No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=37.0

DSSP  ...........................LLLEEEEELLLLLLEEeEEEELLLHHHHHHHHH
Query ...........................TDNVFYATNAFTGEALpLAFPVHTEVEVNQAAT   33
ident                                                      ||     
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggSGQEIEVKSPIDLATI.AKVISPSREEVERTLD   59
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelLLLEEEEELLLLLLEE.EEEELLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHH.HHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AAAKV.ARDFRRLNNSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLTGEIARTAN   92
ident    |      |      |   ||  |   |   |            |     ||      
Sbjct VLFKRgRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAVGEVKAAVD  119
DSSP  HHHHLhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhlHHHLEEEELLLLLLLllLLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllL
Query QLRLFADVVnsgSYHQAILDTPNPTRAplPKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaG  152
ident  |||                    |               || ||     | ||      
Sbjct RLRLAELDL...KKIGGDYIPGDWTYD.tLETEGLVRREPLGVVAAITPFNYPLFDA..V  173
DSSP  HHHLLLHHH...HHLLLEEEELLLLLL.lLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHH..H


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHHEEEELLLlLHHHHHH
Query GDTASALAAGCPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqLPQAIFTLLQGNqRALGQAL  212
ident          |  | ||     |            |      |     ||           
Sbjct NKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAG....FPPDAIALLNLP.GKEAEKI  228
DSSP  HHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLLLLEEELLLL.HHHLHHH


DSSP  HHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHH
Query VSHPEIKAVGFTGSVGGGRALFNLAHerpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQ  272
ident |      || ||||   |                  |||   |      |       || 
Sbjct VADDRVAAVSFTGSTEVGERVVKVGG....VKQYVMELGGGDPAIVLEDAD..LDLAADK  282
DSSP  HLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHL....LLEEEEELLLLEEEEELLLLL..HHHHHHH


DSSP  HHHHHLHHHHLLLLLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........LLLLLHH
Query FVASMTMGCGQFCTKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP..........STLLTPG  322
ident          || |     | |          |                       |  | 
Sbjct IARGIYSYAGQRCDAIKLVLAERP.VYGKLVEEVAKRLSSLRVgdprdptvdvGPLISPS  341
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHLLLLllllllllllLLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLlLEEE.EELLLLLL.LLLLEEEEEEHHHHHhLHHHH.LLLLLLEE
Query IRDSYQSQVVSRGSDdGIDV.TFSQAESP.CVASALFVTSSENWRkHPAWE.EEIFGPQS  379
ident   |             |  |        |  |                     | | |  
Sbjct AVDEMMAAIEDAVEK.GGRVlAGGRRLGPtYVQPTFVEAPADRVK.DMVLYkREVFAPVA  399
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHL.LLEEeELLLEEELlEELLEEEELLHHHHL.LLHHHhLLLLLLEE


DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLlLLL
Query LIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPtGVE  439
ident | |          |       | |       |          |    |    |  |    
Sbjct LAVEVKDLDQAIELANGRPYGLDAAVFGR..DVVKIRRAVRLL..EVGAIYINDMP.RHG  454
DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLEELEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLLL.LLL


DSSP  LLLlLLLLLLLLLLLlllLLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhllllllllleee
Query VGYaMVHGGPYPASThsaSTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenpleiarav  499
ident  ||    ||                |                                  
Sbjct IGY.YPFGGRKKSGV...FREGIGYAVEAVTAYKTIVF................nykgkg  494
DSSP  LLL.LLLLLEELLEE...LLLLLLLLHHHHEEEEEEEE................elllll


DSSP  lllll
Query dgkaa  504
ident      
Sbjct vwkye  499
DSSP  lllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhh
Query ..........tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskr   50
ident                                                             
Sbjct lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlee
Query asllrtiaselearsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqai  110
ident                                                             
Sbjct iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee


DSSP  eellllllllllllleeeeeeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHH....HLLL.
Query ldtpnptraplpkpdirrqqiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALA....AGCP.  164
ident                        |                 |                  
Sbjct gstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLA..ADKIARGIYSyagqRCDAi  298
DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHHhhhlLLLLe


DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHH......................................
Query VIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQ......................................  186
ident   |       |                                                 
Sbjct KLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekgg  358
DSSP  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ...HHHHH.....LLLH.....................hHEEEELLLLLHHHHHHHHL.L
Query ...ALKQE.....QLPQ.....................aIFTLLQGNQRALGQALVSH.P  216
ident    |           |                                      |    |
Sbjct rvlAGGRRlgptyVQPTfveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVKDLDQAIELANGrP  418
DSSP  eeeELLLEeelleELLEeeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLlL


DSSP  LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhh
Query EIKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfva  275
ident         |  |   |    |          |                            
Sbjct YGLDAAVFGrDVVKIRRAVRLLE....VGAIYIN..........................  448
DSSP  EELEEEEELlLHHHHHHHHHHLL....LLEEEEL..........................


DSSP  hhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query smtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrg  335
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhh
Query sddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslse  395
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllllllllllllllll
Query mlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasth  455
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhHHEEEE............eeelllhhhllhhhllllllllleeellll
Query sastsvgaeaihRWLRPV............ayqalpesllpdslkaenpleiaravdgka  503
ident                                                             
Sbjct ..........dmPRHGIGyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwky  498
DSSP  ..........llLLLLLLlllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeelllllllll


DSSP  l
Query a  504
ident  
Sbjct e  499
DSSP  l


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll
Query learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
ident                                                             
Sbjct ...................................agllegvikekggvpvypsylagew   25
DSSP  ...................................lhhhlllleeelleeeeleelllle


DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh
Query lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
ident                                                             
Sbjct ggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldvlfkrgrwsardmpgterlavlrkaa   85
DSSP  elllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl
Query aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
ident                                                             
Sbjct diiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdrlrlaeldlkkiggdyipgdwtydtl  145
DSSP  hhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhllleeeellllllll


DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhllLHHHHHHHHHLHHHhllllLLLEEEEELLhHHH
Query pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakaDLADQFVASMTMGCgqfctKPGVVFALNTpETQ  300
ident                              |                   ||         
Sbjct eteglvrreplGVVAAITPFNYP...lFDAVNKITYSFIYG.....NAVVVKPSIS.DPL  196
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLL...lHHHHHHHHHHHHLL.....LEEEEELLLL.LLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllLEEEeee
Query AFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvaSALFvts  360
ident         |                                                   
Sbjct PAAMAVKALLDAG........................................FPPD...  213
DSSP  HHHHHHHHHHHLL........................................LLLL...


DSSP  hhhhhhlhhhhllllllEEEEEEELlHHHHHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHHH
Query senwrkhpaweeeifgpQSLIVVCEnVADMLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQLIP  420
ident                                                             
Sbjct .................AIALLNLP.GKEAEKIVA.DDRVAAVSFTG...STEVGERVVK  251
DSSP  .................LEEELLLL.HHHLHHHHL.LLLLLEEEEEL...LHHHHHHHHH


DSSP  HHHLleEEEEEL................................................
Query RLEEiaGRLVFN................................................  432
ident          |                                                  
Sbjct VGGV..KQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpvyg  309
DSSP  HHLL..LEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct klveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgp  369
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct tyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfgrd  429
DSSP  leelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeelll


DSSP  ................................................lLLLLlllllll
Query ................................................gWPTGvevgyam  444
ident                                                    |        
Sbjct vvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTA.......  482
DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEE.......


DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query vhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                             
Sbjct ...........................................yktivfnykgkgvwkye  499
DSSP  ...........................................eeeeeeellllllllll