No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=15.5

DSSP  lEEEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELL..EEE
Query mSYPYYIVDAFAEEVFKGNPAAVYVLEKWLPEAVMQNIAIENNLSETAFTVKEGQ..SYA   58
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Sbjct .SRRYWQLDVFAERPLTGNGLAVFDDASALDDAAMQAWTRELRQFESIFLLPGDDprAFR   59
DSSP  .LLLEEEEEELLLLLLLLEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELLLllEEE


DSSP  EEEELLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHhLLLL..LLEEEEEELLEEEEEEEELL....EEE
Query LRWFTPEREIDLCGHATLATAFVLFNyYSVA..EETLHFTSQSGPLAVTKKEE....YYY  112
ident  | || | |    ||  |  |  |         |        |   |          |  
Sbjct ARIFTLEEELPFAGHPLLGAAALLHH.LRGGdnEQHWTLHLASKSVALRSVRAgsgfYAE  118
DSSP  EEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH.HHLLllLEEEEEELLLLEEEEEEEEElleeEEE


DSSP  EE.EELLLLEEllllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhhhhhllllhhhhhhlll
Query LD.FPYILPERipilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeetvakitpdfsalkaldl  171
ident  |                                                          
Sbjct MDqGRAEFGAT.................................................  129
DSSP  EElLLLLLLLL.................................................


DSSP  llleeeeeellllleeeeeeehhhleeeellllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeellll
Query gvgvivtasgdsvdfvsrtffpklrinedpvcgsahanlipywgkrlnqttlsayqvspr  231
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Sbjct ............................................................  129
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeeelleeeeeeleeeeeeeeeel
Query ggfltcevkenrviiggtaklfakgeayl  260
ident                              
Sbjct .............................  129
DSSP  .............................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.1

DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee
Query msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll
Query wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllhhhhhhhllllLEEEEL...........LLEEEELLLhhhhhhLLLL.HHHHHH
Query eripilpeyeaalgtkiYEAYLG...........RDLFFVLKDeetvakITPD.FSALKA  168
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Sbjct ................sRRYWQLdvfaerpltgnGLAVFDDAS....alDDAAmQAWTRE   40
DSSP  ................lLLEEEEeelllllllleEEEEELLLL....llLHHHhHHHHHH


DSSP  LlLLLLEEEEEELLL.lLEEEEEEEHhhlEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHL...lLEEE
Query LdLGVGVIVTASGDS.vDFVSRTFFPklrINEDPVCGSAHANLIPYWGKRLN...qTTLS  224
ident |      |    ||    |  | |       | |  |                       
Sbjct L.RQFESIFLLPGDDprAFRARIFTL...EEELPFAGHPLLGAAALLHHLRGgdneQHWT   96
DSSP  H.LLLEEEEEEELLLllEEEEEEEEL...LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLllllEEEE


DSSP  EEELlllLLEEEEEEELL....EEEEEELEEEEEEEeeel
Query AYQVsprGGFLTCEVKEN....RVIIGGTAKLFAKGeayl  260
ident                                 |       
Sbjct LHLA...SKSVALRSVRAgsgfYAEMDQGRAEFGAT....  129
DSSP  EELL...LLEEEEEEEEElleeEEEEELLLLLLLLL....