No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=67.8

DSSP  LLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEEELEELLLLLLLL
Query QQIDWDLALIKYYTSYPTALEFSEDFGEQAFLQAVARYPERPLSLYVHIPFCHKLCYFCG   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct QQIDWDLALIKYYTSYPTALEFSEDFGEQAFLQAVARYPERPLSLYVHIPFCHKLCYFCG   60
DSSP  LLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEEELEELLLLLLLL


DSSP  LLLEELLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEELLHHHLLHHHHHHHHHHH
Query CNKIVTRQQHKADQYLDALEQEIVHRAPLFAGRHVSQLHWGGGTPTYLNKAQISRLMKLL  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct CNKIVTRQQHKADQYLDALEQEIVHRAPLFAGRHVSQLHWGGGTPTYLNKAQISRLMKLL  120
DSSP  LLLEELLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEELLHHHLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLEEEEEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLHHHHHHHLLLLLHHH
Query RENFQFNADAEISIEVDPREIELDVLDHLRAEGFNRLSMGVQDFNKEVQRLVNREQDEEF  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct RENFQFNADAEISIEVDPREIELDVLDHLRAEGFNRLSMGVQDFNKEVQRLVNREQDEEF  180
DSSP  HHHLLEEEEEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLHHHHHHHLLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLLLLH
Query IFALLNHAREIGFTSTNIDLIYGLPKQTPESFAFTLKRVAELNPDRLSVFNYAHLPTIFA  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct IFALLNHAREIGFTSTNIDLIYGLPKQTPESFAFTLKRVAELNPDRLSVFNYAHLPTIFA  240
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLLLLH


DSSP  HHHHLLHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEELLLLHHHHHHHHLLLEELL
Query AQRKIKDADLPSPQQKLDILQETIAFLTQSGYQFIGMDHFARPDDELAVAQREGVLHRNF  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AQRKIKDADLPSPQQKLDILQETIAFLTQSGYQFIGMDHFARPDDELAVAQREGVLHRNF  300
DSSP  HHHHLLHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEELLLLHHHHHHHHLLLEELL


DSSP  LLEELLLLLEEEEELLLLEEEELLEEEEELLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLHHHHHH
Query QGYTTQGDTDLLGMGVSAISMIGDCYAQNQKELKQYYQQVDEQGNALWRGIALTRDDCIR  360
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct QGYTTQGDTDLLGMGVSAISMIGDCYAQNQKELKQYYQQVDEQGNALWRGIALTRDDCIR  360
DSSP  LLEELLLLLEEEEELLLLEEEELLEEEEELLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLEEEHHHHHHHLLLLHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLEEELLLEEEELLLLH
Query RDVIKSLICNFRLDYSPIEQQWDLLFADYFAEDLKLLAPLAKDGLVDVDEKGIQVTAKGR  420
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct RDVIKSLICNFRLDYSPIEQQWDLLFADYFAEDLKLLAPLAKDGLVDVDEKGIQVTAKGR  420
DSSP  HHHHHHHHHHLEEEHHHHHHHLLLLHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLEEELLLEEEELLLLH


DSSP  HHHHHHHHLLLLLL
Query LLIRNICMCFDTYL  434
ident ||||||||||||||
Sbjct LLIRNICMCFDTYL  434
DSSP  HHHHHHHHLLLLLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  ..LLLLL.LLLLlllllllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeeleelllll
Query ..QQIDW.DLALikyytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipfchklcy   57
ident      |                                                      
Sbjct qqIDWDLaLIKY.ytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipfchklcyfc   59
DSSP  llLLLLLlLLLL.llllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeeleelllllll


DSSP  lllllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhhhhhhhh
Query fcgcnkivtrqqhkadqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkaqisrlm  117
ident                                                             
Sbjct gcnkivtrqqhkadqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkaqisrlmkl  119
DSSP  lllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhlleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhlllleEEEEEELLL.HHHHhhhlLLL
Query kllrenfqfnadaeisievdpreieldvldhlraegfnrLSMGVQDFN.KEVQrlvnREQ  176
ident                                                             
Sbjct lrenfqfnadaeisievdpreieldvldhlraegfnrlsMGVQDFNKEvQRLV....NRE  175
DSSP  hhhhlleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhlllleeeEEEELLLHHhHHHH....LLL


DSSP  LhhhHHHHHHHHHHLL......lLLLEEEEEELlllllhhHHHHHHHHHHHHL......l
Query DeefIFALLNHAREIG......fTSTNIDLIYGlpkqtpeSFAFTLKRVAELN......p  224
ident                        |                                    
Sbjct Q...DEEFIFALLNHAreigftsTNIDLIYGLP......kQTPESFAFTLKRVaelnpdr  226
DSSP  L...LHHHHHHHHHHHhhlllllLEEEEEELLL......lLLHHHHHHHHHHHhhhllle


DSSP  LEEEEEELLLLlllLHHHhhllhhHLLLhhhHHHHHHHHHHHHHHLL.....lEEEElle
Query DRLSVFNYAHLptiFAAQrkikdaDLPSpqqKLDILQETIAFLTQSG.....yQFIGmdh  279
ident                 |                                           
Sbjct LSVFNYAHLPT...IFAA..qrkiKDAD.lpSPQQKLDILQETIAFLtqsgyqFIGM...  277
DSSP  EEEEELLLLLL...LLHH..hhhlLHHH.llLHHHHHHHHHHHHHHHhhllleEEEL...


DSSP  EELLLlhhHHHHHHLL...leelllleellllleeeeelllleeeelleeeeelllhhhh
Query FARPDdelAVAQREGV...lhrnfqgyttqgdtdllgmgvsaismigdcyaqnqkelkqy  336
ident                                                             
Sbjct DHFAR.pdDELAVAQRegvlhrnfqgyttqgdtdllgmgvsaismigdcyaqnqkelkqy  336
DSSP  LEEEL.llLHHHHHHHhllleelllleellllleeeeelllleeeelleeeeelllhhhh


DSSP  hhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhh
Query yqqvdeqgnalwrgialtrddcirrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkl  396
ident                                                             
Sbjct yqqvdeqgnalwrgialtrddcirrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkl  396
DSSP  hhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhh


DSSP  hhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll
Query laplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                                       
Sbjct laplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
DSSP  hhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  llLLLLLlLLLL.llllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeeleelllllll
Query qqIDWDLaLIKY.ytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipfchklcyfc   59
ident      |                                                      
Sbjct ..QQIDW.DLALikyytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipfchklcy   57
DSSP  ..LLLLL.LLLLlllllllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeeleelllll


DSSP  lllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhhhhhhhhhh
Query gcnkivtrqqhkadqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkaqisrlmkl  119
ident                                                             
Sbjct fcgcnkivtrqqhkadqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkaqisrlm  117
DSSP  lllllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhhhhhhhh


DSSP  hhhhlleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhlllleeeEEEELLLHHhHHHH....LLL
Query lrenfqfnadaeisievdpreieldvldhlraegfnrlsMGVQDFNKEvQRLV....NRE  175
ident                                                             
Sbjct kllrenfqfnadaeisievdpreieldvldhlraegfnrLSMGVQDFN.KEVQrlvnREQ  176
DSSP  hhhhhhlleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhlllleEEEEEELLL.HHHHhhhlLLL


DSSP  L...LHHHHHHHHHHHhhlllllLEEEEEELLL......lLLHHHHHHHHHHHhhhllle
Query Q...DEEFIFALLNHAreigftsTNIDLIYGLP......kQTPESFAFTLKRVaelnpdr  226
ident                        |                                    
Sbjct DeefIFALLNHAREIG......fTSTNIDLIYGlpkqtpeSFAFTLKRVAELN......p  224
DSSP  LhhhHHHHHHHHHHLL......lLLLEEEEEELlllllhhHHHHHHHHHHHHL......l


DSSP  EEEEELLLLLL...LLHH..hhhlLHHH.llLHHHHHHHHHHHHHHHhhllleEEEL...
Query LSVFNYAHLPT...IFAA..qrkiKDAD.lpSPQQKLDILQETIAFLtqsgyqFIGM...  277
ident                 |                                           
Sbjct DRLSVFNYAHLptiFAAQrkikdaDLPSpqqKLDILQETIAFLTQSG.....yQFIGmdh  279
DSSP  LEEEEEELLLLlllLHHHhhllhhHLLLhhhHHHHHHHHHHHHHHLL.....lEEEElle


DSSP  LEEEL.llLHHHHHHHhllleelllleellllleeeeelllleeeelleeeeelllhhhh
Query DHFAR.pdDELAVAQRegvlhrnfqgyttqgdtdllgmgvsaismigdcyaqnqkelkqy  336
ident                                                             
Sbjct FARPDdelAVAQREGV...lhrnfqgyttqgdtdllgmgvsaismigdcyaqnqkelkqy  336
DSSP  EELLLlhhHHHHHHLL...leelllleellllleeeeelllleeeelleeeeelllhhhh


DSSP  hhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhh
Query yqqvdeqgnalwrgialtrddcirrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkl  396
ident                                                             
Sbjct yqqvdeqgnalwrgialtrddcirrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkl  396
DSSP  hhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhh


DSSP  hhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll
Query laplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                                       
Sbjct laplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
DSSP  hhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  ..............................................llllllllllllll
Query ..............................................qqidwdlalikyyt   14
ident                                                             
Sbjct qqidwdlalikyytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipfchklcyfcg   60
DSSP  llllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeeleellllllll


DSSP  llllhhhLLLLLL....................................hHHHHHHHLLL
Query syptaleFSEDFG....................................eQAFLQAVARY   38
ident                                                             
Sbjct cnkivtrQQHKADqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkAQISRLMKLL  120
DSSP  llleellLLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhHHHHHHHHHH


DSSP  ........lLLLEEEEEeeleellllllllllleellllhhhhhhhhhHHHHHhHHHHHH
Query ........pERPLSLYVhipfchklcyfcgcnkivtrqqhkadqyldaLEQEIvHRAPLF   90
ident                                                  | |        
Sbjct renfqfnadAEISIEVD..............................pREIEL.DVLDHL  149
DSSP  hhhlleeeeEEEEEEEL..............................lLLLLL.HHHHHH


DSSP  L..LLLEEEEEEeellHHHLL.......hhHHHHHHHHHHHHL...LEEEeEEEEEEELL
Query A..GRHVSQLHWgggtPTYLN.......kaQISRLMKLLRENF...QFNAdAEISIEVDP  138
ident    |                          |       |        |     |      
Sbjct RaeGFNRLSMGV....QDFNKevqrlvnreQDEEFIFALLNHAreiGFTS.TNIDLIYGL  204
DSSP  HhlLLLEEEEEE....ELLLHhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHhhlLLLL.LEEEEEELL


DSSP  LLLLLHHHHHHHHLL......lLEEEEEEELLLhhhhhhHLLLLL.hhHHHHHHHHHHHL
Query REIELDVLDHLRAEG......fNRLSMGVQDFNkevqrlVNREQD.eeFIFALLNHAREI  191
ident                                                      |    | 
Sbjct PKQTPESFAFTLKRVaelnpdrLSVFNYAHLPT.ifaaqRKIKDAdlpSPQQKLDILQET  263
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHhhhllleEEEEELLLLLL.llhhhHHLLHHhllLHHHHHHHHHHH


DSSP  Llllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllllllhhhhhllhhhll
Query Gftstnidliyglpkqtpesfaftlkrvaelnpdrlsvfnyahlptifaaqrkikdadlp  251
ident                                                             
Sbjct I...........................................................  264
DSSP  H...........................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeellllhhhhhhHHLLLEEllllEELLlllee
Query spqqkldilqetiafltqsgyqfigmdhfarpddelavaqREGVLHRnfqgYTTQgdtdl  311
ident                                                             
Sbjct ...........afltqsgyqfigmdhfarpddelavaqreGVLHRNF....QGYT.....  304
DSSP  ...........hhhhhllleeeelleeellllhhhhhhhhLLLEELL....LLEE.....


DSSP  eeelllleeeelleeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhHHHHhhhhhhl
Query lgmgvsaismigdcyaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrgialtrddcirRDVIkslicnf  371
ident                                                     |       
Sbjct ...................................tqgdtdllgmgvsaISMI.......  322
DSSP  ...................................llllleeeeellllEEEE.......


DSSP  eeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeellllhhhHHHH.....
Query rldyspieqqwdllfadyfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtakgrllIRNI.....  426
ident                                                             
Sbjct ........................gdcyaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrGIALtrddc  358
DSSP  ........................lleeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeEEELlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  426
ident                                                             
Sbjct irrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtak  418
DSSP  hhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeelll


DSSP  ........hhllllll
Query ........cmcfdtyl  434
ident                 
Sbjct grllirnicmcfdtyl  434
DSSP  lhhhhhhhhhllllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  llllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeeleellllllll
Query qqidwdlalikyytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipfchklcyfcg   60
ident                                                             
Sbjct ..............................................qqidwdlalikyyt   14
DSSP  ..............................................llllllllllllll


DSSP  llleellLLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhHHHHHHHHHH
Query cnkivtrQQHKADqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkAQISRLMKLL  120
ident                                                             
Sbjct syptaleFSEDFG....................................eQAFLQAVARY   38
DSSP  llllhhhLLLLLL....................................hHHHHHHHLLL


DSSP  hhhlleeeeEEEEEEEL..............................lLLLLL.HHHHHH
Query renfqfnadAEISIEVD..............................pREIEL.DVLDHL  149
ident                                                  | |        
Sbjct ........pERPLSLYVhipfchklcyfcgcnkivtrqqhkadqyldaLEQEIvHRAPLF   90
DSSP  ........lLLLEEEEEeeleellllllllllleellllhhhhhhhhhHHHHHhHHHHHH


DSSP  HhlLLLEEEEEE....ELLLHhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHhhlLLLL.LEEEEEELL
Query RaeGFNRLSMGV....QDFNKevqrlvnreQDEEFIFALLNHAreiGFTS.TNIDLIYGL  204
ident    |                          |       |        |     |      
Sbjct A..GRHVSQLHWgggtPTYLN.......kaQISRLMKLLRENF...QFNAdAEISIEVDP  138
DSSP  L..LLLEEEEEEeellHHHLL.......hhHHHHHHHHHHHHL...LEEEeEEEEEEELL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHhhhllleEEEEELLLLLL.llhhhHHLLHHhllLHHHHHHHHHHH
Query PKQTPESFAFTLKRVaelnpdrLSVFNYAHLPT.ifaaqRKIKDAdlpSPQQKLDILQET  263
ident                                                      |    | 
Sbjct REIELDVLDHLRAEG......fNRLSMGVQDFNkevqrlVNREQD.eeFIFALLNHAREI  191
DSSP  LLLLLHHHHHHHHLL......lLEEEEEEELLLhhhhhhHLLLLL.hhHHHHHHHHHHHL


DSSP  H...........................................................
Query I...........................................................  264
ident                                                             
Sbjct Gftstnidliyglpkqtpesfaftlkrvaelnpdrlsvfnyahlptifaaqrkikdadlp  251
DSSP  Llllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllllllhhhhhllhhhll


DSSP  ...........hhhhhllleeeelleeellllhhhhhhhhLLLEELL....LLEE.....
Query ...........afltqsgyqfigmdhfarpddelavaqreGVLHRNF....QGYT.....  304
ident                                                             
Sbjct spqqkldilqetiafltqsgyqfigmdhfarpddelavaqREGVLHRnfqgYTTQgdtdl  311
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeellllhhhhhhHHLLLEEllllEELLlllee


DSSP  ...................................llllleeeeellllEEEE.......
Query ...................................tqgdtdllgmgvsaISMI.......  322
ident                                                     |       
Sbjct lgmgvsaismigdcyaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrgialtrddcirRDVIkslicnf  371
DSSP  eeelllleeeelleeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhHHHHhhhhhhl


DSSP  ........................lleeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeEEELlhhhh
Query ........................gdcyaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrGIALtrddc  358
ident                                                             
Sbjct rldyspieqqwdllfadyfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtakgrllIRNI.....  426
DSSP  eeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeellllhhhHHHH.....


DSSP  hhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeelll
Query irrdvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtak  418
ident                                                             
Sbjct ............................................................  426
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhllllll
Query grllirnicmcfdtyl  434
ident                 
Sbjct ........cmcfdtyl  434
DSSP  ........hhllllll