No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=39.7

DSSP  lllleeelleeellLLLEEEEEELLLLEEEE.EEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query mqhkllingelvsgEGEKQPVYNPATGDVLL.EIAEASAEQVDAAVRAADAAFAEWGQTT   59
ident                       |  ||  |           |  |  ||           
Sbjct ..............TDNVFYATNAFTGEALPlAFPVHTEVEVNQAATAAAKVARDFRRLN   46
DSSP  ..............LLLEEEEELLLLLLEEEeEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLL..L
Query PKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFnDEIPAIVDVFRFFAGAAR..C  117
ident    ||  |   |   |                |       ||       | ||       
Sbjct NSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLT.GEIARTANQLRLFADVVNsgS  105
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHhlH


DSSP  LLLLLLEEEEL......LEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHH..HHHHHHHHHLLLEE
Query LNGLAAGEYLE......GHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMA..AWKLAPALAAGNCV  169
ident                            || ||     | ||         | |||||  |
Sbjct YHQAILDTPNPtraplpKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAGCPV  165
DSSP  HHLEEEELLLLllllllLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHLLLE


DSSP  EEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.....LLLLEEELLLLLLLLHHHHHLLLLEEEEEEEL
Query VLKPSEITPLTALKLAELAKDIF.....PAGVVNILFGRGKTVGDPLTGHPKVRMVSLTG  224
ident   |     | |    ||           |      | |     |  |  ||    |  ||
Sbjct IVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqlPQAIFTLLQGNQRALGQALVSHPEIKAVGFTG  225
DSSP  EEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLHHHEEEELLLLLHHHHHHHHLLLLLEEEEEL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHH..LLEEEEELLLLLEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHLLHHHHLLL
Query SIATGEHIISHTASS..IKRTHMELGGKAPVIVFDDAD..IEAVVEGVRTFGYYNAGQDC  280
ident |   |                  |||   |   |  |                   || |
Sbjct SVGGGRALFNLAHERpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGCGQFC  285
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHHHLLL


DSSP  LLLLEEEEELL.LHHHHHHHHHHHHHLLLLllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query TAACRIYAQKG.IYDTLVEKLGAAVATLKSgapddestelGPLSSLAHLERVGKAVEEAK  339
ident |      |          |                       |            |    
Sbjct TKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP..........STLLTPGIRDSYQSQVVSRG  335
DSSP  LLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........LLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLEEEELlLLLLlllLLLLLEEEELL...LLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHH
Query ATGHIKVITGgEKRKgngYYYAPTLLAGA...LQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVV  396
ident     | |              |  |                | |||        |     
Sbjct SDDGIDVTFS.QAES...PCVASALFVTSsenWRKHPAWEEEIFGPQSLIVVCENVADML  391
DSSP  LLLLEEEEEL.LLLL...LLLLLEEEEEEhhhHHHLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLLEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLL.LLLLLL..LLLLLLHH
Query NWANDSQYGLASSVWTK..DVGRAHRVSARL..QYGCTWVNTH.FMLVSE..MPHGGQKL  449
ident          |         |         ||    |    |           | |||   
Sbjct SLSEMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWpTGVEVGyaMVHGGPYP  451
DSSP  HHHHLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLlLLLLLLllLLLLLLLL


DSSP  HEE...LLLLHHHHHHLLEEEEEEEE.........................el
Query SGY...GKDMSLYGLEDYTVVRHVMV.........................kh  474
ident                                                      
Sbjct ASThsaSTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  LLLlllLLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.9

DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
Query mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
ident                                                             
Sbjct ..............................................tdnvfyatnaftge   14
DSSP  ..............................................llleeeeellllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlLLHH..........................
Query kvraecllkladvieengqvfaelesrncgKPLH..........................   94
ident                                                             
Sbjct alplafpvhtevevnqaataaakvardfrrLNNSkrasllrtiaselearsddiiarahl   74
DSSP  eeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  .........................hhHHLHhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeell
Query .........................saFNDEipaivdvfrffagaarclnglaageyleg  129
ident                                                             
Sbjct etalpevrltgeiartanqlrlfadvvNSGS.............................  105
DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLH.............................


DSSP  eeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhl
Query htsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitpltalklaelak  189
ident                                                             
Sbjct ............................................................  105
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelLL
Query difpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassikrthmelGG  249
ident                                                            |
Sbjct ...............................yhqaildtpnptraplpkpdirrqqiaLG  134
DSSP  ...............................hhleeeellllllllllllleeeeeeeLL


DSSP  LLEEEELLLlLHHH..HHHH.HHHHLLHHhhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHl
Query KAPVIVFDDaDIEA..VVEG.VRTFGYYNagqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVAt  306
ident    |         |     |                            |           
Sbjct PVAVFGASN.FPLAfsAAGGdTASALAAG......CPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQ.  186
DSSP  LEEEELLLL.LLLLllLLLHhHHHHHHHL......LLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHH.


DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeELLLLlllllllLLLEeee
Query lksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikviTGGEKrkgngyyYAPTlla  366
ident                                                        |    
Sbjct .........................................ALKQE.......QLPQ...  195
DSSP  .........................................HHHHH.......LLLH...


DSSP  llllllhhhhlllllLEEEEEEELLhHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL
Query galqddaivqkevfgPVVSVTPFDNeEQVVNWANDSQYGLASSVWTkDVGRAHRVSARLQ  426
ident                                         |       ||          
Sbjct ...............AIFTLLQGNQ.RALGQALVSHPEIKAVGFTG.SVGGGRALFNLAH  238
DSSP  ...............HHEEEELLLL.LHHHHHHHHLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHH


DSSP  ....lLEEEEL.................................................
Query ....yGCTWVN.................................................  433
ident                                                             
Sbjct erpepIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpe  298
DSSP  hllllLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  433
ident                                                             
Sbjct tqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfv  358
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  433
ident                                                             
Sbjct tssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypqvsql  418
DSSP  eehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  .............................................llllllllllllllh
Query .............................................thfmlvsemphggqk  448
ident                                                             
Sbjct iprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqal  478
DSSP  hhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeell


DSSP  hheellllhhhhhhlleeeeeeeeel
Query lsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
ident                           
Sbjct pesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lhhhllhhhllllllllleeelllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................................................lllleeel
Query ....................................................mqhkllin    8
ident                                                             
Sbjct learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll


DSSP  leeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
Query gelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecll   68
ident                                                             
Sbjct lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeel
Query kladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclnglaageyle  128
ident                                                             
Sbjct aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLH...hHHHHHhHHHHHHL......lLEEEEELLLL.LL
Query ghtsmirrdplGVVASIAPWNYP...lMMAAWkLAPALAA......gNCVVLKPSEI.TP  178
ident                              |                    |         
Sbjct pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakaDLADQ.FVASMTMgcgqfctKPGVVFALNTpET  299
DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhllLHHHH.HHHHHLHhhhllllLLLEEEEELLhHH


DSSP  HHHHHHHHH.................................HLLL........LLLL..
Query LTALKLAEL.................................AKDI........FPAG..  195
ident       |                                                     
Sbjct QAFIETAQSlirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidVTFSqaespcvaSALFvt  359
DSSP  HHHHHHHHHhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeEEELllllllllLEEEee


DSSP  ..................LEEELLL.LLLLlHHHHHL.LLLEEEEEEEL...LHHHHHHH
Query ..................VVNILFG.RGKTvGDPLTG.HPKVRMVSLTG...SIATGEHI  232
ident                      |            |                         
Sbjct ssenwrkhpaweeeifgpQSLIVVCeNVAD.MLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQL  418
DSSP  ehhhhhhlhhhhllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhhhhllllllleeeeelll
Query ISHTASSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyynagqdctaacriyaqkgi  292
ident |        |                                                  
Sbjct IPRLEEIAGRLVFN..............................................  432
DSSP  HHHHHLLEEEEEEL..............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellll
Query ydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggek  352
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeel
Query rkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqvvnwandsqyglassvwt  412
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellllhhhhhhLLEE......
Query kdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygleDYTV......  466
ident                                                     |       
Sbjct .................................................gWPTGvevgya  443
DSSP  .................................................lLLLLllllll


DSSP  .....................................................eeeeeee
Query .....................................................vrhvmvk  473
ident                                                             
Sbjct mvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgka  503
DSSP  lllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeellll


DSSP  l
Query h  474
ident  
Sbjct a  504
DSSP  l