HEADER Transport Protein 17-NOV-09 3KQ4 TITLE Structure of Intrinsic Factor-Cobalamin bound to its receptor Cubilin COMPND MOL_ID: 2; COMPND 2 MOLECULE: Cubilin; COMPND 3 CHAIN: B, D, F; COMPND 4 FRAGMENT: UNP residues ; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.30 ANGSTORMS DBREF 3KQ4 D 932 1388 UNP O60494 CUBN_HUMAN 932 1388 MODRES 3KQ4 ASN D 388 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 354 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 376 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 286 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 237 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 161 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 53 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 401 ASN GLYCOSYLATION SITE SEQRES 1 D 113 CYS GLY GLY ASN LEU THR THR SER SER GLY THR PHE ILE SEQRES 2 D 113 SER PRO ASN TYR PRO MET PRO TYR TYR HIS SER SER GLU SEQRES 3 D 113 CYS TYR TRP TRP LEU LYS SER SER HIS GLY SER ALA PHE SEQRES 4 D 113 GLU LEU GLU PHE LYS ASP PHE HIS LEU GLU HIS HIS PRO SEQRES 5 D 113 ASN CYS THR LEU ASP TYR LEU ALA VAL TYR ASP GLY PRO SEQRES 6 D 113 SER SER ASN SER HIS LEU LEU THR GLN LEU CYS GLY ASP SEQRES 7 D 113 GLU LYS PRO PRO LEU ILE ARG SER SER GLY ASP SER MET SEQRES 8 D 113 PHE ILE LYS LEU ARG THR ASP GLU GLY GLN GLN GLY ARG SEQRES 9 D 113 GLY PHE LYS ALA GLU TYR ARG GLN THR ATOM 1 N CYS D1165 6.557 -13.343 -71.943 1.00104.89 ATOM 2 CA CYS D1165 5.382 -14.053 -71.446 1.00 97.44 ATOM 3 C CYS D1165 5.270 -14.050 -69.902 1.00 97.05 ATOM 4 O CYS D1165 6.266 -14.020 -69.201 1.00101.93 ATOM 5 CB CYS D1165 5.236 -15.423 -72.137 1.00 92.59 ATOM 6 SG CYS D1165 5.419 -16.907 -71.146 1.00 92.74 ATOM 7 N GLY D1166 4.045 -14.034 -69.389 1.00109.28 ATOM 8 CA GLY D1166 3.786 -13.601 -68.021 1.00108.39 ATOM 9 C GLY D1166 3.500 -12.097 -67.984 1.00108.22 ATOM 10 O GLY D1166 3.345 -11.487 -69.043 1.00109.51 ATOM 11 N GLY D1167 3.433 -11.495 -66.793 1.00 90.01 ATOM 12 CA GLY D1167 3.102 -10.078 -66.673 1.00105.96 ATOM 13 C GLY D1167 3.188 -9.428 -65.292 1.00106.21 ATOM 14 O GLY D1167 3.686 -10.020 -64.334 1.00 90.20 ATOM 15 N ASN D1168 2.683 -8.199 -65.192 1.00118.48 ATOM 16 CA ASN D1168 2.818 -7.400 -63.968 1.00120.44 ATOM 17 C ASN D1168 1.713 -7.519 -62.871 1.00112.08 ATOM 18 O ASN D1168 1.814 -6.848 -61.833 1.00112.66 ATOM 19 CB ASN D1168 3.084 -5.927 -64.329 1.00129.05 ATOM 20 CG ASN D1168 4.578 -5.593 -64.416 1.00139.97 ATOM 21 OD1 ASN D1168 5.388 -6.161 -63.690 1.00142.31 ATOM 22 ND2 ASN D1168 4.931 -4.641 -65.286 1.00147.34 ATOM 23 N LEU D1169 0.683 -8.349 -63.110 1.00 97.28 ATOM 24 CA LEU D1169 -0.383 -8.711 -62.126 1.00 89.27 ATOM 25 C LEU D1169 -0.718 -7.732 -61.006 1.00 89.11 ATOM 26 O LEU D1169 -0.127 -7.774 -59.930 1.00 90.20 ATOM 27 CB LEU D1169 -0.116 -10.077 -61.499 1.00 85.84 ATOM 28 CG LEU D1169 -0.714 -11.190 -62.341 1.00 84.43 ATOM 29 CD1 LEU D1169 0.023 -11.266 -63.644 1.00 85.42 ATOM 30 CD2 LEU D1169 -0.644 -12.497 -61.622 1.00 82.62 ATOM 31 N THR D1170 -1.723 -6.902 -61.234 1.00103.63 ATOM 32 CA THR D1170 -1.926 -5.746 -60.381 1.00105.80 ATOM 33 C THR D1170 -3.082 -5.776 -59.370 1.00 98.77 ATOM 34 O THR D1170 -3.211 -4.878 -58.539 1.00100.94 ATOM 35 CB THR D1170 -1.993 -4.489 -61.231 1.00110.96 ATOM 36 OG1 THR D1170 -0.887 -3.650 -60.883 1.00120.58 ATOM 37 CG2 THR D1170 -3.311 -3.747 -61.006 1.00108.89 ATOM 38 N THR D1171 -3.914 -6.800 -59.418 1.00114.87 ATOM 39 CA THR D1171 -5.049 -6.839 -58.510 1.00108.13 ATOM 40 C THR D1171 -4.712 -7.454 -57.156 1.00105.16 ATOM 41 O THR D1171 -3.944 -8.395 -57.082 1.00106.28 ATOM 42 CB THR D1171 -6.233 -7.573 -59.151 1.00102.85 ATOM 43 OG1 THR D1171 -5.793 -8.826 -59.690 1.00103.28 ATOM 44 CG2 THR D1171 -6.806 -6.730 -60.269 1.00104.96 ATOM 45 N SER D1172 -5.312 -6.929 -56.093 1.00115.57 ATOM 46 CA SER D1172 -5.086 -7.429 -54.736 1.00112.51 ATOM 47 C SER D1172 -5.356 -8.898 -54.611 1.00108.64 ATOM 48 O SER D1172 -5.107 -9.490 -53.573 1.00107.23 ATOM 49 CB SER D1172 -5.979 -6.712 -53.738 1.00109.13 ATOM 50 OG SER D1172 -5.833 -5.310 -53.869 1.00107.61 ATOM 51 N SER D1173 -5.891 -9.480 -55.668 1.00 74.26 ATOM 52 CA SER D1173 -6.158 -10.907 -55.688 1.00 72.46 ATOM 53 C SER D1173 -6.612 -11.334 -57.092 1.00 72.30 ATOM 54 O SER D1173 -7.218 -10.544 -57.830 1.00 72.43 ATOM 55 CB SER D1173 -7.175 -11.299 -54.600 1.00 67.06 ATOM 56 OG SER D1173 -8.460 -11.522 -55.129 1.00 64.11 ATOM 57 N GLY D1174 -6.297 -12.574 -57.466 1.00 84.78 ATOM 58 CA GLY D1174 -6.427 -13.001 -58.850 1.00 98.22 ATOM 59 C GLY D1174 -6.022 -14.443 -59.061 1.00 98.33 ATOM 60 O GLY D1174 -5.952 -15.214 -58.108 1.00 96.58 ATOM 61 N THR D1175 -5.751 -14.794 -60.315 1.00 73.25 ATOM 62 CA THR D1175 -5.484 -16.174 -60.722 1.00 74.34 ATOM 63 C THR D1175 -4.616 -16.188 -61.982 1.00 79.27 ATOM 64 O THR D1175 -4.845 -15.384 -62.887 1.00 80.40 ATOM 65 CB THR D1175 -6.799 -16.895 -61.028 1.00121.89 ATOM 66 OG1 THR D1175 -7.452 -17.202 -59.799 1.00117.67 ATOM 67 CG2 THR D1175 -6.549 -18.178 -61.777 1.00125.23 ATOM 68 N PHE D1176 -3.623 -17.077 -62.067 1.00 83.62 ATOM 69 CA PHE D1176 -2.867 -17.181 -63.323 1.00 88.41 ATOM 70 C PHE D1176 -2.448 -18.580 -63.722 1.00 89.68 ATOM 71 O PHE D1176 -2.624 -19.515 -62.955 1.00 88.39 ATOM 72 CB PHE D1176 -1.675 -16.227 -63.372 1.00 93.20 ATOM 73 CG PHE D1176 -0.689 -16.425 -62.264 1.00 93.71 ATOM 74 CD1 PHE D1176 -1.104 -16.426 -60.928 1.00 89.96 ATOM 75 CD2 PHE D1176 0.659 -16.569 -62.551 1.00 98.24 ATOM 76 CE1 PHE D1176 -0.191 -16.585 -59.896 1.00 90.60 ATOM 77 CE2 PHE D1176 1.575 -16.739 -61.531 1.00 99.02 ATOM 78 CZ PHE D1176 1.145 -16.748 -60.195 1.00 95.17 ATOM 79 N ILE D1177 -1.866 -18.681 -64.922 1.00 94.37 ATOM 80 CA ILE D1177 -1.768 -19.935 -65.671 1.00 96.38 ATOM 81 C ILE D1177 -0.420 -20.197 -66.350 1.00100.69 ATOM 82 O ILE D1177 0.071 -19.390 -67.138 1.00101.88 ATOM 83 CB ILE D1177 -2.830 -19.959 -66.792 1.00119.46 ATOM 84 CG1 ILE D1177 -4.203 -20.169 -66.200 1.00118.27 ATOM 85 CG2 ILE D1177 -2.583 -21.083 -67.747 1.00121.97 ATOM 86 CD1 ILE D1177 -4.223 -21.315 -65.249 1.00118.69 ATOM 87 N SER D1178 0.164 -21.350 -66.063 1.00110.41 ATOM 88 CA SER D1178 1.264 -21.864 -66.869 1.00114.67 ATOM 89 C SER D1178 0.761 -22.071 -68.283 1.00116.73 ATOM 90 O SER D1178 -0.301 -22.646 -68.476 1.00117.10 ATOM 91 CB SER D1178 1.718 -23.217 -66.314 1.00116.01 ATOM 92 OG SER D1178 0.734 -24.230 -66.493 1.00115.48 ATOM 93 N PRO D1179 1.435 -21.485 -69.272 1.00101.79 ATOM 94 CA PRO D1179 0.954 -21.574 -70.653 1.00103.50 ATOM 95 C PRO D1179 0.219 -22.887 -71.019 1.00103.16 ATOM 96 O PRO D1179 0.416 -23.933 -70.388 1.00100.75 ATOM 97 CB PRO D1179 2.240 -21.399 -71.470 1.00108.51 ATOM 98 CG PRO D1179 3.055 -20.455 -70.640 1.00109.24 ATOM 99 CD PRO D1179 2.705 -20.747 -69.183 1.00104.86 ATOM 100 N ASN D1180 -0.622 -22.807 -72.051 1.00 94.63 ATOM 101 CA ASN D1180 -1.361 -23.948 -72.574 1.00 96.46 ATOM 102 C ASN D1180 -2.304 -24.638 -71.613 1.00112.03 ATOM 103 O ASN D1180 -3.226 -25.328 -72.049 1.00114.74 ATOM 104 CB ASN D1180 -0.410 -24.957 -73.173 1.00118.50 ATOM 105 CG ASN D1180 0.094 -24.517 -74.506 1.00107.03 ATOM 106 OD1 ASN D1180 -0.665 -23.949 -75.297 1.00109.38 ATOM 107 ND2 ASN D1180 1.382 -24.765 -74.778 1.00125.50 ATOM 108 N TYR D1181 -2.073 -24.455 -70.314 1.00 96.38 ATOM 109 CA TYR D1181 -2.936 -25.031 -69.292 1.00 95.46 ATOM 110 C TYR D1181 -4.388 -24.940 -69.699 1.00 95.88 ATOM 111 O TYR D1181 -4.799 -23.965 -70.309 1.00 93.53 ATOM 112 CB TYR D1181 -2.764 -24.291 -67.988 1.00 89.93 ATOM 113 CG TYR D1181 -3.426 -24.966 -66.823 1.00 89.58 ATOM 114 CD1 TYR D1181 -2.920 -26.138 -66.310 1.00 91.01 ATOM 115 CD2 TYR D1181 -4.540 -24.423 -66.217 1.00 88.16 ATOM 116 CE1 TYR D1181 -3.512 -26.761 -65.213 1.00 91.42 ATOM 117 CE2 TYR D1181 -5.145 -25.033 -65.117 1.00 88.31 ATOM 118 CZ TYR D1181 -4.627 -26.204 -64.618 1.00 90.14 ATOM 119 OH TYR D1181 -5.216 -26.838 -63.538 1.00 91.18 ATOM 120 N PRO D1182 -5.166 -25.972 -69.385 1.00 71.93 ATOM 121 CA PRO D1182 -4.756 -27.199 -68.697 1.00 75.79 ATOM 122 C PRO D1182 -3.885 -28.148 -69.571 1.00 81.95 ATOM 123 O PRO D1182 -3.536 -29.242 -69.134 1.00 86.39 ATOM 124 CB PRO D1182 -6.091 -27.879 -68.379 1.00 80.31 ATOM 125 CG PRO D1182 -7.169 -26.979 -68.944 1.00 77.80 ATOM 126 CD PRO D1182 -6.516 -26.096 -69.938 1.00 74.78 ATOM 127 N MET D1183 -3.563 -27.742 -70.794 1.00100.00 ATOM 128 CA MET D1183 -2.625 -28.499 -71.616 1.00105.62 ATOM 129 C MET D1183 -1.168 -28.296 -71.159 1.00103.40 ATOM 130 O MET D1183 -0.791 -27.203 -70.700 1.00 97.72 ATOM 131 CB MET D1183 -2.781 -28.130 -73.096 1.00107.15 ATOM 132 CG MET D1183 -3.421 -29.195 -73.957 1.00115.64 ATOM 133 SD MET D1183 -4.627 -30.230 -73.107 1.00122.94 ATOM 134 CE MET D1183 -5.746 -29.033 -72.385 1.00114.97 ATOM 135 N PRO D1184 -0.349 -29.364 -71.255 1.00104.94 ATOM 136 CA PRO D1184 1.103 -29.298 -71.084 1.00103.88 ATOM 137 C PRO D1184 1.685 -28.069 -71.758 1.00101.70 ATOM 138 O PRO D1184 1.246 -27.703 -72.842 1.00103.95 ATOM 139 CB PRO D1184 1.569 -30.564 -71.793 1.00111.72 ATOM 140 CG PRO D1184 0.470 -31.560 -71.490 1.00116.72 ATOM 141 CD PRO D1184 -0.814 -30.764 -71.353 1.00113.05 ATOM 142 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D1186 4.337 -24.391 -76.435 1.00148.65 ATOM 161 CD2 TYR D1186 3.830 -22.312 -75.394 1.00147.58 ATOM 162 CE1 TYR D1186 3.246 -24.261 -77.264 1.00149.08 ATOM 163 CE2 TYR D1186 2.732 -22.165 -76.232 1.00147.80 ATOM 164 CZ TYR D1186 2.444 -23.150 -77.167 1.00148.57 ATOM 165 OH TYR D1186 1.354 -23.037 -78.011 1.00149.04 ATOM 166 N HIS D1187 8.235 -25.604 -74.124 1.00144.52 ATOM 167 CA HIS D1187 9.554 -25.955 -73.590 1.00144.92 ATOM 168 C HIS D1187 10.586 -24.829 -73.676 1.00147.11 ATOM 169 O HIS D1187 10.416 -23.871 -74.437 1.00148.89 ATOM 170 CB HIS D1187 10.098 -27.218 -74.263 1.00145.68 ATOM 171 CG HIS D1187 10.238 -27.104 -75.746 1.00147.90 ATOM 172 ND1 HIS D1187 11.384 -26.653 -76.357 1.00150.16 ATOM 173 CD2 HIS D1187 9.369 -27.394 -76.751 1.00148.44 ATOM 174 CE1 HIS D1187 11.222 -26.660 -77.669 1.00151.77 ATOM 175 NE2 HIS D1187 10.005 -27.108 -77.928 1.00150.74 ATOM 176 N SER D1188 11.649 -24.957 -72.881 1.00127.36 ATOM 177 CA SER D1188 12.788 -24.033 -72.915 1.00130.13 ATOM 178 C SER 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PHE D1203 -0.758 -8.718 -53.967 1.00142.30 ATOM 307 CZ PHE D1203 0.260 -7.906 -54.402 1.00147.92 ATOM 308 N GLU D1204 -0.111 -13.829 -50.756 1.00112.92 ATOM 309 CA GLU D1204 0.063 -15.229 -50.428 1.00111.05 ATOM 310 C GLU D1204 -0.438 -16.112 -51.566 1.00110.85 ATOM 311 O GLU D1204 -1.464 -15.830 -52.156 1.00108.37 ATOM 312 CB GLU D1204 -0.631 -15.547 -49.119 1.00105.92 ATOM 313 CG GLU D1204 -2.009 -16.084 -49.259 1.00100.77 ATOM 314 CD GLU D1204 -2.718 -16.300 -47.908 1.00 96.25 ATOM 315 OE1 GLU D1204 -2.148 -15.981 -46.826 1.00 96.86 ATOM 316 OE2 GLU D1204 -3.872 -16.792 -47.932 1.00 92.19 ATOM 317 N LEU D1205 0.319 -17.158 -51.890 1.00112.64 ATOM 318 CA LEU D1205 0.038 -18.065 -53.015 1.00111.70 ATOM 319 C LEU D1205 -0.724 -19.328 -52.632 1.00108.16 ATOM 320 O LEU D1205 -0.921 -19.623 -51.454 1.00107.18 ATOM 321 CB LEU D1205 1.340 -18.545 -53.641 1.00116.39 ATOM 322 CG LEU D1205 2.003 -17.728 -54.731 1.00122.24 ATOM 323 CD1 LEU D1205 1.580 -18.239 -56.083 1.00125.57 ATOM 324 CD2 LEU 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PHE D1207 1.737 -22.571 -57.930 1.00103.09 ATOM 343 CE2 PHE D1207 1.817 -22.649 -55.534 1.00 95.36 ATOM 344 CZ PHE D1207 2.346 -22.215 -56.745 1.00100.55 ATOM 345 N LYS D1208 -4.512 -24.673 -57.137 1.00147.13 ATOM 346 CA LYS D1208 -5.578 -25.636 -57.258 1.00150.70 ATOM 347 C LYS D1208 -5.057 -26.845 -58.018 1.00157.47 ATOM 348 O LYS D1208 -5.817 -27.742 -58.341 1.00164.10 ATOM 349 CB LYS D1208 -6.799 -25.024 -57.961 1.00150.33 ATOM 350 CG LYS D1208 -7.492 -23.876 -57.198 1.00143.87 ATOM 351 CD LYS D1208 -8.138 -24.337 -55.881 1.00140.82 ATOM 352 CE LYS D1208 -8.705 -23.175 -55.067 1.00147.40 ATOM 353 NZ LYS D1208 -7.620 -22.259 -54.614 1.00147.85 ATOM 354 N ASP D1209 -3.755 -26.872 -58.289 1.00115.64 ATOM 355 CA ASP D1209 -3.221 -27.867 -59.217 1.00122.19 ATOM 356 C ASP D1209 -1.730 -27.677 -59.582 1.00119.70 ATOM 357 O ASP D1209 -1.365 -26.703 -60.255 1.00116.37 ATOM 358 CB ASP D1209 -4.055 -27.801 -60.492 1.00126.60 ATOM 359 CG ASP D1209 -4.043 -29.085 -61.274 1.00136.00 ATOM 360 OD1 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