No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=10.4

DSSP  .......................LLLLllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhll
Query .......................QQIDwdlalikyytsyptalefsedfgeqaflqavar   37
ident                         |                                   
Sbjct rprwtlsqvtelfekplldllfeAQQV..........................hrqhfdp   34
DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhHHHH..........................hhhhlll


DSSP  llllleeeEEEEL.EELLLLLLLLlLLEEllllhhhhHHHHhHHHHhhhhhhhhlllleE
Query yperplslYVHIP.FCHKLCYFCGcNKIVtrqqhkadQYLDaLEQEivhraplfagrhvS   96
ident                |   |  |                |                    
Sbjct rqvqvstlLSIKTgACPEDCKYCP.QSSR.yktgleaERLM.EVEQvlesarkakaagsT   91
DSSP  llleeeeeEEEELlLLLLLLLLLL.LLLL.lllllllLLLL.LHHHhhhhhhhhhhlllL


DSSP  EEEEEELLhhHLLHHHHHHHHHhhhhhlleEEEEEEEEEELLllLLLHHHHHHHHLLLLE
Query QLHWGGGTptYLNKAQISRLMKllrenfqfNADAEISIEVDPreIELDVLDHLRAEGFNR  156
ident     |              |              |                 |   |   
Sbjct RFCMGAAW.kNPHERDMPYLEQ..mvqgvkAMGLEACMTLGT..LSESQAQRLANAGLDY  146
DSSP  EEEEEELL.lLLLLLLHHHHHH..hhhhhhHLLLEEEEELLL..LLHHHHHHHHHHLLLE


DSSP  EEEEEELLLHhHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEEELLLlLLHHHHHHHH
Query LSMGVQDFNKeVQRLVNREQDEEFIFALLNHAREIGFTsTNIDLIYGLPkQTPESFAFTL  216
ident                             |   |  |        | ||   |    |  |
Sbjct YNHNLDTSPE.FYGNIITTRTYQERLDTLEKVRDAGIK.VCSGGIVGLG.ETVKDRAGLL  203
DSSP  EELLLLLLHH.HHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLE.EELLEEELLL.LLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHH..LLLEEEEEELLLLlllLHHHhHLLHhhLLLHhhhHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query KRVAEL..NPDRLSVFNYAHLptiFAAQrKIKDadLPSPqqkLDILQETIAFLTQSGY..  272
ident    | |   |                                      |||         
Sbjct LQLANLptPPESVPINMLVKV...KGTP.LADN..DDVD...AFDFIRTIAVARIMMPts  254
DSSP  HHHHLLllLLLEEEEEELLLL...LLLL.LLLL..LLLL...HHHHHHHHHHHHHHLLll


DSSP  ......................EEEELleeellllhhhhhhhhlllEELLLleellllle
Query ......................QFIGMdhfarpddelavaqregvlHRNFQgyttqgdtd  310
ident                                                             
Sbjct yvrlsagreqmneqtqamcfmaGANSI..................fYGCKL.........  287
DSSP  eeeeellhhhllhhhhhhhhhhLLLEE..................eLLLLL.........


DSSP  eeeelllleeeelleeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhHHHHHhhH
Query llgmgvsaismigdcyaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrgialtrddcirrdVIKSLicN  370
ident                                                             
Sbjct ............................................lttpnpeeDKDLQ..L  301
DSSP  ............................................lllllllhHHHHH..H


DSSP  LEEehhhhhhhllllhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleEEELlllhhhhhhhhhll
Query FRLdyspieqqwdllfadyfaedlkllaplakdglvdvdekgIQVTakgrllirnicmcf  430
ident ||                                                          
Sbjct FRK.......................................LGLN..............  308
DSSP  HHH.......................................LLLL..............


DSSP  llll
Query dtyl  434
ident     
Sbjct pqqt  312
DSSP  llll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  ....................................................llllllll
Query ....................................................qqidwdla    8
ident                                                             
Sbjct rprwtlsqvtelfekplldllfeaqqvhrqhfdprqvqvstllsiktgacpedckycpqs   60
DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllllllllllll


DSSP  lllllllLLLH....................hhllllllhhhHHHHHL.........lll
Query likyytsYPTA....................lefsedfgeqaFLQAVA.........ryp   39
ident                                                             
Sbjct sryktglEAERlmeveqvlesarkakaagstrfcmgaawknpHERDMPyleqmvqgvkam  120
DSSP  lllllllLLLLlllhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllLLLLHHhhhhhhhhhhhl


DSSP  lllEEEEEEEleellllllllllleellllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHlLLLEEEEE
Query erpLSLYVHIpfchklcyfcgcnkivtrqqhkadqyldaleqeIVHRAPLFaGRHVSQLH   99
ident                                                |            
Sbjct gleACMTLGT................................lSESQAQRLaNAGLDYYN  148
DSSP  lleEEEELLL................................lLHHHHHHHhHHLLLEEE


DSSP  EeellHHHLL........hhHHHHHHHHhhhhlleeeEEEEEEEELLLL.....LLLHHH
Query WgggtPTYLN........kaQISRLMKLlrenfqfnaDAEISIEVDPRE.....IELDVL  146
ident                                                            |
Sbjct H...nLDTSPefygniittrTYQERLDT..lekvrdaGIKVCSGGIVGLgetvkDRAGLL  203
DSSP  L...lLLLLHhhhhhhllllLHHHHHHH..hhhhhhhHLEEELLEEELLlllhhHHHHHH


DSSP  HHHHHL..LLLEEEEEEelllhhhhhHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.lLLLEEEeeel
Query DHLRAE..GFNRLSMGVqdfnkevqrLVNREQDEEFIFALLNHAREIG.fTSTNIDliyg  203
ident   |                         |   |          ||               
Sbjct LQLANLptPPESVPINMlvkvkgtplADNDDVDAFDFIRTIAVARIMMptSYVRLS....  259
DSSP  HHHHLLllLLLEEEEEElllllllllLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLllLEEEEE....


DSSP  lllllhhhhhhHHHHHHHHL...LLEEEEEELlllllllhhhhhllhhhlllhhhhhhHH
Query lpkqtpesfafTLKRVAELN...PDRLSVFNYahlptifaaqrkikdadlpspqqkldIL  260
ident                 |                                           
Sbjct .....agreqmNEQTQAMCFmagANSIFYGCK...................llttpnpEE  295
DSSP  .....llhhhlLHHHHHHHHhhlLLEEELLLL...................lllllllLH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEelleeellllhhhhhhhhllleelllleellllleeeeellllee
Query QETIAFLTQSGYQFIgmdhfarpddelavaqregvlhrnfqgyttqgdtdllgmgvsais  320
ident           |                                                 
Sbjct DKDLQLFRKLGLNPQ.............................................  310
DSSP  HHHHHHHHHLLLLLL.............................................


DSSP  eelleeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhh
Query migdcyaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrgialtrddcirrdvikslicnfrldyspieq  380
ident                                                             
Sbjct ............................................................  310
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll
Query qwdllfadyfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                                                       
Sbjct ....................................................qt  312
DSSP  ....................................................ll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  lLLLL..LLLLLLLllllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleeeeeeelEELLLLLL
Query qQIDW..DLALIKYytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplslyvhipFCHKLCYF   58
ident                                                             
Sbjct rPRWTlsQVTELFE......kplldllfeaqqvhrqhfdprqvqvstllsikTGACPEDC   54
DSSP  lLLLLllLLHHHHH......llhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeeLLLLLLLL


DSSP  LLLLL.......EELLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhHLLHH
Query CGCNK.......IVTRqqhkadqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptYLNKA  111
ident   |                                                         
Sbjct KYCPQssryktgLEAE......................................rLMEVE   76
DSSP  LLLLLlllllllLLLL......................................lLLLHH


DSSP  HHHhhhhhhhhhlleeeeEEEEEEEL...LLLL.LLHHHHHHHHLLL....LEEEEEEel
Query QISrlmkllrenfqfnadAEISIEVD...PREI.ELDVLDHLRAEGF....NRLSMGVqd  163
ident |                                     |                     
Sbjct QVL.....esarkakaagSTRFCMGAawkNPHErDMPYLEQMVQGVKamglEACMTLG..  129
DSSP  HHH.....hhhhhhhhllLLEEEEEElllLLLLlLHHHHHHHHHHHHhlllEEEEELL..


DSSP  llhhhhhhhlllllhhhHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEEE....LLLL.llhhHHHHHHHH
Query fnkevqrlvnreqdeefIFALLNHAREIGFTsTNIDLIY....GLPK.qtpeSFAFTLKR  218
ident                             |                            |  
Sbjct ...............tlSESQAQRLANAGLD.YYNHNLDtspeFYGNiittrTYQERLDT  173
DSSP  ...............llLHHHHHHHHHHLLL.EEELLLLllhhHHHHhllllLHHHHHHH


DSSP  HHHHL...LLEEEEEELLLlllllhhhhhllhhhLLLHHHHHHHHHHHHHhhhHLLL...
Query VAELN...PDRLSVFNYAHlptifaaqrkikdadLPSPQQKLDILQETIAfltQSGY...  272
ident             |                               |               
Sbjct LEKVRdagIKVCSGGIVGL...............GETVKDRAGLLLQLAN...LPTPpes  215
DSSP  HHHHHhhhLEEELLEEELL...............LLLHHHHHHHHHHHHL...LLLLlle


DSSP  .....................................EEEEL.leeellllhhhhhhhhl
Query .....................................QFIGM.dhfarpddelavaqreg  294
ident                                                             
Sbjct vpinmlvkvkgtpladnddvdafdfirtiavarimmpTSYVRlsagreqmneqtqamcfm  275
DSSP  eeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllLLEEEeellhhhllhhhhhhhhh


DSSP  lleELLLleellllleeeeelLLLEEEELleeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeell
Query vlhRNFQgyttqgdtdllgmgVSAISMIGdcyaqnqkelkqyyqqvdeqgnalwrgialt  354
ident                                                             
Sbjct agaNSIF.......ygcklltTPNPEEDK.............................dl  299
DSSP  hllLEEE.......lllllllLLLLLHHH.............................hh


DSSP  hhhHHHHHhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeellleee
Query rddCIRRDvikslicnfrldyspieqqwdllfadyfaedlkllaplakdglvdvdekgiq  414
ident                                                             
Sbjct qlfRKLGL....................................................  307
DSSP  hhhHHLLL....................................................


DSSP  ellllhhhhhhhhhllllll
Query vtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                     
Sbjct ...............npqqt  312
DSSP  ...............lllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.7

DSSP  ................................................llllllllllll
Query ................................................qqidwdlaliky   12
ident                                                             
Sbjct rprwtlsqvtelfekplldllfeaqqvhrqhfdprqvqvstllsiktgacpedckycpqs   60
DSSP  lllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllllllllllll


DSSP  llllllhhhllllllhhhhhhhhllllllleEEEEEELEEllllllllllleellllhhh
Query ytsyptalefsedfgeqaflqavaryperplSLYVHIPFChklcyfcgcnkivtrqqhka   72
ident                                                             
Sbjct sryktgleaerlmeveqvlesarkakaagstRFCMGAAWK....................  100
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllEEEEEELLL....................


DSSP  hhHHHHHHHHHHhhhhhhllLLEEEEEEEellHHHLlhhHHHH..HHHHHHhhlleeeee
Query dqYLDALEQEIVhraplfagRHVSQLHWGggtPTYLnkaQISR..LMKLLRenfqfnada  130
ident                                    |     |                  
Sbjct npHERDMPYLEQ..mvqgvkAMGLEACMT...LGTL...SESQaqRLANAG........l  144
DSSP  llLLLLHHHHHH..hhhhhhHLLLEEEEE...LLLL...LHHHhhHHHHHL........l


DSSP  EEEEEELL..............LLLLLHHHHHHHHLLLLEEEEEEeLLLHhhhhhhllll
Query EISIEVDP..............REIELDVLDHLRAEGFNRLSMGVqDFNKevqrlvnreq  176
ident                           || |   |  |    | |                
Sbjct DYYNHNLDtspefygniittrtYQERLDTLEKVRDAGIKVCSGGI.VGLG......etvk  197
DSSP  LEEELLLLllhhhhhhhlllllHHHHHHHHHHHHHHHLEEELLEE.ELLL......llhh


DSSP  LHHHHHHHHHHhhHLLLLLLEEEEE........ellLLLLhhHHHHHHHHHHHHL.....
Query DEEFIFALLNHarEIGFTSTNIDLI........yglPKQTpeSFAFTLKRVAELN.....  223
ident |       |                                          |        
Sbjct DRAGLLLQLAN..LPTPPESVPINMlvkvkgtpladNDDV..DAFDFIRTIAVARimmpt  253
DSSP  HHHHHHHHHHL..LLLLLLEEEEEElllllllllllLLLL..LHHHHHHHHHHHHhhlll


DSSP  LLEE.EEEELlllllllhhhhhllhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLLeeeelleeel
Query PDRL.SVFNYahlptifaaqrkikdadlpspqqkldILQETIAFLTQSGYqfigmdhfar  282
ident      |                                  | |     |           
Sbjct SYVRlSAGRE.........................qMNEQTQAMCFMAGA..........  278
DSSP  LEEEeELLHH.........................hLLHHHHHHHHHHLL..........


DSSP  lllhhhhhhhhllleelllleellllleeeeelllleeeelleeeeelllhhhhhhhhhh
Query pddelavaqregvlhrnfqgyttqgdtdllgmgvsaismigdcyaqnqkelkqyyqqvde  342
ident                                                             
Sbjct .........................................................nsi  281
DSSP  .........................................................lee


DSSP  hllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhHHHLEEehhhhhhhllllhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query qgnalwrgialtrddcirrdvikslICNFRLdyspieqqwdllfadyfaedlkllaplak  402
ident                                                             
Sbjct fygckllttpnpeedkdlqlfrklgLNPQQT.............................  312
DSSP  ellllllllllllhhhhhhhhhhllLLLLLL.............................


DSSP  llleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll
Query dglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                                 
Sbjct ................................  312
DSSP  ................................


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.2

DSSP  llllllllllllllllllhhhllllllhHHHHHHHLL.LLLL....LEEEeeeeleelll
Query qqidwdlalikyytsyptalefsedfgeQAFLQAVAR.YPER....PLSLyvhipfchkl   55
ident                                          |    |             
Sbjct .............rprwtlsqvtelfekPLLDLLFEAqQVHRqhfdPRQV..........   37
DSSP  .............lllllllllhhhhhlLHHHHHHHHhHHHHhhllLLLL..........


DSSP  lllllllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhllhhhhhh
Query cyfcgcnkivtrqqhkadqyldaleqeivhraplfagrhvsqlhwgggtptylnkaqisr  115
ident                                                             
Sbjct ............................................................   37
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlleeeeeEEEEEELL...........................LLLL..LHHH
Query lmkllrenfqfnadaEISIEVDP...........................REIE..LDVL  146
ident                  |                                 | |  |   
Sbjct ...............QVSTLLSIktgacpedckycpqssryktgleaerlMEVEqvLESA   82
DSSP  ...............EEEEEEEEellllllllllllllllllllllllllLLHHhhHHHH


DSSP  HHHHHLLLLEEEEEE..eLLLHhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEEEll
Query DHLRAEGFNRLSMGV..qDFNKevqrlvnreqDEEFIFALLNHAREIGFTsTNIDLIYgl  204
ident     | |  |  ||                  |              |       |    
Sbjct RKAKAAGSTRFCMGAawkNPHE.........rDMPYLEQMVQGVKAMGLE.ACMTLGT..  130
DSSP  HHHHHLLLLEEEEEElllLLLL.........lLHHHHHHHHHHHHHLLLE.EEEELLL..


DSSP  llllhhhhhhHHHHHHHHL...LLEEEEEELLLlllllhhhhhllhhhlllhHHHHHHHH
Query pkqtpesfafTLKRVAELN...PDRLSVFNYAHlptifaaqrkikdadlpspQQKLDILQ  261
ident                  |     |                                    
Sbjct .........lSESQAQRLAnagLDYYNHNLDTS..........pefygniitTRTYQERL  171
DSSP  .........lLHHHHHHHHhhlLLEEELLLLLL..........hhhhhhhllLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLL..........................eeEELL.................
Query ETIAFLTQSGY..........................qfIGMD.................  278
ident  |       |                                                  
Sbjct DTLEKVRDAGIkvcsggivglgetvkdraglllqlanlpTPPEsvpinmlvkvkgtplad  231
DSSP  HHHHHHHHHHLeeelleeelllllhhhhhhhhhhhhlllLLLLeeeeeelllllllllll


DSSP  .....eeellllhhhhhhhhllleELLLleellllleeeeELLL...LEEE..ELLEeee
Query .....hfarpddelavaqregvlhRNFQgyttqgdtdllgMGVS...AISM..IGDCyaq  328
ident                                                   |         
Sbjct nddvdafdfirtiavarimmptsyVRLS..........agREQMneqTQAMcfMAGA...  278
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleEEEE..........llHHHLlhhHHHHhhHHLL...


DSSP  elllhhhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhleeehhhhhhhllllhhh
Query nqkelkqyyqqvdeqgnalwrgialtrddcirrdvikslicnfrldyspieqqwdllfad  388
ident                                                             
Sbjct ............................................................  278
DSSP  ............................................................


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhllleeellleeeellllhhhhhhhhhllllll
Query yfaedlkllaplakdglvdvdekgiqvtakgrllirnicmcfdtyl  434
ident                                               
Sbjct ............nsifygckllttpnpeedkdlqlfrklglnpqqt  312
DSSP  ............leeellllllllllllhhhhhhhhhhllllllll