No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.6

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHlLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....
Query ...SISDTVKRAREAFNsGKTR.SLQFRIQQLEALQRMINENLKSISGALASDLG.....   51
ident    |     | || | |      |   |   |         |   |  |   ||      
Sbjct hmsSSQQIAKNARKAGN.ILKTiSNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAvaket   59
DSSP  lllHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhl


DSSP  .......llhhhHHHHLHHHHHHHHHHHHHHhHHHH.LLEELLLLllLLLLEEEEEEEEL
Query .......knewtSYYEEVAHVLEELDTTIKElPDWA.EDEPVAKTrqTQQDDLYIHSEPL  103
ident                      |           |                  ||    | 
Sbjct gladsllkrldlFKGDKFEVMLQGIKDVAEL.EDPVgKVKMAREL..DDGLTLYQVTAPV  116
DSSP  lllhhhhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLlLEEEEEEE..ELLEEEEEEEEEL


DSSP  LEEEEELLLllLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL.......
Query GVVLVIGAWnyPFNLTIQPMVGAVAAGNAVILKPSEVSGHMADLLATLIPQYM.......  156
ident || |||                    ||| |||    |       |              
Sbjct GVLLVIFES..RPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqset  174
DSSP  LEEEEEELL..LLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhh


DSSP  ..LLLLEEELLLlhhHHHHHLLLL..LLEEEEELLHHHHHHHHHHHHlllLLEEEELLLL
Query ..DQNLYLVVKGgvpETTELLKER..FDHIMYTGSTAVGKIVMAAAAkhlTPVTLELGGK  212
ident                    ||      |     || |              ||     | 
Sbjct gvPVGSVQLIET...RVSDLLDQDeyIDLVVPRGSNALVRKIKDTTK...IPVLGHADGI  228
DSSP  llLLLLEEELLL...LLHHHHHLLllLLEEEEELLHHHHHHHHHLLL...LLLLLLLLLL


DSSP  LEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLlllllllllLEEEELHH..HHHHHHHHHHHHHHhhh
Query SPCYVDKDCDLDVACRRIAWGKFMnsgqtcvapDYILCDPS..IQNQIVEKLKKSLKdfy  270
ident    | | | ||  | |     |              |  |         | |        
Sbjct CSIYLDEDADLIKAKRISLDAKTN.....cnamETLLINPKfsKWWEVLENLTLEGG...  280
DSSP  EEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLL.....llllEEEEELLLllLHHHHHHHHHHHHL...


DSSP  lllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllleelLEEELLLL.......
Query gedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryiaPTILVDVD.......  323
ident                                               ||    |       
Sbjct .............................................VTIHATKDlktayfd  295
DSSP  .............................................LLLEELHHhhhhhhh


DSSP  ......lllhhhlllllLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHL
Query ......pqspvmqeeifGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVFSNNEKVIKKMIA  377
ident                          | | | ||| ||             |     |   
Sbjct klnelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMK  355
DSSP  hhhhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHH


DSSP  LLLLLEEEELL.LLHHhhlllllllllhhheelllllhHHHHHLEEEEEEEELLLLLLLL
Query ETSSGGVTAND.VIVHitvptlpfggvgnsgmgayhgkKSFETFSHRRSCLVKSLLNEEA  436
ident    | ||  |                                                  
Sbjct GVDSSGVYWNAsTRFA.....................dVGLDGLVSYQYQIRGDGQVASD  394
DSSP  HLLLLEEEELLlHHHL.....................lLLLHHHEEEEEEEELLLLLLLL


DSSP  Lhhhllllll
Query Hkaryppspa  446
ident           
Sbjct Y.........  395
DSSP  L.........


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ...............lhhhhhhhhhHHHHLlhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ...............sisdtvkrarEAFNSgktrslqfriqqlealqrminenlksisga   45
ident                                                             
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgSNALV..............................  210
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeelLHHHH..............................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeeLLE
Query lasdlgknewtsyyeevahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihsepLGV  105
ident                                                           | 
Sbjct ..........................................rkikdttkipvlghaDGI  228
DSSP  ..........................................hhhhhllllllllllLLL


DSSP  EEEELLLLlLLHHHHHHHHHHHHLL.LEEEEELLLLLHhHHHHHHHHHHH..HLLLL...
Query VLVIGAWNyPFNLTIQPMVGAVAAG.NAVILKPSEVSGhMADLLATLIPQ..YMDQN...  159
ident                     |         |                             
Sbjct CSIYLDEDaDLIKAKRISLDAKTNCnAMETLLINPKFS.KWWEVLENLTLegGVTIHatk  287
DSSP  EEEEELLLlLHHHHHHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLLL.LHHHHHHHHHHhhLLLLEelh


DSSP  ...........................LEEELLLLH.hHHHHHLLLL..lLEEEEEL.LH
Query ...........................LYLVVKGGV.pETTELLKER..fDHIMYTG.ST  188
ident                                                             
Sbjct dlktayfdklnelgklteaiqcktvslDLAAKFVTSteSAIQHINTHssrHTDAIVTeNK  347
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllLLEEEELLLhhHHHHHHLLLlllLEEEEELlLH


DSSP  HHHHHHHHHHhlLLLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllee
Query AVGKIVMAAAakHLTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyi  248
ident |     |         |                                           
Sbjct ANAEKFMKGV..DSSGVYWN........................................  365
DSSP  HHHHHHHHHL..LLLEEEEL........................................


DSSP  eelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeelllee
Query lcdpsiqnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwd  308
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleelleeelllllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelll
Query qssryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnn  368
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhhHHHHleeeeeeee
Query ekvikkmiaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkkSFETfshrrsclv  428
ident                                                             
Sbjct .............................................asTRFA...dvgldg  377
DSSP  .............................................llHHHL...llllhh


DSSP  lllllllllhhhllllll
Query ksllneeahkaryppspa  446
ident                   
Sbjct lvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  heeeeeeeelllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
Query sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyye   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelllllllhhhh
Query evahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigawnypfnlti  120
ident                                                             
Sbjct ..................................hmsssqqiaknarkagnilktisneg   26
DSSP  ..................................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh


DSSP  hhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhhhllllll
Query qpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpettellkerfd  180
ident                                                             
Sbjct rsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgikd   86
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeellLLLEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHLLLLl
Query himytgstavgkivmaaaakhltpvtlelgGKSPCYVDkdCDLDvACRRIAWGKFMNSGq  240
ident                               |                  |          
Sbjct vaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvGVLLVIFE..SRPE.VIANITALSIKSGN.  142
DSSP  hhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelLEEEEEEL..LLLH.HHHHHHHHHHHHLL.


DSSP  lllllLEEEELHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhllllll
Query tcvapDYILCDPSIQNQIVEKLKKslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqk  300
ident                |   |  |                                     
Sbjct ....aAILKGGKESVNTFREMAKI...................................v  163
DSSP  ....eEEEELLHHHHHHHHHHHHH...................................h


DSSP  eEELL.LEELlllEELLEeelllllllhhhllllllLEELEEELLlhhhHHHHHHLLLLL
Query vAHGG.TWDQssrYIAPTilvdvdpqspvmqeeifgPVMPIVCVRsleeAIQFINQREKP  359
ident                 |                           |          | |  
Sbjct nDTIAqFQSE...TGVPV..................GSVQLIETR....VSDLLDQDEYI  198
DSSP  hHHHHhHHHH...HLLLL..................LLEEELLLL....LHHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHLLLLLlEEEEL................................
Query LALYVFSnNEKVIKKMIAETSSgGVTAN................................  387
ident               |    |    |                                   
Sbjct DLVVPRG.SNALVRKIKDTTKI.PVLGHadgicsiyldedadlikakrisldaktncnam  256
DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHLLLL.LLLLLlllleeeeelllllhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  387
ident                                                             
Sbjct etllinpkfskwwevlenltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldl  316
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllll


DSSP  ........................................................LLLH
Query ........................................................DVIV  391
ident                                                             
Sbjct aakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLD  376
DSSP  eeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLH


DSSP  Hhhlllllllllhhheelllllhhhhhhleeeeeeeelllllllllhhhllllll
Query Hitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
ident                                                        
Sbjct G....................................lvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  H....................................heeeeeeeelllllllll