No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.4

DSSP  lllLLLE.................EEEEEEELlEELEEEEE.llLLLLlllhhhhhhhhh
Query mrsTKVI.................HIVGCHAEgEVGDVIVG.gvAPPPgetvweqsrfia   42
ident                                             |               
Sbjct .pdAGTCrwfaeafslsandlsghPPRVVSTG.LPYLLLPVtaeALGR............   46
DSSP  .llHHHHhhhhhhllllhhhllllLLEEELLL.LLEEEEELlhhHHHL............


DSSP  hHLHHhhhhhLLLLLL..llLLEEEEElllllllLEEEELLLLL..LLLLLLHHHHHHHH
Query nDETLrnfvlNKPRGG..vfRHVNLLVppkdpraQMGFIIMEPA..DTPPMSGSNSICVS   98
ident                       | ||                          ||    | 
Sbjct aRQVN....dLQEALDklgaAFVYLLD.....vdGREGRTWDNLglVEDVATGSAAGPVA   97
DSSP  lLLLL....lLHHHHHhhllLEEEEEE.....llLLEEELLLLLllLLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLLLLlllEEEEEEELL.....LLEEEEEEEELllleEEEEEElLLLEELLLLE
Query TVLLDSGIIAMqepVTHMVLEAP.....GGIIEVEAECRngkaERISVRnVPSFADRLDA  153
ident   |   |  |        ||             |             |            
Sbjct AYLVEYGLAAR...GEPFVLHQGrflerPSRLDVQVATD....GSVRVG.GHVQLLARAE  149
DSSP  HHHHHLLLLLL...LLLEEEEELhhhllLEEEEEEELLL....LLEEEE.LLLLLLLLLL


DSSP  EEELlllleeeeeeeellleeeeeehhhlllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllll
Query PLDVtglgtimvdtayggdsfvivdaaqigepgqarelaeigvkitkafrhperdwrhis  213
ident  |                                                          
Sbjct LLTS........................................................  153
DSSP  LLLL........................................................


DSSP  eeeeellleellleeeeleelllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllleeeeeee
Query fcqitepvtregdvltgvntvptgtgcsarmavlhakgqmkagerfigksvtefhcrldk  273
ident                                                             
Sbjct ............................................................  153
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelleeeeeeeeeeleeeeeeeeellllllllllll
Query vlelggkpaispiisgrawvtgtsqlmldpsdpfphgy  311
ident                                       
Sbjct ......................................  153
DSSP  ......................................


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.2

DSSP  lllllleeeeeeeelleeleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll
Query mrstkvihivgchaegevgdvivggvapppgetvweqsrfiandetlrnfvlnkprggvf   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeelllllllleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeel
Query rhvnllvppkdpraqmgfiimepadtppmsgsnsicvstvlldsgiiamqepvthmvlea  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llleeeeeeeelllleeeeeeelllleelllleEEEL....lLLLE.....eeEEEEELL
Query pggiieveaecrngkaerisvrnvpsfadrldaPLDV....tGLGT.....imVDTAYGG  171
ident                                            |               |
Sbjct .............................pdagTCRWfaeafSLSAndlsghpPRVVSTG   31
DSSP  .............................llhhHHHHhhhhlLLLHhhlllllLEEELLL


DSSP  LEEEEEEHH..hllLHHHhhhHHHHHHHHhlllllllllllLLLEEEEELLLEellleee
Query DSFVIVDAA..qigEPGQareLAEIGVKItkafrhperdwrHISFCQITEPVTregdvlt  229
ident                  |                          |               
Sbjct LPYLLLPVTaealgRARQ.vnDLQEALDK...........lGAAFVYLLDVDG.......   72
DSSP  LLEEEEELLhhhhhLLLL.llLLHHHHHH...........hLLLEEEEEELLL.......


DSSP  ELEEL..........LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEELLL......LLEEEEEEE
Query GVNTV..........PTGTGCSARMAVLHAKGQMKAGERFIGKSV......TEFHCRLDK  273
ident                 ||       | |   |    || |                    
Sbjct REGRTwdnlglvedvATGSAAGPVAAYLVEYGLAARGEPFVLHQGrflerpSRLDVQVAT  132
DSSP  LEEELllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLEEEEELhhhlllEEEEEEELL


DSSP  EeeelleeeEEEEEEELEEEEEEEEELLLlllllllll
Query VlelggkpaISPIISGRAWVTGTSQLMLDpsdpfphgy  311
ident           |    |         |            
Sbjct D........GSVRVGGHVQLLARAELLTS.........  153
DSSP  L........LLEEEELLLLLLLLLLLLLL.........