No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=11.5

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct msypyyivdafaeevfkgnpaavyvlekwlpeavmqniaiennlsetaftvkegqsyalr   60
DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct wftpereidlcghatlatafvlfnyysvaeetlhftsqsgplavtkkeeyyyldfpyilp  120
DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelleeeeeeeelleeeeeeellll


DSSP  ..LLHHhhHHHHHHLLLlhhHLLLllLEEEllllLEEEEELLH.HHHHLLLLLLL.LHHH
Query ..PDAGtcRWFAEAFSLsanDLSGhpPRVVstglPYLLLPVTA.EALGRARQVND.LQEA   56
ident              |                      |       |           |   
Sbjct erIPIL..PEYEAALGT...KIYE..AYLG....RDLFFVLKDeETVAKITPDFSaLKAL  169
DSSP  eeLLLL..HHHHHHHLL...LLLE..EEEL....LLEEEELLLhHHHHHLLLLHHhHHHL


DSSP  HhhhLLLEEEEEELLL...LEEELLLL.LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHllLLLLlLLE
Query LdklGAAFVYLLDVDG...REGRTWDN.LGLVEDVATGSAAGPVAAYLVEygLAARgEPF  112
ident         |             ||    |   ||   |||      |             
Sbjct D...LGVGVIVTASGDsvdFVSRTFFPkLRINEDPVCGSAHANLIPYWGK..RLNQ.TTL  223
DSSP  L...LLLLEEEEEELLlllEEEEEEEHhHLEEEELLLLLLHHHHHHHHHH..HHLL.LEE


DSSP  EEEELHHhlLLEEEEEEELlLLLEEEELLLLLLLLLLLLLl
Query VLHQGRFleRPSRLDVQVAtDGSVRVGGHVQLLARAELLTs  153
ident    |     |   |   |     |  ||   | |  |    
Sbjct SAYQVSP..RGGFLTCEVK.ENRVIIGGTAKLFAKGEAYL.  260
DSSP  EEEELLL..LLLEEEEEEE.LLEEEEEELEEEEEEEEEEL.


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=7.8

DSSP  llhhhhhhhhhhllllhHHLLlllLEEELL.......LLLEEEEELLHhhHHLLLLllll
Query pdagtcrwfaeafslsaNDLSghpPRVVST.......GLPYLLLPVTAeaLGRARQvndl   53
ident                            |         | |                    
Sbjct .................MSYP...YYIVDAfaeevfkGNPAAVYVLEK..WLPEAVmqni   38
DSSP  .................LEEE...EEEEEElllllllLEEEEEEELLL..LLLHHHhhhh


DSSP  hHHHHhhlLLEEEEEELL..LLEEELLLLLLllLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLL
Query qEALDklgAAFVYLLDVD..GREGRTWDNLGlvEDVATGSAAGPVAAYLVEYGLAARgEP  111
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Sbjct aIENN...LSETAFTVKEgqSYALRWFTPER..EIDLCGHATLATAFVLFNYYSVAE.ET   92
DSSP  hHHHL...LLLEEEEEEEllEEEEEEELLLL..EELLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.LE


DSSP  EEEEELhhhllLEEEEEEELLlLLEEEELLLLLLLLLLLLLL..................
Query FVLHQGrflerPSRLDVQVATdGSVRVGGHVQLLARAELLTS..................  153
ident               | |               |  |   |                    
Sbjct LHFTSQ.....SGPLAVTKKE.EYYYLDFPYILPERIPILPEyeaalgtkiyeaylgrdl  146
DSSP  EEEEEL.....LEEEEEEEEL.LEEEEEEELLLLEELLLLHHhhhhhllllleeeellle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  153
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Sbjct ffvlkdeetvakitpdfsalkaldlgvgvivtasgdsvdfvsrtffpklrinedpvcgsa  206
DSSP  eeelllhhhhhhllllhhhhhhlllllleeeeeellllleeeeeeehhhleeeellllll


DSSP  ......................................................
Query ......................................................  153
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Sbjct hanlipywgkrlnqttlsayqvsprggfltcevkenrviiggtaklfakgeayl  260
DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllleeeeeeelleeeeeeleeeeeeeeeel