No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct namaihvgiidqdpvrlvtplldhrtvsrhiifigdhtqtviyqrlsdvlnkrnistdff   60
DSSP  llleeeeeelllllhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct eipagsntsaiksairelaetlkargeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvep  120
DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nsdclcwlypegnndtqvqdritiadyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalel  180
DSSP  llleeeeeelllllleellllllhhhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gpglatlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlllsdlveakiasyengiltfinee  240
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellhh


DSSP  .LLHH.HHHHHHHHHHHHHHLL......LEEE.ELHH.........hLLLLEEEELLLLE
Query .MYRK.GAQAERELIKLLEKHG......FAVV.RSAG.........sKKVDLVAGNGKKY   42
ident       |   |                                       |       | 
Sbjct aRRFAnGEWLETLVHSTVKQIQddmptiQDRSlNVQVyrqlgerevrNELDVATVVNNKL  300
DSSP  hHHHHhLLHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEeEEEEeeeelleeeeEEEEEEEEELLEE


DSSP  EEEEEEEellllEEEL..HHHHHHHHHHHHHHL...LEEEEEEEEllleeeeeelLLLLl
Query LCIEVKVtkkdhLYVG..KRDMGRLIEFSRRFG...GIPVLAVKFlnvgwrfievSPKIe   97
ident   || |                  |       |       |                   
Sbjct HIIECKT.....KGMRdgDDTLYKLESLRDLLGglqARAMLVSFR.plrhnditrAEDLg  354
DSSP  EEEEEEL.....LLLLllLLHHHHHHHHHHHHHhhhLEEEEEELL.lllhhhhhhHHHHl


DSSP  leeelHHHL....lLHHHHLLHhhlll
Query kfvftPSSG....vSLEVLLGIqktle  120
ident      |         |           
Sbjct laligPDELkdlktHLTQWFKA.aggn  380
DSSP  leeelHHHHhhhhhHHHHHHHL.llll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  .........lLHHHhHHHHHHHHHhhHLLLEEEELHH.......................
Query .........mYRKGaQAERELIKLleKHGFAVVRSAG.......................   28
ident                                                             
Sbjct namaihvgiiDQDP.VRLVTPLLD..HRTVSRHIIFIgdhtqtviyqrlsdvlnkrnist   57
DSSP  llleeeeeelLLLL.HHHHHHHHL..LLLLLLEEEEEelhhhhhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  .................hlllleeeellllEEEEEEEeelllleeeLHHHHHHHHHHHhh
Query .................skkvdlvagngkkYLCIEVKvtkkdhlyvGKRDMGRLIEFSrr   71
ident                                                             
Sbjct dffeipagsntsaiksairelaetlkargeEVKFNAS...cglrhrLLSAYEVFRSYH..  112
DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllEEEEELL...lllhhhHHHHHHHHHHLL..


DSSP  hllEEEEEEEELlLEEEEEELlllllleeelhhHLLLH......................
Query fggIPVLAVKFLnVGWRFIEVspkiekfvftpsSGVSL......................  109
ident     |   |                                                   
Sbjct ...WPIFVVEPN.SDCLCWLY..........peGNNDTqvqdritiadyltifgargefn  158
DSSP  ...LLEEEELLL.LLEEEEEE..........llLLLLEellllllhhhhhhhllleeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
ident                                                             
Sbjct spqldqqlyqlgerwasnalelgpglatlnylattcrkeqkldvelsdkqqgyrelnlll  218
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeellhhhhllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
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Sbjct sdlveakiasyengiltfineearrfangewletlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvy  278
DSSP  hhhhhllleeeelleeeellhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
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Sbjct rqlgerevrneldvatvvnnklhiiecktkgmrdgddtlykleslrdllgglqaramlvs  338
DSSP  eeelleeeeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeee


DSSP  ...............................hhhllhhhlll
Query ...............................evllgiqktle  120
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Sbjct frplrhnditraedlglaligpdelkdlkthltqwfkaaggn  380
DSSP  lllllhhhhhhhhhhlleeelhhhhhhhhhhhhhhhhlllll