No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=39.3

DSSP  llllleeelleeelLLLEEEEELLLLLLEE.EEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query tkqyknyvngewklSENEIKIYEPASGAEL.GSVPAMSTEEVDYVYASAKKAQPAWRALS   59
ident                 |         |  |    |     ||      | |     | | 
Sbjct ..............TDNVFYATNAFTGEALpLAFPVHTEVEVNQAATAAAKVARDFRRLN   46
DSSP  ..............LLLEEEEELLLLLLEEeEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LL
Query YIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAVSEVVRTAEIINYAAEEGL..RM  117
ident    ||  |   |  |      | |    | |        |  |||      |        
Sbjct NSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLTGEIARTANQLRLFADVVNsgSY  106
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlHH


DSSP  LL.EEEEHhhLLHH..hLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHH..HHHHHHHHHLLLE
Query EG.EVLEGgsFEAA..sKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLA..GSKIAPALIAGNV  172
ident                   |          | |      | |      |   | || ||  
Sbjct HQaILDTP..NPTRaplPKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaGGDTASALAAGCP  164
DSSP  HLeEEELL..LLLLlllLLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllLHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL....LLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEE
Query IAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAG....LPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNFINFT  228
ident    |  |         ||    |     ||   |    |     |   | |       ||
Sbjct VIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqLPQAIFTLLQGNQRALGQALVSHPEIKAVGFT  224
DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHHEEEELLLLLHHHHHHHHLLLLLEEEEE


DSSP  LLHHHHHHHHHHLL....LLLEEEELLLLEEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query GSTGIGERIGKMAG....MRPIMLELGGKDSAIVLEDAD..LELTAKNIIAGAFGYSGQR  282
ident || | |      |       |   |||          |       |    |      || 
Sbjct GSVGGGRALFNLAHerpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGCGQF  284
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHHHLL


DSSP  LLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhhllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query CTAVKRVLVMES.VADELVEKIREKVLALTIgnpeddadiTPLIDTKSADYVEGLINDAN  341
ident ||    |            |                      |      |          
Sbjct CTKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP.........STLLTPGIRDSYQSQVVSRG  335
DSSP  LLLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL.........LLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLL.LEELLLLLEELlEELLEEEEL...lLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH
Query DKG.ATALTEIKREGnLICPILFDK...vTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEIS  397
ident                      ||              || |||   |     |      |
Sbjct SDDgIDVTFSQAESP.CVASALFVTssenWRKHPAWEEEIFGPQSLIVVCENVADMLSLS  394
DSSP  LLLlEEEEELLLLLL.LLLLEEEEEehhhHHHLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHLLEELEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLLLLLLLLL..LLLLLEELLEE
Query NKSEYGLQASIFTN..DFPRAFGIAEQL..EVGTVHINNKTQRGTDN..FPFLGAKKSGA  451
ident       | | |     | |        |    |    |               |      
Sbjct EMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPTGVEVGyaMVHGGPYPAST  454
DSSP  HLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLLLLLLLllLLLLLLLLLLL


DSSP  L...LLLHHHHHHHLEEEEEEEE........................ell
Query G...IQGVKYSIEAMTTVKSVVF........................dik  474
ident            |                                      
Sbjct HsasTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  LlllLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.3

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ............................................tdnvfyatnaftgeal   16
DSSP  ............................................llleeeeellllllee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLH...........................
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevAKGY...........................   93
ident                                                             
Sbjct plafpvhtevevnqaataaakvardfrrlNNSKrasllrtiaselearsddiiarahlet   76
DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......................hhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhh
Query .......................ksAVSEvvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaa  130
ident                                                             
Sbjct alpevrltgeiartanqlrlfadvvNSGS...............................  105
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLH...............................


DSSP  hlleeeeeeeeelleeeeelllllllHHHHhhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhh
Query skkkiavvrrepvglvlaispfnypvNLAGskiapaliagnviafkpptqgsisglllae  190
ident                                                             
Sbjct ........................yhQAIL..............................  111
DSSP  ........................hhLEEE..............................


DSSP  hhhhhlLLLL...LEEEllllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhlllllee
Query afaeagLPAG...VFNTitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkmagmrpim  247
ident        |                                                    
Sbjct ...dtpNPTRaplPKPD.......................................irrq  129
DSSP  ...ellLLLLlllLLLL.......................................eeee


DSSP  eelLLLEEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHHhhhlLLLLeEEEEEEHHHHHHHHHHHHH
Query lelGGKDSAIVLEDaDLELT..AKNIIAGAFGysgqRCTAvKRVLVMESVADELVEKIRE  305
ident     |                 |    | |             |                
Sbjct qiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALA....AGCP.VIVKGHTAHPGTSQIVAEC  183
DSSP  eeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHH....HLLL.EEEELLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleelLLLLeelleELLEEeel
Query KVLAltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalTEIKregnlICPILfdk  365
ident    |                                                  |     
Sbjct IEQA.......................................LKQE.....QLPQA...  196
DSSP  HHHH.......................................HHHH.....LLLHH...


DSSP  lllllhhhlllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLeeLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL.
Query vttdmrlaweepfgpVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEygLQASIFTnDFPRAFGIAEQLE.  424
ident                                    |                        
Sbjct ...............IFTLLQGNQRALGQALVSHPE.iKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHe  239
DSSP  ...............HEEEELLLLLHHHHHHHHLLL.lLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHh


DSSP  ...LLEEEEL..................................................
Query ...VGTVHIN..................................................  431
ident                                                             
Sbjct rpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpet  299
DSSP  lllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct qafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfvt  359
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct ssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypqvsqli  419
DSSP  ehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............................................llLLLLllllllll
Query ..............................................nkTQRGtdnfpflg  445
ident                                                             
Sbjct prleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihRWLR........  471
DSSP  hhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhHHEE........


DSSP  eelleellLLHH............hhhhhleeeeeeeeell
Query akksgagiQGVK............ysieamttvksvvfdik  474
ident                                          
Sbjct ........PVAYqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  ........EEEEelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ................................................llllleeellee
Query ................................................tkqyknyvngew   12
ident                                                             
Sbjct learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll


DSSP  elllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query klseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsyieraaylhkvad   72
ident                                                             
Sbjct lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhl
Query ilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaask  132
ident                                                             
Sbjct aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLLLL...lHHHHHHHHHHHH....LLLE.EEEELLLL.LHH
Query kkiavvrrepvGLVLAISPFNYP...vNLAGSKIAPALI....AGNV.IAFKPPTQ.GSI  183
ident                             ||    |                         
Sbjct pepipfygelgAINPTFIFPSAMrakaDLADQFVASMTMgcgqFCTKpGVVFALNTpETQ  300
DSSP  llllleeeellLLLEEEELHHHHhhllLHHHHHHHHHLHhhhlLLLLlLEEEEELLhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHL.......................................LLLL....
Query SGLLLAEAFAEAG.......................................LPAG....  200
ident      |                                                |     
Sbjct AFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvASALfvts  360
DSSP  HHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllllllLLEEeeee


DSSP  .................LEEELLLLHhHHHHHHHH.LLLLLEEEEEL...LHHHHHHHHH
Query .................VFNTITGRGsEIGDYIVE.HQAVNFINFTG...STGIGERIGK  239
ident                                   |                         
Sbjct senwrkhpaweeeifgpQSLIVVCENvADMLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQLIP  420
DSSP  hhhhhhlhhhhllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHHH


DSSP  HLLL..LLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhh
Query MAGM..RPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvad  297
ident                                                             
Sbjct RLEEiaGRLVFN................................................  432
DSSP  HHHLleEEEEEL................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelle
Query elvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnl  357
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  elleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhh
Query icpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfpraf  417
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhHLEE............
Query giaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieAMTT............  465
ident                                               |             
Sbjct ...........................................gWPTGvevgyamvhggp  449
DSSP  ...........................................lLLLLllllllllllll


DSSP  ..............................................eeeeeeell
Query ..............................................vksvvfdik  474
ident                                                        
Sbjct ypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  ...............LLLLLEeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhHHHHHHH
Query ...............TKQYKNyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamstEEVDYVY   45
ident                                                           | 
Sbjct tdnvfyatnaftgeaLPLAFP...............................vHTEVEVN   29
DSSP  llleeeeelllllleEEEEEE...............................lLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHH.LLHHhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhHHHHHHHL.......lLHHHHH
Query ASAKKAQPAWRA.LSYIeRAAYLHKVADILMRDKEKIgAILSKEVA.......kGYKSAV   97
ident   |  |    |                 |                               
Sbjct QAATAAAKVARDfRRLN.NSKRASLLRTIASELEARS.DDIIARAHletalpevRLTGEI   87
DSSP  HHHHHHHHHHHHhHHLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHHHhhhlllhhHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLL........................................l
Query SEVVRTAEIINYAAEEGLR........................................m  117
ident                 |                                           
Sbjct ARTANQLRLFADVVNSGSYhqaildtpnptraplpkpdirrqqialgpvavfgasnfpla  147
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLHHhleeeellllllllllllleeeeeeellleeeellllllll


DSSP  lleeeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeel
Query egevleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkp  177
ident                                                             
Sbjct fsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqivaecieqalkqeqlpqaiftllqgnqra  207
DSSP  lllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllh


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhh
Query ptqgsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigeri  237
ident                                                             
Sbjct lgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaherpepipfygelgainptfifpsamraka  267
DSSP  hhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllleeeelhhhhhhll


DSSP  hhhllllleeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhh
Query gkmagmrpimlelggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesvad  297
ident                                                             
Sbjct dladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsy  327
DSSP  lhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelle
Query elvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnl  357
ident                                                             
Sbjct qsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenv  387
DSSP  hhhhhhhhlllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellh


DSSP  elleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhhh
Query icpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfpraf  417
ident                                                             
Sbjct admlslsemlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhg  447
DSSP  hhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllllllll


DSSP  hhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query giaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                                                          
Sbjct gpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll