No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.3

DSSP  .................................................lLLHHHHHHHH
Query .................................................hMSSSQQIAKN   11
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsREEVERTLDV   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllHHHHHHHHHH


DSSP  HH.HHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhL
Query AR.KAGNILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAvaketgladsllkrlD   70
ident                 |   | |  |    |     |                       
Sbjct LFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAG...........kpksA  109
DSSP  HHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL...........llhhH


DSSP  LLLllHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLEEEEEEE.....ELLEEEEEEEEELLEEEEEELL
Query LFKgdKFEVMLQGIKDVAELEDPvgKVKMAREL.....DDGLTLYQVTAPVGVLLVIFES  125
ident                                                  | ||   |   
Sbjct AVG..EVKAAVDRLRLAELDLKK..IGGDYIPGdwtydTLETEGLVRREPLGVVAAITPF  165
DSSP  HHH..HHHHHHHHHHLLLHHHHH..LLLEEEELlllllLLLEEEEEEEEELLEEEEELLL


DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLLLLLEEE
Query ..RPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqsetgVPVGSVQL  183
ident         |    |   |||   |             |   |           |     |
Sbjct nyPLFDAVNKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAG........FPPDAIAL  217
DSSP  llLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL........LLLLLEEE


DSSP  LLLL...LHHHHHLLlLLLEEEEELLHHHHHHHHHLLL.LLLLL................
Query IETR...VSDLLDQDeYIDLVVPRGSNALVRKIKDTTK.IPVLG................  223
ident               |     |   ||                                  
Sbjct LNLPgkeAEKIVADD.RVAAVSFTGSTEVGERVVKVGGvKQYVMelgggdpaivledadl  276
DSSP  LLLLhhhLHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLlLEEEEelllleeeeelllllh


DSSP  .............llllleeeeelllLLHHHHHhhhhhlllllllleeeeellllllhhh
Query .............hadgicsiyldedADLIKAKrisldaktncnametllinpkfskwwe  270
ident                           |                                 
Sbjct dlaadkiargiysyagqrcdaiklvlAERPVYG.......klveevakrlsslrvgdprd  329
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeEEHHHHH.......hhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  hhhhhhhhhlllleeLHHHHHHH..hhhHHHH..................llllHHHH.L
Query vlenltleggvtihaTKDLKTAY..fdkLNEL..................gkltEAIQ.C  309
ident                                |                            
Sbjct ptvdvgplispsavdEMMAAIEDavekgGRVLaggrrlgptyvqptfveapadrVKDMvL  389
DSSP  llllllllllhhhhhHHHHHHHHhhhllLEEEellleeelleelleeeellhhhHLLLhH


DSSP  LLL..........................LLLLeeeelllhhhhhhhhllllllleeeee
Query KTV..........................SLDLaakfvtstesaiqhinthssrhtdaiv  343
ident                                                             
Sbjct YKRevfapvalavevkdldqaielangrpYGLD....aavfgrdvvkirravrllevgai  445
DSSP  HHLllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllEELE....eeeelllhhhhhhhhhhllllee


DSSP  lllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllLLHHHEEEEEEEELLlLLLLL...l
Query tenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadvGLDGLVSYQYQIRGDgQVASD...y  395
ident                                      |                 
Sbjct yindmprhgigyypfggrkksgvfregigyAVEAVTAYKTIVFNY.KGKGVwkye  499
DSSP  eellllllllllllllleelleelllllllLHHHHEEEEEEEEEL.LLLLLllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=12.3

DSSP  .....................................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query .....................................hmsssqqiaknarkagnilktis   23
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhh
Query negrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqg   83
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlle
Query ikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvllvifesrpevianitalsiksgna  143
ident                                                             
Sbjct lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllhhhhhlllllleeee
Query ailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgsvqlietrvsdlldqdeyidlvvp  203
ident                                                             
Sbjct iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee


DSSP  ellhhhhhhhhhlllllllllLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLL..LLLL...EE
Query rgsnalvrkikdttkipvlghADGICSIYLDEDADLIKAKRISLDAKTN..CNAM...ET  258
ident                        |       |||||  |                     
Sbjct gstevgervvkvggvkqyvmeLGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSyaGQRCdaiKL  300
DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeeLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLlleEE


DSSP  EEELLLLllHHHHHHHHHHHHL......................................
Query LLINPKFskWWEVLENLTLEGG......................................  280
ident  |            |                                             
Sbjct VLAERPV..YGKLVEEVAKRLSslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekgg  358
DSSP  EEEEHHH..HHHHHHHHHHHHHlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ...............LLLEELHHhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHH
Query ...............VTIHATKDlktayfdklnelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTE  325
ident                 |                                   |  |    
Sbjct rvlaggrrlgptyvqPTFVEAPA..........drvkdmvlykrevfAPVALAVEVKDLD  408
DSSP  eeeellleeelleelLEEEELLH..........hhhlllhhhhllllLLEEEEEEELLHH


DSSP  HHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHHHLL.............
Query SAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDSSGVYWNASTRFAD.............  372
ident  ||   |        |                     | |   |                
Sbjct QAIELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGIgyypfggrkksgv  468
DSSP  HHHHHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLllllllleellee


DSSP  ........lllhhheeeeeeeelllllllll
Query ........vgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
ident                                
Sbjct fregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
DSSP  llllllllhhhheeeeeeeeellllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee
Query ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
ident                                                             
Sbjct ..........................agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeiev   34
DSSP  ..........................lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeee


DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhHHHH.............................
Query vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnALVR.............................  211
ident                                                             
Sbjct kspidlatiakvispsreevertldvlFKRGrwsardmpgterlavlrkaadiiernldv   94
DSSP  elllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhHHLHhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh


DSSP  ...............................................hhhhlllllllll
Query ...............................................kikdttkipvlgh  224
ident                                                             
Sbjct faevlvmnagkpksaavgevkaavdrlrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrre  154
DSSP  hhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeee


DSSP  lLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLL.LLHHHHHHHHHHHhLLLL
Query aDGICSIYLDEDADLIKAKRISLDAKTNCnAMETLLINPKF.SKWWEVLENLTLEgGVTI  283
ident   |           |  |                                 |    |   
Sbjct pLGVVAAITPFNYPLFDAVNKITYSFIYG.NAVVVKPSISDpLPAAMAVKALLDA.GFPP  212
DSSP  eLLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LEEEEELLLLLlHHHHHHHHHHHHL.LLLL


DSSP  EelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllLLEEEELLLhHHHHHHHLLLLllLEEEEE
Query HatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvslDLAAKFVTStESAIQHINTHSsrHTDAIV  343
ident                                  |         |                
Sbjct D..............................AIALLNLPG.KEAEKIVADDR.vAAVSFT  240
DSSP  L..............................LEEELLLLH.HHLHHHHLLLL.lLEEEEE


DSSP  LlLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL......................................
Query TeNKANAEKFMKGVDSSGVYWN......................................  365
ident        |   |                                                
Sbjct G.STEVGERVVKVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaik  299
DSSP  L.LHHHHHHHHHHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct lvlaerpvygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggr  359
DSSP  eeeeehhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct vlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpy  419
DSSP  eeellleeelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllle


DSSP  .........................................................llH
Query .........................................................asT  368
ident                                                             
Sbjct gldaavfgrdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveA  479
DSSP  eleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhH


DSSP  HHLLlllhhheEEEEEE...ELLLLlllll
Query RFADvgldglvSYQYQI...RGDGQvasdy  395
ident   |                           
Sbjct VTAY.....ktIVFNYKgkgVWKYE.....  499
DSSP  HEEE.....eeEEEELLlllLLLLL.....


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  ...................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query ...................hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkan   41
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHLLL.........
Query ahaieeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaELED.........   92
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpkSAAVgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhHHHHhhhhhhhhh


DSSP  ................................................llLLEEE.....
Query ................................................pvGKVKM.....   99
ident                                                     |       
Sbjct lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfDAVNKitysf  180
DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhHHHHHhhhhh


DSSP  ..............................................eeeeELLEEEEEEE
Query ..............................................arelDDGLTLYQVT  113
ident                                                   ||       |
Sbjct iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaDDRVAAVSFT  240
DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlLLLLLEEEEE


DSSP  E....................eLLEEEEEEL..LLLH.HHHHHHHHHHH....HLLE.EE
Query A....................pVGVLLVIFE..SRPE.VIANITALSIK....SGNA.AI  145
ident                        |    |             |             |   
Sbjct GstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLedADLDlAADKIARGIYSyagqRCDAiKL  300
DSSP  LlhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEE


DSSP  EELLHHHHHHHHHHHHHHHHH.......................................
Query LKGGKESVNTFREMAKIVNDT.......................................  166
ident             |                                               
Sbjct VLAERPVYGKLVEEVAKRLSSlrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrv  360
DSSP  EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  .HHHHHHH..HLLLL.....................LLEEELLLL....LHHHHHLLLLL
Query .IAQFQSE..TGVPV.....................GSVQLIETR....VSDLLDQDEYI  198
ident              |                            |         |     | 
Sbjct lAGGRRLGptYVQPTfveapadrvkdmvlykrevfaPVALAVEVKdldqAIELANGRPYG  420
DSSP  eELLLEEEllEELLEeeellhhhhlllhhhhlllllLEEEEEEELlhhhHHHHHHLLLEE


DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHLLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhllllllll
Query DLVVPRG.SNALVRKIKDTTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnam  256
ident       |      |                                              
Sbjct LDAAVFGrDVVKIRRAVRLLEVgAIYI.................................  447
DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE.................................


DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllll
Query etllinpkfskwwevlenltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldl  316
ident                                                             
Sbjct ............................................................  447
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLH
Query aakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLD  376
ident                                                             
Sbjct .....................................................ndmPRHG  454
DSSP  .....................................................lllLLLL


DSSP  .............hheeeeeeeelllllLLLL.............
Query .............glvsyqyqirgdgqvASDY.............  395
ident                                              
Sbjct igyypfggrkksgvfregigyaveavtaYKTIvfnykgkgvwkye  499
DSSP  lllllllleelleellllllllhhhheeEEEEeeellllllllll