No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=10.5

DSSP  ......LLLEEEEELLEEEEEEEellLLLL...............lLHHHHHHHHLLlLL
Query ......MQFSKMHGLGNDFVVVDgvtQNVF...............fTPETIRRLANRhCG   39
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Sbjct mrstkvIHIVGCHAEGEVGDVIV...GGVApppgetvweqsrfianDETLRNFVLNK.PR   56
DSSP  llllllEEEEEEEELLEELEEEE...ELLLllllllhhhhhhhhhhHLHHHHHHHLL.LL


DSSP  LL.LLEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLlLEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLL....LE
Query IG.FDQLLIVEAPYDPELDFHYRIFNADgSEVSQCGNGARCFARFVTLKGLTNK....KD   94
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Sbjct GGvFRHVNLLVPPKDPRAQMGFIIMEPA.DTPPMSGSNSICVSTVLLDSGIIAMqepvTH  115
DSSP  LLlLLLEEEEELLLLLLLLEEEELLLLL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllleEE


DSSP  EEEELLLLEEEEEELLL....LLEEEELL...............................
Query ISVSTQKGNMVLTVKDD....NQIRVNMG...............................  119
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Sbjct MVLEAPGGIIEVEAECRngkaERISVRNVpsfadrldapldvtglgtimvdtayggdsfv  175
DSSP  EEEELLLLEEEEEEEELllleEEEEEELLlleelllleeeellllleeeeeeeellleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct ivdaaqigepgqarelaeigvkitkafrhperdwrhisfcqitepvtregdvltgvntvp  235
DSSP  eeehhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeellleellleeeeleell


DSSP  ....................................LLLLL..HHHL.............
Query ....................................EPIWE..PAKI.............  128
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Sbjct tgtgcsarmavlhakgqmkagerfigksvtefhcrlDKVLElgGKPAispiisgrawvtg  295
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllleeeeeEEEEEelLEEEeeeeeeeleeeee


DSSP  ..............ll
Query ..............pf  130
ident                 
Sbjct tsqlmldpsdpfphgy  311
DSSP  eeeellllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct mrstkvihivgchaegevgdvivggvapppgetvweqsrfiandetlrnfvlnkprggvf   60
DSSP  lllllleeeeeeeelleeleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct rhvnllvppkdpraqmgfiimepadtppmsgsnsicvstvlldsgiiamqepvthmvlea  120
DSSP  lleeeeelllllllleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeel


DSSP  ..........................................LLLEEEEELlEEEEEEEE
Query ..........................................MQFSKMHGLgNDFVVVDG   18
ident                                                  |    || || 
Sbjct pggiieveaecrngkaerisvrnvpsfadrldapldvtglgtIMVDTAYGG.DSFVIVDA  179
DSSP  llleeeeeeeelllleeeeeeelllleelllleeeellllleEEEEEEELL.LEEEEEEH


DSSP  llLLLLLLHHHHHHHHlllLLLL..............LLEEEEEELLLLL..llLEEEEE
Query vtQNVFFTPETIRRLAnrhCGIG..............FDQLLIVEAPYDP..elDFHYRI   62
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Sbjct ..AQIGEPGQARELAE...IGVKitkafrhperdwrhISFCQITEPVTREgdvlTGVNTV  234
DSSP  ..HHLLLHHHHHHHHH...HHHHhhllllllllllllLLEEEEELLLEELlleeEELEEL


DSSP  eelllleelllLLLHHHHHHHHHHLLLLL.lLEEEEELLlLEEEEEELLL........LL
Query fnadgsevsqcGNGARCFARFVTLKGLTN.kKDISVSTQkGNMVLTVKDD........NQ  113
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Sbjct .........ptGTGCSARMAVLHAKGQMKagERFIGKSV.TEFHCRLDKVlelggkpaIS  284
DSSP  .........llHHHHHHHHHHHHHLLLLLllLEEEELLL.LLEEEEEEEEeeelleeeEE


DSSP  EEEELLLLLLLHH..........hlll
Query IRVNMGEPIWEPA..........kipf  130
ident                            
Sbjct PIISGRAWVTGTSqlmldpsdpfphgy  311
DSSP  EEEEELEEEEEEEeellllllllllll