No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  llleeeeeelllllhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeee
Query namaihvgiidqdpvrlvtplldhrtvsrhiifigdhtqtviyqrlsdvlnkrnistdff   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeell
Query eipagsntsaiksairelaetlkargeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvep  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeelllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query nsdclcwlypegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalel  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhh
Query gpglatlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfinee  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hHHHHhLLHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEeEEEEeeeelleeeeEEEEEEEEELLEE
Query aRRFAnGEWLETLVHSTVKQIQddmptiQDRSlNVQVyrqlgerevrNELDVATVVNNKL  300
ident       |   |                                       |       | 
Sbjct .MYRK.GAQAERELIKLLEKHG......FAVV.RSAG.........sKKVDLVAGNGKKY   42
DSSP  .LLHH.HHHHHHHHHHHHHHLL......LEEE.ELHH.........hLLLLEEEELLLLE


DSSP  EEEEEEL.....LLLLllLLHHHHHHHHHHHHHhhhLEEEEEELL.lllhhhhhhHHHHl
Query HIIECKT.....KGMRdgDDTLYKLESLRDLLGglqARAMLVSFR.plrhnditrAEDLg  354
ident   || |                  |       |       |                   
Sbjct LCIEVKVtkkdhLYVG..KRDMGRLIEFSRRFG...GIPVLAVKFlnvgwrfievSPKIe   97
DSSP  EEEEEEEellllEEEL..HHHHHHHHHHHHHHL...LEEEEEEEEllleeeeeelLLLLl


DSSP  leeelHHHHhhhhhHHHHHHHL.llll
Query laligPDELkdlktHLTQWFKA.aggn  380
ident      |         |           
Sbjct kfvftPSSG....vSLEVLLGIqktle  120
DSSP  leeelHHHL....lLHHHHLLHhhlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.7

DSSP  llleeeeeelLLLL.HHHHHHHHL..LLLLLLEEeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhllleE
Query namaihvgiiDQDP.VRLVTPLLD..HRTVSRHIifigdhtqtviyqrlsdvlnkrnisT   57
ident                                                             
Sbjct .........mYRKGaQAERELIKLleKHGFAVVR.........................S   26
DSSP  .........lLHHHhHHHHHHHHHhhHLLLEEEE.........................L


DSSP  EEEellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLEEEEELL..lllhhHHHHHHHHHHHLL...
Query DFFeipagsntsaiksairelaetlkarGEEVKFNAS..cglrhRLLSAYEVFRSYH...  112
ident                                                             
Sbjct AGS..............kkvdlvagngkKYLCIEVKVtkkdhlyVGKRDMGRLIEFSrrf   72
DSSP  HHH..............lllleeeelllLEEEEEEEEelllleeELHHHHHHHHHHHhhh


DSSP  ...LLEEEELLLLlEEEEEEL...........lLLLLEEllllllhhhhhhhllleeell
Query ...WPIFVVEPNSdCLCWLYP...........eGNNDTQvqdritiadyltifgargefn  158
ident        |   |                                                
Sbjct ggiPVLAVKFLNV.GWRFIEVspkiekfvftpsSGVSLE.....................  110
DSSP  lleEEEEEEELLL.EEEEEELlllllleeelhhHLLLHH.....................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhh
Query spqldqqlyqlgerwasnalelgpglatlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlll  218
ident                                                             
Sbjct ............................................................  110
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeelleeeellhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeee
Query sdlveakiasyengiltfineearrfangewletlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvy  278
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Sbjct ............................................................  110
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelleeeeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeee
Query rqlgerevrneldvatvvnnklhiiecktkgmrdgddtlykleslrdllgglqaramlvs  338
ident                                                             
Sbjct ............................................................  110
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhlleeelhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query frplrhnditraedlglaligpdelkdlkthltqwfkaaggn  380
ident                                           
Sbjct ................................vllgiqktle  120
DSSP  ................................hhllhhhlll