No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  .LLLLlLEEE.EEEEEEEEellEEEEEEEEEELLEEEEEEELLLLEEEELLLLLLLLLlh
Query .AFQGpTSFH.VIQTSSFTnstWAQTQGSGWLDDLQIHGWDSDSGTAIFLKPWSKGNFsd   58
ident                  |        |     |       |          |        
Sbjct dIVAD.HVAScGVNLYQFY...GPSGQYTHEFDGDEQFYVDLERKETAWRWPEFSKFG..   54
DSSP  lLLLL.LLEEeEEEEEELL...LLEEEEEEEELLEEEEEEELLLLEEELLLHHHHHHL..


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLleeeeeeeeeeellllleeeeeeeeell
Query kevaeLEEIFRVYIFGFAREVQDFAGDFQMKYpfeiqgiagcelhsggaivsflrgalgg  118
ident                                                             
Sbjct ...gfDPQGALRNMAVAKHNLNIMIKRYNSTA............................   83
DSSP  ...llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL............................


DSSP  eeeeeeelleeeelhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlhhh
Query ldflsvknascvpspeggsraqkfcaliiqyqgimetvrillyetcpryllgvlnagkad  178
ident                                                             
Sbjct ............................................................   83
DSSP  ............................................................


DSSP  hll
Query lqr  181
ident    
Sbjct ...   83
DSSP  ...


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=4.6

DSSP  lllllleeeeeeeeeeeelLEEEeeeeeeelleeeeeeelllleeeellllllllllhhh
Query afqgptsfhviqtssftnsTWAQtqgsgwlddlqihgwdsdsgtaiflkpwskgnfsdke   60
ident                                                             
Sbjct ...................DIVA.....................................    4
DSSP  ...................LLLL.....................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllLEEEE.EEEEEEELlllLEEEEEEEEELLE
Query vaeleeifrvyifgfarevqdfagdfqmkyPFEIQ.GIAGCELHsggAIVSFLRGALGGL  119
ident                                     |                     | 
Sbjct ..............................DHVAScGVNLYQFY...GPSGQYTHEFDGD   31
DSSP  ..............................LLLEEeEEEEEELL...LLEEEEEEEELLE


DSSP  EEEEEEL..LEEEELHhhhHHHHHhhHHHLllhhHHHHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHLHH
Query DFLSVKN..ASCVPSPeggSRAQKfcALIIqyqgIMETVRILLyETCPRYLLGVLNAGKA  177
ident     |                  |                          |         
Sbjct EQFYVDLerKETAWRW...PEFSK..FGGF....DPQGALRNM.AVAKHNLNIMIKRYNS   81
DSSP  EEEEEELllLEEELLL...HHHHH..HLLL....LHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  HHll
Query DLqr  181
ident     
Sbjct TA..   83
DSSP  LL..