HEADER TRANSFERASE 10-MAR-04 1SMY TITLE Structural basis for transcription regulation by alarmone ppGpp COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase beta' chain; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.70 ANGSTORMS DBREF 1SMY D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THETH 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -22.043 40.427 37.099 1.00 80.21 ATOM 2 CA ALA D1270 -21.936 39.944 38.469 1.00 77.65 ATOM 3 C ALA D1270 -20.578 40.315 39.043 1.00 75.76 ATOM 4 O ALA D1270 -19.665 39.489 39.127 1.00 75.64 ATOM 5 CB ALA D1270 -22.140 38.435 38.484 1.00 77.43 ATOM 6 N LYS D1271 -20.446 41.578 39.428 1.00 73.70 ATOM 7 CA LYS D1271 -19.191 42.059 39.981 1.00 72.49 ATOM 8 C LYS D1271 -18.814 41.274 41.206 1.00 71.58 ATOM 9 O LYS D1271 -19.667 40.934 42.015 1.00 72.05 ATOM 10 CB LYS D1271 -19.292 43.531 40.361 1.00 71.54 ATOM 11 CG LYS D1271 -17.989 44.066 40.939 1.00 71.14 ATOM 12 CD LYS D1271 -17.985 45.569 40.910 1.00 72.38 ATOM 13 CE LYS D1271 -18.952 46.142 41.932 1.00 73.69 ATOM 14 NZ LYS D1271 -19.152 47.601 41.737 1.00 74.06 ATOM 15 N ALA D1272 -17.529 40.985 41.335 1.00 71.35 ATOM 16 CA ALA D1272 -17.035 40.250 42.483 1.00 71.38 ATOM 17 C ALA D1272 -16.246 41.190 43.382 1.00 71.12 ATOM 18 O ALA D1272 -15.297 41.854 42.940 1.00 72.04 ATOM 19 CB ALA D1272 -16.153 39.089 42.023 1.00 71.34 ATOM 20 N VAL D1273 -16.647 41.257 44.644 1.00 69.99 ATOM 21 CA VAL D1273 -15.967 42.133 45.562 1.00 69.75 ATOM 22 C VAL D1273 -14.523 41.699 45.739 1.00 68.85 ATOM 23 O VAL D1273 -14.231 40.580 46.146 1.00 68.49 ATOM 24 CB VAL D1273 -16.702 42.188 46.957 1.00 70.58 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -18.165 42.499 46.742 1.00 70.95 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -16.582 40.878 47.711 1.00 71.29 ATOM 27 N ILE D1274 -13.617 42.594 45.386 1.00 68.17 ATOM 28 CA ILE D1274 -12.206 42.333 45.542 1.00 67.48 ATOM 29 C ILE D1274 -11.762 42.854 46.891 1.00 67.23 ATOM 30 O ILE D1274 -12.409 43.733 47.454 1.00 67.58 ATOM 31 CB ILE D1274 -11.432 43.000 44.431 1.00 67.32 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -12.050 44.357 44.088 1.00 68.96 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -11.494 42.140 43.224 1.00 67.09 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -11.759 45.464 45.088 1.00 71.62 ATOM 35 N SER D1275 -10.675 42.321 47.421 1.00 67.45 ATOM 36 CA SER D1275 -10.232 42.743 48.737 1.00 67.59 ATOM 37 C SER D1275 -9.166 43.812 48.674 1.00 67.88 ATOM 38 O SER D1275 -8.010 43.518 48.393 1.00 68.22 ATOM 39 CB SER D1275 -9.694 41.554 49.507 1.00 68.31 ATOM 40 OG SER D1275 -9.367 41.953 50.822 1.00 69.90 ATOM 41 N GLU D1276 -9.559 45.051 48.951 1.00 67.21 ATOM 42 CA GLU D1276 -8.642 46.181 48.925 1.00 67.59 ATOM 43 C GLU D1276 -7.460 45.976 49.857 1.00 67.64 ATOM 44 O GLU D1276 -6.452 46.672 49.744 1.00 67.72 ATOM 45 CB GLU D1276 -9.378 47.441 49.328 1.00 69.06 ATOM 46 CG GLU D1276 -10.548 47.759 48.418 1.00 72.88 ATOM 47 CD GLU D1276 -11.448 48.854 48.975 1.00 76.26 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -12.407 49.264 48.272 1.00 77.14 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -11.206 49.310 50.116 1.00 77.55 ATOM 50 N ILE D1277 -7.583 45.016 50.771 1.00 67.56 ATOM 51 CA ILE D1277 -6.534 44.711 51.749 1.00 67.42 ATOM 52 C ILE D1277 -5.954 43.323 51.506 1.00 67.05 ATOM 53 O ILE D1277 -6.521 42.512 50.781 1.00 67.36 ATOM 54 CB ILE D1277 -7.114 44.754 53.191 1.00 68.25 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -7.848 46.086 53.402 1.00 68.01 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -6.000 44.566 54.232 1.00 69.58 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -8.581 46.192 54.727 1.00 66.43 ATOM 58 N ASP D1278 -4.811 43.063 52.119 1.00 66.45 ATOM 59 CA ASP D1278 -4.162 41.773 52.052 1.00 68.06 ATOM 60 C ASP D1278 -4.040 41.246 53.478 1.00 68.59 ATOM 61 O ASP D1278 -3.124 41.626 54.200 1.00 70.36 ATOM 62 CB ASP D1278 -2.774 41.918 51.400 1.00 68.92 ATOM 63 CG ASP D1278 -2.053 43.202 51.805 1.00 70.54 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -2.642 44.298 51.671 1.00 71.35 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -0.887 43.130 52.259 1.00 69.61 ATOM 66 N GLY D1279 -4.967 40.384 53.894 1.00 68.32 ATOM 67 CA GLY D1279 -4.919 39.886 55.260 1.00 69.27 ATOM 68 C GLY D1279 -5.558 38.527 55.464 1.00 69.90 ATOM 69 O GLY D1279 -5.437 37.658 54.607 1.00 70.04 ATOM 70 N VAL D1280 -6.240 38.359 56.602 1.00 70.09 ATOM 71 CA VAL D1280 -6.896 37.099 56.986 1.00 69.80 ATOM 72 C VAL D1280 -8.417 37.199 56.873 1.00 70.61 ATOM 73 O VAL D1280 -8.987 38.280 57.000 1.00 71.40 ATOM 74 CB VAL D1280 -6.550 36.725 58.426 1.00 68.55 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -6.650 35.248 58.584 1.00 69.41 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -5.153 37.196 58.776 1.00 68.57 ATOM 77 N VAL D1281 -9.072 36.066 56.647 1.00 71.64 ATOM 78 CA VAL D1281 -10.518 36.022 56.432 1.00 73.45 ATOM 79 C VAL D1281 -11.336 35.659 57.669 1.00 75.49 ATOM 80 O VAL D1281 -10.910 34.868 58.514 1.00 75.38 ATOM 81 CB VAL D1281 -10.831 35.009 55.299 1.00 72.47 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -12.315 34.838 55.109 1.00 72.63 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -10.227 35.503 54.029 1.00 73.28 ATOM 84 N ARG D1282 -12.531 36.253 57.733 1.00 78.12 ATOM 85 CA ARG D1282 -13.519 36.032 58.793 1.00 81.60 ATOM 86 C ARG D1282 -14.950 36.219 58.239 1.00 82.83 ATOM 87 O ARG D1282 -15.203 37.179 57.511 1.00 83.35 ATOM 88 CB ARG D1282 -13.288 37.006 59.943 1.00 83.55 ATOM 89 CG ARG D1282 -12.010 36.748 60.730 1.00 86.84 ATOM 90 CD ARG D1282 -12.116 37.233 62.177 1.00 89.60 ATOM 91 NE ARG D1282 -13.056 36.423 62.958 1.00 92.38 ATOM 92 CZ ARG D1282 -14.368 36.640 63.044 1.00 93.00 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -14.930 37.662 62.404 1.00 93.44 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -15.125 35.824 63.767 1.00 93.69 ATOM 95 N ILE D1283 -15.877 35.317 58.579 1.00 84.12 ATOM 96 CA ILE D1283 -17.258 35.380 58.064 1.00 85.64 ATOM 97 C ILE D1283 -18.310 35.335 59.185 1.00 87.04 ATOM 98 O ILE D1283 -17.975 35.090 60.341 1.00 87.49 ATOM 99 CB ILE D1283 -17.555 34.200 57.100 1.00 85.94 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -16.267 33.716 56.434 1.00 86.48 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -18.540 34.659 56.026 1.00 86.02 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -16.411 32.418 55.682 1.00 86.10 ATOM 103 N GLU D1284 -19.581 35.561 58.831 1.00 88.74 ATOM 104 CA GLU D1284 -20.687 35.570 59.805 1.00 90.28 ATOM 105 C GLU D1284 -21.958 34.821 59.326 1.00 91.83 ATOM 106 O GLU D1284 -22.060 34.453 58.154 1.00 92.67 ATOM 107 CB GLU D1284 -21.017 37.017 60.141 1.00 89.61 ATOM 108 CG GLU D1284 -19.880 37.742 60.819 1.00 89.06 ATOM 109 CD GLU D1284 -19.579 37.193 62.200 1.00 89.68 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -19.408 35.960 62.357 1.00 89.80 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -19.510 38.006 63.144 1.00 90.15 ATOM 112 N GLU D1285 -22.926 34.620 60.238 1.00 92.97 ATOM 113 CA GLU D1285 -24.160 33.849 59.944 1.00 93.27 ATOM 114 C GLU D1285 -25.485 34.592 60.075 1.00 93.28 ATOM 115 O GLU D1285 -26.524 33.931 59.981 1.00 93.11 ATOM 116 CB GLU D1285 -24.293 32.632 60.873 1.00 93.55 ATOM 117 CG GLU D1285 -24.901 32.867 62.299 1.00 93.12 ATOM 118 CD GLU D1285 -24.054 33.752 63.215 1.00 93.19 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -22.938 33.329 63.593 1.00 92.66 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -24.504 34.871 63.561 1.00 92.58 ATOM 121 N THR D1286 -25.507 35.901 60.295 1.00 93.11 ATOM 122 CA THR D1286 -26.810 36.538 60.471 1.00 93.14 ATOM 123 C THR D1286 -27.723 36.249 59.301 1.00 92.24 ATOM 124 O THR D1286 -27.277 36.118 58.164 1.00 90.97 ATOM 125 CB THR D1286 -26.693 38.051 60.640 1.00 94.37 ATOM 126 OG1 THR D1286 -25.485 38.362 61.348 1.00 95.55 ATOM 127 CG2 THR D1286 -27.878 38.579 61.457 1.00 94.62 ATOM 128 N GLU D1287 -29.004 36.148 59.620 1.00 92.58 ATOM 129 CA GLU D1287 -30.050 35.811 58.676 1.00 93.93 ATOM 130 C GLU D1287 -29.914 36.461 57.297 1.00 94.91 ATOM 131 O GLU D1287 -29.394 35.839 56.374 1.00 95.59 ATOM 132 CB GLU D1287 -31.413 36.160 59.278 1.00 93.87 ATOM 133 CG GLU D1287 -32.600 35.497 58.562 1.00 93.83 ATOM 134 CD GLU D1287 -32.543 33.959 58.501 1.00 93.39 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -33.518 33.374 57.981 1.00 93.28 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -31.553 33.328 58.952 1.00 92.27 ATOM 137 N GLU D1288 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