No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=10.8

DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhHHHHhhllleeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh
Query ytpveekengrmivivakkyegdikdfVDWKnqrglrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
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Sbjct ....................rvarmpvDRNA.............................   11
DSSP  ....................lllllllLLLL.............................


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh
Query qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
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Sbjct ............................................................   11
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhHHHHhlLLLLLllLLEEEEEELLL.lllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query lktqidrtIHYErnITTEDkwLGQALCIASAE.ggpsadngESDIQHENVIANLLTQYGY  179
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Sbjct ........PYYN..MNHKH..RGMAIIFNHEHfdihslksrTGTNVDSDNLSKVLKTLGF   59
DSSP  ........LLLL..LLLLE..EEEEEEEELLLlllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  lEEEEEELLLL..LHHHHHHHHHH.....llLEEEEELLLLLLLLLL..lLLLLLL.hHH
Query tKIIKCYDPGV..TPKNIIDAFNG.....giSLVNYTGHGSETAWGT..sHFGTTH.vKQ  229
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Sbjct .KVTVFPNLKSeeINKFIQQTAEMdhsdadcLLVAVLTHGELGMLYAkdtHYKPDNlwYY  118
DSSP  .EEEEEELLLHhhHHHHHHHHHLLlllleeeEEEEEELLEELLEEELlllEELLLHhhHL


DSSP  LL......LLLLLLEEEEELLLllllllllllhhhhhhhleeLLEELLLLEEEE..ELLL
Query LT......NSNQLPFIFDVACVngdflfsmpcfaealmraqkDGKPTGTVAIIA..STID  281
ident  |              |  ||                              |        
Sbjct FTadkcptLAGKPKLFFIQACQ......gdrldggitlsrsyRIPVHADFLIAFstVPGY  172
DSSP  LLllllhhHLLLLEEEEEELLL......llllllllllllllLLLLLLLEEEEEllLLLL


DSSP  .LLLL..hhHHHHHHHHHHHLLLlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH........hhH
Query .QYWA..ppMRGQDEMNEILCEKhpnniKRTFGGVTMNGMFAMVEKYKK........dgE  330
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Sbjct fSWRNttrgSWFMQALCEELRYA...gtERDILTLLTFVCQKVALDFESnapdsammhqQ  229
DSSP  lLLEEllleEHHHHHHHHHHHHH...llLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllllhhhllL


DSSP  HHHhhEEEEL.lllLLLLlll
Query NMLdtWTVFG.dpsLLVRtlv  350
ident               |||    
Sbjct KQV..PCITSmltrLLVF.gk  247
DSSP  LLL..LEEEEllllLLLL.ll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  ............lllllllLLLEEEEEELHH...........HHHHLHHHHHHHHHLLLE
Query ............ytpveekENGRMIVIVAKK...........YEGDIKDFVDWKNQRGLR   37
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Sbjct rvarmpvdrnapyynmnhkHRGMAIIFNHEHfdihslksrtgTNVDSDNLSKVLKTLGFK   60
DSSP  lllllllllllllllllllEEEEEEEEELLLlllllllllllHHHHHHHHHHHHHHLLLE


DSSP  EEEEEHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLLL..lleEEEEEELLL....LLLLleeellee
Query TEVKVAediaspVTANAIQQFVKQEYEKEG..ndlTYVLLVGDH....KDIPakitpgik   91
ident   |              |  |  |  |          |                      
Sbjct VTVFPN......LKSEEINKFIQQTAEMDHsdadcLLVAVLTHGelgmLYAK....dthy  110
DSSP  EEEEEL......LLHHHHHHHHHHHHLLLLlleeeEEEEEELLEelleEELL....llee


DSSP  ELHHHHLL.LLLL....llllLEEEEEL................................
Query SDQVYGQI.VGND....hyneVFIGRFS................................  114
ident                                                             
Sbjct KPDNLWYYfTADKcptlagkpKLFFIQAcqgdrldggitlsrsyripvhadfliafstvp  170
DSSP  LLLHHHHLlLLLLlhhhllllEEEEEELllllllllllllllllllllllleeeeellll


DSSP  ..llLHHH..HHHHHHHHHHHHHLLlllllllleeeeeellllllllhhhllhhhhhhhh
Query ..ceSKED..LKTQIDRTIHYERNIttedkwlgqalciasaeggpsadngesdiqhenvi  170
ident                       |                                     
Sbjct gyfsWRNTtrGSWFMQALCEELRYA...................................  195
DSSP  llllLEELllEEHHHHHHHHHHHHH...................................


DSSP  hhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllllllllllhhhl
Query anlltqygytkiikcydpgvtpkniidafnggislvnytghgsetawgtshfgtthvkql  230
ident                                                             
Sbjct ................................................gterdiltlltf  207
DSSP  ................................................lllllhhhhhhh


DSSP  llLLLLleeeeelllllllllllllhhhhhhhleelleeLLLLEEEEelllllllhhhhh
Query tnSNQLpfifdvacvngdflfsmpcfaealmraqkdgkpTGTVAIIAstidqywappmrg  290
ident                                             |               
Sbjct vcQKVA.................ldfesnapdsammhqqKQVPCITS.............  237
DSSP  hhHHHH.................hhllllllllhhhlllLLLLEEEE.............


DSSP  hhhhhhhhllllllLLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelllllllllll
Query qdemneilcekhpnNIKRTfggvtmngmfamvekykkdgenmldtwtvfgdpsllvrtlv  350
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Sbjct ...........mltRLLVF.......................................gk  247
DSSP  ...........lllLLLLL.......................................ll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.2

DSSP  ..lLLLL.......LLLL.LEEEEEELHH................HHHHLHHHHHHHhhl
Query ..yTPVE.......EKEN.GRMIVIVAKK................YEGDIKDFVDWKnqr   34
ident                     |   |                                   
Sbjct rvaRMPVdrnapyyNMNHkHRGMAIIFNHehfdihslksrtgtnvDSDNLSKVLKTL...   57
DSSP  lllLLLLlllllllLLLLlEEEEEEEEELlllllllllllllhhhHHHHHHHHHHHL...


DSSP  llEEEEEEHHhhLLLLL.HHHHHHHHHHHHhlllLLEEEEEEELL.....lllllleeel
Query glRTEVKVAEdiASPVT.ANAIQQFVKQEYekegNDLTYVLLVGD.....hkdipakitp   88
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Sbjct ..GFKVTVFP.nLKSEEiNKFIQQTAEMDH....SDADCLLVAVLthgelgmlyakdthy  110
DSSP  ..LLEEEEEE.lLLHHHhHHHHHHHHLLLL....LLEEEEEEEEElleelleeellllee


DSSP  leEELHHHHLLLlllllLLLEEEEELLLLhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeee
Query giKSDQVYGQIVgndhyNEVFIGRFSCESkedlktqidrtihyernittedkwlgqalci  148
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Sbjct kpDNLWYYFTADkcptlAGKPKLFFIQAC...............................  139
DSSP  llLHHHHLLLLLllhhhLLLLEEEEEELL...............................


DSSP  ellllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhhllleeee
Query asaeggpsadngesdiqhenvianlltqygytkiikcydpgvtpkniidafnggislvny  208
ident                                                             
Sbjct ............................................................  139
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllllllllllllhhhlllllllleeeeelllllllllllllhhhhhhhleelle
Query tghgsetawgtshfgtthvkqltnsnqlpfifdvacvngdflfsmpcfaealmraqkdgk  268
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Sbjct ..................................qgdrldggitlsrsyripvhadflia  165
DSSP  ..................................lllllllllllllllllllllleeee


DSSP  elllleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ptgtvaiiastidqywappmrgqdemneilcekhpnnikrtfggvtmngmfamvekykkd  328
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Sbjct fstvpgyfswrnttrgswfmqalceelryagterdiltlltfvcqkvaldfesnapdsam  225
DSSP  ellllllllleellleehhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhh


DSSP  hhhhhhheeeelllllllllll
Query genmldtwtvfgdpsllvrtlv  350
ident                       
Sbjct mhqqkqvpcitsmltrllvfgk  247
DSSP  hllllllleeeellllllllll