No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=48.9

DSSP  ..............LLLLEEELLEEElLLLLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHH
Query ..............MQHKLLINGELVsGEGEKQPVYNPATGDVLLEIAEASAEQVDAAVR   46
ident                       ||   | |    |  |            | | |     
Sbjct agllegvikekggvPVYPSYLAGEWG.GSGQEIEVKSPIDLATIAKVISPSREEVERTLD   59
DSSP  lhhhlllleeelleEEELEELLLLEE.LLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHH


DSSP  HHH.HHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHH
Query AAD.AAFAEWGQTTPKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFnDEIPAIV  105
ident                  |   | | || || |  ||||    | |||   |   |  | |
Sbjct VLFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAV.GEVKAAV  118
DSSP  HHHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLLLEEE....ELLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHH
Query DVFRFFAGAARCLNGLAAGEY....LEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMAAWKLAP  161
ident |  |          |                  || |||||| | | ||||  |  |   
Sbjct DRLRLAELDLKKIGGDYIPGDwtydTLETEGLVRREPLGVVAAITPFNYPLFDAVNKITY  178
DSSP  HHHHLLLHHHHHLLLEEEELLllllLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEELLLLLLLlHHHHHLLLLEEEE
Query ALAAGNCVVLKPSEITPLTALKLAELAKD.IFPAGVVNILFGRGKTvGDPLTGHPKVRMV  220
ident     || || |||   || |        |  ||      |   ||           |  |
Sbjct SFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDaGFPPDAIALLNLPGKE.AEKIVADDRVAAV  237
DSSP  HHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHlLLLLLLEEELLLLHHH.LHHHHLLLLLLEE


DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLLL
Query SLTGSIATGEHIISHTAssIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQDC  280
ident | |||   ||          |   |||||  | ||  |||            |  ||| |
Sbjct SFTGSTEVGERVVKVGG..VKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSYAGQRC  295
DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHL..LLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query TAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVATLKSGAPDDESTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAKA  340
ident  |     |    |  |||        |  | | |     ||| |         | | |  
Sbjct DAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLRVGDPRDPTVDVGPLISPSAVDEMMAAIEDAVE  355
DSSP  LLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LlLLEEEELLLLLLllLLLLLLEEEELL...LLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHH
Query TgHIKVITGGEKRKgnGYYYAPTLLAGA...LQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVVN  397
ident      |  ||        |  ||          |      ||| ||          |   
Sbjct K.GGRVLAGGRRLG..PTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVALAVEVKDLDQAIE  412
DSSP  L.LLEEEELLLEEE..LLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLL.LLLLLLLLHHHEELLLL
Query WANDSQYGLASSVWTKDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTHFMLV.SEMPHGGQKLSGYGKDM  456
ident  ||   |||   |   ||    |    |  |    |          | || | ||     
Sbjct LANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGiGYYPFGGRKKSGVFREG  472
DSSP  HHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLlLLLLLLLEELLEELLLL


DSSP  HHHHHHLLEEEEEEEEEL.........
Query SLYGLEDYTVVRHVMVKH.........  474
ident   |  |  |                  
Sbjct IGYAVEAVTAYKTIVFNYkgkgvwkye  499
DSSP  LLLLHHHHEEEEEEEEELlllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................lllleeelleeelllll
Query ...........................................mqhkllingelvsgege   17
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query kqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecllkladvieen   77
ident                                                             
Sbjct lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleEEELL..eeEEEE
Query gqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclnglaagEYLEG..htSMIR  135
ident                                                             
Sbjct iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekIVADDrvaaVSFT  240
DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhHHLLLllleEEEE


DSSP  ...................eeeLLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHH....LLLE.EE
Query ...................rdpLGVVASIAPWN.YPLMMAAWKLAPALA....AGNC.VV  170
ident                        |    |          |                    
Sbjct gstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLAADKIARGIYSyagqRCDAiKL  300
DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEE


DSSP  EELLLLLLHHHHHHHHH...........................................
Query LKPSEITPLTALKLAEL...........................................  187
ident                                                             
Sbjct VLAERPVYGKLVEEVAKrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrv  360
DSSP  EEEEHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  HLLL........LLLL.....................LEEELL.LLLLlLHHHHHLL.LL
Query AKDI........FPAG.....................VVNILF.GRGKtVGDPLTGH.PK  216
ident              |                       |               |    | 
Sbjct LAGGrrlgptyvQPTFveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEvKDLD.QAIELANGrPY  419
DSSP  EELLleeelleeLLEEeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEeLLHH.HHHHHHHLlLE


DSSP  EEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhh
Query VRMVSLTG.SIATGEHIISHTasSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyyn  275
ident        |                                                    
Sbjct GLDAAVFGrDVVKIRRAVRLL..EVGAIYIN.............................  448
DSSP  ELEEEEELlLHHHHHHHHHHL..LLLEEEEL.............................


DSSP  hhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query agqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkav  335
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhh
Query eeakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqv  395
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelll
Query vnwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkd  455
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhlLEEE.....................................eeeeeel
Query mslygledYTVV.....................................rhvmvkh  474
ident                                                         
Sbjct .....dmpRHGIgyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
DSSP  .....lllLLLLllllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
Query mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query kvraecllkladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclng  120
ident                                                             
Sbjct ................................agllegvikekggvpvypsylagewggs   28
DSSP  ................................lhhhlllleeelleeeeleelllleell


DSSP  llleeeelleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhh
Query laageyleghtsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitplt  180
ident                                                             
Sbjct gqeievkspidlatiakvispsreevertldvlfkrgrwsardmpgterlavlrkaadii   88
DSSP  lleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl
Query alklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassi  240
ident                                                             
Sbjct ernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdrlrlaeldlkkiggdyipgdwtydtlete  148
DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhllleeeelllllllllee


DSSP  leeeeellLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHhhhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHH
Query krthmelgGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYnagqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKL  300
ident         |    |          |        |        |                 
Sbjct glvrreplGVVAAITPFNYPLFDAVNKITYSFIY......gNAVVVKPSISDPLPAAMAV  202
DSSP  eeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHL......lLEEEEELLLLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllll
Query GAAVATlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggekrkgngyyy  360
ident  |                                                          
Sbjct KALLDA......................................................  208
DSSP  HHHHHL......................................................


DSSP  LLEEeellllllhhhhlllllLEEEEEEELLhHHHHHHHHlLLLLLEEEEELlLHHHHHH
Query APTLlagalqddaivqkevfgPVVSVTPFDNeEQVVNWANdSQYGLASSVWTkDVGRAHR  420
ident                                               | |          |
Sbjct GFPP.................DAIALLNLPG.KEAEKIVA.DDRVAAVSFTG.STEVGER  248
DSSP  LLLL.................LLEEELLLLH.HHLHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLEEEEL...............................................
Query VSARLQYGCTWVN...............................................  433
ident |                                                           
Sbjct VVKVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpvy  308
DSSP  HHHHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  433
ident                                                             
Sbjct gklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlg  368
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  433
ident                                                             
Sbjct ptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfgr  428
DSSP  lleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeell


DSSP  .................................................lLLLLLLLlll
Query .................................................tHFMLVSEmph  444
ident                                                             
Sbjct dvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTAYKT...  485
DSSP  lhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEEEEE...


DSSP  lllhhheellllhhhhhhlleeeeeeeeel
Query ggqklsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
ident                               
Sbjct ................ivfnykgkgvwkye  499
DSSP  ................eeeellllllllll