No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=32.8

DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query hmSSSQQIAKNARKAGNILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAVAKETG   60
ident         ||  | |   |             ||   |      | ||| ||   | | |
Sbjct ..DELLEKAKKVREAWDVLRNATTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVEKARERG   58
DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEEEELLEEEEEEEEELLEEE
Query LADSLLKRLDLFkGDKFEVMLQGIKDVAELEDPVGKVKMARELDDGLTLYQVTAPVGVLL  120
ident    ||  || |        |      |  | |||| |       |||    |  | |   
Sbjct VKESLVDRLALN.DKRIDEMIKACETVIGLKDPVGEVIDSWVREDGLRIARVRVPIGPIG  117
DSSP  LLHHHHHHHLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELLLLLEEEEEEEELLLEE


DSSP  EEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhLLLLLL
Query VIFESRPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIAQFqsetGVPVGS  180
ident  | |||| |    | |  ||||   | ||    |                      |  |
Sbjct IIYESRPNVTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALKET....EIPESS  173
DSSP  EELLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....LLLHHH


DSSP  EEELLLL....LHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLEEEEELLL
Query VQLIETR....VSDLLDQDEYIDLVVPRGSNALVRKIKDTTKIPVLGHADGICSIYLDED  236
ident |  ||      |       ||  || |||   |     |    |||    | | |  || 
Sbjct VEFIENTdrslVLEMIRLREYLSLVIPRGGYGLISFVRDNATVPVLETGVGNCHIFVDES  233
DSSP  EEELLLLllhhHHHHLLLLLLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLEEEEELLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHLL.LLLL...llEEEEELLLL.LLHH.HHHHHHHHhHLLLLEELHHHH
Query ADLIKAKRISLDAK.TNCN...amETLLINPKF.SKWW.EVLENLTLeGGVTIHATKDLK  290
ident ||| ||      ||          | ||   |          | |    ||         
Sbjct ADLKKAVPVIINAKtQRPGtcnaaEKLLVHEKIaKEFLpVIVEELRK.HGVEVRGCEKTR  292
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHhLLLLlllleEEEEEEHHHhHHHHhHHHHHHHH.LLLEEEELHHHH


DSSP  HHHHHhhhhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHH
Query TAYFDklnelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANA  350
ident     |                  |  | | |     || ||   |  |   | |||  ||
Sbjct EIVPD...vvpateddwpteylDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNA  349
DSSP  HHLLL...leellhhhllllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHH


DSSP  HHHHHHLLLLEEEELLLHHHLL......................LLLHHHEEEEEEEELL
Query EKFMKGVDSSGVYWNASTRFAD......................VGLDGLVSYQYQIRGD  388
ident  ||    |   || |||||| |                      |||  |  |     | 
Sbjct KKFVSEIDAAAVYVNASTRFTDggqfgfgaeigistqrfhargpVGLRELTTYKFVVLGE  409
DSSP  HHHHHHLLLLEEEELLLHHHLLllllllllllleellllllleeLLLHHHEEEEEEEELL


DSSP  LLLLLll
Query GQVASdy  395
ident   |    
Sbjct YHVRE..  414
DSSP  LLLLL..


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee
Query ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
ident                                                             
Sbjct .....................................................delleka    7
DSSP  .....................................................lhhhhhh


DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
ident                                                             
Sbjct kkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvkeslvdrl   67
DSSP  hhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllllllLLLEEEEELLllLHH
Query vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttkipvlghaDGICSIYLDEdaDLI  240
ident                                               |   |         
Sbjct alndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpIGPIGIIYES..RPN  125
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeeLLLEEEELLL..LLH


DSSP  HHHHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLLL.LHHHHHHHHHHHH....LLLLeelhhhhhhhhh
Query KAKRISLDAKTNCnAMETLLINPKFS.KWWEVLENLTLEG....GVTIhatkdlktayfd  295
ident         |         |                                         
Sbjct VTVETTILALKSG.NTILLRGGSDALnSNKAIVSAIREALketeIPES............  172
DSSP  HHHHHHHHHHHLL.LLEEEELLHHHHhHHHHHHHHHHHHHllllLLHH............


DSSP  hhhhhllllhhhhllllllLLEEE.ELLLhHHHHHHHLLLLLlLEEEEELlLHHHHHHHH
Query klnelgklteaiqcktvslDLAAK.FVTStESAIQHINTHSSrHTDAIVTeNKANAEKFM  354
ident                                     |                       
Sbjct ...................SVEFIeNTDR.SLVLEMIRLREYlSLVIPRG.GYGLISFVR  211
DSSP  ...................HEEELlLLLL.HHHHHHLLLLLLlLEEEELL.LHHHHHHHH


DSSP  HHLLLlEEEEL.................................................
Query KGVDSsGVYWN.................................................  365
ident        |                                                    
Sbjct DNATV.PVLETgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakef  270
DSSP  HHLLL.LLLLLlllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct lpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehi  330
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct kkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqrfha  390
DSSP  hhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellllll


DSSP  ....llhHHLLlllhhheeeeeeeelllllllll
Query ....astRFADvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
ident                                   
Sbjct rgpvglrELTT..........ykfvvlgeyhvre  414
DSSP  leelllhHHEE..........eeeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ...............................................lllhhhhhhhhhh
Query ...............................................hmsssqqiaknar   13
ident                                                             
Sbjct eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllll
Query kagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrldlfk   73
ident                                                             
Sbjct esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeellEEEEEEL..LLLH.HH
Query gdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgVLLVIFE..SRPE.VI  130
ident                                                             
Sbjct drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvgNCHIFVDesADLKkAV  240
DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllllLEEEEELllLLHHhHH


DSSP  HHHHHHHHHHL....LEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..................
Query ANITALSIKSG....NAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIA..................  168
ident   |             |  |         |                              
Sbjct PVIINAKTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKHGvevrgcektreivpdvvp  300
DSSP  HHHHHHHHLLLllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLleeeelhhhhhhllllee


DSSP  ...hhhhhhlLLLLlEEELLL....lLHHHHHLLlLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHLLLL.
Query ...qfqsetgVPVGsVQLIET....rVSDLLDQDeYIDLVVPRG.SNALVRKIKDTTKI.  219
ident                                                    |        
Sbjct ateddwpteyLDLI.IAIKVVknvdeAIEHIKKYsTGHSESILTeNYSNAKKFVSEIDAa  359
DSSP  llhhhlllllLLLE.EEEEEEllhhhHHHHHHHHlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLl


DSSP  LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhh
Query PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevlenltleg  279
ident  |                                                          
Sbjct AVYV........................................................  363
DSSP  EEEE........................................................


DSSP  lllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhllllllle
Query gvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinthssrht  339
ident                                                             
Sbjct ............................................................  363
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllllhhheeeeeeeelllllllll
Query daivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
ident                                                         
Sbjct .....nastrftdggqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  .....lllhhhllllllllllllleellllllleelllhhheeeeeeeelllllll