No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2C Z-score=3.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sefvqplpftlpetvpletlqrfwahpvraffqmrlqvnfrtedseipdtepfileglsr   60
DSSP  lllllllllllllleehhhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllllllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yqinqqllnalveqddaerlfrrfraagdlpygafgeifwetqcqemqqladrviacrqp  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gqsmeidlacngvqitgwlpqvqpdgllrwrpsllsvaqgmqlwlehlvycasggngesr  180
DSSP  leeeeeeeeelleeeeeeeeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleee


DSSP  ...............................llhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhHLLL
Query ...............................mnkqevilkVQECAAWWILERQSklTKLM   29
ident                                           |    |            
Sbjct lflrkdgewrfpplaaeqalhylsqliegyregmsapllvLPESGGAWLKTCYD..AQND  238
DSSP  eelhhhleeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHEE..LHHH


DSSP  llllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhHLHH......HH
Query setmsinpfmtpfifdyhslndfdelveaiiakhLMTGHDTGFGKLIdEKIL......PR   83
ident                                             |               
Sbjct ..............................amldDDSTLQKARTKFL.QAYEgnmmvrGE  267
DSSP  ..............................eellLHHHHHHHHHHHH.HHHLllllllLL


DSSP  HHLleellhhhhhhllllllhhhhhlleeeellllleeeeeeelllllllhhhhhhhhhh
Query VFGaykldksyraanepfihpcfdeidhviqrddgriellslkagkwtiqltmavqlnka  143
ident                                                             
Sbjct GDD.........................................................  270
DSSP  LLL.........................................................


DSSP  hhhhhhhlhhhlleeeeeellllllllllhhhhlllllllllllllllllleeeeelhhh
Query fheiinnypgvadnivvgvfygnshgltdkyrilrgintganhnvidirdkvhvyagkef  203
ident                                                             
Sbjct ............................................................  270
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllllHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlHHHHhhhhhhhhhhhllllllllllllllh
Query wswlnngeaeTQHWVLEGIERAVKEADIKeKNKDliekfkehvakkyneqvlnadgtaqw  263
ident           |        |                                        
Sbjct iwyqrlwrqlTPETMEAIVEQSQRFLLPLfRFNQ..........................  304
DSSP  hhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL..........................


DSSP  hhhhhhhhl
Query hkllemine  272
ident          
Sbjct .........  304
DSSP  .........


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2C Z-score=2.1

DSSP  ...................................................LLHHH..hH
Query ...................................................MNKQE..vI    7
ident                                                        |    
Sbjct sefvqplpftlpetvpletlqrfwahpvraffqmrlqvnfrtedseipdtePFILEglsR   60
DSSP  lllllllllllllleehhhhhhhlllhhhhhhhllllllllllllllllllLLLLLhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllllllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query LKVQECAAWWILERqskltklmsetmsinpfmtpfifdyhslndfdelveaiiakhlmtg   67
ident             |                                               
Sbjct YQINQQLLNALVEQ..............................................   74
DSSP  HHHHHHHHHHHHLL..............................................


DSSP  hhhHHHHHHHHlHHHHHHlleellhhhhhhllllllhhhhhlleeeellllleeeeeeel
Query hdtGFGKLIDEkILPRVFgaykldksyraanepfihpcfdeidhviqrddgriellslka  127
ident        |                                                    
Sbjct ..dDAERLFRR.FRAAGD..........................................   89
DSSP  ..lLHHHHHHH.HHHHLL..........................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlleeeeeellllllllllhhhhlllllllllll
Query gkwtiqltmavqlnkafheiinnypgvadnivvgvfygnshgltdkyrilrgintganhn  187
ident                                                             
Sbjct ............................................................   89
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllleeeeelhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLL.............
Query vidirdkvhvyagkefwswlnngeaETQHWVLEGIERAVKEA.DIKE.............  233
ident                                          |                  
Sbjct ....................lpygaFGEIFWETQCQEMQQLAdRVIAcrqpgqsmeidla  129
DSSP  ....................lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  233
ident                                                             
Sbjct cngvqitgwlpqvqpdgllrwrpsllsvaqgmqlwlehlvycasggngesrlflrkdgew  189
DSSP  elleeeeeeeeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhlee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  233
ident                                                             
Sbjct rfpplaaeqalhylsqliegyregmsapllvlpesggawlktcydaqndamldddstlqk  249
DSSP  eellllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhheelhhheelllhhhhhh


DSSP  ................hhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhl
Query ................knkdliekfkehvakkyneqvlnadgtaqwhkllemine  272
ident                                                        
Sbjct artkflqayegnmmvrgegddiwyqrlwrqltpetmeaiveqsqrfllplfrfnq  304
DSSP  hhhhhhhhhllllllllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll