cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1D") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1D") cmd.show('ribbon', "chain1D") cmd.select("e5doy1D2", "c. D & i. 127-276") cmd.center("e5doy1D2", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5doy1D2", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5doy1D2") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5doy1D2") cmd.disable("e5doy1D2") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 3020 | c. A & i. 3024 | c. A & i. 3149 | c. A & i. 3269 | c. A & i. 3300 | c. A & i. 3488 | c. A & i. 3493 | c. A & i. 3724 | c. A & i. 3841 | c. A & i. 3896 | c. A & i. 3917 | c. A & i. 3918 | c. D & i. 302 | c. D & i. 303 | c. D & i. 304 | c. D & i. 305') util.cbag('c. A & i. 3020 | c. A & i. 3024 | c. A & i. 3149 | c. A & i. 3269 | c. A & i. 3300 | c. A & i. 3488 | c. A & i. 3493 | c. A & i. 3724 | c. A & i. 3841 | c. A & i. 3896 | c. A & i. 3917 | c. A & i. 3918 | c. D & i. 302 | c. D & i. 303 | c. D & i. 304 | c. D & i. 305')