No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=15.4

DSSP  ...........................lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh
Query ...........................dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkia   33
ident                                                             
Sbjct ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttv   60
DSSP  lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  hhhhhlhHHHHHHHHHhhhhhhhllllhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHH..LLLLl
Query eklderrKEILEANRIdvekarergvkeslvdrlalnDKRIDEMIKACETVIG..LKDPv   91
ident         ||  |                        |     |  |             
Sbjct talkvsaEEIAAASER...................lsDELKQAMAVAVKNIETfhTAQK.  100
DSSP  llllllhHHHHHHHHH...................llHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLL.


DSSP  lLEEEEEELLLLLEEEEEEEELLLEEEELLL....LLHHHHHHHHHHHHLLL.LEEEELL
Query gEVIDSWVREDGLRIARVRVPIGPIGIIYES....RPNVTVETTILALKSGN.TILLRGG  146
ident            | |   |  |    |                    |   |     |   
Sbjct .LPPVDVETQPGVRCQQVTRPVASVGLYIPGgsapLFSTVLMLATPASIAGCkKVVLCSP  159
DSSP  .LLLEEEEEELLEEEEEEEEELLEEEEELLLllllLHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEEL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllhhhEEELlLLLL.HHHHHHLLL...llLLLEEEELL
Query SDALNSNKAIVSAIRealketeipessVEFIeNTDR.SLVLEMIRL...reYLSLVIPRG  202
ident                                 |                          |
Sbjct PPIADEILYAAQLCG...........vQDVF.NVGGaQAIAALAFGtesvpKVDKIFGPG  207
DSSP  LLLLHHHHHHHHHLL...........lLEEE.ELLHhHHHHHHHHLlllllLLLEEELLL


DSSP  LHHHHHHHHHHL....LLLLLL.LLLLLEEEEELLLLlhhhHHHHHHHHHHLLLLLL.lL
Query GYGLISFVRDNA....TVPVLE.TGVGNCHIFVDESAdlkkAVPVIINAKTQRPGTC.nA  256
ident         |               |        |  |                       
Sbjct NAFVTEAKRQVSqrldGAAIDMpAGPSEVLVIADSGA....TPDFVASDLLSQAEHGpdS  263
DSSP  LHHHHHHHHHHHhlllLLEELLlLLLLEEEEEELLLL....LHHHHHHHHHHHHLLLllL


DSSP  EEEEEEEhhhHHHHHHHHHHHHHHLLleeeelhhhhhhlllleellhhhllllLLLLEEE
Query AEKLLVHekiAKEFLPVIVEELRKHGvevrgcektreivpdvvpateddwpteYLDLIIA  316
ident    ||     |        |                                        
Sbjct QVILLTP...AADMARRVAEAVERQL.................aelpraetarQALNASR  303
DSSP  EEEEEEL...LHHHHHHHHHHHHHHH.................hlllllhhhhHHHLLLE


DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHHLLlLEEEEELLlhhHHHHHHHHL.LLLEEEEL..LLHHHLLll
Query IKVVKNVDEAIEHIKKYSTgHSESILTEnysNAKKFVSEI.DAAAVYVN..ASTRFTDgg  373
ident   | |      |    |       | |    ||   |  |  |  |           |  
Sbjct LIVTKDLAQCVEISNQYGP.EHLIIQTR...NARELVDSItSAGSVFLGdwSPESAGD..  357
DSSP  EEELLLHHHHHHHHHHHLL.LEEEEELL...LHHHHHHHLlLLLEEEELllLLHHHHH..


DSSP  llllLLLLLEE...LLLLllLEELLLHHHEEEEEEEELLL..LLLL..............
Query qfgfGAEIGIS...TQRFhaRGPVGLRELTTYKFVVLGEY..HVRE..............  414
ident     |                   ||        |                         
Sbjct .yasGTNHVLPtygYTAT..CSSLGLADFQKRMTVQELSKegFSALastietlaaaerlt  414
DSSP  .hllLLLLLLLlllHHHL..LLLLLHHHHEEEEEEEEELHhhHHHHhhhhhhhhhhlllh


DSSP  .................
Query .................  414
ident                  
Sbjct ahknavtlrvnalkeqa  431
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.9

DSSP  ...........lhhHHHHHH........................................
Query ...........delLEKAKK........................................    9
ident                                                             
Sbjct ntiidwnsctaeqqRQLLMRpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttv   60
DSSP  lleeehhhllhhhhHHHLLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    9
ident                                                             
Sbjct talkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgvrcqqvtrp  120
DSSP  llllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeee


DSSP  ..........hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ..........vreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergv   59
ident                                                             
Sbjct vasvglyipggsaplfstvlmlatpasiagckkvvlcspppiadeilyaaqlcgvqdvfn  180
DSSP  lleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhlllleeee


DSSP  lhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeEEEEElLLEEEE
Query keslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriaRVRVPiGPIGII  119
ident                                                     |      |
Sbjct vggaqaiaalafgtesvpkvdkifgpgnafvteakrqvsqrldgaaidMPAGP.SEVLVI  239
DSSP  llhhhhhhhhhhllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhllllleelLLLLL.LEEEEE


DSSP  LLL..LLHHHHHHHHHHHHLL..LLEEEEL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLL...lh
Query YES..RPNVTVETTILALKSG..NTILLRG.GSDALNSNKAIVSAIREALkETEI...pe  171
ident   |   |             |      |     |        |      |   |      
Sbjct ADSgaTPDFVASDLLSQAEHGpdSQVILLTpAADMARRVAEAVERQLAELpRAETarqal  299
DSSP  ELLllLHHHHHHHHHHHHLLLllLEEEEEElLHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLHHhhhhh


DSSP  HHEEELLLLLLHHHHHHLLLLllLLEEEELLLhHHHHHhHHHL.LLLLLLLlllleeeee
Query SSVEFIENTDRSLVLEMIRLReyLSLVIPRGGyGLISFvRDNA.TVPVLETgvgnchifv  230
ident      |   |     |           |            |                   
Sbjct NASRLIVTKDLAQCVEISNQY.gPEHLIIQTR.NAREL.VDSItSAGSVFL.........  347
DSSP  LLLEEEELLLHHHHHHHHHHH.lLLEEEEELL.LHHHH.HHHLlLLLEEEE.........


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelhh
Query desadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakeflpviveelrkhgvevrgcek  290
ident                                                             
Sbjct ............................................................  347
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhh
Query treivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehikkystghsesiltenysnak  350
ident                                                             
Sbjct ............................................................  347
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllleeeelllhhhllllllllllLLLEE..lLLLLL..................
Query kfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaEIGIS..tQRFHA..................  390
ident                                                             
Sbjct .........................gdwsPESAGdyaSGTNHvlptygytatcsslglad  382
DSSP  .........................llllLHHHHhhlLLLLLllllllhhhllllllhhh


DSSP  .........................leelllhhheeeeeeeelllllll
Query .........................rgpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                                  
Sbjct fqkrmtvqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
DSSP  heeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.2

DSSP  .......lhhhHHHHHHHH........................hhhhhllllhhhhhhhh
Query .......dellEKAKKVRE........................awdvlrnattreknkai   29
ident            |                                                
Sbjct ntiidwnsctaEQQRQLLMrpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttv   60
DSSP  lleeehhhllhHHHHHHLLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhHHHHhhlll
Query kkiaeklderrkeileanridvekarergvkeslvdrlalndkridemikaCETViglkd   89
ident                                                             
Sbjct talkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgVRCQ.....  115
DSSP  llllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeellEEEE.....


DSSP  lllleeeeeellllleeeeeeeellleeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhh
Query pvgevidswvredglriarvrvpigpigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsda  149
ident                                                             
Sbjct ............................................................  115
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhh
Query lnsnkaivsairealketeipessvefientdrslvlemirlreylslviprggyglisf  209
ident                                                             
Sbjct ............................................................  115
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllllllllLLEEEEELLL..lLHHHHHHHHHHHHHLLLlllllEEEEEEEHHHH
Query vrdnatvpvletgvGNCHIFVDES..aDLKKAVPVIINAKTQRPgtcnaAEKLLVHEKIA  267
ident                                       |             |     ||
Sbjct ........qvtrpvASVGLYIPGGsapLFSTVLMLATPASIAGC....kKVVLCSPPPIA  163
DSSP  ........eeeeelLEEEEELLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHLL....lEEEEEELLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleEEEEEElLHHHHH
Query KEFLPVIVEELrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliIAIKVVkNVDEAI  327
ident  | |                                                |     ||
Sbjct DEILYAAQLCG...................................vQDVFNV.GGAQAI  187
DSSP  HHHHHHHHHLL...................................lLEEEEL.LHHHHH


DSSP  HHHHHH....lllLEEEEELllHHHHHHHHHHLL....LLEEEE................
Query EHIKKY....stgHSESILTenYSNAKKFVSEID....AAAVYV................  363
ident                                        ||                   
Sbjct AALAFGtesvpkvDKIFGPG..NAFVTEAKRQVSqrldGAAIDMpagpsevlviadsgat  245
DSSP  HHHHHLlllllllLEEELLL..LHHHHHHHHHHHhlllLLEELLllllleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  363
ident                                                             
Sbjct pdfvasdllsqaehgpdsqvilltpaadmarrvaeaverqlaelpraetarqalnasrli  305
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  363
ident                                                             
Sbjct vtkdlaqcveisnqygpehliiqtrnarelvdsitsagsvflgdwspesagdyasgtnhv  365
DSSP  elllhhhhhhhhhhhllleeeeelllhhhhhhhllllleeeelllllhhhhhhlllllll


DSSP  ...........lllhhHLLL....lllllllllleellllllleelllhhheeeeeeeel
Query ...........nastrFTDG....gqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlg  408
ident                                                             
Sbjct lptygytatcsslglaDFQKrmtvqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvn  425
DSSP  lllllhhhllllllhhHHEEeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllll
Query eyhvre  414
ident       
Sbjct alkeqa  431
DSSP  hhhhhl


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  ........lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhh
Query ........dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridve   52
ident                                                             
Sbjct ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttv   60
DSSP  lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  hhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeee
Query karergvkeslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvp  112
ident                                                             
Sbjct talkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgvrcqqvtrp  120
DSSP  llllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeee


DSSP  llleeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhh
Query igpigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipes  172
ident                                                             
Sbjct vasvglyipggsaplfstvlmlatpasiagckkvvlcspppiadeilyaaqlcgvqdvfn  180
DSSP  lleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhlllleeee


DSSP  heeellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllllllEEEEELL
Query svefientdrslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvgnCHIFVDE  232
ident                                                          |  
Sbjct vggaqaiaalafgtesvpkvdkifgpgnafvteakrqvsqrldgaaidmpagpSEVLVIA  240
DSSP  llhhhhhhhhhhllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhllllleellllllLEEEEEE


DSSP  L.....lLHHHHHHHHHHHHHlllllllleEEEEEEHH...HHHHHHHHHHHHH...hHL
Query S.....aDLKKAVPVIINAKTqrpgtcnaaEKLLVHEK...IAKEFLPVIVEEL...rKH  281
ident                                           |          |      
Sbjct DsgatpdFVASDLLSQAEHGP........dSQVILLTPaadMARRVAEAVERQLaelpRA  292
DSSP  LllllhhHHHHHHHHHHLLLL........lLEEEEEELlhhHHHHHHHHHHHHHhlllLL


DSSP  LLeeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleEEEEEEL......LHHHHHhhhhhhll
Query GVevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliIAIKVVK......NVDEAIehikkyst  335
ident                                   |            |            
Sbjct ET..........................arqalNASRLIVtkdlaqCVEISN.......q  319
DSSP  HH..........................hhhhhLLLEEEElllhhhHHHHHH.......h


DSSP  lleEEEELL...LHHHHHHhHHHLllleEEEL..............llHHHL........
Query ghsESILTE...NYSNAKKfVSEIdaaaVYVN..............asTRFT........  370
ident    |                          |                             
Sbjct ygpEHLIIQtrnARELVDS.ITSA....GSVFlgdwspesagdyasgtNHVLptygytat  374
DSSP  hllLEEEEElllHHHHHHH.LLLL....LEEEelllllhhhhhhllllLLLLllllhhhl


DSSP  .............lllllllllllleellllllleelllhhheeeeeeeelllllll
Query .............dggqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                                          
Sbjct csslgladfqkrmtvqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
DSSP  lllllhhhheeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl