No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=16.7

DSSP  lEEEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEE..LLEEE
Query mSYPYYIVDAFAEEVFKGNPAAVYVLEKWLPEAVMQNIAIENNLSETAFTVKE..GQSYA   58
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Sbjct .MHNYVIIDAFASVPLEGNPVAVFFDADDLPPAQMQRIAREMNLSESTFVLKPrnGGDAL   59
DSSP  .LLLEEEEEELLLLLLLLEEEEEELLHHHLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLllLLLEE


DSSP  EEEELLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHHllLLLLEEEEEELLEEEEEEEEL.....LEEEE
Query LRWFTPEREIDLCGHATLATAFVLFNYysVAEETLHFTSQSGPLAVTKKE.....EYYYL  113
ident  | |||  |    |   | ||  |          |    | |  |               
Sbjct IRIFTPVNELPFAGAPLLGTAIALGAH..TDNHRLYLETQMGTIAFELERqngsvIAASM  117
DSSP  EEEELLLLEELLLHHHHHHHHHHHHLL..LLLLEEEEEELLEEEEEEEEEelleeEEEEE


DSSP  E.EELLLLEELlllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhhhhhllllhhhhhhllll
Query D.FPYILPERIpilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeetvakitpdfsalkaldlg  172
ident |                                                           
Sbjct DqPIPTWTALG.................................................  128
DSSP  LlLLLLLLLLL.................................................


DSSP  lleeeeeellllleeeeeeehhhleeeellllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllll
Query vgvivtasgdsvdfvsrtffpklrinedpvcgsahanlipywgkrlnqttlsayqvsprg  232
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Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeeeeelleeeeeeleeeeeeeeeel
Query gfltcevkenrviiggtaklfakgeayl  260
ident                             
Sbjct ............................  128
DSSP  ............................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.9

DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee
Query msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll
Query wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eellllhhhhhhhllllLEEEEL...........LLEEEELLLhhhhhhLLLL.HHHHHH
Query eripilpeyeaalgtkiYEAYLG...........RDLFFVLKDeetvakITPD.FSALKA  168
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Sbjct ................mHNYVIIdafasvplegnPVAVFFDAD....dlPPAQmQRIARE   40
DSSP  ................lLLEEEEeelllllllleEEEEELLHH....hlLHHHhHHHHHH


DSSP  LlLLLLEEEEEELL.LLLEEEEEEEHHhleEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEE
Query LdLGVGVIVTASGD.SVDFVSRTFFPKlriNEDPVCGSAHANLIPYWGKRLNQTTLSAYQ  227
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Sbjct M.NLSESTFVLKPRnGGDALIRIFTPV...NELPFAGAPLLGTAIALGAHTDNHRLYLET   96
DSSP  H.LLLLEEEEELLLlLLLEEEEEELLL...LEELLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEE


DSSP  LlllLLEEEEEEEL.....LEEEEEELEEEEEEEEeel
Query VsprGGFLTCEVKE.....NRVIIGGTAKLFAKGEayl  260
ident      |    |                           
Sbjct Q...MGTIAFELERqngsvIAASMDQPIPTWTALG...  128
DSSP  L...LEEEEEEEEEelleeEEEEELLLLLLLLLLL...