No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.6

DSSP  ........................................LEELLLLL............
Query ........................................MKWGFRWY............    8
ident                                                             
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehLRFSIAYWhtftadgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhHLEEEEHHhhhlllllllll


DSSP  ....................LLLLlllLHHHHLLLLlLLEEEEL..LLLLL.....llll
Query ....................GAAGdaiPLKHIRQIPgITGVVGT..LLNKL.....pgdv   41
ident                                   |                         
Sbjct katmqrpwnhytdpmdiakaRVEA...AFEFFDKIN.APYFCFHdrDIAPEgdtlretnk  116
DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhHHHH...HHHHHHHHL.LLEEEEEhhHHLLLlllhhhhhh


DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELlLLLL.......HHHHHLLL.LHHHHHHHHHHHHHH
Query wTVAEIQALKQSVEQEGLALLGIEsVAIH.......DAIKAGTD.QRDHYIDNYRQTLRN   93
ident          |          |                |                   |  
Sbjct nLDTIVAMIKDYLKTSKTKVLWGT.ANLFsnprfvhGASTSCNAdVFAYSAAQVKKALEI  175
DSSP  hHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEE.LLLLllhhhllLLLLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLEEEELL..LLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllll
Query LGKCGISLVCYSF..KPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihswe  151
ident     |                                                       
Sbjct TKELGGENYVFWGgrEGYE.........................................  194
DSSP  HHHLLLLEEEELLllLEEL.........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHLLEEEELLLllLLLLllL
Query eerlqqfqelkamyAGVTeEDLVENLRYFLERVIPVCE..EENIKMGIHPDdpPWEIfgL  209
ident                    |    |   ||                 | |   | |    
Sbjct ...........tllNTDM.EFELDNFARFLHMAVDYAKeiGFEGQFLIEPK..PKEP.tK  239
DSSP  ...........lhhHLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEELLL..LLLL.lL


DSSP  LLLLLLHHHHHHHHH..HLLLLlEELLEELLHHHHLLlLLHHHHHHHHH..HHLLLEEEL
Query PRITKNLADLKRILS..LVDSPaNGITFCTGSLGADPtNDLPTMIREIG..HRINFVHFR  265
ident        |     |     |                   |     |              
Sbjct HQYDFDVANVLAFLRkyDLDKY.FKVNIEANHATLAF.HDFQHELRYARinGVLGSIDAN  297
DSSP  EELLLLHHHHHHHHHhlLLLLL.EEEEEEHHHHHHLL.LLHHHHHHHHHhlLLEEEEELL


DSSP  LEEELllLEEEE.LLLLHhhlllLHHHHHHHHHHHLLL..LEEEELLLLLLLLLLLLlll
Query NVKYLgeHRFEE.TAHPSvagslDMAELMQALVDVGYE..GVIRPDHGRAIWDEKAMpgy  322
ident     |                       |      |    |    |              
Sbjct TGDML..LGWDTdQFPTD...irMTTLAMYEVIKMGGFdkGGLNFDAKVRRASFEPE..d  350
DSSP  LLLLL..LLLLLlLLLLL...hhHHHHHHHHHHHLLLLllLLEEELLLLLLLLLLLH..h


DSSP  LLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLL......................................
Query GLYDRAMGLTYIQGLYEATKAK......................................  344
ident        |                                                    
Sbjct LFLGHIAGMDAFAKGFKVAYKLvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrsleky  410
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  ...........................
Query ...........................  344
ident                            
Sbjct alersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.5

DSSP  ...............leelllllllllllllhhhhllllLLLEEEEL...LLLL......
Query ...............mkwgfrwygaagdaiplkhirqipGITGVVGT...LLNK......   36
ident                                                             
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeeHLRFSIAYwhtFTADgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhHHLEEEEHhhhHLLLllllll


DSSP  ...........llllllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEeLLLLllhhhhhllLLHHHHHH
Query ...........lpgdvwTVAEIQALKQSVEQEGLALLGiESVAihdaikagtDQRDHYID   85
ident                    |   |                            |       
Sbjct katmqrpwnhytdpmdiAKARVEAAFEFFDKINAPYFC.FHDR...diapegDTLRETNK  116
DSSP  llllllhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEE.EEHH...hhllllLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLL......LLEEEELLLLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlll
Query NYRQTLRNLGKCG......ISLVCYSFKPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmq  139
ident |                                                           
Sbjct NLDTIVAMIKDYLktsktkVLWGTANLFSNP.............................  147
DSSP  HHHHHHHHHHHHHllllleEEEEELLLLLLH.............................


DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EEEEL
Query pedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvTEEDLVENLRYFLERVIPVCEEENI.KMGIH  198
ident                                 |                 |         
Sbjct ....................rfvhgastsCNADVFAYSAAQVKKALEITKELGGeNYVFW  187
DSSP  ....................hhlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlEEEEL


DSSP  LLLlLLLLLL.lllllllHHHHHHHHHHLLL.......lleELLEEllhHHHL.....ll
Query PDDpPWEIFG.lpritknLADLKRILSLVDS.......panGITFCtgsLGAD.....pt  245
ident                   |    | |                                  
Sbjct GGR.EGYETLlntdmefeLDNFARFLHMAVDyakeigfegqFLIEP...KPKEptkhqyd  243
DSSP  LLL.LEELLHhhllhhhhHHHHHHHHHHHHHhhhhllllleEEELL...LLLLllleell


DSSP  LLHHHHHHHH.....HHHL.lLEEEL..LEEElllleeeellllhhhllLLHHHHHHHHH
Query NDLPTMIREI.....GHRI.nFVHFR..NVKYlgehrfeetahpsvagsLDMAELMQALV  297
ident  |                                                |         
Sbjct FDVANVLAFLrkydlDKYFkvNIEANhaTLAF.................HDFQHELRYAR  286
DSSP  LLHHHHHHHHhhlllLLLEeeEEEHHhhHHLL.................LLHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEELLLLlllllllllllLLHHhhHHHLHHHHHHHHHH...............
Query DVGYEGVIRPDHGRaiwdekampgyGLYDraMGLTYIQGLYEATK...............  342
ident   |  | |    |               |     |                         
Sbjct INGVLGSIDANTGD..mllgwdtdqFPTD.iRMTTLAMYEVIKMGgfdkgglnfdakvrr  343
DSSP  HLLLEEEEELLLLL..lllllllllLLLL.hHHHHHHHHHHHHLLlllllleeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  342
ident                                                             
Sbjct asfepedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkad  403
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllll


DSSP  ................................ll
Query ................................ak  344
ident                                   
Sbjct frslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nkyfenvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmeehlrfsiaywhtftadgtdqfg   60
DSSP  lllllllllleellllllllleellllllleelleehhhhhleeeehhhhhlllllllll


DSSP  ................................leELLLLLLlLLLL..............
Query ................................mkWGFRWYGaAGDA..............   14
ident                                     |        |              
Sbjct katmqrpwnhytdpmdiakarveaafeffdkinaPYFCFHD.RDIApegdtlretnknld  119
DSSP  llllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLEEEEEH.HHHLlllllhhhhhhhhh


DSSP  lLHHHHLLL...LLLLEEEELLLLL.......LLLL.......llLHHHHHHHHHHHHHl
Query iPLKHIRQI...PGITGVVGTLLNK.......LPGD.......vwTVAEIQALKQSVEQe   57
ident      |             ||                          |            
Sbjct tIVAMIKDYlktSKTKVLWGTANLFsnprfvhGASTscnadvfaySAAQVKKALEITKE.  178
DSSP  hHHHHHHHHhllLLLEEEEEELLLLllhhhllLLLLlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHH.


DSSP  lLEEE.EELLL.LLLHhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......lLEEEELLLLL
Query gLALL.GIESV.AIHDaikagtDQRDHYIDNYRQTLRNLGKCG......iSLVCYSFKPI  109
ident  |                           ||    |                        
Sbjct .LGGEnYVFWGgREGY.etllnTDMEFELDNFARFLHMAVDYAkeigfegQFLIEPKPKE  236
DSSP  .LLLLeEEELLlLLEE.llhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllllEEEELLLLLL


DSSP  Lllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllll
Query Fgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyqlihsweeerlqqfqelkamyagvt  169
ident                                                             
Sbjct P..........................................................t  238
DSSP  L..........................................................l


DSSP  hhhhhhhhHHHHHHHH..HHHHhhlLEEEELLLLlllllllllLLLLL.HHHHHHHHHHL
Query eedlvenlRYFLERVI..PVCEeenIKMGIHPDDppweifglpRITKN.LADLKRILSLV  226
ident            |                                        |       
Sbjct khqydfdvANVLAFLRkyDLDK...YFKVNIEAN......hatLAFHDfQHELRYARING  289
DSSP  leellllhHHHHHHHHhlLLLL...LEEEEEEHH......hhhHLLLLhHHHHHHHHHLL


DSSP  llllEELLEELLH.........hhhllllLHHHHHHHHHH.....hlLLEEELLEEELL.
Query dspaNGITFCTGS.........lgadptnDLPTMIREIGH.....riNFVHFRNVKYLG.  271
ident                                 |                  |        
Sbjct ....VLGSIDANTgdmllgwdtdqfptdiRMTTLAMYEVIkmggfdkGGLNFDAKVRRAs  345
DSSP  ....LEEEEELLLlllllllllllllllhHHHHHHHHHHHhllllllLLEEELLLLLLLl


DSSP  .lleeeeLLLLHhhlllLHHHHHHHHHHH.......................lllleeee
Query .ehrfeeTAHPSvagslDMAELMQALVDV.......................gyegvirp  307
ident          |        |                                         
Sbjct fepedlfLGHIA.....GMDAFAKGFKVAyklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsg  400
DSSP  lllhhhhHHHHH.....HHHHHHHHHHHHhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhl


DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhll
Query dhgraiwdekampgyglydramgltyiqglyeatkak  344
ident                                      
Sbjct kadfrslekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  lllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhHHHHH...........
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvAEIQA...........   49
ident                                               |             
Sbjct .....................................nkyfenvSKIKYegpksnnpysf   23
DSSP  .....................................lllllllLLLEElllllllllee


DSSP  hhHHHHHL.......lLEEEEEL..LLLL...............lhhhhhLLLLHHHHHH
Query lkQSVEQE.......gLALLGIE..SVAI...............hdaikaGTDQRDHYID   85
ident      |               |                              |       
Sbjct kfYNPEEVidgktmeeHLRFSIAywHTFTadgtdqfgkatmqrpwnhytdPMDIAKARVE   83
DSSP  llLLLLLEelleehhhHHLEEEEhhHHHLllllllllllllllhhhhlllHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhlLLLEEEELLLlllllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhhh
Query NYRQTLRNLgkcGISLVCYSFKpifgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmyq  145
ident                  |                                          
Sbjct AAFEFFDKI...NAPYFCFHDR......................................  102
DSSP  HHHHHHHHH...LLLEEEEEHH......................................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LEEEELLLLlLL
Query lihsweeerlqqfqelkamyagVTEEDLVENLRYFLERVIPVCEEEN.IKMGIHPDDpPW  204
ident                        |      ||                            
Sbjct ................diapegDTLRETNKNLDTIVAMIKDYLKTSKtKVLWGTANL.FS  145
DSSP  ................hhllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlEEEEEELLL.LL


DSSP  LLL.........lllllllLHHHHHHHHHH.LLLLLeeLLEElLHHHH..........ll
Query EIF.........glpritkNLADLKRILSL.VDSPAngITFCtGSLGA..........dp  244
ident                      |  |  |            |  |                
Sbjct NPRfvhgastscnadvfaySAAQVKKALEItKELGGenYVFW.GGREGyetllntdmefe  204
DSSP  LHHhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHhHHLLLleEEEL.LLLLEellhhhllhhhh


DSSP  llLHHHHHHHHHH.......hlllEEELLeeellllEEEE.lLLLHhhlllLHHHHHH..
Query tnDLPTMIREIGH.......rinfVHFRNvkylgehRFEE.tAHPSvagslDMAELMQ..  294
ident                                                             
Sbjct ldNFARFLHMAVDyakeigfegqfLIEPK...pkepTKHQydFDVA.....NVLAFLRky  256
DSSP  hhHHHHHHHHHHHhhhhllllleeEELLL...llllLLEEllLLHH.....HHHHHHHhl


DSSP  hHHHHlllleEEEL..LLLLllllllllllllHHHHHhhLHHHHHH..............
Query aLVDVgyegvIRPD..HGRAiwdekampgyglYDRAMglTYIQGLY..............  338
ident  |              |                |      |                   
Sbjct dLDKY...fkVNIEanHATL..........afHDFQHelRYARINGvlgsidantgdmll  303
DSSP  lLLLL...eeEEEEhhHHHH..........llLLHHHhhHHHHHLLleeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  338
ident                                                             
Sbjct gwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfepedlflghiagmdafa  363
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  338
ident                                                             
Sbjct kgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrslekyalersqivnksgr  423
DSSP  hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  ........hhhhll
Query ........eatkak  344
ident               
Sbjct qellesilnqylfa  437
DSSP  hhhhhhhhhhhhll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.5

DSSP  leelllllllllllllhhhhllllllleeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhllle
Query mkwgfrwygaagdaiplkhirqipgitgvvgtllnklpgdvwtvaeiqalkqsveqegla   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeellllllhhhhhllllhhHHHHH........................hhhhhhhhHH
Query llgiesvaihdaikagtdqrdHYIDN........................yrqtlrnlGK   96
ident                                                             
Sbjct .....................NKYFEnvskikyegpksnnpysfkfynpeevidgktmEE   39
DSSP  .....................LLLLLllllleellllllllleellllllleelleehHH


DSSP  LLLLEEEEL..LLLLLllllleeeeellllleeeeeehhhhhlllhhhhHHHLLlllhhh
Query CGISLVCYS..FKPIFgwaktdlayenedgslsllfdqavvenmqpedmYQLIHsweeer  154
ident        |   |                                      |         
Sbjct HLRFSIAYWhtFTADG................................tDQFGK......   61
DSSP  HHLEEEEHHhhHLLLL................................lLLLLL......


DSSP  hhhhhhhhhhLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLEEEELLLllllllllllllll
Query lqqfqelkamYAGVTEEDLVENLRYFLERVIPVCEeeNIKMGIHPDdppweifglpritk  214
ident                  |                         |                
Sbjct ...atmqrpwNHYTDPMDIAKARVEAAFEFFDKIN..APYFCFHDR...diapegdtlre  113
DSSP  ...lllllhhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLEEEEEHH...hhllllllhhh


DSSP  LHHHHHHHHHHLLL.....lleelLEELlHHHH................LLLL.LHHHHH
Query NLADLKRILSLVDS.....pangiTFCTgSLGA................DPTN.DLPTMI  252
ident     |  |                      |                             
Sbjct TNKNLDTIVAMIKDylktsktkvlWGTA.NLFSnprfvhgastscnadvFAYSaAQVKKA  172
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhllllleeeEEEL.LLLLlhhhlllllllllhhhHHHHhHHHHHH


DSSP  HHHHH..HLLLEEELLEEelllleeeellllhHHLL..lLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEL
Query REIGH..RINFVHFRNVKylgehrfeetahpsVAGS..lDMAELMQALVDVGYEGVIRPD  308
ident  ||          |                                     | ||     
Sbjct LEITKelGGENYVFWGGR.egyetllntdmefELDNfarFLHMAVDYAKEIGFEGQFLIE  231
DSSP  HHHHHhlLLLEEEELLLL.leellhhhllhhhHHHHhhhHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEL


DSSP  LLLLLllllLLLLlllHHHHHHHLH....hHHHH..........................
Query HGRAIwdekAMPGyglYDRAMGLTY....iQGLY..........................  338
ident                  | |  |          |                          
Sbjct PKPKE...pTKHQ.ydFDVANVLAFlrkydLDKYfkvnieanhatlafhdfqhelryari  287
DSSP  LLLLL...lLLEE.llLLHHHHHHHhhhllLLLLeeeeeehhhhhhllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  338
ident                                                             
Sbjct ngvlgsidantgdmllgwdtdqfptdirmttlamyevikmggfdkgglnfdakvrrasfe  347
DSSP  llleeeeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  338
ident                                                             
Sbjct pedlflghiagmdafakgfkvayklvkdrvfdkfieeryasykdgigadivsgkadfrsl  407
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhllllhhhh


DSSP  ........................hhhhll
Query ........................eatkak  344
ident                               
Sbjct ekyalersqivnksgrqellesilnqylfa  437
DSSP  hhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhll