No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=27.3

DSSP  ......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLH
Query ......................................DELLEKAKKVREAWDVLRNATT   22
ident                                        |          |    |    
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamstEEVDYVYASAKKAQPAWRALSY   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHhhhhhllllhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHH
Query REKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVekarergvkeslvdrlalNDKRIDEMIKACE   82
ident  |      | |  |      |       |                               
Sbjct IERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEV............akgyksAVSEVVRTAEIIN  108
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHH............lllhhhHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLlLLEEeEEELL......LLLEEEEEEEELLLEEEELLL..LLHHHHHHHHHH
Query TVIGLKDPvGEVIdSWVRE......DGLRIARVRVPIGPIGIIYES..RPNVTVETTILA  134
ident           |                      | | |    |       |        |
Sbjct YAAEEGLR.MEGE.VLEGGsfeaasKKKIAVVRREPVGLVLAISPFnyPVNLAGSKIAPA  166
DSSP  HHHHHHLL.LLLE.EEEHHhllhhhLLEEEEEEEEELLEEEEELLLllLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHEEELLlLLLH.HHHHHLLLLl
Query LKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeIPESSVEFIEnTDRS.LVLEMIRLRe  193
ident |  || |          |      |  ||      |      |     |           
Sbjct LIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAG....LPAGVFNTIT.GRGSeIGDYIVEHQ.  220
DSSP  HHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL....LLLLLEEELL.LLHHhHHHHHHHLL.


DSSP  LLLEEEELLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.L
Query YLSLVIPRGGYGLISFVRDNAT.VPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTQR.P  251
ident         |  |        |   |      |     | | |||      ||        
Sbjct AVNFINFTGSTGIGERIGKMAGmRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYsG  280
DSSP  LLLEEEEELLHHHHHHHHHHLLlLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhH


DSSP  LLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL..............................
Query GTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH..............................  281
ident   | |    || |  | |    | |                                   
Sbjct QRCTAVKRVLVMESVADELVEKIREKVLALtignpeddaditplidtksadyveglinda  340
DSSP  LLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..................LLEEEELhhhhhhlllleELLHHHLLLLLLLLEEEEEEELLH
Query ..................GVEVRGCektreivpdvvPATEDDWPTEYLDLIIAIKVVKNV  323
ident                                              |       |  |  |
Sbjct ndkgatalteikregnliCPILFDK..........vTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSV  390
DSSP  hhllleellllleelleeLLEEEEL..........lLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHhHLLLLLLLllllllE
Query DEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVNASTrFTDGGQFGfgaeigI  383
ident  ||||   |   |   || |     |           |  |  |       |        
Sbjct EEAIEISNKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKT.QRGTDNFP......F  443
DSSP  HHHHHHHHHLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLL.LLLLLLLL......L


DSSP  ELLLlllLEEL....LLHHHEEEEEEEELLLllll
Query STQRfhaRGPV....GLRELTTYKFVVLGEYhvre  414
ident         |           || | ||        
Sbjct LGAKksgAGIQgvkySIEAMTTVKSVVFDIK....  474
DSSP  LLEElleELLLlhhhHHHHLEEEEEEEEELL....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel
Query eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
ident                                                             
Sbjct ....................tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamstee   40
DSSP  ....................llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhh


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll
Query esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
ident                                                             
Sbjct vdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsev  100
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEELLLLlHHHHH
Query drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgVGNCHIFVDESAdLKKAV  240
ident                                           ||              | 
Sbjct vrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkkiavvrrepVGLVLAISPFNYpVNLAG  160
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhlleeeeeeeeeLLEEEEELLLLLlLHHHH


DSSP  HHHHHHhHLLLllllLEEEEEEEHHHHHHHHHhHHHHHHHLLLEEEelhhhhhhllllee
Query PVIINAkTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPvIVEELRKHGVEVRgcektreivpdvvp  300
ident   |  |                        |    |     |                  
Sbjct SKIAPA.LIAG....NVIAFKPPTQGSISGLL.LAEAFAEAGLPAG..............  200
DSSP  HHHHHH.HHLL....LEEEEELLLLLHHHHHH.HHHHHHHHLLLLL..............


DSSP  llhhhllllllllEEEEEEELLhhHHHHHH.HHHLllLEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLL
Query ateddwpteyldlIIAIKVVKNvdEAIEHI.KKYStgHSESILTeNYSNAKKFVSEIDAA  359
ident                                                             
Sbjct .............VFNTITGRGseIGDYIVeHQAV..NFINFTG.STGIGERIGKMAGMR  244
DSSP  .............LEEELLLLHhhHHHHHHhLLLL..LEEEEEL.LHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  EEEEL.......................................................
Query AVYVN.......................................................  364
ident                                                             
Sbjct PIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvadelvekir  304
DSSP  LEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct ekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicpilfd  364
DSSP  hhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct kvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfprafgiaeqle  424
DSSP  llllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhhhhhhhll


DSSP  ................................llHHHLlllllllllllleellllllle
Query ................................asTRFTdggqfgfgaeigistqrfharg  392
ident                                                             
Sbjct vgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkySIEA......................  462
DSSP  lleeeellllllllllllllleelleellllhhhHHHH......................


DSSP  elllhhheeeeeeeelllllll
Query pvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                       
Sbjct ..........mttvksvvfdik  474
DSSP  ..........leeeeeeeeell


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  .......lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
Query .......dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvek   53
ident                                                             
Sbjct tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  hhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHLL.........................
Query arergvkeslvdrlalndkridemikacetvIGLK.........................   88
ident                                                             
Sbjct ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakGYKSavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle


DSSP  .............................lllLLEE.........eeeelllLLEEEE..
Query .............................dpvGEVI.........dswvredGLRIAR..  108
ident                                                             
Sbjct vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfNYPVnlagskiapaliagnvIAFKPPtq  180
DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllLLLLhhhhhhhhhhhhllleEEEELLll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  108
ident                                                             
Sbjct gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  ......eeeeLLLEEEELL..LLLH.HHHHHHHHHHHLLL.....lEEEELLHHHHHHHH
Query ......vrvpIGPIGIIYE..SRPN.VTVETTILALKSGN.....tILLRGGSDALNSNK  154
ident            |    |                 |                         
Sbjct agmrpimlelGGKDSAIVLedADLElTAKNIIAGAFGYSGqrctavKRVLVMESVADELV  300
DSSP  llllleeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHH......................................hLLLL......LL
Query AIVSAIREA......................................lKETE......IP  170
ident         |                                        |         |
Sbjct EKIREKVLAltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalTEIKregnliCP  360
DSSP  HHHHHHHHLlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleelLLLLeelleeLL


DSSP  HH..................HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLLLEEEELL.LHHHHHHHH
Query ES..................SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYLSLVIPRG.GYGLISFVR  211
ident                         |  |      |     ||                  
Sbjct ILfdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFTnDFPRAFGIA  420
DSSP  EEeellllllhhhlllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEELlLHHHHHHHH


DSSP  HHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhh
Query DNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakef  270
ident     |  |                                                    
Sbjct EQLEVgTVHI..................................................  430
DSSP  HHLLLlEEEE..................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhh
Query lpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehi  330
ident                                                             
Sbjct ............................................................  430
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellllLL
Query kkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqrfHA  390
ident                                                             
Sbjct .....................................................nnktqRG  437
DSSP  .....................................................lllllLL


DSSP  LE.............elllhhheeeeeeeelllllll
Query RG.............pvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                      
Sbjct TDnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
DSSP  LLlllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell