HEADER TRANSFERASE 02-JUL-05 2A6E TITLE Crystal structure of the T. Thermophilus RNA polymerase holoenzyme COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase beta' chain; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.80 ANGSTORMS DBREF 2A6E D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 244 CYS GLN LYS CYS TYR GLY TYR ASP LEU SER MET ALA ARG SEQRES 2 D 244 PRO VAL SER ILE GLY GLU ALA VAL GLY ILE VAL ALA ALA SEQRES 3 D 244 GLN SER ILE GLY GLU PRO GLY THR GLN LEU THR MET ARG SEQRES 4 D 244 THR PHE HIS THR GLY GLY VAL ALA GLY ALA ALA ASP ILE SEQRES 5 D 244 THR GLN GLY LEU PRO ARG VAL ILE GLU LEU PHE GLU ALA SEQRES 6 D 244 ARG ARG PRO LYS ASP PRO HIS GLN LEU LEU GLU ALA LYS SEQRES 7 D 244 GLY PRO GLU ALA VAL GLU ARG TYR LEU VAL GLU GLU ILE SEQRES 8 D 244 GLN LYS VAL TYR ARG ALA GLN GLY VAL LYS LEU HIS ASP SEQRES 9 D 244 LYS HIS ILE GLU ILE VAL VAL ARG GLN MET MET LYS TYR SEQRES 10 D 244 VAL GLU VAL THR ASP PRO GLY ASP SER ARG LEU LEU GLU SEQRES 11 D 244 GLY GLN VAL LEU GLU LYS TRP ASP VAL GLU ALA LEU ASN SEQRES 12 D 244 GLU ARG LEU ILE ALA GLU GLY LYS THR PRO VAL ALA TRP SEQRES 13 D 244 LYS PRO LEU LEU MET GLY VAL THR LYS SER ALA LEU SER SEQRES 14 D 244 THR LYS SER TRP LEU SER ALA ALA SER PHE GLN ASN THR SEQRES 15 D 244 THR HIS VAL LEU THR GLU ALA ALA ILE ALA GLY LYS LYS SEQRES 16 D 244 ASP GLU LEU ILE GLY LEU LYS GLU ASN VAL ILE LEU GLY SEQRES 17 D 244 ARG LEU ILE PRO ALA GLY THR GLY SER ASP PHE VAL ARG SEQRES 18 D 244 PHE THR GLN VAL VAL ASP GLN LYS THR LEU LYS ALA ILE SEQRES 19 D 244 GLU GLU ALA ARG LYS GLU ALA VAL GLU ALA ATOM 1 N CYS D1201 7.931 185.784 21.368 1.00 68.09 ATOM 2 CA CYS D1201 9.239 185.397 20.866 1.00 67.11 ATOM 3 C CYS D1201 9.378 183.925 20.492 1.00 65.22 ATOM 4 O CYS D1201 8.517 183.102 20.771 1.00 64.23 ATOM 5 CB CYS D1201 10.278 185.758 21.910 1.00 70.89 ATOM 6 SG CYS D1201 10.209 184.726 23.402 1.00 76.71 ATOM 7 N GLN D1202 10.500 183.633 19.847 1.00 64.92 ATOM 8 CA GLN D1202 10.864 182.295 19.392 1.00 66.64 ATOM 9 C GLN D1202 10.819 181.285 20.527 1.00 66.84 ATOM 10 O GLN D1202 10.165 180.243 20.442 1.00 68.00 ATOM 11 CB GLN D1202 12.297 182.255 18.842 1.00 66.61 ATOM 12 CG GLN D1202 12.585 182.783 17.460 1.00 66.39 ATOM 13 CD GLN D1202 14.086 182.772 17.148 1.00 66.24 ATOM 14 OE1 GLN D1202 14.494 182.745 15.974 1.00 65.86 ATOM 15 NE2 GLN D1202 14.912 182.799 18.200 1.00 63.90 ATOM 16 N LYS D1203 11.546 181.602 21.589 1.00 67.55 ATOM 17 CA LYS D1203 11.636 180.714 22.716 1.00 67.39 ATOM 18 C LYS D1203 10.292 180.563 23.446 1.00 67.13 ATOM 19 O LYS D1203 10.006 179.486 23.970 1.00 67.41 ATOM 20 CB LYS D1203 12.744 181.216 23.655 1.00 67.35 ATOM 21 CG LYS D1203 14.185 181.098 23.080 1.00 66.92 ATOM 22 CD LYS D1203 14.625 179.633 22.793 1.00 66.77 ATOM 23 CE LYS D1203 16.118 179.527 22.390 1.00 66.21 ATOM 24 NZ LYS D1203 16.575 178.166 21.940 1.00 64.63 ATOM 25 N CYS D1204 9.456 181.601 23.488 1.00 67.74 ATOM 26 CA CYS D1204 8.173 181.428 24.175 1.00 68.13 ATOM 27 C CYS D1204 7.132 180.741 23.282 1.00 67.43 ATOM 28 O CYS D1204 6.272 180.027 23.817 1.00 68.87 ATOM 29 CB CYS D1204 7.570 182.763 24.675 1.00 70.47 ATOM 30 SG CYS D1204 8.200 183.532 26.232 1.00 75.04 ATOM 31 N TYR D1205 7.162 180.928 21.953 1.00 65.98 ATOM 32 CA TYR D1205 6.164 180.214 21.143 1.00 64.03 ATOM 33 C TYR D1205 6.521 178.746 21.077 1.00 62.37 ATOM 34 O TYR D1205 5.804 177.919 21.624 1.00 62.01 ATOM 35 CB TYR D1205 6.038 180.740 19.700 1.00 64.34 ATOM 36 CG TYR D1205 4.824 180.124 18.996 1.00 63.41 ATOM 37 CD1 TYR D1205 3.632 180.842 18.800 1.00 62.33 ATOM 38 CD2 TYR D1205 4.847 178.798 18.560 1.00 62.71 ATOM 39 CE1 TYR D1205 2.492 180.213 18.187 1.00 61.88 ATOM 40 CE2 TYR D1205 3.715 178.172 17.946 1.00 62.89 ATOM 41 CZ TYR D1205 2.548 178.901 17.766 1.00 62.58 ATOM 42 OH TYR D1205 1.446 178.345 17.181 1.00 62.57 ATOM 43 N GLY D1206 7.606 178.401 20.398 1.00 61.47 ATOM 44 CA GLY D1206 7.980 177.009 20.397 1.00 61.34 ATOM 45 C GLY D1206 8.536 176.470 19.110 1.00 61.33 ATOM 46 O GLY D1206 9.469 176.995 18.522 1.00 62.65 ATOM 47 N TYR D1207 7.917 175.381 18.690 1.00 60.11 ATOM 48 CA TYR D1207 8.268 174.608 17.503 1.00 58.70 ATOM 49 C TYR D1207 7.437 175.007 16.254 1.00 58.31 ATOM 50 O TYR D1207 7.854 175.699 15.322 1.00 56.92 ATOM 51 CB TYR D1207 7.958 173.160 17.830 1.00 57.37 ATOM 52 CG TYR D1207 9.002 172.101 17.705 1.00 56.08 ATOM 53 CD1 TYR D1207 8.596 170.744 17.697 1.00 56.33 ATOM 54 CD2 TYR D1207 10.382 172.399 17.633 1.00 56.02 ATOM 55 CE1 TYR D1207 9.535 169.684 17.623 1.00 56.73 ATOM 56 CE2 TYR D1207 11.351 171.341 17.560 1.00 55.93 ATOM 57 CZ TYR D1207 10.905 169.987 17.555 1.00 56.31 ATOM 58 OH TYR D1207 11.793 168.946 17.473 1.00 55.70 ATOM 59 N ASP D1208 6.208 174.514 16.343 1.00 57.89 ATOM 60 CA ASP D1208 5.153 174.517 15.358 1.00 56.49 ATOM 61 C ASP D1208 4.867 175.725 14.564 1.00 57.90 ATOM 62 O ASP D1208 4.061 176.605 14.888 1.00 58.04 ATOM 63 CB ASP D1208 3.817 174.063 15.954 1.00 52.33 ATOM 64 CG ASP D1208 3.038 173.117 15.017 1.00 48.62 ATOM 65 OD1 ASP D1208 3.498 172.833 13.892 1.00 43.51 ATOM 66 OD2 ASP D1208 1.957 172.646 15.406 1.00 44.50 ATOM 67 N LEU D1209 5.591 175.716 13.478 1.00 59.65 ATOM 68 CA LEU D1209 5.267 176.550 12.373 1.00 61.68 ATOM 69 C LEU D1209 4.433 175.484 11.638 1.00 63.13 ATOM 70 O LEU D1209 4.218 174.427 12.270 1.00 63.50 ATOM 71 CB LEU D1209 6.528 176.894 11.589 1.00 59.74 ATOM 72 CG LEU D1209 6.300 177.646 10.293 1.00 58.76 ATOM 73 CD1 LEU D1209 7.367 178.663 10.217 1.00 59.06 ATOM 74 CD2 LEU D1209 6.306 176.736 9.069 1.00 57.83 ATOM 75 N SER D1210 3.938 175.624 10.413 1.00 63.90 ATOM 76 CA SER D1210 3.284 174.417 9.896 1.00 63.56 ATOM 77 C SER D1210 4.351 173.289 9.818 1.00 62.41 ATOM 78 O SER D1210 4.052 172.099 9.758 1.00 62.26 ATOM 79 CB SER D1210 2.664 174.692 8.535 1.00 63.43 ATOM 80 OG SER D1210 1.279 174.935 8.690 1.00 64.68 ATOM 81 N MET D1211 5.606 173.730 9.853 1.00 61.53 ATOM 82 CA MET D1211 6.803 172.905 9.860 1.00 59.31 ATOM 83 C MET D1211 7.152 172.520 11.311 1.00 59.10 ATOM 84 O MET D1211 6.742 173.184 12.271 1.00 59.41 ATOM 85 CB MET D1211 7.901 173.715 9.171 1.00 58.06 ATOM 86 CG MET D1211 9.272 173.673 9.707 1.00 55.76 ATOM 87 SD MET D1211 10.029 175.148 9.020 1.00 54.44 ATOM 88 CE MET D1211 9.686 176.307 10.246 1.00 54.46 ATOM 89 N ALA D1212 7.915 171.455 11.481 1.00 58.62 ATOM 90 CA ALA D1212 8.193 170.978 12.825 1.00 58.07 ATOM 91 C ALA D1212 9.413 171.565 13.509 1.00 58.42 ATOM 92 O ALA D1212 9.682 171.167 14.623 1.00 59.01 ATOM 93 CB ALA D1212 8.320 169.484 12.806 1.00 58.29 ATOM 94 N ARG D1213 10.163 172.479 12.910 1.00 59.06 ATOM 95 CA ARG D1213 11.340 172.998 13.620 1.00 59.07 ATOM 96 C ARG D1213 10.966 174.174 14.561 1.00 57.36 ATOM 97 O ARG D1213 9.827 174.225 15.007 1.00 57.62 ATOM 98 CB ARG D1213 12.418 173.371 12.574 1.00 61.86 ATOM 99 CG ARG D1213 12.050 174.231 11.411 1.00 63.17 ATOM 100 CD ARG D1213 12.737 173.687 10.174 1.00 63.33 ATOM 101 NE ARG D1213 12.656 172.226 10.154 1.00 64.49 ATOM 102 CZ ARG D1213 12.189 171.500 9.143 1.00 65.24 ATOM 103 NH1 ARG D1213 11.746 172.090 8.039 1.00 64.45 ATOM 104 NH2 ARG D1213 12.171 170.175 9.240 1.00 65.80 ATOM 105 N PRO D1214 11.899 175.098 14.910 1.00 55.13 ATOM 106 CA PRO D1214 11.338 176.129 15.786 1.00 52.47 ATOM 107 C PRO D1214 10.466 177.061 14.995 1.00 50.50 ATOM 108 O PRO D1214 10.457 176.985 13.778 1.00 49.74 ATOM 109 CB PRO D1214 12.555 176.839 16.333 1.00 53.32 ATOM 110 CG PRO D1214 13.669 175.851 16.154 1.00 54.14 ATOM 111 CD PRO D1214 13.370 175.238 14.860 1.00 54.78 ATOM 112 N VAL D1215 9.738 177.936 15.666 1.00 49.71 ATOM 113 CA VAL D1215 8.917 178.891 14.946 1.00 49.86 ATOM 114 C VAL D1215 9.821 179.846 14.221 1.00 51.17 ATOM 115 O VAL D1215 10.899 180.156 14.714 1.00 51.72 ATOM 116 CB VAL D1215 7.993 179.672 15.904 1.00 48.95 ATOM 117 CG1 VAL D1215 7.624 181.081 15.375 1.00 47.34 ATOM 118 CG2 VAL D1215 6.755 178.929 16.012 1.00 49.61 ATOM 119 N SER D1216 9.384 180.300 13.048 1.00 52.89 ATOM 120 CA SER D1216 10.174 181.233 12.256 1.00 53.34 ATOM 121 C SER D1216 9.674 182.652 12.486 1.00 51.80 ATOM 122 O SER D1216 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46.72 ATOM 141 CB GLU D1219 4.923 182.768 12.313 1.00 49.23 ATOM 142 CG GLU D1219 3.546 182.057 12.182 1.00 51.17 ATOM 143 CD GLU D1219 3.587 180.513 12.206 1.00 53.22 ATOM 144 OE1 GLU D1219 4.359 179.884 11.433 1.00 53.39 ATOM 145 OE2 GLU D1219 2.825 179.920 13.005 1.00 52.65 ATOM 146 N ALA D1220 2.640 184.961 11.654 1.00 47.68 ATOM 147 CA ALA D1220 1.445 185.560 12.206 1.00 49.29 ATOM 148 C ALA D1220 0.781 184.578 13.168 1.00 49.13 ATOM 149 O ALA D1220 -0.216 183.935 12.844 1.00 50.54 ATOM 150 CB ALA D1220 0.495 185.909 11.097 1.00 50.86 ATOM 151 N VAL D1221 1.332 184.461 14.362 1.00 48.70 ATOM 152 CA VAL D1221 0.795 183.533 15.324 1.00 48.06 ATOM 153 C VAL D1221 -0.591 183.903 15.792 1.00 46.82 ATOM 154 O VAL D1221 -1.451 183.024 15.984 1.00 46.47 ATOM 155 CB VAL D1221 1.689 183.471 16.515 1.00 48.73 ATOM 156 CG1 VAL D1221 0.960 182.758 17.652 1.00 50.93 ATOM 157 CG2 VAL D1221 3.004 182.827 16.111 1.00 49.81 ATOM 158 N GLY D1222 -0.782 185.196 15.995 1.00 45.32 ATOM 159 CA GLY D1222 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