No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=50.8

DSSP  lLLLLEEELLEEELLL.LEEEEELLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query tKQYKNYVNGEWKLSE.NEIKIYEPASGAELGSVPAMSTEEVDYVYASAKKAQPAWRALS   59
ident   | |   |||    |      | || |  |      | | ||     |  |   |    
Sbjct .MQHKLLINGELVSGEgEKQPVYNPATGDVLLEIAEASAEQVDAAVRAADAAFAEWGQTT   59
DSSP  .LLLLEEELLEEELLLlLEEEEEELLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query YIERAAYLHKVADILMRDKEKIGAILSKEVAKGYKSAV.SEVVRTAEIINYAAEEGLRME  118
ident    ||  | | ||             |    |   ||   |           |       
Sbjct PKVRAECLLKLADVIEENGQVFAELESRNCGKPLHSAFnDEIPAIVDVFRFFAGAARCLN  119
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEHHhllhhHLLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELL
Query GEVLEGGsfeaaSKKKIAVVRREPVGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAGNVIAFKPP  178
ident |                   || | | |  | | |||   |  | |||| |||    || 
Sbjct GLAAGEY.....LEGHTSMIRRDPLGVVASIAPWNYPLMMAAWKLAPALAAGNCVVLKPS  174
DSSP  LLLLEEE.....ELLEEEEEEEEELLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLHHHHHHHH
Query TQGSISGLLLAEAFAEaGLPAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQAVNFINFTGSTGIGERIG  238
ident        | |||       |||| |   |||   ||    |  |     |||   || | 
Sbjct EITPLTALKLAELAKD.IFPAGVVNILFGRGKTVGDPLTGHPKVRMVSLTGSIATGEHII  233
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLLEEELLLLLLLLHHHHHLLLLEEEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHLL..LLLEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHH
Query KMAG..MRPIMLELGGKDSAIVLEDADLELTAKNIIAGAFGYSGQRCTAVKRVLVMESVA  296
ident             |||||   ||  ||| |              || |||  |        
Sbjct SHTAssIKRTHMELGGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNAGQDCTAACRIYAQKGIY  293
DSSP  HHHHhhLLEEEEELLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHLLLLLLLEEEEELLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLEELLLLLEE
Query DELVEKIREKVLALTIGNPEDD.ADITPLIDTKSADYVEGLINDANDK.GATALTEIKRE  354
ident | ||||    |  |  | | |      ||        |      |         |     
Sbjct DTLVEKLGAAVATLKSGAPDDEsTELGPLSSLAHLERVGKAVEEAKATgHIKVITGGEKR  353
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLEEEELLLLL


DSSP  ...LLEELLEEEELLLLLLHHHLLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLEELEEEEELL
Query ...GNLICPILFDKVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVTSVEEAIEISNKSEYGLQASIFTN  411
ident    |    | |      |      | ||||         |      | | |||  |  | 
Sbjct kgnGYYYAPTLLAGALQDDAIVQKEVFGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSQYGLASSVWTK  413
DSSP  lllLLLLLLEEEELLLLLLHHHHLLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL


DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLlLLLLLLLLLEELLEELLLLHHHHHHHLEEEEEEEE
Query DFPRAFGIAEQLEVGTVHINNKTQrGTDNFPFLGAKKSGAGIQGVKYSIEAMTTVKSVVF  471
ident |  ||      |  |    |          |  | | || |     |  |  | |  |  
Sbjct DVGRAHRVSARLQYGCTWVNTHFM.LVSEMPHGGQKLSGYGKDMSLYGLEDYTVVRHVMV  472
DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL.LLLLLLLLLLHHHEELLLLHHHHHHLLEEEEEEEE


DSSP  ELl
Query DIk  474
ident    
Sbjct KH.  474
DSSP  EL.


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.7

DSSP  llllleeelleeelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
Query tkqyknyvngewklseneikiyepasgaelgsvpamsteevdyvyasakkaqpawralsy   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ieraaylhkvadilmrdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmege  120
ident                                                             
Sbjct ....................................................mqhkllin    8
DSSP  ....................................................lllleeel


DSSP  eeehhhllhhhlleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellll
Query vleggsfeaaskkkiavvrrepvglvlaispfnypvnlagskiapaliagnviafkpptq  180
ident                                                             
Sbjct gelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttpkvraecll   68
DSSP  leeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhh
Query gsisglllaeafaeaglpagvfntitgrgseigdyivehqavnfinftgstgigerigkm  240
ident                                                             
Sbjct kladvieengqvfaelesrncgkplhsafndeipaivdvfrffagaarclnglaageyle  128
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeel


DSSP  llllleeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllleEEEEEEHHHHHHHH
Query agmrpimlelGGKDSAIVLEDaDLELTAKNIIAGAFGYSGqrctavKRVLVMESVADELV  300
ident            |    |          |    | |                 |       
Sbjct ghtsmirrdpLGVVASIAPWN.YPLMMAAWKLAPALAAGN.....cVVLKPSEITPLTAL  182
DSSP  leeeeeeeeeLLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHHLLL.....eEEEELLLLLLHHHH


DSSP  HHHHHhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleELLLlleelleelL
Query EKIREkvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatALTEikregnlicP  360
ident                                               |             
Sbjct KLAEL.........................................AKDI.........F  192
DSSP  HHHHH.........................................HLLL.........L


DSSP  EEEellllllhhhlllllllEEEEEEElLHHH.HHHHHHhLLEELEEEEELlLHHHHHHH
Query ILFdkvttdmrlaweepfgpVLPIIRVtSVEE.AIEISNkSEYGLQASIFTnDFPRAFGI  419
ident                     |  |                       |           |
Sbjct PAG.................VVNILFG.RGKTvGDPLTG.HPKVRMVSLTG.SIATGEHI  232
DSSP  LLL.................LEEELLL.LLLLlHHHHHL.LLLEEEEEEEL.LHHHHHHH


DSSP  HHHL..LLLEEEEL..............................................
Query AEQL..EVGTVHIN..............................................  431
ident            |                                                
Sbjct ISHTasSIKRTHMElggkapvivfddadieavvegvrtfgyynagqdctaacriyaqkgi  292
DSSP  HHHHhhHLLEEEEEllllleeeelllllhhhhhhhhhhhllhhhhllllllleeeeelll


DSSP  .........................................................lll
Query .........................................................nkt  434
ident                                                             
Sbjct ydtlveklgaavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvitggek  352
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellll


DSSP  llllllllllleelleellllhhhhhhhleEEEEEEEELL....................
Query qrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamtTVKSVVFDIK....................  474
ident                                |    ||                      
Sbjct rkgngyyyaptllagalqddaivqkevfgpVVSVTPFDNEeqvvnwandsqyglassvwt  412
DSSP  lllllllllleeeellllllhhhhllllllEEEEEEELLHhhhhhhhhlllllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  474
ident                                                             
Sbjct kdvgrahrvsarlqygctwvnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygledytvvrhvmv  472
DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellllhhhhhhlleeeeeeee


DSSP  ..
Query ..  474
ident   
Sbjct kh  474
DSSP  el


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  ................................llllleeelleeelllleeeeellllll
Query ................................tkqyknyvngewklseneikiyepasga   28
ident                                                             
Sbjct mqhkllingelvsgegekqpvynpatgdvlleiaeasaeqvdaavraadaafaewgqttp   60
DSSP  lllleeelleeellllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  eeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLHH...........................
Query elgsvpamsteevdyvyasakkaqpawrALSYI...........................   61
ident                                                             
Sbjct kvraecllkladvieengqvfaelesrnCGKPLhsafndeipaivdvfrffagaarclng  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhHLLLHhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ..............................................hhhhhhhhhhhhhh
Query ..............................................eraaylhkvadilm   75
ident                                                             
Sbjct laageyleghtsmirrdplgvvasiapwnyplmmaawklapalaagncvvlkpseitplt  180
DSSP  llleeeelleeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhh


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeehhhllhhhllee
Query rdkekigailskevakgyksavsevvrtaeiinyaaeeglrmegevleggsfeaaskkki  135
ident                                                             
Sbjct alklaelakdifpagvvnilfgrgktvgdpltghpkvrmvsltgsiatgehiishtassi  240
DSSP  hhhhhhhhlllllllleeellllllllhhhhhlllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  eeeeeeelLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLL......LEEEEELLLLLHHHHHHHH
Query avvrrepvGLVLAISPFNYPVNLAGSKIAPALIAG......NVIAFKPPTQGSISGLLLA  189
ident         |    |                                              
Sbjct krthmelgGKAPVIVFDDADIEAVVEGVRTFGYYNagqdctAACRIYAQKGIYDTLVEKL  300
DSSP  leeeeellLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLHHhhllllLLLEEEEELLLHHHHHHHH


DSSP  HH...........................................hHHHL..........
Query EA...........................................fAEAG..........  196
ident  |                                               |          
Sbjct GAavatlksgapddestelgplsslahlervgkaveeakatghikvITGGekrkgngyyy  360
DSSP  HHhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeEELLllllllllll


DSSP  ..................llLLLEEELLLLHHHHHHHHHHLL.LLLEEEEEL.LHHHHHH
Query ..................lpAGVFNTITGRGSEIGDYIVEHQ.AVNFINFTG.STGIGER  236
ident                       |         |                      |   |
Sbjct aptllagalqddaivqkevfGPVVSVTPFDNEEQVVNWANDSqYGLASSVWTkDVGRAHR  420
DSSP  lleeeellllllhhhhllllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHLLlLLLEEEEELlLHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeehhhh
Query IGKMAGMRPIMlelggkdsaivledadleltakniiagafgysgqrctavkrvlvmesva  296
ident                                                             
Sbjct VSARLQYGCTW.................................................  431
DSSP  HHHHLLLLEEE.................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllleell
Query delvekirekvlaltignpeddaditplidtksadyveglindandkgatalteikregn  356
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  eelleeeellllllhhhllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhlleeleeeeelllhhhh
Query licpilfdkvttdmrlaweepfgpvlpiirvtsveeaieisnkseyglqasiftndfpra  416
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleellllhhhhhhhleeeeeeeeell
Query fgiaeqlevgtvhinnktqrgtdnfpflgakksgagiqgvkysieamttvksvvfdik  474
ident                                                           
Sbjct ...............vnthfmlvsemphggqklsgygkdmslygledytvvrhvmvkh  474
DSSP  ...............elllllllllllllllhhheellllhhhhhhlleeeeeeeeel