No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=41.2

DSSP  .......................................LHHHHHHHHHHHHHlLHHH.L
Query .......................................SISDTVKRAREAFNsGKTR.S   20
ident                                             |  |  ||        
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeQVDAAVRAADAAFA.EWGQtT   59
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Query LQFRIQQLEALQRMINENLKSISGALASDLGKNEWTSYYEEVAHVLEELDTTIKELPDWa   80
ident    |   |  |   | ||            ||        |                   
Sbjct PKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFNDEIPAIVDVFRFFAGAARCL.  118
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.


DSSP  LLEELLLLllLLLLEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLL
Query EDEPVAKTrqTQQDDLYIHSEPLGVVLVIGAWNYPFNLTIQPMVGAVAAGNAVILKPSEV  140
ident                  |   |||||  |  ||||          | |||| | ||||| 
Sbjct NGLAAGEY..LEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMAAWKLAPALAAGNCVVLKPSEI  176
DSSP  LLLLLEEE..ELLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLH.HHHHHHLLLL.LLEEEEELLHHHHHHHHHHH
Query SGHMADLLATLIPQYMDQNLYLVVKGGV.PETTELLKER.FDHIMYTGSTAVGKIVMAAA  198
ident     |  || |              |        |           ||| | |       
Sbjct TPLTALKLAELAKDIFPAGVVNILFGRGkTVGDPLTGHPkVRMVSLTGSIATGEHIISHT  236
DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEELLLLLlLLHHHHHLLLlEEEEEEELLHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLLEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEELHHHHHHH
Query AKHLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDVACRRIAWGKFMNSGQTCVAPDYILCDPSIQNQI  258
ident |        ||||| |  |  | |              | || | |   |     |    
Sbjct ASSIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQDCTAACRIYAQKGIYDTL  296
DSSP  HHHLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhlllHHHL.....LLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLL......LEEELLLE
Query VEKLKKSLKDFygedAKQS.....RDYGRIINDRHFQRVKGLIDNQ......KVAHGGTW  307
ident ||||                       |      |  ||             ||  ||  
Sbjct VEKLGAAVATL....KSGApddesTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAkatghiKVITGGEK  352
DSSP  HHHHHHHHHLL....LLLLlllllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhllllEEEELLLL


DSSP  EL.LLLEELLEEELLLLLLLHHHLLLLLLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEL
Query DQ.SSRYIAPTILVDVDPQSPVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVFS  366
ident       | ||| |          | | ||||         |      |     ||  |  
Sbjct RKgNGYYYAPTLLAGALQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQYGLASSVWT  412
DSSP  LLlLLLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEL


DSSP  LLHHHHHHHHLLLLLLEEEELLLLHhhHLLLLLLLLLHHHEELLLLLHHHHHHLEEEEEE
Query NNEKVIKKMIAETSSGGVTANDVIVhiTVPTLPFGGVGNSGMGAYHGKKSFETFSHRRSC  426
ident           |    |    |       |   | ||   || |        |     |  
Sbjct KDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTHFM..LVSEMPHGGQKLSGYGKDMSLYGLEDYTVVRHV  470
DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL..LLLLLLLLLLHHHEELLLLHHHHHHLLEEEEEE


DSSP  EELLlllllllhhhllllll
Query LVKSllneeahkaryppspa  446
ident  ||                 
Sbjct MVKH................  474
DSSP  EEEL................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
Query sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyye   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelllllllhhhh
Query evahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigawnypfnlti  120
ident                                                             
Sbjct ...........mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraad   49
DSSP  ...........lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhhhllllll
Query qpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpettellkerfd  180
ident                                                             
Sbjct aafaewgqttpkvraecllkladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfr  109
DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeellLLLEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHLllll
Query himytgstavgkivmaaaakhltpvtlelgGKSPCYVDKDcDLDVACRRIAWGKFMnsgq  240
ident                               |                             
Sbjct ffagaarclnglaageyleghtsmirrdplGVVASIAPWN.YPLMMAAWKLAPALA....  164
DSSP  hhhhhllllllllleeeelleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHH....


DSSP  LLLLlLEEEELHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhllllll
Query TCVApDYILCDPSIQNQIVEKLKKslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqk  300
ident                                                             
Sbjct AGNC.VVLKPSEITPLTALKLAEL....................................  187
DSSP  LLLE.EEEELLLLLLHHHHHHHHH....................................


DSSP  eeellleelllleelleeelllllllhhhlllllLLEELEEELlLHHH.HHHHHHlLLLL
Query vahggtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeeifGPVMPIVCVrSLEE.AIQFINqREKP  359
ident                                     |  |                  | 
Sbjct ............................akdifpAGVVNILFG.RGKTvGDPLTG.HPKV  217
DSSP  ............................hlllllLLLEEELLL.LLLLlHHHHHL.LLLE


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHLLLL..lLEEEEL..............................
Query LALYVFSnNEKVIKKMIAETS..sGGVTAN..............................  387
ident                 |  |                                        
Sbjct RMVSLTG.SIATGEHIISHTAssiKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyyna  276
DSSP  EEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhhlLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  387
ident                                                             
Sbjct gqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkave  336
DSSP  hllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  387
ident                                                             
Sbjct eakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqvv  396
DSSP  hhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  387
ident                                                             
Sbjct nwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkdm  456
DSSP  hhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellll


DSSP  ...lllHHHHlllllllllhhheelllllhhhhhhleeeeeeeelllllllllhhhllll
Query ...dviVHITvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvksllneeahkarypps  444
ident                                                             
Sbjct slygleDYTV............................................vrhvmv  472
DSSP  hhhhhhLLEE............................................eeeeee


DSSP  ll
Query pa  446
ident   
Sbjct kh  474
DSSP  el


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  ...................lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ...................sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlks   41
ident                                                             
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  hhhhhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHHHH.....................h
Query isgalasdlgknewtsyyeevahvleeldttiKELPDW.....................a   80
ident                                                             
Sbjct kvraecllkladvieengqvfaelesrncgkpLHSAFNdeipaivdvfrffagaarclng  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  lleeLLLL....................................................
Query edepVAKT....................................................   88
ident                                                             
Sbjct laagEYLEghtsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitplt  180
DSSP  llleEEELleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhh


DSSP  .....................................................lllllle
Query .....................................................rqtqqdd   95
ident                                                             
Sbjct alklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassi  240
DSSP  hhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  eeeeeeeLLEEEEELLLL.LLLHHhHHHH.HHHHHLL.....LEEEEELLLLlhhHHHHH
Query lyihsepLGVVLVIGAWN.YPFNLtIQPM.VGAVAAG.....NAVILKPSEVsghMADLL  148
ident         |   ||                             |             | |
Sbjct krthmelGGKAPVIVFDDaDIEAV.VEGVrTFGYYNAgqdctAACRIYAQKG...IYDTL  296
DSSP  leeeeelLLLLEEEELLLlLHHHH.HHHHhHHLLHHHhllllLLLEEEEELL...LHHHH


DSSP  HHHHHHH.....................................................
Query ATLIPQY.....................................................  155
ident                                                             
Sbjct VEKLGAAvatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggekrkgn  356
DSSP  HHHHHHHhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllll


DSSP  .....LLLL.................LEEELLLLH.HHHHHHLLLL..LLEEEEEL.LHH
Query .....MDQN.................LYLVVKGGV.PETTELLKER..FDHIMYTG.STA  189
ident                              |                              
Sbjct gyyyaPTLLagalqddaivqkevfgpVVSVTPFDNeEQVVNWANDSqyGLASSVWTkDVG  416
DSSP  lllllLEEEellllllhhhhllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHLLllLLEEEEELlLHH


DSSP  HHHHHHHHHHlllLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleee
Query VGKIVMAAAAkhlTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyil  249
ident     | |                                                     
Sbjct RAHRVSARLQ..yGCTWVN.........................................  433
DSSP  HHHHHHHHLL..lLEEEEL.........................................


DSSP  elhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleel
Query cdpsiqnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdq  309
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  llleelleeelllllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelllh
Query ssryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnne  369
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhhhhhhleeeeeeeel
Query kvikkmiaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvk  429
ident                                                             
Sbjct ....................................thfmlvsemphggqklsgygkdms  457
DSSP  ....................................llllllllllllllhhheellllh


DSSP  llllllllhhhllllll
Query sllneeahkaryppspa  446
ident                  
Sbjct lygledytvvrhvmvkh  474
DSSP  hhhhhlleeeeeeeeel