No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=47.0

DSSP  lLLHHHHHH..........LLLEEEeEEEEEELLHHHHHHHLLEEEEEEEEELLLLLLLL
Query iITIEDAIK..........NNSFYGsELKIEKGDLKKGFSEADNVVSGELYIGGQDHFYL   50
ident   |   | |           |     |   | ||    | |||             |   
Sbjct .MTPKAAMKagaialhddkPNNILR.EVHAEFGDVAAAFAEADLIREKTYTFAEVNHVHM   58
DSSP  .LLHHHHHLllllllllllLLLEEE.EEEEEELLHHHHHHLLLEEEEEEEEELLLLLLLL


DSSP  LLLEEEEEELLLLLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLl
Query ETHCTIAIPKGEEGEMELFVSTQNAMKTQSFVAKMLGVPVNRILVRVKRMGGGFGGKETr  110
ident |   | |          |   ||        ||  |     || |     |||||     
Sbjct ELNATLAEYDPVRDMLTLNTTTQVPYYVHLKVAACLQMDSARIRVIKPFLGGGFGARTE.  117
DSSP  LLLEEEEEEELLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLLLLLLLL.


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEE
Query STLVSVAVALAAYKTGHPVRCMLDRNEDMLITGGRHPFLARYKVGFMKTGTIVALEVDHY  170
ident          | | |    ||    | |      ||       | |  | | | ||     
Sbjct ALHFEIIAGLLARKAKGTVRLLQTREETFIAHRGRPWTEVKMKIGLKKDGKIAALALEAT  177
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLHHHHHHHLLLLLEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEE


DSSP  EEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH
Query SNAGNSRDLSHSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLSSNTAFRGFGGPQALFIAE  230
ident    |                |   | || |        ||     | || |        |
Sbjct QAGGAYAGYGIITILYTGALMHGLYHIPAIKHDAWRVYTNTPPCGAMRGHGTVDTRAAFE  237
DSSP  EELLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLLL.LLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHHhh
Query NWMSEVAVTCGLPAEEVRWKNMYKEG.DLTHFNQRLEGFSVPRCWDECLKSSQYYARKse  289
ident     |     |      |  ||       |   ||     || |       |    ||  
Sbjct ALLTEMGEELGIDSLKIRQINMLPQIpYVTMYAQRVMSYGVPECLEKVKAASGWEERK..  295
DSSP  HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLlEELLLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHLHHHHL..


DSSP  HHHHHhhllleEEEEEEEEEEEEELLlLHHH.....lEEEEEEEELLLLLEEEEELLLLL
Query VDKFNkencwkKRGLCIIPTKFGISFtVPFL.....nQAGALIHVYTDGSVLVSHGGTEM  344
ident             ||| |    |                |        ||      |    
Sbjct GKLPK......GRGLGIALSHFVSGT.STPKhwtgepHATVNLKLDFDGGITLLTGAADI  348
DSSP  LLLLL......LEEEEEEEEEEELLL.LLLLllllllLEEEEEEELLLLLEEEEELLLLL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEELLLEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query GQGLHTKMVQVASKALKIPISKIYISETSTNTVPNSSPTAASVSTDIYGQAVYEACQTIL  404
ident |||  |   |||   |    | |          |       |  |   | |   |     
Sbjct GQGSNTMASQVAAEVLGVRLSRIRVISADSALTPKDNGSYSSRVTFMVGNASISAAEELK  408
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLL......................LLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELL
Query KRLEPFKKKNP......................DGSWEDWVMAAYQDRVSLSTTGFYRTP  442
ident   |     |                          |    | ||  |       | |  |
Sbjct GVLVKAAAKKLdareedievidemfmvsgsqdpGLSFQEVVKAAMVDSGTITVKGTYTCP  468
DSSP  HHHHHHHHHHLlllhhheeeelleeeellllllLEEHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELLL


DSSP  L.LLLL.lLLLLL.lLLLEEEEEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHH
Query N.LGYS.fETNSG.nAFHYFTYGVACSEVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIG  499
ident            |   |   | |     |   |  ||           |||  |||    |
Sbjct TeFQGDkkIRGSAigATMGFCYAAQVVEASVDEITGKVTAHKVWVAVDVGKALNPLAVEG  528
DSSP  HhHLLLllLHHHHllLLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlLLLLLLLLLLLLLLLLHHHLLlEEEEEELLlLLLLLLH
Query QVEGAFVQGLGLFTLEELHYSpEGSLHTRGPSTYKIPAFGSIPtEFRVSLLRdCPNKKAI  559
ident |  |    | |    ||  |   |         |  |     |    |            
Sbjct QTQGGVWMGMGQALSEETVYD.NGRMVHGNILDYRVPTIVESP.DIEVIIVE.SMDPNGP  585
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLEE.LLEELLLLLLLLLLLLLLLLL.EEEEEEEL.LLLLLLH


DSSP  HHLLLLLLLLHHHHH.HHHHHHHHHHHhhhhhhllllllllLLLLLLLLHHHHHHHLLLl
Query YASKAVGEPPLFLGA.SVFFAIKDAIRaaraqhtnnntkelFRLDSPATPEKIRNACVDk  618
ident    |   |  |         |   |                   | |  |  |       
Sbjct FGAKEASEGMLAGFLpAIHEAVYEAVG.............vRATDFPLSPDRITELLDAk  632
DSSP  HHLLLLLLLLLLLHHhHHHHHHHHHHL.............lLLLEELLLHHHHHHHHHHh


DSSP  LLLLllllllllllllllll
Query FTTLcvtgapgnckpwslrv  638
ident                     
Sbjct EAAA................  636
DSSP  HHLL................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.3

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllE
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwK  300
ident                                                             
Sbjct ...................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeaD   41
DSSP  ...................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllL


DSSP  EEEEEEEEEEEEELLllhhHLEEEEEEEEL.LLLLEEEEELLLLllllhHHHHHHHHHHH
Query KRGLCIIPTKFGISFtvpfLNQAGALIHVY.TDGSVLVSHGGTEmgqglHTKMVQVASKA  359
ident                          |                                  
Sbjct LIREKTYTFAEVNHV...hMELNATLAEYDpVRDMLTLNTTTQV.....PYYVHLKVAAC   93
DSSP  EEEEEEEEELLLLLL...lLLLLEEEEEEElLLLEEEEEELLLL.....HHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLHHHEELlLEELlllllLLLLLlLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllllh
Query LKIPISKIYIsETSTntvpnSSPTAaSVSTDiyGQAVYEACQTILKRLepfkkknpdgsw  419
ident |      |                     |         |     |              
Sbjct LQMDSARIRV.IKPF.....LGGGF.GARTE.aLHFEIIAGLLARKAK............  133
DSSP  HLLLHHHEEE.ELLL.....LLLLL.LLLLL.lLHHHHHHHHHHHHHL............


DSSP  hhhhhhhhhllllLEEEEEEELLllllllllllllllleEEEEEEEEEEEEELlLLLEEE
Query edwvmaayqdrvsLSTTGFYRTPnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEVEIDClTGDHKN  479
ident                                                        |    
Sbjct .............GTVRLLQTRE........etfiahrgRPWTEVKMKIGLKK.DGKIAA  171
DSSP  .............LEEEEELLHH........hhhhhlllLLEEEEEEEEEELL.LLLEEE


DSSP  EEEEEEEELLLLLLhhHHHHHHHHhHHHHHHHHHLlllllllllllllllllllllllhh
Query LRTDIVMDVGSSLNpaIDIGQVEGaFVQGLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipafg  539
ident |        |        |                                         
Sbjct LALEATQAGGAYAG..YGIITILY.TGALMHGLYH.........................  203
DSSP  EEEEEEEELLLLLL..LHHHHHHH.HHHLLLLLLL.........................


DSSP  hllLEEEEEELlLLLLlllhhHLLLLL.LLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHH.........
Query sipTEFRVSLLrDCPNkkaiyASKAVG.EPPLFLG.ASVFFAIKDAIRAAR.........  588
ident                                     |                       
Sbjct ipaIKHDAWRV.YTNT.....PPCGAMrGHGTVDTrAAFEALLTEMGEELGidslkirqi  257
DSSP  lllEEEEEEEE.LLLL.....LLLLLLlLLLLHHHhHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhh


DSSP  ...................................hhhlllllllLLLLLL.........
Query ...................................aqhtnnntkeLFRLDS.........  604
ident                                                             
Sbjct nmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrGLGIALshfvsgtst  317
DSSP  llllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleEEEEEEeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  604
ident                                                             
Sbjct pkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisad  377
DSSP  llllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  604
ident                                                             
Sbjct saltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsg  437
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  604
ident                                                             
Sbjct sqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvvea  497
DSSP  llllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  604
ident                                                             
Sbjct svdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgn  557
DSSP  eelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellll


DSSP  .............................................lllhhhhhhhlllll
Query .............................................patpekirnacvdkf  619
ident                                                             
Sbjct ildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratd  617
DSSP  llllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllle


DSSP  lllllllllllllllllll
Query ttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                    
Sbjct fplspdritelldakeaaa  636
DSSP  elllhhhhhhhhhhhhhll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ..................................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhh
Query ..................................iitiedaiknnsfygselkiekgdlk   26
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  hhhhhlleeeeeeeeelllllllllllEEEEEELLLLlLEEEEELLL.....LHHHHHHH
Query kgfseadnvvsgelyiggqdhfylethCTIAIPKGEEgEMELFVSTQ.....NAMKTQSF   81
ident                                          |                  
Sbjct grglgialshfvsgtstpkhwtgephaTVNLKLDFDG.GITLLTGAAdigqgSNTMASQV  359
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllleEEEEEELLLL.LEEEEELLLlllllHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELL......LLLLL.LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL........
Query VAKMLGVPVNRILVRVKR......MGGGF.GGKETRSTLVSVAVALAAYKTG........  126
ident  |  |||   || |            |             |   |               
Sbjct AAEVLGVRLSRIRVISADsaltpkDNGSYsSRVTFMVGNASISAAEELKGVLvkaaakkl  419
DSSP  HHHHHLLLHHHEEEEELLllllllLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhl


DSSP  .......................................LLEEEellhhhhhhhllllll
Query .......................................HPVRCmldrnedmlitggrhp  147
ident                                          |                  
Sbjct dareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtITVKG................  463
DSSP  lllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhlllllEEEEE................


DSSP  eeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeee
Query flarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlc  207
ident                                                             
Sbjct ............................................................  463
DSSP  ............................................................


DSSP  elllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllll
Query ktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrleg  267
ident                                                             
Sbjct ............................................................  463
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeee
Query fsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciiptkfgisftvpflnqagali  327
ident                                                             
Sbjct ............................................................  463
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheellleellllllllllllll
Query hvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyisetstntvpnssptaasv  387
ident                                                             
Sbjct ............................................................  463
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllleeeeeeelllllll
Query stdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgys  447
ident                                                             
Sbjct ............................................................  463
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhh
Query fetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvq  507
ident                                                             
Sbjct ..................tytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgk  505
DSSP  ..................eelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeellllll


DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllll
Query glglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavge  567
ident                                                             
Sbjct vtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvpt  565
DSSP  eeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllll


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhlllllllllllll
Query pplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtga  627
ident                                                             
Sbjct ivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdri  625
DSSP  llllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhh


DSSP  lllllllllll
Query pgnckpwslrv  638
ident            
Sbjct telldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhhhhll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.6

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ...................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaead   41
DSSP  ...................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhlll


DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHhLEEEEEEEELlllLEEEEELL.llllLLHHHHHHHHHHHh
Query krglciiptkfgisfTVPFlNQAGALIHVYtdgSVLVSHGG.temgQGLHTKMVQVASKa  359
ident                     |   |                        | |        
Sbjct lirektytfaevnhvHMEL.NATLAEYDPV...RDMLTLNTttqvpYYVHLKVAACLQM.   96
DSSP  eeeeeeeeellllllLLLL.LEEEEEEELL...LLEEEEEEllllhHHHHHHHHHHHLL.


DSSP  hlllhhhEELLleellllllllllLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllh
Query lkipiskIYISetstntvpnssptAASVStDIYGQAVYEACQTIlkrlepfkkknpdgsw  419
ident          |                         |   |                    
Sbjct .....dsARIR.vikpflgggfgaRTEAL.HFEIIAGLLARKAK................  133
DSSP  .....lhHHEE.eellllllllllLLLLL.HHHHHHHHHHHHHL................


DSSP  hhhhhhhhhllllleEEEEEELLLL...................................
Query edwvmaayqdrvslsTTGFYRTPNL...................................  444
ident                 |                                           
Sbjct ...............GTVRLLQTREetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatq  178
DSSP  ...............LEEEEELLHHhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct aggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafea  238
DSSP  elllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct lltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgkl  298
DSSP  hhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct pkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasq  358
DSSP  llleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct vaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakk  418
DSSP  hhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................llllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeee
Query ........................gysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknl  480
ident                                                             
Sbjct ldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkir  478
DSSP  llllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllh


DSSP  eeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhh
Query rtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
ident                                                             
Sbjct gsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgm  538
DSSP  hhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllll
Query iptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkelf  600
ident                                                             
Sbjct gqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlag  598
DSSP  hhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllll


DSSP  lllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query rldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                       
Sbjct flpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.2

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct .........mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfa   51
DSSP  .........llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeel


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct evnhvhmelnatlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflggg  111
DSSP  lllllllllleeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllll


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct fgartealhfeiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaa  171
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleee


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct laleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvd  231
DSSP  eeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhh


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct traafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgw  291
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhHHLE...........eEEEEEELL....LLLEEEEEllllll
Query krglciiptkfgisftvpFLNQ...........aGALIHVYT....DGSVLVSHggtemg  345
ident                                    |              |         
Sbjct eerkgklpkgrglgialsHFVSgtstpkhwtgepHATVNLKLdfdgGITLLTGA....ad  347
DSSP  hhhllllllleeeeeeeeEEELllllllllllllLEEEEEEEllllLEEEEELL....ll


DSSP  LLHHhhHHHHHHHHHLL......lhhHEELLleellllllllllllllHHHHHHHHHHHH
Query QGLHtkMVQVASKALKI......pisKIYISetstntvpnssptaasvSTDIYGQAVYEA  399
ident  |        ||                                            |  |
Sbjct IGQG..SNTMASQVAAEvlgvrlsriRVISA......dsaltpkdngsYSSRVTFMVGNA  399
DSSP  LLLL..HHHHHHHHHHHhhlllhhheEEEEL......lllllllllllLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHH............................hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlll
Query CQTILKR............................lepfkkknpdgswedwvmaayqdrv  431
ident                                                             
Sbjct SISAAEElkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgti  459
DSSP  HHHHHHHhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllle


DSSP  LLEEEEE..................eELLLLllllllllllllleeeeeeeeeeeeeell
Query SLSTTGF..................yRTPNLgysfetnsgnafhyftygvacseveidcl  473
ident     |                                                       
Sbjct TVKGTYTcptefqgdkkirgsaigatMGFCY.............................  490
DSSP  EEEEEELllhhhllllllhhhhllllLLEEE.............................


DSSP  llleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllll
Query tgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpsty  533
ident                                                             
Sbjct ...................aaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtq  531
DSSP  ...................eeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhh


DSSP  llllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtn  593
ident                                                             
Sbjct ggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakea  591
DSSP  hhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhllll


DSSP  llllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query nntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                              
Sbjct segmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 6: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.1

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct .............................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefg   31
DSSP  .............................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeel


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllLLLLhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlEGFSvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct dvaaafaeadlirektytfaevnhvHMEL...............................   60
DSSP  lhhhhhhllleeeeeeeeellllllLLLL...............................


DSSP  eeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhh
Query krglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskal  360
ident                                                             
Sbjct ............................................................   60
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query kipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswe  420
ident                                                             
Sbjct ............................................................   60
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeEEEEEEEEEEeellllleeeE
Query dwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyfTYGVACSEVEidcltgdhknL  480
ident                                            |                
Sbjct .......................................NATLAEYDPV.........rD   72
DSSP  .......................................LEEEEEEELL.........lL


DSSP  EEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllllllllllllllllhhh
Query RTDIVMDVgsslnpaiDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykipafgs  540
ident                     |       |                               
Sbjct MLTLNTTT.......qVPYYVHLKVAACLQ.............................m   96
DSSP  EEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.............................l


DSSP  LLLEEEEEELLLLLLLllhhHLLL.LLLLLHH.HHHHHHHH...................
Query IPTEFRVSLLRDCPNKkaiyASKA.VGEPPLF.LGASVFFA...................  579
ident      ||                                                     
Sbjct DSARIRVIKPFLGGGF....GARTeALHFEIIaGLLARKAKgtvrllqtreetfiahrgr  152
DSSP  LHHHEEEELLLLLLLL....LLLLlLLHHHHHhHHHHHHHLleeeeellhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct pwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdaw  212
DSSP  leeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct rvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqr  272
DSSP  eelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct vmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlk  332
DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct ldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrv  392
DSSP  ellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct tfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaa  452
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct mvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvw  512
DSSP  hllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  579
ident                                                             
Sbjct vavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdi  572
DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleelllllllllllllllllee


DSSP  .....hhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllll
Query .....ikdairaaraqhtnnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpw  634
ident                                                             
Sbjct eviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldak  632
DSSP  eeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhh


DSSP  llll
Query slrv  638
ident     
Sbjct eaaa  636
DSSP  hhll


No 7: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.4

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ....lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleee
Query ....iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethcti   56
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  eeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhh
Query aipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsv  116
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  hhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeell
Query avalaayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagns  176
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  lllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query rdlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsev  236
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhllLLLLLLllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query avtcglpaeevrwknmyKEGDLThfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnke  296
ident                                                             
Sbjct grglgialshfvsgtstPKHWTG.....................................  323
DSSP  leeeeeeeeeeelllllLLLLLL.....................................


DSSP  llleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh
Query ncwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqva  356
ident                                                             
Sbjct ............................................................  323
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query skalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpd  416
ident                                                             
Sbjct ............................................................  323
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleEEEEEEEEEEeeelllll
Query gswedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyFTYGVACSEVeidcltgd  476
ident                                                             
Sbjct ........................................epHATVNLKLDF........  335
DSSP  ........................................llLEEEEEEELL........


DSSP  eeeEEEEEEEELLlLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllllllll
Query hknLRTDIVMDVGsSLNPaIDIGQVEGAFVQGLGlftleelhyspegslhtrgpstykip  536
ident                                 ||                          
Sbjct ..dGGITLLTGAA.DIGQ.GSNTMASQVAAEVLG..........................  365
DSSP  ..lLLEEEEELLL.LLLL.LHHHHHHHHHHHHHL..........................


DSSP  lhhhLLLEEEEEELLL......lLLLLLhhhllLLLLLLHHHHHHHH.............
Query afgsIPTEFRVSLLRD......cPNKKAiyaskAVGEPPLFLGASVF.............  577
ident          ||                       ||                        
Sbjct ...vRLSRIRVISADSaltpkdnGSYSS.rvtfMVGNASISAAEELKgvlvkaaakklda  421
DSSP  ...lLHHHEEEEELLLlllllllLLLLL.lhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  577
ident                                                             
Sbjct reedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsa  481
DSSP  lhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  577
ident                                                             
Sbjct igatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqa  541
DSSP  lllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..................................hhhhhhhhhhhhhhllllllllllll
Query ..................................faikdairaaraqhtnnntkelfrld  603
ident                                                             
Sbjct lseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflp  601
DSSP  hllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhh


DSSP  llllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query spatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                    
Sbjct aiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 8: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.3

DSSP  .......................................................lllhh
Query .......................................................iitie    5
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  hhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeellllll
Query daiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipkgeege   65
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query melfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvavalaaykt  125
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  llleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllhhhhhh
Query ghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdlshsime  185
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhh
Query ralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtcglpae  245
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  hhhhhhlllllllllllllllLLLHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeee
Query evrwknmykegdlthfnqrleGFSVprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglc  305
ident                                                             
Sbjct grglgialshfvsgtstpkhwTGEP...................................  325
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllLLLL...................................


DSSP  eeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhh
Query iiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipis  365
ident                                                             
Sbjct ............................................................  325
DSSP  ............................................................


DSSP  heellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query kiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvma  425
ident                                                             
Sbjct ............................................................  325
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeEEEEEEEEEeellllLEEEeEEEEE
Query ayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftYGVACSEVEidcltgDHKNlRTDIV  485
ident                                                   |         
Sbjct ...................................HATVNLKLD.....fDGGI.TLLTG  344
DSSP  ...................................LEEEEEEEL.....lLLLE.EEEEL


DSSP  EellllllhHHHHhhHHHHHHHHHHHHHLllllllllllllllllllllllLHHHLLleE
Query MdvgsslnpAIDIgqVEGAFVQGLGLFTLeelhyspegslhtrgpstykipAFGSIPteF  545
ident                      |                                 |    
Sbjct A......adIGQG..SNTMASQVAAEVLG.....................vRLSRIR..V  373
DSSP  L......llLLLL..HHHHHHHHHHHHHL.....................lLHHHEE..E


DSSP  EEEelllllllllhhhLLLLLLL.LHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllLLLLl
Query RVSllrdcpnkkaiyaSKAVGEP.PLFLGA.SVFFAIKDAIRAARAQHTNnntkeLFRLd  603
ident                                           ||                
Sbjct ISA..dsaltpkdngsYSSRVTFmVGNASIsAAEELKGVLVKAAAKKLDA...reEDIE.  427
DSSP  EEL..lllllllllllLLLLHHHhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...lhHHEE.


DSSP  lllLHHH.....................................................
Query spaTPEK.....................................................  610
ident                                                             
Sbjct .viDEMFmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatm  486
DSSP  .eeLLEEeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  610
ident                                                             
Sbjct gfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqtqggvwmgmgqalseet  546
DSSP  leeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  610
ident                                                             
Sbjct vydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgakeasegmlagflpaihea  606
DSSP  leelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlllllllllllhhhhhhhh


DSSP  ..hhhhllllllllllllllllllllllll
Query ..irnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                               
Sbjct vyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 9: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.8

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ...................................................mtpkaamka    9
DSSP  ...................................................llhhhhhll


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct gaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydp   69
DSSP  lllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeel


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllLLHHHH...............
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgFGGPQA...............  225
ident                                         ||  |               
Sbjct vrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflGGGFGArtealhfeiiaglla  129
DSSP  llleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeellllLLLLLLlllllhhhhhhhhhh


DSSP  ..............hhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhh
Query ..............lfiaenwmsevavtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvp  271
ident                                                             
Sbjct rkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygii  189
DSSP  hhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhh


DSSP  hhhhhhhhhlLHHH.............................hhhHHHHHHHH......
Query rcwdeclkssQYYA.............................rksEVDKFNKE......  296
ident             |                                               
Sbjct tilytgalmhGLYHipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraaFEALLTEMgeelgi  249
DSSP  hhhhhhhlllLLLLllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhHHHHHHHHhhhhll


DSSP  ...................................................lLLEEEEEE
Query ...................................................nCWKKRGLC  305
ident                                                           | 
Sbjct dslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpkgRGLGIALS  309
DSSP  lhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllEEEEEEEE


DSSP  EEEEEeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhh
Query IIPTKfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipis  365
ident                                                             
Sbjct HFVSG.......................................................  314
DSSP  EEELL.......................................................


DSSP  heellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query kiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvma  425
ident                                                             
Sbjct ......................tstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgs  352
DSSP  ......................lllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllh


DSSP  hhhllllleeeeeeellllllllllllllllLEEE.........................
Query ayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafHYFT.........................  460
ident                                                             
Sbjct ntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkDNGSyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlv  412
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllLLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  460
ident                                                             
Sbjct kaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefq  472
DSSP  hhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhl


DSSP  .............EEEEEEEEEEEL.........LLLLEEEeEEEEEeellllllhhhhH
Query .............YGVACSEVEIDC.........LTGDHKNlRTDIVmdvgsslnpaidI  498
ident               |                             |               
Sbjct gdkkirgsaigatMGFCYAAQVVEAsvdeitgkvTAHKVWV.AVDVG............K  519
DSSP  lllllhhhhllllLLEEEEEEEEEEeelllllleEEEEEEE.EEELL............L


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHL............lllllllllllllllllllllllhhHLLLeEE
Query GQVEGAFVQGLGLFTL............eelhyspegslhtrgpstykipafgSIPTeFR  546
ident      |                                                      
Sbjct ALNPLAVEGQTQGGVWmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdiEVII.VE  578
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeEEEE.EL


DSSP  EEELLlllllllhhhllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLLLlllll
Query VSLLRdcpnkkaiyaskavgepplfLGASVFFAIKDAIRAARAQHTNNNTkELFRldspa  606
ident                                     ||  |            |      
Sbjct SMDPN.............gpfgakeASEGMLAGFLPAIHEAVYEAVGVRA.TDFP.....  619
DSSP  LLLLL.............lhhhlllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLL.LEEL.....


DSSP  lhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query tpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                 
Sbjct ...............lspdritelldakeaaa  636
DSSP  ...............llhhhhhhhhhhhhhll


No 10: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct ..........................mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdva   34
DSSP  ..........................llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhh


DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHHLE..eEEEEEEL.....llLLEEEEellllllllhhhHHH
Query krglciiptkfgisfTVPFLNQ..aGALIHVY.....tdGSVLVShggtemgqglhtKMV  353
ident                                                             
Sbjct aafaeadlirektytFAEVNHVhmeLNATLAEydpvrdmLTLNTT...........tQVP   83
DSSP  hhhhllleeeeeeeeELLLLLLlllLLEEEEEeelllleEEEEEL...........lLLH


DSSP  HHHHHHHL......llhhHEELLleellllllllllllllHHHHHHHhHHHHHHHHHHHh
Query QVASKALK......ipisKIYISetstntvpnssptaasvSTDIYGQaVYEACQTILKRl  407
ident                                                             
Sbjct YYVHLKVAaclqmdsariRVIKP.............flggGFGARTE.ALHFEIIAGLL.  128
DSSP  HHHHHHHHhhhlllhhheEEELL.............llllLLLLLLL.LLHHHHHHHHH.


DSSP  hhhhhhlllllhhhhHHHHHhlllLLEEE.......eEEELLLL................
Query epfkkknpdgswedwVMAAYqdrvSLSTT.......gFYRTPNL................  444
ident                  |                     |                    
Sbjct ..............aRKAKG....TVRLLqtreetfiAHRGRPWtevkmkiglkkdgkia  170
DSSP  ..............hHHHLL....EEEEEllhhhhhhHLLLLLEeeeeeeeeelllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct alaleatqaggayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtv  230
DSSP  eeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct dtraafealltemgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasg  290
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct weerkgklpkgrglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigq  350
DSSP  hhhhllllllleeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  444
ident                                                             
Sbjct gsntmasqvaaevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgv  410
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ................................llllllllllllleeeeeeeeeeeeeel
Query ................................gysfetnsgnafhyftygvacseveidc  472
ident                                                             
Sbjct lvkaaakkldareedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcpte  470
DSSP  hhhhhhhhllllhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhh


DSSP  lllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllll
Query ltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpst  532
ident                                                             
Sbjct fqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnplavegqt  530
DSSP  hllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhh


DSSP  lllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query ykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqht  592
ident                                                             
Sbjct qggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpngpfgake  590
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllllhhhlll


DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query nnntkelfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                               
Sbjct asegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 11: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct grglgialshfvsgtstpkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqva  360
DSSP  leeeeeeeeeeelllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aevlgvrlsrirvisadsaltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkld  420
DSSP  hhhhlllhhheeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeell
Query ................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyigg   44
ident                                                             
Sbjct areedievidemfmvsgsqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgs  480
DSSP  llhhheeeelleeeellllllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhh


DSSP  lllllllllEEEEEELL.........LLLLEEEEELL.......lLHHHHHHHHHHHHL.
Query qdhfylethCTIAIPKG.........EEGEMELFVST.......qNAMKTQSFVAKMLG.   87
ident                                   |              ||  |    | 
Sbjct aigatmgfcYAAQVVEAsvdeitgkvTAHKVWVAVDVgkalnplaVEGQTQGGVWMGMGq  540
DSSP  hlllllleeEEEEEEEEeelllllleEEEEEEEEEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  ..........................llhhHEEEEELlLLLL....LLLLllLLHHHHHH
Query ..........................vpvnRILVRVKrMGGG....FGGKetRSTLVSVA  117
ident                                | |            || |         |
Sbjct alseetvydngrmvhgnildyrvptivespDIEVIIV.ESMDpngpFGAK..EASEGMLA  597
DSSP  hhllllleelleelllllllllllllllllEEEEEEE.LLLLlllhHHLL..LLLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelll
Query VALAAYKTGhpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsr  177
ident   | |                                                       
Sbjct GFLPAIHEA...................................................  606
DSSP  LHHHHHHHH...................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query dlshsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmseva  237
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhl
Query vtcglpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnken  297
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeeeeeeeeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhh
Query cwkkrglciiptkfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvas  357
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllhhheellleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query kalkipiskiyisetstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdg  417
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllle
Query swedwvmaayqdrvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdh  477
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query knlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipa  537
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query fgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntk  597
ident                                                             
Sbjct ............................................................  606
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query elfrldspatpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                          
Sbjct ...........vyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  ...........hhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 12: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mtpkaamkagaialhddkpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmel   60
DSSP  llhhhhhlllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct natlaeydpvrdmltlntttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealh  120
DSSP  leeeeeeelllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct feiiagllarkakgtvrllqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqag  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gayagygiitilytgalmhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafeall  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .............................lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhh
Query .............................iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfse   31
ident                                                             
Sbjct temgeelgidslkirqinmlpqipyvtmyaqrvmsygvpeclekvkaasgweerkgklpk  300
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhllllllleellllleellllhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  lleeeeeeeeelllllLLLLLLeeeeeelllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhh
Query adnvvsgelyiggqdhFYLETHctiaipkgeegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvn   91
ident                                                             
Sbjct grglgialshfvsgtsTPKHWT......................................  322
DSSP  leeeeeeeeeeellllLLLLLL......................................


DSSP  heeeeellllLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhllLLLLEEEE
Query rilvrvkrmgGGFGgketrstlvsvavalaayktghpvrcmldrnedmlitgGRHPFLAR  151
ident           |                                                 
Sbjct ..........GEPH......................................ATVNLKLD  334
DSSP  ..........LLLL......................................EEEEEEEL


DSSP  eeeeellllleeeeeeEEEEEEELLL...LLHHHHHHHHHHLLLllllllleeeEEEEEE
Query ykvgfmktgtivalevDHYSNAGNSR...DLSHSIMERALFHMDncykipnirgTGRLCK  208
ident                       |               |                 |   
Sbjct .............fdgGITLLTGAADigqGSNTMASQVAAEVLG......vrlsRIRVIS  375
DSSP  .............lllLEEEEELLLLlllLHHHHHHHHHHHHHL......llhhHEEEEE


DSSP  LLLL............llllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH.......HH
Query TNLS............sntafrGFGGPQALFIAENWMSEVAVTCGLPAEEV.......RW  249
ident                             |           |       |           
Sbjct ADSAltpkdngsyssrvtfmvgNASISAAEELKGVLVKAAAKKLDAREEDIevidemfMV  435
DSSP  LLLLllllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHEeeelleeEE


DSSP  HHllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeee
Query KNmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwkkrglciipt  309
ident                                                             
Sbjct SG..........................................................  437
DSSP  LL..........................................................


DSSP  eeeellllhhhleeeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheel
Query kfgisftvpflnqagalihvytdgsvlvshggtemgqglhtkmvqvaskalkipiskiyi  369
ident                                                             
Sbjct ............................................................  437
DSSP  ............................................................


DSSP  lleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhl
Query setstntvpnssptaasvstdiygqavyeacqtilkrlepfkkknpdgswedwvmaayqd  429
ident                                                             
Sbjct ............................................................  437
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeell
Query rvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacseveidcltgdhknlrtdivmdvg  489
ident                                                             
Sbjct ............................................................  437
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllhhhllleeeeee
Query sslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtrgpstykipafgsiptefrvsl  549
ident                                                             
Sbjct ............................................................  437
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLLL.....
Query lrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaaraqhtnnntkeLFRLDS.....  604
ident                                                             
Sbjct .................................sqdpglsfqevvkaamVDSGTItvkgt  464
DSSP  .................................llllleehhhhhhhhhLLLLLEeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  604
ident                                                             
Sbjct ytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyaaqvveasvdeitgkvtahkvwvavdvgkalnpl  524
DSSP  elllhhhllllllhhhhlllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeellllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  604
ident                                                             
Sbjct avegqtqggvwmgmgqalseetvydngrmvhgnildyrvptivespdieviivesmdpng  584
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleellllllllllllllllleeeeeeelllllll


DSSP  ..................lllhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
Query ..................patpekirnacvdkfttlcvtgapgnckpwslrv  638
ident                                                     
Sbjct pfgakeasegmlagflpaiheavyeavgvratdfplspdritelldakeaaa  636
DSSP  hhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleelllhhhhhhhhhhhhhll


No 13: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  lllhhhhhhllleeeeeeeeeellhhhhhhhlleeeeeeeeellllllllllleeeeeel
Query iitiedaiknnsfygselkiekgdlkkgfseadnvvsgelyiggqdhfylethctiaipk   60
ident                                                             
Sbjct ...........................................mtpkaamkagaialhdd   17
DSSP  ...........................................llhhhhhllllllllll


DSSP  llllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeellllllllllllllhhhhhhhhh
Query geegemelfvstqnamktqsfvakmlgvpvnrilvrvkrmgggfggketrstlvsvaval  120
ident                                                             
Sbjct kpnnilrevhaefgdvaaafaeadlirektytfaevnhvhmelnatlaeydpvrdmltln   77
DSSP  lllleeeeeeeeellhhhhhhllleeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllleeeee


DSSP  hhhhhllleeeellhhhhhhhlllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelllllh
Query aayktghpvrcmldrnedmlitggrhpflarykvgfmktgtivalevdhysnagnsrdls  180
ident                                                             
Sbjct tttqvpyyvhlkvaaclqmdsarirvikpflgggfgartealhfeiiagllarkakgtvr  137
DSSP  ellllhhhhhhhhhhhhlllhhheeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleee


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query hsimeralfhmdncykipnirgtgrlcktnlssntafrgfggpqalfiaenwmsevavtc  240
ident                                                             
Sbjct llqtreetfiahrgrpwtevkmkiglkkdgkiaalaleatqaggayagygiitilytgal  197
DSSP  eellhhhhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhl


DSSP  lllhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllle
Query glpaeevrwknmykegdlthfnqrlegfsvprcwdeclkssqyyarksevdkfnkencwk  300
ident                                                             
Sbjct mhglyhipaikhdawrvytntppcgamrghgtvdtraafealltemgeelgidslkirqi  257
DSSP  llllllllleeeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  eeeeeeeeeeeeellLLHHHL.......................................
Query krglciiptkfgisfTVPFLN.......................................  321
ident                                                             
Sbjct nmlpqipyvtmyaqrVMSYGVpeclekvkaasgweerkgklpkgrglgialshfvsgtst  317
DSSP  llllllleellllleELLLLHhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  321
ident                                                             
Sbjct pkhwtgephatvnlkldfdggitlltgaadigqgsntmasqvaaevlgvrlsrirvisad  377
DSSP  llllllllleeeeeeellllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  321
ident                                                             
Sbjct saltpkdngsyssrvtfmvgnasisaaeelkgvlvkaaakkldareedievidemfmvsg  437
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeell


DSSP  ....................................................eEEEEEEE
Query ....................................................qAGALIHV  329
ident                                                      |      
Sbjct sqdpglsfqevvkaamvdsgtitvkgtytcptefqgdkkirgsaigatmgfcyAAQVVEA  497
DSSP  llllleehhhhhhhhhllllleeeeeeelllhhhllllllhhhhlllllleeeEEEEEEE


DSSP  LL.....LLLE.EEEELL......lLLLL..LHHHHHHHHHHHHHL..............
Query YT.....DGSV.LVSHGG......tEMGQ..GLHTKMVQVASKALK..............  361
ident              |                             ||               
Sbjct SVdeitgKVTAhKVWVAVdvgkalnPLAVegQTQGGVWMGMGQALSeetvydngrmvhgn  557
DSSP  EElllllLEEEeEEEEEEellllllHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHLlllleelleellll


DSSP  ....LLHH..HEELL..leelllllllllllLLLHHHhHHHHHHHHHHHHHH.....HHH
Query ....IPIS..KIYIS..etstntvpnssptaASVSTDiYGQAVYEACQTILK.....RLE  408
ident                                   |          |           |  
Sbjct ildyRVPTivESPDIeviivesmdpngpfgaKEASEG.MLAGFLPAIHEAVYeavgvRAT  616
DSSP  llllLLLLllLLLEEeeeeelllllllhhhlLLLLLL.LLLLHHHHHHHHHHhhhllLLL


DSSP  HhhhhlllllHHHHHHHHHHLLllleeeeeeellllllllllllllllleeeeeeeeeee
Query PfkkknpdgsWEDWVMAAYQDRvslsttgfyrtpnlgysfetnsgnafhyftygvacsev  468
ident             |                                               
Sbjct D......fplSPDRITELLDAK......................................  632
DSSP  E......ellLHHHHHHHHHHH......................................


DSSP  eeellllleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll
Query eidcltgdhknlrtdivmdvgsslnpaidigqvegafvqglglftleelhyspegslhtr  528
ident                                                             
Sbjct ............................................................  632
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhllleeeeeelllllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gpstykipafgsiptefrvsllrdcpnkkaiyaskavgepplflgasvffaikdairaar  588
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