No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=22.3

DSSP  ........................................LEEEEEH.HHHLLL......
Query ........................................MKLCFNE.ATTLEN......   13
ident                                                  |          
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehLRFSIAYwHTFTADgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhHLEEEEHhHHHLLLllllll


DSSP  ...................lLHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLlHHHH.........hlll
Query ...................sNLKLDLELCEKHGYDYIEIRTMdKLPE.........ylkd   45
ident                           |   |    |                        
Sbjct katmqrpwnhytdpmdiakaRVEAAFEFFDKINAPYFCFHDR.DIAPegdtlretnknld  119
DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEHH.HHLLllllhhhhhhhhh


DSSP  LLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEEL........LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query HSLDDLAEYFQTHHIKPLALNALVF........FNNR.DEKGHNEIITEFKGMMETCKTL   96
ident         |  |   | |   |  |                         |   |  | |
Sbjct TIVAMIKDYLKTSKTKVLWGTANLFsnprfvhgASTScNADVFAYSAAQVKKALEITKEL  179
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLLllhhhlllLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLEEEEEL..LLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHLLEEEEELLLLL...
Query GVKYVVAVP..LVTEQK..IVKEEIKKSSVDVLTELSDIAE..PYGVKIALEFVGHP...  147
ident |    |        |       |         |    | |           |        
Sbjct GGENYVFWGgrEGYETLlnTDMEFELDNFARFLHMAVDYAKeiGFEGQFLIEPKPKEptk  239
DSSP  LLLEEEELLllLEELLHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEELLLLLLlll


DSSP  LLLLLLHHHHHHHHH..HHLLLlEEEEEEHHHHHHLLLL.HHHHHL.LLHHHEEEEEELE
Query QCTVNTFEQAYEIVN..TVNRDnVGLVLDSFHFHAMGSN.IESLKQ.ADGKKIFIYHIDD  203
ident                                |           |                
Sbjct HQYDFDVANVLAFLRkyDLDKY.FKVNIEANHATLAFHDfQHELRYaRINGVLGSIDANT  298
DSSP  EELLLLHHHHHHHHHhlLLLLL.EEEEEEHHHHHHLLLLhHHHHHHhHHLLLEEEEELLL


DSSP  ELLLlllLLLHhHEELLLLlllLHHHHHHHHHHLLLLL..EEEELLLLHHhHHLLhhHHH
Query TEDFpigFLTDeDRVWPGQgaiDLDAHLSALKEIGFSD..VVSVELFRPEyYKLTaeEAI  261
ident           |     |                 |  |                   |  
Sbjct GDML...LGWD.TDQFPTD.irMTTLAMYEVIKMGGFDkgGLNFDAKVRRaSFEP..EDL  351
DSSP  LLLL...LLLL.LLLLLLL.hhHHHHHHHHHHHLLLLLllLEEELLLLLLlLLLL..HHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLL............................................
Query QTAKKTTVDVVSKYFS............................................  277
ident         |   | |                                             
Sbjct FLGHIAGMDAFAKGFKvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekya  411
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  .........................l
Query .........................m  278
ident                           
Sbjct lersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.5

DSSP  .............leeeeehhhhlllllhhhhhhhhhhlLLLEEEEELlLHHHH......
Query .............mklcfneattlensnlkldlelcekhGYDYIEIRTmDKLPE......   41
ident                                                             
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYW.HTFTAdgtdqf   59
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHH.HHHLLllllll


DSSP  ................hlllLLHHHHHHHHHLLLLEEEEEeEEELlllllHHHHHHHHHH
Query ................ylkdHSLDDLAEYFQTHHIKPLALnALVFfnnrdEKGHNEIITE   85
ident                            | |                         |    
Sbjct gkatmqrpwnhytdpmdiakARVEAAFEFFDKINAPYFCF.HDRD.iapeGDTLRETNKN  117
DSSP  lllllllhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLEEEE.EHHH.hlllLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHH......LLLEEEEELLLLLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query FKGMMETCKTL......GVKYVVAVPLVTEQ......kIVKEEIKKSSVDVLTELSDIAE  133
ident         |         |    |                       |         |  
Sbjct LDTIVAMIKDYlktsktKVLWGTANLFSNPRfvhgastSCNADVFAYSAAQVKKALEITK  177
DSSP  HHHHHHHHHHHhlllllEEEEEELLLLLLHHhllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLL.EEEEELL.LLLL.....lllllhhHHHHHHHHHLLLL.......eEEEEEhhhHH
Query PYGV.KIALEFV.GHPQ.....ctvntfeQAYEIVNTVNRDN.......vGLVLDsfhFH  179
ident   |                                                |        
Sbjct ELGGeNYVFWGGrEGYEtllntdmefeldNFARFLHMAVDYAkeigfegqFLIEP...KP  234
DSSP  HLLLlEEEELLLlLEELlhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhhllllleEEELL...LL


DSSP  HL.......lllHHHHHLL.....LHHHEEEEEE..LEELllllllllhhheelllllLL
Query AM.......gsnIESLKQA.....DGKKIFIYHI..DDTEdfpigfltdedrvwpgqgAI  225
ident                |        |                                   
Sbjct KEptkhqydfdvANVLAFLrkydlDKYFKVNIEAnhATLA..................FH  276
DSSP  LLllleellllhHHHHHHHhhlllLLLEEEEEEHhhHHHL..................LL


DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLhhhhhllhhhHHHHhhHHHHHHHLLLLLL.......
Query DLDAHLSALKEIGFSDVVSVELFRpeyykltaeeAIQTakKTTVDVVSKYFSM.......  278
ident |    |      |                                               
Sbjct DFQHELRYARINGVLGSIDANTGD.mllgwdtdqFPTD..IRMTTLAMYEVIKmggfdkg  333
DSSP  LHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLL.lllllllllLLLL..HHHHHHHHHHHHHlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  278
ident                                                             
Sbjct glnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgi  393
DSSP  leeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhh


DSSP  ............................................
Query ............................................  278
ident                                             
Sbjct gadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll


DSSP  .................................LEEEEEHHHHLLL.........lLHHH
Query .................................MKLCFNEATTLEN.........sNLKL   18
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Sbjct katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinAPYFCFHDRDIAPegdtlretnkNLDT  120
DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLEEEEEHHHHLLllllhhhhhhHHHH


DSSP  HHHHHHHLL....lLEEEEEL...........................LLHHhhhlllll
Query DLELCEKHG....yDYIEIRT...........................MDKLpeylkdhs   47
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Sbjct IVAMIKDYLktsktKVLWGTAnlfsnprfvhgastscnadvfaysaaqVKKA........  172
DSSP  HHHHHHHHHlllllEEEEEELlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhHHHH........


DSSP  hhhhhhhhhlllLEEEEEEEEE.......lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLL
Query lddlaeyfqthhIKPLALNALV.......ffnnrDEKGHNEIITEFKGMMETCK.TLGVK   99
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Sbjct ......leitkeLGGENYVFWGgregyetllntdMEFELDNFARFLHMAVDYAKeIGFEG  226
DSSP  ......hhhhhhLLLLEEEELLllleellhhhllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLL


DSSP  EEEEELLLL.LLLLlhhhhhHHHHHHHH..HHHHhhhhhllEEEEEL...LLLLLlllLL
Query YVVAVPLVT.EQKIvkeeikKSSVDVLT..ELSDiaepygvKIALEF...VGHPQctvNT  153
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Sbjct QFLIEPKPKePTKHqydfdvANVLAFLRkyDLDK.......YFKVNIeanHATLA..fHD  277
DSSP  EEEELLLLLlLLLEellllhHHHHHHHHhlLLLL.......LEEEEEehhHHHHL..lLL


DSSP  HHHHHHHHHHHLlllEEEEEEHhhHHHL.............llLHHHHHLL...LHHH.e
Query FEQAYEIVNTVNrdnVGLVLDSfhFHAM.............gsNIESLKQA...DGKK.i  196
ident |              |    |                                  |    
Sbjct FQHELRYARING...VLGSIDA..NTGDmllgwdtdqfptdirMTTLAMYEvikMGGFdk  332
DSSP  HHHHHHHHHHLL...LEEEEEL..LLLLlllllllllllllhhHHHHHHHHhhhLLLLll


DSSP  EEEEELEELLLllllllhhheellLLLL..LLHHHHHHHHHHLL................
Query FIYHIDDTEDFpigfltdedrvwpGQGA..IDLDAHLSALKEIG................  238
ident      |                           ||     |                   
Sbjct GGLNFDAKVRR......asfepedLFLGhiAGMDAFAKGFKVAYklvkdrvfdkfieery  386
DSSP  LLEEELLLLLL......lllllhhHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhhhhhl


DSSP  ...........llleeeellllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ...........fsdvvsvelfrpeyykltaeeaiqtakkttvdvvskyfsm  278
ident                                                    
Sbjct asykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.3

DSSP  leeeeehhhhlllllhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhlLLLLhHHHHHhHHLLL.
Query mklcfneattlensnlkldlelcekhgydyieirtmdklpeylKDHSlDDLAEyFQTHH.   59
ident                                               |             
Sbjct .........................nkyfenvskikyegpksnNPYS.FKFYN.PEEVId   33
DSSP  .........................lllllllllleellllllLLLE.ELLLL.LLLEEl


DSSP  ......LEEEEEEEE...................elllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ......IKPLALNAL...................vffnnrDEKGHNEIITEFKGMMETCK   94
ident                                                             
Sbjct gktmeeHLRFSIAYWhtftadgtdqfgkatmqrpwnhytdPMDIAKARVEAAFEFFDKIN   93
DSSP  leehhhHHLEEEEHHhhhlllllllllllllllhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  hhlLLEEEEELLL.llllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEE.EEELLLLLL....
Query tlgVKYVVAVPLV.teqkIVKEEIKKSSVDVLTELSDIAEPYGVKI.ALEFVGHPQ....  148
ident      |                |  |          |       |               
Sbjct ...APYFCFHDRDiapegDTLRETNKNLDTIVAMIKDYLKTSKTKVlWGTANLFSNprfv  150
DSSP  ...LLEEEEEHHHhllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEeEEELLLLLLhhhl


DSSP  .............llllLHHHHHHHHHhhllLLEEEEEEHHhhHHLL.............
Query .............ctvnTFEQAYEIVNtvnrDNVGLVLDSFhfHAMG.............  182
ident                      | ||         |                         
Sbjct hgastscnadvfaysaaQVKKALEITK....ELGGENYVFW..GGREgyetllntdmefe  204
DSSP  llllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHH....HLLLLEEEEL..LLLLeellhhhllhhhh


DSSP  .....lLHHHHHLLL...HHHEeeEEELEELLLLlllllhhHEELLLLllLLHH..hHHH
Query .....sNIESLKQAD...GKKIfiYHIDDTEDFPigfltdeDRVWPGQgaIDLD..aHLS  232
ident                   |       |      |                  |       
Sbjct ldnfarFLHMAVDYAkeiGFEG.qFLIEPKPKEP...tkhqYDFDVANvlAFLRkydLDK  260
DSSP  hhhhhhHHHHHHHHHhhlLLLL.eEEELLLLLLL...lleeLLLLHHHhhHHHHhllLLL


DSSP  HHhhllllleEEELLLL..HHHHhllhhhHHHHHHHHHHHHH..................
Query ALkeigfsdvVSVELFR..PEYYkltaeeAIQTAKKTTVDVV..................  272
ident                                |                            
Sbjct YF........KVNIEANhaTLAF.....hDFQHELRYARINGvlgsidantgdmllgwdt  307
DSSP  LE........EEEEEHHhhHHLL.....lLHHHHHHHHHHLLleeeeellllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  272
ident                                                             
Sbjct dqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmdafakgfk  367
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  272
ident                                                             
Sbjct vayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgrqell  427
DSSP  hhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhh


DSSP  ....llllll
Query ....skyfsm  278
ident           
Sbjct esilnqylfa  437
DSSP  hhhhhhhhll