No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=13.4

DSSP  ......................LLLLEEEEEELllLLLL.........LLLLEEEEEEL.
Query ......................TPRGFVVHTAPvgLADD.........GRDDFTVLAST.   28
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Sbjct kprardlglpftgvtgpynaitDVDGVGVGFQT..IIENeprpgrkrpARSGVTAILPHm   58
DSSP  lllhhhhlllllllllllllhhHLLLLEEEEEE..EELLlllllllllLEEEEEEEELLl


DSSP  .....LLLEEEEEELLLllLLHHhhHHHHHLL.LLLLL.EEEEEEEElllllhhhhhhhH
Query .....APATVSAVFTRSrfAGPSvvLCREAVA.DGQAR.GVVVLARNanvatglegeenA   81
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Sbjct qsetpVPVYAGVHRFNG..NGEM..TGTHWIEdGGYFLgPVVITNTH...........gI  103
DSSP  lllllLLEEEEEEEEEE..LLLL..LLHHHHHhHLEELlLEEEEEHH...........hH


DSSP  HHHHHHHHHHHL............lLHHHeEEEEEEEL....lLLLLHhhHHHHHLL.LL
Query REVREAVARALG............lPEGEmLIASTGVI....gRQYPMesIREHLKT.LE  124
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Sbjct GMAHHATVRWMVdryastyqtddflWIMP.VVAETYDGalndiNGFPV..TEADVRKaLD  160
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhlhhhhllllllLLLL.EEEEELLLllllhHHLLL..LHHHHHHhHH


DSSP  LLlLLLLHHHhhHHLL..LLLL....lLEEEEEEEL....LEEEEEEE.ELLL.......
Query WPaGEGGFDRaaRAIM..TTDT....rPKEVRVSVG....GATLVGIA.KGVG.......  166
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Sbjct NV.ASGPVQEgnCGGGtgMITYgfkggTGTASRVVEfggrSFTIGALVqANHGqrdwlti  219
DSSP  LL.LLLLLLLllLHHHllLEELleeleEEEEEEEEEelleEEEEEEEEeELLLlhhhlll


DSSP  ...........lllllllLLEEEEEEEEELLHHHHHHHHHhHHHHLHHHLL.llLLLLlL
Query ...........mlepdmaTLLTFFATDARLDPAEQDRLFRrVMDRTFNAVS.idTDTStS  214
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Sbjct agvpvgqhmrdgtpqsqlSIIVVLATDLPLMPHQLKRLAR.RASIGIGRNGtpgGNNS.G  277
DSSP  llllhhhhlllllhhhhlLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHH.LHHHHHHLLLlllLLLL.E


DSSP  LEEEEEEEEE................eeelLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......
Query DTAVLFANGL................agevDAGEFEEALHTAALALVKDIASD.......  251
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Sbjct DIFIAFSTANqrpmqhrsapfldvemvndePLDTVYLAAVDSVEEAVVNAMIAaedmggt  337
DSSP  EEEEEEELLLllllhhhllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllleell


DSSP  ......llLLLLeeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhl
Query ......geGAAKlievqvtgarddaqakrvgktvvnsplvktavhgcdpnwgrvamaigk  305
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Sbjct pfdrllvqAIDH................................................  349
DSSP  llllleelLLLH................................................


DSSP  lllllllllllleeeelleeeelllhhhhhhhhhhlllleeeeeeellllleeeeeeeel
Query csddtdidqervtirfgevevyppddalraavaehlrgdevvigidlaiadgaftvygcd  365
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Sbjct ............................................................  349
DSSP  ............................................................


DSSP  LLHH...hhhhhhl
Query LTEG...yvrlnse  376
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Sbjct ERLRavlrqygrla  363
DSSP  HHHHhhhhhlllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct kprardlglpftgvtgpynaitdvdgvgvgfqtiieneprpgrkrparsgvtailphmqs   60
DSSP  lllhhhhlllllllllllllhhhlllleeeeeeeelllllllllllleeeeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct etpvpvyagvhrfngngemtgthwiedggyflgpvvitnthgigmahhatvrwmvdryas  120
DSSP  llllleeeeeeeeeellllllhhhhhhhleellleeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh


DSSP  .......................................................LLLL.
Query .......................................................TPRG.    4
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Sbjct tyqtddflwimpvvaetydgalndingfpvteadvrkaldnvasgpvqegncgggTGMIt  180
DSSP  hhlllllllllleeeeelllllllhhhllllhhhhhhhhhllllllllllllhhhLLLEe


DSSP  .....EEEEEELLL.llLLLLLLEEEEEELLlleeeeeelllllllhhhhhhhhhlllll
Query .....FVVHTAPVG.laDDGRDDFTVLASTApatvsavftrsrfagpsvvlcreavadgq   58
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Sbjct ygfkgGTGTASRVVefgGRSFTIGALVQANH...gqrdwltiagvpvgqhmrdgtpqsql  237
DSSP  lleelEEEEEEEEEeelLEEEEEEEEEEELL...llhhhlllllllhhhhlllllhhhhl


DSSP  LLEEEEEEEELLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHL.......llhhHEEEEEEEE.....
Query ARGVVVLARNANvatgleGEENAREVREAVARALG.......lpegEMLIASTGV.....  106
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Sbjct SIIVVLATDLPL......MPHQLKRLARRASIGIGrngtpggnnsgDIFIAFSTAnqrpm  291
DSSP  LEEEEEEELLLL......LHHHHHHHHHLHHHHHHlllllllllleEEEEEEELLlllll


DSSP  .........LLLL..lLHHHHHHHHLL..LLLL...LLLLlhhhhhhhlllllllleeee
Query .........IGRQ..yPMESIREHLKT..LEWP...AGEGgfdraaraimttdtrpkevr  150
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Sbjct qhrsapfldVEMVndePLDTVYLAAVDsvEEAVvnaMIAA....................  331
DSSP  hhhllllllLLLLllhHHHHHHHHHHHhhHHHHhhhHHHL....................


DSSP  eeelleeeeeeeelllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllll
Query vsvggatlvgiakgvgmlepdmatlltffatdarldpaeqdrlfrrvmdrtfnavsidtd  210
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Sbjct ............................................................  331
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeeellhh
Query tstsdtavlfanglagevdagefeealhtaalalvkdiasdgegaaklievqvtgardda  270
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Sbjct ............................................................  331
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllllllllllllleeeelleeeelll
Query qakrvgktvvnsplvktavhgcdpnwgrvamaigkcsddtdidqervtirfgevevyppd  330
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Sbjct ............................................................  331
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeeeeellllleeeeeeeelllhhhhhhhhl
Query dalraavaehlrgdevvigidlaiadgaftvygcdltegyvrlnse  376
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Sbjct ..............edmggtpfdrllvqaidherlravlrqygrla  363
DSSP  ..............lleellllllleellllhhhhhhhhhhlllll