No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.2

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL.
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlCDALNAWQLVKELKQALG.   59
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Sbjct .......................................haMNHETFLKRAVTLACEGVn   21
DSSP  .......................................llLLHHHHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  .....LLEEEEEELLEEEEEEELLLLLHhhhhhllllllhHHLLhhhHHHHHHHHL.LLL
Query .....IPAAASFKHVSPAGAAVGIPLSEeeaqvcmvhdlhKTLTplaSAYARSRGA.DRM  113
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Sbjct agiggPFGAVIVKDGAIIAEGQNNVTTS...........nDPTA...HAEVTAIRKaCKV   67
DSSP  lllllLLEEEEEELLEEEEEEELLHHHH...........lLLLL...LHHHHHHHHhHHH


DSSP  L....LLLEEEEELLLLLHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLHhhhhhhhhhhhhlleeeeel
Query S....SFGDFIALSDICDVPTAKIISREVSDGVVAPGYEEealkilskkknggycvlqmd  169
ident              |          |       |                           
Sbjct LgayqLDDCILYTSCEPCPMCLGAIYWARPKAVFYAAEHT....................  107
DSSP  HllllLLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEELHH....................


DSSP  llllllleeeeeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhll
Query pnyepddneirtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdlivasiavkyt  229
ident                                                             
Sbjct ............................................................  107
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlleelllllhhhhh
Query qsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvlsmkfkagvkraevs  289
ident                                                             
Sbjct ............................................................  107
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleeeeelllllllhhh
Query naidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltavslssdaffpfrdnv  349
ident                                                             
Sbjct .....................................................daaeagf  114
DSSP  .....................................................hhhhlll


DSSP  hhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll
Query drakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
ident                                             
Sbjct ddsfiykeidkpaeertipfyqvtltehlspfqawrnfankkey  158
DSSP  lhhhhhhhhlllhhhllllllllllllllhhhhhhhhlllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.0

DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlL
Query gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlcdalnawqlvkelkqalgI   60
ident                                                             
Sbjct ...........................................................H    1
DSSP  ...........................................................L


DSSP  LEEeeeelleeeeeeelllllhhhhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhlllllllleee
Query PAAasfkhvspagaavgiplseeeaqvcmvhdlhktltplasayarsrgadrmssfgdfi  120
ident                                                             
Sbjct AMN.........................................................    4
DSSP  LLL.........................................................


DSSP  eelllllhhhhhhhhllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllleeee
Query alsdicdvptakiisrevsdgvvapgyeeealkilskkknggycvlqmdpnyepddneir  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    4
DSSP  ............................................................


DSSP  eelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHLLL..........
Query tlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdLIVASIAVKYTQ..........  230
ident                                                             
Sbjct ......................................HETFLKRAVTLAcegvnagigg   26
DSSP  ......................................HHHHHHHHHHHHhhhhhlllll


DSSP  LLLEEEEELLEEEEEELLLL.....lhHHHHHHHHHHHHHHHHlllhhhhlleelllllh
Query SNSVCYAKDGQVIGIGAGQQ.....srIHCTRLAGDKANSWWLrhhprvlsmkfkagvkr  285
ident        |||  |  |            |    |  ||                      
Sbjct PFGAVIVKDGAIIAEGQNNVttsndptAHAEVTAIRKACKVLG.................   69
DSSP  LLEEEEEELLEEEEEEELLHhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHL.................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhHLLLLLEEEEELLLLlL
Query aevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwIAKLTAVSLSSDAFFpF  345
ident                                               |    |        
Sbjct ...........................................AYQLDDCILYTSCEP.C   85
DSSP  ...........................................LLLLLLEEEEEEELL.L


DSSP  LHHHHHHHLLLEEEEEE.ELLL.......LLHHHH.................hhhhhhhl
Query RDNVDRAKRIGVQFIVA.PSGS.......AADEVV.................ieacnelg  380
ident                                                             
Sbjct PMCLGAIYWARPKAVFYaAEHTdaaeagfDDSFIYkeidkpaeertipfyqvtltehlsp  145
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEEeELHHhhhhlllLHHHHHhhhlllhhhllllllllllllllhh


DSSP  leeeeelllllll
Query itlihtnlrlfhh  393
ident              
Sbjct fqawrnfankkey  158
DSSP  hhhhhhlllllll