No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=26.5

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Query ........tqleqawelakqrfaavgidvEEAL.RQLDR.LPVSMHCWQGDDV.....sg   45
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Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeEVIDgKTMEEhLRFSIAYWHTFTAdgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllLEELlEEHHHhHLEEEEHHHHHLLlllllll


DSSP  llLLLL...........llLLHHHHHHHHHHHHhllllLEEEEEEHHHLLL....lLLLL
Query feNYPG...........kaRNASELRADLEQAMrlipgPKRLNLHAIYLES....dTPVS   90
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Sbjct kaTMQRpwnhytdpmdiakARVEAAFEFFDKIN.....APYFCFHDRDIAPegdtlRETN  115
DSSP  llLLLLhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHL.....LLEEEEEHHHHLLllllhHHHH


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Query rdqiKPEHFKNWVEWAKANQLGL.DFNPSCFSHPLSADgFTLSHADDSIRQFWIDHCKAS  149
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Sbjct ..knLDTIVAMIKDYLKTSKTKVlWGTANLFSNPRFVH.GASTSCNADVFAYSAAQVKKA  172
DSSP  ..hhHHHHHHHHHHHHLLLLLEEeEEELLLLLLHHHLL.LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHhhhllLEEEEELLL.LEELLL.LLLLHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLLll
Query RRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIP.DGMKDI.TVDRLAPRQRLLAALDEVISE...KLNPah  204
ident        |           |    |       |           |               
Sbjct LEITKELG.....GENYVFWGGrEGYETLlNTDMEFELDNFARFLHMAVDYakeIGFE..  225
DSSP  HHHHHHLL.....LLEEEELLLlLEELLHhHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLL..


DSSP  EEEEEELLLLLLllLLEELLLH.HHHHHHHH....HHLLEEEEELLLL.LLLLLHHHHHH
Query HIDAVESKLFGIgaESYTVGSN.EFYMGYAT....SRQTALCLDAGHF.HPTEVISDKIS  258
ident      | |                                    | |             
Sbjct GQFLIEPKPKEP..TKHQYDFDvANVLAFLRkydlDKYFKVNIEANHAtLAFHDFQHELR  283
DSSP  LEEEELLLLLLL..LLEELLLLhHHHHHHHHhlllLLLEEEEEEHHHHhHLLLLHHHHHH


DSSP  HHLLLLLLEEEEELLLL...LLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLHHHLEEEEELLLLLL
Query AAMLYVPQLLLHVSRPV...RWDSDHVVLLDDETQAIASEIVRHDLFDRVHIGLDFFDAS  315
ident  |                   || |        |     |      ||      |     
Sbjct YARINGVLGSIDANTGDmllGWDTDQFPTDIRMTTLAMYEVIKMGGFDKGGLNFDAKVRR  343
DSSP  HHHHLLLEEEEELLLLLlllLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEELLLLLL


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Query .....INRIAAWVIGTRNMKKALLRALLE.PTAELRKLEAPG..................  351
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Sbjct asfepEDLFLGHIAGMDAFAKGFKVAYKLvKDRVFDKFIEERyasykdgigadivsgkad  403
DSSP  lllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLHHHHHHHHHlhhhllhhhhhhhhllll


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Query ...................DYTARLALLEEQKSLpwqavwemycqrhdtpagsewlesvr  392
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Sbjct frslekyalersqivnksgRQELLESILNQYLFA..........................  437
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllLHHHHHHHHHHHHLL..........................


DSSP  hhhhhlllll
Query ayekeilsrr  402
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Sbjct ..........  437
DSSP  ..........


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.2

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
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Sbjct .........................................nkyfenvskikyegpksnn   19
DSSP  .........................................lllllllllleelllllll


DSSP  hhhHHHHH........llllLEEEE.EEHHHL.............lLLLL......LLHH
Query adlEQAMR........lipgPKRLN.LHAIYL.............eSDTP......VSRD   92
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Sbjct pysFKFYNpeevidgktmeeHLRFSiAYWHTFtadgtdqfgkatmqRPWNhytdpmDIAK   79
DSSP  lleELLLLllleelleehhhHHLEEeEHHHHHllllllllllllllLHHHhlllhhHHHH


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Query qiKPEHFKNWVEWAKanqlGLDFNPSCFshplsadgftlshADDSIRQFWIDHCKASRRv  152
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Sbjct .aRVEAAFEFFDKIN...aPYFCFHDRD.......iapegdTLRETNKNLDTIVAMIKD.  127
DSSP  .hHHHHHHHHHHHHL...lLEEEEEHHH.......hlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHH.


DSSP  hhhhhHHHLlLEEEEELLLL...EELL.....LLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLllllll
Query sayfgEQLGtPSVMNIWIPD...GMKD.....ITVDRLAPRQRLLAALDEVISEklnpah  204
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Sbjct ..ylkTSKT.KVLWGTANLFsnpRFVHgastsCNADVFAYSAAQVKKALEITKE....lg  180
DSSP  ..hhlLLLL.EEEEEELLLLllhHHLLlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....ll


DSSP  EEEEEELLL.LLLL......llleelllhHHHHHHhHHHL......LEEEEELlLLLL..
Query HIDAVESKL.FGIG......aesytvgsnEFYMGYaTSRQ......TALCLDAgHFHP..  249
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Sbjct GENYVFWGGrEGYEtllntdmefeldnfaRFLHMA.VDYAkeigfeGQFLIEP.KPKEpt  238
DSSP  LLEEEELLLlLEELlhhhllhhhhhhhhhHHHHHH.HHHHhhllllLEEEELL.LLLLll


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Query ....tEVISDKISAA....MLYVpqLLLHVS..RPVRwdsdhvVLLDdETQAIASEIvrh  299
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Sbjct khqydFDVANVLAFLrkydLDKY.fKVNIEAnhATLA....fhDFQH.ELRYARING...  289
DSSP  leellLLHHHHHHHHhhllLLLL.eEEEEEHhhHHHL....llLHHH.HHHHHHHLL...


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Query dlfdrvHIGLDFFDA......sinRIAAwVIGTRNMKKALLRAL.......leptaelrk  346
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Sbjct ....vlGSIDANTGDmllgwdtdqFPTD.IRMTTLAMYEVIKMGgfdkgglnfdakvrra  344
DSSP  ....leEEEELLLLLlllllllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHLLlllllleeelllllll


DSSP  hhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhHHHHHHH............................
Query leapgdytarlalleeqkslpwqavWEMYCQR............................  378
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Sbjct sfepedlflghiagmdafakgfkvaYKLVKDRvfdkfieeryasykdgigadivsgkadf  404
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DSSP  .........................llllLLLLhhhhhhhhhhhlllll
Query .........................hdtpAGSEwlesvrayekeilsrr  402
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Sbjct rslekyalersqivnksgrqellesilnqYLFA................  437
DSSP  hhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhHHLL................


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
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Query ....tqleqawelakqrfaavgidveealrqldRLPVSMHCWQGDdvsgfenypgKARN.   55
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Sbjct katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinAPYFCFHDRDIA..........PEGDt  110
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Query ASELRADLEQAMRLI......PGPKR.LNLH..........aiylesdTPVSrdqikpeh   98
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Sbjct LRETNKNLDTIVAMIkdylktSKTKVlWGTAnlfsnprfvhgastscnADVF....aysa  166
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Query fknwvewakanQLGL.DFNPSCFSHPLsadgftlshaDDSIRQFWIDHCKASRRVSAYFG  157
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Sbjct aqvkkaleitkELGGeNYVFWGGREGY...etllntdMEFELDNFARFLHMAVDYAKEIG  223
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Query EqlgtPSVMNIWIPDGMkditvdrlaprqRLLAALD..EVISEklnpahhiDAVES...K  212
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Sbjct F....EGQFLIEPKPKE.ptkhqydfdvaNVLAFLRkyDLDKY........FKVNIeanH  270
DSSP  L....LLEEEELLLLLL.llleellllhhHHHHHHHhlLLLLL........EEEEEehhH


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Query LFGigaesytvgsNEFYMGYATSRQTALCLDAGhFHPT.............evisdKISA  259
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Sbjct ATL......afhdFQHELRYARINGVLGSIDAN.TGDMllgwdtdqfptdirmttlAMYE  323
DSSP  HHH......llllHHHHHHHHHHLLLEEEEELL.LLLLllllllllllllhhhhhhHHHH


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Query AMLY..vPQLLLHVSRPVRwdsdhvvlLDDETQAIASEIVRHD.................  300
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Sbjct VIKMggfDKGGLNFDAKVRrasfepedLFLGHIAGMDAFAKGFkvayklvkdrvfdkfie  383
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Query ........lfdrvhigldffdasinriaawvigtrnmkkallralleptAELRKleapgd  352
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Sbjct eryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnQYLFA......  437
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Query ytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesvrayekeilsrr  402
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Sbjct ..................................................  437
DSSP  ..................................................