No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=22.3

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhHLEEEEHhHHHLLLllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehLRFSIAYwHTFTADgtdqfg   60
ident                                                  |          
Sbjct ........................................MKLCFNE.ATTLEN......   13
DSSP  ........................................LEEEEEH.HHHLLL......


DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHH.HHLLllllhhhhhhhhh
Query katmqrpwnhytdpmdiakaRVEAAFEFFDKINAPYFCFHDR.DIAPegdtlretnknld  119
ident                           |   |    |                        
Sbjct ...................sNLKLDLELCEKHGYDYIEIRTMdKLPE.........ylkd   45
DSSP  ...................lLHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLlHHHH.........hlll


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLLllhhhlllLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query TIVAMIKDYLKTSKTKVLWGTANLFsnprfvhgASTScNADVFAYSAAQVKKALEITKEL  179
ident         |  |   | |   |  |                         |   |  | |
Sbjct HSLDDLAEYFQTHHIKPLALNALVF........FNNR.DEKGHNEIITEFKGMMETCKTL   96
DSSP  LLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEEL........LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLEEEELLllLEELLHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEELLLLLLlll
Query GGENYVFWGgrEGYETLlnTDMEFELDNFARFLHMAVDYAKeiGFEGQFLIEPKPKEptk  239
ident |    |        |       |         |    | |           |        
Sbjct GVKYVVAVP..LVTEQK..IVKEEIKKSSVDVLTELSDIAE..PYGVKIALEFVGHP...  147
DSSP  LLLEEEEEL..LLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHLLEEEEELLLLL...


DSSP  EELLLLHHHHHHHHHhlLLLLL.EEEEEEHHHHHHLLLLhHHHHHHhHHLLLEEEEELLL
Query HQYDFDVANVLAFLRkyDLDKY.FKVNIEANHATLAFHDfQHELRYaRINGVLGSIDANT  298
ident                                |           |                
Sbjct QCTVNTFEQAYEIVN..TVNRDnVGLVLDSFHFHAMGSN.IESLKQ.ADGKKIFIYHIDD  203
DSSP  LLLLLLHHHHHHHHH..HHLLLlEEEEEEHHHHHHLLLL.HHHHHL.LLHHHEEEEEELE


DSSP  LLLL...LLLL.LLLLLLL.hhHHHHHHHHHHHLLLLLllLEEELLLLLLlLLLL..HHH
Query GDML...LGWD.TDQFPTD.irMTTLAMYEVIKMGGFDkgGLNFDAKVRRaSFEP..EDL  351
ident           |     |                 |  |                   |  
Sbjct TEDFpigFLTDeDRVWPGQgaiDLDAHLSALKEIGFSD..VVSVELFRPEyYKLTaeEAI  261
DSSP  ELLLlllLLLHhHEELLLLlllLHHHHHHHHHHLLLLL..EEEELLLLHHhHHLLhhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhh
Query FLGHIAGMDAFAKGFKvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekya  411
ident         |   | |                                             
Sbjct QTAKKTTVDVVSKYFS............................................  277
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLL............................................


DSSP  hhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query lersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                           
Sbjct .........................m  278
DSSP  .........................l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.5

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHH.HHHLLllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYW.HTFTAdgtdqf   59
ident                                                             
Sbjct .............mklcfneattlensnlkldlelcekhGYDYIEIRTmDKLPE......   41
DSSP  .............leeeeehhhhlllllhhhhhhhhhhlLLLEEEEELlLHHHH......


DSSP  lllllllhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLEEEE.EHHH.hlllLLLHHHHHHH
Query gkatmqrpwnhytdpmdiakARVEAAFEFFDKINAPYFCF.HDRD.iapeGDTLRETNKN  117
ident                            | |                         |    
Sbjct ................ylkdHSLDDLAEYFQTHHIKPLALnALVFfnnrdEKGHNEIITE   85
DSSP  ................hlllLLHHHHHHHHHLLLLEEEEEeEEELlllllHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhlllllEEEEEELLLLLLHHhllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query LDTIVAMIKDYlktsktKVLWGTANLFSNPRfvhgastSCNADVFAYSAAQVKKALEITK  177
ident         |         |    |                       |         |  
Sbjct FKGMMETCKTL......GVKYVVAVPLVTEQ......kIVKEEIKKSSVDVLTELSDIAE  133
DSSP  HHHHHHHHHHH......LLLEEEEELLLLLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLlEEEELLLlLEELlhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhhllllleEEELL...LL
Query ELGGeNYVFWGGrEGYEtllntdmefeldNFARFLHMAVDYAkeigfegqFLIEP...KP  234
ident   |                                                |        
Sbjct PYGV.KIALEFV.GHPQ.....ctvntfeQAYEIVNTVNRDN.......vGLVLDsfhFH  179
DSSP  HHLL.EEEEELL.LLLL.....lllllhhHHHHHHHHHLLLL.......eEEEEEhhhHH


DSSP  LLllleellllhHHHHHHHhhlllLLLEEEEEEHhhHHHL..................LL
Query KEptkhqydfdvANVLAFLrkydlDKYFKVNIEAnhATLA..................FH  276
ident                |        |                                   
Sbjct AM.......gsnIESLKQA.....DGKKIFIYHI..DDTEdfpigfltdedrvwpgqgAI  225
DSSP  HL.......lllHHHHHLL.....LHHHEEEEEE..LEELllllllllhhheelllllLL


DSSP  LHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLL.lllllllllLLLL..HHHHHHHHHHHHHlllllll
Query DFQHELRYARINGVLGSIDANTGD.mllgwdtdqFPTD..IRMTTLAMYEVIKmggfdkg  333
ident |    |      |                                               
Sbjct DLDAHLSALKEIGFSDVVSVELFRpeyykltaeeAIQTakKTTVDVVSKYFSM.......  278
DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLhhhhhllhhhHHHHhhHHHHHHHLLLLLL.......


DSSP  leeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhh
Query glnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgi  393
ident                                                             
Sbjct ............................................................  278
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query gadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                             
Sbjct ............................................  278
DSSP  ............................................


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.4

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLEEEEEHHHHLLllllhhhhhhHHHH
Query katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinAPYFCFHDRDIAPegdtlretnkNLDT  120
ident                                                         ||  
Sbjct .................................MKLCFNEATTLEN.........sNLKL   18
DSSP  .................................LEEEEEHHHHLLL.........lLHHH


DSSP  HHHHHHHHHlllllEEEEEELlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhHHHH........
Query IVAMIKDYLktsktKVLWGTAnlfsnprfvhgastscnadvfaysaaqVKKA........  172
ident                                                   |         
Sbjct DLELCEKHG....yDYIEIRT...........................MDKLpeylkdhs   47
DSSP  HHHHHHHLL....lLEEEEEL...........................LLHHhhhlllll


DSSP  ......hhhhhhLLLLEEEELLllleellhhhllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLL
Query ......leitkeLGGENYVFWGgregyetllntdMEFELDNFARFLHMAVDYAKeIGFEG  226
ident                                    |                 |      
Sbjct lddlaeyfqthhIKPLALNALV.......ffnnrDEKGHNEIITEFKGMMETCK.TLGVK   99
DSSP  hhhhhhhhhlllLEEEEEEEEE.......lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLL


DSSP  EEEELLLLLlLLLEellllhHHHHHHHHhlLLLL.......LEEEEEehhHHHHL..lLL
Query QFLIEPKPKePTKHqydfdvANVLAFLRkyDLDK.......YFKVNIeanHATLA..fHD  277
ident      |      |             |    |                            
Sbjct YVVAVPLVT.EQKIvkeeikKSSVDVLT..ELSDiaepygvKIALEF...VGHPQctvNT  153
DSSP  EEEEELLLL.LLLLlhhhhhHHHHHHHH..HHHHhhhhhllEEEEEL...LLLLLlllLL


DSSP  HHHHHHHHHHLL...LEEEEEL..LLLLlllllllllllllhhHHHHHHHHhhhLLLLll
Query FQHELRYARING...VLGSIDA..NTGDmllgwdtdqfptdirMTTLAMYEvikMGGFdk  332
ident |              |    |                                  |    
Sbjct FEQAYEIVNTVNrdnVGLVLDSfhFHAM.............gsNIESLKQA...DGKK.i  196
DSSP  HHHHHHHHHHHLlllEEEEEEHhhHHHL.............llLHHHHHLL...LHHH.e


DSSP  LLEEELLLLLL......lllllhhHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhhhhhl
Query GGLNFDAKVRR......asfepedLFLGhiAGMDAFAKGFKVAYklvkdrvfdkfieery  386
ident      |                           ||     |                   
Sbjct FIYHIDDTEDFpigfltdedrvwpGQGA..IDLDAHLSALKEIG................  238
DSSP  EEEEELEELLLllllllhhheellLLLL..LLHHHHHHHHHHLL................


DSSP  hhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query asykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                                    
Sbjct ...........fsdvvsvelfrpeyykltaeeaiqtakkttvdvvskyfsm  278
DSSP  ...........llleeeellllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.3

DSSP  .........................lllllllllleellllllLLLE.ELLLL.LLLEEl
Query .........................nkyfenvskikyegpksnNPYS.FKFYN.PEEVId   33
ident                                               |             
Sbjct mklcfneattlensnlkldlelcekhgydyieirtmdklpeylKDHSlDDLAEyFQTHH.   59
DSSP  leeeeehhhhlllllhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhlLLLLhHHHHHhHHLLL.


DSSP  leehhhHHLEEEEHHhhhlllllllllllllllhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query gktmeeHLRFSIAYWhtftadgtdqfgkatmqrpwnhytdPMDIAKARVEAAFEFFDKIN   93
ident                                                             
Sbjct ......IKPLALNAL...................vffnnrDEKGHNEIITEFKGMMETCK   94
DSSP  ......LEEEEEEEE...................elllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  ...LLEEEEEHHHhllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEeEEELLLLLLhhhl
Query ...APYFCFHDRDiapegDTLRETNKNLDTIVAMIKDYLKTSKTKVlWGTANLFSNprfv  150
ident      |                |  |          |       |               
Sbjct tlgVKYVVAVPLV.teqkIVKEEIKKSSVDVLTELSDIAEPYGVKI.ALEFVGHPQ....  148
DSSP  hhlLLEEEEELLL.llllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEE.EEELLLLLL....


DSSP  llllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHH....HLLLLEEEEL..LLLLeellhhhllhhhh
Query hgastscnadvfaysaaQVKKALEITK....ELGGENYVFW..GGREgyetllntdmefe  204
ident                      | ||         |                         
Sbjct .............ctvnTFEQAYEIVNtvnrDNVGLVLDSFhfHAMG.............  182
DSSP  .............llllLHHHHHHHHHhhllLLEEEEEEHHhhHHLL.............


DSSP  hhhhhhHHHHHHHHHhhlLLLL.eEEELLLLLLL...lleeLLLLHHHhhHHHHhllLLL
Query ldnfarFLHMAVDYAkeiGFEG.qFLIEPKPKEP...tkhqYDFDVANvlAFLRkydLDK  260
ident                   |       |      |                  |       
Sbjct .....sNIESLKQAD...GKKIfiYHIDDTEDFPigfltdeDRVWPGQgaIDLD..aHLS  232
DSSP  .....lLHHHHHLLL...HHHEeeEEELEELLLLlllllhhHEELLLLllLLHH..hHHH


DSSP  LE........EEEEEHHhhHHLL.....lLHHHHHHHHHHLLleeeeellllllllllll
Query YF........KVNIEANhaTLAF.....hDFQHELRYARINGvlgsidantgdmllgwdt  307
ident                                |                            
Sbjct ALkeigfsdvVSVELFR..PEYYkltaeeAIQTAKKTTVDVV..................  272
DSSP  HHhhllllleEEELLLL..HHHHhllhhhHHHHHHHHHHHHH..................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query dqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfk  367
ident                                                             
Sbjct ............................................................  272
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhh
Query vayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqell  427
ident                                                             
Sbjct ............................................................  272
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhll
Query esilnqylfa  437
ident           
Sbjct ....skyfsm  278
DSSP  ....llllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  ......................lllllllllleellllllllleeLLLL.lLLEELLEeh
Query ......................nkyfenvskikyegpksnnpysfKFYN.pEEVIDGKtm   37
ident                                                     |       
Sbjct mklcfneattlensnlkldlelcekhgydyieirtmdklpeylkdHSLDdlAEYFQTH..   58
DSSP  leeeeehhhhlllllhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhlllLLHHhhHHHHHLL..


DSSP  hhHHLE...................................EEEHHhhhLLLLLLlllll
Query eeHLRF...................................SIAYWhtfTADGTDqfgka   62
ident                                                             
Sbjct hiKPLAlnalvffnnrdekghneiitefkgmmetcktlgvkYVVAV...PLVTEQ.....  110
DSSP  llEEEEeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllEEEEE...LLLLLL.....


DSSP  llllhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEHHhhllllllhhhhhhHHHHHH
Query tmqrpwnhytDPMDIAKARVEAAFEFFDKINApYFCFHDRdiapegdtlretnkNLDTIV  122
ident                                                           ||
Sbjct .....kivkeEIKKSSVDVLTELSDIAEPYGV.KIALEFV...ghpqctvntfeQAYEIV  161
DSSP  .....lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EEEEELL...lllllllllhhHHHHHH


DSSP  HHhHHHHllllleeeEEEL..LLLLlhhhlllllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHhHHLL
Query AMiKDYLktsktkvlWGTA..NLFSnprfvhgastscnadvfaysaAQVKKALEItKELG  180
ident                                                             
Sbjct NT.VNRD....nvglVLDSfhFHAM....................gSNIESLKQAdGKKI  196
DSSP  HH.HLLL....leeeEEEHhhHHHL....................lLLHHHHHLLlHHHE


DSSP  LlEEEELLLLLEEllhhhllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLllllle
Query GeNYVFWGGREGYetllntdmefeldnfarFLHMAVDYAKEIGFEGQFLIEPKPkeptkh  240
ident    |                           |       |||||      |         
Sbjct F.IYHIDDTEDFPigfltdedrvwpgqgaiDLDAHLSALKEIGFSDVVSVELFR......  249
DSSP  E.EEEELEELLLLlllllhhheelllllllLHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL......


DSSP  ellllhhhhhhhhhhlllllleeeeeehHHHHhlLLLHHHHHHHHHhlLLEEeeelllll
Query qydfdvanvlaflrkydldkyfkvnieaNHATlaFHDFQHELRYARinGVLGsidantgd  300
ident                                             |               
Sbjct ............................PEYY..KLTAEEAIQTAK..KTTV........  269
DSSP  ............................HHHH..HLLHHHHHHHHH..HHHH........


DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhh
Query mllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmd  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................  269
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlllllll
Query afakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnk  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................  269
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhll
Query sgrqellesilnqylfa  437
ident                  
Sbjct ........dvvskyfsm  278
DSSP  ........hhhllllll