No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2D Z-score=12.5

DSSP  ...................LLLLLLEEELLL.....LLLEEEELLLLLE.EELL...LLH
Query ...................NVYTAEATATGG.....RAGTTRSSDDRLN.LDLS...VPA   32
ident                            |          ||       ||           
Sbjct hhhhdydipttenlyfqghMTIHKKGQAHWEgdikrGKGTVSTESGVLNqQPYGfntRFE   60
DSSP  lllllllllllllllllllLLLLLLEEEEEElllllLEEEEEELLLLLLlEEELhhhHHL


DSSP  HhllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlLEEEEEEEEEEELLEEEE
Query EmggdgGPGTNPEQLFAAGYAACFQGALGVVSRRQKIDVPAdSTITARVGLQKAGLAFAL   92
ident         ||||| |  |  ||||  ||                 || | | |    || 
Sbjct G.....EKGTNPEELIGAAHAACFSMALSLMLGEAGFTPTS.IDTTADVSLDKVDAGFAI  114
DSSP  L.....LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLE.EEEEEEEEEELLLLLLEE


DSSP  .EEEEEEELL..LLLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHllLLLLEEEELL..
Query .DVELEGHFP..GLSREQAEGLMHAAHEVCPYSAATrnNVDVRLKVRE..  137
ident     |       |       |    |   || |          |      
Sbjct tKIALKSEVAvpGIDASTFDGIIQKAKAGCPVSQVL..KAEITLDYQLks  162
DSSP  eEEEEEEEEEllLLLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHL..LLEEEEEEEEel


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2D Z-score=5.5

DSSP  .....................LLLLLLEEELLLL.LLEEEEL.....LLLLEEELlllhh
Query .....................NVYTAEATATGGR.AGTTRSS.....DDRLNLDLsvpae   33
ident                            |   |    |    |                  
Sbjct hhhhdydipttenlyfqghmtIHKKGQAHWEGDIkRGKGTVStesgvLNQQPYGF.....   55
DSSP  lllllllllllllllllllllLLLLEEEEEELLLlLLEEEEEellllLLLEEELH.....


DSSP  hllllllLLLHH....hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....lllLLLLEEEEEEEEE
Query mggdggpGTNPE....qLFAAGYAACFQGALGVVSRRQK.....idvPADSTITARVGLQ   84
ident         |  |            |                        | |        
Sbjct .......NTRFEgekgtNPEELIGAAHAACFSMALSLMLgeagftptSIDTTADVSLDKV  108
DSSP  .......HHHHLlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllEEEEEEEEEEELL


DSSP  EElleEEEEEEEEEELLL........lLHHHHHHHHHHH..HHHLhhhhhhllllLLEEE
Query KAglaFALDVELEGHFPG........lSREQAEGLMHAA..HEVCpysaatrnnvDVRLK  134
ident  |                                         |                
Sbjct DA...GFAITKIALKSEVavpgidastFDGIIQKAKAGCpvSQVL..........KAEIT  155
DSSP  LL...LLEEEEEEEEEEEelllllhhhHHHHHHHHHHHLhhHHHL..........LLEEE


DSSP  ELL....
Query VRE....  137
ident        
Sbjct LDYqlks  162
DSSP  EEEeeel