No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=48.9

DSSP  lhhhlllleeelleEEELEELLLLEE.LLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHH
Query agllegvikekggvPVYPSYLAGEWG.GSGQEIEVKSPIDLATIAKVISPSREEVERTLD   59
ident                       ||   | |    |  |            | | |     
Sbjct ..............MQHKLLINGELVsGEGEKQPVYNPATGDVLLEIAEASAEQVDAAVR   46
DSSP  ..............LLLLEEELLEEElLLLLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHH
Query VLFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAV.GEVKAAV  118
ident                  |   | | || || |  ||||    | |||   |   |  | |
Sbjct AAD.AAFAEWGQTTPKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFnDEIPAIV  105
DSSP  HHH.HHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHH


DSSP  HHHHLL.LHHHHhLLLEEEELLllllLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHH
Query DRLRLA.ELDLKkIGGDYIPGDwtydTLETEGLVRREPLGVVAAITPFNYPLFDAVNKIT  177
ident |  |           |                  || |||||| | | ||||  |  |  
Sbjct DVFRFFaGAARC.LNGLAAGEY....LEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMAAWKLA  160
DSSP  HHHHHHhHHLLL.LLLLLLEEE....ELLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHlLLLLLLEEELLLLHHH.LHHHHLLLLLLE
Query YSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDaGFPPDAIALLNLPGKE.AEKIVADDRVAA  236
ident      || || |||   || |        |  ||      |   ||           |  
Sbjct PALAAGNCVVLKPSEITPLTALKLAELAKD.IFPAGVVNILFGRGKTvGDPLTGHPKVRM  219
DSSP  HHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEELLLLLLLlHHHHHLLLLEEE


DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHHL..LLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query VSFTGSTEVGERVVKVGG..VKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSYAGQR  294
ident || |||   ||          |   |||||  | ||  |||            |  ||| 
Sbjct VSLTGSIATGEHIISHTAssIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQD  279
DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLL


DSSP  LLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query CDAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLRVGDPRDPTVDVGPLISPSAVDEMMAAIEDAV  354
ident | |     |    |  |||        |  | | |     ||| |         | | | 
Sbjct CTAACRIYAQKGIYDTLVEKLGAAVATLKSGAPDDESTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAK  339
DSSP  LLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HL.LLEEEELLLEEE..LLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHH
Query EK.GGRVLAGGRRLG..PTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVALAVEVKDLDQAI  411
ident       |  ||        |  ||          |      ||| ||          |  
Sbjct ATgHIKVITGGEKRKgnGYYYAPTLLAGA...LQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVV  396
DSSP  HLlLLEEEELLLLLLllLLLLLLEEEELL...LLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHH


DSSP  HHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLlLLLLLLLEELLEELLL
Query ELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGiGYYPFGGRKKSGVFRE  471
ident   ||   |||   |   ||    |    |  |    |          | || | ||    
Sbjct NWANDSQYGLASSVWTKDVGRAHRVSARLQYGCTWVNTHFMLV.SEMPHGGQKLSGYGKD  455
DSSP  HHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLL.LLLLLLLLHHHEELLL


DSSP  LLLLLHHHHEEEEEEEEELlllllllll
Query GIGYAVEAVTAYKTIVFNYkgkgvwkye  499
ident    |  |  |                  
Sbjct MSLYGLEDYTVVRHVMVKH.........  474
DSSP  LHHHHHHLLEEEEEEEEEL.........


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct ...........................................mqhkllingelvsgege   17
DSSP  ...........................................lllleeelleeelllll


DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh
Query lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
ident                                                             
Sbjct kqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecllkladvieen   77
DSSP  eeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhHHLLLllleEEEE
Query iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekIVADDrvaaVSFT  240
ident                                                             
Sbjct gqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclnglaagEYLEG..htSMIR  135
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleEEELL..eeEEEE


DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEE
Query gstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLAADKIARGIYSyagqRCDAiKL  300
ident                        |    |          |                    
Sbjct ...................rdpLGVVASIAPWN.YPLMMAAWKLAPALA....AGNC.VV  170
DSSP  ...................eeeLLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHH....LLLE.EE


DSSP  EEEEHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllee
Query VLAERPVYGKLVEEVAKrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrv  360
ident                                                             
Sbjct LKPSEITPLTALKLAEL...........................................  187
DSSP  EELLLLLLHHHHHHHHH...........................................


DSSP  EELLleeelleeLLEEeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEeLLHH.HHHHHHHLlLE
Query LAGGrrlgptyvQPTFveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEvKDLD.QAIELANGrPY  419
ident              |                       |               |    | 
Sbjct AKDI........FPAG.....................VVNILF.GRGKtVGDPLTGH.PK  216
DSSP  HLLL........LLLL.....................LEEELL.LLLLlLHHHHHLL.LL


DSSP  ELEEEEELlLHHHHHHHHHHL..LLLEEEEL.............................
Query GLDAAVFGrDVVKIRRAVRLL..EVGAIYIN.............................  448
ident        |                                                    
Sbjct VRMVSLTG.SIATGEHIISHTasSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyyn  275
DSSP  EEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct agqdctaacriyaqkgiydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkav  335
DSSP  hhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct eeakatghikvitggekrkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpvvsvtpfdneeqv  395
DSSP  hhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct vnwandsqyglassvwtkdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkd  455
DSSP  hhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelll


DSSP  .....lllLLLLllllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll
Query .....dmpRHGIgyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
ident                                                         
Sbjct mslygledYTVV.....................................rhvmvkh  474
DSSP  lhhhhhhlLEEE.....................................eeeeeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  ................lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleee
Query ................agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatia   44
ident                                                             
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  eeelllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhllLHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhl
Query kvispsreevertldvlfkrgrwsardmPGTErlavlrkaadiiernldvfaevlvmnag  104
ident                              |                              
Sbjct kvraecllkladvieengqvfaelesrnCGKP............................   92
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhHLLL............................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhHHLL..LEeeellllllllleeeeEE..........
Query kpksaavgevkaavdrlrlaeldlKKIG..GDyipgdwtydtleteglVR..........  152
ident                                                             
Sbjct ...................lhsafNDEIpaIV................DVfrffagaarc  117
DSSP  ...................hhhhhHLHHhhHH................HHhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  152
ident                                                             
Sbjct lnglaageyleghtsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseit  177
DSSP  lllllleeeelleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  152
ident                                                             
Sbjct pltalklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishta  237
DSSP  lhhhhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......eeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHH.HHLL.....LEEEEELLLLLLHHHH
Query .......replGVVAAITPFNYPLFDAVNKITYS.FIYG.....NAVVVKPSISDPLPAA  199
ident            |    |          |                 |              
Sbjct ssikrthmelgGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFgYYNAgqdctAACRIYAQKGIYDTLV  297
DSSP  hhlleeeeellLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHlLHHHhllllLLLEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHL...................................................
Query MAVKALLDA...................................................  208
ident     |                                                       
Sbjct EKLGAAVATlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggekrkgng  357
DSSP  HHHHHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllll


DSSP  ...LLLL.................lLEEELLLLH.HHLHHHHLLL.LLLEEEEEL.LHHH
Query ...GFPP.................dAIALLNLPG.KEAEKIVADD.RVAAVSFTG.STEV  245
ident                                            |     | |        
Sbjct yyyAPTLlagalqddaivqkevfgpVVSVTPFDNeEQVVNWANDSqYGLASSVWTkDVGR  417
DSSP  lllLLEEeellllllhhhhllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHLLlLLLEEEEELlLHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeh
Query GERVVKVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaer  305
ident   ||                                                        
Sbjct AHRVSARLQYGCTWVN............................................  433
DSSP  HHHHHHHLLLLEEEEL............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelll
Query pvygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggr  365
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeee
Query rlgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaav  425
ident                                                             
Sbjct ............................................................  433
DSSP  ............................................................


DSSP  elllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEEEEE
Query fgrdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTAYKT  485
ident                                                             
Sbjct ....................................................tHFMLVSE  441
DSSP  ....................................................lLLLLLLL


DSSP  ...................eeeellllllllll
Query ...................ivfnykgkgvwkye  499
ident                                  
Sbjct mphggqklsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
DSSP  llllllhhheellllhhhhhhlleeeeeeeeel