No 1: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=45.4

DSSP  LLHHHLLLLLLLLLLHHHlllleelleelllLLEEEEEEEELHHHHHHHHHHLLEEEEEE
Query VDPFKAMEPDAPLLREDIkdkmtgahgarkhHNHIFRWEIGDKEGTDATFAKAEVVSKDM   60
ident      |   ||                     |  |   |   | |   || | |     
Sbjct MSGPAAAAEDAIEIHPGT.............PNVYFEQPIVKGEDTGPIFASADVTVEGD   47
DSSP  LLHHHHHLLLLLLLLLLL.............LLEEEEEEEEELLLHHHHHHHLLEEEEEE


DSSP  EEELLLlllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query FTYHRVhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident |   |                                                       
Sbjct FYVGRQ..phmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvan  105
DSSP  EEELLL..lllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeel


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllEELLEEEEEEEEELLLL
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsFARDYHMTTELAATKDG  180
ident                                                  |    || |||
Sbjct pmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgKRSPWEMNVKFAAKKDG  165
DSSP  lllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlllLLLLEEEEEEEEELLLL


DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLLLlllLLLLLH.HHLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLEElL
Query KILAMRCHVLADHGAFDACADpskWPAGFM.NICTGSYDMPVAHLAVDGVYTNKASGGvA  239
ident   |||    | |||      |                |  |        | ||   |  |
Sbjct TLLAMESDWLVDHGPYSEFGD...LLTLRGaQFIGAGYNIPNIRGLGRTVATNHVWGS.A  221
DSSP  LEEEEEEEEEEELLLLLLLHH...HHHHHHhHHLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLL.L


DSSP  LLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLHHhllEELLLLLEELLLLHHH
Query YRCsFRVTEAVYAIERAIETLAQRLEMDSADLRIKNFIQPEqfpYMAPLGWEYDSGNYPL  299
ident  |          | |     ||  | ||   || ||   |       | | |      | 
Sbjct FRG.YGAPQSMFASECLMDMLAEKLGMDPLELRYKNAYRPG...DTNPTGQEPEVFSLPD  277
DSSP  LLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLLL...LLLLLLLLLLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHhhLHHHHHHHHHHHHhhhhlllLLEEEEEEEEEEELLLlllllllleelleel
Query AMKKAMDtvGYHQLRAEQKAKQeafkrgeTREIMGIGISFFTEIVgagpskncdilgvsm  359
ident           |                       | |||                     
Sbjct MIDQLRP..KYQAALEKAQKES......tATHKKGVGISIGVYGS...............  314
DSSP  HHHHHHH..HHHHHHHHHHHHL......lLLEEEEEEEEEEEEEL...............


DSSP  leeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllll
Query fdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapygl  419
ident                                                             
Sbjct ..........gldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgv  364
DSSP  ..........lllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeeh
Query gtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktm  479
ident                                                             
Sbjct apekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelka  424
DSSP  lhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEE
Query kelawasynspppnlepgleavnyydppNMTYPFGAYFCIMDIDVDTGVAKTRRFYALDD  539
ident                                |  |        || ||           |
Sbjct adkptkitgnwtasgathcdavtglgkpFVVYMYGVFMAEVTVDVATGQTTVDGMTLMAD  484
DSSP  llllleeeeeeellllllllllllllllLLLEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEE


DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEllllLEELLLLLLLLLLLLLLLL.LLEE
Query CGTRINPMIIEGQVHGGLTEAFAVAMGQEIRYdeqgNVLGASFMDFFLPTAVETP.KWET  598
ident  |   |     ||  |||      |               |       |     | |   
Sbjct LGSLCNQLATDGQIYGGLAQGIGLALSEDFED....IKKHATLVGAGFPFIKQIPdKLDI  540
DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL....LLLLLLLLLLLLLLHHHLLlLEEE


DSSP  EELLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLLLLLLLHHHHHHHHHH
Query DYTVTPSPHHPIGAKGVGESPHVGGVPCFSNAVNDAYAflnAGHIQMPHDAWRLWKVGEQ  658
ident  |   | |  | || |||| |         ||   |           |            
Sbjct VYVNHPRPDGPFGASGVGELPLTSPHAAIINAIKSATG...VRIYRLPAYPEKVLEALKA  597
DSSP  EELLLLLLLLHHHLLLLLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHL...LLLLLLLLLHHHHHHHHHL


DSSP  lllll
Query lglhv  663
ident      
Sbjct .....  597
DSSP  .....


No 2: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=20.1

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct .............msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegd   47
DSSP  .............llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeee


DSSP  eeelllLLLLLLLLEEEEEEElLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLL
Query ftyhrvHPSPLETCQCVASMDkIKGELTLWGTFQAPHVIRTVVSLISGLPEHKIHVIAPD  120
ident          | |     | |    |           |          ||        |  
Sbjct fyvgrqPHMPIEPDVAFAYMG.DDGKCYIHSKSIGVHLHLYMIAPGVGLEPDQLVLVANP  106
DSSP  eeelllLLLLLLLLEEEEEEL.LLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELL


DSSP  LLLLLLLLLLLLhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHLLeelleeeeeeeeellll
Query IGGGFGNKVGAYsGYVCAVVASIVLGVPVKWVEDRMENLSTTSfardyhmttelaatkdg  180
ident  || || |           ||    | ||            |                  
Sbjct MGGTFGYKFSPT.SEALVAVAAMATGRPVHLRYNYQQQQQYTG...............kr  150
DSSP  LLLLLLHHHLLL.LHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHLLL...............ll


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct spwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgr  210
DSSP  lleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeee


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct tvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqep  270
DSSP  eellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelllLLLLLllleelleeLL
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivGAGPSkncdilgvsMF  360
ident                                             |               
Sbjct evfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsGLDGP.........DA  321
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeelLLLLL.........LE


DSSP  EEEEEEELLLLLEEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHL...LLHHHEEEELLLLLLLLL
Query DSAEIRIHPTGSVIARMGTKSQGQGHETTYAQIIATELG...IPADDIMIEEGNTDTAPY  417
ident   |       |           |||            |         |     || | | 
Sbjct SEAWAELNADGTITVHTAWEDHGQGADIGCVGTAHEALRpmgVAPEKIKFTWPNTATTPN  381
DSSP  EEEEEEELLLLLEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhlLLHHHEEELLLLLLLLLL


DSSP  LLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhlllhhheeellleeeelleeeeee
Query GLGTYGSRSTPTAGAATAVAARKIKAKAQmiAAHMlevhegdlewdvdrfrvkglpekfk  477
ident      |||     | |  ||                                        
Sbjct SGPSGGSRQQVMTGNAIRVACENLLKACE..KPGG.........................  414
DSSP  LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLL.........................


DSSP  ehhHHHHHHHHLLlllllLLLEEEEEELLL...llllleeeeeeeeeeellllleeeeee
Query tmkELAWASYNSPppnlePGLEAVNYYDPP...nmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrf  534
ident                                                             
Sbjct .gyYTYDELKAAD.....KPTKITGNWTASgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvd  468
DSSP  .llLLHHHHHHLL.....LLLEEEEEEELLllllllllllllllllleeeeeeeeeeeee


DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllllllllllllll
Query yalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetp  594
ident                                                             
Sbjct vatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagf  528
DSSP  llllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllll


DSSP  lleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhh
Query kwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwk  654
ident                                                             
Sbjct pfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpayp  588
DSSP  llhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllh


DSSP  hhhhlllll
Query vgeqlglhv  663
ident          
Sbjct ekvlealka  597
DSSP  hhhhhhhhl


No 3: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=12.6

DSSP  llhhhlllllLLLLLHHHLLLleelleellllleEEEE.eeelhhhhHHHHhhlleEEEE
Query vdpfkamepdAPLLREDIKDKmtgahgarkhhnhIFRW.eigdkegtDATFakaevVSKD   59
ident           |    |                                |           
Sbjct ...msgpaaaAEDAIEIHPGT........pnvyfEQPIvkgedtgpiFASA.....DVTV   44
DSSP  ...llhhhhhLLLLLLLLLLL........lleeeEEEEeelllhhhhHHHL.....LEEE


DSSP  EEEELLLLLLLL................................................
Query MFTYHRVHPSPL................................................   71
ident                                                             
Sbjct EGDFYVGRQPHMpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlva  104
DSSP  EEEEEELLLLLLllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeee


DSSP  ......................................LLLEeeeeeelllleeeeeell
Query ......................................ETCQcvasmdkikgeltlwgtf   93
ident                                                             
Sbjct npmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqQQQY..................  146
DSSP  llllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhHHHL..................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeel
Query qaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwve  153
ident                                                             
Sbjct ............................................................  146
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhlleELLEEEEEEEEelllllEEEEeeeeeeelllllllllllllllllhhhl
Query drmenlsttsfARDYHMTTELAatkdgkILAMrchvladhgafdacadpskwpagfmnic  213
ident                                                             
Sbjct ......tgkrsPWEMNVKFAAK.....kDGTL............................  167
DSSP  ......lllllLEEEEEEEEEL.....lLLLE............................


DSSP  llllllllEEEEeeeelllLLLE.....................................
Query tgsydmpvAHLAvdgvytnKASG.....................................  236
ident                                                             
Sbjct ........LAME....sdwLVDHgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatn  215
DSSP  ........EEEE....eeeEEELllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeelll


DSSP  ........eLLLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhHHHHHLLlhhhllEELLL
Query ........gVAYRCsfRVTEAVYAIERAIETLAqrlemdsadLRIKNFIqpeqfpYMAPL  288
ident                              | |                       |    
Sbjct hvwgsafrgYGAPQ..SMFASECLMDMLAEKLG........mDPLELRY...knaYRPGD  262
DSSP  lllllllllLLHHH..HHHHHHHHHHHHHHHHL........lLHHHHHH...hhlLLLLL


DSSP  LL.......EELL.LLHHHHHHHHHHHhlHHHHHHHHHhhhhhhhllllleEEEEEEEEE
Query GW.......EYDS.GNYPLAMKKAMDTvgYHQLRAEQKakqeafkrgetreIMGIGISFF  340
ident                       |            |                   |    
Sbjct TNptgqepeVFSLpDMIDQLRPKYQAA..LEKAQKEST............aTHKKGVGIS  308
DSSP  LLlllllllLLLHhHHHHHHHHHHHHH..HHHHHHHLL............lLEEEEEEEE


DSSP  ELLLLLLLL...................................................
Query TEIVGAGPS...................................................  349
ident     | |                                                     
Sbjct IGVYGSGLDgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapek  368
DSSP  EEEEELLLLllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  349
ident                                                             
Sbjct ikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkp  428
DSSP  eeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllll


DSSP  ..........llLEEL....lEELLeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhh
Query ..........knCDIL....gVSMFdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiia  395
ident                         |                                   
Sbjct tkitgnwtasgaTHCDavtglGKPF...................................  453
DSSP  leeeeeeellllLLLLlllllLLLL...................................


DSSP  hhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query telgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlev  455
ident                                                             
Sbjct ............................................................  453
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeellLLLLLLEEE
Query hegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydpPNMTYPFGA  515
ident                                                        |    
Sbjct ...................................................VVYMYGVFM  462
DSSP  ...................................................LLEEEEEEE


DSSP  EEEEEEEEllllLEEEEEEEEEEELLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllll
Query YFCIMDIDvdtgVAKTRRFYALDDCGT......rINPMIIEGQVHGGLTEAFAvamgqei  569
ident      |         |                       | |    |   |         
Sbjct AEVTVDVA....TGQTTVDGMTLMADLgslcnqlATDGQIYGGLAQGIGLALS.......  511
DSSP  EEEEEELL....LLLEEEEEEEEEEELlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......


DSSP  eellllleelLLLLLL....lLLLLLlLLLL.EEEELLLLLLL....lLLLLL..LLLLH
Query rydeqgnvlgASFMDF....fLPTAVeTPKW.ETDYTVTPSPH....hPIGAK..GVGES  618
ident                                   |      |                 |
Sbjct .......edfEDIKKHatlvgAGFPFiKQIPdKLDIVYVNHPRpdgpfGASGVgeLPLTS  564
DSSP  .......lllLLLLLLlllllLLLLLhHHLLlLEEEEELLLLLlllhhHLLLLllHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllLLLL......LLHHHHHHhhhhlllll
Query PHVGGVPCFSNAVNdayaflnaghIQMP......HDAWRLWKvgeqlglhv  663
ident ||         |                           |           
Sbjct PHAAIINAIKSATG.........vRIYRlpaypeKVLEALKA.........  597
DSSP  HHHHHHHHHHHHHL.........lLLLLllllhhHHHHHHHL.........


No 4: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=6.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhh
Query ........vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfak   52
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  lleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHH
Query aevvskdmftyhrvhpspleTCQCVASMDkIKGELTLWGTFQ.....APHVIRTVVSLIS  107
ident                          |      |  |           |            
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpdASEAWAELN.ADGTITVHTAWEdhgqgADIGCVGTAHEAL  359
DSSP  eeeeeeeeeeeeelllllllEEEEEEEEL.LLLLEEEELLLLlllllHHHHHHHHHHHHH


DSSP  L...LLHHHEEEELLL......lLLLL.LLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHL..........
Query G...LPEHKIHVIAPD......iGGGF.GNKVG.AYSGYVCAVVASIVLG..........  146
ident         ||    |        |                 |                  
Sbjct RpmgVAPEKIKFTWPNtattpnsGPSGgSRQQVmTGNAIRVACENLLKACekpgggyyty  419
DSSP  HhhlLLHHHEEELLLLlllllllLLLLlLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllh


DSSP  .........LLEEEELLhhhHHHHlleelleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllll
Query .........VPVKWVEDrmeNLSTtsfardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgafd  197
ident                                                             
Sbjct delkaadkpTKITGNWT...ASGA....................................  440
DSSP  hhhhhllllLEEEEEEE...LLLL....................................


DSSP  llllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhhh
Query acadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaierai  257
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query etlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeq  317
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeee
Query kakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarm  377
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhh
Query gtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatava  437
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllll
Query arkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepg  497
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhh
Query leavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhggl  557
ident                                                             
Sbjct .........thcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnq  491
DSSP  .........llllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllh


DSSP  hhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllll
Query teafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvge  617
ident                                                             
Sbjct latdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgp  551
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query sphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                               
Sbjct fgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 5: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=6.6

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlLEEEEEE
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaEVVSKDM   60
ident                                                       |     
Sbjct ...........msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvTVEGDFY   49
DSSP  ...........llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleEEEEEEE


DSSP  Eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query Ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct V......grqphmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlv  103
DSSP  E......llllllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeee


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeEEEEEEELL..
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhMTTELAATK..  178
ident                                                             
Sbjct anpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspWEMNVKFAAkk  163
DSSP  ellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlllllllEEEEEEEEEll


DSSP  ..LLLEEEEEEeeeeelllllllllllllllllhHHLLL......llllLLEEEeeeeel
Query ..DGKILAMRChvladhgafdacadpskwpagfmNICTG......sydmPVAHLavdgvy  230
ident                                                             
Sbjct dgTLLAMESDW........lvdhgpysefgdlltLRGAQfigagynipnIRGLG......  209
DSSP  llLEEEEEEEE........eeelllllllhhhhhHHHHHhlllllllleEEEEE......


DSSP  llllleellllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhhhlllhhhlleelllll
Query tnkasggvayrcsfrVTEAVYAIERAIETLAQRLEMdsadlriknfiqpeqfpymaplgw  290
ident                          | | |   |                          
Sbjct ..rtvatnhvwgsafRGYGAPQSMFASECLMDMLAE...klgmdplelryknayrpgdtn  264
DSSP  ..eeellllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH...hhlllhhhhhhhhllllllll


DSSP  eellllhhHHHHHHHHHHLhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeEEEEELLLLlllll
Query eydsgnypLAMKKAMDTVGyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigISFFTEIVGagpsk  350
ident                |                                            
Sbjct ptgqepevFSLPDMIDQLR...pkyqaalekaqkestathkkgvgiSIGVYGSGL.....  316
DSSP  llllllllLLHHHHHHHHH...hhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeEEEEEELLL.....


DSSP  lleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeell
Query ncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieeg  410
ident                                                             
Sbjct .......................dgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvg  353
DSSP  .......................lllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhh


DSSP  lllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeel
Query ntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvk  470
ident                                                             
Sbjct tahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpg  413
DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  leeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllLEEEEEEEEEE....elll
Query glpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtyPFGAYFCIMDI....dvdt  526
ident                                                             
Sbjct ggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvVYMYGVFMAEVtvdvatgq  473
DSSP  lllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllLEEEEEEEEEEeeelllll


DSSP  lleEEEEEEEEEellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllllll
Query gvaKTRRFYALDdcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdff  586
ident          |                                                  
Sbjct ttvDGMTLMADL...gslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpf  530
DSSP  eeeEEEEEEEEL...lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllll


DSSP  lllllllllLEEEELLLLLllllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLLLL
Query lptavetpkWETDYTVTPSphhpigakgvgeSPHVGGVPCFSNAVNDAYAF..LNAGHIQ  644
ident                  |                         |   |            
Sbjct ikqipdkldIVYVNHPRPD......gpfgasGVGELPLTSPHAAIINAIKSatGVRIYRL  584
DSSP  hhhlllleeEEELLLLLLL......lhhhllLLLLHHHLLHHHHHHHHHHHhhLLLLLLL


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllll
Query mphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                    
Sbjct ......paypekvlealka  597
DSSP  ......lllhhhhhhhhhl


No 6: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=6.2

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellLLHHH.
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsGNYPL.  299
ident                                                          |  
Sbjct ......................................................MSGPAa    6
DSSP  ......................................................LLHHHh


DSSP  ...hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEEEEEEEEEELLLLLLllllleell
Query ...amkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgeTREIMGIGISFFTEIVGAGpskncdilg  356
ident                                        |                    
Sbjct aaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifaSADVTVEGDFYVGRQPHMP.........   57
DSSP  hllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhHLLEEEEEEEEELLLLLLL.........


DSSP  eELLEEEEEEELLLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELllllllL
Query vSMFDSAEIRIHPTGSVIARMGTKsqgqgHETTYAQIIATELGIPADDIMIEEgntdtaP  416
ident     | |       |                      ||   |   |             
Sbjct .IEPDVAFAYMGDDGKCYIHSKSI.....GVHLHLYMIAPGVGLEPDQLVLVA......N  105
DSSP  .LLLLEEEEEELLLLLEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEE......L


DSSP  LLLLLLlLLLLLlhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeee
Query YGLGTYgSRSTPtaGAATAVAARKIKAKaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekf  476
ident    ||             |  |    |                                 
Sbjct PMGGTF.GYKFS..PTSEALVAVAAMAT................................  130
DSSP  LLLLLL.LHHHL..LLLHHHHHHHHHHH................................


DSSP  eehhhhhhhhhhllllllllLLEEEEEE...LLLL..lLLLEEEEEEEEEEELlLLLEEE
Query ktmkelawasynspppnlepGLEAVNYY...DPPN..mTYPFGAYFCIMDIDVdTGVAKT  531
ident                     |      |                           |    
Sbjct ....................GRPVHLRYnyqQQQQytgKRSPWEMNVKFAAKK.DGTLLA  169
DSSP  ....................LLLEEEELlhhHHHHlllLLLLEEEEEEEEELL.LLLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLLLLhhHHHHHHHhHHHHHHhHHHLllleellllleelllllllllllll
Query RRFYALDDCGTRINpmIIEGQVHgGLTEAFaVAMGqeirydeqgnvlgasfmdfflptav  591
ident      | | |                      |                           
Sbjct MESDWLVDHGPYSE..FGDLLTL.RGAQFI.GAGY.......................ni  202
DSSP  EEEEEEEELLLLLL..LHHHHHH.HHHHHL.LLLL.......................ll


DSSP  LLLLLEEEEL.LLLLllllllLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlllllH
Query ETPKWETDYT.VTPSphhpigAKGVG.ESPHVGGVPCFSNAVNDAYAFLNAGHIqmphdA  649
ident                                                 |           
Sbjct PNIRGLGRTVaTNHV......WGSAFrGYGAPQSMFASECLMDMLAEKLGMDPL...elR  253
DSSP  LEEEEEEEEElLLLL......LLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHH...hhH


DSSP  HHH.........................................................
Query WRL.........................................................  652
ident                                                             
Sbjct YKNayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvyg  313
DSSP  HHHllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  652
ident                                                             
Sbjct sgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftw  373
DSSP  llllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  652
ident                                                             
Sbjct pntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitg  433
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  652
ident                                                             
Sbjct nwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqla  493
DSSP  eeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  652
ident                                                             
Sbjct tdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfg  553
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhh


DSSP  .................................hhhhhhlllll
Query .................................wkvgeqlglhv  663
ident                                             
Sbjct asgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  llllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 7: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................v    1
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhHHHHHHHLL.......
Query dpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegTDATFAKAE.......   54
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpKYQAALEKAqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhllll


DSSP  ...EEEEEEEEELLL........................................lllll
Query ...VVSKDMFTYHRV........................................hpspl   71
ident     |      |                                                
Sbjct hkkGVGISIGVYGSGldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeeEEEEEEEEEELLllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllll
Query etcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvga  131
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelLEEEEEEEEELLL.....LLEEEEE
Query ysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfarDYHMTTELAATKD.....GKILAMR  186
ident                                              | |          | 
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvYMYGVFMAEVTVDvatgqTTVDGMT  480
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllEEEEEEEEEEEEElllllEEEEEEE


DSSP  EEEEEELlllllLLLLllLLLL.LHHH.LLLLL...........................
Query CHVLADHgafdaCADPskWPAG.FMNI.CTGSY...........................  217
ident                                                             
Sbjct LMADLGS.....LCNQ..LATDgQIYGgLAQGIglalsedfedikkhatlvgagfpfikq  533
DSSP  EEEELLL.....LLLH..HHHHhHHHHhHHHHHhhhhllllllllllllllllllllhhh


DSSP  LLLLEEEEEEEELLLLLLEelllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.hHHHHh
Query DMPVAHLAVDGVYTNKASGgvayrcsfRVTEAVYAIERAIETLAQRLE.MDSA.dLRIKn  275
ident                                       ||                    
Sbjct IPDKLDIVYVNHPRPDGPF....gasgVGELPLTSPHAAIINAIKSATgVRIYrlPAYP.  588
DSSP  LLLLEEEEELLLLLLLLHH....hlllLLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHlLLLLllLLLH.


DSSP  lllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeee
Query fiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgi  335
ident                                                             
Sbjct ............................................................  588
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhh
Query gisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiia  395
ident                                                             
Sbjct ............................................................  588
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query telgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlev  455
ident                                                             
Sbjct ............................................................  588
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleee
Query hegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfga  515
ident                                                             
Sbjct ............................................................  588
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellll
Query yfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqg  575
ident                                                             
Sbjct ............................................................  588
DSSP  ............................................................


DSSP  leelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query nvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavnday  635
ident                                                             
Sbjct ............................................................  588
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query aflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                             
Sbjct ...................ekvlealka  597
DSSP  ...................hhhhhhhhl


No 8: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ..........msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyv   50
DSSP  ..........llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeee


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct grqphmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggt  110
DSSP  llllllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllll


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
ident                                                             
Sbjct fgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllam  170
DSSP  llhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeee


DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll
Query dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
ident                                                             
Sbjct esdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqs  230
DSSP  eeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhh


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh
Query tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
ident                                                             
Sbjct mfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaal  290
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeelllLLLLLEEEEEEEEEeellllleeeEEEEEEEEL
Query elawasynspppnlepgleavnyydppNMTYPFGAYFCIMDidvdtgvaktRRFYALDDC  540
ident                                         |                   
Sbjct ekaqkestathkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELNAD..........GTITVHTAW  340
DSSP  hhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEELLL..........LLEEEELLL


DSSP  llLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllleellllleelllllllllllllLLLLLEEEE
Query gtRINPmIIEGQVHGGLTEAFAVAMgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavETPKWETDY  600
ident               |   ||                                  |     
Sbjct .eDHGQ.GADIGCVGTAHEALRPMG.........................vAPEKIKFTW  373
DSSP  .lLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHL.........................lLHHHEEELL


DSSP  L........LLLLlllllLLLL...LLLHHHHHHHHHHHHH......HHHH..HHLLL..
Query T........VTPSphhpiGAKG...VGESPHVGGVPCFSNA......VNDA..YAFLN..  639
ident                   |       |    |                            
Sbjct PntattpnsGPSG.....GSRQqvmTGNAIRVACENLLKACekpgggYYTYdeLKAADkp  428
DSSP  LllllllllLLLL.....LLLHhhhHHHHHHHHHHHHHHHHllllllLLLHhhHHHLLll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  639
ident                                                             
Sbjct tkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgsl  488
DSSP  leeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  639
ident                                                             
Sbjct cnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprp  548
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllll


DSSP  .........................lllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query .........................aghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                                  
Sbjct dgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  llhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 9: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhll
Query ......vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakae   54
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  eeeeeeeeellllllllLLLEEEEEEELL...LLEEEEE........ellllhhhhhhhh
Query vvskdmftyhrvhpsplETCQCVASMDKI...KGELTLW........gtfqaphvirtvv  103
ident                        |                                    
Sbjct hkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELNadgTITVHTAwedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEELlllLEEEELLlllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhlllhhHEEEELL.llllllllLLLLL.HHHHHHHHHHHHHL...............
Query slisglpehKIHVIAP.digggfgnKVGAY.SGYVCAVVASIVLG...............  146
ident          |                          |                       
Sbjct pmgvapekiKFTWPNTattpnsgpsGGSRQqVMTGNAIRVACENLlkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheEELLLLLlllllllllLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllllllhh


DSSP  ..........LLEEEELLHHhhhhhlleelleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellll
Query ..........VPVKWVEDRMenlsttsfardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgaf  196
ident               |                                             
Sbjct elkaadkptkITGNWTASGA........................................  440
DSSP  hhhhllllleEEEEEELLLL........................................


DSSP  lllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhh
Query dacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaiera  256
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query ietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlrae  316
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeee
Query qkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviar  376
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhh
Query mgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatav  436
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhllllllll
Query aarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlep  496
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh
Query gleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgg  556
ident                                                             
Sbjct ..........thcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcn  490
DSSP  ..........llllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  hhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllllleeeellllllllllllllll
Query lteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvg  616
ident                                                             
Sbjct qlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdg  550
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllll


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query esphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                                
Sbjct pfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 10: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...............................LLHHHLlllllllllhhhlllleelleel
Query ...............................VDPFKAmepdapllredikdkmtgahgar   29
ident                                |                            
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepeVFSLPD.......................  277
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhlllllllllllllllLLLHHH.......................


DSSP  lllleeeeeeeelhhhhhhhHHHL...LEEEEEEEEELLLlllllllleeeeeeelllle
Query khhnhifrweigdkegtdatFAKA...EVVSKDMFTYHRVhpspletcqcvasmdkikge   86
ident                                                             
Sbjct ....midqlrpkyqaalekaQKEStatHKKGVGISIGVYG....................  313
DSSP  ....hhhhhhhhhhhhhhhhHHHLlllEEEEEEEEEEEEE....................


DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhl
Query ltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavvasivlg  146
ident                                                             
Sbjct ............................................................  313
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeellhhhhhhhllE..........................................
Query vpvkwvedrmenlsttsF..........................................  164
ident                                                             
Sbjct .................Sgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtah  356
DSSP  .................Llllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  164
ident                                                             
Sbjct ealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggy  416
DSSP  hhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  .......................................eLLEEEEEEEEELL.LLLEEE
Query .......................................aRDYHMTTELAATK.DGKILA  184
ident                                                |       |    
Sbjct ytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvyMYGVFMAEVTVDVaTGQTTV  476
DSSP  llhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleEEEEEEEEEEEELlLLLEEE


DSSP  EEEEEEEELlLLLLlLLLL.lLLLLL.HHHLL.LLLL...................lLLE
Query MRCHVLADHgAFDAcADPS.kWPAGF.MNICT.GSYD...................mPVA  222
ident       ||                                                    
Sbjct DGMTLMADL.GSLC.NQLAtdGQIYGgLAQGIgLALSedfedikkhatlvgagfpfiKQI  534
DSSP  EEEEEEEEL.LLLL.LHHHhhHHHHHhHHHHHhHHHLlllllllllllllllllllhHHL


DSSP  E..EEEEEELLLL......LLEELLlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhhhhh
Query H..LAVDGVYTNK......ASGGVAyrcsfRVTEAVYAIERAIETLAQRlemdsadlrik  274
ident    |    |          |||          |    ||  ||                 
Sbjct PdkLDIVYVNHPRpdgpfgASGVGE....lPLTSPHAAIINAIKSATGV...........  579
DSSP  LllEEEEELLLLLlllhhhLLLLLL....hHHLLHHHHHHHHHHHHHLL...........


DSSP  hlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeee
Query nfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimg  334
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  eeEEEEellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh
Query igISFFteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqii  394
ident                                                             
Sbjct riYRLP......................................................  585
DSSP  llLLLL......................................................


DSSP  hhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query atelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmle  454
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllllee
Query vhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfg  514
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleelll
Query ayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeq  574
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  lleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavnda  634
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query yaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                              
Sbjct .................aypekvlealka  597
DSSP  .................llhhhhhhhhhl


No 11: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.6

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllHHHLLeellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqPEQFPymaplgweydsgnypla  300
ident                                        |                    
Sbjct ...............................msgpaaaAEDAI.................   12
DSSP  ...............................llhhhhhLLLLL.................


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeEEEEEEEEellllllllllleELLEELL
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreiMGIGISFFteivgagpskncdILGVSMF  360
ident                                        |                    
Sbjct ....eihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasaDVTVEGDF......yvgrqphMPIEPDV   62
DSSP  ....lllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlLEEEEEEE......eelllllLLLLLLE


DSSP  EEEEEEELllllEEEEELLLLLlLLHHHHHHHHHHhhhlllHHHEEEELLLLllllllLL
Query DSAEIRIHptgsVIARMGTKSQgQGHETTYAQIIAtelgipADDIMIEEGNTdtapygLG  420
ident   |                      |    |            |      |         
Sbjct AFAYMGDD...gKCYIHSKSIGvHLHLYMIAPGVG.....lEPDQLVLVANPmggtfgYK  114
DSSP  EEEEELLL...lLEEEEELLLLhHHHHHHHHHHHL.....lLHHHEEEEELLllllllHH


DSSP  LLllllllLHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh
Query TYgsrstpTAGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
ident                 |                                           
Sbjct FS....ptSEALVAVAAMATG.......................................  131
DSSP  HL....llLHHHHHHHHHHHL.......................................


DSSP  hhhhhhhhlllllllllleEEEEELL.........lllllleeEEEEEEEEelllllEEE
Query elawasynspppnlepgleAVNYYDP.........pnmtypfgAYFCIMDIdvdtgvAKT  531
ident                                                             
Sbjct ...................RPVHLRYnyqqqqqytgkrspwemNVKFAAKK.....dGTL  167
DSSP  ...................LLEEEELlhhhhhhllllllleeeEEEEEELL.....lLLE


DSSP  EEEEEEEellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllll
Query RRFYALDdcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptav  591
ident                                                             
Sbjct LAMESDW...........................lvdhgpysefgdlltlrgaqfigagy  200
DSSP  EEEEEEE...........................eeelllllllhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  lllLLEEEELLL................................................
Query etpKWETDYTVT................................................  603
ident                                                             
Sbjct nipNIRGLGRTVatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrp  260
DSSP  lllEEEEEEEEEllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  603
ident                                                             
Sbjct gdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpd  320
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeelllllll


DSSP  ........................................................llll
Query ........................................................psph  607
ident                                                             
Sbjct aseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattp  380
DSSP  eeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllll


DSSP  lllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllllllllhhhhhhHHHHLLLLL....
Query hpigakgvgESPHVGGVPCFSNAVNDAYAFLnaghiqmphdawrlwkVGEQLGLHV....  663
ident               |                                    |        
Sbjct nsgpsggsrQQVMTGNAIRVACENLLKACEK..........pgggyyTYDELKAADkptk  430
DSSP  lllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..........llllllLHHHHHHLLllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  663
ident                                                             
Sbjct itgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcn  490
DSSP  eeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  663
ident                                                             
Sbjct qlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdg  550
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllll


DSSP  ...............................................
Query ...............................................  663
ident                                                
Sbjct pfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 12: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.3

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct .........................................msgpaaaaedaieihpgtp   19
DSSP  .........................................llhhhhhllllllllllll


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct nvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiepdvafaymgddgkcyihsks   79
DSSP  leeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeellllleeeeell


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct igvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlryn  139
DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeell


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct yqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigag  199
DSSP  hhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhllll


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct ynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayr  259
DSSP  lllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlll


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelL
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmF  360
ident                                                             
Sbjct pgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgP  319
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeelllllL


DSSP  EEEEEEELLL....LLEEEEelllllLLLHhhHHHHHHHHHHL.........llhhHEEE
Query DSAEIRIHPT....GSVIARmgtksqGQGHetTYAQIIATELG.........ipadDIMI  407
ident |  |            |           |                               
Sbjct DASEAWAELNadgtITVHTA....weDHGQ..GADIGCVGTAHealrpmgvapekiKFTW  373
DSSP  LEEEEEEEELllllEEEELL....llLLLL..LHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhheEELL


DSSP  ELllllllllllllllLLLLllHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllee
Query EEgntdtapyglgtygSRSTptAGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevhegdlewdvdrf  467
ident                   |       |  | |                            
Sbjct PN....tattpnsgpsGGSR..QQVMTGNAIRVA..........................  401
DSSP  LL....llllllllllLLLL..HHHHHHHHHHHH..........................


DSSP  eelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllLEEEEEELLL.llllleeeeeeeeeeelll
Query rvkglpekfktmkelawasynspppnlepgLEAVNYYDPP.nmtypfgayfcimdidvdt  526
ident                                                             
Sbjct .cenllkacekpgggyytydelkaadkptkITGNWTASGAthcdavtglgkpfvvymygv  460
DSSP  .hhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleEEEEEELLLLllllllllllllllleeeee


DSSP  lleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllllll
Query gvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdff  586
ident                                                             
Sbjct fmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkh  520
DSSP  eeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  lllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
Query lptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmp  646
ident                                                             
Sbjct atlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvr  580
DSSP  llllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  llhhhhhhhhhhlllll
Query hdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                  
Sbjct iyrlpaypekvlealka  597
DSSP  lllllllhhhhhhhhhl


No 13: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.1

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ................msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtv   44
DSSP  ................llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleee


DSSP  eeelllLLLLLLL.lEEEEEEELL...LLEEEEEellllhhhHHHHHHHHHL......ll
Query ftyhrvHPSPLET.cQCVASMDKI...KGELTLWgtfqaphvIRTVVSLISG......lp  110
ident          |       ||        |                                
Sbjct egdfyvGRQPHMPiePDVAFAYMGddgKCYIHSK......siGVHLHLYMIApgvglepd   98
DSSP  eeeeeeLLLLLLLllLLEEEEEELlllLEEEEEL......llLHHHHHHHHHhhhlllhh


DSSP  hhHEEEELLLLllllllLLLLLHhhHHHHHHHHHHL......LLEEEELLhhhhhhhlle
Query ehKIHVIAPDIgggfgnKVGAYSgyVCAVVASIVLG......VPVKWVEDrmenlsttsf  164
ident                       |          |        |                 
Sbjct qlVLVANPMGG.....tFGYKFS..PTSEALVAVAAmatgrpVHLRYNYQ..........  141
DSSP  heEEEELLLLL.....lLLHHHL..LLLHHHHHHHHhhhlllEEEELLHH..........


DSSP  elleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleee
Query ardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahl  224
ident                                                             
Sbjct ...........................................qqqqytgkrspwemnvk  158
DSSP  ...........................................hhhhllllllleeeeee


DSSP  eeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlle
Query avdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpy  284
ident                                                             
Sbjct faakkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvw  218
DSSP  eeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllll


DSSP  ellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelll
Query maplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteiv  344
ident                                                             
Sbjct gsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdm  278
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhh


DSSP  lllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query gagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipadd  404
ident                                                             
Sbjct idqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvht  338
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeel


DSSP  eeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeell
Query imieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdv  464
ident                                                             
Sbjct awedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnai  398
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  leeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeel
Query drfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidv  524
ident                                                             
Sbjct rvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymy  458
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleee


DSSP  lllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleellllll
Query dtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmd  584
ident                                                             
Sbjct gvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedik  518
DSSP  eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  lllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query fflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiq  644
ident                                                             
Sbjct khatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatg  578
DSSP  llllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllll
Query mphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                    
Sbjct vriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhl


No 14: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ........................................................msgp    4
DSSP  ........................................................llhh


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleelLLLLEELLLlhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaPLGWEYDSGnypla  300
ident                                                             
Sbjct aaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvGRQPHMPIE.....   59
DSSP  hhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeeLLLLLLLLL.....


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   59
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllll
Query dsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglg  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   59
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehh
Query tygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmk  480
ident                                                             
Sbjct ............................................................   59
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllLLEEEEEEEeeeellllleeeeEEEEEEEl
Query elawasynspppnlepgleavnyydppnmtYPFGAYFCImdidvdtgvaktrRFYALDDc  540
ident                                                       |     
Sbjct ..............................PDVAFAYMG..........ddgKCYIHSK.   78
DSSP  ..............................LLEEEEEEL..........lllLEEEEEL.


DSSP  lllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhlllleellllleellllllllllllllLLLLEEEE
Query gtrinpmiIEGQVHGGLTEAFAvamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptaveTPKWETDY  600
ident                                                             
Sbjct ......siGVHLHLYMIAPGVG............................lePDQLVLVA  104
DSSP  ......llLHHHHHHHHHHHHL............................llHHHEEEEE


DSSP  LLLLLlllllLLLL.LLLHHHHHHHHHHHHH.............................
Query TVTPSphhpiGAKG.VGESPHVGGVPCFSNA.............................  630
ident                   |     |                                   
Sbjct NPMGG....tFGYKfSPTSEALVAVAAMATGrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfa  160
DSSP  LLLLL....lLLHHhLLLLHHHHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhllllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct akkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgs  220
DSSP  ellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct afrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmid  280
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct qlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtaw  340
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct edhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairv  400
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct acenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygv  460
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  630
ident                                                             
Sbjct fmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkh  520
DSSP  eeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  ............................................hhhhhhllllllllll
Query ............................................vndayaflnaghiqmp  646
ident                                                             
Sbjct atlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvr  580
DSSP  llllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  llhhhhhhhhhhlllll
Query hdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                  
Sbjct iyrlpaypekvlealka  597
DSSP  lllllllhhhhhhhhhl


No 15: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ....................................llhhhllllllllllhhhllllee
Query ....................................vdpfkamepdapllredikdkmtg   24
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  lleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelll
Query ahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdmftyhrvhpspletcqcvasmdkik   84
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  leeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhh
Query geltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapdigggfgnkvgaysgyvcavvasiv  144
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllll
Query lgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdgkilamrchvladhgafdacadpsk  204
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  lllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query wpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvayrcsfrvteavyaieraietlaqrl  264
ident                                                             
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query emdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeaf  324
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  hllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelLEEEEEEELLL..........LLEE
Query krgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmFDSAEIRIHPT..........GSVI  374
ident                                              |              
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvYMYGVFMAEVTvdvatgqttvDGMT  480
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllEEEEEEEEEEEeellllleeeEEEE


DSSP  EEELL.lLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL.........................lLHHHEEE
Query ARMGT.kSQGQ.GHETTYAQIIATELG.........................iPADDIMI  407
ident           |           |   |                            |   |
Sbjct LMADLgsLCNQlATDGQIYGGLAQGIGlalsedfedikkhatlvgagfpfikqIPDKLDI  540
DSSP  EEEELllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllhhhLLLLEEE


DSSP  ELLlllllllllLLLL......LLLLllhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query EEGntdtapyglGTYG......SRSTptaGAATAVAARKIkakaqmiaahmlevhegdle  461
ident                              |                              
Sbjct VYV.........NHPRpdgpfgASGV...GELPLTSPHAA....................  568
DSSP  EEL.........LLLLlllhhhLLLL...LLHHHLLHHHH....................


DSSP  ellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllLeeeeeelllllllleeeeeeeee
Query wdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgLeavnyydppnmtypfgayfcimd  521
ident                                                             
Sbjct ....................................I.......................  569
DSSP  ....................................H.......................


DSSP  eellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelll
Query idvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgas  581
ident                                                             
Sbjct ............................................................  569
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query fmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnag  641
ident                                                             
Sbjct ......................................................inaiks  575
DSSP  ......................................................hhhhhh


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhlllll
Query hiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                       
Sbjct atgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhllllllllllhhhhhhhhhl


No 16: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeeeeeeeellll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhmttelaatkdg  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllllllhhhllllllllleeeeeeeelllllleelll
Query kilamrchvladhgafdacadpskwpagfmnictgsydmpvahlavdgvytnkasggvay  240
ident                                                             
Sbjct ............................msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkged   32
DSSP  ............................llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelll


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleellllhhhh
Query rcsfrvteavyaieraietlaqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweydsgnypla  300
ident                                                             
Sbjct tgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapg   92
DSSP  hhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllleelleell
Query mkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncdilgvsmf  360
ident                                                             
Sbjct vglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrsp  152
DSSP  hlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlllllll


DSSP  EEEEEEELL.....LLLEEEEE.....llllllllhhHHHHHHHhhHHLLLhhHEEEELl
Query DSAEIRIHP.....TGSVIARM.....gtksqgqgheTTYAQIIatELGIPadDIMIEEg  410
ident                                         || |          |     
Sbjct WEMNVKFAAkkdgtLLAMESDWlvdhgpysefgdlltLRGAQFI.gAGYNI.pNIRGLG.  209
DSSP  EEEEEEEEElllllEEEEEEEEeeelllllllhhhhhHHHHHHL.lLLLLL.lEEEEEE.


DSSP  lllllllllllllLLLLllhHHHHHHHHHHH.............................
Query ntdtapyglgtygSRSTptaGAATAVAARKI.............................  441
ident                           |                                 
Sbjct rtvatnhvwgsafRGYG...APQSMFASECLmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnpt  266
DSSP  eeellllllllllLLLL...HHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  441
ident                                                             
Sbjct gqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawa  326
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeee


DSSP  .................................................hhhhhhhhhhh
Query .................................................kakaqmiaahm  452
ident                                                             
Sbjct elnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsg  386
DSSP  eellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllllllllll


DSSP  hlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllll
Query levhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtyp  512
ident                                                             
Sbjct gsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdav  446
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllll


DSSP  eeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleel
Query fgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeiryd  572
ident                                                             
Sbjct tglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgi  506
DSSP  llllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query eqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavn  632
ident                                                             
Sbjct glalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsph  566
DSSP  hhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhh


DSSP  hhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query dayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                
Sbjct aaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 17: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeEEEEEL........hhhhhhhhhh
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifRWEIGD........kegtdatfak   52
ident                                                             
Sbjct .................msgpaaaaedaieihpgtpNVYFEQpivkgedtgpifasadvt   43
DSSP  .................llhhhhhllllllllllllLEEEEEeeeelllhhhhhhhllee


DSSP  lLEEEEEEEEELlllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhh
Query aEVVSKDMFTYHrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpeh  112
ident  |         |                                                
Sbjct vEGDFYVGRQPH..........mpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgv   93
DSSP  eEEEEEELLLLL..........lllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhh


DSSP  heeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleeLLEEEEE
Query kihviapdigggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfaRDYHMTT  172
ident                                                             
Sbjct glepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqyTGKRSPW  153
DSSP  lllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlLLLLLLE


DSSP  EEEELLL........lLEEEEEEEEEEelllllllllllllLLLLHHHL...LLLL....
Query ELAATKD........gKILAMRCHVLAdhgafdacadpskwPAGFMNIC...TGSY....  217
ident |                                           |               
Sbjct EMNVKFAakkdgtllaMESDWLVDHGP..............YSEFGDLLtlrGAQFigag  199
DSSP  EEEEEEEellllleeeEEEEEEEELLL..............LLLLHHHHhhhHHHHllll


DSSP  .....llLLEEEEEEEElllllleellllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLL......
Query .....dmPVAHLAVDGVytnkasggvayrcsfrvteavYAIERAIETLAQRLEM......  266
ident                                                    |        
Sbjct ynipnirGLGRTVATNH..............vwgsafrGYGAPQSMFASECLMDmlaekl  245
DSSP  lllleeeEEEEEELLLL..............lllllllLLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  266
ident                                                             
Sbjct gmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgv  305
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeee


DSSP  lhHHHHhhhlllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query dsADLRiknfiqpeqfpymaplgweydsgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkr  326
ident                                                             
Sbjct giSIGV......................................................  311
DSSP  eeEEEE......................................................


DSSP  lllleeeeeeeeeeellllllllllleelleelleeeeeeellllleeeeellllllllh
Query getreimgigisffteivgagpskncdilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqgh  386
ident                                                             
Sbjct ...................................................ygsgldgpd  320
DSSP  ...................................................eelllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ettyaqiiatelgipaddimieegntdtapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaq  446
ident                                                             
Sbjct aseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattp  380
DSSP  eeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllll


DSSP  hhhhhhhlllhhheeellleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeell
Query miaahmlevhegdlewdvdrfrvkglpekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydp  506
ident                                                             
Sbjct nsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasga  440
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellll


DSSP  lllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query pnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrrfyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamg  566
ident                                                             
Sbjct thcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiyg  500
DSSP  llllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhh


DSSP  llleellllleelllllllllllllllllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhh
Query qeirydeqgnvlgasfmdfflptavetpkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpc  626
ident                                                             
Sbjct glaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgel  560
DSSP  hhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllh


DSSP  hhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
Query fsnavndayaflnaghiqmphdawrlwkvgeqlglhv  663
ident                                      
Sbjct pltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 18: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  llhhhllllllllllhhhlllleelleellllleeeeeeeelhhhhhhhhhhlleeeeee
Query vdpfkamepdapllredikdkmtgahgarkhhnhifrweigdkegtdatfakaevvskdm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelll
Query ftyhrvhpspletcqcvasmdkikgeltlwgtfqaphvirtvvslisglpehkihviapd  120
ident                                                             
Sbjct ...............................................msgpaaaaedaie   13
DSSP  ...............................................llhhhhhllllll


DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlleelleeEEEEEEEllll
Query igggfgnkvgaysgyvcavvasivlgvpvkwvedrmenlsttsfardyhMTTELAAtkdg  180
ident                                                             
Sbjct ihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiepdvAFAYMGD....   69
DSSP  llllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleEEEEELL....


DSSP  lEEEEEEEEEeellllllllllllllllLHHH...llLLLLlLLEEEEE.EEELllllLE
Query kILAMRCHVLadhgafdacadpskwpagFMNI...ctGSYDmPVAHLAV.DGVYtnkaSG  236
ident        |                                      |            |
Sbjct .DGKCYIHSK.............sigvhLHLYmiapgVGLEpDQLVLVAnPMGG...tFG  112
DSSP  .LLLEEEEEL.............lllhhHHHHhhhhhHLLLhHHEEEEElLLLL...lLL


DSSP  ELlllllLLHHhHHHHHHHHHHHH....................................
Query GVayrcsFRVTeAVYAIERAIETL....................................  260
ident                    |  |                                     
Sbjct YK....fSPTS.EALVAVAAMATGrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtl  167
DSSP  HH....hLLLL.HHHHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllle


DSSP  ...........................hhhhlllhhhhhhhhlllhhhlleellllleel
Query ...........................aqrlemdsadlriknfiqpeqfpymaplgweyd  293
ident                                                             
Sbjct lamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgyga  227
DSSP  eeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllh


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeellllllllllle
Query sgnyplamkkamdtvgyhqlraeqkakqeafkrgetreimgigisffteivgagpskncd  353
ident                                                             
Sbjct pqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyq  287
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  elleelleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllll
Query ilgvsmfdsaeirihptgsviarmgtksqgqghettyaqiiatelgipaddimieegntd  413
ident                                                             
Sbjct aalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqga  347
DSSP  hhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllh


DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellleeeellee
Query tapyglgtygsrstptagaatavaarkikakaqmiaahmlevhegdlewdvdrfrvkglp  473
ident                                                             
Sbjct digcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllk  407
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeehhhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllleeeeeeeeeeellllleeeee
Query ekfktmkelawasynspppnlepgleavnyydppnmtypfgayfcimdidvdtgvaktrr  533
ident                                                             
Sbjct acekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtv  467
DSSP  hhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeee


DSSP  eeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllll
Query fyalddcgtrinpmiiegqvhgglteafavamgqeirydeqgnvlgasfmdfflptavet  593
ident                                                             
Sbjct dvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgag  527
DSSP  ellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllll


DSSP  llleeeelllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhh
Query pkwetdytvtpsphhpigakgvgesphvggvpcfsnavndayaflnaghiqmphdawrlw  653
ident                                                             
Sbjct fpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpay  587
DSSP  lllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  hhhhhlllll
Query kvgeqlglhv  663
ident           
Sbjct pekvlealka  597
DSSP  hhhhhhhhhl