No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=48.1

DSSP  ..................................LLLLLEEELLEEELLLLEEEEELLLL
Query ..................................TKQYKNYVNGEWKLSENEIKIYEPAS   26
ident                                      |  |  |||           |  
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefGRHYPLYIGGEWVDTKERMVSLNPSA   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLEEELEEELLEEELLLLEEEEEELLE


DSSP  L.LEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH
Query G.AELGSVPAMSTEEVDYVYASAKKAQPAWRALSYIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAIL   85
ident      |        |       | ||   |       |   | | |    | |    | |
Sbjct PsEVVGTTAKAGKAEAEAALEAAWKAFKTWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEATL  120
DSSP  EeEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLEEEEHhhllhhhLLEEEEEEEEE
Query SKEVAKGYKSAVSEVVRTAEIINYAAEEGLRM...EGEVLEGgsfeaasKKKIAVVRREP  142
ident   || |    |   |      | | |   ||      ||                    |
Sbjct VYEVGKNWVEASADVAEAIDFIEYYARAALRYrypAVEVVPY.......PGEDNESFYVP  173
DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLLLLL.......LLEEEEEEEEE


DSSP  LLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLE
Query VGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAGLPAGVF  202
ident  |    | | | ||      |      ||    ||       |    | | ||| | || 
Sbjct LGAGVVIAPWNFPVAIFTGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAGFPPGVV  233
DSSP  LLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLE


DSSP  EELLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHLL........LLLEEEELLLLE
Query NTITGRGSEIGDYIVEHQAVNFINFTGSTGIGERIGKMAG........MRPIMLELGGKD  254
ident |   | | | | | |||    |||||||   |  |   ||              | ||| 
Sbjct NFLPGVGEEVGAYLVEHPRIRFINFTGSLEVGLKIYEAAGrlapgqtwFKRAYVETGGKN  293
DSSP  EELLLLLLHHHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLllllllllLLEEEEELLLLE


DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query SAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTAVKRVLVMESVADELVEKIREKVLALTIGN  314
ident   || | ||  | |      | |  || | |  |            |        |  | 
Sbjct AIIVDETADFDLAAEGVVVSAYGFQGQKCSAASRLILTQGAYEPVLERVLKRAERLSVGP  353
DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLL


DSSP  HHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlLEELLLLLEE...LLEELLEEEELLLLLLH
Query PEDDADITPLIDTKSADYVEGLINDANDKgATALTEIKRE...GNLICPILFDKVTTDMR  371
ident  |   |  |         |   |              ||    |  | |  |  |    |
Sbjct AEENPDLGPVVSAEQERKVLSYIEIGKNE.GQLVLGGKRLegeGYFIAPTVFTEVPPKAR  412
DSSP  HHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLL.LEEEELLLLLlllLLLLLLEEEELLLLLLH


DSSP  HHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL
Query LAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHIN  431
ident  | || |||||  |||    || |  |   |||                    ||    |
Sbjct IAQEEIFGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSRKREHLEWARREFHVGNLYFN  472
DSSP  HHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL


DSSP  LLLLLLLLL.LLLLLEELLEE.LLLLHHHHHHHLEEEEEEEEELl
Query NKTQRGTDN.FPFLGAKKSGA.GIQGVKYSIEAMTTVKSVVFDIk  474
ident  |         || | | ||     |           | |     
Sbjct RKITGALVGvQPFGGFKLSGTnAKTGALDYLRLFLEMKAVAERF.  516
DSSP  LLLLLLLLLlLLLLLLHHHLLlLLLLLHHHHHLLEEEEEEEEEL.


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  ...........................llllleeelleeelllleeeeelllllleeeee
Query ...........................tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsv   33
ident                                                             
Sbjct vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee


DSSP  elllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllh
Query pamsteevdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgy   93
ident                                                             
Sbjct apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhlleeeeeeeeeLLEEEEELLLL
Query ksavsevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkkiavvrrepVGLVLAISPFN  153
ident                                                   |    |    
Sbjct eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDET  300
DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELLL


DSSP  LLLHHHHHHHHHH.HHLL.....LEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL...........
Query YPVNLAGSKIAPA.LIAG.....NVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAG...........  196
ident     ||                                |      ||             
Sbjct ADFDLAAEGVVVSaYGFQgqkcsAASRLILTQGAYEPVLERVLKRAERLsvgpaeenpdl  360
DSSP  LLHHHHHHHHHHHhHHHHhllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllhhhllll


DSSP  .......................................LLLL.................
Query .......................................LPAG.................  200
ident                                         |                   
Sbjct gpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiAPTVftevppkariaqeeifg  420
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllLLEEeellllllhhhllllll


DSSP  .LEEELLLLHhhHHHHHHHLL.LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHLLlLLEEEElllleeee
Query .VFNTITGRGseIGDYIVEHQ.AVNFINFTG.STGIGERIGKMAGmRPIMLElggkdsai  257
ident  |   |                               |                      
Sbjct pVLSVIRVKDfaEALEVANDTpYGLTGGVYSrKREHLEWARREFHvGNLYFN........  472
DSSP  lEEEEEEELLhhHHHHHHHLLlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLLlLEEEEL........


DSSP  elllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhh
Query vledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvadelvekirekvlaltignped  317
ident                                                             
Sbjct ............................................................  472
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelleeeellllllhhhllll
Query daditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicpilfdkvttdmrlaweep  377
ident                                                             
Sbjct ............................rkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylr  504
DSSP  ............................llllllllllllllllhhhllllllllhhhhh


DSSP  lllEEEEEEELLhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllll
Query fgpVLPIIRVTSveeaieisnkseyglqasiftndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrg  437
ident                                                             
Sbjct lflEMKAVAERF................................................  516
DSSP  lleEEEEEEEEL................................................


DSSP  lllllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query tdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                                      
Sbjct .....................................  516
DSSP  .....................................


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.6

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct .................mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyig   43
DSSP  .................llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeel


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
ident                                                             
Sbjct gewvdtkermvslnpsapsevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlll  103
DSSP  leeelllleeeeeelleeeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct kaaalmrrrkreleatlvyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpyp  163
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLEEEEEEEHHHHHHHH
Query agmrpimlelgGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGysgqrctAVKRVLVMESVADELV  300
ident            |    |             |                     |       
Sbjct gednesfyvplGAGVVIAPWNFPVAIFTGMIVGPVAV......gNTVIAKPAEDAVVVGA  217
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHL......lLEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelL
Query EKIREKVLALtignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicP  360
ident         |                                                   
Sbjct KVFEIFHEAG.................................................F  228
DSSP  HHHHHHHHHL.................................................L


DSSP  EEEellllllhhhlllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHHlLEELEEEEELlLHHHHHHHH
Query ILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSVEEAIEISNKsEYGLQASIFTnDFPRAFGIA  420
ident                     |         |                           | 
Sbjct PPG.................VVNFLPGVGEEVGAYLVEH.PRIRFINFTG.SLEVGLKIY  269
DSSP  LLL.................LEEELLLLLLHHHHHHHLL.LLLLEEEEEL.LHHHHHHHH


DSSP  HHL........llLEEEEL.........................................
Query EQL........evGTVHIN.........................................  431
ident |                                                           
Sbjct EAAgrlapgqtwfKRAYVEtggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrli  329
DSSP  HHHllllllllllLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct ltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlgg  389
DSSP  eehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct krlegegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggv  449
DSSP  lllllllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeee


DSSP  .....................................................lllLLLL
Query .....................................................nktQRGT  438
ident                                                             
Sbjct ysrkrehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlFLEM  509
DSSP  elllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlLEEE


DSSP  Llllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query Dnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                                     
Sbjct K.............................avaerf  516
DSSP  E.............................eeeeel


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  .................................lllLLEEEL..LEEELLL.....leee
Query .................................tkqYKNYVN..GEWKLSE.....neik   20
ident                                                   |         
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrHYPLYIggEWVDTKErmvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleEELEEEllEEELLLLeeeeeelle


DSSP  EELLlllleeeeeelllhhHHHHHHHHHHHH..........hhhhhhlLHHHHHHHHHHH
Query IYEPasgaelgsvpamsteEVDYVYASAKKA..........qpawralSYIERAAYLHKV   70
ident   |                      |    |                      ||     
Sbjct PSEV........vgttakaGKAEAEAALEAAwkafktwkdwpqedrsrLLLKAAALMRRR  112
DSSP  EEEE........eeeeellLHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHL


DSSP  HHHHHHL.HHHHHhhhhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.eeeehhhll
Query ADILMRD.KEKIGailskevakgyksavsEVVRTAEIINYAAEEGLRMEG.evleggsfe  128
ident    |        |                |            |   |             
Sbjct KRELEATlVYEVG............knwvEASADVAEAIDFIEYYARAALryrypavevv  160
DSSP  HHHHHHHhHHHHL............llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllll


DSSP  hhhlleeeeeeeeeLLEEEEelllllLLHHhHHHHHHHHHLLL.....EEEEELllllHH
Query aaskkkiavvrrepVGLVLAispfnyPVNLaGSKIAPALIAGN.....VIAFKPptqgSI  183
ident                  |                              |||         
Sbjct pypgednesfyvplGAGVVI....apWNFP.VAIFTGMIVGPVavgntVIAKPA....ED  211
DSSP  lllleeeeeeeeelLEEEEE....llLLLL.LHHHHHHHHHHHhllleEEEELL....HH


DSSP  HHhHHHHHHHHHLL.....lllLEEELLL..........lhhhhhhhhhhllllleeeee
Query SGlLLAEAFAEAGL.....pagVFNTITG..........rgseigdyivehqavnfinft  228
ident           |           |                                     
Sbjct AV.VVGAKVFEIFHeagfppgvVNFLPGVgeevgaylvehprirfinftgslevglkiye  270
DSSP  HH.HHHHHHHHHHHhhllllllEEELLLLllhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhhhhhllllleeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleee
Query gstgigerigkmagmrpimlelggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkr  288
ident                                                             
Sbjct aagrlapgqtwfkrayvetggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrlil  330
DSSP  hhllllllllllleeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeee


DSSP  eeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleel
Query vlvmesvadelvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatal  348
ident                                                             
Sbjct tqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggk  390
DSSP  ehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelll


DSSP  lllleelleelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeee
Query teikregnlicpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasi  408
ident                                                             
Sbjct rlegegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggvy  450
DSSP  llllllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeee


DSSP  elllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhleeeee
Query ftndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvks  468
ident                                                             
Sbjct srkrehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlflemk  510
DSSP  lllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlleeee


DSSP  eeeell
Query vvfdik  474
ident       
Sbjct avaerf  516
DSSP  eeeeel