No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=26.2

DSSP  .........................LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query .........................DELLEKAKKVREAWDVLRNATTREKNKAIKKIAEK   35
ident                           |    |          |             ||  
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhteVEVNQAATAAAKVARDFRRLNNSKRASLLRTIASE   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHHHHHHHhhhhhhllllhhHHHHhllLHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLLL
Query LDERRKEILEANRIDvekarergvkesLVDRlalNDKRIDEMIKACETVIGL..KDPVGE   93
ident |  |   |                              |                     
Sbjct LEARSDDIIARAHLE............TALPevrLTGEIARTANQLRLFADVvnSGSYHQ  108
DSSP  HHHLHHHHHHHHHHH............HLLLhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLHHHL


DSSP  EeEEEELLL......LLEEEEEEEELLLEEEELLL..LLHH.HHHH.HHHHHHLLLLEEE
Query ViDSWVRED......GLRIARVRVPIGPIGIIYES..RPNV.TVET.TILALKSGNTILL  143
ident                   | |     ||      |            |  ||  |     
Sbjct A.ILDTPNPtraplpKPDIRRQQIALGPVAVFGASnfPLAFsAAGGdTASALAAGCPVIV  167
DSSP  E.EEELLLLllllllLLLEEEEEEELLLEEEELLLllLLLLlLLLHhHHHHHHHLLLEEE


DSSP  ELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHEEELLLLLLHHHHHHLLLLlLLLEEEELLL
Query RGGSDALNSNKAIVSAIREALKETEIPESSVEFIENTDRSLVLEMIRLReYLSLVIPRGG  203
ident  |              |  |||    |           | |             |   | 
Sbjct KGHTAHPGTSQIVAECIEQALKQEQLPQAIFTLLQGNQRALGQALVSHP.EIKAVGFTGS  226
DSSP  ELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLHHHHHHHHLL.LLLEEEEELL


DSSP  HHHHHHHHHHLL.....LLLLLLLLLLEEEEELLLLL..HHHHHHHHHHHHHLL.LLLLL
Query YGLISFVRDNAT.....VPVLETGVGNCHIFVDESAD..LKKAVPVIINAKTQR.PGTCN  255
ident  |        |       |           |   ||               |      | 
Sbjct VGGGRALFNLAHerpepIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQFVASMTMGcGQFCT  286
DSSP  HHHHHHHHHHHHhllllLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHHHHHHHLHHhHLLLL


DSSP  LEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHHLL................................
Query AAEKLLVHEK.IAKEFLPVIVEELRKHG................................  282
ident                |        |                                   
Sbjct KPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSpstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsq  346
DSSP  LLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeell


DSSP  .......LEEEELHhhhhhlllleelLHHHlLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLL
Query .......VEVRGCEktreivpdvvpaTEDDwPTEYLDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYST  335
ident                                  |       | |  ||            
Sbjct aespcvaSALFVTS......senwrkHPAW.EEEIFGPQSLIVVCENVADMLSLSEMLAG  399
DSSP  lllllllLEEEEEE......hhhhhhLHHH.HLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLL


DSSP  LLEEEEELL..LHHHHHHHHHHLL..LLEEEELLLHHHLLLLLLLllllllEELLL...l
Query GHSESILTE..NYSNAKKFVSEID..AAAVYVNASTRFTDGGQFGfgaeigISTQR...f  388
ident      |      |             |     |        |                  
Sbjct SLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLEeiAGRLVFNGWPTGVEVGYAM.....vHGGPYpast  454
DSSP  EEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHHllEEEEEELLLLLLLLLLLLL.....lLLLLLllll


DSSP  LLLEEL....LLHHHEEEEEEEELL....................lllll
Query HARGPV....GLRELTTYKFVVLGE....................yhvre  414
ident |                                                 
Sbjct HSASTSvgaeAIHRWLRPVAYQALPesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  LLLLLLllhhHHHHHEEEEEEELLLhhhllhhhllllllllleeelllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.7

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel
Query eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
ident                                                             
Sbjct ..............................tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnq   30
DSSP  ..............................llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhh


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll
Query esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
ident                                                             
Sbjct aataaakvardfrrlnnskrasllrtiaselearsddiiarahletalpevrltgeiart   90
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEELLLlLHHHH.
Query drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgVGNCHIFVDESaDLKKA.  239
ident                                            |    |           
Sbjct anqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptraplpkpdirrqqiaLGPVAVFGASN.FPLAFs  149
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllllllllleeeeeeeLLLEEEELLLL.LLLLLl


DSSP  ..HHHHHHHHHLLlllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLEEeelhhhhh
Query ..VPVIINAKTQRpgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH....GVEVrgcektre  293
ident         |                |         |                        
Sbjct aaGGDTASALAAG.....CPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqLPQA........  196
DSSP  llLHHHHHHHHHL.....LLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHH........


DSSP  hlllleellhhhllllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHHHlLLLEEEEELlLHHHHHHHH
Query ivpdvvpateddwpteyldlIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYsTGHSESILTeNYSNAKKFV  353
ident                     |                                       
Sbjct ....................IFTLLQGNQRALGQALVSHP.EIKAVGFTG.SVGGGRALF  234
DSSP  ....................HEEEELLLLLHHHHHHHHLL.LLLEEEEEL.LHHHHHHHH


DSSP  HHLL....LLEEEEL.............................................
Query SEID....AAAVYVN.............................................  364
ident             |                                               
Sbjct NLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfal  294
DSSP  HHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct ntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvas  354
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct alfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypq  414
DSSP  eeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhh


DSSP  .................................................llhHHLLllll
Query .................................................astRFTDggqf  375
ident                                                             
Sbjct vsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaiHRWL....  470
DSSP  hhhhhhhhhlleeeeeelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhHHHE....


DSSP  llllllleellllllleelllhhheeeeeeeelllllll
Query gfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                        
Sbjct .....rpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  .....eeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiase   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct learsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptrap  120
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllllll


DSSP  ..................lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh
Query ..................dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrke   42
ident                                                             
Sbjct lpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsqiv  180
DSSP  llllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelll
Query ileanridvekarergvkeslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvred  102
ident                                                             
Sbjct aecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlaher  240
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  lleeeeeeeelLLEEEELLL.....LLHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEEELLHH.HHH
Query glriarvrvpiGPIGIIYES.....RPNVTVETTILALKSG.....NTILLRGGSD.ALN  151
ident                                                             
Sbjct pepipfygelgAINPTFIFPsamraKADLADQFVASMTMGCgqfctKPGVVFALNTpETQ  300
DSSP  llllleeeellLLLEEEELHhhhhhLLLHHHHHHHHHLHHHhllllLLLEEEEELLhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHH...............................HLLL....LLLHH....
Query SNKAIVSAIREA...............................LKET....EIPES....  172
ident                                                             
Sbjct AFIETAQSLIRQqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtFSQAespcVASALfvts  360
DSSP  HHHHHHHHHHHHllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeELLLllllLLLEEeeee


DSSP  .................HEEELLLLLLHHHHHHL.LLLLlLLEEEELL...LHHHHHHHH
Query .................SVEFIENTDRSLVLEMI.RLREyLSLVIPRG...GYGLISFVR  211
ident                               |     |               |   |   
Sbjct senwrkhpaweeeifgpQSLIVVCENVADMLSLSeMLAG.SLTATIHAteeDYPQVSQLI  419
DSSP  hhhhhhlhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHhLLLL.EEEEEEELlhhHHHHHHHHH


DSSP  HH.LLLL..LLLLlllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhh
Query DN.ATVP..VLETgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiak  268
ident                                                             
Sbjct PRlEEIAgrLVFN...............................................  432
DSSP  HHhHLLEeeEEEL...............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhh
Query eflpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaie  328
ident                                                             
Sbjct ............................................................  432
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellll
Query hikkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqrf  388
ident                                                             
Sbjct ..............gwptgvevgyamvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqal  478
DSSP  ..............llllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeell


DSSP  llleelllhhheeeeeeeelllllll
Query hargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                           
Sbjct pesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  lhhhllhhhllllllllleeelllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel
Query eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll
Query esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
ident                                                             
Sbjct ..tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtia   58
DSSP  ..llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeelllllhhhhh
Query drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvgnchifvdesadlkkav  240
ident                                                             
Sbjct selearsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptr  118
DSSP  hhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllll


DSSP  hhhhhhhhlllllllleeeeeEEHHHHHHH..HHHHHHHHHHLLLEEEELHH..hhHHLL
Query pviinaktqrpgtcnaaekllVHEKIAKEF..LPVIVEELRKHGVEVRGCEK..trEIVP  296
ident                              |             |  |             
Sbjct aplpkpdirrqqialgpvavfGASNFPLAFsaAGGDTASALAAGCPVIVKGHtahpGTSQ  178
DSSP  llllllleeeeeeellleeeeLLLLLLLLLllLLHHHHHHHHHLLLEEEELLlllhHHHH


DSSP  ..................lLEEL.......lhHHLLLLLllleeeeeeELLHHHHHHHHH
Query ..................dVVPA.......teDDWPTEYldliiaikvVKNVDEAIEHIK  331
ident                                                    |        
Sbjct ivaecieqalkqeqlpqaiFTLLqgnqralgqALVSHPE...ikavgfTGSVGGGRALFN  235
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhhEEEElllllhhhhHHHHLLL...lleeeeELLHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLL......................................................
Query KYSTGH......................................................  337
ident                                                             
Sbjct LAHERPepipfygelgainptfifpsamrakadladqfvasmtmgcgqfctkpgvvfaln  295
DSSP  HHHHLLlllleeeellllleeeelhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  337
ident                                                             
Sbjct tpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvasa  355
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  337
ident                                                             
Sbjct lfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslsemlagsltatihateedypqv  415
DSSP  eeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhh


DSSP  ......................eeeeelllhhhHHHHhhhlllleeEELLLhhhllllll
Query ......................sesiltenysnAKKFvseidaaavYVNAStrftdggqf  375
ident                                                             
Sbjct sqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggPYPA.......stHSAST...svgaea  465
DSSP  hhhhhhhhlleeeeeelllllllllllllllllLLLL.......llLLLLL...lllhhh


DSSP  llllllleellllllleelllhhheeeeeeeelllllll
Query gfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                        
Sbjct ihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgkaa  504
DSSP  hhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeelllll