No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.2

DSSP  .......................................llLLHHHHHHHHHHHHHHHHh
Query .......................................haMNHETFLKRAVTLACEGVn   21
ident                                                      |      
Sbjct gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlCDALNAWQLVKELKQALG.   59
DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  lllllLLEEEEEELLEEEEEEELLHHHH...........lLLLL...LHHHHHHHHhHHH
Query agiggPFGAVIVKDGAIIAEGQNNVTTS...........nDPTA...HAEVTAIRKaCKV   67
ident         |   |                                   |           
Sbjct .....IPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEeeaqvcmvhdlhKTLTplaSAYARSRGA.DRM  113
DSSP  .....LLEEEEEELLEEEEEEELLLLLHhhhhhllllllhHHLLhhhHHHHHHHHL.LLL


DSSP  HllllLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEELHH....................
Query LgayqLDDCILYTSCEPCPMCLGAIYWARPKAVFYAAEHT....................  107
ident              |          |       |                           
Sbjct S....SFGDFIALSDICDVPTAKIISREVSDGVVAPGYEEealkilskkknggycvlqmd  169
DSSP  L....LLLEEEEELLLLLHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLHhhhhhhhhhhhhlleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  107
ident                                                             
Sbjct pnyepddneirtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdlivasiavkyt  229
DSSP  llllllleeeeeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  107
ident                                                             
Sbjct qsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvlsmkfkagvkraevs  289
DSSP  lllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlleelllllhhhhh


DSSP  .....................................................hhhhlll
Query .....................................................daaeagf  114
ident                                                             
Sbjct naidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltavslssdaffpfrdnv  349
DSSP  hhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleeeeelllllllhhh


DSSP  lhhhhhhhhlllhhhllllllllllllllhhhhhhhhlllllll
Query ddsfiykeidkpaeertipfyqvtltehlspfqawrnfankkey  158
ident                                             
Sbjct drakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
DSSP  hhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  ...........................................................L
Query ...........................................................H    1
ident                                                             
Sbjct gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlcdalnawqlvkelkqalgI   60
DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlL


DSSP  LLL.........................................................
Query AMN.........................................................    4
ident                                                             
Sbjct PAAasfkhvspagaavgiplseeeaqvcmvhdlhktltplasayarsrgadrmssfgdfi  120
DSSP  LEEeeeelleeeeeeelllllhhhhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhlllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    4
ident                                                             
Sbjct alsdicdvptakiisrevsdgvvapgyeeealkilskkknggycvlqmdpnyepddneir  180
DSSP  eelllllhhhhhhhhllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllleeee


DSSP  ......................................HHHHHHHHHHHHhhhhhlllll
Query ......................................HETFLKRAVTLAcegvnagigg   26
ident                                                             
Sbjct tlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdLIVASIAVKYTQ..........  230
DSSP  eelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHLLL..........


DSSP  LLEEEEEELLEEEEEEELLHhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHL.................
Query PFGAVIVKDGAIIAEGQNNVttsndptAHAEVTAIRKACKVLG.................   69
ident        |||  |  |            |    |  ||                      
Sbjct SNSVCYAKDGQVIGIGAGQQ.....srIHCTRLAGDKANSWWLrhhprvlsmkfkagvkr  285
DSSP  LLLEEEEELLEEEEEELLLL.....lhHHHHHHHHHHHHHHHHlllhhhhlleelllllh


DSSP  ...........................................LLLLLLEEEEEEELL.L
Query ...........................................AYQLDDCILYTSCEP.C   85
ident                                               |    |        
Sbjct aevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwIAKLTAVSLSSDAFFpF  345
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhHLLLLLEEEEELLLLlL


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEEeELHHhhhhlllLHHHHHhhhlllhhhllllllllllllllhh
Query PMCLGAIYWARPKAVFYaAEHTdaaeagfDDSFIYkeidkpaeertipfyqvtltehlsp  145
ident                                                             
Sbjct RDNVDRAKRIGVQFIVA.PSGS.......AADEVV.................ieacnelg  380
DSSP  LHHHHHHHLLLEEEEEE.ELLL.......LLHHHH.................hhhhhhhl


DSSP  hhhhhhlllllll
Query fqawrnfankkey  158
ident              
Sbjct itlihtnlrlfhh  393
DSSP  leeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  ...................................llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query ...................................haMNHETFLKRAVTLACEGVNAGIG   25
ident                                               |  |  |   |   
Sbjct gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgFINLCDALNAWQLVKELKQALGI   60
DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLLeeeeeelleeeeeeelLHHH................hlLLLL...............
Query GPFgavivkdgaiiaegqnNVTT................snDPTA...............   54
ident                                           | |               
Sbjct PAA....asfkhvspagaaVGIPlseeeaqvcmvhdlhktlTPLAsayarsrgadrmssf  116
DSSP  LEE....eeeelleeeeeeELLLllhhhhhhllllllhhhlLHHHhhhhhhhhlllllll


DSSP  ...........lhhHHHHHHHHhhhlllllllEEEEEeELLLHHHHHHHHHH..LLLEEE
Query ...........haeVTAIRKACkvlgayqlddCILYTsCEPCPMCLGAIYWA..RPKAVF  101
ident                  |                           |            | 
Sbjct gdfialsdicdvptAKIISREV.........sDGVVA.PGYEEEALKILSKKknGGYCVL  166
DSSP  leeeeelllllhhhHHHHHLLL.........eEEEEE.LLLLHHHHHHHHHHhhHLLEEE


DSSP  EEE.........................................................
Query YAA.........................................................  104
ident                                                             
Sbjct QMDpnyepddneirtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdlivasiav  226
DSSP  EELllllllleeeeeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .....................lhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhllllllllllllll
Query .....................ehtdaaeagfddsfiykeidkpaeertipfyqvtltehl  143
ident                                                             
Sbjct kytqsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvlsmkfkagvkra  286
DSSP  hlllllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlleelllllhh


DSSP  HHHHHHHHLLLL................................................
Query SPFQAWRNFANK................................................  155
ident     |                                                       
Sbjct EVSNAIDQYVTGtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltavslssdaffpfr  346
DSSP  HHHHHHHHHHHLlllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleeeeelllllll


DSSP  ............................................lll
Query ............................................key  158
ident                                                
Sbjct dnvdrakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
DSSP  hhhhhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll