No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=12.0

DSSP  .llEEEEEEEEEEEEE.lLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEelllLEEEELLLLLLHHHHHH
Query .glQRLHMLQISYFRD.pYHVWYQGNASLGGHLTHVLEGpdtnTTIIQLQPLQEPESWAR   58
ident      |                  |     |                             
Sbjct gseSGLRYAYTLVVDGtaNTARCFGTGHVDGEAFVGYSN....NKTHGIGRWVNASHVEE   56
DSSP  lllLLEEEEEEEEEELllEEEEEEEEEEELLEEEEEEEL....LEEEELLLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEEEEellllllLEEEEEEEELLEEEE
Query TQSGLQSYLLQFHGLVRLVHQERTLAFPLTIRCFLGCElppegsrAHVFFEVAVNGSSFV  118
ident                              |     ||               |  |    
Sbjct ENKEFVRQCKELQAELDKMQNNSAVIGVKTVQLDVGCT.......SKIEKHYAYDGNETE  109
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLEEEEEELLL.......LLLLLEEEELLEELL


DSSP  EEElllleeeellllllhhhhhhhhhhlllllLLHHhHHHHhLHHHHHHHHHLL......
Query SFRperalwqadtqvtsgvvtftlqqlnaynrTRYElREFLeDTCVQYVQKHIS......  172
ident                                       |     |               
Sbjct DDT.............................ATSA.SERA.RDCQKKLTEYRKlvlasa  138
DSSP  LLL.............................LLLL.LLLH.HHHHHHHHHHHHhhhhll


DSSP  .
Query .  172
ident  
Sbjct v  139
DSSP  l


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.1

DSSP  lleeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeelleeeeeeeeelllleeeellllllhhhhhhhh
Query glqrlhmlqisyfrdpyhvwyqgnaslgghlthvlegpdtnttiiqlqplqepeswartq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllEEEEEEEEEEELLLLLLLEEEEEEEELLEEEEEE
Query sglqsyllqfhglvrlvhqertlafpLTIRCFLGCELPPEGSRAHVFFEVAVNGSSFVSF  120
ident                              |             |  |    | |  ||  
Sbjct .......................gseSGLRYAYTLVVDGTANTARCFGTGHVDGEAFVGY   37
DSSP  .......................lllLLEEEEEEEEEELLLEEEEEEEEEEELLEEEEEE


DSSP  ELllLEEEELLLLllhhHHHHHHHHlllllllhhHHHHHhLHHHHHHHHHLL........
Query RPerALWQADTQVtsgvVTFTLQQLnaynrtryeLREFLeDTCVQYVQKHIS........  172
ident                                                 |           
Sbjct SN..NKTHGIGRW...vNASHVEEE......nkeFVRQC.KELQAELDKMQNnsavigvk   85
DSSP  EL..LEEEELLLL...lLHHHHHHH......hhhHHHHH.HHHHHHHHHHHLllllllll


DSSP  ......................................................
Query ......................................................  172
ident                                                       
Sbjct tvqldvgctskiekhyaydgneteddtatsaserardcqkklteyrklvlasav  139
DSSP  eeeeeelllllllleeeelleellllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  lleeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeLLEE.EEEEEEEL......LLLEEEELL.....
Query glqrlhmlqisyfrdpyhvwyqgnaslGGHL.THVLEGPD......TNTTIIQLQ.....   48
ident                                                             
Sbjct ..........................gSESGlRYAYTLVVdgtantARCFGTGHVdgeaf   34
DSSP  ..........................lLLLLeEEEEEEEEellleeEEEEEEEEElleee


DSSP  ...............lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..............
Query ...............plqEPESWARTQSGLQSYLLQFHGLVRLVHQ..............   79
ident                     |            |                          
Sbjct vgysnnkthgigrwvnasHVEEENKEFVRQCKELQAELDKMQNNSAvigvktvqldvgct   94
DSSP  eeeelleeeellllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllllleeeeeelll


DSSP  ....hhlllllEEEEEEeeeeellllllleeeeeeeelleeeeeeelllleeeellllll
Query ....ertlafpLTIRCFlgcelppegsrahvffevavngssfvsfrperalwqadtqvts  135
ident                                                             
Sbjct skiekhyaydgNETEDD...........................................  111
DSSP  llllleeeellEELLLL...........................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllllllhhHHHHhHLHHHHHHHHHLL..........
Query gvvtftlqqlnaynrtryeLREFlEDTCVQYVQKHIS..........  172
ident                                  |             
Sbjct ..................tATSA.SERARDCQKKLTEyrklvlasav  139
DSSP  ..................lLLLL.LLLHHHHHHHHHHhhhhhhhlll