No 1: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=9.9

DSSP  ...............................LLLHH........................
Query ...............................GALES........................    5
ident                                                             
Sbjct ytpveekengrmivivakkyegdikdfvdwkNQRGLrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhhhhhHHLLLeeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    5
ident                                                             
Sbjct qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh


DSSP  ..hhhlllLLLL...lLLLL.LEEEEEEELLLllhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ..lrgnadLAYI...lSMEP.CGHCLIINNVNfcresglrtrTGSNIDCEKLRRRFSSLH   59
ident           |           |  | |                                
Sbjct lktqidrtIHYErnitTEDKwLGQALCIASAE..ggpsadngESDIQHENVIANLLTQYG  178
DSSP  hhhhhhhhHHHHhlllLLLLlLLEEEEEELLL..lllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  E.EEEEEELLLhhHHHHHHHHHHHLllllllEEEEEEEEEEELLlllllllEEELllllE
Query F.MVEVKGDLTakKMVLALLELARQdhgaldCCVVVILSHGCQAshlqfpgAVYGtdgcP  118
ident         |                         |    ||          |        
Sbjct YtKIIKCYDPG..VTPKNIIDAFNG.....gISLVNYTGHGSET.......AWGT...sH  221
DSSP  LlEEEEEELLL..LLHHHHHHHHHH.....lLLEEEEELLLLLL.......LLLL...lL


DSSP  EEHHHhhHLLLllllhhHLLLLEEEEEEEEL.............lllllllLLLL.lLEE
Query VSVEKivNIFNgtscpsLGGKPKLFFIQACG.............atpfqssLPTP.sDIF  164
ident                          |  ||                        |     
Sbjct FGTTH.vKQLT......NSNQLPFIFDVACVngdflfsmpcfaealmraqkDGKPtgTVA  274
DSSP  LLLLL.hHHLL......LLLLLLEEEEELLLllllllllllhhhhhhhleeLLEEllLLE


DSSP  EEEE..lLLLLlllllllllLHHHHHHHHHHHH...hlLLLLHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query VSYS..tFPGFvswrdpksgSWYVETLDDIFEQ...waHSEDLQSLLLRVANAVSVKG..  217
ident    |                         |                      |   |   
Sbjct IIAStidQYWA.......ppMRGQDEMNEILCEkhpnnIKRTFGGVTMNGMFAMVEKYkk  327
DSSP  EEEElllLLLL.......hhHHHHHHHHHHHLLlllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ..LLLL.LLLLEELlllLLLLlll
Query ..IYKQ.MPGCFNFlrkKLFFkts  238
ident            |      |     
Sbjct dgENMLdTWTVFGD.psLLVRtlv  350
DSSP  hhHHHHhHEEEELL.llLLLLlll


No 2: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.7

DSSP  lllhhhhhllLLLLlllllLLEEEEEEELLlllhhhlllllLLHHHhHHHHHHHHHHLLE
Query galeslrgnaDLAYilsmePCGHCLIINNVnfcresglrtrTGSNIdCEKLRRRFSSLHF   60
ident                      |    |                                 
Sbjct ..........YTPV..eekENGRMIVIVAK...........KYEGD.IKDFVDWKNQRGL   36
DSSP  ..........LLLL..lllLLLEEEEEELH...........HHHHH.LHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEEEELL......LHHHHHHHHHHHHHLLLlllleEEEEEEEEEEllllllllleeell
Query MVEVKGDL......TAKKMVLALLELARQDHgaldcCVVVILSHGCqashlqfpgavygt  114
ident   |||         ||                      |                     
Sbjct RTEVKVAEdiaspvTANAIQQFVKQEYEKEG..ndlTYVLLVGDHK..............   80
DSSP  EEEEEEHHhhllllLHHHHHHHHHHHHHLLL..lleEEEEEELLLL..............


DSSP  llLEEE.......HHHHHHlLLLLllhhhllllEEEEEEEELllllllllllllleeeee
Query dgCPVS.......VEKIVNiFNGTscpslggkpKLFFIQACGatpfqsslptpsdifvsy  167
ident    |                  |                 |                   
Sbjct .dIPAKitpgiksDQVYGQ.IVGN....dhyneVFIGRFSCE..................  116
DSSP  .lLLLEeelleeeLHHHHL.LLLL....lllllLEEEEELLL..................


DSSP  ellLLLLllllllllLHHHHHHHHHHHHH...............................
Query stfPGFVswrdpksgSWYVETLDDIFEQW...............................  196
ident                                                             
Sbjct ...SKED.......lKTQIDRTIHYERNIttedkwlgqalciasaeggpsadngesdiqh  166
DSSP  ...LHHH.......hHHHHHHHHHHHHLLlllllllleeeeeellllllllhhhllhhhh


DSSP  ..........................................................ll
Query ..........................................................ah  198
ident                                                             
Sbjct envianlltqygytkiikcydpgvtpkniidafnggislvnytghgsetawgtshfgtth  226
DSSP  hhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllllllllll


DSSP  lllhhhhhHHHH........hhhhllllLLLL...............LLLE.........
Query sedlqsllLRVA........navsvkgiYKQM...............PGCF.........  226
ident                                                             
Sbjct vkqltnsnQLPFifdvacvngdflfsmpCFAEalmraqkdgkptgtvAIIAstidqywap  286
DSSP  hhhlllllLLLEeeeellllllllllllLHHHhhhhleelleellllEEEEelllllllh


DSSP  ...........................ELLL.........................llll
Query ...........................NFLR.........................kklf  234
ident                                                             
Sbjct pmrgqdemneilcekhpnnikrtfggvTMNGmfamvekykkdgenmldtwtvfgdpsllv  346
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelllllll


DSSP  llll
Query fkts  238
ident     
Sbjct rtlv  350
DSSP  llll


No 3: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ytpveekengrmivivakkyegdikdfvdwknqrglrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhhhhhhhllleeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh


DSSP  .lllhhhhhlllLLLLLLlllleeEEEEElllllhhhLLLL.........LLLHHHHHHH
Query .galeslrgnadLAYILSmepcghCLIINnvnfcresGLRT.........RTGSNIDCEK   50
ident                                                       |     
Sbjct lktqidrtihyeRNITTE..dkwlGQALC.....iasAEGGpsadngesdIQHENVIANL  173
DSSP  hhhhhhhhhhhhHLLLLL..llllLEEEE.....eelLLLLlllhhhllhHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHhhlleeEEEEElllhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeeeeellllllllle
Query LRRRFsslhfmVEVKGdltakkmvlallelarqdhgaldccvvvilshgcqashlqfpga  110
ident |                                                           
Sbjct LTQYG.....yTKIIK............................................  184
DSSP  HHHHL.....lLEEEE............................................


DSSP  eeLLLLLEE.EHHHHHHLllllllhhhlllleeEEEEEEL...........lllllllll
Query vyGTDGCPV.SVEKIVNIfngtscpslggkpklFFIQACG...........atpfqsslp  158
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Sbjct .cYDPGVTPkNIIDAFNG.............giSLVNYTGhgsetawgtshfgtthvkql  230
DSSP  .eELLLLLHhHHHHHHHH.............llLEEEEELllllllllllllllllhhhl


DSSP  llLLEEEEEELL............................................LLLL
Query tpSDIFVSYSTF............................................PGFV  174
ident   |                                                     |   
Sbjct tnSNQLPFIFDVacvngdflfsmpcfaealmraqkdgkptgtvaiiastidqywapPMRG  290
DSSP  llLLLLLEEEEElllllllllllllhhhhhhhleelleelllleeeeelllllllhHHHH


DSSP  llllllllLHHHHHHHHhHHHHlllllhhHHHHHHHHHHHLL............LLLLLl
Query swrdpksgSWYVETLDDiFEQWahsedlqSLLLRVANAVSVK............GIYKQm  222
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Sbjct .......qDEMNEILCE.KHPN....nikRTFGGVTMNGMFAmvekykkdgenmLDTWT.  337
DSSP  .......hHHHHHHHLL.LLLL....lllLLHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhHHHEE.


DSSP  llleelllllllllll
Query pgcfnflrkklffkts  238
ident                 
Sbjct ...vfgdpsllvrtlv  350
DSSP  ...eelllllllllll