No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=14.4

DSSP  ...............llllllllLLLLLLLLL..lLEEEEEEEEELLLLLLllLLLLLLH
Query ...............rvarmpvdRNAPYYNMN..hKHRGMAIIFNHEHFDIhsLKSRTGT   43
ident                          |  |           | |   | ||      ||| 
Sbjct tssgsegnvklcsleeaqriwkqKSAEIYPIMdksSRTRLALIICNEEFDS..IPRRTGA   58
DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhLLLLLLLLLlllLLLLEEEEEELLLLLL..LLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHLLL.LLLEEEEEEEEELLEELLE
Query NVDSDNLSKVLKTLGFKVTVFPNLKSEEINKFIQQTAEMD.HSDADCLLVAVLTHGELGM  102
ident  ||       |  ||  | |  ||            |    |   |        ||    
Sbjct EVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELEAFAHRPeHKTSDSTFLVFMSHGIREG  118
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHLLHhHHHLLLEEEEEELLEELLE


DSSP  EELLL......LEELLLHHHHLLLLLLLHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLLLLLLlllll
Query LYAKD......THYKPDNLWYYFTADKCPTLAGKPKLFFIQACQGDRLDGGITLSrsyri  156
ident    |                       || |  |||   |||  ||              
Sbjct ICGKKhseqvpDILQLNAIFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQAARGDSPGVVWFKD.....  173
DSSP  EELLLllllllLEELHHHHHHHHLLLLLHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLLLLLL.....


DSSP  llllleeeeellllllllleellleehhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhl
Query pvhadfliafstvpgyfswrnttrgswfmqalceelryagterdiltlltfvcqkvaldf  216
ident                                                             
Sbjct ............................................................  173
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhllllllleeeellllllllll
Query esnapdsammhqqkqvpcitsmltrllvfgk  247
ident                                
Sbjct ...............................  173
DSSP  ...............................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=6.7

DSSP  llllllllllllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query rvarmpvdrnapyynmnhkhrgmaiifnhehfdihslksrtgtnvdsdnlskvlktlgfk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleelleeelllleelllhhhhlll
Query vtvfpnlkseeinkfiqqtaemdhsdadcllvavlthgelgmlyakdthykpdnlwyyft  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhlllleeeeeelllllllllllllllLLLLLLLLLEEEEELLLLLLLLLEELLL
Query adkcptlagkpklffiqacqgdrldggitlsrSYRIPVHADFLIAFSTVPGYFSWRNTTR  180
ident                                         ||    |  |   |||  | 
Sbjct ...............................aIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTM   29
DSSP  ...............................lLLLLLLLLLEEEEELLLLLLLLLEELLL


DSSP  EEHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHhHHHLLllllllhhhlLLLLLLEEE.ELL
Query GSWFMQALCEELRYAGTERDILTLLTFVCQKvALDFEsnapdsammhQQKQVPCIT.SML  239
ident || |   | |         |       |                      | |      |
Sbjct GSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFS.FEQPD..........GRAQMPTTErVTL   78
DSSP  EEHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHH.LLLLL..........LLLLLLEEElLLL


DSSP  LLLLLLLL..
Query TRLLVFGK..  247
ident ||        
Sbjct TRCFYLFPgh   88
DSSP  LLLLLLLLll