No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=6.5

DSSP  llllllllhhHHLL......LLLHHHHHHHHHHLL.lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query vnhkyilpedWHLR......FPSGSEIIQYAASHY.dpdEQLLDRRRVEYDIFLLVEELH   53
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Sbjct .......mdiISKSgegnkyTINSAIAFVAYASHIdintTEFSKVLSGLRDFINDEAIRL   53
DSSP  .......lllEEELllllleEELHHHHHHHHHHLLllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHLL...LHHHHHHHHHHHLLL......lLLLL
Query VLdiirkgfgsvdefialansvsnRRKSRAG...KSLELHLEHLFIEHG......lRHFA  104
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Sbjct GG....................kiSDGSFNKcngDWYEWLIGIRAIEFFlesetnfIVVK   93
DSSP  LL....................llLHHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhlllleEEEE


DSSP  LLL....................................LLLLLL...............
Query TQA....................................PDFLFP...............  113
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Sbjct MPNatsfdvmsiyksclsefiydlrsklslnnvnlitsnPDFSIIdirgrreelksmlkd  153
DSSP  LLLlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLLEEEEellllhhhhhhhlll


DSSP  ................lHHHHL.......lLLLLEEELLLL.LLLHHHHL..........
Query ................sAGAYH.......pLRMLAVKTTCK.DRWRQILN..........  139
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Sbjct isfsnislstiseidnlYKNFIdyaelehiKSFLSVKTTFRpDRRLQLAHegslmkalyt  213
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhHHHHLllllllleEEEEEELLLLLhHHHHHHHHhhhhhhhhhh


DSSP  ................LEEELLLLLLhhHHHHHHL..............LLLL.EELLhh
Query ................HLFTLQEGVSlaQYREMRE..............SGVR.LVVPss  168
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Sbjct hlqtrtwtinptgiryYAAATSIGNA..DVIGLKTvathsitdvkslpqSAVDeIFKI..  269
DSSP  hhhhhllllllllleeEEEELLLLHH..HHHHHLLllhhhhllllllllLLLLeEEEL..


DSSP  hhlllllllhhhllLHHHHHHHHLl
Query lhkkypeavraelmTLGAFIAELTg  193
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Sbjct ..........nsvlDVDSCLSHIL.  283
DSSP  ..........llhhHHHHHHHHHL.


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=2.5

DSSP  llllllllhhhhllllLHHHhHHHHHHLL.........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Query vnhkyilpedwhlrfpSGSEiIQYAASHY.........DPDEQLLDRRRVEYDIFLLVEe   51
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Sbjct ....mdiisksgegnkYTIN.SAIAFVAYashidinttEFSKVLSGLRDFINDEAIRLG.   54
DSSP  ....llleeellllllEEEL.HHHHHHHHhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  hhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LHHHHHHHH.................
Query lhvldiirkgfgsvdefialansvsnrrkSRAG.KSLELHLEH.................   93
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Sbjct ............................gKISDgSFNKCNGDWyewligiraiefflese   86
DSSP  ............................lLLLHhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   93
ident                                                             
Sbjct tnfivvkmpnatsfdvmsiyksclsefiydlrsklslnnvnlitsnpdfsiidirgrree  146
DSSP  lleeeeellllllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeellllhhh


DSSP  .....................................hhhllllllllllllllllllhh
Query .....................................lfiehglrhfatqapdflfpsag  116
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Sbjct lksmlkdisfsnislstiseidnlyknfidyaelehiksflsvkttfrpdrrlqlahegs  206
DSSP  hhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllllleeelllllllhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleellhhhhllllll
Query ayhplrmlavkttckdrwrqilnhlftlqegvslaqyremresgvrlvvpsslhkkypea  176
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Sbjct lmkalythlqtrtwtinptgiryyaaatsignadviglktvathsitdvkslpqsavdei  266
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllllleeeeeellllhhhhhhhllllhhhhllllllllllllee


DSSP  lhhhlllhhhhhhhhll
Query vraelmtlgafiaeltg  193
ident                  
Sbjct fkinsvldvdsclshil  283
DSSP  eelllhhhhhhhhhhhl