No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.6

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Query mnkqevilkvqecaawwilerqskltklmsetmsinpfmtpfifdyhslndfdelveaii   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhHHHHHHHlHHHHHHL.....LEELlhhhhhhllllLLHHHhhLLEEEEL
Query akhlmtghdtgFGKLIDEkILPRVFG.....AYKLdksyraanepfIHPCFdeIDHVIQR  115
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Sbjct ...........NLYFQGH.MVARLLEehgfeTKTN.....vivqgnCVEQE..IDVVAER   41
DSSP  ...........LHHHHHH.HHHHHHHlllleEEEE.....eeeellLLEEE..EEEEEEE


DSSP  LlLLEEEEEEELL..lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhlHHHLLEEEEEELLLllllLLLH
Query DdGRIELLSLKAG..kWTIQLTMAVQLNKAFHEIInnyPGVADNIVVGVFYGnshgLTDK  173
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Sbjct D.GERYMIECKFHnipVYTGLKEAMYTYARFLDVE...KHGFTQPWIFTNTK...fSEEA   94
DSSP  L.LEEEEEEELLLlllLEELHHHHHHHHHHHHHHH...HHLLLEEEEELLLE...eLHHH


DSSP  HHHLLLlllllllllllllLLEEEEELH....HHHHhhlllllLHHHHHHHhhhhhhhhh
Query YRILRGintganhnvidirDKVHVYAGK....EFWSwlnngeaETQHWVLEgieravkea  229
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Sbjct KKYAGC.............VGIKLTGWSypekEGIE.......VLLESKGL.........  125
DSSP  HHHHHH.............HLLEEELLLllllLLHH.......HHHHLLLL.........


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhl
Query dikeknkdliekfkehvakkyneqvlnadgtaqwhkllemine  272
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Sbjct ...........................................  125
DSSP  ...........................................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhh
Query mnkqevilkvqecaawwilerqskltklmsetmsinpfmtpfifdyhslndfdelveaii   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhHHHHHHHHHHhLHHHhHHLLEELlhhhhhhllllLLHH.....hhhlLEEEEl
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Sbjct .......NLYFQGHMVA.RLLE.EHGFETK........tnvIVQGncveqeidvVAERD.   42
DSSP  .......LHHHHHHHHH.HHHH.LLLLEEE........eeeEEELllleeeeeeEEEEL.


DSSP  llllEEEEEEELL........lllLLHHHHHHHHHHHHHHhhhlhhhlleEEEEELL.LL
Query ddgrIELLSLKAG........kwtIQLTMAVQLNKAFHEIinnypgvadnIVVGVFY.GN  166
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Sbjct ....GERYMIECKfhnipvytglkEAMYTYARFLDVEKHG.........fTQPWIFTnTK   89
DSSP  ....LEEEEEEELlllllleelhhHHHHHHHHHHHHHHHL.........lLEEEEELlLE


DSSP  LLL.LLLHHhhlllllllllllllllllleeeeelhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHhh
Query SHG.LTDKYrilrgintganhnvidirdkvhvyagkefwswlnngeaETQHWVLEGIEra  225
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Sbjct FSEeAKKYA.......................gcvgikltgwsypekEGIEVLLESKG..  124
DSSP  ELHhHHHHH.......................hhhlleeelllllllLLHHHHHHLLL..


DSSP  hhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhl
Query vkeadikeknkdliekfkehvakkyneqvlnadgtaqwhkllemine  272
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Sbjct ..............................................l  125
DSSP  ..............................................l