No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.9

DSSP  .LEELLLLLllllLLLL....HHHHLLLLlLLEEEE.LLLLllllllllhHHHHHHHHHH
Query .MKWGFRWYgaagDAIP....LKHIRQIPgITGVVG.TLLNklpgdvwtvAEIQALKQSV   54
ident                 |        |       |      |                   
Sbjct mPRFAANLS.mmfTEVPfierFAAARKAG.FDAVEFlFPYN.........YSTLQIQKQL   49
DSSP  lLLEEEELL.lllLLLLhhhhHHHHHHHL.LLEEELlLLLL.........LLHHHHHHHH


DSSP  HHLLLEEEEeLLLLLL.......hhHHHLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL
Query EQEGLALLGiESVAIH.......daIKAGTdQRDHYIDNYRQTLRNLGKCGISLVCYSFK  107
ident ||  | |      |                             |          |     
Sbjct EQNHLTLAL.FNTAPGdinagewglSALPG.REHEAHADIDLALEYALALNCEQVHVMAG  107
DSSP  HHLLLEEEE.EELLLLlhhhlllllLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLL


DSSP  LLlllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhLLL
Query PIfgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamYAG  167
ident                                                           ||
Sbjct VV.......................................................PAG  112
DSSP  LL.......................................................LLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLllllLLLLLLHHHHHHHHHHL
Query VTEEDLVENLRYFLERVIPVCEEENIKMGIHPDD.PPWEifglPRITKNLADLKRILSLV  226
ident    |                                                   |   |
Sbjct EDAERYRAVFIDNIRYAADRFAPHGKRILVEALSpGVKP....HYLFSSQYQALAIVEEV  168
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLlLLLL....LLLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLEELLEELLHHHHLlLLLHHHHHHHHHHHLLLEEELLEEelllleeEELLLLhhHLL
Query DSPANGITFCTGSLGADpTNDLPTMIREIGHRINFVHFRNVKylgehrfEETAHPsvAGS  286
ident       |   |          |   ||        |                      | 
Sbjct ARDNVFIQLDTFHAQKV.DGNLTHLIRDYAGKYAHVQIAGLP.......DRHEPD..DGE  218
DSSP  LLLLEEEEEEHHHHHHH.LLLHHHHHHHLLLLEEEEEELLLL.......LLLLLL..LLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLlllllllllLLHHhHHHHLHHHHhhhhhhll
Query LDMAELMQALVDVGYEGVIRPDHGRAIwdekampgyGLYDrAMGLTYIQGlyeatkak  344
ident      |      ||| | |                              |        
Sbjct INYPWLFRLFDEVGYQGWIGCEYKPRG........lTEEG.LGWFDAWRG.......s  260
DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLLL........lLHHH.LHHHHHHHH.......l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.9

DSSP  ............................LEELLLLLLLLlllLLHHHHLLL...LLLLEE
Query ............................MKWGFRWYGAAgdaIPLKHIRQI...PGITGV   29
ident                                                |         |  
Sbjct mprfaanlsmmftevpfierfaaarkagFDAVEFLFPYN...YSTLQIQKQleqNHLTLA   57
DSSP  llleeeelllllllllhhhhhhhhhhhlLLEEELLLLLL...LLHHHHHHHhhhLLLEEE


DSSP  EELLLLL.....LLLLL.......lLHHHHHHHHHHHHHllLEEEEELLLLLLHhhhhlL
Query VGTLLNK.....LPGDV.......wTVAEIQALKQSVEQegLALLGIESVAIHDaikagT   77
ident               |            | |           |        |         
Sbjct LFNTAPGdinagEWGLSalpgreheAHADIDLALEYALA..LNCEQVHVMAGVV...paG  112
DSSP  EEELLLLlhhhlLLLLLlllllhhhHHHHHHHHHHHHHH..LLLLEEELLLLLL...llL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....LLEEEELLLLLLLlllleeeeellllleeeeeehh
Query DQRDHYIDNYRQTLRNLGKCG....ISLVCYSFKPIFGwaktdlayenedgslsllfdqa  133
ident      |        |                   |                         
Sbjct EDAERYRAVFIDNIRYAADRFaphgKRILVEALSPGVK......................  150
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLEEEELLLLLLLL......................


DSSP  hhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHhHHHLL
Query vvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlvenLRYFLERVIPVcEEENI  193
ident                                                |  |  |    | 
Sbjct ....................................phylfssQYQALAIVEEV.ARDNV  173
DSSP  ....................................lllllllHHHHHHHHHHH.LLLLE


DSSP  EEEELLLlllllllllLLLLllhhHHHHHHHHlLLLLEElLEELLH....hHHLLLLLHH
Query KMGIHPDdppweifglPRITknlaDLKRILSLvDSPANGiTFCTGS....lGADPTNDLP  249
ident                          |                  |        |     |
Sbjct FIQLDTF......haqKVDG....NLTHLIRD.YAGKYAhVQIAGLpdrhePDDGEINYP  222
DSSP  EEEEEHH......hhhHHLL....LHHHHHHH.LLLLEEeEEELLLlllllLLLLLLLHH


DSSP  HHHHHHH..HHLLLEEElleeelllleEEELLllhHHLLLLHHHHHHhhhhhlllleeee
Query TMIREIG..HRINFVHFrnvkylgehrFEETAhpsVAGSLDMAELMQalvdvgyegvirp  307
ident    |                                 |                      
Sbjct WLFRLFDevGYQGWIGC.......eykPRGLT...EEGLGWFDAWRG.............  259
DSSP  HHHHHHHhlLLLLLEEE.......lllLLLLL...HHHLHHHHHHHH.............


DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll
Query dhgraiwdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
ident                                      
Sbjct ....................................s  260
DSSP  ....................................l


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.1

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllLLLEEEEL...LLLLlllllllhHHHHHHHHHHhhl
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipGITGVVGT...LLNKlpgdvwtvAEIQALKQSVeqe   57
ident                                                    |        
Sbjct ........................MPRFAANLsmmFTEV.....pfiERFAAARKAG...   28
DSSP  ........................LLLEEEELlllLLLL.....lhhHHHHHHHHHL...


DSSP  llEEEEELLLLLLhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHLL.LLEEEELLLLLLllllle
Query glALLGIESVAIHdaikagtdqrdhyidNYRQTLRNLGKCG.ISLVCYSFKPIFgwaktd  116
ident                                |    |                       
Sbjct ..FDAVEFLFPYN..............ySTLQIQKQLEQNHlTLALFNTAPGDI......   66
DSSP  ..LLEEELLLLLL..............lLHHHHHHHHHHLLlEEEEEELLLLLH......


DSSP  eeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHH
Query layenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvTEEDLVEN  176
ident                                                       |     
Sbjct .........................................nagewglsalpGREHEAHA   85
DSSP  .........................................hhlllllllllLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhlLEEEELLLllLLLLL...lllllllLHHHHHHHHHHLL.LLLEE
Query LRYFLERVIPVCEeenIKMGIHPDdpPWEIF...glpritkNLADLKRILSLVD.SPANG  232
ident                                                             
Sbjct DIDLALEYALALN...CEQVHVMA..GVVPAgedaeryravFIDNIRYAADRFApHGKRI  140
DSSP  HHHHHHHHHHHLL...LLEEELLL..LLLLLlllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhHLLEE


DSSP  LlEELL........HHHHllllLHHHHHHHH..hHHLLlEEELLEeelllleeeellllh
Query ItFCTG........SLGAdptnDLPTMIREI..gHRINfVHFRNVkylgehrfeetahps  282
ident                              |                              
Sbjct L.VEALspgvkphyLFSS..qyQALAIVEEVardNVFIqLDTFHA...............  182
DSSP  E.ELLLllllllllLLLL..hhHHHHHHHHHlllLEEEeEEHHHH...............


DSSP  hhLLLLHHHHHHHHHhhLLLLeEEELLLLllllllllLLLLLHHhhHHHLHHHHHHHHHH
Query vaGSLDMAELMQALVdvGYEGvIRPDHGRaiwdekamPGYGLYDraMGLTYIQGLYEATK  342
ident          |       |                         |          |     
Sbjct qkVDGNLTHLIRDYA..GKYAhVQIAGLP........DRHEPDDgeINYPWLFRLFDEVG  232
DSSP  hhHLLLHHHHHHHLL..LLEEeEEELLLL........LLLLLLLllLLHHHHHHHHHHLL


DSSP  ..........................ll
Query ..........................ak  344
ident                             
Sbjct yqgwigceykprglteeglgwfdawrgs  260
DSSP  lllleeellllllllhhhlhhhhhhhhl


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhllle
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiqalkqsveqegla   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeellllllhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLEEEELLllllllllleeeee
Query llgiesvaihdaikagtdqrdhyidnyrqtlrnlgkCGISLVCYSFkpifgwaktdlaye  120
ident                                             |               
Sbjct ....................................MPRFAANLSM..............   10
DSSP  ....................................LLLEEEELLL..............


DSSP  llllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhHHHHHH
Query nedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlvENLRYF  180
ident                                                             
Sbjct ..................................................mfteVPFIER   20
DSSP  ..................................................llllLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhlLEEEELLlllllllllllllllLHHHHHHHHHHLL.llLEELLEELlh
Query LERVIPVCEeenIKMGIHPddppweifglpritkNLADLKRILSLVD.spANGITFCTgs  239
ident                                          |             | |  
Sbjct FAAARKAGF...DAVEFLF..............pYNYSTLQIQKQLEqnhLTLALFNT..   61
DSSP  HHHHHHHLL...LEEELLL..............lLLLLHHHHHHHHHhllLEEEEEEL..


DSSP  HHHL................lllLHHHHHHHHHH..HLLLEEELLEEELLlleeeellll
Query LGAD................ptnDLPTMIREIGH..RINFVHFRNVKYLGehrfeetahp  281
ident    |                          |         ||                  
Sbjct APGDinagewglsalpgreheahADIDLALEYALalNCEQVHVMAGVVPA...gedaery  118
DSSP  LLLLhhhlllllllllllhhhhhHHHHHHHHHHHhlLLLEEELLLLLLLL...lllhhhh


DSSP  HHHLllLHHHHHHHHHHHLLlleEEELLLLLllllllLLLL..llHHHHHHHLHHHHHhH
Query SVAGslDMAELMQALVDVGYegvIRPDHGRAiwdekaMPGY..glYDRAMGLTYIQGLyE  339
ident                   |    |                           |        
Sbjct RAVFidNIRYAADRFAPHGK..rILVEALSP......GVKPhylfSSQYQALAIVEEV.A  169
DSSP  HHHHhhHHHHHHHHHHHHLL..eEEELLLLL......LLLLllllLLHHHHHHHHHHH.L


DSSP  HHH.........................................................
Query ATK.........................................................  342
ident                                                             
Sbjct RDNvfiqldtfhaqkvdgnlthlirdyagkyahvqiaglpdrhepddgeinypwlfrlfd  229
DSSP  LLLeeeeeehhhhhhhlllhhhhhhhlllleeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  .............................ll
Query .............................ak  344
ident                                
Sbjct evgyqgwigceykprglteeglgwfdawrgs  260
DSSP  hlllllleeellllllllhhhlhhhhhhhhl


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  ......................................................LEELLL
Query ......................................................MKWGFR    6
ident                                                           | 
Sbjct mprfaanlsmmftevpfierfaaarkagfdaveflfpynystlqiqkqleqnhlTLALFN   60
DSSP  llleeeelllllllllhhhhhhhhhhhllleeellllllllhhhhhhhhhhlllEEEEEE


DSSP  LL...................lLLLLlLLHHHHLLLLLLLEEEELLLLL...llllllLH
Query WY...................gAAGDaIPLKHIRQIPGITGVVGTLLNK...lpgdvwTV   44
ident                       |  |               |                  
Sbjct TApgdinagewglsalpgreheAHADiDLALEYALALNCEQVHVMAGVVpagedaeryRA  120
DSSP  LLlllhhhlllllllllllhhhHHHHhHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLlllllhhhhHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLL..lEEEEELlLLLLHhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHLL...L
Query AEIQALKQSVEQEG..lALLGIEsVAIHDaikagtdqrdhyidNYRQTLRNLGKCG...I   99
ident   |                   |                       | |           
Sbjct VFIDNIRYAADRFAphgKRILVE.ALSPG......vkphylfsSQYQALAIVEEVArdnV  173
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhlLEEEEL.LLLLL......llllllllLHHHHHHHHHHHLlllE


DSSP  LEEEELLllllllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query SLVCYSFkpifgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfq  159
ident       |                                                     
Sbjct FIQLDTF.....................................................  180
DSSP  EEEEEHH.....................................................


DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhlleeEELLLlllllllllLLLLLLH...
Query elkamyagvteedlvenlrYFLERVIPVCEEenikmGIHPDdppweifglPRITKNL...  216
ident                      |   |                        |         
Sbjct .............haqkvdGNLTHLIRDYAG.kyahVQIAG........lPDRHEPDdge  218
DSSP  .............hhhhhlLLHHHHHHHLLL.leeeEEELL........lLLLLLLLlll


DSSP  hHHHHHHHHL..lllleeLLEELLH.hhHLLLLL.HHHHHHHhhhhllleeelleeelll
Query aDLKRILSLV..dspangITFCTGS.lgADPTND.LPTMIREighrinfvhfrnvkylge  272
ident         |         |                                         
Sbjct iNYPWLFRLFdevgyqgwIGCEYKPrglTEEGLGwFDAWRGS..................  260
DSSP  lLHHHHHHHHhhllllllEEELLLLlllLHHHLHhHHHHHHL..................


DSSP  leeeellllhhhllllhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhl
Query hrfeetahpsvagsldmaelmqalvdvgyegvirpdhgraiwdekampgyglydramglt  332
ident                                                             
Sbjct ............................................................  260
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhll
Query yiqglyeatkak  344
ident             
Sbjct ............  260
DSSP  ............


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllE
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiqalkqsveqeglA   60
ident                                                             
Sbjct ...........................................................M    1
DSSP  ...........................................................L


DSSP  EEEElLLLL.....LHHHhhllllhhhHHHHHHHHhhhhhhlllleeEELLlllllllll
Query LLGIeSVAI.....HDAIkagtdqrdhYIDNYRQTlrnlgkcgislvCYSFkpifgwakt  115
ident                  |              |                 |         
Sbjct PRFA.ANLSmmfteVPFI........eRFAAARKA.......gfdavEFLF.........   36
DSSP  LLEE.EELLlllllLLHH........hHHHHHHHH.......llleeELLL.........


DSSP  eeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhHH
Query dlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlVE  175
ident                                                             
Sbjct .........................................................pYN   39
DSSP  .........................................................lLL


DSSP  HHH.HHHHHHHHHHhhhlLEEEELLLllLLLLLL........llllllLHHHHHHHHHH.
Query NLR.YFLERVIPVCeeenIKMGIHPDdpPWEIFG........lpritkNLADLKRILSL.  225
ident                             |  |                  ||    |   
Sbjct YSTlQIQKQLEQNH...lTLALFNTA..PGDINAgewglsalpgreheAHADIDLALEYa   94
DSSP  LLHhHHHHHHHHLL...lEEEEEELL..LLLHHHlllllllllllhhhHHHHHHHHHHHh


DSSP  LLLLlEELLEellhHHHLL.........llLHHHHHHHHH......HHLLlEEELLeeel
Query VDSPaNGITFctgsLGADP.........tnDLPTMIREIG......HRINfVHFRNvkyl  270
ident                                    ||                       
Sbjct LALN.CEQVH...vMAGVVpagedaeryraVFIDNIRYAAdrfaphGKRI.LVEAL..sp  147
DSSP  HHLL.LLEEE...lLLLLLlllllhhhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhLLEE.EELLL..ll


DSSP  llLEEE.elLLLHhhllllHHHHHHHhhHHLLlleEEEL..LLLLllllllllllLLHHh
Query geHRFE.etAHPSvagsldMAELMQAlvDVGYegvIRPD..HGRAiwdekampgyGLYDr  327
ident                     |              |  |  |                  
Sbjct gvKPHYlfsSQYQ.....aLAIVEEV..ARDN.vfIQLDtfHAQK.........vDGNL.  189
DSSP  llLLLLlllLHHH.....hHHHHHHH..LLLL.eeEEEEhhHHHH.........hLLLH.


DSSP  HHHHLHHHHH..................................................
Query AMGLTYIQGL..................................................  337
ident         |                                                   
Sbjct THLIRDYAGKyahvqiaglpdrhepddgeinypwlfrlfdevgyqgwigceykprgltee  249
DSSP  HHHHHHLLLLeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllleeellllllllhh


DSSP  ....hhhhhll
Query ....yeatkak  344
ident            
Sbjct glgwfdawrgs  260
DSSP  hlhhhhhhhhl


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhllle
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiqalkqsveqegla   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeellllllhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllleeeee
Query llgiesvaihdaikagtdqrdhyidnyrqtlrnlgkcgislvcysfkpifgwaktdlaye  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhh
Query nedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlvenlryf  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhHLLEEEELLLllllllllllLLLLlHHHHHHHHHHLlllLEELLEELlhh
Query lervipvceeENIKMGIHPDdppweifglpRITKnLADLKRILSLVdspANGITFCTgsl  240
ident                                                       |     
Sbjct ..........MPRFAANLSM.......mftEVPF.IERFAAARKAG...FDAVEFLF...   36
DSSP  ..........LLLEEEELLL.......lllLLLH.HHHHHHHHHHL...LLEEELLL...


DSSP  hhlllLLHHHHHHHHH....hHLLLEEELLEEELlllEEEELL.........LLHHhlll
Query gadptNDLPTMIREIG....hRINFVHFRNVKYLgehRFEETA.........HPSVagsl  287
ident      |     |                           |                    
Sbjct ...pyNYSTLQIQKQLeqnhlTLALFNTAPGDIN...AGEWGLsalpgreheAHAD....   86
DSSP  ...llLLLHHHHHHHHhhlllEEEEEELLLLLHH...HLLLLLllllllhhhHHHH....


DSSP  lHHHHHHHHHHHLLLlEEEELLLLLlLLLLLllllLLHHHHHHHLHHHHHHHHHH.....
Query dMAELMQALVDVGYEgVIRPDHGRAiWDEKAmpgyGLYDRAMGLTYIQGLYEATK.....  342
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