No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  leeeeeeeellhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHHLL.hHHHLL....LLLL..........
Query mrivevyshlngleyiqvhlphiweeiqEIIVSID.aEACRT....ILYS..........   45
ident                                          |                  
Sbjct ..................mqplftqerrIFHKKLLdgNILATnnrgVVSNadgsntrsfn   42
DSSP  ..................lllhhhhhhhHHHHHHHhlLLLLLllllLLLLlllllhhhhh


DSSP  ...................HHHHHHHHHHHHHHL.................LLEEeeeee
Query ...................PVALNEAFKEKLEAK.................GWKEsrtny   69
ident                          ||                                 
Sbjct iakgiadllhsetvserlpGQTSGNAFEAICSEFvqsafeklqhirpgdwnVKQV.....   97
DSSP  hhhhhhhhlllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhllllllleeEEEL.....


DSSP  eelllhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHLLLLL..EEEE..EEEEEEEL.............
Query yvtadpkliretlsLEPEEQKKVIEAAGKEA..LKSY..NQTDFVKD.............  112
ident                      |  |     |  | |      |                 
Sbjct gsrnrleiaryqqyAHLTALAKAAEENPELAaaLGSDytITPDIIVTrnliadaeinrne  157
DSSP  llllllhhhhlhhhLHHHHHHHHHLLLHHHHhhHLLLllLLLLEEEEellllhhhhllll


DSSP  .......................LEEEEEL.LLLHHHHHHHHhLHHHHHHHLL..lLLEE
Query .......................RVAIEVQ.FGKYSFVAYDLfVKHMAFYVSD..kIDVG  146
ident                           |                                 
Sbjct flvdeniatyaslragngnmpllHASISCKwTIRSDRAQNAR.SEGLNLVRNRkgrLPHI  216
DSSP  llllllllllllllllllllleeEEEEEEElLLLLLHHHHHH.HHHHHHHHHLlllLLEE


DSSP  EEEEELHhhhllllllllLHHHHHHHHhlllllLLLLLEEEEEEE...............
Query VEILPMKelskemssgisYYEGELYNVirqgrgVPAVPLVLIGIA...............  191
ident |                                           |               
Sbjct VVVTAEP...........TPSRISSIA.....lGTGEIDCVYHFAlyeleqilqslnyed  260
DSSP  EEEELLL...........LHHHHHHHH.....lLLLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhllhh


DSSP  .........................l
Query .........................p  192
ident                           
Sbjct aldlfyimvngkrlkdisdlpldlav  286
DSSP  hhhhhhhhhhllleeehhhhhhhlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  leeeeeeeellhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhllHHHHLL...................
Query mrivevyshlngleyiqvhlphiweeiqeiivsidAEACRT...................   41
ident                                                             
Sbjct ........................mqplftqerriFHKKLLdgnilatnnrgvvsnadgs   36
DSSP  ........................lllhhhhhhhhHHHHHHhllllllllllllllllll


DSSP  .............................lllLHHHHHHHHHHHHHHL......LLEE..
Query .............................ilySPVALNEAFKEKLEAK......GWKE..   64
ident                                       |      |         |    
Sbjct ntrsfniakgiadllhsetvserlpgqtsgnaFEAICSEFVQSAFEKLqhirpgDWNVkq   96
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHllllllLEEEee


DSSP  .............eEEEE....EELL.LHHHHHHHLlllhhhhhhhhhhllllleeeeee
Query .............sRTNY....YVTA.DPKLIRETLslepeeqkkvieaagkealksynq  106
ident                             | |                             
Sbjct vgsrnrleiaryqqYAHLtalaKAAEeNPELAAALG................sdytitpd  140
DSSP  lllllllhhhhlhhHLHHhhhhHHHLlLHHHHHHHL................llllllll


DSSP  eEEEE................................LLEEEEELLL......LHHHHHH
Query tDFVK................................DRVAIEVQFG......KYSFVAY  128
ident                                                             
Sbjct iIVTRnliadaeinrneflvdeniatyaslragngnmPLLHASISCKwtirsdRAQNARS  200
DSSP  eEEEEllllhhhhllllllllllllllllllllllllLEEEEEEEEEllllllHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHhhllLLLEEEEEEELhhHHLLlllllllhHHHHHHHhlllllllllleeEE
Query DLFVKHMAFyvsdKIDVGVEILPMkeLSKEmssgisyyEGELYNVirqgrgvpavplvLI  188
ident              |                                              
Sbjct EGLNLVRNR....KGRLPHIVVVT..AEPT....psriSSIALGT..........geiDC  240
DSSP  HHHHHHHHL....LLLLLEEEEEE..LLLL....hhhhHHHHLLL..........lllLE


DSSP  EEEL..........................................
Query GIAP..........................................  192
ident                                               
Sbjct VYHFalyeleqilqslnyedaldlfyimvngkrlkdisdlpldlav  286
DSSP  EEELlhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeehhhhhhhlll