No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=11.9

DSSP  .....LLLEEEEEELllllllLEEEEEELLhHHLL..............hHHHHHHHHH.
Query .....MHNYVIIDAFasvpleGNPVAVFFDaDDLP..............pAQMQRIARE.   40
ident          |   |       |    |       |                         
Sbjct mrstkVIHIVGCHAE......GEVGDVIVGgVAPPpgetvweqsrfiandETLRNFVLNk   54
DSSP  lllllLEEEEEEEEL......LEELEEEEElLLLLllllhhhhhhhhhhhLHHHHHHHLl


DSSP  ...hLLLLEEEEELLLL.LLLEEEEEELLLLEELLLHHHHHHHHHHHHL..LLLL....L
Query ...mNLSESTFVLKPRN.GGDALIRIFTPVNELPFAGAPLLGTAIALGA..HTDN....H   90
ident               |          |  |    |  |         |             
Sbjct prggVFRHVNLLVPPKDpRAQMGFIIMEPADTPPMSGSNSICVSTVLLDsgIIAMqepvT  114
DSSP  llllLLLLEEEEELLLLlLLLEEEELLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLLllleE


DSSP  EEEEEELLEEEEEEEEEELLEEEEEEELLLLLLLLLLL......................
Query RLYLETQMGTIAFELERQNGSVIAASMDQPIPTWTALG......................  128
ident    ||   | |  | |  ||     |          |                       
Sbjct HMVLEAPGGIIEVEAECRNGKAERISVRNVPSFADRLDapldvtglgtimvdtayggdsf  174
DSSP  EEEEELLLLEEEEEEEELLLLEEEEEEELLLLEELLLLeeeellllleeeeeeeelllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct vivdaaqigepgqarelaeigvkitkafrhperdwrhisfcqitepvtregdvltgvntv  234
DSSP  eeeehhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeellleellleeeeleel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct ptgtgcsarmavlhakgqmkagerfigksvtefhcrldkvlelggkpaispiisgrawvt  294
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllleeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeleeee


DSSP  .................
Query .................  128
ident                  
Sbjct gtsqlmldpsdpfphgy  311
DSSP  eeeeellllllllllll


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mrstkvihivgchaegevgdvivggvapppgetvweqsrfiandetlrnfvlnkprggvf   60
DSSP  lllllleeeeeeeelleeleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rhvnllvppkdpraqmgfiimepadtppmsgsnsicvstvlldsgiiamqepvthmvlea  120
DSSP  lleeeeelllllllleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeel


DSSP  .........................................LLLEEEEEELlllllllEE
Query .........................................MHNYVIIDAFasvplegNP   19
ident                                                             
Sbjct pggiieveaecrngkaerisvrnvpsfadrldapldvtglgTIMVDTAYGG.......DS  173
DSSP  llleeeeeeeelllleeeeeeelllleelllleeeelllllEEEEEEEELL.......LE


DSSP  EEEELlHHHL..LHHHHHHHHHHHL..............LLLEEEEELLLLL...lLEEE
Query VAVFFdADDL..PPAQMQRIAREMN..............LSESTFVLKPRNG...gDALI   60
ident       |     |                           |                   
Sbjct FVIVD.AAQIgePGQARELAEIGVKitkafrhperdwrhISFCQITEPVTREgdvlTGVN  232
DSSP  EEEEE.HHHLllHHHHHHHHHHHHHhhllllllllllllLLEEEEELLLEELlleeEELE


DSSP  EEelllleelLLHHHHHHHHHHHHL..LLLL.LEEEEEELlEEEEEEE.EEEL...lEEE
Query RIftpvnelpFAGAPLLGTAIALGA..HTDN.HRLYLETQmGTIAFEL.ERQN...gSVI  113
ident             |         | |        |             |           |
Sbjct TV........PTGTGCSARMAVLHAkgQMKAgERFIGKSV.TEFHCRLdKVLElggkPAI  283
DSSP  EL........LLHHHHHHHHHHHHHllLLLLlLEEEELLL.LLEEEEEeEEEEelleEEE


DSSP  EEEELLLLLLLLLLL.............
Query AASMDQPIPTWTALG.............  128
ident                             
Sbjct SPIISGRAWVTGTSQlmldpsdpfphgy  311
DSSP  EEEEEELEEEEEEEEellllllllllll


No 3: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mrstkvihivgchaegevgdvivggvapppgetvweqsrfiandetlrnfvlnkprggvf   60
DSSP  lllllleeeeeeeelleeleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rhvnllvppkdpraqmgfiimepadtppmsgsnsicvstvlldsgiiamqepvthmvlea  120
DSSP  lleeeeelllllllleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pggiieveaecrngkaerisvrnvpsfadrldapldvtglgtimvdtayggdsfvivdaa  180
DSSP  llleeeeeeeelllleeeeeeelllleelllleeeellllleeeeeeeellleeeeeehh


DSSP  .....................................lLLEEEEEelllllllleEEEEE
Query .....................................mHNYVIIDafasvplegnPVAVF   23
ident                                                         |   
Sbjct qigepgqarelaeigvkitkafrhperdwrhisfcqitEPVTREG..........DVLTG  230
DSSP  hlllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeeLLLEELL..........LEEEE


DSSP  LlHHHLLHHHHHHHHHHHL.......lLLEEEEellllllleeeEEELL...........
Query FdADDLPPAQMQRIAREMN.......lSESTFVlkprnggdaliRIFTP...........   65
ident                                                             
Sbjct V.NTVPTGTGCSARMAVLHakgqmkagERFIGK.......svteFHCRLdkvlelggkpa  282
DSSP  L.EELLLHHHHHHHHHHHHhlllllllLEEEEL.......llllEEEEEeeeeeelleee


DSSP  ..LLEELllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeeeelleeeeeeellllll
Query ..VNELPfagapllgtaialgahtdnhrlyletqmgtiafelerqngsviaasmdqpipt  123
ident                                                             
Sbjct isPIISG....................................rawvtgtsqlmldpsdp  306
DSSP  eeEEEEE....................................leeeeeeeeelllllll


DSSP  lllll
Query wtalg  128
ident      
Sbjct fphgy  311
DSSP  lllll