No 1: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=47.4

DSSP  .....................LEEEEEEE.LLLHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLL
Query .....................VSRTSRAR.DELAPIFASSAGVVRGQFSCGRVSACPMET   38
ident                                   |||||    | | |  ||    | | 
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvYFEQPIVKgEDTGPIFASADVTVEGDFYVGRQPHMPIEP   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleEEEEEEEElLLHHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLLLL


DSSP  LEeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query RGavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhp   98
ident                                                             
Sbjct DV..afaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfspt  118
DSSP  LE..eeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhlll


DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL
Query eellvcllsralgrpvrwIEDRQENFLGATHAKQQRNEMGLAFDGDGRFLALENRSITDG  158
ident                       |                  |   ||  || |     | 
Sbjct sealvavaamatgrpvhlRYNYQQQQQYTGKRSPWEMNVKFAAKKDGTLLAMESDWLVDH  178
DSSP  lhhhhhhhhhhhllleeeELLHHHHHHLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEL


DSSP  LLLLLlllLHHHLHHHHHHLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH
Query GAYNNlpwTQLVESHVGNAVILGVYKVPAVSEESIAVATNKCPIGAYRGVGFTAGQIARE  218
ident | |             |   |   |  |        ||||     | || |      | |
Sbjct GPYSE...FGDLLTLRGAQFIGAGYNIPNIRGLGRTVATNHVWGSAFRGYGAPQSMFASE  235
DSSP  LLLLL...LHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLhhhLLEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHlHHHHH
Query TLIDRAARQLGLSPFEIRRRNVVMpedFPFTNRLGQTHREGTYLQTINLLEEMVnPEAFR  278
ident  | |  |  ||  | | |  |         ||  ||          |  |       |  
Sbjct CLMDMLAEKLGMDPLELRYKNAYR...PGDTNPTGQEPEVFSLPDMIDQLRPKY.QAALE  291
DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLL...LLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHH.HHHHH


DSSP  HHHHHHHlLLEEEEEEEEEEEEEELLlhhhH.............................
Query QRQAEARaRGKYLGLGVSVFNEVTGTgtrtL.............................  309
ident   | |        | | |      |                                   
Sbjct KAQKEST.ATHKKGVGISIGVYGSGL....Dgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqg  346
DSSP  HHHHHLL.LLEEEEEEEEEEEEELLL....Lllleeeeeeeellllleeeelllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  309
ident                                                             
Sbjct adigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenll  406
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..................................HHLLLlllllleeeeeellllleeee
Query ..................................SFLGTpttthdsatvridptgkvtvt  335
ident                                                             
Sbjct kacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgaTHCDA.....................  445
DSSP  hhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllLLLLL.....................


DSSP  ellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhh
Query tslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigra  395
ident                                                             
Sbjct ............................................................  445
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllll
Query asivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgf  455
ident                                                             
Sbjct ............................................................  445
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeellllLLEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHH
Query datleatatydpsDLVLANGGHAAIVEIDASTYATRVTDFFAVEDCGTMINPMIVEGQIR  515
ident                |   |   | |  |  |  | |       | |   |     ||| 
Sbjct ......vtglgkpFVVYMYGVFMAEVTVDVATGQTTVDGMTLMADLGSLCNQLATDGQIY  499
DSSP  ......lllllllLLLEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLLllllLLLLLLLLLLLLLLLLLLL.LEEEEELLLLLLLLHHHLL
Query GGIAQAIGQTLLEEVIYddfgQLVTTTLMDYLIPTTLDVP.DIRIRHLETPSPLVPGGIK  574
ident || || ||  | |             ||     |     |    |     | |  | |  
Sbjct GGLAQGIGLALSEDFED....IKKHATLVGAGFPFIKQIPdKLDIVYVNHPRPDGPFGAS  555
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLL....LLLLLLLLLLLLLLHHHLLlLEEEEELLLLLLLLHHHLL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLEELLLHHHHHHHHHLll
Query GMGESAMISAPAAVVAAVNDALAhleVVIETVPITPERIFRSIQErp  621
ident | ||    |  ||   |   |     | |   |  ||          
Sbjct GVGELPLTSPHAAIINAIKSATG...VRIYRLPAYPEKVLEALKA..  597
DSSP  LLLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHL...LLLLLLLLLHHHHHHHHHL..


No 2: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=20.2

DSSP  ......................leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll
Query ......................vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmet   38
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  leEEEEEElLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLLLLh
Query rgAVAQYEwTTQQLILWTATQMPSFVRTMVAMFCAIPEHLIEVRVPDVGGGFGQKAHLHp   98
ident   | |                       | |                 || || |     
Sbjct dvAFAYMG.DDGKCYIHSKSIGVHLHLYMIAPGVGLEPDQLVLVANPMGGTFGYKFSPT.  118
DSSP  leEEEEEL.LLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLHHHLLL.


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel
Query EELLVCLLSRALGRPVRWiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdg  158
ident  | ||     | ||||                                            
Sbjct SEALVAVAAMATGRPVHL..................rynyqqqqqytgkrspwemnvkfa  160
DSSP  LHHHHHHHHHHHLLLEEE..................ellhhhhhhllllllleeeeeeee


DSSP  lllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query gaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiare  218
ident                                                             
Sbjct akkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgs  220
DSSP  ellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllll


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query tlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafr  278
ident                                                             
Sbjct afrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmid  280
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllLLLLLEEEEEELLLLLEEEEELL
Query qrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpTTTHDSATVRIDPTGKVTVTTSL  338
ident                                            |       |  || |  
Sbjct qlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELNADGTITVHTAW  340
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEELLLLLEEEELLL


DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHL...LLHHHEEEELLLLL.LLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query ASSGQGHETTLAQIAADVLG...VPASDVVIQAGSTK.NTYGFGAYASRGAVIGAGSIGR  394
ident    |||        |   |    |           |           ||  |     |  
Sbjct EDHGQGADIGCVGTAHEALRpmgVAPEKIKFTWPNTAtTPNSGPSGGSRQQVMTGNAIRV  400
DSSP  LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhlLLHHHEEELLLLLLlLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhhlllHHHEeeelleeeelleeeeeeehhhHHHHHHHLHhhllll
Query AASIVRERVKQlaghlleaaSEDIviedglvhvagvpakgmpfaeVVGAAYFADathppg  454
ident |                                                   ||      
Sbjct ACENLLKACEK.........PGGG...................yyTYDELKAAD......  426
DSSP  HHHHHHHHHLL.........LLLL...................llLHHHHHHLL......


DSSP  llLLLEEEEELLLLLL......eeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhh
Query fdATLEATATYDPSDL......vlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpm  508
ident        |     |                                              
Sbjct ..KPTKITGNWTASGAthcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmad  484
DSSP  ..LLLEEEEEEELLLLllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeelllllll
Query ivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpspl  568
ident                                                             
Sbjct lgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvn  544
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeell


DSSP  lhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query vpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                      
Sbjct hprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  llllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 3: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=13.7

DSSP  .......................LEEEEEEEL...LLHHHhhhlleEEEEEEEELLLLLL
Query .......................VSRTSRARD...ELAPIfassagVVRGQFSCGRVSAC   34
ident                                |     |         |            
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfEQPIVKGEDtgpIFASA......DVTVEGDFYVGRQP   54
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeEEEEEELLLhhhHHHHL......LEEEEEEEEELLLL


DSSP  LLLlleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeE.............
Query PMEtrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlieV.............   81
ident  |                                            |             
Sbjct HMP.......................................iepdVafaymgddgkcyi   75
DSSP  LLL.......................................llllEeeeeellllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   81
ident                                                             
Sbjct hsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvh  135
DSSP  eellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  .ELL.....llLLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllLLLEEE
Query .RVP.....dvGGGFGqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathAKQQRN  135
ident  |          |                                               
Sbjct lRYNyqqqqqyTGKRS......................................PWEMNV  157
DSSP  eELLhhhhhhlLLLLL......................................LEEEEE


DSSP  EEEEEEllllLEEEEeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleEEEEE...
Query EMGLAFdgdgRFLALenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpaVSEES...  192
ident               |                                       |     
Sbjct KFAAKK....DGTLL.....................................AMESDwlv  176
DSSP  EEEELL....LLLEE.....................................EEEEEeee


DSSP  ...............................eEELLLLL......llllllLLLHHHHHH
Query ...............................iAVATNKC......pigayrGVGFTAGQI  215
ident                                                         |   
Sbjct dhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglGRTVATNhvwgsafrgygaPQSMFASEC  236
DSSP  elllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeEEEELLLlllllllllllhHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhhlllhhhHHHLLLLlhhhLLEELL...LLLE.ELLL..LHHHHHHHHH
Query ARETLIDRAArqlglspfeIRRRNVVmpedFPFTNR...LGQT.HREG..TYLQTINLLE  269
ident     |                                                |      
Sbjct LMDMLAEKLG........mDPLELRY.knaYRPGDTnptGQEPeVFSLpdMIDQLRPKYQ  287
DSSP  HHHHHHHHHL........lLHHHHHH.hhlLLLLLLlllLLLLlLLLHhhHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLH.HHHHhhhhhhhlllEEEEEEEEEEEEEELLLHH.....................
Query EMVNP.EAFRqrqaearargKYLGLGVSVFNEVTGTGTR.....................  307
ident                          ||     | | |                       
Sbjct AALEKaQKES.........tATHKKGVGISIGVYGSGLDgpdaseawaelnadgtitvht  338
DSSP  HHHHHhHHHL.........lLLEEEEEEEEEEEEELLLLllleeeeeeeellllleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  307
ident                                                             
Sbjct awedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnai  398
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  .............................................hhhhlLLLLllllee
Query .............................................tlsflGTPTtthdsa  322
ident                                                             
Sbjct rvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtgLGKP......  452
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllLLLL......


DSSP  eeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllll
Query tvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayas  382
ident                                                             
Sbjct ............................................................  452
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhh
Query rgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvg  442
ident                                                             
Sbjct ............................................................  452
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlhhhllllllllleeeeellllLLEEEEEEEEEEEEEEllllLEEEEEEEEEEELL
Query aayfadathppgfdatleatatydpsDLVLANGGHAAIVEIDastyATRVTDFFAVEDCG  502
ident                                       |           |         
Sbjct ........................fvVYMYGVFMAEVTVDVA....TGQTTVDGMTLMAD  484
DSSP  ........................llLEEEEEEEEEEEEELL....LLLEEEEEEEEEEE


DSSP  L......lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllLLLLL...lLLLLLLll
Query T......mINPMIVEGQIRGGIAQAIGqtlleeviyddfgqlvTTTLM...dYLIPTTld  553
ident                |    ||  |                                   
Sbjct LgslcnqlATDGQIYGGLAQGIGLALS............edfeDIKKHatlvGAGFPF.i  531
DSSP  LlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL............llllLLLLLllllLLLLLL.h


DSSP  LLLE.EEEELLLLLLL....lHHHLL..LLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllLLEE
Query VPDI.RIRHLETPSPL....vPGGIK..GMGESAMISAPAAVVAAVNdalahlevvIETV  606
ident               |                 |       |   |               
Sbjct KQIPdKLDIVYVNHPRpdgpfGASGVgeLPLTSPHAAIINAIKSATG.........VRIY  582
DSSP  HHLLlLEEEEELLLLLlllhhHLLLLllHHHLLHHHHHHHHHHHHHL.........LLLL


DSSP  L......LLHHHHHHhhhlll
Query P......ITPERIFRsiqerp  621
ident           |          
Sbjct RlpaypeKVLEALKA......  597
DSSP  LllllhhHHHHHHHL......


No 4: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=7.6

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHhlllEEEEEEEEEEEE
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrQRQAEArargKYLGLGVSVFNE  300
ident                                          | |         |      
Sbjct ....msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgPIFASA....DVTVEGDFYVGR   52
DSSP  ....llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhHHHHHL....LEEEEEEEEELL


DSSP  EeLLLHhhhhhlllllLLLLEEEEEELLLLLEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHLLL
Query VtGTGTrtlsflgtptTTHDSATVRIDPTGKVTVTTSLAssgqgHETTLAQIAADVLGVP  360
ident                    | |       ||                      |   |  
Sbjct Q.PHMP..........IEPDVAFAYMGDDGKCYIHSKSI.....GVHLHLYMIAPGVGLE   96
DSSP  L.LLLL..........LLLLEEEEEELLLLLEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHEEEELLLlllllLLLLLlLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhheee
Query ASDVVIQAGStkntyGFGAYaSRGAVigAGSIGRAASIVRERVkqlaghlleaasedivi  420
ident     |  |         |            |    |                        
Sbjct PDQLVLVANP.....MGGTF.GYKFS..PTSEALVAVAAMATG.................  131
DSSP  HHHEEEEELL.....LLLLL.LHHHL..LLLHHHHHHHHHHHL.................


DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllLEEEEEL...LLLL..lEEEEE
Query edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatLEATATY...DPSD..lVLANG  475
ident                                             |               
Sbjct ......................................RPVHLRYnyqQQQQytgKRSPW  153
DSSP  ......................................LLEEEELlhhHHHHlllLLLLE


DSSP  EEEEEEEEELlLLLEEEEEEEEEEELLLLLLhhHHHHHHHhHHHHHHHHHHLllllllll
Query GHAAIVEIDAsTYATRVTDFFAVEDCGTMINpmIVEGQIRgGIAQAIGQTLLeeviyddf  535
ident                         | |                || ||            
Sbjct EMNVKFAAKK.DGTLLAMESDWLVDHGPYSE..FGDLLTL.RGAQFIGAGYN........  201
DSSP  EEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEEELLLLLL..LHHHHHH.HHHHHLLLLLL........


DSSP  llllllllllllllllLLLLlEEEEEL.LLLLlllhhhLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHH
Query gqlvtttlmdylipttLDVPdIRIRHL.ETPSplvpggIKGMG.ESAMISAPAAVVAAVN  593
ident                         |                            |      
Sbjct ...............iPNIR.GLGRTVaTNHV......WGSAFrGYGAPQSMFASECLMD  239
DSSP  ...............lLEEE.EEEEEElLLLL......LLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHH.HLLLLleelllHHHH.......................................
Query DALAH.LEVVIetvpitPERI.......................................  613
ident                                                             
Sbjct MLAEKlGMDPL.....eLRYKnayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaq  294
DSSP  HHHHHhLLLHH.....hHHHHhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  613
ident                                                             
Sbjct kestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgt  354
DSSP  hhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  613
ident                                                             
Sbjct ahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgg  414
DSSP  hhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  613
ident                                                             
Sbjct gyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqt  474
DSSP  llllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  613
ident                                                             
Sbjct tvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqi  534
DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhl


DSSP  .......................................................hhhhh
Query .......................................................frsiq  618
ident                                                             
Sbjct pdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlea  594
DSSP  llleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhh


DSSP  lll
Query erp  621
ident    
Sbjct lka  597
DSSP  hhl


No 5: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=7.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................leeeeeeelllhhhhhh
Query ...........................................vsrtsrardelapifas   17
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  lleeeeeeeeelllllllllLLEEEEEEElLLLEEEEEELLL.....LHHHHHHHHHHHH
Query sagvvrgqfscgrvsacpmeTRGAVAQYEwTTQQLILWTATQ.....MPSFVRTMVAMFC   72
ident                        | |            ||                    
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpdASEAWAELN.ADGTITVHTAWEdhgqgADIGCVGTAHEAL  359
DSSP  eeeeeeeeeeeeelllllllEEEEEEEEL.LLLLEEEELLLLlllllHHHHHHHHHHHHH


DSSP  L...LLHHHEEEELLL......lLLLL.LLLLL.lLHHHHHHHHHHHHHL..........
Query A...IPEHLIEVRVPD......vGGGF.GQKAH.lHPEELLVCLLSRALG..........  111
ident          |    |        |                  |                 
Sbjct RpmgVAPEKIKFTWPNtattpnsGPSGgSRQQVmtGNAIRVACENLLKACekpgggyyty  419
DSSP  HhhlLLHHHEEELLLLlllllllLLLLlLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllh


DSSP  .........LLEEEELLHH.........................................
Query .........RPVRWIEDRQ.........................................  121
ident                                                             
Sbjct delkaadkpTKITGNWTASgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgm  479
DSSP  hhhhhllllLEEEEEEELLllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  121
ident                                                             
Sbjct tlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkld  539
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhllllee


DSSP  .....hhHHHLllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhh
Query .....enFLGAthakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgn  176
ident                                                             
Sbjct ivyvnhpRPDG.................................................  550
DSSP  eeellllLLLL.................................................


DSSP  hllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhh
Query avilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeir  236
ident                                                             
Sbjct ............................................................  550
DSSP  ............................................................


DSSP  hlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeee
Query rrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvs  296
ident                                                             
Sbjct ............................................................  550
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhh
Query vfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadv  356
ident                                                             
Sbjct ............................................................  550
DSSP  ............................................................


DSSP  hlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhh
Query lgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaase  416
ident                                                             
Sbjct ............................................................  550
DSSP  ............................................................


DSSP  heeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeee
Query diviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangg  476
ident                                                             
Sbjct ............................................................  550
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
Query haaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfg  536
ident                                                             
Sbjct ............................................................  550
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query qlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndal  596
ident                                                             
Sbjct ......................................pfgasgvgelpltsphaaiina  572
DSSP  ......................................hhhllllllhhhllhhhhhhhh


DSSP  hhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query ahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                          
Sbjct iksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 6: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...................................leeeeeeelLLHHHHHHL.......
Query ...................................vsrtsrardELAPIFASS.......   18
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpKYQAALEKAqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhllll


DSSP  ..LEEEEEEEEELLLLLL........................................ll
Query ..AGVVRGQFSCGRVSAC........................................pm   36
ident    ||       |                                               
Sbjct hkKGVGISIGVYGSGLDGpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeEEEEEEEEEEELLLLLlleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllll
Query etrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahl   96
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEEELLL.....LLEEEEE
Query hpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMGLAFDGD.....GRFLALE  151
ident                                                |            
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvYMYGVFMAEVTVDvatgqTTVDGMT  480
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllEEEEEEEEEEEEElllllEEEEEEE


DSSP  EEEEEELllllllllLHHHlHHHHHH.LLLL...........................lL
Query NRSITDGgaynnlpwTQLVeSHVGNA.VILG...........................vY  183
ident                                                             
Sbjct LMADLGS.......lCNQLaTDGQIYgGLAQgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikQ  533
DSSP  EEEELLL.......lLLHHhHHHHHHhHHHHhhhhhhllllllllllllllllllllhhH


DSSP  LLLEEEEEEEEELLLLLLlllllllLHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHLllhhhhhhlllll
Query KVPAVSEESIAVATNKCPigayrgvGFTAGQIARETLIDR.AARQLGlspfeirrrnvvm  242
ident                  |                   |        |             
Sbjct IPDKLDIVYVNHPRPDGP..fgasgVGELPLTSPHAAIINaIKSATG.............  578
DSSP  LLLLEEEEELLLLLLLLH..hhlllLLLHHHLLHHHHHHHhHHHHHL.............


DSSP  hhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeee
Query pedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevt  302
ident                                                             
Sbjct ............................................................  578
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhh
Query gtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpas  362
ident                                                             
Sbjct ............................................................  578
DSSP  ............................................................


DSSP  heeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeel
Query dvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivied  422
ident                                                             
Sbjct ............................................................  578
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeee
Query glvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaive  482
ident                                                             
Sbjct ............................................................  578
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllll
Query idastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvttt  542
ident                                                             
Sbjct ............................................................  578
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query lmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevv  602
ident                                                             
Sbjct ............................................................  578
DSSP  ............................................................


DSSP  lleelllhhhhhhhhhlll
Query ietvpitperifrsiqerp  621
ident                    
Sbjct vriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhl


No 7: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct .................msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvt   43
DSSP  .................llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhllee


DSSP  eelllhhhhhhllllllllLEEEEEELllllEEEEELLLLLL.LLHHHHHHHHHHHhhll
Query vtgtgtrtlsflgtpttthDSATVRIDptgkVTVTTSLASSG.QGHETTLAQIAADvlgv  359
ident                      |    |            | |   |    |         
Sbjct vegdfyvgrqphmpiepdvAFAYMGDD....GKCYIHSKSIGvHLHLYMIAPGVGL....   95
DSSP  eeeeeeellllllllllleEEEEELLL....LLEEEEELLLLhHHHHHHHHHHHLL....


DSSP  lHHHEEEELLLlllllllllLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhhee
Query pASDVVIQAGStkntygfgaYASRGaVIGAGSIGRAASIVrervkqlaghlleaasediv  419
ident    |                |        |     |                        
Sbjct .EPDQLVLVAN..pmggtfgYKFSP.TSEALVAVAAMATG....................  131
DSSP  .LHHHEEEEEL..lllllllHHHLL.LLHHHHHHHHHHHL....................


DSSP  eelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleEEEEL..............
Query iedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleATATY..............  465
ident                                                             
Sbjct .........................................RPVHLrynyqqqqqytgkr  150
DSSP  .........................................LLEEEellhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct spwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgr  210
DSSP  lleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct tvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqep  270
DSSP  eellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct evfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelna  330
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct dgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrq  390
DSSP  llleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllh


DSSP  ...................................................llllleeee
Query ...................................................dpsdlvlan  474
ident                                                             
Sbjct qvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglg  450
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllll


DSSP  eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query gghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviydd  534
ident                                                             
Sbjct kpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglal  510
DSSP  llllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query fgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavnd  594
ident                                                             
Sbjct sedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaii  570
DSSP  llllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhh


DSSP  hhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query alahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                            
Sbjct naiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 8: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......................................leeeeeeelllhhhHHHL...
Query .......................................vsrtsrardelapiFASS...   18
ident                                                         |   
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaQKEStat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLlll


DSSP  LEEEEEEEEELLLLL.............................................
Query AGVVRGQFSCGRVSA.............................................   33
ident      |       |                                              
Sbjct HKKGVGISIGVYGSGldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  EEEEEEEEEEEEELLllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   33
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  .................................Lllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query .................................Cpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfV..........................  454
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllL..........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................  454
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlLLLlLEEEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEEELLlLLLLLLLHHhlHHHHHHLL
Query qenflgaTHAkQQRNEMGLAFDG.DGRFLALENRSITDGGaYNNLPWTQLveSHVGNAVI  179
ident                      |   |           | |               | |  
Sbjct .......VYM.YGVFMAEVTVDVaTGQTTVDGMTLMADLG.SLCNQLATDgqIYGGLAQG  505
DSSP  .......LEE.EEEEEEEEEEELlLLLEEEEEEEEEEELL.LLLLHHHHHhhHHHHHHHH


DSSP  L.LLLL....................LLEE.EEEEEEELLLL.....LLLLLLlLLLHHH
Query L.GVYK....................VPAV.SEESIAVATNK.....CPIGAYrGVGFTA  212
ident                                      |            |       | 
Sbjct IgLALSedfedikkhatlvgagfpfiKQIPdKLDIVYVNHPRpdgpfGASGVG.ELPLTS  564
DSSP  HhHHHLlllllllllllllllllllhHHLLlLEEEEELLLLLlllhhHLLLLL.LHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhh
Query GQIARETLIDRAARQlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemv  272
ident    |    |  |                                                
Sbjct PHAAIINAIKSATGV.............................................  579
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLL.............................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhllleeeeeEEEEEeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllle
Query npeafrqrqaearargkylglGVSVFnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkv  332
ident                                                             
Sbjct ....................rIYRLP..................................  585
DSSP  ....................lLLLLL..................................


DSSP  eeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhh
Query tvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsi  392
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhll
Query graasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathp  452
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhh
Query pgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmiveg  512
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhh
Query qirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpgg  572
ident                                                             
Sbjct ............................................................  585
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query ikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                  
Sbjct .....................................aypekvlealka  597
DSSP  .....................................llhhhhhhhhhl


No 9: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...............................leeeeeeeLLLHHHHHHL...........
Query ...............................vsrtsrarDELAPIFASS...........   18
ident                                        | | |                
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmiDQLRPKYQAAlekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhhllll


DSSP  ....LEEEEEEEEELLL....................................lllllll
Query ....AGVVRGQFSCGRV....................................sacpmet   38
ident      |   |    |                                             
Sbjct hkkgVGISIGVYGSGLDgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeeeEEEEEEEEELLLLllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh
Query rgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhp   98
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllLEEEEEEEEELL..........LLLEe
Query eellvcllsralgrpvrwiedrqenflgathakQQRNEMGLAFDG..........DGRFl  148
ident                                                             
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfVVYMYGVFMAEVtvdvatgqttVDGM.  479
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllLLEEEEEEEEEEeeellllleeEEEE.


DSSP  EEEEEEeeellllllllllhhhlHHHH.................................
Query ALENRSitdggaynnlpwtqlveSHVG.................................  175
ident  |                                                          
Sbjct TLMADL.................GSLCnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhat  522
DSSP  EEEEEL.................LLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  .....hhllllllllleEEEE.EEEEllllllllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHl
Query .....navilgvykvpaVSEE.SIAVatnkcpigayrgvgftAGQIARETLIDRAARQLg  229
ident                                                  |    |     
Sbjct lvgagfpfikqipdkldIVYVnHPRP.........dgpfgasGVGELPLTSPHAAIINA.  572
DSSP  llllllllhhhlllleeEEELlLLLL.........llhhhllLLLLHHHLLHHHHHHHH.


DSSP  llhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllle
Query lspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargk  289
ident                                                             
Sbjct ............................................................  572
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhh
Query ylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettl  349
ident                                                             
Sbjct ............................................................  572
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query aqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlagh  409
ident                                                             
Sbjct ............................................................  572
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllll
Query lleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsd  469
ident                                                             
Sbjct ............................................................  572
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query lvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtllee  529
ident                                                             
Sbjct ............................................................  572
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhh
Query viyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavv  589
ident                                                             
Sbjct ............................................................  572
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query aavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                 
Sbjct .......iksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  .......hhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 10: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=4.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................leeeeeeelllhhhhhhll
Query .........................................vsrtsrardelapifassa   19
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  eeeeeeeeellllllllLLLEEEEEEELL...LLEEEEE........ellllhhhhhhhh
Query gvvrgqfscgrvsacpmETRGAVAQYEWT...TQQLILW........tatqmpsfvrtmv   68
ident                        |  |     |                           
Sbjct hkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELNadgTITVHTAwedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEELlllLEEEELLlllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhlllhhHEEEELL.llllllllLLLLLH.HHHHHHHHHHHHL...............
Query amfcaipehLIEVRVP.dvgggfgqKAHLHP.EELLVCLLSRALG...............  111
ident                                                             
Sbjct pmgvapekiKFTWPNTattpnsgpsGGSRQQvMTGNAIRVACENLlkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheEELLLLLlllllllllLLLLHHhHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllllllhh


DSSP  ..........LLEEEELLHHhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellll
Query ..........RPVRWIEDRQenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggay  161
ident               |                                             
Sbjct elkaadkptkITGNWTASGA........................................  440
DSSP  hhhhllllleEEEEEELLLL........................................


DSSP  llllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhh
Query nnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretli  221
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query draarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrq  281
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeelllll
Query aearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslass  341
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivre  401
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllllllee
Query rvkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatlea  461
ident                                                             
Sbjct ............................................................  440
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query tatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqa  521
ident                                                             
Sbjct ...thcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgq  497
DSSP  ...llllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhh
Query igqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesam  581
ident                                                             
Sbjct iygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgv  557
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query isapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                         
Sbjct gelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  llhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 11: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=3.2

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhlleellllleeLLLLH.................hhhhhhhhhHHLHhhHHHHhhh
Query vmpedfpftnrlgqthREGTY.................lqtinlleeMVNPeaFRQRqae  283
ident                   |                               |  |      
Sbjct ................MSGPAaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgeDTGP.iFASA...   40
DSSP  ................LLHHHhhllllllllllllleeeeeeeeellLHHH.hHHHL...


DSSP  hhllleeEEEEEEEEEEEELLLHhhhhhlllllllLLEEeeeellllleeeeelllllll
Query arargkyLGLGVSVFNEVTGTGTrtlsflgtptttHDSAtvridptgkvtvttslassgq  343
ident               |                                             
Sbjct .......DVTVEGDFYVGRQPHM..........piEPDV.....................   62
DSSP  .......LEEEEEEEEELLLLLL..........llLLLE.....................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrerv  403
ident                                                             
Sbjct ...........................................afaymgddgkcyihsks   79
DSSP  ...........................................eeeeellllleeeeell


DSSP  hhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleEEE
Query kqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleATA  463
ident                                                             
Sbjct igvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlRYN  139
DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeELL


DSSP  E..LLLL..lleEEEEEEEEEEEEellllLEEEEEEEEEEELLL....lLLHHHHHhHHH
Query T..YDPS..dlvLANGGHAAIVEIdastyATRVTDFFAVEDCGT....mINPMIVEgQIR  515
ident                                                             
Sbjct YqqQQQYtgkrsPWEMNVKFAAKK.....DGTLLAMESDWLVDHgpyseFGDLLTL.RGA  193
DSSP  HhhHHHLlllllLEEEEEEEEELL.....LLLEEEEEEEEEEELlllllLHHHHHH.HHH


DSSP  HHHhhHHHHhhllllllllllllllllllllllllllLLLLEEEEELLLLLLLLH..hhl
Query GGIaqAIGQtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttlDVPDIRIRHLETPSPLVP..ggi  573
ident   |    |                               | ||          |      
Sbjct QFI..GAGY............................NIPNIRGLGRTVATNHVWgsafr  223
DSSP  HHL..LLLL............................LLLEEEEEEEEELLLLLLlllll


DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLE.ELLL.......................
Query kgMGESAMISAPAAVVAAVNDALahlevVIET.VPIT.......................  609
ident        |                                                    
Sbjct gyGAPQSMFASECLMDMLAEKLG.....MDPLeLRYKnayrpgdtnptgqepevfslpdm  278
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....LLHHhHHHHhllllllllllllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct idqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvht  338
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct awedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnai  398
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct rvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymy  458
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct gvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedik  518
DSSP  eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  609
ident                                                             
Sbjct khatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatg  578
DSSP  llllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  .......hhhhhhhhhlll
Query .......perifrsiqerp  621
ident                    
Sbjct vriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhl


No 12: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  .................leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeee
Query .................vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgava   43
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  eeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhh
Query qyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellv  103
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllll
Query cllsralgrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynn  163
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  llllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query lpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidr  223
ident                                                             
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query aarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqae  283
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  hhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlllllllLLEEEEEELL..........lLLEE
Query arargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtptttHDSATVRIDP..........tGKVT  333
ident                                                            |
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvYMYGVFMAEVtvdvatgqttvDGMT  480
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllEEEEEEEEEEeeellllleeeEEEE


DSSP  EEELL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHL.........................lLHHHEEE
Query VTTSL.ASSGQ.GHETTLAQIAADVLG.........................vPASDVVI  366
ident     |     |           |   |                                |
Sbjct LMADLgSLCNQlATDGQIYGGLAQGIGlalsedfedikkhatlvgagfpfikqIPDKLDI  540
DSSP  EEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllhhhLLLLEEE


DSSP  ELLLLlllllllllllLHHHhhhHHHHHHHHHHHH..Hhhhhhhhhhlllhhheeeelle
Query QAGSTkntygfgayasRGAVigaGSIGRAASIVRE..Rvkqlaghlleaasediviedgl  424
ident                  |                                          
Sbjct VYVNH..prpdgpfgaSGVG...ELPLTSPHAAIInaI......................  573
DSSP  EELLL..lllllhhhlLLLL...LHHHLLHHHHHHhhH......................


DSSP  eeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllLLLleeeeelllllleeeeeeeeeeeeee
Query vhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfDATleatatydpsdlvlangghaaiveid  484
ident                                                             
Sbjct ...............................KSA..........................  576
DSSP  ...............................HHH..........................


DSSP  llllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllll
Query astyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlm  544
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query dylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvie  604
ident                                                             
Sbjct ........................................................tgvr  580
DSSP  ........................................................hlll


DSSP  eelllhhhhhhhhhlll
Query tvpitperifrsiqerp  621
ident                  
Sbjct iyrlpaypekvlealka  597
DSSP  lllllllhhhhhhhhhl


No 13: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  .........leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllle
Query .........vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqq   51
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhl
Query lilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralg  111
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  lleeeellhhhhhhhlllllleeEEEEEEEllllleEEEEEEEEEEllllllllLLHHhl
Query rpvrwiedrqenflgathakqqrNEMGLAFdgdgrfLALENRSITDggaynnlpWTQLve  171
ident                            |                            |   
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpdaseAWAELNA.....dGTITVHTAWE.......dHGQG..  346
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleeeEEEEELL.....lLLEEEELLLL.......lLLLL..


DSSP  hHHHH.HLLLL...lLLLL..EEEEEEEEE...llllllLLLL.lLLLHHHHHHHHHHHH
Query sHVGN.AVILG...vYKVP..AVSEESIAV...atnkcpIGAY.rGVGFTAGQIARETLI  221
ident    |             |                      |         |   | | | 
Sbjct aDIGCvGTAHEalrpMGVApeKIKFTWPNTattpnsgpsGGSRqqVMTGNAIRVACENLL  406
DSSP  hHHHHhHHHHHhhhhHLLLhhHEEELLLLLlllllllllLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHhhHLLLhhHHHHlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query DRAArqLGLSpfEIRRrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrq  281
ident                                                             
Sbjct KACE..KPGG..GYYT............................................  418
DSSP  HHHL..LLLL..LLLL............................................


DSSP  hhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeelllll
Query aearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslass  341
ident                                                             
Sbjct ............................................................  418
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivre  401
ident                                                             
Sbjct ............................................................  418
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllllllee
Query rvkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatlea  461
ident                                                             
Sbjct ............................................................  418
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query tatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqa  521
ident                                                             
Sbjct .............................................ydelkaadkptkitg  433
DSSP  .............................................hhhhhhllllleeee


DSSP  hhHHHLL.....................................................
Query igQTLLE.....................................................  528
ident                                                             
Sbjct nwTASGAthcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqla  493
DSSP  eeELLLLllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhh


DSSP  ...........lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhlllll
Query ...........eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmg  577
ident                                                             
Sbjct tdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfg  553
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query esamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                             
Sbjct asgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  llllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 14: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct .......................................................msgpa    5
DSSP  .......................................................llhhh


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhHHHHHHLHhhhhhhhhhhhllleeeeEEEEEEEE
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinLLEEMVNPeafrqrqaearargkylgLGVSVFNE  300
ident                                                             
Sbjct aaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgeDTGPIFAS.................aDVTVEGDF   48
DSSP  hhllllllllllllleeeeeeeeellLHHHHHHH.................lLEEEEEEE


DSSP  EElllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query VTgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
ident                                                             
Sbjct YV..........................................................   50
DSSP  EE..........................................................


DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee
Query asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
ident                                                             
Sbjct ........grqphmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvl  102
DSSP  ........llllllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellllllEEEEEEEEEE
Query edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlVLANGGHAAI  480
ident                                                      |   || 
Sbjct vanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspWEMNVKFAAK  162
DSSP  eellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlllllllEEEEEEEEEL


DSSP  EeeellllleeEEEE.EEEEEL..............lLLLLHhhhhhhHHHHhhhhhhhh
Query VeidastyatrVTDF.FAVEDC..............gTMINPmivegqIRGGiaqaigqt  525
ident                     |                             |         
Sbjct K..........DGTLlAMESDWlvdhgpysefgdlltLRGAQ....fiGAGY........  200
DSSP  L..........LLLEeEEEEEEeeelllllllhhhhhHHHHH....hlLLLL........


DSSP  hllllllllllllllllllllllllllllllEEEEELL........llllllhhhllLLL
Query lleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdIRIRHLE........tpsplvpggikGMG  577
ident                                  || |                       
Sbjct .............................niPNIRGLGrtvatnhvwgsafrgygapQSM  231
DSSP  .............................llLEEEEEEeeellllllllllllllhhHHH


DSSP  LHHHHH......................................................
Query ESAMIS......................................................  583
ident                                                             
Sbjct FASECLmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaale  291
DSSP  HHHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  583
ident                                                             
Sbjct kaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigc  351
DSSP  hhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  583
ident                                                             
Sbjct vgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacek  411
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  583
ident                                                             
Sbjct pgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvat  471
DSSP  lllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  583
ident                                                             
Sbjct gqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfi  531
DSSP  lleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllh


DSSP  ............................hhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhh
Query ............................apaavvaavndalahlevvietvpitperifr  615
ident                                                             
Sbjct kqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekv  591
DSSP  hhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhh


DSSP  hhhlll
Query siqerp  621
ident       
Sbjct lealka  597
DSSP  hhhhhl


No 15: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllLLLEEEEeeelllleeeeeELLLl
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmETRGAVAqyewttqqlilwTATQm   60
ident                                                             
Sbjct ...........................msgpaaaaeDAIEIHP..........gtPNVY.   22
DSSP  ...........................llhhhhhllLLLLLLL..........llLLEE.


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................   22
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlHHHH.....
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveSHVG.....  175
ident                                                             
Sbjct ...............feqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiEPDVafaym   67
DSSP  ...............eeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllLLLEeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  175
ident                                                             
Sbjct gddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaa  127
DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhh


DSSP  .........HHllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .........NAvilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraar  226
ident                                                             
Sbjct matgrpvhlRY.................................................  138
DSSP  hhhllleeeEL.................................................


DSSP  hhlllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhl
Query qlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaeara  286
ident                                                             
Sbjct ............................................................  138
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhHLLLL...lllLLEEEEEELL.....lLLEEEEELL
Query rgkylglgvsvfnevtgtgtrtlsFLGTP...tttHDSATVRIDP.....tGKVTVTTSL  338
ident                                         |                   
Sbjct ......................nyQQQQQytgkrsPWEMNVKFAAkkdgtlLAMESDWLV  176
DSSP  ......................lhHHHHHllllllLEEEEEEEEEllllleEEEEEEEEE


DSSP  L.....lllLLHHHHHHHHHHHhHLLLhHHEEEELLllllllllllLLLLhhHHHHHHHH
Query A.....ssgQGHETTLAQIAADvLGVPaSDVVIQAGstkntygfgaYASRgaVIGAGSIG  393
ident                 ||                                    ||    
Sbjct DhgpysefgDLLTLRGAQFIGA.GYNI.PNIRGLGR..tvatnhvwGSAF.rGYGAPQSM  231
DSSP  ElllllllhHHHHHHHHHHLLL.LLLL.LEEEEEEE..eellllllLLLL.lLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhhllLHHHEE..EELL...............eeeeLLEEeeeee
Query RAASIVRERVKQLAGHlleaASEDIV..IEDG...............lvhvAGVPakgmp  436
ident  |            |                                             
Sbjct FASECLMDMLAEKLGM....DPLELRykNAYRpgdtnptgqepevfslpdmIDQL.....  282
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLL....LHHHHHhhHLLLlllllllllllllllhhhhHHHH.....


DSSP  hhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeee
Query faevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdff  496
ident                                                             
Sbjct ....................................rpkyqaalekaqkestathkkgvg  306
DSSP  ....................................hhhhhhhhhhhhhhlllleeeeee


DSSP  eeeellLLLLH.................................................
Query avedcgTMINP.................................................  507
ident                                                             
Sbjct isigvyGSGLDgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvap  366
DSSP  eeeeeeELLLLllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  507
ident                                                             
Sbjct ekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaad  426
DSSP  hheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhll


DSSP  ..............HH............................................
Query ..............MI............................................  509
ident                                                             
Sbjct kptkitgnwtasgaTHcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlg  486
DSSP  llleeeeeeellllLLllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeell


DSSP  ............hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllle
Query ............vegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdi  557
ident                                                             
Sbjct slcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhp  546
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellll


DSSP  eEEEL...LLLL.LLLHhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhh
Query rIRHL...ETPS.PLVPggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperi  613
ident                                                             
Sbjct rPDGPfgaSGVGeLPLT.................sphaaiinaiksatgvriyrlpaype  589
DSSP  lLLLHhhlLLLLlHHHL.................lhhhhhhhhhhhhhllllllllllhh


DSSP  hhhhhlll
Query frsiqerp  621
ident         
Sbjct kvlealka  597
DSSP  hhhhhhhl


No 16: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................................leeeeeeelllhhhhhhlLE
Query ........................................vsrtsrardelapifassAG   20
ident                                                           | 
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestAT  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLL


DSSP  EEEEEEEELLLLL...............................................
Query VVRGQFSCGRVSA...............................................   33
ident    |      |                                                 
Sbjct HKKGVGISIGVYGsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  EEEEEEEEEEEEEllllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   33
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  ...................................Lllllleeeeeeelllleeeeeell
Query ...................................Cpmetrgavaqyewttqqlilwtat   58
ident                                                             
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvY........................  456
DSSP  hhhhllllleeeeeeelllllllllllllllllllE........................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeel
Query qmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwie  118
ident                                                             
Sbjct ............................................................  456
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhlLLLlLEEEEEEEEEllllLEEEEEE.EEEEELL...llllLLLL..HHHLH
Query drqenflgaTHAkQQRNEMGLAFdgdgRFLALEN.RSITDGG...aynnLPWT..QLVES  172
ident                  |                               |          
Sbjct .........MYG.VFMAEVTVDV....ATGQTTVdGMTLMADlgslcnqLATDgqIYGGL  502
DSSP  .........EEE.EEEEEEEEEL....LLLLEEEeEEEEEEEllllllhHHHHhhHHHHH


DSSP  HHHHHLLLL..............llllleeEEEE.EEELLLL..........llLLLL.l
Query HVGNAVILG..............vykvpavSEES.IAVATNK..........cpIGAY.r  206
ident   |    |                                               |    
Sbjct AQGIGLALSedfedikkhatlvgagfpfikQIPDkLDIVYVNhprpdgpfgasgVGELpl  562
DSSP  HHHHHHHHLlllllllllllllllllllhhHLLLlEEEEELLllllllhhhlllLLLHhh


DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHH............hHHHHLllhhhhhhlllllhhhlleelllll
Query gvGFTAGQIARETLIDR............aARQLGlspfeirrrnvvmpedfpftnrlgq  254
ident      |   |                                                  
Sbjct tsPHAAIINAIKSATGVriyrlpaypekvlEALKA.........................  597
DSSP  llHHHHHHHHHHHHHLLllllllllhhhhhHHHHL.........................


DSSP  eellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhlll
Query thregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgt  314
ident                                                             
Sbjct ............................................................  597
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllll
Query pttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstknt  374
ident                                                             
Sbjct ............................................................  597
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeee
Query ygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakg  434
ident                                                             
Sbjct ............................................................  597
DSSP  ............................................................


DSSP  eehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeee
Query mpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtd  494
ident                                                             
Sbjct ............................................................  597
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllllll
Query ffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldv  554
ident                                                             
Sbjct ............................................................  597
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhh
Query pdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperif  614
ident                                                             
Sbjct ............................................................  597
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlll
Query rsiqerp  621
ident        
Sbjct .......  597
DSSP  .......


No 17: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ......................................................leeeee
Query ......................................................vsrtsr    6
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  eelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllLEEEEEEELL....LLEEEEEE......
Query ardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetRGAVAQYEWT....TQQLILWT......   56
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspWEMNVKFAAKkdgtLLAMESDWlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhlllllllEEEEEEEEELllllEEEEEEEEeeelll


DSSP  ....llllhHHHHHHHhhhHLLLhHHEEEEL....lllllllllllLLLHHHHHHHHHHh
Query ....atqmpSFVRTMVamfCAIPeHLIEVRV....pdvgggfgqkaHLHPEELLVCLLSr  108
ident                           |                      |          
Sbjct ysefgdlltLRGAQFI..gAGYNiPNIRGLGrtvatnhvwgsafrgYGAPQSMFASECL.  237
DSSP  llllhhhhhHHHHHHL..lLLLLlLEEEEEEeeellllllllllllLLHHHHHHHHHHH.


DSSP  hhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllh
Query algrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtq  168
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Sbjct ............................................................  237
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarql  228
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Sbjct ............................................................  237
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll
Query glspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaeararg  288
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Sbjct .................................mdmlaeklgmdplelryknayrpgdtn  264
DSSP  .................................hhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllll


DSSP  eeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhh
Query kylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghett  348
ident                                                             
Sbjct ptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdasea  324
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeee


DSSP  hhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query laqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlag  408
ident                                                             
Sbjct waelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgp  384
DSSP  eeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllllllll


DSSP  hhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellll
Query hlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydps  468
ident                                                             
Sbjct sggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcd  444
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllll


DSSP  lleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlle  528
ident                                                             
Sbjct avtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaq  504
DSSP  llllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhh
Query eviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaav  588
ident                                                             
Sbjct giglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelplts  564
DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query vaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                  
Sbjct phaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 18: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  ............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeell
Query ............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewt   48
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  lleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query tqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsr  108
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  hhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllh
Query algrpvrwiedrqenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtq  168
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  hhlhhhhhhllllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lveshvgnavilgvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarql  228
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll
Query glspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaeararg  288
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  eeeeeeeeeeeeeelllhhHHHHllllllllLEEEEEELllllEEEEELLL...lllllh
Query kylglgvsvfnevtgtgtrTLSFlgtpttthDSATVRIDptgkVTVTTSLA...ssgqgh  345
ident                      |           |    |     | |   |         
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpDASE........AWAELNAD....GTITVHTAwedhgqgad  348
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllLEEE........EEEEELLL....LLEEEELLlllllllhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeeLLLL.lllLLLL......lLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query ettlaqiaadvlgvpasdvviqAGST.kntYGFG......aYASRGAVIGAGSIGRAASI  398
ident                                                             
Sbjct igcvgtahealrpmgvapekikFTWPntatTPNSgpsggsrQQVMTGNAIRVACENLLKA  408
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhheeELLLllllLLLLlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllll
Query vrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdat  458
ident                                                             
Sbjct ..........................................cekpgggyytydelkaad  426
DSSP  ..........................................hlllllllllhhhhhhll


DSSP  leeEEELLLlllEEEE..........eeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhh
Query leaTATYDPsdlVLAN..........gghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpm  508
ident      |                                                      
Sbjct kptKITGNW..tASGAthcdavtglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmad  484
DSSP  lllEEEEEE..eLLLLllllllllllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeelllllll
Query ivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpspl  568
ident                                                             
Sbjct lgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvn  544
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeell


DSSP  lhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query vpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                                      
Sbjct hprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  llllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 19: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeeeellll
Query vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewttqqlilwtatqm   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellh
Query psfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsralgrpvrwiedr  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhlll
Query qenflgathakqqrnemglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavil  180
ident                                                             
Sbjct ...............................msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivk   29
DSSP  ...............................llhhhhhllllllllllllleeeeeeeee


DSSP  lllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlll
Query gvykvpavseesiavatnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnv  240
ident                                                             
Sbjct gedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiepdvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymi   89
DSSP  lllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeellllleeeeellllhhhhhhhh


DSSP  llhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeee
Query vmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfne  300
ident                                                             
Sbjct apgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgk  149
DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllll


DSSP  eelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvp  360
ident                                                             
Sbjct rspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgpysefgdlltlrgaqfigagynipnirglg  209
DSSP  llleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeee


DSSP  hhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheee
Query asdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasedivi  420
ident                                                             
Sbjct rtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdmlaeklgmdplelryknayrpgdtnptgqe  269
DSSP  eeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  elleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellllLLEEEEEEEEEE
Query edglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsDLVLANGGHAAI  480
ident                                                             
Sbjct pevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldGPDASEAWAELN  329
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllLLLEEEEEEEEL


DSSP  eeeellllleeeEEEEEEEELlLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllllll
Query veidastyatrvTDFFAVEDCgTMINPmIVEGQIRGGIAQAIGQTLleeviyddfgqlvt  540
ident                                    |    |                   
Sbjct ..........adGTITVHTAW.EDHGQ.GADIGCVGTAHEALRPMG..............  363
DSSP  ..........llLLEEEELLL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHL..............


DSSP  llllllllllllLLLLEEEEEL........LLLLlllhhHLLL...LLLHHHHHHHHHHH
Query ttlmdylipttlDVPDIRIRHL........ETPSplvpgGIKG...MGESAMISAPAAVV  589
ident                 |                      |       |            
Sbjct ...........vAPEKIKFTWPntattpnsGPSG.....GSRQqvmTGNAIRVACENLLK  407
DSSP  ...........lLHHHEEELLLllllllllLLLL.....LLLHhhhHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HH.......HHHHH.HHHL.........................................
Query AA.......VNDAL.AHLE.........................................  600
ident |                                                           
Sbjct ACekpgggyYTYDElKAADkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvfmaevtv  467
DSSP  HHlllllllLLHHHhHHLLllleeeeeeellllllllllllllllllleeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  600
ident                                                             
Sbjct dvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkhatlvgag  527
DSSP  ellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllll


DSSP  .................................................lllleelllhh
Query .................................................vvietvpitpe  611
ident                                                             
Sbjct fpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvriyrlpay  587
DSSP  lllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  hhhhhhhlll
Query rifrsiqerp  621
ident           
Sbjct pekvlealka  597
DSSP  hhhhhhhhhl


No 20: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  .........................................................lee
Query .........................................................vsr    3
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllLLLL.........................
Query tsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacPMET.........................   38
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepeVFSLpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhlllllllllllllllLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   38
ident                                                             
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpdaseawaelnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealr  360
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   38
ident                                                             
Sbjct pmgvapekikftwpntattpnsgpsggsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytyd  420
DSSP  hhlllhhheeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  ......................................LEEEEEEELL....LLEE.EEE
Query ......................................RGAVAQYEWT....TQQL.ILW   55
ident                                           |                 
Sbjct elkaadkptkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymyGVFMAEVTVDvatgQTTVdGMT  480
DSSP  hhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllleeeEEEEEEEEEEllllLEEEeEEE


DSSP  EL............llLHHHHHHHHHHHHL..................lLHHHEE..EEL
Query TA............tqMPSFVRTMVAMFCA..................iPEHLIE..VRV   83
ident                                                      |      
Sbjct LMadlgslcnqlatdgQIYGGLAQGIGLALsedfedikkhatlvgagfpFIKQIPdkLDI  540
DSSP  EEeellllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHlllllllllllllllllllLHHHLLllEEE


DSSP  LLLLL.......lLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhlllllleee
Query PDVGG.......gFGQKAH.LHPEELLVCLLSRALGrpvrwiedrqenflgathakqqrn  135
ident   |                                                         
Sbjct VYVNHprpdgpfgASGVGElPLTSPHAAIINAIKSA........................  576
DSSP  EELLLlllllhhhLLLLLLhHHLLHHHHHHHHHHHH........................


DSSP  eeeeeellllleeeeeeeeeeellllllllllhhhlhhhhhhllllllllleeeeeeeee
Query emglafdgdgrflalenrsitdggaynnlpwtqlveshvgnavilgvykvpavseesiav  195
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllhhhlleellllle
Query atnkcpigayrgvgftagqiaretlidraarqlglspfeirrrnvvmpedfpftnrlgqt  255
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllll
Query hregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtp  315
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllll
Query ttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstknty  375
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeee
Query gfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgm  435
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  ehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeee
Query pfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdf  495
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllll
Query favedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvp  555
ident                                                             
Sbjct ............................................................  576
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhh
Query dirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavvaavndalahlevvietvpitperifr  615
ident                                                             
Sbjct .............................................tgvriyrlpaypekv  591
DSSP  .............................................hllllllllllhhhh


DSSP  hhhlll
Query siqerp  621
ident       
Sbjct lealka  597
DSSP  hhhhhl


No 21: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ................leeEEEEELL..........lhhhhhhlLEEEEEEEEELLL..L
Query ................vsrTSRARDE..........lapifassAGVVRGQFSCGRV..S   32
ident                                              |              
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpNVYFEQPivkgedtgpifasadvtvEGDFYVGRQPHMPieP   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllLEEEEEEeeelllhhhhhhhlleeeEEEEEELLLLLLLllL


DSSP  LLllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllll
Query ACpmetrgavaqyewttqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgq   92
ident                                                             
Sbjct DV..........................................................   62
DSSP  LE..........................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlL........................
Query kahlhpeellvcllsralgrpvrwiedrqenflgaT........................  128
ident                                                             
Sbjct ...................................Afaymgddgkcyihsksigvhlhly   87
DSSP  ...................................Eeeeellllleeeeellllhhhhhh


DSSP  .........................................................lLL
Query .........................................................hAK  131
ident                                                             
Sbjct miapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptsealvavaamatgrpvhlrynyqqqqqYT  147
DSSP  hhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhLL


DSSP  LEEEEEEEEELLL........lLEEEEEEEEEeellllllllllhhhlHHHHHHLL.LLL
Query QQRNEMGLAFDGD........gRFLALENRSItdggaynnlpwtqlveSHVGNAVI.LGV  182
ident   |                                                      |  
Sbjct GKRSPWEMNVKFAakkdgtllaMESDWLVDHG...............pYSEFGDLLtLRG  192
DSSP  LLLLLEEEEEEEEellllleeeEEEEEEEELL...............lLLLLHHHHhHHH


DSSP  L...........llLEEEEEEEEelllllllllllllLHHHhhHHHHH.HHHHHHHHHLl
Query Y...........kvPAVSEESIAvatnkcpigayrgvGFTAgqIARET.LIDRAARQLGl  230
ident                                      |                      
Sbjct AqfigagynipnirGLGRTVATN...........hvwGSAF.rGYGAPqSMFASECLMD.  239
DSSP  HhhlllllllleeeEEEEEELLL...........lllLLLL.lLLLHHhHHHHHHHHHH.


DSSP  lhhhhhhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllee
Query spfeirrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeafrqrqaearargky  290
ident                                                             
Sbjct .................................mlaeklgmdplelryknayrpgdtnpt  266
DSSP  .................................hhhhhhlllhhhhhhhhllllllllll


DSSP  eeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeellllllllhhhhhh
Query lglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvttslassgqghettla  350
ident                                                             
Sbjct gqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestathkkgvgisigvygsgldgpdaseawa  326
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeellllllleeeeee


DSSP  hhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query qiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraasivrervkqlaghl  410
ident                                                             
Sbjct elnadgtitvhtawedhgqgadigcvgtahealrpmgvapekikftwpntattpnsgpsg  386
DSSP  eellllleeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllllllllll


DSSP  hlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhllllllllleeeeellllll
Query leaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfdatleatatydpsdl  470
ident                                                             
Sbjct gsrqqvmtgnairvacenllkacekpgggyytydelkaadkptkitgnwtasgathcdav  446
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllll


DSSP  eeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query vlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirggiaqaigqtlleev  530
ident                                                             
Sbjct tglgkpfvvymygvfmaevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgi  506
DSSP  llllllllleeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhh
Query iyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmgesamisapaavva  590
ident                                                             
Sbjct glalsedfedikkhatlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsph  566
DSSP  hhhhllllllllllllllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhh


DSSP  hhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhlll
Query avndalahlevvietvpitperifrsiqerp  621
ident                                
Sbjct aaiinaiksatgvriyrlpaypekvlealka  597
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhl


No 22: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msgpaaaaedaieihpgtpnvyfeqpivkgedtgpifasadvtvegdfyvgrqphmpiep   60
DSSP  llhhhhhllllllllllllleeeeeeeeelllhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dvafaymgddgkcyihsksigvhlhlymiapgvglepdqlvlvanpmggtfgykfsptse  120
DSSP  leeeeeellllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllhhhllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alvavaamatgrpvhlrynyqqqqqytgkrspwemnvkfaakkdgtllamesdwlvdhgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelll


DSSP  ............leeeeeeelllhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeeell
Query ............vsrtsrardelapifassagvvrgqfscgrvsacpmetrgavaqyewt   48
ident                                                             
Sbjct ysefgdlltlrgaqfigagynipnirglgrtvatnhvwgsafrgygapqsmfaseclmdm  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh
Query tqqlilwtatqmpsfvrtmvamfcaipehlievrvpdvgggfgqkahlhpeellvcllsr  108
ident                                                             
Sbjct laeklgmdplelryknayrpgdtnptgqepevfslpdmidqlrpkyqaalekaqkestat  300
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  hhllleeeellhhhhhhhlllLLLEEEEEEeeellllleeeeEEEEEEELllLLLLLLLH
Query algrpvrwiedrqenflgathAKQQRNEMGlafdgdgrflalENRSITDGgaYNNLPWTQ  168
ident                                                             
Sbjct hkkgvgisigvygsgldgpdaSEAWAELNA...........dGTITVHTA.wEDHGQGAD  348
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllleEEEEEEELL...........lLLEEEELL.lLLLLLLHH


DSSP  HHLHHHHHHLLLLLLllleeeEEEEEELLLL.........lllLLLL..LLLHHHHHHHH
Query LVESHVGNAVILGVYkvpavsEESIAVATNK.........cpiGAYR..GVGFTAGQIAR  217
ident                                                       |     
Sbjct IGCVGTAHEALRPMG..vapeKIKFTWPNTAttpnsgpsggsrQQVMtgNAIRVACENLL  406
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHL..llhhHEEELLLLLLllllllllllllHHHHhhHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHhhhhhhlllhHHHHhlllllhhhlleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query ETLIDraarqlglspFEIRrrnvvmpedfpftnrlgqthregtylqtinlleemvnpeaf  277
ident                                                             
Sbjct KACEK..........PGGG.........................................  415
DSSP  HHHLL..........LLLL.........................................


DSSP  hhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhllllllllleeeeeellllleeeeel
Query rqrqaearargkylglgvsvfnevtgtgtrtlsflgtpttthdsatvridptgkvtvtts  337
ident                                                             
Sbjct ............................................................  415
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query lassgqghettlaqiaadvlgvpasdvviqagstkntygfgayasrgavigagsigraas  397
ident                                                             
Sbjct ............................................................  415
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelleeeelleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhlllllll
Query ivrervkqlaghlleaasediviedglvhvagvpakgmpfaevvgaayfadathppgfda  457
ident                                                             
Sbjct ............................................................  415
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeelllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhh
Query tleatatydpsdlvlangghaaiveidastyatrvtdffavedcgtminpmivegqirgg  517
ident                                                             
Sbjct ............................................................  415
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllleeeeellllllllhhhlllll
Query iaqaigqtlleeviyddfgqlvtttlmdylipttldvpdirirhletpsplvpggikgmg  577
ident                                                             
Sbjct ............................................................  415
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLL.................................
Query esamisapaavvaavndalahlEVVIE.................................  604
ident                                                             
Sbjct ..............yytydelkAADKPtkitgnwtasgathcdavtglgkpfvvymygvf  461
DSSP  ..............lllhhhhhHLLLLleeeeeeellllllllllllllllllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  604
ident                                                             
Sbjct maevtvdvatgqttvdgmtlmadlgslcnqlatdgqiygglaqgiglalsedfedikkha  521
DSSP  eeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  ...........................................................e
Query ...........................................................t  605
ident                                                             
Sbjct tlvgagfpfikqipdkldivyvnhprpdgpfgasgvgelpltsphaaiinaiksatgvri  581
DSSP  lllllllllhhhlllleeeeellllllllhhhllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  elllhhhhhhhhhlll
Query vpitperifrsiqerp  621
ident                 
Sbjct yrlpaypekvlealka  597
DSSP  llllllhhhhhhhhhl