cmd.read_pdbstr("""\ """, "chain1D") cmd.hide("all") cmd.color('grey70', "chain1D") cmd.show('ribbon', "chain1D") cmd.select("e5v8i1D2", "c. D & i. 127-276") cmd.center("e5v8i1D2", state=0, origin=1) cmd.zoom("e5v8i1D2", animate=-1) cmd.show_as('cartoon', "e5v8i1D2") cmd.spectrum('count', 'rainbow', "e5v8i1D2") cmd.disable("e5v8i1D2") cmd.show('spheres', 'c. A & i. 3247 | c. A & i. 3425 | c. A & i. 3496 | c. A & i. 3557 | c. A & i. 3611 | c. A & i. 3777 | c. A & i. 3876 | c. A & i. 3878 | c. D & i. 301 | c. D & i. 302 | c. D & i. 303 | c. D & i. 304 | c. D & i. 307 | c. D & i. 312') util.cbag('c. A & i. 3247 | c. A & i. 3425 | c. A & i. 3496 | c. A & i. 3557 | c. A & i. 3611 | c. A & i. 3777 | c. A & i. 3876 | c. A & i. 3878 | c. D & i. 301 | c. D & i. 302 | c. D & i. 303 | c. D & i. 304 | c. D & i. 307 | c. D & i. 312')