No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.7

DSSP  ......LHHHHHHH...hhHHHHHH..LLLL..EEELLLLLEEE.....lLLLHhHHHHH
Query ......SLRSDLIN...alYDENQK..YDVC..GIISAEGKIYP.....lGSDTaVLSTI   42
ident                     |       |                        |    | 
Sbjct epdddlERVRATLYsldpdGDRTAGvlRDTLdqLYDGQRTGRWNfdqlhkTEKT.HMGTL   59
DSSP  lllhhhHHHHHHHHhhlllLHHHHHhhHHHHhhHHLHHHHLLLLhhhllhHHHH.LHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhllleEELLllllLLLLEEEElllllllEEEEEEEEEEEllllllL
Query FELFSRPIINkiaekhgyiVEEPkqqnHYPDFTLYkpsepnkKIAIDIKTTYTnkenekI  102
ident  |                            |               | |           
Sbjct VEINLHREFQ.........FGDG....FETDYEIA.......GVQVDCKFSMS.....qG   94
DSSP  HHHHHHHHHL.........LEEL....LLLLEEEL.......LEEEEEEEELL.....lL


DSSP  LLEEEElllllllllllllllhhheeeEEEEEEEEEELlllllllllllhhhhhhllllE
Query KFTLGGytsfirnntknivypfdqyiaHWIIGYVYTRVatrksslktyninelneipkpY  162
ident    |                       |                                
Sbjct AWMLPP.................esigHICLVIWASDQ.....................Q  116
DSSP  LLLLLH.................hhllLEEEEEEEELL.....................L


DSSP  EEEEEEEEEHHhhLLLLLllLLLLEEELLLLlhHHHH.......................
Query KGVKVFLQDKWviAGDLAgsGNTTNIGSIHAhyKDFV.......................  199
ident       |          |                  |                       
Sbjct CAWTAGLVKVIpqFLGTA..NRDLKRRLTPEgrAQVVklwpdhgklqenlllhipgdvrd  174
DSSP  LEEEEEEEELLhhHLLLL..LLLLLLLLLHHhhLLLEelllllllllllhhhlllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  199
ident                                                             
Sbjct qifsaksqhgqarvnelfrrvhgrligraviatvaqqddfmkrvrgsggarsilrpegii  234
DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhlllllhhhlllllllllllhhhlee


DSSP  ................hlllllllhhhhhhhhhlllllhhhhllllllhhhhhhhhhhll
Query ................egkgifdsedefldywrnyertsqlrndkynniseyrnwiyrgr  243
ident                                                             
Sbjct ilghqdkvandlglpvprkgqvvaarvvpadegdqrqtaeiqgrrwavavpgdpiveapv  294
DSSP  eellllllllllllllllllleeeeeeeelllllllleeelllleeeellllllllllll


DSSP  l
Query k  244
ident  
Sbjct v  295
DSSP  l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.7

DSSP  .................lhHHHHHHHHHHHHHHLL............LLEEellllleee
Query .................slRSDLINALYDENQKYD............VCGIisaegkiyp   31
ident                           | |                               
Sbjct epdddlervratlysldpdGDRTAGVLRDTLDQLYdgqrtgrwnfdqLHKT.........   51
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHlhhhhllllhhhLLHH.........


DSSP  llllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhllLEEELLllllllllEEEELllllLLEEEEEEE
Query lgsdtavlsTIFELFSRPIINKIAEkhgYIVEEPkqqnhypdFTLYKpsepNKKIAIDIK   91
ident          |                                                  
Sbjct .......ekTHMGTLVEINLHREFQ...FGDGFE.......tDYEIA....GVQVDCKFS   90
DSSP  .......hhHLHHHHHHHHHHHHHL...LEELLL.......lLEEEL....LEEEEEEEE


DSSP  EEeellllllllLEEEelllllllllllllllhhheEEEEEEEEEEEellllllllllll
Query TTytnkenekikFTLGgytsfirnntknivypfdqyIAHWIIGYVYTrvatrksslktyn  151
ident                                          |                  
Sbjct MS.........qGAWM.............lppesigHICLVIWASDQ.............  115
DSSP  LL.........lLLLL.............llhhhllLEEEEEEEELL.............


DSSP  hhhhhhlllleeEEEEEEEEHHhhllLLLLLLL..LLEEELL..................
Query inelneipkpykGVKVFLQDKWviagDLAGSGN..TTNIGSI..................  191
ident                              |  |                           
Sbjct ............QCAWTAGLVK.vipQFLGTANrdLKRRLTPegraqvvklwpdhgklqe  162
DSSP  ............LLEEEEEEEE.llhHHLLLLLllLLLLLLHhhhllleellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  191
ident                                                             
Sbjct nlllhipgdvrdqifsaksqhgqarvnelfrrvhgrligraviatvaqqddfmkrvrgsg  222
DSSP  lhhhlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhlllllhhhlllll


DSSP  ....................lllhhhhhhlllllllhhhhhhhhhlllllhhhhllllll
Query ....................hahykdfvegkgifdsedefldywrnyertsqlrndkynn  231
ident                                                             
Sbjct garsilrpegiiilghqdkvandlglpvprkgqvvaarvvpadegdqrqtaeiqgrrwav  282
DSSP  llllllhhhleeeellllllllllllllllllleeeeeeeelllllllleeelllleeee


DSSP  hhhhhhhhhhlll
Query iseyrnwiyrgrk  244
ident              
Sbjct avpgdpiveapvv  295
DSSP  lllllllllllll