No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.6

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhHLEEEEHHhhhlllllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehLRFSIAYWhtftadgtdqfg   60
ident                                                             
Sbjct ........................................MKWGFRWY............    8
DSSP  ........................................LEELLLLL............


DSSP  llllllhhhhlllhhhhHHHHhhHHHHHHHHHL.LLEEEEEhhHHLLLlllhhhhhhhHH
Query katmqrpwnhytdpmdiAKARveAAFEFFDKIN.APYFCFHdrDIAPEgdtlretnknLD  119
ident                  |             |                            
Sbjct ................gAAGD.aIPLKHIRQIPgITGVVGT..LLNKL.....pgdvwTV   44
DSSP  ................lLLLL.lLLHHHHLLLLlLLEEEEL..LLLLL.....lllllLH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEEE.LLLLllhhhllLLLLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query TIVAMIKDYLKTSKTKVLWGT.ANLFsnprfvhGASTSCNAdVFAYSAAQVKKALEITKE  178
ident       |          |                |                   |     
Sbjct AEIQALKQSVEQEGLALLGIEsVAIH.......DAIKAGTD.QRDHYIDNYRQTLRNLGK   96
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEEELlLLLL.......HHHHHLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLEEEELLllLEEL............................................
Query LGGENYVFWGgrEGYE............................................  194
ident  |                                                          
Sbjct CGISLVCYSF..KPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeer  154
DSSP  LLLLEEEELL..LLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhh


DSSP  ........lhhHLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEELLL..LLLL.lLEEL
Query ........tllNTDM.EFELDNFARFLHMAVDYAKeiGFEGQFLIEPK..PKEP.tKHQY  242
ident                 |    |   ||                 | |   | |       
Sbjct lqqfqelkamyAGVTeEDLVENLRYFLERVIPVCE..EENIKMGIHPDdpPWEIfgLPRI  212
DSSP  hhhhhhhhhhlLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHLLEEEELLLllLLLLllLLLL


DSSP  LLLHHHHHHHHHhlLLLLL.EEEEEEHHHHHHLL.LLHHHHHHHHHhlLLEEEEELLLLL
Query DFDVANVLAFLRkyDLDKY.FKVNIEANHATLAF.HDFQHELRYARinGVLGSIDANTGD  300
ident     |     |     |                   |     |                 
Sbjct TKNLADLKRILS..LVDSPaNGITFCTGSLGADPtNDLPTMIREIG..HRINFVHFRNVK  268
DSSP  LLLHHHHHHHHH..HLLLLlEELLEELLHHHHLLlLLHHHHHHHHH..HHLLLEEELLEE


DSSP  LL..LLLLLlLLLLLH...hHHHHHHHHHHHLLLLllLLEEELLLLLLlLLLLH...hHH
Query ML..LGWDTdQFPTDI...rMTTLAMYEVIKMGGFdkGGLNFDAKVRRaSFEPE...dLF  352
ident  |                       |      |    |    |        |        
Sbjct YLgeHRFEE.TAHPSVagslDMAELMQALVDVGYE..GVIRPDHGRAI.WDEKAmpgyGL  324
DSSP  ELllLEEEE.LLLLHHhlllLHHHHHHHHHHHLLL..LEEEELLLLLL.LLLLLllllLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
Query LGHIAGMDAFAKGFKVAYKLvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyal  412
ident      |                                                      
Sbjct YDRAMGLTYIQGLYEATKAK........................................  344
DSSP  HHHHHHHLHHHHHHHHHHLL........................................


DSSP  hllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query ersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                          
Sbjct .........................  344
DSSP  .........................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.5

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHhhhHLLLllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYwhtFTADgtdqfg   60
ident                                                             
Sbjct ...............mkwgfrwygaagdaiplkhirqipGITGVVGT...LLNK......   36
DSSP  ...............leelllllllllllllhhhhllllLLLEEEEL...LLLL......


DSSP  llllllhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEE.EEHH...hhllllLLHHHHHH
Query katmqrpwnhytdpmdiAKARVEAAFEFFDKINAPYFC.FHDR...diapegDTLRETNK  116
ident                    |   |                            |       
Sbjct ...........lpgdvwTVAEIQALKQSVEQEGLALLGiESVAihdaikagtDQRDHYID   85
DSSP  ...........llllllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEeLLLLllhhhhhllLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHllllleEEEEELLLLLLH.............................
Query NLDTIVAMIKDYLktsktkVLWGTANLFSNP.............................  147
ident |                                                           
Sbjct NYRQTLRNLGKCG......ISLVCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmq  139
DSSP  HHHHHHHHHHHLL......LLEEEELLLLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlll


DSSP  ....................hhlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlEEEEL
Query ....................rfvhgastsCNADVFAYSAAQVKKALEITKELGGeNYVFW  187
ident                                 |                 |         
Sbjct pedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvTEEDLVENLRYFLERVIPVCEEENI.KMGIH  198
DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EEEEL


DSSP  LLL.LEELLHhhllhhhhHHHHHHHHHHHHHhhhhllllleEEELL...LLLLllleell
Query GGR.EGYETLlntdmefeLDNFARFLHMAVDyakeigfegqFLIEP...KPKEptkhqyd  243
ident                   |    | |                                  
Sbjct PDDpPWEIFG.lpritknLADLKRILSLVDS.......panGITFCtgsLGAD.....pt  245
DSSP  LLLlLLLLLL.lllllllHHHHHHHHHHLLL.......lleELLEEllhHHHL.....ll


DSSP  LLHHHHHHHHhhlllLLLEeeEEEHHhhHHLL.................LLHHHHHHHHH
Query FDVANVLAFLrkydlDKYFkvNIEANhaTLAF.................HDFQHELRYAR  286
ident  |                                                |         
Sbjct NDLPTMIREI.....GHRI.nFVHFR..NVKYlgehrfeetahpsvagsLDMAELMQALV  297
DSSP  LLHHHHHHHH.....HHHL.lLEEEL..LEEElllleeeellllhhhllLLHHHHHHHHH


DSSP  HLLLEEEEELLLLL..lllllllllLLLL.hHHHHHHHHHHHHLLlllllleeellllll
Query INGVLGSIDANTGD..mllgwdtdqFPTD.iRMTTLAMYEVIKMGgfdkgglnfdakvrr  343
ident   |  | |    |               |     |                         
Sbjct DVGYEGVIRPDHGRaiwdekampgyGLYDraMGLTYIQGLYEATK...............  342
DSSP  HHLLLLEEEELLLLlllllllllllLLHHhhHHHLHHHHHHHHHH...............


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllll
Query asfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkad  403
ident                                                             
Sbjct ............................................................  342
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query frslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                   
Sbjct ................................ak  344
DSSP  ................................ll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.6

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLEEEEEH.HHHLlllllhhhhhhhhh
Query katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinaPYFCFHD.RDIApegdtlretnknld  119
ident                                     |        |              
Sbjct ................................mkWGFRWYGaAGDA..............   14
DSSP  ................................leELLLLLLlLLLL..............


DSSP  hHHHHHHHHhllLLLEEEEEELLLLllhhhllLLLLlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHH.
Query tIVAMIKDYlktSKTKVLWGTANLFsnprfvhGASTscnadvfaySAAQVKKALEITKE.  178
ident      |             ||                          |            
Sbjct iPLKHIRQI...PGITGVVGTLLNK.......LPGD.......vwTVAEIQALKQSVEQe   57
DSSP  lLHHHHLLL...LLLLEEEELLLLL.......LLLL.......llLHHHHHHHHHHHHHl


DSSP  .LLLLeEEELLlLLEE.llhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllllEEEELLLLLL
Query .LGGEnYVFWGgREGY.etllnTDMEFELDNFARFLHMAVDYAkeigfegQFLIEPKPKE  236
ident  |                           ||    |                        
Sbjct gLALL.GIESV.AIHDaikagtDQRDHYIDNYRQTLRNLGKCG......iSLVCYSFKPI  109
DSSP  lLEEE.EELLL.LLLHhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......lLEEEELLLLL


DSSP  L..........................................................l
Query P..........................................................t  238
ident                                                             
Sbjct Fgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvt  169
DSSP  Lllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  leellllhHHHHHHHHhlLLLL...LEEEEEEHH......hhhHLLLLhHHHHHHHHHLL
Query khqydfdvANVLAFLRkyDLDK...YFKVNIEAN......hatLAFHDfQHELRYARING  289
ident            |                                        |       
Sbjct eedlvenlRYFLERVI..PVCEeenIKMGIHPDDppweifglpRITKN.LADLKRILSLV  226
DSSP  hhhhhhhhHHHHHHHH..HHHHhhlLEEEELLLLlllllllllLLLLL.HHHHHHHHHHL


DSSP  ....LEEEEELLLlllllllllllllllhHHHHHHHHHHHhllllllLLEEELLLLLLLl
Query ....VLGSIDANTgdmllgwdtdqfptdiRMTTLAMYEVIkmggfdkGGLNFDAKVRRAs  345
ident                                 |                  |        
Sbjct dspaNGITFCTGS.........lgadptnDLPTMIREIGH.....riNFVHFRNVKYLG.  271
DSSP  llllEELLEELLH.........hhhllllLHHHHHHHHHH.....hlLLEEELLEEELL.


DSSP  lllhhhhHHHHH.....HHHHHHHHHHHHhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhl
Query fepedlfLGHIA.....GMDAFAKGFKVAyklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsg  400
ident          |        |                                         
Sbjct .ehrfeeTAHPSvagslDMAELMQALVDV.......................gyegvirp  307
DSSP  .lleeeeLLLLHhhlllLHHHHHHHHHHH.......................lllleeee


DSSP  lllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query kadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                      
Sbjct dhgraiwdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  .....................................lllllllLLLEElllllllllee
Query .....................................nkyfenvSKIKYegpksnnpysf   23
ident                                               |             
Sbjct mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvAEIQA...........   49
DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhHHHHH...........


DSSP  llLLLLLEelleehhhHHLEEEEhhHHHLllllllllllllllhhhhlllHHHHHHHHHH
Query kfYNPEEVidgktmeeHLRFSIAywHTFTadgtdqfgkatmqrpwnhytdPMDIAKARVE   83
ident      |               |                              |       
Sbjct lkQSVEQE.......gLALLGIE..SVAI...............hdaikaGTDQRDHYID   85
DSSP  hhHHHHHL.......lLEEEEEL..LLLL...............lhhhhhLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHH...LLLEEEEEHH......................................
Query AAFEFFDKI...NAPYFCFHDR......................................  102
ident                  |                                          
Sbjct NYRQTLRNLgkcGISLVCYSFKpifgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyq  145
DSSP  HHHHHHHHHhhlLLLEEEELLLlllllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhh


DSSP  ................hhllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlEEEEEELLL.LL
Query ................diapegDTLRETNKNLDTIVAMIKDYLKTSKtKVLWGTANL.FS  145
ident                        |      ||                            
Sbjct lihsweeerlqqfqelkamyagVTEEDLVENLRYFLERVIPVCEEEN.IKMGIHPDDpPW  204
DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LEEEELLLLlLL


DSSP  LHHhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHhHHLLLleEEEL.LLLLEellhhhllhhhh
Query NPRfvhgastscnadvfaySAAQVKKALEItKELGGenYVFW.GGREGyetllntdmefe  204
ident                      |  |  |            |  |                
Sbjct EIF.........glpritkNLADLKRILSL.VDSPAngITFCtGSLGA..........dp  244
DSSP  LLL.........lllllllLHHHHHHHHHH.LLLLLeeLLEElLHHHH..........ll


DSSP  hhHHHHHHHHHHHhhhhllllleeEELLL...llllLLEEllLLHH.....HHHHHHHhl
Query ldNFARFLHMAVDyakeigfegqfLIEPK...pkepTKHQydFDVA.....NVLAFLRky  256
ident                                                             
Sbjct tnDLPTMIREIGH.......rinfVHFRNvkylgehRFEE.tAHPSvagslDMAELMQ..  294
DSSP  llLHHHHHHHHHH.......hlllEEELLeeellllEEEE.lLLLHhhlllLHHHHHH..


DSSP  lLLLL...eeEEEEhhHHHH..........llLLHHHhhHHHHHLLleeeeellllllll
Query dLDKY...fkVNIEanHATL..........afHDFQHelRYARINGvlgsidantgdmll  303
ident  |              |                |      |                   
Sbjct aLVDVgyegvIRPD..HGRAiwdekampgyglYDRAMglTYIQGLY..............  338
DSSP  hHHHHlllleEEEL..LLLLllllllllllllHHHHHhhLHHHHHH..............


DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query gwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmdafa  363
ident                                                             
Sbjct ............................................................  338
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllll
Query kgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgr  423
ident                                                             
Sbjct ............................................................  338
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhll
Query qellesilnqylfa  437
ident               
Sbjct ........eatkak  344
DSSP  ........hhhhll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiqalkqsveqegla   60
DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  .....................LLLLLllllleellllllllleellllllleelleehHH
Query .....................NKYFEnvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmEE   39
ident                                                             
Sbjct llgiesvaihdaikagtdqrdHYIDN........................yrqtlrnlGK   96
DSSP  eeeellllllhhhhhllllhhHHHHH........................hhhhhhhhHH


DSSP  HHLEEEEHHhhHLLLL................................lLLLLL......
Query HLRFSIAYWhtFTADG................................tDQFGK......   61
ident        |   |                                      |         
Sbjct CGISLVCYS..FKPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmYQLIHsweeer  154
DSSP  LLLLEEEEL..LLLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhHHHLLlllhhh


DSSP  ...lllllhhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLEEEEEHH...hhllllllhhh
Query ...atmqrpwNHYTDPMDIAKARVEAAFEFFDKIN..APYFCFHDR...diapegdtlre  113
ident                  |                         |                
Sbjct lqqfqelkamYAGVTEEDLVENLRYFLERVIPVCEeeNIKMGIHPDdppweifglpritk  214
DSSP  hhhhhhhhhhLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLEEEELLLllllllllllllll


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhllllleeeEEEL.LLLLlhhhlllllllllhhhHHHHhHHHHHH
Query TNKNLDTIVAMIKDylktsktkvlWGTA.NLFSnprfvhgastscnadvFAYSaAQVKKA  172
ident     |  |                      |                             
Sbjct NLADLKRILSLVDS.....pangiTFCTgSLGA................DPTN.DLPTMI  252
DSSP  LHHHHHHHHHHLLL.....lleelLEELlHHHH................LLLL.LHHHHH


DSSP  HHHHHhlLLLEEEELLLL.leellhhhllhhhHHHHhhhHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEL
Query LEITKelGGENYVFWGGR.egyetllntdmefELDNfarFLHMAVDYAKEIGFEGQFLIE  231
ident  ||          |                                     | ||     
Sbjct REIGH..RINFVHFRNVKylgehrfeetahpsVAGS..lDMAELMQALVDVGYEGVIRPD  308
DSSP  HHHHH..HLLLEEELLEEelllleeeellllhHHLL..lLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEL


DSSP  LLLLL...lLLEE.llLLHHHHHHHhhhllLLLLeeeeeehhhhhhllllhhhhhhhhhh
Query PKPKE...pTKHQ.ydFDVANVLAFlrkydLDKYfkvnieanhatlafhdfqhelryari  287
ident                  | |  |          |                          
Sbjct HGRAIwdekAMPGyglYDRAMGLTY....iQGLY..........................  338
DSSP  LLLLLllllLLLLlllHHHHHHHLH....hHHHH..........................


DSSP  llleeeeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeellllllllll
Query ngvlgsidantgdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfe  347
ident                                                             
Sbjct ............................................................  338
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhh
Query pedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrsl  407
ident                                                             
Sbjct ............................................................  338
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query ekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                               
Sbjct ........................eatkak  344
DSSP  ........................hhhhll