HEADER TRANSFERASE 22-APR-02 1IW7 TITLE Crystal structure of the RNA polymerase holoenzyme from Thermus TITLE 2 thermophilus at 2.6A resolution COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: RNA polymerase beta subunit; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.60 ANGSTORMS DBREF 1IW7 D 1 1524 PDB 1IW7 1IW7 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -22.488 40.173 36.938 1.00 65.60 ATOM 2 CA ALA D1270 -22.365 39.711 38.309 1.00 66.00 ATOM 3 C ALA D1270 -20.963 40.050 38.776 1.00 66.64 ATOM 4 O ALA D1270 -20.005 39.316 38.530 1.00 66.68 ATOM 5 CB ALA D1270 -22.599 38.210 38.384 1.00 65.30 ATOM 6 N LYS D1271 -20.854 41.193 39.432 1.00 67.08 ATOM 7 CA LYS D1271 -19.583 41.670 39.925 1.00 67.95 ATOM 8 C LYS D1271 -19.122 40.826 41.104 1.00 68.57 ATOM 9 O LYS D1271 -19.933 40.370 41.908 1.00 68.61 ATOM 10 CB LYS D1271 -19.747 43.146 40.314 1.00 67.40 ATOM 11 CG LYS D1271 -18.676 43.752 41.187 1.00 67.63 ATOM 12 CD LYS D1271 -19.352 44.618 42.235 1.00 68.55 ATOM 13 CE LYS D1271 -18.431 44.910 43.403 1.00 70.73 ATOM 14 NZ LYS D1271 -19.159 45.516 44.562 1.00 71.15 ATOM 15 N ALA D1272 -17.818 40.605 41.189 1.00 69.15 ATOM 16 CA ALA D1272 -17.245 39.854 42.291 1.00 70.03 ATOM 17 C ALA D1272 -16.510 40.817 43.184 1.00 70.39 ATOM 18 O ALA D1272 -15.542 41.449 42.758 1.00 71.68 ATOM 19 CB ALA D1272 -16.287 38.808 41.780 1.00 70.82 ATOM 20 N VAL D1273 -16.956 40.947 44.420 1.00 69.06 ATOM 21 CA VAL D1273 -16.290 41.883 45.282 1.00 67.91 ATOM 22 C VAL D1273 -14.855 41.447 45.545 1.00 66.25 ATOM 23 O VAL D1273 -14.582 40.445 46.204 1.00 65.23 ATOM 24 CB VAL D1273 -17.103 42.061 46.595 1.00 69.01 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -18.540 42.418 46.227 1.00 69.82 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -17.084 40.804 47.435 1.00 69.59 ATOM 27 N ILE D1274 -13.933 42.216 44.984 1.00 64.52 ATOM 28 CA ILE D1274 -12.518 41.956 45.159 1.00 63.50 ATOM 29 C ILE D1274 -12.088 42.382 46.544 1.00 62.45 ATOM 30 O ILE D1274 -12.775 43.143 47.218 1.00 60.77 ATOM 31 CB ILE D1274 -11.647 42.724 44.135 1.00 64.28 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -12.470 43.818 43.452 1.00 65.33 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -11.082 41.754 43.125 1.00 63.41 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -12.887 44.958 44.374 1.00 67.49 ATOM 35 N SER D1275 -10.938 41.887 46.959 1.00 62.56 ATOM 36 CA SER D1275 -10.410 42.187 48.271 1.00 63.25 ATOM 37 C SER D1275 -9.374 43.307 48.220 1.00 63.63 ATOM 38 O SER D1275 -8.221 43.088 47.846 1.00 64.07 ATOM 39 CB SER D1275 -9.797 40.917 48.844 1.00 63.16 ATOM 40 OG SER D1275 -8.938 41.213 49.912 1.00 63.06 ATOM 41 N GLU D1276 -9.797 44.508 48.600 1.00 63.15 ATOM 42 CA GLU D1276 -8.922 45.675 48.607 1.00 63.05 ATOM 43 C GLU D1276 -7.763 45.490 49.572 1.00 62.78 ATOM 44 O GLU D1276 -6.710 46.099 49.415 1.00 62.71 ATOM 45 CB GLU D1276 -9.690 46.911 49.039 1.00 63.51 ATOM 46 CG GLU D1276 -10.918 47.227 48.252 1.00 64.49 ATOM 47 CD GLU D1276 -11.900 48.012 49.087 1.00 65.98 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -12.603 48.879 48.531 1.00 67.17 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -11.971 47.757 50.310 1.00 66.62 ATOM 50 N ILE D1277 -7.975 44.648 50.576 1.00 63.10 ATOM 51 CA ILE D1277 -6.976 44.378 51.605 1.00 63.67 ATOM 52 C ILE D1277 -6.357 43.000 51.431 1.00 64.10 ATOM 53 O ILE D1277 -6.999 42.080 50.963 1.00 65.20 ATOM 54 CB ILE D1277 -7.614 44.430 53.039 1.00 63.26 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -7.906 45.875 53.435 1.00 62.77 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -6.681 43.779 54.078 1.00 63.38 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -8.652 45.975 54.762 1.00 61.36 ATOM 58 N ASP D1278 -5.101 42.857 51.806 1.00 64.35 ATOM 59 CA ASP D1278 -4.485 41.554 51.764 1.00 65.34 ATOM 60 C ASP D1278 -4.314 41.092 53.194 1.00 66.00 ATOM 61 O ASP D1278 -3.558 41.693 53.959 1.00 66.71 ATOM 62 CB ASP D1278 -3.131 41.603 51.056 1.00 65.97 ATOM 63 CG ASP D1278 -2.634 43.009 50.839 1.00 67.30 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -3.401 43.857 50.332 1.00 68.28 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -1.461 43.267 51.171 1.00 68.04 ATOM 66 N GLY D1279 -5.033 40.037 53.559 1.00 66.40 ATOM 67 CA GLY D1279 -4.962 39.530 54.919 1.00 66.32 ATOM 68 C GLY D1279 -5.647 38.185 55.102 1.00 65.94 ATOM 69 O GLY D1279 -5.536 37.318 54.247 1.00 65.92 ATOM 70 N VAL D1280 -6.358 38.012 56.214 1.00 65.18 ATOM 71 CA VAL D1280 -7.035 36.750 56.514 1.00 63.73 ATOM 72 C VAL D1280 -8.561 36.911 56.544 1.00 63.24 ATOM 73 O VAL D1280 -9.071 37.986 56.845 1.00 62.60 ATOM 74 CB VAL D1280 -6.509 36.208 57.853 1.00 63.72 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -7.302 34.999 58.291 1.00 63.96 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -5.043 35.838 57.693 1.00 63.25 ATOM 77 N VAL D1281 -9.268 35.818 56.248 1.00 63.72 ATOM 78 CA VAL D1281 -10.737 35.781 56.120 1.00 65.06 ATOM 79 C VAL D1281 -11.535 35.325 57.366 1.00 65.66 ATOM 80 O VAL D1281 -11.077 34.490 58.144 1.00 66.66 ATOM 81 CB VAL D1281 -11.110 34.852 54.961 1.00 64.52 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -12.584 34.921 54.681 1.00 64.41 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -10.342 35.250 53.741 1.00 65.51 ATOM 84 N ARG D1282 -12.750 35.889 57.500 1.00 65.86 ATOM 85 CA ARG D1282 -13.732 35.607 58.580 1.00 65.90 ATOM 86 C ARG D1282 -15.210 35.759 58.067 1.00 66.70 ATOM 87 O ARG D1282 -15.554 36.811 57.527 1.00 65.81 ATOM 88 CB ARG D1282 -13.491 36.567 59.751 1.00 66.18 ATOM 89 CG ARG D1282 -12.250 36.267 60.591 1.00 64.76 ATOM 90 CD ARG D1282 -12.002 37.348 61.646 1.00 64.36 ATOM 91 NE ARG D1282 -13.151 37.562 62.526 1.00 64.34 ATOM 92 CZ ARG D1282 -14.107 38.467 62.323 1.00 64.17 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -14.064 39.264 61.264 1.00 64.63 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -15.112 38.572 63.182 1.00 62.76 ATOM 95 N ILE D1283 -16.070 34.736 58.254 1.00 67.67 ATOM 96 CA ILE D1283 -17.480 34.718 57.741 1.00 69.04 ATOM 97 C ILE D1283 -18.586 34.723 58.863 1.00 71.22 ATOM 98 O ILE D1283 -18.252 34.515 60.024 1.00 70.54 ATOM 99 CB ILE D1283 -17.650 33.466 56.823 1.00 68.06 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -16.416 33.326 55.913 1.00 66.76 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -18.899 33.612 55.966 1.00 68.24 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -16.442 32.152 54.936 1.00 66.45 ATOM 103 N GLU D1284 -19.881 34.949 58.523 1.00 74.37 ATOM 104 CA GLU D1284 -20.989 35.019 59.537 1.00 78.10 ATOM 105 C GLU D1284 -22.427 34.579 59.019 1.00 80.98 ATOM 106 O GLU D1284 -22.813 34.862 57.878 1.00 81.91 ATOM 107 CB GLU D1284 -21.072 36.447 60.069 1.00 77.73 ATOM 108 CG GLU D1284 -19.759 37.053 60.514 1.00 77.55 ATOM 109 CD GLU D1284 -19.381 36.706 61.941 1.00 77.65 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -19.209 35.511 62.268 1.00 77.60 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -19.256 37.654 62.739 1.00 77.41 ATOM 112 N GLU D1285 -23.215 33.943 59.914 1.00 83.65 ATOM 113 CA GLU D1285 -24.546 33.312 59.639 1.00 85.85 ATOM 114 C GLU D1285 -25.882 34.060 59.875 1.00 86.65 ATOM 115 O GLU D1285 -26.894 33.389 59.645 1.00 86.90 ATOM 116 CB GLU D1285 -24.715 32.026 60.453 1.00 87.05 ATOM 117 CG GLU D1285 -25.149 32.257 61.906 1.00 88.55 ATOM 118 CD GLU D1285 -24.016 32.619 62.835 1.00 89.37 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -23.457 31.693 63.451 1.00 89.56 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -23.684 33.818 62.953 1.00 90.10 ATOM 121 N THR D1286 -26.011 35.318 60.300 1.00 88.02 ATOM 122 CA THR D1286 -27.405 35.778 60.501 1.00 89.57 ATOM 123 C THR D1286 -28.229 35.608 59.209 1.00 90.05 ATOM 124 O THR D1286 -27.676 35.318 58.156 1.00 90.48 ATOM 125 CB THR D1286 -27.476 37.248 61.038 1.00 90.18 ATOM 126 OG1 THR D1286 -26.743 37.335 62.270 1.00 91.35 ATOM 127 CG2 THR D1286 -28.926 37.649 61.372 1.00 90.35 ATOM 128 N GLU D1287 -29.538 35.790 59.291 1.00 90.80 ATOM 129 CA GLU D1287 -30.468 35.491 58.203 1.00 91.83 ATOM 130 C GLU D1287 -30.355 36.171 56.813 1.00 91.52 ATOM 131 O GLU D1287 -30.168 35.442 55.844 1.00 91.29 ATOM 132 CB GLU D1287 -31.881 35.664 58.753 1.00 93.44 ATOM 133 CG GLU D1287 -32.187 34.607 59.814 1.00 95.89 ATOM 134 CD GLU D1287 -33.397 34.952 60.657 1.00 97.74 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -34.464 35.234 60.074 1.00 98.90 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -33.287 34.941 61.903 1.00 98.52 ATOM 137 N GLU D1288 -30.458 37.494 56.660 1.00 91.27 ATOM 138 CA GLU D1288 -30.502 38.069 55.293 1.00 90.96 ATOM 139 C GLU D1288 -29.190 38.121 54.492 1.00 89.68 ATOM 140 O GLU D1288 -29.126 37.531 53.403 1.00 89.66 ATOM 141 CB GLU D1288 -31.120 39.491 55.313 1.00 92.26 ATOM 142 CG GLU D1288 -32.367 39.667 54.382 1.00 93.59 ATOM 143 CD GLU D1288 -32.783 41.130 54.136 1.00 93.91 ATOM 144 OE1 GLU D1288 -31.983 41.915 53.578 1.00 93.22 ATOM 145 OE2 GLU D1288 -33.922 41.493 54.499 1.00 94.59 ATOM 146 N LYS D1289 -28.150 38.798 54.977 1.00 87.78 ATOM 147 CA LYS D1289 -26.949 38.899 54.149 1.00 85.53 ATOM 148 C LYS D1289 -25.665 38.397 54.813 1.00 83.83 ATOM 149 O LYS D1289 -25.386 38.644 55.988 1.00 83.32 ATOM 150 CB LYS D1289 -26.751 40.356 53.703 1.00 85.43 ATOM 151 CG LYS D1289 -28.015 41.067 53.194 1.00 85.42 ATOM 152 CD LYS D1289 -27.693 42.505 52.763 1.00 85.71 ATOM 153 CE LYS D1289 -28.943 43.346 52.502 1.00 85.69 ATOM 154 NZ LYS D1289 -28.616 44.770 52.161 1.00 85.32 ATOM 155 N LEU D1290 -24.893 37.686 54.000 1.00 81.80 ATOM 156 CA LEU D1290 -23.601 37.129 54.357 1.00 79.52 ATOM 157 C LEU D1290 -22.595 38.267 54.525 1.00 78.61 ATOM 158 O LEU D1290 -22.888 39.409 54.170 1.00 78.74 ATOM 159 CB LEU D1290 -23.150 36.198 53.232 1.00 79.13 ATOM 160 CG LEU D1290 -22.870 34.724 53.486 1.00 78.80 ATOM 161 CD1 LEU D1290 -23.162 33.932 52.231 1.00 78.89 ATOM 162 CD2 LEU D1290 -21.430 34.559 53.907 1.00 77.95 ATOM 163 N SER D1291 -21.418 37.970 55.065 1.00 77.26 ATOM 164 CA SER D1291 -20.389 38.994 55.220 1.00 75.00 ATOM 165 C SER D1291 -19.002 38.380 55.334 1.00 73.37 ATOM 166 O SER D1291 -18.753 37.514 56.174 1.00 73.12 ATOM 167 CB SER D1291 -20.681 39.858 56.450 1.00 74.59 ATOM 168 OG SER D1291 -21.086 39.072 57.551 1.00 74.54 ATOM 169 N VAL D1292 -18.103 38.831 54.469 1.00 71.67 ATOM 170 CA VAL D1292 -16.735 38.345 54.477 1.00 70.80 ATOM 171 C VAL D1292 -15.810 39.420 55.019 1.00 70.89 ATOM 172 O VAL D1292 -15.749 40.532 54.492 1.00 70.95 ATOM 173 CB VAL D1292 -16.275 37.948 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