cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1E") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1E") cmd.show('ribbon', "chain1E") cmd.select("e5doy1E1", "c. E & i. 1-204") cmd.center("e5doy1E1", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5doy1E1", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5doy1E1") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5doy1E1") cmd.disable("e5doy1E1") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 3013 | c. A & i. 3084 | c. A & i. 3854 | c. A & i. 3897 | c. A & i. 3898 | c. A & i. 3899 | c. A & i. 3900 | c. A & i. 3919 | c. A & i. 3920 | c. A & i. 3960 | c. A & i. 3961 | c. E & i. 301 | c. E & i. 302 | c. E & i. 303 | c. E & i. 304 | c. E & i. 305') util.cbag('c. A & i. 3013 | c. A & i. 3084 | c. A & i. 3854 | c. A & i. 3897 | c. A & i. 3898 | c. A & i. 3899 | c. A & i. 3900 | c. A & i. 3919 | c. A & i. 3920 | c. A & i. 3960 | c. A & i. 3961 | c. E & i. 301 | c. E & i. 302 | c. E & i. 303 | c. E & i. 304 | c. E & i. 305')