No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=21.0

DSSP  llllllEEEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHLlLEEEEEEEELHHHHLLlllllLLLLHHHH
Query mkhvppTVLVWFRNDLRLHDHEPLHRALKSgLAITAVYCYDPRQFAQthqgfAKTGPWRS   60
ident          |||| |||  |   |  |        |     |             |    
Sbjct ......CSIVWFRRDLRVEDNPALAAAVRA.GPVIALFVWAPEEEGH.....YHPGRVSR   48
DSSP  ......LEEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHH.LLEEEEEEELHHHHLL.....LLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLLEEEEEEELLLLHHHHHHHH
Query NFLQQSVQNLAESLQKVGNKLLVTTG.LPEQVIPQIAKQINAKTIYYHREVTQEELDVER  119
ident   |  |   |  ||   |  |                |   |  |          |    
Sbjct WWLKNSLAQLDSSLRSLGTCLITKRStDSVASLLDVVKSTGASQIFFNHLYDPLSLVRDH  108
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLEEEEELLLLLLLHHHLLLlhHHLLLLHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLL
Query NLVKQLTILGIEAKGYWGSTLCHPEDLPFsiQDLPDLFTKFRKDIEKKKISIRPCFFAPS  179
ident      ||  ||         |  |             |  |                 | 
Sbjct RAKDVLTAQGIAVRSFNADLLYEPWEVTDelGRPFSMFAAFWERCLSMPYDPESPLLPPK  168
DSSP  HHHHHHHLLLLEEEEELLLLLLLHHHLLLllLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLL


DSSP  LLLLLLLLLllLLLLLHhhllllll
Query QLLPSPNIKleLTAPPPeffpqinf  204
ident         |                
Sbjct KIISGDVSKcvADPLVF........  185
DSSP  LLLLLLHHHllLLLLLL........


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  lllllLEEEEEELllllllllhhhhhhhhllleeeeeeeelhhhhlllllllllllhhhh
Query mkhvpPTVLVWFRndlrlhdheplhralksglaitavycydprqfaqthqgfaktgpwrs   60
ident             |                                               
Sbjct .....CSIVWFRR...............................................    8
DSSP  .....LEEEEELL...............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellHHHHhhhHHHHL...leEEEEEEL.........
Query nflqqsvqnlaeslqkvgnkllvttglPEQVipqIAKQI...naKTIYYHR.........  108
ident                                                             
Sbjct ..........................dLRVEdnpALAAAvragpVIALFVWapeeeghyh   42
DSSP  ..........................lLLLLllhHHHHHhhhllEEEEEEElhhhhllll


DSSP  ...lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLlllllhhhllllhhhllllhhhhhhhhh
Query ...eVTQEELDVERNLVKQLTILGIEAKGYWGstlchpedlpfsiqdlpdlftkfrkdie  165
ident                |   |  ||                                    
Sbjct pgrvSRWWLKNSLAQLDSSLRSLGTCLITKRS.tdsvaslldvvkstgasqiffnhlydp  101
DSSP  llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEL.llhhhhhhhhhhhhllleeeeellllh


DSSP  lllllllllLLLL..LLLLLLllllLLLLLLL.HHHLL.....LLLL.............
Query kkkisirpcFFAP..SQLLPSpnikLELTAPP.PEFFP.....QINF.............  204
ident                                  |                          
Sbjct lslvrdhraKDVLtaQGIAVR...sFNADLLYePWEVTdelgrPFSMfaafwerclsmpy  158
DSSP  hhhhhhhhhHHHHhlLLLEEE...eELLLLLLlHHHLLlllllLLLLhhhhhhhhhllll


DSSP  ...........................
Query ...........................  204
ident                            
Sbjct dpespllppkkiisgdvskcvadplvf  185
DSSP  llllllllllllllllhhhllllllll