No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=25.8

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhHHHHHHHHHH
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkEDVDKAVKAA   60
ident                                                          |  
Sbjct ..................................................DELLEKAKKV   10
DSSP  ..................................................LHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHH...........lllhh
Query RAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDN...........gkpyv  109
ident | |       |              |      |         |                 
Sbjct REAWD...VLRNATTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVekarergvkeslvdrl   67
DSSP  HHHHH...HHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  hHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLEELLL.LLEEEEEEEEELLEEEEELLLllHHH
Query iSYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKY.HGKTIPID.GDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWnfPLL  167
ident        |   |      |  |                      | |  | |        
Sbjct aLNDKRIDEMIKACETVIGLKDPVgEVIDSWVReDGLRIARVRVPIGPIGIIYES..RPN  125
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLEEEEEELlLLLEEEEEEEELLLEEEELLL..LLH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL....LLLLLEEELL.LLLLlH
Query MQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAG....FPPGVVNIVP.GFGPtA  222
ident         ||  ||                    | ||      |   |           
Sbjct VTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeIPESSVEFIEnTDRS.L  184
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHEEELLlLLLH.H


DSSP  HHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHhhllLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHH
Query GAAIASHE.DVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAgssnLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAV  281
ident              |   |           |       |     |         ||   ||
Sbjct VLEMIRLReYLSLVIPRGGYGLISFVRDNA....TVPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAV  240
DSSP  HHHHLLLLlLLLEEEELLLHHHHHHHHHHL....LLLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllllllllh
Query EQAHFALFFNqGQCSCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRvvgnpfdskteqgpqvde  341
ident      |          |     | | |  ||    |                        
Sbjct PVIINAKTQR.PGTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH..................  281
DSSP  HHHHHHHHLL.LLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL..................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllllllllllLLEEEEL..........lllLLHHHH
Query tqfkkilgyintgkqegakllcgggiaadrgyfiQPTVFGD..........vqdGMTIAK  391
ident                                      | |                    
Sbjct ..................................GVEVRGCektreivpdvvpaTEDDWP  307
DSSP  ..................................LLEEEELhhhhhhlllleelLHHHLL


DSSP  LLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL.
Query EEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY.  450
ident  |       |   |   |          |      |     |        |  | ||   
Sbjct TEYLDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVNASt  367
DSSP  LLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLh


DSSP  LLLLLLLL.......LLLLHhheELLLllhhHHHHHEEEEEEEEELLLLLL
Query DVFGAQSP.......FGGYKmsgSGRElgeyGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS  494
ident                         |      ||   |  | |         
Sbjct RFTDGGQFgfgaeigISTQRfhaRGPV....GLRELTTYKFVVLGEYHVRE  414
DSSP  HHLLLLLLlllllllEELLLlllLEEL....LLHHHEEEEEEEELLLLLLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ..........llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllh
Query ..........avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdk   50
ident                                                             
Sbjct eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query edvdkavkaaraafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvi  110
ident                                                             
Sbjct esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHh
Query sylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvGVCGQIIPWN.FPLLMq  169
ident                                            | |              
Sbjct drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvGNCHIFVDESaDLKKA.  239
DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEELLLlLHHHH.


DSSP  HHHHHHH.HHLL....LEEEEELLLLLLHHHHHH.HHHHHHHLLLLL.............
Query AWKLGPA.LATG....NVVVMKVAEQTPLTALYV.ANLIKEAGFPPG.............  210
ident       |               | |      | |        |                 
Sbjct VPVIINAkTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPViVEELRKHGVEVRgcektreivpdvv  299
DSSP  HHHHHHHhHLLLllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHhHHHHHHLLLEEEelhhhhhhlllle


DSSP  ..............LEEELLL.LLLLhHHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHh
Query ..............VVNIVPG.FGPTaGAAIAS.HEDVDKVAFTG.STEIGRVIQVAAGs  253
ident                  |                                          
Sbjct pateddwpteyldlIIAIKVVkNVDE.AIEHIKkYSTGHSESILTeNYSNAKKFVSEID.  357
DSSP  ellhhhllllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHhHLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL.


DSSP  llLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhh
Query snLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqediydefv  313
ident      |                                                      
Sbjct ..AAAVYVN...................................................  364
DSSP  ..LLEEEEL...................................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllllllll
Query ersvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggiaadrgy  373
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhh
Query fiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavftkdldka  433
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelllllhhhhhHHEE............
Query nylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrelgeyglqAYTE............  481
ident                                                             
Sbjct ..........................................asTRFTdggqfgfgaeig  382
DSSP  ..........................................llHHHLllllllllllll


DSSP  ...................eeeeeeellllll
Query ...................vktvtvkvpqkns  494
ident                                 
Sbjct istqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  eellllllleelllhhheeeeeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.5

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh
Query raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
ident                                                             
Sbjct ...............................dellekakkvreawdvlrnattreknkai   29
DSSP  ...............................lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell
Query nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
ident                                                             
Sbjct kkiaeklderrkeileanridvekarergvkeslvdrlalndkridemikacetviglkd   89
DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleE
Query teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSdadMDWAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
ident                         |    |  |                           
Sbjct pvgevidswvredglriarvrvpiGPIGIIYES...RPNVTVETTILALKSGN.....tI  141
DSSP  lllleeeeeellllleeeeeeeelLLEEEELLL...LLHHHHHHHHHHHHLLL.....lE


DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle
Query RTFVQEDIYDEFVERSVARAKSrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
ident       |          |                                          
Sbjct LLRGGSDALNSNKAIVSAIREA......................................  163
DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHHHHHHH......................................


DSSP  eeELLLllllllllLLLEEeellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLL
Query llCGGGiaadrgyfIQPTVfgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYG  420
ident                 |                                |        | 
Sbjct ..LKET........EIPES..................SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYL  195
DSSP  ..HLLL........LLLHH..................HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLL


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEEL................................
Query LAAAVFTkDLDKANYLSQALQAgTVWVN................................  448
ident                         |                                   
Sbjct SLVIPRG.GYGLISFVRDNATV.PVLETgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgt  253
DSSP  LEEEELL.LHHHHHHHHHHLLL.LLLLLlllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct cnaaekllvhekiakeflpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldl  313
DSSP  llleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct iiaikvvknvdeaiehikkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdgg  373
DSSP  eeeeeeellhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllll


DSSP  ......lLLLLlllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll
Query ......cYDVFgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
ident                                                     
Sbjct qfgfgaeIGIS...........tqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  lllllllLLEE...........llllllleelllhhheeeeeeeelllllll