No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.3

DSSP  .LEELLLLLLLLLllllHHHHLLLLlLLEEEELLLLLLLLLLLLHH..HHHHHHHHHHHL
Query .MKWGFRWYGAAGdaipLKHIRQIPgITGVVGTLLNKLPGDVWTVA..EIQALKQSVEQE   57
ident     |     | |          |   |       |             |   |   |  
Sbjct mKYIGAHVSAAGGlanaAIRAAEID.ATAFALFTKNQRQWRAAPLTtqTIDEFKAACEKY   59
DSSP  lLEEEEELLLLLLhhhhHHHHHHLL.LLEEELLLLLLLLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLEE..EEELLLLLLHhHHHL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLllllll
Query GLAL..LGIESVAIHDaIKAG.TDQRDHYIDNYRQTLRNLGKCGISLVCYSFKPifgwak  114
ident                       |       |            | ||             
Sbjct HYTSaqILPHDSYLIN.LGHPvTEALEKSRDAFIDEMQRCEQLGLSLLNFHPGS......  112
DSSP  LLLHhhLLLLLLLLLL.LLLLlHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLL......


DSSP  leeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhLLLLLHHHHH
Query tdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamYAGVTEEDLV  174
ident                                                        |||  
Sbjct .................................................hLMQISEEDCL  123
DSSP  .................................................lLLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhHLLEEEELLLllLLLLlllLLLLLLHHHHHHHHHHLL.LLLEEL
Query ENLRYFLERVIPVCeeENIKMGIHPDdpPWEIfglPRITKNLADLKRILSLVD.SPANGI  233
ident                       |                     |  |   |      | 
Sbjct ARIAESINIALDKT..QGVTAVIENT..AGQG...SNLGFKFEHLAAIIDGVEdKSRVGV  176
DSSP  HHHHHHHHHHHHHL..LLLEEEEELL..LLLL...LLLLLLHHHHHHHHHHLLlHHHEEE


DSSP  LEELLHHHHLLLL........LHHHHHHH..HHHHLLLEEELLEEEL.llleEEELLLLh
Query TFCTGSLGADPTN........DLPTMIRE..IGHRINFVHFRNVKYL.gehrFEETAHPs  282
ident    |    |                              |    |               
Sbjct CIDTCHAFAAGYDlrtpaeceKTFADFARtvGFKYLRGMHLNDAKSTfgsrvDRHHSLG.  235
DSSP  EEEHHHHHHHLLLlllhhhhhHHHHHHHHhlLHHHEEEEEELEELLLlllllLLEELLL.


DSSP  hHLLL...LHHHHHHhhHHHLLLLEEEELLLLllllllllllllLHHHHHHHLHHHHHHh
Query vAGSL...DMAELMQalVDVGYEGVIRPDHGRaiwdekampgygLYDRAMGLTYIQGLYe  339
ident   |          ||   |                             |           
Sbjct .EGNIghdAFRWIMQ..DDRFDGIPLILETIN............PDIWAEEIAWLKAQQ.  279
DSSP  .LLLLllhHHHHHHL..LHHHLLLEEEELLLL............HHHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  HHHL.l
Query ATKA.k  344
ident   ||  
Sbjct TEKAva  285
DSSP  LLLLll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.4

DSSP  .........................leELLLlLLLL........llllLHHHHLLL...L
Query .........................mkWGFRwYGAA........gdaiPLKHIRQI...P   24
ident                                                             
Sbjct mkyigahvsaagglanaairaaeidatAFAL.FTKNqrqwraaplttqTIDEFKAAcekY   59
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhllllEEEL.LLLLllllllllllhhHHHHHHHHhhhL


DSSP  LLLE...eEELLLLLlLLLL.......lLHHHHHHHHHHHHHllLEEEEELLLLLLHhhh
Query GITG...vVGTLLNKlPGDV.......wTVAEIQALKQSVEQegLALLGIESVAIHDaik   74
ident   |                                  |  ||  | |             
Sbjct HYTSaqilPHDSYLI.NLGHpvtealekSRDAFIDEMQRCEQ..LGLSLLNFHPGSH...  113
DSSP  LLLHhhllLLLLLLL.LLLLllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHH..LLLLEEEELLLLL...


DSSP  hlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLEEEELLLLLLllllleeeeellllleeeeeeh
Query agTDQRDHYIDNYRQTLRNLGKCG..ISLVCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsllfdq  132
ident                              |                              
Sbjct lmQISEEDCLARIAESINIALDKTqgVTAVIENTAGQG......................  151
DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLEEEEELLLLLL......................


DSSP  hhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHL
Query avvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlvenLRYFLERVIPVCEEEN  192
ident                                                 |   |   |   
Sbjct .......................................snlgfKFEHLAAIIDGVEDKS  172
DSSP  .......................................lllllLHHHHHHHHHHLLLHH


DSSP  L.EEEELLLllllllllllLLLLL.....HHHHH.HHHHHLLLLlEELLEELLH......
Query I.KMGIHPDdppweifglpRITKN.....LADLK.RILSLVDSPaNGITFCTGS......  239
ident      |                                  |                   
Sbjct RvGVCIDTC......hafaAGYDLrtpaeCEKTFaDFARTVGFK.YLRGMHLNDakstfg  225
DSSP  HeEEEEEHH......hhhhHLLLLllhhhHHHHHhHHHHHLLHH.HEEEEEELEelllll


DSSP  .........hhHLLLLL.HHHHH.HHHHHhlLLEEELLEEelllleeeELLLLHhhlllL
Query .........lgADPTND.LPTMI.REIGHriNFVHFRNVKylgehrfeETAHPSvagslD  288
ident                 |                                           
Sbjct srvdrhhslgeGNIGHDaFRWIMqDDRFD.gIPLILETIN........PDIWAE.....E  271
DSSP  llllleellllLLLLLHhHHHHHlLHHHL.lLEEEELLLL........HHHHHH.....H


DSSP  HHHHHHHHHHhlllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll
Query MAELMQALVDvgyegvirpdhgraiwdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
ident  | |                                                    
Sbjct IAWLKAQQTE..........................................kava  285
DSSP  HHHHHHHLLL..........................................llll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.2

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllLLLEEEELLLLlllllLLLHhHHHHHHHHHHhllLE
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipGITGVVGTLLNklpgdVWTVaEIQALKQSVEqegLA   60
ident                                                             
Sbjct ........................MKYIGAHVSAA.....GGLA.NAAIRAAEID...AT   27
DSSP  ........................LLEEEEELLLL.....LLHH.HHHHHHHHLL...LL


DSSP  EEeELLL.LLLHHHhhllllhhhHHHHhhhhhHHHHHLL........lLEEEELLLllll
Query LLgIESV.AIHDAIkagtdqrdhYIDNyrqtlRNLGKCG........iSLVCYSFKpifg  111
ident                                                  |   |      
Sbjct AF.ALFTkNQRQWR.........AAPLttqtiDEFKAACekyhytsaqILPHDSYL....   73
DSSP  EE.ELLLlLLLLLL.........LLLLlhhhhHHHHHHHhhllllhhhLLLLLLLL....


DSSP  lllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllHH
Query waktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvtEE  171
ident                                                             
Sbjct ....................................................inlghpVT   81
DSSP  ....................................................llllllLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EEEELLLllLLLLLLllllllLHHHHHHHHHHLL...
Query DLVENLRYFLERVIPVCEEENI.KMGIHPDdpPWEIFGlpritkNLADLKRILSLVD...  227
ident    |  |         ||         ||                ||             
Sbjct EALEKSRDAFIDEMQRCEQLGLsLLNFHPG..SHLMQI..seedCLARIAESINIALdkt  137
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlEEEELLL..LLLLLL..lhhhHHHHHHHHHHHHHhhl


DSSP  LLLEELLEELLhhHHLL.lllHHHHHHHHH.......hHLLLEEE..LLEEelllleeeE
Query SPANGITFCTGslGADP.tndLPTMIREIG.......hRINFVHF..RNVKylgehrfeE  277
ident          |   |              |                               
Sbjct QGVTAVIENTA..GQGSnlgfKFEHLAAIIdgvedksrVGVCIDTchAFAA........G  187
DSSP  LLLEEEEELLL..LLLLllllLHHHHHHHHhhlllhhhEEEEEEHhhHHHH........L


DSSP  LLLL.hhhlllLHHHHHHHHHhHLLLLEEEELLLLLLLlllllLLLLLH...HHHHHHLH
Query TAHP.svagslDMAELMQALVdVGYEGVIRPDHGRAIWdekamPGYGLY...DRAMGLTY  333
ident              |          |                      |            
Sbjct YDLRtpaecekTFADFARTVG.FKYLRGMHLNDAKSTFgsrvdRHHSLGegnIGHDAFRW  246
DSSP  LLLLlhhhhhhHHHHHHHHLL.HHHEEEEEELEELLLLlllllLEELLLlllLLLHHHHH


DSSP  HHHHHH............................hhhll
Query IQGLYE............................atkak  344
ident |                                      
Sbjct IMQDDRfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqtekava  285
DSSP  HHLLHHhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrqwraaplttqtidefkaacekyh   60
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ...LEELLLLLLLL...........lllLLHHHHLLL...LLLLEEEELLLLlllllllL
Query ...MKWGFRWYGAA...........gdaIPLKHIRQI...PGITGVVGTLLNklpgdvwT   43
ident                                    |     |                  
Sbjct ytsAQILPHDSYLInlghpvtealeksrDAFIDEMQRceqLGLSLLNFHPGS.hlmqisE  119
DSSP  llhHHLLLLLLLLLllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhLLLLEEEELLLL.llllllH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLL.....LEEEEELLLLllhhhhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLL
Query VAEIQALKQSVEQEG.....LALLGIESVAihdaikagtdqrdhyidnyrqTLRNLGKCG   98
ident          |                                             |    
Sbjct EDCLARIAESINIALdktqgVTAVIENTAG..............qgsnlgfKFEHLAAII  165
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhhlllLEEEEELLLL..............lllllllLHHHHHHHH


DSSP  ........lLEEEELLllllllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhllll
Query ........iSLVCYSFkpifgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsw  150
ident                                                             
Sbjct dgvedksrvGVCIDTC............................................  181
DSSP  hhlllhhheEEEEEHH............................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLE....eEELLL......
Query eeerlqqfqelkamyagvteedlveNLRYFLERVIPVCEEENIK....mGIHPD......  200
ident                                |                     |      
Sbjct ................hafaagydlRTPAECEKTFADFARTVGFkylrgMHLNDakstfg  225
DSSP  ................hhhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLHhheeeEEELEelllll


DSSP  ......LLLLllllllLLLLlhhhHHHHHHhLLLL.leeLLEELLhhHHLLlllhHHHHH
Query ......DPPWeifglpRITKnladLKRILSlVDSP.angITFCTGslGADPtndlPTMIR  253
ident                  |         |    |          |     |        | 
Sbjct srvdrhHSLG....egNIGH..daFRWIMQ.DDRFdgipLILETI..NPDI...wAEEIA  273
DSSP  llllleELLL....llLLLL..hhHHHHHL.LHHHllleEEELLL..LHHH...hHHHHH


DSSP  HHHhhllleeelleeelllleeeellllhhhllllhhhhhhhhhhhlllleeeellllll
Query EIGhrinfvhfrnvkylgehrfeetahpsvagsldmaelmqalvdvgyegvirpdhgrai  313
ident                                                             
Sbjct WLK.........................................................  276
DSSP  HHH.........................................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll
Query wdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
ident                                
Sbjct ......................aqqtekava  285
DSSP  ......................hhlllllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllE
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiqalkqsveqeglA   60
ident                                                             
Sbjct ...........................................................M    1
DSSP  ...........................................................L


DSSP  EEEELLLLLLHHhhhllllhhhhhhhHHHHHHHHhhllLLEEEELLLLLLllllleeeee
Query LLGIESVAIHDAikagtdqrdhyidnYRQTLRNLgkcgISLVCYSFKPIFgwaktdlaye  120
ident       |                                       |             
Sbjct KYIGAHVSAAGG..........lanaAIRAAEID....ATAFALFTKNQR..........   37
DSSP  LEEEEELLLLLL..........hhhhHHHHHHLL....LLEEELLLLLLL..........


DSSP  llllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllHHHHHHHHHHH
Query nedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvtEEDLVENLRYF  180
ident                                                     |       
Sbjct ..............................................qwrAAPLTTQTIDE   51
DSSP  ..............................................lllLLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhllEEEELLLLLL.....llllllllllLLHHHHHHHHHHLllllEELLE
Query LERVIPVCEeeniKMGIHPDDPP.....weifglpritKNLADLKRILSLVdspaNGITF  235
ident                  |                           |   |          
Sbjct FKAACEKYHytsaQILPHDSYLInlghpvtealeksrdAFIDEMQRCEQLG....LSLLN  107
DSSP  HHHHHHHLLllhhHLLLLLLLLLllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHLL....LLEEE


DSSP  EllHHHH........llllLHHHHHHHH....hhhllLEEELLEEElllleeeellllhh
Query CtgSLGA........dptnDLPTMIREI....ghrinFVHFRNVKYlgehrfeetahpsv  283
ident      |                  |                                   
Sbjct F..HPGShlmqiseedclaRIAESINIAldktqgvtaVIENTAGQG..............  151
DSSP  E..LLLLllllllhhhhhhHHHHHHHHHhhhlllleeEEELLLLLL..............


DSSP  hLLLL..HHHHHHHHH..HHLLlleEEELLL.............................
Query aGSLD..MAELMQALV..DVGYegvIRPDHG.............................  310
ident    |      |                 |                               
Sbjct .SNLGfkFEHLAAIIDgvEDKSrvgVCIDTChafaagydlrtpaecektfadfartvgfk  210
DSSP  .LLLLllHHHHHHHHHhlLLHHheeEEEEHHhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllhh


DSSP  .........LLLLllllllLLLL................................hhhhh
Query .........RAIWdekampGYGL................................ydram  329
ident                                                             
Sbjct ylrgmhlndAKSTfgsrvdRHHSlgegnighdafrwimqddrfdgipliletinpdiwae  270
DSSP  heeeeeeleELLLllllllLEELllllllllhhhhhhhllhhhllleeeellllhhhhhh


DSSP  hhlhhhhhhhhhhll
Query gltyiqglyeatkak  344
ident                
Sbjct eiawlkaqqtekava  285
DSSP  hhhhhhhhlllllll