No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=50.8

DSSP  .LLLLEEELLEEELLLlLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query .MQHKLLINGELVSGEgEKQPVYNPATGDVLLEIAEASAEQVDAAVRAADAAFAEWGQTT   59
ident   | |   |||    |      | || |  |      | | ||     |  |   |    
Sbjct tKQYKNYVNGEWKLSE.NEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYASAKKAQPAWRALS   59
DSSP  lLLLLEEELLEEELLL.LEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL
Query PKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFnDEIPAIVDVFRFFAGAARCLN  119
ident    ||  | | ||             |    |   ||   |           |       
Sbjct YIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAV.SEVVRTAEIINYAAEEGLRME  118
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  LLlLEEEE......LLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL
Query GLaAGEYL......EGHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMAAWKLAPALAAGNCVVLKP  173
ident |    |               || | | |  | | |||   |  | |||| |||    ||
Sbjct GE.VLEGGsfeaasKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAGNVIAFKP  177
DSSP  LE.EEEHHhllhhhLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL


DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEELLLLLLLLHHHHHLLLLEEEEEEELLHHHHHHH
Query SEITPLTALKLAELAKD.IFPAGVVNILFGRGKTVGDPLTGHPKVRMVSLTGSIATGEHI  232
ident         | |||       |||| |   |||   ||    |  |     |||   || |
Sbjct PTQGSISGLLLAEAFAEaGLPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNFINFTGSTGIGERI  237
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHH


DSSP  HHHHHhhLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLLLLLLLEEEEELLL
Query ISHTAssIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQDCTAACRIYAQKGI  292
ident              |||||   ||  ||| |              || |||  |       
Sbjct GKMAG..MRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTAVKRVLVMESV  295
DSSP  HHHLL..LLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLEEEELLLL
Query YDTLVEKLGAAVATLKSGAPDDEsTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAKATgHIKVITGGEK  352
ident  | ||||    |  |  | | |      ||        |      |         |    
Sbjct ADELVEKIREKVLALTIGNPEDD.ADITPLIDTKSADYVEGLINDANDK.GATALTEIKR  353
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLEELLLLLE


DSSP  LlllLLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEL
Query RkgnGYYYAPTLLAGALQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQYGLASSVWT  412
ident     |    | |      |      | ||||         |      | | |||  |  |
Sbjct E...GNLICPILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFT  410
DSSP  E...LLEELLEEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEEL


DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL.LLLLLLLLLLHHHEELLLLHHHHHHLLEEEEEEE
Query KDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTHFM.LVSEMPHGGQKLSGYGKDMSLYGLEDYTVVRHVM  471
ident  |  ||      |  |    |          |  | | || |     |  |  | |  | 
Sbjct NDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKTQrGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSIEAMTTVKSVV  470
DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLlLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHHHHLEEEEEEE


DSSP  EEL.
Query VKH.  474
ident     
Sbjct FDIk  474
DSSP  EELl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.7

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  ....................................................lllleeel
Query ....................................................mqhkllin    8
ident                                                             
Sbjct ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle


DSSP  leeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
Query gelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecll   68
ident                                                             
Sbjct vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeel
Query kladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclnglaageyle  128
ident                                                             
Sbjct gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeLLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eEEEELLLLLLHHHH
Query ghtsmirrdpLGVVASIAPWN.YPLMMAAWKLAPALAAGN.....cVVLKPSEITPLTAL  182
ident            |    |          |    | |                 |       
Sbjct agmrpimlelGGKDSAIVLEDaDLELTAKNIIAGAFGYSGqrctavKRVLVMESVADELV  300
DSSP  llllleeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH


DSSP  HHHHH.........................................HLLL.........L
Query KLAEL.........................................AKDI.........F  192
ident                                               |             
Sbjct EKIREkvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatALTEikregnlicP  360
DSSP  HHHHHhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleELLLlleelleelL


DSSP  LLL.................LEEELLL.LLLLlHHHHHL.LLLEEEEEEEL.LHHHHHHH
Query PAG.................VVNILFG.RGKTvGDPLTG.HPKVRMVSLTG.SIATGEHI  232
ident                     |  |                       |           |
Sbjct ILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVtSVEE.AIEISNkSEYGLQASIFTnDFPRAFGI  419
DSSP  EEEellllllhhhlllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHhLLEELEEEEELlLHHHHHHH


DSSP  HHHHhhHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhhhhllllllleeeeelll
Query ISHTasSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyynagqdctaacriyaqkgi  292
ident            |                                                
Sbjct AEQL..EVGTVHIN..............................................  431
DSSP  HHHL..LLLEEEEL..............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellll
Query ydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggek  352
ident                                                             
Sbjct .........................................................nkt  434
DSSP  .........................................................lll


DSSP  lllllllllleeeellllllhhhhllllllEEEEEEELLHhhhhhhhhlllllleeeeel
Query rkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpVVSVTPFDNEeqvvnwandsqyglassvwt  412
ident                                |    ||                      
Sbjct qrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamtTVKSVVFDIK....................  474
DSSP  llllllllllleelleellllhhhhhhhleEEEEEEEELL....................


DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellllhhhhhhlleeeeeeee
Query kdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygledytvvrhvmv  472
ident                                                             
Sbjct ............................................................  474
DSSP  ............................................................


DSSP  el
Query kh  474
ident   
Sbjct ..  474
DSSP  ..


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
Query mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
ident                                                             
Sbjct ................................tkqyknyvngewklseneikiyepasga   28
DSSP  ................................llllleeelleeelllleeeeellllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhHLLLHhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query kvraecllkladvieengqvfaelesrnCGKPLhsafndeipaivdvfrffagaarclng  120
ident                                                             
Sbjct elgsvpamsteevdyvyasakkaqpawrALSYI...........................   61
DSSP  eeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLHH...........................


DSSP  llleeeelleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhh
Query laageyleghtsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitplt  180
ident                                                             
Sbjct ..............................................eraaylhkvadilm   75
DSSP  ..............................................hhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl
Query alklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassi  240
ident                                                             
Sbjct rdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkki  135
DSSP  hlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhllee


DSSP  leeeeellLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHhhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHH
Query krthmelgGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNagqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKL  300
ident         |    |                                              
Sbjct avvrrepvGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAG......NVIAFKPPTQGSISGLLLA  189
DSSP  eeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLL......LEEEEELLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeEELLllllllllll
Query GAavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvITGGekrkgngyyy  360
ident  |                                               |          
Sbjct EA...........................................fAEAG..........  196
DSSP  HH...........................................hHHHL..........


DSSP  lleeeellllllhhhhllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLlLLLEEEEELlLHHHHHH
Query aptllagalqddaivqkevfGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSqYGLASSVWTkDVGRAHR  420
ident                       |         |                      |   |
Sbjct ..................lpAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQ.AVNFINFTG.STGIGER  236
DSSP  ..................llLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLL.LLLEEEEEL.LHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLEEE.................................................
Query VSARLQYGCTW.................................................  431
ident                                                             
Sbjct IGKMAGMRPIMlelggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesva  296
DSSP  HHHHLLLLLEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct delvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregn  356
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct licpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfpra  416
DSSP  eelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhh


DSSP  ...............elllllllllllllllhhheellllhhhhhhlleeeeeeeeel
Query ...............vnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
ident                                                           
Sbjct fgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
DSSP  hhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell