No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=50.0

DSSP  .............LLLLLEEELLEEELLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHH
Query .............TKQYKNYVNGEWKLSENEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYAS   47
ident                 |  |  |||  |  ||    |   |    |   | |||      
Sbjct agllegvikekggVPVYPSYLAGEWGGSGQEIEVKSPIDLATIAKVISPSREEVERTLDV   60
DSSP  lhhhlllleeellEEEELEELLLLEELLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHH


DSSP  HH.HHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query AK.KAQPAWRALSYIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVSEVVRTAEI  106
ident          |     || | | | |||  |        |     |    || ||      
Sbjct LFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAVGEVKAAVDR  120
DSSP  HHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHhHHHLL.LLLEEEEHHhLLHHHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHH
Query INYAaEEGLR.MEGEVLEGGsFEAASKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAP  165
ident    | |  |    |    |             ||||| | | || |||||   |  ||  
Sbjct LRLA.ELDLKkIGGDYIPGD.WTYDTLETEGLVRREPLGVVAAITPFNYPLFDAVNKITY  178
DSSP  HHLL.LHHHHhLLLEEEELL.LLLLLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLHHhHHHHHHHLLLLLEE
Query ALIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAGLPAGVFNTITGRGSeIGDYIVEHQAVNFI  225
ident   | ||    ||             |   || |          |      ||    |   
Sbjct SFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAGFPPDAIALLNLPGK.EAEKIVADDRVAAV  237
DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEELLLLHH.HLHHHHLLLLLLEE


DSSP  EEELLHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL
Query NFTGSTGIGERIGKMAGMRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTA  285
ident  |||||  |||  |  |      |||| | ||||||||| | |  |  |   | |||| |
Sbjct SFTGSTEVGERVVKVGGVKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSYAGQRCDA  297
DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL


DSSP  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query VKRVLVMESVADELVEKIREKVLALTIGNPEDD.ADITPLIDTKSADYVEGLINDANDKG  344
ident  | ||    |   |||        |  | | |   |  |||     |     | ||  ||
Sbjct IKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLRVGDPRDPtVDVGPLISPSAVDEMMAAIEDAVEKG  357
DSSP  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LEELLLLLE.ELLEELLEEEELL...LLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHL
Query ATALTEIKR.EGNLICPILFDKV...TTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKS  400
ident    |    |       |           || |   | | ||     |     |||  |  
Sbjct GRVLAGGRRlGPTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVALAVEVKDLDQAIELANGR  417
DSSP  LEEEELLLEeELLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLL


DSSP  LEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHH
Query EYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKTQRGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSI  460
ident  ||| |  |  |          ||||   ||     |    || | ||||    |  |  
Sbjct PYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGIGYYPFGGRKKSGVFREGIGYAV  477
DSSP  LEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLEELLEELLLLLLLLH


DSSP  HHLEEEEEEEEELL........
Query EAMTTVKSVVFDIK........  474
ident || |  |  ||  |        
Sbjct EAVTAYKTIVFNYKgkgvwkye  499
DSSP  HHHEEEEEEEEELLllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct ...................................agllegvikekggvpvypsylagew   25
DSSP  ...................................lhhhlllleeelleeeeleelllle


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
ident                                                             
Sbjct ggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldvlfkrgrwsardmpgterlavlrkaa   85
DSSP  elllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct diiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdrlrlaeldlkkiggdyipgdwtydtl  145
DSSP  hhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhllleeeellllllll


DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEEEEEEHHHHHHHH
Query agmrpimlelgGKDSAIVLEDaDLELTAKNIIAGAFGysgqRCTAvKRVLVMESVADELV  300
ident            |   ||          | | |   |        |   |    |      
Sbjct eteglvrreplGVVAAITPFN.YPLFDAVNKITYSFI....YGNA.VVVKPSISDPLPAA  199
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHHHH....LLLE.EEEELLLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHLlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleeLL
Query EKIREKVLAltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnliCP  360
ident         |                                                   
Sbjct MAVKALLDA.................................................GF  210
DSSP  HHHHHHHHL.................................................LL


DSSP  EEeellllllhhhllllllLEEEEEEELLhHHHHHHHHhLLEELEEEEELlLHHHHHHHH
Query ILfdkvttdmrlaweepfgPVLPIIRVTSvEEAIEISNkSEYGLQASIFTnDFPRAFGIA  420
ident                                ||  |          |             
Sbjct PP.................DAIALLNLPG.KEAEKIVA.DDRVAAVSFTG.STEVGERVV  250
DSSP  LL.................LLEEELLLLH.HHLHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEEL.................................................
Query EQLEVGTVHIN.................................................  431
ident     |                                                       
Sbjct KVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpvygk  310
DSSP  HHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct lveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgpt  370
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct yvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfgrdv  430
DSSP  eelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeelllh


DSSP  ..............................................llLLLLLLLlllll
Query ..............................................nkTQRGTDNfpflg  445
ident                                                             
Sbjct vkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTAYKT.....  485
DSSP  hhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEEEEE.....


DSSP  eelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query akksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                              
Sbjct ...............ivfnykgkgvwkye  499
DSSP  ...............eeeellllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  .............................................llllleeelleeell
Query .............................................tkqyknyvngewkls   15
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  lleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHhhhhhhhhhhhhhh
Query eneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawraLSYIeraaylhkvadilm   75
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnAGKP..............  106
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhHLLL..............


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLL..................
Query rdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeEGLRM..................  117
ident                                                             
Sbjct ....................................kSAAVGevkaavdrlrlaeldlkk  130
DSSP  ....................................hHHHHHhhhhhhhhhhlllhhhhh


DSSP  .......................................LLEE.................
Query .......................................EGEV.................  121
ident                                           |                 
Sbjct iggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplFDAVnkitysfiygnavvvkp  190
DSSP  llleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllHHHHhhhhhhhhllleeeeel


DSSP  ............eehHHLLhhHLLEE..................................
Query ............legGSFEaaSKKKI..................................  135
ident                          |                                  
Sbjct sisdplpaamavkalLDAG.fPPDAIallnlpgkeaekivaddrvaavsftgstevgerv  249
DSSP  lllllhhhhhhhhhhHHLL.lLLLLEeellllhhhlhhhhlllllleeeeellhhhhhhh


DSSP  ......eeeeeeeLLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLL.....LEEEEELLLLLHH
Query ......avvrrepVGLVLAISPFN.YPVNLAGSKIAPaLIAG.....NVIAFKPPTQGSI  183
ident               |   ||          |                             
Sbjct vkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLAADKIARGiYSYAgqrcdAIKLVLAERPVYG  309
DSSP  hhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHhHHHHhllllLEEEEEEEHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHH................................................
Query SGLLLAEAFAEA................................................  195
ident                                                             
Sbjct KLVEEVAKRLSSlrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgp  369
DSSP  HHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeel


DSSP  ..LLLL.....................LLEEELLLLHhhHHHHHHHL.LLLLEEEEEL.L
Query ..GLPA.....................GVFNTITGRGseIGDYIVEH.QAVNFINFTG.S  230
ident     |                       |                            |  
Sbjct tyVQPTfveapadrvkdmvlykrevfaPVALAVEVKDldQAIELANGrPYGLDAAVFGrD  429
DSSP  leELLEeeellhhhhlllhhhhlllllLEEEEEEELLhhHHHHHHHLlLEELEEEEELlL


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeee
Query TGIGERIGKMAGMRPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvl  290
ident      |         |                                            
Sbjct VVKIRRAVRLLEVGAIYIN.........................................  448
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLEEEEL.........................................


DSSP  eehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleelll
Query vmesvadelvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalte  350
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  lleelleelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeel
Query ikregnlicpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasift  410
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhLEEEE...
Query ndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieaMTTVK...  467
ident                                                             
Sbjct .................................................dmpRHGIGyyp  459
DSSP  .................................................lllLLLLLlll


DSSP  .................................eeeeell
Query .................................svvfdik  474
ident                                         
Sbjct fggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
DSSP  llleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll