No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=9.9

DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhhhhhhhllleeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh
Query ytpveekengrmivivakkyegdikdfvdwknqrglrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh
Query qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
ident                                                             
Sbjct .........................................................gal    3
DSSP  .........................................................lll


DSSP  hhhhhhhhHHHHhlllLLLLlLLEEEEEELLL..lllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHL
Query lktqidrtIHYErnitTEDKwLGQALCIASAE..ggpsadngESDIQHENVIANLLTQYG  178
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Sbjct eslrgnadLAYI...lSMEP.CGHCLIINNVNfcresglrtrTGSNIDCEKLRRRFSSLH   59
DSSP  hhhhhlllLLLL...lLLLL.LEEEEEEELLLllhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LlEEEEEELLL..LLHHHHHHHHHH.....llLEEEEELLLLLL.......LLLL...lL
Query YtKIIKCYDPG..VTPKNIIDAFNG.....giSLVNYTGHGSET.......AWGT...sH  221
ident         |                         |    ||          |        
Sbjct F.MVEVKGDLTakKMVLALLELARQdhgaldcCVVVILSHGCQAshlqfpgAVYGtdgcP  118
DSSP  E.EEEEEELLLhhHHHHHHHHHHHLlllllleEEEEEEEEEELLlllllllEEELllllE


DSSP  LLLLL.hHHLL......LLLLLLEEEEELLLllllllllllhhhhhhhleeLLEEllLLE
Query FGTTH.vKQLT......NSNQLPFIFDVACVngdflfsmpcfaealmraqkDGKPtgTVA  274
ident                          |  ||                        |     
Sbjct VSVEKivNIFNgtscpsLGGKPKLFFIQACG.............atpfqssLPTP.sDIF  164
DSSP  EEHHHhhHLLLllllhhHLLLLEEEEEEEEL.............lllllllLLLL.lLEE


DSSP  EEEElllLLLL.......hhHHHHHHHHHHHLLlllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhh
Query IIAStidQYWA.......ppMRGQDEMNEILCEkhpnnIKRTFGGVTMNGMFAMVEKYkk  327
ident    |                         |                      |   |   
Sbjct VSYS..tFPGFvswrdpksgSWYVETLDDIFEQ...waHSEDLQSLLLRVANAVSVKG..  217
DSSP  EEEE..lLLLLlllllllllLHHHHHHHHHHHH...hlLLLLHHHHHHHHHHHHHLLL..


DSSP  hhHHHHhHEEEEL.lllLLLLlll
Query dgENMLdTWTVFG.dpsLLVRtlv  350
ident            |      |     
Sbjct ..IYKQ.MPGCFNflrkKLFFkts  238
DSSP  ..LLLL.LLLLEEllllLLLLlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.7

DSSP  ...........LLLLL.llLLLEEEEEELH............HHHHHLHHHHHHHHHLLL
Query ...........YTPVE.ekENGRMIVIVAK............KYEGDIKDFVDWKNQRGL   36
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Sbjct galeslrgnadLAYILsmePCGHCLIINNVnfcresglrtrtGSNIDCEKLRRRFSSLHF   60
DSSP  lllhhhhhlllLLLLLlllLLEEEEEEELLlllhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHLLE


DSSP  EEEEEEHHhhllllLHHHHHHHHHHHHHLLLL..leEEEEEELLLLlllleEELL.....
Query RTEVKVAEdiaspvTANAIQQFVKQEYEKEGN..dlTYVLLVGDHKdipakITPG.....   89
ident   |||         ||                      |                     
Sbjct MVEVKGDL......TAKKMVLALLELARQDHGaldcCVVVILSHGC....qASHLqfpga  110
DSSP  EEEEEELL......LHHHHHHHHHHHHHLLLLllleEEEEEEEEEE....lLLLLlllle


DSSP  .......eeELHHHHL.LLLL....lllllLEEEEEL.....................LL
Query .......ikSDQVYGQ.IVGN....dhyneVFIGRFS.....................CE  116
ident          |         |                                        
Sbjct vygtdgcpvSVEKIVNiFNGTscpslggkpKLFFIQAcgatpfqsslptpsdifvsysTF  170
DSSP  eellllleeEHHHHHHlLLLLllhhhllllEEEEEEEelllllllllllllleeeeeeLL


DSSP  LHhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query SKedlktqidrtihyernittedkwlgqalciasaeggpsadngesdiqhenvianlltq  176
ident                                                             
Sbjct PG..........................................................  172
DSSP  LL..........................................................


DSSP  hllleeeeeelllllhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllllllllllhhhlllllll
Query ygytkiikcydpgvtpkniidafnggislvnytghgsetawgtshfgtthvkqltnsnql  236
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Sbjct ............................................................  172
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeelllllllllllllhhhhhhhleelleelllleeeeelllllllhhhhhhhhhhh
Query pfifdvacvngdflfsmpcfaealmraqkdgkptgtvaiiastidqywappmrgqdemne  296
ident                                                             
Sbjct ................................................fvswrdpksgsw  184
DSSP  ................................................lllllllllllh


DSSP  hhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelllllllllll
Query ilcekhpnnikrtfggvtmngmfamvekykkdgenmldtwtvfgdpsllvrtlv  350
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Sbjct yvetlddifeqwahsedlqslllrvanavsvkgiykqmpgcfnflrkklffkts  238
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleelllllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.3

DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhhhhhhhllleeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh
Query ytpveekengrmivivakkyegdikdfvdwknqrglrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh
Query qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhHLLLLL..llllLEEEE.....eelLLLLlllhhhllhHHHHHHHHHH
Query lktqidrtihyeRNITTE..dkwlGQALC.....iasAEGGpsadngesdIQHENVIANL  173
ident                                                       |     
Sbjct .galeslrgnadLAYILSmepcghCLIINnvnfcresGLRT.........RTGSNIDCEK   50
DSSP  .lllhhhhhlllLLLLLLlllleeEEEEElllllhhhLLLL.........LLLHHHHHHH


DSSP  HHHHL.....lLEEEE............................................
Query LTQYG.....yTKIIK............................................  184
ident |                                                           
Sbjct LRRRFsslhfmVEVKGdltakkmvlallelarqdhgaldccvvvilshgcqashlqfpga  110
DSSP  HHHHHhhlleeEEEEElllhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeeeeellllllllle


DSSP  .eELLLLLHhHHHHHHHH.............llLEEEEELllllllllllllllllhhhl
Query .cYDPGVTPkNIIDAFNG.............giSLVNYTGhgsetawgtshfgtthvkql  230
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Sbjct vyGTDGCPV.SVEKIVNIfngtscpslggkpklFFIQACG...........atpfqsslp  158
DSSP  eeLLLLLEE.EHHHHHHLllllllhhhlllleeEEEEEEL...........lllllllll


DSSP  llLLLLLEEEEElllllllllllllhhhhhhhleelleelllleeeeelllllllhHHHH
Query tnSNQLPFIFDVacvngdflfsmpcfaealmraqkdgkptgtvaiiastidqywapPMRG  290
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Sbjct tpSDIFVSYSTF............................................PGFV  174
DSSP  llLLEEEEEELL............................................LLLL


DSSP  .......hHHHHHHHLL.LLLL....lllLLHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhHHHEE.
Query .......qDEMNEILCE.KHPN....nikRTFGGVTMNGMFAmvekykkdgenmLDTWT.  337
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Sbjct swrdpksgSWYVETLDDiFEQWahsedlqSLLLRVANAVSVK............GIYKQm  222
DSSP  llllllllLHHHHHHHHhHHHHlllllhhHHHHHHHHHHHLL............LLLLLl


DSSP  ...eelllllllllll
Query ...vfgdpsllvrtlv  350
ident                 
Sbjct pgcfnflrkklffkts  238
DSSP  llleelllllllllll