No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=54.6

DSSP  lllllllllllLLLLEEELLEEELLLLlLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHH
Query avpapnqqpevFCNQIFINNEWHDAVSrKTFPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAA   60
ident                  || |          |  || || |    ||   | || || ||
Sbjct ...........MQHKLLINGELVSGEG.EKQPVYNPATGDVLLEIAEASAEQVDAAVRAA   48
DSSP  ...........LLLLEEELLEEELLLL.LEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHLHHHHHH
Query RAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVL  120
ident  |||     |       |   |  ||| ||      | ||    |||             
Sbjct DAAFA...EWGQTTPKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFNDEIPAIV  105
DSSP  HHHHH...HHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLEEL.LLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL
Query KCLRYYAGWADKYHGKTIP.IDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALAT  179
ident    |  || |    |           |  |  | ||   | ||| || | |||| |||| 
Sbjct DVFRFFAGAARCLNGLAAGeYLEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMAAWKLAPALAA  165
DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLLLEeEELLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHhLLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHLLLLLLEEEEEL
Query GNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEaGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTG  239
ident || || |  | ||||||  | | |   || |||||  | | | |     |  |  |  ||
Sbjct GNCVVLKPSEITPLTALKLAELAKD.IFPAGVVNILFGRGKTVGDPLTGHPKVRMVSLTG  224
DSSP  LLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEELLLLLLLLHHHHHLLLLEEEEEEEL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHlLLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLE
Query STEIGRVIQVAAGSsNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCSCAG  299
ident |   |  |     |   ||   ||||| | |   |||    ||        | ||   | 
Sbjct SIATGEHIISHTAS.SIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQDCTAA  283
DSSP  LHHHHHHHHHHHHH.HLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLLLLLL


DSSP  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.L
Query SRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQE.G  358
ident  |   |  |||  ||   |       | | |  || ||                 |    
Sbjct CRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVATLKSGAPDDESTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAKATgH  343
DSSP  LEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlL


DSSP  LEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLL
Query AKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNST  418
ident  |   ||      ||   ||          |   | ||||     |   | ||  || | 
Sbjct IKVITGGEKRKGNGYYYAPTLLAGALQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQ  403
DSSP  LEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHEELLLLLHHHHHH
Query YGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQA  478
ident ||||  | |||   |   |  || |  |||         | || | || |     |||  
Sbjct YGLASSVWTKDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTHFMLVSEMPHGGQKLSGYGKDMSLYGLED  463
DSSP  LLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHEELLLLHHHHHHL


DSSP  HEEEEEEEEELlllll
Query YTEVKTVTVKVpqkns  494
ident || |  | ||      
Sbjct YTVVRHVMVKH.....  474
DSSP  LEEEEEEEEEL.....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh
Query raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
ident                                                             
Sbjct .....mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaew   55
DSSP  .....lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell
Query nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
ident                                                             
Sbjct gqttpkvraecllkladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaa  115
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleE
Query teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSDaDMDWAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
ident                         |    |                              
Sbjct rclnglaageyleghtsmirrdplGVVASIAPWN.YPLMMAAWKLAPALAAGN.....cV  169
DSSP  lllllllleeeelleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eE


DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle
Query RTFVQEDIYDEFVERSVAraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
ident      |                                                      
Sbjct VLKPSEITPLTALKLAEL..........................................  187
DSSP  EEELLLLLLHHHHHHHHH..........................................


DSSP  eEELLlllllllllllLEEEellllllhhhhllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHLLlL
Query lLCGGgiaadrgyfiqPTVFgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFkTIEE.VVGRANNStY  419
ident                                      |  ||                  
Sbjct .AKDI...........FPAG.................VVNILFG.RGKTvGDPLTGHP.K  216
DSSP  .HLLL...........LLLL.................LEEELLL.LLLLlHHHHHLLL.L


DSSP  LLEEEEELlLHHHHHHHHHHL..LLLEEEEL.............................
Query GLAAAVFTkDLDKANYLSQAL..QAGTVWVN.............................  448
ident                                                             
Sbjct VRMVSLTG.SIATGEHIISHTasSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyyn  275
DSSP  EEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct agqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkav  335
DSSP  hhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct eeakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqv  395
DSSP  hhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct vnwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkd  455
DSSP  hhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelll


DSSP  ......lLLLLlllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll
Query ......cYDVFgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
ident                                                     
Sbjct mslygleDYTV.................................vrhvmvkh  474
DSSP  lhhhhhhLLEE.................................eeeeeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
ident                                                             
Sbjct ..................................mqhkllingelvsgegekqpvynpat   26
DSSP  ..................................lllleeelleeellllleeeeeelll


DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh
Query raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
ident                                                             
Sbjct gdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecllkladvieengqvfaeles   86
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhlLLLL..............................................
Query kclryyagwaDKYH..............................................  134
ident                                                             
Sbjct rncgkplhsaFNDEipaivdvfrffagaarclnglaageyleghtsmirrdplgvvasia  146
DSSP  hhhlllhhhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeelleeeeeeeeelleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  134
ident                                                             
Sbjct pwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitpltalklaelakdifpagvvnilfgrgkt  206
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhlllllllleeelllllll


DSSP  .......................lleellllleeeeeeeeelLEEEEELLLLLHHHHHHH
Query .......................gktipidgdffsytrhepvGVCGQIIPWNFPLLMQAW  171
ident                                           |    |            
Sbjct vgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassikrthmelgGKAPVIVFDDADIEAVVE  266
DSSP  lhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhlleeeeellLLLEEEELLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHH.HHLL.....LEEEEELLLLLLHHHHHHHHH........................
Query KLGPA.LATG.....NVVVMKVAEQTPLTALYVANL........................  201
ident                             |                               
Sbjct GVRTFgYYNAgqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAavatlksgapddestelgplssla  326
DSSP  HHHHHlLHHHhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllllhh


DSSP  ...................hHHHL..........LLLL..................LEEE
Query ...................iKEAG..........FPPG..................VVNI  214
ident                        |           |                    ||  
Sbjct hlervgkaveeakatghikvITGGekrkgngyyyAPTLlagalqddaivqkevfgpVVSV  386
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllleeEELLllllllllllLLEEeellllllhhhhllllllEEEE


DSSP  LLLL.LLLHHHHHHLLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhlLLLEEEEElllleeeeel
Query VPGF.GPTAGAAIASHEDVDKVAFTG.STEIGRVIQVAAgssNLKRVTLElggkspniim  272
ident  |                                                          
Sbjct TPFDnEEQVVNWANDSQYGLASSVWTkDVGRAHRVSARL...QYGCTWVN..........  433
DSSP  EEELlHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHL...LLLEEEEL..........


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
Query sdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdsk  332
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhl
Query teqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiake  392
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllll
Query eifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydv  452
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllhhheelllllhhhhhhHEEEE.......................eeeeel
Query fgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaYTEVK.......................tvtvkv  489
ident                              |                              
Sbjct ........................thFMLVSemphggqklsgygkdmslygledytvvrh  469
DSSP  ........................llLLLLLlllllllhhheellllhhhhhhlleeeee


DSSP  lllll
Query pqkns  494
ident      
Sbjct vmvkh  474
DSSP  eeeel