No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.3

DSSP  ........................................................LHHH
Query ........................................................GKNA    4
ident                                                         |   
Sbjct epdddlervratlysldpdgdrtagvlrdtldqlydgqrtgrwnfdqlhktekthmGTLV   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhllllhhhllhhhhhlhHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhllleEEELllllLLLEEEEelleEEEEEEEEELLLE.EEELHHHHHhhhh
Query ERELVSILRgegfnAVRIptnpLPDIFATkgntLLSIECKSTWENK.VKVKEHQVRklld   63
ident |  |                    |             ||                    
Sbjct EINLHREFQ.....FGDG...fETDYEIA....GVQVDCKFSMSQGaWMLPPESIG....  104
DSSP  HHHHHHHHL.....LEEL...lLLLEEEL....LEEEEEEEELLLLlLLLLHHHLL....


DSSP  hhhlllleeeEEEEEEEHH....HLEEEEELLLL........llLEEE...eLLLLEEHH
Query flsmftmkgvPLIAIKFKQ....VHEWRVLVPEK........aeDIIV...tIDNSIPIE  108
ident                                                             
Sbjct ..........HICLVIWASdqqcAWTAGLVKVIPqflgtanrdlKRRLtpegRAQVVKLW  154
DSSP  ..........LEEEEEEEEllllEEEEEEEELLHhhllllllllLLLLlhhhHLLLEELL


DSSP  H...........................................................
Query D...........................................................  109
ident                                                             
Sbjct Pdhgklqenlllhipgdvrdqifsaksqhgqarvnelfrrvhgrligraviatvaqqddf  214
DSSP  Lllllllllhhhlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
ident                                                             
Sbjct mkrvrgsggarsilrpegiiilghqdkvandlglpvprkgqvvaarvvpadegdqrqtae  274
DSSP  hhhlllllllllllhhhleeeellllllllllllllllllleeeeeeeelllllllleee


DSSP  ...........hhhhhhhhhl
Query ...........lfkilekrie  119
ident                      
Sbjct iqgrrwavavpgdpiveapvv  295
DSSP  lllleeeelllllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  .....................................................LHHHHHH
Query .....................................................GKNAERE    7
ident                                                             
Sbjct epdddlervratlysldpdgdrtagvlrdtldqlydgqrtgrwnfdqlhktekTHMGTLV   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhllllhhhllhhhhHLHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEeeelllllllleEEEELLEEEEEEEEEElllEEEElhhHHHHhHHHHhl
Query LVSILRGEGFNavriptnplpdiFATKGNTLLSIECKSTwenKVKVkehQVRKlLDFLsm   67
ident      |   |                                                  
Sbjct EINLHREFQFG.......dgfetDYEIAGVQVDCKFSMS...QGAW...MLPPeSIGH..  105
DSSP  HHHHHHHHLLE.......ellllLEEELLEEEEEEEELL...LLLL...LLLHhHLLL..


DSSP  llleeEEEEEEEEHHHLEEEEELL...lLLLL............eeeellLLEE......
Query ftmkgVPLIAIKFKQVHEWRVLVP...eKAED............iivtidNSIP......  106
ident        |      |   |                                         
Sbjct .....ICLVIWASDQQCAWTAGLVkvipQFLGtanrdlkrrltpegraqvVKLWpdhgkl  160
DSSP  .....EEEEEEEELLLLEEEEEEEellhHHLLlllllllllllhhhhlllEELLllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  106
ident                                                             
Sbjct qenlllhipgdvrdqifsaksqhgqarvnelfrrvhgrligraviatvaqqddfmkrvrg  220
DSSP  lllhhhlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhlllllhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  106
ident                                                             
Sbjct sggarsilrpegiiilghqdkvandlglpvprkgqvvaarvvpadegdqrqtaeiqgrrw  280
DSSP  llllllllhhhleeeellllllllllllllllllleeeeeeeelllllllleeellllee


DSSP  ..hhhhhhhhhhhhl
Query ..iedlfkilekrie  119
ident                
Sbjct avavpgdpiveapvv  295
DSSP  eelllllllllllll