No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlh
Query mynlhrekifmsynqnkqylednpeiqekielyglnllnevisdneeeiradyneanflh   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllllllllllllllllhhhhhhHLHHHHHHHHHLL....LLLEEELLL......
Query pfwmnyppldrgkmpkgdqipwievgekAVGSKLTRLVSQR....EDITVREIG......  110
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Sbjct ............................XTLEDDLNATNEYyrerGIAVIHKKPtpvqiv   32
DSSP  ............................LLHHHHHHHHHHHhhhlLLLEEEELLlleeee


DSSP  ...................LLLLlleEEEEELHHhhhhlllllLEEEEEEEELLLlllll
Query ...................LPTGpdeRYLLTSPTiysltngftDSIMMFVDIKSVgprds  151
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Sbjct rvdypkrsaaviteayfrqASTT...DYNGVYRG.........KYIDFEAKETKN.....   75
DSSP  eeellllllleeeeeeellLLLL...LEEEEELL.........EEEEEEEEEELL.....


DSSP  LLEEE..ELHHhlllllllllllllllllleeeelllleeeellLLLL..EEELllllEE
Query DYDLV..LSPNqvsgngdwaqleggiqnnqqtiqgprssqiflpTIPP..LYILsdgtIA  207
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Sbjct KTAFPlkNFHA...............................hqIRHXeqVVAH....GG  100
DSSP  LLEEEhhHLLH...............................hhHHHHhhHHHL....LL


DSSP  EEEEEEEEEEeeehhhlllllleeeeEEEEEEELLHhhhhllllhhhlhhhllleeelLL
Query PVVHLFIKPIyamrsltkgdtgqslyKIKLASVPNGlglfcnpgyafdsaykflfrpgKD  267
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Sbjct ICFAILRFSL................LNETYLLDAS..............hliawwnkQE  130
DSSP  EEEEEEEELL................LLEEEEEEHH..............hhhhhhhhHH


DSSP  LLllllllllEEEEHHHHLLLllLEEE..............eelll
Query DRtksllqkrVRVDLRVLDKIgpRVMT..............idmdk  299
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Sbjct AG......grKSIPKQEIERH..GHSIplgyqprldyisvvdnvyf  168
DSSP  HL......llLEEEHHHHHHH..LEELlllllllllhhhhhhhhhl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.6

DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlh
Query mynlhrekifmsynqnkqylednpeiqekielyglnllnevisdneeeiradyneanflh   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllllllllllllllllhHHHHHHLhHHHHHHHHLLlLLEE..............
Query pfwmnyppldrgkmpkgdqipwiEVGEKAVgSKLTRLVSQReDITV..............  106
ident                           |             |  | |              
Sbjct .......................XTLEDDL.NATNEYYRER.GIAVihkkptpvqivrvd   35
DSSP  .......................LLHHHHH.HHHHHHHHHL.LLLEeeelllleeeeeee


DSSP  ...........elllllLLLLEEEEEElhhhhhhllllllEEEEEEEELLLLLLLLLlee
Query ...........reiglpTGPDERYLLTsptiysltngftdSIMMFVDIKSVGPRDSDydl  155
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Sbjct ypkrsaaviteayfrqaSTTDYNGVYR.............GKYIDFEAKETKNKTAFplk   82
DSSP  llllllleeeeeeelllLLLLEEEEEL.............LEEEEEEEEEELLLLEEehh


DSSP  EELHHHLLlllllllllllllllleeeelllleeeelllLLLEEellllleeEEEEEEEE
Query VLSPNQVSgngdwaqleggiqnnqqtiqgprssqiflptIPPLYilsdgtiaPVVHLFIK  215
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Sbjct NFHAHQIR.............................hxEQVVA.......hGGICFAIL  106
DSSP  HLLHHHHH.............................hhHHHHH.......lLLEEEEEE


DSSP  EEEEehhhlllllleeeEEEEEEEELlhhhhhllllhhhlhhhllleEELLlllllllll
Query PIYAmrsltkgdtgqslYKIKLASVPnglglfcnpgyafdsaykflfRPGKddrtksllq  275
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Sbjct RFSL............lNETYLLDAS.........hliawwnkqeagGRKS.........  136
DSSP  EELL............lLEEEEEEHH.........hhhhhhhhhhhlLLLE.........


DSSP  lleeeeHHHHllllllEEEEEL...............ll
Query krvrvdLRVLdkigprVMTIDM...............dk  299
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Sbjct .ipkqeIERH......GHSIPLgyqprldyisvvdnvyf  168
DSSP  .eehhhHHHH......LEELLLlllllllhhhhhhhhhl