No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=37.9

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhHHHHHHHH
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreEVERTLDV   60
ident                                                         |   
Sbjct ....................................................SISDTVKR    8
DSSP  ....................................................LHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHHLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH.HHHHHHH
Query LFKRGRWSARDmPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAVG.EVKAAVD  119
ident                 |   |      |  ||      |    ||        ||     
Sbjct AREAFNSGKTR.SLQFRIQQLEALQRMINENLKSISGALASDLGKNEWTSYYeEVAHVLE   67
DSSP  HHHHHHLLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHhLHHHHHH


DSSP  HHHLLLHHH.HHLLLEeeellllllllleeeeEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHH
Query RLRLAELDL.KKIGGDyipgdwtydtleteglVRREPLGVVAAITPFNYPLFDAVNKITY  178
ident  |      |                          ||||||  |   |||          
Sbjct ELDTTIKELpDWAEDE..pvaktrqtqqddlyIHSEPLGVVLVIGAWNYPFNLTIQPMVG  125
DSSP  HHHHHHHHHhHHHLLE..elllllllllleeeEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLLEEELLLLHHHLHHHHLLLlLLEEE
Query SFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAgFPPDAIALLNLPGKEAEKIVADDrVAAVS  238
ident     ||||  |||      |                         |              
Sbjct AVAAGNAVILKPSEVSGHMADLLATLIPQY.MDQNLYLVVKGGVPETTELLKER.FDHIM  183
DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLEEELLLLHHHHHHHLLLL.LLEEE


DSSP  EELLHHHHHHHHHHHL..LLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query FTGSTEVGERVVKVGG..VKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSYAGQRCD  296
ident  |||| ||  |             ||||  |  |  | ||| |   || |     || | 
Sbjct YTGSTAVGKIVMAAAAkhLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDVACRRIAWGKFMNSGQTCV  243
DSSP  EELLHHHHHHHHHHHHllLLLEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL


DSSP  LEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLL....LLLLlllllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSL....RVGDprdptVDVGPLISPSAVDEMMAAIED  352
ident |    |         ||   | |                 | |  |           |  
Sbjct APDYILCDPSIQNQIVEKLKKSLKDFygedAKQS.....RDYGRIINDRHFQRVKGLIDN  298
DSSP  LLLEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllHHHL.....LLLLLLLLHHHHHHHHHLLLL


DSSP  hhhllLEEEELLLEEE.LLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHH
Query avekgGRVLAGGRRLG.PTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVALAVEVKDLDQAI  411
ident        |  ||       |  ||                 | | ||   | |  |  ||
Sbjct .....QKVAHGGTWDQsSRYIAPTILVDV...DPQSPVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAI  350
DSSP  .....LLEEELLLEELlLLEELLEEELLL...LLLLHHHLLLLLLLEELEEELLLHHHHH


DSSP  HHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL.LLLLLLLLLLEELLEELL
Query ELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPR.HGIGYYPFGGRKKSGVFR  470
ident    | |   |   ||      |         |    ||          ||||   ||   
Sbjct QFINQREKPLALYVFSNNEKVIKKMIAETSSGGVTANDVIVhITVPTLPFGGVGNSGMGA  410
DSSP  HHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLEEEELLLLHhHHLLLLLLLLLHHHEELL


DSSP  LLLLLLHHHHEEEEE.......eeeellllllllll
Query EGIGYAVEAVTAYKT.......ivfnykgkgvwkye  499
ident        |                            
Sbjct YHGKKSFETFSHRRSclvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  LLLHHHHHHLEEEEEeeelllllllllhhhllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.6

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct ..........sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdl   50
DSSP  ..........lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllHHHHHL..LLEeeellllllllleeeeEE..........................
Query lrlaeLDLKKI..GGDyipgdwtydtleteglVR..........................  152
ident                                                             
Sbjct gknewTSYYEEvaHVL................EEldttikelpdwaedepvaktrqtqqd   94
DSSP  lllhhHHHHHLhhHHH................HHhhhhhhhhhhhhlleellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  152
ident                                                             
Sbjct dlyihseplgvvlvigawnypfnltiqpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipq  154
DSSP  eeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................................................eeeLLEEE
Query ....................................................repLGVVA  160
ident                                                         |   
Sbjct ymdqnlylvvkggvpettellkerfdhimytgstavgkivmaaaakhltpvtlelGGKSP  214
DSSP  hllllleeellllhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeelLLLLE


DSSP  EELLLL.LLLHHHHHHHHHHHH....LLLE.EEEELLLLLLHHHHHHHHH..........
Query AITPFN.YPLFDAVNKITYSFI....YGNA.VVVKPSISDPLPAAMAVKA..........  204
ident                     |        |        |         |           
Sbjct CYVDKDcDLDVACRRIAWGKFMnsgqTCVApDYILCDPSIQNQIVEKLKKslkdfygeda  274
DSSP  EEELLLlLHHHHHHHHHHHHHLllllLLLLlLEEEELHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllh


DSSP  ....................................hhhLLLL.................
Query ....................................lldAGFP.................  211
ident                                                             
Sbjct kqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryIAPTilvdvdpqspvmqeeif  334
DSSP  hhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllleELLEeelllllllhhhlllll


DSSP  LLLEEELLLLH.HHLHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLLLEEEeelllleee
Query PDAIALLNLPG.KEAEKIVA.DDRVAAVSFTG.STEVGERVVKVGGVKQYVmelgggdpa  268
ident              ||           |         |                       
Sbjct GPVMPIVCVRSlEEAIQFINqREKPLALYVFSnNEKVIKKMIAETSSGGVT.........  385
DSSP  LLEELEEELLLhHHHHHHHHlLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHLLLLLLEEE.........


DSSP  eelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query ivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpvygklveevakrlsslrvgdpr  328
ident                                                             
Sbjct ............................................................  385
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeelleelleeeellhhhhlllh
Query dptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmv  388
ident                                                             
Sbjct ............................................................  385
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeel
Query lykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfgrdvvkirravrllevgaiyin  448
ident                                                             
Sbjct ............................................................  385
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllleelleelllllllLHHHhEEEE........................
Query dmprhgigyypfggrkksgvfregigyAVEAvTAYK........................  484
ident                                                             
Sbjct ........................andVIVH.ITVPtlpfggvgnsgmgayhgkksfetf  420
DSSP  ........................ellLLHH.HHLLlllllllhhheelllllhhhhhhl


DSSP  ...........eeeeellllllllll
Query ...........tivfnykgkgvwkye  499
ident                           
Sbjct shrrsclvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  eeeeeeeelllllllllhhhllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh
Query lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
ident                                                             
Sbjct ........................................sisdtvkrareafnsgktrs   20
DSSP  ........................................lhhhhhhhhhhhhhllhhhl


DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee
Query iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
ident                                                             
Sbjct lqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyyeevahvleeldttikelpdwa   80
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeellLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLEEE
Query gstevgervvkvggvkqyvmelgGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSyagqrcdAIKL  300
ident                        |    |        |                      
Sbjct edepvaktrqtqqddlyihseplGVVLVIGAWNYPFNLTIQPMVGAVAA......gNAVI  134
DSSP  lleelllllllllleeeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHL......lLEEE


DSSP  EEEEHH...HHHHHHHhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query VLAERP...VYGKLVEevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekg  357
ident              |                                              
Sbjct LKPSEVsghMADLLAT............................................  150
DSSP  EELLLLlhhHHHHHHH............................................


DSSP  leEEELlleeelleelLEEEellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHLl
Query grVLAGgrrlgptyvqPTFVeapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVKDlDQAIELANGr  417
ident                                           | |         ||    
Sbjct .lIPQY..........MDQN....................LYLVVKGGV.PETTELLKE.  177
DSSP  .hHHHH..........LLLL....................LEEELLLLH.HHHHHHLLL.


DSSP  lEELEEEEELlLHHHHHHHHHHL..LLLEEEEL...........................
Query pYGLDAAVFGrDVVKIRRAVRLL..EVGAIYIN...........................  448
ident          |                                                  
Sbjct .RFDHIMYTG.STAVGKIVMAAAakHLTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkf  235
DSSP  .LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct mnsgqtcvapdyilcdpsiqnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkgl  295
DSSP  llllllllllleeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct idnqkvahggtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinq  355
DSSP  llllleeellleelllleelleeelllllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct rekplalyvfsnnekvikkmiaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkk  415
DSSP  llllleeeeelllhhhhhhhhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhh


DSSP  ..llLLLLLllllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll
Query ..dmPRHGIgyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
ident       |                                              
Sbjct sfetFSHRR......................sclvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  hhhhLEEEE......................eeeelllllllllhhhllllll