No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngspgfinlcdalnawqlvkelkqalgi   60
DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct paaasfkhvspagaavgiplseeeaqvcmvhdlhktltplasayarsrgadrmssfgdfi  120
DSSP  leeeeeelleeeeeeelllllhhhhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhlllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alsdicdvptakiisrevsdgvvapgyeeealkilskkknggycvlqmdpnyepddneir  180
DSSP  eelllllhhhhhhhhllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllleeee


DSSP  ....................lllllllllLLLL..HHHHHHHHHHHHHLLL.LEEEEL.L
Query ....................gsdkihhhhHHVE..KNLLRSALKIFEKKDL.SLLAYS.G   36
ident                                 |     |  |          |      |
Sbjct tlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknkTLPEsaVRDLIVASIAVKYTQSnSVCYAKdG  240
DSSP  eelleeeeeelllllllhhhhllllllllLLLHhhHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEElL


DSSP  LEEEEEL.LLLL.HHHHHHHHHLL....................................
Query RSIFESK.DSGL.KPVVELFKRFD....................................   58
ident   |                                                         
Sbjct QVIGIGAgQQSRiHCTRLAGDKANswwlrhhprvlsmkfkagvkraevsnaidqyvtgti  300
DSSP  EEEEEELlLLLHhHHHHHHHHHHHhhhhlllhhhhlleelllllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ..............................llLLLEEEE.EEEL.HHHHHHHHHHLLLEE
Query ..............................nlEGSLVID.KMVG.KAAASFLLKMKPDHI   86
ident                                                            |
Sbjct gededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiaklTAVSLSSdAFFPfRDNVDRAKRIGVQFI  360
DSSP  lllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhlllLLEEEEElLLLLlLHHHHHHHLLLEEEE


DSSP  EEEE...eEHHHHHHHHHLLLLEEEEEeellllllllllllhhhhhhhllllhhhhhhhh
Query HAKV...iSKPALKLMNEYGQSFSYDEkipfvlgkdgksmcpfeklvlemddpeeiiriv  143
ident  |              || |                                        
Sbjct VAPSgsaaDEVVIEACNELGITLIHTN...............................lr  389
DSSP  EEELllllHHHHHHHHHHHLLEEEEEL...............................ll


DSSP  hlll
Query lskf  147
ident     
Sbjct lfhh  393
DSSP  llll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.8

DSSP  .........................lllllllllLLLL..HHHHHHHHHHHHHLL.....
Query .........................gsdkihhhhHHVE..KNLLRSALKIFEKKD.....   28
ident                                               |             
Sbjct gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngSPGFinLCDALNAWQLVKELKqalgi   60
DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeelLLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhll


DSSP  lLEEEEL.LLEEEEELL.....................LLLHHHHH.HHHHLLlLLLLEE
Query lSLLAYS.GRSIFESKD.....................SGLKPVVE.LFKRFDnLEGSLV   65
ident                                                         |   
Sbjct pAAASFKhVSPAGAAVGiplseeeaqvcmvhdlhktltPLASAYARsRGADRMsSFGDFI  120
DSSP  lEEEEEElLEEEEEEELllllhhhhhhllllllhhhllHHHHHHHHhHHLLLLlLLLEEE


DSSP  EE.EEELHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEEHHHHHHHHHL...LLLEEEEE...........
Query ID.KMVGKAAASFLLKMKPDHIHAKVISKPALKLMNEY...GQSFSYDE...........  110
ident           |        |   |      |||        |                  
Sbjct ALsDICDVPTAKIISREVSDGVVAPGYEEEALKILSKKkngGYCVLQMDpnyepddneir  180
DSSP  EElLLLLHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHhhhLLEEEEELllllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct tlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavrdlivasiavkytqsnsvcyakdg  240
DSSP  eelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct qvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvlsmkfkagvkraevsnaidqyvtgti  300
DSSP  eeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlleelllllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ........................................................eell
Query ........................................................kipf  114
ident                                                             
Sbjct gededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltavslssdaffpfrdnvdrakrigvqfi  360
DSSP  lllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleeeeelllllllhhhhhhhllleeee


DSSP  llllllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhlll
Query vlgkdgksmcpfeklvlemddpeeiirivlskf  147
ident                                  
Sbjct vapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
DSSP  eeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ........................llllllllllLLLHHHHHHHHHHHHHLL.......l
Query ........................gsdkihhhhhHVEKNLLRSALKIFEKKD.......l   29
ident                                         |  ||               
Sbjct gvsqlplrygmnphqspaqlyttrpklpltvvngSPGFINLCDALNAWQLVKelkqalgi   60
DSSP  llleeeelllllllllleeeellllllleeeeelLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhll


DSSP  leeeELLL..................................................ee
Query sllaYSGR..................................................si   39
ident                                                             
Sbjct paaaSFKHvspagaavgiplseeeaqvcmvhdlhktltplasayarsrgadrmssfgdfi  120
DSSP  leeeEEELleeeeeeelllllhhhhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhlllllllleee


DSSP  eeelllLLHHHHHHHHHLlllllLEEEEEEELHHHHHHHHHH..LLLEEEEEeeehhhhh
Query feskdsGLKPVVELFKRFdnlegSLVIDKMVGKAAASFLLKM..KPDHIHAKviskpalk   97
ident                          |        |   | |                   
Sbjct alsdicDVPTAKIISREV....sDGVVAPGYEEEALKILSKKknGGYCVLQM........  168
DSSP  eellllLHHHHHHHHLLL....eEEEEELLLLHHHHHHHHHHhhHLLEEEEE........


DSSP  hhhhlllleeeEEEE.............................................
Query lmneygqsfsyDEKI.............................................  112
ident            |                                                
Sbjct ...........DPNYepddneirtlyglqlmqkrnnavidrslfknivtknktlpesavr  217
DSSP  ...........LLLLlllleeeeeelleeeeeelllllllhhhhlllllllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  112
ident                                                             
Sbjct dlivasiavkytqsnsvcyakdgqvigigagqqsrihctrlagdkanswwlrhhprvlsm  277
DSSP  hhhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  112
ident                                                             
Sbjct kfkagvkraevsnaidqyvtgtigededlvkwqamfeevpaqlteaekkqwiakltavsl  337
DSSP  eelllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeellllllhhhhhhhhllllleee


DSSP  .....................llllllllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhlll
Query .....................pfvlgkdgksmcpfeklvlemddpeeiirivlskf  147
ident                                                         
Sbjct ssdaffpfrdnvdrakrigvqfivapsgsaadevvieacnelgitlihtnlrlfhh  393
DSSP  eelllllllhhhhhhhllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlleeeeelllllll