTGPKGSTGDKGPDGVTGQLGLQ 716
>gi|38649122|gb|AAH63249.1| Collagen, type I, alpha 1 [Danio rerio]
Length = 1447
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 46/107 (42%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G SG +GP+G+ G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 764 DKGESGAQGLVGPTGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKG 820
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G+ GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 821 DAGAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRV 867
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G SG+ +GP+G GP G G G + GP G G G +G G
Sbjct: 766 GESGAQGLVGPTG---ARGPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEPGDNGAKGDA 822
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 183
GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 823 GAPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRVGP 869
>gi|165881928|gb|ABY71230.1| Col2a1 [Leucoraja erinacea]
Length = 738
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/95 (32%), Positives = 37/95 (38%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ G G GP G + GP GS G G G G GP G
Sbjct: 67 GPTGTAGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGSDGQAGQKGEPGETGQKGDAGAPGPQGPS 126
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G GP G + GP G + G +GR
Sbjct: 127 GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGR 161
>gi|48762934|ref|NP_000080.2| collagen alpha-2(I) chain precursor [Homo sapiens]
gi|296439507|sp|P08123.7|CO1A2_HUMAN RecName: Full=Collagen alpha-2(I) chain; AltName: Full=Alpha-2 type I
collagen; Flags: Precursor
Length = 1366
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 953 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 1009
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 1010 EPGEKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 1066
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 1067 RTGHPGTVGPAG 1078
>gi|410926031|ref|XP_003976482.1| PREDICTED: collagen alpha-2(XI) chain-like [Takifugu rubripes]
Length = 1780
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/183 (32%), Positives = 72/183 (39%), Gaps = 6/183 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GPSG+ GPSG P G + Y GP G G G + G G
Sbjct: 693 GPPGHPGKEGPSGTKGNQGPSG------PQGPIGYPGPRGLKGGQGIRGLKGHKGEKGED 746
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+ G G G G + GP G GP GR G +G L +G G+L G
Sbjct: 747 GFPGIKGDFGIKGERGEIGVPGPRGEDGPEGPKGRFGPPGETGPLGAVGEKGKLGVPGLP 806
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 193
G GP G L + G G G G GP G+ GP G+ G +G+L
Sbjct: 807 GYPGRQGPKGSLGFPGFPGSNGEKGTRGLTGKSGPRGQRGPTGPRGQRGPRGATGKLGPK 866
Query: 194 GLS 196
G S
Sbjct: 867 GTS 869
>gi|326667849|ref|XP_001343747.4| PREDICTED: collagen alpha-1(XXIV) chain [Danio rerio]
Length = 1545
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/155 (34%), Positives = 63/155 (40%), Gaps = 12/155 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGR 90
GP+G GP GR GP+G GPSG G +G+ GP GS LGP G
Sbjct: 769 AGPAGERGSRGPPGRQGETGPTGFQGLPGPSGLPGAEGVTGK---QGPPGS---LGPQGS 822
Query: 91 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNS------DGPSGRLRYLGPSGR 144
GP G G SG + G G GP+G S G GR+ GP+G
Sbjct: 823 KGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGS 882
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
+G G GP+G GP G LG G
Sbjct: 883 KGDVGSPGPKGKPGPNGFQGEQGPQGSQGVLGAPG 917
>gi|5921192|sp|P02467.2|CO1A2_CHICK RecName: Full=Collagen alpha-2(I) chain; AltName: Full=Alpha-2 type
I collagen; Flags: Precursor
Length = 1362
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/116 (35%), Positives = 53/116 (45%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL---RYLG 140
G +G LG SG GPSG + GP+G G G +DGP GR + G
Sbjct: 885 IAGATGEPGPLGVSGPPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKG 944
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GPSG L GP G+ +GPSG+ G G + +GP+G GL+
Sbjct: 945 ERGAPGNPGPSGALGAPGPHGQ---VGPSGKPGNRGDPGPVGPVGPAGAFGPRGLA 997
>gi|17481338|dbj|BAB79230.1| type I collagen alpha 2 chain [Oncorhynchus keta]
Length = 1346
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/171 (33%), Positives = 70/171 (40%), Gaps = 12/171 (7%)
Query: 31 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP 87
GPSG + G +GR+ GP SG GP+G+ G G GP G +GP
Sbjct: 764 AGPSGLTGFPGAAGRVGGPGPAGISGPPGSAGPAGKDGPRGLRGDSGPAGPQGEHGQIGP 823
Query: 88 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL---NSDGPSGRLRYLGPSGR 144
SG GP+G GP G GP G LGPSG + S G G G G
Sbjct: 824 SGIAGDKGPTGES---GPPGAPGTAGPQG---VLGPSGFVGLPGSRGDKGLPGGPGAVGE 877
Query: 145 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
LGP+G GP+G + G +G G G GP GR G
Sbjct: 878 PGRLGPAGASGPRGPAGNIGMPGMTGTQGEAGREGSPGNDGPPGRPGTAGF 928
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/154 (34%), Positives = 66/154 (42%), Gaps = 12/154 (7%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GP G +GPSG GP+G GP G+ GP G LGPSG + G G
Sbjct: 812 AGPQGEHGQIGPSGIAGDKGPTGES---GPPGAPGTAGPQG---VLGPSGFVGLPGSRGD 865
Query: 82 LRYLGPSGRLRY---LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRY 138
G G + LGP+G GP+G + G +G G G +DGP GR
Sbjct: 866 KGLPGGPGAVGEPGRLGPAGASGPRGPAGNIGMPGMTGTQGEAGREGSPGNDGPPGR--- 922
Query: 139 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
G +G G G LG SG+ GPSG +
Sbjct: 923 PGTAGFKGDRGEPGSPGALGSSGQPGPNGPSGAV 956
>gi|87882930|emb|CAJ58484.1| hypothetical protein BA_2450 [Bacillus anthracis]
Length = 179
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/129 (24%), Positives = 44/129 (34%), Gaps = 24/129 (18%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTG 92
Query: 126 RLNSDGPS------------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
+ GP+ G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 93 ITGATGPAGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTG 152
Query: 162 RLRYLGPSG 170
G +G
Sbjct: 153 ATGLAGATG 161
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/128 (23%), Positives = 43/128 (33%), Gaps = 24/128 (18%)
Query: 93 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G +G G +G G +G GP+G + GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTG 92
Query: 153 RLRYLGPS------------------------GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP+ G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 93 ITGATGPAGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTG 152
Query: 189 RLRYLGLS 196
G +
Sbjct: 153 ATGLAGAT 160
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/129 (24%), Positives = 43/129 (33%), Gaps = 24/129 (18%)
Query: 57 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTG 92
Query: 117 RLRYLGP------------------------SGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
GP +G G +G GP+G GP+G
Sbjct: 93 ITGATGPAGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTG 152
Query: 153 RLRYLGPSG 161
G +G
Sbjct: 153 ATGLAGATG 161
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/129 (24%), Positives = 44/129 (34%), Gaps = 24/129 (18%)
Query: 48 YLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 107
G +G G +G G +G GP+G GP+G GP+G GP+G
Sbjct: 33 VTGATGITGVTGATGITGVTGATGITGVTGPTGITGATGPTGITGATGPAGITGATGPTG 92
Query: 108 RLRYLGP------------------------SGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP +G G +G + GP+G GP+G
Sbjct: 93 ITGATGPAGITGATGPTGTTGVTGPTGDTGLAGATGPTGATGLAGATGPTGDTGATGPTG 152
Query: 144 RLRYLGPSG 152
G +G
Sbjct: 153 ATGLAGATG 161
>gi|444707998|gb|ELW49126.1| Collagen alpha-2(I) chain [Tupaia chinensis]
Length = 1195
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/183 (31%), Positives = 74/183 (40%), Gaps = 9/183 (4%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY---LGP---SGSLRYLGPSGRLRYL 67
G GR +GP G+ GPSG G GR +GP GS +GP+G+ +
Sbjct: 372 GADGRAGVMGPPGNRGSSGPSGVRGPNGDPGRPGEPGLMGPRGLPGSPGNIGPAGKEGPV 431
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G GP G G +G + + GP G G G + G +G GP G
Sbjct: 432 GLPGIDGRPGPIGPAGARGEAGNIGFPGPKGPTGDPGKPGEKGHAGLAGARGAPGPDGNN 491
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
+ GP G G G GP+G + G G GP+G GP G GPS
Sbjct: 492 GAQGPPGLQGVQGGKGEQ---GPAGPPGFQGLPGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPS 548
Query: 188 GRL 190
G +
Sbjct: 549 GPI 551
>gi|322785850|gb|EFZ12469.1| hypothetical protein SINV_09102 [Solenopsis invicta]
Length = 1963
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/100 (34%), Positives = 57/100 (57%), Gaps = 12/100 (12%)
Query: 93 YLGPSG--RLRYLGPSGRLRYLGPSG--RLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYL 148
+GP+G ++ + GPS +GP+G ++ GP G++N + PSG+ +GP G +
Sbjct: 310 QIGPNGPGQMGHNGPS----QMGPNGPTQMGMGGPPGQMNMNAPSGQ---MGPGGPGNQM 362
Query: 149 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP-SGRLRYLGPS 187
GP+G +GP+ +GP+G +GP SG + LGP+
Sbjct: 363 GPAGAGNQMGPNTPGSQMGPAGPGGQMGPGSGPVSQLGPN 402
>gi|156406454|ref|XP_001641060.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
gi|156228197|gb|EDO48997.1| predicted protein [Nematostella vectensis]
Length = 352
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/118 (32%), Positives = 51/118 (43%), Gaps = 6/118 (5%)
Query: 19 LRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP 78
+ YLG G + GP GS G G+ GP GS +G SG G G+ G
Sbjct: 46 MGYLGEPGVVGGAGPKGSSGRPGDVGQAGASGPKGSSGNVGKSGSKGESGDKGQPGKPGK 105
Query: 79 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GS GP+G+ G +G GP+G+ G G + GR +DGP G +
Sbjct: 106 PGSRGQAGPAGKRGSPGDTGPQGAPGPAGKRGMTGAQGVM------GRTGADGPKGMI 157
>gi|254976931|ref|ZP_05273403.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-66c26]
gi|255316071|ref|ZP_05357654.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-76w55]
gi|255518730|ref|ZP_05386406.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-97b34]
gi|255651850|ref|ZP_05398752.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-37x79]
gi|260684877|ref|YP_003216162.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile CD196]
gi|306521634|ref|ZP_07407981.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile QCD-32g58]
gi|384362544|ref|YP_006200396.1| exosporium glycoprotein [Clostridium difficile BI1]
gi|260211040|emb|CBA66377.1| putative exosporium glycoprotein [Clostridium difficile CD196]
Length = 675
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/142 (25%), Positives = 53/142 (37%), Gaps = 15/142 (10%)
Query: 66 YLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY-----LGPSGR--L 118
GP+G G +G+ GP+G G G G +G + GP+G +
Sbjct: 120 VTGPTGPTGATGATGADGVTGPTGPTGATGADGITGPTGATGATGFGVTGPTGPTGATGV 179
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGR-----LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 173
G +G + G +G GP+G + GP+G G G GP+G
Sbjct: 180 GVTGATGLIGPTGATGTPGATGPTGAIGATGIGITGPTGATGATGADGATGVTGPTGPTG 239
Query: 174 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP+G G+
Sbjct: 240 ATGADG---VTGPTGATGATGI 258
>gi|45361285|ref|NP_989220.1| collagen alpha-1(II) chain precursor [Xenopus (Silurana)
tropicalis]
gi|82202407|sp|Q6P4Z2.1|CO2A1_XENTR RecName: Full=Collagen alpha-1(II) chain; AltName: Full=Alpha-1
type II collagen; Flags: Precursor
gi|38648940|gb|AAH63191.1| collagen, type II, alpha 1 [Xenopus (Silurana) tropicalis]
Length = 1492
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 44/138 (31%), Positives = 53/138 (38%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G + G G GP G + GP G G G G G GP G
Sbjct: 815 GPAGIVGARGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGADGQAGLKGDQGESGQKGDAGAPGPQGPS 874
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G +GP G GP G + G +GR+ GP+G G G GP
Sbjct: 875 GAPGPQGPTGVNGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGPNGNPGPSGAPGSAGKEGPK 934
Query: 179 GRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP+GR GL
Sbjct: 935 GARGDAGPTGRAGDPGLQ 952
>gi|62088952|dbj|BAD92923.1| collagen, type XXIV, alpha 1 variant [Homo sapiens]
Length = 867
Score = 37.0 bits (84), Expect = 4.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/169 (28%), Positives = 67/169 (39%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G + GP G+ G G G G +G +G G G G G
Sbjct: 174 DVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQG 233
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G G G +G G + LG SG+ GP G + G GR G
Sbjct: 234 KDGLKGVPGGRGLPGEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKG 293
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ +GP+G + GP G++ GP G G G L +GP G
Sbjct: 294 DKGQ---IGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGE 339
>gi|2388555|gb|AAB69977.1| alpha2(I) collagen, partial [Homo sapiens]
Length = 1186
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 45/132 (34%), Positives = 60/132 (45%), Gaps = 6/132 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP G GP G + G G+ GPSG +GP+G++ GPSG G G
Sbjct: 773 NIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSG---PVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKG 829
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
GP G G +G L+ L G + G G +GP+G GPSG DG
Sbjct: 830 EPGEKGPRGLPGLKGHNG-LQGL--PGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDG 886
Query: 132 PSGRLRYLGPSG 143
+G +GP+G
Sbjct: 887 RTGHPGTVGPAG 898
>gi|169826010|ref|YP_001696168.1| hypothetical protein Bsph_0411 [Lysinibacillus sphaericus C3-41]
gi|168990498|gb|ACA38038.1| hypothetical glycine-rich protein [Lysinibacillus sphaericus C3-41]
Length = 1142
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/102 (26%), Positives = 47/102 (46%), Gaps = 6/102 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
N+GP+G G +G G +G+ +GP+G +G +G+ G +G G +G
Sbjct: 515 NIGPTGATGVAGIAGVTGATGSTGATGDIGPTGATGAIGVTGATGAAGIAGVTGATGSTG 574
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 113
+GP+G++ G + GP+G G +G + G
Sbjct: 575 ATGDVGPTGAIGVTGAT------GPTGAAGIAGVTGATGFTG 610
>gi|326677607|ref|XP_002665924.2| PREDICTED: collagen alpha-1(V) chain [Danio rerio]
Length = 2118
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 58/177 (32%), Positives = 66/177 (37%), Gaps = 6/177 (3%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GPSG LGP GP G + Y GP G G G G G
Sbjct: 1038 GPPGHPGKEGPSGEKGNLGPH------GPQGPIGYPGPRGVKGADGVRGLKGNKGEKGED 1091
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+ G G + G G L GP G GP GR G G L LG G+L G
Sbjct: 1092 GFPGFKGDMGVKGDKGELGAAGPRGEDGPEGPKGRSGLPGDPGPLGPLGEKGKLGVPGLP 1151
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 190
G GP G + G G G G GP G+ GP G GP+G+
Sbjct: 1152 GYPGRQGPKGSQGFQGFQGTSGEKGTRGTAGKPGPRGQRGPTGPRGERGPRGPTGKA 1208
>gi|118477013|ref|YP_894164.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis str. Al Hakam]
gi|118416238|gb|ABK84657.1| collagen-like protein [Bacillus thuringiensis str. Al Hakam]
Length = 742
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/103 (29%), Positives = 39/103 (37%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 420 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGAT 479
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSG 134
G G GP+G G G GP+G + G G
Sbjct: 480 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 522
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/103 (29%), Positives = 38/103 (36%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G G G GP+G+ G G GP+G+ G G GP+G
Sbjct: 420 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGAT 479
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 116
G G GP+G G G GP+G G G
Sbjct: 480 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 522
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/103 (29%), Positives = 38/103 (36%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G+ G G GP+G G G GP+G G G GP+G
Sbjct: 420 GPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGATGATGAQGPQGIQGPAGAT 479
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 152
G G GP+G + G G GP+G G G
Sbjct: 480 GATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQGPQGVQGPAGATGATGAQG 522
>gi|211607|gb|AAA69962.1| alpha-2 type I collagen [Gallus gallus]
Length = 896
Score = 37.0 bits (84), Expect = 5.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 41/116 (35%), Positives = 53/116 (45%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL---RYLG 140
G +G LG SG GPSG + GP+G G G +DGP GR + G
Sbjct: 419 IAGATGEPGPLGVSGPPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKG 478
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GPSG L GP G+ +GPSG+ G G + +GP+G GL+
Sbjct: 479 ERGAPGNPGPSGALGAPGPHGQ---VGPSGKPGNRGDPGPVGPVGPAGAFGPRGLA 531
>gi|228920266|ref|ZP_04083614.1| hypothetical protein bthur0011_12820 [Bacillus thuringiensis
serovar huazhongensis BGSC 4BD1]
gi|228839465|gb|EEM84758.1| hypothetical protein bthur0011_12820 [Bacillus thuringiensis
serovar huazhongensis BGSC 4BD1]
Length = 389
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/149 (28%), Positives = 59/149 (39%), Gaps = 17/149 (11%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP G GP+G+ GP G GP+G G G G +G
Sbjct: 139 GPAGAT---GPQGLQGIQGPAGAT---GPQGLQGIQGPAGATGATGAQGVQGPAGATGAT 192
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
G G + G +G GP+G GP G GP+G G +G GP+
Sbjct: 193 GAQGVQGPAGATGATGAQGIQGPAGAT---GPQGPQGIQGPAGAT---GATGAQGIQGPA 246
Query: 179 GRLRYLGPSG-----RLRYLGLSDGLRVS 202
G GP+G + +G S+ +S
Sbjct: 247 GATGATGPAGTPIPVTIAAIGNSNAQTIS 275
>gi|355672417|ref|ZP_09058347.1| hypothetical protein HMPREF9469_01384 [Clostridium citroniae
WAL-17108]
gi|354815118|gb|EHE99714.1| hypothetical protein HMPREF9469_01384 [Clostridium citroniae
WAL-17108]
Length = 529
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 49/112 (43%), Gaps = 12/112 (10%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP+G GP G GP+G+ +GP G Y+GP+G +GP G GP+
Sbjct: 63 GPTGPTGPQGPRGCPGIQGPTGATGAIGPQG---YVGPTGPTGPMGPRGFNGATGPA--- 116
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 125
GP G GP+G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 117 ---GPQGPQGIQGPAGLTGATGPTG---LQGPQGIQGPTGVTGIQGIQGPQG 162
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 49/112 (43%), Gaps = 12/112 (10%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G GP G GP+G+ +GP G Y+GP+G +GP G GP+
Sbjct: 63 GPTGPTGPQGPRGCPGIQGPTGATGAIGPQG---YVGPTGPTGPMGPRGFNGATGPA--- 116
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSG 143
GP G GP+G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 117 ---GPQGPQGIQGPAGLTGATGPTG---LQGPQGIQGPTGVTGIQGIQGPQG 162
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 49/112 (43%), Gaps = 12/112 (10%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP+G GP G GP+G +GP G Y+GP+G +GP G GP+
Sbjct: 63 GPTGPTGPQGPRGCPGIQGPTGATGAIGPQG---YVGPTGPTGPMGPRGFNGATGPA--- 116
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 161
GP G GP+G + GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 117 ---GPQGPQGIQGPAGLTGATGPTG---LQGPQGIQGPTGVTGIQGIQGPQG 162
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/112 (33%), Positives = 49/112 (43%), Gaps = 12/112 (10%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
GP+G GP G GP+G +GP G Y+GP+G +GP G + GP+
Sbjct: 63 GPTGPTGPQGPRGCPGIQGPTGATGAIGPQG---YVGPTGPTGPMGPRGFNGATGPA--- 116
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
GP G GP+G GP+G GP G G +G GP G
Sbjct: 117 ---GPQGPQGIQGPAGLTGATGPTG---LQGPQGIQGPTGVTGIQGIQGPQG 162
>gi|225575174|ref|ZP_03783784.1| hypothetical protein RUMHYD_03263, partial [Blautia
hydrogenotrophica DSM 10507]
gi|225037641|gb|EEG47887.1| collagen triple helix repeat protein, partial [Blautia
hydrogenotrophica DSM 10507]
Length = 276
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 51/165 (30%), Positives = 62/165 (37%), Gaps = 18/165 (10%)
Query: 35 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSG---RL 91
G + GP G GP+G GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 26 GPMGPQGPKGDSGCPGPAGPRGAAGPAG---PRGPQGVRGDAGPKGDPGSIGPQGIQGNP 82
Query: 92 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 151
+GP G +GP G GP +GP G G G GP G + G +
Sbjct: 83 GAIGPQGDRGPVGPKGDTGPAGP------VGPKGERGERGERGPAGEQGPQGEQGFAGVT 136
Query: 152 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GP G + GP G GP+G GP G G S
Sbjct: 137 G---PQGPQGEVGCPGPQGEQGIQGPTG---ATGPKGEKGDDGAS 175
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 59/212 (27%), Positives = 77/212 (36%), Gaps = 36/212 (16%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP---SGRLRYLGPS 70
GP G GP+G GP+G GP G GP G +GP G +GP
Sbjct: 32 GPKGDSGCPGPAGPRGAAGPAGPR---GPQGVRGDAGPKGDPGSIGPQGIQGNPGAIGPQ 88
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 124
G +GP G GP G GP+G GP G + G +G GP
Sbjct: 89 GDRGPVGPKGDTGPAGPVGPKGERGERGERGPAGE---QGPQGEQGFAGVTG---PQGPQ 142
Query: 125 GRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY----LGPSGR--------- 171
G + GP G GP+G GP G G S + G + +
Sbjct: 143 GEVGCPGPQGEQGIQGPTG---ATGPKGEKGDDGASPTVVVGNVTAGENAQVTANPTETG 199
Query: 172 --LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLSDGLRV 201
L ++ P+G GP G G+S + V
Sbjct: 200 VSLDFVIPAGATGETGPQGEKGEAGVSPTVSV 231
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/158 (31%), Positives = 61/158 (38%), Gaps = 18/158 (11%)
Query: 26 GSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG---SL 82
G + GP G GP+G GP+G GP G GP G +GP G +
Sbjct: 26 GPMGPQGPKGDSGCPGPAGPRGAAGPAGPR---GPQGVRGDAGPKGDPGSIGPQGIQGNP 82
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
+GP G +GP G GP +GP G G G GP G + G +
Sbjct: 83 GAIGPQGDRGPVGPKGDTGPAGP------VGPKGERGERGERGPAGEQGPQGEQGFAGVT 136
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G GP G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 137 G---PQGPQGEVGCPGPQGEQGIQGPTG---ATGPKGE 168
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/155 (30%), Positives = 59/155 (38%), Gaps = 21/155 (13%)
Query: 17 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG---RL 73
G + GP G GP+G GP+G GP G GP G +GP G
Sbjct: 26 GPMGPQGPKGDSGCPGPAGPRGAAGPAG---PRGPQGVRGDAGPKGDPGSIGPQGIQGNP 82
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG------RLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
+GP G +GP G GP G GP+G GP G + G +G
Sbjct: 83 GAIGPQGDRGPVGPKGDTGPAGPVGPKGERGERGERGPAGE---QGPQGEQGFAGVTG-- 137
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 162
GP G + GP G GP+G GP G
Sbjct: 138 -PQGPQGEVGCPGPQGEQGIQGPTG---ATGPKGE 168
>gi|161528190|ref|YP_001582016.1| triple helix repeat-containing collagen [Nitrosopumilus maritimus
SCM1]
gi|160339491|gb|ABX12578.1| Collagen triple helix repeat [Nitrosopumilus maritimus SCM1]
Length = 542
Score = 36.6 bits (83), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/122 (31%), Positives = 45/122 (36%), Gaps = 12/122 (9%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
G G + GP G G G GP G GP+G P G GP+
Sbjct: 374 GTEGPIGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGPTG------PPGEKGLTGPA--- 424
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G + +GP G GP+G GP G GP G GP G + GP
Sbjct: 425 ---GPPGEIGTVGPQGSQGERGPTGPSGEKGPQGPQGIQGPQGERGPTGPIGSIGEAGPR 481
Query: 170 GR 171
G
Sbjct: 482 GE 483
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/122 (31%), Positives = 45/122 (36%), Gaps = 12/122 (9%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G G + GP G G G GP G GP+G P G GP+G
Sbjct: 374 GTEGPIGEKGPQGPQGPAGAKGLTGVPGPQGEKGEKGPTG------PPGEKGLTGPAG-- 425
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
P G + +GP G GP+G GP G GP G GP G + GP
Sbjct: 426 ----PPGEIGTVGPQGSQGERGPTGPSGEKGPQGPQGIQGPQGERGPTGPIGSIGEAGPR 481
Query: 188 GR 189
G
Sbjct: 482 GE 483
>gi|348541185|ref|XP_003458067.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XI) chain-like [Oreochromis niloticus]
Length = 1811
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/176 (30%), Positives = 70/176 (39%), Gaps = 15/176 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GP G GP G+ GP+G P G + Y GP G G G + G G
Sbjct: 723 GPPGHPGKEGPPGTKGNQGPNG------PQGAIGYPGPRGVKGEQGIRGLKGHKGEKGED 776
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
+ G G G G + GP G GP GR+ G G + +G G+L G
Sbjct: 777 GFPGIKGDFGVKGERGEIGVSGPRGEDGPEGPKGRVGPPGEVGAIGLIGEKGKLGVPGVP 836
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 189
G GP G L + G + G +G GPSG+ GP G+ GP G+
Sbjct: 837 GYPGRQGPKGSLGFPG------FPGSNGEKGTRGPSGK---PGPRGQRGPTGPRGQ 883
>gi|326921773|ref|XP_003207130.1| PREDICTED: collagen alpha-2(I) chain-like [Meleagris gallopavo]
Length = 1330
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/116 (34%), Positives = 53/116 (45%), Gaps = 6/116 (5%)
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL---RYLG 140
G +G LG SG GPSG + GP+G G G +DGP GR + G
Sbjct: 853 IAGATGEPGPLGVSGPPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKG 912
Query: 141 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G GPSG + GP G+ +GPSG+ G G + +GP+G GL+
Sbjct: 913 ERGAPGNPGPSGAVGAPGPHGQ---VGPSGKPGNRGDPGPVGAVGPAGAFGPRGLA 965
>gi|386850000|ref|YP_006268013.1| Collagen alpha-5(VI) chain [Actinoplanes sp. SE50/110]
gi|359837504|gb|AEV85945.1| Collagen alpha-5(VI) chain [Actinoplanes sp. SE50/110]
Length = 327
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/130 (33%), Positives = 50/130 (38%), Gaps = 3/130 (2%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
G +G GP G GP G+ GP G GP G GP G + GP G
Sbjct: 72 GATGATGLTGPQGTTGLTGPQGATGLTGPQGPTGLTGPQGATGLTGPQGPIGLTGPQGP- 130
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 178
GP G GP+G G G GP+G GP G+ GP G GP
Sbjct: 131 --TGPQGATGPQGPAGAQGATGLPGSDGAAGPAGPAGAQGPQGKTGATGPQGAKGATGPQ 188
Query: 179 GRLRYLGPSG 188
G GP+G
Sbjct: 189 GPQGVPGPAG 198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/130 (33%), Positives = 52/130 (40%), Gaps = 3/130 (2%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
G +G+ GP G+ GP G GP G GP G GP G + GP G
Sbjct: 72 GATGATGLTGPQGTTGLTGPQGATGLTGPQGPTGLTGPQGATGLTGPQGPIGLTGPQGP- 130
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G GP+G G G GP+G GP G+ + GP G GP
Sbjct: 131 --TGPQGATGPQGPAGAQGATGLPGSDGAAGPAGPAGAQGPQGKTGATGPQGAKGATGPQ 188
Query: 143 GRLRYLGPSG 152
G GP+G
Sbjct: 189 GPQGVPGPAG 198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 46/144 (31%), Positives = 55/144 (38%), Gaps = 3/144 (2%)
Query: 36 SLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 95
S G +G G +G+ GP G GP G GP G GP G G
Sbjct: 58 SWNAKGVAGPAGPAGATGATGLTGPQGTTGLTGPQGATGLTGPQGPTGLTGPQGATGLTG 117
Query: 96 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 155
P G + GP G GP G GP+G + G G GP+G GP G+
Sbjct: 118 PQGPIGLTGPQGP---TGPQGATGPQGPAGAQGATGLPGSDGAAGPAGPAGAQGPQGKTG 174
Query: 156 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
GP G GP G GP+G
Sbjct: 175 ATGPQGAKGATGPQGPQGVPGPAG 198
>gi|326324004|gb|ADZ54068.1| virulence-associated trimeric autotransporter [Haemophilus parasuis
SH0165]
Length = 1047
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 60/189 (31%), Positives = 75/189 (39%), Gaps = 18/189 (9%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYL---GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPS 70
GP+G GP G GP G GP G + GP+G GP G GP
Sbjct: 631 GPAGPRGEAGPKG---EAGPKG---EAGPKGEAGPVGPAGPTGPAGAAGPKGEKGDPGPK 684
Query: 71 GRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL--- 127
G GP+G GP G GP+G GP G G +G+ GP+G
Sbjct: 685 GEAGSTGPTGP---AGPKGDPGQAGPAGPRGPAGPKGDAGPKGDTGQRGETGPAGPAGPK 741
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 187
GP G GP+G GP G GP+G GP+G GP+G GP+
Sbjct: 742 GEPGPKGEQGIPGPAG---PAGPKGDKGDTGPAGPQGPAGPTGPQGPAGPTGSQDPAGPT 798
Query: 188 GRLRYLGLS 196
G G++
Sbjct: 799 GNSELKGIT 807
>gi|320333804|ref|YP_004170515.1| Tail Collar domain-containing protein [Deinococcus maricopensis DSM
21211]
gi|319755093|gb|ADV66850.1| Tail Collar domain protein [Deinococcus maricopensis DSM 21211]
Length = 482
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/124 (30%), Positives = 50/124 (40%), Gaps = 2/124 (1%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGP--SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 106
GP G+ GP+G G +G +GP +GS+ GP G GP G G
Sbjct: 122 TGPQGAPGDTGPAGPQGPKGDTGAQGPVGPGGTGSVGPQGPQGEKGETGPQGVPGLQGLM 181
Query: 107 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL 166
G G G + GP G G G + GP G GP+G + +GP G
Sbjct: 182 GAQGPQGEKGEIGAQGPQGEKGETGAQGPMGLPGPMGMAGPAGPAGPVGPVGPQGLQGQA 241
Query: 167 GPSG 170
G +G
Sbjct: 242 GAAG 245
>gi|327283919|ref|XP_003226687.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXVII) chain-like [Anolis carolinensis]
Length = 1783
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/96 (33%), Positives = 44/96 (45%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP GR GP G + LGP G+ LG +G+ G G++ +G +G + G G
Sbjct: 996 GPKGRRGARGPDGLVGELGPQGAKGLLGNTGKDGLHGQQGKIGEIGEAGPRGFPGIQGPS 1055
Query: 119 RYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 154
G G L GP G GP G + + GP G +
Sbjct: 1056 GPQGTKGPLGDPGPQGAQGPPGPLGEIGHKGPPGSV 1091
>gi|300810921|gb|ADK35755.1| collagen type I alpha 1 [Ctenopharyngodon idella]
Length = 1448
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 43/105 (40%), Gaps = 3/105 (2%)
Query: 77 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRL 136
G +G+ +GP+G GP G G G + GP G G G +G G
Sbjct: 767 GETGAPGLVGPTG---ARGPPGERGETGAPGPAGFAGPPGADGLPGAKGEAGDNGAKGDA 823
Query: 137 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 181
GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 824 GSPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRV 868
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/107 (29%), Positives = 46/107 (42%), Gaps = 3/107 (2%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+ G +G +GP+G+ G G GP+G + GP G+ G G G G
Sbjct: 765 DKGETGAPGLVGPTGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEAGDNGAKG 821
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G+ GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 822 DAGSPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRV 868
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 44/105 (41%), Gaps = 3/105 (2%)
Query: 68 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 127
G +G +GP+G+ G G GP+G + GP G G G G G
Sbjct: 767 GETGAPGLVGPTGARGPPGERGETGAPGPAG---FAGPPGADGLPGAKGEAGDNGAKGDA 823
Query: 128 NSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
S GP+G GP G + GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 824 GSPGPAGATGAPGPQGPVGATGPKGARGAAGPPGATGFPGAAGRV 868
>gi|348528769|ref|XP_003451888.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain-like isoform 2 [Oreochromis
niloticus]
Length = 1421
Score = 36.6 bits (83), Expect = 6.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/97 (31%), Positives = 38/97 (39%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GPSG+ G G GP G + GP G+ G G G G GP G
Sbjct: 743 AGPSGAPGVRGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGTKGEQGEPGQKGDAGAPGPQGP 802
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 803 SGAPGPAGPTGVSGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 839
>gi|218688947|ref|YP_002397159.1| hypothetical protein ECED1_1138 [Escherichia coli ED1a]
gi|218426511|emb|CAR07339.1| conserved hypothetical protein [Escherichia coli ED1a]
Length = 566
Score = 36.6 bits (83), Expect = 7.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/166 (32%), Positives = 65/166 (39%), Gaps = 16/166 (9%)
Query: 7 VEKALNLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRY 66
E+ PSG GP G GP+G GP G GP G P+G+
Sbjct: 325 AEEVATTRPSGE-SIPGPKGDRGEQGPAGPT---GPKGERGEPGPQG------PAGQKGE 374
Query: 67 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 126
G G GP+G++ GP G GP G GP G G G +GP+G
Sbjct: 375 QGLRGLQGATGPAGAVGPAGPQGPAGAAGPKGDAGPAGPRGERGPAGAQGVPGPVGPAGP 434
Query: 127 LNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G G +GR GP G GP G GP+GRL
Sbjct: 435 AGKTGPRG---LQGETGRQGPTGPQGPTGETGPQG---PQGPTGRL 474
>gi|348528767|ref|XP_003451887.1| PREDICTED: collagen alpha-1(II) chain-like isoform 1 [Oreochromis
niloticus]
Length = 1491
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/97 (31%), Positives = 38/97 (39%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GPSG+ G G GP G + GP G+ G G G G GP G
Sbjct: 813 AGPSGAPGVRGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGTKGEQGEPGQKGDAGAPGPQGP 872
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 873 SGAPGPAGPTGVSGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 909
>gi|317418814|emb|CBN80852.1| Uncharacterized protein [Dicentrarchus labrax]
Length = 1490
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/97 (32%), Positives = 39/97 (40%)
Query: 49 LGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 108
GPSG+ G G GP G + GP GS G G G G GP G
Sbjct: 812 AGPSGAPGTRGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGSDGQPGIKGEQGESGQKGDAGAPGPQGP 871
Query: 109 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRL 145
GP+G GP G + GP G + G +GR+
Sbjct: 872 SGAPGPAGPTGVSGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 908
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/97 (32%), Positives = 38/97 (39%)
Query: 22 LGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGS 81
GPSG+ G G GP G + GP GS G G G G GP G
Sbjct: 812 AGPSGAPGTRGAPGDRGETGPPGPAGFAGPPGSDGQPGIKGEQGESGQKGDAGAPGPQGP 871
Query: 82 LRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP G GP G + G +GR+
Sbjct: 872 SGAPGPAGPTGVSGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRV 908
>gi|47198224|emb|CAF87674.1| unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Length = 291
Score = 36.2 bits (82), Expect = 7.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 55/172 (31%), Positives = 74/172 (43%), Gaps = 25/172 (14%)
Query: 25 SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLG-PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLR 83
SG + G G+ +GP G LGP+GS L PSG GP+G + G +G+L
Sbjct: 17 SGMKGFRGNRGAPGVMGPHGLKGALGPAGSPGALVRPSGERGPPGPAGAIGQPGRAGALG 76
Query: 84 YLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYL---------------GPSGRLN 128
GP G G G +GP+G+ GP G L + G G+
Sbjct: 77 VAGPMGEK---GEPGEKGPVGPAGKDGEQGPLGALGVIGPPGPPGDDGDKGEQGEPGQKG 133
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
S G G LGP+G GP+G+L +G G +GP G+ GP G
Sbjct: 134 SKGDKGEGGPLGPTG---PQGPAGQLGVVGADG---PVGPRGQQGMYGPKGD 179
>gi|432910778|ref|XP_004078520.1| PREDICTED: collagen alpha-2(V) chain-like [Oryzias latipes]
Length = 639
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/185 (28%), Positives = 72/185 (38%), Gaps = 9/185 (4%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
LG G + GP G + G +GS+ GP+G P G G G G G
Sbjct: 200 ELGLKGDIGIQGPRGGVGAPGETGSIGDPGPAG------PRGGKGIKGSRGEQGKQGLQG 253
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G+ + G +G Y G G+ +GPSG G G G G DG
Sbjct: 254 KDGLKGQIGAPGFPGDNGERGYSGYPGQPGGIGPSG---PKGSKGHGGLPGSDGEPGEDG 310
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR 191
P+G ++G G G G GP GR+ +GP G G G+ G G+
Sbjct: 311 PTGVTGFMGEPGPFGVKGSKGDPGTKGPRGRVGRVGPQGEPGDAGVPGKQGVKGLQGQTG 370
Query: 192 YLGLS 196
G +
Sbjct: 371 AQGET 375
>gi|456391299|gb|EMF56672.1| hypothetical protein SBD_2001 [Streptomyces bottropensis ATCC
25435]
Length = 385
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/67 (37%), Positives = 34/67 (50%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 118
GP+G GP+G GP GS+ GP+G + GP+G +GP+G + GP G
Sbjct: 251 GPAGPTGPEGPAGDTGPTGPPGSVGPTGPAGSVGPTGPAGPTGPVGPTGPVGPEGPKGDT 310
Query: 119 RYLGPSG 125
GP G
Sbjct: 311 GPQGPEG 317
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/67 (37%), Positives = 34/67 (50%)
Query: 32 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRL 91
GP+G GP+G GP GS+ GP+G + GP+G +GP+G + GP G
Sbjct: 251 GPAGPTGPEGPAGDTGPTGPPGSVGPTGPAGSVGPTGPAGPTGPVGPTGPVGPEGPKGDT 310
Query: 92 RYLGPSG 98
GP G
Sbjct: 311 GPQGPEG 317
>gi|443688146|gb|ELT90915.1| hypothetical protein CAPTEDRAFT_132144, partial [Capitella teleta]
Length = 196
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/146 (32%), Positives = 60/146 (41%), Gaps = 9/146 (6%)
Query: 50 GPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 109
GP G++ GP G L GP G +GP G GP G G G GP G +
Sbjct: 58 GPPGTVGTNGPIGTL---GPPGTPGTIGPDG---LTGPPGTKGLKGVKGTHGPPGPIGNI 111
Query: 110 RYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPS 169
GP G GP G + GP G +G G + +G G GP G +GP
Sbjct: 112 GATGPPGTPGTYGPMGPPGTAGPKGLKGLIGTKGVIGTIGTQGIQGQRGPRGTPGTIGPK 171
Query: 170 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G Y G G+ G +G L +G+
Sbjct: 172 G---YKGAPGQQGPPGTAGLLGTVGV 194
>gi|410923563|ref|XP_003975251.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXVII) chain B-like [Takifugu rubripes]
Length = 1645
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 47/150 (31%), Positives = 61/150 (40%), Gaps = 6/150 (4%)
Query: 52 SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGP------SGRLRYLGP 105
SG + LG G ++GP+G + G G G G GP G + GP
Sbjct: 811 SGEVGKLGERGLPGFVGPAGPMGITGEKGDRGKTGAPGLPGEKGPMGPPGLCGSIGIRGP 870
Query: 106 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRY 165
G GP G + G SG +GP G+L LG G+L LG G + G G
Sbjct: 871 KGFRGPAGPDGPVGDKGSSGVKGPEGPPGKLGLLGAMGKLGELGEPGPQGFPGVPGPSGP 930
Query: 166 LGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGL 195
G G GP+G +GP G + GL
Sbjct: 931 RGAKGVAGEPGPAGPAGTIGPLGEMGLSGL 960
>gi|348528105|ref|XP_003451559.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXVII) chain A-like [Oreochromis
niloticus]
Length = 1784
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 48/174 (27%), Positives = 65/174 (37%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
+GP G GP G G G G G +G G + G G GP+G
Sbjct: 1088 TIGPLGETGQKGPPGKAGEPGLPGEPGEKGAIGLPGNIGEQGLIGQRGEPGLEGEAGPAG 1147
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
G G + G G G G+ G G GP G+ +G G+ S G
Sbjct: 1148 PDGTKGEKGDMGQEGDKGEKGETGQKGKEGPPGSPGFTGVRGPEGKPGKIGERGKPGSKG 1207
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLG 185
G +LG +G + GP G + G G + ++G GR+ G G Y G
Sbjct: 1208 AKGNQGHLGETGPVGKTGPPGFVGPKGSRGTIGHVGAPGRMGQQGEPGIAGYEG 1261
>gi|256090420|ref|XP_002581189.1| hypothetical protein [Schistosoma mansoni]
Length = 713
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 68/174 (39%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GPSG G G +G G LGP G G G GP G + G G
Sbjct: 297 GPSGMKGEDGRPGDSGLIGLKGDKGELGPPGPKGDQGLPGEEGPRGPHGDIGDQGDPGLP 356
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G+ GP G+ GP GR LG G GP+G + + GP G GP+
Sbjct: 357 GVRGPVGQPGPQGPRGKPGNQGPRGRKGELGEPGLPGLPGPAGPIGTSGPEGMAGPRGPT 416
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G SG G G + GP G +GP G GP+G G+
Sbjct: 417 GVAGQRGRSGPSGVPGTDGLPGFPGPKGD---VGPKGD---TGPNGSKGDTGIQ 464
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 57/175 (32%), Positives = 65/175 (37%), Gaps = 3/175 (1%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
GPSG G G +G G LGP G G G GP G + G G
Sbjct: 297 GPSGMKGEDGRPGDSGLIGLKGDKGELGPPGPKGDQGLPGEEGPRGPHGDIGDQGDPGLP 356
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
GP G GP G+ GP GR LG G GP+G + GP G GP+
Sbjct: 357 GVRGPVGQPGPQGPRGKPGNQGPRGRKGELGEPGLPGLPGPAGPIGTSGPEGMAGPRGPT 416
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 188
G G SG G G + GP G +GP G G G GP G
Sbjct: 417 GVAGQRGRSGPSGVPGTDGLPGFPGPKGD---VGPKGDTGPNGSKGDTGIQGPRG 468
>gi|344272030|ref|XP_003407839.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXVII) chain [Loxodonta africana]
Length = 1861
Score = 36.2 bits (82), Expect = 8.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 49/137 (35%), Positives = 62/137 (45%), Gaps = 15/137 (10%)
Query: 59 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR-----LRYL-GPSGRLRYL 112
G GR + GP GR GP GS GP G+ G +GR L+ L GP G +
Sbjct: 1380 GQQGRPGHPGPQGRP---GPKGSKGEEGPKGKQGKAGAAGRRGIQGLQGLPGPRGVVGRQ 1436
Query: 113 GPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 172
GP G GP G DGP+G+ G G +GP+G+ G +G GP G
Sbjct: 1437 GPEG---VAGPDGLPGRDGPAGQQGEQGDDGDPGPMGPAGKRGNPGVAGLPGAQGPPG-- 1491
Query: 173 RYLGPSGRLRYLGPSGR 189
+ G SG LGP G+
Sbjct: 1492 -FKGESGLPGQLGPPGK 1507
>gi|355745425|gb|EHH50050.1| hypothetical protein EGM_00812 [Macaca fascicularis]
Length = 1714
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/172 (30%), Positives = 73/172 (42%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
++GP G + GP G G G+ +GP+G + G G LR G G G
Sbjct: 1000 DVGPPGEMGIEGPPGIEGESGLQGEPGAKGDVGPAGSVGEPGEPG-LR--GEPGAPGEEG 1056
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G+ G SG G G +G G + LG SG++ GP G + G GRL
Sbjct: 1057 LQGKDGLKGASGGRGLPGEDGEKGDMGLPGIIGPLGRSGQMGLPGPEGIVGIPGQRGRLG 1116
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G+ +GP+G + G G++ GP G G G L +GP G
Sbjct: 1117 KKGDKGQ---IGPTGEVGSRGSPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGE 1165
>gi|423003217|ref|ZP_16993963.1| hypothetical protein EUDG_00701 [Escherichia coli O104:H4 str.
04-8351]
gi|354870750|gb|EHF31150.1| hypothetical protein EUDG_00701 [Escherichia coli O104:H4 str.
04-8351]
Length = 881
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 54/167 (32%), Positives = 65/167 (38%), Gaps = 6/167 (3%)
Query: 13 LGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGR 72
GP+G GP G GP+G+ G G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 480 AGPAGPAGPQGPKGDTGAAGPAGAQGPKGDKGDPGVAGPAGPAGPQGPKGDTGAAGPAGA 539
Query: 73 LRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGP 132
G G GP+G GP G GP+G G G GP+G GP
Sbjct: 540 QGPKGDKGDPGVAGPAGPAGPQGPKGDTGAAGPAGAQGPKGDKGDPGVAGPAGPAGPQGP 599
Query: 133 SGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 179
G GP+G GP G GP+G GP G GP+G
Sbjct: 600 KGDTGAAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG---PQGPKGDTGAAGPAG 640
>gi|395530618|ref|XP_003767386.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXIV) chain [Sarcophilus harrisii]
Length = 1661
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 52/167 (31%), Positives = 68/167 (40%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRL 73
G +G + +GP G G SG G G L +G G+ G G G G
Sbjct: 946 GDAGPVGEMGPEGPPGIEGESGLQGEPGTKGDLGPVGNVGASGEPGLRGEPGTPGEDGLQ 1005
Query: 74 RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPS 133
G G + GP G G +G +GPSG +GPSG +G G+ G
Sbjct: 1006 GKDGIKGHIGDTGPPGEPGEQGETGLPGIIGPSGGPGTIGPSGPEGAVGNPGQRGRPGKK 1065
Query: 134 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G LGP+G + G G+ +GP G GP G L +GP G
Sbjct: 1066 GEKGQLGPTGEIGSTGALGQTGEIGPKGARGTRGPVGSLGLMGPEGE 1112
>gi|363736914|ref|XP_422363.3| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: collagen alpha-1(XXIV) chain [Gallus
gallus]
Length = 1808
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/91 (34%), Positives = 42/91 (46%)
Query: 80 GSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYL 139
GS GP+G + G +G G G + GP G +G G L GP+G++ Y
Sbjct: 1466 GSQGDQGPAGEVGAKGQTGEDGDQGLMGFQGFPGPKGPAGDVGLVGILGPKGPTGQIGYS 1525
Query: 140 GPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSG 170
GP G+ GP+GR G G +GP G
Sbjct: 1526 GPVGQEGITGPTGRPGPRGEKGTRGEMGPQG 1556
>gi|397467268|ref|XP_003805346.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXIV) chain [Pan paniscus]
Length = 1714
Score = 36.2 bits (82), Expect = 9.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 50/169 (29%), Positives = 67/169 (39%), Gaps = 3/169 (1%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSG 71
++GP G + GP G+ G G G G +G +G G G G G
Sbjct: 1000 DVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQG 1059
Query: 72 RLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDG 131
+ G G G G +G G + LG SG+ GP G + G GR G
Sbjct: 1060 KDGLKGVPGGRGLPGEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKG 1119
Query: 132 PSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G+ +GP+G + GP GR+ GP G G G L +GP G
Sbjct: 1120 DKGQ---IGPTGEVGSRGPPGRIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGE 1165
>gi|353229666|emb|CCD75837.1| hypothetical protein Smp_196840 [Schistosoma mansoni]
Length = 1533
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 56/174 (32%), Positives = 68/174 (39%), Gaps = 6/174 (3%)
Query: 23 GPSGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGSL 82
GPSG G G +G G LGP G G G GP G + G G
Sbjct: 281 GPSGMKGEDGRPGDSGLIGLKGDKGELGPPGPKGDQGLPGEEGPRGPHGDIGDQGDPGLP 340
Query: 83 RYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLNSDGPSGRLRYLGPS 142
GP G+ GP G+ GP GR LG G GP+G + + GP G GP+
Sbjct: 341 GVRGPVGQPGPQGPRGKPGNQGPRGRKGELGEPGLPGLPGPAGPIGTSGPEGMAGPRGPT 400
Query: 143 GRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGLS 196
G G SG G G + GP G +GP G GP+G G+
Sbjct: 401 GVAGQRGRSGPSGVPGTDGLPGFPGPKGD---VGPKGD---TGPNGSKGDTGIQ 448
>gi|332025170|gb|EGI65350.1| ATP-dependent helicase brm [Acromyrmex echinatior]
Length = 1953
Score = 35.8 bits (81), Expect = 9.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 43/128 (33%), Positives = 66/128 (51%), Gaps = 11/128 (8%)
Query: 14 GPSGRLRYLGPSGSL---RYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGP-SGRLRYLGP 69
GP G++ P G + +GP+G+ +GPS +GP+G +GP SG + LGP
Sbjct: 313 GPPGQMSMNAPGGQMGPGNQMGPAGTGNQMGPSAPGSQMGPTGPGGQMGPGSGPVGQLGP 372
Query: 70 SGRLRYLGP-SGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLR-YLGPSGRL 127
+ L +GP SGS+ SG + +GP+G GP+G P G++ GP G++
Sbjct: 373 NS-LGQMGPGSGSVPMTTSSGPVS-IGPNGP---NGPTGICVMSAPGGQMTSSSGPGGQM 427
Query: 128 NSDGPSGR 135
+ GP G
Sbjct: 428 GAAGPGGN 435
>gi|109009549|ref|XP_001109249.1| PREDICTED: collagen alpha-1(XXIV) chain-like isoform 2 [Macaca
mulatta]
Length = 1714
Score = 35.8 bits (81), Expect = 10.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 53/172 (30%), Positives = 73/172 (42%), Gaps = 9/172 (5%)
Query: 12 NLGPSGRLRYLGP---SGSLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLG 68
++GP G + GP G G G+ +GP+G + G G LR G G G
Sbjct: 1000 DVGPPGEMGIEGPPGIEGESGLQGEPGAKGDVGPAGSVGEPGEPG-LR--GEPGAPGEEG 1056
Query: 69 PSGRLRYLGPSGSLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLN 128
G+ G SG G G +G G + LG SG++ GP G + G GRL
Sbjct: 1057 LQGKDGLKGASGGRGLPGEDGEKGDMGLPGIIGPLGRSGQMGLPGPEGIVGIPGQRGRLG 1116
Query: 129 SDGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGRLRYLGPSGR 180
G G+ +GP+G + G G++ GP G G G L +GP G
Sbjct: 1117 KKGDKGQ---IGPTGEVGSRGSPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGE 1165
Database: nr
Posted date: Mar 3, 2013 10:45 PM
Number of letters in database: 999,999,864
Number of sequences in database: 2,912,245
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.01
Posted date: Mar 3, 2013 10:52 PM
Number of letters in database: 999,999,666
Number of sequences in database: 2,912,720
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.02
Posted date: Mar 3, 2013 10:58 PM
Number of letters in database: 999,999,938
Number of sequences in database: 3,014,250
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.03
Posted date: Mar 3, 2013 11:03 PM
Number of letters in database: 999,999,780
Number of sequences in database: 2,805,020
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.04
Posted date: Mar 3, 2013 11:08 PM
Number of letters in database: 999,999,551
Number of sequences in database: 2,816,253
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.05
Posted date: Mar 3, 2013 11:13 PM
Number of letters in database: 999,999,897
Number of sequences in database: 2,981,387
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.06
Posted date: Mar 3, 2013 11:18 PM
Number of letters in database: 999,999,649
Number of sequences in database: 2,911,476
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.07
Posted date: Mar 3, 2013 11:24 PM
Number of letters in database: 999,999,452
Number of sequences in database: 2,920,260
Database: /local_scratch/syshi//blastdatabase/nr.08
Posted date: Mar 3, 2013 11:25 PM
Number of letters in database: 64,230,274
Number of sequences in database: 189,558
Lambda K H
0.321 0.150 0.466
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 4,096,385,389
Number of Sequences: 23463169
Number of extensions: 219777765
Number of successful extensions: 1451143
Number of sequences better than 100.0: 1000
Number of HSP's better than 100.0 without gapping: 5796
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 2581
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 524836
Number of HSP's gapped (non-prelim): 279500
length of query: 205
length of database: 8,064,228,071
effective HSP length: 136
effective length of query: 69
effective length of database: 9,168,204,383
effective search space: 632606102427
effective search space used: 632606102427
T: 11
A: 40
X1: 16 ( 7.4 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (21.7 bits)
S2: 73 (32.7 bits)