No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=47.6

DSSP  lllllllllLLLL............LLEEELLEEELLllLLEEEEEELLLLEEEEEEELL
Query avpapnqqpEVFC............NQIFINNEWHDAvsRKTFPTVNPSTGEVICQVAEG   48
ident                                 ||             |     |  |   
Sbjct .........AGLLegvikekggvpvYPSYLAGEWGGS..GQEIEVKSPIDLATIAKVISP   49
DSSP  .........LHHHlllleeelleeeELEELLLLEELL..LLEEEEELLLLLLEEEEEELL


DSSP  LHHHHHHHHHHHH.HHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL
Query DKEDVDKAVKAAR.AAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKP  107
ident   | |                  | |    |   |   || |||     |       |||
Sbjct SREEVERTLDVLFkRGRW...SARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKP  106
DSSP  LHHHHHHHHHHHHhLHHH...HHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEELLL.....LLEEEEEEEEELLEEEEELLL
Query YVISYlVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPID.....GDFFSYTRHEPVGVCGQIIPW  162
ident                ||       |  |  || |            | || ||   | | 
Sbjct KSAAV.GEVKAAVDRLRLAELDLKKIGGDYIPGDwtydtLETEGLVRREPLGVVAAITPF  165
DSSP  HHHHH.HHHHHHHHHHHLLLHHHHHLLLEEEELLlllllLLEEEEEEEEELLEEEEELLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLLLLh
Query NFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTa  222
ident | ||     |       || || |     || |         |||||         |   
Sbjct NYPLFDAVNKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAGFPPDAIALLNLPGKE.  224
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEELLLLHHH.


DSSP  HHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHhllLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHH
Query GAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGssnLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVE  282
ident    |     |  | |||||| |       |    |    ||||  | |   ||| | |  
Sbjct AEKIVADDRVAAVSFTGSTEVGERVVKVGG...VKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAAD  281
DSSP  LHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHL...LLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLHH
Query QAHFALFFNQGQCSCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDET  342
ident           ||   |          |   ||    |  |  || | |     ||     
Sbjct KIARGIYSYAGQRCDAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLRVGDPRDPTVDVGPLISPS  341
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLllLLLLLLEEEELL...LLLLHHHHLLLLLLEE
Query QFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAAdrGYFIQPTVFGDV...QDGMTIAKEEIFGPVM  399
ident         |      |   | ||          |||           |   | | | || 
Sbjct AVDEMMAAIEDAVEKGGRVLAGGRRLG..PTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVA  399
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLEEE..LLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEE


DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLL.LLLL
Query QILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFG.AQSP  458
ident      |        ||   ||| ||||  |  |       |  |    |     |    |
Sbjct LAVEVKDLDQAIELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGiGYYP  459
DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLlLLLL


DSSP  LLLLHHHEELLLLLHHHHHHHEEEEEEEEEL..LLLL..l
Query FGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKV..PQKN..s  494
ident ||| | ||  ||   |   | |  ||              
Sbjct FGGRKKSGVFREGIGYAVEAVTAYKTIVFNYkgKGVWkye  499
DSSP  LLLEELLEELLLLLLLLHHHHEEEEEEEEELllLLLLlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.3

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh
Query raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
ident                                                             
Sbjct ................................................agllegvikekg   12
DSSP  ................................................lhhhlllleeel


DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
ident                                                             
Sbjct gvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldvlfkrgrwsardm   72
DSSP  leeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhll


DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell
Query nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
ident                                                             
Sbjct pgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdrlrlaeldlkkig  132
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleE
Query teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSDaDMDWAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
ident                         |    |                  |           
Sbjct gdyipgdwtydtleteglvrreplGVVAAITPFN.YPLFDAVNKITYSFIYGN.....aV  186
DSSP  leeeellllllllleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHHHHLLL.....eE


DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle
Query RTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
ident                  |                                          
Sbjct VVKPSISDPLPAAMAVKALLDAG.....................................  209
DSSP  EEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL.....................................


DSSP  eeelllllllllllllLEEEellllllhhhhllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHLLlLL
Query llcgggiaadrgyfiqPTVFgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFKTiEEVVGRANNStYG  420
ident                                          |      |           
Sbjct ................FPPD.................AIALLNLPG.KEAEKIVADD.RV  234
DSSP  ................LLLL.................LEEELLLLH.HHLHHHHLLL.LL


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL................................
Query LAAAVFTkDLDKANYLSQALQAGTVWVN................................  448
ident  |                                                          
Sbjct AAVSFTG.STEVGERVVKVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagq  293
DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct rcdaiklvlaerpvygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaieda  353
DSSP  lllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct vekggrvlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaiel  413
DSSP  hhllleeeellleeelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct angrpygldaavfgrdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregi  473
DSSP  hhllleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleelllll


DSSP  ....lLLLLlllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll
Query ....cYDVFgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
ident                                                   
Sbjct gyaveAVTA........................yktivfnykgkgvwkye  499
DSSP  lllhhHHEE........................eeeeeeellllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  ..................................................llllllllll
Query ..................................................avpapnqqpe   10
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query vfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaraafqlgspw   70
ident                                                             
Sbjct lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhl
Query rrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwa  130
ident                                                             
Sbjct iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee


DSSP  lllllleellllleeeeeeeeeLLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHH....LLLE.EE
Query dkyhgktipidgdffsytrhepVGVCGQIIPWN.FPLLMQAWKLGPALA....TGNV.VV  184
ident                        |    |        |                      
Sbjct gstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLAADKIARGIYSyagqRCDAiKL  300
DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEE


DSSP  EELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL......................................
Query MKVAEQTPLTALYVANLIKEAG......................................  206
ident                                                             
Sbjct VLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrv  360
DSSP  EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  ............LLLL.....................LEEELLL.LLLLHHHHHHLLLLL
Query ............FPPG.....................VVNIVPG.FGPTAGAAIASHEDV  232
ident              |                       |   |       |          
Sbjct laggrrlgptyvQPTFveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVkDLDQAIELANGRPYG  420
DSSP  eellleeelleeLLEEeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEElLHHHHHHHHHLLLEE


DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhlLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query DKVAFTG.STEIGRVIQVAAgssNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffn  291
ident    |  |      |                                              
Sbjct LDAAVFGrDVVKIRRAVRLL...EVGAIYIN.............................  448
DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHL...LLLEEEEL.............................


DSSP  hhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query qgqcscagsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyi  351
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhh
Query ntgkqegakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevv  411
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellll
Query grannstyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrel  471
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhHHEEEE................................eeeeellllll
Query geyglqAYTEVK................................tvtvkvpqkns  494
ident                                                        
Sbjct ....dmPRHGIGyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
DSSP  ....llLLLLLLlllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll