No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=74.6

DSSP  LLHHHHHLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEELLHHHHHHLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLL
Query MTPKAAMKAGAIALHDDKPNNILREVHAEFGDVAAAFAEADLIREKTYTFAEVNHVHMEL   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct MTPKAAMKAGAIALHDDKPNNILREVHAEFGDVAAAFAEADLIREKTYTFAEVNHVHMEL   60
DSSP  LLHHHHHLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEELLHHHHHHLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLL


DSSP  LEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLLLLH
Query NATLAEYDPVRDMLTLNTTTQVPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPFLGGGFGARTEALH  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct NATLAEYDPVRDMLTLNTTTQVPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPFLGGGFGARTEALH  120
DSSP  LEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHLLLLLEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL
Query FEIIAGLLARKAKGTVRLLQTREETFIAHRGRPWTEVKMKIGLKKDGKIAALALEATQAG  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct FEIIAGLLARKAKGTVRLLQTREETFIAHRGRPWTEVKMKIGLKKDGKIAALALEATQAG  180
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHLLLLLEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL


DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query GAYAGYGIITILYTGALMHGLYHIPAIKHDAWRVYTNTPPCGAMRGHGTVDTRAAFEALL  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GAYAGYGIITILYTGALMHGLYHIPAIKHDAWRVYTNTPPCGAMRGHGTVDTRAAFEALL  240
DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHLLLLLL
Query TEMGEELGIDSLKIRQINMLPQIPYVTMYAQRVMSYGVPECLEKVKAASGWEERKGKLPK  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct TEMGEELGIDSLKIRQINMLPQIPYVTMYAQRVMSYGVPECLEKVKAASGWEERKGKLPK  300
DSSP  HHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHLLLLLL


DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLHHHHHHHHH
Query GRGLGIALSHFVSGTSTPKHWTGEPHATVNLKLDFDGGITLLTGAADIGQGSNTMASQVA  360
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GRGLGIALSHFVSGTSTPKHWTGEPHATVNLKLDFDGGITLLTGAADIGQGSNTMASQVA  360
DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query AEVLGVRLSRIRVISADSALTPKDNGSYSSRVTFMVGNASISAAEELKGVLVKAAAKKLD  420
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AEVLGVRLSRIRVISADSALTPKDNGSYSSRVTFMVGNASISAAEELKGVLVKAAAKKLD  420
DSSP  HHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHEEEELLEEEELLLLLLLEEHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELLLHHHLLLLLLHHH
Query AREEDIEVIDEMFMVSGSQDPGLSFQEVVKAAMVDSGTITVKGTYTCPTEFQGDKKIRGS  480
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AREEDIEVIDEMFMVSGSQDPGLSFQEVVKAAMVDSGTITVKGTYTCPTEFQGDKKIRGS  480
DSSP  LLHHHEEEELLEEEELLLLLLLEEHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELLLHHHLLLLLLHHH


DSSP  HLLLLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query AIGATMGFCYAAQVVEASVDEITGKVTAHKVWVAVDVGKALNPLAVEGQTQGGVWMGMGQ  540
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AIGATMGFCYAAQVVEASVDEITGKVTAHKVWVAVDVGKALNPLAVEGQTQGGVWMGMGQ  540
DSSP  HLLLLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLLEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLLHHHLLLLLLLLLLLHH
Query ALSEETVYDNGRMVHGNILDYRVPTIVESPDIEVIIVESMDPNGPFGAKEASEGMLAGFL  600
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ALSEETVYDNGRMVHGNILDYRVPTIVESPDIEVIIVESMDPNGPFGAKEASEGMLAGFL  600
DSSP  HHLLLLLEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLLHHHLLLLLLLLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHLL
Query PAIHEAVYEAVGVRATDFPLSPDRITELLDAKEAAA  636
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct PAIHEAVYEAVGVRATDFPLSPDRITELLDAKEAAA  636
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.1

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct ....................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaea   40
DSSP  ....................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhll


DSSP  leeeeeeeeeeellLLLLlllllllLEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHH
Query grglgialshfvsgTSTPkhwtgepHATVNLKLD.FDGGITLLTGAAdigqgSNTMASQV  359
ident                                  |      || |                
Sbjct dlirektytfaevnHVHM......eLNATLAEYDpVRDMLTLNTTTQ.....VPYYVHLK   89
DSSP  leeeeeeeeellllLLLL......lLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELLllllllLLLLLlLLHHhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhl
Query AAEVLGVRLSRIRVISADsaltpkDNGSYsSRVTfmvGNASISAAEELKgvlvkaaakkl  419
ident  |  |     |||||           |      |       | |                
Sbjct VAACLQMDSARIRVIKPF......LGGGF.GART.eaLHFEIIAGLLAR...........  130
DSSP  HHHHHLLLHHHEEEELLL......LLLLL.LLLL.llLHHHHHHHHHHH...........


DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllLEEEEEEELLL...........
Query dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgTITVKGTYTCP...........  468
ident                                         ||    |             
Sbjct ....................................kaKGTVRLLQTREetfiahrgrpw  154
DSSP  ....................................hhLLEEEEELLHHhhhhhllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct tevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrv  214
DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct ytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvm  274
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct sygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkld  334
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct fdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtf  394
DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct mvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamv  454
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  468
ident                                                             
Sbjct dsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwva  514
DSSP  lllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeee


DSSP  ........................................HHHLlllllhhhhlllllle
Query ........................................TEFQgdkkirgsaigatmgf  488
ident                                                             
Sbjct vdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvHGNI................  558
DSSP  eellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelLLLL................


DSSP  eeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle
Query cyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvy  548
ident                                                             
Sbjct ............................................................  558
DSSP  ............................................................


DSSP  elleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhh
Query dngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavy  608
ident                                                             
Sbjct ..........ldyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavy  608
DSSP  ..........lllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query eavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                             
Sbjct eavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhll
Query ....................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaea   40
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  leeeeeeeeellllLLLL......lLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHH
Query dlirektytfaevnHVHM......eLNATLAEYDpVRDMLTLNTTTQ.....VPYYVHLK   89
ident                                  |      || |                
Sbjct grglgialshfvsgTSTPkhwtgepHATVNLKLD.FDGGITLLTGAAdigqgSNTMASQV  359
DSSP  leeeeeeeeeeellLLLLlllllllLEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHEEEELLL......LLLLL.LLLL.llLHHHHHHHHHHH...........
Query VAACLQMDSARIRVIKPF......LGGGF.GART.eaLHFEIIAGLLAR...........  130
ident  |  |     |||||           |      |       | |                
Sbjct AAEVLGVRLSRIRVISADsaltpkDNGSYsSRVTfmvGNASISAAEELKgvlvkaaakkl  419
DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELLllllllLLLLLlLLHHhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhl


DSSP  ....................................hhLLEEEEELLHHhhhhhllllle
Query ....................................kaKGTVRLLQTREetfiahrgrpw  154
ident                                         ||    |             
Sbjct dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgTITVKGTYTCP...........  468
DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllLEEEEEEELLL...........


DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeee
Query tevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrv  214
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleel
Query ytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvm  274
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeel
Query sygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkld  334
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhh
Query fdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtf  394
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhl
Query mvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamv  454
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeee
Query dsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwva  514
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelLLLL................
Query vdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvHGNI................  558
ident                                                             
Sbjct ........................................TEFQgdkkirgsaigatmgf  488
DSSP  ........................................HHHLlllllhhhhlllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  558
ident                                                             
Sbjct cyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvy  548
DSSP  eeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllle


DSSP  ..........lllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhh
Query ..........ldyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavy  608
ident                                                             
Sbjct dngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavy  608
DSSP  elleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query eavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                             
Sbjct eavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.8

DSSP  .llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeelllllllll
Query .mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhme   59
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  lleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllll
Query lnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgarteal  119
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeee
Query hfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqa  179
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhh
Query ggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeal  239
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllll
Query ltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklp  299
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  lleeeeeeeeeeellllllLLLLLL.lLEEEEEEEllllLEEEEELL....llLLLL..H
Query kgrglgialshfvsgtstpKHWTGE.pHATVNLKLdfdgGITLLTGA....adIGQG..S  352
ident                                 |                     |     
Sbjct grglgialshfvsgtstpkHWTGEPhaTVNLKLDF....DGGITLLTgaadigQGSNtmA  356
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllLLLLLLleEEEEEELL....LLLEEEEEllllllLLHHhhH


DSSP  HHHHHHHHHHhhlllHHHEeEEELLLLlllLLLL......lllLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query NTMASQVAAEvlgvrLSRIrVISADSAltpKDNG......sysSRVTFMVGNASISAAEE  406
ident    |  |                                      |      |       
Sbjct SQVAAEVLGV.....RLSR.IRVISADsalTPKDngsyssrvtFMVGNASISAAEELKGV  410
DSSP  HHHHHHHHLL.....LHHH.EEEEELLlllLLLLlllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhllllHHHEEEEL..LEEEELlllLLLEEHhhhhhhhhllLLLEEEEEE
Query LKGVLVKAAAkkldarEEDIEVID..EMFMVSgsqDPGLSFqevvkaamvdSGTITVKGT  464
ident |     |          |                                     |    
Sbjct LVKAAAKKLD.....aREEDIEVIdeMFMVSG..sQDPGLS.fqevvkaamVDSGTITVK  462
DSSP  HHHHHHHHLL.....lLHHHEEEEllEEEELL..lLLLLEE.hhhhhhhhhLLLLLEEEE


DSSP  ELLLHHhllllllhhhHLLL............llleeeeeeeeeeeelllllleeeeeee
Query YTCPTEfqgdkkirgsAIGA............tmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvw  512
ident  |                                                          
Sbjct GTYTCP..........TEFQgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvw  512
DSSP  EEELLL..........HHHLlllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeee


DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllllllllllllllee
Query vavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdi  572
ident                                                             
Sbjct vavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdi  572
DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllllllllllllllee


DSSP  eeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhh
Query eviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldak  632
ident                                                             
Sbjct eviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldak  632
DSSP  eeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhll
Query eaaa  636
ident     
Sbjct eaaa  636
DSSP  hhll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.8

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct .mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhme   59
DSSP  .llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeelllllllll


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct lnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgarteal  119
DSSP  lleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct hfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqa  179
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeee


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeal  239
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct ltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklp  299
DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllll


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllLLLLLLleEEEEEELL....LLLEEEEEllllllLLHHhhH
Query grglgialshfvsgtstpkHWTGEPhaTVNLKLDF....DGGITLLTgaadigQGSNtmA  356
ident                                 |                     |     
Sbjct kgrglgialshfvsgtstpKHWTGE.pHATVNLKLdfdgGITLLTGA....adIGQG..S  352
DSSP  lleeeeeeeeeeellllllLLLLLL.lLEEEEEEEllllLEEEEELL....llLLLL..H


DSSP  HHHHHHHHLL.....LHHH.EEEEELLlllLLLLlllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query SQVAAEVLGV.....RLSR.IRVISADsalTPKDngsyssrvtFMVGNASISAAEELKGV  410
ident    |  |                                      |      |       
Sbjct NTMASQVAAEvlgvrLSRIrVISADSAltpKDNG......sysSRVTFMVGNASISAAEE  406
DSSP  HHHHHHHHHHhhlllHHHEeEEELLLLlllLLLL......lllLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLL.....lLHHHEEEEllEEEELL..lLLLLEE.hhhhhhhhhLLLLLEEEE
Query LVKAAAKKLD.....aREEDIEVIdeMFMVSG..sQDPGLS.fqevvkaamVDSGTITVK  462
ident |     |          |                                     |    
Sbjct LKGVLVKAAAkkldarEEDIEVID..EMFMVSgsqDPGLSFqevvkaamvdSGTITVKGT  464
DSSP  HHHHHHHHHHhhllllHHHEEEEL..LEEEELlllLLLEEHhhhhhhhhllLLLEEEEEE


DSSP  EEELLL..........HHHLlllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeee
Query GTYTCP..........TEFQgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvw  512
ident  |                                                          
Sbjct YTCPTEfqgdkkirgsAIGA............tmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvw  512
DSSP  ELLLHHhllllllhhhHLLL............llleeeeeeeeeeeelllllleeeeeee


DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllllllllllllllee
Query vavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdi  572
ident                                                             
Sbjct vavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdi  572
DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllllllllllllllee


DSSP  eeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhh
Query eviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldak  632
ident                                                             
Sbjct eviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldak  632
DSSP  eeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhll
Query eaaa  636
ident     
Sbjct eaaa  636
DSSP  hhll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.7

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleeLLLL............hhhhhhhhhhh
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvMSYG............vpeclekvkaa  288
ident                                  |                          
Sbjct .................................MTPKaamkagaialhddkpnnilrevh   27
DSSP  .................................LLHHhhhlllllllllllllleeeeee


DSSP  hlhhhhlllllllEEEEEEEEEEELLLLLLLllllllleeeeeeellLLLEEEEELllll
Query sgweerkgklpkgRGLGIALSHFVSGTSTPKhwtgephatvnlkldfDGGITLLTGaadi  348
ident                       |                               |     
Sbjct aefgdvaaafaeaDLIREKTYTFAEVNHVHM..elnatlaeydpvrdMLTLNTTTQ....   81
DSSP  eeellhhhhhhllLEEEEEEEEELLLLLLLL..llleeeeeeellllEEEEEELLL....


DSSP  lllhhhhhhhhhhhHHLLlhhheeeeellllLLLLLLLLllllhhhhhhhhHHHHHHHHH
Query gqgsntmasqvaaeVLGVrlsrirvisadsaLTPKDNGSyssrvtfmvgnaSISAAEELK  408
ident                                                             
Sbjct .......vpyyvhlKVAAclqmdsarirvikPFLGGGFG........arteALHFEIIAG  126
DSSP  .......lhhhhhhHHHHhhlllhhheeeelLLLLLLLL........llllLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllLLEE...eeeEE
Query GVLVKAAakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsGTIT...vkgTY  465
ident     ||                                          ||          
Sbjct LLARKAK.........................................GTVRllqtreET  145
DSSP  HHHHHHL.........................................LEEEeellhhHH


DSSP  LLlhhhllllllhhhhlllllLEEEEEEEEEEEELlllllEEEEEEEEEEELLL....lL
Query TCptefqgdkkirgsaigatmGFCYAAQVVEASVDeitgkVTAHKVWVAVDVGK....aL  521
ident                                   |                         
Sbjct FI..............ahrgrPWTEVKMKIGLKKD.....GKIAALALEATQAGgayagY  186
DSSP  HH..............hllllLEEEEEEEEEELLL.....LLEEEEEEEEEEELlllllL


DSSP  LHHHHHhHHHHHHHHhhhhhhllllleelleellllllllllllllLLLEEEEEEELLLL
Query NPLAVEgQTQGGVWMgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivESPDIEVIIVESMD  581
ident         |                                       | |         
Sbjct GIITIL.YTGALMHG.............................lyHIPAIKHDAWRVYT  216
DSSP  HHHHHH.HHHHLLLL.............................llLLLLEEEEEEEELL


DSSP  LLLH..hhlllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHhLLLLLEeLLLH.................
Query PNGP..fgakeASEGMLAGFLPAIHEAVYEAvGVRATDfPLSP.................  622
ident    |             | |     |   |  |                           
Sbjct NTPPcgamrghGTVDTRAAFEALLTEMGEEL.GIDSLK.IRQInmlpqipyvtmyaqrvm  274
DSSP  LLLLlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLHHH.HHHHllllllleellllleel


DSSP  ............hhhhhhhhHHHHL...................................
Query ............dritelldAKEAA...................................  635
ident                                                             
Sbjct sygvpeclekvkaasgweerKGKLPkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkld  334
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlhhhhLLLLLlleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  635
ident                                                             
Sbjct fdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtf  394
DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  635
ident                                                             
Sbjct mvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamv  454
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  635
ident                                                             
Sbjct dsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwva  514
DSSP  lllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  635
ident                                                             
Sbjct vdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdiev  574
DSSP  eellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  635
ident                                                             
Sbjct iivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakea  634
DSSP  eeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .l
Query .a  636
ident   
Sbjct aa  636
DSSP  ll


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.7

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .................................LLHHhhhlllllllllllllleeeeee
Query .................................MTPKaamkagaialhddkpnnilrevh   27
ident                                  |                          
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvMSYG............vpeclekvkaa  288
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleeLLLL............hhhhhhhhhhh


DSSP  eeellhhhhhhllLEEEEEEEEELLLLLLLL..llleeeeeeellllEEEEEELLL....
Query aefgdvaaafaeaDLIREKTYTFAEVNHVHM..elnatlaeydpvrdMLTLNTTTQ....   81
ident                       |                               |     
Sbjct sgweerkgklpkgRGLGIALSHFVSGTSTPKhwtgephatvnlkldfDGGITLLTGaadi  348
DSSP  hlhhhhlllllllEEEEEEEEEEELLLLLLLllllllleeeeeeellLLLEEEEELllll


DSSP  .......lhhhhhhHHHHhhlllhhheeeelLLLLLLLL........llllLLHHHHHHH
Query .......vpyyvhlKVAAclqmdsarirvikPFLGGGFG........arteALHFEIIAG  126
ident                                                             
Sbjct gqgsntmasqvaaeVLGVrlsrirvisadsaLTPKDNGSyssrvtfmvgnaSISAAEELK  408
DSSP  lllhhhhhhhhhhhHHLLlhhheeeeellllLLLLLLLLllllhhhhhhhhHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHL.........................................LEEEeellhhHH
Query LLARKAK.........................................GTVRllqtreET  145
ident     ||                                          ||          
Sbjct GVLVKAAakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsGTIT...vkgTY  465
DSSP  HHHHHHHhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllLLEE...eeeEE


DSSP  HH..............hllllLEEEEEEEEEELLL.....LLEEEEEEEEEEELlllllL
Query FI..............ahrgrPWTEVKMKIGLKKD.....GKIAALALEATQAGgayagY  186
ident                                   |                         
Sbjct TCptefqgdkkirgsaigatmGFCYAAQVVEASVDeitgkVTAHKVWVAVDVGK....aL  521
DSSP  LLlhhhllllllhhhhlllllLEEEEEEEEEEEELlllllEEEEEEEEEEELLL....lL


DSSP  HHHHHH.HHHHLLLL.............................llLLLLEEEEEEEELL
Query GIITIL.YTGALMHG.............................lyHIPAIKHDAWRVYT  216
ident         |                                       | |         
Sbjct NPLAVEgQTQGGVWMgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivESPDIEVIIVESMD  581
DSSP  LHHHHHhHHHHHHHHhhhhhhllllleelleellllllllllllllLLLEEEEEEELLLL


DSSP  LLLLlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLHHH.HHHHllllllleellllleel
Query NTPPcgamrghGTVDTRAAFEALLTEMGEEL.GIDSLK.IRQInmlpqipyvtmyaqrvm  274
ident    |             | |     |   |  |                           
Sbjct PNGP..fgakeASEGMLAGFLPAIHEAVYEAvGVRATDfPLSP.................  622
DSSP  LLLH..hhlllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHhLLLLLEeLLLH.................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlhhhhLLLLLlleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeel
Query sygvpeclekvkaasgweerKGKLPkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkld  334
ident                                                             
Sbjct ............dritelldAKEAA...................................  635
DSSP  ............hhhhhhhhHHHHL...................................


DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhh
Query fdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtf  394
ident                                                             
Sbjct ............................................................  635
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhl
Query mvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamv  454
ident                                                             
Sbjct ............................................................  635
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeee
Query dsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwva  514
ident                                                             
Sbjct ............................................................  635
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeee
Query vdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdiev  574
ident                                                             
Sbjct ............................................................  635
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhh
Query iivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakea  634
ident                                                             
Sbjct ............................................................  635
DSSP  ............................................................


DSSP  ll
Query aa  636
ident   
Sbjct .a  636
DSSP  .l


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................................LLHHhhhlllllllllllllle
Query ......................................MTPKaamkagaialhddkpnni   22
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvPECL..................  282
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhHHHH..................


DSSP  eeeeeeeellhhhhhhlllEEEEEEEEELLLL............................
Query lrevhaefgdvaaafaeadLIREKTYTFAEVN............................   54
ident                      |                                      
Sbjct ..ekvkaasgweerkgklpKGRGLGIALSHFVsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggit  340
DSSP  ..hhhhhhhlhhhhlllllLLEEEEEEEEEEElllllllllllllleeeeeeelllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   54
ident                                                             
Sbjct lltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnas  400
DSSP  eeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   54
ident                                                             
Sbjct isaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtit  460
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllllee


DSSP  ......................LLllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhh
Query ......................HVhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaa   92
ident                                                             
Sbjct vkgtytcptefqgdkkirgsaiGA....................................  484
DSSP  eeeeelllhhhllllllhhhhlLL....................................


DSSP  hhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhHHHllLL
Query clqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetFIAhrGR  152
ident                                                             
Sbjct .....................................................TMG..FC  489
DSSP  .....................................................LLL..EE


DSSP  LEEEEEEEEEELlLLLEeEEEEEEEEELLLLLL...LHHHHHH.HHHHLLL..LLLL...
Query PWTEVKMKIGLKkDGKIaALALEATQAGGAYAG...YGIITIL.YTGALMH..GLYH...  203
ident     |                          |                 |          
Sbjct YAAQVVEASVDE.ITGKvTAHKVWVAVDVGKALnplAVEGQTQgGVWMGMGqaLSEEtvy  548
DSSP  EEEEEEEEEELL.LLLLeEEEEEEEEEELLLLLlhhHHHHHHHhHHHHHHHhhHLLLlle


DSSP  .................lLLEEEEEEEELLLL.......LLLLLLlllLLHHHHHHHHHH
Query .................iPAIKHDAWRVYTNT.......PPCGAMrghGTVDTRAAFEAL  239
ident                                                        |    
Sbjct dngrmvhgnildyrvptiVESPDIEVIIVESMdpngpfgAKEASE..gMLAGFLPAIHEA  606
DSSP  elleelllllllllllllLLLLEEEEEEELLLllllhhhLLLLLL..lLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllll
Query LTEMGEElgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklp  299
ident   |                                                         
Sbjct VYEAVGV.....................................................  613
DSSP  HHHHHLL.....................................................


DSSP  lleeeeEEEEeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhh
Query kgrglgIALShfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqv  359
ident                                                             
Sbjct ....raTDFP..................................................  619
DSSP  ....llLEEL..................................................


DSSP  hhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query aaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkl  419
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhh
Query dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirg  479
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query saigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmg  539
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllh
Query qalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagf  599
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query lpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                      
Sbjct ....................lspdritelldakeaaa  636
DSSP  ....................llhhhhhhhhhhhhhll


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhHHHH..................
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvPECL..................  282
ident                                                             
Sbjct ......................................MTPKaamkagaialhddkpnni   22
DSSP  ......................................LLHHhhhlllllllllllllle


DSSP  ..hhhhhhhlhhhhlllllLLEEEEEEEEEEElllllllllllllleeeeeeelllllee
Query ..ekvkaasgweerkgklpKGRGLGIALSHFVsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggit  340
ident                      |                                      
Sbjct lrevhaefgdvaaafaeadLIREKTYTFAEVN............................   54
DSSP  eeeeeeeellhhhhhhlllEEEEEEEEELLLL............................


DSSP  eeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhh
Query lltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnas  400
ident                                                             
Sbjct ............................................................   54
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllllee
Query isaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtit  460
ident                                                             
Sbjct ............................................................   54
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeelllhhhllllllhhhhlLL....................................
Query vkgtytcptefqgdkkirgsaiGA....................................  484
ident                                                             
Sbjct ......................HVhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaa   92
DSSP  ......................LLllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhh


DSSP  .....................................................LLL..EE
Query .....................................................TMG..FC  489
ident                                                             
Sbjct clqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetFIAhrGR  152
DSSP  hhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhHHHllLL


DSSP  EEEEEEEEEELL.LLLLeEEEEEEEEEELLLLLlhhHHHHHHHhHHHHHHHhhHLLLlle
Query YAAQVVEASVDE.ITGKvTAHKVWVAVDVGKALnplAVEGQTQgGVWMGMGqaLSEEtvy  548
ident     |                          |                 |          
Sbjct PWTEVKMKIGLKkDGKIaALALEATQAGGAYAG...YGIITIL.YTGALMH..GLYH...  203
DSSP  LEEEEEEEEEELlLLLEeEEEEEEEEELLLLLL...LHHHHHH.HHHHLLL..LLLL...


DSSP  elleelllllllllllllLLLLEEEEEEELLLllllhhhLLLLLL..lLLLLHHHHHHHH
Query dngrmvhgnildyrvptiVESPDIEVIIVESMdpngpfgAKEASE..gMLAGFLPAIHEA  606
ident                                                        |    
Sbjct .................iPAIKHDAWRVYTNT.......PPCGAMrghGTVDTRAAFEAL  239
DSSP  .................lLLEEEEEEEELLLL.......LLLLLLlllLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLL.....................................................
Query VYEAVGV.....................................................  613
ident   |                                                         
Sbjct LTEMGEElgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklp  299
DSSP  HHHHHHHhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllll


DSSP  ....llLEEL..................................................
Query ....raTDFP..................................................  619
ident                                                             
Sbjct kgrglgIALShfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqv  359
DSSP  lleeeeEEEEeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  619
ident                                                             
Sbjct aaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkl  419
DSSP  hhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  619
ident                                                             
Sbjct dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirg  479
DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  619
ident                                                             
Sbjct saigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmg  539
DSSP  hhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  619
ident                                                             
Sbjct qalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagf  599
DSSP  hhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllh


DSSP  ....................llhhhhhhhhhhhhhll
Query ....................lspdritelldakeaaa  636
ident                                      
Sbjct lpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ....................................llhhhhhlllllllllllllleee
Query ....................................mtpkaamkagaialhddkpnnilr   24
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllLLLLL.......................
Query evhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvHMELN.......................   61
ident                                  |                          
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrVMSYGvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleELLLLhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   61
ident                                                             
Sbjct grglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqva  360
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   61
ident                                                             
Sbjct aevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkld  420
DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   61
ident                                                             
Sbjct areedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgs  480
DSSP  llhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhh


DSSP  .........EEEEEEELL.........lLEEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.
Query .........ATLAEYDPV.........rDMLTLNTTT.......qVPYYVHLKVAACLQ.   95
ident                                              |       |      
Sbjct aigatmgfcYAAQVVEASvdeitgkvtaHKVWVAVDVgkalnplaVEGQTQGGVWMGMGq  540
DSSP  hlllllleeEEEEEEEEEelllllleeeEEEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  ..........................llHHHEEEELLlLLLL.....LLLLlLLLHhHHH
Query ..........................mdSARIRVIKPfLGGG.....FGARtEALHfEII  124
ident                             |  | ||                         
Sbjct alseetvydngrmvhgnildyrvptiveSPDIEVIIV.ESMDpngpfGAKE.ASEG.MLA  597
DSSP  hhllllleelleelllllllllllllllLLEEEEEEE.LLLLlllhhHLLL.LLLL.LLL


DSSP  HHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllll
Query AGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggaya  184
ident   | |                                                       
Sbjct GFLPAIHEA...................................................  606
DSSP  LHHHHHHHH...................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query gygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemg  244
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleee
Query eelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrgl  304
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query gialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevl  364
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhh
Query gvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldaree  424
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  heeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlll
Query dievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaiga  484
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalse  544
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  llleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhh
Query etvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaih  604
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query eavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                 
Sbjct ..vyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  ..hhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 11: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ....................................mtpkaamkagaialhddkpnnilr   24
DSSP  ....................................llhhhhhlllllllllllllleee


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleELLLLhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrVMSYGvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                  |                          
Sbjct evhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvHMELN.......................   61
DSSP  eeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllLLLLL.......................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh
Query grglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqva  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   61
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkld  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   61
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhh
Query areedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgs  480
ident                                                             
Sbjct ............................................................   61
DSSP  ............................................................


DSSP  hlllllleeEEEEEEEEEelllllleeeEEEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHh
Query aigatmgfcYAAQVVEASvdeitgkvtaHKVWVAVDVgkalnplaVEGQTQGGVWMGMGq  540
ident                                              |       |      
Sbjct .........ATLAEYDPV.........rDMLTLNTTT.......qVPYYVHLKVAACLQ.   95
DSSP  .........EEEEEEELL.........lLEEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  hhllllleelleelllllllllllllllLLEEEEEEE.LLLLlllhhHLLL.LLLL.LLL
Query alseetvydngrmvhgnildyrvptiveSPDIEVIIV.ESMDpngpfGAKE.ASEG.MLA  597
ident                             |  | ||                         
Sbjct ..........................mdSARIRVIKPfLGGG.....FGARtEALHfEII  124
DSSP  ..........................llHHHEEEELLlLLLL.....LLLLlLLLHhHHH


DSSP  LHHHHHHHH...................................................
Query GFLPAIHEA...................................................  606
ident   | |                                                       
Sbjct AGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggaya  184
DSSP  HHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct gygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemg  244
DSSP  llhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct eelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrgl  304
DSSP  hhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct gialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevl  364
DSSP  eeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct gvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldaree  424
DSSP  lllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct dievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaiga  484
DSSP  heeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct tmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalse  544
DSSP  llleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct etvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaih  604
DSSP  llleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhh


DSSP  ..hhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query ..vyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                 
Sbjct eavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 12: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  .......................................................llhhh
Query .......................................................mtpka    5
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  hhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeee
Query amkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatla   65
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  eeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhh
Query eydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiia  125
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  hhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll
Query gllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayag  185
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemge  245
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  hhlllhhhhhhhllllLLLEELlllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeee
Query elgidslkirqinmlpQIPYVTmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglg  305
ident                      |                                      
Sbjct grglgialshfvsgtsTPKHWT......................................  322
DSSP  leeeeeeeeeeellllLLLLLL......................................


DSSP  eeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhl
Query ialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlg  365
ident                                                             
Sbjct ............................................................  322
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh
Query vrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareed  425
ident                                                             
Sbjct ............................................................  322
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhllll
Query ievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigat  485
ident                                                             
Sbjct ...........................................................g  323
DSSP  ...........................................................l


DSSP  llEEEEEEEEEEeelllllleeeEEEEEEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlll
Query mgFCYAAQVVEAsvdeitgkvtaHKVWVAVDVgKALNPlAVEGQTQGGVWMGMGqalsee  545
ident                                                      |      
Sbjct epHATVNLKLDF..........dGGITLLTGA.ADIGQ.GSNTMASQVAAEVLG......  365
DSSP  llLEEEEEEELL..........lLLEEEEELL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL......


DSSP  lleelleellllllllllllllllLEEEEEEE........lLLLLllhhhLLLL...LLL
Query tvydngrmvhgnildyrvptivesPDIEVIIV........eSMDPngpfgAKEA...SEG  594
ident                           | ||                              
Sbjct .....................vrlSRIRVISAdsaltpkdnGSYS.....SRVTfmvGNA  399
DSSP  .....................llhHHEEEEELlllllllllLLLL.....LLHHhhhHHH


DSSP  LLLLHHHHH...................................................
Query MLAGFLPAI...................................................  603
ident                                                             
Sbjct SISAAEELKgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
DSSP  HHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  603
ident                                                             
Sbjct tvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgk  519
DSSP  eeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  603
ident                                                             
Sbjct alnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviives  579
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeell


DSSP  ........................hhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query ........................heavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                          
Sbjct mdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 13: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct .......................................................mtpka    5
DSSP  .......................................................llhhh


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct amkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatla   65
DSSP  hhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeee


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct eydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiia  125
DSSP  eeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct gllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayag  185
DSSP  hhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct ygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemge  245
DSSP  lhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeeellllLLLLLL......................................
Query grglgialshfvsgtsTPKHWT......................................  322
ident                      |                                      
Sbjct elgidslkirqinmlpQIPYVTmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglg  305
DSSP  hhlllhhhhhhhllllLLLEELlllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct ialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlg  365
DSSP  eeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct vrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareed  425
DSSP  llhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................g  323
ident                                                             
Sbjct ievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigat  485
DSSP  eeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhllll


DSSP  llLEEEEEEELL..........lLLEEEEELL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL......
Query epHATVNLKLDF..........dGGITLLTGA.ADIGQ.GSNTMASQVAAEVLG......  365
ident                                                      |      
Sbjct mgFCYAAQVVEAsvdeitgkvtaHKVWVAVDVgKALNPlAVEGQTQGGVWMGMGqalsee  545
DSSP  llEEEEEEEEEEeelllllleeeEEEEEEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlll


DSSP  .....................llhHHEEEEELlllllllllLLLL.....LLHHhhhHHH
Query .....................vrlSRIRVISAdsaltpkdnGSYS.....SRVTfmvGNA  399
ident                           | ||                              
Sbjct tvydngrmvhgnildyrvptivesPDIEVIIV........eSMDPngpfgAKEA...SEG  594
DSSP  lleelleellllllllllllllllLEEEEEEE........lLLLLllhhhLLLL...LLL


DSSP  HHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllle
Query SISAAEELKgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
ident                                                             
Sbjct MLAGFLPAI...................................................  603
DSSP  LLLLHHHHH...................................................


DSSP  eeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeelll
Query tvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgk  519
ident                                                             
Sbjct ............................................................  603
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeell
Query alnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviives  579
ident                                                             
Sbjct ............................................................  603
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query mdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                                          
Sbjct ........................heavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  ........................hhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll