No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=10.1

DSSP  lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhHHHH............hhh
Query ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitrtvndildnvkARGD............eal   48
ident                                                             
Sbjct .........................................HMSSsqqiaknarkagnil   19
DSSP  .........................................LLLHhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhlllllllllllllhhhhHHHHHH........................LLHHHHHH
Query reysakfdkttvtalkvsaeeiAAASER........................LSDELKQA   84
ident                       | | |                                 
Sbjct ktisnegrsdilykihdalkanAHAIEEankidlavaketgladsllkrldlFKGDKFEV   79
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlHHHHHHhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhHLLL..LLLEEEEEELLEEEEEEEEELLEEEEELLLllllLHHHHHHH
Query MAVAVKNIETfhTAQK..LPPVDVETQPGVRCQQVTRPVASVGLYIPGgsapLFSTVLML  142
ident |    |                  |   |    ||| ||                     
Sbjct MLQGIKDVAE..LEDPvgKVKMARELDDGLTLYQVTAPVGVLLVIFES....RPEVIANI  133
DSSP  HHHHHHHHHH..LLLLllLEEEEEEEELLEEEEEEEEELLEEEEEELL....LLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLlEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLL...............lLEEEELlhhhhH
Query ATPASIAGCkKVVLCSPPPIADEILYAAQLCG...............vQDVFNVggaqaI  187
ident        |     |             |                                
Sbjct TALSIKSGN.AAILKGGKESVNTFREMAKIVNdtiaqfqsetgvpvgsVQLIET....rV  188
DSSP  HHHHHHHLL.EEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllEEELLL....lL


DSSP  HHHHHLlllllLLLEEELLLLHhhhhhhhhhhhlllLLEELLLLlllEEEEEELLLLLHH
Query AALAFGtesvpKVDKIFGPGNAfvteakrqvsqrldGAAIDMPAgpsEVLVIADSGATPD  247
ident   |          |     |                       |         |  |   
Sbjct SDLLDQ...deYIDLVVPRGSN....alvrkikdttKIPVLGHA.dgICSIYLDEDADLI  240
DSSP  HHHHHL...llLLLEEEEELLH....hhhhhhhhllLLLLLLLL.llLEEEEELLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLlLLLEEEEEELLH.HHHHHHHHHHHHHHH...................
Query FVASDLLSQAEHgPDSQVILLTPAA.DMARRVAEAVERQLA...................  287
ident       |            ||          | |                          
Sbjct KAKRISLDAKTN.CNAMETLLINPKfSKWWEVLENLTLEGGvtihatkdlktayfdklne  299
DSSP  HHHHHHHHLLLL.LLLLEEEEELLLlLLHHHHHHHHHHHHLllleelhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....lllllhhhHHHHllLEEEELLLHHHHHHHHHHH.llLEEEEELL...LHHHHHHHL
Query ....elpraetaRQALnaSRLIVTKDLAQCVEISNQY.gpEHLIIQTR...NARELVDSI  339
ident                                   |         | |    ||       
Sbjct lgklteaiqcktVSLD..LAAKFVTSTESAIQHINTHssrHTDAIVTEnkaNAEKFMKGV  357
DSSP  hllllhhhhlllLLLL..LEEEELLLHHHHHHHHLLLlllLEEEEELLlhhHHHHHHHHL


DSSP  lLLLEEEELllLLHHhhhhllllllllllllhhhllllLLHHHHEEEEEEEEElhhhhhh
Query tSAGSVFLGdwSPESagdyasgtnhvlptygytatcssLGLADFQKRMTVQELskegfsa  399
ident      |                                 ||                   
Sbjct .DSSGVYWN..ASTR....................fadVGLDGLVSYQYQIRG.......  387
DSSP  .LLLEEEEL..LLHH....................hllLLLHHHEEEEEEEEL.......


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query lastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
ident                                 
Sbjct ........................dgqvasdy  395
DSSP  ........................llllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .............................................lleeehhhllhhhhh
Query .............................................ntiidwnsctaeqqr   15
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  hhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhh
Query qllmrpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttvtalkvsaeeiaaase   75
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  hllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeeeLLEEEEELLLLlllL
Query rlsdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgvrcqqvtrpVASVGLYIPGGsapL  135
ident                                                    |        
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttkipvlghaDGICSIYLDED..aD  238
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllllllLLLEEEEELLL..lL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLHhHHHHHHHLL.....................
Query FSTVLMLATPASIAGCKKVVLCSPPPIADeILYAAQLCG.....................  174
ident           |         |   |                                   
Sbjct LIKAKRISLDAKTNCNAMETLLINPKFSK.WWEVLENLTleggvtihatkdlktayfdkl  297
DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEELLLLLL.HHHHHHHHHhhhlllleelhhhhhhhhhhh


DSSP  .................lLEEEEL.LHHHHHHHHHHLlllllllLEEELLL..LHHHHHH
Query .................vQDVFNV.GGAQAIAALAFGtesvpkvDKIFGPG..NAFVTEA  214
ident                        |     ||                       |     
Sbjct nelgklteaiqcktvsldLAAKFVtSTESAIQHINTH....ssrHTDAIVTenKANAEKF  353
DSSP  hhhllllhhhhlllllllLEEEELlLHHHHHHHHLLL....lllLEEEEELllHHHHHHH


DSSP  HHHHHhlllLLEELLllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeellhhh
Query KRQVSqrldGAAIDMpagpsevlviadsgatpdfvasdllsqaehgpdsqvilltpaadm  274
ident    |                                                        
Sbjct MKGVD....SSGVYW.............................................  364
DSSP  HHHLL....LLEEEE.............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeelllhhh
Query arrvaeaverqlaelpraetarqalnasrlivtkdlaqcveisnqygpehliiqtrnare  334
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeeelllllhhhhhhllllllllllllhhhllllllhhhheeeeeeEEELh
Query lvdsitsagsvflgdwspesagdyasgtnhvlptygytatcsslgladfqkrmtvQELSk  394
ident                                                             
Sbjct ............................nastrfadvgldglvsyqyqirgdgqvASDY.  395
DSSP  ............................lllhhhlllllhhheeeeeeeelllllLLLL.


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query egfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
ident                                      
Sbjct .....................................  395
DSSP  .....................................


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.7

DSSP  lleeehhhllHHHH.HHHLLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ntiidwnsctAEQQ.RQLLMRpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdktt   59
ident                 |                                           
Sbjct ..........HMSSsQQIAKN.......................................   11
DSSP  ..........LLLHhHHHHHH.......................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeee
Query vtalkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgvrcqqvtr  119
ident                                                             
Sbjct ............................................................   11
DSSP  ............................................................


DSSP  elleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhlllleee
Query pvasvglyipggsaplfstvlmlatpasiagckkvvlcspppiadeilyaaqlcgvqdvf  179
ident                                                             
Sbjct ..........arkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgl   61
DSSP  ..........hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ellhhhhhhhhhhllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhllllleelLLLLL.LEEEE
Query nvggaqaiaalafgtesvpkvdkifgpgnafvteakrqvsqrldgaaidMPAGP.SEVLV  238
ident                                                      |    ||
Sbjct adsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyQVTAPvGVLLV  121
DSSP  lhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeEEEEElLEEEE


DSSP  EELLllLHHHHHHHHHHHHLLLllLEEEEEElLHHHHHHHHHHHHHHHHLL....lLLHH
Query IADSgaTPDFVASDLLSQAEHGpdSQVILLTpAADMARRVAEAVERQLAEL....pRAET  294
ident |  |   |   |         |     ||            |                  
Sbjct IFES..RPEVIANITALSIKSG..NAAILKG.GKESVNTFREMAKIVNDTIaqfqsETGV  176
DSSP  EELL..LLHHHHHHHHHHHHHL..LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhHHLL


DSSP  hhhhhLLLEEEELLlhhhHHHHhHHHL..LLEEEEELLL.HHHH.HHHLlLLLEE.....
Query arqalNASRLIVTKdlaqCVEIsNQYG..PEHLIIQTRN.AREL.VDSItSAGSV.....  345
ident          || |                         |       |             
Sbjct ...pvGSVQLIETR....VSDL.LDQDeyIDLVVPRGSNaLVRKiKDTT.KIPVLghadg  227
DSSP  ...llLLEEELLLL....LHHH.HHLLllLLEEEEELLHhHHHHhHHLL.LLLLLlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  345
ident                                                             
Sbjct icsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevlenltleggvtihatk  287
DSSP  leeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllleelh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  345
ident                                                             
Sbjct dlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinthssrhtdaivtenk  347
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhllllllleeeeelllh


DSSP  ...................eellllLHHHHhhllllllllllllhhhllllllhhhheee
Query ...................flgdwsPESAGdyasgtnhvlptygytatcsslgladfqkr  386
ident                              |                              
Sbjct anaekfmkgvdssgvywnastrfadVGLDG..............................  377
DSSP  hhhhhhhhhlllleeeelllhhhllLLLHH..............................


DSSP  eeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query mtvqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
ident                                              
Sbjct ...........................lvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  ...........................heeeeeeeelllllllll