No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=13.7

DSSP  lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttv   60
ident                                                             
Sbjct .......................mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrh   37
DSSP  .......................llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  lLLLL..LHHH.................................................
Query tALKV..SAEE.................................................   69
ident   |                                                         
Sbjct yPLYIggEWVDtkermvslnpsapsevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqed   97
DSSP  eLEEEllEEELllleeeeeelleeeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh


DSSP  ......hhhhhhhLLHHHHH...............HHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL...
Query ......iaaaserLSDELKQ...............AMAVAVKNIETFHTAQ..KLPP...  103
ident                                    |                        
Sbjct rsrlllkaaalmrRRKRELEatlvyevgknwveasADVAEAIDFIEYYARAalRYRYpav  157
DSSP  hhhhhhhhhhhhhHLHHHHHhhhhhhhlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLlll


DSSP  EEEEEeLLEEEEEEEEELLEEEEELLLllllLHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEELLLLL
Query VDVETqPGVRCQQVTRPVASVGLYIPGgsapLFSTVLMLATPASIAGCkKVVLCSPPPIA  163
ident   |   ||        |        |                    |   |         
Sbjct EVVPY.PGEDNESFYVPLGAGVVIAPW..nfPVAIFTGMIVGPVAVGN.TVIAKPAEDAV  213
DSSP  LLLLL.LLEEEEEEEEELLEEEEELLL..llLLHHHHHHHHHHHHLLL.EEEEELLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL.......llLEEEELlhHHHHHHHHHLlllllLLLEEELLLLHHHHHHHH
Query DEILYAAQLC.......gvQDVFNVggAQAIAALAFGtesvpKVDKIFGPGNAFVTEAKR  216
ident                                | |            |   |   |     
Sbjct VVGAKVFEIFheagfppgvVNFLPGvgEEVGAYLVEH....pRIRFINFTGSLEVGLKIY  269
DSSP  HHHHHHHHHHhhhllllllEEELLLllLHHHHHHHLL....lLLLEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLL.....lLEELLLLLlLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHH.LLLLL...LEEEE
Query QVSQRLD.....gAAIDMPAGpSEVLVIADSGATPDFVASDLLSQA.EHGPD...SQVIL  267
ident     ||              |      | |  |  |  |      |             |
Sbjct EAAGRLApgqtwfKRAYVETG.GKNAIIVDETADFDLAAEGVVVSAyGFQGQkcsAASRL  328
DSSP  HHHLLLLllllllLEEEEELL.LLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHhHHHHLlllLEEEE


DSSP  EELLHhHHHHHHHHHHHHHHLLL.......LLHH..........................
Query LTPAAdMARRVAEAVERQLAELP.......RAET..........................  294
ident           | | |      |                                      
Sbjct ILTQG.AYEPVLERVLKRAERLSvgpaeenPDLGpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvl  387
DSSP  EEEHH.HHHHHHHHHHHHHLLLLlllhhhlLLLLllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeee


DSSP  ...........hHHHH.................LLLEEEELLLHHHHHHHHHHH.LLLEE
Query ...........aRQAL.................NASRLIVTKDLAQCVEISNQY.GPEHL  325
ident                                       |  || |   |  |        
Sbjct ggkrlegegyfiAPTVftevppkariaqeeifgPVLSVIRVKDFAEALEVANDTpYGLTG  447
DSSP  llllllllllllLLEEeellllllhhhllllllLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLlLLLEE


DSSP  EEELL...LHHHHHHHLlLLLEEEELllLLHHHHhHLLLLLLlLLLLLHhhlLLLL....
Query IIQTR...NARELVDSItSAGSVFLGdwSPESAGdYASGTNHvLPTYGYtatCSSL....  378
ident     |               |                                       
Sbjct GVYSRkreHLEWARREF.HVGNLYFN..RKITGA.LVGVQPF.GGFKLS.gtNAKTgald  501
DSSP  EEELLlhhHHHHHHHHL.LLLEEEEL..LLLLLL.LLLLLLL.LLLHHH.llLLLLllhh


DSSP  LHHHHEEEEEEEEElhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query GLADFQKRMTVQELskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
ident  |  |     | |                                        
Sbjct YLRLFLEMKAVAER......................................f  516
DSSP  HHHLLEEEEEEEEE......................................l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  .....llEEEHHhllhhhhHHHLLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query .....ntIIDWNsctaeqqRQLLMRpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakf   55
ident                       |                                     
Sbjct psevvgtTAKAG...kaeaEAALEA...................................   82
DSSP  eeeeeeeEELLL...hhhhHHHHHH...................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeee
Query dkttvtalkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgvrcq  115
ident                                                             
Sbjct ............................................................   82
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeelleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhlll
Query qvtrpvasvglyipggsaplfstvlmlatpasiagckkvvlcspppiadeilyaaqlcgv  175
ident                                                             
Sbjct ..........................awkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkrel  116
DSSP  ..........................hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  leeeellhhhhhhhhhhllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhllllleelLLLLLLE
Query qdvfnvggaqaiaalafgtesvpkvdkifgpgnafvteakrqvsqrldgaaidMPAGPSE  235
ident                                                             
Sbjct eatlvyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesFYVPLGA  176
DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeEEEELLE


DSSP  EEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHLLLllLEEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhh
Query VLVIADSGATPDFVASDLLSQAEHGpdSQVILLTPAaDMARRVAEAVERQLAELpraeta  295
ident   |||                   |    ||      |     |   |            
Sbjct GVVIAPWNFPVAIFTGMIVGPVAVG..NTVIAKPAE.DAVVVGAKVFEIFHEAG......  227
DSSP  EEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LEEEEELLH.HHHHHHHHHHHHHHHHL......


DSSP  HHHHlLLEEEELLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEELL..LHHHHHHHLL.......llLEEE
Query RQALnASRLIVTKDLAQCVEISNQYGPEHLIIQTR..NARELVDSIT.......saGSVF  346
ident                                                             
Sbjct FPPG.VVNFLPGVGEEVGAYLVEHPRIRFINFTGSleVGLKIYEAAGrlapgqtwfKRAY  286
DSSP  LLLL.LEEELLLLLLHHHHHHHLLLLLLEEEEELLhhHHHHHHHHHLlllllllllLEEE


DSSP  ELLL........................................................
Query LGDW........................................................  350
ident                                                             
Sbjct VETGgknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrliltqgayepvlervlkra  346
DSSP  EELLlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  350
ident                                                             
Sbjct erlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiaptvfte  406
DSSP  lllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  350
ident                                                             
Sbjct vppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggvysrkrehlewarrefhv  466
DSSP  lllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlll


DSSP  .........................llhhHHHHLLllllllllllhhhllllllhhhhee
Query .........................spesAGDYASgtnhvlptygytatcsslgladfqk  385
ident                                                             
Sbjct gnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaKTGALD.........................  501
DSSP  leeeelllllllllllllllllhhhllllLLLLHH.........................


DSSP  eeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query rmtvqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
ident                                               
Sbjct ...............................ylrlflemkavaerf  516
DSSP  ...............................hhhlleeeeeeeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  .................................lleeehhhllhhhhhhhlllllllllh
Query .................................ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisase   27
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhh
Query sitrtvndildnvkargdealreysakfdkttvtalkvsaeeiaaaserlsdelkqamav   87
ident                                                             
Sbjct psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhHHHHL.LLLL...............................leeeeeeLLEEEE
Query avknieTFHTA.QKLP...............................pvdvetqPGVRCQ  115
ident           |                                                 
Sbjct vyevgkNWVEAsADVAeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplGAGVVI  180
DSSP  hhhhllLHHHHhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelLEEEEE


DSSP  EEEE........................................................
Query QVTR........................................................  119
ident                                                             
Sbjct APWNfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
DSSP  LLLLlllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll


DSSP  ................................................eLLEEEEELLLL
Query ................................................pVASVGLYIPGG  131
ident                                                             
Sbjct eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDET  300
DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELLL


DSSP  lllLHHHHHHHHHHHHH..HLLL..eEEEEELLLLLHHHHHHHHHLL.............
Query sapLFSTVLMLATPASI..AGCK..kVVLCSPPPIADEILYAAQLCG.............  174
ident               |             |          |                    
Sbjct .adFDLAAEGVVVSAYGfqGQKCsaaSRLILTQGAYEPVLERVLKRAerlsvgpaeenpd  359
DSSP  .llHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLlleEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHlllllllhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  174
ident                                                             
Sbjct lgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiaptvftevppkariaqeeif  419
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhlllll


DSSP  ..lLEEEEL.LHHHHHHHHHHLllllllLLEEELLL.LHHHHHHHHHHhhllllLEELLl
Query ..vQDVFNV.GGAQAIAALAFGtesvpkVDKIFGPG.NAFVTEAKRQVsqrldgAAIDMp  230
ident      |  |   | |                           |  |              
Sbjct gpvLSVIRVkDFAEALEVANDT....pyGLTGGVYSrKREHLEWARRE...fhvGNLYF.  471
DSSP  lleEEEEEElLHHHHHHHHHLL....llLLEEEEELlLHHHHHHHHHH...lllLEEEE.


DSSP  lllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query agpsevlviadsgatpdfvasdllsqaehgpdsqvilltpaadmarrvaeaverqlaelp  290
ident                                                             
Sbjct ..................................nrkitgalvgvqpfggfklsgtnakt  497
DSSP  ..................................lllllllllllllllllhhhllllll


DSSP  llhhhhhhhLLLEEEELLLhhhhhhhhhhhllleeeeelllhhhhhhhllllleeeelll
Query raetarqalNASRLIVTKDlaqcveisnqygpehliiqtrnarelvdsitsagsvflgdw  350
ident                                                             
Sbjct galdylrlfLEMKAVAERF.........................................  516
DSSP  llhhhhhllEEEEEEEEEL.........................................


DSSP  llhhhhhhllllllllllllhhhllllllhhhheeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query spesagdyasgtnhvlptygytatcsslgladfqkrmtvqelskegfsalastietlaaa  410
ident                                                             
Sbjct ............................................................  516
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query erltahknavtlrvnalkeqa  431
ident                      
Sbjct .....................  516
DSSP  .....................