No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.4

DSSP  ................................................llLHHHHHHHHH
Query ................................................hmSSSQQIAKNA   12
ident                                                          | |
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkEDVDKAVKAA   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHH...HHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhh
Query RKAGN...ILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAvaketgladsllkrl   69
ident | |              |   |    |               |                 
Sbjct RAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNG............kpy  108
DSSP  HHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL............llh


DSSP  llLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLlLLEEeEEEEELLEEEEEEEEELLEEEEEELL..LL
Query dlFKGDKFEVMLQGIKDVAELEDPvGKVKmARELDDGLTLYQVTAPVGVLLVIFES..RP  127
ident            |      |   |     |     |     |    ||||   |       
Sbjct viSYLVDLDMVLKCLRYYAGWADK.YHGK.TIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWnfPL  166
DSSP  hhHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.EELLLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLllHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLLLLLEEELLLL
Query EVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqsetgVPVGSVQLIETR  187
ident    |         ||    |       |    |                | | |      
Sbjct LMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAG........FPPGVVNIVPGF  218
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL........LLLLLEEELLLL


DSSP  ....LHHHHHLLlLLLEEEEELLHHHHHHHHHLL....LLLLLLlllLLEEEEELLLLLH
Query ....VSDLLDQDeYIDLVVPRGSNALVRKIKDTT....KIPVLGhadGICSIYLDEDADL  239
ident                | |   ||    | |           |     |        ||| 
Sbjct gptaGAAIASHE.DVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAgssnLKRVTLelgGKSPNIIMSDADM  277
DSSP  lllhHHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHhhllLLEEEEellLLEEEEELLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHLLLL.....llllEEEEELLLLllHHHHHHHHHHHHL..............
Query IKAKRISLDAKTN.....cnamETLLINPKFskWWEVLENLTLEGG..............  280
ident   |      |                         |  |                     
Sbjct DWAVEQAHFALFFnqgqcscagSRTFVQEDI..YDEFVERSVARAKsrvvgnpfdskteq  335
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhllllleEEEEEEHHH..HHHHHHHHHHHHHhlllllllllllll


DSSP  .........................................lLLEELhhhhhhhhhhhhh
Query .........................................vTIHATkdlktayfdklne  299
ident                                           |                 
Sbjct gpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggiaadrgyfiqpTVFGD.............  382
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllllllllllllEEEEL.............


DSSP  hllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLL
Query lgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDS  359
ident                          |      |        |  |     |         
Sbjct vqdgmtiakeeifGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQA  442
DSSP  lllllhhhhllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LEEEELLlHHHL...................llLLHHHEEEEEEEELLLLLLlll
Query SGVYWNAsTRFA...................dvGLDGLVSYQYQIRGDGQVAsdy  395
ident   |  |                           ||              |     
Sbjct GTVWVNC.YDVFgaqspfggykmsgsgrelgeyGLQAYTEVKTVTVKVPQKN..s  494
DSSP  LEEEELL.LLLLlllllllllhhheelllllhhHHHHHEEEEEEEEELLLLL..l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee
Query ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
ident                                                             
Sbjct ..............................avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrkt   30
DSSP  ..............................llllllllllllllleeelleeelllllle


DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhHHHHhlllllLLLL................
Query vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvRKIKdttkipVLGH................  224
ident                               |                             
Sbjct fptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaRAAF.....qLGSPwrrmdashrgrllnrl   85
DSSP  eeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhHHHL.....lLLLHhhhllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  224
ident                                                             
Sbjct adlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidgdff  145
DSSP  hhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleelllllee


DSSP  ......llLLEEEEELLLlLHHHHHHHH.HHLLLLLlLLEEEEELLLLllHHHHHHHhhh
Query ......adGICSIYLDEDaDLIKAKRIS.LDAKTNCnAMETLLINPKFskWWEVLENltl  277
ident         | |                    |                      |     
Sbjct sytrhepvGVCGQIIPWN.FPLLMQAWKlGPALATG.NVVVMKVAEQT..PLTALYV...  198
DSSP  eeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHHHHHhHHHHHLL.LEEEEELLLLL..LHHHHHH...


DSSP  hhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhHHLLllllLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLll
Query eggvtihatkdlktayfdklnelgklteaIQCKtvslDLAAKFVTSTESAIQHINTHSsr  337
ident                                                             
Sbjct .........................anliKEAGfppgVVNIVPGFGPTAGAAIASHED.v  232
DSSP  .........................hhhhHHHLllllLEEELLLLLLLHHHHHHLLLL.l


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHL...LLLEEEEL.............................
Query HTDAIVTeNKANAEKFMKGV...DSSGVYWN.............................  365
ident    |                       |                                
Sbjct DKVAFTG.STEIGRVIQVAAgssNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffn  291
DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhlLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct qgqcscagsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyi  351
DSSP  hhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct ntgkqegakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevv  411
DSSP  hhhhhllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct grannstyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrel  471
DSSP  hhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellll


DSSP  ....llHHHLLlllhhheeeeeeeelllllllll
Query ....asTRFADvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
ident                                   
Sbjct geyglqAYTEV...........ktvtvkvpqkns  494
DSSP  lhhhhhHHEEE...........eeeeeellllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  ...................................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhh
Query ...................................hmsssqqiaknarkagnilktisne   25
ident                                                             
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhh
Query grsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgik   85
ident                                                             
Sbjct raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh


DSSP  hhhhllllllleeeEEEEEL....LEEE................................
Query dvaeledpvgkvkmARELDD....GLTL................................  109
ident                                                             
Sbjct kclryyagwadkyhGKTIPIdgdfFSYTrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
DSSP  hhhhhhhhhlllllLLEELLllleEEEEeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
ident                                                             
Sbjct nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell


DSSP  .................eeeeeelLEEEEEEL..LLLH.HHHHHHHHHHHHLL.....eE
Query .................yqvtapvGVLLVIFE..SRPE.VIANITALSIKSGN.....aA  144
ident                         |    |                              
Sbjct teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMsdADMDwAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHHHHllllleE


DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....................................
Query ILKGGKESVNTFREMAKIVNDTI.....................................  167
ident            | |                                              
Sbjct RTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ..HHHHHH.....HLLLLL..................LEEELLL....lLHHHHHLLLLL
Query ..AQFQSE.....TGVPVG..................SVQLIET....rVSDLLDQDEYI  198
ident                 |                      |         |        | 
Sbjct llCGGGIAadrgyFIQPTVfgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFktieeVVGRANNSTYG  420
DSSP  eeELLLLLlllllLLLLEEeellllllhhhhllllllEEEEEEEllhhhHHHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHLLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhllllllll
Query DLVVPRG.SNALVRKIKDTTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnam  256
ident                         |                                   
Sbjct LAAAVFTkDLDKANYLSQALQAgTVWV.................................  447
DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE.................................


DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllll
Query etllinpkfskwwevlenltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldl  316
ident                                                             
Sbjct ............................................................  447
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLH
Query aakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLD  376
ident                                                             
Sbjct ......................................................ncYDVF  453
DSSP  ......................................................llLLLL


DSSP  ......................hheeeeeeEELLLlLLLLL.
Query ......................glvsyqyqIRGDGqVASDY.  395
ident                                     |     
Sbjct gaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevkTVTVK.VPQKNs  494
DSSP  lllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeEEEEE.LLLLLl