No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.8

DSSP  .....................lhhhhllllhhhhlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhh
Query .....................kpfenhlksvddlkttyeeYRAGFIAFALEKNKRstpyi   39
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Sbjct nltnsncveeykengktkirikpfnalielyhhqtptgsiKENLDKLENYVKDVV.....   55
DSSP  lhhhllleeeelllllleeeelhhhhhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHHHHHH.....


DSSP  hhhhhhhhhhlllllhhhhhhlhhhhhhhhhhllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query eraralkvaasvaktpkdllylediqdallyasgisdkakkflteddkkesinnlienfl   99
ident                                                             
Sbjct ............................................................   55
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLeeeeell
Query epageefidelifryllfqgdslGGTMRNIAGALAQQKLTRAIISALDIANIPykwldsr  159
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Sbjct ..............kakglaiptSGAFSNTRGTWFEVMIAIQSWNYRVKRELN.......   94
DSSP  ..............hhhllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.......


DSSP  lllllleeelllllllhhhheeeeeeeelleEEEEEEEE.....EELL............
Query dkkytnwmdkpeddyeletfakgiswtingkHRTLMYNI.....TVSL............  202
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Sbjct ...............................DYLIIKMPnvktfDFRKifdnetreklhq  123
DSSP  ...............................LEEEEELLlllllLHHHhllhhhhhhhhh


DSSP  ..............lLEEEEEEEEELLL...............................L
Query ..............vKKNVDICLFNCEP...............................Q  217
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Sbjct leksllthkqqvrliTSNPDLLIIRQKDlikseynlpinklthenidvaltlfkdiegkC  183
DSSP  hhhhhhlllllllllLLLLLEEEEELHHhllhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhlllL


DSSP  LHHHEEEEEEEELLllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......LLLEEEEEELL
Query QPEKYLLLGELKGGidpagADEHWKTANTALTRIRNKFSEKG.......LSPKTIFIGAA  270
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Sbjct KWDSLVAGVGLKTS....lRPDRRLQLVHEGNILKSLFAHLKmrywnpkAEFKYYGASSE  239
DSSP  LHHHEEEEEEEELL....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLLEEEEEELL


DSSP  .LLHHHHHHHHHH..........hhHLLLLEEEELLLHHHHHHHHHHHHLL
Query .IEHSMAEEIWDQ..........lqSGSLTNSANLTKTEQVGSLCRWIINI  310
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Sbjct pVSKADDDALQTAathtivnvnstpERAVDDIFSLTSFEDIDKMLDQIIKK  290
DSSP  lLLHHHHHHLLLLlhhhllllllllLLLLLEEEELLLHHHHHHHHHHHHLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  lhhhhllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhh
Query kpfenhlksvddlkttyeeyragfiafaleknkrstpyieraralkvaasvaktpkdlly   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lediqdallyasgisdkakkflteddkkesinnlienflepageefidelifryllfqgd  120
ident                                                             
Sbjct ...................................nltnsncveeykengktkirikpfn   25
DSSP  ...................................lhhhllleeeelllllleeeelhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllleeelllllllhhhhe
Query slggtmrniagalaqqkltraiisaldianipykwldsrdkkytnwmdkpeddyeletfa  180
ident                                                             
Sbjct alielyhhqtptgsikenldklenyvkdvvkakglaiptsgafsntrgtwfevmiaiqsw   85
DSSP  hhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeeelLEEEEEEEEEE................................eLLLLeeee
Query kgiswtinGKHRTLMYNIT................................vSLVKknvd  208
ident                                                             
Sbjct nyrvkrelNDYLIIKMPNVktfdfrkifdnetreklhqleksllthkqqvrlITSN...p  142
DSSP  hhhhhhllLLEEEEELLLLllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLL...l


DSSP  EEEEELL.................................lllhhHEEEEEEEEllllhh
Query ICLFNCE.................................pqqpeKYLLLGELKggidpa  235
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Sbjct DLLIIRQkdlikseynlpinklthenidvaltlfkdiegkckwdsLVAGVGLKT......  196
DSSP  LEEEEELhhhllhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhlllllhhhEEEEEEEEL......


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL............lLLEEEEEELLllhhhHHHHHHHH
Query gadehWKTANTALTRIRNKFSEKG............lSPKTIFIGAAiehsmAEEIWDQL  283
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Sbjct ...slRPDRRLQLVHEGNILKSLFahlkmrywnpkaeFKYYGASSEP....vSKADDDAL  249
DSSP  ...llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllllLEEEEEELLL....lLHHHHHHL


DSSP  HH...............llLLEEEelllhhhhhhhhhhhhll
Query QS...............gsLTNSAnltkteqvgslcrwiini  310
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Sbjct QTaathtivnvnstperavDDIFS.ltsfedidkmldqiikk  290
DSSP  LLllhhhllllllllllllLEEEE.lllhhhhhhhhhhhhll