No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=15.0

DSSP  .....llllllllllLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query .....rvarmpvdrnAPYYNMNHKHRGMAIIFNHEHFDI.HSLKSRTGTNVDSDNLSKVL   54
ident                   |      || |      ||     |  | |  ||   |    
Sbjct lqvkpctpefyqthfQLAYRLQSRPRGLALVLSNVHFTGeKELEFRSGGDVDHSTLVTLF   60
DSSP  lllllllhhhhhhhhHHLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHLLL.LLLEEEEEEEEELLEELLEEELLL.LEELL
Query KTLGFKVTVFPNLKSEEINKFIQQTAEMD.HSDADCLLVAVLTHGELGMLYAKD.THYKP  112
ident | ||  | |       |     |  |    |   |   || | ||  |  |  |      
Sbjct KLLGYDVHVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPaHRVTDSCIVALLSHGVEGAIYGVDgKLLQL  120
DSSP  HHLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHLLHhHHLLLEEEEEEELLEELLEEELLLlLEEEH


DSSP  LHHHHLLLLLLLHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLLLLLLlllllllllleeeeellllll
Query DNLWYYFTADKCPTLAGKPKLFFIQACQGDRLDGGITLSrsyripvhadfliafstvpgy  172
ident       |    || |  ||| |||||| ||  | |                         
Sbjct QEVFQLFDNANCPSLQNKPKMFFIQACRGDETDRGVDQQ.....................  159
DSSP  HHHHHHLLLLLLHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLLLLLL.....................


DSSP  llleellleehhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhllllll
Query fswrnttrgswfmqalceelryagterdiltlltfvcqkvaldfesnapdsammhqqkqv  232
ident                                                             
Sbjct ............................................................  159
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeellllllllll
Query pcitsmltrllvfgk  247
ident                
Sbjct ...............  159
DSSP  ...............


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=8.5

DSSP  llllllllllllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query rvarmpvdrnapyynmnhkhrgmaiifnhehfdihslksrtgtnvdsdnlskvlktlgfk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleelleeelllleelllhhhhlll
Query vtvfpnlkseeinkfiqqtaemdhsdadcllvavlthgelgmlyakdthykpdnlwyyft  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhlllleeeeeelllllllllllllllLLLLLLLLLEEEEELLLLLLLLLEELLL
Query adkcptlagkpklffiqacqgdrldggitlsrSYRIPVHADFLIAFSTVPGYFSWRNTTR  180
ident                                   | |   |         |    ||| |
Sbjct ...............................pKMRLPTRSDMICGYACLKGTAAMRNTKR   29
DSSP  ...............................lLLLLLLLLLEEEEELLLLLLLLLEELLL


DSSP  EEHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLLLhHHLLLLLLLEEEELLL
Query GSWFMQALCEELRYAGTERDILTLLTFVCQKVALdFESNAPDSaMMHQQKQVPCITSMLT  240
ident |||   ||                |  |        |  ||     |  |      | | 
Sbjct GSWYIEALAQVFSERACDMHVADMLVKVNALIKD.REGYAPGT.EFHRCKEMSEYCSTLC   87
DSSP  EEHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLLLL.LLLLLLLLLEEEELLL


DSSP  LLLLLLL....
Query RLLVFGK....  247
ident | |        
Sbjct RHLYLFPghpp   98
DSSP  LLLLLLLllll