No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.7

DSSP  ...........llLLLLEEEEEEEElLEELEEEEEllLLLLlllhhhhhhhhhhhLHHHH
Query ...........mrSTKVIHIVGCHAeGEVGDVIVGgvAPPPgetvweqsrfiandETLRN   49
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Sbjct tankfeknyilrtDIQTVLCGAVSM.GNPHCVVQV.dDIQT...........anvEQLGP   47
DSSP  lllllllleeeelLLLEEEEEEEEL.LLEEEEEEL.lLLLL...........llhHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLLLLLEEEEELLlllllLEEEELLLL.LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query FVLNKPRGGVFRHVNLLVPPkdpraQMGFIIMEP.ADTPPMSGSNSICVSTVLLDSGIIA  108
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Sbjct LLESHERFPERVNAGFMQII..nkeHIKLRVYERgAGETQACGSGACAAVAVGIMQGLLN  105
DSSP  HHHLLLLLLLLLEEEEEEEE..ellEEEEEEEELlLEELLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  lllleEEEEEELLLLEEEEEEEELLlleEEEEEELlLLEELLLlEEEELlllleeeeeee
Query mqepvTHMVLEAPGGIIEVEAECRNgkaERISVRNvPSFADRLdAPLDVtglgtimvdta  168
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Sbjct .....NNVQVDLPGGSLMIEWNGVG...HPLYMTG.EATHIYD.GFITL...........  144
DSSP  .....LEEEEEELLEEEEEEELLLL...LLEEEEL.LLLLLLL.LLLLL...........


DSSP  ellleeeeeehhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeellleelllee
Query yggdsfvivdaaqigepgqarelaeigvkitkafrhperdwrhisfcqitepvtregdvl  228
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Sbjct ............................................................  144
DSSP  ............................................................


DSSP  eeleelllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllleeeeeeeeeeelleeeeeeeee
Query tgvntvptgtgcsarmavlhakgqmkagerfigksvtefhcrldkvlelggkpaispiis  288
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Sbjct ............................................................  144
DSSP  ............................................................


DSSP  eleeeeeeeeellllllllllll
Query grawvtgtsqlmldpsdpfphgy  311
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Sbjct .......................  144
DSSP  .......................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.6

DSSP  lllllleeeeeeeelleeleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll
Query mrstkvihivgchaegevgdvivggvapppgetvweqsrfiandetlrnfvlnkprggvf   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeelllllllleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeel
Query rhvnllvppkdpraqmgfiimepadtppmsgsnsicvstvlldsgiiamqepvthmvlea  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeeelllleeeeeeelllleelLLLEEEELLLLlEEEEEEEELLLEEEEEEHH
Query pggiieveaecrngkaerisvrnvpsfadRLDAPLDVTGLgTIMVDTAYGGDSFVIVDAA  180
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Sbjct ........................tankfEKNYILRTDIQ.TVLCGAVSMGNPHCVVQVD   35
DSSP  ........................lllllLLLEEEELLLL.EEEEEEEELLLEEEEEELL


DSSP  ..hllLHHHHHHHHHHHhhHHLLlllllllllLLLEEEEELLLEEllleEEELEEL....
Query ..qigEPGQARELAEIGvkITKAfrhperdwrHISFCQITEPVTRegdvLTGVNTV....  234
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Sbjct diqtaNVEQLGPLLESH..ERFP.........ERVNAGFMQIINK....EHIKLRVyerg   80
DSSP  lllllLHHHHHHHHHLL..LLLL.........LLLEEEEEEEEEL....LEEEEEEeell


DSSP  .....LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLllLEEEEL.LLLLEEEEEEEEEEelleeeeEEEEE
Query .....PTGTGCSARMAVLHAKGQMKagERFIGK.SVTEFHCRLDKVLElggkpaiSPIIS  288
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Sbjct agetqACGSGACAAVAVGIMQGLLN..NNVQVDlPGGSLMIEWNGVGH.......PLYMT  131
DSSP  leellLLHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LEEEEEeLLEEEEEEELLLLL.......LEEEE


DSSP  ELEEEEEEEEELLllllllllll
Query GRAWVTGTSQLMLdpsdpfphgy  311
ident | |         |          
Sbjct GEATHIYDGFITL..........  144
DSSP  LLLLLLLLLLLLL..........