No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=26.9

DSSP  ......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLH
Query ......................................DELLEKAKKVREAWDVLRNATT   22
ident                                                   |       | 
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaEQVDAAVRAADAAFAEWGQTTP   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHH
Query REKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVEkarergvkeslvdrlaLNDKRIDEMIKACE   82
ident         | |    |      |                            |        
Sbjct KVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCG...........kplhsAFNDEIPAIVDVFR  109
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL...........llhhhHHHLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHH.LLLLllLEEEEEELLLLLEEEEEEEELLLEEEELLL..LLHHHHHHHHHHHHLLL
Query TVIG.LKDPvgEVIDSWVREDGLRIARVRVPIGPIGIIYES..RPNVTVETTILALKSGN  139
ident    |                 |      | | |    |                ||  ||
Sbjct FFAGaARCL..NGLAAGEYLEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWnyPLMMAAWKLAPALAAGN  167
DSSP  HHHHhLLLL..LLLLLEEEELLEEEEEEEEELLEEEEELLLllHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllLHHHEEELLlLLLH.HHHHHLLLLlLLLEE
Query TILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeiPESSVEFIEnTDRS.LVLEMIRLReYLSLV  198
ident    |                          |   |                        |
Sbjct CVVLKPSEITPLTALKLAELAKDIF.....PAGVVNILF.GRGKtVGDPLTGHP.KVRMV  220
DSSP  EEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.....LLLLEEELL.LLLLlLHHHHHLLL.LEEEE


DSSP  EELLLHHHHHHHHHHL...LLLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLL
Query IPRGGYGLISFVRDNA...TVPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTQR.PGTC  254
ident    |                        |     |   ||    |              |
Sbjct SLTGSIATGEHIISHTassIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNaGQDC  280
DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHhhhLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHhHLLL


DSSP  LLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL.................................
Query NAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH.................................  281
ident  ||        |                                                
Sbjct TAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVATLksgapddestelgplsslahlervgkaveeaka  340
DSSP  LLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................LLEEEELhhhhhhlllleelLHHHLLLLLLLLEEEEEEEL
Query ....................GVEVRGCektreivpdvvpaTEDDWPTEYLDLIIAIKVVK  321
ident                                                |            
Sbjct tghikvitggekrkgngyyyAPTLLAG..........alqDDAIVQKEVFGPVVSVTPFD  390
DSSP  lllleeeellllllllllllLLEEEEL..........lllLLHHHHLLLLLLEEEEEEEL


DSSP  LHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLhHHLLLLLLllllll
Query NVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVNAStRFTDGGQFgfgaei  381
ident |             |   |  |     |             ||                 
Sbjct NEEQVVNWANDSQYGLASSVWTKDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTH.FMLVSEMP......  443
DSSP  LHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL.LLLLLLLL......


DSSP  lEELLLlllLEEL....LLHHHEEEEEEEELLlllll
Query gISTQRfhaRGPV....GLRELTTYKFVVLGEyhvre  414
ident     |     |      ||   |    |         
Sbjct .HGGQKlsgYGKDmslyGLEDYTVVRHVMVKH.....  474
DSSP  .LLLLHhheELLLlhhhHHHLLEEEEEEEEEL.....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  .........lhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query .........dellekakkvreawdvlrnaTTREknkaikkiaeklderrkeileanridv   51
ident                                                             
Sbjct kvraecllkladvieengqvfaelesrncGKPL...........................   93
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLH...........................


DSSP  hhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHLL.......................
Query ekarergvkeslvdrlalndkridemikacetvIGLK.......................   88
ident                                                             
Sbjct ..............................hsaFNDEipaivdvfrffagaarclnglaa  123
DSSP  ..............................hhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  .......................llLLLeeeeeellllleeeeeE...............
Query .......................dpVGEvidswvredglriarvR...............  110
ident                                                             
Sbjct geyleghtsmirrdplgvvasiapwNYP................Lmmaawklapalaagn  167
DSSP  eeeelleeeeeeeeelleeeeelllLLH................Hhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct cvvlkpseitpltalklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsia  227
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhh


DSSP  ..................eeLLLEEEELLL..LLHHHHHHH.HHHHHLL.....LLEEEE
Query ..................vpIGPIGIIYES..RPNVTVETT.ILALKSG.....NTILLR  144
ident                      |    |          ||                     
Sbjct tgehiishtassikrthmelGGKAPVIVFDdaDIEAVVEGVrTFGYYNAgqdctAACRIY  287
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeelLLLLEEEELLllLHHHHHHHHhHHLLHHHhllllLLLEEE


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHH.........................................
Query GGSDALNSNKAIVSAIREA.........................................  163
ident               |                                             
Sbjct AQKGIYDTLVEKLGAAVATlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvi  347
DSSP  EELLLHHHHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  .HLLL.......LLLHH..................HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLLLE
Query .LKET.......EIPES..................SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYLSL  197
ident    |          |                     |          |        |   
Sbjct tGGEKrkgngyyYAPTLlagalqddaivqkevfgpVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQYGLA  407
DSSP  eLLLLlllllllLLLEEeellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLE


DSSP  EEELL.LHHHHHHHHHHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query VIPRG.GYGLISFVRDNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcn  255
ident         |    |                                              
Sbjct SSVWTkDVGRAHRVSARLQYgCTWV...................................  432
DSSP  EEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE...................................


DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhllllllllee
Query aaekllvhekiakeflpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldlii  315
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllll
Query aikvvknvdeaiehikkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqf  375
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllleellLLLL......leelllhhheeeeeeeelllllll
Query gfgaeigistqRFHA......rgpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                              
Sbjct ...nthfmlvsEMPHggqklsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
DSSP  ...llllllllLLLLlllhhheellllhhhhhhlleeeeeeeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  ............................lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh
Query ............................dellekakkvreawdvlrnattreknkaikki   32
ident                                                             
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  hhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query aeklderrkeileanridvekarergvkeslvdrlalndkridemikacetviglkdpvg   92
ident                                                             
Sbjct kvraecllkladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclng  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  LEEEEEElllllEEEEEEeellleeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhh
Query EVIDSWVredglRIARVRvpigpigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsdalns  152
ident                                                             
Sbjct LAAGEYL....eGHTSMI..........................................  134
DSSP  LLLEEEE....lLEEEEE..........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhheeellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhh
Query nkaivsairealketeipessvefientdrslvlemirlreylslviprggyglisfvrd  212
ident                                                             
Sbjct ............................................................  134
DSSP  ............................................................


DSSP  hlllllllllllLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHlllllllLEEEEEEEHHHHHHHHH
Query natvpvletgvgNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTqrpgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLP  272
ident                        |  |      |             |   |      | 
Sbjct ......rrdplgVVASIAPWNYPLMMAAWKLAPALA.....agNCVVLKPSEITPLTALK  183
DSSP  ......eeeellEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH.....llLEEEEELLLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHllleeeelhhhhhhlllleellhhhllllllllEEEEEEeLLHH.HHHHHHH
Query VIVEELRKhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldlIIAIKVvKNVD.EAIEHIK  331
ident                                             |               
Sbjct LAELAKDI.............................fpagVVNILF.GRGKtVGDPLTG  213
DSSP  HHHHHLLL.............................llllLEEELL.LLLLlLHHHHHL


DSSP  HhlllLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL..LLEEEEL.........................
Query KystgHSESILTeNYSNAKKFVSEID..AAAVYVN.........................  364
ident         |             |                                     
Sbjct H.pkvRMVSLTG.SIATGEHIISHTAssIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtf  271
DSSP  L.lleEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct gyynagqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlerv  331
DSSP  llhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct gkaveeakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdn  391
DSSP  hhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct eeqvvnwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsg  451
DSSP  hhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhhe


DSSP  ........llhHHLLLlllllllllleellllllleelllhhheeeEEEEElllllll
Query ........astRFTDGgqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttyKFVVLgeyhvre  414
ident              |                                  |         
Sbjct ygkdmslygleDYTVV............................rhVMVKH.......  474
DSSP  ellllhhhhhhLLEEE............................eeEEEEL.......