No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=9.0

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Query ..eGETRaaiinalhlteddilpglPIQVATTG.HSKVMIP..lKPEVD..IDAL....S   49
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Sbjct mrsTKVI..................HIVGCHAEgEVGDVIVggvAPPPGetVWEQsrfiA   42
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Query PDLNALTAIS.KKIG..cNGFFPFQIR.pgknETDGRMFSPaigIVEDPVTGNANGPMGA  105
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Sbjct NDETLRNFVLnKPRGgvfRHVNLLVPPkdpraQMGFIIMEP...ADTPPMSGSNSICVST   99
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DSSP  HHHHLLLLLLLLLEEEEEEEELhhhllLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEL.LLLLLLL.LL
Query WLVHHNVLPHDGNVLRVKGHQGralgrDGMIEVTVTIRDNQPEKVTISG.TAVILFH.AE  163
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Sbjct VLLDSGIIAMQEPVTHMVLEAP.....GGIIEVEAECRNGKAERISVRNvPSFADRLdAP  154
DSSP  HHHHHLLLLLLLLEEEEEEELL.....LLEEEEEEEELLLLEEEEEEELlLLEELLLlEE


DSSP  LLLLL.......................................................
Query WAIEL.......................................................  168
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Sbjct LDVTGlgtimvdtayggdsfvivdaaqigepgqarelaeigvkitkafrhperdwrhisf  214
DSSP  EELLLlleeeeeeeellleeeeeehhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllle


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Sbjct cqitepvtregdvltgvntvptgtgcsarmavlhakgqmkagerfigksvtefhcrldkv  274
DSSP  eeeellleellleeeeleelllhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllleeeeeeee


DSSP  .....................................
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Sbjct lelggkpaispiisgrawvtgtsqlmldpsdpfphgy  311
DSSP  eeelleeeeeeeeeeleeeeeeeeellllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.2

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct mrstkvihivgchaegevgdvivggvapppgetvweqsrfiandetlrnfvlnkprggvf   60
DSSP  lllllleeeeeeeelleeleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
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Sbjct rhvnllvppkdpraqmgfiimepadtppmsgsnsicvstvlldsgiiamqepvthmvlea  120
DSSP  lleeeeelllllllleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeel


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Query ..............................egeTRAAiinalHLTEddilpglpIQVATT   30
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Sbjct pggiieveaecrngkaerisvrnvpsfadrldaPLDV....tGLGT......imVDTAYG  170
DSSP  llleeeeeeeelllleeeeeeelllleelllleEEEL....lLLLE......eeEEEEEL


DSSP  LLLEEEEELLllllhhHLLLL.HHHHHHHHHHH..........LLLLEEEEE.ELLL..L
Query GHSKVMIPLKpevdidALSPD.LNALTAISKKI..........GCNGFFPFQ.IRPG..K   76
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Sbjct GDSFVIVDAA...qigEPGQArELAEIGVKITKafrhperdwrHISFCQITEpVTREgdV  227
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Query NETDGRMfspaigivedpVTGNANGPMGAWLVHHNVLPHdgnVLRVKGHQGralgrdGMI  136
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Sbjct LTGVNTV...........PTGTGCSARMAVLHAKGQMKA...GERFIGKSV......TEF  267
DSSP  EEELEEL...........LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLL...LLEEEELLL......LLE


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Query EVTV.TIRD...nQPEKVTISGTAVILFHAEWAIEL........  168
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Sbjct HCRLdKVLElggkPAISPIISGRAWVTGTSQLMLDPsdpfphgy  311
DSSP  EEEEeEEEEelleEEEEEEEEELEEEEEEEEELLLLllllllll