No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=47.0

DSSP  .LLHHHHHLllllllllllLLLEEE.EEEEEELLHHHHHHLLLEEEEEEEEELLLLLLLL
Query .MTPKAAMKagaialhddkPNNILR.EVHAEFGDVAAAFAEADLIREKTYTFAEVNHVHM   58
ident   |   | |           |     |   | ||    | |||             |   
Sbjct iITIEDAIK..........NNSFYGsELKIEKGDLKKGFSEADNVVSGELYIGGQDHFYL   50
DSSP  lLLHHHHHH..........LLLEEEeEEEEEELLHHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLL


DSSP  LLLEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLL.
Query ELNATLAEYDPVRDMLTLNTTTQVPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPFLGGGFGARTE.  117
ident |   | |          |   ||        ||  |     || |     |||||     
Sbjct ETHCTIAIPKGEEGEMELFVSTQNAMKTQSFVAKMLGVPVNRILVRVKRMGGGFGGKETr  110
DSSP  LLLEEEEEELLLLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLl


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHLLLLLEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEE
Query ALHFEIIAGLLARKAKGTVRLLQTREETFIAHRGRPWTEVKMKIGLKKDGKIAALALEAT  177
ident          | | |    ||    | |      ||       | |  | | | ||     
Sbjct STLVSVAVALAAYKTGHPVRCMLDRNEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGTIVALEVDHY  170
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEE


DSSP  EELLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHH
Query QAGGAYAGYGIITILYTGALMHGLYHIPAIKHDAWRVYTNTPPCGAMRGHGTVDTRAAFE  237
ident    |                |   | || |        ||     | || |        |
Sbjct SNAGNSRDLSHSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLSSNTAFRGFGGPQALFIAE  230
DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLlEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHL..
Query ALLTEMGEELGIDSLKIRQINMLPQIpYVTMYAQRVMSYGVPECLEKVKAASGWEERK..  295
ident     |     |      |  ||       |   ||     || |       |    ||  
Sbjct NWMSEVAVTCGLPAEEVRWKNMYKEG.DLTHFNQRLEGFSVPRCWDECLKSSQYYARKse  289
DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLLL.LLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHHhh


DSSP  LLLLL......LEEEEEEEEEEELLL.LLLLllllllLEEEEEEELLLLLEEEEELLLLL
Query GKLPK......GRGLGIALSHFVSGT.STPKhwtgepHATVNLKLDFDGGITLLTGAADI  348
ident             ||| |    |                |        ||      |    
Sbjct VDKFNkencwkKRGLCIIPTKFGISFtVPFL.....nQAGALIHVYTDGSVLVSHGGTEM  344
DSSP  HHHHHhhllleEEEEEEEEEEEEELLlLHHH.....lEEEEEEEELLLLLEEEEELLLLL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query GQGSNTMASQVAAEVLGVRLSRIRVISADSALTPKDNGSYSSRVTFMVGNASISAAEELK  408
ident |||  |   |||   |    | |          |       |  |   | |   |     
Sbjct GQGLHTKMVQVASKALKIPISKIYISETSTNTVPNSSPTAASVSTDIYGQAVYEACQTIL  404
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEELLLEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLlllhhheeeelleeeellllllLEEHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELLL
Query GVLVKAAAKKLdareedievidemfmvsgsqdpGLSFQEVVKAAMVDSGTITVKGTYTCP  468
ident   |     |                          |    | ||  |       | |  |
Sbjct KRLEPFKKKNP......................DGSWEDWVMAAYQDRVSLSTTGFYRTP  442
DSSP  HHHHHHHHHLL......................LLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELL


DSSP  HhHLLLllLHHHHllLLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHH
Query TeFQGDkkIRGSAigATMGFCYAAQVVEASVDEITGKVTAHKVWVAVDVGKALNPLAVEG  528
ident            |   |   | |     |   |  ||           |||  |||    |
Sbjct N.LGYS.fETNSG.nAFHYFTYGVACSEVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIG  499
DSSP  L.LLLL.lLLLLL.lLLLEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLEE.LLEELLLLLLLLLLLLLLLLL.EEEEEEEL.LLLLLLH
Query QTQGGVWMGMGQALSEETVYD.NGRMVHGNILDYRVPTIVESP.DIEVIIVE.SMDPNGP  585
ident |  |    | |    ||  |   |         |  |     |    |            
Sbjct QVEGAFVQGLGLFTLEELHYSpEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPtEFRVSLLRdCPNKKAI  559
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLlEEEEEELLlLLLLLLH


DSSP  HHLLLLLLLLLLLHHhHHHHHHHHHHL.............lLLLEELLLHHHHHHHHHHh
Query FGAKEASEGMLAGFLpAIHEAVYEAVG.............vRATDFPLSPDRITELLDAk  632
ident    |   |  |         |   |                   | |  |  |       
Sbjct YASKAVGEPPLFLGA.SVFFAIKDAIRaaraqhtnnntkelFRLDSPATPEKIRNACVDk  618
DSSP  HHLLLLLLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHhhhhhhllllllllLLLLLLLLHHHHHHHLLLl


DSSP  HHLL................
Query EAAA................  636
ident                     
Sbjct FTTLcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  LLLLllllllllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllL
Query ...................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeaD   41
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwK  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllE


DSSP  EEEEEEEEELLLLLL...lLLLLEEEEEEElLLLEEEEEELLLL.....HHHHHHHHHHH
Query LIREKTYTFAEVNHV...hMELNATLAEYDpVRDMLTLNTTTQV.....PYYVHLKVAAC   93
ident                          |                                  
Sbjct KRGLCIIPTKFGISFtvpfLNQAGALIHVY.TDGSVLVSHGGTEmgqglHTKMVQVASKA  359
DSSP  EEEEEEEEEEEEELLllhhHLEEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLLllllhHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLHHHEEE.ELLL.....LLLLL.LLLLL.lLHHHHHHHHHHHHHL............
Query LQMDSARIRV.IKPF.....LGGGF.GARTE.aLHFEIIAGLLARKAK............  133
ident |      |                     |         |     |              
Sbjct LKIPISKIYIsETSTntvpnSSPTAaSVSTDiyGQAVYEACQTILKRLepfkkknpdgsw  419
DSSP  HLLLHHHEELlLEELlllllLLLLLlLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllllh


DSSP  .............LEEEEELLHH........hhhhhlllLLEEEEEEEEEELL.LLLEEE
Query .............GTVRLLQTRE........etfiahrgRPWTEVKMKIGLKK.DGKIAA  171
ident                                                        |    
Sbjct edwvmaayqdrvsLSTTGFYRTPnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEVEIDClTGDHKN  479
DSSP  hhhhhhhhhllllLEEEEEEELLllllllllllllllleEEEEEEEEEEEEELlLLLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLLLL..LHHHHHHH.HHHLLLLLLL.........................
Query LALEATQAGGAYAG..YGIITILY.TGALMHGLYH.........................  203
ident |        |        |                                         
Sbjct LRTDIVMDVGSSLNpaIDIGQVEGaFVQGLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipafg  539
DSSP  EEEEEEEELLLLLLhhHHHHHHHHhHHHHHHHHHLlllllllllllllllllllllllhh


DSSP  lllEEEEEEEE.LLLL.....LLLLLLlLLLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhh
Query ipaIKHDAWRV.YTNT.....PPCGAMrGHGTVDTrAAFEALLTEMGEELGidslkirqi  257
ident                                     |                       
Sbjct sipTEFRVSLLrDCPNkkaiyASKAVG.EPPLFLG.ASVFFAIKDAIRAAR.........  588
DSSP  hllLEEEEEELlLLLLlllhhHLLLLL.LLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHH.........


DSSP  llllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleEEEEEEeeeelllll
Query nmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrGLGIALshfvsgtst  317
ident                                                             
Sbjct ...................................aqhtnnntkeLFRLDS.........  604
DSSP  ...................................hhhlllllllLLLLLL.........


DSSP  llllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeell
Query pkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisad  377
ident                                                             
Sbjct ............................................................  604
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeell
Query saltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsg  437
ident                                                             
Sbjct ............................................................  604
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeee
Query sqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvvea  497
ident                                                             
Sbjct ............................................................  604
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellll
Query svdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgn  557
ident                                                             
Sbjct ............................................................  604
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllle
Query ildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratd  617
ident                                                             
Sbjct .............................................patpekirnacvdkf  619
DSSP  .............................................lllhhhhhhhlllll


DSSP  elllhhhhhhhhhhhhhll
Query fplspdritelldakeaaa  636
ident                    
Sbjct ttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lllllllllllllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.9

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct ..................................iitiedaiknnsfygselkiekgdlk   26
DSSP  ..................................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhh


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllleEEEEEELLLL.LEEEEELLLlllllHHHHHHHH
Query grglgialshfvsgtstpkhwtgephaTVNLKLDFDG.GITLLTGAAdigqgSNTMASQV  359
ident                                          |                  
Sbjct kgfseadnvvsgelyiggqdhfylethCTIAIPKGEEgEMELFVSTQ.....NAMKTQSF   81
DSSP  hhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEELLLLlLEEEEELLL.....LHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELLllllllLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhl
Query AAEVLGVRLSRIRVISADsaltpkDNGSYsSRVTFMVGNASISAAEELKGVLvkaaakkl  419
ident  |  |||   || |            |             |   |               
Sbjct VAKMLGVPVNRILVRVKR......MGGGF.GGKETRSTLVSVAVALAAYKTG........  126
DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELL......LLLLL.LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL........


DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllllEEEEE................
Query dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtITVKG................  463
ident                                          |                  
Sbjct .......................................HPVRCmldrnedmlitggrhp  147
DSSP  .......................................LLEEEellhhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  463
ident                                                             
Sbjct flarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlc  207
DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  463
ident                                                             
Sbjct ktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrleg  267
DSSP  elllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  463
ident                                                             
Sbjct fsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagali  327
DSSP  llhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  463
ident                                                             
Sbjct hvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasv  387
DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  463
ident                                                             
Sbjct stdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgys  447
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeelllllll


DSSP  ..................eelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeellllll
Query ..................tytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgk  505
ident                                                             
Sbjct fetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvq  507
DSSP  lllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllll
Query vtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvpt  565
ident                                                             
Sbjct glglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavge  567
DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllll


DSSP  llllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhh
Query ivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdri  625
ident                                                             
Sbjct pplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtga  627
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhll
Query telldakeaaa  636
ident            
Sbjct pgnckpwslrv  638
DSSP  lllllllllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhlll
Query ...................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaead   41
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  eeeeeeeeellllllLLLL.LEEEEEEELL...LLEEEEEEllllhHHHHHHHHHHHLL.
Query lirektytfaevnhvHMEL.NATLAEYDPV...RDMLTLNTttqvpYYVHLKVAACLQM.   96
ident                     |   |                        | |        
Sbjct krglciiptkfgisfTVPFlNQAGALIHVYtdgSVLVSHGG.temgQGLHTKMVQVASKa  359
DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHhLEEEEEEEELlllLEEEEELL.llllLLHHHHHHHHHHHh


DSSP  .....lhHHEE.eellllllllllLLLLL.HHHHHHHHHHHHHL................
Query .....dsARIR.vikpflgggfgaRTEAL.HFEIIAGLLARKAK................  133
ident          |                         |   |                    
Sbjct lkipiskIYISetstntvpnssptAASVStDIYGQAVYEACQTIlkrlepfkkknpdgsw  419
DSSP  hlllhhhEELLleellllllllllLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllh


DSSP  ...............LEEEEELLHHhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeee
Query ...............GTVRLLQTREetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatq  178
ident                 |                                           
Sbjct edwvmaayqdrvslsTTGFYRTPNL...................................  444
DSSP  hhhhhhhhhllllleEEEEEELLLL...................................


DSSP  elllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhh
Query aggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafea  238
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllll
Query lltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgkl  298
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhh
Query pkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasq  358
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query vaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakk  418
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllh
Query ldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkir  478
ident                                                             
Sbjct ........................gysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknl  480
DSSP  ........................llllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeee


DSSP  hhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgm  538
ident                                                             
Sbjct rtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
DSSP  eeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhh


DSSP  hhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllll
Query gqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlag  598
ident                                                             
Sbjct iptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelf  600
DSSP  llleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query flpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                       
Sbjct rldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  .........llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeel
Query .........mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfa   51
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  lllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllll
Query evnhvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflggg  111
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleee
Query fgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaa  171
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  eeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhh
Query laleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvd  231
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlh
Query traafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgw  291
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  hhhllllllleeeeeeeeEEELllllllllllllLEEEEEEEllllLEEEEELL....ll
Query eerkgklpkgrglgialsHFVSgtstpkhwtgepHATVNLKLdfdgGITLLTGA....ad  347
ident                                    |              |         
Sbjct krglciiptkfgisftvpFLNQ...........aGALIHVYT....DGSVLVSHggtemg  345
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhHHLE...........eEEEEEELL....LLLEEEEEllllll


DSSP  LLLL..HHHHHHHHHHHhhlllhhheEEEEL......lllllllllllLLLLHHHHHHHH
Query IGQG..SNTMASQVAAEvlgvrlsriRVISA......dsaltpkdngsYSSRVTFMVGNA  399
ident  |        ||                                            |  |
Sbjct QGLHtkMVQVASKALKI......pisKIYISetstntvpnssptaasvSTDIYGQAVYEA  399
DSSP  LLHHhhHHHHHHHHHLL......lhhHEELLleellllllllllllllHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllle
Query SISAAEElkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
ident                                                             
Sbjct CQTILKR............................lepfkkknpdgswedwvmaayqdrv  431
DSSP  HHHHHHH............................hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlll


DSSP  EEEEEELllhhhllllllhhhhllllLLEEE.............................
Query TVKGTYTcptefqgdkkirgsaigatMGFCY.............................  490
ident     |                                                       
Sbjct SLSTTGF..................yRTPNLgysfetnsgnafhyftygvacseveidcl  473
DSSP  LLEEEEE..................eELLLLllllllllllllleeeeeeeeeeeeeell


DSSP  ...................eeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhh
Query ...................aaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtq  531
ident                                                             
Sbjct tgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpsty  533
DSSP  llleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllll
Query ggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakea  591
ident                                                             
Sbjct kipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtn  593
DSSP  llllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query segmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                              
Sbjct nntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  .............................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeel
Query .............................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefg   31
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhllleeeeeeeeellllllLLLL...............................
Query dvaaafaeadlirektytfaevnhvHMEL...............................   60
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlEGFSvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllLLLLhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   60
ident                                                             
Sbjct krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   60
ident                                                             
Sbjct kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  .......................................LEEEEEEELL.........lL
Query .......................................NATLAEYDPV.........rD   72
ident                                            |                
Sbjct dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyfTYGVACSEVEidcltgdhknL  480
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeEEEEEEEEEEeellllleeeE


DSSP  EEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.............................l
Query MLTLNTTT.......qVPYYVHLKVAACLQ.............................m   96
ident                     |       |                               
Sbjct RTDIVMDVgsslnpaiDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
DSSP  EEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhh


DSSP  LHHHEEEELLLLLLLL....LLLLlLLHHHHHhHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllll
Query DSARIRVIKPFLGGGF....GARTeALHFEIIaGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgr  152
ident      ||                                                     
Sbjct IPTEFRVSLLRDCPNKkaiyASKA.VGEPPLF.LGASVFFA...................  579
DSSP  LLLEEEEEELLLLLLLllhhHLLL.LLLLLHH.HHHHHHHH...................


DSSP  leeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeee
Query pwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdaw  212
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllle
Query rvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqr  272
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeee
Query vmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlk  332
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllh
Query ldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrv  392
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhh
Query tfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaa  452
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeee
Query mvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvw  512
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllllllllllllllee
Query vavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdi  572
ident                                                             
Sbjct ............................................................  579
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhh
Query eviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldak  632
ident                                                             
Sbjct .....ikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpw  634
DSSP  .....hhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllll


DSSP  hhll
Query eaaa  636
ident     
Sbjct slrv  638
DSSP  llll


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.4

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ....iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethcti   56
DSSP  ....lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleee


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct aipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsv  116
DSSP  eeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct avalaayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagns  176
DSSP  hhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeell


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct rdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsev  236
DSSP  lllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeeelllllLLLLLL.....................................
Query grglgialshfvsgtstPKHWTG.....................................  323
ident                                                             
Sbjct avtcglpaeevrwknmyKEGDLThfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnke  296
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhllLLLLLLllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  323
ident                                                             
Sbjct ncwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqva  356
DSSP  llleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  323
ident                                                             
Sbjct skalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpd  416
DSSP  hhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ........................................llLEEEEEEELL........
Query ........................................epHATVNLKLDF........  335
ident                                                             
Sbjct gswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEVeidcltgd  476
DSSP  llhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEEEEeeelllll


DSSP  ..lLLEEEEELLL.LLLL.LHHHHHHHHHHHHHL..........................
Query ..dGGITLLTGAA.DIGQ.GSNTMASQVAAEVLG..........................  365
ident                                 ||                          
Sbjct hknLRTDIVMDVGsSLNPaIDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykip  536
DSSP  eeeEEEEEEEELLlLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllllllll


DSSP  ...lLHHHEEEEELLLlllllllLLLLL.lhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlll
Query ...vRLSRIRVISADSaltpkdnGSYSS.rvtfMVGNASISAAEELKgvlvkaaakklda  421
ident          ||                       ||                        
Sbjct afgsIPTEFRVSLLRD......cPNKKAiyaskAVGEPPLFLGASVF.............  577
DSSP  lhhhLLLEEEEEELLL......lLLLLLhhhllLLLLLLHHHHHHHH.............


DSSP  lhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhh
Query reedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsa  481
ident                                                             
Sbjct ............................................................  577
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query igatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqa  541
ident                                                             
Sbjct ............................................................  577
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhh
Query lseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflp  601
ident                                                             
Sbjct ..................................faikdairaaraqhtnnntkelfrld  603
DSSP  ..................................hhhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query aiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                    
Sbjct spatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.3

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct .......................................................iitie    5
DSSP  .......................................................lllhh


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct daiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipkgeege   65
DSSP  hhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeellllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct melfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaaykt  125
DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsime  185
DSSP  llleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhh


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct ralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpae  245
DSSP  hhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllLLLL...................................
Query grglgialshfvsgtstpkhwTGEP...................................  325
ident                                                             
Sbjct evrwknmykegdlthfnqrleGFSVprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglc  305
DSSP  hhhhhhlllllllllllllllLLLHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  325
ident                                                             
Sbjct iiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipis  365
DSSP  eeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  325
ident                                                             
Sbjct kiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvma  425
DSSP  heellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh


DSSP  ...................................LEEEEEEEL.....lLLLE.EEEEL
Query ...................................HATVNLKLD.....fDGGI.TLLTG  344
ident                                                   |         
Sbjct ayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftYGVACSEVEidcltgDHKNlRTDIV  485
DSSP  hhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeEEEEEEEEEeellllLEEEeEEEEE


DSSP  L......llLLLL..HHHHHHHHHHHHHL.....................lLHHHEE..E
Query A......adIGQG..SNTMASQVAAEVLG.....................vRLSRIR..V  373
ident                      |                                 |    
Sbjct MdvgsslnpAIDIgqVEGAFVQGLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipAFGSIPteF  545
DSSP  EellllllhHHHHhhHHHHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllllllLHHHLLleE


DSSP  EEL..lllllllllllLLLLHHHhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...lhHHEE.
Query ISA..dsaltpkdngsYSSRVTFmVGNASIsAAEELKGVLVKAAAKKLDA...reEDIE.  427
ident                                           ||                
Sbjct RVSllrdcpnkkaiyaSKAVGEP.PLFLGA.SVFFAIKDAIRAARAQHTNnntkeLFRLd  603
DSSP  EEEelllllllllhhhLLLLLLL.LHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllLLLLl


DSSP  .eeLLEEeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllll
Query .viDEMFmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatm  486
ident                                                             
Sbjct spaTPEK.....................................................  610
DSSP  lllLHHH.....................................................


DSSP  leeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query gfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseet  546
ident                                                             
Sbjct ............................................................  610
DSSP  ............................................................


DSSP  leelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhh
Query vydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaihea  606
ident                                                             
Sbjct ............................................................  610
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query vyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                               
Sbjct ..irnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  ..hhhhllllllllllllllllllllllll


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ...................................................llhhhhhll
Query ...................................................mtpkaamka    9
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  lllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeel
Query gaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydp   69
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  llleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllLLLLLLlllllhhhhhhhhhh
Query vrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflGGGFGArtealhfeiiaglla  129
ident                                         ||  |               
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgFGGPQA...............  225
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllLLHHHH...............


DSSP  hhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhh
Query rkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygii  189
ident                                                             
Sbjct ..............lfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvp  271
DSSP  ..............hhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhh


DSSP  hhhhhhhlllLLLLllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhHHHHHHHHhhhhll
Query tilytgalmhGLYHipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraaFEALLTEMgeelgi  249
ident             |                                               
Sbjct rcwdeclkssQYYA.............................rksEVDKFNKE......  296
DSSP  hhhhhhhhhlLHHH.............................hhhHHHHHHHH......


DSSP  lhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllEEEEEEEE
Query dslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgRGLGIALS  309
ident                                                           | 
Sbjct ...................................................nCWKKRGLC  305
DSSP  ...................................................lLLEEEEEE


DSSP  EEELL.......................................................
Query HFVSG.......................................................  314
ident                                                             
Sbjct IIPTKfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipis  365
DSSP  EEEEEeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ......................lllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllh
Query ......................tstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgs  352
ident                                                             
Sbjct kiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvma  425
DSSP  heellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllLLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkDNGSyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlv  412
ident                                                             
Sbjct ayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFT.........................  460
DSSP  hhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEE.........................


DSSP  hhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhl
Query kaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefq  472
ident                                                             
Sbjct ............................................................  460
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhllllLLEEEEEEEEEEeelllllleEEEEEEE.EEELL............L
Query gdkkirgsaigatMGFCYAAQVVEAsvdeitgkvTAHKVWV.AVDVG............K  519
ident               |                             |               
Sbjct .............YGVACSEVEIDC.........LTGDHKNlRTDIVmdvgsslnpaidI  498
DSSP  .............EEEEEEEEEEEL.........LLLLEEEeEEEEEeellllllhhhhH


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeEEEE.EL
Query ALNPLAVEGQTQGGVWmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdiEVII.VE  578
ident      |                                                      
Sbjct GQVEGAFVQGLGLFTL............eelhyspegslhtrgpstykipafgSIPTeFR  546
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHL............lllllllllllllllllllllllhhHLLLeEE


DSSP  LLLLL.............lhhhlllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLL.LEEL.....
Query SMDPN.............gpfgakeASEGMLAGFLPAIHEAVYEAVGVRA.TDFP.....  619
ident                                     ||  |            |      
Sbjct VSLLRdcpnkkaiyaskavgepplfLGASVFFAIKDAIRAARAQHTNNNTkELFRldspa  606
DSSP  EEELLlllllllhhhllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLLLlllll


DSSP  ...............llhhhhhhhhhhhhhll
Query ...............lspdritelldakeaaa  636
ident                                 
Sbjct tpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhh
Query ..........................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdva   34
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  hhhhllleeeeeeeeELLLLLLlllLLEEEEEeelllleEEEEEL...........lLLH
Query aafaeadlirektytFAEVNHVhmeLNATLAEydpvrdmLTLNTT...........tQVP   83
ident                                                             
Sbjct krglciiptkfgisfTVPFLNQ..aGALIHVY.....tdGSVLVShggtemgqglhtKMV  353
DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHHLE..eEEEEEEL.....llLLEEEEellllllllhhhHHH


DSSP  HHHHHHHHhhhlllhhheEEELL.............llllLLLLLLL.LLHHHHHHHHH.
Query YYVHLKVAaclqmdsariRVIKP.............flggGFGARTE.ALHFEIIAGLL.  128
ident                                                             
Sbjct QVASKALK......ipisKIYISetstntvpnssptaasvSTDIYGQaVYEACQTILKRl  407
DSSP  HHHHHHHL......llhhHEELLleellllllllllllllHHHHHHHhHHHHHHHHHHHh


DSSP  ..............hHHHLL....EEEEEllhhhhhhHLLLLLEeeeeeeeeelllllee
Query ..............aRKAKG....TVRLLqtreetfiAHRGRPWtevkmkiglkkdgkia  170
ident                  |                     |                    
Sbjct epfkkknpdgswedwVMAAYqdrvSLSTT.......gFYRTPNL................  444
DSSP  hhhhhhlllllhhhhHHHHHhlllLLEEE.......eEEELLLL................


DSSP  eeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllh
Query alaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtv  230
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhl
Query dtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasg  290
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeelllllll
Query weerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigq  350
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgv  410
ident                                                             
Sbjct ............................................................  444
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhh
Query lvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcpte  470
ident                                                             
Sbjct ................................gysfetnsgnafhyftygvacseveidc  472
DSSP  ................................llllllllllllleeeeeeeeeeeeeel


DSSP  hllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhh
Query fqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqt  530
ident                                                             
Sbjct ltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpst  532
DSSP  lllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlll
Query qggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgake  590
ident                                                             
Sbjct ykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqht  592
DSSP  lllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query asegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                               
Sbjct nnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 11: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh
Query grglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqva  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkld  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhh
Query areedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgs  480
ident                                                             
Sbjct ................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyigg   44
DSSP  ................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeell


DSSP  hlllllleeEEEEEEEEeelllllleEEEEEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHh
Query aigatmgfcYAAQVVEAsvdeitgkvTAHKVWVAVDVgkalnplaVEGQTQGGVWMGMGq  540
ident                                   |              ||  |    | 
Sbjct qdhfylethCTIAIPKG.........EEGEMELFVST.......qNAMKTQSFVAKMLG.   87
DSSP  lllllllllEEEEEELL.........LLLLEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  hhllllleelleelllllllllllllllllEEEEEEE.LLLLlllhHHLL..LLLLLLLL
Query alseetvydngrmvhgnildyrvptivespDIEVIIV.ESMDpngpFGAK..EASEGMLA  597
ident                                | |            || |         |
Sbjct ..........................vpvnRILVRVKrMGGG....FGGKetRSTLVSVA  117
DSSP  ..........................llhhHEEEEELlLLLL....LLLLllLLHHHHHH


DSSP  LHHHHHHHH...................................................
Query GFLPAIHEA...................................................  606
ident   | |                                                       
Sbjct VALAAYKTGhpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsr  177
DSSP  HHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct dlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmseva  237
DSSP  llhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct vtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnken  297
DSSP  hhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct cwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvas  357
DSSP  lleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct kalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdg  417
DSSP  hhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct swedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdh  477
DSSP  lhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct knlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipa  537
DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  606
ident                                                             
Sbjct fgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntk  597
DSSP  hhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ...........hhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll
Query ...........vyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
ident                                          
Sbjct elfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  llllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 12: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ...........................................llhhhhhllllllllll
Query ...........................................mtpkaamkagaialhdd   17
ident                                                             
Sbjct iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel


DSSP  lllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeee
Query kpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydpvrdmltln   77
ident                                                             
Sbjct geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleee
Query tttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvr  137
ident                                                             
Sbjct aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh


DSSP  eellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhl
Query llqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgal  197
ident                                                             
Sbjct hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
Query mhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqi  257
ident                                                             
Sbjct glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  llllllleellllleELLLLHhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllll
Query nmlpqipyvtmyaqrVMSYGVpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtst  317
ident                                                             
Sbjct krglciiptkfgisfTVPFLN.......................................  321
DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHHL.......................................


DSSP  llllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeell
Query pkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisad  377
ident                                                             
Sbjct ............................................................  321
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeell
Query saltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsg  437
ident                                                             
Sbjct ............................................................  321
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeEEEEEEE
Query sqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyAAQVVEA  497
ident                                                      |      
Sbjct ....................................................qAGALIHV  329
DSSP  ....................................................eEEEEEEE


DSSP  EElllllLEEEeEEEEEEellllllHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHLlllleelleellll
Query SVdeitgKVTAhKVWVAVdvgkalnPLAVegQTQGGVWMGMGQALSeetvydngrmvhgn  557
ident              |                             ||               
Sbjct YT.....DGSV.LVSHGG......tEMGQ..GLHTKMVQVASKALK..............  361
DSSP  LL.....LLLE.EEEELL......lLLLL..LHHHHHHHHHHHHHL..............


DSSP  llllLLLLllLLLEEeeeeelllllllhhhlLLLLLL.LLLLHHHHHHHHHHhhhllLLL
Query ildyRVPTivESPDIeviivesmdpngpfgaKEASEG.MLAGFLPAIHEAVYeavgvRAT  616
ident                                   |          |           |  
Sbjct ....IPIS..KIYIS..etstntvpnssptaASVSTDiYGQAVYEACQTILK.....RLE  408
DSSP  ....LLHH..HEELL..leelllllllllllLLLHHHhHHHHHHHHHHHHHH.....HHH


DSSP  E......ellLHHHHHHHHHHH......................................
Query D......fplSPDRITELLDAK......................................  632
ident             |                                               
Sbjct PfkkknpdgsWEDWVMAAYQDRvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacsev  468
DSSP  HhhhhlllllHHHHHHHHHHLLllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  632
ident                                                             
Sbjct eidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtr  528
DSSP  eeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  632
ident                                                             
Sbjct gpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaar  588
DSSP  lllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............................................hhll
Query ..............................................eaaa  636
ident                                                   
Sbjct aqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
DSSP  hhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll


No 13: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll
Query mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
Query temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
ident                                                             
Sbjct .............................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfse   31
DSSP  .............................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhh


DSSP  leeeeeeeeeeellllLLLLLL......................................
Query grglgialshfvsgtsTPKHWT......................................  322
ident                                                             
Sbjct adnvvsgelyiggqdhFYLETHctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvn   91
DSSP  lleeeeeeeeelllllLLLLLLeeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ..........LLLL......................................EEEEEEEL
Query ..........GEPH......................................ATVNLKLD  334
ident           |                                                 
Sbjct rilvrvkrmgGGFGgketrstlvsvavalaayktghpvrcmldrnedmlitgGRHPFLAR  151
DSSP  heeeeellllLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllLLLLEEEE


DSSP  .............lllLEEEEELLLLlllLHHHHHHHHHHHHHL......llhhHEEEEE
Query .............fdgGITLLTGAADigqGSNTMASQVAAEVLG......vrlsRIRVIS  375
ident                       |               |                 |   
Sbjct ykvgfmktgtivalevDHYSNAGNSR...DLSHSIMERALFHMDncykipnirgTGRLCK  208
DSSP  eeeeellllleeeeeeEEEEEEELLL...LLHHHHHHHHHHLLLllllllleeeEEEEEE


DSSP  LLLLllllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHEeeelleeEE
Query ADSAltpkdngsyssrvtfmvgNASISAAEELKGVLVKAAAKKLDAREEDIevidemfMV  435
ident                             |           |       |           
Sbjct TNLS............sntafrGFGGPQALFIAENWMSEVAVTCGLPAEEV.......RW  249
DSSP  LLLL............llllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH.......HH


DSSP  LL..........................................................
Query SG..........................................................  437
ident                                                             
Sbjct KNmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciipt  309
DSSP  HHllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  437
ident                                                             
Sbjct kfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyi  369
DSSP  eeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  437
ident                                                             
Sbjct setstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqd  429
DSSP  lleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  437
ident                                                             
Sbjct rvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvg  489
DSSP  lllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  437
ident                                                             
Sbjct sslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsl  549
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeee


DSSP  .................................llllleehhhhhhhhhLLLLLEeeeee
Query .................................sqdpglsfqevvkaamVDSGTItvkgt  464
ident                                                             
Sbjct lrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkeLFRLDS.....  604
DSSP  lllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLLL.....


DSSP  elllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhh
Query ytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnpl  524
ident                                                             
Sbjct ............................................................  604
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllll
Query avegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpng  584
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