No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=37.0

DSSP  ................................................LLLEEEEELLLL
Query ................................................TDNVFYATNAFT   12
ident                                                 |       |   
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdTKERMVSLNPSA   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelLLLEEEEEELLE


DSSP  LLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH
Query GEALPLAFPVHTEVEVNQAATAAAKVARDFRRLNNSKRASLLRTIASELEARSDDIIARA   72
ident               |   |  || |            |  ||   |     |     |  
Sbjct PSEVVGTTAKAGKAEAEAALEAAWKAFKTWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEATL  120
DSSP  EEEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLHHH..LEEEELLLlllllllLLLEEEEE
Query HLETALPEVRLTGEIARTANQLRLFADVVnsGSYH..QAILDTPNptraplpKPDIRRQQ  130
ident   |     |      |         |       |                    |     
Sbjct VYEVGKNWVEASADVAEAIDFIEYYARAA..LRYRypAVEVVPYP.......GEDNESFY  171
DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHHLllLLLLLLLL.......LEEEEEEE


DSSP  EELLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhh
Query IALGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAGCPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkq  190
ident   ||   |    ||| |     |      | |  || |           | |    |   
Sbjct VPLGAGVVIAPWNFPVAIF..TGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAG..  227
DSSP  EELLEEEEELLLLLLLHHH..HHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..


DSSP  hlLLHHHEEEELLLLLHHHHHHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLL....LLLLE
Query eqLPQAIFTLLQGNQRALGQALVSHPEIKAVGFTGSVGGGRALFNLAHERP....EPIPF  246
ident    |      | |     |  || || |    ||||   |      |             
Sbjct ..FPPGVVNFLPGVGEEVGAYLVEHPRIRFINFTGSLEVGLKIYEAAGRLApgqtWFKRA  285
DSSP  ..LLLLLEEELLLLLLHHHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLllllLLLEE


DSSP  EEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHHHLLLLLLLEEEEELLhHHHHHHHHH
Query YGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGCGQFCTKPGVVFALNTpETQAFIETA  306
ident | | |  |       |       |   | |     || |                  |  
Sbjct YVETGGKNAIIVDETAD..FDLAAEGVVVSAYGFQGQKCSAASRLILTQG.AYEPVLERV  342
DSSP  EEELLLLEEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLL.........LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLllEEEEEL.LLLL...LLLL
Query QSLIRQQSP.........STLLTPGIRDSYQSQVVSRGSDdgIDVTFS.QAES...PCVA  353
ident        |                       |                           |
Sbjct LKRAERLSVgpaeenpdlGPVVSAEQERKVLSYIEIGKNE..GQLVLGgKRLEgegYFIA  400
DSSP  HHHHLLLLLllhhhllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLL..LEEEELlLLLLlllLLLL


DSSP  LEEEEEehhhHHHLHHH.HLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLhhHH
Query SALFVTssenWRKHPAW.EEEIFGPQSLIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATIHATeeDY  412
ident    |               ||||||          |  |         ||          
Sbjct PTVFTE....VPPKARIaQEEIFGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSR..KR  454
DSSP  LEEEEL....LLLLLHHhLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL..LH


DSSP  HHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLLLLLLLlLLLLLLLLLLLLLllLLLLLHHHHHHHEEE
Query PQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPTGVEVGyAMVHGGPYPASTHsaSTSVGAEAIHRWLRP  472
ident               | | ||   ||  ||     ||     |               |  
Sbjct EHLEWARREF..HVGNLYFNRKITGALVG.VQPFGGFKLSGTN..AKTGALDYLRLFLEM  509
DSSP  HHHHHHHHHL..LLLEEEELLLLLLLLLL.LLLLLLLHHHLLL..LLLLLHHHHHLLEEE


DSSP  EEEELllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query VAYQAlpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident  |                              
Sbjct KAVAE.........................rf  516
DSSP  EEEEE.........................el


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  .....................................llleeeeelllllleeeeeeell
Query .....................................tdnvfyatnaftgealplafpvh   23
ident                                                             
Sbjct vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query tevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiaselearsddiiarahletalpevrl   83
ident                                                             
Sbjct apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllllllllleeeeeeeLLLEEEELLLL
Query tgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptraplpkpdirrqqiaLGPVAVFGASN  143
ident                                                   |  |      
Sbjct eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDET  300
DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELLL


DSSP  .LLLLLlllLHHHHHHHHH......lLLEEEELLLLLH......................
Query .FPLAFsaaGGDTASALAA......gCPVIVKGHTAHP......................  174
ident                                                             
Sbjct aDFDLA...AEGVVVSAYGfqgqkcsAASRLILTQGAYepvlervlkraerlsvgpaeen  357
DSSP  lLHHHH...HHHHHHHHHHhhhllllLEEEEEEEHHHHhhhhhhhhhhhlllllllhhhl


DSSP  .................hhhhhhhhhhHHHHH.......hhlLLHH..............
Query .................gtsqivaeciEQALK.......qeqLPQA..............  196
ident                                            |                
Sbjct pdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqLVLGGkrlegegyfiAPTVftevppkariaqee  417
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleEEELLllllllllllLLEEeellllllhhhlll


DSSP  ....HEEEELLLLLHHHHHHHHLL.LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhllllLLEEEEl
Query ....IFTLLQGNQRALGQALVSHP.EIKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHerpepIPFYGEl  250
ident               |               |                |        |   
Sbjct ifgpVLSVIRVKDFAEALEVANDTpYGLTGGVYSrKREHLEWARREFH....vGNLYFN.  472
DSSP  llllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL....lLEEEEL.


DSSP  lllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhh
Query gainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqsli  310
ident                                                             
Sbjct ............................................................  472
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhh
Query rqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaw  370
ident                                                             
Sbjct ............................................................  472
DSSP  ............................................................


DSSP  hlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeee
Query eeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlv  430
ident                                                             
Sbjct ............................................................  472
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhHEEEEE.....eelllhhhllh
Query fngwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihrWLRPVA.....yqalpesllpd  485
ident                                           |                 
Sbjct ...................................rkiTGALVGvqpfggfklsgtnakt  497
DSSP  ...................................lllLLLLLLlllllllhhhllllll


DSSP  hhllllllllleeelllll
Query slkaenpleiaravdgkaa  504
ident                    
Sbjct galdylrlflemkavaerf  516
DSSP  llhhhhhlleeeeeeeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  ............................................llleeeeellllllee
Query ............................................tdnvfyatnaftgeal   16
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHH
Query plafpvhtevevnqaataaakvardfrrlNNSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLET   76
ident                                               |             
Sbjct psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEATL  120
DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH


DSSP  L........llHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhleeeellllllllllllleee
Query A........lpEVRLTGEIARTANQLRLFADVVnsgsyhqaildtpnptraplpkpdirr  128
ident                   |       |                                 
Sbjct VyevgknwveaSADVAEAIDFIEYYARAALRYR...........................  153
DSSP  HhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...........................


DSSP  eeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query qqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqivaecieqal  188
ident                                                             
Sbjct .............ypavevvpypgednesfyvplgagvviapwnfpvaiftgmivgpvav  200
DSSP  .............llllllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllleee
Query kqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaherpepipfyg  248
ident                                                             
Sbjct gntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvgeevgaylvehprirfinftg  260
DSSP  lleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllllhhhhhhhlllllleeeeel


DSSP  ellllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhh
Query elgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqs  308
ident                                                             
Sbjct slevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgq  320
DSSP  lhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlh
Query lirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhp  368
ident                                                             
Sbjct kcsaasrliltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigk  380
DSSP  lllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleee
Query aweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypqvsqliprleeiagr  428
ident                                                             
Sbjct negqlvlggkrlegegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevand  440
DSSP  llleeeelllllllllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhl


DSSP  eeelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhl
Query lvfngwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslk  488
ident                                                             
Sbjct tpygltggvysrkrehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgal  500
DSSP  llllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllh


DSSP  lllllllleeelllll
Query aenpleiaravdgkaa  504
ident                 
Sbjct dylrlflemkavaerf  516
DSSP  hhhhlleeeeeeeeel


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll
Query learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
ident                                                             
Sbjct .................mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyig   43
DSSP  .................llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeel


DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh
Query lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
ident                                                             
Sbjct gewvdtkermvslnpsapsevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlll  103
DSSP  leeelllleeeeeelleeeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl
Query aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
ident                                                             
Sbjct kaaalmrrrkreleatlvyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpyp  163
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhlLLHHHH.HHHHHLHhhhllllLLLEEEEELLhHH
Query pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakADLADQ.FVASMTMgcgqfctKPGVVFALNTpET  299
ident                                   |                         
Sbjct gednesfyvplGAGVVIAPWNFP...VAIFTGmIVGPVAV......gNTVIAKPAED.AV  213
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLL...LHHHHHhHHHHHHL......lLEEEEELLHH.HH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllLEEEee
Query QAFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvaSALFvt  359
ident                                                             
Sbjct VVGAKVFEIFHEAG........................................FPPG..  231
DSSP  HHHHHHHHHHHHHL........................................LLLL..


DSSP  ehhhhhhlhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHH
Query ssenwrkhpaweeeifgpQSLIVVCENVADMLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQLI  419
ident                                  | |                        
Sbjct ..................VVNFLPGVGEEVGAYLVE.HPRIRFINFTG...SLEVGLKIY  269
DSSP  ..................LEEELLLLLLHHHHHHHL.LLLLLEEEEEL...LHHHHHHHH


DSSP  HHHHL......leEEEEEL.........................................
Query PRLEE......iaGRLVFN.........................................  432
ident               |                                             
Sbjct EAAGRlapgqtwfKRAYVEtggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrli  329
DSSP  HHHLLllllllllLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct ltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlgg  389
DSSP  eehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeell


DSSP  .......................................................lllll
Query .......................................................gwptg  437
ident                                                             
Sbjct krlegegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggv  449
DSSP  lllllllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeee


DSSP  lllllllllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllle
Query vevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiar  497
ident                                                             
Sbjct ysrkrehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlflem  509
DSSP  elllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlleee


DSSP  eelllll
Query avdgkaa  504
ident        
Sbjct kavaerf  516
DSSP  eeeeeel