cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1Y") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1Y") cmd.show('ribbon', "chain1Y") cmd.select("e5j4c1Y1", "c. Y & i. 1-107") cmd.center("e5j4c1Y1", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5j4c1Y1", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5j4c1Y1") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5j4c1Y1") cmd.disable("e5j4c1Y1") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 4197 | c. A & i. 4198 | c. A & i. 4199 | c. Y & i. 501 | c. Y & i. 502 | c. Y & i. 503') util.cbag('c. A & i. 4197 | c. A & i. 4198 | c. A & i. 4199 | c. Y & i. 501 | c. Y & i. 502 | c. Y & i. 503')