HEADER TRANSFERASE 01-JUL-05 2A68 TITLE Crystal structure of the T. thermophilus RNA polymerase holoenzyme in TITLE 2 complex with antibiotic rifabutin COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase beta' chain; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.50 ANGSTORMS DBREF 2A68 D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -24.380 177.879 37.158 1.00 54.54 ATOM 2 CA ALA D1270 -24.185 177.427 38.520 1.00 54.56 ATOM 3 C ALA D1270 -22.776 177.722 38.967 1.00 55.11 ATOM 4 O ALA D1270 -21.849 176.925 38.772 1.00 55.14 ATOM 5 CB ALA D1270 -24.451 175.950 38.650 1.00 54.96 ATOM 6 N LYS D1271 -22.635 178.898 39.561 1.00 54.46 ATOM 7 CA LYS D1271 -21.370 179.354 40.082 1.00 53.69 ATOM 8 C LYS D1271 -20.913 178.414 41.202 1.00 56.02 ATOM 9 O LYS D1271 -21.709 177.660 41.772 1.00 56.03 ATOM 10 CB LYS D1271 -21.553 180.775 40.632 1.00 51.66 ATOM 11 CG LYS D1271 -20.448 181.793 40.313 1.00 49.49 ATOM 12 CD LYS D1271 -20.453 183.044 41.232 1.00 47.39 ATOM 13 CE LYS D1271 -19.537 182.896 42.490 1.00 45.75 ATOM 14 NZ LYS D1271 -19.732 183.960 43.531 1.00 38.08 ATOM 15 N ALA D1272 -19.625 178.449 41.504 1.00 57.86 ATOM 16 CA ALA D1272 -19.075 177.670 42.606 1.00 58.65 ATOM 17 C ALA D1272 -18.293 178.617 43.494 1.00 59.63 ATOM 18 O ALA D1272 -17.256 179.144 43.070 1.00 60.91 ATOM 19 CB ALA D1272 -18.154 176.560 42.094 1.00 58.49 ATOM 20 N VAL D1273 -18.780 178.853 44.712 1.00 59.75 ATOM 21 CA VAL D1273 -18.089 179.784 45.580 1.00 58.52 ATOM 22 C VAL D1273 -16.703 179.267 45.923 1.00 57.22 ATOM 23 O VAL D1273 -16.528 178.183 46.478 1.00 56.51 ATOM 24 CB VAL D1273 -18.928 180.063 46.857 1.00 58.64 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -20.269 180.628 46.437 1.00 58.55 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -19.130 178.808 47.672 1.00 58.40 ATOM 27 N ILE D1274 -15.710 180.056 45.547 1.00 57.25 ATOM 28 CA ILE D1274 -14.327 179.697 45.793 1.00 57.62 ATOM 29 C ILE D1274 -13.890 180.178 47.151 1.00 58.29 ATOM 30 O ILE D1274 -14.549 181.027 47.760 1.00 59.55 ATOM 31 CB ILE D1274 -13.378 180.308 44.749 1.00 57.44 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -14.031 181.532 44.112 1.00 56.52 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -13.005 179.265 43.735 1.00 56.92 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -14.077 182.727 45.005 1.00 58.18 ATOM 35 N SER D1275 -12.772 179.640 47.615 1.00 57.84 ATOM 36 CA SER D1275 -12.254 179.987 48.919 1.00 57.66 ATOM 37 C SER D1275 -11.250 181.122 48.851 1.00 57.83 ATOM 38 O SER D1275 -10.103 180.913 48.464 1.00 56.64 ATOM 39 CB SER D1275 -11.597 178.763 49.520 1.00 57.26 ATOM 40 OG SER D1275 -10.662 178.248 48.584 1.00 56.16 ATOM 41 N GLU D1276 -11.684 182.318 49.236 1.00 59.06 ATOM 42 CA GLU D1276 -10.804 183.481 49.251 1.00 61.65 ATOM 43 C GLU D1276 -9.653 183.274 50.234 1.00 63.08 ATOM 44 O GLU D1276 -8.588 183.894 50.108 1.00 63.21 ATOM 45 CB GLU D1276 -11.582 184.732 49.662 1.00 61.06 ATOM 46 CG GLU D1276 -12.412 185.334 48.548 1.00 60.85 ATOM 47 CD GLU D1276 -13.835 185.619 48.969 1.00 61.63 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -14.592 186.147 48.128 1.00 62.25 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -14.203 185.317 50.130 1.00 61.30 ATOM 50 N ILE D1277 -9.882 182.394 51.207 1.00 65.36 ATOM 51 CA ILE D1277 -8.906 182.103 52.250 1.00 66.37 ATOM 52 C ILE D1277 -8.438 180.663 52.204 1.00 68.47 ATOM 53 O ILE D1277 -9.217 179.751 51.925 1.00 69.52 ATOM 54 CB ILE D1277 -9.503 182.337 53.635 1.00 65.20 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -10.104 183.736 53.695 1.00 65.26 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -8.417 182.180 54.698 1.00 65.48 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -10.956 183.964 54.876 1.00 63.73 ATOM 58 N ASP D1278 -7.154 180.465 52.481 1.00 70.22 ATOM 59 CA ASP D1278 -6.594 179.124 52.527 1.00 71.48 ATOM 60 C ASP D1278 -6.475 178.696 53.987 1.00 71.07 ATOM 61 O ASP D1278 -5.610 179.174 54.730 1.00 70.91 ATOM 62 CB ASP D1278 -5.219 179.088 51.820 1.00 73.49 ATOM 63 CG ASP D1278 -4.220 180.087 52.399 1.00 74.05 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -4.552 181.290 52.504 1.00 74.86 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -3.094 179.660 52.745 1.00 74.53 ATOM 66 N GLY D1279 -7.372 177.805 54.398 1.00 71.25 ATOM 67 CA GLY D1279 -7.370 177.343 55.776 1.00 70.49 ATOM 68 C GLY D1279 -8.056 176.001 55.957 1.00 69.22 ATOM 69 O GLY D1279 -7.889 175.106 55.136 1.00 69.16 ATOM 70 N VAL D1280 -8.831 175.859 57.033 1.00 68.81 ATOM 71 CA VAL D1280 -9.532 174.602 57.322 1.00 67.41 ATOM 72 C VAL D1280 -11.068 174.756 57.239 1.00 67.41 ATOM 73 O VAL D1280 -11.607 175.851 57.397 1.00 67.21 ATOM 74 CB VAL D1280 -9.150 174.046 58.730 1.00 66.92 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -8.635 172.654 58.575 1.00 65.80 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -8.084 174.907 59.407 1.00 66.60 ATOM 77 N VAL D1281 -11.755 173.635 57.006 1.00 66.93 ATOM 78 CA VAL D1281 -13.209 173.591 56.786 1.00 67.31 ATOM 79 C VAL D1281 -14.063 173.246 58.005 1.00 67.80 ATOM 80 O VAL D1281 -13.672 172.457 58.868 1.00 68.07 ATOM 81 CB VAL D1281 -13.529 172.567 55.688 1.00 66.87 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -15.041 172.473 55.438 1.00 67.15 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -12.813 172.967 54.434 1.00 67.33 ATOM 84 N ARG D1282 -15.256 173.850 58.017 1.00 67.70 ATOM 85 CA ARG D1282 -16.279 173.676 59.046 1.00 67.53 ATOM 86 C ARG D1282 -17.688 173.844 58.429 1.00 66.73 ATOM 87 O ARG D1282 -17.923 174.807 57.709 1.00 65.73 ATOM 88 CB ARG D1282 -16.066 174.705 60.158 1.00 68.57 ATOM 89 CG ARG D1282 -15.161 174.275 61.327 1.00 68.85 ATOM 90 CD ARG D1282 -15.320 175.239 62.511 1.00 68.02 ATOM 91 NE ARG D1282 -16.739 175.493 62.758 1.00 67.41 ATOM 92 CZ ARG D1282 -17.406 176.553 62.309 1.00 66.67 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -16.780 177.483 61.595 1.00 65.15 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -18.705 176.665 62.552 1.00 66.20 ATOM 95 N ILE D1283 -18.610 172.923 58.729 1.00 66.85 ATOM 96 CA ILE D1283 -19.967 172.897 58.155 1.00 68.20 ATOM 97 C ILE D1283 -21.076 172.936 59.231 1.00 70.68 ATOM 98 O ILE D1283 -20.822 172.556 60.373 1.00 70.21 ATOM 99 CB ILE D1283 -20.121 171.618 57.318 1.00 67.60 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -18.902 171.456 56.402 1.00 68.28 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -21.369 171.687 56.491 1.00 66.46 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -18.788 170.074 55.761 1.00 68.43 ATOM 103 N GLU D1284 -22.297 173.379 58.869 1.00 72.82 ATOM 104 CA GLU D1284 -23.427 173.481 59.831 1.00 75.98 ATOM 105 C GLU D1284 -24.774 172.825 59.336 1.00 78.05 ATOM 106 O GLU D1284 -24.984 172.605 58.142 1.00 78.32 ATOM 107 CB GLU D1284 -23.635 174.957 60.201 1.00 75.53 ATOM 108 CG GLU D1284 -22.338 175.689 60.650 1.00 75.93 ATOM 109 CD GLU D1284 -22.103 175.754 62.169 1.00 76.01 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -21.536 174.802 62.759 1.00 76.96 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -22.490 176.777 62.774 1.00 74.93 ATOM 112 N GLU D1285 -25.670 172.564 60.306 1.00 80.86 ATOM 113 CA GLU D1285 -26.949 171.784 60.210 1.00 82.73 ATOM 114 C GLU D1285 -28.328 172.427 59.943 1.00 83.02 ATOM 115 O GLU D1285 -29.125 171.817 59.218 1.00 81.65 ATOM 116 CB GLU D1285 -27.128 170.971 61.507 1.00 83.31 ATOM 117 CG GLU D1285 -27.166 171.783 62.849 1.00 84.17 ATOM 118 CD GLU D1285 -25.874 172.566 63.207 1.00 84.02 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -24.758 171.998 63.156 1.00 83.61 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -25.986 173.767 63.553 1.00 84.05 ATOM 121 N THR D1286 -28.633 173.588 60.529 1.00 84.33 ATOM 122 CA THR D1286 -29.986 174.173 60.438 1.00 85.74 ATOM 123 C THR D1286 -30.646 174.081 59.061 1.00 86.45 ATOM 124 O THR D1286 -30.008 174.127 58.016 1.00 86.03 ATOM 125 CB THR D1286 -30.011 175.668 60.943 1.00 85.27 ATOM 126 OG1 THR D1286 -29.665 175.707 62.333 1.00 84.29 ATOM 127 CG2 THR D1286 -31.440 176.285 60.810 1.00 83.32 ATOM 128 N GLU D1287 -31.965 173.935 59.146 1.00 88.70 ATOM 129 CA GLU D1287 -32.949 173.755 58.076 1.00 91.29 ATOM 130 C GLU D1287 -32.705 174.440 56.729 1.00 93.29 ATOM 131 O GLU D1287 -32.359 173.771 55.750 1.00 93.31 ATOM 132 CB GLU D1287 -34.324 174.181 58.584 1.00 91.59 ATOM 133 CG GLU D1287 -34.824 173.316 59.688 1.00 92.86 ATOM 134 CD GLU D1287 -35.061 174.111 60.941 1.00 94.73 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -35.969 174.977 60.933 1.00 95.51 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -34.339 173.873 61.932 1.00 95.55 ATOM 137 N GLU D1288 -32.898 175.752 56.667 1.00 94.79 ATOM 138 CA GLU D1288 -32.815 176.466 55.398 1.00 95.95 ATOM 139 C GLU D1288 -31.468 176.412 54.660 1.00 96.84 ATOM 140 O GLU D1288 -31.328 175.641 53.699 1.00 98.15 ATOM 141 CB GLU D1288 -33.226 177.924 55.592 1.00 96.05 ATOM 142 CG GLU D1288 -34.406 178.323 54.724 1.00 95.94 ATOM 143 CD GLU D1288 -34.426 179.806 54.389 1.00 96.41 ATOM 144 OE1 GLU D1288 -33.485 180.279 53.710 1.00 96.04 ATOM 145 OE2 GLU D1288 -35.383 180.497 54.804 1.00 96.71 ATOM 146 N LYS D1289 -30.483 177.212 55.074 1.00 96.89 ATOM 147 CA LYS D1289 -29.225 177.255 54.324 1.00 96.28 ATOM 148 C LYS D1289 -28.024 176.655 55.044 1.00 95.76 ATOM 149 O LYS D1289 -27.854 176.773 56.256 1.00 95.81 ATOM 150 CB LYS D1289 -28.909 178.711 53.921 1.00 96.20 ATOM 151 CG LYS D1289 -29.947 179.345 52.969 1.00 95.67 ATOM 152 CD LYS D1289 -29.908 180.868 53.051 1.00 95.92 ATOM 153 CE LYS D1289 -31.110 181.519 52.374 1.00 95.33 ATOM 154 NZ LYS D1289 -31.180 182.990 52.654 1.00 95.21 ATOM 155 N LEU D1290 -27.195 176.003 54.241 1.00 94.83 ATOM 156 CA LEU D1290 -25.968 175.394 54.693 1.00 93.76 ATOM 157 C LEU D1290 -24.925 176.487 54.852 1.00 92.75 ATOM 158 O LEU D1290 -25.230 177.668 54.636 1.00 91.56 ATOM 159 CB LEU D1290 -25.503 174.367 53.662 1.00 94.54 ATOM 160 CG LEU D1290 -25.091 172.984 54.137 1.00 95.01 ATOM 161 CD1 LEU D1290 -24.554 172.212 52.943 1.00 96.06 ATOM 162 CD2 LEU D1290 -24.035 173.090 55.217 1.00 95.84 ATOM 163 N SER D1291 -23.706 176.110 55.218 1.00 92.54 ATOM 164 CA SER D1291 -22.648 177.091 55.395 1.00 92.47 ATOM 165 C SER D1291 -21.301 176.428 55.589 1.00 92.04 ATOM 166 O SER D1291 -21.159 175.525 56.420 1.00 92.54 ATOM 167 CB SER D1291 -22.946 177.975 56.609 1.00 93.49 ATOM 168 OG SER D1291 -23.138 177.201 57.783 1.00 94.65 ATOM 169 N VAL D1292 -20.316 176.872 54.822 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