No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=39.7

DSSP  lllllllllleellllllllleelLLLLlleelleeHHHHhLEEEEHHHHHlLLLLLLLL
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkFYNPeevidgktMEEHlRFSIAYWHTFtADGTDQFG   60
ident                          | |          |  ||    |      | | ||
Sbjct ........................SYQP........TPED.RFTFGLWTVG.WQGRDPFG   26
DSSP  ........................LLLL........LHHH.LEEEEHHHHL.LLLLLLLL


DSSP  LLLLLLhhhhlllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHHHLLLlllhhHHHH.HHH
Query KATMQRpwnhytdpmdiakaRVEAAFEFFDKINAPYFCFHDRDIAPEgdtlrETNK.NLD  119
ident  ||                              |    ||| |  |              
Sbjct DATRPA.............lDPVETVQRLAELGAHGVTFHDDDLIPF.....GSSDtERE   68
DSSP  LLLLLL.............lLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHHHLLL.....LLLHhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLLLLHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query TIVAMIKDYLKTSKTKVLWGTANLFSNPRFVHGASTSCNADVFAYSAAQVKKALEITKEL  179
ident          |      |   | |||  | |  |  |    ||  |             ||
Sbjct SHIKRFRQALDATGMTVPMATTNLFTHPVFKDGGFTANDRDVRRYALRKTIRNIDLAVEL  128
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLEEEELLLLLEELLHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLL
Query GGENYVFWGGREGYETLLNTDMEFELDNFARFLHMAVDYAKEIGFEGQFLIEPKPKEPTK  239
ident |   || |||||| |     |    ||           |    |    | ||||| ||  
Sbjct GAKTYVAWGGREGAESGAAKDVRVALDRMKEAFDLLGEYVTSQGYDIRFAIEPKPNEPRG  188
DSSP  LLLEEEELLLLLEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLL


DSSP  EELLLLHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLL
Query HQYDFDVANVLAFLRKYDLDKYFKVNIEANHATLAFHDFQHELRYARINGVLGSIDANTG  299
ident       |   |||           || |  |   |   | |    |   | |  || |  
Sbjct DILLPTVGHALAFIERLERPELYGVNPEVGHEQMAGLNFPHGIAQALWAGKLFHIDLNGQ  248
DSSP  EELLLLHHHHHHHHLLLLLHHHEEELLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLLEELLL


DSSP  LLlLLLLLLLLLL..LHHHHHHHHHHHHHLLLLllLLEEELLLLLLLLlLLHHHHHHHHH
Query DMlLGWDTDQFPT..DIRMTTLAMYEVIKMGGFdkGGLNFDAKVRRASfEPEDLFLGHIA  357
ident       | |      | |            |    |   || |  |              
Sbjct SG.IKYDQDLRFGagDLRAAFWLVDLLESAGYE..GPRHFDFKPPRTE.DIDGVWASAAG  304
DSSP  LL.LLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLEEELLLLLLLL.LHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHH..HHLHHHLlhhhHHHHHLL.LLHHHhHHHHHHL
Query GMDAFAKGFKVAYKLVKDRVFDKFIE..ERYASYKdgigADIVSGK.ADFRSlEKYALER  414
ident  |         |     |                          |               
Sbjct CMRNYLILKERAAAFRADPEVQEALRasRLDELAQ....PTAADGVqELLAD.RTAFEDF  359
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHhlLHHHHLL....LLLLLLHhHHHHL.HHHLLLL


DSSP  LLL..LLLLLLHHHHHHHHHHHHLL..
Query SQI..VNKSGRQELLESILNQYLFA..  437
ident             | |       |    
Sbjct DVDaaAARGMAFERLDQLAMDHLLGar  386
DSSP  LHHhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.5

DSSP  .........................................................lll
Query .........................................................nky    3
ident                                                             
Sbjct syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelgahgvtfhdddlipf   60
DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhlll


DSSP  lLLLLlleellllllLLLE..ELLLLllleelleehhhHHLEEEEHHhhHLLLLllllll
Query fENVSkikyegpksnNPYS..FKFYNpeevidgktmeeHLRFSIAYWhtFTADGtdqfgk   61
ident                                                             
Sbjct gSSDT.......ereSHIKrfRQALD.........atgMTVPMATTN..LFTHP.....v   97
DSSP  lLLHH.......hhhHHHHhhHHHHH.........hhlLLLLEEELL..LLLLH.....h


DSSP  lllllhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHH...hhllllLLHHHHHHHH
Query atmqrpwnhyTDPMDIAKARVEAAFEFFDKINAPYFCFHDR...diapegDTLRETNKNL  118
ident            |    |               |                    |      
Sbjct fkdggftandRDVRRYALRKTIRNIDLAVELGAKTYVAWGGregaesgaaKDVRVALDRM  157
DSSP  hlllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLlleelllllLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL..LLLLEEeEEELLLL.LLHHhlllllllllhhhhhhhhhhHHHHHHH
Query DTIVAMIKDYLK..TSKTKVlWGTANLF.SNPRfvhgastscnadvfaysaaqVKKALEI  175
ident          |                                           |  ||  
Sbjct KEAFDLLGEYVTsqGYDIRF.AIEPKPNePRGD...............illptVGHALAF  201
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhLLLLEE.EELLLLLlLLLE...............ellllHHHHHHH


DSSP  HH....HLLLLEEEE..LLLLLEellhhhllhhhhhhhHHHHHHHHHHhhhhllLLLE.e
Query TK....ELGGENYVF..WGGREGyetllntdmefeldnFARFLHMAVDyakeigFEGQ.f  228
ident                       |               |      |              
Sbjct IErlerPELYGVNPEvgHEQMAG.............lnFPHGIAQALW......AGKLfh  242
DSSP  HLllllHHHEEELLLhhHHHLLL.............llHHHHHHHHHH......LLLLll


DSSP  EELLLLLLLLLeellLLHHH....HHHHHhhlLLLLL...eeEEEEhhHHHH.......l
Query LIEPKPKEPTKhqydFDVAN....VLAFLrkyDLDKY...fkVNIEanHATL.......a  274
ident                             |    |                          
Sbjct IDLNGQSGIKY.dqdLRFGAgdlrAAFWL.vdLLESAgyegpRHFD..FKPPrtedidgv  298
DSSP  LEELLLLLLLL.lllLLLLLllhhHHHHH.hhHHHHHlllllEEEL..LLLLllllhhhh


DSSP  lLLHHHHHHHHHHLLleeeeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query fHDFQHELRYARINGvlgsidantgdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgg  334
ident         |   |                                               
Sbjct wASAAGCMRNYLILK.............................................  313
DSSP  hHHHHHHHHHHHHHH.............................................


DSSP  eeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhh
Query lnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgig  394
ident                                                             
Sbjct ..............................eraaafradpevqealrasrldelaqptaa  343
DSSP  ..............................hhhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllll


DSSP  hhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query adivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                            
Sbjct dgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  llhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.4

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhHHHHhhLLLEEEEEHhHHLL.llllhhhhhHHHH
Query katmqrpwnhytdpmdiakarveaafEFFDkiNAPYFCFHDrDIAP.egdtlretnKNLD  119
ident                                                           ||
Sbjct .........................sYQPT.pEDRFTFGLWtVGWQgrdpfgdatrPALD   34
DSSP  .........................lLLLL.hHHLEEEEHHhHLLLllllllllllLLLL


DSSP  hhHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLllllhhhlllllllllhhhhhHHHH.........hhh
Query tiVAMIKDYLKTSKTKVLWGTANlfsnprfvhgastscnadvfaYSAA.........qvk  170
ident          |                                                  
Sbjct ..PVETVQRLAELGAHGVTFHDD..................dliPFGSsdtereshikrf   74
DSSP  ..HHHHHHHHHHHLLLEEEEEHH..................hhlLLLLlhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhLLLLEEEELLL...LLEEllhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLL.
Query kaleitkeLGGENYVFWGG...REGYetllntDMEFELDNFARFLHMAVDYAKeiGFEG.  226
ident                                           |      | |        
Sbjct rqaldatgMTVPMATTNLFthpVFKD.ggftaNDRDVRRYALRKTIRNIDLAV..ELGAk  131
DSSP  hhhhhhhlLLLLEEELLLLllhHHLL.lllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHLLl


DSSP  EEEELLL.LLLL..lleellllhhHHHHHHHhlLLLL.........LEEEEEehhhHHHL
Query QFLIEPK.PKEP..tkhqydfdvaNVLAFLRkyDLDK.........YFKVNIeanhATLA  274
ident                                   |            |            
Sbjct TYVAWGGrEGAEsgaakdvrvaldRMKEAFD..LLGEyvtsqgydiRFAIEP....KPNE  185
DSSP  EEEELLLlLEELllllllhhhhhhHHHHHHH..HHHHhhhhhllllEEEELL....LLLL


DSSP  .....lllHHHHHHHHHH.....LLLEEEEELL..LLLLllllllllllllhhHHHHHHH
Query .....fhdFQHELRYARI.....NGVLGSIDAN..TGDMllgwdtdqfptdirMTTLAMY  322
ident                                                             
Sbjct prgdillpTVGHALAFIErlerpELYGVNPEVGheQMAG.............lNFPHGIA  232
DSSP  llleelllLHHHHHHHHLllllhHHEEELLLHHhhHLLL.............lLHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLlLLEEElLLLLllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH............
Query EVIKMGGFDkGGLNFdAKVRrasfepedlfLGHIAGMDAFAKGFKVAY............  370
ident      |                         |              |             
Sbjct QALWAGKLF.HIDLN.GQSGikydqdlrfgAGDLRAAFWLVDLLESAGyegprhfdfkpp  290
DSSP  HHHHLLLLL.LLEEL.LLLLllllllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHLlllleeelllll


DSSP  .............................hhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhll
Query .............................klvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgk  401
ident                                                             
Sbjct rtedidgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasrldelaqptaadgvqell  350
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhh


DSSP  llhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query adfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                     
Sbjct adrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  hlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.9

DSSP  ......lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEeEEHH..HHHL
Query ......nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFsIAYW..HTFT   52
ident                                                             
Sbjct syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelGAHG.VTFHddDLIP   59
DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhLLLE.EEEEhhHHLL


DSSP  llllllllllllllhhhhlllHHHHhhHHHHHHHHHHHHHL...LLEEEEEHH.......
Query adgtdqfgkatmqrpwnhytdPMDIakARVEAAFEFFDKIN...APYFCFHDR.......  102
ident                             |      |                        
Sbjct .....................FGSSdtERESHIKRFRQALDatgMTVPMATTNlfthpvf   98
DSSP  .....................LLLLhhHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLEEELLllllhhh


DSSP  ....hhllllLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhhllllLEEEEEELLLLllhHHLL.lllllL
Query ....diapegDTLRETNKNLDTIVAmikdylktskTKVLWGTANLFsnpRFVH.gastsC  157
ident           |  |                            |      |          
Sbjct kdggftandrDVRRYALRKTIRNID......laveLGAKTYVAWGG...REGAesgaakD  149
DSSP  lllllllllhHHHHHHHHHHHHHHH......hhhhHLLLEEEELLL...LLEEllllllL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HLLLlEEEELLLlLEELlhhhllhhhhhhHHHHHHHHH
Query NADVFAYSAAQVKKALEITK..ELGGeNYVFWGGrEGYEtllntdmefeldNFARFLHMA  215
ident                 |                                      |    
Sbjct VRVALDRMKEAFDLLGEYVTsqGYDI.RFAIEPK.PNEP..rgdillptvgHALAFIERL  205
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLL.EEEELLL.LLLL..lleellllhhHHHHHHLLL


DSSP  hHHHHHllllleEEEL...LLLLlllleellLLHHHHHHHHHhlllLLLEE.eEEEHhhH
Query vDYAKEigfegqFLIE...PKPKeptkhqydFDVANVLAFLRkydlDKYFK.vNIEAnhA  271
ident                                       |                     
Sbjct .ERPEL.....yGVNPevgHEQM......agLNFPHGIAQAL....WAGKLfhIDLN..G  247
DSSP  .LLHHH.....eEELLlhhHHHL......llLLHHHHHHHHH....HLLLLllLEEL..L


DSSP  HHL.........lLLHHHHHHHHHHLL....leEEEEL.LLLLLLlllllllLLLL.HHH
Query TLA.........fHDFQHELRYARING....vlGSIDA.NTGDMLlgwdtdqFPTD.IRM  316
ident                                  |                          
Sbjct QSGikydqdlrfgAGDLRAAFWLVDLLesagyeGPRHFdFKPPRT..edidgVWASaAGC  305
DSSP  LLLllllllllllLLLHHHHHHHHHHHhhhlllLLEEElLLLLLL..llhhhHHHHhHHH


DSSP  HHHHHHHHHhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query TTLAMYEVIkmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdr  376
ident                                                             
Sbjct MRNYLILKE........................................raaafradpev  325
DSSP  HHHHHHHHH........................................hhhhhhhlhhh


DSSP  hhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhl
Query vfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylf  436
ident                                                             
Sbjct qealrasrldelaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllga  385
DSSP  hhhhhhllhhhhllllllllhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  l
Query a  437
ident  
Sbjct r  386
DSSP  l


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.8

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhllllllhhhhhhhhhh
Query katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinapyfcfhdrdiapegdtlretnknldt  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhHHHHhhhlllllEEEEEELLL..LLLHhhlllllllllhHHHHhHHHHHHHHHHHHHh
Query ivAMIKdylktsktKVLWGTANL..FSNPrfvhgastscnaDVFAySAAQVKKALEITKe  178
ident                                                   |    |    
Sbjct ..SYQP......tpEDRFTFGLWtvGWQG...rdpfgdatrPALD.PVETVQRLAELGA.   47
DSSP  ..LLLL......lhHHLEEEEHHhhLLLL...lllllllllLLLL.HHHHHHHHHHHLL.


DSSP  lllleEEELLLLLEellhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllleEEELLLLlLLL
Query lggenYVFWGGREGyetllnTDMEFELDNFARFLHMAVDYAKeigfegqFLIEPKPkEPT  238
ident        |                 |          | |                     
Sbjct ...hgVTFHDDDLI....pfGSSDTERESHIKRFRQALDATG....mtvPMATTNL.FTH   95
DSSP  ...leEEEEHHHHL....llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....lllLEEELLL.LLL


DSSP  L................eellLLHHHHHhhhhhlllLLLEE.eEEEHH............
Query K................hqydFDVANVLaflrkydlDKYFK.vNIEAN............  269
ident                          |                                  
Sbjct PvfkdggftandrdvrryalrKTIRNID......laVELGAktYVAWGgregaesgaakd  149
DSSP  HhhlllllllllhhhhhhhhhHHHHHHH......hhHHHLLleEEELLllleelllllll


DSSP  ...hhhhlllLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLlLLLL...lllLLLLLHHHHHHhHHH
Query ...hatlafhDFQHELRYARINGVLGSIDANTGDmLLGW...dtdQFPTDIRMTTLaMYE  323
ident            |     |    |                                     
Sbjct vrvaldrmkeAFDLLGEYVTSQGYDIRFAIEPKP.NEPRgdillpTVGHALAFIER.LER  207
DSSP  hhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLL.LLLLleelllLHHHHHHHHLL.LLL


DSSP  HHhlllllllleEELL...LLLLlllllhHHHHHHHHHHH....................
Query VIkmggfdkgglNFDA...KVRRasfepeDLFLGHIAGMD....................  360
ident                                  |                          
Sbjct PE........lyGVNPevgHEQM...aglNFPHGIAQALWagklfhidlngqsgikydqd  256
DSSP  HH........heEELLlhhHHHL...lllLHHHHHHHHHHllllllleelllllllllll


DSSP  .....................................................hhhhhhh
Query .....................................................afakgfk  367
ident                                                             
Sbjct lrfgagdlraafwlvdllesagyegprhfdfkpprtedidgvwasaagcmrnylilkera  316
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhh
Query vayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqell  427
ident                                                             
Sbjct aafradpevqealrasrldelaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldq  376
DSSP  hhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhll
Query esilnqylfa  437
ident           
Sbjct lamdhllgar  386
DSSP  hhhhhhhlll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelgahgvtfhdddlipf   60
DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhlll


DSSP  ................................................lLLLLlllllee
Query ................................................nKYFEnvskiky   12
ident                                                             
Sbjct gssdtereshikrfrqaldatgmtvpmattnlfthpvfkdggftandrdVRRY.......  113
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllllhhhlllllllllhhHHHH.......


DSSP  llllllllleellllllleelleEHHH.HHLE.EEEHHHhhLLLLLllllllllllhhhh
Query egpksnnpysfkfynpeevidgkTMEE.HLRF.SIAYWHtfTADGTdqfgkatmqrpwnh   70
ident                                    |                        
Sbjct ..............alrktirniDLAVeLGAKtYVAWGG.rEGAES............ga  146
DSSP  ..............hhhhhhhhhHHHHhHLLLeEEELLL.lLEELL............ll


DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....lLEEEEEHHhhllllllhhhhhhhhHHHHHHH
Query yTDPMDIAKARVEAAFEFFDKIN.....aPYFCFHDRdiapegdtlretnknlDTIVAMI  125
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Sbjct ERL.eRPELYGvnpevgHEQMAG....................LNFPHGIAQALwAGKLF  241
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Sbjct tedidgVWASAAGCMR..NYLI......................................  311
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Sbjct ............................................................  311
DSSP  ............................................................


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Query mdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqiv  418
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Sbjct ....lkeraaafradpevqealrasrldelaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaar  367
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Query nksgrqellesilnqylfa  437
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Sbjct gmaferldqlamdhllgar  386
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