No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.1

DSSP  ..........llhhhhhhhhhhlllllllHHHHHHHH.......................
Query ..........kseleekkselrhklkyvpHEYIELIE.......................   27
ident                                   |                         
Sbjct vnhkyilpedwhlrfpsgseiiqyaashyDPDEQLLDrrrveydifllveelhvldiirk   60
DSSP  llllllllhhhhlllllhhhhhhhhhhllLHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ................hlllhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELll
Query ................iarnsTQDRILEMKVMEFFMKVYGYRGKHLggsrkPDGAIYTvg   71
ident                           ||      |                ||       
Sbjct gfgsvdefialansvsnrrksRAGKSLELHLEHLFIEHGLRHFATQ....aPDFLFPS.a  115
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLL....lLLLLLLL.h


DSSP  llllLEEEEEEELllllllLLHHHhHHHHHhhhhhhhlllllllllhhhhllllllleee
Query spidYGVIVDTKAysggynLPIGQaDEMQRyveenqtrnkhinpnewwkvypssvtefkf  131
ident            |                                                
Sbjct gayhPLRMLAVKT.....tCKDRW.RQILN..............................  139
DSSP  hhhlLLLLLEEEL.....lLLLLL.HHHHL..............................


DSSP  EEEELL.LLLL.HHHHHHHHhhhhllEEEEEEHH...............HHHHHHHHhhh
Query LFVSGH.FKGN.YKAQLTRLnhitncNGAVLSVE...............ELLIGGEMika  174
ident                                                   |         
Sbjct HLFTLQeGVSLaQYREMRES......GVRLVVPSslhkkypeavraelmTLGAFIAE...  190
DSSP  LEEELLlLLLHhHHHHHHLL......LLLEELLHhhhlllllllhhhllLHHHHHHH...


DSSP  llllhhhhhllllleelll
Query gtltleevrrkfnngeinf  193
ident                    
Sbjct ................ltg  193
DSSP  ................hll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  llHHHHH..........hhhhhlllllLLHH.........HHHHHH..............
Query ksELEEK..........kselrhklkyVPHE.........YIELIE..............   27
ident                              |                              
Sbjct ..VNHKYilpedwhlrfpsgseiiqyaASHYdpdeqlldrRRVEYDifllveelhvldii   58
DSSP  ..LLLLLlllhhhhlllllhhhhhhhhHHLLlhhhhhhhhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ................hllLHHHHHHhhHHHHHHHHHHLL......LEEEelllllllle
Query ................iarNSTQDRIleMKVMEFFMKVYG......YRGKhlggsrkpdg   65
ident                                                             
Sbjct rkgfgsvdefialansvsnRRKSRAG..KSLELHLEHLFIehglrhFATQ........ap  108
DSSP  hhllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHLL..LHHHHHHHHHHHllllllLLLL........ll


DSSP  EEELL...llllLLEEEEEEelllllllllhhHHHHHHhHHHHhhhlllllllllhhhhl
Query AIYTV...gspiDYGVIVDTkaysggynlpigQADEMQrYVEEnqtrnkhinpnewwkvy  122
ident                  | |              |                         
Sbjct DFLFPsagayhpLRMLAVKT...........tCKDRWR.QILN.................  139
DSSP  LLLLLlhhhhllLLLLEEEL...........lLLLLLH.HHHL.................


DSSP  lllllleEEEEEelllllLHHH.HHHHHHHhHLLEEEEE...ehhhhhhhhhhhhhllll
Query pssvtefKFLFVsghfkgNYKA.QLTRLNHiTNCNGAVL...sveelliggemikagtlt  178
ident                        |             |                      
Sbjct .......HLFTL....qeGVSLaQYREMRE.SGVRLVVPsslhkkypeavraelmtlgaf  187
DSSP  .......LEEEL....llLLLHhHHHHHHL.LLLLEELLhhhhlllllllhhhlllhhhh


DSSP  HHHHhllllleelll
Query LEEVrrkfnngeinf  193
ident   |            
Sbjct IAEL.........tg  193
DSSP  HHHH.........ll