No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=4.7

DSSP  ........lLEEEEEEEEEEE...............LLEEEEEEEEEELLllllLLLL..
Query ........dEVIIKAGLNSTG...............PNYTEIKAVVYNQTgwpaRVTD..   35
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Sbjct dqqlvdqlsQLKLNVKMLDNRagengvdcaalgadwASCNRVLFTLSNDG....QAIDgk   56
DSSP  lhhhhhhhlLLEEEEEEEELLhhhhlllllllllhhHLEEEEEEEEELLL....LLLLll


DSSP  .leeeEEEEelhhhhhllllhhhleEELLLllLLLEELlLEEEehhhleEEEEEEL..lL
Query .kisfKYFMdlseivaagidplslvTSSYSegKNTKVSgVLPWdvsnnvYYVNVDL..tG   92
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Sbjct dwviyFHSP.............rqtLRVDN..DQFKIA.HLTG......DLYKLEPtakF   94
DSSP  lleeeEELL.............lleEEELL..LLEEEE.ELLL......LEEEEEElllL


DSSP  LLLLLLllllLEEEEEEEEElllllllLLHHhlhhHLLLlllllleellLLLEEEL....
Query ENIYPGgqsaCRREVQFRIAapqgttyWNPKndfsYDGLpttstvntvtNIPVYDN....  148
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Sbjct SGFPAG....KAVEIPVVAE.......YWQL...fRNDF..........LPRWYATsgda  130
DSSP  LLLLLL....LEEEEEEEEE.......LLLL...lHHHL..........LLLLEEEllll


DSSP  .LEEEE.LLLL................................
Query .GVKVF.GNEP................................  157
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Sbjct kPKMLAnTDTEnldqfvapftgdqwkrtkddknilmtpasrfv  173
DSSP  lLEELHhHLLLlhhhllllllllllllllllllllllhhhhhl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=3.5

DSSP  .....LLEE.EEEEEEEEEL...................LEEEEEEEEEEllllllllLL
Query .....DEVI.IKAGLNSTGP...................NYTEIKAVVYNqtgwparvTD   35
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Sbjct dqqlvDQLSqLKLNVKMLDNragengvdcaalgadwascNRVLFTLSNDG....qaidGK   56
DSSP  lhhhhHHHLlLEEEEEEEELlhhhhlllllllllhhhleEEEEEEEELLL....llllLL


DSSP  LEEEEEEEELhhhhhllllhhhLEEELlllllllEELLlEEEEHhhlEEEEEEEllllll
Query KISFKYFMDLseivaagidplsLVTSSysegkntKVSGvLPWDVsnnVYYVNVDltgeni   95
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Sbjct DWVIYFHSPR..........qtLRVDN......dQFKI.AHLTG...DLYKLEP.....t   91
DSSP  LLEEEEELLL..........leEEELL......lLEEE.EELLL...LEEEEEE.....l


DSSP  llllllLLEEEEEEEEELLlllLLLL.hHHLHHhllllllllleellLLLEEELLEEEEL
Query ypggqsACRREVQFRIAAPqgtTYWN.pKNDFSydglpttstvntvtNIPVYDNGVKVFG  154
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Sbjct akfsgfPAGKAVEIPVVAE...YWQLfrNDFLP..............RWYATSGDAKPKM  134
DSSP  llllllLLLLEEEEEEEEE...LLLLlhHHLLL..............LLEEELLLLLLEE


DSSP  ....................................lll
Query ....................................nep  157
ident                                        
Sbjct lantdtenldqfvapftgdqwkrtkddknilmtpasrfv  173
DSSP  lhhhllllhhhllllllllllllllllllllllhhhhhl