HHsearch results for GI: 254781029 and protein with PDBid: 2a01_A
>2a01_A Apolipoprotein A-I; four-helix bundle, lipid transport; HET: AC9; 2.40A {Homo sapiens} PDB: 3k2s_A* 1av1_A 1gw3_A 1gw4_A
Probab=97.43 E-value=0.00078 Score=45.37 Aligned_cols=231 Identities=8% Similarity=0.100 Sum_probs=0.0
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf 9999999999999999999999999--99999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q gi|254781029|r 323 ISSKIDQLLEVLHSTSIVITKDFDN--RIESLSNTLNNSGRSLANQVGNYTLMLGNNTDKVSIALKEQSQQFMQAFTSHI 400 (1828)
Q Consensus 323 l~~~~~~l~~~L~~~~~~~~~~~~~--~~e~l~~~L~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~e~l~~~l~e~~~~l~e~l~~~~ 400 (1828)
+....+...+.+..........+.. ....+...|......+...+......+....+.+...+......+.+.+...+
T Consensus 11 ~~d~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~s~~~~~l~~~l~e~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~ 90 (243)
T 2a01_A 11 VKDLATVYVDVLKDSGRDYVSQFEGSALGKQLNLKLLDNWDSVTSTFSKLREQLGPVTQEFWDNLEKETEGLRQEMSKDL 90 (243)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCSSCCSSSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCS
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf 99999999999999899999998874789999999999999999999999998789999999999999999999999999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
Q gi|254781029|r 401 CEMSNFFSEKQKSITVTLNDVLQSLRISLQEKEDSFCSNLKSTTDNTLREVDNRTNTLENRITAFLKEIVETFNNSITDF 480 (1828)
Q Consensus 401 ~e~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~l~~~l~e~~~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~~ 480 (1828)
.++...+......+...+......+...+......+...+....+.+...+......+...+......+...+......+
T Consensus 91 ~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~ 170 (243)
T 2a01_A 91 EEVKAKVQPYLDDFQKKWQEEMELYRQKVEPLRAELQEGARQKLHELQEKLSPLGEEMRDRARAHVDALRTHLAPYSDEL 170 (243)
T ss_dssp SCSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSCCSSTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf 99999999878899999999999999998999999999988668999999876789999999999999998889999998
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999844
Q gi|254781029|r 481 SSFYKDNLSEFESNLQGNIDKLQGCFADSHGNMEDLFLSNIQTIGSNLDKKTLLFEDILSKKQNNISQITSMN 553 (1828)
Q Consensus 481 ~~~~~~~~~el~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~l~~~~~~l~~~~~~~ 553 (1828)
...+...+..+...+...+..+...+......+...+......+...+......+...+......+...+...
T Consensus 171 ~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~~~e~l~~~l~~~~e~l~~~l~~~~ee~~~~l~~q 243 (243)
T 2a01_A 171 RQRLAARLEALKENGGARLAEYHAKATEHLSTLSEKAKPALEDLRQGLLPVLESFKVSFLSALEEYTKKLNTQ 243 (243)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHTTTSSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
T ss_conf 7768999999998888889999999999999999999999999999879999999999999999999876578