No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=44.3

DSSP  lllhhhhhhllleeEEEEEEEELLHHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLeeeeeel
Query iitiedaiknnsfyGSELKIEKGDLKKGFSEADNVVSGELYIGGQDHFYLETHctiaipk   60
ident                |        |   |     || |    |       ||        
Sbjct ..............VSRTSRARDELAPIFASSAGVVRGQFSCGRVSACPMETR.gavaqy   45
DSSP  ..............LEEEEEEELLLHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLL.eeeeee


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcl  105
DSSP  elllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  hhhhhllleeeELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEEELLLL..
Query aayktghpvrcMLDRNEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGTIVALEVDHYSNAGNSRD..  178
ident              || |  |               |   |   |||       |      
Sbjct lsralgrpvrwIEDRQENFLGATHAKQQRNEMGLAFDGDGRFLALENRSITDGGAYNNlp  165
DSSP  hhhhhllleeeELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLll


DSSP  .LHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .LSHSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLSSNTAFRGFGGPQALFIAENWMSEVA  237
ident                  || |          ||     | || |        |      |
Sbjct wTQLVESHVGNAVILGVYKVPAVSEESIAVATNKCPIGAYRGVGFTAGQIARETLIDRAA  225
DSSP  lLHHHLHHHHHHLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLHHHHHHHHLLL...LLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHH
Query VTCGLPAEEVRWKNMYK...EGDLTHFNQRLEGFSVPRCWDECLKSSQYYARKSEVDKFN  294
ident    ||   | |  |              |                     |         
Sbjct RQLGLSPFEIRRRNVVMpedFPFTNRLGQTHREGTYLQTINLLEEMVNPEAFRQRQAEAR  285
DSSP  HHHLLLHHHHHHLLLLLhhhLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLllEEEEEEEEEEEEEEllllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhh
Query KENcwKKRGLCIIPTKFGIsftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvq  354
ident      |  ||                                                  
Sbjct ARG..KYLGLGVSVFNEVT.........................................  302
DSSP  LLL..EEEEEEEEEEEEEE.........................................


DSSP  hhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query vaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkkn  414
ident                                                             
Sbjct ............................................................  302
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllLLLL..................
Query pdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsGNAF..................  456
ident                                                             
Sbjct ...................................gtgTRTLsflgtpttthdsatvrid  327
DSSP  ...................................lllHHHHhhllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  456
ident                                                             
Sbjct ptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavi  387
DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  456
ident                                                             
Sbjct gagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfa  447
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhl


DSSP  ......................LEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLH
Query ......................HYFTYGVACSEVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNP  494
ident                            |     ||||  |          | | |   ||
Sbjct dathppgfdatleatatydpsdLVLANGGHAAIVEIDASTYATRVTDFFAVEDCGTMINP  507
DSSP  hhhllllllllleeeeelllllLEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLlEEEEEELLlLL
Query AIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPtEFRVSLLRdCP  554
ident  |  ||  |   |  |   |||  |   | | |     | ||     |   |   |   |
Sbjct MIVEGQIRGGIAQAIGQTLLEEVIYDDFGQLVTTTLMDYLIPTTLDVP.DIRIRHLE.TP  565
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL.LEEEEELL.LL


DSSP  LLLLHHHLLLLLLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHhhhhlllllllLLLL.LLLLLHHHHH
Query NKKAIYASKAVGEPPLFLGA.SVFFAIKDAIRAAraqhtnnntkeLFRL.DSPATPEKIR  612
ident         |  ||         |  |  ||                      | ||| | 
Sbjct SPLVPGGIKGMGESAMISAPaAVVAAVNDALAHL...........EVVIeTVPITPERIF  614
DSSP  LLLLHHHLLLLLLHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHH...........LLLLlEELLLHHHHH


DSSP  HHLLLlllllllllllllllllllll
Query NACVDkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                           
Sbjct RSIQE...................rp  621
DSSP  HHHHL...................ll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=22.3

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEEL
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethCTIAIPK   60
ident                                                         |   
Sbjct ..............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrGAVAQYE   46
DSSP  ..............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEEE


DSSP  LLLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLlLHHHHHHHHH
Query GEEGEMELFVSTQNAMKTQSFVAKMLGVPVNRILVRVKRMGGGFGGKETrSTLVSVAVAL  120
ident        |   ||        ||     |   | |||   ||||| |          | |
Sbjct WTTQQLILWTATQMPSFVRTMVAMFCAIPEHLIEVRVPDVGGGFGQKAH.LHPEELLVCL  105
DSSP  LLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLL.LLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLEEE.....ellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeel
Query AAYKTGHPVRC.....mldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagn  175
ident      | |||                                                  
Sbjct LSRALGRPVRWiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlp  165
DSSP  HHHHHLLLEEEellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllll


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query srdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmse  235
ident                                                             
Sbjct wtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraa  225
DSSP  llhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query vavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnk  295
ident                                                             
Sbjct rqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaear  285
DSSP  hhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh


DSSP  hllleeeeeeeeeeeeeeLLLLH.......HHLEEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLH
Query encwkkrglciiptkfgiSFTVP.......FLNQAGALIHVYTDGSVLVSHGGTEMGQGL  348
ident                     |               |       | | |       ||| 
Sbjct argkylglgvsvfnevtgTGTRTlsflgtpTTTHDSATVRIDPTGKVTVTTSLASSGQGH  345
DSSP  llleeeeeeeeeeeeeelLLHHHhhhllllLLLLLEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLHHHEELLLEELLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query HTKMVQVASKALKIPISKIYISETSTNTVPnSSPTAASVSTDIYGQAVYEACQTILKRLE  408
ident  |   | |   |  | |   |   ||          ||    |       |      |  
Sbjct ETTLAQIAADVLGVPASDVVIQAGSTKNTY.GFGAYASRGAVIGAGSIGRAASIVRERVK  404
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLL......................LLLHHHHHHHHHHLL........LLLEEEEE
Query PFKKKNP......................DGSWEDWVMAAYQDR........VSLSTTGF  438
ident                                     | |||             |  |  
Sbjct QLAGHLLeaasediviedglvhvagvpakGMPFAEVVGAAYFADathppgfdATLEATAT  464
DSSP  HHHHHHHlllhhheeeelleeeelleeeeEEEHHHHHHHHHHLHhhllllllLLLEEEEE


DSSP  EELLLLllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhh
Query YRTPNLgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidi  498
ident |    |                                                      
Sbjct YDPSDL...........................................vlangghaaiv  481
DSSP  LLLLLL...........................................eeeeeeeeeee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllllll
Query gqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkka  558
ident                                                             
Sbjct eidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtt  541
DSSP  eeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  hhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllll
Query iyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdk  618
ident                                                             
Sbjct tlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlev  601
DSSP  llllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  llllllllllllllllllll
Query fttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                     
Sbjct vietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  llleelllhhhhhhhhhlll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=13.0

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeEEEEELLhhhhhHHLL.........eeEEEEEEELLLLLLlll
Query iitiedaiknnsfygseLKIEKGDlkkgfSEAD.........nvVSGELYIGGQDHFyle   51
ident                               |                             
Sbjct .................VSRTSRA....rDELApifassagvvrGQFSCGRVSACPM...   36
DSSP  .................LEEEEEE....eLLLHhhhhhlleeeeEEEEELLLLLLLL...


DSSP  lleeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllll
Query thctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrs  111
ident                                                             
Sbjct ............................................................   36
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhHHHH..............................
Query tlvsvavalaayktghpvrcmldrneDMLI..............................  141
ident                                                             
Sbjct ..........................ETRGavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvam   70
DSSP  ..........................LLLEeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhh


DSSP  ......................................................lllllL
Query ......................................................tggrhP  147
ident                                                             
Sbjct fcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathA  130
DSSP  hhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllL


DSSP  EEEEEEEEELLL.....LLEE.....................................EE
Query FLARYKVGFMKT.....GTIV.....................................AL  165
ident    |   |                                                    
Sbjct KQQRNEMGLAFDgdgrfLALEnrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavSE  190
DSSP  LLEEEEEEEEELlllleEEEEeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeEE


DSSP  EEEeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeEEEEEELllllllllllLLHHHH
Query EVDhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgTGRLCKTnlssntafrgFGGPQA  225
ident |                                         |                 
Sbjct ESI..................................AVATNKC.......pigAYRGVG  209
DSSP  EEE..................................EELLLLL.......lllLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHH........hhlllHHHHHHhhllLLLLLLLllllLLLLLHhhHHHHH
Query LFIAENWMSEVAV........tcglpAEEVRWknmyKEGDLTHfnqrLEGFSVprCWDEC  277
ident                                                             
Sbjct FTAGQIARETLIDraarqlglspfeiRRRNVVmpedFPFTNRL...gQTHREG..TYLQT  264
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhHHLLLLlhhhLLEELLL...lLEELLL..LHHHH


DSSP  HHHLLHHHHHHHHHHHHHHLL....LEEEEEEEEEEEEEEllllhhhleeeeeeeellll
Query LKSSQYYARKSEVDKFNKENC....WKKRGLCIIPTKFGIsftvpflnqagalihvytdg  333
ident                   |          |        |                     
Sbjct INLLEEMVNPEAFRQRQAEARargkYLGLGVSVFNEVTGT....................  304
DSSP  HHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHllleEEEEEEEEEEEEELL....................


DSSP  leeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhh
Query svlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiyg  393
ident                                                             
Sbjct ............................................................  304
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllLLL
Query qavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetNSG  453
ident                                                             
Sbjct ................................................gtrtlsflgTPT  316
DSSP  ................................................lhhhhhhllLLL


DSSP  L...........................................................
Query N...........................................................  454
ident                                                             
Sbjct Tthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntyg  376
DSSP  Lllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  454
ident                                                             
Sbjct fgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmp  436
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeee


DSSP  .............................lLLEEEEEEEEEEEEEELL....LLLEEEEE
Query .............................aFHYFTYGVACSEVEIDCL....TGDHKNLR  481
ident                                                             
Sbjct faevvgaayfadathppgfdatleatatydPSDLVLANGGHAAIVEIDastyATRVTDFF  496
DSSP  hhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellLLLLEEEEEEEEEEEEEEllllLEEEEEEE


DSSP  EEEEEELlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......llllllllLLLLLLlllLLL
Query TDIVMDVgsslnpaIDIGQVEGAFVQGLGLFTL.......eelhyspeGSLHTRgpsTYK  534
ident               |    |||    |                                 
Sbjct AVEDCGT......mINPMIVEGQIRGGIAQAIGqtlleeviyddfgqlVTTTLM..dYLI  548
DSSP  EEEELLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllLLLLLL..lLLL


DSSP  LLLHhHLLLEEEEEELLlLLLLllhhHLLLLllLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query IPAFgSIPTEFRVSLLRdCPNKkaiyASKAVgePPLFLGA.SVFFAIKDAIRAARAQHTN  593
ident            |       |                     |   |   |   | |    
Sbjct PTTLdVPDIRIRHLETP.SPLV....PGGIK..GMGESAMiSAPAAVVAAVNDALAHLEV  601
DSSP  LLLLlLLLEEEEELLLL.LLLL....HHHLL..LLLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  lllllLLLLLLlllhhHHHHHLL..LLLLLlllllllllllllllll
Query nntkeLFRLDSpatpeKIRNACV..DKFTTlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                
Sbjct .....VIETVP.....ITPERIFrsIQERP.................  621
DSSP  .....LLLEEL.....LLHHHHHhhHHLLL.................


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=9.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  ...........................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhll
Query ...........................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfsead   33
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee


DSSP  eeeeeeeeelllllllllLLEEEEEELLLlLLEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLL
Query nvvsgelyiggqdhfyleTHCTIAIPKGEeGEMELFVSTQ.....NAMKTQSFVAKMLGV   88
ident                               |      |                |  |||
Sbjct vtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRIDPT.GKVTVTTSLAssgqgHETTLAQIAADVLGV  359
DSSP  eelllhhhhhhlllllllLLEEEEEELLL.LLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LHHHEEEEELL.....LLLLL.LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL................
Query PVNRILVRVKR.....MGGGF.GGKETRSTLVSVAVALAAYKTG................  126
ident |                 |                 |                       
Sbjct PASDVVIQAGStkntyGFGAYaSRGAVIGAGSIGRAASIVRERVkqlaghlleaasediv  419
DSSP  LHHHEEEELLLlllllLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhee


DSSP  .......................................LLEEEELlhhhhhhhllllll
Query .......................................HPVRCMLdrnedmlitggrhp  147
ident                                                             
Sbjct iedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatLEATATY..............  465
DSSP  eelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllLEEEEEL..............


DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeee
Query flarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlc  207
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllll
Query ktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrleg  267
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeee
Query fsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagali  327
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllll
Query hvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasv  387
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeelllllll
Query stdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgys  447
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhh
Query fetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvq  507
ident                                                             
Sbjct ...................................dpsdlvlangghaaiveidastyat  490
DSSP  ...................................llllleeeeeeeeeeeeeellllle


DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllll
Query glglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavge  567
ident                                                             
Sbjct rvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipt  550
DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllll
Query pplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtga  627
ident                                                             
Sbjct tldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitp  610
DSSP  lllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllh


DSSP  lllllllllll
Query pgnckpwslrv  638
ident            
Sbjct erifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhlll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=8.1

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct .............................................vsrtsrardelapif   15
DSSP  .............................................leeeeeeelllhhhh


DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHH.lEEEEEEEELL.LLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHH
Query krglciiptkfgisfTVPFL.nQAGALIHVYT.DGSVLVSHGGTemgqgLHTKMVQVASK  358
ident                         ||                                  
Sbjct assagvvrgqfscgrVSACPmeTRGAVAQYEWtTQQLILWTATQ.....MPSFVRTMVAM   70
DSSP  hhlleeeeeeeeellLLLLLllLLEEEEEEELlLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHEELLleelllllllllLLLLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllll
Query ALKIPISKIYISetstntvpnsspTAASVSTDiyGQAVYEACQTILKRlepfkkknpdgs  418
ident    ||   |                                |                  
Sbjct FCAIPEHLIEVR.......vpdvgGGFGQKAH.lHPEELLVCLLSRAL............  110
DSSP  HHLLLHHHEEEE.......lllllLLLLLLLL.lLHHHHHHHHHHHHH............


DSSP  hhhhhhhhhhlllLLEEEEEE...ELLL................................
Query wedwvmaayqdrvSLSTTGFY...RTPN................................  443
ident                                                             
Sbjct .............GRPVRWIEdrqENFLgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitd  157
DSSP  .............LLLEEEELlhhHHHHhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  443
ident                                                             
Sbjct ggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiar  217
DSSP  llllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  443
ident                                                             
Sbjct etlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeaf  277
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  443
ident                                                             
Sbjct rqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvtts  337
DSSP  hhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  443
ident                                                             
Sbjct lassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraas  397
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .............................lllllllllllllleeeeeeeeeeeeeelll
Query .............................lgysfetnsgnafhyftygvacseveidclt  474
ident                                                             
Sbjct ivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfda  457
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllll


DSSP  lleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllll
Query gdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstyk  534
ident                                                             
Sbjct tleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirgg  517
DSSP  lleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh


DSSP  lllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnn  594
ident                                                             
Sbjct iaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmg  577
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhlllll


DSSP  lllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query ntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                             
Sbjct esamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=6.4

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllE
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwK  300
ident                                                             
Sbjct .........................................vsrtsrardelapifassA   19
DSSP  .........................................leeeeeeelllhhhhhhlL


DSSP  EEEEEEEEEEEEEllllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query KRGLCIIPTKFGIsftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident                                                             
Sbjct GVVRGQFSCGRVS...............................................   32
DSSP  EEEEEEEEELLLL...............................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct ..acpmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggf   90
DSSP  ..llllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllll


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEE.EEEEEEEEEEELlLLLEEE
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFT.YGVACSEVEIDClTGDHKN  479
ident                                                    |   |    
Sbjct gqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgATHAkQQRNEMGLAFDG.DGRFLA  149
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhLLLLlLEEEEEEEEELL.LLLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLLLL.hHHHHHHHHHHHHHhHHHHHLlllllllllllllllllllllllh
Query LRTDIVMDVGSSLN.pAIDIGQVEGAFVQgLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipaf  538
ident |      | |   |                                              
Sbjct LENRSITDGGAYNNlpWTQLVESHVGNAV.ILGVYK........................  184
DSSP  EEEEEEEELLLLLLllLLHHHLHHHHHHL.LLLLLL........................


DSSP  hhllLEEEEEELlLLLLlllhhHLLLLL.LLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHH.......
Query gsipTEFRVSLLrDCPNkkaiyASKAVG.EPPLFLG.ASVFFAIKDAIRAARA.......  589
ident                                    |       |  | |           
Sbjct .vpaVSEESIAV.ATNK.....CPIGAYrGVGFTAGqIARETLIDRAARQLGLspfeirr  237
DSSP  .lleEEEEEEEE.LLLL.....LLLLLLlLLLHHHHhHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhh


DSSP  .............................................hhlllllLLLLLLLL
Query .............................................qhtnnntKELFRLDS  604
ident                                                             
Sbjct rnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkYLGLGVSV  297
DSSP  lllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleEEEEEEEE


DSSP  L...........................................................
Query P...........................................................  605
ident                                                             
Sbjct Fnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvl  357
DSSP  Eeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  605
ident                                                             
Sbjct gvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaased  417
DSSP  lllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  605
ident                                                             
Sbjct iviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlanggh  477
DSSP  eeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  605
ident                                                             
Sbjct aaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgq  537
DSSP  eeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  ...................................................llhhhhhhh
Query ...................................................atpekirna  614
ident                                                             
Sbjct lvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndala  597
DSSP  llllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllllllllllllllllllllll
Query cvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                         
Sbjct hlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=5.0

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhHLLLE
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkENCWK  300
ident                                                             
Sbjct .......................................vsrtsrardelapifaSSAGV   21
DSSP  .......................................leeeeeeelllhhhhhHLLEE


DSSP  EEEEEEEEEEEEellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query KRGLCIIPTKFGisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident  ||                                                         
Sbjct VRGQFSCGRVSA................................................   33
DSSP  EEEEEEELLLLL................................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   33
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleE.....................
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyF.....................  459
ident                                                             
Sbjct ......................................Cpmetrgavaqyewttqqlilw   55
DSSP  ......................................Lllllleeeeeeelllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  459
ident                                                             
Sbjct tatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvr  115
DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  ............EEE.EEEEEEEEEL....LLLLEEEeEEEEEEELLllllHHHHhhHHH
Query ............TYG.VACSEVEIDC....LTGDHKNlRTDIVMDVGsslnPAIDigQVE  502
ident             |       |               | |                     
Sbjct wiedrqenflgaTHAkQQRNEMGLAFdgdgRFLALEN.RSITDGGAY...nNLPW..TQL  169
DSSP  eellhhhhhhhlLLLlLEEEEEEEEEllllLEEEEEE.EEEEELLLL...lLLLL..LHH


DSSP  HhHHHHHHHHHLLllllllllllllllllllllllhhhllLEEEEEELLlllllllhhhl
Query GaFVQGLGLFTLEelhyspegslhtrgpstykipafgsipTEFRVSLLRdcpnkkaiyas  562
ident      |                                   |                  
Sbjct VeSHVGNAVILGV....................ykvpavsEESIAVATN.........kc  200
DSSP  HlHHHHHHLLLLL....................lllleeeEEEEEELLL.........ll


DSSP  llLLLLlhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..............................
Query kaVGEPplFLGASVFFAIKDAIRAARAQHT..............................  592
ident                 |    |  |  |                                
Sbjct piGAYR.gVGFTAGQIARETLIDRAARQLGlspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthreg  259
DSSP  llLLLL.lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhlllllhhhlleellllleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  592
ident                                                             
Sbjct tylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttth  319
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  592
ident                                                             
Sbjct dsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfga  379
DSSP  leeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  592
ident                                                             
Sbjct yasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfae  439
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  592
ident                                                             
Sbjct vvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffave  499
DSSP  hhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  592
ident                                                             
Sbjct dcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdiri  559
DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleee


DSSP  ................lllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllll
Query ................nnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwsl  636
ident                                                             
Sbjct rhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqe  619
DSSP  eellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhl


DSSP  ll
Query rv  638
ident   
Sbjct rp  621
DSSP  ll


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.3

DSSP  ...............lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelll
Query ...............iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggq   45
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  lllllllleeEEEEL......llllleeeeeLLLLH.hhhhhhhHHHHLL..........
Query dhfylethctIAIPK......geegemelfvSTQNA.mktqsfvAKMLGV..........   88
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamFCAIPehlievrvpdvgggfgQKAHLhpeellvcLLSRALgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhHHLLLhhheeeelllllllllLLLLLlhhhhhhhHHHHHHllleeeellh


DSSP  .........................lhhheeeeelllllllllLLLLlhhhhhhhhhhhh
Query .........................pvnrilvrvkrmgggfggKETRstlvsvavalaay  123
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnLPWT.............  167
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllLLLL.............


DSSP  hhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhh
Query ktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsi  183
ident                                                             
Sbjct ............................................................  167
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query meralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglp  243
ident                                                             
Sbjct ....qlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidr  223
DSSP  ....hhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeee
Query aeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrg  303
ident                                                             
Sbjct aarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqae  283
DSSP  hhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeeeeeellllhhHLEE...............eEEEEELLL....LLEEEEElllll
Query lciiptkfgisftvpfLNQA...............gALIHVYTD....GSVLVSHggtem  344
ident                                         |  |      |  |      
Sbjct arargkylglgvsvfnEVTGtgtrtlsflgtpttthDSATVRIDptgkVTVTTSL....a  339
DSSP  hhllleeeeeeeeeeeEEELllhhhhhhllllllllLEEEEEELllllEEEEELL....l


DSSP  lLLHHhhHHHHHHHHHLL......lhhHEELLLEellllllllllllllHHHHHHHHHHH
Query gQGLHtkMVQVASKALKI......pisKIYISETstntvpnssptaasvSTDIYGQAVYE  398
ident   |                         |    |                          
Sbjct sSGQG..HETTLAQIAADvlgvpasdvVIQAGST.......kntygfgaYASRGAVIGAG  390
DSSP  lLLLL..HHHHHHHHHHHhhlllhhheEEELLLL.......llllllllLLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHL............................LLLL........hhhh
Query ACQTILKRLEPFKKKN............................PDGS........wedw  422
ident              |                                              
Sbjct SIGRAASIVRERVKQLaghlleaasediviedglvhvagvpakgMPFAevvgaayfadat  450
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeEEHHhhhhhhhhlhhh


DSSP  hhhhhHLLLLLEEEEEE...ELLLLllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleee
Query vmaayQDRVSLSTTGFY...RTPNLgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhkn  479
ident              |         |                                    
Sbjct hppgfDATLEATATYDPsdlVLANG...................................  475
DSSP  lllllLLLLEEEEELLLlllEEEEE...................................


DSSP  eeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhh
Query lrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafg  539
ident                                                             
Sbjct .............ghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqai  522
DSSP  .............eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query siptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkel  599
ident                                                             
Sbjct gqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesami  582
DSSP  hhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhh


DSSP  llllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query frldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                        
Sbjct sapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.8

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ..................................................vsrtsrarde   10
DSSP  ..................................................leeeeeeell


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllLLLLhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlEGFSvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct lapifassagvvrgqfscgrvsacpMETR...............................   39
DSSP  lhhhhhhlleeeeeeeeelllllllLLLL...............................


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   39
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   39
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeEEEEEEEEEeellllleeeE
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftYGVACSEVEidcltgdhknL  480
ident                                           ||  |             
Sbjct ........................................GAVAQYEWT.........tQ   50
DSSP  ........................................EEEEEEELL.........lL


DSSP  EEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhh
Query RTDIVMDVgsslnpaiDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
ident                     |                                       
Sbjct QLILWTAT.......qMPSFVRTMVAMFCA.............................i   74
DSSP  EEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.............................l


DSSP  LLLEEEEEELLLLLLLllhhHLLLLLLL.LHHHHH.HHHHH...................
Query IPTEFRVSLLRDCPNKkaiyASKAVGEP.PLFLGA.SVFFA...................  579
ident       |               ||   |  |     |                       
Sbjct PEHLIEVRVPDVGGGF....GQKAHLHPeELLVCLlSRALGrpvrwiedrqenflgatha  130
DSSP  LHHHEEEELLLLLLLL....LLLLLLLHhHHHHHHhHHHHLlleeeellhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct kqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavse  190
DSSP  lleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct esiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftn  250
DSSP  eeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct rlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtls  310
DSSP  lllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct flgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqags  370
DSSP  hllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct tkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagv  430
DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct pakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyat  490
DSSP  eeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct rvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipt  550
DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


DSSP  ............hhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllll
Query ............ikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtga  627
ident                                                             
Sbjct tldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitp  610
DSSP  lllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllh


DSSP  lllllllllll
Query pgnckpwslrv  638
ident            
Sbjct erifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhlll


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.3

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhHHHHHLLHhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdECLKSSQYyarksevdkfnkencwk  300
ident                                    |                        
Sbjct ..........................vsrtsrardELAPIFAS.................   17
DSSP  ..........................leeeeeeelLLHHHHHH.................


DSSP  eeeEEEEEEEEEELLllhhhLEEEeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query krgLCIIPTKFGISFtvpflNQAGalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident           |           |                                     
Sbjct ..sAGVVRGQFSCGR.....VSAC...................................p   35
DSSP  ..lLEEEEEEEEELL.....LLLL...................................l


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct metrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkah   95
DSSP  lllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEEEEEEEEEEEeellllleeEE
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFTYGVACSEVEidcltgdhkNL  480
ident                                                             
Sbjct lhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMGLAFDGD.........GR  146
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEEELLL.........LL


DSSP  EEEEEEELL............llllhhHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllllllllll
Query RTDIVMDVG............sslnpaIDIGQVEGafvqglglftleelhyspegslhtr  528
ident                                   |                         
Sbjct FLALENRSItdggaynnlpwtqlveshVGNAVILG.........................  181
DSSP  EEEEEEEEEeellllllllllhhhlhhHHHHLLLL.........................


DSSP  lllllllllhhhllleEEEEELllLLLL.........llhhhllLLLLLLHHHH.HHHHH
Query gpstykipafgsipteFRVSLLrdCPNK.........kaiyaskAVGEPPLFLG.ASVFF  578
ident                   ||                        |       |       
Sbjct ............vykvPAVSEE..SIAVatnkcpigayrgvgftAGQIARETLIdRAARQ  227
DSSP  ............llllLEEEEE..EEEEllllllllllllllhhHHHHHHHHHHhHHHHH


DSSP  HH..........................................................
Query AI..........................................................  580
ident                                                             
Sbjct LGlspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearar  287
DSSP  HLllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  580
ident                                                             
Sbjct gkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghet  347
DSSP  leeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  580
ident                                                             
Sbjct tlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqla  407
DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  580
ident                                                             
Sbjct ghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydp  467
DSSP  hhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  580
ident                                                             
Sbjct sdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtll  527
DSSP  llleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ....................................hhhhhhhhhhhlllllllllllll
Query ....................................kdairaaraqhtnnntkelfrlds  604
ident                                                             
Sbjct eeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaa  587
DSSP  llllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhh


DSSP  lllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query patpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                   
Sbjct vvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 11: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.3

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEL
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfyleTHCTIAIPK   60
ident                                                             
Sbjct ............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrGAVAQYEWT   48
DSSP  ............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEEELL


DSSP  llllLEEEEEL......llLHHHHHHHHHhhhlllhhheEEEELLLLL.....lllllll
Query geegEMELFVS......tqNAMKTQSFVAkmlgvpvnriLVRVKRMGG.....gfggket  109
ident        |                  | |          |  |                 
Sbjct ....TQQLILWtatqmpsfVRTMVAMFCA......ipehLIEVRVPDVgggfgqkahlhp   98
DSSP  ....LLEEEEEellllhhhHHHHHHHHHL......llhhHEEEELLLLlllllllllllh


DSSP  lLHHHHHHHHHHHhhhlllEEEELlhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeee
Query rSTLVSVAVALAAyktghpVRCMLdrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdh  169
ident    ||                                                       
Sbjct eELLVCLLSRALG......RPVRWiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalen  152
DSSP  hHHHHHHHHHHHL......LLEEEellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeee


DSSP  eeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhh
Query ysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfia  229
ident                                                             
Sbjct rsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgfta  212
DSSP  eeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhh
Query enwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarkse  289
ident                                                             
Sbjct gqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemv  272
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhh
Query vdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglh  349
ident                                                             
Sbjct npeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkv  332
DSSP  lhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllle


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query tkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlep  409
ident                                                             
Sbjct tvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsi  392
DSSP  eeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeee
Query fkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseve  469
ident                                                             
Sbjct graasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathp  452
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhll


DSSP  eellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllll
Query idcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrg  529
ident                                                             
Sbjct pgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmiveg  512
DSSP  llllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhh


DSSP  llllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query pstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaara  589
ident                                                             
Sbjct qirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpgg  572
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhh


DSSP  hhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query qhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                  
Sbjct ikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 12: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.0

DSSP  .................................................lllhhhhhhll
Query .................................................iitiedaiknn   11
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  leeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeelllllleeeeel
Query sfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipkgeegemelfvs   71
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllleee
Query tqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaayktghpvrc  131
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhll
Query mldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhm  191
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  lllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhh
Query dncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwkn  251
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee


DSSP  lllllllllllllllLLLHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query mykegdlthfnqrleGFSVprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkf  311
ident                                                             
Sbjct vtgtgtrtlsflgtpTTTH.........................................  319
DSSP  eelllhhhhhhllllLLLL.........................................


DSSP  eellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheelll
Query gisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyise  371
ident                                                             
Sbjct ............................................................  319
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlll
Query tstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrv  431
ident                                                             
Sbjct ............................................................  319
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeeellllllllllllllllleeeeEEEEEEEEeellllLEEEeEEEEEEellll
Query slsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftyGVACSEVEidcltgDHKNlRTDIVMdvgss  491
ident                                 |             |             
Sbjct ..............................DSATVRID.....pTGKV.TVTTSL.....  338
DSSP  ..............................LEEEEEEL.....lLLLE.EEEELL.....


DSSP  llHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllllllllllllllhHHLLleEEEEELl
Query lnPAIDigQVEGAFVQGLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipafGSIPteFRVSLLr  551
ident           |    |                                            
Sbjct .aSSGQ..GHETTLAQIAADVLG.....................vpaSDVV..IQAGST.  371
DSSP  .lLLLL..LHHHHHHHHHHHHHL.....................llhHHEE..EELLLL.


DSSP  lllllllhhhLLLLLLL.LHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllLLLLlllLLHH
Query dcpnkkaiyaSKAVGEP.PLFLGA.SVFFAIKDAIRAARAQHTNnntkeLFRLdspATPE  609
ident               |                      |                      
Sbjct ..kntygfgaYASRGAViGAGSIGrAASIVRERVKQLAGHLLEA...asEDIV...IEDG  423
DSSP  ..llllllllLLLLHHHhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...lhHHEE...EELL


DSSP  HHH.........................................................
Query KIR.........................................................  612
ident                                                             
Sbjct LVHvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaivei  483
DSSP  EEEelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  612
ident                                                             
Sbjct dastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttl  543
DSSP  ellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllll


DSSP  ....................................................hhllllll
Query ....................................................nacvdkft  620
ident                                                             
Sbjct mdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvi  603
DSSP  llllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  llllllllllllllllll
Query tlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                   
Sbjct etvpitperifrsiqerp  621
DSSP  leelllhhhhhhhhhlll


No 13: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.0

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ..........................................vsrtsrardelapifass   18
DSSP  ..........................................leeeeeeelllhhhhhhl


DSSP  eeeeeeeeeeeeeLLLL...........................................
Query krglciiptkfgiSFTV...........................................  317
ident              |                                              
Sbjct agvvrgqfscgrvSACPmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehl   78
DSSP  leeeeeeeeelllLLLLlllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  .................................................hhhlEEEEEEE
Query .................................................pflnQAGALIH  328
ident                                                      |      
Sbjct ievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMG  138
DSSP  eeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEE


DSSP  ELL.....lLLEEEEELLL........lllllhhHHHHHHHHHhhLLLHHHEELLleell
Query VYT.....dGSVLVSHGGT........emgqglhTKMVQVASKalKIPISKIYISetstn  375
ident                                        |                    
Sbjct LAFdgdgrfLALENRSITDggaynnlpwtqlvesHVGNAVILG..VYKVPAVSEE...si  193
DSSP  EEEllllleEEEEEEEEEEllllllllllhhhlhHHHHHLLLL..LLLLLEEEEE...ee


DSSP  llllllllLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH......................
Query tvpnssptAASVstDIYGQAVYEACQTILKRLEPFKKK......................  413
ident                    |   |  |   |                             
Sbjct avatnkcpIGAY.rGVGFTAGQIARETLIDRAARQLGLspfeirrrnvvmpedfpftnrl  252
DSSP  eellllllLLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhlllllhhhlleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  413
ident                                                             
Sbjct gqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsfl  312
DSSP  lleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  413
ident                                                             
Sbjct gtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstk  372
DSSP  lllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  413
ident                                                             
Sbjct ntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpa  432
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  413
ident                                                             
Sbjct kgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrv  492
DSSP  eeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleee


DSSP  .....lllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeELLLLllllllllllllleeeeeeeeeee
Query .....npdgswedwvmaayqdrvslsttgfyRTPNLgysfetnsgnafhyftygvacsev  468
ident                                 |                           
Sbjct tdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigQTLLE........................  528
DSSP  eeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLL........................


DSSP  eeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll
Query eidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtr  528
ident                                                             
Sbjct ............................................................  528
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaar  588
ident                                                             
Sbjct .................eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpg  571
DSSP  .................lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhh


DSSP  hhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query aqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                   
Sbjct gikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 14: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.9

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ....................vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrg   40
DSSP  ....................leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllle


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct avaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpee  100
DSSP  eeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhh


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct llvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdgga  160
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident                                                             
Sbjct ynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretl  220
DSSP  lllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct idraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqr  280
DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEEEeeeellllleeee
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEveidcltgdhknl  480
ident                                                             
Sbjct qaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRID..........ptg  330
DSSP  hhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlllllllLLEEEEEEL..........lll


DSSP  EEEEEEELLlLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhh
Query RTDIVMDVGsSLNPaIDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
ident           |                 ||                              
Sbjct KVTVTTSLA.SSGQ.GHETTLAQIAADVLG.............................v  359
DSSP  LEEEEELLL.LLLL.LHHHHHHHHHHHHHL.............................l


DSSP  LLLEEEEEELLL.llllllhhhlLLLL...LLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhhhllll
Query IPTEFRVSLLRD.cpnkkaiyasKAVG...EPPLFLGA.SVFFAIKDAIRAARaqhtnnn  595
ident                                                |            
Sbjct PASDVVIQAGSTkntygfgayasRGAVigaGSIGRAASiVRERVKQLAGHLLE.......  412
DSSP  LHHHEEEELLLLlllllllllllLHHHhhhHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHL.......


DSSP  llllllLLLL.......lLHHHhHHHL.................................
Query tkelfrLDSP.......aTPEKiRNAC.................................  615
ident        |                                                    
Sbjct ...aasEDIViedglvhvAGVP.AKGMpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydps  468
DSSP  ...llhHHEEeelleeeeLLEE.EEEEehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  615
ident                                                             
Sbjct dlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlle  528
DSSP  lleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  615
ident                                                             
Sbjct eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaav  588
DSSP  lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ..........lllllllllllllllllllllll
Query ..........vdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                  
Sbjct vaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 15: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  ...............lLLHHhhhhllleeeeeeeeeelLHHHHHHH.........lLEEE
Query ...............iITIEdaiknnsfygselkiekgDLKKGFSE.........aDNVV   36
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthREGT......ylqtinlleemvNPEAFRQRqaearargkyLGLG  294
DSSP  llhhhlleellllleeLLLL......hhhhhhhhhhhhLHHHHHHHhhhhhllleeEEEE


DSSP  EEEEEELLLLLL...........LLLLL................................
Query SGELYIGGQDHF...........YLETH................................   53
ident                                                             
Sbjct VSVFNEVTGTGTrtlsflgtpttTHDSAtvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaa  354
DSSP  EEEEEEEELLLHhhhhhllllllLLLEEeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................eeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhh
Query ............................ctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakm   85
ident                                                             
Sbjct dvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaa  414
DSSP  hhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  hlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeELLHhhHHHHllll
Query lgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaayktghpvrcMLDRneDMLItggr  145
ident                                                             
Sbjct sediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleATAT..YDPS..dl  470
DSSP  hhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleEEEE..LLLL..ll


DSSP  lLEEEEEEEEELL.....lLLEEEEEEEEEEEEelllLLHHHHHHHHHHLL.LLLL....
Query hPFLARYKVGFMK.....tGTIVALEVDHYSNAgnsrDLSHSIMERALFHM.DNCY....  195
ident                                                             
Sbjct vLANGGHAAIVEIdastyaTRVTDFFAVEDCGT...mINPMIVEGQIRGGIaQAIGqtll  527
DSSP  eEEEEEEEEEEEEelllllEEEEEEEEEEELLL...lLLHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhl


DSSP  .........................LLLLEEEEEEEEELL.LLLLllllllLHHHHHHHH
Query .........................KIPNIRGTGRLCKTN.LSSNtafrgfGGPQALFIA  229
ident                            | ||                     |  |   |
Sbjct eeviyddfgqlvtttlmdylipttlDVPDIRIRHLETPSPlVPGG...ikgMGESAMISA  584
DSSP  lllllllllllllllllllllllllLLLLEEEEELLLLLLlLHHH...lllLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL.....LLHHhHHHHhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhh
Query ENWMSEVAVTCG.....LPAEeVRWKnmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyy  284
ident                       |                                     
Sbjct PAAVVAAVNDALahlevVIET.VPIT..................................  609
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhhllLLLE.ELLL..................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeelllll
Query arksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtem  344
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtil  404
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeee
Query krlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygva  464
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
Query cseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegs  524
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdai  584
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlLLLLlllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query raaraqhtNNNTkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                       
Sbjct perifrsiQERP..........................................  621
DSSP  hhhhhhhhHLLL..........................................


No 16: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.6

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ...........................................vsrtsrardelapifas   17
DSSP  ...........................................leeeeeeelllhhhhhh


DSSP  eeeeeEEEEEEEELLLLhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query krglcIIPTKFGISFTVpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident            |                                                
Sbjct sagvvRGQFSCGRVSAC...........................................   34
DSSP  lleeeEEEEEELLLLLL...........................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct .pmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqk   93
DSSP  .llllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllll


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEeeeeeellllleeee
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACseveidcltgdhknl  480
ident                                                             
Sbjct ahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMG.....lafdgdgrfl  148
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEE.....eeelllllee


DSSP  eEEEEEELLL.......lllhhhhHHHHHHhHHHHhhhhhllllllllllllllllllll
Query rTDIVMDVGS.......slnpaidIGQVEGaFVQGlglftleelhyspegslhtrgpsty  533
ident                                                             
Sbjct aLENRSITDGgaynnlpwtqlvesHVGNAV.ILGV.........................  182
DSSP  eEEEEEEEELlllllllllhhhlhHHHHHL.LLLL.........................


DSSP  llllhhHLLLEEEEEELllLLLLLLH..hhlllLLLLL......................
Query kipafgSIPTEFRVSLLrdCPNKKAI..yaskaVGEPP......................  569
ident                        |                                    
Sbjct ......YKVPAVSEESI.aVATNKCPigayrgvGFTAGqiaretlidraarqlglspfei  235
DSSP  ......LLLLEEEEEEE.eELLLLLLlllllllLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  569
ident                                                             
Sbjct rrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgv  295
DSSP  hhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  569
ident                                                             
Sbjct svfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaad  355
DSSP  eeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  569
ident                                                             
Sbjct vlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaas  415
DSSP  hhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  569
ident                                                             
Sbjct ediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlang  475
DSSP  hheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  569
ident                                                             
Sbjct ghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddf  535
DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  .................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhh
Query .................lflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekir  612
ident                                                             
Sbjct gqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavnda  595
DSSP  llllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhllllllllllllllllllllllll
Query nacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                           
Sbjct lahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 17: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.5

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct ...........................................................v    1
DSSP  ...........................................................l


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEEEEEEEEEeeeellllleeee
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFTYGVACSEveidcltgdhknl  480
ident                                                             
Sbjct srtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmeTRGAVAQYEWT.............   48
DSSP  eeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEELL.............


DSSP  EEEEEEELLLLLlhHHHHHHHHhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhh
Query RTDIVMDVGSSLnpAIDIGQVEgafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
ident                     |                                       
Sbjct TQQLILWTATQM.pSFVRTMVA...................................mfc   72
DSSP  LLEEEEEELLLL.hHHHHHHHH...................................hhh


DSSP  llleEEEEELLlLLLLLL.HHHL...llLLLLLHH.HHHH....................
Query ipteFRVSLLRdCPNKKA.IYAS...kaVGEPPLF.LGAS....................  575
ident                                  |                          
Sbjct aipeHLIEVRV.PDVGGGfGQKAhlhpeELLVCLLsRALGrpvrwiedrqenflgathak  131
DSSP  lllhHHEEEEL.LLLLLLlLLLLlllhhHHHHHHHhHHHLlleeeellhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  575
ident                                                             
Sbjct qqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavsee  191
DSSP  leeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  575
ident                                                             
Sbjct siavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnr  251
DSSP  eeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  575
ident                                                             
Sbjct lgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsf  311
DSSP  llleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  575
ident                                                             
Sbjct lgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagst  371
DSSP  llllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  575
ident                                                             
Sbjct kntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvp  431
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeellee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  575
ident                                                             
Sbjct akgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatr  491
DSSP  eeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeelllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  575
ident                                                             
Sbjct vtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdyliptt  551
DSSP  eeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllll


DSSP  .......hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllll
Query .......vffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgap  628
ident                                                             
Sbjct ldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitpe  611
DSSP  llllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhh


DSSP  llllllllll
Query gnckpwslrv  638
ident           
Sbjct rifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhlll


No 18: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.4

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelL................
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyigG................   44
ident                                                             
Sbjct ..........vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsaCpmetrgavaqyewttq   50
DSSP  ..........leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllLllllleeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   44
ident                                                             
Sbjct qlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsral  110
DSSP  eeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .................LLLLlllLLEEEEEELL....LLLLEEEEEL............
Query .................QDHFyleTHCTIAIPKG....EEGEMELFVS............   71
ident                                            |                
Sbjct grpvrwiedrqenflgaTHAK...QQRNEMGLAFdgdgRFLALENRSItdggaynnlpwt  167
DSSP  llleeeellhhhhhhhlLLLL...LEEEEEEEEEllllLEEEEEEEEEeellllllllll


DSSP  .lllhhhhhhHHHHhhLLLHHHEEEEElLLLL....lllllllLLHHHHHHHHHHHHHHL
Query .tqnamktqsFVAKmlGVPVNRILVRVkRMGG....gfggketRSTLVSVAVALAAYKTG  126
ident                    |                                        
Sbjct qlveshvgnaVILG..VYKVPAVSEES.IAVAtnkcpigayrgVGFTAGQIARETLIDRA  224
DSSP  hhhlhhhhhhLLLL..LLLLLEEEEEE.EEELlllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  lleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhh
Query hpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimer  186
ident                                                             
Sbjct ............................................................  224
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query alfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaee  246
ident                                                             
Sbjct .......................................................arqlg  229
DSSP  .......................................................hhhhl


DSSP  hhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeee
Query vrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglci  306
ident                                                             
Sbjct lspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargk  289
DSSP  llhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  eeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query iptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipisk  366
ident                                                             
Sbjct ylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettl  349
DSSP  eeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhh


DSSP  eellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query iyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaa  426
ident                                                             
Sbjct aqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlagh  409
DSSP  hhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeee
Query yqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivm  486
ident                                                             
Sbjct lleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsd  469
DSSP  hhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllll


DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleee
Query dvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefr  546
ident                                                             
Sbjct lvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtllee  529
DSSP  leeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  eeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll
Query vsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspa  606
ident                                                             
Sbjct viyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavv  589
DSSP  llllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query tpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                 
Sbjct aavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 19: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  .................................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhh
Query .................................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkk   27
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee


DSSP  hhhhlleeeeeeeeELLL..........................................
Query gfseadnvvsgelyIGGQ..........................................   45
ident                                                             
Sbjct vtgtgtrtlsflgtPTTThdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
DSSP  eelllhhhhhhlllLLLLlleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   45
ident                                                             
Sbjct asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  .............................................LLLlLLLLEEEEEEL
Query .............................................DHFyLETHCTIAIPK   60
ident                                              |              
Sbjct edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatyDPS.DLVLANGGHAA  479
DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelLLL.LLEEEEEEEEE


DSSP  ...........llllLEEEEELLLL..HHHHHHHHH........................
Query ...........geegEMELFVSTQN..AMKTQSFVA........................   83
ident                             |                               
Sbjct iveidastyatrvtdFFAVEDCGTMinPMIVEGQIRggiaqaigqtlleeviyddfgqlv  539
DSSP  eeeeellllleeeeeEEEEEELLLLllHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  .........hhhlllhhHEEEEELLLLL.LLLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHLlleeeel
Query .........kmlgvpvnRILVRVKRMGG.GFGGKetrSTLVSVAVALAAYKTGhpvrcml  133
ident                                ||        |      |           
Sbjct tttlmdylipttldvpdIRIRHLETPSPlVPGGI..kGMGESAMISAPAAVVA.......  590
DSSP  lllllllllllllllllEEEEELLLLLLlLHHHL..lLLLLHHHHHHHHHHHH.......


DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhllll
Query drnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdn  193
ident                                                             
Sbjct ............................................................  590
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhll
Query cykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmy  253
ident                                                             
Sbjct ............................................................  590
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeee
Query kegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgi  313
ident                                                             
Sbjct ............................................................  590
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheelllee
Query sftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisets  373
ident                                                             
Sbjct ............................................................  590
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlllll
Query tntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvsl  433
ident                                                             
Sbjct ............................................................  590
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll
Query sttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgssln  493
ident                                                             
Sbjct ............................................................  590
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeellll
Query paidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdc  553
ident                                                             
Sbjct ............................................................  590
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhh
Query pnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirn  613
ident                                                             
Sbjct ......................................................avndal  596
DSSP  ......................................................hhhhhh


DSSP  hllllllllllllllllllllllll
Query acvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                          
Sbjct ahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 20: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
DSSP  eelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  ..lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEE
Query ..iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethCTIAI   58
ident                                                           ||
Sbjct edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangGHAAI  480
DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeEEEEE


DSSP  ELLL....LLLE.EEEEL.............lLLHHHHHHHHHHHHL.............
Query PKGE....EGEM.ELFVS.............tQNAMKTQSFVAKMLG.............   87
ident                |                |            |              
Sbjct VEIDastyATRVtDFFAVedcgtminpmivegQIRGGIAQAIGQTLLeeviyddfgqlvt  540
DSSP  EEEEllllLEEEeEEEEEeellllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllll


DSSP  ........lLHHHEEEEELLLLL.........lLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHLllee
Query ........vPVNRILVRVKRMGG.........gFGGKeTRSTLVSVAVALAAYKTGhpvr  130
ident                    |              |           |   ||        
Sbjct ttlmdylipTTLDVPDIRIRHLEtpsplvpggiKGMG.ESAMISAPAAVVAAVNDA....  595
DSSP  lllllllllLLLLLLLEEEEELLllllllhhhlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHH....


DSSP  eellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhl
Query cmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfh  190
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
Query mdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwk  250
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeee
Query nmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptk  310
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheell
Query fgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyis  370
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  leellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhll
Query etstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdr  430
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query vslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgs  490
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeel
Query slnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsll  550
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhh
Query rdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpek  610
ident                                                             
Sbjct ............................................................  595
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllllllllllllllllllllll
Query irnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                             
Sbjct ..lahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  ..hhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 21: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.2

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ..........................................vsrtsrardelapifass   18
DSSP  ..........................................leeeeeeelllhhhhhhl


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhlEEEEEEEELlllLEEEEELlllllllHHHHHHHhhhhhh
Query krglciiptkfgisftvpflnQAGALIHVYtdgSVLVSHGgtemgqgLHTKMVQvaskal  360
ident                       | |          |             |          
Sbjct agvvrgqfscgrvsacpmetrGAVAQYEWT..tQQLILWTatqmpsfVRTMVAM......   70
DSSP  leeeeeeeeelllllllllllEEEEEEELL..lLEEEEEEllllhhhHHHHHHH......


DSSP  lllhhheellleellllllllllllLLHHhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaaSVSTdIYGQAVYEACQTIlkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct .fcaipehlievrvpdvgggfgqkaHLHP.EELLVCLLSRALG.................  111
DSSP  .hhlllhhheeeellllllllllllLLLH.HHHHHHHHHHHHL.................


DSSP  hhhhhhhhllllleEEEEEELLLLllllllllllLLLE......................
Query dwvmaayqdrvslsTTGFYRTPNLgysfetnsgnAFHY......................  458
ident                                                             
Sbjct ..............RPVRWIEDRQ........enFLGAthakqqrnemglafdgdgrfla  149
DSSP  ..............LLEEEELLHH........hhHHHLllllleeeeeeeeellllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  458
ident                                                             
Sbjct lenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvg  209
DSSP  eeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  458
ident                                                             
Sbjct ftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlle  269
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  458
ident                                                             
Sbjct emvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridpt  329
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  458
ident                                                             
Sbjct gkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgaviga  389
DSSP  lleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhh


DSSP  ....................................................eeeeeeee
Query ....................................................ftygvacs  466
ident                                                             
Sbjct gsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfada  449
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhh


DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll
Query eveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslh  526
ident                                                             
Sbjct thppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmi  509
DSSP  hllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh


DSSP  lllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query trgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdaira  586
ident                                                             
Sbjct vegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplv  569
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllll


DSSP  hhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query araqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                     
Sbjct pggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 22: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.1

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ........................................vsrtsrardelapifassag   20
DSSP  ........................................leeeeeeelllhhhhhhlle


DSSP  eeeeeeeeeeeeeLLLLH..........................................
Query krglciiptkfgiSFTVP..........................................  318
ident                                                             
Sbjct vvrgqfscgrvsaCPMETrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlie   80
DSSP  eeeeeeeelllllLLLLLleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhhee


DSSP  ......HHLEE......................................eEEEEEL....
Query ......FLNQA......................................gALIHVY....  330
ident                                                             
Sbjct vrvpdvGGGFGqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathaKQQRNEmgla  140
DSSP  eellllLLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllllLLEEEEeeee


DSSP  .........lllLEEEEellLLLLLLHHHHHHHHHHHHHL......llhHHEELLleell
Query .........tdgSVLVShggTEMGQGLHTKMVQVASKALK......ipiSKIYISetstn  375
ident                                  |                          
Sbjct fdgdgrflalenRSITDggaYNNLPWTQLVESHVGNAVILgvykvpavsEESIAV.....  195
DSSP  ellllleeeeeeEEEEElllLLLLLLLHHHLHHHHHHLLLlllllleeeEEEEEE.....


DSSP  llllllllllllHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...................
Query tvpnssptaasvSTDIygQAVYEACQTILKRLEPFKKKNPD...................  416
ident                        | |     |                            
Sbjct .....atnkcpiGAYR..GVGFTAGQIARETLIDRAARQLGlspfeirrrnvvmpedfpf  248
DSSP  .....lllllllLLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhlllllhhhlle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  416
ident                                                             
Sbjct tnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrt  308
DSSP  ellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  416
ident                                                             
Sbjct lsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqa  368
DSSP  hhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  416
ident                                                             
Sbjct gstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhva  428
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  416
ident                                                             
Sbjct gvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidasty  488
DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  416
ident                                                             
Sbjct atrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdyli  548
DSSP  leeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllll


DSSP  ........................................llhhhhhhhhhHLLLLLeee
Query ........................................gswedwvmaayQDRVSLstt  436
ident                                                             
Sbjct pttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlEVVIET...  605
DSSP  lllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLE...


DSSP  eeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh
Query gfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpai  496
ident                                                             
Sbjct ............................................................  605
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllll
Query digqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnk  556
ident                                                             
Sbjct ............................................................  605
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhll
Query kaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacv  616
ident                                                             
Sbjct ............................................................  605
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllllllllll
Query dkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                       
Sbjct ......vpitperifrsiqerp  621
DSSP  ......elllhhhhhhhhhlll