No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=26.4

DSSP  ...................................................LHHHHHHHH
Query ...................................................DELLEKAKK    9
ident                                                     |       
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsrEEVERTLDV   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhHHHHHHHHH


DSSP  HH.HHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHhhhhhllllhhhhhhhl
Query VR.EAWDVLRNATTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVekarergvkeslvdrla   68
ident          |     |      | |           |                       
Sbjct LFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNA............gkpks  108
DSSP  HHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHH............lllhh


DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLEEEEEELL.....LLLEEEEEEEELLLEEEELLL.
Query lNDKRIDEMIKACETVIGLKDPvgEVIDSWVRE.....DGLRIARVRVPIGPIGIIYES.  122
ident                            |                  | | |    |    
Sbjct aAVGEVKAAVDRLRLAELDLKK..IGGDYIPGDwtydtLETEGLVRREPLGVVAAITPFn  166
DSSP  hHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH..LLLEEEELLlllllLLEEEEEEEEELLEEEEELLLl


DSSP  .LLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHEEELLlLL
Query .RPNVTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeIPESSVEFIEnTD  181
ident       |         ||                 | |   |      |           
Sbjct yPLFDAVNKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAG....FPPDAIALLN.LP  221
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLLLLEEELL.LL


DSSP  LHHHHHHLLLLlLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHH
Query RSLVLEMIRLReYLSLVIPRGGYGLISFVRDNAT.VPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAV  240
ident                 |   |       |              |     | | |||  | 
Sbjct GKEAEKIVADD.RVAAVSFTGSTEVGERVVKVGGvKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAA  280
DSSP  HHHLHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLlLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLL.LLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL..................
Query PVIINAKTQR.PGTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH..................  281
ident   |           | |    |                |                     
Sbjct DKIARGIYSYaGQRCDAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLrvgdprdptvdvgplisp  340
DSSP  HHHHHHHHHHhHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllh


DSSP  ................................LLEEEELHHhhhhlllleelLHHHLLLL
Query ................................GVEVRGCEKtreivpdvvpaTEDDWPTE  309
ident                                                            |
Sbjct savdemmaaiedavekggrvlaggrrlgptyvQPTFVEAPA.......drvkDMVLYKRE  393
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeelleeLLEEEELLH.......hhhlLLHHHHLL


DSSP  LLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLhHH
Query YLDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVNAStRF  369
ident           ||  | |||       |                |      | | |     
Sbjct VFAPVALAVEVKDLDQAIELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDM.PR  452
DSSP  LLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL.LL


DSSP  LL.LLLLlllllllEELLLlllLEEL....LLHHHEEEEEEEELLlLLLL.....
Query TD.GGQFgfgaeigISTQRfhaRGPV....GLRELTTYKFVVLGEyHVRE.....  414
ident    |                               | ||  |             
Sbjct HGiGYYP.......FGGRKksgVFREgigyAVEAVTAYKTIVFNY.KGKGvwkye  499
DSSP  LLlLLLL.......LLLEElleELLLllllLHHHHEEEEEEEEEL.LLLLlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  ......................................................lhhhhh
Query ......................................................dellek    6
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhh
Query akkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvkeslvdr   66
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hlllhhhhhhhhhH................HHHhhhllllllleeeeeellllleeeeee
Query lalndkridemikA................CETviglkdpvgevidswvredglriarvr  110
ident                                                             
Sbjct lrlaeldlkkiggDyipgdwtydtleteglVRR...........................  153
DSSP  hhlllhhhhhlllEeeellllllllleeeeEEE...........................


DSSP  eellleeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vpigpigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeip  170
ident                                                             
Sbjct ............................................................  153
DSSP  ............................................................


DSSP  hhheeellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEE
Query essvefientdrslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvGNCHIFV  230
ident                                                      |      
Sbjct ..................................................eplGVVAAIT  163
DSSP  ..................................................eelLEEEEEL


DSSP  LLLlLHHHH.HHHHHHHhHLLLllllLEEEEEEEHHHHhHHHHHHHHHHHHLLLEEEelh
Query DESaDLKKA.VPVIINAkTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAkEFLPVIVEELRKHGVEVRgce  289
ident           |  |             |                 |  |   |       
Sbjct PFN.YPLFDaVNKITYS.FIYG....NAVVVKPSISDP.LPAAMAVKALLDAGFPPD...  213
DSSP  LLL.LLLHHhHHHHHHH.HHLL....LEEEEELLLLLL.HHHHHHHHHHHHLLLLLL...


DSSP  hhhhhlllleellhhhllllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHHhLLLLEEEEELlLHHHH
Query ktreivpdvvpateddwpteyldlIIAIKVVKNvDEAIEHIKKySTGHSESILTeNYSNA  349
ident                          ||        ||             |         
Sbjct ........................AIALLNLPG.KEAEKIVAD.DRVAAVSFTG.STEVG  246
DSSP  ........................LEEELLLLH.HHLHHHHLL.LLLLEEEEEL.LHHHH


DSSP  HHHHHHLLLLEEEEL.............................................
Query KKFVSEIDAAAVYVN.............................................  364
ident    |                                                        
Sbjct ERVVKVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerp  306
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct vygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrr  366
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct lgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavf  426
DSSP  eelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeee


DSSP  .................................................llhHHLLLLll
Query .................................................astRFTDGGqf  375
ident                                                       |     
Sbjct grdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTAYK..  484
DSSP  lllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEEEE..


DSSP  llllllleellllllleelllhhheeeeeeeelllllll
Query gfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                        
Sbjct ........................tivfnykgkgvwkye  499
DSSP  ........................eeeeellllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  .......................lhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHhhhhhhhhhhhhh
Query .......................dellekakkvreawdvlrnaTTREknkaikkiaekld   37
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnaGKPK.............  107
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLH.............


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHLL.........
Query errkeileanridvekarergvkeslvdrlalndkridemikacetvIGLK.........   88
ident                                                             
Sbjct ..............................................sAAVGevkaavdrl  121
DSSP  ..............................................hHHHHhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................lLLLLeeeeeellllle
Query ...........................................dPVGEvidswvredglr  105
ident                                                             
Sbjct rlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfNYPL............  169
DSSP  hlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllLLLL............


DSSP  eeeeE.......................................................
Query iarvR.......................................................  110
ident                                                             
Sbjct ....Fdavnkitysfiygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkea  225
DSSP  ....Hhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhl


DSSP  ...................................eeLLLEEEELL..LLLH.HHHHHHH
Query ...................................vpIGPIGIIYE..SRPN.VTVETTI  132
ident                                       |    |                
Sbjct ekivaddrvaavsftgstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLedADLDlAADKIAR  285
DSSP  hhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHH


DSSP  HHHHLL.....LLEEEELLHHHHHHHHHHHHHH...........................
Query LALKSG.....NTILLRGGSDALNSNKAIVSAI...........................  160
ident               |              |                              
Sbjct GIYSYAgqrcdAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRlsslrvgdprdptvdvgplispsavde  345
DSSP  HHHHHHhllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHhhlllllllllllllllllllhhhhhh


DSSP  ..............hHHHLLL.....LLLHH.....................HEEELLLL
Query ..............rEALKET.....EIPES.....................SVEFIENT  180
ident                 |           |                            |  
Sbjct mmaaiedavekggrvLAGGRRlgptyVQPTFveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVK  405
DSSP  hhhhhhhhhhllleeEELLLEeelleELLEEeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEEL


DSSP  LLHHHHHHLLLLLLLLEEEELL.LHHHHHHHHHHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhh
Query DRSLVLEMIRLREYLSLVIPRG.GYGLISFVRDNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkk  238
ident |     |    | |       |     |        |                       
Sbjct DLDQAIELANGRPYGLDAAVFGrDVVKIRRAVRLLEVgAIYI..................  447
DSSP  LHHHHHHHHHLLLEELEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE..................


DSSP  hhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhllll
Query avpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakeflpviveelrkhgvevrgcektreivpdv  298
ident                                                             
Sbjct ............................................................  447
DSSP  ............................................................


DSSP  eellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlll
Query vpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehikkystghsesiltenysnakkfvseida  358
ident                                                             
Sbjct ............................................................  447
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeelllhhhllllllllllllleellLLLL...............leelllhhheeee
Query aavyvnastrftdggqfgfgaeigistqRFHA...............rgpvglrelttyk  403
ident                                                             
Sbjct ...................ndmprhgigYYPFggrkksgvfregigyaveavtayktivf  488
DSSP  ...................lllllllllLLLLlleelleellllllllhhhheeeeeeee


DSSP  eeeelllllll
Query fvvlgeyhvre  414
ident            
Sbjct nykgkgvwkye  499
DSSP  ellllllllll