No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=9.5

DSSP  ................lhhhhllllhhhhlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhh
Query ................kpfenhlksvddlkttyeeYRAGFIAFALEKNKRstpyierara   44
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Sbjct mdiisksgegnkytinsaiafvayashidinttefSKVLSGLRDFINDEA..........   50
DSSP  llleeelllllleeelhhhhhhhhhhllllllllhHHHHHHHHHHHHHHH..........


DSSP  hhhhhlllllhhhhhhlhhhhhhhhhhllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query lkvaasvaktpkdllylediqdallyasgisdkakkflteddkkesinnlienflepage  104
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Sbjct ............................................................   50
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleeeeelllllll
Query efidelifryllfqgdslGGTMRNIAGALAQQKLTRAIISALDIAnipykwldsrdkkyt  164
ident                    |      |           |                     
Sbjct ..........irlggkisDGSFNKCNGDWYEWLIGIRAIEFFLES...............   85
DSSP  ..........hhhlllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...............


DSSP  leeelllllllhhhheeeeeeeellEEEEEEEEE....EELL..................
Query nwmdkpeddyeletfakgiswtingKHRTLMYNI....TVSL..................  202
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Sbjct ........................eTNFIVVKMPnatsFDVMsiyksclsefiydlrskl  121
DSSP  ........................lLLEEEEELLllllLLHHhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......lLEEEEEEEEELLL...................................LLHH
Query .......vKKNVDICLFNCEP...................................QQPE  220
ident           | |                                              |
Sbjct slnnvnliTSNPDFSIIDIRGrreelksmlkdisfsnislstiseidnlyknfidyAELE  181
DSSP  hhllllllLLLLLEEEEELLLlhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllLLLL


DSSP  HEEEEEEEELLllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........LLLEEEEEELLLL
Query KYLLLGELKGGidpagADEHWKTANTALTRIRNKFSEKG........LSPKTIFIGAAIE  272
ident         |                                                 | 
Sbjct HIKSFLSVKTT....fRPDRRLQLAHEGSLMKALYTHLQtrtwtinpTGIRYYAAATSIG  237
DSSP  LEEEEEEELLL....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllLLLEEEEEELLLL


DSSP  HHHHHHHHHH.........hHHLL.LLEEEELLLHHHHHHHHHHHHll
Query HSMAEEIWDQ.........lQSGS.LTNSANLTKTEQVGSLCRWIIni  310
ident                        |             | |    |   
Sbjct NADVIGLKTVathsitdvksLPQSaVDEIFKINSVLDVDSCLSHIL..  283
DSSP  HHHHHHHLLLlhhhhlllllLLLLlLLEEEELLLHHHHHHHHHHHL..


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=2.2

DSSP  lhhhhllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhh
Query kpfenhlksvddlkttyeeyragfiafaleknkrstpyieraralkvaasvaktpkdlly   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lediqdallyasgisdkakkflteddkkesinnlienflepageefidelifryllfqgd  120
ident                                                             
Sbjct ...mdiisksgegnkytinsaiafvayashidinttefskvlsglrdfindeairlggki   57
DSSP  ...llleeelllllleeelhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHlllleeeeelllllllleeelllllllhhhhe
Query slggtmrniagalAQQKLTRAIISALDIanipykwldsrdkkytnwmdkpeddyeletfa  180
ident                    |||   |                                  
Sbjct sdgsfnkcngdwyEWLIGIRAIEFFLES................................   85
DSSP  lhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHL................................


DSSP  eeeeeeelleeeEEEE............eEEELLLL.....................eee
Query kgiswtingkhrTLMY............nITVSLVK.....................knv  207
ident                              |  |                           
Sbjct ..........etNFIVvkmpnatsfdvmsIYKSCLSefiydlrsklslnnvnlitsnpdf  135
DSSP  ..........llLEEEeellllllllhhhHLLHHHHhhhhhhhhhhhhllllllllllle


DSSP  EEEEEELLL...............................llhhhEEEEEEEELLL....
Query DICLFNCEP...............................qqpekYLLLGELKGGI....  232
ident  |                                                 |        
Sbjct SIIDIRGRReelksmlkdisfsnislstiseidnlyknfidyaelEHIKSFLSVKTtfrp  195
DSSP  EEEELLLLHhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllLLEEEEEEELLlllh


DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLLLLEEEEEEL......llLHHHHHH.......
Query .DPAGADEHWKTANTALTRIRNKfSEKGLSPKTIFIGA......aiEHSMAEE.......  278
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Sbjct dRRLQLAHEGSLMKALYTHLQTR.TWTINPTGIRYYAAatsignadVIGLKTVathsitd  254
DSSP  hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLLLLEEEEEellllhhhHHHHLLLlhhhhll


DSSP  ..hHHHHhhlllleEEELLL......hHHHHHHHhhhhll
Query ..iWDQLqsgsltnSANLTK......tEQVGSLCrwiini  310
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Sbjct vksLPQS.....avDEIFKInsvldvdSCLSHIL......  283
DSSP  lllLLLL.....llLEEEELllhhhhhHHHHHHL......