No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=22.5

DSSP  lllllhHHLEEEEHHhhllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHH.hll
Query syqptpEDRFTFGLWtvgwqgrdpfgdatrpALDPVETVQRLAELGAHGVTFHDDD.lip   59
ident                                |        | ||  |             
Sbjct ......MKYIGAHVS...............aAGGLANAAIRAAEIDATAFALFTKNqrqw   39
DSSP  ......LLEEEEELL...............lLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLllll


DSSP  LLLLhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LEEELLLLllhhhlllLLLLLLHHHHHHHHHH
Query FGSSdteRESHIKRFRQALDATGMTV..PMATTNLFthpvfkdgGFTANDRDVRRYALRK  117
ident            |  |  |      |                                   
Sbjct RAAP..lTTQTIDEFKAACEKYHYTSaqILPHDSYL.......iNLGHPVTEALEKSRDA   90
DSSP  LLLL..lLHHHHHHHHHHHHHLLLLHhhLLLLLLLL.......lLLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLlLLEELlllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLEE
Query TIRNIDLAVELGAKTYVAWGgREGAEsgaAKDVRVALDRMKEAFDLLGEYVtsqgYDIRF  177
ident  |        ||                        | |  |                  
Sbjct FIDEMQRCEQLGLSLLNFHP.GSHLM...QISEEDCLARIAESINIALDKT....QGVTA  142
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLEEEELL.LLLLL...LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLLEE


DSSP  EELLLLLLllLEELLLLHHHHHHHHLLLLLHHHEEELLLHHHHHLLLLLH......hHHH
Query AIEPKPNEprGDILLPTVGHALAFIERLERPELYGVNPEVGHEQMAGLNF......pHGI  231
ident  ||       |  |     |  | |   |     ||     |   ||             
Sbjct VIENTAGQ..GSNLGFKFEHLAAIIDGVEDKSRVGVCIDTCHAFAAGYDLrtpaeceKTF  200
DSSP  EEELLLLL..LLLLLLLHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEEEHHHHHHHLLLLllhhhhhHHH


DSSP  HHHH...HLLLLLLLEELLL.LLLL..LLLLLLLLLL..LHHHHHHHHHhhHHHLLLLLE
Query AQAL...WAGKLFHIDLNGQ.SGIK..YDQDLRFGAG..DLRAAFWLVDllESAGYEGPR  283
ident |          |    ||   |      |     | |     |  |            | 
Sbjct ADFArtvGFKYLRGMHLNDAkSTFGsrVDRHHSLGEGniGHDAFRWIMQ..DDRFDGIPL  258
DSSP  HHHHhhlLHHHEEEEEELEElLLLLllLLLEELLLLLllLLHHHHHHHL..LHHHLLLEE


DSSP  EELLLLlllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhlhhhhhhhhhllhhhhllllll
Query HFDFKPprtedidgvWASAAGCMRNYLILKERaAAFRadpevqealrasrldelaqptaa  343
ident                    |              |                         
Sbjct ILETIN.........PDIWAEEIAWLKAQQTE.KAVA.......................  285
DSSP  EELLLL.........HHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.......................


DSSP  llhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query dgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
ident                                            
Sbjct ...........................................  285
DSSP  ...........................................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  ..........lllLLHHH..........LEEEehhHHLLlllllllllllllLLHHH.hh
Query ..........syqPTPED..........RFTFglwTVGWqgrdpfgdatrpaLDPVE.tv   39
ident                                |                            
Sbjct mkyigahvsaaggLANAAiraaeidataFALF..tKNQR.............QWRAAplt   45
DSSP  lleeeeellllllHHHHHhhhhhlllleEELL..lLLLL.............LLLLLlll


DSSP  hhhHHHL.............llEEEEEHHhhlllllLHHHHHHHHH..hhhhhhhhHLLL
Query qrlAELG.............ahGVTFHDDdlipfgsSDTERESHIK..rfrqaldaTGMT   84
ident                                          |                  
Sbjct tqtIDEFkaacekyhytsaqilPHDSYLI..nlghpVTEALEKSRDafidemqrceQLGL  103
DSSP  hhhHHHHhhhhhhllllhhhllLLLLLLL..lllllLHHHHHHHHHhhhhhhhhhhHLLL


DSSP  .lLEEELLLllLHHHlllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LLLEEEELLLLl
Query .vPMATTNLftHPVFkdggftandrdVRRYALRKTIRNIDLAVEL...GAKTYVAWGGRe  140
ident                                |      |  |               |  
Sbjct slLNFHPGS.hLMQI...........SEEDCLARIAESINIALDKtqgVTAVIENTAGQ.  150
DSSP  leEEELLLL.lLLLL...........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLEEEEELLLLL.


DSSP  eelllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhHLLL.LEEEEL...LLLLlllleeLLLL..
Query gaesgaakdvrvaldrMKEAFDLLGEYVtsQGYD.IRFAIE...PKPNeprgdiLLPT..  194
ident                   |        |           |                    
Sbjct ..........gsnlgfKFEHLAAIIDGV..EDKSrVGVCIDtchAFAA......GYDLrt  192
DSSP  ..........llllllLHHHHHHHHHHL..LLHHhEEEEEEhhhHHHH......LLLLll


DSSP  ...HHHHHHHHLLLLLHHHEEELLLHhhHHLL...............LLLHhHHHHHHH.
Query ...VGHALAFIERLERPELYGVNPEVghEQMA...............GLNFpHGIAQAL.  235
ident         |   |                                               
Sbjct paeCEKTFADFARTVGFKYLRGMHLN..DAKStfgsrvdrhhslgegNIGH.DAFRWIMq  249
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHLLHHHEEEEEEL..EELLlllllllleelllllLLLL.HHHHHHHl


DSSP  HLLL..llLLEELLlllllllllllLLLLlhhhHHHHHHHHHHHLlllleeellllllll
Query WAGK..lfHIDLNGqsgikydqdlrFGAGdlraAFWLVDLLESAGyegprhfdfkpprte  293
ident          |                              |                   
Sbjct DDRFdgipLILETI...........NPDI....WAEEIAWLKAQQ...............  279
DSSP  LHHHllleEEELLL...........LHHH....HHHHHHHHHHHL...............


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhhhlh
Query didgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasrldelaqptaadgvqelladr  353
ident                                                             
Sbjct ............................................................  279
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query tafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
ident                                  
Sbjct ...........................tekava  285
DSSP  ...........................llllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  .................................................LLLL.......
Query .................................................SYQP.......    4
ident                                                             
Sbjct mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqrqwraaplttqtiDEFKaacekyh   60
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeelllllllllllllllhhhhHHHHhhhhhll


DSSP  lhhhleEEEHHHHLllllllllllllLLLL.hHHHHHHHHH...HLLLEEEEEHhhhLLL
Query tpedrfTFGLWTVGwqgrdpfgdatrPALD.pVETVQRLAE...LGAHGVTFHDddlIPF   60
ident                                             ||     ||       
Sbjct ytsaqiLPHDSYLI....nlghpvteALEKsrDAFIDEMQRceqLGLSLLNFHP...GSH  113
DSSP  llhhhlLLLLLLLL....llllllhhHHHHhhHHHHHHHHHhhhLLLLEEEELL...LLL


DSSP  L...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLeEELLLLLLhhhlllllllllhhhhhhhhh
Query G...SSDTERESHIKRFRQALDATG.MTVPmATTNLFTHpvfkdggftandrdvrryalr  116
ident     |              ||| |   |                                
Sbjct LmqiSEEDCLARIAESINIALDKTQgVTAV.IENTAGQG................snlgf  156
DSSP  LlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLEEE.EELLLLLL................lllll


DSSP  HHHHHHHHH.....hHHLLleEEEL...LLLLeelllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query KTIRNIDLA.....vELGAktYVAW...GGREgaesgaakdvrvALDRMKEAFDLLGEYV  168
ident |                                                   |      |
Sbjct KFEHLAAIIdgvedkSRVG.vCIDTchaFAAG........ydlrTPAECEKTFADFARTV  207
DSSP  LHHHHHHHHhhlllhHHEE.eEEEHhhhHHHL........llllLHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  hhhlLLLE.eeeLLLLLL...........lllEELLllhhHHHHHHLllllHHHE...eE
Query tsqgYDIR.faiEPKPNE...........prgDILLptvgHALAFIErlerPELY...gV  213
ident                                          |   |              
Sbjct ...gFKYLrgmhLNDAKStfgsrvdrhhslgeGNIG...hDAFRWIM...qDDRFdgipL  258
DSSP  ...lHHHEeeeeELEELLlllllllleellllLLLL...lHHHHHHH...lLHHHllleE


DSSP  LLLhhHHHLllLLHHHHHHHHHHLLllllleellllllllllllllllllhhhhhhhhhh
Query NPEvgHEQMagLNFPHGIAQALWAGklfhidlngqsgikydqdlrfgagdlraafwlvdl  273
ident   |              ||                                         
Sbjct ILE..TINP..DIWAEEIAWLKAQQ...................................  279
DSSP  EEL..LLLH..HHHHHHHHHHHHHL...................................


DSSP  hhhhllllleeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhll
Query lesagyegprhfdfkpprtedidgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasr  333
ident                                                             
Sbjct ............................................................  279
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllllllhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query ldelaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
ident                                                      
Sbjct ...............................................tekava  285
DSSP  ...............................................llllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhlll
Query syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelgahgvtfhdddlipf   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLEEELLLLllhhhlllllllllhhhhhhhhhhHHH
Query gssdtereshikrfrqaldatgMTVPMATTNLFthpvfkdggftandrdvrryalrkTIR  120
ident                       |    |                                
Sbjct ......................MKYIGAHVSAA...................gglanAAI   19
DSSP  ......................LLEEEEELLLL...................llhhhHHH


DSSP  HHHHHHhhllleEEELLLLLEElllllllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHLLL.lEEEE
Query NIDLAVelgaktYVAWGGREGAesgaakdvrvALDRmKEAFDLLGEYVTSQGYD.iRFAI  179
ident                                 |        |          |       
Sbjct RAAEID...ataFALFTKNQRQ.......wraAPLT.TQTIDEFKAACEKYHYTsaQILP   68
DSSP  HHHHLL...lleEELLLLLLLL.......lllLLLL.HHHHHHHHHHHHHLLLLhhHLLL


DSSP  LLLLL.......lllleelllLHHHHHHHHLLLllhhHEEELLLhhHHHL.........l
Query EPKPN.......eprgdillpTVGHALAFIERLerpeLYGVNPEvgHEQM.........a  223
ident                               | |             |             
Sbjct HDSYLinlghpvtealeksrdAFIDEMQRCEQL....GLSLLNF..HPGShlmqiseedc  122
DSSP  LLLLLlllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHL....LLLEEEE..LLLLllllllhhhh


DSSP  llLHHHHHHHHHH..LLLLllLEELLLLLLLlllllllllLLHHHHHHHHHHHhHHLLll
Query glNFPHGIAQALW..AGKLfhIDLNGQSGIKydqdlrfgaGDLRAAFWLVDLLeSAGYeg  281
ident        |  ||    |       |                         |         
Sbjct laRIAESINIALDktQGVT.aVIENTAGQGS......nlgFKFEHLAAIIDGV.EDKSrv  174
DSSP  hhHHHHHHHHHHHhlLLLE.eEEELLLLLLL......lllLLHHHHHHHHHHL.LLHHhe


DSSP  lEEELLL.llllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....hhhhhhhlhhhhhhhhhllhh
Query pRHFDFK.pprtedidGVWASAAGCMRNYLILKE.....raaafradpevqealrasrld  335
ident     |              |                                        
Sbjct gVCIDTChafaagydlRTPAECEKTFADFARTVGfkylrgmhlndakstfgsrvdrhhsl  234
DSSP  eEEEEHHhhhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLhhheeeeeeleelllllllllleell


DSSP  hhllllllllhhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query elaqptaadgvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
ident                                                    
Sbjct gegnighdafrwimqddrfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqtekava  285
DSSP  lllllllhhhhhhhllhhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  lllllhhhleeeehhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhlll
Query syqptpedrftfglwtvgwqgrdpfgdatrpaldpvetvqrlaelgahgvtfhdddlipf   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllllhhhlllllllllhhhhHHHHHH...
Query gssdtereshikrfrqaldatgmtvpmattnlfthpvfkdggftandrdvrRYALRK...  117
ident                                                    |        
Sbjct ...............mkyigahvsaagglanaairaaeidatafalftknqRQWRAAplt   45
DSSP  ...............lleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeellllllLLLLLLlll


DSSP  ........hhhhhhhhhhhllleEEELLllleelllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ........tirnidlavelgaktYVAWGgregaesgaakdVRVALDRMKEAFDLLGEYVT  169
ident                                         |  ||     ||        
Sbjct tqtidefkaacekyhytsaqilpHDSYL......inlghpVTEALEKSRDAFIDEMQRCE   99
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhlllLLLLL......llllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEELLLLLLllleelllLHHHHHHHHLLLLL...hhHEEELLLHhhHHLL.ll
Query SQGYDIRFAIEPKPNEprgdillpTVGHALAFIERLER...peLYGVNPEVghEQMA.gl  225
ident   |                             |                     |     
Sbjct QLGLSLLNFHPGSHLM..qiseedCLARIAESINIALDktqgvTAVIENTA..GQGSnlg  155
DSSP  HLLLLEEEELLLLLLL..lllhhhHHHHHHHHHHHHHHhllllEEEEELLL..LLLLlll


DSSP  lHHHHHHHHHHLLllllleellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllleee
Query nFPHGIAQALWAGklfhidlngqsgikydqdlrfgagdlraafwlvdllesagyegprhf  285
ident       |                                                     
Sbjct fKFEHLAAIIDGV...............................edksrvgvcidtchaf  184
DSSP  lLHHHHHHHHHHL...............................llhhheeeeeehhhhh


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhllhhhhllllllll
Query dfkpprtedidgvwasaagcmrnylilkeraaafradpevqealrasrldelaqptaadg  345
ident                                                             
Sbjct aagydlrtpaecektfadfartvgfkylrgmhlndakstfgsrvdrhhslgegnighdaf  244
DSSP  hhllllllhhhhhhhhhhhhhhllhhheeeeeeleelllllllllleelllllllllhhh


DSSP  hhhhhhlhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query vqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlamdhllgar  386
ident                                          
Sbjct rwimqddrfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqqtekava  285
DSSP  hhhhllhhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllll