No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=10.5

DSSP  llllllEEEEEEEELLEELEEEE...ELLLllllllhhhhhhhhhhHLHHHHHHHLL.LL
Query mrstkvIHIVGCHAEGEVGDVIV...GGVApppgetvweqsrfianDETLRNFVLNK.PR   56
ident             |  |    |       |                          |    
Sbjct ......MQFSKMHGLGNDFVVVDgvtQNVF...............fTPETIRRLANRhCG   39
DSSP  ......LLLEEEEELLEEEEEEEellLLLL...............lLHHHHHHHHLLlLL


DSSP  LLllLLEEEEELLLLLLLLEEEELLLLL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllleEE
Query GGvfRHVNLLVPPKDPRAQMGFIIMEPA.DTPPMSGSNSICVSTVLLDSGIIAMqepvTH  115
ident  |          | ||       |           |    |        |          
Sbjct IG.fDQLLIVEAPYDPELDFHYRIFNADgSEVSQCGNGARCFARFVTLKGLTNK....KD   94
DSSP  LL.lLEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLlLEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLL....LE


DSSP  EEEELLLLEEEEEEEELllleEEEEEELLLLEELllleeeellllleeeeeeeellleee
Query MVLEAPGGIIEVEAECRngkaERISVRNVPSFADrldapldvtglgtimvdtayggdsfv  175
ident        |               | |                                  
Sbjct ISVSTQKGNMVLTVKDD....NQIRVNMGEPIWE..........................  124
DSSP  EEEELLLLEEEEEELLL....LLEEEELLLLLLL..........................


DSSP  eeehhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeellleellleeeeleell
Query ivdaaqigepgqarelaeigvkitkafrhperdwrhisfcqitepvtregdvltgvntvp  235
ident                                                             
Sbjct ............................................................  124
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllleeeeeeeeeEELLeeeeeeeeeeleeeee
Query tgtgcsarmavlhakgqmkagerfigksvtefhcrldkvlELGGkpaispiisgrawvtg  295
ident                                                             
Sbjct ......................................paKIPF................  130
DSSP  ......................................hhHLLL................


DSSP  eeeellllllllllll
Query tsqlmldpsdpfphgy  311
ident                 
Sbjct ................  130
DSSP  ................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.5

DSSP  lllllleeeeeeeelleeleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll
Query mrstkvihivgchaegevgdvivggvapppgetvweqsrfiandetlrnfvlnkprggvf   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeelllllllleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeel
Query rhvnllvppkdpraqmgfiimepadtppmsgsnsicvstvlldsgiiamqepvthmvlea  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeeelllleeeeeeelllleelllleeeellllleEEEEEEELL.LEEEEEEH
Query pggiieveaecrngkaerisvrnvpsfadrldapldvtglgtIMVDTAYGG.DSFVIVDA  179
ident                                                  |    || || 
Sbjct ..........................................MQFSKMHGLgNDFVVVDG   18
DSSP  ..........................................LLLEEEEELlEEEEEEEE


DSSP  ..HHLLLHHHHHHHHH...HHHHhhllllllllllllLLEEEEELLLEELlleeEELEEL
Query ..AQIGEPGQARELAE...IGVKitkafrhperdwrhISFCQITEPVTREgdvlTGVNTV  234
ident                     |                     | |               
Sbjct vtQNVFFTPETIRRLAnrhCGIG..............FDQLLIVEAPYDP..elDFHYRI   62
DSSP  llLLLLLLHHHHHHHHlllLLLL..............LLEEEEEELLLLL..llLEEEEE


DSSP  .........llHHHHHHHHHHHHHLLLLLllLEEEELLL.LLEEEEEEEEeeelleeeEE
Query .........ptGTGCSARMAVLHAKGQMKagERFIGKSV.TEFHCRLDKVlelggkpaIS  284
ident            | |          ||                                  
Sbjct fnadgsevsqcGNGARCFARFVTLKGLTN.kKDISVSTQkGNMVLTVKDD........NQ  113
DSSP  eelllleelllLLLHHHHHHHHHHLLLLL.lLEEEEELLlLEEEEEELLL........LL


DSSP  EEEEELEEEEEEEeellllllllllll
Query PIISGRAWVTGTSqlmldpsdpfphgy  311
ident                            
Sbjct IRVNMGEPIWEPA..........kipf  130
DSSP  EEEELLLLLLLHH..........hlll