No 1: Query=mol1 Sbjct=mol2A Z-score=3.1

DSSP  llllllllLLHHHH...hhhhhHLLLllHHHHHhhllLLLL...........LLLLL.LL
Query prpllsppETEEQL...laqaqQLSGytLGELAalvgLVTP...........ENLKR.DK   45
ident              |           |  |                          |    
Sbjct .epdddleRVRATLysldpdgdRTAG.vLRDTL....DQLYdgqrtgrwnfdQLHKTeKT   54
DSSP  .lllhhhhHHHHHHhhhllllhHHHH.hHHHHH....HHHHlhhhhllllhhHLLHHhHH


DSSP  LHHHHHHHHHLL........lllhhhHLLLLEEEEEEEllllllllLEEEEellllllll
Query GWIGVLLEIWLG........apeqdfAALGVELKTIPVdslgrpleTTFVCvapltgnsg   97
ident                           |   |  |                          
Sbjct HMGTLVEINLHRefqfgdgfetdyeiAGVQVDCKFSMS......qgAWMLP.........   99
DSSP  LHHHHHHHHHHHhhlleellllleeeLLEEEEEEEELL......llLLLLL.........


DSSP  llllllhhHHHL.LLEEEEEEELLllllhhhLLLLlLEEELllhhhHHHHhhhhhhhhhh
Query vtwetshvRHKL.KRVLWIPVEGEasiplaqRRVGsPLLWSpneeeDRQLredweelmdm  156
ident                 | |                   |         |           
Sbjct ........PESIgHICLVIWASDQ......qCAWT.AGLVK....vIPQF..........  130
DSSP  ........HHHLlLEEEEEEEELL......lLEEE.EEEEE....lLHHH..........


DSSP  hhlllhhhlllllllLEEEELleeeellllleeeellLEEEELHHHHHHHH.........
Query ivlgqveritarhgeYLQIRPlteaigargeriltlpRGFYLKKNFTSALL.........  207
ident                                                 |           
Sbjct ...............LGTANR................DLKRRLTPEGRAQVvklwpdhgk  159
DSSP  ...............LLLLLL................LLLLLLLHHHHLLLeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  207
ident                                                             
Sbjct lqenlllhipgdvrdqifsaksqhgqarvnelfrrvhgrligraviatvaqqddfmkrvr  219
DSSP  llllhhhlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhlllllhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  207
ident                                                             
Sbjct gsggarsilrpegiiilghqdkvandlglpvprkgqvvaarvvpadegdqrqtaeiqgrr  279
DSSP  lllllllllhhhleeeellllllllllllllllllleeeeeeeelllllllleeelllle


DSSP  .........hhlllll
Query .........arhfliq  214
ident                 
Sbjct wavavpgdpiveapvv  295
DSSP  eeelllllllllllll


No 2: Query=mol1 Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  llllllllllhhHHHHHHHH......llLLLHHHhhhhlllLLLL...............
Query prpllsppeteeQLLAQAQQ......lsGYTLGElaalvglVTPE...............   39
ident               |             |             |                 
Sbjct .........epdDDLERVRAtlysldpdGDRTAG....vlrDTLDqlydgqrtgrwnfdq   47
DSSP  .........lllHHHHHHHHhhhhhlllLHHHHH....hhhHHHHhhhlhhhhllllhhh


DSSP  ...llLLLL.LHHHHHHH..hHLLLllhhhhlLLLE........EEEEEELlllLLLLLE
Query ...nlKRDK.GWIGVLLE..iWLGApeqdfaaLGVE........LKTIPVDslgRPLETT   85
ident      |          |      |                                    
Sbjct lhkteKTHMgTLVEINLHrefQFGD.......GFETdyeiagvqVDCKFSM..sQGAWML   98
DSSP  llhhhHHLHhHHHHHHHHhhhLLEE.......LLLLleeelleeEEEEEEL..lLLLLLL


DSSP  EEeellllllllllllllhhhhHLLLEEEEEEELLLLLLhhhLLLLlLEEELLLHhhhhh
Query FVcvapltgnsgvtwetshvrhKLKRVLWIPVEGEASIPlaqRRVGsPLLWSPNEeedrq  145
ident                                              |      |       
Sbjct PP....................ESIGHICLVIWASDQQC..aWTAG.LVKVIPQF.....  130
DSSP  LH....................HHLLLEEEEEEEELLLL..eEEEE.EEELLHHH.....


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllLEEEelleeeellllleeeelllEEEElhhHHHH
Query lredweelmdmivlgqveritarhgeYLQIrplteaigargeriltlprGFYLkknFTSA  205
ident                                                             
Sbjct ........................lgTANR...................DLKR...RLTP  144
DSSP  ........................llLLLL...................LLLL...LLLH


DSSP  .HHHHL......................................................
Query .LLARH......................................................  210
ident    |                                                        
Sbjct eGRAQVvklwpdhgklqenlllhipgdvrdqifsaksqhgqarvnelfrrvhgrligrav  204
DSSP  hHHLLLeelllllllllllhhhlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  210
ident                                                             
Sbjct iatvaqqddfmkrvrgsggarsilrpegiiilghqdkvandlglpvprkgqvvaarvvpa  264
DSSP  hhhhhlllllhhhlllllllllllhhhleeeellllllllllllllllllleeeeeeeel


DSSP  ...........................llll
Query ...........................fliq  214
ident                                
Sbjct degdqrqtaeiqgrrwavavpgdpiveapvv  295
DSSP  llllllleeelllleeeelllllllllllll