cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1D") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1D") cmd.show('ribbon', "chain1D") cmd.select("e5v8i1D1", "c. D & i. 2-126") cmd.center("e5v8i1D1", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5v8i1D1", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5v8i1D1") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5v8i1D1") cmd.disable("e5v8i1D1") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 3074 | c. A & i. 3209 | c. A & i. 3228 | c. A & i. 3255 | c. A & i. 3610 | c. A & i. 3811 | c. A & i. 3839 | c. A & i. 3840 | c. A & i. 3878 | c. D & i. 302 | c. D & i. 305 | c. D & i. 306 | c. D & i. 308 | c. D & i. 310 | c. D & i. 311 | c. D & i. 312') util.cbag('c. A & i. 3074 | c. A & i. 3209 | c. A & i. 3228 | c. A & i. 3255 | c. A & i. 3610 | c. A & i. 3811 | c. A & i. 3839 | c. A & i. 3840 | c. A & i. 3878 | c. D & i. 302 | c. D & i. 305 | c. D & i. 306 | c. D & i. 308 | c. D & i. 310 | c. D & i. 311 | c. D & i. 312')