No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=19.9

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Query rxargenEPGGVPFGYLADICQSsrvnyedpvrVSLDVVATGAMLYdQIWLgSYMS..GG   58
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Sbjct .....gyALRNIMVNHVVAATLK..........NTLQAAALSTILE.QTAM.FEMGdaVG   43
DSSP  .....llHHHLLLHHHHHHHLLL..........LHHHHHHHHHHHH.HHHH.HHLLllLH


DSSP  LL...LHHHHHLL..LLLLHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHH
Query VG...FTQYATAA..YTDNILDDFTYFGKEYVedkyglceapnnmdtvldVATEVTFYGL  113
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Sbjct AFermHLLGLAYQgmNADNLVFDLVKANGKEG..................TVGSVIADLV   85
DSSP  HHhhhHHHHHHHHhlLHHHHHHHHHHHHLLLL..................LHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLhHHHH..............hlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHH
Query EQYEEYpALLE..............dqFGGSXRAAVVAAAAGCSTAFATGNAQTGLSGWY  159
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Sbjct ERALED.GVIKvekeltdykvygtddlAMWNAYAAAGLMAATMVNQGAARAAQGVSSTLL  144
DSSP  HHHHHL.LLLEeeeeelleeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLL.LLLLlLHHHHHHHHHHL..LLLLLlLLLHHHLLLLLHHHLL.LLLLH
Query LSMYLHKEQHSR.LGFYyDLQDQXGASNVF..SIRGDeGLPLELRGPNYPNYAM.NVGHQ  215
ident     |                        |        |        |            
Sbjct YYNDLIEFETGLpSVDF.GKVEGTAVGFSFfsHSIYG.GGGPGIFNGNHIVTRHsKGFAI  202
DSSP  HHHHHHHHHHLLlLHHH.HHHHHHHHHHHHllLLLLL.LLLHHHLLLLLLLLLLlLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHhhHHLLlLLLL...HHHHHHLLLllllLLLLLHHHHHHHHHLLLllllll
Query GEYAGISQAPhaARGDaFVFN...PLVKIAFADdnlvFDFTNVRGEFAKGALREfepage  272
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Sbjct PCVAAAMALD..AGTQmFSPEatsGLIKEVFSQ...vDEFREPLKYVVEAAAEI......  251
DSSP  HHHHHHHHHL..LLLLlLLHHhhlHHHHHHHLL...lHHHHLHHHHHHHHHHHH......


DSSP  lhhhlll
Query ralitpa  279
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Sbjct ...knei  255
DSSP  ...llll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.1

DSSP  llllllllhhhllhHHHHHH..llhhHHLLL...LHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLHhhhh
Query rxargenepggvpfGYLADI..cqssRVNYE...DPVRVSLDVVATGAMLY.DQIWlgsy   54
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Sbjct .............gYALRNImvnhvvAATLKntlQAAALSTILEQTAMFEMgDAVG....   43
DSSP  .............lLHHHLLlhhhhhHHLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLH....


DSSP  lllllLLHHHHHLLLL............................................
Query msggvGFTQYATAAYT............................................   70
ident       |                                                     
Sbjct .....AFERMHLLGLAyqgmnadnlvfdlvkangkegtvgsviadlveraledgvikvek   98
DSSP  .....HHHHHHHHHHHhhhllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeee


DSSP  .................LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllhhhhhHHHHHHHHHHH
Query .................DNILDDFTYFGKEYVEDKYGLceapnnmdtvlDVATEVTFYGL  113
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Sbjct eltdykvygtddlamwnAYAAAGLMAATMVNQGAARAA..........qGVSSTLLYYND  148
DSSP  eelleeeeelllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLH..........hHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLHHHhhhlllhhHHHHHHH.......hhhhhhhhhhHLLHhhhhhhhhhhhhhhh
Query EQYEEYPALledqfggsXRAAVVA.......aaagcstafaTGNAqtglsgwylsmylhk  166
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Sbjct LIEFETGLP......svDFGKVEGtavgfsffshsiyggggPGIF...............  187
DSSP  HHHHHHLLL......lhHHHHHHHhhhhhhhllllllllllHHHL...............


DSSP  hhhllllllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhlllllhhhlllllLHHHhhhhhhhhh
Query eqhsrlgfyydlqdqxgasnvfsirgdeglplelrgpnypnyamnvgHQGEyagisqaph  226
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Sbjct .......................................ngnhivtrHSKG......fai  202
DSSP  .......................................llllllllLLLL......llh


DSSP  hhhlllllllhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhllllllllllhhhlll
Query aargdafvfnplvkiafaddnlvfdftnvrgefakgalrefepageralitpa  279
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Sbjct pcvaaamaldagtqmfspeatsglikevfsqvdefreplkyvveaaaeiknei  255
DSSP  hhhhhhhhhllllllllhhhhlhhhhhhhlllhhhhlhhhhhhhhhhhhllll