No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=14.8

DSSP  lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitrtvndildnvkargdealreysakfdkttv   60
ident                                                             
Sbjct ...................................sisdtvkrareafnsgktrslqfri   25
DSSP  ...................................lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhh


DSSP  llllllhhhhhhHHHHLL..........HHHHHH.HHHHHHHHHHHHHLL...LLLLEEE
Query talkvsaeeiaaASERLS..........DELKQA.MAVAVKNIETFHTAQ...KLPPVDV  106
ident                  |                     |                   |
Sbjct qqlealqrmineNLKSISgalasdlgknEWTSYYeEVAHVLEELDTTIKElpdWAEDEPV   85
DSSP  hhhhhhhhhhhhHHHHHHhhhhhhhlllHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHhhhHHLLEEL


DSSP  EE...ELLEEEEEEEEELLEEEEELLLllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEELLLLL
Query ET...QPGVRCQQVTRPVASVGLYIPGgsAPLFSTVLMLATPASIAGCkKVVLCSPPPIA  163
ident                 |   |           |         |  ||   | |       
Sbjct AKtrqTQQDDLYIHSEPLGVVLVIGAW..NYPFNLTIQPMVGAVAAGN.AVILKPSEVSG  142
DSSP  LLlllLLLLEEEEEEEELLEEEEELLL..LLLLHHHHHHHHHHHHLLL.EEEEELLLLLH


DSSP  HHHHHH......hhhlllLEEEELLHHHHhHHHHHLlllllLLLEEELLLLHHHHHHHHH
Query DEILYA......aqlcgvQDVFNVGGAQAiAALAFGtesvpKVDKIFGPGNAFVTEAKRQ  217
ident                     |   |       |          | |   |   |      
Sbjct HMADLLatlipqymdqnlYLVVKGGVPET.TELLKE.....RFDHIMYTGSTAVGKIVMA  196
DSSP  HHHHHHhhhhhhhlllllEEELLLLHHHH.HHHLLL.....LLLEEEEELLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLlLLLEELLLLLlLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHLLLL....lLEEEEEElLHH
Query VSQRlDGAAIDMPAGpSEVLVIADSGATPDFVASDLLSQAEHGP....dSQVILLTpAAD  273
ident               |        |     |                        |     
Sbjct AAAK.HLTPVTLELG.GKSPCYVDKDCDLDVACRRIAWGKFMNSgqtcvAPDYILC.DPS  253
DSSP  HHHL.LLLLEEEELL.LLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLlllllLLLEEEE.LHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLL.........................................ll
Query MARRVAEAVERQLAELP.........................................ra  292
ident       |     |                                               
Sbjct IQNQIVEKLKKSLKDFYgedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssry  313
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllle


DSSP  HHHH...............hhhLLLEEEELLLHHHHHHHHHHH.LLLEEEEELL...LHH
Query ETAR...............qalNASRLIVTKDLAQCVEISNQY.GPEHLIIQTR...NAR  333
ident                                 |       ||   |  |           
Sbjct IAPTilvdvdpqspvmqeeifgPVMPIVCVRSLEEAIQFINQReKPLALYVFSNnekVIK  373
DSSP  ELLEeelllllllhhhllllllLEELEEELLLHHHHHHHHHLLlLLLEEEEELLlhhHHH


DSSP  HHHHHLlLLLEEEELllLLHHhHHHLLLLLLlLLLLLHhhlLLLL....LHHHHEEEEEE
Query ELVDSItSAGSVFLGdwSPESaGDYASGTNHvLPTYGYtatCSSL....GLADFQKRMTV  389
ident        | | |                                         |  |   
Sbjct KMIAET.SSGGVTAN..DVIV.HITVPTLPF.GGVGNS..gMGAYhgkkSFETFSHRRSC  426
DSSP  HHHLLL.LLLEEEEL..LLLH.HHHLLLLLL.LLLHHH..eELLLllhhHHHHLEEEEEE


DSSP  EEELHhhhhHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhHHHHhhHHHHhl
Query QELSKegfsALAStietlaaaerltahknaVTLRvnALKEqa  431
ident    |                             |        
Sbjct LVKSL...lNEEA.................HKAR..YPPSpa  446
DSSP  EELLL...lLLLL.................LHHH..LLLLll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.1

DSSP  lleeehhhllhhHHHHHLL.....LLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ntiidwnsctaeQQRQLLM.....RPAIsasesitrtvndildnvkargdealreysakf   55
ident                                                             
Sbjct ............SISDTVKrareaFNSG................................   16
DSSP  ............LHHHHHHhhhhhHHLL................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeee
Query dkttvtalkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavknietfhtaqklppvdvetqpgvrcq  115
ident                                                             
Sbjct ................ktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyye   60
DSSP  ................hhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  eeeeelleeeeelllllLLLHhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhLLL
Query qvtrpvasvglyipggsAPLFstvlmlatpasiagckkvvlcspppiadeilyaaqlCGV  175
ident                                                             
Sbjct evahvleeldttikelpDWAE.................................depVAK   87
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhHHHL.................................leeLLL


DSSP  LeeeellhhhhhhhhhhllllllllleeELLLlhhhhhhhhhhhhllllleelllllLLE
Query QdvfnvggaqaiaalafgtesvpkvdkiFGPGnafvteakrqvsqrldgaaidmpagPSE  235
ident                                                             
Sbjct T...................rqtqqddlYIHS.......................epLGV  105
DSSP  L...................lllllleeEEEE.......................eeLLE


DSSP  EEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHLLLllLEEEEEELL..HHHHHHHHHHHhhhhhlllllh
Query VLVIADSGATPDFVASDLLSQAEHGpdSQVILLTPA..ADMARRVAEAVerqlaelprae  293
ident ||||                    |    |||        ||   |              
Sbjct VLVIGAWNYPFNLTIQPMVGAVAAG..NAVILKPSEvsGHMADLLATLI...........  152
DSSP  EEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LEEEEELLLllHHHHHHHHHHH...........


DSSP  hhhHHHLLLEEEELlLHHHHHHHHhHHLLLEEEEELllHHHHHHH.LLLL....LEEEEL
Query tarQALNASRLIVTkDLAQCVEISnQYGPEHLIIQTrnARELVDS.ITSA....GSVFLG  348
ident       |              |        |                  |      | | 
Sbjct pqyMDQNLYLVVKG.GVPETTELL.KERFDHIMYTG..STAVGKIvMAAAakhlTPVTLE  208
DSSP  hhhLLLLLEEELLL.LHHHHHHHL.LLLLLEEEEEL..LHHHHHHhHHHHhlllLLEEEE


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  348
ident                                                             
Sbjct lggkspcyvdkdcdldvacrriawgkfmnsgqtcvapdyilcdpsiqnqiveklkkslkd  268
DSSP  llllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllleeeelhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  348
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Sbjct fygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnqkvahggtwdqssryiaptilvdvdpqspv  328
DSSP  hhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllleeellleelllleelleeelllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  348
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Sbjct mqeeifgpvmpivcvrsleeaiqfinqrekplalyvfsnnekvikkmiaetssggvtand  388
DSSP  hllllllleeleeelllhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhlllllleeeell


DSSP  ..................llLLHH..HHHHllllllllllllhhhllllllhhhheeeee
Query ..................dwSPES..AGDYasgtnhvlptygytatcsslgladfqkrmt  388
ident                                                             
Sbjct vivhitvptlpfggvgnsgmGAYHgkKSFE..............................  418
DSSP  llhhhhlllllllllhhheeLLLLlhHHHH..............................


DSSP  eeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query vqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
ident                                            
Sbjct ...............tfshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  ...............hleeeeeeeelllllllllhhhllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sisdtvkrareafnsgktrslqfriqqlealqrminenlksisgalasdlgknewtsyye   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  .............................lleeehhhllhhhhhhhlllllllllhhhhh
Query .............................ntiidwnsctaeqqrqllmrpaisasesitr   31
ident                                                             
Sbjct evahvleeldttikelpdwaedepvaktrqtqqddlyihseplgvvlvigawnypfnlti  120
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllllleeeeeeeelleeeeelllllllhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query tvndildnvkargdealreysakfdkttvtalkvsaeeiaaaserlsdelkqamavavkn   91
ident                                                             
Sbjct qpmvgavaagnavilkpsevsghmadllatlipqymdqnlylvvkggvpettellkerfd  180
DSSP  hhhhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhhhllllll


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeeelLEEEEELLLLllLLHHHHHHHHHHHHH..H
Query ietfhtaqklppvdvetqpgvrcqqvtrpvASVGLYIPGGsaPLFSTVLMLATPASI..A  149
ident                                    |       |       |        
Sbjct himytgstavgkivmaaaakhltpvtlelgGKSPCYVDKD.cDLDVACRRIAWGKFMnsG  239
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhllllleeeellLLLEEEELLL.lLHHHHHHHHHHHHHLllL


DSSP  LLL..eEEEEELLLLLHHHHHHHHHL..................................
Query GCK..kVVLCSPPPIADEILYAAQLC..................................  173
ident             | |   |                                         
Sbjct QTCvapDYILCDPSIQNQIVEKLKKSlkdfygedakqsrdygriindrhfqrvkglidnq  299
DSSP  LLLlllLEEEELHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhlllll


DSSP  ....................................llLEEEEL.lHHHHHHHHHHLlll
Query ....................................gvQDVFNV.gGAQAIAALAFGtes  196
ident                                            |     ||         
Sbjct kvahggtwdqssryiaptilvdvdpqspvmqeeifgpvMPIVCVrsLEEAIQFINQR...  356
DSSP  leeellleelllleelleeelllllllhhhllllllleELEEELllHHHHHHHHHLL...


DSSP  llLLLEEELLL..LHHHHHHHHHHHhllllLEELlllllleeeeeelllllhhhhhhhhh
Query vpKVDKIFGPG..NAFVTEAKRQVSqrldgAAIDmpagpsevlviadsgatpdfvasdll  254
ident   |                     |                                   
Sbjct .eKPLALYVFSnnEKVIKKMIAETS....sGGVT..........................  385
DSSP  .lLLLEEEEELllHHHHHHHHLLLL....lLEEE..........................


DSSP  hhhlllllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllleeeelllhhhhh
Query sqaehgpdsqvilltpaadmarrvaeaverqlaelpraetarqalnasrlivtkdlaqcv  314
ident                                                             
Sbjct ............................................................  385
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhllleeeeelllhhhhhhhllllleeeelllllhhhhhhllllllllllllhhhl
Query eisnqygpehliiqtrnarelvdsitsagsvflgdwspesagdyasgtnhvlptygytat  374
ident                                                             
Sbjct ........................................................andv  389
DSSP  ........................................................elll


DSSP  lllllhhhheeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query csslgladfqkrmtvqelskegfsalastietlaaaerltahknavtlrvnalkeqa  431
ident                                                          
Sbjct ivhitvptlpfggvgnsgmgayhgkksfetfshrrsclvksllneeahkaryppspa  446
DSSP  lhhhhlllllllllhhheelllllhhhhhhleeeeeeeelllllllllhhhllllll