cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1D") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1D") cmd.show('ribbon', "chain1D") cmd.select("e5dox1D1", "c. D & i. 2-126") cmd.center("e5dox1D1", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5dox1D1", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5dox1D1") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5dox1D1") cmd.disable("e5dox1D1") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 3348 | c. A & i. 3738 | c. A & i. 3753 | c. D & i. 301 | c. D & i. 304 | c. D & i. 306') util.cbag('c. A & i. 3348 | c. A & i. 3738 | c. A & i. 3753 | c. D & i. 301 | c. D & i. 304 | c. D & i. 306')