No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=39.3

DSSP  ..............LLLEEEEELLLLLLEEeEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ..............TDNVFYATNAFTGEALpLAFPVHTEVEVNQAATAAAKVARDFRRLN   46
ident                 |         |  |    |     ||      | |     | | 
Sbjct tkqyknyvngewklSENEIKIYEPASGAEL.GSVPAMSTEEVDYVYASAKKAQPAWRALS   59
DSSP  llllleeelleeelLLLEEEEELLLLLLEE.EEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlHH
Query NSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLTGEIARTANQLRLFADVVNsgSY  106
ident    ||  |   |  |      | |    | |        |  |||      |        
Sbjct YIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVSEVVRTAEIINYAAEEGL..RM  117
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LL


DSSP  HLeEEELL..LLLLlllLLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHLLL
Query HQaILDTP..NPTRaplPKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAGCP  164
ident                   |          | |      | |      |   | || ||  
Sbjct EG.EVLEGgsFEAA..sKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLA..GSKIAPALIAGNV  172
DSSP  LL.EEEEHhhLLHH..hLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHH..HHHHHHHHHLLLE


DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHHEEEELLLLLHHHHHHHHLLLLLEEEEE
Query VIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqLPQAIFTLLQGNQRALGQALVSHPEIKAVGFT  224
ident    |  |         ||    |     ||   |    |     |   | |       ||
Sbjct IAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAG....LPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNFINFT  228
DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL....LLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEE


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHHHLL
Query GSVGGGRALFNLAHerpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGCGQF  284
ident || | |      |       |   |||          |       |    |      || 
Sbjct GSTGIGERIGKMAG....MRPIMLELGGKDSAIVLEDAD..LELTAKNIIAGAFGYSGQR  282
DSSP  LLHHHHHHHHHHLL....LLLEEEELLLLEEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL.........LLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query CTKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP.........STLLTPGIRDSYQSQVVSRG  335
ident ||    |            |                      |      |          
Sbjct CTAVKRVLVMES.VADELVEKIREKVLALTIgnpeddadiTPLIDTKSADYVEGLINDAN  341
DSSP  LLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhhllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLlEEEEELLLLLL.LLLLEEEEEehhhHHHLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH
Query SDDgIDVTFSQAESP.CVASALFVTssenWRKHPAWEEEIFGPQSLIVVCENVADMLSLS  394
ident                      ||              || |||   |     |      |
Sbjct DKG.ATALTEIKREGnLICPILFDK...vTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEIS  397
DSSP  HLL.LEELLLLLEELlEELLEEEEL...lLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLLLLLLLllLLLLLLLLLLL
Query EMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPTGVEVGyaMVHGGPYPAST  454
ident       | | |     | |        |    |    |               |      
Sbjct NKSEYGLQASIFTN..DFPRAFGIAEQL..EVGTVHINNKTQRGTDN..FPFLGAKKSGA  451
DSSP  HHLLEELEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLLLLLLLLL..LLLLLEELLEE


DSSP  LlllLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query HsasTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident            |                                      
Sbjct G...IQGVKYSIEAMTTVKSVVF........................dik  474
DSSP  L...LLLHHHHHHHLEEEEEEEE........................ell


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.3

DSSP  ............................................llleeeeellllllee
Query ............................................tdnvfyatnaftgeal   16
ident                                                             
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query plafpvhtevevnqaataaakvardfrrlNNSKrasllrtiaselearsddiiarahlet   76
ident                                                             
Sbjct ieraaylhkvadilmrdkekigailskevAKGY...........................   93
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLH...........................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLH...............................
Query alpevrltgeiartanqlrlfadvvNSGS...............................  105
ident                                                             
Sbjct .......................ksAVSEvvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaa  130
DSSP  .......................hhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhh


DSSP  ........................hhLEEE..............................
Query ........................yhQAIL..............................  111
ident                                                             
Sbjct skkkiavvrrepvglvlaispfnypvNLAGskiapaliagnviafkpptqgsisglllae  190
DSSP  hlleeeeeeeeelleeeeelllllllHHHHhhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhh


DSSP  ...ellLLLLlllLLLL.......................................eeee
Query ...dtpNPTRaplPKPD.......................................irrq  129
ident        |                                                    
Sbjct afaeagLPAG...VFNTitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkmagmrpim  247
DSSP  hhhhhlLLLL...LEEEllllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhlllllee


DSSP  eeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHH....HLLL.EEEELLLLLHHHHHHHHHH
Query qiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALA....AGCP.VIVKGHTAHPGTSQIVAEC  183
ident     |                 |    | |             |                
Sbjct lelGGKDSAIVLEDaDLELT..AKNIIAGAFGysgqRCTAvKRVLVMESVADELVEKIRE  305
DSSP  eelLLLEEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHHhhhlLLLLeEEEEEEHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHH.......................................HHHH.....LLLHH...
Query IEQA.......................................LKQE.....QLPQA...  196
ident    |                                                  |     
Sbjct KVLAltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalTEIKregnlICPILfdk  365
DSSP  HHHLlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleelLLLLeelleELLEEeel


DSSP  ...............HEEEELLLLLHHHHHHHHLLL.lLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHh
Query ...............IFTLLQGNQRALGQALVSHPE.iKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHe  239
ident                                    |                        
Sbjct vttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEygLQASIFTnDFPRAFGIAEQLE.  424
DSSP  lllllhhhlllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLeeLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL.


DSSP  lllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhhh
Query rpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpet  299
ident                                                             
Sbjct ...VGTVHIN..................................................  431
DSSP  ...LLEEEEL..................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeeee
Query qafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfvt  359
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  ehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhh
Query ssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypqvsqli  419
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhHHEE........
Query prleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihRWLR........  471
ident                                                             
Sbjct ..............................................nkTQRGtdnfpflg  445
DSSP  ..............................................llLLLLllllllll


DSSP  ........EEEEelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query ........PVAYqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                          
Sbjct akksgagiQGVK............ysieamttvksvvfdik  474
DSSP  eelleellLLHH............hhhhhleeeeeeeeell


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll
Query learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
ident                                                             
Sbjct ................................................tkqyknyvngew   12
DSSP  ................................................llllleeellee


DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh
Query lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
ident                                                             
Sbjct klseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvad   72
DSSP  elllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl
Query aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
ident                                                             
Sbjct ilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaask  132
DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhl


DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhllLHHHHHHHHHLHhhhlLLLLlLEEEEELLhHHH
Query pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakaDLADQFVASMTMgcgqFCTKpGVVFALNTpETQ  300
ident                             ||    |                         
Sbjct kkiavvrrepvGLVLAISPFNYP...vNLAGSKIAPALI....AGNV.IAFKPPTQ.GSI  183
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLL...lHHHHHHHHHHHH....LLLE.EEEELLLL.LHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllllllLLEEeeee
Query AFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvASALfvts  360
ident      |                                                |     
Sbjct SGLLLAEAFAEAG.......................................LPAG....  200
DSSP  HHHHHHHHHHHHL.......................................LLLL....


DSSP  hhhhhhlhhhhllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHHH
Query senwrkhpaweeeifgpQSLIVVCENvADMLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQLIP  420
ident                                   |                         
Sbjct .................VFNTITGRGsEIGDYIVE.HQAVNFINFTG...STGIGERIGK  239
DSSP  .................LEEELLLLHhHHHHHHHH.LLLLLEEEEEL...LHHHHHHHHH


DSSP  HHHLleEEEEEL................................................
Query RLEEiaGRLVFN................................................  432
ident                                                             
Sbjct MAGM..RPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvad  297
DSSP  HLLL..LLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct elvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnl  357
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct icpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfpraf  417
DSSP  elleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhh


DSSP  ...........................................lLLLLllllllllllll
Query ...........................................gWPTGvevgyamvhggp  449
ident                                               |             
Sbjct giaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieAMTT............  465
DSSP  hhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhHLEE............


DSSP  lllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query ypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                        
Sbjct ..............................................vksvvfdik  474
DSSP  ..............................................eeeeeeell


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  llleeeeelllllleEEEEEE...............................lLLHHHHH
Query tdnvfyatnaftgeaLPLAFP...............................vHTEVEVN   29
ident                                                           | 
Sbjct ...............TKQYKNyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamstEEVDYVY   45
DSSP  ...............LLLLLEeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHhHHLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHHHhhhlllhhHHHHHH
Query QAATAAAKVARDfRRLN.NSKRASLLRTIASELEARS.DDIIARAHletalpevRLTGEI   87
ident   |  |    |                 |                               
Sbjct ASAKKAQPAWRA.LSYIeRAAYLHKVADILMRDKEKIgAILSKEVA.......kGYKSAV   97
DSSP  HHHHHHHHHHHH.LLHHhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhHHHHHHHL.......lLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHhleeeellllllllllllleeeeeeellleeeellllllll
Query ARTANQLRLFADVVNSGSYhqaildtpnptraplpkpdirrqqialgpvavfgasnfpla  147
ident                 |                                           
Sbjct SEVVRTAEIINYAAEEGLR........................................m  117
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLL........................................l


DSSP  lllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllh
Query fsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqivaecieqalkqeqlpqaiftllqgnqra  207
ident                                                             
Sbjct egevleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkp  177
DSSP  lleeeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeel


DSSP  hhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllleeeelhhhhhhll
Query lgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaherpepipfygelgainptfifpsamraka  267
ident                                                             
Sbjct ptqgsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigeri  237
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhh
Query dladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsy  327
ident                                                             
Sbjct gkmagmrpimlelggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvad  297
DSSP  hhhllllleeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellh
Query qsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenv  387
ident                                                             
Sbjct elvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnl  357
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelle


DSSP  hhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllllllll
Query admlslsemlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhg  447
ident                                                             
Sbjct icpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfpraf  417
DSSP  elleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhh


DSSP  lllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query gpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                          
Sbjct giaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
DSSP  hhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell