No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=19.1

DSSP  .......................llLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................hmSSSQQIAKNARKAGNILKTISNEGRSDILYKIHDA   37
ident                              | |  | |         |  |   |  |   
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhteVEVNQAATAAAKVARDFRRLNNSKRASLLRTIASE   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhLLLLllHHHHHHHHHHHHHHL..LLLL.
Query LKANAHAIEEANKIDLAvaketgladsllkrlDLFKgdKFEVMLQGIKDVAEL..EDPV.   94
ident | |    |        |                |                |         
Sbjct LEARSDDIIARAHLETA...........lpevRLTG..EIARTANQLRLFADVvnSGSYh  107
DSSP  HHHLHHHHHHHHHHHHL...........llhhHHHH..HHHHHHHHHHHHHHHhhHLHHh


DSSP  ....lleeeeeeeelleeeeeeeeELLEEEEEELL..LLHH..HHHHHHHHHHHLLEEEE
Query ....gkvkmarelddgltlyqvtaPVGVLLVIFES..RPEV..IANITALSIKSGNAAIL  146
ident                           |   |   |            ||     |   | 
Sbjct qaildtpnptraplpkpdirrqqiALGPVAVFGASnfPLAFsaAGGDTASALAAGCPVIV  167
DSSP  leeeellllllllllllleeeeeeELLLEEEELLLllLLLLllLLHHHHHHHHHLLLEEE


DSSP  ELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLLEEELLLL....LHHHHHLlLLLLEEE
Query KGGKESVNTFREMAKIVNDTIAQFQsetgVPVGSVQLIETR....VSDLLDQdEYIDLVV  202
ident ||      |    |        | |     |     |           |      |  | 
Sbjct KGHTAHPGTSQIVAECIEQALKQEQ....LPQAIFTLLQGNqralGQALVSH.PEIKAVG  222
DSSP  ELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLHHHEEEELLLllhhHHHHHHL.LLLLEEE


DSSP  EELLHHHHHHHHHLL.....LLLLL...................................
Query PRGSNALVRKIKDTT.....KIPVL...................................  222
ident   ||    |            ||                                     
Sbjct FTGSVGGGRALFNLAherpePIPFYgelgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcg  282
DSSP  EELLHHHHHHHHHHHhhlllLLLEEeellllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  222
ident                                                             
Sbjct qfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidv  342
DSSP  llllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  222
ident                                                             
Sbjct tfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagslt  402
DSSP  eelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleee


DSSP  ..................................................LLLLlleeee
Query ..................................................GHADgicsiy  232
ident                                                             
Sbjct atihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypaSTHS......  456
DSSP  eeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllLLLL......


DSSP  elllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhh
Query ldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevlenltleggvtihatkdlkta  292
ident                                                             
Sbjct ............................................................  456
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhh
Query yfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaek  352
ident                                                             
Sbjct ............................................................  456
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllleeeelllhhhlllLLHHHE..................eeeeeeellllllll
Query fmkgvdssgvywnastrfadvGLDGLV..................syqyqirgdgqvasd  394
ident                                                             
Sbjct .............astsvgaeAIHRWLrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgka  503
DSSP  .............llllllhhHHHHHEeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeellll


DSSP  l
Query y  395
ident  
Sbjct a  504
DSSP  l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.7

DSSP  .........lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query .........hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeanki   51
ident                                                             
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleEEEEEEEL......
Query dlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvKMARELDD......  105
ident                                                 |           
Sbjct learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyHQAILDTPnptrap  120
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhHLEEEELLllllll


DSSP  ....LEEEEEE......eeelleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhh
Query ....GLTLYQV......tapvgvllvifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvnt  155
ident          |                                                  
Sbjct lpkpDIRRQQIalgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
DSSP  llllLEEEEEEellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhh
Query fremakivndtiaqfqsetgvpvgsvqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikd  215
ident                                                             
Sbjct aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  lllllllllllLLEEEEELLLLL..HHHHHHHHHHLLLL..LLLL...EEEEELLLlLLH
Query ttkipvlghadGICSIYLDEDAD..LIKAKRISLDAKTN..CNAM...ETLLINPKfSKW  268
ident             |        |               |                      
Sbjct pepipfygelgAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMgcGQFCtkpGVVFALNT.PET  299
DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHhhHLLLlllLEEEEELL.HHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL..........................................lLLEEL
Query WEVLENLTLEGG..........................................vTIHAT  286
ident     |                                                      |
Sbjct QAFIETAQSLIRqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasALFVT  359
DSSP  HHHHHHHHHHHHhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllllllllEEEEE


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELL.
Query kdlktayfdklnelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTE.  345
ident                                                     |  |    
Sbjct ..........ssenwrkhpaweeeifGPQSLIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATIHATe  409
DSSP  ..........ehhhhhhlhhhhllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLh


DSSP  .LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLLHHH......................lllllhhhee
Query .NKANAEKFMKGV..DSSGVYWNASTRF......................advgldglvs  380
ident                       |                                     
Sbjct eDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPTGvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihrw  469
DSSP  hHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLLLlllllllllllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  eEEEEELLlLLLL.....................ll
Query yQYQIRGDgQVAS.....................dy  395
ident             |                       
Sbjct lRPVAYQA.LPESllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  eEEEEEEL.LLHHhllhhhllllllllleeelllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee
Query ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
ident                                                             
Sbjct .......................................................tdnvf    5
DSSP  .......................................................lllee


DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhHHHH..........................
Query vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvRKIK..........................  214
ident                                |                            
Sbjct yatnaftgealplafpvhtevevnqaataaAKVArdfrrlnnskrasllrtiaselears   65
DSSP  eeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  ........................................................hlll
Query ........................................................dttk  218
ident                                                             
Sbjct ddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptraplpkpd  125
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeelllllllllllll


DSSP  lllllllLLLEEEEELLLLLHHHH..HHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLLL.LHHHHHHHH
Query ipvlghaDGICSIYLDEDADLIKA..KRISLDAKTNCnAMETLLINPKFS.KWWEVLENL  275
ident         |           |           |                      | |  
Sbjct irrqqiaLGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAG.CPVIVKGHTAHPgTSQIVAECI  184
DSSP  eeeeeeeLLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHL.LLEEEELLLLLHhHHHHHHHHH


DSSP  HHHhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhHHHLLllllLLEEEELLLHHHHHHHHLLLL
Query TLEggvtihatkdlktayfdklnelgklteAIQCKtvslDLAAKFVTSTESAIQHINTHS  335
ident                                                             
Sbjct EQA..........................lKQEQL.pqaIFTLLQGNQRALGQALVSHPE  217
DSSP  HHH..........................hHHHLL.lhhHEEEELLLLLHHHHHHHHLLL


DSSP  llLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL....LLEEEEL..........................
Query srHTDAIVTeNKANAEKFMKGVD....SSGVYWN..........................  365
ident                                |                            
Sbjct .iKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfva  275
DSSP  .lLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct smtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrg  335
DSSP  hhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct sddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslse  395
DSSP  lllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  365
ident                                                             
Sbjct mlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasth  455
DSSP  lllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllllllllllllllll


DSSP  .......llHHHL............llllhhheeeeeeeelllllllll
Query .......asTRFA............dvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
ident                                                  
Sbjct sastsvgaeAIHRwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lllllllhhHHHHheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll


DSSP  ...............lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query ...............hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahai   45
ident                                                             
Sbjct lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeel
Query eeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmareldd  105
ident                                                             
Sbjct aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  leeeeeeeeelLEEEEEELL.....LLHHHHHHHHHHHHHL.....LEEEEELLHH.HHH
Query gltlyqvtapvGVLLVIFES.....RPEVIANITALSIKSG.....NAAILKGGKE.SVN  154
ident                                   |                         
Sbjct pepipfygelgAINPTFIFPsamraKADLADQFVASMTMGCgqfctKPGVVFALNTpETQ  300
DSSP  llllleeeellLLLEEEELHhhhhhLLLHHHHHHHHHLHHHhllllLLLEEEEELLhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHH..............................HHHHHH.HLLLLL....
Query TFREMAKIVNDTI..............................AQFQSE.TGVPVG....  179
ident  | | |                                                      
Sbjct AFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtFSQAESpCVASALfvts  360
DSSP  HHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeELLLLLlLLLLEEeeee


DSSP  .................LEEELLLL....LHHHHHLLLLLLEEEEEL...LHHHHHHHHH
Query .................SVQLIETR....VSDLLDQDEYIDLVVPRG...SNALVRKIKD  215
ident                                 |                     |     
Sbjct senwrkhpaweeeifgpQSLIVVCEnvadMLSLSEMLAGSLTATIHAteeDYPQVSQLIP  420
DSSP  hhhhhhlhhhhllllllEEEEEEELlhhhHHHHHHLLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHHH


DSSP  L.LLLL..LLLLlllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhh
Query T.TKIP..VLGHadgicsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevl  272
ident     |                                                       
Sbjct RlEEIAgrLVFN................................................  432
DSSP  HhHLLEeeEEEL................................................


DSSP  hhhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhl
Query enltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhin  332
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLH................
Query thssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLD................  376
ident                                                             
Sbjct .......................................gWPTGvevgyamvhggpypas  453
DSSP  .......................................lLLLLllllllllllllllll


DSSP  ................................hheeeeeeeelllllllll
Query ................................glvsyqyqirgdgqvasdy  395
ident                                                    
Sbjct thsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  .....................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHHHHH
Query .....................hmsssqqiaknarkagnilktisnEGRSDILYKIHDALK   39
ident                                                          |  
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlNNSKRASLLRTIASE   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLHHHHHHHHHHHHHHHhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleee
Query ANAHAIEEANKIDLAVAketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkm   99
ident   |          |  |                                           
Sbjct LEARSDDIIARAHLETA...........................................   77
DSSP  HHHLHHHHHHHHHHHHL...........................................


DSSP  eeeeelleeeeeeeeelleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhHHHHHHHHH
Query arelddgltlyqvtapvgvllvifesrpevianitalsiksgnaailkggkESVNTFREM  159
ident                                                      |    | 
Sbjct ..................................................lPEVRLTGEI   87
DSSP  ..................................................lLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHL............................................
Query AKIVNDTIAQFQSETG............................................  175
ident |   |                                                       
Sbjct ARTANQLRLFADVVNSgsyhqaildtpnptraplpkpdirrqqialgpvavfgasnfpla  147
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHlhhhleeeellllllllllllleeeeeeellleeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  175
ident                                                             
Sbjct fsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqivaecieqalkqeqlpqaiftllqgnqra  207
DSSP  lllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  175
ident                                                             
Sbjct lgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaherpepipfygelgainptfifpsamraka  267
DSSP  hhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllleeeelhhhhhhll


DSSP  .................llllleeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhlll
Query .................vpvgsvqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttk  218
ident                                                             
Sbjct dladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsy  327
DSSP  lhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhh


DSSP  lllllllllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhh
Query ipvlghadgicsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevlenltle  278
ident                                                             
Sbjct qsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenv  387
DSSP  hhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellh


DSSP  hlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhlllllll
Query ggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinthssrh  338
ident                                                             
Sbjct admlslsemlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhg  447
DSSP  hhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllllllll


DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllllhhheeeeeeeelllllllll
Query tdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
ident                                                          
Sbjct gpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll