No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=5.7

DSSP  ......llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhHHHHHHHHHHHHH
Query ......gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlCDALNAWQLVKEL   54
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Sbjct mhprfqtafaqladnlqsalepiladkyfpalltgeqvsslksatglDEDALAFALLPLA   60
DSSP  llhhhhhhhhlllhhhhhhhllhhhlllllleelhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HH......hhLLLEEEEEE.LLEEeEEEELLLllhhhhhhllllllhHHLLhhhHHHHHH
Query KQ......alGIPAAASFK.HVSPaGAAVGIPlseeeaqvcmvhdlhKTLTplaSAYARS  107
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Sbjct AAcartplsnFNVGAIARGvSGTW.YFGANME.........figatmQQTV...HAEQSA  107
DSSP  HLllllllllLLLEEEEEElLLLE.EEEELLL.........lllllhHHLL...LHHHHH


DSSP  HHL..LLLLlLLEEEEELLLLLHHHHHHHHLLLE...EEEEELlllhhhhhhhhhhhhhl
Query RGA..DRMSsFGDFIALSDICDVPTAKIISREVS...DGVVAPgyeeealkilskkkngg  162
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Sbjct ISHawLSGEkALAAITVNYTPCGHCRQFMNELNSgldLRIHLP.................  150
DSSP  HHHhhHLLLlLEEEEEELLLLLHHHHHHHLLLLLhhhLEEELL.................


DSSP  leeeeelllllllleeeeeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhh
Query ycvlqmdpnyepddneirtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdliva  222
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Sbjct ............................................................  150
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlleelll
Query siavkytqsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvlsmkfkag  282
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Sbjct ............................................................  150
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleeeeelll
Query vkraevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltavslssdaf  342
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Sbjct ............................................................  150
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll
Query fpfrdnvdrakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
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Sbjct ...................................................  150
DSSP  ...................................................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2 Z-score=3.7

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhHHHHHHHHHHHH.hHHHHHhhl
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfINLCDALNAWQL.vKELKQalg   59
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Sbjct ......................................MHPRFQTAFAQLadNLQSA...   19
DSSP  ......................................LLHHHHHHHHLLlhHHHHH...


DSSP  lleeeeeelleeEEEEelllllhhhhhhllllllhhhllhhhHHHHhhhhllllllllee
Query ipaaasfkhvspAGAAvgiplseeeaqvcmvhdlhktltplaSAYArsrgadrmssfgdf  119
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Sbjct .lepiladkyfpALLT.........................gEQVS..............   39
DSSP  .hllhhhlllllLEEL.........................hHHHH..............


DSSP  eeelllllhhhhhhhhllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllleee
Query ialsdicdvptakiisrevsdgvvapgyeeealkilskkknggycvlqmdpnyepddnei  179
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Sbjct ............................................................   39
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHLLL.........
Query rtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavRDLIVASIAVKYTQ.........  230
ident                                           |                 
Sbjct .............................slksatglDEDALAFALLPLAAacartplsn   70
DSSP  .............................hhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHlllllllll


DSSP  .LLLEEEEE.LLEEeEEELLLL.......lhhHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhhlleell
Query .SNSVCYAK.DGQViGIGAGQQ.......sriHCTRLAGDKANSWWlrhhprvlsmkfka  281
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Sbjct fNVGAIARGvSGTW.YFGANMEfigatmqqtvHAEQSAISHAWLSG..............  115
DSSP  lLLEEEEEElLLLE.EEEELLLlllllhhhllLHHHHHHHHHHHLL..............


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllLLLEEEEELL
Query gvkraevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakLTAVSLSSDA  341
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Sbjct .................................................eKALAAITVNY  126
DSSP  .................................................lLLEEEEEELL


DSSP  LLlLLHHHHHHHLL...leEEEEEElllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll
Query FFpFRDNVDRAKRI...gvQFIVAPsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
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Sbjct TP.CGHCRQFMNELnsgldLRIHLP..............................  150
DSSP  LL.LHHHHHHHLLLllhhhLEEELL..............................