No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=10.6

DSSP  ...............LEEEEEEEEElllllllLEEEEEEELLL...LLLHHHHHHHHHH.
Query ...............MSYPYYIVDAfaeevfkGNPAAVYVLEK...WLPEAVMQNIAIE.   41
ident                       |         |||  |           |          
Sbjct tankfeknyilrtdiQTVLCGAVSM.......GNPHCVVQVDDiqtANVEQLGPLLESHe   53
DSSP  lllllllleeeelllLEEEEEEEEL.......LLEEEEEELLLlllLLHHHHHHHHHLLl


DSSP  ..hlLLLEEEEEEELL.EEEEEEE.LLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLEEEEEE
Query ..nnLSETAFTVKEGQ.SYALRWF.TPEREIDLCGHATLATAFVLFNYYSVaEETLHFTS   97
ident          |          ||       |   ||    |   |                
Sbjct rfpeRVNAGFMQIINKeHIKLRVYeRGAGETQACGSGACAAVAVGIMQGLL.NNNVQVDL  112
DSSP  llllLLEEEEEEEEELlEEEEEEEeLLLEELLLLHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLEEEEEE


DSSP  LLEEEEEEEE..LLEEEEEEELLLleellllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhh
Query QSGPLAVTKK..EEYYYLDFPYILperipilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeet  155
ident   | |           |                                           
Sbjct PGGSLMIEWNgvGHPLYMTGEATH....................................  136
DSSP  LLEEEEEEELllLLLEEEELLLLL....................................


DSSP  hhhllllhhhhhhlllllleeeeeellllleeeeeeehhhleeeellllllhhhhhhhhh
Query vakitpdfsalkaldlgvgvivtasgdsvdfvsrtffpklrinedpvcgsahanlipywg  215
ident                                                             
Sbjct ............................................................  136
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllleeeeeelllllleeeeeeelleeeeeeleeeeeeeeeel
Query krlnqttlsayqvsprggfltcevkenrviiggtaklfakgeayl  260
ident                                              
Sbjct .....................................iydgfitl  144
DSSP  .....................................llllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.0

DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee
Query msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll
Query wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
ident                                                             
Sbjct ......................................................tankfe    6
DSSP  ......................................................llllll


DSSP  EELLLL..HHHHhhhlllllEEEEL....LLEEEELLlhhHHHH.LLLL.hHHHHHLLL.
Query ERIPIL..PEYEaalgtkiyEAYLG....RDLFFVLKdeeTVAK.ITPD.fSALKALDL.  171
ident                                                      |      
Sbjct KNYILRtdIQTV........LCGAVsmgnPHCVVQVD...DIQTaNVEQlgPLLESHERf   55
DSSP  LLEEEEllLLEE........EEEEEelllEEEEEELL...LLLLlLHHHhhHHHHLLLLl


DSSP  ..lLLEEEEEELLllLEEEEEEEHhhLEEEELLLLLLHHHHHHHHHH.HHLLLEEEEEEL
Query ..gVGVIVTASGDsvDFVSRTFFPklRINEDPVCGSAHANLIPYWGK.RLNQTTLSAYQV  228
ident    |               |         |   |||             |          
Sbjct perVNAGFMQIINkeHIKLRVYER..GAGETQACGSGACAAVAVGIMqGLLNNNVQVDLP  113
DSSP  lllLEEEEEEEEEllEEEEEEEEL..LLEELLLLHHHHHHHHHHHHHhLLLLLEEEEEEL


DSSP  lllLLEEEEEEEL..LEEEEEeleeeeeeeeeel
Query sprGGFLTCEVKE..NRVIIGgtaklfakgeayl  260
ident    || |  |                        
Sbjct ...GGSLMIEWNGvgHPLYMTgeathiydgfitl  144
DSSP  ...LEEEEEEELLllLLEEEElllllllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tankfeknyilrtdiqtvlcgavsmgnphcvvqvddiqtanveqlgpllesherfpervn   60
DSSP  lllllllleeeelllleeeeeeeellleeeeeellllllllhhhhhhhhhllllllllle


DSSP  .leEEEEEeeelllllllleeEEEEE.........lLLLLlHHHHHHHHHHHL.....LL
Query .msYPYYIvdafaeevfkgnpAAVYV.........lEKWLpEAVMQNIAIENN.....LS   45
ident                                                             
Sbjct agfMQIIN.............KEHIKlrvyergageTQAC.GSGACAAVAVGImqgllNN  106
DSSP  eeeEEEEE.............LLEEEeeeeellleeLLLL.HHHHHHHHHHHHhhlllLL


DSSP  LEEEEEeelleEEEEEELL......LLEELllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeLL
Query ETAFTVkegqsYALRWFTP......EREIDlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsQS   99
ident                                                             
Sbjct NVQVDL....pGGSLMIEWngvghpLYMTG............................EA  134
DSSP  EEEEEE....lLEEEEEEEllllllEEEEL............................LL


DSSP  EEeeeeeelleeeeeeelllleellllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhhhhhl
Query GPlavtkkeeyyyldfpyilperipilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeetvaki  159
ident                                                             
Sbjct TH..........................................................  136
DSSP  LL..........................................................


DSSP  lllhhhhhhlllllleeeeeellllleeeeeeehhhleeeellllllhhhhhhhhhhhhl
Query tpdfsalkaldlgvgvivtasgdsvdfvsrtffpklrinedpvcgsahanlipywgkrln  219
ident                                                             
Sbjct ............................................................  136
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeelllllleeeeeeelleeeeeeleeeeeeeeeel
Query qttlsayqvsprggfltcevkenrviiggtaklfakgeayl  260
ident                                          
Sbjct .................................iydgfitl  144
DSSP  .................................llllllll


No 4: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee
Query msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll
Query wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
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Sbjct ....................................................tankfekn    8
DSSP  ....................................................llllllll


DSSP  eellllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhhhhhllllhhhhhhlllllleEEEEE
Query eripilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeetvakitpdfsalkaldlgvgvIVTAS  180
ident                                                             
Sbjct yilrtdiqtvlcgavsmgnphcvvqvddiqtanveqlgpllesherfpervnagfMQIIN   68
DSSP  eeeelllleeeeeeeellleeeeeellllllllhhhhhhhhhllllllllleeeeEEEEE


DSSP  LllllEEEEE...eehhhleeeELLL.LLLHHHHHHHHhhhhllleEEEEELL.LLLLEE
Query GdsvdFVSRT...ffpklrineDPVC.GSAHANLIPYWgkrlnqttLSAYQVS.PRGGFL  235
ident                              | |  |                         
Sbjct K....EHIKLrvyergagetqaCGSGaCAAVAVGIMQG.....llnNNVQVDLpGGSLMI  119
DSSP  L....LEEEEeeeellleelllLHHHhHHHHHHHHHHL.....lllLEEEEEElLEEEEE


DSSP  EEEEELleeEEEEL..eeeeeeeeeel
Query TCEVKEnrvIIGGT..aklfakgeayl  260
ident              |             
Sbjct EWNGVG..hPLYMTgeathiydgfitl  144
DSSP  EELLLL..lLEEEElllllllllllll


No 5: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee
Query msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll
Query wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllhhhhhhhlllllEEEELlLEEEElllhhhhhhllllhhhhhhlllllleeeEEE
Query eripilpeyeaalgtkiyEAYLGrDLFFVlkdeetvakitpdfsalkaldlgvgvivTAS  180
ident                                                             
Sbjct .........tankfeknyILRTD.IQTVL............................CGA   22
DSSP  .........lllllllleEEELL.LLEEE............................EEE


DSSP  LLL..lLEEEEEeehhhleEEEL.LLLL.LHHHHHHHhhHHHLLleEEEEE......lll
Query GDS..vDFVSRTffpklriNEDP.VCGS.AHANLIPYwgKRLNQttLSAYQ......vsp  230
ident         |                        |      |       |           
Sbjct VSMgnpHCVVQV.......DDIQtANVEqLGPLLESH..ERFPE.rVNAGFmqiinkehi   72
DSSP  EELlleEEEEEL.......LLLLlLLHHhHHHHHHLL..LLLLL.lLEEEEeeeeellee


DSSP  llLEEEEEeelleeEEEE..........................................
Query rgGFLTCEvkenrvIIGG..........................................  248
ident                                                             
Sbjct klRVYERG......AGETqacgsgacaavavgimqgllnnnvqvdlpggslmiewngvgh  126
DSSP  eeEEEELL......LEELlllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeelleeeeeeelllll


DSSP  ......leeeeeeeeeel
Query ......taklfakgeayl  260
ident                   
Sbjct plymtgeathiydgfitl  144
DSSP  leeeelllllllllllll