No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=17.9

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH
Query psevvgttakagKAEAEAALEAAWKAFKTWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEATL  120
ident                       | ||    |    | ||  | |            |   
Sbjct ...........hMSSSQQIAKNARKAGNILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEAN   49
DSSP  ...........lLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH


DSSP  HHHHL...........llhhHHHH..HHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLLLLLL.LEE
Query VYEVG...........knwvEASA..DVAEAIDFIEYYARAaLRYRYPAVEVVPYP.GED  166
ident                                   |   |                  |  
Sbjct KIDLAvaketgladsllkrlDLFKgdKFEVMLQGIKDVAEL.EDPVGKVKMARELDdGLT  108
DSSP  HHHHHhhhhllllhhhhhhhLLLLllHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLLEEEEEEEElLEE


DSSP  EEEEEEELLEEEEELLLllLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query NESFYVPLGAGVVIAPWnfPVAIFTGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEA  226
ident       | |   ||                    ||  | |     |        |    
Sbjct LYQVTAPVGVLLVIFES..RPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDT  166
DSSP  EEEEEEELLEEEEEELL..LLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  L........LLLLLEEELLLLllhhHHHHHLL.LLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHlllll
Query G........FPPGVVNFLPGVgeevGAYLVEH.PRIRFINFTGSLEVGLKIYEAAgrlap  277
ident           | | |             |      |      ||     ||         
Sbjct IaqfqsetgVPVGSVQLIETR....VSDLLDQdEYIDLVVPRGSNALVRKIKDTT.....  217
DSSP  HhhhhhhhlLLLLLEEELLLL....LHHHHHLlLLLLEEEEELLHHHHHHHHHLL.....


DSSP  lllllLEEEEelLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllllleEEEEEEHHH..H
Query gqtwfKRAYVetGGKNAIIVDETADFDLAAEGVVVSAYGfqgqkcsaaSRLILTQGA..Y  335
ident              |   |  || ||   |                     |         
Sbjct ....kIPVLGhaDGICSIYLDEDADLIKAKRISLDAKTN.....cnamETLLINPKFskW  268
DSSP  ....lLLLLLllLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLL.....llllEEEEELLLLllH


DSSP  HHHHHHHHHHHLllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllll
Query EPVLERVLKRAErlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlege  395
ident   |||                                                       
Sbjct WEVLENLTLEGG................................................  280
DSSP  HHHHHHHHHHHL................................................


DSSP  lllllLEEEELLL.............lllhhhlllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLL
Query gyfiaPTVFTEVP.............pkariaqeeifGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTP  442
ident       |                                 |    |     |    |   
Sbjct .....VTIHATKDlktayfdklnelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHS  335
DSSP  .....LLLEELHHhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLL


DSSP  LLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLllllllllllhhhllllllllhhH
Query YGLTGGVYSRKREHLEWARREFHVGNLYFNRKITGAlvgvqpfggfklsgtnaktgaldY  502
ident    |           |           | |     |                        
Sbjct SRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDSSGVYWNASTRFA.....................dvG  374
DSSP  LLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHHHL.....................llL


DSSP  HHLLEEEEEEEEEL.......
Query LRLFLEMKAVAERF.......  516
ident |                    
Sbjct LDGLVSYQYQIRGDgqvasdy  395
DSSP  LHHHEEEEEEEELLlllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.3

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee
Query vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
ident                                                             
Sbjct ......................................................hmsssq    6
DSSP  ......................................................lllhhh


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll
Query apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
ident                                                             
Sbjct qiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsll   66
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhh


DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeellLLEEEEEllL
Query eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetgGKNAIIVdeT  300
ident                                                   |    |    
Sbjct krldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvGVLLVIF..E  124
DSSP  hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelLEEEEEE..L


DSSP  LLHhHHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllhhhllll
Query ADFdLAAEGVVVSAYGFQGqkcsaaSRLILTQGAYEPVLERVLKRAERLsvgpaeenpdl  360
ident                            |           |                    
Sbjct SRP.EVIANITALSIKSGN.....aAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTI...........  167
DSSP  LLL.HHHHHHHHHHHHHLL.....eEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHH...........


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelLllllllllllLLEEeellllllhhhllllll
Query gpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlgGkrlegegyfiAPTVftevppkariaqeeifg  420
ident                             |           |                   
Sbjct .....................aqfqsetG..........VPVG.................  179
DSSP  .....................hhhhhhhL..........LLLL.................


DSSP  lEEEEEEELlhhhHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE.........
Query pVLSVIRVKdfaeALEVANDTPYGLTGGVYSrKREHLEWARREFHVgNLYF.........  471
ident      |                |                                     
Sbjct .SVQLIETR....VSDLLDQDEYIDLVVPRG.SNALVRKIKDTTKI.PVLGhadgicsiy  232
DSSP  .LEEELLLL....LHHHHHLLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHLLLL.LLLLllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  471
ident                                                             
Sbjct ldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevlenltleggvtihatkdlkta  292
DSSP  elllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  471
ident                                                             
Sbjct yfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaek  352
DSSP  hhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhh


DSSP  .....................llllLLLLLLlllllllhhhllllllllhhhhhlleeee
Query .....................nrkiTGALVGvqpfggfklsgtnaktgaldylrlflemk  510
ident                                                             
Sbjct fmkgvdssgvywnastrfadvgldgLVSYQY.......................qirgdg  389
DSSP  hhhhlllleeeelllhhhlllllhhHEEEEE.......................eeelll


DSSP  eeeeel
Query avaerf  516
ident       
Sbjct qvasdy  395
DSSP  llllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  ....................................................llllllll
Query ....................................................mtvepfrn    8
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelleeeeeeeee
Query epietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsapsevvgtt   68
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  elllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllh
Query akagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatlvyevgknw  128
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeellEEEEEL....lLL
Query veasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgAGVVIA....pWN  184
ident                                                             
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttkipvlghadgICSIYLdedadLI  240
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllllllllLEEEEElllllHH


DSSP  LLLHHHHHhhhhhhhlllEEEEELLHH.................hhhhhhHHHHHHHHHL
Query FPVAIFTGmivgpvavgnTVIAKPAED.................avvvgaKVFEIFHEAG  227
ident     |                                                       
Sbjct KAKRISLD...aktncnaMETLLINPKfskwwevlenltleggvtihatkDLKTAYFDKL  297
DSSP  HHHHHHHH...lllllllLEEEEELLLlllhhhhhhhhhhhhlllleelhHHHHHHHHHH


DSSP  .............lllllEEELLLLLLHHHHHHHLL.lllLEEEEEL.LHHHHHHHHHHh
Query .............fppgvVNFLPGVGEEVGAYLVEH.priRFINFTG.SLEVGLKIYEAa  272
ident                            |                          |     
Sbjct nelgklteaiqcktvsldLAAKFVTSTESAIQHINThssrHTDAIVTeNKANAEKFMKG.  356
DSSP  hhhllllhhhhlllllllLEEEELLLHHHHHHHHLLllllLEEEEELlLHHHHHHHHHH.


DSSP  llllllllllLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeh
Query grlapgqtwfKRAYVEtggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrliltq  332
ident              |                                              
Sbjct .......vdsSGVYWN............................................  365
DSSP  .......lllLEEEEL............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllll
Query gayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrl  392
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeell
Query egegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggvysr  452
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlleeeeee
Query krehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlflemkav  512
ident                                                             
Sbjct ..................................astrfadvgldglvsyqyqirgdgqv  391
DSSP  ..................................llhhhlllllhhheeeeeeeelllll


DSSP  eeel
Query aerf  516
ident     
Sbjct asdy  395
DSSP  llll