HEADER TRANSFERASE 02-JUL-05 2A6E TITLE Crystal structure of the T. Thermophilus RNA polymerase holoenzyme COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase beta' chain; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.80 ANGSTORMS DBREF 2A6E D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -24.443 178.031 36.861 1.00 63.71 ATOM 2 CA ALA D1270 -24.243 177.489 38.182 1.00 63.75 ATOM 3 C ALA D1270 -22.795 177.662 38.569 1.00 63.95 ATOM 4 O ALA D1270 -21.955 176.780 38.361 1.00 63.86 ATOM 5 CB ALA D1270 -24.613 176.048 38.216 1.00 63.82 ATOM 6 N LYS D1271 -22.521 178.832 39.123 1.00 64.21 ATOM 7 CA LYS D1271 -21.197 179.172 39.580 1.00 66.42 ATOM 8 C LYS D1271 -20.814 178.219 40.707 1.00 68.34 ATOM 9 O LYS D1271 -21.575 177.308 41.062 1.00 69.02 ATOM 10 CB LYS D1271 -21.209 180.629 40.083 1.00 66.04 ATOM 11 CG LYS D1271 -19.872 181.287 40.466 1.00 66.14 ATOM 12 CD LYS D1271 -20.054 182.458 41.457 1.00 66.66 ATOM 13 CE LYS D1271 -19.110 182.380 42.691 1.00 66.73 ATOM 14 NZ LYS D1271 -19.416 183.368 43.792 1.00 65.27 ATOM 15 N ALA D1272 -19.628 178.432 41.253 1.00 70.09 ATOM 16 CA ALA D1272 -19.124 177.666 42.373 1.00 72.43 ATOM 17 C ALA D1272 -18.349 178.610 43.263 1.00 74.27 ATOM 18 O ALA D1272 -17.290 179.113 42.856 1.00 75.60 ATOM 19 CB ALA D1272 -18.212 176.526 41.893 1.00 72.05 ATOM 20 N VAL D1273 -18.852 178.873 44.467 1.00 75.06 ATOM 21 CA VAL D1273 -18.133 179.808 45.322 1.00 75.41 ATOM 22 C VAL D1273 -16.727 179.290 45.656 1.00 75.27 ATOM 23 O VAL D1273 -16.547 178.174 46.163 1.00 74.94 ATOM 24 CB VAL D1273 -18.948 180.102 46.612 1.00 75.63 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -20.302 180.688 46.217 1.00 74.63 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -19.135 178.838 47.435 1.00 75.21 ATOM 27 N ILE D1274 -15.732 180.110 45.327 1.00 75.31 ATOM 28 CA ILE D1274 -14.343 179.763 45.578 1.00 76.06 ATOM 29 C ILE D1274 -13.926 180.231 46.951 1.00 75.92 ATOM 30 O ILE D1274 -14.603 181.052 47.581 1.00 76.47 ATOM 31 CB ILE D1274 -13.386 180.412 44.555 1.00 75.45 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -13.688 181.909 44.440 1.00 75.44 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -13.520 179.716 43.224 1.00 76.30 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -12.676 182.681 43.636 1.00 73.89 ATOM 35 N SER D1275 -12.799 179.711 47.401 1.00 76.26 ATOM 36 CA SER D1275 -12.278 180.047 48.710 1.00 75.66 ATOM 37 C SER D1275 -11.285 181.198 48.648 1.00 76.24 ATOM 38 O SER D1275 -10.131 180.998 48.261 1.00 76.37 ATOM 39 CB SER D1275 -11.593 178.827 49.275 1.00 75.89 ATOM 40 OG SER D1275 -10.689 178.356 48.283 1.00 74.05 ATOM 41 N GLU D1276 -11.727 182.392 49.027 1.00 76.52 ATOM 42 CA GLU D1276 -10.844 183.545 49.047 1.00 77.49 ATOM 43 C GLU D1276 -9.706 183.308 50.023 1.00 78.25 ATOM 44 O GLU D1276 -8.621 183.883 49.893 1.00 79.02 ATOM 45 CB GLU D1276 -11.577 184.792 49.500 1.00 77.94 ATOM 46 CG GLU D1276 -12.297 185.519 48.418 1.00 80.37 ATOM 47 CD GLU D1276 -13.786 185.430 48.602 1.00 82.45 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -14.500 186.384 48.213 1.00 83.41 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -14.242 184.397 49.135 1.00 83.54 ATOM 50 N ILE D1277 -9.965 182.453 51.006 1.00 79.10 ATOM 51 CA ILE D1277 -8.976 182.152 52.028 1.00 79.99 ATOM 52 C ILE D1277 -8.496 180.711 51.961 1.00 81.22 ATOM 53 O ILE D1277 -9.260 179.804 51.622 1.00 82.31 ATOM 54 CB ILE D1277 -9.559 182.391 53.405 1.00 79.34 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -10.175 183.787 53.445 1.00 79.53 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -8.464 182.290 54.441 1.00 78.50 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -11.038 184.012 54.609 1.00 80.00 ATOM 58 N ASP D1278 -7.218 180.511 52.277 1.00 81.93 ATOM 59 CA ASP D1278 -6.646 179.168 52.324 1.00 81.31 ATOM 60 C ASP D1278 -6.582 178.746 53.790 1.00 80.44 ATOM 61 O ASP D1278 -5.769 179.260 54.566 1.00 79.61 ATOM 62 CB ASP D1278 -5.237 179.141 51.679 1.00 82.37 ATOM 63 CG ASP D1278 -4.221 180.037 52.403 1.00 83.02 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -4.477 181.257 52.549 1.00 82.59 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -3.163 179.515 52.825 1.00 83.83 ATOM 66 N GLY D1279 -7.464 177.831 54.174 1.00 79.71 ATOM 67 CA GLY D1279 -7.505 177.396 55.557 1.00 78.58 ATOM 68 C GLY D1279 -8.168 176.047 55.737 1.00 77.73 ATOM 69 O GLY D1279 -8.009 175.168 54.899 1.00 78.69 ATOM 70 N VAL D1280 -8.918 175.877 56.826 1.00 76.17 ATOM 71 CA VAL D1280 -9.573 174.593 57.113 1.00 74.57 ATOM 72 C VAL D1280 -11.096 174.695 56.976 1.00 72.76 ATOM 73 O VAL D1280 -11.642 175.792 57.057 1.00 73.25 ATOM 74 CB VAL D1280 -9.200 174.088 58.549 1.00 74.92 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -8.745 172.650 58.473 1.00 75.14 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -8.064 174.916 59.151 1.00 75.26 ATOM 77 N VAL D1281 -11.768 173.558 56.788 1.00 70.84 ATOM 78 CA VAL D1281 -13.221 173.522 56.547 1.00 70.44 ATOM 79 C VAL D1281 -14.090 173.203 57.755 1.00 70.40 ATOM 80 O VAL D1281 -13.697 172.426 58.624 1.00 70.10 ATOM 81 CB VAL D1281 -13.543 172.491 55.472 1.00 69.83 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -15.054 172.385 55.228 1.00 67.96 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -12.843 172.890 54.230 1.00 72.16 ATOM 84 N ARG D1282 -15.286 173.811 57.751 1.00 70.53 ATOM 85 CA ARG D1282 -16.326 173.656 58.771 1.00 71.74 ATOM 86 C ARG D1282 -17.716 173.816 58.120 1.00 72.49 ATOM 87 O ARG D1282 -17.911 174.742 57.343 1.00 72.14 ATOM 88 CB ARG D1282 -16.138 174.711 59.868 1.00 71.80 ATOM 89 CG ARG D1282 -14.939 174.496 60.807 1.00 71.69 ATOM 90 CD ARG D1282 -14.804 175.598 61.857 1.00 69.79 ATOM 91 NE ARG D1282 -16.099 175.942 62.440 1.00 68.40 ATOM 92 CZ ARG D1282 -16.838 176.987 62.073 1.00 67.06 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -16.407 177.803 61.121 1.00 66.16 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -18.012 177.219 62.655 1.00 66.53 ATOM 95 N ILE D1283 -18.665 172.929 58.450 1.00 74.27 ATOM 96 CA ILE D1283 -20.024 172.899 57.864 1.00 76.71 ATOM 97 C ILE D1283 -21.140 172.954 58.931 1.00 79.40 ATOM 98 O ILE D1283 -20.890 172.606 60.086 1.00 79.26 ATOM 99 CB ILE D1283 -20.162 171.609 57.022 1.00 76.56 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -19.067 171.609 55.944 1.00 77.92 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -21.543 171.502 56.414 1.00 75.17 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -18.825 170.274 55.228 1.00 78.52 ATOM 103 N GLU D1284 -22.358 173.382 58.553 1.00 82.69 ATOM 104 CA GLU D1284 -23.488 173.497 59.508 1.00 86.71 ATOM 105 C GLU D1284 -24.824 172.834 59.011 1.00 89.67 ATOM 106 O GLU D1284 -25.021 172.628 57.810 1.00 90.30 ATOM 107 CB GLU D1284 -23.703 174.977 59.840 1.00 86.11 ATOM 108 CG GLU D1284 -22.407 175.730 60.251 1.00 86.10 ATOM 109 CD GLU D1284 -22.116 175.748 61.765 1.00 86.17 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -21.647 174.727 62.328 1.00 85.53 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -22.364 176.804 62.391 1.00 86.03 ATOM 112 N GLU D1285 -25.722 172.555 59.979 1.00 93.15 ATOM 113 CA GLU D1285 -27.001 171.770 59.873 1.00 96.47 ATOM 114 C GLU D1285 -28.386 172.418 59.634 1.00 97.35 ATOM 115 O GLU D1285 -29.206 171.790 58.947 1.00 96.88 ATOM 116 CB GLU D1285 -27.164 170.916 61.144 1.00 98.16 ATOM 117 CG GLU D1285 -27.276 171.713 62.477 1.00100.64 ATOM 118 CD GLU D1285 -26.074 172.626 62.793 1.00101.74 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -24.910 172.182 62.625 1.00102.81 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -26.293 173.790 63.206 1.00101.93 ATOM 121 N THR D1286 -28.681 173.596 60.195 1.00 98.31 ATOM 122 CA THR D1286 -30.036 174.184 60.105 1.00 99.03 ATOM 123 C THR D1286 -30.712 174.037 58.743 1.00 99.31 ATOM 124 O THR D1286 -30.087 174.083 57.683 1.00 99.37 ATOM 125 CB THR D1286 -30.022 175.686 60.553 1.00 99.15 ATOM 126 OG1 THR D1286 -29.955 175.730 61.981 1.00 99.90 ATOM 127 CG2 THR D1286 -31.301 176.442 60.109 1.00 99.02 ATOM 128 N GLU D1287 -32.025 173.853 58.851 1.00100.34 ATOM 129 CA GLU D1287 -33.004 173.619 57.785 1.00101.34 ATOM 130 C GLU D1287 -32.792 174.327 56.442 1.00102.00 ATOM 131 O GLU D1287 -32.562 173.654 55.440 1.00101.55 ATOM 132 CB GLU D1287 -34.395 173.972 58.300 1.00101.93 ATOM 133 CG GLU D1287 -34.905 173.036 59.366 1.00102.72 ATOM 134 CD GLU D1287 -35.859 173.738 60.304 1.00103.48 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -36.702 174.538 59.829 1.00103.10 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -35.760 173.488 61.524 1.00105.02 ATOM 137 N GLU D1288 -32.877 175.655 56.402 1.00103.12 ATOM 138 CA GLU D1288 -32.802 176.378 55.125 1.00104.58 ATOM 139 C GLU D1288 -31.455 176.371 54.378 1.00104.48 ATOM 140 O GLU D1288 -31.298 175.619 53.405 1.00105.69 ATOM 141 CB GLU D1288 -33.253 177.825 55.318 1.00105.10 ATOM 142 CG GLU D1288 -34.737 177.998 55.136 1.00107.14 ATOM 143 CD GLU D1288 -35.065 179.254 54.372 1.00109.10 ATOM 144 OE1 GLU D1288 -34.614 179.361 53.206 1.00109.58 ATOM 145 OE2 GLU D1288 -35.765 180.131 54.935 1.00110.77 ATOM 146 N LYS D1289 -30.487 177.192 54.790 1.00103.13 ATOM 147 CA LYS D1289 -29.231 177.251 54.032 1.00100.77 ATOM 148 C LYS D1289 -28.023 176.655 54.747 1.00 99.09 ATOM 149 O LYS D1289 -27.825 176.805 55.952 1.00 98.22 ATOM 150 CB LYS D1289 -28.913 178.708 53.631 1.00101.28 ATOM 151 CG LYS D1289 -29.470 179.156 52.255 1.00101.02 ATOM 152 CD LYS D1289 -30.757 179.972 52.377 1.00100.06 ATOM 153 CE LYS D1289 -31.089 180.700 51.084 1.00 99.12 ATOM 154 NZ LYS D1289 -32.122 181.750 51.296 1.00 98.62 ATOM 155 N LEU D1290 -27.221 175.966 53.947 1.00 97.28 ATOM 156 CA LEU D1290 -25.997 175.350 54.392 1.00 95.79 ATOM 157 C LEU D1290 -24.975 176.444 54.587 1.00 94.48 ATOM 158 O LEU D1290 -25.308 177.614 54.446 1.00 93.97 ATOM 159 CB LEU D1290 -25.502 174.378 53.333 1.00 96.07 ATOM 160 CG LEU D1290 -25.048 173.006 53.793 1.00 96.88 ATOM 161 CD1 LEU D1290 -24.413 172.328 52.599 1.00 97.44 ATOM 162 CD2 LEU D1290 -24.062 173.096 54.951 1.00 97.21 ATOM 163 N SER D1291 -23.741 176.081 54.894 1.00 93.77 ATOM 164 CA SER D1291 -22.709 177.081 55.089 1.00 93.66 ATOM 165 C SER D1291 -21.365 176.441 55.309 1.00 93.28 ATOM 166 O SER D1291 -21.212 175.574 56.177 1.00 93.77 ATOM 167 CB SER D1291 -23.053 177.940 56.292 1.00 94.15 ATOM 168 OG SER D1291 -23.554 177.100 57.309 1.00 95.23 ATOM 169 N VAL D1292 -20.390 176.865 54.518 1.00 92.66 ATOM 170 CA VAL D1292 -19.046 176.346 54.678 1.00 92.46 ATOM 171 C VAL D1292 -18.130 177.460 55.133 1.00 92.13 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