No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=33.4

DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhHHHHHHHHHHHHHH.HHHHLlHHHHHHHHHHHHH
Query tdnvfyatnaftgealplafpvhtevEVNQAATAAAKVAR.DFRRLnNSKRASLLRTIAS   59
ident                                   |         |     |   |     
Sbjct ..........................SISDTVKRAREAFNsGKTRS.LQFRIQQLEALQR   33
DSSP  ..........................LHHHHHHHHHHHHHlLHHHL.HHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHLEEEELLLLLl
Query ELEARSDDIIARAHLETALPEVRLTG.EIARTANQLRLFADVVnsGSYHQAILDTPNPTr  118
ident         |           |      | |     |                        
Sbjct MINENLKSISGALASDLGKNEWTSYYeEVAHVLEELDTTIKEL..PDWAEDEPVAKTRQ.   90
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHH..HHHHLLEELLLLLL.


DSSP  lllLLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHHH
Query aplPKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAGCPVIVKGHTAHPGTSQ  178
ident       |       || | | || | |            | |||  || |          
Sbjct ..tQQDDLYIHSEPLGVVLVIGAWNYPFNLT..IQPMVGAVAAGNAVILKPSEVSGHMAD  146
DSSP  ..lLLLEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHH..HHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhhllLHHHEEEELLLlLHHHHHHHHLLlLLEEEEELLHHHHHHHHHHHH
Query IVAECIEQALkqeqlPQAIFTLLQGNqRALGQALVSHPeIKAVGFTGSVGGGRALFNLAH  238
ident   |  | |        |       |        |           |||   |      | 
Sbjct LLATLIPQYM.....DQNLYLVVKGG.VPETTELLKER.FDHIMYTGSTAVGKIVMAAAA  199
DSSP  HHHHHHHHHL.....LLLLEEELLLL.HHHHHHHLLLL.LLEEEEELLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHHHLLLLLLLEEEEELLhH
Query ERpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGCGQFCTKPGVVFALNTpE  298
ident       |   |||   |                       |  || |  |          
Sbjct KH..LTPVTLELGGKSPCYVDKDCD..LDVACRRIAWGKFMNSGQTCVAPDYILCDPS.I  254
DSSP  LL..LLLEEEELLLLLEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEELHH.H


DSSP  HHHHHHHHHHHHH....HLLL.....LLLLLHHHHHHHHHhHHHHHllllEEEEELLLLL
Query TQAFIETAQSLIR....QQSP.....STLLTPGIRDSYQSqVVSRGsddgIDVTFSQAES  349
ident      |                                                      
Sbjct QNQIVEKLKKSLKdfygEDAKqsrdyGRIINDRHFQRVKG.LIDNQ....KVAHGGTWDQ  309
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHhllllLLLLLHHHHHHHHH.LLLLL....LEEELLLEEL


DSSP  ..LLLLLEEEEEEhhhHHHLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEL
Query ..PCVASALFVTSsenWRKHPAWEEEIFGPQSLIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATIHA  407
ident      |    |         |   ||||||   ||                  |      
Sbjct ssRYIAPTILVDV...DPQSPVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVFS  366
DSSP  llLEELLEEELLL...LLLLHHHLLLLLLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEL


DSSP  LhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLLLLLLLlLLLLLLLLLLLLlllLLLLLHHHHH
Query TeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPTGVEVGyAMVHGGPYPASThsaSTSVGAEAIH  467
ident            |       |    |       |      ||             |     
Sbjct N..NEKVIKKMIAET..SSGGVTANDVIVHITVP.TLPFGGVGNSGM...GAYHGKKSFE  418
DSSP  L..LHHHHHHHHLLL..LLLEEEELLLLHHHHLL.LLLLLLLHHHEE...LLLLLHHHHH


DSSP  HHEEEEEEELLLhhhllhhhllllllllleeelllll
Query RWLRPVAYQALPesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                      
Sbjct TFSHRRSCLVKS.........llneeahkaryppspa  446
DSSP  HLEEEEEEEELL.........lllllllhhhllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.8

DSSP  .....llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHhhhhhhh
Query .....tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrLNNSkrasllr   55
ident                                                  |          
Sbjct sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdLGKN.......   53
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.......


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLHH.........
Query tiaselearsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvNSGSY.........  106
ident                                                |            
Sbjct ............................................ewTSYYEevahvleel   69
DSSP  ............................................hhHHHHHlhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  106
ident                                                             
Sbjct dttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigawnypfnltiqpmvgavaa  129
DSSP  hhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ......................................................hleeee
Query ......................................................hqaild  112
ident                                                             
Sbjct gnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpettellkerfdhimytgsta  189
DSSP  lleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhhhlllllleeeeellhh


DSSP  llllllllllllleeeeeeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHHHLL.....lEE
Query tpnptraplpkpdirrqqiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALAAGC.....pVI  166
ident                      |                                      
Sbjct vgkivmaaaakhltpvtlelGGKSPCYVDKDcDLDVA..CRRIAWGKFMNSGqtcvapDY  247
DSSP  hhhhhhhhhhllllleeeelLLLLEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHLLLLllllllLE


DSSP  EELLLLLHHHHHHHHH...................................hhHHHHHHH
Query VKGHTAHPGTSQIVAE...................................ciEQALKQE  191
ident                                                             
Sbjct ILCDPSIQNQIVEKLKkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkVAHGGTW  307
DSSP  EEELHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhllllllEEELLLE


DSSP  ......LLLH..................HHEEEELLLLLHHHHHHHH.LLLLLEEEEEL.
Query ......QLPQ..................AIFTLLQGNQRALGQALVS.HPEIKAVGFTG.  225
ident         |                                            |      
Sbjct dqssryIAPTilvdvdpqspvmqeeifgPVMPIVCVRSLEEAIQFINqREKPLALYVFSn  367
DSSP  elllleELLEeelllllllhhhllllllLEELEEELLLHHHHHHHHHlLLLLLEEEEELl


DSSP  LHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhlll
Query SVGGGRALFNLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfc  285
ident                                                             
Sbjct NEKVIKKMIAETS....SGGVTAN....................................  387
DSSP  LHHHHHHHHLLLL....LLEEEEL....................................


DSSP  lllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeel
Query tkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfs  345
ident                                                             
Sbjct ............................................................  387
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeee
Query qaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltati  405
ident                                                             
Sbjct ............................................................  387
DSSP  ............................................................


DSSP  ellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllllLLLL.....ll
Query hateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypastHSAS.....ts  460
ident                                                  |          
Sbjct .............................................dvivHITVptlpfgg  402
DSSP  .............................................lllhHHHLlllllll


DSSP  llhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query vgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                             
Sbjct vgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  lhhheelllllhhhhhhleeeeeeeelllllllllhhhllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
ident                                                             
Sbjct ...sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewts   57
DSSP  ...lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhh


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll
Query learsddiiarahletalpEVRLtgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
ident                                                             
Sbjct yyeevahvleeldttikelPDWA.....................................   80
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhhhhHHHH.....................................


DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh
Query lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................   80
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl
Query aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
ident                                                             
Sbjct ................................................edepvaktrqtq   92
DSSP  ................................................lleellllllll


DSSP  llllleeeelLLLLEEEELHHHHHhLLLHhhHHHHHHLHhhhllllLLLEEEEEL..LHH
Query pepipfygelGAINPTFIFPSAMRaKADLadQFVASMTMgcgqfctKPGVVFALN..TPE  298
ident                                |                            
Sbjct qddlyihsepLGVVLVIGAWNYPF.NLTI..QPMVGAVA.....agNAVILKPSEvsGHM  144
DSSP  lleeeeeeeeLLEEEEELLLLLLL.HHHH..HHHHHHHH.....llLEEEEELLLllHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllllllllEEEE
Query TQAFIETAQSLirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasALFV  358
ident                                                             
Sbjct ADLLATLIPQY.............................................MDQN  159
DSSP  HHHHHHHHHHH.............................................LLLL


DSSP  eehhhhhhlhhhhllllllEEEEEEElLHHHHHHHHHLLllEEEEEEELlhhHHHHHHHH
Query tssenwrkhpaweeeifgpQSLIVVCeNVADMLSLSEMLagSLTATIHAteeDYPQVSQL  418
ident                      | |    |     |                         
Sbjct ...................LYLVVKG.GVPETTELLKER..FDHIMYTG...STAVGKIV  194
DSSP  ...................LEEELLL.LHHHHHHHLLLL..LLEEEEEL...LHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLEEEEEEL..............................................
Query IPRLEEIAGRLVFN..............................................  432
ident                                                             
Sbjct MAAAAKHLTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyilcdpsi  254
DSSP  HHHHHLLLLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleeeelhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct qnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryi  314
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleellllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct aptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnnekvikk  374
DSSP  lleeelllllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhh


DSSP  ......................................lllLLLLlllllllllllllll
Query ......................................gwpTGVEvgyamvhggpypast  454
ident                                                             
Sbjct miaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkkSFET...............  419
DSSP  hhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhhHHHH...............


DSSP  llllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query hsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                   
Sbjct .......................fshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  .......................leeeeeeeelllllllllhhhllllll