No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=34.6

DSSP  ........................................LLLLLLLEELLllllLLEEE
Query ........................................GRHSLQRIHCRsetsKGVYC   20
ident                                                          |  
Sbjct dyfqgamgskpaysfhvtadgqmqpvpfppdaligpgiprHARQINTLNHG....EVVCA   56
DSSP  llllllllllllleeeellllleeelllllllllllllllEEEEEEEELLL....LLLLE


DSSP  EELL..LLEEEEEELlLLEEEEELL...LLLEEEEELLLL..LLEEEEELL..LLEEEEE
Query LQYD..DQKIVSGLRdNTIKIWDKN...TLECKRILTGHT..GSVLCLQYD..ERVIITG   71
ident             |      | ||            |                     | |
Sbjct VTISnpTRHVYTGGK.GCVKVWDIShpgNKSPVSQLDCLNrdNYIRSCKLLpdGCTLIVG  115
DSSP  EEELllLLEEEEELL.LEEEEEELLlllLLLLLEEEELLLllLLEEEEEELllLLEEEEE


DSSP  ELLLLEEEEELLLLLEEEEELLLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLlllLLE
Query SSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFN..NGMMVTCSKDRSIAVWDMAsptDIT  129
ident    ||   ||         |     |   |           |  |  |||||       |
Sbjct GEASTLSIWDLAAPRIKAELTSSAPACYALAISpdSKVCFSCCSDGNIAVWDLH...NQT  172
DSSP  ELLLEEEEEELLLLEEEEEEELLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEELL...LLE


DSSP  EEEEELLLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLEEEEEELLLLLEEEEEElLLLLEEEEEEE
Query LRRVLVGHRAAVNVVDFD..DKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNgHKRGIACLQYR  187
ident | |   ||       |             | |   |                 |  | | 
Sbjct LVRQFQGHTDGASCIDISndGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQHD.FTSQIFSLGYC  231
DSSP  EEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLLEEEEEEE.LLLLEEEEEEL


DSSP  ..LLEEEEEELLLLEEEEELLLlLEEEEELLLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEE
Query ..DRLVVSGSSDNTIRLWDIECgACLRVLEGHEELVRCIRFD..NKRIVSGAYDGKIKVW  243
ident         |                   |  ||  |    |    |  ||   |     |
Sbjct ptGEWLAVGMESSNVEVLHVNK.PDKYQLHLHESCVLSLKFAycGKWFVSTGKDNLLNAW  290
DSSP  llLLEEEEEELLLLEEEEELLL.LLEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEE


DSSP  EHHHHlllllllllLEEEEELlLLLLLLLEEEL..LLLEEELLLLLEEEEEL...
Query DLVAAldprapagtLCLRTLVeHSGRVFRLQFD..EFQIVSSSHDDTILIWD...  293
ident                        |  |           ||  | |          
Sbjct RTPYG.........ASIFQSK.ESSSVLSCDISvdDKYIVTGSGDKKATVYEviy  335
DSSP  ELLLL.........LEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEEeel


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=27.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dyfqgamgskpaysfhvtadgqmqpvpfppdaligpgiprharqintlnhgevvcavtis   60
DSSP  llllllllllllleeeellllleeellllllllllllllleeeeeeeellllllleeeel


DSSP  .......................LLLLLLLEELLLLLlLLEEEEELL..LLEEEEEELLL
Query .......................GRHSLQRIHCRSETsKGVYCLQYD..DQKIVSGLRDN   35
ident                                 |                      |    
Sbjct nptrhvytggkgcvkvwdishpgNKSPVSQLDCLNRD.NYIRSCKLLpdGCTLIVGGEAS  119
DSSP  lllleeeeellleeeeeelllllLLLLLEEEELLLLL.LLEEEEEELllLLEEEEEELLL


DSSP  LEEEEELLLLLEEEEELLLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLLLLEEEEELL
Query TIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYD..ERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIH   93
ident |  |||      |  ||        |       |     ||    |||            
Sbjct TLSIWDLAAPRIKAELTSSAPACYALAISpdSKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQG  179
DSSP  EEEEEELLLLEEEEEEELLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEELLLLEEEEEELL


DSSP  LLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLlllLLEEEEEELlLLLLEEEEEEE..LL
Query HCEAVLHLRFN..NGMMVTCSKDRSIAVWDMAsptDITLRRVLVgHRAAVNVVDFD..DK  149
ident |                 |   |     ||                              
Sbjct HTDGASCIDISndGTKLWTGGLDNTVRSWDLR...EGRQLQQHD.FTSQIFSLGYCptGE  235
DSSP  LLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELL...LLEEEEEEE.LLLLEEEEEELllLL


DSSP  EEEEEELLLEEEEEELLLlLEEEEEELLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLLEEEEELLL
Query YIVSASGDRTIKVWNTSTcEFVRTLNGHKRGIACLQYR..DRLVVSGSSDNTIRLWDIEC  207
ident             |           |  |      |         ||   ||    |    
Sbjct WLAVGMESSNVEVLHVNK.PDKYQLHLHESCVLSLKFAycGKWFVSTGKDNLLNAWRTPY  294
DSSP  EEEEEELLLLEEEEELLL.LLEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLL


DSSP  LLEEEEELlLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEEHHHhlllllllllleeeeell
Query GACLRVLEgHEELVRCIRFD..NKRIVSGAYDGKIKVWDLVAaldprapagtlclrtlve  265
ident ||           |         | || |  | |  |                       
Sbjct GASIFQSK.ESSSVLSCDISvdDKYIVTGSGDKKATVYEVIY..................  335
DSSP  LLEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEEEEL..................


DSSP  llllllleeelllleeellllleeeeel
Query hsgrvfrlqfdefqivssshddtiliwd  293
ident                             
Sbjct ............................  335
DSSP  ............................


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=26.4

DSSP  llllllleelllllllleeeeelllleeeeeelllleeeeeLLLLLEEEEELlLLLLEEE
Query grhslqrihcrsetskgvyclqyddqkivsglrdntikiwdKNTLECKRILTgHTGSVLC   60
ident                                                   |  |   |  
Sbjct ...dyfqgamgskpaysfhvtadgqmqpvpfppdaligpgiPRHARQINTLN.HGEVVCA   56
DSSP  ...llllllllllllleeeellllleeelllllllllllllLLEEEEEEEEL.LLLLLLE


DSSP  EELL..LLEEEEEElLLLEEEEELL...LLLEEEEELLLL..LLEEEEELL..LLEEEEE
Query LQYD..ERVIITGSsDSTVRVWDVN...TGEMLNTLIHHC..EAVLHLRFN..NGMMVTC  111
ident        |   ||     | |||            |                        
Sbjct VTISnpTRHVYTGG.KGCVKVWDIShpgNKSPVSQLDCLNrdNYIRSCKLLpdGCTLIVG  115
DSSP  EEELllLLEEEEEL.LLEEEEEELLlllLLLLLEEEELLLllLLEEEEEELllLLEEEEE


DSSP  ELLLLEEEEELLLlllLEEEEEELLLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLEEEEEELLLLL
Query SKDRSIAVWDMASptdITLRRVLVGHRAAVNVVDFD..DKYIVSASGDRTIKVWNTSTCE  169
ident         || |          |     |          |   |   |  | ||      
Sbjct GEASTLSIWDLAA...PRIKAELTSSAPACYALAISpdSKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQT  172
DSSP  ELLLEEEEEELLL...LEEEEEEELLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEELLLLE


DSSP  EEEEEELLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLLEEEEELLLLLEEEEELlLLLLEEEEELL
Query FVRTLNGHKRGIACLQYR..DRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEgHEELVRCIRFD  227
ident  ||   ||  |  |            |  ||| | ||   |  |                
Sbjct LVRQFQGHTDGASCIDISndGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQHD.FTSQIFSLGYC  231
DSSP  EEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLLEEEEEEE.LLLLEEEEEEL


DSSP  ..LLEEEEEELLLLEEEEEHHHhllllllllLLEEeEELLLLLLLLLEEEL..LLLEEEL
Query ..NKRIVSGAYDGKIKVWDLVAaldprapagTLCLrTLVEHSGRVFRLQFD..EFQIVSS  283
ident         |       |                    |  |   |  | |       || 
Sbjct ptGEWLAVGMESSNVEVLHVNK.........PDKY.QLHLHESCVLSLKFAycGKWFVST  281
DSSP  llLLEEEEEELLLLEEEEELLL.........LLEE.EELLLLLLEEEEEELllLLEEEEE


DSSP  LLLLEEEEEL............................................
Query SHDDTILIWD............................................  293
ident   |     |                                             
Sbjct GKDNLLNAWRtpygasifqskesssvlscdisvddkyivtgsgdkkatvyeviy  335
DSSP  ELLLEEEEEEllllleeeeeelllleeeeeellllleeeeeelllleeeeeeel


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=19.7

DSSP  llllllleelllllllleeeeelllleeeeeelllleEEEELL...LLLEEeeellllll
Query grhslqrihcrsetskgvyclqyddqkivsglrdntiKIWDKN...TLECKriltghtgs   57
ident                                                             
Sbjct .........................dyfqgamgskpaYSFHVTadgQMQPV.........   26
DSSP  .........................llllllllllllLEEEELlllLEEEL.........


DSSP  eeeeelllleeeeeelllleeeeelLLLLEEEEELLLLLLEEEEELL..LLEEEEEELlL
Query vlclqyderviitgssdstvrvwdvNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFN..NGMMVTCSKdR  115
ident                                     | | |             |  |  
Sbjct .............pfppdaligpgiPRHARQINTLNHGEVVCAVTISnpTRHVYTGGK.G   72
DSSP  .............llllllllllllLLEEEEEEEELLLLLLLEEEELllLLEEEEELL.L


DSSP  LEEEEELLLLLLLEEEEEELLLL..LLEEEEEEE..LLEEEEEELLLEEEEEELLLLLEE
Query SIAVWDMASPTDITLRRVLVGHR..AAVNVVDFD..DKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFV  171
ident    |||   |        |                            |   |        
Sbjct CVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNrdNYIRSCKLLpdGCTLIVGGEASTLSIWDLAAPRIK  132
DSSP  EEEEEELLLLLLLLLLEEEELLLllLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLLEEE


DSSP  EEEELLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLLEEEEELLLLLEEEEELLLLLLEEEEELL..
Query RTLNGHKRGIACLQYR..DRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFD..  227
ident   |         |          |  ||  |  ||       |   ||     ||     
Sbjct AELTSSAPACYALAISpdSKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISnd  192
DSSP  EEEELLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEELLLLEEEEEELLLLLLEEEEEELll


DSSP  LLEEEEEELLLLEEEEEHHHHlllllllllLEEEEELlLLLLLLLEEEL..LLLEEELLL
Query NKRIVSGAYDGKIKVWDLVAAldprapagtLCLRTLVeHSGRVFRLQFD..EFQIVSSSH  285
ident       |  |     |||              |          | |              
Sbjct GTKLWTGGLDNTVRSWDLREG.........RQLQQHD.FTSQIFSLGYCptGEWLAVGME  242
DSSP  LLEEEEEELLLEEEEEELLLL.........EEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLEEEEEEL


DSSP  LLEEEEEL....................................................
Query DDTILIWD....................................................  293
ident                                                             
Sbjct SSNVEVLHvnkpdkyqlhlhescvlslkfaycgkwfvstgkdnllnawrtpygasifqsk  302
DSSP  LLLEEEEEllllleeeelllllleeeeeellllleeeeeellleeeeeellllleeeeee


DSSP  .................................
Query .................................  293
ident                                  
Sbjct esssvlscdisvddkyivtgsgdkkatvyeviy  335
DSSP  lllleeeeeellllleeeeeelllleeeeeeel


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dyfqgamgskpaysfhvtadgqmqpvpfppdaligpgiprharqintlnhgevvcavtis   60
DSSP  llllllllllllleeeellllleeellllllllllllllleeeeeeeellllllleeeel


DSSP  ............................LLLLL.......................llEE
Query ............................GRHSL.......................qrIH    9
ident                                                             
Sbjct nptrhvytggkgcvkvwdishpgnkspvSQLDClnrdnyirsckllpdgctlivggeaST  120
DSSP  lllleeeeellleeeeeellllllllllEEEELlllllleeeeeellllleeeeeellLE


DSSP  LL.............llLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLLLLEEEEELLL
Query CR.............seTSKGVYCLQYD..DQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGH   54
ident                       | |          |   |  |  ||       |   ||
Sbjct LSiwdlaaprikaeltsSAPACYALAISpdSKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGH  180
DSSP  EEeeelllleeeeeeelLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEELLLLEEEEEELLL


DSSP  LLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLLLLEEEEELlLLLLEEEEELL..LLEEEE
Query TGSVLCLQYD..ERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIhHCEAVLHLRFN..NGMMVT  110
ident |    |           ||  | ||| ||   |  |            |           
Sbjct TDGASCIDISndGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQHD.FTSQIFSLGYCptGEWLAV  239
DSSP  LLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLLEEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLEEEE


DSSP  EELLLLEEEEELllllLLEEEEEELLLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLEEEEEELLLL
Query CSKDRSIAVWDMasptDITLRRVLVGHRAAVNVVDFD..DKYIVSASGDRTIKVWNTSTC  168
ident         |              |  |   |    |    |  ||   |     | |   
Sbjct GMESSNVEVLHV....NKPDKYQLHLHESCVLSLKFAycGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYG  295
DSSP  EELLLLEEEEEL....LLLLEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLL


DSSP  LEEEEEElLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLLEEEEELLLlleeeeelllllleeeeel
Query EFVRTLNgHKRGIACLQYR..DRLVVSGSSDNTIRLWDIECgaclrvlegheelvrcirf  226
ident                      |   | || |                             
Sbjct ASIFQSK.ESSSVLSCDISvdDKYIVTGSGDKKATVYEVIY...................  335
DSSP  LEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEEEEL...................


DSSP  llleeeeeelllleeeeehhhhlllllllllleeeeellllllllleeelllleeellll
Query dnkrivsgaydgkikvwdlvaaldprapagtlclrtlvehsgrvfrlqfdefqivssshd  286
ident                                                             
Sbjct ............................................................  335
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeel
Query dtiliwd  293
ident        
Sbjct .......  335
DSSP  .......


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=14.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dyfqgamgskpaysfhvtadgqmqpvpfppdaligpgiprharqintlnhgevvcavtis   60
DSSP  llllllllllllleeeellllleeellllllllllllllleeeeeeeellllllleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nptrhvytggkgcvkvwdishpgnkspvsqldclnrdnyirsckllpdgctlivggeast  120
DSSP  lllleeeeellleeeeeelllllllllleeeellllllleeeeeellllleeeeeellle


DSSP  .................................................LLLLLLLEELL
Query .................................................GRHSLQRIHCR   11
ident                                                             
Sbjct lsiwdlaaprikaeltssapacyalaispdskvcfsccsdgniavwdlhNQTLVRQFQGH  180
DSSP  eeeeelllleeeeeeellllleeeeeellllleeeeeelllleeeeellLLEEEEEELLL


DSSP  LlllLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLLLLEEEEELlLLLLEEEEELL..LLE
Query SetsKGVYCLQYD..DQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTgHTGSVLCLQYD..ERV   67
ident      |  |        |   |  |||   ||             |     | |      
Sbjct T...DGASCIDISndGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQHD.FTSQIFSLGYCptGEW  236
DSSP  L...LLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLLEEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLE


DSSP  EEEEELLLLEEEEELLLlLEEEEELLLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELlll
Query IITGSSDSTVRVWDVNTgEMLNTLIHHCEAVLHLRFN..NGMMVTCSKDRSIAVWDMasp  125
ident    |   | | |  ||       |  |   || | |       |   ||     |     
Sbjct LAVGMESSNVEVLHVNK.PDKYQLHLHESCVLSLKFAycGKWFVSTGKDNLLNAWRT...  292
DSSP  EEEEELLLLEEEEELLL.LLEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEEL...


DSSP  lLLEEEEEELlLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELLLEEEEEELLLlleeeeeellllleee
Query tDITLRRVLVgHRAAVNVVDFD..DKYIVSASGDRTIKVWNTSTcefvrtlnghkrgiac  183
ident                |   |    |||||  |||    |                     
Sbjct pYGASIFQSK.ESSSVLSCDISvdDKYIVTGSGDKKATVYEVIY................  335
DSSP  lLLLEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEEEEL................


DSSP  eeeelleeeeeelllleeeeellllleeeeelllllleeeeelllleeeeeelllleeee
Query lqyrdrlvvsgssdntirlwdiecgaclrvlegheelvrcirfdnkrivsgaydgkikvw  243
ident                                                             
Sbjct ............................................................  335
DSSP  ............................................................


DSSP  ehhhhlllllllllleeeeellllllllleeelllleeellllleeeeel
Query dlvaaldprapagtlclrtlvehsgrvfrlqfdefqivssshddtiliwd  293
ident                                                   
Sbjct ..................................................  335
DSSP  ..................................................


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=13.1

DSSP  llllllleelllllllleeeeelllleeeeeelllleeeeellllleEEEElllllleee
Query grhslqrihcrsetskgvyclqyddqkivsglrdntikiwdkntlecKRILtghtgsvlc   60
ident                                                             
Sbjct ..................................dyfqgamgskpaySFHV.........   17
DSSP  ..................................lllllllllllllEEEE.........


DSSP  eelllleeeeeelllleeeeellllLEEEeelllllleeeeelllleeeeeelllleeee
Query lqyderviitgssdstvrvwdvntgEMLNtlihhceavlhlrfnngmmvtcskdrsiavw  120
ident                                                             
Sbjct ........tadgqmqpvpfppdaliGPGI...............................   38
DSSP  ........llllleeelllllllllLLLL...............................


DSSP  elllLLLLEEEEEELlLLLLEEEEEEE..LLEEEEEELlLEEEEEELLL...lLEEEEEE
Query dmasPTDITLRRVLVgHRAAVNVVDFD..DKYIVSASGdRTIKVWNTST...cEFVRTLN  175
ident     |        |  |   |  |                  |||  |       |  | 
Sbjct ....PRHARQINTLN.HGEVVCAVTISnpTRHVYTGGK.GCVKVWDISHpgnkSPVSQLD   92
DSSP  ....LLEEEEEEEEL.LLLLLLEEEELllLLEEEEELL.LEEEEEELLLllllLLLEEEE


DSSP  LLL..LLEEEEEEE..LLEEEEEELLLLEEEEELLLLLEEEEELLLLLLEEEEELL..LL
Query GHK..RGIACLQYR..DRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFD..NK  229
ident        |              |    |   ||         |                |
Sbjct CLNrdNYIRSCKLLpdGCTLIVGGEASTLSIWDLAAPRIKAELTSSAPACYALAISpdSK  152
DSSP  LLLllLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLLEEEEEEELLLLLEEEEEELllLL


DSSP  EEEEEELLLLEEEEEHHHHlllllllllLEEEEELLLLLLLLLEEEL..LLLEEELLLLL
Query RIVSGAYDGKIKVWDLVAAldprapagtLCLRTLVEHSGRVFRLQFD..EFQIVSSSHDD  287
ident    |   || | ||||               |    |                     | 
Sbjct VCFSCCSDGNIAVWDLHNQ.........TLVRQFQGHTDGASCIDISndGTKLWTGGLDN  203
DSSP  EEEEEELLLLEEEEELLLL.........EEEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLL


DSSP  EEEEEL......................................................
Query TILIWD......................................................  293
ident |   ||                                                      
Sbjct TVRSWDlregrqlqqhdftsqifslgycptgewlavgmessnvevlhvnkpdkyqlhlhe  263
DSSP  EEEEEElllleeeeeeelllleeeeeellllleeeeeelllleeeeellllleeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  293
ident                                                             
Sbjct scvlslkfaycgkwfvstgkdnllnawrtpygasifqskesssvlscdisvddkyivtgs  323
DSSP  lleeeeeellllleeeeeellleeeeeellllleeeeeelllleeeeeellllleeeeee


DSSP  ............
Query ............  293
ident             
Sbjct gdkkatvyeviy  335
DSSP  lllleeeeeeel


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dyfqgamgskpaysfhvtadgqmqpvpfppdaligpgiprharqintlnhgevvcavtis   60
DSSP  llllllllllllleeeellllleeellllllllllllllleeeeeeeellllllleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nptrhvytggkgcvkvwdishpgnkspvsqldclnrdnyirsckllpdgctlivggeast  120
DSSP  lllleeeeellleeeeeelllllllllleeeellllllleeeeeellllleeeeeellle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lsiwdlaaprikaeltssapacyalaispdskvcfsccsdgniavwdlhnqtlvrqfqgh  180
DSSP  eeeeelllleeeeeeellllleeeeeellllleeeeeelllleeeeelllleeeeeelll


DSSP  ...............................LLLLLLLEELLllllLLEEEEELL..LLE
Query ...............................GRHSLQRIHCRsetsKGVYCLQYD..DQK   27
ident                                    ||              | |      
Sbjct tdgascidisndgtklwtggldntvrswdlrEGRQLQQHDFT....SQIFSLGYCptGEW  236
DSSP  llleeeeeellllleeeeeellleeeeeellLLEEEEEEELL....LLEEEEEELllLLE


DSSP  EEEEELLLLEEEEELLLlLEEEEELLLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLLL
Query IVSGLRDNTIKIWDKNTlECKRILTGHTGSVLCLQYD..ERVIITGSSDSTVRVWDVNTG   85
ident    |           |    |  |  |   || |              |     |    |
Sbjct LAVGMESSNVEVLHVNK.PDKYQLHLHESCVLSLKFAycGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYG  295
DSSP  EEEEELLLLEEEEELLL.LLEEEELLLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLEEEEEELLLL


DSSP  LEEEEELlLLLLEEEEELL..LLEEEEEELLLLEEEEELLLlllleeeeeelllllleee
Query EMLNTLIhHCEAVLHLRFN..NGMMVTCSKDRSIAVWDMASptditlrrvlvghraavnv  143
ident             ||           || | |    |                        
Sbjct ASIFQSK.ESSSVLSCDISvdDKYIVTGSGDKKATVYEVIY...................  335
DSSP  LEEEEEE.LLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLEEEEEEEL...................


DSSP  eeeelleeeeeellleeeeeellllleeeeeellllleeeeeeelleeeeeelllleeee
Query vdfddkyivsasgdrtikvwntstcefvrtlnghkrgiaclqyrdrlvvsgssdntirlw  203
ident                                                             
Sbjct ............................................................  335
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllleeeeelllllleeeeelllleeeeeelllleeeeehhhhlllllllllleeeee
Query diecgaclrvlegheelvrcirfdnkrivsgaydgkikvwdlvaaldprapagtlclrtl  263
ident                                                             
Sbjct ............................................................  335
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllleeelllleeellllleeeeel
Query vehsgrvfrlqfdefqivssshddtiliwd  293
ident                               
Sbjct ..............................  335
DSSP  ..............................


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.4

DSSP  llllllleelllllllleeeeelllleeeeeelllleeeeellllleeeeelllllleee
Query grhslqrihcrsetskgvyclqyddqkivsglrdntikiwdkntleckriltghtgsvlc   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllleeeeeelllleeeeelllLLEEEEElllllleeeeelllleeeeeelllleeee
Query lqyderviitgssdstvrvwdvntGEMLNTLihhceavlhlrfnngmmvtcskdrsiavw  120
ident                                                             
Sbjct ..............dyfqgamgskPAYSFHV.............................   17
DSSP  ..............llllllllllLLLEEEE.............................


DSSP  ellllllleeeeeelllllleeeeeeelleeeeeellleeeeeellllleeeeeeLLLLL
Query dmasptditlrrvlvghraavnvvdfddkyivsasgdrtikvwntstcefvrtlnGHKRG  180
ident                                                         |   
Sbjct ........................tadgqmqpvpfppdaligpgiprharqintlNHGEV   53
DSSP  ........................llllleeellllllllllllllleeeeeeeeLLLLL


DSSP  EEEEEEE..LLEEEEEELlLLEEEEELLL...LLEEEEELLLL..LLEEEEELL..LLEE
Query IACLQYR..DRLVVSGSSdNTIRLWDIEC...GACLRVLEGHE..ELVRCIRFD..NKRI  231
ident           | |  |        |||           |         |           
Sbjct VCAVTISnpTRHVYTGGK.GCVKVWDISHpgnKSPVSQLDCLNrdNYIRSCKLLpdGCTL  112
DSSP  LLEEEELllLLEEEEELL.LEEEEEELLLlllLLLLEEEELLLllLLEEEEEELllLLEE


DSSP  EEEELLLLEEEEEHHHHlllllllllLEEEEELLLLLLLLLEEEL..LLLEEELLLLLEE
Query VSGAYDGKIKVWDLVAAldprapagtLCLRTLVEHSGRVFRLQFD..EFQIVSSSHDDTI  289
ident   |        ||| |               |         |          |   |  |
Sbjct IVGGEASTLSIWDLAAP.........RIKAELTSSAPACYALAISpdSKVCFSCCSDGNI  163
DSSP  EEEELLLEEEEEELLLL.........EEEEEEELLLLLEEEEEELllLLEEEEEELLLLE


DSSP  EEEL........................................................
Query LIWD........................................................  293
ident   ||                                                        
Sbjct AVWDlhnqtlvrqfqghtdgascidisndgtklwtggldntvrswdlregrqlqqhdfts  223
DSSP  EEEElllleeeeeelllllleeeeeellllleeeeeellleeeeeelllleeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  293
ident                                                             
Sbjct qifslgycptgewlavgmessnvevlhvnkpdkyqlhlhescvlslkfaycgkwfvstgk  283
DSSP  leeeeeellllleeeeeelllleeeeellllleeeelllllleeeeeellllleeeeeel


DSSP  ....................................................
Query ....................................................  293
ident                                                     
Sbjct dnllnawrtpygasifqskesssvlscdisvddkyivtgsgdkkatvyeviy  335
DSSP  lleeeeeellllleeeeeelllleeeeeellllleeeeeelllleeeeeeel


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  llllllleelllllllleeeeelllleeeeeelllleeeeellllleeeeelllllleee
Query grhslqrihcrsetskgvyclqyddqkivsglrdntikiwdkntleckriltghtgsvlc   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllleeeeeelllleeeeellllleeeeelllllleeeeelllleeeeeelllleeee
Query lqyderviitgssdstvrvwdvntgemlntlihhceavlhlrfnngmmvtcskdrsiavw  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllleeeeeelllllleeeeeeelleeeeeellleeeeeellllleeeeeelllll
Query dmasptditlrrvlvghraavnvvdfddkyivsasgdrtikvwntstcefvrtlnghkrg  180
ident                                                             
Sbjct ...............................................dyfqgamgskpay   13
DSSP  ...............................................lllllllllllll


DSSP  eeeeeeelleeeeeelllleeeeellllleeeeeLLLLLLEEEEELL..LLEEEEEElLL
Query iaclqyrdrlvvsgssdntirlwdiecgaclrvlEGHEELVRCIRFD..NKRIVSGAyDG  238
ident                                     | | |              |   |
Sbjct sfhvtadgqmqpvpfppdaligpgiprharqintLNHGEVVCAVTISnpTRHVYTGG.KG   72
DSSP  eeeellllleeellllllllllllllleeeeeeeELLLLLLLEEEELllLLEEEEEL.LL


DSSP  LEEEEEHHHhllllLLLLlLEEEEEL..................................
Query KIKVWDLVAaldprAPAGtLCLRTLV..................................  264
ident   ||||                  |                                   
Sbjct CVKVWDISH.....PGNK.SPVSQLDclnrdnyirsckllpdgctlivggeastlsiwdl  126
DSSP  EEEEEELLL.....LLLL.LLLEEEEllllllleeeeeellllleeeeeellleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  264
ident                                                             
Sbjct aaprikaeltssapacyalaispdskvcfsccsdgniavwdlhnqtlvrqfqghtdgasc  186
DSSP  llleeeeeeellllleeeeeellllleeeeeelllleeeeelllleeeeeelllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  264
ident                                                             
Sbjct idisndgtklwtggldntvrswdlregrqlqqhdftsqifslgycptgewlavgmessnv  246
DSSP  eeellllleeeeeellleeeeeelllleeeeeeelllleeeeeellllleeeeeelllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  264
ident                                                             
Sbjct evlhvnkpdkyqlhlhescvlslkfaycgkwfvstgkdnllnawrtpygasifqskesss  306
DSSP  eeeellllleeeelllllleeeeeellllleeeeeellleeeeeellllleeeeeellll


DSSP  lllllllleeelllleeellllleeeeel
Query ehsgrvfrlqfdefqivssshddtiliwd  293
ident                              
Sbjct vlscdisvddkyivtgsgdkkatvyeviy  335
DSSP  eeeeeellllleeeeeelllleeeeeeel