No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.5

DSSP  ................LLLLLLLLL.LEEEEEELHH............HHHHLHHHHHHH
Query ................YTPVEEKEN.GRMIVIVAKK............YEGDIKDFVDWK   31
ident                           |   |                    |    |   
Sbjct lqvkpctpefyqthfqLAYRLQSRPrGLALVLSNVHftgekelefrsgGDVDHSTLVTLF   60
DSSP  lllllllhhhhhhhhhHLLLLLLLLlEEEEEEELLLllllllllllllHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLEEEEEEHhhhllllLHHHHHHHHHHHHHLLLL...leEEEEEELLL...LLLLle
Query NQRGLRTEVKVAediaspvTANAIQQFVKQEYEKEGN...dlTYVLLVGDH...KDIPak   85
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Sbjct KLLGYDVHVLCD......qTAQEMQEKLQNFAQLPAHrvtdsCIVALLSHGvegAIYG..  112
DSSP  HHLLEEEEEEEL......lLHHHHHHHHHHHHLLHHHhllleEEEEEELLEellEEEL..


DSSP  eelleeELHHHHLL.LLLL....llllLEEEEELLLlhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query itpgikSDQVYGQI.VGND....hyneVFIGRFSCEskedlktqidrtihyernittedk  140
ident         |   |                     |                         
Sbjct vdgkllQLQEVFQLfDNANcpslqnkpKMFFIQACR........................  148
DSSP  lllleeEHHHHHHHlLLLLlhhhllllEEEEEELLL........................


DSSP  llleeeeeellllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhh
Query wlgqalciasaeggpsadngesdiqhenvianlltqygytkiikcydpgvtpkniidafn  200
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Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hllleeeeelllllllllllllllllhhhlllllllleeeeelllllllllllllhhhhh
Query ggislvnytghgsetawgtshfgtthvkqltnsnqlpfifdvacvngdflfsmpcfaeal  260
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hhleelleelllleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhh
Query mraqkdgkptgtvaiiastidqywappmrgqdemneilcekhpnnikrtfggvtmngmfa  320
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhheeeelllllllllll
Query mvekykkdgenmldtwtvfgdpsllvrtlv  350
ident                               
Sbjct ...................gdetdrgvdqq  159
DSSP  ...................lllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.9

DSSP  lllllllllleeeeeelhhhhhhlhhhhhhhhhllleeeeeehhhhlllllhhhhhhhhh
Query ytpveekengrmivivakkyegdikdfvdwknqrglrtevkvaediaspvtanaiqqfvk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllleeelleeelhhhhllllllllllleeeeellllhhh
Query qeyekegndltyvllvgdhkdipakitpgiksdqvygqivgndhynevfigrfscesked  120
ident                                                             
Sbjct .........................................................lqv    3
DSSP  .........................................................lll


DSSP  hhhhhhhhhhhhHLLLLLLL.lLLEEEEEELLL..lllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query lktqidrtihyeRNITTEDK.wLGQALCIASAE..ggpsadngESDIQHENVIANLLTQY  177
ident                        | ||                            |    
Sbjct kpctpefyqthfQLAYRLQSrpRGLALVLSNVHftgekelefrSGGDVDHSTLVTLFKLL   63
DSSP  llllhhhhhhhhHHLLLLLLllLEEEEEEELLLllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLlEEEEEELLL..LLHHHHHHHHHH......llLEEEEELLLLLLLLLL...lLLLLLL
Query GYtKIIKCYDPG..VTPKNIIDAFNG......giSLVNYTGHGSETAWGT...sHFGTTH  226
ident ||       |                          |    || | |             
Sbjct GY.DVHVLCDQTaqEMQEKLQNFAQLpahrvtdsCIVALLSHGVEGAIYGvdgkLLQLQE  122
DSSP  LE.EEEEEELLLhhHHHHHHHHHHLLhhhhllleEEEEEELLEELLEEELllllEEEHHH


DSSP  .HHHL...LLLLL...LLEEEEELLLllllllllllhhhhhhhleelleelllleeeeel
Query .VKQL...TNSNQ...LPFIFDVACVngdflfsmpcfaealmraqkdgkptgtvaiiast  279
ident                     |  ||                                   
Sbjct vFQLFdnaNCPSLqnkPKMFFIQACR..................................  148
DSSP  hHHHLlllLLHHHlllLEEEEEELLL..................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhheeee
Query idqywappmrgqdemneilcekhpnnikrtfggvtmngmfamvekykkDGENmldtwtvf  339
ident                                                             
Sbjct .............................................gdeTDRG........  155
DSSP  .............................................lllLLLL........


DSSP  lllllllllll
Query gdpsllvrtlv  350
ident            
Sbjct .......vdqq  159
DSSP  .......llll