No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=12.0

DSSP  LEEEEEEEEEEE..........lLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLllhhHLEEEEEEEEL
Query AGAGVFEAVITG..........kTIDPVVAASSIVLSLQQLVSREtdplDSKVVTVSKVN   50
ident  |       |||                | ||  ||                        
Sbjct SGIAYVQVNITGkashagaapelGVNALVEASDLVLRTMNIDDKA....KNLRFNWTIAK   56
DSSP  LEEEEEEEEEELlleellllhhhLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLL....LLEEEEEEEEE


DSSP  ........LLEEEEEEEEEELL..LHHHHHHHHHHHHHHhhHHLL.EEEEEELLhhhlLL
Query ........PDSITIGGTLRAFT..GFTQLQQRVKEVITKqaAVHR.CNASVNLTpngrEP   99
ident         | | |     |      |        |               |  |      
Sbjct agnvsniiPASATLNADVRYARneDFDAAMKTLEERAQQ..KKLPeADVKVIVT....RG  110
DSSP  ellllleeLLEEEEEEEEEELLhhHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLlLEEEEEEE....EL


DSSP  LLL
Query MPP  102
ident  | 
Sbjct RPA  113
DSSP  LLL


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=5.7

DSSP  ..LEEEEEEEEEE......elLLHHHhhHHHHHHHHHLLL..LLLLLHhHLEEEeeEEEL
Query ..AGAGVFEAVIT......gkTIDPVvaASSIVLSLQQLV..SRETDPlDSKVVtvSKVN   50
ident                                                          |  
Sbjct sgIAYVQVNITGKashagaapELGVN.aLVEASDLVLRTMniDDKAKN.LRFNWtiAKAG   58
DSSP  leEEEEEEEEELLleellllhHHLLL.hHHHHHHHHHHHHhhLLLLLL.EEEEEeeEEEL


DSSP  ....llEEEEEEEEEEL........lLHHHHHHHHHHhhhHHHHhlleEEEEELLhhhll
Query ....pdSITIGGTLRAF........tGFTQLQQRVKEvitKQAAvhrcNASVNLTpngre   98
ident                               |  |      |        | |        
Sbjct nvsniiPASATLNADVRyarnedfdaAMKTLEERAQQ...KKLP....EADVKVI.....  106
DSSP  lllleeLLEEEEEEEEEellhhhhhhHHHHHHHHHLL...LLLL....LLEEEEE.....


DSSP  LLLL...
Query PMPP...  102
ident        
Sbjct VTRGrpa  113
DSSP  EEELlll