No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=33.4

DSSP  ..........................LHHHHHHHHHHHHHlLHHHL.HHHHHHHHHHHHH
Query ..........................SISDTVKRAREAFNsGKTRS.LQFRIQQLEALQR   33
ident                                   |         |     |   |     
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevEVNQAATAAAKVAR.DFRRLnNSKRASLLRTIAS   59
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhHHHHHHHHHHHHHH.HHHHLlHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHH..HHHHLLEELLLL...
Query MINENLKSISGALASDLGKNEWTSYYeEVAHVLEELDTTIKEL..PDWAEDEPVAKT...   88
ident         |           |      | |     |                        
Sbjct ELEARSDDIIARAHLETALPEVRLTG.EIARTANQLRLFADVVnsGSYHQAILDTPNptr  118
DSSP  HHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHLEEEELLLlll


DSSP  ..LLLLllEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHH..HHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLHHH
Query ..RQTQqdDLYIHSEPLGVVLVIGAWNYPFNLT..IQPMVGAVAAGNAVILKPSEVSGHM  144
ident         |       || | | || | |            | |||  || |        
Sbjct apLPKP..DIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAGCPVIVKGHTAHPGT  176
DSSP  llLLLL..LEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL.....LLLLEEELLLL.HHHHHHHLLLL.LLEEEEELLHHHHHHHHHH
Query ADLLATLIPQYM.....DQNLYLVVKGG.VPETTELLKER.FDHIMYTGSTAVGKIVMAA  197
ident     |  | |        |       |        |           |||   |      
Sbjct SQIVAECIEQALkqeqlPQAIFTLLQGNqRALGQALVSHPeIKAVGFTGSVGGGRALFNL  236
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhhllLHHHEEEELLLlLHHHHHHHHLLlLLEEEEELLHHHHHHHHHH


DSSP  HHLL..LLLEEEELLLLLEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEELHH
Query AAKH..LTPVTLELGGKSPCYVDKDCD..LDVACRRIAWGKFMNSGQTCVAPDYILCDPS  253
ident |       |   |||   |                       |  || |  |        
Sbjct AHERpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGCGQFCTKPGVVFALNT  296
DSSP  HHHLllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHHHLLLLLLLEEEEELL


DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHhllllLLLLLHHHHHHHHH.LLLLL....LEEELLLE
Query .IQNQIVEKLKKSLKdfygEDAKqsrdyGRIINDRHFQRVKG.LIDNQ....KVAHGGTW  307
ident        |                                                    
Sbjct pETQAFIETAQSLIR....QQSP.....STLLTPGIRDSYQSqVVSRGsddgIDVTFSQA  347
DSSP  hHHHHHHHHHHHHHH....HLLL.....LLLLLHHHHHHHHHhHHHHHllllEEEEELLL


DSSP  ELllLEELLEEELLL...LLLLHHHLLLLLLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEE
Query DQssRYIAPTILVDV...DPQSPVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYV  364
ident        |    |         |   ||||||   ||                  |    
Sbjct ES..PCVASALFVTSsenWRKHPAWEEEIFGPQSLIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATI  405
DSSP  LL..LLLLLEEEEEEhhhHHHLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEE


DSSP  ELL..LHHHHHHHHLLL..LLLEEEELLLLHHHHLL.LLLLLLLHHHEE...LLLLLHHH
Query FSN..NEKVIKKMIAET..SSGGVTANDVIVHITVP.TLPFGGVGNSGM...GAYHGKKS  416
ident              |       |    |       |      ||             |   
Sbjct HATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPTGVEVGyAMVHGGPYPASThsaSTSVGAEA  465
DSSP  ELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLLLLLLLlLLLLLLLLLLLLlllLLLLLHHH


DSSP  HHHLEEEEEEEELL.........lllllllhhhllllll
Query FETFSHRRSCLVKS.........llneeahkaryppspa  446
ident                                        
Sbjct IHRWLRPVAYQALPesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  HHHHEEEEEEELLLhhhllhhhllllllllleeelllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.8

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.......
Query sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdLGKN.......   53
ident                                                  |          
Sbjct .....tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrLNNSkrasllr   55
DSSP  .....llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHhhhhhhh


DSSP  ............................................hhHHHHHlhhhhhhhh
Query ............................................ewTSYYEevahvleel   69
ident                                                |            
Sbjct tiaselearsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvNSGSY.........  106
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLHH.........


DSSP  hhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhl
Query dttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigawnypfnltiqpmvgavaa  129
ident                                                             
Sbjct ............................................................  106
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhhhlllllleeeeellhh
Query gnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpettellkerfdhimytgsta  189
ident                                                             
Sbjct ......................................................hqaild  112
DSSP  ......................................................hleeee


DSSP  hhhhhhhhhhllllleeeelLLLLEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHLLLLllllllLE
Query vgkivmaaaakhltpvtlelGGKSPCYVDKDcDLDVA..CRRIAWGKFMNSGqtcvapDY  247
ident                      |                                      
Sbjct tpnptraplpkpdirrqqiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALAAGC.....pVI  166
DSSP  llllllllllllleeeeeeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHHHLL.....lEE


DSSP  EEELHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhllllllEEELLLE
Query ILCDPSIQNQIVEKLKkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkVAHGGTW  307
ident                                                             
Sbjct VKGHTAHPGTSQIVAE...................................ciEQALKQE  191
DSSP  EELLLLLHHHHHHHHH...................................hhHHHHHHH


DSSP  elllleELLEeelllllllhhhllllllLEELEEELLLHHHHHHHHHlLLLLLEEEEELl
Query dqssryIAPTilvdvdpqspvmqeeifgPVMPIVCVRSLEEAIQFINqREKPLALYVFSn  367
ident         |                                            |      
Sbjct ......QLPQ..................AIFTLLQGNQRALGQALVS.HPEIKAVGFTG.  225
DSSP  ......LLLH..................HHEEEELLLLLHHHHHHHH.LLLLLEEEEEL.


DSSP  LHHHHHHHHLLLL....LLEEEEL....................................
Query NEKVIKKMIAETS....SGGVTAN....................................  387
ident                                                             
Sbjct SVGGGRALFNLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfc  285
DSSP  LHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  387
ident                                                             
Sbjct tkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfs  345
DSSP  lllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  387
ident                                                             
Sbjct qaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltati  405
DSSP  llllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeee


DSSP  .............................................lllhHHHLlllllll
Query .............................................dvivHITVptlpfgg  402
ident                                                  |          
Sbjct hateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypastHSAS.....ts  460
DSSP  ellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllllLLLL.....ll


DSSP  lhhheelllllhhhhhhleeeeeeeelllllllllhhhllllll
Query vgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
ident                                             
Sbjct vgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  llhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
Query sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyye   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllEELL..................................
Query evahvleeldttikelpdwaedEPVA..................................   86
ident                                                             
Sbjct ...............tdnvfyaTNAFtgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrl   45
DSSP  ...............llleeeeELLLllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ...................llllllllEEEE.............................
Query ...................ktrqtqqdDLYI.............................   98
ident                             |                               
Sbjct nnskrasllrtiaselearsddiiaraHLETalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgs  105
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   98
ident                                                             
Sbjct yhqaildtpnptraplpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpv  165
DSSP  hhleeeellllllllllllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   98
ident                                                             
Sbjct ivkghtahpgtsqivaecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftg  225
DSSP  eeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeel


DSSP  .....................eeeeLLEEEEELLLLLLLH..hhhhhHHHHHHL......
Query .....................hsepLGVVLVIGAWNYPFN..ltiqpMVGAVAA......  129
ident                                                 |           
Sbjct svgggralfnlaherpepipfygelGAINPTFIFPSAMRAkadladqFVASMTMgcgqfc  285
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllleeeelLLLLEEEELHHHHHHlllhhhhHHHHHLHhhhlll


DSSP  lLEEEEELLLllHHHHHHHHHHHHHH..................................
Query gNAVILKPSEvsGHMADLLATLIPQY..................................  155
ident                                                             
Sbjct tKPGVVFALN..TPETQAFIETAQSLirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvt  343
DSSP  lLLLEEEEEL..LHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeee


DSSP  ..........LLLL....................LEEELLL.LHHHHHHHLLLL..lLEE
Query ..........MDQN....................LYLVVKG.GVPETTELLKER..fDHI  182
ident                                     | |    |     |          
Sbjct fsqaespcvaSALFvtssenwrkhpaweeeifgpQSLIVVCeNVADMLSLSEMLagsLTA  403
DSSP  elllllllllLEEEeeehhhhhhlhhhhllllllEEEEEEElLHHHHHHHHHLLlleEEE


DSSP  EEEL...LHHHHHHHHHHHHLLllLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhllll
Query MYTG...STAVGKIVMAAAAKHltPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsg  239
ident                                                             
Sbjct TIHAteeDYPQVSQLIPRLEEIagRLVFN...............................  432
DSSP  EEELlhhHHHHHHHHHHHHHLLeeEEEEL...............................


DSSP  llllllleeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllll
Query qtcvapdyilcdpsiqnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnq  299
ident                                                             
Sbjct .....................................................gwptgve  439
DSSP  .....................................................lllllll


DSSP  leeellLEELLLleelleeelllllllhhhllllllleeleeelllhHHHHHhhhlllll
Query kvahggTWDQSSryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrslEEAIQfinqrekp  359
ident                                                             
Sbjct vgyamvHGGPYP...asthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllPDSLK....aenp  492
DSSP  llllllLLLLLL...lllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhlLHHHL....llll


DSSP  leeEEELLLHhhhhhhhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhhhhhh
Query lalYVFSNNEkvikkmiaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfet  419
ident                                                             
Sbjct leiARAVDGK..................................................  502
DSSP  lllLEEELLL..................................................


DSSP  leeeeeeeelllllllllhhhllllll
Query fshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
ident                            
Sbjct .........................aa  504
DSSP  .........................ll