No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=17.2

DSSP  ..............................LEELLLLL................lLLLLL
Query ..............................MKWGFRWY................gAAGDA   14
ident                                                        |    
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrLPVSMHCWqgddvsgfenypgkarnASELR   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLEEEEHHhhlllllllllllllllHHHHH


DSSP  LLHHHHLL.LLLLLEEEELLL......LLLLlLLLLHHHHHHHHHHHHHlLLEEEEELlL
Query IPLKHIRQ.IPGITGVVGTLL......NKLPgDVWTVAEIQALKQSVEQeGLALLGIEsV   67
ident   |      |||                    |                     |     
Sbjct ADLEQAMRlIPGPKRLNLHAIylesdtPVSR.DQIKPEHFKNWVEWAKA.NQLGLDFN.P  117
DSSP  HHHHHHHHlLLLLEEEEEEHHhlllllLLLH.HHLLHHHHHHHHHHHHH.LLLEEEEE.L


DSSP  LLL........HHHHHLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEEELLLLLLlll
Query AIH........DAIKAGTDQ.RDHYIDNYRQTLRNLGKCG.....ISLVCYSFKPIFgwa  113
ident                   |  |   ||      |     |      |             
Sbjct SCFshplsadgFTLSHADDSiRQFWIDHCKASRRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIPDGM...  174
DSSP  LLLllhhhlllLLLLLLLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEELLLLEE...


DSSP  lleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlLLLLhHHH
Query ktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyAGVTeEDL  173
ident                                                             
Sbjct .................................................kdiTVDR.LAP  184
DSSP  .................................................lllLLLL.HHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhHHHL..LEEEELLLllLLLLL.LLLL.LLLLhhHHHHHHHhlLLL
Query VENLRYFLERVIPVcEEEN..IKMGIHPDdpPWEIF.GLPR.ITKNlaDLKRILSlvDSP  229
ident    |   |  ||                      |                         
Sbjct RQRLLAALDEVISE.KLNPahHIDAVESK..LFGIGaESYTvGSNE..FYMGYAT..SRQ  237
DSSP  HHHHHHHHHHHLLL.LLLLllEEEEEELL..LLLLLlLLEElLLHH..HHHHHHH..HHL


DSSP  LeELLEELLHHhhLLLLLHHHHHHHHH..HHLLLEEELLEEElllleeEELLLLHHhllL
Query AnGITFCTGSLgaDPTNDLPTMIREIG..HRINFVHFRNVKYlgehrfEETAHPSVagsL  287
ident         |     ||      |            |                        
Sbjct T.ALCLDAGHF..HPTEVISDKISAAMlyVPQLLLHVSRPVR....wdSDHVVLLD...D  287
DSSP  L.EEEEELLLL..LLLLLHHHHHHHHLllLLLEEEEELLLLL....llLLLLLLLL...H


DSSP  LHHHHHHHHHHHLLL..LEEEELLLLLLLllllllllLLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLL.
Query DMAELMQALVDVGYE..GVIRPDHGRAIWdekampgyGLYDRAMGLTYIQGLYEATKAK.  344
ident          |         |  |   |                 |               
Sbjct ETQAIASEIVRHDLFdrVHIGLDFFDASI.......nRIAAWVIGTRNMKKALLRALLEp  340
DSSP  HHHHHHHHHHHLLHHhlEEEEELLLLLLL.......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  344
ident                                                             
Sbjct taelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesvrayekeils  400
DSSP  hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ..
Query ..  344
ident   
Sbjct rr  402
DSSP  ll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  ....leelllllllllllllhhhhllllllLEEEEL.lLLLL...........llllllH
Query ....mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgiTGVVGT.lLNKL...........pgdvwtV   44
ident                                 |                           
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrLPVSMHcwQGDDvsgfenypgkarnaselR   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLEEEEhhHHLLlllllllllllllhhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHhhlLLEEeEELLLLL......lHHHHHllllhhhHHHHHHHHHHHHHHLL
Query AEIQALKQSVeqeGLALlGIESVAI......hDAIKAgtdqrdhYIDNYRQTLRNLGKCG   98
ident |                      ||                                   
Sbjct ADLEQAMRLI...PGPK.RLNLHAIylesdtpVSRDQ......iKPEHFKNWVEWAKANQ  110
DSSP  HHHHHHHHLL...LLLE.EEEEEHHhllllllLLHHH......lLHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLEEEELLLLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query ISLVCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqf  158
ident   |                                                         
Sbjct LGLDFNPSCFSH...........................................plsad  127
DSSP  LEEEEELLLLLL...........................................hhhll


DSSP  hhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EEEELLLLllLLLL.....lllll
Query qelkamyagVTEEDLVENLRYFLERVIPVCEEENI.KMGIHPDDppWEIF.....glpri  212
ident                               |                             
Sbjct gftlshaddSIRQFWIDHCKASRRVSAYFGEQLGTpSVMNIWIP..DGMKditvdrlapr  185
DSSP  llllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEELLL..LEELllllllhhhh


DSSP  llLHHHHHHHHHHLLLL.LEELLEEllHHHH.........lllLLHHHHHHHHhHHLLlE
Query tkNLADLKRILSLVDSP.ANGITFCtgSLGA.........dptNDLPTMIREIgHRINfV  262
ident    || |    |    |          |                                
Sbjct qrLLAALDEVISEKLNPaHHIDAVE..SKLFgigaesytvgsnEFYMGYATSR.QTAL.C  241
DSSP  hhHHHHHHHHLLLLLLLlLEEEEEE..LLLLlllllleelllhHHHHHHHHHH.LLEE.E


DSSP  EEL.LEEElllleeeellllhhhllllhhhHHHHHHHHlLLLEEEELLLLLlllllllLL
Query HFR.NVKYlgehrfeetahpsvagsldmaeLMQALVDVgYEGVIRPDHGRAiwdekamPG  321
ident                                  |   |                      
Sbjct LDAgHFHP...............tevisdkISAAMLYV.PQLLLHVSRPVR.....wdSD  280
DSSP  EELlLLLL...............lllhhhhHHHHLLLL.LLEEEEELLLLL.....llLL


DSSP  LLLHhhHHHHLHHHHHHHHHH.......................................
Query YGLYdrAMGLTYIQGLYEATK.......................................  342
ident             |                                               
Sbjct HVVL.lDDETQAIASEIVRHDlfdrvhigldffdasinriaawvigtrnmkkallralle  339
DSSP  LLLL.lLHHHHHHHHHHHHLLhhhleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  342
ident                                                             
Sbjct ptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesvrayekeil  399
DSSP  lhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhll


DSSP  .ll
Query .ak  344
ident    
Sbjct srr  402
DSSP  lll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh


DSSP  ............LEELLLLLllLLLL............lLHHHHLLL...LLLLEEEELL
Query ............MKWGFRWYgaAGDA............iPLKHIRQI...PGITGVVGTL   33
ident              |                           |                  
Sbjct adleqamrlipgPKRLNLHA..IYLEsdtpvsrdqikpeHFKNWVEWakaNQLGLDFNPS  118
DSSP  hhhhhhhhllllLEEEEEEH..HHLLllllllhhhllhhHHHHHHHHhhhLLLEEEEELL


DSSP  LL.....llLLLL.........lLHHHHHHHHHHHHHLL....lEEEEELLLLLLHhhhH
Query LN.....klPGDV.........wTVAEIQALKQSVEQEG....lALLGIESVAIHDaikA   75
ident                              |        |                     
Sbjct CFshplsadGFTLshaddsirqfWIDHCKASRRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIPDGM..kD  176
DSSP  LLllhhhllLLLLllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEELLLLEE..lL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL......lLLEEEELLLLLLllllleeeeellllleeee
Query GTDQRDHYIDNYRQTLRNLGKC......gISLVCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsll  129
ident  |  |          |             |  |      |                    
Sbjct ITVDRLAPRQRLLAALDEVISEklnpahhIDAVESKLFGIG...................  217
DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLlllllleEEEEELLLLLLL...................


DSSP  eehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHH
Query fdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlvenlryFLERVIPVCE  189
ident                                                     |       
Sbjct ...........................................aesytvgSNEFYMGYAT  234
DSSP  ...........................................llleellLHHHHHHHHH


DSSP  HHLLEEEELLLllllllllllLLLLLhhhHHHHHHHL.LLLLeELLEELLH......hhh
Query EENIKMGIHPDdppweifglpRITKNladLKRILSLV.DSPAnGITFCTGS......lga  242
ident                        |          |                         
Sbjct SRQTALCLDAG........hfHPTEV...ISDKISAAmLYVPqLLLHVSRPvrwdsdhvv  283
DSSP  HHLLEEEEELL........llLLLLL...HHHHHHHHlLLLLlEEEEELLLlllllllll


DSSP  lllLLHHHHHHHHH.....hhLLLEEELleeelllleEEEL..LLLHhhlllLHHHHHHH
Query dptNDLPTMIREIG.....hrINFVHFRnvkylgehrFEET..AHPSvagslDMAELMQA  295
ident            ||                              |               |
Sbjct lldDETQAIASEIVrhdlfdrVHIGLDF......fdaSINRiaAWVI.....GTRNMKKA  332
DSSP  lllHHHHHHHHHHHhllhhhlEEEEELL......lllLLLHhhHHHH.....HHHHHHHH


DSSP  HHHHLllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhHHHHLL...........
Query LVDVGyegvirpdhgraiwdekampgyglydramgltyiqglyEATKAK...........  344
ident |                                          |                
Sbjct LLRAL...leptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwEMYCQRhdtpagsewle  389
DSSP  HHHHH...lllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhHHHHHHllllllllhhh


DSSP  .............
Query .............  344
ident              
Sbjct svrayekeilsrr  402
DSSP  hhhhhhhhlllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct adleqamrlipgpkrlnlhaiylesdtpvsrdqikpehfknwvewakanqlgldfnpscf  120
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeehhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeeeellll


DSSP  .........................................LEELLLLL...........
Query .........................................MKWGFRWY...........    8
ident                                                             
Sbjct shplsadgftlshaddsirqfwidhckasrrvsayfgeqlgTPSVMNIWipdgmkditvd  180
DSSP  llhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLEEEEELllleellllll


DSSP  .lllLLLL..LHHHHLLLLL...lLEEEELLLL....llllllllhHHHHHHHHHHHhll
Query .gaaGDAI..PLKHIRQIPG...iTGVVGTLLN....klpgdvwtvAEIQALKQSVEqeg   58
ident            |                                          |     
Sbjct rlapRQRLlaALDEVISEKLnpahHIDAVESKLfgigaesytvgsnEFYMGYATSRQ...  237
DSSP  lhhhHHHHhhHHHHHLLLLLllllEEEEEELLLllllllleelllhHHHHHHHHHHL...


DSSP  leEEEELLL.LLLHHhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHL.LLLEEEELLLLLLLLllle
Query laLLGIESV.AIHDAikagtdqrdhyidNYRQTLRNLGKC.GISLVCYSFKPIFGWaktd  116
ident             |                               |   |           
Sbjct ..TALCLDAgHFHPT............eVISDKISAAMLYvPQLLLHVSRPVRWDS....  279
DSSP  ..LEEEEELlLLLLL............lLHHHHHHHHLLLlLLEEEEELLLLLLLL....


DSSP  eeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query layenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlven  176
ident                                                             
Sbjct ........................................................dhvv  283
DSSP  ........................................................llll


DSSP  HHHH.HHHHHHHHHHHL....LEEEELLLlLLLLlllllllllLHHHHHHHHHHLLL...
Query LRYF.LERVIPVCEEEN....IKMGIHPDdPPWEifglpritkNLADLKRILSLVDS...  228
ident |                       |                    |              
Sbjct LLDDeTQAIASEIVRHDlfdrVHIGLDFF.DASI........nRIAAWVIGTRNMKKall  334
DSSP  LLLHhHHHHHHHHHHLLhhhlEEEEELLL.LLLL........lHHHHHHHHHHHHHHhhh


DSSP  ......................................lleelleellhhhhllllLHHH
Query ......................................pangitfctgslgadptnDLPT  250
ident                                                             
Sbjct ralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesVRAY  394
DSSP  hhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHHHH


DSSP  hhhhhhhhllleeelleeelllleeeellllhhhllllhhhhhhhhhhhlllleeeelll
Query mireighrinfvhfrnvkylgehrfeetahpsvagsldmaelmqalvdvgyegvirpdhg  310
ident                                                             
Sbjct ............................................................  394
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll
Query raiwdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
ident                                   
Sbjct ..........................ekeilsrr  402
DSSP  ..........................hhhlllll