No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=48.9

DSSP  llllllllllllllllhhHHHHHhhhHHHHhhlLLEEELEEELLEEELL..LLEEEEEEL
Query mtvepfrnepietfqteeARRAMreaLRRVreeFGRHYPLYIGGEWVDT..KERMVSLNP   58
ident                   |  |                   |  || |          ||
Sbjct ..................AVPAP...NQQP...EVFCNQIFINNEWHDAvsRKTFPTVNP   36
DSSP  ..................LLLLL...LLLL...LLLLLLEEELLEEELLllLLEEEEEEL


DSSP  LEEeEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHH...HHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHH
Query SAPsEVVGTTAKAGKAEAEAALEAAWKAFK...TWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRE  115
ident |   ||    |   |     |  ||  ||     |       | |||   | |  |    
Sbjct STG.EVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTY   95
DSSP  LLL.EEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLLLLLLLEEEEEEEEEL
Query LEATLVYEVGKNWVEAS.ADVAEAIDFIEYYARAALRYRypAVEVVPYPGEDNESFYVPL  174
ident | |      ||  |     |         |||  |  |                    | 
Sbjct LAALETLDNGKPYVISYlVDLDMVLKCLRYYAGWADKYH..GKTIPIDGDFFSYTRHEPV  153
DSSP  HHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL..LLEELLLLLEEEEEEEEEL


DSSP  LEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEE
Query GAGVVIAPWNFPVAIFTGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAGFPPGVVN  234
ident |    | |||||            | || |  | ||        |     ||||||||||
Sbjct GVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVN  213
DSSP  LEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEE


DSSP  ELLLLLLHHHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLlllllLLEEEEELLLLEE
Query FLPGVGEEVGAYLVEHPRIRFINFTGSLEVGLKIYEAAGRLApgqtwFKRAYVETGGKNA  294
ident   || |   ||    |       |||| | |  |  |||         ||   | |||  
Sbjct IVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSN.....LKRVTLELGGKSP  268
DSSP  ELLLLLLLHHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEEEELLLLEE


DSSP  EEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLH
Query IIVDETADFDLAAEGVVVSAYGFQGQKCSAASRLILTQGAYEPVLERVLKRAERLSVGPA  354
ident  |    || | | |         |||   | ||       |    ||   ||    ||  
Sbjct NIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCSCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNP  328
DSSP  EEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL


DSSP  HHL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLL.LEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLH
Query EEN.PDLGPVVSAEQERKVLSYIEIGKNE.GQLVLGGKRLEGEGYFIAPTVFTEVPPKAR  412
ident        || |   |  | | ||  || |   |  ||      |||| ||||  |     
Sbjct FDSkTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEgAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMT  388
DSSP  LLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlLEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLH


DSSP  HHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL
Query IAQEEIFGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSRKREHLEWARREFHVGNLYFN  472
ident || |||||||      |   |    ||   |||   |                 |    |
Sbjct IAKEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVN  448
DSSP  HHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL


DSSP  LLlLLLLLLlLLLLLLHHHLLlLLLLLHHHHHLLEEEEEEEEEL.....
Query RKiTGALVGvQPFGGFKLSGTnAKTGALDYLRLFLEMKAVAERF.....  516
ident            |||| | ||          |    | | |         
Sbjct CY.DVFGAQ.SPFGGYKMSGS.GRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVpqkns  494
DSSP  LL.LLLLLL.LLLLLLHHHEE.LLLLLHHHHHHHEEEEEEEEELlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee
Query vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
ident                                                             
Sbjct .................avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevic   43
DSSP  .................llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeee


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll
Query apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
ident                                                             
Sbjct qvaegdkedvdkavkaaraafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletld  103
DSSP  eeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeellLLEEEEELLL
Query eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetgGKNAIIVDET  300
ident                                                   |    |    
Sbjct ngkpyvisylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvGVCGQIIPWN  163
DSSP  hlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelLEEEEELLLL


DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllhhhllll
Query aDFDLAAEGVVVSAYGFQGqkcsaaSRLILTQGAYEPVLERVLKRAERLsvgpaeenpdl  360
ident     |        |                        |       |             
Sbjct .FPLLMQAWKLGPALATGN.....vVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAG...........  206
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL...........


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllLLEEeellllllhhhllllll
Query gpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiAPTVftevppkariaqeeifg  420
ident                                         |                   
Sbjct .......................................FPPG.................  210
DSSP  .......................................LLLL.................


DSSP  lEEEEEEElLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL...lLEEEEL.....
Query pVLSVIRVkDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSrKREHLEWARREFH...vGNLYFN.....  472
ident  |           |                    |                         
Sbjct .VVNIVPG.FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTG.STEIGRVIQVAAGssnlKRVTLElggks  267
DSSP  .LEEELLL.LLLLHHHHHHLLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhlllLEEEEElllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct pniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqediydefversvaraksrvvgn  327
DSSP  eeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct pfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgm  387
DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllllllllleeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct tiakeeifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwv  447
DSSP  hhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeee


DSSP  ............................llLLLLLLLlllllllhhhllllllllhhhhh
Query ............................rkITGALVGvqpfggfklsgtnaktgaldylr  504
ident                                                             
Sbjct ncydvfgaqspfggykmsgsgrelgeyglqAYTEVKT.......................  484
DSSP  lllllllllllllllhhheelllllhhhhhHHEEEEE.......................


DSSP  lleeeeeeeeel
Query lflemkavaerf  516
ident             
Sbjct ..vtvkvpqkns  494
DSSP  ..eeeellllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............................llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ..............................mtvepfrnepietfqteearramrealrrv   30
ident                                                             
Sbjct raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh


DSSP  hhllleeeleeelleeelllleeeeeelleeeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query reefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsapsevvgttakagkaeaeaaleaawkafktw   90
ident                                                             
Sbjct kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query kdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatlvyevgknwveasadvaeaidfieyyaraal  150
ident                                                             
Sbjct nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell


DSSP  hhlllllllllllleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHHHHLLL.....eE
Query ryrypavevvpypgednesfyvplGAGVVIAPWN.FPVAIFTGMIVGPVAVGN.....tV  204
ident                         |    |                              
Sbjct teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSDaDMDWAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleE


DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....................................
Query IAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAG.....................................  227
ident      ||                                                     
Sbjct RTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ................LLLL.................LEEELLLLLLHHHHHHHLLL.LL
Query ................FPPG.................VVNFLPGVGEEVGAYLVEHP.RI  253
ident                                      |   |     |            
Sbjct llcgggiaadrgyfiqPTVFgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFKTIEEVVGRANNStYG  420
DSSP  eeelllllllllllllLEEEellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLlLL


DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHllllllllllLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhh
Query RFINFTG.SLEVGLKIYEAAgrlapgqtwfKRAYVEtggknaiivdetadfdlaaegvvv  312
ident          |        |               |                         
Sbjct LAAAVFTkDLDKANYLSQAL........qaGTVWVN........................  448
DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHL........llLEEEEL........................


DSSP  hhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhh
Query saygfqgqkcsaasrliltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkv  372
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhh
Query lsyieigknegqlvlggkrlegegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfa  432
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhl
Query ealevandtpygltggvysrkrehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsg  492
ident                                                             
Sbjct ......................................cydvfgaqspfggykmsgsgre  470
DSSP  ......................................llllllllllllllhhheelll


DSSP  lllllllhhhhhlleeeeeeeeel
Query tnaktgaldylrlflemkavaerf  516
ident                         
Sbjct lgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
DSSP  llhhhhhhheeeeeeeeellllll