No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=54.6

DSSP  ...........LLLLEEELLEEELLLL.LEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHH
Query ...........MQHKLLINGELVSGEG.EKQPVYNPATGDVLLEIAEASAEQVDAAVRAA   48
ident                  || |          |  || || |    ||   | || || ||
Sbjct avpapnqqpevFCNQIFINNEWHDAVSrKTFPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAA   60
DSSP  lllllllllllLLLLEEELLEEELLLLlLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHH...HHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHLHHHHHH
Query DAAFA...EWGQTTPKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFNDEIPAIV  105
ident  |||     |       |   |  ||| ||      | ||    |||             
Sbjct RAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVL  120
DSSP  HHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLLLEeEELLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL
Query DVFRFFAGAARCLNGLAAGeYLEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMAAWKLAPALAA  165
ident    |  || |    |           |  |  | ||   | ||| || | |||| |||| 
Sbjct KCLRYYAGWADKYHGKTIP.IDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALAT  179
DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLEEL.LLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEELLLLLLLLHHHHHLLLLEEEEEEEL
Query GNCVVLKPSEITPLTALKLAELAKD.IFPAGVVNILFGRGKTVGDPLTGHPKVRMVSLTG  224
ident || || |  | ||||||  | | |   || |||||  | | | |     |  |  |  ||
Sbjct GNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEaGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTG  239
DSSP  LLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHhLLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHLLLLLLEEEEEL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHH.HLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLLLLLL
Query SIATGEHIISHTAS.SIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQDCTAA  283
ident |   |  |     |   ||   ||||| | |   |||    ||        | ||   | 
Sbjct STEIGRVIQVAAGSsNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCSCAG  299
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHlLLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLE


DSSP  LEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlL
Query CRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVATLKSGAPDDESTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAKATgH  343
ident  |   |  |||  ||   |       | | |  || ||                 |    
Sbjct SRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQE.G  358
DSSP  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.L


DSSP  LEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLL
Query IKVITGGEKRKGNGYYYAPTLLAGALQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQ  403
ident  |   ||      ||   ||          |   | ||||     |   | ||  || | 
Sbjct AKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNST  418
DSSP  LEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHEELLLLHHHHHHL
Query YGLASSVWTKDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTHFMLVSEMPHGGQKLSGYGKDMSLYGLED  463
ident ||||  | |||   |   |  || |  |||         | || | || |     |||  
Sbjct YGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQA  478
DSSP  LLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHEELLLLLHHHHHH


DSSP  LEEEEEEEEEL.....
Query YTVVRHVMVKH.....  474
ident || |  | ||      
Sbjct YTEVKTVTVKVpqkns  494
DSSP  HEEEEEEEEELlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh


DSSP  .....lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .....mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaew   55
ident                                                             
Sbjct kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhl
Query gqttpkvraecllkladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaa  115
ident                                                             
Sbjct nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell


DSSP  lllllllleeeelleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eE
Query rclnglaageyleghtsmirrdplGVVASIAPWN.YPLMMAAWKLAPALAAGN.....cV  169
ident                         |    |                              
Sbjct teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSDaDMDWAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleE


DSSP  EEELLLLLLHHHHHHHHH..........................................
Query VLKPSEITPLTALKLAEL..........................................  187
ident      |                                                      
Sbjct RTFVQEDIYDEFVERSVAraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  .HLLL...........LLLL.................LEEELLL.LLLLlHHHHHLLL.L
Query .AKDI...........FPAG.................VVNILFG.RGKTvGDPLTGHP.K  216
ident                                      |  ||                  
Sbjct lLCGGgiaadrgyfiqPTVFgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFkTIEE.VVGRANNStY  419
DSSP  eEELLlllllllllllLEEEellllllhhhhllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHLLlL


DSSP  EEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhh
Query VRMVSLTG.SIATGEHIISHTasSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyyn  275
ident                                                             
Sbjct GLAAAVFTkDLDKANYLSQAL..QAGTVWVN.............................  448
DSSP  LLEEEEELlLHHHHHHHHHHL..LLLEEEEL.............................


DSSP  hhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query agqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkav  335
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhh
Query eeakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqv  395
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelll
Query vnwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkd  455
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhLLEE.................................eeeeeeel
Query mslygleDYTV.................................vrhvmvkh  474
ident                                                     
Sbjct ......cYDVFgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
DSSP  ......lLLLLlllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  ..................................lllleeelleeellllleeeeeelll
Query ..................................mqhkllingelvsgegekqpvynpat   26
ident                                                             
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query gdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecllkladvieengqvfaeles   86
ident                                                             
Sbjct raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh


DSSP  hhhlllhhhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeelleeeeeeeeelleeeeel
Query rncgkplhsaFNDEipaivdvfrffagaarclnglaageyleghtsmirrdplgvvasia  146
ident                                                             
Sbjct kclryyagwaDKYH..............................................  134
DSSP  hhhhhhhhhlLLLL..............................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhlllllllleeelllllll
Query pwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitpltalklaelakdifpagvvnilfgrgkt  206
ident                                                             
Sbjct ............................................................  134
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhlleeeeellLLLEEEELLLLLHHHHHH
Query vgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassikrthmelgGKAPVIVFDDADIEAVVE  266
ident                                           |    |            
Sbjct .......................gktipidgdffsytrhepvGVCGQIIPWNFPLLMQAW  171
DSSP  .......................lleellllleeeeeeeeelLEEEEELLLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHlLHHHhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllllhh
Query GVRTFgYYNAgqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAavatlksgapddestelgplssla  326
ident                             |                               
Sbjct KLGPA.LATG.....NVVVMKVAEQTPLTALYVANL........................  201
DSSP  HHHHH.HHLL.....LEEEEELLLLLLHHHHHHHHH........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllleeEELLllllllllllLLEEeellllllhhhhllllllEEEE
Query hlervgkaveeakatghikvITGGekrkgngyyyAPTLlagalqddaivqkevfgpVVSV  386
ident                        |           |                    ||  
Sbjct ...................iKEAG..........FPPG..................VVNI  214
DSSP  ...................hHHHL..........LLLL..................LEEE


DSSP  EEELlHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHL...LLLEEEEL..........
Query TPFDnEEQVVNWANDSQYGLASSVWTkDVGRAHRVSARL...QYGCTWVN..........  433
ident  |                                                          
Sbjct VPGF.GPTAGAAIASHEDVDKVAFTG.STEIGRVIQVAAgssNLKRVTLElggkspniim  272
DSSP  LLLL.LLLHHHHHHLLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhlLLLEEEEElllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  433
ident                                                             
Sbjct sdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdsk  332
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  433
ident                                                             
Sbjct teqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiake  392
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  433
ident                                                             
Sbjct eifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydv  452
DSSP  llllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllll


DSSP  ........................llLLLLLlllllllhhheellllhhhhhhlleeeee
Query ........................thFMLVSemphggqklsgygkdmslygledytvvrh  469
ident                              |                              
Sbjct fgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaYTEVK.......................tvtvkv  489
DSSP  llllllllllhhheelllllhhhhhhHEEEE.......................eeeeel


DSSP  eeeel
Query vmvkh  474
ident      
Sbjct pqkns  494
DSSP  lllll