No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.5

DSSP  .............................LLLEEEELLlLLLL..........LLHH.HH
Query .............................MPRFAANLSmMFTE..........VPFI.ER   20
ident                                                           | 
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldRLPVSMHCW.QGDDvsgfenypgkARNAsEL   59
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlLLLEEEEHH.HHLLllllllllllLLLHhHH


DSSP  HHHHHHHL.....LLEEELLLLLLL.............LHHHHHHHHHHLLLEEeEEELL
Query FAAARKAG.....FDAVEFLFPYNY.............STLQIQKQLEQNHLTLaLFNTA   62
ident  |    |               |                          | | |  ||  
Sbjct RADLEQAMrlipgPKRLNLHAIYLEsdtpvsrdqikpeHFKNWVEWAKANQLGL.DFNPS  118
DSSP  HHHHHHHHhllllLEEEEEEHHHLLllllllhhhllhhHHHHHHHHHHHLLLEE.EEELL


DSSP  LLLH..HHLLllLLLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEELLLLLLL..L
Query PGDI..NAGEwgLSALPG..REHEAHADIDLALEYALALN.....CEQVHVMAGVVP..A  111
ident        |                                                    
Sbjct CFSHplSADG.fTLSHADdsIRQFWIDHCKASRRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIPDGMkdI  177
DSSP  LLLLhhHLLL.lLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEELLLLEEllL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHL..LEEEELLLLLLLLL..LLLLLLhHHHHHHHHH
Query GEDAERYRAVFIDNIRYAADRfAPHG..KRILVEALSPGVKP..HYLFSSqYQALAIVEE  167
ident   |    |                        ||    |         |           
Sbjct TVDRLAPRQRLLAALDEVISE.KLNPahHIDAVESKLFGIGAesYTVGSN.EFYMGYATS  235
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLllEEEEEELLLLLLLLllEELLLH.HHHHHHHHH


DSSP  HlllLEEEEEEHHHHhHHLLLHHHHHHHLL..LLEEEEEELLLL...LLLLLLLlLLLHH
Query VardNVFIQLDTFHAqKVDGNLTHLIRDYA..GKYAHVQIAGLP...DRHEPDDgEINYP  222
ident          ||  |           |                       |          
Sbjct R...QTALCLDAGHF.HPTEVISDKISAAMlyVPQLLLHVSRPVrwdSDHVVLL.DDETQ  290
DSSP  H...LLEEEEELLLL.LLLLLHHHHHHHHLllLLLEEEEELLLLlllLLLLLLL.LHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLL..LLEEELLLLL.LLLHHH.LHHHHHHHH...................
Query WLFRLFDEVGYQ..GWIGCEYKPR.GLTEEG.LGWFDAWRG...................  259
ident                 ||                                          
Sbjct AIASEIVRHDLFdrVHIGLDFFDAsINRIAAwVIGTRNMKKallralleptaelrkleap  350
DSSP  HHHHHHHHLLHHhlEEEEELLLLLlLLHHHHhHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhhhhhll


DSSP  ...................................................l
Query ...................................................s  260
ident                                                     
Sbjct gdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesvrayekeilsrr  402
DSSP  llhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.2

DSSP  ..llleeeelllllllllhhhhhhhhhhhllLEEELLLL................LLLLH
Query ..mprfaanlsmmftevpfierfaaarkagfDAVEFLFP................YNYST   42
ident                                                             
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlPVSMHCWQgddvsgfenypgkarnASELR   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllLEEEEHHHhlllllllllllllllHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLlEEEEEELLLllhhhllllLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLEE
Query LQIQKQLEQNHlTLALFNTAPgdinagewgLSALpgreheAHADIDLALEYALALNCEQV  102
ident                |   |                             | | |      
Sbjct ADLEQAMRLIPgPKRLNLHAI.ylesdtpvSRDQ.....iKPEHFKNWVEWAKANQLGLD  114
DSSP  HHHHHHHHLLLlLEEEEEEHH.hlllllllLHHH.....lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEE


DSSP  ELLLL.LLLL..........llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLEE.EELLLLLL.
Query HVMAG.VVPA..........geDAERYRAVFIDNIRYAADRF.APHGKRI.LVEALSPG.  148
ident         |                          |     |    |           | 
Sbjct FNPSCfSHPLsadgftlshaddSIRQFWIDHCKASRRVSAYFgEQLGTPSvMNIWIPDGm  174
DSSP  EELLLlLLHHhllllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLEeEEELLLLEe


DSSP  .....llllllllLHHHHHHHHHhHLLL..LEEEEEEHH......hhhHHLL..LHHHHH
Query .....vkphylfsSQYQALAIVEeVARD..NVFIQLDTF......haqKVDG..NLTHLI  193
ident                                                  |          
Sbjct kditvdrlaprqrLLAALDEVIS.EKLNpaHHIDAVESKlfgigaesyTVGSneFYMGYA  233
DSSP  lllllllhhhhhhHHHHHHHHLL.LLLLllLEEEEEELLlllllllleELLLhhHHHHHH


DSSP  HHLLLleeeEEEL.LLLLlllllllLLLHHHHHHHHHHLLLLLLEEElLLLLL....llh
Query RDYAGkyahVQIA.GLPDrhepddgEINYPWLFRLFDEVGYQGWIGCeYKPRG....lte  248
ident             |                            |        |         
Sbjct TSRQT..alCLDAgHFHP.......TEVISDKISAAMLYVPQLLLHV.SRPVRwdsdhvv  283
DSSP  HHHLL..eeEEELlLLLL.......LLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEE.LLLLLlllllll


DSSP  hHLHHHHHHHHL................................................
Query eGLGWFDAWRGS................................................  260
ident        |                                                    
Sbjct lLDDETQAIASEivrhdlfdrvhigldffdasinriaawvigtrnmkkallralleptae  343
DSSP  lLLHHHHHHHHHhhhllhhhleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  ...........................................................
Query ...........................................................  260
ident                                                            
Sbjct lrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesvrayekeilsrr  402
DSSP  hhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhlllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh


DSSP  ..........LLLEEEELLlllLLLL.............HHHHHHHHHHHLLlEEELLL.
Query ..........MPRFAANLSmmfTEVP.............FIERFAAARKAGFdAVEFLF.   36
ident                 ||                     |      |         |   
Sbjct adleqamrliPGPKRLNLH.aiYLESdtpvsrdqikpehFKNWVEWAKANQL.GLDFNPs  118
DSSP  hhhhhhhhllLLLEEEEEE.hhHLLLlllllhhhllhhhHHHHHHHHHHLLL.EEEEELl


DSSP  ..............................LLLLlhhhhhhhhhhlLLEE.EEEELLLLL
Query ..............................PYNYstlqiqkqleqnHLTL.ALFNTAPGD   65
ident                                                |      |    |
Sbjct cfshplsadgftlshaddsirqfwidhckaSRRV......sayfgeQLGTpSVMNIWIPD  172
DSSP  llllhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhHHHH......hhhhhhHHLLlEEEEELLLL


DSSP  ..hhhlllllllLLLLHHHHHHHHHHhhHHHHhlLLLEEELLLLLL...LLLLlhhhHHH
Query ..inagewglsaLPGREHEAHADIDLalEYALalNCEQVHVMAGVV...PAGEdaerYRA  120
ident                        |                |                   
Sbjct gmkditvdrlapRQRLLAALDEVISE..KLNP..AHHIDAVESKLFgigAESY.tvgSNE  227
DSSP  eelllllllhhhHHHHHHHHHHHLLL..LLLL..LLEEEEEELLLLlllLLLE.ellLHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhhlleEEELLLLlllllllllLLHHHHHHHHHHHllllEEEEEEHH
Query VFIDNIRYAAdrfaphgkrILVEALSpgvkphylfSSQYQALAIVEEVardnVFIQLDTF  180
ident                                           |    |        |   
Sbjct FYMGYATSRQ.........TALCLDA..ghfhpteVISDKISAAMLYV....PQLLLHVS  272
DSSP  HHHHHHHHHL.........LEEEEEL..lllllllLHHHHHHHHLLLL....LLEEEEEL


DSSP  ........hhhhhlLLHHHHHH...HLLL.lEEEEEELLLLL....llLLLLlllLHHHH
Query ........haqkvdGNLTHLIR...DYAG.kYAHVQIAGLPD....rhEPDDgeiNYPWL  224
ident                                  |                          
Sbjct rpvrwdsdhvvlldDETQAIASeivRHDLfdRVHIGLDFFDAsinriaAWVI...GTRNM  329
DSSP  llllllllllllllHHHHHHHHhhhHLLHhhLEEEEELLLLLlllhhhHHHH...HHHHH


DSSP  HHHHHHLL................lllleeellllllllhhhlhhhhhHHHL........
Query FRLFDEVG................yqgwigceykprglteeglgwfdaWRGS........  260
ident                                                             
Sbjct KKALLRALleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqRHDTpagsewle  389
DSSP  HHHHHHHHlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhHLLLlllllhhh


DSSP  .............
Query .............  260
ident              
Sbjct svrayekeilsrr  402
DSSP  hhhhhhhhlllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh


DSSP  ..................................................LLLEEeELLL
Query ..................................................MPRFAaNLSM   10
ident                                                         | | 
Sbjct adleqamrlipgpkrlnlhaiylesdtpvsrdqikpehfknwvewakanqLGLDF.NPSC  119
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeehhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllLEEEE.ELLL


DSSP  ................llllLLHHHHHHHHhhhLLLE...........EELLL.......
Query ................mfteVPFIERFAAArkaGFDA...........VEFLF.......   36
ident                        |    |       |                       
Sbjct fshplsadgftlshaddsirQFWIDHCKAS..rRVSAyfgeqlgtpsvMNIWIpdgmkdi  177
DSSP  lllhhhllllllllllhhhhHHHHHHHHHH..hHHHHhhhhhhllleeEEELLlleelll


DSSP  ......lllLLHHHHHHhHHHLL...lEEEEEElLLLLH..HHLLlllllllllhhhHHH
Query ......pynYSTLQIQKqLEQNH...lTLALFNtAPGDI..NAGEwglsalpgreheAHA   85
ident                                                             
Sbjct tvdrlaprqRLLAALDEvISEKLnpahHIDAVE.SKLFGigAESY........tvgsNEF  228
DSSP  llllhhhhhHHHHHHHHhLLLLLllllEEEEEE.LLLLLllLLLE........elllHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhlllLEEELLL..LLLLllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhhlLEEEEL
Query DIDLALEYAlalncEQVHVMA..GVVPagedaeryravFIDNIRYAADRFaphgKRILVE  143
ident     |               |                   | |  |           |  
Sbjct YMGYATSRQ.....TALCLDAghFHPT.........evISDKISAAMLYV....PQLLLH  270
DSSP  HHHHHHHHL.....LEEEEELllLLLL.........llHHHHHHHHLLLL....LLEEEE


DSSP  LLLlllLLLL.......llllhHHHHHHHHHHLL.LLEEEEEEHH....hhhhHLLLH.h
Query ALSpgvKPHY.......lfssqYQALAIVEEVAR.DNVFIQLDTF....haqkVDGNL.t  190
ident                                    | | | || |               
Sbjct VSR...PVRWdsdhvvllddetQAIASEIVRHDLfDRVHIGLDFFdasinriaAWVIGtr  327
DSSP  ELL...LLLLlllllllllhhhHHHHHHHHHLLHhHLEEEEELLLlllllhhhHHHHHhh


DSSP  hhHHHLL.....lleeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllleeellllll
Query hlIRDYA.....gkyahvqiaglpdrhepddgeinypwlfrlfdevgyqgwigceykprg  245
ident                                                             
Sbjct nmKKALLralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsew  387
DSSP  hhHHHHHhhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllh


DSSP  llhhhlhhhhhhhhl
Query lteeglgwfdawrgs  260
ident                
Sbjct lesvrayekeilsrr  402
DSSP  hhhhhhhhhhlllll