No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=15.5

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Query .SRRYWQLDVFAERPLTGNGLAVFDDaSALDDAAMQAWTRELRQFESIFLLPGDDprAFR   59
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Sbjct mSYPYYIVDAFAEEVFKGNPAAVYVLeKWLPEAVMQNIAIENNLSETAFTVKEGQ..SYA   58
DSSP  lEEEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELlLLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELL..EEE


DSSP  EEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHH.HHLLllLEEEEEELLLLEEEEEEEEElleeEEE
Query ARIFTLEEELPFAGHPLLGAAALLHH.LRGGdnEQHWTLHLASKSVALRSVRAgsgfYAE  118
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Sbjct LRWFTPEREIDLCGHATLATAFVLFNyYSVA..EETLHFTSQSGPLAVTKKEE....YYY  112
DSSP  EEEELLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHhLLLL..LLEEEEEELLEEEEEEEELL....EEE


DSSP  EElLLLLLLLL.................................................
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Sbjct LD.FPYILPERipilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeetvakitpdfsalkaldl  171
DSSP  EE.EELLLLEEllllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhhhhhllllhhhhhhlll


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Sbjct gvgvivtasgdsvdfvsrtffpklrinedpvcgsahanlipywgkrlnqttlsayqvspr  231
DSSP  llleeeeeellllleeeeeeehhhleeeellllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeellll


DSSP  .............................
Query .............................  129
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Sbjct ggfltcevkenrviiggtaklfakgeayl  260
DSSP  lleeeeeeelleeeeeeleeeeeeeeeel


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.1

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee


DSSP  ............................................................
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Sbjct wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll


DSSP  ................lLLEEEEeelllllllleEEEEElLLLL.....lLHHHhHHHHH
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Sbjct eripilpeyeaalgtkiYEAYLG...........RDLFF.VLKDeetvakITPD.FSALK  167
DSSP  eellllhhhhhhhllllLEEEEL...........LLEEE.ELLLhhhhhhLLLL.HHHHH


DSSP  HH.LLLEEEEEEELLLllEEEEEEEEL...LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLllllEEE
Query EL.RQFESIFLLPGDDprAFRARIFTL...EEELPFAGHPLLGAAALLHHLRGgdneQHW   95
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Sbjct ALdLGVGVIVTASGDS.vDFVSRTFFPklrINEDPVCGSAHANLIPYWGKRLN...qTTL  223
DSSP  HLlLLLLEEEEEELLL.lLEEEEEEEHhhlEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHL...lLEE


DSSP  EEELL...LLEEEEEEEEElleeEEEEELLLLLLLLL....
Query TLHLA...SKSVALRSVRAgsgfYAEMDQGRAEFGAT....  129
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Sbjct SAYQVsprGGFLTCEVKEN....RVIIGGTAKLFAKGeayl  260
DSSP  EEEELlllLLEEEEEEELL....EEEEEELEEEEEEEeeel