No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=36.1

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhhHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLlHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH
Query psevvgttakagkaEAEAALEAAWKAFK.TWKDWpQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEAT  119
ident                       |  ||           |   |                 
Sbjct ..............SISDTVKRAREAFNsGKTRS.LQFRIQQLEALQRMINENLKSISGA   45
DSSP  ..............LHHHHHHHHHHHHHlLHHHL.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLLL...LLLEEEEEEEEELL
Query LVYEVGKNWVEAS.ADVAEAIDFIEYYARAALRYRYPaVEVVP...YPGEDNESFYVPLG  175
ident |    |||        ||                      |         |      |||
Sbjct LASDLGKNEWTSYyEEVAHVLEELDTTIKELPDWAED.EPVAKtrqTQQDDLYIHSEPLG  104
DSSP  HHHHHLLLHHHHHhHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.EELLLlllLLLLEEEEEEEELL


DSSP  EEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLEEE
Query AGVVIAPWNFPVAIFTGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAgFPPGVVNF  235
ident    ||  || |        || || || || || |                         
Sbjct VVLVIGAWNYPFNLTIQPMVGAVAAGNAVILKPSEVSGHMADLLATLIPQY.MDQNLYLV  163
DSSP  EEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLEEE


DSSP  LLLLlLHHHHHHHLLlLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLllllllLLEEEEELLLLEEE
Query LPGVgEEVGAYLVEHpRIRFINFTGSLEVGLKIYEAAGRLapgqtwFKRAYVETGGKNAI  295
ident   |        |    |   |  |||  ||     ||               | |||   
Sbjct VKGG.VPETTELLKE.RFDHIMYTGSTAVGKIVMAAAAKH......LTPVTLELGGKSPC  215
DSSP  LLLL.HHHHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHLL......LLLEEEELLLLLEE


DSSP  EELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLL....LL
Query IVDETADFDLAAEGVVVSAYGFQGQKCSAASRLILTQGAYEPVLERVLKRAERL....SV  351
ident  ||   | | |            || | |               |   |           
Sbjct YVDKDCDLDVACRRIAWGKFMNSGQTCVAPDYILCDPSIQNQIVEKLKKSLKDFygedAK  275
DSSP  EELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllHH


DSSP  LLhhhlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHllllEEEELLLLLlLLLLLLLLEEEELLLLLL
Query GPaeenPDLGPVVSAEQERKVLSYIEIGknegQLVLGGKRLeGEGYFIAPTVFTEVPPKA  411
ident        | |          |   |           ||         ||||    | |  
Sbjct QS....RDYGRIINDRHFQRVKGLIDNQ....KVAHGGTWD.QSSRYIAPTILVDVDPQS  326
DSSP  HL....LLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLL....LEEELLLEE.LLLLEELLEEELLLLLLL


DSSP  HHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEE
Query RIAQEEIFGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSRKREHLEWARREFHVGNLYF  471
ident    ||||||||     |    ||    |     |   | |           |   |    
Sbjct PVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVFSNNEKVIKKMIAETSSGGVTA  386
DSSP  HHHLLLLLLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLEEEE


DSSP  LLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLlLLLLLHHHHHLLEEEEEEEEEL...............
Query NRKITGALVGVQPFGGFKLSGTnAKTGALDYLRLFLEMKAVAERF...............  516
ident |  |    |   ||||   ||             |                         
Sbjct NDVIVHITVPTLPFGGVGNSGM.GAYHGKKSFETFSHRRSCLVKSllneeahkaryppsp  445
DSSP  LLLLHHHHLLLLLLLLLHHHEE.LLLLLHHHHHHLEEEEEEEELLlllllllhhhlllll


DSSP  .
Query .  516
ident  
Sbjct a  446
DSSP  l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee
Query vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll
Query apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
ident                                                             
Sbjct .......sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgkn   53
DSSP  .......lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELLL
Query eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDET  300
ident                                                   |    |    
Sbjct ewtsyyeevahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihsepLGVVLVIGAWN  113
DSSP  hhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeeLLEEEEELLLL


DSSP  lLHHHH.HHHHHHHhhhhhHLLLlLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllhhhlll
Query aDFDLA.AEGVVVSaygfqGQKCsAASRLILTQGAYEPVLERVLKRAERlsvgpaeenpd  359
ident            |             |  |                               
Sbjct .YPFNLtIQPMVGA.....VAAG.NAVILKPSEVSGHMADLLATLIPQY...........  155
DSSP  .LLLHHhHHHHHHH.....HHLL.LEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH...........


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllLEEEellllllhhhlllll
Query lgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiaPTVFtevppkariaqeeif  419
ident                                                             
Sbjct .........................................MDQN...............  159
DSSP  .........................................LLLL...............


DSSP  llEEEEEEELLhHHHHHHHHLLllLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL..lLEEEEL.....
Query gpVLSVIRVKDfAEALEVANDTpyGLTGGVYSrKREHLEWARREFH..vGNLYFN.....  472
ident      |       |  |                                           
Sbjct ..LYLVVKGGV.PETTELLKER..FDHIMYTG.STAVGKIVMAAAAkhlTPVTLElggks  213
DSSP  ..LEEELLLLH.HHHHHHLLLL..LLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHlllLLEEEElllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct pcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyilcdpsiqnqiveklkkslkdfyged  273
DSSP  eeeelllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct akqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeei  333
DSSP  hhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllleelleeelllllllhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct fgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnnekvikkmiaetssggvtandvivhi  393
DSSP  llleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhlllllleeeellllhhh


DSSP  .......................lllLLLLLLlllllllhhhllllllllhhhhhlleee
Query .......................rkiTGALVGvqpfggfklsgtnaktgaldylrlflem  509
ident                                                             
Sbjct tvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetFSHRRS..............clvksllneeahka  439
DSSP  hlllllllllhhheelllllhhhhhhLEEEEE..............eeelllllllllhh


DSSP  eeeeeel
Query kavaerf  516
ident        
Sbjct ryppspa  446
DSSP  hllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  ....................................llllllllllllllllhhhhhhhh
Query ....................................mtvepfrnepietfqteearramr   24
ident                                                             
Sbjct sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyye   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelleeeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhh
Query ealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsapsevvgttakagkaeaeaaleaaw   84
ident                                                             
Sbjct evahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigawnypfnlti  120
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelllllllhhhh


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query kafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatlvyevgknwveasadvaeaidfiey  144
ident                                                             
Sbjct qpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpettellkerfd  180
DSSP  hhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhhhllllll


DSSP  hhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelLEEEEELLL.LLLLHHHHHHHHHHHH....
Query yaraalryrypavevvpypgednesfyvplGAGVVIAPW.NFPVAIFTGMIVGPVA....  199
ident                               |                     |       
Sbjct himytgstavgkivmaaaakhltpvtlelgGKSPCYVDKdCDLDVACRRIAWGKFMnsgq  240
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeellLLLEEEELLlLLHHHHHHHHHHHHHLllll


DSSP  LLLE.EEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHL...............................
Query VGNT.VIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAG...............................  227
ident                                                             
Sbjct TCVApDYILCDPSIQNQIVEKLKKSLKDFygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqk  300
DSSP  LLLLlLEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhllllll


DSSP  ................................llLLLEEELLLLLLHHHHHHHL.LLLLL
Query ................................fpPGVVNFLPGVGEEVGAYLVE.HPRIR  254
ident                                     |         |             
Sbjct vahggtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeeifGPVMPIVCVRSLEEAIQFINqREKPL  360
DSSP  eeellleelllleelleeelllllllhhhlllllLLEELEEELLLHHHHHHHHHlLLLLL


DSSP  EEEEEL.LHHHHHHHHHHHLlllllllllLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhh
Query FINFTG.SLEVGLKIYEAAGrlapgqtwfKRAYVEtggknaiivdetadfdlaaegvvvs  313
ident           |  |                                              
Sbjct ALYVFSnNEKVIKKMIAETS........sGGVTAN.........................  387
DSSP  EEEEELlLHHHHHHHHLLLL........lLEEEEL.........................


DSSP  hhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhh
Query aygfqgqkcsaasrliltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvl  373
ident                                                             
Sbjct ............................................................  387
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhh
Query syieigknegqlvlggkrlegegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfae  433
ident                                                             
Sbjct ............................................................  387
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhll
Query alevandtpygltggvysrkrehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgt  493
ident                                                             
Sbjct ............................................................  387
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhLLEE............................................e
Query naktgaldylrLFLE............................................m  509
ident                                                             
Sbjct ........dviVHITvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvksllneeahka  439
DSSP  ........lllHHHHlllllllllhhheelllllhhhhhhleeeeeeeelllllllllhh


DSSP  eeeeeel
Query kavaerf  516
ident        
Sbjct ryppspa  446
DSSP  hllllll