No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  ............llHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhll
Query ............mnKQEVILkvqecaawwilerqskltklmsetmsinpfmtpfifdyhs   48
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Sbjct kseleekkselrhkLKYVPH........................................   20
DSSP  llhhhhhhhhhhllLLLLLH........................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLHHHHHHL..LEELlhhhhhhlllllLHHH
Query lndfdelveaiiakhlmtghdtgfGKLIDEKILPRVFG..AYKLdksyraanepfiHPCF  106
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Sbjct .......eyielieiarnstqdriLEMKVMEFFMKVYGyrGKHL...........gGSRK   62
DSSP  .......hhhhhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLleEEEL...........lLLLL


DSSP  hhLLEEEELL...LLLEEEEEEELLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHLHH..........
Query deIDHVIQRD...DGRIELLSLKAGKWTIQltMAVQLNKAFHEIINNYPG..........  153
ident    |  |               ||                                    
Sbjct ..PDGAIYTVgspIDYGVIVDTKAYSGGYN..LPIGQADEMQRYVEENQTrnkhinpnew  118
DSSP  ..LLEEEELLlllLLLEEEEEEELLLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllh


DSSP  ........hlLEEEEEELllllllLLLHHHHLLLllllllllllLLLL....LEEEEELH
Query ........vaDNIVVGVFygnshgLTDKYRILRGintganhnviDIRD....KVHVYAGK  201
ident                             |                          |    
Sbjct wkvypssvteFKFLFVSG.....hFKGNYKAQLT..........RLNHitncNGAVLSVE  163
DSSP  hhhlllllllEEEEEEEL.....lLLLLHHHHHH..........HHHHhhllEEEEEEHH


DSSP  HHHHhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll
Query EFWSwlnngeaetqhwvlegieravkeadikeknkdliekfkehvakkyneqvlnadgta  261
ident |                                                           
Sbjct ELLI.........................................ggemikagtltleev  182
DSSP  HHHH.........................................hhhhhhhllllhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhl
Query qwhkllemine  272
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Sbjct rrkfnngeinf  193
DSSP  hllllleelll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhh
Query mnkqevilkvqecaawwilerqskltklmsetmsinpfmtpfifdyhslndfdelveaii   60
ident                                                             
Sbjct ...................................kseleekkselrhklkyvpheyiel   25
DSSP  ...................................llhhhhhhhhhhlllllllhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhllEELLhhhhhhllllllHHHHhlLEEEElLLLLE
Query akhlmtghdtgfgklidekilprvfgaYKLDksyraanepfihPCFDeiDHVIQrDDGRI  120
ident                                               |             
Sbjct ieiarnstqdrilemkvmeffmkvygyRGKH........lggsRKPD.gAIYTV.GSPID   75
DSSP  hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllEEEE........llllLLLL.eEEELL.LLLLL


DSSP  EEEEEEL....llLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH............lhHHLLEEEEEELL
Query ELLSLKA....gkWTIQLTMAVQLNKAFHEIINN............ypGVADNIVVGVFY  164
ident                     |        |                              
Sbjct YGVIVDTkaysggYNLPIGQADEMQRYVEENQTRnkhinpnewwkvypSSVTEFKFLFVS  135
DSSP  LEEEEEEelllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllllhhhhllLLLLLEEEEEEE


DSSP  .lllllLLLHHHHLLllllllllllLLLLllEEEEELhhhhhhhllllllhhhhhhhhhh
Query .gnshgLTDKYRILRgintganhnvIDIRdkVHVYAGkefwswlnngeaetqhwvlegie  223
ident              |                                              
Sbjct ghfkgnYKAQLTRLN..........HITN..CNGAVL.......................  160
DSSP  llllllHHHHHHHHH..........HHHL..LEEEEE.......................


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhl
Query ravkeadikeknkdliekfkehvakkyneqvlnadgtaqwhkllemine  272
ident                                                  
Sbjct ................sveelliggemikagtltleevrrkfnngeinf  193
DSSP  ................ehhhhhhhhhhhhhllllhhhhhllllleelll