No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  .........LHHHLLLeeeelllllleeeeLHHHHHHHHLLLLlllLLHHHHHHHHHHHH
Query .........NLTNSNCveeykengktkiriKPFNALIELYHHQtptGSIKENLDKLENYV   51
ident                                          |                  
Sbjct vnhkyilpeDWHLRFP..............SGSEIIQYAASHYdpdEQLLDRRRVEYDIF   46
DSSP  llllllllhHHHLLLL..............LHHHHHHHHHHLLlhhHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLL..................LLLL.HHHHHHhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhl
Query KDVVKAKGL..................AIPT.SGAFSNtrgTWFEVMIAIQSWNYRvkre   92
ident   |     |                                   |               
Sbjct LLVEELHVLdiirkgfgsvdefialanSVSNrRKSRAG...KSLELHLEHLFIEHG....   99
DSSP  HHHHHHHHHhhhhhllllhhhhhhhhhHHHHhHHHHLL...LHHHHHHHHHHHLLL....


DSSP  lllEEEEELlllllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllLLEEEEelhhh
Query lndYLIIKMpnvktfdfrkifdnetreklhqleksllthkqqvrlitsnPDLLIIrqkdl  152
ident                                                  || |       
Sbjct ..lRHFATQ.......................................aPDFLFP.....  113
DSSP  ..lLLLLLL.......................................lLLLLLL.....


DSSP  llhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhHHLLlllhhheEEEEEEELLLLhHHHHhhhHHHHh
Query ikseynlpinklthenidvaltlfkDIEGkckwdslVAGVGLKTSLRpDRRLqlvHEGNi  212
ident                                           ||    ||        | 
Sbjct .......................saGAYH......pLRMLAVKTTCK.DRWR...QILN.  139
DSSP  .......................lhHHHL......lLLLLEEELLLL.LLLH...HHHL.


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeEEEELLLLLHH.HHHHLLLllhhhlllllllllLLLLeE
Query lkslfahlkmrywnpkaefkyYGASSEPVSKA.DDDALQTaathtivnvnstpeRAVDdI  271
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Sbjct .....................HLFTLQEGVSLaQYREMRE..............SGVR.L  163
DSSP  .....................LEEELLLLLLHhHHHHHHL..............LLLL.E


DSSP  EELL............lhhHHHHHHHHHHLl
Query FSLT............sfeDIDKMLDQIIKk  290
ident                                
Sbjct VVPSslhkkypeavraelmTLGAFIAELTG.  193
DSSP  ELLHhhhlllllllhhhllLHHHHHHHHLL.


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  lHHHLL.leeEELLllllEEEE..LHHHHHHHHllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query nLTNSN.cveEYKEngktKIRI..KPFNALIELyhhqtptgSIKENLDKLENYVKDVVKA   57
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Sbjct vNHKYIlpedWHLR....FPSGseIIQYAASHY........DPDEQLLDRRRVEYDIFLL   48
DSSP  lLLLLLllhhHHLL....LLLHhhHHHHHHHLL........LHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLL........................lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhll
Query KGL........................aipTSGAFSNTRGTWFEVMIAIQSWNyrvkrel   93
ident                                            |                
Sbjct VEElhvldiirkgfgsvdefialansvsnrRKSRAGKSLELHLEHLFIEHGLR.......  101
DSSP  HHHhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLHHHHHHHHHHHLLLLL.......


DSSP  lleeeeellllllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeelhhhl
Query ndyliikmpnvktfdfrkifdnetreklhqleksllthkqqvrlitsnpdlliirqkdli  153
ident                                                             
Sbjct ............................................................  101
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhlllllllhhhhhhHHLHhhhhlllllhhheeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhh
Query kseynlpinklthenidvALTLfkdiegkckwdslvagvglktslrpdrrlqlvhegnil  213
ident                     |                                       
Sbjct .................hFATQ.......................apdflfpsagayhpl  121
DSSP  .................lLLLL.......................llllllllhhhhlll


DSSP  hhhhhhhhhhhllllllleeeeeelllllhhhhhhlllllhhhllllllllllllleeee
Query kslfahlkmrywnpkaefkyygassepvskadddalqtaathtivnvnstperavddifs  273
ident                                                             
Sbjct rmlavkttckdrwrqilnhlftlqegvslaqyremresgvrlvvpsslhkkypeavrael  181
DSSP  llleeelllllllhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleellhhhhlllllllhhhl


DSSP  lLLHHHHHHHHHhhhll
Query lTSFEDIDKMLDqiikk  290
ident  |    |          
Sbjct mTLGAFIAELTG.....  193
DSSP  lLHHHHHHHHLL.....