No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=16.6

DSSP  .............................LLEEEEELL..............LLLLhhHH
Query .............................MKYIGAHVS..............AAGGlaNA   17
ident                                    |                |       
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldRLPVSMHCWqgddvsgfenypgkARNA.sEL   59
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlLLLEEEEHHhhllllllllllllLLLH.hHH


DSSP  HHHHHHLL.....lLEEELLLLL.....lLLLLLlLLLHhhHHHHHHHHHHLLLLhhhLL
Query AIRAAEID.....aTAFALFTKN.....qRQWRAaPLTTqtIDEFKAACEKYHYTsaqIL   67
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Sbjct RADLEQAMrlipgpKRLNLHAIYlesdtpVSRDQiKPEH..FKNWVEWAKANQLG...LD  114
DSSP  HHHHHHHHhlllllEEEEEEHHHllllllLLHHHlLHHH..HHHHHHHHHHLLLE...EE


DSSP  LLLLLL........lLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEEELLLLLL
Query PHDSYL........iNLGHPVTEALEKSRDAFIDEMQRCEQLG.....LSLLNFHPGSHL  114
ident    |            | |          |            |      |  |       
Sbjct FNPSCFshplsadgfTLSHADDSIRQFWIDHCKASRRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIPDGM  174
DSSP  EELLLLllhhhllllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEELLLLEE


DSSP  ...LLLLhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...LEEEEELLLLL....LLLLLLlHHHHHHH
Query ...MQISeEDCLARIAESINIALDKTQG...VTAVIENTAGQ....GSNLGFkFEHLAAI  164
ident              |                      |             |   |     
Sbjct kdiTVDR.LAPRQRLLAALDEVISEKLNpahHIDAVESKLFGigaeSYTVGS.NEFYMGY  232
DSSP  lllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlllEEEEEELLLLLllllLEELLL.HHHHHHH


DSSP  HHHLllhhhEEEEEEHHHHhhHLLLLllhhhhhHHHHHHHHhlLHHHEeEEEELEELLll
Query IDGVedksrVGVCIDTCHAfaAGYDLrtpaeceKTFADFARtvGFKYLrGMHLNDAKStf  224
ident             | |  |                             |   |        
Sbjct ATSR....qTALCLDAGHF..HPTEV.....isDKISAAML..YVPQL.LLHVSRPVR..  276
DSSP  HHHH....lLEEEEELLLL..LLLLL.....hhHHHHHHLL..LLLLE.EEEELLLLL..


DSSP  lllLLLEELLLllllLLHHHHHHHLLH...HHLL.LEEEELLLL.....HHHHHHHHHHH
Query gsrVDRHHSLGegniGHDAFRWIMQDD...RFDG.IPLILETIN.....PDIWAEEIAWL  275
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Sbjct ...WDSDHVVL....LDDETQAIASEIvrhDLFDrVHIGLDFFDasinrIAAWVIGTRNM  329
DSSP  ...LLLLLLLL....LLHHHHHHHHHHhhlLHHHlEEEEELLLLllllhHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLL..LLLL................................................
Query KAQQTE..KAVA................................................  285
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Sbjct KKALLRalLEPTaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewle  389
DSSP  HHHHHHhhLLLHhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhh


DSSP  .............
Query .............  285
ident              
Sbjct svrayekeilsrr  402
DSSP  hhhhhhhhlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh


DSSP  ...........llEEEEEL..LLLL........LHHHhHHHHHHLL...lLEEELLlLLL
Query ...........mkYIGAHV..SAAG........GLANaAIRAAEID...aTAFALFtKNQ   36
ident                                            |                
Sbjct adleqamrlipgpKRLNLHaiYLESdtpvsrdqIKPEhFKNWVEWAkanqLGLDFN.PSC  119
DSSP  hhhhhhhhlllllEEEEEEhhHLLLlllllhhhLLHHhHHHHHHHHhhllLEEEEE.LLL


DSSP  L.................lLLLLlllhhhhhhhhhhhhhlLLLHHhLLLLLLLL...lll
Query R.................qWRAAplttqtidefkaacekyHYTSAqILPHDSYL...inl   76
ident                                                             
Sbjct FshplsadgftlshaddsiRQFW.idhckasrrvsayfgeQLGTP.SVMNIWIPdgmkdi  177
DSSP  LllhhhllllllllllhhhHHHH.hhhhhhhhhhhhhhhhHHLLL.EEEEELLLleelll


DSSP  lllLHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLL..LLEEEELLLL...lLLLLlhhhHHHHHHHHHH
Query ghpVTEALEKSRDAFIDEMQrcEQLG..LSLLNFHPGS...hLMQIseedCLARIAESIN  131
ident              |        | |                                   
Sbjct tvdRLAPRQRLLAALDEVIS..EKLNpaHHIDAVESKLfgigAESY.tvgSNEFYMGYAT  234
DSSP  lllLHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLllLEEEEEELLLllllLLLE.ellLHHHHHHHHH


DSSP  HHHhhllllEEEEEL.LLLLLllllLLHHHHHHHHHHLllhhHEEEEEEHhhHHHHllll
Query IALdktqgvTAVIEN.TAGQGsnlgFKFEHLAAIIDGVedksRVGVCIDTchAFAAgydl  190
ident          ||                     |    |                      
Sbjct SRQ......TALCLDaGHFHP..teVISDKISAAMLYV....PQLLLHVS..RPVR.wds  279
DSSP  HHL......LEEEEElLLLLL..llLHHHHHHHHLLLL....LLEEEEEL..LLLL.lll


DSSP  llhhHHHHHHHHHHHHL....LHHHEEEEEELEELLlllllllleeLLLLlllLLHHHHH
Query rtpaECEKTFADFARTV....GFKYLRGMHLNDAKStfgsrvdrhhSLGEgniGHDAFRW  246
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Sbjct dhvvLLDDETQAIASEIvrhdLFDRVHIGLDFFDAS........inRIAA...WVIGTRN  328
DSSP  llllLLLHHHHHHHHHHhhllHHHLEEEEELLLLLL........llHHHH...HHHHHHH


DSSP  HHLLHH...................hllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlLLLL....
Query IMQDDR...................fdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqTEKA....  283
ident                                                     |       
Sbjct MKKALLralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdTPAGsewl  388
DSSP  HHHHHHhhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllLLLLllhh


DSSP  ............ll
Query ............va  285
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Sbjct esvrayekeilsrr  402
DSSP  hhhhhhhhhlllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  .....lleeeeellllllhhhhhhhhhhllLLEEELLL....lLLLL....llLLLLL.h
Query .....mkyigahvsaagglanaairaaeidATAFALFT....kNQRQ....wrAAPLT.t   46
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Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrLPVSMHCWqgddvSGFEnypgkaRNASElr   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLEEEEHHhhlllLLLLllllllLLHHHhh


DSSP  HHHHHHHHHHhhLLLLhhhLLLLLLLllllllllhhhhHHHHhhHHHHHHHHHHLL....
Query QTIDEFKAACekYHYTsaqILPHDSYlinlghpvtealEKSRdaFIDEMQRCEQLG....  102
ident                     |                                       
Sbjct ADLEQAMRLI..PGPK...RLNLHAI.....ylesdtpVSRDqiKPEHFKNWVEWAkanq  110
DSSP  HHHHHHHHLL..LLLE...EEEEEHH.....hllllllLLHHhlLHHHHHHHHHHHhhll


DSSP  LLEEEELLL....LLLL.......LLLHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL....leeEEELL
Query LSLLNFHPG....SHLM.......QISEEDCLARIAESINIALdKTQG....vtaVIENT  147
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Sbjct LGLDFNPSCfshpLSADgftlshaDDSIRQFWIDHCKASRRVSaYFGEqlgtpsvMNIWI  170
DSSP  LEEEEELLLlllhHHLLlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhllleeEEELL


DSSP  LLLL........lllllLHHHHHHHHHhLLLH..HHEEEEEehhHHHH.......HLLLl
Query AGQG........snlgfKFEHLAAIIDgVEDK..SRVGVCIdtcHAFA.......AGYDl  190
ident                      |   |                                  
Sbjct PDGMkditvdrlaprqrLLAALDEVIS.EKLNpaHHIDAVE...SKLFgigaesyTVGS.  225
DSSP  LLEElllllllhhhhhhHHHHHHHHLL.LLLLllLEEEEEE...LLLLlllllleELLL.


DSSP  llhhhhhhHHHHHHHhllHHHEeEEEELEElllllllllleelllllLLLLhHHHHHHLL
Query rtpaecekTFADFARtvgFKYLrGMHLNDAkstfgsrvdrhhslgegNIGHdAFRWIMQD  250
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Sbjct .....nefYMGYATS...RQTAlCLDAGHF.................HPTE.VISDKISA  259
DSSP  .....hhhHHHHHHH...HLLEeEEELLLL.................LLLL.LHHHHHHH


DSSP  HH..hlLLEEEELL.......LLHHHhHHHHHHHHHHLLL....................
Query DR..fdGIPLILET.......INPDIwAEEIAWLKAQQTE....................  281
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Sbjct AMlyvpQLLLHVSRpvrwdsdHVVLL.DDETQAIASEIVRhdlfdrvhigldffdasinr  318
DSSP  HLllllLEEEEELLlllllllLLLLL.LHHHHHHHHHHHHllhhhleeeeellllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  281
ident                                                             
Sbjct iaawvigtrnmkkallralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqr  378
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................llll
Query ....................kava  285
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Sbjct hdtpagsewlesvrayekeilsrr  402
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhlllll