No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct kpfenhlksvddlkttyeeyragfiafaleknkrstpyieraralkvaasvaktpkdlly   60
DSSP  lhhhhllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhh


DSSP  ........................................................llll
Query ........................................................lsgr    4
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Sbjct lediqdallyasgisdkakkflteddkkesinnlienflepageefidelifryllfqgd  120
DSSP  lhhhhhhhhhhllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHL....LLLL..........................
Query lnwqalaglkasgaeQNLYNVFNAVF....EGTK..........................   34
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Sbjct slggtmrniagalaqQKLTRAIISALdianIPYKwldsrdkkytnwmdkpeddyeletfa  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHhhllLLEEeeelllllllleeelllllllhhhhe


DSSP  ...........EEEEELLLLLLlllllllllhhhhhhlllllllhhhlllLLLLLEEEEE
Query ...........YVLYEKPKHLKnlyaqvvlpddvikeifnplidlsttqwGVSPAFAIEN   83
ident              |                                             |
Sbjct kgiswtingkhRTLMYNITVSL...........................vKKNVDICLFN  213
DSSP  eeeeeeelleeEEEEEEEEELL...........................lLEEEEEEEEE


DSSP  LL...lLLEE.EEEEEELLlllllllhhHHLL..LHHHHHH.HHHLhhHHHHHHHhhlll
Query TE...tHKIL.FGEIKRQDgwvegkdpsAGRG..NAHERSC.KLFTpgLLKAYRTiggin  136
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Sbjct CEpqqpEKYLlLGELKGGI.........DPAGadEHWKTANtALTR..IRNKFSE.....  257
DSSP  LLlllhHHEEeEEEEELLL.........LHHHhhHHHHHHHhHHHH..HHHHHHH.....


DSSP  llllLLEEEEEELHHhhLHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEELLLLL.HHHHHHHHHHHlhhh
Query deeiLPFWVVFEGDItrDPKRVREITFWYDHYQDNYFMWRPNES.GEKLVQHFNEKlkky  195
ident      |        |        ||                       |           
Sbjct .kglSPKTIFIGAAI..EHSMAEEIWDQLQSGSLTNSANLTKTEqVGSLCRWIINI....  310
DSSP  .lllLLEEEEEELLL..LHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHHhHHHHHHHHHLL....


DSSP  hl
Query ld  197
ident   
Sbjct ..  310
DSSP  ..


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kpfenhlksvddlkttyeeyragfiafaleknkrstpyieraralkvaasvaktpkdlly   60
DSSP  lhhhhllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lediqdallyasgisdkakkflteddkkesinnlienflepageefidelifryllfqgd  120
DSSP  lhhhhhhhhhhllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...................llllllHHHHH...................hhhhLLLLllh
Query ...................lsgrlnWQALA...................glkaSGAEqnl   22
ident                                                         |   
Sbjct slggtmrniagalaqqkltraiisaLDIANipykwldsrdkkytnwmdkpeddYELE..t  178
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLlleeeeelllllllleeelllllLLHH..h


DSSP  hhhhhhhLLLLlEEEEELllllllllllllllhhhhhhlllllllhhhlllllllLEEEE
Query ynvfnavFEGTkYVLYEKpkhlknlyaqvvlpddvikeifnplidlsttqwgvspAFAIE   82
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Sbjct fakgiswTING.KHRTLM.......................ynitvslvkknvdiCLFNC  214
DSSP  heeeeeeEELL.EEEEEE.......................eeeeelllleeeeeEEEEL


DSSP  ELllllEEEEEEEELlllLLLLlHHHHLL..LHHHHHHH.HHLHHHhhhhhhhhllllll
Query NTethkILFGEIKRQdgwVEGKdPSAGRG..NAHERSCK.LFTPGLlkayrtiggindee  139
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Sbjct EPqqpeKYLLLGELKggiDPAGaDEHWKTanTALTRIRNkFSEKGL..............  260
DSSP  LLllhhHEEEEEEEElllLHHHhHHHHHHhhHHHHHHHHhHHHLLL..............


DSSP  llLEEEEEELH..hhhLHHHHHHHHHHHllllllEEEELLL...LLHHHHHHHHHhhlhh
Query ilPFWVVFEGD..itrDPKRVREITFWYdhyqdnYFMWRPN...ESGEKLVQHFNeklkk  194
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Sbjct ..SPKTIFIGAaiehsMAEEIWDQLQSG....slTNSANLTkteQVGSLCRWIIN.....  309
DSSP  ..LLEEEEEELlllhhHHHHHHHHHHHL....llLEEEELLlhhHHHHHHHHHHL.....


DSSP  hhl
Query yld  197
ident    
Sbjct ..i  310
DSSP  ..l