No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.7

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeelLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngSPGFINLCDALNAWQLVKELKQ....   56
ident                                     | |                     
Sbjct ..................................KVGGIEDRQLEALKRAALKACElsys   26
DSSP  ..................................LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhlll


DSSP  ..hhLLLEEEEEE.LLEEeEEEELLLllhhhhhhllllllhHHLLhhhHHHHHHHHLLL.
Query ..alGIPAAASFK.HVSPaGAAVGIPlseeeaqvcmvhdlhKTLTplaSAYARSRGADR.  112
ident                                                  |          
Sbjct pyshFRVGCSILTnNDVI.FTGANVE...........nasySNCI...CAERSAMIQVLm   71
DSSP  llllLLEEEEEELlLLLE.EEEELLL...........lllhHHLL...LHHHHHHHHHHh


DSSP  .LLLLLE.EEEEL.......LLLLHHHHHHHHLLL..eEEEEELL..llhhhhhhHHHHh
Query .MSSFGD.FIALS.......DICDVPTAKIISREV..sDGVVAPG..yeeealkiLSKKk  159
ident      |                        |   |      |                  
Sbjct aGHRSGWkCMVICgdsedqcVSPCGVCRQFINEFVvkdFPIVMLNstgsrskvmtMGEL.  130
DSSP  lLLLLLLlEEEEEellllllLLLLHHHHHHHHLLLlllLEEEEELllllleeeeeHHHH.


DSSP  hhlleeeeelllllllleeeeeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhh
Query nggycvlqmdpnyepddneirtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdl  219
ident                                                             
Sbjct ............................................................  130
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlleE
Query ivasiavkytqsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvlsmkF  279
ident                                                             
Sbjct ....................................................lpmafgpS  138
DSSP  ....................................................llllllhH


DSSP  LLLllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleeeee
Query KAGvkraevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltavslss  339
ident                                                             
Sbjct HLN.........................................................  141
DSSP  HLL.........................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll
Query daffpfrdnvdrakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
ident                                                       
Sbjct ......................................................  141
DSSP  ......................................................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.3

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlcdalnawqlvkelkqalgi   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeelleeeeeeelllllhhhhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhlllllllleee
Query paaasfkhvspagaavgiplseeeaqvcmvhdlhktltplasayarsrgadrmssfgdfi  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllllhhhhhhhhllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllleeee
Query alsdicdvptakiisrevsdgvvapgyeeealkilskkknggycvlqmdpnyepddneir  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelleeeeeelllllllhhhhlllllllllLLHHhHHHHHHHHHHHHLLL..........
Query tlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktLPESaVRDLIVASIAVKYTQ..........  230
ident                                     | |     |               
Sbjct ............................kvGGIE.DRQLEALKRAALKACelsyspyshf   31
DSSP  ............................llLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHhhllllllll


DSSP  LLLEEEEE.LLEEeEEELLLL.....lhhHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhhlleelllll
Query SNSVCYAK.DGQViGIGAGQQ.....sriHCTRLAGDKANSWWlrhhprvlsmkfkagvk  284
ident                 ||              | |                         
Sbjct RVGCSILTnNDVI.FTGANVEnasysnciCAERSAMIQVLMAG.................   73
DSSP  LEEEEEELlLLLE.EEEELLLlllhhhllLHHHHHHHHHHHLL.................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhlLLLLEEEEEL....
Query raevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiaKLTAVSLSSD....  340
ident                                                             
Sbjct .............................................hRSGWKCMVICgdse   88
DSSP  .............................................lLLLLLEEEEEelll


DSSP  ...LLLLlLHHHHHHHLLL..eEEEEEE...lllllhhhhHHHHHHHlleeeeellllll
Query ...AFFPfRDNVDRAKRIG..vQFIVAP...sgsaadevvIEACNELgitlihtnlrlfh  392
ident                         ||               |                  
Sbjct dqcVSPC.GVCRQFINEFVvkdFPIVMLnstgsrskvmtmGELLPMA.......fgpshl  140
DSSP  lllLLLL.HHHHHHHHLLLlllLEEEEElllllleeeeehHHHLLLL.......llhhhl


DSSP  l
Query h  393
ident  
Sbjct n  141
DSSP  l


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeelLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..hhh
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngSPGFINLCDALNAWQLVKELK..qal   58
ident                                         |     |     ||      
Sbjct ...............................kvgGIEDRQLEALKRAALKACELSyspys   29
DSSP  ...............................lllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllll


DSSP  LLLEeeeeelleeeeeeelllllhhhhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhlllllLLLE
Query GIPAaasfkhvspagaavgiplseeeaqvcmvhdlhktltplasayarsrgadrmsSFGD  118
ident                                                             
Sbjct HFRV..............................................gcsiltNNDV   43
DSSP  LLLE..............................................eeeeelLLLL


DSSP  EEEELL..............lllhhhhhhhhLLLEEEEEE........LLLLHHHHHHHH
Query FIALSD..............icdvptakiisREVSDGVVA........PGYEEEALKILS  156
ident                                |      |                     
Sbjct IFTGANvenasysncicaersamiqvlmaghRSGWKCMVIcgdsedqcVSPCGVCRQFIN  103
DSSP  EEEEELlllllhhhlllhhhhhhhhhhhlllLLLLLEEEEeellllllLLLLHHHHHHHH


DSSP  .HHHHhLLEEEEELLLLLllleeeeeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhh
Query .KKKNgGYCVLQMDPNYEpddneirtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesa  215
ident                                                             
Sbjct eFVVK.DFPIVMLNSTGS..........................................  120
DSSP  lLLLL.LLEEEEELLLLL..........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query vrdlivasiavkytqsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvl  275
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  lleelllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllle
Query smkfkagvkraevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltav  335
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelllllllhhhhhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll
Query slssdaffpfrdnvdrakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
ident                                                           
Sbjct .....................................rskvmtmgellpmafgpshln  141
DSSP  .....................................leeeeehhhhllllllhhhll