No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  lhhhllleeeelllllleeeelhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query nltnsncveeykengktkirikpfnalielyhhqtptgsikenldklenyvkdvvkakgl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhlllleeeeeLLLLllllhhhhllhhhhhh
Query aiptsgafsntrgtwfeVMIAIQSWNYRVKrelndyliikMPNVktfdfrkifdnetrek  120
ident                             ||                              
Sbjct ......vkvvvdsrelrSEVVKRLKLLGVK.......levKTLD................   31
DSSP  ......leeeeehhhllLHHHHHHHHLLLE.......eeeELLL................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllLLLEEEEelhhhllhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhl
Query lhqleksllthkqqvrlitsNPDLLIIrqkdlikseynlpinklthenidvaltlfkdie  180
ident                       |  |                                  
Sbjct ....................VGDYIIS.................................   38
DSSP  ....................LLLEELL.................................


DSSP  llllhhhEEEEEEEELL..LLHH....hHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllLEEE
Query gkckwdsLVAGVGLKTS..LRPD....rRLQLVHEGNILKslfahlkmrywnpkaeFKYY  234
ident               |    |            |                           
Sbjct .......EDVAIERKSAndLIQSiidggLFDQVKRLKEAY................SRPI   75
DSSP  .......LLEEEEEEEHhhHHHHhhlllHHHHHHHHHHHL................LEEE


DSSP  EEELLL..........lLHHHHHHLLLLlhhhlllllllllLLLLeEEELLLHHHHHHHH
Query GASSEP..........vSKADDDALQTAathtivnvnstpeRAVDdIFSLTSFEDIDKML  284
ident                        |                   |  |      |      
Sbjct MIVEGSlygirnvhpnaIRGAIAAVTVD.............FGVP.IIFSSTPEETAQYI  121
DSSP  EEEELLllllllllhhhHHHHHHHHHHL.............LLLL.EEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHHHLL....
Query DQIIKK....  290
ident   | |     
Sbjct FLIAKReqee  131
DSSP  HHHHHHhhhl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  lhhhllleeeelllllleeeelhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query nltnsncveeykengktkirikpfnalielyhhqtptgsikenldklenyvkdvvkakgl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH.HHHHHHHLLLLEeeeellllllLLHHhhllhhhhh
Query aiptsgafsntrgtwfevmiAIQS.WNYRVKRELNDYliikmpnvktFDFRkifdnetre  119
ident                                                             
Sbjct ...........vkvvvdsreLRSEvVKRLKLLGVKLE.........vKTLD.........   31
DSSP  ...........leeeeehhhLLLHhHHHHHHLLLEEE.........eELLL.........


DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllllllleEEEElhhhllhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhh
Query klhqleksllthkqqvrlitsnpdlLIIRqkdlikseynlpinklthenidvaltlfkdi  179
ident                            |                                
Sbjct .......................vgDYII...............................   37
DSSP  .......................llLEEL...............................


DSSP  lllllhHHEEEEEEEELlllhhHHHH.hhhhhHHHHHHHHHHhhhhllllLLLEEEEEEL
Query egkckwDSLVAGVGLKTslrpdRRLQ.lvhegNILKSLFAHLkmrywnpkAEFKYYGASS  238
ident                                                            |
Sbjct .....sEDVAIERKSAN....dLIQSiidgglFDQVKRLKEA.......ySRPIMIVEGS   81
DSSP  .....lLLEEEEEEEHH....hHHHHhhlllhHHHHHHHHHH.......lLEEEEEEELL


DSSP  LL....lLHHHHHHLLLLLhhhlllllLLLLlllLEEEElllhhHHHHHHHHHHLL....
Query EP....vSKADDDALQTAAthtivnvnSTPEravDDIFSltsfeDIDKMLDQIIKK....  290
ident                  |                    |             |       
Sbjct LYgirnvHPNAIRGAIAAV.......tVDFG.vpIIFSS.....TPEETAQYIFLIakre  128
DSSP  LLlllllLHHHHHHHHHHH.......hHLLL.llEEEEL.....LHHHHHHHHHHHhhhh


DSSP  ...
Query ...  290
ident    
Sbjct qee  131
DSSP  hhl