No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=16.3

DSSP  llllllllllLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLL.LLLL.......LLLLLLHHHHHHHHHH
Query rvarmpvdrnAPYYNMNHKHRGMAIIFNHEHF.DIHS.......LKSRTGTNVDSDNLSK   52
ident              | |  | ||   | |   |               | ||  |   |  
Sbjct ..........DKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFaKAREkvpklhsIRDRNGTHLDAGALTT   50
DSSP  ..........LLLLLLLLLLLLEEEEEELLLLhHHHHhlhhhllLLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLEELLEEELLL.LEEL
Query VLKTLGFKVTVFPNLKSEEINKFIQQTAEMDHSDADCLLVAVLTHGELGMLYAKD.THYK  111
ident     | |          | |         ||||  ||     | ||  |  |  |     
Sbjct TFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQLMDHSNMDCFICCILSHGDKGIIYGTDgQEAP  110
DSSP  HHHHLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEELLEELLEEELLLlLEEE


DSSP  LLHHHHLLLLLLLHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLllllllllleeeeelllll
Query PDNLWYYFTADKCPTLAGKPKLFFIQACQGDRLDGGITLSRsyripvhadfliafstvpg  171
ident    |   ||  ||| |||||| |||||||||    ||                       
Sbjct IYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPVET...................  151
DSSP  HHHHHHHHLLLLLHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLLLLLLL...................


DSSP  lllleellleehhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhlllll
Query yfswrnttrgswfmqalceelryagterdiltlltfvcqkvaldfesnapdsammhqqkq  231
ident                                                             
Sbjct ............................................................  151
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeellllllllll
Query vpcitsmltrllvfgk  247
ident                 
Sbjct ...............d  152
DSSP  ...............l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=8.2

DSSP  llllllllllllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query rvarmpvdrnapyynmnhkhrgmaiifnhehfdihslksrtgtnvdsdnlskvlktlgfk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleelleeelllleelllhhhhlll
Query vtvfpnlkseeinkfiqqtaemdhsdadcllvavlthgelgmlyakdthykpdnlwyyft  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhlllleeeeeelllllllllllllllLLLLLLLLLEEEEELLLLLLLLLEELLL
Query adkcptlagkpklffiqacqgdrldggitlsrSYRIPVHADFLIAFSTVPGYFSWRNTTR  180
ident                                    ||  ||||    ||    | ||   
Sbjct ................................TRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAE   28
DSSP  ................................LLLLLLLLLEEEEELLLLLLLLLEELLL


DSSP  EEHHHHHHHHHHHHHLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLlllhhhLLLLLLLEEEELL
Query GSWFMQALCEELRYAGT.ERDILTLLTFVCQKVALdFESNApdsammHQQKQVPCITSML  239
ident | |  | ||  ||       |||| || |   |                 || |  |  |
Sbjct GTWYIQSLCQSLRERCPrGDDILTILTEVNYEVSN.KDDKK......NMGKQMPQPTFTL   81
DSSP  EEHHHHHHHHHHHHHHHhLLLHHHHHHHHHHHHHH.LLLLL......LLLLLLLEEEELL


DSSP  LLLLLLLL.
Query TRLLVFGK.  247
ident    |||   
Sbjct RKKLVFPSd   90
DSSP  LLLLLLLLl


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.7

DSSP  llllllllLLLLLLllLLLEEEEEEEEELLL..LLLLL..LLLLlLHHHhHHHHHHHHHH
Query rvarmpvdRNAPYYnmNHKHRGMAIIFNHEH..FDIHS..LKSRtGTNVdSDNLSKVLKT   56
ident                         |                  |   |         | |
Sbjct ........DKVYQMksKPRGYCLIINNHNFAkaREKVPklHSIR.DRNG.THLDAGALTT   50
DSSP  ........LLLLLLllLLLLEEEEEELLLLHhhHHHLHhhLLLL.LLLL.HHHHHHHHHH


DSSP  LL......LEEEEEelllhhHHHHHHHHHHLLL.....llleEEEEEEEElleelleeel
Query LG......FKVTVFpnlkseEINKFIQQTAEMD.....hsdaDCLLVAVLthgelgmlya  105
ident          |                                                  
Sbjct TFeelhfeIKPHDD.....cTVEQIYEILKIYQlmdhsnmdcFICCILSH...gdkgiiy  102
DSSP  HHhhllleEEEEEL.....lLHHHHHHHHHHHHhllllllllEEEEEELL...eelleee


DSSP  llleELLLhhHHLLLlLLLH.......hhlLLLEEEEEElLLLLLlllllllllllllll
Query kdthYKPDnlWYYFTaDKCP.......tlaGKPKLFFIQaCQGDRldggitlsrsyripv  158
ident            |  |                |                            
Sbjct gtdgQEAP..IYELT.SQFTglkcpslagkPKVFFIQACqGDNYQ...............  144
DSSP  llllLEEE..HHHHH.HHHLllllhhhlllLEEEEEELLlLLLLL...............


DSSP  llleeeeellllllllleellleehhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query hadfliafstvpgyfswrnttrgswfmqalceelryagterdiltlltfvcqkvaldfes  218
ident                                                             
Sbjct ............................................................  144
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhHHLLllllleeeellllllllll
Query napdsaMMHQqkqvpcitsmltrllvfgk  247
ident                              
Sbjct .....kGIPV................etd  152
DSSP  .....lLLLL................lll