HEADER ISOMERASE/DNA/ANTIBIOTIC 25-APR-10 2XCT TITLE THE TWINNED 3.35A STRUCTURE OF S. AUREUS GYRASE COMPLEX WITH TITLE 2 CIPROFLOXACIN AND DNA COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: DNA GYRASE SUBUNIT B, DNA GYRASE SUBUNIT A; COMPND 3 CHAIN: B, D, S, U; COMPND 4 MUTATION: YES; COMPND 5 EC: 5.99.1.3; COMPND 6 FRAGMENT: GYRB- C-TERMINAL 27KDA DOMAIN, RESIDUES 410-543 AND 580-644, GYRA- COMPND 7 N-TERMINAL 56KDA DOMAIN, RESIDUES ; COMPND 8 ENGINEERED: YES; COMPND 9 C-TERMINUS GYRB (644) FUSED TO N-TERMINUS GYRA (1002). GREEK KEY COMPND 10 OTHER_DETAILS: DOMAIN (544-579) DELETED AND REPLACED WITH TWO RESIDUES, TG; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.35 ANGSTORMS DBREF 2XCT D 410 545 UNP P66937 GYRB_STAAN 410 545 DBREF 2XCT D 580 644 UNP P66937 GYRB_STAAN 580 644 DBREF 2XCT D 1002 1491 UNP Q99XG5 GYRA_STAAN 2 491 SEQRES 1 D 164 GLN THR SER PHE GLY VAL ASN MET ILE ALA LEU VAL ASN SEQRES 2 D 164 GLY ARG PRO LYS LEU ILE ASN LEU LYS GLU ALA LEU VAL SEQRES 3 D 164 HIS TYR LEU GLU HIS GLN LYS THR VAL VAL ARG ARG ARG SEQRES 4 D 164 THR GLN TYR ASN LEU ARG LYS ALA LYS ASP ARG ALA HIS SEQRES 5 D 164 ILE LEU GLU GLY LEU ARG ILE ALA LEU ASP HIS ILE ASP SEQRES 6 D 164 GLU ILE ILE SER THR ILE ARG GLU SER ASP THR ASP LYS SEQRES 7 D 164 VAL ALA MET GLU SER LEU GLN GLN ARG PHE LYS LEU SER SEQRES 8 D 164 GLU LYS GLN ALA GLN ALA ILE LEU ASP MET ARG LEU ARG SEQRES 9 D 164 ARG LEU THR GLY LEU GLU ARG ASP LYS ILE GLU ALA GLU SEQRES 10 D 164 TYR ASN GLU LEU LEU ASN TYR ILE SER GLU LEU GLU THR SEQRES 11 D 164 ILE LEU ALA ASP GLU GLU VAL LEU LEU GLN LEU VAL ARG SEQRES 12 D 164 ASP GLU LEU THR GLU ILE ARG ASP ARG PHE GLY ASP ASP SEQRES 13 D 164 ARG ARG THR GLU ILE GLN LEU GLY ATOM 1 N GLN D1328 -33.283 59.834 62.668 1.00 67.23 ATOM 2 CA GLN D1328 -34.487 59.358 63.337 1.00 66.95 ATOM 3 C GLN D1328 -34.501 57.835 63.359 1.00 66.55 ATOM 4 O GLN D1328 -34.482 57.186 62.310 1.00 67.10 ATOM 5 CB GLN D1328 -35.746 59.909 62.674 1.00 67.62 ATOM 6 CG GLN D1328 -37.011 59.188 63.090 1.00 67.63 ATOM 7 CD GLN D1328 -38.171 60.136 63.235 1.00 68.57 ATOM 8 OE1 GLN D1328 -38.014 61.329 63.017 1.00 70.27 ATOM 9 NE2 GLN D1328 -39.337 59.621 63.612 1.00 69.31 ATOM 10 N THR D1329 -34.519 57.282 64.568 1.00 67.30 ATOM 11 CA THR D1329 -34.452 55.842 64.774 1.00 67.17 ATOM 12 C THR D1329 -35.463 55.441 65.841 1.00 66.45 ATOM 13 O THR D1329 -36.062 56.296 66.490 1.00 66.27 ATOM 14 CB THR D1329 -33.017 55.385 65.137 1.00 66.75 ATOM 15 OG1 THR D1329 -32.122 55.780 64.087 1.00 68.76 ATOM 16 CG2 THR D1329 -32.935 53.865 65.318 1.00 67.26 ATOM 17 N SER D1330 -35.647 54.138 66.014 1.00 60.62 ATOM 18 CA SER D1330 -36.783 53.622 66.747 1.00 60.29 ATOM 19 C SER D1330 -36.369 52.561 67.731 1.00 58.82 ATOM 20 O SER D1330 -35.708 51.594 67.362 1.00 58.70 ATOM 21 CB SER D1330 -37.714 52.951 65.771 1.00 61.58 ATOM 22 OG SER D1330 -37.085 51.776 65.297 1.00 65.15 ATOM 23 N PHE D1331 -36.797 52.728 68.977 1.00 67.78 ATOM 24 CA PHE D1331 -36.507 51.759 70.011 1.00 66.48 ATOM 25 C PHE D1331 -37.584 50.683 70.050 1.00 66.44 ATOM 26 O PHE D1331 -38.764 50.963 70.289 1.00 66.42 ATOM 27 CB PHE D1331 -36.366 52.435 71.361 1.00 65.54 ATOM 28 CG PHE D1331 -35.575 51.636 72.327 1.00 64.92 ATOM 29 CD1 PHE D1331 -34.301 51.208 72.005 1.00 64.18 ATOM 30 CD2 PHE D1331 -36.104 51.287 73.550 1.00 63.49 ATOM 31 CE1 PHE D1331 -33.566 50.455 72.903 1.00 64.08 ATOM 32 CE2 PHE D1331 -35.377 50.538 74.452 1.00 63.96 ATOM 33 CZ PHE D1331 -34.111 50.121 74.133 1.00 63.37 ATOM 34 N GLY D1332 -37.167 49.446 69.798 1.00 65.75 ATOM 35 CA GLY D1332 -38.096 48.342 69.685 1.00 65.96 ATOM 36 C GLY D1332 -38.389 47.680 71.006 1.00 65.64 ATOM 37 O GLY D1332 -37.960 46.550 71.225 1.00 65.66 ATOM 38 N VAL D1333 -39.128 48.369 71.872 1.00 45.10 ATOM 39 CA VAL D1333 -39.397 47.864 73.216 1.00 45.26 ATOM 40 C VAL D1333 -39.958 46.434 73.250 1.00 46.32 ATOM 41 O VAL D1333 -40.932 46.125 72.583 1.00 47.46 ATOM 42 CB VAL D1333 -40.301 48.817 74.026 1.00 45.25 ATOM 43 CG1 VAL D1333 -40.463 48.257 75.428 1.00 44.59 ATOM 44 CG2 VAL D1333 -39.671 50.185 74.073 1.00 44.48 ATOM 45 N ASN D1334 -39.306 45.569 74.020 1.00 47.37 ATOM 46 CA ASN D1334 -39.607 44.139 74.078 1.00 48.37 ATOM 47 C ASN D1334 -39.020 43.507 75.346 1.00 48.03 ATOM 48 O ASN D1334 -37.912 42.974 75.344 1.00 47.84 ATOM 49 CB ASN D1334 -39.098 43.435 72.828 1.00 48.93 ATOM 50 CG ASN D1334 -39.215 41.940 72.917 1.00 50.95 ATOM 51 OD1 ASN D1334 -38.232 41.232 72.771 1.00 53.49 ATOM 52 ND2 ASN D1334 -40.411 41.450 73.161 1.00 50.18 ATOM 53 N MET D1335 -39.826 43.541 76.405 1.00 48.16 ATOM 54 CA MET D1335 -39.402 43.299 77.786 1.00 48.21 ATOM 55 C MET D1335 -39.466 41.849 78.307 1.00 47.83 ATOM 56 O MET D1335 -40.332 41.494 79.125 1.00 48.23 ATOM 57 CB MET D1335 -40.174 44.229 78.733 1.00 48.16 ATOM 58 CG MET D1335 -40.012 45.702 78.430 1.00 48.93 ATOM 59 SD MET D1335 -40.649 46.708 79.785 1.00 49.92 ATOM 60 CE MET D1335 -42.406 46.384 79.717 1.00 49.66 ATOM 61 N ILE D1336 -38.504 41.050 77.841 1.00 51.21 ATOM 62 CA ILE D1336 -38.205 39.707 78.348 1.00 51.23 ATOM 63 C ILE D1336 -37.089 39.694 79.425 1.00 50.49 ATOM 64 O ILE D1336 -35.907 39.672 79.079 1.00 49.72 ATOM 65 CB ILE D1336 -37.813 38.805 77.160 1.00 52.01 ATOM 66 CG1 ILE D1336 -38.943 38.847 76.134 1.00 53.08 ATOM 67 CG2 ILE D1336 -37.520 37.373 77.600 1.00 52.43 ATOM 68 CD1 ILE D1336 -38.793 37.878 74.997 1.00 53.47 ATOM 69 N ALA D1337 -37.489 39.709 80.711 1.00 35.04 ATOM 70 CA ALA D1337 -36.599 39.665 81.896 1.00 34.66 ATOM 71 C ALA D1337 -36.738 38.327 82.624 1.00 35.68 ATOM 72 O ALA D1337 -37.783 37.710 82.545 1.00 36.69 ATOM 73 CB ALA D1337 -36.928 40.818 82.855 1.00 33.90 ATOM 74 N LEU D1338 -35.711 37.879 83.345 1.00 56.81 ATOM 75 CA LEU D1338 -35.794 36.586 84.055 1.00 58.19 ATOM 76 C LEU D1338 -36.570 36.634 85.389 1.00 59.21 ATOM 77 O LEU D1338 -36.059 37.068 86.423 1.00 58.98 ATOM 78 CB LEU D1338 -34.406 35.933 84.222 1.00 57.81 ATOM 79 CG LEU D1338 -33.925 35.093 83.029 1.00 57.82 ATOM 80 CD1 LEU D1338 -32.424 35.029 82.924 1.00 56.64 ATOM 81 CD2 LEU D1338 -34.486 33.703 83.105 1.00 58.50 ATOM 82 N VAL D1339 -37.809 36.163 85.351 1.00 97.99 ATOM 83 CA VAL D1339 -38.687 36.242 86.508 1.00 99.13 ATOM 84 C VAL D1339 -39.039 34.874 87.085 1.00101.15 ATOM 85 O VAL D1339 -39.572 33.995 86.395 1.00101.83 ATOM 86 CB VAL D1339 -39.983 37.002 86.175 1.00 99.02 ATOM 87 CG1 VAL D1339 -40.800 37.236 87.444 1.00 99.34 ATOM 88 CG2 VAL D1339 -39.660 38.323 85.467 1.00 97.92 ATOM 89 N ASN D1340 -38.748 34.723 88.371 1.00 78.70 ATOM 90 CA ASN D1340 -38.948 33.466 89.078 1.00 81.27 ATOM 91 C ASN D1340 -38.099 32.374 88.448 1.00 82.10 ATOM 92 O ASN D1340 -38.396 31.188 88.583 1.00 83.67 ATOM 93 CB ASN D1340 -40.436 33.066 89.136 1.00 82.92 ATOM 94 CG ASN D1340 -41.219 33.831 90.208 1.00 85.43 ATOM 95 OD1 ASN D1340 -40.678 34.707 90.882 1.00 86.74 ATOM 96 ND2 ASN D1340 -42.499 33.497 90.363 1.00 87.25 ATOM 97 N GLY D1341 -37.041 32.794 87.758 1.00 63.23 ATOM 98 CA GLY D1341 -36.078 31.873 87.186 1.00 63.61 ATOM 99 C GLY D1341 -36.178 31.682 85.680 1.00 63.59 ATOM 100 O GLY D1341 -35.252 31.151 85.061 1.00 64.00 ATOM 101 N ARG D1342 -37.286 32.119 85.083 1.00 51.04 ATOM 102 CA ARG D1342 -37.584 31.812 83.684 1.00 51.77 ATOM 103 C ARG D1342 -37.640 33.074 82.825 1.00 49.24 ATOM 104 O ARG D1342 -37.671 34.176 83.362 1.00 48.07 ATOM 105 CB ARG D1342 -38.918 31.073 83.602 1.00 44.63 ATOM 106 N PRO D1343 -37.639 32.918 81.482 1.00 41.72 ATOM 107 CA PRO D1343 -37.829 34.062 80.577 1.00 40.54 ATOM 108 C PRO D1343 -39.290 34.512 80.569 1.00 40.64 ATOM 109 O PRO D1343 -40.167 33.654 80.576 1.00 41.35 ATOM 110 CB PRO D1343 -37.462 33.491 79.209 1.00 41.23 ATOM 111 CG PRO D1343 -36.837 32.135 79.469 1.00 42.44 ATOM 112 CD PRO D1343 -37.394 31.663 80.746 1.00 42.72 ATOM 113 N LYS D1344 -39.542 35.821 80.532 1.00 51.27 ATOM 114 CA LYS D1344 -40.895 36.365 80.709 1.00 51.54 ATOM 115 C LYS D1344 -41.128 37.742 80.080 1.00 49.73 ATOM 116 O LYS D1344 -40.391 38.683 80.334 1.00 48.15 ATOM 117 CB LYS D1344 -41.206 36.475 82.204 1.00 51.42 ATOM 118 CG LYS D1344 -41.565 35.170 82.907 1.00 54.95 ATOM 119 CD LYS D1344 -43.069 34.895 82.854 1.00 55.59 ATOM 120 CE LYS D1344 -43.873 35.718 83.874 1.00 59.18 ATOM 121 NZ LYS D1344 -44.223 37.107 83.427 1.00 59.49 ATOM 122 N LEU D1345 -42.176 37.870 79.282 1.00 61.55 ATOM 123 CA LEU D1345 -42.582 39.186 78.798 1.00 60.66 ATOM 124 C LEU D1345 -43.504 39.848 79.828 1.00 60.31 ATOM 125 O LEU D1345 -44.480 39.248 80.291 1.00 60.87 ATOM 126 CB LEU D1345 -43.298 39.065 77.451 1.00 61.51 ATOM 127 CG LEU D1345 -44.003 40.317 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