No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=43.1

DSSP  lLLHHHHHH......................LLLEEEeEEEEEE.LLHHHHHHHLLEEEE
Query iITIEDAIK......................NNSFYGsELKIEK.GDLKKGFSEADNVVS   37
ident       |                                  |         |  |  |  
Sbjct .VDPFKAMEpdapllredikdkmtgahgarkHHNHIF.RWEIGDkEGTDATFAKAEVVSK   58
DSSP  .LLHHHLLLlllllllhhhlllleelleellLLLEEE.EEEEELhHHHHHHHHHLLEEEE


DSSP  EEEEELLLLLLLLLLLEEEEEELLLLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEE
Query GELYIGGQDHFYLETHCTIAIPKGEEGEMELFVSTQNAMKTQSFVAKMLGVPVNRILVRV   97
ident             |||    |      ||  |    |        |    | |   | |  
Sbjct DMFTYHRVHPSPLETCQCVASMDKIKGELTLWGTFQAPHVIRTVVSLISGLPEHKIHVIA  118
DSSP  EEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEL


DSSP  LLLLLLLLLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEEL
Query KRMGGGFGGKETrSTLVSVAVALAAYKTGHPVRCMLDRNEDMLITGGRHPFLARYKVGFM  157
ident    ||||| |        |    |    | ||    || |    |               
Sbjct PDIGGGFGNKVG.AYSGYVCAVVASIVLGVPVKWVEDRMENLSTTSFARDYHMTTELAAT  177
DSSP  LLLLLLLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHLLEELLEEEEEEEEEL


DSSP  LLLLEEEEEEEEEEEEELLLLLHH...HHHHHHhHLLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLL
Query KTGTIVALEVDHYSNAGNSRDLSH...SIMERAlFHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLSSN  214
ident | | | |         |                       |  |          ||  | 
Sbjct KDGKILAMRCHVLADHGAFDACADpskWPAGFM.NICTGSYDMPVAHLAVDGVYTNKASG  236
DSSP  LLLLEEEEEEEEEEELLLLLLLLLlllLLLLLH.HHLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLE


DSSP  L.LLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLL...LLLLLLLLLLLLLL
Query T.AFRG.FGGPQALFIAENWMSEVAVTCGLPAEEVRWKNMYKE...GDLTHFNQRLEGFS  269
ident   | |  |    |    |      |          | ||                     
Sbjct GvAYRCsFRVTEAVYAIERAIETLAQRLEMDSADLRIKNFIQPeqfPYMAPLGWEYDSGN  296
DSSP  ElLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLHhhlLEELLLLLEELLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHL....LLEEEEEEEEEEEEEELL....LLHH..
Query VPRCWDECLKSSQYYARKSEVDKFNKEN....CWKKRGLCIIPTKFGISF....TVPF..  319
ident  |           |     |                 |  |                   
Sbjct YPLAMKKAMDTVGYHQLRAEQKAKQEAFkrgeTREIMGIGISFFTEIVGAgpskNCDIlg  356
DSSP  HHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLEEEEEEEEEEELLLLLllllLLEEll


DSSP  .HLEEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEELLLEELLLLL
Query .LNQAGALIHVYTDGSVLVSHGGTEMGQGLHTKMVQVASKALKIPISKIYISETSTNTVP  378
ident       | |     |||    |    |||  |   |     | ||   | | |  | | |
Sbjct vSMFDSAEIRIHPTGSVIARMGTKSQGQGHETTYAQIIATELGIPADDIMIEEGNTDTAP  416
DSSP  eELLEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLL


DSSP  LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......................L
Query NSSPTAASVSTDIYGQAVYEACQTILKRLEPFKKKNP......................D  416
ident     |  | ||   | |   |   |                                   
Sbjct YGLGTYGSRSTPTAGAATAVAARKIKAKAQMIAAHMLevhegdlewdvdrfrvkglpekF  476
DSSP  LLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllhhheeellleeeelleeeeE


DSSP  LLHHHHHHHHHHLL.....LLLEEEEEEELLlllllllllllllLLEEEEEEEEEEEEEE
Query GSWEDWVMAAYQDR.....VSLSTTGFYRTPnlgysfetnsgnaFHYFTYGVACSEVEID  471
ident         | |          |     |  |                   |       ||
Sbjct KTMKELAWASYNSPppnlePGLEAVNYYDPP.............NMTYPFGAYFCIMDID  523
DSSP  EEHHHHHHHHHHLLlllllLLLEEEEEELLL.............LLLLLEEEEEEEEEEE


DSSP  LLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLL
Query CLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPS  531
ident   ||  |  |     | |   || |  ||| |            |  |   |        
Sbjct VDTGVAKTRRFYALDDCGTRINPMIIEGQVHGGLTEAFAVAMGQEIRYDEQGNVLGASFM  583
DSSP  LLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEELLLLLEELLLLL


DSSP  LLLLLLHHHLLlEEEEEELLlLLLLLLHHHLLLLLLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhh
Query TYKIPAFGSIPtEFRVSLLRdCPNKKAIYASKAVGEPPLFLGA.SVFFAIKDAIRAARaq  590
ident     |     |           |        | ||| |   |      |  ||       
Sbjct DFFLPTAVETP.KWETDYTV.TPSPHHPIGAKGVGESPHVGGVpCFSNAVNDAYAFLN..  639
DSSP  LLLLLLLLLLL.LLEEEELL.LLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHhHHHHHHHHHHHLLL..


DSSP  hlllllllLLLLLLLLLHHHHHHHL..LLLLLllllllllllllllllll
Query htnnntkeLFRLDSPATPEKIRNAC..VDKFTtlcvtgapgnckpwslrv  638
ident               |                                   
Sbjct ........AGHIQMPHDAWRLWKVGeqLGLHV..................  663
DSSP  ........LLLLLLLLLHHHHHHHHhhLLLLL..................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=13.2

DSSP  ......................lllhhhhhhllleeeeEEEEE..elLHHHHHhhlleEE
Query ......................iitiedaiknnsfygsELKIE..kgDLKKGFseadnVV   36
ident                                       |                    |
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrwEIGDKegtdATFAKA.....EV   55
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeEEELHhhhhHHHHHL.....LE


DSSP  EEEEEEL...lllllllllleeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhhe
Query SGELYIG...gqdhfylethctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnri   93
ident                                                             
Sbjct VSKDMFTyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkih  115
DSSP  EEEEEEEellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhhee


DSSP  eeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllllllEEEEEE
Query lvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaayktghpvrcmldrnedmlitggrhpFLARYK  153
ident                                                             
Sbjct viapdigggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhMTTELA  175
DSSP  eelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeEEEEEE


DSSP  EEEllllLEEEEEEEE..........eeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeee
Query VGFmktgTIVALEVDH..........ysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgt  203
ident            |                                                
Sbjct ATK....DGKILAMRChvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvyt  231
DSSP  ELL....LLLEEEEEEeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeell


DSSP  eeeeelllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhHHHHHL...LLLL...L
Query grlcktnlssntafRGFGGPQALFIAENWMSEVAvtcglpaeeVRWKNM...YKEG...D  257
ident                           |                                 
Sbjct nkasggvayrcsfrVTEAVYAIERAIETLAQRLE........mDSADLRiknFIQPeqfP  283
DSSP  lllleellllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL........lLHHHHHhhhLLLHhhlL


DSSP  LLL...LLLLLLLL..LHHHHHHHHHHhlLHHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEEEEEEEEE
Query LTH...FNQRLEGF..SVPRCWDECLKssQYYARKSEVDKFNKENCwKKRGLCIIPTKFG  312
ident                       |      |  |         |          |    | 
Sbjct YMAplgWEYDSGNYplAMKKAMDTVGY.hQLRAEQKAKQEAFKRGE.TREIMGIGISFFT  341
DSSP  EELlllLEELLLLHhhHHHHHHHHHLH.hHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLEEEEEEEEEEE


DSSP  E..........................llllhhhleeeeeeeellllleeeeelllllll
Query I..........................sftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgq  346
ident                                                             
Sbjct Eivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgip  401
DSSP  Llllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query glhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkr  406
ident                                                             
Sbjct addimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdle  461
DSSP  hhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhee


DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllLLLLlEEEEEEEEE
Query lepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsGNAFhYFTYGVACS  466
ident                                                     |       
Sbjct wdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppNMTY.PFGAYFCIM  520
DSSP  ellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllLLLL.LEEEEEEEE


DSSP  EEEEEllllLEEEEEEEEEEELL......llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllll
Query EVEIDcltgDHKNLRTDIVMDVG......ssLNPAIDIGQVEGAFVQGLGlftleelhys  520
ident     |                                 |    ||    |          
Sbjct DIDVD....TGVAKTRRFYALDDcgtrinpmIIEGQVHGGLTEAFAVAMG......qeir  570
DSSP  EEELL....LLLEEEEEEEEEEEllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......llle


DSSP  lllllllllllllllLLHHhllleEEEEELLlLLLLL....lhhhlLLLL..LLLHHHHH
Query pegslhtrgpstykiPAFGsipteFRVSLLRdCPNKK....aiyasKAVG..EPPLFLGA  574
ident                                                             
Sbjct ydeqgnvlgasfmdfFLPT.avetPKWETDY.TVTPSphhpigakgVGESphVGGVPCFS  628
DSSP  ellllleelllllllLLLL.llllLLLEEEE.LLLLLlllllllllLLLHhhHHHHHHHH


DSSP  .HHHHHHHHHHHhhhhhhllllllllllLLLL......LLHHHHHHHLllllllllllll
Query .SVFFAIKDAIRaaraqhtnnntkelfrLDSP......ATPEKIRNACvdkfttlcvtga  627
ident   |  |                                                      
Sbjct nAVNDAYAFLNA................GHIQmphdawRLWKVGEQLG............  660
DSSP  hHHHHHHHLLLL................LLLLllllhhHHHHHHHHLL............


DSSP  lllllllllll
Query pgnckpwslrv  638
ident            
Sbjct ........lhv  663
DSSP  ........lll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=7.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  .....................................................lLLHHHH
Query .....................................................iITIEDA    7
ident                                                            |
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsGNYPLA  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellLLHHHH


DSSP  HH.....llleeeeeeeeeellhhhhhhHLLEEEEEEEEELLLLLLL..........LLL
Query IK.....nnsfygselkiekgdlkkgfsEADNVVSGELYIGGQDHFY..........LET   52
ident  |                                 |                        
Sbjct MKkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgeTREIMGIGISFFTEIVGAGpskncdilgvSMF  360
DSSP  HHhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEEEEEEEEEELLLLLLllllleelleELL


DSSP  LEEEEEELLLlLLEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELL......LL
Query HCTIAIPKGEeGEMELFVSTQ.....NAMKTQSFVAKMLGVPVNRILVRVKR......MG  101
ident            |       |               |  || |   |              
Sbjct DSAEIRIHPT.GSVIARMGTKsqgqgHETTYAQIIATELGIPADDIMIEEGNtdtapyGL  419
DSSP  EEEEEEELLL.LLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLllllllLL


DSSP  LLLLLLLLL.LHHHHHHHHHHH......................................
Query GGFGGKETR.STLVSVAVALAA......................................  122
ident |  |   |          |                                         
Sbjct GTYGSRSTPtAGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktm  479
DSSP  LLLLLLLLLlHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeeh


DSSP  ..............hhhLLLEEEELlhhHHHHhlLLLLLEEEEEEEEELL.LLLEeeEEE
Query ..............yktGHPVRCMLdrnEDMLitGGRHPFLARYKVGFMK.TGTIvaLEV  167
ident                  |                                 ||       
Sbjct kelawasynspppnlepGLEAVNYY...DPPN..MTYPFGAYFCIMDIDVdTGVAktRRF  534
DSSP  hhhhhhhhhllllllllLLEEEEEE...LLLL..LLLLEEEEEEEEEEELlLLLEeeEEE


DSSP  EEEEEEELL..LLLHHHHHHHHHHLLL.LLLL........................lllE
Query DHYSNAGNS..RDLSHSIMERALFHMD.NCYK........................ipnI  200
ident       |               |                                     
Sbjct YALDDCGTRinPMIIEGQVHGGLTEAFaVAMGqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetP  594
DSSP  EEEEELLLLllHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLllleellllleelllllllllllllllL


DSSP  EEEEEEEeLLLL......LLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHH..hhHHHHl
Query RGTGRLCkTNLS......SNTAFrGFGGPQALFIAENWMSEVAVTCGLPAE..evRWKNm  252
ident            |                        |                       
Sbjct KWETDYT.VTPSphhpigAKGVG.ESPHVGGVPCFSNAVNDAYAFLNAGHIqmphDAWR.  651
DSSP  LLEEEEL.LLLLllllllLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLllllLHHH.


DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeee
Query ykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfg  312
ident                                                             
Sbjct ............................................................  651
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellle
Query isftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyiset  372
ident                                                             
Sbjct ............................................................  651
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllll
Query stntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvs  432
ident                                                             
Sbjct ............................................................  651
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllll
Query lsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgssl  492
ident                                                             
Sbjct ............................................................  651
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelll
Query npaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrd  552
ident                                                             
Sbjct ............................................................  651
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhh
Query cpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekir  612
ident                                                             
Sbjct ............................................................  651
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllllllllllllllllllllll
Query nacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                           
Sbjct ..............lwkvgeqlglhv  663
DSSP  ..............hhhhhhhlllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=7.7

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ..........vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatf   50
DSSP  ..........llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhh


DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHH.HLEEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHH
Query krglciiptkfgisfTVPF.LNQAGALIHVY.TDGSVLVSHGGTemgqgLHTKMVQVASK  358
ident                  |  |             |                     | | 
Sbjct akaevvskdmftyhrVHPSpLETCQCVASMDkIKGELTLWGTFQ.....APHVIRTVVSL  105
DSSP  hhlleeeeeeeeellLLLLlLLLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHEELLleelllllllllLLLLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllll
Query ALKIPISKIYISetstntvpnsspTAASVSTDiYGQAVYEACQTILKRlepfkkknpdgs  418
ident     |  ||                               |                   
Sbjct ISGLPEHKIHVI.......apdigGGFGNKVG.AYSGYVCAVVASIVL............  145
DSSP  HHLLLHHHEEEE.......lllllLLLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHH............


DSSP  hhhhhhhhhhlllLLEEEEEEELL....................................
Query wedwvmaayqdrvSLSTTGFYRTP....................................  442
ident                                                             
Sbjct .............GVPVKWVEDRMenlsttsfardyhmttelaatkdgkilamrchvlad  192
DSSP  .............LLLEEEELLHHhhhhhlleelleeeeeeeeellllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  442
ident                                                             
Sbjct hgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavya  252
DSSP  lllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  442
ident                                                             
Sbjct ieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhq  312
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  442
ident                                                             
Sbjct lraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgs  372
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  442
ident                                                             
Sbjct viarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptaga  432
DSSP  eeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhh


DSSP  ...................................llllllllllllllleeeeeeeeee
Query ...................................nlgysfetnsgnafhyftygvacse  467
ident                                                             
Sbjct atavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynsppp  492
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhllll


DSSP  eeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllll
Query veidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslht  527
ident                                                             
Sbjct nlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegq  552
DSSP  lllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhh


DSSP  llllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query rgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaa  587
ident                                                             
Sbjct vhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpiga  612
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeellllllllllll


DSSP  hhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query raqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                    
Sbjct kgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=5.8

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllE
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwK  300
ident                                                             
Sbjct ......vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaE   54
DSSP  ......llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlL


DSSP  EEEEEEEEEEEEellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query KRGLCIIPTKFGisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident                                                             
Sbjct VVSKDMFTYHRV................................................   66
DSSP  EEEEEEEEELLL................................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct hpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfg  126
DSSP  lllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllll


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEEEEEEELlLLLEEEE
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEVEIDClTGDHKNL  480
ident                                               |       |     
Sbjct nkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfARDYHMTTELAATK.DGKILAM  185
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleELLEEEEEEEEELL.LLLEEEE


DSSP  EEEEEEELLLLLLHHH.hhHHHHHhHHHHHhHHHLlllllllllllllllllllllllhH
Query RTDIVMDVGSSLNPAI.diGQVEGaFVQGLgLFTLeelhyspegslhtrgpstykipafG  539
ident |     | |     |                                             
Sbjct RCHVLADHGAFDACADpskWPAGF.MNICT.GSYD.......................mP  220
DSSP  EEEEEEELLLLLLLLLlllLLLLL.HHHLL.LLLL.......................lL


DSSP  HLLleEEEEELLLLLLlllhhhLLLLL...LLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHhhhllll
Query SIPteFRVSLLRDCPNkkaiyaSKAVG...EPPLFLG.ASVFFAIKDAIRAARaqhtnnn  595
ident        |              |  |                 ||               
Sbjct VAH..LAVDGVYTNKA......SGGVAyrcSFRVTEAvYAIERAIETLAQRLE.......  265
DSSP  LEE..EEEEEELLLLL......LEELLlllLLLHHHHhHHHHHHHHHHHHHHL.......


DSSP  lllllllllllLHHH.............................................
Query tkelfrldspaTPEK.............................................  610
ident                                                             
Sbjct .....mdsadlRIKNfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkak  320
DSSP  .....llhhhhHHHHlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  610
ident                                                             
Sbjct qeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtk  380
DSSP  hhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  610
ident                                                             
Sbjct sqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaark  440
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  610
ident                                                             
Sbjct ikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepglea  500
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhllllllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  610
ident                                                             
Sbjct vnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhggltea  560
DSSP  eeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  610
ident                                                             
Sbjct favamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesph  620
DSSP  hhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhh


DSSP  ...............hhhhllllllllllllllllllllllll
Query ...............irnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                            
Sbjct vggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh


DSSP  ......lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllE
Query ......iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethC   54
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmF  360
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelL


DSSP  EEEEELLL...LLLEEEEellllhhhhhhhHHHHHL......lLHHHEEE.eelllllll
Query TIAIPKGE...EGEMELFvstqnamktqsfVAKMLG......vPVNRILV.rvkrmgggf  104
ident   |                            |               |            
Sbjct DSAEIRIHptgSVIARMG.tksqgqghettYAQIIAtelgipaDDIMIEEgntdtapygl  419
DSSP  EEEEEEELlllLEEEEEL.lllllllhhhhHHHHHHhhhlllhHHEEEELllllllllll


DSSP  lllllllhhhhHHHHHHHHHHL......................................
Query ggketrstlvsVAVALAAYKTG......................................  126
ident             |    |                                          
Sbjct gtygsrstptaGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktm  479
DSSP  llllllllllhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeeh


DSSP  ....................LLEEEellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeee
Query ....................HPVRCmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivale  166
ident                                                             
Sbjct kelawasynspppnlepgleAVNYY...................................  504
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleEEEEE...................................


DSSP  eeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhh
Query vdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqal  226
ident                                                             
Sbjct ............................................................  504
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhh
Query fiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyar  286
ident                                                             
Sbjct ............................................................  504
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeelllllll
Query ksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgq  346
ident                                                             
Sbjct ............................................................  504
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query glhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkr  406
ident                                                             
Sbjct ............................................................  504
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeee
Query lepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacs  466
ident                                                             
Sbjct ............................................................  504
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll
Query eveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslh  526
ident                                                             
Sbjct .............dppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiieg  551
DSSP  .............lllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhh


DSSP  lllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query trgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdaira  586
ident                                                             
Sbjct qvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpig  611
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllll


DSSP  hhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query araqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                     
Sbjct akgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.7

DSSP  .....................................lllhhhhhhllleeeeeeeeeel
Query .....................................iitiedaiknnsfygselkiekg   23
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  lhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhh
Query dlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfva   83
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  hhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhll
Query kmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaayktghpvrcmldrnedmlitg  143
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  lllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeee
Query grhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgt  203
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  eeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhHHHLLllllllllll
Query grlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrWKNMYkegdlthfnq  263
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymAPLGW..........  290
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleeLLLLL..........


DSSP  llllllhhhhHHHHhhHLLHhhhhhhhhhHHHHLL...................lEEEEE
Query rlegfsvprcWDEClkSSQYyarksevdkFNKENC...................wKKRGL  304
ident            |                                                
Sbjct .........eYDSG..NYPLamkkamdtvGYHQLRaeqkakqeafkrgetreimgIGISF  339
DSSP  .........eELLL..LHHHhhhhhhhhhLHHHHHhhhhhhhhhhhllllleeeeEEEEE


DSSP  EEEEE.............eeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhh
Query CIIPT.............kfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtk  351
ident                                                             
Sbjct FTEIVgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelg  399
DSSP  EELLLlllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query mvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfk  411
ident                                                             
Sbjct ipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegd  459
DSSP  llhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeEEEEEEEEEEE
Query kknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftYGVACSEVEID  471
ident                                                             
Sbjct lewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnMTYPFGAYFCI  519
DSSP  eeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllLLLLEEEEEEE


DSSP  .........llllLEEEeEEEEEeellllllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHL........
Query .........cltgDHKNlRTDIVmdvgsslnpaiDIGQvEGAFVQGLGLFTL........  514
ident                     |                                       
Sbjct mdidvdtgvaktrRFYA.LDDCG...........TRIN.PMIIEGQVHGGLTeafavamg  566
DSSP  eeeellllleeeeEEEE.EEELL...........LLLL.HHHHHHHHHHHHHhhhhhhhl


DSSP  ....................lLLLLllllllllllllllllllhHHLLleEEEEE.LLLL
Query ....................eELHYspegslhtrgpstykipafGSIPteFRVSL.LRDC  553
ident                                                     |       
Sbjct qeirydeqgnvlgasfmdfflPTAV...............etpkWETD..YTVTPsPHHP  609
DSSP  llleellllleelllllllllLLLL...............llllLEEE..ELLLLlLLLL


DSSP  lllllhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLLLLLLlllllhhhhhh
Query pnkkaiyaskavgepPLFLGASVFFAIKDAIRAARAQhTNNNTKELFRLdspatpekirn  613
ident                                         |                   
Sbjct ..........igakgVGESPHVGGVPCFSNAVNDAYA.FLNAGHIQMPH...........  647
DSSP  ..........lllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLLLLLL...........


DSSP  hllllllllllllllllllllllll
Query acvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                          
Sbjct .........dawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  .........lhhhhhhhhhhlllll


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.4

DSSP  ........................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleee
Query ........................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvv   36
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  eeeeeelLLLLLLllLLEEEEEELllllLEEEEEL......llLHHHHHHHHHhhhlllh
Query sgelyigGQDHFYleTHCTIAIPKgeegEMELFVS......tqNAMKTQSFVAkmlgvpv   90
ident                               ||                            
Sbjct ftyhrvhPSPLET.cQCVASMDKI....KGELTLWgtfqaphvIRTVVSLISG......l  109
DSSP  eeellllLLLLLL.lEEEEEEELL....LLEEEEEellllhhhHHHHHHHHHL......l


DSSP  hheEEEELLLLL....lLLLLLLL.LHHHHHHHHHHHhhhlllEEEELlhhHHHHhllll
Query nriLVRVKRMGG....gFGGKETR.STLVSVAVALAAyktghpVRCMLdrnEDMLitggr  145
ident       |                       ||           |                
Sbjct pehKIHVIAPDIgggfgNKVGAYSgYVCAVVASIVLG......VPVKW...VEDR.....  155
DSSP  lhhHEEEELLLLlllllLLLLLLHhHHHHHHHHHHHL......LLEEE...ELLH.....


DSSP  lleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeee
Query hpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgr  205
ident                                                             
Sbjct ............................................................  155
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelllLLLL..................................................
Query lcktnlSSNT..................................................  215
ident       |                                                     
Sbjct ..menlSTTSfardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnic  213
DSSP  ..hhhhHHLLeelleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhl


DSSP  ...........................llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhh
Query ...........................afrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevr  248
ident                                                             
Sbjct tgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlri  273
DSSP  lllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhh


DSSP  hhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeee
Query wknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciip  308
ident                                                             
Sbjct knfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreim  333
DSSP  hhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleee


DSSP  eeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query tkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiy  368
ident                                                             
Sbjct gigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqi  393
DSSP  eeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhh


DSSP  llleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
Query isetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayq  428
ident                                                             
Sbjct iatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahml  453
DSSP  hhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query drvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdv  488
ident                                                             
Sbjct evhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypf  513
DSSP  lllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllle


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeee
Query gsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvs  548
ident                                                             
Sbjct gayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeiryde  573
DSSP  eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleell


DSSP  elllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllh
Query llrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatp  608
ident                                                             
Sbjct qgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavnd  633
DSSP  llleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query ekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                               
Sbjct ayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  hhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.3

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct .......vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfaka   53
DSSP  .......llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhl


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhHHLEEEEEEEELlllLEEEEEL.lllllLLHHHHHHHHHHhh
Query krglciiptkfgisftvpFLNQAGALIHVYtdgSVLVSHG.gtemgQGLHTKMVQVASka  359
ident                      |  |                         |         
Sbjct evvskdmftyhrvhpsplETCQCVASMDKI...KGELTLWgtfqapHVIRTVVSLISG..  108
DSSP  leeeeeeeeellllllllLLLEEEEEEELL...LLEEEEEellllhHHHHHHHHHHHL..


DSSP  hlllhhheELLLeellllllllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllh
Query lkipiskiYISEtstntvpnssptaasvstdIYGQAVYEACQTIlkrlepfkkknpdgsw  419
ident          |                      |  ||                       
Sbjct ....lpehKIHV..iapdigggfgnkvgaysGYVCAVVASIVLG................  146
DSSP  ....llhhHEEE..elllllllllllllllhHHHHHHHHHHHHL................


DSSP  hhhhhhhhhllllleEEEEEEL......................................
Query edwvmaayqdrvslsTTGFYRT......................................  441
ident                                                             
Sbjct ...............VPVKWVEdrmenlsttsfardyhmttelaatkdgkilamrchvla  191
DSSP  ...............LLEEEELlhhhhhhhlleelleeeeeeeeellllleeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  441
ident                                                             
Sbjct dhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavy  251
DSSP  elllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  441
ident                                                             
Sbjct aieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyh  311
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  441
ident                                                             
Sbjct qlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptg  371
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  441
ident                                                             
Sbjct sviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptag  431
DSSP  leeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhh


DSSP  ...................................lllllllllllllllleeeeeeeee
Query ...................................pnlgysfetnsgnafhyftygvacs  466
ident                                                             
Sbjct aatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspp  491
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlll


DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll
Query eveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslh  526
ident                                                             
Sbjct pnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiieg  551
DSSP  llllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhh


DSSP  lllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query trgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdaira  586
ident                                                             
Sbjct qvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpig  611
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllll


DSSP  hhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query araqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                     
Sbjct akgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.1

DSSP  ................................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhh
Query ................................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkg   28
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  hhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhll
Query fseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgv   88
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  lhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllle
Query pvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaayktghpvrcmldrnedmlitggrhpf  148
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  eeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeee
Query larykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlck  208
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllllllllllll
Query tnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegf  268
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeEEllllhhhleeeeeee
Query svprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfGIsftvpflnqagalih  328
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteiVG...............  345
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellLL...............


DSSP  ellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllh
Query vytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvs  388
ident                                                             
Sbjct ............................................................  345
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllll
Query tdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysf  448
ident                                                             
Sbjct ............................................................  345
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllLE............EEEEEEEEEeeeellllleeeeEEEEEEELLlLLLHhH
Query etnsgnafHY............FTYGVACSEveidcltgdhknlRTDIVMDVGsSLNPaI  496
ident                       |                          |    |     
Sbjct ........AGpskncdilgvsmFDSAEIRIH..........ptgSVIARMGTK.SQGQ.G  385
DSSP  ........LLllllleelleelLEEEEEEEL..........lllLEEEEELLL.LLLL.L


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhhlllEEEEEELLL..ll
Query DIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptEFRVSLLRD..cp  554
ident             ||                                              
Sbjct HETTYAQIIATELG.............................ipadDIMIEEGNTdtap  416
DSSP  HHHHHHHHHHHHHL.............................llhhHEEEELLLLllll


DSSP  llllhhhLLLL...LLLLHHHHHHHH..................................
Query nkkaiyaSKAV...GEPPLFLGASVF..................................  577
ident        |      |                                             
Sbjct yglgtygSRSTptaGAATAVAARKIKakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekf  476
DSSP  lllllllLLLLllhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  577
ident                                                             
Sbjct ktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfya  536
DSSP  eehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  577
ident                                                             
Sbjct lddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkw  596
DSSP  eeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllllllllllllllll


DSSP  ......hhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllllllll
Query ......faikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnc  631
ident                                                             
Sbjct etdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvg  656
DSSP  eeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  lllllll
Query kpwslrv  638
ident        
Sbjct eqlglhv  663
DSSP  hhlllll


No 11: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  ......lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeELLLLLLLLL...
Query ......iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyIGGQDHFYLE...   51
ident                                                 |           
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymapLGWEYDSGNYpla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellLLLEELLLLHhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   51
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   51
ident                                                             
Sbjct dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   51
ident                                                             
Sbjct tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh


DSSP  ................................LLEEEEE.....elllllleEEEELL..
Query ................................THCTIAI.....pkgeegemELFVST..   72
ident                                       |                     
Sbjct elawasynspppnlepgleavnyydppnmtypFGAYFCImdidvdtgvaktrRFYALDdc  540
DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllllEEEEEEEeeeellllleeeeEEEEEEel


DSSP  ...........lLHHHHHHHHHHHHLL......................lhHHEEEEELL
Query ...........qNAMKTQSFVAKMLGV......................pvNRILVRVKR   99
ident                      |   |                                  
Sbjct gtrinpmiiegqVHGGLTEAFAVAMGQeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDY  600
DSSP  lllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLlleellllleelllllllllllllLLLLLEEEE


DSSP  LLL.......lLLLLlLLLH.HHHHHHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhlllllleeee
Query MGG.......gFGGKeTRST.LVSVAVALAAYKTGhpvrcmldrnedmlitggrhpflar  151
ident              |    |     |     |                             
Sbjct TVTpsphhpigAKGV.GESPhVGGVPCFSNAVNDA.........................  634
DSSP  LLLllllllllLLLL.LLHHhHHHHHHHHHHHHHH.........................


DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelll
Query ykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnl  211
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhh
Query ssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvp  271
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeell
Query rcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvyt  331
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhh
Query dgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdi  391
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeelllllllllll
Query ygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetn  451
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query sgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglgl  511
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhh
Query ftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplf  571
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllllllll
Query lgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnc  631
ident                                                             
Sbjct ......................................yaflnaghiqmphdawrlwkvg  656
DSSP  ......................................hhllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  lllllll
Query kpwslrv  638
ident        
Sbjct eqlglhv  663
DSSP  hhlllll


No 12: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  .......................................................lllhh
Query .......................................................iitie    5
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  hhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEELL....
Query daiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethCTIAIPKG....   61
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyHMTTELAAtkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleEEEEEEEEllll


DSSP  LLLLEEEEELL.............llHHHHhHHHHhHHLLLhHHEEEEELLLLL..lLLL
Query EEGEMELFVST.............qnAMKTqSFVAkMLGVPvNRILVRVKRMGG..gFGG  106
ident     |   |                 |                     |         ||
Sbjct KILAMRCHVLAdhgafdacadpskwpAGFM.NICT.GSYDM.PVAHLAVDGVYTnkaSGG  237
DSSP  LEEEEEEEEEEellllllllllllllLLLH.HHLL.LLLLL.LLEEEEEEEELLlllLEE


DSSP  L...lLLLHHHHHHHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeelllllee
Query K...eTRSTLVSVAVALAAYKTGhpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtiv  163
ident             |     |  |                                      
Sbjct VayrcSFRVTEAVYAIERAIETL.....................................  260
DSSP  LllllLLLHHHHHHHHHHHHHHH.....................................


DSSP  eeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhh
Query alevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggp  223
ident                                                             
Sbjct ............................................................  260
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllh
Query qalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqy  283
ident                                                             
Sbjct ............aqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtv  308
DSSP  ............hhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellll
Query yarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggte  343
ident                                                             
Sbjct gyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirih  368
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeel


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query mgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqti  403
ident                                                             
Sbjct ptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstp  428
DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeee
Query lkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygv  463
ident                                                             
Sbjct tagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasyn  488
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
Query acseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspeg  523
ident                                                             
Sbjct spppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmi  548
DSSP  lllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh


DSSP  llllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query slhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikda  583
ident                                                             
Sbjct iegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphh  608
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeellllllll


DSSP  hhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query iraaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                        
Sbjct pigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 13: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  ...................................................lLLHHhhhh
Query ...................................................iITIEdaik    9
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweyDSGN....  296
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleeLLLL....


DSSP  llleeeeeeeeeellhhhHHHHLL...................eEEEEEEEELL......
Query nnsfygselkiekgdlkkGFSEAD...................nVVSGELYIGG......   44
ident                   |                                         
Sbjct ......yplamkkamdtvGYHQLRaeqkakqeafkrgetreimgIGISFFTEIVgagpsk  350
DSSP  ......hhhhhhhhhhhhLHHHHHhhhhhhhhhhhllllleeeeEEEEEEELLLllllll


DSSP  ..........................................................ll
Query ..........................................................qd   46
ident                                                             
Sbjct ncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieeg  410
DSSP  lleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeell


DSSP  llllllleeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeelllllllll
Query hfylethctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfgg  106
ident                                                             
Sbjct ntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvk  470
DSSP  lllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeel


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEE.....elllll
Query ketrstlvsvavalaayktghpvrcmldrnedmlitggrhPFLARYKVG.....fmktgt  161
ident                                              |              
Sbjct glpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtYPFGAYFCImdidvdtgvak  530
DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllLLEEEEEEEeeeelllllee


DSSP  eeEEEEEEEEEEellllLHHHHHHHHHH.LLLL...........................
Query ivALEVDHYSNAgnsrdLSHSIMERALF.HMDN...........................  193
ident                      | |                                    
Sbjct trRFYALDDCGT....rINPMIIEGQVHgGLTEafavamgqeirydeqgnvlgasfmdff  586
DSSP  eeEEEEEEELLL....lLLHHHHHHHHHhHHHHhhhhhhlllleellllleellllllll


DSSP  ....lLLLLlEEEEEEEEE.LLLLLLllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......L
Query ....cYKIPnIRGTGRLCK.TNLSSNtafrgfGGPQALFIAENWMSEVAVTCG......L  242
ident                                  |           |              
Sbjct lptavETPK.WETDYTVTPsPHHPIG...akgVGESPHVGGVPCFSNAVNDAYaflnagH  642
DSSP  lllllLLLL.LEEEELLLLlLLLLLL...lllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllL


DSSP  LHHHHhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleee
Query PAEEVrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkr  302
ident                                                             
Sbjct IQMPH.......................................................  647
DSSP  LLLLL.......................................................


DSSP  eeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhll
Query glciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalki  362
ident                                                             
Sbjct ............................................................  647
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhh
Query piskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedw  422
ident                                                             
Sbjct ............................................................  647
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeee
Query vmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrt  482
ident                                                             
Sbjct ............................................................  647
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhll
Query divmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsip  542
ident                                                             
Sbjct ............................................................  647
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
Query tefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrl  602
ident                                                             
Sbjct ............................................................  647
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query dspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                     
Sbjct ....................dawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  ....................lhhhhhhhhhhlllll


No 14: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.0

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ................vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdke   44
DSSP  ................llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhh


DSSP  lllhhhhhhhhlllllllllllllLLLLlhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrLEGFsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct gtdatfakaevvskdmftyhrvhpSPLE................................   72
DSSP  hhhhhhhhlleeeeeeeeelllllLLLL................................


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   72
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   72
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEEEEEeellllleeeE
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEVEidcltgdhknL  480
ident                                           ||                
Sbjct ......................................TCQCVASMDKI.........kG   85
DSSP  ......................................LLEEEEEEELL.........lL


DSSP  EEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhh
Query RTDIVMDVgsslnpaiDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
ident                              |                              
Sbjct ELTLWGTF.......qAPHVIRTVVSLISG.............................l  109
DSSP  EEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.............................l


DSSP  LLLEEEEEELLLLLLlllhhHLLLLLLL..LHHHHH.HHHHH..................
Query IPTEFRVSLLRDCPNkkaiyASKAVGEP..PLFLGA.SVFFA..................  579
ident       |                 ||           |                      
Sbjct PEHKIHVIAPDIGGG.....FGNKVGAYsgYVCAVVaSIVLGvpvkwvedrmenlsttsf  164
DSSP  LHHHEEEELLLLLLL.....LLLLLLLLhhHHHHHHhHHHHLlleeeellhhhhhhhlle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct ardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahl  224
DSSP  elleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct avdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpy  284
DSSP  eeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct maplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteiv  344
DSSP  ellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct gagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipadd  404
DSSP  lllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct imieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdv  464
DSSP  eeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct drfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidv  524
DSSP  leeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct dtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmd  584
DSSP  lllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllll


DSSP  ....................hhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllll
Query ....................ikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkf  619
ident                                                             
Sbjct fflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiq  644
DSSP  lllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  lllllllllllllllllll
Query ttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                    
Sbjct mphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  llllhhhhhhhhhhlllll


No 15: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.5

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeEEELlllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilVRVKrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhIFRW......................   38
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleEEEE......................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................   38
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................   38
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ....................................................eigdkegt   46
DSSP  ....................................................eeelhhhh


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhH........................................
Query krglciiptkfgisftvpfL........................................  320
ident                                                             
Sbjct datfakaevvskdmftyhrVhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvsli  106
DSSP  hhhhhhlleeeeeeeeellLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................................LEE
Query .........................................................NQA  323
ident                                                             
Sbjct sglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsFAR  166
DSSP  hlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllEEL


DSSP  ..EEEEEELL.....lLLEEEEELL........llLLLLHHHHHHhHHHHhHLLLhHHEE
Query ..GALIHVYT.....dGSVLVSHGG........teMGQGLHTKMVqVASKaLKIPiSKIY  368
ident                                            |                
Sbjct dyHMTTELAAtkdgkiLAMRCHVLAdhgafdacadPSKWPAGFMN.ICTG.SYDM.PVAH  223
DSSP  leEEEEEEEEllllleEEEEEEEEEelllllllllLLLLLLLLHH.HLLL.LLLL.LLEE


DSSP  LLLEELllllllllllLLLH...hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...........
Query ISETSTntvpnssptaASVS...tDIYGQAVYEACQTILKRLEPFKKKN...........  414
ident                                  |       |                  
Sbjct LAVDGV.....ytnkaSGGVayrcSFRVTEAVYAIERAIETLAQRLEMDsadlriknfiq  278
DSSP  EEEEEE.....lllllLEELllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  414
ident                                                             
Sbjct peqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigis  338
DSSP  hhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  414
ident                                                             
Sbjct ffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatel  398
DSSP  eeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................llllhhhhhhhhhhlllll
Query .........................................pdgswedwvmaayqdrvsl  433
ident                                                             
Sbjct gipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevheg  458
DSSP  lllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  eeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll
Query sttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgssln  493
ident                                                             
Sbjct dlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfc  518
DSSP  heeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeellll
Query paidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdc  553
ident                                                             
Sbjct imdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvl  578
DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleelllllee


DSSP  lllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhh
Query pnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirn  613
ident                                                             
Sbjct gasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayafl  638
DSSP  lllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  hllllllllllllllllllllllll
Query acvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                          
Sbjct naghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 16: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh


DSSP  ..lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlLEEEEEEEEE................
Query ..iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseaDNVVSGELYI................   42
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgIGISFFTEIVgagpskncdilgvsmf  360
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeEEEEEEELLLlllllllleelleell


DSSP  ............................................llllllllllleeeee
Query ............................................ggqdhfylethctiai   58
ident                                                             
Sbjct dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll


DSSP  elllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhh
Query pkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvav  118
ident                                                             
Sbjct tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh


DSSP  hhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEEEL.........llllEEEEEEEE
Query alaayktghpvrcmldrnedmlitggrhPFLARYKVGFM.........ktgtIVALEVDH  169
ident                                                           | 
Sbjct elawasynspppnlepgleavnyydppnMTYPFGAYFCImdidvdtgvaktrRFYALDDC  540
DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeellllLLLLEEEEEEEeeeellllleeeeEEEEEEEL


DSSP  EeeeelllllhhhHHHHhHHLL......................................
Query YsnagnsrdlshsIMERaLFHM......................................  191
ident                                                             
Sbjct G............TRIN.PMIIegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdffl  587
DSSP  L............LLLL.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllll


DSSP  ..lllllllLEEEEE.EEEElllllllllllllhhHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhhh
Query ..dncykipNIRGTG.RLCKtnlssntafrgfggpQALFIAENWmsevavtcglpaeevr  248
ident              |                                              
Sbjct ptavetpkwETDYTVtPSPH.........hpigakGVGESPHVG................  622
DSSP  lllllllllEEEELLlLLLL.........llllllLLLLHHHHH................


DSSP  hhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeee
Query wknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciip  308
ident                                                             
Sbjct ............................................................  622
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query tkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiy  368
ident                                                             
Sbjct ............................................................  622
DSSP  ............................................................


DSSP  llleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
Query isetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayq  428
ident                                                             
Sbjct ............................................................  622
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query drvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdv  488
ident                                                             
Sbjct ............................................................  622
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeee
Query gsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvs  548
ident                                                             
Sbjct ............................................................  622
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllh
Query llrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatp  608
ident                                                             
Sbjct .................................................gvpcfsnavnd  633
DSSP  .................................................hhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query ekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                               
Sbjct ayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  hhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll