No 1: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=44.3

DSSP  LLHHHLLLLLLLLLLHHhlllleelleelLLLLEEEEEEEELHhHHHHHHHHLLEEEEEE
Query VDPFKAMEPDAPLLREDikdkmtgahgarKHHNHIFRWEIGDKeGTDATFAKAEVVSKDM   60
ident   |  ||   |  |  |            |  |              | || |       
Sbjct MTPKAAMKAGAIALHDD............KPNNILREVHAEFG.DVAAAFAEADLIREKT   47
DSSP  LLHHHHHLLLLLLLLLL............LLLLEEEEEEEEEL.LHHHHHHLLLEEEEEE


DSSP  EEELLLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query FTYHRVhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident  |   |                                                      
Sbjct YTFAEVnhvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpf  107
DSSP  EEELLLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllEELLEEEEEEEEELLLL
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsFARDYHMTTELAATKDG  180
ident                                                          |||
Sbjct lgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrGRPWTEVKMKIGLKKDG  167
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllLLLEEEEEEEEEELLLL


DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLLLlllLLLLLHH.HLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLEElL
Query KILAMRCHVLADHGAFDACADpskWPAGFMN.ICTGSYDMPVAHLAVDGVYTNKASGGvA  239
ident || |         ||                    | |  |        ||||    | |
Sbjct KIAALALEATQAGGAYAGYGI...ITILYTGaLMHGLYHIPAIKHDAWRVYTNTPPCG.A  223
DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLHH...HHHHHHHhLLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLLL.L


DSSP  LLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLhhHLLEELLLLLEELLLLHHH
Query YRCsFRVTEAVYAIERAIETLAQRLEMDSADLRIKNFIQpeQFPYMAPLGWEYDSGNYPL  299
ident  |          | |         |  ||   |  |     | ||         |   | 
Sbjct MRG.HGTVDTRAAFEALLTEMGEELGIDSLKIRQINMLP..QIPYVTMYAQRVMSYGVPE  280
DSSP  LLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLL..LLLEELLLLLEELLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHLHHHHHhhHHHHHhhhhllllleEEEEEEEEEELLL........lllllll
Query AMKKAMDTVGYHQLRaeQKAKQeafkrgetreIMGIGISFFTEIV........gagpskn  351
ident    |     |        |               | ||                      
Sbjct CLEKVKAASGWEERK..GKLPK..........GRGLGIALSHFVSgtstpkhwtgephat  328
DSSP  HHHHHHHHHLHHHHL..LLLLL..........LEEEEEEEEEEELlllllllllllllee


DSSP  leelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query cdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegn  411
ident                                                             
Sbjct vnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsy  388
DSSP  eeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeelllllllllllll


DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeell
Query tdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkg  471
ident                                                             
Sbjct ssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqev  448
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhh


DSSP  eeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLEEE
Query lpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppNMTYPFGAYFCIMDIDVDTGVAKT  531
ident                                      |     |       |  ||    
Sbjct vkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigaTMGFCYAAQVVEASVDEITGKVTA  508
DSSP  hhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEELLlLLEELLLLLLLLLLLLL
Query RRFYALDDCGTRINPMIIEGQVHGGLTEAFAVAMGQEIRYDEqGNVLGASFMDFFLPTAV  591
ident        | |   ||   |||  ||       |   |  ||  |        |   || |
Sbjct HKVWVAVDVGKALNPLAVEGQTQGGVWMGMGQALSEETVYDN.GRMVHGNILDYRVPTIV  567
DSSP  EEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEL.LEELLLLLLLLLLLLLL


DSSP  LLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLLLLLLLHHH
Query ETPKWETDYTVTPSPHHPIGAKGVGESPHVGGVPCFSNAVNDAYAflnAGHIQMPHDAWR  651
ident | |  |        |  | |||   |    |  |    ||  |           |    |
Sbjct ESPDIEVIIVESMDPNGPFGAKEASEGMLAGFLPAIHEAVYEAVG...VRATDFPLSPDR  624
DSSP  LLLEEEEEEELLLLLLLHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHL...LLLLEELLLHHH


DSSP  HHHHHHHLLLLL
Query LWKVGEQLGLHV  663
ident             
Sbjct ITELLDAKEAAA  636
DSSP  HHHHHHHHHHLL


No 2: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=26.9

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct .............mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirekt   47
DSSP  .............llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeee


DSSP  eeelllLLLLLLLLEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLL
Query ftyhrvHPSPLETCQCVASMDKIKGELTLWGTFQAPHVIRTVVSLISGLPEHKIHVIAPD  120
ident            |     |  |     |||  | | |      |          | || | 
Sbjct ytfaevNHVHMELNATLAEYDPVRDMLTLNTTTQVPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPF  107
DSSP  eeelllLLLLLLLLEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLL


DSSP  LLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHLLeelleeeeeeeeellll
Query IGGGFGNKVGAYSGYVCAVVASIVLGVPVKWVEDRMENLSTTSfardyhmttelaatkdg  180
ident  |||||    |      |          |     | |                       
Sbjct LGGGFGARTEALHFEIIAGLLARKAKGTVRLLQTREETFIAHR.................  150
DSSP  LLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHLL.................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ..grpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaik  208
DSSP  ..llleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhllllllllllee


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct hdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtm  268
DSSP  eeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleell


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllLLLLlllLEELLE.EL
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivGAGPsknCDILGV.SM  359
ident                                                             
Sbjct yaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvSGTS...TPKHWTgEP  325
DSSP  llleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeeLLLL...LLLLLLlLL


DSSP  LEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLL
Query FDSAEIRIHPTGSVIARMGTKSQGQGHETTYAQIIATELGIPADDIMIEEGNTDTAPYGL  419
ident            |      |    |||  |   |  |  ||     |          |   
Sbjct HATVNLKLDFDGGITLLTGAADIGQGSNTMASQVAAEVLGVRLSRIRVISADSALTPKDN  385
DSSP  LEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLL


DSSP  LLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEELLLEEEELLEEEEEEEH
Query GTYGSRSTPTAGAATAVAARKIKAKAQMIAAHMLEVHEGDLEWDVDRFRVKGLPEKFKTM  479
ident | | || |   | |   ||   |      ||  |   | | |     | | |        
Sbjct GSYSSRVTFMVGNASISAAEELKGVLVKAAAKKLDAREEDIEVIDEMFMVSGSQDPGLSF  445
DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHEEEELLEEEELLLLLLLEEH


DSSP  HHHHHHHHHLlllllLLLLEEEEEELLL............llllleeeeeeeeeeellll
Query KELAWASYNSpppnlEPGLEAVNYYDPP............nmtypfgayfcimdidvdtg  527
ident  |   |                  |  |                                
Sbjct QEVVKAAMVD.....SGTITVKGTYTCPtefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvd  500
DSSP  HHHHHHHHLL.....LLLEEEEEEELLLhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeel


DSSP  leeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllll
Query vaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdffl  587
ident                                                             
Sbjct eitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnild  560
DSSP  llllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllll


DSSP  llllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
Query ptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmph  647
ident                                                             
Sbjct yrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfpl  620
DSSP  lllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleell


DSSP  lhhhhhhhhhhlllll
Query dawrlwkvgeqlglhv  663
ident                 
Sbjct spdritelldakeaaa  636
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=8.1

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelL
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmF  360
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmeL   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeelllllllllL


DSSP  EEEEEEELL.LLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLlllllllL
Query DSAEIRIHP.TGSVIARMGTKsqgqgHETTYAQIIATELGIPADDIMIEEGNtdtapygL  419
ident         |          |               |  |      |             |
Sbjct NATLAEYDPvRDMLTLNTTTQ.....VPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPF.......L  108
DSSP  LEEEEEEELlLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLL.......L


DSSP  LLLLLLLlllhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeeh
Query GTYGSRStptaGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktm  479
ident |                |                                          
Sbjct GGGFGAR.teaLHFEIIAGLLA......................................  129
DSSP  LLLLLLL.lllLHHHHHHHHHH......................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllLEEEEEELLL................................
Query kelawasynspppnlepgLEAVNYYDPP................................  507
ident                                                             
Sbjct ..............rkakGTVRLLQTREetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalale  175
DSSP  ..............hhhlLEEEEELLHHhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  507
ident                                                             
Sbjct atqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraa  235
DSSP  eeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  507
ident                                                             
Sbjct fealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerk  295
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  507
ident                                                             
Sbjct gklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntm  355
DSSP  lllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  507
ident                                                             
Sbjct asqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaa  415
DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  507
ident                                                             
Sbjct akkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdk  475
DSSP  hhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllll


DSSP  .....llllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .....nmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafa  562
ident                                                             
Sbjct kirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvw  535
DSSP  llhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhh
Query vamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvg  622
ident                                                             
Sbjct mgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegm  595
DSSP  hhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query gvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                          
Sbjct lagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=7.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ........llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhh
Query ........vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfak   52
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  lleeeeeeeeelllLLLL.....llLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHH
Query aevvskdmftyhrvHPSP.....leTCQCVASMDkIKGELTLWGTFQ.....APHVIRTV  102
ident                  |               |   |  ||                 |
Sbjct grglgialshfvsgTSTPkhwtgepHATVNLKLD.FDGGITLLTGAAdigqgSNTMASQV  359
DSSP  leeeeeeeeeeellLLLLlllllllLEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHEEEELLL......LLLLL.LLLLL.LLHHHHHHHHHHHHH.........
Query VSLISGLPEHKIHVIAPD......IGGGF.GNKVG.AYSGYVCAVVASIVL.........  145
ident      |     | ||  |        |                |                
Sbjct AAEVLGVRLSRIRVISADsaltpkDNGSYsSRVTFmVGNASISAAEELKGVlvkaaakkl  419
DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELLllllllLLLLLlLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhl


DSSP  ......................................LLLEEEELLHHhhhhhlleell
Query ......................................GVPVKWVEDRMenlsttsfard  167
ident                                          ||                 
Sbjct dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgTITVKGTYTCP...........  468
DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllLEEEEEEELLL...........


DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeee
Query yhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavd  227
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleell
Query gvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymap  287
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  llleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllll
Query lgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgag  347
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheee
Query pskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimi  407
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllee
Query eegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrf  467
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  eelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellll
Query rvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtg  527
ident                                                             
Sbjct ............................tefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvd  500
DSSP  ............................hhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeel


DSSP  leeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllll
Query vaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdffl  587
ident                                                             
Sbjct eitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnild  560
DSSP  llllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllll


DSSP  llllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
Query ptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmph  647
ident                                                             
Sbjct yrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfpl  620
DSSP  lllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleell


DSSP  lhhhhhhhhhhlllll
Query dawrlwkvgeqlglhv  663
ident                 
Sbjct spdritelldakeaaa  636
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhll


No 5: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ...............................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhae   29
DSSP  ...............................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeee


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct fgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlk   89
DSSP  ellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhh


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct vaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiah  149
DSSP  hhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhl


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct rgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikh  209
DSSP  lllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleee


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct dawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmy  269
DSSP  eeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleelll


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllLLLLlllleelLEEL.
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivGAGPskncdilGVSM.  359
ident                                             |               
Sbjct aqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsGTST......pKHWTg  323
DSSP  lleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelLLLL......lLLLLl


DSSP  leEEEEEELL....LLLEEEEEllllllLLHHhhHHHHHHHHHL......llhhHEEEEL
Query fdSAEIRIHP....TGSVIARMgtksqgQGHEttYAQIIATELG......ipadDIMIEE  409
ident    |                         |                              
Sbjct epHATVNLKLdfdgGITLLTGA....adIGQG..SNTMASQVAAevlgvrlsriRVISAD  377
DSSP  llLEEEEEEEllllLEEEEELL....llLLLL..HHHHHHHHHHhhhlllhhheEEEELL


DSSP  LLlllLLLLlllllLLLLllHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhhhhhhlllhhheeellleee
Query GNtdtAPYGlgtygSRSTptAGAATAVAARKIKAKAQ.miaahmlevhegdlewdvdrfr  468
ident         |       |          |                                
Sbjct SAltpKDNG....sYSSR..VTFMVGNASISAAEELKgvlvkaaakkldareedievide  431
DSSP  LLlllLLLL....lLLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllhhheeeell


DSSP  elleeeeeeehhhhhhhhhhllllllLLLLEEEEeELLLLL...........llleeeee
Query vkglpekfktmkelawasynspppnlEPGLEAVNyYDPPNM...........typfgayf  517
ident                                      |                      
Sbjct mfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgTITVKGTY.TCPTEFqgdkkirgsaigatmgfcy  490
DSSP  eeeellllllleehhhhhhhhhllllLEEEEEEE.LLLHHHllllllhhhhlllllleee


DSSP  eeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllle
Query cimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnv  577
ident                                                             
Sbjct aaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydn  550
DSSP  eeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleel


DSSP  elllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query lgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaf  637
ident                                                             
Sbjct grmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyea  610
DSSP  leellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query lnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                           
Sbjct vgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 6: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  ....................................llhhhllllllllllhhhllllee
Query ....................................vdpfkamepdapllredikdkmtg   24
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  lleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelll
Query ahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdmftyhrvhpspletcqcvasmdkik   84
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  leeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhh
Query geltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavvasiv  144
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  hllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllll
Query lgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpsk  204
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query wpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrl  264
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  lllhhhhhhhhlllhhHLLEelllLLEEllllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query emdsadlriknfiqpeQFPYmaplGWEYdsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeaf  324
ident                                                             
Sbjct grglgialshfvsgtsTPKH....WTGE................................  324
DSSP  leeeeeeeeeeellllLLLL....LLLL................................


DSSP  hllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeelllllll
Query krgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgq  384
ident                                                             
Sbjct ............................................................  324
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query ghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikak  444
ident                                                             
Sbjct ............................................................  324
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeee
Query aqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyy  504
ident                                                             
Sbjct ............................................................  324
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllLLEEEEEEEeeeellllleeeEEEEEEEELllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhh
Query dppnmtYPFGAYFCImdidvdtgvaktRRFYALDDCgtRINPmIIEGQVHGGLTEAFAva  564
ident                                 |      |              |     
Sbjct .....pHATVNLKLD..........fdGGITLLTGA.aDIGQ.GSNTMASQVAAEVLG..  365
DSSP  .....lLEEEEEEEL..........llLLEEEEELL.lLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL..


DSSP  hlllleellllleelllllllllllllLLLLLEEEEL.......LLLLLlllLLLL..LL
Query mgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDYT.......VTPSPhhpIGAK..GV  615
ident                                                |           |
Sbjct ..........................vRLSRIRVISAdsaltpkDNGSY...SSRVtfMV  396
DSSP  ..........................lLHHHEEEEELlllllllLLLLL...LLLHhhHH


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL..LLLL.llhhHHHH..................
Query GESPHVGGVPCFSNAVNDAYAFLNAGH..IQMP.hdawRLWK..................  654
ident |              |  |   | |    |                              
Sbjct GNASISAAEELKGVLVKAAAKKLDAREedIEVIdemfmVSGSqdpglsfqevvkaamvds  456
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHhhEEEElleeeELLLlllleehhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  654
ident                                                             
Sbjct gtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavd  516
DSSP  lleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  654
ident                                                             
Sbjct vgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdievii  576
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeee


DSSP  ...................................................hhhhlllll
Query ...................................................vgeqlglhv  663
ident                                                             
Sbjct vesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  elllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 7: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.9

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ........................................................mtpk    4
DSSP  ........................................................llhh


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleeLLLLhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweyDSGNypla  300
ident                                                             
Sbjct aamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvHMEL....   60
DSSP  hhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllLLLL....


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   60
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll
Query dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   60
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh
Query tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
ident                                                             
Sbjct ............................................................   60
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllLEEEEEEEEEeellllleeEEEEEEEEEL
Query elawasynspppnlepgleavnyydppnmtyPFGAYFCIMDidvdtgvakTRRFYALDDC  540
ident                                                             
Sbjct ...............................NATLAEYDPV.........RDMLTLNTTT   80
DSSP  ...............................LEEEEEEELL.........LLEEEEEELL


DSSP  lllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhlllleellllleelllllllllllllLLLLLEEEE
Query gtrinpmiIEGQVHGGLTEAFAvamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDY  600
ident             ||                                              
Sbjct .......qVPYYVHLKVAACLQ............................mDSARIRVIK  105
DSSP  .......lLHHHHHHHHHHHHL............................lLHHHEEEEL


DSSP  L.LLLLlllllLLLL..LLLHHHHHHHHHHHHH...........................
Query T.VTPSphhpiGAKG..VGESPHVGGVPCFSNA...........................  630
ident                          |                                  
Sbjct PfLGGG.....FGARteALHFEIIAGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmk  160
DSSP  LlLLLL.....LLLLllLLHHHHHHHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct iglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntpp  220
DSSP  eeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct cgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpe  280
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct clekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggit  340
DSSP  hhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeelllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct lltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnas  400
DSSP  eeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct isaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtit  460
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct vkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgka  520
DSSP  eeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct lnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesm  580
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelll


DSSP  .......................hhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query .......................vndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                                         
Sbjct dpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  llllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 8: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ..llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhHHHHhHHHL.....
Query ..vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkeGTDAtFAKA.....   53
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkAASG.WEERkgklp  299
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhHHHL.HHHHlllll


DSSP  ..LEEEEEEEEELL..............................................
Query ..EVVSKDMFTYHR..............................................   65
ident                                                             
Sbjct kgRGLGIALSHFVSgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqv  359
DSSP  llEEEEEEEEEEELllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   65
ident                                                             
Sbjct aaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkl  419
DSSP  hhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   65
ident                                                             
Sbjct dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirg  479
DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhh


DSSP  .....Llllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query .....Vhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct saigaT......................................................  485
DSSP  hhlllL......................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllEELlEEEEEEEEELL..
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsFARdYHMTTELAATK..  178
ident                                                        |    
Sbjct ...........................................MGF.CYAAQVVEASVde  501
DSSP  ...........................................LLE.EEEEEEEEEEEll


DSSP  ...LLLEEEEEEEEEEELlllllllllLLLLL.LLHH.HLLLLL................
Query ...DGKILAMRCHVLADHgafdacadpSKWPA.GFMN.ICTGSY................  217
ident              |                   |                          
Sbjct itgKVTAHKVWVAVDVGK.......alNPLAVeGQTQgGVWMGMgqalseetvydngrmv  554
DSSP  lllLEEEEEEEEEEELLL.......llLHHHHhHHHHhHHHHHHhhhhllllleelleel


DSSP  .............LLLLEEEEEEEELLLLLLeelllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .............DMPVAHLAVDGVYTNKASggvayrcsfRVTEAVYAIERAIETLAQRL  264
ident                |                                   ||       
Sbjct hgnildyrvptivESPDIEVIIVESMDPNGP....fgakeASEGMLAGFLPAIHEAVYEA  610
DSSP  lllllllllllllLLLEEEEEEELLLLLLLH....hhlllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  .LLLHHHhHHHHlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
Query .EMDSADlRIKNfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqea  323
ident       |                                                     
Sbjct vGVRATD.FPLS................................................  621
DSSP  hLLLLLE.ELLL................................................


DSSP  hhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllll
Query fkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqg  383
ident                                                             
Sbjct ............................................................  621
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query qghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkika  443
ident                                                             
Sbjct ............................................................  621
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeee
Query kaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavny  503
ident                                                             
Sbjct ............................................................  621
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafav  563
ident                                                             
Sbjct ............................................................  621
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhh
Query amgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvgg  623
ident                                                             
Sbjct ............................................................  621
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query vpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                         
Sbjct .........................pdritelldakeaaa  636
DSSP  .........................hhhhhhhhhhhhhll


No 9: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.4

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellLLHHH.
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsGNYPL.  299
ident                                                             
Sbjct ......................................................MTPKAa    6
DSSP  ......................................................LLHHHh


DSSP  .......................hhhhhhhhhlhhhHHhhhhhhhhhhhllllleeeeEE
Query .......................amkkamdtvgyhqLRaeqkakqeafkrgetreimgIG  336
ident                                      |                      
Sbjct mkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlIR....................EK   46
DSSP  hlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleEE....................EE


DSSP  EEEEELLLlllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhh
Query ISFFTEIVgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiat  396
ident    | |                                                      
Sbjct TYTFAEVN....................................................   54
DSSP  EEEELLLL....................................................


DSSP  hhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query elgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevh  456
ident                                                             
Sbjct ..................hvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqm   96
DSSP  ..................llllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhll


DSSP  hhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllLLLL.LEEE
Query egdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppNMTY.PFGA  515
ident                                                         |   
Sbjct dsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiAHRGrPWTE  156
DSSP  lhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhHLLLlLEEE


DSSP  EEEEeeeellllleeeeEEEEEEELLLLLLhhHHHHHHHhHHHHHHHhhHLLLleellll
Query YFCImdidvdtgvaktrRFYALDDCGTRINpmIIEGQVHgGLTEAFAvaMGQEirydeqg  575
ident                     |    |                                  
Sbjct VKMK.iglkkdgkiaalALEATQAGGAYAG..YGIITIL.YTGALMH..GLYH.......  203
DSSP  EEEE.eeellllleeeeEEEEEEELLLLLL..LHHHHHH.HHHHLLL..LLLL.......


DSSP  leellllllllllllLLLLlLEEEELLLLLlllllLLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query nvlgasfmdfflptaVETPkWETDYTVTPSphhpiGAKGVG.ESPHVGGVPCFSNAVNDA  634
ident                            |          |       |     |       
Sbjct ..............iPAIK.HDAWRVYTNT.....PPCGAMrGHGTVDTRAAFEALLTEM  243
DSSP  ..............lLLEE.EEEEEELLLL.....LLLLLLlLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLLL....................................................
Query YAFLNAGH....................................................  642
ident    |                                                        
Sbjct GEELGIDSlkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrg  303
DSSP  HHHHLLLHhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllee


DSSP  .LLLL.......................................................
Query .IQMP.......................................................  646
ident                                                             
Sbjct lGIALshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaev  363
DSSP  eEEEEeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  646
ident                                                             
Sbjct lgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldare  423
DSSP  hlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  646
ident                                                             
Sbjct edievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaig  483
DSSP  hheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  646
ident                                                             
Sbjct atmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqals  543
DSSP  lllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  646
ident                                                             
Sbjct eetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpai  603
DSSP  lllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhh


DSSP  ................llhhhhhhhhhhlllll
Query ................hdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                  
Sbjct heavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 10: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.2

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleEEEEEEEL...hhhhhhhhhhlLEEE
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhIFRWEIGD...kegtdatfakaEVVS   57
ident                                       |                     
Sbjct ..............mtpkaamkagaialhddkpnNILREVHAefgdvaaafaeadlIREK   46
DSSP  ..............llhhhhhlllllllllllllLEEEEEEEeellhhhhhhllleEEEE


DSSP  EEEEEELLLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeee
Query KDMFTYHRVhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihvi  117
ident    |                                                        
Sbjct TYTFAEVNH....vhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarir  102
DSSP  EEEELLLLL....lllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhhee


DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllEELLEEEEEEE...
Query apdigggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsFARDYHMTTEL...  174
ident                                                             
Sbjct vikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiaHRGRPWTEVKMkig  162
DSSP  eelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhLLLLLEEEEEEeee


DSSP  .eellllleeeEEEEEEEELlllllllllllLLLLLH.HHLL.LLLL.....lLLEEEEE
Query .aatkdgkilaMRCHVLADHgafdacadpskWPAGFM.NICT.GSYD.....mPVAHLAV  226
ident                                                             
Sbjct lkkdgkiaalaLEATQAGGA.........yaGYGIITiLYTGaLMHGlyhipaIKHDAWR  213
DSSP  ellllleeeeeEEEEEELLL.........llLLHHHHhHHHHhLLLLllllllEEEEEEE


DSSP  EEELLlllleellllllllhHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleel
Query DGVYTnkasggvayrcsfrvTEAVYAIERAietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpyma  286
ident     |                        |                              
Sbjct VYTNT........ppcgamrGHGTVDTRAA......fealltemgeelgidslkirqinm  259
DSSP  ELLLL........lllllllLLLLHHHHHH......hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhll


DSSP  lllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllll
Query plgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivga  346
ident                                                             
Sbjct lpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpk  319
DSSP  llllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllll


DSSP  lllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query gpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddim  406
ident                                                             
Sbjct hwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsa  379
DSSP  llllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellll


DSSP  eelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellle
Query ieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdr  466
ident                                                             
Sbjct ltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsq  439
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellll


DSSP  eeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeelll
Query frvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdt  526
ident                                                             
Sbjct dpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasv  499
DSSP  llleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeee


DSSP  lleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllllll
Query gvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdff  586
ident                                                             
Sbjct deitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnil  559
DSSP  lllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllll


DSSP  lllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
Query lptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmp  646
ident                                                             
Sbjct dyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfp  619
DSSP  llllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleel


DSSP  llhhhhhhhhhhlllll
Query hdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                  
Sbjct lspdritelldakeaaa  636
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhll


No 11: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.2

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleEEEEEEELHHHHHHHHhhlleEEEEE
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhIFRWEIGDKEGTDATFakaevVSKDM   60
ident                                       | ||     |            
Sbjct ..........mtpkaamkagaialhddkpnnilrEVHAEFGDVAAAFAEA.....DLIRE   45
DSSP  ..........llhhhhhlllllllllllllleeeEEEEEELLHHHHHHLL.....LEEEE


DSSP  EEELLLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query FTYHRVhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident  ||                                                         
Sbjct KTYTFA......................................................   51
DSSP  EEEEEL......................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllE................
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsF................  164
ident                                                             
Sbjct ...........................................Evnhvhmelnatlaeyd   68
DSSP  ...........................................Lllllllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  164
ident                                                             
Sbjct pvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagll  128
DSSP  lllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  .........................elLEEEEEEEeellllleeeEEEEEEEELLL....
Query .........................arDYHMTTELaatkdgkilaMRCHVLADHGA....  195
ident                               |   |                |        
Sbjct arkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtEVKMKIGL....kkdgkiAALALEATQAGgaya  184
DSSP  hhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeEEEEEEEE....llllleEEEEEEEEEELllll


DSSP  ..LLLLlllllLLLLLHHhlllllllllEEEEEEEELLL........lllEELLlllllL
Query ..FDACadpskWPAGFMNictgsydmpvAHLAVDGVYTN........kasGGVAyrcsfR  245
ident                 |                |                 |        
Sbjct gyGIIT...ilYTGALMH.....glyhiPAIKHDAWRVYtntppcgamrgHGTV....dT  232
DSSP  llHHHH...hhHHHHLLL.....lllllLLEEEEEEEELlllllllllllLLLH....hH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhh
Query VTEAVYAIERAietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkam  305
ident                                                             
Sbjct RAAFEALLTEM..............geelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygv  278
DSSP  HHHHHHHHHHH..............hhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllh


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeee
Query dtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaei  365
ident                                                             
Sbjct peclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdgg  338
DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeelllll


DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllll
Query rihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsr  425
ident                                                             
Sbjct itlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgn  398
DSSP  eeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhh
Query stptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawa  485
ident                                                             
Sbjct asisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgt  458
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllll


DSSP  hhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll
Query synspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrin  545
ident                                                             
Sbjct itvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvg  518
DSSP  eeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeell


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllll
Query pmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtps  605
ident                                                             
Sbjct kalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviive  578
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeel


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query phhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                                           
Sbjct smdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  llllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 12: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.1

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ..........................................................mt    2
DSSP  ..........................................................ll


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellLLLEELLLLHhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymapLGWEYDSGNYpla  300
ident                                                             
Sbjct pkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytFAEVNHVHME...   59
DSSP  hhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeELLLLLLLLL...


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   59
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll
Query dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   59
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh
Query tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
ident                                                             
Sbjct ............................................................   59
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllllEEEEEEEeeeellllleeeeEEEEEEel
Query elawasynspppnlepgleavnyydppnmtypFGAYFCImdidvdtgvaktrRFYALDdc  540
ident                                   |                         
Sbjct ................................LNATLAE.....ydpvrdmlTLNTTT..   80
DSSP  ................................LLEEEEE.....eelllleeEEEELL..


DSSP  lllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLllleellllleelllllllllllllLLLLLEEEE
Query gtrinpmiiegQVHGGLTEAFAVAMGqeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDY  600
ident                      |                                      
Sbjct ..........qVPYYVHLKVAACLQM.......................dsARIRVIKPF  107
DSSP  ..........lLHHHHHHHHHHHHLL.......................lhHHEEEELLL


DSSP  LLLllllllllLLLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHH..........................
Query TVTpsphhpigAKGVGEsPHVGGVPCFSNAVNDA..........................  634
ident                 |            |                              
Sbjct LGG.......gFGARTE.ALHFEIIAGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkm  159
DSSP  LLL.......lLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  634
ident                                                             
Sbjct kiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntp  219
DSSP  eeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  634
ident                                                             
Sbjct pcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvp  279
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  634
ident                                                             
Sbjct eclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggi  339
DSSP  hhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  634
ident                                                             
Sbjct tlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgna  399
DSSP  eeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  634
ident                                                             
Sbjct sisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  634
ident                                                             
Sbjct tvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgk  519
DSSP  eeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  634
ident                                                             
Sbjct alnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviives  579
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeell


DSSP  ............................hhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query ............................yaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                                          
Sbjct mdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 13: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  .......................................llhhhllllllllllhhhlll
Query .......................................vdpfkamepdapllredikdk   21
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  leelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeee
Query mtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdmftyhrvhpspletcqcvasmd   81
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  lllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhh
Query kikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavva  141
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  hhhhllleeeellhhhhhhhlleelLEEEEEEEEEllllleEEEEEEEEEelllllllll
Query sivlgvpvkwvedrmenlsttsfarDYHMTTELAAtkdgkiLAMRCHVLAdhgafdacad  201
ident                                 |                |          
Sbjct grglgialshfvsgtstpkhwtgepHATVNLKLDF.....dGGITLLTGA........ad  347
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllLEEEEEEELL.....lLLEEEEELL........ll


DSSP  LLLLLLLLHH.HLLL.LLLL.LLEEEEEEEE.....lllllLEELlllLLLLHHHHHHHH
Query PSKWPAGFMN.ICTG.SYDM.PVAHLAVDGV.....ytnkaSGGVayrCSFRVTEAVYAI  253
ident                                          |  |             | 
Sbjct IGQGSNTMASqVAAEvLGVRlSRIRVISADSaltpkdngsySSRV...TFMVGNASISAA  404
DSSP  LLLLHHHHHHhHHHHhHLLLhHHEEEEELLLllllllllllLLLH...HHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL.......LLHHhhHHHHlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhh
Query ERAIETLAQRLE.......MDSAdlRIKNfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamd  306
ident |     |             |     |                                 
Sbjct EELKGVLVKAAAkkldareEDIE..VIDE...............................  431
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhllllhHHEE..EELL...............................


DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeee
Query tvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeir  366
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllll
Query ihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrs  426
ident                                                             
Sbjct ............................................................  431
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhh
Query tptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawas  486
ident                                                             
Sbjct ................................mfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
DSSP  ................................eeeellllllleehhhhhhhhhllllle


DSSP  hhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllh
Query ynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinp  546
ident                                                             
Sbjct tvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgk  519
DSSP  eeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeelll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeellllll
Query miiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsp  606
ident                                                             
Sbjct alnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviives  579
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeell


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query hhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                                          
Sbjct mdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 14: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleeLLLLHhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweyDSGNYpla  300
ident                                                             
Sbjct ....................................................MTPKAamk    8
DSSP  ....................................................LLHHHhhl


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeEEEEEEEEELLLLLLllllleelleeL.
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreiMGIGISFFTEIVGAGpskncdilgvsM.  359
ident                                   |     |                   
Sbjct agaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeaDLIREKTYTFAEVNH...........Vh   57
DSSP  llllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllLEEEEEEEEELLLLL...........Ll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  359
ident                                                             
Sbjct melnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgarte  117
DSSP  lllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllll


DSSP  ............................LEEeeeeellllleeeeellllllllhhhhhh
Query ............................FDSaeirihptgsviarmgtksqgqghettya  391
ident                             |                               
Sbjct alhfeiiagllarkakgtvrllqtreetFIA.............................  148
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhHHH.............................


DSSP  hhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query qiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaah  451
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllLL
Query mlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmTY  511
ident                                                             
Sbjct ......................................................hrgrPW  154
DSSP  ......................................................llllLE


DSSP  LEEEEEEEEEEellllLEEEEEEEEEEELLL....lLLHHHHHhHHHHHHHHhhhhhhll
Query PFGAYFCIMDIdvdtgVAKTRRFYALDDCGT....rINPMIIEgQVHGGLTEafavamgq  567
ident                   |                      |                  
Sbjct TEVKMKIGLKK.....DGKIAALALEATQAGgayagYGIITIL.YTGALMHG........  200
DSSP  EEEEEEEEELL.....LLLEEEEEEEEEEELlllllLHHHHHH.HHHHLLLL........


DSSP  lleellllleelllllllllllllLLLLLEEEELLLLlLLLLLL...lllLLLHHHHHHH
Query eirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDYTVTPsPHHPIG...akgVGESPHVGGV  624
ident                           |    |         |                  
Sbjct ......................lyHIPAIKHDAWRVY.TNTPPCgamrghGTVDTRAAFE  237
DSSP  ......................llLLLLEEEEEEEEL.LLLLLLllllllLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhlllllLLLL.LLLH.............................hhhhh
Query PCFSNAVNDAYaflnagHIQM.PHDA.............................wrlwk  654
ident                                                             
Sbjct ALLTEMGEELG......IDSLkIRQInmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgw  291
DSSP  HHHHHHHHHHL......LLHHhHHHHllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  hhHHLL......................................................
Query vgEQLG......................................................  660
ident                                                             
Sbjct eeRKGKlpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqg  351
DSSP  hhHLLLlllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  660
ident                                                             
Sbjct sntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvl  411
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  660
ident                                                             
Sbjct vkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptef  471
DSSP  hhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  660
ident                                                             
Sbjct qgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtq  531
DSSP  llllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  660
ident                                                             
Sbjct ggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakea  591
DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllll


DSSP  ..........................................lll
Query ..........................................lhv  663
ident                                              
Sbjct segmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 15: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct .............................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefg   31
DSSP  .............................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeel


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct dvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkva   91
DSSP  lhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct aclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrg  151
DSSP  hhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhlll


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct rpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhda  211
DSSP  lleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeee


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllllllLLLLEEL.....
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpSKNCDIL.....  355
ident                                                             
Sbjct wrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmLPQIPYVtmyaq  271
DSSP  eeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllLLLLLEElllll


DSSP  LEELL.......................................................
Query GVSMF.......................................................  360
ident  |                                                          
Sbjct RVMSYgvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnl  331
DSSP  EELLLlhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  360
ident                                                             
Sbjct kldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssr  391
DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  360
ident                                                             
Sbjct vtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvka  451
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhh


DSSP  .....................................EEEEEEELLL..........LLE
Query .....................................DSAEIRIHPT..........GSV  373
ident                                        |                   |
Sbjct amvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfCYAAQVVEASvdeitgkvtaHKV  511
DSSP  hhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleEEEEEEEEEEelllllleeeEEE


DSSP  EEEELL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL...........................llhhH
Query IARMGT.KSQGQ.GHETTYAQIIATELG...........................ipadD  404
ident        |       |           |                               |
Sbjct WVAVDVgKALNPlAVEGQTQGGVWMGMGqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespD  571
DSSP  EEEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllleelleelllllllllllllllllE


DSSP  EEEELLlllllllllLLLL......LLLLllhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhh
Query IMIEEGntdtapyglGTYG......SRSTptaGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevheg  458
ident |                                                           
Sbjct IEVIIV.........ESMDpngpfgAKEA...SEGMLAGFLPA.................  602
DSSP  EEEEEE.........LLLLlllhhhLLLL...LLLLLLLHHHH.................


DSSP  heeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllLeeeeeelllllllleeeeee
Query dlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgLeavnyydppnmtypfgayfc  518
ident                                                             
Sbjct .......................................I....................  603
DSSP  .......................................H....................


DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleelllllee
Query imdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvl  578
ident                                                             
Sbjct ............................................................  603
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayafl  638
ident                                                             
Sbjct ....................................................heavyeav  611
DSSP  ....................................................hhhhhhhh


DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query naghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                          
Sbjct gvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  llllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 16: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ...............................................mtpkaamkagaia   13
DSSP  ...............................................llhhhhhllllll


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelLEEEEEEEeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfarDYHMTTELaatkdg  180
ident                                                     |       
Sbjct lhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmeLNATLAEY....dp   69
DSSP  lllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEE....el


DSSP  leeeEEEEEEeelllllllllllllLLLLH.HHLL..LLLLLLLEEEEE.EEELllllLE
Query kilaMRCHVLadhgafdacadpskwPAGFM.NICT..GSYDMPVAHLAV.DGVYtnkaSG  236
ident                                         |                  |
Sbjct vrdmLTLNTT.............tqVPYYVhLKVAacLQMDSARIRVIKpFLGG...gFG  113
DSSP  llleEEEEEL.............llLHHHHhHHHHhhHLLLHHHEEEELlLLLL...lLL


DSSP  ELlllllLLHHHHHHHHHHH........................................
Query GVayrcsFRVTEAVYAIERA........................................  256
ident                |   |                                        
Sbjct AR....tEALHFEIIAGLLArkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgki  169
DSSP  LL....lLLLHHHHHHHHHHhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  256
ident                                                             
Sbjct aalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgt  229
DSSP  eeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query ietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlrae  316
ident                                                             
Sbjct vdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaas  289
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeee
Query qkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviar  376
ident                                                             
Sbjct gweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadig  349
DSSP  lhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllll


DSSP  ellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhh
Query mgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatav  436
ident                                                             
Sbjct qgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkg  409
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhllllllll
Query aarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlep  496
ident                                                             
Sbjct vlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcpt  469
DSSP  hhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllh


DSSP  lleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh
Query gleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgg  556
ident                                                             
Sbjct efqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegq  529
DSSP  hhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeellllllllllllllll
Query lteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvg  616
ident                                                             
Sbjct tqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgak  589
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhll


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query esphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                                
Sbjct easegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll