No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct namaihvgiidqdpvrlvtplldhrtvsrhiifigdhtqtviyqrlsdvlnkrnistdff   60
DSSP  llleeeeeelllllhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eipagsntsaiksairelaetlkargeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvep  120
DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nsdclcwlypegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalel  180
DSSP  llleeeeeelllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gpglatlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfinee  240
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhh


DSSP  leeeeehhhllLHHHHHHHHLLLE.......eeEELL..........LLLLEELL...LL
Query vkvvvdsrelrSEVVKRLKLLGVK.......leVKTL..........DVGDYIIS...ED   40
ident              |    |                               |         
Sbjct arrfangewleTLVHSTVKQIQDDmptiqdrslNVQVyrqlgerevrNELDVATVvnnKL  300
DSSP  hhhhhhllhhhHHHHHHHHHHHLLllleeeeeeEEEEeeeelleeeeEEEEEEEEellEE


DSSP  EEEEEEEhhHHHHhhhLLLHhhHHHHHHHHL.......LEEEEEEELLllllllllhhhH
Query VAIERKSanDLIQsiiDGGLfdQVKRLKEAY.......SRPIMIVEGSlygirnvhpnaI   93
ident   || |          ||        |            |                    
Sbjct HIIECKT..KGMR...DGDD..TLYKLESLRdllgglqARAMLVSFRP..........lR  343
DSSP  EEEEEEL..LLLL...LLLL..HHHHHHHHHhhhhhhhLEEEEEELLL..........lL


DSSP  HHHHHHHHhLLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query RGAIAAVTvDFGVPIIFSSTPEETAQYIFLIAKREQEE  131
ident    |     | |   |                |     
Sbjct HNDITRAE.DLGLALIGPDELKDLKTHLTQWFKAAGGN  380
DSSP  HHHHHHHH.HHLLEEELHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  leeeeehhhlllhhhhhhhhllleeeeelllllleellLLEEEEEEEHHhhHHHHhllLH
Query vkvvvdsrelrsevvkrlkllgvklevktldvgdyiisEDVAIERKSANdlIQSIidgGL   60
ident                                          ||                |
Sbjct ......................................NAMAIHVGIID..QDPV...RL   17
DSSP  ......................................LLLEEEEEELL..LLLH...HH


DSSP  HHHHHHhhHHLLEEEEEEELLLLllllllhHHHHHHHHHHHhLLLLLEEEEL........
Query FDQVKRlkEAYSRPIMIVEGSLYgirnvhpNAIRGAIAAVTvDFGVPIIFSS........  112
ident                 |  |                             |          
Sbjct VTPLLD..HRTVSRHIIFIGDHT.....qtVIYQRLSDVLN.KRNISTDFFEipagsnts   69
DSSP  HHHHHL..LLLLLLEEEEEELHH.....hhHHHHHHHHHHH.HLLLEEEEEEllllllhh


DSSP  ....LHHHHHHHHHHHH...........................................
Query ....TPEETAQYIFLIA...........................................  125
ident        | |                                                  
Sbjct aiksAIRELAETLKARGeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvepnsdclcwly  129
DSSP  hhhhHHHHHHHHHHHHLleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  125
ident                                                             
Sbjct pegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalelgpglatlny  189
DSSP  lllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  125
ident                                                             
Sbjct lattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfineearrfangew  249
DSSP  hhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhhhhhhhhllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  125
ident                                                             
Sbjct letlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvyrqlgerevrneldvatvvnnklhiiecktkg  309
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeeelleeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  125
ident                                                             
Sbjct mrdgddtlykleslrdllgglqaramlvsfrplrhnditraedlglaligpdelkdlkth  369
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllllhhhhhhhhhhlleeelhhhhhhhhhh


DSSP  .....hhhhhl
Query .....kreqee  131
ident            
Sbjct ltqwfkaaggn  380
DSSP  hhhhhhlllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  leeeeehhhlllhhhhhhhhllleeeeelllllleelLLLEEEEEEehhhHHHHhhlllH
Query vkvvvdsrelrsevvkrlkllgvklevktldvgdyiiSEDVAIERKsandLIQSiidggL   60
ident                                                     |       
Sbjct .....................................NAMAIHVGI....IDQD.....P   14
DSSP  .....................................LLLEEEEEE....LLLL.....L


DSSP  HHHHHHHHH..HLLEEEEEEELLLlllllllhhhHHHHHHHHHHLLL....LLEEEEL..
Query FDQVKRLKE..AYSRPIMIVEGSLygirnvhpnaIRGAIAAVTVDFG....VPIIFSS..  112
ident    |  |      || |                                      |    
Sbjct VRLVTPLLDhrTVSRHIIFIGDHT..........QTVIYQRLSDVLNkrniSTDFFEIpa   64
DSSP  HHHHHHHHLllLLLLEEEEEELHH..........HHHHHHHHHHHHHhlllEEEEEELll


DSSP  ......LHHHHHHHHHHHHHHH......................................
Query ......TPEETAQYIFLIAKRE......................................  128
ident                     |                                       
Sbjct gsntsaIKSAIRELAETLKARGeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvepnsdc  124
DSSP  lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct lcwlypegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalelgpgl  184
DSSP  eeeeelllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct atlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfineearrf  244
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct angewletlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvyrqlgerevrneldvatvvnnklhiie  304
DSSP  hhllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeeelleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct cktkgmrdgddtlykleslrdllgglqaramlvsfrplrhnditraedlglaligpdelk  364
DSSP  eelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllllhhhhhhhhhhlleeelhhhhh


DSSP  .............hhl
Query .............qee  131
ident                 
Sbjct dlkthltqwfkaaggn  380
DSSP  hhhhhhhhhhhlllll