No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=38.1

DSSP  ..........................LLLEEEEELLLLLLEEEeEEELLLHHHHHHHHHH
Query ..........................TDNVFYATNAFTGEALPlAFPVHTEVEVNQAATA   34
ident                               |   |  |||             |  |  |
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavSRKTFPTVNPSTGEVIC.QVAEGDKEDVDKAVKA   59
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllLLLEEEEEELLLLEEEE.EEELLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHH...HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHH
Query AAKVAR...DFRRLNNSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLT.GEIART   90
ident |          ||   | |  ||   |   |       |   |    | |          
Sbjct ARAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYlVDLDMV  119
DSSP  HHHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHhlHHHLeEEELLLLllllllLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLl
Query ANQLRLFADVVNsgSYHQaILDTPNPtraplpKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSa  150
ident    ||  |       ||                          |        ||||    
Sbjct LKCLRYYAGWAD..KYHG.KTIPIDG......DFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQ.  169
DSSP  HHHHHHHHHHLL..LLLL.LEELLLL......LEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHH.


DSSP  lLHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHHEEEELLLLLHHHH
Query aGGDTASALAAGCPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqLPQAIFTLLQGNQRALGQ  210
ident        ||| |  |  |     | |   ||  |  |      |        |     | 
Sbjct .AWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAG....FPPGVVNIVPGFGPTAGA  224
DSSP  .HHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL....LLLLLEEELLLLLLLHHH


DSSP  HHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLlLLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHH
Query ALVSHPEIKAVGFTGSVGGGRALFNLAHERpEPIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLA  270
ident |  ||     | ||||   ||     |           |||   |  |   |        
Sbjct AIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSS.NLKRVTLELGGKSPNIIMSDAD..MDWAV  281
DSSP  HHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHL.LLLEEEEELLLLEEEEELLLLL..HHHHH


DSSP  HHHHHHHLHHHHLLLLLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........LLLLL
Query DQFVASMTMGCGQFCTKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP..........STLLT  320
ident  |         ||        |         | |                          
Sbjct EQAHFALFFNQGQCSCAGSRTFVQED.IYDEFVERSVARAKSRVVgnpfdskteqGPQVD  340
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllllLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLlEEEEEL.LLLL...LLLLLEEEEEehhhHHHLHHHHLLLLL
Query PGIRDSYQSQVVSRGSDDgIDVTFS.QAES...PCVASALFVTssenWRKHPAWEEEIFG  376
ident                                         |              |||||
Sbjct ETQFKKILGYINTGKQEG.AKLLCGgGIAAdrgYFIQPTVFGD...vQDGMTIAKEEIFG  396
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLL.LEEEELlLLLLlllLLLLLEEEEL...lLLLLHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLlL
Query PQSLIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWpT  436
ident |   |                   | |       |      |   |   ||    |    
Sbjct PVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTK..DLDKANYLSQAL..QAGTVWVNCY.D  451
DSSP  LEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLL.L


DSSP  LLLLLllLLLLLLLLLLLlllLLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhlllllllll
Query GVEVGyaMVHGGPYPASThsaSTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenpleia  496
ident           ||             |                                  
Sbjct VFGAQ..SPFGGYKMSGS...GRELGEYGLQAYTEVKTVTV...................  487
DSSP  LLLLL..LLLLLLHHHEE...LLLLLHHHHHHHEEEEEEEE...................


DSSP  eeelllll
Query ravdgkaa  504
ident         
Sbjct .kvpqkns  494
DSSP  .ellllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  ......llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh
Query ......tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasll   54
ident                                                             
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLH..HHLE...
Query rtiaselearsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfaDVVNSGS..YHQA...  109
ident                                                   |         
Sbjct raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldnGKPYVISylVDLDmvl  120
DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLHHHHhhLHHHhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
ident                                                             
Sbjct kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .............EEEL........lLLLLlllLLLL.......................
Query .............ILDT........pNPTRaplPKPD.......................  125
ident                            |                                
Sbjct nvvvmkvaeqtplTALYvanlikeagFPPG...VVNIvpgfgptagaaiashedvdkvaf  237
DSSP  leeeeellllllhHHHHhhhhhhhhlLLLL...LEEElllllllhhhhhhlllllleeee


DSSP  ...................eeeeeeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHH....H
Query ...................irrqqiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALA....A  161
ident                            |       |                        
Sbjct tgsteigrviqvaagssnlkrvtlelGGKSPNIIMSDaDMDWA..VEQAHFALFFnqgqC  295
DSSP  ellhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHHhhhlL


DSSP  LLL.EEEELLLLLHHHHHHHHHHHH...................................
Query GCP.VIVKGHTAHPGTSQIVAECIE...................................  185
ident  |                                                          
Sbjct SCAgSRTFVQEDIYDEFVERSVARAksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgk  355
DSSP  LLLeEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......HHHHHH.......LLLH..................hHEEEELLLLLHHHHHHHH
Query ......QALKQE.......QLPQ..................aIFTLLQGNQRALGQALVS  214
ident                      |                        |             
Sbjct qegaklLCGGGIaadrgyfIQPTvfgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFKTIEEVVGRAN  415
DSSP  hllleeEELLLLlllllllLLLEeeellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHH


DSSP  LL.LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhh
Query HP.EIKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladq  272
ident       |             |                                       
Sbjct NStYGLAAAVFTkDLDKANYLSQALQ....AGTVWVN.......................  448
DSSP  LLlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL....LLEEEEL.......................


DSSP  hhhhhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhh
Query fvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvv  332
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhh
Query srgsddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmls  392
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllll
Query lsemlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypa  452
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllhhhhhHHEEE.......eeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query sthsastsvgaeaihRWLRP.......vayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                            
Sbjct .............cyDVFGAqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
DSSP  .............llLLLLLlllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.2

DSSP  llleeeeellLLLLEEEEEEE..................................lLLHH
Query tdnvfyatnaFTGEALPLAFP..................................vHTEV   26
ident                                                             
Sbjct .....avpapNQQPEVFCNQIfinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkeDVDK   55
DSSP  .....lllllLLLLLLLLLLEeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhhhllhhhhhHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH...hHHHH.......
Query EVNQAATAAAKVArdfrrlnnskraSLLRTIASELEARSDDIIAR...aHLET.......   76
ident  |  |  |                          |    | |                  
Sbjct AVKAARAAFQLGS........pwrrMDASHRGRLLNRLADLIERDrtylAALEtldngkp  107
DSSP  HHHHHHHHLLLLL........hhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhHHHHhhhhlll


DSSP  .....lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhleeeellllllllllllleeeeee
Query .....aLPEVRLTGEIARTANQLRLFadvvnsgsyhqaildtpnptraplpkpdirrqqi  131
ident                    |                                        
Sbjct yvisylVDLDMVLKCLRYYAGWADKY..................hgktipidgdffsytr  149
DSSP  hhhhhhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..................llleellllleeeeee


DSSP  elllEEEEL......lllLLLLLLllLHHHHHHhhhlllEEEELLLL......LHHHHHH
Query algpVAVFG......asnFPLAFSaaGGDTASAlaagcpVIVKGHTA......HPGTSQI  179
ident                           |   |          |    |             
Sbjct hepvGVCGQiipwnfpllMQAWKL..GPALATG......NVVVMKVAeqtpltALYVANL  201
DSSP  eeelLEEEEelllllhhhHHHHHH..HHHHHLL......LEEEEELLllllhhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHhhhhhhlllhhhEEEELLLL......LHHH.HHHHhllllleEEEEL......L
Query VAECIEqalkqeqlpqaiFTLLQGNQ......RALG.QALVshpeikaVGFTG......S  226
ident   |                              |      |                   
Sbjct IKEAGF..........ppGVVNIVPGfgptagAAIAsHEDV.......DKVAFtgsteiG  244
DSSP  HHHHLL..........llLLEEELLLllllhhHHHHlLLLL.......LEEEEellhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHHhllllllEEEELLLL.........leeeelhhhhhhlllhhhhhhhhh
Query VGGGRALFNLAHerpepipFYGELGAI.........nptfifpsamrakadladqfvasm  277
ident      |                 |                                    
Sbjct RVIQVAAGSSNL.......KRVTLELGgkspniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcsc  297
DSSP  HHHHHHHHHLLL.......LEEEEELLlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  lhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsd  337
ident                                                             
Sbjct agsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqe  357
DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  lleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhll
Query dgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslseml  397
ident                                                             
Sbjct gakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevvgranns  417
DSSP  lleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhll


DSSP  lleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllLLLLllllllllLLLL.lllll
Query agsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwpTGVEvgyamvhgGPYP.asths  456
ident                                                             
Sbjct tyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaQSPF......ggYKMSgsgrel  471
DSSP  lllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllLLLL......llLHHHeellll


DSSP  llLLLLhhhhhHHEEeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query asTSVGaeaihRWLRpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                 
Sbjct geYGLQ...ayTEVK......................tvtvkvpqkns  494
DSSP  lhHHHH...hhEEEE......................eeeeellllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll
Query learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
ident                                                             
Sbjct ......................................avpapnqqpevfcnqifinnew   22
DSSP  ......................................llllllllllllllleeellee


DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh
Query lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
ident                                                             
Sbjct hdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaraafqlgspwrrmdashrgrll   82
DSSP  elllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhllhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl
Query aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
ident                                                             
Sbjct nrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidg  142
DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleellll


DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhlLLHHHHHHHHHLHHHhllllLLLEEEEELLhHHH
Query pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakADLADQFVASMTMGCgqfctKPGVVFALNTpETQ  300
ident                  |                               |          
Sbjct dffsytrhepvGVCGQIIPWNFP...LLMQAWKLGPALATG.....NVVVMKVAEQ.TPL  193
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLH...HHHHHHHHHHHHHLL.....LEEEEELLLL.LLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllLEEEeee
Query AFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvaSALFvts  360
ident      |                                                      
Sbjct TALYVANLIKEAG........................................FPPG...  210
DSSP  HHHHHHHHHHHHL........................................LLLL...


DSSP  hhhhhhlhhhhllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHH
Query senwrkhpaweeeifgpQSLIVVCeNVAD.MLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQLI  419
ident                     ||                                      
Sbjct .................VVNIVPG.FGPTaGAAIAS.HEDVDKVAFTG...STEIGRVIQ  248
DSSP  .................LEEELLL.LLLLhHHHHHL.LLLLLEEEEEL...LHHHHHHHH


DSSP  HHHH.LLEEEEEEL..............................................
Query PRLE.EIAGRLVFN..............................................  432
ident          |                                                  
Sbjct VAAGsSNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqedi  308
DSSP  HHHHhLLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct ydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggia  368
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct adrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavftk  428
DSSP  llllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeell


DSSP  ...............................................lLLLLllllllll
Query ...............................................gWPTGvevgyamv  445
ident                                                             
Sbjct dldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrelgeyglQAYT........  480
DSSP  lhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelllllhhhhHHHE........


DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll
Query hggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
ident                                                            
Sbjct .............................................evktvtvkvpqkns  494
DSSP  .............................................eeeeeeeellllll