Query psy6082
Match_columns 275
No_of_seqs 341 out of 1195
Neff 9.5
Searched_HMMs 29240
Date Fri Aug 16 17:11:34 2013
Command hhsearch -i /work/01045/syshi/Psyhhblits/psy6082.a3m -d /work/01045/syshi/HHdatabase/pdb70.hhm -o /work/01045/syshi/hhsearch_pdb/6082hhsearch_pdb -cpu 12 -v 0
No Hit Prob E-value P-value Score SS Cols Query HMM Template HMM
1 3b5x_A Lipid A export ATP-bind 99.9 8E-25 2.7E-29 203.8 29.7 228 32-272 69-296 (582)
2 3b60_A Lipid A export ATP-bind 99.9 6.6E-25 2.3E-29 204.3 27.8 228 32-272 69-296 (582)
3 2yl4_A ATP-binding cassette SU 99.9 1.1E-24 3.8E-29 203.3 29.0 227 32-271 66-292 (595)
4 4f4c_A Multidrug resistance pr 99.9 5.5E-25 1.9E-29 220.7 28.3 234 26-272 134-367 (1321)
5 3qf4_B Uncharacterized ABC tra 99.9 1.1E-24 3.6E-29 203.4 27.1 228 30-270 79-306 (598)
6 3qf4_A ABC transporter, ATP-bi 99.9 2E-24 6.8E-29 201.0 28.2 228 32-272 67-294 (587)
7 4a82_A Cystic fibrosis transme 99.9 5.8E-25 2E-29 204.5 23.8 232 28-272 61-292 (578)
8 3g5u_A MCG1178, multidrug resi 99.9 1.7E-23 5.7E-28 209.6 24.6 223 29-264 109-331 (1284)
9 4f4c_A Multidrug resistance pr 99.9 8.4E-21 2.9E-25 190.6 17.7 222 29-263 795-1018(1321)
10 3g5u_A MCG1178, multidrug resi 99.8 4.6E-19 1.6E-23 177.6 27.6 223 29-264 750-974 (1284)
11 3qf4_A ABC transporter, ATP-bi 93.9 3.9 0.00013 37.6 24.7 155 23-195 62-220 (587)
12 3b5x_A Lipid A export ATP-bind 92.7 5.8 0.0002 36.3 22.9 57 30-86 71-131 (582)
13 3qf4_B Uncharacterized ABC tra 92.2 7.1 0.00024 35.9 24.2 64 23-86 76-143 (598)
14 3b60_A Lipid A export ATP-bind 89.1 13 0.00046 33.9 24.9 152 30-199 71-226 (582)
15 4a82_A Cystic fibrosis transme 87.1 18 0.00061 33.1 22.0 62 25-86 62-127 (578)
16 2yl4_A ATP-binding cassette SU 85.6 22 0.00074 32.6 25.5 58 30-87 68-129 (595)
No 1
>3b5x_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; 5.50A {Vibrio cholerae}
Probab=99.94 E-value=8e-25 Score=203.76 Aligned_cols=228 Identities=15% Similarity=0.093 Sum_probs=211.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHHHHHHH
Q psy6082 32 LGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMVFNIVP 111 (275)
Q Consensus 32 ~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~~~~i~ 111 (275)
++++++.++..++.++..+...+.+.++..++|.++|+|++++|+++|+++++|++++|+++|++.+++.+...+..++.
T Consensus 69 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~rl~~d~~~i~~~~~~~~~~~~~ 148 (582)
T 3b5x_A 69 FMILGLMFVRGLSGFASSYCLSWVSGNVVMQMRRRLFNHFMHMPVRFFDQESTGGLLSRITYDSEQVAGATSRALVSIVR 148 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 33455566678889999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHhhcchH
Q psy6082 112 TIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSLINYE 191 (275)
Q Consensus 112 ~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~~i~ 191 (275)
.++.+++.++++ +.++|+++++++++.|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|++
T Consensus 149 ~~~~~i~~~~~l-------------~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~ 215 (582)
T 3b5x_A 149 EGASIIGLLTLM-------------FWNSWQLSLVLIVVAPVVAFAISFVSKRFRKISRNMQTAMGHVTSSAEQMLKGHK 215 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHH-------------HHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHH
Confidence 999999999999 8999999999999999999888999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHHHHHhhhc
Q psy6082 192 TVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQNFIRCTLT 271 (275)
Q Consensus 192 ~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~~~~~~~~ 271 (275)
+||+||.|+.+.++|++..++..+...+..+.......+.+++..+..++++++|++++.+|.+|+|++..+..+...+.
T Consensus 216 ~Ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~~~~~ 295 (582)
T 3b5x_A 216 VVLSYGGQEVERKRFDKVSNSMRQQTMKLVSAQSIADPVIQMIASLALFAVLFLASVDSIRAELTPGTFTVVFSAMFGLM 295 (582)
T ss_pred HHHHcCCcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999887766655444
Q ss_pred c
Q psy6082 272 W 272 (275)
Q Consensus 272 ~ 272 (275)
.
T Consensus 296 ~ 296 (582)
T 3b5x_A 296 R 296 (582)
T ss_pred H
Confidence 3
No 2
>3b60_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; HET: ANP; 3.70A {Salmonella typhimurium} SCOP: c.37.1.12 f.37.1.1 PDB: 3b5y_A* 3b5z_A* 3b5w_A
Probab=99.94 E-value=6.6e-25 Score=204.31 Aligned_cols=228 Identities=16% Similarity=0.112 Sum_probs=211.6
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHHHHHHH
Q psy6082 32 LGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMVFNIVP 111 (275)
Q Consensus 32 ~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~~~~i~ 111 (275)
++++++.++..++.++..+...+.+.++..++|.++|+|++++|+++|+++++|++++|+++|++.+++.+...+..++.
T Consensus 69 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~d~~~i~~~~~~~~~~~~~ 148 (582)
T 3b60_A 69 LVVIGLMILRGITSYISSYCISWVSGKVVMTMRRRLFGHMMGMPVAFFDKQSTGTLLSRITYDSEQVASSSSGALITVVR 148 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCSTHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHCCCChhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 33455566678888999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHhhcchH
Q psy6082 112 TIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSLINYE 191 (275)
Q Consensus 112 ~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~~i~ 191 (275)
.++.+++.++++ +.++|+++++++++.|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|++
T Consensus 149 ~~~~~i~~~~~l-------------~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~ 215 (582)
T 3b60_A 149 EGASIIGLFIMM-------------FYYSWQLSIILVVLAPIVSIAIRVVSKRFRSISKNMQNTMGQVTTSAEQMLKGHK 215 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHH-------------HHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHH-------------HHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHH
Confidence 999999999999 8999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHHHHHhhhc
Q psy6082 192 TVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQNFIRCTLT 271 (275)
Q Consensus 192 ~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~~~~~~~~ 271 (275)
+||+||.|+.+.++|++..++..+...+..+.......+..++..+..++++++|++++.+|.+|+|++..+..+...+.
T Consensus 216 ~Ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~~~~~ 295 (582)
T 3b60_A 216 EVLIFGGQEVETKRFDKVSNKMRLQGMKMVSASSISDPIIQLIASLALAFVLYAASFPSVMDSLTAGTITVVFSSMIALM 295 (582)
T ss_dssp HHHHHTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSTTSSSHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHhCcCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999887776655444
Q ss_pred c
Q psy6082 272 W 272 (275)
Q Consensus 272 ~ 272 (275)
+
T Consensus 296 ~ 296 (582)
T 3b60_A 296 R 296 (582)
T ss_dssp H
T ss_pred H
Confidence 3
No 3
>2yl4_A ATP-binding cassette SUB-family B member 10, mitochondrial; membrane protein, mitochondrial transport; HET: ACP LMT CDL 14Y; 2.85A {Homo sapiens} PDB: 4aa3_A*
Probab=99.94 E-value=1.1e-24 Score=203.28 Aligned_cols=227 Identities=15% Similarity=0.153 Sum_probs=208.8
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHHHHHHH
Q psy6082 32 LGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMVFNIVP 111 (275)
Q Consensus 32 ~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~~~~i~ 111 (275)
+.++++.++..++.+++.+...+.+.++..++|.++|+|++++|+++|+++++|++++|+++|++.+++.+...+..++.
T Consensus 66 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~d~~~i~~~~~~~~~~~~~ 145 (595)
T 2yl4_A 66 LGLSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDTALLGRSVTENLSDGLR 145 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHCCCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 33444555667888999999999999999999999999999999999999999999999999999999999888999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHhhcchH
Q psy6082 112 TIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSLINYE 191 (275)
Q Consensus 112 ~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~~i~ 191 (275)
.++.+++.++++ +.++|+++++++++.|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|++
T Consensus 146 ~~~~~i~~~~~l-------------~~~~~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~ 212 (595)
T 2yl4_A 146 AGAQASVGISMM-------------FFVSPNLATFVLSVVPPVSIIAVIYGRYLRKLTKVTQDSLAQATQLAEERIGNVR 212 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHH-------------HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHH-------------HHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHH
Confidence 999999999999 9999999999999999999899999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHHHHHhhhc
Q psy6082 192 TVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQNFIRCTLT 271 (275)
Q Consensus 192 ~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~~~~~~~~ 271 (275)
+||+||.|+.+.++|++..++..+...+..+.......+..++..+..++++++|++++.+|.+|+|++..+..+...+.
T Consensus 213 ~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~~~~~ 292 (595)
T 2yl4_A 213 TVRAFGKEMTEIEKYASKVDHVMQLARKEAFARAGFFGATGLSGNLIVLSVLYKGGLLMGSAHMTVGELSSFLMYAFWVG 292 (595)
T ss_dssp HHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHhCccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999887766554443
No 4
>4f4c_A Multidrug resistance protein PGP-1; ABC transporter, ATPase, multi-drug transporter, exporter, A binding, hydrolase,protein transport; HET: NDG NAG BMA MAN 0SA; 3.40A {Caenorhabditis elegans}
Probab=99.94 E-value=5.5e-25 Score=220.74 Aligned_cols=234 Identities=9% Similarity=0.077 Sum_probs=216.3
Q ss_pred hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHH
Q psy6082 26 SATSIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAM 105 (275)
Q Consensus 26 ~~~~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~ 105 (275)
....+++.++.+.+...++.+++.++....++++..++|.++|+|++++|++||+++++|++++|+++|++.+++.+...
T Consensus 134 ~~~~~~~~~~~l~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~r~~~~lR~~~~~~ll~~~~~~fd~~~~G~l~sr~~~D~~~i~~~~~~~ 213 (1321)
T 4f4c_A 134 DVMNVVWSYAAMTVGMWAAGQITVTCYLYVAEQMNNRLRREFVKSILRQEISWFDTNHSGTLATKLFDNLERVKEGTGDK 213 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCHHHHHHTCCTTHHHHHHHHHHHHHHTSSHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34445555666667778889999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHH
Q psy6082 106 VFNIVPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAID 185 (275)
Q Consensus 106 ~~~~i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e 185 (275)
+..++..++.++++++++ +.++|++++++++++|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|
T Consensus 214 l~~~~~~~~~~i~~~i~~-------------~~~~~~l~lv~l~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e 280 (1321)
T 4f4c_A 214 IGMAFQYLSQFITGFIVA-------------FTHSWQLTLVMLAVTPIQALCGFAIAKSMSTFAIRETLRYAKAGKVVEE 280 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHCHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999999 9999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hhcchHHHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHHH
Q psy6082 186 SLINYETVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQNF 265 (275)
Q Consensus 186 ~l~~i~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~~ 265 (275)
.++|+++||+||.|+.+.++|++..++..+...+.............++..+..++++++|++++.+|.+|+|++..+..
T Consensus 281 ~l~gi~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~~v~~g~lt~g~~~~~~~ 360 (1321)
T 4f4c_A 281 TISSIRTVVSLNGLRYELERYSTAVEEAKKAGVLKGLFLGISFGAMQASNFISFALAFYIGVGWVHDGSLNFGDMLTTFS 360 (1321)
T ss_dssp HHHTHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTSSCHHHHHHHHH
T ss_pred HHHhHHHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCcHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999877766
Q ss_pred HHhhhcc
Q psy6082 266 IRCTLTW 272 (275)
Q Consensus 266 ~~~~~~~ 272 (275)
+...+.+
T Consensus 361 ~~~~~~~ 367 (1321)
T 4f4c_A 361 SVMMGSM 367 (1321)
T ss_dssp HHHHHHH
T ss_pred HHHHHHH
Confidence 5544443
No 5
>3qf4_B Uncharacterized ABC transporter ATP-binding prote TM_0288; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=99.94 E-value=1.1e-24 Score=203.38 Aligned_cols=228 Identities=14% Similarity=0.163 Sum_probs=211.5
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHHHHH
Q psy6082 30 IILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMVFNI 109 (275)
Q Consensus 30 l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~~~~ 109 (275)
+++.++++.++..++.+++.+...+.+.++..++|.++|+|++++|+++|+++++|++++|+++|++.+++.+...+..+
T Consensus 79 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G~l~~r~~~D~~~i~~~~~~~~~~~ 158 (598)
T 3qf4_B 79 YMLILGTIYALTSLLFWLQGKIMLTLSQDVVFRLRKELFEKLQRVPVGFFDRTPHGDIISRVINDVDNINNVLGNSIIQF 158 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCTHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHcCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34455555566788889999999999999999999999999999999999999999999999999999999999989999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHhhcc
Q psy6082 110 VPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSLIN 189 (275)
Q Consensus 110 i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~~ 189 (275)
+..++.+++.++++ +.++|+++++.+++.|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|
T Consensus 159 ~~~~~~~i~~~~~l-------------~~~~~~l~l~~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~g 225 (598)
T 3qf4_B 159 FSGIVTLAGAVIMM-------------FRVNVILSLVTLSIVPLTVLITQIVSSQTRKYFYENQRVLGQLNGIIEEDISG 225 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHH-------------HHHCHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcC
Confidence 99999999999999 99999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred hHHHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHHHHHhh
Q psy6082 190 YETVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQNFIRCT 269 (275)
Q Consensus 190 i~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~~~~~~ 269 (275)
+++||+||.|+.+.++|++..++..+...+..........+..++..+..++++++|++++.+|.+++|++..+..+...
T Consensus 226 i~~Ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~l~~~g~ls~g~~~~~~~~~~~ 305 (598)
T 3qf4_B 226 LTVIKLFTREEKEMEKFDRVNESLRKVGTKAQIFSGVLPPLMNMVNNLGFALISGFGGWLALKDIITVGTIATFIGYSRQ 305 (598)
T ss_dssp HHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTSSCHHHHHHHHTTTTS
T ss_pred HHHHHHcCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999998877655443
Q ss_pred h
Q psy6082 270 L 270 (275)
Q Consensus 270 ~ 270 (275)
+
T Consensus 306 ~ 306 (598)
T 3qf4_B 306 F 306 (598)
T ss_dssp S
T ss_pred H
Confidence 3
No 6
>3qf4_A ABC transporter, ATP-binding protein; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=99.94 E-value=2e-24 Score=201.03 Aligned_cols=228 Identities=7% Similarity=0.006 Sum_probs=208.6
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHHHHHHH
Q psy6082 32 LGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMVFNIVP 111 (275)
Q Consensus 32 ~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~~~~i~ 111 (275)
+.++++.++..++.++..+...+.+.++..++|.++|+|++++|+.+|++.++|++++|+++|++.+++.+...+..++.
T Consensus 67 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G~l~~r~~~D~~~i~~~~~~~~~~~~~ 146 (587)
T 3qf4_A 67 ILMLIVALIGAVGGIGCTVFASYASQNFGADLRRDLFRKVLSFSISNVNRFHTSSLITRLTNDVTQLQNLVMMLLRIVVR 146 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHccCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 33444455567788889999999999999999999999999999999999999999999999999999999988888888
Q ss_pred HHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHhhcchH
Q psy6082 112 TIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSLINYE 191 (275)
Q Consensus 112 ~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~~i~ 191 (275)
.++.+++.++++ +.++|.++++++++.|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++|++
T Consensus 147 ~~~~~i~~~~~l-------------~~~~~~l~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~gi~ 213 (587)
T 3qf4_A 147 APLLFVGGIVMA-------------VSINVKLSSVLIFLIPPIVLLFVWLTKKGNPLFRKIQESTDEVNRVVRENLLGVR 213 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHH-------------HHHCTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHH
Confidence 888888888888 8999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHHHHHhhhc
Q psy6082 192 TVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQNFIRCTLT 271 (275)
Q Consensus 192 ~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~~~~~~~~ 271 (275)
+||+|+.|+.+.++|++..++..+...+..........+..++..+..++++++|++++.+|.+++|++.++..+...+.
T Consensus 214 ~Ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~vl~~g~~~v~~g~lt~g~~~~~~~~~~~~~ 293 (587)
T 3qf4_A 214 VVRAFRREEYENENFRKANESLRRSIISAFSLIVFALPLFIFIVNMGMIAVLWFGGVLVRNNQMEIGSIMAYTNYLMQIM 293 (587)
T ss_dssp HHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcCHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999887776655544
Q ss_pred c
Q psy6082 272 W 272 (275)
Q Consensus 272 ~ 272 (275)
+
T Consensus 294 ~ 294 (587)
T 3qf4_A 294 F 294 (587)
T ss_dssp H
T ss_pred H
Confidence 3
No 7
>4a82_A Cystic fibrosis transmembrane conductance regulat; CFTR, ION channel, transport protein, casse protein; 2.00A {Homo sapiens} PDB: 2onj_A* 2hyd_A
Probab=99.94 E-value=5.8e-25 Score=204.48 Aligned_cols=232 Identities=15% Similarity=0.081 Sum_probs=213.1
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHHH
Q psy6082 28 TSIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMVF 107 (275)
Q Consensus 28 ~~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~~ 107 (275)
..+.+.++++.++..++.+++.+...+.+.++..++|.++|+|++++|+++|+++++|++++|+++|++.+++.+...+.
T Consensus 61 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G~l~~r~~~D~~~i~~~~~~~~~ 140 (578)
T 4a82_A 61 IAIGIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLM 140 (578)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHCCCC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHcCCChHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34445555566677889999999999999999999999999999999999999999999999999999999999888788
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHhh
Q psy6082 108 NIVPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSL 187 (275)
Q Consensus 108 ~~i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l 187 (275)
.++..++.+++.++++ +.++|+++++.+++.|+..++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.+
T Consensus 141 ~~~~~~~~~i~~~~~l-------------~~~~~~l~l~~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l 207 (578)
T 4a82_A 141 NIWLDCITIIIALSIM-------------FFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERV 207 (578)
T ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHCTTTHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 8888888888888898 999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred cchHHHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHHHHH
Q psy6082 188 INYETVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQNFIR 267 (275)
Q Consensus 188 ~~i~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~~~~ 267 (275)
+|+++||+||.|+.+.++|++..++..+...+..+.......+...+..+..++++++|++++.+|.+|+|++..+..+.
T Consensus 208 ~gi~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~lt~g~l~~~~~~~ 287 (578)
T 4a82_A 208 QGISVVKSFAIEDNEAKNFDKKNTNFLTRALKHTRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYL 287 (578)
T ss_dssp HHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCHHHHHHHHHTH
T ss_pred hhHHHHHHhcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCcCHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999988876665
Q ss_pred hhhcc
Q psy6082 268 CTLTW 272 (275)
Q Consensus 268 ~~~~~ 272 (275)
..+.+
T Consensus 288 ~~~~~ 292 (578)
T 4a82_A 288 ELLFG 292 (578)
T ss_dssp HHHTT
T ss_pred HHHHH
Confidence 54443
No 8
>3g5u_A MCG1178, multidrug resistance protein 1A; P-glycoprotein, PGP, cyclic peptide, membrane protein; 3.80A {Mus musculus} PDB: 3g61_A* 3g60_A*
Probab=99.92 E-value=1.7e-23 Score=209.57 Aligned_cols=223 Identities=14% Similarity=0.049 Sum_probs=209.0
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHHHH
Q psy6082 29 SIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMVFN 108 (275)
Q Consensus 29 ~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~~~ 108 (275)
.+.+.++++.++..++.+++.++....+.+...++|.++|+|++++|++||+++++|++++|+++|++.+++.+...+..
T Consensus 109 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~l~~~~~~~f~~~~~G~l~sr~~~D~~~i~~~~~~~~~~ 188 (1284)
T 3g5u_A 109 TYAYYYTGIGAGVLIVAYIQVSFWCLAAGRQIHKIRQKFFHAIMNQEIGWFDVHDVGELNTRLTDDVSKINEGIGDKIGM 188 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHSCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHccCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 34455666666778888999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHhhc
Q psy6082 109 IVPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDSLI 188 (275)
Q Consensus 109 ~i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~l~ 188 (275)
++..++.+++.++++ +..+|+++++++++.|++.++...+.++.++..++.++..++..+.+.|.++
T Consensus 189 ~~~~~~~~i~~~~~~-------------~~~~~~l~l~~l~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E~l~ 255 (1284)
T 3g5u_A 189 FFQAMATFFGGFIIG-------------FTRGWKLTLVILAISPVLGLSAGIWAKILSSFTDKELHAYAKAGAVAEEVLA 255 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHH-------------HHTTSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCCCC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 999999999999999 9999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q ss_pred chHHHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHH
Q psy6082 189 NYETVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQN 264 (275)
Q Consensus 189 ~i~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~ 264 (275)
|+++||+||.|+.+.++|++..++..+...+.........++..++..+..++++++|++++..|.+++|++..+.
T Consensus 256 gi~~ikaf~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~lv~~g~~~~g~~~~~~ 331 (1284)
T 3g5u_A 256 AIRTVIAFGGQKKELERYNNNLEEAKRLGIKKAITANISMGAAFLLIYASYALAFWYGTSLVISKEYSIGQVLTVF 331 (1284)
T ss_dssp CHHHHHTTCCCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCSSCHHHHH
T ss_pred CHHHHHHhcchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCCCHHHHHHHH
Confidence 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999976543
No 9
>4f4c_A Multidrug resistance protein PGP-1; ABC transporter, ATPase, multi-drug transporter, exporter, A binding, hydrolase,protein transport; HET: NDG NAG BMA MAN 0SA; 3.40A {Caenorhabditis elegans}
Probab=99.85 E-value=8.4e-21 Score=190.56 Aligned_cols=222 Identities=12% Similarity=0.069 Sum_probs=201.0
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHhh--cCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHH
Q psy6082 29 SIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHLN--RQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMV 106 (275)
Q Consensus 29 ~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~--~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~ 106 (275)
.+.+.++++.++..++.++..++....+.++..++|.++|++++++|++||+. +++|++++|+++|++.++..+...+
T Consensus 795 ~~~~~~~~l~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~il~~~~~ffd~~~~~~G~i~~r~s~D~~~i~~~l~~~l 874 (1321)
T 4f4c_A 795 FWALMFLVLAAAQGICSFLMTFFMGIASESLTRDLRNKLFRNVLSQHIGFFDSPQNASGKISTRLATDVPNLRTAIDFRF 874 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCSSSTTSGGGCHHHHHHHHHTHHHHHHTTTSHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcCCchhhccCCCChHHHHhcchhhHHHHHHHHHHHH
Confidence 34455666667778889999999999999999999999999999999999985 7899999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHh
Q psy6082 107 FNIVPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDS 186 (275)
Q Consensus 107 ~~~i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~ 186 (275)
..++..++.+++.++++ +..+|++++++++++|+..+......++.++...+..+..++....+.|.
T Consensus 875 ~~~~~~~~~~i~~~~~~-------------~~~~~~l~lv~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~ 941 (1321)
T 4f4c_A 875 STVITTLVSMVAGIGLA-------------FFYGWQMALLIIAILPIVAFGQYLRGRRFTGKNVKSASEFADSGKIAIEA 941 (1321)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCSSCSTTTSSHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHhhhHHHHeeee-------------hHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999999999998 99999999999999999888888888877777777788888899999999
Q ss_pred hcchHHHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHH
Q psy6082 187 LINYETVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQ 263 (275)
Q Consensus 187 l~~i~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~ 263 (275)
++|+++||+|+.|+.+.++|.+..++..+...+..........+...+..+..++++++|++++..|..++|....+
T Consensus 942 l~gi~tIra~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~lv~~~~~~~~~~~~~ 1018 (1321)
T 4f4c_A 942 IENVRTVQALAREDTFYENFCEKLDIPHKEAIKEAFIQGLSYGCASSVLYLLNTCAYRMGLALIITDPPTMQPMRVL 1018 (1321)
T ss_dssp HHTHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHTTSSSSCSSCHHHHH
T ss_pred HhhHHHHHhccchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhcCccccchHHHH
Confidence 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999888765443
No 10
>3g5u_A MCG1178, multidrug resistance protein 1A; P-glycoprotein, PGP, cyclic peptide, membrane protein; 3.80A {Mus musculus} PDB: 3g61_A* 3g60_A*
Probab=99.85 E-value=4.6e-19 Score=177.61 Aligned_cols=223 Identities=16% Similarity=0.093 Sum_probs=204.2
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCChhhHh--hcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHHH
Q psy6082 29 SIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFLHLHNLDLAFHL--NRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAMV 106 (275)
Q Consensus 29 ~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~--~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~~ 106 (275)
.+.+.++++.++..++.+++.+...+.+.++..++|.++|++++++|+.||+ ++++|++.+|+++|++.++..+...+
T Consensus 750 ~~~~~~~~l~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~ff~~~~~~~G~l~~rl~~D~~~i~~~~~~~l 829 (1284)
T 3g5u_A 750 LFSLLFLILGIISFITFFLQGFTFGKAGEILTKRLRYMVFKSMLRQDVSWFDDPKNTTGALTTRLANDAAQVKGATGSRL 829 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSHHHHSCSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHcCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 3444555666667788889999999999999999999999999999999999 47899999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHh
Q psy6082 107 FNIVPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAIDS 186 (275)
Q Consensus 107 ~~~i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~ 186 (275)
..++..+..++..++++ +.++|.++++++++.|+..+......+..++...+..+..++......|.
T Consensus 830 ~~~~~~~~~~~~~~i~~-------------~~~~~~l~lv~l~~~p~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e~ 896 (1284)
T 3g5u_A 830 AVIFQNIANLGTGIIIS-------------LIYGWQLTLLLLAIVPIIAIAGVVEMKMLSGQALKDKKELEGSGKIATEA 896 (1284)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HSSCSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 99999999998888888 99999999999999999999888888888888888888999999999999
Q ss_pred hcchHHHHhhhchHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhcccchhhHHHHHH
Q psy6082 187 LINYETVKYFNNEKFEADRYEGVLKKYEQAALKTSTSLATLNFGQSAIGKLMLTLVLNLQSFEPHQLLDCLLTWQKQN 264 (275)
Q Consensus 187 l~~i~~ik~~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~v~~~g~~~v~~g~ltiG~~~~~~ 264 (275)
++|+++||+|+.|+.+.++|++..++..+...+..........+...+..+..++++++|++++.+|.+++|++..+.
T Consensus 897 l~gi~ti~a~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~g~~lv~~~~~~~~~~~~~~ 974 (1284)
T 3g5u_A 897 IENFRTVVSLTREQKFETMYAQSLQIPYRNAMKKAHVFGITFSFTQAMMYFSYAAAFRFGAYLVTQQLMTFENVLLVF 974 (1284)
T ss_dssp HTTCTTTTTCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCSSSCSCSTTHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHhccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhCCccHHHHHHHH
Confidence 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999876544
No 11
>3qf4_A ABC transporter, ATP-binding protein; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=93.89 E-value=3.9 Score=37.61 Aligned_cols=155 Identities=10% Similarity=0.091 Sum_probs=74.3
Q ss_pred hhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchH
Q psy6082 23 LIASATSIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFL----HLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGI 98 (275)
Q Consensus 23 ~~~~~~~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~----~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i 98 (275)
.......+++..++..++..+..++..+...+...++..++-+++.+ ...+.+....-++-+.|+-. +.+ .+
T Consensus 62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G~l~~r~~~D~~~-i~~---~~ 137 (587)
T 3qf4_A 62 VLKTGILMLIVALIGAVGGIGCTVFASYASQNFGADLRRDLFRKVLSFSISNVNRFHTSSLITRLTNDVTQ-LQN---LV 137 (587)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHH-HHH---HH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHccCCHHHHHHHHHHHHHH-HHH---HH
Confidence 33444444444455555566666777777777777777777766654 35556666665544444322 211 22
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Q psy6082 99 NFVLSAMVFNIVPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENE 178 (275)
Q Consensus 99 ~~~~~~~~~~~i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 178 (275)
...+...+...+..+..++..+.+- ......+.+.+.+..++..++.+...+..++..+...+..+.
T Consensus 138 ~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~l~~~~-------------~~l~l~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 204 (587)
T 3qf4_A 138 MMLLRIVVRAPLLFVGGIVMAVSIN-------------VKLSSVLIFLIPPIVLLFVWLTKKGNPLFRKIQESTDEVNRV 204 (587)
T ss_dssp HHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-------------TTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Confidence 2233333333333333333333333 344444444444444455555555555555444444433333
Q ss_pred hhhHHHHhhcchHHHHh
Q psy6082 179 AGNKAIDSLINYETVKY 195 (275)
Q Consensus 179 ~~~~~~e~l~~i~~ik~ 195 (275)
.. ...+.+.-++.-..
T Consensus 205 ~~-e~l~gi~~Ik~~~~ 220 (587)
T 3qf4_A 205 VR-ENLLGVRVVRAFRR 220 (587)
T ss_dssp HH-HHHHTHHHHHHTTC
T ss_pred HH-HHHhhHHHHHHhcc
Confidence 33 33333443444333
No 12
>3b5x_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; 5.50A {Vibrio cholerae}
Probab=92.74 E-value=5.8 Score=36.32 Aligned_cols=57 Identities=12% Similarity=-0.028 Sum_probs=31.8
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHhCChhhHhhcCCch
Q psy6082 30 IILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFL----HLHNLDLAFHLNRQTGA 86 (275)
Q Consensus 30 l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~----~ll~~~~~~~~~~~~g~ 86 (275)
+++..++..++..+..+.......+...++..++-+++.+ ...+.+.....++-+.|
T Consensus 71 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~rl~~d 131 (582)
T 3b5x_A 71 ILGLMFVRGLSGFASSYCLSWVSGNVVMQMRRRLFNHFMHMPVRFFDQESTGGLLSRITYD 131 (582)
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
Confidence 4444444455556666666666677777666666666554 33444555544443333
No 13
>3qf4_B Uncharacterized ABC transporter ATP-binding prote TM_0288; multidrug transporter, transport protein; HET: ANP; 2.90A {Thermotoga maritima}
Probab=92.15 E-value=7.1 Score=35.92 Aligned_cols=64 Identities=8% Similarity=-0.048 Sum_probs=38.4
Q ss_pred hhHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHhCChhhHhhcCCch
Q psy6082 23 LIASATSIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFL----HLHNLDLAFHLNRQTGA 86 (275)
Q Consensus 23 ~~~~~~~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~----~ll~~~~~~~~~~~~g~ 86 (275)
.......+++.+++..++..+..++......++..++..++-+++.+ ...+.+....-++-+.|
T Consensus 76 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G~l~~r~~~D 143 (598)
T 3qf4_B 76 LPRYMLILGTIYALTSLLFWLQGKIMLTLSQDVVFRLRKELFEKLQRVPVGFFDRTPHGDIISRVIND 143 (598)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCTHHHHHSCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHcCCCHHHHHHHHHHH
Confidence 33344445555555556666667777777777777777777766654 34556666555443333
No 14
>3b60_A Lipid A export ATP-binding/permease protein MSBA; ABC transporter, lipid flippase, hydrolase, inner membrane, lipid transport, membrane; HET: ANP; 3.70A {Salmonella typhimurium} SCOP: c.37.1.12 f.37.1.1 PDB: 3b5y_A* 3b5z_A* 3b5w_A
Probab=89.06 E-value=13 Score=33.91 Aligned_cols=152 Identities=11% Similarity=-0.042 Sum_probs=71.3
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHhCChhhHhhcCCchhhhHhhcccchHHHHHHHH
Q psy6082 30 IILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFL----HLHNLDLAFHLNRQTGALSKIIDRGSRGINFVLSAM 105 (275)
Q Consensus 30 l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~----~ll~~~~~~~~~~~~g~l~~~i~~d~~~i~~~~~~~ 105 (275)
+++..++-.++..+..+.......+...++..++-+++.+ ...+.+.....++-+.|+- .+.. .+...+...
T Consensus 71 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~d~~-~i~~---~~~~~~~~~ 146 (582)
T 3b60_A 71 VIGLMILRGITSYISSYCISWVSGKVVMTMRRRLFGHMMGMPVAFFDKQSTGTLLSRITYDSE-QVAS---SSSGALITV 146 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCSTHHHHSCHHHHHHHHHHHHH-HHHH---HHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHCCCChhHHHHHHHHHHH-HHHH---HHHHHHHHH
Confidence 4444444455556666777777777777777777776654 3445555555544333332 2211 223333344
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHhcccccccccccceeeechhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHH
Q psy6082 106 VFNIVPTIFELALISSILSYKCGTLISSILSYKCGSEFSLLAVSCVGIYTAYTLSITQWRTQFRVNMNKAENEAGNKAID 185 (275)
Q Consensus 106 ~~~~i~~~~~~i~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~li~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~e 185 (275)
+..++..+..++..+.+- ........+.+.+..++.........+..++..+...+.. .......+
T Consensus 147 ~~~~~~~i~~~~~l~~~~-------------~~l~li~l~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~-~~~~e~l~ 212 (582)
T 3b60_A 147 VREGASIIGLFIMMFYYS-------------WQLSIILVVLAPIVSIAIRVVSKRFRSISKNMQNTMGQVT-TSAEQMLK 212 (582)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHT-------------TTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHh-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHh
Confidence 444444443333333322 3333333333333334444445554444444443333333 33334444
Q ss_pred hhcchHHHHhhhch
Q psy6082 186 SLINYETVKYFNNE 199 (275)
Q Consensus 186 ~l~~i~~ik~~~~e 199 (275)
.+.-++.-..-..+
T Consensus 213 gi~~Ik~~~~e~~~ 226 (582)
T 3b60_A 213 GHKEVLIFGGQEVE 226 (582)
T ss_dssp THHHHHHHTCHHHH
T ss_pred hHHHHHHhCcCHHH
Confidence 55555555554443
No 15
>4a82_A Cystic fibrosis transmembrane conductance regulat; CFTR, ION channel, transport protein, casse protein; 2.00A {Homo sapiens} PDB: 2onj_A* 2hyd_A
Probab=87.09 E-value=18 Score=33.06 Aligned_cols=62 Identities=8% Similarity=-0.064 Sum_probs=34.5
Q ss_pred HhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHhCChhhHhhcCCch
Q psy6082 25 ASATSIILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFL----HLHNLDLAFHLNRQTGA 86 (275)
Q Consensus 25 ~~~~~l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~----~ll~~~~~~~~~~~~g~ 86 (275)
.....+++..++..++..+-.++......+...++..++-+++.+ ...+.+....-++-+.|
T Consensus 62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~ll~~~~~~~~~~~~G~l~~r~~~D 127 (578)
T 4a82_A 62 AIGIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVIND 127 (578)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHTSCHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHcCCChHHHHHHHHHH
Confidence 334444444444445556666666667777766666666666544 34556666555443333
No 16
>2yl4_A ATP-binding cassette SUB-family B member 10, mitochondrial; membrane protein, mitochondrial transport; HET: ACP LMT CDL 14Y; 2.85A {Homo sapiens} PDB: 4aa3_A*
Probab=85.56 E-value=22 Score=32.59 Aligned_cols=58 Identities=7% Similarity=-0.024 Sum_probs=31.6
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHhCChhhHhhcCCchh
Q psy6082 30 IILGYGIARICSSGFNELRNAVFASVAQRSIRKIAKNVFL----HLHNLDLAFHLNRQTGAL 87 (275)
Q Consensus 30 l~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~----~ll~~~~~~~~~~~~g~l 87 (275)
+++..++..++..+..+.......++..++..++-+++.+ ...+.+.....++-+.|+
T Consensus 68 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~lr~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~g~l~~r~~~d~ 129 (595)
T 2yl4_A 68 LSAVFLCGAAANAIRVYLMQTSGQRIVNRLRTSLFSSILRQEVAFFDKTRTGELINRLSSDT 129 (595)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHSCHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcCCHHHHCCCChHHHHHHHHHHH
Confidence 3333333444455556666666666666666666655544 345566666555444443
Done!