No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=50.0

DSSP  lhhhlllleeellEEEELEELLLLEELLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHH
Query agllegvikekggVPVYPSYLAGEWGGSGQEIEVKSPIDLATIAKVISPSREEVERTLDV   60
ident                 |  |  |||  |  ||    |   |    |   | |||      
Sbjct .............TKQYKNYVNGEWKLSENEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYAS   47
DSSP  .............LLLLLEEELLEEELLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query LFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAVGEVKAAVDR  120
ident          |     || | | | |||  |        |     |    || ||      
Sbjct AK.KAQPAWRALSYIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVSEVVRTAEI  106
DSSP  HH.HHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLL.LHHHHhLLLEEEELL.LLLLLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHH
Query LRLA.ELDLKkIGGDYIPGD.WTYDTLETEGLVRREPLGVVAAITPFNYPLFDAVNKITY  178
ident    | |  |    |    |             ||||| | | || |||||   |  ||  
Sbjct INYAaEEGLR.MEGEVLEGGsFEAASKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAP  165
DSSP  HHHHhHHHLL.LLLEEEEHHhLLHHHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEELLLLHH.HLHHHHLLLLLLEE
Query SFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAGFPPDAIALLNLPGK.EAEKIVADDRVAAV  237
ident   | ||    ||             |   || |          |      ||    |   
Sbjct ALIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAGLPAGVFNTITGRGSeIGDYIVEHQAVNFI  225
DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLHHhHHHHHHHLLLLLEE


DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL
Query SFTGSTEVGERVVKVGGVKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSYAGQRCDA  297
ident  |||||  |||  |  |      |||| | ||||||||| | |  |  |   | |||| |
Sbjct NFTGSTGIGERIGKMAGMRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTA  285
DSSP  EEELLHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL


DSSP  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query IKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLRVGDPRDPtVDVGPLISPSAVDEMMAAIEDAVEKG  357
ident  | ||    |   |||        |  | | |   |  |||     |     | ||  ||
Sbjct VKRVLVMESVADELVEKIREKVLALTIGNPEDD.ADITPLIDTKSADYVEGLINDANDKG  344
DSSP  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LEEEELLLEeELLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLL
Query GRVLAGGRRlGPTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVALAVEVKDLDQAIELANGR  417
ident    |    |       |           || |   | | ||     |     |||  |  
Sbjct ATALTEIKR.EGNLICPILFDKV...TTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKS  400
DSSP  LEELLLLLE.ELLEELLEEEELL...LLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHL


DSSP  LEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLEELLEELLLLLLLLH
Query PYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGIGYYPFGGRKKSGVFREGIGYAV  477
ident  ||| |  |  |          ||||   ||     |    || | ||||    |  |  
Sbjct EYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKTQRGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSI  460
DSSP  LEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHH


DSSP  HHHEEEEEEEEELLllllllll
Query EAVTAYKTIVFNYKgkgvwkye  499
ident || |  |  ||  |        
Sbjct EAMTTVKSVVFDIK........  474
DSSP  HHLEEEEEEEEELL........


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ................................tkqyknyvngewklseneikiyepasga   28
DSSP  ................................llllleeelleeelllleeeeellllll


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct elgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvadilmrdkekigailske   88
DSSP  eeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllhHHHHL..LLEeeellllllllleeeeE...........................
Query lrlaelDLKKI..GGDyipgdwtydtleteglV...........................  151
ident                                                             
Sbjct vakgykSAVSEvvRTA................Eiinyaaeeglrmegevleggsfeaask  132
DSSP  hlllhhHHHHHhhHHH................Hhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct kkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptqgsisglllaeaf  192
DSSP  leeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................................................eeeelL
Query ......................................................rreplG  157
ident                                                            |
Sbjct aeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkmagmrpimlelgG  252
DSSP  hhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhllllleeeellL


DSSP  EEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHHHH....LLLE.EEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHL...
Query VVAAITPFN.YPLFDAVNKITYSFI....YGNA.VVVKPSISDPLPAAMAVKALLDA...  208
ident    ||          | | |   |        |   |    |              |   
Sbjct KDSAIVLEDaDLELTAKNIIAGAFGysgqRCTAvKRVLVMESVADELVEKIREKVLAlti  312
DSSP  LEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLlll


DSSP  ..............................................LLLL..........
Query ..............................................GFPP..........  212
ident                                                             
Sbjct gnpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnliCPILfdkvttdmrl  372
DSSP  llhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleeLLEEeellllllhh


DSSP  .......LLEEELLLLH.HHLHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLLLEEEEEl
Query .......DAIALLNLPG.KEAEKIVA.DDRVAAVSFTG.STEVGERVVKVGGVKQYVMEl  262
ident                    ||  |          |                 |       
Sbjct aweepfgPVLPIIRVTSvEEAIEISNkSEYGLQASIFTnDFPRAFGIAEQLEVGTVHIN.  431
DSSP  hllllllLEEEEEEELLhHHHHHHHHhLLEELEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL.


DSSP  llleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpvygklveevakrlssl  322
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeelleelleeeellhh
Query rvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgptyvqptfveapad  382
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeelllhhhhhhhhhhlll
Query rvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfgrdvvkirravrllev  442
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEEEEE.................
Query gaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTAYKT.................  485
ident                                                             
Sbjct ..................................nkTQRGTDNfpflgakksgagiqgvk  457
DSSP  ..................................llLLLLLLLllllleelleellllhh


DSSP  ...eeeellllllllll
Query ...ivfnykgkgvwkye  499
ident                  
Sbjct ysieamttvksvvfdik  474
DSSP  hhhhhleeeeeeeeell


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct .............................................tkqyknyvngewkls   15
DSSP  .............................................llllleeelleeell


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhHLLL..............
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnAGKP..............  106
ident                                                             
Sbjct eneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawraLSYIeraaylhkvadilm   75
DSSP  lleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................................hHHHHHhhhhhhhhhhlllhhhhh
Query ....................................kSAAVGevkaavdrlrlaeldlkk  130
ident                                                             
Sbjct rdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeEGLRM..................  117
DSSP  hlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLL..................


DSSP  llleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllHHHHhhhhhhhhllleeeeel
Query iggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplFDAVnkitysfiygnavvvkp  190
ident                                           |                 
Sbjct .......................................EGEV.................  121
DSSP  .......................................LLEE.................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhHHLL.lLLLLEeellllhhhlhhhhlllllleeeeellhhhhhhh
Query sisdplpaamavkalLDAG.fPPDAIallnlpgkeaekivaddrvaavsftgstevgerv  249
ident                          |                                  
Sbjct ............legGSFEaaSKKKI..................................  135
DSSP  ............eehHHLLhhHLLEE..................................


DSSP  hhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHhHHHHhllllLEEEEEEEHHHHH
Query vkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLAADKIARGiYSYAgqrcdAIKLVLAERPVYG  309
ident               |   ||          |                             
Sbjct ......avvrrepVGLVLAISPFN.YPVNLAGSKIAPaLIAG.....NVIAFKPPTQGSI  183
DSSP  ......eeeeeeeLLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLL.....LEEEEELLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeel
Query KLVEEVAKRLSSlrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgp  369
ident                                                             
Sbjct SGLLLAEAFAEA................................................  195
DSSP  HHHHHHHHHHHH................................................


DSSP  leELLEeeellhhhhlllhhhhlllllLEEEEEEELLhhHHHHHHHLlLEELEEEEELlL
Query tyVQPTfveapadrvkdmvlykrevfaPVALAVEVKDldQAIELANGrPYGLDAAVFGrD  429
ident     |                       |                            |  
Sbjct ..GLPA.....................GVFNTITGRGseIGDYIVEH.QAVNFINFTG.S  230
DSSP  ..LLLL.....................LLEEELLLLHhhHHHHHHHL.LLLLEEEEEL.L


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLEEEEL.........................................
Query VVKIRRAVRLLEVGAIYIN.........................................  448
ident      |         |                                            
Sbjct TGIGERIGKMAGMRPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvl  290
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct vmesvadelvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalte  350
DSSP  eehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct ikregnlicpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasift  410
DSSP  lleelleelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeel


DSSP  .................................................lllLLLLLlll
Query .................................................dmpRHGIGyyp  459
ident                                                             
Sbjct ndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieaMTTVK...  467
DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhLEEEE...


DSSP  llleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll
Query fggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
ident                                         
Sbjct .................................svvfdik  474
DSSP  .................................eeeeell