HEADER Transport Protein 17-NOV-09 3KQ4 TITLE Structure of Intrinsic Factor-Cobalamin bound to its receptor Cubilin COMPND MOL_ID: 2; COMPND 2 MOLECULE: Cubilin; COMPND 3 CHAIN: B, D, F; COMPND 4 FRAGMENT: UNP residues ; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.30 ANGSTORMS DBREF 3KQ4 D 932 1388 UNP O60494 CUBN_HUMAN 932 1388 MODRES 3KQ4 ASN D 388 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 354 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 376 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 286 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 237 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 161 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 53 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3KQ4 ASN D 401 ASN GLYCOSYLATION SITE SEQRES 1 D 110 GLU ASN VAL VAL ILE VAL ASN GLN THR TYR GLY ILE LEU SEQRES 2 D 110 GLU SER ILE GLY TYR PRO ASN PRO TYR SER GLU ASN GLN SEQRES 3 D 110 HIS CYS ASN TRP THR ILE ARG ALA THR THR GLY ASN THR SEQRES 4 D 110 VAL ASN TYR THR PHE LEU ALA PHE ASP LEU GLU HIS HIS SEQRES 5 D 110 ILE ASN CYS SER THR ASP TYR LEU GLU LEU TYR ASP GLY SEQRES 6 D 110 PRO ARG GLN MET GLY ARG TYR CYS GLY VAL ASP LEU PRO SEQRES 7 D 110 PRO PRO GLY SER THR THR SER SER LYS LEU GLN VAL LEU SEQRES 8 D 110 LEU LEU THR ASP GLY VAL GLY ARG ARG GLU LYS GLY PHE SEQRES 9 D 110 GLN MET GLN TRP PHE VAL ATOM 1 N GLU D1279 -3.055 -10.059 -42.222 1.00167.98 ATOM 2 CA GLU D1279 -3.002 -10.429 -40.823 1.00167.67 ATOM 3 C GLU D1279 -1.588 -10.692 -40.333 1.00173.69 ATOM 4 O GLU D1279 -0.930 -11.645 -40.737 1.00175.13 ATOM 5 CB GLU D1279 -3.983 -11.542 -40.434 1.00161.43 ATOM 6 CG GLU D1279 -4.509 -11.306 -39.010 1.00158.68 ATOM 7 CD GLU D1279 -5.479 -12.361 -38.498 1.00157.39 ATOM 8 OE1 GLU D1279 -6.363 -12.804 -39.266 1.00158.17 ATOM 9 OE2 GLU D1279 -5.366 -12.721 -37.303 1.00156.13 ATOM 10 N ASN D1280 -1.154 -9.810 -39.447 1.00130.20 ATOM 11 CA ASN D1280 0.096 -9.960 -38.741 1.00135.69 ATOM 12 C ASN D1280 1.325 -9.716 -39.595 1.00144.14 ATOM 13 O ASN D1280 2.319 -10.410 -39.428 1.00143.59 ATOM 14 CB ASN D1280 0.157 -11.338 -38.080 1.00130.76 ATOM 15 CG ASN D1280 -0.849 -11.483 -36.939 1.00128.20 ATOM 16 OD1 ASN D1280 -1.536 -12.494 -36.833 1.00132.40 ATOM 17 ND2 ASN D1280 -0.943 -10.463 -36.084 1.00122.23 ATOM 18 N VAL D1281 1.270 -8.733 -40.497 1.00 78.90 ATOM 19 CA VAL D1281 2.452 -8.356 -41.276 1.00 88.05 ATOM 20 C VAL D1281 3.364 -7.375 -40.576 1.00 96.58 ATOM 21 O VAL D1281 2.958 -6.635 -39.680 1.00 96.69 ATOM 22 CB VAL D1281 2.142 -7.704 -42.621 1.00 93.67 ATOM 23 CG1 VAL D1281 1.568 -8.713 -43.584 1.00 85.69 ATOM 24 CG2 VAL D1281 1.232 -6.520 -42.418 1.00 99.07 ATOM 25 N VAL D1282 4.600 -7.357 -41.067 1.00 66.43 ATOM 26 CA VAL D1282 5.691 -6.578 -40.512 1.00 71.21 ATOM 27 C VAL D1282 6.580 -6.016 -41.629 1.00 83.58 ATOM 28 O VAL D1282 7.134 -6.752 -42.451 1.00 84.51 ATOM 29 CB VAL D1282 6.550 -7.450 -39.599 1.00 69.10 ATOM 30 CG1 VAL D1282 7.971 -6.966 -39.612 1.00 77.89 ATOM 31 CG2 VAL D1282 6.004 -7.438 -38.195 1.00 64.57 ATOM 32 N ILE D1283 6.685 -4.697 -41.675 1.00 97.39 ATOM 33 CA ILE D1283 7.690 -4.068 -42.505 1.00110.86 ATOM 34 C ILE D1283 8.955 -4.037 -41.646 1.00117.76 ATOM 35 O ILE D1283 9.041 -3.269 -40.678 1.00116.35 ATOM 36 CB ILE D1283 7.280 -2.637 -42.873 1.00116.16 ATOM 37 CG1 ILE D1283 5.755 -2.520 -42.954 1.00105.57 ATOM 38 CG2 ILE D1283 7.941 -2.204 -44.165 1.00131.26 ATOM 39 CD1 ILE D1283 5.135 -3.442 -43.947 1.00100.58 ATOM 40 N VAL D1284 9.925 -4.890 -41.971 1.00181.29 ATOM 41 CA VAL D1284 11.125 -5.010 -41.146 1.00188.59 ATOM 42 C VAL D1284 12.036 -3.815 -41.324 1.00193.28 ATOM 43 O VAL D1284 12.605 -3.297 -40.363 1.00199.45 ATOM 44 CB VAL D1284 11.911 -6.295 -41.457 1.00187.91 ATOM 45 CG1 VAL D1284 11.724 -7.324 -40.341 1.00179.02 ATOM 46 CG2 VAL D1284 11.505 -6.850 -42.814 1.00193.58 ATOM 47 N ASN D1285 12.167 -3.368 -42.562 1.00139.94 ATOM 48 CA ASN D1285 13.011 -2.222 -42.822 1.00146.68 ATOM 49 C ASN D1285 12.665 -1.504 -44.095 1.00154.70 ATOM 50 O ASN D1285 12.512 -2.099 -45.162 1.00150.62 ATOM 51 CB ASN D1285 14.481 -2.622 -42.857 1.00141.63 ATOM 52 CG ASN D1285 14.844 -3.396 -44.107 1.00140.28 ATOM 53 OD1 ASN D1285 14.797 -2.869 -45.223 1.00144.18 ATOM 54 ND2 ASN D1285 15.217 -4.666 -43.924 1.00135.09 ATOM 55 N GLN D1286 12.421 -0.217 -43.953 1.00114.40 ATOM 56 CA GLN D1286 12.069 0.621 -45.070 1.00124.13 ATOM 57 C GLN D1286 12.160 2.029 -44.559 1.00133.39 ATOM 58 O GLN D1286 11.641 2.364 -43.489 1.00135.44 ATOM 59 CB GLN D1286 10.658 0.336 -45.588 1.00126.06 ATOM 60 CG GLN D1286 10.570 -0.822 -46.575 1.00120.92 ATOM 61 CD GLN D1286 9.244 -0.874 -47.309 1.00111.63 ATOM 62 OE1 GLN D1286 8.353 -0.062 -47.065 1.00110.17 ATOM 63 NE2 GLN D1286 9.108 -1.833 -48.220 1.00105.99 ATOM 64 N THR D1287 12.868 2.834 -45.331 1.00115.77 ATOM 65 CA THR D1287 12.985 4.252 -45.097 1.00126.56 ATOM 66 C THR D1287 11.580 4.885 -45.037 1.00118.08 ATOM 67 O THR D1287 11.223 5.556 -44.062 1.00114.56 ATOM 68 CB THR D1287 13.790 4.866 -46.249 1.00146.81 ATOM 69 OG1 THR D1287 14.466 3.819 -46.964 1.00152.19 ATOM 70 CG2 THR D1287 14.804 5.872 -45.732 1.00159.13 ATOM 71 N TYR D1288 10.779 4.642 -46.074 1.00128.62 ATOM 72 CA TYR D1288 9.446 5.226 -46.188 1.00121.53 ATOM 73 C TYR D1288 8.449 4.228 -46.774 1.00102.44 ATOM 74 O TYR D1288 8.805 3.099 -47.118 1.00 93.54 ATOM 75 CB TYR D1288 9.501 6.463 -47.078 1.00133.30 ATOM 76 CG TYR D1288 9.923 6.175 -48.502 1.00130.88 ATOM 77 CD1 TYR D1288 9.093 6.479 -49.569 1.00125.29 ATOM 78 CD2 TYR D1288 11.153 5.592 -48.779 1.00135.00 ATOM 79 CE1 TYR D1288 9.478 6.220 -50.880 1.00124.23 ATOM 80 CE2 TYR D1288 11.550 5.325 -50.089 1.00133.77 ATOM 81 CZ TYR D1288 10.709 5.641 -51.142 1.00128.60 ATOM 82 OH TYR D1288 11.087 5.382 -52.452 1.00128.28 ATOM 83 N GLY D1289 7.192 4.644 -46.882 1.00 98.76 ATOM 84 CA GLY D1289 6.210 3.852 -47.603 1.00 83.02 ATOM 85 C GLY D1289 4.769 4.281 -47.431 1.00 76.31 ATOM 86 O GLY D1289 4.478 5.295 -46.798 1.00 84.33 ATOM 87 N ILE D1290 3.871 3.468 -47.984 1.00107.33 ATOM 88 CA ILE D1290 2.437 3.710 -47.886 1.00 99.59 ATOM 89 C ILE D1290 1.681 2.553 -47.228 1.00 83.67 ATOM 90 O ILE D1290 2.041 1.387 -47.374 1.00 77.68 ATOM 91 CB ILE D1290 1.821 3.964 -49.262 1.00100.48 ATOM 92 CG1 ILE D1290 2.332 5.288 -49.831 1.00105.57 ATOM 93 CG2 ILE D1290 0.327 4.009 -49.152 1.00103.63 ATOM 94 CD1 ILE D1290 2.367 6.423 -48.821 1.00109.81 ATOM 95 N LEU D1291 0.645 2.898 -46.474 1.00 95.07 ATOM 96 CA LEU D1291 -0.275 1.916 -45.926 1.00 80.65 ATOM 97 C LEU D1291 -1.711 2.102 -46.438 1.00 73.96 ATOM 98 O LEU D1291 -2.361 3.097 -46.102 1.00 76.98 ATOM 99 CB LEU D1291 -0.262 2.006 -44.418 1.00 77.63 ATOM 100 CG LEU D1291 0.330 0.757 -43.800 1.00 73.92 ATOM 101 CD1 LEU D1291 -0.362 0.594 -42.506 1.00 69.03 ATOM 102 CD2 LEU D1291 0.124 -0.484 -44.665 1.00 70.66 ATOM 103 N GLU D1292 -2.217 1.158 -47.232 1.00128.56 ATOM 104 CA GLU D1292 -3.581 1.282 -47.739 1.00122.15 ATOM 105 C GLU D1292 -4.371 0.015 -47.472 1.00110.87 ATOM 106 O GLU D1292 -3.857 -1.099 -47.613 1.00108.99 ATOM 107 CB GLU D1292 -3.604 1.656 -49.230 1.00127.04 ATOM 108 CG GLU D1292 -3.161 0.555 -50.182 1.00126.90 ATOM 109 CD GLU D1292 -3.013 1.030 -51.626 1.00132.08 ATOM 110 OE1 GLU D1292 -2.807 2.248 -51.832 1.00143.21 ATOM 111 OE2 GLU D1292 -3.100 0.185 -52.553 1.00125.51 ATOM 112 N SER D1293 -5.615 0.200 -47.053 1.00 82.54 ATOM 113 CA SER D1293 -6.522 -0.912 -46.811 1.00 72.50 ATOM 114 C SER D1293 -6.749 -1.731 -48.099 1.00 70.66 ATOM 115 O SER D1293 -7.189 -1.181 -49.104 1.00 73.02 ATOM 116 CB SER D1293 -7.850 -0.389 -46.234 1.00 66.53 ATOM 117 OG SER D1293 -8.581 0.443 -47.141 1.00 69.78 ATOM 118 N ILE D1294 -6.496 -3.039 -48.058 1.00 84.23 ATOM 119 CA ILE D1294 -6.325 -3.858 -49.276 1.00 83.95 ATOM 120 C ILE D1294 -7.031 -3.368 -50.545 1.00 83.52 ATOM 121 O ILE D1294 -6.383 -3.014 -51.523 1.00 88.14 ATOM 122 CB ILE D1294 -6.726 -5.304 -49.065 1.00 77.41 ATOM 123 CG1 ILE D1294 -8.071 -5.324 -48.310 1.00 69.87 ATOM 124 CG2 ILE D1294 -5.608 -6.068 -48.365 1.00 79.85 ATOM 125 CD1 ILE D1294 -9.107 -6.515 -48.658 1.00 63.85 ATOM 126 N GLY D1295 -8.345 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ATOM 145 O PRO D1297 -11.945 2.569 -53.023 1.00 68.72 ATOM 146 CB PRO D1297 -9.759 4.018 -54.086 1.00 90.40 ATOM 147 CG PRO D1297 -8.575 4.070 -54.951 1.00 98.61 ATOM 148 CD PRO D1297 -8.128 2.656 -55.115 1.00 93.64 ATOM 149 N ASN D1298 -10.896 0.688 -53.617 1.00112.84 ATOM 150 CA ASN D1298 -12.125 -0.084 -53.471 1.00103.88 ATOM 151 C ASN D1298 -12.539 -0.199 -52.002 1.00 99.58 ATOM 152 O ASN D1298 -11.698 -0.360 -51.126 1.00102.82 ATOM 153 CB ASN D1298 -11.972 -1.453 -54.114 1.00101.75 ATOM 154 CG ASN D1298 -11.688 -1.357 -55.596 1.00103.96 ATOM 155 OD1 ASN D1298 -12.163 -0.435 -56.267 1.00105.18 ATOM 156 ND2 ASN D1298 -10.912 -2.304 -56.121 1.00104.58 ATOM 157 N PRO D1299 -13.843 -0.103 -51.724 1.00 88.39 ATOM 158 CA PRO D1299 -14.398 -0.143 -50.364 1.00 83.61 ATOM 159 C PRO D1299 -13.987 -1.413 -49.631 1.00 81.11 ATOM 160 O PRO D1299 -13.875 -2.475 -50.245 1.00 79.94 ATOM 161 CB PRO D1299 -15.903 -0.156 -50.619 1.00 75.42 ATOM 162 CG PRO D1299 -16.023 -0.684 -52.008 1.00 75.98 ATOM 163 CD PRO D1299 -14.917 0.004 -52.713 1.00 84.84 ATOM 164 N TYR D1300 -13.772 -1.312 -48.328 1.00 74.59 ATOM 165 CA TYR D1300 -12.976 -2.333 -47.660 1.00 65.33 ATOM 166 C TYR D1300 -13.734 -3.621 -47.302 1.00 62.82 ATOM 167 O TYR D1300 -14.927 -3.605 -46.951 1.00 62.00 ATOM 168 CB TYR D1300 -12.265 -1.742 -46.455 1.00 68.70 ATOM 169 CG TYR D1300 -13.168 -0.971 -45.546 1.00 74.45 ATOM 170 CD1 TYR D1300 -13.890 -1.618 -44.591 1.00 67.59 ATOM 171 CD2 TYR D1300 -13.288 0.396 -45.640 1.00 78.32 ATOM 172 CE1 TYR D1300 -14.717 -0.955 -43.757 1.00 63.78 ATOM 173 CE2 TYR D1300 -14.111 1.089 -44.793 1.00 74.98 ATOM 174 CZ TYR D1300 -14.837 0.398 -43.836 1.00 66.78 ATOM 175 OH TYR D1300 -15.705 1.028 -42.937 1.00 61.96 ATOM 176 N SER D1301 -13.042 -4.747 -47.394 1.00 92.23 ATOM 177 CA SER D1301 -13.693 -6.030 -47.193 1.00 87.92 ATOM 178 C SER D1301 -14.265 -6.150 -45.799 1.00 83.54 ATOM 179 O SER D1301 -13.678 -5.678 -44.827 1.00 83.80 ATOM 180 CB SER D1301 -12.703 -7.151 -47.463 1.00 90.90 ATOM 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THR D1314 20.072 2.052 -33.532 1.00171.68 ATOM 291 N GLY D1315 17.427 2.769 -32.699 1.00134.30 ATOM 292 CA GLY D1315 16.735 3.617 -31.746 1.00137.44 ATOM 293 C GLY D1315 16.048 4.795 -32.409 1.00144.14 ATOM 294 O GLY D1315 16.070 5.910 -31.888 1.00158.47 ATOM 295 N ASN D1316 15.455 4.551 -33.575 1.00137.82 ATOM 296 CA ASN D1316 14.667 5.566 -34.283 1.00141.38 ATOM 297 C ASN D1316 13.161 5.556 -33.922 1.00125.34 ATOM 298 O ASN D1316 12.734 4.922 -32.941 1.00112.89 ATOM 299 CB ASN D1316 14.839 5.423 -35.806 1.00142.22 ATOM 300 CG ASN D1316 16.289 5.412 -36.240 1.00157.71 ATOM 301 OD1 ASN D1316 17.146 6.013 -35.596 1.00170.62 ATOM 302 ND2 ASN D1316 16.568 4.727 -37.346 1.00157.16 ATOM 303 N THR D1317 12.372 6.264 -34.733 1.00152.75 ATOM 304 CA THR D1317 10.918 6.327 -34.577 1.00139.00 ATOM 305 C THR D1317 10.196 6.288 -35.934 1.00133.20 ATOM 306 O THR D1317 10.798 5.937 -36.958 1.00137.07 ATOM 307 CB THR D1317 10.483 7.588 -33.810 1.00148.61 ATOM 308 OG1 THR D1317 10.833 8.758 -34.561 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-39.280 1.00 85.67 ATOM 879 CG2 VAL D1388 11.894 4.903 -41.418 1.00 83.19 TER