No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.6

DSSP  llllllLLLLLlllEEEEEEEEELLlllhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEE
Query sgisldNSYKMdypEMGLCIIINNKnfhkstgmtsrsGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNK   60
ident               | |  | |  |                |                 |
Sbjct ......YTPVE.ekENGRMIVIVAK............KYEGDIKDFVDWKNQRGLRTEVK   41
DSSP  ......LLLLL.llLLLEEEEEELH............HHHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEE


DSSP  EL......LLHHHHHHHHHHHHLLLLlleeeEEEEEELLEellEEEE...lleeeEHHHH
Query ND......LTREEIVELMRDVSKEDHskrssFVCVLLSHGeegIIFG...tngpvDLKKI  111
ident          |   |                     |                        
Sbjct VAediaspVTANAIQQFVKQEYEKEG..ndlTYVLLVGDH...KDIPakitpgikSDQVY   96
DSSP  EHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLLL..lleEEEEEELLL...LLLLleeelleeELHHH


DSSP  HHLlLLLLlhhhllllEEEEEELL....................................
Query TNFfRGDRcrsltgkpKLFIIQAC....................................  135
ident      |                 |                                    
Sbjct GQI.VGND....hyneVFIGRFSCeskedlktqidrtihyernittedkwlgqalciasa  151
DSSP  HLL.LLLL....llllLEEEEELLllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct eggpsadngesdiqhenvianlltqygytkiikcydpgvtpkniidafnggislvnytgh  211
DSSP  llllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhhllleeeeell


DSSP  .....................................LLLLL..................
Query .....................................RGTEL..................  140
ident                                                             
Sbjct gsetawgtshfgtthvkqltnsnqlpfifdvacvngdFLFSMpcfaealmraqkdgkptg  271
DSSP  lllllllllllllllhhhlllllllleeeeellllllLLLLLllhhhhhhhleelleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  140
ident                                                             
Sbjct tvaiiastidqywappmrgqdemneilcekhpnnikrtfggvtmngmfamvekykkdgen  331
DSSP  lleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .............llllll
Query .............dcgiet  146
ident                    
Sbjct mldtwtvfgdpsllvrtlv  350
DSSP  hhhheeeelllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.5

DSSP  ..............................LLLL..........................
Query ..............................SGIS..........................    4
ident                                                             
Sbjct ytpveekengrmivivakkyegdikdfvdwKNQRglrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhhhhHHHLlleeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    4
ident                                                             
Sbjct qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh


DSSP  ..........lLLLLLlLLLE.EEEEEEEELLLllhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHL
Query ..........lDNSYKmDYPE.MGLCIIINNKNfhkstgmtsrSGTDVDAANLRETFRNL   53
ident                        |    |                               
Sbjct lktqidrtihyERNIT.TEDKwLGQALCIASAE..ggpsadngESDIQHENVIANLLTQY  177
DSSP  hhhhhhhhhhhHHLLL.LLLLlLLEEEEEELLL..lllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LL.EEEEEELLLhhHHHHHHHHHHLLlllleeeEEEEEELLEELLEEEElleEEEHHHhH
Query KY.EVRNKNDLTreEIVELMRDVSKEdhskrssFVCVLLSHGEEGIIFGtngPVDLKKiT  112
ident  |       |           |                  || |                
Sbjct GYtKIIKCYDPG..VTPKNIIDAFNG.....giSLVNYTGHGSETAWGT..sHFGTTH.V  227
DSSP  LLlEEEEEELLL..LLHHHHHHHHHH.....llLEEEEELLLLLLLLLL..lLLLLLL.H


DSSP  HLLlllLLHHHlllLEEEEEELLL....................................
Query NFFrgdRCRSLtgkPKLFIIQACR....................................  136
ident                      ||                                     
Sbjct KQL...TNSNQ...LPFIFDVACVngdflfsmpcfaealmraqkdgkptgtvaiiastid  281
DSSP  HHL...LLLLL...LLEEEEELLLllllllllllhhhhhhhleelleelllleeeeelll


DSSP  ...........................................lllLLLL..........
Query ...........................................gteLDCG..........  143
ident                                                             
Sbjct qywappmrgqdemneilcekhpnnikrtfggvtmngmfamvekykkDGENmldtwtvfgd  341
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhheeeell


DSSP  ......lll
Query ......iet  146
ident          
Sbjct psllvrtlv  350
DSSP  lllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.6

DSSP  llllLLLLLLLLLlEEEEEEEEElllllhhhlllllllhhhHHHHHHHHHHHLL.....L
Query sgisLDNSYKMDYpEMGLCIIINnknfhkstgmtsrsgtdvDAANLRETFRNLK.....Y   55
ident                    |                                        
Sbjct ....YTPVEEKEN.GRMIVIVAK.................kYEGDIKDFVDWKNqrglrT   38
DSSP  ....LLLLLLLLL.LEEEEEELH.................hHHHHLHHHHHHHHhllleE


DSSP  EEEEEE..LLLHhhHHHHHHHHHLLLL....LLEEEEEEEEELLeelleeeelleeeehH
Query EVRNKN..DLTReeIVELMRDVSKEDH....SKRSSFVCVLLSHgeegiifgtngpvdlK  109
ident ||                     |               |                   |
Sbjct EVKVAEdiASPV..TANAIQQFVKQEYekegNDLTYVLLVGDHK.....dipakitpgiK   91
DSSP  EEEEHHhhLLLL..LHHHHHHHHHHHHhlllLLEEEEEEELLLL.....lllleeelleE


DSSP  HHHHLLLLLllhhhLLLLEEEEEEL...................................
Query KITNFFRGDrcrslTGKPKLFIIQA...................................  134
ident                                                             
Sbjct SDQVYGQIVgndhyNEVFIGRFSCEskedlktqidrtihyernittedkwlgqalciasa  151
DSSP  ELHHHHLLLlllllLLLEEEEELLLlhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  134
ident                                                             
Sbjct eggpsadngesdiqhenvianlltqygytkiikcydpgvtpkniidafnggislvnytgh  211
DSSP  llllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhhllleeeeell


DSSP  ......................................LLLL..................
Query ......................................CRGT..................  138
ident                                                             
Sbjct gsetawgtshfgtthvkqltnsnqlpfifdvacvngdfLFSMpcfaealmraqkdgkptg  271
DSSP  lllllllllllllllhhhlllllllleeeeelllllllLLLLllhhhhhhhleelleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  138
ident                                                             
Sbjct tvaiiastidqywappmrgqdemneilcekhpnnikrtfggvtmngmfamvekykkdgen  331
DSSP  lleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........llllllll
Query ...........eldcgiet  146
ident                    
Sbjct mldtwtvfgdpsllvrtlv  350
DSSP  hhhheeeelllllllllll


No 4: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ytpveekengrmivivakkyegdikdfvdwknqrglrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhhhhhhhllleeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................k    1
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Sbjct qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh


DSSP  LLLLL.......................................................
Query IPVDA.......................................................    6
ident                                                             
Sbjct LKTQIdrtihyernittedkwlgqalciasaeggpsadngesdiqhenvianlltqygyt  180
DSSP  HHHHHhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    6
ident                                                             
Sbjct kiikcydpgvtpkniidafnggislvnytghgsetawgtshfgtthvkqltnsnqlpfif  240
DSSP  eeeeeelllllhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllllllllllhhhlllllllleee


DSSP  ...............................LEEEEEllllLLLLLEellleEHHHHHHH
Query ...............................DFLYAYstapGYYSWRnskdgSWFIQSLC   35
ident                                                             
Sbjct dvacvngdflfsmpcfaealmraqkdgkptgTVAIIA...sTIDQYW.....APPMRGQD  292
DSSP  eelllllllllllllhhhhhhhleelleellLLEEEE...eLLLLLL.....LHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLL.....LLLH.HHHHHHHHHHHHHHLLLllllhhhlllLLLL...EEEELlll
Query AMLKQYAD.....KLEF.MHILTRVNRKVATEFESfsfdatfhakKQIP...CIVSMltk   86
ident  |                                                          
Sbjct EMNEILCEkhpnnIKRTfGGVTMNGMFAMVEKYKK........dgENMLdtwTVFGD.ps  343
DSSP  HHHHHHLLlllllLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHHH........hhHHHHhheEEELL.ll


DSSP  LLLLLL.
Query ELYFYH.   92
ident  |     
Sbjct LLVRTLv  350
DSSP  LLLLLLl