No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=47.4

DSSP  llhhhhhllllllllllllleEEEEEEEElLLHHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLL
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvYFEQPIVKgEDTGPIFASADVTVEGDFYVGRQPHMPIEP   60
ident                                   |||||    | | |  ||    | | 
Sbjct .....................VSRTSRAR.DELAPIFASSAGVVRGQFSCGRVSACPMET   38
DSSP  .....................LEEEEEEE.LLLHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLL


DSSP  LE..eeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhlll
Query DV..afaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfspt  118
ident                                                             
Sbjct RGavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhp   98
DSSP  LEeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  lhhhhhhhhhhhllleeeELLHHHHHHLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL
Query sealvavaamatgrpvhlRYNYQQQQQYTGKRSPWEMNVKFAAKKDGTLLAMESDWLVDH  178
ident                       |                  |   ||  || |     | 
Sbjct eellvcllsralgrpvrwIEDRQENFLGATHAKQQRNEMGLAFDGDGRFLALENRSITDG  158
DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL


DSSP  LLLLL...LHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH
Query GPYSE...FGDLLTLRGAQFIGAGYNIPNIRGLGRTVATNHVWGSAFRGYGAPQSMFASE  235
ident | |             |   |   |  |        ||||     | || |      | |
Sbjct GAYNNlpwTQLVESHVGNAVILGVYKVPAVSEESIAVATNKCPIGAYRGVGFTAGQIARE  218
DSSP  LLLLLlllLHHHLHHHHHHLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLL...LLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHH.HHHHH
Query CLMDMLAEKLGMDPLELRYKNAYR...PGDTNPTGQEPEVFSLPDMIDQLRPKY.QAALE  291
ident  | |  |  ||  | | |  |         ||  ||          |  |       |  
Sbjct TLIDRAARQLGLSPFEIRRRNVVMpedFPFTNRLGQTHREGTYLQTINLLEEMVnPEAFR  278
DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLhhhLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHlHHHHH


DSSP  HHHHHLL.LLEEEEEEEEEEEEELLL....Lllleeeeeeeellllleeeelllllllll
Query KAQKEST.ATHKKGVGISIGVYGSGL....Dgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqg  346
ident   | |        | | |      |                                   
Sbjct QRQAEARaRGKYLGLGVSVFNEVTGTgtrtL.............................  309
DSSP  HHHHHHHlLLEEEEEEEEEEEEEELLlhhhH.............................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query adigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenll  406
ident                                                             
Sbjct ............................................................  309
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllLLLLL.....................
Query kacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgaTHCDA.....................  445
ident                                                             
Sbjct ..................................SFLGTpttthdsatvridptgkvtvt  335
DSSP  ..................................HHLLLlllllleeeeeellllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  445
ident                                                             
Sbjct tslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigra  395
DSSP  ellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  445
ident                                                             
Sbjct asivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgf  455
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllll


DSSP  ......lllllllLLLEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHH
Query ......vtglgkpFVVYMYGVFMAEVTVDVATGQTTVDGMTLMADLGSLCNQLATDGQIY  499
ident                |   |   | |  |  |  | |       | |   |     ||| 
Sbjct datleatatydpsDLVLANGGHAAIVEIDASTYATRVTDFFAVEDCGTMINPMIVEGQIR  515
DSSP  lllleeeeellllLLEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLL....LLLLLLLLLLLLLLHHHLLlLEEEEELLLLLLLLHHHLL
Query GGLAQGIGLALSEDFED....IKKHATLVGAGFPFIKQIPdKLDIVYVNHPRPDGPFGAS  555
ident || || ||  | |             ||     |     |    |     | |  | |  
Sbjct GGIAQAIGQTLLEEVIYddfgQLVTTTLMDYLIPTTLDVP.DIRIRHLETPSPLVPGGIK  574
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLLllllLLLLLLLLLLLLLLLLLLL.LEEEEELLLLLLLLHHHLL


DSSP  LLLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHL...LLLLLLLLLHHHHHHHHHL..
Query GVGELPLTSPHAAIINAIKSATG...VRIYRLPAYPEKVLEALKA..  597
ident | ||    |  ||   |   |     | |   |  ||          
Sbjct GMGESAMISAPAAVVAAVNDALAhleVVIETVPITPERIFRSIQErp  621
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLEELLLHHHHHHHHHLll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=20.2

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ......................vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmet   38
DSSP  ......................leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  leEEEEEL.LLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLHHHLLL.
Query dvAFAYMG.DDGKCYIHSKSIGVHLHLYMIAPGVGLEPDQLVLVANPMGGTFGYKFSPT.  118
ident   | |                       | |                 || || |     
Sbjct rgAVAQYEwTTQQLILWTATQMPSFVRTMVAMFCAIPEHLIEVRVPDVGGGFGQKAHLHp   98
DSSP  leEEEEEElLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLLLLh


DSSP  LHHHHHHHHHHHLLLEEE..................ellhhhhhhllllllleeeeeeee
Query SEALVAVAAMATGRPVHL..................rynyqqqqqytgkrspwemnvkfa  160
ident  | ||     | ||||                                            
Sbjct EELLVCLLSRALGRPVRWiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdg  158
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllll
Query akkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgs  220
ident                                                             
Sbjct gaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiare  218
DSSP  lllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhh
Query afrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmid  280
ident                                                             
Sbjct tlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafr  278
DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEELLLLLEEEELLL
Query qlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELNADGTITVHTAW  340
ident                                            |       |  || |  
Sbjct qrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpTTTHDSATVRIDPTGKVTVTTSL  338
DSSP  hhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllLLLLLEEEEEELLLLLEEEEELL


DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhlLLHHHEEELLLLLLlLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query EDHGQGADIGCVGTAHEALRpmgVAPEKIKFTWPNTAtTPNSGPSGGSRQQVMTGNAIRV  400
ident    |||        |   |    |           |           ||  |     |  
Sbjct ASSGQGHETTLAQIAADVLG...VPASDVVIQAGSTK.NTYGFGAYASRGAVIGAGSIGR  394
DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHL...LLHHHEEEELLLLL.LLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLL.........LLLL...................llLHHHHHHLL......
Query ACENLLKACEK.........PGGG...................yyTYDELKAAD......  426
ident |                                                   ||      
Sbjct AASIVRERVKQlaghlleaaSEDIviedglvhvagvpakgmpfaeVVGAAYFADathppg  454
DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhhlllHHHEeeelleeeelleeeeeeehhhHHHHHHHLHhhllll


DSSP  ..LLLEEEEEEELLLLllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeee
Query ..KPTKITGNWTASGAthcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmad  484
ident        |     |                                              
Sbjct fdATLEATATYDPSDL......vlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpm  508
DSSP  llLLLEEEEELLLLLL......eeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeell
Query lgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvn  544
ident                                                             
Sbjct ivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpspl  568
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeelllllll


DSSP  llllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query hprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                                                      
Sbjct vpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  lhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=13.7

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeEEEEEELLLhhhHHHHL......LEEEEEEEEELLLL
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfEQPIVKGEDtgpIFASA......DVTVEGDFYVGRQP   54
ident                                |     |         |            
Sbjct .......................VSRTSRARD...ELAPIfassagVVRGQFSCGRVSAC   34
DSSP  .......................LEEEEEEEL...LLHHHhhhlleEEEEEEEELLLLLL


DSSP  LLL.......................................llllEeeeeellllleee
Query HMP.......................................iepdVafaymgddgkcyi   75
ident  |                                            |             
Sbjct PMEtrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlieV.............   81
DSSP  LLLlleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeE.............


DSSP  eellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhlllee
Query hsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvh  135
ident                                                             
Sbjct ............................................................   81
DSSP  ............................................................


DSSP  eELLhhhhhhlLLLLL......................................LEEEEE
Query lRYNyqqqqqyTGKRS......................................PWEMNV  157
ident  |          |                                               
Sbjct .RVP.....dvGGGFGqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathAKQQRN  135
DSSP  .ELL.....llLLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllLLLEEE


DSSP  EEEELL....LLLEE.....................................EEEEEeee
Query KFAAKK....DGTLL.....................................AMESDwlv  176
ident               |                                       |     
Sbjct EMGLAFdgdgRFLALenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpaVSEES...  192
DSSP  EEEEEEllllLEEEEeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleEEEEE...


DSSP  elllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeEEEELLLlllllllllllhHHHHHHHHH
Query dhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglGRTVATNhvwgsafrgygaPQSMFASEC  236
ident                                                         |   
Sbjct ...............................iAVATNKC......pigayrGVGFTAGQI  215
DSSP  ...............................eEELLLLL......llllllLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL........lLHHHHHH.hhlLLLLLLlllLLLLlLLLHhhHHHHHHHHHH
Query LMDMLAEKLG........mDPLELRY.knaYRPGDTnptGQEPeVFSLpdMIDQLRPKYQ  287
ident     |                                                |      
Sbjct ARETLIDRAArqlglspfeIRRRNVVmpedFPFTNR...LGQT.HREG..TYLQTINLLE  269
DSSP  HHHHHHHHHHhhhlllhhhHHHLLLLlhhhLLEELL...LLLE.ELLL..LHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHhHHHL.........lLLEEEEEEEEEEEEELLLLllleeeeeeeellllleeeel
Query AALEKaQKES.........tATHKKGVGISIGVYGSGLDgpdaseawaelnadgtitvht  338
ident                          ||     | | |                       
Sbjct EMVNP.EAFRqrqaearargKYLGLGVSVFNEVTGTGTR.....................  307
DSSP  HHHLH.HHHHhhhhhhhlllEEEEEEEEEEEEEELLLHH.....................


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhh
Query awedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnai  398
ident                                                             
Sbjct ............................................................  307
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllLLLL......
Query rvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtgLGKP......  452
ident                                                             
Sbjct .............................................tlsflGTPTtthdsa  322
DSSP  .............................................hhhhlLLLLllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  452
ident                                                             
Sbjct tvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayas  382
DSSP  eeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  452
ident                                                             
Sbjct rgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvg  442
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhh


DSSP  ........................llLEEEEEEEEEEEEELL....LLLEEEEEEEEEEE
Query ........................fvVYMYGVFMAEVTVDVA....TGQTTVDGMTLMAD  484
ident                                       |           |         
Sbjct aayfadathppgfdatleatatydpsDLVLANGGHAAIVEIDastyATRVTDFFAVEDCG  502
DSSP  hhhhlhhhllllllllleeeeellllLLEEEEEEEEEEEEEEllllLEEEEEEEEEEELL


DSSP  LlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL............llllLLLLLllllLLLLLL.h
Query LgslcnqlATDGQIYGGLAQGIGLALS............edfeDIKKHatlvGAGFPF.i  531
ident                |    ||  |                                   
Sbjct T......mINPMIVEGQIRGGIAQAIGqtlleeviyddfgqlvTTTLM...dYLIPTTld  553
DSSP  L......lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllLLLLL...lLLLLLLll


DSSP  HHLLlLEEEEELLLLLlllhhHLLLLllHHHLLHHHHHHHHHHHHHL.........LLLL
Query KQIPdKLDIVYVNHPRpdgpfGASGVgeLPLTSPHAAIINAIKSATG.........VRIY  582
ident               |                 |       |   |               
Sbjct VPDI.RIRHLETPSPL....vPGGIK..GMGESAMISAPAAVVAAVNdalahlevvIETV  606
DSSP  LLLE.EEEELLLLLLL....lHHHLL..LLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllLLEE


DSSP  LllllhhHHHHHHHL......
Query RlpaypeKVLEALKA......  597
ident           |          
Sbjct P......ITPERIFRsiqerp  621
DSSP  L......LLHHHHHHhhhlll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=7.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  ....llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhHHHHHL....LEEEEEEEEELL
Query ....msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgPIFASA....DVTVEGDFYVGR   52
ident                                          | |         |      
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrQRQAEArargKYLGLGVSVFNE  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHhlllEEEEEEEEEEEE


DSSP  L.LLLL..........LLLLEEEEEELLLLLEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLLL
Query Q.PHMP..........IEPDVAFAYMGDDGKCYIHSKSI.....GVHLHLYMIAPGVGLE   96
ident                    | |       ||                      |   |  
Sbjct VtGTGTrtlsflgtptTTHDSATVRIDPTGKVTVTTSLAssgqgHETTLAQIAADVLGVP  360
DSSP  EeLLLHhhhhhlllllLLLLEEEEEELLLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHEEEEELL.....LLLLL.LHHHL..LLLHHHHHHHHHHHL.................
Query PDQLVLVANP.....MGGTF.GYKFS..PTSEALVAVAAMATG.................  131
ident     |  |         |            |    |                        
Sbjct ASDVVIQAGStkntyGFGAYaSRGAVigAGSIGRAASIVRERVkqlaghlleaasedivi  420
DSSP  HHHEEEELLLlllllLLLLLlLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  ......................................LLEEEELlhhHHHHlllLLLLE
Query ......................................RPVHLRYnyqQQQQytgKRSPW  153
ident                                             |               
Sbjct edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatLEATATY...DPSD..lVLANG  475
DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllLEEEEEL...LLLL..lEEEEE


DSSP  EEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEEELLLLLL..LHHHHHH.HHHHHLLLLLL........
Query EMNVKFAAKK.DGTLLAMESDWLVDHGPYSE..FGDLLTL.RGAQFIGAGYN........  201
ident                         | |                || ||            
Sbjct GHAAIVEIDAsTYATRVTDFFAVEDCGTMINpmIVEGQIRgGIAQAIGQTLLeeviyddf  535
DSSP  EEEEEEEEELlLLLEEEEEEEEEEELLLLLLhhHHHHHHHhHHHHHHHHHHLllllllll


DSSP  ...............lLEEE.EEEEEElLLLL......LLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHH
Query ...............iPNIR.GLGRTVaTNHV......WGSAFrGYGAPQSMFASECLMD  239
ident                         |                            |      
Sbjct gqlvtttlmdylipttLDVPdIRIRHL.ETPSplvpggIKGMG.ESAMISAPAAVVAAVN  593
DSSP  llllllllllllllllLLLLlEEEEEL.LLLLlllhhhLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHhLLLHH.....hHHHHhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query MLAEKlGMDPL.....eLRYKnayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaq  294
ident                                                             
Sbjct DALAH.LEVVIetvpitPERI.......................................  613
DSSP  HHHHH.HLLLLleelllHHHH.......................................


DSSP  hhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhh
Query kestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgt  354
ident                                                             
Sbjct ............................................................  613
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query ahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgg  414
ident                                                             
Sbjct ............................................................  613
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllle
Query gyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqt  474
ident                                                             
Sbjct ............................................................  613
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhl
Query tvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqi  534
ident                                                             
Sbjct ............................................................  613
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhh
Query pdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlea  594
ident                                                             
Sbjct .......................................................frsiq  618
DSSP  .......................................................hhhhh


DSSP  hhl
Query lka  597
ident    
Sbjct erp  621
DSSP  lll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=7.1

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLlll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaQKEStat  300
ident                                                         |   
Sbjct .......................................vsrtsrardelapiFASS...   18
DSSP  .......................................leeeeeeelllhhhHHHL...


DSSP  EEEEEEEEEEEEELLLLLlLEEEEEEEEL.LLLLEEEELLLLlllllHHHHHHHHHHHHH
Query HKKGVGISIGVYGSGLDGpDASEAWAELN.ADGTITVHTAWEdhgqgADIGCVGTAHEAL  359
ident      |       |         | |            ||                    
Sbjct AGVVRGQFSCGRVSACPM.ETRGAVAQYEwTTQQLILWTATQ.....MPSFVRTMVAMFC   72
DSSP  LEEEEEEEEELLLLLLLL.LLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHH


DSSP  HhhlLLHHHEEELLLLlllllllLLLLlLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllh
Query RpmgVAPEKIKFTWPNtattpnsGPSGgSRQQVmtGNAIRVACENLLKACekpgggyyty  419
ident          |    |        |                  |                 
Sbjct A...IPEHLIEVRVPD......vGGGF.GQKAH.lHPEELLVCLLSRALG..........  111
DSSP  L...LLHHHEEEELLL......lLLLL.LLLLL.lLHHHHHHHHHHHHHL..........


DSSP  hhhhhllllLEEEEEEELLLllllllllllllllLLEE.EEEEEEEEEEELlLLLEEEEE
Query delkaadkpTKITGNWTASGathcdavtglgkpfVVYM.YGVFMAEVTVDVaTGQTTVDG  478
ident                                                  |   |      
Sbjct .........RPVRWIEDRQE..........nflgATHAkQQRNEMGLAFDG.DGRFLALE  151
DSSP  .........LLEEEELLHHH..........hhhhLLLLlLEEEEEEEEELL.LLLEEEEE


DSSP  EEEEEELL..LLLLhhHHHHHH.HHHHHHHHhHHHLlllllllllllllllllllhHHLL
Query MTLMADLG..SLCNqlATDGQI.YGGLAQGIgLALSedfedikkhatlvgagfpfiKQIP  535
ident      | |         |       | |                                
Sbjct NRSITDGGayNNLP..WTQLVEsHVGNAVIL.GVYK...................vPAVS  189
DSSP  EEEEEELLllLLLL..LLHHHLhHHHHHLLL.LLLL...................lLEEE


DSSP  llEEEEELLLLLlllhhHLLLLL.LHHHLLHHHHHHHHHHHHHLLllllllllhHHHHHH
Query dkLDIVYVNHPRpdgpfGASGVG.ELPLTSPHAAIINAIKSATGVriyrlpaypEKVLEA  594
ident        |            |       |    |    |  |                  
Sbjct ..EESIAVATNK.....CPIGAYrGVGFTAGQIARETLIDRAARQ....lglspFEIRRR  238
DSSP  ..EEEEEELLLL.....LLLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hlllhHHHHHL


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  594
ident                                                             
Sbjct nvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvf  298
DSSP  llllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  594
ident                                                             
Sbjct nevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlg  358
DSSP  eeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  594
ident                                                             
Sbjct vpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedi  418
DSSP  llhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhe


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  594
ident                                                             
Sbjct viedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlanggha  478
DSSP  eeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  594
ident                                                             
Sbjct aiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgql  538
DSSP  eeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  594
ident                                                             
Sbjct vtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalah  598
DSSP  lllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................hhl
Query ....................lka  597
ident                        
Sbjct levvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hllllleelllhhhhhhhhhlll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.5

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpKYQAALEKAqkestat  300
ident                                                             
Sbjct ...................................vsrtsrardELAPIFASS.......   18
DSSP  ...................................leeeeeeelLLHHHHHHL.......


DSSP  eeEEEEEEEEEEELLLLLlleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query hkKGVGISIGVYGSGLDGpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
ident    ||       |                                               
Sbjct ..AGVVRGQFSCGRVSAC........................................pm   36
DSSP  ..LEEEEEEEEELLLLLL........................................ll


DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh
Query pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
ident                                                             
Sbjct etrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahl   96
DSSP  llleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllll


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllEEEEEEEEEEEEElllllEEEEEEE
Query elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvYMYGVFMAEVTVDvatgqTTVDGMT  480
ident                                                |            
Sbjct hpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMGLAFDGD.....GRFLALE  151
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEEELLL.....LLEEEEE


DSSP  EEEELLL.......lLLHHhHHHHHHhHHHHhhhhhhllllllllllllllllllllhhH
Query LMADLGS.......lCNQLaTDGQIYgGLAQgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikQ  533
ident                                                             
Sbjct NRSITDGgaynnlpwTQLVeSHVGNA.VILG...........................vY  183
DSSP  EEEEEELllllllllLHHHlHHHHHH.LLLL...........................lL


DSSP  LLLLEEEEELLLLLLLLH..hhlllLLLHHHLLHHHHHHHhHHHHHL.............
Query IPDKLDIVYVNHPRPDGP..fgasgVGELPLTSPHAAIINaIKSATG.............  578
ident                  |                   |        |             
Sbjct KVPAVSEESIAVATNKCPigayrgvGFTAGQIARETLIDR.AARQLGlspfeirrrnvvm  242
DSSP  LLLEEEEEEEEELLLLLLlllllllLHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHLllhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  578
ident                                                             
Sbjct pedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevt  302
DSSP  hhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  578
ident                                                             
Sbjct gtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpas  362
DSSP  lllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  578
ident                                                             
Sbjct dvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivied  422
DSSP  heeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  578
ident                                                             
Sbjct glvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaive  482
DSSP  leeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  578
ident                                                             
Sbjct idastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvttt  542
DSSP  eellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  578
ident                                                             
Sbjct lmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevv  602
DSSP  lllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhl
Query vriyrlpaypekvlealka  597
ident                    
Sbjct ietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  lleelllhhhhhhhhhlll


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  .................llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhllee
Query .................msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvt   43
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee


DSSP  eeeeeeellllllllllleEEEEELLL....LLEEEEELLLLhHHHHHHHHHHHLL....
Query vegdfyvgrqphmpiepdvAFAYMGDD....GKCYIHSKSIGvHLHLYMIAPGVGL....   95
ident                      |    |            | |   |    |         
Sbjct vtgtgtrtlsflgtpttthDSATVRIDptgkVTVTTSLASSG.QGHETTLAQIAADvlgv  359
DSSP  eelllhhhhhhllllllllLEEEEEELllllEEEEELLLLLL.LLHHHHHHHHHHHhhll


DSSP  .LHHHEEEEEL..lllllllHHHLL.LLHHHHHHHHHHHL....................
Query .EPDQLVLVAN..pmggtfgYKFSP.TSEALVAVAAMATG....................  131
ident    |                |        |     |                        
Sbjct pASDVVIQAGStkntygfgaYASRGaVIGAGSIGRAASIVrervkqlaghlleaasediv  419
DSSP  lHHHEEEELLLlllllllllLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhhee


DSSP  .........................................LLEEEellhhhhhhlllll
Query .........................................RPVHLrynyqqqqqytgkr  150
ident                                                             
Sbjct iedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleATATY..............  465
DSSP  eelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleEEEEL..............


DSSP  lleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeee
Query spwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgr  210
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllll
Query tvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqep  270
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeell
Query evfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelna  330
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllh
Query dgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrq  390
ident                                                             
Sbjct ............................................................  465
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllll
Query qvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglg  450
ident                                                             
Sbjct ...................................................dpsdlvlan  474
DSSP  ...................................................llllleeee


DSSP  llllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query kpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglal  510
ident                                                             
Sbjct gghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviydd  534
DSSP  eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  llllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhh
Query sedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaii  570
ident                                                             
Sbjct fgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavnd  594
DSSP  lllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query naiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                            
Sbjct alahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.1

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmiDQLRPKYQAAlekaqkestat  300
ident                                        | | |                
Sbjct ...............................vsrtsrarDELAPIFASS...........   18
DSSP  ...............................leeeeeeeLLLHHHHHHL...........


DSSP  eeeeEEEEEEEEELLLLllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query hkkgVGISIGVYGSGLDgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
ident      |   |    |                                             
Sbjct ....AGVVRGQFSCGRV....................................sacpmet   38
DSSP  ....LEEEEEEEEELLL....................................lllllll


DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh
Query pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
ident                                                             
Sbjct rgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhp   98
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllLLEEEEEEEEEEeeellllleeEEEE.
Query elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfVVYMYGVFMAEVtvdvatgqttVDGM.  479
ident                                                             
Sbjct eellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMGLAFDG..........DGRFl  148
DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEEELL..........LLLEe


DSSP  EEEEEL.................LLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll
Query TLMADL.................GSLCnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhat  522
ident  |                                                          
Sbjct ALENRSitdggaynnlpwtqlveSHVG.................................  175
DSSP  EEEEEEeeellllllllllhhhlHHHH.................................


DSSP  llllllllhhhlllleeEEELlLLLL.........llhhhllLLLLHHHLLHHHHHHHH.
Query lvgagfpfikqipdkldIVYVnHPRP.........dgpfgasGVGELPLTSPHAAIINA.  572
ident                                                  |    |     
Sbjct .....navilgvykvpaVSEE.SIAVatnkcpigayrgvgftAGQIARETLIDRAARQLg  229
DSSP  .....hhllllllllleEEEE.EEEEllllllllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  572
ident                                                             
Sbjct lspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargk  289
DSSP  llhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  572
ident                                                             
Sbjct ylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettl  349
DSSP  eeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  572
ident                                                             
Sbjct aqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlagh  409
DSSP  hhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  572
ident                                                             
Sbjct lleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsd  469
DSSP  hhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  572
ident                                                             
Sbjct lvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtllee  529
DSSP  leeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  572
ident                                                             
Sbjct viyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavv  589
DSSP  llllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .......hhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query .......iksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                                 
Sbjct aavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=4.0

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
ident                                                             
Sbjct .........................................vsrtsrardelapifassa   19
DSSP  .........................................leeeeeeelllhhhhhhll


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEELlllLEEEELLlllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query hkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELNadgTITVHTAwedhgqgadigcvgtahealr  360
ident                        |  |     |                           
Sbjct gvvrgqfscgrvsacpmETRGAVAQYEWT...TQQLILW........tatqmpsfvrtmv   68
DSSP  eeeeeeeeellllllllLLLEEEEEEELL...LLEEEEE........ellllhhhhhhhh


DSSP  hhlllhhheEELLLLLlllllllllLLLLHHhHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllllllhh
Query pmgvapekiKFTWPNTattpnsgpsGGSRQQvMTGNAIRVACENLlkacekpgggyytyd  420
ident                                                             
Sbjct amfcaipehLIEVRVP.dvgggfgqKAHLHP.EELLVCLLSRALG...............  111
DSSP  hhhhlllhhHEEEELL.llllllllLLLLLH.HHHHHHHHHHHHL...............


DSSP  hhhhllllleEEEEEELLLL........................................
Query elkaadkptkITGNWTASGA........................................  440
ident               |                                             
Sbjct ..........RPVRWIEDRQenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggay  161
DSSP  ..........LLEEEELLHHhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  440
ident                                                             
Sbjct nnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretli  221
DSSP  llllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  440
ident                                                             
Sbjct draarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrq  281
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  440
ident                                                             
Sbjct aearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslass  341
DSSP  hhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  440
ident                                                             
Sbjct gqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivre  401
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  440
ident                                                             
Sbjct rvkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatlea  461
DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllllllee


DSSP  ...llllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhh
Query ...thcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgq  497
ident                                                             
Sbjct tatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqa  521
DSSP  eeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllll
Query iygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgv  557
ident                                                             
Sbjct igqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesam  581
DSSP  hhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhh


DSSP  llhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query gelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                                         
Sbjct isapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=3.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  ................LLHHHhhllllllllllllleeeeeeeeellLHHH.hHHHL...
Query ................MSGPAaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgeDTGP.iFASA...   40
ident                   |                               |  |      
Sbjct vmpedfpftnrlgqthREGTY.................lqtinlleeMVNPeaFRQRqae  283
DSSP  llhhhlleellllleeLLLLH.................hhhhhhhhhHHLHhhHHHHhhh


DSSP  .......LEEEEEEEEELLLLLL..........llLLLE.....................
Query .......DVTVEGDFYVGRQPHM..........piEPDV.....................   62
ident               |                                             
Sbjct arargkyLGLGVSVFNEVTGTGTrtlsflgtptttHDSAtvridptgkvtvttslassgq  343
DSSP  hhllleeEEEEEEEEEEEELLLHhhhhhlllllllLLEEeeeellllleeeeelllllll


DSSP  ...........................................eeeeellllleeeeell
Query ...........................................afaymgddgkcyihsks   79
ident                                                             
Sbjct ghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrerv  403
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeELL
Query igvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlRYN  139
ident                                                             
Sbjct kqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleATA  463
DSSP  hhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleEEE


DSSP  HhhHHHLlllllLEEEEEEEEELL.....LLLEEEEEEEEEEELlllllLHHHHHH.HHH
Query YqqQQQYtgkrsPWEMNVKFAAKK.....DGTLLAMESDWLVDHgpyseFGDLLTL.RGA  193
ident                                                             
Sbjct T..YDPS..dlvLANGGHAAIVEIdastyATRVTDFFAVEDCGT....mINPMIVEgQIR  515
DSSP  E..LLLL..lleEEEEEEEEEEEEellllLEEEEEEEEEEELLL....lLLHHHHHhHHH


DSSP  HHL..LLLL............................LLLEEEEEEEEELLLLLLlllll
Query QFI..GAGY............................NIPNIRGLGRTVATNHVWgsafr  223
ident   |    |                               | ||          |      
Sbjct GGIaqAIGQtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttlDVPDIRIRHLETPSPLVP..ggi  573
DSSP  HHHhhHHHHhhllllllllllllllllllllllllllLLLLEEEEELLLLLLLLH..hhl


DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....LLHHhHHHHhllllllllllllllllllhhhh
Query gyGAPQSMFASECLMDMLAEKLG.....MDPLeLRYKnayrpgdtnptgqepevfslpdm  278
ident        |                                                    
Sbjct kgMGESAMISAPAAVVAAVNDALahlevVIET.VPIT.......................  609
DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLE.ELLL.......................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeel
Query idqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvht  338
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhh
Query awedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnai  398
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleee
Query rvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymy  458
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query gvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedik  518
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhl
Query khatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatg  578
ident                                                             
Sbjct ............................................................  609
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhl
Query vriyrlpaypekvlealka  597
ident                    
Sbjct .......perifrsiqerp  621
DSSP  .......hhhhhhhhhlll


No 11: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.6

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct .................vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgava   43
DSSP  .................leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeee


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct qyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellv  103
DSSP  eeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhh


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
ident                                                             
Sbjct cllsralgrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynn  163
DSSP  hhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query hkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
ident                                                             
Sbjct lpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidr  223
DSSP  llllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh
Query pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
ident                                                             
Sbjct aarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqae  283
DSSP  hhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllEEEEEEEEEEeeellllleeeEEEE
Query elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvYMYGVFMAEVtvdvatgqttvDGMT  480
ident                                                            |
Sbjct arargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRIDP..........tGKVT  333
DSSP  hhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlllllllLLEEEEEELL..........lLLEE


DSSP  EEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllhhhLLLLEEE
Query LMADLgSLCNQlATDGQIYGGLAQGIGlalsedfedikkhatlvgagfpfikqIPDKLDI  540
ident     |     |           |   |                                |
Sbjct VTTSL.ASSGQ.GHETTLAQIAADVLG.........................vPASDVVI  366
DSSP  EEELL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL.........................lLHHHEEE


DSSP  EELLL..lllllhhhlLLLL...LHHHLLHHHHHHhhH......................
Query VYVNH..prpdgpfgaSGVG...ELPLTSPHAAIInaI......................  573
ident                  |                                          
Sbjct QAGSTkntygfgayasRGAVigaGSIGRAASIVRE..Rvkqlaghlleaasediviedgl  424
DSSP  ELLLLlllllllllllLHHHhhhHHHHHHHHHHHH..Hhhhhhhhhhlllhhheeeelle


DSSP  ...............................HHH..........................
Query ...............................KSA..........................  576
ident                                                             
Sbjct vhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfDATleatatydpsdlvlangghaaiveid  484
DSSP  eeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllLLLleeeeelllllleeeeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct astyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlm  544
DSSP  llllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllll


DSSP  ........................................................hlll
Query ........................................................tgvr  580
ident                                                             
Sbjct dylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvie  604
DSSP  lllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  lllllllhhhhhhhhhl
Query iyrlpaypekvlealka  597
ident                  
Sbjct tvpitperifrsiqerp  621
DSSP  eelllhhhhhhhhhlll


No 12: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.6

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct .........vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqq   51
DSSP  .........leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllle


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
ident                                                             
Sbjct lilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralg  111
DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleeeEEEEELL.....lLLEEEELLLL.......lLLLL..
Query hkkgvgisigvygsgldgpdaseAWAELNA.....dGTITVHTAWE.......dHGQG..  346
ident                            |                            |   
Sbjct rpvrwiedrqenflgathakqqrNEMGLAFdgdgrfLALENRSITDggaynnlpWTQLve  171
DSSP  lleeeellhhhhhhhlllllleeEEEEEEEllllleEEEEEEEEEEllllllllLLHHhl


DSSP  hHHHHhHHHHHhhhhHLLLhhHEEELLLLLlllllllllLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query aDIGCvGTAHEalrpMGVApeKIKFTWPNTattpnsgpsGGSRqqVMTGNAIRVACENLL  406
ident    |             |                      |         |   | | | 
Sbjct sHVGN.AVILG...vYKVP..AVSEESIAV...atnkcpIGAY.rGVGFTAGQIARETLI  221
DSSP  hHHHH.HLLLL...lLLLL..EEEEEEEEE...llllllLLLL.lLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHL..LLLL..LLLL............................................
Query KACE..KPGG..GYYT............................................  418
ident                                                             
Sbjct DRAArqLGLSpfEIRRrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrq  281
DSSP  HHHHhhHLLLhhHHHHlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  418
ident                                                             
Sbjct aearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslass  341
DSSP  hhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  418
ident                                                             
Sbjct gqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivre  401
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  418
ident                                                             
Sbjct rvkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatlea  461
DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllllllee


DSSP  .............................................hhhhhhllllleeee
Query .............................................ydelkaadkptkitg  433
ident                                                             
Sbjct tatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqa  521
DSSP  eeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeELLLLllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh
Query nwTASGAthcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqla  493
ident                                                             
Sbjct igQTLLE.....................................................  528
DSSP  hhHHHLL.....................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhh
Query tdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfg  553
ident                                                             
Sbjct ...........eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmg  577
DSSP  ...........lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhlllll


DSSP  llllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query asgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                                             
Sbjct esamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 13: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.5

DSSP  ...........................llhhhhhllLLLLLLL..........llLLEE.
Query ...........................msgpaaaaeDAIEIHP..........gtPNVY.   22
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmETRGAVAqyewttqqlilwTATQm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllLLLEEEEeeelllleeeeeELLLl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   22
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ...............eeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllLLLEeeeee
Query ...............feqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiEPDVafaym   67
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveSHVG.....  175
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlHHHH.....


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhh
Query gddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaa  127
ident                                                             
Sbjct ............................................................  175
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllleeeEL.................................................
Query matgrpvhlRY.................................................  138
ident                                                             
Sbjct .........NAvilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraar  226
DSSP  .........HHllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  138
ident                                                             
Sbjct qlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaeara  286
DSSP  hhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ......................lhHHHHHllllllLEEEEEEEEEllllleEEEEEEEEE
Query ......................nyQQQQQytgkrsPWEMNVKFAAkkdgtlLAMESDWLV  176
ident                                         |                   
Sbjct rgkylglgvsvfnevtgtgtrtlsFLGTP...tttHDSATVRIDP.....tGKVTVTTSL  338
DSSP  lleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhHLLLL...lllLLEEEEEELL.....lLLEEEEELL


DSSP  ElllllllhHHHHHHHHHHLLL.LLLL.LEEEEEEE..eellllllLLLL.lLLLHHHHH
Query DhgpysefgDLLTLRGAQFIGA.GYNI.PNIRGLGR..tvatnhvwGSAF.rGYGAPQSM  231
ident                 ||                                    ||    
Sbjct A.....ssgQGHETTLAQIAADvLGVPaSDVVIQAGstkntygfgaYASRgaVIGAGSIG  393
DSSP  L.....lllLLHHHHHHHHHHHhHLLLhHHEEEELLllllllllllLLLLhhHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLL....LHHHHHhhHLLLlllllllllllllllhhhhHHHH.....
Query FASECLMDMLAEKLGM....DPLELRykNAYRpgdtnptgqepevfslpdmIDQL.....  282
ident  |            |                                             
Sbjct RAASIVRERVKQLAGHlleaASEDIV..IEDG...............lvhvAGVPakgmp  436
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhhllLHHHEE..EELL...............eeeeLLEEeeeee


DSSP  ....................................hhhhhhhhhhhhhhlllleeeeee
Query ....................................rpkyqaalekaqkestathkkgvg  306
ident                                                             
Sbjct faevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdff  496
DSSP  hhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeee


DSSP  eeeeeeELLLLllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllh
Query isigvyGSGLDgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvap  366
ident                                                             
Sbjct avedcgTMINP.................................................  507
DSSP  eeeellLLLLH.................................................


DSSP  hheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhll
Query ekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaad  426
ident                                                             
Sbjct ............................................................  507
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeellllLLllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeell
Query kptkitgnwtasgaTHcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlg  486
ident                                                             
Sbjct ..............MI............................................  509
DSSP  ..............HH............................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellll
Query slcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhp  546
ident                                                             
Sbjct ............vegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdi  557
DSSP  ............hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllle


DSSP  lLLLHhhlLLLLlHHHL.................lhhhhhhhhhhhhhllllllllllhh
Query rPDGPfgaSGVGeLPLT.................sphaaiinaiksatgvriyrlpaype  589
ident                                                             
Sbjct rIRHL...ETPS.PLVPggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperi  613
DSSP  eEEEL...LLLL.LLLHhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhh


DSSP  hhhhhhhl
Query kvlealka  597
ident         
Sbjct frsiqerp  621
DSSP  hhhhhlll


No 14: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  .......................................................llhhh
Query .......................................................msgpa    5
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  hhllllllllllllleeeeeeeeellLHHHHHHH.................lLEEEEEEE
Query aaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgeDTGPIFAS.................aDVTVEGDF   48
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinLLEEMVNPeafrqrqaearargkylgLGVSVFNE  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhHHHHHHLHhhhhhhhhhhhllleeeeEEEEEEEE


DSSP  EE..........................................................
Query YV..........................................................   50
ident                                                             
Sbjct VTgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
DSSP  EElllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ........llllllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheee
Query ........grqphmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvl  102
ident                                                             
Sbjct asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  eellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlllllllEEEEEEEEEL
Query vanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspWEMNVKFAAK  162
ident                                                      |   || 
Sbjct edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlVLANGGHAAI  480
DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellllllEEEEEEEEEE


DSSP  L..........LLLEeEEEEEEeeelllllllhhhhhHHHHH....hlLLLL........
Query K..........DGTLlAMESDWlvdhgpysefgdlltLRGAQ....fiGAGY........  200
ident                     |                             |         
Sbjct VeidastyatrVTDF.FAVEDC..............gTMINPmivegqIRGGiaqaigqt  525
DSSP  EeeellllleeEEEE.EEEEEL..............lLLLLHhhhhhhHHHHhhhhhhhh


DSSP  .............................llLEEEEEEeeellllllllllllllhhHHH
Query .............................niPNIRGLGrtvatnhvwgsafrgygapQSM  231
ident                                  || |                       
Sbjct lleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdIRIRHLE........tpsplvpggikGMG  577
DSSP  hllllllllllllllllllllllllllllllEEEEELL........llllllhhhllLLL


DSSP  HHHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query FASECLmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaale  291
ident                                                             
Sbjct ESAMIS......................................................  583
DSSP  LHHHHH......................................................


DSSP  hhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhh
Query kaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigc  351
ident                                                             
Sbjct ............................................................  583
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query vgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacek  411
ident                                                             
Sbjct ............................................................  583
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeelll
Query pgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvat  471
ident                                                             
Sbjct ............................................................  583
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllh
Query gqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfi  531
ident                                                             
Sbjct ............................................................  583
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhh
Query kqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekv  591
ident                                                             
Sbjct ............................apaavvaavndalahlevvietvpitperifr  615
DSSP  ............................hhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhh


DSSP  hhhhhl
Query lealka  597
ident       
Sbjct siqerp  621
DSSP  hhhlll


No 15: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.4

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLL
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestAT  300
ident                                                           | 
Sbjct ........................................vsrtsrardelapifassAG   20
DSSP  ........................................leeeeeeelllhhhhhhlLE


DSSP  EEEEEEEEEEEEEllllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query HKKGVGISIGVYGsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
ident    |      |                                                 
Sbjct VVRGQFSCGRVSA...............................................   33
DSSP  EEEEEEEELLLLL...............................................


DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh
Query pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   33
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllE........................
Query elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvY........................  456
ident                                                             
Sbjct ...................................Cpmetrgavaqyewttqqlilwtat   58
DSSP  ...................................Lllllleeeeeeelllleeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  456
ident                                                             
Sbjct qmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwie  118
DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeel


DSSP  .........EEE.EEEEEEEEEL....LLLLEEEeEEEEEEEllllllhHHHHhhHHHHH
Query .........MYG.VFMAEVTVDV....ATGQTTVdGMTLMADlgslcnqLATDgqIYGGL  502
ident                  |                               |          
Sbjct drqenflgaTHAkQQRNEMGLAFdgdgRFLALEN.RSITDGG...aynnLPWT..QLVES  172
DSSP  lhhhhhhhlLLLlLEEEEEEEEEllllLEEEEEE.EEEEELL...llllLLLL..HHHLH


DSSP  HHHHHHHHLlllllllllllllllllllhhHLLLlEEEEELLllllllhhhlllLLLHhh
Query AQGIGLALSedfedikkhatlvgagfpfikQIPDkLDIVYVNhprpdgpfgasgVGELpl  562
ident   |    |                                               |    
Sbjct HVGNAVILG..............vykvpavSEES.IAVATNK..........cpIGAY.r  206
DSSP  HHHHHLLLL..............llllleeEEEE.EEELLLL..........llLLLL.l


DSSP  llHHHHHHHHHHHHHLLllllllllhhhhhHHHHL.........................
Query tsPHAAIINAIKSATGVriyrlpaypekvlEALKA.........................  597
ident      |   |                                                  
Sbjct gvGFTAGQIARETLIDR............aARQLGlspfeirrrnvvmpedfpftnrlgq  254
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHH............hHHHHLllhhhhhhlllllhhhlleelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  597
ident                                                             
Sbjct thregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgt  314
DSSP  eellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  597
ident                                                             
Sbjct pttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstknt  374
DSSP  lllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  597
ident                                                             
Sbjct ygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakg  434
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  597
ident                                                             
Sbjct mpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtd  494
DSSP  eehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  597
ident                                                             
Sbjct ffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldv  554
DSSP  eeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  597
ident                                                             
Sbjct pdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperif  614
DSSP  lleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhh


DSSP  .......
Query .......  597
ident        
Sbjct rsiqerp  621
DSSP  hhhhlll


No 16: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.4

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ......................................................vsrtsr    6
DSSP  ......................................................leeeee


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlllllllEEEEEEEEELllllEEEEEEEEeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspWEMNVKFAAKkdgtLLAMESDWlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetRGAVAQYEWT....TQQLILWT......   56
DSSP  eelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllLEEEEEEELL....LLEEEEEE......


DSSP  llllhhhhhHHHHHHL..lLLLLlLEEEEEEeeellllllllllllLLHHHHHHHHHHH.
Query ysefgdlltLRGAQFI..gAGYNiPNIRGLGrtvatnhvwgsafrgYGAPQSMFASECL.  237
ident                           |                      |          
Sbjct ....atqmpSFVRTMVamfCAIPeHLIEVRV....pdvgggfgqkaHLHPEELLVCLLSr  108
DSSP  ....llllhHHHHHHHhhhHLLLhHHEEEEL....lllllllllllLLLHHHHHHHHHHh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  237
ident                                                             
Sbjct algrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtq  168
DSSP  hhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  237
ident                                                             
Sbjct lveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarql  228
DSSP  hhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .................................hhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllll
Query .................................mdmlaeklgmdplelryknayrpgdtn  264
ident                                                             
Sbjct glspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaeararg  288
DSSP  lllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeee
Query ptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdasea  324
ident                                                             
Sbjct kylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghett  348
DSSP  eeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhh


DSSP  eeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllllllll
Query waelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgp  384
ident                                                             
Sbjct laqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlag  408
DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllll
Query sggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcd  444
ident                                                             
Sbjct hlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydps  468
DSSP  hhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellll


DSSP  llllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhh
Query avtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaq  504
ident                                                             
Sbjct dlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlle  528
DSSP  lleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhll
Query giglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelplts  564
ident                                                             
Sbjct eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaav  588
DSSP  lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query phaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                                  
Sbjct vaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 17: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh


DSSP  ...............................llhhhhhllllllllllllleeeeeeeee
Query ...............................msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivk   29
ident                                                             
Sbjct qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll


DSSP  lllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhh
Query gedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymi   89
ident                                                             
Sbjct gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll


DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllll
Query apgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgk  149
ident                                                             
Sbjct vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee


DSSP  llleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeee
Query rspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglg  209
ident                                                             
Sbjct vtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
DSSP  eelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  eeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllllllll
Query rtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqe  269
ident                                                             
Sbjct asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEEL
Query pevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELN  329
ident                                                             
Sbjct edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsDLVLANGGHAAI  480
DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellllLLEEEEEEEEEE


DSSP  ..........llLLEEEELLL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHL..............
Query ..........adGTITVHTAW.EDHGQ.GADIGCVGTAHEALRPMG..............  363
ident                                    |    |                   
Sbjct veidastyatrvTDFFAVEDCgTMINPmIVEGQIRGGIAQAIGQTLleeviyddfgqlvt  540
DSSP  eeeellllleeeEEEEEEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllllll


DSSP  ...........lLHHHEEELLLllllllllLLLL.....LLLHhhhHHHHHHHHHHHHHH
Query ...........vAPEKIKFTWPntattpnsGPSG.....GSRQqvmTGNAIRVACENLLK  407
ident                 |                      |       |            
Sbjct ttlmdylipttlDVPDIRIRHL........ETPSplvpgGIKG...MGESAMISAPAAVV  589
DSSP  llllllllllllLLLLEEEEEL........LLLLlllhhHLLL...LLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHlllllllLLHHHhHHLLllleeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeee
Query ACekpgggyYTYDElKAADkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtv  467
ident |                                                           
Sbjct AA.......VNDAL.AHLE.........................................  600
DSSP  HH.......HHHHH.HHHL.........................................


DSSP  ellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllll
Query dvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgag  527
ident                                                             
Sbjct ............................................................  600
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllll
Query fpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpay  587
ident                                                             
Sbjct .................................................vvietvpitpe  611
DSSP  .................................................lllleelllhh


DSSP  hhhhhhhhhl
Query pekvlealka  597
ident           
Sbjct rifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhlll


No 18: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.3

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct .........................................................vsr    3
DSSP  .........................................................lee


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhlllllllllllllllLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepeVFSLpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
ident                                                             
Sbjct tsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacPMET.........................   38
DSSP  eeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllLLLL.........................


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query hkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   38
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh
Query pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   38
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeEEEEEEEEEEllllLEEEeEEE
Query elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymyGVFMAEVTVDvatgQTTVdGMT  480
ident                                           |                 
Sbjct ......................................RGAVAQYEWT....TQQL.ILW   55
DSSP  ......................................LEEEEEEELL....LLEE.EEE


DSSP  EEeellllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHlllllllllllllllllllLHHHLLllEEE
Query LMadlgslcnqlatdgQIYGGLAQGIGLALsedfedikkhatlvgagfpFIKQIPdkLDI  540
ident                                                      |      
Sbjct TA............tqMPSFVRTMVAMFCA..................iPEHLIE..VRV   83
DSSP  EL............llLHHHHHHHHHHHHL..................lLHHHEE..EEL


DSSP  EELLLlllllhhhLLLLLLhHHLLHHHHHHHHHHHH........................
Query VYVNHprpdgpfgASGVGElPLTSPHAAIINAIKSA........................  576
ident   |                                                         
Sbjct PDVGG.......gFGQKAH.LHPEELLVCLLSRALGrpvrwiedrqenflgathakqqrn  135
DSSP  LLLLL.......lLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhlllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct emglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiav  195
DSSP  eeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct atnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqt  255
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct hregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtp  315
DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct ttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstknty  375
DSSP  llllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct gfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgm  435
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct pfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdf  495
DSSP  ehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  576
ident                                                             
Sbjct favedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvp  555
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllll


DSSP  .............................................hllllllllllhhhh
Query .............................................tgvriyrlpaypekv  591
ident                                                             
Sbjct dirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifr  615
DSSP  leeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhh


DSSP  hhhhhl
Query lealka  597
ident       
Sbjct siqerp  621
DSSP  hhhlll


No 19: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.3

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewt   48
DSSP  ............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeell


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct tqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsr  108
DSSP  lleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct algrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtq  168
DSSP  hhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllh


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct lveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarql  228
DSSP  hhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
ident                                                             
Sbjct glspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaeararg  288
DSSP  lllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllLEEE........EEEEELLL....LLEEEELLlllllllhh
Query hkkgvgisigvygsgldgpDASE........AWAELNAD....GTITVHTAwedhgqgad  348
ident                      |           |    |     | |   |         
Sbjct kylglgvsvfnevtgtgtrTLSFlgtpttthDSATVRIDptgkVTVTTSLA...ssgqgh  345
DSSP  eeeeeeeeeeeeeelllhhHHHHllllllllLEEEEEELllllEEEEELLL...lllllh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhheeELLLllllLLLLlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query igcvgtahealrpmgvapekikFTWPntatTPNSgpsggsrQQVMTGNAIRVACENLLKA  408
ident                                                             
Sbjct ettlaqiaadvlgvpasdvviqAGST.kntYGFG......aYASRGAVIGAGSIGRAASI  398
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeeLLLL.lllLLLL......lLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  ..........................................hlllllllllhhhhhhll
Query ..........................................cekpgggyytydelkaad  426
ident                                                             
Sbjct vrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdat  458
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllll


DSSP  lllEEEEEE..eLLLLllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeee
Query kptKITGNW..tASGAthcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmad  484
ident      |                                                      
Sbjct leaTATYDPsdlVLAN..........gghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpm  508
DSSP  leeEEELLLlllEEEE..........eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeell
Query lgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvn  544
ident                                                             
Sbjct ivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpspl  568
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeelllllll


DSSP  llllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query hprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                                                      
Sbjct vpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  lhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 20: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.1

DSSP  llhhhhhllllllllllllLEEEEEEeeelllhhhhhhhlleeeEEEEEELLLLLLLllL
Query msgpaaaaedaieihpgtpNVYFEQPivkgedtgpifasadvtvEGDFYVGRQPHMPieP   60
ident                                              |              
Sbjct ................vsrTSRARDE..........lapifassAGVVRGQFSCGRV..S   32
DSSP  ................leeEEEEELL..........lhhhhhhlLEEEEEEEEELLL..L


DSSP  LE..........................................................
Query DV..........................................................   62
ident                                                             
Sbjct ACpmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgq   92
DSSP  LLllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllll


DSSP  ...................................Eeeeellllleeeeellllhhhhhh
Query ...................................Afaymgddgkcyihsksigvhlhly   87
ident                                                             
Sbjct kahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgaT........................  128
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlL........................


DSSP  hhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhLL
Query miapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqYT  147
ident                                                             
Sbjct .........................................................hAK  131
DSSP  .........................................................lLL


DSSP  LLLLLEEEEEEEEellllleeeEEEEEEEELL...............lLLLLHHHHhHHH
Query GKRSPWEMNVKFAakkdgtllaMESDWLVDHG...............pYSEFGDLLtLRG  192
ident   |                                                      |  
Sbjct QQRNEMGLAFDGD........gRFLALENRSItdggaynnlpwtqlveSHVGNAVI.LGV  182
DSSP  LEEEEEEEEELLL........lLEEEEEEEEEeellllllllllhhhlHHHHHHLL.LLL


DSSP  HhhlllllllleeeEEEEEELLL...........lllLLLL.lLLLHHhHHHHHHHHHH.
Query AqfigagynipnirGLGRTVATN...........hvwGSAF.rGYGAPqSMFASECLMD.  239
ident                                      |                      
Sbjct Y...........kvPAVSEESIAvatnkcpigayrgvGFTAgqIARET.LIDRAARQLGl  230
DSSP  L...........llLEEEEEEEEelllllllllllllLHHHhhHHHHH.HHHHHHHHHLl


DSSP  .................................hhhhhhlllhhhhhhhhllllllllll
Query .................................mlaeklgmdplelryknayrpgdtnpt  266
ident                                                             
Sbjct spfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargky  290
DSSP  lhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeee
Query gqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawa  326
ident                                                             
Sbjct lglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettla  350
DSSP  eeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhh


DSSP  eellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllllllllll
Query elnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsg  386
ident                                                             
Sbjct qiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghl  410
DSSP  hhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllll
Query gsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdav  446
ident                                                             
Sbjct leaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdl  470
DSSP  hlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellllll


DSSP  llllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query tglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgi  506
ident                                                             
Sbjct vlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleev  530
DSSP  eeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  hhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhh
Query glalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsph  566
ident                                                             
Sbjct iyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavva  590
DSSP  lllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl
Query aaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
ident                                
Sbjct avndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
DSSP  hhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll


No 21: Query=mol1A Sbjct=mol2B Z-score=2.0

DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh
Query dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
ident                                                             
Sbjct ............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewt   48
DSSP  ............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeell


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
ident                                                             
Sbjct tqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsr  108
DSSP  lleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleEEEEEEELL...........lLLEEEELL.lLLLLLLHH
Query hkkgvgisigvygsgldgpdaSEAWAELNA...........dGTITVHTA.wEDHGQGAD  348
ident                                                             
Sbjct algrpvrwiedrqenflgathAKQQRNEMGlafdgdgrflalENRSITDGgaYNNLPWTQ  168
DSSP  hhllleeeellhhhhhhhlllLLLEEEEEEeeellllleeeeEEEEEEELllLLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHL..llhhHEEELLLLLLllllllllllllHHHHhhHHHHHHHHHHH
Query IGCVGTAHEALRPMG..vapeKIKFTWPNTAttpnsgpsggsrQQVMtgNAIRVACENLL  406
ident                                                       |     
Sbjct LVESHVGNAVILGVYkvpavsEESIAVATNK.........cpiGAYR..GVGFTAGQIAR  217
DSSP  HHLHHHHHHLLLLLLllleeeEEEEEELLLL.........lllLLLL..LLLHHHHHHHH


DSSP  HHHLL..........LLLL.........................................
Query KACEK..........PGGG.........................................  415
ident                                                             
Sbjct ETLIDraarqlglspFEIRrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeaf  277
DSSP  HHHHHhhhhhhlllhHHHHhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  415
ident                                                             
Sbjct rqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvtts  337
DSSP  hhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  415
ident                                                             
Sbjct lassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraas  397
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  415
ident                                                             
Sbjct ivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfda  457
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  415
ident                                                             
Sbjct tleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirgg  517
DSSP  lleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  415
ident                                                             
Sbjct iaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmg  577
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhlllll


DSSP  ..............lllhhhhhHLLLLleeeeeeellllllllllllllllllleeeeee
Query ..............yytydelkAADKPtkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvf  461
ident                                                             
Sbjct esamisapaavvaavndalahlEVVIE.................................  604
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLL.................................


DSSP  eeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
Query maevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkha  521
ident                                                             
Sbjct ............................................................  604
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllll
Query tlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvri  581
ident                                                             
Sbjct ...........................................................t  605
DSSP  ...........................................................e


DSSP  llllllhhhhhhhhhl
Query yrlpaypekvlealka  597
ident                 
Sbjct vpitperifrsiqerp  621
DSSP  elllhhhhhhhhhlll