No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=37.9

DSSP  ....................................................LHHHHHHH
Query ....................................................SISDTVKR    8
ident                                                         |   
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreEVERTLDV   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhHHHHHHHH


DSSP  HH.HHHHlLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHhLHHHHH
Query AR.EAFNsGKTR.SLQFRIQQLEALQRMINENLKSISGALASDLGKNEWTSYYeEVAHVL   66
ident                  |   |      |  ||      |    ||        ||    
Sbjct LFkRGRW.SARDmPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKPKSAAVG.EVKAAV  118
DSSP  HHhLHHH.HHHLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH.HHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhHHHLlEELLL...LLLLLLLEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHH
Query EELDTTIKELpDWAEdEPVAK...TRQTQQDDLYIHSEPLGVVLVIGAWNYPFNLTIQPM  123
ident   |      |              |  |         ||||||  |   |||        
Sbjct DRLRLAELDL.KKIG.GDYIPgdwTYDTLETEGLVRREPLGVVAAITPFNYPLFDAVNKI  176
DSSP  HHHHLLLHHH.HHLL.LEEEElllLLLLLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLEEELLLLHHHHHHHLLLL.LLE
Query VGAVAAGNAVILKPSEVSGHMADLLATLIPQY.MDQNLYLVVKGGVPETTELLKER.FDH  181
ident       ||||  |||      |                         |            
Sbjct TYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAgFPPDAIALLNLPGKEAEKIVADDrVAA  236
DSSP  HHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLLEEELLLLHHHLHHHHLLLlLLE


DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHHHllLLLEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query IMYTGSTAVGKIVMAAAAkhLTPVTLELGGKSPCYVDKDCDLDVACRRIAWGKFMNSGQT  241
ident    |||| ||  |             ||||  |  |  | ||| |   || |     || 
Sbjct VSFTGSTEVGERVVKVGG..VKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSYAGQR  294
DSSP  EEEELLHHHHHHHHHHHL..LLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLLLLEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllHHHL.....LLLLLLLLHHHHHHHHHLL
Query CVAPDYILCDPSIQNQIVEKLKKSLKDFygedAKQS.....RDYGRIINDRHFQRVKGLI  296
ident | |    |         ||   | |                 | |  |           |
Sbjct CDAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSL....RVGDprdptVDVGPLISPSAVDEMMAAI  350
DSSP  LLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLL....LLLLlllllLLLLLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  LL.....LLEEELLLEELlLLEELLEEELLL...LLLLHHHLLLLLLLEELEEELLLHHH
Query DN.....QKVAHGGTWDQsSRYIAPTILVDV...DPQSPVMQEEIFGPVMPIVCVRSLEE  348
ident          |  ||       |  ||                 | | ||   | |  |  
Sbjct EDavekgGRVLAGGRRLG.PTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVALAVEVKDLDQ  409
DSSP  HHhhhllLEEEELLLEEE.LLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHH


DSSP  HHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLEEEELLLLHhHHLLLLLLLLLHHHEE
Query AIQFINQREKPLALYVFSNNEKVIKKMIAETSSGGVTANDVIVhITVPTLPFGGVGNSGM  408
ident ||   | |   |   ||      |         |    ||          ||||   || 
Sbjct AIELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPR.HGIGYYPFGGRKKSGV  468
DSSP  HHHHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL.LLLLLLLLLLEELLEE


DSSP  LLLLLHHHHHHLEEEEEEEELLL.LLLLLLhhhllllll
Query GAYHGKKSFETFSHRRSCLVKSL.LNEEAHkaryppspa  446
ident          |                             
Sbjct FREGIGYAVEAVTAYKTIVFNYKgKGVWKY........e  499
DSSP  LLLLLLLLHHHHEEEEEEEEELLlLLLLLL........l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  ..........lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..........sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdl   50
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllhhHHHHHLhhHHH................HHhhhhhhhhhhhhlleellllllllll
Query gknewTSYYEEvaHVL................EEldttikelpdwaedepvaktrqtqqd   94
ident                                                             
Sbjct lrlaeLDLKKI..GGDyipgdwtydtleteglVR..........................  152
DSSP  hhlllHHHHHL..LLEeeellllllllleeeeEE..........................


DSSP  eeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhh
Query dlyihseplgvvlvigawnypfnltiqpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipq  154
ident                                                             
Sbjct ............................................................  152
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllleeellllhhhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeelLLLLE
Query ymdqnlylvvkggvpettellkerfdhimytgstavgkivmaaaakhltpvtlelGGKSP  214
ident                                                         |   
Sbjct ....................................................repLGVVA  160
DSSP  ....................................................eeeLLEEE


DSSP  EEELLLlLHHHHHHHHHHHHHLllllLLLLlLEEEELHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllh
Query CYVDKDcDLDVACRRIAWGKFMnsgqTCVApDYILCDPSIQNQIVEKLKKslkdfygeda  274
ident                     |        |        |         |           
Sbjct AITPFN.YPLFDAVNKITYSFI....YGNA.VVVKPSISDPLPAAMAVKA..........  204
DSSP  EELLLL.LLLHHHHHHHHHHHH....LLLE.EEEELLLLLLHHHHHHHHH..........


DSSP  hhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllleELLEeelllllllhhhlllll
Query kqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryIAPTilvdvdpqspvmqeeif  334
ident                                                             
Sbjct ....................................lldAGFP.................  211
DSSP  ....................................hhhLLLL.................


DSSP  LLEELEEELLLhHHHHHHHHlLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHLLLLLLEEE.........
Query GPVMPIVCVRSlEEAIQFINqREKPLALYVFSnNEKVIKKMIAETSSGGVT.........  385
ident              ||           |         |                       
Sbjct PDAIALLNLPG.KEAEKIVA.DDRVAAVSFTG.STEVGERVVKVGGVKQYVmelgggdpa  268
DSSP  LLLEEELLLLH.HHLHHHHL.LLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLLLEEEeelllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  385
ident                                                             
Sbjct ivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerpvygklveevakrlsslrvgdpr  328
DSSP  eelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  385
ident                                                             
Sbjct dptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmv  388
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeelleelleeeellhhhhlllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  385
ident                                                             
Sbjct lykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavfgrdvvkirravrllevgaiyin  448
DSSP  hhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeel


DSSP  ........................ellLLHH.HHLLlllllllhhheelllllhhhhhhl
Query ........................andVIVH.ITVPtlpfggvgnsgmgayhgkksfetf  420
ident                                                             
Sbjct dmprhgigyypfggrkksgvfregigyAVEAvTAYK........................  484
DSSP  lllllllllllllleelleelllllllLHHHhEEEE........................


DSSP  eeeeeeeelllllllllhhhllllll
Query shrrsclvksllneeahkaryppspa  446
ident                           
Sbjct ...........tivfnykgkgvwkye  499
DSSP  ...........eeeeellllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................................lhhhhhhhhhhhhhllhhhl
Query ........................................sisdtvkrareafnsgktrs   20
ident                                                             
Sbjct lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyyeevahvleeldttikelpdwa   80
ident                                                             
Sbjct iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee


DSSP  lleelllllllllleeeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHL......lLEEE
Query edepvaktrqtqqddlyihseplGVVLVIGAWNYPFNLTIQPMVGAVAA......gNAVI  134
ident                        |    |        |                      
Sbjct gstevgervvkvggvkqyvmelgGGDPAIVLEDADLDLAADKIARGIYSyagqrcdAIKL  300
DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeellLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLEEE


DSSP  EELLLLlhhHHHHHHH............................................
Query LKPSEVsghMADLLAT............................................  150
ident              |                                              
Sbjct VLAERP...VYGKLVEevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekg  357
DSSP  EEEEHH...HHHHHHHhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .hHHHH..........LLLL....................LEEELLLLH.HHHHHHLLL.
Query .lIPQY..........MDQN....................LYLVVKGGV.PETTELLKE.  177
ident                                           | |         ||    
Sbjct grVLAGgrrlgptyvqPTFVeapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVKDlDQAIELANGr  417
DSSP  leEEELlleeelleelLEEEellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHLl


DSSP  .LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhh
Query .RFDHIMYTG.STAVGKIVMAAAakHLTPVTLElggkspcyvdkdcdldvacrriawgkf  235
ident          |                                                  
Sbjct pYGLDAAVFGrDVVKIRRAVRLL..EVGAIYIN...........................  448
DSSP  lEELEEEEELlLHHHHHHHHHHL..LLLEEEEL...........................


DSSP  llllllllllleeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhl
Query mnsgqtcvapdyilcdpsiqnqiveklkkslkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkgl  295
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeellleelllleelleeelllllllhhhllllllleeleeelllhhhhhhhhhl
Query idnqkvahggtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinq  355
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeelllhhhhhhhhlllllleeeellllhhhhlllllllllhhheelllllhh
Query rekplalyvfsnnekvikkmiaetssggvtandvivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkk  415
ident                                                             
Sbjct ............................................................  448
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhLEEEE......................eeeelllllllllhhhllllll
Query sfetFSHRR......................sclvksllneeahkaryppspa  446
ident       |                                              
Sbjct ..dmPRHGIgyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
DSSP  ..llLLLLLllllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll