No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=19.5

DSSP  .......................................LLEEEEELL............
Query .......................................MKYIGAHVS............    9
ident                                                             
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYWhtftadgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHHhhhlllllllll


DSSP  .................llLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLL......llllLLLLLLH
Query .................aaGGLANAAIRAAEIDATAFALFTKN......qrqwRAAPLTT   46
ident                         |      | |  |                    | |
Sbjct katmqrpwnhytdpmdiakARVEAAFEFFDKINAPYFCFHDRDiapegdtlreTNKNLDT  120
DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHHhllllllhhhHHHHHHH


DSSP  hHHHHHHHHHHHLLLLHhhLLLLLLLL.......lLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query qTIDEFKAACEKYHYTSaqILPHDSYL.......iNLGHPVTEALEKSRDAFIDEMQRCE   99
ident       |                                        |            
Sbjct .IVAMIKDYLKTSKTKV..LWGTANLFsnprfvhgASTSCNADVFAYSAAQVKKALEITK  177
DSSP  .HHHHHHHHHLLLLLEE..EEEELLLLllhhhlllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLEEEELL..LLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLLEEEEELLLLL.
Query QLGLSLLNFHP..GSHLMQ..ISEEDCLARIAESINIALDKT....QGVTAVIENTAGQ.  150
ident  ||     |               |  |   |     | |            ||      
Sbjct ELGGENYVFWGgrEGYETLlnTDMEFELDNFARFLHMAVDYAkeigFEGQFLIEPKPKEp  237
DSSP  HLLLLEEEELLllLEELLHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllLLLEEEELLLLLLl


DSSP  .LLLLLLLHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEEEHHHHHHHLLLLllhhhhhHHHHHHHhhlLH
Query .GSNLGFKFEHLAAIIDGVEDKSRVGVCIDTCHAFAAGYDLrtpaeceKTFADFArtvGF  209
ident       |      |            | |   ||  |  |                    
Sbjct tKHQYDFDVANVLAFLRKYDLDKYFKVNIEANHATLAFHDF......qHELRYAR...IN  288
DSSP  lLEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEHHHHHHLLLLH......hHHHHHHH...HL


DSSP  HHEEEEEELEELlLLLLlLLLEELLLllllLLHHHHHHHLLH...HHLL.LEEEELLLL.
Query KYLRGMHLNDAKsTFGSrVDRHHSLGegniGHDAFRWIMQDD...RFDG.IPLILETIN.  264
ident   |     |          |                  |             |       
Sbjct GVLGSIDANTGD.MLLG.WDTDQFPT....DIRMTTLAMYEVikmGGFDkGGLNFDAKVr  342
DSSP  LLEEEEELLLLL.LLLL.LLLLLLLL....LHHHHHHHHHHHhhlLLLLlLLEEELLLLl


DSSP  .........HHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.............................
Query .........PDIWAEEIAWLKAQQTE.KAVA.............................  285
ident                                                             
Sbjct rasfepedlFLGHIAGMDAFAKGFKVaYKLVkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgka  402
DSSP  llllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhlll


DSSP  ...................................
Query ...................................  285
ident                                    
Sbjct dfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  lhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.5

DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllllLLLLLLhhHHHH.........
Query mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrqwRAAPLTtqTIDE.........   51
ident                                                 |           
Sbjct .....................................nkYFENVS..KIKYegpksnnpy   21
DSSP  .....................................llLLLLLL..LLEElllllllll


DSSP  ..hhHHHHH.....LLLLhhHLLLLLLL..............llllllllHHHHHHHHHH
Query ..fkAACEK.....YHYTsaQILPHDSY..............linlghpvTEALEKSRDA   90
ident        |                                          |         
Sbjct sfkfYNPEEvidgkTMEEhlRFSIAYWHtftadgtdqfgkatmqrpwnhyTDPMDIAKAR   81
DSSP  eellLLLLLeelleEHHHhhLEEEEHHHhhlllllllllllllllhhhhlLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLEEEELLL...LLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLEE.EE
Query FIDEMQRCEQLGLSLLNFHPG...SHLMqiSEEDCLARIAESINIALDKT..QGVTA.VI  144
ident                  ||                            |            
Sbjct VEAAFEFFDKINAPYFCFHDRdiaPEGD..TLRETNKNLDTIVAMIKDYLktSKTKVlWG  139
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHhhlLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLEEeEE


DSSP  ELLLLLL................llllLLHHHHHHHHhhlllHHHE.EEEEEhhhhHHHL
Query ENTAGQG................snlgFKFEHLAAIIdgvedKSRV.GVCIDtchaFAAG  187
ident                                    |                        
Sbjct TANLFSNprfvhgastscnadvfaysaAQVKKALEIT....kELGGeNYVFW....GGRE  191
DSSP  ELLLLLLhhhlllllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHH....hHLLLlEEEEL....LLLL


DSSP  ........llllLHHHHHHHHHHHHHHLL...HHHEEEEEeLEELLLllllllleellll
Query ........ydlrTPAECEKTFADFARTVG...FKYLRGMHlNDAKSTfgsrvdrhhslge  236
ident                                 |           |               
Sbjct gyetllntdmefELDNFARFLHMAVDYAKeigFEGQFLIE.PKPKEP...........tk  239
DSSP  eellhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEEL.LLLLLL...........ll


DSSP  LLLL...LHHHHHHH...lLHHHllleEEELLL....lHHHHHHHHHHHHHHL.......
Query GNIG...HDAFRWIM...qDDRFdgipLILETI....nPDIWAEEIAWLKAQQ.......  279
ident                    |  |       |             |               
Sbjct HQYDfdvANVLAFLRkydlDKYF...kVNIEANhatlaFHDFQHELRYARINGvlgsida  296
DSSP  EELLllhHHHHHHHHhlllLLLE...eEEEEHHhhhhlLLLHHHHHHHHHHLLleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  279
ident                                                             
Sbjct ntgdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghi  356
DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  279
ident                                                             
Sbjct agmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersq  416
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlll


DSSP  ...............llllll
Query ...............tekava  285
ident                      
Sbjct ivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  ..............lleeeeellllllhhhhhhhhhhllLLEEELLL..LLLL.......
Query ..............mkyigahvsaagglanaairaaeidATAFALFT..KNQR.......   37
ident                                           |                 
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYwhTFTAdgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHhhHHLLlllllll


DSSP  ................LLLLLlllhhhhHHHHHHHhhllllhhhLLLLL..LLLLlllll
Query ................QWRAAplttqtiDEFKAACekyhytsaqILPHD..SYLInlghp   79
ident                    |          |                             
Sbjct katmqrpwnhytdpmdIAKAR..veaafEFFDKIN........aPYFCFhdRDIApegdt  110
DSSP  llllllhhhhlllhhhHHHHH..hhhhhHHHHHHL........lLEEEEehHHHLlllll


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLL.LLLL...........LLHHHHHHHHH
Query VTEALEKSRDAFIDEMQRCEQLGLSLLNFHPGS.HLMQ...........ISEEDCLARIA  127
ident   |                       |                             |   
Sbjct LRETNKNLDTIVAMIKDYLKTSKTKVLWGTANLfSNPRfvhgastscnaDVFAYSAAQVK  170
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLlLLHHhlllllllllhHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHhlllLEEEEELLLLL...........llllllLHHHHHHHHHHL..LLHHhE
Query ESINIALDktqgVTAVIENTAGQ...........gsnlgfKFEHLAAIIDGV..EDKSrV  174
ident     |                |                      |    |          
Sbjct KALEITKE...lGGENYVFWGGRegyetllntdmefeldnFARFLHMAVDYAkeIGFE.G  226
DSSP  HHHHHHHH...lLLLEEEELLLLleellhhhllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhLLLL.L


DSSP  EEEEEhhHHHH.....HLLLLllhhhHHHHHHHHHHH.LLHHHEeeEEELEEllllllll
Query GVCIDtcHAFA.....AGYDLrtpaeCEKTFADFART.VGFKYLrgMHLNDAkstfgsrv  228
ident    |                           |                            
Sbjct QFLIE..PKPKeptkhQYDFD.....VANVLAFLRKYdLDKYFK.vNIEANH........  270
DSSP  EEEEL..LLLLlllleELLLL.....HHHHHHHHHHLlLLLLEE.eEEEHHH........


DSSP  lleelllLLLLLL..HHHHHHhLLHHHllLEEEELLL..........LHHHhHHHHHHHH
Query drhhslgEGNIGH..DAFRWImQDDRFdgIPLILETI..........NPDIwAEEIAWLK  276
ident                   |                |            |           
Sbjct ......aTLAFHDfqHELRYA.RINGV.lGSIDANTGdmllgwdtdqFPTD.IRMTTLAM  321
DSSP  ......hHHLLLLhhHHHHHH.HHLLL.eEEEELLLLllllllllllLLLL.HHHHHHHH


DSSP  HHLLL.......................................................
Query AQQTE.......................................................  281
ident                                                             
Sbjct YEVIKmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkf  381
DSSP  HHHHHlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhh


DSSP  ....................................................llll
Query ....................................................kava  285
ident                                                         
Sbjct ieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll


DSSP  .................................LLEEeEELLLL........llhhhhhh
Query .................................MKYIgAHVSAA........gglanaai   19
ident                                    |                        
Sbjct katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinAPYF.CFHDRDiapegdtlretnknld  119
DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLEE.EEEHHHhllllllhhhhhhhhh


DSSP  hhHHLL.........LLEEELL......llllLLLL......LLLLlhhhhhhhhhhhhh
Query raAEID.........ATAFALF......tknqRQWR......AAPLttqtidefkaacek   58
ident                                            |                
Sbjct tiVAMIkdylktsktKVLWGTAnlfsnprfvhGASTscnadvFAYS..aaqvkkaleitk  177
DSSP  hhHHHHhhhhlllllEEEEEELlllllhhhllLLLLlllhhhHHHH..hhhhhhhhhhhh


DSSP  LLLLhhHLLLLLLLLL.llllllhHHHHHhHHHHHHHHHHHHHLL......lLEEEELLL
Query YHYTsaQILPHDSYLI.nlghpvtEALEKsRDAFIDEMQRCEQLG......lSLLNFHPG  111
ident                                | |                    |     
Sbjct ELGG..ENYVFWGGREgyetllntDMEFE.LDNFARFLHMAVDYAkeigfegQFLIEPKP  234
DSSP  HLLL..LEEEELLLLLeellhhhlLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHhhlllllEEEELLLL


DSSP  LllllllhhhhHHHHHHHHHHHhhHLLLLEEEEELLL..LLLLllllLHHHHHHHHHHll
Query ShlmqiseedcLARIAESINIAldKTQGVTAVIENTA..GQGSnlgfKFEHLAAIIDGve  169
ident             |                  |                   |        
Sbjct KeptkhqydfdVANVLAFLRKY..DLDKYFKVNIEANhaTLAF..hdFQHELRYARIN..  288
DSSP  LlllleellllHHHHHHHHHHL..LLLLLEEEEEEHHhhHHLL..llHHHHHHHHHHL..


DSSP  lhhhEEEEEEHhhHHHHL...lllllhhHHHHHHHHHHHhLLHH....heEEEEE.LEEL
Query dksrVGVCIDTchAFAAG...ydlrtpaECEKTFADFARtVGFK....ylRGMHL.NDAK  221
ident     |   ||                                 |       |        
Sbjct ...gVLGSIDA..NTGDMllgwdtdqfpTDIRMTTLAMY.EVIKmggfdkGGLNFdAKVR  342
DSSP  ...lLEEEEEL..LLLLLllllllllllLLHHHHHHHHH.HHHHllllllLLEEElLLLL


DSSP  llllllllleeLLLLlllLLHHHHHH..................................
Query stfgsrvdrhhSLGEgniGHDAFRWI..................................  247
ident             |     || |                                      
Sbjct ....rasfepeDLFL...GHIAGMDAfakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgiga  395
DSSP  ....llllllhHHHH...HHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhh


DSSP  ....hllhhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query ....mqddrfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqtekava  285
ident                                           
Sbjct divsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllLLLLLLLlhhHHHHHHhhhhhll
Query mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrQWRAAPLttqTIDEFKaacekyh   60
ident                                                     |       
Sbjct ..................nkyfenvskikyegpksnnPYSFKFYnpeEVIDGK.......   35
DSSP  ..................lllllllllleelllllllLLEELLLlllLEELLE.......


DSSP  llhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLEEEEL..LLLL.....
Query ytsaqilphdsylinlghpvtealeksrdafidemqrcEQLGLSLLNFH..PGSH.....  113
ident                                       |                     
Sbjct ....................................tmEEHLRFSIAYWhtFTADgtdqf   59
DSSP  ....................................ehHHHHLEEEEHHhhHLLLlllll


DSSP  .........LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELL..lllllllllLHHHHH
Query .........LMQISEEDCLARIAESINIALDKTQGVTAVIENT..agqgsnlgfKFEHLA  162
ident                 |      |      ||                          | 
Sbjct gkatmqrpwNHYTDPMDIAKARVEAAFEFFDKINAPYFCFHDRdiapegdtlreTNKNLD  119
DSSP  lllllllhhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHhhllllllhhhHHHHHH


DSSP  HHHHHL.LLHH...HEEEEEEhhHHHHHL..........llllLHHHHHHHHHHHhhhll
Query AIIDGV.EDKS...RVGVCIDtcHAFAAG..........ydlrTPAECEKTFADFartvg  208
ident  |                                           |              
Sbjct TIVAMIkDYLKtskTKVLWGT..ANLFSNprfvhgastscnadVFAYSAAQVKKA.leit  176
DSSP  HHHHHHhHHHLlllLEEEEEE..LLLLLLhhhlllllllllhhHHHHHHHHHHHH.hhhh


DSSP  HHHEE.EEEELEELLlllllllleelllllllLLHHHHHHHLLHH..hLLLEEEELLLL.
Query FKYLR.GMHLNDAKStfgsrvdrhhslgegniGHDAFRWIMQDDR..fDGIPLILETIN.  264
ident                                                        |    
Sbjct KELGGeNYVFWGGRE.gyetllntdmefeldnFARFLHMAVDYAKeigFEGQFLIEPKPk  235
DSSP  HHLLLlEEEELLLLL.eellhhhllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEELLLLl


DSSP  ..........HHHHHHHHH..HHHH...................................
Query ..........PDIWAEEIA..WLKA...................................  277
ident                       |                                     
Sbjct eptkhqydfdVANVLAFLRkyDLDKyfkvnieanhatlafhdfqhelryaringvlgsid  295
DSSP  lllleellllHHHHHHHHHhlLLLLleeeeeehhhhhhllllhhhhhhhhhhllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  277
ident                                                             
Sbjct antgdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflgh  355
DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  277
ident                                                             
Sbjct iagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalers  415
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhll


DSSP  ..............hlllllll
Query ..............qqtekava  285
ident                       
Sbjct qivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.5

DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhll
Query mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrqwraaplttqtidefkaacekyh   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllLHH
Query ytsaqilphdsylinlghpvtealeksrdafidemqrceqlglsllnfhpgshlmqiSEE  120
ident                                                             
Sbjct ........................................................nKYF    4
DSSP  ........................................................lLLL


DSSP  HhhhHHHH............hhhHHHHH.......lLLLEEEEELL...LLLLL......
Query DclaRIAE............sinIALDK.......tQGVTAVIENT...AGQGS......  152
ident                                           |         |       
Sbjct E..nVSKIkyegpksnnpysfkfYNPEEvidgktmeEHLRFSIAYWhtfTADGTdqfgka   62
DSSP  L..lLLLLeellllllllleellLLLLLeelleehhHHHLEEEEHHhhhLLLLLllllll


DSSP  ..............llllLHHHHHHHHHHLllhhhEEEEEEHHHHH.hhlllllLHHHHH
Query ..............nlgfKFEHLAAIIDGVedksrVGVCIDTCHAF.aagydlrTPAECE  197
ident                     |      |          |               |     
Sbjct tmqrpwnhytdpmdiakaRVEAAFEFFDKI...naPYFCFHDRDIApegdtlreTNKNLD  119
DSSP  llllhhhhlllhhhhhhhHHHHHHHHHHHH...llLEEEEEHHHHLlllllhhhHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL..lhHHEEEEEELEELLL.llllllleelllllllLLHHHHHHHL..LHH
Query KTFADFARTV..gfKYLRGMHLNDAKST.fgsrvdrhhslgegniGHDAFRWIMQ..DDR  252
ident    |                  |                                     
Sbjct TIVAMIKDYLktskTKVLWGTANLFSNPrfvhgastscnadvfaySAAQVKKALEitKEL  179
DSSP  HHHHHHHHHHllllLEEEEEELLLLLLHhhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHhhHHL


DSSP  HllLEEEELLLLHH..............HHHHHHHHHHHHLLLLL...............
Query FdgIPLILETINPD..............IWAEEIAWLKAQQTEKA...............  283
ident                               |           |                 
Sbjct G.gENYVFWGGREGyetllntdmefeldNFARFLHMAVDYAKEIGfegqfliepkpkept  238
DSSP  L.lLEEEELLLLLEellhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLllleeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  283
ident                                                             
Sbjct khqydfdvanvlaflrkydldkyfkvnieanhatlafhdfqhelryaringvlgsidant  298
DSSP  leellllhhhhhhhhhhlllllleeeeeehhhhhhllllhhhhhhhhhhllleeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  283
ident                                                             
Sbjct gdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiag  358
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  283
ident                                                             
Sbjct mdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqiv  418
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlllll


DSSP  .................ll
Query .................va  285
ident                    
Sbjct nksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhll