No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=26.9

DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLH
Query mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaEQVDAAVRAADAAFAEWGQTTP   60
ident                                                   |       | 
Sbjct ......................................DELLEKAKKVREAWDVLRNATT   22
DSSP  ......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL...........llhhhHHHLHHHHHHHHHH
Query KVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCG...........kplhsAFNDEIPAIVDVFR  109
ident         | |    |      |                            |        
Sbjct REKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVEkarergvkeslvdrlaLNDKRIDEMIKACE   82
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHlLLLL..LLLLEEEELLEEEEEEEEELLEEEEELLLllHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query FFAGAaRCLN..GLAAGEYLEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWnyPLMMAAWKLAPALAAGN  167
ident    |                 |      | | |    |                ||  ||
Sbjct TVIGL.KDPVgeVIDSWVREDGLRIARVRVPIGPIGIIYES..RPNVTVETTILALKSGN  139
DSSP  HHHHL.LLLLllEEEEEELLLLLEEEEEEEELLLEEEELLL..LLHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.....LLLLEEELL.LLLLlLHHHHHLLL.LEEEE
Query CVVLKPSEITPLTALKLAELAKDIF.....PAGVVNILF.GRGKtVGDPLTGHP.KVRMV  220
ident    |                          |   |                        |
Sbjct TILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeiPESSVEFIEnTDRS.LVLEMIRLReYLSLV  198
DSSP  LEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllLHHHEEELLlLLLH.HHHHHLLLLlLLLEE


DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHhhhLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHhHLLL
Query SLTGSIATGEHIISHTassIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNaGQDC  280
ident    |                        |     |   ||    |              |
Sbjct IPRGGYGLISFVRDNA...TVPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTQR.PGTC  254
DSSP  EELLLHHHHHHHHHHL...LLLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLL


DSSP  LLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query TAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVATLksgapddestelgplsslahlervgkaveeaka  340
ident  ||        |                                                
Sbjct NAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH.................................  281
DSSP  LLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL.................................


DSSP  lllleeeellllllllllllLLEEEEL..........lllLLHHHHLLLLLLEEEEEEEL
Query tghikvitggekrkgngyyyAPTLLAG..........alqDDAIVQKEVFGPVVSVTPFD  390
ident                                                |            
Sbjct ....................GVEVRGCektreivpdvvpaTEDDWPTEYLDLIIAIKVVK  321
DSSP  ....................LLEEEELhhhhhhlllleelLHHHLLLLLLLLEEEEEEEL


DSSP  LHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL.LLLLLLLL......
Query NEEQVVNWANDSQYGLASSVWTKDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTH.FMLVSEMP......  443
ident |             |   |  |     |             ||                 
Sbjct NVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVNAStRFTDGGQFgfgaei  381
DSSP  LHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLhHHLLLLLLllllll


DSSP  .LLLLHhheELLLlhhhHHHLLEEEEEEEEEL.....
Query .HGGQKlsgYGKDmslyGLEDYTVVRHVMVKH.....  474
ident     |     |      ||   |    |         
Sbjct gISTQRfhaRGPV....GLRELTTYKFVVLGEyhvre  414
DSSP  lEELLLlllLEEL....LLHHHEEEEEEEELLlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
Query mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLH...........................
Query kvraecllkladvieengqvfaelesrncGKPL...........................   93
ident                                                             
Sbjct .........dellekakkvreawdvlrnaTTREknkaikkiaeklderrkeileanridv   51
DSSP  .........lhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............................hhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhlllllllll
Query ..............................hsaFNDEipaivdvfrffagaarclnglaa  123
ident                                                             
Sbjct ekarergvkeslvdrlalndkridemikacetvIGLK.......................   88
DSSP  hhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHLL.......................


DSSP  eeeelleeeeeeeeelleeeeelllLLH................Hhhhhhhhhhhhhlll
Query geyleghtsmirrdplgvvasiapwNYP................Lmmaawklapalaagn  167
ident                                                             
Sbjct .......................dpVGEvidswvredglriarvR...............  110
DSSP  .......................llLLLeeeeeellllleeeeeE...............


DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhh
Query cvvlkpseitpltalklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsia  227
ident                                                             
Sbjct ............................................................  110
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeelLLLLEEEELLllLHHHHHHHHhHHLLHHHhllllLLLEEE
Query tgehiishtassikrthmelGGKAPVIVFDdaDIEAVVEGVrTFGYYNAgqdctAACRIY  287
ident                      |    |          ||                     
Sbjct ..................vpIGPIGIIYES..RPNVTVETT.ILALKSG.....NTILLR  144
DSSP  ..................eeLLLEEEELLL..LLHHHHHHH.HHHHHLL.....LLEEEE


DSSP  EELLLHHHHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleee
Query AQKGIYDTLVEKLGAAVATlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvi  347
ident               |                                             
Sbjct GGSDALNSNKAIVSAIREA.........................................  163
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHH.........................................


DSSP  eLLLLlllllllLLLEEeellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLE
Query tGGEKrkgngyyYAPTLlagalqddaivqkevfgpVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQYGLA  407
ident    |          |                     |          |        |   
Sbjct .LKET.......EIPES..................SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYLSL  197
DSSP  .HLLL.......LLLHH..................HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLLLE


DSSP  EEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE...................................
Query SSVWTkDVGRAHRVSARLQYgCTWV...................................  432
ident         |    |                                              
Sbjct VIPRG.GYGLISFVRDNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcn  255
DSSP  EEELL.LHHHHHHHHHHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct aaekllvhekiakeflpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldlii  315
DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhllllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  432
ident                                                             
Sbjct aikvvknvdeaiehikkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqf  375
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllll


DSSP  ...llllllllLLLLlllhhheellllhhhhhhlleeeeeeeeel
Query ...nthfmlvsEMPHggqklsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
ident                                              
Sbjct gfgaeigistqRFHA......rgpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  llllllleellLLLL......leelllhhheeeeeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.9

DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
Query mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
ident                                                             
Sbjct ............................dellekakkvreawdvlrnattreknkaikki   32
DSSP  ............................lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query kvraecllkladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclng  120
ident                                                             
Sbjct aeklderrkeileanridvekarergvkeslvdrlalndkridemikacetviglkdpvg   92
DSSP  hhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  LLLEEEE....lLEEEEE..........................................
Query LAAGEYL....eGHTSMI..........................................  134
ident                                                             
Sbjct EVIDSWVredglRIARVRvpigpigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsdalns  152
DSSP  LEEEEEElllllEEEEEEeellleeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  134
ident                                                             
Sbjct nkaivsairealketeipessvefientdrslvlemirlreylslviprggyglisfvrd  212
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhheeellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhh


DSSP  ......eeeellEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH.....llLEEEEELLLLLLHHHHH
Query ......rrdplgVVASIAPWNYPLMMAAWKLAPALA.....agNCVVLKPSEITPLTALK  183
ident                        |  |      |             |   |      | 
Sbjct natvpvletgvgNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTqrpgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLP  272
DSSP  hlllllllllllLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHlllllllLEEEEEEEHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLL.............................llllLEEELL.LLLLlLHHHHHL
Query LAELAKDI.............................fpagVVNILF.GRGKtVGDPLTG  213
ident                                             |               
Sbjct VIVEELRKhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldlIIAIKVvKNVD.EAIEHIK  331
DSSP  HHHHHHHHllleeeelhhhhhhlllleellhhhllllllllEEEEEEeLLHH.HHHHHHH


DSSP  L.lleEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhh
Query H.pkvRMVSLTG.SIATGEHIISHTAssIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtf  271
ident         |             |                                     
Sbjct KystgHSESILTeNYSNAKKFVSEID..AAAVYVN.........................  364
DSSP  HhlllLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL..LLEEEEL.........................


DSSP  llhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhh
Query gyynagqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlerv  331
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeell
Query gkaveeakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdn  391
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhhe
Query eeqvvnwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsg  451
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllhhhhhhLLEEE............................eeEEEEL.......
Query ygkdmslygleDYTVV............................rhVMVKH.......  474
ident              |                                  |         
Sbjct ........astRFTDGgqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttyKFVVLgeyhvre  414
DSSP  ........llhHHLLLlllllllllleellllllleelllhhheeeEEEEElllllll