No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=17.2

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLEEEEHHhhlllllllllllllllHHHHH
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrLPVSMHCWqgddvsgfenypgkarnASELR   60
ident                                                        |    
Sbjct ..............................MKWGFRWY................gAAGDA   14
DSSP  ..............................LEELLLLL................lLLLLL


DSSP  HHHHHHHHlLLLLEEEEEEhhHLLLlllllHHHLLHHHHHHHHHHHHH.LLLEEEEE.LL
Query ADLEQAMRlIPGPKRLNLHaiYLESdtpvsRDQIKPEHFKNWVEWAKA.NQLGLDFN.PS  118
ident   |      |||          |        |                     |      
Sbjct IPLKHIRQ.IPGITGVVGT..LLNK...lpGDVWTVAEIQALKQSVEQeGLALLGIEsVA   68
DSSP  LLHHHHLL.LLLLLEEEEL..LLLL...llLLLLLHHHHHHHHHHHHHlLLEEEEELlLL


DSSP  LLllhhhlllLLLLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEELLLLEE....
Query CFshplsadgFTLSHADDsIRQFWIDHCKASRRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIPDGM....  174
ident                  |  |   ||      |     |      |              
Sbjct IH........DAIKAGTD.QRDHYIDNYRQTLRNLGKCG.....ISLVCYSFKPIFgwak  114
DSSP  LL........HHHHHLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEEELLLLLLllll


DSSP  ................................................lllLLLL.HHHH
Query ................................................kdiTVDR.LAPR  185
ident                                                             
Sbjct tdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyAGVTeEDLV  174
DSSP  leeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlLLLLhHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLL.LLLLllEEEEEELL..LLLLLlLLEElLLHH..HHHHHHH..HHLL
Query QRLLAALDEVISE.KLNPahHIDAVESK..LFGIGaESYTvGSNE..FYMGYAT..SRQT  238
ident   |   |  ||                      |                          
Sbjct ENLRYFLERVIPVcEEEN..IKMGIHPDdpPWEIF.GLPR.ITKNlaDLKRILSlvDSPA  230
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhHHHL..LEEEELLLllLLLLL.LLLL.LLLLhhHHHHHHHhlLLLL


DSSP  .EEEEELLLL..LLLLLHHHHHHHHLllLLLEEEEELLLL.....LLLLlLLLLLL...H
Query .ALCLDAGHF..HPTEVISDKISAAMlyVPQLLLHVSRPV.....RWDSdHVVLLD...D  287
ident        |     ||      |            |          |              
Sbjct nGITFCTGSLgaDPTNDLPTMIREIG..HRINFVHFRNVKylgehRFEE.TAHPSVagsL  287
DSSP  eELLEELLHHhhLLLLLHHHHHHHHH..HHLLLEEELLEEellllEEEE.LLLLHHhllL


DSSP  HHHHHHHHHHHLLHHhlEEEEELLLLLLL.......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query ETQAIASEIVRHDLFdrVHIGLDFFDASI.......nRIAAWVIGTRNMKKALLRALLEp  340
ident          |         |  |   |                 |               
Sbjct DMAELMQALVDVGYE..GVIRPDHGRAIWdekampgyGLYDRAMGLTYIQGLYEATKAK.  344
DSSP  LHHHHHHHHHHHLLL..LEEEELLLLLLLllllllllLLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLL.


DSSP  hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhlll
Query taelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesvrayekeils  400
ident                                                             
Sbjct ............................................................  344
DSSP  ............................................................


DSSP  ll
Query rr  402
ident   
Sbjct ..  344
DSSP  ..


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLEEEEhhHHLLlllllllllllllhhhhH
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrLPVSMHcwQGDDvsgfenypgkarnaselR   60
ident                                 |                           
Sbjct ....mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgiTGVVGT.lLNKL...........pgdvwtV   44
DSSP  ....leelllllllllllllhhhhllllllLEEEEL.lLLLL...........llllllH


DSSP  HHHHHHHHLL...LLLE.EEEEEHHhllllllLLHHH......lLHHHHHHHHHHHHHLL
Query ADLEQAMRLI...PGPK.RLNLHAIylesdtpVSRDQ......iKPEHFKNWVEWAKANQ  110
ident |                      ||                                   
Sbjct AEIQALKQSVeqeGLALlGIESVAI......hDAIKAgtdqrdhYIDNYRQTLRNLGKCG   98
DSSP  HHHHHHHHHHhhlLLEEeEELLLLL......lHHHHHllllhhhHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LEEEEELLLLLL...........................................hhhll
Query LGLDFNPSCFSH...........................................plsad  127
ident   |                                                         
Sbjct ISLVCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqf  158
DSSP  LLEEEELLLLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhh


DSSP  llllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEELLL..LEELllllllhhhh
Query gftlshaddSIRQFWIDHCKASRRVSAYFGEQLGTpSVMNIWIP..DGMKditvdrlapr  185
ident                               |                             
Sbjct qelkamyagVTEEDLVENLRYFLERVIPVCEEENI.KMGIHPDDppWEIF.....glpri  212
DSSP  hhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EEEELLLLllLLLL.....lllll


DSSP  hhHHHHHHHHLLLLLLLlLEEEEEE..LLLLlllllleelllhHHHHHHHHHH.LLEE.E
Query qrLLAALDEVISEKLNPaHHIDAVE..SKLFgigaesytvgsnEFYMGYATSR.QTAL.C  241
ident    || |    |    |          |                                
Sbjct tkNLADLKRILSLVDSP.ANGITFCtgSLGA.........dptNDLPTMIREIgHRINfV  262
DSSP  llLHHHHHHHHHHLLLL.LEELLEEllHHHH.........lllLLHHHHHHHHhHHLLlE


DSSP  EELlLLLL...............lllhhhhHHHHLLLL.LLEEEEELLLLL.....llLL
Query LDAgHFHP...............tevisdkISAAMLYV.PQLLLHVSRPVR.....wdSD  280
ident                                  |   |                      
Sbjct HFR.NVKYlgehrfeetahpsvagsldmaeLMQALVDVgYEGVIRPDHGRAiwdekamPG  321
DSSP  EEL.LEEElllleeeellllhhhllllhhhHHHHHHHHlLLLEEEELLLLLlllllllLL


DSSP  LLLL.lLHHHHHHHHHHHHLLhhhleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query HVVL.lDDETQAIASEIVRHDlfdrvhigldffdasinriaawvigtrnmkkallralle  339
ident             |                                               
Sbjct YGLYdrAMGLTYIQGLYEATK.......................................  342
DSSP  LLLHhhHHHHLHHHHHHHHHH.......................................


DSSP  lhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhll
Query ptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesvrayekeil  399
ident                                                             
Sbjct ............................................................  342
DSSP  ............................................................


DSSP  lll
Query srr  402
ident    
Sbjct .ak  344
DSSP  .ll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.2

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllLEEEEEEH..HHLLllllllhhhllhhHHHHHHHHhhhLLLEEEEELL
Query adleqamrlipgPKRLNLHA..IYLEsdtpvsrdqikpeHFKNWVEWakaNQLGLDFNPS  118
ident              |                           |                  
Sbjct ............MKWGFRWYgaAGDA............iPLKHIRQI...PGITGVVGTL   33
DSSP  ............LEELLLLLllLLLL............lLHHHHLLL...LLLLEEEELL


DSSP  LLllhhhllLLLLllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEELLLLEE..lL
Query CFshplsadGFTLshaddsirqfWIDHCKASRRVSAYFGeqlgtPSVMNIWIPDGM..kD  176
ident                              |        |                     
Sbjct LN.....klPGDV.........wTVAEIQALKQSVEQEG....lALLGIESVAIHDaikA   75
DSSP  LL.....llLLLL.........lLHHHHHHHHHHHHHLL....lEEEEELLLLLLHhhhH


DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLlllllleEEEEELLLLLLL...................
Query ITVDRLAPRQRLLAALDEVISEklnpahhIDAVESKLFGIG...................  217
ident  |  |          |             |  |      |                    
Sbjct GTDQRDHYIDNYRQTLRNLGKC......gISLVCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsll  129
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL......lLLEEEELLLLLLllllleeeeellllleeee


DSSP  ...........................................llleellLHHHHHHHHH
Query ...........................................aesytvgSNEFYMGYAT  234
ident                                                     |       
Sbjct fdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlvenlryFLERVIPVCE  189
DSSP  eehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLEEEEELL........llLLLLL...HHHHHHHHlLLLLlEEEEELLLlllllllll
Query SRQTALCLDAG........hfHPTEV...ISDKISAAmLYVPqLLLHVSRPvrwdsdhvv  283
ident                        |          |                         
Sbjct EENIKMGIHPDdppweifglpRITKNladLKRILSLV.DSPAnGITFCTGS......lga  242
DSSP  HHLLEEEELLLllllllllllLLLLLhhhHHHHHHHL.LLLLeELLEELLH......hhh


DSSP  lllHHHHHHHHHHHhllhhhlEEEEELL......lllLLLHhhHHHH.....HHHHHHHH
Query lldDETQAIASEIVrhdlfdrVHIGLDF......fdaSINRiaAWVI.....GTRNMKKA  332
ident            ||                              |               |
Sbjct dptNDLPTMIREIG.....hrINFVHFRnvkylgehrFEET..AHPSvagslDMAELMQA  295
DSSP  lllLLHHHHHHHHH.....hhLLLEEELleeelllleEEEL..LLLHhhlllLHHHHHHH


DSSP  HHHHH...lllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhHHHHHHllllllllhhh
Query LLRAL...leptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwEMYCQRhdtpagsewle  389
ident |                                          |                
Sbjct LVDVGyegvirpdhgraiwdekampgyglydramgltyiqglyEATKAK...........  344
DSSP  HHHHLllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhHHHHLL...........


DSSP  hhhhhhhhlllll
Query svrayekeilsrr  402
ident              
Sbjct .............  344
DSSP  .............


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.1

DSSP  .............................lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlll
Query .............................tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrl   31
ident                                                             
Sbjct mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiqalkqsveqegla   60
DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  lEEEEHHhhlllLLLL....llllllLLHHHHHHHHHHHHHlllllEEEEEEHH......
Query pVSMHCWqgddvSGFE....nypgkaRNASELRADLEQAMRlipgpKRLNLHAI......   81
ident                                 |  |                        
Sbjct lLGIESV.....AIHDaikagtdqrdHYIDNYRQTLRNLGK..cgiSLVCYSFKpifgwa  113
DSSP  eEEELLL.....LLLHhhhhllllhhHHHHHHHHHHHHHHH..lllLEEEELLLllllll


DSSP  .................................................hllllLLLL.h
Query .................................................ylesdTPVS.r   91
ident                                                             
Sbjct ktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagVTEEdl  173
DSSP  lleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllLLHHhh


DSSP  hhlLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELL.lLLLHhhllllllllllhhhhhhHHHHHHHHH
Query dqiKPEHFKNWVEWAKANQLGLDFNPS.cFSHPlsadgftlshaddsirqfWIDHCKASR  150
ident                          |                              |   
Sbjct venLRYFLERVIPVCEEENIKMGIHPDdpPWEI..........fglpritkNLADLKRIL  223
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLllLLLL..........llllllllLHHHHHHHH


DSSP  HHhHHHHhhhlllEEEEE..LLLLeelllllllhhhhhHHHHHHHHHllllllllleeee
Query RVsAYFGeqlgtpSVMNI..WIPDgmkditvdrlaprqRLLAALDEViseklnpahhida  208
ident                                        |     |              
Sbjct SL.VDSP....anGITFCtgSLGA..........dptnDLPTMIREI......ghrinfv  262
DSSP  HH.LLLL....leELLEEllHHHH..........llllLHHHHHHHH......hhhllle


DSSP  eelLLLLLL..........llLEELlLHHHHHHHHHHHLLeeeeelllllllllhhhhhh
Query vesKLFGIG..........aeSYTVgSNEFYMGYATSRQTalcldaghfhptevisdkis  258
ident         |                      |                            
Sbjct hfrNVKYLGehrfeetahpsvAGSL.DMAELMQALVDVGY....................  301
DSSP  eelLEEELLlleeeellllhhHLLL.LHHHHHHHHHHHLL....................


DSSP  hhllllLLEEEEELLLL..lllllllLLLLhHHHHHHHhhhhllhhhleeeeelllllll
Query aamlyvPQLLLHVSRPV..rwdsdhvVLLDdETQAIASeivrhdlfdrvhigldffdasi  316
ident                             |                               
Sbjct ......EGVIRPDHGRAiwdekampgYGLY.DRAMGLT......................  332
DSSP  ......LLEEEELLLLLlllllllllLLLH.HHHHHHL......................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
Query nriaawvigtrnmkkallralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemyc  376
ident                                                             
Sbjct ............................................................  332
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllllllhhhhhhhhhhhlllll
Query qrhdtpagsewlesvrayekeilsrr  402
ident                           
Sbjct ..............yiqglyeatkak  344
DSSP  ..............hhhhhhhhhhll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllllllllllhhhhh
Query tqleqawelakqrfaavgidveealrqldrlpvsmhcwqgddvsgfenypgkarnaselr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeehhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query adleqamrlipgpkrlnlhaiylesdtpvsrdqikpehfknwvewakanqlgldfnpscf  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLEEEEELllleellllll
Query shplsadgftlshaddsirqfwidhckasrrvsayfgeqlgTPSVMNIWipdgmkditvd  180
ident                                                             
Sbjct .........................................MKWGFRWY...........    8
DSSP  .........................................LEELLLLL...........


DSSP  lhhhHHHHhhHHHHHLLLLLllllEEEEEELLLllllllleelllhHHHHHHHHHHL...
Query rlapRQRLlaALDEVISEKLnpahHIDAVESKLfgigaesytvgsnEFYMGYATSRQ...  237
ident            |                                          |     
Sbjct .gaaGDAI..PLKHIRQIPG...iTGVVGTLLN....klpgdvwtvAEIQALKQSVEqeg   58
DSSP  .lllLLLL..LHHHHLLLLL...lLEEEELLLL....llllllllhHHHHHHHHHHHhll


DSSP  ..LEEEEELlLLLLL............lLHHHHHHHHLLLlLLEEEEELLLLLLLL....
Query ..TALCLDAgHFHPT............eVISDKISAAMLYvPQLLLHVSRPVRWDS....  279
ident             |                               |   |           
Sbjct laLLGIESV.AIHDAikagtdqrdhyidNYRQTLRNLGKC.GISLVCYSFKPIFGWaktd  116
DSSP  leEEEELLL.LLLHHhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHL.LLLEEEELLLLLLLLllle


DSSP  ........................................................llll
Query ........................................................dhvv  283
ident                                                             
Sbjct layenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvteedlven  176
DSSP  eeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh


DSSP  LLLHhHHHHHHHHHHLLhhhlEEEEELLL.LLLL........lHHHHHHHHHHHHHHhhh
Query LLDDeTQAIASEIVRHDlfdrVHIGLDFF.DASI........nRIAAWVIGTRNMKKall  334
ident |                       |                    |              
Sbjct LRYF.LERVIPVCEEEN....IKMGIHPDdPPWEifglpritkNLADLKRILSLVDS...  228
DSSP  HHHH.HHHHHHHHHHHL....LEEEELLLlLLLLlllllllllLHHHHHHHHHHLLL...


DSSP  hhhlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHHHH
Query ralleptaelrkleapgdytarlalleeqkslpwqavwemycqrhdtpagsewlesVRAY  394
ident                                                             
Sbjct ......................................pangitfctgslgadptnDLPT  250
DSSP  ......................................lleelleellhhhhllllLHHH


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  394
ident                                                             
Sbjct mireighrinfvhfrnvkylgehrfeetahpsvagsldmaelmqalvdvgyegvirpdhg  310
DSSP  hhhhhhhhllleeelleeelllleeeellllhhhllllhhhhhhhhhhhlllleeeelll


DSSP  ..........................hhhlllll
Query ..........................ekeilsrr  402
ident                                   
Sbjct raiwdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll