No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=18.3

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllHHHHHHHHHH
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsREEVERTLDV   60
ident                                                             
Sbjct .................................................hMSSSQQIAKN   11
DSSP  .................................................lLLHHHHHHHH


DSSP  HHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL...........llhhH
Query LFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAG...........kpksA  109
ident                 |   | |  |    |     |                       
Sbjct AR.KAGNILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAvaketgladsllkrlD   70
DSSP  HH.HHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhL


DSSP  HHH..HHHHHHHHHHLLLHHHHH..LLLEEEELlllllLLLEEEEEEEEELLEEEEELLL
Query AVG..EVKAAVDRLRLAELDLKK..IGGDYIPGdwtydTLETEGLVRREPLGVVAAITPF  165
ident                                                  | ||   |   
Sbjct LFKgdKFEVMLQGIKDVAELEDPvgKVKMAREL.....DDGLTLYQVTAPVGVLLVIFES  125
DSSP  LLLllHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLEEEEEEE.....ELLEEEEEEEEELLEEEEEELL


DSSP  llLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL........LLLLLEEE
Query nyPLFDAVNKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAG........FPPDAIAL  217
ident         |    |   |||   |             |   |           |     |
Sbjct ..RPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqsetgVPVGSVQL  183
DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLLLLLEEE


DSSP  LLLLhhhLHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLlLEEEE.elllleeeEELLlll
Query LNLPgkeAEKIVADD.RVAAVSFTGSTEVGERVVKVGGvKQYVM.elgggdpaIVLEdad  275
ident               |     |   ||                                  
Sbjct IETR...VSDLLDQDeYIDLVVPRGSNALVRKIKDTTK.IPVLGhadgicsiyLDED...  236
DSSP  LLLL...LHHHHHLLlLLLEEEEELLHHHHHHHHHLLL.LLLLLllllleeeeELLL...


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhHHHHHHH..........hhhhhhhlllll
Query ldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpVYGKLVE..........evakrlsslrvg  325
ident                                   |                         
Sbjct ..............................aDLIKAKRisldaktncnametllinpkfs  266
DSSP  ..............................lLHHHHHHhhhhlllllllleeeeelllll


DSSP  llllllllllllllhhhhhHHHHHHHHhhhllLEEEellleeelleelleeeellhhHHL
Query dprdptvdvgplispsavdEMMAAIEDavekgGRVLaggrrlgptyvqptfveapadRVK  385
ident                                    |                        
Sbjct kwwevlenltleggvtihaTKDLKTAY..fdkLNEL..................gklTEA  306
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllleeLHHHHHHH..hhhHHHH..................lllLHH


DSSP  LLhHHHLllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeelllhhhhhhhhhhllllee
Query DMvLYKRevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfgrdvvkirravrllevgai  445
ident                                                             
Sbjct IQ.CKTV.....................................................  312
DSSP  HH.LLLL.....................................................


DSSP  eelllllllllllllllEELL.......................................
Query yindmprhgigyypfggRKKS.......................................  466
ident                                                             
Sbjct .................SLDLaakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaekfmk  355
DSSP  .................LLLLeeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhh


DSSP  .........eelllllllLHHHHEEEEEEEEELLLllLLLLl
Query .........gvfregigyAVEAVTAYKTIVFNYKGkgVWKYe  499
ident                          |           |    
Sbjct gvdssgvywnastrfadvGLDGLVSYQYQIRGDGQ..VASDy  395
DSSP  hlllleeeelllhhhlllLLHHHEEEEEEEELLLL..LLLLl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=12.3

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct .....................................hmsssqqiaknarkagnilktis   23
DSSP  .....................................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct negrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqg   83
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhh


DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh
Query lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
ident                                                             
Sbjct ikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvllvifesrpevianitalsiksgna  143
DSSP  hhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlle


DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee
Query iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
ident                                                             
Sbjct ailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgsvqlietrvsdlldqdeyidlvvp  203
DSSP  eeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllhhhhhlllllleeee


DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeeLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLlleEE
Query gstevgervvkvggvkqyvmeLGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSyaGQRCdaiKL  300
ident                        |       |||||  |                     
Sbjct rgsnalvrkikdttkipvlghADGICSIYLDEDADLIKAKRISLDAKTN..CNAM...ET  258
DSSP  ellhhhhhhhhhlllllllllLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLL..LLLL...EE


DSSP  EEEEHHH..HHHHHHHHHHHHHlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query VLAERPV..YGKLVEEVAKRLSslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekgg  358
ident  |            |                                             
Sbjct LLINPKFskWWEVLENLTLEGG......................................  280
DSSP  EEELLLLllHHHHHHHHHHHHL......................................


DSSP  eeeellleeelleelLEEEELLH..........hhhlllhhhhllllLLEEEEEEELLHH
Query rvlaggrrlgptyvqPTFVEAPA..........drvkdmvlykrevfAPVALAVEVKDLD  408
ident                 |                                   |  |    
Sbjct ...............VTIHATKDlktayfdklnelgklteaiqcktvSLDLAAKFVTSTE  325
DSSP  ...............LLLEELHHhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllLLLLEEEELLLHH


DSSP  HHHHHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLllllllleellee
Query QAIELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGIgyypfggrkksgv  468
ident  ||   |        |                     | |   |                
Sbjct SAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDSSGVYWNASTRFAD.............  372
DSSP  HHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHHHLL.............


DSSP  llllllllhhhheeeeeeeeellllllllll
Query fregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
ident                                
Sbjct ........vgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  ........lllhhheeeeeeeelllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  ..........................lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeee
Query ..........................agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeiev   34
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  elllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhHHLHhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh
Query kspidlatiakvispsreevertldvlFKRGrwsardmpgterlavlrkaadiiernldv   94
ident                                                             
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnALVR.............................  211
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhHHHH.............................


DSSP  hhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeee
Query faevlvmnagkpksaavgevkaavdrlrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrre  154
ident                                                             
Sbjct ...............................................kikdttkipvlgh  224
DSSP  ...............................................hhhhlllllllll


DSSP  eLLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LEEEEELLLLLlHHHHHHHHHHHHL.LLLL
Query pLGVVAAITPFNYPLFDAVNKITYSFIYG.NAVVVKPSISDpLPAAMAVKALLDA.GFPP  212
ident   |           |  |                                 |    |   
Sbjct aDGICSIYLDEDADLIKAKRISLDAKTNCnAMETLLINPKF.SKWWEVLENLTLEgGVTI  283
DSSP  lLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLL.LLHHHHHHHHHHHhLLLL


DSSP  L..............................LEEELLLLH.HHLHHHHLLLL.lLEEEEE
Query D..............................AIALLNLPG.KEAEKIVADDR.vAAVSFT  240
ident                                  |         |                
Sbjct HatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvslDLAAKFVTStESAIQHINTHSsrHTDAIV  343
DSSP  EelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllLLEEEELLLhHHHHHHHLLLLllLEEEEE


DSSP  L.LHHHHHHHHHHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllee
Query G.STEVGERVVKVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaik  299
ident        |   |                                                
Sbjct TeNKANAEKFMKGVDSSGVYWN......................................  365
DSSP  LlLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL......................................


DSSP  eeeeehhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle
Query lvlaerpvygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggr  359
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellleeelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllle
Query vlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpy  419
ident                                                             
Sbjct ............................................................  365
DSSP  ............................................................


DSSP  eleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhH
Query gldaavfgrdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveA  479
ident                                                             
Sbjct .........................................................asT  368
DSSP  .........................................................llH


DSSP  HEEE.....eeEEEELLlllLLLLL.....
Query VTAY.....ktIVFNYKgkgVWKYE.....  499
ident   |                           
Sbjct RFADvgldglvSYQYQI...RGDGQvasdy  395
DSSP  HHLLlllhhheEEEEEE...ELLLLlllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ...................hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkan   41
DSSP  ...................lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhHHHHhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpkSAAVgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct ahaieeankidlavaketgladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaELED.........   92
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHLLL.........


DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhHHHHHhhhhh
Query lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfDAVNKitysf  180
ident                                                     |       
Sbjct ................................................pvGKVKM.....   99
DSSP  ................................................llLLEEE.....


DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlLLLLLEEEEE
Query iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaDDRVAAVSFT  240
ident                                                   ||       |
Sbjct ..............................................arelDDGLTLYQVT  113
DSSP  ..............................................eeeeELLEEEEEEE


DSSP  LlhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEE
Query GstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLedADLDlAADKIARGIYSyagqRCDAiKL  300
ident                        |    |             |             |   
Sbjct A....................pVGVLLVIFE..SRPE.VIANITALSIK....SGNA.AI  145
DSSP  E....................eLLEEEEEEL..LLLH.HHHHHHHHHHH....HLLE.EE


DSSP  EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllee
Query VLAERPVYGKLVEEVAKRLSSlrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrv  360
ident             |                                               
Sbjct LKGGKESVNTFREMAKIVNDT.......................................  166
DSSP  EELLHHHHHHHHHHHHHHHHH.......................................


DSSP  eELLLEEEllEELLEeeellhhhhlllhhhhlllllLEEEEEEELlhhhHHHHHHLLLEE
Query lAGGRRLGptYVQPTfveapadrvkdmvlykrevfaPVALAVEVKdldqAIELANGRPYG  420
ident              |                            |         |     | 
Sbjct .IAQFQSE..TGVPV.....................GSVQLIETR....VSDLLDQDEYI  198
DSSP  .HHHHHHH..HLLLL.....................LLEEELLLL....LHHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE.................................
Query LDAAVFGrDVVKIRRAVRLLEVgAIYI.................................  447
ident       |      |                                              
Sbjct DLVVPRG.SNALVRKIKDTTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnam  256
DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHLLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  447
ident                                                             
Sbjct etllinpkfskwwevlenltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldl  316
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllll


DSSP  .....................................................lllLLLL
Query .....................................................ndmPRHG  454
ident                                                             
Sbjct aakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLD  376
DSSP  eeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLH


DSSP  lllllllleelleellllllllhhhheeEEEEeeellllllllll
Query igyypfggrkksgvfregigyaveavtaYKTIvfnykgkgvwkye  499
ident                                              
Sbjct .............glvsyqyqirgdgqvASDY.............  395
DSSP  .............hheeeeeeeelllllLLLL.............