cmd.read_pdbstr("""\ ATOM 1 N GLU D1612 -37.971 8.936 -10.792 1.00 0.48 \ ATOM 2 CA GLU D1612 -36.823 8.395 -11.580 1.00 0.48 \ ATOM 3 C GLU D1612 -36.816 8.864 -13.034 1.00 0.48 \ ATOM 4 O GLU D1612 -37.839 8.829 -13.726 1.00 0.48 \ ATOM 5 CB GLU D1612 -36.814 6.862 -11.531 1.00 0.48 \ ATOM 6 N VAL D1613 -35.650 9.297 -13.503 1.00 0.80 \ ATOM 7 CA VAL D1613 -35.431 9.439 -14.936 1.00 0.80 \ ATOM 8 C VAL D1613 -35.215 8.049 -15.537 1.00 0.80 \ ATOM 9 O VAL D1613 -35.211 7.877 -16.759 1.00 0.80 \ ATOM 10 CB VAL D1613 -34.227 10.360 -15.250 1.00 0.80 \ ATOM 11 N THR D1614 -35.030 7.061 -14.665 1.00 1.79 \ ATOM 12 CA THR D1614 -34.938 5.655 -15.066 1.00 1.79 \ ATOM 13 C THR D1614 -36.240 5.179 -15.745 1.00 1.79 \ ATOM 14 O THR D1614 -36.203 4.578 -16.817 1.00 1.79 \ ATOM 15 CB THR D1614 -34.585 4.752 -13.856 1.00 1.79 \ ATOM 16 N VAL D1615 -37.379 5.493 -15.122 1.00 -0.48 \ ATOM 17 CA VAL D1615 -38.708 5.212 -15.673 1.00 -0.48 \ ATOM 18 C VAL D1615 -39.039 6.089 -16.893 1.00 -0.48 \ ATOM 19 O VAL D1615 -39.866 5.719 -17.738 1.00 -0.48 \ ATOM 20 CB VAL D1615 -39.832 5.312 -14.583 1.00 -0.48 \ ATOM 21 CG1 VAL D1615 -39.524 4.412 -13.379 1.00 -0.48 \ ATOM 22 CG2 VAL D1615 -40.073 6.749 -14.122 1.00 -0.48 \ ATOM 23 N GLY D1616 -38.371 7.238 -16.993 1.00 0.94 \ ATOM 24 CA GLY D1616 -38.520 8.141 -18.144 1.00 0.94 \ ATOM 25 C GLY D1616 -38.239 7.521 -19.504 1.00 0.94 \ ATOM 26 O GLY D1616 -38.782 7.965 -20.523 1.00 0.94 \ ATOM 27 N LYS D1617 -37.403 6.487 -19.549 1.00 1.79 \ ATOM 28 CA LYS D1617 -37.119 5.844 -20.849 1.00 1.79 \ ATOM 29 C LYS D1617 -38.315 5.031 -21.346 1.00 1.79 \ ATOM 30 O LYS D1617 -38.592 4.993 -22.535 1.00 1.79 \ ATOM 31 CB LYS D1617 -35.868 4.966 -20.766 1.00 1.79 \ ATOM 32 CG LYS D1617 -34.540 5.741 -20.656 1.00 1.79 \ ATOM 33 CD LYS D1617 -33.861 5.842 -22.003 1.00 1.79 \ ATOM 34 CE LYS D1617 -32.477 6.483 -21.864 1.00 1.79 \ ATOM 35 NZ LYS D1617 -32.163 7.367 -23.009 1.00 1.79 \ ATOM 36 N PHE D1618 -39.027 4.399 -20.420 1.00 -0.46 \ ATOM 37 CA PHE D1618 -40.274 3.720 -20.734 1.00 -0.46 \ ATOM 38 C PHE D1618 -41.309 4.717 -21.191 1.00 -0.46 \ ATOM 39 O PHE D1618 -42.051 4.461 -22.122 1.00 -0.46 \ ATOM 40 CB PHE D1618 -40.830 3.058 -19.487 1.00 -0.46 \ ATOM 41 CG PHE D1618 -40.171 1.772 -19.118 1.00 -0.46 \ ATOM 42 CD1 PHE D1618 -40.390 0.620 -19.869 1.00 -0.46 \ ATOM 43 CD2 PHE D1618 -39.374 1.697 -17.991 1.00 -0.46 \ ATOM 44 CE1 PHE D1618 -39.804 -0.581 -19.510 1.00 -0.46 \ ATOM 45 CE2 PHE D1618 -38.786 0.495 -17.616 1.00 -0.46 \ ATOM 46 CZ PHE D1618 -39.004 -0.643 -18.387 1.00 -0.46 \ ATOM 47 N TYR D1619 -41.421 5.834 -20.484 1.00 1.79 \ ATOM 48 CA TYR D1619 -42.491 6.779 -20.801 1.00 1.79 \ ATOM 49 C TYR D1619 -42.208 7.441 -22.152 1.00 1.79 \ ATOM 50 O TYR D1619 -43.123 7.667 -22.943 1.00 1.79 \ ATOM 51 CB TYR D1619 -42.692 7.804 -19.684 1.00 1.79 \ ATOM 52 CG TYR D1619 -44.073 8.473 -19.692 1.00 1.79 \ ATOM 53 CD1 TYR D1619 -44.261 9.722 -20.297 1.00 1.79 \ ATOM 54 CD2 TYR D1619 -45.186 7.861 -19.066 1.00 1.79 \ ATOM 55 CE1 TYR D1619 -45.528 10.347 -20.295 1.00 1.79 \ ATOM 56 CE2 TYR D1619 -46.453 8.482 -19.035 1.00 1.79 \ ATOM 57 CZ TYR D1619 -46.617 9.718 -19.665 1.00 1.79 \ ATOM 58 OH TYR D1619 -47.851 10.327 -19.661 1.00 1.79 \ ATOM 59 N ALA D1620 -40.933 7.744 -22.410 1.00 1.79 \ ATOM 60 CA ALA D1620 -40.525 8.343 -23.684 1.00 1.79 \ ATOM 61 C ALA D1620 -40.978 7.502 -24.849 1.00 1.79 \ ATOM 62 O ALA D1620 -41.384 8.027 -25.851 1.00 1.79 \ ATOM 63 CB ALA D1620 -39.022 8.544 -23.734 1.00 1.79 \ ATOM 64 N THR D1621 -40.937 6.176 -24.706 1.00 -0.42 \ ATOM 65 CA THR D1621 -41.352 5.273 -25.804 1.00 -0.42 \ ATOM 66 C THR D1621 -42.872 5.311 -25.980 1.00 -0.42 \ ATOM 67 O THR D1621 -43.367 5.316 -27.115 1.00 -0.42 \ ATOM 68 CB THR D1621 -40.931 3.852 -25.512 1.00 -0.42 \ ATOM 69 OG1 THR D1621 -39.521 3.834 -25.286 1.00 -0.42 \ ATOM 70 CG2 THR D1621 -41.249 2.946 -26.686 1.00 -0.42 \ ATOM 71 N PHE D1622 -43.604 5.366 -24.853 1.00 -0.10 \ ATOM 72 CA PHE D1622 -45.038 5.527 -24.888 1.00 -0.10 \ ATOM 73 C PHE D1622 -45.330 6.812 -25.644 1.00 -0.10 \ ATOM 74 O PHE D1622 -46.218 6.837 -26.507 1.00 -0.10 \ ATOM 75 CB PHE D1622 -45.627 5.597 -23.467 1.00 -0.10 \ ATOM 76 CG PHE D1622 -46.979 6.259 -23.404 1.00 -0.10 \ ATOM 77 CD1 PHE D1622 -48.125 5.555 -23.741 1.00 -0.10 \ ATOM 78 CD2 PHE D1622 -47.098 7.589 -23.039 1.00 -0.10 \ ATOM 79 CE1 PHE D1622 -49.371 6.170 -23.707 1.00 -0.10 \ ATOM 80 CE2 PHE D1622 -48.325 8.203 -22.998 1.00 -0.10 \ ATOM 81 CZ PHE D1622 -49.466 7.497 -23.323 1.00 -0.10 \ ATOM 82 N LEU D1623 -44.563 7.861 -25.350 1.00 0.80 \ ATOM 83 CA LEU D1623 -44.767 9.148 -26.012 1.00 0.80 \ ATOM 84 C LEU D1623 -44.504 9.024 -27.511 1.00 0.80 \ ATOM 85 O LEU D1623 -45.255 9.554 -28.295 1.00 0.80 \ ATOM 86 CB LEU D1623 -43.919 10.255 -25.384 1.00 0.80 \ ATOM 87 CG LEU D1623 -44.327 10.734 -23.970 1.00 0.80 \ ATOM 88 CD1 LEU D1623 -43.444 11.881 -23.534 1.00 0.80 \ ATOM 89 CD2 LEU D1623 -45.783 11.164 -23.915 1.00 0.80 \ ATOM 90 N ILE D1624 -43.463 8.299 -27.893 1.00 1.79 \ ATOM 91 CA ILE D1624 -43.151 8.108 -29.327 1.00 1.79 \ ATOM 92 C ILE D1624 -44.330 7.426 -30.023 1.00 1.79 \ ATOM 93 O ILE D1624 -44.678 7.810 -31.114 1.00 1.79 \ ATOM 94 CB ILE D1624 -41.822 7.331 -29.556 1.00 1.79 \ ATOM 95 CG1 ILE D1624 -40.621 8.201 -29.203 1.00 1.79 \ ATOM 96 CG2 ILE D1624 -41.675 6.906 -31.051 1.00 1.79 \ ATOM 97 CD1 ILE D1624 -39.433 7.395 -28.647 1.00 1.79 \ ATOM 98 N GLN D1625 -44.946 6.430 -29.374 1.00 -1.00 \ ATOM 99 CA GLN D1625 -46.091 5.680 -29.895 1.00 -1.00 \ ATOM 100 C GLN D1625 -47.354 6.502 -29.908 1.00 -1.00 \ ATOM 101 O GLN D1625 -48.234 6.347 -30.792 1.00 -1.00 \ ATOM 102 CB GLN D1625 -46.393 4.493 -29.015 1.00 -1.00 \ ATOM 103 CG GLN D1625 -45.474 3.334 -29.054 1.00 -1.00 \ ATOM 104 CD GLN D1625 -46.135 2.124 -28.373 1.00 -1.00 \ ATOM 105 OE1 GLN D1625 -45.980 0.982 -28.808 1.00 -1.00 \ ATOM 106 NE2 GLN D1625 -46.907 2.389 -27.332 1.00 -1.00 \ ATOM 107 N GLU D1626 -47.456 7.361 -28.908 1.00 -1.00 \ ATOM 108 CA GLU D1626 -48.530 8.317 -28.807 1.00 -1.00 \ ATOM 109 C GLU D1626 -48.494 9.279 -29.975 1.00 -1.00 \ ATOM 110 O GLU D1626 -49.536 9.616 -30.506 1.00 -1.00 \ ATOM 111 CB GLU D1626 -48.410 9.088 -27.491 1.00 -1.00 \ ATOM 112 CG GLU D1626 -49.535 10.064 -27.198 1.00 -1.00 \ ATOM 113 CD GLU D1626 -50.698 9.415 -26.486 1.00 -1.00 \ ATOM 114 OE1 GLU D1626 -51.243 10.053 -25.554 1.00 -1.00 \ ATOM 115 OE2 GLU D1626 -51.063 8.274 -26.852 1.00 -1.00 \ ATOM 116 N TYR D1627 -47.300 9.721 -30.366 1.00 -1.00 \ ATOM 117 CA TYR D1627 -47.130 10.615 -31.518 1.00 -1.00 \ ATOM 118 C TYR D1627 -47.759 10.068 -32.808 1.00 -1.00 \ ATOM 119 O TYR D1627 -48.398 10.813 -33.551 1.00 -1.00 \ ATOM 120 CB TYR D1627 -45.644 10.916 -31.747 1.00 -1.00 \ ATOM 121 CG TYR D1627 -45.406 12.133 -32.594 1.00 -1.00 \ ATOM 122 CD1 TYR D1627 -45.114 12.018 -33.949 1.00 -1.00 \ ATOM 123 CD2 TYR D1627 -45.469 13.411 -32.040 1.00 -1.00 \ ATOM 124 CE1 TYR D1627 -44.918 13.157 -34.742 1.00 -1.00 \ ATOM 125 CE2 TYR D1627 -45.269 14.544 -32.811 1.00 -1.00 \ ATOM 126 CZ TYR D1627 -44.989 14.417 -34.163 1.00 -1.00 \ ATOM 127 OH TYR D1627 -44.790 15.554 -34.914 1.00 -1.00 \ ATOM 128 N PHE D1628 -47.531 8.785 -33.075 1.00 -1.00 \ ATOM 129 CA PHE D1628 -48.150 8.026 -34.175 1.00 -1.00 \ ATOM 130 C PHE D1628 -49.659 7.753 -34.027 1.00 -1.00 \ ATOM 131 O PHE D1628 -50.413 7.837 -35.007 1.00 -1.00 \ ATOM 132 CB PHE D1628 -47.417 6.712 -34.375 1.00 -1.00 \ ATOM 133 CG PHE D1628 -46.070 6.874 -35.018 1.00 -1.00 \ ATOM 134 CD1 PHE D1628 -45.963 7.060 -36.383 1.00 -1.00 \ ATOM 135 CD2 PHE D1628 -44.908 6.850 -34.260 1.00 -1.00 \ ATOM 136 CE1 PHE D1628 -44.702 7.200 -37.012 1.00 -1.00 \ ATOM 137 CE2 PHE D1628 -43.672 7.018 -34.860 1.00 -1.00 \ ATOM 138 CZ PHE D1628 -43.561 7.189 -36.220 1.00 -1.00 \ ATOM 139 N ARG D1629 -50.098 7.378 -32.835 1.00 -1.00 \ ATOM 140 CA ARG D1629 -51.505 7.019 -32.632 1.00 -1.00 \ ATOM 141 C ARG D1629 -52.418 8.240 -32.792 1.00 -1.00 \ ATOM 142 O ARG D1629 -53.503 8.138 -33.361 1.00 -1.00 \ ATOM 143 CB ARG D1629 -51.694 6.330 -31.273 1.00 -1.00 \ ATOM 144 CG ARG D1629 -53.115 6.363 -30.707 1.00 -1.00 \ ATOM 145 CD ARG D1629 -53.221 5.681 -29.311 1.00 -1.00 \ ATOM 146 NE ARG D1629 -52.217 6.168 -28.358 1.00 -1.00 \ ATOM 147 CZ ARG D1629 -51.167 5.459 -27.930 1.00 -1.00 \ ATOM 148 NH1 ARG D1629 -50.969 4.224 -28.355 1.00 -1.00 \ ATOM 149 NH2 ARG D1629 -50.314 5.992 -27.067 1.00 -1.00 \ ATOM 150 N LYS D1630 -51.971 9.387 -32.283 1.00 -1.00 \ ATOM 151 CA LYS D1630 -52.712 10.643 -32.413 1.00 -1.00 \ ATOM 152 C LYS D1630 -52.941 10.985 -33.896 1.00 -1.00 \ ATOM 153 O LYS D1630 -54.075 11.270 -34.316 1.00 -1.00 \ ATOM 154 CB LYS D1630 -51.976 11.780 -31.690 1.00 -1.00 \ ATOM 155 N PHE D1631 -51.870 10.933 -34.682 1.00 -1.00 \ ATOM 156 CA PHE D1631 -51.969 11.148 -36.128 1.00 -1.00 \ ATOM 157 C PHE D1631 -52.992 10.237 -36.833 1.00 -1.00 \ ATOM 158 O PHE D1631 -53.869 10.715 -37.595 1.00 -1.00 \ ATOM 159 CB PHE D1631 -50.600 11.051 -36.828 1.00 -1.00 \ ATOM 160 CG PHE D1631 -50.706 11.026 -38.325 1.00 -1.00 \ ATOM 161 CD1 PHE D1631 -51.033 12.184 -39.031 1.00 -1.00 \ ATOM 162 CD2 PHE D1631 -50.511 9.847 -39.025 1.00 -1.00 \ ATOM 163 CE1 PHE D1631 -51.151 12.162 -40.425 1.00 -1.00 \ ATOM 164 CE2 PHE D1631 -50.630 9.814 -40.435 1.00 -1.00 \ ATOM 165 CZ PHE D1631 -50.953 10.966 -41.127 1.00 -1.00 \ ATOM 166 N LYS D1632 -52.862 8.935 -36.583 1.00 -1.00 \ ATOM 167 CA LYS D1632 -53.687 7.931 -37.244 1.00 -1.00 \ ATOM 168 C LYS D1632 -55.190 8.163 -36.987 1.00 -1.00 \ ATOM 169 O LYS D1632 -56.027 8.029 -37.902 1.00 -1.00 \ ATOM 170 CB LYS D1632 -53.248 6.533 -36.802 1.00 -1.00 \ ATOM 171 CG LYS D1632 -51.874 6.135 -37.388 1.00 -1.00 \ ATOM 172 CD LYS D1632 -51.542 4.659 -37.210 1.00 -1.00 \ ATOM 173 CE LYS D1632 -51.640 4.197 -35.794 1.00 -1.00 \ ATOM 174 NZ LYS D1632 -51.334 2.739 -35.704 1.00 -1.00 \ ATOM 175 N LYS D1633 -55.507 8.531 -35.748 1.00 -1.00 \ ATOM 176 CA LYS D1633 -56.883 8.893 -35.335 1.00 -1.00 \ ATOM 177 C LYS D1633 -57.409 10.119 -36.102 1.00 -1.00 \ ATOM 178 O LYS D1633 -58.526 10.110 -36.653 1.00 -1.00 \ ATOM 179 CB LYS D1633 -56.906 9.167 -33.835 1.00 -1.00 \ ATOM 180 N ARG D1634 -56.590 11.169 -36.151 1.00 -1.00 \ ATOM 181 CA ARG D1634 -56.921 12.374 -36.914 1.00 -1.00 \ ATOM 182 C ARG D1634 -57.214 12.112 -38.400 1.00 -1.00 \ ATOM 183 O ARG D1634 -58.201 12.641 -38.951 1.00 -1.00 \ ATOM 184 CB ARG D1634 -55.823 13.416 -36.754 1.00 -1.00 \ ATOM 185 CG ARG D1634 -55.855 14.114 -35.414 1.00 -1.00 \ ATOM 186 CD ARG D1634 -54.938 15.330 -35.383 1.00 -1.00 \ ATOM 187 NE ARG D1634 -53.531 14.985 -35.621 1.00 -1.00 \ ATOM 188 CZ ARG D1634 -52.659 14.679 -34.671 1.00 -1.00 \ ATOM 189 NH1 ARG D1634 -53.028 14.663 -33.396 1.00 -1.00 \ ATOM 190 NH2 ARG D1634 -51.413 14.390 -34.997 1.00 -1.00 \ ATOM 191 N LYS D1635 -56.374 11.292 -39.032 1.00 -1.00 \ ATOM 192 CA LYS D1635 -56.544 10.907 -40.439 1.00 -1.00 \ ATOM 193 C LYS D1635 -57.840 10.100 -40.672 1.00 -1.00 \ ATOM 194 O LYS D1635 -58.517 10.270 -41.698 1.00 -1.00 \ ATOM 195 CB LYS D1635 -55.296 10.147 -40.943 1.00 -1.00 \ ATOM 196 CG LYS D1635 -55.300 9.836 -42.441 1.00 -1.00 \ ATOM 197 CD LYS D1635 -54.054 9.035 -42.874 1.00 -1.00 \ ATOM 198 CE LYS D1635 -54.198 8.493 -44.321 1.00 -1.00 \ ATOM 199 NZ LYS D1635 -53.934 9.515 -45.353 1.00 -1.00 \ ATOM 200 N GLU D1636 -58.183 9.229 -39.722 1.00 -1.00 \ ATOM 201 CA GLU D1636 -59.425 8.467 -39.811 1.00 -1.00 \ ATOM 202 C GLU D1636 -60.665 9.369 -39.709 1.00 -1.00 \ ATOM 203 O GLU D1636 -61.549 9.312 -40.575 1.00 -1.00 \ ATOM 204 CB GLU D1636 -59.475 7.358 -38.761 1.00 -1.00 \ ATOM 205 CG GLU D1636 -58.709 6.102 -39.168 1.00 -1.00 \ ATOM 206 CD GLU D1636 -59.581 4.855 -39.156 1.00 -1.00 \ ATOM 207 OE1 GLU D1636 -59.768 4.264 -38.073 1.00 -1.00 \ ATOM 208 OE2 GLU D1636 -60.080 4.470 -40.242 1.00 -1.00 \ ATOM 209 N GLN D1637 -60.708 10.211 -38.675 1.00 -1.00 \ ATOM 210 CA GLN D1637 -61.875 11.060 -38.405 1.00 -1.00 \ ATOM 211 C GLN D1637 -61.938 12.360 -39.224 1.00 -1.00 \ ATOM 212 O GLN D1637 -62.843 13.175 -39.030 1.00 -1.00 \ ATOM 213 CB GLN D1637 -61.996 11.357 -36.909 1.00 -1.00 \ ATOM 214 CG GLN D1637 -62.585 10.211 -36.072 1.00 -1.00 \ ATOM 215 CD GLN D1637 -64.019 9.831 -36.458 1.00 -1.00 \ ATOM 216 OE1 GLN D1637 -64.274 9.382 -37.578 1.00 -1.00 \ ATOM 217 NE2 GLN D1637 -64.955 9.989 -35.517 1.00 -1.00 \ ATOM 218 N GLY D1638 -60.990 12.536 -40.139 1.00 -1.00 \ ATOM 219 CA GLY D1638 -60.925 13.712 -41.009 1.00 -1.00 \ ATOM 220 C GLY D1638 -60.627 15.018 -40.291 1.00 -1.00 \ ATOM 221 O GLY D1638 -61.255 16.043 -40.566 1.00 -1.00 \ ATOM 222 N LEU D1639 -59.656 14.984 -39.381 1.00 -1.00 \ ATOM 223 CA LEU D1639 -59.306 16.160 -38.578 1.00 -1.00 \ ATOM 224 C LEU D1639 -57.821 16.555 -38.652 1.00 -1.00 \ ATOM 225 O LEU D1639 -57.326 17.265 -37.774 1.00 -1.00 \ ATOM 226 CB LEU D1639 -59.740 15.966 -37.109 1.00 -1.00 \ ATOM 227 CG LEU D1639 -61.232 15.853 -36.778 1.00 -1.00 \ ATOM 228 CD1 LEU D1639 -61.427 15.469 -35.309 1.00 -1.00 \ ATOM 229 CD2 LEU D1639 -61.991 17.140 -37.108 1.00 -1.00 \ ATOM 230 N VAL D1640 -57.119 16.108 -39.695 1.00 -1.00 \ ATOM 231 CA VAL D1640 -55.699 16.449 -39.872 1.00 -1.00 \ ATOM 232 C VAL D1640 -55.487 17.960 -40.067 1.00 -1.00 \ ATOM 233 O VAL D1640 -56.043 18.565 -40.978 1.00 -1.00 \ ATOM 234 CB VAL D1640 -55.036 15.633 -41.029 1.00 -1.00 \ ATOM 235 CG1 VAL D1640 -53.716 16.242 -41.437 1.00 -1.00 \ ATOM 236 CG2 VAL D1640 -54.814 14.184 -40.607 1.00 -1.00 \ """, "e2be6D1_csv") cmd.show_as('cartoon', "all") cmd.spectrum('b', selection="all") cmd.center("e2be6D1_csv", state=0, origin=1) cmd.zoom("e2be6D1_csv", animate=-1)