No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  llleeeeeelllllhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeee
Query namaihvgiidqdpvrlvtplldhrtvsrhiifigdhtqtviyqrlsdvlnkrnistdff   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeell
Query eipagsntsaiksairelaetlkargeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvep  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeelllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query nsdclcwlypegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalel  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhh
Query gpglatlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfinee  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhllhhhHHHHHHHHHHHLLllleeeeeeEEEEeeeelleeeeEEEEEEEEellEE
Query arrfangewleTLVHSTVKQIQDDmptiqdrslNVQVyrqlgerevrNELDVATVvnnKL  300
ident              |    |                               |         
Sbjct vkvvvdsrelrSEVVKRLKLLGVK.......leVKTL..........DVGDYIIS...ED   40
DSSP  leeeeehhhllLHHHHHHHHLLLE.......eeEELL..........LLLLEELL...LL


DSSP  EEEEEEL..LLLL...LLLL..HHHHHHHHHhhhhhhhLEEEEEELLL..........lL
Query HIIECKT..KGMR...DGDD..TLYKLESLRdllgglqARAMLVSFRP..........lR  343
ident   || |          ||        |            |                    
Sbjct VAIERKSanDLIQsiiDGGLfdQVKRLKEAY.......SRPIMIVEGSlygirnvhpnaI   93
DSSP  EEEEEEEhhHHHHhhhLLLHhhHHHHHHHHL.......LEEEEEEELLllllllllhhhH


DSSP  HHHHHHHH.HHLLEEELHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL
Query HNDITRAE.DLGLALIGPDELKDLKTHLTQWFKAAGGN  380
ident    |     | |   |                |     
Sbjct RGAIAAVTvDFGVPIIFSSTPEETAQYIFLIAKREQEE  131
DSSP  HHHHHHHHhLLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  ......................................LLLEEEEEELL..LLLH...HH
Query ......................................NAMAIHVGIID..QDPV...RL   17
ident                                          ||                |
Sbjct vkvvvdsrelrsevvkrlkllgvklevktldvgdyiisEDVAIERKSANdlIQSIidgGL   60
DSSP  leeeeehhhlllhhhhhhhhllleeeeelllllleellLLEEEEEEEHHhhHHHHhllLH


DSSP  HHHHHL..LLLLLLEEEEEELHH.....hhHHHHHHHHHHH.HLLLEEEEEEllllllhh
Query VTPLLD..HRTVSRHIIFIGDHT.....qtVIYQRLSDVLN.KRNISTDFFEipagsnts   69
ident                 |  |                             |          
Sbjct FDQVKRlkEAYSRPIMIVEGSLYgirnvhpNAIRGAIAAVTvDFGVPIIFSS........  112
DSSP  HHHHHHhhHHLLEEEEEEELLLLllllllhHHHHHHHHHHHhLLLLLEEEEL........


DSSP  hhhhHHHHHHHHHHHHLleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllleeeeee
Query aiksAIRELAETLKARGeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvepnsdclcwly  129
ident        | |                                                  
Sbjct ....TPEETAQYIFLIA...........................................  125
DSSP  ....LHHHHHHHHHHHH...........................................


DSSP  lllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhh
Query pegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalelgpglatlny  189
ident                                                             
Sbjct ............................................................  125
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhhhhhhhhllh
Query lattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfineearrfangew  249
ident                                                             
Sbjct ............................................................  125
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeeelleeeeeeeelll
Query letlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvyrqlgerevrneldvatvvnnklhiiecktkg  309
ident                                                             
Sbjct ............................................................  125
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllllhhhhhhhhhhlleeelhhhhhhhhhh
Query mrdgddtlykleslrdllgglqaramlvsfrplrhnditraedlglaligpdelkdlkth  369
ident                                                             
Sbjct ............................................................  125
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllll
Query ltqwfkaaggn  380
ident            
Sbjct .....kreqee  131
DSSP  .....hhhhhl


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  .....................................LLLEEEEEE....LLLL.....L
Query .....................................NAMAIHVGI....IDQD.....P   14
ident                                                     |       
Sbjct vkvvvdsrelrsevvkrlkllgvklevktldvgdyiiSEDVAIERKsandLIQSiidggL   60
DSSP  leeeeehhhlllhhhhhhhhllleeeeelllllleelLLLEEEEEEehhhHHHHhhlllH


DSSP  HHHHHHHHLllLLLLEEEEEELHH..........hHHHHHHHHHHHHhlllEEEEEELll
Query VRLVTPLLDhrTVSRHIIFIGDHT..........qTVIYQRLSDVLNkrniSTDFFEIpa   64
ident    |  |      || |                                      |    
Sbjct FDQVKRLKE..AYSRPIMIVEGSLygirnvhpnaiRGAIAAVTVDFG....VPIIFSS..  112
DSSP  HHHHHHHHH..HLLEEEEEEELLLlllllllhhhhHHHHHHHHHLLL....LLEEEEL..


DSSP  lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllle
Query gsntsaIKSAIRELAETLKARGeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvepnsdc  124
ident                     |                                       
Sbjct ......TPEETAQYIFLIAKRE......................................  128
DSSP  ......LHHHHHHHHHHHHHHH......................................


DSSP  eeeeelllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query lcwlypegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalelgpgl  184
ident                                                             
Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhhhhhh
Query atlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfineearrf  244
ident                                                             
Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeeelleeeeee
Query angewletlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvyrqlgerevrneldvatvvnnklhiie  304
ident                                                             
Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllllhhhhhhhhhhlleeelhhhhh
Query cktkgmrdgddtlykleslrdllgglqaramlvsfrplrhnditraedlglaligpdelk  364
ident                                                             
Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllll
Query dlkthltqwfkaaggn  380
ident                 
Sbjct .............qee  131
DSSP  .............hhl