No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=12.5

DSSP  llLLLEEEEEEELL..LLLEEEE.LLEEEELLHhhhllLLLLLEEEEELLlllhhHLEEE
Query vlSGALCFRMKDSA..LKVLYLH.NNQLLAGGLhaekvIKGEEISVVPNRaldasLSPVI   57
ident         |          |                           |          | 
Sbjct ..GIKRLRRLYCNVgiGFHLQALpDGRIGGAHA....dTRDSLLELSPVE.....RGVVS   49
DSSP  ..LLLEEEEEEELLllLEEEEELlLLLEEEELL....lLHHHLEEEEEEE.....LLEEE


DSSP  EEELLlLEEEELLLllLLLLEEELLlhhhhhhllllLHHHEEEEEELL.LLEEEEELLLL
Query LGVQGgSQCLSCGTekGPILKLEPVnimelylgakeSKSFTFYRRDMG.LTSSFESAAYP  116
ident                    |   |                ||            ||  ||
Sbjct IFGVAsRFFVAMSS..KGKLYGSPF..........fTDECTFKEILLPnNYNAYESYKYP   97
DSSP  EEELLlLEEEEELL..LLLEEEELL..........lLLLLEEEEEELHhHLEEEEELLLL


DSSP  LLEEELLLLllEELE.EELLlllllllLLLLLEEEEEll
Query GWFLCTSPEadQPVR.LTQIpedpawdAPITDFYFQQcd  154
ident | |                           | |      
Sbjct GMFIALGKN..GKTKkGNRV....sptMKVTHFLPRL..  128
DSSP  LLLLLLLLL..LLLLlHHHL....lllLHHHLEEEEL..


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.8

DSSP  llllleeeeeeellllleeeelleeeellhhhhllllllleeeeelllllhHHLEEEEEE
Query vlsgalcfrmkdsalkvlylhnnqllagglhaekvikgeeisvvpnraldaSLSPVILGV   60
ident                                                          |  
Sbjct ..................................................gIKRLRRLYC   10
DSSP  ..................................................lLLEEEEEEE


DSSP  LL.lLEEEELLLllLLLLEEELLlhhhhhhllllLHHHEEEEEELL.LLEEEEELLLLlL
Query QG.gSQCLSCGTekGPILKLEPVnimelylgakeSKSFTFYRRDMG.LTSSFESAAYPgW  118
ident        |                                          |    |    
Sbjct NVgiGFHLQALP..DGRIGGAHA..........dTRDSLLELSPVErGVVSIFGVASR.F   57
DSSP  LLllLEEEEELL..LLLEEEELL..........lLHHHLEEEEEEElLEEEEEELLLL.E


DSSP  EEELLLLllEELEEELLllllllllLLLLEEEEELL........................
Query FLCTSPEadQPVRLTQIpedpawdaPITDFYFQQCD........................  154
ident |   |                        |                              
Sbjct FVAMSSK..GKLYGSPF......ftDECTFKEILLPnnynayesykypgmfialgkngkt  109
DSSP  EEEELLL..LLEEEELL......llLLLEEEEEELHhhleeeeellllllllllllllll


DSSP  ...................
Query ...................  154
ident                    
Sbjct kkgnrvsptmkvthflprl  128
DSSP  llhhhlllllhhhleeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  ........................................lllllEEEEEEEL.LLLLEE
Query ........................................vlsgaLCFRMKDS.ALKVLY   19
ident                                                             
Sbjct gikrlrrlycnvgigfhlqalpdgriggahadtrdsllelspverGVVSIFGVaSRFFVA   60
DSSP  llleeeeeeellllleeeeellllleeeellllhhhleeeeeeelLEEEEEELlLLEEEE


DSSP  EELL.EEEELLHhhhllLLLLLEEEEELLlllhhHLEEEEEE.LLLLEEEELLLllLLLL
Query LHNN.QLLAGGLhaekvIKGEEISVVPNRaldasLSPVILGV.QGGSQCLSCGTekGPIL   77
ident       |                                             |       
Sbjct MSSKgKLYGSPF....fTDECTFKEILLP.....NNYNAYESyKYPGMFIALGK..NGKT  109
DSSP  ELLLlLEEEELL....lLLLLEEEEEELH.....HHLEEEEElLLLLLLLLLLL..LLLL


DSSP  EEELllhhhhhhlllLLHHHEEEEEElllleeeeelllllleeelllllleeleeellll
Query KLEPvnimelylgakESKSFTFYRRDmgltssfesaaypgwflctspeadqpvrltqipe  137
ident |                |   |  |                                   
Sbjct KKGN.......rvspTMKVTHFLPRL..................................  128
DSSP  LLHH.......hlllLLHHHLEEEEL..................................


DSSP  lllllllllleeeeell
Query dpawdapitdfyfqqcd  154
ident                  
Sbjct .................  128
DSSP  .................