cmd.read_pdbstr("""\ ATOM 1 N VAL D1615 7.925 4.042 -2.417 1.00 -0.49 \ ATOM 2 CA VAL D1615 8.811 3.182 -1.630 1.00 -0.49 \ ATOM 3 C VAL D1615 10.185 3.094 -2.308 1.00 -0.49 \ ATOM 4 O VAL D1615 10.295 3.046 -3.541 1.00 -0.49 \ ATOM 5 CB VAL D1615 8.217 1.751 -1.415 1.00 -0.49 \ ATOM 6 CG1 VAL D1615 8.879 1.054 -0.217 1.00 -0.49 \ ATOM 7 CG2 VAL D1615 6.707 1.795 -1.246 1.00 -0.49 \ ATOM 8 N GLY D1616 11.231 3.074 -1.485 1.00 0.96 \ ATOM 9 CA GLY D1616 12.590 3.019 -1.976 1.00 0.96 \ ATOM 10 C GLY D1616 13.024 4.332 -2.583 1.00 0.96 \ ATOM 11 O GLY D1616 12.189 5.154 -3.000 1.00 0.96 \ ATOM 12 N LYS D1617 14.344 4.530 -2.661 1.00 1.78 \ ATOM 13 CA LYS D1617 14.878 5.801 -3.128 1.00 1.78 \ ATOM 14 C LYS D1617 14.975 5.874 -4.646 1.00 1.78 \ ATOM 15 O LYS D1617 15.085 6.979 -5.194 1.00 1.78 \ ATOM 16 CB LYS D1617 16.252 6.051 -2.499 1.00 1.78 \ ATOM 17 CG LYS D1617 16.223 6.948 -1.250 1.00 1.78 \ ATOM 18 CD LYS D1617 15.372 6.339 -0.140 1.00 1.78 \ ATOM 19 CE LYS D1617 15.272 7.262 1.072 1.00 1.78 \ ATOM 20 NZ LYS D1617 14.293 8.400 0.912 1.00 1.78 \ ATOM 21 N PHE D1618 14.928 4.734 -5.337 1.00 -0.46 \ ATOM 22 CA PHE D1618 14.963 4.764 -6.796 1.00 -0.46 \ ATOM 23 C PHE D1618 13.722 5.455 -7.362 1.00 -0.46 \ ATOM 24 O PHE D1618 13.826 6.357 -8.201 1.00 -0.46 \ ATOM 25 CB PHE D1618 15.083 3.346 -7.359 1.00 -0.46 \ ATOM 26 CG PHE D1618 16.426 2.709 -7.149 1.00 -0.46 \ ATOM 27 CD1 PHE D1618 17.593 3.332 -7.581 1.00 -0.46 \ ATOM 28 CD2 PHE D1618 16.519 1.465 -6.539 1.00 -0.46 \ ATOM 29 CE1 PHE D1618 18.824 2.725 -7.405 1.00 -0.46 \ ATOM 30 CE2 PHE D1618 17.739 0.862 -6.358 1.00 -0.46 \ ATOM 31 CZ PHE D1618 18.898 1.495 -6.792 1.00 -0.46 \ ATOM 32 N TYR D1619 12.537 5.021 -6.934 1.00 1.78 \ ATOM 33 CA TYR D1619 11.318 5.622 -7.447 1.00 1.78 \ ATOM 34 C TYR D1619 11.206 7.077 -7.016 1.00 1.78 \ ATOM 35 O TYR D1619 10.732 7.917 -7.787 1.00 1.78 \ ATOM 36 CB TYR D1619 10.101 4.823 -6.988 1.00 1.78 \ ATOM 37 CG TYR D1619 8.873 5.119 -7.809 1.00 1.78 \ ATOM 38 CD1 TYR D1619 8.752 4.643 -9.109 1.00 1.78 \ ATOM 39 CD2 TYR D1619 7.846 5.894 -7.300 1.00 1.78 \ ATOM 40 CE1 TYR D1619 7.638 4.928 -9.876 1.00 1.78 \ ATOM 41 CE2 TYR D1619 6.720 6.185 -8.054 1.00 1.78 \ ATOM 42 CZ TYR D1619 6.624 5.702 -9.343 1.00 1.78 \ ATOM 43 OH TYR D1619 5.514 5.984 -10.099 1.00 1.78 \ ATOM 44 N ALA D1620 11.668 7.399 -5.808 1.00 1.78 \ ATOM 45 CA ALA D1620 11.603 8.780 -5.347 1.00 1.78 \ ATOM 46 C ALA D1620 12.440 9.687 -6.231 1.00 1.78 \ ATOM 47 O ALA D1620 12.019 10.792 -6.579 1.00 1.78 \ ATOM 48 CB ALA D1620 12.058 8.858 -3.903 1.00 1.78 \ ATOM 49 N THR D1621 13.607 9.209 -6.645 1.00 -0.42 \ ATOM 50 CA THR D1621 14.470 9.977 -7.533 1.00 -0.42 \ ATOM 51 C THR D1621 13.821 10.199 -8.894 1.00 -0.42 \ ATOM 52 O THR D1621 13.865 11.307 -9.445 1.00 -0.42 \ ATOM 53 CB THR D1621 15.801 9.242 -7.681 1.00 -0.42 \ ATOM 54 OG1 THR D1621 16.478 9.272 -6.428 1.00 -0.42 \ ATOM 55 CG2 THR D1621 16.652 9.873 -8.747 1.00 -0.42 \ ATOM 56 N PHE D1622 13.226 9.154 -9.459 1.00 -0.10 \ ATOM 57 CA PHE D1622 12.449 9.344 -10.676 1.00 -0.10 \ ATOM 58 C PHE D1622 11.420 10.458 -10.505 1.00 -0.10 \ ATOM 59 O PHE D1622 11.297 11.334 -11.367 1.00 -0.10 \ ATOM 60 CB PHE D1622 11.770 8.043 -11.068 1.00 -0.10 \ ATOM 61 CG PHE D1622 10.589 8.225 -11.975 1.00 -0.10 \ ATOM 62 CD1 PHE D1622 10.765 8.466 -13.319 1.00 -0.10 \ ATOM 63 CD2 PHE D1622 9.294 8.151 -11.479 1.00 -0.10 \ ATOM 64 CE1 PHE D1622 9.676 8.623 -14.161 1.00 -0.10 \ ATOM 65 CE2 PHE D1622 8.195 8.312 -12.322 1.00 -0.10 \ ATOM 66 CZ PHE D1622 8.389 8.549 -13.659 1.00 -0.10 \ ATOM 67 N LEU D1623 10.693 10.456 -9.382 1.00 0.80 \ ATOM 68 CA LEU D1623 9.633 11.438 -9.199 1.00 0.80 \ ATOM 69 C LEU D1623 10.206 12.845 -9.168 1.00 0.80 \ ATOM 70 O LEU D1623 9.627 13.782 -9.728 1.00 0.80 \ ATOM 71 CB LEU D1623 8.847 11.143 -7.924 1.00 0.80 \ ATOM 72 CG LEU D1623 7.908 9.928 -7.952 1.00 0.80 \ ATOM 73 CD1 LEU D1623 7.160 9.765 -6.617 1.00 0.80 \ ATOM 74 CD2 LEU D1623 6.909 10.036 -9.079 1.00 0.80 \ ATOM 75 N ILE D1624 11.366 13.009 -8.550 1.00 1.78 \ ATOM 76 CA ILE D1624 11.941 14.342 -8.466 1.00 1.78 \ ATOM 77 C ILE D1624 12.408 14.788 -9.843 1.00 1.78 \ ATOM 78 O ILE D1624 12.242 15.952 -10.220 1.00 1.78 \ ATOM 79 CB ILE D1624 13.064 14.363 -7.412 1.00 1.78 \ ATOM 80 CG1 ILE D1624 12.451 14.180 -6.001 1.00 1.78 \ ATOM 81 CG2 ILE D1624 13.893 15.632 -7.535 1.00 1.78 \ ATOM 82 CD1 ILE D1624 13.487 13.841 -4.900 1.00 1.78 \ ATOM 83 N GLN D1625 12.947 13.858 -10.634 1.00 -1.00 \ ATOM 84 CA GLN D1625 13.327 14.178 -12.007 1.00 -1.00 \ ATOM 85 C GLN D1625 12.118 14.572 -12.845 1.00 -1.00 \ ATOM 86 O GLN D1625 12.207 15.488 -13.667 1.00 -1.00 \ ATOM 87 CB GLN D1625 14.059 12.999 -12.646 1.00 -1.00 \ ATOM 88 CG GLN D1625 15.495 12.884 -12.178 1.00 -1.00 \ ATOM 89 CD GLN D1625 16.179 11.629 -12.679 1.00 -1.00 \ ATOM 90 OE1 GLN D1625 15.620 10.536 -12.603 1.00 -1.00 \ ATOM 91 NE2 GLN D1625 17.401 11.778 -13.184 1.00 -1.00 \ ATOM 92 N GLU D1626 10.976 13.909 -12.644 1.00 -1.00 \ ATOM 93 CA GLU D1626 9.771 14.309 -13.367 1.00 -1.00 \ ATOM 94 C GLU D1626 9.280 15.690 -12.926 1.00 -1.00 \ ATOM 95 O GLU D1626 8.775 16.464 -13.749 1.00 -1.00 \ ATOM 96 CB GLU D1626 8.671 13.267 -13.187 1.00 -1.00 \ ATOM 97 CG GLU D1626 7.469 13.483 -14.124 1.00 -1.00 \ ATOM 98 CD GLU D1626 7.574 12.686 -15.423 1.00 -1.00 \ ATOM 99 OE1 GLU D1626 7.600 13.284 -16.528 1.00 -1.00 \ ATOM 100 OE2 GLU D1626 7.635 11.444 -15.338 1.00 -1.00 \ ATOM 101 N TYR D1627 9.411 16.013 -11.634 1.00 -1.00 \ ATOM 102 CA TYR D1627 8.947 17.306 -11.143 1.00 -1.00 \ ATOM 103 C TYR D1627 9.741 18.435 -11.800 1.00 -1.00 \ ATOM 104 O TYR D1627 9.170 19.431 -12.267 1.00 -1.00 \ ATOM 105 CB TYR D1627 9.069 17.335 -9.611 1.00 -1.00 \ ATOM 106 CG TYR D1627 8.780 18.649 -8.931 1.00 -1.00 \ ATOM 107 CD1 TYR D1627 7.704 19.441 -9.315 1.00 -1.00 \ ATOM 108 CD2 TYR D1627 9.574 19.093 -7.875 1.00 -1.00 \ ATOM 109 CE1 TYR D1627 7.433 20.647 -8.685 1.00 -1.00 \ ATOM 110 CE2 TYR D1627 9.297 20.311 -7.215 1.00 -1.00 \ ATOM 111 CZ TYR D1627 8.230 21.083 -7.635 1.00 -1.00 \ ATOM 112 OH TYR D1627 7.941 22.289 -7.016 1.00 -1.00 \ ATOM 113 N PHE D1628 11.066 18.269 -11.866 1.00 -1.00 \ ATOM 114 CA PHE D1628 11.922 19.170 -12.630 1.00 -1.00 \ ATOM 115 C PHE D1628 11.575 19.144 -14.113 1.00 -1.00 \ ATOM 116 O PHE D1628 11.509 20.195 -14.764 1.00 -1.00 \ ATOM 117 CB PHE D1628 13.382 18.776 -12.427 1.00 -1.00 \ ATOM 118 CG PHE D1628 13.939 19.227 -11.129 1.00 -1.00 \ ATOM 119 CD1 PHE D1628 14.033 20.576 -10.843 1.00 -1.00 \ ATOM 120 CD2 PHE D1628 14.362 18.316 -10.185 1.00 -1.00 \ ATOM 121 CE1 PHE D1628 14.546 21.004 -9.642 1.00 -1.00 \ ATOM 122 CE2 PHE D1628 14.870 18.744 -8.982 1.00 -1.00 \ ATOM 123 CZ PHE D1628 14.960 20.081 -8.706 1.00 -1.00 \ ATOM 124 N ARG D1629 11.346 17.946 -14.658 1.00 -1.00 \ ATOM 125 CA ARG D1629 10.995 17.810 -16.066 1.00 -1.00 \ ATOM 126 C ARG D1629 9.716 18.570 -16.378 1.00 -1.00 \ ATOM 127 O ARG D1629 9.639 19.294 -17.376 1.00 -1.00 \ ATOM 128 CB ARG D1629 10.855 16.320 -16.402 1.00 -1.00 \ ATOM 129 CG ARG D1629 10.704 15.950 -17.851 1.00 -1.00 \ ATOM 130 CD ARG D1629 10.580 14.417 -17.985 1.00 -1.00 \ ATOM 131 NE ARG D1629 11.745 13.750 -17.395 1.00 -1.00 \ ATOM 132 CZ ARG D1629 11.720 12.868 -16.394 1.00 -1.00 \ ATOM 133 NH1 ARG D1629 10.583 12.491 -15.829 1.00 -1.00 \ ATOM 134 NH2 ARG D1629 12.857 12.343 -15.970 1.00 -1.00 \ ATOM 135 N LYS D1630 8.714 18.446 -15.506 1.00 -1.00 \ ATOM 136 CA LYS D1630 7.428 19.086 -15.752 1.00 -1.00 \ ATOM 137 C LYS D1630 7.509 20.596 -15.578 1.00 -1.00 \ ATOM 138 O LYS D1630 6.778 21.337 -16.246 1.00 -1.00 \ ATOM 139 CB LYS D1630 6.364 18.499 -14.819 1.00 -1.00 \ ATOM 140 N PHE D1631 8.377 21.072 -14.685 1.00 -1.00 \ ATOM 141 CA PHE D1631 8.506 22.512 -14.508 1.00 -1.00 \ ATOM 142 C PHE D1631 9.060 23.167 -15.763 1.00 -1.00 \ ATOM 143 O PHE D1631 8.653 24.276 -16.130 1.00 -1.00 \ ATOM 144 CB PHE D1631 9.408 22.827 -13.324 1.00 -1.00 \ ATOM 145 CG PHE D1631 9.824 24.257 -13.275 1.00 -1.00 \ ATOM 146 CD1 PHE D1631 8.956 25.219 -12.789 1.00 -1.00 \ ATOM 147 CD2 PHE D1631 11.066 24.649 -13.741 1.00 -1.00 \ ATOM 148 CE1 PHE D1631 9.327 26.539 -12.750 1.00 -1.00 \ ATOM 149 CE2 PHE D1631 11.435 25.977 -13.709 1.00 -1.00 \ ATOM 150 CZ PHE D1631 10.564 26.918 -13.215 1.00 -1.00 \ ATOM 151 N LYS D1632 10.010 22.502 -16.421 1.00 -1.00 \ ATOM 152 CA LYS D1632 10.590 23.040 -17.645 1.00 -1.00 \ ATOM 153 C LYS D1632 9.570 23.109 -18.781 1.00 -1.00 \ ATOM 154 O LYS D1632 9.574 24.066 -19.566 1.00 -1.00 \ ATOM 155 CB LYS D1632 11.783 22.194 -18.052 1.00 -1.00 \ ATOM 156 CG LYS D1632 12.852 22.128 -17.001 1.00 -1.00 \ ATOM 157 CD LYS D1632 13.930 21.174 -17.446 1.00 -1.00 \ ATOM 158 CE LYS D1632 15.042 21.050 -16.447 1.00 -1.00 \ ATOM 159 NZ LYS D1632 16.038 20.100 -16.994 1.00 -1.00 \ ATOM 160 N LYS D1633 8.699 22.106 -18.902 1.00 -1.00 \ ATOM 161 CA LYS D1633 7.700 22.156 -19.965 1.00 -1.00 \ ATOM 162 C LYS D1633 6.837 23.404 -19.827 1.00 -1.00 \ ATOM 163 O LYS D1633 6.644 24.146 -20.795 1.00 -1.00 \ ATOM 164 CB LYS D1633 6.840 20.890 -19.958 1.00 -1.00 \ ATOM 165 N ARG D1634 6.340 23.670 -18.617 1.00 -1.00 \ ATOM 166 CA ARG D1634 5.547 24.874 -18.383 1.00 -1.00 \ ATOM 167 C ARG D1634 6.337 26.134 -18.732 1.00 -1.00 \ ATOM 168 O ARG D1634 5.789 27.075 -19.324 1.00 -1.00 \ ATOM 169 CB ARG D1634 5.076 24.915 -16.925 1.00 -1.00 \ ATOM 170 N LYS D1635 7.631 26.162 -18.392 1.00 -1.00 \ ATOM 171 CA LYS D1635 8.479 27.323 -18.645 1.00 -1.00 \ ATOM 172 C LYS D1635 8.974 27.409 -20.089 1.00 -1.00 \ ATOM 173 O LYS D1635 9.747 28.321 -20.407 1.00 -1.00 \ ATOM 174 CB LYS D1635 9.675 27.331 -17.688 1.00 -1.00 \ ATOM 175 N GLU D1636 8.564 26.489 -20.966 1.00 -1.00 \ ATOM 176 CA GLU D1636 8.730 26.672 -22.401 1.00 -1.00 \ ATOM 177 C GLU D1636 7.417 26.959 -23.112 1.00 -1.00 \ ATOM 178 O GLU D1636 7.433 27.580 -24.179 1.00 -1.00 \ ATOM 179 CB GLU D1636 9.388 25.436 -23.033 1.00 -1.00 \ ATOM 180 N GLN D1637 6.291 26.542 -22.542 1.00 -1.00 \ ATOM 181 CA GLN D1637 4.975 26.841 -23.095 1.00 -1.00 \ ATOM 182 C GLN D1637 4.595 28.304 -22.858 1.00 -1.00 \ ATOM 183 O GLN D1637 4.629 28.795 -21.726 1.00 -1.00 \ ATOM 184 CB GLN D1637 3.918 25.915 -22.484 1.00 -1.00 \ """, "e6dafD1_csv") cmd.show_as('cartoon', "all") cmd.spectrum('b', selection="all") cmd.center("e6dafD1_csv", state=0, origin=1) cmd.zoom("e6dafD1_csv", animate=-1)