No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=26.4

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhHHHHHHHHH
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsrEEVERTLDV   60
ident                                                     |       
Sbjct ...................................................DELLEKAKK    9
DSSP  ...................................................LHHHHHHHH


DSSP  HHhLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHH............lllhh
Query LFkRGRWSARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNA............gkpks  108
ident          |     |      | |           |                       
Sbjct VR.EAWDVLRNATTREKNKAIKKIAEKLDERRKEILEANRIDVekarergvkeslvdrla   68
DSSP  HH.HHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHhhhhhllllhhhhhhhl


DSSP  hHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH..LLLEEEELLlllllLLEEEEEEEEELLEEEEELLLl
Query aAVGEVKAAVDRLRLAELDLKK..IGGDYIPGDwtydtLETEGLVRREPLGVVAAITPFn  166
ident                            |                  | | |    |    
Sbjct lNDKRIDEMIKACETVIGLKDPvgEVIDSWVRE.....DGLRIARVRVPIGPIGIIYES.  122
DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLEEEEEELL.....LLLEEEEEEEELLLEEEELLL.


DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLLLLEEELL.LL
Query yPLFDAVNKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAG....FPPDAIALLN.LP  221
ident       |         ||                 | |   |      |           
Sbjct .RPNVTVETTILALKSGNTILLRGGSDALNSNKAIVSAIREALketeIPESSVEFIEnTD  181
DSSP  .LLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHEEELLlLL


DSSP  HHHLHHHHLLL.LLLEEEEELLHHHHHHHHHHHLlLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHH
Query GKEAEKIVADD.RVAAVSFTGSTEVGERVVKVGGvKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAA  280
ident                 |   |       |              |     | | |||  | 
Sbjct RSLVLEMIRLReYLSLVIPRGGYGLISFVRDNAT.VPVLETGVGNCHIFVDESADLKKAV  240
DSSP  LHHHHHHLLLLlLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLLLLLEEEEELLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllh
Query DKIARGIYSYaGQRCDAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLrvgdprdptvdvgplisp  340
ident   |           | |    |                |                     
Sbjct PVIINAKTQR.PGTCNAAEKLLVHEKIAKEFLPVIVEELRKH..................  281
DSSP  HHHHHHHHLL.LLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHL..................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeelleeLLEEEELLH.......hhhlLLHHHHLL
Query savdemmaaiedavekggrvlaggrrlgptyvQPTFVEAPA.......drvkDMVLYKRE  393
ident                                                            |
Sbjct ................................GVEVRGCEKtreivpdvvpaTEDDWPTE  309
DSSP  ................................LLEEEELHHhhhhlllleelLHHHLLLL


DSSP  LLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL.LL
Query VFAPVALAVEVKDLDQAIELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDM.PR  452
ident           ||  | |||       |                |      | | |     
Sbjct YLDLIIAIKVVKNVDEAIEHIKKYSTGHSESILTENYSNAKKFVSEIDAAAVYVNAStRF  369
DSSP  LLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLhHH


DSSP  LLlLLLL.......LLLEElleELLLllllLHHHHEEEEEEEEEL.LLLLlllll
Query HGiGYYP.......FGGRKksgVFREgigyAVEAVTAYKTIVFNY.KGKGvwkye  499
ident    |                               | ||  |             
Sbjct TD.GGQFgfgaeigISTQRfhaRGPV....GLRELTTYKFVVLGEyHVRE.....  414
DSSP  LL.LLLLlllllllEELLLlllLEEL....LLHHHEEEEEEEELLlLLLL.....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ......................................................dellek    6
DSSP  ......................................................lhhhhh


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct akkvreawdvlrnattreknkaikkiaeklderrkeileanridvekarergvkeslvdr   66
DSSP  hhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhh


DSSP  hhlllhhhhhlllEeeellllllllleeeeEEE...........................
Query lrlaeldlkkiggDyipgdwtydtleteglVRR...........................  153
ident                                                             
Sbjct lalndkridemikA................CETviglkdpvgevidswvredglriarvr  110
DSSP  hlllhhhhhhhhhH................HHHhhhllllllleeeeeellllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  153
ident                                                             
Sbjct vpigpigiiyesrpnvtvettilalksgntillrggsdalnsnkaivsairealketeip  170
DSSP  eellleeeelllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ..................................................eelLEEEEEL
Query ..................................................eplGVVAAIT  163
ident                                                      |      
Sbjct essvefientdrslvlemirlreylslviprggyglisfvrdnatvpvletgvGNCHIFV  230
DSSP  hhheeellllllhhhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEE


DSSP  LLL.LLLHHhHHHHHHH.HHLL....LEEEEELLLLLL.HHHHHHHHHHHHLLLLLL...
Query PFN.YPLFDaVNKITYS.FIYG....NAVVVKPSISDP.LPAAMAVKALLDAGFPPD...  213
ident           |  |             |                 |  |   |       
Sbjct DESaDLKKA.VPVIINAkTQRPgtcnAAEKLLVHEKIAkEFLPVIVEELRKHGVEVRgce  289
DSSP  LLLlLHHHH.HHHHHHHhHLLLllllLEEEEEEEHHHHhHHHHHHHHHHHHLLLEEEelh


DSSP  ........................LEEELLLLH.HHLHHHHLL.LLLLEEEEEL.LHHHH
Query ........................AIALLNLPG.KEAEKIVAD.DRVAAVSFTG.STEVG  246
ident                          ||        ||             |         
Sbjct ktreivpdvvpateddwpteyldlIIAIKVVKNvDEAIEHIKKySTGHSESILTeNYSNA  349
DSSP  hhhhhlllleellhhhllllllllEEEEEEELLhHHHHHHHHHhLLLLEEEEELlLHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehh
Query ERVVKVGGVKQYVMElgggdpaivledadldlaadkiargiysyagqrcdaiklvlaerp  306
ident    |                                                        
Sbjct KKFVSEIDAAAVYVN.............................................  364
DSSP  HHHHHHLLLLEEEEL.............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellle
Query vygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrvlaggrr  366
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  eelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhhhhhhllleeleeeee
Query lgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqaielangrpygldaavf  426
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllllllhhHHEEEE..
Query grdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfregigyaveAVTAYK..  484
ident                                                       |     
Sbjct .................................................astRFTDGGqf  375
DSSP  .................................................llhHHLLLLll


DSSP  ........................eeeeellllllllll
Query ........................tivfnykgkgvwkye  499
ident                                        
Sbjct gfgaeigistqrfhargpvglrelttykfvvlgeyhvre  414
DSSP  llllllleellllllleelllhhheeeeeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.1

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLH.............
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnaGKPK.............  107
ident                                                             
Sbjct .......................dellekakkvreawdvlrnaTTREknkaikkiaekld   37
DSSP  .......................lhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............................................hHHHHhhhhhhhhh
Query ..............................................sAAVGevkaavdrl  121
ident                                                             
Sbjct errkeileanridvekarergvkeslvdrlalndkridemikacetvIGLK.........   88
DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHLL.........


DSSP  hlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllLLLL............
Query rlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfNYPL............  169
ident                                                             
Sbjct ...........................................dPVGEvidswvredglr  105
DSSP  ...........................................lLLLLeeeeeellllle


DSSP  ....Hhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhl
Query ....Fdavnkitysfiygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkea  225
ident                                                             
Sbjct iarvR.......................................................  110
DSSP  eeeeE.......................................................


DSSP  hhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELllLLHHhHHHHHHH
Query ekivaddrvaavsftgstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLedADLDlAADKIAR  285
ident                                       |    |                
Sbjct ...................................vpIGPIGIIYE..SRPN.VTVETTI  132
DSSP  ...................................eeLLLEEEELL..LLLH.HHHHHHH


DSSP  HHHHHHhllllLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHhhlllllllllllllllllllhhhhhh
Query GIYSYAgqrcdAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRlsslrvgdprdptvdvgplispsavde  345
ident               |              |                              
Sbjct LALKSG.....NTILLRGGSDALNSNKAIVSAI...........................  160
DSSP  HHHHLL.....LLEEEELLHHHHHHHHHHHHHH...........................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeEELLLEeelleELLEEeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEEL
Query mmaaiedavekggrvLAGGRRlgptyVQPTFveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVK  405
ident                 |           |                            |  
Sbjct ..............rEALKET.....EIPES.....................SVEFIENT  180
DSSP  ..............hHHHLLL.....LLLHH.....................HEEELLLL


DSSP  LHHHHHHHHHLLLEELEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLlEEEE..................
Query DLDQAIELANGRPYGLDAAVFGrDVVKIRRAVRLLEVgAIYI..................  447
ident |     |    | |       |     |        |                       
Sbjct DRSLVLEMIRLREYLSLVIPRG.GYGLISFVRDNATV.PVLEtgvgnchifvdesadlkk  238
DSSP  LLHHHHHHLLLLLLLLEEEELL.LHHHHHHHHHHLLL.LLLLllllleeeeelllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  447
ident                                                             
Sbjct avpviinaktqrpgtcnaaekllvhekiakeflpviveelrkhgvevrgcektreivpdv  298
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  447
ident                                                             
Sbjct vpateddwpteyldliiaikvvknvdeaiehikkystghsesiltenysnakkfvseida  358
DSSP  eellhhhlllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhlll


DSSP  ...................lllllllllLLLLlleelleellllllllhhhheeeeeeee
Query ...................ndmprhgigYYPFggrkksgvfregigyaveavtayktivf  488
ident                                                             
Sbjct aavyvnastrftdggqfgfgaeigistqRFHA...............rgpvglrelttyk  403
DSSP  leeeelllhhhllllllllllllleellLLLL...............leelllhhheeee


DSSP  ellllllllll
Query nykgkgvwkye  499
ident            
Sbjct fvvlgeyhvre  414
DSSP  eeeelllllll