No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=49.5

DSSP  lllllllllllLLLLEEELLEEELLllLLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHH
Query avpapnqqpevFCNQIFINNEWHDAvsRKTFPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAA   60
ident                   | ||             |  |     |     | ||     |
Sbjct ..........tKQYKNYVNGEWKLS..ENEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYASA   48
DSSP  ..........lLLLLEEELLEEELL..LLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHH
Query RAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYlVDLDMVL  120
ident   |      ||      |   |   ||   ||     |       | |            
Sbjct KKAQP...AWRALSYIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAV.SEVVRTA  104
DSSP  HHHHH...HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLEELLL......LLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHH
Query KCLRYYAGWADKYHGKTIPID......GDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLG  174
ident     | |       |                   | ||||    | | | |      |  
Sbjct EIINYAAEEGLRMEGEVLEGGsfeaasKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIA  164
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEHHhllhhhLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHLLLLLLE
Query PALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDK  234
ident |||  |||   |   |     |  |    ||| | || |   | |   |  |  |  |  
Sbjct PALIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAGLPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNF  224
DSSP  HHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLE


DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHHHhllLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query VAFTGSTEIGRVIQVAAGssnLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQ  294
ident   ||||| ||  |   ||        ||||||   |   |||            |   ||
Sbjct INFTGSTGIGERIGKMAG...MRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQ  281
DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHLL...LLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query CSCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSkTEQGPQVDETQFKKILGYINTG  354
ident    |  |  | |   || ||           ||| |      |  |        | ||  
Sbjct RCTAVKRVLVMESVADELVEKIREKVLALTIGNPEDD.ADITPLIDTKSADYVEGLINDA  340
DSSP  LLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLEEEELLLLLLlllLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH
Query KQEGAKLLCGGGIAAdrgYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRA  414
ident    ||  |            | |  |  |   |  | || ||||  |      ||     
Sbjct NDKGATALTEIKREG...NLICPILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEIS  397
DSSP  HHLLLEELLLLLEEL...LEELLEEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL.LLLLLLLLLLLLHHHEELLLLLH
Query NNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY.DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGE  473
ident | | ||| |  || |   |      |  |||  |          || | | || |     
Sbjct NKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKtQRGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVK  457
DSSP  HHLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLlLLLLLLLLLLLEELLEELLLLHH


DSSP  HHHHHHEEEEEEEEELLllll
Query YGLQAYTEVKTVTVKVPqkns  494
ident |   | | || |         
Sbjct YSIEAMTTVKSVVFDIK....  474
DSSP  HHHHHLEEEEEEEEELL....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  ......................................llllllllllllllleeellee
Query ......................................avpapnqqpevfcnqifinnew   22
ident                                                             
Sbjct ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle


DSSP  elllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhllhhhhhhhh
Query hdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaraafqlgspwrrmdashrgrll   82
ident                                                             
Sbjct vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll


DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleellll
Query nrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidg  142
ident                                                             
Sbjct gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eEEEELLLLLLHHHH
Query dffsytrhepvGVCGQIIPWN.FPLLMQAWKLGPALATGN.....vVVMKVAEQTPLTAL  196
ident            |    |        |        |               | |       
Sbjct agmrpimlelgGKDSAIVLEDaDLELTAKNIIAGAFGYSGqrctavKRVLVMESVADELV  300
DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL.................................................L
Query YVANLIKEAG.................................................F  207
ident         |                                                   
Sbjct EKIREKVLALtignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicP  360
DSSP  HHHHHHHHLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelL


DSSP  LLL.................LEEELLL.LLLLhHHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHH
Query PPG.................VVNIVPG.FGPTaGAAIAS.HEDVDKVAFTG.STEIGRVI  247
ident                     |  |            |    |                 |
Sbjct ILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVtSVEE.AIEISNkSEYGLQASIFTnDFPRAFGI  419
DSSP  EEEellllllhhhlllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHhLLEELEEEEELlLHHHHHHH


DSSP  HHHHhhlLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehh
Query QVAAgssNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqed  307
ident            |                                                
Sbjct AEQL...EVGTVHIN.............................................  431
DSSP  HHHL...LLLEEEEL.............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellll
Query iydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggi  367
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeel
Query aadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavft  427
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelllllhhhhhHHEE......
Query kdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrelgeyglqAYTE......  481
ident                                                             
Sbjct ................................................nkTQRGtdnfpf  443
DSSP  ................................................llLLLLllllll


DSSP  ..........EEEE........eeellllll
Query ..........VKTV........tvkvpqkns  494
ident                                
Sbjct lgakksgagiQGVKysieamttvksvvfdik  474
DSSP  lleelleellLLHHhhhhhleeeeeeeeell


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh
Query raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
ident                                                             
Sbjct .tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawrals   59
DSSP  .llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell
Query nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
ident                                                             
Sbjct yieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmeg  119
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleE
Query teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSDaDMDWAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
ident                         |    |                              
Sbjct evleggsfeaaskkkiavvrrepvGLVLAISPFN.YPVNLAGSKIAPALIAGN.....vI  173
DSSP  eeeehhhllhhhlleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHHHHLLL.....eE


DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle
Query RTFVQEDIYDEFVERSVARAKSrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
ident                  | |                                        
Sbjct AFKPPTQGSISGLLLAEAFAEA......................................  195
DSSP  EEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH......................................


DSSP  eeellllllllllllLLEEEellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLlLL
Query llcgggiaadrgyfiQPTVFgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFKTIEEVVGRANNStYG  420
ident                                      |         |            
Sbjct ...............GLPAG.................VFNTITGRGSEIGDYIVEHQ.AV  222
DSSP  ...............LLLLL.................LEEELLLLHHHHHHHHHHLL.LL


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLlLEEEEL................................
Query LAAAVFTkDLDKANYLSQALQaGTVWVN................................  448
ident                                                             
Sbjct NFINFTG.STGIGERIGKMAGmRPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgq  281
DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHLLlLLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct rctavkrvlvmesvadelvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindan  341
DSSP  lllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct dkgatalteikregnlicpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkse  401
DSSP  hllleellllleelleelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhll


DSSP  ........................................................lLLL
Query ........................................................cYDV  452
ident                                                             
Sbjct yglqasiftndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkySIE  461
DSSP  eeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhHHH


DSSP  Llllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll
Query Fgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
ident                                           
Sbjct A.............................mttvksvvfdik  474
DSSP  H.............................leeeeeeeeell