No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=39.7

DSSP  ..............LLLEEEEELLLLLLEEEeEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ..............TDNVFYATNAFTGEALPlAFPVHTEVEVNQAATAAAKVARDFRRLN   46
ident                       |  ||  |           |  |  ||           
Sbjct mqhkllingelvsgEGEKQPVYNPATGDVLL.EIAEASAEQVDAAVRAADAAFAEWGQTT   59
DSSP  lllleeelleeellLLLEEEEEELLLLEEEE.EEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHhlH
Query NSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLT.GEIARTANQLRLFADVVNsgS  105
ident    ||  |   |   |                |       ||       | ||       
Sbjct PKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFnDEIPAIVDVFRFFAGAAR..C  117
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLL..L


DSSP  HHLEEEELLLLllllllLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHLLLE
Query YHQAILDTPNPtraplpKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAGCPV  165
ident                            || ||     | ||         | |||||  |
Sbjct LNGLAAGEYLE......GHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMA..AWKLAPALAAGNCV  169
DSSP  LLLLLLEEEEL......LEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHH..HHHHHHHHHLLLEE


DSSP  EEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLHHHEEEELLLLLHHHHHHHHLLLLLEEEEEL
Query IVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqlPQAIFTLLQGNQRALGQALVSHPEIKAVGFTG  225
ident   |     | |    ||           |      | |     |  |  ||    |  ||
Sbjct VLKPSEITPLTALKLAELAKDIF.....PAGVVNILFGRGKTVGDPLTGHPKVRMVSLTG  224
DSSP  EEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.....LLLLEEELLLLLLLLHHHHHLLLLEEEEEEEL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHHHLLL
Query SVGGGRALFNLAHERpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGCGQFC  285
ident |   |                  |||   |   |  |                   || |
Sbjct SIATGEHIISHTASS..IKRTHMELGGKAPVIVFDDAD..IEAVVEGVRTFGYYNAGQDC  280
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHH..LLEEEEELLLLLEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHLLHHHHLLL


DSSP  LLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........LLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query TKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP..........STLLTPGIRDSYQSQVVSRG  335
ident |      |          |                       |            |    
Sbjct TAACRIYAQKG.IYDTLVEKLGAAVATLKSgapddestelGPLSSLAHLERVGKAVEEAK  339
DSSP  LLLLEEEEELL.LHHHHHHHHHHHHHLLLLllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLEEE.EELLLLL...LLLLLEEEEEEHHhhhhLHHH.HLLLLLLEEEEEEELLHHHH
Query SDDGIDV.TFSQAES...PCVASALFVTSSEnwrkHPAW.EEEIFGPQSLIVVCENVADM  390
ident     | | |            |  |            |    | |||        |    
Sbjct ATGHIKViTGGEKRKgngYYYAPTLLAGALQ....DDAIvQKEVFGPVVSVTPFDNEEQV  395
DSSP  HLLLLEEeELLLLLLlllLLLLLEEEELLLL....LLHHhHLLLLLLEEEEEEELLHHHH


DSSP  HHHHHLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLlLLLLLLllLLLLLLL
Query LSLSEMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWpTGVEVGyaMVHGGPY  450
ident           |         |         ||    |    |           | |||  
Sbjct VNWANDSQYGLASSVWTK..DVGRAHRVSARL..QYGCTWVNTH.FMLVSE..MPHGGQK  448
DSSP  HHHHHLLLLLLEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLL.LLLLLL..LLLLLLH


DSSP  LLLLlllLLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query PASThsaSTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                       
Sbjct LSGY...GKDMSLYGLEDYTVVRHVMV.........................kh  474
DSSP  HHEE...LLLLHHHHHHLLEEEEEEEE.........................el


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.9

DSSP  ..............................................llleeeeellllll
Query ..............................................tdnvfyatnaftge   14
ident                                                             
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  eeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query alplafpvhtevevnqaataaakvardfrrLNNSkrasllrtiaselearsddiiarahl   74
ident                                                             
Sbjct kvraecllkladvieengqvfaelesrncgKPLH..........................   94
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlLLHH..........................


DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLH.............................
Query etalpevrltgeiartanqlrlfadvvNSGS.............................  105
ident                                                             
Sbjct .........................saFNDEipaivdvfrffagaarclnglaageyleg  129
DSSP  .........................hhHHLHhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  105
ident                                                             
Sbjct htsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitpltalklaelak  189
DSSP  eeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhl


DSSP  ...............................hhleeeellllllllllllleeeeeeeLL
Query ...............................yhqaildtpnptraplpkpdirrqqiaLG  134
ident                                                            |
Sbjct difpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassikrthmelGG  249
DSSP  llllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelLL


DSSP  LEEEELLLL.LLLLllLLLHhHHHHHHHL......LLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHH.
Query PVAVFGASN.FPLAfsAAGGdTASALAAG......CPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQ.  186
ident    |         |     |                            |           
Sbjct KAPVIVFDDaDIEA..VVEG.VRTFGYYNagqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVAt  306
DSSP  LLEEEELLLlLHHH..HHHH.HHHHLLHHhhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHl


DSSP  .........................................HHHHH.......LLLH...
Query .........................................ALKQE.......QLPQ...  195
ident                                                        |    
Sbjct lksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikviTGGEKrkgngyyYAPTlla  366
DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeELLLLlllllllLLLEeee


DSSP  ...............HHEEEELLLL.LHHHHHHHHLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHH
Query ...............AIFTLLQGNQ.RALGQALVSHPEIKAVGFTG.SVGGGRALFNLAH  238
ident                                         |       ||          
Sbjct galqddaivqkevfgPVVSVTPFDNeEQVVNWANDSQYGLASSVWTkDVGRAHRVSARLQ  426
DSSP  llllllhhhhlllllLEEEEEEELLhHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL


DSSP  hllllLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhh
Query erpepIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpe  298
ident                                                             
Sbjct ....yGCTWVN.................................................  433
DSSP  ....lLEEEEL.................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeee
Query tqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfv  358
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  eehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhh
Query tssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypqvsql  418
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeell
Query iprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqal  478
ident                                                             
Sbjct .............................................thfmlvsemphggqk  448
DSSP  .............................................llllllllllllllh


DSSP  lhhhllhhhllllllllleeelllll
Query pesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                           
Sbjct lsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
DSSP  hheellllhhhhhhlleeeeeeeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll
Query learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
ident                                                             
Sbjct ....................................................mqhkllin    8
DSSP  ....................................................lllleeel


DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh
Query lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
ident                                                             
Sbjct gelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecll   68
DSSP  leeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl
Query aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
ident                                                             
Sbjct kladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclnglaageyle  128
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeel


DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhllLHHHH.HHHHHLHhhhllllLLLEEEEELLhHH
Query pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakaDLADQ.FVASMTMgcgqfctKPGVVFALNTpET  299
ident                              |                    |         
Sbjct ghtsmirrdplGVVASIAPWNYP...lMMAAWkLAPALAA......gNCVVLKPSEI.TP  178
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLH...hHHHHHhHHHHHHL......lLEEEEELLLL.LL


DSSP  HHHHHHHHHhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeEEELllllllllLEEEee
Query QAFIETAQSlirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidVTFSqaespcvaSALFvt  359
ident       |                                                     
Sbjct LTALKLAEL.................................AKDI........FPAG..  195
DSSP  HHHHHHHHH.................................HLLL........LLLL..


DSSP  ehhhhhhlhhhhllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHH
Query ssenwrkhpaweeeifgpQSLIVVCeNVAD.MLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQL  418
ident                      |            |                         
Sbjct ..................VVNILFG.RGKTvGDPLTG.HPKVRMVSLTG...SIATGEHI  232
DSSP  ..................LEEELLL.LLLLlHHHHHL.LLLEEEEEEEL...LHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLEEEEEEL..............................................
Query IPRLEEIAGRLVFN..............................................  432
ident |        |                                                  
Sbjct ISHTASSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyynagqdctaacriyaqkgi  292
DSSP  HHHHHHHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhhhhllllllleeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct ydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggek  352
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct rkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqvvnwandsqyglassvwt  412
DSSP  lllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeel


DSSP  .................................................lLLLLllllll
Query .................................................gWPTGvevgya  443
ident                                                     |       
Sbjct kdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygleDYTV......  466
DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellllhhhhhhLLEE......


DSSP  lllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeellll
Query mvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgka  503
ident                                                             
Sbjct .....................................................vrhvmvk  473
DSSP  .....................................................eeeeeee


DSSP  l
Query a  504
ident  
Sbjct h  474
DSSP  l