No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=25.3

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH
Query psevvgttakagkAEAEAALEAAWKAFKTWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEATL  120
ident               |          |                 | |     |  |     
Sbjct .............DELLEKAKKVREAWDVLRNATTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEAN   47
DSSP  .............LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH


DSSP  HHHH............lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLLLLL.LLEEE
Query VYEV............gknwveASADVAEAIDFIEYYARAaLRYRYPAVEVVPY.PGEDN  167
ident    |                        | |   |                     |   
Sbjct RIDVekarergvkeslvdrlalNDKRIDEMIKACETVIGL.KDPVGEVIDSWVReDGLRI  106
DSSP  HHHHhhhhhllllhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLLEEEEEELlLLLEE


DSSP  EEEEEELLEEEEELLLllLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query ESFYVPLGAGVVIAPWnfPVAIFTGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAG  227
ident     || |    |                    |||       ||            || 
Sbjct ARVRVPIGPIGIIYES..RPNVTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREAL  164
DSSP  EEEEEELLLEEEELLL..LLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  ....LLLLLEEELLLLLLHHHHHHHLLLL.LLEEEEELLHHHHHHHHHHHLlllllllll
Query ....FPPGVVNFLPGVGEEVGAYLVEHPR.IRFINFTGSLEVGLKIYEAAGrlapgqtwf  282
ident      |   | |                         |           |          
Sbjct keteIPESSVEFIENTDRSLVLEMIRLREyLSLVIPRGGYGLISFVRDNAT.........  215
DSSP  llllLLHHHEEELLLLLLHHHHHHLLLLLlLLEEEELLLHHHHHHHHHHLL.........


DSSP  LEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHH
Query KRAYVETGGKNAIIVDETADFDLAAEGVVVSAYGFqGQKCSAASRLILTQGAYEPVLERV  342
ident         |   | ||| ||   |               | ||  |          |   
Sbjct VPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTQR.PGTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVI  274
DSSP  LLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllLLE
Query LKRAERLsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiAPT  402
ident                                                             
Sbjct VEELRKH..................................................GVE  284
DSSP  HHHHHHL..................................................LLE


DSSP  EEEL..........lllLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL
Query VFTE..........vppKARIAQEEIFGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSR  452
ident |                       |          ||   || |       |        
Sbjct VRGCektreivpdvvpaTEDDWPTEYLDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTE  344
DSSP  EEELhhhhhhlllleelLHHHLLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELL


DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLLL......LLLLHhhlLLLLLllhhHHHLL
Query KREHLEWARREFHVGNLYFNRKITGALVGVQP......FGGFKlsgTNAKTgaldYLRLF  506
ident           |      | |        |                           ||  
Sbjct NYSNAKKFVSEIDAAAVYVNASTRFTDGGQFGfgaeigISTQR.fhARGPV....GLREL  399
DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHHHLLLLLLLllllllEELLL.llLLEEL....LLHHH


DSSP  EEEEEEEEEL.....
Query LEMKAVAERF.....  516
ident    | |         
Sbjct TTYKFVVLGEyhvre  414
DSSP  EEEEEEEELLlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.7

DSSP  ........................llllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL...
Query ........................mtvepfrnepietfQTEEARRAMREALRRVREE...   33
ident                                          |   | |      ||    
Sbjct dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaekldeRRKEILEANRIDVEKARERgvk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHHHHHHHHHHLlll


DSSP  ......................lleeeleeelleeelllleeeeeelleeeeeeeeeell
Query ......................fgrhyplyiggewvdtkermvslnpsapsevvgttaka   71
ident                                                             
Sbjct eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query gkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatlvyevgknwvea  131
ident                                                             
Sbjct esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeeLLEEEEELLLL.LLLHHh
Query sadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvpLGAGVVIAPWN.FPVAIf  190
ident                                            |                
Sbjct drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgVGNCHIFVDESaDLKKA.  239
DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEELLLlLHHHH.


DSSP  HHHHHHHHHLL.....LEEEEELLHHHHHHHHHH.HHHHHHHLLL...............
Query TGMIVGPVAVG.....NTVIAKPAEDAVVVGAKV.FEIFHEAGFP...............  229
ident    |                    |        |  |     |                 
Sbjct VPVIINAKTQRpgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPViVEELRKHGVEvrgcektreivpdvv  299
DSSP  HHHHHHHHHLLlllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHhHHHHHHLLLEeeelhhhhhhlllle


DSSP  ............LLLEEELLLLLLHHHHHHHLLL.LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLll
Query ............PGVVNFLPGVGEEVGAYLVEHP.RIRFINFTG.SLEVGLKIYEAAGrl  275
ident                                                    |        
Sbjct pateddwpteylDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYsTGHSESILTeNYSNAKKFVSEID..  357
DSSP  ellhhhllllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL..


DSSP  lllllllLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhh
Query apgqtwfKRAYVEtggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrliltqgay  335
ident           ||                                                
Sbjct ......aAAVYVN...............................................  364
DSSP  ......lLEEEEL...............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllll
Query epvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlege  395
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhh
Query gyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggvysrkre  455
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhLLEE.......
Query hlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrLFLE.......  508
ident                                                             
Sbjct .............................................astrFTDGgqfgfga  379
DSSP  .............................................llhhHLLLlllllll


DSSP  .............EEEEE..............eel
Query .............MKAVA..............erf  516
ident                                    
Sbjct eigistqrfhargPVGLRelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  llleellllllleELLLHhheeeeeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.4

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee
Query vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
ident                                                             
Sbjct .........................................................del    3
DSSP  .........................................................lhh


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll
Query apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
ident                                                             
Sbjct lekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvkesl   63
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh


DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELll
Query eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDet  300
ident                                                   |   ||    
Sbjct vdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpIGPIGIIYE..  121
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeeLLLEEEELL..


DSSP  LLHHhHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllhhhllll
Query ADFDlAAEGVVVSAYGFQGqkcsaaSRLILTQGAYEPVLERVLKRAERLsvgpaeenpdl  360
ident              |             |     |       |    | |           
Sbjct SRPN.VTVETTILALKSGN.....tILLRGGSDALNSNKAIVSAIREAL...........  164
DSSP  LLLH.HHHHHHHHHHHLLL.....lEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHH...........


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeLLllllllllllLLEEeellllllhhhllllll
Query gpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlGGkrlegegyfiAPTVftevppkariaqeeifg  420
ident                                         |                   
Sbjct .........................keTE..........IPES.................  172
DSSP  .........................llLL..........LLHH.................


DSSP  lEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE.........
Query pVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSrKREHLEWARREFHVgNLYF.........  471
ident      |   |    ||      |                 |    |              
Sbjct .SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYLSLVIPRG.GYGLISFVRDNATV.PVLEtgvgnchif  229
DSSP  .HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLLLEEEELL.LHHHHHHHHHHLLL.LLLLllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  471
ident                                                             
Sbjct vdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakeflpviveelrkhgvevrgce  289
DSSP  elllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  471
ident                                                             
Sbjct ktreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehikkystghsesiltenysna  349
DSSP  hhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhh


DSSP  ...........................llllllllllLLLLlllhhhllllllllhhhhh
Query ...........................nrkitgalvgVQPFggfklsgtnaktgaldylr  504
ident                                                             
Sbjct kkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqRFHA.......rgpvglreltty  402
DSSP  hhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellLLLL.......leelllhhheee


DSSP  lleeeeeeeeel
Query lflemkavaerf  516
ident             
Sbjct kfvvlgeyhvre  414
DSSP  eeeeelllllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle
Query mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
ident                                                             
Sbjct ......dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridveka   54
DSSP  ......lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee
Query vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
ident                                                             
Sbjct rergvkeslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpig  114
DSSP  hhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeell


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll
Query apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
ident                                                             
Sbjct pigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessv  174
DSSP  leeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhe


DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELLl
Query eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDEt  300
ident                                                  |          
Sbjct efientdrslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvGNCHIFVDES.  233
DSSP  eellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEELLL.


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhllll
Query adfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrliltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdl  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................  233
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhllllll
Query gpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiaptvftevppkariaqeeifg  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................  233
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelLHHHHHHHHHLL........LLLLEEEEELLL.HHHHHHHHHH........
Query pvlsvirvkDFAEALEVANDT........PYGLTGGVYSRK.REHLEWARRE........  463
ident          |   |  |                   |      | |     |        
Sbjct ........aDLKKAVPVIINAktqrpgtcNAAEKLLVHEKIaKEFLPVIVEElrkhgvev  285
DSSP  ........lLHHHHHHHHHHHhhllllllLLEEEEEEEHHHhHHHHHHHHHHhhhlllee


DSSP  ..........................lllLEEEELL........................
Query ..........................fhvGNLYFNR........................  473
ident                                                             
Sbjct rgcektreivpdvvpateddwpteyldliIAIKVVKnvdeaiehikkystghsesilten  345
DSSP  eelhhhhhhlllleellhhhlllllllleEEEEEELlhhhhhhhhhhhlllleeeeelll


DSSP  ..........................lllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlle
Query ..........................kitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlfl  507
ident                                                             
Sbjct ysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttykfv  405
DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellllllleelllhhheeeeee


DSSP  eeeeeeeel
Query emkavaerf  516
ident          
Sbjct vlgeyhvre  414
DSSP  eelllllll