No 1: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=44.3

DSSP  ..............LEEEEEEELLLHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLL.eeeeee
Query ..............VSRTSRARDELAPIFASSAGVVRGQFSCGRVSACPMETR.gavaqy   45
ident                |        |   |     || |    |       ||        
Sbjct iitiedaiknnsfyGSELKIEKGDLKKGFSEADNVVSGELYIGGQDHFYLETHctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeEEEEEEEELLHHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLeeeeeel


DSSP  elllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhh
Query ewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcl  105
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhllleeeELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLll
Query lsralgrpvrwIEDRQENFLGATHAKQQRNEMGLAFDGDGRFLALENRSITDGGAYNNlp  165
ident              || |  |               |   |   |||       |      
Sbjct aayktghpvrcMLDRNEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGTIVALEVDHYSNAGNSRD..  178
DSSP  hhhhhllleeeELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEEELLLL..


DSSP  lLHHHLHHHHHHLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query wTQLVESHVGNAVILGVYKVPAVSEESIAVATNKCPIGAYRGVGFTAGQIARETLIDRAA  225
ident                  || |          ||     | || |        |      |
Sbjct .LSHSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLSSNTAFRGFGGPQALFIAENWMSEVA  237
DSSP  .LHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLHHHHHHLLLLLhhhLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHH
Query RQLGLSPFEIRRRNVVMpedFPFTNRLGQTHREGTYLQTINLLEEMVNPEAFRQRQAEAR  285
ident    ||   | |  |              |                     |         
Sbjct VTCGLPAEEVRWKNMYK...EGDLTHFNQRLEGFSVPRCWDECLKSSQYYARKSEVDKFN  294
DSSP  HHHLLLHHHHHHHHLLL...LLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLL..EEEEEEEEEEEEEE.........................................
Query ARG..KYLGLGVSVFNEVT.........................................  302
ident      |  ||                                                  
Sbjct KENcwKKRGLCIIPTKFGIsftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvq  354
DSSP  HHLllEEEEEEEEEEEEEEllllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  302
ident                                                             
Sbjct vaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkkn  414
DSSP  hhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ...................................lllHHHHhhllllllllleeeeeel
Query ...................................gtgTRTLsflgtpttthdsatvrid  327
ident                                                             
Sbjct pdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsGNAF..................  456
DSSP  llllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllLLLL..................


DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhh
Query ptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavi  387
ident                                                             
Sbjct ............................................................  456
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhl
Query gagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfa  447
ident                                                             
Sbjct ............................................................  456
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllllllllleeeeelllllLEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLH
Query dathppgfdatleatatydpsdLVLANGGHAAIVEIDASTYATRVTDFFAVEDCGTMINP  507
ident                            |     ||||  |          | | |   ||
Sbjct ......................HYFTYGVACSEVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNP  494
DSSP  ......................LEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL.LEEEEELL.LL
Query MIVEGQIRGGIAQAIGQTLLEEVIYDDFGQLVTTTLMDYLIPTTLDVP.DIRIRHLE.TP  565
ident  |  ||  |   |  |   |||  |   | | |     | ||     |   |   |   |
Sbjct AIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPtEFRVSLLRdCP  554
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLlEEEEEELLlLL


DSSP  LLLLHHHLLLLLLHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHH...........LLLLlEELLLHHHHH
Query SPLVPGGIKGMGESAMISAPaAVVAAVNDALAHL...........EVVIeTVPITPERIF  614
ident         |  ||         |  |  ||                      | ||| | 
Sbjct NKKAIYASKAVGEPPLFLGA.SVFFAIKDAIRAAraqhtnnntkeLFRL.DSPATPEKIR  612
DSSP  LLLLHHHLLLLLLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHhhhhlllllllLLLL.LLLLLHHHHH


DSSP  HHHHL...................ll
Query RSIQE...................rp  621
ident                           
Sbjct NACVDkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  HHLLLlllllllllllllllllllll


No 2: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=22.3

DSSP  ..............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEEE
Query ..............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrGAVAQYE   46
ident                                                         |   
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethCTIAIPK   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEEL


DSSP  LLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLL.LLHHHHHHHH
Query WTTQQLILWTATQMPSFVRTMVAMFCAIPEHLIEVRVPDVGGGFGQKAH.LHPEELLVCL  105
ident        |   ||        ||     |   | |||   ||||| |          | |
Sbjct GEEGEMELFVSTQNAMKTQSFVAKMLGVPVNRILVRVKRMGGGFGGKETrSTLVSVAVAL  120
DSSP  LLLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLlLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLEEEellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllll
Query LSRALGRPVRWiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlp  165
ident      | |||                                                  
Sbjct AAYKTGHPVRC.....mldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagn  175
DSSP  HHHHHLLLEEE.....ellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeel


DSSP  llhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query wtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraa  225
ident                                                             
Sbjct srdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmse  235
DSSP  llllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query rqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaear  285
ident                                                             
Sbjct vavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnk  295
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llleeeeeeeeeeeeeelLLHHHhhhllllLLLLLEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLH
Query argkylglgvsvfnevtgTGTRTlsflgtpTTTHDSATVRIDPTGKVTVTTSLASSGQGH  345
ident                     |               |       | | |       ||| 
Sbjct encwkkrglciiptkfgiSFTVP.......FLNQAGALIHVYTDGSVLVSHGGTEMGQGL  348
DSSP  hllleeeeeeeeeeeeeeLLLLH.......HHLEEEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLL.LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ETTLAQIAADVLGVPASDVVIQAGSTKNTY.GFGAYASRGAVIGAGSIGRAASIVRERVK  404
ident  |   | |   |  | |   |   ||          ||    |       |      |  
Sbjct HTKMVQVASKALKIPISKIYISETSTNTVPnSSPTAASVSTDIYGQAVYEACQTILKRLE  408
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLHHHEELLLEELLLLLlLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHlllhhheeeelleeeelleeeeEEEHHHHHHHHHHLHhhllllllLLLEEEEE
Query QLAGHLLeaasediviedglvhvagvpakGMPFAEVVGAAYFADathppgfdATLEATAT  464
ident                                     | |||             |  |  
Sbjct PFKKKNP......................DGSWEDWVMAAYQDR........VSLSTTGF  438
DSSP  HHHHHLL......................LLLHHHHHHHHHHLL........LLLEEEEE


DSSP  LLLLLL...........................................eeeeeeeeeee
Query YDPSDL...........................................vlangghaaiv  481
ident |    |                                                      
Sbjct YRTPNLgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidi  498
DSSP  EELLLLllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhh


DSSP  eeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll
Query eidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtt  541
ident                                                             
Sbjct gqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkka  558
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllllll


DSSP  llllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlev  601
ident                                                             
Sbjct iyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdk  618
DSSP  hhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllll


DSSP  llleelllhhhhhhhhhlll
Query vietvpitperifrsiqerp  621
ident                     
Sbjct fttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllllllllllllllllll


No 3: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=13.0

DSSP  .................LEEEEEE....eLLLHhhhhhlleeeeEEEEELLLLLLLL...
Query .................VSRTSRA....rDELApifassagvvrGQFSCGRVSACPM...   36
ident                               |                             
Sbjct iitiedaiknnsfygseLKIEKGDlkkgfSEAD.........nvVSGELYIGGQDHFyle   51
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeEEEEELLhhhhhHHLL.........eeEEEEEEELLLLLLlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   36
ident                                                             
Sbjct thctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrs  111
DSSP  lleeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllll


DSSP  ..........................LLLEeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhh
Query ..........................ETRGavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvam   70
ident                                                             
Sbjct tlvsvavalaayktghpvrcmldrneDMLI..............................  141
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhHHHH..............................


DSSP  hhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllL
Query fcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathA  130
ident                                                             
Sbjct ......................................................tggrhP  147
DSSP  ......................................................lllllL


DSSP  LLEEEEEEEEELlllleEEEEeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeEE
Query KQQRNEMGLAFDgdgrfLALEnrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavSE  190
ident    |   |                                                    
Sbjct FLARYKVGFMKT.....GTIV.....................................AL  165
DSSP  EEEEEEEEELLL.....LLEE.....................................EE


DSSP  EEE..................................EELLLLL.......lllLLLLLL
Query ESI..................................AVATNKC.......pigAYRGVG  209
ident |                                         |                 
Sbjct EVDhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgTGRLCKTnlssntafrgFGGPQA  225
DSSP  EEEeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeEEEEEELllllllllllLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhHHLLLLlhhhLLEELLL...lLEELLL..LHHHH
Query FTAGQIARETLIDraarqlglspfeiRRRNVVmpedFPFTNRL...gQTHREG..TYLQT  264
ident                                                             
Sbjct LFIAENWMSEVAV........tcglpAEEVRWknmyKEGDLTHfnqrLEGFSVprCWDEC  277
DSSP  HHHHHHHHHHHHH........hhlllHHHHHHhhllLLLLLLLllllLLLLLHhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHllleEEEEEEEEEEEEELL....................
Query INLLEEMVNPEAFRQRQAEARargkYLGLGVSVFNEVTGT....................  304
ident                   |          |        |                     
Sbjct LKSSQYYARKSEVDKFNKENC....WKKRGLCIIPTKFGIsftvpflnqagalihvytdg  333
DSSP  HHHLLHHHHHHHHHHHHHHLL....LEEEEEEEEEEEEEEllllhhhleeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  304
ident                                                             
Sbjct svlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiyg  393
DSSP  leeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhh


DSSP  ................................................lhhhhhhllLLL
Query ................................................gtrtlsflgTPT  316
ident                                                             
Sbjct qavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetNSG  453
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllLLL


DSSP  Lllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllll
Query Tthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntyg  376
ident                                                             
Sbjct N...........................................................  454
DSSP  L...........................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeee
Query fgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmp  436
ident                                                             
Sbjct ............................................................  454
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellLLLLEEEEEEEEEEEEEEllllLEEEEEEE
Query faevvgaayfadathppgfdatleatatydPSDLVLANGGHAAIVEIDastyATRVTDFF  496
ident                                                             
Sbjct .............................aFHYFTYGVACSEVEIDCL....TGDHKNLR  481
DSSP  .............................lLLEEEEEEEEEEEEEELL....LLLEEEEE


DSSP  EEEELLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllLLLLLL..lLLL
Query AVEDCGT......mINPMIVEGQIRGGIAQAIGqtlleeviyddfgqlVTTTLM..dYLI  548
ident               |    |||    |                                 
Sbjct TDIVMDVgsslnpaIDIGQVEGAFVQGLGLFTL.......eelhyspeGSLHTRgpsTYK  534
DSSP  EEEEEELlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......llllllllLLLLLLlllLLL


DSSP  LLLLlLLLEEEEELLLL.LLLL....HHHLL..LLLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query PTTLdVPDIRIRHLETP.SPLV....PGGIK..GMGESAMiSAPAAVVAAVNDALAHLEV  601
ident            |       |                     |   |   |   | |    
Sbjct IPAFgSIPTEFRVSLLRdCPNKkaiyASKAVgePPLFLGA.SVFFAIKDAIRAARAQHTN  593
DSSP  LLLHhHLLLEEEEEELLlLLLLllhhHLLLLllLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  .....LLLEEL.....LLHHHHHhhHHLLL.................
Query .....VIETVP.....ITPERIFrsIQERP.................  621
ident                                                
Sbjct nntkeLFRLDSpatpeKIRNACV..DKFTTlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lllllLLLLLLlllhhHHHHHLL..LLLLLlllllllllllllllll


No 4: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=9.3

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct ...........................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfsead   33
DSSP  ...........................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhll


DSSP  eelllhhhhhhlllllllLLEEEEEELLL.LLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLL
Query vtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRIDPT.GKVTVTTSLAssgqgHETTLAQIAADVLGV  359
ident                               |      |                |  |||
Sbjct nvvsgelyiggqdhfyleTHCTIAIPKGEeGEMELFVSTQ.....NAMKTQSFVAKMLGV   88
DSSP  eeeeeeeeelllllllllLLEEEEEELLLlLLEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LHHHEEEELLLlllllLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhee
Query PASDVVIQAGStkntyGFGAYaSRGAVIGAGSIGRAASIVRERVkqlaghlleaasediv  419
ident |                 |                 |                       
Sbjct PVNRILVRVKR.....MGGGF.GGKETRSTLVSVAVALAAYKTG................  126
DSSP  LHHHEEEEELL.....LLLLL.LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL................


DSSP  eelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllLEEEEEL..............
Query iedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatLEATATY..............  465
ident                                                             
Sbjct .......................................HPVRCMLdrnedmlitggrhp  147
DSSP  .......................................LLEEEELlhhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct flarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlc  207
DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct ktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrleg  267
DSSP  elllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct fsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagali  327
DSSP  llhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct hvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasv  387
DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct stdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgys  447
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeelllllll


DSSP  ...................................llllleeeeeeeeeeeeeellllle
Query ...................................dpsdlvlangghaaiveidastyat  490
ident                                                             
Sbjct fetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvq  507
DSSP  lllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query rvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipt  550
ident                                                             
Sbjct glglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavge  567
DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllll


DSSP  lllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllh
Query tldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitp  610
ident                                                             
Sbjct pplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtga  627
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhlll
Query erifrsiqerp  621
ident            
Sbjct pgnckpwslrv  638
DSSP  lllllllllll


No 5: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=8.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .............................................leeeeeeelllhhhh
Query .............................................vsrtsrardelapif   15
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  hhlleeeeeeeeellLLLLLllLLEEEEEEELlLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHH
Query assagvvrgqfscgrVSACPmeTRGAVAQYEWtTQQLILWTATQ.....MPSFVRTMVAM   70
ident                         ||                                  
Sbjct krglciiptkfgisfTVPFL.nQAGALIHVYT.DGSVLVSHGGTemgqgLHTKMVQVASK  358
DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHH.lEEEEEEEELL.LLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHEEEE.......lllllLLLLLLLL.lLHHHHHHHHHHHHH............
Query FCAIPEHLIEVR.......vpdvgGGFGQKAH.lHPEELLVCLLSRAL............  110
ident    ||   |                                |                  
Sbjct ALKIPISKIYISetstntvpnsspTAASVSTDiyGQAVYEACQTILKRlepfkkknpdgs  418
DSSP  HHLLLHHHEELLleelllllllllLLLLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllll


DSSP  .............LLLEEEELlhhHHHHhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeee
Query .............GRPVRWIEdrqENFLgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitd  157
ident                                                             
Sbjct wedwvmaayqdrvSLSTTGFY...RTPN................................  443
DSSP  hhhhhhhhhhlllLLEEEEEE...ELLL................................


DSSP  llllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhh
Query ggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiar  217
ident                                                             
Sbjct ............................................................  443
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query etlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeaf  277
ident                                                             
Sbjct ............................................................  443
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeel
Query rqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvtts  337
ident                                                             
Sbjct ............................................................  443
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query lassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraas  397
ident                                                             
Sbjct ............................................................  443
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllll
Query ivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfda  457
ident                                                             
Sbjct .............................lgysfetnsgnafhyftygvacseveidclt  474
DSSP  .............................lllllllllllllleeeeeeeeeeeeeelll


DSSP  lleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh
Query tleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirgg  517
ident                                                             
Sbjct gdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstyk  534
DSSP  lleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhlllll
Query iaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmg  577
ident                                                             
Sbjct ipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnn  594
DSSP  lllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query esamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                             
Sbjct ntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 6: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=6.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................leeeeeeelllhhhhhhlL
Query .........................................vsrtsrardelapifassA   19
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwK  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllE


DSSP  EEEEEEEEELLLL...............................................
Query GVVRGQFSCGRVS...............................................   32
ident                                                             
Sbjct KRGLCIIPTKFGIsftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  EEEEEEEEEEEEEllllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..llllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllll
Query ..acpmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggf   90
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhLLLLlLEEEEEEEEELL.LLLEEE
Query gqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgATHAkQQRNEMGLAFDG.DGRFLA  149
ident                                                    |   |    
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFT.YGVACSEVEIDClTGDHKN  479
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEE.EEEEEEEEEEELlLLLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLLLLllLLHHHLHHHHHHL.LLLLLL........................
Query LENRSITDGGAYNNlpWTQLVESHVGNAV.ILGVYK........................  184
ident |      | |   |                                              
Sbjct LRTDIVMDVGSSLN.pAIDIGQVEGAFVQgLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipaf  538
DSSP  EEEEEEEELLLLLL.hHHHHHHHHHHHHHhHHHHHLlllllllllllllllllllllllh


DSSP  .lleEEEEEEEE.LLLL.....LLLLLLlLLLHHHHhHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhh
Query .vpaVSEESIAV.ATNK.....CPIGAYrGVGFTAGqIARETLIDRAARQLGLspfeirr  237
ident                                    |       |  | |           
Sbjct gsipTEFRVSLLrDCPNkkaiyASKAVG.EPPLFLG.ASVFFAIKDAIRAARA.......  589
DSSP  hhllLEEEEEELlLLLLlllhhHLLLLL.LLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHH.......


DSSP  lllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleEEEEEEEE
Query rnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkYLGLGVSV  297
ident                                                             
Sbjct .............................................qhtnnntKELFRLDS  604
DSSP  .............................................hhlllllLLLLLLLL


DSSP  Eeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query Fnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvl  357
ident                                                             
Sbjct P...........................................................  605
DSSP  L...........................................................


DSSP  lllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query gvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaased  417
ident                                                             
Sbjct ............................................................  605
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeee
Query iviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlanggh  477
ident                                                             
Sbjct ............................................................  605
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
Query aaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgq  537
ident                                                             
Sbjct ............................................................  605
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndala  597
ident                                                             
Sbjct ...................................................atpekirna  614
DSSP  ...................................................llhhhhhhh


DSSP  hhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query hlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                         
Sbjct cvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllllllllllllllllllllll


No 7: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......................................leeeeeeelllhhhhhHLLEE
Query .......................................vsrtsrardelapifaSSAGV   21
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkENCWK  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhHLLLE


DSSP  EEEEEEELLLLL................................................
Query VRGQFSCGRVSA................................................   33
ident  ||                                                         
Sbjct KRGLCIIPTKFGisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  EEEEEEEEEEEEellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   33
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  ......................................Lllllleeeeeeelllleeeee
Query ......................................Cpmetrgavaqyewttqqlilw   55
ident                                                             
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyF.....................  459
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleE.....................


DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllee
Query tatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvr  115
ident                                                             
Sbjct ............................................................  459
DSSP  ............................................................


DSSP  eellhhhhhhhlLLLlLEEEEEEEEEllllLEEEEEE.EEEEELLLL...lLLLL..LHH
Query wiedrqenflgaTHAkQQRNEMGLAFdgdgRFLALEN.RSITDGGAY...nNLPW..TQL  169
ident             |       |               | |                     
Sbjct ............TYG.VACSEVEIDC....LTGDHKNlRTDIVMDVGsslnPAIDigQVE  502
DSSP  ............EEE.EEEEEEEEEL....LLLLEEEeEEEEEEELLllllHHHHhhHHH


DSSP  HlHHHHHHLLLLL....................lllleeeEEEEEELLL.........ll
Query VeSHVGNAVILGV....................ykvpavsEESIAVATN.........kc  200
ident      |                                   |                  
Sbjct GaFVQGLGLFTLEelhyspegslhtrgpstykipafgsipTEFRVSLLRdcpnkkaiyas  562
DSSP  HhHHHHHHHHHLLllllllllllllllllllllllhhhllLEEEEEELLlllllllhhhl


DSSP  llLLLL.lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhlllllhhhlleellllleelll
Query piGAYR.gVGFTAGQIARETLIDRAARQLGlspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthreg  259
ident                 |    |  |  |                                
Sbjct kaVGEPplFLGASVFFAIKDAIRAARAQHT..............................  592
DSSP  llLLLLlhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..............................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllll
Query tylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttth  319
ident                                                             
Sbjct ............................................................  592
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll
Query dsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfga  379
ident                                                             
Sbjct ............................................................  592
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhh
Query yasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfae  439
ident                                                             
Sbjct ............................................................  592
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeee
Query vvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffave  499
ident                                                             
Sbjct ............................................................  592
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleee
Query dcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdiri  559
ident                                                             
Sbjct ............................................................  592
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhl
Query rhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqe  619
ident                                                             
Sbjct ................nnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwsl  636
DSSP  ................lllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllll


DSSP  ll
Query rp  621
ident   
Sbjct rv  638
DSSP  ll


No 8: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.3

DSSP  .....leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeee
Query .....vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilw   55
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllee
Query tatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvr  115
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  eellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhh
Query wiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvg  175
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  hhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query navilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfei  235
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeee
Query rrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgv  295
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  eeeeeeelllhhhhhhlllllllLLEEEEEELllllEEEEELL....llLLLL..HHHHH
Query svfnevtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRIDptgkVTVTTSL....asSGQG..HETTL  349
ident                             |  |      |  |        |         
Sbjct krglciiptkfgisftvpflnqaGALIHVYTD....GSVLVSHggtemgQGLHtkMVQVA  356
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeEEEEEELLL....LLEEEEEllllllLLHHhhHHHHH


DSSP  HHHHHHhhlllhhheEEELLLLL.......lllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query AQIAADvlgvpasdvVIQAGSTK.......ntygfgaYASRGAVIGAGSIGRAASIVRER  402
ident                 |    |                                      
Sbjct SKALKI......pisKIYISETStntvpnssptaasvSTDIYGQAVYEACQTILKRLEPF  410
DSSP  HHHHLL......lhhHEELLLEEllllllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllLLLLEEE
Query vkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfDATLEAT  462
ident                                                             
Sbjct ....................................kkknpdgswedwvmaayQDRVSLS  434
DSSP  ....................................hhhlllllhhhhhhhhhHLLLLLE


DSSP  EEL.............................................llllleeeeeee
Query ATY.............................................dpsdlvlanggh  477
ident  |                                                          
Sbjct TTGfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnp  494
DSSP  EEEeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllh


DSSP  eeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
Query aaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgq  537
ident                                                             
Sbjct aidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcp  554
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllll


DSSP  llllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndala  597
ident                                                             
Sbjct nkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirna  614
DSSP  llllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  hhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query hlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                         
Sbjct cvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllllllllllllllllllllll


No 9: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ..................................................leeeeeeell
Query ..................................................vsrtsrarde   10
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhlleeeeeeeeelllllllLLLL...............................
Query lapifassagvvrgqfscgrvsacpMETR...............................   39
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlEGFSvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllLLLLhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  ........................................EEEEEEELL.........lL
Query ........................................GAVAQYEWT.........tQ   50
ident                                           ||  |             
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftYGVACSEVEidcltgdhknL  480
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeEEEEEEEEEeellllleeeE


DSSP  EEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.............................l
Query QLILWTAT.......qMPSFVRTMVAMFCA.............................i   74
ident                     |                                       
Sbjct RTDIVMDVgsslnpaiDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
DSSP  EEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhh


DSSP  LHHHEEEELLLLLLLL....LLLLLLLHhHHHHHHhHHHHLlleeeellhhhhhhhllll
Query PEHLIEVRVPDVGGGF....GQKAHLHPeELLVCLlSRALGrpvrwiedrqenflgatha  130
ident       |               ||   |  |     |                       
Sbjct IPTEFRVSLLRDCPNKkaiyASKAVGEP.PLFLGA.SVFFA...................  579
DSSP  LLLEEEEEELLLLLLLllhhHLLLLLLL.LHHHHH.HHHHH...................


DSSP  lleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeee
Query kqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavse  190
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleel
Query esiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftn  250
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhh
Query rlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtls  310
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query flgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqags  370
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelle
Query tkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagv  430
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllle
Query pakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyat  490
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query rvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipt  550
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllh
Query tldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitp  610
ident                                                             
Sbjct ............ikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtga  627
DSSP  ............hhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhlll
Query erifrsiqerp  621
ident            
Sbjct pgnckpwslrv  638
DSSP  lllllllllll


No 10: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........................leeeeeeelLLHHHHHH.................
Query ..........................vsrtsrardELAPIFAS.................   17
ident                                    |                        
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdECLKSSQYyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhHHHHHLLHhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ..lLEEEEEEEEELL.....LLLL...................................l
Query ..sAGVVRGQFSCGR.....VSAC...................................p   35
ident           |           |                                     
Sbjct krgLCIIPTKFGISFtvpflNQAGalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  eeeEEEEEEEEEELLllhhhLEEEeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllll
Query metrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkah   95
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEEELLL.........LL
Query lhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMGLAFDGD.........GR  146
ident                                                             
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFTYGVACSEVEidcltgdhkNL  480
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEEEEEEEEEEEeellllleeEE


DSSP  EEEEEEEEEeellllllllllhhhlhhHHHHLLLL.........................
Query FLALENRSItdggaynnlpwtqlveshVGNAVILG.........................  181
ident                                   |                         
Sbjct RTDIVMDVG............sslnpaIDIGQVEGafvqglglftleelhyspegslhtr  528
DSSP  EEEEEEELL............llllhhHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  ............llllLEEEEE..EEEEllllllllllllllhhHHHHHHHHHHhHHHHH
Query ............vykvPAVSEE..SIAVatnkcpigayrgvgftAGQIARETLIdRAARQ  227
ident                   ||                        |       |       
Sbjct gpstykipafgsipteFRVSLLrdCPNK.........kaiyaskAVGEPPLFLG.ASVFF  578
DSSP  lllllllllhhhllleEEEEELllLLLL.........llhhhllLLLLLLHHHH.HHHHH


DSSP  HLllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query LGlspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearar  287
ident                                                             
Sbjct AI..........................................................  580
DSSP  HH..........................................................


DSSP  leeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhh
Query gkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghet  347
ident                                                             
Sbjct ............................................................  580
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query tlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqla  407
ident                                                             
Sbjct ............................................................  580
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelll
Query ghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydp  467
ident                                                             
Sbjct ............................................................  580
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query sdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtll  527
ident                                                             
Sbjct ............................................................  580
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhh
Query eeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaa  587
ident                                                             
Sbjct ....................................kdairaaraqhtnnntkelfrlds  604
DSSP  ....................................hhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query vvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                   
Sbjct patpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 11: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.3

DSSP  ............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEEELL
Query ............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrGAVAQYEWT   48
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfyleTHCTIAIPK   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEL


DSSP  ....LLEEEEEellllhhhHHHHHHHHHL......llhhHEEEELLLLlllllllllllh
Query ....TQQLILWtatqmpsfVRTMVAMFCA......ipehLIEVRVPDVgggfgqkahlhp   98
ident        |                  | |          |  |                 
Sbjct geegEMELFVS......tqNAMKTQSFVAkmlgvpvnriLVRVKRMGG.....gfggket  109
DSSP  llllLEEEEEL......llLHHHHHHHHHhhhlllhhheEEEELLLLL.....lllllll


DSSP  hHHHHHHHHHHHL......LLEEEellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeee
Query eELLVCLLSRALG......RPVRWiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalen  152
ident    ||                                                       
Sbjct rSTLVSVAVALAAyktghpVRCMLdrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdh  169
DSSP  lLHHHHHHHHHHHhhhlllEEEELlhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeee


DSSP  eeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhh
Query rsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgfta  212
ident                                                             
Sbjct ysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfia  229
DSSP  eeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhh
Query gqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemv  272
ident                                                             
Sbjct enwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarkse  289
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllle
Query npeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkv  332
ident                                                             
Sbjct vdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglh  349
DSSP  hhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhh


DSSP  eeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhh
Query tvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsi  392
ident                                                             
Sbjct tkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlep  409
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhll
Query graasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathp  452
ident                                                             
Sbjct fkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseve  469
DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeee


DSSP  llllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhh
Query pgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmiveg  512
ident                                                             
Sbjct idcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrg  529
DSSP  eellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhh
Query qirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpgg  572
ident                                                             
Sbjct pstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaara  589
DSSP  llllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query ikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                  
Sbjct qhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 12: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct .................................................iitiedaiknn   11
DSSP  .................................................lllhhhhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct sfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipkgeegemelfvs   71
DSSP  leeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeelllllleeeeel


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct tqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaayktghpvrc  131
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllleee


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct mldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhm  191
DSSP  ellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhll


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct dncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwkn  251
DSSP  lllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhh


DSSP  eelllhhhhhhllllLLLL.........................................
Query vtgtgtrtlsflgtpTTTH.........................................  319
ident                                                             
Sbjct mykegdlthfnqrleGFSVprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkf  311
DSSP  lllllllllllllllLLLHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  319
ident                                                             
Sbjct gisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyise  371
DSSP  eellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  319
ident                                                             
Sbjct tstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrv  431
DSSP  eellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlll


DSSP  ..............................LEEEEEEL.....lLLLE.EEEELL.....
Query ..............................DSATVRID.....pTGKV.TVTTSL.....  338
ident                                 |             |             
Sbjct slsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftyGVACSEVEidcltgDHKNlRTDIVMdvgss  491
DSSP  lleeeeeeellllllllllllllllleeeeEEEEEEEEeellllLEEEeEEEEEEellll


DSSP  .lLLLL..LHHHHHHHHHHHHHL.....................llhHHEE..EELLLL.
Query .aSSGQ..GHETTLAQIAADVLG.....................vpaSDVV..IQAGST.  371
ident           |    |                                            
Sbjct lnPAIDigQVEGAFVQGLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipafGSIPteFRVSLLr  551
DSSP  llHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllllllllllllllhHHLLleEEEEELl


DSSP  ..llllllllLLLLHHHhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...lhHHEE...EELL
Query ..kntygfgaYASRGAViGAGSIGrAASIVRERVKQLAGHLLEA...asEDIV...IEDG  423
ident               |                      |                      
Sbjct dcpnkkaiyaSKAVGEP.PLFLGA.SVFFAIKDAIRAARAQHTNnntkeLFRLdspATPE  609
DSSP  lllllllhhhLLLLLLL.LHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllLLLLlllLLHH


DSSP  EEEelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeee
Query LVHvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaivei  483
ident                                                             
Sbjct KIR.........................................................  612
DSSP  HHH.........................................................


DSSP  ellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllll
Query dastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttl  543
ident                                                             
Sbjct ............................................................  612
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query mdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvi  603
ident                                                             
Sbjct ....................................................nacvdkft  620
DSSP  ....................................................hhllllll


DSSP  leelllhhhhhhhhhlll
Query etvpitperifrsiqerp  621
ident                   
Sbjct tlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllllllllllllllll


No 13: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........................................leeeeeeelllhhhhhhl
Query ..........................................vsrtsrardelapifass   18
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  leeeeeeeeelllLLLLlllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query agvvrgqfscgrvSACPmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehl   78
ident              |                                              
Sbjct krglciiptkfgiSFTV...........................................  317
DSSP  eeeeeeeeeeeeeLLLL...........................................


DSSP  eeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEE
Query ievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMG  138
ident                                                      |      
Sbjct .................................................pflnQAGALIH  328
DSSP  .................................................hhhlEEEEEEE


DSSP  EEEllllleEEEEEEEEEEllllllllllhhhlhHHHHHLLLL..LLLLLEEEEE...ee
Query LAFdgdgrfLALENRSITDggaynnlpwtqlvesHVGNAVILG..VYKVPAVSEE...si  193
ident                                        |                    
Sbjct VYT.....dGSVLVSHGGT........emgqglhTKMVQVASKalKIPISKIYISetstn  375
DSSP  ELL.....lLLEEEEELLL........lllllhhHHHHHHHHHhhLLLHHHEELLleell


DSSP  eellllllLLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhlllllhhhlleelll
Query avatnkcpIGAY.rGVGFTAGQIARETLIDRAARQLGLspfeirrrnvvmpedfpftnrl  252
ident                    |   |  |   |                             
Sbjct tvpnssptAASVstDIYGQAVYEACQTILKRLEPFKKK......................  413
DSSP  llllllllLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH......................


DSSP  lleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhl
Query gqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsfl  312
ident                                                             
Sbjct ............................................................  413
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllll
Query gtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstk  372
ident                                                             
Sbjct ............................................................  413
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleee
Query ntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpa  432
ident                                                             
Sbjct ............................................................  413
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleee
Query kgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrv  492
ident                                                             
Sbjct ............................................................  413
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLL........................
Query tdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigQTLLE........................  528
ident                                 |                           
Sbjct .....npdgswedwvmaayqdrvslsttgfyRTPNLgysfetnsgnafhyftygvacsev  468
DSSP  .....lllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeELLLLllllllllllllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  528
ident                                                             
Sbjct eidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtr  528
DSSP  eeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  .................lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhh
Query .................eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpg  571
ident                                                             
Sbjct gpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaar  588
DSSP  lllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query gikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                   
Sbjct aqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 14: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleeLLLL......hhhhhhhhhhhhLHHHHHHHhhhhhllleeEEEE
Query vmpedfpftnrlgqthREGT......ylqtinlleemvNPEAFRQRqaearargkyLGLG  294
ident                                                             
Sbjct ...............iITIEdaiknnsfygselkiekgDLKKGFSE.........aDNVV   36
DSSP  ...............lLLHHhhhhllleeeeeeeeeelLHHHHHHH.........lLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLHhhhhhllllllLLLEEeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhh
Query VSVFNEVTGTGTrtlsflgtpttTHDSAtvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaa  354
ident                                                             
Sbjct SGELYIGGQDHF...........YLETH................................   53
DSSP  EEEEEELLLLLL...........LLLLL................................


DSSP  hhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query dvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaa  414
ident                                                             
Sbjct ............................ctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakm   85
DSSP  ............................eeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleEEEE..LLLL..ll
Query sediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleATAT..YDPS..dl  470
ident                                                             
Sbjct lgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaayktghpvrcMLDRneDMLItggr  145
DSSP  hlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeELLHhhHHHHllll


DSSP  eEEEEEEEEEEEEelllllEEEEEEEEEEELLL...lLLHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhl
Query vLANGGHAAIVEIdastyaTRVTDFFAVEDCGT...mINPMIVEGQIRGGIaQAIGqtll  527
ident                                                             
Sbjct hPFLARYKVGFMK.....tGTIVALEVDHYSNAgnsrDLSHSIMERALFHM.DNCY....  195
DSSP  lLEEEEEEEEELL.....lLLEEEEEEEEEEEEelllLLHHHHHHHHHHLL.LLLL....


DSSP  lllllllllllllllllllllllllLLLLEEEEELLLLLLlLHHH...lllLLLHHHHHH
Query eeviyddfgqlvtttlmdylipttlDVPDIRIRHLETPSPlVPGG...ikgMGESAMISA  584
ident                            | ||                     |  |   |
Sbjct .........................KIPNIRGTGRLCKTN.LSSNtafrgfGGPQALFIA  229
DSSP  .........................LLLLEEEEEEEEELL.LLLLllllllLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHhhhllLLLE.ELLL..................................
Query PAAVVAAVNDALahlevVIET.VPIT..................................  609
ident                       |                                     
Sbjct ENWMSEVAVTCG.....LPAEeVRWKnmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyy  284
DSSP  HHHHHHHHHHHL.....LLHHhHHHHhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct arksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtem  344
DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct gqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtil  404
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct krlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygva  464
DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct cseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegs  524
DSSP  eeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct lhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdai  584
DSSP  lllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhHLLL..........................................
Query perifrsiQERP..........................................  621
ident                                                       
Sbjct raaraqhtNNNTkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hhhhhhhlLLLLlllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 15: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ....................leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllle
Query ....................vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrg   40
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  eeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhh
Query avaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpee  100
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query llvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdgga  160
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  lllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query ynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretl  220
ident                                                             
Sbjct krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query idraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqr  280
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  hhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlllllllLLEEEEEEL..........lll
Query qaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRID..........ptg  330
ident                                                             
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEveidcltgdhknl  480
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEEEeeeellllleeee


DSSP  LEEEEELLL.LLLL.LHHHHHHHHHHHHHL.............................l
Query KVTVTTSLA.SSGQ.GHETTLAQIAADVLG.............................v  359
ident           |                 ||                              
Sbjct RTDIVMDVGsSLNPaIDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
DSSP  EEEEEEELLlLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhh


DSSP  LHHHEEEELLLLlllllllllllLHHHhhhHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHL.......
Query PASDVVIQAGSTkntygfgayasRGAVigaGSIGRAASiVRERVKQLAGHLLE.......  412
ident                                                |            
Sbjct IPTEFRVSLLRD.cpnkkaiyasKAVG...EPPLFLGA.SVFFAIKDAIRAARaqhtnnn  595
DSSP  LLLEEEEEELLL.llllllhhhlLLLL...LLLHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhhhllll


DSSP  ...llhHHEEeelleeeeLLEE.EEEEehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellll
Query ...aasEDIViedglvhvAGVP.AKGMpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydps  468
ident        |                                                    
Sbjct tkelfrLDSP.......aTPEKiRNAC.................................  615
DSSP  llllllLLLL.......lLHHHhHHHL.................................


DSSP  lleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlle  528
ident                                                             
Sbjct ............................................................  615
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhh
Query eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaav  588
ident                                                             
Sbjct ............................................................  615
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query vaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                  
Sbjct ..........vdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  ..........lllllllllllllllllllllll


No 16: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................leeeeeeelllhhhhhh
Query ...........................................vsrtsrardelapifas   17
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  lleeeEEEEEELLLLLL...........................................
Query sagvvRGQFSCGRVSAC...........................................   34
ident            |                                                
Sbjct krglcIIPTKFGISFTVpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  eeeeeEEEEEEEELLLLhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .llllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllll
Query .pmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqk   93
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEE.....eeelllllee
Query ahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMG.....lafdgdgrfl  148
ident                                                             
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACseveidcltgdhknl  480
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEeeeeeellllleeee


DSSP  eEEEEEEEELlllllllllhhhlhHHHHHL.LLLL.........................
Query aLENRSITDGgaynnlpwtqlvesHVGNAV.ILGV.........................  182
ident                                                             
Sbjct rTDIVMDVGS.......slnpaidIGQVEGaFVQGlglftleelhyspegslhtrgpsty  533
DSSP  eEEEEEELLL.......lllhhhhHHHHHHhHHHHhhhhhllllllllllllllllllll


DSSP  ......LLLLEEEEEEE.eELLLLLLlllllllLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query ......YKVPAVSEESI.aVATNKCPigayrgvGFTAGqiaretlidraarqlglspfei  235
ident                        |                                    
Sbjct kipafgSIPTEFRVSLLrdCPNKKAI..yaskaVGEPP......................  569
DSSP  llllhhHLLLEEEEEELllLLLLLLH..hhlllLLLLL......................


DSSP  hhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeee
Query rrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgv  295
ident                                                             
Sbjct ............................................................  569
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhh
Query svfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaad  355
ident                                                             
Sbjct ............................................................  569
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllh
Query vlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaas  415
ident                                                             
Sbjct ............................................................  569
DSSP  ............................................................


DSSP  hheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeee
Query ediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlang  475
ident                                                             
Sbjct ............................................................  569
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllll
Query ghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddf  535
ident                                                             
Sbjct ............................................................  569
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavnda  595
ident                                                             
Sbjct .................lflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekir  612
DSSP  .................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhh


DSSP  hhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query lahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                           
Sbjct nacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hhllllllllllllllllllllllll


No 17: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................v    1
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  eeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEELL.............
Query srtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmeTRGAVAQYEWT.............   48
ident                                                             
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFTYGVACSEveidcltgdhknl  480
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEEEEEEEEEeeeellllleeee


DSSP  LLEEEEEELLLL.hHHHHHHHH...................................hhh
Query TQQLILWTATQM.pSFVRTMVA...................................mfc   72
ident                     |                                       
Sbjct RTDIVMDVGSSLnpAIDIGQVEgafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
DSSP  EEEEEEELLLLLlhHHHHHHHHhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhh


DSSP  lllhHHEEEEL.LLLLLLlLLLLlllhhHHHHHHHhHHHLlleeeellhhhhhhhlllll
Query aipeHLIEVRV.PDVGGGfGQKAhlhpeELLVCLLsRALGrpvrwiedrqenflgathak  131
ident                                  |                          
Sbjct ipteFRVSLLRdCPNKKA.IYAS...kaVGEPPLF.LGAS....................  575
DSSP  llleEEEEELLlLLLLLL.HHHL...llLLLLLHH.HHHH....................


DSSP  leeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeee
Query qqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavsee  191
ident                                                             
Sbjct ............................................................  575
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleell
Query siavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnr  251
ident                                                             
Sbjct ............................................................  575
DSSP  ............................................................


DSSP  llleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhh
Query lgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsf  311
ident                                                             
Sbjct ............................................................  575
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellll
Query lgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagst  371
ident                                                             
Sbjct ............................................................  575
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeellee
Query kntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvp  431
ident                                                             
Sbjct ............................................................  575
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeelllllee
Query akgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatr  491
ident                                                             
Sbjct ............................................................  575
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllll
Query vtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdyliptt  551
ident                                                             
Sbjct ............................................................  575
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhh
Query ldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitpe  611
ident                                                             
Sbjct .......vffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgap  628
DSSP  .......hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhlll
Query rifrsiqerp  621
ident           
Sbjct gnckpwslrv  638
DSSP  llllllllll


No 18: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  ..........leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeelllllLllllleeeeeeellll
Query ..........vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsaCpmetrgavaqyewttq   50
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyigG................   44
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelL................


DSSP  eeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhh
Query qlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsral  110
ident                                                             
Sbjct ............................................................   44
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeellhhhhhhhlLLLL...LEEEEEEEEEllllLEEEEEEEEEeellllllllll
Query grpvrwiedrqenflgaTHAK...QQRNEMGLAFdgdgRFLALENRSItdggaynnlpwt  167
ident                                            |                
Sbjct .................QDHFyleTHCTIAIPKG....EEGEMELFVS............   71
DSSP  .................LLLLlllLLEEEEEELL....LLLLEEEEEL............


DSSP  hhhlhhhhhhLLLL..LLLLLEEEEEE.EEELlllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query qlveshvgnaVILG..VYKVPAVSEES.IAVAtnkcpigayrgVGFTAGQIARETLIDRA  224
ident                    |                                        
Sbjct .tqnamktqsFVAKmlGVPVNRILVRVkRMGG....gfggketRSTLVSVAVALAAYKTG  126
DSSP  .lllhhhhhhHHHHhhLLLHHHEEEEElLLLL....lllllllLLHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  224
ident                                                             
Sbjct hpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimer  186
DSSP  lleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhh


DSSP  .......................................................hhhhl
Query .......................................................arqlg  229
ident                                                             
Sbjct alfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaee  246
DSSP  hhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  llhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllle
Query lspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargk  289
ident                                                             
Sbjct vrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglci  306
DSSP  hhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeee


DSSP  eeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhh
Query ylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettl  349
ident                                                             
Sbjct iptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipisk  366
DSSP  eeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  hhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query aqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlagh  409
ident                                                             
Sbjct iyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaa  426
DSSP  eellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh


DSSP  hhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllll
Query lleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsd  469
ident                                                             
Sbjct yqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivm  486
DSSP  hhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeee


DSSP  leeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query lvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtllee  529
ident                                                             
Sbjct dvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefr  546
DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleee


DSSP  llllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhh
Query viyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavv  589
ident                                                             
Sbjct vsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspa  606
DSSP  eeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query aavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                 
Sbjct tpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 19: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee
Query asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeEEEEE
Query edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangGHAAI  480
ident                                                           ||
Sbjct ..iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethCTIAI   58
DSSP  ..lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEE


DSSP  EEEEllllLEEEeEEEEEeellllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllllll
Query VEIDastyATRVtDFFAVedcgtminpmivegQIRGGIAQAIGQTLLeeviyddfgqlvt  540
ident                |                |            |              
Sbjct PKGE....EGEM.ELFVS.............tQNAMKTQSFVAKMLG.............   87
DSSP  ELLL....LLLE.EEEEL.............lLLHHHHHHHHHHHHL.............


DSSP  lllllllllLLLLLLLEEEEELLllllllhhhlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHH....
Query ttlmdylipTTLDVPDIRIRHLEtpsplvpggiKGMG.ESAMISAPAAVVAAVNDA....  595
ident                    |              |           |   ||        
Sbjct ........vPVNRILVRVKRMGG.........gFGGKeTRSTLVSVAVALAAYKTGhpvr  130
DSSP  ........lLHHHEEEEELLLLL.........lLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHLllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct cmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfh  190
DSSP  eellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct mdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwk  250
DSSP  llllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct nmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptk  310
DSSP  hllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct fgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyis  370
DSSP  eeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct etstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdr  430
DSSP  leellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct vslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgs  490
DSSP  llleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct slnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsll  550
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  595
ident                                                             
Sbjct rdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpek  610
DSSP  llllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhh


DSSP  ..hhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query ..lahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                             
Sbjct irnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hhhhllllllllllllllllllllllll


No 20: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct .................................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkk   27
DSSP  .................................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhh


DSSP  eelllhhhhhhlllLLLLlleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgtgtrtlsflgtPTTThdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
ident                                                             
Sbjct gfseadnvvsgelyIGGQ..........................................   45
DSSP  hhhhlleeeeeeeeELLL..........................................


DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee
Query asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   45
DSSP  ............................................................


DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelLLL.LLEEEEEEEEE
Query edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatyDPS.DLVLANGGHAA  479
ident                                              |              
Sbjct .............................................DHFyLETHCTIAIPK   60
DSSP  .............................................LLLlLLLLEEEEEEL


DSSP  eeeeellllleeeeeEEEEEELLLLllHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllllllllll
Query iveidastyatrvtdFFAVEDCGTMinPMIVEGQIRggiaqaigqtlleeviyddfgqlv  539
ident                             |                               
Sbjct ...........geegEMELFVSTQN..AMKTQSFVA........................   83
DSSP  ...........llllLEEEEELLLL..HHHHHHHHH........................


DSSP  lllllllllllllllllEEEEELLLLLLlLHHHL..lLLLLHHHHHHHHHHHH.......
Query tttlmdylipttldvpdIRIRHLETPSPlVPGGI..kGMGESAMISAPAAVVA.......  590
ident                                ||        |      |           
Sbjct .........kmlgvpvnRILVRVKRMGG.GFGGKetrSTLVSVAVALAAYKTGhpvrcml  133
DSSP  .........hhhlllhhHEEEEELLLLL.LLLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHLlleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct drnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdn  193
DSSP  lhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct cykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmy  253
DSSP  lllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct kegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgi  313
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct sftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisets  373
DSSP  llllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheelllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct tntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvsl  433
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct sttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgssln  493
DSSP  eeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct paidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdc  553
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeellll


DSSP  ......................................................hhhhhh
Query ......................................................avndal  596
ident                                                             
Sbjct pnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirn  613
DSSP  lllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhh


DSSP  hhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query ahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                          
Sbjct acvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hllllllllllllllllllllllll


No 21: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........................................leeeeeeelllhhhhhhl
Query ..........................................vsrtsrardelapifass   18
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  leeeeeeeeelllllllllllEEEEEEELL..lLEEEEEEllllhhhHHHHHHH......
Query agvvrgqfscgrvsacpmetrGAVAQYEWT..tQQLILWTatqmpsfVRTMVAM......   70
ident                       | |          |             |          
Sbjct krglciiptkfgisftvpflnQAGALIHVYtdgSVLVSHGgtemgqgLHTKMVQvaskal  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhlEEEEEEEELlllLEEEEELlllllllHHHHHHHhhhhhh


DSSP  .hhlllhhheeeellllllllllllLLLH.HHHHHHHHHHHHL.................
Query .fcaipehlievrvpdvgggfgqkaHLHP.EELLVCLLSRALG.................  111
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaaSVSTdIYGQAVYEACQTIlkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllLLHHhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  ..............LLEEEELLHH........hhHHHLllllleeeeeeeeellllleee
Query ..............RPVRWIEDRQ........enFLGAthakqqrnemglafdgdgrfla  149
ident                                                             
Sbjct dwvmaayqdrvslsTTGFYRTPNLgysfetnsgnAFHY......................  458
DSSP  hhhhhhhhllllleEEEEEELLLLllllllllllLLLE......................


DSSP  eeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllll
Query lenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvg  209
ident                                                             
Sbjct ............................................................  458
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhh
Query ftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlle  269
ident                                                             
Sbjct ............................................................  458
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeelll
Query emvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridpt  329
ident                                                             
Sbjct ............................................................  458
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhh
Query gkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgaviga  389
ident                                                             
Sbjct ............................................................  458
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhh
Query gsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfada  449
ident                                                             
Sbjct ....................................................ftygvacs  466
DSSP  ....................................................eeeeeeee


DSSP  hllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh
Query thppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmi  509
ident                                                             
Sbjct eveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslh  526
DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllll
Query vegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplv  569
ident                                                             
Sbjct trgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdaira  586
DSSP  lllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query pggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                     
Sbjct araqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 22: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................................leeeeeeelllhhhhhhlle
Query ........................................vsrtsrardelapifassag   20
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  eeeeeeeelllllLLLLLleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query vvrgqfscgrvsaCPMETrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlie   80
ident                                                             
Sbjct krglciiptkfgiSFTVP..........................................  318
DSSP  eeeeeeeeeeeeeLLLLH..........................................


DSSP  eellllLLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllllLLEEEEeeee
Query vrvpdvGGGFGqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathaKQQRNEmgla  140
ident                                                             
Sbjct ......FLNQA......................................gALIHVY....  330
DSSP  ......HHLEE......................................eEEEEEL....


DSSP  ellllleeeeeeEEEEElllLLLLLLLHHHLHHHHHHLLLlllllleeeEEEEEE.....
Query fdgdgrflalenRSITDggaYNNLPWTQLVESHVGNAVILgvykvpavsEESIAV.....  195
ident                                  |                          
Sbjct .........tdgSVLVShggTEMGQGLHTKMVQVASKALK......ipiSKIYISetstn  375
DSSP  .........lllLEEEEellLLLLLLHHHHHHHHHHHHHL......llhHHEELLleell


DSSP  .....lllllllLLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhlllllhhhlle
Query .....atnkcpiGAYR..GVGFTAGQIARETLIDRAARQLGlspfeirrrnvvmpedfpf  248
ident                        | |     |                            
Sbjct tvpnssptaasvSTDIygQAVYEACQTILKRLEPFKKKNPD...................  416
DSSP  llllllllllllHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...................


DSSP  ellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhh
Query tnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrt  308
ident                                                             
Sbjct ............................................................  416
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeel
Query lsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqa  368
ident                                                             
Sbjct ............................................................  416
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeel
Query gstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhva  428
ident                                                             
Sbjct ............................................................  416
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellll
Query gvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidasty  488
ident                                                             
Sbjct ............................................................  416
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllll
Query atrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdyli  548
ident                                                             
Sbjct ............................................................  416
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLE...
Query pttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlEVVIET...  605
ident                                                             
Sbjct ........................................gswedwvmaayQDRVSLstt  436
DSSP  ........................................llhhhhhhhhhHLLLLLeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  605
ident                                                             
Sbjct gfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpai  496
DSSP  eeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  605
ident                                                             
Sbjct digqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnk  556
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  605
ident                                                             
Sbjct kaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacv  616
DSSP  llhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhll


DSSP  ......elllhhhhhhhhhlll
Query ......vpitperifrsiqerp  621
ident                       
Sbjct dkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllllllllllllllllllll