No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=49.5

DSSP  ..........lLLLLEEELLEEELL..LLEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHH
Query ..........tKQYKNYVNGEWKLS..ENEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYASA   48
ident                   | ||             |  |     |     | ||     |
Sbjct avpapnqqpevFCNQIFINNEWHDAvsRKTFPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAA   60
DSSP  lllllllllllLLLLEEELLEEELLllLLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHH...HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHH
Query KKAQP...AWRALSYIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAV.SEVVRTA  104
ident   |      ||      |   |   ||   ||     |       | |            
Sbjct RAAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKPYVISYlVDLDMVL  120
DSSP  HHHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLEEEEHHhllhhhLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHH
Query EIINYAAEEGLRMEGEVLEGGsfeaasKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIA  164
ident     | |       |                   | ||||    | | | |      |  
Sbjct KCLRYYAGWADKYHGKTIPID......GDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLG  174
DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLEELLL......LLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLE
Query PALIAGNVIAFKPPTQGSISGLLLAEAFAEAGLPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNF  224
ident |||  |||   |   |     |  |    ||| | || |   | |   |  |  |  |  
Sbjct PALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDK  234
DSSP  HHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHLLLLLLE


DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHLL...LLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query INFTGSTGIGERIGKMAG...MRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQ  281
ident   ||||| ||  |   ||        ||||||   |   |||            |   ||
Sbjct VAFTGSTEIGRVIQVAAGssnLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQ  294
DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHHHhllLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query RCTAVKRVLVMESVADELVEKIREKVLALTIGNPEDD.ADITPLIDTKSADYVEGLINDA  340
ident    |  |  | |   || ||           ||| |      |  |        | ||  
Sbjct CSCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSkTEQGPQVDETQFKKILGYINTG  354
DSSP  LLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLEELLLLLEEL...LEELLEEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH
Query NDKGATALTEIKREG...NLICPILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEIS  397
ident    ||  |            | |  |  |   |  | || ||||  |      ||     
Sbjct KQEGAKLLCGGGIAAdrgYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRA  414
DSSP  HHLLLEEEELLLLLLlllLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLlLLLLLLLLLLLEELLEELLLLHH
Query NKSEYGLQASIFTNDFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKtQRGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVK  457
ident | | ||| |  || |   |      |  |||  |          || | | || |     
Sbjct NNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY.DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGE  473
DSSP  HLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL.LLLLLLLLLLLLHHHEELLLLLH


DSSP  HHHHHLEEEEEEEEELL....
Query YSIEAMTTVKSVVFDIK....  474
ident |   | | || |         
Sbjct YGLQAYTEVKTVTVKVPqkns  494
DSSP  HHHHHHEEEEEEEEELLllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvl  120
DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhh


DSSP  .llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query .tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawrals   59
ident                                                             
Sbjct kclryyagwadkyhgktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllmqawklgpalatg  180
DSSP  hhhhhhhhhllllllleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query yieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmeg  119
ident                                                             
Sbjct nvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaftgs  240
DSSP  leeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeeell


DSSP  eeeehhhllhhhlleeeeeeeeelLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHHHHLLL.....eE
Query evleggsfeaaskkkiavvrrepvGLVLAISPFN.YPVNLAGSKIAPALIAGN.....vI  173
ident                         |    |                              
Sbjct teigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSDaDMDWAVEQAHFALFFNQGqcscagS  300
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleE


DSSP  EEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH......................................
Query AFKPPTQGSISGLLLAEAFAEA......................................  195
ident                  | |                                        
Sbjct RTFVQEDIYDEFVERSVARAKSrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegak  360
DSSP  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ...............LLLLL.................LEEELLLLHHHHHHHHHHLL.LL
Query ...............GLPAG.................VFNTITGRGSEIGDYIVEHQ.AV  222
ident                                      |         |            
Sbjct llcgggiaadrgyfiQPTVFgdvqdgmtiakeeifgpVMQILKFKTIEEVVGRANNStYG  420
DSSP  eeellllllllllllLLEEEellllllhhhhllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLlLL


DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHLLlLLEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query NFINFTG.STGIGERIGKMAGmRPIMLElggkdsaivledadleltakniiagafgysgq  281
ident                                                             
Sbjct LAAAVFTkDLDKANYLSQALQaGTVWVN................................  448
DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHLLlLEEEEL................................


DSSP  lllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query rctavkrvlvmesvadelvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindan  341
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hllleellllleelleelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhll
Query dkgatalteikregnlicpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkse  401
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  eeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhHHH
Query yglqasiftndfprafgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkySIE  461
ident                                                             
Sbjct ........................................................cYDV  452
DSSP  ........................................................lLLL


DSSP  H.............................leeeeeeeeell
Query A.............................mttvksvvfdik  474
ident                                           
Sbjct Fgaqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
DSSP  Llllllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct ......................................avpapnqqpevfcnqifinnew   22
DSSP  ......................................llllllllllllllleeellee


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
ident                                                             
Sbjct hdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaraafqlgspwrrmdashrgrll   82
DSSP  elllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhllhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct nrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwadkyhgktipidg  142
DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllleellll


DSSP  llllleeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH
Query agmrpimlelgGKDSAIVLEDaDLELTAKNIIAGAFGYSGqrctavKRVLVMESVADELV  300
ident            |    |        |        |               | |       
Sbjct dffsytrhepvGVCGQIIPWN.FPLLMQAWKLGPALATGN.....vVVMKVAEQTPLTAL  196
DSSP  leeeeeeeeelLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eEEEELLLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleelleelL
Query EKIREKVLALtignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregnlicP  360
ident         |                                                   
Sbjct YVANLIKEAG.................................................F  207
DSSP  HHHHHHHHHL.................................................L


DSSP  EEEellllllhhhlllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHhLLEELEEEEELlLHHHHHHH
Query ILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVtSVEE.AIEISNkSEYGLQASIFTnDFPRAFGI  419
ident                     |  |            |    |                 |
Sbjct PPG.................VVNIVPG.FGPTaGAAIAS.HEDVDKVAFTG.STEIGRVI  247
DSSP  LLL.................LEEELLL.LLLLhHHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHH


DSSP  HHHL...LLLEEEEL.............................................
Query AEQL...EVGTVHIN.............................................  431
ident            |                                                
Sbjct QVAAgssNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffnqgqcscagsrtfvqed  307
DSSP  HHHHhhlLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct iydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqegakllcgggi  367
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct aadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevvgrannstyglaaavft  427
DSSP  lllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeel


DSSP  ................................................llLLLLllllll
Query ................................................nkTQRGtdnfpf  443
ident                                                             
Sbjct kdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrelgeyglqAYTE......  481
DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheelllllhhhhhHHEE......


DSSP  lleelleellLLHHhhhhhleeeeeeeeell
Query lgakksgagiQGVKysieamttvksvvfdik  474
ident                                
Sbjct ..........VKTV........tvkvpqkns  494
DSSP  ..........EEEE........eeellllll