No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhh
Query mnkqevilkvqecaawwilerqskltklmsetmsinpfmtpfifdyhslndfdelveaii   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhllEELLHhhhhhllllllhhhHHLLEEEELlLLLE
Query akhlmtghdtgfgklidekilprvfgaYKLDKsyraanepfihpcfDEIDHVIQRdDGRI  120
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Sbjct .........savernivsrlrdkgfavVRAPA..............PIPDIIALK.NGVI   36
DSSP  .........lhhhhhhhhhhhhllleeEELLL..............LLLLEEEEE.LLEE


DSSP  EEEEEE....llLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHhlHHHLlEEEEEELLLLLlllllhhhh
Query ELLSLK....agKWTIqltmAVQLNKAFHEIINnyPGVAdNIVVGVFYGNShgltdkyri  176
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Sbjct ILIEMKsrkdieGKIY...vRREQAEGIIEFAR..KSGG.SLFLGVKKPGV..lkfipfe   88
DSSP  EEEEELleelllLLEE...eLHHHHHHHHHHHH..HHLL.EEEEEEELLLL..eeeeehh


DSSP  lLLLLlllLLLLlllllleeeeelhHHHHHHLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh
Query lRGINtgaNHNVidirdkvhvyagkEFWSWLNNGeaetqhwvlegieravkeadikeknk  236
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Sbjct kLRRT...ETGN....yvadseiegLDLEDLVRL..........................  115
DSSP  hLEEL...LLLL....eelllllllLLHHHHHHH..........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhl
Query dliekfkehvakkyneqvlnadgtaqwhkllemine  272
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Sbjct ..........................veakisrtld  125
DSSP  ..........................hhhhhhhhhl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhh
Query mnkqevilkvqecaawwilerqskltklmsetmsinpfmtpfifdyhslndfdelveaii   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhHHHHHHHHLHHHHhHLLEELlhhhhhhllllllhhhHHLLEEEELlllLE
Query akhlmtghdtGFGKLIDEKILPRvFGAYKLdksyraanepfihpcfDEIDHVIQRddgRI  120
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Sbjct ..........SAVERNIVSRLRD.KGFAVV...........rapapIPDIIALKN...GV   35
DSSP  ..........LHHHHHHHHHHHH.LLLEEE...........ellllLLLEEEEEL...LE


DSSP  EEEEEELLL......LLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhllEEEEEELLLlllllllhh
Query ELLSLKAGK......WTIQLTMAVQLNKAFHEIInnypgvadNIVVGVFYGnshgltdky  174
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Sbjct IILIEMKSRkdiegkIYVRREQAEGIIEFARKSG........GSLFLGVKK..pgvlkfi   85
DSSP  EEEEEELLEelllllEEELHHHHHHHHHHHHHHL........LEEEEEEEL..llleeee


DSSP  hhlllLLLLLlllllllllleeeeeLHHHHHHHLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
Query rilrgINTGAnhnvidirdkvhvyaGKEFWSWLNNgeaetqhwvlegieravkeadikek  234
ident        |                 |                                  
Sbjct pfeklRRTET.....gnyvadseieGLDLEDLVRL.........................  115
DSSP  ehhhlEELLL.....lleellllllLLLHHHHHHH.........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhl
Query nkdliekfkehvakkyneqvlnadgtaqwhkllemine  272
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Sbjct ............................veakisrtld  125
DSSP  ............................hhhhhhhhhl