No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  llleeeeeelllllhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeee
Query namaihvgiidqdpvrlvtplldhrtvsrhiifigdhtqtviyqrlsdvlnkrnistdff   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeell
Query eipagsntsaiksairelaetlkargeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvep  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeelllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query nsdclcwlypegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalel  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhh
Query gpglatlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfinee  240
ident                                                             
Sbjct ................................kseleekkselrhklkyvpheyieliei   28
DSSP  ................................llhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhLLHHHHHHHHHH.HHHHllllleeEEEEEEEEeeeelleeeeEEEEEEEEEL..
Query arrfanGEWLETLVHSTV.KQIQddmptiqDRSLNVQVyrqlgerevrNELDVATVVN..  297
ident          ||  |     |                               | |      
Sbjct arnstqDRILEMKVMEFFmKVYG......yRGKHLGGS..........RKPDGAIYTVgs   72
DSSP  lllhhhHHHHHHHHHHHHhHHLL......lEEEELLLL..........LLLLEEEELLll


DSSP  ..LEEEEEEEELLL..llllLLHHHHHHHHHHHHHH..................hhLEEE
Query ..NKLHIIECKTKG..mrdgDDTLYKLESLRDLLGG..................lqARAM  335
ident       |   |                                                 
Sbjct piDYGVIVDTKAYSggynlpIGQADEMQRYVEENQTrnkhinpnewwkvypssvteFKFL  132
DSSP  llLLEEEEEEELLLllllllHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllhhhhlllllllEEEE


DSSP  EEELLlLLHHHHHHHHHHL......LEEELhhhHHHHHHH.......hhhhhHLLL....
Query LVSFRpLRHNDITRAEDLG......LALIGpdeLKDLKTH.......ltqwfKAAG....  378
ident  ||      |       |        |         |                       
Sbjct FVSGH.FKGNYKAQLTRLNhitncnGAVLS...VEELLIGgemikagtltleEVRRkfnn  188
DSSP  EEELL.LLLLHHHHHHHHHhhhlleEEEEE...HHHHHHHhhhhhhllllhhHHHLllll


DSSP  ...ll
Query ...gn  380
ident      
Sbjct geinf  193
DSSP  eelll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kseleekkselrhklkyvpheyielieiarnstqdrilemkvmeffmkvygyrgkhlggs   60
DSSP  llhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellll


DSSP  .............lLLEEEEEE........LLLLL.HHHHHHHHLLL.............
Query .............nAMAIHVGI........IDQDP.VRLVTPLLDHR.............   25
ident                    |                                        
Sbjct rkpdgaiytvgspiDYGVIVDTkaysggynLPIGQaDEMQRYVEENQtrnkhinpnewwk  120
DSSP  lllleeeellllllLLEEEEEEelllllllLLHHHhHHHHHHHHHHHhlllllllllhhh


DSSP  .....lLLLEEEEEE.LHHHhhHHHHHHHHHHH.LLLEEEEEELlllllhhhhhHHHHHH
Query .....tVSRHIIFIG.DHTQtvIYQRLSDVLNK.RNISTDFFEIpagsntsaikSAIREL   78
ident             |          |      ||   |                        
Sbjct vypssvTEFKFLFVSgHFKG..NYKAQLTRLNHiTNCNGAVLSV..........EELLIG  168
DSSP  hlllllLLEEEEEEElLLLL..LHHHHHHHHHHhHLLEEEEEEH..........HHHHHH


DSSP  HHH....hHHHLleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllleeeeeelllll
Query AET....lKARGeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvepnsdclcwlypegnn  134
ident  |                                                          
Sbjct GEMikagtLTLE................................................  180
DSSP  HHHhhhllLLHH................................................


DSSP  leellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query dtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalelgpglatlnylattc  194
ident                                                             
Sbjct ............................................................  180
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhhhhhhhhllhhhhhh
Query rkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfineearrfangewletlv  254
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Sbjct ............................................................  180
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeeelleeeeeeeellllllll
Query hstvkqiqddmptiqdrslnvqvyrqlgerevrneldvatvvnnklhiiecktkgmrdgd  314
ident                                                             
Sbjct ............................................................  180
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllllhhhhhhhhhhlleeelhhhhhhhhhhhhhhh
Query dtlykleslrdllgglqaramlvsfrplrhnditraedlglaligpdelkdlkthltqwf  374
ident                                                             
Sbjct .....................................................evrrkfn  187
DSSP  .....................................................hhhllll


DSSP  hlllll
Query kaaggn  380
ident       
Sbjct ngeinf  193
DSSP  leelll