No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=44.3

DSSP  LLHHHHHLLLLLLLLLLL............LLLEEEEEEEEEL.LHHHHHHLLLEEEEEE
Query MTPKAAMKAGAIALHDDK............PNNILREVHAEFG.DVAAAFAEADLIREKT   47
ident   |  ||   |  |  |               |              | || |       
Sbjct VDPFKAMEPDAPLLREDIkdkmtgahgarkHHNHIFRWEIGDKeGTDATFAKAEVVSKDM   60
DSSP  LLHHHLLLLLLLLLLHHHlllleelleellLLLEEEEEEEELHhHHHHHHHHLLEEEEEE


DSSP  EEELLLLLLllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query YTFAEVNHVhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpf  107
ident  |   |                                                      
Sbjct FTYHRVHPSpletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  EEELLLLLLllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhHHHLLLLLEEEEEEEEEELLLL
Query lgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetFIAHRGRPWTEVKMKIGLKKDG  167
ident                                                          |||
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenLSTTSFARDYHMTTELAATKDG  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhHHHLLEELLEEEEEEEEELLLL


DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLHH...HHHHHHHhLLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLLL.L
Query KIAALALEATQAGGAYAGYGI...ITILYTGaLMHGLYHIPAIKHDAWRVYTNTPPCG.A  223
ident || |         ||                    | |  |        ||||    | |
Sbjct KILAMRCHVLADHGAFDACADpskWPAGFMN.ICTGSYDMPVAHLAVDGVYTNKASGGvA  239
DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLLLlllLLLLLHH.HLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLEElL


DSSP  LLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLL..LLLEELLLLLEELLLLHHH
Query MRG.HGTVDTRAAFEALLTEMGEELGIDSLKIRQINMLP..QIPYVTMYAQRVMSYGVPE  280
ident  |          | |         |  ||   |  |     | ||         |   | 
Sbjct YRCsFRVTEAVYAIERAIETLAQRLEMDSADLRIKNFIQpeQFPYMAPLGWEYDSGNYPL  299
DSSP  LLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLhhHLLEELLLLLEELLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHLHHHHL..LLLLL..........LEEEEEEEEEEELlllllllllllllee
Query CLEKVKAASGWEERK..GKLPK..........GRGLGIALSHFVSgtstpkhwtgephat  328
ident    |     |        |               | ||                      
Sbjct AMKKAMDTVGYHQLRaeQKAKQeafkrgetreIMGIGISFFTEIV...............  344
DSSP  HHHHHHHHHLHHHHHhhHHHHHhhhhllllleEEEEEEEEEELLL...............


DSSP  eeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeelllllllllllll
Query vnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsy  388
ident                                                             
Sbjct ............................................................  344
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhh
Query ssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqev  448
ident                                                             
Sbjct ............................................................  344
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllllleeeeeeelllhhhlllLLLHH.............................
Query vkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdKKIRG.............................  479
ident                            |                                
Sbjct ......................gagpSKNCDilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksq  382
DSSP  ......................llllLLLLEelleelleeeeeeellllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  479
ident                                                             
Sbjct gqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkik  442
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  479
ident                                                             
Sbjct akaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavn  502
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeee


DSSP  hhlllLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query saigaTMGFCYAAQVVEASVDEITGKVTAHKVWVAVDVGKALNPLAVEGQTQGGVWMGMG  539
ident       |     |       |  ||           | |   ||   |||  ||      
Sbjct yydppNMTYPFGAYFCIMDIDVDTGVAKTRRFYALDDCGTRINPMIIEGQVHGGLTEAFA  562
DSSP  eelllLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLEEL.LEELLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLLHHHLLLLLLLLLLL
Query QALSEETVYDN.GRMVHGNILDYRVPTIVESPDIEVIIVESMDPNGPFGAKEASEGMLAG  598
ident  |   |  ||  |        |   || || |  |        |  | |||   |    |
Sbjct VAMGQEIRYDEqGNVLGASFMDFFLPTAVETPKWETDYTVTPSPHHPIGAKGVGESPHVG  622
DSSP  HHHLLLLEELLlLLEELLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHL...LLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHLL
Query FLPAIHEAVYEAVG...VRATDFPLSPDRITELLDAKEAAA  636
ident   |    ||  |           |    |            
Sbjct GVPCFSNAVNDAYAflnAGHIQMPHDAWRLWKVGEQLGLHV  663
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHlllLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=16.0

DSSP  .............llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeee
Query .............mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirekt   47
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  eeellllllLLLLLEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLL
Query ytfaevnhvHMELNATLAEYDPVRDMLTLNTTTQVPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPF  107
ident            |     |  |     |||  | | |      |          | || | 
Sbjct ftyhrvhpsPLETCQCVASMDKIKGELTLWGTFQAPHVIRTVVSLISGLPEHKIHVIAPD  120
DSSP  eeellllllLLLLLEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLL


DSSP  LLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHH.....................h
Query LGGGFGARTEALHFEIIAGLLARKAKGTVRLLQTREET.....................f  146
ident  |||||    |      |          |     | |                       
Sbjct IGGGFGNKVGAYSGYVCAVVASIVLGVPVKWVEDRMENlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  LLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  hhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhllllllllll
Query iahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipa  206
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  eeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlllllllee
Query ikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyv  266
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh


DSSP  llllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeellllllllllllll
Query tmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgeph  326
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell


DSSP  EEEEEEEllllLEEEEELlllllllHHHHHHHHHHHHHlllhhhEEEEELllllllllll
Query ATVNLKLdfdgGITLLTGaadigqgSNTMASQVAAEVLgvrlsrIRVISAdsaltpkdng  386
ident                  |         |   |  |  |      |               
Sbjct DSAEIRIhptgSVIARMGtksqgqgHETTYAQIIATELgipaddIMIEEGntdtapyglg  420
DSSP  EEEEEEEllllLEEEEELlllllllHHHHHHHHHHHHHlllhhhEEEELLllllllllll


DSSP  lllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllhhhEEEELLEEEELLllllleeHH
Query syssrVTFMVGNASISAAEELKGVLVKAAAKKldareedIEVIDEMFMVSGsqdpglsFQ  446
ident       |   | |   ||   |      ||          |     | | |         
Sbjct tygsrSTPTAGAATAVAARKIKAKAQMIAAHMlevhegdLEWDVDRFRVKGlpekfktMK  480
DSSP  lllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhEEELLLEEEELLeeeeeeeHH


DSSP  HHHHHHH.....lllllEEEEEEElllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeell
Query EVVKAAM.....vdsgtITVKGTYtcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvde  501
ident |   |                  |                                    
Sbjct ELAWASYnspppnlepgLEAVNYY............dppnmtypfgayfcimdidvdtgv  528
DSSP  HHHHHHHhlllllllllLEEEEEE............lllllllleeeeeeeeeeelllll


DSSP  lllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllll
Query itgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildy  561
ident                                                             
Sbjct aktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflp  588
DSSP  eeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllllllll


DSSP  llllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelll
Query rvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfpls  621
ident                                                             
Sbjct tavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphd  648
DSSP  lllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhll
Query pdritelldakeaaa  636
ident                
Sbjct awrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  hhhhhhhhhhlllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=8.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh


DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeelllllllllL
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmeL   60
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmF  360
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelL


DSSP  LEEEEEEELlLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLL.......L
Query NATLAEYDPvRDMLTLNTTTQ.....VPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPF.......L  108
ident         |          |               |  |      |             |
Sbjct DSAEIRIHP.TGSVIARMGTKsqgqgHETTYAQIIATELGIPADDIMIEEGNtdtapygL  419
DSSP  EEEEEEELL.LLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLlllllllL


DSSP  LLLLLLL.lllLHHHHHHHHHH......................................
Query GGGFGAR.teaLHFEIIAGLLA......................................  129
ident |                |                                          
Sbjct GTYGSRStptaGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktm  479
DSSP  LLLLLLLlllhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeeh


DSSP  ..............hhhlLEEEEELLHHhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeee
Query ..............rkakGTVRLLQTREetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalale  175
ident                                                             
Sbjct kelawasynspppnlepgLEAVNYYDPP................................  507
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllLEEEEEELLL................................


DSSP  eeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhh
Query atqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraa  235
ident                                                             
Sbjct ............................................................  507
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhl
Query fealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerk  295
ident                                                             
Sbjct ............................................................  507
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhh
Query gklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntm  355
ident                                                             
Sbjct ............................................................  507
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query asqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaa  415
ident                                                             
Sbjct ............................................................  507
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllll
Query akkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdk  475
ident                                                             
Sbjct ............................................................  507
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhh
Query kirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvw  535
ident                                                             
Sbjct .....nmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafa  562
DSSP  .....llllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllllllll
Query mgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegm  595
ident                                                             
Sbjct vamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvg  622
DSSP  hhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhh


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query lagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                          
Sbjct gvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=7.0

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct ........vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfak   52
DSSP  ........llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeeellLLLLlllllllLEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHH
Query grglgialshfvsgTSTPkhwtgepHATVNLKLD.FDGGITLLTGAAdigqgSNTMASQV  359
ident                  |               |   |  ||                 |
Sbjct aevvskdmftyhrvHPSP.....leTCQCVASMDkIKGELTLWGTFQ.....APHVIRTV  102
DSSP  lleeeeeeeeelllLLLL.....llLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELLllllllLLLLLlLLHHHhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhl
Query AAEVLGVRLSRIRVISADsaltpkDNGSYsSRVTFmVGNASISAAEELKgvlvkaaakkl  419
ident      |     | ||  |        |                |                
Sbjct VSLISGLPEHKIHVIAPD......IGGGF.GNKVG.AYSGYVCAVVASI...........  143
DSSP  HHHHHLLLHHHEEEELLL......LLLLL.LLLLL.LLHHHHHHHHHHH...........


DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllLEEEEEEELLL...........
Query dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgTITVKGTYTCP...........  468
ident                                          ||                 
Sbjct ....................................vlGVPVKWVEDRMenlsttsfard  167
DSSP  ....................................hhLLLEEEELLHHhhhhhlleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct yhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavd  227
DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct gvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymap  287
DSSP  eelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct lgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgag  347
DSSP  llleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct pskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimi  407
DSSP  llllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct eegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrf  467
DSSP  elllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct rvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtg  527
DSSP  eelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellll


DSSP  ...................................................HHHLlllll
Query ...................................................TEFQgdkki  477
ident                                                             
Sbjct vaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlGASF.....  582
DSSP  leeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleeLLLL.....


DSSP  hhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query rgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmg  537
ident                                                             
Sbjct ............................................................  582
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllllllllll
Query mgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmla  597
ident                                                             
Sbjct ..................mdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggv  624
DSSP  ..................lllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query gflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                        
Sbjct pcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.4

DSSP  ...............................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeee
Query ...............................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhae   29
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhh
Query fgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlk   89
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  hhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhl
Query vaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiah  149
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  lllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleee
Query rgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikh  209
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  eeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleelll
Query dawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmy  269
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh


DSSP  lleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelLLLL......lLLLLl
Query aqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsGTST......pKHWTg  323
ident                                             |               
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivGAGPskncdilGVSM.  359
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllLLLLlllleelLEEL.


DSSP  llLEEEEEEEllllLEEEEELL....llLLLL..HHHHHHHHHHhhhlllhhheEEEELL
Query epHATVNLKLdfdgGITLLTGA....adIGQG..SNTMASQVAAevlgvrlsriRVISAD  377
ident    |                         |                              
Sbjct fdSAEIRIHP....TGSVIARMgtksqgQGHEttYAQIIATELG......ipadDIMIEE  409
DSSP  leEEEEEELL....LLLEEEEEllllllLLHHhhHHHHHHHHHL......llhhHEEEEL


DSSP  LLlllLLLL....lLLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllhhheeeell
Query SAltpKDNG....sYSSR..VTFMVGNASISAAEELKgvlvkaaakkldareedievide  431
ident         |       |          |                                
Sbjct GNtdtAPYGlgtygSRSTptAGAATAVAARKIKAKAQ.miaahmlevhegdlewdvdrfr  468
DSSP  LLlllLLLLlllllLLLLllHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhhhhhhlllhhheeellleee


DSSP  eeeellllllleehhhhhhhhhllllLEEEEEEE.LLLHHHllllllhhhhlllllleee
Query mfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgTITVKGTY.TCPTEFqgdkkirgsaigatmgfcy  490
ident                                      |                      
Sbjct vkglpekfktmkelawasynspppnlEPGLEAVNyYDPPNM...........typfgayf  517
DSSP  elleeeeeeehhhhhhhhhhllllllLLLLEEEEeELLLLL...........llleeeee


DSSP  eeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleel
Query aaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydn  550
ident                                                             
Sbjct cimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnv  577
DSSP  eeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllle


DSSP  leellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhh
Query grmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyea  610
ident                                                             
Sbjct lgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaf  637
DSSP  elllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query vgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                           
Sbjct lnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.4

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ....................................vdpfkamepdapllredikdkmtg   24
DSSP  ....................................llhhhllllllllllhhhllllee


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdmftyhrvhpspletcqcvasmdkik   84
DSSP  lleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelll


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct geltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavvasiv  144
DSSP  leeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct lgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpsk  204
DSSP  hllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllll


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct wpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrl  264
DSSP  lllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeeellllLLLL....LLLL................................
Query grglgialshfvsgtsTPKH....WTGE................................  324
ident                                                             
Sbjct emdsadlriknfiqpeQFPYmaplGWEYdsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeaf  324
DSSP  lllhhhhhhhhlllhhHLLEelllLLEEllllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  324
ident                                                             
Sbjct krgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgq  384
DSSP  hllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  324
ident                                                             
Sbjct ghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikak  444
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  324
ident                                                             
Sbjct aqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyy  504
DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeee


DSSP  .....lLEEEEEEEL..........llLLEEEEELL.lLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL..
Query .....pHATVNLKLD..........fdGGITLLTGA.aDIGQ.GSNTMASQVAAEVLG..  365
ident                                 |      |              |     
Sbjct dppnmtYPFGAYFCImdidvdtgvaktRRFYALDDCgtRINPmIIEGQVHGGLTEAFAva  564
DSSP  llllllLLEEEEEEEeeeellllleeeEEEEEEEELllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ..........................lLHHHEEEEELlllllllLLLLL...LLLHhhHH
Query ..........................vRLSRIRVISAdsaltpkDNGSY...SSRVtfMV  396
ident                                                |           |
Sbjct mgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDYT.......VTPSPhhpIGAK..GV  615
DSSP  hlllleellllleelllllllllllllLLLLLEEEEL.......LLLLLlllLLLL..LL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHhhEEEElleeeELLLlllleehhhhhhhhhlll
Query GNASISAAEELKGVLVKAAAKKLDAREedIEVIdemfmVSGSqdpglsfqevvkaamvds  456
ident |              |  |   | |    |                              
Sbjct GESPHVGGVPCFSNAVNDAYAFLNAGH..IQMP.hdawRLWK..................  654
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL..LLLL.llhhHHHH..................


DSSP  lleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeee
Query gtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavd  516
ident                                                             
Sbjct ............................................................  654
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeee
Query vgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdievii  576
ident                                                             
Sbjct ............................................................  654
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query vesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                             
Sbjct ...................................................vgeqlglhv  663
DSSP  ...................................................hhhhlllll


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ........................................................llhh
Query ........................................................mtpk    4
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  hhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllLLLL....
Query aamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvHMEL....   60
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweyDSGNypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleeLLLLhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   60
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   60
ident                                                             
Sbjct dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   60
ident                                                             
Sbjct tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh


DSSP  ...............................LEEEEEEELL.........LLEEEEEELL
Query ...............................NATLAEYDPV.........RDMLTLNTTT   80
ident                                                             
Sbjct elawasynspppnlepgleavnyydppnmtyPFGAYFCIMDidvdtgvakTRRFYALDDC  540
DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllLEEEEEEEEEeellllleeEEEEEEEEEL


DSSP  .......lLHHHHHHHHHHHHL............................lLHHHEEEEL
Query .......qVPYYVHLKVAACLQ............................mDSARIRVIK  105
ident             ||                                              
Sbjct gtrinpmiIEGQVHGGLTEAFAvamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDY  600
DSSP  lllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhlllleellllleelllllllllllllLLLLLEEEE


DSSP  LlLLLL.....LLLLllLLHHHHHHHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllllleeeeeee
Query PfLGGG.....FGARteALHFEIIAGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmk  160
ident                          |                                  
Sbjct T.VTPSphhpiGAKG..VGESPHVGGVPCFSNA...........................  630
DSSP  L.LLLLlllllLLLL..LLLHHHHHHHHHHHHH...........................


DSSP  eeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeellllll
Query iglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntpp  220
ident                                                             
Sbjct ............................................................  630
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhh
Query cgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpe  280
ident                                                             
Sbjct ............................................................  630
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeelllllee
Query clekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggit  340
ident                                                             
Sbjct ............................................................  630
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhh
Query lltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnas  400
ident                                                             
Sbjct ............................................................  630
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllllee
Query isaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtit  460
ident                                                             
Sbjct ............................................................  630
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellll
Query vkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgka  520
ident                                                             
Sbjct ............................................................  630
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelll
Query lnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesm  580
ident                                                             
Sbjct ............................................................  630
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query dpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                         
Sbjct .......................vndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  .......................hhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.5

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhHHHL.HHHHlllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkAASG.WEERkgklp  299
ident                                                             
Sbjct ..vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkeGTDAtFAKA.....   53
DSSP  ..llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhHHHHhHHHL.....


DSSP  llEEEEEEEEEEELllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhh
Query kgRGLGIALSHFVSgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqv  359
ident                                                             
Sbjct ..EVVSKDMFTYHR..............................................   65
DSSP  ..LEEEEEEEEELL..............................................


DSSP  hhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query aaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkl  419
ident                                                             
Sbjct ............................................................   65
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhh
Query dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirg  479
ident                                                             
Sbjct ............................................................   65
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllL......................................................
Query saigaT......................................................  485
ident                                                             
Sbjct .....Vhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  .....Llllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ...........................................LLE.EEEEEEEEEEEll
Query ...........................................MGF.CYAAQVVEASVde  501
ident                                                        |    
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsFARdYHMTTELAATK..  178
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllEELlEEEEEEEEELL..


DSSP  lllLEEEEEEEEEEELLL.......llLHHHHhHHHHhHHHHHHhhhhllllleelleel
Query itgKVTAHKVWVAVDVGK.......alNPLAVeGQTQgGVWMGMgqalseetvydngrmv  554
ident              |                   |                          
Sbjct ...DGKILAMRCHVLADHgafdacadpSKWPA.GFMN.ICTGSY................  217
DSSP  ...LLLEEEEEEEEEEELlllllllllLLLLL.LLHH.HLLLLL................


DSSP  lllllllllllllLLLEEEEEEELLLLLLLH....hhlllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query hgnildyrvptivESPDIEVIIVESMDPNGP....fgakeASEGMLAGFLPAIHEAVYEA  610
ident                |                                   ||       
Sbjct .............DMPVAHLAVDGVYTNKASggvayrcsfRVTEAVYAIERAIETLAQRL  264
DSSP  .............LLLLEEEEEEEELLLLLLeelllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  hLLLLLE.ELLL................................................
Query vGVRATD.FPLS................................................  621
ident       |                                                     
Sbjct .EMDSADlRIKNfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqea  323
DSSP  .LLLHHHhHHHHlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct fkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqg  383
DSSP  hhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct qghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkika  443
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct kaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavny  503
DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct ydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafav  563
DSSP  elllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct amgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvgg  623
DSSP  hhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhh


DSSP  .........................hhhhhhhhhhhhhll
Query .........................pdritelldakeaaa  636
ident                                         
Sbjct vpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  ......................................................LLHHHh
Query ......................................................MTPKAa    6
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsGNYPL.  299
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellLLHHH.


DSSP  hlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleEE....................EE
Query mkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlIR....................EK   46
ident                                      |                      
Sbjct .......................amkkamdtvgyhqLRaeqkakqeafkrgetreimgIG  336
DSSP  .......................hhhhhhhhhlhhhHHhhhhhhhhhhhllllleeeeEE


DSSP  EEEELLLL....................................................
Query TYTFAEVN....................................................   54
ident    | |                                                      
Sbjct ISFFTEIVgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiat  396
DSSP  EEEEELLLlllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ..................llllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhll
Query ..................hvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqm   96
ident                                                             
Sbjct elgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevh  456
DSSP  hhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  lhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhHLLLlLEEE
Query dsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiAHRGrPWTE  156
ident                                                         |   
Sbjct egdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppNMTY.PFGA  515
DSSP  hhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllLLLL.LEEE


DSSP  EEEE.eeellllleeeeEEEEEEELLLLLL..LHHHHHH.HHHHLLL..LLLL.......
Query VKMK.iglkkdgkiaalALEATQAGGAYAG..YGIITIL.YTGALMH..GLYH.......  203
ident                     |    |                                  
Sbjct YFCImdidvdtgvaktrRFYALDDCGTRINpmIIEGQVHgGLTEAFAvaMGQEirydeqg  575
DSSP  EEEEeeeellllleeeeEEEEEEELLLLLLhhHHHHHHHhHHHHHHHhhHLLLleellll


DSSP  ..............lLLEE.EEEEEELLLL.....LLLLLLlLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query ..............iPAIK.HDAWRVYTNT.....PPCGAMrGHGTVDTRAAFEALLTEM  243
ident                            |          |       |     |       
Sbjct nvlgasfmdfflptaVETPkWETDYTVTPSphhpiGAKGVG.ESPHVGGVPCFSNAVNDA  634
DSSP  leellllllllllllLLLLlLEEEELLLLLlllllLLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLHhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllee
Query GEELGIDSlkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrg  303
ident    |                                                        
Sbjct YAFLNAGH....................................................  642
DSSP  HHLLLLLL....................................................


DSSP  eEEEEeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhh
Query lGIALshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaev  363
ident                                                             
Sbjct .IQMP.......................................................  646
DSSP  .LLLL.......................................................


DSSP  hlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
Query lgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldare  423
ident                                                             
Sbjct ............................................................  646
DSSP  ............................................................


DSSP  hheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhll
Query edievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaig  483
ident                                                             
Sbjct ............................................................  646
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query atmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqals  543
ident                                                             
Sbjct ............................................................  646
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhh
Query eetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpai  603
ident                                                             
Sbjct ............................................................  646
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query heavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                  
Sbjct ................hdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  ................llhhhhhhhhhhlllll


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.2

DSSP  ..............llhhhhhlllllllllllllLEEEEEEEeellhhhhhhllleEEEE
Query ..............mtpkaamkagaialhddkpnNILREVHAefgdvaaafaeadlIREK   46
ident                                       |                     
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhIFRWEIGD...kegtdatfakaEVVS   57
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleEEEEEEEL...hhhhhhhhhhlLEEE


DSSP  EEEELLLLL....lllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query TYTFAEVNH....vhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarir  102
ident    |                                                        
Sbjct KDMFTYHRVhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihvi  117
DSSP  EEEEEELLLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeee


DSSP  eelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhLLLLLEEEEEEeee
Query vikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiaHRGRPWTEVKMkig  162
ident                                                             
Sbjct apdigggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsFARDYHMTTEL...  174
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllEELLEEEEEEE...


DSSP  ellllleeeeeEEEEEELLL.........llLLHHHHhHHHHhLLLLllllllEEEEEEE
Query lkkdgkiaalaLEATQAGGA.........yaGYGIITiLYTGaLMHGlyhipaIKHDAWR  213
ident                                                             
Sbjct .aatkdgkilaMRCHVLADHgafdacadpskWPAGFM.NICT.GSYD.....mPVAHLAV  226
DSSP  .eellllleeeEEEEEEEELlllllllllllLLLLLH.HHLL.LLLL.....lLLEEEEE


DSSP  ELLLL........lllllllLLLLHHHHHH......hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhll
Query VYTNT........ppcgamrGHGTVDTRAA......fealltemgeelgidslkirqinm  259
ident     |                        |                              
Sbjct DGVYTnkasggvayrcsfrvTEAVYAIERAietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpyma  286
DSSP  EEELLlllleellllllllhHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleel


DSSP  llllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllll
Query lpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpk  319
ident                                                             
Sbjct plgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivga  346
DSSP  lllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllll


DSSP  llllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellll
Query hwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsa  379
ident                                                             
Sbjct gpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddim  406
DSSP  lllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhee


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellll
Query ltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsq  439
ident                                                             
Sbjct ieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdr  466
DSSP  eelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellle


DSSP  llleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeee
Query dpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasv  499
ident                                                             
Sbjct frvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdt  526
DSSP  eeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeelll


DSSP  lllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllll
Query deitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnil  559
ident                                                             
Sbjct gvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdff  586
DSSP  lleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllllll


DSSP  llllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleel
Query dyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfp  619
ident                                                             
Sbjct lptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmp  646
DSSP  lllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhll
Query lspdritelldakeaaa  636
ident                  
Sbjct hdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  llhhhhhhhhhhlllll


No 11: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.2

DSSP  ..........llhhhhhlllllllllllllleeeEEEEEELLHHHHHHLL.....LEEEE
Query ..........mtpkaamkagaialhddkpnnilrEVHAEFGDVAAAFAEA.....DLIRE   45
ident                                       | ||     |            
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhIFRWEIGDKEGTDATFakaevVSKDM   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleEEEEEEELHHHHHHHHhhlleEEEEE


DSSP  EEEEEL......................................................
Query KTYTFA......................................................   51
ident  ||                                                         
Sbjct FTYHRVhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  EEELLLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ...........................................Lllllllllleeeeeee
Query ...........................................Evnhvhmelnatlaeyd   68
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsF................  164
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllE................


DSSP  lllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhh
Query pvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagll  128
ident                                                             
Sbjct ............................................................  164
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeEEEEEEEE....llllleEEEEEEEEEELllll
Query arkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtEVKMKIGL....kkdgkiAALALEATQAGgaya  184
ident                               |   |                |        
Sbjct .........................arDYHMTTELaatkdgkilaMRCHVLADHGA....  195
DSSP  .........................elLEEEEEEEeellllleeeEEEEEEEELLL....


DSSP  llHHHH...hhHHHHLLL.....lllllLLEEEEEEEELlllllllllllLLLH....hH
Query gyGIIT...ilYTGALMH.....glyhiPAIKHDAWRVYtntppcgamrgHGTV....dT  232
ident                 |                |                 |        
Sbjct ..FDACadpskWPAGFMNictgsydmpvAHLAVDGVYTN........kasGGVAyrcsfR  245
DSSP  ..LLLLlllllLLLLLHHhlllllllllEEEEEEEELLL........lllEELLlllllL


DSSP  HHHHHHHHHHH..............hhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllh
Query RAAFEALLTEM..............geelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygv  278
ident                                                             
Sbjct VTEAVYAIERAietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkam  305
DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeelllll
Query peclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdgg  338
ident                                                             
Sbjct dtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaei  365
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeee


DSSP  eeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhh
Query itlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgn  398
ident                                                             
Sbjct rihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsr  425
DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllll
Query asisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgt  458
ident                                                             
Sbjct stptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawa  485
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhh


DSSP  eeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeell
Query itvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvg  518
ident                                                             
Sbjct synspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrin  545
DSSP  hhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeel
Query kalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviive  578
ident                                                             
Sbjct pmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtps  605
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllll


DSSP  llllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query smdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                           
Sbjct phhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 12: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ..........................................................ll
Query ..........................................................mt    2
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  hhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeELLLLLLLLL...
Query pkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytFAEVNHVHME...   59
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymapLGWEYDSGNYpla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellLLLEELLLLHhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   59
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   59
ident                                                             
Sbjct dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   59
ident                                                             
Sbjct tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh


DSSP  ................................LLEEEEE.....eelllleeEEEELL..
Query ................................LNATLAE.....ydpvrdmlTLNTTT..   80
ident                                   |                         
Sbjct elawasynspppnlepgleavnyydppnmtypFGAYFCImdidvdtgvaktrRFYALDdc  540
DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllllEEEEEEEeeeellllleeeeEEEEEEel


DSSP  ..........lLHHHHHHHHHHHHLL.......................lhHHEEEELLL
Query ..........qVPYYVHLKVAACLQM.......................dsARIRVIKPF  107
ident                      |                                      
Sbjct gtrinpmiiegQVHGGLTEAFAVAMGqeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDY  600
DSSP  lllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLllleellllleelllllllllllllLLLLLEEEE


DSSP  LLL.......lLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllllleeeeee
Query LGG.......gFGARTE.ALHFEIIAGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkm  159
ident                 |            |                              
Sbjct TVTpsphhpigAKGVGEsPHVGGVPCFSNAVNDA..........................  634
DSSP  LLLllllllllLLLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHH..........................


DSSP  eeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllll
Query kiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntp  219
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhh
Query pcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvp  279
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllle
Query eclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggi  339
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhh
Query tlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgna  399
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllle
Query sisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeelll
Query tvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgk  519
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeell
Query alnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviives  579
ident                                                             
Sbjct ............................................................  634
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query mdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                          
Sbjct ............................yaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  ............................hhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 13: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.0

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct .......................................vdpfkamepdapllredikdk   21
DSSP  .......................................llhhhllllllllllhhhlll


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct mtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdmftyhrvhpspletcqcvasmd   81
DSSP  leelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeee


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct kikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavva  141
DSSP  lllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllLEEEEEEELL.....lLLEEEEELL........ll
Query grglgialshfvsgtstpkhwtgepHATVNLKLDF.....dGGITLLTGA........ad  347
ident                                 |                |          
Sbjct sivlgvpvkwvedrmenlsttsfarDYHMTTELAAtkdgkiLAMRCHVLAdhgafdacad  201
DSSP  hhhhllleeeellhhhhhhhlleelLEEEEEEEEEllllleEEEEEEEEEelllllllll


DSSP  LLLLHHHHHHhHHHHhHLLLhHHEEEEELLLllllllllllLLLH...HHHHHHHHHHHH
Query IGQGSNTMASqVAAEvLGVRlSRIRVISADSaltpkdngsySSRV...TFMVGNASISAA  404
ident                                          |  |             | 
Sbjct PSKWPAGFMN.ICTG.SYDM.PVAHLAVDGV.....ytnkaSGGVayrCSFRVTEAVYAI  253
DSSP  LLLLLLLLHH.HLLL.LLLL.LLEEEEEEEE.....lllllLEELlllLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHhhllllhHHEE..EELL...............................
Query EELKGVLVKAAAkkldareEDIE..VIDE...............................  431
ident |     |             |     |                                 
Sbjct ERAIETLAQRLE.......MDSAdlRIKNfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamd  306
DSSP  HHHHHHHHHHHL.......LLHHhhHHHHlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct tvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeir  366
DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  431
ident                                                             
Sbjct ihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrs  426
DSSP  ellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllll


DSSP  ................................eeeellllllleehhhhhhhhhllllle
Query ................................mfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
ident                                                             
Sbjct tptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawas  486
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhh


DSSP  eeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeelll
Query tvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgk  519
ident                                                             
Sbjct ynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinp  546
DSSP  hhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllh


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeell
Query alnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviives  579
ident                                                             
Sbjct miiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsp  606
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeellllll


DSSP  lllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query mdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                          
Sbjct hhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 14: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  ....................................................LLHHHhhl
Query ....................................................MTPKAamk    8
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweyDSGNYpla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleeLLLLHhhh


DSSP  llllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllLEEEEEEEEELLLLL...........Ll
Query agaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeaDLIREKTYTFAEVNH...........Vh   57
ident                                   |     |                   
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreiMGIGISFFTEIVGAGpskncdilgvsM.  359
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeEEEEEEEEELLLLLLllllleelleeL.


DSSP  lllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllll
Query melnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgarte  117
ident                                                             
Sbjct ............................................................  359
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhHHH.............................
Query alhfeiiagllarkakgtvrllqtreetFIA.............................  148
ident                             |                               
Sbjct ............................FDSaeirihptgsviarmgtksqgqghettya  391
DSSP  ............................LEEeeeeellllleeeeellllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  148
ident                                                             
Sbjct qiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaah  451
DSSP  hhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................................................llllLE
Query ......................................................hrgrPW  154
ident                                                             
Sbjct mlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmTY  511
DSSP  hhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllLL


DSSP  EEEEEEEEELL.....LLLEEEEEEEEEEELlllllLHHHHHH.HHHHLLLL........
Query TEVKMKIGLKK.....DGKIAALALEATQAGgayagYGIITIL.YTGALMHG........  200
ident                   |                      |                  
Sbjct PFGAYFCIMDIdvdtgVAKTRRFYALDDCGT....rINPMIIEgQVHGGLTEafavamgq  567
DSSP  LEEEEEEEEEEellllLEEEEEEEEEEELLL....lLLHHHHHhHHHHHHHHhhhhhhll


DSSP  ......................llLLLLEEEEEEEEL.LLLLLLllllllLLHHHHHHHH
Query ......................lyHIPAIKHDAWRVY.TNTPPCgamrghGTVDTRAAFE  237
ident                           |    |         |                  
Sbjct eirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDYTVTPsPHHPIG...akgVGESPHVGGV  624
DSSP  lleellllleelllllllllllllLLLLLEEEELLLLlLLLLLL...lllLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHL......LLHHhHHHHllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlh
Query ALLTEMGEELG......IDSLkIRQInmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgw  291
ident                                                             
Sbjct PCFSNAVNDAYaflnagHIQM.PHDA.............................wrlwk  654
DSSP  HHHHHHHHHHHhlllllLLLL.LLLH.............................hhhhh


DSSP  hhHLLLlllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllll
Query eeRKGKlpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqg  351
ident                                                             
Sbjct vgEQLG......................................................  660
DSSP  hhHHLL......................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query sntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvl  411
ident                                                             
Sbjct ............................................................  660
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhh
Query vkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptef  471
ident                                                             
Sbjct ............................................................  660
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhh
Query qgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtq  531
ident                                                             
Sbjct ............................................................  660
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllll
Query ggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakea  591
ident                                                             
Sbjct ............................................................  660
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query segmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                              
Sbjct ..........................................lhv  663
DSSP  ..........................................lll


No 15: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  .............................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeel
Query .............................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefg   31
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  lhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhh
Query dvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkva   91
ident                                                             
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll


DSSP  hhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhlll
Query aclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrg  151
ident                                                             
Sbjct kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll


DSSP  lleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeee
Query rpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhda  211
ident                                                             
Sbjct rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh


DSSP  eeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllLLLLLEElllll
Query wrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmLPQIPYVtmyaq  271
ident                                                             
Sbjct mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpSKNCDIL.....  355
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllllllLLLLEEL.....


DSSP  EELLLlhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeee
Query RVMSYgvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnl  331
ident  |                                                          
Sbjct GVSMF.......................................................  360
DSSP  LEELL.......................................................


DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllll
Query kldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssr  391
ident                                                             
Sbjct ............................................................  360
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhh
Query vtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvka  451
ident                                                             
Sbjct ............................................................  360
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleEEEEEEEEEEelllllleeeEEE
Query amvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfCYAAQVVEASvdeitgkvtaHKV  511
ident                                        |                   |
Sbjct .....................................DSAEIRIHPT..........GSV  373
DSSP  .....................................EEEEEEELLL..........LLE


DSSP  EEEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllleelleelllllllllllllllllE
Query WVAVDVgKALNPlAVEGQTQGGVWMGMGqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespD  571
ident        |       |           |                               |
Sbjct IARMGT.KSQGQ.GHETTYAQIIATELG...........................ipadD  404
DSSP  EEEELL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL...........................llhhH


DSSP  EEEEEE.........LLLLlllhhhLLLL...LLLLLLLHHHH.................
Query IEVIIV.........ESMDpngpfgAKEA...SEGMLAGFLPA.................  602
ident |                                                           
Sbjct IMIEEGntdtapyglGTYG......SRSTptaGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevheg  458
DSSP  EEEELLlllllllllLLLL......LLLLllhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  .......................................H....................
Query .......................................I....................  603
ident                                                             
Sbjct dlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgLeavnyydppnmtypfgayfc  518
DSSP  heeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllLeeeeeelllllllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  603
ident                                                             
Sbjct imdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvl  578
DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleelllllee


DSSP  ....................................................hhhhhhhh
Query ....................................................heavyeav  611
ident                                                             
Sbjct gasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayafl  638
DSSP  lllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  llllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query gvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                          
Sbjct naghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhlllll


No 16: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  ...............................................llhhhhhllllll
Query ...............................................mtpkaamkagaia   13
ident                                                             
Sbjct ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  lllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEE....el
Query lhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmeLNATLAEY....dp   69
ident                                                     |       
Sbjct igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfarDYHMTTELaatkdg  180
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelLEEEEEEEeellll


DSSP  llleEEEEEL.............llLHHHHhHHHHhhHLLLHHHEEEELlLLLL...lLL
Query vrdmLTLNTT.............tqVPYYVhLKVAacLQMDSARIRVIKpFLGG...gFG  113
ident                                         |                  |
Sbjct kilaMRCHVLadhgafdacadpskwPAGFM.NICT..GSYDMPVAHLAV.DGVYtnkaSG  236
DSSP  leeeEEEEEEeelllllllllllllLLLLH.HHLL..LLLLLLLEEEEE.EEELllllLE


DSSP  LL....lLLLHHHHHHHHHHhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllle
Query AR....tEALHFEIIAGLLArkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgki  169
ident                |   |                                        
Sbjct GVayrcsFRVTEAVYAIERA........................................  256
DSSP  ELlllllLLHHHHHHHHHHH........................................


DSSP  eeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllll
Query aalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgt  229
ident                                                             
Sbjct ............................................................  256
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhh
Query vdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaas  289
ident                                                             
Sbjct ietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlrae  316
DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh


DSSP  lhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllll
Query gweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadig  349
ident                                                             
Sbjct qkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviar  376
DSSP  hhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeee


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query qgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkg  409
ident                                                             
Sbjct mgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatav  436
DSSP  ellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllh
Query vlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcpt  469
ident                                                             
Sbjct aarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlep  496
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhllllllll


DSSP  hhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhh
Query efqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegq  529
ident                                                             
Sbjct gleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgg  556
DSSP  lleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhll
Query tqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgak  589
ident                                                             
Sbjct lteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvg  616
DSSP  hhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeellllllllllllllll


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query easegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                
Sbjct esphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll