No 1: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=45.9

DSSP  ......................LEEEEEEELLLHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLllll
Query ......................VSRTSRARDELAPIFASSAGVVRGQFSCGRVSACpmet   38
ident                                  |  ||              |       
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnniLREVHAEFGDVAAAFAEADLIREKTYTFAEVNHVhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleEEEEEEEELLHHHHHHLLLEEEEEEEEELLLLLLllll


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query rgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhp   98
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL
Query eellvcllsralgrpvrwiedrqenflgaTHAKQQRNEMGLAFDGDGRFLALENRSITDG  158
ident                                       |      ||   ||       |
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahRGRPWTEVKMKIGLKKDGKIAALALEATQAG  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhlLLLLEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL


DSSP  LLLLLlllLHHHLHHHHHHLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH
Query GAYNNlpwTQLVESHVGNAVILGVYKVPAVSEESIAVATNKCPIGAYRGVGFTAGQIARE  218
ident |||               |   | |  ||       | ||  | || || |      | |
Sbjct GAYAG...YGIITILYTGALMHGLYHIPAIKHDAWRVYTNTPPCGAMRGHGTVDTRAAFE  237
DSSP  LLLLL...LHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLhhHLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHH
Query TLIDRAARQLGLSPFEIRRRNVVMpeDFPFTNRLGQTHREGTYLQTINLLEEMVNPEAFR  278
ident  |       ||     ||  |       |      |                    |   
Sbjct ALLTEMGEELGIDSLKIRQINMLP..QIPYVTMYAQRVMSYGVPECLEKVKAASGWEERK  295
DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLL..LLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHL


DSSP  HHHHhhhlllEEEEEEEEEEEEEELLLHH...............................
Query QRQAearargKYLGLGVSVFNEVTGTGTR...............................  307
ident           |  |||      | || |                                
Sbjct GKLP......KGRGLGIALSHFVSGTSTPkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadig  349
DSSP  LLLL......LLEEEEEEEEEEELLLLLLlllllllleeeeeeellllleeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  307
ident                                                             
Sbjct qgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkg  409
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  307
ident                                                             
Sbjct vlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcpt  469
DSSP  hhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllh


DSSP  ........hHHHLlllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhll
Query ........tLSFLgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgv  359
ident           |                                                 
Sbjct efqgdkkirGSAI...............................................  482
DSSP  hhllllllhHHHL...............................................


DSSP  lhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query pasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediv  419
ident                                                             
Sbjct ............................................................  482
DSSP  ............................................................


DSSP  eelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllLEEEEEEEEE
Query iedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdLVLANGGHAA  479
ident                                                             
Sbjct ...............................................gatMGFCYAAQVV  495
DSSP  ...............................................lllLLEEEEEEEE


DSSP  EEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlLLLLL
Query IVEIDASTYATRVTDFFAVEDCGTMINPMIVEGQIRGGIAQAIGQTLLEEVIYDdFGQLV  539
ident     |  |            | |   ||  ||||  ||     || | ||  ||  |  |
Sbjct EASVDEITGKVTAHKVWVAVDVGKALNPLAVEGQTQGGVWMGMGQALSEETVYD.NGRMV  554
DSSP  EEEELLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEE.LLEEL


DSSP  LLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLLLLLHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh
Query TTTLMDYLIPTTLDVPDIRIRHLETPSPLVPGGIKGMGESAMISAPAAVVAAVNDALAhl  599
ident      ||  ||    |||     |   |  | | |   |        |   ||  |    
Sbjct HGNILDYRVPTIVESPDIEVIIVESMDPNGPFGAKEASEGMLAGFLPAIHEAVYEAVG..  612
DSSP  LLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLLHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHL..


DSSP  lLLLLEELLLHHHHHHHHHLLL...
Query eVVIETVPITPERIFRSIQERP...  621
ident  |     |  | ||           
Sbjct .VRATDFPLSPDRITELLDAKEaaa  636
DSSP  .LLLLEELLLHHHHHHHHHHHHhll


No 2: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=26.2

DSSP  ......................leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllLLLL
Query ......................vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacPMET   38
ident                                                          || 
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvHMEL   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllLLLL


DSSP  LEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLLLLH
Query RGAVAQYEWTTQQLILWTATQMPSFVRTMVAMFCAIPEHLIEVRVPDVGGGFGQKAHLHP   98
ident     | |      | | | || |  |   ||         | |  |  |||||       
Sbjct NATLAEYDPVRDMLTLNTTTQVPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPFLGGGFGARTEALH  120
DSSP  LEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHLllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query EELLVCLLSRALGRPVRWIEDRQENFLGAthakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdg  158
ident  |    || |     ||    | | |                                  
Sbjct FEIIAGLLARKAKGTVRLLQTREETFIAH...............rgrpwtevkmkiglkk  165
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHL...............lllleeeeeeeeeell


DSSP  lllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query gaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiare  218
ident                                                             
Sbjct dgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamr  225
DSSP  llleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllll


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query tlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafr  278
ident                                                             
Sbjct ghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekv  285
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlllllllLLEEEEEELLLLLEEEEELL
Query qrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRIDPTGKVTVTTSL  338
ident                                         |       |  |  |  |  
Sbjct kaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgepHATVNLKLDFDGGITLLTGA  345
DSSP  hhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllLEEEEEEELLLLLEEEEELL


DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLL.LLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query ASSGQGHETTLAQIAADVLGVPASDVVIQAGSTK.NTYGFGAYASRGAVIGAGSIGRAAS  397
ident |  |||  |   | || ||||  |                | | ||           || 
Sbjct ADIGQGSNTMASQVAAEVLGVRLSRIRVISADSAlTPKDNGSYSSRVTFMVGNASISAAE  405
DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLlLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLEEEELLEEEEEEEHHHHHHHHHHLhhhlllllLL
Query IVRERVKQLAGHLLEAASEDIVIEDGLVHVAGVPAKGMPFAEVVGAAYFAdathppgfDA  457
ident          |   | |  |||   |    | |    |  | ||| ||             
Sbjct ELKGVLVKAAAKKLDAREEDIEVIDEMFMVSGSQDPGLSFQEVVKAAMVD........SG  457
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLHHHEEEELLEEEELLLLLLLEEHHHHHHHHHLL........LL


DSSP  LLEEEEEL...............llllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeell
Query TLEATATY...............dpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcg  502
ident |     ||                                                    
Sbjct TITVKGTYtcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdv  517
DSSP  LEEEEEEElllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeel


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeel
Query tminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhl  562
ident                                                             
Sbjct gkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviiv  577
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeee


DSSP  lllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query etpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                            
Sbjct esmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=9.5

DSSP  ........................LEEEEEEEL.LLHHHhhhlleEEEEEEEELLLLLLL
Query ........................VSRTSRARD.ELAPIfassagVVRGQFSCGRVSACP   35
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrEVHAEFGDVaAAFAE.....aDLIREKTYTFAEVNH   55
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeEEEEEELLHhHHHHL.....lLEEEEEEEEELLLLL


DSSP  L...........................................................
Query M...........................................................   36
ident                                                             
Sbjct Vhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgar  115
DSSP  Lllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllll


DSSP  ..............................LLLeeeeeeelllleeeeeellllhhhhhh
Query ..............................ETRgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrt   66
ident                                                             
Sbjct tealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetFIA...........................  148
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhHHH...........................


DSSP  hhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhh
Query mvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflg  126
ident                                                             
Sbjct ..........................................................hr  150
DSSP  ..........................................................ll


DSSP  lLLLLLEEEEEEEEEllllLEEEEEEEEEEELLL...llLLLLLHHHLhHHHHHLLLlll
Query aTHAKQQRNEMGLAFdgdgRFLALENRSITDGGA...ynNLPWTQLVEsHVGNAVILgvy  183
ident            ||                              | |              
Sbjct gRPWTEVKMKIGLKK....DGKIAALALEATQAGgayagYGIITILYT.GALMHGLY...  202
DSSP  lLLEEEEEEEEEELL....LLLEEEEEEEEEEELlllllLHHHHHHHH.HHLLLLLL...


DSSP  llleEEEEEEEELLLL......lllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhHHH
Query kvpaVSEESIAVATNK......cpigayrGVGFTAGQIARETLIDRAArqlglspfeIRR  237
ident           |                       |                         
Sbjct ..hiPAIKHDAWRVYTntppcgamrghgtVDTRAAFEALLTEMGEELG........iDSL  252
DSSP  ..llLLEEEEEEEELLlllllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHL........lLHH


DSSP  LLLL.lhhhlLEELLL...lLEELLL..LHHHHHHHHH..HHHLHhhhhhhhhhhhllle
Query RNVV.mpedfPFTNRL...gQTHREG..TYLQTINLLE..EMVNPeafrqrqaearargk  289
ident                                         |                   
Sbjct KIRQinmlpqIPYVTMyaqrVMSYGVpeCLEKVKAASGweERKGK..............l  298
DSSP  HHHHhlllllLLEELLllleELLLLHhhHHHHHHHHHLhhHHLLL..............l


DSSP  eEEEEeEEEEEEELL.............................................
Query yLGLGvSVFNEVTGT.............................................  304
ident   | |                                                       
Sbjct pKGRGlGIALSHFVSgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasq  358
DSSP  lLLEEeEEEEEEEELllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  304
ident                                                             
Sbjct vaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakk  418
DSSP  hhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................................................lhhhhhhl
Query ....................................................gtrtlsfl  312
ident                                                             
Sbjct ldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkir  478
DSSP  llllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllh


DSSP  LLLLlllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllll
Query GTPTtthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstk  372
ident |                                                           
Sbjct GSAI........................................................  482
DSSP  HHHL........................................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleee
Query ntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpa  432
ident                                                             
Sbjct ............................................................  482
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllLLLEEEEEEEEEEeeeellllleee
Query kgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpSDLVLANGGHAAIveidastyatrv  492
ident                                         |     |             
Sbjct ................................gatMGFCYAAQVVEAS............  498
DSSP  ................................lllLLEEEEEEEEEEE............


DSSP  eeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllL
Query tdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttL  552
ident                                                             
Sbjct .......................................................vdeiT  503
DSSP  .......................................................elllL


DSSP  LLLLEEEEEL.lLLLLLLHH........................................
Query DVPDIRIRHL.eTPSPLVPG........................................  571
ident                                                             
Sbjct GKVTAHKVWVavDVGKALNPlavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrv  563
DSSP  LLEEEEEEEEeeELLLLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllll


DSSP  .........................HLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllll
Query .........................GIKG..MGESAMISAPAAVVAAvndalahlevvie  604
ident                                |          ||  |             
Sbjct ptivespdieviivesmdpngpfgaKEASegMLAGFLPAIHEAVYEA.........vgvr  614
DSSP  llllllleeeeeeelllllllhhhlLLLLllLLLLHHHHHHHHHHHH.........hlll


DSSP  EELL......LHHHHHHHHHLLl
Query TVPI......TPERIFRSIQERp  621
ident             |          
Sbjct ATDFplspdrITELLDAKEAAA.  636
DSSP  LLEElllhhhHHHHHHHHHHLL.


No 4: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=8.8

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct ...................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaead   41
DSSP  ...................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhlll


DSSP  eelllhhhhhhlllllllLLEEEEEELL.LLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLL
Query vtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRIDP.TGKVTVTTSLAssgqgHETTLAQIAADVLGV  359
ident                           ||     |  |                 |  |  
Sbjct lirektytfaevnhvhmeLNATLAEYDPvRDMLTLNTTTQ.....VPYYVHLKVAACLQM   96
DSSP  eeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEELlLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LHHHEEEELLLLlllllLLLLlLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhhee
Query PASDVVIQAGSTkntygFGAYaSRGAViGAGSIGRAASIVRERVkqlaghlleaasediv  419
ident                   |                |    |                   
Sbjct DSARIRVIKPFL.....GGGF.GARTE.ALHFEIIAGLLARKAK................  133
DSSP  LHHHEEEELLLL.....LLLL.LLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHL................


DSSP  eelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllLEEEEEL..............
Query iedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatLEATATY..............  465
ident                                                             
Sbjct .......................................GTVRLLQtreetfiahrgrpw  154
DSSP  .......................................LEEEEELlhhhhhhhllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct tevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrv  214
DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct ytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvm  274
DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct sygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkld  334
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct fdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtf  394
DSSP  lllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct mvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamv  454
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhl


DSSP  ..........................llllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeee
Query ..........................dpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffave  499
ident                                                             
Sbjct dsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwva  514
DSSP  lllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeee


DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleee
Query dcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdiri  559
ident                                                             
Sbjct vdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdiev  574
DSSP  eellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeee


DSSP  eellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhl
Query rhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqe  619
ident                                                             
Sbjct iivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakea  634
DSSP  eeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ll
Query rp  621
ident   
Sbjct aa  636
DSSP  ll


No 5: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=7.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................leeeeeeelllhhhhhh
Query ...........................................vsrtsrardelapifas   17
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  lleeeeeeeeelllLLLLL.....lLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHH
Query sagvvrgqfscgrvSACPM.....eTRGAVAQYEwTTQQLILWTATQ.....MPSFVRTM   67
ident                  |                       | |                
Sbjct grglgialshfvsgTSTPKhwtgepHATVNLKLD.FDGGITLLTGAAdigqgSNTMASQV  359
DSSP  leeeeeeeeeeellLLLLLllllllLEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHEEEELLL......LLLLL.LLLLL.lLHHHHHHHHHHH...........
Query VAMFCAIPEHLIEVRVPD......VGGGF.GQKAH.lHPEELLVCLLSR...........  108
ident  |         | |   |        |                                 
Sbjct AAEVLGVRLSRIRVISADsaltpkDNGSYsSRVTFmvGNASISAAEELKgvlvkaaakkl  419
DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELLllllllLLLLLlLLHHHhhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhl


DSSP  ....................................hhLLLEEEELLHHhhhhhllllll
Query ....................................alGRPVRWIEDRQenflgathakq  132
ident                                          |                  
Sbjct dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgTITVKGTYTCP...........  468
DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllLEEEEEEELLL...........


DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeee
Query qrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavsees  192
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleelll
Query iavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrl  252
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  lleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhl
Query gqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsfl  312
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllll
Query gtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstk  372
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleee
Query ntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpa  432
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleee
Query kgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrv  492
ident                                                             
Sbjct ............................................................  468
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllLLLL.........
Query tdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvTTTL.........  543
ident                                                |            
Sbjct ...............................................TEFQgdkkirgsa  481
DSSP  ...............................................HHHLlllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  543
ident                                                             
Sbjct igatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqa  541
DSSP  lllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .................llllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhh
Query .................mdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapa  586
ident                                                             
Sbjct lseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflp  601
DSSP  hllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query avvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                    
Sbjct aiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 6: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=5.4

DSSP  .....leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeee
Query .....vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilw   55
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllee
Query tatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvr  115
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  eellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhh
Query wiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvg  175
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  hhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query navilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfei  235
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeee
Query rrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgv  295
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  eeeeeeelllhhhhhhlllllllllEEEEEELL....LLLEEEEEllllllLLHHhhHHH
Query svfnevtgtgtrtlsflgtpttthdSATVRIDP....TGKVTVTTslassgQGHEttLAQ  351
ident                           |||                       |       
Sbjct grglgialshfvsgtstpkhwtgepHATVNLKLdfdgGITLLTGA....adIGQG..SNT  354
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllLEEEEEEEllllLEEEEELL....llLLLL..HHH


DSSP  HHHHHHLL......lhhHEEEELL.lllLLLLLLLllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query IAADVLGV......pasDVVIQAG.stkNTYGFGAyasrgaVIGAGSIGRAASIVRERVK  404
ident  |  |             |            |                | |     |  |
Sbjct MASQVAAEvlgvrlsriRVISADSaltpKDNGSYS......SRVTFMVGNASISAAEELK  408
DSSP  HHHHHHHHhhlllhhheEEEELLLllllLLLLLLL......LLHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHL..llhhheeeellEEEELLE....eEEEEehhhhhhhhhhLHHHllllllLL
Query QLAGHLLE..aasediviedgLVHVAGV....pAKGMpfaevvgaayfADAThppgfdAT  458
ident                                                            |
Sbjct GVLVKAAAkkldareedieviDEMFMVSgsqdpGLSF....qevvkaaMVDS....gtIT  460
DSSP  HHHHHHHHhhllllhhheeeeLLEEEELlllllLEEH....hhhhhhhHLLL....llEE


DSSP  LEEEEEL.............llllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllll
Query LEATATY.............dpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtmi  505
ident    | |                                                      
Sbjct VKGTYTCptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgka  520
DSSP  EEEEELLlhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellll


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellll
Query npmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletp  565
ident                                                             
Sbjct lnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesm  580
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelll


DSSP  llllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query splvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                         
Sbjct dpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  llllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 7: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.4

DSSP  .........leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllle
Query .........vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqq   51
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhl
Query lilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralg  111
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  lleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhl
Query rpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlve  171
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  hhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query shvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlgls  231
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleee
Query pfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkyl  291
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  eeeeeeeeeeelllhHHHHhlLLLLLL.lLEEEEEELllLLEEEEELLLLLL..LLHH..
Query glgvsvfnevtgtgtRTLSflGTPTTT.hDSATVRIDptGKVTVTTSLASSG..QGHE..  346
ident                 |                               |           
Sbjct grglgialshfvsgtSTPK..HWTGEPhaTVNLKLDF..DGGITLLTGAADIgqGSNTma  356
DSSP  leeeeeeeeeeelllLLLL..LLLLLLleEEEEEELL..LLLEEEEELLLLLllLHHHhh


DSSP  .HHHHHHHHHhhlllHHHEEEELLLLlllLLLL....lLLLL..HHHHHHHHHHHHHhhh
Query .TTLAQIAADvlgvpASDVVIQAGSTkntYGFG....aYASR..GAVIGAGSIGRAAsiv  399
ident     |                                                       
Sbjct sQVAAEVLGV.....RLSRIRVISADsalTPKDngsysSRVTfmVGNASISAAEELK...  408
DSSP  hHHHHHHHLL.....LHHHEEEEELLlllLLLLlllllLLHHhhHHHHHHHHHHHHH...


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllL
Query rervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatL  459
ident                                                             
Sbjct ..........gvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgT  458
DSSP  ..........hhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllL


DSSP  EEEEELLLLLL................eeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll
Query EATATYDPSDL................vlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgt  503
ident                                                             
Sbjct ITVKGTYTCPTefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvg  518
DSSP  EEEEEEELLLHhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeell


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeell
Query minpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhle  563
ident                                                             
Sbjct kalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviive  578
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeel


DSSP  llllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query tpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                           
Sbjct smdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  llllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 8: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleeLLLLH......hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeEEEE
Query vmpedfpftnrlgqthREGTY......lqtinlleemvnpeafrqrqaearargkyLGLG  294
ident                                                             
Sbjct ................MTPKAamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeaDLIR   44
DSSP  ................LLHHHhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLHhhhhhllLLLLllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhh
Query VSVFNEVTGTGTrtlsflgTPTTthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaa  354
ident                                                             
Sbjct EKTYTFAEVNHV.......HMEL.....................................   60
DSSP  EEEEEELLLLLL.......LLLL.....................................


DSSP  hhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query dvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaa  414
ident                                                             
Sbjct ..........................natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaacl   94
DSSP  ..........................leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelLLLL..leE
Query sediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatyDPSD..lvL  472
ident                                                             
Sbjct qmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetFIAHrgrpW  154
DSSP  lllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhHHHLllllE


DSSP  EEEEEEEEEEEellllLEEEEEEEEEEELLL....lLLHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhll
Query ANGGHAAIVEIdastyATRVTDFFAVEDCGT....mINPMIVEGQIRGGiAQAIgqtlle  528
ident                                                             
Sbjct TEVKMKIGLKK.....DGKIAALALEATQAGgayagYGIITILYTGALM.HGLY......  202
DSSP  EEEEEEEEELL.....LLLEEEEEEEEEEELlllllLHHHHHHHHHHLL.LLLL......


DSSP  llllllllllllllllllllllllLLLLEEEEELLLLLLLLH..hhlllLLLHHHHHHHH
Query eviyddfgqlvtttlmdylipttlDVPDIRIRHLETPSPLVP..ggikgMGESAMISAPA  586
ident                           | |            |                 |
Sbjct ........................HIPAIKHDAWRVYTNTPPcgamrghGTVDTRAAFEA  238
DSSP  ........................LLLLEEEEEEEELLLLLLlllllllLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhhllLLLE.ELLL............................hhhhhhhh
Query AVVAAVNDALahlevVIET.VPIT............................perifrsi  617
ident                                                             
Sbjct LLTEMGEELG.....IDSLkIRQInmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgwee  293
DSSP  HHHHHHHHHL.....LLHHhHHHHllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhh


DSSP  HLLL........................................................
Query QERP........................................................  621
ident                                                             
Sbjct RKGKlpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsn  353
DSSP  HLLLlllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct tmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvk  413
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct aaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqg  473
DSSP  hhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct dkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqgg  533
DSSP  llllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  621
ident                                                             
Sbjct vwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakease  593
DSSP  hhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllllll


DSSP  ...........................................
Query ...........................................  621
ident                                            
Sbjct gmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 9: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................................leeeeeeelllhhhhhhllE
Query ........................................vsrtsrardelapifassaG   20
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpK  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllL


DSSP  EEEEEEEELLLLLL..............................................
Query VVRGQFSCGRVSAC..............................................   34
ident                                                             
Sbjct GRGLGIALSHFVSGtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqva  360
DSSP  LEEEEEEEEEEELLlllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh


DSSP  .................................llllleeeeeeelllleeeeeellllh
Query .................................pmetrgavaqyewttqqlilwtatqmp   61
ident                                                             
Sbjct aevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkld  420
DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhh
Query sfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrq  121
ident                                                             
Sbjct areedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgs  480
DSSP  llhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhh


DSSP  hhhhhlLLLLLEEEEEEEEELlLLLEeEEEEEEEEELLLLLLL.LLLHHHLHHHHHHLLL
Query enflgaTHAKQQRNEMGLAFDgDGRFlALENRSITDGGAYNNL.PWTQLVESHVGNAVIL  180
ident                                                             
Sbjct aigatmGFCYAAQVVEASVDE.ITGKvTAHKVWVAVDVGKALNpLAVEGQTQGGVWMGMG  539
DSSP  hlllllLEEEEEEEEEEEELL.LLLLeEEEEEEEEEELLLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  .LLLL.....................lLEEEEEEEEELLLL.......LLLLLlllLLHH
Query .GVYK.....................vPAVSEESIAVATNK.......CPIGAyrgVGFT  211
ident                                                             
Sbjct qALSEetvydngrmvhgnildyrvptiVESPDIEVIIVESMdpngpfgAKEAS..eGMLA  597
DSSP  hHHLLllleelleelllllllllllllLLLLEEEEEEELLLllllhhhLLLLL..lLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhh
Query AGQIARETLIDRAARQlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleem  271
ident     |       |                                               
Sbjct GFLPAIHEAVYEAVGV............................................  613
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLL............................................


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhllleeeeeEEEEEeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeelllll
Query vnpeafrqrqaearargkylglGVSVFnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgk  331
ident                                                             
Sbjct .....................rATDFP.................................  619
DSSP  .....................lLLEEL.................................


DSSP  eeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhh
Query vtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigags  391
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhl
Query igraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadath  451
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhh
Query ppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmive  511
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhh
Query gqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpg  571
ident                                                             
Sbjct ............................................................  619
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query gikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                   
Sbjct .................................lspdritelldakeaaa  636
DSSP  .................................llhhhhhhhhhhhhhll


No 10: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelLH
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwieDR  120
ident                                                             
Sbjct .........................................mtpkaamkagaialhddKP   19
DSSP  .........................................llhhhhhllllllllllLL


DSSP  HHH.............................hhhlllllLEEEEEEEEELllllEEEEE
Query QEN.............................flgathakQQRNEMGLAFDgdgrFLALE  151
ident                                                           | 
Sbjct NNIlrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmeLNATLAEYDPV....RDMLT   75
DSSP  LLEeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEELL....LLEEE


DSSP  EEEEeellllllllllhhhlhHHHHH.LLLL..LLLLLEEEEEEEEEllllllllllllL
Query NRSItdggaynnlpwtqlvesHVGNA.VILG..VYKVPAVSEESIAVatnkcpigayrgV  208
ident                                                             
Sbjct LNTT..............tqvPYYVHlKVAAclQMDSARIRVIKPFL....gggfgartE  117
DSSP  EEEL..............lllHHHHHhHHHHhhLLLHHHEEEELLLL....llllllllL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHH............................................
Query GFTAGQIARETLIDRA............................................  224
ident       ||                                                    
Sbjct ALHFEIIAGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleat  177
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeee


DSSP  .......................................................hhhhl
Query .......................................................arqlg  229
ident                                                             
Sbjct qaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafe  237
DSSP  eelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllle
Query lspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargk  289
ident                                                             
Sbjct alltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgk  297
DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlll


DSSP  eeeeeeeeeeeeeLLLHH..........................................
Query ylglgvsvfnevtGTGTR..........................................  307
ident                                                             
Sbjct lpkgrglgialshFVSGTstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmas  357
DSSP  lllleeeeeeeeeEELLLllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhh


DSSP  .......................hhhHLLLLL............................
Query .......................tlsFLGTPT............................  316
ident                             |                               
Sbjct qvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkDNGSYSsrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaak  417
DSSP  hhhhhhhlllhhheeeeellllllllLLLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  316
ident                                                             
Sbjct kldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkki  477
DSSP  hllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllll


DSSP  ..........lllLEEEEEE.....llLLLE.EEEELL......lLLLL..LHHHHHHHH
Query ..........tthDSATVRI.....dpTGKV.TVTTSL......aSSGQ..GHETTLAQI  352
ident                  |               |                          
Sbjct rgsaigatmgfcyAAQVVEAsvdeitgKVTAhKVWVAVdvgkalnPLAVegQTQGGVWMG  537
DSSP  hhhhlllllleeeEEEEEEEeelllllLEEEeEEEEEEellllllHHHHhhHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHL.....................llhHHEEEELLLL..llllllllllLLHHhHHH
Query AADVLG.....................vpaSDVVIQAGST..kntygfgayaSRGAvIGA  389
ident     |                             |                         
Sbjct MGQALSeetvydngrmvhgnildyrvptivESPDIEVIIVesmdpngpfgakEASE.GML  596
DSSP  HHHHHLlllleelleellllllllllllllLLLEEEEEEElllllllhhhllLLLL.LLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeeHHHHHHHHHHLHH
Query GSIGRAASIVRERVKQLaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpFAEVVGAAYFADA  449
ident      |                                                   |  
Sbjct AGFLPAIHEAVYEAVGV.......................ratdfplSPDRITELLDAKE  633
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLL.......................llleellLHHHHHHHHHHHH


DSSP  hllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh
Query thppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmi  509
ident                                                             
Sbjct ............................................................  633
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllll
Query vegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplv  569
ident                                                             
Sbjct ............................................................  633
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query pggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                     
Sbjct .................................................aaa  636
DSSP  .................................................hll


No 11: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.7

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .............................................leeeeeeelllhhhh
Query .............................................vsrtsrardelapif   15
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  hhlleeeeeeeeellLLLLLlllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlll
Query assagvvrgqfscgrVSACPmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaip   75
ident                                                             
Sbjct grglgialshfvsgtSTPKH........................................  320
DSSP  leeeeeeeeeeelllLLLLL........................................


DSSP  hhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllllllEEE
Query ehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakqQRN  135
ident                                                             
Sbjct ...................................................wtgephATV  329
DSSP  ...................................................llllllEEE


DSSP  EEEEEellllleEEEEEEEEEEllllllllllhhhlhhHHHHLLLL..LLLLLEEEEEEE
Query EMGLAfdgdgrfLALENRSITDggaynnlpwtqlveshVGNAVILG..VYKVPAVSEESI  193
ident    |                                      |               | 
Sbjct NLKLD.....fdGGITLLTGAA........digqgsntMASQVAAEvlGVRLSRIRVISA  376
DSSP  EEEEL.....llLLEEEEELLL........lllllhhhHHHHHHHHhhLLLHHHEEEEEL


DSSP  EE...llllllLLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......LLHHHhHHLLLllh
Query AV...atnkcpIGAY.rGVGFTAGQIARETLIDRAARQLG......LSPFEiRRRNVvmp  243
ident                       |   | | |                   |         
Sbjct DSaltpkdngsYSSRvtFMVGNASISAAEELKGVLVKAAAkkldarEEDIE.VIDEM...  432
DSSP  LLlllllllllLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllHHHEE.EELLE...


DSSP  hhlleellllleellllhhhhhhhhHHHHlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeel
Query edfpftnrlgqthregtylqtinllEEMVnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtg  303
ident                                                             
Sbjct .....................fmvsGSQD...............................  440
DSSP  .....................eeelLLLL...............................


DSSP  llhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query tgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasd  363
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeell
Query vviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedg  423
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeee
Query lvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaivei  483
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLL..............
Query dastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigQTLLEE..............  529
ident                                             |               
Sbjct ...............pglsfqevvkaamvdsgtitvkgtyTCPTEFqgdkkirgsaigat  485
DSSP  ...............lleehhhhhhhhhllllleeeeeeeLLLHHHllllllhhhhllll


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................v  530
ident                                                             
Sbjct mgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalsee  545
DSSP  lleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  lllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhh
Query iyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavva  590
ident                                                             
Sbjct tvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaihe  605
DSSP  lleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query avndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                
Sbjct avyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 12: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  .............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeel
Query .............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyew   47
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  llleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhh
Query ttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvclls  107
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  hhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllll
Query ralgrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwt  167
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  hhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query qlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarq  227
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query lglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearar  287
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  leeeeeeeeeeeeeeLLLHHhHHHLlllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhh
Query gkylglgvsvfnevtGTGTRtLSFLgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghet  347
ident                 |                                           
Sbjct grglgialshfvsgtSTPKH.WTGE...................................  324
DSSP  leeeeeeeeeeelllLLLLL.LLLL...................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query tlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqla  407
ident                                                             
Sbjct ............................................................  324
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelll
Query ghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydp  467
ident                                                             
Sbjct ............................................................  324
DSSP  ............................................................


DSSP  llleEEEEEEEEEeeeellllleeeEEEEEEEELllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhl
Query sdlvLANGGHAAIveidastyatrvTDFFAVEDCgtMINPmIVEGQIRGGIAQAIGqtll  527
ident      |                               |             |   |    
Sbjct ...pHATVNLKLD..........fdGGITLLTGA.aDIGQ.GSNTMASQVAAEVLG....  365
DSSP  ...lLEEEEEEEL..........llLLEEEEELL.lLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL....


DSSP  lllllllllllllllllllllllllLLLLEEEEEL........LLLLlllhhHLLL...L
Query eeviyddfgqlvtttlmdylipttlDVPDIRIRHL........ETPSplvpgGIKG...M  576
ident                              ||                             
Sbjct ........................vRLSRIRVISAdsaltpkdNGSY.....SSRVtfmV  396
DSSP  ........................lLHHHEEEEELllllllllLLLL.....LLLHhhhH


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LEEL.llhhHHHH..................
Query GESAMISAPAAVVAAVNDALAHLEVVI..ETVP.itpeRIFR..................  615
ident |      |       |  |   |        |                            
Sbjct GNASISAAEELKGVLVKAAAKKLDAREedIEVIdemfmVSGSqdpglsfqevvkaamvds  456
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHhhEEEElleeeELLLlllleehhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  615
ident                                                             
Sbjct gtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavd  516
DSSP  lleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  615
ident                                                             
Sbjct vgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdievii  576
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeee


DSSP  ......................................................hhhlll
Query ......................................................siqerp  621
ident                                                             
Sbjct vesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  elllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 13: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct ..........................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdva   34
DSSP  ..........................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhh


DSSP  eelllhhhhhhlllLLLLlleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgtgtrtlsflgtPTTThdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
ident                                                             
Sbjct aafaeadlirektyTFAE..........................................   52
DSSP  hhhhllleeeeeeeEELL..........................................


DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee
Query asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   52
DSSP  ............................................................


DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelLlLLLE..EEEEEEE
Query edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatyDpSDLV..LANGGHA  478
ident                                                      |      
Sbjct .............................................V.NHVHmeLNATLAE   66
DSSP  .............................................L.LLLLllLLEEEEE


DSSP  EeeeeellllleeeeeEEEEEELlllllhhhHHHHHHhhhhhhhhhhhllllllllllll
Query AiveidastyatrvtdFFAVEDCgtminpmiVEGQIRggiaqaigqtlleeviyddfgql  538
ident                                |                            
Sbjct Y.........dpvrdmLTLNTTT.......qVPYYVH.......................   87
DSSP  E.........elllleEEEEELL.......lLHHHHH.......................


DSSP  llllllllllllllllllEEEEELLLLLlllhhhlllLLLHHHHHHHHHHHH........
Query vtttlmdylipttldvpdIRIRHLETPSplvpggikgMGESAMISAPAAVVA........  590
ident                   ||                       |    |  |        
Sbjct .....lkvaaclqmdsarIRVIKPFLGG..gfgarteALHFEIIAGLLARKAkgtvrllq  140
DSSP  .....hhhhhhhlllhhhEEEELLLLLL..lllllllLLHHHHHHHHHHHHHlleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct treetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhg  200
DSSP  lhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct lyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinml  260
DSSP  lllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct pqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkh  320
DSSP  lllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct wtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsal  380
DSSP  lllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct tpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqd  440
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct pglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvd  500
DSSP  lleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  590
ident                                                             
Sbjct eitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnild  560
DSSP  llllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllll


DSSP  .............................................hhhhhhhhhllllle
Query .............................................avndalahlevviet  605
ident                                                             
Sbjct yrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfpl  620
DSSP  lllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleell


DSSP  elllhhhhhhhhhlll
Query vpitperifrsiqerp  621
ident                 
Sbjct spdritelldakeaaa  636
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhll


No 14: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .......................................leeeeeeelllhhhhhhllee
Query .......................................vsrtsrardelapifassagv   21
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  EEEEEEELLLLLL...............................................
Query VRGQFSCGRVSAC...............................................   34
ident  ||                                                         
Sbjct GRGLGIALSHFVSgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqva  360
DSSP  LEEEEEEEEEEELllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh


DSSP  ..................................llllleeeeeeelllleeeeeellll
Query ..................................pmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
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Sbjct aevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkld  420
DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct areedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgs  480
DSSP  llhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhh


DSSP  hhhhhhlLLLLLEEEEEEEEEllllLEEEEEE.EEEEELLL.....lllllLLHHHLHHH
Query qenflgaTHAKQQRNEMGLAFdgdgRFLALEN.RSITDGGA.....ynnlpWTQLVESHV  174
ident             |  |                                            
Sbjct aigatmgFCYAAQVVEASVDE....ITGKVTAhKVWVAVDVgkalnplaveGQTQGGVWM  536
DSSP  hllllllEEEEEEEEEEEELL....LLLLEEEeEEEEEEELlllllhhhhhHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLL..................lllleEEEEEEEELLLL.........llLLLLll
Query GNAVILGV..................ykvpaVSEESIAVATNK.........cpIGAYrg  207
ident |    |                          |                           
Sbjct GMGQALSEetvydngrmvhgnildyrvptivESPDIEVIIVESmdpngpfgakeASEGml  596
DSSP  HHHHHHLLllleelleellllllllllllllLLLEEEEEEELLlllllhhhlllLLLLll


DSSP  LLHH.HHHHHHHHHHHH............hHHHHLllhhhhhhlllllhhhlleelllll
Query VGFT.AGQIARETLIDR............aARQLGlspfeirrrnvvmpedfpftnrlgq  254
ident  ||  |   |                                                  
Sbjct AGFLpAIHEAVYEAVGVratdfplspdritELLDA.........................  631
DSSP  LLHHhHHHHHHHHHHLLllleelllhhhhhHHHHH.........................


DSSP  eellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlll
Query thregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgt  314
ident                                                             
Sbjct ............................................................  631
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllll
Query pttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstknt  374
ident                                                             
Sbjct ............................................................  631
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeee
Query ygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakg  434
ident                                                             
Sbjct ............................................................  631
DSSP  ............................................................


DSSP  eehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeee
Query mpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtd  494
ident                                                             
Sbjct ............................................................  631
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllllll
Query ffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldv  554
ident                                                             
Sbjct ............................................................  631
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhh
Query pdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperif  614
ident                                                             
Sbjct ............................................................  631
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlll
Query rsiqerp  621
ident        
Sbjct ..keaaa  636
DSSP  ..hhhll