No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=19.1

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLH
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsTEEVDYVYASAKKAQPAWRALSY   60
ident                                                | ||       | 
Sbjct ....................................hMSSSQQIAKNARKAGNILKTISN   24
DSSP  ....................................lLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL...........llhhHHHH..HHHHHHHHH
Query IERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVA...........kgykSAVS..EVVRTAEII  107
ident   |   | |  | |      |        |                             |
Sbjct EGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAvaketgladsllkrlDLFKgdKFEVMLQGI   84
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhLLLLllHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLL.LLLE.EEEHhhllhhHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLllLLHHHHHHHHH
Query NYAAEEGLR.MEGE.VLEGgsfeaaSKKKIAVVRREPVGLVLAISPFnyPVNLAGSKIAP  165
ident    ||            |                  |||  | |              | 
Sbjct KDVAELEDPvGKVKmAREL......DDGLTLYQVTAPVGVLLVIFES..RPEVIANITAL  136
DSSP  HHHHHLLLLlLLEEeEEEE......ELLEEEEEEEEELLEEEEEELL..LLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL........LLLLLEEELLLLhhhhHHHHH
Query ALIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAG........LPAGVFNTITGRgseiGDYIV  217
ident     ||    |            |                | |    |  |         
Sbjct SIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqsetgVPVGSVQLIETR....VSDLL  192
DSSP  HHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLLLLLEEELLLL....LHHHH


DSSP  HLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHLLlLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query EHQ.AVNFINFTGSTGIGERIGKMAGmRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAF  276
ident             ||      |       |      |  |    |||||            
Sbjct DQDeYIDLVVPRGSNALVRKIKDTTK.IPVLGHADGICSIYLDEDADLIKAKRISLDAKT  251
DSSP  HLLlLLLEEEEELLHHHHHHHHHLLL.LLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLL


DSSP  HhhhllllleEEEEEEHHH..HHHHHHHHHHHHHllllllhhhlllllllllhhhhhhhh
Query GysgqrctavKRVLVMESV..ADELVEKIREKVLaltignpeddaditplidtksadyve  334
ident              |         |  |                                 
Sbjct N.....cnamETLLINPKFskWWEVLENLTLEGG..........................  280
DSSP  L.....llllEEEEELLLLllHHHHHHHHHHHHL..........................


DSSP  hhhhhhhhllleellllleelleelLEEEEL.............lllllhhhlllllLLE
Query glindandkgatalteikregnlicPILFDK.............vttdmrlaweepfGPV  381
ident                                                             
Sbjct .........................VTIHATkdlktayfdklnelgklteaiqcktvSLD  315
DSSP  .........................LLLEELhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllLLL


DSSP  EEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLllllll
Query LPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKTQrgtdnf  441
ident |    ||| | ||   |         | |     |           |  |  |       
Sbjct LAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDSSGVYWNASTR......  369
DSSP  LEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHH......


DSSP  lllleelleellllhhhHHHHLEEEEEEEEELL......
Query pflgakksgagiqgvkySIEAMTTVKSVVFDIK......  474
ident                                        
Sbjct .............fadvGLDGLVSYQYQIRGDGqvasdy  395
DSSP  .............hlllLLHHHEEEEEEEELLLllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.6

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
ident                                                             
Sbjct ...............hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahai   45
DSSP  ...............lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct eeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmareldd  105
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeel


DSSP  llllleeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH
Query agmrpimlelGGKDSAIVLedADLElTAKNIIAGAFGYSGqrctavKRVLVMESVADELV  300
ident            |    |       |    || |                           
Sbjct gltlyqvtapVGVLLVIFE..SRPE.VIANITALSIKSGN.....aAILKGGKESVNTFR  157
DSSP  leeeeeeeeeLLEEEEEEL..LLLH.HHHHHHHHHHHHLL.....eEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleelLLLLEEllEELL
Query EKIREKVLAltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalTEIKREgnLICP  360
ident |                                                    |     |
Sbjct EMAKIVNDT......................................iAQFQSE..TGVP  177
DSSP  HHHHHHHHH......................................hHHHHHH..HLLL


DSSP  EEeellllllhhhlllllllEEEEEEELlhhhHHHHHHHLLEELEEEEELlLHHHHHHHH
Query ILfdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTsveeAIEISNKSEYGLQASIFTnDFPRAFGIA  420
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Sbjct VG..................SVQLIETR....VSDLLDQDEYIDLVVPRG.SNALVRKIK  214
DSSP  LL..................LEEELLLL....LHHHHHLLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHH


DSSP  HHLLLlEEEE..................................................
Query EQLEVgTVHI..................................................  430
ident        |                                                    
Sbjct DTTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevle  273
DSSP  HLLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhh


DSSP  ..............................llllllllllllllleelleellllhhhhh
Query ..............................nnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysi  460
ident                                                             
Sbjct nltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhint  333
DSSP  hhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhll


DSSP  hhlEEEEEEEEELL..............................................
Query eamTTVKSVVFDIK..............................................  474
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Sbjct hssRHTDAIVTENKanaekfmkgvdssgvywnastrfadvgldglvsyqyqirgdgqvas  393
DSSP  lllLLEEEEELLLHhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllllhhheeeeeeeelllllll


DSSP  ..
Query ..  474
ident   
Sbjct dy  395
DSSP  ll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .......................llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelll
Query .......................tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpams   37
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhh
Query teevdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksav   97
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhlleeeeeeeeelLEEEEEL...LLLL
Query sevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkkiavvrrepvGLVLAIS...PFNY  154
ident                                               |             
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttkipvlghadGICSIYLdedADLI  240
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhlllllllllllLLEEEEElllLLHH


DSSP  .LLHHHHHHhhhhhHLLLEEEEELLL..LLHHHHHHHH......................
Query .PVNLAGSKiapalIAGNVIAFKPPT..QGSISGLLLA......................  189
ident                                   |                         
Sbjct kAKRISLDA...ktNCNAMETLLINPkfSKWWEVLENLtleggvtihatkdlktayfdkl  297
DSSP  hHHHHHHHL...llLLLLLEEEEELLllLLHHHHHHHHhhhhlllleelhhhhhhhhhhh


DSSP  ......hhhhhhlllLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLL.lLEEEEEL.LHHHHHHHHHHL
Query ......eafaeaglpAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQA.vNFINFTG.STGIGERIGKMA  241
ident                            |                         |   |  
Sbjct nelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSsrHTDAIVTeNKANAEKFMKGV  357
DSSP  hhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLllLEEEEELlLHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLLEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhh
Query GMRPIMlelggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvadelve  301
ident                                                             
Sbjct DSSGVY......................................................  363
DSSP  LLLEEE......................................................


DSSP  hhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelle
Query kirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicpi  361
ident                                                             
Sbjct ............................................................  363
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhhhhhh
Query lfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfprafgiae  421
ident                                                             
Sbjct ............................................................  363
DSSP  ............................................................


DSSP  hlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query qlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                                                      
Sbjct .....................wnastrfadvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  .....................elllhhhlllllhhheeeeeeeelllllllll