No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=60.4

DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query HMSSSQQIAKNARKAGNILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAVAKETG   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct HMSSSQQIAKNARKAGNILKTISNEGRSDILYKIHDALKANAHAIEEANKIDLAVAKETG   60
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEEEELLEEEEEEEEELLEEE
Query LADSLLKRLDLFKGDKFEVMLQGIKDVAELEDPVGKVKMARELDDGLTLYQVTAPVGVLL  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct LADSLLKRLDLFKGDKFEVMLQGIKDVAELEDPVGKVKMARELDDGLTLYQVTAPVGVLL  120
DSSP  LLHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEEEELLEEEEEEEEELLEEE


DSSP  EEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query VIFESRPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIAQFQSETGVPVGS  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct VIFESRPEVIANITALSIKSGNAAILKGGKESVNTFREMAKIVNDTIAQFQSETGVPVGS  180
DSSP  EEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL


DSSP  EEELLLLLHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLLHH
Query VQLIETRVSDLLDQDEYIDLVVPRGSNALVRKIKDTTKIPVLGHADGICSIYLDEDADLI  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct VQLIETRVSDLLDQDEYIDLVVPRGSNALVRKIKDTTKIPVLGHADGICSIYLDEDADLI  240
DSSP  EEELLLLLHHHHHLLLLLLEEEEELLHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHLLLLLLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEELHHHHHHHHHHHHHH
Query KAKRISLDAKTNCNAMETLLINPKFSKWWEVLENLTLEGGVTIHATKDLKTAYFDKLNEL  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct KAKRISLDAKTNCNAMETLLINPKFSKWWEVLENLTLEGGVTIHATKDLKTAYFDKLNEL  300
DSSP  HHHHHHHHLLLLLLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEELHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLHHHHLLLLLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLL
Query GKLTEAIQCKTVSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDSS  360
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GKLTEAIQCKTVSLDLAAKFVTSTESAIQHINTHSSRHTDAIVTENKANAEKFMKGVDSS  360
DSSP  LLLLHHHHLLLLLLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  EEEELLLHHHLLLLLHHHEEEEEEEELLLLLLLLL
Query GVYWNASTRFADVGLDGLVSYQYQIRGDGQVASDY  395
ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GVYWNASTRFADVGLDGLVSYQYQIRGDGQVASDY  395
DSSP  EEEELLLHHHLLLLLHHHEEEEEEEELLLLLLLLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee
Query ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
ident                                                             
Sbjct ..................................................hmsssqqiak   10
DSSP  ..................................................lllhhhhhhh


DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
ident                                                             
Sbjct narkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrld   70
DSSP  hhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhl


DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllllllllLEEEEELLllLHH
Query vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttkipvlghadgICSIYLDEdaDLI  240
ident                                                             
Sbjct lfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgVLLVIFES..RPE  128
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeellEEEEEELL..LLH


DSSP  HHHHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLLL.LHHHHHHHHHHHhlllleelhhhhhhhhhhhhh
Query KAKRISLDAKTNCnAMETLLINPKFS.KWWEVLENLTLEggvtihatkdlktayfdklne  299
ident     |             |           |                             
Sbjct VIANITALSIKSG.NAAILKGGKESVnTFREMAKIVNDT.....................  166
DSSP  HHHHHHHHHHHHL.LEEEEELLHHHHhHHHHHHHHHHHH.....................


DSSP  hllllhhHHLL....lllLLLEEEELllhhhhHHHHLLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHH
Query lgklteaIQCK....tvsLDLAAKFVtstesaIQHINTHSSRHTDAIVTeNKANAEKFMK  355
ident         |                                           |   |   
Sbjct ......iAQFQsetgvpvGSVQLIET....rvSDLLDQDEYIDLVVPRG.SNALVRKIKD  215
DSSP  ......hHHHHhhhllllLLEEELLL....llHHHHHLLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHH


DSSP  HLLLlEEEE...................................................
Query GVDSsGVYW...................................................  364
ident       |                                                     
Sbjct TTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevlen  274
DSSP  LLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  364
ident                                                             
Sbjct ltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinth  334
DSSP  hhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhlll


DSSP  ......................................lllhHHLLlllhHHEEE..EEE
Query ......................................nastRFADvgldGLVSY..QYQ  384
ident                                                          |  
Sbjct ssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadvgldGLVS..yqYQIRGdgQVA  392
DSSP  lllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllllhHHEE..eeEEEELllLLL


DSSP  EELllllllll
Query IRGdgqvasdy  395
ident            
Sbjct SDY........  395
DSSP  LLL........


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hmsssqqiaknarkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketg   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ..................................................lllhhhhhhh
Query ..................................................hmsssqqiak   10
ident                                                             
Sbjct ladsllkrldlfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgvll  120
DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelleee


DSSP  hhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhl
Query narkagnilktisnegrsdilykihdalkanahaieeankidlavaketgladsllkrld   70
ident                                                             
Sbjct vifesrpevianitalsiksgnaailkggkesvntfremakivndtiaqfqsetgvpvgs  180
DSSP  eeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeellEEEEEELL..LLH
Query lfkgdkfevmlqgikdvaeledpvgkvkmarelddgltlyqvtapvgVLLVIFES..RPE  128
ident                                                             
Sbjct vqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdttkipvlghadgICSIYLDEdaDLI  240
DSSP  eeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllllllllLEEEEELLllLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHL.LEEEEELLHHHHhHHHHHHHHHHHH.....................
Query VIANITALSIKSG.NAAILKGGKESVnTFREMAKIVNDT.....................  166
ident     |             |           |                             
Sbjct KAKRISLDAKTNCnAMETLLINPKFS.KWWEVLENLTLEggvtihatkdlktayfdklne  299
DSSP  HHHHHHHHLLLLLlLLEEEEELLLLL.LHHHHHHHHHHHhlllleelhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......hHHHHhhhllllLLEEELLL....llHHHHHLLLLLLEEEEEL.LHHHHHHHHH
Query ......iAQFQsetgvpvGSVQLIET....rvSDLLDQDEYIDLVVPRG.SNALVRKIKD  215
ident         |                                           |   |   
Sbjct lgklteaIQCK....tvsLDLAAKFVtstesaIQHINTHSSRHTDAIVTeNKANAEKFMK  355
DSSP  hllllhhHHLL....lllLLLEEEELllhhhhHHHHLLLLLLLEEEEELlLHHHHHHHHH


DSSP  LLLL.LLLLllllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhh
Query TTKI.PVLGhadgicsiyldedadlikakrisldaktncnametllinpkfskwwevlen  274
ident       |                                                     
Sbjct GVDSsGVYW...................................................  364
DSSP  HLLLlEEEE...................................................


DSSP  hhhhhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhlll
Query ltleggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinth  334
ident                                                             
Sbjct ............................................................  364
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllllhHHEE..eeEEEELllLLL
Query ssrhtdaivtenkanaekfmkgvdssgvywnastrfadvgldGLVS..yqYQIRGdgQVA  392
ident                                                          |  
Sbjct ......................................nastRFADvgldGLVSY..QYQ  384
DSSP  ......................................lllhHHLLlllhHHEEE..EEE


DSSP  LLL........
Query SDY........  395
ident            
Sbjct IRGdgqvasdy  395
DSSP  EELllllllll