No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=13.4

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Query kprardlglpftgvtgpynaitDVDGVGVGFQT..IIENeprpgrkrpARSGVTAILPHm   58
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Sbjct ......................TPRGFVVHTAPvgLADD.........GRDDFTVLAST.   28
DSSP  ......................LLLLEEEEEELllLLLL.........LLLLEEEEEEL.


DSSP  lllllLLEEEEEEEEEE..LLLL..LLHHHHHhHLEELlLEEEEEHH...........hH
Query qsetpVPVYAGVHRFNG..NGEM..TGTHWIEdGGYFLgPVVITNTH...........gI  103
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Sbjct .....APATVSAVFTRSrfAGPSvvLCREAVA.DGQAR.GVVVLARNanvatglegeenA   81
DSSP  .....LLLEEEEEELLLllLLHHhhHHHHHLL.LLLLL.EEEEEEEElllllhhhhhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHHhhlhhhhllllllLLLL.EEEEELLLllllhHHLLL..LHHHHHHhHH
Query GMAHHATVRWMVdryastyqtddflWIMP.VVAETYDGalndiNGFPV..TEADVRKaLD  160
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Sbjct REVREAVARALG............lPEGEmLIASTGVI....gRQYPMesIREHLKT.LE  124
DSSP  HHHHHHHHHHHL............lLHHHeEEEEEEEL....lLLLLHhhHHHHHLL.LL


DSSP  LL.LLLLLLLllLHHHllLEELleeleEEEEEEEEEelleEEEEEEEEeELLLlhhhlll
Query NV.ASGPVQEgnCGGGtgMITYgfkggTGTASRVVEfggrSFTIGALVqANHGqrdwlti  219
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Sbjct WPaGEGGFDRaaRAIM..TTDT....rPKEVRVSVG....GATLVGIA.KGVG.......  166
DSSP  LLlLLLLHHHhhHHLL..LLLL....lLEEEEEEEL....LEEEEEEE.ELLL.......


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Query agvpvgqhmrdgtpqsqlSIIVVLATDLPLMPHQLKRLAR.RASIGIGRNGtpgGNNS.G  277
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Sbjct ...........mlepdmaTLLTFFATDARLDPAEQDRLFRrVMDRTFNAVS.idTDTStS  214
DSSP  ...........lllllllLLEEEEEEEEELLHHHHHHHHHhHHHHLHHHLL.llLLLLlL


DSSP  EEEEEEELLLllllhhhllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllleell
Query DIFIAFSTANqrpmqhrsapfldvemvndePLDTVYLAAVDSVEEAVVNAMIAaedmggt  337
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Sbjct DTAVLFANGL................agevDAGEFEEALHTAALALVKDIASD.......  251
DSSP  LEEEEEEEEE................eeelLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......


DSSP  llllleelLLLH................................................
Query pfdrllvqAIDH................................................  349
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Sbjct ......geGAAKlievqvtgarddaqakrvgktvvnsplvktavhgcdpnwgrvamaigk  305
DSSP  ......llLLLLeeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  349
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Sbjct csddtdidqervtirfgevevyppddalraavaehlrgdevvigidlaiadgaftvygcd  365
DSSP  lllllllllllleeeelleeeelllhhhhhhhhhhlllleeeeeeellllleeeeeeeel


DSSP  HHHHhhhhhlllll
Query ERLRavlrqygrla  363
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Sbjct LTEG...yvrlnse  376
DSSP  LLHH...hhhhhhl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  lllhhhhlllllllllllllhhhlllleeeeeeeelllllllllllleeeeeeeelllll
Query kprardlglpftgvtgpynaitdvdgvgvgfqtiieneprpgrkrparsgvtailphmqs   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllleeeeeeeeeellllllhhhhhhhleellleeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
Query etpvpvyagvhrfngngemtgthwiedggyflgpvvitnthgigmahhatvrwmvdryas  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllllllllleeeeelllllllhhhllllhhhhhhhhhllllllllllllhhhlllee
Query tyqtddflwimpvvaetydgalndingfpvteadvrkaldnvasgpvqegncgggtgmit  180
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleELEEEEEEEEEEELLEE.eEEEEEEEELLL.lhhhlllllllhhhhlllllhhhhll
Query ygfKGGTGTASRVVEFGGRS.fTIGALVQANHG.qrdwltiagvpvgqhmrdgtpqsqls  238
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Sbjct ..tPRGFVVHTAPVGLADDGrdDFTVLASTAPAtvsavftrsrfagpsvvlcreavadgq   58
DSSP  ..lLLLEEEEEELLLLLLLLllLEEEEEELLLLeeeeeelllllllhhhhhhhhhlllll


DSSP  eEEEEEEL.LLLL......HHHHHHHHHLHHHHHHlllllllllleEEEEEEELLLllll
Query iIVVLATD.LPLM......PHQLKRLARRASIGIGrngtpggnnsgDIFIAFSTANqrpm  291
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Sbjct aRGVVVLArNANVatglegEENAREVREAVARALG........lpeGEMLIASTGV....  106
DSSP  lLEEEEEEeELLLllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHL........llhHHEEEEEEEE....


DSSP  hhhllllllLLLLllhHHHHHHHHHhhHHHH...............hhhhhhhhlLLEEl
Query qhrsapfldVEMVndePLDTVYLAAvdSVEE...............avvnamiaaEDMGg  336
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Sbjct .........IGRQ..yPMESIREHLktLEWPageggfdraaraimttdtrpkevrVSVG.  154
DSSP  .........LLLL..lLHHHHHHHHllLLLLlllllhhhhhhhlllllllleeeeEEEL.


DSSP  llllllEELL..............................llHHHHHHHHHHLLL.....
Query tpfdrlLVQA..............................idHERLRAVLRQYGR.....  361
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Sbjct ......GATLvgiakgvgmlepdmatlltffatdarldpaeqDRLFRRVMDRTFNavsid  208
DSSP  ......LEEEeeeeelllllllllllleeeeeeeeellhhhhHHHHHHHHHHLHHhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  361
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Sbjct tdtstsdtavlfanglagevdagefeealhtaalalvkdiasdgegaaklievqvtgard  268
DSSP  llllllleeeeeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  361
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Sbjct daqakrvgktvvnsplvktavhgcdpnwgrvamaigkcsddtdidqervtirfgevevyp  328
DSSP  hhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllllllllllllleeeelleeeel


DSSP  ..............................................ll
Query ..............................................la  363
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Sbjct pddalraavaehlrgdevvigidlaiadgaftvygcdltegyvrlnse  376
DSSP  llhhhhhhhhhhlllleeeeeeellllleeeeeeeelllhhhhhhhhl