No 1: Query=mol1 Sbjct=mol2A Z-score=4.3

DSSP  lllllllllLHHHHHHHHH.HLLLLLhhhHHHH.....lLLLLLlllllLLLHHHHHHHH
Query prpllsppeTEEQLLAQAQ.QLSGYTlgeLAAL.....vGLVTPenlkrDKGWIGVLLEI   54
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Sbjct ........sLRSDLINALYdENQKYD...VCGIisaegkIYPLG....sDTAVLSTIFEL   45
DSSP  ........lHHHHHHHHHHhHHHHLL...LLEEelllllEEELL....lLHHHHHHHHHH


DSSP  HLLL.......llhHHHL......................lLLEEEEEEELLLLLLlLLE
Query WLGA.......peqDFAA......................lGVELKTIPVDSLGRPlETT   85
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Sbjct FSRPiinkiaekhgYIVEepkqqnhypdftlykpsepnkkiAIDIKTTYTNKENEK.IKF  104
DSSP  HHHHhhhhhhhhllLEEElllllllllleeeellllllleeEEEEEEEEELLLLLL.LLL


DSSP  EEEELLllllllLLLLLLH....hhhhlLLEEEEEEEL...............lllllHH
Query FVCVAPltgnsgVTWETSH....vrhklKRVLWIPVEG...............easipLA  126
ident                                                             
Sbjct TLGGYT...sfiRNNTKNIvypfdqyiaHWIIGYVYTRvatrksslktyninelneipKP  161
DSSP  EEEELL...lllLLLLLLLlllhhheeeEEEEEEEEEEllllllllllllhhhhhhllLL


DSSP  HLLLLlLEEELllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllLEEEELleeeellll
Query QRRVGsPLLWSpneeedrqlredweelmdmivlgqveritarhgeYLQIRPlteaigarg  186
ident    |    |                                                   
Sbjct YKGVK.VFLQD.............................kwviaGDLAGS.........  182
DSSP  EEEEE.EEEEE.............................hhhhlLLLLLL.........


DSSP  leeeeLLLEEEELHHHHHHHHHH.....................................
Query eriltLPRGFYLKKNFTSALLAR.....................................  209
ident                                                             
Sbjct ....gNTTNIGSIHAHYKDFVEGkgifdsedefldywrnyertsqlrndkynniseyrnw  238
DSSP  ....lLLLEEELLLLLHHHHHHLllllllhhhhhhhhhlllllhhhhllllllhhhhhhh


DSSP  .lllll
Query .hfliq  214
ident       
Sbjct iyrgrk  244
DSSP  hhhlll


No 2: Query=mol1 Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  llllllllllhHHHHHHHHHLLlllhhhHHHHllLLLLL.............LLLLLLLH
Query prpllsppeteEQLLAQAQQLSgytlgeLAALvgLVTPE.............NLKRDKGW   47
ident                     |                                       
Sbjct ...........SLRSDLINALY.....dENQK..YDVCGiisaegkiyplgsDTAVLSTI   42
DSSP  ...........LHHHHHHHHHH.....hHHHH..LLLLEeellllleeelllLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLL....lLLHH...................hhllLLEEEEEEELL.....LL
Query IGVLLEIWLG....aPEQD...................faalGVELKTIPVDS.....LG   79
ident                                                             
Sbjct FELFSRPIINkiaekHGYIveepkqqnhypdftlykpsepnkKIAIDIKTTYTnkeneKI  102
DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhLLLEeelllllllllleeeelllllllEEEEEEEEEEElllllLL


DSSP  LLllLEEEeelllllllllllllLHHH...........hhlLLEEEEEEELLLL......
Query RPleTTFVcvapltgnsgvtwetSHVR...........hklKRVLWIPVEGEAS......  122
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Sbjct KF..TLGG..............yTSFIrnntknivypfdqyIAHWIIGYVYTRVatrkss  146
DSSP  LL..EEEE..............lLLLLllllllllllhhheEEEEEEEEEEEELllllll


DSSP  .............lLHHHLLLlLLEEEL................................
Query .............iPLAQRRVgSPLLWS................................  137
ident               |     |                                       
Sbjct lktyninelneipkPYKGVKV.FLQDKWviagdlagsgnttnigsihahykdfvegkgif  205
DSSP  lllllhhhhhhlllLEEEEEE.EEEEHHhhllllllllllleeelllllhhhhhhlllll


DSSP  .lLHHHHHHHHHHhhHHHHhhhlllhhhlllLLLLleeeelleeeellllleeeelllee
Query .pNEEEDRQLREDweELMDmivlgqveritaRHGEylqirplteaigargeriltlprgf  196
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Sbjct dsEDEFLDYWRNY..ERTS.......qlrndKYNN.........................  231
DSSP  llHHHHHHHHHLL..LLLH.......hhhllLLLL.........................


DSSP  eelhhhhhhhhhhlllll
Query ylkknftsallarhfliq  214
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Sbjct .....iseyrnwiyrgrk  244
DSSP  .....hhhhhhhhhhlll