No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=20.7

DSSP  .LEEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHH..LLEEEEEEELHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query .CSIVWFRRDLRVEDNPALAAAVRA..GPVIALFVWAPEEEGHYHPGRVSRWWLKNSLAQ   57
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Sbjct tTHLVWFRQDLRLHDNLALAAACRNssARVLALYIATPRQWATHNMSPRQAELINAQLNG   60
DSSP  lEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHLLLllLEEEEEEEELHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLLEEEEELL...LHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query LDSSLRSLGTCLITKRST...DSVASLLDVVKSTGASQIFFNHLYDPLSLVRDHRAKDVL  114
ident |   |   |  |          ||     |         | |  |      ||      |
Sbjct LQIALAEKGIPLLFREVDdfvASVEIVKQVCAENSVTHLFYNYQYEVNERARDVEVERAL  120
DSSP  HHHHHHHLLLLEEEEELLlhhHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  hlLLLEEEEELLLLLLLHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLL.LLLLLLLLLLLLLLlll
Query taQGIAVRSFNADLLYEPWEVTDELGRPFSMFAAFWERCLSM.PYDPESPLLPPKKIisg  173
ident          |       |  |          |  |    |             ||     
Sbjct ..RNVVCEGFDDSVILPPGAVMTGNHEMYKVFTPFKNAWLKRlREGMPECVAAPKVRssg  178
DSSP  ..LLLEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHhHLLLLLLLLLLLLLlll


DSSP  lhhhllllLLLL..........
Query dvskcvadPLVF..........  185
ident          |            
Sbjct siepspsiTLNYprqsfdtahf  200
DSSP  llllllllLLLLllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  ..LEEEEELllllllllhhhhhhhhhlleeeeeeelhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ..CSIVWFRrdlrvednpalaaavragpvialfvwapeeeghyhpgrvsrwwlknslaql   58
ident                                                             
Sbjct ttHLVWFRQ...................................................    9
DSSP  leEEEELLL...................................................


DSSP  hhhhhhlllleeeeelllHHHHhHHHHHHHL.....lLEEEEEL............llLH
Query dsslrslgtclitkrstdSVASlLDVVKSTG.....aSQIFFNH............lyDP  101
ident                                                             
Sbjct ................dlRLHD.NLALAAACrnssarVLALYIAtprqwathnmsprqAE   52
DSSP  ................llLLLL.LHHHHHHLllllleEEEEEEElhhhhhhllllhhhHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLLLL..lhhhlllllllllllhhhhhhhhhlllll
Query LSLVRDHRAKDVLTAQGIAVRSFNADLLY..epwevtdelgrpfsmfaafwerclsmpyd  159
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Sbjct LINAQLNGLQIALAEKGIPLLFREVDDFVasveivkqvcaensvthlfynyqyevnerar  112
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllhhhhhh


DSSP  llllllLLLLLLLLLhhhllLLLLLL..................................
Query pespllPPKKIISGDvskcvADPLVF..................................  185
ident                                                             
Sbjct dveverALRNVVCEG.fddsVILPPGavmtgnhemykvftpfknawlkrlregmpecvaa  171
DSSP  hhhhhhHLLLLEEEE.elllLLLLLLllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  .............................
Query .............................  185
ident                              
Sbjct pkvrssgsiepspsitlnyprqsfdtahf  200
DSSP  lllllllllllllllllllllllllllll