HEADER RIBOSOME 16-APR-14 1VW8 TITLE S. cerevisiae 80S ribosome bound with Taura syndrome virus (TSV) TITLE 2 IRES, 5 degree rotation (Class II). This entry contains the large TITLE 3 subunit ribosomal proteins. COMPND MOL_ID: 24; COMPND 2 MOLECULE: 60S ribosomal protein L25; COMPND 3 CHAIN: Y; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 1VW8 Y 1 142 UNP P04456 RL25_YEAST 1 142 SEQRES 1 Y 121 LYS ALA LEU LYS VAL ARG THR SER ALA THR PHE ARG LEU SEQRES 2 Y 121 PRO LYS THR LEU LYS LEU ALA ARG ALA PRO LYS TYR ALA SEQRES 3 Y 121 SER LYS ALA VAL PRO HIS TYR ASN ARG LEU ASP SER TYR SEQRES 4 Y 121 LYS VAL ILE GLU GLN PRO ILE THR SER GLU THR ALA MET SEQRES 5 Y 121 LYS LYS VAL GLU ASP GLY ASN ILE LEU VAL PHE GLN VAL SEQRES 6 Y 121 SER MET LYS ALA ASN LYS TYR GLN ILE LYS LYS ALA VAL SEQRES 7 Y 121 LYS GLU LEU TYR GLU VAL ASP VAL LEU LYS VAL ASN THR SEQRES 8 Y 121 LEU VAL ARG PRO ASN GLY THR LYS LYS ALA TYR VAL ARG SEQRES 9 Y 121 LEU THR ALA ASP TYR ASP ALA LEU ASP ILE ALA ASN ARG SEQRES 10 Y 121 ILE GLY TYR ILE ATOM 1 N LYS Y 22 245.808 245.851 315.633 1.00200.00 ATOM 2 CA LYS Y 22 244.524 245.082 315.715 1.00200.00 ATOM 3 C LYS Y 22 244.231 244.454 314.346 1.00200.00 ATOM 4 O LYS Y 22 245.119 243.857 313.723 1.00200.00 ATOM 5 CB LYS Y 22 243.363 246.011 316.130 1.00200.00 ATOM 6 CG LYS Y 22 243.530 246.729 317.477 1.00200.00 ATOM 7 CD LYS Y 22 244.696 247.732 317.447 1.00200.00 ATOM 8 CE LYS Y 22 244.848 248.498 318.765 1.00200.00 ATOM 9 NZ LYS Y 22 245.312 247.653 319.909 1.00200.00 ATOM 10 N ALA Y 23 242.985 244.566 313.892 1.00200.00 ATOM 11 CA ALA Y 23 242.610 244.036 312.586 1.00200.00 ATOM 12 C ALA Y 23 242.484 245.211 311.613 1.00200.00 ATOM 13 O ALA Y 23 243.322 246.123 311.607 1.00200.00 ATOM 14 CB ALA Y 23 241.281 243.265 312.676 1.00200.00 ATOM 15 N LEU Y 24 241.423 245.198 310.808 1.00200.00 ATOM 16 CA LEU Y 24 241.168 246.244 309.808 1.00200.00 ATOM 17 C LEU Y 24 239.808 246.928 310.051 1.00200.00 ATOM 18 O LEU Y 24 239.303 246.948 311.178 1.00200.00 ATOM 19 CB LEU Y 24 241.178 245.625 308.397 1.00200.00 ATOM 20 CG LEU Y 24 242.401 244.839 307.887 1.00200.00 ATOM 21 CD1 LEU Y 24 242.650 243.585 308.741 1.00200.00 ATOM 22 CD2 LEU Y 24 242.167 244.445 306.431 1.00200.00 ATOM 23 N LYS Y 25 239.230 247.492 308.988 1.00200.00 ATOM 24 CA LYS Y 25 237.915 248.137 309.065 1.00200.00 ATOM 25 C LYS Y 25 236.870 247.163 308.492 1.00200.00 ATOM 26 O LYS Y 25 237.202 246.032 308.104 1.00200.00 ATOM 27 CB LYS Y 25 237.882 249.458 308.276 1.00200.00 ATOM 28 CG LYS Y 25 239.006 250.459 308.584 1.00200.00 ATOM 29 CD LYS Y 25 240.196 250.247 307.646 1.00200.00 ATOM 30 CE LYS Y 25 241.237 251.350 307.739 1.00200.00 ATOM 31 NZ LYS Y 25 242.282 251.217 306.682 1.00200.00 ATOM 32 N VAL Y 26 235.616 247.607 308.426 1.00200.00 ATOM 33 CA VAL Y 26 234.513 246.769 307.944 1.00200.00 ATOM 34 C VAL Y 26 233.856 247.229 306.630 1.00200.00 ATOM 35 O VAL Y 26 233.143 248.237 306.597 1.00200.00 ATOM 36 CB VAL Y 26 233.410 246.654 309.048 1.00200.00 ATOM 37 CG1 VAL Y 26 233.067 248.042 309.587 1.00200.00 ATOM 38 CG2 VAL Y 26 232.152 245.968 308.493 1.00200.00 ATOM 39 N ARG Y 27 234.083 246.475 305.553 1.00200.00 ATOM 40 CA ARG Y 27 233.492 246.820 304.261 1.00200.00 ATOM 41 C ARG Y 27 232.284 245.953 303.902 1.00200.00 ATOM 42 O ARG Y 27 232.382 244.726 303.808 1.00200.00 ATOM 43 CB ARG Y 27 234.539 246.767 303.132 1.00200.00 ATOM 44 CG ARG Y 27 235.594 245.678 303.241 1.00200.00 ATOM 45 CD ARG Y 27 236.673 245.986 304.294 1.00200.00 ATOM 46 NE ARG Y 27 237.265 247.319 304.146 1.00200.00 ATOM 47 CZ ARG Y 27 238.415 247.699 304.701 1.00200.00 ATOM 48 NH1 ARG Y 27 239.108 246.842 305.441 1.00200.00 ATOM 49 NH2 ARG Y 27 238.867 248.938 304.528 1.00200.00 ATOM 50 N THR Y 28 231.145 246.625 303.715 1.00200.00 ATOM 51 CA THR Y 28 229.883 245.973 303.372 1.00200.00 ATOM 52 C THR Y 28 229.615 245.986 301.865 1.00200.00 ATOM 53 O THR Y 28 228.701 245.305 301.390 1.00200.00 ATOM 54 CB THR Y 28 228.676 246.641 304.109 1.00200.00 ATOM 55 OG1 THR Y 28 228.640 248.045 303.812 1.00200.00 ATOM 56 CG2 THR Y 28 228.794 246.448 305.624 1.00200.00 ATOM 57 N SER Y 29 230.409 246.753 301.114 1.00200.00 ATOM 58 CA SER Y 29 230.247 246.841 299.660 1.00200.00 ATOM 59 C SER Y 29 231.344 246.075 298.907 1.00200.00 ATOM 60 O SER Y 29 232.512 246.101 299.304 1.00200.00 ATOM 61 CB SER Y 29 230.223 248.308 299.221 1.00200.00 ATOM 62 OG SER Y 29 230.019 248.437 297.821 1.00200.00 ATOM 63 N ALA Y 30 230.965 245.410 297.810 1.00200.00 ATOM 64 CA ALA Y 30 231.904 244.610 297.009 1.00200.00 ATOM 65 C ALA Y 30 232.732 245.362 295.949 1.00200.00 ATOM 66 O ALA Y 30 233.861 244.960 295.638 1.00200.00 ATOM 67 CB ALA Y 30 231.155 243.437 296.352 1.00200.00 ATOM 68 N THR Y 31 232.179 246.436 295.389 1.00200.00 ATOM 69 CA THR Y 31 232.891 247.215 294.367 1.00200.00 ATOM 70 C THR Y 31 233.836 248.245 294.996 1.00200.00 ATOM 71 O THR Y 31 233.463 248.968 295.935 1.00200.00 ATOM 72 CB THR Y 31 231.905 247.995 293.435 1.00200.00 ATOM 73 OG1 THR Y 31 230.793 247.159 293.091 1.00200.00 ATOM 74 CG2 THR Y 31 232.610 248.432 292.143 1.00200.00 ATOM 75 N PHE Y 32 235.061 248.311 294.477 1.00200.00 ATOM 76 CA PHE Y 32 236.038 249.274 294.978 1.00200.00 ATOM 77 C PHE Y 32 236.090 250.501 294.075 1.00200.00 ATOM 78 O PHE Y 32 236.157 250.381 292.851 1.00200.00 ATOM 79 CB PHE Y 32 237.456 248.677 295.068 1.00200.00 ATOM 80 CG PHE Y 32 238.474 249.638 295.645 1.00200.00 ATOM 81 CD1 PHE Y 32 238.417 250.000 296.984 1.00200.00 ATOM 82 CD2 PHE Y 32 239.444 250.234 294.841 1.00200.00 ATOM 83 CE1 PHE Y 32 239.299 250.943 297.516 1.00200.00 ATOM 84 CE2 PHE Y 32 240.329 251.181 295.370 1.00200.00 ATOM 85 CZ PHE Y 32 240.253 251.534 296.710 1.00200.00 ATOM 86 N ARG Y 33 236.071 251.683 294.683 1.00200.00 ATOM 87 CA ARG Y 33 236.125 252.918 293.917 1.00200.00 ATOM 88 C ARG Y 33 237.209 253.872 294.396 1.00200.00 ATOM 89 O ARG Y 33 237.566 253.900 295.581 1.00200.00 ATOM 90 CB ARG Y 33 234.774 253.639 293.949 1.00200.00 ATOM 91 CG ARG Y 33 233.607 252.812 293.442 1.00200.00 ATOM 92 CD ARG Y 33 232.762 252.341 294.604 1.00200.00 ATOM 93 NE ARG Y 33 231.629 251.516 294.189 1.00200.00 ATOM 94 CZ ARG Y 33 230.533 251.339 294.922 1.00200.00 ATOM 95 NH1 ARG Y 33 230.424 251.936 296.106 1.00200.00 ATOM 96 NH2 ARG Y 33 229.550 250.564 294.479 1.00200.00 ATOM 97 N LEU Y 34 237.717 254.649 293.445 1.00200.00 ATOM 98 CA LEU Y 34 238.748 255.651 293.679 1.00200.00 ATOM 99 C LEU Y 34 238.379 256.518 294.894 1.00200.00 ATOM 100 O LEU Y 34 237.246 257.025 294.995 1.00200.00 ATOM 101 CB LEU Y 34 238.889 256.514 292.407 1.00200.00 ATOM 102 CG LEU Y 34 239.823 257.727 292.243 1.00200.00 ATOM 103 CD1 LEU Y 34 239.317 258.924 293.054 1.00200.00 ATOM 104 CD2 LEU Y 34 241.244 257.354 292.641 1.00200.00 ATOM 105 N PRO Y 35 239.326 256.695 295.839 1.00200.00 ATOM 106 CA PRO Y 35 239.089 257.507 297.044 1.00200.00 ATOM 107 C PRO Y 35 239.030 259.005 296.725 1.00200.00 ATOM 108 O PRO Y 35 239.915 259.533 296.043 1.00200.00 ATOM 109 CB PRO Y 35 240.293 257.169 297.938 1.00200.00 ATOM 110 CG PRO Y 35 240.756 255.827 297.434 1.00200.00 ATOM 111 CD PRO Y 35 240.607 255.973 295.944 1.00200.00 ATOM 112 N LYS Y 36 237.991 259.686 297.204 1.00200.00 ATOM 113 CA LYS Y 36 237.887 261.124 296.957 1.00200.00 ATOM 114 C LYS Y 36 239.032 261.846 297.660 1.00200.00 ATOM 115 O LYS Y 36 239.379 261.522 298.805 1.00200.00 ATOM 116 CB LYS Y 36 236.554 261.677 297.457 1.00200.00 ATOM 117 CG LYS Y 36 235.422 261.529 296.468 1.00200.00 ATOM 118 CD LYS Y 36 234.101 261.938 297.092 1.00200.00 ATOM 119 CE LYS Y 36 232.964 261.842 296.079 1.00200.00 ATOM 120 NZ LYS Y 36 231.655 262.156 296.688 1.00200.00 ATOM 121 N THR Y 37 239.620 262.821 296.972 1.00200.00 ATOM 122 CA THR Y 37 240.727 263.588 297.527 1.00200.00 ATOM 123 C THR Y 37 240.410 265.091 297.565 1.00200.00 ATOM 124 O THR Y 37 239.274 265.512 297.267 1.00200.00 ATOM 125 CB THR Y 37 242.034 263.340 296.708 1.00200.00 ATOM 126 OG1 THR Y 37 243.148 263.934 297.384 1.00200.00 ATOM 127 CG2 THR Y 37 241.909 263.914 295.297 1.00200.00 ATOM 128 N LEU Y 38 241.418 265.892 297.918 1.00200.00 ATOM 129 CA LEU Y 38 241.258 267.339 298.009 1.00200.00 ATOM 130 C LEU Y 38 241.513 268.024 296.658 1.00200.00 ATOM 131 O LEU Y 38 242.627 267.984 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