No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=38.1

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllLLLEEEEEELLLLEEEE.EEELLLHHHHHHHHHH
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavSRKTFPTVNPSTGEVIC.QVAEGDKEDVDKAVKA   59
ident                               |   |  |||             |  |  |
Sbjct ..........................TDNVFYATNAFTGEALPlAFPVHTEVEVNQAATA   34
DSSP  ..........................LLLEEEEELLLLLLEEEeEEELLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHH
Query ARAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYlVDLDMV  119
ident |          ||   | |  ||   |   |       |   |    | |          
Sbjct AAKVAR...DFRRLNNSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLT.GEIART   90
DSSP  HHHHHH...HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLL..LLLLEELLLL.......LEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHH.
Query LKCLRYYAGWADK..YHGKTIPIDG.......DFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQ.  169
ident    ||  |       ||                          |        ||||    
Sbjct ANQLRLFADVVNSgsYHQAILDTPNptraplpKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSa  150
DSSP  HHHHHHHHHHHHHlhHHLEEEELLLlllllllLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLl


DSSP  .HHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL....LLLLLEEELLLLLLLHHH
Query .AWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAG....FPPGVVNIVPGFGPTAGA  224
ident        ||| |  |  |     | |   ||  |  |      |        |     | 
Sbjct aGGDTASALAAGCPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqLPQAIFTLLQGNQRALGQ  210
DSSP  lLHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHHEEEELLLLLHHHH


DSSP  HHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHL.LLLEEEEELLLLEEEEELLLL...LHHHh
Query AIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSS.NLKRVTLELGGKSPNIIMSDA...DMDWa  280
ident |  ||     | ||||   ||     |           |||   |  |   |     |  
Sbjct ALVSHPEIKAVGFTGSVGGGRALFNLAHERpEPIPFYGELGAINPTFIFPSAmraKADL.  269
DSSP  HHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLlLLLLEEEELLLLLEEEELHHHhhhLLLH.


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllllLLLL
Query VEQAHFALFFNQGQCSCAGSRTFVQED.IYDEFVERSVARAKSRVVgnpfdskteqGPQV  339
ident   |         ||        |         | |                         
Sbjct ADQFVASMTMGCGQFCTKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP..........STLL  319
DSSP  HHHHHHHHLHHHHLLLLLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........LLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LEEEELlLLLLlllLLLLLEEEEL...lLLLLHHHHLLLL
Query DETQFKKILGYINTGKQEG.AKLLCGgGIAAdrgYFIQPTVFGD...vQDGMTIAKEEIF  395
ident                                          |              ||||
Sbjct TPGIRDSYQSQVVSRGSDDgIDVTFS.QAES...PCVASALFVTssenWRKHPAWEEEIF  375
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHLLLlEEEEEL.LLLL...LLLLLEEEEEehhhHHHLHHHHLLLL


DSSP  LLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLL.
Query GPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTK..DLDKANYLSQAL..QAGTVWVNCY.  450
ident ||   |                   | |       |      |   |   ||    |   
Sbjct GPQSLIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWp  435
DSSP  LLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLl


DSSP  LLLLLL..LLLLLLHHHEE...LLLLLHHHHHHHEEEEEEEE..................
Query DVFGAQ..SPFGGYKMSGS...GRELGEYGLQAYTEVKTVTV..................  487
ident            ||             |                                 
Sbjct TGVEVGyaMVHGGPYPASThsaSTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenplei  495
DSSP  LLLLLLllLLLLLLLLLLLlllLLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhllllllll


DSSP  ..ellllll
Query ..kvpqkns  494
ident          
Sbjct aravdgkaa  504
DSSP  leeelllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh
Query avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
ident                                                             
Sbjct ......tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasll   54
DSSP  ......llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh


DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLHHHHhhLHHHhhh
Query raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldnGKPYVISylVDLDmvl  120
ident                                                   |         
Sbjct rtiaselearsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfaDVVNSGS..YHQA...  109
DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLH..HHLE...


DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll
Query kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................  109
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeellllllhHHHHhhhhhhhhlLLLL...LEEElllllllhhhhhhlllllleeee
Query nvvvmkvaeqtplTALYvanlikeagFPPG...VVNIvpgfgptagaaiashedvdkvaf  237
ident                            |                                
Sbjct .............ILDT........pNPTRaplPKPD.......................  125
DSSP  .............EEEL........lLLLLlllLLLL.......................


DSSP  ellhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHHhhhlL
Query tgsteigrviqvaagssnlkrvtlelGGKSPNIIMSDaDMDWA..VEQAHFALFFnqgqC  295
ident                            |       |                        
Sbjct ...................irrqqiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALA....A  161
DSSP  ...................eeeeeeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHH....H


DSSP  LLLeEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query SCAgSRTFVQEDIYDEFVERSVARAksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgk  355
ident  |                                                          
Sbjct GCP.VIVKGHTAHPGTSQIVAECIE...................................  185
DSSP  LLL.EEEELLLLLHHHHHHHHHHHH...................................


DSSP  hllleeEELLLLlllllllLLLEeeellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHH
Query qegaklLCGGGIaadrgyfIQPTvfgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFKTIEEVVGRAN  415
ident                      |                        |             
Sbjct ......QALKQE.......QLPQ..................aIFTLLQGNQRALGQALVS  214
DSSP  ......HHHHHH.......LLLH..................hHEEEELLLLLHHHHHHHH


DSSP  LLlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL....LLEEEEL.......................
Query NStYGLAAAVFTkDLDKANYLSQALQ....AGTVWVN.......................  448
ident       |             |                                       
Sbjct HP.EIKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladq  272
DSSP  LL.LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct fvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvv  332
DSSP  hhhhhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct srgsddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmls  392
DSSP  hhhlllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct lsemlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypa  452
DSSP  hhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllll


DSSP  .............llLLLLLlllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll
Query .............cyDVFGAqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
ident                                                            
Sbjct sthsastsvgaeaihRWLRP.......vayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  llllllllllhhhhhHHEEE.......eeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.2

DSSP  .....lllllLLLLLLLLLLEeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhHHHH
Query .....avpapNQQPEVFCNQIfinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkeDVDK   55
ident                                                             
Sbjct tdnvfyatnaFTGEALPLAFP..................................vHTEV   26
DSSP  llleeeeellLLLLEEEEEEE..................................lLLHH


DSSP  HHHHHHHHLLLLL........hhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhHHHHhhhhlll
Query AVKAARAAFQLGS........pwrrMDASHRGRLLNRLADLIERDrtylAALEtldngkp  107
ident  |  |  |                          |    | |                  
Sbjct EVNQAATAAAKVArdfrrlnnskraSLLRTIASELEARSDDIIAR...aHLET.......   76
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhhhllhhhhhHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH...hHHHH.......


DSSP  hhhhhhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..................llleellllleeeeee
Query yvisylVDLDMVLKCLRYYAGWADKY..................hgktipidgdffsytr  149
ident                    |                                        
Sbjct .....aLPEVRLTGEIARTANQLRLFadvvnsgsyhqaildtpnptraplpkpdirrqqi  131
DSSP  .....lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhleeeellllllllllllleeeeee


DSSP  eeelLEEEEelllllhhhHHHHHH..HHHHHLL......LEEEEELLllllhhHHHHHHH
Query hepvGVCGQiipwnfpllMQAWKL..GPALATG......NVVVMKVAeqtpltALYVANL  201
ident                           |   |          |    |             
Sbjct algpVAVFG......asnFPLAFSaaGGDTASAlaagcpVIVKGHTA......HPGTSQI  179
DSSP  elllEEEEL......lllLLLLLLllLHHHHHHhhhlllEEEELLLL......LHHHHHH


DSSP  HHHHLL..........llLLEEELLLllllhhHHHHlLLLL.......LEEEEellhhhH
Query IKEAGF..........ppGVVNIVPGfgptagAAIAsHEDV.......DKVAFtgsteiG  244
ident   |                              |      |                   
Sbjct VAECIEqalkqeqlpqaiFTLLQGNQ......RALG.QALVshpeikaVGFTG......S  226
DSSP  HHHHHHhhhhhhlllhhhEEEELLLL......LHHH.HHHHhllllleEEEEL......L


DSSP  HHHHHHHHHLLL.......LEEEEELLlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query RVIQVAAGSSNL.......KRVTLELGgkspniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcsc  297
ident      |                 |                                    
Sbjct VGGGRALFNLAHerpepipFYGELGAI.........nptfifpsamrakadladqfvasm  277
DSSP  HHHHHHHHHHHHhllllllEEEELLLL.........leeeelhhhhhhlllhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query agsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqe  357
ident                                                             
Sbjct tmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsd  337
DSSP  lhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  lleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhll
Query gakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevvgranns  417
ident                                                             
Sbjct dgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslseml  397
DSSP  lleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhll


DSSP  lllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllLLLL......llLHHHeellll
Query tyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaQSPF......ggYKMSgsgrel  471
ident                                                             
Sbjct agsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwpTGVEvgyamvhgGPYP.asths  456
DSSP  lleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllLLLLllllllllLLLL.lllll


DSSP  lhHHHH...hhEEEE......................eeeeellllll
Query geYGLQ...ayTEVK......................tvtvkvpqkns  494
ident                                                 
Sbjct asTSVGaeaihRWLRpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  llLLLLhhhhhHHEEeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................................llllllllllllllleeellee
Query ......................................avpapnqqpevfcnqifinnew   22
ident                                                             
Sbjct learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll


DSSP  elllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhllhhhhhhhh
Query hdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaraafqlgspwrrmdashrgrll   82
ident                                                             
Sbjct lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleellll
Query nrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidg  142
ident                                                             
Sbjct aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLH...HHHHHHHHHHHHHLL.....LEEEEELLLL.LLH
Query dffsytrhepvGVCGQIIPWNFP...LLMQAWKLGPALATG.....NVVVMKVAEQ.TPL  193
ident                  |                               |          
Sbjct pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakADLADQFVASMTMGCgqfctKPGVVFALNTpETQ  300
DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhlLLHHHHHHHHHLHHHhllllLLLEEEEELLhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHL........................................LLLL...
Query TALYVANLIKEAG........................................FPPG...  210
ident      |                                                      
Sbjct AFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvaSALFvts  360
DSSP  HHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllLEEEeee


DSSP  .................LEEELLL.LLLLhHHHHHL.LLLLLEEEEEL...LHHHHHHHH
Query .................VVNIVPG.FGPTaGAAIAS.HEDVDKVAFTG...STEIGRVIQ  248
ident                     ||                                      
Sbjct senwrkhpaweeeifgpQSLIVVCeNVAD.MLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQLI  419
DSSP  hhhhhhlhhhhllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHH


DSSP  HHHHhLLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhh
Query VAAGsSNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqedi  308
ident          |                                                  
Sbjct PRLE.EIAGRLVFN..............................................  432
DSSP  HHHH.LLEEEEEEL..............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelllll
Query ydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggia  368
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeell
Query adrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavftk  428
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelllllhhhhHHHE........
Query dldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrelgeyglQAYT........  480
ident                                                             
Sbjct ...............................................gWPTGvevgyamv  445
DSSP  ...............................................lLLLLllllllll


DSSP  .............................................eeeeeeeellllll
Query .............................................evktvtvkvpqkns  494
ident                                                            
Sbjct hggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll