No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=19.5

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHHhhhlllllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYWhtftadgtdqfg   60
ident                                                             
Sbjct .......................................MKYIGAHVS............    9
DSSP  .......................................LLEEEEELL............


DSSP  llllllhhhhlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHHhllllllhhhHHHHHHH
Query katmqrpwnhytdpmdiaKARVEAAFEFFDKINAPYFCFHDRDiapegdtlreTNKNLDT  120
ident                         |      | |  |                    | |
Sbjct .................aAGGLANAAIRAAEIDATAFALFTKN......qrqwRAAPLTT   46
DSSP  .................lLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLL......llllLLLLLLH


DSSP  .HHHHHHHHHLLLLLEE..EEEELLLLllhhhlllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .IVAMIKDYLKTSKTKV..LWGTANLFsnprfvhgASTSCNADVFAYSAAQVKKALEITK  177
ident       |                                        |            
Sbjct qTIDEFKAACEKYHYTSaqILPHDSYL.......iNLGHPVTEALEKSRDAFIDEMQRCE   99
DSSP  hHHHHHHHHHHHLLLLHhhLLLLLLLL.......lLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLEEEELLllLEELLHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllLLLEEEELLLLLLl
Query ELGGENYVFWGgrEGYETLlnTDMEFELDNFARFLHMAVDYAkeigFEGQFLIEPKPKEp  237
ident  ||     |               |  |   |     | |            ||      
Sbjct QLGLSLLNFHP..GSHLMQ..ISEEDCLARIAESINIALDKT....QGVTAVIENTAGQ.  150
DSSP  HLLLLEEEELL..LLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLLEEEEELLLLL.


DSSP  lLEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEHHHHHHLLLLH......HHHHHHHH...HL
Query tKHQYDFDVANVLAFLRKYDLDKYFKVNIEANHATLAFHDF......QHELRYAR...IN  288
ident       |      |            | |   ||  |  |                    
Sbjct .GSNLGFKFEHLAAIIDGVEDKSRVGVCIDTCHAFAAGYDLrtpaecEKTFADFArtvGF  209
DSSP  .LLLLLLLHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEEEHHHHHHHLLLLllhhhhHHHHHHHHhhlLH


DSSP  LLEEEEELLLLL.LLLL.LLLLLLLL....LHHHHHHHHHHHhhlLLLLlLLEEELLLLl
Query GVLGSIDANTGD.MLLG.WDTDQFPT....DIRMTTLAMYEVikmGGFDkGGLNFDAKVr  342
ident   |     |          |                  |             |       
Sbjct KYLRGMHLNDAKsTFGSrVDRHHSLGegniGHDAFRWIMQDD...RFDG.IPLILETIN.  264
DSSP  HHEEEEEELEELlLLLLlLLLEELLLllllLLHHHHHHHLLH...HHLL.LEEEELLLL.


DSSP  llllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhlll
Query rasfepedlFLGHIAGMDAFAKGFKVaYKLVkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgka  402
ident                                                             
Sbjct .........PDIWAEEIAWLKAQQTE.KAVA.............................  285
DSSP  .........HHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.............................


DSSP  lhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query dfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                    
Sbjct ...................................  285
DSSP  ...................................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.5

DSSP  .....................................llLLLLLL..LLEElllllllll
Query .....................................nkYFENVS..KIKYegpksnnpy   21
ident                                                 |           
Sbjct mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrqwRAAPLTtqTIDE.........   51
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllllLLLLLLhhHHHH.........


DSSP  eellLLLLLeelleEHHHhhLEEEEHHHhhlllllllllllllllhhhhlLLHHHHHHHH
Query sfkfYNPEEvidgkTMEEhlRFSIAYWHtftadgtdqfgkatmqrpwnhyTDPMDIAKAR   81
ident        |                                          |         
Sbjct ..fkAACEK.....YHYTsaQILPHDSY..............linlghpvTEALEKSRDA   90
DSSP  ..hhHHHHH.....LLLLhhHLLLLLLL..............llllllllHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHhhlLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLEEeEE
Query VEAAFEFFDKINAPYFCFHDRdiaPEGD..TLRETNKNLDTIVAMIKDYLktSKTKVlWG  139
ident                  ||                            |            
Sbjct FIDEMQRCEQLGLSLLNFHPG...SHLMqiSEEDCLARIAESINIALDKT..QGVTA.VI  144
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLEEEELLL...LLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLEE.EE


DSSP  ELLLLLLhhhlllllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHH....hHLLLlEEEEL....LLLL
Query TANLFSNprfvhgastscnadvfaysaAQVKKALEIT....kELGGeNYVFW....GGRE  191
ident                                    |                        
Sbjct ENTAGQG................snlgFKFEHLAAIIdgvedKSRV.GVCIDtchaFAAG  187
DSSP  ELLLLLL................llllLLHHHHHHHHhhlllHHHE.EEEEEhhhhHHHL


DSSP  eellhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEEL.LLLLLL...........ll
Query gyetllntdmefELDNFARFLHMAVDYAKeigFEGQFLIE.PKPKEP...........tk  239
ident                                 |           |               
Sbjct ........ydlrTPAECEKTFADFARTVG...FKYLRGMHlNDAKSTfgsrvdrhhslge  236
DSSP  ........llllLHHHHHHHHHHHHHHLL...HHHEEEEEeLEELLLllllllleellll


DSSP  EELLllhHHHHHHHHhlllLLLE...eEEEEHHhhhhlLLLHHHHHHHHHHLLleeeeel
Query HQYDfdvANVLAFLRkydlDKYF...kVNIEANhatlaFHDFQHELRYARINGvlgsida  296
ident                    |  |       |             |               
Sbjct GNIG...HDAFRWIM...qDDRFdgipLILETI....nPDIWAEEIAWLKAQQ.......  279
DSSP  LLLL...LHHHHHHH...lLHHHllleEEELLL....lHHHHHHHHHHHHHHL.......


DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhh
Query ntgdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghi  356
ident                                                             
Sbjct ............................................................  279
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlll
Query agmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersq  416
ident                                                             
Sbjct ............................................................  279
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhll
Query ivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                      
Sbjct ...............tekava  285
DSSP  ...............llllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHhhHHLLlllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYwhTFTAdgtdqfg   60
ident                                           |                 
Sbjct ..............mkyigahvsaagglanaairaaeidATAFALFT..KNQR.......   37
DSSP  ..............lleeeeellllllhhhhhhhhhhllLLEEELLL..LLLL.......


DSSP  llllllhhhhlllhhhHHHHH..hhhhhHHHHHHL........lLEEEEehHHHLlllll
Query katmqrpwnhytdpmdIAKAR..veaafEFFDKIN........aPYFCFhdRDIApegdt  110
ident                    |          |                             
Sbjct ................QWRAAplttqtiDEFKAACekyhytsaqILPHD..SYLInlghp   79
DSSP  ................LLLLLlllhhhhHHHHHHHhhllllhhhLLLLL..LLLLlllll


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLlLLHHhlllllllllhHHHHHHHHHHH
Query LRETNKNLDTIVAMIKDYLKTSKTKVLWGTANLfSNPRfvhgastscnaDVFAYSAAQVK  170
ident   |                       |                             |   
Sbjct VTEALEKSRDAFIDEMQRCEQLGLSLLNFHPGS.HLMQ...........ISEEDCLARIA  127
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLL.LLLL...........LLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHH...lLLLEEEELLLLleellhhhllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhLLLL.L
Query KALEITKE...lGGENYVFWGGRegyetllntdmefeldnFARFLHMAVDYAkeIGFE.G  226
ident     |                |                      |    |          
Sbjct ESINIALDktqgVTAVIENTAGQ...........gsnlgfKFEHLAAIIDGV..EDKSrV  174
DSSP  HHHHHHHHhlllLEEEEELLLLL...........llllllLHHHHHHHHHHL..LLHHhE


DSSP  EEEEL..LLLLlllleELLLL.....HHHHHHHHHHLlLLLLEE.eEEEHHH........
Query QFLIE..PKPKeptkhQYDFD.....VANVLAFLRKYdLDKYFK.vNIEANH........  270
ident    |                           |                            
Sbjct GVCIDtcHAFA.....AGYDLrtpaeCEKTFADFART.VGFKYLrgMHLNDAkstfgsrv  228
DSSP  EEEEEhhHHHH.....HLLLLllhhhHHHHHHHHHHH.LLHHHEeeEEELEEllllllll


DSSP  ......hHHLLLLhhHHHHHH.HHLLL.eEEEELLLLllllllllllLLLL.HHHHHHHH
Query ......aTLAFHDfqHELRYA.RINGV.lGSIDANTGdmllgwdtdqFPTD.IRMTTLAM  321
ident                   |                |            |           
Sbjct drhhslgEGNIGH..DAFRWImQDDRFdgIPLILETI..........NPDIwAEEIAWLK  276
DSSP  lleelllLLLLLL..HHHHHHhLLHHHllLEEEELLL..........LHHHhHHHHHHHH


DSSP  HHHHHlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhh
Query YEVIKmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkf  381
ident                                                             
Sbjct AQQTE.......................................................  281
DSSP  HHLLL.......................................................


DSSP  hhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query ieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                                         
Sbjct ....................................................kava  285
DSSP  ....................................................llll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll
Query nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLEE.EEEHHHhllllllhhhhhhhhh
Query katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinAPYF.CFHDRDiapegdtlretnknld  119
ident                                    |                        
Sbjct .................................MKYIgAHVSAA........gglanaai   19
DSSP  .................................LLEEeEELLLL........llhhhhhh


DSSP  hhHHHHhhhhlllllEEEEEELlllllhhhllLLLLlllhhhHHHH..hhhhhhhhhhhh
Query tiVAMIkdylktsktKVLWGTAnlfsnprfvhGASTscnadvFAYS..aaqvkkaleitk  177
ident                                            |                
Sbjct raAEID.........ATAFALF......tknqRQWR......AAPLttqtidefkaacek   58
DSSP  hhHHLL.........LLEEELL......llllLLLL......LLLLlhhhhhhhhhhhhh


DSSP  HLLL..LEEEELLLLLeellhhhlLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHhhlllllEEEELLLL
Query ELGG..ENYVFWGGREgyetllntDMEFE.LDNFARFLHMAVDYAkeigfegQFLIEPKP  234
ident                                | |                    |     
Sbjct YHYTsaQILPHDSYLI.nlghpvtEALEKsRDAFIDEMQRCEQLG......lSLLNFHPG  111
DSSP  LLLLhhHLLLLLLLLL.llllllhHHHHHhHHHHHHHHHHHHHLL......lLEEEELLL


DSSP  LlllleellllHHHHHHHHHHL..LLLLLEEEEEEHHhhHHLL..llHHHHHHHHHHL..
Query KeptkhqydfdVANVLAFLRKY..DLDKYFKVNIEANhaTLAF..hdFQHELRYARIN..  288
ident             |                  |                   |        
Sbjct ShlmqiseedcLARIAESINIAldKTQGVTAVIENTA..GQGSnlgfKFEHLAAIIDGve  169
DSSP  LllllllhhhhHHHHHHHHHHHhhHLLLLEEEEELLL..LLLLllllLHHHHHHHHHHll


DSSP  ...lLEEEEEL..LLLLLllllllllllLLHHHHHHHHH.HHHHllllllLLEEElLLLL
Query ...gVLGSIDA..NTGDMllgwdtdqfpTDIRMTTLAMY.EVIKmggfdkGGLNFdAKVR  342
ident     |   ||                                 |       |        
Sbjct dksrVGVCIDTchAFAAG...ydlrtpaECEKTFADFARtVGFK....ylRGMHL.NDAK  221
DSSP  lhhhEEEEEEHhhHHHHL...lllllhhHHHHHHHHHHHhLLHH....heEEEEE.LEEL


DSSP  ....llllllhHHHH...HHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhh
Query ....rasfepeDLFL...GHIAGMDAfakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgiga  395
ident             |     || |                                      
Sbjct stfgsrvdrhhSLGEgniGHDAFRWI..................................  247
DSSP  llllllllleeLLLLlllLLHHHHHH..................................


DSSP  hhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll
Query divsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                                           
Sbjct ....mqddrfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqtekava  285
DSSP  ....hllhhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  ..................lllllllllleelllllllLLEELLLlllLEELLE.......
Query ..................nkyfenvskikyegpksnnPYSFKFYnpeEVIDGK.......   35
ident                                                     |       
Sbjct mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrQWRAAPLttqTIDEFKaacekyh   60
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllLLLLLLLlhhHHHHHHhhhhhll


DSSP  ....................................ehHHHHLEEEEHHhhHLLLlllll
Query ....................................tmEEHLRFSIAYWhtFTADgtdqf   59
ident                                       |                     
Sbjct ytsaqilphdsylinlghpvtealeksrdafidemqrcEQLGLSLLNFH..PGSH.....  113
DSSP  llhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLEEEEL..LLLL.....


DSSP  lllllllhhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHhhllllllhhhHHHHHH
Query gkatmqrpwNHYTDPMDIAKARVEAAFEFFDKINAPYFCFHDRdiapegdtlreTNKNLD  119
ident                 |      |      ||                          | 
Sbjct .........LMQISEEDCLARIAESINIALDKTQGVTAVIENT..agqgsnlgfKFEHLA  162
DSSP  .........LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELL..lllllllllLHHHHH


DSSP  HHHHHHhHHHLlllLEEEEEE..LLLLLLhhhlllllllllhhHHHHHHHHHHHH.hhhh
Query TIVAMIkDYLKtskTKVLWGT..ANLFSNprfvhgastscnadVFAYSAAQVKKA.leit  176
ident  |                                           |              
Sbjct AIIDGV.EDKS...RVGVCIDtcHAFAAG..........ydlrTPAECEKTFADFartvg  208
DSSP  HHHHHL.LLHH...HEEEEEEhhHHHHHL..........llllLHHHHHHHHHHHhhhll


DSSP  HHLLLlEEEELLLLL.eellhhhllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEELLLLl
Query KELGGeNYVFWGGRE.gyetllntdmefeldnFARFLHMAVDYAKeigFEGQFLIEPKPk  235
ident                                                        |    
Sbjct FKYLR.GMHLNDAKStfgsrvdrhhslgegniGHDAFRWIMQDDR..fDGIPLILETIN.  264
DSSP  HHHEE.EEEELEELLlllllllleelllllllLLHHHHHHHLLHH..hLLLEEEELLLL.


DSSP  lllleellllHHHHHHHHHhlLLLLleeeeeehhhhhhllllhhhhhhhhhhllleeeee
Query eptkhqydfdVANVLAFLRkyDLDKyfkvnieanhatlafhdfqhelryaringvlgsid  295
ident                       |                                     
Sbjct ..........PDIWAEEIA..WLKA...................................  277
DSSP  ..........HHHHHHHHH..HHHH...................................


DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhh
Query antgdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflgh  355
ident                                                             
Sbjct ............................................................  277
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhll
Query iagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalers  415
ident                                                             
Sbjct ............................................................  277
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhll
Query qivnksgrqellesilnqylfa  437
ident                       
Sbjct ..............qqtekava  285
DSSP  ..............hlllllll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrqwraaplttqtidefkaacekyh   60
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ........................................................lLLL
Query ........................................................nKYF    4
ident                                                             
Sbjct ytsaqilphdsylinlghpvtealeksrdafidemqrceqlglsllnfhpgshlmqiSEE  120
DSSP  llhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllLHH


DSSP  L..lLLLLeellllllllleellLLLLLeelleehhHHHLEEEEHHhhhLLLLLllllll
Query E..nVSKIkyegpksnnpysfkfYNPEEvidgktmeEHLRFSIAYWhtfTADGTdqfgka   62
ident                                           |         |       
Sbjct DclaRIAE............sinIALDK.......tQGVTAVIENT...AGQGS......  152
DSSP  HhhhHHHH............hhhHHHHH.......lLLLEEEEELL...LLLLL......


DSSP  llllhhhhlllhhhhhhhHHHHHHHHHHHH...llLEEEEEHHHHLlllllhhhHHHHHH
Query tmqrpwnhytdpmdiakaRVEAAFEFFDKI...naPYFCFHDRDIApegdtlreTNKNLD  119
ident                     |      |          |               |     
Sbjct ..............nlgfKFEHLAAIIDGVedksrVGVCIDTCHAF.aagydlrTPAECE  197
DSSP  ..............llllLHHHHHHHHHHLllhhhEEEEEEHHHHH.hhlllllLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHllllLEEEEEELLLLLLHhhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHhhHHL
Query TIVAMIKDYLktskTKVLWGTANLFSNPrfvhgastscnadvfaySAAQVKKALEitKEL  179
ident    |                  |                                     
Sbjct KTFADFARTV..gfKYLRGMHLNDAKST.fgsrvdrhhslgegniGHDAFRWIMQ..DDR  252
DSSP  HHHHHHHHHL..lhHHEEEEEELEELLL.llllllleelllllllLLHHHHHHHL..LHH


DSSP  L.lLEEEELLLLLEellhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLllleeeellllllll
Query G.gENYVFWGGREGyetllntdmefeldNFARFLHMAVDYAKEIGfegqfliepkpkept  238
ident                               |           |                 
Sbjct FdgIPLILETINPD..............IWAEEIAWLKAQQTEKA...............  283
DSSP  HllLEEEELLLLHH..............HHHHHHHHHHHHLLLLL...............


DSSP  leellllhhhhhhhhhhlllllleeeeeehhhhhhllllhhhhhhhhhhllleeeeelll
Query khqydfdvanvlaflrkydldkyfkvnieanhatlafhdfqhelryaringvlgsidant  298
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Sbjct ............................................................  283
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhh
Query gdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiag  358
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Sbjct ............................................................  283
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlllll
Query mdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqiv  418
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Sbjct ............................................................  283
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhll
Query nksgrqellesilnqylfa  437
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Sbjct .................va  285
DSSP  .................ll