HHsearch results for GI: 254781029 and protein with PDBid: 2a01_A

>2a01_A Apolipoprotein A-I; four-helix bundle, lipid transport; HET: AC9; 2.40A {Homo sapiens} PDB: 3k2s_A* 1av1_A 1gw3_A 1gw4_A
Probab=97.43  E-value=0.00078  Score=45.37  Aligned_cols=231  Identities=8%  Similarity=0.100  Sum_probs=0.0

Q ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf             9999999999999999999999999--99999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q gi|254781029|r  323 ISSKIDQLLEVLHSTSIVITKDFDN--RIESLSNTLNNSGRSLANQVGNYTLMLGNNTDKVSIALKEQSQQFMQAFTSHI  400 (1828)
Q Consensus       323 l~~~~~~l~~~L~~~~~~~~~~~~~--~~e~l~~~L~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~e~l~~~l~e~~~~l~e~l~~~~  400 (1828)
                      +....+...+.+..........+..  ....+...|......+...+......+....+.+...+......+.+.+...+
T Consensus        11 ~~d~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~s~~~~~l~~~l~e~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~   90 (243)
T 2a01_A           11 VKDLATVYVDVLKDSGRDYVSQFEGSALGKQLNLKLLDNWDSVTSTFSKLREQLGPVTQEFWDNLEKETEGLRQEMSKDL   90 (243)
T ss_dssp             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSSCCSSSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCS
T ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf             99999999999999899999998874789999999999999999999999998789999999999999999999999999


Q ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf             99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q gi|254781029|r  401 CEMSNFFSEKQKSITVTLNDVLQSLRISLQEKEDSFCSNLKSTTDNTLREVDNRTNTLENRITAFLKEIVETFNNSITDF  480 (1828)
Q Consensus       401 ~e~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~l~~~l~e~~~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~~  480 (1828)
                      .++...+......+...+......+...+......+...+....+.+...+......+...+......+...+......+
T Consensus        91 ~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~  170 (243)
T 2a01_A           91 EEVKAKVQPYLDDFQKKWQEEMELYRQKVEPLRAELQEGARQKLHELQEKLSPLGEEMRDRARAHVDALRTHLAPYSDEL  170 (243)
T ss_dssp             SCSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSCCSSTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf             99999999878899999999999999998999999999988668999999876789999999999999998889999998


Q ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf             9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999844
Q gi|254781029|r  481 SSFYKDNLSEFESNLQGNIDKLQGCFADSHGNMEDLFLSNIQTIGSNLDKKTLLFEDILSKKQNNISQITSMN  553 (1828)
Q Consensus       481 ~~~~~~~~~el~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~l~~~~~~~  553 (1828)
                      ...+...+..+...+...+..+...+......+...+......+...+......+...+......+...+...
T Consensus       171 ~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~~~e~l~~~l~~~~e~l~~~l~~~~ee~~~~l~~q  243 (243)
T 2a01_A          171 RQRLAARLEALKENGGARLAEYHAKATEHLSTLSEKAKPALEDLRQGLLPVLESFKVSFLSALEEYTKKLNTQ  243 (243)
T ss_dssp             HHHHHHHHHHHHHHHHHTTTSSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
T ss_conf             7768999999998888889999999999999999999999999999879999999999999999999876578