Diaphorina citri psyllid: psy7959


Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
ATP-dependent DNA helicase RecQ Involved in the recF recombination pathway; its gene expression is under the regulation of the SOS system. It is a DNA helicase.confidentP40724

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0042803 [MF]protein homodimerization activityprobableGO:0046983, GO:0003674, GO:0005515, GO:0042802, GO:0005488
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GO:0005813 [CC]centrosomeprobableGO:0005856, GO:0005575, GO:0015630, GO:0043232, GO:0044464, GO:0005623, GO:0005815, GO:0044446, GO:0043229, GO:0043228, GO:0044430, GO:0044424, GO:0005622, GO:0043226, GO:0044422
GO:0009378 [MF]four-way junction helicase activityprobableGO:0016787, GO:0016818, GO:0003824, GO:0017111, GO:0016817, GO:0016462, GO:0003674, GO:0003678, GO:0004386
GO:0016043 [BP]cellular component organizationprobableGO:0008150, GO:0071840
GO:0030894 [CC]replisomeprobableGO:0005575, GO:0032991, GO:0043232, GO:0032993, GO:0044464, GO:0005623, GO:0005622, GO:0044446, GO:0043229, GO:0005657, GO:0044424, GO:0043228, GO:0044427, GO:0005694, GO:0043226, GO:0044422
GO:0035639 [MF]purine ribonucleoside triphosphate bindingprobableGO:0043168, GO:0097159, GO:0043167, GO:0003674, GO:0005488, GO:1901363, GO:1901265
GO:0044454 [CC]nuclear chromosome partprobableGO:0031974, GO:0043229, GO:0043228, GO:0000228, GO:0043227, GO:0043226, GO:0044446, GO:0031981, GO:0005634, GO:0005694, GO:0043231, GO:0043232, GO:0043233, GO:0044464, GO:0005623, GO:0005622, GO:0005575, GO:0070013, GO:0044428, GO:0044424, GO:0044427, GO:0044422

Prediction of Enzyme Commission Number ?

No confident prediction of EC number!


Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 1OYW, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 2-98
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL