No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=10.3

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH..
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlCDALNAWQLVKELKQAL..   58
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Sbjct .........................................MKASTVLQIAYLVSQESkc   19
DSSP  .........................................LLHHHHHHHHHHHHLLLll


DSSP  ..LLLEEEEEELLEEEEEEELLLLLH......................hhhhhllllllH
Query ..GIPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSE......................eeaqvcmvhdlH   94
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Sbjct csWKVGAVIEKNGRIISTGYNGSPAGgvnccdyaaeqgwllnkrfvlakehrsahsewsS   79
DSSP  llLLLEEEEEELLEEEEEEELLLLLLlllhhhhhhhhlleeelleeelhhhhhhhhhhhH


DSSP  HHLLhhhHHHHHHHHLLL...LLLLLEEEEELLLLLHHHHHHHHLLLEEEEEELLL....
Query KTLTplaSAYARSRGADR...MSSFGDFIALSDICDVPTAKIISREVSDGVVAPGY....  147
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Sbjct KNEI...HAELNAILFAAengSSIEGATMYVTLSPCPDCAKAIAQSGIKKLVYCETydkn  136
DSSP  HHLL...LHHHHHHHHHHhhlLLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEELllll


DSSP  lHHHHHHHHHHHhhlLEEEEELLLLLLlleeeeeelleeeeeelLLLLLlhhhhllllll
Query eEEALKILSKKKnggYCVLQMDPNYEPddneirtlyglqlmqkrNNAVIdrslfknivtk  207
ident       ||         |                          |   |           
Sbjct kPGWDDILRNAG...IEVFNVPKKNLN...............klNWENI...........  167
DSSP  lLLLLHHHHHLL...LEEEELLHHHLL...............llLHHHL...........


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query nktlpesavrdlivasiavkytqsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkansww  267
ident                                                             
Sbjct ............................................................  167
DSSP  ............................................................


DSSP  hlllhhhhlleelllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhh
Query lrhhprvlsmkfkagvkraevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkq  327
ident                                                             
Sbjct ............................................................  167
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllleeeeelllllllhhhhhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeel
Query wiakltavslssdaffpfrdnvdrakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtn  387
ident                                                             
Sbjct ............................................................  167
DSSP  ............................................................


DSSP  llllll
Query lrlfhh  393
ident       
Sbjct nefcge  173
DSSP  llllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.8

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlcdalnawqlvkelkqalgi   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeelleeeeeeelllllhhhhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhlllllllleee
Query paaasfkhvspagaavgiplseeeaqvcmvhdlhktltplasayarsrgadrmssfgdfi  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllllhhhhhhhhllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllleeee
Query alsdicdvptakiisrevsdgvvapgyeeealkilskkknggycvlqmdpnyepddneir  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHLLL........LL
Query tlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavRDLIVASIAVKYTQ........SN  232
ident                                                             
Sbjct ....................................MKASTVLQIAYLVSqeskccswKV   24
DSSP  ....................................LLHHHHHHHHHHHHllllllllLL


DSSP  LEEEEELLEEEEEELLLL......................................lhhH
Query SVCYAKDGQVIGIGAGQQ......................................sriH  254
ident      | |  |  |                                             |
Sbjct GAVIEKNGRIISTGYNGSpaggvnccdyaaeqgwllnkrfvlakehrsahsewsskneiH   84
DSSP  EEEEEELLEEEEEEELLLllllllhhhhhhhhlleeelleeelhhhhhhhhhhhhhhllL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHlllhhhhlleelllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllee
Query CTRLAGDKANSWWLrhhprvlsmkfkagvkraevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfe  314
ident     |   |                                                   
Sbjct AELNAILFAAENGS..............................................   98
DSSP  HHHHHHHHHHHHLL..............................................


DSSP  ellllllhhhhhhhhlllLLEEEEELLLLlLLHHHHHHHLLLEEEEEEE.LLLLLHHHHH
Query evpaqlteaekkqwiaklTAVSLSSDAFFpFRDNVDRAKRIGVQFIVAP.SGSAADEVVI  373
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Sbjct ................siEGATMYVTLSP.CPDCAKAIAQSGIKKLVYCeTYDKNKPGWD  141
DSSP  ................llLLLEEEEEELL.LHHHHHHHHHHLLLEEEEEeLLLLLLLLLL


DSSP  HHHHHHLLEEEEELL............lllll
Query EACNELGITLIHTNL............rlfhh  393
ident       ||                        
Sbjct DILRNAGIEVFNVPKknlnklnweninefcge  173
DSSP  HHHHHLLLEEEELLHhhlllllhhhlllllll