No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=32.8

DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ..DELLEKAKKVREAWDVLRNATTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVEKARERG   58
ident         ||  | |   |             ||   |      | ||| ||   | | |
Sbjct hmSSSQQIAKNARKAGNILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAVAKETG   60
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELLLLLEEEEEEEELLLEE
Query VKESLVDRLALN.DKRIDEMIKACETVIGLKDPVGEVIDSWVREDGLRIARVRVPIGPIG  117
ident    ||  || |        |      |  | |||| |       |||    |  | |   
Sbjct LADSLLKRLDLFkGDKFEVMLQGIKDVAELEDPVGKVKMARELDDGLTLYQVTAPVGVLL  120
DSSP  LLHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEEEELLEEEEEEEEELLEEE


DSSP  EELLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....LLLHHH
Query IIYESRPNVTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALKET....EIPESS  173
ident  | |||| |    | |  ||||   | ||    |                      |  |
Sbjct VIFESRPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIAQFqsetGVPVGS  180
DSSP  EEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhLLLLLL


DSSP  EEELLLLllhhHHHHLLLLLLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLEEEEELLL
Query VEFIENTdrslVLEMIRLREYLSLVIPRGGYGLISFVRDNATVPVLETGVGNCHIFVDES  233
ident |  ||      |       ||  || |||   |     |    |||    | | |  || 
Sbjct VQLIETR....VSDLLDQDEYIDLVVPRGSNALVRKIKDTTKIPVLGHADGICSIYLDED  236
DSSP  EEELLLL....LHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLEEEEELLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLlLLLLlleEEEEEEHHHhHHHHhHHHHHHHH.LLLEEEELHHHH
Query ADLKKAVPVIINAKTQrPGTCnaaEKLLVHEKIaKEFLpVIVEELRK.HGVEVRGCEKTR  292
ident ||| ||      |||         | ||   |          | |    ||         
Sbjct ADLIKAKRISLDAKTN.CNAM...ETLLINPKF.SKWW.EVLENLTLeGGVTIHATKDLK  290
DSSP  LLHHHHHHHHHHLLLL.LLLL...EEEEELLLL.LLHH.HHHHHHHHhHLLLLEELHHHH


DSSP  HHLLL...leellhhhllllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHH
Query EIVPD...vvpateddwpteylDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNA  349
ident     |                  |  | | |     || ||   |  |   | |||  ||
Sbjct TAYFDklnelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANA  350
DSSP  HHHHHhhhhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHH


DSSP  HHHHHHLLLLEEEELLLHHHLLllllllllllleellllllleeLLLHHHEEEEEEEELL
Query KKFVSEIDAAAVYVNASTRFTDggqfgfgaeigistqrfhargpVGLRELTTYKFVVLGE  409
ident  ||    |   || |||||| |                      |||  |  |     | 
Sbjct EKFMKGVDSSGVYWNASTRFAD......................VGLDGLVSYQYQIRGD  388
DSSP  HHHHHHLLLLEEEELLLHHHLL......................LLLHHHEEEEEEEELL


DSSP  LLLLL..
Query YHVRE..  414
ident   |    
Sbjct GQVASdy  395
DSSP  LLLLLll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .....................................................lhhhhhh
Query .....................................................delleka    7
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  hhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhh
Query kkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvkeslvdrl   67
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeeLLLEEEELLL..LLH
Query alndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpIGPIGIIYES..RPN  125
ident                                               |   |         
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttkipvlghaDGICSIYLDEdaDLI  240
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllllllLLLEEEEELLllLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLL.LLEEEELLHHHHhHHHHHHHHHHHHHllllLLHH............
Query VTVETTILALKSG.NTILLRGGSDALnSNKAIVSAIREALketeIPES............  172
ident         |         |                                         
Sbjct KAKRISLDAKTNCnAMETLLINPKFS.KWWEVLENLTLEG....GVTIhatkdlktayfd  295
DSSP  HHHHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLLL.LHHHHHHHHHHHH....LLLLeelhhhhhhhhh


DSSP  ...................HEEELlLLLL.HHHHHHLLLLLLlLEEEELL.LHHHHHHHH
Query ...................SVEFIeNTDR.SLVLEMIRLREYlSLVIPRG.GYGLISFVR  211
ident                                     |                       
Sbjct klnelgklteaiqcktvslDLAAK.FVTStESAIQHINTHSSrHTDAIVTeNKANAEKFM  354
DSSP  hhhhhllllhhhhllllllLLEEE.ELLLhHHHHHHHLLLLLlLEEEEELlLHHHHHHHH


DSSP  HHLLL.LLLLLlllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhh
Query DNATV.PVLETgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakef  270
ident        |                                                    
Sbjct KGVDSsGVYWN.................................................  365
DSSP  HHLLLlEEEEL.................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhh
Query lpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehi  330
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellllll
Query kkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqrfha  390
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  leelllhHHEE..........eeeeeelllllll
Query rgpvglrELTT..........ykfvvlgeyhvre  414
ident                                   
Sbjct ....astRFADvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  ....llhHHLLlllhhheeeeeeeelllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel
Query eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
ident                                                             
Sbjct ...............................................hmsssqqiaknar   13
DSSP  ...............................................lllhhhhhhhhhh


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll
Query esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
ident                                                             
Sbjct kagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrldlfk   73
DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllll


DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEELllLLHHhHH
Query drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgVGNCHIFVDesADLKkAV  240
ident                                           ||                
Sbjct gdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapVGVLLVIFE..SRPE.VI  130
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeeLLEEEEEEL..LLLH.HH


DSSP  HHHHHHHHLLLllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL........LLEEeelhhhh
Query PVIINAKTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH........GVEVrgcektr  292
ident   |             |  |         |                              
Sbjct ANITALSIKSG....NAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqsetgVPVG.......  179
DSSP  HHHHHHHHHHL....LEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLLLL.......


DSSP  hhlllleellhhhllllllllEEEEEEEllhhhHHHHHHHHlLLLEEEEELlLHHHHHHH
Query eivpdvvpateddwpteyldlIIAIKVVknvdeAIEHIKKYsTGHSESILTeNYSNAKKF  352
ident                                                           | 
Sbjct .....................SVQLIET....rVSDLLDQDeYIDLVVPRG.SNALVRKI  213
DSSP  .....................LEEELLL....lLHHHHHLLlLLLEEEEEL.LHHHHHHH


DSSP  HHHLLLlEEEE.................................................
Query VSEIDAaAVYV.................................................  363
ident         |                                                   
Sbjct KDTTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevl  272
DSSP  HHLLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  363
ident                                                             
Sbjct enltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhin  332
DSSP  hhhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhl


DSSP  ......................................llLHHHLlllllllllllleel
Query ......................................naSTRFTdggqfgfgaeigist  385
ident                                                             
Sbjct thssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLDG...............  377
DSSP  lllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLHH...............


DSSP  lllllleelllhhheeeeeeeelllllll
Query qrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                              
Sbjct ...........lvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  ...........heeeeeeeelllllllll