No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=22.5

DSSP  ......LLEEEEELL...............lLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLllll
Query ......MKYIGAHVS...............aAGGLANAAIRAAEIDATAFALFTKNqrqw   39
ident                                |        | ||  |             
Sbjct syqptpEDRFTFGLWtvgwqgrdpfgdatrpALDPVETVQRLAELGAHGVTFHDDD.lip   59
DSSP  lllllhHHLEEEEHHhhllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHH.hll


DSSP  LLLL..lLHHHHHHHHHHHHHLLLLHhhLLLLLLLL.......lLLLLLLHHHHHHHHHH
Query RAAP..lTTQTIDEFKAACEKYHYTSaqILPHDSYL.......iNLGHPVTEALEKSRDA   90
ident            |  |  |      |                                   
Sbjct FGSSdteRESHIKRFRQALDATGMTV..PMATTNLFthpvfkdgGFTANDRDVRRYALRK  117
DSSP  LLLLhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LEEELLLLllhhhlllLLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLEEEELL.LLLLL...LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLLEE
Query FIDEMQRCEQLGLSLLNFHP.GSHLM...QISEEDCLARIAESINIALDKT....QGVTA  142
ident  |        ||                        | |  |                  
Sbjct TIRNIDLAVELGAKTYVAWGgREGAEsgaAKDVRVALDRMKEAFDLLGEYVtsqgYDIRF  177
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLlLLEELlllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLEE


DSSP  EEELLLLL..LLLLLLLHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEEEHHHHHHHLLLLllhhhhHHHH
Query VIENTAGQ..GSNLGFKFEHLAAIIDGVEDKSRVGVCIDTCHAFAAGYDLrtpaecEKTF  200
ident  ||       |  |     |  | |   |     ||     |   ||             
Sbjct AIEPKPNEprGDILLPTVGHALAFIERLERPELYGVNPEVGHEQMAGLNF......PHGI  231
DSSP  EELLLLLLllLEELLLLHHHHHHHHLLLLLHHHEEELLLHHHHHLLLLLH......HHHH


DSSP  HHHHhhlLHHHEEEEEELEElLLLLllLLLEELLLLLllLLHHHHHHHL..LHHHLLLEE
Query ADFArtvGFKYLRGMHLNDAkSTFGsrVDRHHSLGEGniGHDAFRWIMQ..DDRFDGIPL  258
ident |          |    ||   |      |     | |     |  |            | 
Sbjct AQAL...WAGKLFHIDLNGQ.SGIK..YDQDLRFGAG..DLRAAFWLVDllESAGYEGPR  283
DSSP  HHHH...HLLLLLLLEELLL.LLLL..LLLLLLLLLL..LHHHHHHHHHhhHHHLLLLLE


DSSP  EELLLL.........HHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.......................
Query ILETIN.........PDIWAEEIAWLKAQQTE.KAVA.......................  285
ident                    |              |                         
Sbjct HFDFKPprtedidgvWASAAGCMRNYLILKERaAAFRadpevqealrasrldelaqptaa  343
DSSP  EELLLLlllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhlhhhhhhhhhllhhhhllllll


DSSP  ...........................................
Query ...........................................  285
ident                                            
Sbjct dgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  llhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  lleeeeellllllHHHHHhhhhhlllleEELL..lLLLL.............LLLLLlll
Query mkyigahvsaaggLANAAiraaeidataFALF..tKNQR.............QWRAAplt   45
ident                                |                            
Sbjct ..........syqPTPED..........RFTFglwTVGWqgrdpfgdatrpaLDPVE.tv   39
DSSP  ..........lllLLHHH..........LEEEehhHHLLlllllllllllllLLHHH.hh


DSSP  hhhHHHHhhhhhhllllhhhllLLLLLLL..lllllLHHHHHHHHHhhhhhhhhhhHLLL
Query tqtIDEFkaacekyhytsaqilPHDSYLI..nlghpVTEALEKSRDafidemqrceQLGL  103
ident                                          |                  
Sbjct qrlAELG.............ahGVTFHDDdlipfgsSDTERESHIK..rfrqaldaTGMT   84
DSSP  hhhHHHL.............llEEEEEHHhhlllllLHHHHHHHHH..hhhhhhhhHLLL


DSSP  leEEELLLL.lLLLL...........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLEEEEELLLLL.
Query slLNFHPGS.hLMQI...........SEEDCLARIAESINIALDKtqgVTAVIENTAGQ.  150
ident                                |      |  |               |  
Sbjct .vPMATTNLftHPVFkdggftandrdVRRYALRKTIRNIDLAVEL...GAKTYVAWGGRe  140
DSSP  .lLEEELLLllLHHHlllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LLLEEEELLLLl


DSSP  ..........llllllLHHHHHHHHHHL..LLHHhEEEEEEhhhHHHH......LLLLll
Query ..........gsnlgfKFEHLAAIIDGV..EDKSrVGVCIDtchAFAA......GYDLrt  192
ident                   |        |           |                    
Sbjct gaesgaakdvrvaldrMKEAFDLLGEYVtsQGYD.IRFAIE...PKPNeprgdiLLPT..  194
DSSP  eelllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhHLLL.LEEEEL...LLLLlllleeLLLL..


DSSP  hhhHHHHHHHHHHHLLHHHEEEEEEL..EELLlllllllleelllllLLLL.HHHHHHHl
Query paeCEKTFADFARTVGFKYLRGMHLN..DAKStfgsrvdrhhslgegNIGH.DAFRWIMq  249
ident         |   |                                               
Sbjct ...VGHALAFIERLERPELYGVNPEVghEQMA...............GLNFpHGIAQAL.  235
DSSP  ...HHHHHHHHLLLLLHHHEEELLLHhhHHLL...............LLLHhHHHHHHH.


DSSP  LHHHllleEEELLL...........LHHH....HHHHHHHHHHHL...............
Query DDRFdgipLILETI...........NPDI....WAEEIAWLKAQQ...............  279
ident          |                              |                   
Sbjct WAGK..lfHIDLNGqsgikydqdlrFGAGdlraAFWLVDLLESAGyegprhfdfkpprte  293
DSSP  HLLL..llLLEELLlllllllllllLLLLlhhhHHHHHHHHHHHLlllleeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  279
ident                                                             
Sbjct didgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasrldelaqptaadgvqelladr  353
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhhhlh


DSSP  ...........................llllll
Query ...........................tekava  285
ident                                  
Sbjct tafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  hhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllllllllllhhhhHHHHhhhhhll
Query mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrqwraaplttqtiDEFKaacekyh   60
ident                                                             
Sbjct .................................................SYQP.......    4
DSSP  .................................................LLLL.......


DSSP  llhhhlLLLLLLLL....llllllhhHHHHhhHHHHHHHHHhhhLLLLEEEELL...LLL
Query ytsaqiLPHDSYLI....nlghpvteALEKsrDAFIDEMQRceqLGLSLLNFHP...GSH  113
ident                                             ||     ||       
Sbjct tpedrfTFGLWTVGwqgrdpfgdatrPALD.pVETVQRLAE...LGAHGVTFHDddlIPF   60
DSSP  lhhhleEEEHHHHLllllllllllllLLLL.hHHHHHHHHH...HLLLEEEEEHhhhLLL


DSSP  LlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLEEE.EELLLLLL................lllll
Query LmqiSEEDCLARIAESINIALDKTQgVTAV.IENTAGQG................snlgf  156
ident     |              ||| |   |                                
Sbjct G...SSDTERESHIKRFRQALDATG.MTVPmATTNLFTHpvfkdggftandrdvrryalr  116
DSSP  L...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLeEELLLLLLhhhlllllllllhhhhhhhhh


DSSP  LHHHHHHHHhhlllhHHEE.eEEEHhhhHHHL........llllLHHHHHHHHHHHHHHL
Query KFEHLAAIIdgvedkSRVG.vCIDTchaFAAG........ydlrTPAECEKTFADFARTV  207
ident |                                                   |      |
Sbjct KTIRNIDLA.....vELGAktYVAW...GGREgaesgaakdvrvALDRMKEAFDLLGEYV  168
DSSP  HHHHHHHHH.....hHHLLleEEEL...LLLLeelllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  ...lHHHEeeeeELEELLlllllllleellllLLLL...lHHHHHHH...lLHHHllleE
Query ...gFKYLrgmhLNDAKStfgsrvdrhhslgeGNIG...hDAFRWIM...qDDRFdgipL  258
ident                                          |   |              
Sbjct tsqgYDIR.faiEPKPNE...........prgDILLptvgHALAFIErlerPELY...gV  213
DSSP  hhhlLLLE.eeeLLLLLL...........lllEELLllhhHHHHHHLllllHHHE...eE


DSSP  EEL..LLLH..HHHHHHHHHHHHHL...................................
Query ILE..TINP..DIWAEEIAWLKAQQ...................................  279
ident   |              ||                                         
Sbjct NPEvgHEQMagLNFPHGIAQALWAGklfhidlngqsgikydqdlrfgagdlraafwlvdl  273
DSSP  LLLhhHHHLllLLHHHHHHHHHHLLllllleellllllllllllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  279
ident                                                             
Sbjct lesagyegprhfdfkpprtedidgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasr  333
DSSP  hhhhllllleeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhll


DSSP  ...............................................llllll
Query ...............................................tekava  285
ident                                                      
Sbjct ldelaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  hhhhllllllllhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelgahgvtfhdddlipf   60
DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhlll


DSSP  ......................LLEEEEELLLL...................llhhhHHH
Query ......................MKYIGAHVSAA...................gglanAAI   19
ident                       |    |                                
Sbjct gssdtereshikrfrqaldatgMTVPMATTNLFthpvfkdggftandrdvrryalrkTIR  120
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLEEELLLLllhhhlllllllllhhhhhhhhhhHHH


DSSP  HHHHLL...lleEELLLLLLLL.......lllLLLL.HHHHHHHHHHHHHLLLLhhHLLL
Query RAAEID...ataFALFTKNQRQ.......wraAPLT.TQTIDEFKAACEKYHYTsaQILP   68
ident                                 |        |          |       
Sbjct NIDLAVelgaktYVAWGGREGAesgaakdvrvALDRmKEAFDLLGEYVTSQGYD.iRFAI  179
DSSP  HHHHHHhhllleEEELLLLLEElllllllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHLLL.lEEEE


DSSP  LLLLLlllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHL....LLLEEEE..LLLLllllllhhhh
Query HDSYLinlghpvtealeksrdAFIDEMQRCEQL....GLSLLNF..HPGShlmqiseedc  122
ident                               | |             |             
Sbjct EPKPN.......eprgdillpTVGHALAFIERLerpeLYGVNPEvgHEQM.........a  223
DSSP  LLLLL.......lllleelllLHHHHHHHHLLLllhhHEEELLLhhHHHL.........l


DSSP  hhHHHHHHHHHHHhlLLLE.eEEELLLLLLL......lllLLHHHHHHHHHHL.LLHHhe
Query laRIAESINIALDktQGVT.aVIENTAGQGS......nlgFKFEHLAAIIDGV.EDKSrv  174
ident        |  ||    |       |                         |         
Sbjct glNFPHGIAQALW..AGKLfhIDLNGQSGIKydqdlrfgaGDLRAAFWLVDLLeSAGYeg  281
DSSP  llLHHHHHHHHHH..LLLLllLEELLLLLLLlllllllllLLHHHHHHHHHHHhHHLLll


DSSP  eEEEEHHhhhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLhhheeeeeeleelllllllllleell
Query gVCIDTChafaagydlRTPAECEKTFADFARTVGfkylrgmhlndakstfgsrvdrhhsl  234
ident     |              |                                        
Sbjct pRHFDFK.pprtedidGVWASAAGCMRNYLILKE.....raaafradpevqealrasrld  335
DSSP  lEEELLL.llllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....hhhhhhhlhhhhhhhhhllhh


DSSP  lllllllhhhhhhhllhhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query gegnighdafrwimqddrfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqtekava  285
ident                                                    
Sbjct elaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  hhllllllllhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelgahgvtfhdddlipf   60
DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhlll


DSSP  ...............lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeellllllLLLLLLlll
Query ...............mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqRQWRAAplt   45
ident                                                    |        
Sbjct gssdtereshikrfrqaldatgmtvpmattnlfthpvfkdggftandrdvrRYALRK...  117
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllllhhhlllllllllhhhhHHHHHH...


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhlllLLLLL......llllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query tqtidefkaacekyhytsaqilpHDSYL......inlghpVTEALEKSRDAFIDEMQRCE   99
ident                                         |  ||     ||        
Sbjct ........tirnidlavelgaktYVAWGgregaesgaakdVRVALDRMKEAFDLLGEYVT  169
DSSP  ........hhhhhhhhhhhllleEEELLllleelllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLEEEELLLLLLL..lllhhhHHHHHHHHHHHHHHhllllEEEEELLL..LLLLlll
Query QLGLSLLNFHPGSHLM..qiseedCLARIAESINIALDktqgvTAVIENTA..GQGSnlg  155
ident   |                             |                     |     
Sbjct SQGYDIRFAIEPKPNEprgdillpTVGHALAFIERLER...peLYGVNPEVghEQMA.gl  225
DSSP  HHLLLLEEEELLLLLLllleelllLHHHHHHHHLLLLL...hhHEEELLLHhhHHLL.ll


DSSP  lLHHHHHHHHHHL...............................llhhheeeeeehhhhh
Query fKFEHLAAIIDGV...............................edksrvgvcidtchaf  184
ident       |                                                     
Sbjct nFPHGIAQALWAGklfhidlngqsgikydqdlrfgagdlraafwlvdllesagyegprhf  285
DSSP  lHHHHHHHHHHLLllllleellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllleee


DSSP  hhllllllhhhhhhhhhhhhhhllhhheeeeeeleelllllllllleelllllllllhhh
Query aagydlrtpaecektfadfartvgfkylrgmhlndakstfgsrvdrhhslgegnighdaf  244
ident                                                             
Sbjct dfkpprtedidgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasrldelaqptaadg  345
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllll


DSSP  hhhhllhhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query rwimqddrfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqtekava  285
ident                                          
Sbjct vqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
DSSP  hhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll