No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=27.3

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLH
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamstEEVDYVYASAKKAQPAWRALSY   60
ident                                        |          |    |    
Sbjct ......................................DELLEKAKKVREAWDVLRNATT   22
DSSP  ......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHH............HLLLhhHHHH.HHHHHHHHH
Query IERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKE............VAKGykSAVS.EVVRTAEII  107
ident  |      | |  |      |                                       
Sbjct REKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDvekarergvkesLVDR.lALNDkRIDEMIKAC   81
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhhhhhhllllhhHHHH.hLLLHhHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLL.LLLE.EEEHHhllhhhLLEEEEEEEEELLEEEEELLLllLLHHHHHHHHH
Query NYAAEEGLR.MEGE.VLEGGsfeaasKKKIAVVRREPVGLVLAISPFnyPVNLAGSKIAP  165
ident            |                      | | |    |       |        
Sbjct ETVIGLKDPvGEVIdSWVRE......DGLRIARVRVPIGPIGIIYES..RPNVTVETTIL  133
DSSP  HHHHHLLLLlLLEEeEEELL......LLLEEEEEEEELLLEEEELLL..LLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL....LLLLLEEELL.LLHHhHHHHHHHLL
Query ALIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAG....LPAGVFNTIT.GRGSeIGDYIVEHQ  220
ident ||  || |          |      |  ||      |      |     |          
Sbjct ALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeIPESSVEFIEnTDRS.LVLEMIRLR  192
DSSP  HHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHEEELLlLLLH.HHHHHLLLL


DSSP  .LLLEEEEELLHHHHHHHHHHLLlLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHh
Query .AVNFINFTGSTGIGERIGKMAGmRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYs  279
ident          |  |        |   |      |     | | |||      ||       
Sbjct eYLSLVIPRGGYGLISFVRDNAT.VPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTQR.  250
DSSP  lLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.


DSSP  HLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhh
Query GQRCTAVKRVLVMESVADELVEKIREKVLALtignpeddaditplidtksadyveglind  339
ident    | |    || |  | |    | |                                  
Sbjct PGTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH.............................  281
DSSP  LLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL.............................


DSSP  hhhllleellllleelleeLLEEEEL..........llLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELL
Query andkgatalteikregnliCPILFDK..........vtTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTS  389
ident                                               |       |  |  
Sbjct ...................GVEVRGCektreivpdvvpATEDDWPTEYLDLIIAIKVVKN  322
DSSP  ...................LLEEEELhhhhhhlllleeLLHHHLLLLLLLLEEEEEEELL


DSSP  HHHHHHHHHHLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLL.LLLLLLL......l
Query VEEAIEISNKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKT.QRGTDNF......p  442
ident | ||||   |   |   || |     |           |  |  |       |       
Sbjct VDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVNASTrFTDGGQFgfgaeig  382
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHhHLLLLLLlllllll


DSSP  LLLEelleeLLLLhhHHHHHLEEEEEEEEELL....
Query FLGAkksgaGIQGvkYSIEAMTTVKSVVFDIK....  474
ident                      || | ||        
Sbjct ISTQ..rfhARGP..VGLRELTTYKFVVLGEYhvre  414
DSSP  EELL..lllLLEE..LLLHHHEEEEEEEELLLllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ....................llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhh
Query ....................tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamstee   40
ident                                                             
Sbjct eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhh
Query vdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsev  100
ident                                                             
Sbjct esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhlleeeeeeeeelLEEEEELLLLLlLHHHH
Query vrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkkiavvrrepvGLVLAISPFNYpVNLAG  160
ident                                            |              | 
Sbjct drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvGNCHIFVDESAdLKKAV  240
DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEELLLLlHHHHH


DSSP  HHHHHH.HHLL....LEEEEELLLLLHHHHHH.HHHHHHHHLLLLL..............
Query SKIAPA.LIAG....NVIAFKPPTQGSISGLL.LAEAFAEAGLPAG..............  200
ident   |  |                        |    |     |                  
Sbjct PVIINAkTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPvIVEELRKHGVEVRgcektreivpdvvp  300
DSSP  HHHHHHhHLLLllllLEEEEEEEHHHHHHHHHhHHHHHHHLLLEEEelhhhhhhllllee


DSSP  .............LEEELLLLHhhHHHHHHhLLLL..LEEEEEL.LHHHHHHHHHHLLLL
Query .............VFNTITGRGseIGDYIVeHQAV..NFINFTG.STGIGERIGKMAGMR  244
ident                                                             
Sbjct ateddwpteyldlIIAIKVVKNvdEAIEHI.KKYStgHSESILTeNYSNAKKFVSEIDAA  359
DSSP  llhhhllllllllEEEEEEELLhhHHHHHH.HHHLllLEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  LEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhh
Query PIMlelggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvadelvekir  304
ident                                                             
Sbjct AVY.........................................................  362
DSSP  EEE.........................................................


DSSP  hhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelleeee
Query ekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicpilfd  364
ident                                                             
Sbjct ............................................................  362
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhhhhhhhll
Query kvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfprafgiaeqle  424
ident                                                             
Sbjct ..........................................................vn  364
DSSP  ..........................................................el


DSSP  lleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query vgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                                                   
Sbjct astrftdggqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  llhhhllllllllllllleellllllleelllhhheeeeeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct .......dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvek   53
DSSP  .......lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakGYKSavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct arergvkeslvdrlalndkridemikacetvIGLK.........................   88
DSSP  hhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHLL.........................


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllLLLLhhhhhhhhhhhhllleEEEELLll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfNYPVnlagskiapaliagnvIAFKPPtq  180
ident                                                             
Sbjct .............................dpvGEVI.........dswvredGLRIAR..  108
DSSP  .............................lllLLEE.........eeeelllLLEEEE..


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................  108
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH
Query agmrpimlelGGKDSAIVLedADLElTAKNIIAGAFGYSGqrctavKRVLVMESVADELV  300
ident            |    |                 |                         
Sbjct ......vrvpIGPIGIIYE..SRPN.VTVETTILALKSGN.....tILLRGGSDALNSNK  154
DSSP  ......eeeeLLLEEEELL..LLLH.HHHHHHHHHHHLLL.....lEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleelLLLLeelleeLL
Query EKIREKVLAltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalTEIKregnliCP  360
ident         |                                        |         |
Sbjct AIVSAIREA......................................lKETE......IP  170
DSSP  HHHHHHHHH......................................hLLLL......LL


DSSP  EEeellllllhhhlllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEELlLHHHHHHHH
Query ILfdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFTnDFPRAFGIA  420
ident                         |  |      |     ||                  
Sbjct ES..................SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYLSLVIPRG.GYGLISFVR  211
DSSP  HH..................HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLLLEEEELL.LHHHHHHHH


DSSP  HHLLLlEEEE..................................................
Query EQLEVgTVHI..................................................  430
ident     |  |                                                    
Sbjct DNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakef  270
DSSP  HHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  430
ident                                                             
Sbjct lpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehi  330
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhh


DSSP  .....................................................lllllLL
Query .....................................................nnktqRG  437
ident                                                             
Sbjct kkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqrfHA  390
DSSP  hhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellllLL


DSSP  LLlllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query TDnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                                      
Sbjct RG.............pvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  LE.............elllhhheeeeeeeelllllll