No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=25.7

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHlLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......
Query .SISDTVKRAREAFNsGKTR.SLQFRIQQLEALQRMINENLKSISGALASDLG.......   51
ident        |  |||                         |  | |  |   |         
Sbjct dELLEKAKKVREAWD.VLRNaTTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVEkarergv   59
DSSP  lHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHhhhhlll


DSSP  .....llhhhHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLE.ELLLLLLLllLEEEEEEEELLE
Query .....knewtSYYEeVAHVLEELDTTIKELPdWAEDE.PVAKTRQTqqDDLYIHSEPLGV  105
ident                         | |                             | | 
Sbjct keslvdrlalNDKR.IDEMIKACETVIGLKD.PVGEViDSWVREDG..LRIARVRVPIGP  115
DSSP  lhhhhhhhllLHHH.HHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLEeEEEELLLL..LEEEEEEEELLL


DSSP  EEEELLLllLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHL.....LLLL
Query VLVIGAWnyPFNLTIQPMVGAVAAGNAVILKPSEVSGHMADLLATLIPQYM.....DQNL  160
ident    |       | |      |   ||   |                |             
Sbjct IGIIYES..RPNVTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeiPESS  173
DSSP  EEEELLL..LLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllLHHH


DSSP  EEELL.LLHHHHHHHLLLL..LLEEEEELLHHHHHHHHHHHHlllLLEEEELLLLLEEEE
Query YLVVK.GGVPETTELLKER..FDHIMYTGSTAVGKIVMAAAAkhlTPVTLELGGKSPCYV  217
ident              |    |         |       |   |     ||     |     |
Sbjct VEFIEnTDRSLVLEMIRLReyLSLVIPRGGYGLISFVRDNAT...VPVLETGVGNCHIFV  230
DSSP  EEELLlLLLHHHHHHLLLLllLLEEEELLLHHHHHHHHHHLL...LLLLLLLLLLEEEEE


DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHHLLlLLLLLLLLEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhl
Query DKDCDLDVACRRIAWGKFMNsGQTCVAPDYILCDPSIQNQIVEKLKKSLKDFygedakqs  277
ident |   ||  |   |   |      || |    |    |           |           
Sbjct DESADLKKAVPVIINAKTQR.PGTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH........  281
DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL........


DSSP  llllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllleeLLEEELLL..........LLLLH
Query rdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryiAPTILVDV..........DPQSP  327
ident                                                             
Sbjct .....................................GVEVRGCEktreivpdvvPATED  304
DSSP  .....................................LLEEEELHhhhhhlllleELLHH


DSSP  HHLLLLLLLEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEL
Query VMQEEIFGPVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVFSNNEKVIKKMIAETSSGGVTAN  387
ident     |       |  |    |||  |              |    ||   |     |  |
Sbjct DWPTEYLDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVN  364
DSSP  HLLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEL


DSSP  LL.LHHH..HLLL...lLLLLLHhheELLLllhhHHHHLEEEEEEEELLLLLLLllhhhl
Query DV.IVHI..TVPT...lPFGGVGnsgMGAYhgkkSFETFSHRRSCLVKSLLNEEahkary  441
ident                            |                         |      
Sbjct AStRFTDggQFGFgaeiGISTQRfhaRGPV....GLRELTTYKFVVLGEYHVRE......  414
DSSP  LLhHHLLllLLLLllllLEELLLlllLEEL....LLHHHEEEEEEEELLLLLLL......


DSSP  lllll
Query ppspa  446
ident      
Sbjct .....  414
DSSP  .....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
Query sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyye   60
ident                                                             
Sbjct esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeeLLEEEEELLLL.LLLHHh
Query evahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihsepLGVVLVIGAWN.YPFNLt  119
ident                                            |                
Sbjct drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgVGNCHIFVDESaDLKKA.  239
DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEELLLlLHHHH.


DSSP  HHHHHHH.HHLL....LEEEEELLLLLH.HHHHHHHHHHHH.HLLLL.............
Query IQPMVGA.VAAG....NAVILKPSEVSG.HMADLLATLIPQ.YMDQN.............  159
ident       |          |  |   |                                   
Sbjct VPVIINAkTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAkEFLPVIVEELRKhGVEVRgcektreivpdvv  299
DSSP  HHHHHHHhHLLLllllLEEEEEEEHHHHhHHHHHHHHHHHHlLLEEEelhhhhhhlllle


DSSP  ..............LEEELLLLH.HHHHHHLLLLL..LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHll
Query ..............LYLVVKGGV.PETTELLKERF..DHIMYTG.STAVGKIVMAAAAkh  201
ident                          |  |  |                  |         
Sbjct pateddwpteyldlIIAIKVVKNvDEAIEHIKKYStgHSESILTeNYSNAKKFVSEID..  357
DSSP  ellhhhllllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHHHLllLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL..


DSSP  LLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleeeelhhhhhhhhhh
Query LTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyilcdpsiqnqivek  261
ident    |                                                        
Sbjct AAAVYVN.....................................................  364
DSSP  LLEEEEL.....................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllleelleeell
Query lkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryiaptilvd  321
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhlllll
Query vdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnnekvikkmiaetss  381
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhhhhHHLE..................ee
Query ggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfETFS..................hr  423
ident                                                             
Sbjct .................................astRFTDggqfgfgaeigistqrfhar  391
DSSP  .................................llhHHLLllllllllllleelllllll


DSSP  eeeeelllllllllhhhllllll
Query rsclvksllneeahkaryppspa  446
ident                        
Sbjct gpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  eelllhhheeeeeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  .............................lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhh
Query .............................sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqleal   31
ident                                                             
Sbjct dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhHHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllll
Query qrminenlksisgalasdlgknewTSYYEevahvleeldttikelpdwaedepvaktrqt   91
ident                                                             
Sbjct eslvdrlalndkridemikacetvIGLKD...............................   89
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHLLL...............................


DSSP  llleeeeeeeelleeeeelLL................LLllhhhhhhhhhhhhllleeee
Query qqddlyihseplgvvlvigAW................NYpfnltiqpmvgavaagnavil  135
ident                                                             
Sbjct .................pvGEvidswvredglriarvRV.....................  111
DSSP  .................llLLeeeeeellllleeeeeEE.....................


DSSP  elllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhh
Query kpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpettellkerfdhimytgstavgkivm  195
ident                                                             
Sbjct ............................................................  111
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeeelLLLLEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHLLLLllllllLEEEELHHHH
Query aaaakhltpvtlelGGKSPCYVDkdCDLDvACRRIAWGKFMNSGqtcvapDYILCDPSIQ  255
ident                |                                            
Sbjct .............pIGPIGIIYE..SRPN.VTVETTILALKSGN.....tILLRGGSDAL  150
DSSP  .............eLLLEEEELL..LLLH.HHHHHHHHHHHLLL.....lEEEELLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleEELLLEelllleEL
Query NQIVEKLKKslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvAHGGTWdqssryIA  315
ident |                                                           
Sbjct NSNKAIVSA...................................irEALKET......EI  169
DSSP  HHHHHHHHH...................................hhHHHLLL......LL


DSSP  LEEelllllllhhhlllllllEELEEELLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHHH
Query PTIlvdvdpqspvmqeeifgpVMPIVCVRSLEEAIQFINQREKPLALYVFSnNEKVIKKM  375
ident |                                    |  ||              |   
Sbjct PES..................SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYLSLVIPRG.GYGLISFV  210
DSSP  LHH..................HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLLLEEEELL.LHHHHHHH


DSSP  HLLLLLlEEEE.................................................
Query IAETSSgGVTA.................................................  386
ident         |                                                   
Sbjct RDNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiake  269
DSSP  HHHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  386
ident                                                             
Sbjct flpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaieh  329
DSSP  hhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhh


DSSP  .................................................llLLHHhhlll
Query .................................................ndVIVHitvpt  397
ident                                                             
Sbjct ikkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeIGIS...tq  386
DSSP  hhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllllllllllLLEE...ll


DSSP  LLLLllhhheelllllhhhhhhleeeeeeeelllllllllhhhllllll
Query LPFGgvgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
ident                                                  
Sbjct RFHA.....................rgpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  LLLL.....................leelllhhheeeeeeeelllllll