No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  lhhhllleeeelllllleeeelhhhhhhhhllllLLLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query nltnsncveeykengktkirikpfnalielyhhqTPTGSIkenldklenyvkdvvkakgl   60
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Sbjct ........................sqgvigifgdYAKAHD....................   16
DSSP  ........................lllhhhhhhhHHHHHL....................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHL....lLLEEEEELllllllLHHHhllhH
Query aiptsgafsntrgtwfevMIAIQSWNYRVKRE....lNDYLIIKMpnvktfDFRKifdnE  116
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Sbjct .................lAVGEVSKLVKKALSneypqLSFRYRDS.....iKKTE..inE   52
DSSP  .................lLHHHHHHHHHHHHHhhlllLLEEEELL.....eEHHH..hhH


DSSP  HHHH....HHHHHhhhhlllllLLLLLLLLL.EEEEELHHhllhhhhlllllllhhhhhh
Query TREK....LHQLEksllthkqqVRLITSNPD.LLIIRQKDlikseynlpinklthenidv  171
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Sbjct ALKKidpdLGGTL........fVSNSSIKPDgGIVEVKDD....................   84
DSSP  HHHHhlllLLLLL........lLLLLEELLLlLEEEEELL....................


DSSP  hhlhhhhhlllllhHHEEEEEEEEL.......................lllHHHHHhHHH
Query altlfkdiegkckwDSLVAGVGLKT.......................slrPDRRLqLVH  208
ident                  |     |                                    
Sbjct ...........ygeWRVVLVAEAKHqgkdiinirngllvgkrgdqdlmaagNAIER.SHK  132
DSSP  ...........lllEEEEEEEEEEElllhhhhhhlllllllllllllllllLHHHH.HHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhllllLLLEEEEEEL..........................llll
Query EGNILKSLFAHlkmrywnpkAEFKYYGASS..........................epvs  242
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Sbjct NISEIANFMLS........eSHFPYVLFLEgsnfltenisitrpdgrvvnleynsgilnr  184
DSSP  HHHHHHHHLLL........lLLLLEEEEEElllllllleeeellllleeeelllllllll


DSSP  hHHHHHLLL.......llhhHLLL...LLLLLLLllLEEEE.....lLLHHHHHHHHHHH
Query kADDDALQT.......aathTIVN...VNSTPERavDDIFS.....lTSFEDIDKMLDQI  287
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Sbjct lDRLTAANYgmpinsnlcinKFVNhkdKSIMLQA..ASIYTqgdgreWDSKIMFEIMFDI  242
DSSP  hHHLHHHHLlllllllllllEEELlllLLEEELL..LEEEEllllllLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HLL................
Query IKK................  290
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Sbjct STTslrvlgrdlfeqltsk  261
DSSP  HHHhhhhlhhhlhhhhhll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  lhhhllleeeelllllleeeelhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query nltnsncveeykengktkirikpfnalielyhhqtptgsikenldklenyvkdvvkakgl   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLL.llEEEE......ellllllllhhHHL
Query aiptsgafsntrgtwfevmiaiqswNYRVKREL.ndYLII......kmpnvktfdfrKIF  113
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Sbjct ................sqgvigifgDYAKAHDLavgEVSKlvkkalsneypqlsfryRDS   44
DSSP  ................lllhhhhhhHHHHHHLLlhhHHHHhhhhhhhhhllllleeeELL


DSSP  LhhHHHHHHH........hHHHHHlllllllllllllleEEEElhhhllhhhhlllllll
Query DneTREKLHQ........lEKSLLthkqqvrlitsnpdlLIIRqkdlikseynlpinklt  165
ident                       |                                     
Sbjct I..KKTEINEalkkidpdlGGTLF.......vsnssikpDGGI.................   78
DSSP  E..EHHHHHHhhhhhllllLLLLL.......lllleellLLLE.................


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhlllllhhHEEEEEEEELL...................lLHHHhhHH
Query henidvaltlfkdiegkckwdSLVAGVGLKTS...................lRPDRrlQL  206
ident                       |||                                   
Sbjct .........vevkddygewrvVLVAEAKHQGKdiinirngllvgkrgdqdlmAAGN..AI  127
DSSP  .........eeeellllleeeEEEEEEEELLLhhhhhhllllllllllllllLLLL..HH


DSSP  HHHhHHHHHHHHHHHHhhLLLLLLLEEEEEE.................llllLHHH.hHH
Query VHEgNILKSLFAHLKMryWNPKAEFKYYGAS.................sepvSKAD.dDA  248
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Sbjct ERS.HKNISEIANFML..SESHFPYVLFLEGsnfltenisitrpdgrvvnleYNSGilNR  184
DSSP  HHH.HHHHHHHHHHLL..LLLLLLEEEEEELllllllleeeellllleeeelLLLLllLL


DSSP  LL..LLLH...............hhlllLLLLlllllLEEEELLlhhHHHHhhHHHHLL.
Query LQ..TAAT...............htivnVNSTperavDDIFSLTsfeDIDKmlDQIIKK.  290
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Sbjct LDrlTAANygmpinsnlcinkfvnhkdkSIML.qaasIYTQGDG...REWD.sKIMFEIm  239
DSSP  HHhlHHHHlllllllllllleeelllllLEEE.llleEEELLLL...LLLL.hHHHHHHh


DSSP  ......................
Query ......................  290
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Sbjct fdisttslrvlgrdlfeqltsk  261
DSSP  hhhhhhhhhhlhhhlhhhhhll