No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=67.6

DSSP  LLLLLEEELLEEELLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLH
Query TKQYKNYVNGEWKLSENEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYASAKKAQPAWRALSY   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct TKQYKNYVNGEWKLSENEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYASAKKAQPAWRALSY   60
DSSP  LLLLLEEELLEEELLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLE
Query IERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVSEVVRTAEIINYAAEEGLRMEGE  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct IERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVSEVVRTAEIINYAAEEGLRMEGE  120
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLE


DSSP  EEEHHHLLHHHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLL
Query VLEGGSFEAASKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAGNVIAFKPPTQ  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct VLEGGSFEAASKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAGNVIAFKPPTQ  180
DSSP  EEEHHHLLHHHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHH
Query GSISGLLLAEAFAEAGLPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNFINFTGSTGIGERIGKM  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GSISGLLLAEAFAEAGLPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNFINFTGSTGIGERIGKM  240
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHH
Query AGMRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTAVKRVLVMESVADELV  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AGMRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTAVKRVLVMESVADELV  300
DSSP  LLLLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLLLLHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEELLLLLEELLEELL
Query EKIREKVLALTIGNPEDDADITPLIDTKSADYVEGLINDANDKGATALTEIKREGNLICP  360
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct EKIREKVLALTIGNPEDDADITPLIDTKSADYVEGLINDANDKGATALTEIKREGNLICP  360
DSSP  HHHHHHHHLLLLLLHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEELLLLLEELLEELL


DSSP  EEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEELLLHHHHHHHH
Query ILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIA  420
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIA  420
DSSP  EEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEELLLHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHHHHLEEEEEEEEELL
Query EQLEVGTVHINNKTQRGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSIEAMTTVKSVVFDIK  474
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct EQLEVGTVHINNKTQRGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSIEAMTTVKSVVFDIK  474
DSSP  HHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHHHHLEEEEEEEEELL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  ................................................llllleeellee
Query ................................................tkqyknyvngew   12
ident                                                             
Sbjct ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle


DSSP  elllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query klseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvad   72
ident                                                             
Sbjct vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhl
Query ilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaask  132
ident                                                             
Sbjct gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHL......lLEEEEELLLLLHHHHH
Query kkiavvrrepvGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIA......gNVIAFKPPTQGSISGL  186
ident            |   ||        |    |              |              
Sbjct agmrpimlelgGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGysgqrctAVKRVLVMESVADELV  300
DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLEEEEEEEHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL.................................................L
Query LLAEAFAEAG.................................................L  197
ident         |                                                   
Sbjct EKIREKVLALtignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicP  360
DSSP  HHHHHHHHLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelL


DSSP  LLL.................LEEELLLLHhhHHHHHHHL.LLLLEEEEEL.LHHHHHHHH
Query PAG.................VFNTITGRGseIGDYIVEH.QAVNFINFTG.STGIGERIG  238
ident                     |   |          |                      | 
Sbjct ILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSveEAIEISNKsEYGLQASIFTnDFPRAFGIA  420
DSSP  EEEellllllhhhlllllllEEEEEEELLhhHHHHHHHHlLEELEEEEELlLHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhh
Query KMAGMRPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvade  298
ident                                                             
Sbjct EQLEVGTVHIN.................................................  431
DSSP  HHLLLLEEEEL.................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleellee
Query lvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnli  358
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhhh
Query cpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfprafg  418
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhLEEEEE..........
Query iaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieaMTTVKS..........  468
ident                                                             
Sbjct .........................................nktQRGTDNfpflgakksg  450
DSSP  .........................................lllLLLLLLllllleelle


DSSP  ..................eeeell
Query ..................vvfdik  474
ident                         
Sbjct agiqgvkysieamttvksvvfdik  474
DSSP  ellllhhhhhhhleeeeeeeeell


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct ................................................tkqyknyvngew   12
DSSP  ................................................llllleeellee


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
ident                                                             
Sbjct klseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvad   72
DSSP  elllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct ilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaask  132
DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhl


DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLEEEEEEEHHHHHHHH
Query agmrpimlelgGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGysgqrctAVKRVLVMESVADELV  300
ident            |   ||        |    |              |              
Sbjct kkiavvrrepvGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIA......gNVIAFKPPTQGSISGL  186
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHL......lLEEEEELLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelL
Query EKIREKVLALtignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicP  360
ident         |                                                   
Sbjct LLAEAFAEAG.................................................L  197
DSSP  HHHHHHHHHL.................................................L


DSSP  EEEellllllhhhlllllllEEEEEEELLhhHHHHHHHHlLEELEEEEELlLHHHHHHHH
Query ILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSveEAIEISNKsEYGLQASIFTnDFPRAFGIA  420
ident                     |   |          |                      | 
Sbjct PAG.................VFNTITGRGseIGDYIVEH.QAVNFINFTG.STGIGERIG  238
DSSP  LLL.................LEEELLLLHhhHHHHHHHL.LLLLEEEEEL.LHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEEL.................................................
Query EQLEVGTVHIN.................................................  431
ident                                                             
Sbjct KMAGMRPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvade  298
DSSP  HHLLLLLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct lvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnli  358
DSSP  hhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleellee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct cpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfprafg  418
DSSP  lleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhhh


DSSP  .........................................lllLLLLLLllllleelle
Query .........................................nktQRGTDNfpflgakksg  450
ident                                                             
Sbjct iaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieaMTTVKS..........  468
DSSP  hhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhLEEEEE..........


DSSP  ellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query agiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                         
Sbjct ..................vvfdik  474
DSSP  ..................eeeell