No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=39.8

DSSP  .......................................LHHHHHHHHHHHHHlLHHH.L
Query .......................................SISDTVKRAREAFNsGKTR.S   20
ident                                                |  |        |
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteEVDYVYASAKKAQP.AWRAlS   59
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhHHHHHHHHHHHHHH.HHHHlL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Query LQFRIQQLEALQRMINENLKSISGALASDLGKNEWTSYYeEVAHVLEELDTTIKELPDWa   80
ident    |   |             |   |     |        ||    |       |     
Sbjct YIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVS.EVVRTAEIINYAAEEGLRM.  117
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHLLL.


DSSP  LLEELLLL...LLLLLLEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL
Query EDEPVAKT...RQTQQDDLYIHSEPLGVVLVIGAWNYPFNLTIQPMVGAVAAGNAVILKP  137
ident | |                    || | || |   ||| ||       |  |||    ||
Sbjct EGEVLEGGsfeAASKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAGNVIAFKP  177
DSSP  LLEEEEHHhllHHHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLEEELLLLH.HHHHHHLLLL.LLEEEEELLHHHHHHH
Query SEVSGHMADLLATLIPQY.MDQNLYLVVKGGV.PETTELLKER.FDHIMYTGSTAVGKIV  194
ident          |||                 |                 |  ||||  |   
Sbjct PTQGSISGLLLAEAFAEAgLPAGVFNTITGRGsEIGDYIVEHQaVNFINFTGSTGIGERI  237
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLEEELLLLHhHHHHHHHHLLlLLEEEEELLHHHHHHH


DSSP  HHHHHllLLLEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEELHHH
Query MAAAAkhLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDVACRRIAWGKFMNSGQTCVAPDYILCDPSI  254
ident    |     |  ||||||    |  | ||      |  | |  ||| | |    |   | 
Sbjct GKMAG..MRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTAVKRVLVMESV  295
DSSP  HHHLL..LLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhlllHHHL...LLLL.LLLLHHHHHHHHHLLLLL.....LEEELL
Query QNQIVEKLKKSLKDFygedAKQS...RDYG.RIINDRHFQRVKGLIDNQ.....KVAHGG  305
ident     |||                          |       | |||              
Sbjct ADELVEKIREKVLAL....TIGNpedDADItPLIDTKSADYVEGLINDAndkgaTALTEI  351
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLL....LLLLhhhLLLLlLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhlllEELLLL


DSSP  LEELllLEELLEEELLLLLLLHHHLLLLLLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEE
Query TWDQssRYIAPTILVDVDPQSPVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVF  365
ident         | |     |        || |||| ||  | | ||||   |  |  |    |
Sbjct KREG..NLICPILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIF  409
DSSP  LEEL..LEELLEEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEE


DSSP  LLLHHHHHHHHLLLLLLEEEELLLLHhHHLLLLLLLLLHHHEELLLLLHHHHHHLEEEEE
Query SNNEKVIKKMIAETSSGGVTANDVIVhITVPTLPFGGVGNSGMGAYHGKKSFETFSHRRS  425
ident  |              | |  |           || |   || |    | | |      |
Sbjct TNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKTQ.RGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSIEAMTTVKS  468
DSSP  LLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL.LLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHHHHLEEEEE


DSSP  EEELLLllllllhhhllllll
Query CLVKSLlneeahkaryppspa  446
ident                      
Sbjct VVFDIK...............  474
DSSP  EEEELL...............


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  ................lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ................sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisg   44
ident                                                             
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHHHH.hLLEE...................
Query alasdlgknewtsyyeevahvleeldttiKELPDW.aEDEP...................   84
ident                                                             
Sbjct ieraaylhkvadilmrdkekigailskevAKGYKSavSEVVrtaeiinyaaeeglrmege  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLHHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   84
ident                                                             
Sbjct vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll


DSSP  ........llLLLLLLL...........................................
Query ........vaKTRQTQQ...........................................   93
ident                                                             
Sbjct gsisglllaeAFAEAGLpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
DSSP  lhhhhhhhhhHHHHHLLlllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  .leeeeeeeelLEEEEELLLL.LLLHHhHHHH.HHHHH....LLLE.EEEELLLLlhhHH
Query .ddlyihseplGVVLVIGAWN.YPFNLtIQPM.VGAVA....AGNA.VILKPSEVsghMA  145
ident            |    |                 ||         |       |     |
Sbjct agmrpimlelgGKDSAIVLEDaDLELT.AKNIiAGAFGysgqRCTAvKRVLVMES...VA  296
DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLlLHHHH.HHHHhHHHHHhhhlLLLLeEEEEEEHH...HH


DSSP  HHHHHH.HHHH.................................................
Query DLLATL.IPQY.................................................  155
ident | |                                                         
Sbjct DELVEKiREKVlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregn  356
DSSP  HHHHHHhHHHHhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleell


DSSP  ...LLLL.................LEEELLLLH.HHHHHHLLL..LLLEEEEEL.LHHHH
Query ...MDQN.................LYLVVKGGV.PETTELLKE..RFDHIMYTG.STAVG  191
ident                                    |  |                     
Sbjct licPILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSvEEAIEISNKseYGLQASIFTnDFPRA  416
DSSP  eelLEEEellllllhhhlllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHHllEELEEEEELlLHHHH


DSSP  HHHHHHHhlLLLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleeeel
Query KIVMAAAakHLTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyilcd  251
ident              |                                              
Sbjct FGIAEQL..EVGTVHIN...........................................  431
DSSP  HHHHHHL..LLLEEEEL...........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelll
Query psiqnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqss  311
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  leelleeelllllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhh
Query ryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnnekv  371
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhhhhhhLEEEE.......
Query ikkmiaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetFSHRR.......  424
ident                                                             
Sbjct .............................................nktQRGTDnfpflga  446
DSSP  .............................................lllLLLLLlllllle


DSSP  ...eeeelllllllllhhhlLLLL...l
Query ...sclvksllneeahkaryPPSP...a  446
ident                             
Sbjct kksgagiqgvkysieamttvKSVVfdik  474
DSSP  elleellllhhhhhhhleeeEEEEeell


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.8

DSSP  ........lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLL
Query ........sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdLGK   52
ident                                                          |  
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawraLSY   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLH


DSSP  Lhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelll
Query Newtsyyeevahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigaw  112
ident                                                             
Sbjct I...........................................................   61
DSSP  H...........................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhh
Query nypfnltiqpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpett  172
ident                                                             
Sbjct ................eraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtae  105
DSSP  ................hhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeellLLLEEEELLlLLHHHHHHHHHH
Query ellkerfdhimytgstavgkivmaaaakhltpvtlelgGKSPCYVDKdCDLDVACRRIAW  232
ident                                       |                     
Sbjct iinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkkiavvrrepvGLVLAISPF.NYPVNLAGSKIA  164
DSSP  hhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhlleeeeeeeeelLEEEEELLL.LLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLllllllLEEEELHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhh
Query GKFMNSGqtcvapDYILCDPSIQNQIVEKLKKslkdfygedakqsrdygriindrhfqrv  292
ident                                                             
Sbjct PALIAGN.....vIAFKPPTQGSISGLLLAEA............................  191
DSSP  HHHHLLL.....eEEEELLLLLHHHHHHHHHH............................


DSSP  hhlllllleEELLleelllleelleeelllllllhhhlllllllEELEEELLLHHHHHHH
Query kglidnqkvAHGGtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpVMPIVCVRSLEEAIQF  352
ident          |  |                               |      |  |     
Sbjct ........fAEAG...........................lpagVFNTITGRGSEIGDYI  216
DSSP  ........hHHHL...........................llllLEEELLLLHHHHHHHH


DSSP  HHlLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHLLLLLLEEE...........................
Query INqREKPLALYVFSnNEKVIKKMIAETSSGGVT...........................  385
ident                                                             
Sbjct VE.HQAVNFINFTG.STGIGERIGKMAGMRPIMlelggkdsaivledadleltakniiag  274
DSSP  HH.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHLLLLLEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  385
ident                                                             
Sbjct afgysgqrctavkrvlvmesvadelvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyve  334
DSSP  hhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  385
ident                                                             
Sbjct glindandkgatalteikregnlicpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeai  394
DSSP  hhhhhhhhllleellllleelleelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhh


DSSP  ...................ellllhhhhlllllllllhhheelllllhhhhhhleeeeee
Query ...................andvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetfshrrsc  426
ident                                                             
Sbjct eisnkseyglqasiftndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiq  454
DSSP  hhhhhlleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleelll


DSSP  eelllllllllhhhllllll
Query lvksllneeahkaryppspa  446
ident                     
Sbjct gvkysieamttvksvvfdik  474
DSSP  lhhhhhhhleeeeeeeeell