cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1U") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1U") cmd.show('ribbon', "chain1U") cmd.select("e5doy1U1", "c. U & i. 2-117") cmd.center("e5doy1U1", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5doy1U1", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5doy1U1") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5doy1U1") cmd.disable("e5doy1U1") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 3110 | c. A & i. 3111 | c. A & i. 3138 | c. A & i. 3144 | c. A & i. 3193 | c. A & i. 3250 | c. A & i. 3314 | c. A & i. 3315 | c. A & i. 3770 | c. A & i. 3861 | c. A & i. 3907 | c. A & i. 3908 | c. A & i. 3909 | c. A & i. 3934 | c. A & i. 3935 | c. A & i. 3936 | c. A & i. 3937 | c. A & i. 3938 | c. A & i. 3939 | c. N & i. 3005 | c. N & i. 3006 | c. U & i. 201 | c. U & i. 202 | c. U & i. 203 | c. U & i. 204 | c. U & i. 205') util.cbag('c. A & i. 3110 | c. A & i. 3111 | c. A & i. 3138 | c. A & i. 3144 | c. A & i. 3193 | c. A & i. 3250 | c. A & i. 3314 | c. A & i. 3315 | c. A & i. 3770 | c. A & i. 3861 | c. A & i. 3907 | c. A & i. 3908 | c. A & i. 3909 | c. A & i. 3934 | c. A & i. 3935 | c. A & i. 3936 | c. A & i. 3937 | c. A & i. 3938 | c. A & i. 3939 | c. N & i. 3005 | c. N & i. 3006 | c. U & i. 201 | c. U & i. 202 | c. U & i. 203 | c. U & i. 204 | c. U & i. 205')