No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  ........................................llLHHHHHHHHHLLHHH...
Query ........................................mrTELLSKLYDDFGIDQ...   17
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Sbjct mynlhrekifmsynqnkqylednpeiqekielyglnllneviSDNEEEIRADYNEANflh   60
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLHHHHHHHHHHHHhlh


DSSP  ...............llLLLHhhHHHHHHH.HHHHHHHHHLLLHhhhhhhlllllhhhhh
Query ...............lpHTQHgvTSDRLGK.LYEKYILDIFKDIeslkkyntnafpqekd   61
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Sbjct pfwmnyppldrgkmpkgDQIP..WIEVGEKaVGSKLTRLVSQRE................  102
DSSP  hhhllllllllllllllLLLL..LHHHHHHhLHHHHHHHHHLLL................


DSSP  hhhhhhhhllllhhheeEEEEEELLLllllllLLLL.lLEEEEEEE....lLLLEEEEEE
Query isskllkalnldldniiDVSSSDTDLgrtiagGSPK.tDATIRFTF....hNQSSRLVPL  116
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Sbjct .................DITVREIGL......PTGPdeRYLLTSPTiysltNGFTDSIMM  139
DSSP  .................LLEEELLLL......LLLLleEEEEELHHhhhhlLLLLLEEEE


DSSP  EEEEEL......LLLLEEEeelhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhh
Query NIKHSS......KKKVSIAeydvetictgvgisdgelkelirkhqndqsaklftpvqkqr  170
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Sbjct FVDIKSvgprdsDYDLVLS.........................................  158
DSSP  EEEELLllllllLLEEEEL.........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhHHLLL............................lLLLLL....l
Query ltellepyrerfirwcVTLRA............................eKSEGN....i  198
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Sbjct .............pnqVSGNGdwaqleggiqnnqqtiqgprssqiflptiPPLYIlsdgt  205
DSSP  .............hhhLLLLLllllllllllllleeeelllleeeellllLLEEElllll


DSSP  lllLEEEEEEEEL.............LEEEEEEEEEH.HHHH...HHHHHHHHllllhhh
Query lhpDLLIRFQVID.............REYVDVTIKNI.DDYV...SDRIAEGSkarkpgf  241
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Sbjct iapVVHLFIKPIYamrsltkgdtgqsLYKIKLASVPNgLGLFcnpGYAFDSAY.......  258
DSSP  eeeEEEEEEEEEEeehhhlllllleeEEEEEEEEELLhHHHHlllLHHHLHHH.......


DSSP  HLLLEEEELLlLLLLL..EEEEL...................
Query GTGLNWTYASgSKAKK..MQFKG...................  262
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Sbjct KFLFRPGKDD.RTKSLlqKRVRVdlrvldkigprvmtidmdk  299
DSSP  LLLEEELLLL.LLLLLllLLEEEehhhhlllllleeeeelll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.1

DSSP  ...........................................llLHHHHHHHHHlLHHH
Query ...........................................mrTELLSKLYDDfGIDQ   17
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Sbjct mynlhrekifmsynqnkqylednpeiqekielyglnllnevisdnEEEIRADYNE.ANFL   59
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlHHHHHHHHHH.HHHL


DSSP  L...LLLLH..........hHHHHHHHHH.HHHHHHHHLLLHHhhhhhlllllhhhhhhh
Query L...PHTQH..........gVTSDRLGKL.YEKYILDIFKDIEslkkyntnafpqekdis   63
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Sbjct HpfwMNYPPldrgkmpkgdqIPWIEVGEKaVGSKLTRLVSQRE.................  102
DSSP  HhhhLLLLLlllllllllllLLLHHHHHHhLHHHHHHHHHLLL.................


DSSP  hhhhhhllllhhheEEEEeeellllllllllLLLLLEEEEEEELLL........LEEEEE
Query skllkalnldldniIDVSssdtdlgrtiaggSPKTDATIRFTFHNQ........SSRLVP  115
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Sbjct ..............DITV........reiglPTGPDERYLLTSPTIysltngftDSIMMF  140
DSSP  ..............LLEE........ellllLLLLLEEEEEELHHHhhhlllllLEEEEE


DSSP  EEEEEELLllleeeeelhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhh
Query LNIKHSSKkkvsiaeydvetictgvgisdgelkelirkhqndqsaklftpvqkqrltell  175
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Sbjct VDIKSVGP................rdsdydlvlspnqvsgngdwaqleggiqnnqqtiqg  184
DSSP  EEELLLLL................llllleeeelhhhlllllllllllllllllleeeel


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllllLEEEEEEEEL.........LEEEEEEEEE.....
Query epyrerfirwcvtlraeksegnilhpDLLIRFQVID.........REYVDVTIKN.....  221
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Sbjct prssqiflptipplyilsdgtiapvvHLFIKPIYAMrsltkgdtgQSLYKIKLASvpngl  244
DSSP  llleeeelllllleeellllleeeeeEEEEEEEEEEhhhllllllEEEEEEEEEEellhh


DSSP  ..............hhhhhhhhhhhhhllllhhhhllleeeelllllllleeeel
Query ..............iddyvsdriaegskarkpgfgtglnwtyasgskakkmqfkg  262
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Sbjct glfcnpgyafdsaykflfrpgkddrtksllqkrvrvdlrvldkigprvmtidmdk  299
DSSP  hhhllllhhhlhhhllleeellllllllllllleeeehhhhlllllleeeeelll