No 1: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=6.5

DSSP  lEEEEEEEEELLLLLL...LLLEeeeeeellllllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhh
Query qGIFTLEFSFKNDDTK...GDYVldkfkagiatnvtpqvtratisgpdleavklayesfl   57
ident  |        |                                                 
Sbjct .GSLSGNLTVKGKQGHiayPHLA.....................................   22
DSSP  .LEEEEEEEEELLLEElllHHHL.....................................


DSSP  hhhlleeeeeeelleeeeeeellllllllhhhlllhhhhhhhhhllllllHHHHHHHHHH
Query adkeldgsfeindesadivligqgahasapqvgknsatflalfldqyafaGRDKNFLHFL  117
ident                                                        |   |
Sbjct .................................................iNPVHTFAPAL   33
DSSP  .................................................lLHHHHHHHHH


DSSP  hHLLLLLllllllllLLEEL.LLEELEEEEEEEEEE......lllLEEEEEEEEELLLLL
Query aEVEHEDfygkklgiFHHDD.LMGDLASSPSMFDYE......hagKASLLNNVRYPQGTD  170
ident                               |                    | |      
Sbjct .LELTQE.......vWDEGNeYFPPTSFQISNINGGtgatnvipgELNVKFNFRFSTEST   85
DSSP  .HHHHHL.......lLLLLLlLLLLLEEEEEEEELLllllleellEEEEEEEEELLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHL...LLEEEELLLLLLl
Query PDTMIKQVLDKFS...GILDVTYNGFEEp  196
ident        |           |         
Sbjct EAGLKQRVHAILDkhgVQYDLQWSCSGQ.  113
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhllLLEEEEEEEEEL.


No 2: Query=mol1A Sbjct=mol2A Z-score=3.0

DSSP  .LEEEEEEEEEllllllllleeeeeeellllllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhh
Query .QGIFTLEFSFknddtkgdyvldkfkagiatnvtpqvtratisgpdleavklayesflad   59
ident       |                                                     
Sbjct gSLSGNLTVKG.................................................   11
DSSP  lEEEEEEEEEL.................................................


DSSP  hlleeeeeeelleeeeeeellllllllhhhlllhhhhhhhhhlllLLLHHHhhhhhhhhh
Query keldgsfeindesadivligqgahasapqvgknsatflalfldqyAFAGRDknflhflae  119
ident                                                             
Sbjct .......................................kqghiaYPHLAI.........   23
DSSP  .......................................lleellLHHHLL.........


DSSP  lllllllllLLLLL..lEELL.....LEELEEEEEEEEE..elLLLEEEEEEEEELL...
Query vehedfygkKLGIF..hHDDL.....MGDLASSPSMFDY..ehAGKASLLNNVRYPQ...  167
ident           |       |             |               |           
Sbjct npvhtfapaLLELTqevWDEGneyfpPTSFQISNINGGTgatnVIPGELNVKFNFRFste   83
DSSP  lhhhhhhhhHHHHHhllLLLLlllllLLEEEEEEEELLLllllEELLEEEEEEEEELlll


DSSP  ...llLHHHHHHHHHHHHLlleEEELLlLLLL..
Query ...gtDPDTMIKQVLDKFSgilDVTYNgFEEP..  196
ident                                   
Sbjct steagLKQRVHAILDKHGV...QYDLQ.WSCSgq  113
DSSP  llhhhHHHHHHHHHHHLLL...LEEEE.EEEEel