No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=48.8

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllEEELEEELLEEEL.LLLEEEEEELL
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgRHYPLYIGGEWVD.TKERMVSLNPS   59
ident                                        | | || |    |     || 
Sbjct ...................................MQHKLLINGELVSgEGEKQPVYNPA   25
DSSP  ...................................LLLLEEELLEEELlLLLEEEEEELL


DSSP  EEeEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH
Query APsEVVGTTAKAGKAEAEAALEAAWKAFKTWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEAT  119
ident     |    | |      ||  ||  ||  |       |   ||| |             
Sbjct TG.DVLLEIAEASAEQVDAAVRAADAAFAEWGQTTPKVRAECLLKLADVIEENGQVFAEL   84
DSSP  LL.EEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLLLLL..LLEEEEEEEEELLE
Query LVYEVGKNWVEAS.ADVAEAIDFIEYYARAALRYrypAVEVVPY..PGEDNESFYVPLGA  176
ident      ||    |         |     | ||                |        ||| 
Sbjct ESRNCGKPLHSAFnDEIPAIVDVFRFFAGAARCL...NGLAAGEylEGHTSMIRRDPLGV  141
DSSP  HHHHHLLLHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLL...LLLLLEEeeLLEEEEEEEEELLE


DSSP  EEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLEEEL
Query GVVIAPWNFPVAIFTGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEaGFPPGVVNFL  236
ident    ||||| |            | || |  || |       |  |      || |||| |
Sbjct VASIAPWNYPLMMAAWKLAPALAAGNCVVLKPSEITPLTALKLAELAKD.IFPAGVVNIL  200
DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEEL


DSSP  LLLLLHHHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLllllllLLEEEEELLLLEEEE
Query PGVGEEVGAYLVEHPRIRFINFTGSLEVGLKIYEAAGRLapgqtwFKRAYVETGGKNAII  296
ident  | |  ||  |  ||  |    |||   |  |              ||   | |||   |
Sbjct FGRGKTVGDPLTGHPKVRMVSLTGSIATGEHIISHTASS......IKRTHMELGGKAPVI  254
DSSP  LLLLLLLHHHHHLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHH......LLEEEEELLLLLEEE


DSSP  ELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHH
Query VDETADFDLAAEGVVVSAYGFQGQKCSAASRLILTQGAYEPVLERVLKRAERLSVGPAEE  356
ident |   ||     |||    |   || | || |     | |    |        |  |    
Sbjct VFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQDCTAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVATLKSGAPDD  314
DSSP  ELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLL


DSSP  L.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLL..LEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLHH
Query N.PDLGPVVSAEQERKVLSYIEIGKNE..GQLVLGGKRLEGEGYFIAPTVFTEVPPKARI  413
ident     |||  |      |    |  |         ||    | ||  |||          |
Sbjct EsTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAKATghIKVITGGEKRKGNGYYYAPTLLAGALQDDAI  374
DSSP  LlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLllLEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLHH


DSSP  HLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELL
Query AQEEIFGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSRKREHLEWARREFHVGNLYFNR  473
ident  | | |||| ||            |||  |||   |                 |    | 
Sbjct VQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQYGLASSVWTKDVGRAHRVSARLQYGCTWVNT  434
DSSP  HHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELL


DSSP  lLLLLLLLLlLLLLLHHHLLlLLLLLHHHHHLLEEEEEEEEEL
Query kITGALVGVqPFGGFKLSGTnAKTGALDYLRLFLEMKAVAERF  516
ident           | || ||||   |   |  |        |    
Sbjct .HFMLVSEM.PHGGQKLSGY.GKDMSLYGLEDYTVVRHVMVKH  474
DSSP  .LLLLLLLL.LLLLLHHHEE.LLLLHHHHHHLLEEEEEEEEEL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.4

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLEEELEEEllEEELLLLE...eeeee
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefGRHYPLYIggEWVDTKER...mvsln   57
ident                                     |  |          |         
Sbjct ..................................MQHKLLIN..GELVSGEGekqpvynp   24
DSSP  ..................................LLLLEEEL..LEEELLLLleeeeeel


DSSP  lleEEEE..eeeeelLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHH
Query psaPSEV..vgttakAGKAEAEAALEAAWKAFktwkdwpqeDRSRLLLKAAALMRRRKRE  115
ident                   |   ||  |                                |
Sbjct atgDVLLeiaeasaeQVDAAVRAADAAFAEWG........qTTPKVRAECLLKLADVIEE   76
DSSP  lllEEEEeeelllhhHHHHHHHHHHHHHHHHL........lLLHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL.........LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhllllllllllllee
Query LEATLVYEVG.........KNWVEASADVAEAIDFIEYYaRAALryrypavevvpypged  166
ident                        |  | |     |     |                   
Sbjct NGQVFAELESrncgkplhsAFNDEIPAIVDVFRFFAGAA.RCLN.....glaageylegh  130
DSSP  LHHHHHHHHHhhhlllhhhHHHLHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL.....lllleeeelle


DSSP  eeeeeeELLEEEEELL....LLLLLHHHHHHHHHHHhlllEEEEELL....HHHHHHHH.
Query nesfyvPLGAGVVIAP....WNFPVAIFTGMIVGPVavgnTVIAKPA....EDAVVVGA.  217
ident            |             |                                | 
Sbjct tsmirrDPLGVVASIApwnyPLMMAAWKLAPALAAG....NCVVLKPseitPLTALKLAe  186
DSSP  eeeeeeEELLEEEEELllllHHHHHHHHHHHHHHLL....LEEEEELllllLHHHHHHHh


DSSP  HHHHHHHhhllllllEEELLLLLlhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhlllll
Query KVFEIFHeagfppgvVNFLPGVGeevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlap  277
ident     ||         |                                            
Sbjct LAKDIFP......agVVNILFGR.....gktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiish  235
DSSP  HHLLLLL......llLEEELLLL.....llllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  lllllleeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhh
Query gqtwfkrayvetggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrliltqgayep  337
ident                                                             
Sbjct tassikrthmelggkapvivfddadieavvegvrtfgyynagqdctaacriyaqkgiydt  295
DSSP  hhhhlleeeeellllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhhhhllllllleeeeelllhhh


DSSP  hhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllllll
Query vlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegy  397
ident                                                             
Sbjct lveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggekrkg  355
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllll


DSSP  lllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhh
Query fiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggvysrkrehl  457
ident                                                             
Sbjct ngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqvvnwandsqyglassvwtkdv  415
DSSP  llllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllh


DSSP  hhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlleeeeeeeeel
Query ewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlflemkavaerf  516
ident                                                            
Sbjct grahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
DSSP  hhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellllhhhhhhlleeeeeeeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee
Query vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
ident                                                             
Sbjct ...............................mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdv   29
DSSP  ...............................lllleeelleeellllleeeeeellllee


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll
Query apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
ident                                                             
Sbjct lleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecllkladvieengqvfaelesrnc   89
DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELLL
Query eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDET  300
ident                                                   |  | |    
Sbjct gkplhsafndeipaivdvfrffagaarclnglaageyleghtsmirrdpLGVVASIAPWN  149
DSSP  lllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeelleeeeeeeeeLLEEEEELLLL


DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHHHHHHHhhlllllllhhhllll
Query aDFDLAAEGVVVSAYGFQGqkcsaaSRLILTQGAYEPVLERVLKraerlsvgpaeenpdl  360
ident       |      |             |          |                     
Sbjct .YPLMMAAWKLAPALAAGN.....cVVLKPSEITPLTALKLAEL................  187
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eEEEELLLLLLHHHHHHHHH................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeEELLllllllllllLLEEeellllllhhhllllll
Query gpvvsaeqerkvlsyieigknegqlVLGGkrlegegyfiAPTVftevppkariaqeeifg  420
ident                                         |                   
Sbjct .........................AKDI..........FPAG.................  195
DSSP  .........................HLLL..........LLLL.................


DSSP  lEEEEEEElLHHH.HHHHHHLLlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHL..llLEEEEL.....
Query pVLSVIRVkDFAE.ALEVANDTpYGLTGGVYSrKREHLEWARREF..hvGNLYFN.....  472
ident  |                                    |                     
Sbjct .VVNILFG.RGKTvGDPLTGHP.KVRMVSLTG.SIATGEHIISHTassiKRTHMElggka  251
DSSP  .LEEELLL.LLLLlHHHHHLLL.LEEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhhlLEEEEElllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct pvivfddadieavvegvrtfgyynagqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksga  311
DSSP  eeeelllllhhhhhhhhhhhllhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct pddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqd  371
DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  472
ident                                                             
Sbjct daivqkevfgpvvsvtpfdneeqvvnwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctw  431
DSSP  lhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  .............................lllLLLLLLlllllllhhhllllllllhhhh
Query .............................rkiTGALVGvqpfggfklsgtnaktgaldyl  503
ident                                                             
Sbjct vnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygledYTVVRH......................  469
DSSP  elllllllllllllllhhheellllhhhhhhlLEEEEE......................


DSSP  hlleeeeeeeeel
Query rlflemkavaerf  516
ident              
Sbjct ........vmvkh  474
DSSP  ........eeeel


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  ..............llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeellee
Query ..............mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggew   46
ident                                                             
Sbjct kvraecllkladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclng  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  elllleeeeeelleeeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh
Query vdtkermvslnpsapsevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaa  106
ident                                                             
Sbjct laageyleghtsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitplt  180
DSSP  llleeeelleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhh


DSSP  hhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllee
Query almrrrkreleatlvyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypged  166
ident                                                             
Sbjct alklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassi  240
DSSP  hhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  eeeeeeeLLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHL......lLEEEEELLHHHHHHHHHHH
Query nesfyvpLGAGVVIAPWNFPVAIFTGMIVGPVAV......gNTVIAKPAEDAVVVGAKVF  220
ident         |   ||                                              
Sbjct krthmelGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYnagqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKL  300
DSSP  leeeeelLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHhhhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHH


DSSP  HH...........................................hHHHL..........
Query EI...........................................fHEAG..........  227
ident                                                  |          
Sbjct GAavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvITGGekrkgngyyy  360
DSSP  HHhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeEELLllllllllll


DSSP  ..................llLLLEEELLLLLlhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhh
Query ..................fpPGVVNFLPGVGeevgaylvehprirfinftgslevglkiy  269
ident                       ||   |                                
Sbjct aptllagalqddaivqkevfGPVVSVTPFDN.............................  391
DSSP  lleeeellllllhhhhllllLLEEEEEEELL.............................


DSSP  hhhllllllllllleeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeee
Query eaagrlapgqtwfkrayvetggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrli  329
ident                                                             
Sbjct ............................................................  391
DSSP  ............................................................


DSSP  eehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeell
Query ltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlgg  389
ident                                                             
Sbjct ............................................................  391
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeee
Query krlegegyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggv  449
ident                                                             
Sbjct ............................................eeqvvnwandsqygla  407
DSSP  ............................................hhhhhhhhhlllllle


DSSP  elllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlleee
Query ysrkrehlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlflem  509
ident                                                             
Sbjct ssvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygledytvv  467
DSSP  eeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellllhhhhhhlleee


DSSP  eeeeeel
Query kavaerf  516
ident        
Sbjct rhvmvkh  474
DSSP  eeeeeel