No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=12.2

DSSP  llllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhHHLLLllLLEEEEEEEL.EELLLLLLL
Query qqidwdlalikyytsyptalefsedfgeqaflqAVARYpeRPLSLYVHIP.FCHKLCYFC   59
ident                                             |       |   |  |
Sbjct ..............................eqiKDKLG.rPIRDLRLSVTdRCNFRCDYC   29
DSSP  ..............................lllLLLLL.lLLLEEEEELLlLLLLLLLLL


DSSP  L...llleelLLLHH.hHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllEEEEEEEELLHHHLLhhHHHH
Query G...cnkivtRQQHK.aDQYLDALEQEIVHRAPLFagrhVSQLHWGGGTPTYLNkaQISR  115
ident               |      |         | |     |      || |          
Sbjct MpkevfgddfVFLPKneLLTFDEMARIAKVYAELG....VKKIRITGGEPLMRR..DLDV   83
DSSP  LlllllllllLLLLHhhLLLHHHHHHHHHHHHHLL....LLEEEEELLLHHHLL..LHHH


DSSP  HHHHHHHHLLEeeeEEEEEEELLLlLLLHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLHHHHHHH.LL
Query LMKLLRENFQFnadAEISIEVDPReIELDVLDHLRAEGFNRLSMGVQDFNKEVQRLV.NR  174
ident |   |           |                |   |  |                 ||
Sbjct LIAKLNQIDGI...EDIGLTTNGL.LLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSInNR  139
DSSP  HHHHHLLLLLL...LEEEEEELLL.LHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHhLL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEEELLLLLLhHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEELLL
Query EQDEEFIFALLNHAREIGFTsTNIDLIYGLPKQTpESFAFTLKRVAELNPdRLSVFNYAH  234
ident       |      |  ||                       |                  
Sbjct NIKATTILEQIDYATSIGLN.VKVNVVIQKGIND.DQIIPMLEYFKDKHI.EIRFIEFMD  196
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLE.EEEEEEELLLLLH.HHHHHHHHHHHHLLL.LEEEEELLL


DSSP  LllllhhhhhllhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHllleeeelleeellllhhHHHHhhl
Query LptifaaqrkikdadlpspqQKLDILQETIAFLTQsgyqfigmdhfarpddelAVAQreg  294
ident                      |   |                                  
Sbjct V.......gndngwdfskvvTKDEMLTMIEQHFEI................dpVEPK..y  231
DSSP  L.......llllllllllllLHHHHHHHHHHHLLE................eeELLL..l


DSSP  LLEE................lllleelllLLEEEEEL..LLLEEEelleeEEELllhhhH
Query VLHR................nfqgyttqgDTDLLGMG..VSAISMigdcyAQNQkelkqY  336
ident                                                             
Sbjct FGEVakyyrhkdngvqfglitsvsqsfcsTCTRARLSsdGKFYGClfatvDGFN.....V  286
DSSP  LLLLleeeeellllleeeeelllllllhhHLLEEEELllLLEELLlllllLLLL.....H


DSSP  HHHHHHHllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhh
Query YQQVDEQgnalwrgialtrddcirrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkl  396
ident                                                             
Sbjct KAFIRSG.....................................................  293
DSSP  HHHHHLL.....................................................


DSSP  hhhhhhllleeellleeeellllhhhHHHHHHLLLLll
Query laplakdglvdvdekgiqvtakgrllIRNICMCFDTyl  434
ident                                       
Sbjct ..vtdeelkeqfkalwqirddrysdeRTAQTVANRQ..  327
DSSP  ..llhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHHLL..


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  ......................llllllllllllllllllhhhllllllhhhhHHHHLLL
Query ......................qqidwdlalikyytsyptalefsedfgeqafLQAVARY   38
ident                                                            |
Sbjct eqikdklgrpirdlrlsvtdrcnfrcdycmpkevfgddfvflpknelltfdemARIAKVY   60
DSSP  lllllllllllleeeeellllllllllllllllllllllllllhhhlllhhhhHHHHHHH


DSSP  L...lLLEEEEEEEleellllllllllleellllhhhhhhhhHHHHhHHHHHHHHLLL..
Query P...eRPLSLYVHIpfchklcyfcgcnkivtrqqhkadqyldALEQeIVHRAPLFAGR..   93
ident                                                             
Sbjct AelgvKKIRITGGE..........................plMRRD.LDVLIAKLNQIdg   93
DSSP  HhlllLEEEEELLL..........................hhHLLL.HHHHHHHHLLLll


DSSP  .lEEEEEEEellhhhllhhHHHHHHHHHHHHLleeeeEEEEEEELLLLL...........
Query .hVSQLHWGggtptylnkaQISRLMKLLRENFqfnadAEISIEVDPREI...........  141
ident      |                     |           |    |               
Sbjct ieDIGLTTN........glLLKKHGQKLYDAG....lRRINVSLDAIDDtlfqsinnrni  141
DSSP  llEEEEEEL........llLHHHHHHHHHHHL....lLEEEEELLLLLHhhhhhhhllll


DSSP  .LLHHHHHHHHLL....LLEEEEEEELLlhhhhhhhlllllhhHHHHHHHHHHHLLLLlL
Query .ELDVLDHLRAEG....FNRLSMGVQDFnkevqrlvnreqdeeFIFALLNHAREIGFTsT  196
ident      |                   |                  |   |           
Sbjct kATTILEQIDYATsiglNVKVNVVIQKG...........inddQIIPMLEYFKDKHIE.I  189
DSSP  lHHHHHHHHHHHHhlllEEEEEEEELLL...........llhhHHHHHHHHHHHLLLL.E


DSSP  EEEEeellllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeEEELLLlllllhhhhhllhhhlllhhhh
Query NIDLiyglpkqtpesfaftlkrvaelnpdrlsVFNYAHlptifaaqrkikdadlpspqqk  256
ident                                                             
Sbjct RFIE............................FMDVGN...........dngwdfskvvt  210
DSSP  EEEE............................LLLLLL...........lllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhHLLLeeeelleeeLLLLhhHHHH......................hhl
Query ldilqetiafltQSGYqfigmdhfaRPDDelAVAQ......................reg  294
ident                                                             
Sbjct kdemltmieqhfEIDP.........VEPK..YFGEvakyyrhkdngvqfglitsvsqsfc  259
DSSP  hhhhhhhhhhhlLEEE.........ELLL..LLLLlleeeeellllleeeeelllllllh


DSSP  LLEELllleellllleeeeelllleeeelleEEEElllhhhhhhhhhhhllleEEEE...
Query VLHRNfqgyttqgdtdllgmgvsaismigdcYAQNqkelkqyyqqvdeqgnalWRGI...  351
ident                                                             
Sbjct STCTR.........................aRLSS..................DGKFygc  276
DSSP  HHLLE.........................eEELL..................LLLEell


DSSP  ........................eLLHHHHHHHhhHHHHhhhleeehhhhhhhllllhh
Query ........................aLTRDDCIRRdvIKSLicnfrldyspieqqwdllfa  387
ident                                  |                          
Sbjct lfatvdgfnvkafirsgvtdeelkeQFKALWQIR..DDRY....................  314
DSSP  lllllllllhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHLL..LLLH....................


DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeelllLHHHhhhhhhllllll
Query dyfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtakGRLLirnicmcfdtyl  434
ident                                                
Sbjct ..........................sdertAQTV........anrq  327
DSSP  ..........................hhhhhHHHH........hhll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.3

DSSP  llllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeeleellllllll
Query qqidwdlalikyytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipfchklcyfcg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhhhhhhhHHHH
Query cnkivtrqqhkadqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkaqisrlMKLL  120
ident                                                             
Sbjct .......................................................eQIKD    5
DSSP  .......................................................lLLLL


DSSP  hhHLLEeeeEEEEEEELL.............................LLLL..LHHHHHH
Query reNFQFnadAEISIEVDP.............................REIE..LDVLDHL  149
ident                                                             
Sbjct ..KLGR...PIRDLRLSVtdrcnfrcdycmpkevfgddfvflpknelLTFDemARIAKVY   60
DSSP  ..LLLL...LLLEEEEELlllllllllllllllllllllllllhhhlLLHHhhHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEEE..EELLlhhhhhhhllLLLHhHHHHHHHHHhhLLLLLLEEEEEElllll
Query RAEGFNRLSMG..VQDFnkevqrlvnrEQDEeFIFALLNHAreIGFTSTNIDLIYglpkq  207
ident    |                         |     | ||     |               
Sbjct AELGVKKIRITggEPLM..........RRDLdVLIAKLNQI..DGIEDIGLTTNG.....  103
DSSP  HHLLLLEEEEEllLHHH..........LLLHhHHHHHHLLL..LLLLEEEEEELL.....


DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEELLllllllhhhhhLLHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query tpeSFAFTLKRVAELNPdRLSVFNYAhlptifaaqrkIKDADLPSPQQKLDILQETIAFL  267
ident                   |  |   |                       |          
Sbjct ..lLLKKHGQKLYDAGLrRINVSLDA....iddtlfqSINNRNIKATTILEQIDYATSIG  157
DSSP  ..lLHHHHHHHHHHHLLlEEEEELLL....llhhhhhHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  .......................hhlllEEEEL....................leeelll
Query .......................tqsgyQFIGM....................dhfarpd  284
ident                                                             
Sbjct lnvkvnvviqkginddqiipmleyfkdkHIEIRfiefmdvgndngwdfskvvtkdemltm  217
DSSP  leeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlLLLEEeeelllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhHLLLeelllleeLLLL....................leeEEEL.........
Query delavaqrEGVLhrnfqgytTQGD....................tdlLGMG.........  315
ident                                                             
Sbjct ieqhfeidPVEP........KYFGevakyyrhkdngvqfglitsvsqSFCStctrarlss  269
DSSP  hhhhlleeEELL........LLLLllleeeeellllleeeeelllllLLHHhlleeeell


DSSP  ..........................................LLLEEeelleeeeelllh
Query ..........................................VSAISmigdcyaqnqkel  333
ident                                                             
Sbjct dgkfygclfatvdgfnvkafirsgvtdeelkeqfkalwqirdDRYSD.............  316
DSSP  llleelllllllllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllLLHHH.............


DSSP  hhhhhhhhhhllleeEEEEllhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhh
Query kqyyqqvdeqgnalwRGIAltrddcirrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaed  393
ident                                                             
Sbjct ............ertAQTV.........................................  323
DSSP  ............hhhHHHH.........................................


DSSP  hhhhhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll
Query lkllaplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                                          
Sbjct .....................................anrq  327
DSSP  .....................................hhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  ......................llllllllllllllllllhHHLL.LLLLH.........
Query ......................qqidwdlalikyytsyptaLEFS.EDFGE.........   28
ident                                          |                  
Sbjct eqikdklgrpirdlrlsvtdrcnfrcdycmpkevfgddfvfLPKNeLLTFDemariakvy   60
DSSP  lllllllllllleeeeellllllllllllllllllllllllLLHHhLLLHHhhhhhhhhh


DSSP  ......................hhhHHHHLLLLLLLEEEEEEeleellllllllllleel
Query ......................qafLQAVARYPERPLSLYVHipfchklcyfcgcnkivt   66
ident                                       |                     
Sbjct aelgvkkiritggeplmrrdldvliAKLNQIDGIEDIGLTTN..................  102
DSSP  hhlllleeeeelllhhhlllhhhhhHHHLLLLLLLEEEEEEL..................


DSSP  lllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHlllleeEEEEEellHHHLL.............HHHH
Query rqqhkadqyldALEQEIVHRAPLFagrhvsQLHWGggtPTYLN.............KAQI  113
ident             |                                              |
Sbjct .........glLLKKHGQKLYDAG....lrRINVS...LDAIDdtlfqsinnrnikATTI  146
DSSP  .........llLHHHHHHHHHHHL....llEEEEE...LLLLLhhhhhhhhlllllHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLEeeeeeEEEEELL..LLLL..LHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLHHHH
Query SRLMKLLRENFQFnadaeISIEVDP..REIE..LDVLDHLRAEGFNRLSMGVQDFNKEVQ  169
ident                       |             |                |      
Sbjct LEQIDYATSIGLN....vKVNVVIQkgINDDqiIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNG  202
DSSP  HHHHHHHHHLLLE....eEEEEEELllLLHHhhHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLLLLLLL


DSSP  hhhlllllhhhhHHHHHH........................hhhllLLLLEEEEeelll
Query rlvnreqdeefiFALLNH........................areigFTSTNIDLiyglp  205
ident                |                                            
Sbjct ...wdfskvvtkDEMLTMieqhfeidpvepkyfgevakyyrhkdngvQFGLITSV.....  254
DSSP  ...llllllllhHHHHHHhhhhlleeeellllllllleeeeelllllEEEEELLL.....


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhllleEEEEellllllllhhhhhllhhhlllhhhhhhhhhhhhh
Query kqtpesfaftlkrvaelnpdrLSVFnyahlptifaaqrkikdadlpspqqkldilqetia  265
ident                         |                                   
Sbjct .....................SQSF...................................  258
DSSP  .....................LLLL...................................


DSSP  hhhhllleEEELleeellllhhhhhhhhllLEELllleellllleeeeelllleeeelle
Query fltqsgyqFIGMdhfarpddelavaqregvLHRNfqgyttqgdtdllgmgvsaismigdc  325
ident                                                             
Sbjct ........CSTC..................TRAR.........................l  267
DSSP  ........HHHL..................LEEE.........................e


DSSP  eeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeelLHHHHHHHHHHHHHHhhleeehhhhhhhllll
Query yaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrgialTRDDCIRRDVIKSLIcnfrldyspieqqwdll  385
ident                                                             
Sbjct ssdgkfygclfatvdgfnvkafirsgvtDEELKEQFKALWQIR.................  310
DSSP  llllleelllllllllllhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHHLL.................


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll
Query fadyfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                                                  
Sbjct ................................ddrysdertaqtvanrq  327
DSSP  ................................lllhhhhhhhhhhhhll