No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nltnsncveeykengktkirikpfnalielyhhqtptgsikenldklenyvkdvvkakgl   60
DSSP  lhhhllleeeelllllleeeelhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ......leeeeehhhllLHHHHHHHHLLLE.......eeeELLL................
Query ......vkvvvdsrelrSEVVKRLKLLGVK.......levKTLD................   31
ident                             ||                              
Sbjct aiptsgafsntrgtwfeVMIAIQSWNYRVKrelndyliikMPNVktfdfrkifdnetrek  120
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhlllleeeeeLLLLllllhhhhllhhhhhh


DSSP  ....................LLLEELL.................................
Query ....................VGDYIIS.................................   38
ident                       |  |                                  
Sbjct lhqleksllthkqqvrlitsNPDLLIIrqkdlikseynlpinklthenidvaltlfkdie  180
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllLLLEEEEelhhhllhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhl


DSSP  .......LLEEEEEEEHhhHHHHhhlllHHHHHHHHHHHL................LEEE
Query .......EDVAIERKSAndLIQSiidggLFDQVKRLKEAY................SRPI   75
ident               |    |            |                           
Sbjct gkckwdsLVAGVGLKTS..LRPD....rRLQLVHEGNILKslfahlkmrywnpkaeFKYY  234
DSSP  llllhhhEEEEEEEELL..LLHH....hHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllLEEE


DSSP  EEEELLllllllllhhhHHHHHHHHHHL.............LLLL.EEEELLHHHHHHHH
Query MIVEGSlygirnvhpnaIRGAIAAVTVD.............FGVP.IIFSSTPEETAQYI  121
ident                        |                   |  |      |      
Sbjct GASSEP..........vSKADDDALQTAathtivnvnstpeRAVDdIFSLTSFEDIDKML  284
DSSP  EEELLL..........lLHHHHHHLLLLlhhhlllllllllLLLLeEEELLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHhhhl
Query FLIAKReqee  131
ident   | |     
Sbjct DQIIKK....  290
DSSP  HHHHLL....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nltnsncveeykengktkirikpfnalielyhhqtptgsikenldklenyvkdvvkakgl   60
DSSP  lhhhllleeeelllllleeeelhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ...........leeeeehhhLLLHhHHHHHHLLLEEE.........eELLL.........
Query ...........vkvvvdsreLRSEvVKRLKLLGVKLE.........vKTLD.........   31
ident                                                             
Sbjct aiptsgafsntrgtwfevmiAIQS.WNYRVKRELNDYliikmpnvktFDFRkifdnetre  119
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH.HHHHHHHLLLLEeeeellllllLLHHhhllhhhhh


DSSP  .......................llLEEL...............................
Query .......................vgDYII...............................   37
ident                            |                                
Sbjct klhqleksllthkqqvrlitsnpdlLIIRqkdlikseynlpinklthenidvaltlfkdi  179
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllllllleEEEElhhhllhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhh


DSSP  .....lLLEEEEEEEHH....hHHHHhhlllhHHHHHHHHHH.......lLEEEEEEELL
Query .....sEDVAIERKSAN....dLIQSiidgglFDQVKRLKEA.......ySRPIMIVEGS   81
ident                                                            |
Sbjct egkckwDSLVAGVGLKTslrpdRRLQ.lvhegNILKSLFAHLkmrywnpkAEFKYYGASS  238
DSSP  lllllhHHEEEEEEEELlllhhHHHH.hhhhhHHHHHHHHHHhhhhllllLLLEEEEEEL


DSSP  LLlllllLHHHHHHHHHHH.......hHLLL.llEEEEL.....LHHHHHHHHHHHhhhh
Query LYgirnvHPNAIRGAIAAV.......tVDFG.vpIIFSS.....TPEETAQYIFLIakre  128
ident                  |                    |             |       
Sbjct EP....vSKADDDALQTAAthtivnvnSTPEravDDIFSltsfeDIDKMLDQIIKK....  290
DSSP  LL....lLHHHHHHLLLLLhhhlllllLLLLlllLEEEElllhhHHHHHHHHHHLL....


DSSP  hhl
Query qee  131
ident    
Sbjct ...  290
DSSP  ...