No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.0

DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhHHHHHHHHHHhhlHHHHHHHhhHHHHL.
Query mynlhrekifmsynqnkqylednpeiqekielYGLNLLNEVIsdnEEEIRADynEANFL.   59
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Sbjct ................................SLRSDLINAL...YDENQKY..DVCGIi   23
DSSP  ................................LHHHHHHHHH...HHHHHHL..LLLEEe


DSSP  ...hHHHLlllllllllllllLLLL..LHHHHHHHLhHHHHHHHHLLllLEEEL..lLLL
Query ...hPFWMnyppldrgkmpkgDQIP..WIEVGEKAVgSKLTRLVSQRedITVRE..iGLP  112
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Sbjct saegKIYP............lGSDTavLSTIFELFS.RPIINKIAEK..HGYIVeepKQQ   68
DSSP  llllLEEE............lLLLHhhHHHHHHHHH.HHHHHHHHHH..LLLEEellLLL


DSSP  L.LLLEEEeEELHhhhhhllllLLEEEEEEEELLLLL...LLLLlEEEELHhhlllllll
Query T.GPDERYlLTSPtiysltngfTDSIMMFVDIKSVGP...RDSDyDLVLSPnqvsgngdw  168
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Sbjct NhYPDFTL.YKPS.........EPNKKIAIDIKTTYTnkeNEKI.KFTLGG.........  108
DSSP  LlLLLEEE.ELLL.........LLLLEEEEEEEEEEElllLLLL.LLEEEE.........


DSSP  llllllllllleeeelllleeeELLLL.........LLEEellllleeEEEEEEEEEEEE
Query aqleggiqnnqqtiqgprssqiFLPTI.........PPLYilsdgtiaPVVHLFIKPIYA  219
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Sbjct ......................YTSFIrnntknivyPFDQ........YIAHWIIGYVYT  138
DSSP  ......................LLLLLlllllllllLHHH........EEEEEEEEEEEE


DSSP  EHHHLLL.............LLLEEEEEEEEEEELlhhhhhllllhhhlhhhllLEEELL
Query MRSLTKG.............DTGQSLYKIKLASVPnglglfcnpgyafdsaykfLFRPGK  266
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Sbjct RVATRKSslktyninelneiPKPYKGVKVFLQDKW................viaGDLAGS  182
DSSP  ELLLLLLllllllhhhhhhlLLLEEEEEEEEEEHH................hhlLLLLLL


DSSP  LLllllllLLLEEEE.........HHHHlLLLL...........................
Query DDrtksllQKRVRVD.........LRVLdKIGP...........................  290
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Sbjct GN......TTNIGSIhahykdfveGKGI.FDSEdefldywrnyertsqlrndkynnisey  235
DSSP  LL......LLEEELLlllhhhhhhLLLL.LLLHhhhhhhhhlllllhhhhllllllhhhh


DSSP  leeeeelll
Query rvmtidmdk  299
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Sbjct rnwiyrgrk  244
DSSP  hhhhhhlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLHHHHHHHHHHHHHLH
Query mynlhrekifmsynqnkqylednpeiqekielyglnllnevisDNEEEIRADYNEANFLH   60
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Sbjct ...........................................SLRSDLINALYDENQKY   17
DSSP  ...........................................LHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  ..hhhllllllllllllLLLL..LLLHhhHHHHLhHHHHHHHHllllleeellllllllL
Query ..pfwmnyppldrgkmpKGDQ..IPWIevGEKAVgSKLTRLVSqreditvreiglptgpD  116
ident                                     |                       
Sbjct dvcgiisaegkiyplgsDTAVlsTIFElfSRPII.NKIAEKHG.yiveepkqqnhypdfT   75
DSSP  llleeellllleeelllLHHHhhHHHHhhHHHHH.HHHHHHLL.leeelllllllllleE


DSSP  EEEEEelhhhhhhlllllleEEEEEEELLLLL........LLLLLE.......eeeLHHH
Query ERYLLtsptiysltngftdsIMMFVDIKSVGP........RDSDYD.......lvlSPNQ  161
ident                           |                                 
Sbjct LYKPS..............ePNKKIAIDIKTTytnkenekIKFTLGgytsfirnntKNIV  121
DSSP  EELLL..............lLLLEEEEEEEEEeellllllLLLEEEelllllllllLLLL


DSSP  LLlllllllllllllllleeeelllleeeelllllleeellllleeeeEEEEEEEEEEEH
Query VSgngdwaqleggiqnnqqtiqgprssqiflptipplyilsdgtiapvVHLFIKPIYAMR  221
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Sbjct YP...........................................fdqYIAHWIIGYVYT  138
DSSP  LL...........................................hhhEEEEEEEEEEEE


DSSP  ..................hhllllLLEEEeEEEEEeellhhhhhllllhhhlhhhlllee
Query ..................sltkgdTGQSLyKIKLAsvpnglglfcnpgyafdsaykflfr  263
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Sbjct rvatrksslktyninelneipkpyKGVKV.FLQDK.................wviagdla  180
DSSP  ellllllllllllhhhhhhlllleEEEEE.EEEEH.................hhhlllll


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Query pgkddrtksllqkrvrvdlrvldKIGPR............................vmti  295
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Sbjct gsgnttnigsihahykdfvegkgIFDSEdefldywrnyertsqlrndkynniseyrnwiy  240
DSSP  lllllleeelllllhhhhhhlllLLLLHhhhhhhhhlllllhhhhllllllhhhhhhhhh


DSSP  elll
Query dmdk  299
ident     
Sbjct rgrk  244
DSSP  hlll