No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=11.7

DSSP  lllllllleeeellllEEEEEEEEL.......LLEEEEE.ELLLlLLLL.HHHHHHHHHl
Query tankfeknyilrtdiqTVLCGAVSM.......GNPHCVV.QVDDiQTAN.VEQLGPLLEs   51
ident                                 ||   |                   |  
Sbjct ................SRRYWQLDVfaerpltGNGLAVFdDASA.LDDAaMQAWTRELR.   42
DSSP  ................LLLEEEEEElllllllLEEEEEElLLLL.LLHHhHHHHHHHHL.


DSSP  llllllLLEEEEEEEE.ELLEEEEEEEElLLEELLLLHHHHHHHHHHHHHHL..lllLEE
Query herfpeRVNAGFMQII.NKEHIKLRVYErGAGETQACGSGACAAVAVGIMQG..llnNNV  108
ident            |            |       |    |     | |              
Sbjct ......QFESIFLLPGdDPRAFRARIFT.LEEELPFAGHPLLGAAALLHHLRggdneQHW   95
DSSP  ......LLEEEEEEELlLLLEEEEEEEE.LLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHlllllEEE


DSSP  EEEELLEEEEEEELLLL..LLEEEELL.LLLLLLlllll
Query QVDLPGGSLMIEWNGVG..HPLYMTGE.ATHIYDgfitl  144
ident    |   |        |      |    |          
Sbjct TLHLASKSVALRSVRAGsgFYAEMDQGrAEFGAT.....  129
DSSP  EEELLLLEEEEEEEEELleEEEEEELLlLLLLLL.....


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.5

DSSP  lllllllleeeelllleeeeeeeellleeeeeellllllllhhhhhhhhhllllllllle
Query tankfeknyilrtdiqtvlcgavsmgnphcvvqvddiqtanveqlgpllesherfpervn   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeEEEE.............LLEE.EEEEeellleelllLHHHHHHHHHHHHhhlllLL
Query agfmQIIN.............KEHI.KLRVyergagetqaCGSGACAAVAVGImqgllNN  106
ident                                               |             
Sbjct ..srRYWQldvfaerpltgngLAVFdDASA.........lDDAAMQAWTRELR.....QF   44
DSSP  ..llLEEEeeelllllllleeEEEElLLLL.........lLHHHHHHHHHHHL.....LL


DSSP  EEEEEEL......LEEEEEEEllllllEEEELLL..........................
Query NVQVDLP......GGSLMIEWngvghpLYMTGEA..........................  134
ident      ||                          |                          
Sbjct ESIFLLPgddpraFRARIFTL......EEELPFAghpllgaaallhhlrggdneqhwtlh   98
DSSP  EEEEEEEllllleEEEEEEEL......LLLLLLLllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeee


DSSP  ......................LLLLLLLlll
Query ......................THIYDGFitl  144
ident                                 
Sbjct lasksvalrsvragsgfyaemdQGRAEFG.at  129
DSSP  lllleeeeeeeeelleeeeeeeLLLLLLL.ll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.0

DSSP  llLLLL...................LLEE............eelllLEEEEEEEELlLEE
Query taNKFE...................KNYI............lrtdiQTVLCGAVSMgNPH   29
ident                                                             
Sbjct ..SRRYwqldvfaerpltgnglavfDDASalddaamqawtrelrqfESIFLLPGDD.PRA   57
DSSP  ..LLLEeeeeelllllllleeeeeeLLLLlllhhhhhhhhhhhlllEEEEEEELLL.LLE


DSSP  EEEE..lllllLLLHHHHHHHHHLL.LLLL.....LLLEEEEeeeeelleeeeEEEELL.
Query CVVQ..vddiqTANVEQLGPLLESH.ERFP.....ERVNAGFmqiinkehiklRVYERG.   80
ident                                                             
Sbjct FRARiftleeeLPFAGHPLLGAAALlHHLRggdneQHWTLHL.........asKSVALRs  108
DSSP  EEEEeeellllLLLLLLHHHHHHHHhHHHHlllllEEEEEEL.........llLEEEEEe


DSSP  .........LEELlllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeelleeeeeeelllllleeee
Query .........AGETqacgsgacaavavgimqgllnnnvqvdlpggslmiewngvghplymt  131
ident                                                             
Sbjct vragsgfyaEMDQ...............................................  121
DSSP  eeelleeeeEEEL...............................................


DSSP  lllllllllllll
Query geathiydgfitl  144
ident              
Sbjct .....graefgat  129
DSSP  .....llllllll