cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1X") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1X") cmd.show('ribbon', "chain1X") cmd.select("e5doy1X1", "c. X & i. 1-95") cmd.center("e5doy1X1", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5doy1X1", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5doy1X1") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5doy1X1") cmd.disable("e5doy1X1") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 3317 | c. A & i. 3462 | c. A & i. 3858 | c. A & i. 3862 | c. X & i. 3001 | c. X & i. 3002 | c. X & i. 3003 | c. X & i. 3004') util.cbag('c. A & i. 3317 | c. A & i. 3462 | c. A & i. 3858 | c. A & i. 3862 | c. X & i. 3001 | c. X & i. 3002 | c. X & i. 3003 | c. X & i. 3004')