HEADER TRANSFERASE 02-JUL-05 2A69 TITLE Crystal structure of the T. Thermophilus RNA polymerase holoenzyme in TITLE 2 complex with antibiotic rifapentin COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase beta' chain; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.50 ANGSTORMS DBREF 2A69 D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -24.345 178.092 36.793 1.00 59.41 ATOM 2 CA ALA D1270 -24.124 177.539 38.123 1.00 58.38 ATOM 3 C ALA D1270 -22.666 177.753 38.519 1.00 58.49 ATOM 4 O ALA D1270 -21.783 176.920 38.247 1.00 58.49 ATOM 5 CB ALA D1270 -24.464 176.062 38.148 1.00 57.57 ATOM 6 N LYS D1271 -22.433 178.902 39.149 1.00 58.36 ATOM 7 CA LYS D1271 -21.113 179.303 39.609 1.00 58.19 ATOM 8 C LYS D1271 -20.684 178.400 40.750 1.00 60.09 ATOM 9 O LYS D1271 -21.449 177.542 41.198 1.00 61.54 ATOM 10 CB LYS D1271 -21.155 180.754 40.106 1.00 56.47 ATOM 11 CG LYS D1271 -19.862 181.540 39.933 1.00 55.38 ATOM 12 CD LYS D1271 -19.780 182.710 40.916 1.00 53.98 ATOM 13 CE LYS D1271 -19.101 182.279 42.219 1.00 53.46 ATOM 14 NZ LYS D1271 -19.226 183.223 43.380 1.00 53.42 ATOM 15 N ALA D1272 -19.461 178.587 41.217 1.00 62.23 ATOM 16 CA ALA D1272 -18.944 177.833 42.347 1.00 63.65 ATOM 17 C ALA D1272 -18.160 178.779 43.241 1.00 65.92 ATOM 18 O ALA D1272 -17.103 179.296 42.837 1.00 66.95 ATOM 19 CB ALA D1272 -18.041 176.701 41.878 1.00 63.27 ATOM 20 N VAL D1273 -18.666 179.022 44.449 1.00 67.10 ATOM 21 CA VAL D1273 -17.977 179.950 45.321 1.00 67.12 ATOM 22 C VAL D1273 -16.577 179.461 45.654 1.00 66.63 ATOM 23 O VAL D1273 -16.387 178.401 46.256 1.00 65.58 ATOM 24 CB VAL D1273 -18.791 180.198 46.613 1.00 67.28 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -20.113 180.868 46.242 1.00 67.18 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -19.035 178.895 47.356 1.00 66.13 ATOM 27 N ILE D1274 -15.597 180.252 45.227 1.00 66.79 ATOM 28 CA ILE D1274 -14.199 179.934 45.467 1.00 67.26 ATOM 29 C ILE D1274 -13.772 180.380 46.838 1.00 67.99 ATOM 30 O ILE D1274 -14.435 181.199 47.479 1.00 68.65 ATOM 31 CB ILE D1274 -13.258 180.609 44.442 1.00 66.29 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -13.958 181.787 43.757 1.00 65.04 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -12.789 179.582 43.465 1.00 65.35 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -13.855 183.083 44.509 1.00 65.43 ATOM 35 N SER D1275 -12.651 179.840 47.280 1.00 68.29 ATOM 36 CA SER D1275 -12.117 180.165 48.584 1.00 69.07 ATOM 37 C SER D1275 -11.124 181.328 48.531 1.00 70.22 ATOM 38 O SER D1275 -9.971 181.143 48.133 1.00 69.95 ATOM 39 CB SER D1275 -11.426 178.934 49.130 1.00 69.14 ATOM 40 OG SER D1275 -10.616 178.384 48.094 1.00 67.01 ATOM 41 N GLU D1276 -11.565 182.517 48.934 1.00 70.82 ATOM 42 CA GLU D1276 -10.685 183.675 48.959 1.00 72.49 ATOM 43 C GLU D1276 -9.539 183.444 49.925 1.00 73.77 ATOM 44 O GLU D1276 -8.451 184.015 49.772 1.00 74.81 ATOM 45 CB GLU D1276 -11.425 184.906 49.424 1.00 71.49 ATOM 46 CG GLU D1276 -12.236 185.563 48.383 1.00 72.65 ATOM 47 CD GLU D1276 -13.605 185.858 48.899 1.00 73.63 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -14.199 186.863 48.471 1.00 74.38 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -14.091 185.073 49.735 1.00 74.39 ATOM 50 N ILE D1277 -9.800 182.598 50.918 1.00 74.29 ATOM 51 CA ILE D1277 -8.834 182.296 51.965 1.00 75.49 ATOM 52 C ILE D1277 -8.313 180.868 51.893 1.00 76.76 ATOM 53 O ILE D1277 -9.064 179.934 51.615 1.00 77.85 ATOM 54 CB ILE D1277 -9.466 182.483 53.350 1.00 75.03 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -9.986 183.909 53.481 1.00 74.44 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -8.443 182.158 54.436 1.00 75.04 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -10.702 184.183 54.767 1.00 74.41 ATOM 58 N ASP D1278 -7.020 180.704 52.146 1.00 77.50 ATOM 59 CA ASP D1278 -6.455 179.371 52.183 1.00 77.40 ATOM 60 C ASP D1278 -6.349 178.952 53.638 1.00 76.64 ATOM 61 O ASP D1278 -5.468 179.414 54.368 1.00 77.21 ATOM 62 CB ASP D1278 -5.070 179.318 51.465 1.00 77.78 ATOM 63 CG ASP D1278 -4.134 180.474 51.824 1.00 78.38 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -4.544 181.655 51.700 1.00 78.60 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -2.974 180.189 52.221 1.00 77.48 ATOM 66 N GLY D1279 -7.279 178.094 54.056 1.00 76.67 ATOM 67 CA GLY D1279 -7.309 177.631 55.437 1.00 76.05 ATOM 68 C GLY D1279 -7.943 176.261 55.606 1.00 75.17 ATOM 69 O GLY D1279 -7.753 175.383 54.771 1.00 74.89 ATOM 70 N VAL D1280 -8.700 176.075 56.686 1.00 74.63 ATOM 71 CA VAL D1280 -9.344 174.790 56.966 1.00 73.70 ATOM 72 C VAL D1280 -10.865 174.890 56.861 1.00 72.90 ATOM 73 O VAL D1280 -11.416 175.985 56.926 1.00 72.52 ATOM 74 CB VAL D1280 -8.948 174.300 58.359 1.00 73.87 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -9.380 172.880 58.540 1.00 73.85 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -7.434 174.407 58.535 1.00 74.61 ATOM 77 N VAL D1281 -11.529 173.739 56.717 1.00 72.47 ATOM 78 CA VAL D1281 -12.984 173.665 56.500 1.00 72.54 ATOM 79 C VAL D1281 -13.850 173.346 57.723 1.00 73.19 ATOM 80 O VAL D1281 -13.462 172.578 58.600 1.00 73.78 ATOM 81 CB VAL D1281 -13.277 172.619 55.428 1.00 72.29 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -14.782 172.415 55.242 1.00 72.39 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -12.652 173.079 54.150 1.00 72.96 ATOM 84 N ARG D1282 -15.046 173.953 57.717 1.00 73.39 ATOM 85 CA ARG D1282 -16.089 173.808 58.742 1.00 74.45 ATOM 86 C ARG D1282 -17.507 173.984 58.124 1.00 75.68 ATOM 87 O ARG D1282 -17.766 174.977 57.447 1.00 75.52 ATOM 88 CB ARG D1282 -15.877 174.853 59.841 1.00 73.93 ATOM 89 CG ARG D1282 -15.173 174.369 61.109 1.00 72.04 ATOM 90 CD ARG D1282 -15.335 175.393 62.247 1.00 69.02 ATOM 91 NE ARG D1282 -16.740 175.742 62.481 1.00 66.04 ATOM 92 CZ ARG D1282 -17.331 176.839 62.014 1.00 63.07 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -16.632 177.704 61.288 1.00 61.88 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -18.616 177.070 62.270 1.00 60.56 ATOM 95 N ILE D1283 -18.417 173.037 58.382 1.00 77.24 ATOM 96 CA ILE D1283 -19.785 173.004 57.806 1.00 79.57 ATOM 97 C ILE D1283 -20.907 173.059 58.873 1.00 80.98 ATOM 98 O ILE D1283 -20.654 172.720 60.026 1.00 81.63 ATOM 99 CB ILE D1283 -19.931 171.707 56.971 1.00 78.99 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -18.723 171.575 56.031 1.00 78.87 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -21.220 171.723 56.191 1.00 78.09 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -18.679 170.306 55.231 1.00 78.60 ATOM 103 N GLU D1284 -22.134 173.467 58.496 1.00 82.76 ATOM 104 CA GLU D1284 -23.259 173.558 59.464 1.00 85.45 ATOM 105 C GLU D1284 -24.592 172.883 58.976 1.00 88.39 ATOM 106 O GLU D1284 -24.833 172.706 57.782 1.00 87.95 ATOM 107 CB GLU D1284 -23.495 175.036 59.837 1.00 84.77 ATOM 108 CG GLU D1284 -22.221 175.776 60.354 1.00 83.86 ATOM 109 CD GLU D1284 -21.970 175.716 61.882 1.00 82.91 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -21.579 174.653 62.437 1.00 81.72 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -22.166 176.762 62.534 1.00 81.79 ATOM 112 N GLU D1285 -25.440 172.545 59.959 1.00 91.71 ATOM 113 CA GLU D1285 -26.704 171.762 59.879 1.00 95.22 ATOM 114 C GLU D1285 -28.065 172.439 59.625 1.00 97.03 ATOM 115 O GLU D1285 -28.877 171.837 58.915 1.00 97.39 ATOM 116 CB GLU D1285 -26.865 170.957 61.183 1.00 96.49 ATOM 117 CG GLU D1285 -26.894 171.799 62.500 1.00 98.48 ATOM 118 CD GLU D1285 -25.663 172.702 62.733 1.00 99.01 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -24.512 172.200 62.676 1.00 99.17 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -25.859 173.920 62.980 1.00 99.33 ATOM 121 N THR D1286 -28.334 173.621 60.195 1.00 98.22 ATOM 122 CA THR D1286 -29.659 174.286 60.109 1.00 99.30 ATOM 123 C THR D1286 -30.415 174.062 58.786 1.00100.48 ATOM 124 O THR D1286 -29.829 173.955 57.709 1.00100.78 ATOM 125 CB THR D1286 -29.531 175.802 60.377 1.00 98.50 ATOM 126 OG1 THR D1286 -28.846 175.989 61.621 1.00 97.33 ATOM 127 CG2 THR D1286 -30.909 176.468 60.470 1.00 98.00 ATOM 128 N GLU D1287 -31.738 174.001 58.914 1.00101.81 ATOM 129 CA GLU D1287 -32.680 173.718 57.830 1.00103.20 ATOM 130 C GLU D1287 -32.454 174.416 56.487 1.00104.52 ATOM 131 O GLU D1287 -32.089 173.756 55.510 1.00104.66 ATOM 132 CB GLU D1287 -34.090 174.032 58.289 1.00102.68 ATOM 133 CG GLU D1287 -34.598 173.093 59.323 1.00102.46 ATOM 134 CD GLU D1287 -35.306 173.842 60.401 1.00102.65 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -36.124 174.723 60.051 1.00103.23 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -35.046 173.557 61.590 1.00102.37 ATOM 137 N GLU D1288 -32.670 175.726 56.424 1.00105.34 ATOM 138 CA GLU D1288 -32.605 176.437 55.149 1.00106.44 ATOM 139 C GLU D1288 -31.253 176.424 54.441 1.00106.33 ATOM 140 O GLU D1288 -31.071 175.665 53.484 1.00107.37 ATOM 141 CB GLU D1288 -33.068 177.892 55.326 1.00107.39 ATOM 142 CG GLU D1288 -34.053 178.379 54.238 1.00108.49 ATOM 143 CD GLU D1288 -33.388 179.056 53.027 1.00109.49 ATOM 144 OE1 GLU D1288 -32.636 178.389 52.280 1.00109.96 ATOM 145 OE2 GLU D1288 -33.628 180.269 52.823 1.00109.93 ATOM 146 N LYS D1289 -30.302 177.239 54.887 1.00105.67 ATOM 147 CA LYS D1289 -29.047 177.347 54.147 1.00104.50 ATOM 148 C LYS D1289 -27.826 176.742 54.827 1.00103.16 ATOM 149 O LYS D1289 -27.595 176.903 56.025 1.00102.70 ATOM 150 CB LYS D1289 -28.797 178.830 53.822 1.00104.49 ATOM 151 CG LYS D1289 -29.796 179.397 52.815 1.00104.32 ATOM 152 CD LYS D1289 -29.889 180.913 52.930 1.00104.37 ATOM 153 CE LYS D1289 -31.020 181.512 52.099 1.00104.08 ATOM 154 NZ LYS D1289 -31.291 182.933 52.478 1.00103.13 ATOM 155 N LEU D1290 -27.052 176.028 54.014 1.00101.63 ATOM 156 CA LEU D1290 -25.814 175.405 54.433 1.00100.47 ATOM 157 C LEU D1290 -24.767 176.499 54.588 1.00 99.68 ATOM 158 O LEU D1290 -25.082 177.669 54.390 1.00 99.25 ATOM 159 CB LEU D1290 -25.363 174.401 53.371 1.00100.96 ATOM 160 CG LEU D1290 -24.892 173.021 53.816 1.00100.95 ATOM 161 CD1 LEU D1290 -24.248 172.330 52.617 1.00101.72 ATOM 162 CD2 LEU D1290 -23.890 173.136 54.946 1.00101.14 ATOM 163 N SER D1291 -23.536 176.140 54.932 1.00 98.65 ATOM 164 CA SER D1291 -22.496 177.146 55.082 1.00 97.87 ATOM 165 C SER D1291 -21.138 176.514 55.313 1.00 96.66 ATOM 166 O SER D1291 -20.977 175.648 56.184 1.00 96.73 ATOM 167 CB SER D1291 -22.835 178.086 56.248 1.00 99.26 ATOM 168 OG SER D1291 -23.291 177.362 57.369 1.00102.25 ATOM 169 N VAL D1292 -20.163 176.943 54.517 1.00 94.89 ATOM 170 CA VAL D1292 -18.805 176.446 54.666 1.00 93.25 ATOM 171 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