No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=37.0

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelLLLEEEEELLLLLLEE.EEEELLLHHHHHHHHH
Query agllegvikekggvpvypsylagewggSGQEIEVKSPIDLATI.AKVISPSREEVERTLD   59
ident                                                      ||     
Sbjct ...........................TDNVFYATNAFTGEALpLAFPVHTEVEVNQAAT   33
DSSP  ...........................LLLEEEEELLLLLLEEeEEEELLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query VLFKRgRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAVGEVKAAVD  119
ident    |      |      |   ||  |   |   |            |     ||      
Sbjct AAAKV.ARDFRRLNNSKRASLLRTIASELEARSDDIIARAHLETALPEVRLTGEIARTAN   92
DSSP  HHHHH.HHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLHHH...HHLLLEEEELLLLLL.lLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHH..H
Query RLRLAELDL...KKIGGDYIPGDWTYD.tLETEGLVRREPLGVVAAITPFNYPLFDA..V  173
ident  |||                    |               || ||     | ||      
Sbjct QLRLFADVVnsgSYHQAILDTPNPTRAplPKPDIRRQQIALGPVAVFGASNFPLAFSaaG  152
DSSP  HHHHHHHHHhhlHHHLEEEELLLLLLLllLLLLEEEEEEELLLEEEELLLLLLLLLLllL


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLLLLEEELLLL.HHHLHHH
Query NKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAG....FPPDAIALLNLP.GKEAEKI  228
ident          |  | ||     |            |      |     ||           
Sbjct GDTASALAAGCPVIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQALkqeqLPQAIFTLLQGNqRALGQAL  212
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLHHHEEEELLLlLHHHHHH


DSSP  HLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHL....LLEEEEELLLLEEEEELLLLL..HHHHHHH
Query VADDRVAAVSFTGSTEVGERVVKVGG....VKQYVMELGGGDPAIVLEDAD..LDLAADK  282
ident |      || ||||   |                  |||   |      |       || 
Sbjct VSHPEIKAVGFTGSVGGGRALFNLAHerpePIPFYGELGAINPTFIFPSAMraKADLADQ  272
DSSP  HHLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEELLLLLEEEELHHHHhhLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHLLLLllllllllllLLLLLHH
Query IARGIYSYAGQRCDAIKLVLAERP.VYGKLVEEVAKRLSSLRVgdprdptvdvGPLISPS  341
ident          || |     | |          |                       |  | 
Sbjct FVASMTMGCGQFCTKPGVVFALNTpETQAFIETAQSLIRQQSP..........STLLTPG  322
DSSP  HHHHHLHHHHLLLLLLLEEEEELLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........LLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHL.LLEEeELLLEEELlEELLEEEELLHHHHL.LLHHHhLLLLLLEE
Query AVDEMMAAIEDAVEK.GGRVlAGGRRLGPtYVQPTFVEAPADRVK.DMVLYkREVFAPVA  399
ident   |             |  |        |  |                     | | |  
Sbjct IRDSYQSQVVSRGSDdGIDV.TFSQAESP.CVASALFVTSSENWRkHPAWE.EEIFGPQS  379
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLlLEEE.EELLLLLL.LLLLEEEEEEHHHHHhLHHHH.LLLLLLEE


DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLEELEEEEELL..LHHHHHHHHHHL..LLLEEEELLLL.LLL
Query LAVEVKDLDQAIELANGRPYGLDAAVFGR..DVVKIRRAVRLL..EVGAIYINDMP.RHG  454
ident | |          |       | |       |          |    |    |  |    
Sbjct LIVVCENVADMLSLSEMLAGSLTATIHATeeDYPQVSQLIPRLeeIAGRLVFNGWPtGVE  439
DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHhlLEEEEEELLLLlLLL


DSSP  LLL.LLLLLEELLEE...LLLLLLLLHHHHEEEEEEEE................elllll
Query IGY.YPFGGRKKSGV...FREGIGYAVEAVTAYKTIVF................nykgkg  494
ident  ||    ||                |                                  
Sbjct VGYaMVHGGPYPASThsaSTSVGAEAIHRWLRPVAYQAlpesllpdslkaenpleiarav  499
DSSP  LLLlLLLLLLLLLLLlllLLLLLHHHHHHHEEEEEEELllhhhllhhhllllllllleee


DSSP  lllll
Query vwkye  499
ident      
Sbjct dgkaa  504
DSSP  lllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.3

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh
Query lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
ident                                                             
Sbjct ..........tdnvfyatnaftgealplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskr   50
DSSP  ..........llleeeeelllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhh


DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee
Query iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
ident                                                             
Sbjct asllrtiaselearsddiiarahletalpevrltgeiartanqlrlfadvvnsgsyhqai  110
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlee


DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHH..HHHHHHHHHHhhhlLLLLe
Query gstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLA..ADKIARGIYSyagqRCDAi  298
ident                        |                 |                  
Sbjct ldtpnptraplpkpdirrqqiaLGPVAVFGASN.FPLAFsaAGGDTASALA....AGCP.  164
DSSP  eellllllllllllleeeeeeeLLLEEEELLLL.LLLLLllLLHHHHHHHH....HLLL.


DSSP  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query KLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekgg  358
ident   |       |                                                 
Sbjct VIVKGHTAHPGTSQIVAECIEQ......................................  186
DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHHHH......................................


DSSP  eeeELLLEeelleELLEeeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLlL
Query rvlAGGRRlgptyVQPTfveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVKDLDQAIELANGrP  418
ident    |           |                                      |    |
Sbjct ...ALKQE.....QLPQ.....................aIFTLLQGNQRALGQALVSH.P  216
DSSP  ...HHHHH.....LLLH.....................hHEEEELLLLLHHHHHHHHL.L


DSSP  EELEEEEELlLHHHHHHHHHHLL....LLEEEEL..........................
Query YGLDAAVFGrDVVKIRRAVRLLE....VGAIYIN..........................  448
ident         |  |   |    |          |                            
Sbjct EIKAVGFTG.SVGGGRALFNLAHerpePIPFYGElgainptfifpsamrakadladqfva  275
DSSP  LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEEEllllleeeelhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct smtmgcgqfctkpgvvfalntpetqafietaqslirqqspstlltpgirdsyqsqvvsrg  335
DSSP  hhlhhhhllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct sddgidvtfsqaespcvasalfvtssenwrkhpaweeeifgpqslivvcenvadmlslse  395
DSSP  lllleeeeelllllllllleeeeeehhhhhhlhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct mlagsltatihateedypqvsqliprleeiagrlvfngwptgvevgyamvhggpypasth  455
DSSP  lllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllllllllllllllll


DSSP  ..........llLLLLLLlllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeelllllllll
Query ..........dmPRHGIGyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwky  498
ident                                                             
Sbjct sastsvgaeaihRWLRPV............ayqalpesllpdslkaenpleiaravdgka  503
DSSP  lllllllhhhhhHHEEEE............eeelllhhhllhhhllllllllleeellll


DSSP  l
Query e  499
ident  
Sbjct a  504
DSSP  l


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ..............................................tdnvfyatnaftge   14
DSSP  ..............................................llleeeeellllll


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct alplafpvhtevevnqaataaakvardfrrlnnskrasllrtiaselearsddiiarahl   74
DSSP  eeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllhhhhhlLLEeeellllllllleeeeE.............................
Query lrlaeldlkkiGGDyipgdwtydtleteglV.............................  151
ident                                                             
Sbjct etalpevrltgEIA................Rtanqlrlfadvvnsgsyhqaildtpnptr  118
DSSP  hhlllhhhhhhHHH................Hhhhhhhhhhhhhhhlhhhleeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct aplpkpdirrqqialgpvavfgasnfplafsaaggdtasalaagcpvivkghtahpgtsq  178
DSSP  llllllleeeeeeellleeeelllllllllllllhhhhhhhhhllleeeelllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct ivaecieqalkqeqlpqaiftllqgnqralgqalvshpeikavgftgsvgggralfnlah  238
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........eeeelLEEEEELLLLLL...lHHHHHHHHHHHHLL.....LEEEEELLLL.L
Query ........rreplGVVAAITPFNYP...lFDAVNKITYSFIYG.....NAVVVKPSIS.D  194
ident                                |                   ||       
Sbjct erpepipfygelgAINPTFIFPSAMrakaDLADQFVASMTMGCgqfctKPGVVFALNTpE  298
DSSP  hlllllleeeellLLLEEEELHHHHhhllLHHHHHHHHHLHHHhllllLLLEEEEELLhH


DSSP  LHHHHHHHHHHHHLL........................................LLLL.
Query PLPAAMAVKALLDAG........................................FPPD.  213
ident           |                                                 
Sbjct TQAFIETAQSLIRQQspstlltpgirdsyqsqvvsrgsddgidvtfsqaespcvaSALFv  358
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllLEEEe


DSSP  ...................LEEELLLL.HHHLHHHHL.LLLLLEEEEEL...LHHHHHHH
Query ...................AIALLNLP.GKEAEKIVA.DDRVAAVSFTG...STEVGERV  249
ident                                                             
Sbjct tssenwrkhpaweeeifgpQSLIVVCEnVADMLSLSEmLAGSLTATIHAteeDYPQVSQL  418
DSSP  eehhhhhhlhhhhllllllEEEEEEELlHHHHHHHHHlLLLEEEEEEELlhhHHHHHHHH


DSSP  HHHHLL..LEEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhh
Query VKVGGV..KQYVmelgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpv  307
ident            |                                                
Sbjct IPRLEEiaGRLV................................................  430
DSSP  HHHHHLleEEEE................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelllee
Query ygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrl  367
ident                                                             
Sbjct ............................................................  430
DSSP  ............................................................


DSSP  elleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeel
Query gptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfg  427
ident                                                             
Sbjct ............................................................  430
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEEEEE..
Query rdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTAYKT..  485
ident                                                             
Sbjct ...............................................fngwPTGVEVGya  443
DSSP  ...............................................elllLLLLLLLll


DSSP  ...............................................eeeelllllllll
Query ...............................................ivfnykgkgvwky  498
ident                                                             
Sbjct mvhggpypasthsastsvgaeaihrwlrpvayqalpesllpdslkaenpleiaravdgka  503
DSSP  lllllllllllllllllllhhhhhhheeeeeeelllhhhllhhhllllllllleeellll


DSSP  l
Query e  499
ident  
Sbjct a  504
DSSP  l