No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.4

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhHHHHHHHHHH
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkEDVDKAVKAA   60
ident                                                          | |
Sbjct ................................................hmSSSQQIAKNA   12
DSSP  ................................................llLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL............llh
Query RAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNG............kpy  108
ident | |              |   |    |               |                 
Sbjct RKAGN...ILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAvaketgladsllkrl   69
DSSP  HHHHH...HHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhh


DSSP  hhHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.EELLLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLllHH
Query viSYLVDLDMVLKCLRYYAGWADK.YHGK.TIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWnfPL  166
ident            |      |   |     |     |     |    ||||   |       
Sbjct dlFKGDKFEVMLQGIKDVAELEDPvGKVKmARELDDGLTLYQVTAPVGVLLVIFES..RP  127
DSSP  llLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLlLLEEeEEEEELLEEEEEEEEELLEEEEEELL..LL


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL........LLLLLEEELLLL
Query LMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAG........FPPGVVNIVPGF  218
ident    |         ||    |       |    |                | | |      
Sbjct EVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqsetgVPVGSVQLIETR  187
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLLLLLEEELLLL


DSSP  lllhHHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHhhllLLEEEEellLLEEEEELLLLLH
Query gptaGAAIASHE.DVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAgssnLKRVTLelgGKSPNIIMSDADM  277
ident                | |   ||    | |           |     |        ||| 
Sbjct ....VSDLLDQDeYIDLVVPRGSNALVRKIKDTT....KIPVLGhadGICSIYLDEDADL  239
DSSP  ....LHHHHHLLlLLLEEEEELLHHHHHHHHHLL....LLLLLLlllLLEEEEELLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhllllleEEEEEEHHH..HHHHHHHHHHHHHhlllllllllllll
Query DWAVEQAHFALFFnqgqcscagSRTFVQEDI..YDEFVERSVARAKsrvvgnpfdskteq  335
ident   |      |                         |  |                     
Sbjct IKAKRISLDAKTN.....cnamETLLINPKFskWWEVLENLTLEGG..............  280
DSSP  HHHHHHHHHLLLL.....llllEEEEELLLLllHHHHHHHHHHHHL..............


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllllllllllllEEEEL.............
Query gpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggiaadrgyfiqpTVFGD.............  382
ident                                           |                 
Sbjct .........................................vTIHATkdlktayfdklne  299
DSSP  .........................................lLLEELhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllhhhhllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLL
Query vqdgmtiakeeifGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQA  442
ident                          |      |        |  |     |         
Sbjct lgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDS  359
DSSP  hllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LEEEELL.LLLLlllllllllhhheelllllhhHHHHHEEEEEEEEELLLLL..l
Query GTVWVNC.YDVFgaqspfggykmsgsgrelgeyGLQAYTEVKTVTVKVPQKN..s  494
ident   |  |                           ||              |     
Sbjct SGVYWNAsTRFA...................dvGLDGLVSYQYQIRGDGQVAsdy  395
DSSP  LEEEELLlHHHL...................llLLHHHEEEEEEEELLLLLLlll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  ..............................llllllllllllllleeelleeelllllle
Query ..............................avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrkt   30
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  eeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhHHHL.....lLLLHhhhllhhhhhhhhhhh
Query fptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaRAAF.....qLGSPwrrmdashrgrllnrl   85
ident                               |                             
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvRKIKdttkipVLGH................  224
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhHHHHhlllllLLLL................


DSSP  hhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleelllllee
Query adlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidgdff  145
ident                                                             
Sbjct ............................................................  224
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHHHHHhHHHHHLL.LEEEEELLLLL..LHHHHHH...
Query sytrhepvGVCGQIIPWN.FPLLMQAWKlGPALATG.NVVVMKVAEQT..PLTALYV...  198
ident         | |                    |                      |     
Sbjct ......adGICSIYLDEDaDLIKAKRIS.LDAKTNCnAMETLLINPKFskWWEVLENltl  277
DSSP  ......llLLEEEEELLLlLHHHHHHHH.HHLLLLLlLLEEEEELLLLllHHHHHHHhhh


DSSP  .........................hhhhHHHLllllLEEELLLLLLLHHHHHHLLLL.l
Query .........................anliKEAGfppgVVNIVPGFGPTAGAAIASHED.v  232
ident                                                             
Sbjct eggvtihatkdlktayfdklnelgklteaIQCKtvslDLAAKFVTSTESAIQHINTHSsr  337
DSSP  hhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhHHLLllllLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLll


DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhlLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query DKVAFTG.STEIGRVIQVAAgssNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffn  291
ident    |                       |                                
Sbjct HTDAIVTeNKANAEKFMKGV...DSSGVYWN.............................  365
DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHL...LLLEEEEL.............................


DSSP  hhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query qgqcscagsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyi  351
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhh
Query ntgkqegakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevv  411
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellll
Query grannstyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrel  471
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhHHEEE...........eeeeeellllll
Query geyglqAYTEV...........ktvtvkvpqkns  494
ident                                   
Sbjct ....asTRFADvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  ....llHHHLLlllhhheeeeeeeelllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
ident                                                             
Sbjct ...................................hmsssqqiaknarkagnilktisne   25
DSSP  ...................................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhh


DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh
Query raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
ident                                                             
Sbjct grsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgik   85
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhlllllLLEELLllleEEEEeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query kclryyagwadkyhGKTIPIdgdfFSYTrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
ident                                                             
Sbjct dvaeledpvgkvkmARELDD....GLTL................................  109
DSSP  hhhhllllllleeeEEEEEL....LEEE................................


DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell
Query nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................  109
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHHHHllllleE
Query teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMsdADMDwAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
ident                         |    |                              
Sbjct .................yqvtapvGVLLVIFE..SRPE.VIANITALSIKSGN.....aA  144
DSSP  .................eeeeeelLEEEEEEL..LLLH.HHHHHHHHHHHHLL.....eE


DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle
Query RTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
ident            | |                                              
Sbjct ILKGGKESVNTFREMAKIVNDTI.....................................  167
DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....................................


DSSP  eeELLLLLlllllLLLLEEeellllllhhhhllllllEEEEEEEllhhhHHHHHHLLLLL
Query llCGGGIAadrgyFIQPTVfgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFktieeVVGRANNSTYG  420
ident                 |                      |         |        | 
Sbjct ..AQFQSE.....TGVPVG..................SVQLIET....rVSDLLDQDEYI  198
DSSP  ..HHHHHH.....HLLLLL..................LEEELLL....lLHHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE.................................
Query LAAAVFTkDLDKANYLSQALQAgTVWV.................................  447
ident                         |                                   
Sbjct DLVVPRG.SNALVRKIKDTTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnam  256
DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHLLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  447
ident                                                             
Sbjct etllinpkfskwwevlenltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldl  316
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllll


DSSP  ......................................................llLLLL
Query ......................................................ncYDVF  453
ident                                                             
Sbjct aakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLD  376
DSSP  eeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLH


DSSP  lllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeEEEEE.LLLLLl
Query gaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevkTVTVK.VPQKNs  494
ident                                     |     
Sbjct ......................glvsyqyqIRGDGqVASDY.  395
DSSP  ......................hheeeeeeEELLLlLLLLL.