No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.2

DSSP  lhhhhhhhhlllLLLLllEEEEL.......LLEEEEEELlLHHHhhHLLLlhhhhLLLLL
Query rdaellkalgisDSTFpiEIYHN.......GPRHVFVGLpSIDAlsALHPdhralSNFHD   53
ident                    |          |           |                 
Sbjct ............MHNY..VIIDAfasvpleGNPVAVFFD.ADDL..PPAQmqriaREMNL   43
DSSP  ............LLLE..EEEEElllllllLEEEEEELL.HHHL..LHHHhhhhhHHHLL


DSSP  LEEEEEEEE..lLEEEEEEELHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHllLLLLlLLEEEEEL
Query MAINCFAGA..gRRWRSRMFSPaygVVEDAATGSAAGPLAIHLARhgQIEFgQPVEILQG  111
ident                  | | |   | |    |      || |                 
Sbjct SESTFVLKPrngGDALIRIFTP...VNELPFAGAPLLGTAIALGA..HTDN.HRLYLETQ   97
DSSP  LLEEEEELLlllLLEEEEEELL...LLEELLLHHHHHHHHHHHHL..LLLL.LEEEEEEL


DSSP  hhhllLEEEEEEEEEElLEEEEEEEELLLLLLLLLLlll
Query veigrPSLMFAKAEGRaEQLTRVEVSGNGVTFGRGTivl  150
ident              |                |        
Sbjct .....MGTIAFELERQnGSVIAASMDQPIPTWTALG...  128
DSSP  .....LEEEEEEEEEElLEEEEEEELLLLLLLLLLL...


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  lhhhhhhhhllllllllleeeellleeeeeelllhhhhhhllllhhhhlllllleeeEEE
Query rdaellkalgisdstfpieiyhngprhvfvglpsidalsalhpdhralsnfhdmainCFA   60
ident                                                             
Sbjct .........................................................MHN    3
DSSP  .........................................................LLL


DSSP  EEL..............LEEEEEEElhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHhlllllllLLE
Query GAG..............RRWRSRMFspaygvvedaaTGSAAGPLAIHLArhgqiefgQPV  106
ident                                             |               
Sbjct YVIidafasvplegnpvAVFFDADD..........lPPAQMQRIAREMN.......lSES   46
DSSP  EEEeeelllllllleeeEEELLHHH..........lLHHHHHHHHHHHL.......lLLE


DSSP  EEEELH.hhLLLEEEEEEEeeelleeeeEEEE..........................LL
Query EILQGV.eiGRPSLMFAKAegraeqltrVEVS..........................GN  139
ident          |                  |                               
Sbjct TFVLKPrngGDALIRIFTP.........VNELpfagapllgtaialgahtdnhrlyleTQ   97
DSSP  EEEELLlllLLEEEEEELL.........LLEElllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeEL


DSSP  LL....................LLLLLLLLL
Query GV....................TFGRGTIVL  150
ident                            |   
Sbjct MGtiafelerqngsviaasmdqPIPTWTALG  128
DSSP  LEeeeeeeeeelleeeeeeellLLLLLLLLL