No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=25.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  .............LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH
Query .............DELLEKAKKVREAWDVLRNATTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEAN   47
ident               |          |                 | |     |  |     
Sbjct psevvgttakagkAEAEAALEAAWKAFKTWKDWPQEDRSRLLLKAAALMRRRKRELEATL  120
DSSP  eeeeeeeeelllhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH


DSSP  HHHHhhhhhllllhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLLEEEEEELlLLLEE
Query RIDVekarergvkeslvdrlalNDKRIDEMIKACETVIGL.KDPVGEVIDSWVReDGLRI  106
ident    |                        | |   |                     |   
Sbjct VYEV............gknwveASADVAEAIDFIEYYARAaLRYRYPAVEVVPY.PGEDN  167
DSSP  HHHH............lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLLLLL.LLEEE


DSSP  EEEEEELLLEEEELLL..LLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ARVRVPIGPIGIIYES..RPNVTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREAL  164
ident     || |    |                    |||       ||            || 
Sbjct ESFYVPLGAGVVIAPWnfPVAIFTGMIVGPVAVGNTVIAKPAEDAVVVGAKVFEIFHEAG  227
DSSP  EEEEEELLEEEEELLLllLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  llllLLHHHEEELLLLLLHHHHHHLLLLLlLLEEEELLLHHHHHHHHHHLL.........
Query keteIPESSVEFIENTDRSLVLEMIRLREyLSLVIPRGGYGLISFVRDNAT.........  215
ident      |   | |                         |           |          
Sbjct ....FPPGVVNFLPGVGEEVGAYLVEHPR.IRFINFTGSLEVGLKIYEAAGrlapgqtwf  282
DSSP  ....LLLLLEEELLLLLLHHHHHHHLLLL.LLEEEEELLHHHHHHHHHHHLlllllllll


DSSP  LLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHH
Query VPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAVPVIINAKTQR.PGTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVI  274
ident         |   | ||| ||   |               | ||  |          |   
Sbjct KRAYVETGGKNAIIVDETADFDLAAEGVVVSAYGFqGQKCSAASRLILTQGAYEPVLERV  342
DSSP  LEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHL..................................................LLE
Query VEELRKH..................................................GVE  284
ident                                                             
Sbjct LKRAERLsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiAPT  402
DSSP  HHHHLLLllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllLLE


DSSP  EEELhhhhhhlllleelLHHHLLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELL
Query VRGCektreivpdvvpaTEDDWPTEYLDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTE  344
ident |                       |          ||   || |       |        
Sbjct VFTE..........vppKARIAQEEIFGPVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSR  452
DSSP  EEEL..........lllLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL


DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHHHLLLLLLlllllllEELLL.llLLEEL....LLHHH
Query NYSNAKKFVSEIDAAAVYVNASTRFTDGGQFgfgaeigISTQR.fhARGPV....GLREL  399
ident           |      | |        |                           ||  
Sbjct KREHLEWARREFHVGNLYFNRKITGALVGVQ......pFGGFKlsgTNAKTgaldYLRLF  506
DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLLL......lLLLLHhhlLLLLLllhhHHHLL


DSSP  EEEEEEEELLlllll
Query TTYKFVVLGEyhvre  414
ident    | |         
Sbjct LEMKAVAERF.....  516
DSSP  EEEEEEEEEL.....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.7

DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHHHHHHHHHHLlll
Query dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaekldeRRKEILEANRIDVEKARERgvk   60
ident                                          |   | |      ||    
Sbjct ........................mtvepfrnepietfQTEEARRAMREALRRVREE...   33
DSSP  ........................llllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL...


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeellleeeel
Query eslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpigpigiiy  120
ident                                                             
Sbjct ......................fgrhyplyiggewvdtkermvslnpsapsevvgttaka   71
DSSP  ......................lleeeleeelleeelllleeeeeelleeeeeeeeeell


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhheeellll
Query esrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessvefient  180
ident                                                             
Sbjct gkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatlvyevgknwvea  131
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhh


DSSP  llhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEELLLlLHHHH.
Query drslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgVGNCHIFVDESaDLKKA.  239
ident                                            |                
Sbjct sadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvpLGAGVVIAPWN.FPVAIf  190
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeeLLEEEEELLLL.LLLHHh


DSSP  HHHHHHHHHLLlllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHhHHHHHHLLLEeeelhhhhhhlllle
Query VPVIINAKTQRpgtcnAAEKLLVHEKIAKEFLPViVEELRKHGVEvrgcektreivpdvv  299
ident    |                    |        |  |     |                 
Sbjct TGMIVGPVAVG.....NTVIAKPAEDAVVVGAKV.FEIFHEAGFP...............  229
DSSP  HHHHHHHHHLL.....LEEEEELLHHHHHHHHHH.HHHHHHHLLL...............


DSSP  ellhhhllllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHlLLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLL..
Query pateddwpteylDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYsTGHSESILTeNYSNAKKFVSEID..  357
ident                                                    |        
Sbjct ............PGVVNFLPGVGEEVGAYLVEHP.RIRFINFTG.SLEVGLKIYEAAGrl  275
DSSP  ............LLLEEELLLLLLHHHHHHHLLL.LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLll


DSSP  ......lLEEEEL...............................................
Query ......aAAVYVN...............................................  364
ident           ||                                                
Sbjct apgqtwfKRAYVEtggknaiivdetadfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrliltqgay  335
DSSP  lllllllLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct epvlervlkraerlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlege  395
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct gyfiaptvftevppkariaqeeifgpvlsvirvkdfaealevandtpygltggvysrkre  455
DSSP  lllllleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhlllllleeeeelllhh


DSSP  .............................................llhhHLLLlllllll
Query .............................................astrFTDGgqfgfga  379
ident                                                             
Sbjct hlewarrefhvgnlyfnrkitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrLFLE.......  508
DSSP  hhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllllhhhllllllllhhhhhLLEE.......


DSSP  llleellllllleELLLHhheeeeeeeelllllll
Query eigistqrfhargPVGLRelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                    
Sbjct .............MKAVA..............erf  516
DSSP  .............EEEEE..............eel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  .............................................lhhhhhhhhhhhhhh
Query .............................................dellekakkvreawd   15
ident                                                             
Sbjct psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  hhllLLHHhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhh
Query vlrnATTReknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvkeslvdrlalndkrid   75
ident                                                             
Sbjct vyevGKNW....................................................  128
DSSP  hhhhLLLH....................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllLLLLLeeeeeellllleeeeeE.........................
Query emikacetviglkDPVGEvidswvredglriarvR.........................  110
ident                                                             
Sbjct .............VEASA................Dvaeaidfieyyaraalryrypavev  159
DSSP  .............HHHHH................Hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct vpypgednesfyvplgagvviapwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakv  219
DSSP  llllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct feifheagfppgvvnflpgvgeevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgq  279
DSSP  hhhhhhhlllllleeellllllhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ........eeLLLEEEELL..LLLH.HHHHHHHHHHHLLL.....lEEEELLHHHHHHHH
Query ........vpIGPIGIIYE..SRPN.VTVETTILALKSGN.....tILLRGGSDALNSNK  154
ident            |   ||                 |             |     |     
Sbjct twfkrayvetGGKNAIIVDetADFDlAAEGVVVSAYGFQGqkcsaaSRLILTQGAYEPVL  339
DSSP  lllleeeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHH.......................................HLLL.......L
Query AIVSAIREA.......................................LKET.......E  168
ident   |    |                                                    
Sbjct ERVLKRAERlsvgpaeenpdlgpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlGGKRlegegyfI  399
DSSP  HHHHHHHLLlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeLLLLlllllllL


DSSP  LLHH..................HEEELLLLLLHHHHHHLLLLLLLLEEEELL.LHHHHHH
Query IPES..................SVEFIENTDRSLVLEMIRLREYLSLVIPRG.GYGLISF  209
ident  |                        |   |    ||      |                
Sbjct APTVftevppkariaqeeifgpVLSVIRVKDFAEALEVANDTPYGLTGGVYSrKREHLEW  459
DSSP  LLEEeellllllhhhlllllllEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELlLHHHHHH


DSSP  HHHHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhh
Query VRDNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkkavpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiak  268
ident  |    |                                                     
Sbjct ARREFHVgNLYF................................................  471
DSSP  HHHHLLLlEEEE................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhlllleellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhh
Query eflpviveelrkhgvevrgcektreivpdvvpateddwpteyldliiaikvvknvdeaie  328
ident                                                             
Sbjct ............................................................  471
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellLL
Query hikkystghsesiltenysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqRF  388
ident                                                             
Sbjct ................................................nrkitgalvgVQ  483
DSSP  ................................................llllllllllLL


DSSP  LL.......leelllhhheeeeeeeelllllll
Query HA.......rgpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
ident                                  
Sbjct PFggfklsgtnaktgaldylrlflemkavaerf  516
DSSP  LLlllhhhllllllllhhhhhlleeeeeeeeel


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtvepfrnepietfqteearramrealrrvreefgrhyplyiggewvdtkermvslnpsa   60
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeleeelleeelllleeeeeelle


DSSP  ......lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query ......dellekakkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridveka   54
ident                                                             
Sbjct psevvgttakagkaeaeaaleaawkafktwkdwpqedrsrlllkaaalmrrrkreleatl  120
DSSP  eeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  hhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeeeeeell
Query rergvkeslvdrlalndkridemikacetviglkdpvgevidswvredglriarvrvpig  114
ident                                                             
Sbjct vyevgknwveasadvaeaidfieyyaraalryrypavevvpypgednesfyvplgagvvi  180
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeelleeeee


DSSP  leeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhe
Query pigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeipessv  174
ident                                                             
Sbjct apwnfpvaiftgmivgpvavgntviakpaedavvvgakvfeifheagfppgvvnflpgvg  240
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll


DSSP  eellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEELLL.
Query efientdrslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvGNCHIFVDES.  233
ident                                                  |          
Sbjct eevgaylvehprirfinftgslevglkiyeaagrlapgqtwfkrayvetGGKNAIIVDEt  300
DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllllleeeeelLLLEEEEELLl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  233
ident                                                             
Sbjct adfdlaaegvvvsaygfqgqkcsaasrliltqgayepvlervlkraerlsvgpaeenpdl  360
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  233
ident                                                             
Sbjct gpvvsaeqerkvlsyieigknegqlvlggkrlegegyfiaptvftevppkariaqeeifg  420
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhllllll


DSSP  ........lLHHHHHHHHHHHhhllllllLLEEEEEEEHHHhHHHHHHHHHHhhhlllee
Query ........aDLKKAVPVIINAktqrpgtcNAAEKLLVHEKIaKEFLPVIVEElrkhgvev  285
ident          |   |  |                   |      | |     |        
Sbjct pvlsvirvkDFAEALEVANDT........PYGLTGGVYSRK.REHLEWARRE........  463
DSSP  leeeeeeelLHHHHHHHHHLL........LLLLEEEEELLL.HHHHHHHHHH........


DSSP  eelhhhhhhlllleellhhhlllllllleEEEEEELlhhhhhhhhhhhlllleeeeelll
Query rgcektreivpdvvpateddwpteyldliIAIKVVKnvdeaiehikkystghsesilten  345
ident                                                             
Sbjct ..........................fhvGNLYFNR........................  473
DSSP  ..........................lllLEEEELL........................


DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeelllhhhllllllllllllleellllllleelllhhheeeeee
Query ysnakkfvseidaaavyvnastrftdggqfgfgaeigistqrfhargpvglrelttykfv  405
ident                                                             
Sbjct ..........................kitgalvgvqpfggfklsgtnaktgaldylrlfl  507
DSSP  ..........................lllllllllllllllhhhllllllllhhhhhlle


DSSP  eelllllll
Query vlgeyhvre  414
ident          
Sbjct emkavaerf  516
DSSP  eeeeeeeel