No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=47.6

DSSP  .........LHHHlllleeelleeeELEELLLLEELL..LLEEEEELLLLLLEEEEEELL
Query .........AGLLegvikekggvpvYPSYLAGEWGGS..GQEIEVKSPIDLATIAKVISP   49
ident                                 ||             |     |  |   
Sbjct avpapnqqpEVFC............NQIFINNEWHDAvsRKTFPTVNPSTGEVICQVAEG   48
DSSP  lllllllllLLLL............LLEEELLEEELLllLLEEEEEELLLLEEEEEEELL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHhLHHH...HHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL
Query SREEVERTLDVLFkRGRW...SARDMPGTERLAVLRKAADIIERNLDVFAEVLVMNAGKP  106
ident   | |                  | |    |   |   || |||     |       |||
Sbjct DKEDVDKAVKAAR.AAFQlgsPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNGKP  107
DSSP  LHHHHHHHHHHHH.HHLLlllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHHH.HHHHHHHHHHHLLLHHHHHLLLEEEELLlllllLLEEEEEEEEELLEEEEELLL
Query KSAAV.GEVKAAVDRLRLAELDLKKIGGDYIPGDwtydtLETEGLVRREPLGVVAAITPF  165
ident                ||       |  |  || |            | || ||   | | 
Sbjct YVISYlVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPID.....GDFFSYTRHEPVGVCGQIIPW  162
DSSP  HHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEELLL.....LLEEEEEEEEELLEEEEELLL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEELLLLHHH.
Query NYPLFDAVNKITYSFIYGNAVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDAGFPPDAIALLNLPGKE.  224
ident | ||     |       || || |     || |         |||||         |   
Sbjct NFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTa  222
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLLLLh


DSSP  LHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHL...LLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHH
Query AEKIVADDRVAAVSFTGSTEVGERVVKVGG...VKQYVMELGGGDPAIVLEDADLDLAAD  281
ident    |     |  | |||||| |       |    |    ||||  | |   ||| | |  
Sbjct GAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGssnLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVE  282
DSSP  HHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHhllLLEEEEELLLLEEEEELLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHH
Query KIARGIYSYAGQRCDAIKLVLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLRVGDPRDPTVDVGPLISPS  341
ident           ||   |          |   ||    |  |  || | |     ||     
Sbjct QAHFALFFNQGQCSCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDET  342
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLEEE..LLEELLEEEELLhhhHLLLHHHHLLLLLLEE
Query AVDEMMAAIEDAVEKGGRVLAGGRRLG..PTYVQPTFVEAPadrVKDMVLYKREVFAPVA  399
ident         |      |   | ||          |||           |   | | | || 
Sbjct QFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAAdrGYFIQPTVFGDV...QDGMTIAKEEIFGPVM  399
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLllLLLLLLEEEELL...LLLLHHHHLLLLLLEE


DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLEELEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLlLLLL
Query LAVEVKDLDQAIELANGRPYGLDAAVFGRDVVKIRRAVRLLEVGAIYINDMPRHGiGYYP  459
ident      |        ||   ||| ||||  |  |       |  |    |     |    |
Sbjct QILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFG.AQSP  458
DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLL.LLLL


DSSP  LLLEELLEELLLLLLLLHHHHEEEEEEEEELllLLLLlll
Query FGGRKKSGVFREGIGYAVEAVTAYKTIVFNYkgKGVWkye  499
ident ||| | ||  ||   |   | |  ||              
Sbjct FGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKV..PQKN..s  494
DSSP  LLLLHHHEELLLLLHHHHHHHEEEEEEEEEL..LLLL..l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.3

DSSP  ..............................lhhhlllleeelleeeeleelllleellll
Query ..............................agllegvikekggvpvypsylagewggsgq   30
ident                                                             
Sbjct avpapnqqpevfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaa   60
DSSP  llllllllllllllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllhHHHHhhhhhhhhhhhh
Query eievkspidlatiakvispsreevertldvlfkrgrwsardmpgTERLavlrkaadiier   90
ident                                                             
Sbjct raafqlgspwrrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldnGKPY............  108
DSSP  hhhlllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLH............


DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhHHLL..................
Query nldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdrlrlaeldlKKIG..................  132
ident                                                             
Sbjct ..................................visyLVDLdmvlkclryyagwadkyh  134
DSSP  ..................................hhhhHLHHhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  .................................LEeeellllllllleeeeEE.......
Query .................................GDyipgdwtydtleteglVR.......  152
ident                                                             
Sbjct gktipidgdffsytrhepvgvcgqiipwnfpllMQ................AWklgpala  178
DSSP  lleellllleeeeeeeeelleeeeelllllhhhHH................HHhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  152
ident                                                             
Sbjct tgnvvvmkvaeqtpltalyvanlikeagfppgvvnivpgfgptagaaiashedvdkvaft  238
DSSP  llleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllllllhhhhhhlllllleeeee


DSSP  ......................eeelLEEEEELLLL.LLLHHHHHHHHHHHHLLL.....
Query ......................replGVVAAITPFN.YPLFDAVNKITYSFIYGN.....  184
ident                           |    |                  |         
Sbjct gsteigrviqvaagssnlkrvtlelgGKSPNIIMSDaDMDWAVEQAHFALFFNQGqcsca  298
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHlllll


DSSP  eEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHL....................................
Query aVVVKPSISDPLPAAMAVKALLDA....................................  208
ident                    |                                        
Sbjct gSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyintgkqeg  358
DSSP  eEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .................LLLL.................LLEEELLLLH.HHLHHHHLLL.
Query .................GFPP.................DAIALLNLPG.KEAEKIVADD.  232
ident                                            |      |         
Sbjct akllcgggiaadrgyfiQPTVfgdvqdgmtiakeeifgPVMQILKFKTiEEVVGRANNSt  418
DSSP  leeeellllllllllllLLEEeellllllhhhhlllllLEEEEEEELLhHHHHHHHHLLl


DSSP  LLLEEEEEL.LHHHHHHHHHHHLLLEEEeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query RVAAVSFTG.STEVGERVVKVGGVKQYVmelgggdpaivledadldlaadkiargiysya  291
ident    |                                                        
Sbjct YGLAAAVFTkDLDKANYLSQALQAGTVW................................  446
DSSP  LLLEEEEELlLHHHHHHHHHHLLLLEEE................................


DSSP  hllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhh
Query gqrcdaiklvlaerpvygklveevakrlsslrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaie  351
ident                                                             
Sbjct ............................................................  446
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllleeeellleeelleelleeeellhhhhlllhhhhlllllleeeeeeellhhhhh
Query davekggrvlaggrrlgptyvqptfveapadrvkdmvlykrevfapvalavevkdldqai  411
ident                                                             
Sbjct ............................................................  446
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllleeleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeellllllllllllllleelleelll
Query elangrpygldaavfgrdvvkirravrllevgaiyindmprhgigyypfggrkksgvfre  471
ident                                                             
Sbjct ............................................................  446
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhHHEEEE........................eeeeellllllllll
Query gigyaveAVTAYK........................tivfnykgkgvwkye  499
ident                                                     
Sbjct ....vncYDVFGAqspfggykmsgsgrelgeyglqaytevktvtvkvpqkns  494
DSSP  ....ellLLLLLLlllllllhhheelllllhhhhhhheeeeeeeeellllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.8

DSSP  lhhhlllleeelleeeeleelllleelllleeeeelllllleeeeeelllhhhhhhhhhh
Query agllegvikekggvpvypsylagewggsgqeievkspidlatiakvispsreevertldv   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query lfkrgrwsardmpgterlavlrkaadiiernldvfaevlvmnagkpksaavgevkaavdr  120
ident                                                             
Sbjct ..................................................avpapnqqpe   10
DSSP  ..................................................llllllllll


DSSP  hhlllhhhhhllleeeellllllllleeeeeeeeelleeeeelllllllhhhhhhhhhhh
Query lrlaeldlkkiggdyipgdwtydtleteglvrreplgvvaaitpfnyplfdavnkitysf  180
ident                                                             
Sbjct vfcnqifinnewhdavsrktfptvnpstgevicqvaegdkedvdkavkaaraafqlgspw   70
DSSP  llllleeelleeelllllleeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  hllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllllleeellllhhhlhhhhlllllleeeee
Query iygnavvvkpsisdplpaamavkalldagfppdaiallnlpgkeaekivaddrvaavsft  240
ident                                                             
Sbjct rrmdashrgrllnrladlierdrtylaaletldngkpyvisylvdldmvlkclryyagwa  130
DSSP  hhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeelLLLEEEEELLLlLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLeEE
Query gstevgervvkvggvkqyvmelGGGDPAIVLEDaDLDLAADKIARGIYSyagqRCDAiKL  300
ident                        |    |        |                      
Sbjct dkyhgktipidgdffsytrhepVGVCGQIIPWN.FPLLMQAWKLGPALA....TGNV.VV  184
DSSP  lllllleellllleeeeeeeeeLLEEEEELLLL.LHHHHHHHHHHHHHH....LLLE.EE


DSSP  EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllee
Query VLAERPVYGKLVEEVAKRLSSLrvgdprdptvdvgplispsavdemmaaiedavekggrv  360
ident                                                             
Sbjct MKVAEQTPLTALYVANLIKEAG......................................  206
DSSP  EELLLLLLHHHHHHHHHHHHHL......................................


DSSP  eellleeelleeLLEEeellhhhhlllhhhhllllllEEEEEEElLHHHHHHHHHLLLEE
Query laggrrlgptyvQPTFveapadrvkdmvlykrevfapVALAVEVkDLDQAIELANGRPYG  420
ident              |                       |   |       |          
Sbjct ............FPPG.....................VVNIVPG.FGPTAGAAIASHEDV  232
DSSP  ............LLLL.....................LEEELLL.LLLLHHHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEELlLHHHHHHHHHHL...LLLEEEEL.............................
Query LDAAVFGrDVVKIRRAVRLL...EVGAIYIN.............................  448
ident    |  |      |                                              
Sbjct DKVAFTG.STEIGRVIQVAAgssNLKRVTLElggkspniimsdadmdwaveqahfalffn  291
DSSP  LEEEEEL.LHHHHHHHHHHHhhlLLLEEEEElllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct qgqcscagsrtfvqediydefversvaraksrvvgnpfdskteqgpqvdetqfkkilgyi  351
DSSP  hhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct ntgkqegakllcgggiaadrgyfiqptvfgdvqdgmtiakeeifgpvmqilkfktieevv  411
DSSP  hhhhhllleeeelllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeeellhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  448
ident                                                             
Sbjct grannstyglaaavftkdldkanylsqalqagtvwvncydvfgaqspfggykmsgsgrel  471
DSSP  hhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllllllllhhheellll


DSSP  ....llLLLLLLlllllleelleellllllllhhhheeeeeeeeellllllllll
Query ....dmPRHGIGyypfggrkksgvfregigyaveavtayktivfnykgkgvwkye  499
ident                                                        
Sbjct geyglqAYTEVK................................tvtvkvpqkns  494
DSSP  lhhhhhHHEEEE................................eeeeellllll