No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=14.8

DSSP  ..........................lhhhlllleeelleeeeleelllleelllLEEEe
Query ..........................agllegvikekggvpvypsylagewggsgQEIEv   34
ident                                                             
Sbjct ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfDKTT.   59
DSSP  lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLL.


DSSP  elllllleeeeEELLlhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHH
Query kspidlatiakVISPsreevertldvlfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiierNLDV   94
ident            |                                              | 
Sbjct ...........VTAL............................kvsaeeiaaaserLSDE   80
DSSP  ...........LLLL............................lllhhhhhhhhhhLLHH


DSSP  HHhhhhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHHLLLHHhhHLLLEEEELLlllllLLEEEEEEEE
Query FAevlvmnagkpksaaVGEVKAAVDRLRLAELDlkKIGGDYIPGDwtydtLETEGLVRRE  154
ident                      |             |                        
Sbjct LK..............QAMAVAVKNIETFHTAQ..KLPPVDVETQ.....PGVRCQQVTR  119
DSSP  HH..............HHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLEEEEEE.....LLEEEEEEEE


DSSP  ELLEEEEELLL..lLLLHHHHHHHHHHHHLLL.EEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHhllll
Query PLGVVAAITPF..nYPLFDAVNKITYSFIYGN.AVVVKPSISDPLPAAMAVKALLdagfp  211
ident |   |    |              |   | |   ||             |          
Sbjct PVASVGLYIPGgsaPLFSTVLMLATPASIAGCkKVVLCSPPPIADEILYAAQLCG.....  174
DSSP  ELLEEEEELLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLL.....


DSSP  lllEEELLLLHHHL.HHHHLL....lLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHL...LLEEEEELL
Query pdaIALLNLPGKEA.EKIVAD....dRVAAVSFTGSTEVGERVVKVGG...VKQYVMELG  263
ident        |  |  |             |      |   | |    |          |  |
Sbjct ..vQDVFNVGGAQAiAALAFGtesvpKVDKIFGPGNAFVTEAKRQVSQrldGAAIDMPAG  232
DSSP  ..lLEEEELLHHHHhHHHHHLlllllLLLEEELLLLHHHHHHHHHHHHlllLLEELLLLL


DSSP  .LLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHhHHHHLlllLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHL
Query .GGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIySYAGQrcdAIKLVLAERP.VYGKLVEEVAKRLSS  321
ident       |    |  |  |                     |           | |   |  
Sbjct pSEVLVIADSGATPDFVASDLLSQA.EHGPD...SQVILLTPAAdMARRVAEAVERQLAE  288
DSSP  lLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHH.LLLLL...LEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeelleELLEeeellh
Query LRVgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgptyVQPTfveapa  381
ident |                                                           
Sbjct LPR..............................................aETAR......  296
DSSP  LLL..............................................lHHHH......


DSSP  hhhlllhhhhllllLLEE..EEEEELLHHHHHHHHHLLlEELEEEEELLlhhHHHHHHHH
Query drvkdmvlykrevfAPVA..LAVEVKDLDQAIELANGRpYGLDAAVFGRdvvKIRRAVRL  439
ident                          ||| |  |  |            |     |  |  
Sbjct ..............QALNasRLIVTKDLAQCVEISNQY.GPEHLIIQTR...NARELVDS  338
DSSP  ..............HHHLllEEEELLLHHHHHHHHHHH.LLLEEEEELL...LHHHHHHH


DSSP  L.LLLEEEEL..LLLL..LLLLLLLL.LLEELL..eELLLllllLHHHHEEEEEEEEELL
Query L.EVGAIYIN..DMPR..HGIGYYPF.GGRKKS..gVFREgigyAVEAVTAYKTIVFNYK  491
ident     |                                                |     |
Sbjct ItSAGSVFLGdwSPESagDYASGTNHvLPTYGYtatCSSL....GLADFQKRMTVQELSK  394
DSSP  LlLLLEEEELllLLHHhhHHLLLLLLlLLLLLHhhlLLLL....LHHHHEEEEEEEEELH


DSSP  L.lLLLL............................ll
Query G.kGVWK............................ye  499
ident                                      
Sbjct EgfSALAstietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
DSSP  HhhHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  lhhhlllleeelleeeELEElllleelllleeeeelllllleeeeeeLLLH...HHHHHH
Query agllegvikekggvpvYPSYlagewggsgqeievkspidlatiakviSPSR...EEVERT   57
ident                                                       |     
Sbjct ................NTII...........................DWNSctaEQQRQL   17
DSSP  ................LLEE...........................EHHHllhHHHHHH


DSSP  HHH.........................................................
Query LDV.........................................................   60
ident |                                                           
Sbjct LMRpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttvtalkvsaeeiaaaserl   77
DSSP  LLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   60
ident                                                             
Sbjct sdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgvrcqqvtrpvasvglyipggsaplfs  137
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeeelleeeeellllllllhh


DSSP  .hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhh
Query .lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavd  119
ident                                                             
Sbjct tvlmlatpasiagckkvvlcspppiadeilyaaqlcgvqdvfnvggaqaiaalafgtesv  197
DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhlllll


DSSP  hhhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeEEEEElLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHH
Query rlrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglVRREPlGVVAAITPFNYPLFDAVNKITYS  179
ident                                    |   |  |                 
Sbjct pkvdkifgpgnafvteakrqvsqrldgaaidMPAGP.SEVLVIADSGATPDFVASDLLSQ  256
DSSP  lllleeellllhhhhhhhhhhhhllllleelLLLLL.LEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLL..LEEEEELLLLLL.HHHHHHHHHHHHLL.......LLLLLEEELLLLH.HHLHHH
Query FIYG..NAVVVKPSISDP.LPAAMAVKALLDAG.......FPPDAIALLNLPG.KEAEKI  228
ident    |    |       |     | ||   |              |  |           |
Sbjct AEHGpdSQVILLTPAADMaRRVAEAVERQLAELpraetarQALNASRLIVTKDlAQCVEI  316
DSSP  HLLLllLEEEEEELLHHHhHHHHHHHHHHHHLLlllhhhhHHHLLLEEEELLLhHHHHHH


DSSP  HLLLLLLEEEEELLHhhHHHHHHHHLLL.EEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhh
Query VADDRVAAVSFTGSTevGERVVKVGGVK.QYVMElgggdpaivledadldlaadkiargi  287
ident                      |                                      
Sbjct SNQYGPEHLIIQTRN..ARELVDSITSAgSVFLG..........................  348
DSSP  HHHHLLLEEEEELLL..HHHHHHHLLLLlEEEEL..........................


DSSP  hhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhh
Query ysyagqrcdaiklvlaerpvygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemm  347
ident                                                             
Sbjct ............................................................  348
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllleeeellleeelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellh
Query aaiedavekggrvlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdl  407
ident                                                             
Sbjct ............................................................  348
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelle
Query dqaielangrpygldaavfgrdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksg  467
ident                                                             
Sbjct ............................................................  348
DSSP  ............................................................


DSSP  eLLLLllLLHH.................................................
Query vFREGigYAVE.................................................  478
ident         |                                                   
Sbjct dWSPE..SAGDyasgtnhvlptygytatcsslgladfqkrmtvqelskegfsalastiet  406
DSSP  lLLLH..HHHHhllllllllllllhhhllllllhhhheeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....hheeeeeeeeellllllllll
Query ....avtayktivfnykgkgvwkye  499
ident                          
Sbjct laaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh
Query lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
ident                                                             
Sbjct ......................ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitrtvndild   38
DSSP  ......................lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee
Query iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
ident                                                             
Sbjct nvkargdealreysakfdkttvtalkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavknietfhta   98
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeellLLEEEEELLL.lLHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLlleE
Query gstevgervvkvggvkqyvmelgGGDPAIVLED.aDLDLAADKIARGIYSyaGQRCdaiK  299
ident                                     |       |               
Sbjct qklppvdvetqpgvrcqqvtrpvASVGLYIPGGsaPLFSTVLMLATPASI..AGCK..kV  154
DSSP  llllleeeeeelleeeeeeeeelLEEEEELLLLllLLHHHHHHHHHHHHH..HLLL..eE


DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle
Query LVLAERPVYGKLVEEVAKRLsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggr  359
ident       |                                                     
Sbjct VLCSPPPIADEILYAAQLCG........................................  174
DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHLL........................................


DSSP  eeellleeelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeEEEEElLHHHHHHHHHLL..
Query vlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvaLAVEVkDLDQAIELANGR..  417
ident                                             |    |||        
Sbjct ......................................vqDVFNV.GGAQAIAALAFGte  195
DSSP  ......................................llEEEEL.LHHHHHHHHHHLll


DSSP  ..lEELEEEEELllHHHHHHHHHHLL....LLEEE.........................
Query ..pYGLDAAVFGrdVVKIRRAVRLLE....VGAIY.........................  446
ident            |        | |         ||                          
Sbjct svpKVDKIFGPG..NAFVTEAKRQVSqrldGAAIDmpagpsevlviadsgatpdfvasdl  253
DSSP  lllLLLEEELLL..LHHHHHHHHHHHhlllLLEELlllllleeeeeelllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  446
ident                                                             
Sbjct lsqaehgpdsqvilltpaadmarrvaeaverqlaelpraetarqalnasrlivtkdlaqc  313
DSSP  hhhhlllllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllleeeelllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  446
ident                                                             
Sbjct veisnqygpehliiqtrnarelvdsitsagsvflgdwspesagdyasgtnhvlptygyta  373
DSSP  hhhhhhhllleeeeelllhhhhhhhllllleeeelllllhhhhhhllllllllllllhhh


DSSP  .....ellllllllllllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll
Query .....indmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
ident                                                           
Sbjct tcsslgladfqkrmtvqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
DSSP  llllllhhhheeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl