No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=13.7

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll


DSSP  .lhhHHHHHHHHLLLlhHHLLllllLEEEllllLEEEEELLLlLLHHHLLLLHHHHHHHh
Query .egeTRAAIINALHLteDDILpglpIQVAttghSKVMIPLKPeVDIDALSPDLNALTAIs   59
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Sbjct eripILPEYEAALGT..KIYE....AYLG....RDLFFVLKDeETVAKITPDFSALKAL.  169
DSSP  eellLLHHHHHHHLL..LLLE....EEEL....LLEEEELLLhHHHHHLLLLHHHHHHL.


DSSP  hhHLLLLEEEEEELLLLlEEEELEEEHHHLEEEELLLHHHHHHHHHHHHHllLLLLllle
Query kkIGCNGFFPFQIRPGKnETDGRMFSPAIGIVEDPVTGNANGPMGAWLVHhnVLPHdgnv  119
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Sbjct ..DLGVGVIVTASGDSV.DFVSRTFFPKLRINEDPVCGSAHANLIPYWGK..RLNQ....  220
DSSP  ..LLLLLEEEEEELLLL.LEEEEEEEHHHLEEEELLLLLLHHHHHHHHHH..HHLL....


DSSP  EEEEEEELHHhlLLEEEEEEEEEelleeEEEEEELLLLLLLLLLLLLll
Query LRVKGHQGRAlgRDGMIEVTVTIrdnqpEKVTISGTAVILFHAEWAIel  168
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Sbjct TTLSAYQVSP..RGGFLTCEVKE.....NRVIIGGTAKLFAKGEAYL..  260
DSSP  LEEEEEELLL..LLLEEEEEEEL.....LEEEEEELEEEEEEEEEEL..


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.1

DSSP  lhhhhhhhhhhllllHHHLlllllLEEELLL.......LLEEEEELLLlllHHHLLLlhh
Query egetraaiinalhltEDDIlpglpIQVATTG.......HSKVMIPLKPevdIDALSPdln   53
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Sbjct ...............MSYP.....YYIVDAFaeevfkgNPAAVYVLEK...WLPEAVmqn   37
DSSP  ...............LEEE.....EEEEEELlllllllEEEEEEELLL...LLLHHHhhh


DSSP  hHHHHHhhhlLLLEEEEEELLllLEEEELEEEHhhlEEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query aLTAISkkigCNGFFPFQIRPgkNETDGRMFSPaigIVEDPVTGNANGPMGAWLVHHNVL  113
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Sbjct iAIENN....LSETAFTVKEG..QSYALRWFTP...EREIDLCGHATLATAFVLFNYYSV   88
DSSP  hHHHHL....LLLEEEEEEEL..LEEEEEEELL...LLEELLLHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLllleEEEEEEELhhhllLEEEEEEEEEelleeEEEE......................
Query PHdgnvLRVKGHQGralgrDGMIEVTVTIrdnqpEKVT......................  151
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Sbjct AE....ETLHFTSQ.....SGPLAVTKKE.....EYYYldfpyilperipilpeyeaalg  134
DSSP  LL....LEEEEEEL.....LEEEEEEEEL.....LEEEeeeelllleellllhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
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Sbjct tkiyeaylgrdlffvlkdeetvakitpdfsalkaldlgvgvivtasgdsvdfvsrtffpk  194
DSSP  lllleeeellleeeelllhhhhhhllllhhhhhhlllllleeeeeellllleeeeeeehh


DSSP  .................................................eelllllllll
Query .................................................isgtavilfha  162
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Sbjct lrinedpvcgsahanlipywgkrlnqttlsayqvsprggfltcevkenrviiggtaklfa  254
DSSP  hleeeellllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllleeeeeeelleeeeeeleeeee


DSSP  llllll
Query ewaiel  168
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Sbjct kgeayl  260
DSSP  eeeeel