No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=16.2

DSSP  ..LEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLlLLEEE
Query ..PQVYHVDAFTSQPFRGNSAGVVFPADNLSEAQMQLIARELGHSETAFLLHSDdSDVRI   58
ident      | ||||    | || | |      | || || || |   |||||           
Sbjct msYPYYIVDAFAEEVFKGNPAAVYVLEKWLPEAVMQNIAIENNLSETAFTVKEG.QSYAL   59
DSSP  leEEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEL.LEEEE


DSSP  EEELLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLEEEEEEEEEelleEEEEELL
Query RYFTPTVEVPICGHATVAAHYVRAKVLGLGNCTIWQTSLAGKHRVTIEKhnddYRISLEQ  118
ident | |||  |   ||||| |   |          |   ||  |   ||           |  
Sbjct RWFTPEREIDLCGHATLATAFVLFNYYSVAEETLHFTSQSGPLAVTKKE....EYYYLDF  115
DSSP  EEELLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELLEEEEEEEEL....LEEEEEE


DSSP  LLLLLLLLL...................................................
Query GTPGFEPPL...................................................  127
ident      |                                                      
Sbjct PYILPERIPilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeetvakitpdfsalkaldlgvgv  175
DSSP  ELLLLEELLllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhhhhhllllhhhhhhlllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  127
ident                                                             
Sbjct ivtasgdsvdfvsrtffpklrinedpvcgsahanlipywgkrlnqttlsayqvsprggfl  235
DSSP  eeeeellllleeeeeeehhhleeeellllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllllee


DSSP  .........................
Query .........................  127
ident                          
Sbjct tcevkenrviiggtaklfakgeayl  260
DSSP  eeeeelleeeeeeleeeeeeeeeel


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=8.6

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll


DSSP  .................LEEEEEeelllllllleEEEEEELLL....llLHHHhHHHHHH
Query .................PQVYHVdaftsqpfrgnSAGVVFPAD....nlSEAQmQLIARE   39
ident                     |                     |                 
Sbjct eripilpeyeaalgtkiYEAYLG...........RDLFFVLKDeetvakITPD.FSALKA  168
DSSP  eellllhhhhhhhllllLEEEEL...........LLEEEELLLhhhhhhLLLL.HHHHHH


DSSP  H.LLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLL...LEELLLHHHHHHHHHHHHHHHLLllEEEEEE
Query L.GHSETAFLLHSDDSDVRIRYFTPT...VEVPICGHATVAAHYVRAKVLGLgnCTIWQT   95
ident |            |  |   | | |     | | || |         | |     |    
Sbjct LdLGVGVIVTASGDSVDFVSRTFFPKlriNEDPVCGSAHANLIPYWGKRLNQ..TTLSAY  226
DSSP  LlLLLLEEEEEELLLLLEEEEEEEHHhleEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LEEEEE


DSSP  EL...LEEEEEEEEEelleEEEEELLLLLLLLLLL...
Query SL...AGKHRVTIEKhnddYRISLEQGTPGFEPPL...  127
ident       |             |         |       
Sbjct QVsprGGFLTCEVKE....NRVIIGGTAKLFAKGEayl  260
DSSP  ELlllLLEEEEEEEL....LEEEEEELEEEEEEEEeel


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll


DSSP  ........leeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeEELL.
Query ........pqvyhvdaftsqpfrgnsagvvfpadnlseaqmqliarelghsetafLLHS.   51
ident                                                             
Sbjct eripilpeyeaalgtkiyeaylgrdlffvlkdeetvakitpdfsalkaldlgvgvIVTAs  180
DSSP  eellllhhhhhhhllllleeeellleeeelllhhhhhhllllhhhhhhlllllleEEEEe


DSSP  ...lllLEEEeeelllleelllhhhHHHHHHHHHHHHL....lLLEEEEEEElLEEEEEE
Query ...ddsDVRIryftptvevpicghaTVAAHYVRAKVLG....lGNCTIWQTSlAGKHRVT  104
ident         |                   ||       |           | |       |
Sbjct gdsvdfVSRT...ffpklrinedpvCGSAHANLIPYWGkrlnqTTLSAYQVS.PRGGFLT  236
DSSP  llllleEEEE...eehhhleeeellLLLLHHHHHHHHHhhhllLEEEEEELL.LLLLEEE


DSSP  EEEELLEEEEEEL.llllllllll
Query IEKHNDDYRISLE.qgtpgfeppl  127
ident  |       |              
Sbjct CEVKENRVIIGGTaklfakgeayl  260
DSSP  EEEELLEEEEEELeeeeeeeeeel