No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=19.9

DSSP  .......LEELLLLL.............llLLLL..LLHHHHLLLLlLLEEEEL...LLL
Query .......MKWGFRWY.............gaAGDA..IPLKHIRQIPgITGVVGT...LLN   35
ident            |                                     ||      |  
Sbjct syqptpeDRFTFGLWtvgwqgrdpfgdatrPALDpvETVQRLAELG.AHGVTFHdddLIP   59
DSSP  lllllhhHLEEEEHHhhlllllllllllllLLLLhhHHHHHHHHHL.LLEEEEEhhhHLL


DSSP  LLlllllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELlLLLL.......HHHHHLLLL.HHHHHHHH
Query KLpgdvwTVAEIQALKQSVEQEGLALLGIEsVAIH.......DAIKAGTDQ.RDHYIDNY   87
ident            |    |     |                       |     |       
Sbjct FGssdteRESHIKRFRQALDATGMTVPMAT.TNLFthpvfkdGGFTANDRDvRRYALRKT  118
DSSP  LLllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEE.LLLLllhhhllLLLLLLLHHhHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLLEEEELL..LLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhh
Query RQTLRNLGKCGISLVCYSF..KPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyq  145
ident           |                                                 
Sbjct IRNIDLAVELGAKTYVAWGgrEGAE...................................  143
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLllLEEL...................................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhhhlLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHLLEEEELLLllL
Query lihsweeerlqqfqelkamyAGVTEEDLVENLRYFLERVIPVCE..EENIKMGIHPDdpP  203
ident                     |                            |   | |   |
Sbjct ..................sgAAKDVRVALDRMKEAFDLLGEYVTsqGYDIRFAIEPK..P  183
DSSP  ..................llLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLEEEELLL..L


DSSP  LLLllLLLLLLLHHHHHHHHHHL.LLLLEELLEELLHHHHLLlLLHHHHHHHHH..HHLL
Query WEIfgLPRITKNLADLKRILSLV.DSPANGITFCTGSLGADPtNDLPTMIREIG..HRIN  260
ident  |                           |     |          |  |          
Sbjct NEP.rGDILLPTVGHALAFIERLeRPELYGVNPEVGHEQMAG.LNFPHGIAQALwaGKLF  241
DSSP  LLL.lLEELLLLHHHHHHHHLLLlLHHHEEELLLHHHHHLLL.LLHHHHHHHHHhlLLLL


DSSP  LEEELLEEElllLEEEE.LLLLhhHLLL.LHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLlLLLL
Query FVHFRNVKYlgeHRFEE.TAHPsvAGSL.DMAELMQALVDVGYEGVIRPDHGRAIwDEKA  318
ident                         || |     |   |   ||||    |       |  
Sbjct HIDLNGQSG...IKYDQdLRFG..AGDLrAAFWLVDLLESAGYEGPRHFDFKPPR.TEDI  295
DSSP  LLEELLLLL...LLLLLlLLLL..LLLHhHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLL.LLLH


DSSP  llllLLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLL..................................
Query mpgyGLYDRAMGLTYIQGLYEATKAK..................................  344
ident          |        | |   |                                   
Sbjct ..dgVWASAAGCMRNYLILKERAAAFradpevqealrasrldelaqptaadgvqelladr  353
DSSP  ..hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhhhlh


DSSP  .................................
Query .................................  344
ident                                  
Sbjct tafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  hhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.0

DSSP  leelllllllllllllhHHHLllllLLEEEEL...LLLL...lllllllhhHHHHHHHHH
Query mkwgfrwygaagdaiplKHIRqipgITGVVGT...LLNK...lpgdvwtvaEIQALKQSV   54
ident                               |                          |  
Sbjct ................sYQPT..peDRFTFGLwtvGWQGrdpfgdatrpalDPVETVQRL   42
DSSP  ................lLLLL..hhHLEEEEHhhhLLLLllllllllllllLHHHHHHHH


DSSP  HHLLLEEeEELLLLllhhhhhllllHHHHhhhhhhhhhHHHHLL......LLEEEELLLL
Query EQEGLALlGIESVAihdaikagtdqRDHYidnyrqtlrNLGKCG......ISLVCYSFKP  108
ident    |                                                        
Sbjct AELGAHG.VTFHDD......dlipfGSSD.tereshikRFRQALdatgmtVPMATTNLFT   94
DSSP  HHHLLLE.EEEEHH......hhlllLLLH.hhhhhhhhHHHHHHhhhlllLLEEELLLLL


DSSP  LLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllll
Query IFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagv  168
ident                                                             
Sbjct HP.................................................vfkdggfta  105
DSSP  LH.................................................hhlllllll


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EEEELLLLlLLLLLL.lllllllHHHHHHHHHHL
Query TEEDLVENLRYFLERVIPVCEEENI.KMGIHPDDpPWEIFG.lpritknLADLKRILSLV  226
ident    |          | |    |                  |        |   |    | 
Sbjct NDRDVRRYALRKTIRNIDLAVELGAkTYVAWGGR.EGAESGaakdvrvaLDRMKEAFDLL  164
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEELLLL.LEELLLllllhhhhHHHHHHHHHHH


DSSP  L.......LLLEELLEEllHHHH....lllllHHHHHHHH......hHHLLLEEE..LLE
Query D.......SPANGITFCtgSLGA....dptndLPTMIREI......gHRINFVHF..RNV  267
ident                                        |                    
Sbjct GeyvtsqgYDIRFAIEP..KPNEprgdillptVGHALAFIerlerpeLYGVNPEVghEQM  222
DSSP  HhhhhhhlLLLEEEELL..LLLLllleellllHHHHHHHHlllllhhHEEELLLHhhHHL


DSSP  EelllleeeellllhhhlLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLllllllllLLLLlhHH
Query KylgehrfeetahpsvagSLDMAELMQALVDVGYEGVIRPDHGRaiwdekamPGYGlyDR  327
ident                    |            |    |                      
Sbjct A.................GLNFPHGIAQALWAGKLFHIDLNGQS....gikyDQDL..RF  259
DSSP  L.................LLLHHHHHHHHHHLLLLLLLEELLLL....llllLLLL..LL


DSSP  HH....HHLHHHHHHHHHH.........................................
Query AM....GLTYIQGLYEATK.........................................  342
ident              | |                                            
Sbjct GAgdlrAAFWLVDLLESAGyegprhfdfkpprtedidgvwasaagcmrnylilkeraaaf  319
DSSP  LLllhhHHHHHHHHHHHHLlllleeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  342
ident                                                             
Sbjct radpevqealrasrldelaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlam  379
DSSP  hhlhhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhh


DSSP  .....ll
Query .....ak  344
ident        
Sbjct dhllgar  386
DSSP  hhhhlll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.4

DSSP  .............................................leELLLLLLlLLLL.
Query .............................................mkWGFRWYGaAGDA.   14
ident                                                 |           
Sbjct syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelgaHGVTFHD.DDLIp   59
DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllLEEEEEH.HHHLl


DSSP  .........lLHHHHLLL...LLLLEeEELLLLL.....lLLLL.........lLHHHHH
Query .........iPLKHIRQI...PGITGvVGTLLNK.....lPGDV.........wTVAEIQ   48
ident             |  ||     | |    |           |                  
Sbjct fgssdteresHIKRFRQAldaTGMTVpMATTNLFthpvfkDGGFtandrdvrryALRKTI  119
DSSP  llllhhhhhhHHHHHHHHhhhHLLLLlEEELLLLllhhhlLLLLllllhhhhhhHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHllLEEEEELLLL.LLHHhhhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LLE
Query ALKQSVEQegLALLGIESVA.IHDAikagTDQRDHYIDNYRQTLRNLGKCG......ISL  101
ident           |             |            |        ||         |  
Sbjct RNIDLAVE..LGAKTYVAWGgREGAesgaAKDVRVALDRMKEAFDLLGEYVtsqgydIRF  177
DSSP  HHHHHHHH..HLLLEEEELLlLLEEllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllLEE


DSSP  EEELLLLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
Query VCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqel  161
ident                                                             
Sbjct AIEPKPNEP...................................................  186
DSSP  EELLLLLLL...................................................


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHhHHHLLEEEELLLlllllllllllLLLL..hHHH
Query kamyagvteedlvenlRYFLERVIPVcEEENIKMGIHPDdppweifglprITKN..lADL  219
ident                    |         |                              
Sbjct .......rgdillptvGHALAFIERLeRPELYGVNPEVG...........HEQMaglNFP  228
DSSP  .......lleellllhHHHHHHHLLLlLHHHEEELLLHH...........HHHLlllLHH


DSSP  HHHHHhlLLLLEelLEELLH..........HHHLllLLHHHHHHHHHH...hlllEEELL
Query KRILSlvDSPANgiTFCTGS..........LGADptNDLPTMIREIGH...rinfVHFRN  266
ident   |               |            ||                           
Sbjct HGIAQalWAGKLfhIDLNGQsgikydqdlrFGAGdlRAAFWLVDLLESagyegprHFDFK  288
DSSP  HHHHHhhHLLLLllLEELLLllllllllllLLLLlhHHHHHHHHHHHHhllllleEELLL


DSSP  EEELllleeeELLLLHhhllllHHHHHHHHHH.........................hll
Query VKYLgehrfeETAHPSvagsldMAELMQALVD.........................vgy  301
ident             |         |                                     
Sbjct PPRT.edidgVWASAA....gcMRNYLILKERaaafradpevqealrasrldelaqptaa  343
DSSP  LLLL.llhhhHHHHHH....hhHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllll


DSSP  lleeeelllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll
Query egvirpdhgraiwdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
ident                                            
Sbjct dgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  llhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.5

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhHHHHhhhhhlllE
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiQALKqsveqeglA   60
ident                                                             
Sbjct ..............................................sYQPT......peD    8
DSSP  ..............................................lLLLL......hhH


DSSP  EEEEL.LLLLlhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLlllllllleeee
Query LLGIE.SVAIhdaikagtdqrdhyidNYRQTLRNLGKCGISLVCYSFKpifgwaktdlay  119
ident                               |   |   |   |                 
Sbjct RFTFGlWTVG.wqgrdpfgdatrpalDPVETVQRLAELGAHGVTFHDD............   55
DSSP  LEEEEhHHHL.lllllllllllllllLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHH............


DSSP  ellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllHHHHhHHHHH
Query enedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvtEEDLvENLRY  179
ident                                                             
Sbjct .............................................dlipfGSSD.TERES   69
DSSP  .............................................hhlllLLLH.HHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLEE.EELLLLLlLLLL.........lllllllLHHHHHHHHHHllLL
Query FLERVIPVCEEENIKM.GIHPDDPpWEIF.........glpritkNLADLKRILSLvdSP  229
ident    |                                          |    |   |    
Sbjct HIKRFRQALDATGMTVpMATTNLF.THPVfkdggftandrdvrryALRKTIRNIDL.aVE  127
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLlEEELLLL.LLHHhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHH.hHH


DSSP  LEE.lLEELlhHHHL............lllLHHHHHHHHH......hhllleeELLEeel
Query ANG.iTFCTgsLGAD............ptnDLPTMIREIG......hrinfvhFRNVkyl  270
ident             |                          |                    
Sbjct LGAktYVAW..GGREgaesgaakdvrvaldRMKEAFDLLGeyvtsqgydirfaIEPK..p  183
DSSP  HLLleEEEL..LLLLeelllllllhhhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhlllleeeELLL..l


DSSP  lllEEEE..LLLLHhhlllLHHHHHhhhHHHLL...........................
Query gehRFEE..TAHPSvagslDMAELMqalVDVGY...........................  301
ident    |                 |                                      
Sbjct nepRGDIllPTVGH.....ALAFIE.rlERPELygvnpevgheqmaglnfphgiaqalwa  237
DSSP  lllLLEEllLLHHH.....HHHHHL.llLLHHHeeelllhhhhhlllllhhhhhhhhhhl


DSSP  .llEEEEllllllllLLLLLLL......................................
Query .egVIRPdhgraiwdEKAMPGY......................................  322
ident                                                             
Sbjct gklFHID....lngqSGIKYDQdlrfgagdlraafwlvdllesagyegprhfdfkpprte  293
DSSP  lllLLLE....elllLLLLLLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct didgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasrldelaqptaadgvqelladr  353
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhhhlh


DSSP  ...........llhhhhhhhlhhhhhhhhhhll
Query ...........glydramgltyiqglyeatkak  344
ident                                  
Sbjct tafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  hhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll