HEADER RECOMBINATION 31-DEC-69 3CMV TITLE Mechanism of homologous recombination from the RecA-ssDNA/dsDNA TITLE 2 structures COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: Protein recA; COMPND 3 CHAIN: A, B, C, D, E, F, G, H; COMPND 4 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.30 ANGSTORMS REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 GLY D 830 REMARK 465 GLU D 831 REMARK 465 ILE D 832 REMARK 465 GLY D 833 REMARK 465 ASP D 834 REMARK 465 SER D 835 REMARK 465 HIS D 836 REMARK 465 MET D 837 REMARK 465 ILE D 868 REMARK 465 ARG D 869 REMARK 465 MET D 870 REMARK 465 LYS D 871 REMARK 465 ILE D 872 REMARK 465 GLY D 873 REMARK 465 VAL D 874 REMARK 465 MET D 875 REMARK 465 PHE D 876 REMARK 465 GLY D 877 REMARK 465 ASN D 878 REMARK 465 PRO D 879 REMARK 465 GLU D 880 REMARK 465 THR D 881 REMARK 465 THR D 882 REMARK 465 THR D 883 DBREF 3CMV D 30 334 UNP P0A7G6 RECA_ECOLI 31 335 DBREF 3CMV D 1001 1334 UNP P0A7G6 RECA_ECOLI 2 335 DBREF 3CMV D 2001 2334 UNP P0A7G6 RECA_ECOLI 2 335 DBREF 3CMV D 3001 3334 UNP P0A7G6 RECA_ECOLI 2 335 SEQRES 1 D 264 LYS GLN LYS ALA LEU ALA ALA ALA LEU GLY GLN ILE GLU SEQRES 2 D 264 LYS GLN PHE GLY LYS GLY SER ILE MET ARG LEU GLY GLU SEQRES 3 D 264 ASP ARG SER MET ASP VAL GLU THR ILE SER THR GLY SER SEQRES 4 D 264 LEU SER LEU ASP ILE ALA LEU GLY ALA GLY GLY LEU PRO SEQRES 5 D 264 MET GLY ARG ILE VAL GLU ILE TYR GLY PRO GLU SER SER SEQRES 6 D 264 GLY LYS THR THR LEU THR LEU GLN VAL ILE ALA ALA ALA SEQRES 7 D 264 GLN ARG GLU GLY LYS THR CYS ALA PHE ILE ASP ALA GLU SEQRES 8 D 264 HIS ALA LEU ASP PRO ILE TYR ALA ARG LYS LEU GLY VAL SEQRES 9 D 264 ASP ILE ASP ASN LEU LEU CYS SER GLN PRO ASP THR GLY SEQRES 10 D 264 GLU GLN ALA LEU GLU ILE CYS ASP ALA LEU ALA ARG SER SEQRES 11 D 264 GLY ALA VAL ASP VAL ILE VAL VAL ASP SER VAL ALA ALA SEQRES 12 D 264 LEU THR PRO LYS ALA GLU ILE GLU GLY GLU ILE GLY ASP SEQRES 13 D 264 SER HIS MET GLY LEU ALA ALA ARG MET MET SER GLN ALA SEQRES 14 D 264 MET ARG LYS LEU ALA GLY ASN LEU LYS GLN SER ASN THR SEQRES 15 D 264 LEU LEU ILE PHE ILE ASN GLN ILE ARG MET LYS ILE GLY SEQRES 16 D 264 VAL MET PHE GLY ASN PRO GLU THR THR THR GLY GLY ASN SEQRES 17 D 264 ALA LEU LYS PHE TYR ALA SER VAL ARG LEU ASP ILE ARG SEQRES 18 D 264 ARG ILE GLY ALA VAL LYS GLU GLY GLU ASN VAL VAL GLY SEQRES 19 D 264 SER GLU THR ARG VAL LYS VAL VAL LYS ASN LYS ILE ALA SEQRES 20 D 264 ALA PRO PHE LYS GLN ALA GLU PHE GLN ILE LEU TYR GLY SEQRES 21 D 264 GLU GLY ILE ASN ATOM 1 N LYS D2006 -19.333 -6.258 106.479 1.00263.84 ATOM 2 CA LYS D2006 -20.319 -7.169 107.145 1.00264.04 ATOM 3 C LYS D2006 -19.696 -7.690 108.472 1.00264.42 ATOM 4 O LYS D2006 -18.528 -7.369 108.758 1.00264.30 ATOM 5 CB LYS D2006 -20.718 -8.309 106.178 1.00263.44 ATOM 6 CG LYS D2006 -22.198 -8.721 106.187 1.00260.84 ATOM 7 CD LYS D2006 -22.979 -7.958 105.150 1.00257.26 ATOM 8 CE LYS D2006 -24.439 -8.102 105.408 1.00254.96 ATOM 9 NZ LYS D2006 -25.164 -7.176 104.534 1.00253.27 ATOM 10 N GLN D2007 -20.471 -8.448 109.275 1.00264.81 ATOM 11 CA GLN D2007 -19.978 -9.153 110.496 1.00264.96 ATOM 12 C GLN D2007 -19.305 -10.461 110.126 1.00265.72 ATOM 13 O GLN D2007 -18.842 -11.225 110.981 1.00265.10 ATOM 14 CB GLN D2007 -21.120 -9.452 111.450 1.00264.80 ATOM 15 CG GLN D2007 -21.693 -8.227 112.103 1.00264.89 ATOM 16 CD GLN D2007 -22.947 -8.534 112.875 1.00265.11 ATOM 17 OE1 GLN D2007 -23.009 -9.511 113.621 1.00264.78 ATOM 18 NE2 GLN D2007 -23.963 -7.698 112.703 1.00265.85 ATOM 19 N LYS D2008 -19.324 -10.691 108.816 1.00267.32 ATOM 20 CA LYS D2008 -18.603 -11.728 108.077 1.00268.80 ATOM 21 C LYS D2008 -17.083 -11.431 108.155 1.00269.69 ATOM 22 O LYS D2008 -16.303 -12.265 108.641 1.00269.72 ATOM 23 CB LYS D2008 -19.102 -11.703 106.596 1.00269.00 ATOM 24 CG LYS D2008 -19.424 -13.048 105.865 1.00268.86 ATOM 25 CD LYS D2008 -20.206 -12.802 104.534 1.00268.63 ATOM 26 CE LYS D2008 -19.987 -13.899 103.473 1.00268.44 ATOM 27 NZ LYS D2008 -20.731 -15.167 103.725 1.00267.91 ATOM 28 N ALA D2009 -16.687 -10.231 107.698 1.00270.63 ATOM 29 CA ALA D2009 -15.272 -9.816 107.567 1.00271.05 ATOM 30 C ALA D2009 -14.627 -9.392 108.903 1.00271.12 ATOM 31 O ALA D2009 -13.396 -9.495 109.077 1.00271.23 ATOM 32 CB ALA D2009 -15.132 -8.694 106.503 1.00270.96 ATOM 33 N LEU D2010 -15.467 -8.922 109.833 1.00270.74 ATOM 34 CA LEU D2010 -15.017 -8.442 111.142 1.00270.15 ATOM 35 C LEU D2010 -14.739 -9.605 112.092 1.00269.61 ATOM 36 O LEU D2010 -13.589 -9.780 112.522 1.00269.70 ATOM 37 CB LEU D2010 -16.039 -7.467 111.758 1.00270.20 ATOM 38 CG LEU D2010 -15.646 -6.640 112.995 1.00270.26 ATOM 39 CD1 LEU D2010 -14.807 -5.424 112.604 1.00270.00 ATOM 40 CD2 LEU D2010 -16.877 -6.211 113.808 1.00269.94 ATOM 41 N ALA D2011 -15.782 -10.392 112.399 1.00268.71 ATOM 42 CA ALA D2011 -15.679 -11.528 113.326 1.00267.73 ATOM 43 C ALA D2011 -14.525 -12.486 112.964 1.00267.00 ATOM 44 O ALA D2011 -14.060 -13.258 113.814 1.00267.12 ATOM 45 CB ALA D2011 -17.017 -12.273 113.424 1.00267.53 ATOM 46 N ALA D2012 -14.059 -12.398 111.710 1.00265.88 ATOM 47 CA ALA D2012 -12.927 -13.187 111.189 1.00264.70 ATOM 48 C ALA D2012 -11.555 -12.484 111.281 1.00263.91 ATOM 49 O ALA D2012 -10.576 -13.113 111.700 1.00264.06 ATOM 50 CB ALA D2012 -13.204 -13.649 109.747 1.00264.58 ATOM 51 N ALA D2013 -11.481 -11.203 110.894 1.00262.59 ATOM 52 CA ALA D2013 -10.234 -10.429 110.994 1.00261.25 ATOM 53 C ALA D2013 -9.885 -10.058 112.444 1.00260.42 ATOM 54 O ALA D2013 -8.817 -9.510 112.700 1.00260.17 ATOM 55 CB ALA D2013 -10.284 -9.190 110.110 1.00260.83 ATOM 56 N LEU D2014 -10.790 -10.366 113.377 1.00259.60 ATOM 57 CA LEU D2014 -10.555 -10.221 114.821 1.00258.79 ATOM 58 C LEU D2014 -9.644 -11.313 115.346 1.00258.24 ATOM 59 O LEU D2014 -8.500 -11.047 115.701 1.00258.38 ATOM 60 CB LEU D2014 -11.866 -10.289 115.614 1.00258.73 ATOM 61 CG LEU D2014 -12.720 -9.043 115.848 1.00258.78 ATOM 62 CD1 LEU D2014 -13.905 -9.374 116.763 1.00258.31 ATOM 63 CD2 LEU D2014 -11.893 -7.905 116.426 1.00258.68 ATOM 64 N GLY D2015 -10.169 -12.537 115.404 1.00257.58 ATOM 65 CA GLY D2015 -9.415 -13.703 115.840 1.00257.08 ATOM 66 C GLY D2015 -8.118 -13.885 115.076 1.00257.15 ATOM 67 O GLY D2015 -7.327 -14.755 115.422 1.00256.87 ATOM 68 N GLN D2016 -7.914 -13.059 114.041 1.00257.51 ATOM 69 CA GLN D2016 -6.691 -13.030 113.202 1.00257.70 ATOM 70 C GLN D2016 -5.493 -12.391 113.914 1.00257.79 ATOM 71 O GLN D2016 -4.333 -12.629 113.560 1.00257.58 ATOM 72 CB GLN D2016 -6.944 -12.247 111.897 1.00257.66 ATOM 73 CG GLN D2016 -7.497 -13.064 110.717 1.00256.83 ATOM 74 CD GLN D2016 -6.436 -13.471 109.699 1.00256.20 ATOM 75 OE1 GLN D2016 -6.470 -13.033 108.545 1.00255.39 ATOM 76 NE2 GLN D2016 -5.494 -14.317 110.120 1.00256.23 ATOM 77 N ILE D2017 -5.782 -11.554 114.899 1.00257.84 ATOM 78 CA ILE D2017 -4.739 -10.822 115.581 1.00257.60 ATOM 79 C ILE D2017 -4.451 -11.551 116.861 1.00257.68 ATOM 80 O ILE D2017 -3.327 -11.543 117.339 1.00257.27 ATOM 81 CB ILE D2017 -5.173 -9.391 115.893 1.00257.65 ATOM 82 CG1 ILE D2017 -6.159 -8.862 114.830 1.00257.77 ATOM 83 CG2 ILE D2017 -3.949 -8.507 116.064 1.00257.07 ATOM 84 CD1 ILE D2017 -5.640 -8.879 113.386 1.00257.88 ATOM 85 N GLU D2018 -5.492 -12.183 117.400 1.00258.26 ATOM 86 CA GLU D2018 -5.381 -13.027 118.578 1.00258.91 ATOM 87 C GLU D2018 -4.539 -14.259 118.293 1.00259.01 ATOM 88 O GLU D2018 -3.860 -14.771 119.183 1.00259.16 ATOM 89 CB GLU D2018 -6.762 -13.460 119.073 1.00259.26 ATOM 90 CG GLU D2018 -7.359 -12.512 120.095 1.00260.53 ATOM 91 CD GLU D2018 -8.614 -13.064 120.753 1.00261.35 ATOM 92 OE1 GLU D2018 -9.572 -13.408 120.020 1.00261.87 ATOM 93 OE2 GLU D2018 -8.642 -13.144 122.004 1.00261.41 ATOM 94 N LYS D2019 -4.601 -14.744 117.055 1.00258.99 ATOM 95 CA LYS D2019 -3.767 -15.868 116.612 1.00258.59 ATOM 96 C LYS D2019 -2.310 -15.393 116.513 1.00258.23 ATOM 97 O LYS D2019 -1.380 -16.084 116.952 1.00257.70 ATOM 98 CB LYS D2019 -4.283 -16.426 115.253 1.00258.69 ATOM 99 CG LYS D2019 -3.715 -17.803 114.780 1.00258.81 ATOM 100 CD LYS D2019 -4.150 -18.158 113.340 1.00257.83 ATOM 101 CE LYS D2019 -3.375 -19.341 112.783 1.00256.49 ATOM 102 NZ LYS D2019 -3.754 -19.602 111.384 1.00254.84 ATOM 103 N GLN D2020 -2.137 -14.186 115.981 1.00258.13 ATOM 104 CA GLN D2020 -0.834 -13.712 115.555 1.00258.15 ATOM 105 C GLN D2020 -0.063 -12.958 116.640 1.00257.43 ATOM 106 O GLN D2020 1.168 -13.071 116.714 1.00257.40 ATOM 107 CB GLN D2020 -0.995 -12.835 114.313 1.00258.82 ATOM 108 CG GLN D2020 0.213 -12.842 113.377 1.00260.58 ATOM 109 CD GLN D2020 0.268 -11.616 112.474 1.00261.81 ATOM 110 OE1 GLN D2020 1.348 -11.222 112.021 1.00261.70 ATOM 111 NE2 GLN D2020 -0.898 -11.001 112.215 1.00262.53 ATOM 112 N PHE D2021 -0.784 -12.206 117.476 1.00256.48 ATOM 113 CA PHE D2021 -0.164 -11.259 118.419 1.00255.27 ATOM 114 C PHE D2021 -0.406 -11.488 119.923 1.00254.39 ATOM 115 O PHE D2021 -0.718 -10.535 120.644 1.00254.48 ATOM 116 CB PHE D2021 -0.573 -9.823 118.057 1.00255.05 ATOM 117 CG PHE D2021 0.242 -9.225 116.953 1.00254.93 ATOM 118 CD1 PHE D2021 1.641 -9.140 117.057 1.00255.01 ATOM 119 CD2 PHE D2021 -0.379 -8.739 115.809 1.00254.55 ATOM 120 CE1 PHE D2021 2.411 -8.584 116.029 1.00254.77 ATOM 121 CE2 PHE D2021 0.376 -8.179 114.773 1.00254.58 ATOM 122 CZ PHE D2021 1.777 -8.101 114.883 1.00254.61 ATOM 123 N GLY D2022 -0.241 -12.724 120.403 1.00253.10 ATOM 124 CA GLY D2022 -0.525 -13.040 121.811 1.00251.21 ATOM 125 C GLY D2022 -2.022 -13.048 122.091 1.00249.92 ATOM 126 O GLY D2022 -2.758 -12.138 121.669 1.00249.94 ATOM 127 N LYS D2023 -2.472 -14.074 122.813 1.00248.45 ATOM 128 CA LYS D2023 -3.911 -14.369 122.952 1.00246.88 ATOM 129 C LYS D2023 -4.673 -13.217 123.647 1.00245.52 ATOM 130 O LYS D2023 -4.362 -12.849 124.778 1.00245.60 ATOM 131 CB LYS D2023 -4.148 -15.753 123.634 1.00246.63 ATOM 132 CG LYS D2023 -3.563 -17.029 122.887 1.00246.56 ATOM 133 CD LYS D2023 -2.208 -17.564 123.469 1.00245.74 ATOM 134 CE LYS D2023 -1.326 -18.322 122.443 1.00244.99 ATOM 135 NZ LYS D2023 -1.869 -19.640 122.050 1.00243.28 ATOM 136 N GLY D2024 -5.631 -12.625 122.936 1.00243.83 ATOM 137 CA GLY D2024 -6.479 -11.566 123.480 1.00241.64 ATOM 138 C GLY D2024 -5.833 -10.204 123.581 1.00240.14 ATOM 139 O GLY D2024 -5.808 -9.617 124.658 1.00240.22 ATOM 140 N SER D2025 -5.313 -9.689 122.469 1.00238.62 ATOM 141 CA SER D2025 -4.724 -8.353 122.477 1.00237.36 ATOM 142 C SER D2025 -5.645 -7.318 121.862 1.00236.32 ATOM 143 O SER D2025 -5.193 -6.338 121.265 1.00235.74 ATOM 144 CB SER D2025 -3.360 -8.340 121.800 1.00237.21 ATOM 145 OG SER D2025 -2.330 -8.410 122.770 1.00238.47 ATOM 146 N ILE D2026 -6.945 -7.542 122.024 1.00235.52 ATOM 147 CA ILE D2026 -7.954 -6.610 121.555 1.00234.76 ATOM 148 C ILE D2026 -9.315 -7.205 121.847 1.00234.35 ATOM 149 O ILE D2026 -9.449 -8.428 121.895 1.00233.84 ATOM 150 CB ILE D2026 -7.792 -6.335 120.050 1.00234.49 ATOM 151 CG1 ILE D2026 -8.929 -5.452 119.523 1.00234.77 ATOM 152 CG2 ILE D2026 -7.713 -7.635 119.297 1.00234.02 ATOM 153 CD1 ILE D2026 -8.854 -5.134 118.017 1.00235.14 ATOM 154 N MET D2027 -10.305 -6.338 122.069 1.00234.37 ATOM 155 CA MET D2027 -11.686 -6.774 122.246 1.00235.00 ATOM 156 C MET D2027 -12.704 -5.650 122.326 1.00234.97 ATOM 157 O MET D2027 -12.360 -4.494 122.537 1.00234.17 ATOM 158 CB MET D2027 -11.826 -7.669 123.477 1.00234.91 ATOM 159 CG MET D2027 -11.284 -7.067 124.744 1.00235.48 ATOM 160 SD MET D2027 -10.603 -8.331 125.834 1.00236.34 ATOM 161 CE MET D2027 -12.076 -9.217 126.388 1.00235.81 ATOM 162 N ARG D2028 -13.966 -6.022 122.127 1.00236.03 ATOM 163 CA ARG D2028 -15.101 -5.164 122.422 1.00237.04 ATOM 164 C ARG D2028 -15.078 -5.052 123.917 1.00237.68 ATOM 165 O ARG D2028 -14.819 -6.031 124.621 1.00237.07 ATOM 166 CB ARG D2028 -16.450 -5.792 121.995 1.00237.37 ATOM 167 CG ARG D2028 -16.809 -5.809 120.460 1.00237.66 ATOM 168 CD ARG D2028 -18.313 -6.166 120.143 1.00237.03 ATOM 169 NE ARG D2028 -18.778 -7.420 120.771 1.00236.57 ATOM 170 CZ ARG D2028 -19.761 -7.527 121.676 1.00236.19 ATOM 171 NH1 ARG D2028 -20.446 -6.454 122.083 1.00236.28 ATOM 172 NH2 ARG D2028 -20.072 -8.726 122.173 1.00235.43 ATOM 173 N LEU D2029 -15.347 -3.854 124.400 1.00239.24 ATOM 174 CA LEU D2029 -15.281 -3.601 125.824 1.00241.06 ATOM 175 C LEU D2029 -16.441 -4.235 126.564 1.00242.39 ATOM 176 O LEU D2029 -16.350 -4.481 127.771 1.00242.80 ATOM 177 CB LEU D2029 -15.247 -2.099 126.095 1.00241.00 ATOM 178 CG LEU D2029 -13.900 -1.432 125.846 1.00240.92 ATOM 179 CD1 LEU D2029 -14.081 0.053 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-13.010 129.702 1.00257.14 ATOM 198 CB ASP D2032 -19.633 -12.241 128.589 1.00255.63 ATOM 199 CG ASP D2032 -20.874 -11.413 128.900 1.00255.35 ATOM 200 OD1 ASP D2032 -21.588 -11.772 129.859 1.00255.06 ATOM 201 OD2 ASP D2032 -21.142 -10.419 128.189 1.00255.28 ATOM 202 N ARG D2033 -16.533 -12.577 127.483 1.00257.43 ATOM 203 CA ARG D2033 -15.465 -13.554 127.250 1.00258.06 ATOM 204 C ARG D2033 -14.225 -13.249 128.119 1.00257.49 ATOM 205 O ARG D2033 -13.587 -12.181 128.009 1.00257.12 ATOM 206 CB ARG D2033 -15.111 -13.638 125.741 1.00258.31 ATOM 207 CG ARG D2033 -14.669 -15.033 125.194 1.00259.17 ATOM 208 CD ARG D2033 -13.563 -14.918 124.106 1.00259.84 ATOM 209 NE ARG D2033 -12.236 -14.647 124.691 1.00263.50 ATOM 210 CZ ARG D2033 -11.585 -13.474 124.656 1.00265.29 ATOM 211 NH1 ARG D2033 -12.110 -12.418 124.035 1.00266.14 ATOM 212 NH2 ARG D2033 -10.387 -13.354 125.239 1.00265.92 ATOM 213 N SER D2034 -13.944 -14.195 129.015 1.00257.12 ATOM 214 CA SER D2034 -12.720 -14.229 129.800 1.00256.57 ATOM 215 C SER D2034 -11.913 -15.458 129.383 1.00256.61 ATOM 216 O SER D2034 -12.461 -16.572 129.335 1.00256.67 ATOM 217 CB SER D2034 -13.035 -14.272 131.306 1.00256.21 ATOM 218 OG SER D2034 -13.670 -15.483 131.699 1.00254.95 ATOM 219 N MET D2035 -10.632 -15.249 129.052 1.00256.46 ATOM 220 CA MET D2035 -9.684 -16.362 128.873 1.00256.18 ATOM 221 C MET D2035 -9.628 -17.120 130.202 1.00255.55 ATOM 222 O MET D2035 -9.369 -16.509 131.250 1.00255.71 ATOM 223 CB MET D2035 -8.270 -15.874 128.500 1.00256.36 ATOM 224 CG MET D2035 -8.195 -14.718 127.497 1.00256.11 ATOM 225 SD MET D2035 -6.532 -14.323 126.909 1.00256.42 ATOM 226 CE MET D2035 -5.542 -14.342 128.426 1.00256.81 ATOM 227 N ASP D2036 -9.890 -18.430 130.170 1.00254.39 ATOM 228 CA ASP D2036 -9.969 -19.213 131.406 1.00253.02 ATOM 229 C ASP D2036 -8.518 -19.569 131.857 1.00251.85 ATOM 230 O ASP D2036 -8.095 -20.712 131.689 1.00251.72 ATOM 231 CB ASP D2036 -10.909 -20.438 131.220 1.00252.90 ATOM 232 CG ASP D2036 -12.012 -20.528 132.299 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