No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.0

DSSP  LEEEEEEEEEEL..........................lllLHHH...............
Query FNAASVNIKIVG..........................nnvHPGT...............   19
ident                                                             
Sbjct QGIFTLEFSFKNddtkgdyvldkfkagiatnvtpqvtratiSGPDleavklayesfladk   60
DSSP  LEEEEEEEEELLllllllleeeeeeellllllllleeeeeeELLLhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................lllllLLHHHHHHHHHH.L
Query .........................................akgvmVNALSLAARIHA.E   37
ident                                                          |  
Sbjct eldgsfeindesadivligqgahasapqvgknsatflalfldqyafAGRDKNFLHFLAeV  120
DSSP  lleeeeeeelleeeeeeellllllllhhhlllhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHhL


DSSP  LLLLLL.......hhhllLLLLEEEEEEEEELL.LEEEEEEEEEELLhHHHH.HHHHHHH
Query VPADEA.......petteGYEGFYHLASMKGTV.DRAEMHYIIRDFDrKQFE.ARKRKMM   88
ident    |                                |      |                
Sbjct EHEDFYgkklgifhhddlMGDLASSPSMFDYEHaGKASLLNNVRYPQ.GTDPdTMIKQVL  179
DSSP  LLLLLLlllllllleellLEELEEEEEEEEEELlLLEEEEEEEEELL.LLLHhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHlllllllllEEEEEEEEEL.
Query EIAKKVgkglhpdcyIELVIEDSYY.  113
ident                           
Sbjct DKFSGI.........LDVTYNGFEEp  196
DSSP  HHHLLL.........EEEELLLLLLl


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=2.1

DSSP  ...............................LEEEEEEEEEELllllhhhlllllLLHHH
Query ...............................FNAASVNIKIVGnnvhpgtakgvmVNALS   29
ident                                         | |                 
Sbjct qgiftlefsfknddtkgdyvldkfkagiatnVTPQVTRATISG............PDLEA   48
DSSP  leeeeeeeeellllllllleeeeeeelllllLLLLEEEEEEEL............LLHHH


DSSP  HHHHHHHLLLLlllhhhlllllleeEEEEEEELLLEEEEEEEE.EELL..HHHHHHHHHH
Query LAARIHAEVPAdeapettegyegfyHLASMKGTVDRAEMHYII.RDFD..RKQFEARKRK   86
ident                             |       |    |                  
Sbjct VKLAYESFLAD............keLDGSFEINDESADIVLIGqGAHAsaPQVGKNSATF   96
DSSP  HHHHHHHHHHH............hlLEEEEEEELLEEEEEEELlLLLLllHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHhLLLLLL..............................................
Query MMEIAKKvGKGLHP..............................................  100
ident                                                             
Sbjct LALFLDQ.YAFAGRdknflhflaevehedfygkklgifhhddlmgdlasspsmfdyehag  155
DSSP  HHHHHLL.LLLLHHhhhhhhhhhhllllllllllllllleellleeleeeeeeeeeelll


DSSP  ............................llleeeeeeeeel
Query ............................dcyielviedsyy  113
ident                                          
Sbjct kasllnnvrypqgtdpdtmikqvldkfsgildvtyngfeep  196
DSSP  leeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhllleeeelllllll