HEADER IMMUNE SYSTEM/TOXIN 30-NOV-10 3PRX TITLE Structure of Complement C5 in Complex with CVF and SSL7 COMPND MOL_ID: 2; COMPND 2 MOLECULE: Cobra venom factor; COMPND 3 CHAIN: B, D; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.30 ANGSTORMS REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 GLN D 1334 REMARK 465 GLU D 1335 REMARK 465 LYS D 1336 REMARK 465 ALA D 1337 REMARK 465 ASN D 1338 REMARK 465 ASN D 1355 REMARK 465 ALA D 1356 REMARK 465 MET D 1357 REMARK 465 GLY D 1358 REMARK 465 ALA D 1359 DBREF 3PRX D 1 1642 UNP Q91132 CO3_NAJKA 1 1642 MODRES 3PRX ASN D 209 ASN GLYCOSYLATION SITE MODRES 3PRX ASN D 1346 ASN GLYCOSYLATION SITE SEQRES 1 D 139 GLN GLU LYS ALA ASN VAL CYS ASN LYS PHE HIS LEU ASN SEQRES 2 D 139 VAL SER VAL GLU ASN ILE HIS LEU ASN ALA MET GLY ALA SEQRES 3 D 139 LYS GLY ALA LEU MET LEU LYS ILE CYS THR ARG TYR LEU SEQRES 4 D 139 GLY GLU VAL ASP SER THR MET THR ILE ILE ASP ILE SER SEQRES 5 D 139 MET LEU THR GLY PHE LEU PRO ASP ALA GLU ASP LEU THR SEQRES 6 D 139 ARG LEU SER LYS GLY VAL ASP ARG TYR ILE SER ARG TYR SEQRES 7 D 139 GLU VAL ASP ASN ASN MET ALA GLN LYS VAL ALA VAL ILE SEQRES 8 D 139 ILE TYR LEU ASN LYS VAL SER HIS SER GLU ASP GLU CYS SEQRES 9 D 139 LEU HIS PHE LYS ILE LEU LYS HIS PHE GLU VAL GLY PHE SEQRES 10 D 139 ILE GLN PRO GLY SER VAL LYS VAL TYR SER TYR TYR ASN SEQRES 11 D 139 LEU ASP GLU LYS CYS THR LYS PHE TYR ATOM 1 N VAL D1339 141.657 -60.543 -7.412 1.00190.35 ATOM 2 CA VAL D1339 140.441 -59.856 -7.846 1.00189.01 ATOM 3 C VAL D1339 140.262 -58.453 -7.227 1.00189.12 ATOM 4 O VAL D1339 140.711 -58.187 -6.110 1.00190.87 ATOM 5 CB VAL D1339 139.184 -60.722 -7.584 1.00189.88 ATOM 6 CG1 VAL D1339 139.340 -62.099 -8.234 1.00191.07 ATOM 7 CG2 VAL D1339 138.937 -60.856 -6.091 1.00192.07 ATOM 8 N CYS D1340 139.611 -57.568 -7.984 1.00192.37 ATOM 9 CA CYS D1340 139.317 -56.190 -7.569 1.00193.43 ATOM 10 C CYS D1340 140.463 -55.185 -7.640 1.00194.57 ATOM 11 O CYS D1340 141.149 -54.932 -6.650 1.00196.62 ATOM 12 CB CYS D1340 138.717 -56.137 -6.169 1.00195.47 ATOM 13 SG CYS D1340 138.295 -54.455 -5.713 1.00198.11 ATOM 14 N ASN D1341 140.637 -54.601 -8.817 1.00186.14 ATOM 15 CA ASN D1341 141.515 -53.463 -9.000 1.00187.92 ATOM 16 C ASN D1341 140.628 -52.314 -9.439 1.00189.56 ATOM 17 O ASN D1341 139.422 -52.349 -9.206 1.00189.47 ATOM 18 CB ASN D1341 142.546 -53.762 -10.077 1.00186.73 ATOM 19 CG ASN D1341 141.914 -54.323 -11.331 1.00184.87 ATOM 20 OD1 ASN D1341 141.858 -55.539 -11.516 1.00183.46 ATOM 21 ND2 ASN D1341 141.404 -53.441 -12.187 1.00185.63 ATOM 22 N LYS D1342 141.217 -51.313 -10.088 1.00174.92 ATOM 23 CA LYS D1342 140.471 -50.162 -10.600 1.00177.50 ATOM 24 C LYS D1342 139.917 -49.246 -9.506 1.00181.32 ATOM 25 O LYS D1342 140.188 -48.051 -9.502 1.00185.77 ATOM 26 CB LYS D1342 139.342 -50.602 -11.541 1.00175.22 ATOM 27 CG LYS D1342 139.808 -51.159 -12.885 1.00173.24 ATOM 28 CD LYS D1342 140.642 -50.160 -13.697 1.00176.10 ATOM 29 CE LYS D1342 139.778 -49.301 -14.625 1.00178.61 ATOM 30 NZ LYS D1342 140.591 -48.431 -15.538 1.00182.06 ATOM 31 N PHE D1343 139.150 -49.806 -8.574 1.00175.23 ATOM 32 CA PHE D1343 138.501 -48.998 -7.533 1.00179.34 ATOM 33 C PHE D1343 138.788 -49.416 -6.079 1.00180.16 ATOM 34 O PHE D1343 138.770 -50.600 -5.738 1.00177.27 ATOM 35 CB PHE D1343 136.986 -49.008 -7.726 1.00178.56 ATOM 36 CG PHE D1343 136.532 -48.365 -8.982 1.00178.85 ATOM 37 CD1 PHE D1343 136.072 -47.063 -8.981 1.00183.85 ATOM 38 CD2 PHE D1343 136.551 -49.064 -10.158 1.00174.97 ATOM 39 CE1 PHE D1343 135.641 -46.465 -10.134 1.00184.80 ATOM 40 CE2 PHE D1343 136.125 -48.482 -11.314 1.00175.81 ATOM 41 CZ PHE D1343 135.665 -47.173 -11.305 1.00180.64 ATOM 42 N HIS D1344 139.037 -48.430 -5.222 1.00198.98 ATOM 43 CA HIS D1344 138.986 -48.642 -3.780 1.00196.90 ATOM 44 C HIS D1344 137.510 -48.620 -3.450 1.00189.01 ATOM 45 O HIS D1344 136.759 -47.815 -4.008 1.00186.88 ATOM 46 CB HIS D1344 139.690 -47.498 -3.038 1.00200.29 ATOM 47 CG HIS D1344 140.830 -47.930 -2.166 1.00202.98 ATOM 48 ND1 HIS D1344 141.565 -47.036 -1.409 1.00206.86 ATOM 49 CD2 HIS D1344 141.369 -49.149 -1.933 1.00202.68 ATOM 50 CE1 HIS D1344 142.504 -47.688 -0.750 1.00208.78 ATOM 51 NE2 HIS D1344 142.407 -48.973 -1.051 1.00206.26 ATOM 52 N LEU D1345 137.098 -49.493 -2.544 1.00129.33 ATOM 53 CA LEU D1345 135.695 -49.586 -2.166 1.00122.14 ATOM 54 C LEU D1345 135.476 -50.133 -0.741 1.00119.06 ATOM 55 O LEU D1345 135.547 -51.342 -0.520 1.00119.07 ATOM 56 CB LEU D1345 134.963 -50.460 -3.173 1.00120.75 ATOM 57 CG LEU D1345 133.586 -50.924 -2.718 1.00114.45 ATOM 58 CD1 LEU D1345 132.676 -49.747 -2.440 1.00111.12 ATOM 59 CD2 LEU D1345 133.006 -51.837 -3.774 1.00114.25 ATOM 60 N ASN D1346 135.240 -49.245 0.226 1.00191.64 ATOM 61 CA ASN D1346 134.786 -49.679 1.547 1.00189.47 ATOM 62 C ASN D1346 133.267 -49.762 1.488 1.00184.68 ATOM 63 O ASN D1346 132.652 -49.039 0.714 1.00183.06 ATOM 64 CB ASN D1346 135.147 -48.669 2.656 1.00191.13 ATOM 65 CG ASN D1346 136.629 -48.681 3.079 1.00196.56 ATOM 66 OD1 ASN D1346 137.481 -49.311 2.465 1.00199.63 ATOM 67 ND2 ASN D1346 136.901 -47.963 4.188 1.00198.44 ATOM 68 N VAL D1347 132.663 -50.636 2.294 1.00122.19 ATOM 69 CA VAL D1347 131.221 -50.556 2.583 1.00119.19 ATOM 70 C VAL D1347 130.922 -50.987 4.000 1.00120.39 ATOM 71 O VAL D1347 131.257 -52.108 4.425 1.00121.60 ATOM 72 CB VAL D1347 130.332 -51.403 1.686 1.00116.71 ATOM 73 CG1 VAL D1347 128.909 -51.422 2.250 1.00115.04 ATOM 74 CG2 VAL D1347 130.325 -50.867 0.278 1.00116.27 ATOM 75 N SER D1348 130.260 -50.086 4.716 1.00162.55 ATOM 76 CA SER D1348 129.967 -50.286 6.123 1.00165.45 ATOM 77 C SER D1348 128.487 -50.088 6.355 1.00165.05 ATOM 78 O SER D1348 127.778 -49.563 5.502 1.00162.43 ATOM 79 CB SER D1348 130.753 -49.293 6.983 1.00168.87 ATOM 80 OG SER D1348 130.176 -47.994 6.913 1.00168.32 ATOM 81 N VAL D1349 128.039 -50.494 7.532 1.00141.11 ATOM 82 CA VAL D1349 126.630 -50.519 7.851 1.00142.50 ATOM 83 C VAL D1349 126.435 -50.755 9.338 1.00148.88 ATOM 84 O VAL D1349 127.082 -51.630 9.928 1.00151.09 ATOM 85 CB VAL D1349 125.952 -51.677 7.119 1.00139.93 ATOM 86 CG1 VAL D1349 126.699 -52.970 7.407 1.00140.52 ATOM 87 CG2 VAL D1349 124.512 -51.796 7.540 1.00142.82 ATOM 88 N GLU D1350 125.541 -49.981 9.947 1.00208.44 ATOM 89 CA GLU D1350 125.132 -50.269 11.333 1.00216.28 ATOM 90 C GLU D1350 124.080 -49.309 11.911 1.00221.58 ATOM 91 O GLU D1350 123.859 -48.216 11.396 1.00219.14 ATOM 92 CB GLU D1350 126.338 -50.439 12.283 1.00220.09 ATOM 93 CG GLU D1350 127.338 -49.325 12.198 1.00218.70 ATOM 94 CD GLU D1350 126.660 -48.000 11.942 1.00218.22 ATOM 95 OE1 GLU D1350 126.102 -47.429 12.905 1.00224.79 ATOM 96 OE2 GLU D1350 126.654 -47.554 10.771 1.00212.01 ATOM 97 N ASN D1351 123.473 -49.737 13.012 1.00197.84 ATOM 98 CA ASN D1351 122.187 -49.224 13.493 1.00204.48 ATOM 99 C ASN D1351 122.079 -47.769 13.935 1.00206.30 ATOM 100 O ASN D1351 123.067 -47.125 14.271 1.00207.24 ATOM 101 CB ASN D1351 121.676 -50.117 14.633 1.00210.79 ATOM 102 CG ASN D1351 122.643 -51.257 14.976 1.00212.19 ATOM 103 OD1 ASN D1351 123.869 -51.085 15.013 1.00210.40 ATOM 104 ND2 ASN D1351 122.082 -52.429 15.232 1.00215.15 ATOM 105 N ILE D1352 120.849 -47.267 13.876 1.00203.87 ATOM 106 CA ILE D1352 120.356 -46.201 14.749 1.00208.61 ATOM 107 C ILE D1352 118.847 -46.447 14.809 1.00210.03 ATOM 108 O ILE D1352 118.254 -46.799 13.789 1.00207.33 ATOM 109 CB ILE D1352 120.631 -44.762 14.226 1.00206.05 ATOM 110 CG1 ILE D1352 122.042 -44.615 13.645 1.00202.39 ATOM 111 CG2 ILE D1352 120.419 -43.741 15.355 1.00211.47 ATOM 112 CD1 ILE D1352 122.480 -43.167 13.461 1.00202.45 ATOM 113 N HIS D1353 118.222 -46.265 15.977 1.00299.58 ATOM 114 CA HIS D1353 116.882 -46.841 16.227 1.00300.23 ATOM 115 C HIS D1353 115.630 -45.996 15.900 1.00297.88 ATOM 116 O HIS D1353 115.488 -44.855 16.351 1.00296.59 ATOM 117 CB HIS D1353 116.782 -47.398 17.660 1.00302.52 ATOM 118 CG HIS D1353 115.925 -48.630 17.775 1.00305.43 ATOM 119 ND1 HIS D1353 115.786 -49.546 16.754 1.00307.29 ATOM 120 CD2 HIS D1353 115.178 -49.100 18.804 1.00307.93 ATOM 121 CE1 HIS D1353 114.983 -50.522 17.142 1.00311.47 ATOM 122 NE2 HIS D1353 114.602 -50.275 18.382 1.00311.93 ATOM 123 N LEU D1354 114.732 -46.600 15.116 1.00246.53 ATOM 124 CA LEU D1354 113.390 -46.080 14.833 1.00245.04 ATOM 125 C LEU D1354 112.366 -47.164 15.161 1.00248.31 ATOM 126 O LEU D1354 112.421 -48.273 14.619 1.00251.43 ATOM 127 CB LEU D1354 113.238 -45.658 13.361 1.00242.96 ATOM 128 CG LEU D1354 111.905 -45.023 12.917 1.00241.19 ATOM 129 CD1 LEU D1354 112.090 -44.175 11.671 1.00238.56 ATOM 130 CD2 LEU D1354 110.786 -46.044 12.696 1.00243.81 ATOM 131 N LYS D1360 110.388 -50.120 12.463 1.00237.75 ATOM 132 CA LYS D1360 110.384 -51.575 12.371 1.00244.02 ATOM 133 C LYS D1360 111.766 -52.139 12.672 1.00241.79 ATOM 134 O LYS D1360 111.927 -53.340 12.912 1.00244.71 ATOM 135 CB LYS D1360 109.931 -52.013 10.983 1.00241.95 ATOM 136 CG LYS D1360 108.436 -51.927 10.772 1.00248.42 ATOM 137 CD LYS D1360 107.758 -53.213 11.214 1.00255.96 ATOM 138 CE LYS D1360 106.242 -53.109 11.095 1.00257.16 ATOM 139 NZ LYS D1360 105.826 -52.534 9.781 1.00250.42 ATOM 140 N GLY D1361 112.757 -51.254 12.672 1.00225.85 ATOM 141 CA GLY D1361 114.143 -51.641 12.833 1.00221.86 ATOM 142 C GLY D1361 114.902 -50.927 11.744 1.00212.63 ATOM 143 O GLY D1361 114.346 -50.653 10.688 1.00209.27 ATOM 144 N ALA D1362 116.169 -50.628 11.970 1.00200.11 ATOM 145 CA ALA D1362 116.859 -49.781 11.016 1.00192.92 ATOM 146 C ALA D1362 118.358 -49.963 11.063 1.00189.95 ATOM 147 O ALA D1362 118.914 -50.416 12.067 1.00193.45 ATOM 148 CB ALA D1362 116.520 -48.341 11.297 1.00193.73 ATOM 149 N LEU D1363 119.013 -49.598 9.967 1.00148.96 ATOM 150 CA LEU D1363 120.465 -49.452 9.984 1.00144.43 ATOM 151 C LEU D1363 121.008 -48.568 8.849 1.00136.91 ATOM 152 O LEU D1363 120.298 -48.222 7.905 1.00134.16 ATOM 153 CB LEU D1363 121.196 -50.808 10.073 1.00142.69 ATOM 154 CG LEU D1363 121.323 -51.770 8.890 1.00136.09 ATOM 155 CD1 LEU D1363 122.170 -52.984 9.249 1.00135.97 ATOM 156 CD2 LEU D1363 119.961 -52.214 8.441 1.00137.73 ATOM 157 N MET D1364 122.274 -48.184 8.969 1.00159.53 ATOM 158 CA MET D1364 122.882 -47.218 8.059 1.00154.20 ATOM 159 C MET D1364 123.849 -47.858 7.081 1.00148.38 ATOM 160 O MET D1364 124.718 -48.661 7.492 1.00148.84 ATOM 161 CB MET D1364 123.641 -46.162 8.857 1.00157.03 ATOM 162 CG 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