No 1: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.9

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct elqgwdgqspgteshqkgkpvpriaelmgkklpnfgpyleqrkkiiaeekmrlkeqnerk   60
DSSP  lllllllllllllleelleelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ...............................LEEE.EEEHHHLLLLLHHHHHHHHHHlll
Query ...............................SKGF.FVDTTRCTACRGCQVACKQWHgnp   28
ident                                       |   |  |  |   |       
Sbjct pfipkkpipaikdvigkalqylgtfgelsniEQVVaVIDEEMCINCGKCYMTCNDSG...  117
DSSP  llllllllllhhhhllllhhhlllhhhllllLLEEeEELLLLLLLLLHHHHHHHHHL...


DSSP  lllllllllllllllllllLLLEEEEEeeeelleeeeEEEEELLLlllllhhhhhhllll
Query atptentgfhqnppdfnfhTYKLVRMHeqeidgridwLFFPDQCRhciappckatadmed   88
ident                                         |                   
Sbjct ..................yQAIQFDPE..........THLPTVTD...............  134
DSSP  ..................lLLEEELLL..........LLLEEELL...............


DSSP  llleeelllllleeelhhhhhlllhhhhhhhlllllleelllllleeLLLLLhhhhllll
Query esaiihddatgcvlftpktkdledyesvisacpydvprkvaesnqmaKCDMCidritngl  148
ident                                                 |  |        
Sbjct ...............................................TCTGC........  139
DSSP  ...............................................LLLLL........


DSSP  lLHHHHHLLL.LLEEEEEHHhhhhhhhhhhhhhllllllleellllllleeeeelllhhh
Query rPACVTSCPT.GAMNFGDLSemeamasarlaeikaaysdaklcdpddvrvifltahnpkl  207
ident    |   ||                                                   
Sbjct .TLCLSVCPIiDCIRMVSRT......................................tp  160
DSSP  .LHHHHHLLLlLLEEEEELL......................................ll


DSSP  lllllll
Query yheyava  214
ident        
Sbjct yepkrgl  167
DSSP  lllllll


No 2: Query=mol1B Sbjct=mol2A Z-score=2.6

DSSP  leeeeeehhhlllllhhhhhhhhhhlllllllllllllllLLLLllllllEEEE......
Query skgffvdttrctacrgcqvackqwhgnpatptentgfhqnPPDFnfhtykLVRM......   54
ident                                                             
Sbjct ..............................elqgwdgqspGTES..hqkgKPVPriaelm   28
DSSP  ..............................llllllllllLLLL..eellEELLllllll


DSSP  .........................................................eee
Query .........................................................heq   57
ident                                                             
Sbjct gkklpnfgpyleqrkkiiaeekmrlkeqnerkpfipkkpipaikdvigkalqylgtfgel   88
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhllllhhhlllhhhl


DSSP  eelleeeeeeeeELLLLLllLHHHHHHL.LLLLlLEEELLLLLLEEELHHHhhLLLHhHH
Query eidgridwlffpDQCRHCiaPPCKATAD.MEDEsAIIHDDATGCVLFTPKTkdLEDYeSV  116
ident               |  |    |  |        ||  |  |     |            
Sbjct snieqvvavideEMCINC..GKCYMTCNdSGYQ.AIQFDPETHLPTVTDTC..TGCT.LC  142
DSSP  llllleeeeellLLLLLL..LHHHHHHHhHLLL.LEEELLLLLLEEELLLL..LLLL.HH


DSSP  HHHLLLL.LLEELLLLlleelllllhhhhllllllhhhhhllllleeeeehhhhhhhhhh
Query ISACPYD.VPRKVAESnqmakcdmcidritnglrpacvtscptgamnfgdlsemeamasa  175
ident  | ||     | |                                               
Sbjct LSVCPIIdCIRMVSRT............................................  158
DSSP  HHHLLLLlLEEEEELL............................................


DSSP  hhhhhllllllleellllllleeeeelllhhhlllllll
Query rlaeikaaysdaklcdpddvrvifltahnpklyheyava  214
ident                                        
Sbjct ..............................tpyepkrgl  167
DSSP  ..............................lllllllll