No 1: Query=mol1 Sbjct=mol2C Z-score=2.2

DSSP  .......................................llleeelllLLLEE....eLH
Query .......................................mdiisksgeGNKYT....iNS   17
ident                                                             
Sbjct sefvqplpftlpetvpletlqrfwahpvraffqmrlqvnfrtedseipDTEPFileglSR   60
DSSP  lllllllllllllleehhhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllllLLLLLlllhhHH


DSSP  HHHHHHHHH.LLLLllllhhhHHHHHHHHHHHHHhhhlllLLHHHHHHHHHHHhhhhhhh
Query AIAFVAYAS.HIDInttefskVLSGLRDFINDEAirlggkISDGSFNKCNGDWyewligi   76
ident                          |                                  
Sbjct YQINQQLLNaLVEQ......dDAERLFRRFRAAG...dlpYGAFGEIFWETQC.......  104
DSSP  HHHHHHHHHhHHLL......lLHHHHHHHHHHHL...lllLHHHHHHHHHHHH.......


DSSP  hhhhhhhhlllleeeeellllllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllee
Query raiefflesetnfivvkmpnatsfdvmsiyksclsefiydlrsklslnnvnlitsnpdfs  136
ident                                                             
Sbjct .......qemqqladrviacrqpgqsmeidlacngvqitgwlpqvqpdgllrwrpsllsv  157
DSSP  .......hhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleeeeeeeeeellleeeeellllllh


DSSP  eeellllhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeelllllhh
Query iidirgrreelksmlkdisfsnislstiseidnlyknfidyaelehiksflsvkttfrpd  196
ident                                                             
Sbjct aqgmqlwlehlvycasggngesrlflrkdgewrfpplaaeqalhylsqliegyregmsap  217
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhleeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeeeellllhhhhhhhllllhhhhllll
Query rrlqlahegslmkalythlqtrtwtinptgiryyaaatsignadviglktvathsitdvk  256
ident                                                             
Sbjct llvlpesggawlktcydaqndamldddstlqkartkflqayegnmmvrgegddiwyqrlw  277
DSSP  llllhhhhhhhhhhheelhhheelllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhlll


DSSP  lllllllleeeelllhhhhhhhhhhhl
Query slpqsavdeifkinsvldvdsclshil  283
ident                            
Sbjct rqltpetmeaiveqsqrfllplfrfnq  304
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 2: Query=mol1 Sbjct=mol2C Z-score=2.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sefvqplpftlpetvpletlqrfwahpvraffqmrlqvnfrtedseipdtepfileglsr   60
DSSP  lllllllllllllleehhhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllllllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yqinqqllnalveqddaerlfrrfraagdlpygafgeifwetqcqemqqladrviacrqp  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gqsmeidlacngvqitgwlpqvqpdgllrwrpsllsvaqgmqlwlehlvycasggngesr  180
DSSP  leeeeeeeeelleeeeeeeeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleee


DSSP  .............................................lLLEE..ELLL.LLL
Query .............................................mDIIS..KSGE.GNK   12
ident                                                             
Sbjct lflrkdgewrfpplaaeqalhylsqliegyregmsapllvlpesggAWLKtcYDAQnDAM  240
DSSP  eelhhhleeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhHHHHhhEELHhHEE


DSSP  E......eeLHHHHHHHHH.......HLLL...LLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query Y......tiNSAIAFVAYA.......SHID...INTTEFsKVLSGLRDFINDEAIRLGgk   56
ident                 ||           |                          |   
Sbjct LdddstlqkARTKFLQAYEgnmmvrgEGDDiwyQRLWRQ.LTPETMEAIVEQSQRFLL..  297
DSSP  LllhhhhhhHHHHHHHHHLlllllllLLLLhhhHLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHH..


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllllllhhhhllhhhhhhhhh
Query isdgsfnkcngdwyewligiraiefflesetnfivvkmpnatsfdvmsiyksclsefiyd  116
ident                                                             
Sbjct ............................................................  297
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllllllllllleeeeellllhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query lrsklslnnvnlitsnpdfsiidirgrreelksmlkdisfsnislstiseidnlyknfid  176
ident                                                             
Sbjct ............................................................  297
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeeeelll
Query yaelehiksflsvkttfrpdrrlqlahegslmkalythlqtrtwtinptgiryyaaatsi  236
ident                                                             
Sbjct ............................................................  297
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhllllhhhhlllllllllllleeeelllhhhhhhhhhhhl
Query gnadviglktvathsitdvkslpqsavdeifkinsvldvdsclshil  283
ident                                                
Sbjct ........................................plfrfnq  304
DSSP  ........................................hhhllll