No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=12.0

DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleEEEEEEEELlLLLLLLLLLllL
Query rprwtlsqvtelfekplldllfeaqqvhrqhfdprqvqVSTLLSIKTgACPEDCKYCpqS   60
ident                                           ||     |   | ||   
Sbjct ...........................eqikdklgrpiRDLRLSVTD.RCNFRCDYC..M   30
DSSP  ...........................lllllllllllLEEEEELLL.LLLLLLLLL..L


DSSP  LLLLL..lLLLL...LLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLlLLLLllhhHHHHHHH
Query SRYKT..gLEAE...RLMEVEQVLESARKAKAAGSTRFCMGAAWkNPHErdmpYLEQMVQ  115
ident                 |         |      |                    |     
Sbjct PKEVFgddFVFLpknELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEpLMRR....DLDVLIA   86
DSSP  LLLLLlllLLLLlhhHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLhHHLL....LHHHHHH


DSSP  HHHHL..LLEEEEELLL.LLHHHHHHHHHHLLLEEELLLLLLH.HHHHHHLLL.LLHHHH
Query GVKAM..GLEACMTLGT.LSESQAQRLANAGLDYYNHNLDTSP.EFYGNIITT.RTYQER  170
ident              |    |     | |  |||   |  ||         |          
Sbjct KLNQIdgIEDIGLTTNGlLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDdTLFQSINNRnIKATTI  146
DSSP  HHLLLllLLEEEEEELLlLHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLhHHHHHHHLLlLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLEEELLEEEL.lLLLHhHHHHHHHHHHLlLLLLleEEEEELLLLL.lll
Query LDTLEKVRDAGIKVCSGGIVG.lGETVkDRAGLLLQLANlPTPPesVPINMLVKVK.gtp  228
ident |         |  |                   |                    |     
Sbjct LEQIDYATSIGLNVKVNVVIQkgINDD.QIIPMLEYFKD.KHIE..IRFIEFMDVGndng  202
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEEEEELllLLHH.HHHHHHHHHHH.LLLL..EEEEELLLLLllll


DSSP  lllLLLLLHHHHHHHHH................hhHHHL..LLLEEEEElLHHHLLHhhh
Query ladNDDVDAFDFIRTIA................vaRIMM..PTSYVRLSaGREQMNEqtq  270
ident       |        |                               |            
Sbjct wdfSKVVTKDEMLTMIEqhfeidpvepkyfgevakYYRHkdNGVQFGLI.TSVSQSF.cs  260
DSSP  lllLLLLLHHHHHHHHHhhlleeeellllllllleEEEEllLLLEEEEE.LLLLLLL.hh


DSSP  hhhhhhllleeelLLLL......................llllllLHHHH...hhhhhhl
Query amcfmagansifyGCKL......................lttpnpEEDKD...lqlfrkl  305
ident                 |                                           
Sbjct tctrarlssdgkfYGCLfatvdgfnvkafirsgvtdeelkeqfkaLWQIRddrysderta  320
DSSP  hlleeeellllleELLLllllllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhHHHLLlllhhhhhhh


DSSP  lllllll
Query glnpqqt  312
ident        
Sbjct qtvanrq  327
DSSP  hhhhhll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllllllllllll
Query rprwtlsqvtelfekplldllfeaqqvhrqhfdprqvqvstllsiktgacpedckycpqs   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhHHHHhllllEEEEEELLL....................
Query sryktgleaerlmeveqvlesaRKAKaagstRFCMGAAWK....................  100
ident                       |                                     
Sbjct ..............eqikdklgRPIR.....DLRLSVTDRcnfrcdycmpkevfgddfvf   41
DSSP  ..............llllllllLLLL.....EEEEELLLLllllllllllllllllllll


DSSP  ..lllLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LEEEEE...LLLLLhHHHHHHHHH......llLEEE
Query ..nphERDMPYLEQMVQGVKAMG.LEACMT...LGTLSeSQAQRLANA......glDYYN  148
ident                       |      |               |              
Sbjct lpkneLLTFDEMARIAKVYAELGvKKIRITggePLMRR.DLDVLIAKLnqidgiedIGLT  100
DSSP  llhhhLLLHHHHHHHHHHHHHLLlLEEEEElllHHHLL.LHHHHHHHHllllllleEEEE


DSSP  LLLlllhhhhhhhlllllhhHHHHHHHHHHHHHL.EEELLEEE..lLLLL.....hhHHH
Query HNLdtspefygniittrtyqERLDTLEKVRDAGI.KVCSGGIV..gLGET.....vkDRA  200
ident  |                         |  |||                           
Sbjct TNG................lLLKKHGQKLYDAGLrRINVSLDAiddTLFQsinnrniKAT  144
DSSP  ELL................lLHHHHHHHHHHHLLlEEEEELLLllhHHHHhhhllllLHH


DSSP  HHHHHHHLL...LLLLlEEEEEELlllllllllllLLLLHhHHHHHHHHHHHHLllLEEE
Query GLLLQLANL...PTPPeSVPINMLvkvkgtpladnDDVDAfDFIRTIAVARIMMptSYVR  257
ident   | |             |                   |    |               |
Sbjct TILEQIDYAtsiGLNV.KVNVVIQ..........kGINDD.QIIPMLEYFKDKH..IEIR  190
DSSP  HHHHHHHHHhhlLLEE.EEEEEEL..........lLLLHH.HHHHHHHHHHHLL..LLEE


DSSP  EELL..............hHHLL.HHHHH.....................hhhhhLLLEE
Query LSAG..............rEQMN.EQTQA.....................mcfmaGANSI  281
ident                                                             
Sbjct FIEFmdvgndngwdfskvvTKDEmLTMIEqhfeidpvepkyfgevakyyrhkdngVQFGL  250
DSSP  EEELlllllllllllllllLHHHhHHHHHhhlleeeellllllllleeeeellllLEEEE


DSSP  EllllllllLLLLHH.............................................
Query FygckllttPNPEED.............................................  296
ident                                                             
Sbjct I.......tSVSQSFcstctrarlssdgkfygclfatvdgfnvkafirsgvtdeelkeqf  303
DSSP  E.......lLLLLLLhhhlleeeellllleelllllllllllhhhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  ........hhhhhhhhllllllll
Query ........kdlqlfrklglnpqqt  312
ident                         
Sbjct kalwqirddrysdertaqtvanrq  327
DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllllllllllll
Query rprwtlsqvtelfekplldllfeaqqvhrqhfdprqvqvstllsiktgacpedckycpqs   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllHHHHHhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhl
Query sryktgleaerlmeVEQVLesarkakaagstrfcmgaawknpherdmpyleqmvqgvkam  120
ident                                                             
Sbjct ..........eqikDKLGR.........................................    9
DSSP  ..........llllLLLLL.........................................


DSSP  lleEEEELL.................................llLHHHHHHHHHHLLLEE
Query gleACMTLG.................................tlSESQAQRLANAGLDYY  147
ident        |                                        |   |  |    
Sbjct .piRDLRLSvtdrcnfrcdycmpkevfgddfvflpknelltfdeMARIAKVYAELGVKKI   68
DSSP  .llLEEEEEllllllllllllllllllllllllllhhhlllhhhHHHHHHHHHHLLLLEE


DSSP  ELL.lLLLHhhhhhhlllllHHHHHHHHHHHHHH..HLEEELLEEElllllhhHHHHHHH
Query NHN.lDTSPefygniittrtYQERLDTLEKVRDA..GIKVCSGGIVglgetvkDRAGLLL  204
ident                              |                              
Sbjct RITggEPLM...........RRDLDVLIAKLNQIdgIEDIGLTTNG......lLLKKHGQ  111
DSSP  EEEllLHHH...........LLLHHHHHHHHLLLllLLEEEEEELL......lLHHHHHH


DSSP  HHHlLLLLLlEEEEEE......lLLLLlllllLLLLLLhHHHHHHHHHHHHHLllLEEEE
Query QLAnLPTPPeSVPINM......lVKVKgtplaDNDDVDaFDFIRTIAVARIMMptSYVRL  258
ident  |                                           |  |        |  
Sbjct KLY.DAGLR.RINVSLdaiddtlFQSI....nNRNIKA.TTILEQIDYATSIG..LNVKV  162
DSSP  HHH.HHLLL.EEEEELllllhhhHHHH....hLLLLLH.HHHHHHHHHHHHLL..LEEEE


DSSP  eLLHH......hLLHHHHHHHHHHLLLeEELLLLL........llllllLHHHHHHHHHH
Query sAGRE......qMNEQTQAMCFMAGANsIFYGCKL........lttpnpEEDKDLQLFRK  304
ident                             |                      |  |     
Sbjct .NVVIqkginddQIIPMLEYFKDKHIE.IRFIEFMdvgndngwdfskvvTKDEMLTMIEQ  220
DSSP  .EEEElllllhhHHHHHHHHHHHLLLL.EEEEELLllllllllllllllLHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLLLLL....................................................
Query LGLNPQQT....................................................  312
ident                                                             
Sbjct HFEIDPVEpkyfgevakyyrhkdngvqfglitsvsqsfcstctrarlssdgkfygclfat  280
DSSP  HLLEEEELlllllllleeeeellllleeeeelllllllhhhlleeeellllleellllll


DSSP  ...............................................
Query ...............................................  312
ident                                                
Sbjct vdgfnvkafirsgvtdeelkeqfkalwqirddrysdertaqtvanrq  327
DSSP  lllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllllllllllll
Query rprwtlsqvtelfekplldllfeaqqvhrqhfdprqvqvstllsiktgacpedckycpqs   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhl
Query sryktgleaerlmeveqvlesarkakaagstrfcmgaawknpherdmpyleqmvqgvkam  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeelllllhhhHHHHhhhllleeellllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhh
Query gleacmtlgtlsesqAQRLanagldyynhnldtspefygniittrtyqerldtlekvrda  180
ident                                                             
Sbjct ...........eqikDKLG.........................................    8
DSSP  ...........llllLLLL.........................................


DSSP  HLEEELLEEELL.........................LLLHhhHHHHHHHHHLL.LLLLL
Query GIKVCSGGIVGL.........................GETVkdRAGLLLQLANL.PTPPE  214
ident          |                                                  
Sbjct RPIRDLRLSVTDrcnfrcdycmpkevfgddfvflpknELLT..FDEMARIAKVYaELGVK   66
DSSP  LLLLEEEEELLLlllllllllllllllllllllllhhHLLL..HHHHHHHHHHHhHLLLL


DSSP  EEEEEELLllllllllllllLLHHhHHHHHHHHHHHllLLEEEeELLHHHLLHHHHHHHH
Query SVPINMLVkvkgtpladnddVDAFdFIRTIAVARIMmpTSYVRlSAGREQMNEQTQAMCF  274
ident    |                         ||                             
Sbjct KIRITGGE..........plMRRD.LDVLIAKLNQIdgIEDIG.LTTNGLLLKKHGQKLY  114
DSSP  EEEEELLL..........hhHLLL.HHHHHHHHLLLllLLEEE.EEELLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLEEELLLL...........lllllllLHHHHHHHHHHLL.................
Query MAGANSIFYGCK...........llttpnpEEDKDLQLFRKLG.................  306
ident  ||   |                                   |                 
Sbjct DAGLRRINVSLDaiddtlfqsinnrnikatTILEQIDYATSIGlnvkvnvviqkginddq  174
DSSP  HHLLLEEEEELLlllhhhhhhhhlllllhhHHHHHHHHHHHLLleeeeeeeelllllhhh


DSSP  .......llLLLL...............................................
Query .......lnPQQT...............................................  312
ident                                                             
Sbjct iipmleyfkDKHIeirfiefmdvgndngwdfskvvtkdemltmieqhfeidpvepkyfge  234
DSSP  hhhhhhhhhHLLLleeeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhlleeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  312
ident                                                             
Sbjct vakyyrhkdngvqfglitsvsqsfcstctrarlssdgkfygclfatvdgfnvkafirsgv  294
DSSP  lleeeeellllleeeeelllllllhhhlleeeellllleelllllllllllhhhhhhlll


DSSP  .................................
Query .................................  312
ident                                  
Sbjct tdeelkeqfkalwqirddrysdertaqtvanrq  327
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllllllllllll
Query rprwtlsqvtelfekplldllfeaqqvhrqhfdprqvqvstllsiktgacpedckycpqs   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllHHHHHhhhhhhhhl
Query sryktgleaerlmeveqvlesarkakaagstrfcmgaawknpherdMPYLEqmvqgvkam  120
ident                                                             
Sbjct ..........................................eqikDKLGR.........    9
DSSP  ..........................................llllLLLLL.........


DSSP  lleeeeelllllhhhhhhhhhhLLLEEELLLL.............llhhhhhHHLLLLLH
Query gleacmtlgtlsesqaqrlanaGLDYYNHNLD.............tspefygNIITTRTY  167
ident                                                             
Sbjct ......................PIRDLRLSVTdrcnfrcdycmpkevfgddfVFLPKNEL   47
DSSP  ......................LLLEEEEELLllllllllllllllllllllLLLLHHHL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHH....LEEELLEEElllllhhhHHHHHHHHHLLLL...llLEEEEEE
Query QERLDTLEKVRDAG....IKVCSGGIVglgetvkdRAGLLLQLANLPT...ppESVPINM  220
ident                    |    |          |  |    | |              
Sbjct LTFDEMARIAKVYAelgvKKIRITGGE.....plmRRDLDVLIAKLNQidgieDIGLTTN  102
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHhlllLEEEEELLL.....hhhLLLHHHHHHHHLLlllllEEEEEEL


DSSP  llllllllllllllllhhHHHHHHHHHHHHLllLEEEEEL................lhHH
Query lvkvkgtpladnddvdafDFIRTIAVARIMMptSYVRLSA................grEQ  264
ident                                                             
Sbjct ................glLLKKHGQKLYDAG..LRRINVSldaiddtlfqsinnrnikAT  144
DSSP  ................llLHHHHHHHHHHHL..LLEEEEElllllhhhhhhhhlllllHH


DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLEEELLLLlllllllLHHHHHHHHHHLLLL................
Query MNEQTQAMCFMAGANSIFYGCKllttpnpEEDKDLQLFRKLGLN................  308
ident             | |                   |  |                      
Sbjct TILEQIDYATSIGLNVKVNVVIqkginddQIIPMLEYFKDKHIEirfiefmdvgndngwd  204
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEElllllhhHHHHHHHHHHHLLLLeeeeelllllllllll


DSSP  ..................................LLLL......................
Query ..................................PQQT......................  312
ident                                                             
Sbjct fskvvtkdemltmieqhfeidpvepkyfgevakyYRHKdngvqfglitsvsqsfcstctr  264
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhlleeeellllllllleeEEELlllleeeeelllllllhhhlle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  312
ident                                                             
Sbjct arlssdgkfygclfatvdgfnvkafirsgvtdeelkeqfkalwqirddrysdertaqtva  324
DSSP  eeellllleelllllllllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ...
Query ...  312
ident    
Sbjct nrq  327
DSSP  hll