No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=16.6

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlLLLEEEEHHhhllllllllllllLLLH.hHH
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldRLPVSMHCWqgddvsgfenypgkARNA.sEL   59
ident                                    |                |       
Sbjct .............................MKYIGAHVS..............AAGGlaNA   17
DSSP  .............................LLEEEEELL..............LLLLhhHH


DSSP  HHHHHHHHhlllllEEEEEEHHHllllllLLHHHlLHHH..HHHHHHHHHHLLLE...EE
Query RADLEQAMrlipgpKRLNLHAIYlesdtpVSRDQiKPEH..FKNWVEWAKANQLG...LD  114
ident                   |                                         
Sbjct AIRAAEID.....aTAFALFTKN.....qRQWRAaPLTTqtIDEFKAACEKYHYTsaqIL   67
DSSP  HHHHHHLL.....lLEEELLLLL.....lLLLLLlLLLHhhHHHHHHHHHHLLLLhhhLL


DSSP  EELLLLllhhhllllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEELLLLEE
Query FNPSCFshplsadgfTLSHADDSIRQFWIDHCKASRRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIPDGM  174
ident    |            | |          |            |      |  |       
Sbjct PHDSYL........iNLGHPVTEALEKSRDAFIDEMQRCEQLG.....LSLLNFHPGSHL  114
DSSP  LLLLLL........lLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEEELLLLLL


DSSP  lllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlllEEEEEELLLLLllllLEELLL.HHHHHHH
Query kdiTVDR.LAPRQRLLAALDEVISEKLNpahHIDAVESKLFGigaeSYTVGS.NEFYMGY  232
ident              |                      |             |   |     
Sbjct ...MQISeEDCLARIAESINIALDKTQG...VTAVIENTAGQ....GSNLGFkFEHLAAI  164
DSSP  ...LLLLhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...LEEEEELLLLL....LLLLLLlHHHHHHH


DSSP  HHHH....lLEEEEELLLL..LLLLL.....hhHHHHHHLL..LLLLE.EEEELLLLL..
Query ATSR....qTALCLDAGHF..HPTEV.....isDKISAAML..YVPQL.LLHVSRPVR..  276
ident             | |  |                             |   |        
Sbjct IDGVedksrVGVCIDTCHAfaAGYDLrtpaeceKTFADFARtvGFKYLrGMHLNDAKStf  224
DSSP  HHHLllhhhEEEEEEHHHHhhHLLLLllhhhhhHHHHHHHHhlLHHHEeEEEELEELLll


DSSP  ...LLLLLLLL....lLHHHHHHHHHHhhlLHHHlEEEEELLLLllllhHHHHHHHHHHH
Query ...WDSDHVVL....lDDETQAIASEIvrhDLFDrVHIGLDFFDasinrIAAWVIGTRNM  329
ident     |  |         |    |                |            |       
Sbjct gsrVDRHHSLGegnigHDAFRWIMQDD...RFDG.IPLILETIN.....PDIWAEEIAWL  275
DSSP  lllLLLEELLLlllllLHHHHHHHLLH...HHLL.LEEEELLLL.....HHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHhhLLLHhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhh
Query KKALLRalLEPTaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewle  389
ident |                                                           
Sbjct KAQQTE..KAVA................................................  285
DSSP  HHHLLL..LLLL................................................


DSSP  hhhhhhhhlllll
Query svrayekeilsrr  402
ident              
Sbjct .............  285
DSSP  .............


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllLLEEEEEEhhHLLLlllllhhhlLHHHH.HHHHHHHhhllLEEEEE.LL
Query adleqamrlipGPKRLNLHaiYLESdtpvsrdqiKPEHF.KNWVEWAkanqLGLDFN.PS  118
ident                                             |               
Sbjct ...........MKYIGAHV..SAAG.........GLANAaIRAAEID...aTAFALFtKN   35
DSSP  ...........LLEEEEEL..LLLL.........LHHHHhHHHHHLL...lLEEELLlLL


DSSP  LLllhhhllllllllllhhhhhHHHHH....hhhhhhhhhhhhhHHLLL.EEEEELLLle
Query CFshplsadgftlshaddsirqFWIDH....ckasrrvsayfgeQLGTP.SVMNIWIPdg  173
ident                        |                                    
Sbjct QR....................QWRAAplttqtidefkaacekyHYTSAqILPHDSYL..   73
DSSP  LL....................LLLLLlllhhhhhhhhhhhhhlLLLHHhLLLLLLLL..


DSSP  ellllllLHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLllLEEEEEELLLllllLLLE.elllHHHHH
Query mkditvdRLAPRQRLLAALDEVIS..EKLNpaHHIDAVESKLfgigAESY.tvgsNEFYM  230
ident                  |        | |                               
Sbjct .inlghpVTEALEKSRDAFIDEMQrcEQLG..LSLLNFHPGS...hLMQIseedcLARIA  127
DSSP  .llllllLHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLL..LLEEEELLLL...lLLLLlhhhhHHHHH


DSSP  HHHHHHL......LEEEEELLLL.llllLHHHHHHHHLLLL....LLEEEEEL...LLLL
Query GYATSRQ......TALCLDAGHF.hpteVISDKISAAMLYV....PQLLLHVS...RPVR  276
ident              ||                    |    |                   
Sbjct ESINIALdktqgvTAVIENTAGQgsnlgFKFEHLAAIIDGVedksRVGVCIDTchaFAAG  187
DSSP  HHHHHHHhhllllEEEEELLLLLlllllLLHHHHHHHHHHLllhhHEEEEEEHhhhHHHL


DSSP  lllllllLLLHHHHHHHHHHHhllhHHLEEEEElLLLLL.........lLHHH...HHHH
Query wdsdhvvLLDDETQAIASEIVrhdlFDRVHIGLdFFDAS.........iNRIA...AWVI  324
ident                 |        |            |                     
Sbjct ydlrtpaECEKTFADFARTVG....FKYLRGMHlNDAKStfgsrvdrhhSLGEgniGHDA  243
DSSP  lllllhhHHHHHHHHHHHHLL....HHHEEEEEeLEELLlllllllleeLLLLlllLLHH


DSSP  HhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhLLLLLL
Query GtrnmkkallralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrHDTPAG  384
ident                                                           | 
Sbjct F...................rwimqddrfdgipliletinpdiwaeeiawlkaqQTEKAV  284
DSSP  H...................hhhhllhhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhLLLLLL


DSSP  Llhhhhhhhhhhhlllll
Query Sewlesvrayekeilsrr  402
ident                   
Sbjct A.................  285
DSSP  L.................


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLEEEEHHhhlllLLLLllllllLLHHHhh
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrLPVSMHCWqgddvSGFEnypgkaRNASElr   60
ident                                                             
Sbjct .....mkyigahvsaagglanaairaaeidATAFALFT....kNQRQ....wrAAPLT.t   46
DSSP  .....lleeeeellllllhhhhhhhhhhllLLEEELLL....lLLLL....llLLLLL.h


DSSP  HHHHHHHHLL..LLLE...EEEEEHH.....hllllllLLHHhlLHHHHHHHHHHHhhll
Query ADLEQAMRLI..PGPK...RLNLHAI.....ylesdtpVSRDqiKPEHFKNWVEWAkanq  110
ident                     |                                       
Sbjct QTIDEFKAACekYHYTsaqILPHDSYlinlghpvtealEKSRdaFIDEMQRCEQLG....  102
DSSP  HHHHHHHHHHhhLLLLhhhLLLLLLLllllllllhhhhHHHHhhHHHHHHHHHHLL....


DSSP  LEEEEELLLlllhHHLLlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhllleeEEELL
Query LGLDFNPSCfshpLSADgftlshaDDSIRQFWIDHCKASRRVSaYFGEqlgtpsvMNIWI  170
ident | |                       |                                 
Sbjct LSLLNFHPG....SHLM.......QISEEDCLARIAESINIALdKTQG....vtaVIENT  147
DSSP  LLEEEELLL....LLLL.......LLLHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL....leeEEELL


DSSP  LLEElllllllhhhhhhHHHHHHHHLL.LLLLllLEEEEEE...LLLLlllllleELLL.
Query PDGMkditvdrlaprqrLLAALDEVIS.EKLNpaHHIDAVE...SKLFgigaesyTVGS.  225
ident                      |   |                                  
Sbjct AGQG........snlgfKFEHLAAIIDgVEDK..SRVGVCIdtcHAFA.......AGYDl  190
DSSP  LLLL........lllllLHHHHHHHHHhLLLH..HHEEEEEehhHHHH.......HLLLl


DSSP  .....hhhHHHHHHH...HLLEeEEELLLL.................LLLL.LHHHHHHH
Query .....nefYMGYATS...RQTAlCLDAGHF.................HPTE.VISDKISA  259
ident                                                             
Sbjct rtpaecekTFADFARtvgFKYLrGMHLNDAkstfgsrvdrhhslgegNIGHdAFRWIMQD  250
DSSP  llhhhhhhHHHHHHHhllHHHEeEEEELEElllllllllleelllllLLLLhHHHHHHLL


DSSP  HLllllLEEEEELLlllllllLLLLL.LHHHHHHHHHHHHllhhhleeeeellllllllh
Query AMlyvpQLLLHVSRpvrwdsdHVVLL.DDETQAIASEIVRhdlfdrvhigldffdasinr  318
ident          |                   |                              
Sbjct DR..fdGIPLILET.......INPDIwAEEIAWLKAQQTE....................  281
DSSP  HH..hlLLEEEELL.......LLHHHhHHHHHHHHHHLLL....................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh
Query iaawvigtrnmkkallralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqr  378
ident                                                             
Sbjct ............................................................  281
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhlllll
Query hdtpagsewlesvrayekeilsrr  402
ident                         
Sbjct ....................kava  285
DSSP  ....................llll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeehhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhlllEEEE.ELLL
Query adleqamrlipgpkrlnlhaiylesdtpvsrdqikpehfknwvewakanqlGLDF.NPSC  119
ident                                                             
Sbjct ...................................................MKYIgAHVS    9
DSSP  ...................................................LLEEeEELL


DSSP  lllhhhllLLLLllllhhhhhhHHHHHHHhHHHHhhhhhhhllleeeEELLLLEelllll
Query fshplsadGFTLshaddsirqfWIDHCKAsRRVSayfgeqlgtpsvmNIWIPDGmkditv  179
ident            |                                                
Sbjct .......aAGGL........anAAIRAAE.IDAT...........afALFTKNQ...rqw   39
DSSP  .......lLLLH........hhHHHHHHH.LLLL...........eeELLLLLL...lll


DSSP  llHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllllEEEEEELLLL......lllllleellLHHHHHHHH
Query drLAPRQRLLAALDEVISEKLnpahHIDAVESKLF......gigaesytvgSNEFYMGYA  233
ident                                                         |   
Sbjct raAPLTTQTIDEFKAACEKYH.ytsAQILPHDSYLinlghpvtealeksrdAFIDEMQRC   98
DSSP  llLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.llhHHLLLLLLLLlllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLEEEEELL........llllllLHHHHHHHHLL.LLLLEEEEELL.LLLLLllllL
Query TSRQTALCLDAG........hfhpteVISDKISAAML.YVPQLLLHVSR.PVRWDsdhvV  283
ident       |                    |   |  |                         
Sbjct EQLGLSLLNFHPgshlmqiseedclaRIAESINIALDkTQGVTAVIENTaGQGSN..lgF  156
DSSP  HHLLLLEEEELLllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHhLLLLEEEEELLlLLLLL..llL


DSSP  LLLhHHHHHHHHHhhLLHHhLEEEEEL..LLLL.LLLH.....HHHH.hhHHHHHH....
Query LLDdETQAIASEIvrHDLFdRVHIGLD..FFDA.SINR.....IAAW.viGTRNMK....  330
ident        ||       |   ||    |     |                   |       
Sbjct KFE.HLAAIIDGV..EDKS.RVGVCIDtcHAFAaGYDLrtpaeCEKTfadFARTVGfkyl  212
DSSP  LHH.HHHHHHHHL..LLHH.HEEEEEEhhHHHHhLLLLllhhhHHHHhhhHHHHLLhhhe


DSSP  .hhhhhhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhh
Query .kallralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewle  389
ident                                                             
Sbjct rgmhlndakstfgsrvdrhhslgegnighdafrwimqddrfdgipliletinpdiwaeei  272
DSSP  eeeeeleelllllllllleelllllllllhhhhhhhllhhhllleeeellllhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllll
Query svrayekeilsrr  402
ident              
Sbjct awlkaqqtekava  285
DSSP  hhhhhhlllllll