No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=39.8

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhHHHHHHHHHHHHH.HHHHhLL
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteEVDYVYASAKKAQ.PAWRaLS   59
ident                                                |  |        |
Sbjct .......................................SISDTVKRAREAFnSGKT.RS   20
DSSP  .......................................LHHHHHHHHHHHHhLLHH.HL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHLLL.
Query YIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVS.EVVRTAEIINYAAEEGLRM.  117
ident    |   |             |   |     |        ||    |       |     
Sbjct LQFRIQQLEALQRMINENLKSISGALASDLGKNEWTSYYeEVAHVLEELDTTIKELPDWa   80
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  LLEEEEHHhllHHHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL
Query EGEVLEGGsfeAASKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAGNVIAFKP  177
ident | |                    || | || |   ||| ||       |  |||    ||
Sbjct EDEPVAKT...RQTQQDDLYIHSEPLGVVLVIGAWNYPFNLTIQPMVGAVAAGNAVILKP  137
DSSP  LLEELLLL...LLLLLLEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLEEELLLLHhHHHHHHHHLLlLLEEEEELLHHHHHHH
Query PTQGSISGLLLAEAFAEAgLPAGVFNTITGRGsEIGDYIVEHQaVNFINFTGSTGIGERI  237
ident          |||                 |                 |  ||||  |   
Sbjct SEVSGHMADLLATLIPQY.MDQNLYLVVKGGV.PETTELLKER.FDHIMYTGSTAVGKIV  194
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLEEELLLLH.HHHHHHLLLL.LLEEEEELLHHHHHHH


DSSP  HHHLL..LLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHH
Query GKMAG..MRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTAVKRVLVMESV  295
ident    |     |  ||||||    |  | ||      |  | |  ||| | |    |   | 
Sbjct MAAAAkhLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDVACRRIAWGKFMNSGQTCVAPDYILCDPSI  254
DSSP  HHHHHllLLLEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEELHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLL...LLLLhhHLLLlLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhlllEELLLLL
Query ADELVEKIREKVLAL...TIGNpeDDADiTPLIDTKSADYVEGLINDAndkgaTALTEIK  352
ident     |||                         |       | |||               
Sbjct QNQIVEKLKKSLKDFygeDAKQ..SRDY.GRIINDRHFQRVKGLIDNQ.....KVAHGGT  306
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhllLHHH..LLLL.LLLLLHHHHHHHHHLLLLL.....LEEELLL


DSSP  EEL..LEELLEEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEEL
Query REG..NLICPILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFT  410
ident        | |     |        || |||| ||  | | ||||   |  |  |    | 
Sbjct WDQssRYIAPTILVDVDPQSPVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVFS  366
DSSP  EELllLEELLEEELLLLLLLHHHLLLLLLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEL


DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL.LLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHHHHLEEEEEE
Query NDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKTQ.RGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSIEAMTTVKSV  469
ident |              | |  |           || |   || |    | | |      | 
Sbjct NNEKVIKKMIAETSSGGVTANDVIVhITVPTLPFGGVGNSGMGAYHGKKSFETFSHRRSC  426
DSSP  LLHHHHHHHHLLLLLLEEEELLLLHhHHLLLLLLLLLHHHEELLLLLHHHHHHLEEEEEE


DSSP  EEELL...............
Query VFDIK...............  474
ident                     
Sbjct LVKSLlneeahkaryppspa  446
DSSP  EELLLllllllhhhllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ................sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisg   44
DSSP  ................lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLHHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevAKGYKSavSEVVrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct alasdlgknewtsyyeevahvleeldttiKELPDW.aEDEP...................   84
DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHHHH.hLLEE...................


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................   84
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhHHHHHLLlllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeAFAEAGLpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct ........vaKTRQTQQ...........................................   93
DSSP  ........llLLLLLLL...........................................


DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLlLHHHH.HHHHhHHHHHhhhlLLLLeEEEEEEHH...HH
Query agmrpimlelgGKDSAIVLEDaDLELT.AKNIiAGAFGysgqRCTAvKRVLVMES...VA  296
ident            |    |                 ||         |       |     |
Sbjct .ddlyihseplGVVLVIGAWN.YPFNLtIQPM.VGAVA....AGNA.VILKPSEVsghMA  145
DSSP  .leeeeeeeelLEEEEELLLL.LLLHHhHHHH.HHHHH....LLLE.EEEELLLLlhhHH


DSSP  HHHHHHhHHHHhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleell
Query DELVEKiREKVlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregn  356
ident | |                                                         
Sbjct DLLATL.IPQY.................................................  155
DSSP  HHHHHH.HHHH.................................................


DSSP  eelLEEEellllllhhhlllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHHllEELEEEEELlLHHHH
Query licPILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSvEEAIEISNKseYGLQASIFTnDFPRA  416
ident                                    |  |                     
Sbjct ...MDQN.................LYLVVKGGV.PETTELLKE..RFDHIMYTG.STAVG  191
DSSP  ...LLLL.................LEEELLLLH.HHHHHHLLL..LLLEEEEEL.LHHHH


DSSP  HHHHHHL..LLLEEEEL...........................................
Query FGIAEQL..EVGTVHIN...........................................  431
ident              |                                              
Sbjct KIVMAAAakHLTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyilcd  251
DSSP  HHHHHHHhlLLLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct psiqnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqss  311
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct ryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnnekv  371
DSSP  leelleeelllllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhh


DSSP  .............................................lllLLLLLlllllle
Query .............................................nktQRGTDnfpflga  446
ident                                                             
Sbjct ikkmiaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetFSHRR.......  424
DSSP  hhhhhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhhhhhhLEEEE.......


DSSP  elleellllhhhhhhhleeeEEEEeell
Query kksgagiqgvkysieamttvKSVVfdik  474
ident                             
Sbjct ...sclvksllneeahkaryPPSP...a  446
DSSP  ...eeeelllllllllhhhlLLLL...l


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.8

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLH
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawraLSY   60
ident                                                          |  
Sbjct ........sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdLGK   52
DSSP  ........lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLL


DSSP  H...........................................................
Query I...........................................................   61
ident                                                             
Sbjct Newtsyyeevahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigaw  112
DSSP  Lhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelll


DSSP  ................hhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhh
Query ................eraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtae  105
ident                                                             
Sbjct nypfnltiqpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpett  172
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhlleeeeeeeeelLEEEEELLL.LLLLHHHHHHHH
Query iinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkkiavvrrepvGLVLAISPF.NYPVNLAGSKIA  164
ident                                       |                     
Sbjct ellkerfdhimytgstavgkivmaaaakhltpvtlelgGKSPCYVDKdCDLDVACRRIAW  232
DSSP  hhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeellLLLEEEELLlLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLL.....eEEEELLLLLHHHHHHHHHH............................
Query PALIAGN.....vIAFKPPTQGSISGLLLAEA............................  191
ident                                                             
Sbjct GKFMNSGqtcvapDYILCDPSIQNQIVEKLKKslkdfygedakqsrdygriindrhfqrv  292
DSSP  HHHLLLLllllllLEEEELHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhh


DSSP  ........hHHHL...........................llllLEEELLLLHHHHHHHH
Query ........fAEAG...........................lpagVFNTITGRGSEIGDYI  216
ident          |  |                               |      |  |     
Sbjct kglidnqkvAHGGtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpVMPIVCVRSLEEAIQF  352
DSSP  hhlllllleEELLleelllleelleeelllllllhhhlllllllEELEEELLLHHHHHHH


DSSP  HH.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHLLLLLEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhh
Query VE.HQAVNFINFTG.STGIGERIGKMAGMRPIMlelggkdsaivledadleltakniiag  274
ident                                                             
Sbjct INqREKPLALYVFSnNEKVIKKMIAETSSGGVT...........................  385
DSSP  HHlLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHLLLLLLEEE...........................


DSSP  hhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhh
Query afgysgqrctavkrvlvmesvadelvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyve  334
ident                                                             
Sbjct ............................................................  385
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllleellllleelleelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhh
Query glindandkgatalteikregnlicpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeai  394
ident                                                             
Sbjct ............................................................  385
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleelll
Query eisnkseyglqasiftndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiq  454
ident                                                             
Sbjct ...................andvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetfshrrsc  426
DSSP  ...................ellllhhhhlllllllllhhheelllllhhhhhhleeeeee


DSSP  lhhhhhhhleeeeeeeeell
Query gvkysieamttvksvvfdik  474
ident                     
Sbjct lvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  eelllllllllhhhllllll